View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0755_low_94 (Length: 300)

Name: NF0755_low_94
Description: NF0755
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0755_low_94
NF0755_low_94
[»] chr7 (68 HSPs)
chr7 (9-281)||(12366642-12366914)
chr7 (9-277)||(16316455-16316723)
chr7 (9-274)||(10883072-10883339)
chr7 (9-277)||(22577919-22578187)
chr7 (28-277)||(21283271-21283520)
chr7 (9-281)||(13880096-13880370)
chr7 (28-277)||(28409050-28409300)
chr7 (10-233)||(15088513-15088736)
chr7 (9-262)||(29935272-29935524)
chr7 (9-233)||(44467056-44467281)
chr7 (12-267)||(11319400-11319657)
chr7 (9-267)||(11792899-11793159)
chr7 (9-233)||(13137837-13138061)
chr7 (9-233)||(13302802-13303026)
chr7 (9-233)||(21695393-21695617)
chr7 (9-248)||(13648721-13648960)
chr7 (9-213)||(2500030-2500234)
chr7 (9-233)||(2913550-2913774)
chr7 (9-233)||(9069554-9069778)
chr7 (9-229)||(21692279-21692499)
chr7 (28-248)||(30945285-30945503)
chr7 (28-277)||(15467927-15468178)
chr7 (28-248)||(24788152-24788372)
chr7 (9-233)||(33691654-33691878)
chr7 (38-281)||(13692372-13692606)
chr7 (9-243)||(30944257-30944489)
chr7 (9-277)||(13260521-13260781)
chr7 (11-226)||(13730624-13730839)
chr7 (29-233)||(9709746-9709948)
chr7 (9-233)||(30025897-30026121)
chr7 (28-233)||(23279901-23280105)
chr7 (12-205)||(5000791-5000985)
chr7 (14-197)||(19237022-19237204)
chr7 (28-233)||(33605696-33605900)
chr7 (28-233)||(48236846-48237049)
chr7 (28-248)||(14426558-14426776)
chr7 (33-233)||(28622300-28622498)
chr7 (12-233)||(39284507-39284727)
chr7 (9-199)||(13018481-13018671)
chr7 (9-233)||(331637-331860)
chr7 (9-121)||(16309961-16310073)
chr7 (9-248)||(41842201-41842439)
chr7 (31-233)||(35952631-35952832)
chr7 (33-197)||(13880604-13880768)
chr7 (145-229)||(4494634-4494718)
chr7 (62-233)||(16542964-16543133)
chr7 (62-233)||(16622529-16622698)
chr7 (11-146)||(14193108-14193243)
chr7 (34-233)||(12174284-12174482)
chr7 (9-233)||(16111828-16112050)
chr7 (62-231)||(15704445-15704612)
chr7 (9-233)||(4821466-4821687)
chr7 (37-199)||(13032048-13032210)
chr7 (29-233)||(2265463-2265665)
chr7 (28-225)||(13893949-13894145)
chr7 (91-201)||(13472553-13472664)
chr7 (9-233)||(8182922-8183143)
chr7 (36-137)||(9098284-9098385)
chr7 (186-277)||(14193243-14193336)
chr7 (28-101)||(19339324-19339397)
chr7 (9-77)||(27871710-27871778)
chr7 (28-101)||(1293041-1293114)
chr7 (28-129)||(19711059-19711160)
chr7 (9-77)||(24794813-24794881)
chr7 (70-149)||(16556664-16556743)
chr7 (70-149)||(16608919-16608998)
chr7 (28-101)||(14425458-14425531)
chr7 (9-101)||(48062894-48062986)
[»] chr4 (50 HSPs)
chr4 (9-281)||(16632430-16632702)
chr4 (28-277)||(37435388-37435637)
chr4 (28-277)||(14604759-14605009)
chr4 (9-262)||(29680410-29680665)
chr4 (9-248)||(55380280-55380519)
chr4 (28-277)||(45833403-45833654)
chr4 (17-255)||(12601099-12601337)
chr4 (9-217)||(37985525-37985733)
chr4 (9-229)||(19620962-19621182)
chr4 (9-233)||(19884692-19884915)
chr4 (9-214)||(19666362-19666567)
chr4 (9-233)||(3395580-3395804)
chr4 (9-204)||(9140902-9141097)
chr4 (9-277)||(12811029-12811296)
chr4 (9-233)||(14904253-14904477)
chr4 (9-277)||(40846089-40846359)
chr4 (12-248)||(56034567-56034803)
chr4 (29-233)||(13576013-13576215)
chr4 (22-230)||(22675422-22675628)
chr4 (72-230)||(14833449-14833607)
chr4 (9-229)||(19911781-19912002)
chr4 (28-231)||(10072944-10073146)
chr4 (36-233)||(3483738-3483935)
chr4 (9-233)||(10692841-10693063)
chr4 (9-233)||(10906607-10906829)
chr4 (28-233)||(413011-413214)
chr4 (28-233)||(54679939-54680140)
chr4 (28-233)||(17247253-17247455)
chr4 (9-277)||(6641674-6641941)
chr4 (11-200)||(29121362-29121551)
chr4 (116-255)||(23123528-23123669)
chr4 (75-267)||(15139283-15139478)
chr4 (9-233)||(6517475-6517697)
chr4 (9-231)||(23750512-23750732)
chr4 (9-241)||(3105311-3105540)
chr4 (28-163)||(8105646-8105782)
chr4 (29-176)||(16940026-16940172)
chr4 (28-154)||(11915709-11915835)
chr4 (28-150)||(25651084-25651206)
chr4 (9-118)||(16853493-16853602)
chr4 (28-173)||(56533018-56533164)
chr4 (9-233)||(17398583-17398795)
chr4 (103-233)||(55731863-55731991)
chr4 (9-80)||(22190836-22190907)
chr4 (9-80)||(38513868-38513939)
chr4 (28-101)||(15475172-15475245)
chr4 (36-78)||(3499704-3499746)
chr4 (28-225)||(17540404-17540598)
chr4 (9-109)||(40860657-40860758)
chr4 (9-77)||(39419787-39419855)
[»] chr1 (53 HSPs)
chr1 (9-281)||(33256164-33256436)
chr1 (9-281)||(33276336-33276608)
chr1 (9-277)||(19717519-19717787)
chr1 (9-277)||(22153852-22154122)
chr1 (9-277)||(48704199-48704467)
chr1 (9-281)||(22599993-22600267)
chr1 (9-248)||(12284418-12284657)
chr1 (9-277)||(20954288-20954558)
chr1 (9-229)||(28492269-28492489)
chr1 (9-262)||(1577862-1578115)
chr1 (9-248)||(10757416-10757656)
chr1 (28-277)||(35401823-35402072)
chr1 (9-229)||(22201601-22201821)
chr1 (9-277)||(38282562-38282831)
chr1 (9-219)||(1900340-1900550)
chr1 (9-277)||(2268526-2268792)
chr1 (28-233)||(22427220-22427423)
chr1 (28-248)||(2267103-2267321)
chr1 (28-233)||(32785799-32786003)
chr1 (28-233)||(39200855-39201058)
chr1 (9-216)||(36134185-36134391)
chr1 (32-281)||(23036340-23036589)
chr1 (9-233)||(26701990-26702214)
chr1 (12-248)||(30893090-30893327)
chr1 (9-233)||(29215792-29216014)
chr1 (28-233)||(22464671-22464875)
chr1 (28-197)||(16235193-16235362)
chr1 (9-200)||(25448460-25448651)
chr1 (28-233)||(2834704-2834907)
chr1 (9-233)||(35040161-35040383)
chr1 (31-262)||(7309836-7310068)
chr1 (12-154)||(21191805-21191947)
chr1 (29-248)||(17024811-17025029)
chr1 (9-197)||(12613713-12613899)
chr1 (28-233)||(2327302-2327506)
chr1 (9-199)||(21028788-21028978)
chr1 (28-233)||(30572211-30572413)
chr1 (9-233)||(48570095-48570316)
chr1 (9-233)||(21702809-21703030)
chr1 (9-233)||(44821408-44821630)
chr1 (28-182)||(14263362-14263517)
chr1 (9-233)||(46088984-46089197)
chr1 (9-80)||(37642243-37642314)
chr1 (28-118)||(7745066-7745156)
chr1 (28-101)||(42284642-42284715)
chr1 (139-233)||(10251102-10251193)
chr1 (28-101)||(21984610-21984683)
chr1 (9-101)||(21121057-21121149)
chr1 (28-80)||(21204937-21204989)
chr1 (214-277)||(21191694-21191757)
chr1 (210-248)||(12284651-12284689)
chr1 (28-114)||(18896577-18896663)
chr1 (9-101)||(21135153-21135245)
[»] chr2 (61 HSPs)
chr2 (9-277)||(10009591-10009860)
chr2 (9-267)||(20568600-20568860)
chr2 (9-277)||(22187942-22188212)
chr2 (9-248)||(25829124-25829363)
chr2 (9-277)||(23234997-23235267)
chr2 (9-277)||(30666979-30667249)
chr2 (9-262)||(19540406-19540659)
chr2 (9-277)||(25037099-25037369)
chr2 (9-277)||(25041206-25041476)
chr2 (9-277)||(24576025-24576294)
chr2 (9-277)||(9015211-9015478)
chr2 (9-277)||(21537088-21537358)
chr2 (9-274)||(24850508-24850776)
chr2 (9-233)||(13963864-13964088)
chr2 (9-233)||(24377091-24377315)
chr2 (49-277)||(22260436-22260664)
chr2 (9-233)||(18376792-18377016)
chr2 (13-233)||(30621210-30621430)
chr2 (13-233)||(30623831-30624051)
chr2 (9-277)||(40782467-40782729)
chr2 (9-229)||(28140509-28140729)
chr2 (9-233)||(22317583-22317808)
chr2 (28-277)||(38781408-38781657)
chr2 (97-273)||(7609039-7609216)
chr2 (36-233)||(20151922-20152118)
chr2 (9-199)||(24779333-24779523)
chr2 (9-262)||(41121577-41121829)
chr2 (28-233)||(6574010-6574215)
chr2 (9-199)||(39037562-39037752)
chr2 (9-274)||(22454833-22455100)
chr2 (9-262)||(23595427-23595677)
chr2 (9-233)||(31800775-31800997)
chr2 (12-199)||(25189391-25189577)
chr2 (9-233)||(28711586-28711808)
chr2 (28-233)||(28701117-28701320)
chr2 (28-198)||(6392642-6392814)
chr2 (34-173)||(45087130-45087269)
chr2 (28-233)||(31327853-31328057)
chr2 (28-233)||(31334574-31334778)
chr2 (28-154)||(26619066-26619192)
chr2 (28-248)||(22802469-22802687)
chr2 (28-233)||(34321824-34322027)
chr2 (9-233)||(33074216-33074438)
chr2 (28-233)||(30557207-30557412)
chr2 (28-262)||(44881176-44881409)
chr2 (9-262)||(23184170-23184414)
chr2 (91-277)||(22272205-22272390)
chr2 (9-130)||(35743989-35744110)
chr2 (28-224)||(19115092-19115287)
chr2 (9-233)||(28550816-28551028)
chr2 (9-101)||(44840424-44840516)
chr2 (186-248)||(22776171-22776231)
chr2 (186-248)||(22781549-22781609)
chr2 (9-233)||(31967941-31968153)
chr2 (28-80)||(1587072-1587124)
chr2 (29-101)||(14581525-14581597)
chr2 (9-101)||(22776306-22776398)
chr2 (9-101)||(22781684-22781776)
chr2 (9-101)||(40332077-40332169)
chr2 (28-101)||(3277039-3277112)
chr2 (31-80)||(23392707-23392756)
[»] chr5 (44 HSPs)
chr5 (9-277)||(17814960-17815228)
chr5 (9-248)||(23412880-23413119)
chr5 (9-277)||(7745570-7745838)
chr5 (9-248)||(89328-89567)
chr5 (9-277)||(19536177-19536446)
chr5 (9-262)||(21072131-21072385)
chr5 (9-248)||(21910548-21910787)
chr5 (9-248)||(6512337-6512573)
chr5 (9-229)||(41566359-41566579)
chr5 (9-229)||(20550887-20551107)
chr5 (9-233)||(26784346-26784570)
chr5 (28-233)||(33022675-33022878)
chr5 (28-219)||(13545455-13545638)
chr5 (9-244)||(31117869-31118103)
chr5 (9-281)||(23881059-23881332)
chr5 (9-277)||(21099580-21099849)
chr5 (9-233)||(11993880-11994102)
chr5 (28-233)||(42243691-42243895)
chr5 (9-233)||(4887014-4887236)
chr5 (9-233)||(6499231-6499453)
chr5 (28-233)||(15516980-15517183)
chr5 (9-233)||(29138331-29138551)
chr5 (28-228)||(30742991-30743189)
chr5 (9-173)||(33933259-33933424)
chr5 (28-277)||(642583-642833)
chr5 (9-184)||(12352765-12352940)
chr5 (9-231)||(14086462-14086684)
chr5 (9-249)||(21198910-21199148)
chr5 (28-233)||(26759160-26759363)
chr5 (28-153)||(26765509-26765634)
chr5 (28-199)||(25096779-25096952)
chr5 (28-199)||(25154749-25154922)
chr5 (31-233)||(3245365-3245564)
chr5 (9-107)||(9398781-9398879)
chr5 (119-233)||(5429985-5430098)
chr5 (214-277)||(12352693-12352758)
chr5 (9-130)||(28139599-28139720)
chr5 (9-80)||(9088961-9089032)
chr5 (9-128)||(30115863-30115982)
chr5 (28-130)||(32160777-32160879)
chr5 (9-101)||(35932059-35932151)
chr5 (155-238)||(9398661-9398744)
chr5 (28-233)||(28464272-28464465)
chr5 (186-233)||(30115799-30115844)
[»] chr8 (54 HSPs)
chr8 (9-277)||(39693523-39693793)
chr8 (9-277)||(16681198-16681466)
chr8 (9-281)||(16188972-16189244)
chr8 (12-281)||(17525619-17525889)
chr8 (10-277)||(20382289-20382556)
chr8 (36-277)||(33082872-33083113)
chr8 (9-276)||(16207294-16207563)
chr8 (10-272)||(17267463-17267724)
chr8 (28-276)||(19943242-19943494)
chr8 (12-233)||(12757702-12757923)
chr8 (9-277)||(29693303-29693573)
chr8 (9-233)||(602659-602883)
chr8 (9-233)||(19156184-19156408)
chr8 (9-277)||(17914447-17914717)
chr8 (9-248)||(18718989-18719228)
chr8 (9-277)||(24646326-24646596)
chr8 (28-277)||(23263506-23263756)
chr8 (12-262)||(18321067-18321319)
chr8 (12-262)||(17441716-17441967)
chr8 (9-267)||(17701733-17701993)
chr8 (29-233)||(23185167-23185369)
chr8 (9-248)||(18679803-18680042)
chr8 (9-261)||(18121018-18121269)
chr8 (9-233)||(21932871-21933095)
chr8 (10-233)||(30421369-30421591)
chr8 (9-233)||(17797410-17797632)
chr8 (12-281)||(19707497-19707765)
chr8 (28-233)||(15336029-15336232)
chr8 (28-233)||(15425094-15425297)
chr8 (28-233)||(15516398-15516601)
chr8 (77-266)||(20255472-20255660)
chr8 (28-233)||(24551281-24551484)
chr8 (128-274)||(22745594-22745742)
chr8 (9-233)||(45538380-45538602)
chr8 (28-233)||(9320575-9320780)
chr8 (9-233)||(40845329-40845550)
chr8 (28-200)||(1237644-1237816)
chr8 (28-197)||(18685372-18685541)
chr8 (9-195)||(43644884-43645069)
chr8 (28-197)||(18722621-18722790)
chr8 (28-197)||(18730966-18731135)
chr8 (29-233)||(36105203-36105405)
chr8 (28-233)||(22663123-22663326)
chr8 (28-233)||(22673785-22673988)
chr8 (31-233)||(24832997-24833198)
chr8 (9-85)||(25164058-25164134)
chr8 (9-233)||(6407714-6407926)
chr8 (31-137)||(19956376-19956482)
chr8 (28-154)||(22461656-22461782)
chr8 (9-101)||(14989522-14989614)
chr8 (28-101)||(13430699-13430772)
chr8 (28-101)||(21301029-21301102)
chr8 (9-101)||(18151717-18151809)
chr8 (28-80)||(21288410-21288462)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (9-277)||(14644-14912)
[»] chr6 (44 HSPs)
chr6 (28-277)||(13435547-13435798)
chr6 (9-277)||(24116824-24117094)
chr6 (9-248)||(12715333-12715573)
chr6 (28-229)||(14100373-14100574)
chr6 (9-277)||(13602168-13602438)
chr6 (11-277)||(9717841-9718109)
chr6 (10-233)||(20112628-20112852)
chr6 (13-277)||(23284564-23284830)
chr6 (9-233)||(19086154-19086368)
chr6 (9-248)||(15302196-15302435)
chr6 (9-281)||(15531503-15531777)
chr6 (9-262)||(19623975-19624228)
chr6 (9-233)||(32544261-32544485)
chr6 (9-233)||(26972157-26972379)
chr6 (9-195)||(18378310-18378496)
chr6 (28-243)||(29918032-29918246)
chr6 (12-199)||(15987232-15987420)
chr6 (36-243)||(19688789-19688994)
chr6 (43-233)||(34451597-34451787)
chr6 (28-276)||(21625116-21625363)
chr6 (29-233)||(20730635-20730837)
chr6 (92-277)||(25597558-25597745)
chr6 (31-233)||(18435574-18435776)
chr6 (28-233)||(22802156-22802359)
chr6 (9-233)||(16265081-16265303)
chr6 (9-233)||(22076338-22076560)
chr6 (28-233)||(19832963-19833167)
chr6 (28-233)||(21618259-21618462)
chr6 (28-231)||(15954718-15954919)
chr6 (28-197)||(10640384-10640553)
chr6 (28-233)||(16877228-16877431)
chr6 (9-233)||(16336123-16336345)
chr6 (28-277)||(19470685-19470933)
chr6 (28-153)||(20487927-20488052)
chr6 (28-229)||(12349008-12349206)
chr6 (28-156)||(26943591-26943719)
chr6 (28-183)||(12423276-12423430)
chr6 (9-100)||(25594064-25594155)
chr6 (28-117)||(21235140-21235229)
chr6 (140-233)||(21235240-21235331)
chr6 (9-122)||(33351967-33352079)
chr6 (9-101)||(19066079-19066171)
chr6 (9-80)||(17381517-17381588)
chr6 (210-277)||(26943761-26943828)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (11-277)||(18466-18734)
[»] chr3 (61 HSPs)
chr3 (9-275)||(49642658-49642926)
chr3 (9-277)||(14392900-14393168)
chr3 (9-248)||(12963010-12963249)
chr3 (9-277)||(20646149-20646420)
chr3 (9-277)||(6090727-6090997)
chr3 (12-277)||(13948334-13948601)
chr3 (9-248)||(37467328-37467567)
chr3 (28-277)||(52920420-52920670)
chr3 (9-279)||(31303381-31303653)
chr3 (12-277)||(15903196-15903464)
chr3 (9-233)||(2561183-2561407)
chr3 (28-248)||(17238847-17239067)
chr3 (9-281)||(18121511-18121786)
chr3 (11-277)||(28582103-28582372)
chr3 (9-194)||(41494994-41495179)
chr3 (9-248)||(18142677-18142916)
chr3 (9-248)||(12726155-12726394)
chr3 (28-229)||(38177587-38177788)
chr3 (9-274)||(29951335-29951602)
chr3 (9-274)||(30000489-30000756)
chr3 (28-255)||(49553407-49553634)
chr3 (28-233)||(47405363-47405566)
chr3 (28-233)||(14969341-14969546)
chr3 (9-181)||(13780576-13780748)
chr3 (9-233)||(16658558-16658782)
chr3 (9-233)||(40799869-40800091)
chr3 (28-233)||(47207720-47207924)
chr3 (9-248)||(19888869-19889107)
chr3 (36-205)||(13824091-13824260)
chr3 (28-233)||(2785078-2785282)
chr3 (28-233)||(20627373-20627576)
chr3 (28-233)||(11223577-11223780)
chr3 (9-199)||(16032520-16032709)
chr3 (9-233)||(24775474-24775698)
chr3 (28-233)||(14955441-14955644)
chr3 (9-233)||(53056669-53056891)
chr3 (28-233)||(46349786-46349989)
chr3 (9-248)||(22140759-22140996)
chr3 (28-277)||(20725101-20725349)
chr3 (28-262)||(5213591-5213822)
chr3 (9-137)||(22804059-22804187)
chr3 (28-199)||(19249387-19249557)
chr3 (9-133)||(25398295-25398419)
chr3 (10-199)||(12388847-12389035)
chr3 (31-158)||(33583246-33583374)
chr3 (28-233)||(21640881-21641083)
chr3 (28-200)||(29855423-29855596)
chr3 (91-233)||(11869145-11869285)
chr3 (160-277)||(25398169-25398286)
chr3 (9-80)||(11868264-11868335)
chr3 (107-233)||(49666357-49666480)
chr3 (28-154)||(12968320-12968446)
chr3 (9-101)||(21636742-21636834)
chr3 (36-163)||(50300245-50300372)
chr3 (28-118)||(11909079-11909169)
chr3 (28-154)||(23538185-23538311)
chr3 (9-101)||(21605726-21605818)
chr3 (28-80)||(46796460-46796512)
chr3 (9-80)||(30054310-30054381)
chr3 (139-233)||(46796319-46796410)
chr3 (235-277)||(13824255-13824297)
[»] scaffold0026 (4 HSPs)
scaffold0026 (9-277)||(60012-60280)
scaffold0026 (9-248)||(7922-8161)
scaffold0026 (201-277)||(115709-115785)
scaffold0026 (224-277)||(151735-151788)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (9-277)||(12205-12475)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (28-277)||(212369-212619)
scaffold0005 (72-230)||(6092-6250)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (12-277)||(19319-19584)
scaffold0035 (9-233)||(99101-99320)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (9-277)||(5537-5805)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (9-277)||(1686-1954)
[»] scaffold0771 (1 HSPs)
scaffold0771 (12-277)||(474-741)
[»] scaffold0210 (1 HSPs)
scaffold0210 (28-248)||(1675-1895)
[»] scaffold0084 (3 HSPs)
scaffold0084 (9-263)||(49328-49584)
scaffold0084 (9-219)||(32481-32691)
scaffold0084 (28-118)||(351-441)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (12-277)||(25820-26087)
scaffold0083 (49-176)||(44652-44779)
[»] scaffold0004 (4 HSPs)
scaffold0004 (9-277)||(377404-377674)
scaffold0004 (9-277)||(220234-220503)
scaffold0004 (9-248)||(211394-211631)
scaffold0004 (28-152)||(244256-244380)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (9-248)||(9965-10204)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (9-248)||(27305-27544)
[»] scaffold0861 (1 HSPs)
scaffold0861 (31-277)||(4792-5040)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (28-248)||(15132-15352)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (9-277)||(36620-36890)
scaffold0120 (9-277)||(42115-42385)
[»] scaffold0161 (2 HSPs)
scaffold0161 (12-233)||(9998-10220)
scaffold0161 (12-80)||(14816-14884)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (9-277)||(20816-21086)
[»] scaffold0227 (1 HSPs)
scaffold0227 (9-233)||(22672-22896)
[»] scaffold0426 (1 HSPs)
scaffold0426 (9-183)||(13567-13741)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (43-277)||(9825-10059)
[»] scaffold1434 (1 HSPs)
scaffold1434 (78-277)||(633-832)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (28-262)||(103587-103821)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (22-233)||(7712-7923)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (72-230)||(30283-30441)
scaffold0047 (9-262)||(9899-10151)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (9-233)||(89948-90170)
[»] scaffold0217 (3 HSPs)
scaffold0217 (9-233)||(19027-19251)
scaffold0217 (28-233)||(9575-9777)
scaffold0217 (9-233)||(22024-22246)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (9-229)||(15789-16011)
[»] scaffold1359 (2 HSPs)
scaffold1359 (28-248)||(533-751)
scaffold1359 (28-101)||(1778-1851)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (28-233)||(215390-215593)
[»] scaffold0022 (5 HSPs)
scaffold0022 (76-233)||(39488-39645)
scaffold0022 (76-233)||(137548-137705)
scaffold0022 (9-199)||(159051-159240)
scaffold0022 (28-66)||(37417-37455)
scaffold0022 (28-66)||(135477-135515)
[»] scaffold0439 (1 HSPs)
scaffold0439 (31-233)||(6633-6833)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (9-248)||(6003-6241)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (9-233)||(9952-10176)
[»] scaffold1331 (1 HSPs)
scaffold1331 (29-227)||(1598-1794)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (28-233)||(78259-78462)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (71-217)||(143146-143292)
[»] scaffold0056 (4 HSPs)
scaffold0056 (28-277)||(36032-36280)
scaffold0056 (9-101)||(34827-34919)
scaffold0056 (28-101)||(25688-25761)
scaffold0056 (201-277)||(25520-25599)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (28-181)||(5545-5698)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (129-277)||(4838-4988)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (28-233)||(60818-61021)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (28-233)||(9170-9372)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (142-233)||(5830-5922)
[»] scaffold0414 (1 HSPs)
scaffold0414 (28-233)||(7049-7252)
[»] scaffold0485 (1 HSPs)
scaffold0485 (192-277)||(9253-9338)
[»] scaffold0471 (1 HSPs)
scaffold0471 (29-233)||(3320-3522)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (28-199)||(43845-44015)
[»] scaffold0527 (1 HSPs)
scaffold0527 (44-233)||(7963-8149)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (9-153)||(2702-2845)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (28-154)||(1491-1617)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (28-114)||(74596-74682)
scaffold0025 (164-277)||(74718-74831)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (68-233)||(65322-65484)
scaffold0011 (68-233)||(144367-144529)
scaffold0011 (28-130)||(164940-165042)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (29-86)||(2033-2090)
[»] scaffold0273 (2 HSPs)
scaffold0273 (22-154)||(5636-5767)
scaffold0273 (220-262)||(5867-5909)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (28-118)||(1803-1893)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (28-194)||(40652-40817)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (28-80)||(7396-7448)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (139-233)||(23456-23547)
scaffold0247 (9-130)||(25393-25514)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (194-262)||(60729-60799)
[»] scaffold1747 (1 HSPs)
scaffold1747 (28-84)||(1332-1388)
[»] scaffold1745 (1 HSPs)
scaffold1745 (28-84)||(23-79)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (9-80)||(17809-17880)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (28-123)||(38086-38181)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (9-80)||(87644-87715)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (210-264)||(13391-13447)
[»] scaffold0473 (1 HSPs)
scaffold0473 (9-77)||(2738-2806)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (28-80)||(865-917)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 68)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 9 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 12366914 - 12366642
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  12366914 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacagacatccaatgctttcaaa 12366815  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12366814 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 12366715  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatgatgtc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12366714 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctgatgagatgcttttgatgaacttgattctgatgatgtc 12366642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16316723 - 16316455
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||    
T  16316723 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatttcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatggcttcaaa 16316624  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |     
T  16316623 tcctttcaaaatagctgttgcttcactcttctggtcttctgcaattcttagacgtgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatcc 16316524  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  16316523 cctgatgaacttcaacttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 16316455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 10883339 - 10883072
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10883339 agcagagacgcaaactgagtagtggaggtagtgattgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaggcatccaatgccttcaaa 10883240  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||    
T  10883239 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgaaatgattagacgagattaaatccattgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatct 10883140  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctga 274  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  10883139 cctgatgaactacagcttctggtgatcttcagcttctgatgggatgcttctgatgaacttgcttctga 10883072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 22578187 - 22577919
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| ||  ||| |||||| ||||||    
T  22578187 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttttaagaacaatcattcaatgccttcaaa 22578088  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||    
T  22578087 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttacagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatctattgaacaccctttgaagctttaagtcttgcatct 22577988  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||| |||| |||| ||||    
T  22577987 cctgatgaacttcagcttctggtgatcttgcctctgatgagatgcttctgatgaccttgcttctaatga 22577919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21283520 - 21283271
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||  || | || ||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||    
T  21283520 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaataacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatggacgtt 21283421  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||    
T  21283420 gctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatatcctgatgaacttcaacttc 21283321  T
Q  228 tggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  21283320 tggtgatcttgcttctgatgagattcttctgatgaacttgattctgatga 21283271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 281
Target Start/End: Original strand, 13880096 - 13880370
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||    
T  13880096 agcagagacacaaagtgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatctaatgccttcaaa 13880195  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||  |    
T  13880196 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcgtcgagtcttctgcaatgcttagacgagattaagtccattgaacagcctttgaagctttatgtcttgcaatt 13880295  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatgatgtc 281  Q
    |||||||||||  |||||||  ||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  13880296 cctgatgaactagagcttctcatgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgatgtc 13880370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 28409050 - 28409300
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  28409050 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaataattgtt 28409149  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| || ||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  28409150 gcttcactcttctagtcttctgcaatgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagccttatgtcttgcatctcttgatgaactttagcttc 28409249  T
Q  228 tggtgac-cttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  28409250 tggtgactgttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 28409300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Original strand, 15088513 - 15088736
Alignment:
Q  10 gcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||  |||||||    
T  15088513 gcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatccaatgtcttcaaat 15088612  T
Q  110 cctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctc 209  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||    
T  15088613 cctttcaaaatagtcgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttacgtcttgcatctc 15088712  T
Q  210 ctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    |||||||| |  ||||||||||||    
T  15088713 ctgatgaattagagcttctggtga 15088736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 29935524 - 29935272
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  29935524 agcagagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 29935425  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||  | ||||||||  |||||||| || |||||  ||||||| ||||| ||    
T  29935424 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatg-ttaagtgtgattaaatatattgaacaacctttgaaattttaagtcttgcatct 29935326  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatga 262  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  29935325 cctgatgaactttagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatga 29935272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 44467056 - 44467281
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||    
T  44467056 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 44467155  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcc-cttgaagctttaagttttgcacc 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||| |    
T  44467156 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatc 44467255  T
Q  208 tcctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  44467256 tcctgatgaacttcagcttttggtga 44467281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 267
Target Start/End: Original strand, 11319400 - 11319657
Alignment:
Q  12 agagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcc 111  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||| | ||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||    
T  11319400 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtgcaattgtaatttgtcaacgctcttcaaaaaacacgcatccaatgcattcaaatcc 11319499  T
Q  112 tttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcct 211  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| ||| |    
T  11319500 tttcaaaatagttgttacttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacatcctttgaagcttgaagtcttgcatctctt 11319599  T
Q  212 gatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttg 267  Q
    ||||| || || |||||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  11319600 gatgacctacaacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttg 11319657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 267
Target Start/End: Original strand, 11792899 - 11793159
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  11792899 agcagagacacaaactaagtggtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgctttcaaa 11792998  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||    |||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
T  11792999 tgctttcaaaatagtcgttgcttcactcttatggtctttcgcaatgcttagacgagattaagtccattgaacaacctttaaagctttaagtcttgcatct 11793098  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttg 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||| || |||||||||||    
T  11793099 cctgatgaacttcagcttctggtgatctttagcttctgatgagatgtttatgatgaacttg 11793159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13138061 - 13137837
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  13138061 agcagagacataaactgagtaatggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 13137962  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | || |||||||||||||| ||||| ||    
T  13137961 tcttttcaaaatagttgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgattaacctttgaagctttaagtcttgcatct 13137862  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    ||| |||||||  ||||||||||||    
T  13137861 ccttatgaactagagcttctggtga 13137837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 13302802 - 13303026
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||    
T  13302802 agcagagacacaaactgagtagtggtgatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaa 13302901  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||    
T  13302902 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttctacaatgcttagacgatattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 13303001  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||    
T  13303002 cctaatgaactacagcttctggtga 13303026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 21695393 - 21695617
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  21695393 agcagagacacaaactgagtagttgaggtactggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 21695492  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    || |||  ||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||    
T  21695493 tcattttgaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaagtcttgcatct 21695592  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  21695593 cttgatgaacttcagcttctggtga 21695617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Original strand, 13648721 - 13648960
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  || |||    
T  13648721 agcagagacacaaattgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagatcaagcatccaatgtctttaaa 13648820  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||| | ||| ||    
T  13648821 tcctttcaaaatagccgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgcgattaaatccattgaacatcttttgaagctttaagtctcgcatct 13648920  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 248  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  13648921 cctgatgagctttagcttctgttgatcttgcttctgatga 13648960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 213
Target Start/End: Original strand, 2500030 - 2500234
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||||||   | ||||||||||||||||||    
T  2500030 agcagagacacaaactgagtagtggagaaagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaactctcttcaaaggataagcatccaatgctttcaaa 2500129  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||    
T  2500130 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 2500229  T
Q  209 cctga 213  Q
    |||||    
T  2500230 cctga 2500234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2913774 - 2913550
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  2913774 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 2913675  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| | | ||||||||||| || ||| | |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||    
T  2913674 tcctttcaaaatagtcgttgctccacttttctagtcttctgcattgtttagatgagattaaattcattgaacagcctttgaagatttaagtcttgcatct 2913575  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||    
T  2913574 cctgatgaactacagtttctggtga 2913550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 9069554 - 9069778
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||| |  |||| || |||| |||||| || |||    
T  9069554 agcagagacaaaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctccttgaagaacaagcatacaatgcctttaaa 9069653  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| ||    
T  9069654 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgatattaaatcccttgaacaacctttgaagctttaagttttgcatct 9069753  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||    
T  9069754 cctgatgaaatagagcttctggtga 9069778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 229
Target Start/End: Original strand, 21692279 - 21692499
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  21692279 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 21692378  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||| | |  |||||||||||||| ||||| ||    
T  21692379 tcctttcaaaacagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagaagagattaaaatcattgaataacttttgaagctttaagtcttgcatct 21692478  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctg 229  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  21692479 cctaatgaacttcagcttctg 21692499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 30945503 - 30945285
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||  | || || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30945503 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaggaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgtt 30945404  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||||||| | ||| |||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  30945403 gcttcacttttccaatcttctacaatacttagacgagattaaatccgttgaacaacctttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcagcttc 30945306  T
Q  228 tggtgaccttgcttctaatga 248  Q
    || ||| ||||||||| ||||    
T  30945305 tgatgaacttgcttctgatga 30945285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 15467927 - 15468178
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||    
T  15467927 tagtggaggtaatggttgtacacctcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttaaaatagtcgtt 15468026  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    | |||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||    
T  15468027 gattcactcttccagtcttctgcattgcctagacgagattaaatctattgaacaccctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttc 15468126  T
Q  228 tggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    |||| | |||  || ||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  15468127 tggtaatcttcagcatctgatgagatgcatatgatgaacttgcttctgatga 15468178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 248
Target Start/End: Original strand, 24788152 - 24788372
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||  |||||  |||| || ||| ||||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  24788152 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaattctctttgaagaacaagcacccaatgccttcaaatcctttcaaaatattcgtt 24788251  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  24788252 gcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagatgatattaaatctattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctaatgaacttcagcttc 24788351  T
Q  228 tggtgaccttgcttctaatga 248  Q
    |||||| ||||||||| ||||    
T  24788352 tggtgatcttgcttctgatga 24788372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 33691878 - 33691654
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| || ||||| || || || |||    
T  33691878 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatctaacgcctttaaa 33691779  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||| ||    
T  33691778 ttctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccatttaacagcctttgaagctttatgtcttgcatct 33691679  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    |||||||||||  ||||||||||||    
T  33691678 cctgatgaactagagcttctggtga 33691654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 38 - 281
Target Start/End: Original strand, 13692372 - 13692606
Alignment:
Q  38 agtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactct 137  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||  ||||| || ||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||    
T  13692372 agtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctataaagatcaagcatccaatgt---------ctttcaaaatagttgttgcttcactct 13692462  T
Q  138 cccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctggtgacctt 237  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || || ||||||| ||| |||||||||||| |||    
T  13692463 tccagtcttctgcaatgcttatacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttacatcttctgatgagctttagcttctggtgatctt 13692562  T
Q  238 gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatgatgtc 281  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  13692563 gcttctgaagagatgcttctgatgaacttgcttctgatgatgtc 13692606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 9 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 30944489 - 30944257
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||  ||||  | ||||||||||| ||||||    
T  30944489 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtattttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaa 30944390  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||  ||||| ||    
T  30944389 tcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccaatcttctgcaatacttagacgagattaaatccgttgaacaacctttgaagctttaag--ttgcatct 30944292  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttct 243  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||    
T  30944291 cctgatgaactgcagcttctgatgaacgtgcttct 30944257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 13260781 - 13260521
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||| || |||||||||||||||| |    
T  13260781 agcagagacacaaactgggtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatctcaatgctcttccaagaacaagcatccaatgctttcata 13260682  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
           | |||||||||||||| ||||  |  |||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||| ||||| ||    
T  13260681 -------agaatagttgttgctttactcctctggtcttccgcaatgcttggacgagattaaatccatt-aacagtctttggagctttaagtcttgcatct 13260590  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  13260589 cctgatgaactttagcttctggtgatcttgcttctaatgagatgcttatgatgaacttgcttctgatga 13260521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13730839 - 13730624
Alignment:
Q  11 cagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatc 110  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  13730839 cagagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgcattcaaatc 13730740  T
Q  111 ctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcc 210  Q
     |||||||||||  |||||||||||||   |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| ||||    
T  13730739 ttttcaaaatagccgttgcttcactcttttagtcttatgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagccttgcatctcc 13730640  T
Q  211 tgatgaacttcagctt 226  Q
    || ||| ||| |||||    
T  13730639 tggtgagctttagctt 13730624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 29 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9709948 - 9709746
Alignment:
Q  29 agtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttg 128  Q
    |||||| ||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||| || ||||| ||||| |||||||||||||||| |||  ||||    
T  9709948 agtggatgtagtggttttacacttcgtacagttgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatctaatgccttcaaatcctttcaaactaggcgttg 9709849  T
Q  129 cttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttct 228  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  | ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  9709848 cttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaggctttgaagcttta--tgttgcatctcctgatgaactgcagcttct 9709751  T
Q  229 ggtga 233  Q
    |||||    
T  9709750 ggtga 9709746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 30025897 - 30026121
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||| || |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||     
T  30025897 agcagagacacaaactgagtagtagagatattggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatcgaatgccttcaat 30025996  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    || |||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| ||    
T  30025997 tcttttcaaaatagccgttgcttcactctttcagtcttctgcgatgcttatacgagactaaatccattgaccagcgtttgaagctttaagtcttgcatct 30026096  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    | |||||||||  ||||||||||||    
T  30026097 cttgatgaactagagcttctggtga 30026121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23280105 - 23279901
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||    
T  23280105 tagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactagccgtt 23280006  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    ||| |||| | |||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||    
T  23280005 gctccacttttccagtcttctacaatgcttagacaagattaaatcca-tgaatagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacaacttc 23279907  T
Q  228 tggtga 233  Q
    ||||||    
T  23279906 tggtga 23279901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 5000985 - 5000791
Alignment:
Q  12 agagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcc 111  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  5000985 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgttcttcaaagaacaagcattcaatgctttcaaatcc 5000886  T
Q  112 tttcaaaatagttgttgcttcac-tctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgca 205  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||   ||||| ||||||||||   ||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  5000885 tttcaaaatagtcgttgcttcacttctcttggtcttttgcaatgcttgggcgagattgaatccattgaacaacctttgaagctctaagtcttgca 5000791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 19237204 - 19237022
Alignment:
Q  14 agacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctt 113  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  19237204 agacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtataattgtagtttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctt 19237105  T
Q  114 tcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaa 197  Q
    ||||| |||  ||||||||||||| |  |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  19237104 tcaaagtagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-tagacgagattaaatcctttgaacagcctttgaagctttaa 19237022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Original strand, 33605696 - 33605900
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  33605696 tagtgaaggtagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcatt 33605795  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcc-cttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagctt 226  Q
    |||||| | | |||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||  | ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  33605796 gcttcaattttccagtcatctgcattgcttagacgagattaaatccgttgaaaagccttttgaagcttta--tgttgcatctcctgatgaactgcagctt 33605893  T
Q  227 ctggtga 233  Q
    |||||||    
T  33605894 ctggtga 33605900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 48237049 - 48236846
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||  | |||||  |||| |||||||||||||||| | || |||    
T  48237049 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatctgatgccttcaaatcctttcaaacttgtcgtt 48236950  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||||||  |  ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  48236949 gcttcaccttttcagtcttatgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcagcttc 48236852  T
Q  228 tggtga 233  Q
    ||||||    
T  48236851 tggtga 48236846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 248
Target Start/End: Original strand, 14426558 - 14426776
