View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0757_low_8 (Length: 361)

Name: NF0757_low_8
Description: NF0757
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0757_low_8
NF0757_low_8
[»] chr1 (20 HSPs)
chr1 (1-361)||(41394234-41394593)
chr1 (35-361)||(20931357-20931682)
chr1 (35-361)||(20913049-20913367)
chr1 (146-361)||(18601143-18601358)
chr1 (121-361)||(5072388-5072628)
chr1 (35-361)||(20893551-20893877)
chr1 (35-361)||(37844374-37844702)
chr1 (35-361)||(20445691-20446019)
chr1 (35-361)||(20531456-20531783)
chr1 (159-361)||(22227821-22228022)
chr1 (159-361)||(22232518-22232719)
chr1 (146-361)||(2116266-2116481)
chr1 (34-307)||(45051489-45051759)
chr1 (109-256)||(51452608-51452755)
chr1 (2-67)||(21860334-21860399)
chr1 (2-67)||(44034838-44034903)
chr1 (1-101)||(27675086-27675184)
chr1 (2-67)||(41218728-41218793)
chr1 (36-67)||(15861327-15861358)
chr1 (35-67)||(51452809-51452841)
[»] chr6 (28 HSPs)
chr6 (121-361)||(25175575-25175815)
chr6 (121-361)||(27653983-27654223)
chr6 (121-361)||(16825752-16825994)
chr6 (35-361)||(23153459-23153786)
chr6 (36-361)||(14626045-14626369)
chr6 (34-361)||(1650020-1650344)
chr6 (109-361)||(1657748-1657998)
chr6 (109-361)||(35009439-35009690)
chr6 (109-361)||(15862485-15862734)
chr6 (35-104)||(23148266-23148335)
chr6 (2-67)||(19983159-19983224)
chr6 (2-67)||(35015024-35015089)
chr6 (109-305)||(29665941-29666137)
chr6 (2-67)||(18583640-18583705)
chr6 (109-194)||(27751603-27751688)
chr6 (35-67)||(18002395-18002427)
chr6 (35-67)||(23995247-23995279)
chr6 (35-67)||(26090059-26090091)
chr6 (125-209)||(29605612-29605696)
chr6 (36-67)||(4991396-4991427)
chr6 (35-65)||(15742120-15742150)
chr6 (1-51)||(21623506-21623556)
chr6 (35-67)||(1657661-1657693)
chr6 (35-67)||(15862789-15862821)
chr6 (35-67)||(18823283-18823315)
chr6 (35-67)||(18839138-18839170)
chr6 (35-67)||(27751742-27751774)
chr6 (35-67)||(32276659-32276691)
[»] chr5 (32 HSPs)
chr5 (121-361)||(25426640-25426880)
chr5 (121-361)||(12386-12626)
chr5 (121-361)||(19499911-19500151)
chr5 (121-361)||(22366481-22366721)
chr5 (146-361)||(18778017-18778232)
chr5 (121-361)||(21073595-21073835)
chr5 (35-361)||(23506977-23507302)
chr5 (146-361)||(43443420-43443635)
chr5 (35-361)||(27182471-27182798)
chr5 (146-361)||(4200010-4200225)
chr5 (146-361)||(27009853-27010068)
chr5 (35-361)||(22053753-22054084)
chr5 (35-361)||(18530988-18531318)
chr5 (121-321)||(29188284-29188483)
chr5 (109-361)||(34939290-34939540)
chr5 (109-256)||(20623085-20623232)
chr5 (109-256)||(21233528-21233675)
chr5 (111-255)||(25900408-25900552)
chr5 (109-256)||(16536313-16536460)
chr5 (109-256)||(37052860-37053007)
chr5 (2-66)||(11584374-11584438)
chr5 (35-67)||(16105967-16105999)
chr5 (35-67)||(20623286-20623318)
chr5 (35-67)||(21233442-21233474)
chr5 (35-67)||(25900320-25900352)
chr5 (35-67)||(37053061-37053093)
chr5 (125-209)||(29918127-29918212)
chr5 (116-205)||(32950862-32950951)
chr5 (35-67)||(108728-108760)
chr5 (35-67)||(9730278-9730310)
chr5 (35-67)||(16536514-16536546)
chr5 (329-361)||(29190482-29190514)
[»] chr2 (32 HSPs)
chr2 (121-361)||(19886661-19886901)
chr2 (35-361)||(462750-463075)
chr2 (2-361)||(20627205-20627564)
chr2 (2-361)||(19794596-19794955)
chr2 (35-361)||(8891254-8891581)
chr2 (2-361)||(43642848-43643208)
chr2 (35-361)||(36982364-36982692)
chr2 (109-361)||(17396653-17396904)
chr2 (35-361)||(24341309-24341640)
chr2 (109-361)||(25265390-25265641)
chr2 (159-361)||(7507894-7508095)
chr2 (109-256)||(19689401-19689548)
chr2 (35-131)||(22863169-22863267)
chr2 (109-256)||(23820187-23820334)
chr2 (109-256)||(14906440-14906587)
chr2 (109-256)||(20015127-20015274)
chr2 (2-67)||(22275045-22275110)
chr2 (2-67)||(22284278-22284343)
chr2 (2-66)||(15633538-15633602)
chr2 (34-67)||(19689314-19689347)
chr2 (35-67)||(9652796-9652828)
chr2 (35-67)||(14906354-14906386)
chr2 (35-67)||(23820388-23820420)
chr2 (36-67)||(25213372-25213403)
chr2 (126-207)||(68156-68238)
chr2 (1-51)||(43646232-43646282)
chr2 (35-67)||(7507757-7507789)
chr2 (35-67)||(17396567-17396599)
chr2 (35-67)||(20015328-20015360)
chr2 (35-67)||(28031134-28031166)
chr2 (35-101)||(31146073-31146138)
chr2 (35-67)||(33128372-33128404)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (35-358)||(3508-3830)
scaffold0266 (35-361)||(1136-1462)
[»] chr4 (28 HSPs)
chr4 (121-361)||(47357666-47357906)
chr4 (2-361)||(54118135-54118495)
chr4 (35-361)||(13246442-13246769)
chr4 (146-361)||(10644231-10644446)
chr4 (35-273)||(121989-122226)
chr4 (109-361)||(13048221-13048473)
chr4 (35-361)||(15675009-15675340)
chr4 (35-305)||(10104170-10104445)
chr4 (136-361)||(31115641-31115865)
chr4 (109-361)||(26680213-26680463)
chr4 (109-256)||(10488678-10488825)
chr4 (109-256)||(16327926-16328073)
chr4 (35-172)||(33240900-33241043)
chr4 (2-67)||(25119074-25119139)
chr4 (276-361)||(111407-111492)
chr4 (125-305)||(40885570-40885749)
chr4 (35-141)||(31132545-31132657)
chr4 (2-67)||(5682395-5682460)
chr4 (35-67)||(14952085-14952117)
chr4 (35-67)||(15135907-15135939)
chr4 (35-67)||(15272211-15272243)
chr4 (35-67)||(16327840-16327872)
chr4 (35-67)||(16609013-16609045)
chr4 (35-67)||(26680517-26680549)
chr4 (126-207)||(15044992-15045074)
chr4 (1-67)||(41165815-41165881)
chr4 (35-67)||(8045272-8045304)
chr4 (35-67)||(16523146-16523178)
[»] chr7 (41 HSPs)
chr7 (2-361)||(3059978-3060336)
chr7 (121-361)||(10989422-10989661)
chr7 (35-361)||(16211778-16212103)
chr7 (146-361)||(2437469-2437684)
chr7 (35-361)||(13036938-13037265)
chr7 (35-361)||(11580661-11580990)
chr7 (35-361)||(36052679-36053003)
chr7 (146-361)||(13911049-13911265)
chr7 (146-361)||(13572688-13572903)
chr7 (109-361)||(25292338-25292589)
chr7 (116-361)||(18253842-18254086)
chr7 (109-361)||(47481031-47481282)
chr7 (146-361)||(16478987-16479201)
chr7 (109-361)||(7293029-7293279)
chr7 (109-256)||(11516343-11516490)
chr7 (109-256)||(15441564-15441711)
chr7 (109-256)||(30262129-30262276)
chr7 (110-361)||(13321026-13321278)
chr7 (2-67)||(32493913-32493978)
chr7 (6-67)||(126738-126799)
chr7 (2-67)||(1936884-1936949)
chr7 (37-230)||(295893-296087)
chr7 (2-67)||(111136-111201)
chr7 (1-101)||(13377819-13377917)
chr7 (2-66)||(7283923-7283987)
chr7 (35-67)||(2029244-2029276)
chr7 (35-67)||(7293333-7293365)
chr7 (35-67)||(11516544-11516576)
chr7 (35-67)||(14113903-14113935)
chr7 (35-67)||(15441478-15441510)
chr7 (35-104)||(15709428-15709501)
chr7 (35-67)||(30262043-30262075)
chr7 (35-67)||(42056188-42056220)
chr7 (126-207)||(13377693-13377775)
chr7 (1-51)||(13389693-13389743)
chr7 (35-67)||(371417-371449)
chr7 (35-67)||(3049905-3049937)
chr7 (35-67)||(13321334-13321366)
chr7 (39-67)||(15516765-15516793)
chr7 (35-67)||(25124450-25124482)
chr7 (35-67)||(47480944-47480976)
[»] chr3 (54 HSPs)
chr3 (35-361)||(14842487-14842812)
chr3 (121-361)||(55316231-55316471)
chr3 (35-361)||(13838906-13839232)
chr3 (35-361)||(2049822-2050147)
chr3 (35-361)||(12030073-12030398)
chr3 (121-361)||(41270087-41270327)
chr3 (1-256)||(16744007-16744262)
chr3 (146-361)||(16821151-16821366)
chr3 (99-361)||(51158008-51158269)
chr3 (109-361)||(13975722-13975973)
chr3 (72-361)||(15858986-15859275)
chr3 (109-361)||(45860817-45861068)
chr3 (109-361)||(13954890-13955141)
chr3 (116-361)||(15936634-15936878)
chr3 (116-361)||(15938476-15938720)
chr3 (2-172)||(19231981-19232154)
chr3 (34-361)||(15614846-15615170)
chr3 (109-361)||(17912483-17912732)
chr3 (35-155)||(19260749-19260869)
chr3 (109-256)||(2449238-2449385)
chr3 (2-67)||(3992873-3992938)
chr3 (1-70)||(15857129-15857198)
chr3 (2-67)||(55513193-55513258)
chr3 (2-67)||(2844514-2844579)
chr3 (12-67)||(17955861-17955916)
chr3 (2-67)||(54037991-54038056)
chr3 (6-67)||(45581954-45582016)
chr3 (2-67)||(7854305-7854370)
chr3 (125-209)||(4145814-4145898)
chr3 (35-67)||(2449152-2449184)
chr3 (35-67)||(16261777-16261809)
chr3 (35-67)||(16933869-16933901)
chr3 (35-67)||(17912398-17912430)
chr3 (35-67)||(23492696-23492728)
chr3 (35-67)||(38168237-38168269)
chr3 (35-67)||(53771365-53771397)
chr3 (1-51)||(17205019-17205069)
chr3 (1-67)||(38810875-38810941)
chr3 (116-205)||(11986173-11986262)
chr3 (125-166)||(14080715-14080756)
chr3 (1-66)||(15550922-15550987)
chr3 (260-361)||(47984662-47984763)
chr3 (260-361)||(47993949-47994050)
chr3 (260-361)||(48003236-48003337)
chr3 (260-361)||(48012522-48012623)
chr3 (35-67)||(11986080-11986112)
chr3 (1-49)||(12031849-12031897)
chr3 (35-67)||(13954804-13954836)
chr3 (35-67)||(14285289-14285321)
chr3 (35-67)||(19947026-19947058)
chr3 (35-67)||(30153265-30153297)
chr3 (35-67)||(33342204-33342236)
chr3 (35-67)||(45861122-45861154)
chr3 (35-67)||(51961031-51961063)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (35-361)||(48610-48935)
scaffold0023 (146-361)||(36105-36320)
scaffold0023 (35-67)||(61122-61154)
[»] chr8 (33 HSPs)
chr8 (35-361)||(16193643-16193967)
chr8 (121-361)||(30120734-30120974)
chr8 (35-361)||(43373392-43373719)
chr8 (183-361)||(222753-222931)
chr8 (183-361)||(736376-736554)
chr8 (183-361)||(860271-860449)
chr8 (35-361)||(24928716-24929042)
chr8 (121-361)||(16674392-16674632)
chr8 (146-361)||(21844597-21844812)
chr8 (146-361)||(21851990-21852205)
chr8 (2-361)||(16404867-16405223)
chr8 (121-361)||(6774258-6774497)
chr8 (121-361)||(24548994-24549233)
chr8 (109-361)||(17345582-17345832)
chr8 (109-361)||(22907214-22907464)
chr8 (109-256)||(5238203-5238350)
chr8 (109-256)||(24661248-24661395)
chr8 (109-256)||(43685662-43685809)
chr8 (183-245)||(691908-691970)
chr8 (2-67)||(274766-274831)
chr8 (2-67)||(641018-641083)
chr8 (2-67)||(826824-826889)
chr8 (2-67)||(24716729-24716794)
chr8 (2-67)||(39115598-39115663)
chr8 (35-67)||(5238404-5238436)
chr8 (35-67)||(22907128-22907160)
chr8 (35-67)||(24385652-24385684)
chr8 (35-67)||(24661162-24661194)
chr8 (35-67)||(43685863-43685895)
chr8 (35-67)||(2545265-2545297)
chr8 (35-67)||(3431176-3431208)
chr8 (35-67)||(22886654-22886686)
chr8 (126-166)||(38533855-38533895)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (35-361)||(5990-6314)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (35-361)||(882-1206)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (35-361)||(8890-9215)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (35-361)||(171917-172242)
scaffold0001 (35-361)||(177620-177945)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (35-361)||(247366-247693)
scaffold0012 (35-67)||(34075-34107)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (35-361)||(12127-12450)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (35-361)||(41741-42066)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (45-361)||(4996-5312)
[»] scaffold0162 (3 HSPs)
scaffold0162 (35-358)||(26340-26663)
scaffold0162 (109-256)||(8180-8327)
scaffold0162 (1-51)||(6884-6934)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (146-361)||(43009-43224)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (34-361)||(36836-37164)
scaffold0077 (2-66)||(15334-15398)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (38-361)||(19218-19543)
scaffold0195 (109-361)||(21302-21553)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (35-361)||(272037-272362)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (35-361)||(128095-128419)
scaffold0008 (146-361)||(31700-31916)
[»] scaffold0772 (2 HSPs)
scaffold0772 (116-349)||(5552-5785)
scaffold0772 (35-67)||(5846-5878)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (35-361)||(123087-123415)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (146-361)||(47-262)
scaffold0116 (2-67)||(30417-30482)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (177-361)||(64584-64768)
scaffold0026 (116-361)||(107759-108003)
scaffold0026 (124-166)||(89863-89905)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (37-255)||(51110-51328)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (116-361)||(48199-48443)
scaffold0049 (6-66)||(20493-20553)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (146-361)||(21141-21355)
scaffold0139 (146-361)||(14086-14300)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (83-361)||(148733-149012)
scaffold0025 (35-361)||(8861-9192)
scaffold0025 (35-130)||(146843-146938)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (35-255)||(89378-89600)
scaffold0028 (35-160)||(107708-107835)
scaffold0028 (36-67)||(130880-130911)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (146-361)||(9374-9588)
scaffold0215 (146-361)||(16272-16486)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (159-361)||(5254-5454)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (159-361)||(3734-3936)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (121-267)||(1304-1450)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (109-360)||(534-784)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (109-361)||(34460-34712)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (120-361)||(2974-3215)
[»] scaffold0132 (3 HSPs)
scaffold0132 (109-242)||(13636-13769)
scaffold0132 (2-67)||(42677-42739)
scaffold0132 (35-67)||(13824-13856)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (109-361)||(41660-41911)
scaffold0125 (35-75)||(41957-41997)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (146-277)||(13350-13480)
[»] scaffold0078 (3 HSPs)
scaffold0078 (109-361)||(37066-37316)
scaffold0078 (2-67)||(41632-41697)
scaffold0078 (35-67)||(36980-37012)
[»] scaffold0141 (4 HSPs)
scaffold0141 (109-256)||(26911-27058)
scaffold0141 (116-256)||(22656-22796)
scaffold0141 (35-67)||(22857-22889)
scaffold0141 (35-67)||(27112-27144)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (109-256)||(1582-1729)
scaffold0124 (35-67)||(1496-1528)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (267-361)||(9-103)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (267-361)||(48526-48620)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (2-67)||(80187-80252)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (2-68)||(162045-162111)
scaffold0016 (2-68)||(166131-166197)
scaffold0016 (1-67)||(116417-116483)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (2-67)||(5744-5809)
scaffold0686 (2-67)||(5950-6015)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (2-67)||(31147-31212)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (276-361)||(9394-9479)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (2-68)||(319-385)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (109-202)||(3360-3453)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (2-66)||(1701-1765)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (2-66)||(94-158)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (2-66)||(19817-19881)
scaffold0122 (6-66)||(24125-24185)
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (2-66)||(6271-6335)
scaffold0310 (29-66)||(4-41)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (1-67)||(1370-1436)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (116-205)||(56106-56195)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (125-166)||(70307-70348)
scaffold0058 (35-67)||(57392-57424)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (34-67)||(193396-193429)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (35-67)||(6443-6475)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (35-67)||(878-910)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (35-67)||(9882-9914)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (35-67)||(13285-13317)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (35-67)||(55904-55936)
scaffold0032 (35-67)||(108075-108107)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (35-78)||(18015-18058)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (125-207)||(8174-8257)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (126-207)||(2317-2399)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (159-205)||(45198-45244)
scaffold0066 (35-67)||(45338-45370)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (1-51)||(35816-35866)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (35-67)||(17209-17241)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (35-67)||(5476-5508)
[»] scaffold0303 (1 HSPs)
scaffold0303 (35-67)||(4346-4378)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (35-67)||(17304-17336)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (35-67)||(5549-5581)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (35-67)||(34308-34340)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (35-67)||(12418-12450)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 20)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 41394593 - 41394234
Alignment:
Q  1 taaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41394593 taaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaa 41394494  T
Q  101 ttttgattatggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||| ||||    
T  41394493 ttttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaagttac 41394394  T
Q  201 atgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatg 300  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||  ||||| | ||||||||| |||| ||    
T  41394393 atgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttatgttgagatttgattcttgctcaattg 41394295  T
Q  301 atgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    |||||||   ||||||||||| || |  ||||||||| | || ||||||||||||||||||    
T  41394294 atgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgattgggtatgcatattcat 41394234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 35 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 20931682 - 20931357
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtac 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  20931682 taaggtaagggggttagcctttatcataatcatcctcattttgcaaattttcaattgttgtatgaagtttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 20931583  T
Q  135 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 234  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  20931582 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaa 20931483  T
Q  235 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 334  Q
    |||||||||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||    
T  20931482 attgtgctaaattggtgaattt-tgctaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatg 20931384  T
Q  335 aataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||    
T  20931383 aataatttcttgggtatgcatattcat 20931357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 35 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 20913367 - 20913049
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |    
T  20913367 taaggtaagggggttagtctttatcgtaatcatcctcattttgcaaattttcaattgttgtatgaattttgcttacggataattgttgctaaattcgtgc 20913268  T
Q  135 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 234  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  20913267 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaa 20913168  T
Q  235 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 334  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | | |||||||||||||||       |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||    
T  20913167 attgtgctcaattggtgaattt-tgcaaagttgttgttaatt-------tgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatcttgtggttgatg 20913076  T
Q  335 aataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  20913075 aataattgcttgggtatgcatattcat 20913049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 146 - 361
Target Start/End: Original strand, 18601143 - 18601358
Alignment:
Q  146 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  18601143 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaa 18601242  T
Q  246 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 345  Q
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  18601243 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgctt 18601342  T
Q  346 gggtatgcatattcat 361  Q
    |||| |||||||||||    
T  18601343 gggtttgcatattcat 18601358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 121 - 361
Target Start/End: Original strand, 5072388 - 5072628
Alignment:
Q  121 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 220  Q
    |||||||||||| |||   || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5072388 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 5072487  T
Q  221 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 320  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5072488 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 5072587  T
Q  321 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5072588 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcat 5072628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 35 - 361
Target Start/End: Original strand, 20893551 - 20893877
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 132  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||| |    
T  20893551 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaa-ttttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattctt 20893649  T
Q  133 actccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 232  Q
     |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||    
T  20893650 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgttgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 20893749  T
Q  233 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 332  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  |||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||    
T  20893750 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgatttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttga 20893848  T
Q  333 tgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  20893849 tgaatcattgtttgggtatgcatattcat 20893877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 35 - 361
Target Start/End: Original strand, 37844374 - 37844702
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||| |    
T  37844374 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcat 37844473  T
Q  133 actccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtta-tg 231  Q
     ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  || | | |||||||||  || ||    
T  37844474 gctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataaaatagtg 37844573  T
Q  232 aagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 331  Q
    || |||||||| ||    ||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||    
T  37844574 aaaattgtgctcaattaatgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttg 37844672  T
Q  332 atgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  37844673 atgagtcattgcttgggtatgcatattcat 37844702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 35 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 20446019 - 20445691
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 131  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  20446019 taaggtaagggagttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 20445920  T
Q  132 tactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 231  Q
    | |||||| | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  || | | |||||||||||  ||    
T  20445919 tgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtg 20445820  T
Q  232 aagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 331  Q
    || |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  |||    
T  20445819 aaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttg 20445721  T
Q  332 atgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20445720 atgaatcattgcttgggtatgcatattcat 20445691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 20531783 - 20531456
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 132  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  20531783 taaggtaaggaaattagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 20531684  T
Q  133 actccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 232  Q
     |||||| | || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  || | | |||||||||||  |||    
T  20531683 gctccaaatgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtga 20531584  T
Q  233 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 332  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||    
T  20531583 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttga 20531485  T
Q  333 tgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20531484 tgaatcattgcttgggtatgcatattcat 20531456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 159 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 22228022 - 22227821
Alignment:
Q  159 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttct 258  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||   ||  | ||||||| |    
T  22228022 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattt-t 22227924  T
Q  259 cctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatatt 358  Q
     ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22227923 gctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatatt 22227824  T
Q  359 cat 361  Q
    |||    
T  22227823 cat 22227821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 159 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 22232719 - 22232518
Alignment:
Q  159 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttct 258  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||   ||  | ||||||| |    
