View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0755_low_96 (Length: 295)

Name: NF0755_low_96
Description: NF0755
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0755_low_96
NF0755_low_96
[»] chr5 (84 HSPs)
chr5 (31-295)||(25421532-25421796)
chr5 (31-295)||(25431395-25431658)
chr5 (31-295)||(23390353-23390617)
chr5 (31-295)||(24493569-24493832)
chr5 (31-295)||(8286699-8286964)
chr5 (31-293)||(13025311-13025572)
chr5 (31-295)||(9077952-9078216)
chr5 (31-291)||(13095495-13095754)
chr5 (34-291)||(24529223-24529480)
chr5 (31-295)||(1096467-1096731)
chr5 (31-261)||(22075018-22075249)
chr5 (31-198)||(21808343-21808510)
chr5 (31-198)||(21729018-21729185)
chr5 (34-197)||(42245365-42245527)
chr5 (45-242)||(18418594-18418789)
chr5 (31-139)||(21997547-21997655)
chr5 (34-197)||(264768-264930)
chr5 (34-197)||(39363384-39363546)
chr5 (34-180)||(10732957-10733102)
chr5 (31-261)||(21292861-21293090)
chr5 (34-235)||(22412187-22412377)
chr5 (34-197)||(20909012-20909174)
chr5 (34-197)||(29329934-29330096)
chr5 (34-197)||(29345980-29346142)
chr5 (34-197)||(32027393-32027555)
chr5 (34-180)||(39245136-39245281)
chr5 (34-197)||(36154783-36154942)
chr5 (34-178)||(11581218-11581361)
chr5 (33-185)||(17517168-17517320)
chr5 (34-197)||(29348453-29348615)
chr5 (34-197)||(29350926-29351088)
chr5 (34-146)||(20902060-20902172)
chr5 (34-146)||(2154665-2154776)
chr5 (34-142)||(31061068-31061175)
chr5 (37-197)||(18319033-18319193)
chr5 (50-240)||(22144068-22144259)
chr5 (34-197)||(10775675-10775838)
chr5 (34-142)||(38619434-38619541)
chr5 (35-210)||(21873254-21873426)
chr5 (35-142)||(23064512-23064618)
chr5 (34-128)||(20918017-20918110)
chr5 (80-206)||(18356364-18356488)
chr5 (135-295)||(21986004-21986164)
chr5 (38-209)||(37723910-37724080)
chr5 (31-107)||(19660879-19660956)
chr5 (31-107)||(21329541-21329618)
chr5 (37-142)||(24067110-24067214)
chr5 (80-206)||(20910745-20910869)
chr5 (31-154)||(21502154-21502277)
chr5 (50-149)||(20026942-20027043)
chr5 (35-157)||(21565546-21565668)
chr5 (35-107)||(22959576-22959649)
chr5 (97-177)||(20766095-20766174)
chr5 (168-295)||(22107230-22107357)
chr5 (31-129)||(36314577-36314675)
chr5 (35-209)||(22032323-22032492)
chr5 (31-240)||(40725853-40726063)
chr5 (31-150)||(26012037-26012154)
chr5 (35-120)||(26704075-26704160)
chr5 (35-120)||(26973808-26973893)
chr5 (35-209)||(18769947-18770118)
chr5 (35-105)||(23501402-23501472)
chr5 (31-107)||(19668898-19668975)
chr5 (35-120)||(23201360-23201445)
chr5 (50-150)||(22178221-22178323)
chr5 (35-208)||(23572084-23572254)
chr5 (34-88)||(20806850-20806904)
chr5 (35-120)||(14079149-14079234)
chr5 (58-99)||(20805575-20805616)
chr5 (47-100)||(26732884-26732937)
chr5 (80-150)||(29448052-29448123)
chr5 (58-98)||(20766997-20767037)
chr5 (32-180)||(24767518-24767665)
chr5 (58-94)||(26680605-26680641)
chr5 (58-94)||(26952212-26952248)
chr5 (35-94)||(21366722-21366781)
chr5 (50-100)||(26740697-26740747)
chr5 (43-83)||(26742806-26742847)
chr5 (58-94)||(123363-123399)
chr5 (58-94)||(12028623-12028659)
chr5 (58-94)||(17919209-17919245)
chr5 (58-94)||(22757148-22757184)
chr5 (58-94)||(23535637-23535673)
chr5 (58-94)||(31342170-31342206)
[»] chr2 (73 HSPs)
chr2 (31-295)||(23060513-23060776)
chr2 (31-295)||(23076442-23076706)
chr2 (31-295)||(22738037-22738300)
chr2 (31-270)||(22731116-22731355)
chr2 (31-295)||(23285865-23286125)
chr2 (31-295)||(22337115-22337379)
chr2 (31-295)||(23660023-23660286)
chr2 (31-295)||(23654243-23654507)
chr2 (34-234)||(298732-298933)
chr2 (31-295)||(37973-38235)
chr2 (34-197)||(22105412-22105575)
chr2 (37-197)||(21155060-21155219)
chr2 (34-197)||(18808943-18809105)
chr2 (34-197)||(23130862-23131024)
chr2 (34-197)||(23133329-23133491)
chr2 (34-197)||(23709532-23709694)
chr2 (34-197)||(23712013-23712175)
chr2 (34-197)||(26505379-26505541)
chr2 (34-197)||(26507857-26508019)
chr2 (34-197)||(34402522-34402684)
chr2 (34-197)||(39682313-39682475)
chr2 (34-180)||(23135590-23135735)
chr2 (32-197)||(32214921-32215085)
chr2 (34-197)||(571397-571559)
chr2 (34-197)||(6725995-6726157)
chr2 (34-197)||(24367774-24367936)
chr2 (34-197)||(24898195-24898358)
chr2 (34-197)||(24900678-24900841)
chr2 (34-197)||(24903155-24903318)
chr2 (34-197)||(24905632-24905795)
chr2 (34-197)||(24908107-24908270)
chr2 (31-235)||(20309108-20309309)
chr2 (38-185)||(25616192-25616339)
chr2 (34-197)||(32039498-32039660)
chr2 (31-240)||(23708530-23708738)
chr2 (34-197)||(28577099-28577261)
chr2 (34-180)||(45029871-45030016)
chr2 (36-197)||(43137301-43137461)
chr2 (35-210)||(22799068-22799243)
chr2 (36-157)||(28405981-28406103)
chr2 (34-146)||(24529580-24529691)
chr2 (35-210)||(23019648-23019823)
chr2 (31-200)||(23103348-23103516)
chr2 (34-197)||(38967374-38967537)
chr2 (31-108)||(8946657-8946734)
chr2 (31-213)||(19671830-19672010)
chr2 (31-94)||(23040247-23040310)
chr2 (189-295)||(27753733-27753839)
chr2 (35-157)||(25175854-25175976)
chr2 (50-179)||(32451901-32452031)
chr2 (35-154)||(7679589-7679707)
chr2 (37-113)||(24643034-24643109)
chr2 (32-107)||(22134251-22134326)
chr2 (31-129)||(23071972-23072070)
chr2 (61-178)||(7707-7824)
chr2 (58-180)||(25963688-25963809)
chr2 (35-210)||(22740902-22741081)
chr2 (35-180)||(21916071-21916215)
chr2 (50-150)||(23207296-23207398)
chr2 (35-99)||(40622263-40622327)
chr2 (46-107)||(18786947-18787009)
chr2 (50-235)||(20520109-20520295)
chr2 (35-120)||(22758751-22758836)
chr2 (52-101)||(23287384-23287433)
chr2 (120-197)||(24642856-24642933)
chr2 (58-94)||(24655396-24655432)
chr2 (58-94)||(24869903-24869939)
chr2 (58-94)||(25961592-25961628)
chr2 (52-100)||(26392403-26392451)
chr2 (50-108)||(22413181-22413240)
chr2 (35-94)||(22811969-22812028)
chr2 (58-120)||(23038054-23038116)
chr2 (58-94)||(24174823-24174859)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (31-295)||(51913-52177)
scaffold0011 (31-293)||(167838-168099)
[»] chr3 (106 HSPs)
chr3 (31-291)||(26686887-26687147)
chr3 (31-295)||(43840932-43841196)
chr3 (31-295)||(13442274-13442538)
chr3 (31-295)||(17487856-17488120)
chr3 (31-295)||(23083218-23083482)
chr3 (35-295)||(14576690-14576949)
chr3 (31-295)||(17499338-17499602)
chr3 (31-287)||(14972854-14973110)
chr3 (31-295)||(20698293-20698556)
chr3 (31-295)||(18438534-18438798)
chr3 (31-295)||(25476242-25476506)
chr3 (34-235)||(24153126-24153326)
chr3 (44-295)||(14572602-14572852)
chr3 (49-295)||(42386428-42386675)
chr3 (31-295)||(11424620-11424880)
chr3 (34-295)||(40213578-40213838)
chr3 (31-235)||(12399209-12399413)
chr3 (34-197)||(16454281-16454443)
chr3 (34-213)||(29172567-29172745)
chr3 (46-295)||(30029855-30030103)
chr3 (34-197)||(9707607-9707769)
chr3 (34-197)||(17463178-17463340)
chr3 (34-197)||(34159326-34159488)
chr3 (34-197)||(45606907-45607069)
chr3 (34-197)||(55476491-55476653)
chr3 (34-180)||(28848628-28848773)
chr3 (34-197)||(7781347-7781509)
chr3 (34-197)||(8899094-8899256)
chr3 (34-197)||(17672626-17672788)
chr3 (34-197)||(38961891-38962053)
chr3 (34-197)||(13151790-13151953)
chr3 (34-197)||(13154255-13154418)
chr3 (33-197)||(13544024-13544187)
chr3 (33-185)||(46822267-46822419)
chr3 (34-197)||(6469134-6469296)
chr3 (34-197)||(10247723-10247885)
chr3 (38-197)||(12567564-12567722)
chr3 (34-197)||(17446655-17446816)
chr3 (34-177)||(36166598-36166739)
chr3 (34-148)||(55500942-55501055)
chr3 (33-209)||(12511059-12511236)
chr3 (36-197)||(16282811-16282971)
chr3 (31-178)||(43550497-43550644)
chr3 (34-197)||(50242822-50242984)
chr3 (36-197)||(41123892-41124049)
chr3 (50-197)||(53070653-53070799)
chr3 (34-160)||(15977515-15977640)
chr3 (34-142)||(12119780-12119887)
chr3 (34-142)||(15412429-15412536)
chr3 (45-177)||(21618460-21618590)
chr3 (34-131)||(44494809-44494905)
chr3 (34-142)||(8499518-8499625)
chr3 (31-240)||(24340634-24340844)
chr3 (34-150)||(10556985-10557101)
chr3 (50-213)||(52523666-52523831)
chr3 (34-175)||(53301527-53301669)
chr3 (49-213)||(23274705-23274869)
chr3 (31-146)||(13210333-13210448)
chr3 (34-213)||(27165250-27165429)
chr3 (34-131)||(17737236-17737335)
chr3 (31-154)||(14234487-14234610)
chr3 (35-150)||(15470928-15471043)
chr3 (35-157)||(16103784-16103905)
chr3 (31-240)||(37642176-37642386)
chr3 (35-107)||(12174303-12174376)
chr3 (38-150)||(32307684-32307795)
chr3 (35-177)||(856140-856280)
chr3 (35-157)||(16097332-16097454)
chr3 (169-235)||(14179570-14179636)
chr3 (35-107)||(49668120-49668193)
chr3 (32-180)||(14665398-14665545)
chr3 (32-180)||(14668554-14668701)
chr3 (35-99)||(23077530-23077594)
chr3 (58-180)||(11298500-11298621)
chr3 (34-95)||(28194693-28194755)
chr3 (35-107)||(9512924-9512997)
chr3 (35-107)||(9520899-9520972)
chr3 (34-87)||(45577947-45578000)
chr3 (113-213)||(2051138-2051238)
chr3 (169-293)||(16796685-16796809)
chr3 (35-120)||(15878083-15878168)
chr3 (35-120)||(17525190-17525275)
chr3 (35-99)||(14878569-14878633)
chr3 (58-178)||(19725886-19726004)
chr3 (50-150)||(37251168-37251270)
chr3 (50-150)||(43925977-43926079)
chr3 (38-107)||(1644718-1644787)
chr3 (35-120)||(23408428-23408513)
chr3 (58-94)||(3389994-3390030)
chr3 (50-150)||(22110352-22110454)
chr3 (31-210)||(22147467-22147646)
chr3 (35-83)||(26196500-26196548)
chr3 (35-94)||(12172796-12172855)
chr3 (58-180)||(12496280-12496402)
chr3 (35-94)||(18383973-18384032)
chr3 (50-154)||(12377940-12378046)
chr3 (58-100)||(15051531-15051573)
chr3 (58-100)||(15060307-15060349)
chr3 (58-206)||(11862816-11862964)
chr3 (35-84)||(12038019-12038068)
chr3 (52-101)||(13919350-13919399)
chr3 (58-94)||(1982868-1982904)
chr3 (58-94)||(2897873-2897909)
chr3 (58-94)||(3403014-3403050)
chr3 (58-94)||(11595197-11595233)
chr3 (39-99)||(23053140-23053200)
[»] chr1 (63 HSPs)
chr1 (31-292)||(22532269-22532530)
chr1 (32-295)||(50210070-50210333)
chr1 (34-295)||(34509783-34510044)
chr1 (31-295)||(27250586-27250850)
chr1 (31-261)||(21026680-21026910)
chr1 (32-295)||(20135188-20135451)
chr1 (32-235)||(22468614-22468816)
chr1 (108-295)||(22354429-22354616)
chr1 (34-213)||(23593719-23593897)
chr1 (34-197)||(13988866-13989028)
chr1 (34-197)||(21923291-21923453)
chr1 (31-197)||(45574842-45575008)
chr1 (34-197)||(21475087-21475249)
chr1 (34-197)||(31612313-31612475)
chr1 (34-213)||(433012-433188)
chr1 (34-197)||(16275363-16275526)
chr1 (33-197)||(21840766-21840929)
chr1 (34-197)||(29298137-29298298)
chr1 (34-197)||(29776688-29776850)
chr1 (143-295)||(22356031-22356184)
chr1 (143-295)||(22357717-22357870)
chr1 (32-213)||(16361915-16362095)
chr1 (35-214)||(21787980-21788159)
chr1 (31-131)||(20847175-20847275)
chr1 (31-234)||(38801309-38801508)
chr1 (50-213)||(21896195-21896358)
chr1 (31-142)||(13212917-13213027)
chr1 (28-142)||(15860064-15860177)
chr1 (28-142)||(21342090-21342203)
chr1 (34-234)||(21346961-21347161)
chr1 (34-160)||(21707167-21707292)
chr1 (34-160)||(21711709-21711834)
chr1 (34-197)||(22123067-22123230)
chr1 (37-142)||(40389157-40389261)
chr1 (50-212)||(21861510-21861672)
chr1 (35-157)||(33681011-33681133)
chr1 (80-206)||(33797570-33797694)
chr1 (46-240)||(16758664-16758860)
chr1 (32-99)||(20454606-20454673)
chr1 (35-157)||(22921864-22921986)
chr1 (38-150)||(21754052-21754163)
chr1 (35-146)||(20248283-20248394)
chr1 (169-235)||(48603652-48603718)
chr1 (35-120)||(21714546-21714631)
chr1 (31-146)||(14295557-14295672)
chr1 (50-234)||(35260998-35261180)
chr1 (35-157)||(22237631-22237753)
chr1 (35-180)||(18182093-18182237)
chr1 (35-120)||(42865245-42865330)
chr1 (47-146)||(20918620-20918719)
chr1 (35-92)||(21161720-21161778)
chr1 (50-150)||(50614117-50614219)
chr1 (50-150)||(50621945-50622047)
chr1 (50-150)||(41050036-41050138)
chr1 (46-107)||(52928014-52928076)
chr1 (35-95)||(20091533-20091593)
chr1 (50-150)||(16368287-16368388)
chr1 (32-94)||(24783150-24783212)
chr1 (58-94)||(3472980-3473016)
chr1 (58-94)||(3705122-3705158)
chr1 (58-94)||(18394023-18394059)
chr1 (35-99)||(21022631-21022695)
chr1 (58-94)||(45310426-45310462)
[»] chr8 (75 HSPs)
chr8 (31-295)||(18818266-18818530)
chr8 (31-295)||(23406379-23406645)
chr8 (31-295)||(20536208-20536472)
chr8 (31-291)||(21923789-21924049)
chr8 (31-295)||(7372778-7373034)
chr8 (31-295)||(22626736-22626999)
chr8 (32-295)||(28648901-28649164)
chr8 (31-261)||(21918891-21919121)
chr8 (32-295)||(23648554-23648817)
chr8 (31-295)||(16092198-16092463)
chr8 (31-295)||(18879094-18879352)
chr8 (28-287)||(6759255-6759512)
chr8 (31-295)||(22875065-22875329)
chr8 (31-295)||(31971257-31971519)
chr8 (31-261)||(45130889-45131117)
chr8 (34-197)||(14409444-14409606)
chr8 (34-197)||(1484402-1484564)
chr8 (34-197)||(5853292-5853454)
chr8 (38-197)||(16413316-16413474)
chr8 (34-197)||(20403227-20403389)
chr8 (34-197)||(22001753-22001915)
chr8 (31-295)||(16199503-16199765)
chr8 (33-185)||(18678069-18678221)
chr8 (33-185)||(32121734-32121886)
chr8 (34-197)||(15203231-15203393)
chr8 (34-197)||(41598188-41598350)
chr8 (34-197)||(4483281-4483442)
chr8 (34-197)||(4542373-4542535)
chr8 (34-197)||(20046195-20046357)
chr8 (34-197)||(19896265-19896430)
chr8 (32-197)||(26223917-26224081)
chr8 (34-177)||(26219717-26219858)
chr8 (31-234)||(21389371-21389571)
chr8 (31-234)||(21778697-21778897)
chr8 (34-197)||(14823774-14823935)
chr8 (31-235)||(21395900-21396101)
chr8 (31-235)||(21790393-21790594)
chr8 (35-214)||(23776773-23776952)
chr8 (34-177)||(26225268-26225409)
chr8 (28-142)||(19937061-19937174)
chr8 (38-197)||(45290694-45290853)
chr8 (47-142)||(15070571-15070665)
chr8 (31-157)||(38855246-38855372)
chr8 (34-197)||(25484275-25484430)
chr8 (31-154)||(6520368-6520491)
chr8 (38-213)||(13508024-13508199)
chr8 (50-213)||(20498581-20498744)
chr8 (50-240)||(19801339-19801527)
chr8 (169-295)||(25362997-25363123)
chr8 (38-213)||(13597556-13597731)
chr8 (31-129)||(17140916-17141014)
chr8 (31-128)||(21490995-21491092)
chr8 (31-146)||(5866280-5866395)
chr8 (35-150)||(21285601-21285716)
chr8 (31-203)||(17612059-17612231)
chr8 (46-149)||(983407-983512)
chr8 (35-102)||(23760893-23760961)
chr8 (58-208)||(20465982-20466132)
chr8 (43-157)||(21673716-21673830)
chr8 (35-120)||(17353975-17354060)
chr8 (35-107)||(26355742-26355815)
chr8 (35-180)||(30643264-30643408)
chr8 (50-213)||(37116366-37116530)
chr8 (58-180)||(16410226-16410347)
chr8 (31-81)||(21249384-21249434)
chr8 (31-81)||(21255222-21255272)
chr8 (57-234)||(17439423-17439602)
chr8 (58-180)||(17926678-17926799)
chr8 (50-150)||(24353039-24353140)
chr8 (57-154)||(19154883-19154982)
chr8 (35-99)||(21162111-21162175)
chr8 (35-99)||(21168784-21168848)
chr8 (57-101)||(22963464-22963508)
chr8 (35-99)||(24755714-24755778)
chr8 (58-94)||(39094982-39095018)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (34-295)||(22886-23146)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (31-295)||(3008-3271)
[»] chr7 (84 HSPs)
chr7 (31-295)||(9509189-9509453)
chr7 (31-295)||(12698831-12699096)
chr7 (31-295)||(38227481-38227744)
chr7 (34-295)||(3564221-3564482)
chr7 (34-235)||(18456330-18456530)
chr7 (31-261)||(26211995-26212226)
chr7 (31-261)||(10589039-10589268)
chr7 (31-261)||(16386138-16386369)
chr7 (31-197)||(13647325-13647491)
chr7 (34-213)||(16213684-16213861)
chr7 (34-150)||(48273392-48273508)
chr7 (34-197)||(456321-456483)
chr7 (34-197)||(11972496-11972658)
chr7 (34-197)||(14949122-14949284)
chr7 (34-197)||(15376713-15376875)
chr7 (34-197)||(16232520-16232682)
chr7 (34-197)||(18640272-18640434)
chr7 (34-197)||(20385123-20385285)
chr7 (34-197)||(21189595-21189757)
chr7 (34-197)||(32125491-32125653)
chr7 (34-197)||(41522917-41523079)
chr7 (34-197)||(41525379-41525541)
chr7 (35-197)||(11393287-11393448)
chr7 (31-197)||(18430709-18430874)
chr7 (38-180)||(24275175-24275316)
chr7 (33-261)||(40443393-40443619)
chr7 (34-177)||(16410059-16410201)
chr7 (34-197)||(24702238-24702400)
chr7 (34-197)||(27216860-27217022)
chr7 (31-240)||(2280030-2280238)
chr7 (34-197)||(44116509-44116671)
chr7 (35-200)||(14932685-14932851)
chr7 (35-200)||(15356120-15356286)
chr7 (35-200)||(15360234-15360400)
chr7 (34-177)||(3386333-3386475)
chr7 (34-197)||(24704688-24704847)
chr7 (34-142)||(13869346-13869453)
chr7 (46-287)||(15143902-15144143)
chr7 (34-240)||(17061872-17062077)
chr7 (34-160)||(13831373-13831498)
chr7 (34-214)||(20110556-20110724)
chr7 (38-197)||(38898376-38898535)
chr7 (31-235)||(27847750-27847951)
chr7 (31-150)||(67745-67864)
chr7 (31-150)||(22072913-22073033)
chr7 (31-146)||(34200786-34200901)
chr7 (31-129)||(28505321-28505419)
chr7 (58-207)||(15211484-15211633)
chr7 (97-197)||(26355983-26356083)
chr7 (97-197)||(26358435-26358535)
chr7 (70-197)||(12756671-12756797)
chr7 (35-157)||(18005650-18005772)
chr7 (35-154)||(811129-811248)
chr7 (35-154)||(16219715-16219834)
chr7 (31-146)||(16495402-16495517)
chr7 (31-154)||(47831807-47831930)
chr7 (31-240)||(19486655-19486865)
chr7 (46-240)||(1867907-1868101)
chr7 (80-161)||(2530129-2530208)
chr7 (31-128)||(11996051-11996148)
chr7 (35-144)||(44014182-44014291)
chr7 (35-209)||(17138006-17138177)
chr7 (37-120)||(18154873-18154956)
chr7 (31-160)||(10063810-10063939)
chr7 (46-150)||(16056343-16056446)
chr7 (35-99)||(12187019-12187083)
chr7 (31-146)||(15754893-15755008)
chr7 (32-94)||(2832499-2832561)
chr7 (58-208)||(12321685-12321835)
chr7 (57-235)||(15008415-15008594)
chr7 (35-120)||(9703263-9703348)
chr7 (35-120)||(19649521-19649606)
chr7 (58-94)||(9446216-9446252)
chr7 (58-94)||(20569654-20569690)
chr7 (35-99)||(32216601-32216665)
chr7 (35-94)||(9751812-9751871)
chr7 (46-108)||(12901338-12901401)
chr7 (50-101)||(18203831-18203882)
chr7 (35-94)||(39267957-39268016)
chr7 (35-84)||(14429883-14429932)
chr7 (191-235)||(48273538-48273583)
chr7 (46-101)||(14044761-14044817)
chr7 (46-101)||(14354791-14354847)
chr7 (58-94)||(42204017-42204053)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (31-295)||(38761-39024)
scaffold0145 (31-235)||(32942-33145)
scaffold0145 (29-146)||(9744-9860)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (31-295)||(1851-2115)
[»] chr6 (75 HSPs)
chr6 (31-295)||(17287653-17287917)
chr6 (31-295)||(20360817-20361081)
chr6 (31-288)||(22780091-22780348)
chr6 (31-287)||(29060540-29060796)
chr6 (31-295)||(20638140-20638404)
chr6 (31-295)||(25629212-25629476)
chr6 (32-295)||(18409684-18409947)
chr6 (31-295)||(20593773-20594037)
chr6 (31-287)||(19303406-19303661)
chr6 (31-198)||(16496244-16496411)
chr6 (31-198)||(20076700-20076863)
chr6 (32-197)||(34963371-34963535)
chr6 (34-197)||(12742317-12742479)
chr6 (34-197)||(18334592-18334754)
chr6 (34-197)||(19005046-19005208)
chr6 (34-197)||(19858919-19859081)
chr6 (34-197)||(22782227-22782389)
chr6 (34-197)||(24422547-24422709)
chr6 (34-177)||(25688502-25688644)
chr6 (34-197)||(33861794-33861956)
chr6 (34-197)||(33864278-33864440)
chr6 (34-180)||(1540928-1541073)
chr6 (32-197)||(30676710-30676874)
chr6 (34-197)||(2291180-2291342)
chr6 (34-197)||(8055029-8055191)
chr6 (34-197)||(25754809-25754971)
chr6 (34-197)||(26924640-26924802)
chr6 (34-177)||(25656629-25656771)
chr6 (34-178)||(1595549-1595692)
chr6 (50-240)||(18456735-18456924)
chr6 (46-213)||(25644335-25644503)
chr6 (34-197)||(3852017-3852179)
chr6 (50-180)||(18461895-18462024)
chr6 (31-206)||(35245586-35245758)
chr6 (37-197)||(16448526-16448686)
chr6 (34-146)||(20556943-20557054)
chr6 (33-185)||(23992429-23992578)
chr6 (58-235)||(15041468-15041644)
chr6 (33-158)||(19847989-19848114)
chr6 (31-232)||(16920553-16920751)
chr6 (31-213)||(20109140-20109322)
chr6 (50-203)||(18821795-18821946)
chr6 (58-235)||(25603302-25603478)
chr6 (58-232)||(25611643-25611816)
chr6 (31-107)||(27333262-27333339)
chr6 (31-107)||(27394002-27394079)
chr6 (31-240)||(8227422-8227632)
chr6 (31-235)||(22831503-22831706)
chr6 (31-92)||(25714417-25714478)
chr6 (80-206)||(27415887-27416011)
chr6 (31-146)||(28496477-28496592)
chr6 (31-146)||(29808888-29809003)
chr6 (58-180)||(21766718-21766839)
chr6 (31-150)||(23019408-23019525)
chr6 (35-150)||(19652199-19652313)
chr6 (35-180)||(18907111-18907255)
chr6 (35-120)||(19873120-19873205)
chr6 (35-120)||(22432249-22432334)
chr6 (35-120)||(22438799-22438884)
chr6 (31-146)||(1561303-1561418)
chr6 (46-108)||(9098557-9098620)
chr6 (46-149)||(19668386-19668491)
chr6 (35-210)||(25642125-25642304)
chr6 (35-120)||(19862978-19863063)
chr6 (35-84)||(31155465-31155514)
chr6 (52-108)||(33443068-33443124)
chr6 (43-102)||(4185870-4185930)
chr6 (58-94)||(19790837-19790873)
chr6 (35-95)||(22334954-22335014)
chr6 (35-94)||(16523441-16523500)
chr6 (31-78)||(22080799-22080846)
chr6 (50-180)||(11185524-11185652)
chr6 (35-99)||(15894491-15894555)
chr6 (58-94)||(20908039-20908075)
chr6 (58-94)||(27553629-27553665)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (31-295)||(8389-8650)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (31-295)||(13211-13475)
[»] chr4 (78 HSPs)
chr4 (31-295)||(16239827-16240090)
chr4 (31-295)||(44052829-44053093)
chr4 (31-288)||(7893703-7893957)
chr4 (31-292)||(12902757-12903018)
chr4 (31-235)||(16270153-16270356)
chr4 (34-289)||(16377386-16377639)
chr4 (31-214)||(7798774-7798957)
chr4 (33-295)||(22636437-22636698)
chr4 (36-287)||(14038653-14038904)
chr4 (31-295)||(7088877-7089141)
chr4 (31-203)||(6899891-6900062)
chr4 (38-261)||(23374250-23374473)
chr4 (31-156)||(52873363-52873488)
chr4 (34-240)||(44928835-44929042)
chr4 (34-197)||(18215274-18215436)
chr4 (34-177)||(54798729-54798872)
chr4 (34-197)||(12307-12469)
chr4 (34-213)||(1837494-1837671)
chr4 (31-295)||(14053159-14053422)
chr4 (34-197)||(15118352-15118514)
chr4 (34-197)||(52312510-52312672)
chr4 (28-197)||(19242693-19242861)
chr4 (32-197)||(19618172-19618336)
chr4 (34-197)||(3515007-3515169)
chr4 (34-157)||(14280316-14280438)
chr4 (34-197)||(23803265-23803427)
chr4 (34-197)||(44615288-44615450)
chr4 (34-197)||(44773087-44773249)
chr4 (34-197)||(50222339-50222501)
chr4 (34-180)||(18239436-18239581)
chr4 (34-197)||(51463868-51464030)
chr4 (34-197)||(44102214-44102376)
chr4 (38-197)||(15355324-15355483)
chr4 (31-117)||(3096293-3096379)
chr4 (32-177)||(14970727-14970871)
chr4 (34-197)||(12610950-12611105)
chr4 (31-240)||(15367690-15367899)
chr4 (31-240)||(15402703-15402912)
chr4 (46-240)||(52243105-52243302)
chr4 (31-261)||(17046487-17046714)
chr4 (50-213)||(13790-13953)
chr4 (34-177)||(8574844-8574985)
chr4 (31-142)||(15370018-15370128)
chr4 (31-142)||(15371202-15371312)
chr4 (31-142)||(15373483-15373593)
chr4 (50-180)||(21815602-21815731)
chr4 (34-197)||(7641192-7641344)
chr4 (35-210)||(15093775-15093950)
chr4 (31-142)||(16223532-16223642)
chr4 (169-295)||(17047929-17048055)
chr4 (37-142)||(20149832-20149936)
chr4 (33-197)||(22353835-22353999)
chr4 (46-213)||(43198492-43198661)
chr4 (31-102)||(15551817-15551889)
chr4 (31-154)||(39706286-39706409)
chr4 (80-206)||(43256106-43256230)
chr4 (35-107)||(12774011-12774084)
chr4 (50-179)||(6190481-6190611)
chr4 (46-149)||(12288211-12288316)
chr4 (146-260)||(3096759-3096872)
chr4 (58-180)||(16356924-16357045)
chr4 (35-107)||(8846360-8846433)
chr4 (35-180)||(16488050-16488194)
chr4 (35-208)||(15121747-15121917)
chr4 (58-180)||(16348636-16348757)
chr4 (32-94)||(20157517-20157579)
chr4 (35-120)||(13569502-13569587)
chr4 (35-180)||(13812991-13813135)
chr4 (58-94)||(11250619-11250655)
chr4 (58-94)||(15353365-15353401)
chr4 (35-95)||(23843478-23843538)
chr4 (106-180)||(15464903-15464977)
chr4 (191-235)||(14280462-14280507)
chr4 (195-235)||(54798680-54798721)
chr4 (35-99)||(12570014-12570078)
chr4 (66-129)||(16596683-16596746)
chr4 (58-94)||(25555503-25555539)
chr4 (50-150)||(46640456-46640558)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (31-295)||(3470-3734)
scaffold0292 (31-295)||(343-606)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (83-295)||(13144-13356)
scaffold0175 (31-106)||(34123-34199)
scaffold0175 (31-87)||(273-329)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (31-295)||(39913-40176)
scaffold0080 (58-210)||(18597-18749)
scaffold0080 (50-150)||(19885-19987)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (31-293)||(25896-26157)
scaffold0026 (31-293)||(39858-40118)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (31-288)||(5985-6245)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (33-295)||(39479-39740)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (33-295)||(75072-75333)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (49-295)||(24158-24406)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (31-295)||(8479-8739)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (31-295)||(4508-4771)
scaffold0228 (31-295)||(12090-12353)
scaffold0228 (31-295)||(22042-22305)
[»] scaffold0056 (3 HSPs)
scaffold0056 (32-295)||(17072-17337)
scaffold0056 (50-233)||(79248-79430)
scaffold0056 (35-99)||(14139-14203)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (38-287)||(25930-26179)
scaffold0122 (34-177)||(44682-44825)
scaffold0122 (168-295)||(33352-33479)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (31-295)||(16457-16721)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (31-293)||(908-1169)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (32-235)||(3103-3306)
[»] scaffold0003 (4 HSPs)
scaffold0003 (34-284)||(339818-340065)
scaffold0003 (34-197)||(158450-158612)
scaffold0003 (80-206)||(71350-71474)
scaffold0003 (62-94)||(414108-414140)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (31-235)||(4849-5053)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (31-293)||(32818-33077)
scaffold0120 (31-293)||(45928-46187)
scaffold0120 (31-235)||(16113-16316)
scaffold0120 (31-92)||(17389-17450)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (31-287)||(20910-21167)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (31-295)||(1952-2216)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (112-295)||(27911-28094)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (31-295)||(32067-32328)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (90-292)||(823-1021)
scaffold0395 (31-97)||(4888-4954)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (31-161)||(28414-28544)
scaffold0046 (31-146)||(11292-11407)
scaffold0046 (31-146)||(1997-2112)
scaffold0046 (31-84)||(4552-4605)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (31-235)||(4712-4915)
scaffold0358 (96-235)||(1-139)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (31-295)||(13497-13759)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (31-295)||(10283-10544)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (31-198)||(128751-128917)
scaffold0031 (50-240)||(20337-20524)
scaffold0031 (59-120)||(65830-65891)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (31-261)||(15356-15584)
scaffold0114 (35-99)||(7295-7359)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (121-295)||(124675-124849)
scaffold0021 (32-209)||(174767-174943)
scaffold0021 (31-100)||(121766-121835)
scaffold0021 (50-149)||(136370-136471)
scaffold0021 (50-149)||(145078-145179)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (52-295)||(4545-4787)
[»] scaffold0327 (2 HSPs)
scaffold0327 (94-257)||(3424-3588)
scaffold0327 (35-94)||(289-348)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (34-197)||(20747-20909)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (34-197)||(37821-37983)
[»] scaffold0023 (9 HSPs)
scaffold0023 (34-197)||(94411-94573)
scaffold0023 (38-197)||(17440-17598)
scaffold0023 (34-180)||(44454-44600)
scaffold0023 (35-210)||(38421-38596)
scaffold0023 (35-158)||(100378-100501)
scaffold0023 (31-102)||(119875-119947)
scaffold0023 (35-157)||(40169-40291)
scaffold0023 (123-210)||(23608-23695)
scaffold0023 (35-107)||(101503-101576)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (34-180)||(13392-13537)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (32-197)||(11286-11450)
scaffold0029 (35-208)||(12763-12933)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (34-197)||(4694-4856)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (34-197)||(13947-14109)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (34-197)||(136680-136842)
scaffold0028 (34-197)||(139149-139311)
scaffold0028 (34-197)||(144087-144249)
scaffold0028 (34-197)||(134211-134373)
scaffold0028 (34-197)||(141618-141780)
scaffold0028 (33-157)||(62200-62321)
scaffold0028 (35-117)||(132662-132745)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (33-197)||(10772-10935)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (34-197)||(16784-16946)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (34-197)||(82072-82234)
scaffold0037 (46-157)||(22665-22776)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (38-197)||(501088-501246)
scaffold0001 (34-240)||(85536-85742)
scaffold0001 (35-157)||(160688-160809)
scaffold0001 (58-94)||(422589-422625)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (90-295)||(6669-6874)
[»] scaffold0761 (2 HSPs)
scaffold0761 (37-197)||(4300-4459)
scaffold0761 (35-180)||(6281-6425)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (34-197)||(40400-40562)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (32-197)||(12249-12413)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (31-261)||(16282-16509)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (34-197)||(4214-4377)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (33-197)||(9241-9404)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (34-197)||(106-268)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (31-235)||(969-1170)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (31-235)||(46995-47196)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (34-177)||(116430-116571)
scaffold0022 (50-150)||(128971-129072)
scaffold0022 (35-94)||(73824-73883)
scaffold0022 (57-150)||(78348-78442)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (31-153)||(11442-11564)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (46-213)||(8481-8650)
scaffold0621 (31-157)||(6535-6661)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (35-196)||(29558-29720)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (48-177)||(29946-30074)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (34-197)||(12064-12220)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (31-232)||(1289-1487)
scaffold0106 (31-232)||(7266-7464)
scaffold0106 (34-99)||(15291-15356)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (50-240)||(13147-13339)
scaffold0357 (46-240)||(16011-16206)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (46-240)||(27660-27855)
scaffold0165 (190-295)||(3640-3745)
scaffold0165 (190-295)||(7704-7809)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (34-197)||(161089-161252)
scaffold0007 (114-240)||(164547-164674)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (31-213)||(11464-11646)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (31-240)||(17938-18148)
scaffold0247 (34-142)||(2184-2291)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (31-213)||(38195-38377)
scaffold0124 (35-94)||(42627-42686)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (35-210)||(4746-4921)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (31-235)||(51582-51783)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (169-295)||(1052-1178)
[»] scaffold0101 (2 HSPs)
scaffold0101 (37-142)||(1336-1440)
scaffold0101 (35-120)||(8995-9080)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (58-210)||(16291-16442)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (191-295)||(10323-10427)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (34-213)||(38641-38820)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (35-157)||(19268-19390)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (58-200)||(29117-29262)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (61-213)||(53488-53640)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (80-206)||(15362-15486)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (35-157)||(2801-2923)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (43-157)||(129917-130031)
scaffold0010 (57-235)||(60631-60811)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (35-157)||(14692-14814)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (34-146)||(15664-15776)
scaffold0261 (35-120)||(1339-1424)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (31-154)||(6121-6244)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (34-214)||(5069-5246)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (43-157)||(5655-5769)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (50-203)||(51833-51985)
scaffold0034 (31-150)||(32538-32654)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (52-213)||(7998-8161)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (31-107)||(6611-6688)
scaffold0333 (31-107)||(13991-14068)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (31-107)||(15821-15898)
scaffold0020 (35-98)||(178898-178961)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (50-157)||(1051-1158)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (46-157)||(10536-10647)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (50-213)||(12587-12749)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (31-146)||(1075-1190)
scaffold0184 (58-94)||(4284-4320)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (35-157)||(133-255)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (35-180)||(1881-2024)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (58-207)||(192920-193070)
scaffold0017 (58-94)||(15268-15304)
scaffold0017 (58-94)||(19790-19826)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (35-120)||(23843-23928)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (88-213)||(225465-225588)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (31-102)||(1083-1155)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (31-154)||(12766-12889)
[»] scaffold0297 (2 HSPs)
scaffold0297 (35-99)||(10575-10639)
scaffold0297 (35-95)||(15736-15796)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (35-209)||(26828-26999)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (35-209)||(21749-21920)
scaffold0210 (35-209)||(29641-29812)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (35-102)||(2694-2762)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (35-154)||(12943-13062)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (35-150)||(45794-45909)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (35-107)||(28813-28887)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (58-180)||(920-1041)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (58-180)||(1853-1974)
scaffold0104 (58-180)||(9536-9656)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (35-107)||(1086-1159)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (35-107)||(23927-24000)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (35-120)||(69794-69879)
[»] scaffold1895 (1 HSPs)
scaffold1895 (122-210)||(1169-1257)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (50-150)||(6284-6386)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (46-149)||(8075-8180)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (58-208)||(46670-46820)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (58-180)||(44104-44225)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (43-107)||(6824-6889)
scaffold0556 (106-150)||(8090-8134)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (35-180)||(159-304)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (210-295)||(17844-17929)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (46-150)||(10542-10646)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (35-120)||(18236-18321)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (52-101)||(206575-206624)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (35-99)||(6095-6159)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (46-150)||(25121-25226)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (35-129)||(32102-32197)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (35-98)||(36454-36517)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (35-208)||(4430-4603)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (50-92)||(11982-12024)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (58-96)||(4999-5037)
[»] scaffold1296 (1 HSPs)
scaffold1296 (35-180)||(393-537)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (57-150)||(38342-38437)
scaffold0139 (35-120)||(19980-20065)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (35-99)||(7870-7934)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (58-94)||(7328-7364)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (32-180)||(10015-10162)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (35-99)||(14664-14728)
scaffold0081 (35-99)||(23679-23743)
scaffold0081 (35-99)||(39103-39167)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (50-150)||(267679-267781)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (50-149)||(569-669)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (35-94)||(1494-1553)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (50-213)||(97024-97188)
scaffold0006 (50-213)||(106302-106466)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (58-180)||(2057-2178)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (58-180)||(6387-6508)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (88-157)||(2213-2281)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (119-180)||(13092-13153)
[»] scaffold0637 (1 HSPs)
scaffold0637 (58-94)||(8583-8619)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (58-94)||(7494-7530)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (58-94)||(2191-2227)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (223-295)||(20595-20667)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (58-94)||(35569-35605)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 84)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Original strand, 25421532 - 25421796
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25421532 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 25421631  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421632 attgcaagtcaacagcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 25421731  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||| | |||| |||| ||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  25421732 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatgctaccccaaggttcaactctcaacaact 25421796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Original strand, 25431395 - 25431658
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25431395 acatcatcatcttcataaa-ttagaccgactcatgcatcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 25431493  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25431494 attgcaagtcaacaacatcttaaatgttcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 25431593  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||| | |||| |||| ||||||||||||| |||| ||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  25431594 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatgctacctcaaggttcaactctcaacaact 25431658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 23390617 - 23390353
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23390617 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 23390518  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  23390517 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaatagctt 23390418  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||| | |||| |||| || ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  23390417 cacagattataattaacatcctcattaagtcttaatactatcccaaggttcaactctcgacaact 23390353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Original strand, 24493569 - 24493832
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24493569 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaagtaacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 24493667  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  24493668 aatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtgatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacatatcttaaatagctt 24493767  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||| | |||| |||| |||| ||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24493768 cacagattataattaacatcattattaagtcttaatactaccccaaggttcaactctcaacaact 24493832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 8286964 - 8286699
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaa-cagcatgacataataatatc 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8286964 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaacagcatgacataataatatc 8286865  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagct 229  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8286864 aattgcaattcatcaacatcttaaataatcaaacattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 8286765  T
Q  230 tcacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    |||||    |||| |||| || ||||||||||  ||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  8286764 tcacataatataattaacatcttcattaagtcttaatactacccaaaggttcaactctcaacaact 8286699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 31 - 293
Target Start/End: Original strand, 13025311 - 13025572
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  13025311 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacatattgatatca 13025409  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||    
T  13025410 aatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgtacataacattatatcacatcgtaatcaacatcaacatatcttaaacaactt 13025509  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaa 293  Q
    ||||  | |||| |||| |||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13025510 cacatattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactctcaacaa 13025572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Original strand, 9077952 - 9078216
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9077952 acatcatcatcttcatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatca 9078051  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    | |||||||||||||||||| || ||| || | |||  |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9078052 agtgcaagtcaacaacatctcaattatacattcataactcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 9078151  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||| | |||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| || |||||||    
T  9078152 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaacccttaacaact 9078216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 31 - 291
Target Start/End: Original strand, 13095495 - 13095754
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  13095495 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacatattgatatca 13095593  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||    
T  13095594 aatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgtacataacattatatcacatcgtaatcaacatcaacatatcttaaacaactt 13095693  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaac 291  Q
    ||||  | |||| |||| |||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13095694 cacatattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactctcaac 13095754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 34 - 291
Target Start/End: Original strand, 24529223 - 24529480
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  24529223 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataatgatatcaaat 24529322  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcac 233  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || | |||  |||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24529323 gcaagtcaacaacatcttaattatacattcatatctcaagtaatgcttataacattatatcacatcatattcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 24529422  T
Q  234 aggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaac 291  Q
    || | |||  |||| ||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24529423 agattatagttaacatcatcattaagtttcaatactaccccaaggttcaactctcaac 24529480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Original strand, 1096467 - 1096731
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  1096467 acatcaacatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggtagtatgcaaaaacaacataacataataatatca 1096566  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    | ||||| |||||||||||| | |||| || | ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1096567 aatgcaaatcaacaacatctcacatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 1096666  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    || |||| |||| |||| || |||||||||| |||||||| ||||| || ||||| | |||||||    
T  1096667 cataggttataattaacatcctcattaagtctcaatactaccccaaggtccaacttttaacaact 1096731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 31 - 261
Target Start/End: Original strand, 22075018 - 22075249
Alignment:
Q  31 acatcatcat-cttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22075018 acatcatcattcttcaacaacttagaccgactcattcagcttagttaaataacaacagcaacataggaagtatacaaaatcaacatgacataataatatc 22075117  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagct 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  22075118 aattgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagct 22075217  T
Q  230 tcacaggtcataaataacgtcatcattaagtc 261  Q
    |||||  | |||| |||| || ||||||||||    
T  22075218 tcacatattataattaacctcttcattaagtc 22075249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 31 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21808510 - 21808343
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21808510 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatca 21808411  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacat 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  21808410 attgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacat 21808343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 31 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21729185 - 21729018
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21729185 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatca 21729086  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacat 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||| | || | ||||||||||    
T  21729085 attgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaatattatatcacat 21729018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 42245527 - 42245365
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42245527 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 42245429  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  42245428 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 42245365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 45 - 242
Target Start/End: Original strand, 18418594 - 18418789
Alignment:
Q  45 atcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaa-taacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaac 143  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  18418594 atcaacttagactgactcgtgcaacttagttaaaataacaacatcaacataggcagtatacaaa--cagcatgacataataatatcatttgcaattca-c 18418690  T
Q  144 aacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatctt-aaacagcttcacaggtcataa 242  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||  ||||  |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  18418691 aacatcttaa-tattcaataaaacttcaagtaatgtacacaacattatatcacatcataatcaatgtcaaaacatcttaaaacagcttcacaggttataa 18418789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 21997655 - 21997547
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21997655 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 21997556  T
Q  131 attgcaagt 139  Q
    | |||||||    
T  21997555 aatgcaagt 21997547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 264930 - 264768
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  264930 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 264832  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  264831 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 264768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 39363384 - 39363546
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39363384 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 39363482  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  39363483 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 39363546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 10733102 - 10732957
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10733102 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 10733004  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgca 180  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||    
T  10733003 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgca 10732957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 21293090 - 21292861
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||    
T  21293090 acatcatcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac--aaacagtatgacataataatatca 21292993  T
Q  131 --attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagc 228  Q
      |||  || ||| ||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| || ||||  |||||| ||| |    
T  21292992 atattcaaattcatcaacatcttaggtatacaattattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacaac 21292894  T
Q  229 ttcacaggtcataaataacgtcatcattaagtc 261  Q
    ||||||| | |||| |||| |||| ||||||||    
T  21292893 ttcacagattataattaacctcattattaagtc 21292861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 235
Target Start/End: Original strand, 22412187 - 22412377
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  22412187 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacgataacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 22412285  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcac 233  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||      ||||     ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22412286 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagta------ataa----gtatgacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 22412375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 20909012 - 20909174
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20909012 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20909110  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  20909111 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20909174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 29329934 - 29330096
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  29329934 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 29330032  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  29330033 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29330096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 29345980 - 29346142
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29345980 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaacagcatcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 29346078  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  29346079 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29346142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 32027393 - 32027555
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32027393 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacaacaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 32027491  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
     |||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  32027492 ccaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 32027555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 34 - 180
Target Start/End: Original strand, 39245136 - 39245281
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39245136 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 39245234  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgca 180  Q
    ||||||||| ||| ||  || ||||||  |||| |||||||||||||    
T  39245235 gcaagtcaataacgtcccaattattcacatataattcaagtaatgca 39245281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 36154942 - 36154783
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36154942 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaaca-ca---gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 36154847  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  36154846 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 36154783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 34 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 11581361 - 11581218
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  11581361 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 11581263  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatg 178  Q
    ||||||||| ||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||    
T  11581262 gcaagtcaataacgtctcaattattcacgtataattcaagtaatg 11581218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 33 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 17517320 - 17517168
Alignment:
Q  33 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 132  Q
    |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||  ||||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  17517320 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaat 17517221  T
Q  133 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataa 185  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  17517220 cgcaattcaacaacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgcacataa 17517168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 29348453 - 29348615
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29348453 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataagaacagcatcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 29348551  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  29348552 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29348615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 29350926 - 29351088
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29350926 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataagaacagcatcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 29351024  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  29351025 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29351088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 20902172 - 20902060
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcat-caacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 132  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20902172 tcatcatcttaattcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaag 20902074  T
Q  133 tgcaagtcaacaac 146  Q
    ||||||||||||||    
T  20902073 tgcaagtcaacaac 20902060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 2154776 - 2154665
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2154776 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaact 2154678  T
Q  134 gcaagtcaacaac 146  Q
    |||||||||||||    
T  2154677 gcaagtcaacaac 2154665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 142
Target Start/End: Original strand, 31061068 - 31061175
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31061068 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaaaaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 31061166  T
Q  134 gcaagtcaa 142  Q
    |||||||||    
T  31061167 gcaagtcaa 31061175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 37 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 18319193 - 18319033
Alignment:
Q  37 tcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18319193 tcatcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 18319095  T
Q  137 agtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    |||||| |||| ||| || ||||||  |||| ||||| ||||||| |||  | |||||||||    
T  18319094 agtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 18319033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 50 - 240
Target Start/End: Original strand, 22144068 - 22144259
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataaca-acagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 148  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  22144068 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacatcaacataggtagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaattgcaaatcaacaacat 22144166  T
Q  149 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatctta-aacagcttcacaggtcat 240  Q
    || ||| |||||  |||| ||||||||||||| |||  | ||||||||||  ||| |||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||    
T  22144167 ctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattgtaaacaacatcaattcatcttataacaacttcacaggtcat 22144259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 10775838 - 10775675
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |    
T  10775838 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgacagcgacaca-gcagtatataaaaccagcatgacataataatatcaaat 10775740  T
Q  134 gcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||| |||| ||| || ||||||  |||| ||||| ||||||| |||  | |||||||||    
T  10775739 gcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 10775675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 142
