View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0758_low_5 (Length: 547)

Name: NF0758_low_5
Description: NF0758
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0758_low_5
NF0758_low_5
[»] chr6 (62 HSPs)
chr6 (37-540)||(18823209-18823712)
chr6 (37-540)||(18839064-18839567)
chr6 (166-524)||(32276601-32276959)
chr6 (37-304)||(4991002-4991270)
chr6 (89-351)||(19629314-19629575)
chr6 (166-351)||(16299991-16300176)
chr6 (37-157)||(18583264-18583384)
chr6 (84-184)||(31628245-31628346)
chr6 (397-527)||(19629612-19629740)
chr6 (397-527)||(16299825-16299953)
chr6 (72-332)||(35015187-35015447)
chr6 (434-532)||(13620644-13620743)
chr6 (90-180)||(16086001-16086091)
chr6 (87-332)||(26089716-26089960)
chr6 (59-234)||(18398890-18399065)
chr6 (87-332)||(18002526-18002770)
chr6 (72-332)||(19983322-19983581)
chr6 (201-369)||(22585539-22585707)
chr6 (201-369)||(22590370-22590538)
chr6 (84-184)||(22440911-22441012)
chr6 (37-158)||(17083373-17083496)
chr6 (72-185)||(18381851-18381965)
chr6 (119-184)||(18432656-18432721)
chr6 (65-217)||(25919571-25919723)
chr6 (84-184)||(32898767-32898868)
chr6 (436-527)||(15742058-15742150)
chr6 (84-180)||(16106499-16106590)
chr6 (201-351)||(15889717-15889867)
chr6 (434-527)||(18002333-18002427)
chr6 (65-234)||(22361885-22362054)
chr6 (87-320)||(23994902-23995136)
chr6 (84-176)||(25744390-25744483)
chr6 (202-332)||(25640585-25640715)
chr6 (88-185)||(25367405-25367503)
chr6 (434-508)||(26090059-26090133)
chr6 (84-184)||(13014878-13014979)
chr6 (201-327)||(18583411-18583537)
chr6 (434-508)||(23148303-23148377)
chr6 (434-508)||(23153754-23153828)
chr6 (434-508)||(27751742-27751816)
chr6 (434-504)||(35009314-35009384)
chr6 (201-369)||(15004900-15005067)
chr6 (85-184)||(28195263-28195362)
chr6 (87-185)||(33324673-33324772)
chr6 (87-185)||(35136180-35136279)
chr6 (434-508)||(23995247-23995321)
chr6 (87-332)||(15742249-15742498)
chr6 (87-177)||(18777126-18777217)
chr6 (72-234)||(21623133-21623295)
chr6 (434-508)||(29666181-29666255)
chr6 (165-251)||(29869886-29869971)
chr6 (76-217)||(33538506-33538647)
chr6 (434-467)||(1657660-1657693)
chr6 (434-467)||(15862789-15862822)
chr6 (87-217)||(19854135-19854265)
chr6 (68-217)||(25651197-25651347)
chr6 (64-217)||(29605406-29605560)
chr6 (85-146)||(15740207-15740269)
chr6 (205-351)||(17374930-17375076)
chr6 (166-307)||(23221976-23222116)
chr6 (434-466)||(1650021-1650053)
chr6 (434-466)||(18583640-18583672)
[»] chr4 (76 HSPs)
chr4 (37-540)||(16522748-16523252)
chr4 (85-527)||(8044920-8045365)
chr4 (166-532)||(14500046-14500412)
chr4 (37-365)||(9295624-9295953)
chr4 (167-532)||(32460537-32460890)
chr4 (85-345)||(14996107-14996366)
chr4 (85-351)||(19697383-19697648)
chr4 (85-351)||(19707968-19708233)
chr4 (166-351)||(9795276-9795461)
chr4 (434-540)||(9795533-9795639)
chr4 (434-540)||(19020793-19020899)
chr4 (84-183)||(45459025-45459124)
chr4 (72-184)||(34395222-34395335)
chr4 (59-332)||(14951713-14951987)
chr4 (397-527)||(19697217-19697346)
chr4 (397-527)||(19707802-19707931)
chr4 (84-184)||(16732146-16732247)
chr4 (84-279)||(23270008-23270204)
chr4 (65-185)||(19821944-19822065)
chr4 (59-184)||(55376766-55376893)
chr4 (84-184)||(44055892-44055993)
chr4 (72-332)||(25119237-25119498)
chr4 (72-332)||(5682557-5682817)
chr4 (88-184)||(13809679-13809776)
chr4 (65-185)||(37957193-37957314)
chr4 (84-184)||(53704902-53705003)
chr4 (84-176)||(53907873-53907966)
chr4 (204-351)||(34177651-34177797)
chr4 (90-176)||(820090-820177)
chr4 (84-184)||(18494497-18494598)
chr4 (84-184)||(21959632-21959733)
chr4 (37-217)||(7185981-7186159)
chr4 (65-217)||(7964848-7965000)
chr4 (85-184)||(12837369-12837468)
chr4 (64-234)||(15044784-15044955)
chr4 (85-184)||(27960950-27961049)
chr4 (84-184)||(30457880-30457981)
chr4 (72-185)||(14901197-14901311)
chr4 (434-508)||(15674967-15675041)
chr4 (149-251)||(22738313-22738414)
chr4 (435-532)||(22738577-22738675)
chr4 (87-320)||(15272354-15272588)
chr4 (434-507)||(40885418-40885491)
chr4 (435-508)||(55376452-55376525)
chr4 (64-234)||(15109469-15109640)
chr4 (72-234)||(41166066-41166228)
chr4 (434-508)||(10104128-10104202)
chr4 (434-508)||(15135865-15135939)
chr4 (434-508)||(15272169-15272243)
chr4 (436-532)||(18248527-18248624)
chr4 (434-475)||(33241011-33241052)
chr4 (437-508)||(31132628-31132699)
chr4 (208-334)||(49071788-49071914)
chr4 (129-307)||(54398406-54398583)
chr4 (434-508)||(13246737-13246811)
chr4 (165-251)||(26339080-26339165)
chr4 (87-184)||(30232665-30232763)
chr4 (64-307)||(41256416-41256660)
chr4 (96-176)||(44346816-44346897)
chr4 (434-466)||(54118168-54118200)
chr4 (434-532)||(8378493-8378592)
chr4 (397-466)||(14996409-14996477)
chr4 (87-308)||(15013328-15013549)
chr4 (129-307)||(18238204-18238381)
chr4 (400-467)||(26680484-26680550)
chr4 (73-217)||(40905071-40905214)
chr4 (112-234)||(52265628-52265749)
chr4 (434-467)||(7850314-7850347)
chr4 (434-467)||(14952085-14952118)
chr4 (397-466)||(16327840-16327908)
chr4 (434-467)||(16609012-16609045)
chr4 (165-210)||(22352197-22352242)
chr4 (164-217)||(47468485-47468537)
chr4 (72-156)||(47535243-47535328)
chr4 (128-176)||(8872651-8872699)
chr4 (271-347)||(21417471-21417547)
[»] chr3 (101 HSPs)
chr3 (37-527)||(19946629-19947120)
chr3 (72-532)||(16933803-16934263)
chr3 (166-532)||(14285021-14285387)
chr3 (37-351)||(9303110-9303425)
chr3 (85-351)||(8275855-8276120)
chr3 (85-351)||(8268755-8269020)
chr3 (169-351)||(11477201-11477383)
chr3 (37-332)||(33341812-33342106)
chr3 (37-332)||(54685331-54685625)
chr3 (37-332)||(7853913-7854207)
chr3 (434-540)||(12901933-12902039)
chr3 (434-540)||(15938320-15938426)
chr3 (37-185)||(47784915-47785064)
chr3 (434-540)||(15936478-15936584)
chr3 (397-532)||(11477029-11477163)
chr3 (59-332)||(30152893-30153167)
chr3 (84-184)||(35123674-35123774)
chr3 (84-184)||(14298399-14298499)
chr3 (84-184)||(14304026-14304126)
chr3 (202-371)||(18970016-18970185)
chr3 (84-184)||(14295415-14295516)
chr3 (87-184)||(53898624-53898721)
chr3 (87-332)||(45581611-45581856)
chr3 (85-185)||(14059381-14059482)
chr3 (87-327)||(38167894-38168134)
chr3 (65-185)||(38811176-38811297)
chr3 (85-184)||(11329130-11329230)
chr3 (85-184)||(17139486-17139586)
chr3 (204-406)||(48421674-48421877)
chr3 (72-320)||(17956026-17956274)
chr3 (117-182)||(8631801-8631866)
chr3 (471-540)||(9302968-9303036)
chr3 (84-184)||(14528181-14528282)
chr3 (68-183)||(17523059-17523176)
chr3 (84-184)||(22144441-22144542)
chr3 (84-184)||(19570857-19570957)
chr3 (114-184)||(17938582-17938652)
chr3 (87-327)||(54038159-54038399)
chr3 (87-332)||(3992529-3992775)
chr3 (87-332)||(23492353-23492598)
chr3 (84-184)||(317677-317778)
chr3 (84-184)||(6146915-6147015)
chr3 (84-184)||(6154500-6154600)
chr3 (84-176)||(13817492-13817585)
chr3 (84-184)||(14301042-14301143)
chr3 (84-184)||(16182114-16182215)
chr3 (115-184)||(50112220-50112289)
chr3 (87-320)||(53771020-53771254)
chr3 (84-184)||(55441018-55441119)
chr3 (112-184)||(12349899-12349970)
chr3 (434-508)||(11986038-11986112)
chr3 (112-234)||(12488846-12488967)
chr3 (116-320)||(2844201-2844404)
chr3 (85-217)||(12560373-12560505)
chr3 (116-320)||(16261463-16261666)
chr3 (92-184)||(16996228-16996321)
chr3 (65-185)||(17960481-17960602)
chr3 (212-351)||(15550703-15550842)
chr3 (64-217)||(1990759-1990913)
chr3 (88-184)||(12349708-12349810)
chr3 (434-508)||(16261777-16261851)
chr3 (85-234)||(17191519-17191668)
chr3 (74-214)||(17204667-17204807)
chr3 (434-507)||(51960990-51961063)
chr3 (59-217)||(12952915-12953074)
chr3 (220-332)||(28558284-28558396)
chr3 (114-217)||(16880131-16880233)
chr3 (434-508)||(53771365-53771439)
chr3 (87-184)||(54423993-54424090)
chr3 (73-185)||(9590922-9591035)
chr3 (85-185)||(15876046-15876147)
chr3 (87-234)||(3576558-3576705)
chr3 (166-351)||(10912945-10913130)
chr3 (90-184)||(17100636-17100731)
chr3 (90-184)||(17101321-17101416)
chr3 (87-153)||(28558186-28558253)
chr3 (253-332)||(55513016-55513095)
chr3 (434-508)||(2050115-2050189)
chr3 (64-307)||(6228672-6228916)
chr3 (434-508)||(38168237-38168311)
chr3 (253-351)||(38375699-38375797)
chr3 (434-508)||(54651764-54651838)
chr3 (73-184)||(3578057-3578166)
chr3 (434-467)||(13839200-13839233)
chr3 (65-181)||(34559857-34559974)
chr3 (434-466)||(15857163-15857195)
chr3 (409-467)||(8268649-8268708)
chr3 (409-467)||(8275749-8275808)
chr3 (397-467)||(2449151-2449220)
chr3 (434-508)||(33342204-33342278)
chr3 (397-467)||(45861086-45861155)
chr3 (112-185)||(11061174-11061247)
chr3 (434-467)||(14842486-14842519)
chr3 (434-467)||(17912397-17912430)
chr3 (434-467)||(19260748-19260781)
chr3 (434-467)||(23492696-23492729)
chr3 (129-182)||(51961308-51961361)
chr3 (434-466)||(7854305-7854337)
chr3 (40-76)||(8901257-8901293)
chr3 (434-466)||(15615137-15615169)
chr3 (434-466)||(17955884-17955916)
[»] chr5 (53 HSPs)
chr5 (37-508)||(108686-109158)
chr5 (72-527)||(9730216-9730672)
chr5 (166-532)||(7528960-7529326)
chr5 (37-320)||(16105573-16105856)
chr5 (85-351)||(17909485-17909750)
chr5 (38-176)||(11583982-11584121)
chr5 (84-332)||(2031787-2032035)
chr5 (59-184)||(1168373-1168500)
chr5 (397-532)||(17909787-17909921)
chr5 (84-184)||(11337355-11337455)
chr5 (59-332)||(11342635-11342910)
chr5 (73-184)||(19405503-19405615)
chr5 (434-527)||(34939595-34939688)
chr5 (206-507)||(25004915-25005210)
chr5 (87-332)||(21650675-21650920)
chr5 (65-234)||(7728378-7728547)
chr5 (87-184)||(20712056-20712154)
chr5 (84-176)||(21397066-21397159)
chr5 (84-184)||(23466434-23466535)
chr5 (84-176)||(24475560-24475653)
chr5 (84-184)||(28261498-28261599)
chr5 (115-184)||(21906729-21906795)
chr5 (112-184)||(24183301-24183370)
chr5 (87-320)||(21204905-21205139)
chr5 (87-217)||(23493899-23494029)
chr5 (434-508)||(27182429-27182503)
chr5 (65-217)||(21616974-21617126)
chr5 (65-157)||(32966343-32966436)
chr5 (436-508)||(18530946-18531018)
chr5 (64-217)||(6456580-6456734)
chr5 (84-160)||(4865239-4865317)
chr5 (434-508)||(22053711-22053785)
chr5 (434-508)||(23507270-23507344)
chr5 (38-76)||(24225596-24225634)
chr5 (438-508)||(32951016-32951086)
chr5 (84-184)||(21646908-21647009)
chr5 (431-508)||(23981363-23981440)
chr5 (253-369)||(22662668-22662784)
chr5 (84-234)||(19862186-19862336)
chr5 (85-185)||(16595486-16595587)
chr5 (64-224)||(23981646-23981806)
chr5 (436-508)||(2032135-2032207)
chr5 (129-217)||(24084100-24084187)
chr5 (397-467)||(20623250-20623319)
chr5 (397-467)||(21233441-21233510)
chr5 (165-251)||(23328618-23328703)
chr5 (165-251)||(24616222-24616307)
chr5 (165-251)||(24712598-24712683)
chr5 (165-251)||(24745616-24745701)
chr5 (397-467)||(25900319-25900388)
chr5 (434-467)||(16105967-16106000)
chr5 (161-300)||(23417296-23417435)
chr5 (434-467)||(37053061-37053094)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (168-540)||(61048-61419)
scaffold0023 (434-508)||(48903-48977)
[»] chr8 (70 HSPs)