T  22232719 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgtccaattgttgaattt-t 22232621  T
Q  259 cctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatatt 358  Q
     ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22232620 gctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatatt 22232521  T
Q  359 cat 361  Q
    |||    
T  22232520 cat 22232518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 146 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 2116481 - 2116266
Alignment:
Q  146 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||    
T  2116481 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaa 2116382  T
Q  246 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttga-gttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgct 344  Q
      ||||||||| | ||||||| ||||||||||||  || ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||| ||||||    
T  2116381 ttggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgatattttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgct 2116283  T
Q  345 tgggtatgcatattcat 361  Q
    |||||||||||||||||    
T  2116282 tgggtatgcatattcat 2116266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 45051759 - 45051489
Alignment:
Q  34 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |  |||||  ||||||||||||  | | || ||| |  |||  ||||| ||||||    
T  45051759 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatg-tgattttgca--ttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgt 45051663  T
Q  133 actccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 232  Q
      ||  ||| || ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  45051662 gttcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 45051563  T
Q  233 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttat 307  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||| | ||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||    
T  45051562 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttat 45051489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 109 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 51452755 - 51452608
Alignment:
Q  109 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  51452755 atggataattgttgctaaattcgtgcttcaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 51452656  T
Q  209 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 256  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  51452655 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 51452608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 21860399 - 21860334
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21860399 aaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 21860334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Original strand, 44034838 - 44034903
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44034838 aaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 44034903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 27675184 - 27675086
Alignment:
Q  1 taaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaa 100  Q
    |||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |  |  |  ||||||||||||| |||||||||||    
T  27675184 taaagtgaagcttgggctaggaattggagataattaaggtaagggggttagaatttatcataatcgt--ttttagtgtaaattttcaattgttgtatgaa 27675087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 41218793 - 41218728
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  41218793 aaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcatgatcat 41218728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 36 - 67
Target Start/End: Original strand, 15861327 - 15861358
Alignment:
Q  36 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15861327 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15861358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 51452841 - 51452809
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51452841 taaggtaagggggttagtctttatcttaatcat 51452809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 28)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 121 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 25175815 - 25175575
Alignment:
Q  121 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 220  Q
    |||||||||||| |||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175815 tgctaaattcgtgctcttgctgtgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 25175716  T
Q  221 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175715 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 25175616  T
Q  321 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175615 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 25175575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 121 - 361
Target Start/End: Original strand, 27653983 - 27654223
Alignment:
Q  121 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 220  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27653983 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 27654082  T
Q  221 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27654083 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttccaatgatgttatgaatgttatttga 27654182  T
Q  321 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27654183 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 27654223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 121 - 361
Target Start/End: Original strand, 16825752 - 16825994
Alignment:
Q  121 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgta--taattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaa 218  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16825752 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtaattaattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaa 16825851  T
Q  219 atgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttattt 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16825852 atgataagttatgaagattgtgctaaattggtggatttctcctaatttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatct 16825951  T
Q  319 gatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16825952 gatattatgattgatgaataattgctttgttatgcatattcat 16825994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 35 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 23153786 - 23153459
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 132  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||| ||||||||||    
T  23153786 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgtttctaaattcgt 23153687  T
Q  133 actccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 232  Q
     |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||    
T  23153686 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 23153587  T
Q  233 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 332  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||| ||||| || || ||||    
T  23153586 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatattatggctgttaattgatgttgtggttga 23153488  T
Q  333 tgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    ||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  23153487 tgaatcattacttgggtatacatattcat 23153459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 36 - 361
Target Start/End: Original strand, 14626045 - 14626369
Alignment:
Q  36 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtact 135  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||| |||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  14626045 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatcttcactttacaaattctcaaatgttgtttgaattgtgattatggataattattgctaaattcgtgct 14626144  T
Q  136 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 235  Q
    |   || || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  14626145 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaa 14626244  T
Q  236 ttgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 335  Q
    |||||   ||  |||||| || | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  |||||||    
T  14626245 ttgtgtgcaattggtgaa-ttatgctaagttgttgttaacttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatga 14626343  T
Q  336 ataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  14626344 atcattgcttgggtatgcatattcat 14626369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 34 - 361
Target Start/End: Original strand, 1650020 - 1650344
Alignment:
Q  34 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |  |||||  ||||||||||||  | | || ||| |  |||  ||||| ||||||    
T  1650020 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatg-taattttgca--ttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgt 1650116  T
Q  133 actccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 232  Q
     |||  ||| || ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||    
T  1650117 gctcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaagaatgataagttgtga 1650216  T
Q  233 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 332  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||| | ||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| || |  ||||    
T  1650217 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttga 1650315  T
Q  333 tgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  1650316 tgaatcactgcttgggtatgcatattcat 1650344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 109 - 361
Target Start/End: Original strand, 1657748 - 1657998
Alignment:
Q  109 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  1657748 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 1657847  T
Q  209 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 308  Q
     |||| |||||||  |||||||||| |||||||| ||  | || |||| | ||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||  |||||||||     
T  1657848 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattgtgaa-ttgagttatgattcttgttcagttgatgttatt 1657945  T
Q  309 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  1657946 gttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcat 1657998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 109 - 361
Target Start/End: Original strand, 35009439 - 35009690
Alignment:
Q  109 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  35009439 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 35009538  T
Q  209 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 308  Q
     |||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||| ||||||||| | ||  | || ||  | ||||||| ||||||| |     
T  35009539 ttatgtaaaaatgtgaagttttgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 35009637  T
Q  309 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35009638 gttgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcat 35009690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 109 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 15862734 - 15862485
Alignment:
Q  109 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 208  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  15862734 atggataattgttactaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 15862635  T
Q  209 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 308  Q
     |||| | |||||  |||||||||| |||||||| ||  | || |||| | ||||||| |||| || ||||||| |||||||||||| | | |||||||     
T  15862634 ttatgtataaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattgtgaa-ttgagttatgattcttgttc-atttatgttatt 15862538  T
Q  309 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
      || || ||||| || |  ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  15862537 gctgataattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcat 15862485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 35 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 23148335 - 23148266
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23148335 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 23148266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Original strand, 19983159 - 19983224
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19983159 aaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 19983224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Original strand, 35015024 - 35015089
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35015024 aaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 35015089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 29666137 - 29665941
Alignment:
Q  109 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatg-ttca 207  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||| | || || |||||| ||  |||| ||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  29666137 atggataattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttca 29666038  T
Q  208 ta-tatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 305  Q
     | |||||| |||||  |||||||||| ||||| || ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  29666037 aagtatgcataaatgtcaagttatgaa-attgtactcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaaatgagatatgattcatgttcaattgatgtt 29665941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 18583705 - 18583640
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18583705 aaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 18583640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 27751688 - 27751603
Alignment:
Q  109 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtga 194  Q
    |||||| | ||| ||||||||||| ||| || | || |||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||    
T  27751688 atggataaatgtagctaaattcgtgctctaattgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgacaattgtatgattgttggtga 27751603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 18002395 - 18002427
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18002395 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 18002427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 23995279 - 23995247
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23995279 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23995247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 26090091 - 26090059
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26090091 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 26090059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29605696 - 29605612
Alignment:
Q  125 aaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 209  Q
    |||||||| ||| || |||| || |||||||| |||||||||||  || || ||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  29605696 aaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcata 29605612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 36 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 4991427 - 4991396
Alignment:
Q  36 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4991427 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 4991396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 65
Target Start/End: Original strand, 15742120 - 15742150
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatc 65  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15742120 taaggtaagggggttagtctttatcataatc 15742150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 21623556 - 21623506
Alignment:
Q  1 taaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 51  Q
    |||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21623556 taaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 21623506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 1657661 - 1657693
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1657661 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 1657693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 15862821 - 15862789
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15862821 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 15862789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 18823283 - 18823315
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18823283 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 18823315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 18839138 - 18839170
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18839138 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 18839170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 27751774 - 27751742
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27751774 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 27751742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 32276659 - 32276691
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32276659 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 32276691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 32)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 121 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 25426880 - 25426640
Alignment:
Q  121 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 220  Q
    |||||||||||| |||   || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426880 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 25426781  T
Q  221 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426780 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 25426681  T
Q  321 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426680 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 25426640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 121 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 12626 - 12386
Alignment:
Q  121 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 220  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12626 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 12527  T
Q  221 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12526 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 12427  T
Q  321 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12426 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 12386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 121 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 19500151 - 19499911
Alignment:
Q  121 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 220  Q
    |||||||||||| |||   || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19500151 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 19500052  T
Q  221 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19500051 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 19499952  T
Q  321 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  19499951 tattatgattgattaataattgctttggtatgcatattcat 19499911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 121 - 361
Target Start/End: Original strand, 22366481 - 22366721
Alignment:
Q  121 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 220  Q
    |||||||||||| |||   || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366481 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 22366580  T
Q  221 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366581 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 22366680  T
Q  321 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366681 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 22366721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 146 - 361
Target Start/End: Original strand, 18778017 - 18778232
Alignment:
Q  146 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778017 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 18778116  T
Q  246 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 345  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778117 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatattatttgatattatgattgatgaataattgctt 18778216  T
Q  346 gggtatgcatattcat 361  Q
    ||||||||||||||||    
T  18778217 gggtatgcatattcat 18778232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 121 - 361
Target Start/End: Original strand, 21073595 - 21073835
Alignment:
Q  121 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 220  Q
    |||||||||||| |||   || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073595 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 21073694  T
Q  221 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21073695 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttcttctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatcaatgttatttga 21073794  T
Q  321 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073795 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 21073835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 35 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 23507302 - 23506977
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  23507302 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatctccattttgtaagatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 23507203  T
Q  135 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 234  Q
    ||||  | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  23507202 tccatttgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 23507103  T
Q  235 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 334  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||    
T  23507102 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatg 23507004  T
Q  335 aataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  23507003 aataattgcttgggtatgcatattcat 23506977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 146 - 361
Target Start/End: Original strand, 43443420 - 43443635
Alignment:
Q  146 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  43443420 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaa 43443519  T
Q  246 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 345  Q
      ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43443520 ttggtgaatttcttctaagttgttgttgatttgagatgtgagtcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 43443619  T
Q  346 gggtatgcatattcat 361  Q
    |||| |||||||||||    
T  43443620 gggtttgcatattcat 43443635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 35 - 361
Target Start/End: Original strand, 27182471 - 27182798
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 132  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||| |    
T  27182471 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcat 27182570  T
Q  133 actccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 232  Q
     |||||||| || || |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||    
T  27182571 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaactgatgataattgtatgattgttgatgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 27182670  T
Q  233 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 332  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||    
T  27182671 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttga 27182769  T
Q  333 tgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  27182770 tgaatcattgcttgagtatgcatattcat 27182798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 146 - 361
Target Start/End: Original strand, 4200010 - 4200225
Alignment:
Q  146 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  4200010 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctaaa 4200109  T
Q  246 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 345  Q
      |||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4200110 ttggtgaatttctcttatgttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaatgattgctt 4200209  T
Q  346 gggtatgcatattcat 361  Q
    |||| |||||||||||    
T  4200210 gggtttgcatattcat 4200225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 146 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 27010068 - 27009853
Alignment:
Q  146 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| | |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  27010068 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtactcaa 27009969  T
Q  246 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 345  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27009968 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgctt 27009869  T
Q  346 gggtatgcatattcat 361  Q
    |||| |||||||||||    
T  27009868 gggtttgcatattcat 27009853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 35 - 361
Target Start/End: Original strand, 22053753 - 22054084
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 128  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  22053753 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgaaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 22053852  T
Q  129 tcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtt 228  Q
    |||| |||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||    
T  22053853 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgtatgaattgatgatagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 22053952  T
Q  229 atgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatga 328  Q
     |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |      
T  22053953 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttg 22054051  T
Q  329 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  22054052 ttgatgaatcattgcttgggtctacatattcat 22054084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 35 - 361
Target Start/End: Original strand, 18530988 - 18531318