Target Start/End: Original strand, 38619434 - 38619541
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38619434 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 38619532  T
Q  134 gcaagtcaa 142  Q
    |||||||||    
T  38619533 gcaagtcaa 38619541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 35 - 210
Target Start/End: Original strand, 21873254 - 21873426
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 134  Q
    |||||||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| | ||||||||| | |||||||||||      
T  21873254 catcatcttattcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaaaagcagcataggcaggatacaacatcagcatgacttcataatatcaatct 21873353  T
Q  135 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacat 210  Q
    ||  |   |||||||||||  ||||||| |||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  21873354 cattt---caacatcttaaccattcaataatatcttaagtaatgcacataacattatatcacatcatattcaacat 21873426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 142
Target Start/End: Original strand, 23064512 - 23064618
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 134  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  23064512 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacctaataatatcaaatg 23064610  T
Q  135 caagtcaa 142  Q
    ||||||||    
T  23064611 caagtcaa 23064618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 20918110 - 20918017
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatat 128  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20918110 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacaaaataatat 20918017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 80 - 206
Target Start/End: Original strand, 18356364 - 18356488
Alignment:
Q  80 aacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgc 179  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||   | |||||||||    
T  18356364 aacaacagcaacataggcagcatacaaa--cagcatgatataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaatattcaaatatttcttaagtaatgc 18356461  T
Q  180 acataacactatatcacatcataatca 206  Q
    | | |||| |||||||||| |||||||    
T  18356462 ataaaacattatatcacattataatca 18356488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 135 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 21986164 - 21986004
Alignment:
Q  135 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcaca 234  Q
    ||||||||||||||||| | |||  | | |||  |||||||||||| |||||| | |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  21986164 caagtcaacaacatcttcattataaattcatatctcaagtaatgcatataacattttatcacctcatattcaacatcaacacatcttaaacaacttcaca 21986065  T
Q  235 ggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
      | |||  |||| ||||||| |||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  21986064 aattatagttaacatcatcatcaagtctgaatactaccccaaggttcaactctcaacaact 21986004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 38 - 209
Target Start/End: Original strand, 37723910 - 37724080
Alignment:
Q  38 catcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataaca-acagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 136  Q
    |||||||| || ||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| || ||||||| |  |    
T  37723910 catcttcaacatcttagactgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatac---aacagcatgacatgattatatcaaattaa 37724006  T
Q  137 agtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacat-aacactatatcacatcataatcaaca 209  Q
    | ||| |||||||| ||  ||||| | ||| |||||||||||||  | |||| |||||||||||||| ||||||    
T  37724007 attcatcaacatctcaatcattcattcataattcaagtaatgcaattaaacattatatcacatcatattcaaca 37724080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 19660956 - 19660879
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 107  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  19660956 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 19660879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 21329618 - 21329541
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  21329618 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 21329541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 142
Target Start/End: Original strand, 24067110 - 24067214
Alignment:
Q  37 tcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  24067110 tcatcttaatcaacttagaccgaccaatgcagcttggttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 24067208  T
Q  137 agtcaa 142  Q
    ||||||    
T  24067209 agtcaa 24067214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20910869 - 20910745
Alignment:
Q  80 aacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattc-aattatacttcaagtaatg 178  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||| ||| || ||| ||||||||    
T  20910869 aacaacagcaacatagacagcatacaaa--cagcatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaacattcaaataattctt-aagtaatg 20910773  T
Q  179 cacataacactatatcacatcataatca 206  Q
    || | |||| |||||||||| |||||||    
T  20910772 cataaaacattatatcacattataatca 20910745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 21502277 - 21502154
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||   ||| |||||||| |||| ||||||    
T  21502277 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtat-gtaaatcagcatgatataacaatatc 21502179  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaa 154  Q
     | ||||||||| || |||||||||    
T  21502178 gaatgcaagtcatcatcatcttaaa 21502154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 50 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 20027043 - 20026942
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 146  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||  ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20027043 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat-ccaaaacagttcatgatataataatatcaaatgcaattcaacaac 20026945  T
Q  147 atc 149  Q
    |||    
T  20026944 atc 20026942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 157
Target Start/End: Original strand, 21565546 - 21565668
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  21565546 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtat-ccaaatcatcatgatataacaatatcgaat 21565644  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatat 157  Q
    |||||||| |||||| | ||||||    
T  21565645 gcaagtcatcaacatttcaaatat 21565668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 22959649 - 22959576
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 107  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  22959649 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 22959576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 20766174 - 20766095
Alignment:
Q  97 cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaat 177  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||    
T  20766174 cagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 20766095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 168 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 22107357 - 22107230
Alignment:
Q  168 ttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaata 267  Q
    ||||||||||||| |  | | ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| | |||| |||| || ||||||||||  ||||    
T  22107357 ttcaagtaatgcataatatattatatcacatcataatcaacaacaacacaccttaaacagcttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaata 22107258  T
Q  268 ctatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    |||  | || ||||| ||||||||||||    
T  22107257 ctactcaaaggttcatctctcaacaact 22107230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 129
Target Start/End: Original strand, 36314577 - 36314675
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  36314577 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 36314675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 209
Target Start/End: Original strand, 22032323 - 22032492
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 134  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||| | | ||||  ||||| ||| |||||     
T  22032323 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaacataggcagattacaaaca-atcatg--ataattataccaatt- 22032418  T
Q  135 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaaca 209  Q
    ||| ||| ||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||| | |||| ||||  |||||||| ||||||    
T  22032419 caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcatattcaaca 22032492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 240
Target Start/End: Original strand, 40725853 - 40726063
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    |||||| |||||||| | |||| || ||||||||||| ||||||||  |||  | ||||||| |||||||||| ||||  || ||||| |||||||||||    
T  40725853 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaag-catcatgatataataatatc 40725951  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaa-cagc 228  Q
        | |||| |||||||||| ||||| |||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||| |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
T  40725952 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagc 40726051  T
Q  229 ttcacaggtcat 240  Q
    ||||||| ||||    
T  40726052 ttcacagatcat 40726063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 26012154 - 26012037
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  26012154 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaagcaacatgatataacaatatc 26012058  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatct 150  Q
    || ||  | ||||||||||||    
T  26012057 aaatgtgaatcaacaacatct 26012037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 120
Target Start/End: Original strand, 26704075 - 26704160
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 120  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  26704075 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacat 26704160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 120
Target Start/End: Original strand, 26973808 - 26973893
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 120  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  26973808 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacat 26973893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18770118 - 18769947
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaac-agcatgacataataatatcaatt 133  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||  ||||| ||| | ||||  ||||| ||| |||||    
T  18770118 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggtcgaataacaatagcaacataggcagattacaacaacaatcatg--ataattataccaatt 18770021  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaaca 209  Q
     ||| ||| ||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||| | |||| ||||  |||||||| ||||||    
T  18770020 -caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcatattcaaca 18769947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 23501472 - 23501402
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtataca 105  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||| |||||    
T  23501472 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcacaggcagaataca 23501402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 107
Target Start/End: Original strand, 19668898 - 19668975
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 107  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||    
T  19668898 acatcatcatcatcatcaacttagaccgactcttgcagctcagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcaaa 19668975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 120
Target Start/End: Original strand, 23201360 - 23201445
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 120  Q
    |||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||  |||||||    
T  23201360 catcatcttgttcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacattatgacat 23201445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 22178323 - 22178221
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 146  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||  |||||||  ||||| || | |||||||| ||||| ||||||||    
T  22178323 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtata-taaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaac 22178225  T
Q  147 atct 150  Q
    ||||    
T  22178224 atct 22178221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 208
Target Start/End: Original strand, 23572084 - 23572254
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaac-agcatgacataataatatcaatt 133  Q
    ||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||   |||| ||| | ||||  ||||| ||| |||||    
T  23572084 catcatcttaatcatcttatatggactcatgcaacttagttcaataacaataacagcataggcagatcacaacaacaatcatg--ataattataccaatt 23572181  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaac 208  Q
     ||| ||| ||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||| | |||| ||||  ||||||||||||||    
T  23572182 -caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcataatcaac 23572254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 20806904 - 20806850
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagc 88  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  20806904 tcatcatcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttaattaaataacaacagc 20806850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 120
Target Start/End: Original strand, 14079149 - 14079234
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 120  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| | ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||  | ||| ||||| |||||||    
T  14079149 catcatcttaatcatcttatatcaattcatgcaacatagttaaataacaatagcagcataggcagattgcaacaacagtatgacat 14079234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 99
Target Start/End: Original strand, 20805575 - 20805616
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcag 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  20805575 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcag 20805616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 26732937 - 26732884
Alignment:
Q  47 caacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagt 100  Q
    |||| |||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26732937 caacatagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagt 26732884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 150
Target Start/End: Original strand, 29448052 - 29448123
Alignment:
Q  80 aacaacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatct 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  29448052 aacaacagcaacataggcagtata-taaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatct 29448123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 98
Target Start/End: Original strand, 20766997 - 20767037
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggca 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  20766997 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggca 20767037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 24767665 - 24767518
Alignment:
Q  32 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 131  Q
    |||||||||||| |||| |||| || || | |||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||   |||  || || || || | ||||||||||    
T  24767665 catcatcatcttaatcatcttatatagatttatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacatcaatagtataactttataatatcaa 24767566  T
Q  132 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgca 180  Q
    || ||  ||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||    
T  24767565 tt-catttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgca 24767518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Original strand, 26680605 - 26680641
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26680605 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcagcata 26680641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Original strand, 26952212 - 26952248
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26952212 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcagcata 26952248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 21366781 - 21366722
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    ||||||||| |||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  21366781 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcata 21366722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 26740747 - 26740697
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagt 100  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  26740747 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacatagacagt 26740697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 26742847 - 26742806
Alignment:
Q  43 tcatcaacttagatc-gactcatgcaacttagttaaataaca 83  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  26742847 tcatcaacttagttcagactcatgcaacttagttaaataaca 26742806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 123399 - 123363
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  123399 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcata 123363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 12028659 - 12028623
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  12028659 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcata 12028623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 17919245 - 17919209
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  17919245 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcata 17919209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Original strand, 22757148 - 22757184
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22757148 gactcatgtaacttagttaaataacagcagcaacata 22757184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 23535673 - 23535637
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  23535673 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcata 23535637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Original strand, 31342170 - 31342206
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  31342170 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcata 31342206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 73)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Original strand, 23060513 - 23060776
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23060513 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 23060612  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23060613 attgcaagtcaacaacatcttaaatattaaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 23060712  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||  | |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  23060713 caca-attataattaacatcatcattaagtcccaatactaccccaaagttcaattctcaacaact 23060776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Original strand, 23076442 - 23076706
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076442 acatcatcatcttcatccacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 23076541  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  23076542 attgcaagtcaacaatatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacagcttaaacagctt 23076641  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||| | |||| |||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23076642 cacagattataattaacatcatcataaaatcccaatactaccccaaagttcaactctcaacaact 23076706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 22738300 - 22738037
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22738300 acatcatcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacattaa-ataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 22738202  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22738201 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 22738102  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||| | |||| |||| || ||||||||||  ||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  22738101 cacagattataattaacatcctcattaagtcttaatactaccccaaggttcaattctcaacaact 22738037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 31 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 22731355 - 22731116
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22731355 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 22731256  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22731255 attgcaattcatcaacatattaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 22731156  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatacta 270  Q
    ||||| | |||| |||| || ||||||||||  |||||||    
T  22731155 cacagattataattaacatcctcattaagtcttaatacta 22731116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Original strand, 23285865 - 23286125
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  23285865 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacag----acataataatatca 23285960  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  23285961 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatgttcttcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagctt 23286060  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||| | |||| |||| || ||||||||||  ||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  23286061 cacagattataattaacatcttcattaagtcttaatactacccaaaggttcaactctcaacaact 23286125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Original strand, 22337115 - 22337379
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22337115 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggctgtatataaaaacagcatgacataataatatca 22337214  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||    
T  22337215 aatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacatatcttaaacaactt 22337314  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||  | |||| |||| |||||||||||||  |||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  22337315 cacaaattataattaacatcatcattaagtcttaatactactccaaggttcaactctcaacaact 22337379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Original strand, 23660023 - 23660286
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  23660023 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtatcttagttaaacaacaacagcaacataggcagtatacgaaa-caggatgacataataatatca 23660121  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23660122 aatgcaaatcaacaacatcttaaatattcaatcataactcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 23660221  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
     |||  | |||| |||| |||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||    
T  23660222 tacaaattataattaacatcatcaataagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaataact 23660286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 23654507 - 23654243
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  23654507 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacagcataggcagcatacaaatacatcatgacataataatatca 23654408  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||   |||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||    
T  23654407 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaagtattactcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataattaacaacaacacatcttaaacagctt 23654308  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||| | |||| |||| || ||||||||||  ||| ||| || || ||||||||||| ||||||    
T  23654307 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctacccaaaggttcaactctcgacaact 23654243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 34 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 298933 - 298732
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 132  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  298933 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 298834  T
Q  133 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttca 232  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||| | |||| |||||||||||||||| || | |||| ||||||| |||||||||    
T  298833 tgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataattaataacaacacatcttatacagcttca 298734  T
Q  233 ca 234  Q
    ||    
T  298733 ca 298732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 38235 - 37973
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38235 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatca 38137  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    ||| | | ||| || |||||||  ||| |||  || |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||   ||||| |||||||    
T  38136 atttcgattcatcatcatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacaacatgtcttatacagctt 38038  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    || || | |||| |||| ||||  |||||||  ||| ||| || || ||||||||||| ||||||    
T  38037 cagagattataattaacctcattgttaagtcttaatcctacccaaaggttcaactctcgacaact 37973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 22105412 - 22105575
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22105412 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaat 22105511  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  22105512 gcaagtcaacaacttctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22105575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21155219 - 21155060
Alignment:
Q  37 tcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21155219 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 21155121  T
Q  137 agtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    |||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  21155120 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 21155060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 18808943 - 18809105
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18808943 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18809041  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  18809042 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 18809105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 23130862 - 23131024
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23130862 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23130960  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  23130961 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 23131024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 23133329 - 23133491
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23133329 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23133427  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  23133428 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 23133491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23709694 - 23709532
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23709694 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23709596  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  23709595 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 23709532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23712175 - 23712013
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23712175 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23712077  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  23712076 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 23712013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 26505379 - 26505541
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  26505379 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaat 26505477  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  26505478 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 26505541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 26507857 - 26508019
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  26507857 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaat 26507955  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  26507956 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 26508019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 34402684 - 34402522
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34402684 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 34402586  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  34402585 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 34402522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 39682313 - 39682475
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39682313 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 39682411  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  39682412 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 39682475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 180
Target Start/End: Original strand, 23135590 - 23135735
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23135590 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23135688  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgca 180  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||    
T  23135689 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgca 23135735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 32 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 32215085 - 32214921
Alignment:
Q  32 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 131  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32215085 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 32214987  T
Q  132 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
     |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  32214986 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 32214921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 571397 - 571559
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  571397 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 571495  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || | ||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  571496 gcaagtcaacaacgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 571559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 6725995 - 6726157
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6725995 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 6726093  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    | ||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  6726094 gtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 6726157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 24367774 - 24367936
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24367774 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 24367872  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  24367873 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24367936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 24898358 - 24898195
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaactt-agttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 132  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24898358 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24898260  T
Q  133 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  24898259 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24898195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 24900841 - 24900678
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaactt-agttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 132  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24900841 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24900743  T
Q  133 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  24900742 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24900678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 24903318 - 24903155
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaactt-agttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 132  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24903318 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24903220  T
Q  133 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  24903219 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24903155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 24905795 - 24905632
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaactt-agttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 132  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24905795 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24905697  T
Q  133 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  24905696 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24905632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 24908270 - 24908107
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaactt-agttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 132  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24908270 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24908172  T
Q  133 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  24908171 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24908107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 235
Target Start/End: Original strand, 20309108 - 20309309
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||    
T  20309108 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatac---aacagcatgacataattatatc 20309204  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagct 229  Q
    || | ||| ||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| ||||  ||||||  |||||    
T  20309205 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcataatcaacaacaacatatcttattcagct 20309303  T
Q  230 tcacag 235  Q
    ||||||    
T  20309304 tcacag 20309309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 185
Target Start/End: Original strand, 25616192 - 25616339
Alignment:
Q  38 catcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 137  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||  ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  25616192 catcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaattacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaattgcaa 25616291  T
Q  138 gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataa 185  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  25616292 ttcaacaacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgcacataa 25616339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 32039660 - 32039498
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32039660 tcatcatcttaatcaacttagaccggctcatgcagcttagttaaataacaacagtaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 32039562  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  32039561 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 32039498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23708738 - 23708530
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataaca-acagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  23708738 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcaagcagcttagttaaataacagatagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatc 23708642  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatctta-aacagc 228  Q
    |||||||| ||| | |||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||| |||| |||||||||  ||||||| ||||||    
T  23708641 aattgcaaatcatcgacatctcaaacattcaaatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaattcatcttataacagc 23708542  T
Q  229 ttcacaggtcat 240  Q
    ||||||| ||||    
T  23708541 ttcacagatcat 23708530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 28577099 - 28577261
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  28577099 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacgcaa-cagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaat 28577197  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  28577198 gcaagccaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 28577261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 34 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 45030016 - 45029871
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |  || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  45030016 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaa-caatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 45029918  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgca 180  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||    
T  45029917 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgca 45029871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 36 - 197
Target Start/End: Original strand, 43137301 - 43137461
Alignment:
Q  36 atcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgc 135  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  43137301 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagtaa-tatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgc 43137399  T
Q  136 aagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||| ||| || | ||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  43137400 aagtcaacaacgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 43137461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22799243 - 22799068
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 134  Q
    |||||||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||   |||| |||| |||||| | ||||||||||||     
T  22799243 catcatcttattcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacatcatgacttcataatatcaattt 22799144  T
Q  135 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacat 210  Q
    ||  |||||||||||||||  ||||||| |||  | |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  22799143 catttcaacaacatcttaatcattcaataatatcttaagtaaggcacataacattatatcacatcatattcaacat 22799068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 157
Target Start/End: Original strand, 28405981 - 28406103
Alignment:
Q  36 atcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 134  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| | ||    
T  28405981 atcatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 28406080  T
Q  135 caagtcaacaacatcttaaatat 157  Q
    ||| |||||||||||| ||||||    
T  28406081 caaatcaacaacatctcaaatat 28406103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 24529691 - 24529580
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24529691 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaacaacaacacat-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagt 24529593  T
Q  134 gcaagtcaacaac 146  Q
    |||||| ||||||    
T  24529592 gcaagttaacaac 24529580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23019823 - 23019648
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 134  Q
    ||||||||| |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||||||   |||| |||| |||||| | ||||||||||||     
T  23019823 catcatcttaatcatcttatattgactcataaaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacaacatgacttcataatatcaattt 23019724  T
Q  135 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacat 210  Q
    ||  |||||||||||||||  ||||||| |||  | ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  23019723 catttcaacaacatcttaatcattcaataatatcttaagtaatgcacataacgttatatcacatcatattcaacat 23019648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 31 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 23103516 - 23103348
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||    
T  23103516 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaacagcaacataggcagtatac--aaacagcatgacatgattatatca 23103419  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacat-aacactatatcacatca 200  Q
    | | ||| ||| |||||||| ||  ||||| | ||| ||||||| |||||  | |||| ||||||||||||    
T  23103418 aattcaattcatcaacatctcaatcattcattcataattcaagtcatgcaattaaacattatatcacatca 23103348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 38967374 - 38967537
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |  || |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |    
T  38967374 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacatcgacaca-acaatatacaaaaatagcatgaaataataatatcaaat 38967472  T
Q  134 gcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||  |||| ||||| ||||||| |||  | |||||||||    
T  38967473 gcaagtcaatcaacatctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 38967537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 108
Target Start/End: Original strand, 8946657 - 8946734
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8946657 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttagataacaatagcaacataggcagtatacaaaa 8946734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 213
Target Start/End: Original strand, 19671830 - 19672010
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    |||||| |||||||| | |||||||  |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  19671830 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 19671928  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaa 213  Q
     |  |||||| ||||||||| | ||||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||| |||| |||||||||    
T  19671929 gaacgcaagtaaacaacatc-tcaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataa-caacatcaa 19672010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 23040310 - 23040247
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23040310 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 23040247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 189 - 295
Target Start/End: Original strand, 27753733 - 27753839
Alignment:
Q  189 tatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctc 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  | |||| |||| |||||||||||||  ||| |||||||||  ||||||||||    
T  27753733 tatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagtttcacatattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcccaagcttcaactctc 27753832  T
Q  289 aacaact 295  Q
     ||||||    
T  27753833 gacaact 27753839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 157
Target Start/End: Original strand, 25175854 - 25175976
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    ||||||| |||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  25175854 catcatcatcatcaacttagacagattcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 25175952  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatat 157  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  25175953 gcaaatcaacaacatctcaaatat 25175976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 50 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 32452031 - 32451901
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaa-ca 147  Q
    |||||| ||||||||||| ||| |||||| | ||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||    
T  32452031 cttagaccgactcatgcagcttggttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatcaa-tgcaagccaacaatca 32451933  T
Q  148 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgc 179  Q
    ||| || |||||| ||| ||||||||||||||    
T  32451932 tctcaattattcatttaaacttcaagtaatgc 32451901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 154
Target Start/End: Original strand, 7679589 - 7679707
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||||| |    
T  7679589 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaa-t 7679686  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaa 154  Q
    | |||||| ||||||| ||||    
T  7679687 gtaagtcatcaacatcataaa 7679707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 24643109 - 24643034
Alignment:
Q  37 tcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagc 113  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  24643109 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-tcagtatacaaaaacagc 24643034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 22134326 - 22134251
Alignment:
Q  32 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaa 107  Q
    |||||||||| |||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22134326 catcatcatcatcatcatcatagaccgactcatgcagcttagttaaatatcaacagcaacataggcagtatgcaaa 22134251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 23072070 - 23071972
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  23072070 acatcatcatcttcaacaacttagtccgactcatgcagcttagttaaataacgaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 23071972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 7824 - 7707
Alignment:
Q  61 tcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattc 159  Q
    ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  7824 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaacattc 7726  T
Q  160 aattatacttcaagtaatg 178  Q
    |  |||| |||||||||||    
T  7725 atatataattcaagtaatg 7707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 25963809 - 25963688
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 157  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||   |||| |||||||| |  | |||||||||||| ||  ||||||||||||| |  ||    
T  25963809 gactcatgcaacttagttcaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaatt-catttcaacaacatcttgatcat 25963711  T
Q  158 tcaattatacttcaagtaatgca 180  Q
    ||||| ||| |||||||||||||    
T  25963710 tcaataatatttcaagtaatgca 25963688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22741081 - 22740902
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacag-----catgacataataatatc 129  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||| |||  ||||| |||||     ||| ||||||  |||||    
T  22741081 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaactaggttaaataacaatagcagcatagacagattacaacaacagtatgacatcacataacgatatc 22740982  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataa-cactatatcacatcataatcaacat 210  Q
    |||   ||  ||||||||||||||  ||||| | ||| |||||||||||||  ||| || |||||||||||||| |||||||    
T  22740981 aat--aaaaacaacaacatcttaatcattcattcataattcaagtaatgcaattaatcattatatcacatcatattcaacat 22740902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 21916215 - 21916071
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 134  Q
    ||||||||| |||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||   |||| || ||||| |  | ||||||||||||     
T  21916215 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaaaaacaacataatcagatcacaacaaaagcataaattcataatatcaatt- 21916117  T
Q  135 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgca 180  Q
    ||  ||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||    
T  21916116 catttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgca 21916071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 150
Target Start/End: Original strand, 23207296 - 23207398
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 146  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||    
T  23207296 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtata-taaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacgac 23207394  T
Q  147 atct 150  Q
    ||||    
T  23207395 atct 23207398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 40622327 - 40622263
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcag 99  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||||||    
T  40622327 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcagcataggcag 40622263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 18787009 - 18786947
Alignment:
Q  46 tcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaa 107  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||    
T  18787009 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagtaacataggtagtatgcaaa 18786947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20520295 - 20520109
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 146  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||| |||||| |  |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  20520295 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatatgcagtaca-taaaacagttcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaac 20520198  T
Q  147 atcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatctta-aacagcttcacag 235  Q
    |||| ||| | |||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||| || | | |||||||  ||||||| |||| ||||||||    
T  20520197 atctcaaaca-tcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacgacatcaaatcatcttataacaacttcacag 20520109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 22758836 - 22758751
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 120  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||   ||||||||||| |||| ||||| |||  ||||| ||||| |||||||    
T  22758836 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaactagtttaaataacaatagcagcatagacagattacaacaacagtatgacat 22758751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 101
Target Start/End: Original strand, 23287384 - 23287433
Alignment:
Q  52 tagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagta 101  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  23287384 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagta 23287433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 24642933 - 24642856
Alignment:
Q  120 taataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  24642933 taataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24642856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 24655432 - 24655396
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24655432 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacata 24655396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Original strand, 24869903 - 24869939
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24869903 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcagcata 24869939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 25961628 - 25961592
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25961628 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcagcata 25961592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 100
Target Start/End: Original strand, 26392403 - 26392451
Alignment:
Q  52 tagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagt 100  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26392403 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagt 26392451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 22413240 - 22413181
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa 108  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  22413240 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaa 22413181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 22812028 - 22811969
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    ||||||||| |||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22812028 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcata 22811969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 120
Target Start/End: Original strand, 23038054 - 23038116
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 120  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  23038054 gactcatgcagcttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacat 23038116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Original strand, 24174823 - 24174859
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24174823 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcata 24174859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Original strand, 51913 - 52177
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51913 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcaatatacaaaaacagcatgacataataatatca 52012  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  52013 attgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatctacatcaacacatcttaaacagctt 52112  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||| | |||| |||| |||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  52113 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactctcaacaact 52177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 31 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 168099 - 167838
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  168099 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatca 168000  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||    
T  167999 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaaccaaaacacatcttaaacagctt 167901  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaa 293  Q
    || || | |||| |||| || ||||||||||  ||| ||| || || ||||||||||| ||||    
T  167900 caaagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctacccaaaggttcaactctcgacaa 167838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 106)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 31 - 291
Target Start/End: Original strand, 26686887 - 26687147
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26686887 acatcatcatcttcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 26686986  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26686987 attgcaagtcaacatcatcttaaatattccattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 26687086  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaac 291  Q
    ||||| | |||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26687087 cacagattataattaacatcctcattaagtcccaatactaccccaaagttcaactctcaac 26687147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Original strand, 43840932 - 43841196
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43840932 acatcattatcttcatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 43841031  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43841032 attgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 43841131  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||| | |||| |||| || || |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  43841132 cacagattataattaacatcctcgttaagtcccaatactaccccaaagtcaaactctcaacaact 43841196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Original strand, 13442274 - 13442538
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13442274 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacggcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 13442373  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13442374 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 13442473  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||| | |||| |||| |||||||||||||  |||   ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  13442474 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgtcatcccaaggttcaactctcgacaact 13442538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Original strand, 17487856 - 17488120
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17487856 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 17487955  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  17487956 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagatt 17488055  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||| | |||| |||| |||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  17488056 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcccaaggttcaactctcgacaact 17488120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 23083482 - 23083218
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23083482 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagaatgacataataatatca 23083383  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  23083382 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattttacttctagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaatatcaacacatcttaaacagctt 23083283  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||| |  ||| |||| |||||| ||||||  ||||||| | ||| |||||||||| |||||||    
T  23083282 cacagattgtaattaacatcatcactaagtcttaatactacctcaaggttcaactctgaacaact 23083218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 35 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 14576949 - 14576690
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 134  Q
    |||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  14576949 catcatcaacatcaacttagaccgactcattcaacttagttaaataacaacagcaacatagacagtata-aacaacagcatgacataataatatcaattg 14576851  T
Q  135 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcaca 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  14576850 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacaacttcaca 14576751  T
Q  235 ggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    | | |||| |||| |||||||||| ||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  14576750 gattataattaacatcatcattaaatcttaatactaccccaaggttcaactctcaacaact 14576690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Original strand, 17499338 - 17499602
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499338 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 17499437  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  17499438 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaacacatcttaaacagatt 17499537  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||  | |||| |||| |||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  17499538 cacaaattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcccaaggttcaactctcgacaact 17499602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Original strand, 14972854 - 14973110
