View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0756_low_7 (Length: 411)

Name: NF0756_low_7
Description: NF0756
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0756_low_7
NF0756_low_7
[»] chr8 (98 HSPs)
chr8 (132-411)||(27345642-27345922)
chr8 (132-411)||(23117135-23117417)
chr8 (132-411)||(10956609-10956890)
chr8 (129-411)||(40144219-40144501)
chr8 (142-411)||(26485943-26486215)
chr8 (123-411)||(14746442-14746733)
chr8 (129-411)||(16266793-16267077)
chr8 (134-408)||(3224609-3224886)
chr8 (129-411)||(3697567-3697851)
chr8 (132-411)||(23224671-23224950)
chr8 (185-409)||(11392532-11392757)
chr8 (185-384)||(14416525-14416725)
chr8 (166-411)||(16887222-16887469)
chr8 (129-410)||(36800367-36800649)
chr8 (132-410)||(27909509-27909788)
chr8 (132-410)||(27955928-27956207)
chr8 (132-411)||(14736745-14737024)
chr8 (199-384)||(29328188-29328374)
chr8 (166-404)||(14563501-14563741)
chr8 (142-411)||(28980661-28980931)
chr8 (142-411)||(28985881-28986151)
chr8 (142-411)||(9205274-9205545)
chr8 (166-410)||(4520658-4520905)
chr8 (132-405)||(14765515-14765788)
chr8 (185-384)||(29299030-29299227)
chr8 (185-384)||(29305576-29305773)
chr8 (185-375)||(25701529-25701719)
chr8 (166-404)||(35541008-35541248)
chr8 (185-384)||(43687379-43687577)
chr8 (271-411)||(6588135-6588276)
chr8 (271-409)||(27873818-27873957)
chr8 (271-409)||(27948606-27948745)
chr8 (129-269)||(31418804-31418948)
chr8 (271-409)||(27889948-27890087)
chr8 (266-410)||(214002-214149)
chr8 (266-410)||(238105-238252)
chr8 (266-410)||(727625-727772)
chr8 (266-410)||(800126-800273)
chr8 (266-410)||(851519-851666)
chr8 (132-250)||(6588040-6588158)
chr8 (141-269)||(31412622-31412754)
chr8 (330-411)||(10948527-10948608)
chr8 (14-152)||(8729261-8729399)
chr8 (14-152)||(44476057-44476195)
chr8 (14-152)||(44479319-44479457)
chr8 (134-221)||(5240007-5240094)
chr8 (129-265)||(30767066-30767204)
chr8 (184-322)||(23653816-23653957)
chr8 (134-265)||(23825051-23825184)
chr8 (14-152)||(27942422-27942560)
chr8 (141-265)||(21281992-21282119)
chr8 (185-298)||(23653070-23653186)
chr8 (365-410)||(807963-808008)
chr8 (132-250)||(213914-214030)
chr8 (132-250)||(238224-238340)
chr8 (132-250)||(727537-727653)
chr8 (132-250)||(800038-800154)
chr8 (132-250)||(851431-851547)
chr8 (47-152)||(16259367-16259474)
chr8 (47-152)||(20974239-20974344)
chr8 (185-265)||(24321720-24321801)
chr8 (207-322)||(39363480-39363599)
chr8 (185-265)||(14057724-14057806)
chr8 (207-322)||(19859506-19859626)
chr8 (185-243)||(27873777-27873834)
chr8 (185-243)||(27889907-27889964)
chr8 (185-243)||(27948565-27948622)
chr8 (185-265)||(8729130-8729211)
chr8 (185-265)||(27942291-27942372)
chr8 (185-265)||(18609771-18609853)
chr8 (247-322)||(20783932-20784006)
chr8 (207-269)||(21690546-21690611)
chr8 (207-267)||(22025700-22025762)
chr8 (207-267)||(22050201-22050263)
chr8 (207-267)||(22055719-22055781)
chr8 (207-267)||(22177586-22177648)
chr8 (207-322)||(14594813-14594933)
chr8 (47-152)||(19988405-19988511)
chr8 (185-265)||(8596208-8596289)
chr8 (47-124)||(21322499-21322576)
chr8 (47-124)||(21327087-21327164)
chr8 (188-265)||(25409535-25409614)
chr8 (187-265)||(19903044-19903125)
chr8 (207-269)||(21686222-21686287)
chr8 (187-265)||(44476216-44476297)
chr8 (187-265)||(44479478-44479559)
chr8 (187-221)||(17053577-17053611)
chr8 (187-221)||(23865414-23865448)
chr8 (247-316)||(16259558-16259627)
chr8 (332-384)||(20006386-20006439)
chr8 (330-375)||(22063558-22063603)
chr8 (230-267)||(22063703-22063740)
chr8 (330-375)||(22176030-22176075)
chr8 (246-318)||(38186023-38186096)
chr8 (207-267)||(21300291-21300354)
chr8 (100-152)||(22743603-22743655)
chr8 (332-375)||(39363648-39363692)
chr8 (207-267)||(41009574-41009637)
[»] chr3 (131 HSPs)
chr3 (123-411)||(38742833-38743123)
chr3 (129-411)||(48774578-48774862)
chr3 (123-411)||(12271355-12271645)
chr3 (129-411)||(9771876-9772159)
chr3 (185-384)||(30596848-30597047)
chr3 (187-384)||(54520022-54520220)
chr3 (185-408)||(29545127-29545351)
chr3 (185-410)||(16331556-16331780)
chr3 (142-411)||(29493471-29493742)
chr3 (185-409)||(16833196-16833420)
chr3 (185-384)||(8373914-8374113)
chr3 (142-411)||(2499005-2499275)
chr3 (132-411)||(21151418-21151697)
chr3 (185-384)||(9691396-9691595)
chr3 (185-384)||(32388006-32388205)
chr3 (132-411)||(43724025-43724305)
chr3 (132-411)||(10381848-10382128)
chr3 (132-411)||(10410501-10410781)
chr3 (185-384)||(11956585-11956783)
chr3 (185-384)||(29550898-29551097)
chr3 (132-408)||(54833151-54833429)
chr3 (132-410)||(53571196-53571474)
chr3 (132-408)||(10767665-10767941)
chr3 (142-411)||(28758816-28759087)
chr3 (132-395)||(45611575-45611838)
chr3 (142-411)||(50142730-50143001)
chr3 (185-375)||(19344151-19344340)
chr3 (142-411)||(3782712-3782983)
chr3 (199-384)||(20377229-20377415)
chr3 (199-384)||(46071099-46071285)
chr3 (166-411)||(47121086-47121335)
chr3 (166-411)||(47128454-47128703)
chr3 (206-410)||(50655950-50656156)
chr3 (142-402)||(14845137-14845399)
chr3 (224-384)||(20187754-20187915)
chr3 (198-384)||(12725113-12725299)
chr3 (207-384)||(54520256-54520435)
chr3 (185-375)||(49163129-49163317)
chr3 (134-289)||(20187620-20187775)
chr3 (271-409)||(54091700-54091839)
chr3 (271-384)||(3802557-3802671)
chr3 (271-384)||(15374700-15374814)
chr3 (271-384)||(3802719-3802833)
chr3 (14-152)||(20249385-20249523)
chr3 (330-411)||(6927502-6927583)
chr3 (136-322)||(10597792-10597982)
chr3 (134-322)||(11850722-11850913)
chr3 (134-322)||(18757021-18757214)
chr3 (118-265)||(31690713-31690863)
chr3 (136-294)||(12419320-12419481)
chr3 (254-375)||(18961002-18961122)
chr3 (129-265)||(8583411-8583549)
chr3 (129-265)||(14084453-14084591)
chr3 (129-265)||(14089854-14089992)
chr3 (129-265)||(49399395-49399533)
chr3 (118-244)||(31943352-31943480)
chr3 (14-152)||(38312399-38312536)
chr3 (185-258)||(18957741-18957814)
chr3 (14-152)||(14764379-14764515)
chr3 (14-152)||(12304541-12304677)
chr3 (14-152)||(9532641-9532777)
chr3 (14-152)||(23372125-23372263)
chr3 (14-152)||(29545401-29545539)
chr3 (14-152)||(51299892-51300030)
chr3 (47-152)||(11305988-11306093)
chr3 (185-245)||(3802515-3802575)
chr3 (185-245)||(15374658-15374718)
chr3 (14-152)||(3802329-3802465)
chr3 (185-251)||(27029558-27029623)
chr3 (185-251)||(27031726-27031791)
chr3 (47-152)||(18136532-18136637)
chr3 (169-265)||(13968950-13969048)
chr3 (169-265)||(13974425-13974523)
chr3 (185-245)||(54091821-54091880)
chr3 (174-265)||(24123320-24123413)
chr3 (47-152)||(11965112-11965217)
chr3 (47-152)||(12202180-12202285)
chr3 (185-265)||(17130675-17130756)
chr3 (51-152)||(18130018-18130119)
chr3 (47-152)||(54900326-54900431)
chr3 (224-322)||(17512558-17512658)
chr3 (207-267)||(16382994-16383056)
chr3 (61-152)||(23173656-23173747)
chr3 (207-245)||(3802699-3802737)
chr3 (185-267)||(18913984-18914069)
chr3 (47-152)||(2270478-2270583)
chr3 (185-265)||(12034465-12034546)
chr3 (185-265)||(14764248-14764329)
chr3 (185-265)||(23371994-23372075)
chr3 (185-265)||(38312268-38312349)
chr3 (185-265)||(51300080-51300161)
chr3 (185-265)||(18888944-18889027)
chr3 (247-322)||(11644878-11644953)
chr3 (207-267)||(13203653-13203715)
chr3 (207-267)||(14652830-14652892)
chr3 (185-265)||(17190814-17190896)
chr3 (207-265)||(19443469-19443528)
chr3 (90-152)||(17496018-17496080)
chr3 (207-269)||(17496119-17496184)
chr3 (129-182)||(13969063-13969116)
chr3 (129-182)||(13974538-13974591)
chr3 (185-265)||(14864766-14864847)
chr3 (207-322)||(2270320-2270439)
chr3 (247-322)||(11305830-11305905)
chr3 (207-269)||(12274221-12274287)
chr3 (312-375)||(12274371-12274435)
chr3 (210-267)||(14292706-14292765)
chr3 (47-152)||(14569642-14569748)
chr3 (187-265)||(9532829-9532910)
chr3 (207-269)||(15955128-15955193)
chr3 (185-220)||(17157039-17157074)
chr3 (185-264)||(18899983-18900065)
chr3 (185-220)||(24191740-24191775)
chr3 (373-411)||(16414244-16414281)
chr3 (207-265)||(18719251-18719312)
chr3 (187-221)||(41456311-41456345)
chr3 (185-265)||(10553851-10553932)
chr3 (330-375)||(13313907-13313952)
chr3 (207-265)||(14544308-14544368)
chr3 (185-265)||(20249254-20249335)
chr3 (330-375)||(23173922-23173967)
chr3 (308-375)||(35984860-35984926)
chr3 (236-303)||(12356036-12356104)
chr3 (236-303)||(12362585-12362653)
chr3 (207-267)||(12363445-12363508)
chr3 (207-267)||(12961517-12961580)
chr3 (332-375)||(15934960-15935004)
chr3 (185-221)||(16802612-16802648)
chr3 (118-154)||(16823969-16824005)
chr3 (185-265)||(17243796-17243879)
chr3 (332-375)||(17512707-17512751)
[»] chr6 (90 HSPs)
chr6 (129-411)||(94438-94722)
chr6 (123-411)||(8069637-8069927)
chr6 (129-375)||(14582727-14582972)
chr6 (185-409)||(27767337-27767562)
chr6 (132-411)||(29158992-29159274)
chr6 (132-411)||(4106621-4106899)
chr6 (185-409)||(10470682-10470906)
chr6 (129-410)||(17309596-17309878)
chr6 (129-410)||(15332067-15332349)
chr6 (185-384)||(10464185-10464384)
chr6 (132-411)||(1070543-1070823)
chr6 (132-407)||(25315593-25315868)
chr6 (132-407)||(26203087-26203362)
chr6 (142-411)||(34133914-34134184)
chr6 (132-407)||(30799385-30799659)
chr6 (185-384)||(12447172-12447372)
chr6 (166-411)||(25463797-25464046)
chr6 (132-408)||(24369114-24369389)
chr6 (142-411)||(16223602-16223873)
chr6 (134-410)||(22406549-22406827)
chr6 (185-384)||(29925674-29925872)
chr6 (185-384)||(17207714-17207913)
chr6 (185-384)||(23021325-23021525)
chr6 (185-385)||(13940411-13940612)
chr6 (237-384)||(13128242-13128390)
chr6 (118-322)||(23234987-23235195)
chr6 (134-322)||(26418724-26418917)
chr6 (136-322)||(5290201-5290390)
chr6 (271-408)||(24362631-24362770)
chr6 (330-411)||(19096731-19096812)
chr6 (132-245)||(19096815-19096928)
chr6 (129-265)||(24562204-24562342)
chr6 (185-269)||(17894613-17894697)
chr6 (14-152)||(12941592-12941728)
chr6 (14-152)||(4476155-4476293)
chr6 (185-322)||(25347060-25347201)
chr6 (185-322)||(25395978-25396120)
chr6 (185-265)||(15457443-15457524)
chr6 (185-265)||(15464038-15464119)
chr6 (47-151)||(19818761-19818865)
chr6 (142-250)||(24362549-24362654)
chr6 (206-267)||(1592758-1592821)
chr6 (207-265)||(19300787-19300846)
chr6 (47-152)||(14616481-14616586)
chr6 (47-152)||(17413850-17413955)
chr6 (185-265)||(20008998-20009079)
chr6 (185-265)||(31250270-31250351)
chr6 (185-265)||(31251347-31251428)
chr6 (185-241)||(13135929-13135984)
chr6 (185-322)||(19472384-19472526)
chr6 (210-267)||(21724875-21724934)
chr6 (247-322)||(23233468-23233544)
chr6 (89-152)||(2708273-2708336)
chr6 (207-265)||(14581975-14582034)
chr6 (247-322)||(17414038-17414113)
chr6 (185-264)||(18786040-18786122)
chr6 (207-267)||(19726606-19726668)
chr6 (187-265)||(25470807-25470888)
chr6 (14-152)||(28290456-28290591)
chr6 (185-265)||(4476343-4476424)
chr6 (47-152)||(8760643-8760748)
chr6 (207-322)||(10582900-10583019)
chr6 (185-265)||(21365585-21365666)
chr6 (185-265)||(23969567-23969648)
chr6 (187-220)||(34641142-34641175)
chr6 (187-220)||(34647816-34647849)
chr6 (247-322)||(19451326-19451402)
chr6 (185-240)||(20011082-20011138)
chr6 (100-152)||(24412513-24412564)
chr6 (185-265)||(24513944-24514026)
chr6 (207-322)||(24720594-24720715)
chr6 (185-265)||(12941778-12941860)
chr6 (247-321)||(14133105-14133180)
chr6 (224-267)||(22906984-22907027)
chr6 (185-265)||(28290324-28290406)
chr6 (207-265)||(8760544-8760605)
chr6 (187-221)||(11284008-11284042)
chr6 (187-221)||(12167217-12167251)
chr6 (330-375)||(14133011-14133057)
chr6 (187-221)||(19286126-19286160)
chr6 (187-221)||(19787036-19787070)
chr6 (187-221)||(19877310-19877344)
chr6 (187-221)||(19883086-19883120)
chr6 (330-375)||(8768145-8768190)
chr6 (330-375)||(19300639-19300684)
chr6 (207-267)||(14375426-14375489)
chr6 (330-377)||(17027156-17027204)
chr6 (332-375)||(18786230-18786274)
chr6 (330-374)||(19726766-19726810)
chr6 (207-265)||(24412404-24412466)
[»] chr5 (125 HSPs)
chr5 (132-411)||(22507434-22507714)
chr5 (132-411)||(19508038-19508319)
chr5 (132-411)||(22500856-22501133)
chr5 (129-384)||(19800320-19800577)
chr5 (129-390)||(597147-597408)
chr5 (185-384)||(41877985-41878185)
chr5 (132-393)||(25852850-25853113)
chr5 (132-407)||(5582235-5582510)
chr5 (132-411)||(14614904-14615184)
chr5 (185-384)||(20990281-20990479)
chr5 (142-411)||(40010926-40011195)
chr5 (185-384)||(5341700-5341899)
chr5 (185-411)||(16774996-16775222)
chr5 (132-393)||(25846218-25846481)
chr5 (132-410)||(11995012-11995291)
chr5 (132-410)||(22248196-22248475)
chr5 (185-384)||(23081720-23081920)
chr5 (166-408)||(30780973-30781217)
chr5 (185-384)||(28259854-28260053)
chr5 (185-384)||(37566016-37566216)
chr5 (132-411)||(43028917-43029196)
chr5 (132-410)||(10686021-10686299)
chr5 (142-410)||(14888946-14889216)
chr5 (185-384)||(23076272-23076472)
chr5 (142-410)||(24794971-24795240)
chr5 (142-410)||(24800338-24800607)
chr5 (166-411)||(37539912-37540160)
chr5 (166-411)||(37547456-37547704)
chr5 (132-407)||(18894953-18895228)
chr5 (166-407)||(5454396-5454640)
chr5 (142-410)||(14882269-14882539)
chr5 (142-411)||(1111632-1111901)
chr5 (185-384)||(24057578-24057777)
chr5 (132-407)||(15461348-15461623)
chr5 (132-405)||(17938843-17939117)
chr5 (132-410)||(38013610-38013888)
chr5 (190-384)||(23544842-23545037)
chr5 (142-411)||(7507968-7508239)
chr5 (199-384)||(7773629-7773814)
chr5 (185-384)||(26650381-26650579)
chr5 (185-384)||(26921966-26922164)
chr5 (185-384)||(19801866-19802066)
chr5 (185-384)||(18941195-18941393)
chr5 (185-384)||(39608854-39609053)
chr5 (185-375)||(25419798-25419988)
chr5 (185-384)||(19362576-19362776)
chr5 (101-322)||(24751589-24751813)
chr5 (101-322)||(24669051-24669275)
chr5 (101-322)||(24738820-24739044)
chr5 (118-322)||(27635935-27636143)
chr5 (268-411)||(20347154-20347300)
chr5 (271-411)||(18566603-18566744)
chr5 (268-411)||(20340550-20340696)
chr5 (271-384)||(41877815-41877929)
chr5 (142-250)||(29746666-29746774)
chr5 (271-411)||(29746546-29746689)
chr5 (14-152)||(37599542-37599680)
chr5 (14-148)||(22749543-22749677)
chr5 (14-152)||(42959872-42960010)
chr5 (271-383)||(22379546-22379658)
chr5 (330-411)||(24008126-24008207)
chr5 (132-250)||(20347062-20347180)
chr5 (129-250)||(18566506-18566626)
chr5 (14-152)||(19510820-19510958)
chr5 (132-250)||(20340458-20340576)
chr5 (14-149)||(28371677-28371812)
chr5 (14-152)||(22335899-22336035)
chr5 (14-152)||(22339437-22339573)
chr5 (14-152)||(23112986-23113122)
chr5 (14-152)||(41878235-41878371)
chr5 (47-152)||(22232852-22232957)
chr5 (47-152)||(34828850-34828956)
chr5 (185-245)||(22379504-22379564)
chr5 (129-265)||(1857620-1857758)
chr5 (14-152)||(9775259-9775395)
chr5 (129-265)||(21675588-21675726)
chr5 (129-222)||(33536228-33536320)
chr5 (14-110)||(38146042-38146138)
chr5 (47-152)||(6404711-6404815)
chr5 (47-152)||(6728470-6728575)
chr5 (185-265)||(19235825-19235906)
chr5 (185-265)||(28371543-28371624)
chr5 (185-265)||(38145870-38145951)
chr5 (185-265)||(42960060-42960141)
chr5 (207-245)||(41877911-41877949)
chr5 (47-152)||(22008134-22008239)
chr5 (185-265)||(22336085-22336166)
chr5 (185-265)||(22460080-22460161)
chr5 (185-265)||(22466704-22466785)
chr5 (185-265)||(22749731-22749812)
chr5 (185-265)||(34829006-34829087)
chr5 (207-322)||(427215-427336)
chr5 (207-322)||(23444259-23444380)
chr5 (207-267)||(758365-758427)
chr5 (247-322)||(21829546-21829621)
chr5 (207-267)||(22312943-22313005)
chr5 (207-267)||(22509284-22509346)
chr5 (185-265)||(23112854-23112936)
chr5 (207-322)||(21574076-21574195)
chr5 (185-265)||(22339623-22339704)
chr5 (185-265)||(28890476-28890557)
chr5 (185-265)||(28897180-28897261)
chr5 (185-265)||(28910380-28910461)
chr5 (185-265)||(28925648-28925729)
chr5 (185-265)||(28932071-28932152)
chr5 (185-265)||(28933575-28933656)
chr5 (185-265)||(28946775-28946856)
chr5 (185-265)||(18409149-18409232)
chr5 (185-265)||(9775445-9775527)
chr5 (187-265)||(19510979-19511060)
chr5 (207-267)||(20937594-20937656)
chr5 (185-265)||(37805432-37805514)
chr5 (207-322)||(20843142-20843262)
chr5 (187-221)||(23527428-23527462)
chr5 (317-375)||(34829179-34829236)
chr5 (185-265)||(20819108-20819189)
chr5 (185-265)||(20826208-20826289)
chr5 (330-375)||(23112708-23112753)
chr5 (207-322)||(23561669-23561788)
chr5 (118-178)||(20831689-20831749)
chr5 (330-374)||(20937755-20937799)
chr5 (330-374)||(22312801-22312845)
chr5 (185-221)||(22439888-22439924)
chr5 (332-375)||(23444167-23444211)
chr5 (100-152)||(25013495-25013547)
[»] chr7 (152 HSPs)
chr7 (132-411)||(13963967-13964249)
chr7 (129-411)||(46174247-46174531)
chr7 (132-411)||(37285134-37285416)
chr7 (132-384)||(46649695-46649948)
chr7 (142-404)||(17468226-17468488)
chr7 (142-404)||(17584726-17584988)
chr7 (129-384)||(2388551-2388806)
chr7 (132-408)||(11899278-11899556)
chr7 (132-408)||(2438809-2439087)
chr7 (132-408)||(18437135-18437412)
chr7 (129-411)||(20019636-20019920)
chr7 (132-408)||(11339696-11339974)
chr7 (132-408)||(17726301-17726579)
chr7 (166-390)||(49158703-49158927)
chr7 (185-384)||(16843865-16844063)
chr7 (132-408)||(642475-642753)
chr7 (132-407)||(11878994-11879269)
chr7 (132-411)||(5187208-5187489)
chr7 (166-407)||(26113725-26113969)
chr7 (132-408)||(33404579-33404856)
chr7 (185-384)||(19439290-19439489)
chr7 (132-407)||(32627324-32627599)
chr7 (142-411)||(8197165-8197434)
chr7 (166-404)||(11299626-11299866)
chr7 (166-404)||(11307990-11308230)
chr7 (142-408)||(749778-750046)
chr7 (185-384)||(23520981-23521179)
chr7 (142-411)||(1317701-1317972)
chr7 (142-411)||(26089916-26090187)
chr7 (142-411)||(40684728-40684999)
chr7 (185-384)||(13019686-13019885)
chr7 (132-410)||(42058476-42058755)
chr7 (142-410)||(49150520-49150791)
chr7 (142-410)||(49157210-49157481)
chr7 (142-411)||(48987886-48988157)
chr7 (166-407)||(26120338-26120582)
chr7 (142-411)||(2281022-2281293)
chr7 (206-410)||(40922889-40923095)
chr7 (185-384)||(12461497-12461695)
chr7 (167-410)||(2026191-2026436)
chr7 (271-411)||(21757357-21757498)
chr7 (271-411)||(13453767-13453908)
chr7 (271-404)||(37379955-37380089)
chr7 (134-322)||(32771422-32771614)
chr7 (134-322)||(37244364-37244557)
chr7 (142-298)||(15086004-15086163)
chr7 (266-411)||(30602827-30602974)
chr7 (142-348)||(8213299-8213505)
chr7 (14-152)||(16007874-16008012)
chr7 (271-384)||(30271776-30271889)
chr7 (142-322)||(18958485-18958670)
chr7 (14-152)||(15166564-15166702)
chr7 (132-250)||(15622094-15622212)
chr7 (123-322)||(3327715-3327919)
chr7 (141-298)||(16952318-16952478)
chr7 (129-265)||(4279885-4280023)
chr7 (129-265)||(19616217-19616355)
chr7 (129-250)||(37379858-37379978)
chr7 (14-152)||(14421145-14421282)
chr7 (15-152)||(16109282-16109419)
chr7 (14-152)||(18871656-18871794)
chr7 (14-150)||(14565500-14565634)
chr7 (14-152)||(146859-146995)
chr7 (15-152)||(833162-833298)
chr7 (15-152)||(1198342-1198478)
chr7 (166-322)||(26289824-26289985)
chr7 (14-152)||(29795522-29795658)
chr7 (14-152)||(29799341-29799477)
chr7 (129-251)||(13453884-13453997)
chr7 (129-251)||(21757268-21757381)
chr7 (141-265)||(36306152-36306279)
chr7 (47-154)||(3289993-3290100)
chr7 (14-152)||(11302645-11302780)
chr7 (326-384)||(15838732-15838791)
chr7 (14-152)||(23666076-23666212)
chr7 (207-322)||(15437663-15437783)
chr7 (15-152)||(837159-837294)
chr7 (15-152)||(1202339-1202474)
chr7 (47-152)||(14946052-14946157)
chr7 (47-152)||(15373645-15373750)
chr7 (185-322)||(46624820-46624962)
chr7 (185-267)||(13678260-13678345)
chr7 (185-265)||(147045-147126)
chr7 (185-265)||(2965909-2965990)
chr7 (207-322)||(14179066-14179185)
chr7 (185-265)||(14320683-14320764)
chr7 (185-265)||(14565686-14565767)
chr7 (166-250)||(30602946-30603030)
chr7 (47-152)||(46348969-46349074)
chr7 (14-78)||(10897504-10897568)
chr7 (207-267)||(14431989-14432051)
chr7 (207-267)||(15338826-15338888)
chr7 (207-267)||(15723330-15723392)
chr7 (185-265)||(18606844-18606926)
chr7 (185-267)||(19145544-19145629)
chr7 (185-267)||(20744943-20745028)
chr7 (207-267)||(35962852-35962914)
chr7 (185-265)||(15166752-15166833)
chr7 (47-152)||(15437832-15437937)
chr7 (185-265)||(18871844-18871925)
chr7 (185-267)||(21232149-21232232)
chr7 (185-265)||(29182169-29182250)
chr7 (185-265)||(31154345-31154426)
chr7 (207-267)||(11220227-11220290)
chr7 (207-322)||(46682249-46682370)
chr7 (187-265)||(12591751-12591832)
chr7 (187-265)||(12711016-12711097)
chr7 (187-265)||(13124087-13124168)
chr7 (207-321)||(15098023-15098143)
chr7 (207-267)||(15711106-15711168)
chr7 (207-267)||(16109181-16109243)
chr7 (206-245)||(30271871-30271910)
chr7 (185-265)||(3858473-3858554)
chr7 (185-265)||(10897301-10897382)
chr7 (185-265)||(16008062-16008143)
chr7 (185-265)||(16089999-16090080)
chr7 (185-265)||(20907478-20907559)
chr7 (207-322)||(82133-82254)
chr7 (207-297)||(15104426-15104520)
chr7 (207-267)||(1612623-1612685)
chr7 (207-267)||(6411821-6411883)
chr7 (185-265)||(11383955-11384037)
chr7 (185-265)||(11390443-11390525)
chr7 (207-267)||(14281760-14281822)
chr7 (187-265)||(14421334-14421415)
chr7 (185-265)||(16676170-16676252)
chr7 (185-265)||(17650407-17650489)
chr7 (197-265)||(20328365-20328435)
chr7 (185-265)||(23665944-23666026)
chr7 (101-152)||(45185358-45185408)
chr7 (185-223)||(11302830-11302868)
chr7 (187-221)||(13006286-13006320)
chr7 (185-266)||(14266118-14266202)
chr7 (118-152)||(14582875-14582909)
chr7 (209-264)||(19599844-19599901)
chr7 (185-223)||(29795708-29795746)
chr7 (185-223)||(29799527-29799565)
chr7 (185-265)||(2464291-2464372)
chr7 (207-322)||(10519836-10519955)
chr7 (319-375)||(16073934-16073991)
chr7 (312-375)||(16476101-16476163)
chr7 (330-375)||(18607026-18607071)
chr7 (332-384)||(32771662-32771715)
chr7 (316-371)||(11309145-11309201)
chr7 (316-371)||(11312453-11312509)
chr7 (100-152)||(12547071-12547122)
chr7 (330-374)||(14281617-14281661)
chr7 (207-266)||(16575546-16575608)
chr7 (207-266)||(16590054-16590116)
chr7 (207-266)||(23442259-23442321)
chr7 (330-374)||(35962709-35962753)
chr7 (207-269)||(45185447-45185513)
[»] chr2 (86 HSPs)
chr2 (132-411)||(27037170-27037452)
chr2 (132-411)||(33976-34258)
chr2 (129-411)||(11465995-11466278)
chr2 (132-400)||(22013048-22013319)
chr2 (132-411)||(35243959-35244241)
chr2 (132-411)||(2385847-2386129)
chr2 (132-411)||(24426766-24427048)
chr2 (184-384)||(17592492-17592695)
chr2 (185-384)||(13101133-13101333)
chr2 (132-411)||(27729436-27729715)
chr2 (129-408)||(28292642-28292924)
chr2 (185-384)||(15643249-15643448)
chr2 (132-407)||(4077348-4077623)
chr2 (199-411)||(27272244-27272458)
chr2 (132-411)||(44091014-44091293)
chr2 (132-411)||(20850117-20850397)
chr2 (142-410)||(21604701-21604970)
chr2 (132-410)||(24481526-24481804)
chr2 (132-411)||(4071469-4071749)
chr2 (132-410)||(30196441-30196719)
chr2 (206-375)||(14563832-14564001)
chr2 (132-410)||(1067024-1067302)
chr2 (185-384)||(32911442-32911642)
chr2 (205-384)||(36800556-36800735)
chr2 (142-411)||(36984490-36984761)
chr2 (166-411)||(31828571-31828820)
chr2 (166-411)||(31833923-31834172)
chr2 (185-384)||(45028487-45028687)
chr2 (132-410)||(11360170-11360444)
chr2 (132-410)||(1061641-1061919)
chr2 (185-384)||(25590161-25590359)
chr2 (134-322)||(28971337-28971529)
chr2 (129-322)||(21133311-21133509)
chr2 (14-152)||(9241123-9241261)
chr2 (330-411)||(71439-71520)
chr2 (132-291)||(71521-71679)
chr2 (14-152)||(19663073-19663211)
chr2 (118-265)||(19649660-19649811)
chr2 (14-149)||(6261798-6261933)
chr2 (14-152)||(6482142-6482280)
chr2 (14-152)||(6485609-6485747)
chr2 (206-287)||(35585357-35585438)
chr2 (129-221)||(43693323-43693415)
chr2 (129-221)||(6744487-6744579)
chr2 (18-152)||(10685873-10686005)
chr2 (14-152)||(20260616-20260752)
chr2 (129-265)||(27367700-27367838)
chr2 (129-265)||(200563-200701)
chr2 (185-267)||(23062479-23062564)
chr2 (90-152)||(26884019-26884081)
chr2 (185-265)||(9500-9581)
chr2 (236-328)||(22796682-22796776)
chr2 (185-265)||(19662942-19663023)
chr2 (185-265)||(26884131-26884212)
chr2 (185-265)||(27211097-27211178)
chr2 (185-265)||(21074096-21074179)
chr2 (187-265)||(6261664-6261743)
chr2 (185-265)||(10685741-10685823)
chr2 (207-267)||(2105577-2105640)
chr2 (187-220)||(5707178-5707211)
chr2 (47-152)||(22809745-22809850)
chr2 (185-265)||(29280919-29281000)
chr2 (207-321)||(38931619-38931738)
chr2 (207-267)||(20724032-20724095)
chr2 (247-322)||(24660500-24660576)
chr2 (207-322)||(25267199-25267320)
chr2 (187-265)||(6482301-6482382)
chr2 (187-265)||(6485768-6485849)
chr2 (231-322)||(8890027-8890121)
chr2 (207-267)||(22809882-22809944)
chr2 (185-265)||(23102575-23102657)
chr2 (185-265)||(23169415-23169497)
chr2 (185-265)||(23580672-23580754)
chr2 (207-322)||(19035478-19035598)
chr2 (330-375)||(9241493-9241538)
chr2 (207-261)||(22703489-22703545)
chr2 (330-375)||(22810043-22810088)
chr2 (207-322)||(22860301-22860420)
chr2 (187-265)||(26582655-26582735)
chr2 (185-221)||(9241311-9241347)
chr2 (207-265)||(20914451-20914513)
chr2 (185-265)||(21907226-21907309)
chr2 (185-221)||(23090193-23090229)
chr2 (200-265)||(23269192-23269259)
chr2 (200-265)||(23276061-23276128)
chr2 (207-267)||(24658773-24658836)
[»] chr4 (100 HSPs)
chr4 (126-384)||(47872376-47872636)
chr4 (132-410)||(5938798-5939079)
chr4 (123-410)||(7359113-7359402)
chr4 (132-410)||(1583783-1584064)
chr4 (129-411)||(45959668-45959953)
chr4 (129-375)||(54844912-54845159)
chr4 (132-411)||(21396689-21396971)
chr4 (129-384)||(35462566-35462821)
chr4 (142-411)||(42955949-42956220)
chr4 (129-411)||(11202357-11202641)
chr4 (132-375)||(34772041-34772286)
chr4 (129-384)||(45142503-45142760)
chr4 (185-409)||(19128272-19128497)
chr4 (185-408)||(20894922-20895146)
chr4 (132-411)||(52500426-52500705)
chr4 (185-408)||(20889303-20889527)
chr4 (185-384)||(33097022-33097221)
chr4 (185-384)||(49548538-49548738)
chr4 (132-408)||(29382695-29382973)
chr4 (199-384)||(2972687-2972873)
chr4 (185-384)||(31664988-31665188)
chr4 (132-408)||(3259922-3260198)
chr4 (185-384)||(21881521-21881720)
chr4 (185-384)||(42220360-42220559)
chr4 (167-410)||(23435911-23436156)
chr4 (132-411)||(11937033-11937313)
chr4 (129-410)||(26395556-26395838)
chr4 (185-408)||(36037491-36037715)
chr4 (132-410)||(29448605-29448883)
chr4 (132-410)||(29455289-29455567)
chr4 (199-384)||(33221312-33221498)
chr4 (142-411)||(3266547-3266818)
chr4 (132-406)||(39266170-39266443)
chr4 (142-411)||(49240772-49241043)
chr4 (142-411)||(49749486-49749757)
chr4 (185-384)||(46044825-46045025)
chr4 (190-384)||(899527-899721)
chr4 (123-341)||(7356120-7356339)
chr4 (185-384)||(30396127-30396324)
chr4 (207-384)||(49548323-49548502)
chr4 (185-384)||(41404662-41404861)
chr4 (129-287)||(45151372-45151529)
chr4 (129-291)||(50082132-50082292)
chr4 (132-312)||(391001-391180)
chr4 (271-408)||(391178-391317)
chr4 (134-298)||(13452154-13452320)
chr4 (15-152)||(30146601-30146738)
chr4 (141-322)||(37881330-37881516)
chr4 (15-152)||(14047854-14047991)
chr4 (330-408)||(50082293-50082371)
chr4 (14-152)||(15533578-15533714)
chr4 (185-322)||(15244077-15244219)
chr4 (91-152)||(14910452-14910513)
chr4 (185-269)||(10977133-10977220)
chr4 (185-266)||(14821334-14821418)
chr4 (132-240)||(15470652-15470758)
chr4 (14-112)||(36037311-36037409)
chr4 (185-319)||(13886644-13886783)
chr4 (207-322)||(13899676-13899797)
chr4 (185-322)||(15306979-15307121)
chr4 (47-152)||(2585385-2585487)
chr4 (89-152)||(14556298-14556361)
chr4 (185-265)||(14910563-14910645)
chr4 (207-267)||(23121599-23121661)
chr4 (207-322)||(16484596-16484716)
chr4 (205-322)||(53905376-53905499)
chr4 (207-322)||(15360884-15361003)
chr4 (47-152)||(41529295-41529400)
chr4 (185-265)||(11847031-11847113)
chr4 (207-269)||(18271262-18271327)
chr4 (207-267)||(20940260-20940322)
chr4 (207-265)||(27905211-27905270)
chr4 (207-265)||(40908583-40908642)
chr4 (90-152)||(16484496-16484557)
chr4 (47-152)||(14062770-14062875)
chr4 (185-265)||(16147891-16147972)
chr4 (47-136)||(16221092-16221181)
chr4 (207-269)||(15005083-15005149)
chr4 (207-265)||(1651177-1651236)
chr4 (207-267)||(4831203-4831265)
chr4 (207-267)||(4834498-4834560)
chr4 (210-322)||(16229180-16229297)
chr4 (247-322)||(18166347-18166422)
chr4 (207-269)||(18261297-18261362)
chr4 (330-375)||(14485672-14485717)
chr4 (330-375)||(14910747-14910792)
chr4 (197-267)||(15406902-15406973)
chr4 (330-375)||(18212298-18212343)
chr4 (330-375)||(26077682-26077727)
chr4 (207-267)||(2585283-2585346)
chr4 (207-322)||(8833771-8833892)
chr4 (332-375)||(10972873-10972917)
chr4 (247-322)||(12931881-12931957)
chr4 (207-269)||(13444207-13444273)
chr4 (210-267)||(14484432-14484491)
chr4 (100-152)||(15546468-15546520)
chr4 (330-374)||(17000139-17000183)
chr4 (100-152)||(27849699-27849751)
chr4 (100-152)||(30237647-30237699)
chr4 (312-375)||(30237894-30237958)
[»] chr1 (89 HSPs)
chr1 (132-411)||(42626124-42626404)
chr1 (129-408)||(4231109-4231391)
chr1 (132-411)||(20570666-20570947)
chr1 (142-408)||(21962939-21963208)
chr1 (145-411)||(20292617-20292886)
chr1 (132-408)||(18026665-18026942)
chr1 (132-411)||(6740444-6740723)
chr1 (185-384)||(49328011-49328210)
chr1 (132-407)||(20277166-20277441)
chr1 (132-407)||(28556416-28556691)
chr1 (132-411)||(37682012-37682292)
chr1 (132-410)||(39094247-39094525)
chr1 (142-411)||(18418060-18418329)
chr1 (132-411)||(37675319-37675599)
chr1 (142-410)||(39189592-39189861)
chr1 (132-411)||(38907964-38908243)
chr1 (142-411)||(31535210-31535481)
chr1 (142-411)||(31563927-31564198)
chr1 (142-411)||(48427787-48428058)
chr1 (199-384)||(29596794-29596980)
chr1 (132-346)||(17146182-17146397)
chr1 (220-384)||(29602229-29602394)
chr1 (185-384)||(47484085-47484284)
chr1 (199-384)||(21920788-21920974)
chr1 (185-384)||(36614913-36615113)
chr1 (185-373)||(43088369-43088557)
chr1 (132-411)||(20396783-20397067)
chr1 (206-391)||(22185534-22185721)
chr1 (142-291)||(9269867-9270016)
chr1 (129-279)||(24850022-24850171)
chr1 (132-289)||(52990639-52990796)
chr1 (241-411)||(20076860-20077033)
chr1 (129-298)||(23195559-23195731)
chr1 (132-312)||(3652709-3652888)
chr1 (101-322)||(24109083-24109309)
chr1 (132-291)||(36212043-36212200)
chr1 (14-152)||(16371327-16371465)
chr1 (129-250)||(20299279-20299400)
chr1 (271-411)||(20299377-20299515)
chr1 (330-411)||(36211961-36212042)
chr1 (141-298)||(24079485-24079646)
chr1 (15-152)||(29534763-29534900)
chr1 (15-152)||(32649926-32650063)
chr1 (129-265)||(21541978-21542116)
chr1 (129-265)||(42096020-42096158)
chr1 (14-152)||(20438780-20438918)
chr1 (342-410)||(17149454-17149523)
chr1 (47-152)||(16883757-16883862)
chr1 (47-152)||(20824562-20824667)
chr1 (47-152)||(20838381-20838486)
chr1 (185-265)||(20852183-20852264)
chr1 (185-265)||(20858809-20858890)
chr1 (185-265)||(21705200-21705281)
chr1 (207-375)||(21698132-21698305)
chr1 (231-375)||(22030704-22030849)
chr1 (207-267)||(3706877-3706939)
chr1 (90-152)||(19852929-19852991)
chr1 (90-152)||(19859064-19859126)
chr1 (47-152)||(11141222-11141327)
chr1 (207-322)||(21410736-21410857)
chr1 (207-267)||(955157-955219)
chr1 (247-322)||(11141063-11141138)
chr1 (247-322)||(15316566-15316641)
chr1 (185-265)||(19664246-19664328)
chr1 (207-267)||(22448378-22448440)
chr1 (185-266)||(21987081-21987165)
chr1 (205-286)||(10813614-10813697)
chr1 (185-265)||(16371515-16371596)
chr1 (185-265)||(16669390-16669471)
chr1 (198-322)||(20849014-20849144)
chr1 (185-265)||(11156939-11157022)
chr1 (207-267)||(20824467-20824530)
chr1 (207-267)||(20941971-20942034)
chr1 (100-152)||(23630856-23630907)
chr1 (100-152)||(23712376-23712427)
chr1 (247-321)||(21664203-21664278)
chr1 (207-267)||(23066816-23066878)
chr1 (245-322)||(31927478-31927556)
chr1 (47-152)||(19666952-19667056)
chr1 (330-375)||(19961297-19961342)
chr1 (330-375)||(20242694-20242739)
chr1 (236-322)||(11157038-11157126)
chr1 (331-375)||(20824329-20824373)
chr1 (207-267)||(20838286-20838349)
chr1 (47-136)||(20942087-20942178)
chr1 (100-152)||(21698035-21698086)
chr1 (330-374)||(23066673-23066717)
chr1 (285-375)||(23631074-23631165)
chr1 (207-267)||(29554560-29554623)
[»] scaffold0001 (7 HSPs)
scaffold0001 (129-411)||(512489-512771)
scaffold0001 (185-384)||(178981-179181)
scaffold0001 (47-152)||(95704-95809)
scaffold0001 (185-265)||(494075-494156)
scaffold0001 (188-221)||(174725-174758)
scaffold0001 (332-375)||(488350-488394)
scaffold0001 (207-266)||(524649-524711)
[»] scaffold0560 (1 HSPs)
scaffold0560 (129-411)||(971-1256)
[»] scaffold0103 (2 HSPs)
scaffold0103 (132-411)||(19533-19813)
scaffold0103 (132-411)||(23771-24052)
[»] scaffold0279 (1 HSPs)
scaffold0279 (123-411)||(5675-5965)
[»] scaffold0214 (1 HSPs)
scaffold0214 (129-384)||(15179-15436)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (129-384)||(15025-15281)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (129-411)||(4593-4875)
scaffold0188 (118-322)||(31632-31840)
[»] scaffold0320 (1 HSPs)
scaffold0320 (129-384)||(814-1072)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (131-411)||(24966-25245)
[»] scaffold1427 (2 HSPs)
scaffold1427 (185-384)||(602-802)
scaffold1427 (330-375)||(1000-1045)
[»] scaffold0457 (1 HSPs)
scaffold0457 (142-411)||(12181-12452)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (129-411)||(31562-31847)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (185-384)||(74112-74311)
scaffold0031 (207-298)||(120787-120882)
scaffold0031 (207-298)||(131664-131759)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (186-384)||(1995-2192)
[»] scaffold0154 (2 HSPs)
scaffold0154 (166-411)||(18373-18621)
scaffold0154 (185-265)||(29726-29808)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (185-408)||(65260-65484)
[»] scaffold0443 (1 HSPs)
scaffold0443 (132-411)||(13333-13613)
[»] scaffold0076 (4 HSPs)
scaffold0076 (185-384)||(39-239)
scaffold0076 (129-265)||(30262-30400)
scaffold0076 (129-265)||(35663-35801)
scaffold0076 (330-375)||(51672-51717)
[»] scaffold0089 (2 HSPs)
scaffold0089 (166-407)||(18481-18724)
scaffold0089 (185-267)||(1873-1958)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (132-408)||(104214-104490)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (208-384)||(24648-24825)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (185-384)||(101645-101843)
[»] scaffold0310 (3 HSPs)
scaffold0310 (185-355)||(7692-7861)
scaffold0310 (271-409)||(12924-13063)
scaffold0310 (185-245)||(12883-12942)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (206-410)||(50000-50206)
[»] scaffold0113 (4 HSPs)
scaffold0113 (224-411)||(19231-19419)
scaffold0113 (271-411)||(15180-15321)
scaffold0113 (187-289)||(19150-19252)
scaffold0113 (199-245)||(15152-15198)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (219-384)||(30845-31010)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (185-384)||(246998-247197)
scaffold0009 (185-384)||(253512-253711)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (185-384)||(41210-41408)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (132-291)||(16100-16258)
[»] scaffold0326 (2 HSPs)
scaffold0326 (101-322)||(451-675)
scaffold0326 (338-375)||(5377-5415)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (134-322)||(26018-26210)
scaffold0104 (134-322)||(27400-27592)
[»] scaffold1726 (1 HSPs)
scaffold1726 (134-298)||(151-319)
[»] scaffold0034 (5 HSPs)
scaffold0034 (117-265)||(10223-10374)
scaffold0034 (101-265)||(17519-17687)
scaffold0034 (185-267)||(35839-35924)
scaffold0034 (207-265)||(72229-72288)
scaffold0034 (330-375)||(10076-10121)
[»] scaffold0026 (10 HSPs)
scaffold0026 (14-152)||(109983-110121)
scaffold0026 (185-265)||(110171-110252)
scaffold0026 (207-267)||(63308-63370)
scaffold0026 (47-152)||(124687-124792)
scaffold0026 (185-267)||(142610-142694)
scaffold0026 (207-265)||(124588-124649)
scaffold0026 (187-265)||(12994-13074)
scaffold0026 (207-269)||(28033-28099)
scaffold0026 (332-375)||(38723-38767)
scaffold0026 (207-269)||(38870-38936)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (288-384)||(9835-9932)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (185-269)||(143940-144024)
scaffold0019 (289-384)||(137159-137254)
[»] scaffold1584 (1 HSPs)
scaffold1584 (118-265)||(230-381)
[»] scaffold0106 (4 HSPs)
scaffold0106 (129-265)||(38323-38461)
scaffold0106 (47-152)||(46974-47079)
scaffold0106 (47-152)||(51247-51352)
scaffold0106 (207-319)||(36180-36298)
[»] scaffold0011 (9 HSPs)
scaffold0011 (129-265)||(174678-174816)
scaffold0011 (47-152)||(258354-258459)
scaffold0011 (47-152)||(197656-197760)
scaffold0011 (47-149)||(146862-146964)
scaffold0011 (90-152)||(251782-251844)
scaffold0011 (247-322)||(147050-147126)
scaffold0011 (207-297)||(56853-56947)
scaffold0011 (231-322)||(75156-75250)
scaffold0011 (207-267)||(197555-197618)
[»] scaffold0124 (5 HSPs)
scaffold0124 (14-152)||(37066-37204)
scaffold0124 (247-322)||(9268-9343)
scaffold0124 (247-322)||(44938-45013)
scaffold0124 (330-375)||(36789-36834)
scaffold0124 (185-221)||(36980-37016)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (129-265)||(52501-52639)
scaffold0028 (129-265)||(47096-47233)
scaffold0028 (207-322)||(64965-65085)
scaffold0028 (247-322)||(999-1075)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (118-265)||(52753-52904)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (118-322)||(5187-5396)
[»] scaffold0348 (4 HSPs)
scaffold0348 (131-265)||(2843-2980)
scaffold0348 (47-152)||(1942-2047)
scaffold0348 (207-267)||(1841-1904)
scaffold0348 (207-267)||(15579-15641)
[»] scaffold0544 (2 HSPs)
scaffold0544 (14-152)||(3098-3236)
scaffold0544 (185-265)||(2967-3048)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (185-322)||(5-146)
[»] scaffold0276 (1 HSPs)
scaffold0276 (349-411)||(22039-22101)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (47-152)||(55771-55876)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (118-265)||(9913-10063)
scaffold0420 (102-152)||(4970-5020)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (185-322)||(4183-4324)
scaffold0395 (332-375)||(4091-4135)
[»] scaffold0102 (4 HSPs)
scaffold0102 (207-375)||(38421-38594)
scaffold0102 (101-152)||(29702-29752)
scaffold0102 (207-269)||(29801-29867)
scaffold0102 (207-322)||(44580-44701)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (47-149)||(24010-24112)
scaffold0077 (185-221)||(4781-4817)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (47-152)||(17103-17208)
[»] scaffold0249 (2 HSPs)
scaffold0249 (185-265)||(14915-14996)
scaffold0249 (185-267)||(7923-8008)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (207-322)||(47882-48001)
scaffold0114 (207-267)||(41931-41993)
scaffold0114 (330-374)||(42091-42135)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (47-139)||(38204-38296)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (185-267)||(153-238)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (327-384)||(20102-20160)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (185-267)||(16160-16245)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (185-375)||(42904-43096)
scaffold0049 (312-375)||(45094-45156)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (185-266)||(18291-18375)
scaffold0005 (207-267)||(258674-258736)
scaffold0005 (207-267)||(265100-265162)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (44-152)||(29404-29513)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (185-322)||(129752-129894)
scaffold0004 (207-267)||(321062-321125)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (207-267)||(3658-3720)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (207-267)||(141326-141388)
scaffold0021 (207-267)||(146566-146629)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (233-322)||(3358-3448)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (207-322)||(18505-18625)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (185-269)||(51109-51197)
[»] scaffold0720 (1 HSPs)
scaffold0720 (185-265)||(4286-4367)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (207-322)||(5068-5187)
scaffold0556 (100-152)||(10808-10859)
[»] scaffold0407 (1 HSPs)
scaffold0407 (47-152)||(4576-4681)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (207-322)||(8474-8593)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (185-267)||(17054-17137)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (185-319)||(19462-19601)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (185-267)||(41732-41815)
scaffold0107 (330-375)||(41588-41633)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (47-152)||(57449-57554)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (47-152)||(141079-141184)
[»] scaffold0664 (1 HSPs)
scaffold0664 (47-139)||(8285-8377)
[»] scaffold0309 (3 HSPs)
scaffold0309 (207-375)||(5864-6034)
scaffold0309 (207-375)||(8016-8186)
scaffold0309 (47-152)||(20659-20765)
[»] scaffold1299 (2 HSPs)
scaffold1299 (185-265)||(284-366)
scaffold1299 (330-375)||(139-184)
[»] scaffold0535 (1 HSPs)
scaffold0535 (207-267)||(6146-6208)
[»] scaffold0298 (2 HSPs)
scaffold0298 (247-322)||(8280-8355)
scaffold0298 (247-322)||(18364-18439)
[»] scaffold0239 (2 HSPs)
scaffold0239 (207-267)||(14611-14673)
scaffold0239 (330-374)||(14469-14513)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (207-267)||(5122-5184)
scaffold0222 (185-321)||(27972-28113)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (247-322)||(9281-9356)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (185-265)||(103045-103127)
[»] scaffold1061 (1 HSPs)
scaffold1061 (207-322)||(1285-1405)
[»] scaffold0811 (1 HSPs)
scaffold0811 (187-221)||(117-151)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (207-322)||(2868-2988)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (47-152)||(172023-172131)
[»] scaffold1615 (1 HSPs)
scaffold1615 (197-267)||(532-603)
[»] scaffold1426 (1 HSPs)
scaffold1426 (132-185)||(1-54)
[»] scaffold0516 (2 HSPs)
scaffold0516 (198-322)||(6117-6245)
scaffold0516 (332-375)||(6293-6337)
[»] scaffold0343 (1 HSPs)
scaffold0343 (185-265)||(254-335)
[»] scaffold0071 (2 HSPs)
scaffold0071 (207-265)||(51088-51148)
scaffold0071 (330-370)||(50948-50988)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (185-265)||(80551-80632)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (185-265)||(92251-92332)
scaffold0029 (185-265)||(97977-98058)
[»] scaffold0693 (1 HSPs)
scaffold0693 (185-265)||(2016-2099)
[»] scaffold0461 (2 HSPs)
scaffold0461 (185-265)||(1197-1280)
scaffold0461 (185-265)||(8133-8216)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (207-269)||(1469-1535)
[»] scaffold0304 (2 HSPs)
scaffold0304 (207-297)||(97-191)
scaffold0304 (101-152)||(240-290)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (100-152)||(45402-45453)
[»] scaffold0097 (1 HSPs)
scaffold0097 (207-267)||(27861-27924)
[»] scaffold1290 (2 HSPs)
scaffold1290 (101-152)||(1494-1544)
scaffold1290 (207-269)||(1381-1447)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (185-265)||(2544-2626)
[»] scaffold0371 (2 HSPs)
scaffold0371 (101-152)||(1139-1189)
scaffold0371 (207-269)||(1024-1090)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (207-267)||(10341-10403)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (187-265)||(9748-9829)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (247-322)||(17489-17564)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (101-152)||(208011-208061)
scaffold0007 (207-269)||(207898-207964)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (47-152)||(8244-8350)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (247-322)||(9372-9449)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (207-324)||(76714-76837)
[»] scaffold1853 (1 HSPs)
scaffold1853 (207-268)||(921-987)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (330-375)||(11912-11957)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (330-375)||(7410-7455)
[»] scaffold0261 (4 HSPs)
scaffold0261 (330-375)||(24472-24517)
scaffold0261 (332-375)||(10626-10670)
scaffold0261 (207-269)||(10773-10839)
scaffold0261 (332-375)||(18805-18849)
[»] scaffold0192 (2 HSPs)
scaffold0192 (47-152)||(6451-6555)
scaffold0192 (207-267)||(6593-6656)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (207-298)||(19794-19889)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (207-265)||(47529-47589)
scaffold0067 (207-265)||(56563-56623)
scaffold0067 (207-265)||(62949-63009)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (330-375)||(20489-20534)
[»] scaffold0924 (1 HSPs)
scaffold0924 (324-375)||(2410-2462)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (247-322)||(443-519)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (207-267)||(5513-5576)
[»] scaffold0609 (1 HSPs)
scaffold0609 (185-221)||(12-48)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (330-377)||(19439-19487)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (207-265)||(9523-9585)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (207-269)||(11730-11796)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (207-269)||(22823-22889)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (332-375)||(55912-55956)
scaffold0081 (207-269)||(56058-56124)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (330-374)||(17638-17682)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (207-267)||(44231-44294)
scaffold0010 (207-267)||(49297-49360)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (207-267)||(370396-370459)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 98)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Original strand, 27345642 - 27345922
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 231  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27345642 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccg 27345741  T
Q  232 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27345742 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgt 27345841  T
Q  331 ttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  27345842 ttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcatacaaactccatgtgactccacttaaa 27345922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Original strand, 23117135 - 23117417
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 231  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23117135 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatggatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 23117234  T
Q  232 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg- 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||     
T  23117235 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgt 23117334  T
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgc-aactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23117335 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtgactccacttaaa 23117417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 10956890 - 10956609
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 231  Q
    ||||||| | ||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10956890 caacaactaagactcatgcaaatgtcatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatggatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 10956791  T
Q  232 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg- 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||     
T  10956790 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccagggcatgagtcctctccgttgt 10956691  T
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10956690 tttatgcatatgcaatggatctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 10956609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 129 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 40144501 - 40144219
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagga 228  Q
    |||||||||  | |||||||||||  || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40144501 aaccaacaaataagactcatgcaatggacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaa-atatgcaaatatgcatgtggtaccaaccagga 40144403  T
Q  229 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgc 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40144402 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgc 40144303  T
Q  328 tgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  40144302 tgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcatacaaactccatgtgactccacttaaa 40144219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 142 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 26486215 - 26485943
Alignment:
Q  142 gactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcac 241  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26486215 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatggatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcac 26486116  T
Q  242 cgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcata 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26486115 cgcttttgaatggttaaagcattcatcatgaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccactgttttatgcata 26486016  T
Q  340 tgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgc-aactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  26486015 tgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaattgaccatgcaatgcaaactccatgtgacaccacttaaa 26485943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 123 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 14746733 - 14746442
Alignment:
Q  123 aattagaaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaa 222  Q
    ||||| || ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  14746733 aattacaatcaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaa-atatgcaagtatgcatgtggtaccaa 14746635  T
Q  223 acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcct 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14746634 acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccttcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacttgagtcct 14746535  T
Q  322 ctccgctg--tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgc-aactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14746534 ctccgctgtttttatgcatatgcaatcgacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtgactccacttaaa 14746442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 129 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 16267077 - 16266793
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagga 228  Q
    |||||||||  | |||||||||||  || ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16267077 aaccaacaaataagactcatgcaatggacatgacaacactgctaagaaaacaccttagactcctcaa-atatgcaaatatgcatgtggtaccaaccagga 16266979  T
Q  229 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgc 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16266978 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgc 16266879  T
Q  328 tgtttatgcatatgcaatggacctacttgtg--tatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  16266878 tgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatatctacatacaactgaccatgcatacaaactccatgtgactccacttaaa 16266793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 134 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 3224886 - 3224609
Alignment:
Q  134 acaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaa 233  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3224886 acaactacgactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaaatgatgcaaatatacatgtggtaccaaacaggaccgaa 3224787  T
Q  234 gccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg-tt 331  Q
    | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  3224786 gtcctcatcgcttttgaatagttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttt 3224687  T
Q  332 tatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgc-aactccatgtgactccactt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  3224686 tatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtgacaccactt 3224609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 129 - 411
Target Start/End: Original strand, 3697567 - 3697851
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagga 228  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| || ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3697567 aaccaacaacaccgactcatgcaaatgacattacaacaccgctaagacaacaccttagacttctcaa-atatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagga 3697665  T
Q  229 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgc 327  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| || |||||||||||| ||||    
T  3697666 ccgaagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggtccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccagtacatgagtcctcaccgc 3697765  T
Q  328 tg-tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgc-aactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3697766 tgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtgactccacttaaa 3697851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 23224950 - 23224671
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| || |||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  23224950 caacaactacgactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaccatcttagacttctcaatggatgcaa-tatgcatgtggtaccaa-caggaccg 23224853  T
Q  232 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| ||||    || |||| |||||||    
T  23224852 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagcactcaccgctgttgagcaactagtactccaggaacgaagccctcaccgctgt 23224753  T
Q  331 tt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23224752 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 23224671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 185 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 11392757 - 11392532
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  11392757 agactcctcaataaatgcagatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagaattcatcaggaccgaagccctca 11392658  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 383  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11392657 ccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctctgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 11392558  T
Q  384 aatgca-actccatgtgactccactta 409  Q
     || || ||||||| ||||||||||||    
T  11392557 -atacatactccatatgactccactta 11392532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 14416725 - 14416525
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  14416725 agacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgattaaagcattcatcaggaccgaagccctca 14416626  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgc 383  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14416625 ccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctactcgtgtatatctacatacaactagaccatgc 14416526  T
Q  384 a 384  Q
    |    
T  14416525 a 14416525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 166 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 16887469 - 16887222
Alignment:
Q  166 actgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcatt 264  Q
    |||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16887469 actgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcatt 16887371  T
Q  265 catcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtata 362  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16887370 catcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtata 16887271  T
Q  363 tctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16887270 tctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 16887222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 129 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 36800649 - 36800367
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagg 227  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  36800649 aaccaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaattatgcatgtggtaccaatcagg 36800552  T
Q  228 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccg 326  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| |||    
T  36800551 accggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccg 36800452  T
Q  327 ctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 410  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36800451 ctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccaattaa 36800367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 132 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 27909788 - 27909509
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  27909788 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggacc 27909691  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  27909690 ggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 27909591  T
Q  330 ttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 410  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27909590 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccaattaa 27909509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 132 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 27956207 - 27955928
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  27956207 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggacc 27956110  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  27956109 ggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 27956010  T
Q  330 ttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 410  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27956009 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccaattaa 27955928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 14737024 - 14736745
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  14737024 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatggggtaccaaacaggacc 14736928  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| |||||     
T  14736927 gacgccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgcta 14736828  T
Q  330 ttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14736827 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 14736745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 199 - 384
Target Start/End: Original strand, 29328188 - 29328374
Alignment:
Q  199 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaac 298  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29328188 atgcatatatgcatgtcgtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgattaaagcattcatcaagaccgaagccctcaccgctgtgaacaac 29328287  T
Q  299 tagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 384  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29328288 tagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 29328374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 166 - 404
Target Start/End: Original strand, 14563501 - 14563741
Alignment:
Q  166 actgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcatt 264  Q
    |||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14563501 actgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcatt 14563599  T
Q  265 catcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtata 362  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14563600 catcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtata 14563699  T
Q  363 tctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcc 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14563700 tctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcc 14563741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 142 - 411
Target Start/End: Original strand, 28980661 - 28980931
Alignment:
Q  142 gactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataa-atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctca 240  Q
    ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  28980661 gactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgagatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctca 28980758  T
Q  241 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| ||||||    
T  28980759 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaaaccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcat 28980858  T
Q  339 atgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28980859 atgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccaattaaa 28980931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 142 - 411
Target Start/End: Original strand, 28985881 - 28986151
Alignment:
Q  142 gactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataa-atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctca 240  Q
    ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  28985881 gactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgagatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctca 28985978  T
Q  241 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| ||||||    
T  28985979 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaaaccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcat 28986078  T
Q  339 atgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28986079 atgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccaattaaa 28986151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 142 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 9205545 - 9205274
Alignment:
Q  142 gactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat--aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 239  Q
    ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||   ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  9205545 gactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctc 9205448  T
Q  240 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgca 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| |||||    
T  9205447 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgca 9205348  T
Q  338 tatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9205347 tatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcaacttaaa 9205274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 166 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 4520905 - 4520658
Alignment:
Q  166 actgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcatt 264  Q
    |||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4520905 actgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcatt 4520807  T
Q  265 catcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt--atgcatatgcaatggacctacttgtgtat 361  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4520806 catcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtat 4520707  T
Q  362 atctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4520706 atctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccaattaa 4520658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 132 - 405
Target Start/End: Original strand, 14765515 - 14765788
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  14765515 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaatcaggacc 14765611  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| || |||    
T  14765612 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatctggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccactg 14765711  T
Q  330 ttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 405  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14765712 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 14765788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 29299227 - 29299030
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||    
T  29299227 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccgtc-ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaatccctca 29299130  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 383  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29299129 ccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 29299031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 29305773 - 29305576
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||    
T  29305773 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc-ccgcttttgaatggtttaagcattcatcaggaccgaatccctca 29305676  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 383  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29305675 ccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 29305577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 185 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 25701719 - 25701529
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    ||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||| ||||    
T  25701719 agactcctcaaaatatgcaataatgcatgtggtaccaaacaagaccgaagccctcaccgcttctgaatggttaaagcattcatcaggatcgtagccctca 25701620  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25701619 ccgctgtgagcaactagtgctccaggacatgagtcctttccgctgtttatgcttatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 25701529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 166 - 404
Target Start/End: Original strand, 35541008 - 35541248
Alignment:
Q  166 actgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcatt 264  Q
    |||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35541008 actgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggaccaaagccctcatcgcttttgaatggttaaagcatt 35541106  T
Q  265 catcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtata 362  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||| || ||| |||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35541107 catcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactcgtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtata 35541206  T
Q  363 tctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcc 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  35541207 tctacatacaactgaccatgcaatgcaactcaatatgactcc 35541248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Original strand, 43687379 - 43687577
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| | ||||    
T  43687379 agacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagtcctcaccgcttttgaacggttaaagtattcatcaggaccgaaaccctca 43687477  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 383  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||   ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  43687478 ccgctgtgagcaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgtaatggactcccttatgtatatctacatacaacttgaccatgc 43687576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 271 - 411
Target Start/End: Original strand, 6588135 - 6588276
Alignment:
Q  271 gaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacat 369  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6588135 gaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacat 6588234  T
Q  370 acaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  6588235 acaactgaccatgcatacaaactccatgtgactccacttaaa 6588276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 271 - 409
Target Start/End: Original strand, 27873818 - 27873957
Alignment:
Q  271 gaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacata 370  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27873818 gaccgaagccctcaccgttgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacata 27873917  T
Q  371 caac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccactta 409  Q
    |||| ||||||||| || || ||||||| ||||||||||||    
T  27873918 caacttgaccatgc-atacatactccatatgactccactta 27873957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 271 - 409
Target Start/End: Original strand, 27948606 - 27948745
Alignment:
Q  271 gaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacata 370  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27948606 gaccgaagccctcaccgttgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacata 27948705  T
Q  371 caac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccactta 409  Q
    |||| ||||||||| || || ||||||| ||||||||||||    
T  27948706 caacttgaccatgc-atacatactccatatgactccactta 27948745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 129 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 31418948 - 31418804
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacc--aaacag 226  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  31418948 aaccaacaagaccgactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcag 31418849  T
Q  227 gaccgaagccctcaccgc--ttttgaatggttaaagcattcatca 269  Q
    | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  31418848 ggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattcatca 31418804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 271 - 409
Target Start/End: Original strand, 27889948 - 27890087
Alignment:
Q  271 gaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacata 370  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27889948 gaccgaagccctcaccgttgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacata 27890047  T
Q  371 c-aactgaccatgcaatgca-actccatgtgactccactta 409  Q
    | || ||||||||| || || ||||||| ||||||||||||    
T  27890048 caaattgaccatgc-atacatactccatatgactccactta 27890087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 266 - 410
Target Start/End: Original strand, 214002 - 214149
Alignment:
Q  266 atcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt--atgcatatgcaatggacctacttgtgtata 362  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  214002 atcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtata 214101  T
Q  363 tctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  214102 tctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 214149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 266 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 238252 - 238105
Alignment:
Q  266 atcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt--atgcatatgcaatggacctacttgtgtata 362  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  238252 atcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtata 238153  T
Q  363 tctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  238152 tctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 238105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 266 - 410
Target Start/End: Original strand, 727625 - 727772
Alignment:
Q  266 atcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt--atgcatatgcaatggacctacttgtgtata 362  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  727625 atcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtata 727724  T
Q  363 tctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  727725 tctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 727772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 266 - 410
Target Start/End: Original strand, 800126 - 800273
Alignment:
Q  266 atcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt--atgcatatgcaatggacctacttgtgtata 362  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  800126 atcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtata 800225  T
Q  363 tctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  800226 tctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 800273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 266 - 410
Target Start/End: Original strand, 851519 - 851666
Alignment:
Q  266 atcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt--atgcatatgcaatggacctacttgtgtata 362  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  851519 atcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtata 851618  T
Q  363 tctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  851619 tctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 851666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 132 - 250
Target Start/End: Original strand, 6588040 - 6588158
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 231  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  6588040 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaatagatgcaattatgcatgtggtaccaaccaggaccg 6588139  T
Q  232 aagccctcaccgcttttga 250  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  6588140 aagccctcaccgctgttga 6588158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 141 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 31412754 - 31412622
Alignment:
Q  141 cgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacc--aaacaggaccgaagccct 238  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||    
T  31412754 cgactcatgcaaatgacatgacaacactactaagacagcaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccct 31412655  T
Q  239 caccgc--ttttgaatggttaaagcattcatca 269  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  31412654 caccgctgttttgaatggttaaagcattcatca 31412622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 330 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 10948608 - 10948527
Alignment:
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10948608 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 10948527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 8729399 - 8729261
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaaca 113  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| | | ||||||||  ||||||||||||||    
T  8729399 atcatcaataatagatatctaattcatcaattaaatctaacaccctgtcataataataattcatcaatatataagtatatcatctttaacaacatcaaca 8729300  T
Q  114 ccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
     || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8729299 acaaatggtaattaaaaccaacaacaacgactcatgcaa 8729261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Original strand, 44476057 - 44476195
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaaca 113  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| | | |||| |||| ||||||||||||||    
T  44476057 atcatcaataatagatatccaattcatcaattaaatctaacaccctgtcataataataattcatcaatatataagtatattatcattaacaacatcaaca 44476156  T
Q  114 ccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
     || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44476157 acaaatggtaattaaaaccaacaacaacgactcatgcaa 44476195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Original strand, 44479319 - 44479457
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaaca 113  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| | | |||| |||| ||||||||||||||    
T  44479319 atcatcaataatagatatccaattcatcaattaaatctaacaccctgtcataataataattcatcaatatataagtatattatcattaacaacatcaaca 44479418  T
Q  114 ccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
     || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44479419 acaaatggtaattaaaaccaacaacaacgactcatgcaa 44479457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 134 - 221
Target Start/End: Original strand, 5240007 - 5240094
Alignment:
Q  134 acaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 221  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5240007 acaacaccgactcatgcaactgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 5240094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 129 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 30767204 - 30767066
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--cag 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  30767204 aaccaacaacaccgactcatgcaaatgacataacaacaccgctaagacaacaccctagtctcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcag 30767105  T
Q  227 gaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    | |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  30767104 ggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 30767066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 184 - 322
Target Start/End: Original strand, 23653816 - 23653957
Alignment:
Q  184 tagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctttt-gaatggttaaagcattcatcaagaccgaagct 280  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| | |||  |||      
T  23653816 tagactcctcaagaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaatagaatggttaaagcattcattaggacataagtc 23653915  T
Q  281 ctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    ||||||||| |||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  23653916 ctcaccgctttgaacaacaagtgttccaggacatgagtcctc 23653957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 265
Target Start/End: Original strand, 23825051 - 23825184
Alignment:
Q  134 acaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccg 231  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||    
T  23825051 acaacaccgactcatgcaaacgacatgacaacaccgctaagacaaccccttagactcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccg 23825150  T
Q  232 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
       ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  23825151 tgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 23825184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 27942560 - 27942422
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaaca 113  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||| |   ||||||||| ||||||||||||||    
T  27942560 atcatcaataatagatatctaattcatcaattaaatctaacaccctgtcatattaataattcatcaatatataaatatatcatcattaacaacatcaaca 27942461  T
Q  114 ccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
     |  |||||||| | |||||| |||  ||||||||||||    
T  27942460 tccaatggtaataaaaaccaataacttcgactcatgcaa 27942422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 265
Target Start/End: Original strand, 21281992 - 21282119
Alignment:
Q  141 cgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 238  Q
    ||||||||||| |||| ||  ||| || |||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||    
T  21281992 cgactcatgcatatgacataacaacaccgctaagacaacaccctaaactcctcaaataatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccct 21282091  T
Q  239 caccgct-tttgaatggttaaagcattc 265  Q
    |||||||  | |||||||||||||||||    
T  21282092 caccgctaatcgaatggttaaagcattc 21282119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 23653186 - 23653070
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctc 281  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||  |||  |    
T  23653186 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcatttatcaggacataagtcc 23653087  T
Q  282 tcaccgctgtgaacaac 298  Q
    |||||||| ||||||||    
T  23653086 tcaccgctttgaacaac 23653070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 365 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 808008 - 807963
Alignment:
Q  365 tacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  808008 tacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 807963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 250
Target Start/End: Original strand, 213914 - 214030
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  213914 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaatcaggacc 214010  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttga 250  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  214011 gaagccctcaccgctgttga 214030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 238340 - 238224
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  238340 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaatcaggacc 238244  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttga 250  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  238243 gaagccctcaccgctgttga 238224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 250
Target Start/End: Original strand, 727537 - 727653
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  727537 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaatcaggacc 727633  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttga 250  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  727634 gaagccctcaccgctgttga 727653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 250
Target Start/End: Original strand, 800038 - 800154
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  800038 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaatcaggacc 800134  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttga 250  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  800135 gaagccctcaccgctgttga 800154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 250
Target Start/End: Original strand, 851431 - 851547
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  851431 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaatcaggacc 851527  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttga 250  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  851528 gaagccctcaccgctgttga 851547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Original strand, 16259367 - 16259474
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatc--tctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgac 144  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||| ||||  | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||| || |    
T  16259367 aatctaacaccctaacataataacaattcatcaatatataaataaatatcatcattaacaacatcaacaataaatggtaattataaccaacaacatcgtc 16259466  T
Q  145 tcatgcaa 152  Q
    ||||||||    
T  16259467 tcatgcaa 16259474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 20974344 - 20974239
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactc 146  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||   ||| || |||||||||| || ||||||||||| || ||||||| ||  ||||||| || ||||||    
T  20974344 aatctaacaccctatcataataataattcatcaacatatataaatatcatcattatcaacatcaacaacaaatggtaaataagaccaacaccatcgactc 20974245  T
Q  147 atgcaa 152  Q
    ||||||    
T  20974244 atgcaa 20974239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24321801 - 24321720
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||    
T  24321801 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattc 24321720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 322
Target Start/End: Original strand, 39363480 - 39363599
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaacta-gt 302  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| | |  ||||||||| |||||||| | ||    
T  39363480 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaaacattcatcaggacccaggtcctcaccgctttgaacaacaaggt 39363579  T
Q  303 gctctaggacatgagtcctc 322  Q
    | || ||||||| |||||||    
T  39363580 gttccaggacataagtcctc 39363599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 14057806 - 14057724
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  14057806 agactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctatcgaatggttaaagcattc 14057724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 322
Target Start/End: Original strand, 19859506 - 19859626
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaacta-g 301  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||| |||||||| | |    
T  19859506 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaagg 19859605  T
Q  302 tgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    || || |||||||||||||||    
T  19859606 tgttccaggacatgagtcctc 19859626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 243
Target Start/End: Original strand, 27873777 - 27873834
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccg 243  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27873777 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacatgaccgaagccctcaccg 27873834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 243
Target Start/End: Original strand, 27889907 - 27889964
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccg 243  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27889907 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacatgaccgaagccctcaccg 27889964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 243
Target Start/End: Original strand, 27948565 - 27948622
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccg 243  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27948565 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacatgaccgaagccctcaccg 27948622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 8729211 - 8729130
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||    
T  8729211 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattc 8729130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 27942372 - 27942291
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||    
T  27942372 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcaccgttatagaatggttaaaacattc 27942291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 18609771 - 18609853
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  18609771 agactcctcgataattgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcactgctatcgaatggttaaagcattc 18609853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 20784006 - 20783932
Alignment:
Q  247 ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||  ||||  | |||||||||||||||    
T  20784006 ttgaatggttaaagcattcatcaggacctaagc-ctcaccgctttgaacaataagtgtgccaggacatgagtcctc 20783932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 21690611 - 21690546
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatca 269  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21690611 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattcatca 21690546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22025762 - 22025700
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22025762 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 22025700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 22050201 - 22050263
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22050201 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 22050263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 22055719 - 22055781
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22055719 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 22055781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 22177586 - 22177648
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22177586 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 22177648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 14594933 - 14594813
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcacc-gcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaacta-g 301  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| | |  |||| |||||| || |||||||| | |    
T  14594933 atgcatgtggtaccaatctacagggcagaagccctcaccagatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccactttgaacaacaagg 14594834  T
Q  302 tgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    || || |||||||||||||||    
T  14594833 tgttccaggacatgagtcctc 14594813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 19988511 - 19988405
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaatt-agaaccaacaacaacgact 145  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | ||  |||| |  |||||| ||| || || |||||||| || ||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  19988511 aatctaacaccctatcataataataattcttcaatatataaaaatatcctcattatcatcatcaacaacaaatggtaattaaaaaccaacaacatcgact 19988412  T
Q  146 catgcaa 152  Q
    |||||||    
T  19988411 catgcaa 19988405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 8596289 - 8596208
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||  ||||||| |||| || | | |||||||||||||||||    
T  8596289 agactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccatatcagagccgaagctctcatcgttatagaatggttaaagcattc 8596208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 21322576 - 21322499
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaa 124  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||   ||| || |||||||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  21322576 aatctaacaccctatcataataataattcatcaacatatataaatatcatcattatcaacatcaacaacaaatggtaa 21322499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 21327164 - 21327087
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaa 124  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||   ||| || |||||||||| || ||||||||||| || |||||||    
T  21327164 aatctaacaccctatcataataataattcatcaacatatataaatatcatcattatcaacatcaacaacaaatggtaa 21327087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 265
Target Start/End: Original strand, 25409535 - 25409614
Alignment:
Q  188 ctcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  25409535 ctcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataaccagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 25409614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 187 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19903125 - 19903044
Alignment:
Q  187 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa---caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |   |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  19903125 actcctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 19903044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 21686287 - 21686222
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatca 269  Q
    ||||||||||||||||   | ||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21686287 atgcatgtggtaccaatttatagggcagaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattcatca 21686222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 187 - 265
Target Start/End: Original strand, 44476216 - 44476297
Alignment:
Q  187 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa---caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |   |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  44476216 actcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 44476297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 187 - 265
Target Start/End: Original strand, 44479478 - 44479559
Alignment:
Q  187 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa---caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |   |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  44479478 actcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 44479559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 221
Target Start/End: Original strand, 17053577 - 17053611
Alignment:
Q  187 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 221  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17053577 actcctcaataaatgcaactatgcatgtggtacca 17053611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 221
Target Start/End: Original strand, 23865414 - 23865448
Alignment:
Q  187 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 221  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23865414 actcctcaataaatgcaagtatgcatgtggtacca 23865448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 316
Target Start/End: Original strand, 16259558 - 16259627
Alignment:
Q  247 ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatga 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |  |||| ||||||||| |||||||  |||| || |||||||||    
T  16259558 ttgaatggttaaagcattcatcaaagcataagccctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacatga 16259627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 332 - 384
Target Start/End: Original strand, 20006386 - 20006439
Alignment:
Q  332 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 384  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  20006386 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaacttacaatgca 20006439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 22063603 - 22063558
Alignment:
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22063603 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 22063558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 230 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22063740 - 22063703
Alignment:
Q  230 cgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22063740 cgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 22063703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 22176075 - 22176030
Alignment:
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22176075 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 22176030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 38186096 - 38186023
Alignment:
Q  246 tttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaacta-gtgctctaggacatgagt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||| |||||||| | ||| || |||||||||||    
T  38186096 tttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacatgagt 38186023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 21300354 - 21300291
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||| |  ||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21300354 atgcatgtggtaccatattcagggtcgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 21300291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 152
Target Start/End: Original strand, 22743603 - 22743655
Alignment:
Q  100 taacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    ||||||||||||||  |  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22743603 taacaacatcaacaataagtggtaatttcaaccaacaacaacgactcatgcaa 22743655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 332 - 375
Target Start/End: Original strand, 39363648 - 39363692
Alignment:
Q  332 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  39363648 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 39363692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 41009637 - 41009574
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  41009637 atgcatgtggtaccataatcagggccgaaaccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 41009574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 131)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 123 - 411
Target Start/End: Original strand, 38742833 - 38743123
Alignment:
Q  123 aattagaaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaa 222  Q
    ||||| || ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  38742833 aattacaatcaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaa-atatgcaaatttgcatgtggtaccaa 38742931  T
Q  223 acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaa-caactagtgctctaggacatgagtcct 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  38742932 acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagccctcaccgctgttaagcaactagtgctccaggacatgagtcct 38743031  T
Q  322 ctccgctg-tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgc-aactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38743032 ctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacgtacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtgactccacttaaa 38743123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 129 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 48774862 - 48774578
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagga 228  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48774862 aaccaacaaccaagactcatgcaa-tgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagga 48774764  T
Q  229 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgc 327  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  48774763 ccgaagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccac 48774664  T
Q  328 tg-tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||| ||||||||||||||    
T  48774663 tgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacaaactccatatgactccacttaaa 48774578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 123 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 12271645 - 12271355
Alignment:
Q  123 aattagaaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaa 222  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  12271645 aattacaatcaacaactacgactcatgcaaatgacatgacaacactgctaaaacaacaccttagacttctcaa-atatgcaaatatgcatgttgtaccaa 12271547  T
Q  223 acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcct 321  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||| |    
T  12271546 agaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcat 12271447  T
Q  322 ctccgctg-tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgc-aactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12271446 caccgctgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtgactccacttaaa 12271355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 129 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 9772159 - 9771876
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagga 228  Q
    |||||||||| | |||||||||||| || ||| | | ||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9772159 aaccaacaaccaagactcatgcaaacgacatgacgacactactaagacaacacctcagactcctcaa-atatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacagga 9772062  T
Q  229 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgc 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  9772061 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcagggccgaagccctcatcgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgc 9771962  T
Q  328 tg-tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgc-aactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9771961 tgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtgactccacttaaa 9771876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 30597047 - 30596848
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  30597047 agactcctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 30596948  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30596947 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 30596849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 187 - 384
Target Start/End: Original strand, 54520022 - 54520220
Alignment:
Q  187 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcacc 286  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  54520022 actcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgtttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 54520121  T
Q  287 gctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 384  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54520122 gctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 54520220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 185 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 29545351 - 29545127
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  29545351 agactcctcaaaaaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccttca 29545252  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 383  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29545251 ccgctgtgaacaactagtgttccaggacatgagtcctctccgttgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 29545152  T
Q  384 aatgca-actccatgtgactccactt 408  Q
     || || ||||||| |||||||||||    
T  29545151 -atacatactccatatgactccactt 29545127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 185 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 16331780 - 16331556
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16331780 agactcctcaata--tgcaattatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 16331683  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 383  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16331682 ccgctatgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 16331583  T
Q  384 aatgca-actccatgtgactccacttaa 410  Q
     || || ||||||| |||||||||||||    
T  16331582 -atacatactccatatgactccacttaa 16331556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 142 - 411
Target Start/End: Original strand, 29493471 - 29493742
Alignment:
Q  142 gactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctca 240  Q
    ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29493471 gactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctca 29493568  T
Q  241 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt--atgca 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| |||||||||  |||||    
T  29493569 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgca 29493668  T
Q  338 tatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29493669 tatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 29493742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 185 - 409
Target Start/End: Original strand, 16833196 - 16833420
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16833196 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtgccaaacaggaccgaagccctcaccgtttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 16833294  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 383  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16833295 ccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 16833394  T
Q  384 aatgca-actccatgtgactccactta 409  Q
     || || ||||||| ||||||||||||    
T  16833395 -atacatactccatatgactccactta 16833420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 8374113 - 8373914
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  8374113 agacccctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccaaagccctca 8374014  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 383  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8374013 ccgctgtgaagaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 8373915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 142 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 2499275 - 2499005
Alignment:
Q  142 gactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat--aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 239  Q
    ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2499275 gactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 2499179  T
Q  240 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgca 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| |||||    
T  2499178 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgca 2499079  T
Q  338 tatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2499078 tatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 2499005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 21151697 - 21151418
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21151697 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 21151601  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| |||||   || |||| ||||||    
T  21151600 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcagggccgaagccctcaccgctgttgagcaactattactccaggaccgaagccctcaccgctg 21151501  T
Q  330 ttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21151500 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 21151418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 9691595 - 9691396
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  9691595 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 9691497  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgc 383  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9691496 ccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgc 9691397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 32388205 - 32388006
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  32388205 agacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccaaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 32388106  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 383  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32388105 ccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgttatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 32388007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 43724305 - 43724025
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  43724305 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggacc 43724208  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  43724207 gaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 43724108  T
Q  330 -tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  43724107 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgagactcaacttaaa 43724025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Original strand, 10381848 - 10382128
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||||    
T  10381848 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtgataccaatcaggacc 10381944  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  10381945 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 10382044  T
Q  330 ttt--atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10382045 tttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 10382128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Original strand, 10410501 - 10410781
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||||    
T  10410501 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtgataccaatcaggacc 10410597  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  10410598 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 10410697  T
Q  330 ttt--atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10410698 tttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 10410781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 11956783 - 11956585
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    |||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||     
T  11956783 agacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaacaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcc 11956685  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11956684 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 11956586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Original strand, 29550898 - 29551097
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  29550898 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggactgaagccctca 29550996  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||||    
T  29550997 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgttgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatttacatacaacatgaccatgc 29551096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 132 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 54833429 - 54833151
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| || |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  54833429 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacacttctaagacaccatcttagacttctcaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggact 54833331  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||| |||||||| ||| |||||   || |||| ||| ||    
T  54833330 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccttcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgttg 54833231  T
Q  330 -tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccactt 408  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  54833230 ttttatgcacatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactcaatatgactccactt 54833151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 132 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 53571474 - 53571196
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  53571474 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 53571378  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  53571377 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaggccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 53571278  T
Q  330 -tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 410  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53571277 ttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccaattaa 53571196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 132 - 408
Target Start/End: Original strand, 10767665 - 10767941
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10767665 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 10767761  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||   || |||| ||| ||    
T  10767762 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgttg 10767861  T
Q  330 -tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccactt 408  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  10767862 ttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactcaatatgactccactt 10767941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 142 - 411
Target Start/End: Original strand, 28758816 - 28759087
Alignment:
Q  142 gactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat--aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 239  Q
    ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||   ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  28758816 gactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctc 28758913  T
Q  240 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgca 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| |||||    
T  28758914 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgca 28759013  T
Q  338 tatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28759014 tatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcaacttaaa 28759087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 132 - 395
Target Start/End: Original strand, 45611575 - 45611838
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  |||| |||||| || |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45611575 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgccaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 45611671  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  45611672 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 45611771  T
Q  330 -tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactcca 395  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45611772 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactcca 45611838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 142 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 50143001 - 50142730
Alignment:
Q  142 gactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat--aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 239  Q
    ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||   ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  50143001 gactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctc 50142904  T
Q  240 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgca 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| |||||    
T  50142903 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgca 50142804  T
Q  338 tatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50142803 tatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcaacttaaa 50142730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 185 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 19344340 - 19344151
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    ||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19344340 agactcctcaa-atatccaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatagttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 19344242  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19344241 ccgctgtgaacaactagtgctccagaacatgagtcatctccgctgtttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaact 19344151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 142 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 3782983 - 3782712
Alignment:
Q  142 gactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataa-atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctca 240  Q
    ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  3782983 gactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttctgaatgagatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctca 3782886  T
Q  241 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg--tttatgca 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||  ||||||||    
T  3782885 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgca 3782786  T
Q  338 tatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  3782785 tatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatatgacaccacttaaa 3782712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 199 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 20377415 - 20377229
Alignment:
Q  199 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaac 298  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20377415 atgcaattatgcatgtggtaccaaataagaccgaaaccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaac 20377316  T
Q  299 tagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 384  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20377315 tagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 20377229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 199 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 46071285 - 46071099
Alignment:
Q  199 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaac 298  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46071285 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagcccttatcgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaac 46071186  T
Q  299 tagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 384  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  46071185 tagtgctccaggacatgagtcttctccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtatatatctacatacaactagaccatgca 46071099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 166 - 411
Target Start/End: Original strand, 47121086 - 47121335
Alignment:
Q  166 actgctaagacaacaccttagactcctcaat--aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat 263  Q
    |||||||||||| || |||||||| || ||   ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47121086 actgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcat 47121185  T
Q  264 tcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtat 361  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47121186 tcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtat 47121285  T
Q  362 atctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47121286 atccacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcgacttaaa 47121335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 166 - 411
Target Start/End: Original strand, 47128454 - 47128703
Alignment:
Q  166 actgctaagacaacaccttagactcctcaat--aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat 263  Q
    |||||||||||| || |||||||| || ||   ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47128454 actgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcat 47128553  T
Q  264 tcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtat 361  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47128554 tcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtat 47128653  T
Q  362 atctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  47128654 atccacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcgacttaaa 47128703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 206 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 50656156 - 50655950
Alignment:
Q  206 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgc 304  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| |    
T  50656156 tatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 50656057  T
Q  305 tctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactc 403  Q
    || |||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50656056 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactc 50655957  T
Q  404 cacttaa 410  Q
    || ||||    
T  50655956 caattaa 50655950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 142 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 14845399 - 14845137
Alignment:
Q  142 gactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctca 240  Q
    ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  14845399 gactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctca 14845302  T
Q  241 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg--tttatgca 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||| || ||   || |||| | ||||  ||||||||    
T  14845301 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgttgttgagcaactagtgctccagaaccgaagccctcactgctgtttttatgca 14845202  T
Q  338 tatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgact 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14845201 tatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgagact 14845137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 224 - 384
Target Start/End: Original strand, 20187754 - 20187915
Alignment:
Q  224 caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctct 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20187754 caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctct 20187853  T
Q  324 ccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20187854 ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 20187915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 198 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 12725299 - 12725113
Alignment:
Q  198 aatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaa 297  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  12725299 aatgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagtcctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacctctgtgaacaa 12725200  T
Q  298 ctagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 384  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12725199 ctagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctatttatgcatatgaaatggacccactagtgtatatctacatacaacttgaccatgca 12725113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 207 - 384
Target Start/End: Original strand, 54520256 - 54520435
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagtgct 305  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  54520256 atgcatgtggtaccatatcagggccggagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgct 54520355  T
Q  306 ctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 384  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54520356 ccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggaccaactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 54520435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 185 - 375
Target Start/End: Original strand, 49163129 - 49163317
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||| ||||    
T  49163129 agacccctcaataa-tgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagctctcaccgcttttgaatggttcaagcattcatcaggacataagccctca 49163227  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49163228 ccgctgtgaacaaccaatgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaact 49163317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 134 - 289
Target Start/End: Original strand, 20187620 - 20187775
Alignment:
Q  134 acaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaa 233  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20187620 acaacaccgactcatgcaactgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaccaggaccgaa 20187719  T
Q  234 gccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgct 289  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  20187720 gccttcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 20187775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 271 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 54091839 - 54091700
Alignment:
Q  271 gaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacata 370  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54091839 gaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacata 54091740  T
Q  371 caac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccactta 409  Q
    |||| ||||||||| || || ||||||| ||||||||||||    
T  54091739 caacttgaccatgc-atacatactccatatgactccactta 54091700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 271 - 384
Target Start/End: Original strand, 3802557 - 3802671
Alignment:
Q  271 gaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacata 370  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3802557 gaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacata 3802656  T
Q  371 caac-tgaccatgca 384  Q
    |||| ||||||||||    
T  3802657 caacttgaccatgca 3802671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 271 - 384
Target Start/End: Original strand, 15374700 - 15374814
Alignment:
Q  271 gaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacata 370  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15374700 gaccgaagtcctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacata 15374799  T
Q  371 caac-tgaccatgca 384  Q
    |||| ||||||||||    
T  15374800 caacatgaccatgca 15374814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 271 - 384
Target Start/End: Original strand, 3802719 - 3802833
Alignment:
Q  271 gaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacata 370  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  3802719 gaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggactcactcgtgtatatctacata 3802818  T
Q  371 caact-gaccatgca 384  Q
    ||||| |||||||||    
T  3802819 caactagaccatgca 3802833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 20249523 - 20249385
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaaca 113  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| | | ||||||||| ||||||||||||||    
T  20249523 atcatcaataatagatatctaattcatcaattaaatctaacaccctgtcataataataattcatcaatatataagtatatcatcattaacaacatcaaca 20249424  T
Q  114 ccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
     || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20249423 acaaatggtaattaaaaccaacaacaacgactcatgcaa 20249385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 330 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 6927583 - 6927502
Alignment:
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6927583 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 6927502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 136 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 10597982 - 10597792
Alignment:
Q  136 aacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacc--aaacaggaccgaa 233  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||    
T  10597982 aacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccactaagacaacaccttagactcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaa 10597883  T
Q  234 gccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaacta-gtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||| |||||||| | ||| || ||||||| |||||||    
T  10597882 gccgtcaccactgtttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacataagtcctc 10597792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 134 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 11850913 - 11850722
Alignment:
Q  134 acaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccg 231  Q
    |||||| |||| ||||||| | | ||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||    
T  11850913 acaacaccgacgcatgcaactcacatgacaacattgctaagacaacaccttaaactcctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccatattcagggccg 11850814  T
Q  232 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaac-tagtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
     ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||| ||||||||  |||| || |||||||||||||||    
T  11850813 tagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcatcagagcataagctctcaccgctttgaacaacaaagtgttccaggacatgagtcctc 11850722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 134 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 18757214 - 18757021
Alignment:
Q  134 acaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacc--aaacaggaccg 231  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||| ||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||    
T  18757214 acaacaccgactcatgcaactgacatgacaacattgctaagacaacaccttaaacttctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccg 18757115  T
Q  232 aagccctcaccgc--ttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaacta-gtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| | |||  |||  ||||||||| |||||||| | ||| || ||||||| |||||||    
T  18757114 aagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcaatcattaggacaaaagtcctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacataagtcctc 18757021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 118 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 31690863 - 31690713
Alignment:
Q  118 atggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggt 217  Q
    |||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31690863 atggcaattacatccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacacagctaagacaataccctagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggt 31690764  T
Q  218 accaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattc 265  Q
    |||| |  |||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  31690763 accatattcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattc 31690713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 136 - 294
Target Start/End: Original strand, 12419320 - 12419481
Alignment:
Q  136 aacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacc--aaacaggaccgaa 233  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||  || |||| |||||    
T  12419320 aacaccgactcatgcaactgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcgataaatgcaaatatgcatatggtaccataatcagggccgaa 12419419  T
Q  234 gccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaa 294  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||| ||||    
T  12419420 gccctcactgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgctttgaa 12419481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 254 - 375
Target Start/End: Original strand, 18961002 - 18961122
Alignment:
Q  254 gttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctac 353  Q
    |||||||||||||||  |||  |||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  18961002 gttaaagcattcatcgggacataagccctcaccgctgtgaacaacaagtgcttcaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggactcac 18961100  T
Q  354 ttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18961101 ttgtgtatatctacatacaact 18961122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 129 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 8583549 - 8583411
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--cag 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  8583549 aaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcag 8583450  T
Q  227 gaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    | |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  8583449 ggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 8583411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 129 - 265
Target Start/End: Original strand, 14084453 - 14084591
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--cag 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  14084453 aaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcag 14084552  T
Q  227 gaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    | |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  14084553 ggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 14084591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 129 - 265
Target Start/End: Original strand, 14089854 - 14089992
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--cag 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  14089854 aaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcag 14089953  T
Q  227 gaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    | |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  14089954 ggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 14089992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 129 - 265
Target Start/End: Original strand, 49399395 - 49399533
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--cag 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  49399395 aaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcag 49399494  T
Q  227 gaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    | |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  49399495 ggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 49399533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 118 - 244
Target Start/End: Original strand, 31943352 - 31943480
Alignment:
Q  118 atggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggt 217  Q
    |||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31943352 atggcaattacatccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaataccctagacttctcaataaatgcaaatatgcatgtggt 31943451  T
Q  218 accaaa--caggaccgaagccctcaccgc 244  Q
    |||| |  |||| ||||||||||||||||    
T  31943452 accatattcagggccgaagccctcaccgc 31943480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 38312536 - 38312399
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaaca 113  Q
    ||||||| || |||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||  |||| | | ||||||||| ||||||||||||||    
T  38312536 atcatcattaatagatatctaattcatcaattaaatctaacaccttgtcataataataactcatcaatatataagtatatcatcattaacaacatcaaca 38312437  T
Q  114 ccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
     || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38312436 aca-atggtaattaaaaccaacaacaacgactcatgcaa 38312399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 185 - 258
Target Start/End: Original strand, 18957741 - 18957814
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaa 258  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18957741 agacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaa 18957814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 14764515 - 14764379
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaaca 113  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||| | | ||||||||| |||||||||||  |    
T  14764515 atcatcaataatagatatctaactcatcaattaaatctatcaccctgtcataataataattcatcaatatataagtatatcatcattaacaacatca--a 14764418  T
Q  114 ccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14764417 ccaaatgataattaaaaccaacaacaacgactcatgcaa 14764379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Original strand, 12304541 - 12304677
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaaca 113  Q
    |||||||||| || |||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||| | | ||||||||| |||||||||||  |    
T  12304541 atcatcaataataaatatctaactcatcaattaaatctatcaccctgtcataataataattcatcaatatataagtatatcatcattaacaacatca--a 12304638  T
Q  114 ccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12304639 ccaaatgataattaaaaccaacaacaacgactcatgcaa 12304677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Original strand, 9532641 - 9532777
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaaca 113  Q
    |||||||||| || |||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||| | | ||||||||| |||||||||||  |    
T  9532641 atcatcaataataaatatctaactcatcaattaaatctatcaccctgtcataataataattcatcaatatataagtatatcatcattaacaacatca--a 9532738  T
Q  114 ccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    |||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9532739 ccaactgataattaaaaccaacaacaacgactcatgcaa 9532777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 23372263 - 23372125
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaaca 113  Q
    |||||||||| ||||||||||  || ||  || ||||| ||||||||||||  ||||||| ||||  |||| | | ||||||||| ||||||||||||||    
T  23372263 atcatcaataatagatatctaactcttcaatttaatcttacaccctgtcatcgtaataattcatcaatatataagtatatcatcattaacaacatcaaca 23372164  T
Q  114 ccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
     || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  23372163 acaaatggtaattaaaaccaataacaacgactcatgcaa 23372125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 29545539 - 29545401
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaaca 113  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || | ||  |||| |   ||||| ||| | ||||||||||||    
T  29545539 atcatcaataatagatatctaattcatcaattaaatctaacaccctgtcataataatgattcgtcaatatataaatatatcctcattcacaacatcaaca 29545440  T
Q  114 ccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
     || |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  29545439 acaaatggtaattaaaaccaataacatcgactcatgcaa 29545401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Original strand, 51299892 - 51300030
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaaca 113  Q
    |||||||||| ||||||||||  || ||  || ||||| ||||||||||||  ||||||| ||||  |||| | | ||||||||| ||||||||||||||    
T  51299892 atcatcaataatagatatctaactcttcaatttaatcttacaccctgtcatcgtaataattcatcaatatataagtatatcatcattaacaacatcaaca 51299991  T
Q  114 ccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
     || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  51299992 acaaatggtaattaaaaccaataacaacgactcatgcaa 51300030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 11306093 - 11305988
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactc 146  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||| |   ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  11306093 aatctaacaccctgacataataataattcatcaatatataaatatatcatcattaacaacatcaacaacaaatggtaattaaaaccaacaacatcgactc 11305994  T
Q  147 atgcaa 152  Q
    ||||||    
T  11305993 atgcaa 11305988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 245
Target Start/End: Original strand, 3802515 - 3802575
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgct 245  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3802515 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgct 3802575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 245
Target Start/End: Original strand, 15374658 - 15374718
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgct 245  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15374658 agactcctcaataaatgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagtcctcaccgct 15374718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Original strand, 3802329 - 3802465
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaaca 113  Q
    |||||||||| ||||| ||||  |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||| | | | ||||||| |||||||||||  |    
T  3802329 atcatcaataatagatttctaactcatcaattaaatctatcaccctgtcataataataattcatcaatatataagtacatcatcattaacaacatca--a 3802426  T
Q  114 ccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  3802427 ccaaatgataattaaaaccaacaacaacgacccatgcaa 3802465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 185 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 27029623 - 27029558
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaa 251  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27029623 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaa 27029558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 185 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 27031791 - 27031726
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaa 251  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27031791 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaa 27031726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 18136637 - 18136532
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatc--tctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgac 144  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||  | |||||||  ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18136637 aatctaacaccctaacataataataattcatcaatttataaat--atatcatcattaacaacatcaacaacaaatggtaattaaaaccaacaacatcgac 18136540  T
Q  145 tcatgcaa 152  Q
    ||||||||    
T  18136539 tcatgcaa 18136532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 169 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13969048 - 13968950
Alignment:
Q  169 gctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  13969048 gctaagacaacaccctagtctcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 13968950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 169 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13974523 - 13974425
Alignment:
Q  169 gctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  13974523 gctaagacaacaccctagtctcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 13974425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 185 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 54091880 - 54091821
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgct 245  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54091880 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgct 54091821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24123413 - 24123320
Alignment:
Q  174 gacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  24123413 gacaacaccctagactcctcaataaatgcaaatatgcacgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 24123320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 11965217 - 11965112
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactc 146  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||||   ||| || |||||||||| || ||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  11965217 aatctaacactctatcataataataattcatcaacatatataaatatcatcattatcaacatcaacaactaatggtaattaaaaccaacaacatcgactc 11965118  T
Q  147 atgcaa 152  Q
     |||||    
T  11965117 gtgcaa 11965112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Original strand, 12202180 - 12202285
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactc 146  Q
    |||||||||||||  ||||||||| || ||||  |||| |   ||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  12202180 aatctaacaccctaacataataatgattcatcaatatataaatatatcatcattaacaacatcaacaataaatggtaattataaccaacaacatcgactc 12202279  T
Q  147 atgcaa 152  Q
    ||||||    
T  12202280 atgcaa 12202285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 17130675 - 17130756
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||    
T  17130675 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattc 17130756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 18130119 - 18130018
Alignment:
Q  51 taacaccctgtcataataataatacatc--tctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcat 148  Q
    |||||||||  |||||||||||| ||||  | |||||||  |||| |||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18130119 taacaccctaacataataataattcatcaatttataaat--atatgatcattaacaacatcaacaacaaatggtaattaaaaccaacaacatcgactcat 18130022  T
Q  149 gcaa 152  Q
    ||||    
T  18130021 gcaa 18130018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 54900431 - 54900326
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactc 146  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||| ||||  |||| |   ||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  54900431 aatctaacaccctaacataattataattcatcaatatataaatatatcatcattaacaacatcaacaacaaatggtatttataaccaacaacatcgactc 54900332  T
Q  147 atgcaa 152  Q
    ||||||    
T  54900331 atgcaa 54900326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 224 - 322
Target Start/End: Original strand, 17512558 - 17512658
Alignment:
Q  224 caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaacta-gtgctctaggacatgagtcct 321  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |  ||||||||| |||||||| | ||| || ||||||| ||||||    
T  17512558 cagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggacctaggtcctcaccgctttgaacaacaaggtgttcaaggacataagtcct 17512657  T
Q  322 c 322  Q
    |    
T  17512658 c 17512658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 16383056 - 16382994
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  16383056 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 16382994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 152
Target Start/End: Original strand, 23173656 - 23173747
Alignment:
Q  61 tcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    ||||| ||||||| ||||  |||| | | ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  23173656 tcatagtaataattcatcaatatataagtatatcatcattaacaacatcaacaacaaatggtaattaaaaccaacaacatctactcatgcaa 23173747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 245
Target Start/End: Original strand, 3802699 - 3802737
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgct 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3802699 atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgct 3802737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 267
Target Start/End: Original strand, 18913984 - 18914069
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |  || | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  18913984 agactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcaaggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 18914069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 2270583 - 2270478
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactc 146  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||  |||| |   ||||||||  ||||||||||||||  | | |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  2270583 aatctaacaccctaacataataataattcatcaatatataaatatatcatcgttaacaacatcaacaataaagggtaattataaccaacaacatcgactc 2270484  T
Q  147 atgcaa 152  Q
    ||||||    
T  2270483 atgcaa 2270478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 12034546 - 12034465
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||| |  | | |||||||||||||||||    
T  12034546 agactcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccataatagagccgaagccctcatctttatagaatggttaaagcattc 12034465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 14764329 - 14764248
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||    
T  14764329 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattc 14764248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 23372075 - 23371994
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||    
T  23372075 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattc 23371994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 38312349 - 38312268
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||| | | ||||||||||| |||||    
T  38312349 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagggccggagccctcaccgttatagaatggttaaaacattc 38312268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 51300080 - 51300161
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||    
T  51300080 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattc 51300161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 18888944 - 18889027
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  18888944 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattc 18889027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 11644953 - 11644878
Alignment:
Q  247 ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || | || ||||||||| |||||||  |||| || |||||||||||||||    
T  11644953 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaggccctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctc 11644878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 13203715 - 13203653
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtacca--aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  13203715 atgcatgtggtaccataaacaggaccgtagccctcaccgctgtagaatagttaaagcattcat 13203653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 14652892 - 14652830
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14652892 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 14652830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 17190814 - 17190896
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||   ||| ||||| | | |||||||||||||||||    
T  17190814 agactcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccaaattcagggccgtgacccacaccgttgtcgaatggttaaagcattc 17190896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 265
Target Start/End: Original strand, 19443469 - 19443528
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  19443469 atgcatgtggtaccataacagggccggagccctcaccgctatagaatggttaaagcattc 19443528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 152
Target Start/End: Original strand, 17496018 - 17496080
Alignment:
Q  90 atatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  17496018 atatcatcattaacaacatcaacaataaatggtaattataactaacaacatcgactcatgcaa 17496080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 269
Target Start/End: Original strand, 17496119 - 17496184
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatca 269  Q
    ||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  17496119 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcatca 17496184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 129 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 13969116 - 13969063
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacacc 182  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||    
T  13969116 aaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacacc 13969063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 129 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 13974591 - 13974538
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacacc 182  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||    
T  13974591 aaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacacc 13974538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 14864766 - 14864847
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |  | | ||||||||||| |||||    
T  14864766 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatctttatagaatggttaaaacattc 14864847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 2270439 - 2270320
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat-caagaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagt 302  Q
    ||||||||||||||| |  |||| || ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| || |||  |||  ||||||||| |||||||  |||    
T  2270439 atgcatgtggtaccatattcagggccaaagccctcaccgctaattgaatgattaaagcattcattcaggacataagtcctcaccgctttgaacaataagt 2270340  T
Q  303 gctctaggacatgagtcctc 322  Q
    | || |||||||||||||||    
T  2270339 gttccaggacatgagtcctc 2270320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 11305905 - 11305830
Alignment:
Q  247 ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaacta-gtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||| |||||||| | ||| || |||||||||||||||    
T  11305905 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgct-tgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctc 11305830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 269
Target Start/End: Original strand, 12274221 - 12274287
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatca 269  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  12274221 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattcatca 12274287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 375
Target Start/End: Original strand, 12274371 - 12274435
Alignment:
Q  312 catgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    |||||| |||| ||||| | ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  12274371 catgagccctccccgctttatatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 12274435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 267
Target Start/End: Original strand, 14292706 - 14292765
Alignment:
Q  210 catgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    |||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14292706 catgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 14292765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Original strand, 14569642 - 14569748
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatc--atcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgac 144  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||   ||  |||||||| |||||  || |  |||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14569642 aatctaacaccctaacataataataattattccttataaatgtatatctcataatcaacaacatcaacacta-atggtatttacaaccaacaacaacgac 14569740  T
Q  145 tcatgcaa 152  Q
    ||||||||    
T  14569741 tcatgcaa 14569748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 187 - 265
Target Start/End: Original strand, 9532829 - 9532910
Alignment:
Q  187 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa---caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |   |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  9532829 actcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 9532910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 15955193 - 15955128
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatca 269  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  15955193 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccaaatttgaatggttaaagcattcatca 15955128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 185 - 220
Target Start/End: Original strand, 17157039 - 17157074
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacc 220  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17157039 agactcctcaataaatgcaactatgcatgtggtacc 17157074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 185 - 264
Target Start/End: Original strand, 18899983 - 18900065
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcatt 264  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||  |||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  18899983 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccagagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcatt 18900065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 185 - 220
Target Start/End: Original strand, 24191740 - 24191775
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacc 220  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24191740 agactcctcaataaatgcaactatgcatgtggtacc 24191775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 373 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 16414281 - 16414244
Alignment:
Q  373 actgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16414281 actgaccatgcaatgca-ctccatgtgactccacttaaa 16414244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 18719312 - 18719251
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  18719312 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgcttatcgaatggttaaagcattc 18719251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 41456345 - 41456311
Alignment:
Q  187 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 221  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41456345 actcctcaataaatgcaattatgcatgtggtacca 41456311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 10553851 - 10553932
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||  || |||| |||| || | | |||||||||||||||||    
T  10553851 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccaaagctctcatcgttgtagaatggttaaagcattc 10553932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 13313952 - 13313907
Alignment:
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13313952 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 13313907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 14544368 - 14544308
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  14544368 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgttgtcgaatggttaaagcattc 14544308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20249335 - 20249254
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| | |||  ||||| |||||| || | | |||||||||||||||||    
T  20249335 agactcctcaacaaatgcaaccatgcatgtggtaccatatcagagccgaaaccctcatcgttatagaatggttaaagcattc 20249254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 375
Target Start/End: Original strand, 23173922 - 23173967
Alignment:
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23173922 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 23173967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 308 - 375
Target Start/End: Original strand, 35984860 - 35984926
Alignment:
Q  308 aggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    |||||||||| |||| |||||  |||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  35984860 aggacatgagccctcaccgct--ttatgtttatgcaatggactcaacttgtgtatatctacatacaact 35984926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 236 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 12356104 - 12356036
Alignment:
Q  236 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattca-tcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagtg 303  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||  |||  ||||||||| |||||||| ||||    
T  12356104 cctcaccgctattgaatggttaaagcattcattcaggacataagtcctcaccgctttgaacaacaagtg 12356036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 236 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 12362653 - 12362585
Alignment:
Q  236 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattca-tcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagtg 303  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||  |||  ||||||||| |||||||| ||||    
T  12362653 cctcaccgctattgaatggttaaagcattcattcaggacataagtcctcaccgctttgaacaacaagtg 12362585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 12363445 - 12363508
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  12363445 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 12363508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 12961580 - 12961517
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  12961580 atgcatgtggtaccataatcagggccgaaaccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 12961517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 332 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 15935004 - 15934960
Alignment:
Q  332 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  15935004 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 15934960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16802648 - 16802612
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 221  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16802648 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtacca 16802612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 16824005 - 16823969
Alignment:
Q  118 atggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaaat 154  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  16824005 atggtaattacaaccaacaacaacaactcatgcaaat 16823969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 17243879 - 17243796
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |  ||||  || |||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  17243879 agactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggtcggagccctcaccgctagtcgaatggttaaagcattc 17243796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 332 - 375
Target Start/End: Original strand, 17512707 - 17512751
Alignment:
Q  332 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  17512707 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 17512751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 90)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 129 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 94722 - 94438
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagga 228  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94722 aaccaacaattaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagga 94623  T
Q  229 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgc 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  94622 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgc 94523  T
Q  328 tgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||    
T  94522 tgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccacttaaa 94438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 123 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 8069927 - 8069637
Alignment:
Q  123 aattagaaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaa 222  Q
    ||||| || ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  8069927 aattacaatcaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaa-atatgcaaatatgcatgtggtaccaa 8069829  T
Q  223 acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcct 321  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  8069828 acaggactgaagccctcaccgcttttgaatgattaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcct 8069729  T
Q  322 ctccgctg-tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgc-aactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8069728 ctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtgactccacttaaa 8069637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 129 - 375
Target Start/End: Original strand, 14582727 - 14582972
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagga 228  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14582727 aaccaacaactaagactcatgcaaatgacatgacgacactgctaagacaacaccttagactcctcaa-atatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagga 14582825  T
Q  229 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgct 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||    
T  14582826 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctccccact 14582925  T
Q  329 gtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14582926 gtttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaact 14582972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 185 - 409
Target Start/End: Original strand, 27767337 - 27767562
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  27767337 agactcctcaataaatgcatatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 27767436  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 383  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27767437 ccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 27767536  T
Q  384 aatgca-actccatgtgactccactta 409  Q
     || || ||||||| ||||||||||||    
T  27767537 -atacatactccatatgactccactta 27767562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Original strand, 29158992 - 29159274
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 231  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29158992 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatggatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 29159091  T
Q  232 aagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  29159092 aagccctcaccgctttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 29159191  T
Q  330 -tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  29159192 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatatgattccacttaaa 29159274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Original strand, 4106621 - 4106899
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 231  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4106621 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatagatgcaaatatgaatgtggtaccaaacaggaccg 4106720  T
Q  232 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg- 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||     
T  4106721 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggacatgagccctctccgctgt 4106820  T
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgc-aactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||||||||||||| |||||||    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4106821 tttatgcatatgccatggacc----tgtgtatgtctacatacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtgactccacttaaa 4106899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 185 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 10470906 - 10470682
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  10470906 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 10470808  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 383  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10470807 ccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 10470708  T
Q  384 aatgca-actccatgtgactccactta 409  Q
     || || ||||||| ||||||||||||    
T  10470707 -atacatactccatatgactccactta 10470682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 129 - 410
Target Start/End: Original strand, 17309596 - 17309878
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagg 227  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  17309596 aaccaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaattatgcatgtggtaccaatcagg 17309693  T
Q  228 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccg 326  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| |||    
T  17309694 accggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccg 17309793  T
Q  327 ctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 410  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17309794 ctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccaattaa 17309878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 129 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 15332349 - 15332067
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagg 227  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||| | || |||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  15332349 aaccaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagataccatcttagacttcttaatgaaatgcaattatgcatgtggtaccaatcagg 15332252  T
Q  228 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccg 326  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| |||    
T  15332251 accggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccg 15332152  T
Q  327 ctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 410  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15332151 ctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccaattaa 15332067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 10464384 - 10464185
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  10464384 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 10464286  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgc 383  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10464285 ccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagttctctccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgc 10464186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Original strand, 1070543 - 1070823
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  1070543 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggacc 1070640  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  1070641 gaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 1070740  T
Q  330 -tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1070741 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactaaatgtgactccacttaaa 1070823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 132 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 25315868 - 25315593
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  25315868 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacatgacc 25315772  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  25315771 gaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 25315672  T
Q  330 ttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccact 407  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25315671 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccact 25315593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 132 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 26203362 - 26203087
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  26203362 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacatgacc 26203266  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  26203265 gaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 26203166  T
Q  330 ttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccact 407  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26203165 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccact 26203087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 142 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 34134184 - 34133914
Alignment:
Q  142 gactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataa-atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctca 240  Q
    ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  34134184 gactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgagatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctca 34134087  T
Q  241 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| ||||||    
T  34134086 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcat 34133987  T
Q  339 atgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34133986 atgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcaacttaaa 34133914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 132 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 30799659 - 30799385
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  30799659 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaa-caggacc 30799564  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  30799563 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 30799464  T
Q  330 ttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccact 407  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30799463 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgcgactccact 30799385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 12447372 - 12447172
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctc 283  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  12447372 agacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgtagccctc 12447273  T
Q  284 accgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatg 382  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12447272 accgctgtgaacaacaagtgctctaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatg 12447174  T
Q  383 ca 384  Q
    ||    
T  12447173 ca 12447172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 166 - 411
Target Start/End: Original strand, 25463797 - 25464046
Alignment:
Q  166 actgctaagacaacaccttagactcctca-at-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat 263  Q
    |||||||||||| || |||||||| || | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25463797 actgctaagacaccatcttagacttcttatatgaaatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcat 25463896  T
Q  264 tcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtat 361  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25463897 tcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtat 25463996  T
Q  362 atctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25463997 atctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcaacttaaa 25464046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 132 - 408
Target Start/End: Original strand, 24369114 - 24369389
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  24369114 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaa-caggacc 24369209  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  24369210 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 24369309  T
Q  330 ttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccactt 408  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  24369310 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactcaatatgactccactt 24369389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 142 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 16223873 - 16223602
Alignment:
Q  142 gactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat--aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 239  Q
    ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||   ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  16223873 gactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctc 16223776  T
Q  240 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgca 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| |||||    
T  16223775 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgca 16223676  T
Q  338 tatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16223675 tatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcaacttaaa 16223602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 134 - 410
Target Start/End: Original strand, 22406549 - 22406827
Alignment:
Q  134 acaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccga 232  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22406549 acaaccacgactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccga 22406646  T
Q  233 agccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg--tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg- 329  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||  ||||||| ||| |||||   || |||| ||||||     
T  22406647 ggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtttgagtaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgt 22406746  T
Q  330 -tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 410  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22406747 ttttatgcatatgcaatggacctac-tgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatatgactccacttaa 22406827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Original strand, 29925674 - 29925872
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  29925674 agactcctcaatta-tgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagtcctcaccccttttgaatggttaaagcattcatcaggactgaagccctca 29925772  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgc 383  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29925773 ccgctgtgaacaactagtgttccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgc 29925871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 17207913 - 17207714
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctc 283  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  17207913 agactcctcaataa-tgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaaaccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctc 17207815  T
Q  284 accgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatg 382  Q
    |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17207814 accgatatgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccactgtttatgcatatgcaatggaccaactagtgtatatctacatacaacttgaccatg 17207716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 23021525 - 23021325
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctc 283  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||  |||  |||    
T  23021525 agacacctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgctttagaatggttaaagaattcatcaggacataagtcctc 23021426  T
Q  284 accgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatg 382  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23021425 accgctgtgaacaacaagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccccttgtgtatatctacatacaacttgaccatg 23021327  T
Q  383 ca 384  Q
    ||    
T  23021326 ca 23021325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 185 - 385
Target Start/End: Original strand, 13940411 - 13940612
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctc 283  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||    
T  13940411 agacccctcaatagatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagtcctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagccctc 13940510  T
Q  284 accgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatg 382  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13940511 accgctgtgaacaactagtgctccatgacatgagtcctc-ccgttgtttatgcatatgttatggacccaattgtgtatatctacatacaacatgaccatg 13940609  T
Q  383 caa 385  Q
    |||    
T  13940610 caa 13940612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 237 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 13128390 - 13128242
Alignment:
Q  237 ctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgc 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  13128390 ctcaccacttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgg 13128291  T
Q  337 atatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 384  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13128290 atatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 13128242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 118 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 23235195 - 23234987
Alignment:
Q  118 atggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggt 217  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||    
T  23235195 atggcaattacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaaaaaataaaaatatgcatgtggt 23235096  T
Q  218 accaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaac-tagtgctctaggaca 313  Q
    |||| |  || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||| |||||||| | ||| || ||||||    
T  23235095 accatattcaaggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtactcaccgctttgaacaacatggtgttccaggaca 23234996  T
Q  314 tgagtcctc 322  Q
    | |||||||    
T  23234995 taagtcctc 23234987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 134 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 26418917 - 26418724
Alignment:
Q  134 acaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacc--aaacaggaccg 231  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  || |||| |||    
T  26418917 acaacaccgactcatgcaactgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaataaatgcaaatatgcatgtggtatcataatcagggccg 26418818  T
Q  232 aagccctcaccgc--ttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaacta-gtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||| |||||||| | ||| || ||||||| |||||||    
T  26418817 aagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacataagtcctc 26418724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 136 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 5290390 - 5290201
Alignment:
Q  136 aacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaa 233  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||  || |    
T  5290390 aacaccgactcatgcaactgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggacgta 5290291  T
Q  234 gccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaac-tagtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||| ||||||||  |||| || || ||||||||||||    
T  5290290 gccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcatcagagcataagctctcaccgctttgaacaacaaagtgttccagaacatgagtcctc 5290201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 271 - 408
Target Start/End: Original strand, 24362631 - 24362770
Alignment:
Q  271 gaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctaca 368  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24362631 gaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctaca 24362730  T
Q  369 tacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccactt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  24362731 tacaactgaccatgcaatgcaactcaatatgactccactt 24362770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 330 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 19096812 - 19096731
Alignment:
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19096812 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatatgactccacttaaa 19096731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 132 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 19096928 - 19096815
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 231  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19096928 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacgacactgctaagacaacaccttagacttctcaatggatgcaaatatgcatgtggtaccaatcaggaccg 19096829  T
Q  232 aagccctcaccgct 245  Q
    ||||||||||||||    
T  19096828 aagccctcaccgct 19096815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 129 - 265
Target Start/End: Original strand, 24562204 - 24562342
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--cag 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  24562204 aaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcag 24562303  T
Q  227 gaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    | |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  24562304 ggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 24562342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 185 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 17894697 - 17894613
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatca 269  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17894697 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatca 17894613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Original strand, 12941592 - 12941728
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaaca 113  Q
    |||||||||| || |||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||| | | ||||||||| |||||||||||  |    
T  12941592 atcatcaataataaatatctaactcatcaattaaatctatcaccctgtcataataataattcatcaatatataagtatatcatcattaacaacatca--a 12941689  T
Q  114 ccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12941690 ccaaatgataattaaaaccaacaacaacgactcatgcaa 12941728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Original strand, 4476155 - 4476293
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaaca 113  Q
    |||||||||| ||||||||||  || ||  || ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||  |||| | | ||||||||| ||||||||||||||    
T  4476155 atcatcaataatagatatctaactcttcaatttaatctaacaccatgtcatagtaataattcatcaatatataagtatatcatcattaacaacatcaaca 4476254  T
Q  114 ccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
     || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  4476255 acaaatggtaattaaaaccaataacaacgactcatgcaa 4476293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 185 - 322
Target Start/End: Original strand, 25347060 - 25347201
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctc 281  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||| |  ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | || |    
T  25347060 agacacctcaaaaaatgcaactatgcatgtggtaccataatcagggtcgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggacctaggccc 25347159  T
Q  282 tcaccgctgtgaacaacta-gtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    |||||||| |||||||| | ||| || ||||||| |||||||    
T  25347160 tcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacataagtcctc 25347201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 322
Target Start/End: Original strand, 25395978 - 25396120
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcacc-gcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagct 280  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| | |  ||||     
T  25395978 agactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccagatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagcc 25396077  T
Q  281 ctcaccgctgtgaacaacta-gtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    ||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  25396078 ctcaccgctttgaacaacaaggtgttctaggacatgagtcctc 25396120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 15457443 - 15457524
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  15457443 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagggccgaagccctcaccgttatagaatggttaaagcattc 15457524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 15464038 - 15464119
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  15464038 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagggccgaagccctcaccgttatagaatggttaaagcattc 15464119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 151
Target Start/End: Original strand, 19818761 - 19818865
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactc 146  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||| ||||   ||| || |||||||||| || ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  19818761 aatctaaaaccttatcataataataattcatcaacatatataaatatcatcattatcaacatcaacaacaaatggtaattaaaaccaacaacatcgactc 19818860  T
Q  147 atgca 151  Q
    |||||    
T  19818861 atgca 19818865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 250
Target Start/End: Original strand, 24362549 - 24362654
Alignment:
Q  142 gactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctca 240  Q
    ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24362549 gactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaa-caggaccgaagccctca 24362644  T
Q  241 ccgcttttga 250  Q
    ||||| ||||    
T  24362645 ccgctgttga 24362654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 267
Target Start/End: Original strand, 1592758 - 1592821
Alignment:
Q  206 tatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  1592758 tatgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtcgaatggttaaagcattcat 1592821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19300846 - 19300787
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  19300846 atgcatgtggtaccatatcaggaccgaagccctcaccgctatagaatggttaaagcattc 19300787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 14616586 - 14616481
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactc 146  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||   ||| || |||||||||| |  ||||||||| | || | |||||||| ||||||||||  ||||||    
T  14616586 aatctaacaccctatcataataataattcatcaacatatataaatatcatcattttcaacatcaaaaacaaacggtaattaaaaccaacaacttcgactc 14616487  T
Q  147 atgcaa 152  Q
    ||||||    
T  14616486 atgcaa 14616481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Original strand, 17413850 - 17413955
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactc 146  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| | ||  |||| |   ||||||||| ||||||||||||||  | |||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  17413850 aatctaacaccctaacataataataattcctcaatatataaatatatcatcattaacaacatcaacaataaatggtaataaaaaccaacaacatcgactc 17413949  T
Q  147 atgcaa 152  Q
    ||||||    
T  17413950 atgcaa 17413955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20009079 - 20008998
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||    
T  20009079 agactcctcaacaaatgtaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattc 20008998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 31250270 - 31250351
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||| | |||| ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  31250270 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggcgccatatcagggccgaagccctcaccgttatagaatggttaaagcattc 31250351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 31251347 - 31251428
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||| | |||| ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  31251347 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggcgccatatcagggccgaagccctcaccgttatagaatggttaaagcattc 31251428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13135984 - 13135929
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcac 241  Q
    |||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13135984 agactcctca-tatattcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcac 13135929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 19472526 - 19472384
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcacc-gcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagct 280  Q
    |||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||   ||||| | || ||||||||  | | ||||||||||||||||||||||| | |  ||||     
T  19472526 agacccctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccaatttacagggcagaggccctcacgagatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagcc 19472427  T
Q  281 ctcaccgctgtgaacaac-tagtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    ||||||||| ||||||||  |||| || |||||||||||||||    
T  19472426 ctcaccgctttgaacaacaaagtgttccaggacatgagtcctc 19472384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 21724934 - 21724875
Alignment:
Q  210 catgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  21724934 catgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctatagaatggttaaagcattcat 21724875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 23233544 - 23233468
Alignment:
Q  247 ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaacta-gtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||| |||||||| | ||| || |||||||||||||||    
T  23233544 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctc 23233468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 152
Target Start/End: Original strand, 2708273 - 2708336
Alignment:
Q  89 aatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    |||||||||| || ||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  2708273 aatatcatcattatcaacatcaacaacaaatggcaattaaaaccaacaacatcgactcatgcaa 2708336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 14582034 - 14581975
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  14582034 atgcatgtggtaccataacagggccgaggccctcaccgctatagaatggttaaagcattc 14581975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 322
Target Start/End: Original strand, 17414038 - 17414113
Alignment:
Q  247 ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||| |||||||  |||| || |||||||||||||||    
T  17414038 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctc 17414113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 264
Target Start/End: Original strand, 18786040 - 18786122
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcatt 264  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  18786040 agactcctgaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggcagaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcatt 18786122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 19726606 - 19726668
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  19726606 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 19726668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 25470888 - 25470807
Alignment:
Q  187 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa---caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  25470888 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 25470807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 28290591 - 28290456
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaaca 113  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||  ||| ||||||||| ||| |||||||||||| || |  |||| | | ||||||||| |||| ||||||  |    
T  28290591 atcatcaataatagatatccaattcatcaattacatctaacactctgccataataataattcaccaatatataagtatatcatcattaac-acatca--a 28290495  T
Q  114 ccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    ||| ||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  28290494 ccaaatgataattaaagccatcaacaacgactcatgcaa 28290456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 4476343 - 4476424
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| | |||  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||    
T  4476343 agactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattc 4476424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 8760748 - 8760643
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactc 146  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||   ||| ||||| |||||||  | ||||||||||| || ||||||| |  ||| |||| || ||||||    
T  8760748 aatctaacaccctatcataataataattcatcaacatatatgaacatcatcatcatcaacatcaacaacaaatggtaaatgaaacaaacaccatcgactc 8760649  T
Q  147 atgcaa 152  Q
    ||||||    
T  8760648 atgcaa 8760643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 10583019 - 10582900
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagt 302  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||| |||||||  |||    
T  10583019 atgcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaataagt 10582920  T
Q  303 gctctaggacatgagtcctc 322  Q
    | || ||||| |||||||||    
T  10582919 gttccaggacttgagtcctc 10582900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 21365666 - 21365585
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||  ||||||| |||| || | | |||||||||||||||||    
T  21365666 agactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccatatcagagccgaagctctcatcgttatagaatggttaaagcattc 21365585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 23969648 - 23969567
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||  ||||||| |||| || | | |||||||||||||||||    
T  23969648 agactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccatatcagagccgaagctctcatcgttatagaatggttaaagcattc 23969567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 187 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 34641175 - 34641142
Alignment:
Q  187 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34641175 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacc 34641142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 187 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 34647849 - 34647816
Alignment:
Q  187 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34647849 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacc 34647816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 322
Target Start/End: Original strand, 19451326 - 19451402
Alignment:
Q  247 ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaacta-gtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||| |||||||| | ||| || |||||||||||||||    
T  19451326 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctc 19451402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20011138 - 20011082
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctca 240  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  20011138 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctca 20011082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 24412564 - 24412513
Alignment:
Q  100 taacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24412564 taacaacatcaacaata-atggtaattacaaccaacaacaacgactcatgcaa 24412513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24514026 - 24513944
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  24514026 agactcctcgacaaatgcaa-tatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctattcgaatggttaaagcattc 24513944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 322
Target Start/End: Original strand, 24720594 - 24720715
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaact--a 300  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||| ||||||| |  |    
T  24720594 atgcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcatggcataagccctcaccgctttgaacaattaaa 24720693  T
Q  301 gtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    ||| || |||||||||||||||    
T  24720694 gtgttccaggacatgagtcctc 24720715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 12941778 - 12941860
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  12941778 agactcctcaacaaatgaaactatgcatgtggtaccaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 12941860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 247 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 14133180 - 14133105
Alignment:
Q  247 ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaacta-gtgctctaggacatgagtcct 321  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | | ||||| ||||||| | |||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  14133180 ttgaatgattaaagcattcatcagggcagaagccctcaccgttttgaacaacaaggtgttctaggacatgagtcct 14133105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 224 - 267
Target Start/End: Original strand, 22906984 - 22907027
Alignment:
Q  224 caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22906984 caggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 22907027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 28290406 - 28290324
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  28290406 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 28290324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 8760605 - 8760544
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  8760605 atgcatgtggtaccataatcaggaccgaagccctcaccacttatcgaatggttaaagcattc 8760544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11284042 - 11284008
Alignment:
Q  187 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 221  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11284042 actcctcaataaatgcaattatgcatgtggtacca 11284008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 221
Target Start/End: Original strand, 12167217 - 12167251
Alignment:
Q  187 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 221  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12167217 actcctcaataaatgcaactatgcatgtggtacca 12167251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 330 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 14133057 - 14133011
Alignment:
Q  330 tttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  14133057 tttatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 14133011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 221
Target Start/End: Original strand, 19286126 - 19286160
Alignment:
Q  187 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 221  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19286126 actcctcaataaatgcaactatgcatgtggtacca 19286160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19787070 - 19787036
Alignment:
Q  187 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 221  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19787070 actcctcaataaatgcaactatgcatgtggtacca 19787036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 221
Target Start/End: Original strand, 19877310 - 19877344
Alignment:
Q  187 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 221  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19877310 actcctcaataaatgcaactatgcatgtggtacca 19877344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 221
Target Start/End: Original strand, 19883086 - 19883120
Alignment:
Q  187 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 221  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19883086 actcctcaataaatgcaactatgcatgtggtacca 19883120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 8768190 - 8768145
Alignment:
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8768190 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 8768145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 19300684 - 19300639
Alignment:
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  19300684 tttatgcttatgcaattgacccacttatgtatatctacatacaact 19300639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 14375489 - 14375426
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  14375489 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaaggattcat 14375426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 330 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 17027204 - 17027156
Alignment:
Q  330 tttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaactga 377  Q
    ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  17027204 tttatgcttatgcaatgaactccacttgtgtatatctacatacaactga 17027156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 332 - 375
Target Start/End: Original strand, 18786230 - 18786274
Alignment:
Q  332 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  18786230 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 18786274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 330 - 374
Target Start/End: Original strand, 19726766 - 19726810
Alignment:
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 374  Q
    ||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19726766 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 19726810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24412466 - 24412404
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  24412466 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattc 24412404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 125)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Original strand, 22507434 - 22507714
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 231  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  22507434 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaatagatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggacca 22507533  T
Q  232 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgt 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22507534 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgt 22507633  T
Q  331 ttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  22507634 ttatgcatatgcaatggacctacttgtatatatctacatacaactgaccatgcatacaaactccatgtgactccacttaaa 22507714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Original strand, 19508038 - 19508319
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 231  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  19508038 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatggatgcaa-tatacatgtggtaccaaacaggaccg 19508136  T
Q  232 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg- 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||     
T  19508137 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgt 19508236  T
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgc-aactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19508237 tttatgcatatgccatagacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtgactccacttaaa 19508319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Original strand, 22500856 - 22501133
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 231  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||   |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  22500856 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactc---aatagatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggacca 22500952  T
Q  232 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgt 330  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22500953 aaaccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaagacatgagtcctctccgctgt 22501052  T
Q  331 ttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  22501053 ttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcatacaaactccatgtgactccacttaaa 22501133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 129 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 19800577 - 19800320
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagga 228  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19800577 aaccaacaaccaagactcatgcaa-tgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagga 19800479  T
Q  229 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgc 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  19800478 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccac 19800379  T
Q  328 tg-tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 384  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19800378 tgttttatgcatatgcagtggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 19800320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 129 - 390
Target Start/End: Original strand, 597147 - 597408
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagga 228  Q
    |||||||||| | |||||||||||| |||| | | | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  597147 aaccaacaaccaagactcatgcaaacgatacgacgacactgctaagacaacaccttagactcctcaa-atatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacagga 597244  T
Q  229 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgc 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  597245 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactcctggacatgagtcctctccgc 597344  T
Q  328 tg-tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaa 390  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  597345 tgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaa 597408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 41878185 - 41877985
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    ||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  41878185 agactcctcaaaatatacaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 41878086  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 383  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41878085 ccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 41877986  T
Q  384 a 384  Q
    |    
T  41877985 a 41877985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 132 - 393
Target Start/End: Original strand, 25852850 - 25853113
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25852850 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaccatcttagacttctcaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 25852948  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  25852949 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 25853048  T
Q  330 -tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactc 393  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25853049 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactc 25853113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 132 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 5582510 - 5582235
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5582510 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 5582414  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  5582413 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 5582314  T
Q  330 -tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccact 407  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5582313 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccact 5582235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 14615184 - 14614904
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  14615184 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggacc 14615087  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  14615086 gaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 14614987  T
Q  330 ttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14614986 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 14614904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Original strand, 20990281 - 20990479
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  20990281 agactcctcaata--tgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 20990378  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgc 383  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20990379 ccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgc 20990478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 142 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 40011195 - 40010926
Alignment:
Q  142 gactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctca 240  Q
    ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40011195 gactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctca 40011099  T
Q  241 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||   || |||| |||||| |||||||||    
T  40011098 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcat 40010999  T
Q  339 atgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40010998 atgcaatgaacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 40010926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 5341899 - 5341700
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  5341899 agacccctcaataaatgtaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 5341800  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 383  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5341799 ccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 5341701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 185 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 16775222 - 16774996
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16775222 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggcaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 16775124  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 383  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16775123 ccgttgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcatctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 16775024  T
Q  384 aatgca-actccatgtgactccacttaaa 411  Q
     || || ||||||| ||||||||||||||    
T  16775023 -atacatactccatatgactccacttaaa 16774996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 132 - 393
Target Start/End: Original strand, 25846218 - 25846481
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25846218 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaccatcttagacttctcaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 25846316  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||| |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  25846317 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgttgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 25846416  T
Q  330 -tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactc 393  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25846417 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactc 25846481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 132 - 410
Target Start/End: Original strand, 11995012 - 11995291
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  11995012 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggacc 11995109  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||   || |||| |||| |    
T  11995110 ggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactctaggaccgaagccctcaccgcag 11995209  T
Q  330 ttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 410  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11995210 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccaattaa 11995291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 132 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 22248475 - 22248196
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  22248475 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggacc 22248378  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  22248377 gaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 22248278  T
Q  330 ttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 410  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22248277 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccaattaa 22248196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 23081920 - 23081720
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctc 283  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  23081920 agacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctc 23081821  T
Q  284 accgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatg 382  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23081820 accgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatg 23081722  T
Q  383 ca 384  Q
    ||    
T  23081721 ca 23081720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 166 - 408
Target Start/End: Original strand, 30780973 - 30781217
Alignment:
Q  166 actgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcatt 264  Q
    |||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30780973 actgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcatt 30781071  T
Q  265 catcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtata 362  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30781072 catcaggaccgaggccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtata 30781171  T
Q  363 tctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccactt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30781172 tctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccactt 30781217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 28260053 - 28259854
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  28260053 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 28259955  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgc 383  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28259954 ccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgc 28259855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Original strand, 37566016 - 37566216
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  37566016 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 37566115  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 383  Q
    ||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37566116 ccgttgtgaacaactagtgctccagaacatgagtcatctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 37566215  T
Q  384 a 384  Q
    |    
T  37566216 a 37566216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Original strand, 43028917 - 43029196
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |   |||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||    
T  43028917 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgaccat--tgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaatcaagacc 43029013  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  43029014 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 43029113  T
Q  330 ttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43029114 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 43029196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 132 - 410
Target Start/End: Original strand, 10686021 - 10686299
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10686021 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 10686117  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  10686118 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 10686217  T
Q  330 -tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 410  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  10686218 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatacaatgcaacttcatgtgattccacttaa 10686299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 142 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 14889216 - 14888946
Alignment:
Q  142 gactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataa-atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctca 240  Q
    ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  14889216 gactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttctgaatgagatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctca 14889119  T
Q  241 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt--atgca 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| |||||||||  |||||    
T  14889118 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgca 14889019  T
Q  338 tatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14889018 tatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 14888946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 23076472 - 23076272
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctc 283  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  23076472 agacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgtttaaagcattcatcaggaccgaagccctc 23076373  T
Q  284 accgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatg 382  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23076372 accgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatg 23076274  T
Q  383 ca 384  Q
    ||    
T  23076273 ca 23076272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 142 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 24795240 - 24794971
Alignment:
Q  142 gactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataa-atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctca 240  Q
    ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||    
T  24795240 gactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgagatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggtcctca 24795143  T
Q  241 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| ||||||    
T  24795142 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcat 24795043  T
Q  339 atgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24795042 atgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 24794971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 142 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 24800607 - 24800338
Alignment:
Q  142 gactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataa-atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctca 240  Q
    ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||    
T  24800607 gactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgagatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggtcctca 24800510  T
Q  241 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| ||||||    
T  24800509 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcat 24800410  T
Q  339 atgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24800409 atgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 24800338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 166 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 37540160 - 37539912
Alignment:
Q  166 actgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcatt 264  Q
    |||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37540160 actgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcatt 37540061  T
Q  265 catcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtata 362  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37540060 catcaggaccgaagccctcaccgctgttgagtaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtata 37539961  T
Q  363 tctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37539960 tctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccaattaaa 37539912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 166 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 37547704 - 37547456
Alignment:
Q  166 actgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcatt 264  Q
    |||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37547704 actgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcatt 37547605  T
Q  265 catcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtata 362  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| ||  ||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37547604 catcaggaccgaagccctcaccgctgttgagtaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtata 37547505  T
Q  363 tctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37547504 tctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccaattaaa 37547456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 132 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 18895228 - 18894953
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18895228 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 18895132  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  18895131 gaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcagggctgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 18895032  T
Q  330 ttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccact 407  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18895031 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccact 18894953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 166 - 407
Target Start/End: Original strand, 5454396 - 5454640
Alignment:
Q  166 actgctaagacaacaccttagactcctcaat--aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat 263  Q
    |||||||||||| || |||||||| || ||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5454396 actgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat 5454494  T
Q  264 tcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtat 361  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5454495 tcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtat 5454594  T
Q  362 atctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccact 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5454595 atctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgacttcact 5454640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 142 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 14882539 - 14882269
Alignment:
Q  142 gactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataa-atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctca 240  Q
    ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  14882539 gactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttctgaatgagatgcaattatgcatgcggtaccaatcaggaccgaggccctca 14882442  T
Q  241 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt--atgca 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| |||||||||  |||||    
T  14882441 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgca 14882342  T
Q  338 tatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14882341 tatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 14882269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 142 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 1111901 - 1111632
Alignment:
Q  142 gactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataa-atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctca 240  Q
    ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| | |||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  1111901 gactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttctgaatgagatgcat-tatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctca 1111805  T
Q  241 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| ||||||    
T  1111804 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcat 1111705  T
Q  339 atgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1111704 atgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 1111632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Original strand, 24057578 - 24057777
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  24057578 agacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaataggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 24057677  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 383  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  24057678 ccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtgtatgcatatgctatggacccacttgtgtatatcaacatacaacttgaccatgc 24057776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 132 - 407
Target Start/End: Original strand, 15461348 - 15461623
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||   |||||||||||||||| |||||||    
T  15461348 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcatc-atgcatgtggtaccaatcaggacc 15461444  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  15461445 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 15461544  T
Q  330 ttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccact 407  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15461545 ttttatgcatatgcaacggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccact 15461623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 132 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 17939117 - 17938843
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  17939117 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaatcaggacc 17939021  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  17939020 ggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 17938921  T
Q  330 ttt--atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 405  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17938920 tttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcca 17938843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 132 - 410
Target Start/End: Original strand, 38013610 - 38013888
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataa-atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| | |||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  38013610 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgagatgcat-tatgcatgtggtaccaatcaggacc 38013706  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  38013707 ggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 38013806  T
Q  330 ttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 410  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38013807 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccaattaa 38013888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 190 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 23545037 - 23544842
Alignment:
Q  190 cctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgc 288  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23545037 cctcaataaatgcaattatgcatgcggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgc 23544938  T
Q  289 tgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 384  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23544937 tgtgaacaactagtgccccaggacattagtcatc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 23544842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 142 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 7508239 - 7507968
Alignment:
Q  142 gactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataa-atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctca 240  Q
    ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  7508239 gactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgagatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctca 7508142  T
Q  241 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg--tttatgca 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||  ||||||||    
T  7508141 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgca 7508042  T
Q  338 tatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  7508041 tatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatatgacaccacttaaa 7507968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 199 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 7773814 - 7773629
Alignment:
Q  199 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaac 298  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7773814 atgcaattatgcatgtggtaccaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaac 7773716  T
Q  299 tagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 384  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  7773715 tagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgaaatggacccactcgtgtatttctacatacaactagaccatgca 7773629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Original strand, 26650381 - 26650579
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  26650381 agactcctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 26650479  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 383  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26650480 ccgctgtgaacaactagtgctccatgacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgctatggactcactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 26650578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Original strand, 26921966 - 26922164
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  26921966 agactcctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 26922064  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 383  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26922065 ccgctgtgaacaactagtgctccatgacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgctatggactcactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 26922163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 19802066 - 19801866
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctc 283  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  |||    
T  19802066 agacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctc 19801967  T
Q  284 accgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatg 382  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19801966 accgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcatc-ccgctgtttatgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatg 19801868  T
Q  383 ca 384  Q
    ||    
T  19801867 ca 19801866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 18941393 - 18941195
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||     
T  18941393 agacccctcaataa-tgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagccctcg 18941295  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 383  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18941294 ccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagccctc-ccgctgtttatgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 18941196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 39609053 - 39608854
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||    
T  39609053 agaccccttaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcatgatcgaagtcctca 39608954  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 383  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39608953 ccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgttatggactcacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 39608855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 185 - 375
Target Start/End: Original strand, 25419798 - 25419988
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctc 283  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  25419798 agacccctcaataaatgcatttatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccaaagccctc 25419897  T
Q  284 accgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25419898 accgctgtgaacaaatagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgttatggacccacttgtgtatatctacatacaact 25419988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Original strand, 19362576 - 19362776
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctc 283  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  |||    
T  19362576 agacccctcaataaatgcaatcatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctc 19362675  T
Q  284 accgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatg 382  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19362676 accgctgtgaacaacaagtgctccaggacatgagtcatc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatg 19362774  T
Q  383 ca 384  Q
    ||    
T  19362775 ca 19362776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 101 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 24751813 - 24751589
Alignment:
Q  101 aacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaat 200  Q
    |||| ||||| || || |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24751813 aacatcatcatcatcaaatggcaattacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaataaat 24751714  T
Q  201 gcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaac 298  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||| ||||||||    
T  24751713 gcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcatcagagcataagctctcaccgctttgaacaac 24751614  T
Q  299 -tagtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
      |||| || |||||||||||||||    
T  24751613 aaagtgttccaggacatgagtcctc 24751589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 101 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 24669275 - 24669051
Alignment:
Q  101 aacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaat 200  Q
    |||| ||||| || || |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24669275 aacatcatcatcatcaaatggcaattacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaataaat 24669176  T
Q  201 gcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaac 298  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||  || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||| ||||||||    
T  24669175 gcaaatatgcatgtggtaccatattcagggtcgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcatcagagcataagctctcaccgctttgaacaac 24669076  T
Q  299 -tagtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
      |||| || |||||||||||||||    
T  24669075 aaagtgttccaggacatgagtcctc 24669051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 101 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 24739044 - 24738820
Alignment:
Q  101 aacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaat 200  Q
    |||| ||||| || || |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24739044 aacatcatcatcatcaaatggcaattacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaataaat 24738945  T
Q  201 gcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaac 298  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||  || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||| ||||||||    
T  24738944 gcaaatatgcatgtggtaccatattcagggtcgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcatcagagcataagctctcaccgctttgaacaac 24738845  T
Q  299 -tagtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
      |||| || |||||||||||||||    
T  24738844 aaagtgttccaggacatgagtcctc 24738820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 118 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 27636143 - 27635935
Alignment:
Q  118 atggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggt 217  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27636143 atggcaattacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaataagtgcaaatatgcatgtggt 27636044  T
Q  218 accaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaacta-gtgctctaggaca 313  Q
    |||| |  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||| |||||||| | ||| || ||||||    
T  27636043 accatattcagggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggaca 27635944  T
Q  314 tgagtcctc 322  Q
    | |||||||    
T  27635943 taagtcctc 27635935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 268 - 411
Target Start/End: Original strand, 20347154 - 20347300
Alignment:
Q  268 caagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatct 365  Q
    |||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20347154 caagaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggacatgaatcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatct 20347253  T
Q  366 acatacaactgaccatgcaatgc-aactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  20347254 acatacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtgacaccacttaaa 20347300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 271 - 411
Target Start/End: Original strand, 18566603 - 18566744
Alignment:
Q  271 gaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacat 369  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18566603 gaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacat 18566702  T
Q  370 acaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||| ||||||||||    |||||| ||||||||||||||||    
T  18566703 acaattgaccatgcatacaaactccttgtgactccacttaaa 18566744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 268 - 411
Target Start/End: Original strand, 20340550 - 20340696
Alignment:
Q  268 caagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatct 365  Q
    ||||||||||||  |||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20340550 caagaccgaagccatcaccgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatgaacctacttgtgtatatct 20340649  T
Q  366 acatacaactgaccatgcaatgc-aactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  20340650 acatacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtgacaccacttaaa 20340696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 271 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 41877929 - 41877815
Alignment:
Q  271 gaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacata 370  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  41877929 gaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacata 41877830  T
Q  371 caact-gaccatgca 384  Q
    ||||| |||||||||    
T  41877829 caactagaccatgca 41877815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 142 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 29746774 - 29746666
Alignment:
Q  142 gactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcac 241  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29746774 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcac 29746675  T
Q  242 cgcttttga 250  Q
    |||| ||||    
T  29746674 cgctgttga 29746666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 271 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 29746689 - 29746546
Alignment:
Q  271 gaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctaca 368  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29746689 gaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctaca 29746590  T
Q  369 tacaac-tgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||||| ||||||||||    |||||||| ||||| ||||||||    
T  29746589 tacaacttgaccatgcatacaaactccatatgacttcacttaaa 29746546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 37599680 - 37599542
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaaca 113  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| | | ||||||||| ||||||||||||||    
T  37599680 atcatcaataatagatatctaattcatcaattaaatctaacaccctgtcataataataattcatcaatatagaagtatatcatcattaacaacatcaaca 37599581  T
Q  114 ccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
     || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37599580 acaaatggtaattaaaaccaacaacaacgactcatgcaa 37599542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 148
Target Start/End: Original strand, 22749543 - 22749677
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaaca 113  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| | | ||||||||| ||||||||||||||    
T  22749543 atcatcaataatagatatctaattcatcaattaaatctaacaccctgtcataataataattcatcaatatataagtatatcatcattaacaacatcaaca 22749642  T
Q  114 ccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcat 148  Q
     || |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22749643 acaaatggtaattaaaaccaacaacaacgactcat 22749677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Original strand, 42959872 - 42960010
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaaca 113  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| | | ||||||||| ||||||||||||||    
T  42959872 atcaccaataatagatatctaattcatcaattaaatctaacaccctgtcataataataattcatcaatatataagtatatcatcattaacaacatcaaca 42959971  T
Q  114 ccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
     || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42959972 acaaatggtaattaaaaccaacaacaacgactcatgcaa 42960010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 271 - 383
Target Start/End: Original strand, 22379546 - 22379658
Alignment:
Q  271 gaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacata 370  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  22379546 gaccaaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacata 22379644  T
Q  371 caac-tgaccatgc 383  Q
    |||| |||||||||    
T  22379645 caacttgaccatgc 22379658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 330 - 411
Target Start/End: Original strand, 24008126 - 24008207
Alignment:
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24008126 tttatgcatatgcaatggacctacatgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 24008207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 132 - 250
Target Start/End: Original strand, 20347062 - 20347180
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 231  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20347062 caacaactaagactcatgcaaatgacaagacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatggatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaagaccg 20347161  T
Q  232 aagccctcaccgcttttga 250  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  20347162 aagccctcaccgctgttga 20347180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 129 - 250
Target Start/End: Original strand, 18566506 - 18566626
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagga 228  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  18566506 aaccaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaa-atatgcaaatatgcatgtggtaccagacatga 18566604  T
Q  229 ccgaagccctcaccgcttttga 250  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  18566605 ccgaagccctcaccgctgttga 18566626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Original strand, 19510820 - 19510958
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaaca 113  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||| | | |||| |||| ||||||||||||||    
T  19510820 atcatcaataatagatatccaattcatcaattaaatctaacatcctgtcataataataattcatcaatatataagtatattatcattaacaacatcaaca 19510919  T
Q  114 ccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
     || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19510920 acaaatggtaattaaaaccaacaacaacgactcatgcaa 19510958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 132 - 250
Target Start/End: Original strand, 20340458 - 20340576
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 231  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20340458 caacaactaagactcatgcaaatgacaagacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatggatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaagaccg 20340557  T
Q  232 aagccctcaccgcttttga 250  Q
    ||||| |||||||| ||||    
T  20340558 aagccatcaccgctgttga 20340576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 28371812 - 28371677
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaaca 113  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||| | | ||||||||| ||||||||||||||    
T  28371812 atcatcaataatagatatctaactcatcaattaaatctaacaccctgtcataataataatttatcaatatataagtatatcatcattaacaacatcaaca 28371713  T
Q  114 ccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatg 149  Q
     || |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  28371712 acaaatggtaattaaaaccaacaacgacgactcatg 28371677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Original strand, 22335899 - 22336035
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaaca 113  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||| | | ||||||||| |||||||||||  |    
T  22335899 atcatcaataatagatatctaactcatcaattaaatctaacaccctgtcataataacaattcatcaatatataagtatatcatcattaacaacatca--a 22335996  T
Q  114 ccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22335997 ccaaatgataattaaaaccaacaacaacgactcatgcaa 22336035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Original strand, 22339437 - 22339573
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaaca 113  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| | | | ||||||| |||||||||||  |    
T  22339437 atcatcaataatagatatctaactcatcaattaaatctaacaccctgtcataataataattcatcaatatataagtaaatcatcattaacaacatca--a 22339534  T
Q  114 ccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22339535 ccaaatgataattaaaaccaacaacaacgactcatgcaa 22339573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 23113122 - 23112986
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaaca 113  Q
    |||||||||| ||||||| ||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| | | ||||||||| |||||||||||  |    
T  23113122 atcatcaataatagatatataactcatcaattaaatctaacaccctgtcataataataattcatcaatatataagtatatcatcattaacaacatca--a 23113025  T
Q  114 ccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23113024 ccaaatgataattaaaaccaacaacaacgactcatgcaa 23112986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 41878371 - 41878235
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaaca 113  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||  |||| | | ||||||||| |||||||||||  |    