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatc---atcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaat-tttgattat-ggatgattgttgctaaatt 129  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| || || |||| ||||||||||||||    
T  18530988 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcgtcatcatcattttgcaatttttcaaatgtggtatgaatgtttcataattggataattgttgctaaatt 18531087  T
Q  130 cgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtta 229  Q
    ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||     
T  18531088 cgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttg 18531187  T
Q  230 tgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgat 329  Q
    |||| |||||| | ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  |    
T  18531188 tgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgt 18531286  T
Q  330 tgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  18531287 tgatgaatcattgctcgggtatacatattcat 18531318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 121 - 321
Target Start/End: Original strand, 29188284 - 29188483
Alignment:
Q  121 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 220  Q
    ||||| |||||| |||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  29188284 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 29188383  T
Q  221 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 320  Q
    |||||||| |||| || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  29188384 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattga 29188482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 109 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 34939540 - 34939290
Alignment:
Q  109 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 208  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  34939540 atggataactgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 34939441  T
Q  209 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 308  Q
     |||| |||||||  |||||||||| |||||||| ||  | || |||| | ||||||  |||| || ||||||| |||||||||||||  |||||||||     
T  34939440 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagtcattgtgaa-ttgagttatgattcttgttcagttgatgttatt 34939343  T
Q  309 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  34939342 gctgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcat 34939290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 109 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 20623232 - 20623085
Alignment:
Q  109 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  20623232 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 20623133  T
Q  209 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 256  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  20623132 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 20623085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 109 - 256
Target Start/End: Original strand, 21233528 - 21233675
Alignment:
Q  109 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  21233528 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 21233627  T
Q  209 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 256  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  21233628 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 21233675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 111 - 255
Target Start/End: Original strand, 25900408 - 25900552
Alignment:
Q  111 ggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatat 210  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||| |||||   ||    
T  25900408 ggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggttaaattatatgtttgaat 25900507  T
Q  211 atgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatt 255  Q
    |||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  25900508 atgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatt 25900552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 109 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16536460 - 16536313
Alignment:
Q  109 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  16536460 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaatttataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16536361  T
Q  209 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 256  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  16536360 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 16536313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 109 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 37053007 - 37052860
Alignment:
Q  109 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  37053007 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37052908  T
Q  209 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 256  Q
    |||||   |||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  37052907 atatgtggaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 37052860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 11584438 - 11584374
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 66  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  11584438 aaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagaattcatcataatca 11584374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 16105999 - 16105967
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16105999 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16105967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 20623318 - 20623286
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20623318 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 20623286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 21233442 - 21233474
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21233442 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 21233474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 25900320 - 25900352
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25900320 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 25900352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 37053093 - 37053061
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37053093 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 37053061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 29918212 - 29918127
Alignment:
Q  125 aaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 209  Q
    |||||||| |||||| |||| || |||||||| || |||||| |||||| || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  29918212 aaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatacatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 29918127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 32950951 - 32950862
Alignment:
Q  116 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 205  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||| || |||||| || || || |||| |||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  32950951 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgtatgatttgatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtt 32950862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 108728 - 108760
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  108728 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 108760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 9730278 - 9730310
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9730278 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 9730310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 16536546 - 16536514
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16536546 taagataagggggttagtctttatcataatcat 16536514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 329 - 361
Target Start/End: Original strand, 29190482 - 29190514
Alignment:
Q  329 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29190482 ttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcat 29190514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 32)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 121 - 361
Target Start/End: Original strand, 19886661 - 19886901
Alignment:
Q  121 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 220  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19886661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 19886760  T
Q  221 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886761 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 19886860  T
Q  321 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886861 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 19886901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 35 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 463075 - 462750
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  463075 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 462976  T
Q  135 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 234  Q
    ||||||| || || ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  462975 tccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 462876  T
Q  235 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 334  Q
    |||||| | ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |  |||||||||    
T  462875 attgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgtcgtgattgatg 462777  T
Q  335 aataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  462776 aatcattgcttgggtatgcatattcat 462750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 361
Target Start/End: Original strand, 20627205 - 20627564
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaa-ttttcaaatgttgtatgaa 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  20627205 aaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaacggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaaattttcaaatattgtatgaa 20627304  T
Q  101 ttttgattatggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattac 200  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  20627305 ttatgattatggataattgttgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcacgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattac 20627404  T
Q  201 atgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatg 300  Q
    |||| || ||||| ||||||||||| || |||| |||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | | |||||||||||| ||    
T  20627405 atgtccaaatatgtaaaaatgataacttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttaattcttgttcaattg 20627503  T
Q  301 atgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    || |||||  ||||| ||| | || || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20627504 attttatggttgttaattggtgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatggatattcat 20627564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 361
Target Start/End: Original strand, 19794596 - 19794955
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaat 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19794596 aaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattttgtaaa-tttcaaatgttgtatgaat 19794694  T
Q  102 ttt--gattatggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaatta 199  Q
    |||   || |||||| ||||| | ||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||    
T  19794695 ttttgcataatggataattgtcgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaatta 19794794  T
Q  200 catgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaat 299  Q
    |||||||| ||| | | |||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |    
T  19794795 catgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaatt 19794893  T
Q  300 gatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    ||||||||    |||| ||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19794894 gatgttatttccgttaattgatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcat 19794955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 35 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 8891581 - 8891254
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 132  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  8891581 taaggtaaaggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 8891482  T
Q  133 actccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 232  Q
     |||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||    
T  8891481 gctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggcgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 8891382  T
Q  233 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 332  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||| || || ||||    
T  8891381 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggttga 8891283  T
Q  333 tgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8891282 tgaatcattgcttgggtatgcatattcat 8891254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 361
Target Start/End: Original strand, 43642848 - 43643208
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaat 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43642848 aaagtgaagctagagctaatagttggagataattaagggaaggaggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaat 43642947  T
Q  102 tttg--attatggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaatta 199  Q
    |||   ||  ||||| |||||||||||||| || |||||| | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  43642948 ttttgcatagtggataattgttgctaaatttgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatta 43643047  T
Q  200 catgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaat 299  Q
    |||||||| ||| | | ||||| |||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | || ||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |    
T  43643048 catgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-ttcttagttgttattaatttgagatatgattcttgttcaatt 43643146  T
Q  300 gatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    |||| |||   ||||| ||||| || |  ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  43643147 gatgctattgctgttaattgatgttgtagttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcat 43643208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 35 - 361
Target Start/End: Original strand, 36982364 - 36982692
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt-gtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  36982364 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 36982463  T
Q  132 tactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 231  Q
    | |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  36982464 tgctccaactgtgatgatatgtttgtattcatgaattgatgataattgtaagattgctggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 36982563  T
Q  232 aagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 331  Q
    || |||||||| ||  ||||||||| | | ||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  |||    
T  36982564 aaaattgtgctcaattggtgaattt-tgccaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttg 36982662  T
Q  332 atgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  36982663 atgaatcattgtttgggtatgcatattcat 36982692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 109 - 361
Target Start/End: Original strand, 17396653 - 17396904
Alignment:
Q  109 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  17396653 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 17396751  T
Q  209 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 308  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  17396752 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 17396851  T
Q  309 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  17396852 aatgttatttgatattatgattaatggataattgcttgggtttgcatattcat 17396904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 35 - 361
Target Start/End: Original strand, 24341309 - 24341640
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 128  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  24341309 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 24341408  T
Q  129 tcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtt 228  Q
    || | || ||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||  |||||    
T  24341409 tcatgcttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattatatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 24341508  T
Q  229 atgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatga 328  Q
     |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| ||        
T  24341509 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttcctg 24341607  T
Q  329 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24341608 ttgatgaatcattgcttgggtatacatattcat 24341640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 109 - 361
Target Start/End: Original strand, 25265390 - 25265641
Alignment:
Q  109 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  25265390 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 25265489  T
Q  209 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 308  Q
     |||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||| ||||||||| | ||  | || ||  | ||||||| ||||||| |     
T  25265490 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 25265588  T
Q  309 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
      ||||| ||||| || |  || |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  25265589 gttgttaattgatgttgttgtttatgaatcatggcttgggtatgcatattcat 25265641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 159 - 361
Target Start/End: Original strand, 7507894 - 7508095
Alignment:
Q  159 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttct 258  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||| | ||  |||||||||      
T  7507894 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt-g 7507992  T
Q  259 cctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttg-ttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatat 357  Q
     ||||||||||||||| ||||| | |||||| || || || |||||||||   ||||||||||| || |  ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  7507993 gctaagttgttgttaa-ttgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatat 7508091  T
Q  358 tcat 361  Q
    ||||    
T  7508092 tcat 7508095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 109 - 256
Target Start/End: Original strand, 19689401 - 19689548
Alignment:
Q  109 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  19689401 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 19689500  T
Q  209 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 256  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  19689501 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 19689548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 35 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 22863267 - 22863169
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcg 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  22863267 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaattgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 22863169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 109 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 23820334 - 23820187
Alignment:
Q  109 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  23820334 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 23820235  T
Q  209 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 256  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  23820234 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 23820187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 109 - 256
Target Start/End: Original strand, 14906440 - 14906587
Alignment:
Q  109 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  14906440 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 14906539  T
Q  209 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 256  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  14906540 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 14906587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 109 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 20015274 - 20015127
Alignment:
Q  109 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||||||  || |||| | ||||||||| ||||||||||||       
T  20015274 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgcatgcatgaattgataataattgtgtgattgttggttaaattacatgtttga 20015175  T
Q  209 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 256  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  20015174 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 20015127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 22275110 - 22275045
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22275110 aaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagcctttatcataatcat 22275045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 22284343 - 22284278
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22284343 aaagtgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22284278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 15633602 - 15633538
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 66  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15633602 aaagtgaagctagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtctttatcataatca 15633538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Original strand, 19689314 - 19689347
Alignment:
Q  34 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19689314 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 19689347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 9652796 - 9652828
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9652796 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 9652828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 14906354 - 14906386
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14906354 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14906386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 23820420 - 23820388
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23820420 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23820388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 36 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 25213403 - 25213372
Alignment:
Q  36 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25213403 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 25213372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 68238 - 68156
Alignment:
Q  126 aattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 207  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  68238 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 68156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 43646282 - 43646232
Alignment:
Q  1 taaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 51  Q
    |||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  43646282 taaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 43646232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 7507757 - 7507789
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7507757 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 7507789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 17396567 - 17396599
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17396567 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 17396599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 20015360 - 20015328
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20015360 taaggtaagggggttagtctttatcatgatcat 20015328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 28031134 - 28031166
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28031134 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 28031166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 101
Target Start/End: Original strand, 31146073 - 31146138
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaa-tgttgtatgaat 101  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||| |  || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  31146073 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatctt--ttgtgtaaattttcaaattgttgtatgaat 31146138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 33128404 - 33128372
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33128404 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 33128372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 35 - 358
Target Start/End: Original strand, 3508 - 3830
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtac 134  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  3508 taaggtaagggggttagtctttgtcataatcatcttcattttgtaaattttcaaaagttgtatgaattttgattatagataattgttgctaaattcgtgc 3607  T
Q  135 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 234  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  3608 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 3707  T
Q  235 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 334  Q
    |||||||| ||  ||| ||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||||| |    
T  3708 attgtgctcaattggtaaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgagg 3806  T
Q  335 aataattgcttgggtatgcatatt 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  3807 aataattgcttgggtatgcatatt 3830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 35 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 1462 - 1136
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgta 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||     