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14972854 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 14972953  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    | ||||| |||||||||||| | |||| || | ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14972954 aatgcaaatcaacaacatctcatatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 14973053  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactct 287  Q
    || || | |||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  14973054 catagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactct 14973110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 20698556 - 20698293
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20698556 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacgtaataatatca 20698457  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||    
T  20698456 attgcaattcatcaacatcttatatattcaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacttcaacacatcttgaacagctt 20698358  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||| | |||| |||| |||||||||||||  ||| |||||| || ||||||||||| ||||||    
T  20698357 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaattctatccaaaggttcaactctcgacaact 20698293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Original strand, 18438534 - 18438798
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18438534 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatca 18438633  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    | |||||||||||||||||||   ||| || | |||  |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  18438634 aatgcaagtcaacaacatcttttttatacattcatatctcaagtaatgcatataacattatatcacatcatattcaacatcaacacatcttaaacagctt 18438733  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||| | |||  |||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  18438734 cacagattatagttaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaacactcaacaact 18438798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 25476506 - 25476242
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25476506 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaaaaacaacagcaacacaggtagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 25476407  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    | |||||||||||||||||| || ||| || | ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25476406 aatgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgcataacattatatcacatcattatcatcatcaacacatcttaaacagctt 25476307  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||| |  ||| |||| || |||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  25476306 cacagattgtaattaacatcctcattaagtctcaatactacctcaaggttcaactctcaacaact 25476242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 34 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24153326 - 24153126
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  24153326 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgatagcaacataggtagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 24153228  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcac 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24153227 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgcacataacataatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 24153128  T
Q  234 ag 235  Q
    ||    
T  24153127 ag 24153126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 44 - 295
Target Start/End: Original strand, 14572602 - 14572852
Alignment:
Q  44 catcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaac 143  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  14572602 catcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaattgagagtcaac 14572700  T
Q  144 aacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcacaggtcataaa 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||| ||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||| |||||||  | ||||     
T  14572701 aacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgaaaaaaacattatatcacatcataaacaacataaacaaatcttaaacaacttcacaaattataat 14572800  T
Q  244 taacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  14572801 taacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactctcaacaact 14572852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 49 - 295
Target Start/End: Original strand, 42386428 - 42386675
Alignment:
Q  49 acttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 148  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  42386428 acttagaccgactcatgcagtttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataacaatatcaaatgcaagtcaacaacat 42386527  T
Q  149 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatctt-aaacagcttcacaggtcataaataac 247  Q
    || ||||||||| | ||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| | || | ||||    
T  42386528 ctcaaatattcattcataattcaagcaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaaacagcttcacagattatcattaac 42386627  T
Q  248 gtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
     |||| |  |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  42386628 atcataaacaagtcccaatactaccccaaggttcaactcacaacaact 42386675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 11424880 - 11424620
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  11424880 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataacaatatca 11424782  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    || |||| ||||||   ||| || ||| || | ||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  11424781 atagcaaatcaaca---tctcaattatgcattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataaacaacttcaacacatcttaaacagctt 11424685  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||| | | || |||| ||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11424684 cacagattaaaattaacatcaacattaagtctcaatactaccccaaagttcaactctcaacaact 11424620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 40213838 - 40213578
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  40213838 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacatcaacacag-cagtatacataaacatcatgacataataatatcaaat 40213740  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcac 233  Q
    ||||||||||||||||| || ||| || | ||| | ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  40213739 gcaagtcaacaacatctcaattatacattcataatccaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctttac 40213640  T
Q  234 aggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    || | |||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  40213639 agattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttaaactctcaacaact 40213578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 31 - 235
Target Start/End: Original strand, 12399209 - 12399413
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12399209 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatca 12399308  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  12399309 aatgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataagacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaatagctt 12399408  T
Q  231 cacag 235  Q
    |||||    
T  12399409 cacag 12399413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16454443 - 16454281
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16454443 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 16454345  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  16454344 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 16454281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 34 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29172745 - 29172567
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29172745 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 29172647  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaa 213  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||  |  |||||||||||    
T  29172646 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatactatcaacatcaa 29172567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 46 - 295
Target Start/End: Original strand, 30029855 - 30030103
Alignment:
Q  46 tcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaa 145  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||    
T  30029855 tcaacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaatagcagcatagacagattacaacaacagcatgacataagaatatcatttgcaattca-caa 30029953  T
Q  146 catcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcacaggtcataaata 245  Q
    | ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||  | |||   |    
T  30029954 cgtcttaaatattcaataaaacttcaagtaatgtacacaacattatatcacatcataatcaatgtcaaaacatcttaaacagcttcacatattatattaa 30030053  T
Q  246 acgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    || |||||||||||||  ||  ||| || || ||||||||||| ||||||    
T  30030054 acatcatcattaagtcttaaagctacccaaaggttcaactctcgacaact 30030103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 9707769 - 9707607
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9707769 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 9707671  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
     |||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  9707670 acaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 9707607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 17463178 - 17463340
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17463178 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 17463276  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  17463277 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 17463340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 34159326 - 34159488
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34159326 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 34159424  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  34159425 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 34159488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 45607069 - 45606907
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45607069 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 45606971  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  45606970 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 45606907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 55476491 - 55476653
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  55476491 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 55476589  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  55476590 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 55476653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 28848773 - 28848628
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28848773 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 28848675  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgca 180  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||    
T  28848674 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgca 28848628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 7781509 - 7781347
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7781509 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 7781411  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    |||| |||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  7781410 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 7781347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 8899094 - 8899256
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8899094 tcatcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 8899192  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  8899193 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 8899256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 17672626 - 17672788
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17672626 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacatag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 17672724  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    |||| |||||||| ||| || ||||||  |||| ||||| ||||||| |||  | |||||||||    
T  17672725 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaaataatgcatatataattatatcaca 17672788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 38962053 - 38961891
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38962053 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 38961955  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  38961954 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 38961891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 13151953 - 13151790
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaactt-agttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 132  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13151953 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13151855  T
Q  133 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  13151854 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 13151790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 13154418 - 13154255
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaactt-agttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 132  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13154418 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13154320  T
Q  133 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  13154319 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 13154255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 33 - 197
Target Start/End: Original strand, 13544024 - 13544187
Alignment:
Q  33 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 132  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  13544024 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-caatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaa 13544122  T
Q  133 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  13544123 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 13544187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 33 - 185
Target Start/End: Original strand, 46822267 - 46822419
Alignment:
Q  33 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 132  Q
    |||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||  |||| || ||||||| |||||||||    
T  46822267 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacaacaagacataaaaatatcaat 46822366  T
Q  133 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataa 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  46822367 tgcaattcaacaacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgcacataa 46822419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 6469296 - 6469134
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6469296 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 6469198  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || || |||  |||| || |||||||||| |||  | |||||||||    
T  6469197 gcaagtcaacaacgtctcaattagtcacatataattgaagtaatgcatatacaattatatcaca 6469134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 10247885 - 10247723
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10247885 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaacagcagcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 10247787  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  10247786 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 10247723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Original strand, 12567564 - 12567722
Alignment:
Q  38 catcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 137  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  12567564 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-caatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaa 12567662  T
Q  138 gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  12567663 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 12567722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 17446816 - 17446655
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17446816 tcatcatcttaatcaacttaga-cgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 17446719  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||  ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  17446718 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatatcattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 17446655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 177
Target Start/End: Original strand, 36166598 - 36166739
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  36166598 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacag-cagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 36166695  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaat 177  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||    
T  36166696 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 36166739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 34 - 148
Target Start/End: Original strand, 55500942 - 55501055
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  55500942 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 55501040  T
Q  134 gcaagtcaacaacat 148  Q
    |||||||||||||||    
T  55501041 gcaagtcaacaacat 55501055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 33 - 209
Target Start/End: Original strand, 12511059 - 12511236
Alignment:
Q  33 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 132  Q
    |||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||  |||| || ||||||| |||||||||    
T  12511059 atcaacatcttaatcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacaacaagacataaaaatatcaat 12511158  T
Q  133 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacat-aacactatatcacatcataatcaaca 209  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| | ||||||||| || ||||||    
T  12511159 tgcaattcaacaacatcttcaatattcaataatatctcaagtaatgcacataaacaatgtatcacatcttattcaaca 12511236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 36 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16282971 - 16282811
Alignment:
Q  36 atcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgc 135  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  16282971 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatattgaatgc 16282873  T
Q  136 aagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  16282872 aagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 16282811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 43550644 - 43550497
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    |||||||||| |||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  43550644 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataatgacagcaacatatgcagtatgcaaaaacaacatgacataataatatca 43550545  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatg 178  Q
    | |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||    
T  43550544 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatg 43550497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 50242822 - 50242984
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  50242822 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagt-agtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 50242920  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    |||| |||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  50242921 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 50242984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 36 - 197
Target Start/End: Original strand, 41123892 - 41124049
Alignment:
Q  36 atcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgc 135  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41123892 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacacaa----cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 41123987  T
Q  136 aagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  41123988 aagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 41124049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 50 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 53070799 - 53070653
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatc 149  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  53070799 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataa-cagtatacaaaaacaacaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 53070701  T
Q  150 ttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    | || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  53070700 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 53070653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 34 - 160
Target Start/End: Original strand, 15977515 - 15977640
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  15977515 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-atagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 15977613  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattca 160  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||    
T  15977614 gcaagtcaacaacgtctcaattattca 15977640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 12119887 - 12119780
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12119887 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaacagcgacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 12119789  T
Q  134 gcaagtcaa 142  Q
    |||||||||    
T  12119788 gcaagtcaa 12119780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 142
Target Start/End: Original strand, 15412429 - 15412536
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15412429 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 15412527  T
Q  134 gcaagtcaa 142  Q
    |||||||||    
T  15412528 gcaagtcaa 15412536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 177
Target Start/End: Original strand, 21618460 - 21618590
Alignment:
Q  45 atcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 144  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21618460 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 21618557  T
Q  145 acatcttaaatattcaattatacttcaagtaat 177  Q
    |||||| |||||| || | ||| ||||||||||    
T  21618558 acatctcaaatatacattcataattcaagtaat 21618590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 131
Target Start/End: Original strand, 44494809 - 44494905
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 131  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44494809 tcatcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcataacataataatatcaa 44494905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 142
Target Start/End: Original strand, 8499518 - 8499625
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  8499518 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 8499616  T
Q  134 gcaagtcaa 142  Q
    |||||||||    
T  8499617 gcaagtcaa 8499625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 31 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24340844 - 24340634
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    |||||| |||||||| | |||||||  |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  24340844 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcagtatgcacaa-catcatgatataataatatc 24340746  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaa-cagc 228  Q
     |  |||||| |||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||| |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
T  24340745 gaacgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagc 24340646  T
Q  229 ttcacaggtcat 240  Q
    ||||||| ||||    
T  24340645 ttcacagatcat 24340634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 150
Target Start/End: Original strand, 10556985 - 10557101
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  10556985 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-tcagcatacaaaaacggcatgacataataatatcaaat 10557083  T
Q  134 gcaagtcaa-caacatct 150  Q
    ||||| ||| ||||||||    
T  10557084 gcaagccaatcaacatct 10557101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 50 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 52523831 - 52523666
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 146  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||  ||||| |||| |||||| | ||||| ||||||||    
T  52523831 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagttcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaac 52523733  T
Q  147 atcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaa 213  Q
    |||| ||| |||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||| |||| |||||||||    
T  52523732 atctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 52523666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 34 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 53301669 - 53301527
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 132  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||     
T  53301669 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaa 53301571  T
Q  133 tgcaagtca-acaacatcttaaatattcaattatacttcaagta 175  Q
    |||||||||  ||| |||| |||||||||  |||| ||||||||    
T  53301570 tgcaagtcattcaatatctcaaatattcatatataattcaagta 53301527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 49 - 213
Target Start/End: Original strand, 23274705 - 23274869
Alignment:
Q  49 acttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 147  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |  |||||| |||||||    
T  23274705 acttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaaca 23274803  T
Q  148 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaa 213  Q
    ||| |||||||||  |||| ||||||||| | | |||  | || ||||||| |||| |||||||||    
T  23274804 tctcaaatattcacatataattcaagtaaagaatatacaattacatcacattataaacaacatcaa 23274869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 13210448 - 13210333
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  13210448 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 13210350  T
Q  130 aattgcaagtcaacaac 146  Q
     | ||||| ||||||||    
T  13210349 gaatgcaaatcaacaac 13210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 34 - 213
Target Start/End: Original strand, 27165250 - 27165429
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 132  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||| | |||||| ||||| |||  ||||||||     
T  27165250 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaatatagacagtatgc-aaaacaacatgatataccaatatcaaa 27165348  T
Q  133 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaa 213  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||||  |||| || ||||| |||  |||  | |||||||||  |||| |||||||||    
T  27165349 tgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataatttaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 27165429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 131
Target Start/End: Original strand, 17737236 - 17737335
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagta---tacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||   ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17737236 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcaatatactacaacaacagcatgacataataatatca 17737334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 154
Target Start/End: Original strand, 14234487 - 14234610
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  14234487 acatcatcatcttaatcaacttagactgattcatgcagcttagttaaataacaagcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 14234585  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaa 154  Q
     | ||||||||| ||||||| ||||    
T  14234586 gaatgcaagtcatcaacatcataaa 14234610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 150
Target Start/End: Original strand, 15470928 - 15471043
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataaca-acagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  15470928 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 15471026  T
Q  134 gcaagtcaacaacatct 150  Q
    |||||||| ||||||||    
T  15471027 gcaagtcatcaacatct 15471043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 157
Target Start/End: Original strand, 16103784 - 16103905
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  16103784 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacgaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 16103882  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatat 157  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  16103883 gcaa-tcaacaacatctcaaatat 16103905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 37642386 - 37642176
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    |||||| |||||||| | |||| || ||||||||||| ||||||||  |||  | |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  37642386 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 37642288  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaa-cagc 228  Q
        | |||| |||||||||| ||||| |||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||| |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
T  37642287 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagc 37642188  T
Q  229 ttcacaggtcat 240  Q
    ||||||| ||||    
T  37642187 ttcacagatcat 37642176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 12174376 - 12174303
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 107  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  12174376 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 12174303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 150
Target Start/End: Original strand, 32307684 - 32307795
Alignment:
Q  38 catcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 136  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||    
T  32307684 catcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 32307782  T
Q  137 agtcaacaacatct 150  Q
    | ||||||||||||    
T  32307783 a-tcaacaacatct 32307795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 177
Target Start/End: Original strand, 856140 - 856280
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaac-agcatgacataataatatcaatt 133  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| ||| | ||||  ||||| ||| |||||    
T  856140 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttagttgaataacaatagcaacataggcagattacaacaacaatcatg--ataattataccaatt 856237  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaat 177  Q
     ||| ||||||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||    
T  856238 -caattcaacaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaat 856280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 157
Target Start/End: Original strand, 16097332 - 16097454
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| | ||| || ||| | |||| |||||| | |    
T  16097332 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcaatatgc-aaatcatcatcatataacaatatcgaat 16097430  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatat 157  Q
    |||||||| |||||||| ||||||    
T  16097431 gcaagtcatcaacatctcaaatat 16097454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 169 - 235
Target Start/End: Original strand, 14179570 - 14179636
Alignment:
Q  169 tcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcacag 235  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  14179570 tcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacag 14179636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 49668193 - 49668120
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 107  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  49668193 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 49668120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 180
Target Start/End: Original strand, 14665398 - 14665545
Alignment:
Q  32 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 131  Q
    |||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||   |||  ||||| || || | | ||||||||    
T  14665398 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcaacataatcagatcacatcaacagtataactttaaaatatcaa 14665497  T
Q  132 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgca 180  Q
    || ||  ||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||    
T  14665498 tt-catttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgca 14665545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 180
Target Start/End: Original strand, 14668554 - 14668701
Alignment:
Q  32 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 131  Q
    |||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||   |||  ||||| || || | ||||||||||    
T  14668554 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacatcaacagtataactttataatatcaa 14668653  T
Q  132 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgca 180  Q
    || ||  ||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||    
T  14668654 tt-catttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgca 14668701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 23077594 - 23077530
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcag 99  Q
    ||||||||| |||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23077594 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttggttaaataacaacagcaacataggcag 23077530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 11298621 - 11298500
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||   |||| |||| ||| |  | |||||||||||| ||  ||||||||||||| |  ||    
T  11298621 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacaacataatttcataatatcaatt-catttcaacaacatcttgatcat 11298523  T
Q  158 tcaattatacttcaagtaatgca 180  Q
    ||||| ||| |||||||||||||    
T  11298522 tcaataatatttcaagtaatgca 11298500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 95
Target Start/End: Original strand, 28194693 - 28194755
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacatag 95  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  28194693 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 28194755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 107
Target Start/End: Original strand, 9512924 - 9512997
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 107  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  9512924 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 9512997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 107
Target Start/End: Original strand, 9520899 - 9520972
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 107  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  9520899 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 9520972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 45578000 - 45577947
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacag 87  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45578000 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacag 45577947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 2051238 - 2051138
Alignment:
Q  113 catgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatca 212  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||| |||| ||||||||    
T  2051238 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatca 2051139  T
Q  213 a 213  Q
    |    
T  2051138 a 2051138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 293
Target Start/End: Original strand, 16796685 - 16796809
Alignment:
Q  169 tcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatac 268  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||  | |||| || | || ||||||||||  ||| |    
T  16796685 tcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaaaaacaacacatcttaaacaacttcacatattataattagcctcttcattaagtcttaatgc 16796784  T
Q  269 tatcccaaagttcaactctcaacaa 293  Q
    || || || |||||||||| |||||    
T  16796785 tacccaaaggttcaactcttaacaa 16796809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 15878168 - 15878083
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 120  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||  |||||||    
T  15878168 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacaatatgacat 15878083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 17525275 - 17525190
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 120  Q
    |||||| || |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||  | ||| ||||| |||||||    
T  17525275 catcattttgatcatcttatatcgactcatgcaacatagttaaataacaatagcagcataggcagagtgcaacaacagtatgacat 17525190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 14878633 - 14878569
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcag 99  Q
    |||||||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  14878633 catcatcttattcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcag 14878569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 19726004 - 19725886
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||   |||  ||||||||||| | |||||||||||| ||  ||||||||||||| |  ||    
T  19726004 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcatgac-tcataatatcaatt-catttcaacaacatcttgatcat 19725907  T
Q  158 tcaattatacttcaagtaatg 178  Q
    ||||| ||| |||||||||||    
T  19725906 tcaataatatttcaagtaatg 19725886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 37251270 - 37251168
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 146  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  37251270 cttagaccgagtcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 37251172  T
Q  147 atct 150  Q
    ||||    
T  37251171 atct 37251168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 150
Target Start/End: Original strand, 43925977 - 43926079
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagc--atgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 146  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||  |||| |||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  43925977 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaa-cagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 43926075  T
Q  147 atct 150  Q
    ||||    
T  43926076 atct 43926079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 1644787 - 1644718
Alignment:
Q  38 catcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaa 107  Q
    |||| ||||||||||||| | ||| |||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  1644787 catcgtcatcaacttagaccaacttatgttgcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatgcaaa 1644718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 120
Target Start/End: Original strand, 23408428 - 23408513
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 120  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||  ||||| |||||| ||||||    
T  23408428 catcatcttgatcatcttatactgactcatgcaacttggttaattaacaatagcaacatagacagattacaacaacagcgtgacat 23408513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 3390030 - 3389994
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3390030 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcagcata 3389994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 22110454 - 22110352
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 146  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| |||||| |    
T  22110454 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtaca-taaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacagc 22110356  T
Q  147 atct 150  Q
    ||||    
T  22110355 atct 22110352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22147646 - 22147467
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    |||||| |||||||| | |||| || ||| ||||||| ||||||||  |||  | ||||||| ||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  22147646 acatcaacatcttcaacgacttggaccgagtcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcggtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 22147548  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacat 210  Q
        | |||| |||||||||| ||||| |||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||| |||| ||||||    
T  22147547 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat 22147467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 26196548 - 26196500
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataaca 83  Q
    ||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  26196548 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataaca 26196500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 94
Target Start/End: Original strand, 12172796 - 12172855
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    ||||||| | |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  12172796 catcatcataatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcata 12172855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 58 - 180
Target Start/End: Original strand, 12496280 - 12496402
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataa-tatcaattgcaagtcaacaacatcttaaata 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||   |||| |||||||| || | |||| |||||||| ||  || |||||||||| |  |    
T  12496280 gactcatgcaacttagttaaataacaaaagcagcataatcagatcacaacaacagcataacttcataattatcaatt-catttctacaacatcttgatca 12496378  T
Q  157 ttcaattatacttcaagtaatgca 180  Q
    |||||| ||| |||||||||||||    
T  12496379 ttcaataatatttcaagtaatgca 12496402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 18384032 - 18383973
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    ||||||||| |||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18384032 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcata 18383973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 154
Target Start/End: Original strand, 12377940 - 12378046
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaa-acagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 147  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||   |||| ||||||||||||||||||| |||| |   ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  12377940 cttagaccgactcatacagcttagttaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaatagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 12378039  T
Q  148 tcttaaa 154  Q
     ||||||    
T  12378040 acttaaa 12378046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 100
Target Start/End: Original strand, 15051531 - 15051573
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  15051531 gactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagt 15051573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 100
Target Start/End: Original strand, 15060307 - 15060349
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagt 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  15060307 gactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagt 15060349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 206
Target Start/End: Original strand, 11862816 - 11862964
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||   || |||| |  || || | |||||||||||| ||  |||||||||||||    ||    
T  11862816 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcaccaaaatattataacttcataatatcaatt-catttcaacaacatcttggtcat 11862914  T
Q  158 tcaattatacttcaagtaatgcacataa-cactatatcacatcataatca 206  Q
    ||||| ||| |||||||||||||  ||| || || |||||||||||||||    
T  11862915 tcaataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacatcataatca 11862964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 12038068 - 12038019
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa 84  Q
    ||||||||| |||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12038068 catcatcttaatcatcttatataaactcatgcaacttagttaaataacaa 12038019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 101
Target Start/End: Original strand, 13919350 - 13919399
Alignment:
Q  52 tagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagta 101  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  13919350 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacatagggagta 13919399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 1982904 - 1982868
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  1982904 gactcatgcaacttagttaaataacaaaagcagcata 1982868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 2897909 - 2897873
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  2897909 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcata 2897873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 3403050 - 3403014
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  3403050 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcata 3403014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 11595233 - 11595197
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  11595233 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcata 11595197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 23053200 - 23053140
Alignment:
Q  39 atcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcag 99  Q
    ||||| |||| |||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  23053200 atcttaatcatcttatatagactcatgcaacatagttaaataacaatagcagcataagcag 23053140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 63)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 31 - 292
Target Start/End: Original strand, 22532269 - 22532530
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22532269 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaatttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcc 22532368  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22532369 attgcaattcaacaacatcttaaatattcattcataattcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 22532468  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaaca 292  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  22532469 cacagttcataaataacatcatcattaagtctcaatactacctcaaggttcaactctcaaca 22532530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 32 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 50210333 - 50210070
Alignment:
Q  32 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 131  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50210333 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 50210234  T
Q  132 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttc 231  Q
     |||||||||||||||||| || ||| || | ||| ||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50210233 atgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 50210134  T
Q  232 acaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    |||| | |||| |||| ||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  50210133 acagattataattaacatcatcattaagtctcaatactacccaaaggttcaactctcaacaact 50210070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 34 - 295
Target Start/End: Original strand, 34509783 - 34510044
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  34509783 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataatgatatcaaat 34509882  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcac 233  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || | |||  |||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||     
T  34509883 gcaagtcaacaacatcttaattatacattcatatctcaagtaatgcttataacattatatcacatcatattcaacatcaacacatcttaaacagcttcaa 34509982  T
Q  234 aggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    || | |||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  34509983 agattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaaccctcaacaact 34510044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 27250850 - 27250586
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27250850 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 27250751  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  27250750 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagctt 27250651  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||| | |||| |||| || |||||||||  |||| ||| || || ||||||||||| ||||||    
T  27250650 cacagattataattaacctcttcattaagtatcaatgctacccaaaggttcaactctcgacaact 27250586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 31 - 261
Target Start/End: Original strand, 21026680 - 21026910
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||    
T  21026680 acatcatcatcgtcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaatataggcagtatacaaaatcagcatgacgtaaatatatca 21026779  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  21026780 attgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacagcaacacatcttaaacagctt 21026879  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtc 261  Q
    ||||| | |||| |||| || ||||||||||    
T  21026880 cacagattataattaacctcttcattaagtc 21026910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 32 - 295
Target Start/End: Original strand, 20135188 - 20135451
Alignment:
Q  32 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 131  Q
    ||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||     
T  20135188 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaacaacaatagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataataatatcat 20135287  T
Q  132 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttc 231  Q
     ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  20135288 gtgcaattcaacaacatcttaagtattcaataaaacttcaagtaatgcatacaacattatatcatatcataatgaacatcaacacatcttaaacagcttc 20135387  T
Q  232 acaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    |||| | |||| ||||  |||||||| |||  | ||||| || || ||||||||||||||||||    
T  20135388 acagattataattaacaacatcattaggtcttactactaccctaaggttcaactctcaacaact 20135451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 32 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22468816 - 22468614
Alignment:
Q  32 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 131  Q
    ||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  22468816 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcaacataggcagattacaacaacagcatgacatcataatatcaa 22468717  T
Q  132 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttc 231  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||    
T  22468716 ttgcaattcaacaacatcttaattattcaataatatctcaagtaatgcacataacattatatcacatcataat-tacatcagcacatcttaaacagcttc 22468618  T
Q  232 acag 235  Q
    ||||    
T  22468617 acag 22468614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 108 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 22354616 - 22354429
Alignment:
Q  108 aacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaa 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  22354616 aacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaa 22354517  T
Q  208 catcaacgcatcttaaacagcttcacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| || ||||||||||  ||||||| |  || |||||| |||||||||||    
T  22354516 catcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcctcattaagtcttaatactacctaaaggttcaattctcaacaact 22354429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 34 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23593897 - 23593719
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23593897 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23593799  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaa 213  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||  |||| |||||||||    
T  23593798 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataaacaacatcaa 23593719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 13988866 - 13989028
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13988866 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 13988964  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  13988965 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 13989028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21923453 - 21923291
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21923453 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 21923355  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  21923354 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 21923291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 45575008 - 45574842
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    |||||||||| |||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  45575008 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatacca 45574909  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    | |||||||||||||| ||| || |||| |  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  45574908 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 45574842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21475249 - 21475087
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21475249 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 21475151  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  21475150 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 21475087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 31612313 - 31612475
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31612313 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 31612411  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  31612412 gcaagtcaacaacatctcagttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 31612475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 213
Target Start/End: Original strand, 433012 - 433188
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    
T  433012 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacg---gcaacacaggcagtatacaaaaacatcaagacataataatatcaaat 433108  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaa 213  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||  |||| |||||||||    
T  433109 gcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 433188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16275526 - 16275363
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16275526 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacaacgacatag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 16275428  T
Q  134 gcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||| |||| ||| || ||||||  || | ||||| ||||||| ||| || |||||||||    
T  16275427 gcaagtcaatcaacgtctcaattattcacataaaattcaattaatgcatataccattatatcaca 16275363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 33 - 197
Target Start/End: Original strand, 21840766 - 21840929
Alignment:
Q  33 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 132  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  21840766 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaa 21840864  T
Q  133 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| || |||||||||| |||  | |||||||||    
T  21840865 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataatttaagtaatgcatatataattatatcaca 21840929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 29298137 - 29298298
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  29298137 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga-ataataatatcaaat 29298234  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  29298235 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29298298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 29776688 - 29776850
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |    
T  29776688 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaataacatgacataataatatcaaat 29776786  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  29776787 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29776850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 143 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 22356184 - 22356031
Alignment:
Q  143 caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaa-catcaacgcatcttaaacagcttcacaggtcata 241  Q
    ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| | |||    
T  22356184 caacatcataaatattcaaacattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaatcatcaacacatcttaaatagcttcacagattata 22356085  T
Q  242 aataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    | |||| |||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  22356084 attaacatcatcattaagtcttaatgctatcccaaggttcaactctcgacaact 22356031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 143 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 22357870 - 22357717
Alignment:
Q  143 caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaa-catcaacgcatcttaaacagcttcacaggtcata 241  Q
    ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| | |||    
T  22357870 caacatcataaatattcaaacattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaatcatcaacacatcttaaatagcttcacagattata 22357771  T
Q  242 aataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    | |||| |||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  22357770 attaacatcatcattaagtcttaatgctatcccaaggttcaactctcgacaact 22357717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 213
Target Start/End: Original strand, 16361915 - 16362095
Alignment:
Q  32 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 131  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16361915 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgacagcaacacaa-cagtatataaaaacaacatgacataataatatcaa 16362013  T
Q  132 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaa 213  Q
     |||||||||||||| ||| || ||||||   ||| ||||||||||||| |||  | |||||||||  |||| |||||||||    
T  16362014 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacaaataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataaacaacatcaa 16362095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 35 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21788159 - 21787980