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| |||||||||||||  |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  14426558 tagtggaggtagtggttgtacacttagtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgtt 14426657  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||||||| | |||||||||||||||  ||| | ||| || |||||||| ||||||   ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| || ||||    
T  14426658 gcttcacttttccagtcttctgcaatctttagatgagtttgaatccattaaacagcttctgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcaccttc 14426755  T
Q  228 tggtgaccttgcttctaatga 248  Q
    || ||| ||||||||| ||||    
T  14426756 tgatgaacttgcttctgatga 14426776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 33 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 28622498 - 28622300
Alignment:
Q  33 gaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttc 132  Q
    ||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||| |||  || | ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  28622498 gaggtagtggttgtacacctcgtacaattgtactttgtcaacgccctttgaaaaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaattagccgttgcttc 28622399  T
Q  133 actctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctggtg 232  Q
    ||| | | ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  28622398 acttttctagtattctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtg 28622301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 39284727 - 39284507
Alignment:
Q  12 agagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcc 111  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| |    
T  39284727 agagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgccttcaaattc 39284628  T
Q  112 tttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcct 211  Q
     ||  || |||| |||| |||||||| |  |||||| ||||||| ||  || |||||||||| |||||||||| |||||||||| | | |  || || ||    
T  39284627 atttgaattagtcgttgtttcactcttctggtcttcagcaatgc-taggcgtgattaaatcctttgaacagcctttgaagctttgattctctcatcttct 39284529  T
Q  212 gatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  39284528 gatgatcttcagcttctggtga 39284507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 13018671 - 13018481
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | |  ||||||||||| |||||     
T  13018671 agcacagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaatccagcatccaatgccttcaac 13018572  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcc-cttgaagctttaagt 199  Q
    | | || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |   || |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  13018571 ttcatttaaaatagtcgttgcttcactctcctagtcttctgcaatac-tgggcgtgattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagt 13018481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 331637 - 331860
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||| || |   |  || |||||||||| |||| |    
T  331637 agcagagacacaaactgtgtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacatttgtactttgtcaacgcttttgagcaataag-catccaatgccttcaga 331735  T
Q  109 tcctttcaaaa-tagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacc 207  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||  || |||||||  |||| || ||||||||||||| |  ||| |    
T  331736 tcctttcaaaaatagctgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttggacgaccttgaatccataaaacaacctttgaagctttaag-tccgcatc 331834  T
Q  208 tcctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  331835 tcctgatggacttcagcttctggtga 331860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 16310073 - 16309961
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  16310073 agcagagacacaaactgagtagtgtagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 16309974  T
Q  109 tcctttcaaaata 121  Q
    |||||||||||||    
T  16309973 tcctttcaaaata 16309961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 41842439 - 41842201
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||| | || | ||||||||  |||||     
T  41842439 agcagagacacaaactgagtagtgcaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactctgtcaacgcactttaaaaaacaagtatccaatgtcttcaac 41842340  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    | | ||  || |||| |||||||||||||||   |||| |||| |||||| ||||||| ||||| | |||||| || ||||||| |||||| |  || ||    
T  41842339 ttcatttgaattagtcgttgcttcactctcctgatcttatgcagtgcttagacgagatcaaatcaaatgaacaacctttgaagc-ttaagtctctcatct 41842241  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 248  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  41842240 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttgctactaatga 41842201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 35952832 - 35952631
Alignment:
Q  31 tggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgct 130  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| |||||||||||||  | || ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35952832 tggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgatgaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgct 35952733  T
Q  131 tcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaat-ccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctg 229  Q
    ||||| | |||||||||| |||| |||| ||||| || ||| ||||| ||||||  ||||||| |||||  ||||| |  |||||||||| || ||||||    
T  35952732 tcacttttccagtcttcttcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacagcttttgaagccttaag--ttgcatcctctgatgaactgcaacttctg 35952635  T
Q  230 gtga 233  Q
    ||||    
T  35952634 gtga 35952631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 197
Target Start/End: Original strand, 13880604 - 13880768
Alignment:
Q  33 gaggtagtggttgtat-acttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgctt 131  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||||| || | ||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||  || |||| |||||||    
T  13880604 gaggtagtggttgtaccacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaaagaacaagcatccagtgccttcaaatccttttgaattagtcgttgctt 13880703  T
Q  132 cactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaa 197  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||  || |||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  13880704 cactcttctagtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcttttgaacagcctttgaagctttaa 13880768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 145 - 229
Target Start/End: Original strand, 4494634 - 4494718
Alignment:
Q  145 ttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctg 229  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4494634 ttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctg 4494718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 62 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16543133 - 16542964
Alignment:
Q  62 gtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaac 161  Q
    ||||| |||||  ||||||  |||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||    
T  16543133 gtactttgtcagagctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcatttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatcattaaac 16543034  T
Q  162 gagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    ||| || |||||||| ||||||  ||||||| |||  | ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  16543033 gagtttgaatccattaaacagcttttgaagcatta--tgttgcatctcctgatgaactgcagcttatggtga 16542964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 62 - 233
Target Start/End: Original strand, 16622529 - 16622698
Alignment:
Q  62 gtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaac 161  Q
    ||||| |||||  ||||||  |||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||    
T  16622529 gtactttgtcagagctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcatttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatcattaaac 16622628  T
Q  162 gagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    ||| || |||||||| ||||||  ||||||| |||  | ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||    
T  16622629 gagtttgaatccattaaacagcttttgaagcatta--tgttgcatctcctgatgaactgcagcttatggtga 16622698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 146
Target Start/End: Original strand, 14193108 - 14193243
Alignment:
Q  11 cagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatc 110  Q
    |||||||| | || || |||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||| |||||||||  |||| || |||| |||||| ||||||||    
T  14193108 cagagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttcgtacacttgtactttgttaacgctctttgaagaacaagcattcaatgccttcaaatc 14193207  T
Q  111 ctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtctt 146  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14193208 ctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtctt 14193243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12174482 - 12174284
Alignment:
Q  34 aggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaag-agcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttc 132  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||  ||||| |||||||||||||   || | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12174482 aggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttc 12174383  T
Q  133 actctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaat-ccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctggt 231  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||| || ||| ||||  ||||||  ||||||| |||||  ||||| |  |||||||||| |||||||||||    
T  12174382 acttttccagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcccataaaacagcttttgaagc-ttaag--ttgcatcctctgatgaactgcagcttctggt 12174286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16112050 - 16111828
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| || ||||||||||| |||||     
T  16112050 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaat 16111951  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    | ||| ||||| ||| ||||||||||| |  | |||||||||| |  ||| ||||| || |||||||  |||| |  |||||||||||||  ||||| |     
T  16111950 ttcttccaaaaaagtcgttgcttcactttttccgtcttctgcactctttagacgaggttgaatccataaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatcc 16111853  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
     ||||| |||| |||||||||||||    
T  16111852 tctgatcaactgcagcttctggtga 16111828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 62 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15704612 - 15704445
Alignment:
Q  62 gtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaac 161  Q
    |||||||||||||||||||  ||||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||  ||| | |||||||||||||||  ||| ||    
T  15704612 gtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatccttccaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagac 15704513  T
Q  162 gagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctggt 231  Q
    ||| || ||||| || ||||||  ||||||||||||||||  || || |||||||||| || ||||||||    
T  15704512 gagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagttt--catcttctgatgaactacaacttctggt 15704445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 4821466 - 4821687
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | |||||||||||  |||| || ||||||||||| ||||||    
T  4821466 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttttcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 4821565  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    | ||||||||||||  |||||| |||| | | ||||||||| |||  ||| ||||| || |||   || ||||||  |||||||||||||  ||| | ||    
T  4821566 t-ctttcaaaatagccgttgctccacttttctagtcttctgtaatctttagacgagtttgaatttgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgtatct 4821662  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    || |||||||| |||||||||||||    
T  4821663 ccggatgaactgcagcttctggtga 4821687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 13032210 - 13032048
Alignment:
Q  37 tagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactc 136  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||  ||||| ||||  ||||| | | ||  ||||||||||||||||||||    
T  13032210 tagtggttgtacacttcgtacaattatactttgtcaacgctcttcaaaaagccagcatctaatgtcttcaacttcatttgaaatagttgttgcttcactc 13032111  T
Q  137 tcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcc-cttgaagctttaagt 199  Q
    |||  |||||||||||| | ||  || |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  13032110 tcctggtcttctgcaatac-taggcgtgattaaatccattgaacaaccatttgaagctttaagt 13032048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 29 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2265665 - 2265463
Alignment:
Q  29 agtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttg 128  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||  | ||||  ||| | ||||||||||| ||||||||  ||||    
T  2265665 agtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcattaaataccttcaaatccttccaaaatagccgttg 2265566  T
Q  129 cttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttct 228  Q
    ||  ||| |  ||||||||||||||  ||| ||||| || ||||  || ||||||  || ||||||||||  ||||| ||||||||||||| || |||||    
T  2265565 ctatactttttcagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatctgttaaacagcttttaaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacaacttct 2265468  T
Q  229 ggtga 233  Q
    |||||    
T  2265467 ggtga 2265463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13894145 - 13893949
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||| |||||| || | |||| ||| || ||||| ||  ||| |||||| ||||||||||||  || |||  |||    
T  13894145 tagtggaggtagtggttgtacacgttgtacaattgtcctttttcaatgctttttaaagaacaaacattcaatgccttcaaatccttttgaattagccgtt 13894046  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagct 225  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||| ||  || |||||||||| ||||||| || |||||||||||||| || || || ||||||| ||||||||    
T  13894045 gcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtatttcatcttctgatgatcttcagct 13893949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 91 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 13472664 - 13472553
Alignment:
Q  91 gcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcc-cttga 189  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  || |    
T  13472664 gcatcaaatgccatcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactcttatgatcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaccttttaa 13472565  T
Q  190 agctttaagttt 201  Q
    ||||||||||||    
T  13472564 agctttaagttt 13472553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 8182922 - 8183143
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatg-ctttcaa 107  Q
    |||||||||| | || || |||||||| ||||||||||| |||||||| |   ||| |||||||||||||||  ||||  | ||||| | || ||||| |    
T  8182922 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacagacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaagtgtctttc-a 8183020  T
Q  108 atcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||| |||| ||||| || || |  ||  ||| |  || ||||||| ||  ||||| |    
T  8183021 atcctttcaaaatagttgttgctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaaacttttatacaactttttaagctttgag--ttgcatc 8183117  T
Q  208 tcctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    |||||||||||| |||||||||||||    
T  8183118 tcctgatgaactgcagcttctggtga 8183143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 36 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 9098385 - 9098284
Alignment:
Q  36 gtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcact 135  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||  || |||  |||||||||||    
T  9098385 gtagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaaagaacaaacatctaatgcattcaaatccttttgaattagccgttgcttcact 9098286  T
Q  136 ct 137  Q
    ||    
T  9098285 ct 9098284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 277
Target Start/End: Original strand, 14193243 - 14193336
Alignment:
Q  186 ttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||  ||||| |||||| |||  |||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  14193243 ttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaactagagcttatggtgatcttctgcttctgataagatgcttatgatgaacttgcttctgatga 14193336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 19339397 - 19339324
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgc 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||  | |||||||||||    
T  19339397 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 19339324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 77
Target Start/End: Original strand, 27871710 - 27871778
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgct 77  Q
    |||||||||| | || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  27871710 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgct 27871778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 101
Target Start/End: Original strand, 1293041 - 1293114
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgc 101  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||  | |||||||||||    
T  1293041 tagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 1293114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 19711160 - 19711059
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||| ||  ||||| |||||| ||||||  |||   | ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||    
T  19711160 tagtggaaatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagtcgtt 19711061  T
Q  128 gc 129  Q
    ||    
T  19711060 gc 19711059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 24794881 - 24794813
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgct 77  Q
    |||||||||| | || || ||||||| |||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  24794881 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgct 24794813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 70 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 16556743 - 16556664
Alignment:
Q  70 tcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctg 149  Q
    |||||||||||  |||| || |||  |||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||    
T  16556743 tcaacgctctttgaagaacaagcaatcaatgccttaaaatcctttcaaaatagccgttgcttcacttttccagtcttctg 16556664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 70 - 149
Target Start/End: Original strand, 16608919 - 16608998
Alignment:
Q  70 tcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctg 149  Q
    |||||||||||  |||| || |||  |||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||    
T  16608919 tcaacgctctttgaagaacaagcaatcaatgccttaaaatcctttcaaaatagccgttgcttcacttttccagtcttctg 16608998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 101
Target Start/End: Original strand, 14425458 - 14425531
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgc 101  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||  ||| |||||||||||||||  ||||  | |||||||||||    
T  14425458 tagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtaatatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 14425531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 48062986 - 48062894
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgc 101  Q
    |||||||||| | || || || ||||| |||||||||||  ||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||  | |||||||||||    
T  48062986 agcagagacagaaacagagtaatggagatagtggttgtacgcttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 48062894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 50)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 9 - 281
Target Start/End: Original strand, 16632430 - 16632702
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||    
T  16632430 agcagagacacaaactgattggtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagaatccaatgccttcaaa 16632529  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    || |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||    
T  16632530 tcttttcaaaatagtcgttgattcactcttccagtcttctgcaatgcttatacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 16632629  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatgatgtc 281  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  16632630 cctgatgaactttagcttctagtgatcttgcttctgatgagatgcttttgatgaccttgcttctgatggtgtc 16632702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 37435637 - 37435388
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  37435637 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatagtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgtt 37435538  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  37435537 gcttcactcttccaatcttctgcaatgcttggacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttc 37435438  T
Q  228 tggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  37435437 tggtgatcttgcctctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 37435388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 14605009 - 14604759
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaa-tagttgt 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  14605009 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatccttttaaaaatagttgt 14604910  T
Q  127 tgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagctt 226  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||| || |||||    
T  14604909 tgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccatagaatagcctttgaagctttaagtcttggatctcctgatgaagtttagctt 14604810  T
Q  227 ctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  14604809 ctgatgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 14604759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 29680665 - 29680410
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  29680665 agcagagacacatactgagtagtggagataatgattgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 29680566  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||||| ||    
T  29680565 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacctttggagctttaagtcttgcatct 29680466  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatga 262  Q
    |||| | ||||  |||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||    
T  29680465 cctggtaaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 29680410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Original strand, 55380280 - 55380519
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  55380280 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 55380379  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcc-cttgaagctttaagttttgcacc 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||  |  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |    
T  55380380 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctggtcttctgcaatg-ttaggcatgattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtcttgcatc 55380478  T
Q  208 tcctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 248  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  55380479 tcctaatgaacttcagcttctgatgatcttgcttctgatga 55380519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 45833403 - 45833654
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||    
T  45833403 tagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaaaaagcatccaatgcattcaaatactttcaaaatagaagtt 45833502  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||    
T  45833503 gcttaactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttc 45833602  T
Q  228 tggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    |||||| |||  |||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  45833603 tggtgatctttagcttctgatgagatgcttatgataaacttgcttctgatga 45833654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 17 - 255
Target Start/End: Original strand, 12601099 - 12601337
Alignment:
Q  17 cacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttca 116  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  12601099 cacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttca 12601198  T
Q  117 aaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatga 216  Q
    ||||||| |||| |||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||  |||||    
T  12601199 aaatagtcgttgattcactattcaagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgacgctttaagtcttgcatctcgagatga 12601298  T
Q  217 acttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgctt 255  Q
     ||| | ||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  12601299 gctttaacttctagtgatcttgcttctgatgagatgctt 12601337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 37985733 - 37985525
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  37985733 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 37985634  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||    
T  37985633 tcctttcaaaatagttgttgcttcactttttcagtcttctgcgatgcttagatgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 37985534  T
Q  209 cctgatgaa 217  Q
    | |||||||    
T  37985533 catgatgaa 37985525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19621182 - 19620962
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  19621182 agcagagacacaaactgaatagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcatagaacaagcatccaatgctttcaaa 19621083  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||   |  ||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| | ||||| ||    
T  19621082 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaactcttgcatct 19620983  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctg 229  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  19620982 cctgatgaacttcagcttctg 19620962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 19884692 - 19884915
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| || ||||||||||| ||||||    
T  19884692 agcagagacaaaaacagattagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 19884791  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||| ||    
T  19884792 tcctttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcca-tgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 19884890  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  19884891 cctgatgaactacagcttctggtga 19884915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 214
Target Start/End: Original strand, 19666362 - 19666567
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| || | || |||||||||||||    
T  19666362 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaactctcttcaaagaacaagtattcaatgctttcaaa 19666461  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || || ||||||||||| ||||| ||    
T  19666462 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaataacctttcaagctttaagtcttgcatct 19666561  T
Q  209 cctgat 214  Q
    ||||||    
T  19666562 cctgat 19666567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 3395580 - 3395804
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  3395580 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaactagcatccaatgctttcaaa 3395679  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |  |||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |  |||||| ||||||| ||||| ||    
T  3395680 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactttttcagttttctgcaatgcttagacgatatttaatccattgaacaacttttgaagatttaagtcttgcatct 3395779  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||    
T  3395780 cctgatgaactatagcttctagtga 3395804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 204
Target Start/End: Original strand, 9140902 - 9141097
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  9140902 agcagagacacaaactgagtagtgaagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 9141001  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgc 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  9141002 tcctttcaaaatagtcgttgctttacttttccagtcttctacaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacccttgaagctttaagtcttgc 9141097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 12811296 - 12811029
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||| ||   ||| || ||||||||||| ||||||    
T  12811296 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattttactttgtcaacgctatt---agaacaagcatccaatgccttcaaa 12811200  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||    
T  12811199 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgaaactaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 12811100  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgacct--tgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    ||| |||||||  |||||||||||| ||  | || || ||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  12811099 cctaatgaactagagcttctggtgatcttctactactgatgagatgcttctgatgaacttgcttttgatga 12811029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14904477 - 14904253
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||  ||||||    
T  14904477 agcagagacacaaactgagtggtggagataatggttgtttacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgtcttcaaa 14904378  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||| || ||||| ||    
T  14904377 tcctttcaaaatggacgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcctagacgagattaaatcctttgaatagcttttgaagctttaggtcttgcatct 14904278  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    ||||||||||| || ||||||||||    
T  14904277 cctgatgaactacaacttctggtga 14904253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Original strand, 40846089 - 40846359
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||     
T  40846089 agcagagatacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatccaatgctttcaac 40846188  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcc-cttgaagctttaagttttgcacc 207  Q
    | | ||  || |||| ||||||||||| |||  |||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |  || |    
T  40846189 ttcatttgaattagtcgttgcttcactttcctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtctctcatc 40846287  T
Q  208 tcctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    | |||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  40846288 ttctgatgaacttcagcttccggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgtttctgatga 40846359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 12 - 248
Target Start/End: Original strand, 56034567 - 56034803
Alignment:
Q  12 agagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcc 111  Q
    ||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| | ||   | ||||||||| |||||||||||||  |||| ||  |||||||||| |||||||      
T  56034567 agagacacatattgagtagtggagatagtagttgtacattttagacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatta 56034666  T
Q  112 tttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcct 211  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| || ||    
T  56034667 tttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttggacgagattaaatccattgaacagtctttgaagctttaagtcttgcatcttct 56034766  T
Q  212 gatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 248  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  56034767 gatgaacttcagcttctggtgatcttgcttctgatga 56034803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 29 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13576215 - 13576013
Alignment:
Q  29 agtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttg 128  Q
    |||||| ||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||  |||| || ||||| ||||| |||||||||||||||| |||  ||||    
T  13576215 agtggatgtagtggttttacacttcgtacagttgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatctaatgccttcaaatcctttcaaactaggcgttg 13576116  T
Q  129 cttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttct 228  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  | ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  13576115 cttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaggctttgaagcttta--tgttgcatctcctgatgaactgcagcttct 13576018  T
Q  229 ggtga 233  Q
    |||||    
T  13576017 ggtga 13576013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 22 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22675628 - 22675422
Alignment:
Q  22 actgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaata 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||  |||| || ||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  22675628 actgagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaacta 22675529  T
Q  122 gttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttc 221  Q
    || ||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||| ||||| ||||||| |    
T  22675528 gtcgttgcttcacttttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgttgcatctcctaatgaactgc 22675431  T
Q  222 agcttctgg 230  Q
    |||||||||    
T  22675430 agcttctgg 22675422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 72 - 230
Target Start/End: Original strand, 14833449 - 14833607
Alignment:
Q  72 aacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaat 171  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  14833449 aacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaat 14833548  T
Q  172 ccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctgg 230  Q
    | |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| | || |||||||    
T  14833549 ctattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaattacaacttctgg 14833607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19912002 - 19911781
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctc-ttcaaagagcaggcatccaatgctttcaa 107  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||    
T  19912002 agcagaggcacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattatactatgtcaacgctctttcaaagaataagcatccaatgctttcaa 19911903  T
Q  108 atcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacc 207  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||   |  ||||| ||||||||||  |||||||| |||| |||||||| || || ||||||||||| ||||| |    
T  19911902 atcctttcaaaatagtcgttgcttcactgctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatctattgaacaacctttaaagctttaagtcttgcatc 19911803  T
Q  208 tcctgatgaacttcagcttctg 229  Q
    |||||||||||| || ||||||    
T  19911802 tcctgatgaactacaacttctg 19911781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 231
Target Start/End: Original strand, 10072944 - 10073146
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||  || | || || |||||||| |||||||||||||||| |||  |||    
T  10072944 tagtggagatagtggttgtacacttcgtacatttgtactttgtcaacgctctttgaataacaagcctccaatgccttcaaatcctttcaaactagcagtt 10073043  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||    
T  10073044 gcttcacttttccagtcttctgctatgcttaaacgagattaaatcca-tgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactactgcttc 10073142  T
Q  228 tggt 231  Q
    ||||    
T  10073143 tggt 10073146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 36 - 233
Target Start/End: Original strand, 3483738 - 3483935
Alignment:
Q  36 gtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcact 135  Q
    |||||||||||   ||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3483738 gtagtggttgtgcgcttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcact 3483837  T
Q  136 ctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
     | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||| ||||| ||| | |||||||  | ||||||||||    
T  3483838 tttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaatagtttttgaagctttaagtcttgcatctcttaatgaactataacttctggtga 3483935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 10692841 - 10693063
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||  ||||| ||| |||||||||  |||| || ||||||||||| ||||||    
T  10692841 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaaacgtactttgtaaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 10692940  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||| ||||| || ||||| || |||| |  |||||||||||||  ||||| ||    
T  10692941 tcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 10693038  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  10693039 cctgatgaactacagcttctggtga 10693063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 10906607 - 10906829
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||  ||||| ||| |||||||||  |||| || ||||||||||| ||||||    
T  10906607 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaaacgtactttgtaaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 10906706  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||| ||||| || ||||| || |||| |  |||||||||||||  ||||| ||    
T  10906707 tcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 10906804  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  10906805 cctgatgaactacagcttctggtga 10906829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Original strand, 413011 - 413214
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||  |||| ||  ||| |||||| |||||||||||||||| |||  |||    
T  413011 tagtggaggcagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacattcaatgccttcaaatcctttcaaattagccgtt 413110  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||  ||| | ||||||||||||| |||||||    
T  413111 gcttcacttttcgagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaag--ttgaatctcctgatgaactgcagcttc 413208  T
Q  228 tggtga 233  Q
    ||||||    
T  413209 tggtga 413214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Original strand, 54679939 - 54680140
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| |||||| ||||||  |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  54679939 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgtt 54680038  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||||||| | |||||||||||||||  ||| ||||| || |  ||||| ||||||  |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  54680039 gcttcacttttccagtcttctgcaatcattagacgagtttga--ccattaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcagcttc 54680134  T
Q  228 tggtga 233  Q
    ||||||    
T  54680135 tggtga 54680140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Original strand, 17247253 - 17247455
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| | ||||  |||| ||  ||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||    
T  17247253 tagtggaggcagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgttctttgaagaacaaacattcaatgccttcaaatcctttcaaattagtcgtt 17247352  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||| ||  || ||||||||||||| |||||||    
T  17247353 gcttcact-ttccaatcttctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaagatt--catctcctgatgaactgcagcttc 17247449  T
Q  228 tggtga 233  Q
    ||||||    
T  17247450 tggtga 17247455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Original strand, 6641674 - 6641941
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||| ||||| ||||||    
T  6641674 agcagagacataaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagtatcaaatgccttcaaa 6641773  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||  || |||  |||| |||||||| |   |||||| |||||| ||  |  |||||||||| ||||||| || |||||||||||| | |  || ||    
T  6641774 tccttttgaattagccgttgtttcactcttctgatcttctacaatgc-taggcatgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaaatctctcatct 6641872  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
     |||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||    
T  6641873 tctgatgaaattcagcttctggtgatattgcttctgatgaggtgcttctgatgaacttgcttatgatga 6641941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 200
Target Start/End: Original strand, 29121362 - 29121551
Alignment:
Q  11 cagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatc 110  Q
    |||||||| | || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||||||    
T  29121362 cagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcatccagtgccttcaaatc 29121461  T
Q  111 ctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagtt 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||  ||| ||||| || |||||||| ||||||  ||||||| |||||||    
T  29121462 ctttcaaaatagtcgttgcttcactttttcagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacagcttttgaagccttaagtt 29121551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 116 - 255
Target Start/End: Original strand, 23123528 - 23123669
Alignment:
Q  116 aaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatg 215  Q
    ||||||||  ||||||||||||  ||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  23123528 aaaatagtcattgcttcactctttcagtcttctacaatacttagacgagattaaattcattgaacaatctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatg 23123627  T
Q  216 aacttcagcttctggtgacct--tgcttctaatgagatgctt 255  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||    
T  23123628 aacttcagcttctggtgatcttctgcttctgatgagatgctt 23123669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 267
Target Start/End: Original strand, 15139283 - 15139478
Alignment:
Q  75 gctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatcca 174  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||| | | ||  || |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15139283 gctcttcaaaaagcaagcatccaatgccttcaacttcatttgaattagtcgttgcttcactctcctggtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatcca 15139382  T
Q  175 ttgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaac-ttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttg 267  Q
    ||||||| || ||||| |||||||| |  || || ||||||||| || |||||||||||| |||  |||||| | ||| ||||| | |||||||||    
T  15139383 ttgaacaacctttgaatctttaagtctatcatcttctgatgaacttttagcttctggtgatcttcagcttctgacgaggtgcttctaatgaacttg 15139478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 6517475 - 6517697
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||  | |||||  |||||||| ||    
T  6517475 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatctcatgctttccaa 6517574  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||| | |||||||||||||||  ||| ||||| || ||||| || || | |  |||||||||||||  ||||| ||    
T  6517575 tccttccaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatcctttaaataacttttgaagctttaag--ttgcatct 6517672  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    ||||||||||| || ||||||||||    
T  6517673 cctgatgaactacaacttctggtga 6517697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Original strand, 23750512 - 23750732
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttca-aagagcaggcatccaatgctttcaa 107  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||| ||   |||| ||||| || | || ||||| ||||| || ||    
T  23750512 agcagagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttg---acgcacttcataaaaacaagcatcaaatgcctttaa 23750608  T
Q  108 atcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagccctt-gaagctttaagttttgcac 206  Q
     | | ||  ||  ||| |||||||||||||||  |||||||||| |||| |  || |||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||||     
T  23750609 cttcatttgaagcagtcgttgcttcactctcctggtcttctgcagtgct-aggcgtgattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcat 23750707  T
Q  207 ctcctgatgaacttcagcttctggt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  23750708 ctcctgatgaacttcagcttctggt 23750732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 3105540 - 3105311
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||  ||||  |  |||||||| ||||  ||    
T  3105540 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgctctttgaagaataaccatccaatacttttcaa 3105441  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||  ||||    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |  ||||||  |||||||||||||  ||||| ||    
T  3105440 tcctttcaaaatagccgttggaatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatct 3105344  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgctt 241  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  3105343 cctgatgaactgcagcttctgatgaacttgctt 3105311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 163
Target Start/End: Original strand, 8105646 - 8105782
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaag-agcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgt 126  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| ||  ||||| |||||||||||||   || | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  8105646 tagtggaggtagtggttgtacatttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaaatagccgt 8105745  T
Q  127 tgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacga 163  Q
    ||||||| | | ||||||||||||||| |||| ||||    
T  8105746 tgcttcaattttccagtcttctgcaatccttagacga 8105782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 29 - 176
Target Start/End: Original strand, 16940026 - 16940172
Alignment:
Q  29 agtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttg 128  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||| |  ||||  | |||| |||||| ||  ||||||||||||||||| ||||    
T  16940026 agtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctccttgaagaataagcattcaatgcctttcaatcctttcaaaatagtcgttg 16940125  T
Q  129 cttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccatt 176  Q
    ||  ||| | ||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||    
T  16940126 ctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccatt 16940172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 154
Target Start/End: Original strand, 11915709 - 11915835
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||  ||||||||| |||| ||| |||||| || |  ||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||| ||  ||||||| |||    
T  11915709 tagtggaggcggtggttgtacactttgtacaattgtccttttccaacgctcttcaaagaataagcatccaatgccttcaaatccatttgaaatagtcgtt 11915808  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatg 154  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||    
