View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0755_low_88 (Length: 311)

Name: NF0755_low_88
Description: NF0755
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0755_low_88
NF0755_low_88
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (12-311)||(19886483-19886782)
chr2 (12-274)||(11231161-11231426)
chr2 (12-274)||(22513008-22513273)
chr2 (12-274)||(28775630-28775895)
chr2 (12-274)||(24685604-24685869)
chr2 (100-274)||(8944014-8944189)
chr2 (100-274)||(12728560-12728735)
chr2 (12-136)||(24826522-24826646)
chr2 (100-274)||(3798516-3798691)
chr2 (100-274)||(34824643-34824818)
chr2 (105-274)||(23777963-23778133)
chr2 (63-274)||(42177845-42178057)
chr2 (100-274)||(12635781-12635956)
chr2 (100-274)||(16935761-16935936)
chr2 (100-274)||(17006421-17006596)
chr2 (105-274)||(12641560-12641730)
chr2 (190-311)||(25265402-25265523)
chr2 (190-309)||(462870-462989)
chr2 (190-309)||(7507856-7507975)
chr2 (190-311)||(36982453-36982574)
chr2 (193-311)||(19794719-19794837)
chr2 (193-311)||(20627328-20627446)
chr2 (190-311)||(8891372-8891493)
chr2 (100-208)||(23774370-23774479)
chr2 (210-311)||(43642989-43643090)
chr2 (190-310)||(19689413-19689533)
chr2 (190-310)||(23820202-23820322)
chr2 (209-311)||(24341420-24341522)
chr2 (190-311)||(17396665-17396785)
chr2 (105-208)||(5888548-5888652)
chr2 (190-310)||(14906452-14906572)
chr2 (151-239)||(21142098-21142187)
chr2 (190-310)||(20015142-20015262)
chr2 (63-136)||(25213372-25213446)
[»] chr5 (40 HSPs)
chr5 (5-311)||(12505-12811)
chr5 (5-311)||(21073410-21073716)
chr5 (12-311)||(18777814-18778113)
chr5 (12-311)||(19500030-19500328)
chr5 (12-311)||(22366302-22366602)
chr5 (12-311)||(25426759-25427058)
chr5 (12-311)||(4199807-4200106)
chr5 (12-311)||(43443220-43443516)
chr5 (12-311)||(29188107-29188405)
chr5 (38-308)||(27009975-27010244)
chr5 (12-274)||(10777793-10778058)
chr5 (12-274)||(21932204-21932469)
chr5 (12-274)||(21938374-21938639)
chr5 (12-274)||(35582204-35582469)
chr5 (38-274)||(7425492-7425729)
chr5 (62-274)||(11211940-11212153)
chr5 (12-274)||(36989593-36989858)
chr5 (12-241)||(22882907-22883139)
chr5 (12-274)||(17471411-17471676)
chr5 (63-274)||(35790974-35791186)
chr5 (63-274)||(23514729-23514941)
chr5 (100-274)||(1219433-1219608)
chr5 (190-311)||(23507095-23507216)
chr5 (190-311)||(34939407-34939528)
chr5 (12-136)||(11343008-11343134)
chr5 (190-311)||(22053845-22053966)
chr5 (190-309)||(18531079-18531198)
chr5 (100-208)||(23328791-23328900)
chr5 (100-208)||(24616395-24616504)
chr5 (100-208)||(24712771-24712880)
chr5 (100-208)||(24745789-24745898)
chr5 (190-311)||(27182559-27182680)
chr5 (190-310)||(20623100-20623220)
chr5 (190-310)||(21233540-21233660)
chr5 (190-310)||(25900418-25900538)
chr5 (12-136)||(16105967-16106093)
chr5 (190-310)||(16536328-16536448)
chr5 (190-274)||(37052911-37052995)
chr5 (193-274)||(32950862-32950943)
chr5 (194-278)||(26559815-26559900)
[»] chr6 (30 HSPs)
chr6 (12-311)||(27653805-27654104)
chr6 (38-311)||(25175694-25175968)
chr6 (116-311)||(16825678-16825875)
chr6 (12-309)||(14625952-14626249)
chr6 (105-311)||(1650022-1650226)
chr6 (12-274)||(16376196-16376461)
chr6 (12-274)||(16383520-16383785)
chr6 (12-274)||(10488867-10489132)
chr6 (12-241)||(22251389-22251621)
chr6 (38-274)||(16232060-16232297)
chr6 (12-274)||(22225561-22225826)
chr6 (12-212)||(19299467-19299670)
chr6 (23-274)||(16555973-16556227)
chr6 (23-274)||(16632529-16632783)
chr6 (38-274)||(18086674-18086911)
chr6 (100-274)||(1556173-1556348)
chr6 (63-274)||(19610186-19610398)
chr6 (100-274)||(23977937-23978112)
chr6 (38-208)||(29869627-29869798)
chr6 (12-121)||(16814820-16814930)
chr6 (190-311)||(1657760-1657881)
chr6 (190-311)||(35009451-35009572)
chr6 (192-311)||(15862601-15862720)
chr6 (192-311)||(23153577-23153696)
chr6 (105-274)||(13620712-13620882)
chr6 (109-274)||(29666041-29666208)
chr6 (191-263)||(27751603-27751675)
chr6 (63-136)||(4991396-4991470)
chr6 (194-278)||(19854317-19854402)
chr6 (218-278)||(29605612-29605672)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (12-311)||(36224-36523)
scaffold0023 (16-229)||(169736-169951)
scaffold0023 (100-274)||(153920-154095)
scaffold0023 (190-311)||(48728-48849)
[»] chr7 (37 HSPs)
chr7 (12-311)||(13910846-13911145)
chr7 (12-311)||(10989540-10989841)
chr7 (12-309)||(2437590-2437889)
chr7 (12-311)||(16478785-16479083)
chr7 (38-311)||(13572807-13573079)
chr7 (12-274)||(7822896-7823161)
chr7 (12-274)||(7830207-7830472)
chr7 (12-274)||(27176601-27176866)
chr7 (12-274)||(27101460-27101725)
chr7 (12-274)||(27108808-27109073)
chr7 (12-274)||(38783552-38783817)
chr7 (38-274)||(18979872-18980109)
chr7 (38-274)||(15927736-15927973)
chr7 (105-311)||(18253761-18253968)
chr7 (12-274)||(15950613-15950879)
chr7 (100-274)||(13758538-13758713)
chr7 (100-274)||(15760027-15760202)
chr7 (190-309)||(47481043-47481162)
chr7 (190-274)||(13321183-13321267)
chr7 (105-276)||(48622584-48622756)
chr7 (100-274)||(14250811-14250986)
chr7 (105-187)||(15862174-15862257)
chr7 (190-311)||(11580751-11580872)
chr7 (190-311)||(16211896-16212017)
chr7 (190-311)||(13037026-13037147)
chr7 (209-311)||(36052794-36052896)
chr7 (190-310)||(11516358-11516478)
chr7 (190-310)||(15441576-15441696)
chr7 (190-310)||(30262141-30262261)
chr7 (190-310)||(7293147-7293267)
chr7 (105-208)||(16418731-16418835)
chr7 (190-311)||(3060096-3060217)
chr7 (190-311)||(25292350-25292471)
chr7 (105-208)||(10000288-10000392)
chr7 (62-136)||(15516719-15516793)
chr7 (190-299)||(295978-296087)
chr7 (194-278)||(28722272-28722357)
[»] chr8 (30 HSPs)
chr8 (12-311)||(30120853-30121153)
chr8 (12-311)||(24549112-24549410)
chr8 (12-311)||(6774082-6774379)
chr8 (12-311)||(21844393-21844693)
chr8 (12-311)||(21851786-21852086)
chr8 (41-311)||(16674245-16674513)
chr8 (12-274)||(271183-271448)
chr8 (12-274)||(644472-644737)
chr8 (12-274)||(830207-830472)
chr8 (12-215)||(15318982-15319188)
chr8 (12-215)||(15499351-15499557)
chr8 (12-274)||(22088617-22088882)
chr8 (100-274)||(22006171-22006346)
chr8 (63-274)||(13720804-13721016)
chr8 (93-274)||(16195399-16195581)
chr8 (100-274)||(16872964-16873139)
chr8 (63-274)||(13662141-13662353)
chr8 (184-311)||(43373474-43373601)
chr8 (190-311)||(16193728-16193849)
chr8 (190-311)||(16404987-16405108)
chr8 (194-311)||(17345699-17345816)
chr8 (190-311)||(24928803-24928924)
chr8 (252-311)||(222753-222812)
chr8 (252-311)||(691908-691967)
chr8 (252-311)||(736376-736435)
chr8 (252-311)||(860271-860330)
chr8 (190-310)||(5238218-5238338)
chr8 (190-310)||(22907226-22907346)
chr8 (190-310)||(24661260-24661380)
chr8 (190-310)||(43685677-43685797)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (12-311)||(31497-31796)
scaffold0008 (190-311)||(128181-128302)
[»] chr3 (36 HSPs)
chr3 (38-311)||(55316350-55316622)
chr3 (38-311)||(41270206-41270478)
chr3 (12-274)||(49232604-49232869)
chr3 (100-311)||(16821270-16821479)
chr3 (12-274)||(12264614-12264880)
chr3 (105-311)||(15614964-15615168)
chr3 (12-274)||(1467562-1467827)
chr3 (12-241)||(12812042-12812274)
chr3 (105-311)||(15936553-15936760)
chr3 (12-274)||(22275377-22275642)
chr3 (63-274)||(15468216-15468428)
chr3 (63-274)||(25058907-25059119)
chr3 (105-311)||(15938395-15938602)
chr3 (63-274)||(18911161-18911373)
chr3 (105-274)||(12902008-12902178)
chr3 (63-241)||(18896920-18897099)
chr3 (63-274)||(5228481-5228692)
chr3 (190-311)||(51158030-51158151)
chr3 (105-274)||(54651625-54651795)
chr3 (190-311)||(12030159-12030280)
chr3 (190-311)||(15859036-15859157)
chr3 (63-311)||(14842446-14842694)
chr3 (157-311)||(13839024-13839177)
chr3 (190-310)||(17912495-17912614)
chr3 (190-311)||(2049940-2050061)
chr3 (190-310)||(2449250-2449370)
chr3 (105-274)||(44229153-44229323)
chr3 (190-311)||(13975734-13975854)
chr3 (190-311)||(45860936-45861056)
chr3 (190-311)||(13954902-13955022)
chr3 (193-310)||(16744130-16744247)
chr3 (100-137)||(8268646-8268683)
chr3 (100-137)||(8275746-8275783)
chr3 (193-274)||(11986181-11986262)
chr3 (194-278)||(41661727-41661812)
chr3 (194-278)||(31412333-31412418)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (38-311)||(1153-1425)
[»] chr4 (31 HSPs)
chr4 (12-311)||(10644350-10644648)
chr4 (100-311)||(47357785-47357994)
chr4 (38-274)||(15287096-15287333)
chr4 (12-274)||(18169138-18169403)
chr4 (38-274)||(15294205-15294442)
chr4 (100-274)||(7131978-7132153)
chr4 (105-274)||(19020654-19020824)
chr4 (100-274)||(17145570-17145745)
chr4 (100-274)||(20000891-20001066)
chr4 (38-208)||(22351915-22352086)
chr4 (105-239)||(18248421-18248556)
chr4 (114-216)||(8378377-8378480)
chr4 (190-311)||(122019-122140)
chr4 (190-311)||(15675101-15675222)
chr4 (190-311)||(54118256-54118377)
chr4 (190-311)||(10104262-10104383)
chr4 (100-208)||(26339253-26339362)
chr4 (190-310)||(26680331-26680451)
chr4 (143-274)||(22738437-22738568)
chr4 (209-311)||(13246560-13246662)
chr4 (209-275)||(31115795-31115861)
chr4 (218-311)||(13048261-13048354)
chr4 (190-310)||(10488693-10488813)
chr4 (190-310)||(16327938-16328058)
chr4 (38-136)||(14952085-14952183)
chr4 (105-169)||(9795499-9795564)
chr4 (190-241)||(33240900-33240951)
chr4 (209-276)||(40885585-40885652)
chr4 (105-137)||(14996444-14996476)
chr4 (105-138)||(8378491-8378524)
chr4 (194-278)||(18238157-18238242)
[»] chr1 (23 HSPs)
chr1 (38-311)||(5072237-5072509)
chr1 (143-311)||(18601071-18601239)
chr1 (66-309)||(22227941-22228185)
chr1 (66-309)||(22232638-22232882)
chr1 (105-311)||(45051553-45051757)
chr1 (12-274)||(18059581-18059846)
chr1 (105-311)||(2116385-2116589)
chr1 (12-274)||(17148735-17149001)
chr1 (12-274)||(17004806-17005071)
chr1 (12-274)||(38054914-38055179)
chr1 (12-212)||(19962322-19962525)
chr1 (100-274)||(46523557-46523731)
chr1 (190-311)||(20913160-20913281)
chr1 (190-311)||(20931475-20931596)
chr1 (63-208)||(22035681-22035827)
chr1 (190-311)||(41394352-41394473)
chr1 (100-208)||(7640847-7640956)
chr1 (190-311)||(20893638-20893759)
chr1 (190-276)||(20445844-20445930)
chr1 (190-276)||(20531609-20531695)
chr1 (190-276)||(37844462-37844548)
chr1 (190-310)||(51452623-51452743)
chr1 (62-136)||(15861284-15861358)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (34-311)||(13171-13446)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (12-311)||(43128-43427)
scaffold0076 (12-274)||(39271-39536)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (12-307)||(20936-21233)
scaffold0139 (12-311)||(13882-14182)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (63-311)||(3093-3341)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (105-311)||(9266-9470)
scaffold0215 (105-311)||(16164-16368)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (63-309)||(5088-5335)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (38-311)||(64372-64649)
scaffold0026 (105-311)||(107877-108084)
[»] scaffold0213 (2 HSPs)
scaffold0213 (47-216)||(29388-29558)
scaffold0213 (12-73)||(29565-29627)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (63-309)||(3854-4102)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (100-311)||(166-374)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (12-274)||(31477-31742)
scaffold0107 (153-274)||(39814-39935)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (63-216)||(10624-10778)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (63-274)||(1451-1663)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (12-239)||(7278-7509)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (12-274)||(2560-2826)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (63-274)||(1390-1602)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (38-208)||(6831-7002)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (190-311)||(3594-3715)
scaffold0266 (190-311)||(1254-1375)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (190-311)||(19336-19457)
scaffold0195 (190-311)||(21420-21541)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (190-311)||(968-1089)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (105-274)||(10257-10427)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (190-276)||(34472-34558)
scaffold0075 (105-138)||(34374-34407)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (12-136)||(130880-131006)
scaffold0028 (190-311)||(89466-89587)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (190-311)||(5659-5780)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (190-311)||(6076-6197)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (190-311)||(12243-12364)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (38-206)||(23600-23769)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (190-311)||(13636-13757)
scaffold0132 (104-136)||(42677-42709)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (190-311)||(48317-48438)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (193-309)||(41780-41896)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (105-276)||(54040-54212)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (105-274)||(45198-45369)
scaffold0066 (105-274)||(54584-54755)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (193-311)||(36928-37046)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (209-311)||(148851-148953)
scaffold0025 (190-311)||(8979-9100)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (143-276)||(3579-3712)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (190-311)||(8192-8313)
scaffold0162 (190-308)||(26427-26545)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (190-311)||(51194-51315)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (190-311)||(123176-123297)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (184-271)||(3360-3447)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (190-276)||(546-632)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (190-311)||(9008-9129)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (190-311)||(41859-41980)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (105-274)||(34076-34246)
scaffold0012 (190-311)||(247454-247575)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (190-311)||(5073-5194)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (190-311)||(172035-172156)
scaffold0001 (190-311)||(177738-177859)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (105-208)||(12045-12149)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (190-310)||(22671-22791)
scaffold0141 (190-310)||(26926-27046)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (190-310)||(1594-1714)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (190-310)||(37078-37198)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (105-208)||(7443-7547)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (38-129)||(154282-154373)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (12-136)||(17115-17241)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (209-311)||(272155-272257)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (105-169)||(13268-13333)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (193-274)||(56114-56195)
[»] scaffold1666 (1 HSPs)
scaffold1666 (191-274)||(1-84)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (194-276)||(8174-8257)
[»] scaffold0406 (1 HSPs)
scaffold0406 (194-278)||(14198-14283)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (194-278)||(108171-108256)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 292; Significance: 1e-164; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 12 - 311
Target Start/End: Original strand, 19886483 - 19886782
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886483 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 19886582  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886583 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctg 19886682  T
Q  212 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886683 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 19886782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 11231161 - 11231426
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  11231161 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 11231260  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  11231261 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 11231360  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  11231361 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 11231426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 22513008 - 22513273
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  22513008 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 22513107  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  22513108 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 22513207  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  22513208 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 22513273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 28775630 - 28775895
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  28775630 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 28775729  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  28775730 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 28775829  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  28775830 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 28775895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 24685604 - 24685869
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  24685604 agagaagaacaaaagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 24685703  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  24685704 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 24685803  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  24685804 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 24685869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 8944189 - 8944014
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  8944189 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatt 8944090  T
Q  199 cgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  8944089 cgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatatttgtgggtgaaattacatgtt 8944014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 12728735 - 12728560
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  12728735 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatt 12728636  T
Q  199 cgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  12728635 cgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 12728560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 136
Target Start/End: Original strand, 24826522 - 24826646
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  24826522 agagaagagcaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaa 24826621  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcat 136  Q
     ||||||||| || |||||||||||    
T  24826622 aggggttagtcatcatcataatcat 24826646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Original strand, 3798516 - 3798691
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||    
T  3798516 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtataatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaatt 3798615  T
Q  199 cgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  3798616 cgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 3798691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 34824818 - 34824643
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  34824818 cttctaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatt 34824719  T
Q  199 cgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  34824718 cgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 34824643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Original strand, 23777963 - 23778133
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 203  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23777963 aaggtaaaggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 23778062  T
Q  204 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||| |  | ||||  |||| | ||||||||||||||    
T  23778063 tcttgctgtgatgctattttcttatgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtt 23778133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Original strand, 42177845 - 42178057
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgtt 161  Q
    |||| ||||||||||| | ||  || ||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||    
T  42177845 taggggctgaattgaagcaagagtttaggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 42177944  T
Q  162 gtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  || | |||    
T  42177945 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggt 42178044  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  42178045 gaaattacatgtt 42178057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Original strand, 12635781 - 12635956
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||    
T  12635781 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcatttcctcatgttgtatgaaaataggttgatgaacaattgttgctaaatt 12635880  T
Q  199 cgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  12635881 cgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 12635956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16935936 - 16935761
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||    
T  16935936 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaatt 16935837  T
Q  199 cgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    | |||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  ||||  |||||||||||||||    
T  16935836 catgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgtgaaattacatgtt 16935761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17006596 - 17006421
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||    
T  17006596 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaatt 17006497  T
Q  199 cgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    | |||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  ||||  |||||||||||||||    
T  17006496 catgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgtgaaattacatgtt 17006421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Original strand, 12641560 - 12641730
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||    
T  12641560 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgc 12641659  T
Q  204 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||| ||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| | ||||||||||||||    
T  12641660 tcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggctgaaattacatgtt 12641730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Original strand, 25265402 - 25265523
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |    
T  25265402 tgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 25265501  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |  ||||| |||| ||||||||    
T  25265502 gtgaagttgtgaaaattgtgct 25265523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 190 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 462989 - 462870
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  462989 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 462890  T
Q  290 gataagttatgaagattgtg 309  Q
    |||||||| |||| ||||||    
T  462889 gataagttgtgaaaattgtg 462870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 190 - 309
Target Start/End: Original strand, 7507856 - 7507975
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  7507856 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 7507955  T
Q  290 gataagttatgaagattgtg 309  Q
     |||||||||||| ||||||    
T  7507956 aataagttatgaaaattgtg 7507975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Original strand, 36982453 - 36982574