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 134  Q
    |||||||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||   |||| ||||||||||| |  |||||||||||     
T  21788159 catcatcttattcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataaccatagcagcataggcagatcacaacaacagcatgacttcgtaatatcaattt 21788060  T
Q  135 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaac 214  Q
    ||  |||||||||||||||  ||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  21788059 catttcaacaacatcttaatcattcaataatatcttaagtaatgcacataacattatataacatcataatcaacatcaac 21787980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 20847275 - 20847175
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||    
T  20847275 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtacacaaaatcagcatgacataaatatatca 20847176  T
Q  131 a 131  Q
    |    
T  20847175 a 20847175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 38801508 - 38801309
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||   ||||| |||||||| |||||    
T  38801508 acatcatcatcttcaacatcttaga-cgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtgcaa---cagcaagacataattatatc 38801413  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagct 229  Q
    || | ||| ||| |||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||| | |||| |||| |||||| ||||||||| ||||  ||||||  |||||    
T  38801412 aaattcaattcatcaacatattatatatacaattattcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcgtaatcaacaacaacatatcttattcagct 38801314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 50 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21896358 - 21896195
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 148  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  21896358 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 21896260  T
Q  149 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaa 213  Q
    || ||| |||||  |||| |||| |||||| | |||  | |||||||||| |||| |||||||||    
T  21896259 ctcaaacattcatatataattcatgtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 21896195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 31 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 13213027 - 13212917
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13213027 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacgca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 13212929  T
Q  131 attgcaagtcaa 142  Q
    | ||||||||||    
T  13212928 aatgcaagtcaa 13212917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 15860177 - 15860064
Alignment:
Q  28 tggacatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataata 127  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15860177 tggacttcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataata 15860079  T
Q  128 tcaattgcaagtcaa 142  Q
    | || ||||||||||    
T  15860078 ttaaatgcaagtcaa 15860064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 142
Target Start/End: Original strand, 21342090 - 21342203
Alignment:
Q  28 tggacatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataata 127  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21342090 tggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaaagacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataata 21342188  T
Q  128 tcaattgcaagtcaa 142  Q
    |||| ||||||||||    
T  21342189 tcaaatgcaagtcaa 21342203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 34 - 234
Target Start/End: Original strand, 21346961 - 21347161
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||   ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  21346961 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaaagacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 21347059  T
Q  134 gcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaa-cagcttc 231  Q
    ||||||||| |||| ||| || ||||||   ||| ||||| ||||||| |||  | |||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||||||    
T  21347060 gcaagtcaatcaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttc 21347158  T
Q  232 aca 234  Q
    |||    
T  21347159 aca 21347161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 34 - 160
Target Start/End: Original strand, 21707167 - 21707292
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |   |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  21707167 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaca-atagtatacaaaaaaagcatgacagaataatatcaaat 21707265  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattca 160  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||    
T  21707266 gcaagtcaacaacgtctcaattattca 21707292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 34 - 160
Target Start/End: Original strand, 21711709 - 21711834
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |   |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  21711709 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaca-atagtatacaaaaaaagcatgacagaataatatcaaat 21711807  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattca 160  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||    
T  21711808 gcaagtcaacaacgtctcaattattca 21711834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22123230 - 22123067
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 132  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  22123230 tcatcatcttaatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcaaacagcaacacaa-cagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaa 22123132  T
Q  133 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||  | || ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  22123131 tgcaagtcaacaatgtctcaattattcacatttaattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22123067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 142
Target Start/End: Original strand, 40389157 - 40389261
Alignment:
Q  37 tcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 136  Q
    ||||||| |||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40389157 tcatcttaatcaacctagactgactcatgcaacttggttaaataacaacagcgacacat-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 40389255  T
Q  137 agtcaa 142  Q
    ||||||    
T  40389256 agtcaa 40389261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 50 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 21861672 - 21861510
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 148  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| |||  ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  21861672 cttagaccgactcatgcagcttagctaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 21861574  T
Q  149 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatca 212  Q
    || ||| |||||  |||| ||||||||||| | |||  | |||||||||| |||| ||||||||    
T  21861573 ctcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatca 21861510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 35 - 157
Target Start/End: Original strand, 33681011 - 33681133
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  33681011 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 33681109  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatat 157  Q
    |||||||  |||||||| ||||||    
T  33681110 gcaagtcgtcaacatctcaaatat 33681133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 206
Target Start/End: Original strand, 33797570 - 33797694
Alignment:
Q  80 aacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattc-aattatacttcaagtaatg 178  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||  || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| || ||| ||||||||    
T  33797570 aacaacagcaacatatgcagcatacaaa--caacatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaatattcaaataattctt-aagtaatg 33797666  T
Q  179 cacataacactatatcacatcataatca 206  Q
    || | |||| |||||||||| |||||||    
T  33797667 cataaaacattatatcacattataatca 33797694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 46 - 240
Target Start/End: Original strand, 16758664 - 16758860
Alignment:
Q  46 tcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaa 142  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||  ||||| |||| |||||||| | |||  |||    
T  16758664 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaatacaa 16758762  T
Q  143 caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatctta-aacagcttcacaggtcat 240  Q
    |||||||   || |||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||| |||| ||||| |||  ||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  16758763 caacatc-acaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacaacaaatcatattataacagcttcacagatcat 16758860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 20454673 - 20454606
Alignment:
Q  32 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcag 99  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20454673 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 20454606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 22921986 - 22921864
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  22921986 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 22921888  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatat 157  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  22921887 gcaaatcaacaacatctcaaatat 22921864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 38 - 150
Target Start/End: Original strand, 21754052 - 21754163
Alignment:
Q  38 catcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 136  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||||| ||||    
T  21754052 catcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaatgca 21754150  T
Q  137 agtcaacaacatct 150  Q
    | ||||||||||||    
T  21754151 a-tcaacaacatct 21754163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 146
Target Start/End: Original strand, 20248283 - 20248394
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  20248283 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaaaaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 20248381  T
Q  134 gcaagtcaacaac 146  Q
    |||| ||||||||    
T  20248382 gcaaatcaacaac 20248394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 169 - 235
Target Start/End: Original strand, 48603652 - 48603718
Alignment:
Q  169 tcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcacag 235  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  48603652 tcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacag 48603718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 120
Target Start/End: Original strand, 21714546 - 21714631
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 120  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  21714546 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacat 21714631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 14295672 - 14295557
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  14295672 acatcatcatcttcaacattttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 14295574  T
Q  130 aattgcaagtcaacaac 146  Q
     | || || ||||||||    
T  14295573 gaatgtaaatcaacaac 14295557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 50 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 35261180 - 35260998
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 148  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| |||||   | ||||||    
T  35261180 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaa---atcaacat 35261085  T
Q  149 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatctta-aacagcttcaca 234  Q
    || ||| |||||   ||| ||||||||||||| |||  | || ||||||| || | |||||||||  ||||||| |||| |||||||    
T  35261084 ctcaaacattcatacataattcaagtaatgcatatacaattacatcacattattaacaacatcaaatcatcttataacaacttcaca 35260998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 157
Target Start/End: Original strand, 22237631 - 22237753
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  22237631 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaaacagcgacataggcattatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 22237729  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatat 157  Q
    |||||||| |||||||| ||||||    
T  22237730 gcaagtcatcaacatctcaaatat 22237753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 18182237 - 18182093
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 134  Q
    ||||||||| |||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||   |||| |||||||| || | ||||||||||||     
T  18182237 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacagcataacttcataatatcaatt- 18182139  T
Q  135 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgca 180  Q
     |  ||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||    
T  18182138 tatttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgca 18182093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 42865330 - 42865245
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 120  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||  | ||| ||||| |||||||    
T  42865330 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacatagttaaataacaatagcaacatatgcagattgcaacaacagtatgacat 42865245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 146
Target Start/End: Original strand, 20918620 - 20918719
Alignment:
Q  47 caacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaa 145  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| | || || |||||||    
T  20918620 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaactgcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa 20918718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 92
Target Start/End: Original strand, 21161720 - 21161778
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaaca 92  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21161720 catcatcatcatcaacttggatcgactcatgcaacttagttaaacaacaaacagcaaca 21161778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 50614219 - 50614117
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 146  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||| | |||| |||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  50614219 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 50614121  T
Q  147 atct 150  Q
    ||||    
T  50614120 atct 50614117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 50622047 - 50621945
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 146  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||| | |||| |||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  50622047 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 50621949  T
Q  147 atct 150  Q
    ||||    
T  50621948 atct 50621945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 41050138 - 41050036
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-acagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 147  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||||||| |||| |   ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  41050138 cttagaccgactcatgcagcttagttactaaacgaacagcaacataggcagtatataaaatagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 41050039  T
Q  148 tct 150  Q
    |||    
T  41050038 tct 41050036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 52928076 - 52928014
Alignment:
Q  46 tcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 107  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||    
T  52928076 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcaaa 52928014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 20091593 - 20091533
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacatag 95  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||    
T  20091593 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaactaggttaaataacaatagcagcatag 20091533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 16368388 - 16368287
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-acagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 147  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||| |||| |   ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  16368388 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacaattcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaaca 16368290  T
Q  148 tct 150  Q
    |||    
T  16368289 tct 16368287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 24783212 - 24783150
Alignment:
Q  32 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    |||||||||||| |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  24783212 catcatcatcttaatcatcttattcagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcata 24783150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 3473016 - 3472980
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  3473016 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcata 3472980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 3705158 - 3705122
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  3705158 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcata 3705122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 18394059 - 18394023
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18394059 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcata 18394023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 99
Target Start/End: Original strand, 21022631 - 21022695
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcag 99  Q
    ||||||||| |||| |||  || |||||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||    
T  21022631 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacatagttaaataacaatagcagcacaggcag 21022695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 45310462 - 45310426
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  45310462 gactcatgcaacttagttaaataacgacagcagcata 45310426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 75)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 18818530 - 18818266
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818530 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 18818431  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18818430 attgtaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 18818331  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||| | |||| |||| || ||||||||||  ||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  18818330 cacagattataattaacatcctcattaagtcttaatactaccctaaatttcaactctcaacaact 18818266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Original strand, 23406379 - 23406645
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23406379 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 23406478  T
Q  131 attgcaagtcaac--aacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagc 228  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  23406479 attgcaagtcaacatatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacatagtcaacatcaacacatcttaaacaac 23406578  T
Q  229 ttcacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||||  | |||| |||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  23406579 ttcacatattataattaacatcctcattaagtcccaatattatcccaaagttcaactctcaataact 23406645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Original strand, 20536208 - 20536472
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536208 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagaaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 20536307  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  20536308 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcgacatcaacacatcttaaacaactt 20536407  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||| | |||| |||| || ||||||||||  ||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||    
T  20536408 cacagattataattaacatcctcattaagtcttaatactaccccaaggttcaacactcgacaact 20536472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 31 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 21924049 - 21923789
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  21924049 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtctacaaaaacaacatgacatgataatatca 21923950  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  21923949 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataaccttattttgcatcataatcaacaacaacacatcttaaacagctt 21923850  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaac 291  Q
    ||||| | |||| |||| |||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  21923849 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactacctcaaggttcaactctcaac 21923789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Original strand, 7372778 - 7373034
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7372778 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 7372877  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7372878 attgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgc--------ttatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 7372969  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||| | |||| |||| || |||||||||| || ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  7372970 cacagattataattaacatcctcattaagtctcactaccaccccaaagttcaactctcaacaact 7373034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Original strand, 22626736 - 22626999
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  22626736 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatca 22626834  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  22626835 aatacaaatcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgtgtataacattatatcacatcattatcatcatcaacacatcttaaacagctt 22626934  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||| | |||| |||| || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22626935 cacagattataattaacatcctcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaact 22626999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 32 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 28649164 - 28648901
Alignment:
Q  32 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 131  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28649164 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaa 28649065  T
Q  132 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttc 231  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| || | ||| |||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28649064 atgcaagtcaacaacatcttaattatacattcataattcaagtaatgtgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 28648965  T
Q  232 acaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    |||  | |||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  28648964 acatattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaact 28648901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 31 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 21919121 - 21918891
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21919121 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 21919022  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattc-aattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagct 229  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  21919021 attgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcagcagcaacacatcttaaacagct 21918923  T
Q  230 tcacaggtcataaataacgtcatcattaagtc 261  Q
    |||||| || ||| |||| ||||| |||||||    
T  21918922 tcacagatcgtaattaacctcatcgttaagtc 21918891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 32 - 295
Target Start/End: Original strand, 23648554 - 23648817
Alignment:
Q  32 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 131  Q
    ||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||     
T  23648554 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatagcaacataggcagattacaacaacaacatgacataataatatcat 23648653  T
Q  132 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttc 231  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  23648654 ttgcaatacaacaacatcttaaatattcaataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctta 23648753  T
Q  232 acaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    |||| | |||| |||| ||||||||| |||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23648754 acagattataattaacatcatcattaggtcttaatactaccccaaggttcaactctcaacaact 23648817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16092463 - 16092198
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092463 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 16092364  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatctt-aaacagct 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| || | ||| || |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  16092363 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataatttaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacaact 16092264  T
Q  230 tcacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    || ||  | |||| |||| ||||| ||||||| ||||| || ||||| |||||||||| |||||||    
T  16092263 tcgcatattataattaacatcatccttaagtctcaatattaccccaaggttcaactcttaacaact 16092198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 18879352 - 18879094
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||    
T  18879352 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaca-----acataataatatca 18879258  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||    
T  18879257 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgctcataacattatatcacatcataatcaacatcagcacatctt-atcagctt 18879159  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||| | |||  |||| |||||||||||||   || ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  18879158 cacagattatagttaacatcatcattaagtcttgatgctatcccaaggttcaactctcgacaact 18879094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 287
Target Start/End: Original strand, 6759255 - 6759512
Alignment:
Q  28 tggacatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataata 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6759255 tggacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacaacatgacataataata 6759354  T
Q  128 tcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatctt-aaaca 226  Q
    |||| |||||||   |||||||| || ||| || | ||| ||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6759355 tcaaatgcaagt---caacatctcaattatacactcataattcaattaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaaaca 6759451  T
Q  227 gcttcacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactct 287  Q
    ||||||||| | |||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  6759452 gcttcacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactct 6759512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Original strand, 22875065 - 22875329
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  22875065 acatcatcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcagcagcaacacaggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatca 22875163  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatctt-aaacagct 229  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  22875164 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagct 22875263  T
Q  230 tcacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    |||||| | |||| |||| ||| |||||  || |||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  22875264 tcacagattataattaacatcaccattacatctcaatactaccccaaggttcaactcttaacaact 22875329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Original strand, 31971257 - 31971519
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  31971257 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatca 31971355  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||| |||    
T  31971356 attccaattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacaacatatcttatacatctt 31971454  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||| | |||| |||| ||||  |||||||  ||| ||| || || ||||| ||||| ||||||    
T  31971455 cacagattataattaacctcattgttaagtcttaatcctacccaaaggttcagctctcgacaact 31971519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 45131117 - 45130889
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  45131117 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac--aaacagcatgacataataatatca 45131020  T
Q  131 attgc-aagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagct 229  Q
    ||| | || ||| ||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| || ||||  |||||| ||||||    
T  45131019 atttcaaattcatcaacatcttaggtatacaattattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcatcaacaacaaatcttatacagct 45130921  T
Q  230 tcacaggtcataaataacgtcatcattaagtc 261  Q
    |||||| | |||| |||| |||| ||||||||    
T  45130920 tcacagattataattaacctcattattaagtc 45130889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 14409606 - 14409444
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14409606 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14409508  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  14409507 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 14409444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 1484402 - 1484564
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1484402 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 1484500  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  1484501 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 1484564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 5853454 - 5853292
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5853454 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 5853356  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  5853355 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 5853292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16413474 - 16413316
Alignment:
Q  38 catcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 137  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16413474 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 16413376  T
Q  138 gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  16413375 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 16413316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 20403227 - 20403389
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20403227 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20403325  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  20403326 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20403389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 22001753 - 22001915
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22001753 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 22001851  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  22001852 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22001915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16199765 - 16199503
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |  ||||| |||||||||||||||||    
T  16199765 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtattc--aaacaacatgacataataatatc 16199668  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagct 229  Q
    |||| ||| ||| | ||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||    
T  16199667 aatttcaattcatctacatcttaggtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatattacatcataatcaacaacaacatatcttatacagct 16199569  T
Q  230 tcacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    |||||| | |||| |||| ||||  |||||||  ||| ||| || |  ||||||||||| ||||||    
T  16199568 tcacagattataattaacctcattgttaagtcttaatcctacccaagggttcaactctcgacaact 16199503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 33 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 18678221 - 18678069
Alignment:
Q  33 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 132  Q
    |||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  18678221 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaat 18678122  T
Q  133 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataa 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  18678121 tgcaattcaacaacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgcacataa 18678069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 33 - 185
Target Start/End: Original strand, 32121734 - 32121886
Alignment:
Q  33 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 132  Q
    |||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  32121734 atcaacatcttaatcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaat 32121833  T
Q  133 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataa 185  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  32121834 tgcaattcaacaacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgcacataa 32121886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 15203393 - 15203231
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15203393 tcatcatcttaatcaacttagagcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 15203295  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    | ||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  15203294 gtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 15203231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 41598188 - 41598350
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41598188 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataacaacagcaacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 41598286  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  41598287 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 41598350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 4483281 - 4483442
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4483281 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa-taacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 4483378  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  4483379 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 4483442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 4542535 - 4542373
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |   || ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4542535 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacaag-atacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 4542437  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  4542436 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatatagttcaagtaatgcatatacaattatatcaca 4542373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 20046357 - 20046195
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  20046357 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 20046259  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || |||| |  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  20046258 gcaagtcaacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20046195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 19896265 - 19896430
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgac---ataataatatca 130  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  19896265 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acggtatacaaaaacagcatgacataataataatatca 19896363  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    | |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  19896364 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 19896430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 32 - 197
Target Start/End: Original strand, 26223917 - 26224081
Alignment:
Q  32 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 131  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| | || || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26223917 catcaacatcttaatcaacttagatcgacccatgcagcttaattaaataacaacagcaataaag-caatatacaaaaatagcatgacataataatatcaa 26224015  T
Q  132 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
     |||||||||||||||||| || ||||||  |||| || || ||||||| |||  | |||||||||    
T  26224016 atgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataatttaattaatgcatatacaattatatcaca 26224081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 177
Target Start/End: Original strand, 26219717 - 26219858
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||  || |||||||||||||||||| |    
T  26219717 tcatcatcataatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacag-cagtatacaaaat-agtatgacataataatatcaaat 26219814  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaat 177  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||    
T  26219815 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 26219858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21389571 - 21389371
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||||| |||||    
T  21389571 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatac---aacagcatgacataattatatc 21389475  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagct 229  Q
    || | ||| ||| ||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||| | |||| |||| ||| |||||||||||| ||||  ||||||  |||||    
T  21389474 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaacaacaacatatcttattcagct 21389376  T
Q  230 tcaca 234  Q
    |||||    
T  21389375 tcaca 21389371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21778897 - 21778697
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||||| |||||    
T  21778897 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatac---aacagcatgacataattatatc 21778801  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagct 229  Q
    || | ||| ||| ||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||| | |||| |||| ||| |||||||||||| ||||  ||||||  |||||    
T  21778800 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaacaacaacatatcttattcagct 21778702  T
Q  230 tcaca 234  Q
    |||||    
T  21778701 tcaca 21778697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 14823774 - 14823935
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||| ||||| | ||||||||| |  ||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14823774 tcatcatcttaatcaatttagacc-actcatgcagcaaagttaaataacaacaacaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14823871  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  14823872 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 14823935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 31 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21396101 - 21395900
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||    
T  21396101 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac---aacagcatgagataattatatc 21396005  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagct 229  Q
    || | ||| ||| ||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||| | |||| |||| ||| |||||||||| | ||||  ||||||  |||||    
T  21396004 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaataacaacatatcttattcagct 21395906  T
Q  230 tcacag 235  Q
    ||||||    
T  21395905 tcacag 21395900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 31 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21790594 - 21790393
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||    
T  21790594 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac---aacagcatgagataattatatc 21790498  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagct 229  Q
    || | ||| ||| ||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||| | |||| |||| ||| |||||||||| | ||||  ||||||  |||||    
T  21790497 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaataacaacatatcttattcagct 21790399  T
Q  230 tcacag 235  Q
    ||||||    
T  21790398 tcacag 21790393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23776952 - 23776773
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 134  Q
    |||||||||  ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||   |||| | ||||||||| |  |||||||||||     
T  23776952 catcatcttattcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataactatagcagcataggcagatcacaacatcagcatgacttcttaatatcaattt 23776853  T
Q  135 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaac 214  Q
    ||  |||||||||||||||  ||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  23776852 catttcaacaacatcttaatcattcaataatatcttaagtaatgcacataacattatataacatcatattcaacatcaac 23776773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 34 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 26225409 - 26225268
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |  || ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  26225409 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acaatatac-aaaacagtatgacataataatatcaaat 26225312  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaat 177  Q
     |||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||    
T  26225311 acaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 26225268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 19937174 - 19937061
Alignment:
Q  28 tggacatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataata 127  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19937174 tggacttcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataaga 19937076  T
Q  128 tcaattgcaagtcaa 142  Q
    |||| ||||||||||    
T  19937075 tcaaatgcaagtcaa 19937061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 45290853 - 45290694
Alignment:
Q  38 catcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 137  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  45290853 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaa 45290755  T
Q  138 gtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    | ||| |||| ||| || ||||||  |||| ||||| ||||||| |||  | |||||||||    
T  45290754 gccaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcagatacaattatatcaca 45290694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 47 - 142
Target Start/End: Original strand, 15070571 - 15070665
Alignment:
Q  47 caacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaa 142  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15070571 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 15070665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 38855372 - 38855246
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  38855372 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 38855274  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaatat 157  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  38855273 gaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 38855246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 25484430 - 25484275
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||| |        ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25484430 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcgtgcagcttagttaaataacaacagcta--------gtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 25484339  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    |||| |||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  25484338 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 25484275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 154
Target Start/End: Original strand, 6520368 - 6520491
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  6520368 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 6520466  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaa 154  Q
     | ||||||||| ||||||| ||||    
T  6520467 gaatgcaagtcatcaacatcataaa 6520491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 38 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 13508199 - 13508024
Alignment:
Q  38 catcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 136  Q
    |||||||| | |||||||  |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| || || || ||||| ||||||||||| |  |||    
T  13508199 catcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcacaa-catcatgatataataatatcgaacgca 13508101  T
Q  137 agtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaa 213  Q
    ||| |||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||| |||| |||||||||    
T  13508100 agtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 13508024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 50 - 213
Target Start/End: Original strand, 20498581 - 20498744
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 148  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||  ||||  ||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  20498581 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaaat-agcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 20498679  T
Q  149 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaa 213  Q
    || ||| |||||  |||| ||||||||||| | |||  | |||||||||| |||| |||||||||    
T  20498680 ctcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 20498744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 50 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19801527 - 19801339
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatc 149  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  19801527 cttagaccggctcatgcagcttagttaaataacaatagcaacacaa-cagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaacgcaagtcaacaacgtc 19801430  T
Q  150 ttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaa-cagcttcacaggtcat 240  Q
    | || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||| ||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||    
T  19801429 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattataacacaatataa-caacatcaagtcatcgtaaatcagcttcacagatcat 19801339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 169 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 25363123 - 25362997
Alignment:
Q  169 tcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatac 268  Q
    |||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| || | || ||||||||||  |||||    
T  25363123 tcaagtaatgcataaaacattataccacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattagcctcttcattaagtcttaatac 25363024  T
Q  269 tatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    || || || ||||||||||||||||||    
T  25363023 tacccaaaggttcaactctcaacaact 25362997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 38 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 13597731 - 13597556
Alignment:
Q  38 catcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 136  Q
    |||||||| | |||||||  |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||| || ||||| || ||||| ||||||||||| |  |||    
T  13597731 catcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataagcagaatgcaaaa-catcatgatataataatatcgaacgca 13597633  T
Q  137 agtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaa 213  Q
    ||| |||||||||  |||||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||| |||| |||||||||    
T  13597632 agtaaacaacatcccaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 13597556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 129
Target Start/End: Original strand, 17140916 - 17141014
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||  || |||||||||||||||||    
T  17140916 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aatccatcatgacataataatatc 17141014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 128
Target Start/End: Original strand, 21490995 - 21491092
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatat 128  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||    
T  21490995 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatat 21491092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 5866395 - 5866280
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  5866395 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 5866297  T
Q  130 aattgcaagtcaacaac 146  Q
     | || || ||||||||    
T  5866296 gaatgtaaatcaacaac 5866280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 150
Target Start/End: Original strand, 21285601 - 21285716
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||| |    
T  21285601 catcttcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaat 21285699  T
Q  134 gcaagtcaacaacatct 150  Q
    |||| ||||||||||||    
T  21285700 gcaaatcaacaacatct 21285716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 17612231 - 17612059
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    |||||| |||||||| | |||||||  |||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  17612231 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcaacaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 17612133  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataa 203  Q
        | |||| |||||||||| ||||| |||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||| ||||    
T  17612132 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataa 17612059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 983512 - 983407
Alignment:
Q  46 tcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaa-aacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaac 143  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||   ||||| |||| ||| |||| ||||| |||||    
T  983512 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaacaagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaac 983413  T
Q  144 aacatc 149  Q
    ||||||    
T  983412 aacatc 983407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 23760961 - 23760893
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtat 102  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23760961 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 23760893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 20466132 - 20465982
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||   |||| |||| ||| || | |||||||||||| ||  ||||||||||||| |  ||    
T  20466132 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagtataggcagatcacaacaacaacataacttcataatatcaatt-catttcaacaacatcttgatcat 20466034  T
Q  158 tcaattatacttcaagtaatgcacataa-cactatatcacatcataatcaac 208  Q
    ||||| ||| |||||||||||||  ||| || || ||||||| |||||||||    
T  20466033 tcaataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaac 20465982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 157
Target Start/End: Original strand, 21673716 - 21673830
Alignment:
Q  43 tcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtca 141  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||    
T  21673716 tcatcaacttagaccgactcatgcatcatagttaaataacaaacaacaacataggcattatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatca 21673814  T
Q  142 acaacatcttaaatat 157  Q
    ||||||||| ||||||    
T  21673815 acaacatctcaaatat 21673830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 17354060 - 17353975
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 120  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||  |||||||    
T  17354060 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacattatgacat 17353975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 26355815 - 26355742
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 107  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  26355815 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 26355742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 30643408 - 30643264
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 134  Q
    ||||||||| |||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||   |||| |||| ||| || | ||||||||||||     
T  30643408 catcatcttaatcatcttgaatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacaacataacttcataatatcaatt- 30643310  T
Q  135 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgca 180  Q
    ||  ||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||    
T  30643309 catttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgca 30643264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 213
Target Start/End: Original strand, 37116366 - 37116530
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 146  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||| | |||| |||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  37116366 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 37116464  T
Q  147 atcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaa 213  Q
    |||| ||| | |||  |||| |||| |||||||| |||  | |||||||||| || | |||||||||    
T  37116465 atctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaa 37116530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 16410347 - 16410226
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||   |||| |||||||| |  | |||||| ||||| ||  ||||||||||||| |  ||    
T  16410347 gactcatgcaacttagtgaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataataccaatt-catttcaacaacatcttgatcat 16410249  T
Q  158 tcaattatacttcaagtaatgca 180  Q
    ||||| ||| |||||||||||||    
T  16410248 tcaataatatttcaagtaatgca 16410226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 81
Target Start/End: Original strand, 21249384 - 21249434
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataa 81  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  21249384 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 21249434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 81
Target Start/End: Original strand, 21255222 - 21255272
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataa 81  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  21255222 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 21255272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17439602 - 17439423
Alignment:
Q  57 cgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||| || |||||||||||||| | |||| |||  ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  17439602 cgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaa 17439504  T
Q  154 atattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatctta-aacagcttcaca 234  Q
    | | |||  |||| |||| |||||||| |||  | |||||||||| || |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||    
T  17439503 aca-tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattatcaacattaaatcatattataacagcttcaca 17439423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 17926799 - 17926678
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||   | || |||||||| |  | | |||||||||| ||  ||||||||||||| |  ||    
T  17926799 gactcatgcaacttagttaaataacaatagtagcataggcagatcaaaacaacagcataatttcacaatatcaatt-catttcaacaacatcttgatcat 17926701  T
Q  158 tcaattatacttcaagtaatgca 180  Q
    ||||| ||| |||||||||||||    
T  17926700 tcaataatatttcaagtaatgca 17926678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 150
Target Start/End: Original strand, 24353039 - 24353140
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 146  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  24353039 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtaca-taaaacagttcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaac 24353136  T
Q  147 atct 150  Q
    ||||    
T  24353137 atct 24353140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 57 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 19154982 - 19154883
Alignment:
Q  57 cgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaa-acagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaa 154  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||| | | |  || ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||    
T  19154982 cgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacatatccagatataataatatcaagtgctaatcaacaacaacttaaa 19154883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 21162175 - 21162111
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcag 99  Q
    |||||||||  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||| || | || |||||||||    
T  21162175 catcatcttattcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataataataacagcataggcag 21162111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 21168848 - 21168784
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcag 99  Q
    |||||||||  ||| |||| || |||||||||||||||||||||||| || | || |||||||||    
T  21168848 catcatcttattcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataataataacagcataggcag 21168784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 57 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 22963508 - 22963464
Alignment:
Q  57 cgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagta 101  Q
    |||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||    
T  22963508 cgactcatgcaacttaattaatatacaacagcaacataggcagta 22963464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 99
Target Start/End: Original strand, 24755714 - 24755778
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcag 99  Q
    ||||||||| |||| |||| || |||||||||| | |||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  24755714 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcatcatagttaaataacaatagcagcataagcag 24755778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 39095018 - 39094982
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  39095018 gactcatgcaacttagttaaataacaaaagcagcata 39094982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 34 - 295
Target Start/End: Original strand, 22886 - 23146