chr8 (72-527)||(3431114-3431570)
chr8 (166-532)||(22886387-22886753)
chr8 (85-532)||(21494290-21494725)
chr8 (166-351)||(22147498-22147683)
chr8 (85-351)||(18612386-18612651)
chr8 (85-351)||(18619291-18619556)
chr8 (72-351)||(2544916-2545191)
chr8 (414-540)||(16038713-16038839)
chr8 (397-540)||(2545229-2545371)
chr8 (84-184)||(20573361-20573461)
chr8 (397-527)||(22147720-22147849)
chr8 (87-351)||(16038892-16039156)
chr8 (397-525)||(18612688-18612815)
chr8 (84-182)||(20567329-20567427)
chr8 (84-182)||(20573522-20573620)
chr8 (84-332)||(41506839-41507087)
chr8 (65-217)||(38533607-38533759)
chr8 (84-184)||(20647998-20648099)
chr8 (84-184)||(41246635-41246736)
chr8 (84-168)||(20567184-20567268)
chr8 (72-332)||(24716892-24717152)
chr8 (85-184)||(21680980-21681080)
chr8 (84-184)||(20654074-20654175)
chr8 (65-185)||(22736006-22736127)
chr8 (72-234)||(23837163-23837325)
chr8 (84-184)||(25122513-25122614)
chr8 (87-184)||(20481585-20481683)
chr8 (84-184)||(19993223-19993324)
chr8 (85-184)||(39446935-39447034)
chr8 (82-185)||(15969794-15969897)
chr8 (72-234)||(21198272-21198434)
chr8 (65-217)||(5854572-5854724)
chr8 (209-351)||(21259502-21259644)
chr8 (84-184)||(37611645-37611746)
chr8 (59-161)||(29759893-29759997)
chr8 (87-332)||(274423-274668)
chr8 (87-332)||(641181-641426)
chr8 (87-332)||(826987-827232)
chr8 (205-371)||(17502259-17502425)
chr8 (201-332)||(22321476-22321607)
chr8 (204-334)||(23217974-23218104)
chr8 (72-185)||(31194492-31194606)
chr8 (64-217)||(33528383-33528535)
chr8 (118-267)||(22234890-22235038)
chr8 (65-217)||(26011452-26011604)
chr8 (116-332)||(39115285-39115500)
chr8 (201-332)||(24385782-24385913)
chr8 (205-334)||(4233953-4234082)
chr8 (434-508)||(24385610-24385684)
chr8 (434-508)||(43373350-43373424)
chr8 (73-217)||(27233204-27233348)
chr8 (64-217)||(18261608-18261762)
chr8 (424-466)||(16404900-16404942)
chr8 (397-467)||(22907127-22907196)
chr8 (65-217)||(15933256-15933408)
chr8 (112-185)||(23226244-23226317)
chr8 (73-217)||(33611190-33611334)
chr8 (129-345)||(45558946-45559161)
chr8 (114-185)||(23152001-23152072)
chr8 (87-217)||(38635785-38635915)
chr8 (397-467)||(5238368-5238437)
chr8 (434-464)||(17345887-17345917)
chr8 (397-467)||(24661161-24661230)
chr8 (434-504)||(41506671-41506741)
chr8 (397-467)||(43685827-43685896)
chr8 (435-508)||(7000478-7000551)
chr8 (64-185)||(23149736-23149860)
chr8 (434-467)||(31194216-31194249)
chr8 (116-184)||(24385920-24385988)
chr8 (434-466)||(24716762-24716794)
[»] chr7 (68 HSPs)
chr7 (72-527)||(371055-371511)
chr7 (37-184)||(7284229-7284376)
chr7 (434-540)||(18253685-18253792)
chr7 (434-540)||(15862226-15862332)
chr7 (59-332)||(126366-126640)
chr7 (84-184)||(45452335-45452435)
chr7 (84-180)||(11287394-11287491)
chr7 (84-184)||(15822600-15822701)
chr7 (433-532)||(47480878-47480977)
chr7 (37-185)||(14272054-14272203)
chr7 (84-184)||(12758965-12759065)
chr7 (72-234)||(17224058-17224220)
chr7 (87-332)||(111299-111543)
chr7 (84-184)||(39046792-39046893)
chr7 (73-184)||(16570175-16570287)
chr7 (73-184)||(16595375-16595487)
chr7 (85-184)||(49047843-49047943)
chr7 (87-184)||(26070433-26070531)
chr7 (87-184)||(26094220-26094318)
chr7 (84-184)||(12248290-12248391)
chr7 (85-184)||(13274765-13274865)
chr7 (199-351)||(13352044-13352196)
chr7 (87-332)||(32494076-32494321)
chr7 (88-332)||(3049564-3049807)
chr7 (65-185)||(16915096-16915217)
chr7 (205-351)||(39291520-39291666)
chr7 (434-508)||(13321334-13321408)
chr7 (434-508)||(25124450-25124524)
chr7 (84-161)||(35094794-35094872)
chr7 (84-174)||(143622-143713)
chr7 (65-217)||(48356602-48356754)
chr7 (87-327)||(2028900-2029141)
chr7 (64-234)||(13377485-13377656)
chr7 (84-176)||(44865204-44865297)
chr7 (84-184)||(47289758-47289859)
chr7 (87-320)||(42056331-42056565)
chr7 (116-320)||(2190228-2190431)
chr7 (435-527)||(10000225-10000318)
chr7 (112-217)||(31501179-31501283)
chr7 (65-217)||(34241325-34241477)
chr7 (434-508)||(2029244-2029318)
chr7 (165-251)||(10000480-10000565)
chr7 (434-508)||(36052971-36053045)
chr7 (434-508)||(42056146-42056220)
chr7 (201-334)||(15977869-15978002)
chr7 (435-527)||(48622521-48622614)
chr7 (72-161)||(1937200-1937290)
chr7 (87-184)||(3895005-3895103)
chr7 (397-467)||(7293297-7293366)
chr7 (434-508)||(11580619-11580693)
chr7 (434-508)||(13036896-13036970)
chr7 (434-508)||(15709469-15709543)
chr7 (434-508)||(16212071-16212145)
chr7 (165-251)||(16418558-16418643)
chr7 (435-532)||(16418805-16418903)
chr7 (87-307)||(20583601-20583821)
chr7 (397-467)||(30262042-30262111)
chr7 (64-214)||(4484683-4484834)
chr7 (87-182)||(12370011-12370107)
chr7 (283-351)||(17984759-17984827)
chr7 (434-504)||(36024452-36024523)
chr7 (397-467)||(11516508-11516577)
chr7 (397-467)||(14113902-14113971)
chr7 (397-467)||(14423553-14423621)
chr7 (397-467)||(15441477-15441546)
chr7 (129-182)||(25124153-25124206)
chr7 (434-466)||(111169-111201)
chr7 (129-217)||(15358820-15358907)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (85-532)||(6043-6492)
[»] chr2 (58 HSPs)
chr2 (37-465)||(24826615-24827044)
chr2 (166-527)||(17204391-17204753)
chr2 (168-508)||(33128107-33128446)
chr2 (85-532)||(28031068-28031516)
chr2 (37-320)||(25212977-25213261)
chr2 (166-352)||(15633273-15633459)
chr2 (434-540)||(7507683-7507789)
chr2 (37-234)||(19433452-19433649)
chr2 (434-540)||(23777888-23777994)
chr2 (84-184)||(4448302-4448402)
chr2 (65-185)||(3409-3529)
chr2 (84-184)||(271148-271248)
chr2 (73-184)||(22580028-22580140)
chr2 (72-332)||(22274688-22274947)
chr2 (84-184)||(28974026-28974127)
chr2 (72-184)||(25601989-25602102)
chr2 (84-184)||(27261783-27261884)
chr2 (84-184)||(32465835-32465936)
chr2 (37-234)||(43645824-43646020)
chr2 (72-332)||(22283921-22284180)
chr2 (87-332)||(9652926-9653172)
chr2 (84-184)||(23836874-23836975)
chr2 (73-184)||(24571461-24571572)
chr2 (202-351)||(7321612-7321761)
chr2 (87-184)||(36890854-36890952)
chr2 (65-185)||(722353-722474)
chr2 (64-217)||(24884643-24884796)
chr2 (434-508)||(25265261-25265335)
chr2 (85-185)||(25305423-25305524)
chr2 (118-279)||(25875994-25876154)
chr2 (87-240)||(19669222-19669376)
chr2 (435-532)||(5888480-5888578)
chr2 (435-532)||(21142203-21142301)
chr2 (434-508)||(24341267-24341341)
chr2 (68-234)||(67952-68119)
chr2 (83-185)||(31146348-31146451)
chr2 (434-508)||(463043-463117)
chr2 (165-251)||(5888740-5888825)
chr2 (166-307)||(9636805-9636945)
chr2 (84-184)||(6879414-6879515)
chr2 (397-466)||(19689315-19689383)
chr2 (116-320)||(21274091-21274293)
chr2 (112-185)||(24294691-24294764)
chr2 (435-508)||(32466177-32466249)
chr2 (434-466)||(19794629-19794661)
chr2 (68-185)||(23821773-23821892)
chr2 (68-185)||(23830852-23830971)
chr2 (434-508)||(9652754-9652828)
chr2 (397-467)||(14906353-14906422)
chr2 (397-467)||(17396566-17396635)
chr2 (434-508)||(22863235-22863309)
chr2 (165-251)||(23774197-23774282)
chr2 (397-467)||(23820352-23820421)
chr2 (255-345)||(25595168-25595258)
chr2 (434-467)||(36982363-36982396)
chr2 (74-185)||(19666495-19666607)
chr2 (434-466)||(22284278-22284310)
chr2 (129-217)||(24560868-24560955)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (85-532)||(5201-5647)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (68-532)||(5411-5875)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (169-532)||(17761-18124)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (168-467)||(17208-17506)
[»] chr1 (39 HSPs)
chr1 (72-434)||(21649967-21650329)
chr1 (166-345)||(20254373-20254552)
chr1 (397-540)||(20254595-20254736)
chr1 (84-184)||(21718206-21718306)
chr1 (84-184)||(35522488-35522588)
chr1 (59-332)||(15861456-15861728)
chr1 (59-332)||(22366970-22367243)
chr1 (65-185)||(27674755-27674875)
chr1 (84-184)||(49967628-49967728)
chr1 (112-184)||(9784269-9784341)
chr1 (73-184)||(51627833-51627945)
chr1 (72-234)||(20177140-20177302)
chr1 (87-332)||(21859991-21860236)
chr1 (85-176)||(22403287-22403379)
chr1 (66-148)||(22829629-22829712)
chr1 (65-185)||(19603055-19603176)
chr1 (84-176)||(41212046-41212139)
chr1 (65-185)||(38033842-38033962)
chr1 (77-327)||(44035006-44035255)
chr1 (434-508)||(20893509-20893583)
chr1 (72-184)||(13377009-13377122)
chr1 (72-185)||(41229107-41229221)
chr1 (65-185)||(20955607-20955728)
chr1 (90-185)||(36356461-36356557)
chr1 (73-215)||(21194980-21195122)
chr1 (165-251)||(7641044-7641129)
chr1 (434-508)||(20913335-20913409)
chr1 (87-184)||(35054736-35054834)
chr1 (116-184)||(27329924-27329992)
chr1 (434-508)||(20931650-20931724)
chr1 (165-251)||(22035508-22035593)
chr1 (434-508)||(37844332-37844406)
chr1 (397-467)||(51452773-51452842)
chr1 (65-185)||(37234028-37234149)
chr1 (129-217)||(8538047-8538134)
chr1 (129-217)||(8603286-8603373)
chr1 (112-184)||(22143530-22143602)
chr1 (434-466)||(41394527-41394559)
chr1 (434-466)||(45051726-45051758)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (167-532)||(34242-34607)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (37-370)||(130486-130819)
scaffold0028 (87-244)||(79519-79677)
scaffold0028 (434-508)||(89336-89410)
scaffold0028 (434-508)||(107666-107740)
[»] scaffold0001 (6 HSPs)
scaffold0001 (145-351)||(164976-165182)
scaffold0001 (84-184)||(60784-60884)
scaffold0001 (397-527)||(164810-164939)
scaffold0001 (84-178)||(70797-70892)
scaffold0001 (434-508)||(172210-172284)
scaffold0001 (434-508)||(177913-177987)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (85-345)||(49864-50124)
scaffold0029 (397-532)||(49686-49820)
[»] scaffold0162 (5 HSPs)
scaffold0162 (166-352)||(11805-11990)
scaffold0162 (434-508)||(12063-12137)
scaffold0162 (434-507)||(8051-8125)
scaffold0162 (92-185)||(7193-7287)
scaffold0162 (434-508)||(26298-26372)
[»] scaffold0833 (1 HSPs)
scaffold0833 (37-184)||(3230-3377)
[»] scaffold1867 (1 HSPs)
scaffold1867 (37-184)||(75-222)
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (37-184)||(283-430)
scaffold0310 (37-113)||(6603-6679)
[»] scaffold0158 (3 HSPs)
scaffold0158 (37-184)||(24890-25036)
scaffold0158 (107-184)||(25213-25289)
scaffold0158 (435-508)||(25532-25605)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (37-180)||(21442-21586)
scaffold0120 (37-184)||(31141-31289)
[»] scaffold0032 (7 HSPs)
scaffold0032 (434-532)||(13201-13299)
scaffold0032 (166-250)||(13395-13479)
scaffold0032 (65-185)||(93940-94061)
scaffold0032 (116-327)||(55591-55801)
scaffold0032 (434-508)||(108033-108107)
scaffold0032 (87-182)||(104793-104889)
scaffold0032 (434-508)||(55904-55978)
[»] scaffold0574 (2 HSPs)
scaffold0574 (397-532)||(9345-9480)
scaffold0574 (87-351)||(9518-9782)
[»] scaffold0150 (2 HSPs)
scaffold0150 (37-234)||(28466-28663)
scaffold0150 (37-87)||(21637-21687)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (73-184)||(9903-10015)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (434-540)||(108053-108159)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (80-184)||(991-1096)