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  36982453 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtattcatgaattgatgataattgtaagattgctggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 36982552  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||| |||| ||||||||    
T  36982553 gataagttgtgaaaattgtgct 36982574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 193 - 311
Target Start/End: Original strand, 19794719 - 19794837
Alignment:
Q  193 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgat 292  Q
    |||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | || ||||    
T  19794719 taaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgat 19794818  T
Q  293 aagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| |||| ||||||||    
T  19794819 aagttgtgaaaattgtgct 19794837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 193 - 311
Target Start/End: Original strand, 20627328 - 20627446
Alignment:
Q  193 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgat 292  Q
    |||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||    
T  20627328 taaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcacgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtccaaatatgtaaaaatgat 20627427  T
Q  293 aagttatgaagattgtgct 311  Q
    || || |||| ||||||||    
T  20627428 aacttgtgaaaattgtgct 20627446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 8891493 - 8891372
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| | | || |    
T  8891493 tgctaaattcgtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggcgaaattacatgttcaaataggaacaaat 8891394  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||| |||| ||||||||    
T  8891393 gataagttgtgaaaattgtgct 8891372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 100 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 23774479 - 23774370
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||  || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  23774479 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaagttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaatt 23774380  T
Q  199 cgtgctcttg 208  Q
    ||||||||||    
T  23774379 cgtgctcttg 23774370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 210 - 311
Target Start/End: Original strand, 43642989 - 43643090
Alignment:
Q  210 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtg 309  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | || || |||||| |||| ||||||    
T  43642989 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtg 43643088  T
Q  310 ct 311  Q
    ||    
T  43643089 ct 43643090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 190 - 310
Target Start/End: Original strand, 19689413 - 19689533
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||| |    
T  19689413 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 19689512  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgc 310  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  19689513 gaaaagttatgaaaattgtgc 19689533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 190 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23820322 - 23820202
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||| |    
T  23820322 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 23820223  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgc 310  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  23820222 gaaaagttatgaaaattgtgc 23820202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 209 - 311
Target Start/End: Original strand, 24341420 - 24341522
Alignment:
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgt 308  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||| |||| ||  ||||| |||| |||||    
T  24341420 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattatatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgt 24341519  T
Q  309 gct 311  Q
    |||    
T  24341520 gct 24341522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Original strand, 17396665 - 17396785
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||| | |||| |    
T  17396665 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaataagtaaaaat 17396763  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  17396764 gataagttatgaatattgtgct 17396785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 208
Target Start/End: Original strand, 5888548 - 5888652
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 203  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||| | |  ||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5888548 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 5888647  T
Q  204 tcttg 208  Q
    |||||    
T  5888648 tcttg 5888652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 310
Target Start/End: Original strand, 14906452 - 14906572
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||| |    
T  14906452 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 14906551  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgc 310  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  14906552 gaaaagttatgaaaattgtgc 14906572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 21142187 - 21142098
Alignment:
Q  151 tttctcatg-ttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattga 239  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | ||||||||||||    
T  21142187 tttctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattga 21142098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20015262 - 20015142
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||| ||||||||||||||  || |||| | ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||| |    
T  20015262 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgcatgcatgaattgataataattgtgtgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 20015163  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgc 310  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  20015162 gaaaagttatgaaaattgtgc 20015142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 25213446 - 25213372
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaaactaggattaagga-taatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    |||||||||||||||| | ||  || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25213446 taggagctgaattgaagcaagagtttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 25213372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 40)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 5 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12811 - 12505
Alignment:
Q  5 gaggagcagagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttca 104  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  12811 gaggagaagagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagttaggattaaggataatcaacttca 12712  T
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12711 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 12612  T
Q  205 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaaga 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12611 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaaga 12512  T
Q  305 ttgtgct 311  Q
    |||||||    
T  12511 ttgtgct 12505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 5 - 311
Target Start/End: Original strand, 21073410 - 21073716
Alignment:
Q  5 gaggagcagagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttca 104  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21073410 gaggagaagagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagctaggattaaggataatcaacttca 21073509  T
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  21073510 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttaatgaacaattcatgctaaattcgtgct 21073609  T
Q  205 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaaga 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21073610 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 21073709  T
Q  305 ttgtgct 311  Q
    |||||||    
T  21073710 ttgtgct 21073716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 12 - 311
Target Start/End: Original strand, 18777814 - 18778113
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||  |||||| ||||||||||||||    
T  18777814 agagaagaacaagagggttgaagggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataattaacttcaaaggtaa 18777913  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctg 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18777914 gggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgttaaattcgtgctcttgctg 18778013  T
Q  212 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18778014 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 18778113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 12 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 19500328 - 19500030
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  19500328 agagaagaacaagagagttgaagggaagcttgaggaatcaagtgggtgac-taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaa 19500230  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctg 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19500229 gggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacacttcatgctaaattcgtgctcttgctg 19500130  T
Q  212 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19500129 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 19500030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 12 - 311
Target Start/End: Original strand, 22366302 - 22366602
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggta 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  22366302 agagaagagcaagagggttgaagggaagctttagcaatcaagtggggtgacctaggagttgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 22366401  T
Q  111 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgct 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366402 agggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgagcaattcatgctaaattcgtgctcttgct 22366501  T
Q  211 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22366502 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 22366601  T
Q  311 t 311  Q
    |    
T  22366602 t 22366602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 12 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 25427058 - 25426759
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaag-gataatcaacttcaaaggta 110  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||| | |||  | || ||||||||||||||||||||    
T  25427058 agagaagagcaagagggttgaagggaagcttaaagaatcaagtgggtaac-taggagctgaattgaagcaaggggttagagataatcaacttcaaaggta 25426960  T
Q  111 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgct 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426959 agggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgct 25426860  T
Q  211 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25426859 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 25426760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 12 - 311
Target Start/End: Original strand, 4199807 - 4200106
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  4199807 agagaagagcaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaa 4199906  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctg 211  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4199907 gggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgctcttgttg 4200006  T
Q  212 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  4200007 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgct 4200106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 12 - 311
Target Start/End: Original strand, 43443220 - 43443516
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  43443220 agagaagagcatgagggttgaagggaagctt-aggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaa 43443318  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctg 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||  | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43443319 gggggttagtgattatcataatcatgtgtaatt--gcatattctcatgttatatgaaaatggattgatgaacaattcatgttaaattcgtgctcttgctg 43443416  T
Q  212 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  43443417 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgct 43443516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 311
Target Start/End: Original strand, 29188107 - 29188405
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggta 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  29188107 agagaagagcaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 29188206  T
Q  111 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgct 210  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  29188207 agggggttagtgattattataatcatgt--aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggtcgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttact 29188304  T
Q  211 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| || ||||    
T  29188305 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgc 29188404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 38 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 27010244 - 27009975
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27010244 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 27010145  T
Q  138 tgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 237  Q
    |  | ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27010144 ta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 27010046  T
Q  238 gatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgt 308  Q
    |||| |  |||||| | |||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  27010045 gatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgt 27009975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 10777793 - 10778058
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg-aagctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  10777793 agagaagaacaagagagttgaaggggaagcttgaggaatcaagtggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaaggataatcatcttcaaaggt 10777892  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  10777893 aaggggggtagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttg 10777992  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  10777993 ctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 10778058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 21932204 - 21932469
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  21932204 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 21932303  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  21932304 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 21932403  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  21932404 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 21932469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 21938374 - 21938639
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  21938374 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 21938473  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  21938474 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 21938573  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  21938574 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 21938639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 35582469 - 35582204
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  35582469 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 35582370  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  35582369 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 35582270  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  35582269 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 35582204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 38 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 7425729 - 7425492
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7425729 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 7425630  T
Q  138 tgtaattttgg-attttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaat 236  Q
    |  |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||    
T  7425629 tacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaat 7425530  T
Q  237 tgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     |||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  7425529 cgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 7425492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 62 - 274
Target Start/End: Original strand, 11211940 - 11212153
Alignment:
Q  62 ctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgt 160  Q
    ||||||||||||||||| | ||  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||    
T  11211940 ctaggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgt 11212039  T
Q  161 tgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttgg 260  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||    
T  11212040 tgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggg 11212139  T
Q  261 tgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||||    
T  11212140 tgaaattacatgtt 11212153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 36989593 - 36989858
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  36989593 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 36989692  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || |||||||||||||| |    
T  36989693 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctctag 36989792  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  36989793 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 36989858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 22882907 - 22883139
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  | |||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  22882907 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgggaaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagggataatcaacttcaaagat 22883006  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || |||||| |||||||||    
T  22883007 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaatttgtgctcttg 22883106  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatg 241  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| ||||||||||    
T  22883107 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatg 22883139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 17471411 - 17471676
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa--gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaagg 108  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||  |||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | ||  ||   | |||||| |||||||||    
T  17471411 agagaagaacaag-gatttgaagggaatagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagagtttgagttaatcatcttcaaagg 17471509  T
Q  109 taagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctctt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  17471510 taagggggttagttattatcataatcatgtacaaattttgtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgataaattcgtgctctt 17471609  T
Q  208 gctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  17471610 gctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 17471676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Original strand, 35790974 - 35791186
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||    
T  35790974 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 35791073  T
Q  162 gtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  ||||  ||    
T  35791074 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgagt 35791173  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  35791174 gaaattacatgtt 35791186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23514941 - 23514729
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| | |||||||||||||    
T  23514941 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgtt 23514842  T
Q  162 gtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||    
T  23514841 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 23514742  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  23514741 gaaattacatgtt 23514729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Original strand, 1219433 - 1219608
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  1219433 cttctaaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatt 1219532  T
Q  199 cgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||  | ||||| |||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  1219533 cgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcattaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 1219608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 23507216 - 23507095
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  23507216 tgctaaattcgtgctccatttgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 23507117  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||| |||| ||||||||    
T  23507116 gataagttgtgaaaattgtgct 23507095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 34939528 - 34939407
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||  |||| |||| |    
T  34939528 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaat 34939429  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |  |||||||||| ||||||||    
T  34939428 gtgaagttatgaaaattgtgct 34939407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 11343134 - 11343008
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |   | ||| || |||||  ||||||||||    
T  11343134 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaagtggggtgacctaggagctgaattgaagcagaggttagggttaatcttcttcaaaggt 11343035  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  11343034 aagggggttagtttttatcataatcat 11343008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Original strand, 22053845 - 22053966
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |    
T  22053845 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgtatgaattgatgatagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 22053944  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |  ||||| |||| ||||||||    
T  22053945 gtgaagttgtgaaaattgtgct 22053966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 190 - 309
Target Start/End: Original strand, 18531079 - 18531198
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |    
T  18531079 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 18531178  T
Q  290 gataagttatgaagattgtg 309  Q
    |  ||||| |||| ||||||    
T  18531179 gtgaagttgtgaaaattgtg 18531198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 100 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 23328900 - 23328791
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||  || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  23328900 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaatt 23328801  T
Q  199 cgtgctcttg 208  Q
    ||||||||||    
T  23328800 cgtgctcttg 23328791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 100 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 24616504 - 24616395
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||  || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  24616504 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaatt 24616405  T
Q  199 cgtgctcttg 208  Q
    ||||||||||    
T  24616404 cgtgctcttg 24616395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 100 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 24712880 - 24712771
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||  || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  24712880 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaatt 24712781  T
Q  199 cgtgctcttg 208  Q