T  1462 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttcttatggataattgttgctaaattcgtg 1363  T
Q  134 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 233  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  1362 ctccaactttgatgatatgttagtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 1263  T
Q  234 gattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 333  Q
     |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| || |||||    
T  1262 aattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatattgtggttgat 1164  T
Q  334 gaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  1163 gaataattgcttgggtgtgcatattcat 1136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 28)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 121 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 47357906 - 47357666
Alignment:
Q  121 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 220  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357906 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 47357807  T
Q  221 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357806 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 47357707  T
Q  321 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  47357706 tattatgattgatgaataattgattgggtatgtatattcat 47357666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 2 - 361
Target Start/End: Original strand, 54118135 - 54118495
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaat 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54118135 aaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattttgtgaattttcaaatgttgtatgaat 54118234  T
Q  102 ttt--gattatggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaatta 199  Q
    |||   || |||||| ||||||||||||||||| |||||| | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  54118235 ttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatta 54118334  T
Q  200 catgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaat 299  Q
    |||||||| ||| | | || ||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  || |||| |||||||||||||| |    
T  54118335 catgttcaaataggaacaattgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagatttagttatgattcttgttcaatt 54118433  T
Q  300 gatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    ||||||||   ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54118434 gatgttatagttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcat 54118495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 35 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 13246769 - 13246442
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcgt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| |||||||||    
T  13246769 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaaattcgt 13246670  T
Q  133 actccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 232  Q
     || ||||| || || |||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||    
T  13246669 gctacaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattaatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 13246570  T
Q  233 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 332  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||    
T  13246569 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttga 13246471  T
Q  333 tgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13246470 tgaatcattgcttgggtatgcatattcat 13246442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 146 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 10644446 - 10644231
Alignment:
Q  146 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  10644446 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtgctaaa 10644347  T
Q  246 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 345  Q
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10644346 ttggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 10644247  T
Q  346 gggtatgcatattcat 361  Q
    |||| |||||||||||    
T  10644246 gggtttgcatattcat 10644231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 35 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 122226 - 121989
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtac 134  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |    
T  122226 taaggtaaggggattagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaatttgtgc 122127  T
Q  135 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 234  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  122126 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 122027  T
Q  235 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgtta 273  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  122026 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtta 121989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 109 - 361
Target Start/End: Original strand, 13048221 - 13048473
Alignment:
Q  109 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 208  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||    || ||||||||||||||||| |||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  13048221 atggataattgttgctaaattcatgctccaacttcaatgatatgtttgtatgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 13048320  T
Q  209 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 308  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13048321 atatgtaaaaaggataagttatgaatattgtgctcaattgatgaatttctcctaagttgttgttagtttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 13048420  T
Q  309 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13048421 aatgttattagataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcat 13048473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 35 - 361
Target Start/End: Original strand, 15675009 - 15675340
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 128  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  15675009 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 15675108  T
Q  129 tcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtt 228  Q
    |||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||    
T  15675109 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 15675208  T
Q  229 atgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatga 328  Q
     |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |      
T  15675209 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttg 15675307  T
Q  329 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  15675308 ttgatgaatcattgcttgggtatacatattcat 15675340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 35 - 305
Target Start/End: Original strand, 10104170 - 10104445
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 128  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||  || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  10104170 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttacaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 10104269  T
Q  129 tcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtt 228  Q
     ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||    
T  10104270 ccgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 10104369  T
Q  229 atgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 305  Q
     |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  10104370 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 10104445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 136 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 31115865 - 31115641
Alignment:
Q  136 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 235  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||||||  ||||| |||| |    
T  31115865 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttccattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaa 31115766  T
Q  236 ttgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 335  Q
    || |||| ||  ||||||||| ||||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  |||||||    
T  31115765 ttatgctcaattggtgaattt-tcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatga 31115667  T
Q  336 ataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    || ||||||||||||| |||||||||    
T  31115666 atcattgcttgggtatacatattcat 31115641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 109 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 26680463 - 26680213
Alignment:
Q  109 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  26680463 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 26680364  T
Q  209 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 308  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||  | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |     
T  26680363 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatagatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 26680266  T
Q  309 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
     ||| || | ||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  26680265 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcat 26680213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 109 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 10488825 - 10488678
Alignment:
Q  109 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  10488825 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 10488726  T
Q  209 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 256  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  10488725 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 10488678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 109 - 256
Target Start/End: Original strand, 16327926 - 16328073
Alignment:
Q  109 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  16327926 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16328025  T
Q  209 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 256  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  16328026 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 16328073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 35 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 33241043 - 33240900
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 128  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  33241043 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 33240944  T
Q  129 tcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatg 172  Q
    |||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  33240943 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatg 33240900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Original strand, 25119074 - 25119139
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  25119074 aaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggagttagtttttatcataatcat 25119139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 276 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 111492 - 111407
Alignment:
Q  276 ttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  111492 ttgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcat 111407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 305
Target Start/End: Original strand, 40885570 - 40885749
Alignment:
Q  125 aaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata-tatgcaaaaatgat 223  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| || || ||| ||  ||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||      
T  40885570 aaattcgtactccaactgtggtgctatgtttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgtataaatgtc 40885669  T
Q  224 aagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 305  Q
    |||||||||| ||| |||| ||  |||||| || | ||||||| ||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  40885670 aagttatgaa-attatgctcaattggtgaactt-tgctaagttattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 40885749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 31132657 - 31132545
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 128  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  31132657 taaggtaagggggttagtcttcatcataattatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 31132558  T
Q  129 tcgtactccaact 141  Q
    |||| ||||||||    
T  31132557 tcgtgctccaact 31132545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Original strand, 5682395 - 5682460
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5682395 aaagtgaagcatgagctaatagttggtgataattaaggtaagtgggttagtttttatcataatcat 5682460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 14952117 - 14952085
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14952117 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14952085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 15135907 - 15135939
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15135907 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15135939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 15272211 - 15272243
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15272211 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15272243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 16327840 - 16327872
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16327840 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16327872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 16609013 - 16609045
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16609013 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16609045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 26680549 - 26680517
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680549 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 26680517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 15045074 - 15044992
Alignment:
Q  126 aattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 207  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  15045074 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 15044992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 41165815 - 41165881
Alignment:
Q  1 taaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||    
T  41165815 taaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaacgtaagggggttagaattcatcataatcat 41165881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 8045304 - 8045272
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8045304 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 8045272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 16523178 - 16523146
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16523178 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 16523146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 41)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 3060336 - 3059978
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaat 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3060336 aaagtgaagctagagctaatagttggagataatgaaggtaagggggtaagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttatatgaat 3060237  T
Q  102 tttgattatggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattaca 201  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |  ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  | ||||||||||||||||    
T  3060236 tttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgataatatatttgtatgcattaattgatgataattgtaatactgttggtgaaattaca 3060137  T
Q  202 tgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatga 301  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| || |||| ||| |||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||    
T  3060136 tgttcaaatatgtaaaaatgataaattgtgaaaattatgctcaaatggtgaattt-tgttaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattga 3060038  T
Q  302 tgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    |||||||| ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3060037 tgttatgactgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcat 3059978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 121 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 10989661 - 10989422
Alignment:
Q  121 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 220  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 10989562  T
Q  221 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 320  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989561 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttg-taatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 10989463  T
Q  321 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10989462 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcat 10989422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 35 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16212103 - 16211778
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtac 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |    
T  16212103 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggacaattgttgctaaattcgtgc 16212004  T
Q  135 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 234  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  16212003 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 16211904  T
Q  235 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 334  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||    
T  16211903 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttaaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatg 16211805  T
Q  335 aataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    | | |||||||||||||||||||||||    
T  16211804 attcattgcttgggtatgcatattcat 16211778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 146 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 2437684 - 2437469
Alignment:
Q  146 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  2437684 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgttcaa 2437585  T
Q  246 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2437584 ttggtgaatttttcctaagttgttgttaatatgagatttgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 2437485  T
Q  346 gggtatgcatattcat 361  Q
    | || |||||||||||    
T  2437484 gagtttgcatattcat 2437469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 35 - 361
Target Start/End: Original strand, 13036938 - 13037265
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 132  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  13036938 taaggtaagggggttagtcttcaccataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 13037037  T
Q  133 actccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 232  Q
     |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| | | |||||||||||| |||    
T  13037038 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgatgaaattgcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 13037137  T
Q  233 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 332  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||| || || ||||    
T  13037138 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattaatgttatgaatattaattgatgttgtggttga 13037236  T
Q  333 tgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13037237 tgaatcattgcttgggtatgcatattcat 13037265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 35 - 361
Target Start/End: Original strand, 11580661 - 11580990
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt-gtaaattttcaaatgttgtatgaattttg---attatggatgattgttgctaaattc 130  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    || |||||| ||| |||||||||||    
T  11580661 taaggtaaggggattagtctttatcataatcatcatcatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttttgcataatggataattattgctaaattc 11580760  T
Q  131 gtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 230  Q
    || |||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |    
T  11580761 gtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgt 11580860  T
Q  231 gaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 330  Q
    ||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||    
T  11580861 gaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggtt 11580959  T
Q  331 gatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  11580960 gatgaatcattgcttgggtatacatattcat 11580990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 35 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 36053003 - 36052679
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||  |    
T  36053003 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattgttgctaaatttat 36052904  T
Q  133 actccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 232  Q
    ||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  36052903 actccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtaaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 36052804  T
Q  233 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 332  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||   |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||  ||||| ||||| || || ||||    
T  36052803 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttgtggttgttaattgatgttgtggttga 36052708  T
Q  333 tgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36052707 tgaataattgcttgggtatgcatattcat 36052679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 146 - 361
Target Start/End: Original strand, 13911049 - 13911265
Alignment:
Q  146 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||    
T  13911049 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctcaa 13911148  T
Q  246 ggggtgaatttctcct-aagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgct 344  Q
      |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13911149 ttggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatttct 13911248  T
Q  345 tgggtatgcatattcat 361  Q
    ||||| |||||||||||    
T  13911249 tgggtttgcatattcat 13911265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 146 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 13572903 - 13572688
Alignment:
Q  146 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  13572903 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaa 13572804  T
Q  246 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 345  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13572803 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgctt 13572704  T
Q  346 gggtatgcatattcat 361  Q
    |||| |||||||||||    
T  13572703 gggtttgcatattcat 13572688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 109 - 361
Target Start/End: Original strand, 25292338 - 25292589
Alignment:
Q  109 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 208  Q
    |||||| |||||||||||||| || |||||||| || || |||||||||||| |||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  25292338 atggataattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgtatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 25292437  T
Q  209 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 308  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||  |||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25292438 atatgtaaaaaggataagctatgaatattgtgctcaattggtgaatt-ctcctaggttgtcgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 25292536  T
Q  309 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25292537 aatgttatttgatattatgactaatgaataattgcttgggtttgcatattcat 25292589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 116 - 361
Target Start/End: Original strand, 18253842 - 18254086
Alignment:
Q  116 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 215  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |    
T  18253842 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 18253941  T
Q  216 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 315  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18253942 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgtta 18254040  T
Q  316 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
     ||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18254041 attgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcat 18254086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 109 - 361
Target Start/End: Original strand, 47481031 - 47481282
Alignment:
Q  109 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||     
T  47481031 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaa 47481130  T
Q  209 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 308  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||| | ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  47481131 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatc 47481229  T
Q  309 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
      | ||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  47481230 gctcttaattgatgtttttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcat 47481282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 146 - 361
Target Start/End: Original strand, 16478987 - 16479201
Alignment:
Q  146 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||    
T  16478987 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaa 16479086  T
Q  246 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 345  Q
      ||||||||| |  |||||| || |||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| || |  ||||||||| | |||||    
T  16479087 ttggtgaattt-tgttaagttatttttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgctt 16479185  T