T  11915809 gcttcactcttttagtcttctgcaatg 11915835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 25651206 - 25651084
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| ||  |||||| ||||||||||||  ||||  | |||| |||||| ||||||||||| ||||||||  |||    
T  25651206 tagtggaggtagtggttgtacactttgtacaaacgtactacgtcaacgctctttgaagaataagcattcaatgccttcaaatccttccaaaatagccgtt 25651107  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgc 150  Q
    |||||||| | | ||||||||||    
T  25651106 gcttcacttttcaagtcttctgc 25651084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 118
Target Start/End: Original strand, 16853493 - 16853602
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||||||||||||||| ||||| || |  |||||| |||||||||||||  | || || ||||||||||||||||||    
T  16853493 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacagatgtactttgtcaacgctctttgaggaacaagcatccaatgctttcaaa 16853592  T
Q  109 tcctttcaaa 118  Q
    ||| ||||||    
T  16853593 tcccttcaaa 16853602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 56533164 - 56533018
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaag-agcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgt 126  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| ||  ||||| |||||||||||||   || | ||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  56533164 tagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaaacatctaatgcattcaaatcctttcaaaatagccgt 56533065  T
Q  127 tgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatcc 173  Q
    ||||||| | |  |||||||||||||| |||| ||||| || |||||    
T  56533064 tgcttcattttttcagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcc 56533018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17398795 - 17398583
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||  | ||||||||||            
T  17398795 agcagagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg-------- 17398704  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
     |||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||||||||||  |||  |||| || ||||| |  |||| |  |||||||||||||  ||||| ||    
T  17398703 -cctttcaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaat-tttaggcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 17398608  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    ||||||||||  |||||||||||||    
T  17398607 cctgatgaaccgcagcttctggtga 17398583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 103 - 233
Target Start/End: Original strand, 55731863 - 55731991
Alignment:
Q  103 ttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttca-ctctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttt 201  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || | |||| |||||||| ||||||  ||| ||||| || |||||||| |||| |  |||||| ||||||  |    
T  55731863 ttcaaatcctttcaaaatagtcgttgatttacctct-ccagtcttttgcaattgttagacgagtttgaatccattaaacaacttttgaagttttaag--t 55731959  T
Q  202 tgcacctcctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  55731960 tgcatctcctgatgaactgcagcttccggtga 55731991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Original strand, 22190836 - 22190907
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctctt 80  Q
    |||||||||| | || || ||||||| |||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  22190836 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 22190907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Original strand, 38513868 - 38513939
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctctt 80  Q
    |||||||||| | || || ||||| | |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  38513868 agcagagacaaaaacagagtagtgaaagtagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctctt 38513939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 15475245 - 15475172
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgc 101  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||  | ||| | |||||||||||    
T  15475245 tagtggaagtattggttgtacacttcgtataaacgtactatgtcaacgctctttgaggagtaagcatccaatgc 15475172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 3499746 - 3499704
Alignment:
Q  36 gtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctc 78  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  3499746 gtagtggttgtacacttcgtacaaatgtactatgtcaacgctc 3499704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 225
Target Start/End: Original strand, 17540404 - 17540598
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||| |||||| || | ||||| |||| ||| ||  ||||||||| ||  |||| |||| |   || ||||||||    
T  17540404 tagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacactctccaacgaataggcatccactggcttcacatccatctgaattagttgtt 17540503  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagct 225  Q
    |||||| |||  ||||||| |||||||  ||  ||||||||||||  ||||||||||  |||||||| || | || || || ||||||| ||||||||    
T  17540504 gcttcattctttcagtcttttgcaatg-ataggcgagattaaatcatttgaacagcc--tgaagcttcaattctttcaacttctgatgatcttcagct 17540598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 109
Target Start/End: Original strand, 40860657 - 40860758
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgc-tttcaa 107  Q
    |||||||||| | || || ||||||| |||||||||||| || || || ||  |||||||||||||||||||  ||||  | ||||||||||| ||||||    
T  40860657 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacatcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcatttcaa 40860756  T
Q  108 at 109  Q
    ||    
T  40860757 at 40860758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 39419855 - 39419787
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgct 77  Q
    |||||||||| | || || || |||| |||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  39419855 agcagagacaaaaacagagtaatggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgct 39419787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 53)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 9 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 33256436 - 33256164
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  33256436 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcccttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 33256337  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||    
T  33256336 tccttttaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 33256237  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatgatgtc 281  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  33256236 cctgttgaactttagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgataatgtc 33256164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 9 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 33276608 - 33276336
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  33276608 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcccttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 33276509  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||    
T  33276508 tccttttaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 33276409  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatgatgtc 281  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  33276408 cctggtgaactttagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgataatgtc 33276336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Original strand, 19717519 - 19717787
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||    
T  19717519 agcagagacacaaactgatttgtggagttagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccgatgccttcaaa 19717618  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||    
T  19717619 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcctctgcaatgcttcgacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 19717718  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    ||  |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  19717719 ccatatgaactttagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttatgatga 19717787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Original strand, 22153852 - 22154122
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  22153852 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaatcatccaatgctttcaaa 22153951  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  22153952 tcctttcaaattagttgttgcttcactattctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatct 22154051  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgacct--tgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| | | ||||||| |||| ||||    
T  22154052 cctgatgaacttcagcttctggtgatcttctacttcttatgagatgcttctaaggaacttgcttctaatga 22154122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Original strand, 48704199 - 48704467
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | | ||| ||||||||  | |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||| ||| ||||||    
T  48704199 agcagagacataaattgagtagtggagacattggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgttcttcaaagaacaagcatccagtgccttcaaa 48704298  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||    
T  48704299 tcctttcaaaatagttgttgtttcactcttccagtcttctgcattgcttaaacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 48704398  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
     ||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  48704399 tctgatgaactttagcttctggtgatctagcttctgatgagatgcttctgatgaactagcttctgatga 48704467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 22600267 - 22599993
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| || ||||||||||| ||||||    
T  22600267 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 22600168  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  22600167 tcctttcaaaatagtcgttgttttactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatct 22600068  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatgatgtc 281  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  22600067 cctgatgaactagagcttctggtgatctttagcttctgatgagatgcttctgataaacttgcttctgatgatgtc 22599993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Original strand, 12284418 - 12284657
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  12284418 agcagagacacaaactgattagtggagatagtgtttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 12284517  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |  ||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||    
T  12284518 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatct 12284617  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 248  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  12284618 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttgcttctgatga 12284657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20954558 - 20954288
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||    
T  20954558 agcagagaaacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttggtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcctccaatgctttcaaa 20954459  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    |||||||||||| |   |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||    
T  20954458 tcctttcaaaatggccattgcttcactcttcctgtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 20954359  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  20954358 cctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgaatctgatga 20954288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 28492489 - 28492269
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  28492489 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 28492390  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||    
T  28492389 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgatattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 28492290  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctg 229  Q
    ||||||||||| || ||||||    
T  28492289 cctgatgaactacaacttctg 28492269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 262
Target Start/End: Original strand, 1577862 - 1578115
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||| |||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  1577862 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttagtacaattatactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 1577961  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||    
T  1577962 ttctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatctattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatct 1578061  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatga 262  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||| | |||||| || ||||||    
T  1578062 cctgataaactttagcttcttgtgatcttgcttctgacgagatgtttctgatga 1578115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Original strand, 10757416 - 10757656
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  10757416 agcagagacacaaactgagtagtgaagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaatcatccaatgctttcaaa 10757515  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcc-cttgaagctttaagttttgcacc 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |   | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||| |    
T  10757516 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctgattttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatc 10757615  T
Q  208 tcctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 248  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||    
T  10757616 tcctgatgaacttcagcttttgatgatcttgcttctgatga 10757656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 35401823 - 35402072
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||  |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  35401823 tagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgtt 35401922  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||||||| | ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| || |||||||    |||||||    
T  35401923 gcttcacttttccagtcttctgtattgtttaaacgagattaaatccattgaacagtctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatga--gacagcttc 35402020  T
Q  228 tggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    |||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  35402021 tggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 35402072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22201821 - 22201601
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||    
T  22201821 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcatagaacaagcatccaatgccttcaaa 22201722  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||  ||||||||| ||||| ||    
T  22201721 tcctttcaaaatagttgttgctttactttttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatgcattgagcagcctttgtcgctttaagtcttgcatct 22201622  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctg 229  Q
    |||||||| ||| ||||||||    
T  22201621 cctgatgagctttagcttctg 22201601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Original strand, 38282562 - 38282831
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| || |||| |||||| || |||    
T  38282562 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgta-acttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcattcaatgcctttaaa 38282660  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||    
T  38282661 tcctttcaaaatacccgttgcttcactcttccagtcttctgcgatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 38282760  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    |||||||||||  ||||| |||||| |||  || ||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  38282761 cctgatgaactagagcttttggtgatctttagcatctgatgagatgcttctgataaacttgcttctgatga 38282831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 219
Target Start/End: Original strand, 1900340 - 1900550
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||| |||||||||||||  |||| || |||| |||||| || |||    
T  1900340 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcttacaactgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcattcaatgcctttaaa 1900439  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||    
T  1900440 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaataacctttgaagctttaagtcttgcatct 1900539  T
Q  209 cctgatgaact 219  Q
    |||||||||||    
T  1900540 cctgatgaact 1900550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Original strand, 2268526 - 2268792
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||  | || || |||| |||||| ||||||    
T  2268526 agcagagacaaaaacagagtagtcgaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgacgaacaagcattcaatgccttcaaa 2268625  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    || ||||||||||||||   ||| ||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||| ||    
T  2268626 tcatttcaaaatagttg---cttaactcttccagtcttctacaatgattagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagccttaagtcttgcatct 2268722  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga-ccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    ||| |||||||| ||||||| ||||   |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  2268723 cctaatgaactttagcttctagtgattgttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 2268792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22427423 - 22427220
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||    
T  22427423 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcttttttaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgtt 22427324  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||  | ||||| |||||||||||||  ||||||    
T  22427323 gcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatctattgaacagtctttgaagcttta--tgttgcatctcctgatgaactggagcttc 22427226  T
Q  228 tggtga 233  Q
    ||||||    
T  22427225 tggtga 22427220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 248
Target Start/End: Original strand, 2267103 - 2267321
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| || ||||||||||  |||| ||  |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||    
T  2267103 tagtggaggtagtggttgtacacttcatacaattgcactttgacaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaattctttcaaactagttgtt 2267202  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||  | ||||| |||||||||||||  ||||||    
T  2267203 gcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttta--tgttgcatctcctgatgaactgtagcttc 2267300  T
Q  228 tggtgaccttgcttctaatga 248  Q
    || ||| ||||||||||||||    
T  2267301 tgatgaacttgcttctaatga 2267321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 32786003 - 32785799
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||    
T  32786003 tagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttttaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgtt 32785904  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| || ||||    
T  32785903 gcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcca-tgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcatgatgaactacaacttc 32785805  T
Q  228 tggtga 233  Q
    | ||||    
T  32785804 tagtga 32785799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 39201058 - 39200855
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| || ||||||||||  |||||||||||||||| |||  |||    
T  39201058 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgtcttcaaatcctttcaaactagccgtt 39200959  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||  | ||||| ||||| ||||||| ||||||     
T  39200958 gcttcactctttcagtcttctgcaatgcttacatgagattaaatccattgaacagcttttgaagcttta--tgttgcatctcctaatgaactgcagcttt 39200861  T
Q  228 tggtga 233  Q
    ||||||    
T  39200860 tggtga 39200855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 216
Target Start/End: Original strand, 36134185 - 36134391
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| || ||||||||||||| ||||    
T  36134185 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgctt-caaa 36134283  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| | ||    
T  36134284 tcctttcaaaatagttgttgctccacttttccagtcttctgcattgtttagatgagattaaatccattgaacaacctttgaaactttaagtcttgtatct 36134383  T
Q  209 cctgatga 216  Q
     |||||||    
T  36134384 tctgatga 36134391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 32 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 23036589 - 23036340
Alignment:
Q  32 ggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgctt 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||  ||||||||  |||| || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23036589 ggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgttctttgttgacgctctttgaagaacaagcatccaatgtcttcaaatcctttcaaaatagttgttgttt 23036490  T
Q  132 cactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctggt 231  Q
    |||| |   ||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| || |||||||    |||||||||||    
T  23036489 cacttttttagtcttctgcattatttagacgagattaaatccattgaatagcctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatga--gacagcttctggt 23036392  T
Q  232 gacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatgatgtc 281  Q
    || |||  |||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  23036391 gatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaaattgcttctgatgatgtc 23036340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26702214 - 26701990
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||| |||| | ||||||||| |||||     
T  26702214 agcagagacacatactaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcatcactcttcaaaaagcaagaatccaatgccttcaac 26702115  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    | | ||  || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||| |  || ||    
T  26702114 ttcatttgaattaattgttgcttcactctcctggtcttctgcaatgctcaaacgagattgaatccatataacagcctttgaagctttaagtctcccatct 26702015  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
     ||||||||||| ||||||||||||    
T  26702014 tctgatgaactttagcttctggtga 26701990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 248
Target Start/End: Original strand, 30893090 - 30893327
Alignment:
Q  12 agagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcc 111  Q
    ||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||| | |||||||||||||    
T  30893090 agagacacaaacttagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcagcgctattcaaagaacaagcatctagtgctttcaaatcc 30893189  T
Q  112 tttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcc-cttgaagctttaagttttgcacctcc 210  Q
    |||||||||||   |||||||||||  |   |||| ||||||||||  |||||||| |||||| |||||| ||  ||||| |||||||| ||||| ||||    
T  30893190 tttcaaaatagcctttgcttcactcctctgatcttttgcaatgcttggacgagattgaatccaatgaacaaccttttgaaactttaagtcttgcatctcc 30893289  T
Q  211 tgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 248  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  30893290 tgatgaactttagcttttggtgatcttgcttctgatga 30893327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 29215792 - 29216014
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||| | |||||||  |||| || ||||||||||| ||||||    
T  29215792 agcagagacaaaaacagagtagtggagctagtgattgtacacttcgtacaattgtactttgttatcgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 29215891  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| | | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||  ||||| ||    
T  29215892 tcctttcaaactagccgttgcttcacttttctagtcttttgcaatgcttagacgagattaaatccattaaacaacctttgaagctttaag--ttgcatct 29215989  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    ||||||||| | || ||||||||||    
T  29215990 cctgatgaattgcaacttctggtga 29216014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22464875 - 22464671
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||  |||| || ||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||    
T  22464875 tagtggaggtagtggatgtacacttcgtacacttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcatttcaaattagtcgtt 22464776  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcc-cttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagctt 226  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||  | || || |||||||||||||  ||| |    
T  22464775 gcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagatgagattaaatccgttgaacaaccttttgaagcttta--tgttacatctcctgatgaactgtagcat 22464678  T
Q  227 ctggtga 233  Q
    |||||||    
T  22464677 ctggtga 22464671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16235362 - 16235193
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||   ||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  16235362 tagtggaggtagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctttggagaacaagcattcaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgtt 16235263  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaa 197  Q
    |||||||| | ||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||    
T  16235262 gcttcacttttccagtcttctgcattgtttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagttttaa 16235193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 25448651 - 25448460
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| |||||||||||||  ||||  | ||||||||||| ||||||    
T  25448651 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaa 25448552  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagtt 200  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||  ||| ||||| || ||||| || ||||||  |||||||||||||||    
T  25448551 tcctttcaaaatagtcgctgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagtt 25448460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Original strand, 2834704 - 2834907
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||| ||| ||||| |||||||| ||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||    
T  2834704 tagtggaggcagtggttgtacaattcgtacaatcgtactttgtcaacgttctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagccgtt 2834803  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||||||| |  ||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||  ||||| |||| |||||||| |||||||    
T  2834804 gcttcactttttcagtcttcaacaatgcttagacgagattgaatccattgaacaactttggaagctttaag--ttgcatctcccgatgaactgcagcttc 2834901  T
Q  228 tggtga 233  Q
    ||||||    
T  2834902 tggtga 2834907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 35040161 - 35040383
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| |||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||    
T  35040161 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagatcaagcatccaatgctttcaaa 35040260  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| | | |||||||||||||  ||| ||||| ||  ||||||| |||| |  ||||||| |||||  ||||| |     
T  35040261 tcctttcaaaatagtcgttgctttacttttctagtcttctgcaatctttagacgaggttggatccattaaacaacttttgaagccttaag--ttgcatcc 35040358  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    | ||||||| | |||||||||||||    
T  35040359 catgatgaattgcagcttctggtga 35040383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 262
Target Start/End: Original strand, 7309836 - 7310068
Alignment:
Q  31 tggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgct 130  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||| || || || |  ||||||||||| ||||||||| | ||||||    ||||||    
T  7309836 tggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactacgttaacgcttttgaa-gaacgagcatccaatgccttcaaatccctacaaaatgaccgttgct 7309934  T
Q  131 tcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctgg 230  Q
    |||||||   ||||||||||||| |||| |||| | | |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| |||    
T  7309935 tcactcttatagtcttctgcaatccttagacgacactgaatccattgaacagcttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgagctttagcttatgg 7310034  T
Q  231 tgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatga 262  Q
    ||| |||  |||||| |||||||| || ||||||    
T  7310035 tgatcttcagcttctgatgagatgtttctgatga 7310068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 21191947 - 21191805
Alignment:
Q  12 agagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcc 111  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  21191947 agagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 21191848  T
Q  112 tttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatg 154  Q
    |||  || ||| |||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  21191847 ttttgaattagctgttgcttcactcttctggtcttctgcaatg 21191805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 17025029 - 17024811
Alignment:
Q  29 agtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttg 128  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  | | ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||  || |||| ||||    
T  17025029 agtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtcatttttcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttgaattagtcgttg 17024930  T
Q  129 cttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttct 228  Q
    |||||||||    ||||| ||||||| |||  || |||||||||| |||||||| | |||||||||||| | |  || || ||||||| |||||||||||    
T  17024929 cttcactcttatggtcttttgcaatg-ttatgcgtgattaaatcctttgaacagacattgaagctttaattctctcagcttctgatgatcttcagcttct 17024831  T
Q  229 ggtgaccttgcttctaatga 248  Q
    |||||  |||||||| ||||    
T  17024830 ggtgatgttgcttctgatga 17024811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 12613899 - 12613713
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  12613899 agcagagacacaaacagagtagtgaaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaacgctcttcaaagaacaagcaaccaatgctttcaaa 12613800  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaa 197  Q
    | ||||  || |||  ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||  || |||||||||  ||||||| || ||||||||||||    
T  12613799 t-cttttgaattagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcttttgaacaacctttgaagctttaa 12613713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2327506 - 2327302
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaag-agcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgt 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| |||||| ||||||   || | || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  2327506 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcgaatcctttcaaaatagtttt 2327407  T
Q  127 tgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagctt 226  Q
    ||||||||| |  ||||| ||||||||  ||| ||||| || |||| ||| |||| |  |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  2327406 tgcttcactttttcagtcatctgcaatctttagacgagtttgaatctattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcagctt 2327309  T
Q  227 ctggtga 233  Q
    |||||||    
T  2327308 ctggtga 2327302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 9 - 199
Target Start/End: Original strand, 21028788 - 21028978
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| ||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||     
T  21028788 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggctgtacacttcatacaattgtactttgtcagcgctcttcaaaaagcaagcatccaatgccttcaac 21028887  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagt 199  Q
    | | ||  || |||| |||||||||||||    ||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||| |   |||||||||||||    
T  21028888 ttcatttgaattagtcgttgcttcactcttatggtcttctgcaatgcttggatgagattaaattcattgaacaacatatgaagctttaagt 21028978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Original strand, 30572211 - 30572413
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||  |  |||||||||||||  ||||||||||||||||  |||    
T  30572211 tagtggagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctcttctaagaataaacatccaatgcttttcaatcctttcaaaatagccgtt 30572310  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||  ||| | ||||||||||||||| || | ||||| || ||||| |  ||||||  |||||||||||||  ||| | ||||||||||||| || ||||    
T  30572311 gctatacttttccagtcttctgcaat-ctcagacgagtttgaatccttgaaacagctattgaagctttaag--ttgtatctcctgatgaactgcaacttc 30572407  T
Q  228 tggtga 233  Q
    ||||||    
T  30572408 tggtga 30572413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 48570316 - 48570095
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||  | ||||||||||| ||  ||    
T  48570316 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttttaa 48570217  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||| ||||||||| |||| |  ||| | | ||||||||||||| |||| ||||| || ||||| || ||||||  ||||| |||||||  ||||| ||    
T  48570216 tccttccaaaatagtcgttgttatacttttctagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaaactttaag--ttgcatct 48570120  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    ||||||||| | |||||||||||||    
T  48570119 cctgatgaattacagcttctggtga 48570095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 21702809 - 21703030
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||  | |||| ||||||  |  ||    
T  21702809 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcattcaatgcccttcaa 21702908  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||  ||||||  ||| | | ||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |  ||||    |||||||||||||  ||||| ||    
T  21702909 tcctttcaaaatagccgttgctatacttttcaagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacaaattttgaagctttaag--ttgcatct 21703005  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  21703006 cctgatgaactgcagcttctggtga 21703030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 44821630 - 44821408
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||| |||| |||||| |||||||| ||  ||||||||||||| |||||  ||||  | |||| ||| || ||||||    
T  44821630 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtagttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataagcatacaaagccttcaaa 44821531  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||| |  ||||||||| |||  |||| ||||| || ||||| || |||| |  |||||||||||||  ||||| ||    
T  44821530 tccttccaaaatagtcgttgctatactttttcagtcttctacaaaccttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 44821433  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||    
T  44821432 cctgatgaactacagcttatggtga 44821408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 14263517 - 14263362
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||  || || || ||||||||||  | || || | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  14263517 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtgctttgccaacgctctttgaggaacaagtatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgtt 14263418  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatcc-attgaacag 182  Q
    | ||  ||   ||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||| |||||||||    
T  14263417 gttttgcttctccagtcttctgcaatccttagacgggatttaatccaattgaacag 14263362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 46088984 - 46089197
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||  | ||||||||||            
T  46088984 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg-------- 46089075  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
     |||||||||||||| |||||   ||| | |||||||||||||||  |||  |||| || ||||| |  ||||||  |||||||||||||  ||||| ||    
T  46089076 -cctttcaaaatagtcgttgccatacttttccagtcttctgcaatttttaggcgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatct 46089172  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    | ||||||||| |||||||||||||    
T  46089173 catgatgaactgcagcttctggtga 46089197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Original strand, 37642243 - 37642314
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctctt 80  Q
    |||||||||| | || || ||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  37642243 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtataaacgtactatgtcaacgctctt 37642314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 7745156 - 7745066
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaa 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||| |||||||||||||  |||   | ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  7745156 tagtggaggtagtggttgtacactttgtataaacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatcaaatgcattcaaatcctttcaaa 7745066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 101
Target Start/End: Original strand, 42284642 - 42284715
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgc 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||  | |||||||||||    
T  42284642 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaaaaagcatccaatgc 42284715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 233
Target Start/End: Original strand, 10251102 - 10251193
Alignment:
Q  139 ccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| || |||| |  |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  10251102 ccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagctttaagtt--gcatctcctgatgaactgcagcttctggtga 10251193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 101
Target Start/End: Original strand, 21984610 - 21984683
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgc 101  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||  | |||||||||||    
T  21984610 tagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 21984683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 21121149 - 21121057
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgc 101  Q
    |||||||||| | || || ||||||| |||||||||||| || ||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||  | |||||||||||    
T  21121149 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacgtcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 21121057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 21204989 - 21204937
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctctt 80  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  21204989 tagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 21204937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 214 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21191757 - 21191694
Alignment:
Q  214 tgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||| |||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  21191757 tgaacttcagcttcttgtgatattgtttctgatgagatgcttcagatgaacttgcttctgatga 21191694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 210 - 248
Target Start/End: Original strand, 12284651 - 12284689
Alignment:
Q  210 ctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 248  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  12284651 ctgatgaacttcagcttctggtgatcttgcttctgatga 12284689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 18896663 - 18896577
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatccttt 114  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| || |  ||||| ||| ||||||  | ||||||||||| ||||||| ||||    
T  18896663 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaactgtccttttccaacgttctccaaagactaagcatccaatgccttcaaattcttt 18896577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 21135245 - 21135153
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgc 101  Q
    |||||||||| | || || |||||||  ||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| |||||  ||||  | |||||||||||    
T  21135245 agcagagacaaaaacagagtagtggatttagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataagcatccaatgc 21135153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 61)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 10009860 - 10009591
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  10009860 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaattgtactatgtcaacgttcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 10009761  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactc-tcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  10009760 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcctcttggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcccttgaagctttaagtcttgcatc 10009661  T
Q  208 tcctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  10009660 tcctgatgaacttcagcttctggtgatctttcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 10009591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20568860 - 20568600
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  20568860 agcagatacacaaactgagtagtggggatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 20568761  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||    
T  20568760 tcctttcaaaattgttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccatggaacagcctttaaagctttaagtcttgcatct 20568661  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttg--cttctaatgagatgcttttgatgaacttg 267  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  20568660 cctgatgaactacagcttctggtgatcttgaacttcttatgagatgcttctgatgaacttg 20568600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 22188212 - 22187942
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  22188212 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattatactttgttaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 22188113  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |    
T  22188112 tctattcaaaatagttgttgcttcactctttcagtcttctgcaatacttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatgt 22188013  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22188012 cctgatgaacttcaacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 22187942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Original strand, 25829124 - 25829363
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  25829124 agcagagacacaaaatgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 25829223  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||    
T  25829224 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttgaagctctaagtcttgcatct 25829323  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 248  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  25829324 cctgatgaactttagcttctggtgatcttgcttctgatga 25829363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Original strand, 23234997 - 23235267
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||    
T  23234997 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactcttcaaagaataagcatccaatgccttcaaa 23235096  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    | ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  23235097 ttctttcaaaatagtcgttgctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatct 23235196  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    | |||||||||  ||||||||||||  ||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  23235197 catgatgaactagagcttctggtgattttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 23235267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Original strand, 30666979 - 30667249
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  30666979 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagatcaagcatccaatgccttcaaa 30667078  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||| ||    
T  30667079 tcctttcaaaatagtcgttgcttcattcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaattcttgcatct 30667178  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    ||||||||||| || |||||| |   |||  |||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  30667179 cctgatgaactacaacttctgatattcttcagcttctgatgagatgcttctgacgaacttgcttctgatga 30667249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 262
Target Start/End: Original strand, 19540406 - 19540659
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||    
T  19540406 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaataccttcaaa 19540505  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
     |||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||    
T  19540506 acctttcgaaatagccgttgcttcactctcctagtcttctgcaatgcttagatgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 19540605  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatga 262  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  19540606 catgatgaacttcagcttctggtgatcttgcttctgatgaggtgcttctgatga 19540659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 25037369 - 25037099
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  25037369 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgaacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaa 25037270  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    |||||||||| |||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||    
T  25037269 tcctttcaaattagtcgttacatcactcttccagtcttctgcaatgcttcgacaagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 25037170  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25037169 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 25037099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 25041476 - 25041206
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  25041476 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgaacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaa 25041377  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    |||||||||| |||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||    
T  25041376 tcctttcaaattagtcgttacatcactcttccagtcttctgcaatgcttcgacaagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 25041277  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25041276 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 25041206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Original strand, 24576025 - 24576294
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| || ||  || ||||||| || |||    