    ||||||||||    
T  24712780 cgtgctcttg 24712771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 100 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 24745898 - 24745789
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||  || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  24745898 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaatt 24745799  T
Q  199 cgtgctcttg 208  Q
    ||||||||||    
T  24745798 cgtgctcttg 24745789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Original strand, 27182559 - 27182680
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    |||||||||| |||||   |||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| | | || |    
T  27182559 tgctaaattcatgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaactgatgataattgtatgattgttgatgaaattacatgttcaaataggaacaaat 27182658  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||| |||| ||||||||    
T  27182659 gataagttgtgaaaattgtgct 27182680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 190 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20623220 - 20623100
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||| |    
T  20623220 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 20623121  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgc 310  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  20623120 gaaaagttatgaaaattgtgc 20623100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 190 - 310
Target Start/End: Original strand, 21233540 - 21233660
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||| |    
T  21233540 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 21233639  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgc 310  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  21233640 gaaaagttatgaaaattgtgc 21233660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 310
Target Start/End: Original strand, 25900418 - 25900538
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||| |||||   |||||  ||| |    
T  25900418 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggttaaattatatgtttgaatatgtgaaaat 25900517  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgc 310  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  25900518 gaaaagttatgaaaattgtgc 25900538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 16106093 - 16105967
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | ||  || ||| |||||  |||| |||||    
T  16106093 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagagtttaggttaatcttcttctaaggt 16105994  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||    
T  16105993 aagggggttagtctttatcataatcat 16105967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16536448 - 16536328
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||| |    
T  16536448 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaatttataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 16536349  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgc 310  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  16536348 gaaaagttatgaaaattgtgc 16536328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 37052995 - 37052911
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  37052995 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtt 37052911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 32950943 - 32950862
Alignment:
Q  193 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| || || || |||| |||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  32950943 taaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgtatgatttgatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtt 32950862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 278
Target Start/End: Original strand, 26559815 - 26559900
Alignment:
Q  194 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 278  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||| || |||| ||||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  26559815 aaattcgtgctcttgctatgattatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 26559900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 30)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 12 - 311
Target Start/End: Original strand, 27653805 - 27654104
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||  ||||||||||||||||||| |    
T  27653805 agagaagagcaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtga 27653904  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctg 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27653905 gggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaaatcatgctaaattcgtgctcttgctg 27654004  T
Q  212 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27654005 tgatgttatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 27654104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 38 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 25175968 - 25175694
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaag-gataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  25175968 agctttcggaatcaagtgggtgac-taggagctgaattgaagcaaggggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattaccataatcat 25175870  T
Q  137 gtgtaattttggatttt-ctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa 235  Q
    || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25175869 gtataattttgcatttttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgttgttatgtttgtatgcatgaa 25175770  T
Q  236 ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25175769 ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 25175694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 116 - 311
Target Start/End: Original strand, 16825678 - 16825875
Alignment:
Q  116 gttagttattatcataatcatgtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgat 215  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16825678 gttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgat 16825777  T
Q  216 gttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgta--taattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16825778 gttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtaattaattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 16825875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 12 - 309
Target Start/End: Original strand, 14625952 - 14626249
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  14625952 agagaagaacaagagggttgaagggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaa 14626051  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttggattttctc--atgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgc 209  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | | | |||  |  |||||  ||||||| ||||    |||| ||| | ||||  ||||||||||||||||||||    
T  14626052 gggggttagttattatcacaatcatct-tcactttacaaattctcaaatgttgtttgaattgtgatt-atggataattattgctaaattcgtgctcttgc 14626149  T
Q  210 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtg 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  14626150 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtg 14626249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 105 - 311
Target Start/End: Original strand, 1650022 - 1650226
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 204  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1650022 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgct 1650119  T
Q  205 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaaga 304  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||| |||| |    
T  1650120 cttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaagaatgataagttgtgaaaa 1650219  T
Q  305 ttgtgct 311  Q
    |||||||    
T  1650220 ttgtgct 1650226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 16376196 - 16376461
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  16376196 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 16376295  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  16376296 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 16376395  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  16376396 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 16376461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 16383520 - 16383785
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  16383520 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 16383619  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  16383620 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 16383719  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  16383720 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 16383785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 10489132 - 10488867
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  10489132 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 10489033  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  10489032 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 10488933  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  10488932 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 10488867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Original strand, 22251389 - 22251621
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | ||||||| ||||||||||    
T  22251389 agagaagaacaagagtgttgaatggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggt 22251488  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  22251489 atgggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 22251588  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatg 241  Q
    |||||||| ||| ||  | ||||||||||||||    
T  22251589 ctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatg 22251621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 38 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16232297 - 16232060
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232297 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 16232198  T
Q  138 tgtaattttgg-attttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaat 236  Q
    |  |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||    
T  16232197 tacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaat 16232098  T
Q  237 tgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  16232097 tgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 16232060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 22225561 - 22225826
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | ||||||| ||||||||||    
T  22225561 agagaagaacaagagtgttgaatggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggt 22225660  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||     
T  22225661 atgggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttt 22225760  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  22225761 ctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 22225826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 19299670 - 19299467
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| |||| | ||| |||||||||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  19299670 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggattcaatttgggcgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 19299571  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  || ||||||||||||||||    
T  19299570 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttg 19299471  T
Q  209 ctgt 212  Q
    ||||    
T  19299470 ctgt 19299467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 274
Target Start/End: Original strand, 16555973 - 16556227
Alignment:
Q  23 agagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttag 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16555973 agagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttag 16556072  T
Q  121 ttattatcataatcatgtgtaat-tttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgtta 219  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  16556073 ttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcctgctgtgatgcta 16556172  T
Q  220 tgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    | ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  16556173 ttttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 16556227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 23 - 274
Target Start/End: Original strand, 16632529 - 16632783
Alignment:
Q  23 agagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttag 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16632529 agagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaagggggttag 16632628  T
Q  121 ttattatcataatcatgtgtaat-tttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgtta 219  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || ||||||||||||| |||||||||| ||    
T  16632629 ttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcctgctgtgatgcta 16632728  T
Q  220 tgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    | ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  16632729 ttttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 16632783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 274
Target Start/End: Original strand, 18086674 - 18086911
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  18086674 agctttagaaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattagtataatcatg 18086773  T
Q  138 tgtaattttgg-attttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaat 236  Q
    |  |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||    
T  18086774 tacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaat 18086873  T
Q  237 tgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  18086874 tgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 18086911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 1556348 - 1556173
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  1556348 cttctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatt 1556249  T
Q  199 cgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  1556248 cgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 1556173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19610398 - 19610186
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||| |||||    
T  19610398 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctgatgtt 19610299  T
Q  162 gtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||| |||| |  | ||||  |||| |||    
T  19610298 gtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggt 19610199  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  19610198 gaaattacatgtt 19610186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 23978112 - 23977937
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||    
T  23978112 cttctaaggtaagggcgttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaatt 23978013  T
Q  199 cgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  23978012 cgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 23977937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 208
Target Start/End: Original strand, 29869627 - 29869798
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-t 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  ||  || | |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29869627 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttgatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaat 29869726  T
Q  137 gtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
     |  ||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  29869727 ttaaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 29869798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 121
Target Start/End: Original strand, 16814820 - 16814930
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggta 110  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  16814820 agagaagagcaagaggtttgaagggaagctttagcaatcaagtggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 16814919  T
Q  111 agggggttagt 121  Q
    || ||||||||    
T  16814920 agagggttagt 16814930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Original strand, 1657760 - 1657881
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||  |||| |||| |    
T  1657760 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaat 1657859  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |  |||||||||| ||||||||    
T  1657860 gtgaagttatgaaaattgtgct 1657881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Original strand, 35009451 - 35009572
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |    
T  35009451 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 35009550  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |  ||||| |||| ||||||||    
T  35009551 gtgaagttttgaaaattgtgct 35009572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15862720 - 15862601
Alignment:
Q  192 ctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtga 291  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||  |||| | || ||     
T  15862720 ctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtataaatgt 15862621  T
Q  292 taagttatgaagattgtgct 311  Q
     |||||||||| ||||||||    
T  15862620 gaagttatgaaaattgtgct 15862601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 192 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 23153696 - 23153577
Alignment:
Q  192 ctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtga 291  Q
    ||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | || |||    
T  23153696 ctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatga 23153597  T
Q  292 taagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||| |||| ||||||||    
T  23153596 taagttgtgaaaattgtgct 23153577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Original strand, 13620712 - 13620882
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 203  Q
    |||||||||||||||||  |  ||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  13620712 aaggtaagggggttagtcttcttcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 13620811  T
Q  204 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||| ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  13620812 tcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattgcatgtt 13620882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 109 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 29666208 - 29666041
Alignment:
Q  109 taagggggttagttattatcataatcatgtgtaatt-ttggattttctcat-gttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctct 206  Q
    |||| ||||||||  | |||||||||||||  |||| ||| | |||||||| |||||||||||||||  ||||| | ||||  || ||||||||||||||    
T  29666208 taagtgggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgcaatttctcattgttgtatgaaaatggggtgatggataattgttgttaaattcgtgctct 29666109  T
Q  207 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     ||||||||||||| ||  |||| ||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29666108 agctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtt 29666041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 27751675 - 27751603
Alignment:
Q  191 gctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtga 263  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||    
T  27751675 gctaaattcgtgctctaattgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgacaattgtatgattgttggtga 27751603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 4991470 - 4991396
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaaactaggattaagga-taatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    |||||||||||||||| | ||  || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  4991470 taggagctgaattgaagcaagagtttaggaataatcatcttcaaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 4991396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 194 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 19854402 - 19854317
Alignment:
Q  194 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 278  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||  | |||| |||||||| || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  19854402 aaattcgtgctcttgttatgatgttatgtttgagtacatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 19854317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 218 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 29605672 - 29605612
Alignment:
Q  218 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 278  Q
    |||||||| |||||||||||  || || ||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  29605672 tatgtttgaatgcatgaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcata 29605612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 12 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 36523 - 36224
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  36523 agagaagagcaagagggttgaaggaaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagggataatcaacttcaaaggtaa 36424  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctg 211  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  36423 gggggttaatgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaactgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgtag 36324  T
Q  212 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36323 tgatgttatgtttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 36224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 229
Target Start/End: Original strand, 169736 - 169951
Alignment:
Q  16 aagaacaagagggttgaagg-gaagctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagg 113  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||| | ||| |||  |||||||| ||||||| ||||||    
T  169736 aagaacaagagagttgaaggcgaagcttgaggaatcaagtggggtgacataagagctgaattgaagcaagggttagtgataatcatcttcaaaagtaagg 169835  T
Q  114 gggttagttattatcataatcatgtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtg 213  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  169836 gggttagtgattatcataatcatgtataattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtg 169935  T
Q  214 atgttatgtttgtatg 229  Q
    ||||||||||||||||    
T  169936 atgttatgtttgtatg 169951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Original strand, 153920 - 154095
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  153920 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatt 154019  T
Q  199 cgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||||| |||||||||    
T  154020 cgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaagttacatgtt 154095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 48849 - 48728
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |    
T  48849 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaaaaat 48750  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||| |||| ||||||||    
T  48749 gataagttgtgaaaattgtgct 48728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 37)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 12 - 311
Target Start/End: Original strand, 13910846 - 13911145
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  13910846 agagaagagcaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggtaa 13910945  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctg 211  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13910946 gggggttattgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgttg 13911045  T
Q  212 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  13911046 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgct 13911145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 12 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 10989841 - 10989540