Q  346 gggtatgcatattcat 361  Q
    ||||||||||||||||    
T  16479186 gggtatgcatattcat 16479201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 109 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 7293279 - 7293029
Alignment:
Q  109 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  7293279 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattaataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 7293180  T
Q  209 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 308  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||  |  | ||||||||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |     
T  7293179 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgttgttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 7293082  T
Q  309 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
     ||| || | ||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  7293081 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcat 7293029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 109 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 11516490 - 11516343
Alignment:
Q  109 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  11516490 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 11516391  T
Q  209 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 256  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  11516390 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 11516343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 109 - 256
Target Start/End: Original strand, 15441564 - 15441711
Alignment:
Q  109 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  15441564 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 15441663  T
Q  209 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 256  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  15441664 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 15441711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 109 - 256
Target Start/End: Original strand, 30262129 - 30262276
Alignment:
Q  109 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  30262129 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 30262228  T
Q  209 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 256  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  30262229 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 30262276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 13321278 - 13321026
Alignment:
Q  110 tggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatg-ttcat 208  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  13321278 tggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaa 13321179  T
Q  209 a-tatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttg-ttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtta 306  Q
    | |||| | |||||  |||||||||| |||||||| ||  ||||||||| | |||||||| ||||| | ||||| | |||||| ||||||| ||||||||    
T  13321178 agtatgtataaatgtcaagttatgaa-attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtta 13321081  T
Q  307 tgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  ||||||| |||| ||||||    
T  13321080 ttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtttgcacattcat 13321026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Original strand, 32493913 - 32493978
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32493913 aaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 32493978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 126799 - 126738
Alignment:
Q  6 tgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  126799 tgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 126738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Original strand, 1936884 - 1936949
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  1936884 aaagtgaagctagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtttttatcataatcat 1936949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 37 - 230
Target Start/End: Original strand, 295893 - 296087
Alignment:
Q  37 aggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaa-ttttg-attatggatgattgttgctaaattcgtac 134  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||||||| |  |||||||||  ||||||||| ||||| || ||| || |||||||||||||||||      
T  295893 aggtaagggggtttgtcttcaacataattctcatcatttt-tgcattttcaaactttgtatgaaattttgcataatgaataattgttgctaaattcgtgt 295991  T
Q  135 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 230  Q
    || || |  | |||||||||||| ||||||||| |||| || |  ||| ||||||||||||||| |||||| |  |||| |||||||| |||||||    
T  295992 tctaattgaggtgttatgtttgtgtgcatgaatcgatgataatgttatgattgttggtgaaatttcatgttgaattatgtaaaaatgagaagttat 296087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Original strand, 111136 - 111201
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  111136 aaagtgaagcttgagctaaaagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 111201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 13377917 - 13377819
Alignment:
Q  1 taaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaa 100  Q
    |||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||  |  |  ||||||||||||| |||||||||||    
T  13377917 taaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagaattcatcataatcat--ttttagtgtaaattttcaattgttgtatgaa 13377820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Original strand, 7283923 - 7283987
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 66  Q
    ||||||||||| ||| || || |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  7283923 aaagtgaagcttgagttaataattggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 7283987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 2029276 - 2029244
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2029276 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 2029244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 7293365 - 7293333
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7293365 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 7293333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 11516576 - 11516544
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11516576 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 11516544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 14113903 - 14113935
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14113903 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14113935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 15441478 - 15441510
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15441478 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15441510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 15709501 - 15709428
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatc----attttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 104  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    |||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  15709501 taaggtaagaggattagtcttcatcataatcatcatcatcaattttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttt 15709428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 30262043 - 30262075
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30262043 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 30262075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 42056188 - 42056220
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42056188 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 42056220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13377775 - 13377693
Alignment:
Q  126 aattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 207  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  13377775 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 13377693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 13389743 - 13389693
Alignment:
Q  1 taaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 51  Q
    |||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  13389743 taaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 13389693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 371449 - 371417
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  371449 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 371417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 3049937 - 3049905
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3049937 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 3049905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 13321366 - 13321334
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13321366 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 13321334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 39 - 67
Target Start/End: Original strand, 15516765 - 15516793
Alignment:
Q  39 gtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15516765 gtaagggggttagtctttatcataatcat 15516793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 25124482 - 25124450
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25124482 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 25124450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 47480944 - 47480976
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47480944 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 47480976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 54)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 35 - 361
Target Start/End: Original strand, 14842487 - 14842812
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtac 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  14842487 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcactttgcaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 14842586  T
Q  135 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 234  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||     
T  14842587 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgttggtgaaattgcatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttatgaaa 14842686  T
Q  235 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 334  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  14842687 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatg 14842785  T
Q  335 aataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||    
T  14842786 aataattgattgggtttgcatattcat 14842812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 121 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 55316471 - 55316231
Alignment:
Q  121 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 220  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55316471 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 55316372  T
Q  221 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 320  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55316371 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 55316272  T
Q  321 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  55316271 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcat 55316231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 35 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 13839232 - 13838906
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgta 133  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||     
T  13839232 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatgaataattgttgctaaattcgtg 13839133  T
Q  134 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 233  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||    
T  13839132 ctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 13839033  T
Q  234 gattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 333  Q
     |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||||    
T  13839032 aattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgat 13838934  T
Q  334 gaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  13838933 gaatcattgtttgggtatgcatattcat 13838906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 35 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 2050147 - 2049822
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtac 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  2050147 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatcaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 2050048  T
Q  135 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 234  Q
    ||||||| ||  | ||||||||||||| |||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||     
T  2050047 tccaactgtgacgatatgtttgtatgcctgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaacatgataacttgtgaaa 2049948  T
Q  235 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 334  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| || || ||||||    
T  2049947 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgatttttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggttgatg 2049849  T
Q  335 aataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  2049848 aatcattgcttgggtatgcatattcat 2049822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 35 - 361
Target Start/End: Original strand, 12030073 - 12030398
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtac 134  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  12030073 taaggtaagggggttaatcattatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgacttttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 12030172  T
Q  135 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 234  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||     
T  12030173 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaagtgataagttgtgaaa 12030272  T
Q  235 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 334  Q
     ||||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  12030273 gttgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgatatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttatggttgatg 12030371  T
Q  335 aataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  12030372 aatcattgcttgggtatgcatattcat 12030398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 121 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 41270327 - 41270087
Alignment:
Q  121 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 220  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41270327 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtggaattacatgttcatatatgcaaaaat 41270228  T
Q  221 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 320  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41270227 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 41270128  T
Q  321 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41270127 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcat 41270087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 16744007 - 16744262
Alignment:
Q  1 taaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16744007 taaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaacgaggttagtctttaccataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaa 16744106  T
Q  101 ttttgattatggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattac 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||||||  ||  ||||| ||||||||| |||||||    
T  16744107 ttttgattatggatgattgttgttaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatccatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattac 16744206  T
Q  201 atgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 256  Q
    || || | ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  16744207 atttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 16744262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 146 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16821366 - 16821151
Alignment:
Q  146 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 245  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||  |||||||||||    
T  16821366 tgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagctatgagtattgtgctaaa 16821267  T
Q  246 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 345  Q
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16821266 ttggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 16821167  T
Q  346 gggtatgcatattcat 361  Q
    |||| |||||||||||    
T  16821166 gggtttgcatattcat 16821151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 99 - 361
Target Start/End: Original strand, 51158008 - 51158269
Alignment:
Q  99 aattttgattatggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaatt 198  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  51158008 aattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatt 51158107  T
Q  199 acatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaa 298  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||     
T  51158108 acatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaat 51158206  T
Q  299 tgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51158207 tgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcat 51158269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 109 - 361
Target Start/End: Original strand, 13975722 - 13975973
Alignment:
Q  109 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| |     
T  13975722 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13975820  T
Q  209 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 308  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13975821 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 13975920  T
Q  309 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13975921 aatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcat 13975973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 72 - 361
Target Start/End: Original strand, 15858986 - 15859275
Alignment:
Q  72 attttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattg 169  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  15858986 attttgtaaattt-caattgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattg 15859084  T
Q  170 atgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgtt 269  Q
    ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||    
T  15859085 atgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgtt 15859183  T
Q  270 gttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    ||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15859184 gttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcat 15859275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 109 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 45861068 - 45860817
Alignment:
Q  109 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| |     
T  45861068 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 45860970  T
Q  209 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 308  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  45860969 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 45860870  T
Q  309 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45860869 aatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcat 45860817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 109 - 361
Target Start/End: Original strand, 13954890 - 13955141
Alignment:
Q  109 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| |     
T  13954890 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13954988  T
Q  209 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 308  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13954989 ataagtaaaaatgatcagttatgaatattgtgctcaattgatgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 13955088  T
Q  309 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13955089 aatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcat 13955141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 116 - 361
Target Start/End: Original strand, 15936634 - 15936878
Alignment:
Q  116 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 215  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |    
T  15936634 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 15936733  T
Q  216 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 315  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15936734 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgtta 15936832  T
Q  316 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
     ||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  15936833 attgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcat 15936878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 116 - 361
Target Start/End: Original strand, 15938476 - 15938720
Alignment:
Q  116 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 215  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||| |  || ||||||||||  |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |    
T  15938476 attgttactaaatacgtgctccaactgtaatgatatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 15938575  T
Q  216 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 315  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15938576 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgtta 15938674  T
Q  316 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
     ||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  15938675 attgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcat 15938720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 19232154 - 19231981
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaa 100  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19232154 aaagtgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcttaatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaa 19232055  T
Q  101 tttt--gattatggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatg 172  Q
    ||||   || |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||    
T  19232054 tttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttatattcatgaattgatg 19231981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 34 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 15615170 - 15614846
Alignment:
Q  34 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |  |||||  ||||||||||||  | | || ||| |  |||  ||||| ||| ||    
T  15615170 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatg-taattttgca--ttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagatttgt 15615074  T
Q  133 actccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 232  Q
     |||  ||| || |||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  15615073 gctcttactgtggtgttatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 15614974  T
Q  233 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 332  Q
    | || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||| | | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||    
T  15614973 atatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttga 15614875  T
Q  333 tgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15614874 tgaatcattgcttgggtatgcatattcat 15614846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 109 - 361
Target Start/End: Original strand, 17912483 - 17912732
Alignment:
Q  109 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  17912483 atggataattgttgctaaattcgtgctccaact-tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 17912581  T
Q  209 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 308  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||  | ||||||  |  || ||||| ||| | ||||| | |||||| |||||||  ||||||||     
T  17912582 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaattgatgaatt--tgatatgttgtagttgaattgagctatgattcatgttcaatcgatgttatt 17912679  T
Q  309 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  17912680 gttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcat 17912732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 35 - 155
Target Start/End: Original strand, 19260749 - 19260869
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtac 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  19260749 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaagttttcaaatgttgtatgaattttttttatggataattgttgctaaattcgtgc 19260848  T
Q  135 tccaactatgttgttatgttt 155  Q
    || || |||| || |||||||    
T  19260849 tctaattatgatgatatgttt 19260869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 109 - 256
Target Start/End: Original strand, 2449238 - 2449385
Alignment:
Q  109 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  2449238 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 2449337  T
Q  209 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 256  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  2449338 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 2449385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 3992938 - 3992873
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3992938 aaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 3992873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 15857129 - 15857198
Alignment:
Q  1 taaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcat 70  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15857129 taaagtgaagctagagctaatacttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcat 15857198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 55513258 - 55513193
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55513258 aaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 55513193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 2844579 - 2844514