T  24576025 agcagagacacaaactaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaactctcttcaacgaacaaacaaccaatgcctttaaa 24576124  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgaga-ttaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacc 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  24576125 tcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagatgagatttaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtattgcatc 24576224  T
Q  208 tcctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||||||| | |||| |||||| ||||||||| | |||||||||    
T  24576225 tcctaatgaactttagcttctggtgatcttgcttatgatgatatgcttctgatgaactagcttctgatga 24576294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 9015478 - 9015211
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  9015478 agcagagatacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac--cgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgctttcaaa 9015381  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||    
T  9015380 tcctttcaaaatagttgttgtttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 9015281  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgacct--tgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    |||||||||||| || |||||| || ||  ||||||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||    
T  9015280 cctgatgaactttagtttctgg-gatcttctgcttctgatgagttgtttctgatgaacttgcttctgatga 9015211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21537358 - 21537088
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||    
T  21537358 agcaaagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatccaatgcctccaaa 21537259  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||    
T  21537258 acctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgtttaaacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 21537159  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||   ||||| ||||| ||||| || ||| |||| |||||||||    
T  21537158 cctgatgaacttcatcttctagtgatctttaacttctgatgaggtgcttctggtgagcttgcttctgatga 21537088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 24850776 - 24850508
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| | |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  24850776 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttgaaa 24850677  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcc-cttgaagctttaagttttgcacc 207  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |  |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||| |    
T  24850676 tcctttcaaaatattcgttgcttcactcttctggtcttcagcaatgcgtagacgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatc 24850577  T
Q  208 tcctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctga 274  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  24850576 tcctgatgtacttcagcatctggtgatctttagcttctgatgaggtgcttctgatgaacttgcttctga 24850508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13964088 - 13963864
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  13964088 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 13963989  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||| ||    
T  13963988 ttctttcaaaatagtcgttgcttcactctttcagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaaatcttgcatct 13963889  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
     ||||||||||  ||||||| ||||    
T  13963888 actgatgaactagagcttctagtga 13963864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 24377091 - 24377315
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||    
T  24377091 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctctcaaa 24377190  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcc-cttgaagctttaagttttgcacc 207  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||| |    
T  24377191 acctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatc 24377289  T
Q  208 tcctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  24377290 tcttgatgaacttcagcttctggtga 24377315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 49 - 277
Target Start/End: Original strand, 22260436 - 22260664
Alignment:
Q  49 acttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttct 148  Q
    ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| | | ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  22260436 acttcttacaattgtactatgtcaaagctcttcaaagaacaagcatccagttccttcaaatccttccaaaatatttgttgcttcacttttccagtcttct 22260535  T
Q  149 gcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 248  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||| | |||||||||| ||| ||||| ||||    
T  22260536 gcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgacgctttaagtcttgcatctcctgatgagctttaacttctggtgatcttccttctgatga 22260635  T
Q  249 gatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22260636 gatgcttttgatgaacttgcttctgatga 22260664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18377016 - 18376792
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  18377016 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 18376917  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| |   | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  || ||    
T  18376916 tcctttcaaaatagtagttgattcactattaaaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtctctcatct 18376817  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
     |  |||||||||| ||||||||||    
T  18376816 tcaaatgaacttcaacttctggtga 18376792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 233
Target Start/End: Original strand, 30621210 - 30621430
Alignment:
Q  13 gagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcct 112  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||    
T  30621210 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagatcaaacatccaatgccttcaaatcct 30621309  T
Q  113 ttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctg 212  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| | ||||| ||||||    
T  30621310 ttcaaaatagtcgctgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttacacgagattaaatccattgaacaacctttgaacctttaattcttgcatctcctg 30621409  T
Q  213 atgaacttcagcttctggtga 233  Q
    ||| ||| || ||||| ||||    
T  30621410 atgcactacaacttctagtga 30621430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 233
Target Start/End: Original strand, 30623831 - 30624051
Alignment:
Q  13 gagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcct 112  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||    
T  30623831 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagatcaaacatccaatgccttcaaatcct 30623930  T
Q  113 ttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctg 212  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| | ||||| ||||||    
T  30623931 ttcaaaatagtcgctgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttacacgagattaaatccattgaacaacctttgaacctttaattcttgcatctcctg 30624030  T
Q  213 atgaacttcagcttctggtga 233  Q
    ||| ||| || ||||| ||||    
T  30624031 atgcactacaacttctagtga 30624051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Original strand, 40782467 - 40782729
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  40782467 agcagagacacaaactaagtattggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaa 40782566  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |  ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||       |  |||| ||||| ||||| ||    
T  40782567 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaa------atttagctctaagtcttgcatct 40782660  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||| |||||| || |||||||| |||||||||    
T  40782661 cctgatgaaatttagcttctggtgatcttgcttctgatgaaatgcttctggtgaacttgcttctgatga 40782729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 9 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 28140729 - 28140509
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||| | ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  28140729 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtgatggtacactttgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgttttcaaa 28140630  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||      |||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||| ||    
T  28140629 tcctttcaaaatagttgttgcttcactccaatgatcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagttttaagtcttgcatct 28140530  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctg 229  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  28140529 cccgatgaacttcagcttctg 28140509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 22317583 - 22317808
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| || ||||||||||| || |||    
T  22317583 agcagagataaaaactgaatagtggaggtagtggttgtatacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaa 22317682  T
Q  109 tcctttc-aaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacc 207  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||| |    
T  22317683 tcctttcaaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttatgcaatgcttagatgagattaaatccaatgaaaagcctttgaagctttaagtcttgcatc 22317782  T
Q  208 tcctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    || ||||||| |  ||||||||||||    
T  22317783 tcttgatgaaatagagcttctggtga 22317808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 38781408 - 38781657
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| ||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38781408 tagtggatgtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaatcattcaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgtt 38781507  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||||||| | |||||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |  |||||||    || ||||    
T  38781508 gcttcacttttccagtcttctacattgtttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatcctctgatga--gacatcttc 38781605  T
Q  228 tggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    |||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  38781606 tggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 38781657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 97 - 273
Target Start/End: Original strand, 7609039 - 7609216
Alignment:
Q  97 aatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactc-tcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagcttt 195  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||   ||||| || |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7609039 aatgccttcaaatcctttcaaaataggtgttgcttcactcctcttggtcttttgtaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcccttgaagcttt 7609138  T
Q  196 aagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctg 273  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  7609139 aagtcttgcatctcctgatgaactttagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctg 7609216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 36 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20152118 - 20151922
Alignment:
Q  36 gtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcact 135  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||   |||||||||||    
T  20152118 gtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactaaccgttgcttcact 20152019  T
Q  136 ctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
     | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| | ||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  20152018 tttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaa-tgttgcatctcctgatgagctgcagcttctggtga 20151922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 9 - 199
Target Start/End: Original strand, 24779333 - 24779523
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||| |||||||||||    
T  24779333 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttatacacttcatacaattgtactatgtcaacactcttcaaagaacaaacatccgatgctttcaaa 24779432  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagt 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |  ||||| | ||||||||  |||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  24779433 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcctctggtctttttcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagcttcaagt 24779523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 41121829 - 41121577
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| | |||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||   ||||||||| ||||||    
T  41121829 agcagagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacatttcgcacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagagcaataatccaatgccttcaaa 41121730  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||  || ||||  |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||  || |||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |  || ||    
T  41121729 tccttttgaattagtctttgcttcactcatccaatcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcctttgaacagcctttgaagctttaattctcacagct 41121631  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatga 262  Q
     ||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  41121630 tctgatgatcttcagcttctggtgatgttgcttctgatgaggtgcatctgatga 41121577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6574215 - 6574010
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataatt-gtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgt 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||  |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||    
T  6574215 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgt 6574116  T
Q  127 tgcttcactctcccagtcttctgcaatgc-ttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagct 225  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||  | ||||| || |||||||||| || ||    
T  6574115 tgcttcacttttccagtcttctgcaatgcattagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagcttta--tgttgcatcttctgatgaactgcaact 6574018  T
Q  226 tctggtga 233  Q
    ||| ||||    
T  6574017 tctagtga 6574010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 39037752 - 39037562
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||     
T  39037752 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatctaatgccttcaac 39037653  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagt 199  Q
    | | ||  || |||  ||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| || |||||| |||||||    
T  39037652 ttcatttgaattagccgttgcttcactttcctaatcttctgcaatgcttagacgagatcaaatccaatgaacaacctttgaagttttaagt 39037562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 22455100 - 22454833
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||     
T  22455100 agcagagacacaaactgagtagtggaggtactggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcttttcaaaaagcaagcatccaatgccttcaac 22455001  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcc-cttgaagctttaagttttgcacc 207  Q
    | | ||  || ||  |||||||||||||| |  ||||||||||||| ||   || |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |  || |    
T  22455000 ttcatttgaattaactgttgcttcactcttctggtcttctgcaatg-ttgggcgtgattaaatccattgaacacccttttgaagctttaagtctctcatc 22454902  T
Q  208 tcctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctga 274  Q
    | |||| ||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||| ||||| |||||| |||| ||||||    
T  22454901 ttctgaagaacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatgaggtgcttctgatgagcttgcttctga 22454833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 23595677 - 23595427
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||  ||||| ||| || | ||||||||| ||||||    
T  23595677 agcagagacacaaactgagtagaggaggtagtggttctacacttcgtacaattgtactttgtcaacg--cttcagagaacaagaatccaatgccttcaaa 23595580  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    | | ||  || |||| ||||||||||||| |  |||||||||||||| ||   | |||||||||| ||||||| || |||||||||||| | || || ||    
T  23595579 ttcatttgaattagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggtgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaattctttcatct 23595481  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatga 262  Q
     ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  23595480 tctgatgatcttcagcttctggtgaacttgcttctgatgaggtgcttctgatga 23595427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31800997 - 31800775
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||  |||| ||  |||||||||||||||||    
T  31800997 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaatgtactttgtcaacgctctttgaagatcaaacatccaatgctttcaaa 31800898  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||   || ||||| ||  ||||| | | ||||  |||||||||||||  ||||| |     
T  31800897 tcctttcaaaatagttgttgtttcacttttccagtcttctgcaataaatagacgagtttggatccactaagcagcttttgaagctttaag--ttgcatcc 31800800  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    | ||||||||| ||| |||||||||    
T  31800799 catgatgaactgcagtttctggtga 31800775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Original strand, 25189391 - 25189577
Alignment:
Q  12 agagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcc 111  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||| | |    
T  25189391 agagacacaaattgagtagtggaggtagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagaatccaatgccttcaacttc 25189490  T
Q  112 tttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagt 199  Q
     ||  || ||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  25189491 atttgaattagtcattgcttcactctcctggtcttctgcaatgc-taggtgtgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagt 25189577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 28711808 - 28711586
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | |||||||||||  |||| || ||||||||||| ||||||    
T  28711808 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttttcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 28711709  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    | | ||| ||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||  ||| || || || |||||||| ||||||  ||||||| |||||  ||||| |     
T  28711708 ttcattcgaaatagtcgttgctttacttttccagtcttctgcaatctttagacaaggttgaatccattaaacagcttttgaagccttaag--ttgcatcc 28711611  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    | | ||||||| |||||||||||||    
T  28711610 cattatgaactgcagcttctggtga 28711586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 28701320 - 28701117
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||| ||   |||| ||||||||| |||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  28701320 tagtggaggtaatggttgtacacttcgtacaaacttactttgtcaacgccctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatatctgtt 28701221  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaa-acgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagctt 226  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||| ||||| ||||| || |||| ||| ||||||  ||||||| |||||  ||||| | | ||||||||| ||||||    
T  28701220 gctttacttttccagtcttctgcaat-cttaagacgaggttgaatctattaaacagcttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagctt 28701124  T
Q  227 ctggtga 233  Q
    |||||||    
T  28701123 ctggtga 28701117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 198
Target Start/End: Original strand, 6392642 - 6392814
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaag-agcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgt 126  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||| ||  ||||| |||||||||||||   || | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  6392642 tagtggaggtagtggttgcgcacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaaatagtcgt 6392741  T
Q  127 tgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatc-cattgaacagcccttgaagctttaag 198  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||| || |||| |||| ||||||  ||||||| |||||    
T  6392742 tgcttcacttttccagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcacattaaacagcttttgaagccttaag 6392814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 34 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 45087269 - 45087130
Alignment:
Q  34 aggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttca 133  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||  ||||| |||||||||||||   |||  | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45087269 aggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgagaataagcatctaatgcattcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttca 45087170  T
Q  134 ctctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatcc 173  Q
    || | ||||||||||||||| |||| ||||| || |||||    
T  45087169 cttttccagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcc 45087130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31328057 - 31327853
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   |   |||| |||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||| || | ||||||||| |||    
T  31328057 tagtggaggtagtggttgtacacttcgttcgaacatactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgctttcaaaaccctccaaaatagtcgtt 31327958  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagc-ccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagctt 226  Q
    ||||||||   | |||||||||||||  |||  |||| || ||||| ||||||| |   ||||| |||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  31327957 gcttcacttctctagtcttctgcaatctttaggcgagtttgaatccgttgaacaactttttgaaactttaag--ttgcatctcctgatgaactgcagctt 31327860  T
Q  227 ctggtga 233  Q
    |||||||    
T  31327859 ctggtga 31327853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31334778 - 31334574
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||   |   |||| |||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||| || | ||||||||| |||    
T  31334778 tagtggaggtagtggttgtacacttcgttcgaacatactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgctttcaaaaccctccaaaatagtcgtt 31334679  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagc-ccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagctt 226  Q
    ||||||||   | |||||||||||||  |||  |||| || ||||| ||||||| |   ||||| |||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  31334678 gcttcacttctctagtcttctgcaatctttaggcgagtttgaatccgttgaacaactttttgaaactttaag--ttgcatctcctgatgaactgcagctt 31334581  T
Q  227 ctggtga 233  Q
    |||||||    
T  31334580 ctggtga 31334574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 26619192 - 26619066
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| || | |||||| ||| ||||||  | |||| |||||| ||||||| ||||  |||||||||||    
T  26619192 tagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgttctccaaagaataagcattcaatgccttcaaattcttttgaaatagttgtt 26619093  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatg 154  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  26619092 gcttcattcttccagtcttctgcaatg 26619066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 248
Target Start/End: Original strand, 22802469 - 22802687
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| ||||||| |||||  ||||  | |||||  |||| ||||||||||||||||||||   ||    
T  22802469 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaactctctttgaagaataagcatcatatgccttcaaatcctttcaaaatagccatt 22802568  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||| ||  | | |||||||||||||  ||| ||||| || |||||||| || |||  ||||| |||||||  ||||| ||||||||||||| ||| |||    
T  22802569 gctttacctttctagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaatagcttttgaatctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcaggttc 22802666  T
Q  228 tggtgaccttgcttctaatga 248  Q
    || | | ||||||||| ||||    
T  22802667 tgataaacttgcttctgatga 22802687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 34322027 - 34321824
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| || ||  |||||||||||||||||||  ||||  | | ||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||    
T  34322027 tagtgaagatagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagaatccaatgcctttcaatcctttcaaaatagtcgtt 34321928  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||  ||| | |||| ||||||||||  ||| ||||| || ||||| || ||||||  |||| ||||||||  ||||| ||||||||||| | |||||||    
T  34321927 gctatacttttccaggcttctgcaatctttagacgagtttgaatcctttaaacagcttttgaggctttaag--ttgcatctcctgatgaattacagcttc 34321830  T
Q  228 tggtga 233  Q
    | ||||    
T  34321829 tagtga 34321824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 33074216 - 33074438
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||| | ||  ||||  | ||||| ||||| ||| ||    
T  33074216 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtattatgtcaacgttttttgaagaataagcatctaatgccttccaa 33074315  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||  | ||||||||| ||||||  ||| | |||||||||||||||  ||| ||||| || ||||| || ||||||  |||||| ||||||  ||||| ||    
T  33074316 tctgtccaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatcctttaaacagcttttgaagttttaag--ttgcatct 33074413  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||    
T  33074414 cctgatgaactacaacttctagtga 33074438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 30557412 - 30557207
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaag-agcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgt 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| |||||||||||||   || | || ||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |     
T  30557412 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgtgttcaaattctttcaaaatagtcga 30557313  T
Q  127 tgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaat-ccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagct 225  Q
    ||||||||| |  ||||| |||||||| |||| ||||| || ||| ||||| ||||    ||||||| |||||  ||||| |  |||||||||| |||||    
T  30557312 tgcttcactttttcagtcctctgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacaatttttgaagccttaag--ttgcatcctctgatgaactgcagct 30557215  T
Q  226 tctggtga 233  Q
    ||||||||    
T  30557214 tctggtga 30557207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 44881176 - 44881409
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| |||| |||  |  |  |||||||||| |||||| || ||  || ||| || |    
T  44881176 tagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaactctctccaacaaaaaaacatccaatgccttcaaacccatttgaattagctgct 44881275  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||  || ||| |||||| ||  |||||||||| ||||||||| || | |  || || ||||||| |||||||||     
T  44881276 gcttcattcttccagtcttctgcaatg-atagacgtgattaagtcatttgaacagcctttgaagcttcaattatctcagcttctgatgatcttcagcttt 44881374  T
Q  228 tggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatga 262  Q
    ||||||  |||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  44881375 tggtgatgttgcttctgatgaggtgcttctgatga 44881409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 23184414 - 23184170
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||  ||||| ||| || | ||||||||| ||||||    
T  23184414 agcagagacacaaactgagtagaggaggtagtggttctacacttcgtacaattgtactttgtcaacg--cttcagagaaca-gaatccaatgccttcaaa 23184318  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    | | ||  || |||| | ||||||||||| |  ||||||||| |||| ||   | |||| ||||| ||||||| || |||||||||  | || | || ||    
T  23184317 ttcatttgaattagtcg-tgcttcactcttctggtcttctgc-atgc-taggtgtgatt-aatcctttgaacaacctttgaagctt--aattcttcatct 23184224  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatga 262  Q
     ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  23184223 tctgatgatcttcagcttctggtgaacttgcttctgatgaggtgcttctgatga 23184170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 277
Target Start/End: Original strand, 22272205 - 22272390
Alignment:
Q  91 gcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaa 190  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||  || ||||  |||||||| ||| |||||||||||||||| | | ||| |||||||||  ||||||| || |||||    
T  22272205 gcatccaatgccttcaaatccatttgaattagtcattgcttcattcttccagtcttctgcaatgat-agacgtgattaaatcatttgaacaacctttgaa 22272303  T
Q  191 gctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
     ||  || | |  || || ||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||| || || ||||||||||| |||| ||||    
T  22272304 actccaattctctcagcttctgatgatcttcagcttctggtgatgttgcttctgatgaggtgtttctgatgaacttgtttctaatga 22272390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 35744110 - 35743989
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||| |||| |||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||    |||| |||||| ||||||    
T  35744110 agcagagacaaaaactgagtagtggagatagtagttgtacatttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcattcaatgccttcaaa 35744011  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgct 130  Q
    ||||| ||||||||| ||||||    
T  35744010 tccttccaaaatagtcgttgct 35743989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 224
Target Start/End: Original strand, 19115092 - 19115287
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| |||| ||| ||  ||||||||| ||  |||| |||| |   || ||||||||    
T  19115092 tagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacactctccaacgaataggcatccactggcttcacatccatctgaattagttgtt 19115191  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagc 224  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||   ||  ||||||||||| | ||||||| || ||||||||| || | || || || ||||||| |||||||    
T  19115192 gcttcattcttccagtcttctgcaat-agtaggcgagattaaattctttgaacaacctttgaagcttcaattctttcagcttctgatgatcttcagc 19115287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 28551028 - 28550816
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||  | ||||||||||            
T  28551028 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg-------- 28550937  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
     |||||||||||||||||| ||  ||| | |||||||||||||||  |||  |||| || ||||| |  ||||||  |||| | |||||   ||||| ||    
T  28550936 -cctttcaaaatagttgtttctatacttttccagtcttctgcaat-tttaggcgagtttgaatccttgaaacagcttttgaggttttaa--attgcatct 28550841  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  28550840 cctgatgaactgcagcttctggtga 28550816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Original strand, 44840424 - 44840516
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgc 101  Q
    |||||||||| | || || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||  | |||||||||||    
T  44840424 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 44840516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 22776231 - 22776171
Alignment:
Q  186 ttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 248  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  22776231 ttgaagctttaagtt--gcatctcctgatgaactacagcttctgatgaacttgcttctaatga 22776171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 22781609 - 22781549
Alignment:
Q  186 ttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 248  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  22781609 ttgaagctttaagtt--gcatctcctgatgaactacagcttctgatgaacttgcttctaatga 22781549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31968153 - 31967941
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||  ||| |||||||||||||||  ||||  | ||||||||||            
T  31968153 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatg-------- 31968062  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
     | |||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||  |||  |||| || ||||| |  |||| |  |||| ||||||||  ||||| ||    
T  31968061 -catttcaaaatagttgttgctatacttttccagtcttctgcaat-tttatgcgagtttgaatccttgaaacaacttttgaggctttaag--ttgcatct 31967966  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
     |||||||||| |||||||||||||    
T  31967965 tctgatgaactgcagcttctggtga 31967941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 1587124 - 1587072
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctctt 80  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  1587124 tagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 1587072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 101
Target Start/End: Original strand, 14581525 - 14581597
Alignment:
Q  29 agtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgc 101  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||  | |||||||||||    
T  14581525 agtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 14581597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 22776398 - 22776306
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgc 101  Q
    |||||||||| | || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||  | |||||||||||    
T  22776398 agcagagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 22776306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 22781776 - 22781684
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgc 101  Q
    |||||||||| | || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||  | |||||||||||    
T  22781776 agcagagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 22781684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Original strand, 40332077 - 40332169
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgc 101  Q
    |||||||||| | || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||  | |||||||||||    
T  40332077 agcagagacaaaaacagagtaatggagttagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 40332169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 101
Target Start/End: Original strand, 3277039 - 3277112
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgc 101  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||||||  ||||  | |||||||||||    
T  3277039 tagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatatcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 3277112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 23392756 - 23392707
Alignment:
Q  31 tggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctctt 80  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  23392756 tggaagtagtggttgtacacttcgtacagttgtactaggtcaacgctctt 23392707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 44)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Original strand, 17814960 - 17815228
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  17814960 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactccgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgctttcaaa 17815059  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  17815060 tcctttcagaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatct 17815159  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    | ||||||| || |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  17815160 cttgatgaaatttagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgctactgatga 17815228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 23413119 - 23412880
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  23413119 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaaaaacaagcatccaatgctttcaaa 23413020  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| |  ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||    
T  23413019 tcctttcaaaataatcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttggatgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 23412920  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  23412919 cctgatgaacttcagcttctggtgatcttgcttctgatga 23412880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 7745838 - 7745570
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| || ||||||||||| ||||||    
T  7745838 agcagagacaaaaaccgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 7745739  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  | | |||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||    
T  7745738 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctccaatgcttggatgcgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttacatct 7745639  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  7745638 cctgatgtacttcagcttcttgtgatcttgcttctgatgagatgcttttgatgaacttgcttcttatga 7745570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 89567 - 89328
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  89567 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaatgctcttcaaagaacaagcatgcaatgctttcaaa 89468  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||    
T  89467 ttctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaattcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaagttttgcatct 89368  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 248  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||    
T  89367 cctgatgaactacaacttctggtgatcttgcttctgatga 89328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 19536446 - 19536177
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  19536446 agcagagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaa 19536347  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactc-tcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacc 207  Q
    ||| ||||||| ||| |||||||||||| |    ||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  19536346 tccattcaaaaaagtcgttgcttcactccttttggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcccttgaagctttaagtcttgcatc 19536247  T
Q  208 tcctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    |||||||||||||| |||||| | || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  19536246 tcctgatgaacttctgcttcttgcgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttacttctgatga 19536177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 21072385 - 21072131
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  21072385 agcagagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 21072286  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||   | | |||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
T  21072285 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgctgtga-gtgattaaatccatagaacaaccttttaagctttaagtcttgcatct 21072187  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatga 262  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||    
T  21072186 cctgatgaacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 21072131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Original strand, 21910548 - 21910787
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  21910548 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 21910647  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||| || |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||| ||||| ||    
T  21910648 tcctttcaaaataatcgttgcttcacttttccagtcttttgtaatgcttagacgagattaaatcaattcaacagcctttgacgctttaagtcttgcatct 21910747  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 248  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  21910748 cctgatgaactttagcttctggtgatcttgcttctgatga 21910787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 6512573 - 6512337
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||   |||||| ||||||    
T  6512573 agcagagacacaaactgagtagtgaagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagc---caatgccttcaaa 6512477  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||| ||    
T  6512476 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttcagcaatgcttagacgagattaaatccactgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 6512377  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 248  Q
    ||||||||||| || ||||| |||| ||||||||| ||||    
T  6512376 cctgatgaactacaacttctagtgatcttgcttctgatga 6512337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 41566579 - 41566359
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |  |||||||||| ||||||    
T  41566579 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatatcaacgctcttcaaagaataaacatccaatgccttcaaa 41566480  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||| ||    
T  41566479 tcctttcaaaatagacgttgcttcacttttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaatagcttttgaagctttaagtcttgcatct 41566380  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctg 229  Q
    ||||||||||| || ||||||    
T  41566379 cctgatgaactacaacttctg 41566359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 229
Target Start/End: Original strand, 20550887 - 20551107
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||    
T  20550887 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtatt-tgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 20550985  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcc-cttgaagctttaagttttgcacc 207  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||| |    
T  20550986 tcttttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagttttctgcaatgcttagacgagattaaaaccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatc 20551085  T
Q  208 tcctgatgaacttcagcttctg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  20551086 tcctgatgaacttcagcttctg 20551107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 26784346 - 26784570
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| | ||| ||||    
T  26784346 agcagacacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaataagcatccagttcttccaaa 26784445  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||   |  ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| | ||||| ||    
T  26784446 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactgctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcctttaaagctttaaatcttgcatct 26784545  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    |||| |||||| |||||||||||||    
T  26784546 cctgctgaactacagcttctggtga 26784570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Original strand, 33022675 - 33022878
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||    
T  33022675 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgtt 33022774  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||| ||||||||||||| ||  |||    
T  33022775 gcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagatgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgttgcatctcctgatgaactgcaaattc 33022872  T
Q  228 tggtga 233  Q
    ||||||    
T  33022873 tggtga 33022878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13545638 - 13545455
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||  |||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  13545638 tagtggaggtggtggttgtacacttcgtacacttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaagtagttgtt 13545539  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaact 219  Q
    |||||||        |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  13545538 gcttcac--------tcttctgcaatgcttagacgagattaagtccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 13545455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 244
Target Start/End: Original strand, 31117869 - 31118103
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || ||||||| ||||||| |||| |||||||| | ||||||| ||||||| |||||  |||| || ||||||||||| ||||||    
T  31117869 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggatgtacacttcgtacatttgtactttgtcaacactctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 31117968  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcc-cttgaagctttaagttttgcacc 207  Q
    | |||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||| ||  |||||||||||  | ||||| |    
T  31117969 ttctttcaaattagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagtttaaatccgttaaacaaccttttgaagcttta--tgttgcatc 31118066  T
Q  208 tcctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttcta 244  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  31118067 tcctgatgaactgcagcttctgatgaacttgcttcta 31118103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 9 - 281
Target Start/End: Original strand, 23881059 - 23881332
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||     
T  23881059 agcagagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgcactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatccaatgccttcaac 23881158  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcc-cttgaagctttaagttttgcacc 207  Q
    | | ||  || |||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||  || ||||||||||||| |||| ||  |||||||||| ||| |  || |    
T  23881159 ttcatttgaattagtcgttgcttcactctcctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatccattaaacaaccttttgaagcttt-agtctctcatc 23881256  T
Q  208 tcctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatgatgtc 281  Q
    | |||||||||||||||||||||||  |||  |||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  23881257 ttctgatgaacttcagcttctggtgttcttcagcttctgatgaggtgcttctgatgaccttgcttctgatgatgtc 23881332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21099849 - 21099580
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||  ||| ||||||||||| ||||      
T  21099849 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtaaacgttcttcaaaaggcaagcatccaatgccttcagc 21099750  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    | | ||  || |||||||||||||||||||   ||||| || ||||| ||  |  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |   | ||    
T  21099749 ttcatttgaattagttgttgcttcactctcttggtcttttgtaatgc-taggcatgattaaatccatttaacagcctttgaagctttaagtctctgatct 21099651  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
     ||||||||||| ||||||||||||  ||  |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  21099650 tctgatgaactttagcttctggtgattttcagcttctgatgaggtgcttttgatgaacttgcttctgatga 21099580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 11993880 - 11994102