scaffold0673 (84-176)||(7025-7118)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (397-540)||(48468-48610)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (84-306)||(11616-11837)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (84-184)||(254983-255084)
scaffold0011 (84-184)||(261589-261690)
scaffold0011 (434-508)||(123045-123119)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (90-306)||(1300-1516)
scaffold0359 (84-176)||(11828-11921)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (87-351)||(94955-95223)
scaffold0037 (397-527)||(95262-95392)
scaffold0037 (87-184)||(24897-24995)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (434-532)||(41965-42063)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (84-184)||(745-846)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (434-527)||(7034-7127)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (72-327)||(31315-31570)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (72-327)||(41274-41529)
scaffold0078 (434-467)||(36979-37012)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (434-527)||(34312-34405)
scaffold0075 (72-247)||(4906-5081)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (84-184)||(109631-109732)
scaffold0035 (84-180)||(118136-118233)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (59-177)||(1332-1452)
[»] scaffold0480 (2 HSPs)
scaffold0480 (84-184)||(5415-5516)
scaffold0480 (84-184)||(9051-9152)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (84-180)||(8964-9061)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (84-184)||(687-788)
scaffold0195 (434-463)||(19514-19543)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (84-184)||(132419-132520)
scaffold0021 (84-184)||(11664-11765)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (84-184)||(85309-85410)
scaffold0014 (84-184)||(159279-159377)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (84-184)||(22668-22769)
scaffold0008 (434-509)||(128052-128127)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (84-184)||(11877-11977)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (84-182)||(24368-24467)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (204-369)||(1494-1659)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (72-332)||(30056-30319)
[»] scaffold0686 (3 HSPs)
scaffold0686 (72-327)||(6118-6373)
scaffold0686 (433-466)||(5777-5810)
scaffold0686 (433-466)||(5983-6016)
[»] scaffold0091 (2 HSPs)
scaffold0091 (84-287)||(32180-32383)
scaffold0091 (84-287)||(41920-42123)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (65-185)||(103090-103211)
scaffold0022 (84-184)||(112714-112812)
scaffold0022 (85-180)||(109568-109664)
scaffold0022 (166-307)||(68004-68145)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (87-332)||(79844-80089)
scaffold0034 (112-184)||(40664-40736)
scaffold0034 (434-466)||(80187-80219)
[»] scaffold0160 (3 HSPs)
scaffold0160 (87-184)||(1-99)
scaffold0160 (84-180)||(3496-3593)
scaffold0160 (435-508)||(339-412)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (73-182)||(31010-31120)
scaffold0031 (73-114)||(70595-70636)
[»] scaffold0597 (2 HSPs)
scaffold0597 (87-320)||(1020-1254)
scaffold0597 (434-508)||(836-910)
[»] scaffold1295 (1 HSPs)
scaffold1295 (204-406)||(203-406)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (85-184)||(7812-7912)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (87-332)||(17434-17679)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (72-234)||(76967-77129)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (118-184)||(7581-7647)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (87-332)||(12548-12795)
scaffold0039 (87-176)||(19086-19176)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (88-184)||(1897-1994)
[»] scaffold0251 (3 HSPs)
scaffold0251 (87-320)||(13428-13662)
scaffold0251 (434-508)||(13243-13317)
scaffold0251 (87-289)||(21433-21636)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (65-217)||(43935-44087)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (72-184)||(253158-253271)
scaffold0012 (434-508)||(34033-34107)
scaffold0012 (434-508)||(247324-247398)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (85-184)||(33897-33996)
[»] scaffold0004 (4 HSPs)
scaffold0004 (87-332)||(193518-193763)
scaffold0004 (87-327)||(186561-186801)
scaffold0004 (434-508)||(193355-193429)
scaffold0004 (64-214)||(27453-27604)
[»] scaffold0303 (3 HSPs)
scaffold0303 (434-532)||(4279-4378)
scaffold0303 (220-332)||(58-170)
scaffold0303 (220-320)||(4489-4589)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (201-351)||(44125-44275)
[»] scaffold0175 (2 HSPs)
scaffold0175 (87-332)||(14928-15174)
scaffold0175 (434-467)||(881-914)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (84-279)||(14854-15046)
scaffold0083 (84-176)||(14194-14287)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (201-334)||(5977-6110)
[»] scaffold0016 (6 HSPs)
scaffold0016 (72-327)||(162213-162469)
scaffold0016 (84-279)||(164192-164387)
scaffold0016 (72-155)||(166463-166547)
scaffold0016 (72-179)||(116687-116795)
scaffold0016 (434-466)||(162078-162110)
scaffold0016 (434-466)||(166164-166196)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (84-184)||(38275-38376)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (85-184)||(3297-3397)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (68-234)||(270-436)
[»] scaffold0706 (2 HSPs)
scaffold0706 (87-332)||(6573-6818)
scaffold0706 (434-508)||(6401-6475)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (72-234)||(35444-35605)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (434-532)||(3505-3601)
[»] scaffold0009 (3 HSPs)
scaffold0009 (65-217)||(69415-69567)
scaffold0009 (434-506)||(272330-272402)
scaffold0009 (205-244)||(244920-244959)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (84-184)||(48124-48225)
scaffold0068 (84-184)||(61572-61673)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (434-532)||(45338-45437)
scaffold0066 (434-527)||(54724-54818)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (40-97)||(12990-13048)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (434-500)||(13824-13890)
[»] scaffold0465 (3 HSPs)
scaffold0465 (253-332)||(10013-10092)
scaffold0465 (87-184)||(10143-10241)
scaffold0465 (434-508)||(9840-9914)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (77-326)||(487-736)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (91-185)||(7994-8089)
scaffold0123 (434-470)||(8331-8367)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (201-327)||(3876-4002)
[»] scaffold0970 (1 HSPs)
scaffold0970 (64-224)||(2411-2572)
[»] scaffold0740 (1 HSPs)
scaffold0740 (84-157)||(4284-4358)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (434-508)||(9183-9257)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (68-185)||(6622-6740)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (65-217)||(2483-2635)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (435-527)||(11982-12075)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (64-234)||(2436-2607)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (37-77)||(12694-12734)
scaffold0017 (435-527)||(54182-54275)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (64-217)||(22559-22713)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (37-72)||(3392-3427)
[»] scaffold0601 (1 HSPs)
scaffold0601 (253-351)||(883-981)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (434-508)||(12418-12492)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (434-508)||(1430-1504)
scaffold0266 (434-508)||(3466-3540)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (165-251)||(23859-23944)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (434-508)||(57350-57424)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (434-508)||(9160-9234)
scaffold0025 (434-508)||(146906-146980)
scaffold0025 (87-184)||(146581-146679)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (165-251)||(7270-7355)
scaffold0003 (435-532)||(7517-7615)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (65-185)||(30978-31099)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (114-185)||(10670-10741)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (449-527)||(9203-9282)
scaffold0215 (449-527)||(16101-16180)
[»] scaffold0077 (3 HSPs)
scaffold0077 (64-217)||(6500-6654)
scaffold0077 (87-176)||(15651-15741)
scaffold0077 (434-466)||(36837-36869)
[»] scaffold1734 (1 HSPs)
scaffold1734 (72-129)||(1364-1422)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (434-504)||(10218-10288)
[»] scaffold0447 (2 HSPs)
scaffold0447 (112-186)||(4569-4643)
scaffold0447 (112-186)||(9183-9257)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (165-251)||(6658-6743)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (397-467)||(22821-22890)
scaffold0141 (397-467)||(27076-27145)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (397-467)||(1495-1564)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (434-508)||(55971-56045)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (65-217)||(197390-197545)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (434-467)||(5989-6022)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (133-185)||(11121-11173)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (129-217)||(4628-4715)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (112-184)||(33668-33740)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 452; Significance: 0; HSPs: 62)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 37 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 18823712 - 18823209
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18823712 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaagccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 18823613  T
Q  137 catggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18823612 catggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccgcaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaa 18823513  T
Q  237 gcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcacca 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18823512 gcataacttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcacca 18823413  T
Q  337 aaacaagagtacgaaaattagagattgggttcatatgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatg 436  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18823412 aaacaagagcacgaaaattagagattgggttcatatgaattctcactcacttaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatg 18823313  T
Q  437 attatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccccttt 536  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18823312 attatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgattaatccaaacttaaacttcactttagctcctaattctccaatctttaagttttcccccttt 18823213  T
Q  537 gcta 540  Q
    ||||    