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22886 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacac-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 22984  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcac 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22985 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcgtaatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 23084  T
Q  234 aggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    || | ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23085 agattataaataacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaact 23146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 3271 - 3008
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  3271 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatca 3173  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3172 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 3073  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  3072 cacaggttataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaact 3008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 84)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Original strand, 9509189 - 9509453
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9509189 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagtaacataggcagtatacaataacagcatgacataataatatca 9509288  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9509289 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 9509388  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||| | |||| |||| || ||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  9509389 cacagattataattaacatcctcattaagtcttaatgctatcccaaggttcaactctcgacaact 9509453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Original strand, 12698831 - 12699096
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-acagcatgacataataatatc 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12698831 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataataatatc 12698930  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagct 229  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12698931 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 12699030  T
Q  230 tcacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    |||||| | |||| |||| || ||||||| ||  ||||||| ||||| |||||||| || ||||||    
T  12699031 tcacagattataattaacatcctcattaactcttaatactaccccaaggttcaactatcgacaact 12699096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Original strand, 38227481 - 38227744
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38227481 acatcatcatcttcatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 38227579  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| | |||    
T  38227580 aatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaattaatgtacatatcattatatcacatcttaatcaacatcaacatatcttaaatatctt 38227679  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||  | |||| |||| |||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  38227680 cacatattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactcttaacaact 38227744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 34 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 3564482 - 3564221
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  3564482 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 3564383  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcac 233  Q
    | ||||||||||||||| || ||| || | ||| ||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||     
T  3564382 gtaagtcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattagatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacaacttcat 3564283  T
Q  234 aggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    |||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||| |||||||    
T  3564282 aggttataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttaaactcttaacaact 3564221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 34 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18456530 - 18456330
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |    
T  18456530 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgatagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaat 18456432  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcac 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18456431 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 18456332  T
Q  234 ag 235  Q
    ||    
T  18456331 ag 18456330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 31 - 261
Target Start/End: Original strand, 26211995 - 26212226
Alignment:
Q  31 acatcatcat-cttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26211995 acatcatcattcttcaacaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 26212094  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagct 229  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  26212095 aattgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacattataatcaacaacaacacatcttaaacagct 26212194  T
Q  230 tcacaggtcataaataacgtcatcattaagtc 261  Q
    |||||| | |||| |||| || ||||||||||    
T  26212195 tcacagattataattaacctcttcattaagtc 26212226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 31 - 261
Target Start/End: Original strand, 10589039 - 10589268
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  10589039 acatcatcatcttcgacaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatatgcagtatacaaaaacaacatgacataatcatatca 10589138  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||    
T  10589139 attgcaattcaacaacatcttcaatgttcaaatattcttcaagcaatgcata-aacattatatcacatcataatcagcaacaacacatcttaaatagctt 10589237  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtc 261  Q
    ||||| | |||| |||| |||||||||||||    
T  10589238 cacagattataattaacctcatcattaagtc 10589268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 16386369 - 16386138
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  16386369 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacgacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 16386270  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagct 229  Q
    ||||| |  ||| |||||||||||||||||||  |    |||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  16386269 aattgtatttcatcaacatcttaaatattcaaacaattctcaagtaatgcataaaacattatattacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagct 16386170  T
Q  230 tcacaggtcataaataacgtcatcattaagtc 261  Q
    |||||| | |||  |||| || ||||||||||    
T  16386169 tcacagattatagttaacctcttcattaagtc 16386138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 197
Target Start/End: Original strand, 13647325 - 13647491
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    |||||||||| |||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13647325 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatca 13647424  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    | |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  13647425 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 13647491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 34 - 213
Target Start/End: Original strand, 16213684 - 16213861
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  16213684 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 16213782  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaa 213  Q
     |||||||||||| |||||| ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | ||||||||| ||||| |||||||||    
T  16213783 ccaagtcaacaacgtcttaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaacataa-caacatcaa 16213861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 34 - 150
Target Start/End: Original strand, 48273392 - 48273508
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48273392 tcatcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 48273491  T
Q  134 gcaagtcaacaacatct 150  Q
    |||||||||||||||||    
T  48273492 gcaagtcaacaacatct 48273508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 456321 - 456483
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  456321 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 456419  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  456420 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 456483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 11972496 - 11972658
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11972496 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 11972594  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  11972595 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 11972658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 14949284 - 14949122
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14949284 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14949186  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  14949185 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 14949122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 15376875 - 15376713
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15376875 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 15376777  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  15376776 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 15376713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 16232520 - 16232682
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16232520 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 16232618  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  16232619 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 16232682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 18640272 - 18640434
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18640272 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18640370  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  18640371 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 18640434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 20385285 - 20385123
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20385285 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20385187  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  20385186 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20385123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 21189757 - 21189595
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21189757 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 21189659  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  21189658 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 21189595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 32125491 - 32125653
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32125491 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 32125589  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  32125590 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 32125653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 41522917 - 41523079
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41522917 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 41523015  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  41523016 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 41523079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 41525379 - 41525541
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41525379 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 41525477  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  41525478 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 41525541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 35 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11393448 - 11393287
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 134  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11393448 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatg 11393350  T
Q  135 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  11393349 caagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 11393287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 197
Target Start/End: Original strand, 18430709 - 18430874
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  18430709 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatataaaaacatcatgacataataatatca 18430807  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    | |||||||||||||||||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  18430808 aatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 18430874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 38 - 180
Target Start/End: Original strand, 24275175 - 24275316
Alignment:
Q  38 catcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 137  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24275175 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 24275273  T
Q  138 gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgca 180  Q
    ||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||    
T  24275274 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgca 24275316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 33 - 261
Target Start/End: Original strand, 40443393 - 40443619
Alignment:
Q  33 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 131  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40443393 atcatcatcttcaacatcttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacatacgcagtaaacaaa--cagcatgacataataatatcaa 40443490  T
Q  132 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttc 231  Q
    || ||| ||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| | ||  |||||| ||||||||    
T  40443491 tttcaattcatcaacatcttaggtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacgacatatcttatacagcttc 40443589  T
Q  232 acaggtcataaataacgtcatcattaagtc 261  Q
    |||| | |||| |||| ||||  |||||||    
T  40443590 acagattataattaacctcattgttaagtc 40443619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 177
Target Start/End: Original strand, 16410059 - 16410201
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16410059 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 16410157  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaat 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||    
T  16410158 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaat 16410201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 24702238 - 24702400
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  24702238 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 24702336  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  24702337 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24702400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 27216860 - 27217022
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27216860 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 27216958  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  27216959 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 27217022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 2280238 - 2280030
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  2280238 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataataatatc 2280142  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatctta-aacagc 228  Q
    || ||||| |||||||||||| |||||||||  |||| ||||| |||| || |||| | |||||||||| |||| |||||||||  ||||||| ||||||    
T  2280141 aaatgcaaatcaacaacatctcaaatattcatatataattcaaataatacatataaaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcttataacagc 2280042  T
Q  229 ttcacaggtcat 240  Q
    ||||||| ||||    
T  2280041 ttcacagatcat 2280030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 44116509 - 44116671
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  44116509 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 44116607  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||| |||||| |||  | |||||||||    
T  44116608 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagcaatgcatatacaattatatcaca 44116671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 35 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 14932851 - 14932685
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 134  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  14932851 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattg 14932752  T
Q  135 caa-gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatca 200  Q
    |||  |||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  14932751 caatttcaacaacactttaaatattcaataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcacatca 14932685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 35 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 15356286 - 15356120
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 134  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  15356286 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattg 15356187  T
Q  135 caa-gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatca 200  Q
    |||  |||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  15356186 caatttcaacaacactttaaatattcaataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcacatca 15356120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 35 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 15360400 - 15360234
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 134  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  15360400 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattg 15360301  T
Q  135 caa-gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatca 200  Q
    |||  |||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  15360300 caatttcaacaacactttaaatattcaataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcacatca 15360234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 34 - 177
Target Start/End: Original strand, 3386333 - 3386475
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  3386333 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacagcatgacatgataatatcaaat 3386431  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaat 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||    
T  3386432 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaat 3386475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 24704688 - 24704847
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||   || |||||||||||||||| |    
T  24704688 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaa---caagacataataatatcaaat 24704783  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  24704784 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24704847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 142
Target Start/End: Original strand, 13869346 - 13869453
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13869346 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 13869444  T
Q  134 gcaagtcaa 142  Q
    |||||||||    
T  13869445 gcaagtcaa 13869453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 46 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 15144143 - 15143902
Alignment:
Q  46 tcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaa 145  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||| ||| ||||||| || || |||||||||| |||||| ||||||    
T  15144143 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatct-cagtatgcaataacagcaagatatcataatatcaaatgcaagccaacaa 15144045  T
Q  146 catcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatctt-aaacagcttcacaggtcataaat 244  Q
    ||||| || ||| || | ||| || |||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||  ||||  |||||| ||||||||| |||| | |||       
T  15144044 catctcaagtatacattcataatttaagtaatgcgtataacatcatatcacatcataatcaatgtcaaaacatcttaaaacagcttgacagattatatta 15143945  T
Q  245 aacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactct 287  Q
    ||| |||||||||||||  | ||||| ||| | ||||||||||    
T  15143944 aacatcatcattaagtcttagtactaccccgaggttcaactct 15143902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17062077 - 17061872
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 132  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||     
T  17062077 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaac-tcagcagtatac-aaaatagcatgacataataatatcaaa 17061980  T
Q  133 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaa-cagcttc 231  Q
    ||||||||| |||| ||| || |||| |  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||||||    
T  17061979 tgcaagtcagcaacgtctcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttc 17061881  T
Q  232 acaggtcat 240  Q
    |||| ||||    
T  17061880 acagatcat 17061872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 34 - 160
Target Start/End: Original strand, 13831373 - 13831498
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||| || |    
T  13831373 tcatcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaaca-cggtagtatacaaaaacaacatgacataataatataaaat 13831471  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattca 160  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||    
T  13831472 gcaagtcaacaacgtctcaattattca 13831498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 34 - 214
Target Start/End: Original strand, 20110556 - 20110724
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20110556 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagc-----------tatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20110644  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaac 214  Q
    ||||||||| ||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||  |||| ||||||||||    
T  20110645 gcaagtcaataacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaac 20110724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 38898535 - 38898376
Alignment:
Q  38 catcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 137  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38898535 catcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacacag-cagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 38898437  T
Q  138 gtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||| |||||||| || ||||||   ||| ||||| ||||||| |||  | |||||||||    
T  38898436 gtcaatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 38898376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27847951 - 27847750
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||   ||||| |||||||||| |||||    
T  27847951 acatcatcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagtgtac---aacagtatgacataattatatc 27847855  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagct 229  Q
    || | ||| ||| ||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||| | |||| |||  |||||||||||||||| ||||  ||||||  |||||    
T  27847854 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattatcacacatcataatcaacaacaacatatcttattcagct 27847756  T
Q  230 tcacag 235  Q
    ||||||    
T  27847755 tcacag 27847750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Original strand, 67745 - 67864
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  67745 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 67843  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatct 150  Q
     | ||||| ||||||||||||    
T  67844 gaatgcaaatcaacaacatct 67864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Original strand, 22072913 - 22073033
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  22072913 acatcatcatcttaatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcactatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 22073012  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatct 150  Q
    || || |||||||||||||||    
T  22073013 aaatgtaagtcaacaacatct 22073033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 146
Target Start/End: Original strand, 34200786 - 34200901
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  34200786 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 34200884  T
Q  130 aattgcaagtcaacaac 146  Q
     | || || ||||||||    
T  34200885 gaatgtaaatcaacaac 34200901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 28505419 - 28505321
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  28505419 acatcatcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 28505321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Original strand, 15211484 - 15211633
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtat-acaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaata 156  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||| |||| |||||||||| ||||||| ||  || || ||||||||| || ||    
T  15211484 gactcatgcaacttagttaattaacaacagcagcataggcagaatcacaacaacatcatgacataacaatatcatttataattc-acaacatctcaatta 15211582  T
Q  157 ttcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaa 207  Q
    |||||| | ||||||||  ||| | | |||| |||||||||||||||||||    
T  15211583 ttcaataaaacttcaagcgatgtatacaacattatatcacatcataatcaa 15211633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 97 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 26356083 - 26355983
Alignment:
Q  97 cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcac 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | ||||||||    
T  26356083 cagtatacaaaaacagcataacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcac 26355984  T
Q  197 a 197  Q
    |    
T  26355983 a 26355983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 97 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 26358535 - 26358435
Alignment:
Q  97 cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcac 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | ||||||||    
T  26358535 cagtatacaaaaacagcataacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcac 26358436  T
Q  197 a 197  Q
    |    
T  26358435 a 26358435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 12756797 - 12756671
Alignment:
Q  70 ttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatactt 169  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| || ||||||  || | ||    
T  12756797 ttagttaaataacaacagcaacacaa-caatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtaaacaacgtctcaattattcacataaaatt 12756699  T
Q  170 caagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||| |||  | |||||||||    
T  12756698 caagtaatgcatatacaattatatcaca 12756671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 157
Target Start/End: Original strand, 18005650 - 18005772
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||   ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  18005650 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataagcagtat-ggaaatcatcatgatataacaatatcgaat 18005748  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatat 157  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  18005749 gcaaatcaacaacatctcaaatat 18005772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 811248 - 811129
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  811248 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 811150  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaa 154  Q
    ||||||||  |||||| ||||    
T  811149 gcaagtcattaacatcataaa 811129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 16219834 - 16219715
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  16219834 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 16219736  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaa 154  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  16219735 gcaagtcatcaacatcttaaa 16219715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 146
Target Start/End: Original strand, 16495402 - 16495517
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  16495402 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 16495500  T
Q  130 aattgcaagtcaacaac 146  Q
     | || || ||||||||    
T  16495501 gaatgtaaatcaacaac 16495517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 154
Target Start/End: Original strand, 47831807 - 47831930
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||| | | | || ||||| |||| ||||||    
T  47831807 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgc-atatcatcatgatataacaatatc 47831905  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaa 154  Q
     | ||||||||| ||||||| ||||    
T  47831906 gaatgcaagtcatcaacatcataaa 47831930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19486865 - 19486655
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    |||||| |||||||| | |||| || ||||||||||| ||||||||  |||  | |||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||    
T  19486865 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatc 19486767  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaa-cagc 228  Q
        | |||| |||||||||| ||||| |||  |||| ||||||| ||||| |||  | |||||||||| |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
T  19486766 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagttatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagc 19486667  T
Q  229 ttcacaggtcat 240  Q
    ||||||| ||||    
T  19486666 ttcacagatcat 19486655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1868101 - 1867907
Alignment:
Q  46 tcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaa 142  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||  |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| | ||    
T  1868101 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaactaacaacaacataggcagtata-taaaacagctcatgatataacaatatcaa-tgcaaatgaa 1868004  T
Q  143 caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcacaggtcat 240  Q
    |||||||| ||| | |||  |||| |||| |||||||| |||  | |||||||||| || | |||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||    
T  1868003 caacatctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatcttaaaaagcttcacagatcat 1867907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 80 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 2530208 - 2530129
Alignment:
Q  80 aacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaa 161  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||  || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2530208 aacaacagcaacataggcaacatacaaa--caacatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaatattcaa 2530129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 11996148 - 11996051
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatat 128  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||    
T  11996148 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcatcttagttaattaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatat 11996051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 144
Target Start/End: Original strand, 44014182 - 44014291
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  44014182 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 44014280  T
Q  134 gcaagtcaaca 144  Q
    |||| ||||||    
T  44014281 gcaaatcaaca 44014291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17138177 - 17138006
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaac-agcatgacataataatatcaatt 133  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| ||| | ||||  ||||| ||| |||||    
T  17138177 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaacataggcagattacaacaacaatcatg--ataattataccaatt 17138080  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaaca 209  Q
     ||| ||| ||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||| | |||| ||||  |||||||| ||||||    
T  17138079 -caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcatattcaaca 17138006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 18154956 - 18154873
Alignment:
Q  37 tcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 120  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  18154956 tcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcaacataggcagattacaacaacagtatgacat 18154873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 10063939 - 10063810
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    |||||| || ||||| | |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| | | |||| ||||| |||||||||||    
T  10063939 acatcaacaccttcaacgacttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcggtatgc-acaacatcatgatataataatatc 10063841  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattca 160  Q
     |   ||||| |||||||||| |||||||||    
T  10063840 gaacacaagtaaacaacatctcaaatattca 10063810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 150
Target Start/End: Original strand, 16056343 - 16056446
Alignment:
Q  46 tcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 144  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |  ||||| ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||    
T  16056343 tcaacttagaccgactgatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacattatgc--aaacaacatgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca 16056440  T
Q  145 acatct 150  Q
    ||||||    
T  16056441 acatct 16056446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 99
Target Start/End: Original strand, 12187019 - 12187083
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcag 99  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  12187019 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaacataggcag 12187083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 15755008 - 15754893
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||| || | ||| ||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  15755008 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 15754910  T
Q  130 aattgcaagtcaacaac 146  Q
     | ||||| ||||||||    
T  15754909 gaatgcaaatcaacaac 15754893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 2832561 - 2832499
Alignment:
Q  32 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    |||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  2832561 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcata 2832499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 12321835 - 12321685
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 157  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||  |||   |||| |||||||| || | |||||||||||| ||  ||||||||||||| |  ||    
T  12321835 gactcatgcaacgtagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacagcataacttcataatatcaatt-catttcaacaacatcttgatcat 12321737  T
Q  158 tcaattatacttcaagtaatgcacataa-cactatatcacatcataatcaac 208  Q
    || || ||| |||||||||||||  ||| || || ||||||| |||||||||    
T  12321736 tccataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaac 12321685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 57 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15008594 - 15008415
Alignment:
Q  57 cgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||| || ||||||||| |||||| |||| |||  ||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||| || ||    
T  15008594 cgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatataaaa-cagttcatgatataacaatatcaat-gcaaatcaacaacacctcaa 15008497  T
Q  154 atattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatctta-aacagcttcacag 235  Q
    | || ||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||| || | |||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  15008496 acat-catatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatcttataacagcttcacag 15008415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 120
Target Start/End: Original strand, 9703263 - 9703348
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 120  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||  | ||| ||||| |||||||    
T  9703263 catcatcttgatcatcttatatcaactcatgcaacatagttaaataacaataacagcataggcagattgcaacaacagtatgacat 9703348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 19649606 - 19649521
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 120  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |||  ||||| ||||  |||||||    
T  19649606 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcatagacagattacaacaacaatatgacat 19649521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 9446252 - 9446216
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9446252 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacata 9446216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 20569690 - 20569654
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20569690 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacata 20569654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 32216665 - 32216601
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcag 99  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||    
T  32216665 catcatcttgatcatcttatatcaactcatgcaacatagttaaataataatagcagcataggcag 32216601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 9751871 - 9751812
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    ||||||||| |||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  9751871 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcata 9751812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 108
Target Start/End: Original strand, 12901338 - 12901401
Alignment:
Q  46 tcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaa 108  Q
    |||||||| | ||||||||||| |||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  12901338 tcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatacaaaa 12901401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 101
Target Start/End: Original strand, 18203831 - 18203882
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagta 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||| |||||    
T  18203831 cttagatcgactcatgcagcttagttaataaacaacaacaacatagacagta 18203882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 39268016 - 39267957
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    ||||||||| |||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  39268016 catcatcttgatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcata 39267957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 84
Target Start/End: Original strand, 14429883 - 14429932
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa 84  Q
    ||||||||| |||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  14429883 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaa 14429932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 235
Target Start/End: Original strand, 48273538 - 48273583
Alignment:
Q  191 tatcacatcataatcaacatcaacgcatctt-aaacagcttcacag 235  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  48273538 tatgacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttcacag 48273583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 101
Target Start/End: Original strand, 14044761 - 14044817
Alignment:
Q  46 tcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 101  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  14044761 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagta 14044817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 101
Target Start/End: Original strand, 14354791 - 14354847
Alignment:
Q  46 tcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 101  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  14354791 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagta 14354847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Original strand, 42204017 - 42204053
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  42204017 gactcatgcaacttagttaaacaacaacagcagcata 42204053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Original strand, 38761 - 39024
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38761 acatcatcatcttcatcaacttagaccgagtcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 38859  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38860 aatgcaaataaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 38959  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||| | |||| |||| |||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  38960 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaggttcaactctcaacaact 39024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 31 - 235
Target Start/End: Original strand, 32942 - 33145
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32942 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 33040  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33041 aatgcaagttaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 33140  T
Q  231 cacag 235  Q
    |||||    
T  33141 cacag 33145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 146
Target Start/End: Original strand, 9744 - 9860
Alignment:
Q  29 ggacatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatat 128  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9744 ggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagaatgacataataatat 9842  T
Q  129 caattgcaagtcaacaac 146  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  9843 caagtgcaagtcaacaac 9860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Original strand, 1851 - 2115
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1851 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 1950  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  1951 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaatagctt 2050  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||| | |||| |||| || ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  2051 cacagattataattaacatcctcattaagtcttaatactatcccaaggttcaactctcgacaact 2115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 75)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 17287917 - 17287653
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17287917 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggtagtatacaaacacagcatgacataataatatca 17287818  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  17287817 attgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatgtcataacataatcaacctcaacacatcttaaacagctt 17287718  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||||| |||| |||| || |||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  17287717 cacaggttataattaacatcctcattaagtctcaatgctaccccaaggttcaactctcaacaact 17287653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 20361081 - 20360817
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20361081 acatcatcattttcatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagcatacaaaaacagcatgacataataatatca 20360982  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  20360981 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagctt 20360882  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||  | |||| |||| |||||||||||||  ||||||| || || ||||||  ||||||||||    
T  20360881 cacatattataattaacctcatcattaagtcttaatactacccaaaggttcaatcctcaacaact 20360817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 31 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 22780348 - 22780091
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22780348 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacaaaaacataggcaatatacaaaaacagcttgacataataatatca 22780249  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22780248 attgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacgcaacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 22780149  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctc 288  Q
    ||||| | || | |||| |||||||||||||   |||||| ||||| |||||||||||    
T  22780148 cacagattatgattaacatcatcattaagtctttatactaccccaaggttcaactctc 22780091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Original strand, 29060540 - 29060796
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29060540 acatcatcatcttcatcagcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 29060639  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    | |||||||||||||||||| || ||| || | ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29060640 aatgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatctcatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 29060739  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactct 287  Q
    ||||| | |||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||    
T  29060740 cacagattataattaatatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcagctct 29060796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 20638404 - 20638140
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20638404 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 20638305  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    ||||||| | | ||||||||| |||||||||  || |||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20638304 attgcaatttatcaacatctttaatattcaaacattcttcaagtaatgcataaaacgttatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 20638205  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||| | |||| |||| |||||||||||||  |||  |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  20638204 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgttatcccaaggttcaactctcgacaact 20638140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 25629476 - 25629212
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25629476 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaattacaacaggaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataacaatatca 25629377  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    | |||||||||||||||||| || ||| || | ||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25629376 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 25629277  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||| | |||| ||||  |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  25629276 cacagattataattaacaacatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactcttaacaact 25629212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 32 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 18409947 - 18409684
Alignment:
Q  32 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 131  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  18409947 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctcagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacgaaaacaacatgacataataatatcaa 18409848  T
Q  132 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttc 231  Q
     |||||||||||||||||| ||  || || | ||| ||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18409847 atgcaagtcaacaacatctcaatcatccattcataattcaaataatacatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 18409748  T
Q  232 acaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    |||  | |||| |||| ||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||| ||||    
T  18409747 acatattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccctaaggttcaactctcaataact 18409684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Original strand, 20593773 - 20594037
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20593773 acatcatcatcttcatcaacttagaccgaatcatgcagctcagttaaataaaaacagcaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataataatatca 20593872  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    | |||||||||||||||||| || ||| |||| |||  |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20593873 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataaatcaagtaatgcgtataacaatatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 20593972  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||| | |||| || | | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| || |||||||    
T  20593973 cacagattataattatcattatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaacccttaacaact 20594037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 19303661 - 19303406
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  19303661 acatcatcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaggaagtatacaaaa-caacatgacataataatatca 19303563  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    | |||||||||||||||||| || ||| || | ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  19303562 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacattcatatttcaagtaatgtacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttcaacagctt 19303463  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactct 287  Q
    ||||| | |||| |||| |||||||||| || || | ||| ||||| ||||||||||    
T  19303462 cacagattataattaacatcatcattaattctcagtgctaccccaaggttcaactct 19303406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 31 - 198
Target Start/End: Original strand, 16496244 - 16496411
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16496244 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatca 16496343  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacat 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||| | || | ||||||||||    
T  16496344 attgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaatattatatcacat 16496411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 198
Target Start/End: Original strand, 20076700 - 20076863
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  20076700 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac-aaaacagcatgacataataatatca 20076798  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacat 198  Q
    | |||||   | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  20076799 aatgcaa---atcaacatcttaaaaattcaattatacttcaagtaatgcgtataacattatatcacat 20076863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 32 - 197
Target Start/End: Original strand, 34963371 - 34963535
Alignment:
Q  32 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 131  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963371 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 34963469  T
Q  132 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
     |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  34963470 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 34963535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 12742317 - 12742479
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12742317 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 12742415  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  12742416 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 12742479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 18334754 - 18334592
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18334754 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18334656  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  18334655 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 18334592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 19005046 - 19005208
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19005046 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 19005144  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  19005145 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 19005208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 19859081 - 19858919
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19859081 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 19858983  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  19858982 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 19858919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 22782227 - 22782389
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22782227 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 22782325  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||   ||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  22782326 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacacataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22782389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 24422547 - 24422709
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24422547 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 24422645  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  24422646 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24422709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 177
Target Start/End: Original strand, 25688502 - 25688644
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25688502 tcattatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaact 25688600  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaat 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||    
T  25688601 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaat 25688644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 33861794 - 33861956
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33861794 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 33861892  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  33861893 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 33861956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 33864278 - 33864440
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33864278 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 33864376  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  33864377 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 33864440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 1541073 - 1540928
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  1541073 tcatcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagtatgacataataatatcaaat 1540975  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgca 180  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||    
T  1540974 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgca 1540928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 32 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 30676874 - 30676710
Alignment:
Q  32 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 131  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30676874 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaa 30676776  T
Q  132 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
     |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  30676775 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 30676710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 2291342 - 2291180
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  2291342 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 2291244  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  2291243 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 2291180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 8055029 - 8055191
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8055029 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaaa-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 8055127  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  8055128 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 8055191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 25754809 - 25754971
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25754809 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 25754907  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    |||| |||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  25754908 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 25754971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 26924802 - 26924640
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26924802 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 26924704  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  26924703 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 26924640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 177
Target Start/End: Original strand, 25656629 - 25656771
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25656629 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 25656727  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaat 177  Q
    |||||| || ||| ||| || ||||||  |||| ||||| ||||    
T  25656728 gcaagttaataacgtctcaattattcacatataattcaactaat 25656771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 34 - 178
Target Start/End: Original strand, 1595549 - 1595692
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  1595549 tcatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 1595647  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatg 178  Q
    |||| |||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||    
T  1595648 gcaattcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatg 1595692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 50 - 240
Target Start/End: Original strand, 18456735 - 18456924
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatc 149  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  18456735 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 18456833  T
Q  150 ttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaa-cagcttcacaggtcat 240  Q
    | || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||    
T  18456834 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttcacagatcat 18456924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 46 - 213
Target Start/End: Original strand, 25644335 - 25644503
Alignment:
Q  46 tcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataaca-acagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 144  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||| || |||||| ||    
T  25644335 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcgtgatataacaatatcaaatgtaagtcatca 25644434  T