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || ||||||| |||||||||||| |||||||| |   ||||| |||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||    
T  11993880 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacatacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgctttcaaa 11993979  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||| |||||| |||  ||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| |  ||||| |||||||  ||||| ||    
T  11993980 tcccttcaaattagccgttgcttcactattccagtcttctgcaatccttagacgagtttgaatccgttgaacatcttttgaaactttaag--ttgcatct 11994077  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  11994078 cctgatgaactacagcttctggtga 11994102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Original strand, 42243691 - 42243895
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaag-agcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgt 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||| | |||||||||||||  ||| | ||  |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  42243691 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtattttgtcaacgctcttttaaggaacaaacatcaaatgtcttcaaatcctttcaaaatagttgt 42243790  T
Q  127 tgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagctt 226  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||  ||| ||||| || ||||| || ||||||  |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  42243791 tgcttcacttttccagtcttctgcaatttttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacagctt 42243888  T
Q  227 ctggtga 233  Q
    |||||||    
T  42243889 ctggtga 42243895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 4887014 - 4887236
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||||||||||||||| |||||||| |   ||||| |||||||||||||  |||| || ||||||||||| ||||||    
T  4887014 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacacacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 4887113  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaa-acgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacc 207  Q
    || |||||||||||| ||||||  ||| | |||||||| |||||| ||||| || || |||||||||||||||| |  |||||||||||||  |||||      
T  4887114 tcttttcaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttttgcaat-cttaagacaagtttaaatccattgaacaacttttgaagctttaag--ttgcata 4887210  T
Q  208 tcctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    || ||||||||| |||||||||||||    
T  4887211 tcttgatgaactgcagcttctggtga 4887236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 6499231 - 6499453
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||     
T  6499231 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatccgatgccttcaac 6499330  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcc-cttgaagctttaagttttgcacc 207  Q
    | | ||  |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| | |    | |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |  || |    
T  6499331 ttcatttgaaatagatgttgcttcactctcctggtcttctgcaatac-tgggtgtgattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtct--catc 6499427  T
Q  208 tcctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    | |  |||||||||||||||||||||    
T  6499428 ttcatatgaacttcagcttctggtga 6499453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Original strand, 15516980 - 15517183
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||| |||| |||||  ||||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||    
T  15516980 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaaagtactatgccaacactctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatccttccaaaatagccgtt 15517079  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||  ||| | |||||||||||||||  ||| ||||| || ||||| ||||||| |  |||||||||||||  ||||| || |||||||||| || ||||    
T  15517080 gctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttgaacaacttttgaagctttaag--ttgcatcttctgatgaactacaacttc 15517177  T
Q  228 tggtga 233  Q
    ||||||    
T  15517178 tggtga 15517183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29138551 - 29138331
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| || || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||||| ||||||||||  ||||  | ||||||||||| ||| ||    
T  29138551 agcagagacacaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgacaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttctaa 29138452  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||| |||| ||||  || ||||  || ||||||  ||||| |||||||  ||||| ||    
T  29138451 tccttccaaaatagttgttgctatact-ttccagtcttctgcaat-cttagacgattttgaatctgttaaacagcttttgaaactttaag--ttgcatct 29138356  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    ||||||||||| || ||||||||||    
T  29138355 cctgatgaactacaacttctggtga 29138331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 228
Target Start/End: Original strand, 30742991 - 30743189
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| |||||||||||||  ||||  |  |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||    
T  30742991 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaataaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaataatcgtt 30743090  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    ||||  |  | |||||||||||||||  ||| ||||| || |||||||| |||| |  |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| || ||||    
T  30743091 gctttgcctttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcaacttc 30743188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 173
Target Start/End: Original strand, 33933259 - 33933424
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaag-agcaggcatccaatgctttcaa 107  Q
    |||||||||| | || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||||||   || | || ||||||||||| || ||    
T  33933259 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatatcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgtttaa 33933358  T
Q  108 atcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatcc 173  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||| ||||| || |||||    
T  33933359 atcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttttgcaatccttagacgaggttgaatcc 33933424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 642833 - 642583
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||| |   ||  || |||  |||    
T  642833 tagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaaacaagcatccaatgccttcaactttatttgaattagccgtt 642734  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    | ||||||||||   ||||||| ||||| ||   | |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |  || || |||||||||| ||  |||    
T  642733 gtttcactctcctgatcttctgtaatgc-taggtgtgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtctctcatcttctgatgaactgcaatttc 642635  T
Q  228 tggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    |||||| |||  || ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  642634 tggtgatcttcagcatctcatgaggtgcttctgatgaacttgcttctgatga 642583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 12352940 - 12352765
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || ||     
T  12352940 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaatgcaagcatccaatgcctttaac 12352841  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcc 184  Q
    | | ||  || |||   ||||||||| ||||   |||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||    
T  12352840 ttcatttgaattagccattgcttcaccctcctgatcttctgcaatgcttagacaagatcaaatccaatgaacagcc 12352765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 14086684 - 14086462
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaag-agcaggcatccaatgctttcaa 107  Q
    |||||||||| | || || |||||||||||| ||||||| |||||||| ||  ||||| |||||||||||||   || | || ||||||||||| |||||    
T  14086684 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagcggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcattcaa 14086585  T
Q  108 atcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaat-ccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcac 206  Q
    |||  ||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||| || ||| ||||| ||||||  ||||||| |||||  |||||     
T  14086584 atcacttcaaaatagccgttgcttcacttttccagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacagcttttgaagccttaag--ttgcat 14086487  T
Q  207 ctcctgatgaacttcagcttctggt 231  Q
    |  |||||||||| |||||||||||    
T  14086486 cctctgatgaactgcagcttctggt 14086462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21199148 - 21198910
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||| |  ||||||||||| ||||||    
T  21199148 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtgattgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctttccaaagaacgagcatccaatgccttcaaa 21199049  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    | | ||  || |||  ||||| ||| | | |  |||||||||| | | ||  || |||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |  || ||    
T  21199048 ttcatttgaattagccgttgc-tcatttttctggtcttctgcagtac-taggcgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctctcatct 21198951  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgag 249  Q
     |||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||||    
T  21198950 tctgatgaacttcagctcctggtgatattgcttctgatgag 21198910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Original strand, 26759160 - 26759363
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||   |||||| ||| |||||||  ||||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||    
T  26759160 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacttactatttcagcgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatccttccaaaatagtcgtt 26759259  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    | |  ||| | |||||||||||||||  |||  |||  || ||||| || |||| |  |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| || ||||    
T  26759260 gttatacttttccagtcttctgcaatctttaggcgaatttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacaacttc 26759357  T
Q  228 tggtga 233  Q
    ||||||    
T  26759358 tggtga 26759363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 153
Target Start/End: Original strand, 26765509 - 26765634
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||  ||||||| ||| |||||||  ||||  | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  26765509 tagtggaggcagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatttcagcgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatccttccaaaatagttgtt 26765608  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaat 153  Q
    |||  ||| | |||||||||||||||    
T  26765609 gctatacttttccagtcttctgcaat 26765634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 25096952 - 25096779
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgt---caacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtt 124  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || | |   |||||||||| ||||| || ||||||||||  ||||||||||||  || || |     
T  25096952 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttttttcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgtcttcaaatccttttgaattaatc 25096853  T
Q  125 gttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagt 199  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||||| |  ||  ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  25096852 gttgcttcactcttctggtcttctgcaatgct-aggcgtaattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagt 25096779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 25154922 - 25154749
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgt---caacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtt 124  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || | |   |||||||||| ||||| || ||||||||||  ||||||||||||  || || |     
T  25154922 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttttttcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgtcttcaaatccttttgaattaatc 25154823  T
Q  125 gttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagt 199  Q
    ||||||||||||| |  ||||||||||||||| |  ||  ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  25154822 gttgcttcactcttctggtcttctgcaatgct-aggcgtaattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagt 25154749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 3245564 - 3245365
Alignment:
Q  31 tggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgct 130  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||  | ||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||  ||||||    
T  3245564 tggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgcctttcaattctttcaaaatagccgttgct 3245465  T
Q  131 tcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctgg 230  Q
      ||| | ||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |  |||||   | |||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  3245464 atacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagttttggaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcagcttctgg 3245368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 9398879 - 9398781
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaa 107  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || | |||| |||||| |||||    
T  9398879 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagtaagcattcaatgccttcaa 9398781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 233
Target Start/End: Original strand, 5429985 - 5430098
Alignment:
Q  119 atagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaat-ccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaa 217  Q
    |||| |||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||  ||||||  ||||||| |||||  ||||| |||||||||||    
T  5429985 atagctgttgcttcactttttcagtcttctgcaatccttaaacgaggttgaatcccataaaacagcttttgaagccttaag--ttgcatctcctgatgaa 5430082  T
Q  218 cttcagcttctggtga 233  Q
    || |||||||||||||    
T  5430083 ctgcagcttctggtga 5430098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 12352758 - 12352693
Alignment:
Q  214 tgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  12352758 tgaacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttttgatgaacttgcttttgatga 12352693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 130
Target Start/End: Original strand, 28139599 - 28139720
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatg-ctttcaa 107  Q
    |||||||||| | || || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||   |||||||||||||||||   ||||  | |||||||||| ||||| |    
T  28139599 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgctctatgaagaataagcatccaatgtctttc-a 28139697  T
Q  108 atcctttcaaaatagttgttgct 130  Q
    |||||||||||||||| ||||||    
T  28139698 atcctttcaaaatagtcgttgct 28139720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Original strand, 9088961 - 9089032
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctctt 80  Q
    |||||||||| | || || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  9088961 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 9089032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 30115982 - 30115863
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||| ||||||||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||  | ||||| |||||  |  ||    
T  30115982 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgcccttcaa 30115883  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttg 128  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  30115882 tcctttcaaaatagtcgttg 30115863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 130
Target Start/End: Original strand, 32160777 - 32160879
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| |   || || |||||||||||||  |||   | ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  32160777 tagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacatacgttctttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagctgtt 32160876  T
Q  128 gct 130  Q
    |||    
T  32160877 gct 32160879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 35932151 - 35932059
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgc 101  Q
    |||||||||| | || || ||||||| |||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| |||||  ||||  | |||||||||||    
T  35932151 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataagcatccaatgc 35932059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 9398744 - 9398661
Alignment:
Q  155 cttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctggtgaccttg 238  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||||| || ||||| |||||||| |  || || ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  9398744 cttagacgagatcaaatccaatgaacaacctttgaacctttaagtctctcatcttctgatgaacttcaacttctggtgatcttg 9398661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 28464465 - 28464272
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||  | |||||||||||         ||||||||||||  |||    
T  28464465 tagtagagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc---------ctttcaaaatagccgtt 28464375  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    | |  ||| |   ||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |  ||||||  ||||||||||||||| |  | ||||||||||||| |||||||    
T  28464374 gttatacttttttagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaagttgt--atctcctgatgaactgcagcttc 28464278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 30115844 - 30115799
Alignment:
Q  186 ttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  30115844 ttgaagctttaagtt--gcatctcctgatgaactgcagcttctggtga 30115799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 54)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Original strand, 39693523 - 39693793
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  39693523 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 39693622  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||    
T  39693623 tcctttcaaaatagtcattgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 39693722  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    |||||||| || || |||||||||| |||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  39693723 cctgatgagctacaacttctggtgatcttcagcttctgatgacatgcttttgatgaacttgtttctgatga 39693793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16681466 - 16681198
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| || | ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||    
T  16681466 agcagagacacaaactgagtactagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaa 16681367  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||    
T  16681366 tcctttcaaactagacgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctctaagtcttgcatct 16681267  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  16681266 cctgatgaactttagcttctagtgatcttgcttatgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 16681198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 9 - 281
Target Start/End: Original strand, 16188972 - 16189244
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||  | ||||||||||| ||||||    
T  16188972 agcagagacacatactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttagaagaataagcatccaatgccttcaaa 16189071  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| ||    
T  16189072 tcatttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatggttggacgagattaaatccattaaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 16189171  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatgatgtc 281  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  16189172 cctaatgaacttcggcttctggtgatcttgcttctaatgagatacttctgatgaacttgcttctgatgatgtc 16189244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 12 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 17525889 - 17525619
Alignment:
Q  12 agagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcc 111  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  17525889 agagacacaaactgagtagtgaagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcc 17525790  T
Q  112 tttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcc-cttgaagctttaagttttgcacctcc 210  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||| ||||| ||||    
T  17525789 tttcaaaatagttgttgtttcactcttccagtcttctgcagtgcttagacgatattaaatccattgaacaaccttttgaagatttaagtcttgcatctcc 17525690  T
Q  211 tgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatgatgtc 281  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  17525689 tgatgaactacagtttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgacgaacttgcttctgatgatgtc 17525619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20382556 - 20382289
Alignment:
Q  10 gcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaat 109  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| | |||||||||    
T  20382556 gcagagacacaaactgattagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccactactttcaaat 20382457  T
Q  110 cctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctc 209  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||  | |||||| |||||||| |  |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||    
T  20382456 cctttcagaatagccgttgcttcactcctctagtcttttgcaatgcatggacgagattgaatccattgaacagcctttgaagctttaagacttgcatctc 20382357  T
Q  210 ctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  20382356 ctgatgaacttcagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttttgatga 20382289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 36 - 277
Target Start/End: Original strand, 33082872 - 33083113
Alignment:
Q  36 gtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcact 135  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33082872 gtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcact 33082971  T
Q  136 ctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctggtgacc 235  Q
    || |   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33082972 cttctgatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatc 33083071  T
Q  236 ttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||    
T  33083072 ttgcttctgatgagttgcttcagatgaacttgtttctaatga 33083113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 276
Target Start/End: Original strand, 16207294 - 16207563
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| || ||||||||||| ||||||    
T  16207294 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 16207393  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||    
T  16207394 tcctttcaaaatagtagttgctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcgtttgaagctttaagtcttgcatct 16207493  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatg 276  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||    
T  16207494 cctgatgaactagagcttctggtgatctttagcttctaatgagatgcttctgataaacttgcttcagatg 16207563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 272
Target Start/End: Original strand, 17267463 - 17267724
Alignment:
Q  10 gcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaat 109  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  17267463 gcagagacaaaaactgagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaattgtactatgtcaatgctcttcaaagaacaagcatctaatgctttcaaat 17267562  T
Q  110 cctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctc 209  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||   | ||||| ||||||||||  |||||||| || |||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  17267563 cctttcaaaatagctgttgcttcactcctgcggtcttttgcaatgcttggacgagattgaa-ccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctc 17267661  T
Q  210 ctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattct 272  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17267662 ttgatgaacttcagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttttgatgaacttgcttct 17267724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 276
Target Start/End: Original strand, 19943242 - 19943494
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaag-agcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgt 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||| || |||| | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19943242 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattttactttgtcaacgctttttaaaggaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgt 19943341  T
Q  127 tgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcc-cttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagct 225  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  19943342 tgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaatagccttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagct 19943441  T
Q  226 tctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatg 276  Q
    ||| |||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  19943442 tctagtgatctttagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttccgatg 19943494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12757923 - 12757702
Alignment:
Q  12 agagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcc 111  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  12757923 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 12757824  T
Q  112 tttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcct 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||| ||||| |||||    
T  12757823 tttcaaaatagttgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttaaagttttaagtcttgcatctcct 12757724  T
Q  212 gatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    ||||||||  |||| |||||||    
T  12757723 gatgaactagagctactggtga 12757702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Original strand, 29693303 - 29693573
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  29693303 agcagagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaaagctcttcaaagaacaagcatacaatgctttcaaa 29693402  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| | ||| |||||||||| ||||| ||    
T  29693403 tcctttcaaaatagtggttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattaaacagtctttggagctttaagtcttgcatct 29693502  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    ||| ||||||| || ||| |||||| |||  |||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  29693503 cctaatgaactacaacttatggtgatcttcagcttatgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 29693573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 602883 - 602659
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  602883 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 602784  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| || |||||| ||||||| |||||  |    
T  602783 tcctttcaaaatagtcattgcttcactcttcaagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccaatgaacaacctttgaagttttaagtcttgcattt 602684  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||    
T  602683 cctgatgaactttagcttcttgtga 602659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 19156184 - 19156408
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  19156184 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 19156283  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||    
T  19156284 tcctttcaaattagtcgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcatagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaattcttgcatct 19156383  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    | ||||||||| || ||||||||||    
T  19156384 cttgatgaactacaacttctggtga 19156408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Original strand, 17914447 - 17914717
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||| ||| | ||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||    
T  17914447 agcagagaaacaaattgagtagtggagatagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaa 17914546  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| | ||||| ||    
T  17914547 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttacagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaactcttgcaact 17914646  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    ||| |||| || || ||||| |||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  17914647 cctaatgagctacaacttctagtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatga 17914717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Original strand, 18718989 - 18719228
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18718989 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgacaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 18719088  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||  |  ||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||    
T  18719089 tcctatcaaaatagtcgttgcttcactcctctggtcttttgcaatgcttgaacgagattgaatccactgaacagcctttgaagctctaagtcttgcatct 18719188  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 248  Q
     |||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18719189 tctgaagaacttaagcttctggtgatcttgcttctgatga 18719228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Original strand, 24646326 - 24646596
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||  | ||||||||||| | ||||    
T  24646326 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactcttcaaagaataagcatccaatgcctgcaaa 24646425  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||   |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| | ||||| ||    
T  24646426 tcctttcaaaatagctgttgctacactcttttagtcttatgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagctttaactcttgcatct 24646525  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    | |||||||||  |||||||||||| |||  |||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24646526 cttgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgataagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 24646596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23263756 - 23263506
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||  |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  23263756 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaactgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcatt 23263657  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagct-ttaagttttgcacctcctgatgaacttcagctt 226  Q
    | |||||||| | ||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||| || |||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23263656 gtttcactcttctagtcttctgcattgtttagacgagattaaatctattgaacaacctttgaagttcttaagttttgcatctcctgatgaacttcagctt 23263557  T
Q  227 ctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    ||| ||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  23263556 ctgatgatcttgcttctgatgaggtgcttctgatgaacttgcttctgatga 23263506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 18321319 - 18321067
Alignment:
Q  12 agagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcc 111  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||||||||||  ||||||||    
T  18321319 agagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcccttcaaagaacaagcatccaatgccctcaaatcc 18321220  T
Q  112 tttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcct 211  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||    ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||    
T  18321219 tttgaaaatagctgttgcttcactcttttggtctcatgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcct 18321120  T
Q  212 gatgaacttcagcttctggtgacct--tgcttctaatgagatgcttttgatga 262  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||    
T  18321119 gatgaacttcagcttctggtgatcttctacttctgatgagatgcttctgatga 18321067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 12 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 17441967 - 17441716
Alignment:
Q  12 agagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcc 111  Q
    ||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||||    
T  17441967 agagacacaaaatgagtagtggagatagtggttgtacacttagtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgctt-caaatcc 17441869  T
Q  112 tttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcct 211  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||    
T  17441868 tttcaaaatagtcgttgctttagtcttccagtcttctgcaatgcttagaggagattaagtccattgaacaacctttaaagctttaagtcttgcatctcct 17441769  T
Q  212 gatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatga 262  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||  |||||| || |||||||| ||||||    
T  17441768 gatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgattagatgcttctgatga 17441716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 267
Target Start/End: Original strand, 17701733 - 17701993
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| || |||||||||| || ||    ||||||||||| ||||||    
T  17701733 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaattatactttgccaacgctcttaaaggaattagcatccaatgccttcaaa 17701832  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |  || ||    
T  17701833 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctgatcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtctctcatct 17701932  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgacc--ttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttg 267  Q
     |||||||||||||||||||||||| |   ||||||| | ||| ||||| |||||||||||    
T  17701933 tctgatgaacttcagcttctggtgatcatctgcttctgaagaggtgcttctgatgaacttg 17701993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 29 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23185369 - 23185167
Alignment:
Q  29 agtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttg 128  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||  | ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  23185369 agtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttg 23185270  T
Q  129 cttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttct 228  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||  | ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  23185269 cttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttta--tgttgcatctcctgatgaactgcagcttct 23185172  T
Q  229 ggtga 233  Q
    |||||    
T  23185171 ggtga 23185167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Original strand, 18679803 - 18680042
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18679803 agcagagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 18679902  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||||  |  ||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |||||  || |||||||| ||||| ||||| ||    
T  18679903 tcctatcaaaatagtcgttgctttactcctctggtcttttgcaatgcttagacgagattgaatccactgaactacctttgaagctctaagtcttgcatct 18680002  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 248  Q
     |||||||| |  ||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  18680003 tctgatgaaatgaagcttctagtgatcttgcttctgatga 18680042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 18121269 - 18121018
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||| |||||||||||   | |||||||| ||||||||| ||| || ||||||  |||| || ||||||||||| || |||    
T  18121269 agcagagacagaaacagagtagttgaggtagtggt---acacttcgtacaattgtactttgttaatgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaa 18121173  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||    
T  18121172 tcctttcaaaatagcagttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaaactttaagtcttgcatct 18121073  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatg 261  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||||    
T  18121072 cctgatgaactagagcttctggtgatctttagcttctgatgagatgcttctgatg 18121018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 21932871 - 21933095
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||  || | || |||| |||||| || |||    
T  21932871 agcagagacaaacactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattttactttgtcaacgctctttgaaaaacaagcatacaatgcctttaaa 21932970  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||    
T  21932971 tcctttcaaaatagccgttgtttcactctttcagtcttatgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 21933070  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||    
T  21933071 cctgatgaaatagagcttctggtga 21933095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 30421591 - 30421369
Alignment:
Q  10 gcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttc--aaagagcaggcatccaatgctttcaa 107  Q
    ||||||||| | || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||   ||||| || ||||||||||| |||||    
T  30421591 gcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaat-gtactttgtcaacgctctttgaaaagaacaagcatccaatgccttcaa 30421493  T
Q  108 atcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacc 207  Q
    |||| |||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||| |    
T  30421492 atccattcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgttgcatc 30421395  T
Q  208 tcctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    | |||||||||| |||||||||||||    
T  30421394 ttctgatgaactgcagcttctggtga 30421369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 17797410 - 17797632
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| || ||||||||||| |||||     
T  17797410 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaat 17797509  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    |||||||||| |||  ||||| ||||| | ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||||||| |  |||| ||||||||  ||||| ||    
T  17797510 tcctttcaaactagccgttgcatcacttttccagtcttctgtaatggttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaggctttaag--ttgcatct 17797607  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    |||||||| || |||||||||||||    
T  17797608 cctgatgagctgcagcttctggtga 17797632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 281
Target Start/End: Original strand, 19707497 - 19707765
Alignment:
Q  12 agagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcc 111  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| ||  ||| |||||| ||||||| |    
T  19707497 agagacacaaactgagtagaggatgtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgttcttcaaagaacaaccattcaatgccttcaaattc 19707596  T
Q  112 tttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcct 211  Q
     ||  || |||  ||||||||||||| |  ||||||||||||| |||     |||||| ||| |||||||||| |||||||||||| | || || || ||    
T  19707597 atttgaattagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatg-ttaggaatgattaagtcctttgaacagcctttgaagctttaattctttcatcttct 19707695  T
Q  212 gatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatgatgtc 281  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  19707696 gatgatcttcagcttctggcgatcttgcttctaatgaggtgcttctaatgaacttgcttctgatgatgtc 19707765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15336232 - 15336029
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| |||||||||||||  | ||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  15336232 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgacgaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgtt 15336133  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||||||| || ||||||||||||||  ||| ||||| || | |||||| |||| |  |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  15336132 gcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgattccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacagcttc 15336035  T
Q  228 tggtga 233  Q
    ||||||    
T  15336034 tggtga 15336029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15425297 - 15425094
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| |||||||||||||  | ||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  15425297 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgacgaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgtt 15425198  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||||||| || ||||||||||||||  ||| ||||| || | |||||| |||| |  |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  15425197 gcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgattccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacagcttc 15425100  T
Q  228 tggtga 233  Q
    ||||||    
T  15425099 tggtga 15425094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15516601 - 15516398
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| |||||||||||||  | ||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  15516601 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgacgaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgtt 15516502  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||||||| || ||||||||||||||  ||| ||||| || | |||||| |||| |  |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  15516501 gcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgattccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacagcttc 15516404  T
Q  228 tggtga 233  Q
    ||||||    
T  15516403 tggtga 15516398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 77 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 20255660 - 20255472
Alignment:
Q  77 tcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccatt 176  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  20255660 tcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgtaatgcttagacgagattaaatccatt 20255561  T
Q  177 gaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaactt 266  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||    || |||| ||| | |||||||||| |||  |||||| ||||||| ||| ||||||||||    
T  20255560 gaacagcctttgacgctttaagtcttgca---tctaatgagctttatcttctggtgatcttcagcttctgatgagatacttctgatgaactt 20255472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Original strand, 24551281 - 24551484
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  24551281 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgttaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcttttcaaaatagtcgtt 24551380  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||||||| | |||||||||||||||  ||| ||||| || |||||||| |||| |  ||||||| |||||  ||||| | | ||||||||| |||||||    
T  24551381 gcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacaacttttgaagccttaag--ttgcatcccatgatgaactgcagcttc 24551478  T
Q  228 tggtga 233  Q
    ||||||    
T  24551479 tggtga 24551484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 128 - 274
Target Start/End: Original strand, 22745594 - 22745742
Alignment:
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||    
T  22745594 gcttcacacttccagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttc 22745693  T
Q  228 tggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctga 274  Q
    |||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  22745694 tggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctga 22745742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 45538602 - 45538380
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||  | |||||||||||||  |||| || ||||||||||  ||||||    
T  45538602 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtgatttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgtcttcaaa 45538503  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||| ||||| || |||||||| |||| |  ||||||| |||||  ||||| |     
T  45538502 tcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacaacttttgaagccttaag--ttgcatcc 45538405  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    | ||||||||| |||||||||||||    
T  45538404 catgatgaactgcagcttctggtga 45538380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Original strand, 9320575 - 9320780
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttca-aagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgt 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || | |||| |||||||||||||   ||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  9320575 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaatatactttgtcaacgctcttttgaagaataagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaaataattgt 9320674  T
Q  127 tgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatcc-attgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagct 225  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||  ||| ||||| || ||||| ||| ||||||  ||||||| |||||  ||||| |  |||||||||| |||||    
T  9320675 tgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccaattaaacagcttttgaagccttaag--ttgcatcctctgatgaactgcagct 9320772  T
Q  226 tctggtga 233  Q
    ||||||||    
T  9320773 tctggtga 9320780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 40845550 - 40845329
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||  | ||||||||||| ||| ||    
T  40845550 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttccaa 40845451  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||| | |||||||||||||||  ||| ||||| || ||||| || |||| |  |||||||||||||   |||| ||    
T  40845450 tccttccaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatcc-ttaaacaacttttgaagctttaag--ctgcatct 40845354  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    |||||||||||  ||||||||||||    
T  40845353 cctgatgaactatagcttctggtga 40845329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 200
Target Start/End: Original strand, 1237644 - 1237816
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| | ||  ||||| |||||||||||||  |||| ||   ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  1237644 tagtggaggtagtggttgtacacttcgcacaaaagtactttgtcaacgctctttgaagaacaaatatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgtt 1237743  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagtt 200  Q
    |||||||| | || ||||||||||||  ||| ||||| || |||||||| ||||||  ||||||| |||||||    
T  1237744 gcttcacttttccggtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacagcttttgaagccttaagtt 1237816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 18685541 - 18685372