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggtt-gaagggaagctttaggaatcaagtg-ggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  10989841 agagaagatcaagagtgttagaaggggagcttgaggaatcaagtgaggtgacataggagcttaattgaagcaagggttagggataatcaacttcaaaggt 10989742  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgc 209  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10989741 atgggggttagtgattatcataatcatgtataattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaaatcatgctaaattcgtgctcttgc 10989642  T
Q  210 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtg 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10989641 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtg 10989542  T
Q  310 ct 311  Q
    ||    
T  10989541 ct 10989540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 12 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 2437889 - 2437590
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||| | ||||||| ||||||||||    
T  2437889 agagaagaacaggagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaattggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggt 2437790  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  2437789 aagggggttagttattatcataatcatgtacaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggataatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgt 2437690  T
Q  210 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtg 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2437689 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtg 2437590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 12 - 311
Target Start/End: Original strand, 16478785 - 16479083
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg-aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggta 110  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16478785 agagaagaacaagagtgttggaggggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaagtgaagctagggttaaggataatcaacttcaaaggta 16478884  T
Q  111 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgct 210  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||    
T  16478885 agggggttagtgattatcataatcattt--aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgttagattcgtgctcttact 16478982  T
Q  211 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgc 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| |||||||    
T  16478983 gcgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 16479082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 38 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 13573079 - 13572807
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13573079 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 13572980  T
Q  138 tgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 237  Q
    |  | ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13572979 ta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 13572881  T
Q  238 gatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||| |  |||| | |||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  13572880 gatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgct 13572807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 7823161 - 7822896
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  7823161 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 7823062  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  7823061 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 7822962  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  7822961 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 7822896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 7830472 - 7830207
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  7830472 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 7830373  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  7830372 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 7830273  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  7830272 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 7830207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 27176866 - 27176601
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  27176866 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 27176767  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  27176766 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 27176667  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  27176666 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 27176601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 27101460 - 27101725
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  27101460 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 27101559  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  27101560 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 27101659  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  27101660 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 27101725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 27108808 - 27109073
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  27108808 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 27108907  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  27108908 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 27109007  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  27109008 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 27109073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 38783552 - 38783817
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  38783552 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 38783651  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  38783652 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 38783751  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  38783752 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 38783817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 38 - 274
Target Start/End: Original strand, 18979872 - 18980109
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18979872 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 18979971  T
Q  138 tgtaattttgg-attttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaat 236  Q
    |  |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||    
T  18979972 tacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaat 18980071  T
Q  237 tgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  18980072 tgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 18980109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 38 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 15927973 - 15927736
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15927973 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 15927874  T
Q  138 tgtaattttgg-attttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaat 236  Q
    |  |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||    
T  15927873 tacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgatcaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaat 15927774  T
Q  237 tgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  15927773 tgatgattatggtatgcttgtgggtgaaattacatgtt 15927736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 105 - 311
Target Start/End: Original strand, 18253761 - 18253968
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 203  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  18253761 aaggtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgc 18253860  T
Q  204 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaag 303  Q
    ||   |||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||| ||||     
T  18253861 tccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaa 18253960  T
Q  304 attgtgct 311  Q
    ||||||||    
T  18253961 attgtgct 18253968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 15950613 - 15950879
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa--gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaagg 108  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| ||  |||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | ||  ||  || |||||  |||||||||    
T  15950613 agagaagaacaagggttttgaaggaaatagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttcaaagg 15950712  T
Q  109 taagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctctt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15950713 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctctt 15950812  T
Q  208 gctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  15950813 gctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 15950879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13758713 - 13758538
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||    
T  13758713 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaatt 13758614  T
Q  199 cgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  13758613 cgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 13758538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Original strand, 15760027 - 15760202
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  15760027 cttctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaatt 15760126  T
Q  199 cgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  |  |||  |||| ||||||||||||||||    
T  15760127 cgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatgatatgtttgtgggtgaaattacatgtt 15760202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 190 - 309
Target Start/End: Original strand, 47481043 - 47481162
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  47481043 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 47481142  T
Q  290 gataagttatgaagattgtg 309  Q
    |||||||| |||| ||||||    
T  47481143 gataagttgtgaaaattgtg 47481162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 190 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 13321267 - 13321183
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13321267 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 13321183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 105 - 276
Target Start/End: Original strand, 48622584 - 48622756
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 203  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||  |  || ||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48622584 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaattcaaatttttgcattttctcatgttttacgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattcgtgc 48622683  T
Q  204 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 276  Q
    |||| |||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  48622684 tcttactgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttca 48622756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Original strand, 14250811 - 14250986
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||    
T  14250811 cttctaaggtaagggggttagttatcatcgtaatcatgttcattttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaatt 14250910  T
Q  199 cgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||| ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  14250911 cgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggtgaaattacatgtt 14250986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 105 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15862257 - 15862174
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaatt 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15862257 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtataatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatt 15862174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Original strand, 11580751 - 11580872
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | || |    
T  11580751 tgctaaattcgtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 11580850  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||| |||| ||||||||    
T  11580851 gataagttgtgaaaattgtgct 11580872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 16212017 - 16211896
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||| |    
T  16212017 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatgttcaaatatgtaaaaat 16211918  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||| |||| ||||||||    
T  16211917 gataagttgtgaaaattgtgct 16211896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Original strand, 13037026 - 13037147
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| | | || |    
T  13037026 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgatgaaattgcatgttcaaataggaacaaat 13037125  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||| |||| ||||||||    
T  13037126 gataagttgtgaaaattgtgct 13037147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 209 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 36052896 - 36052794
Alignment:
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgt 308  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| |||||    
T  36052896 ctgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtaaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 36052797  T
Q  309 gct 311  Q
    |||    
T  36052796 gct 36052794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 190 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11516478 - 11516358
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||| |    
T  11516478 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 11516379  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgc 310  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  11516378 gaaaagttatgaaaattgtgc 11516358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 190 - 310
Target Start/End: Original strand, 15441576 - 15441696
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||| |    
T  15441576 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 15441675  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgc 310  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  15441676 gaaaagttatgaaaattgtgc 15441696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 190 - 310
Target Start/End: Original strand, 30262141 - 30262261
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||| |    
T  30262141 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 30262240  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgc 310  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  30262241 gaaaagttatgaaaattgtgc 30262261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 7293267 - 7293147
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||| |    
T  7293267 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattaataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 7293168  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgc 310  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  7293167 gaaaagttatgaaaattgtgc 7293147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 16418835 - 16418731
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 203  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||| | |  ||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16418835 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 16418736  T
Q  204 tcttg 208  Q
    |||||    
T  16418735 tcttg 16418731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 3060217 - 3060096
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   |||||||  ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  | |||||||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  3060217 tgctaaattcgtgctccaactgtgataatatatttgtatgcattaattgatgataattgtaatactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 3060118  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| || |||| ||| ||||    
T  3060117 gataaattgtgaaaattatgct 3060096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Original strand, 25292350 - 25292471
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||| ||||||   || ||||| |||||||||||| |||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||      
T  25292350 tgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgtatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaag 25292449  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||| |||||| ||||||||    
T  25292450 gataagctatgaatattgtgct 25292471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 208
Target Start/End: Original strand, 10000288 - 10000392
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 203  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||| | |  ||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  10000288 aaggtaagggggtttgtcttcatcataatcaatttcaaattttgcatcttctcatgttgtataaaaatgggttgatgaacaatttatgtcaaattcgtgc 10000387  T
Q  204 tcttg 208  Q
    |||||    
T  10000388 tcttg 10000392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 62 - 136
Target Start/End: Original strand, 15516719 - 15516793
Alignment:
Q  62 ctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    ||||||||||||||||| | ||  ||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15516719 ctaggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaatgtaagggggttagtctttatcataatcat 15516793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 299
Target Start/End: Original strand, 295978 - 296087
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||| |||   || | |||||||||||| ||||||||| |||| || |  ||| ||||||||||||||| |||||| |  |||| |||| |    
T  295978 tgctaaattcgtgttctaattgaggtgttatgtttgtgtgcatgaatcgatgataatgttatgattgttggtgaaatttcatgttgaattatgtaaaaat 296077  T
Q  290 gataagttat 299  Q
    || |||||||    
T  296078 gagaagttat 296087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 28722357 - 28722272
Alignment:
Q  194 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 278  Q
    ||||||||||||| | | ||||| |||||||| ||||||| ||||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  28722357 aaattcgtgctctagttatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 28722272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 30)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 12 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 30121153 - 30120853
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||  |||||||| ||||||||||||    
T  30121153 agagaagagcaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagtaagggttagagataatcatcttcaaaggtaa 30121054  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgct 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30121053 gggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttttgtataatctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgct 30120954  T
Q  211 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  30120953 gtgatgttatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgc 30120854  T
Q  311 t 311  Q
    |    
T  30120853 t 30120853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 12 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 24549410 - 24549112
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg-aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggta 110  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  24549410 agagaagaacaagagtgttggaggggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaagtgaagctagggttaaggataatcaacttctaaggta 24549311  T
Q  111 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgct 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  24549310 agggggttagtgattatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttact 24549213  T
Q  211 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| || ||||    
T  24549212 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgc 24549113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 12 - 311
Target Start/End: Original strand, 6774082 - 6774379
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg-aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggta 110  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  6774082 agagaagaacaagagtgttggaggggaagcttgaggaatcaagtgggtgac-taggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggta 6774180  T
Q  111 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgct 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  6774181 agggggttagtgattatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttatatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttact 6774278  T
Q  211 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| |||||||    
T  6774279 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 6774378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 311
Target Start/End: Original strand, 21844393 - 21844693
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg--aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21844393 agagaagaacaagagtgttggagggggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctagaagctgaagtggagctaggattaaggataatcaacttcaacggt 21844492  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgc 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  21844493 aagggggttagttattatcacaatcatgta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaattgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 21844591  T
Q  210 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtg 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  21844592 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtg 21844691  T
Q  310 ct 311  Q
    ||    
T  21844692 ct 21844693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 311
Target Start/End: Original strand, 21851786 - 21852086
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg--aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21851786 agagaagaacaagagtgttggagggggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctagaagctgaagtggagctaggattaaggataatcaacttcaaaggt 21851885  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgc 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  21851886 aagggggttagttattatcacaatcatgta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaattgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 21851984  T
Q  210 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtg 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  21851985 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtg 21852084  T
Q  310 ct 311  Q
    ||    
T  21852085 ct 21852086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 41 - 311
Target Start/End: Original strand, 16674245 - 16674513
Alignment:
Q  41 tttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgt 140  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||  || ||  |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||      
T  16674245 tttaggaatcaagtgggtgacttatgagctgaattgaagcaagagttgagt-taatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta- 16674342  T
Q  141 aattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgat 240  Q
    | ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  16674343 atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgttgaacaattcatgctaaattcgtgctctttctgtgatgttatgtttttatgcatgaatttat 16674442  T
Q  241 gttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16674443 gttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgct 16674513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 271183 - 271448
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  271183 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 271282  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  271283 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 271382  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  271383 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 271448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 644737 - 644472