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2844579 aaagtgaagctagagctaatagtttgagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 2844514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 67
Target Start/End: Original strand, 17955861 - 17955916
Alignment:
Q  12 tagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17955861 tagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 17955916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Original strand, 54037991 - 54038056
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54037991 aaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 54038056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 45582016 - 45581954
Alignment:
Q  6 tgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaag-ggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  45582016 tgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaaggggggttagtttttatcataatcat 45581954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 7854370 - 7854305
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  7854370 aaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 7854305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 209
Target Start/End: Original strand, 4145814 - 4145898
Alignment:
Q  125 aaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 209  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||||| || ||||||||| || || ||| ||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  4145814 aaattcgtactccaattatggtgatatgtttgaatacatgaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattacatgttcata 4145898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 2449152 - 2449184
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2449152 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 2449184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 16261809 - 16261777
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16261809 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16261777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 16933869 - 16933901
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16933869 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16933901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 17912398 - 17912430
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17912398 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 17912430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 23492728 - 23492696
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23492728 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23492696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 38168269 - 38168237
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38168269 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 38168237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 53771397 - 53771365
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53771397 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 53771365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 17205069 - 17205019
Alignment:
Q  1 taaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 51  Q
    |||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17205069 taaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 17205019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 38810875 - 38810941
Alignment:
Q  1 taaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||| | ||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  38810875 taaagtgaagcttgggctaggaattggtgataactaaggtaagggggttagaattcatcataatcat 38810941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 205
Target Start/End: Original strand, 11986173 - 11986262
Alignment:
Q  116 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 205  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||| || |||||| || || ||||||| || ||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  11986173 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttaatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtt 11986262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 14080756 - 14080715
Alignment:
Q  125 aaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 166  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  14080756 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 14080715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 15550987 - 15550922
Alignment:
Q  1 taaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 66  Q
    |||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||    
T  15550987 taaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaagataagggggttagaattcatcataatca 15550922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 47984763 - 47984662
Alignment:
Q  260 ctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 359  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  47984763 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 47984664  T
Q  360 at 361  Q
    ||    
T  47984663 at 47984662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 47994050 - 47993949
Alignment:
Q  260 ctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 359  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  47994050 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 47993951  T
Q  360 at 361  Q
    ||    
T  47993950 at 47993949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 48003337 - 48003236
Alignment:
Q  260 ctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 359  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  48003337 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 48003238  T
Q  360 at 361  Q
    ||    
T  48003237 at 48003236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 260 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 48012623 - 48012522
Alignment:
Q  260 ctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 359  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  48012623 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 48012524  T
Q  360 at 361  Q
    ||    
T  48012523 at 48012522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 11986080 - 11986112
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11986080 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 11986112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 12031897 - 12031849
Alignment:
Q  1 taaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggtt 49  Q
    |||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  12031897 taaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggtt 12031849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 13954804 - 13954836
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13954804 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 13954836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 14285321 - 14285289
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14285321 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 14285289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 19947058 - 19947026
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19947058 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 19947026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 30153297 - 30153265
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30153297 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 30153265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 33342236 - 33342204
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33342236 taaggtaagagggttagtctttatcataatcat 33342204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 45861154 - 45861122
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45861154 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 45861122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 51961031 - 51961063
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51961031 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 51961063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 35 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 48935 - 48610
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  48935 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 48836  T
Q  135 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 234  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||     
T  48835 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaaaaatgataagttgtgaaa 48736  T
Q  235 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 334  Q
    |||||||| |   ||||||||| | ||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||| || || ||||||    
T  48735 attgtgctcagttggtgaattt-tgctaagttgttgctagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggttgatg 48637  T
Q  335 aataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  48636 aatcattgcttgggtatgcatattcat 48610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 146 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 36320 - 36105
Alignment:
Q  146 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 245  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36320 tgttatgtttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 36221  T
Q  246 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 345  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36220 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaatagatgttatgaatgttatttgataatatgattgatgaataattgctt 36121  T
Q  346 gggtatgcatattcat 361  Q
    |||| |||||||||||    
T  36120 gggtttgcatattcat 36105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 61122 - 61154
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  61122 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 61154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 33)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 35 - 361
Target Start/End: Original strand, 16193643 - 16193967
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtac 134  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  16193643 taaggtaagggg-ttagtctttatcataatcatcatcatttggtaaattttcaaatattgtatgaattttgcttatggatgattgttgctaaattcgtgc 16193741  T
Q  135 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 234  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  16193742 tccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 16193841  T
Q  235 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 334  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | | || |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||    
T  16193842 attgtgctcaattggtgaattt-tgccaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatg 16193940  T
Q  335 aataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  16193941 aatcattgcttgggtatgcatattcat 16193967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 121 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 30120974 - 30120734
Alignment:
Q  121 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 220  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30120974 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 30120875  T
Q  221 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 320  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30120874 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttga 30120775  T
Q  321 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30120774 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcat 30120734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 35 - 361
Target Start/End: Original strand, 43373392 - 43373719
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   || |||||| |||  ||||||||||||    
T  43373392 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattaatgctaaattcgt 43373491  T
Q  133 actccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 232  Q
     |||||||| || || || ||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  43373492 gctccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 43373591  T
Q  233 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 332  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| || || ||||    
T  43373592 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggttga 43373690  T
Q  333 tgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43373691 tgaataattgcttgggtatgcatattcat 43373719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 183 - 361
Target Start/End: Original strand, 222753 - 222931
Alignment:
Q  183 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222753 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 222852  T
Q  283 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222853 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 222931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 183 - 361
Target Start/End: Original strand, 736376 - 736554
Alignment:
Q  183 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736376 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 736475  T
Q  283 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736476 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 736554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 183 - 361
Target Start/End: Original strand, 860271 - 860449
Alignment:
Q  183 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860271 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 860370  T
Q  283 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860371 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 860449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 35 - 361
Target Start/End: Original strand, 24928716 - 24929042
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgta 133  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  24928716 taaggtaatggggttagtctttatcataatcatcgtcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggataattgttgctaaattcgtg 24928815  T
Q  134 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 233  Q
    |||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||    
T  24928816 ctccaactgtgattatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 24928915  T
Q  234 gattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 333  Q
     |||||||| ||  ||||||||||  ||||||||| |||   ||||||| ||  |||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||| || ||||||||    
T  24928916 aattgtgctcaattggtgaatttc-gctaagttgtggttggattgagttatgtctcttgttcaattgaggttatggttgttaattgatgttgtgattgat 24929014  T
Q  334 gaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  24929015 gaatcattgcttgggtatgcatattcat 24929042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 121 - 361
Target Start/End: Original strand, 16674392 - 16674632
Alignment:
Q  121 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 220  Q
    |||||||||||| |||   || || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16674392 tgctaaattcgtgctctttctgtgatgttatgtttttatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 16674491  T
Q  221 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 320  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16674492 gataagttatgaatattgtgcttaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 16674591  T
Q  321 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16674592 taatatgattaatgaataattgcttgagtttgcatattcat 16674632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 146 - 361
Target Start/End: Original strand, 21844597 - 21844812
Alignment:
Q  146 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  21844597 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaa 21844696  T
Q  246 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 345  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21844697 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatttttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 21844796  T
Q  346 gggtatgcatattcat 361  Q
    |||| |||||||||||    
T  21844797 gggtttgcatattcat 21844812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 146 - 361
Target Start/End: Original strand, 21851990 - 21852205
Alignment:
Q  146 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  21851990 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaa 21852089  T
Q  246 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 345  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21852090 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 21852189  T
Q  346 gggtatgcatattcat 361  Q
    |||| |||||||||||    
T  21852190 gggtttgcatattcat 21852205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 361
Target Start/End: Original strand, 16404867 - 16405223
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaat 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16404867 aaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattt-gtaaattttcaaatgttgtatgaat 16404965  T
Q  102 tttg--attatggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaatta 199  Q
    |||   || |||||| ||| ||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  16404966 ttttgcatgatggataattattgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatta 16405065  T
Q  200 catgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaat 299  Q
    |||||||| ||| | | ||||| |||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||   |||||||| ||||  | |||||||||||||| |    
T  16405066 catgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaaattgacatatgattcttgttcaatt 16405161  T
Q  300 gatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    ||||||||   ||||| ||||| || |  ||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  16405162 gatgttattgttgttaattgatgttttagttgatgaatcactgcttgggtatgcaaattcat 16405223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 121 - 361
Target Start/End: Original strand, 6774258 - 6774497
Alignment:
Q  121 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 220  Q
    ||||| |||||| |||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  6774258 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 6774357  T
Q  221 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 320  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||    
T  6774358 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttga 6774456  T
Q  321 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    | || |  ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  6774457 tgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcat 6774497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 121 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 24549233 - 24548994
Alignment:
Q  121 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 220  Q
    ||||| |||||| |||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24549233 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 24549134  T
Q  221 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 320  Q
    |||||||| |||| || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||| | | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  24549133 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattga 24549035  T
Q  321 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    | || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24549034 tgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcat 24548994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 109 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 17345832 - 17345582
Alignment:
Q  109 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 208  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  17345832 atggataattgttgcgaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 17345733  T
Q  209 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 308  Q
     |||| |||||||  |||||||||| |||||||| ||  | || |||| | ||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||  |||| ||||     
T  17345732 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattgtgaa-ttgagttatgattcttgttcagttgatattatt 17345635  T
Q  309 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  17345634 gttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcat 17345582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 109 - 361
Target Start/End: Original strand, 22907214 - 22907464
Alignment:
Q  109 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  22907214 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 22907313  T
Q  209 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 308  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |     
T  22907314 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 22907411  T
Q  309 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
     ||| || | ||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  22907412 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcat 22907464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 109 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 5238350 - 5238203
Alignment:
Q  109 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  5238350 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 5238251  T
Q  209 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 256  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  5238250 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 5238203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 109 - 256
Target Start/End: Original strand, 24661248 - 24661395
Alignment:
Q  109 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  24661248 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 24661347  T
Q  209 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 256  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  24661348 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 24661395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 109 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 43685809 - 43685662
Alignment:
Q  109 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  43685809 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 43685710  T
Q  209 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 256  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  43685709 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 43685662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 183 - 245
Target Start/End: Original strand, 691908 - 691970
Alignment:
Q  183 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  691908 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 691970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 274831 - 274766
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  274831 aaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 274766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Original strand, 641018 - 641083
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  641018 aaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 641083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Original strand, 826824 - 826889
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  826824 aaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 826889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Original strand, 24716729 - 24716794
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24716729 aaagtgaagctagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24716794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 39115663 - 39115598
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  39115663 aaagtgaagcttgagctaatagttggtaataattaaggtaagggtgttagttttcatcataatcat 39115598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 5238436 - 5238404
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5238436 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 5238404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 22907128 - 22907160
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907128 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22907160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 24385652 - 24385684
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24385652 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24385684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 24661162 - 24661194
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24661162 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24661194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 43685895 - 43685863
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43685895 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 43685863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 2545297 - 2545265
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2545297 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 2545265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 3431176 - 3431208
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3431176 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 3431208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 22886686 - 22886654
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22886686 taaggtaagggggttagtcttaatcataatcat 22886654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 38533895 - 38533855
Alignment:
Q  126 aattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 166  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  38533895 aattcgtactccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaa 38533855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 35 - 361
Target Start/End: Original strand, 5990 - 6314
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtac 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  5990 taaggtaagggggttagtctttatcataatcattttcactttgcaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 6089  T
Q  135 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 234  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| | ||     
T  6090 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtaaaa 6189  T
Q  235 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 334  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||  | ||||||||||||    
T  6190 attgtgctgaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttttgttatgattgatg 6287  T
Q  335 aataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  6288 aataattgcttgggtatgcatattcat 6314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 183; Significance: 6e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 35 - 361
Target Start/End: Original strand, 882 - 1206
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtac 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  882 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcactttacaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 981  T
Q  135 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 234  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||     
T  982 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaa 1081  T
Q  235 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 334  Q
    |||||||| ||  | ||||||| | ||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||||||    
T  1082 attgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagattttattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatg 1179  T
Q  335 aataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  1180 aataattgcttgggtatgcatattcat 1206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 35 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 9215 - 8890
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtac 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |    
T  9215 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcattttgcaaattttcaaaagttgtacgaattttgcttatggaaaattgttgctaaattcgtgc 9116  T
Q  135 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 234  Q
    ||||  | || |||||||||||||||||||||| |||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||| ||||     
T  9115 tccatttgtgatgttatgtttgtatgcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgttaagttgtgaaa 9016  T
Q  235 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 334  Q
    |||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||||||||    
T  9015 attgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatg 8917  T
Q  335 aataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  8916 aataattgcttgggtatgcatattcat 8890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 35 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 172242 - 171917
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |    
T  172242 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtataaattttgattatggataactgttgctaaatacgtgc 172143  T
Q  135 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 234  Q
    ||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||     
T  172142 tccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 172043  T
Q  235 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 334  Q
    |||||||||||  ||||||||| | ||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||    
T  172042 attgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatg 171944  T
Q  335 aataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  171943 aatcattgcttaggtatgcatattcat 171917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 35 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 177945 - 177620
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtac 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |    
T  177945 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtataaattttgattatggataactgttgctaaatacgtgc 177846  T
Q  135 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 234  Q
    ||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||     
T  177845 tccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 177746  T
Q  235 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 334  Q
    |||||||||||  ||||||||| | ||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||    
T  177745 attgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatg 177647  T
Q  335 aataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  177646 aatcattgcttaggtatgcatattcat 177620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 35 - 361
Target Start/End: Original strand, 247366 - 247693
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcgt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  247366 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 247465  T
Q  133 actccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 232  Q
     |||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||  ||||||||| |||||||| ||| | | |||||||||||| |||    
T  247466 gctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgagggtgaaatttcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 247565  T
Q  233 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 332  Q
    | |||||||| ||  ||| ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||    
T  247566 aaattgtgctcaattggtaaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttga 247664  T
Q  333 tgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  247665 tgaatcattgcttgggtatgcatattcat 247693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 34075 - 34107
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34075 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 34107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 35 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 12450 - 12127
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaa-ttttgattatggatgattgttgctaaattcgta 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  12450 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttaattttgtaacttt-caaatgctgtatgaaattttgattatggataattgttgctaaattcgtg 12352  T
Q  134 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 233  Q
    ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||| | || || |||||||||||||| ||||    
T  12351 ctctaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgtttaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaa 12252  T
Q  234 gattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 333  Q
     |||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||  | ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  12251 aattgtgctaaattggtgaattt-tgttaagttgttgt--aattgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattcat 12155  T
Q  334 gaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12154 gaataattgcttgggtatgcatattcat 12127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 35 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 42066 - 41741
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtac 134  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  42066 taaggtaagggggttggtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 41967  T
Q  135 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 234  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||     
T  41966 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtcatattgttggtgaaattacatgctcaaatatgtaaaaatgataatttgtgaaa 41867  T
Q  235 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 334  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||| | || |   |||||    
T  41866 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgctatggctgttaattgttgttgtagatgatg 41768  T
Q  335 aataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  41767 aatcattggttgggtatgcatattcat 41741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 166; Significance: 9e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 45 - 361
Target Start/End: Original strand, 4996 - 5312
Alignment:
Q  45 gggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg-attatggatgattgttgctaaattcgtactccaactat 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  4996 gggttagtctttatcataatcattatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttcataatggataattgttgctaaattcgtactccaactgt 5095  T
Q  144 gttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgcta 243  Q
    |  | ||||||||||||| |||||||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||     
T  5096 gacgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc 5195  T
Q  244 aaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgc 343  Q
    ||  ||||||||| | | ||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||||| |||||    
T  5196 aattggtgaattt-tgcaaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgatgaatcattgc 5294  T
Q  344 ttgggtatgcatattcat 361  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5295 ttgggtatgcatattcat 5312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 3)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 35 - 358
Target Start/End: Original strand, 26340 - 26663
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaa-ttttgattatggatgattgttgctaaattcgta 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| || |||||||||||||||||     
T  26340 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatgatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttcataatgtataattgttgctaaattcgtg 26439  T
Q  134 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 233  Q
    |||||||| || || ||||||||||||| |||||||||| || |||||  ||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  26440 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattattggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 26539  T
Q  234 gattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 333  Q
     ||||| || ||  ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||    
T  26540 aattgttctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgat 26638  T
Q  334 gaataattgcttgggtatgcatatt 358  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  26639 gaatcattgcttgggtatgcatatt 26663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 109 - 256
Target Start/End: Original strand, 8180 - 8327
Alignment:
Q  109 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||| |||||     
T  8180 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattacaggttcaa 8279  T
Q  209 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 256  Q
     |||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||  |||||||||    
T  8280 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt 8327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 6884 - 6934
Alignment:
Q  1 taaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 51  Q
    |||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  6884 taaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 6934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 146 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 43224 - 43009
Alignment:
Q  146 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 245  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43224 tgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgaagattgtgctaaa 43125  T
Q  246 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 345  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43124 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcgtgttcaagtgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 43025  T
Q  346 gggtatgcatattcat 361  Q
    |||| |||||||||||    
T  43024 gggtttgcatattcat 43009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 34 - 361
Target Start/End: Original strand, 36836 - 37164
Alignment:
Q  34 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| ||||||||    
T  36836 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaaattcg 36935  T
Q  132 tactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 231  Q
    | |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  36936 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 37035  T
Q  232 aagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 331  Q
    || |||||||||||  ||||||||| | ||||||||| |||   ||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||| || || |||    
T  37036 aaaattgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgaatcttgttcaattgacgttatggctgttaattgatgttgtggttg 37134  T
Q  332 atgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37135 atgaatcattgcttgggtatgcatattcat 37164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Original strand, 15334 - 15398
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 66  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  15334 aaagtgaagcttgggctaatagttggagataattaaggtaagggggttagcattcatcataatca 15398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 38 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 19543 - 19218
Alignment:
Q  38 ggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt-gtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtac 134  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||| |    
T  19543 ggtaagggggttagtcttcatcataatcatcataatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgc 19444  T
Q  135 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 234  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  19443 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 19344  T
Q  235 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 334  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  ||||||    
T  19343 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatg 19245  T
Q  335 aataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19244 aatcattgcttgggtatgcatattcat 19218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 109 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 21553 - 21302
Alignment:
Q  109 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||     
T  21553 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 21454  T
Q  209 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 308  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||     
T  21453 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttatt 21355  T
Q  309 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21354 gctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcat 21302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 272362 - 272037
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtac 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | | ||||||||| |||||    
T  272362 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatattgtataaattttgattatggataaatattgctaaatacgtac 272263  T
Q  135 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 234  Q
    ||||||| |  || |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||     
T  272262 tccaactgtaatgatatgtttgtatgaatgaattgatgataattgtatgattgatggagaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 272163  T
Q  235 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 334  Q
    |||||||||||  ||||||||| | ||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||| || ||||||   ||||| ||||| || || ||||||    
T  272162 attgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattggtgttatagctgttaattgatgttgtggttgatg 272064  T
Q  335 aataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||    
T  272063 aatcattgcttgggtatgcatattcat 272037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 35 - 361
Target Start/End: Original strand, 128095 - 128419
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtac 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |    
T  128095 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcattttgcaaattttcaaaagttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 128194  T
Q  135 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 234  Q
    | ||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| || || |||  || |||||| ||||     
T  128195 ttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaggtgttaagttgtgaaa 128294  T
Q  235 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 334  Q
    |||||||| ||  || |||||| |  || ||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||| || |||||||||    
T  128295 attgtgctcaattggcgaattt-tgttaggttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaatggatgttgtgattgatg 128392  T
Q  335 aataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    
T  128393 aataattgattgggtatgcatattcat 128419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 361
Target Start/End: Original strand, 31700 - 31916
Alignment:
Q  146 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 245  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||    
T  31700 tgttatgtttgaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctcaa 31799  T
Q  246 ggggtgaatttctcct-aagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgct 344  Q
      |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31800 ttggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttaatattatgattgatgaataattgct 31899  T
Q  345 tgggtatgcatattcat 361  Q
    ||||| |||||||||||    
T  31900 tgggtttgcatattcat 31916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 116 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 5785 - 5552
Alignment:
Q  116 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 215  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  5785 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgta 5686  T
Q  216 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 315  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5685 aaaatgataagtcatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 5586  T
Q  316 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggt 349  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  5585 tttgataatatgattaatgaataattgcttgggt 5552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 5878 - 5846
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5878 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 5846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 35 - 361
Target Start/End: Original strand, 123087 - 123415
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt-gtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 131  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  123087 taaggtaagggggttagtcttcaccataatcatcataatttttgtaaatttgcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 123186  T
Q  132 tactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 231  Q
    | |||||| | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||    
T  123187 tgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtg 123286  T
Q  232 aagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 331  Q
    || |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  || |||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||    
T  123287 aaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattaagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttg 123385  T
Q  332 atgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  123386 atgaataatggcttgggtatgcatattcat 123415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 146 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 262 - 47
Alignment:
Q  146 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||    
T  262 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgtatattgtgctcaa 163  T
Q  246 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 345  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  162 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgctt 63  T
Q  346 gggtatgcatattcat 361  Q
    |||| |||||||||||    
T  62 gggtttgcatattcat 47  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 30482 - 30417
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||| ||| || || |||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  30482 aaagtgaagcttgagttaataattggtgataattaaggtaagggggttatttttcatcataatcat 30417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 177 - 361
Target Start/End: Original strand, 64584 - 64768
Alignment:
Q  177 ttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatt 276  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  64584 ttgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatt 64683  T
Q  277 tgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  64684 tgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcat 64768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 116 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 108003 - 107759
Alignment:
Q  116 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 215  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  108003 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgca 107904  T
Q  216 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 315  Q
    ||||||||||||| | || |||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  107903 aaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgtta 107805  T
Q  316 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
     ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  107804 attgatgttgtgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcat 107759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 166
Target Start/End: Original strand, 89863 - 89905
Alignment:
Q  124 taaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 166  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  89863 taaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 89905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 37 - 255
Target Start/End: Original strand, 51110 - 51328
Alignment:
Q  37 aggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtactc 136  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  51110 aggtaaggagattagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctc 51209  T
Q  137 caactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagat 236  Q
    ||||| || || ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||| ||    
T  51210 caactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaataggtaaaaatgataagttgtgaaaat 51309  T
Q  237 tgtgctaaaggggtgaatt 255  Q
    |||||| ||  ||||||||    
T  51310 tgtgctcaattggtgaatt 51328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 116 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 48443 - 48199
Alignment:
Q  116 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 215  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |    
T  48443 attgttgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 48344  T
Q  216 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 315  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  48343 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatagatgtta 48245  T
Q  316 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
     ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  48244 attgatgttgtgattgatgaataattgcctgggtatgcatattcat 48199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 20553 - 20493
Alignment:
Q  6 tgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 66  Q
    ||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  20553 tgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 20493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 146 - 361
Target Start/End: Original strand, 21141 - 21355
Alignment:
Q  146 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 245  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||| || || ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  21141 tgttatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgagctcaa 21240  T
Q  246 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 345  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21241 ttggtgaattt-tcctaagttgttgttaatttgagattggattcttgttcaattgatgttatgaatgttatttgatgttatgattgatgaataattgctt 21339  T
Q  346 gggtatgcatattcat 361  Q
    | || |||||||||||    
T  21340 gagtttgcatattcat 21355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 146 - 361
Target Start/End: Original strand, 14086 - 14300
Alignment:
Q  146 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 245  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || || ||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14086 tgttatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttgaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgtgctcaa 14185  T
Q  246 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 345  Q
      ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14186 ttggtgaattt-tcctaagttgttgataatttgagattggattcttgttcaattaatgttatgaatgttgtttgatgttatgattgatgaataattgctt 14284  T
Q  346 gggtatgcatattcat 361  Q
    | || |||||||||||    
T  14285 gagtttgcatattcat 14300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 83 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 149012 - 148733
Alignment:
Q  83 tttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgt 180  Q