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| | | ||||||||||||||| |  | ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  18685541 tagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttcaaattctttcaaaatagttgtt 18685442  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttc-tgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaa 197  Q
    |||||||||| |  |||||| |||||||| || ||| ||||| |||| |||||||| | ||||||| ||||    
T  18685441 gcttcactcttctggtcttcttgcaatgc-tagacgtgattatatcctttgaacagtctttgaagcattaa 18685372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 9 - 195
Target Start/End: Original strand, 43644884 - 43645069
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  43644884 agcagagacacaaaccgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttattaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 43644983  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagcttt 195  Q
    | | ||  || |||  ||| ||||||||| |  |||||||||||||| ||  || |||||||||  ||||||| || ||||||||||    
T  43644984 ttcatttgaattagccgtttcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcatttgaacaacctttgaagcttt 43645069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 18722790 - 18722621
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| | | ||||||||||||||| |  | ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||    
T  18722790 tagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttcaaattctttcaaaatagtcgtt 18722691  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttc-tgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaa 197  Q
    |||||||||| |  |||||| |||||||| ||  || |||||||||| |||||||| | ||||||| ||||    
T  18722690 gcttcactcttcttgtcttcttgcaatgc-tagccgtgattaaatcctttgaacagtctttgaagcattaa 18722621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 18731135 - 18730966
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| | | ||||||||||||||| |  | ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||| |||    
T  18731135 tagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttcaaattctttcaaaatagtcgtt 18731036  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttc-tgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaa 197  Q
    |||||||||| |  |||||| |||||||| ||  || |||||||||| |||||||| | ||||||| ||||    
T  18731035 gcttcactcttcttgtcttcttgcaatgc-tagccgtgattaaatcctttgaacagtctttgaagcattaa 18730966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 233
Target Start/End: Original strand, 36105203 - 36105405
Alignment:
Q  29 agtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttg 128  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||    
T  36105203 agtggaggtagtggttgtacactttgtacaaacgtactatatcaacgctctttgaagaataaacatccaatgccttcaaatccttccaaaatagccgttg 36105302  T
Q  129 cttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttct 228  Q
     |  ||| | ||| |||||||||||  ||| ||||| || ||||| || ||||||  |||||||||||||  ||||| |||||||||||||  |||||||    
T  36105303 ttatacttttccaatcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactatagcttct 36105400  T
Q  229 ggtga 233  Q
    |||||    
T  36105401 ggtga 36105405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Original strand, 22663123 - 22663326
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||  | ||||||||||  ||| |||| || |||||||||||||    
T  22663123 tagtggagatattggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgtcttctaatctttccaaaatagttgtt 22663222  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||  | | | |||||||||||||||  | | ||||| || ||||| || ||||||  |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||| || ||||    
T  22663223 gctatatttttccagtcttctgcaatcttcagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctaatgaactacaacttc 22663320  T
Q  228 tggtga 233  Q
    | ||||    
T  22663321 tagtga 22663326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Original strand, 22673785 - 22673988
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||  | ||||||||||  ||| ||||||| |||||||| ||||    
T  22673785 tagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgtcttctaatccttccaaaatagatgtt 22673884  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||  ||| | | |||||||||||||    | ||||| || ||||| || |||| |  |||||||||||||  ||||| |||| |||||||| || ||||    
T  22673885 gctatacttttctagtcttctgcaatctccagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctccggatgaactacaacttc 22673982  T
Q  228 tggtga 233  Q
    ||||||    
T  22673983 tggtga 22673988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24833198 - 24832997
Alignment:
Q  31 tggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaag-agcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgc 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||   || | || ||||||||||| ||||||||| |||||| |||   ||||    
T  24833198 tggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtaccatgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcccttcaaagtagccattgc 24833099  T
Q  130 ttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaat-ccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttct 228  Q
    |||||| |  |||||||||||||| |||| ||||| || ||| ||||| ||||||  ||||||| |||||  ||||| |  |||||||||| ||||||||    
T  24833098 ttcact-tttcagtcttctgcaatccttagacgaggttgaatcccattaaacagcttttgaagccttaag--ttgcatcctctgatgaactgcagcttct 24833002  T
Q  229 ggtga 233  Q
    |||||    
T  24833001 ggtga 24832997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 85
Target Start/End: Original strand, 25164058 - 25164134
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaag 85  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  25164058 agcagagacacaaattgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgacaacactcttcaaag 25164134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 6407714 - 6407926
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||    ||||||||||| |||       
T  6407714 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtagaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcatccaatgccttc--- 6407810  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
          ||||||||  ||||    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| || ||||||  |||||||||||||||  ||| ||    
T  6407811 ------caaaatagccgttgtaatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatcctttaaacagcttttgaagctttaagtt--gcatct 6407901  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  6407902 cctgatgaactgcagcttctggtga 6407926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 19956482 - 19956376
Alignment:
Q  31 tggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgct 130  Q
    ||||||||||||||||| | || ||| |||||| || | |||||||||||||| ||  | | ||||||||| ||||||||||||  || |||| ||||||    
T  19956482 tggaggtagtggttgtacaattagtacaattgtcctttttcaacgctcttcaatgaaaaagtatccaatgccttcaaatcctttagaattagtcgttgct 19956383  T
Q  131 tcactct 137  Q
    |||||||    
T  19956382 tcactct 19956376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 22461782 - 22461656
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||| ||||||||||  ||| |||| |||||| || | ||||| |||| ||| ||  | ||||||||||| ||||||||| ||  || |||| |||    
T  22461782 tagtggagatagtggttgtgcactccgtacaattgtcctttttcaactctctccaacgaataagcatccaatgccttcaaatccatttgaattagtcgtt 22461683  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatg 154  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||    
T  22461682 gcttcattcttctagtcttctgcaatg 22461656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 14989614 - 14989522
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgc 101  Q
    |||||||||| | || || |||||||| ||||||||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||  | |||||||||||    
T  14989614 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 14989522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 13430772 - 13430699
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgc 101  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| |||||  ||||  | |||||||||||    
T  13430772 tagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataagcatccaatgc 13430699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 101
Target Start/End: Original strand, 21301029 - 21301102
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgc 101  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||| ||  |||||||||||||||||||  | ||| | |||||||||||    
T  21301029 tagtggaagtagtggttgtacactttgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaggagtaagcatccaatgc 21301102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 18151809 - 18151717
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgc 101  Q
    |||||||||| | || || |||||||| ||||||||||| | |||||| ||  |||||||||||| ||||||  ||||  | |||||||||||    
T  18151809 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaaacgtactatgtcaatgctctttgaagaataagcatccaatgc 18151717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 80
Target Start/End: Original strand, 21288410 - 21288462
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctctt 80  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  21288410 tagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgaactatgtcaacgctctt 21288462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 161; Significance: 7e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Original strand, 14644 - 14912
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||    
T  14644 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtaaaattgtactttgtcaacgctcttcaaagtacaagcatccaatgccttcaaa 14743  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  |    
T  14744 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcattt 14843  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    ||| ||||  || |||||||||||| ||||||||| |||||||| || | ||||||| | |||||||||    
T  14844 cctaatgatttttagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgtttctaatgaactagcttctgatga 14912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 161; Significance: 7e-86; HSPs: 44)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 13435547 - 13435798
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13435547 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaacaatcattcaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgtt 13435646  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||     
T  13435647 gcttcactcttccaatcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaaaatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagctta 13435746  T
Q  228 tggtgacct--tgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    |||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13435747 tggtgatcttctgcttctgatgagatgcttttgatgaacttgcttctgatga 13435798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Original strand, 24116824 - 24117094
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  24116824 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 24116923  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcc-cttgaagctttaagttttgcacc 207  Q
    |||||||||||||   | | ||||||||  |  ||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |    
T  24116924 tcctttcaaaataaccgctacttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagccttttgaagctttaagtcttgcatc 24117023  T
Q  208 tcctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaa-tgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    | ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24117024 ttctgatgaacttcatcttctggtgatcttgcttctaaccgagatgcttctgatgaacttgtttctgatga 24117094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 12715573 - 12715333
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  12715573 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttctacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataggcatacaatgctttcaaa 12715474  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcc-cttgaagctttaagttttgcacc 207  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |    
T  12715473 tcatttcaaaatagtcgttgcttcactctttcaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtcttgcatc 12715374  T
Q  208 tcctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 248  Q
    |||||||||||| || ||||| |||| ||||||||| ||||    
T  12715373 tcctgatgaactacaacttctagtgatcttgcttctgatga 12715333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 28 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14100574 - 14100373
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14100574 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtataattgtactttgtcaacgctctttaaagaagaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgtt 14100475  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  14100474 tcttcactcttccagtcttctacaatgcttagatgagattaaatccattgaacatcctttgaaactttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttc 14100375  T
Q  228 tg 229  Q
    ||    
T  14100374 tg 14100373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Original strand, 13602168 - 13602438
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||| || ||||||| | |||||||| ||||||||||  | ||||||||||| |||||     
T  13602168 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttatacacttcttacaattgtattttgtcaacgttcttcaaagaataagcatccaatgccttcaat 13602267  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||    
T  13602268 tcatttcaaaatagtggttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 13602367  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    |||||||||||  ||||||| |||| |||  |||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  13602368 cctgatgaactatagcttcttgtgatcttcggcttttgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 13602438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Original strand, 9717841 - 9718109
Alignment:
Q  11 cagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatc 110  Q
    |||||||| | || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| || ||||| ||||| || |||||    
T  9717841 cagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatcaaatgcctttaaatc 9717940  T
Q  111 ctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcc 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||    
T  9717941 ctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcc 9718040  T
Q  211 tgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    |||||||||  ||||||| |||| |||   ||||| ||| ||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  9718041 tgatgaactagagcttctagtgatctttaacttctgatgggatgcttatgataaacttgcttctgatga 9718109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20112852 - 20112628
Alignment:
Q  10 gcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  20112852 gcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaat 20112753  T
Q  110 cctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcc-cttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||| ||||| ||    
T  20112752 cctttcaaaatagtcgttgcttcattcttccggtcttctgcaatgcttagaagagattaaatccattgaacaacctttttaagctttaagtcttgcatct 20112653  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    | ||||||||||||||||| |||||    
T  20112652 cttgatgaacttcagcttcaggtga 20112628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 277
Target Start/End: Original strand, 23284564 - 23284830
Alignment:
Q  13 gagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcct 112  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || || |||| |||||| ||||||||||    
T  23284564 gagacacaaactgagtagtggagataatggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaggaacaagcattcaatgccttcaaatcct 23284663  T
Q  113 ttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctg 212  Q
    ||||||||||  ||||||||||| | |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  23284664 ttcaaaataggcgttgcttcacttttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctg 23284763  T
Q  213 atgaacttcagcttctggtgacct--tgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    |||||||||||||||| | || ||  ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  23284764 atgaacttcagcttctagcgatcttctgcttctgatgagatgcttctaatgaacttgcttctgatga 23284830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 19086154 - 19086368
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||        
T  19086154 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgcttt---- 19086249  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaa-cagcccttgaagctttaagttttgcacc 207  Q
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |    
T  19086250 ------caaaatagtcgttgcttcactctcccagtcttctgcaatacttagacgagattaaatccattgaatcagcccttg-agctttaagtcttgcatc 19086342  T
Q  208 tcctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  19086343 tcctgatgaacttcagcttctggtga 19086368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Original strand, 15302196 - 15302435
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| || |||    
T  15302196 agcagagacactaactgagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtacaatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgcctttaaa 15302295  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||| ||    
T  15302296 tcctttcaaaatagccgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgacgctttaagtcttgcatct 15302395  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 248  Q
    ||| |||| ||| ||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  15302396 cctaatgagctttagcttttggtgatcttgcttctgatga 15302435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 15531777 - 15531503
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| || ||||||||||| ||||||    
T  15531777 agcagagacaaagacagagtagtggaggtagtggttgtacgcttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 15531678  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    |||||||||||||   |||| || ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||| ||||| ||    
T  15531677 tcctttcaaaataaccgttgttttactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttcaagctttaagtcttgcatct 15531578  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgacct--tgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatgatgtc 281  Q
     |||||||||| || |||||||||| ||  || |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  15531577 tctgatgaactacaacttctggtgatcttatgattctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgattatgtc 15531503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 9 - 262
Target Start/End: Original strand, 19623975 - 19624228
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtacta-tgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaa 107  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||    
T  19623975 agcaaagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactagtgt-aacgctctccaaagaacaatcatccaatgctttcaa 19624073  T
Q  108 atcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacc 207  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||  |  ||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||  ||||| |    
T  19624074 atcctttcagaatagtcgttgcttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagacttgcatc 19624173  T
Q  208 tcctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatga 262  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  19624174 tcctgatgaacttcagcttctggtgatcttgtttctgatgagatgcttctgatga 19624228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 32544261 - 32544485
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||  |  |||||||||| || |||    
T  32544261 agcagagacagaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataaacatccaatgcctttaaa 32544360  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||    
T  32544361 tcctttcaaaatagacgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 32544460  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||    
T  32544461 cctgatgaactagagcttatggtga 32544485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26972379 - 26972157
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||| |||||||||||||  |||| ||  |||||||||| || |||    
T  26972379 agcagagacaaatactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgca--attgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgcctttaaa 26972282  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||    
T  26972281 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttcaagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 26972182  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||    
T  26972181 cctgatgaaatagagcttctggtga 26972157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 9 - 195
Target Start/End: Original strand, 18378310 - 18378496
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  18378310 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttatcaacgctcttcaaagaacatgcatccaatgccttcaaa 18378409  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagcttt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  18378410 tcctttcaaaatagttgttgcttgactcttccagtcttttgcaatacttagacgagatttaatccattgaacaaccgttgaagcttt 18378496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 243
Target Start/End: Original strand, 29918032 - 29918246
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| || |||||  |||| |||||||| ||||||| |||| |||    
T  29918032 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatctgatgccttcaaatcttttcaaactagtcgtt 29918131  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  29918132 gcttcacttttccaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatcca-tgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactacagcttc 29918230  T
Q  228 tggtgaccttgcttct 243  Q
    || ||| |||||||||    
T  29918231 tgatgaacttgcttct 29918246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 199
Target Start/End: Original strand, 15987232 - 15987420
Alignment:
Q  12 agagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaat-c 110  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |    
T  15987232 agagacacaaactgagtaatggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 15987331  T
Q  111 ctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagt 199  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  15987332 cttttaaaatagtcattgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttgaagctctaagt 15987420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 36 - 243
Target Start/End: Original strand, 19688789 - 19688994
Alignment:
Q  36 gtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcact 135  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19688789 gtagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtccttgcttcact 19688888  T
Q  136 ctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctggtgacc 235  Q
    || ||||| |||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  19688889 cttccagttttctacaatgcttggacgagaataaatccattgaacaacctttgaagctttaag--tcgcatctcctgatgaacttcagcttctgatgaac 19688986  T
Q  236 ttgcttct 243  Q
    ||||||||    
T  19688987 ttgcttct 19688994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 43 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 34451787 - 34451597
Alignment:
Q  43 ttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccag 142  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||  |||    
T  34451787 ttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaataggcatacaatgctttcaaatcctctcaaattagtcgttgcttcactctttcag 34451688  T
Q  143 tcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    |||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  34451687 tcttctgcaatgcttagacgatactgaatccattgaacagcctttgaatctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtga 34451597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 28 - 276
Target Start/End: Original strand, 21625116 - 21625363
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||  |||| || |||| |||||| ||||||| |||||||| |||  |||    
T  21625116 tagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgttaacgctctttgaagaacaagcatgcaatgccttcaaatgctttcaaa-tagccgtt 21625214  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||    || ||||    
T  21625215 gctttactcttccaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctgtaagtcttgcatctcctgatga--gacaacttc 21625312  T
Q  228 tggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatg 276  Q
    |||||| |||  |||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  21625313 tggtgatcttcagcttctgatgagatgcttatgatgaacttgcctctgatg 21625363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20730837 - 20730635
Alignment:
Q  29 agtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttg 128  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||||||||  |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  20730837 agtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaactagtcgttg 20730738  T
Q  129 cttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttct 228  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||   | || || ||||||||||||| ||||||||    
T  20730737 cttcacttttccagtcttctgcaatacttagatgagattaaatcccttgaacagcctttgaagcttt--ttgttacatctcctgatgaactgcagcttct 20730640  T
Q  229 ggtga 233  Q
     ||||    
T  20730639 agtga 20730635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 92 - 277
Target Start/End: Original strand, 25597558 - 25597745
Alignment:
Q  92 catccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaag 191  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||  || |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  25597558 catccaatgccttcaaatcctttcgaaatagccgtcgcttcactcttccagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttgaag 25597657  T
Q  192 ctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    |||||||| |||||  |||||||||||| || |||||||||| |||  |||| | ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||    
T  25597658 ctttaagtcttgcatgtcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttatgatgagatgcttctgatgaacttgcttcagatga 25597745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 233
Target Start/End: Original strand, 18435574 - 18435776
Alignment:
Q  31 tggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgct 130  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||| |||||||||||||  |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18435574 tggaggtagtggttgtacactttgtacacttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgct 18435673  T
Q  131 tcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctgg 230  Q
    ||||| | | |||||| || ||| |||| |||||||||||||||||||| | || |  ||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||| |    
T  18435674 tcacttttctagtcttttgaaattcttagacgagattaaatccattgaataaccttcaaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctag 18435773  T
Q  231 tga 233  Q
    |||    
T  18435774 tga 18435776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Original strand, 22802156 - 22802359
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||  |||| || ||||||||||| || |||| |||||||| | || |||    
T  22802156 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgttaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaattctttcaaacttgtcgtt 22802255  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    | |||||| | |||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||| || |||||||||||  | ||||| ||||||||||||| || ||||    
T  22802256 gtttcacttttccagtcgtctgcaatgcttagacaatattaaatccattgaacaacctttgaagcttta--tgttgcatctcctgatgaactacaacttc 22802353  T
Q  228 tggtga 233  Q
    ||||||    
T  22802354 tggtga 22802359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16265303 - 16265081
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| | |||||||||||  |||| || ||||||||||| ||||||    
T  16265303 agcagagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgcacacttcgtacaattgtactttctcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcattcaaa 16265204  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
     ||||||||  || | ||||||||||| | |||||| | ||||||||||| | |||||||||||||||||||| || || ||||||||  | ||||| ||    
T  16265203 acctttcaatctactcgttgcttcacttttccagtcctgtgcaatgcttagatgagattaaatccattgaacaacctttcaagcttta--tgttgcatct 16265106  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    | ||| ||||| |||||||||||||    
T  16265105 cttgacgaactgcagcttctggtga 16265081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22076560 - 22076338
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||  | ||||| ||||||||| ||    
T  22076560 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaatgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgctttccaa 22076461  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||| | | |||||||||||||  ||| ||||| |||||||| || ||||||  || ||||||||||  ||||| ||    
T  22076460 tccttccaaaatagtcgttgctatacttttcgagtcttctgcaatctttagacgagtttaaatcctttaaacagcttttaaagctttaag--ttgcatct 22076363  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    ||||||||||| || ||||||||||    
T  22076362 cctgatgaactacatcttctggtga 22076338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19833167 - 19832963
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaag-agcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgt 126  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||   || | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  19833167 tagtggaggtagtgcttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaaatagtcgt 19833068  T
Q  127 tgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagctt 226  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||  ||| | ||| || ||||| || ||||||  || ||||||||||  ||||| ||||||||||||| || |||    
T  19833067 tgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagatgagtttgaatccgttaaacagcttttaaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacatctt 19832970  T
Q  227 ctggtga 233  Q
    |||||||    
T  19832969 ctggtga 19832963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Original strand, 21618259 - 21618462
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||    
T  21618259 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatccttccaaaatagtcgtt 21618358  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||| ||| | |||||||||| ||||  ||| | ||| || ||||| || |||| |  |||||||||||||  ||||| || |||||||||| |||||||    
T  21618359 gctttacttttccagtcttctacaatctttagaagagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatcttctgatgaactacagcttc 21618456  T
Q  228 tggtga 233  Q
    ||||||    
T  21618457 tggtga 21618462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 231
Target Start/End: Original strand, 15954718 - 15954919
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| |||||||||||||  || | || |||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||    
T  15954718 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaataacaagcattcaatgccttcaaatcctttcaaattagtcgtt 15954817  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||||| | | |||||||||||||||  ||| | ||| || ||||| || ||||||  |||||||||||||  ||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  15954818 gcttcatttttccagtcttctgcaatctttagaagagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcttgatgaactacagcttc 15954915  T
Q  228 tggt 231  Q
    ||||    
T  15954916 tggt 15954919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 10640553 - 10640384
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgt-caacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgt 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || | | |||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||  || |||| ||    
T  10640553 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttttcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaatccttttgaattagtcgt 10640454  T
Q  127 tgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaa 197  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||| ||  || |||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  10640453 tgcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaa 10640384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Original strand, 16877228 - 16877431
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| |||||||||||||  | ||    ||||||||| | |||||||||||| || ||||| |||    
T  16877228 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaggaattagcatccaattccttcaaatccttttaagatagtcgtt 16877327  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||||||| || ||||||||||||||  ||| ||||| || |||||||| |||| |  |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| || |||     
T  16877328 gcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacaacttt 16877425  T
Q  228 tggtga 233  Q
    ||||||    
T  16877426 tggtga 16877431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 16336123 - 16336345
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || ||||| || ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||  ||||  | |||| |||||| ||| ||    
T  16336123 agcagagacaaaaacagagtagtgtagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcattcaatgccttctaa 16336222  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||| | |||||||||||||||| ||| ||||| || ||||| || |||| |  ||||||||| |||  ||||| ||    
T  16336223 tccttccaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatgtttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagcttcaag--ttgcatct 16336320  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    |||||||| || || ||||||||||    
T  16336321 cctgatgatctacaacttctggtga 16336345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 19470685 - 19470933
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || | || ||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||||  || |||| |||    
T  19470685 tagtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaattgtcctttttccacgctctgcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttgaattagtcgtt 19470784  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||||| ||| |  ||||| |||||||| ||  || |||||||||  ||||||| || ||||||||| |  | |  || ||  |||||| ||||| ||||    
T  19470785 gcttcattcttctggtcttgtgcaatgc-taggcgtgattaaatctgttgaacaacctttgaagcttcagttctctcatcttttgatgatcttcaacttc 19470883  T
Q  228 tggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    | ||||  |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19470884 ttgtgatgttgcttctgatgaggtgcttctgatgaacttgcttctgatga 19470933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 20488052 - 20487927
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| |||||||||||||  |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  20488052 tagtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagccgtt 20487953  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaat 153  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||    
T  20487952 gcttcacttttacagtcttctgcaat 20487927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 229
Target Start/End: Original strand, 12349008 - 12349206
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||| ||  |||||||||||||||||||  ||||  | ||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||    
T  12349008 tagtggagatagtggttgtacactttgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctttcaatcctttcaaaatagtcgtt 12349107  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||  ||| | ||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |  ||||||  |||||||| ||||  ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  12349108 gctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctctaag--ttgcatctcctgatgaactgcagcttc 12349204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 156
Target Start/End: Original strand, 26943591 - 26943719
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||  | |||||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||| |  ||||||  |||    
T  26943591 tagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaattgtacttcgccaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttctaatcctattgaaatagcggtt 26943690  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgct 156  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  26943691 gcttcactcttctagtcttctgcaatgct 26943719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 183
Target Start/End: Original strand, 12423276 - 12423430
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||  | |||| |||||| ||| ||||||||||||||||| |||    
T  12423276 tagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaaggtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatacaatgccttccaatcctttcaaaatagtcgtt 12423375  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagc 183  Q
    |||  ||| | |||||||||||| || |||| ||||| || |||||||| ||||||    
T  12423376 gctatacttttccagtcttctgc-attcttagacgagtttgaatccattaaacagc 12423430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 100
Target Start/End: Original strand, 25594064 - 25594155
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatg 100  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  25594064 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgcgcttcaaagaacaagcatccaatg 25594155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 28 - 117
Target Start/End: Original strand, 21235140 - 21235229
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaa 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||  |||| || ||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  21235140 tagtggaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatcgaatgccttcaaatgctttcaa 21235229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 233
Target Start/End: Original strand, 21235240 - 21235331
Alignment:
Q  140 cagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||  | ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  21235240 cagccttttgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttaaagcttta--tgttgcatctcctgatgaactgcagcttctagtga 21235331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 33352079 - 33351967
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||  |  ||||||||| |||  ||    
T  33352079 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtgattgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt-gaagaataaacatccaatgtttttcaa 33351981  T
Q  109 tcctttcaaaatag 122  Q
    ||||||||||||||    
T  33351980 tcctttcaaaatag 33351967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 19066171 - 19066079
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgc 101  Q
    |||||||||| | || || ||||||| |||||||||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||  ||||  | |||||||||||    
T  19066171 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 19066079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Original strand, 17381517 - 17381588
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctctt 80  Q
    |||||||||| | || || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||| |||||||||||||    
T  17381517 agcagagacaaaaacagaatagtggaggtagtgattgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctt 17381588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 210 - 277
Target Start/End: Original strand, 26943761 - 26943828
Alignment:
Q  210 ctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||  |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  26943761 ctgatgatcttcagcttttagtgatgttgcttctaatgaggtgcttctgacgaacttgcttctgatga 26943828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18734 - 18466
Alignment:
Q  11 cagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatc 110  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||| ||||||||    
T  18734 cagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtaaaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagtatccaatgccttcaaatc 18635  T
Q  111 ctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcc 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||   ||||    
T  18634 ctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaaatcttgtgtctcc 18535  T
Q  211 tgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||  |||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18534 tgatgaactgcagcttctggtgatcttcagcttatgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 18466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 61)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 49642926 - 49642658
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| ||||||    
T  49642926 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaatcatccaatgccttcaaa 49642827  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||    
T  49642826 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatctattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 49642727  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgat 275  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  49642726 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctaatgagatgcttctgatgaccttgcttctgat 49642658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 14393168 - 14392900
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  14393168 agcagagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 14393069  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| | ||    
T  14393068 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaaactttaagtcttgtatct 14392969  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    ||| |||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  14392968 cctaatgaacttcagcttctagtgatcttgcttttgatgagatgcttatgatgatcttgcttctgatga 14392900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 12963249 - 12963010
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  12963249 agcagagacacatactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacactcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 12963150  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
     ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  12963149 accttctaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcattgcttagacaagattaaatcccttgaacaacccttgaagctttaagtcttgcatct 12963050  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 248  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||    
T  12963049 cctgatgaactacaacttctggtgatcttgcttctgatga 12963010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Original strand, 20646149 - 20646420
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  20646149 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 20646248  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcc-cttgaagctttaagttttgcacc 207  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |  ||||||| ||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||||| |    
T  20646249 tcctttcaaaatagacgttgcttcactcttctggtcttctacaatgcttggacgagatgaaatacattgaacagccttttaaagctttaagtcttgcatc 20646348  T
Q  208 tcctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    |||||||||||| || |||||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  20646349 tcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 20646420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Original strand, 6090727 - 6090997
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||| || ||||| || |||| |||||| ||||||    
T  6090727 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaaagctttttaaagaacaagcattcaatgccttcaaa 6090826  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||| ||||| ||    
T  6090827 tcctttcaaattagatgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgagcaacctttgaagttttaagtcttgcatct 6090926  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgacct--tgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6090927 cctgatgaacttcagcttctggtgatcttctgcttctgatgagatgcttttgatgaacttgcttctgatga 6090997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 277
Target Start/End: Original strand, 13948334 - 13948601
Alignment:
Q  12 agagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcc 111  Q
    |||||||||  |||| || ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  13948334 agagacacaacctgagtaatggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 13948433  T
Q  112 tttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcct 211  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||| ||||| |||||    
T  13948434 tttcaaaatagtcgttgcttcactattccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacatcctttgacgctttaagtcttgcatctcct 13948533  T
Q  212 gatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  13948534 gatgagctttagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgataaacttgcttctgatga 13948601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Original strand, 37467328 - 37467567
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  37467328 agcagagacacaaactgggtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 37467427  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||    
T  37467428 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgcttagatgagattaaatccattgaacaagctttgaagatttaagttttgcatct 37467527  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 248  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  37467528 cctgatgaactactgcttctggtgatcttgcttctgatga 37467567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 52920420 - 52920670
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||| |||| ||| ||||||||    
T  52920420 tagtagaggtagtggttgtatacttcgtacaattttaatttgtcaacgctctttaaagaacaagcatcaaatgccttcaaatacttt-aaattagttgtt 52920518  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  52920519 gcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgagcagcctttgaaactttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttc 52920618  T