T  18823212 gcta 18823209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 37 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 18839567 - 18839064
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 136  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18839567 acatcatcaaaatcaaacttcttctttttcaactcattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 18839468  T
Q  137 catggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18839467 catggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaataacatgtcataagtcatcaattaa 18839368  T
Q  237 gcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcacca 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18839367 gcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcagttaacatactcaaacttatcacca 18839268  T
Q  337 aaacaagagtacgaaaattagagattgggttcatatgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatg 436  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18839267 aaacaagagcacgaaaattagagattgggttcatatgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatg 18839168  T
Q  437 attatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccccttt 536  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18839167 attatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgattaatccaaacttaagcttcactttagcttctaattctccaatctttaagttttcccccttt 18839068  T
Q  537 gcta 540  Q
    ||||    
T  18839067 gcta 18839064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 166 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 32276959 - 32276601
Alignment:
Q  166 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcata 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32276959 caacaacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaattcaacaataacatgtcacaattcatcaattaagcataatttcacaactacccattttcata 32276860  T
Q  266 cattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaaaattagagattggg 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||    
T  32276859 cattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattggg 32276760  T
Q  366 ttcatatgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaac-aaacaattatgattatgatgaagactaacccccttacct 464  Q
    |||| || ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32276759 ttcagataaatacttgctcaattaagcactttttcatacaaataaag-aaaattgcaaacaaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttacct 32276661  T
Q  465 taggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaag 524  Q
    ||| | ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32276660 tagataatgattaatccaaacttaagcttcactttagctcctaattcttcaatcttcaag 32276601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 37 - 304
Target Start/End: Original strand, 4991002 - 4991270
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattt-ctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaag 135  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||| | |||||||    
T  4991002 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag 4991101  T
Q  136 ccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta 235  Q
    |||    | || |||||||||||  |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4991102 ccaaaattcatgatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacaccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta 4991201  T
Q  236 agcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcattta 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  4991202 agcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatattatttcatcatcaaccattcattta 4991270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 89 - 351
Target Start/End: Original strand, 19629314 - 19629575
Alignment:
Q  89 acaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaact 188  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||   ||| | |||||||||||  || || | |||||||||| |  | ||||||||||||||||| || ||    
T  19629314 acaacaactcatttctcaccaacaatcatgatatatgaacacccaagccata-atcataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaattaaatct 19629412  T
Q  189 tgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatc 288  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19629413 tgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatc 19629512  T
Q  289 accaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaa 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  19629513 accaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccacaacaagagcacgaa 19629575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 166 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 16300176 - 16299991
Alignment:
Q  166 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcata 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16300176 caacaacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaattcaaccacaacatgtcataatttatcaattaggcataatttcacaacaacccattttcata 16300077  T
Q  266 cattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaa 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  16300076 cattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccgaaacaagagcacgaa 16299991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 37 - 157
Target Start/End: Original strand, 18583264 - 18583384
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18583264 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 18583363  T
Q  137 catggattatcatcaacaaca 157  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  18583364 catgaattatcatcaacaaca 18583384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Original strand, 31628245 - 31628346
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31628245 caccaacaacatctcatttctccacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 31628344  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  31628345 ga 31628346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 397 - 527
Target Start/End: Original strand, 19629612 - 19629740
Alignment:
Q  397 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaa-caattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttca 495  Q
    ||||||||||  |||| |||||| |||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19629612 tttcatacaa--caaggaaaattccaaacaaaacaatcatgattatgaagaacactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaatttgagcttca 19629709  T
Q  496 ctttagctcctaattctccaatcttcaagttt 527  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19629710 c-ttagctcctaattctccaatcttcaagttt 19629740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 397 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 16299953 - 16299825
Alignment:
Q  397 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcac 496  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||  |||||||    
T  16299953 tttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaacaatcatgattaagaagaagactaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaacttaggcttcac 16299856  T
Q  497 tttagctcctaattctccaatcttcaagttt 527  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16299855 tttagctcctaattcttcaatcttcaagttt 16299825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 72 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 35015447 - 35015187
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaaca 170  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||  | |||||    
T  35015447 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaaca 35015348  T
Q  171 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaa-catgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacatt 269  Q
    |||||| | |||| | | |||  || | | ||||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| ||||||||||||||||     
T  35015347 acaacaaccattg-atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatc 35015250  T
Q  270 atgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 332  Q
    |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  35015249 atgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatc 35015187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 434 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 13620743 - 13620644
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa-ttctccaatcttcaagttttcccc 532  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  13620743 atgattatgaagaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaactcaggcttcactttagctcctaatttcttcaatcttcaagttttcccc 13620644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 90 - 180
Target Start/End: Original strand, 16086001 - 16086091
Alignment:
Q  90 caacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaa 180  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16086001 caacatctcatttctccacataaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgaattatcattaacaacatgacatatcaacaacaacatcaa 16086091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 87 - 332
Target Start/End: Original strand, 26089716 - 26089960
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaa 186  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||| |||| | ||||| || || ||||||||||||| |||||      
T  26089716 caacaacaacttatttcacaacaacaattatgaatcatgcatacccaaaccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat- 26089814  T
Q  187 cttgattcacaccccaattcaacaacaac-atgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttc 285  Q
    | |||  |  | | ||||||| ||||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  26089815 catgaaacttatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacattatgaacttgcaatttc 26089913  T
Q  286 atcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 332  Q
    |||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  26089914 atcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatc 26089960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 59 - 234
Target Start/End: Original strand, 18398890 - 18399065
Alignment:
Q  59 tcattatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaaca 157  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||   ||  | |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18398890 tcataatcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaactcatttcttatcacaattcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcatcaacaaca 18398989  T
Q  158 tgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 234  Q
    | || || |||||||||||||||||| ||| ||| || || | |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  18398990 tcacttagcaacaacaacatcaattg-aacatgaatctcatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 18399065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 18002770 - 18002526
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaa 186  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||| | || || ||||||||||||| |||||      
T  18002770 caacaacaacttatttcacaacaacaagtatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacgtcacttaacaacaacaacatctattgat- 18002672  T