    ||||||||||||||||||||||   || || ||| ||||||| |||||| || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  149012 tttcaaatgttgtatgaatttttgcataattgataattgttgttaaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgt 148913  T
Q  181 ataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgag 280  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  148912 aagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgag 148814  T
Q  281 ttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
     | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||  || || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  148813 atttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgaagttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgtatattcat 148733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 35 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 9192 - 8861
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 128  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| ||||| |||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  9192 taaggtaagtgtgttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgtatttttcataattggataattgttgctaaat 9093  T
Q  129 tcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtt 228  Q
    |||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||    
T  9092 tcgtgctccatctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 8993  T
Q  229 atgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatga 328  Q
     |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||  ||||||| |||||||||   | ||| ||||| || |      
T  8992 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattaatgttcaattgatgttattgctattaattgatgttgttg 8894  T
Q  329 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  8893 ttgatgaatcattgcttgggtatacatattcat 8861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 35 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 146938 - 146843
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  146938 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttcctaaattc 146843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 35 - 255
Target Start/End: Original strand, 89378 - 89600
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 132  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  89378 taaggtaagggggttagtcttcatcatgatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttctatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 89477  T
Q  133 actccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 232  Q
     |||||||| || || ||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||| ||||||| |||    
T  89478 gctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaattataagttgtga 89577  T
Q  233 agattgtgctaaaggggtgaatt 255  Q
    | |||||||| ||  ||||||||    
T  89578 aaattgtgctcaattggtgaatt 89600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 160
Target Start/End: Original strand, 107708 - 107835
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcgt 132  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||| |||||||||||||    
T  107708 taaggtaagggggttagtcttcatcatgatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataatttttgctaaattcgt 107807  T
Q  133 actccaactatgttgttatgtttgtatg 160  Q
     |||||||| || || ||| ||||||||    
T  107808 gctccaactgtgatgatatatttgtatg 107835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 36 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 130911 - 130880
Alignment:
Q  36 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130911 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 130880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 146 - 361
Target Start/End: Original strand, 9374 - 9588
Alignment:
Q  146 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||    
T  9374 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaa 9473  T
Q  246 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 345  Q
      ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||    
T  9474 ttggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgctt 9572  T
Q  346 gggtatgcatattcat 361  Q
    ||||||||||||||||    
T  9573 gggtatgcatattcat 9588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 146 - 361
Target Start/End: Original strand, 16272 - 16486
Alignment:
Q  146 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||    
T  16272 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaa 16371  T
Q  246 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 345  Q
      ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||    
T  16372 ttggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgctt 16470  T
Q  346 gggtatgcatattcat 361  Q
    ||||||||||||||||    
T  16471 gggtatgcatattcat 16486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 159 - 361
Target Start/End: Original strand, 5254 - 5454
Alignment:
Q  159 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttct 258  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||  ||||||||| |    
T  5254 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt-t 5352  T
Q  259 cctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatatt 358  Q
     || |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  5353 gctgagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttgtgattaatgaataattgcttgggt-tgcatatt 5451  T
Q  359 cat 361  Q
    |||    
T  5452 cat 5454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 159 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 3936 - 3734
Alignment:
Q  159 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa-tgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttc 257  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | ||||||   ||  |||||||||     
T  3936 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaaatgataagttatggaaattgtgtccaattggtgaattt- 3838  T
Q  258 tcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatat 357  Q
    | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  3837 tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattacttgggtttgcatat 3738  T
Q  358 tcat 361  Q
    ||||    
T  3737 tcat 3734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 121 - 267
Target Start/End: Original strand, 1304 - 1450
Alignment:
Q  121 tgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 220  Q
    |||||||||||| |||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1304 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 1403  T
Q  221 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttg 267  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  1404 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttg 1450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 109 - 360
Target Start/End: Original strand, 534 - 784
Alignment:
Q  109 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  534 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 633  T
Q  209 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 308  Q
    ||| | | ||||||| |||| |||| ||||| || ||  ||||||||| | |||||||  |||||  || |||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  634 ataggaacaaatgatgagttgtgaaaattgtactcaattggtgaattt-tgctaagttactgttagattaagttatgattcttgtttaattgatgttatg 732  T
Q  309 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattca 360  Q
      || || ||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  733 gctgctaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattca 784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 109 - 361
Target Start/End: Original strand, 34460 - 34712
Alignment:
Q  109 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 208  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  34460 atggataattattgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 34559  T
Q  209 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttg-ttcaaatgatgttat 307  Q
     | || ||||||   ||||| |||| ||||| || ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| || || || |||||||||    
T  34560 ttgtgtaaaaatatgaagttgtgaaaattgttctcaataggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttat 34658  T
Q  308 gaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
       ||||||||||| || |  ||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  34659 tgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactacttgggtatgcatattcat 34712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 120 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 3215 - 2974
Alignment:
Q  120 ttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 219  Q
    ||||||||||||| |||   || || |||||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  3215 ttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaa 3116  T
Q  220 tgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttg-ttcaaatgatgttatgaatgttattt 318  Q
    ||  ||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| || || || |||||||||   ||||||||    
T  3115 tgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttattt 3017  T
Q  319 gatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    ||| || |  ||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  3016 gatgttgttgttgatgaatcactgcttgtgtatgcatattcat 2974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 109 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 13769 - 13636
Alignment:
Q  109 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  13769 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 13670  T
Q  209 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgct 242  Q
     |||| |||||||  ||||| |||| ||||||||    
T  13669 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgct 13636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 42739 - 42677
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42739 aaagtgaagctagagctaatagttggagataa---aggtaagggggttagtttttatcataatcat 42677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 13856 - 13824
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13856 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 13824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 109 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 41911 - 41660
Alignment:
Q  109 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 208  Q
    |||||| ||||||| ||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  41911 atggataattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 41812  T
Q  209 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 308  Q
     |||| |||||||  ||||| |||| |||||| | ||  ||||||||| | ||| ||||||||| | ||  | || ||  | ||||||| ||||||| |     
T  41811 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 41713  T
Q  309 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
      |||||  |||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41712 gttgttaaatgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcat 41660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 41997 - 41957
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattt 75  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||    
T  41997 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcattt 41957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 146 - 277
Target Start/End: Original strand, 13350 - 13480
Alignment:
Q  146 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||    
T  13350 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaa 13449  T
Q  246 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaattt 277  Q
      ||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  13450 ttggtgaattt-tgctaagttattgttaattt 13480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 109 - 361
Target Start/End: Original strand, 37066 - 37316
Alignment:
Q  109 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  37066 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37165  T
Q  209 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 308  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||  |  | ||||| |||   ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |     
T  37166 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttggattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 37263  T
Q  309 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
     ||| || | ||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  37264 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcat 37316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 41697 - 41632
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  41697 aaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatcat 41632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 36980 - 37012
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36980 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 37012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 4)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 109 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 27058 - 26911
Alignment:
Q  109 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  27058 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 26959  T
Q  209 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 256  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  26958 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 26911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 116 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22796 - 22656
Alignment:
Q  116 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 215  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||      
T  22796 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtg 22697  T
Q  216 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 256  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  22696 aaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 22656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 22889 - 22857
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22889 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 27144 - 27112
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27144 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 27112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 109 - 256
Target Start/End: Original strand, 1582 - 1729
Alignment:
Q  109 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 208  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  1582 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 1681  T
Q  209 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 256  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  1682 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 1729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 1496 - 1528
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1496 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 1528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 267 - 361
Target Start/End: Original strand, 9 - 103
Alignment:
Q  267 gttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9 gttgttaatttgatatttgattcttgttcaaatgatattatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcat 103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 267 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 48620 - 48526
Alignment:
Q  267 gttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48620 gttgttaatttgagatttgattcttgttcacttgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcat 48526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 80252 - 80187
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80252 aaagtgaagcttgagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 80187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 68
Target Start/End: Original strand, 162045 - 162111
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatc 68  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  162045 aaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatc 162111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 68
Target Start/End: Original strand, 166131 - 166197
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatc 68  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  166131 aaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatc 166197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 116417 - 116483
Alignment:
Q  1 taaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  116417 taaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttagatttcatcataatcat 116483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Original strand, 5744 - 5809
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  5744 aaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 5809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Original strand, 5950 - 6015
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  5950 aaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 6015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 67
Target Start/End: Original strand, 31147 - 31212
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  31147 aaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatcat 31212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 276 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 9479 - 9394
Alignment:
Q  276 ttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcat 361  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9479 ttgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcat 9394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 68
Target Start/End: Original strand, 319 - 385
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatc 68  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  319 aaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaacggggttattctttatcataatcatc 385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 109 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 3453 - 3360
Alignment:
Q  109 atggatgattgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacat 202  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||| | || || ||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  3453 atggataattgatgctaaattcgtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggtgaaattacat 3360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 1765 - 1701
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 66  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  1765 aaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 1701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 158 - 94
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 66  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  158 aaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 94  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Original strand, 19817 - 19881
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 66  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19817 aaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 19881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 6 - 66
Target Start/End: Original strand, 24125 - 24185
Alignment:
Q  6 tgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 66  Q
    ||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  24125 tgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 24185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 66
Target Start/End: Original strand, 6271 - 6335
Alignment:
Q  2 aaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 66  Q
    ||||||||||| ||| || |||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  6271 aaagtgaagcttgagttaatagtgggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 6335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 66
Target Start/End: Original strand, 4 - 41
Alignment:
Q  29 gataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 66  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  4 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 41  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 1370 - 1436
Alignment:
Q  1 taaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||  || |||||||||||    
T  1370 taaagtgaagcttgagctaggaattggtgataattgaggtaagggggttagaattcatcataatcat 1436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 205
Target Start/End: Original strand, 56106 - 56195
Alignment:
Q  116 attgttgctaaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 205  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||| || |||||| || || ||||||| |||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  56106 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgtt 56195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 166
Target Start/End: Original strand, 70307 - 70348
Alignment:
Q  125 aaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 166  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  70307 aaattcgtactccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 70348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 57392 - 57424
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57392 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 67
Target Start/End: Original strand, 193396 - 193429
Alignment:
Q  34 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193396 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 193429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 6443 - 6475
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6443 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 6475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 878 - 910
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  878 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 9882 - 9914
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9882 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 9914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 13285 - 13317
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13285 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 13317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 55936 - 55904
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55936 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 55904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 108075 - 108107
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  108075 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 108107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 18058 - 18015
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt 78  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  18058 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcataattattttgt 18015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 8257 - 8174
Alignment:
Q  125 aaattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 207  Q
    |||||||| ||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||  ||||||||||| || ||||||||    
T  8257 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttca 8174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 207
Target Start/End: Original strand, 2317 - 2399
Alignment:
Q  126 aattcgtactccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 207  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  2317 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 2399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 45244 - 45198
Alignment:
Q  159 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 205  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  45244 tgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtt 45198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 45370 - 45338
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45370 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 45338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 35866 - 35816
Alignment:
Q  1 taaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttag 51  Q
    |||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  35866 taaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggggttag 35816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 17209 - 17241
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17209 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 17241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 5476 - 5508
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5476 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 5508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 4346 - 4378
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4346 taaggtaagggggttagactttatcataatcat 4378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 17304 - 17336
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17304 taaggtaagcgggttagtctttatcataatcat 17336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 5581 - 5549
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5581 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 5549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 34308 - 34340
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34308 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 34340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Original strand, 12418 - 12450
Alignment:
Q  35 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 67  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12418 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 12450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University