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  644737 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 644638  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  644637 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 644538  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  644537 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 644472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 830472 - 830207
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  830472 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 830373  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  830372 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 830273  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  830272 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 830207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 215
Target Start/End: Original strand, 15318982 - 15319188
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  15318982 agagaagaacaagagtgttgaaggaaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 15319081  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  15319082 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 15319181  T
Q  209 ctgtgat 215  Q
    |||||||    
T  15319182 ctgtgat 15319188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 12 - 215
Target Start/End: Original strand, 15499351 - 15499557
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  15499351 agagaagaacaagagtgttgaaggaaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 15499450  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  15499451 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 15499550  T
Q  209 ctgtgat 215  Q
    |||||||    
T  15499551 ctgtgat 15499557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 22088617 - 22088882
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  22088617 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 22088716  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  22088717 aagggggttagttatcatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgtgttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 22088816  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  22088817 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttataggtgaaattacatgtt 22088882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Original strand, 22006171 - 22006346
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  22006171 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatt 22006270  T
Q  199 cgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  22006271 cgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 22006346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Original strand, 13720804 - 13721016
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||    
T  13720804 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 13720903  T
Q  162 gtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||    
T  13720904 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 13721003  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  13721004 gaaattacatgtt 13721016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 93 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16195581 - 16195399
Alignment:
Q  93 taatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatg 191  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||    
T  16195581 taatcatcttctaaggtaagggggttaattattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttg 16195482  T
Q  192 ctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  16195481 ctaaattcgttctcgtgctgtgatgctatgttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 16195399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Original strand, 16872964 - 16873139
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||    
T  16872964 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaatt 16873063  T
Q  199 cgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  16873064 cgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 16873139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Original strand, 13662141 - 13662353
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||    
T  13662141 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 13662240  T
Q  162 gtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||  ||| |  | ||||  |||| |||    
T  13662241 gtatgaaaatgggttgataaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatgnatgattatggtatgtttgtgggt 13662340  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  13662341 gaaattacatgtt 13662353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 184 - 311
Target Start/End: Original strand, 43373474 - 43373601
Alignment:
Q  184 aattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgc 283  Q
    |||| |||||||||||||||||   |||||||| || ||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||| |||||     
T  43373474 aattaatgctaaattcgtgctccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgt 43373573  T
Q  284 aaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  43373574 aaaaatgataagttgtgaaaattgtgct 43373601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Original strand, 16193728 - 16193849
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  16193728 tgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 16193827  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||| |||| ||||||||    
T  16193828 gataagttgtgaaaattgtgct 16193849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Original strand, 16404987 - 16405108
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | || |    
T  16404987 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 16405086  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    | |||||| |||| ||||||||    
T  16405087 gttaagttgtgaaaattgtgct 16405108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 194 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 17345816 - 17345699
Alignment:
Q  194 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgata 293  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||  |||| |||| ||  |    
T  17345816 aaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaatgtga 17345717  T
Q  294 agttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  17345716 agttatgaaaattgtgct 17345699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Original strand, 24928803 - 24928924
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   |||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | || |    
T  24928803 tgctaaattcgtgctccaactgtgattatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 24928902  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||| |||| ||||||||    
T  24928903 gataagttgtgaaaattgtgct 24928924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 252 - 311
Target Start/End: Original strand, 222753 - 222812
Alignment:
Q  252 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  222753 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 222812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 252 - 311
Target Start/End: Original strand, 691908 - 691967
Alignment:
Q  252 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  691908 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 691967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 252 - 311
Target Start/End: Original strand, 736376 - 736435
Alignment:
Q  252 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  736376 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 736435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 252 - 311
Target Start/End: Original strand, 860271 - 860330
Alignment:
Q  252 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  860271 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 860330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 190 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 5238338 - 5238218
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||| |    
T  5238338 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 5238239  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgc 310  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  5238238 gaaaagttatgaaaattgtgc 5238218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 190 - 310
Target Start/End: Original strand, 22907226 - 22907346
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||| |    
T  22907226 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 22907325  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgc 310  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  22907326 gaaaagttatgaaaattgtgc 22907346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 190 - 310
Target Start/End: Original strand, 24661260 - 24661380
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||| |    
T  24661260 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 24661359  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgc 310  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  24661360 gaaaagttatgaaaattgtgc 24661380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 190 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 43685797 - 43685677
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||| |    
T  43685797 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 43685698  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgc 310  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  43685697 gaaaagttatgaaaattgtgc 43685677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 12 - 311
Target Start/End: Original strand, 31497 - 31796
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaa 111  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||||| ||||    
T  31497 agagaagagcaagagggttgaagggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaatgtaa 31596  T
Q  112 gggggttagttattatcataatcatgtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctg 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  31597 gggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgtgg 31696  T
Q  212 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  31697 tgatgttatgtttgaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgct 31796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Original strand, 128181 - 128302
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    |||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| || || ||| ||    
T  128181 tgctaaattcgtgcttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaggt 128280  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    | |||||| |||| ||||||||    
T  128281 gttaagttgtgaaaattgtgct 128302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 36)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 38 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 55316622 - 55316350
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  55316622 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaaggattagggttaatcttcttcaaaggtaaaggggttagttattatcacaatcatg 55316523  T
Q  138 tgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 237  Q
    |  | ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55316522 ta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 55316424  T
Q  238 gatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  55316423 gatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgct 55316350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 38 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 41270478 - 41270206
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41270478 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaaggattagggttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 41270379  T
Q  138 tgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 237  Q
    |  | ||||| || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41270378 ta-atttttgcatctactcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 41270280  T
Q  238 gatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  41270279 gatgttagttgtatgattgttggtggaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgct 41270206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 49232869 - 49232604
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||| ||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  49232869 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctatgagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 49232770  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  49232769 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttg 49232670  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  49232669 ctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 49232604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 100 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 16821479 - 16821270
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattc 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  |||| |    
T  16821479 cttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatttatgtcaaatcc 16821382  T
Q  200 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||| |||    
T  16821381 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagctat 16821282  T
Q  300 gaagattgtgct 311  Q
    ||  ||||||||    
T  16821281 gagtattgtgct 16821270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 12264614 - 12264880
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt--gggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaagg 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| | | | ||  |  |||||| |||||||||    
T  12264614 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaatttggggtgacctaggagctgaattgaagcaaaggttgggattaatcatcttcaaagg 12264713  T
Q  109 taagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctctt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  12264714 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctctt 12264813  T
Q  208 gctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  12264814 gctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 12264880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 105 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 15615168 - 15614964
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 204  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  15615168 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagatttgtgct 15615071  T
Q  205 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaaga 304  Q
    ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| |    
T  15615070 cttactgtggtgttatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaata 15614971  T
Q  305 ttgtgct 311  Q
    | |||||    
T  15614970 tggtgct 15614964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 1467562 - 1467827
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  1467562 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 1467661  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  1467662 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 1467761  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  1467762 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 1467827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12812274 - 12812042
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||| ||||||    
T  12812274 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaactttaaaggt 12812175  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||  || ||||||||||||||||    
T  12812174 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatattgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttg 12812075  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatg 241  Q
    |||| ||| ||| ||  | ||| ||||||||||    
T  12812074 ctgtaatgctattttcttgtgcttgaattgatg 12812042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 105 - 311
Target Start/End: Original strand, 15936553 - 15936760
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 203  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  15936553 aaggtatgggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgc 15936652  T
Q  204 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaag 303  Q
    ||   |||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||| ||||     
T  15936653 tccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaa 15936752  T
Q  304 attgtgct 311  Q
    ||||||||    
T  15936753 attgtgct 15936760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22275642 - 22275377
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa--gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaagg 108  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||  |||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | |   |||||| |||||| |||||||||    
T  22275642 agagaagaacaag-gatttgaagggaatagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaaaagttaaggttaatcatcttcaaagg 22275544  T
Q  109 taagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctctt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22275543 taagggggttagttattatcataatcatgtacaaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctctt 22275444  T
Q  208 gctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||  || ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  22275443 gctgtgatgccattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 22275377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Original strand, 15468216 - 15468428
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttggattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||| | || |||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||    
T  15468216 taggagctgaattgaagcaagaattagggttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaaattttgcattttctcatgtt 15468315  T
Q  162 gtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||    
T  15468316 gtatgaaaatgggttgaggaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctatgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 15468415  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  15468416 gaaattacatgtt 15468428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 25059119 - 25058907
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||| | |  |||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| | |||||||||||||    
T  25059119 taggagctgaattgaagcaaaaattagggttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgcacaatttttgcattttctcatgtt 25059020  T
Q  162 gtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||    
T  25059019 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 25058920  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  25058919 gaaattacatgtt 25058907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 105 - 311
Target Start/End: Original strand, 15938395 - 15938602
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 203  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||| |||||    
T  15938395 aaggtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaatacgtgc 15938494  T
Q  204 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaag 303  Q
    ||   |||| ||| ||||||||||  |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||||| ||||     
T  15938495 tccaactgtaatgatatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaa 15938594  T
Q  304 attgtgct 311  Q
    ||||||||    
T  15938595 attgtgct 15938602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 18911373 - 18911161
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||    
T  18911373 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 18911274  T
Q  162 gtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||    
T  18911273 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 18911174  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  18911173 gaaattacatgtt 18911161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Original strand, 12902008 - 12902178
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 203  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  12902008 aaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataatttttgctaaattcgtgc 12902107  T
Q  204 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  12902108 tcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 12902178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 63 - 241
Target Start/End: Original strand, 18896920 - 18897099
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttggattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||    
T  18896920 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttccaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaagttttgtattttctcatgtt 18897019  T
Q  162 gtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatg 241  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||    
T  18897020 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgataaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatg 18897099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 5228692 - 5228481
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| | ||||||||||||     
T  5228692 taggagctgaattgaaacaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgtg 5228593  T
Q  162 gtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
     ||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |   | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||    
T  5228592 ttatgaaaatgggttgatgaaca-ttgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatttccttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 5228494  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  5228493 gaaattacatgtt 5228481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Original strand, 51158030 - 51158151
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  51158030 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 51158129  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||| |||| ||||||||    
T  51158130 gataagttgtgaaaattgtgct 51158151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 54651795 - 54651625
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 203  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||||||  |||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  54651795 aaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgc 54651696  T
Q  204 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||  |||||||| ||||||    
T  54651695 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgagtgaaattgcatgtt 54651625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Original strand, 12030159 - 12030280
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  12030159 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaagt 12030258  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||| ||||  |||||||    
T  12030259 gataagttgtgaaagttgtgct 12030280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Original strand, 15859036 - 15859157
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | || |    
T  15859036 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgaacaaat 15859135  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||| |||| ||||||||    
T  15859136 gataagttgtgaaaattgtgct 15859157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 63 - 311
Target Start/End: Original strand, 14842446 - 14842694
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttggattttctca--tgt 160  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||| || |||||  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| | | | |||| |  ||||||  |||    
T  14842446 taggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtctttatcataatcatct-tcactttgcaaattctcaaatgt 14842544  T
Q  161 tgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttgg 260  Q