Q  187 cttgattcacaccccaattcaacaacaac-atgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttc 285  Q
    | |||  || | | ||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||    
T  18002671 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcatcaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttc 18002573  T
Q  286 atcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 332  Q
    |||| |||||||||||||| |||  ||| |||||| |||||| ||||    
T  18002572 atcatcaacaattcatttaacatcaaatgaacatattcaaacatatc 18002526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 19983581 - 19983322
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaaca 170  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||  | |||||    
T  19983581 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaaca 19983482  T
Q  171 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaa-catgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacatt 269  Q
    |||||| | | | || | |||  || | | ||||||| |||||| |||| ||||| |||  |||| |||||| ||| | ||| ||||||||||||||||     
T  19983481 acaacaaccact-aaccatgaaacatatcacaattcatcaacaatcatg-cataattcactaattgagcatagtttta-aactacccattttcatacatc 19983385  T
Q  270 atgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 332  Q
    |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  19983384 atgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatc 19983322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 201 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22585707 - 22585539
Alignment:
Q  201 caattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaa-caacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||| | ||||||||  |||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  22585707 caattcaacaacaacatgtcataattcttcaattgagcataatt-cacaaactacccatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaacaattc 22585609  T
Q  300 atttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaaaattagagattgggttca 369  Q
    | |||||||  |||||| |||||||||| |||||| | |||| ||| |||||  | | ||||||||||||    
T  22585608 aattatcatcaaattaaaatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttca 22585539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 201 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22590538 - 22590370
Alignment:
Q  201 caattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaa-caacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||| | ||||||||  |||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  22590538 caattcaacaacaacatgtcataattcttcaattgagcataatt-cacaaactacccatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaacaattc 22590440  T
Q  300 atttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaaaattagagattgggttca 369  Q
    | |||||||  |||||| |||||||||| |||||| | |||| ||| |||||  | | ||||||||||||    
T  22590439 aattatcatcaaattaaaatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttca 22590370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Original strand, 22440911 - 22441012
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaat 181  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  22440911 caccaacaacatctcatttctccataacaaaatcatgaatcatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacaacaat 22441009  T
Q  182 tga 184  Q
    |||    
T  22441010 tga 22441012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 17083496 - 17083373
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaa 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||   || | |||||||| | ||| | ||||||    
T  17083496 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttcacaaaaacaacaacaacaactcatttctaatcatcaaatcatgatttatgaacacccaa 17083397  T
Q  135 gccatggattatcatcaacaacat 158  Q
    |||||| || |||| |||||||||    
T  17083396 gccatgaatcatcaacaacaacat 17083373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 18381965 - 18381851
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaaca 170  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||| | |||||||||||| || |||| ||||||||| || || |||||    
T  18381965 atttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaaca 18381866  T
Q  171 acaacatcaattgaa 185  Q
    |||||||||||||||    
T  18381865 acaacatcaattgaa 18381851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 119 - 184
Target Start/End: Original strand, 18432656 - 18432721
Alignment:
Q  119 aatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  18432656 aatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacataacatatcaacaacatcatcaattga 18432721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 65 - 217
Target Start/End: Original strand, 25919571 - 25919723
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacat 163  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||  |||||| |||||||| ||| | |||||||||||| || |||| ||||||||| | ||    
T  25919571 tcaactcattttacaaagtcaccaacaataactcatttttcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcatat 25919670  T
Q  164 atcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 217  Q
    | |||||||||||||||||||| | || ||| || |  ||||||||||||||||    
T  25919671 agcaacaacaacatcaattgaa-catggttctcatcataattcaacaacaacat 25919723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Original strand, 32898767 - 32898868
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||    
T  32898767 caccaacatcatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccattaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacttcaatt 32898866  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  32898867 ga 32898868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 436 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 15742150 - 15742058
Alignment:
Q  436 gattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcct-aattctccaatcttcaagttt 527  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  15742150 gattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaacttaggcttcactttagctcctaaatccttcaatcttcaagttt 15742058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 84 - 180
Target Start/End: Original strand, 16106499 - 16106590
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaa 180  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||     | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16106499 caccaacaacatctcatttctccacataaatcatgaatcatgcaaa-----gtcatgaattatcattaacaacatgacatatcaacaacaacatcaa 16106590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 201 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 15889867 - 15889717
Alignment:
Q  201 caattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaa-caacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 299  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| || | ||||||| ||||| | ||||||||  |||||| |||||||||  ||||||||| |||||| ||    
T  15889867 caattcatcaacaacatgtcataattcatcagttgaacataatt-cacaaactacccatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaacaaatc 15889769  T
Q  300 atttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaa 351  Q
    | |||||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||| ||| |||||    
T  15889768 aattatcatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaa 15889717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 434 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 18002427 - 18002333
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcct-aattctccaatcttcaagttt 527  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||   |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  18002427 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggttatgattaatctaaacttagccttcactttagctcctaaatccttcaatcttcaagttt 18002333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 65 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22362054 - 22361885
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacat 163  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||||| |||||  || |||| ||||||| ||| | |||||||||||| || |||| |||||| || || |    
T  22362054 tcaacccattttacaaaactaacaacaacaactcaattctcatcatcaattcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt 22361955  T
Q  164 atcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 234  Q
    | |||||||||||||||||||| | ||| |  || | |||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  22361954 agcaacaacaacatcaattgaa-catgaatttcatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatt 22361885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 87 - 320
Target Start/End: Original strand, 23994902 - 23995136
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||  | |||||||||||| |||||||||||| |||| |||  | ||||| || || ||||||||||||| |||||    
T  23994902 caacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaacaacaacaacatctattga 23995001  T
Q  185 aacttgattcacaccccaattcaacaacaac-atgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatt 283  Q
      | |||  || | | ||||||| ||||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||    
T  23995002 t-catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatt 23995099  T
Q  284 tcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacata 320  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||  ||||||||||    
T  23995100 tcatcatcaaccattcatttaacatcaaattaacata 23995136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 25744483 - 25744390
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaaca 176  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| | | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  25744483 caccaacaacatctcatttctctacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaaca 25744390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 202 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 25640715 - 25640585
Alignment:
Q  202 aattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaa-caacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 300  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||| ||||| | ||||||||   ||||| |||||||||  ||||||||| ||| ||||||    
T  25640715 aattcaacaacaacatgtcacaattcatcaattgagcacaatt-cacaaactacccatttatctacatcatgaacatgcaatttcatcatcaaaaattca 25640617  T
Q  301 tttatcattcaattaacatactcaaacttatc 332  Q
     |||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  25640616 attatcatcaaattaacatactcaaacatatc 25640585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 88 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 25367503 - 25367405
Alignment:
Q  88 aacaacaactcatttctccacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    ||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||   |||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  25367503 aacaacatctcatttctcatcaacaattcatgaatcatgcacacccaagccatgaattatcgataacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 25367405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Original strand, 26090059 - 26090133