Q  145 acatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaa 213  Q
    |||||| ||| |||||  |||| ||||||||||||  |||  | |||||||||||| || |||||||||    
T  25644435 acatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcgtatacaattatatcacatcaaaaacaacatcaa 25644503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 3852179 - 3852017
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |    
T  3852179 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtttaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacagcatgacatgataatataaaat 3852081  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  3852080 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 3852017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 50 - 180
Target Start/End: Original strand, 18461895 - 18462024
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatc 149  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  18461895 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 18461993  T
Q  150 ttaaatattcaattatacttcaagtaatgca 180  Q
    | || ||||||  |||| |||||||||||||    
T  18461994 tcaattattcacatataattcaagtaatgca 18462024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 206
Target Start/End: Original strand, 35245586 - 35245758
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||    
T  35245586 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacaccaacataggcagtatacaacaaca---tgacataataatatc 35245682  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatca 206  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||    
T  35245683 aatttcaattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatca 35245758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 37 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16448686 - 16448526
Alignment:
Q  37 tcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 136  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16448686 tcatcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 16448588  T
Q  137 agtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    |||||| |||| ||| || ||||||  |||| ||||| ||||||| |||  | |||||||||    
T  16448587 agtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 16448526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 20557054 - 20556943
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  20557054 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatggcataataatatcaaat 20556956  T
Q  134 gcaagtcaacaac 146  Q
    |||||||||||||    
T  20556955 gcaagtcaacaac 20556943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 33 - 185
Target Start/End: Original strand, 23992429 - 23992578
Alignment:
Q  33 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 132  Q
    |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  23992429 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagctaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaat 23992528  T
Q  133 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataa 185  Q
    ||||| |   |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  23992529 tgcaatt---caacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgcacataa 23992578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 58 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15041644 - 15041468
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||   |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||    
T  15041644 gactcatgcaacttagttaaataacaatagtagcataggcagatcacaacaacagcatgacattataatatcaaatgcaattcaataacatcttaagtat 15041545  T
Q  158 tcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcacag 235  Q
    ||||| | |  ||||||||||||||| ||| || | || ||| |||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  15041544 tcaataaaatctcaagtaatgcacat-acattaaaccaaatcttaattatcatcaacacatcttaaacagctttacag 15041468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 19848114 - 19847989
Alignment:
Q  33 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 132  Q
    |||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||  |||||||  |||||| |||||||||    
T  19848114 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaacacataaaaatatcaat 19848015  T
Q  133 tgcaagtcaacaacatcttaaatatt 158  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  19848014 tgcaattcaacaatatcttaaatatt 19847989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16920751 - 16920553
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    ||||||||||||||| || ||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||   |||| ||||||||||  |||||    
T  16920751 acatcatcatcttcaacatctttgaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcagcataggcagtatac---aacatcatgacataagtatatc 16920655  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagct 229  Q
    || | | | ||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| ||||  ||||||  |||||    
T  16920654 aaattccattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattataccacatcataatcaacaacaacttatcttattcagct 16920556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 213
Target Start/End: Original strand, 20109140 - 20109322
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| | |||| ||||||    
T  20109140 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacataatataacaatatc 20109236  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacat--aacactatatcacatcataatcaacatcaa 213  Q
    || ||||||||| |||||||| |||||||||  |||| ||||||||||| | ||  || | |||||||||| |||| |||||||||    
T  20109237 aaatgcaagtcatcaacatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaa 20109322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 50 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 18821946 - 18821795
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaa-cat 148  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||| |||||| |||    
T  18821946 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgccataacaatatcaa-cgcaagccaacaatcat 18821849  T
Q  149 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataa 203  Q
    || || |||||| ||| ||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  18821848 ctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtat-acattatatcacatcataa 18821795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 58 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25603478 - 25603302
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 157  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||| |||| |||||||||| ||||||| ||  || || || |||||| || |||    
T  25603478 gactcatgcgacttagttaattaacaacagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataacaatatcatttataattc-actacatctcaattat 25603380  T
Q  158 tcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcacag 235  Q
    ||||| | ||||||||||||| | | ||||  ||||||||||||||||||   | |  ||||||||||||||||||||    
T  25603379 tcaataaaacttcaagtaatgtatacaacatcatatcacatcataatcaatgactaaacatcttaaacagcttcacag 25603302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 58 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 25611816 - 25611643
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 157  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||| |||| |||||||||| ||||||| ||  || || || |||||| || |||    
T  25611816 gactcatgcgacttagttaattaacaacagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataacaatatcatttataattc-actacatctcaattat 25611718  T
Q  158 tcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttca 232  Q
    ||||| | ||||||||||||| | | ||||  ||||||||||||||||||   | |  |||||||||||||||||    
T  25611717 tcaataaaacttcaagtaatgtatacaacatcatatcacatcataatcaatgactaaacatcttaaacagcttca 25611643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 27333339 - 27333262
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  27333339 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 27333262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 27394079 - 27394002
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  27394079 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 27394002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 8227632 - 8227422
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    |||||| |||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||  |||  | ||||||| |||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  8227632 acatcaacatcttcaacaacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 8227534  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaa-cagc 228  Q
        | |||| |||||||||| ||||| |||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||| |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
T  8227533 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagc 8227434  T
Q  229 ttcacaggtcat 240  Q
    ||||||| ||||    
T  8227433 ttcacagatcat 8227422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 31 - 235
Target Start/End: Original strand, 22831503 - 22831706
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    ||||||||||||||| ||   |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | | |   |||  ||||||||||| |||||    
T  22831503 acatcatcatcttcaacatagtagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcactgttc---aacgacatgacataatcatatc 22831599  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaa--tattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacag 227  Q
    || | ||| ||| |||||||||| |  ||| |||  || |||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| ||||  ||||||  |||    
T  22831600 aaattcaattcatcaacatcttagatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcataatcaacaacaacatatcttattcag 22831698  T
Q  228 cttcacag 235  Q
    ||||||||    
T  22831699 cttcacag 22831706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 92
Target Start/End: Original strand, 25714417 - 25714478
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaaca 92  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25714417 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 25714478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 80 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 27416011 - 27415887
Alignment:
Q  80 aacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattc-aattatacttcaagtaatg 178  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| | ||||| ||| || ||| | ||||||    
T  27416011 aacaacagcaacataggcagcatacaaa--cagcatgacataatattatcaatttcaattcaacaacatcttgagtattcaaataattctt-aggtaatg 27415915  T
Q  179 cacataacactatatcacatcataatca 206  Q
    || | |||| |||||||||| |||||||    
T  27415914 cataaaacattatatcacattataatca 27415887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 28496592 - 28496477
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  28496592 acatcatcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 28496494  T
Q  130 aattgcaagtcaacaac 146  Q
     | || || ||||||||    
T  28496493 gaatgtaaatcaacaac 28496477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 29809003 - 29808888
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  29809003 acatcatcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 29808905  T
Q  130 aattgcaagtcaacaac 146  Q
     | || || ||||||||    
T  29808904 gaatgtaaatcaacaac 29808888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 58 - 180
Target Start/End: Original strand, 21766718 - 21766839
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||| ||| |  | |||||||||||| ||  ||||||||||||| |  ||    
T  21766718 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcaacataggcagatcacaacaacaacataatttcataatatcaatt-catttcaacaacatcttgatcat 21766816  T
Q  158 tcaattatacttcaagtaatgca 180  Q
    ||||| ||| |||||||||||||    
T  21766817 tcaataatatttcaagtaatgca 21766839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Original strand, 23019408 - 23019525
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    |||||||||||||  ||| |||||| ||||| ||||| |||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  23019408 acatcatcatctt--tcatcttagaccgacttatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatc 23019504  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatct 150  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  23019505 aaatgcaagtcaacaacatct 23019525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 150
Target Start/End: Original strand, 19652199 - 19652313
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  19652199 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 19652297  T
Q  134 gcaagtcaacaacatct 150  Q
    |||| ||||||||||||    
T  19652298 gcaa-tcaacaacatct 19652313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 180
Target Start/End: Original strand, 18907111 - 18907255
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 134  Q
    ||||||||| |||| |||  || |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  |||   |||| |||||||| || | ||||||||||||     
T  18907111 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcagcttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacagcataacttcataatatcaatt- 18907209  T
Q  135 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgca 180  Q
    ||  ||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||    
T  18907210 catttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgca 18907255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 120
Target Start/End: Original strand, 19873120 - 19873205
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 120  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  19873120 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacat 19873205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 120
Target Start/End: Original strand, 22432249 - 22432334
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 120  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  22432249 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaattaacaatagcagcataggcagtttacaacaacagtatgacat 22432334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 120
Target Start/End: Original strand, 22438799 - 22438884
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 120  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  22438799 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaattaacaatagcagcataggcagtttacaacaacagtatgacat 22438884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 146
Target Start/End: Original strand, 1561303 - 1561418
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||| || | ||| ||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  1561303 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 1561401  T
Q  130 aattgcaagtcaacaac 146  Q
     | ||||| ||||||||    
T  1561402 gaatgcaaatcaacaac 1561418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 9098620 - 9098557
Alignment:
Q  46 tcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa 108  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  9098620 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacaaaggcagtatgcaaaa 9098557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 149
Target Start/End: Original strand, 19668386 - 19668491
Alignment:
Q  46 tcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaa 142  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||  ||||| | |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||    
T  19668386 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacagcaacatagatagtatgc-aaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaa 19668484  T
Q  143 caacatc 149  Q
    |||||||    
T  19668485 caacatc 19668491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 25642304 - 25642125
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacag-----catgacataataatatc 129  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||| |||  ||||| |||||     ||| ||||||  |||||    
T  25642304 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaactaggttaaataacaatagcagcatagacagattacaacaacagtatgacatcacataacgatatc 25642205  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataa-cactatatcacatcataatcaacat 210  Q
    |||   ||  ||||||||||||||  ||||| | ||| |||||||||||||  ||| || |||||||||||||| |||||||    
T  25642204 aat--aaaaacaacaacatcttaatcattcattcataattcaagtaatgcaattaatcattatatcacatcatattcaacat 25642125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 120
Target Start/End: Original strand, 19862978 - 19863063
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 120  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||| ||  ||||| ||||| |||||||    
T  19862978 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggaagattacaacaacagtatgacat 19863063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 31155514 - 31155465
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa 84  Q
    ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31155514 catcatcatcatcaacttggattgactcatgcaacttagttaaataacaa 31155465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 52 - 108
Target Start/End: Original strand, 33443068 - 33443124
Alignment:
Q  52 tagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa 108  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33443068 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagtatataaaa 33443124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 4185930 - 4185870
Alignment:
Q  43 tcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataaca-acagcaacataggcagtat 102  Q
    |||||||||| || ||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  4185930 tcatcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacagacagcaacataggcagtat 4185870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 19790873 - 19790837
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19790873 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcagcata 19790837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 22335014 - 22334954
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacatag 95  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||    
T  22335014 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaactaggttaaataacaatagcagcatag 22334954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 16523500 - 16523441
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    ||||||||| |||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  16523500 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcata 16523441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 22080846 - 22080799
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaa 78  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22080846 acatcatcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaa 22080799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 180
Target Start/End: Original strand, 11185524 - 11185652
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 148  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||  ||||| |||   |||| ||||||||||| ||||||| | ||| ||| || |||    
T  11185524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatgtgcagtgtac---aacaacatgacataattatatcaaattcaattcatcagcat 11185620  T
Q  149 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgca 180  Q
    |||   ||| |||  || ||||||||||||||    
T  11185621 cttttgtatacaaacattcttcaagtaatgca 11185652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 15894555 - 15894491
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcag 99  Q
    ||||||||| |||| |||| || |||||||||| | |||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  15894555 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcatcatagttaaataacaatagcagcataagcag 15894491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 20908075 - 20908039
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20908075 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcata 20908039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 27553665 - 27553629
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  27553665 gactcatgcaacttagttaaagaacaacagcagcata 27553629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 8650 - 8389
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8650 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca---gcaacataggcagtat-caaaaacagcatgacataataatatca 8555  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8554 attgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 8455  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatacta-tcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||| | |||| |||| || |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  8454 cacagattataattaacatcctcattaagtcccaatactacccccaacgttcaactctcaacaact 8389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 181; Significance: 8e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Original strand, 13211 - 13475
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 13310  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13311 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 13410  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||  | |||| |||| |||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||| || ||||||    
T  13411 cacaaattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcccaaggttcaactgtcgacaact 13475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 181; Significance: 8e-98; HSPs: 78)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16240090 - 16239827
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16240090 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttaattaaataacaatagcaaaataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 16239992  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16239991 aatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatactttaagtaatgcaaataacattatatcatatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 16239892  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    | ||| | |||| |||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16239891 cgcagattataattaacatcatcattaagtcttaatactaccccaaagttcaactctcaacaact 16239827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Original strand, 44052829 - 44053093
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44052829 acatcatcatcttcatcaacttaggccgactcatgcagctcagttaaataacaacatcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 44052928  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  44052929 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgctcataacattatatcacatcataatcaacatcagcacatcttaaacagctt 44053028  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||| | |||| |||| |||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  44053029 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcccaaggttcaactctcgacaact 44053093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 31 - 288
Target Start/End: Original strand, 7893703 - 7893957
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7893703 acatcatcatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 7893802  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||   || |||| |||||||||||||||    
T  7893803 attgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataccattatttcacatcataat---cagcaacacatcttaaacagctt 7893899  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctc 288  Q
    ||||| | |||| |||| ||||| |||||||  |||| || ||||| |||||||||||    
T  7893900 cacagattataattaacatcatcgttaagtcttaatattaccccaaggttcaactctc 7893957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 31 - 292
Target Start/End: Original strand, 12902757 - 12903018
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902757 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 12902856  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    |||| || ||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  12902857 attgtaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagctt 12902956  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaaca 292  Q
    ||||| | |||| |||| || ||||||||||  ||| ||| || || |||||||||||||||    
T  12902957 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaatcctacccaaaggttcaactctcaaca 12903018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 31 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16270356 - 16270153
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16270356 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 16270258  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16270257 aatgcaagttaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 16270158  T
Q  231 cacag 235  Q
    |||||    
T  16270157 cacag 16270153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 34 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 16377639 - 16377386
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  16377639 tcattatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaa--cagcatgacataataatatcaaat 16377542  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcac 233  Q
    ||||||||||||||||| || ||| || | ||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16377541 gcaagtcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctccac 16377442  T
Q  234 aggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctca 289  Q
    || | |||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16377441 agattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctca 16377386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 31 - 214
Target Start/End: Original strand, 7798774 - 7798957
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7798774 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 7798873  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaac 214  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  7798874 attgcaagtcatcaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattgtatcacaacataatcaacatcaac 7798957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 33 - 295
Target Start/End: Original strand, 22636437 - 22636698
Alignment:
Q  33 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 132  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22636437 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacatagacagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaat 22636536  T
Q  133 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttca 232  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  22636537 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcgacatcaacacatctt-aacagcttca 22636635  T
Q  233 caggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||| | |||| |||| || || |||||||  ||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  22636636 cagattataattaacatcctcgttaagtcttaatactaccccaaggttcaattctcaacaact 22636698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 36 - 287
Target Start/End: Original strand, 14038653 - 14038904
Alignment:
Q  36 atcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgc 135  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||    
T  14038653 atcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacatgcagtatacaaaaacaacatggcataataatatcaaatgc 14038752  T
Q  136 aagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcacag 235  Q
    ||||||||||||||| || ||| || | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14038753 aagtcaacaacatctcaattatacattcatatttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatgttaaacagcttcacag 14038852  T
Q  236 gtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactct 287  Q
     | |||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  14038853 attataattaatatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactct 14038904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Original strand, 7088877 - 7089141
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7088877 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 7088976  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| | || |||| ||||||||||| |||    
T  7088977 attgcaattcatcaacatcttacatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataattagcaacaacacatcttaaacaactt 7089076  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||| | |||| |||| || ||||||||||  ||| |||  | || ||||||||||| ||||||    
T  7089077 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctactcaaaggttcaactctcgacaact 7089141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 31 - 203
Target Start/End: Original strand, 6899891 - 6900062
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||    
T  6899891 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-caacatagcataataatatca 6899989  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataa 203  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  6899990 aatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgtacataacattatatcacatcataa 6900062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 38 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 23374473 - 23374250
Alignment:
Q  38 catcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 137  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  23374473 catcttcaacaacttagaacgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaa 23374374  T
Q  138 gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcacaggt 237  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| || |    
T  23374373 ttcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacagatcttaaaaagcttcagagat 23374274  T
Q  238 cataaataacgtcatcattaagtc 261  Q
     |||  |||| || ||||||||||    
T  23374273 tatagttaacctcttcattaagtc 23374250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 31 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 52873488 - 52873363
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873488 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 52873389  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaata 156  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  52873388 attgcaagtcaacatcatcttaaata 52873363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 34 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 44929042 - 44928835
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  44929042 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatgtcaaat 44928943  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaa-cagcttca 232  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||  |||| |||||| ||  |||| |||| ||||||||    
T  44928942 gcaagtcaataacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataaacaacataaaatcatcataaatcagcttca 44928843  T
Q  233 caggtcat 240  Q
    ||| ||||    
T  44928842 cagatcat 44928835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 18215436 - 18215274
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18215436 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18215338  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  18215337 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 18215274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 34 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 54798872 - 54798729
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  54798872 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 54798773  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaat 177  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||    
T  54798772 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 54798729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 12469 - 12307
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12469 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 12371  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  12370 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 12307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 1837671 - 1837494
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  1837671 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataataccaaat 1837573  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaa 213  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||| |||| |||||||||    
T  1837572 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacgattatatcacattataa-caacatcaa 1837494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 14053422 - 14053159
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  14053422 acatcatcatcttcaacatcttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaaacaacagcatagacagtatac--aaacagcatgacataataatatc 14053325  T
Q  130 aattgcaagtcaacaaca-tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagc 228  Q
    |||| ||| ||| ||||| |||||   || ||| ||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||| || ||    
T  14053324 aatttcaattcatcaacattcttatgcatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacaacatatcttatacggc 14053226  T
Q  229 ttcacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||||| | |||| |||| ||||  |||||||  ||| ||| || |  ||||||||||| ||||||    
T  14053225 ttcacagattataattaacctcattgttaagtcttaatcctacccaagggttcaactctcgacaact 14053159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 15118514 - 15118352
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15118514 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 15118416  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  15118415 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 15118352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 52312510 - 52312672
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  52312510 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 52312608  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  52312609 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 52312672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 197
Target Start/End: Original strand, 19242693 - 19242861
Alignment:
Q  28 tggacatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataata 127  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242693 tggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataata 19242791  T
Q  128 tcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  19242792 tcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 19242861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 32 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 19618336 - 19618172
Alignment:
Q  32 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 131  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19618336 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaa 19618238  T
Q  132 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
     |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  19618237 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacctataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 19618172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 3515007 - 3515169
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  3515007 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaaaaacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcaagacataataatatcaaat 3515105  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  3515106 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 3515169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 157
Target Start/End: Original strand, 14280316 - 14280438
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  14280316 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-ggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 14280414  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatat 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  14280415 gcaagtcaacaacatctcaaatat 14280438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23803427 - 23803265
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23803427 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23803329  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    |||| |||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  23803328 gcaaatcaacaacgtctaaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 23803265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 44615288 - 44615450
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  44615288 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 44615386  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  44615387 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 44615450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 44773249 - 44773087
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44773249 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 44773151  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||   ||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  44773150 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacaaataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 44773087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 50222501 - 50222339
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50222501 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cattatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 50222403  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  50222402 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 50222339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 18239581 - 18239436
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18239581 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcagcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18239483  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgca 180  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||    
T  18239482 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgca 18239436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 51464030 - 51463868
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51464030 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 51463932  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    |||| |||||||| ||| || ||||||  |||| ||||| ||||||| |||  | |||||||||    
T  51463931 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaaataatgcatatataattatatcaca 51463868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 44102214 - 44102376
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44102214 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaataacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 44102312  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    |||||| |||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  44102313 gcaagtaaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 44102376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 15355483 - 15355324
Alignment:
Q  38 catcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 137  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15355483 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 15355385  T
Q  138 gtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||| |||| ||| || ||||||  |||| ||||| ||||||| |||  | |||||||||    
T  15355384 gtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 15355324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 117
Target Start/End: Original strand, 3096293 - 3096379
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatga 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3096293 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatga 3096379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 32 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14970871 - 14970727
Alignment:
Q  32 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 131  Q
    ||||| ||| || ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14970871 catcaacattttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaacag-caatatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 14970773  T
Q  132 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaat 177  Q
     |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||    
T  14970772 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaat 14970727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 12610950 - 12611105
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |        ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12610950 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca--------acaaaaacagcatgacataataatatcaaat 12611041  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    |||| |||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  12611042 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 12611105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 31 - 240
Target Start/End: Original strand, 15367690 - 15367899
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    |||||| |||||||| | |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15367690 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 15367788  T
Q  131 attgcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaa-cagc 228  Q
    | |||||||||| |||| ||| || ||||||  |||| ||||| ||| ||| |||  | |||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
T  15367789 aatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagc 15367887  T
Q  229 ttcacaggtcat 240  Q
    ||||||| ||||    
T  15367888 ttcacagatcat 15367899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 31 - 240
Target Start/End: Original strand, 15402703 - 15402912
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    |||||| |||||||| | |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15402703 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 15402801  T
Q  131 attgcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaa-cagc 228  Q
    | |||||||||| |||| ||| || ||||||  |||| ||||| ||| ||| |||  | |||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
T  15402802 aatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagc 15402900  T
Q  229 ttcacaggtcat 240  Q
    ||||||| ||||    
T  15402901 ttcacagatcat 15402912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 46 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 52243302 - 52243105
Alignment:
Q  46 tcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaa 142  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||  ||||| |||| |||||||| || || ||||    
T  52243302 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaat-cagttcatgatataacaatatcaaatgaaattcaa 52243204  T
Q  143 caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatctta-aacagcttcacaggtcat 240  Q
    |||||||| ||| |||||  |||| | ||||||||||| |||  | |||||||||| |||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  52243203 caacatctcaaacattcatatataatccaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcttataacagcttcacagatcat 52243105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 261
Target Start/End: Original strand, 17046487 - 17046714
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||   | |||| ||||||||||| |||||    
T  17046487 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtat---agaacaacatgacataattatatc 17046583  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagct 229  Q
    || | ||| ||| ||||||||||  ||| |||  || |||||||||||| | | |||| |||| |||||| ||||||||| ||||  ||||||  |||||    
T  17046584 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgtata-aacattataacacatcttaatcaacaacaacatatcttattcagct 17046682  T
Q  230 tcacaggtcataaataacgtcatcattaagtc 261  Q
    |||||| | |||| |||| | || ||||||||    
T  17046683 tcacagattataattaaccttattattaagtc 17046714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 50 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 13953 - 13790
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 148  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  13953 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 13855  T
Q  149 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaa 213  Q
    || |||||||||  |||| ||||||||||| | |||  | |||||||||| |||| |||||||||    
T  13854 ctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 13790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 8574985 - 8574844
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  8574985 tcatcatcttaattaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaat 8574888  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaat 177  Q
    | || |||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||    
T  8574887 gtaattcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 8574844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 142
Target Start/End: Original strand, 15370018 - 15370128
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    |||||| |||||||| | |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15370018 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 15370116  T
Q  131 attgcaagtcaa 142  Q
    | ||||||||||    
T  15370117 aatgcaagtcaa 15370128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 142
Target Start/End: Original strand, 15371202 - 15371312
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    |||||| |||||||| | |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15371202 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 15371300  T
Q  131 attgcaagtcaa 142  Q
    | ||||||||||    
T  15371301 aatgcaagtcaa 15371312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 142
Target Start/End: Original strand, 15373483 - 15373593
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    |||||| |||||||| | |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15373483 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 15373581  T
Q  131 attgcaagtcaa 142  Q
    | ||||||||||    
T  15373582 aatgcaagtcaa 15373593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 50 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 21815731 - 21815602
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatc 149  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  21815731 cttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacgacagcaacacaa-ctgtatacaaaaacagcatgacataataatataaaatgcaagtcaacaacgtc 21815633  T
Q  150 ttaaatattcaattatacttcaagtaatgca 180  Q
    | || ||||||  |||| |||||||||||||    
T  21815632 tcaattattcacatataattcaagtaatgca 21815602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 7641344 - 7641192
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||           ||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  7641344 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaac-----------acaaaaacaacatgacataataatatcaaat 7641256  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || |||| |  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  7641255 gcaagtcaacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 7641192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 210
Target Start/End: Original strand, 15093775 - 15093950
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 134  Q
    ||||||||| |||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||  ||   |||| ||||||||||| | ||||||||||||     
T  15093775 catcatcttaatcatcttgtattgactcatgcaacttagttaaagaacaatagcagcatagaaagatcacaacaacagcatgacttcataatatcaattt 15093874  T
Q  135 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacat 210  Q
    ||  || ||||||| ||||  ||||||| |||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  15093875 catttctacaacatattaatcattcaataatatattaagtaatgcacataacattatatcacatcatattcaacat 15093950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 142
Target Start/End: Original strand, 16223532 - 16223642
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    |||||| |||||||| | |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16223532 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatct 16223630  T
Q  131 attgcaagtcaa 142  Q
    | ||||||||||    
T  16223631 aatgcaagtcaa 16223642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 169 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 17048055 - 17047929
Alignment:
Q  169 tcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatac 268  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||   || ||||||||||  |||||    
T  17048055 tcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacaggttgtaattagtctcttcattaagtcttaatac 17047956  T
Q  269 tatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    || || || ||||||||||||||||||    
T  17047955 tacccaaaggttcaactctcaacaact 17047929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 37 - 142
Target Start/End: Original strand, 20149832 - 20149936
Alignment:
Q  37 tcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 136  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  | ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20149832 tcatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttgataaaataacaacagcgacacat-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 20149930  T
Q  137 agtcaa 142  Q
    ||||||    
T  20149931 agtcaa 20149936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 33 - 197
Target Start/End: Original strand, 22353835 - 22353999
Alignment:
Q  33 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 132  Q
    |||||||| |||| || |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||  |  |  |||| |||||||||| |||||||||    
T  22353835 atcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttaggtaaataacaacagcagcataggcagattgtagcaacaacatgacataacaatatcaat 22353934  T
Q  133 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    | ||| |||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  22353935 tacaattcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22353999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 46 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 43198661 - 43198492
Alignment:
Q  46 tcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacag-catgacataataatatcaattgcaagtcaac 143  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||  |  ||||| ||||  ||||||| ||||||||| |    
T  43198661 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacaatatgcaaaacaattcatgatataaccatatcaaatgcaagtcatc 43198562  T
Q  144 aacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaa 213  Q
    || |||| |||||||||  |||| ||||||||||| | |||  | |||||||||| |||| |||||||||    
T  43198561 aatatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 43198492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 102
Target Start/End: Original strand, 15551817 - 15551889
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtat 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15551817 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 15551889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 39706409 - 39706286
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  39706409 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 39706311  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaa 154  Q
     | |||||||||  |||||| ||||    
T  39706310 gaatgcaagtcatgaacatcataaa 39706286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 80 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 43256230 - 43256106
Alignment:
Q  80 aacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattc-aattatacttcaagtaatg 178  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||  || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| || ||| ||||||||    
T  43256230 aacaacagcaacataggcagcataccaa--caacatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaatattcaaataattctt-aagtaatg 43256134  T
Q  179 cacataacactatatcacatcataatca 206  Q
    || |||| | |||||||||| |||||||    
T  43256133 catataatattatatcacattataatca 43256106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 107
Target Start/End: Original strand, 12774011 - 12774084
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 107  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  12774011 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 12774084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 179
Target Start/End: Original strand, 6190481 - 6190611
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaa-ca 147  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||| || |||  ||||| ||    
T  6190481 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatcaa-tgtaagcgaacaatca 6190579  T
Q  148 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgc 179  Q
    ||| || |||||| ||| ||||||||||||||    
T  6190580 tctcaattattcatttaaacttcaagtaatgc 6190611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 12288316 - 12288211
Alignment:
Q  46 tcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaa 142  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||    
T  12288316 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaac-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaa 12288218  T
Q  143 caacatc 149  Q
    |||||||    
T  12288217 caacatc 12288211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 146 - 260
Target Start/End: Original strand, 3096759 - 3096872
Alignment:
Q  146 catcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcacaggtcataaata 245  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| | |||| | |||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||  | |||| ||    
T  3096759 catcataaatattcaaatattcttcaagtaatgcata-aacattgtatctcatcataatcagcaacaacacatcttaaacagcttcacatattataatta 3096857  T
Q  246 acgtcatcattaagt 260  Q
    || ||||||||||||    
T  3096858 acctcatcattaagt 3096872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 16357045 - 16356924
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||   |||| |||||||| |  | |||||||||||| ||  || |||||||||| |  ||    
T  16357045 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaatt-catttccacaacatcttgatcat 16356947  T
Q  158 tcaattatacttcaagtaatgca 180  Q
    ||||| ||| |||||||||||||    
T  16356946 tcaataatatttcaagtaatgca 16356924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 107
Target Start/End: Original strand, 8846360 - 8846433
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 107  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  8846360 catcatcatcatcaacttagaccgacttattcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 8846433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 16488194 - 16488050
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 134  Q
    ||||||||| |||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||   |||||| |||||| || | ||||||||||||     
T  16488194 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaaaagcagcataacttcataatatcaatt- 16488096  T
Q  135 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgca 180  Q
    |   ||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||    
T  16488095 cttttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgca 16488050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 15121917 - 15121747
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaa-aaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| | || |||||||||  ||||| ||  | ||||  ||||| |||||||||    
T  15121917 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatatcagcataggcagattacaacaataatcatg--ataattatatcaatt 15121820  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaac 208  Q
     ||| ||| ||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||| | |||| ||||  ||||||||||||||    
T  15121819 -caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcataatcaac 15121747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 16348757 - 16348636
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||   |||| |||||||| |  | |||||||||||| ||  || |||||||||| |  ||    
T  16348757 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaatt-catttccacaacatcttgataat 16348659  T
Q  158 tcaattatacttcaagtaatgca 180  Q
    ||||| ||| || ||||||||||    
T  16348658 tcaataatattttaagtaatgca 16348636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 20157579 - 20157517
Alignment:
Q  32 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    ||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  20157579 catcatcgtcttaatcaacttatatagactcatgcaaattagttaaataacaatagcagcata 20157517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 120
Target Start/End: Original strand, 13569502 - 13569587
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 120  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||  | ||| ||||| |||||||    
T  13569502 catcatcttgatcatcttatatcaactcatgcaacatagttaaataacaataacagcataggcagattgcaacaacagtatgacat 13569587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 13813135 - 13812991
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 134  Q
    ||||||||| |||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||  ||| | ||||  |  || | ||||||||||||     
T  13813135 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattaccacaacattaaaacttcataatatcaatt- 13813037  T
Q  135 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgca 180  Q
    ||  ||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||    
T  13813036 catttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgca 13812991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 11250655 - 11250619
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11250655 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacata 11250619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 15353401 - 15353365
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15353401 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacata 15353365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 95