    ||||||||    |||| ||| | ||||  ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||    
T  14842545 tgtatgaattgtgatt-atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgttgg 14842643  T
Q  261 tgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||||| |||||||| || || |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  14842644 tgaaattgcatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgct 14842694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 157 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 13839177 - 13839024
Alignment:
Q  157 atgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattg 256  Q
    ||||||||||||  | |||| ||||| ||||  ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  13839177 atgttgtatgaattttgatt-atgaataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattg 13839079  T
Q  257 ttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
     ||||||||||||||||||| ||| | | || ||||||||| |||| ||||||||    
T  13839078 atggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgct 13839024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 190 - 310
Target Start/End: Original strand, 17912495 - 17912614
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |    
T  17912495 tgctaaattcgtgctccaact-tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaat 17912593  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgc 310  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  17912594 gaaaagttatgaaaattgtgc 17912614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 2050061 - 2049940
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   |||||| | ||||||||||||| |||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |    
T  2050061 tgctaaattcgtgctccaactgtgacgatatgtttgtatgcctgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaacat 2049962  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| || |||| ||||||||    
T  2049961 gataacttgtgaaaattgtgct 2049940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 310
Target Start/End: Original strand, 2449250 - 2449370
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||| |    
T  2449250 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 2449349  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgc 310  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  2449350 gaaaagttatgaaaattgtgc 2449370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 44229323 - 44229153
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttggattttctcatg-ttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 203  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||  |  ||||||    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  44229323 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaattcaaattttttcatttctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaatccgtgc 44229224  T
Q  204 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| | ||||||||||||||    
T  44229223 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtt 44229153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Original strand, 13975734 - 13975854
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| | ||| | |||| |    
T  13975734 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaat 13975832  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  13975833 gataagttatgaatattgtgct 13975854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 45861056 - 45860936
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| | ||| | |||| |    
T  45861056 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaat 45860958  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  45860957 gataagttatgaatattgtgct 45860936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Original strand, 13954902 - 13955022
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| | ||| | |||| |    
T  13954902 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaat 13955000  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||| ||||||||| ||||||||    
T  13955001 gatcagttatgaatattgtgct 13955022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 310
Target Start/End: Original strand, 16744130 - 16744247
Alignment:
Q  193 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgat 292  Q
    |||||||||||||   || ||||| ||||||||||| |||||||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||||||| || | ||||| |||| |||     
T  16744130 taaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatccatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaa 16744229  T
Q  293 aagttatgaagattgtgc 310  Q
    |||||||||| |||||||    
T  16744230 aagttatgaaaattgtgc 16744247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 137
Target Start/End: Original strand, 8268646 - 8268683
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8268646 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 8268683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 137
Target Start/End: Original strand, 8275746 - 8275783
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8275746 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 8275783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 274
Target Start/End: Original strand, 11986181 - 11986262
Alignment:
Q  193 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| || || ||||||| || ||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  11986181 taaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttaatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtt 11986262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 194 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 41661812 - 41661727
Alignment:
Q  194 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcat-gaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 278  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  41661812 aaattcgtgctcttgctatgatgatatgtttgaatacatggaaatgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 41661727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 278
Target Start/End: Original strand, 31412333 - 31412418
Alignment:
Q  194 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 278  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||| || |||| ||||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  31412333 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 31412418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 38 - 311
Target Start/End: Original strand, 1153 - 1425
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||||| || |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  1153 agctttaggaatcaagttggtgacttaggagctgaattgaagcaaggattagggttaatcttcttcaaaggtaggggggttagttattatcacaatcatg 1252  T
Q  138 tgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 237  Q
    |  | ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1253 ta-atttttgcatttactcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 1351  T
Q  238 gatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  1352 gatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgct 1425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 31)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 12 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 10644648 - 10644350
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg-aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggta 110  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10644648 agagaagaacaagagtgttggaggggaagcttgaggaatcaagtgggtgatctaggagctgaagtgaagttaggattaaggataatcaacttcaaaggta 10644549  T
Q  111 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgct 210  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10644548 agggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgct 10644451  T
Q  211 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgc 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||  |||||||    
T  10644450 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgc 10644351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 100 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 47357994 - 47357785
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattc 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47357994 cttctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttcctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattc 47357897  T
Q  200 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47357896 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 47357797  T
Q  300 gaagattgtgct 311  Q
    ||||||||||||    
T  47357796 gaagattgtgct 47357785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 274
Target Start/End: Original strand, 15287096 - 15287333
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15287096 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 15287195  T
Q  138 tgtaattttgg-attttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaat 236  Q
    |  |||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||    
T  15287196 tacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggatgatgaacaattatagctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaat 15287295  T
Q  237 tgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     |||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  15287296 cgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 15287333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 18169403 - 18169138
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa--gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaagg 108  Q
    ||||||||||||| |  |||||| |||  |||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | || |||| || |||||  |||||| ||    
T  18169403 agagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagaattagggttaatcttcttcaa-gg 18169305  T
Q  109 taagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctctt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18169304 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctctt 18169205  T
Q  208 gctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  18169204 gctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 18169138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 274
Target Start/End: Original strand, 15294205 - 15294442
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15294205 agctttaggaatgaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 15294304  T
Q  138 tgtaattttgg-attttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaat 236  Q
    |  |||||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||    
T  15294305 tacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggatgatgaacaattatagctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaat 15294404  T
Q  237 tgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     |||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  15294405 cgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 15294442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Original strand, 7131978 - 7132153
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  7131978 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttatatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaatt 7132077  T
Q  199 cgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  7132078 cgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 7132153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 19020824 - 19020654
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 203  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19020824 aaggtaagggggttagttaccatcataatcatgttcaatttttgcattttgtcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 19020725  T
Q  204 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  19020724 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 19020654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Original strand, 17145570 - 17145745
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||    
T  17145570 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattgatgttaaatt 17145669  T
Q  199 cgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||  | | |||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  17145670 cgtgctcttactgtgatgctattttcttgtacatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 17145745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 20001066 - 20000891
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||    
T  20001066 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaatt 20000967  T
Q  199 cgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  20000966 cgtgctcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttctgggtgaaattacatgtt 20000891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 208
Target Start/End: Original strand, 22351915 - 22352086
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-t 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22351915 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaat 22352014  T
Q  137 gtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
     |  ||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  22352015 ttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcatgctcttg 22352086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 18248556 - 18248421
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  18248556 aaggtaagggggttagttattatcataatcttgtacaatttttacattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgc 18248457  T
Q  204 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattga 239  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||    
T  18248456 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattga 18248421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8378480 - 8378377
Alignment:
Q  114 gggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgt 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  8378480 gggttagttattatcataatcatgtacaatttttacattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgt 8378381  T
Q  213 gatg 216  Q
    ||||    
T  8378380 gatg 8378377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 122140 - 122019
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  122140 tgctaaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 122041  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||| |||| ||||||||    
T  122040 gataagttgtgaaaattgtgct 122019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Original strand, 15675101 - 15675222
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |    
T  15675101 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 15675200  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |  ||||| |||| ||||||||    
T  15675201 gtgaagttgtgaaaattgtgct 15675222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Original strand, 54118256 - 54118377
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | || |    
T  54118256 tgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaatt 54118355  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||| |||| ||||||||    
T  54118356 gataagttgtgaaaattgtgct 54118377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Original strand, 10104262 - 10104383
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    |||||||| |||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |    
T  10104262 tgctaaatccgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 10104361  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |  ||||| |||| ||||||||    
T  10104362 gtgaagttgtgaaaattgtgct 10104383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 100 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 26339362 - 26339253
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||  || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  26339362 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaatt 26339263  T
Q  199 cgtgctcttg 208  Q
    ||||||||||    
T  26339262 cgtgctcttg 26339253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 190 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26680451 - 26680331
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||| |    
T  26680451 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaat 26680352  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgc 310  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  26680351 gaaaagttatgaaaattgtgc 26680331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 143 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22738568 - 22738437
Alignment:
Q  143 ttttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 242  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||     
T  22738568 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggctgaggaacaattgatgttaaattcgtgttcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatga 22738469  T
Q  243 tagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  22738468 ttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 22738437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 209 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 13246662 - 13246560
Alignment:
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgt 308  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | || ||||||||| |||| |||||    
T  13246662 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattaatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 13246563  T
Q  309 gct 311  Q
    |||    
T  13246562 gct 13246560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 209 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 31115861 - 31115795
Alignment:
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttc 275  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31115861 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttc 31115795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 218 - 311
Target Start/End: Original strand, 13048261 - 13048354
Alignment:
Q  218 tatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  13048261 tatgtttgtatgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaaggataagttatgaatattgtgct 13048354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10488813 - 10488693
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||| |    
T  10488813 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 10488714  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgc 310  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  10488713 gaaaagttatgaaaattgtgc 10488693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 310
Target Start/End: Original strand, 16327938 - 16328058
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||| |    
T  16327938 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 16328037  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgc 310  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  16328038 gaaaagttatgaaaattgtgc 16328058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 14952183 - 14952085
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14952183 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14952085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 9795564 - 9795499
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttggattttctcatgttgtatgaaa 169  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||  |||||||||||||||||||||    
T  9795564 aaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaattttttcattttctcatgttgtatgaaa 9795499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 33240951 - 33240900
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatg 241  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33240951 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatg 33240900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 276
Target Start/End: Original strand, 40885585 - 40885652
Alignment:
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 276  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| || || ||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  40885585 ctgtggtgctatgtttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttca 40885652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 105 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 14996476 - 14996444
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14996476 aaggtaagggggttagttattatcataatcatg 14996444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 8378524 - 8378491
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgt 138  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8378524 aaggtaaggggattagttattatcataatcatgt 8378491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 278
Target Start/End: Original strand, 18238157 - 18238242
Alignment:
Q  194 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatga-attgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 278  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||| |||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  18238157 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgatattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 18238242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 23)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 38 - 311
Target Start/End: Original strand, 5072237 - 5072509
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5072237 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaaagattagggttaatcttcttcaaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 5072336  T
Q  138 tgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt 237  Q
    |  | ||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5072337 ta-atttttgcatttactcaagttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaatt 5072435  T
Q  238 gatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  5072436 gatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgct 5072509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 143 - 311
Target Start/End: Original strand, 18601071 - 18601239
Alignment:
Q  143 ttttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 242  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18601071 ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 18601170  T
Q  243 tagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  18601171 tagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgct 18601239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 66 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 22228185 - 22227941
Alignment:
Q  66 gagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgttgta 164  Q
    ||||||||||||| | ||  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||    
T  22228185 gagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgta 22228086  T
Q  165 tgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaa 264  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||| |||||    
T  22228085 tgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaa 22227986  T
Q  265 attacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtg 309  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  22227985 attacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtg 22227941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 66 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 22232882 - 22232638
Alignment:
Q  66 gagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgttgta 164  Q
    ||||||||||||| | ||  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||    
T  22232882 gagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgta 22232783  T
Q  165 tgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaa 264  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||| |||||    
T  22232782 tgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaa 22232683  T