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||  |||||||||||||||||||    
T  26090059 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 26090133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 13014979 - 13014878
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaat 181  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||  ||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| || || || ||||| ||||    
T  13014979 caccaacaacatctcatttctccataacaaaatcaagaatcatgcaa-cccaagccacgaattatcatcaacaacatgacttaacatcagcaacaacaat 13014881  T
Q  182 tga 184  Q
    |||    
T  13014880 tga 13014878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 201 - 327
Target Start/End: Original strand, 18583411 - 18583537
Alignment:
Q  201 caattcaacaacaac-atgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 299  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  18583411 caattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattc 18583509  T
Q  300 atttatcattcaattaacatactcaaac 327  Q
    ||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  18583510 atttaacatcaaattaacatattcaaac 18583537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Original strand, 23148303 - 23148377
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  23148303 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 23148377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Original strand, 23153754 - 23153828
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  23153754 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 23153828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Original strand, 27751742 - 27751816
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||| |||||||  |||||| ||||||||||||    
T  27751742 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataaagattaatccaaacttaggcttcaatttagctcctaa 27751816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 35009384 - 35009314
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctc 504  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||| |||||||  |||||||||||||||    
T  35009384 atgattatgatgaagactaacccccttactttagataatgattaatccaaactttggcttcactttagctc 35009314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 15005067 - 15004900
Alignment:
Q  201 caattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcac-aacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| ||| ||||||||  |||||| || ||||||  ||||| ||| |||||||||    
T  15005067 caattcaacaacaacatgtcataattcatcaattgaacataa-ttcacaaactacccatttatatacatcataaacatgcaatttcctcatcaacaattc 15004969  T
Q  300 atttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaaaattagagattgggttca 369  Q
    | | | || |||| | |||||||||||| |||||| | |||| ||| |||||  | | ||||||||||||    
T  15004968 aatcaaca-tcaaattacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttca 15004900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 28195362 - 28195263
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 183  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| || |||| ||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||||    
T  28195362 accaacaacatctcatttctcaacaataaatcat-aattatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaaccacaacaattg 28195264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 185
Target Start/End: Original strand, 33324673 - 33324772
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    |||||||||||||||||||  || |||| ||||||| ||| | |||||||||||| || |||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||||    
T  33324673 caacaacaactcatttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaattgaa 33324772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 35136279 - 35136180
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    |||||||||||||||||||  || |||| ||||||| ||| | |||||||||||| || |||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||||    
T  35136279 caacaacaactcatttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaataacaacatcaattgaa 35136180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Original strand, 23995247 - 23995321
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  23995247 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 23995321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 15742498 - 15742249
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatca---att 182  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||| |||  | ||||| || || ||||||||||| ||   |||    
T  15742498 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaacaacaacaacaacatctatt 15742399  T
Q  183 gaaacttgattcacaccccaattcaacaacaac-atgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgtta 281  Q
    ||  | |||  || | | ||||||| ||||||| ||| ||||| ||| ||||| |||||||| |   ||  |||||||||||||||| |||||| ||  |    
T  15742398 gat-catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataatatacaaattacccattttcatacatcatgaacttgcaa 15742301  T
Q  282 tttcatcaccaacaattcattt-atcattcaattaacatactcaaacttatc 332  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||| ||||    
T  15742300 tttcatcatcaacaattcatttaatcatcaaattaacataatcaaacatatc 15742249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 177
Target Start/End: Original strand, 18777126 - 18777217
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacat 177  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||| || || ||||||||||||    
T  18777126 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacat 18777217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 234
Target Start/End: Original strand, 21623133 - 21623295
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaaca 170  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||| ||  | || |||||||||| ||| | ||||||||||||  | || | || |||||| || || |||||    
T  21623133 attttaccaaactaccaacaacaactcatttttcatccacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgactcattaacatcaacatcacttagcaaca 21623232  T
Q  171 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 234  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||  ||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  21623233 acaacatcaatag-aacatgattcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 21623295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Original strand, 29666181 - 29666255
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  |||| | ||||| ||| |||||||  |||||| ||||||||||||    
T  29666181 atgattatgatgaagactaacccacttatgttagataatgattaatccaaacttaggcttcaatttagctcctaa 29666255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 29869971 - 29869886
Alignment:
Q  165 tcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaac 251  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| | ||| || |||| ||||| ||| |||||||||||    
T  29869971 tcaacaacaacatccattgaaacttgtttctcacctcaattcaac-acaacttatcacaaatcattaattaggcaaaatttcacaac 29869886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 33538647 - 33538506
Alignment:
Q  76 tacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaa 174  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||  || | |||||||| | ||| | || ||||||||| || |||| |||||| || || || ||| |||||    
T  33538647 tacaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaataacaa 33538548  T
Q  175 catcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 217  Q
    |||||||| |||| |||||| || | ||||||||||| |||||    
T  33538547 catcaatt-aaacatgattctcatcacaattcaacaataacat 33538506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 1657693 - 1657660
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 467  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1657693 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 1657660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 467
Target Start/End: Original strand, 15862789 - 15862822
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 467  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15862789 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 15862822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 217
Target Start/End: Original strand, 19854135 - 19854265
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    |||||||||||||||||||  || ||| |||||| | ||| | |||||||| ||| || |||| |||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||    
T  19854135 caacaacaactcatttctcatcatcaattcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttagcaacaacaacatcaatt-aa 19854233  T
Q  186 acttgattcacaccccaattcaacaacaacat 217  Q
    || |||||| || | ||||||||||| |||||    
T  19854234 acatgattctcatcacaattcaacaataacat 19854265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 217
Target Start/End: Original strand, 25651197 - 25651347
Alignment:
Q  68 acccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatat 165  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||| | |||||  || | |||||||| | ||| | |||||||||||| || |||| |||||| || || ||     
T  25651197 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttaattctcatcatccaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttag 25651296  T
Q  166 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 217  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| || || |  ||||||||||||||||    
T  25651297 caacaacaacatcaattgaa-catgaatctcatcataattcaacaacaacat 25651347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 217
Target Start/End: Original strand, 29605406 - 29605560
Alignment:
Q  64 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgac 161  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||| ||||||| |||||||   | |||| ||||| | ||||| |||||| ||||| || |||| |||||| ||  |    
T  29605406 atcaacccatttttacaaaaccaacaagaacaacttatttctcattatcaattcatgatttatgcacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatttc 29605505  T
Q  162 atatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 217  Q
     || ||||||||||||||||| || | ||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  29605506 ttagcaacaacaacatcaatt-aagcatgattcacatcataattcaacaacaacat 29605560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 146
Target Start/End: Original strand, 15740207 - 15740269
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcatttctccacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatggattat 146  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  15740207 accaacaacatctcatttctcatcaacaattcatgaatcatgcacacccaaaccatgaattat 15740269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 205 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 17375076 - 17374930
Alignment:
Q  205 tcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcattta 304  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||| || |||||||||   |||  | |||| |  |||||  |||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||    