Target Start/End: Original strand, 23843478 - 23843538
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacatag 95  Q
    |||||| || |||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  23843478 catcattttgatcatcttatatcgactcatgcaacatagttaaataacaatagcagcatag 23843538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 15464977 - 15464903
Alignment:
Q  106 aaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgca 180  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||  |||| |||||||| ||||    
T  15464977 aaaatagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtattgca 15464903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 235
Target Start/End: Original strand, 14280462 - 14280507
Alignment:
Q  191 tatcacatcataatcaacatcaacgcatctt-aaacagcttcacag 235  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  14280462 tatgacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttcacag 14280507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 54798721 - 54798680
Alignment:
Q  195 acatcataatcaacatcaacgcatctt-aaacagcttcacag 235  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  54798721 acatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttcacag 54798680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 99
Target Start/End: Original strand, 12570014 - 12570078
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcag 99  Q
    ||||||||| |||| |||| || |||||||||| | |||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  12570014 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcatcatagttaaataacaatagcagcataagcag 12570078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 66 - 129
Target Start/End: Original strand, 16596683 - 16596746
Alignment:
Q  66 caacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  16596683 caacttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 16596746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Original strand, 25555503 - 25555539
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  25555503 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcata 25555539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 50 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 46640558 - 46640456
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 146  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||  |||||||  ||||| |||| |||||||| || || |||| |||    
T  46640558 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatagacagtata-taaaacagttcatgatataacaatatcaaatgaaaatcaataac 46640460  T
Q  147 atct 150  Q
    ||||    
T  46640459 atct 46640456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Original strand, 3470 - 3734
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3470 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataactaaagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 3569  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3570 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcaaataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 3669  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    || || | |||| |||| || ||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  3670 catagattataattaacatcctcattaagtcttaatactaccccaaagttcaattctcaacaact 3734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Original strand, 343 - 606
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  343 acatcatcatctttatcgacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaataacataggcagtatacaaaat-agcatgacgtaataatatca 441  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  442 attggaagtcaacaacatcttaaatattcgattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 541  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    || |  | |||| |||| || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  542 catatattataattaacatcctcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaact 606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 83 - 295
Target Start/End: Original strand, 13144 - 13356
Alignment:
Q  83 aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcaca 182  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13144 aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcaca 13243  T
Q  183 taacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttca 282  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | |||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13244 taacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagtttcacagattataattaacatcttcattaagtcccaatactaccccaaagttca 13343  T
Q  283 actctcaacaact 295  Q
    |||||||||||||    
T  13344 actctcaacaact 13356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 106
Target Start/End: Original strand, 34123 - 34199
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaa 106  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  34123 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa 34199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 87
Target Start/End: Original strand, 273 - 329
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacag 87  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  273 acatcattatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaacag 329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Original strand, 39913 - 40176
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  39913 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatca 40011  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    | |||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  40012 aatgcatgtcaataacatcttaaatatttgattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcataaagagctt 40111  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||| | |||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  40112 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactctcaacaact 40176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18749 - 18597
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||   |||| ||||| || || | |||||||||||| |   ||||||||||||| |  ||    
T  18749 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagaataacttcataatatcaatt-cgtttcaacaacatcttgatcat 18651  T
Q  158 tcaattatacttcaagtaatgcacataa-cactatatcacatcataatcaacat 210  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |  ||| || || ||||||| |||||||||||    
T  18650 tcaataatatttcaagtaatggaattaatcattaaatcacattataatcaacat 18597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 50 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 19987 - 19885
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 146  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  19987 cttagaccgactcatgcagcttaattaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaac 19889  T
Q  147 atct 150  Q
    ||||    
T  19888 atct 19885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 31 - 293
Target Start/End: Original strand, 25896 - 26157
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  25896 acatcattatcttcatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaat-atcatgacataataatatca 25994  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25995 aatgcaagtaaacaacatctcaaatattcaattatacttcaagtaatgcatttaacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 26094  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaa 293  Q
    ||||| | |||| |||| || |||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26095 cacagattataattaacatcctcattaagtctcaatgctaccccaaggttcaactctcaacaa 26157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 31 - 293
Target Start/End: Original strand, 39858 - 40118
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  39858 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgaagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaat-atcatgacataataatatca 39956  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39957 aatgcaagtaaacaacatctcaaatattcaattatacttcaagtaatgcatttaacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 40056  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaa 293  Q
    ||||  | |||| |||| || |||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  40057 cacaaattataattaacatcctcattaagtctcaatgcta-cccaaggttcaactctcaacaa 40118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 31 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 6245 - 5985
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaaca---taggcagtatacaaaaacagcatgacataataata 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||   |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6245 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaacataggtagtatacaaaaacagcatgacatgataata 6146  T
Q  128 tcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacag 227  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6145 tcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacag 6046  T
Q  228 cttcacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctc 288  Q
    |||||||  | |||| |||| |||||||||||||  ||| ||||||||| |||| ||||||    
T  6045 cttcacattttataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcccaaggttccactctc 5985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 33 - 295
Target Start/End: Original strand, 39479 - 39740
Alignment:
Q  33 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 132  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  39479 atcatcgtcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaa 39577  T
Q  133 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttca 232  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39578 tgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 39677  T
Q  233 caggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
     || | |||| |||| |||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||| || |||||||    
T  39678 tagattataattaacatcattattaagtctcaatactaccccaaggttcaacccttaacaact 39740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 33 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 75333 - 75072
Alignment:
Q  33 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 132  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  75333 atcatcgtcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaa 75235  T
Q  133 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttca 232  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  75234 tgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 75135  T
Q  233 caggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
     || | |||| |||| |||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||| || |||||||    
T  75134 tagattataattaacatcattattaagtctcaatactaccccaaggttcaacccttaacaact 75072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 161; Significance: 7e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 49 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 24406 - 24158
Alignment:
Q  49 acttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-acagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 147  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  24406 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaaca 24307  T
Q  148 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataa-tcaacatcaacgcatcttaaacagcttcacaggtcataaataa 246  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||    
T  24306 tcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataattcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaa 24207  T
Q  247 cgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    | || ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24206 catcctcaataagtcttaatactatcccaaagttcaactctcgacaact 24158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Original strand, 8479 - 8739
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8479 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcaacataggtagtatacaaaaacagtatgacataataatatca 8578  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  8579 attgcaagtcaacaacatcttaaacattcaagtgtacttcaagtaatgcacataacatta----acatcataatcaacatcaacacatcctaaacagctt 8674  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||| |  ||| |||| |||||||||||||  |||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  8675 cacagattgtaattaacatcatcattaagtcttaatactactccaaggttcaactctcaacaact 8739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Original strand, 4508 - 4771
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4508 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgcg-cttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatca 4606  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4607 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 4706  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||| | |||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  4707 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactcttaacaact 4771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Original strand, 12090 - 12353
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12090 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgcg-cttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatca 12188  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12189 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 12288  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||| | |||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  12289 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactcttaacaact 12353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Original strand, 22042 - 22305
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22042 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgcg-cttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatca 22140  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22141 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 22240  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||| | |||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  22241 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactcttaacaact 22305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 3)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 32 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 17337 - 17072
Alignment:
Q  32 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaa--cagcatgacataataatatc 129  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  17337 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaaacagcatgacataataatatc 17238  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagct 229  Q
    || |||||||||||||||||| || ||| || | ||| ||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  17237 aaatgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacgtcttaaacagct 17138  T
Q  230 tcacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    | |||| | |||| |||| |||| |||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  17137 ttacagattataattaacatcatgattaagtctcaatactaccccaaggtttaactctcaacaact 17072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 50 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 79430 - 79248
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatc 149  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||    
T  79430 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-gacagtatataaaaacagcatgacataataatttcaaatgcaagtcaacaacgtc 79332  T
Q  150 ttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaa-cagcttcac 233  Q
    | || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||||||||    
T  79331 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaagtatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttcac 79248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 14203 - 14139
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcag 99  Q
    ||||||||| |||| |||| || |||||||||| | |||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  14203 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcatcatagttaaataacaatagcagcataagcag 14139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 146; Significance: 6e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 38 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 26179 - 25930
Alignment:
Q  38 catcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 137  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  26179 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaa 26080  T
Q  138 gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcacaggt 237  Q
     |||||||| ||| || ||| || | ||| ||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  26079 ttcaacaacgtctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcatagat 25980  T
Q  238 cataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactct 287  Q
     |||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||    
T  25979 tataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcagctct 25930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 34 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 44825 - 44682
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44825 tcatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 44726  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaat 177  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||    
T  44725 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 44682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 168 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 33479 - 33352
Alignment:
Q  168 ttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaata 267  Q
    ||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  33479 ttcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcataggttataattaacatcatcattaagtctcaata 33380  T
Q  268 ctatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  33379 ctaccccaaggttcaactcttaacaact 33352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 145; Significance: 2e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 16721 - 16457
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16721 acatcatcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacgaaaacagcatgacataataatatca 16622  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    | || ||||||||| ||||| || ||| || | ||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16621 aatggaagtcaacagcatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcaaaatcaacatcaacacatcttaaacagctt 16522  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    |||||   |||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||  |||||||    
T  16521 cacagactataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactcctaacaact 16457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 139; Significance: 9e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 31 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 1169 - 908
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1169 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatca 1070  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||    
T  1069 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaaccaaaacacatcttaaacagctt 971  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaa 293  Q
    || || | |||| |||| || ||||||||||  ||| ||| || || ||||||||||| ||||    
T  970 caaagattataattaacctcttcattaagtcttaatgctacccaaaggttcaactctcgacaa 908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 32 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3306 - 3103
Alignment:
Q  32 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 131  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3306 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaa 3207  T
Q  132 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttc 231  Q
     || || |||||||||||| || ||| || | ||| ||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3206 atgtaattcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 3107  T
Q  232 acag 235  Q
    ||||    
T  3106 acag 3103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 4)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 34 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 340065 - 339818
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |    
T  340065 tcatcatcttcgtcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-caacaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaat 339968  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcac 233  Q
     |||||||||||||||| || ||| || | ||| |||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  339967 -caagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgtgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 339869  T
Q  234 aggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaac 284  Q
    || | |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  339868 agattataattaacgtcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaac 339818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 158612 - 158450
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  158612 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 158514  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  158513 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 158450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 80 - 206
Target Start/End: Original strand, 71350 - 71474
Alignment:
Q  80 aacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattc-aattatacttcaagtaatg 178  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| | ||||| ||| || ||| | ||||||    
T  71350 aacaacagcaacataggcagcatacaaa--cagcatgacataatattatcaatttcaattcaacaacatcttgagtattcaaataattctt-aggtaatg 71446  T
Q  179 cacataacactatatcacatcataatca 206  Q
    || | |||| |||||||||| |||||||    
T  71447 cataaaacattatatcacattataatca 71474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 414140 - 414108
Alignment:
Q  62 catgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  414140 catgcaacttagttaaataacaacagcagcata 414108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 31 - 235
Target Start/End: Original strand, 4849 - 5053
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4849 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagattagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatca 4948  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||    |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  4949 aatgcaattcaacaacatcttaagtattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagctt 5048  T
Q  231 cacag 235  Q
    |||||    
T  5049 cacag 5053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 31 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 33077 - 32818
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33077 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaacagcaacacaggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatca 32979  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatc-ttaaacagct 229  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||  ||||| | ||| ||||    
T  32978 attgcaattcaacaacatcttaaatattc-attatacttcgagtaatgcatataacattataacacatcatgatcaacatca--gcatcataaaatagct 32882  T
Q  230 tcacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaa 293  Q
    |||||| | |||| ||||  | ||| |||||  |||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  32881 tcacagattataactaacaccttcaataagtttcaatactaccccaaggttcaactcttaacaa 32818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 31 - 293
Target Start/End: Original strand, 45928 - 46187
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45928 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaacagcaacacaggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatca 46026  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatc-ttaaacagct 229  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||  ||||| | ||| ||||    
T  46027 attgcaattcaacaacatcttaaatattc-attatacttcgagtaatgcatataacattataacacatcatgatcaacatca--gcatcataaaatagct 46123  T
Q  230 tcacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaa 293  Q
    |||||| | |||| ||||  | ||| |||||  |||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  46124 tcacagattataactaacaccttcaataagtttcaatactaccccaaggttcaactcttaacaa 46187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 235
Target Start/End: Original strand, 16113 - 16316
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  16113 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcaagatatcataatatca 16212  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatctt-aaacagct 229  Q
    | |||||| ||||| ||||| || ||| || | |||  |||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||  |||||| ||||||||    
T  16213 aatgcaagccaacatcatctcaagtatacattcataactcaagtaatgcatataacattatatcacgtcatgatcaacatcaa--catcttaaaacagct 16310  T
Q  230 tcacag 235  Q
    ||||||    
T  16311 tcacag 16316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 17450 - 17389
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaaca 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  17450 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaaca 17389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 31 - 287
Target Start/End: Original strand, 20910 - 21167
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    |||||| |||||||| | ||||||| ||||||||  | ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  20910 acatcaacatcttcaacgacttagaccgactcataaagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcaaaaacaacatgacataataatatc 21009  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagct 229  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| | | || ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  21010 aattgcaattcaacaacatcttatatattcaaatgttctacaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcagcatcaacacatcttaaacagct 21109  T
Q  230 tcacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactct 287  Q
    |||||||| |||| |||| || ||||||||||  ||||||| || || ||||||||||    
T  21110 tcacaggttataattaacatcttcattaagtcttaatactacccaaaggttcaactct 21167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Original strand, 1952 - 2216
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  1952 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaacagcgacataggcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatca 2051  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||| ||||  ||| || |||||||    
T  2052 attgcaattcaacaacatcttaaatattcaaacattattcaagtaatgcataaaacattatatctcatcataatcaacaacaacatatcatatacagctt 2151  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
     |||  | || |||||| | |||||||||||  ||| ||| || || ||||||||||| ||||||    
T  2152 tacatattattaataaccttatcattaagtcttaatcctacccaaaggttcaactctcgacaact 2216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 112 - 295
Target Start/End: Original strand, 27911 - 28094
Alignment:
Q  112 gcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatc 211  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27911 gcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatc 28010  T
Q  212 aacgcatcttaaacagcttcacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    |||  |||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  28011 aacaaatcttaaacaacttcacaggttataattaacatcatcattaagtctcaatactaccccaaggttcaactcttaacaact 28094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Original strand, 32067 - 32328
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  32067 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac--aaacaacatgacataataatatca 32164  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| | ||  |||||| |||||||    
T  32165 atttcaattcatcaacatcttaggtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacgacatatcttatacagctt 32263  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||| | |||| |||| ||||  |||||||  ||| ||| || |  ||||||||||| ||||||    
T  32264 cacagattataattaacctcattgttaagtcttaatcctacccaagggttcaactctcgacaact 32328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 90 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 1021 - 823
Alignment:
Q  90 acataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacact 189  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  1021 acataggcagtatacaa---cagcatggcataataatatcaat-gcaagtcaacaaaatctcaaatattcaatcataattcaagtaatgcacataacatt 926  T
Q  190 atatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctca 289  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| | ||| ||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||    
T  925 atatcacatcgtaatcgacatcaacacatcttaaacagcttcacatatcataaatagcatcaccattaagtctcaatactacctcaaggttcaactctca 826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 4954 - 4888
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4954 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggc 4888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 31 - 161
Target Start/End: Original strand, 28414 - 28544
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28414 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 28513  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaa 161  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  28514 attgcaattcaacaacatcttatatattcaa 28544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 146
Target Start/End: Original strand, 11292 - 11407
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  11292 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 11390  T
Q  130 aattgcaagtcaacaac 146  Q
     | || || ||||||||    
T  11391 gaatgtaaatcaacaac 11407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 146
Target Start/End: Original strand, 1997 - 2112
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  1997 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacacaaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 2095  T
Q  130 aattgcaagtcaacaac 146  Q
     | || || ||||||||    
T  2096 gaatgtaaatcaacaac 2112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 31 - 84
Target Start/End: Original strand, 4552 - 4605
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa 84  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4552 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 4605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 31 - 235
Target Start/End: Original strand, 4712 - 4915
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||    
T  4712 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataaatacatca 4811  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||  ||| ||| ||| |||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||| |||    
T  4812 attgcaattcatcaaaatcttatgtatacaaatattcttcaagtaaggcata-aacattatatcacatcataatcaacaacaacatatcttatacaactt 4910  T
Q  231 cacag 235  Q
    |||||    
T  4911 cacag 4915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 96 - 235
Target Start/End: Original strand, 1 - 139
Alignment:
Q  96 gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatca 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||| ||| ||||||  ||| ||| ||| |||||||||| ||| | |||| |||||||    
T  1 gcagtatacaaaaacagcatgacataaatacatcaattgcaattcatcaaaatcttatgtatacaaatattcttcaagtaaggcata-aacattatatca 99  T
Q  196 catcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcacag 235  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||| ||| ||||||||    
T  100 catcataatcaacaacaacatatcttatacaacttcacag 139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Original strand, 13497 - 13759
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  13497 acatcatcaacttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacatgataatatca 13595  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    ||| | | ||| ||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| | ||  |||||| |||||||    
T  13596 atttcgattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacgacatatcttatacagctt 13694  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||| | |||| |||| ||||  |||||||  ||| ||| |  || ||||||||||| ||||||    
T  13695 cacagattataattaacctcattgttaagtcttaatcctaccgaaaggttcaactctcgacaact 13759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 10544 - 10283
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  10544 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcatagttaattaacaaacagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacataataatatc 10448  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagct 229  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||| | | || |||||||||||||||||| || | ||  |||||| ||||||    
T  10447 aatttcaattcaacaacatcttaagtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacgacatatcttatacagct 10349  T
Q  230 tcacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    |||||| | |||| |||| | || ||||||||  ||| ||| || |  ||||||||||| ||||||    
T  10348 tcacagattataattaaccttattattaagtcttaattctacccaagggttcaactctcgacaact 10283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 198
Target Start/End: Original strand, 128751 - 128917
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |   |  | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  128751 acatcatcatcttaatcaaattagaccaactcatgcaacttagttaaataacaaaagcaacaaaaaaaaaaaa-aaaaacagcatgacataataatatca 128849  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacat 198  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  128850 aatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgtacataacattatatcacat 128917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 50 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20524 - 20337
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatc 149  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  20524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacat-cagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 20427  T
Q  150 ttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaa-cagcttcacaggtcat 240  Q
    | || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||  ||||  ||||||||  |||| |||| ||||||||||| ||||    
T  20426 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa--aacatcaaatcatcataaatcagcttcacagatcat 20337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 65891 - 65830
Alignment:
Q  59 actcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 120  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  65891 actcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacat 65830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 15584 - 15356
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  15584 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaagagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatca 15486  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 230  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||  |||  || ||| |||||||||||||| | || | |||||||||||||||||| || ||||  |||||| |||||||    
T  15485 atttcaattcatcaacatcttatgtataaaaatattcttcaagtaatgcata-aatattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagctt 15387  T
Q  231 cacaggtcataaataacgtcatcattaagtc 261  Q
    ||||| | |||| |||| | || ||||||||    
T  15386 cacagattataattaaccttattattaagtc 15356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 99
Target Start/End: Original strand, 7295 - 7359
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcag 99  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  7295 catcatcttaatcatcttaaatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaacataggcag 7359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 121 - 295
Target Start/End: Original strand, 124675 - 124849
Alignment:
Q  121 aataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatct 220  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  124675 aataatatcaattgcaattcatcaacgttttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatct 124774  T
Q  221 taaacagcttcacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||||||||||||| | |||| |||| || ||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  124775 taaacagcttcacagattataattaacatcctcattaagtcttaatgctatcccaaggttcaactctcgacaact 124849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 32 - 209
Target Start/End: Original strand, 174767 - 174943
Alignment:
Q  32 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    |||||||| ||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| || ||||||    
T  174767 catcatcaacttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatac---aacagcatgacatgattatatca 174863  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgc-acataacactatatcacatcataatcaaca 209  Q
    | | ||| |||||||||||| ||  ||||| | ||| |||||||||||| ||  |||| |||||||| ||||| ||||||    
T  174864 aattcaattcaacaacatctcaatcattcattcataattcaagtaatgcaactaaacattatatcacgtcatattcaaca 174943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 100
Target Start/End: Original strand, 121766 - 121835
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  121766 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagt 121835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 136471 - 136370
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 146  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||| || |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  136471 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacac-aaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 136373  T
Q  147 atc 149  Q
    |||    
T  136372 atc 136370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 145179 - 145078
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 146  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||| || |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  145179 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacac-aaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 145081  T
Q  147 atc 149  Q
    |||    
T  145080 atc 145078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 52 - 295
Target Start/End: Original strand, 4545 - 4787
Alignment:
Q  52 tagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatctt 151  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| | ||||| || || |||||||||| |  || |||||||||||||    
T  4545 tagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacagcataggcagtatgcaacagcagcaagatatcataatatcaaatataattcaacaacatctt 4644  T
Q  152 aaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatctt-aaacagcttcacaggtcataaataacgtc 250  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||| |||||  | |||| |||| ||    
T  4645 aaatattcatttatacttcaagtaatgcataatacattatatcacatcatgatcaacatcaa--catcttaaaacagcctcacaaattataattaacatc 4742  T
Q  251 atcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
     ||| |||||| |||||||| | ||| |||||||||| |||||||    
T  4743 ttcaataagtctcaatactacctcaaggttcaactcttaacaact 4787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 94 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 3588 - 3424
Alignment:
Q  94 aggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatat 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| || | ||| ||||||||||||  |||||| |||||    
T  3588 aggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacactcataattcaagtaatgcgtataacattatat 3489  T
Q  194 cacatcataatcaacatcaacgcatctt-aaacagcttcacaggtcataaataacgtcatcatta 257  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || | |||| |||| |||||||||    
T  3488 cacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttcatagattataattaacatcatcatta 3424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 94
Target Start/End: Original strand, 289 - 348
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    ||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  289 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaaaagcagcata 348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 20747 - 20909
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20747 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20845  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  20846 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 37821 - 37983
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37821 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 37919  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  37920 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 37983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 9)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 94411 - 94573
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  94411 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 94509  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  94510 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 94573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 17598 - 17440
Alignment:
Q  38 catcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 137  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17598 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 17500  T
Q  138 gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  17499 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 17440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 180
Target Start/End: Original strand, 44454 - 44600
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-acagcatgacataataatatcaat 132  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  44454 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaaacagcatgacataataatatcaaa 44552  T
Q  133 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgca 180  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||  |||| |||||||||||||    
T  44553 tgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgca 44600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 38596 - 38421
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 134  Q
    ||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||   |||| |||| |||||| |  |||||||||||     
T  38596 catcatcttaatcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcatagacagatcacaacaacaacatgacttcttaatatcaattt 38497  T
Q  135 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacat 210  Q
    ||  |||||||||||||||  ||||||| |||  | ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  38496 catttcaacaacatcttaatcattcaataatatcttaagtaatgcacataacgttatatcacatcatattcaacat 38421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 158
Target Start/End: Original strand, 100378 - 100501
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| | |    
T  100378 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataataatatcgaat 100476  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatatt 158  Q
    |||| |||||||||||| |||||||    
T  100477 gcaaatcaacaacatctcaaatatt 100501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 102
Target Start/End: Original strand, 119875 - 119947
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtat 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  119875 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 119947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 40291 - 40169
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||  | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  40291 catcatcatcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagtaggc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 40193  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatat 157  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  40192 gcaaatcaacaacatctcaaatat 40169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 23695 - 23608
Alignment:
Q  123 taatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacat 210  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||  ||||||| |||  | ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  23695 taatatcaatttcatttcaacaacatcttaatcattcaataatatcttaagtaatgcacataacgttatatcacatcatattcaacat 23608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #9
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 107
Target Start/End: Original strand, 101503 - 101576
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 107  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  101503 catcatcatcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 101576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 180
Target Start/End: Original strand, 13392 - 13537
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13392 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 13490  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgca 180  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||    
T  13491 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgca 13537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 32 - 197
Target Start/End: Original strand, 11286 - 11450
Alignment:
Q  32 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 131  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11286 catcaacatcttaatcaaattagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 11384  T
Q  132 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
     |||||||||||||| ||| || ||||||  |||  ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  11385 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 11450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 208
Target Start/End: Original strand, 12763 - 12933
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaac-agcatgacataataatatcaatt 133  Q
    ||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||   |||| ||| | ||||  ||||| ||| |||||    
T  12763 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttcaataacaataacagcataggcagatcacaacaacaatcatg--ataattataccaatt 12860  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaac 208  Q
     ||| ||| ||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||| | |||| ||||  ||||||||||||||    
T  12861 -caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcataatcaac 12933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 4694 - 4856
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  4694 tcatcatcctaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 4792  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  4793 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 4856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 13947 - 14109
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13947 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagataaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14045  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  14046 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 14109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 136680 - 136842
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  136680 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 136778  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  136779 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 136842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 139149 - 139311
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  139149 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 139247  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  139248 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 139311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 144087 - 144249
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  144087 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 144185  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  144186 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 144249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 134211 - 134373
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  134211 tcatcatcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 134309  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  134310 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 134373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 141618 - 141780
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  141618 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 141716  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  141717 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 141780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 157
Target Start/End: Original strand, 62200 - 62321
Alignment:
Q  33 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 131  Q
    ||||||||| || || ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||| |    
T  62200 atcatcatcatcttcgacttaaaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtat-gaaaaacatcatggtataataatatcga 62298  T
Q  132 ttgcaagtcaacaacatcttaaatat 157  Q
     ||||   ||||||||||| ||||||    
T  62299 atgca---caacaacatctcaaatat 62321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 117
Target Start/End: Original strand, 132662 - 132745
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatga 117  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| || |||||    
T  132662 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacagcaacataagtagtatgcaaaatcatcatga 132745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 33 - 197
Target Start/End: Original strand, 10772 - 10935
Alignment:
Q  33 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 132  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  10772 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaa 10870  T
Q  133 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| || |||||||||| |||  | |||||||||    
T  10871 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataatttaagtaatgcatatataattatatcaca 10935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 16784 - 16946
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  16784 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagt-agtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 16882  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || |||| |  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  16883 gcaagtcaacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 16946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 82072 - 82234
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  82072 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaacagcaacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 82170  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    |||| |||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  82171 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 82234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 22776 - 22665
Alignment:
Q  46 tcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 144  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| ||    
T  22776 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcgacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 22678  T
Q  145 acatcttaaatat 157  Q
    |||||| ||||||    
T  22677 acatctcaaatat 22665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Original strand, 501088 - 501246
Alignment:
Q  38 catcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 137  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  501088 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-caatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 501186  T
Q  138 gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  501187 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 501246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 34 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 85742 - 85536
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  85742 tcatcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 85644  T
Q  134 gcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaa-cagcttc 231  Q
    ||||||||| |||| ||| || ||||||   ||| ||||| ||||||| |||  | |||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||||||    
T  85643 gcaagtcaatcaacgtctgaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttc 85545  T
Q  232 acaggtcat 240  Q
    |||| ||||    
T  85544 acagatcat 85536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 35 - 157
Target Start/End: Original strand, 160688 - 160809
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||||| |    
T  160688 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaat 160786  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatat 157  Q
    |||| |||||||||| | ||||||    
T  160787 gcaa-tcaacaacatgtcaaatat 160809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 422625 - 422589
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  422625 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcata 422589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 90 - 295
Target Start/End: Original strand, 6669 - 6874
Alignment:
Q  90 acataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacact 189  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| | |||  |    
T  6669 acataggcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatcaatagcaattcaacaacatcttaaatattcaaacattattcaagtaatgcataaaacgtt 6768  T
Q  190 atatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctca 289  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||| || ||||||| |||| | ||||||||| | |||||||| ||  ||| ||| || || |||||||||||     
T  6769 atatcacatcataatcaacaacaacatatcatatacagctttacagattataaataaccttatcattaaatcttaatcctacccaaaggttcaactctcg 6868  T
Q  290 acaact 295  Q
    ||||||    
T  6869 acaact 6874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 37 - 197
Target Start/End: Original strand, 4300 - 4459
Alignment:
Q  37 tcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4300 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagt-agtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgca 4398  T
Q  137 agtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    | |||||||| ||| || || |||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  4399 aatcaacaacgtctcaattaatcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 4459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 6425 - 6281
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 134  Q
    ||||||||| |||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||   |||| |||| ||| || | ||||||||||||     
T  6425 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacatcataacttcataatatcaatt- 6327  T
Q  135 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgca 180  Q
    ||  |||||||| |||| |  ||||||| ||| |||||||||||||    
T  6326 catttcaacaacttcttgatcattcaataatatttcaagtaatgca 6281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 40400 - 40562
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  40400 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaggatgacataataatatcaaat 40498  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  || | ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  40499 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacataaaattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 40562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 12413 - 12249
Alignment:
Q  32 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 131  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12413 catcaacatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagaatacaaaaacagcatgacaaaataatatcaa 12315  T
Q  132 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
     |||||||||||||| ||| || ||||||  | || ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  12314 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatttaattcaagtaatgcatatataattatatcaca 12249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 261
Target Start/End: Original strand, 16282 - 16509
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||    
T  16282 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataagaaacagcaacataggcagtatac---aacagcatgacataattatatc 16378  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagct 229  Q
    || | ||| ||| |||||| |||  ||| |||  || |||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| ||||  ||||||  |||||    
T  16379 aaattcaattcatcaacatattatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcataatcaacaacaacatatcttattcagct 16477  T
Q  230 tcacaggtcataaataacgtcatcattaagtc 261  Q
    |||||| | |||  |||| |||| ||||||||    
T  16478 tcacagattatagttaacctcattattaagtc 16509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 4214 - 4377
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  4214 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacgacagcgacaca-gcagtatacaaaaccagcatgacataataatatcaaat 4312  T
Q  134 gcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||| |||| ||| || ||||||  |||| ||||| ||||||| |||  | |||||||||    
T  4313 gcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 4377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 33 - 197
Target Start/End: Original strand, 9241 - 9404
Alignment:
Q  33 atcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 132  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||     
T  9241 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatataaaaacatcatgacataataatatcaaa 9339  T
Q  133 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| || |||||||||| |||  | |||||||||    