Q  228 tggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    |||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  52920619 tggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 52920670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 9 - 279
Target Start/End: Original strand, 31303381 - 31303653
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||  ||||||    
T  31303381 agcagagacacaaactgagtagtggagatagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaaacatcaaatgtcttcaaa 31303480  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||| || || ||    
T  31303481 tcctttcaaaatagttgttccttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttaaagctttaagtctttcatct 31303580  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatgatg 279  Q
    |||||  ||||  |||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  31303581 cctgagtaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatgatg 31303653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 277
Target Start/End: Original strand, 15903196 - 15903464
Alignment:
Q  12 agagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcag-gcatccaatgctttcaaatc 110  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||    
T  15903196 agagacacaaactgagtagtggagatagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaaagcatgcaatgctttcaaatc 15903295  T
Q  111 ctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcc 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||    
T  15903296 ctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttctgtaatgcttagacgagattgaatccattgaacagcgtttgaagctttaagtcttgcatctcc 15903395  T
Q  211 tgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    |||| || | |||||| |||||| |||  |||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  15903396 tgataaattacagcttttggtgatcttcagcttctgatgagatggttctgatgaacttgcttctgatga 15903464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 2561183 - 2561407
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||| ||||  |||| || |||||||||   ||||||    
T  2561183 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacacttgtactttgtcaacgatctttgaagaacaagcatccaatttcttcaaa 2561282  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||    
T  2561283 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 2561382  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    |||||||||||  ||||||||||||    
T  2561383 cctgatgaactagagcttctggtga 2561407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 28 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 17239067 - 17238847
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  17239067 tagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaatcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgat 17238968  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||| ||||    
T  17238967 gcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgatcagcctttgaagctttaagtcttgcatctccttatgcacttcatcttc 17238868  T
Q  228 tggtgaccttgcttctaatga 248  Q
    |||||| ||||||||| ||||    
T  17238867 tggtgatcttgcttctgatga 17238847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 18121786 - 18121511
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||  ||||  | |||| |||||| || |||    
T  18121786 agcagagacaaacacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtaaacgctctttgaagaaaaagcattcaatgcctttaaa 18121687  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| | ||||| ||    
T  18121686 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgctcaaacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaaatcttgcatct 18121587  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatg-agatgcttttgatgaacttgattctgatgatgtc 281  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |||  |||| | ||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18121586 cctgatgaactagagcttctggtgatctttagcttatgatgaacttgcttttgatgaacttgcttctgatgatgtc 18121511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Original strand, 28582103 - 28582372
Alignment:
Q  11 cagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatc 110  Q
    |||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||||  |||| || |||||||||||  | |||||    
T  28582103 cagagacaaaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtattttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccattaaatc 28582202  T
Q  111 ctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcc 210  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  28582203 ctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccaatcttctgcaatgcatagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcc 28582302  T
Q  211 tgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatg-agatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    ||||||| |  ||||||||||||  ||  |||||||||| |  ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  28582303 tgatgaaatagagcttctggtgattttcagcttctaatgtacttgcttctgatgaacttgcttctgatga 28582372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 194
Target Start/End: Original strand, 41494994 - 41495179
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  41494994 agcagatacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 41495093  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctt 194  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41495094 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctt 41495179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 18142916 - 18142677
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||  ||||  | |||| |||||| || |||    
T  18142916 agcagagacaaacacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtaaacgctctttgaagaaaaagcattcaatgcctttaaa 18142817  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||| ||    
T  18142816 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgctcaaacgagattgaatccattgaatagcctttgaagctttaaatcttgcatct 18142717  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 248  Q
    |||||||||||  |||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  18142716 cctgatgaactagagcttctgatgaacttgcttctgatga 18142677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 12726394 - 12726155
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||| ||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  12726394 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgttaactctctttaaagagtaagcatccaatgctttcaaa 12726295  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| | ||    
T  12726294 tcctttcaaaatagtcgttacttcactcttctagtcttctgcaaagcttagacgagattgaatccattgaatagcctttgaagctttaagtcttgaatct 12726195  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 248  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||| |||| ||||    
T  12726194 cctgatgaacttcaacttcttgtgatcttgtttctcatga 12726155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 38177788 - 38177587
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38177788 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgtt 38177689  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||  ||||||    
T  38177688 gcttcactcttccaatcttctgcattgctcagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctaataaactagagcttc 38177589  T
Q  228 tg 229  Q
    ||    
T  38177588 tg 38177587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 29951602 - 29951335
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    ||||||||| || ||||| | |||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  29951602 agcagagactcaaactgagtggtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgttaactctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 29951503  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |  |  ||    
T  29951502 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcctctggtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaaaaacctttgaagctttaagtctctcgtct 29951403  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctga 274  Q
     ||||||||||||||||||| |||| |||  |||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||    
T  29951402 tctgatgaacttcagcttctagtgatcttcagcttctgataaggtgcttctgatgaacttgcttctga 29951335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 9 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 30000756 - 30000489
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    ||||||||| || ||||| | |||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  30000756 agcagagactcaaactgagtggtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgttaactctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 30000657  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |  |  ||    
T  30000656 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcctctggtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaaaaacctttgaagctttaagtctctcgtct 30000557  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctga 274  Q
     ||||||||||||||||||| |||| |||  |||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||    
T  30000556 tctgatgaacttcagcttctagtgatcttcagcttctgataaggtgcttctgatgaacttgcttctga 30000489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 49553634 - 49553407
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||   |||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||   |    
T  49553634 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcact 49553535  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||| ||||  ||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  49553534 gcttcactctttcaatcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacagcctttgaaactttaagtcttgcatctcctgatgaacttcggcttc 49553435  T
Q  228 tggtgaccttgcttctaatgagatgctt 255  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  49553434 tggtgatcttacttctgatgagatgctt 49553407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 47405566 - 47405363
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||||  |||| ||  |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  47405566 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctttgaagaacaaacatcaaatgccttcaaatcctttcaaactagttgtt 47405467  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||||| | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  47405466 gcttcatttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgttgcatctcgtgatgaactgcagcttc 47405369  T
Q  228 tggtga 233  Q
    ||||||    
T  47405368 tggtga 47405363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Original strand, 14969341 - 14969546
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||| ||  ||||  | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  14969341 tagtggagatagtggttgtacacttcgtaaaaatgtactttgtcaacgctatttgaagaataagcatccaatgccatcaaatcctttcaaaatagttgtt 14969440  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  |||| |||||||  ||||||    
T  14969441 gctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatatcctcatgaactagagcttc 14969540  T
Q  228 tggtga 233  Q
    ||||||    
T  14969541 tggtga 14969546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 13780748 - 13780576
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||    
T  13780748 agcagagacacaaactgagtcgtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaataacaagcatccaatgccttcaaa 13780649  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaaca 181  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  13780648 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaaca 13780576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16658782 - 16658558
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  16658782 agcagagacacaaactaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtattatgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgctttcaaa 16658683  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||   |  ||||| || |||||||  |||||||| |||| |||||||| || |||||| || |||| ||||| ||    
T  16658682 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactgctctggtcttttgtaatgcttggacgagattgaatcaattgaacaacctttgaagtttcaagtcttgcatct 16658583  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    ||||||||||| || ||||||||||    
T  16658582 cctgatgaactacaacttctggtga 16658558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 40799869 - 40800091
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| || | ||||||| | ||||||    
T  40799869 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagtatccaattccttcaaa 40799968  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    | |||||||| |||| |||||||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |  |||| ||    
T  40799969 tactttcaaactagtcgttgcttcgcttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgatgcatct 40800066  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    | ||||||||| |||||||||||||    
T  40800067 cttgatgaactgcagcttctggtga 40800091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Original strand, 47207720 - 47207924
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| || ||||||||||| |||||||| ||||||| |||  |||    
T  47207720 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcatttcaaactagccgtt 47207819  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgc-ttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagctt 226  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||  | ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  47207820 gcttcacttttccagtcttctgcaatgctttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagtttta--tgttgcatctcctgatgaactgcagctt 47207917  T
Q  227 ctggtga 233  Q
    |||||||    
T  47207918 ctggtga 47207924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 19889107 - 19888869
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| |||||   |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||  || |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  19889107 agcagagacacaaactgag--gtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtaatatgtcaatcctattcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 19889010  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacag-cccttgaagctttaagttttgcacc 207  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  |  ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||| |    
T  19889009 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcatctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagtctttttaagctttaagtcttgcatc 19888910  T
Q  208 tcctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 248  Q
    || |||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  19888909 tcttgatgaactttagcttctagtgatcttgcttctgatga 19888869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 36 - 205
Target Start/End: Original strand, 13824091 - 13824260
Alignment:
Q  36 gtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcact 135  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| ||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13824091 gtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcatttcaaaatagttgttgcttcact 13824190  T
Q  136 ctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgca 205  Q
    || |||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  13824191 cttccagtcttcttcattgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgca 13824260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Original strand, 2785078 - 2785282
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaag-agcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgt 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||   || | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2785078 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaaatagttgt 2785177  T
Q  127 tgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagctt 226  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||  ||| ||||| || ||||| || |||| |  |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| || |||    
T  2785178 tgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacaactt 2785275  T
Q  227 ctggtga 233  Q
    |||||||    
T  2785276 ctggtga 2785282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20627576 - 20627373
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| |||||||||||||  |  | || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  20627576 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgataaacaagcatccaatgccttcaaatccattcaaaatagttgtt 20627477  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||||||| | |||||||||||||||  ||| ||||| || |||||||| |||| |  |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| || ||||    
T  20627476 gcttcacttttccagtcttctgcaatcattagacgagtttgaatccattaaacatcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcaacttc 20627379  T
Q  228 tggtga 233  Q
    ||||||    
T  20627378 tggtga 20627373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Original strand, 11223577 - 11223780
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||   |||| |||||||||||||  |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  11223577 tagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacatactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgtt 11223676  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||||||| |  |||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||  ||||||||  |||  ||| | ||||||||||||| | |||||    
T  11223677 gcttcactttttcagtcttctgcaatgcatagacgagattgaacccattgaacagcttttgaagctcaaag--ttgtatctcctgatgaactgctgcttc 11223774  T
Q  228 tggtga 233  Q
    ||||||    
T  11223775 tggtga 11223780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 199
Target Start/End: Original strand, 16032520 - 16032709
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  16032520 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 16032619  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagt 199  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||  |||||||||| ||  ||  |  |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  16032620 tcctttcaaaatagtcgttgatacactctcctggtcttctgcagtg-ataggcatgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagt 16032709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24775698 - 24775474
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || ||||||| |||||||||||| |||||||| ||  ||||| |||||| ||||||  ||||  | |||| |||||| ||||||    
T  24775698 agcagagacaaaaacagagtagtggatgtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaaagctctttgaagaataagcattcaatgccttcaaa 24775599  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||| ||||| || ||||| || ||||||  |||||||||||||  ||||| ||    
T  24775598 tcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatct 24775501  T
Q  209 cctgatgaact--tcagcttctggtga 233  Q
    |||||||||||   |||||||||||||    
T  24775500 cctgatgaactgcgcagcttctggtga 24775474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Original strand, 14955441 - 14955644
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| |||||||||||||  ||||  | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  14955441 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatactttcaaaatagttgtt 14955540  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||| ||  | |||||||||||||||  ||| ||||| || |||||||| ||||||  |||||||||| ||  || || ||||||||||||| || ||||    
T  14955541 gctttacctttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagctttgag--ttacatctcctgatgaactgcaacttc 14955638  T
Q  228 tggtga 233  Q
    ||||||    
T  14955639 tggtga 14955644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 53056891 - 53056669
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| ||| |||||||||  |||| || ||||||||||| ||||||    
T  53056891 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtaaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 53056792  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||  ||| ||||  || |||||||| ||||||  ||||| | |||||  ||||| |     
T  53056791 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgatgttgaatccattaaacagcttttgaaaccttaag--ttgcatcc 53056694  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    | ||||||||| |||||||| ||||    
T  53056693 catgatgaactgcagcttctagtga 53056669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 46349989 - 46349786
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| | |||   |||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||    
T  46349989 tagtggaggcagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaatgttctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagtcgtt 46349890  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||| |  ||||||  |||||  ||||  ||||||||||||| || ||||    
T  46349889 gcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattggatcaattgaacaacttttgaagtcttaag--ttgcttctcctgatgaactgcaacttc 46349792  T
Q  228 tggtga 233  Q
    ||||||    
T  46349791 tggtga 46349786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Original strand, 22140759 - 22140996
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || ||||||||||||||||| || |||||||| |   |||||||||||||||||||  |||| || |||||||||| |||||||    
T  22140759 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttatacacttcgtacatacgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgttttcaaa 22140858  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
     || ||||||||||| |||| ||||||   | ||||||||||||| ||||  |||| || ||||| |||||||||  ||||| |||||||  ||||| ||    
T  22140859 acccttcaaaatagtcgttggttcacttatctagtcttctgcaatccttaggcgagtttgaatccgttgaacagcttttgaaactttaag--ttgcatct 22140956  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 248  Q
    |||||||||||  |||||||| ||| || |||||| ||||    
T  22140957 cctgatgaactgtagcttctgatgaactagcttctgatga 22140996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 20725101 - 20725349
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||| ||||  ||||| |||||||| |||||| || | ||||||||||||||  | || ||||||||||  ||||||||||||  || |||| |||    
T  20725101 tagtggagatagttattgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaagaaacaagcatccaatgtcttcaaatccttttgaattagtcgtt 20725200  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||| || ||| ||||| |||  |||||||||| |||||||||||| | |  || ||  |||||| ||||||||||    
T  20725201 gcttcactcttctggtcttctgcaatgc-tagacgtgattagatcttttgaacagcctttgaagctttaattctctcagcttatgatgatcttcagcttc 20725299  T
Q  228 tggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    ||||||  || ||| | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  20725300 tggtgatgtttcttttgatgaggtgcttatgatgaacttgcttctgatga 20725349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 5213591 - 5213822
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||| ||||||||| || ||  |  || |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  5213591 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactacgtcaacgcttttgaataataag-catctaatgccttcaaatccttccaaaatagttgtt 5213689  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||  ||| | |||||||||||||||  ||| ||||| || ||||| || ||||||  |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  5213690 gctatacttttccagtcttctgcaatctttatacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacagcttc 5213787  T
Q  228 tggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatga 262  Q
    || | | ||||||| | ||||  ||||| ||||||    
T  5213788 tgataaacttgcttatgatgaactgcttctgatga 5213822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 22804187 - 22804059
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||| |||||     
T  22804187 agcagagacacaaattgagtagtggagatagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaatcatcgaatgccttcaag 22804088  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactct 137  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  22804087 tcctttcaaaatagccgttgcttcactct 22804059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 19249557 - 19249387
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||  || ||| ||||    
T  19249557 tagtggagtaagtggttgtacacttcgtacaattgtcctatttcagcgctcttcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatccttttgaattagctgtt 19249458  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagt 199  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||| ||  || |||||||||  ||||||| || ||||||||||||||    
T  19249457 gcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcgtttgaacaacctttgaagctttaagt 19249387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 9 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 25398419 - 25398295
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||  |||||||   || |||||| ||||||    
T  25398419 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtgctttgtcaacgctctttgaagagcaaatatgcaatgccttcaaa 25398320  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttca 133  Q
    ||||||||||||||| |||||||||    
T  25398319 tcctttcaaaatagtcgttgcttca 25398295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 12389035 - 12388847
Alignment:
Q  10 gcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaat 109  Q
    ||||||||| | || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || || ||||||||||||||||  | ||||||||||| || ||||    
T  12389035 gcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttgccaacgctcttcaaagaagaagcatccaatgccttaaaat 12388936  T
Q  110 cctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagt 199  Q
     ||||  || |||| || |||||||| | |   ||||||||||| | || ||  |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  12388935 tcttttgaattagtcgtagcttcactgttctgatcttctgcaattc-tagacatgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagt 12388847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 158
Target Start/End: Original strand, 33583246 - 33583374
Alignment:
Q  31 tggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaag-agcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgc 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| |||||||||||||   || | || ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||    
T  33583246 tggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacaagcatccaatgcgttcaaatcctttcaaaatagccgttgc 33583345  T
Q  130 ttcactctcccagtcttctgcaatgctta 158  Q
    |||||| | |||||||||| |||| ||||    
T  33583346 ttcacttttccagtcttctacaatcctta 33583374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Original strand, 21640881 - 21641083
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||  || |  | ||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||    
T  21640881 tagtggagatagtggttgtacacttcgtaaaaacgtactatgtcaacgctctttgaaaaataagcatccaatgcttttcaatccttccaaaatagccgtt 21640980  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||  ||| | |||||||||| |||| ||||  |||| || ||||| |  ||||||  |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||| || ||||    
T  21640981 gctatacttttccagtcttctacaat-cttaggcgagtttgaatccttgaaacagcttttgaggctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcaacttc 21641077  T
Q  228 tggtga 233  Q
    ||||||    
T  21641078 tggtga 21641083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 200
Target Start/End: Original strand, 29855423 - 29855596
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| |||||||||| ||  |||| || ||||||||||| ||||||| |||||||| |||  |||    
T  29855423 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactctgtcaacgctttttgaagaacaagcatccaatgccttcaaattctttcaaactagccgtt 29855522  T
Q  128 gcttcac-tctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagtt 200  Q
    ||||||| | |   |||||||||||||  ||| ||||| || |||||||| ||||||  ||||||  |||||||    
T  29855523 gcttcactttttttagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacagcttttgaagtcttaagtt 29855596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 233
Target Start/End: Original strand, 11869145 - 11869285
Alignment:
Q  91 gcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaa 190  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||| | ||||||||||| | | |||| |||||||| ||| |||| ||||    |||||    
T  11869145 gcatccaatgccttcaaatcctttcaaactagacgttgcttcacttttccagtcttctgtatttcttagacgagattgaattcattaaacaaattttgaa 11869244  T
Q  191 gctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    || |||||  ||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  11869245 gccttaag--ttgcatcccctgatgaactgcagcttctggtga 11869285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 160 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 25398286 - 25398169
Alignment:
Q  160 acgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgctttt 257  Q
    |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||  ||||||    || |||||| ||| |||  |||||||||||||||||| |    
T  25398286 acgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatcttatgatgaga--caacttctgatgatcttcagcttctaatgagatgcttct 25398189  T
Q  258 gatgaacttgattctgatga 277  Q
    |||||||||| |||||||||    
T  25398188 gatgaacttgcttctgatga 25398169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Original strand, 11868264 - 11868335
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctctt 80  Q
    |||||||||| | || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  11868264 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaacgctctt 11868335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 49666480 - 49666357
Alignment:
Q  107 aatcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcac 206  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  ||| | ||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |  |||| |  |||||||||||||||  |||     
T  49666480 aatcctttcaaaatagtcgttgttatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaagtt--gcat 49666384  T
Q  207 ctcctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  49666383 ctcctgatgaactgcagcttctggtga 49666357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 154
Target Start/End: Original strand, 12968320 - 12968446
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |  ||||| ||||||||||  | | ||||||||| ||||||| ||||  || |||| |||    
T  12968320 tagtggagatagtggttgtacacttcgtataattgtccttttccaacgttcttcaaagaataagtatccaatgccttcaaattcttttgaattagtcgtt 12968419  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatg 154  Q
     |||||  || | ||||||||||||||    
T  12968420 acttcatgcttctagtcttctgcaatg 12968446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 21636834 - 21636742
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgc 101  Q
    |||||||||| | || || ||||||| |||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||  | |||||||||||    
T  21636834 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 21636742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 36 - 163
Target Start/End: Original strand, 50300245 - 50300372
Alignment:
Q  36 gtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaag-agcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcac 134  Q
    |||||||||||| |||||||| ||  ||||| |||||||||||||   || | ||  |||||||||| ||||||||| |||||| |||  ||||||||||    
T  50300245 gtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctcttttgaggaacatacatccaatgcgttcaaatcccttcaaa-tagcagttgcttcac 50300343  T
Q  135 tctcccagtcttctgcaatgcttaaacga 163  Q
    | | ||||||||||||||| |||| ||||    
T  50300344 ttttccagtcttctgcaatccttagacga 50300372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 11909169 - 11909079
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaa 118  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| |   ||||| |||||||||||||  |||   | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11909169 tagtggaggtagtggtcgtacacttcgtaaagacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 11909079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 23538311 - 23538185
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| || | |||||| |||  |||||  | |||| |||||| ||||||| ||||  |||||   |||    
T  23538311 tagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgttctctaaagaataagcattcaatgccttcaaattcttttgaaataaccgtt 23538212  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatg 154  Q
    | |||| ||| ||||||||||||||||    
T  23538211 gtttcattcttccagtcttctgcaatg 23538185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 21605818 - 21605726
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgc 101  Q
    |||||||||| | || || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||  ||| |||||||||||||||  ||||  | |||||||||||    
T  21605818 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 21605726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 46796512 - 46796460
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctctt 80  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  46796512 tagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 46796460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 30054381 - 30054310
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctctt 80  Q
    |||||||||| | || || |||||||| ||||||||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  30054381 agcagagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtacatttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 30054310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 139 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 46796410 - 46796319
Alignment:
Q  139 ccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| || |||| |  |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  46796410 ccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatcctttaaacaacttttgaagctttaagtt--gcatctcctgatgaactgcagcttcttgtga 46796319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 277
Target Start/End: Original strand, 13824255 - 13824297
Alignment:
Q  235 cttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  13824255 cttgcatctaatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 13824297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 4)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Original strand, 60012 - 60280
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||    
T  60012 agcagagacacaaactgagtagaagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatggcttcaaa 60111  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||    
T  60112 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaattcttggacgagattaaatccattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 60211  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||  ||||||||    
T  60212 tctgatgaactttagcttctggtgatcttgcttcttatgagatgcttctaatgaacttgcatctgatga 60280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Original strand, 7922 - 8161
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| |||   |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||    
T  7922 agcagagacacaaacttcgtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgaattcaaa 8021  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||    
T  8022 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttacagtcttctacaatgcttggacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagttttgcatct 8121  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 248  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||    
T  8122 cctgatgaactttagcttctggttatcttgcttctgatga 8161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 201 - 277
Target Start/End: Original strand, 115709 - 115785
Alignment:
Q  201 ttgcacctcctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| || ||||||    
T  115709 ttgcatctcctgatgaacatcagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgataaacttgcttttgatga 115785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 224 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 151788 - 151735
Alignment:
Q  224 cttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  151788 cttctggtgatcttgcttctcatgaggtgcttctgatgaacttgcttctgatga 151735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Original strand, 12205 - 12475
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  12205 agcagagacacaatctgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgctttcaaa 12304  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||   ||    
T  12305 ttctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacagcctttgaagctttaagtcttgtgtct 12404  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    |||||||||||  |||||||||||| | |   ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  12405 cctgatgaactagagcttctggtgatcctcaacttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 12475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 212369 - 212619
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaa-tagttgt 126  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  212369 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatccttttaaaaatagttgt 212468  T
Q  127 tgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagctt 226  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||| || |||||    
T  212469 tgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccatagaatagcctttgaagctttaagtcttggatctcctgatgaagtttagctt 212568  T
Q  227 ctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  212569 ctgatgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 212619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 72 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 6250 - 6092
Alignment:
Q  72 aacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaat 171  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  6250 aacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaat 6151  T
Q  172 ccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctgg 230  Q
    | |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| | || |||||||    
T  6150 ctattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaattacaacttctgg 6092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 12 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 19584 - 19319
Alignment:
Q  12 agagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcc 111  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  19584 agagacacaaactgagtagtgaatatagtggttgtacacttcgtacaattgtattatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgcttttaaatcc 19485  T
Q  112 tttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcct 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| |||||    
T  19484 tttcaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaattcttaggcgaaattaaatccattgaacaacttttgaagctttaagtcttgcatctcct 19385  T
Q  212 gatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
     ||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19384 catgaactacaacttctggtgatcttgcttcttatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 19319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 99320 - 99101
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||| |||| |   ||||  | ||||||||||| ||  ||    
T  99320 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcagcgctttg--aagaataagcatccaatgccttgtaa 99223  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||| | || ||| |||||||   ||| ||||| || ||||| || ||||||  |||||||||||||||  |||| |    
T  99222 tccttccaaaatagtcgttgctatacttttccggtcatctgcaact-ttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaagtt--gcactt 99126  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    ||||||||||| || ||||||||||    
T  99125 cctgatgaactacaacttctggtga 99101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 5805 - 5537
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||| |    
T  5805 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtagttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatccaatgccttcata 5706  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||    
T  5705 tcctttcaaaatagatgttgctccactcttccaatcttctacaatacttggacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatct 5606  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  5605 cctgatgaacttcagcttcaggtgatcttgcttctagtgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 5537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Original strand, 1686 - 1954
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||    
T  1686 agcagagacacaaactaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagtacaagcatccaatgccttcaaa 1785  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  |    
T  1786 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcctccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcattt 1885  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    ||| ||||  || ||||||| |||| ||||||||| |||||||| || | ||||||| | |||||||||    
T  1886 cctaatgatttttagcttctagtgatcttgcttctgatgagatgtttctaatgaactagcttctgatga 1954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0771
Description:

Target: scaffold0771; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 12 - 277
Target Start/End: Original strand, 474 - 741
Alignment:
Q  12 agagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcc 111  Q
    |||||||||  |||| || ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  474 agagacacaacctgagtaatggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 573  T
Q  112 tttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcct 211  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||| ||||| |||||    
T  574 tttcaaaatagtcgttgcttcactattccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacatcctttgacgctttaagtcttgcatctcct 673  T
Q  212 gatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  674 gatgagctttagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgataaacttgcttctgatga 741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 28 - 248
Target Start/End: Original strand, 1675 - 1895
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1675 tagtggaggtagtggttgtacacttcctacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagagtaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgtt 1774  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    | |||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  1775 gtttcactcttctagtcttctgcaaagcttagacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttc 1874  T
Q  228 tggtgaccttgcttctaatga 248  Q
    |||||| ||||||||| ||||    
T  1875 tggtgatcttgcttctgatga 1895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 263
Target Start/End: Original strand, 49328 - 49584
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  49328 agcagagacacaaactgagtagtggagatagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 49427  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||  ||||| ||    
T  49428 tcctttcaaaatagtagttgcttcactcttcaaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaactttgaagctttaagacttgcatct 49527  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaa 263  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||  |||||| ||||||||||| |||||||    
T  49528 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaa 49584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 219
Target Start/End: Original strand, 32481 - 32691
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||    
T  32481 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgcattcaaa 32580  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||    
T  32581 tcctttcaaaatagtcgttacttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagtctttgaagctttaagtcttgcatct 32680  T
Q  209 cctgatgaact 219  Q
    |||||||||||    
T  32681 cctgatgaact 32691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 441 - 351
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaa 118  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| |   ||||| |||||||||||||  |||   | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  441 tagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacagacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 26087 - 25820
Alignment:
Q  12 agagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcc 111  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  26087 agagacacaaactgagtagtcgagatagtggttgtacacttcatacaattgtactatgtcaaccctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 25988  T
Q  112 tttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcct 211  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||| |||||    
T  25987 tttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttttgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgacgctttaagtcttgcatctcct 25888  T
Q  212 gatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||  |||||| |||||||| |||| |||||| || |||||||||    
T  25887 gatgagctttagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgtttttcatgaacgtgcttctgatga 25820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 49 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 44779 - 44652
Alignment:
Q  49 acttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttct 148  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||    
T  44779 acttcgtacaattgtattatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaatcctttcaaaatagacgttgcttcacttttccagtcttct 44680  T
Q  149 gcaatgcttaaacgagattaaatccatt 176  Q
     |||| |||| |||||||||||||||||    
T  44679 acaatacttagacgagattaaatccatt 44652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 4)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 377674 - 377404
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  377674 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttggtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 377575  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  |||||| ||||||| ||||| ||    