T  17375076 tcaacaacaacatgacatagttcatcatttgagcataattcatcaagtatccatatatatacaccatgaacatgtaatttcatcatcaataattcaatta 17374977  T
Q  305 tcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaa 351  Q
    |||   ||||| ||||||||||| |||||| | ||| |||| |||||    
T  17374976 tcaacaaattagcatactcaaacatatcactacaactagagcacgaa 17374930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 307
Target Start/End: Original strand, 23221976 - 23222116
Alignment:
Q  166 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta-agcataatttcacaacaacccattttcat 264  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||| || || | ||| |||||||||||||   | || ||| |||||| ||||||||| ||||| |  |||||||||     
T  23221976 caacaacaatatcaatt-aaacatgaatctcatcacaaatcaacaacaacataatacaattcaacaattagagcataatt-cacaatataccattttcac 23222073  T
Q  265 acattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatca 307  Q
    | ||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  23222074 atattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatca 23222116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 1650053 - 1650021
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1650053 atgattatgataaagactaacccccttacctta 1650021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 18583640 - 18583672
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18583640 atgattatgatgaaaactaacccccttacctta 18583672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 413; Significance: 0; HSPs: 76)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 413; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 37 - 540
Target Start/End: Original strand, 16522748 - 16523252
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattt-ctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaag 135  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||| | |||||||    
T  16522748 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag 16522847  T
Q  136 ccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta 235  Q
    ||||   | || |||||||||||  |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16522848 ccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacctcaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta 16522947  T
Q  236 agcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcacc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16522948 agcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcacc 16523047  T
Q  336 aaaacaagagtacgaaaattagagattgggttcatatgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattat 435  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16523048 aaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcatatgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattat 16523147  T
Q  436 gattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttccccctt 535  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16523148 gattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcataattctccaatcttcaagttttccccctt 16523247  T
Q  536 tgcta 540  Q
    |||||    
T  16523248 tgcta 16523252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 85 - 527
Target Start/End: Original strand, 8044920 - 8045365
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcatttctccacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 183  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||||| |||||   ||| | |||||||||||  || || |||||||||||  |  | || |||||||||||||||    
T  8044920 accaacaacatcttatttctcatcaacaattcatgatatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcagcaacaacatcaattg 8045019  T
Q  184 aaacttgattcacacccc--aattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgtta 281  Q
     |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8045020 gaacttgattcacacacctcaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattctcatacattatgaacatgtta 8045119  T
Q  282 tttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaaaattagagattgggttcatatgaattctca 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8045120 tttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcatataaattctca 8045219  T
Q  382 ctcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattc 481  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8045220 cttaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgattaattc 8045319  T
Q  482 aaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttt 527  Q
    ||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8045320 aaacttagacttcactttagctcctaattcttcaatcttcaagttt 8045365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 166 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 14500412 - 14500046
Alignment:
Q  166 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcata 265  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14500412 caacaacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcacaactacccattttcata 14500313  T
Q  266 cattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaaaattagagattggg 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||    
T  14500312 cattatgaacatgttatttcatcaccaataattcatttatcattaaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattggg 14500213  T
Q  366 ttcatatgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaac-aaacaattatgattatgatgaagactaacccccttacct 464  Q
    ||||||| ||| || ||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14500212 ttcatataaatacttactcaaacaagcactttttcatacaaacaaag-aaaattgcaagcaaaacaattatgattatgatgaagcctaacccccttacct 14500114  T
Q  465 taggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 532  Q
    ||| | ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14500113 tagataatgattaatccaaacttaagcttcactttagctcataattcttcaatcttcaagtttccccc 14500046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 37 - 365
Target Start/End: Original strand, 9295624 - 9295953
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattt-ctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaag 135  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||| | |||||||    
T  9295624 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaactcattttacataaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag 9295723  T
Q  136 ccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta 235  Q
    ||||   | || |||||||||||  |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9295724 ccataattcattatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta 9295823  T
Q  236 agcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcacc 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9295824 agcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcattaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcacc 9295923  T
Q  336 aaaacaagagtacgaaaattagagattggg 365  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9295924 aaaacaagagcacgaaaattagagattggg 9295953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 167 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 32460890 - 32460537
Alignment:
Q  167 aacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatac 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||             |||||| |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  32460890 aacaacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaatccaacaacaacatt------------aattaaccataatttcacaactaccccttttcatac 32460803  T
Q  267 attatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaaaattagagattgggt 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| | | |||||||||    
T  32460802 attatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaaattataaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggt 32460703  T
Q  367 tcatatgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaac-aaacaattatgattatgatgaagactaacccccttacctt 465  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32460702 tcatataaatacttactcaattaagcactatttcatacaatccaag-aaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgaagaagactaacccccttacctt 32460604  T
Q  466 aggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 532  Q
    || | ||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  32460603 agataatgattaatccaaacttaggcttcactttagctcctaattcttcaatcttcaagtttccccc 32460537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 85 - 345
Target Start/End: Original strand, 14996107 - 14996366
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||||||||||   ||| | |||||||||||  || || | |||||||||| |  | ||||||||||||||||| |    
T  14996107 accaacaacatcttatttctcaccaacaatcatgatatatgaacacccaagccata-atcataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaattaa 14996205  T
Q  185 aacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttattt 284  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14996206 aacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttattt 14996305  T
Q  285 catcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagag 345  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14996306 catcaccaacaattcttttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagag 14996366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 85 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 19697648 - 19697383
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||||||||||   ||| | |||||||||||  || || | |||||||||| |  | ||||||||||||||||| |    
T  19697648 accaacaacatcttatttctcaccaacaatcatgatatatgaacacccaagccata-atcataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaattaa 19697550  T
Q  185 aacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttattt 284  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19697549 aacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcataacaactcattctcatacattatgaacatgttattt 19697450  T
Q  285 catcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaa 351  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  19697449 cataactaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaaattatcaccaaaacaagagcacgaa 19697383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 85 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 19708233 - 19707968
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||||||||||   ||| | |||||||||||  || || | |||||||||| |  | ||||||||||||||||| |    
T  19708233 accaacaacatcttatttctcaccaacaatcatgatatatgaacacccaagccata-atcataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaattaa 19708135  T
Q  185 aacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttattt 284  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19708134 aacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcataacaactcattctcatacattatgaacatgttattt 19708035  T
Q  285 catcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaa 351  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  19708034 cataactaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaaattatcaccaaaacaagagcacgaa 19707968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 166 - 351