Q  265 attacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtg 309  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  22232682 attacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtg 22232638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 105 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 45051757 - 45051553
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  45051757 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgtg--attttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgtt 45051660  T
Q  205 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaaga 304  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| |    
T  45051659 cttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 45051560  T
Q  305 ttgtgct 311  Q
    |||||||    
T  45051559 ttgtgct 45051553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 18059581 - 18059846
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||| | ||||||| ||||||||||    
T  18059581 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaattggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataatcatcttcaaaggt 18059680  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  18059681 aagggggttagttattatcataatcatgtataatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 18059780  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  18059781 ctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 18059846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 105 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 2116589 - 2116385
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 204  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2116589 aaggtaaaggggttagtgattatcataatcatgt--aattttgcattttctcatgttgtataaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgct 2116492  T
Q  205 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaaga 304  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| |    
T  2116491 tttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 2116392  T
Q  305 ttgtgct 311  Q
    | |||||    
T  2116391 tggtgct 2116385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17149001 - 17148735
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  17149001 agagaagaacaagagggttgaagggaaagcttgaggaatcaagtggggtgacataggagctgaattgaagcaagggttggggataatcaacttcaaaggt 17148902  T
Q  110 aaggggg-ttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctctt 207  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  17148901 aaggggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctctt 17148802  T
Q  208 gctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    | ||| ||||||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  17148801 gttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 17148735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 17005071 - 17004806
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  17005071 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 17004972  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  17004971 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 17004872  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  17004871 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 17004806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Original strand, 38054914 - 38055179
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  38054914 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 38055013  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || |||||||||||| ||     
T  38055014 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcatcttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctttta 38055113  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  38055114 ctgtgatgttattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 38055179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 212
Target Start/End: Original strand, 19962322 - 19962525
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| |||| | ||| |||||||||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  19962322 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggattcaatttgggcgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 19962421  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  || ||||||||||||||||    
T  19962422 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgctcttg 19962521  T
Q  209 ctgt 212  Q
    ||||    
T  19962522 ctgt 19962525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 100 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 46523731 - 46523557
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattc 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  46523731 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttccattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattc 46523632  T
Q  200 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||  |  |||  |||| ||||||||||||||||    
T  46523631 gtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgtttatgttatgtttgtgggtgaaattacatgtt 46523557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 20913281 - 20913160
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  20913281 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaat 20913182  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  20913181 gataagttatgaaaattgtgct 20913160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 20931596 - 20931475
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  20931596 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaat 20931497  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  20931496 gataagttatgaaaattgtgct 20931475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 63 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22035827 - 22035681
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttggattttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||  || ||||||||||    
T  22035827 taggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgtt 22035728  T
Q  162 gtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22035727 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 22035681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 41394473 - 41394352
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |    
T  41394473 tgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaagttacatgttcaaatatgtaaaaat 41394374  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||| |||| ||||||||    
T  41394373 gataagttgtgaaaattgtgct 41394352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 100 - 208
Target Start/End: Original strand, 7640847 - 7640956
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaatt 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||  || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  7640847 cttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaatt 7640946  T
Q  199 cgtgctcttg 208  Q
    ||||||||||    
T  7640947 cgtgctcttg 7640956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Original strand, 20893638 - 20893759
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    |||||||||| |||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| | | || |    
T  20893638 tgctaaattcttgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgttgaaattacatgttcaaataggaacaaat 20893737  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||| |||| ||||||||    
T  20893738 gataagttgtgaaaattgtgct 20893759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 190 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 20445930 - 20445844
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 276  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20445930 tgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 20445844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 190 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 20531695 - 20531609
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 276  Q
    ||||||||||||||||    ||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20531695 tgctaaattcgtgctccaaatgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 20531609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 190 - 276
Target Start/End: Original strand, 37844462 - 37844548
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 276  Q
    |||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37844462 tgctaaattcatgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 37844548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 51452743 - 51452623
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    |||||||||||||||    || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| | |||||  ||| |    
T  51452743 tgctaaattcgtgcttcaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaat 51452644  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgc 310  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  51452643 gaaaagttatgaaaattgtgc 51452623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 62 - 136
Target Start/End: Original strand, 15861284 - 15861358
Alignment:
Q  62 ctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    ||||||||||||||||| | ||  ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15861284 ctaggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15861358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 34 - 311
Target Start/End: Original strand, 13171 - 13446
Alignment:
Q  34 gggaagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataat 133  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13171 gggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctaggaactgaagtgaagctagggttaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagtgattatcataat 13270  T
Q  134 catgtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg 233  Q
    |||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  13271 catgt--aatttttcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctcttagtgtgatgttatgtttgtatgcatg 13368  T
Q  234 aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| || |||||    
T  13369 aattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgct 13446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 43427 - 43128
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg-aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggta 110  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43427 agagaagaacaagagtgttggaggggaagcttgaggaatcaagtgggtgatctaggagctgaagtgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggta 43328  T
Q  111 agggggttagttattatcataatcatgtgtaattttggatttt-ctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgc 209  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  43327 agggggttagttactatcacaaacatgt--aattttgcatttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgagcaattcatgtcaaattcgtgctcttgc 43230  T
Q  210 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtg 309  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||    
T  43229 tgggatgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgaagattgtg 43130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 39536 - 39271
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  39536 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 39437  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  39436 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 39337  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  39336 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 39271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 166; Significance: 7e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 307
Target Start/End: Original strand, 20936 - 21233
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | ||| ||| |  |||||| ||||||||||    
T  20936 agagaagaacaagagttttgaagggaaagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagggttaggattaatcatcttcaaaggt 21035  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  21036 aagggggttagttattatcataatcatgtacaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgt 21135  T
Q  210 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattg 307  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||| || || ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  21136 tgtgatgttatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattg 21233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 311
Target Start/End: Original strand, 13882 - 14182
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | ||| ||| |  |||||| ||||||||||    
T  13882 agagaagaacaagagttttgaagggaaagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagggttaggattaatcatcttcaaaggt 13981  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  13982 aagggggttagttattatcataatcatgtacaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgcacaattcttgctaaa-tcgtgctcttgc 14080  T
Q  210 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtg 309  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  14081 tgtgatgttatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttgaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgtg 14180  T
Q  310 ct 311  Q
    ||    
T  14181 ct 14182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 63 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 3341 - 3093
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttggattttctcatgttg 162  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  3341 taggagctgaattgaagcaagagtttcggttaatcttcttctaaggtaagggggttaattattatcataattatgtacaattttgcattttctcatgttg 3242  T
Q  163 tatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtg 262  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  3241 tatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtg 3142  T
Q  263 aaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||||||||||||  |||| |||| ||  ||||| |||| ||||||||    
T  3141 aaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgct 3093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 105 - 311
Target Start/End: Original strand, 9266 - 9470
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  9266 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 9363  T
Q  205 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaaga 304  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| |    
T  9364 tttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 9463  T
Q  305 ttgtgct 311  Q
    | |||||    
T  9464 tggtgct 9470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 105 - 311
Target Start/End: Original strand, 16164 - 16368
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16164 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 16261  T
Q  205 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaaga 304  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| |    
T  16262 tttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 16361  T
Q  305 ttgtgct 311  Q
    | |||||    
T  16362 tggtgct 16368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 63 - 309
Target Start/End: Original strand, 5088 - 5335
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||| || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| | ||||||||| |||    
T  5088 taggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggagttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcacgtt 5187  T
Q  162 gtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  5188 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgttaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 5287  T
Q  262 gaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtg 309  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  5288 gaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtg 5335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 38 - 311
Target Start/End: Original strand, 64372 - 64649
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatg 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  64372 agcttaaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 64471  T
Q  138 tgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatga--- 234  Q
    |  | ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||       
T  64472 ta-atttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaatt 64570  T
Q  235 --attgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgtgct 311  Q
      ||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  64571 atattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgct 64649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 105 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 108084 - 107877
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 203  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||    
T  108084 aaggtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgc 107985  T
Q  204 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaag 303  Q
    ||   |||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| | ||     
T  107984 tccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgcaaaaatgataagttgtaaaa 107885  T
Q  304 attgtgct 311  Q
    ||||||||    
T  107884 attgtgct 107877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 47 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 29558 - 29388
Alignment:
Q  47 aatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tt 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  29558 aatcaagtgggtgacctaggagctgaagtgaagctaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctt 29459  T
Q  146 tggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatg 216  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  29458 tgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgctcttgctgtgatg 29388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 29627 - 29565
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaaggg-aagctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaa 73  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29627 agagaagaacaagagtgttggaggggaagcttgaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaa 29565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 63 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 4102 - 3854
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||| || |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||    
T  4102 taggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttctaaggtaaggggtttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 4003  T
Q  162 gtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  4002 gtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggt 3903  T
Q  262 gaaattacatgttcatatatg-caaaagtgataagttatgaagattgtg 309  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||| | ||||||    
T  3902 gaaattacatgttcaaatatgtaaaaaatgataagttatggaaattgtg 3854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 100 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 374 - 166
Alignment:
Q  100 cttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattc 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||    
T  374 cttctaaggtaagggggttagttattatcaaaatcatgt--aattttgcattg-ctcatgttatatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattc 278  T
Q  200 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||    
T  277 gtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttat 178  T
Q  300 gaagattgtgct 311  Q
    | | ||||||||    
T  177 gtatattgtgct 166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 31742 - 31477
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagt-gggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| |||  |||||||||||||||||||    
T  31742 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttggggaatcaatttgggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttagagataatcaacttcaaaggt 31643  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcatgtgtaat-tttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || ||||||||||||||||    
T  31642 aagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgctcttg 31543  T
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||| ||| ||  | ||| |||||||||| |  | ||||  || | ||||||||||||||||    
T  31542 ctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtt 31477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 153 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 39935 - 39814
Alignment:
Q  153 tctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtata 252  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||     
T  39935 tctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgattctattttcctgtgcatgaattgatgattatggtatt 39836  T
Q  253 attgttggtgaaattacatgtt 274  Q
     |||| ||||||||||||||||    
T  39835 tttgtgggtgaaattacatgtt 39814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 63 - 216
Target Start/End: Original strand, 10624 - 10778
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||| | ||  ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||    
T  10624 taggagctgaattgaagcaagagttagggttaatcatcttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 10723  T
Q  162 gtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatg 216  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  10724 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtgatg 10778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Original strand, 1451 - 1663
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||    
T  1451 taggagctgaattgaagcaagggtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgtt 1550  T
Q  162 gtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| |||    
T  1551 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaaatcgtgcacttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggt 1650  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  1651 gaaattacatgtt 1663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 89; Significance: 7e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 239
Target Start/End: Original strand, 7278 - 7509
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa--gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaagg 108  Q
    ||||||||||||| |  |||||| |||  |||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | || |||| || |||||  |||||||||    
T  7278 agagaagaacaagggttttgaagagaatagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagaattagggttaatcttcttcaaagg 7377  T
Q  109 taagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctctt 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  7378 taagggggttagttattatcataatcatgttccatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattactaaattcgtgctctt 7477  T
Q  208 gctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattga 239  Q
    | ||||||| ||| ||  | ||||||||||||    
T  7478 gttgtgatgctattttcttgtgcatgaattga 7509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 2826 - 2560
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa--gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaagg 108  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||  |||| ||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | ||  ||  || |||||  |||| ||||    
T  2826 agagaagaacaag-gatttgaagggaatagcttgaggaatcaattggggtaagctaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaagg 2728  T
Q  109 taagggggttagttattatcataatcatgtgtaa--ttttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctct 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  2727 taagggggttagttattatcataatcatgtacaaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctcaattcgtgctct 2628  T
Q  207 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||| |||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  2627 tgccgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgcttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 2560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 63 - 274