T  9340 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataatttaagtaatgcatatataattatatcaca 9404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 106 - 268
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  106 tcatcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 204  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    |||| |||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  205 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1170 - 969
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||   || ||||||||||| |||||    
T  1170 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaataaacatcaacataggcagtatacaa---catcatgacataattatatc 1074  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagct 229  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||| ||||  || ||| ||||||    
T  1073 aatttcaattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcataatcaacaacaacatattttatacagct 975  T
Q  230 tcacag 235  Q
    ||||||    
T  974 tcacag 969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 235
Target Start/End: Original strand, 46995 - 47196
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||||||    
T  46995 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtttacag---cagcatgacataataatatc 47091  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagct 229  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||  ||| ||| ||| || ||||||||||| | |||| ||||||||||||||| || || ||||  |||||| ||||||    
T  47092 aatttcaattcatcaacatcttatgtatacaaatattctccaagtaatgcata-aacattatatcacatcataaacatcaacaacatatcttatacagct 47190  T
Q  230 tcacag 235  Q
    ||||||    
T  47191 tcacag 47196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 34 - 177
Target Start/End: Original strand, 116430 - 116571
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  116430 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaa-cagcatgacataatcatatcaaat 116527  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaat 177  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||    
T  116528 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 116571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 129072 - 128971
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaa-acagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 147  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||| |   ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  129072 cttagaccgactcatgcagcttagttaa-taacaaacagcaacataggcagtacataaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 128974  T
Q  148 tct 150  Q
    |||    
T  128973 tct 128971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 73883 - 73824
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    ||||||||| |||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  73883 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcata 73824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 150
Target Start/End: Original strand, 78348 - 78442
Alignment:
Q  57 cgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatct 150  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||  |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  78348 cgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcata-taaaacagttcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaacatct 78442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 11564 - 11442
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 130  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11564 acatcttcatcttcaacaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggtagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 11465  T
Q  131 attgcaagtcaacaacatcttaa 153  Q
    ||| ||| ||| |||||| ||||    
T  11464 atttcaattcatcaacatgttaa 11442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 46 - 213
Target Start/End: Original strand, 8481 - 8650
Alignment:
Q  46 tcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 144  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||    
T  8481 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatca 8579  T
Q  145 acatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacat--aacactatatcacatcataatcaacatcaa 213  Q
    |||||| |||||||||  |||| ||||||||||| | ||  || | |||||||||| |||| |||||||||    
T  8580 acatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaa 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 157
Target Start/End: Original strand, 6535 - 6661
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  6535 acatcatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 6633  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaatat 157  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  6634 gaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 6661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 196
Target Start/End: Original strand, 29558 - 29720
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 134  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||| || | |||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  29558 catcatcttaatcaacttagactgactcatgtgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaataatagcatgacataataatatcaattg 29657  T
Q  135 caa-gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcac 196  Q
    |||  ||||||| |  ||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  29658 caatttcaacaagactttaaatattcaataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcac 29720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 48 - 177
Target Start/End: Original strand, 29946 - 30074
Alignment:
Q  48 aacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 147  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||     
T  29946 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgtaagtcaacaacg 30044  T
Q  148 tcttaaatattcaattatacttcaagtaat 177  Q
    ||| || ||||||  |||| ||||| ||||    
T  30045 tctcaattattcacatataattcaaataat 30074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 12064 - 12220
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||      |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  12064 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaa------cagcaacacag-cagtatactaaaacagcatgacataataatatcaaat 12156  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  12157 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 12220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 232
Target Start/End: Original strand, 1289 - 1487
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||   |||| ||||||||||| |||||    
T  1289 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtac---aacatcatgacataattatatc 1385  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagct 229  Q
    || | ||| ||| ||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||| | |||| |||| ||| |||||||||||| ||||  ||||||  |||||    
T  1386 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaacaacaacatatcttattcagct 1484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 232
Target Start/End: Original strand, 7266 - 7464
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||   |||| ||||| ||||| |||||    
T  7266 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac---aacaacatgaaataattatatc 7362  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagct 229  Q
    || | ||| ||| ||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||| | |||| |||| ||| |||||||||||| ||||  ||||||  |||||    
T  7363 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaacaacaacatatcttattcagct 7461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 15356 - 15291
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcag 99  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15356 tcatcatcttaatcaacgtagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcag 15291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 50 - 240
Target Start/End: Original strand, 13147 - 13339
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 148  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||  ||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  13147 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacat 13245  T
Q  149 cttaaa-tattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatctta-aacagcttcacaggtcat 240  Q
    || |||  |||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||| |||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  13246 ctgaaaccattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaatcatcttataacagcttcacagatcat 13339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 46 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16206 - 16011
Alignment:
Q  46 tcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 144  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||| || ||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| || || ||||||    
T  16206 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgtaaatcaaca 16108  T
Q  145 acatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatctta-aacagcttcacaggtcat 240  Q
    |||||| ||| ||||   |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||| |||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  16107 acatctcaaacattcttatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaatcatcttataacagcttcacagatcat 16011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 46 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 27855 - 27660
Alignment:
Q  46 tcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 144  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||| || ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || || ||||||    
T  27855 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgtaaatcaaca 27757  T
Q  145 acatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatctta-aacagcttcacaggtcat 240  Q
    |||||| ||| |||||  |||| ||| ||||||||| |||  | |||||||||| |||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  27756 acatctcaaacattcacatataattctagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaatcatcttataacagcttcacagatcat 27660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 190 - 295
Target Start/End: Original strand, 3640 - 3745
Alignment:
Q  190 atatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctca 289  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| || | || ||||||||||  ||||||| || || ||||||||||||    
T  3640 atatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattagcctcttcattaagtcttaatactacccaaaggttcaactctca 3739  T
Q  290 acaact 295  Q
    ||||||    
T  3740 acaact 3745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 190 - 295
Target Start/End: Original strand, 7704 - 7809
Alignment:
Q  190 atatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctca 289  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||| || | || ||||||||||  ||||||| || || ||||||||||||    
T  7704 atatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattagcctcttcattaagtcttaatactacccaaaggttcaactctca 7803  T
Q  290 acaact 295  Q
    ||||||    
T  7804 acaact 7809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 161252 - 161089
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  161252 tcatcatcttaaccaacttagaccgactcatgcagcttagttaaatatcaacagcgacacag-cagtatacaaaaacataatgacataataatatcaaat 161154  T
Q  134 gcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcaca 197  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||   ||| ||||| ||||||| |||  | |||||||||    
T  161153 gcaagtcaatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 161089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 164674 - 164547
Alignment:
Q  114 atgacataataatatcaattgcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatca 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||   ||| ||||| ||||||| |||  | |||||||||  |||| ||||||||    
T  164674 atgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatca 164576  T
Q  213 acgcatcttaaa-cagcttcacaggtcat 240  Q
    |  |||| |||| ||||||||||| ||||    
T  164575 aatcatcataaatcagcttcacagatcat 164547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 213
Target Start/End: Original strand, 11464 - 11646
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    |||||| |||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  11464 acatcaacatcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 11562  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaa 213  Q
        | |||| |||||||||| ||||| |||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||| |||| |||||||||    
T  11563 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 11646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18148 - 17938
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    |||||| |||||||| | |||||||  |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||| || || || ||||| |||||||||||    
T  18148 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcattatgcacaa-catcatgatataataatatc 18050  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaa-cagc 228  Q
     |  |||||| |||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||| |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
T  18049 gaacgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagc 17950  T
Q  229 ttcacaggtcat 240  Q
    ||||||| ||||    
T  17949 ttcacagatcat 17938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 34 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 2291 - 2184
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  2291 tcatcattttaatcaacttagaccgactcttgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 2193  T
Q  134 gcaagtcaa 142  Q
    |||||||||    
T  2192 gcaagtcaa 2184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 38377 - 38195
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    |||||| |||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  38377 acatcaacatcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 38279  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaa 213  Q
        | |||| |||||||||| ||||| |||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||| |||| |||||||||    
T  38278 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 38195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 94
Target Start/End: Original strand, 42627 - 42686
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    ||||||||| |||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  42627 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcata 42686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 35 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 4921 - 4746
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 134  Q
    ||||||||| |||| |||| || |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||   |||| |||||| |||| | ||||||||||||     
T  4921 catcatcttaatcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataataatagcagcataggcagatcacaacaacagcttgacttcataatatcaattt 4822  T
Q  135 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacat 210  Q
    ||  |||||||||||||||  ||||||| |||  | |||||||  |||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  4821 catttcaacaacatcttaatcattcaataatatcttaagtaatatacataacgttatatcacatcatattcaacat 4746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 235
Target Start/End: Original strand, 51582 - 51783
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    |||||||||| |||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| ||| |    
T  51582 acatcatcattttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatac---aacatcatgacataattataac 51678  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagct 229  Q
    || | ||| ||| ||||||||||  ||| ||| ||| ||||||| |||||| | |||| |||| ||| ||||| |||||| ||||  ||||||  |||||    
T  51679 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaatatccttcaagaaatgcata-aacattataacacttcatattcaacaacaacatatcttattcagct 51777  T
Q  230 tcacag 235  Q
    ||||||    
T  51778 tcacag 51783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 169 - 295
Target Start/End: Original strand, 1052 - 1178
Alignment:
Q  169 tcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatac 268  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| | |||| || | || ||||||||||  |||||    
T  1052 tcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacatcttcacagattataattagcctcttcattaagtcttaatac 1151  T
Q  269 tatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    || || |||||||||||||||||||||    
T  1152 tacccaaaagttcaactctcaacaact 1178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 1440 - 1336
Alignment:
Q  37 tcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 136  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||  |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1440 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaacaataacacatg-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 1342  T
Q  137 agtcaa 142  Q
    ||||||    
T  1341 agtcaa 1336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 9080 - 8995
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 120  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||  ||||| ||||  |||||||    
T  9080 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataataatagcagcataggcagattacaacaacattatgacat 8995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 58 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 16442 - 16291
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtat-acaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaata 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||| |||| |||||| | ||||||||||||  |  |||||||||||||||  |    
T  16442 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggca-tatcacaacaacatcatgacttcataatatcaatta-atttcaacaacatcttaatca 16345  T
Q  157 ttcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacat 210  Q
    |||||| |||  | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  16344 ttcaataatatcttaagtaatgcacataacattatatcacatcatattcaacat 16291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 191 - 295
Target Start/End: Original strand, 10323 - 10427
Alignment:
Q  191 tatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaa 290  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | || | |||| |||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||    
T  10323 tatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattattattaacatcattattaagtctcaatactaccccaaggttcaactcttaa 10422  T
Q  291 caact 295  Q
    |||||    
T  10423 caact 10427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 34 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 38820 - 38641
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 132  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||     
T  38820 tcatcatcttaatcaacttagacctactcatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaa 38722  T
Q  133 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaa 213  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||| |  |||| |||||||| |||  |||  | |||||||||  |||| |||||||||    
T  38721 tgcaagtcatcaatatctcaaatatttatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 38641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 35 - 157
Target Start/End: Original strand, 19268 - 19390
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  19268 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 19366  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatat 157  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  19367 gcaaatcaacaacatctcaaatat 19390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 58 - 200
Target Start/End: Original strand, 29117 - 29262
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa-gtcaacaacatcttaa--a 154  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || | |||||| ||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||  |    
T  29117 gactcatgcatcttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattgcaattttaacaacaccttaaata 29216  T
Q  155 tattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatca 200  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  29217 tattcaataaaacttcaagtaatacacacaacattatatcacatca 29262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 53640 - 53488
Alignment:
Q  61 tcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattc 159  Q
    ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  53640 tcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaaatattc 53542  T
Q  160 aattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaa 213  Q
    |  |||| ||||||||||| | |||  | |||||||||| |||| |||||||||    
T  53541 atatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 53488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 80 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 15486 - 15362
Alignment:
Q  80 aacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattc-aattatacttcaagtaatg 178  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| || ||| ||||||||    
T  15486 aacaacatcaacataggcagcatacaaa--cagcatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaatattcaaataattctt-aagtaatg 15390  T
Q  179 cacataacactatatcacatcataatca 206  Q
    || | |||| |||||||||| |||||||    
T  15389 cataaaacattatatcacattataatca 15362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 35 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 2923 - 2801
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||||| |    
T  2923 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagctacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaat 2825  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatat 157  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  2824 gcaaatcaacaacatctcaaatat 2801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 43 - 157
Target Start/End: Original strand, 129917 - 130031
Alignment:
Q  43 tcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataaca-acagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtca 141  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |||||||||    
T  129917 tcatcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacacacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtca 130015  T
Q  142 acaacatcttaaatat 157  Q
     |||||||| ||||||    
T  130016 tcaacatctcaaatat 130031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 60811 - 60631
Alignment:
Q  57 cgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagc--atgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaa 153  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||  ||||||||| |||| |||||||||||| ||    
T  60811 cgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagctcatgatataccaatatcaat-gcaaatcaacaacatctcaa 60714  T
Q  154 atattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacgcatctta-aacagcttcacag 235  Q
    | |||||  |||| ||||||||||||| |||  | |||||||||| || | |||||||||  ||| ||| |||||||||||||    
T  60713 acattcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacataattaacaacatcaaatcattttataacagcttcacag 60631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 35 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 14814 - 14692
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||| || ||||| ||| ||||||| | |    
T  14814 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaactaacaaacagcaacataggcagta-agaaaatcatcatgatatagtaatatcgaat 14716  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatat 157  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  14715 gcaaatcaacaacatctcaaatat 14692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 146
Target Start/End: Original strand, 15664 - 15776
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 132  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||| |     
T  15664 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatac-aaaccatcatgatataataatatcgaa 15762  T
Q  133 tgcaagtcaacaac 146  Q
    || || ||||||||    
T  15763 tgtaaatcaacaac 15776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 120
Target Start/End: Original strand, 1339 - 1424
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 120  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||||  ||||| ||||  |||||||    
T  1339 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttgtttaagtaacaatagcaacataggcagattacaacaacattatgacat 1424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 6244 - 6121
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  6244 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagtaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 6146  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaa 154  Q
     | |||||||||  |||||| ||||    
T  6145 gaatgcaagtcattaacatcataaa 6121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 5246 - 5069
Alignment:
Q  34 tcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 132  Q
    |||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||   |||| ||||||||||| |||||||     
T  5246 tcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggtattatac---aacatcatgacataattatatcaaa 5150  T
Q  133 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaac 214  Q
    | ||| ||| ||||||||||  ||| |||  || |||||||||||| | | |||| |||| |||||| ||||||||| ||||    
T  5149 ttcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgtata-aacattataacacatcttaatcaacaacaac 5069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 43 - 157
Target Start/End: Original strand, 5655 - 5769
Alignment:
Q  43 tcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtca 141  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||    
T  5655 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagtaaaataacaaacagcaacataggcagtat-gaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatca 5753  T
Q  142 acaacatcttaaatat 157  Q
    ||||||||| ||||||    
T  5754 acaacatctcaaatat 5769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 50 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 51985 - 51833
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaa-ca 147  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| | ||| ||||| ||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  51985 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagca-cataggcagcattcaaaaatagcaagacataataatatcaa-tgcaagccaacaatca 51888  T
Q  148 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataa 203  Q
    ||| || |||||| ||| ||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  51887 tctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtat-acattatatcacatcataa 51833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 150
Target Start/End: Original strand, 32538 - 32654
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||    
T  32538 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatc 32634  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatct 150  Q
    || ||||| ||||||||||||    
T  32635 aaatgcaa-tcaacaacatct 32654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 52 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 8161 - 7998
Alignment:
Q  52 tagatcgactcatgcaacttagttaaataacaac-agcaacataggcagtatacaaaaacagc--atgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 148  Q
    |||| |||| |||||| |||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||  |||| ||||||||||||| || || ||||||||||    
T  8161 tagaccgacgcatgcagcttaattaaataacaaatagcagcataggcagtatgcaaat-cagctcatgatataataatatcaaatgaaattcaacaacat 8063  T
Q  149 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaa 213  Q
    |||||| |||||  |||| ||||||||||| | |||| | |||||||||| |||| |||||||||    
T  8062 cttaaacattcatatataattcaagtaatgtatataaaattatatcacattataaacaacatcaa 7998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 107
Target Start/End: Original strand, 6611 - 6688
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  6611 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 6688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 107
Target Start/End: Original strand, 13991 - 14068
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  13991 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 14068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 15898 - 15821
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 107  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  15898 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 15821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 98
Target Start/End: Original strand, 178898 - 178961
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggca 98  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  178898 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcagcataggca 178961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 50 - 157
Target Start/End: Original strand, 1051 - 1158
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 148  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||| | | | ||| ||||||    
T  1051 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacagcatgatataacaatatcaaatacgaatcatcaacat 1149  T
Q  149 cttaaatat 157  Q
    || ||||||    
T  1150 ctcaaatat 1158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 46 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 10647 - 10536
Alignment:
Q  46 tcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 144  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| ||    
T  10647 tcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 10549  T
Q  145 acatcttaaatat 157  Q
    |||||| ||||||    
T  10548 acatctcaaatat 10536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 50 - 213
Target Start/End: Original strand, 12587 - 12749
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 148  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  12587 cttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 12685  T
Q  149 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaa 213  Q
    || ||||| | |  |||| ||| ||||||| | |||  | |||||||||| |||| |||||||||    
T  12686 ctcaaatacttatatataattc-agtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 12749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 1190 - 1075
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  1190 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 1092  T
Q  130 aattgcaagtcaacaac 146  Q
     | || || ||||||||    
T  1091 gaatgtaaatcaacaac 1075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 4320 - 4284
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4320 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacata 4284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 157
Target Start/End: Original strand, 133 - 255
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  133 catcatcatcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 231  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatat 157  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  232 gcaaatcaacaacatctcaaatat 255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 180
Target Start/End: Original strand, 1881 - 2024
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaac-agcatgacataataatatcaatt 133  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| ||| | ||||  ||||| ||| |||||    
T  1881 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaacataggcagattacaacaacaatcatg--ataattataccaatt 1978  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgca 180  Q
     ||| ||| ||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  1979 -caattcatcaacatcttatgtatacaattattcttcaagtaatgca 2024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 193070 - 192920
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtat-acaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaata 156  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||| |||| |||||||||| ||||||| ||  || || ||||||||| || ||    
T  193070 gactcatgcaacttagttaattaacaacagcagcataggcagaatcacaacaacatcatgacataacaatatcatttataattc-acaacatctcaatta 192972  T
Q  157 ttcaattatacttcaagtaatgca-cataacactatatcacatcataatcaa 207  Q
    |||||| | ||||||||| ||| |  | |||| ||||||||| |||||||||    
T  192971 ttcaataaaacttcaagtgatgtattacaacattatatcacaccataatcaa 192920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 15304 - 15268
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15304 gactcatgcaacttagttaaataacaaaagcatcata 15268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 19826 - 19790
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19826 gactcatgcaacttagttaaataacaaaagcagcata 19790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 120
Target Start/End: Original strand, 23843 - 23928
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 120  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  23843 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcaccataggcagattacaacaacagtatgacat 23928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 88 - 213
Target Start/End: Original strand, 225465 - 225588
Alignment:
Q  88 caacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataaca 187  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||  |||| ||||||||||||| |||  |    
T  225465 caacatagtcagtatgcaaaa-cagcgtgatataataatatcaaatgcaa-tcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaa 225562  T
Q  188 ctatatcacatcataatcaacatcaa 213  Q
     |||||||||| |||| |||||||||    
T  225563 ttatatcacattataaacaacatcaa 225588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 1155 - 1083
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtat 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  1155 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtat 1083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 154
Target Start/End: Original strand, 12766 - 12889
Alignment:
Q  31 acatcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  12766 acatcatcataatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagctaaataacaaacaacaacataggcaatatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 12864  T
Q  130 aattgcaagtcaacaacatcttaaa 154  Q
     | ||||||||| ||||||| ||||    
T  12865 gaatgcaagtcatcaacatcataaa 12889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 10639 - 10575
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcag 99  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  10639 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcaacataggcag 10575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 15796 - 15736
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacatag 95  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  15796 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcatag 15736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 209
Target Start/End: Original strand, 26828 - 26999
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaac-agcatgacataataatatcaatt 133  Q
    |||||| || |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||| | ||||  ||||| |||||||||    
T  26828 catcattttaatcatcttatatcgactcatgcatcttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacaatcatg--ataattatatcaatt 26925  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaaca 209  Q
     ||| ||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||| | |||| ||||  |||||||||||||||    
T  26926 -caattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcataatcaaca 26999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21920 - 21749
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaac-agcatgacataataatatcaatt 133  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||| | ||||  ||||| ||| |||||    
T  21920 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacaatcatg--ataattataccaatt 21823  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaaca 209  Q
     ||| ||| ||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||| | |||| ||||  ||||| |||||||||    
T  21822 -caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcttaatcaaca 21749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29812 - 29641
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaac-agcatgacataataatatcaatt 133  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||| | ||||  ||||| ||| |||||    
T  29812 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacaatcatg--ataattataccaatt 29715  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaaca 209  Q
     ||| ||| ||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||| | |||| ||||  ||||| |||||||||    
T  29714 -caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcttaatcaaca 29641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 2762 - 2694
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtat 102  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  2762 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggcagtat 2694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 154
Target Start/End: Original strand, 12943 - 13062
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||||  || ||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| | |    
T  12943 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgctgctcagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcagcatgatataacaatatcgaat 13041  T
Q  134 gcaagtcaacaacatcttaaa 154  Q
    |||||||| ||||||| ||||    
T  13042 gcaagtcatcaacatcataaa 13062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 45909 - 45794
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 133  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  45909 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagaaaaataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 45811  T
Q  134 gcaagtcaacaacatct 150  Q
    | |||||| ||||||||    
T  45810 gtaagtcatcaacatct 45794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 28887 - 28813
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataaca--acagcaacataggcagtatacaaa 107  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  28887 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacattacagcaacataggcagtatgcaaa 28813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 180
Target Start/End: Original strand, 920 - 1041
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 157  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||   |||| |||||||| |  | |||||||||||| ||  ||||||||||||| |  ||    
T  920 gactcatgcaacttagttcaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaatt-catttcaacaacatcttgatcat 1018  T
Q  158 tcaattatacttcaagtaatgca 180  Q
    ||||| ||| |||||||||||||    
T  1019 tcaataatatttcaagtaatgca 1041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 180
Target Start/End: Original strand, 1853 - 1974
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||   |||| |||||||| |  | |||||||||||| ||  ||||||||||||| |  ||    
T  1853 gactcatgcaacttagttaaataacaatggcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaatt-catttcaacaacatcttgatcat 1951  T
Q  158 tcaattatacttcaagtaatgca 180  Q
    ||||| ||| |||||||||||||    
T  1952 tcaataatatttcaagtaatgca 1974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 180
Target Start/End: Original strand, 9536 - 9656
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||   |||  |||||||| || | |||||||||||| ||  ||||||||||||| |  ||    
T  9536 gactcatgcaacttagttaaataacaataacaacataatcagatcacatcaacagcataac-tcataatatcaatt-catttcaacaacatcttgatcat 9633  T
Q  158 tcaattatacttcaagtaatgca 180  Q
    ||||| ||| |||||||||||||    
T  9634 tcaataatatttcaagtaatgca 9656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 107
Target Start/End: Original strand, 1086 - 1159
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 107  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  1086 catcttcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 1159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 24000 - 23927
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 107  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  24000 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 23927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 120
Target Start/End: Original strand, 69794 - 69879
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 120  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  69794 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacat 69879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1895 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1895
Description:

Target: scaffold1895; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1257 - 1169
Alignment:
Q  122 ataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacat 210  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||  ||||||| |||  | || |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  1257 ataatatcaatttcatttcaacaacatcttaatcattcaataatatcttaaataatgcacataacattatatcacatcatattcaacat 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 6386 - 6284
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 146  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| || | |||||||| ||||| ||||||||    
T  6386 cttagaccgactcatgcaacttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtata-taaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaac 6288  T
Q  147 atct 150  Q
    ||||    
T  6287 atct 6284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 46 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 8180 - 8075
Alignment:
Q  46 tcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaa 142  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||  |||  ||||| |||| |||||||| | ||| ||||    
T  8180 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaacaaacaaacagcaacataggcagtatacaaac-cagttcatgatataacaatatcaaatacaaatcaa 8082  T
Q  143 caacatc 149  Q
    |||||||    
T  8081 caacatc 8075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 46820 - 46670
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 157  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||   |||| || ||||| || | |||||||||||| ||  || |||||||||| |  ||    
T  46820 gactcatgcaacttagttacataacaatagcagcataggcagatcacaacaatagcataacttcataatatcaatt-catttccacaacatcttgatcat 46722  T
Q  158 tcaattatacttcaagtaatgcacataa-cactatatcacatcataatcaac 208  Q
    ||||| ||| |||||||||||||  ||| || || ||||||| |||||||||    
T  46721 tcaataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaac 46670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 180
Target Start/End: Original strand, 44104 - 44225
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||   |||| |||||||| |  | |||||||||||| ||  || |||||||||| |  ||    
T  44104 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaatt-catttccacaacatcttgataat 44202  T
Q  158 tcaattatacttcaagtaatgca 180  Q
    ||||| ||| || ||||||||||    
T  44203 tcaataatattttaagtaatgca 44225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 43 - 107
Target Start/End: Original strand, 6824 - 6889
Alignment:
Q  43 tcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 107  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  6824 tcatcatcttagaccgactcatgcagctcagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 6889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 150
Target Start/End: Original strand, 8090 - 8134
Alignment:
Q  106 aaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatct 150  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  8090 aaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatct 8134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 180
Target Start/End: Original strand, 159 - 304
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 134  Q
    ||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||   |||  |||| ||| || | ||||||||||||     
T  159 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacatcaacaacataacttcataatatcaattc 258  T
Q  135 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgca 180  Q
        ||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||    
T  259 attttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgca 304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 17929 - 17844
Alignment:
Q  210 tcaacgcatcttaaacagcttcacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | |||| |||| || ||||||||||  ||||||| || || |||||| |||||||||||    
T  17929 tcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcctcattaagtcttaatactacccaaaggttcaattctcaacaact 17844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 150
Target Start/End: Original strand, 10542 - 10646
Alignment:
Q  46 tcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 144  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| ||    
T  10542 tcaacttagaccgactcatgcagcttttttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 10640  T
Q  145 acatct 150  Q
    ||||||    
T  10641 acatct 10646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 120
Target Start/End: Original strand, 18236 - 18321
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 120  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||  | ||| ||||| |||||||    
T  18236 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacatagttaattaacaatagcagcataggcagattgcaacaacagtatgacat 18321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 206624 - 206575
Alignment:
Q  52 tagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagta 101  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  206624 tagatcgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagta 206575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 99
Target Start/End: Original strand, 6095 - 6159
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcag 99  Q
    ||||||||| |||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  6095 catcatcttaatcatcttatattgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcag 6159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 46 - 150
Target Start/End: Original strand, 25121 - 25226
Alignment:
Q  46 tcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaa 142  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||  ||||||| ||||| ||||    
T  25121 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtata-taaaacagctcatgatataacgatatcaa-tgcaaatcaa 25218  T
Q  143 caacatct 150  Q
    ||||||||    
T  25219 caacatct 25226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 129
Target Start/End: Original strand, 32102 - 32197
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 129  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||| | ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  32102 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacaacaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatc 32197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 98
Target Start/End: Original strand, 36454 - 36517
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggca 98  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| || | ||||||||    
T  36454 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagtagcataggca 36517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 208
Target Start/End: Original strand, 4430 - 4603
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 134  Q
    ||||||||| |||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||  |||   |||| |||||||| |  | ||||||||||||     
T  4430 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatggcagcataatcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaatt- 4528  T
Q  135 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataa-cactatatcacatcataatcaac 208  Q
    ||  ||||||||||||| |  |||| || ||| |||||||||||||  ||| || || ||||||| |||||||||    
T  4529 catttcaacaacatcttgatcattcgataatatttcaagtaatgcaattaatcaataaatcacattataatcaac 4603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 92
Target Start/End: Original strand, 11982 - 12024
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaaca 92  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11982 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 12024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 5037 - 4999
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacatagg 96  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5037 gactcatgcaacttggttaaataacaacagcaacatagg 4999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 180
Target Start/End: Original strand, 393 - 537
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 134  Q
    ||||||||| |||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||   |||| | |||||| || | ||||||||||||     
T  393 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacagcagcataacttcataatatcaatt- 491  T
Q  135 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgca 180  Q
    |   ||||| ||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||    
T  492 cttttcaacgacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgca 537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 57 - 150
Target Start/End: Original strand, 38342 - 38437
Alignment:
Q  57 cgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatct 150  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  |||||||  ||||| || | |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  38342 cgactcatgcagcttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtata-taaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaattcaacaacatct 38437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 120
Target Start/End: Original strand, 19980 - 20065
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 120  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| |||  ||||||||||| || | |||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  19980 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcagcttgattaaataacaatagtagcataggcagattacaacaacagtatgacat 20065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 7934 - 7870
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcag 99  Q
    ||||||||| |||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||    
T  7934 catcatcttgatcatctcatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcctaggcag 7870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 7364 - 7328
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7364 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacata 7328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 10162 - 10015
Alignment:
Q  32 catcatcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 131  Q
    |||||||||||| |||| |||| || || | |||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||   |||  || || || || | ||||||||||    
T  10162 catcatcatcttaatcatcttatatagatttatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacatcaatagtataactttataatatcaa 10063  T
Q  132 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgca 180  Q
    || ||  ||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||    
T  10062 tt-catttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgca 10015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 99
Target Start/End: Original strand, 14664 - 14728
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcag 99  Q
    ||||||||| |||| |||| || ||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  14664 catcatcttaatcatcttatattgactcatacaacttggttaaataacaatagcagcataggcag 14728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 99
Target Start/End: Original strand, 23679 - 23743
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcag 99  Q
    ||||||||| |||| |||| || ||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  23679 catcatcttaatcatcttatattgactcatacaacttggttaaataacaatagcagcataggcag 23743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 99
Target Start/End: Original strand, 39103 - 39167
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcag 99  Q
    ||||||||| |||| |||| || ||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  39103 catcatcttaatcatcttatattgactcatacaacttggttaaataacaatagcagcataggcag 39167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 150
Target Start/End: Original strand, 267679 - 267781
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 146  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||| ||||||||  |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||     
T  267679 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacatcaacatatgcagtata-taaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaat 267777  T
Q  147 atct 150  Q
    ||||    
T  267778 atct 267781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 149
Target Start/End: Original strand, 569 - 669
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 146  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  569 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcata-taaaacagttcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaac 666  T
Q  147 atc 149  Q
    |||    
T  667 atc 669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 35 - 94
Target Start/End: Original strand, 1494 - 1553
Alignment:
Q  35 catcatcttcatcaacttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    ||||||||| |||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  1494 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcata 1553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 213
Target Start/End: Original strand, 97024 - 97188
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 146  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||  || || ||||||||||||||||| | |||| |||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  97024 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 97122  T
Q  147 atcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaa 213  Q
    |||| ||| | |||  |||| |||| |||||||| |||  | |||||||||| || | |||||||||    
T  97123 atctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaa 97188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 213
Target Start/End: Original strand, 106302 - 106466
Alignment:
Q  50 cttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 146  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||  || || ||||||||||||||||| | |||| |||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  106302 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 106400  T
Q  147 atcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaa 213  Q
    |||| ||| | |||  |||| |||| |||||||| |||  | |||||||||| || | |||||||||    
T  106401 atctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaa 106466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 2178 - 2057
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||   |||| |||| ||| || | |||||||||| | ||  ||||||||||||| |  ||    
T  2178 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacaacataacttcataatatcaa-tccatttcaacaacatcttgatcat 2080  T
Q  158 tcaattatacttcaagtaatgca 180  Q
    ||||| | | |||||||||||||    
T  2079 tcaatgaaatttcaagtaatgca 2057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 58 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 6508 - 6387
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 157  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||   |||| || ||||| |  | |||||||||||| ||  ||||||||||||| |  ||    
T  6508 gactcatgcaacatagttaaataacaatagcagcataggaagatcacaacaatagcataatttcataatatcaatt-catttcaacaacatcttgatcat 6410  T
Q  158 tcaattatacttcaagtaatgca 180  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||    
T  6409 tcaataatatttcgagtaatgca 6387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 2281 - 2213
Alignment:
Q  88 caacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 157  Q
    ||||||||||||||| ||||  || ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  2281 caacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 2213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 180
Target Start/End: Original strand, 13092 - 13153
Alignment:
Q  119 ataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgca 180  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| || ||||||||||    
T  13092 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattgaagtaatgca 13153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Original strand, 8583 - 8619
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8583 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcata 8619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Original strand, 7494 - 7530
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  7494 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcata 7530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Original strand, 2191 - 2227
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  2191 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcata 2227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 223 - 295
Target Start/End: Original strand, 20595 - 20667
Alignment:
Q  223 aacagcttcacaggtcataaataacgtcatcattaagtcccaatactatcccaaagttcaactctcaacaact 295  Q
    ||||||||||||| | |||  |||| |||||||||||||  ||| |||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  20595 aacagcttcacagattatagttaacatcatcattaagtcttaatgctattccaaggttcaactctcgacaact 20667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 35605 - 35569
Alignment:
Q  58 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacata 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  35605 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcata 35569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 5876 times since January 2019
Visitors: 4860