T  41878371 atcatcaataatagatatctaactcatcaattaaatctatcaccctgtcataaaaataattcatcaatatataagtatatcatcattaacaacatca--a 41878274  T
Q  114 ccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41878273 ccaaatgataattaaaaccaacaacaacgactcatgcaa 41878235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 22232957 - 22232852
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactc 146  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||| |  |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  22232957 aatctaacaccctatcataataataattcatcaatatataaaaatatcatcattaacaacatcaacaacaaatggtaattaaaaccaacaacatcgactc 22232858  T
Q  147 atgcaa 152  Q
    ||||||    
T  22232857 atgcaa 22232852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Original strand, 34828850 - 34828956
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataa-caacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgact 145  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||||  |||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||    
T  34828850 aatctaacaccctatcatcataataattcatcaatatatatgtatatcatcattaatcaacatcaacaacaaatggtaatttaaaccaacaacaacgact 34828949  T
Q  146 catgcaa 152  Q
    |||||||    
T  34828950 catgcaa 34828956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 245
Target Start/End: Original strand, 22379504 - 22379564
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgct 245  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22379504 agacccctcaataaatgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccaaagccctcaccgct 22379564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 129 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 1857758 - 1857620
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--cag 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |  ||| | | || ||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  1857758 aaccaacaacaccgactcatgcaaaggtcatgaccacaccgctaaaacaacaccctagactccttgataaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcag 1857659  T
Q  227 gaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    | |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  1857658 ggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 1857620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Original strand, 9775259 - 9775395
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaaca 113  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||| |  |||||| || |||||||||||||||||||| ||||  |||| | | ||||||||| |||||||||||  |    
T  9775259 atcatcaataatagatatctaactcaccaattaaatatatcaccctgtcataataataattcatcaatatataagtatatcatcattaacaacatca--a 9775356  T
Q  114 ccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  9775357 ccaaatgataattaaaaccaacaacgacgattcatgcaa 9775395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 129 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 21675726 - 21675588
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--cag 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |  ||| | | || ||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  21675726 aaccaacaacaccgactcatgcaaaggtcatgaccacaccgctaaaacaacaccctagactccttgataaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcag 21675627  T
Q  227 gaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    | |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  21675626 ggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 21675588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 129 - 222
Target Start/End: Original strand, 33536228 - 33536320
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaa 222  Q
    |||||||||  | |||||||||||  || ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  33536228 aaccaacaaataagactcatgcaatggacatgacaacaccgctaagacaacaccttagactcctcaa-atatgcaaatatgcatgtggtaccaa 33536320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 38146138 - 38146042
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatca 110  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||| | | ||||||||| |||||||||||    
T  38146138 atcatcaataatagatatctaactcatcaattaaatctaacaccctatcataataataattcatcaatatataagtatatcatcattaacaacatca 38146042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 6404815 - 6404711
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactc 146  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||  |||| || |||||||||| || ||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  6404815 aatctaagaccctatcataataacaattcatcaatatatataaatatcatcattatcaacatcaacaacaaatggtaattaaaaccaac-acaccgactc 6404717  T
Q  147 atgcaa 152  Q
    ||||||    
T  6404716 atgcaa 6404711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 6728575 - 6728470
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactc 146  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||||   ||| || |||||||||| || |||| |||||| || ||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  6728575 aatctaacactctatcataataataattcatcaacatatataaatatcatcattatcaacgtcaacaacaaatgataattaaaaccaacaacatcgactc 6728476  T
Q  147 atgcaa 152  Q
    ||||||    
T  6728475 atgcaa 6728470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 19235825 - 19235906
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||    
T  19235825 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattc 19235906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 28371624 - 28371543
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  28371624 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcaccgttatagaatggttaaagcattc 28371543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 38145951 - 38145870
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  38145951 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcaccgttatagaatggttaaagcattc 38145870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 42960060 - 42960141
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  42960060 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcaccgttatagaatggttaaagcattc 42960141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 41877949 - 41877911
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgct 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41877949 atgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgct 41877911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 22008239 - 22008134
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactc 146  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||   ||| || |||||||||| || ||||||||||| || |||  | ||| ||||||||||| ||||||    
T  22008239 aatctaacaccctatcaaaataataattcatcaacatatataaatatcatcattatcaacatcaacaacaaatgacatttaaaaccaacaacatcgactc 22008140  T
Q  147 atgcaa 152  Q
    ||||||    
T  22008139 atgcaa 22008134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 22336085 - 22336166
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||    
T  22336085 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattc 22336166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 22460080 - 22460161
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||  | | | |||||||||||||||||    
T  22460080 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcattgttatagaatggttaaagcattc 22460161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 22466704 - 22466785
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||    
T  22466704 agactcatcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattc 22466785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 22749731 - 22749812
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||    
T  22749731 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattc 22749812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 34829006 - 34829087
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||  ||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  34829006 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccggagccctcaccgttatagaatggttaaagcattc 34829087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 322
Target Start/End: Original strand, 427215 - 427336
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaact--a 300  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||| ||||||| |  |    
T  427215 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcatggcataagccctcaccgctttgaacaattaaa 427314  T
Q  301 gtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    ||| || |||||||||||||||    
T  427315 gtgttccaggacatgagtcctc 427336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 23444380 - 23444259
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaact--a 300  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||| ||||||| |  |    
T  23444380 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaattaaa 23444281  T
Q  301 gtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    ||| || |||||||||||||||    
T  23444280 gtgttccaggacatgagtcctc 23444259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 758427 - 758365
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  758427 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 758365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 322
Target Start/End: Original strand, 21829546 - 21829621
Alignment:
Q  247 ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||| |||||||  |||| || |||||||||||||||    
T  21829546 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctc 21829621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22313005 - 22312943
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22313005 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 22312943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22509346 - 22509284
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    |||||||||||||||||  || ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22509346 atgcatgtggtaccaaaatcaagaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 22509284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 23112936 - 23112854
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||   ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  23112936 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataatcagggccgtgaccctcaccgctgtcgaatggttaaagcattc 23112854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 21574195 - 21574076
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagt 302  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||| | || ||||  |||||||  |||||||  |||    
T  21574195 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatagttaaagcattcatcagggcctaagccatcaccgcactgaacaataagt 21574096  T
Q  303 gctctaggacatgagtcctc 322  Q
    | || |||||||||||||||    
T  21574095 gttccaggacatgagtcctc 21574076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 22339623 - 22339704
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| | |||  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||    
T  22339623 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtcgtaccatatcagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattc 22339704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 28890557 - 28890476
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |   || |||||||||||||||||    
T  28890557 agactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccataacagagccgaagctctcatcttattagaatggttaaagcattc 28890476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 28897261 - 28897180
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |   || |||||||||||||||||    
T  28897261 agactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccataacagagccgaagctctcatcttattagaatggttaaagcattc 28897180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 28910461 - 28910380
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |   || |||||||||||||||||    
T  28910461 agactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccataacagagccgaagctctcatcttattagaatggttaaagcattc 28910380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 28925729 - 28925648
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |   || |||||||||||||||||    
T  28925729 agactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccataacagagccgaagctctcatcttattagaatggttaaagcattc 28925648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 28932152 - 28932071
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |   || |||||||||||||||||    
T  28932152 agactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccataacagagccgaagctctcatcttattagaatggttaaagcattc 28932071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 28933656 - 28933575
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |   || |||||||||||||||||    
T  28933656 agactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccataacagagccgaagctctcatcttattagaatggttaaagcattc 28933575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 28946856 - 28946775
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |   || |||||||||||||||||    
T  28946856 agactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccataacagagccgaagctctcatcttattagaatggttaaagcattc 28946775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 18409232 - 18409149
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||| |  |||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  18409232 agactcctcgacaaatgcaactatgcacgtggtaccatattcagggccgaagctctcaccgctaattgaatggttaaagcattc 18409149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 9775445 - 9775527
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||   ||| |||| || | |||||||||||||||||    
T  9775445 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaaatcagggccgtgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattc 9775527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 187 - 265
Target Start/End: Original strand, 19510979 - 19511060
Alignment:
Q  187 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa---caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |   |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  19510979 actcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 19511060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 20937594 - 20937656
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  20937594 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgatgtagaatggttaaagcattcat 20937656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 37805514 - 37805432
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||  ||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  37805514 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaaatcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 37805432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 322
Target Start/End: Original strand, 20843142 - 20843262
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaacta-g 301  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |  | || ||||||||| |||||||| | |    
T  20843142 atgcatgtggtaccaatttacagggcaggagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataggccctcaccgctttgaacaacaagg 20843241  T
Q  302 tgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    || || |||||||||||||||    
T  20843242 tgttccaggacatgagtcctc 20843262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 221
Target Start/End: Original strand, 23527428 - 23527462
Alignment:
Q  187 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 221  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23527428 actcctcaatgaatgcaaatatgcatgtggtacca 23527462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 317 - 375
Target Start/End: Original strand, 34829179 - 34829236
Alignment:
Q  317 gtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34829179 gtcctcaccgct-tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 34829236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 20819108 - 20819189
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||   |||  ||||||| |||| || | | |||||||||||||||||    
T  20819108 agactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccatttcagagccgaagctctcatcgttatagaatggttaaagcattc 20819189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 20826208 - 20826289
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||   |||  ||||||| |||| || | | |||||||||||||||||    
T  20826208 agactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccatttcagagccgaagctctcatcgttatagaatggttaaagcattc 20826289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 23112753 - 23112708
Alignment:
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23112753 tttatgcttatgcaaatgacccacttgtgtatatctacatacaact 23112708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 23561788 - 23561669
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagt 302  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |  |||| |||||||||  || |||  |||    
T  23561788 atgcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgcttggaccaataagt 23561689  T
Q  303 gctctaggacatgagtcctc 322  Q
    | || |||||||||||||||    
T  23561688 gttccaggacatgagtcctc 23561669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 118 - 178
Target Start/End: Original strand, 20831689 - 20831749
Alignment:
Q  118 atggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaa 178  Q
    |||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||    
T  20831689 atggcaattacatccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaa 20831749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 330 - 374
Target Start/End: Original strand, 20937755 - 20937799
Alignment:
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 374  Q
    ||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  20937755 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 20937799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 330 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 22312845 - 22312801
Alignment:
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 374  Q
    ||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22312845 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 22312801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22439924 - 22439888
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 221  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  22439924 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtacca 22439888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 332 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 23444211 - 23444167
Alignment:
Q  332 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  23444211 tatgcttatgcaatggactctacttgtgtatatctacataaaact 23444167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 152
Target Start/End: Original strand, 25013495 - 25013547
Alignment:
Q  100 taacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    ||||||||||||||  |  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  25013495 taacaacatcaacaataagtggtaatttcaaccaacaacaacgactcatgcaa 25013547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 152)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 13964249 - 13963967
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 231  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13964249 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatggatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 13964150  T
Q  232 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg- 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||     
T  13964149 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgt 13964050  T
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgc-aactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  13964049 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtgacaccacttaaa 13963967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 129 - 411
Target Start/End: Original strand, 46174247 - 46174531
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagga 228  Q
    |||||||||  | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46174247 aaccaacaattatgactcatgcaaatgatatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagga 46174346  T
Q  229 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgc 327  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  46174347 ccgaaaccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcccctccgc 46174446  T
Q  328 tgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||    
T  46174447 tgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacatgaccatgc-atacatactccatatgactccacttaaa 46174531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Original strand, 37285134 - 37285416
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 231  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37285134 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatggatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 37285233  T
Q  232 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg- 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||     
T  37285234 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcagggccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcatctccgctgt 37285333  T
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgc-aactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  37285334 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaacttcatgtgacaccacttaaa 37285416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 132 - 384
Target Start/End: Original strand, 46649695 - 46649948
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 231  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46649695 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatggatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 46649794  T
Q  232 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtt 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46649795 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccactgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtt 46649894  T
Q  332 tatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 384  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  46649895 tatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 46649948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 142 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 17468488 - 17468226
Alignment:
Q  142 gactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcac 241  Q
    |||||||||||  || ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17468488 gactcatgcaatggacatgacaacactgctaagacaacaccttaaactcctcaa-atatgcaaatatgcatgtggtaccaaccaggaccgaagccctcac 17468390  T
Q  242 cgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatat 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17468389 cgcttttgaatggttaaagcattcattaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatat 17468290  T
Q  341 gcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcc 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  17468289 gcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcatacaaactccatgtgactcc 17468226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 142 - 404
Target Start/End: Original strand, 17584726 - 17584988
Alignment:
Q  142 gactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcac 241  Q
    |||||||||||  || ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17584726 gactcatgcaatggacatgacaacactgctaagacaacaccttaaactcctcaa-atatgcaaatatgcatgtggtaccaaccaggaccgaagccctcac 17584824  T
Q  242 cgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatat 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17584825 cgcttttgaatggttaaagcattcattaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatat 17584924  T
Q  341 gcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcc 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  17584925 gcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcatacaaactccatgtgactcc 17584988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 129 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 2388806 - 2388551
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagga 228  Q
    |||||||||  | |||||||||||  || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2388806 aaccaacaaataagactcatgcaatggacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaa-atatgcaaatatgcatgtggtaccaaccagga 2388708  T
Q  229 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgc 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  2388707 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccagaacatgagtcctctctgc 2388608  T
Q  328 tgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2388607 tgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 2388551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 132 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 11899556 - 11899278
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11899556 caacaaccaagactcatgcaaatgatatgacaacactgctaagacaccatcttagacttctcaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 11899458  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  11899457 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 11899358  T
Q  330 -tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccactt 408  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11899357 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatatgactccactt 11899278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 132 - 408
Target Start/End: Original strand, 2438809 - 2439087
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 231  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2438809 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatggatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 2438908  T
Q  232 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg- 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||     
T  2438909 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgt 2439008  T
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccactt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  2439009 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctatatacaactgaccatgcaatgcaactcattatgactccactt 2439087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 132 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 18437412 - 18437135
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 231  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18437412 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaccatcttagacttctcaatgaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggaccg 18437314  T
Q  232 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg- 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||     
T  18437313 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcttcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggactgaagccctcaccgctgt 18437214  T
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccactt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18437213 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatatgactccactt 18437135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 129 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 20019920 - 20019636
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagga 228  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20019920 aaccaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcgtcaa-atatgcaaatatgcatgtggtaccagacagga 20019822  T
Q  229 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgc 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||   || |||| ||||    
T  20019821 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgc 20019722  T
Q  328 tg--tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  20019721 tgtttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcatacaaactccatgtgactccacttaaa 20019636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 132 - 408
Target Start/End: Original strand, 11339696 - 11339974
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | |||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11339696 caacaactaagactcatgcacatgacatgacaacactgctaagacaccatcttagactcctcaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 11339794  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  11339795 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 11339894  T
Q  330 -tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccactt 408  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  11339895 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactcaatatgactccactt 11339974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 132 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 17726579 - 17726301
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17726579 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaccatcttagacttctcaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 17726481  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  17726480 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcactgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 17726381  T
Q  330 -tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccactt 408  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  17726380 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatatgattccactt 17726301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 166 - 390
Target Start/End: Original strand, 49158703 - 49158927
Alignment:
Q  166 actgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49158703 actgctaagacaacaccttagactcctcaa-atatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacatgaccaaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 49158800  T
Q  266 atcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatat 363  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49158801 atcatgaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatat 49158900  T
Q  364 ctacatacaactgaccatgcaatgcaa 390  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  49158901 ctacatacaactgaccatgcaatgcaa 49158927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16844063 - 16843865
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16844063 agactcctcaataaatgcat-tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 16843965  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 383  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16843964 ccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 16843866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 132 - 408
Target Start/End: Original strand, 642475 - 642753
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  642475 caacaaccaagactcatgcaaataacatgacaacactgctaagacaccatcttagacttctcaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 642573  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||| |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  642574 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgttgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 642673  T
Q  330 -tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccactt 408  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  642674 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaaatgaccatgcaatgcaactcaatatgactccactt 642753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 132 - 407
Target Start/End: Original strand, 11878994 - 11879269
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11878994 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 11879090  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  11879091 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 11879190  T
Q  330 ttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccact 407  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11879191 tttcatgcatatgcaatggacctacttgtttatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccact 11879269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 5187489 - 5187208
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  5187489 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttctaaatgaaatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggacc 5187392  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  5187391 gaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 5187292  T
Q  330 ttt--atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5187291 tttttatgcatatgcaatggacctacttgcgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 5187208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 166 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 26113969 - 26113725
Alignment:
Q  166 actgctaagacaacaccttagactcctcaat--aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat 263  Q
    |||||||||||| || |||||||| || ||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26113969 actgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat 26113871  T
Q  264 tcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtat 361  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26113870 tcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttaatgcatatgcaatggacctacttgtgtat 26113771  T
Q  362 atctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccact 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26113770 atctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccact 26113725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 132 - 408
Target Start/End: Original strand, 33404579 - 33404856
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 231  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||| ||| | | |||||||||||| || |||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  33404579 caacaactaagactcatgcaagtgacatgactacactgctaagacaccatcttagacttctcaatggatgcaa-tatgcatgtggtaccaaataggaccg 33404677  T
Q  232 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgt 330  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||   || |||| |||||||    
T  33404678 aagccgtcatcgcttttgaatggttaaagcattcataaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactctaggaccgaagccctcaccgctgt 33404777  T
Q  331 tt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccactt 408  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33404778 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatatgactccactt 33404856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Original strand, 19439290 - 19439489
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19439290 agacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtatcaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 19439389  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 383  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19439390 ccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcatc-ccgctgtttatgcatattctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 19439488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 132 - 407
Target Start/End: Original strand, 32627324 - 32627599
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||| ||||||| || |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32627324 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgttaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 32627420  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| || ||   || |||| ||||||    
T  32627421 gaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccagaaccgaagccctcaccgctg 32627520  T
Q  330 ttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccact 407  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32627521 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccact 32627599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 142 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 8197434 - 8197165
Alignment:
Q  142 gactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataa-atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctca 240  Q
    ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| | |||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  8197434 gactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttctaaatgagatgcat-tatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctca 8197338  T
Q  241 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| ||||||    
T  8197337 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcat 8197238  T
Q  339 atgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8197237 atgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 8197165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 166 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 11299866 - 11299626
Alignment:
Q  166 actgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcatt 264  Q
    |||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11299866 actgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcatt 11299768  T
Q  265 catcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtata 362  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11299767 catcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtata 11299668  T
Q  363 tctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcc 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11299667 tctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcc 11299626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 166 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 11308230 - 11307990
Alignment:
Q  166 actgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcatt 264  Q
    |||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11308230 actgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcatt 11308132  T
Q  265 catcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtata 362  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11308131 catcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtata 11308032  T
Q  363 tctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcc 404  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11308031 tctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcc 11307990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 142 - 408
Target Start/End: Original strand, 749778 - 750046
Alignment:
Q  142 gactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat--aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 239  Q
    ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||   ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  749778 gactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctc 749875  T
Q  240 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg-tttatgca 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||   || |||| |||||| ||||||||    
T  749876 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgca 749975  T
Q  338 tatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccactt 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  749976 tatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcaactt 750046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Original strand, 23520981 - 23521179
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  23520981 agacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaataggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 23521079  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 383  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23521080 ccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 23521178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 142 - 411
Target Start/End: Original strand, 1317701 - 1317972
Alignment:
Q  142 gactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat--aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 239  Q
    ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||   ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  1317701 gactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctc 1317798  T
Q  240 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgca 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| |||||    
T  1317799 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgca 1317898  T
Q  338 tatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1317899 tatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcaacttaaa 1317972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 142 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 26090187 - 26089916
Alignment:
Q  142 gactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat--aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 239  Q
    ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||   ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  26090187 gactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctc 26090090  T
Q  240 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgca 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| |||||    
T  26090089 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgca 26089990  T
Q  338 tatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26089989 tatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcaacttaaa 26089916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 142 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 40684999 - 40684728
Alignment:
Q  142 gactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat--aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 239  Q
    ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||   ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  40684999 gactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctc 40684902  T
Q  240 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgca 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| |||||    
T  40684901 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgca 40684802  T
Q  338 tatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40684801 tatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcaacttaaa 40684728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Original strand, 13019686 - 13019885
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||    
T  13019686 agacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcatgatcgaagtcctca 13019785  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 383  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13019786 ccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgttatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 13019884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 132 - 410
Target Start/End: Original strand, 42058476 - 42058755
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  42058476 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaatcaggacc 42058572  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  42058573 ggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 42058672  T
Q  330 ttt--atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 410  Q
    |||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42058673 tttttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccaattaa 42058755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 142 - 410
Target Start/End: Original strand, 49150520 - 49150791
Alignment:
Q  142 gactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat--aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 239  Q
    ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||   ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  49150520 gactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctc 49150617  T
Q  240 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt--atgc 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| |||||||||  ||||    
T  49150618 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgc 49150717  T
Q  337 atatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49150718 atatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgaccccacttaa 49150791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 142 - 410
Target Start/End: Original strand, 49157210 - 49157481
Alignment:
Q  142 gactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat--aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 239  Q
    ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||   ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  49157210 gactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctc 49157307  T
Q  240 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt--atgc 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| |||||||||  ||||    
T  49157308 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgc 49157407  T
Q  337 atatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49157408 atatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgaccccacttaa 49157481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 142 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 48988157 - 48987886
Alignment:
Q  142 gactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat--aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 239  Q
    ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||   ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  48988157 gactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctc 48988060  T
Q  240 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgca 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| |||||    
T  48988059 accgcttttgaatggttaaagcattcatcagggccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgca 48987960  T
Q  338 tatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48987959 tatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcaacttaaa 48987886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 166 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 26120582 - 26120338
Alignment:
Q  166 actgctaagacaacaccttagactcctcaat--aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat 263  Q
    |||||||||||| || |||||||| || ||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26120582 actgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat 26120484  T
Q  264 tcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtat 361  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26120483 tcatcacgaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtggat 26120384  T
Q  362 atctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccact 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  26120383 atctacatacaactgaccatgcaatgcaacaacatgtgactccact 26120338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 142 - 411
Target Start/End: Original strand, 2281022 - 2281293
Alignment:
Q  142 gactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataa-atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctca 240  Q
    ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  2281022 gactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgagatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctca 2281119  T
Q  241 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgc--tgtttatgca 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||   || |||| ||||  | ||||||||    
T  2281120 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctatttttatgca 2281219  T
Q  338 tatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  2281220 tatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatatgacaccacttaaa 2281293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 206 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 40923095 - 40922889
Alignment:
Q  206 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgc 304  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| || |||||||| |    
T  40923095 tatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgatgttgagcaactagtac 40922996  T
Q  305 tctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactc 403  Q
    || |||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40922995 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactc 40922896  T
Q  404 cacttaa 410  Q
    || ||||    
T  40922895 caattaa 40922889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Original strand, 12461497 - 12461695
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||    
T  12461497 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcatttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagcattca 12461595  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgc 383  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12461596 ccgctgtgaacaactagtgctccatgacatgagccctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgc 12461694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 167 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 2026436 - 2026191
Alignment:
Q  167 ctgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2026436 ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaatcgggaccgaagccctcgccgcttttgaatggttaaagcattc 2026338  T
Q  266 atcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatat 363  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||   ||  ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2026337 atcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagctctcaccgttgttttatgcatatggaatggacctacttgtgtatat 2026238  T
Q  364 ctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2026237 ctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccaattaa 2026191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 271 - 411
Target Start/End: Original strand, 21757357 - 21757498
Alignment:
Q  271 gaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacat 369  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21757357 gaccgaagccctcaccgctgttgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacat 21757456  T
Q  370 acaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  21757457 acaactgaccatgcatacaaactccatgtgactccacttaaa 21757498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 271 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 13453908 - 13453767
Alignment:
Q  271 gaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacat 369  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13453908 gaccgaagccctcaccgctgttgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacat 13453809  T
Q  370 acaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||||||||||||||    |||| ||||||||||||||||||    
T  13453808 acaactgaccatgcatacaaacttcatgtgactccacttaaa 13453767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 271 - 404
Target Start/End: Original strand, 37379955 - 37380089
Alignment:
Q  271 gaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacat 369  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37379955 gaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacat 37380054  T
Q  370 acaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcc 404  Q
    |||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  37380055 acaactgaccatgcatacaaactccatgtgactcc 37380089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 134 - 322
Target Start/End: Original strand, 32771422 - 32771614
Alignment:
Q  134 acaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccg 231  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||    
T  32771422 acaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccactaagacaacaccttagactcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccg 32771521  T
Q  232 aagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaacta-gtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||| |||||||| | ||| || |||||||||||||||    
T  32771522 aagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctc 32771614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 134 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 37244557 - 37244364
Alignment:
Q  134 acaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacc--aaacaggaccg 231  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||    
T  37244557 acaacaccgactcatgcaactgacatgacaacattgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccg 37244458  T
Q  232 aagccctcaccgc--ttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaacta-gtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||| | |||||||| | ||| || ||||||| |||||||    
T  37244457 aagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgttttgaacaacaaggtgttccaggacataagtcctc 37244364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 142 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 15086163 - 15086004
Alignment:
Q  142 gactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctc 239  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| | |||||||||    
T  15086163 gactcatgcaactgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggctgaagccctc 15086064  T
Q  240 accgct-tttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaac 298  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||| ||||||||    
T  15086063 accgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgctttgaacaac 15086004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 266 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 30602974 - 30602827
Alignment:
Q  266 atcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatat 363  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30602974 atcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatat 30602875  T
Q  364 ctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  30602874 ctacatacaactgaccatgcaatgcaactctatgtgactcaacttaaa 30602827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 142 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 8213505 - 8213299
Alignment:
Q  142 gactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataa-atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctca 240  Q
    ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| | |||||  ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  8213505 gactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttctaaatgagatgcat-tatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctca 8213409  T
Q  241 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||   || |||| |||||| |||||||||    
T  8213408 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcat 8213309  T
Q  339 atgcaatgga 348  Q
    ||||||||||    
T  8213308 atgcaatgga 8213299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Original strand, 16007874 - 16008012
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaaca 113  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| | | ||||||||| ||||||||||||||    
T  16007874 atcatcaataatagatatctaattcatcaattaaatctaacaccctgtcataataataattcatcaatatataagtatatcatcattaacaacatcaaca 16007973  T
Q  114 ccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
     || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16007974 acaaatggtaattaaaaccaacaacaacgactcatgcaa 16008012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 271 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 30271889 - 30271776
Alignment:
Q  271 gaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacata 370  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  30271889 gaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgctgtggacctacttgtgtatatctacata 30271791  T
Q  371 caac-tgaccatgca 384  Q
    |||| ||||||||||    
T  30271790 caacttgaccatgca 30271776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 142 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 18958670 - 18958485
Alignment:
Q  142 gactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacc--aaacaggaccgaagccctc 239  Q
    ||||||||||| ||| ||  ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||    
T  18958670 gactcatgcaactgacataacaacactgctaagacaacacattagacttctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctc 18958571  T
Q  240 accgc--ttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaacta-gtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||| |||||||| | ||| || ||||||| |||||||    
T  18958570 accgctgttttgaatggttaaagcattcatcatgacataagtcctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacataagtcctc 18958485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Original strand, 15166564 - 15166702
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaaca 113  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| | | ||||||||| ||||||||||||||    
T  15166564 atcatcaataatagatatctaattcatcaattaaatctaacaccctgtcataataataattcatcaatatataagtatatcatcattaacaacatcaaca 15166663  T
Q  114 ccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
     || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  15166664 acaaatggtaattaaaaccaacaacgacgactcatgcaa 15166702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 132 - 250
Target Start/End: Original strand, 15622094 - 15622212
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 231  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15622094 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatggatgcaaatatgcatgtggtaccaaataggaccg 15622193  T
Q  232 aagccctcaccgcttttga 250  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  15622194 aagccctcaccgctgttga 15622212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 123 - 322
Target Start/End: Original strand, 3327715 - 3327919
Alignment:
Q  123 aattagaaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacac-cttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 221  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||| |  ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3327715 aattacaaccgacaacaccgactcatgcaaatgacatggcaacatcgctaagacaacactcctagactcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtacca 3327814  T
Q  222 aa--caggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaacta-gtgctctaggacatgag 317  Q
     |  |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||| |||||||| | ||| || ||||||| ||    
T  3327815 tattcagggccaaagccctcaccgctttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacataag 3327914  T
Q  318 tcctc 322  Q
    |||||    
T  3327915 tcctc 3327919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 141 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 16952478 - 16952318
Alignment:
Q  141 cgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 238  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |  |||| |||||| |||    
T  16952478 cgactcatgcaactgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaataaaagcaaatatgcatgcggtaccatattcagggccgaagacct 16952379  T
Q  239 caccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaac 298  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||  |||  ||||||||| ||||||||    
T  16952378 caccgctgtttgaatggttaaagcattcttcaggacataagtcctcaccgctttgaacaac 16952318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 129 - 265
Target Start/End: Original strand, 4279885 - 4280023
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--cag 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  4279885 aaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcag 4279984  T
Q  227 gaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    | |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  4279985 ggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 4280023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 129 - 265
Target Start/End: Original strand, 19616217 - 19616355
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--cag 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  19616217 aaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcag 19616316  T
Q  227 gaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    | |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  19616317 ggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 19616355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 129 - 250
Target Start/End: Original strand, 37379858 - 37379978
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagga 228  Q
    |||||||||  | |||||||||||  || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37379858 aaccaacaattaagactcatgcaatggacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaa-atatgcaaatatgcatgtggtaccaaccagga 37379956  T
Q  229 ccgaagccctcaccgcttttga 250  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  37379957 ccgaagccctcaccgctgttga 37379978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Original strand, 14421145 - 14421282
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaaca 113  Q
    |||||||||| |||||||| | | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| | | |||| |||| ||||||||||||||    
T  14421145 atcatcaataatagatatcaaat-catcaattaaatctaacaccctgtcataataataattcatcaatatataagtatattatcattaacaacatcaaca 14421243  T
Q  114 ccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
     || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14421244 acaaatggtaattaaaaccaacaacaacgactcatgcaa 14421282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 16109419 - 16109282
Alignment:
Q  15 tcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacac 114  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||| |   ||||||||| ||||||||||||||     
T  16109419 tcatcaataatagatatatagttcatcaattaaatctaacaccctttcataataataattcatcagtatataattatatcatcattaacaacatcaacaa 16109320  T
Q  115 cacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  16109319 caaatggtaattaaaaccaacaacatcgactcatgcaa 16109282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Original strand, 18871656 - 18871794
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaaca 113  Q
    |||||||||| ||||||||||  || ||  || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||| | | ||||||||| ||||||||||||||    
T  18871656 atcatcaataatagatatctaactcttcaatttaatctaacaccctgtcatagtaataattcatcaatatataagtatatcatcattaacaacatcaaca 18871755  T
Q  114 ccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
     || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  18871756 acaaatggtaattaaaaccaataacaacgactcatgcaa 18871794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 150
Target Start/End: Original strand, 14565500 - 14565634
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaaca 113  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||| | | ||||||||| |||||||||||  |    
T  14565500 atcattaataatagatatctaattcatcaattaaatctaacaccctgacataataataattcatcaatatataagtatatcatcattaacaacatca--a 14565597  T
Q  114 ccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgc 150  Q
    ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14565598 ccaaatgataattaaaaccaacaacaacgactcatgc 14565634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Original strand, 146859 - 146995
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaaca 113  Q
    |||||||||| || |||||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||| | | ||||||||| |||||||||||  |    
T  146859 atcatcaataatatatatctaactcatcaattaaatctaacaccctatcataataataattcatcaatatataagtatatcatcattaacaacatca--a 146956  T
Q  114 ccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  146957 ccaaatgataattaaaaccaacaacaacgactcatgcaa 146995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 833298 - 833162
Alignment:
Q  15 tcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacac 114  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||  |||| |   ||||||||| ||||||||||||||     
T  833298 tcatcaataatagatatataattcatcaattaaatctaacactctatcataataataattcatcaatatataaatatatcatcattaacaacatcaacaa 833199  T
Q  115 cacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    || |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  833198 ca-atggtaattaaaaccatcaacatcgactcatgcaa 833162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 1198478 - 1198342
Alignment:
Q  15 tcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacac 114  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||  |||| |   ||||||||| ||||||||||||||     
T  1198478 tcatcaataatagatatataattcatcaattaaatctaacactctatcataataataattcatcaatatataaatatatcatcattaacaacatcaacaa 1198379  T
Q  115 cacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    || |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  1198378 ca-atggtaattaaaaccatcaacatcgactcatgcaa 1198342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 166 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 26289985 - 26289824
Alignment:
Q  166 actgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacc--aaacaggaccgaagccctcaccg--cttttgaatggttaaagc 261  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||  || || | || ||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  26289985 actgctaagacaacaccttagacttctcaaggaatgcaattatgcatgtggtaccataatcaaggccaaagccctcaccgttgttttgaatggttaaagc 26289886  T
Q  262 attcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaacta-gtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    |||||||| |||  |||  ||||||| | |||||||| | ||| || ||||||| |||||||    
T  26289885 attcatcaggacataagtcctcaccgttttgaacaacaaggtgttccaggacataagtcctc 26289824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Original strand, 29795522 - 29795658
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaaca 113  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||  |||||| || |||||||||||||||||||| ||||  |||| | | ||||||||| |||||||||||  |    
T  29795522 atcatcaataatagatatctaactcatcaattaaatatatcaccctgtcataataataattcatcaatatataagtatatcatcattaacaacatca--a 29795619  T
Q  114 ccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  29795620 ccaaatgataattaaaaccaacaacgacgattcatgcaa 29795658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Original strand, 29799341 - 29799477
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaaca 113  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||  |||||| || |||||||||||||||||||| ||||  |||| | | ||||||||| |||||||||||  |    
T  29799341 atcatcaataatagatatctaactcatcaattaaatatatcaccctgtcataataataattcatcaatatataagtatatcatcattaacaacatca--a 29799438  T
Q  114 ccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  29799439 ccaaatgataattaaaaccaacaacgacgattcatgcaa 29799477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 129 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 13453997 - 13453884
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagga 228  Q
    |||||||||  | |||||||||||  || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| |||||    
T  13453997 aaccaacaaataagactcatgcaatggacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaa---------atatgcatgtggtaccaaccagga 13453907  T
Q  229 ccgaagccctcaccgcttttgaa 251  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  13453906 ccgaagccctcaccgctgttgaa 13453884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 129 - 251
Target Start/End: Original strand, 21757268 - 21757381
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagga 228  Q
    |||||||||  | |||||||||||  || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||| |||||    
T  21757268 aaccaacaaataagactcatgcaatggacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaa---------atatgcatgtggtaccaaccagga 21757358  T
Q  229 ccgaagccctcaccgcttttgaa 251  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  21757359 ccgaagccctcaccgctgttgaa 21757381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 141 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 36306279 - 36306152
Alignment:
Q  141 cgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccct 238  Q
    ||||||||||| |||| ||  ||| || |||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||    
T  36306279 cgactcatgcatatgacataacaacaccgctaagacaacaccctaaactcctcaaataatgcaaatatgcatgtggtaccatattcaagaccgaagccct 36306180  T
Q  239 caccgct-tttgaatggttaaagcattc 265  Q
    |||| ||  | |||||||||||||||||    
T  36306179 caccactagtcgaatggttaaagcattc 36306152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 3290100 - 3289993
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactc 146  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||| |   ||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  3290100 aatctaacaccctatcataataataattcatcaatatataaatatatcatcattaacaacgtcaacaacaaatggtaattaaaactaacaacatcgactc 3290001  T
Q  147 atgcaaat 154  Q
    ||||||||    
T  3290000 atgcaaat 3289993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Original strand, 11302645 - 11302780
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaaca 113  Q
    |||||||||| |||||||| | |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| | | ||||||||| |||| ||||||  |    
T  11302645 atcatcaataatagatatccaattcatcatttacatctaacaccctgccataataataattcatcactatataagtatatcatcattaac-acatca--a 11302741  T
Q  114 ccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    ||| ||| | |||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  11302742 ccaaatgatgattaaagccatcaacaacgactcatgcaa 11302780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 326 - 384
Target Start/End: Original strand, 15838732 - 15838791
Alignment:
Q  326 gctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 384  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15838732 gctgtttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 15838791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 23666212 - 23666076
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaaca 113  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||| |  |||||| || |||||||||||||||||||| ||||  |||| | | ||||||||| |||||||||||  |    
T  23666212 atcatcaataatagatatctaactcaccaattaaatatatcaccctgtcataataataattcatcaatatataagtatatcatcattaacaacatca--a 23666115  T
Q  114 ccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  23666114 ccaaatgataattaaaaccaacaacgacgattcatgcaa 23666076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 207 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 15437783 - 15437663
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaacta-g 301  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||| |||||||| | |    
T  15437783 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagctctcaccgctttgaacaacaagg 15437684  T
Q  302 tgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  15437683 tgttctaggacatgagtcctc 15437663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 837294 - 837159
Alignment:
Q  15 tcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacac 114  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||| |   ||||||||| ||||||||| ||||     
T  837294 tcatcaataatagatatataattcatcaattaaatctaacaccctatcataataataattcatcaatatataaatatatcatcattaacaacatgaacaa 837195  T
Q  115 cacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    || |||||||||| || || ||||| ||||||||||||    
T  837194 ca-atggtaatta-aaacatcaacatcgactcatgcaa 837159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 1202474 - 1202339
Alignment:
Q  15 tcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacac 114  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||| |   ||||||||| ||||||||| ||||     
T  1202474 tcatcaataatagatatataattcatcaattaaatctaacaccctatcataataataattcatcaatatataaatatatcatcattaacaacatgaacaa 1202375  T
Q  115 cacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    || |||||||||| || || ||||| ||||||||||||    
T  1202374 ca-atggtaatta-aaacatcaacatcgactcatgcaa 1202339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 14946157 - 14946052
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactc 146  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||   ||| || |||||||||| || |||| |||||| || |||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  14946157 aatctaacaccctatcataataataattcatcatcatatataaatatcatcattatcaacctcaacaacaaatggcaattaaaaccaacaacatcgactc 14946058  T
Q  147 atgcaa 152  Q
    ||||||    
T  14946057 atgcaa 14946052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 15373750 - 15373645
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactc 146  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||   ||| || |||||||||| || |||| |||||| || |||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  15373750 aatctaacaccctatcataataataattcatcatcatatataaatatcatcattatcaacctcaacaacaaatggcaattaaaaccaacaacatcgactc 15373651  T
Q  147 atgcaa 152  Q
    ||||||    
T  15373650 atgcaa 15373645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 185 - 322
Target Start/End: Original strand, 46624820 - 46624962
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagct 280  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |  ||||     
T  46624820 agactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccgatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagcc 46624919  T
Q  281 ctcaccgctgtgaacaac-tagtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    ||||||||| ||||||||  |||| || |||||||||||||||    
T  46624920 ctcaccgctttgaacaacaaagtgttccaggacatgagtcctc 46624962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 267
Target Start/End: Original strand, 13678260 - 13678345
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  13678260 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcacctctaattgaatggttaaagcattcat 13678345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 147045 - 147126
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  147045 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcaccgttatagaatggttaaagcattc 147126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 2965909 - 2965990
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||    
T  2965909 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattc 2965990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 14179185 - 14179066
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagt 302  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||| |||||||  |||    
T  14179185 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaataagt 14179086  T
Q  303 gctctaggacatgagtcctc 322  Q
    | || |||||||||||||||    
T  14179085 gttccaggacatgagtcctc 14179066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 14320764 - 14320683
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  14320764 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagggccggagccctcaccgttatagaatggttaaagcattc 14320683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 14565686 - 14565767
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  14565686 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcaccgttatagaatggttaaagcattc 14565767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 30603030 - 30602946
Alignment:
Q  166 actgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttga 250  Q
    |||||||||||| || |||||||| || ||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  30603030 actgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgtaa-tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgctgttga 30602946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 46349074 - 46348969
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactc 146  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||| ||||  |||| |   ||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  46349074 aatctaacaccctaacataattataattcatcaatatataaatatatcatcattaacaacatcaacaacaaatggtatttataaccaacaacatcgactc 46348975  T
Q  147 atgcaa 152  Q
    ||||||    
T  46348974 atgcaa 46348969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 10897568 - 10897504
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatc 78  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  10897568 atcatcaataatagatatctaattcatcaattaaatctaacactctgtcataataataattcatc 10897504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 14431989 - 14432051
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14431989 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 14432051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 15338826 - 15338888
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  15338826 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 15338888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 15723392 - 15723330
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  15723392 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 15723330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 18606844 - 18606926
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca--aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    |||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  18606844 agactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccatgttcaggaccgtagcccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 18606926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 267
Target Start/End: Original strand, 19145544 - 19145629
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    ||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19145544 agactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccattttacagggcagaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattcat 19145629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 267
Target Start/End: Original strand, 20744943 - 20745028
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    ||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20744943 agactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccattttacagggcagaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattcat 20745028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 35962914 - 35962852
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  35962914 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 35962852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 15166752 - 15166833
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||    
T  15166752 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattc 15166833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 15437937 - 15437832
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactc 146  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||| ||||  |||| |   ||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||| |||||| |||||||| ||    
T  15437937 aatctaacaccctaacattataataattcatcaatatataaatatatcatcattaacaacatcaacaataaatggtaattataaccaaaaacaacgattc 15437838  T
Q  147 atgcaa 152  Q
    ||||||    
T  15437837 atgcaa 15437832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 18871844 - 18871925
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||    
T  18871844 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattc 18871925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 21232232 - 21232149
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  21232232 agactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctc-ccgctaatgaatggttaaagcattcat 21232149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 29182250 - 29182169
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |  | | |||||||||||||||||    
T  29182250 agactcctcaacaattgcaactatgcatgtggtaccataacagggccgaagccctcatctttatagaatggttaaagcattc 29182169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 31154345 - 31154426
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  31154345 agactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagggccgaggccctcaccgttatagaatggttaaagcattc 31154426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 11220290 - 11220227
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11220290 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctatttgaatggttaaagcattcat 11220227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 46682370 - 46682249
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaact--a 300  Q
    |||||| |||||||||   ||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||| ||||||| |  |    
T  46682370 atgcatttggtaccaatttacaggacagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaattaaa 46682271  T
Q  301 gtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    ||| || |||||||||||||||    
T  46682270 gtgttccaggacatgagtcctc 46682249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 12591832 - 12591751
Alignment:
Q  187 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa---caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  12591832 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 12591751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 12711097 - 12711016
Alignment:
Q  187 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa---caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  12711097 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatccagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 12711016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13124168 - 13124087
Alignment:
Q  187 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa---caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  13124168 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatccagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 13124087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 15098143 - 15098023
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaact--a 300  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||| ||||||| |  |    
T  15098143 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaattaaa 15098044  T
Q  301 gtgctctaggacatgagtcct 321  Q
    ||| || ||||||||||||||    
T  15098043 gtgttccaggacatgagtcct 15098023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 15711168 - 15711106
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  15711168 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaatcattcat 15711106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 16109243 - 16109181
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  16109243 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 16109181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 30271910 - 30271871
Alignment:
Q  206 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgct 245  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30271910 tatgcatgtggtatcaaacaggaccgaagccctcaccgct 30271871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 3858554 - 3858473
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||  ||||||| |||| || | | |||||||||||||||||    
T  3858554 agactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccatatcagagccgaagctctcatcgttatagaatggttaaagcattc 3858473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 10897382 - 10897301
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |  | | |||||||||||||||||    
T  10897382 agacttctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatctttatagaatggttaaagcattc 10897301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 16008062 - 16008143
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| | |||  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||    
T  16008062 agactcctcaacaaatgcaaccatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattc 16008143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 16089999 - 16090080
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||  | | ||||||||||| |||||    
T  16089999 agactcctcaacaattgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcacctttatagaatggttaaaccattc 16090080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20907559 - 20907478
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||   ||||||||||| || | | |||||||||||||||||    
T  20907559 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagtcgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattc 20907478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 82254 - 82133
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaact--a 300  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||| | |  |||| ||||||||| ||||||| |  |    
T  82254 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcactcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaattaaa 82155  T
Q  301 gtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    ||| || |||||||||||||||    
T  82154 gtgttccaggacatgagtcctc 82133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 15104520 - 15104426
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaa 297  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||| |||||||    
T  15104520 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaa 15104426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 1612623 - 1612685
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||    
T  1612623 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagcccccaccgctgtagaatggttaaagcattcat 1612685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 6411821 - 6411883
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  6411821 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgtagaattgttaaagcattcat 6411883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 11384037 - 11383955
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca--aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    |||||||| ||||| | ||||| | |||||||||||||||||    
T  11384037 agactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatgttcaggaccgtagcccactccgctgtcgaatggttaaagcattc 11383955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 11390525 - 11390443
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca--aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    |||||||| ||||| | ||||| | |||||||||||||||||    
T  11390525 agactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatgttcaggaccgtagcccactccgctgtcgaatggttaaagcattc 11390443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 14281822 - 14281760
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14281822 atgcatgtggtaccataatcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 14281760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 187 - 265
Target Start/End: Original strand, 14421334 - 14421415
Alignment:
Q  187 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa---caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |   |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  14421334 actcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 14421415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 16676170 - 16676252
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |   |||||||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  16676170 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattaaggaccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 16676252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 17650407 - 17650489
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |   |||||||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  17650407 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatatttaggaccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 17650489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 197 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20328435 - 20328365
Alignment:
Q  197 aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |  |||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  20328435 aaatgctactatgcatgtggtaccatatacaggaccgtagcccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 20328365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 23666026 - 23665944
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||   ||| |||| || | |||||||||||||||||    
T  23666026 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaaatcagggccgtgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattc 23665944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 101 - 152
Target Start/End: Original strand, 45185358 - 45185408
Alignment:
Q  101 aacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    |||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45185358 aacaacatcaacaata-atggtaattacaaccaacaacaacgactcatgcaa 45185408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 223
Target Start/End: Original strand, 11302830 - 11302868
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa 223  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  11302830 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaa 11302868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 221
Target Start/End: Original strand, 13006286 - 13006320
Alignment:
Q  187 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 221  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13006286 actcctcaataaatgcaactatgcatgtggtacca 13006320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 14266202 - 14266118
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca---aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattca 266  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    ||||| | || ||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  14266202 agactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccattttacagggcagaggccctcaccgaatttgaatggttaacgcattca 14266118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 14582909 - 14582875
Alignment:
Q  118 atggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14582909 atggtaattacaaccaacaacaacgactcatgcaa 14582875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 264
Target Start/End: Original strand, 19599844 - 19599901
Alignment:
Q  209 gcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcatt 264  Q
    ||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  19599844 gcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcatt 19599901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 223
Target Start/End: Original strand, 29795708 - 29795746
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa 223  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  29795708 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaa 29795746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 223
Target Start/End: Original strand, 29799527 - 29799565
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa 223  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  29799527 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaa 29799565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 2464291 - 2464372
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||   |||||| |||| || | | |||||||||||||||||    
T  2464291 agactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccatatcagagtcgaagctctcatcgttatagaatggttaaagcattc 2464372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 322
Target Start/End: Original strand, 10519836 - 10519955
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagt 302  Q
    ||||||||||||||||   |||||   |||||||||||||  | || |||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||| |||||||  |||    
T  10519836 atgcatgtggtaccaatttacagggaagaagccctcaccggatattaaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaataagt 10519935  T
Q  303 gctctaggacatgagtcctc 322  Q
    | || || ||||||||||||    
T  10519936 gttccagaacatgagtcctc 10519955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 319 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 16073991 - 16073934
Alignment:
Q  319 cctctccgctgtttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    |||| ||||| | ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16073991 cctcaccgctttatatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 16073934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 16476163 - 16476101
Alignment:
Q  312 catgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    ||||||||||| |||||  |||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16476163 catgagtcctcaccgct--ttatgtttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 16476101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 375
Target Start/End: Original strand, 18607026 - 18607071
Alignment:
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18607026 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 18607071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 332 - 384
Target Start/End: Original strand, 32771662 - 32771715
Alignment:
Q  332 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgca 384  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  32771662 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaacttacaatgca 32771715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 371
Target Start/End: Original strand, 11309145 - 11309201
Alignment:
Q  316 agtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatac 371  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  11309145 agtcctcaccgctttatatgcatatgcaatggactccacttgcgtatatctacatac 11309201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 316 - 371
Target Start/End: Original strand, 11312453 - 11312509
Alignment:
Q  316 agtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatac 371  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  11312453 agtcctcaccgctttatatgcatatgcaatggactccacttgcgtatatctacatac 11312509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 152
Target Start/End: Original strand, 12547071 - 12547122
Alignment:
Q  100 taacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  12547071 taacaacatcaacaata-atggtaattacaaccaacaacaacaactcatgcaa 12547122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 330 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 14281661 - 14281617
Alignment:
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 374  Q
    ||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14281661 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 14281617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16575608 - 16575546
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattca 266  Q
    |||||||||||||||    ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16575608 atgcatgtggtaccattttacagggcagaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattca 16575546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 266
Target Start/End: Original strand, 16590054 - 16590116
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattca 266  Q
    |||||||||||||||    ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  16590054 atgcatgtggtaccattttacagggcagaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattca 16590116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 266
Target Start/End: Original strand, 23442259 - 23442321
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattca 266  Q
    ||||||||||||||||   ||||| |  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  23442259 atgcatgtggtaccaatttacagggcataagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattca 23442321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 330 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 35962753 - 35962709
Alignment:
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 374  Q
    ||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  35962753 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 35962709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 269
Target Start/End: Original strand, 45185447 - 45185513
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatca 269  Q
    |||||||||| |||||   ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  45185447 atgcatgtgggaccaatttacagggcagaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattcatca 45185513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 86)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Original strand, 27037170 - 27037452
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 231  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27037170 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatggatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 27037269  T
Q  232 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg- 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||     
T  27037270 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgt 27037369  T
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgc-aactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  27037370 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtgacaccacttaaa 27037452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Original strand, 33976 - 34258
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 231  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33976 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatggatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 34075  T
Q  232 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg- 329  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||     
T  34076 aagccttcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggactgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgt 34175  T
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgc-aactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34176 tttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtgactccacttaaa 34258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 129 - 411
Target Start/End: Original strand, 11465995 - 11466278
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagga 228  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11465995 aaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacacagctaagacaacaccttagactcctcaacaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacagga 11466093  T
Q  229 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgc 327  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11466094 tcgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcatcgctgttgagcaactagtgctctaggacatgagtcctctccgc 11466193  T
Q  328 tgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||    
T  11466194 tgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccacttaaa 11466278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 132 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 22013319 - 22013048
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 231  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22013319 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 22013220  T
Q  232 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg- 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||||||     
T  22013219 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactaatactccaggacatgagtcctctccgctgt 22013120  T
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgc-aactccatgtga 400  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22013119 tttatgcatatgcaatggaactacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtga 22013048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 35244241 - 35243959
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 231  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35244241 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaatagatacaattatgcatgtggtaccaaacaggaccg 35244142  T
Q  232 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg- 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  35244141 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgt 35244042  T
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||| ||||||||||||||    
T  35244041 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacaaactccatatgactccacttaaa 35243959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 2386129 - 2385847
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 231  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2386129 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatggatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 2386030  T
Q  232 aagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  2386029 aagccctcaccgctttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 2385930  T
Q  330 -tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2385929 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatatgactccacttaaa 2385847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 24427048 - 24426766
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 231  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24427048 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacagcttagacttctcaatggatgcgaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 24426949  T
Q  232 aagccctcaccgctttt-gaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  24426948 aagccctcaccgctttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 24426849  T
Q  330 ttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24426848 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatatgactccacttaaa 24426766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 184 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 17592695 - 17592492
Alignment:
Q  184 tagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggac--cgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctc 281  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |    
T  17592695 tagactcctcaataaatgcagatatgcatgtggtaccagacaggacaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaaaccc 17592596  T
Q  282 tcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgacca 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17592595 tcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgacca 17592496  T
Q  381 tgca 384  Q
    ||||    
T  17592495 tgca 17592492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 13101333 - 13101133
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  13101333 agactcctcaataaatgcatatatgcatgtggtaccaaacatgaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 13101234  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgc 383  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13101233 ccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcatctccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgc 13101134  T
Q  384 a 384  Q
    |    
T  13101133 a 13101133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Original strand, 27729436 - 27729715
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27729436 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 27729532  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||| |   || |||| ||||||    
T  27729533 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactctagggccgaagccctcaccgctg 27729632  T
Q  330 -tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27729633 ttttatgcatatgcaatggacctacttatgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 27729715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 129 - 408
Target Start/End: Original strand, 28292642 - 28292924
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagga 228  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28292642 aaccaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactactaagacaacaccttagactcctccataaatgcaaatatgcatgtggtaccagacagga 28292741  T
Q  229 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgc 327  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||  || | || ||||    
T  28292742 ccgaagccatcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggacaaaagacatcaccgc 28292841  T
Q  328 tg-tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgcaactccatgtgactccactt 408  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    |||||||| |||||||||||    
T  28292842 tgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccttgcatacaaactccatatgactccactt 28292924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 15643448 - 15643249
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  15643448 agactcctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcacctcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagctctcg 15643349  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 383  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15643348 ccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 15643250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 132 - 407
Target Start/End: Original strand, 4077348 - 4077623
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4077348 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 4077444  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  4077445 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagtcctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 4077544  T
Q  330 ttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccact 407  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4077545 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccact 4077623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 199 - 411
Target Start/End: Original strand, 27272244 - 27272458
Alignment:
Q  199 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaa 297  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||    
T  27272244 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtcgagcaa 27272343  T
Q  298 ctagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actcca 395  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||    
T  27272344 ccagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactcca 27272442  T
Q  396 tgtgactccacttaaa 411  Q
    | ||||||||||||||    
T  27272443 tatgactccacttaaa 27272458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 44091293 - 44091014
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44091293 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 44091197  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  44091196 gaagccctcattgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 44091097  T
Q  330 ttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44091096 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 44091014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Original strand, 20850117 - 20850397
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  20850117 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaatcaggacc 20850213  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  20850214 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 20850313  T
Q  330 ttt--atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20850314 tttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 20850397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 142 - 410
Target Start/End: Original strand, 21604701 - 21604970
Alignment:
Q  142 gactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctca 240  Q
    ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  21604701 gactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctca 21604798  T
Q  241 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| ||||||    
T  21604799 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcat 21604898  T
Q  339 atgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21604899 atgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccaattaa 21604970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 132 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 24481804 - 24481526
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  24481804 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaatcaggacc 24481708  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  24481707 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 24481608  T
Q  330 ttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 410  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24481607 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccaattaa 24481526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 4071749 - 4071469
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  4071749 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaatcaggacc 4071653  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  4071652 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 4071553  T
Q  330 ttt--atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4071552 tttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccaagtgactccacttaaa 4071469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 132 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 30196719 - 30196441
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  30196719 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 30196623  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  30196622 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaggccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 30196523  T
Q  330 -tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 410  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30196522 ttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccaattaa 30196441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 206 - 375
Target Start/End: Original strand, 14563832 - 14564001
Alignment:
Q  206 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagtgct 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  14563832 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaaaaactagtgct 14563931  T
Q  306 ctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14563932 ccaggacatgattcctctccgctgtttatgcatatgcaatgaacctacttgtgtatatctacatacaact 14564001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 132 - 410
Target Start/End: Original strand, 1067024 - 1067302
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  1067024 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaatcaggacc 1067120  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  1067121 gaggccctcaccgctttggaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 1067220  T
Q  330 ttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 410  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1067221 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccaattaa 1067302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 32911642 - 32911442
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctc 283  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  32911642 agacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgtttaaagcattcatcaggaccgaagccctc 32911543  T
Q  284 accgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatg 382  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32911542 accgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgctatgcacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatg 32911444  T
Q  383 ca 384  Q
    ||    
T  32911443 ca 32911442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 205 - 384
Target Start/End: Original strand, 36800556 - 36800735
Alignment:
Q  205 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagtgc 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36800556 atatgcatgtggtaccaaacaggaccgaaaccctcaccgcttttgaatggttaaggcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgc 36800655  T
Q  305 tctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 384  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36800656 tccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 36800735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 142 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 36984761 - 36984490
Alignment:
Q  142 gactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataa-atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctca 240  Q
    ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  36984761 gactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgagatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctca 36984664  T
Q  241 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg--tttatgca 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||  ||||||||    
T  36984663 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgca 36984564  T
Q  338 tatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  36984563 tatgcaatggacctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatatgacaccacttaaa 36984490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 166 - 411
Target Start/End: Original strand, 31828571 - 31828820
Alignment:
Q  166 actgctaagacaacaccttagactcctcaataa-atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcatt 264  Q
    |||||||||||| || |||||||| || ||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31828571 actgctaagacaccatcttagacttcttaatgagatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcatt 31828670  T
Q  265 catcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg--tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtat 361  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31828671 catcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtat 31828770  T
Q  362 atctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  31828771 atctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatatgacaccacttaaa 31828820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 166 - 411
Target Start/End: Original strand, 31833923 - 31834172
Alignment:
Q  166 actgctaagacaacaccttagactcctcaataa-atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcatt 264  Q
    |||||||||||| || |||||||| || ||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31833923 actgctaagacaccatcttagacttcttaatgagatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcatt 31834022  T
Q  265 catcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg--tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtat 361  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31834023 catcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgtttttatgcatatgcaatggacctacctgtgtat 31834122  T
Q  362 atctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  31834123 atctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatatgacaccacttaaa 31834172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Original strand, 45028487 - 45028687
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctc 283  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||    
T  45028487 agacccctcgataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagtcctc 45028586  T
Q  284 accgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatg 382  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45028587 accgttgtgaacaactagttctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatg 45028685  T
Q  383 ca 384  Q
    ||    
T  45028686 ca 45028687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 132 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 11360444 - 11360170
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  11360444 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaatcaggacc 11360348  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  11360347 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 11360248  T
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 410  Q
    |||    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11360247 ttt---tatatgcaatggacctacttgtgtatatctatatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccaattaa 11360170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 132 - 410
Target Start/End: Original strand, 1061641 - 1061919
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  1061641 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaatcaggacc 1061737  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||| |||||   || ||||  |||||    
T  1061738 gaggccctcaccgctttggaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactactactccaggaccgaagccctcatcgctg 1061837  T
Q  330 ttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 410  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1061838 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccaattaa 1061919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 25590359 - 25590161
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||    
T  25590359 agacccctcaataa-tgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacaaaagcactca 25590261  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 383  Q
    |||||||||||||||||||  | ||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25590260 ccgctgtgaacaactagtgaaccaggacataagtcatc-ccgctgtttatgcatatgaaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 25590162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 134 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 28971529 - 28971337
Alignment:
Q  134 acaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccg 231  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  28971529 acaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcaggaccg 28971430  T
Q  232 aagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaacta-gtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||| ||| |||||||| | ||| || ||||||| |||||||    
T  28971429 aagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcactgctttgaacaacaaggtgttccaggacataagtcctc 28971337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 129 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 21133509 - 21133311
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--cag 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |  |||    
T  21133509 aaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacatcttagactcctcaacaaatgcaaatatgcatgtagtaccatattcag 21133410  T
Q  227 gaccgaagccctcaccgc--ttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaacta-gtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||| |||||||| | ||| || ||||||| |||||||    
T  21133409 ggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacataagtcctc 21133311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Original strand, 9241123 - 9241261
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaaca 113  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| | | ||||||||| ||||||||||||||    
T  9241123 atcatcaataatagatatctaattcatcaattaaatctaacaccctgtcataataataattcatcaatatataagtatatcatcattaacaacatcaaca 9241222  T
Q  114 ccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
     || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9241223 acaaatggtaattaaaaccaacaacaacgactcatgcaa 9241261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 330 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 71520 - 71439
Alignment:
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  71520 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 71439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 132 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 71679 - 71521
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  || |||||||| || |||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  71679 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctactaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggacc 71582  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt 291  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  71581 gaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 71521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 19663211 - 19663073
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaaca 113  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| | | ||||||||| ||||||||||||||    
T  19663211 atcatcaataatagatatctaactcatcaattaaatctaacaccctgtcataataataattcatcaatatataagtatatcatcattaacaacatcaaca 19663112  T
Q  114 ccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
     || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19663111 acaaatggtaattaaaaccaacaacaacgactcatgcaa 19663073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 118 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19649811 - 19649660
Alignment:
Q  118 atggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacac-cttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtgg 216  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  19649811 atggcaattacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgtcaacaccgctaagacaacactcctagactcctcaacaaatgcagatatgcatgtgg 19649712  T
Q  217 taccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19649711 taccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattc 19649660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 6261933 - 6261798
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaaca 113  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||  |||| | | ||||||||| ||||||||||||||    
T  6261933 atcatcaataatagatatctaactcatcaattaaatctaacaccctgtcataataataatttatcaatatataagtatatcatcattaacaacatcaaca 6261834  T
Q  114 ccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatg 149  Q
     || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6261833 acaaatggtaattaaaaccaacaacaacgactcatg 6261798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Original strand, 6482142 - 6482280
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaaca 113  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||| | | |||| |||| ||||||||||||||    
T  6482142 atcatcaataatagatatccaattcatcaattaaatctaacatcctgtcataataataattcatcaatatataagtatattatcattaacaacatcaaca 6482241  T
Q  114 ccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
     || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6482242 acaaatggtaattaaaaccaacaacaacgactcatgcaa 6482280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Original strand, 6485609 - 6485747
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaaca 113  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||| | | |||| |||| ||||||||||||||    
T  6485609 atcatcaataatagatatccaattcatcaattaaatctaacatcctgtcataataataattcatcaatatataagtatattatcattaacaacatcaaca 6485708  T
Q  114 ccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
     || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6485709 acaaatggtaattaaaaccaacaacaacgactcatgcaa 6485747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 206 - 287
Target Start/End: Original strand, 35585357 - 35585438
Alignment:
Q  206 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccg 287  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  35585357 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccg 35585438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 129 - 221
Target Start/End: Original strand, 43693323 - 43693415
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 221  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43693323 aaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 43693415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 129 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 6744579 - 6744487
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 221  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6744579 aaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctagattcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 6744487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 10686005 - 10685873
Alignment:
Q  18 tcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccac 117  Q
    |||||| || |||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||| | | ||||||||| |||||||||||  ||||     
T  10686005 tcaataataaatatctaactcatcaattaaatctatcaccctgtcataataataattcatcaatatataagtatatcatcattaacaacatca--accaa 10685908  T
Q  118 atggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10685907 atgataattacaaccaacaacaacgactcatgcaa 10685873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Original strand, 20260616 - 20260752
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaaca 113  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||  |||||| || |||||||||||||||||||| ||||  |||| | | ||||||||| |||||||||||  |    
T  20260616 atcatcaataatagatatctaactcatcaattaaatatatcaccctgtcataataataattcatcaatatataagtatatcatcattaacaacatca--a 20260713  T
Q  114 ccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  20260714 ccaaatgataattaaaaccaacaacgacgattcatgcaa 20260752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 129 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 27367838 - 27367700
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--cag 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||  | ||||| || ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  27367838 aaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaactccgctaaaactacaccctaggctcctcgataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcag 27367739  T
Q  227 gaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    | |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  27367738 ggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 27367700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 129 - 265
Target Start/End: Original strand, 200563 - 200701
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatg-ccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--ca 225  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |  ||| ||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||    
T  200563 aaccaacaacaccaactcatgcaaaggtcatgaccacaac-gctaaaacaacaccctagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatca 200661  T
Q  226 ggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    || |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  200662 gggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 200701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 267
Target Start/End: Original strand, 23062479 - 23062564
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  23062479 agactcctcaacaagtgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 23062564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 152
Target Start/End: Original strand, 26884019 - 26884081
Alignment:
Q  90 atatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  26884019 atatcatcattaacaacatcaacatcaaatggtaataaaaaccaacaacaacgactcatgcaa 26884081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 9500 - 9581
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||    
T  9500 agactcctcaaaaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattc 9581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 236 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 22796776 - 22796682
Alignment:
Q  236 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat-caagaccgaagctctcaccgctgtgaacaacta-gtgctctaggacatgagtcctctccgct 328  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||  |||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  22796776 cctcaccgctattgaatggttaaagcattcattccggacataagtcctcaccgctgtgaacaacaaagtgttctaggacatgagtcctcaccgct 22796682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19663023 - 19662942
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||    
T  19663023 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattc 19662942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 26884131 - 26884212
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||| |||  |||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  26884131 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagggccggggccctcaccgttatagaatggttaaagcattc 26884212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 27211178 - 27211097
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||| | | ||||||||||| |||||    
T  27211178 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagggccggagccctcaccgttatagaatggttaaaacattc 27211097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 21074179 - 21074096
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  21074179 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattc 21074096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 6261743 - 6261664
Alignment:
Q  187 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||  ||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  6261743 actcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaaaccctcaccgttatagaatggttaaagcattc 6261664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 10685823 - 10685741
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  10685823 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 10685741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 2105577 - 2105640
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa---caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||| |   |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  2105577 atgcatgtggtaccataattcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 2105640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 187 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 5707211 - 5707178
Alignment:
Q  187 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5707211 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacc 5707178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Original strand, 22809745 - 22809850
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactc 146  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||   ||| || |||||||||| || ||||||||||| ||   |||||||| |||||| |||  | ||||    
T  22809745 aatctaacaccctatcataataataattcatcaacatatataaatatcatcattatcaacatcaacaacattcggtaattaaaaccaataactgcaactc 22809844  T
Q  147 atgcaa 152  Q
    ||||||    
T  22809845 atgcaa 22809850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 29280919 - 29281000
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||  |||||||||||| |  | | |||||||||||||||||    
T  29280919 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatctttatagaatggttaaagcattc 29281000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 38931738 - 38931619
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaa-ctag 301  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||| |||||||   ||    
T  38931738 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaataaag 38931639  T
Q  302 tgctctaggacatgagtcct 321  Q
    || ||||||| |||||||||    
T  38931638 tgttctaggatatgagtcct 38931619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 20724032 - 20724095
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20724032 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 20724095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 322
Target Start/End: Original strand, 24660500 - 24660576
Alignment:
Q  247 ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaac-tagtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||| ||||||||  |||| || |||||||||||||||    
T  24660500 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaaagtgttccaggacatgagtcctc 24660576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 322
Target Start/End: Original strand, 25267199 - 25267320
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaact--a 300  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||| ||||||| |  |    
T  25267199 atgcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaattaaa 25267298  T
Q  301 gtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    ||| || |||||||||||||||    
T  25267299 gtgttccaggacatgagtcctc 25267320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 187 - 265
Target Start/End: Original strand, 6482301 - 6482382
Alignment:
Q  187 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa---caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |   |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  6482301 actcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 6482382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 187 - 265
Target Start/End: Original strand, 6485768 - 6485849
Alignment:
Q  187 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa---caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |   |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  6485768 actcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 6485849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 231 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 8890121 - 8890027
Alignment:
Q  231 gaagccctcacc-gcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaact--agtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||| ||||||| |  |||| || |||||||||||||||    
T  8890121 gaagccctcaccagatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaattaaagtgttccaggacatgagtcctc 8890027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 22809882 - 22809944
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||| |  |||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  22809882 atgcatgtggtaccatatccagggccgaggccctcaccgctatagaatggttaaagcattcat 22809944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 23102657 - 23102575
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  23102657 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 23102575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 23169497 - 23169415
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  23169497 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 23169415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 23580754 - 23580672
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  23580754 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 23580672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 322
Target Start/End: Original strand, 19035478 - 19035598
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaacta-g 301  Q
    ||||||||||||||||   |||||   |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |  |||| |||||| || |||||||| | |    
T  19035478 atgcatgtggtaccaatttacagggtagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccactttgaacaacaagg 19035577  T
Q  302 tgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    || || |||||||||||||||    
T  19035578 tgttccaggacatgagtcctc 19035598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 375
Target Start/End: Original strand, 9241493 - 9241538
Alignment:
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9241493 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 9241538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 261
Target Start/End: Original strand, 22703489 - 22703545
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagc 261  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22703489 atgcatgtggtaccatattcagggccgtagccctcaccgctttagaatggttaaagc 22703545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 375
Target Start/End: Original strand, 22810043 - 22810088
Alignment:
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22810043 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 22810088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 322
Target Start/End: Original strand, 22860301 - 22860420
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagt 302  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |  |||| |||||| || |||||||  |||    
T  22860301 atgcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccggatgttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccactttgaacaataagt 22860400  T
Q  303 gctctaggacatgagtcctc 322  Q
    | || |||||| ||||||||    
T  22860401 gttccaggacacgagtcctc 22860420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 265
Target Start/End: Original strand, 26582655 - 26582735
Alignment:
Q  187 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  26582655 actcttcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataaccagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 26582735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 221
Target Start/End: Original strand, 9241311 - 9241347
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 221  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  9241311 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtacca 9241347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20914513 - 20914451
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20914513 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattc 20914451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 21907226 - 21907309
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||  | ||||||||||| |||||    
T  21907226 agactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaatcgaatggttaaaacattc 21907309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23090229 - 23090193
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 221  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  23090229 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtacca 23090193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 200 - 265
Target Start/End: Original strand, 23269192 - 23269259
Alignment:
Q  200 tgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||| || ||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  23269192 tgcaactaagcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctatcgaatggttaaagcattc 23269259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 200 - 265
Target Start/End: Original strand, 23276061 - 23276128
Alignment:
Q  200 tgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||| || ||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  23276061 tgcaactaagcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctatcgaatggttaaagcattc 23276128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 24658773 - 24658836
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  24658773 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 24658836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 100)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 126 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 47872636 - 47872376
Alignment:
Q  126 tagaaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaaca 225  Q
    ||||||||||||  | |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47872636 tagaaccaacaattaagactcatgtaaatgatatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaca 47872537  T
Q  226 ggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctc 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47872536 ggaccgaagccctcaccgcttttgaatgattaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctctaggacatgagtcctctc 47872437  T
Q  325 cgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47872436 cgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 47872376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 132 - 410
Target Start/End: Original strand, 5938798 - 5939079
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 231  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5938798 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 5938897  T
Q  232 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgc-tgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg- 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||     
T  5938898 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgcttttgagcaactagtactccaagacatgagtcctctccgctgt 5938997  T
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgc-aactccatgtgactccacttaa 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  5938998 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtgacaccacttaa 5939079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 123 - 410
Target Start/End: Original strand, 7359113 - 7359402
Alignment:
Q  123 aattagaaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaa 222  Q
    ||||| || ||||||| | |||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  7359113 aattacaatcaacaactaagactcatgcaaacgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacacctcaa-atatgcaaatatgcatgtggtaccaa 7359211  T
Q  223 acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcct 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  7359212 acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcct 7359311  T
Q  322 ctccgctg-tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgc-aactccatgtgactccacttaa 410  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  7359312 ctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtgacaccacttaa 7359402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 132 - 410
Target Start/End: Original strand, 1583783 - 1584064
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 231  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1583783 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatggatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggactg 1583882  T
Q  232 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg- 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||     
T  1583883 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcatctccgctgt 1583982  T
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgc-aactccatgtgactccacttaa 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  1583983 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtgacaccacttaa 1584064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 129 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 45959953 - 45959668
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagga 228  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45959953 aaccaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctccataaatgcaaatatgcatgtggtaccagacagga 45959854  T
Q  229 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgc 327  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45959853 ccgaagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgc 45959754  T
Q  328 tg-tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||| ||||||||||||||    
T  45959753 tgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacaaactccatatgactccacttaaa 45959668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 129 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 54845159 - 54844912
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagga 228  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54845159 aaccaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaataccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccagacagga 54845060  T
Q  229 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgc 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54845059 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagacctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgc 54844960  T
Q  328 tgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54844959 tgtttatgcatatacaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 54844912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Original strand, 21396689 - 21396971
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 231  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21396689 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatggatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 21396788  T
Q  232 aagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  21396789 aagccctcaccgctttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 21396888  T
Q  330 -tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21396889 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 21396971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 129 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 35462821 - 35462566
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagga 228  Q
    |||||||||  | |||||||||||  || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35462821 aaccaacaattaagactcatgcaatggacatgacaacactgctaagacaacaccttagactccgcaa-atatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagga 35462723  T
Q  229 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgct 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35462722 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgct 35462623  T
Q  329 gtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 384  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35462622 gtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 35462566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 142 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 42956220 - 42955949
Alignment:
Q  142 gactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcac 241  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  42956220 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcac 42956121  T
Q  242 cgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatat 340  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  42956120 cgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgtagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccagaacatgagtcatctctgctgtttatgcatat 42956021  T
Q  341 gcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||    
T  42956020 gcaacggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccacttaaa 42955949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 129 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 11202641 - 11202357
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagga 228  Q
    |||||||||  | |||||||||||  || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11202641 aaccaacaattaagactcatgcaatggacatgacaacactgctaagacaacaccttagactccgcaa-atatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagga 11202543  T
Q  229 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgc 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  11202542 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaacccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctcaccgc 11202443  T
Q  328 tg-tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgc-aactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11202442 tgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacagctgaccatgcaatgcaaactccatgtgactccacttaaa 11202357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 132 - 375
Target Start/End: Original strand, 34772041 - 34772286
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 231  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34772041 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactccccaatagatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccg 34772140  T
Q  232 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg- 329  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  34772141 aagccctcaccgcttttgattggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgt 34772240  T
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34772241 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 34772286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 129 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 45142760 - 45142503
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagga 228  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  45142760 aaccaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaa-atatgtaaatatgtatgtggtaccagacagga 45142662  T
Q  229 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgc 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45142661 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgc 45142562  T
Q  328 tg-tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 384  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45142561 tgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 45142503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 185 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 19128497 - 19128272
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  19128497 agactcctcaataaatgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgagtggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 19128398  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 383  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19128397 ccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgttgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 19128298  T
Q  384 aatgca-actccatgtgactccactta 409  Q
     || || ||||||| ||||||||||||    
T  19128297 -atacatactccatatgactccactta 19128272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 185 - 408
Target Start/End: Original strand, 20894922 - 20895146
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  20894922 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagccctca 20895021  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 383  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20895022 ccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 20895121  T
Q  384 aatgca-actccatgtgactccactt 408  Q
     || || ||||||| |||||||||||    
T  20895122 -atacatactccatatgactccactt 20895146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Original strand, 52500426 - 52500705
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52500426 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 52500522  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  52500523 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 52500622  T
Q  330 ttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52500623 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 52500705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 185 - 408
Target Start/End: Original strand, 20889303 - 20889527
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||     
T  20889303 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcg 20889402  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 383  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20889403 ccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcatctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 20889502  T
Q  384 aatgca-actccatgtgactccactt 408  Q
     || || ||||||| |||||||||||    
T  20889503 -atacatactccatatgactccactt 20889527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Original strand, 33097022 - 33097221
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  33097022 agactcctcaataaatgcagatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcgccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 33097121  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 383  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33097122 ccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 33097220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 49548738 - 49548538
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  49548738 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagccctca 49548639  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 383  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49548638 ccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagttctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 49548539  T
Q  384 a 384  Q
    |    
T  49548538 a 49548538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 132 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 29382973 - 29382695
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| || |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29382973 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaccatcttagacttctcaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 29382875  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  29382874 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 29382775  T
Q  330 -tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccactt 408  Q
     |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  29382774 ttttatgcacatgcaatggatctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactcaatatgactccactt 29382695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 199 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 2972873 - 2972687
Alignment:
Q  199 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaac 298  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2972873 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagcactcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaac 2972774  T
Q  299 tagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 384  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2972773 tagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 2972687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Original strand, 31664988 - 31665188
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    ||||||||||| | |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31664988 agactcctcaaaatatgcagttatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatagttaaagcattcatcaggaccgaagctctca 31665087  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 383  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  31665088 ccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctatatacaacttgaccatgc 31665187  T
Q  384 a 384  Q
    |    
T  31665188 a 31665188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 132 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 3260198 - 3259922
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3260198 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 3260102  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  3260101 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 3260002  T
Q  330 -tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccactt 408  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3260001 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatataactgaccatgcaatgcaacttcatgtgactccactt 3259922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Original strand, 21881521 - 21881720
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  21881521 agactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 21881619  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgc 383  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21881620 ccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgaggcatctccgctgtttatgcatatgcaatggacctactcgtgtatatctacatacaactagaccatgc 21881719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Original strand, 42220360 - 42220559
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  42220360 agactcctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagtcctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggactgaagccctca 42220459  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 383  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42220460 ccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 42220558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 167 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 23436156 - 23435911
Alignment:
Q  167 ctgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23436156 ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 23436058  T
Q  266 atcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatat 363  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23436057 atcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatat 23435958  T
Q  364 ctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23435957 ctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccaattaa 23435911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Original strand, 11937033 - 11937313
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  11937033 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaatcaggacc 11937129  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||   || | || ||||||    
T  11937130 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccttcaccgctg 11937229  T
Q  330 --tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11937230 tttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 11937313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 129 - 410
Target Start/End: Original strand, 26395556 - 26395838
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagg 227  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||| ||| | |  ||||||| ||| || |||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  26395556 aaccaacaaccaaaactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaaaacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaattatgcatgtggtaccaatcagg 26395653  T
Q  228 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccg 326  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| |||    
T  26395654 accggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccg 26395753  T
Q  327 ctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 410  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26395754 ctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccaattaa 26395838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 185 - 408
Target Start/End: Original strand, 36037491 - 36037715
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  36037491 agactcctctacaaatgcaactatgcatgcggtaccaaccaggaccgaagtcctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 36037590  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 383  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36037591 ccgctgtgaacaactaatgttccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 36037690  T
Q  384 aatgca-actccatgtgactccactt 408  Q
     || || ||||||| |||||||||||    
T  36037691 -atacatactccatatgactccactt 36037715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 132 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 29448883 - 29448605
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  29448883 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaatcaggacc 29448787  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  29448786 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 29448687  T
Q  330 -tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 410  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  29448686 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatggaatgcaactccatgtgactccaattaa 29448605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 132 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 29455567 - 29455289
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  29455567 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaatcaggacc 29455471  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  29455470 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 29455371  T
Q  330 -tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 410  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  29455370 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatatgactccaattaa 29455289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 199 - 384
Target Start/End: Original strand, 33221312 - 33221498
Alignment:
Q  199 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaac 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33221312 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcatttatcatgaccgaagccctcaccgctgtgaacaac 33221411  T
Q  299 tagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 384  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  33221412 tagtgctccaggacacgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctatatacaactagaccatgca 33221498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 142 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 3266818 - 3266547
Alignment:
Q  142 gactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat--aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 239  Q
    ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||   ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  3266818 gactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctc 3266721  T
Q  240 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgca 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| |||||    
T  3266720 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgca 3266621  T
Q  338 tatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3266620 tatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcaacttaaa 3266547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 132 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 39266443 - 39266170
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | |||||||||| |||| ||| |||  |||||||||||  | |||||||| || ||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||    
T  39266443 caacaactaagactcatgcacatgacatgacaa--ctgctaagacacaatcttagacttcttaatgaaatg-aattatgcatgtggtaccaa-caggacc 39266348  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  39266347 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 39266248  T
Q  330 ttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccac 406  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39266247 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccac 39266170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 142 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 49241043 - 49240772
Alignment:
Q  142 gactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat--aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 239  Q
    ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||   |||||||   |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  49241043 gactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcagtaatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctc 49240946  T
Q  240 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgca 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| |||||    
T  49240945 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgca 49240846  T
Q  338 tatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49240845 tatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcaacttaaa 49240772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 142 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 49749757 - 49749486
Alignment:
Q  142 gactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat--aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 239  Q
    ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||   |||||||   |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  49749757 gactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcagtaatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctc 49749660  T
Q  240 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgca 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| |||||    
T  49749659 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgca 49749560  T
Q  338 tatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49749559 tatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcaacttaaa 49749486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 46045025 - 46044825
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctc 283  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||| |||    
T  46045025 agacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacattagccctc 46044926  T
Q  284 accgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatg 382  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46044925 accgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatg 46044827  T
Q  383 ca 384  Q
    ||    
T  46044826 ca 46044825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 190 - 384
Target Start/End: Original strand, 899527 - 899721
Alignment:
Q  190 cctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgct 289  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||  ||||||||    
T  899527 cctcaataaatgcaattatgcatgcggtaccaaacaggactgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcagaacataagccatcaccgct 899626  T
Q  290 gtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 384  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  899627 gtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 899721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 123 - 341
Target Start/End: Original strand, 7356120 - 7356339
Alignment:
Q  123 aattagaaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaa 222  Q
    ||||| || ||||||| | |||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  7356120 aattacaatcaacaactaagactcatgcaaacgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacacctcaa-atatgcaaatatgcatgtggtaccaa 7356218  T
Q  223 acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcct 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  7356219 acaggaccgaagccctcaccgctttttaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcct 7356318  T
Q  322 ctccgctg-tttatgcatatg 341  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  7356319 ctccgctgttttatgcatatg 7356339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Original strand, 30396127 - 30396324
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  30396127 agacccctcaataa-tgcagatatgcatgtggtaccaaataggaccgaagccctcaccgcttt-gaatggttaaagtattcatcaggaccgaagccctca 30396224  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 383  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30396225 acgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 30396323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 207 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 49548502 - 49548323
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagtgct 305  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49548502 atgcatgtggtaccatatcagggccggagccctcaccgcttttaaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgct 49548403  T
Q  306 ctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 384  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49548402 ccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggaccaactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 49548323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 41404861 - 41404662
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctc 283  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||    
T  41404861 agacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaactggaccgaagccctcaccacttttgaatggttaaagcattcatcatgaccaaagccctc 41404762  T
Q  284 accgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatg 382  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41404761 accgctgtgaacaactagtgttccaggacatgagtcttc-ccgctg-ttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatg 41404664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 129 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 45151529 - 45151372
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagga 228  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  45151529 aaccaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaa-atatgtaaatatgtatgtggtaccagacagga 45151431  T
Q  229 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccg 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  45151430 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccg 45151372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 129 - 291
Target Start/End: Original strand, 50082132 - 50082292
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagg 227  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50082132 aaccaacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacagg 50082228  T
Q  228 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  50082229 accgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 50082292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 132 - 312
Target Start/End: Original strand, 391001 - 391180
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  391001 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 391097  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggac 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||    
T  391098 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 391180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 271 - 408
Target Start/End: Original strand, 391178 - 391317
Alignment:
Q  271 gaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctaca 368  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  391178 gaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctaca 391277  T
Q  369 tacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccactt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  391278 tacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccactt 391317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 134 - 298
Target Start/End: Original strand, 13452154 - 13452320
Alignment:
Q  134 acaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccg 231  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||    
T  13452154 acaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagaca-caccttagactcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccg 13452252  T
Q  232 aagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaac 298  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||| ||| ||||||||    
T  13452253 aagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcactgctttgaacaac 13452320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 152
Target Start/End: Original strand, 30146601 - 30146738
Alignment:
Q  15 tcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacac 114  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| | | |||| |||| ||||||||||||||     
T  30146601 tcatcaataatagatatctaattcatcaattaaatctaacaccctgtcataataataattcatcaatatataagtatattatcattaacaacatcaacaa 30146700  T
Q  115 cacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  30146701 caaatggtaattaaaaccaacaacatcgactcatgcaa 30146738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 141 - 322
Target Start/End: Original strand, 37881330 - 37881516
Alignment:
Q  141 cgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacc--aaacaggaccgaagccct 238  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||  || |||  ||||||||||    
T  37881330 cgactcatgcaactgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaaagaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagagccgaagccct 37881429  T
Q  239 caccgc--ttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaacta-gtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  |||   |||||||| |||||||| | ||| || ||||||| |||||||    
T  37881430 caccgctattttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcatcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacataagtcctc 37881516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 152
Target Start/End: Original strand, 14047854 - 14047991
Alignment:
Q  15 tcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacac 114  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||| |   ||||||||| ||||||||||||||     
T  14047854 tcatcaataatagatatatagttcatcaattaaatctaacaccctatcataataataattcatcaatatataaatatatcatcattaacaacatcaacaa 14047953  T
Q  115 cacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14047954 caaatggtaattaaaaccaacaacatcgactcatgcaa 14047991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 330 - 408
Target Start/End: Original strand, 50082293 - 50082371
Alignment:
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccactt 408  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  50082293 tttatgcatatgccacggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactcaatatgactccactt 50082371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Original strand, 15533578 - 15533714
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaaca 113  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||  |||||| || |||||||||||||||||||| ||||  |||| | | ||||||||| |||||||||||  |    
T  15533578 atcatcaataatagatatctaactcatcaattaaatatatcaccctgtcataataataattcatcaatatataagtatatcatcattaacaacatca--a 15533675  T
Q  114 ccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  15533676 ccaaatgataattaaaaccaacaacgacgattcatgcaa 15533714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 322
Target Start/End: Original strand, 15244077 - 15244219
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagct 280  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |  ||||     
T  15244077 agactcctcaacaaatgcgactatgcatgtgttaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagcc 15244176  T
Q  281 ctcaccgctgtgaacaac-tagtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    ||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  15244177 ctcaccgctttgaacaacaaagtgttctaggacatgagtcctc 15244219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 91 - 152
Target Start/End: Original strand, 14910452 - 14910513
Alignment:
Q  91 tatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14910452 tatcatcattaacaacatcaacaacaaatggtaattaaaaccaacaacaacgactcatgcaa 14910513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 185 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 10977220 - 10977133
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatca 269  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  10977220 agactcctcaataaatgcgactatgcatgtggtaccatattcagagccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcatca 10977133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 266
Target Start/End: Original strand, 14821334 - 14821418
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattca 266  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  14821334 agactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattca 14821418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 15470758 - 15470652
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  15470758 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 15470662  T
Q  231 gaagccctca 240  Q
    ||||||||||    
T  15470661 gaagccctca 15470652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 112
Target Start/End: Original strand, 36037311 - 36037409
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaac 112  Q
    ||||||||||  |||||||||  |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||| | | ||||||||| |||||||||||||    
T  36037311 atcatcaataaaagatatctaactcatcaattaaatctatcaccctgtcataataataattcatcaatatataagtatatcatcattaacaacatcaac 36037409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 319
Target Start/End: Original strand, 13886644 - 13886783
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcacc-gcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagct 280  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| | | |  ||||     
T  13886644 agactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcattagggcttaagcc 13886743  T
Q  281 ctcaccgctgtgaacaac-tagtgctctaggacatgagtc 319  Q
    ||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||||||    
T  13886744 ctcaccgctttgaacaacaaagtgttcgaggacatgagtc 13886783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 13899797 - 13899676
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaact--a 300  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||| ||||||| |  |    
T  13899797 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaattaaa 13899698  T
Q  301 gtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  13899697 gtgttctaggacatgagtcctc 13899676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 322
Target Start/End: Original strand, 15306979 - 15307121
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagct 280  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||   ||||| |  ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |  ||||     
T  15306979 agactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccaatttacagggcaaaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagcc 15307078  T
Q  281 ctcaccgctgtgaacaac-tagtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    ||||||||| ||||||||  || | || |||||||||||||||    
T  15307079 ctcaccgctttgaacaacaaagcgttccaggacatgagtcctc 15307121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 2585487 - 2585385
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactc 146  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||| |   ||||||||| ||||||| ||||||    |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  2585487 aatctaacaccctatcataataataattcatcaatatataaatatatcatcattaacaacgtcaacaa---atggtaattaaaaccaacaacatcgactc 2585391  T
Q  147 atgcaa 152  Q
    ||||||    
T  2585390 atgcaa 2585385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 14556361 - 14556298
Alignment:
Q  89 aatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    |||||||||| || ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14556361 aatatcatcattatcaacatcaacaacaaatggtaattaaaaccaacaacatcgactcatgcaa 14556298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 14910563 - 14910645
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  14910563 agactactcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataatcagggccggagccctcaccgctatagaatggttaaagcattc 14910645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 23121599 - 23121661
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  23121599 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 23121661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 322
Target Start/End: Original strand, 16484596 - 16484716
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaacta-g 301  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||| |||||||| | |    
T  16484596 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaagg 16484695  T
Q  302 tgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    || || |||||||||||||||    
T  16484696 tgttccaggacatgagtcctc 16484716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 53905499 - 53905376
Alignment:
Q  205 atatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaact- 299  Q
    ||||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||||| | ||||||| |     
T  53905499 atatgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagctctcaccgatttgaacaatta 53905400  T
Q  300 -agtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
     |||| || |||||||||||||||    
T  53905399 aagtgttccaggacatgagtcctc 53905376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 15361003 - 15360884
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagt 302  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||| |||||||   ||    
T  15361003 atgcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgctttgaacaataggt 15360904  T
Q  303 gctctaggacatgagtcctc 322  Q
    | || |||||||||||||||    
T  15360903 gttccaggacatgagtcctc 15360884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 41529400 - 41529295
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactc 146  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||   ||| || ||||| |||| || ||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||| |||| |    
T  41529400 aatctaacaccctatcataataataattcatcaacatatataaatattatcattatcaacatcaacaacaaatgacaattaaaaccaacaacatcgacgc 41529301  T
Q  147 atgcaa 152  Q
    ||||||    
T  41529300 atgcaa 41529295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 11847031 - 11847113
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacc--aaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  11847031 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccataaacagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 11847113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 269
Target Start/End: Original strand, 18271262 - 18271327
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatca 269  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18271262 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattcatca 18271327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 20940260 - 20940322
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  20940260 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgttgtagaatggttaaagcattcat 20940322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 265
Target Start/End: Original strand, 27905211 - 27905270
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  27905211 atgcatgtggtaccatatcaggactgaagccctcaccgctatagaatggttaaagcattc 27905270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 265
Target Start/End: Original strand, 40908583 - 40908642
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  40908583 atgcatgtggtaccataacagggccggagccctcaccgctatagaatggttaaagcattc 40908642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 152
Target Start/End: Original strand, 16484496 - 16484557
Alignment:
Q  90 atatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    ||||||| | ||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16484496 atatcataattaacaacatcaacaata-atggtaattacaaccaacaacaacgactcatgcaa 16484557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Original strand, 14062770 - 14062875
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactc 146  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| ||||   ||| || ||||| |||| || ||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||  | ||||    
T  14062770 aatctaacaccctatcataacaataattcatcaacatatataaatattatcattatcaacatcaacaacaaatggtacttaaaaccaacaacttcaactc 14062869  T
Q  147 atgcaa 152  Q
    ||||||    
T  14062870 atgcaa 14062875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16147972 - 16147891
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |  | | |||||||||||||||||    
T  16147972 agactcctcaacaattgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatctttatagaatggttaaagcattc 16147891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 136
Target Start/End: Original strand, 16221092 - 16221181
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaaca 136  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||   ||| || |||||||||| |||| ||| ||||| || |||| ||||| ||||||||    
T  16221092 aatctaacaccctatcataataataattcatcaacatatataaatatcatcattaaccacagcaacaacaaatggcaattaaaaccaaca 16221181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 15005149 - 15005083
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa---caggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatca 269  Q
    |||||||||||||||||   |||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  15005149 atgcatgtggtaccaaattacagggcagaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattcatca 15005083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 1651236 - 1651177
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  1651236 atgcatgtggtaccataacagggtcggagccctcaccgctatagaatggttaaagcattc 1651177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 4831265 - 4831203
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  4831265 atgcatgtggtaccatattcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 4831203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 4834560 - 4834498
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  4834560 atgcatgtggtaccatattcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 4834498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 210 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 16229297 - 16229180
Alignment:
Q  210 catgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaacta-gtgc 304  Q
    |||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |  |||| |||||| || |||||||| | |||     
T  16229297 catgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccactttgaacaacaaggtgt 16229198  T
Q  305 tctaggacatgagtcctc 322  Q
    || |||||||||||||||    
T  16229197 tccaggacatgagtcctc 16229180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 247 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 18166422 - 18166347
Alignment:
Q  247 ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||| | |||||||  |||| || |||||||||||||||    
T  18166422 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgttttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctc 18166347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 269
Target Start/End: Original strand, 18261297 - 18261362
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatca 269  Q
    ||||||||||||||||   |||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18261297 atgcatgtggtaccaatttacagggtagaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattcatca 18261362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 375
Target Start/End: Original strand, 14485672 - 14485717
Alignment:
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14485672 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 14485717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 375
Target Start/End: Original strand, 14910747 - 14910792
Alignment:
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14910747 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 14910792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 267
Target Start/End: Original strand, 15406902 - 15406973
Alignment:
Q  197 aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  15406902 aaatgcagctatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctc-ccgctaatgaatggttaaagcattcat 15406973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 375
Target Start/End: Original strand, 18212298 - 18212343
Alignment:
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18212298 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 18212343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 26077727 - 26077682
Alignment:
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    ||||||| |||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26077727 tttatgcttatgtaattgacccacttgtgtatatctacatacaact 26077682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 2585346 - 2585283
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  2585346 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatgattaaagcattcat 2585283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 322
Target Start/End: Original strand, 8833771 - 8833892
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa----acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaacta- 300  Q
    ||||||||||||||||    ||||| | ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| | || |||  |||||| || |||||||| |     
T  8833771 atgcatgtggtaccaattttacagggcagaagccctcgccgaattttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagtcctcaccactttgaacaacaag 8833870  T
Q  301 gtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    ||| |||||| |||||| ||||    
T  8833871 gtgttctagggcatgagccctc 8833892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 332 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 10972917 - 10972873
Alignment:
Q  332 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10972917 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 10972873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 322
Target Start/End: Original strand, 12931881 - 12931957
Alignment:
Q  247 ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaacta-gtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||| |||||||| | ||| || ||||||| |||||||    
T  12931881 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacataagtcctc 12931957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 269
Target Start/End: Original strand, 13444207 - 13444273
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatca 269  Q
    |||| |||||||||||   ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  13444207 atgcctgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattcatca 13444273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 210 - 267
Target Start/End: Original strand, 14484432 - 14484491
Alignment:
Q  210 catgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    |||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||||||    
T  14484432 catgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaaacattcat 14484491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 152
Target Start/End: Original strand, 15546468 - 15546520
Alignment:
Q  100 taacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    ||||||||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15546468 taacaacatcaacaaataatggtaatttcaaccaacaacaacgactcatgcaa 15546520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 330 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 17000183 - 17000139
Alignment:
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 374  Q
    ||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17000183 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 17000139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 27849751 - 27849699
Alignment:
Q  100 taacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    ||||||||||||||  |  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27849751 taacaacatcaacaataagtggtaatttcaaccaacaacaacgactcatgcaa 27849699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 152
Target Start/End: Original strand, 30237647 - 30237699
Alignment:
Q  100 taacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    ||||||||||||||    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  30237647 taacaacatcaacaaataatggtaatttcaaccaacaacaacgactcatgcaa 30237699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 375
Target Start/End: Original strand, 30237894 - 30237958
Alignment:
Q  312 catgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    |||||| |||| ||||| | ||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  30237894 catgagccctcaccgctttatatgcttatgaaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 30237958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 89)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Original strand, 42626124 - 42626404
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 231  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42626124 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaatagatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccg 42626223  T
Q  232 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgt 330  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  42626224 aagccctcaccacttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccactgttgagcaactagtgctccaggacatgggtcctctccgctgt 42626323  T
Q  331 ttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  42626324 ttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcatacaaactccatgtgactccacttaaa 42626404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 129 - 408
Target Start/End: Original strand, 4231109 - 4231391
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagga 228  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4231109 aaccaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactactaagacaacaccttagactcctccataaatgcaaatatgcatgtggtaccagacagga 4231208  T
Q  229 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgc 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4231209 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgc 4231308  T
Q  328 tg-tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgcaactccatgtgactccactt 408  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||| |||||||||||    
T  4231309 tgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacaaactccatatgactccactt 4231391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Original strand, 20570666 - 20570947
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 231  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20570666 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacacttctaagacaccaccttagacttctcaatggatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggaccg 20570764  T
Q  232 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaa-caactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg- 329  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||     
T  20570765 aagccctctccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttaagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgt 20570864  T
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgc-aactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20570865 tttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtgactccacttaaa 20570947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 142 - 408
Target Start/End: Original strand, 21962939 - 21963208
Alignment:
Q  142 gactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcac 241  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21962939 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactccccaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacaggaccgaagccctcac 21963038  T
Q  242 cgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcata 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21963039 cgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgttttatgcata 21963138  T
Q  340 tgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgcaactccatgtgactccactt 408  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||| |||||||||||    
T  21963139 tgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacaaactccatatgactccactt 21963208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 145 - 411
Target Start/End: Original strand, 20292617 - 20292886
Alignment:
Q  145 tcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgc 244  Q
    ||||||||  || ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20292617 tcatgcaatggacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgc 20292716  T
Q  245 ttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgc-tgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgc 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| | ||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20292717 ttttgaatggttaaagcattcatcaggatcgaagccctcaccgcttttgagcaactagtactccaggacatgagtcatctccgctgttttatgcatatgc 20292816  T
Q  343 aatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgc-aactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  20292817 aatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtaacaccacttaaa 20292886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 132 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 18026942 - 18026665
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 231  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| || |||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18026942 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaccatcttagacttctcaatgagtgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggaccg 18026844  T
Q  232 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg- 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||     
T  18026843 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgt 18026744  T
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccactt 408  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18026743 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatatgactccactt 18026665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Original strand, 6740444 - 6740723
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| |  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6740444 caacaacaaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcataatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 6740540  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  6740541 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 6740640  T
Q  330 -tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6740641 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcaacttaaa 6740723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Original strand, 49328011 - 49328210
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  49328011 agacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 49328110  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 383  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49328111 ccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 49328209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 132 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 20277441 - 20277166
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20277441 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 20277345  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  20277344 gaagccctcactgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccaaagccctcaccgctg 20277245  T
Q  330 ttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccact 407  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20277244 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccact 20277166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 132 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 28556691 - 28556416
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28556691 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 28556595  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  28556594 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 28556495  T
Q  330 -tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccact 407  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28556494 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgcgactccact 28556416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Original strand, 37682012 - 37682292
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  37682012 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaatcaggacc 37682108  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  37682109 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 37682208  T
Q  330 ttt--atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37682209 tttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 37682292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 132 - 410
Target Start/End: Original strand, 39094247 - 39094525
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  39094247 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaatcaggacc 39094343  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  39094344 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 39094443  T
Q  330 ttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 410  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39094444 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccaattaa 39094525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 142 - 411
Target Start/End: Original strand, 18418060 - 18418329
Alignment:
Q  142 gactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctca 240  Q
    ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18418060 gactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaagccctca 18418156  T
Q  241 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| ||||||    
T  18418157 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgttgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcat 18418256  T
Q  339 atgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18418257 atgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaacgcaactccatgtgactccacttaaa 18418329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Original strand, 37675319 - 37675599
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  37675319 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaatcaggacc 37675415  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||   || | || ||||||    
T  37675416 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccttcaccgctg 37675515  T
Q  330 --tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37675516 tttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 37675599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 142 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 39189861 - 39189592
Alignment:
Q  142 gactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataa-atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctca 240  Q
    ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||    
T  39189861 gactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgagatgcaattatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggtcctca 39189764  T
Q  241 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| ||||||    
T  39189763 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcat 39189664  T
Q  339 atgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39189663 atgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaa 39189592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 38908243 - 38907964
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||| ||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  38908243 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttaaacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaatcaggacc 38908147  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  38908146 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 38908047  T
Q  330 ttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38908046 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaacttcatgtgactccacttaaa 38907964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 142 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 31535481 - 31535210
Alignment:
Q  142 gactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat--aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 239  Q
    ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||   ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  31535481 gactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctc 31535384  T
Q  240 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgca 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| |||||    
T  31535383 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgca 31535284  T
Q  338 tatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31535283 tatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcaacttaaa 31535210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 142 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 31564198 - 31563927
Alignment:
Q  142 gactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat--aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 239  Q
    ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||   ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  31564198 gactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctc 31564101  T
Q  240 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgca 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| |||||    
T  31564100 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgca 31564001  T
Q  338 tatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31564000 tatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcaacttaaa 31563927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 142 - 411
Target Start/End: Original strand, 48427787 - 48428058
Alignment:
Q  142 gactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat--aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctc 239  Q
    ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||   ||||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  48427787 gactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaataatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctc 48427884  T
Q  240 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgca 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| |||||    
T  48427885 accgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgca 48427984  T
Q  338 tatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48427985 tatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactcaacttaaa 48428058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 199 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 29596980 - 29596794
Alignment:
Q  199 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaac 298  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  29596980 atgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgatgccctcaccgctgtgaacaac 29596881  T
Q  299 tagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 384  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  29596880 tagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgtaatggacccactcgtgtatttctacatacaactagaccatgca 29596794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 132 - 346
Target Start/End: Original strand, 17146182 - 17146397
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 231  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17146182 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatggatgcaaatatgcatgtggtaccaa-caggaccg 17146280  T
Q  232 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg- 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||     
T  17146281 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcctctccgctgt 17146380  T
Q  330 tttatgcatatgcaatg 346  Q
    |||||||||||||||||    
T  17146381 tttatgcatatgcaatg 17146397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 220 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 29602394 - 29602229
Alignment:
Q  220 caaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtc 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29602394 caaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtc 29602295  T
Q  320 ctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29602294 ctctccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 29602229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Original strand, 47484085 - 47484284
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||    
T  47484085 agaccccttaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagccctca 47484184  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 383  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47484185 ccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgctatagacccactagtgtatatctacatacaacttgaccatgc 47484283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 199 - 384
Target Start/End: Original strand, 21920788 - 21920974
Alignment:
Q  199 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaac 298  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21920788 atgcaattatgcatgtggtaccaaaaaagaccgaaaccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaac 21920887  T
Q  299 tagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 384  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21920888 tagtactccaggacataagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatgaaccaactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 21920974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Original strand, 36614913 - 36615113
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctc 283  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  |||    
T  36614913 agacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacagggccgaaaccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctc 36615012  T
Q  284 accgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatg 382  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36615013 accgctgtgaacaacaagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccccttgtgtatatctacatacaacttgaccatg 36615111  T
Q  383 ca 384  Q
    ||    
T  36615112 ca 36615113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 185 - 373
Target Start/End: Original strand, 43088369 - 43088557
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctc 283  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||  |||  |||    
T  43088369 agactcctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagtattcattaggacataagtcctc 43088468  T
Q  284 accgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaa 373  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  43088469 accgctgtgaacaacaagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccccttgtgtatatctacatacaa 43088557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 20397067 - 20396783
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 231  Q
    ||||||| | |||| |||||||||| ||| ||| ||| |||||||| || |||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  20397067 caacaactaagacttatgcaaatgacatgacaacactactaagacaccatcttagacttctcaatggatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacagggccg 20396969  T
Q  232 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgc-tgtgaacaactagtgctct----aggacatgagtcctctccg 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| | ||||    ||  ||  |    |||||   || |||| |||    
T  20396968 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcgttcatcaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccg 20396869  T
Q  327 ctg-tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20396868 ctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 20396783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 206 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 22185721 - 22185534
Alignment:
Q  206 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgc 304  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| |    
T  22185721 tatgcatgtggtaccaatcaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtac 22185622  T
Q  305 tctaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaac 391  Q
    || |||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22185621 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaac 22185534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 142 - 291
Target Start/End: Original strand, 9269867 - 9270016
Alignment:
Q  142 gactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcac 241  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9269867 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaataccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagaaccgaagccctcac 9269966  T
Q  242 cgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  9269967 cgcttttgaatggttaaagcattcatcaggactgaagccctcaccgctgt 9270016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 129 - 279
Target Start/End: Original strand, 24850022 - 24850171
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagga 228  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24850022 aaccaacaaccaagactcatgcaa-tgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagga 24850120  T
Q  229 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagc 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24850121 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagc 24850171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 132 - 289
Target Start/End: Original strand, 52990639 - 52990796
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 231  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  52990639 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacattgctaagacaacaccttagactcctcaatagatgcaattatgcatgtggtaccagacaggaccg 52990738  T
Q  232 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgct 289  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  52990739 aaaccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgct 52990796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 241 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 20077033 - 20076860
Alignment:
Q  241 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  20077033 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcatcgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctctgctgttttatgcat 20076934  T
Q  339 atgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||    
T  20076933 atgcaatggacttacttgtgtatatctacatacaacatgaccatgc-atacatactccatatgactccacttaaa 20076860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 129 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 23195731 - 23195559
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--cag 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  23195731 aaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccttagactcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcag 23195632  T
Q  227 gaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaac 298  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||| ||||||||    
T  23195631 ggccgaagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgctttgaacaac 23195559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 132 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 3652888 - 3652709
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3652888 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 3652792  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggac 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||    
T  3652791 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggac 3652709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 101 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 24109309 - 24109083
Alignment:
Q  101 aacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaat 200  Q
    |||| ||||| ||||| |||| || || ||||||||| | |||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||    
T  24109309 aacatcatcatcaccaaatggcaactacaaccaacaagaccgactcatgcaactgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaaagaat 24109210  T
Q  201 gcaaatatgcatgtggtacc--aaacaggaccgaagccctcaccgc--ttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaaca 296  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||| ||||||    
T  24109209 gcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgctttgaaca 24109110  T
Q  297 acta-gtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    || | ||| || ||||||| |||||||    
T  24109109 acgaggtgttccaggacataagtcctc 24109083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 132 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 36212200 - 36212043
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36212200 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacc 36212104  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt 291  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  36212103 gaagccttcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 36212043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Original strand, 16371327 - 16371465
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaaca 113  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| | | ||||||||| ||||||||||||||    
T  16371327 atcatcaataatagatatctaattcatcaattaaatctaacaccctgtcataataataattcatcaatatataagtatatcatcattaacaacatcaaca 16371426  T
Q  114 ccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
     || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16371427 acaaatggtaattaaaaccaacaacaacgactcatgcaa 16371465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 129 - 250
Target Start/End: Original strand, 20299279 - 20299400
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagga 228  Q
    |||||||||  | |||||||||||  || ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299279 aaccaacaaataagactcatgcaatggacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagga 20299378  T
Q  229 ccgaagccctcaccgcttttga 250  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  20299379 ccgaagccctcaccgcttttga 20299400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 271 - 411
Target Start/End: Original strand, 20299377 - 20299515
Alignment:
Q  271 gaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctaca 368  Q
    ||||||||| ||||||||| | || |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20299377 gaccgaagccctcaccgcttttgagcaactagtactccaggacatgagtcatctccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctaca 20299476  T
Q  369 tacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||| |||||||||    
T  20299477 tacaactgaccatgcaatg----tccatgtgacaccacttaaa 20299515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 330 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 36212042 - 36211961
Alignment:
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36212042 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 36211961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 141 - 298
Target Start/End: Original strand, 24079485 - 24079646
Alignment:
Q  141 cgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacc--aaacaggaccgaagccct 238  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||  || |||| ||||||||||    
T  24079485 cgactcatgcaactgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaaagaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcagggccgaagccct 24079584  T
Q  239 caccgc--ttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaac 298  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||| ||||||||    
T  24079585 caccgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgctttgaacaac 24079646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 152
Target Start/End: Original strand, 29534763 - 29534900
Alignment:
Q  15 tcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacac 114  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| | | ||||||||| ||||||||||||||     
T  29534763 tcatcaataatagatatctaattcatcaattaaatctaacaccctgtcataataataattcatcaatatataagtatatcatcattaacaacatcaacaa 29534862  T
Q  115 cacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    || |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  29534863 caaatggtaattaaagccaacaacatcgactcatgcaa 29534900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 152
Target Start/End: Original strand, 32649926 - 32650063
Alignment:
Q  15 tcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacac 114  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| | | ||||||||| ||||||||||||||     
T  32649926 tcatcaataatagatatctaattcatcaattaaatctaacaccctgtcataataataattcatcaatatataagtatatcatcattaacaacatcaacaa 32650025  T
Q  115 cacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    || |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  32650026 caaatggtaattaaaaccaaaaacatcgactcatgcaa 32650063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 129 - 265
Target Start/End: Original strand, 21541978 - 21542116
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--cag 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  21541978 aaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcag 21542077  T
Q  227 gaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    | |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  21542078 ggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 21542116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 129 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 42096158 - 42096020
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--cag 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  42096158 aaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcagtaaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcag 42096059  T
Q  227 gaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    | |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  42096058 ggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 42096020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 20438918 - 20438780
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaaca 113  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||| | | |||| ||||  |||||||||||||    
T  20438918 atcatcaataatagatatccaattcatcaattaaatctaacactctgtcataataataattcatcaatatataagtatattatcatcaacaacatcaaca 20438819  T
Q  114 ccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
     || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20438818 acaaatggtaattaaaaccaacaacaacgactcatgcaa 20438780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 342 - 410
Target Start/End: Original strand, 17149454 - 17149523
Alignment:
Q  342 caatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgc-aactccatgtgactccacttaa 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  17149454 caatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtgacaccacttaa 17149523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 16883862 - 16883757
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactc 146  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||   |||| |  |||||||||| || ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  16883862 aatctaacaccctatcataataataattcatgaatatataaaaatatcatcattatcaacatcaacaacaaatggtaattaaaaccaacaacatcgactc 16883763  T
Q  147 atgcaa 152  Q
    ||||||    
T  16883762 atgcaa 16883757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 20824667 - 20824562
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactc 146  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||   ||| || |||||||||| || ||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  20824667 aatctaacaccctatcataataataattcatcaacatatataaatatcatcattatcaacatcaacaacaaatgataattaaaaccaacaacatcgactc 20824568  T
Q  147 atgcaa 152  Q
    ||||||    
T  20824567 atgcaa 20824562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 20838486 - 20838381
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactc 146  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||||   ||| || |||||||||| || || |||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  20838486 aatctaacactctatcataataataattcatcaacatatataaatatcatcattatcagcatcaacaacaaatggtaattaaaaccaacaacatcgactc 20838387  T
Q  147 atgcaa 152  Q
    ||||||    
T  20838386 atgcaa 20838381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20852264 - 20852183
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||    
T  20852264 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattc 20852183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20858890 - 20858809
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||    
T  20858890 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattc 20858809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 21705200 - 21705281
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||    
T  21705200 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattc 21705281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 375
Target Start/End: Original strand, 21698132 - 21698305
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaa-ctag 301  Q
    |||||||||||| |||   ||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||  | |||||||   ||    
T  21698132 atgcatgtggtatcaatttacagggcagaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattcatcatggcataagccctcaccaatttgaacaataaag 21698231  T
Q  302 tgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    || || ||| |||||| |||| ||||| | ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  21698232 tgttccagggcatgagccctc-ccgctttatatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 21698305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 231 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 22030849 - 22030704
Alignment:
Q  231 gaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaacta-gtgctctaggacatgagtcctctccgct 328  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| | || |||| |||||| || |||||||| | | | || ||| |||||| |||| ||||     
T  22030849 gaagccctcaccgaattttgaatggtcaaagcattcatcagggcctaagccctcaccactttgaacaacaaggcgttccagggcatgagccctcaccgc- 22030751  T
Q  329 gtttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
     ||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  22030750 -tttatgtttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 22030704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 3706939 - 3706877
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  3706939 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 3706877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 90 - 152
Target Start/End: Original strand, 19852929 - 19852991
Alignment:
Q  90 atatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  19852929 atatcatcattaacaacatcaacaacaaatggtatttataaccaacaacatcgactcatgcaa 19852991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 90 - 152
Target Start/End: Original strand, 19859064 - 19859126
Alignment:
Q  90 atatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  19859064 atatcatcattaacaacatcaacaacaaatggtatttataaccaacaacatcgactcatgcaa 19859126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 11141327 - 11141222
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactc 146  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||| ||||  |||| |   ||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||| || |||    
T  11141327 aatctaacaccctaacataataacaattcatcaatatataaatatatcatcattaacaacatcaacaataaatggtaattataaccaacaacatcgtctc 11141228  T
Q  147 atgcaa 152  Q
    ||||||    
T  11141227 atgcaa 11141222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 21410857 - 21410736
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaact--a 300  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||| ||||||| |  |    
T  21410857 atgcatgtggtaccaatttacaggtcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaattaaa 21410758  T
Q  301 gtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    ||| ||||| ||||||||||||    
T  21410757 gtgttctagtacatgagtcctc 21410736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 955219 - 955157
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  955219 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccactgtagaatggttaaagcattcat 955157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 11141138 - 11141063
Alignment:
Q  247 ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |  |||| ||||||||| |||||||  |||| || |||||||||||||||    
T  11141138 ttgaatggttaaagcattcatcaaagcataagccctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctc 11141063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 15316641 - 15316566
Alignment:
Q  247 ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||| |||||||  |||| || |||||||||||||||    
T  15316641 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctc 15316566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19664328 - 19664246
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  19664328 agactcctcaacaaatgcagctatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcactgctatcgaatggttaaagcattc 19664246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22448440 - 22448378
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22448440 atgcatgtggtaccataatcagggccgtagccctcaccgctgttgaatggttaaagcattcat 22448378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 21987165 - 21987081
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca---aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattca 266  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    ||||| | |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21987165 agactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccattttacagggcagaagccttcaccgaatttgaatggttaaagcattca 21987081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 10813697 - 10813614
Alignment:
Q  205 atatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcacc 286  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  10813697 atatgcatgtggtaccatattcaggaccgaagtcctcaccggagtttgaatggttaaagcattca-caggaccgaagccctcacc 10813614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 16371515 - 16371596
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| | |||  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||    
T  16371515 agactcctcaacaaatgcaaccatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattc 16371596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16669471 - 16669390
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||| |||| |   || |||||||||||||||||    
T  16669471 agactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccataacagagccgaagctctcatcttattagaatggttaaagcattc 16669390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 322
Target Start/End: Original strand, 20849014 - 20849144
Alignment:
Q  198 aatgcaaatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtga 293  Q
    |||||||  ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | |||||| |||||| ||||||||||| |  |||| ||||||||| |||    
T  20849014 aatgcaacaatgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaattgttaaaacattcatcaaggcataagccctcaccgctttga 20849113  T
Q  294 acaact--agtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    |||| |  |||| || |||||||||||||||    
T  20849114 acaattaaagtgttccaggacatgagtcctc 20849144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 11156939 - 11157022
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||| |  |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  11156939 agactcctcaacaagtgcaactatgcgtgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccactaattgaatggttaaagcattc 11157022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20824530 - 20824467
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctttt-gaatggttaaagcattcat 267  Q
    |||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  20824530 atgcatgtggtaccaaattcaggaccagagccctcaccgctattagaatggttaaagcattcat 20824467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20942034 - 20941971
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20942034 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctatttgaatggttaaagcattcat 20941971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 152
Target Start/End: Original strand, 23630856 - 23630907
Alignment:
Q  100 taacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23630856 taacaacatcaacaata-atggtaattacaaccaacaacaacgactcatgcaa 23630907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 152
Target Start/End: Original strand, 23712376 - 23712427
Alignment:
Q  100 taacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23712376 taacaacatcaacaata-atggtaattacaaccaacaacaacgactcatgcaa 23712427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 247 - 321
Target Start/End: Original strand, 21664203 - 21664278
Alignment:
Q  247 ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaacta-gtgctctaggacatgagtcct 321  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||| ||| |||||||| | ||| || ||||||||||||||    
T  21664203 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcactgctttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcct 21664278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 23066878 - 23066816
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  23066878 atgcatgtggtaccaaaatcaggatcgtagccctctccgctgtagaatggttaaagcattcat 23066816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 31927556 - 31927478
Alignment:
Q  245 ttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaacta-gtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||  | |||||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  31927556 ttttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccaatttgaacaacaaggtgttctaggacatgagtcctc 31927478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 19667056 - 19666952
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactc 146  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||| ||||  |||| |   ||||||||| |||||||||||||| || ||||||  || ||||||||||  ||||||    
T  19667056 aatctaacaccctaacataattataattcatcaatatataaatatatcatcattaacaacatcaacaaca-atggtatatataaccaacaacgtcgactc 19666958  T
Q  147 atgcaa 152  Q
    ||||||    
T  19666957 atgcaa 19666952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 375
Target Start/End: Original strand, 19961297 - 19961342
Alignment:
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19961297 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 19961342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 375
Target Start/End: Original strand, 20242694 - 20242739
Alignment:
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20242694 tttatgcttatgcaaatgacccacttgtgtatatctacatacaact 20242739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 236 - 322
Target Start/End: Original strand, 11157038 - 11157126
Alignment:
Q  236 cctcaccgcttttgaatggttaaagcattca-tcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaac-tagtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||  |||  |||| |||| ||||||||  |||| || |||||||||||||||    
T  11157038 cctcaccgctattgaatggttaaagcattcattcaggacataagtcctcaacgctttgaacaacaaagtgttccaggacatgagtcctc 11157126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 331 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 20824373 - 20824329
Alignment:
Q  331 ttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20824373 ttatgcttatgcaactaacctacttgtgtatatctacatacaact 20824329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20838349 - 20838286
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  20838349 atgcatgtggtaccaaattcagggccggagccctcaccgctattagaatggttaaagtattcat 20838286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 20942178 - 20942087
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaat--gaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaaca 136  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||| ||||  |||| ||  ||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||||| ||||||||    
T  20942178 aatctaacaccctatcataaaaacaattcatcaatatatataagaataacatcattatcaacatcaacaacaaatggtaattaaaaccaaca 20942087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 152
Target Start/End: Original strand, 21698035 - 21698086
Alignment:
Q  100 taacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    ||||||||||||||  | |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21698035 taacaacatcaacaata-atggaaattacaaccaacaacaacgactcatgcaa 21698086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 330 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 23066717 - 23066673
Alignment:
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 374  Q
    ||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23066717 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 23066673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 285 - 375
Target Start/End: Original strand, 23631074 - 23631165
Alignment:
Q  285 ccgctgtgaacaactag-tgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    ||||| |||||||| || || |||||| |||||| ||||  |||| ||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  23631074 ccgctttgaacaacaaggtgttctagggcatgagccctcatcgct-tttatgtttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 23631165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 29554623 - 29554560
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  29554623 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcactgctaattgaatggttaaagcattcat 29554560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 7)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 129 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 512771 - 512489
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagga 228  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  512771 aaccaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgttaagacaacaccttagactactcaa-atatgcaaatatgcatgtggtaccagacagga 512673  T
Q  229 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgc 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  512672 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctctaggacatgagtcctctccgc 512573  T
Q  328 tgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||||||    
T  512572 tgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcatacaaactccttgtgactccacttaaa 512489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Original strand, 178981 - 179181
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctc 283  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||  |||    
T  178981 agacccctcaataaatgcaatcatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctc 179080  T
Q  284 accgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatg 382  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  179081 accgctgtgaacaacaagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccacttttgtatatctacatacaacttgaccatg 179179  T
Q  383 ca 384  Q
    ||    
T  179180 ca 179181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Original strand, 95704 - 95809
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactc 146  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||| |   ||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||  ||||||    
T  95704 aatctaacaccctatcataataataattcatcaatatataaatatatcatcattaacgacatcaacaacaaatggtaattaaaaccaacaacgtcgactc 95803  T
Q  147 atgcaa 152  Q
    ||||||    
T  95804 atgcaa 95809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 494156 - 494075
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||| |||  |||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  494156 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagggccggggccctcaccgttatagaatggttaaagcattc 494075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 174758 - 174725
Alignment:
Q  188 ctcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 221  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  174758 ctcctcaataaatgcaactatgcatgtggtacca 174725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 332 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 488394 - 488350
Alignment:
Q  332 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  488394 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 488350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 266
Target Start/End: Original strand, 524649 - 524711
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattca 266  Q
    ||||||||||||||||   ||||| |  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  524649 atgcatgtggtaccaatttacagggcataagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattca 524711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 129 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 1256 - 971
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagga 228  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1256 aaccaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacagga 1157  T
Q  229 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgc 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1156 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgc 1057  T
Q  328 tgtt-tatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    |||||||| ||||||||||||||    
T  1056 tgttctatgcatatgcaatcgacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgcatacaaactccatatgactccacttaaa 971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 2)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Original strand, 19533 - 19813
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 231  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  19533 caacaactaagactcatacaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaatagatgcaattatgcatgtggtaccagacaggaccg 19632  T
Q  232 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgt 330  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19633 aagcccttaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgt 19732  T
Q  331 ttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| ||||||||||||||    
T  19733 ttattcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcatacaaactccatatgactccacttaaa 19813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 24052 - 23771
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 231  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  | |||||||    
T  24052 caacaactaagactcatacaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaatagatgcaattatgcatgtggtaccttataggaccg 23953  T
Q  232 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgt 330  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23952 aagcccttaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaatccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgt 23853  T
Q  331 ttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||    
T  23852 ttattcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatatgactccacttaaa 23771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0279 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0279
Description:

Target: scaffold0279; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 123 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 5965 - 5675
Alignment:
Q  123 aattagaaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaa 222  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  5965 aattacaatcaacaactacgactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaa-atatgcaaatatgcatgtggtaccaa 5867  T
Q  223 acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcct 321  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  5866 acaggaccgaagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcagggccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggacatgagtcct 5767  T
Q  322 ctccgctg-tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgc-aactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5766 caccgctgttttatgcatatgccatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaaactccatgtgactccacttaaa 5675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0214 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0214
Description:

Target: scaffold0214; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 129 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 15436 - 15179
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagga 228  Q
    |||||||||  | |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15436 aaccaacaattatgactcatgcaaatgttatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtactaaacagga 15337  T
Q  229 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgc 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15336 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaggattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagtaactagtgctccaggacatgagtcctctccgc 15237  T
Q  328 tgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15236 tgtttatgcatatgcaatggacctatttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 15179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 129 - 384
Target Start/End: Original strand, 15025 - 15281
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagga 228  Q
    |||||||||  | ||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15025 aaccaacaatcaagactcatgcaa-tgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagga 15123  T
Q  229 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgc 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  15124 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggaaatgagtcctccccgc 15223  T
Q  328 tgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15224 tgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 15281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 129 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 4875 - 4593
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagga 228  Q
    |||||||||  | |||||||||||  || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  4875 aaccaacaaataagactcatgcaatggacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaa-atatgcaattatgcatgtggtaccagacagga 4777  T
Q  229 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaa-caactagtgctctaggacatgagtcctctccgc 327  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4776 ccgaagctctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcagaaccgaagccctcaccgctgttaagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgc 4677  T
Q  328 tgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| ||||||||||||||||    
T  4676 tgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcatacaaactccttgtgactccacttaaa 4593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 118 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 31840 - 31632
Alignment:
Q  118 atggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggt 217  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31840 atggcaattacaaccaacaacaccgactcatgcaactgacatgacaacactgctaagacaac-ccttagacttctcaataaatgcaaatatgcatgtggt 31742  T
Q  218 acc--aaacaggaccgaagccctcaccgc--ttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaactag-tgctctaggac 312  Q
    |||  || |||| || |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||| |||||||| || || || |||||    
T  31741 accataatcagggccaaagcactcaccgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgctttgaacaacaagatgttccaggac 31642  T
Q  313 atgagtcctc 322  Q
    || |||||||    
T  31641 ataagtcctc 31632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0320 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0320
Description:

Target: scaffold0320; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 129 - 384
Target Start/End: Original strand, 814 - 1072
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagga 228  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  814 aaccaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaaccctgctaagacaacaccttagactcctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagatagga 913  T
Q  229 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgc 327  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  914 ccgaagccctcaccacttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgc 1013  T
Q  328 tg-tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 384  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1014 tgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 1072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 131 - 411
Target Start/End: Original strand, 24966 - 25245
Alignment:
Q  131 ccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  24966 ccaacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacaccttagacttctcaa-atatgcaaatatgcatgtggtaacaa-caggacc 25063  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgct-gtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25064 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctattgagcaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctg 25163  T
Q  330 -tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
     |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  25164 ttttatgcatatgtaatggatcaacttgtgtatatctacatacaactgaccatgc-atacaactccatgtgactccacataaa 25245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 165; Significance: 4e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Original strand, 602 - 802
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  602 agactcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 701  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 383  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  702 ccgctctgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 801  T
Q  384 a 384  Q
    |    
T  802 a 802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 375
Target Start/End: Original strand, 1000 - 1045
Alignment:
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1000 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 1045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0457 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0457
Description:

Target: scaffold0457; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 142 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 12452 - 12181
Alignment:
Q  142 gactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctca 240  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12452 gactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcag-tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaggccctca 12354  T
Q  241 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcat 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||||| ||||||    
T  12353 ccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcat 12254  T
Q  339 atgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12253 atgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactctatgtgactccacttaaa 12181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 158; Significance: 6e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 129 - 411
Target Start/End: Original strand, 31562 - 31847
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacagga 228  Q
    |||||||||| | |||||||||||| || ||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31562 aaccaacaactaagactcatgcaaacgacatgacaacactgctatgacaacaccttagacttctcaatagatgcaaatatgcatgtggtaccagacagga 31661  T
Q  229 ccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgc 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||  || |||| ||||    
T  31662 ccgaagccctcaccgcttttgaatgattaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggacaaaagacctcaccgc 31761  T
Q  328 tgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    |||||||| ||||||||||||||    
T  31762 tgtttaatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttaaccatgcatacaaactccatatgactccacttaaa 31847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 74311 - 74112
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  74311 agacccctcaattaatgcaattatgcatgtggtatcaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 74212  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 383  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  74211 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgctatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 74113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 298
Target Start/End: Original strand, 120787 - 120882
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaac 298  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| | |  |||| |||||| || ||||||||    
T  120787 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaaatttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccactttgaacaac 120882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 298
Target Start/End: Original strand, 131664 - 131759
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaac 298  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| | |  |||| |||||| || ||||||||    
T  131664 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaaatttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccactttgaacaac 131759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 186 - 384
Target Start/End: Original strand, 1995 - 2192
Alignment:
Q  186 gactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcac 285  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  1995 gactcctcaata--tgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgattaaagcattcatcaggaccgaagccctcac 2092  T
Q  286 cgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 384  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2093 cgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 2192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 151; Significance: 9e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 166 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 18621 - 18373
Alignment:
Q  166 actgctaagacaacaccttagactcctcaat--aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat 263  Q
    |||||||||||| || |||||||| || ||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18621 actgctaagacaccatcttagacttcttaaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat 18523  T
Q  264 tcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtat 361  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||   || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18522 tcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtat 18423  T
Q  362 atctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18422 atctacatacaactgaccatgccatgcaactccatgtgactccacttaaa 18373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 29726 - 29808
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacc--aaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  || |||| ||| | ||| ||||| | | |||||||||||||||||    
T  29726 agactcctcaataaatgcaactatgcatgtggtaccataatcagggccgtaacccacaccgttgtcgaatggttaaagcattc 29808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 185 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 65484 - 65260
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    ||||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  65484 agactcctcaaaatatgcaattattcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatgtttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 65385  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 383  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  65384 ccgttgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatgaaactacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 65285  T
Q  384 aatgca-actccatgtgactccactt 408  Q
     || || ||||||| |||||||||||    
T  65284 -atacatactccatatgactccactt 65260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 146; Significance: 9e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 132 - 411
Target Start/End: Original strand, 13333 - 13613
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||| | || |||||||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  13333 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagataccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaatcaggacc 13429  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  13430 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 13529  T
Q  330 ttt--atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13530 tttttatgcatatccaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 13613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 146; Significance: 9e-77; HSPs: 4)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Original strand, 39 - 239
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctc 283  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||    
T  39 agacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaaacattcatcaggaccgaaaccctc 138  T
Q  284 accgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatg 382  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  139 accgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatg 237  T
Q  383 ca 384  Q
    ||    
T  238 ca 239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 129 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 30400 - 30262
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--cag 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  30400 aaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcag 30301  T
Q  227 gaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    | |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  30300 ggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 30262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 129 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 35801 - 35663
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--cag 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  35801 aaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcag 35702  T
Q  227 gaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    | |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  35701 ggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 35663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 51717 - 51672
Alignment:
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51717 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 51672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 166 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 18724 - 18481
Alignment:
Q  166 actgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcatt 264  Q
    |||||||||||| |  |||||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18724 actgctaagacaccttcttagacttcttaatgaaatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagcatt 18626  T
Q  265 catcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg-tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtata 362  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||   || |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18625 catcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtata 18526  T
Q  363 tctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccact 407  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18525 tctacatacaactgaccttgcaatgcaactccatgtgactccact 18481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 267
Target Start/End: Original strand, 1873 - 1958
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  1873 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 1958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 132 - 408
Target Start/End: Original strand, 104214 - 104490
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaat-aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggacc 230  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||| || |||||||| || ||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  104214 caacaaccaagactcatgcaaatgacatgacca--ctgctaagacaccatcttagacttcttaatgaaatgcat-tatgcatgtggtaccaatcaggacc 104310  T
Q  231 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctg-tgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| |||||   || |||| ||||||    
T  104311 gaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgttgagcaactagtactccaggaccgaagccctcaccgctg 104410  T
Q  330 -tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccactt 408  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  104411 ttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactcaatatgactccactt 104490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 208 - 384
Target Start/End: Original strand, 24648 - 24825
Alignment:
Q  208 tgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagtgctct 307  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24648 tgcatgtggtaccagacaggaccgaggccctcaccgcttttgaatggttaaagtattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctct 24747  T
Q  308 aggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  24748 aggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtttatatctacatagaacttgaccatgca 24825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 101843 - 101645
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    ||||||||||| | |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  101843 agactcctcaa-atatgcgactatgcatctggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctca 101745  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 383  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  101744 ctgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtg-atatctacatacaacatgaccatgc 101646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 3)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 185 - 355
Target Start/End: Original strand, 7692 - 7861
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  7692 agactcctcaatta-tgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccaaagccctca 7790  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctactt 355  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7791 ccgatgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctactt 7861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 271 - 409
Target Start/End: Original strand, 12924 - 13063
Alignment:
Q  271 gaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacata 370  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12924 gaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacata 13023  T
Q  371 c-aactgaccatgcaatgca-actccatgtgactccactta 409  Q
    | || ||||||||| || || ||||||| ||||||||||||    
T  13024 caaattgaccatgc-atacatactccatatgactccactta 13063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 245
Target Start/End: Original strand, 12883 - 12942
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgct 245  Q
    ||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12883 agactcctcaa-atatggaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgct 12942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 206 - 410
Target Start/End: Original strand, 50000 - 50206
Alignment:
Q  206 tatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt-gaacaactagtgc 304  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| || |||||||| |    
T  50000 tatgcatgtggtaccaatcaggaccggagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgatgttgagcaactagtac 50099  T
Q  305 tctaggacatgagtcctctccgctgttt-atgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactc 403  Q
    || |||||   || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50100 tccaggaccgaagccctcaccgctgttttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactc 50199  T
Q  404 cacttaa 410  Q
    || ||||    
T  50200 caattaa 50206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 4)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 224 - 411
Target Start/End: Original strand, 19231 - 19419
Alignment:
Q  224 caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctct 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  19231 caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgttccaggacatgagtcctct 19330  T
Q  324 ccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaa 411  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||| |||||    
T  19331 ctgctgtttatgcatatgaaatggacctacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc-atacatactccatgtgactccatttaaa 19419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 271 - 411
Target Start/End: Original strand, 15180 - 15321
Alignment:
Q  271 gaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacata 370  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15180 gaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgttccaagacatgagtcctctctgctgtttacgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacata 15279  T
Q  371 caact-gaccatgcaatgca-actccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||||| || |||||| | || |||||||||||||||| |||||    
T  15280 caacttgatcatgca-tacatactccatgtgactccatttaaa 15321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 187 - 289
Target Start/End: Original strand, 19150 - 19252
Alignment:
Q  187 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcacc 286  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  19150 actcctcaaaatatgcaattatgcatgtggtaccagacaggacggaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcacc 19249  T
Q  287 gct 289  Q
    |||    
T  19250 gct 19252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 245
Target Start/End: Original strand, 15152 - 15198
Alignment:
Q  199 atgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgct 245  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  15152 atgcaattatgcatgtggtactagacaggaccgaagccctcaccgct 15198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 131; Significance: 8e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 219 - 384
Target Start/End: Original strand, 30845 - 31010
Alignment:
Q  219 ccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagt 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30845 ccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagt 30944  T
Q  319 cctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 384  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30945 cctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 31010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 126; Significance: 7e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Original strand, 246998 - 247197
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctc 283  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||    
T  246998 agacccctcaataa-tgcaattatgcatgtggtacgaaaacaggatcgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagccctc 247096  T
Q  284 accgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatg 382  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  247097 accgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatg 247195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Original strand, 253512 - 253711
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctc 283  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||    
T  253512 agacccctcaataa-tgcaattatgcatgtggtacgaaaacaggatcgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagccctc 253610  T
Q  284 accgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatg 382  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  253611 accgctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgctatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatg 253709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 185 - 384
Target Start/End: Original strand, 41210 - 41408
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctca 284  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||    
T  41210 agacccctcaataa-tgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagccctca 41308  T
Q  285 ccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgc 383  Q
    |||  ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41309 ccgaagtgaacaacaaatgctccaggacatgagtactc-ccactgtttatgcatatgatatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgc 41407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 132 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 16258 - 16100
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccg 231  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||  || |||||||||||| || |||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  16258 caacaactaagactcatgcaaatgacatgaaaacactgctaagacaccatcttagacttctcaatggatgcaa-tatgcatgtggtaccaaacaggacca 16160  T
Q  232 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgt 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  16159 aagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaggaccgaagccctcaccgctgt 16100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 101 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 675 - 451
Alignment:
Q  101 aacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaat 200  Q
    |||| ||||| || || |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  675 aacatcatcatcatcaaatggcaattacaaccaacaacaccgactcatgcaactgacatgacaacactgctaagacaacaccttagactcctcaataaat 576  T
Q  201 gcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaac 298  Q
     |||||||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||| || | ||||| |||||||||||||||   |  |||||||||||||| ||||||||    
T  575 acaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgtagccctcaccactgtagaatgattaaagcattcatcagagcataagctctcaccgctttgaacaac 476  T
Q  299 -tagtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
      |||| || |||||||||||||||    
T  475 aaagtgttccaggacatgagtcctc 451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 338 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 5415 - 5377
Alignment:
Q  338 tatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5415 tatgcaatggactctacttgtgtatatctacatacaact 5377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 134 - 322
Target Start/End: Original strand, 26018 - 26210
Alignment:
Q  134 acaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccg 231  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||    
T  26018 acaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccactaagacaacaccttagactcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccg 26117  T
Q  232 aagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaacta-gtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |  |||| ||||||||| |||||||| | ||| || |||||||||||||||    
T  26118 aagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattcattagggcataagccctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctc 26210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 134 - 322
Target Start/End: Original strand, 27400 - 27592
Alignment:
Q  134 acaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccg 231  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||    
T  27400 acaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccactaagacaacaccttagactcctcaacaaatgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccg 27499  T
Q  232 aagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaac-tagtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |  |||| ||||||||| ||||||||  |||| || |||||||||||||||    
T  27500 aagccctcaccgctgtttgaatggttaaagcattcattagggcataagccctcaccgctttgaacaacaaagtgttccaggacatgagtcctc 27592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1726 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold1726
Description:

Target: scaffold1726; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 134 - 298
Target Start/End: Original strand, 151 - 319
Alignment:
Q  134 acaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacc--aaacaggaccg 231  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || || | |||    
T  151 acaacaccgactcatgcaactgacatgacaacactactaagacaacaccttagacttctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcaaggccg 250  T
Q  232 aagccctcaccgc--ttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaac 298  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||| ||||||||    
T  251 aagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcctcaccgctttgaacaac 319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 5)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 117 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 10374 - 10223
Alignment:
Q  117 catggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtgg 216  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10374 catggcaattacaaccaacaacacagactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtgg 10275  T
Q  217 taccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||| |  |||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  10274 taccatattcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattc 10223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 101 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 17687 - 17519
Alignment:
Q  101 aacaacatcaacacca-catggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaa 199  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||  ||| || ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  17687 aacaacatcatcatcatcatggcaattacaaccaacaacacagactcatgcaaatgacataacaacaccgctaaggtaacaccctagactcctcaataaa 17588  T
Q  200 tgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattc 265  Q
    |||||||||||||||||||||| |  |||| ||||| |||||||||||  | ||||||||||| |||||    
T  17587 tgcaaatatgcatgtggtaccatattcagggccgaaaccctcaccgctgatcgaatggttaaaacattc 17519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 35924 - 35839
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  35924 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagagccgaagccctcaccgctaattgaaaggttaaagcattcat 35839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 265
Target Start/End: Original strand, 72229 - 72288
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa-caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  72229 atgcatgtggtaccatatcaaggccgaagccctcaccgctatagaatggttaaagcattc 72288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 10121 - 10076
Alignment:
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10121 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 10076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 10)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Original strand, 109983 - 110121
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaaca 113  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| | | ||||||||| ||||||||||||||    
T  109983 atcatcaataatagatatctaactcatcaattaaatctaacaccctgtcataataataattcatcaatatataagtatatcatcattaacaacatcaaca 110082  T
Q  114 ccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
     || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  110083 acaaatggtaattaaaaccaacaacaacgactcatgcaa 110121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 110171 - 110252
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||    
T  110171 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattc 110252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 63370 - 63308
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  63370 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 63308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 124792 - 124687
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactc 146  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||   ||| ||||| |||||||  | ||||||||||| || ||||||| |  |||||||| || ||||||    
T  124792 aatctaacatcctatcataataataattcatcaacatatatgaacatcatcatcatcaacatcaacaacaaatggtaaatgaaaccaacaccatcgactc 124693  T
Q  147 atgcaa 152  Q
    ||||||    
T  124692 atgcaa 124687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 185 - 267
Target Start/End: Original strand, 142610 - 142694
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||    ||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  142610 agactcctcaacaa-tgcgactatgcatgtggtaccattatacagggcagaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattcat 142694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 124649 - 124588
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  124649 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgcttatcgaatggttaaagcattc 124588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13074 - 12994
Alignment:
Q  187 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  13074 actcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccataatcaggtccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 12994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #8
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 28099 - 28033
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatca 269  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  28099 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatca 28033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #9
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 332 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 38767 - 38723
Alignment:
Q  332 tatgcatatgcaatggacct-acttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  38767 tatgcttatgcaatggacttcacttgtgtatatctacatacaact 38723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 38936 - 38870
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatca 269  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  38936 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatca 38870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 288 - 384
Target Start/End: Original strand, 9835 - 9932
Alignment:
Q  288 ctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact-gaccatgca 384  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9835 ctgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaactagaccatgca 9932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 185 - 269
Target Start/End: Original strand, 143940 - 144024
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatca 269  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  143940 agacccctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccaaacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatca 144024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 289 - 384
Target Start/End: Original strand, 137159 - 137254
Alignment:
Q  289 tgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 384  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  137159 tgtgaacaactagtgctccaggacatgagtcctc-ccgctgtttatgcatatgcaatggacccacttgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 137254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1584 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1584
Description:

Target: scaffold1584; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 118 - 265
Target Start/End: Original strand, 230 - 381
Alignment:
Q  118 atggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacac-cttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtgg 216  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  230 atggcaattacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgtcaacaccgctaagacaacactcctagactcctcaacaaatgcagatatgcatgtgg 329  T
Q  217 taccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  330 taccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattc 381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 4)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 129 - 265
Target Start/End: Original strand, 38323 - 38461
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--cag 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  38323 aaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcag 38422  T
Q  227 gaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    | |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  38423 ggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 38461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 47079 - 46974
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactc 146  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | ||  |||| |  |||||| ||| ||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  47079 aatctaacaccctatcataataataattcttcaatatataaaaatatcctcattaacatcatcaacaacaaatggtaattaaaaccaacaacatcgactc 46980  T
Q  147 atgcaa 152  Q
    ||||||    
T  46979 atgcaa 46974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 51352 - 51247
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactc 146  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| | ||  |||| |  |||||| ||| ||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  51352 aatctaacaccctatcataataataattcttcaatatataaaaatatcctcattaacatcatcaacaacaaatggtaattaaaaccaacaacatcgactc 51253  T
Q  147 atgcaa 152  Q
    ||||||    
T  51252 atgcaa 51247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 319
Target Start/End: Original strand, 36180 - 36298
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaact--a 300  Q
    |||||||||||| |||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| |   ||| ||||||||| ||||||| |  |    
T  36180 atgcatgtggtaacaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcaaggcatgagccctcaccgctttgaacaattaaa 36279  T
Q  301 gtgctctaggacatgagtc 319  Q
    ||| | |||||||||||||    
T  36280 gtgttttaggacatgagtc 36298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 9)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 129 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 174816 - 174678
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--cag 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  174816 aaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcag 174717  T
Q  227 gaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    | |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  174716 ggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 174678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Original strand, 258354 - 258459
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactc 146  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||   ||| || |||||||||| || ||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  258354 aatctaacaccctatcataataataattcatcaacatatataaatatcatcattatcaacatcaacaacaaatggcaattaaaaccaacaacatcgactc 258453  T
Q  147 atgcaa 152  Q
    ||||||    
T  258454 atgcaa 258459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 197760 - 197656
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactc 146  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||  |||| | ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  197760 aatctaacaccctatcataataacaattcatcaatatataagaatatcatcattatcaacatcaacaacaaatggtaattaaaaccaac-acatcgactc 197662  T
Q  147 atgcaa 152  Q
    ||||||    
T  197661 atgcaa 197656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 47 - 149
Target Start/End: Original strand, 146862 - 146964
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactc 146  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||  |||| |   || |||||| ||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  146862 aatctaacaccctaacataataataattcatcaatatataattatgtcatcattaacaacatcaacaataaatggtaattaaaaccaacaacatcgactc 146961  T
Q  147 atg 149  Q
    |||    
T  146962 atg 146964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 90 - 152
Target Start/End: Original strand, 251782 - 251844
Alignment:
Q  90 atatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  251782 atatcatcattaacaacatcaacaacaaatggtatttataaccaacaacatcgactcatgcaa 251844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 322
Target Start/End: Original strand, 147050 - 147126
Alignment:
Q  247 ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaacta-gtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||| |||||||| | ||| || |||||||||||||||    
T  147050 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctc 147126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 56947 - 56853
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaa 297  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||| |||||||    
T  56947 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaa 56853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 231 - 322
Target Start/End: Original strand, 75156 - 75250
Alignment:
Q  231 gaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaact--agtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||| ||||||| |  |||| || |||||||||||||||    
T  75156 gaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaattaaagtgttccaggacatgagtcctc 75250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #9
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 197618 - 197555
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  197618 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 197555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 5)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 37204 - 37066
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaaca 113  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||| | | ||||||||| ||||||||||||||    
T  37204 atcatcaataatagatatctaactcatcaattaaatctaacaccctatcataataataattcatcaatatataagtatatcatcattaacaacatcaaca 37105  T
Q  114 ccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
      | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37104 ataaatggtaattaaaaccaacaacaacgactcatgcaa 37066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 322
Target Start/End: Original strand, 9268 - 9343
Alignment:
Q  247 ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||| |||||||  |||| || |||||||||||||||    
T  9268 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctc 9343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 322
Target Start/End: Original strand, 44938 - 45013
Alignment:
Q  247 ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||| |||||||  |||| || |||||||||||||||    
T  44938 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctc 45013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 36834 - 36789
Alignment:
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36834 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 36789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 37016 - 36980
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 221  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  37016 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtacca 36980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 129 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 52639 - 52501
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--cag 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  52639 aaccaacaacaccgactcatgcaaaggacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcag 52540  T
Q  227 gaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    | |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  52539 ggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 52501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 129 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 47233 - 47096
Alignment:
Q  129 aaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--cag 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  || ||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  47233 aaccaacaacaccgactcatgcaag-gacatgacaacaccgctaagacaacaccctagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccataatcag 47135  T
Q  227 gaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    | |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  47134 ggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 47096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 322
Target Start/End: Original strand, 64965 - 65085
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaacta-g 301  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||| |||||||| | |    
T  64965 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaatg 65064  T
Q  302 tgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    || || |||||| ||||||||    
T  65065 tgttccaggacacgagtcctc 65085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 322
Target Start/End: Original strand, 999 - 1075
Alignment:
Q  247 ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaac-tagtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||| ||||||||  |||| || |||||||||||||||    
T  999 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacagagtgttccaggacatgagtcctc 1075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 52904 - 52753
Alignment:
Q  118 atggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacac-cttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtgg 216  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  52904 atggcaattacaaccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgtcaacaccgctaagacaacactcctagactcctcaacaaatgctgatatgcatgtgg 52805  T
Q  217 tacc--aaacaggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||  || |||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  52804 taccataatcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattc 52753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 118 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 5396 - 5187
Alignment:
Q  118 atggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacac-cttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtgg 216  Q
    |||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| ||  |||||||||||| | |||||||||||| |||  |||||||||||||||    
T  5396 atggcaattacatccaacaacaccgactcatgcaaatgacataacaacaccactaagacaacactcctagactcctcaacaaacacaaatatgcatgtgg 5297  T
Q  217 taccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaacta-gtgctctaggac 312  Q
    ||||| |  |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||| |||||||| | ||| || |||||    
T  5296 taccatattcagggccgaagccctcaccactaattgaatggttaaagcattcatcaggacataagtactcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggac 5197  T
Q  313 atgagtcctc 322  Q
    || |||||||    
T  5196 ataagtcctc 5187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 4)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 131 - 265
Target Start/End: Original strand, 2843 - 2980
Alignment:
Q  131 ccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca--aacagga 228  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||| || ||||||||| || | ||||||||||||||||||||    ||||     
T  2843 ccaacaacaccgactcatgcaaatgacatgacaacaccgctaagacaacaccctacactcctcaacaattacaaatatgcatgtggtaccatgttcaggg 2942  T
Q  229 ccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattc 265  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  2943 ccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattc 2980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 2047 - 1942
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactc 146  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| | |||   |||| |  |||||||||| || ||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  2047 aatctaacaccctatcataataatatttcatgaatatataaaaatatcatcattatcaacatcaacaacaaatggtaattaaaaccaacgacatcgactc 1948  T
Q  147 atgcaa 152  Q
    ||||||    
T  1947 atgcaa 1942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 1904 - 1841
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  1904 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 1841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 15641 - 15579
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  15641 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaagcattcat 15579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 3236 - 3098
Alignment:
Q  14 atcatcaatattagatatctacttcatcctttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaaca 113  Q
    |||||||||| ||||||||||  || ||  || ||||| ||||||||||||  ||||||| ||||  |||| | | ||||||||| ||||||||||||||    
T  3236 atcatcaataatagatatctaactcttcaatttaatcttacaccctgtcatcgtaataattcatcaatatataagtatatcatcattaacaacatcaaca 3137  T
Q  114 ccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
     || |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  3136 acaaatggtaattaaaaccaataacaacgactcatgcaa 3098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 3048 - 2967
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||  |||||||||||| || | | |||||||||||||||||    
T  3048 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagagccgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattc 2967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 185 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 146 - 5
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctc 281  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||  |||  |    
T  146 agactcctgaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaacggttaaagcattcatcgagacataagtcc 47  T
Q  282 tcaccgctgtgaacaac-tagtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    |||||||| ||||||||  |||| || |||||||||||||||    
T  46 tcaccgctttgaacaacaaagtgttccaggacatgagtcctc 5  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0276 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0276
Description:

Target: scaffold0276; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 349 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 22101 - 22039
Alignment:
Q  349 cctacttgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatgtgactccacttaaa 411  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  22101 cctacctgtgtatatctacatacaactgaccatgcaatgcaactccatatgacaccacttaaa 22039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Original strand, 55771 - 55876
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactc 146  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||   ||| || |||||||||| || ||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  55771 aatctaacaccctatcataataataattcatcaacatatataaatatcatcattatcaacatcaacaacaaatggcaattaaaaccaacaacatcgactc 55870  T
Q  147 atgcaa 152  Q
    ||||||    
T  55871 atgcaa 55876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 118 - 265
Target Start/End: Original strand, 9913 - 10063
Alignment:
Q  118 atggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacaccttagactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggt 217  Q
    |||| ||||| | ||||||| | ||||||||||| |||| ||  ||| || |||||||||||||| || |||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  9913 atggcaattacatccaacaataccgactcatgcatatgacataacaacaccgctaagacaacaccctaaactcttcaaataatgcaaatatgcatgtggt 10012  T
Q  218 accaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattc 265  Q
    |||| |  |||| |||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  10013 accatattcagggccgaagtcctcaccgctaatcgaatggttaaagcattc 10063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 102 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 5020 - 4970
Alignment:
Q  102 acaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    ||||||||||||  | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  5020 acaacatcaacaataaatggtaatttcaaccaacaacaacgactcatgcaa 4970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 4324 - 4183
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctc 281  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||  |||  |    
T  4324 agactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcacctctaattgaatggttaaagcattcatcaggacataagtcc 4225  T
Q  282 tcaccgctgtgaacaacta-gtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    |||||||| |||||||| |  || || |||||||||||||||    
T  4224 tcaccgctttgaacaacaatttgttccaggacatgagtcctc 4183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 332 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 4135 - 4091
Alignment:
Q  332 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  4135 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 4091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 4)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 207 - 375
Target Start/End: Original strand, 38421 - 38594
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctttt--gaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaacta- 300  Q
    ||||||||||||||||   ||||  | |||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||| |||||||| |     
T  38421 atgcatgtggtaccaatttacagagcagaagccctcaccactatttcgaatggttaaagcattcatcaagacataagtcctcaccgctttgaacaacaag 38520  T
Q  301 gtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||| |||| | |||||||| ||||| |||||||||    
T  38521 gtgttctaggacatgagtcctc-ccgct-tatatgcttatgcaacggactccacttgtgtctatcttcatacaact 38594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 101 - 152
Target Start/End: Original strand, 29702 - 29752
Alignment:
Q  101 aacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    |||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29702 aacaacatcaacaata-atggtaattacaaccaacaacaacgactcatgcaa 29752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 269
Target Start/End: Original strand, 29801 - 29867
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatca 269  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  29801 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatca 29867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 322
Target Start/End: Original strand, 44580 - 44701
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgct--tttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaacta- 300  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | ||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||| |||  |||  | ||||||| |||||||| |     
T  44580 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcgccactattttgaatggttaaagcattcatcaggacataagtccacaccgctttgaacaacaag 44679  T
Q  301 gtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    ||| || || ||||||||||||    
T  44680 gtgttccagaacatgagtcctc 44701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 24112 - 24010
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactc 146  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||  |||| || |||||||||| || || |||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24112 aatccaacaccctatcataataataattcatcaatatatataaatatcatcattatcagcatcaacaacaaatggtaattaaaaccaacaacatcgactc 24013  T
Q  147 atg 149  Q
    |||    
T  24012 atg 24010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 4817 - 4781
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 221  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  4817 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtacca 4781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 17208 - 17103
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactc 146  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| || |   ||| || |||||||||| || ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  17208 aatctaacaccctatcatcataataattcaccaacatatataaatatcatcattatcaacatcaacaacaaatggtaattaaaaccaacaacatcgactc 17109  T
Q  147 atgcaa 152  Q
    ||||||    
T  17108 atgcaa 17103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 14996 - 14915
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  14996 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagggccgaagccctcaccgttatagaatggttaaagcattc 14915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 8008 - 7923
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| |  | || ||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  8008 agactcctcaacaaatgcaactatgcatatggtaccatattctgggccggagccctcactgctaattgaatggttaaagcattcat 7923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 207 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 48001 - 47882
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagt 302  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||| |||||||  |||    
T  48001 atgcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgctttgaacaataagt 47902  T
Q  303 gctctaggacatgagtcctc 322  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  47901 gttctaggacatgagtcctc 47882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 41931 - 41993
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  41931 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 41993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 330 - 374
Target Start/End: Original strand, 42091 - 42135
Alignment:
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 374  Q
    ||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  42091 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 42135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 139
Target Start/End: Original strand, 38204 - 38296
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaaca 139  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||   ||| || |||||||||| || ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  38204 aatctaacaccctatcataataataattcatcaacatatataaatatcatcattatcaacatcaacaacaaatggtaattaaaaccaacaaca 38296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 267
Target Start/End: Original strand, 153 - 238
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  153 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccactaattgaatggttaaagcattcat 238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 327 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 20160 - 20102
Alignment:
Q  327 ctgtttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac-tgaccatgca 384  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20160 ctgtttatgcatatgcaatggacccactcgtgtatatctacatacaacttgaccatgca 20102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 16245 - 16160
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||    
T  16245 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaaacattcat 16160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 43096 - 42904
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca---aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctc 281  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    ||||| | ||||||||||||   ||||||||||||||||||||| || | |  |||| |    
T  43096 agactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccattttacagggcagaagccctcacctaatttgaatggttaaagcattca-cagggcataagccc 42998  T
Q  282 tcaccgctgtgaacaacta-gtgctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    |||||  | |||||||| | ||| || ||| |||||| |||| ||||  ||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  42997 tcaccaatttgaacaacaaggtgttccagggcatgagccctcaccgc--tttatgtttatgcaatggactcaacttgtgtatatctacatacaact 42904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 45156 - 45094
Alignment:
Q  312 catgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    ||||||||||| |||||  |||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  45156 catgagtcctcaccgct--ttatgtttatgcaatggactcaacttgtgtatatctacatacaact 45094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18375 - 18291
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattca 266  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  18375 agactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattca 18291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 258674 - 258736
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  258674 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccttcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 258736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 265100 - 265162
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  265100 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccttcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 265162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 44 - 152
Target Start/End: Original strand, 29404 - 29513
Alignment:
Q  44 ttaaatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaatt-agaaccaacaacaacg 142  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||   ||| || |||||||||| || |||||||| || || ||||||||| | ||||||||| | ||    
T  29404 ttaaatctaacaccctatcataataataattcatcaacatatataaatatcatcattatcaacatcatcaacaaatggtaattaaaaaccaacaatatcg 29503  T
Q  143 actcatgcaa 152  Q
    ||||||||||    
T  29504 actcatgcaa 29513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 129894 - 129752
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcacc-gcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagct 280  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| | |  ||||     
T  129894 agactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagcc 129795  T
Q  281 ctcaccgctgtgaacaac-tagtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    ||||||| | ||||||||  |||| || ||| |||||||||||    
T  129794 ctcaccgttttgaacaacaaagtgttccagggcatgagtcctc 129752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 321062 - 321125
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  321062 atgcatgtggtaccataatcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 321125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 3658 - 3720
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  3658 atgcatgtggtaccaaaatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 3720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 141326 - 141388
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  141326 atgcatgtggtaccataatcaggaccgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 141388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 146566 - 146629
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||| |  |||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  146566 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagtcctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 146629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 233 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 3448 - 3358
Alignment:
Q  233 agccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||| |||||||  || | || |||||||||||||||    
T  3448 agccctcaccggattttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgctttgaacaataagggttccaggacatgagtcctc 3358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 322
Target Start/End: Original strand, 18505 - 18625
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcacc-gcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaacta-g 301  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||| |||||||| | |    
T  18505 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccagatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacgagg 18604  T
Q  302 tgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    || || |||||||||||||||    
T  18605 tgttccaggacatgagtcctc 18625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 269
Target Start/End: Original strand, 51109 - 51197
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcacc-gcttttgaatggttaaagcattcatca 269  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||    
T  51109 agactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatca 51197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0720 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0720
Description:

Target: scaffold0720; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 4367 - 4286
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||| |||  |||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  4367 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtaccatatcagggccgttgccctcaccgttatagaatggttaaagcattc 4286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 5187 - 5068
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagt 302  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||| |||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||||||||| |||||||  |||    
T  5187 atgcatgtggtaccaatttacagggccgtagccctcaccggatattgaatggttaaatcattcatcagggcctaagccctcaccgctttgaacaataagt 5088  T
Q  303 gctctaggacatgagtcctc 322  Q
    | || | |||||||||||||    
T  5087 gttccacgacatgagtcctc 5068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 152
Target Start/End: Original strand, 10808 - 10859
Alignment:
Q  100 taacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  10808 taacaacatcaacaata-atggtaatttcaaccaacaacaacgactcatgcaa 10859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 4681 - 4576
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactc 146  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||   ||| |   ||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| |||||||||||  |||||    
T  4681 aatctaacaccctaacataataataattcatcaacatataaatatatcatcattaacaacatcaacaacaaatcgtaattataaccaacaacatggactc 4582  T
Q  147 atgcaa 152  Q
    ||||||    
T  4581 atgcaa 4576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 322
Target Start/End: Original strand, 8474 - 8593
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcacc-gcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagt 302  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | | |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||| |||||||  |||    
T  8474 atgcatgtggtaccaatttacagggcagtagccctcaccagatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaataagt 8573  T
Q  303 gctctaggacatgagtcctc 322  Q
    | || |||||||||||||||    
T  8574 gttccaggacatgagtcctc 8593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 17137 - 17054
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  17137 agactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctc-ccgctaatgaatggttaaagcattcat 17054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 19601 - 19462
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcacc-gcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagct 280  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| | | |  ||||     
T  19601 agactcctcaacaaatgcgactatgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcattagggcttaagcc 19502  T
Q  281 ctcaccgctgtgaacaacta-gtgctctaggacatgagtc 319  Q
     | |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  19501 tttaccgctttgaacaacaatgtgttctaggacatgagtc 19462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 41815 - 41732
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  41815 agactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctc-ccgctaatgaatggttaaagcattcat 41732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 41633 - 41588
Alignment:
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41633 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 41588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 57554 - 57449
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactc 146  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||  |||| |   ||||||||| |||| |||||||||  | | |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  57554 aatctaacaccctaacataataataattcatcaatatataaatatatcatcattaaccacatcaacaataaacggtaattataaccaacaacatcgactc 57455  T
Q  147 atgcaa 152  Q
    ||||||    
T  57454 atgcaa 57449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Original strand, 141079 - 141184
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactc 146  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||  |||| |   ||||||||| |||| |||||||||  | | |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  141079 aatctaacaccctaacataataataattcatcaatatataaatatatcatcattaaccacatcaacaataaacggtaattataaccaacaacatcgactc 141178  T
Q  147 atgcaa 152  Q
    ||||||    
T  141179 atgcaa 141184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0664 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0664
Description:

Target: scaffold0664; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 139
Target Start/End: Original strand, 8285 - 8377
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaaca 139  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||  |||   ||| || |||||||||| || ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  8285 aatctaacaccttatcataataataatttatcaacatatataaatatcatcattatcaacatcaacaacaaatggtaattaaaaccaacaaca 8377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 375
Target Start/End: Original strand, 5864 - 6034
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaacta-gt 302  Q
    |||||||||||||||    ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |  |||| ||||||  | |||||||| | ||    
T  5864 atgcatgtggtaccattttacagggcagaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattc-tcaaggcataagccctcaccaatttgaacaacaaggt 5962  T
Q  303 gctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    | || ||| |||||| |||| ||||  ||||||  ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  5963 gttccagggcatgagccctcaccgc--tttatgtttatgccatggactcaacttgtgtatatctacatacaact 6034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 375
Target Start/End: Original strand, 8016 - 8186
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaacta-gt 302  Q
    |||||||||||||||    ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |  |||| ||||||  | |||||||| | ||    
T  8016 atgcatgtggtaccattttacagggcagaagccctcaccgaatttgaatggttaaagcattc-tcaaggcataagccctcaccaatttgaacaacaaggt 8114  T
Q  303 gctctaggacatgagtcctctccgctgtttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    | || ||| |||||| |||| ||||  ||||||  ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  8115 gttccagggcatgagccctcaccgc--tttatgtttatgccatggactcaacttgtgtatatctacatacaact 8186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Original strand, 20659 - 20765
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccaca-tggtaattagaaccaacaacaacgact 145  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||   ||| || |||||||||| || ||||||||||| || | |||  |||| |||| |||||| |||||    
T  20659 aatctaacaccctatcataataataaatcatcaacatatataaatatcatcattaccaacatcaacaacaaattggcgattaaaacccacaacatcgact 20758  T
Q  146 catgcaa 152  Q
    |||||||    
T  20759 catgcaa 20765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1299 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold1299
Description:

Target: scaffold1299; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 366 - 284
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    |||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  366 agactcctcgacaaatgcaattatgcatgtggtaccatgttcaggaccgtagcccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1299; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 184 - 139
Alignment:
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  184 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0535 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0535
Description:

Target: scaffold0535; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 6208 - 6146
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  6208 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 6146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 322
Target Start/End: Original strand, 8280 - 8355
Alignment:
Q  247 ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||| |||||||  |||| || ||||||||| |||||    
T  8280 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacatgactcctc 8355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 322
Target Start/End: Original strand, 18364 - 18439
Alignment:
Q  247 ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||| |||||||  |||| || ||||||||| |||||    
T  18364 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgctttgaacaataagtgttccaggacatgactcctc 18439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 14673 - 14611
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14673 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 14611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 330 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 14513 - 14469
Alignment:
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 374  Q
    ||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14513 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 14469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 5184 - 5122
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  5184 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 5122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 185 - 321
Target Start/End: Original strand, 27972 - 28113
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcacc-gcttttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagct 280  Q
    ||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||| | | |||||  |||||||||||||| | | |  ||||     
T  27972 agactcctcaacaaatgcgacaatgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaactgttaaagcattcattagggcataagcc 28071  T
Q  281 ctcaccgctgtgaacaact-agtgctctaggacatgagtcct 321  Q
    ||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  28072 ctcgccgctttgaacaactaagtgttccaggacatgagtcct 28113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 322
Target Start/End: Original strand, 9281 - 9356
Alignment:
Q  247 ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || |||| ||||||||| |||||||  |||| || || ||||||||||||    
T  9281 ttgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccctcaccgctttgaacaataagtgttccagaacatgagtcctc 9356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 103127 - 103045
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  103127 agactcctcgataattgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcacttctttcgaatggttaaagcattc 103045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 322
Target Start/End: Original strand, 1285 - 1405
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaacta-g 301  Q
    ||||||||||||||||   ||| | | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||| |||||||| | |    
T  1285 atgcatgtggtaccaatttacaaggcagaagccctcaccgtatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaacaagg 1384  T
Q  302 tgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    || || |||||||||||||||    
T  1385 tgttccaggacatgagtcctc 1405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0811 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0811
Description:

Target: scaffold0811; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 151 - 117
Alignment:
Q  187 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  151 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 322
Target Start/End: Original strand, 2868 - 2988
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaacta-g 301  Q
    ||||||||||||||||   | ||||| | |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | || ||||  |||||||| |||||||| | |    
T  2868 atgcatgtggtaccaatttataggacagtagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcctaagccttcaccgctttgaacaacaagg 2967  T
Q  302 tgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    || || |||||||||||||||    
T  2968 tgttccaggacatgagtcctc 2988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 172131 - 172023
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataata---catctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacga 143  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||   ||||  |||| || |||||||||| |  ||||||||||| || | |||||||| ||||||||||  | |    
T  172131 aatctaacaccctatcataataataataattcatcaatatatataaatatcatcattttcaacatcaacaacaaacggtaattaaaaccaacaacttcaa 172032  T
Q  144 ctcatgcaa 152  Q
    |||||||||    
T  172031 ctcatgcaa 172023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1615 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1615
Description:

Target: scaffold1615; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 197 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 603 - 532
Alignment:
Q  197 aaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  603 aaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctc-ccgctaatgaatggttaaagcattcat 532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1426 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1426
Description:

Target: scaffold1426; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 54 - 1
Alignment:
Q  132 caacaacaacgactcatgcaaatgatatgccaaaactgctaagacaacacctta 185  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  54 caacaactaagactcatgcaaatgacatgacaacactgctaagacaacacctta 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 198 - 322
Target Start/End: Original strand, 6117 - 6245
Alignment:
Q  198 aatgcaaatatgcatgtggtaccaa--acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaa 294  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  ||||| | ||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||| ||||    
T  6117 aatgcaataatgcatgtggtaccaattacagggcagaaaccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaa 6216  T
Q  295 caacta-gtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    |||| | ||| |  |||||||||||||||    
T  6217 caacaaggtgttacaggacatgagtcctc 6245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 332 - 375
Target Start/End: Original strand, 6293 - 6337
Alignment:
Q  332 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  6293 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 6337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0343 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:

Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 335 - 254
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||  | |||||||||| || | | |||||||||||||||||    
T  335 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtgggaccataacagagctgaagccctcatcgttatagaatggttaaagcattc 254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 51148 - 51088
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  51148 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattc 51088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 330 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 50988 - 50948
Alignment:
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacata 370  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  50988 tttatgcttatgcaactgacctacttgtgtatatctacata 50948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 80632 - 80551
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |  | | |||||||||||||||||    
T  80632 agactcctcaacaattgcaactatgcatgtggtaccataacagagccgaagccctcatctttatagaatggttaaagcattc 80551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 92332 - 92251
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||  ||||||| |||| || | | |||||||||||||||||    
T  92332 agactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccatatcagagccgaagctctcatcgttatagaatggttaaagcattc 92251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 98058 - 97977
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca-aacaggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||  ||||||| |||| || | | |||||||||||||||||    
T  98058 agactcctcaacaaatgcaattatgcatgtggtaccatatcagagccgaagctctcatcgttatagaatggttaaagcattc 97977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0693 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0693
Description:

Target: scaffold0693; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 2016 - 2099
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  2016 agactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattc 2099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 1280 - 1197
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  1280 agactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattc 1197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 8216 - 8133
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  8216 agactcctcgacaaatgcaactatgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattc 8133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 1535 - 1469
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatca 269  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  1535 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattcatca 1469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 191 - 97
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaa 297  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||| |||||||    
T  191 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaacaa 97  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 101 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 290 - 240
Alignment:
Q  101 aacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    |||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  290 aacaacatcaacaaaa-atggtaattacaaccaacaacaacgactcatgcaa 240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 152
Target Start/End: Original strand, 45402 - 45453
Alignment:
Q  100 taacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45402 taacaacatcaacaata-atggtaattacaaccaacaacaacgactcatgcaa 45453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 27861 - 27924
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  27861 atgcatgtggtaccataatcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 27924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1290 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold1290
Description:

Target: scaffold1290; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 101 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 1544 - 1494
Alignment:
Q  101 aacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    |||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1544 aacaacatcaacaata-atggtaattacaaccaacaacaacgactcatgcaa 1494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1290; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 1447 - 1381
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatca 269  Q
    ||||||||||||||||   | ||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  1447 atgcatgtggtaccaatttatagggcagaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattcatca 1381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 185 - 265
Target Start/End: Original strand, 2544 - 2626
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  2544 agactcctcgataaatgcaactatgcatgtggtaccataatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 2626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 101 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 1189 - 1139
Alignment:
Q  101 aacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    |||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1189 aacaacatcaacaaaa-atggtaattacaaccaacaacaacgactcatgcaa 1139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 1090 - 1024
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatca 269  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  1090 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatca 1024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 10341 - 10403
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  10341 atgcatgtggtaccataatcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 10403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 187 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 9829 - 9748
Alignment:
Q  187 actcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtaccaaa---caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |   |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  9829 actcctcaataaatgcaattatgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 9748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 247 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 17564 - 17489
Alignment:
Q  247 ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaactagtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||| ||| |||||||  |||| || |||||||||||||||    
T  17564 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcactgctttgaacaataagtgttccaggacatgagtcctc 17489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 101 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 208061 - 208011
Alignment:
Q  101 aacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactcatgcaa 152  Q
    |||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  208061 aacaacatcaacaata-atggtaattacaaccaacaacaacgactcatgcaa 208011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 207964 - 207898
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatca 269  Q
    ||||||||||||||||   | ||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  207964 atgcatgtggtaccaatttatagggcagaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattcatca 207898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 8350 - 8244
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaac-accacatggtaattagaaccaacaacaacgact 145  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||| |  || ||||||| || |||||||||| || | |||||||||| | |||||| |  |||||    
T  8350 aatctaacaccctatcataataataattcatcaatatacaaaaacatcatcattatcaacatcaacaacaaaatggtaattaaagccaacatcttcgact 8251  T
Q  146 catgcaa 152  Q
    |||||||    
T  8250 catgcaa 8244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 322
Target Start/End: Original strand, 9372 - 9449
Alignment:
Q  247 ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaact--agtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||||||| |||| || |  |||| ||||||||||||||||||    
T  9372 ttgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcaccgctttgaaaaattaaagtgttctaggacatgagtcctc 9449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 324
Target Start/End: Original strand, 76714 - 76837
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaact--a 300  Q
    ||||||||||||||||   ||| | | |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||   |  |||| ||||||||| ||||||| |  |    
T  76714 atgcatgtggtaccaatttacaaggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagagcataagccctcaccgctttgaacaattaaa 76813  T
Q  301 gtgctctaggacatgagtcctctc 324  Q
    ||| || |||||||||||||||||    
T  76814 gtgttccaggacatgagtcctctc 76837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1853 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1853
Description:

Target: scaffold1853; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 987 - 921
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc--ttttgaatggttaaagcattcatc 268  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  987 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaatttttgaatggttaaagcattcatc 921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 11957 - 11912
Alignment:
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11957 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 11912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 375
Target Start/End: Original strand, 7410 - 7455
Alignment:
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7410 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 7455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 4)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 24517 - 24472
Alignment:
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24517 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 24472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 332 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 10670 - 10626
Alignment:
Q  332 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10670 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 10626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 10839 - 10773
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa--acaggaccgaagccctcaccgc--ttttgaatggttaaagcattcatca 269  Q
    ||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||    
T  10839 atgcatgtggtaccaattacagggcagaagccctcaccgaatttttgaatggttaaaacattcatca 10773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 332 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 18849 - 18805
Alignment:
Q  332 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  18849 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 18805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Original strand, 6451 - 6555
Alignment:
Q  47 aatctaacaccctgtcataataataatacatctctataaatgaatatcatcaataacaacatcaacaccacatggtaattagaaccaacaacaacgactc 146  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||||||   |||||| |  || |||||||||||  | |||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  6451 aatctaacaccctaacataataataattcatcaatataaaaatatatcacctttatcaacatcaacaataaatgg-aattataaccaacaacatcgactc 6549  T
Q  147 atgcaa 152  Q
    ||||||    
T  6550 atgcaa 6555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 6593 - 6656
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  6593 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 6656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 298
Target Start/End: Original strand, 19794 - 19889
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaac 298  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| | |  |||| ||||| ||| ||||||||    
T  19794 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatcagggcataagccctcacggctttgaacaac 19889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 47589 - 47529
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  47589 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgttgtcgaatggttaaagcattc 47529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 56623 - 56563
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  56623 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgttgtcgaatggttaaagcattc 56563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 63009 - 62949
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  63009 atgcatgtggtaccataatcaggaccgtagccctcaccgttgtcgaatggttaaagcattc 62949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 20534 - 20489
Alignment:
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20534 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaact 20489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0924 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0924
Description:

Target: scaffold0924; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 324 - 375
Target Start/End: Original strand, 2410 - 2462
Alignment:
Q  324 ccgctgtttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  2410 ccgctttttatacttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 2462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 322
Target Start/End: Original strand, 443 - 519
Alignment:
Q  247 ttgaatggttaaagcattcatcaagaccgaagctctcaccgctgtgaacaacta-gtgctctaggacatgagtcctc 322  Q
    |||||||||||||||||||| || | |  |||| ||||||||| |||||||| | ||| || |||||||||||||||    
T  443 ttgaatggttaaagcattcaccagggcataagccctcaccgctttgaacaacaaggtgttccaggacatgagtcctc 519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 5513 - 5576
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgct-tttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  5513 atgcatgtggtaccatattcagggccgaagccctcaccgctaattgaattgttaaagcattcat 5576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0609 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0609
Description:

Target: scaffold0609; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 48 - 12
Alignment:
Q  185 agactcctcaataaatgcaaatatgcatgtggtacca 221  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  48 agactcctcaacaaatgcaactatgcatgtggtacca 12  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 330 - 377
Target Start/End: Original strand, 19439 - 19487
Alignment:
Q  330 tttatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaactga 377  Q
    ||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  19439 tttatgcttatgcaatgaactccacttgtgtatatctacatacaactga 19487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 265
Target Start/End: Original strand, 9523 - 9585
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattc 265  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  9523 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccgaattttgaatggttaaagcattc 9585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 11796 - 11730
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcatca 269  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  11796 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcaccggatattgaatggttaaagcattcatca 11730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 22889 - 22823
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatca 269  Q
    ||||||||||||||||   ||||| |  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  22889 atgcatgtggtaccaatttacagggcaaaagccctcaccgagttttgaatggttaaagcattcatca 22823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 332 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 55956 - 55912
Alignment:
Q  332 tatgcatatgcaatggac-ctacttgtgtatatctacatacaact 375  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  55956 tatgcttatgcaatggactccacttgtgtatatctacatacaact 55912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 56124 - 56058
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaa---acaggaccgaagccctcaccgc-ttttgaatggttaaagcattcatca 269  Q
    ||||||||||||||||   ||||| | ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  56124 atgcatgtggtaccaatttacagggcagaagccctcgccgaattttgaatggttaaagcattcatca 56058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 330 - 374
Target Start/End: Original strand, 17638 - 17682
Alignment:
Q  330 tttatgcatatgcaatggacctacttgtgtatatctacatacaac 374  Q
    ||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17638 tttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaac 17682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 44294 - 44231
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  44294 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 44231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 49360 - 49297
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  49360 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 49297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 267
Target Start/End: Original strand, 370396 - 370459
Alignment:
Q  207 atgcatgtggtaccaaa--caggaccgaagccctcaccgctt-ttgaatggttaaagcattcat 267  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  370396 atgcatgtggtaccatattcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcat 370459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University