Target Start/End: Original strand, 1390 - 1602
Alignment:
Q  63 taggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgtt 161  Q
    |||||||||||||||| | ||  || ||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||    
T  1390 taggagctgaattgaagcaagagtttaggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgtt 1489  T
Q  162 gtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggt 261  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  || | |||    
T  1490 gtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggt 1589  T
Q  262 gaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||    
T  1590 gaaattacatgtt 1602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 7002 - 6831
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-t 136  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  ||  || |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7002 agctttacgaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatcataatcaat 6903  T
Q  137 gtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttg 208  Q
     |  ||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6902 ttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 6831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Original strand, 3594 - 3715
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  3594 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 3693  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||| |||| ||||||||    
T  3694 gataagttgtgaaaattgtgct 3715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 1375 - 1254
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||| ||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  1375 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgttagtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 1276  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||| |||| ||||||||    
T  1275 gataagttgtgaaaattgtgct 1254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 19457 - 19336
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  19457 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 19358  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||| |||| ||||||||    
T  19357 gataagttgtgaaaattgtgct 19336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 21541 - 21420
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  21541 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 21442  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||| |||| ||||||||    
T  21441 gataagttgtgaaaattgtgct 21420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Original strand, 968 - 1089
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  968 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 1067  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
     ||||||| |||| ||||||||    
T  1068 aataagttgtgaaaattgtgct 1089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Original strand, 10257 - 10427
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 203  Q
    |||||||||||||| ||  |  ||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  10257 aaggtaagggggtttgtcttcttcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgc 10356  T
Q  204 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  10357 tcttgctgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 10427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 190 - 276
Target Start/End: Original strand, 34472 - 34558
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 276  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34472 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 34558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 138
Target Start/End: Original strand, 34374 - 34407
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgt 138  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34374 aaggtaagagggttagttattatcataatcatgt 34407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 131006 - 130880
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||| | ||||||| ||||||||||    
T  131006 agagaagaacaagagtgttgaagggaaagcttgaggaatcaattggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggcataatcatcttcaaaggt 130907  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||    
T  130906 aagggggttagtctttatcataatcat 130880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Original strand, 89466 - 89587
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | || |    
T  89466 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 89565  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
     ||||||| |||| ||||||||    
T  89566 tataagttgtgaaaattgtgct 89587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 5780 - 5659
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||| |    
T  5780 tgctaaattcgtgctccaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaat 5681  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||||| ||||| ||||||||    
T  5680 gataagtcatgaatattgtgct 5659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Original strand, 6076 - 6197
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |    
T  6076 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 6175  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
     ||||||| | || ||||||||    
T  6176 aataagttgtaaaaattgtgct 6197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12364 - 12243
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||| | || || |||| |    
T  12364 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgtttaaatgtgtaaaaat 12265  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||| |||| ||||||||    
T  12264 gataagttgtgaaaattgtgct 12243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 38 - 206
Target Start/End: Original strand, 23600 - 23769
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatcataatca-t 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||  ||  || |||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  23600 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggaactgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaagttaagggggttagttattatcatattcaat 23699  T
Q  137 gtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctct 206  Q
     |  ||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  23700 ttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaactcatgtcaaattcgtgctct 23769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 13757 - 13636
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |    
T  13757 tgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 13658  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |  ||||| |||| ||||||||    
T  13657 gtgaagttgtgaaaattgtgct 13636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 104 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 42709 - 42677
Alignment:
Q  104 aaaggtaagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42709 aaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 42677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 48438 - 48317
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||| |    
T  48438 tgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaat 48339  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||| |||| ||||||||    
T  48338 gataagttgtgaaaattgtgct 48317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 193 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 41896 - 41780
Alignment:
Q  193 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgat 292  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||      
T  41896 taaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtg 41797  T
Q  293 aagttatgaagattgtg 309  Q
    ||||| |||| ||||||    
T  41796 aagttgtgaaaattgtg 41780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 105 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 54212 - 54040
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 203  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||  |  || ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54212 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaattcaaatttttgcattttctcatgttttatgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattcgtgc 54113  T
Q  204 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 276  Q
    |||| |||||||| | | ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  54112 tcttactgtgatgctgttttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttca 54040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 45369 - 45198
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatt-ttggattttctcat-gttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtg 202  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||  |||| ||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||  || ||||||||||    
T  45369 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgcaatttctcattgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaattcgtg 45270  T
Q  203 ctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    | |||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  45269 cccttgttgtgatgctattttgatgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtt 45198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 54755 - 54584
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaatt-ttggattttctcat-gttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtg 202  Q
    ||||||||| |||||||  | |||||||||||||  |||| ||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||  || ||||||||||    
T  54755 aaggtaaggtggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgcaatttctcattgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaattcgtg 54656  T
Q  203 ctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
      |||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  54655 tccttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattgcatgtt 54584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 193 - 311
Target Start/End: Original strand, 36928 - 37046
Alignment:
Q  193 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgat 292  Q
    |||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  36928 taaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgat 37027  T
Q  293 aagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| |||| ||||||||    
T  37028 aagttgtgaaaattgtgct 37046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 209 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 148953 - 148851
Alignment:
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgt 308  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| |||| |||||    
T  148953 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 148854  T
Q  309 gct 311  Q
    |||    
T  148853 gct 148851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 9100 - 8979
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |    
T  9100 tgctaaattcgtgctccatctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 9001  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |  ||||| |||| ||||||||    
T  9000 gtgaagttgtgaaaattgtgct 8979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 143 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 3712 - 3579
Alignment:
Q  143 ttttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgt 242  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| | ||  | | ||||||||||||     
T  3712 ttttgcattttctcatgttttatgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattagtgctcttactgtgatgttgttttcttgtccatgaattgatga 3613  T
Q  243 tagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 276  Q
    |  | |||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  3612 ttatggtatgattgtgggtgaaattacatgttca 3579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Original strand, 8192 - 8313
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||| |||||  |||| |||| |    
T  8192 tgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattacaggttcaattatgtaaaaat 8291  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |  ||||| |||| ||||||||    
T  8292 gtgaagttgtgaaaattgtgct 8313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 190 - 308
Target Start/End: Original strand, 26427 - 26545
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||  ||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||| |    
T  26427 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattattggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaat 26526  T
Q  290 gataagttatgaagattgt 308  Q
    |||||||| |||| |||||    
T  26527 gataagttgtgaaaattgt 26545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Original strand, 51194 - 51315
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |    
T  51194 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaataggtaaaaat 51293  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||| |||| ||||||||    
T  51294 gataagttgtgaaaattgtgct 51315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Original strand, 123176 - 123297
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | || |    
T  123176 tgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 123275  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||| |||| ||||||||    
T  123276 gataagttgtgaaaattgtgct 123297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 184 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 3447 - 3360
Alignment:
Q  184 aattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacat 271  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  3447 aattgatgctaaattcgtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggtgaaattacat 3360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 190 - 276
Target Start/End: Original strand, 546 - 632
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 276  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  546 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 9129 - 9008
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| |||| |    
T  9129 tgctaaattcgtgctccatttgtgatgttatgtttgtatgcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaat 9030  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    | |||||| |||| ||||||||    
T  9029 gttaagttgtgaaaattgtgct 9008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 41980 - 41859
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |    
T  41980 tgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtcatattgttggtgaaattacatgctcaaatatgtaaaaat 41881  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    ||||| || |||| ||||||||    
T  41880 gataatttgtgaaaattgtgct 41859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 274
Target Start/End: Original strand, 34076 - 34246
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgg-attttctcat-gttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtg 202  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||  |||||| | |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||  |||||||||||||    
T  34076 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcattgttgtatgaaa-tgggttgatgaaaaattgttgctaaattcgtg 34174  T
Q  203 ctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||| | ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  34175 ctcttgctgtgaagctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 34246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Original strand, 247454 - 247575
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||  ||||||||| |||||||| ||| | | || |    
T  247454 tgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgagggtgaaatttcatgttcaaataggaacaaat 247553  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||| |||| ||||||||    
T  247554 gataagttgtgaaaattgtgct 247575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Original strand, 5073 - 5194
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    |||||||||||| |||   |||||| | ||||||||||||| |||||||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |    
T  5073 tgctaaattcgtactccaactgtgacgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaat 5172  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||| |||| ||||||||    
T  5173 gataagttgtgaaaattgtgct 5194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 172156 - 172035
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    |||||||| |||||||   |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | || |    
T  172156 tgctaaatacgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 172057  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||| |||| ||||||||    
T  172056 gataagttgtgaaaattgtgct 172035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 190 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 177859 - 177738
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    |||||||| |||||||   |||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | || |    
T  177859 tgctaaatacgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaat 177760  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgct 311  Q
    |||||||| |||| ||||||||    
T  177759 gataagttgtgaaaattgtgct 177738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 208
Target Start/End: Original strand, 12045 - 12149
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttggattttctcatg-ttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||  |||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  12045 aaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaatttttcattt-ctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtg 12143  T
Q  203 ctcttg 208  Q
    ||||||    
T  12144 ctcttg 12149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22791 - 22671
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||| |    
T  22791 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 22692  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgc 310  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  22691 gaaaagttatgaaaattgtgc 22671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27046 - 26926
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||| |    
T  27046 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 26947  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgc 310  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  26946 gaaaagttatgaaaattgtgc 26926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 310
Target Start/End: Original strand, 1594 - 1714
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||| |    
T  1594 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 1693  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgc 310  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  1694 gaaaagttatgaaaattgtgc 1714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 190 - 310
Target Start/End: Original strand, 37078 - 37198
Alignment:
Q  190 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 289  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||  ||| |    
T  37078 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaat 37177  T
Q  290 gataagttatgaagattgtgc 310  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  37178 gaaaagttatgaaaattgtgc 37198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 7547 - 7443
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatca-tgtgtaattttggattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 203  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||||| | |  ||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  7547 aaggtaagggggtttgttttcatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 7448  T
Q  204 tcttg 208  Q
    |||||    
T  7447 tcttg 7443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 129
Target Start/End: Original strand, 154282 - 154373
Alignment:
Q  38 agctttaggaatcaagtgggtgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggtaagggggttagttattatca 129  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  ||  || |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  154282 agctttaggaatcaagtgggtgacttaggagctgaattgaagcaagagtttgggttaatcttcttctaaggtaagggggttagttattatca 154373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 136
Target Start/End: Original strand, 17115 - 17241
Alignment:
Q  12 agagaagaacaagagggttgaagggaa-gctttaggaatcaagtggg-tgacctaggagctgaattgaaactaggattaaggataatcaacttcaaaggt 109  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| |||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||| | ||||| | |||| |||||    
T  17115 agagaagcacaggagtgttgaaaggaaagcttgaggaatcaattggggtgacctaggagctgaattgaagcaagggttaggaataataatcttctaaggt 17214  T
Q  110 aagggggttagttattatcataatcat 136  Q
    ||||||||||||  | |||||||||||    
T  17215 aagggggttagtcttcatcataatcat 17241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 272257 - 272155
Alignment:
Q  209 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaagattgt 308  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||| | | || ||||||||| |||| |||||    
T  272257 ctgtaatgatatgtttgtatgaatgaattgatgataattgtatgattgatggagaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 272158  T
Q  309 gct 311  Q
    |||    
T  272157 gct 272155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 105 - 169
Target Start/End: Original strand, 13268 - 13333
Alignment:
Q  105 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaa-ttttggattttctcatgttgtatgaaa 169  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  13268 aaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaa 13333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 274
Target Start/End: Original strand, 56114 - 56195
Alignment:
Q  193 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| || || ||||||| |||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  56114 taaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgtt 56195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1666 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1666
Description:

Target: scaffold1666; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 191 - 274
Target Start/End: Original strand, 1 - 84
Alignment:
Q  191 gctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 274  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||  | |||||||||||||| |  | ||||  |||| ||||||||||||||||    
T  1 gctaaattcgtgctcttgctgtgaggctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtt 84  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 194 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 8257 - 8174
Alignment:
Q  194 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 276  Q
    |||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||  ||||||||||| || ||||||||    
T  8257 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttca 8174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0406 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0406
Description:

Target: scaffold0406; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 14283 - 14198
Alignment:
Q  194 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 278  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||  | |||| ||||| || || ||| || |||| |||||||||| ||||||||||    
T  14283 aaattcgtgctcttgttatgatgttatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattattgctggtgaaattgcatgttcata 14198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 108256 - 108171
Alignment:
Q  194 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 278  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||  | |||| ||||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  108256 aaattcgtgctcttgttatgatgttatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 108171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 5841 times since January 2019
Visitors: 4860