T  377574 tcctttcaatatagtcgttgcttcactcttccggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattcaacaacatttgaagttttaagtcttgcatct 377475  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    |||||||||||  | |||||||||| |||  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  377474 cctgatgaactataacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 377404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Original strand, 220234 - 220503
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||    
T  220234 agcagaggcacaaactgagtagtggaggtagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaataacaagcatccaatgctt-caaa 220332  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    | | ||  || |||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |  || ||    
T  220333 ttcatttgaattagccgttgcttcactctcctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaaaccaatgaacagcctttgaagctttaagtctctcatct 220432  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  220433 cctgatgaacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatgaggtgcttctgatgaacttgcttctgatga 220503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Original strand, 211394 - 211631
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||  | ||||| ||||| || |||    
T  211394 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtagttgtatacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgcattaaaa 211493  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||| | |||||||||||||||  ||| ||||| || ||||| || |||| |  |||||||||||||   |||| ||    
T  211494 tccttacaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ctgcatct 211591  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 248  Q
    |||||||| || ||||||||| | | ||||||||| ||||    
T  211592 cctgatgagctacagcttctgataaacttgcttctgatga 211631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 244380 - 244256
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||  || ||||||||    
T  244380 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgtcttcaaatccttttgaattagttgtt 244281  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaa 152  Q
    |||||||||| |  |||||||||||    
T  244280 gcttcactcttctggtcttctgcaa 244256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Original strand, 9965 - 10204
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  9965 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtgaacgctcttcaaagagtaagcatccaatgctttcaaa 10064  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  10065 tcctttcaaaatagtcgttacttcactcttctagtcttctgcaaagcttagacgagattgaatccattgaatagcctttgaagctttaagtcttgcatct 10164  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 248  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||    
T  10165 cctgatgaacttcaacttcttgtgatcttgcttctgatga 10204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 27544 - 27305
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||| ||    
T  27544 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatggtactttgtcaacgctctttgaagagcaagcatccaatgccttcgaa 27445  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||    
T  27444 tcctatcaaaatagctgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 27345  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 248  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  27344 cctgatgaacttcagcatctggtgatcttgcttctgatga 27305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 31 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 5040 - 4792
Alignment:
Q  31 tggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgct 130  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||  ||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||    
T  5040 tggaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgctctataaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgtcgct 4941  T
Q  131 tcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctgg 230  Q
    |||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||  |||||||||    
T  4940 tcactctttcagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatgaactagagcttctgg 4841  T
Q  231 tgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    ||| |||  |||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  4840 tgatcttcagcttatgatgagatgcttctgatgaacttgcttctgatga 4792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 129; Significance: 9e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 28 - 248
Target Start/End: Original strand, 15132 - 15352
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  15132 tagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaatcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgat 15231  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||| ||||    
T  15232 gcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgatcagcctttgaagctttaagtcttgcatctccttatgcacttcatcttc 15331  T
Q  228 tggtgaccttgcttctaatga 248  Q
    |||||| ||||||||| ||||    
T  15332 tggtgatcttgcttctgatga 15352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 36890 - 36620
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||    
T  36890 agcagagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttcgtacaattgttctttgtcaacactctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 36791  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| | | |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  36790 tcctttcaaattagtcgttgcttcacttttctagtcatctgcaatgcttagacgagattaaattcattgagcagcctttgaagctttaagtcttgcatct 36691  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgacct--tgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  36690 cttgatgaacttcagcttctagtgatcttctgcttctgatgagatgcttctaatgaacttgcttctgatga 36620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Original strand, 42115 - 42385
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||    
T  42115 agcagagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttcgtacaattgttctttgtcaacactctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 42214  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| | | |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  42215 tcctttcaaattagtcgttgcttcacttttctagtcatctgcaatgcttagacgagattaaattcattgagcagcctttgaagctttaagtcttgcatct 42314  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgacct--tgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    | |||||||||||||||||| |||| ||  ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  42315 cttgatgaacttcagcttctagtgatcttctgcttctgatgagatgcttctaatgaacttgcttctgatga 42385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10220 - 9998
Alignment:
Q  12 agagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcc 111  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||| | || ||||||||||| |||||||||    
T  10220 agagacacaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaaaaacaagcatccaatgccttcaaatcc 10121  T
Q  112 tttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcc-cttgaagctttaagttttgcacctcc 210  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||| ||||    
T  10120 tttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttctgcaaagcttagatgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcc 10021  T
Q  211 tgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  10020 tgatgaacttcagcttctggtga 9998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 14884 - 14816
Alignment:
Q  12 agagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctctt 80  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  14884 agagacacaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 14816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 124; Significance: 8e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 9 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21086 - 20816
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||  ||| ||||||||  ||||  | ||||||||||| ||||||    
T  21086 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtacttggtcgacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaa 20987  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||    
T  20986 tcctttcaaaatgaccgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 20887  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    | |||||||||||| ||| |||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  20886 cttgatgaacttcaacttttggtgatcttcagcttctaatgagatgcttctgatgaacttgtttctgatga 20816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0227 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0227
Description:

Target: scaffold0227; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 22672 - 22896
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||| ||||||| |||||  ||||  | ||||||||||| ||||||    
T  22672 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacgcttcatacaattgtactttgtcaacactctttgaagaataagcatccaatgccttcaaa 22771  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||    
T  22772 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 22871  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||    
T  22872 cctgatgaactacagcctctggtga 22896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426 (Bit Score: 119; Significance: 8e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0426
Description:

Target: scaffold0426; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 183
Target Start/End: Original strand, 13567 - 13741
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||    
T  13567 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 13666  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagc 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13667 tcctttcaaaatagttgttgcttcactattccaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagc 13741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 119; Significance: 8e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 43 - 277
Target Start/End: Original strand, 9825 - 10059
Alignment:
Q  43 ttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccag 142  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    |    
T  9825 ttgtacactttgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagcacaagcatccaatgctttcaagtcctttcaaaatagtcgttacttcactcttttgg 9924  T
Q  143 tcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttc 242  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||     
T  9925 tcttctataatgcttagacgagattaaatccattaaacaaaccttgaagctttaaatcttgcatctccagatgaacttcagcttctggtgatcttgctta 10024  T
Q  243 taatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    | ||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  10025 tgatgagatgcttctgattaacttgcttctgatga 10059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1434 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold1434
Description:

Target: scaffold1434; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 78 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 832 - 633
Alignment:
Q  78 cttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattg 177  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  832 cttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcagtgcttcactattccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattg 733  T
Q  178 aacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    ||||| | |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  732 aacagtctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactttagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaacttgcttctaatga 633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 262
Target Start/End: Original strand, 103587 - 103821
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||| || ||||||||||| || | ||| |||||||||||  |||    
T  103587 tagtggaggtagtggttgcacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttaatatcatttcaaaatagccgtt 103686  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||| || | ||||||| |||| |||| || || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  103687 gcttcactcttccagtcttctgcaatgtttagacaaaattaaattcatttaacaacctttcaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttc 103786  T
Q  228 tggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatga 262  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  103787 tggtgtccttgcttctgatgagatacttctgatga 103821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 22 - 233
Target Start/End: Original strand, 7712 - 7923
Alignment:
Q  22 actgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaata 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||  |  ||| |||||| || |||||||| |||||||    
T  7712 actgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataaacatacaatgcctttaaatccttccaaaata 7811  T
Q  122 gttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttc 221  Q
    || || |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |      
T  7812 gtcgtggcttcactcttccagtcttttgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaaatag 7911  T
Q  222 agcttctggtga 233  Q
    ||||||||||||    
T  7912 agcttctggtga 7923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 72 - 230
Target Start/End: Original strand, 30283 - 30441
Alignment:
Q  72 aacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaat 171  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  30283 aacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaat 30382  T
Q  172 ccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctgg 230  Q
    | |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| | || |||||||    
T  30383 ctattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaattacaacttctgg 30441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 262
Target Start/End: Original strand, 9899 - 10151
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||    
T  9899 agcagagacacaaacatagtagtggaggtagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaa 9998  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    | | ||  || |||| |||| | |||||| |   |||||||||||||| | ||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||  || ||    
T  9999 ttcatttgaattagtcgttgttgcactcttctgatcttctgcaatgct-agacgtgattaaatccttagaacagcctttgaagctttaagtttctcatct 10097  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatga 262  Q
     ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  10098 tctgatgaacttcagcttctggtgatattgcttctaatgaggtgcttctgatga 10151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 90170 - 89948
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||| | |||||||||||||  |||| || ||||||||||| ||||||    
T  90170 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtaggggttgtacacttcgtacacttgtattttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 90071  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||| || || |||||||||||||  ||||| ||    
T  90070 tcctttcaaaatagccgttggttcactcttccagtcttctgtaatacttagacgagattaaatacattgatcaacctttgaagctttaag--ttgcatct 89973  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  89972 cctgatgaactgcagcttctggtga 89948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 19027 - 19251
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |  ||||||||||  |||| || ||||| ||||| || |||    
T  19027 agcagagacaaaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacacttgtacttttccaacgctctttgaagaacaagcatcaaatgcctttaaa 19126  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| | |     
T  19127 tccttccaaaatagccgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgctttgacgagattaaatccattgaacagcctttcaagctttaagtcttgtatca 19226  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||    
T  19227 cctgatgaaatagagcttctggtga 19251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Original strand, 9575 - 9777
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||| ||   |||  | |||||||||||  |  ||||||||||||||||| |||    
T  9575 tagtggagatagtggttgtacacttcgtacagtcgtactatgtcaacgctgtttgtagaataagcatccaatgcccttcaatcctttcaaaatagtcgtt 9674  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||  ||| ||||||||||||||||| |||| || || || ||||| |  |||| |  |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  9675 gctatactttcccagtcttctgcaat-cttagacaagtttgaatccttgaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcagcttc 9771  T
Q  228 tggtga 233  Q
    ||||||    
T  9772 tggtga 9777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22246 - 22024
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || || ||||| ||||||||||| |||||||| ||  ||| ||||||||||||| |  ||||  | ||||||||||| ||| ||    
T  22246 agcagagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctcattgaagaataagcatccaatgccttccaa 22147  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    |||||  || ||||| ||||||  |||   |||||||||||||||  ||| ||||| || ||||| || |||| |  ||||| |||||||  ||||| ||    
T  22146 tccttcaaagatagtcgttgctatacttctccagtcttctgcaatctttagacgagttttaatcctttaaacaacttttgaacctttaag--ttgcatct 22049  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
     || ||||||| || ||||||||||    
T  22048 tctaatgaactacaacttctggtga 22024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 229
Target Start/End: Original strand, 15789 - 16011
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataatt-gtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaa 107  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||| | ||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  15789 agcagagacacaaactgagtagtagagatggtggttgtacacttcgtacaatttgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaa 15888  T
Q  108 atcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaac-agcccttgaagctttaagttttgcac 206  Q
     ||||||||||||| ||| ||||||||||  |  ||||| |||||| |||  |||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||| |||||     
T  15889 gtcctttcaaaataattggtgcttcactcctctggtcttttgcaattcttggacgagattgaatccattgaacaatcttttgaagctttaagtcttgcat 15988  T
Q  207 ctcctgatgaacttcagcttctg 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||    
T  15989 ctcctgatgaactttagcttctg 16011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold1359
Description:

Target: scaffold1359; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 751 - 533
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||| |||||||||||||  |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  751 tagtggaggtagtggttgtacacttagtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgtt 652  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||||||| | |||||||||||||||  ||| ||||| || |||||||  ||||||   ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| || ||||    
T  651 gcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccatcaaacagcttctgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcaccttc 554  T
Q  228 tggtgaccttgcttctaatga 248  Q
    || ||| ||||||||| ||||    
T  553 tgatgaacttgcttctgatga 533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 1851 - 1778
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgc 101  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||  ||| |||||||||||||||  ||||  | |||||||||||    
T  1851 tagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtaatatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 1778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 215593 - 215390
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| |||||||||||||  |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  215593 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagccgtt 215494  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||||||| | | |||||||||||||  ||| ||||| || |||||||| ||||||  |||||| ||||||  ||||| |||||||| |||| |||||||    
T  215493 gcttcacttttctagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagttttaag--ttgcatctcctgataaactgcagcttc 215396  T
Q  228 tggtga 233  Q
    ||||||    
T  215395 tggtga 215390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 5)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Original strand, 39488 - 39645
Alignment:
Q  76 ctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccat 175  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| || ||||| || ||||||||||||||||    
T  39488 ctctttaaagaacatgcatctaatgccttcaaatcctttcaaattagttgttgcttcactcttctagtcttttgtaatgcctagacgagattaaatccat 39587  T
Q  176 tgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  39588 tgaacagcctttgaagctttaaatcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtga 39645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 76 - 233
Target Start/End: Original strand, 137548 - 137705
Alignment:
Q  76 ctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccat 175  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| || ||||| || ||||||||||||||||    
T  137548 ctctttaaagaacatgcatctaatgccttcaaatcctttcaaattagttgttgcttcactcttctagtcttttgtaatgcctagacgagattaaatccat 137647  T
Q  176 tgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  137648 tgaacagcctttgaagctttaaatcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtga 137705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 199
Target Start/End: Original strand, 159051 - 159240
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| ||  | |||| |||||||||||| || ||||| || |||||| || ||||||||||||||||||| || ||||  ||||| ||||||    
T  159051 agcagagacacaaacaaagtagtagaggtagtggttttacacttcatacaattgtcctttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatataatgccttcaaa 159150  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagt 199  Q
    | | ||  || |||  ||||||||||||| |   |||| ||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||| || |||||||| |||||    
T  159151 ttcatttgaattagccgttgcttcactcttctgatcttttgcaatg-ttagacgtgattaaatcctttgaacatcctttgaagctctaagt 159240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 66
Target Start/End: Original strand, 37417 - 37455
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtact 66  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  37417 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtact 37455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 66
Target Start/End: Original strand, 135477 - 135515
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtact 66  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  135477 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtact 135515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6833 - 6633
Alignment:
Q  31 tggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgct 130  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| |||||| ||||||  |||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||    
T  6833 tggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcttttcaaaatagtcggtgct 6734  T
Q  131 tcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctgg 230  Q
    ||||| | ||||||||||||||| |||| || || || ||||| || ||||||  |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  6733 tcacttttccagtcttctgcaatccttagacaagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacagcttctgg 6636  T
Q  231 tga 233  Q
    |||    
T  6635 tga 6633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 9 - 248
Target Start/End: Original strand, 6003 - 6241
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||||| |  || |||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  6003 agcagagacacaaatagagtagtagaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 6102  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 208  Q
    ||||||  || |||||||||||||  ||| |  |||||||||||||| ||  || |||||||||| |||||||| | |||||||||||| | |  || ||    
T  6103 tccttttgaattagttgttgcttcggtcttctggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatcctttgaacagtctttgaagctttaaatctctcatct 6201  T
Q  209 cctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatga 248  Q
     ||||||||||||| ||||| ||||  |||||||| ||||    
T  6202 tctgatgaacttcaacttctagtgatattgcttctgatga 6241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Original strand, 9952 - 10176
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||    
T  9952 agcagcgacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcgaatgccttcaaa 10051  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcc-cttgaagctttaagttttgcacc 207  Q
    | | ||  || |||  |||||||||||||    |||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |   | |    
T  10052 ttcatttgaattagccgttgcttcactcttatggtcttctgcaatgc-taggcgtgattaaatccattgaacagccatttgaagctttaagtctcttatc 10150  T
Q  208 tcctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  10151 ttctgatgaacttcagcttctggtga 10176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1331 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1331
Description:

Target: scaffold1331; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 29 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 1794 - 1598
Alignment:
Q  29 agtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttg 128  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| ||  ||||| |||||||||||||  |||| ||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  1794 agtgaaggtagtggttgtacacttcgtaaaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaatcatccagtgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttg 1695  T
Q  129 cttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    ||||||| | | |||||||||||||  ||||||||| || |||||||| ||||||  |||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  1694 cttcacttttcaagtcttctgcaatatttaaacgagtttgaatccattaaacagcttttgaagctttgag--ttgcatctcctgatgaactgcagcttc 1598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 78462 - 78259
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||| ||  ||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  78462 tagtgtaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttaaagaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgtt 78363  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||||||| | |||||||||||||||  ||| ||||| || |||||  | || |||  |||||||||||||   |||| ||| ||||||||| |||||||    
T  78362 gcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgataaatagcttttgaagctttaag--ctgcatctcatgatgaactacagcttc 78265  T
Q  228 tggtga 233  Q
    ||||||    
T  78264 tggtga 78259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 71 - 217
Target Start/End: Original strand, 143146 - 143292
Alignment:
Q  71 caacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaa 170  Q
    ||||||||||  |||| || ||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  143146 caacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaatccttccaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgctttgacgagattaaa 143245  T
Q  171 tccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaa 217  Q
    ||||||||| |||| || ||||||| ||| ||||| ||| |||||||    
T  143246 tccattgaatagcctttcaagctttgagtcttgcatctcgtgatgaa 143292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 4)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 36280 - 36032
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| |  | ||||| |||| ||| ||  | ||||||||||| || ||| || ||  |||||||||||    
T  36280 tagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtccattttcaactctctccaacgaaaaagcatccaatgcctttaaaaccatttgaaatagttgtt 36181  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| | | ||| ||||||||| |||||||| || ||||||||| || |||  ||  | ||||||| |||||||||     
T  36180 gcttcattcttccagtcttctgcaatgat-agacgtgattaaatcaattgaacaacctttgaagcttcaattttctcagattctgatgatcttcagctta 36082  T
Q  228 tggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    ||||||  |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  36081 tggtgatgttgcttctgatgaggtgcttctgatgaacttgcttctgatga 36032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 34919 - 34827
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgc 101  Q
    |||||||||| | || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||  |||||||||||||||||||  ||||  | |||||||||||    
T  34919 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 34827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 25761 - 25688
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgc 101  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||| ||  ||||  | |||||||||||    
T  25761 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctttttgaagaataagcatccaatgc 25688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 201 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 25599 - 25520
Alignment:
Q  201 ttgcacctcctgatgaacttcagcttctggtg--accttgcttctaatg-agatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||  || | |||||| ||| || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25599 ttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtgatacatagcttctgatgaagttgcttctgatgaacttgcttctgatga 25520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 5698 - 5545
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||  ||||  | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5698 tagtggaggtagtggttgtacacttcatataaatgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaaatagttgtt 5599  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaaca 181  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||  ||| ||||| || |||||||| ||||    
T  5598 gctttacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccattaaaca 5545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 129 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 4988 - 4838
Alignment:
Q  129 cttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttct 228  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |  | ||| |    
T  4988 cttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcttgatgaattaaaactttt 4889  T
Q  229 ggtgacct--tgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    ||||| ||   ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  4888 ggtgatctccagcttctaataagatgcttttgatgaacttgcttttgatga 4838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Original strand, 60818 - 61021
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||  |||| || |||| |||||| ||| ||||||| ||||||||  |||    
T  60818 tagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcattcaatgccttccaatccttccaaaatagccgtt 60917  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||  ||| | |||||||||||||||  ||| ||||| |||||||| || |||| |  |||||| ||||||  ||||| ||||||||||||| || ||||    
T  60918 gctatacttttccagtcttctgcaatttttagacgagtttaaatcctttaaacaacttttgaagttttaag--ttgcatctcctgatgaactacaacttc 61015  T
Q  228 tggtga 233  Q
    ||||||    
T  61016 tggtga 61021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Original strand, 9170 - 9372
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||  | ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| |||    
T  9170 tagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttctaatccttccaaaatagtcgtt 9269  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||  ||| | ||| ||||||||||| |||  | ||| || ||||| || ||||||  |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| || ||||    
T  9270 gctatacttttccaatcttctgcaat-ctttgatgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacaacttc 9366  T
Q  228 tggtga 233  Q
    ||||||    
T  9367 tggtga 9372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 142 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 5922 - 5830
Alignment:
Q  142 gtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagccctt-gaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  5922 gtcttctgcaatgcttaaacgagatgaaatccattgaacatccttttgaagctttaagtcttgcatctcctaatgaacttcagcttctggtga 5830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 7252 - 7049
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||| | ||  ||||  | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||    
T  7252 tagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtaccatgtcaacgttgtttgaagaataagcatccaatgctttccaatccttccaaaatagtcgtt 7153  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttc 227  Q
    |||  ||| | |||||||||||||||  | | ||| | || ||||| |  ||||||  |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||    
T  7152 gctatacttttccagtcttctgcaatcttcagacgggtttgaatccttcaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactacagcttc 7055  T
Q  228 tggtga 233  Q
    ||||||    
T  7054 tggtga 7049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0485
Description:

Target: scaffold0485; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 192 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 9338 - 9253
Alignment:
Q  192 ctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaacttgattctgatga 277  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  9338 ctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatcttgcttctgatgagatgcttctgatgaactttcttctgatga 9253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0471
Description:

Target: scaffold0471; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 233
Target Start/End: Original strand, 3320 - 3522
Alignment:
Q  29 agtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttg 128  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||  ||||||| |||||||||||  ||||  |  |||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||    
T  3320 agtggaggtagtggttgtacactttgtacaaacgtactatatcaacgctctttgaagaataaacatccaatgccttcaaatccttccaaaatagccgttg 3419  T
Q  129 cttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttct 228  Q
     |  ||| | ||| |||||||||||  ||| ||||| || ||||| || ||||||  |||||||||||||  ||||| |||||||||||||  |||||||    
T  3420 ttatacttttccaatcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactatagcttct 3517  T
Q  229 ggtga 233  Q
    |||||    
T  3518 ggtga 3522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 44015 - 43845
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||| || ||| || | |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||  || |||   ||    
T  44015 tagtggagatagtggttgtacaattcgtacaaatgtcctttttcaacgctcttcaaggaacaggcatccaatgccttcaaatctttttgaattagccttt 43916  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagt 199  Q
    |||||||||| |   |||||||||||| |||  || |||||||||  |||||||||| |||||| |||||||    
T  43915 gcttcactcttctgatcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatcttttgaacagcctttgaagttttaagt 43845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0527 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0527
Description:

Target: scaffold0527; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 233
Target Start/End: Original strand, 7963 - 8149
Alignment:
Q  44 tgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagt 143  Q
    |||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||  | ||||| |||||  |  ||||||||||||||||| ||||||  ||| | |||||    
T  7963 tgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcgaatgcaattcaatcctttcaaaatagtcgttgctatacttttccagt 8062  T
Q  144 cttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    |||||||||| |||| ||||| || ||||| |  ||||||  |||||||||||||  || || || |||||||||| |||||||||||||    
T  8063 cttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaag--ttacatcttctgatgaactgcagcttctggtga 8149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 2845 - 2702
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| |||||  ||||  | ||||||||||||||| ||    
T  2845 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaatacgcatccaatgctttccaa 2746  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaat 153  Q
     |||| ||||||||| |||||   ||| | |||||||||||||||    
T  2745 -ccttccaaaatagtcgttgcaatacttttccagtcttctgcaat 2702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 1617 - 1491
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| || |  ||||| ||||||||||  |  | |||||||| ||||||||||||  ||||||| |||    
T  1617 tagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttccaacgttcttcaaagaataaacgtccaatgccttcaaatccttttgaaatagtcgtt 1518  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatg 154  Q
    |||||||||    ||||||||||||||    
T  1517 gcttcactcctatagtcttctgcaatg 1491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 114
Target Start/End: Original strand, 74596 - 74682
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatccttt 114  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||    
T  74596 tagtagaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaatgcttttcaaagagcaagcatctaattccttcaaatccttt 74682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 277
Target Start/End: Original strand, 74718 - 74831
Alignment:
Q  164 gattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatgaa 263  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||| | |  || || |||||||  |||||||||||||||  ||| |||| ||||| ||||| |||||||    
T  74718 gattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaattctcacagcttctgatgatgttcagcttctggtgatgttgtttctgatgaggtgcttatgatgaa 74817  T
Q  264 cttgattctgatga 277  Q
    |||| || ||||||    
T  74818 cttgcttatgatga 74831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 65484 - 65322
Alignment:
Q  68 tgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagatt 167  Q
    |||||||||||||  ||||  | |||||||||||  |  ||||||||||||||||| ||| ||  ||| | ||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  65484 tgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccctttaatcctttcaaaatagtcgtttctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagttt 65386  T
Q  168 aaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
     ||||| |  || |||  |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  65385 gaatccttgaaatagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtga 65322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 144529 - 144367
Alignment:
Q  68 tgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagatt 167  Q
    |||||||||||||  ||||  | |||||||||||  |  ||||||||||||| ||| ||||||  ||| | ||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  144529 tgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccctttaatcctttcaaaacagtcgttgctatacttttccagtcttctgcaat-cttagacgagttt 144431  T
Q  168 aaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
     ||||| |  || |||  |||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  144430 gaatccttgaaatagcttttgaagctttaag--ttgcatctcctgatgaactgcagcttctggtga 144367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 165042 - 164940
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| |   ||||| |||||||||||||  |||   | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  165042 tagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacagacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagttgtt 164943  T
Q  128 gct 130  Q
    |||    
T  164942 gct 164940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 29 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 2090 - 2033
Alignment:
Q  29 agtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaaga 86  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2090 agtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaga 2033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 154
Target Start/End: Original strand, 5636 - 5767
Alignment:
Q  22 actgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaata 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |  ||||| ||| ||||||  | ||||||||||| ||||||| | ||  |||||    
T  5636 actgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgta-ttttccaacgttctccaaagaataagcatccaatgccttcaaattcatttgaaata 5734  T
Q  122 gttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatg 154  Q
    || ||||||||| ||| | ||||||||| ||||    
T  5735 gtcgttgcttcattcttctagtcttctggaatg 5767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 262
Target Start/End: Original strand, 5867 - 5909
Alignment:
Q  220 tcagcttctggtgaccttgcttctaatgagatgcttttgatga 262  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  5867 tcagcttctggtgaacttgcttctgatgaggtgcttttgatga 5909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 1893 - 1803
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaa 118  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||   ||||| |||||||||||||  |||   | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1893 tagtggaggtagtggtcgtacacttcgtatagacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 1803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 194
Target Start/End: Original strand, 40652 - 40817
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagttgtt 127  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| || | ||||||||||||||||| |   ||||  |||| ||||||| ||||  || |||  |||    
T  40652 tagtgaaggtagtggttgtacacttcttacaattgttctttttcaacgctcttcaaagaaccaccatcatatgccttcaaattcttttgaattagccgtt 40751  T
Q  128 gcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctt 194  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||| ||   | |||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  40752 gcttcactcttctggtcttctgcaatgc-taggtgtgattaaatcttttgaacagcctttgaagctt 40817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 80
Target Start/End: Original strand, 7396 - 7448
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctctt 80  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  7396 tagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaatgtactatgtcaacgctctt 7448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23547 - 23456
Alignment:
Q  139 ccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctggtga 233  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |  ||||||  |||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  23547 ccagtcttctgcaat-cttagacgagtttgaatccttgaaacagcttttgaagctttaagtt--gcatctcctgatgaactgcagcttctggtga 23456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 25514 - 25393
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaa 108  Q
    |||||||||| | || || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| |||||  ||||  |   |||||||||  |  ||    
T  25514 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataactatccaatgcccttcaa 25415  T
Q  109 tcctttcaaaatagttgttgct 130  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  25414 tcctttcaaaatagtcgttgct 25393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 60799 - 60729
Alignment:
Q  194 ttaagttttgcacctcctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatga 262  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||    
T  60799 ttaagtcttgcatcttctgatgaacttcagcttgtggtgatcttcagcttctaatgagatgcttctgatga 60729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1747 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1747
Description:

Target: scaffold1747; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 84
Target Start/End: Original strand, 1332 - 1388
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaa 84  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| | | |||||||||||||||    
T  1332 tagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaa 1388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1745 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1745
Description:

Target: scaffold1745; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 79 - 23
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaa 84  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| | | |||||||||||||||    
T  79 tagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaa 23  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 17880 - 17809
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctctt 80  Q
    |||||||||| | || || |||||||| ||||||||||| ||||| || ||  |||||||||||||||||||    
T  17880 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgctctt 17809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 38181 - 38086
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctcttcaaagagcaggcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagt 123  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||     ||||| |||||||||||||  |||   | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  38181 tagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacggacgtactttgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagt 38086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 9 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 87715 - 87644
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctctt 80  Q
    |||||||||| | || || ||||||| |||||||||||| |||||||| |   |||||||||||||||||||    
T  87715 agcagagacagaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacagacgtactatgtcaacgctctt 87644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 13447 - 13391
Alignment:
Q  210 ctgatgaacttcagcttctggtgacctt--gcttctaatgagatgcttttgatgaac 264  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||  |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  13447 ctgatgaacttcagcttctggtgttcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaac 13391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 2806 - 2738
Alignment:
Q  9 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgct 77  Q
    |||||||||| | || || |||||||| ||||||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||||    
T  2806 agcagagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgct 2738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 917 - 865
Alignment:
Q  28 tagtggaggtagtggttgtatacttcgtataattgtactatgtcaacgctctt 80  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| ||  ||| |||||||||||||||    
T  917 tagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctctt 865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 5763 times since January 2019
Visitors: 4859