Target Start/End: Original strand, 9795276 - 9795461
Alignment:
Q  166 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcata 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || |||||| | |    
T  9795276 caacaacaacatcaattgaaacttgatttccacctcaattcaacaacaacatgtcataattcaccaattaaacataatttcacaactactcattttgaca 9795375  T
Q  266 cattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaa 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9795376 cattatgaacatgttatttcatcaccaagaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 9795461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 434 - 540
Target Start/End: Original strand, 9795533 - 9795639
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttccccc 533  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9795533 atgattatgatgataactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttccccc 9795632  T
Q  534 tttgcta 540  Q
    |||||||    
T  9795633 tttgcta 9795639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 434 - 540
Target Start/End: Original strand, 19020793 - 19020899
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttccccc 533  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  19020793 atgattatgatggtaactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcaccttagctcctaattctccaatcttcaagtttccccct 19020892  T
Q  534 tttgcta 540  Q
    |||||||    
T  19020893 tttgcta 19020899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 84 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 45459124 - 45459025
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 183  Q
    ||||||||||| || | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45459124 caccaacaacatcttaattctccacacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcttcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 45459025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 184
Target Start/End: Original strand, 34395222 - 34395335
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaaca 170  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34395222 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacatagcaaca 34395321  T
Q  171 acaacatcaattga 184  Q
    ||||||||||||||    
T  34395322 acaacatcaattga 34395335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 59 - 332
Target Start/End: Original strand, 14951713 - 14951987
Alignment:
Q  59 tcattatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaac 156  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||     
T  14951713 tcataatcaacccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatatatcatcatcaacaat 14951812  T
Q  157 atgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaa-catgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacc 255  Q
    |||||  |  |||||||||| | |||| | | |||  || | | ||||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||    
T  14951813 atgactaaataacaacaacaaccattg-atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacc 14951910  T
Q  256 cattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 332  Q
    ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  14951911 cattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatc 14951987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 397 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 19697346 - 19697217
Alignment:
Q  397 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaa-caattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttca 495  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||    
T  19697346 tttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgaagaacactaacccccttaccttaggttatgattaattcacacttaggcttca 19697249  T
Q  496 ctttagctcctaattctccaatcttcaagttt 527  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19697248 ctttacctcctaattcttcaatcttcaagttt 19697217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 397 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 19707931 - 19707802
Alignment:
Q  397 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaa-caattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttca 495  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||    
T  19707931 tttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgaagaacactaacccccttaccttaggttatgattaattcacacttaggcttca 19707834  T
Q  496 ctttagctcctaattctccaatcttcaagttt 527  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19707833 ctttacctcctaattcttcaatcttcaagttt 19707802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Original strand, 16732146 - 16732247
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  16732146 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacgacatcaatt 16732245  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  16732246 ga 16732247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 84 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 23270204 - 23270008
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  23270204 caccaacaacatctcatttctcaaccacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaatt 23270105  T
Q  183 gaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaaca-acccattttcatacattatgaacatgt 279  Q
    | | | |||| |  | | ||||||| ||||||||   ||||| ||||||||| || ||| |||||  ||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  23270104 g-atcatgatacttatcacaattcatcaacaacaatgcataattcatcaattgagtatattttcaacacatacccattttcatacactttgaacatgt 23270008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 65 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 19822065 - 19821944
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacat 163  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||||| ||| | |||||||||||| || |||| ||||||||| ||||    
T  19822065 tcaactcattttacaaagtcaccaaaaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacat 19821966  T
Q  164 atcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  19821965 agcaacaacaacatcaattgaa 19821944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 59 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 55376893 - 55376766
Alignment:
Q  59 tcattatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaac 156  Q
    |||| ||||||||||||| |  ||| |||||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  55376893 tcataatcaacccattttcatcaaaacaccaacatcatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaac 55376794  T
Q  157 atgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    || |  || ||||||||||| |||||||    
T  55376793 ataatttaacaacaacaacaacaattga 55376766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Original strand, 44055892 - 44055993
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  | | |||||||||||||||    
T  44055892 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatggctaaaccacaacaacatcaatt 44055991  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  44055992 ga 44055993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 72 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 25119498 - 25119237
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaac 169  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||  | ||||    
T  25119498 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaaattatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcattatcaacaatatgactaaacaac 25119399  T
Q  170 aacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaa-catgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacat 268  Q
    ||||||| | |||| | | |||  || | | ||||||| ||| || |||| ||||| ||| ||||| | ||||||||   ||| | ||||||||||||||    
T  25119398 aacaacaaccattg-atcatgaaacatatcacaattcatcaaaaaccatg-cataattcaccaattgatcataatttacaaactatccattttcatacat 25119301  T
Q  269 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 332  Q
     |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  25119300 catgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatc 25119237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 5682817 - 5682557
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaaca 170  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||  || ||||||||||| ||||   |  ||||    
T  5682817 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagacatatatcatcatcaacaatatgaataaaaaaca 5682718  T
Q  171 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaa-catgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacatt 269  Q
    |||||| | | | || | |||  || | | ||||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| ||||| ||||||||||     
T  5682717 acaacaaccaat-aatcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccaatttcatacatc 5682620  T
Q  270 atgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 332  Q
    |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  5682619 atgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatc 5682557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 88 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 13809776 - 13809679
Alignment:
Q  88 aacaacaactcatttctccacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||    
T  13809776 aacaacatctcatttctcaacaaccaatcatgaatcatgcatatccaagccatgaattatcatcaacaacatcaattagcaacaacaacatcaattga 13809679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 65 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 37957314 - 37957193
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacat 163  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||  |||||||| || |    
T  37957314 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttatcatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagccgtgaattatcaataacaacatcactt 37957215  T
Q  164 atcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    | || |||| ||||||||||||    
T  37957214 agcagcaaccacatcaattgaa 37957193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 53705003 - 53704902
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| | | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||    
T  53705003 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaatt 53704904  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  53704903 ga 53704902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 84 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 53907966 - 53907873
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaaca 176  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| | | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  53907966 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaatcaacaacaaca 53907873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 204 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 34177797 - 34177651
Alignment:
Q  204 ttcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcattt 303  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| | ||||||| | |||| ||||||||  |||||| |||||||||  |||| |||| |||||||||| ||    
T  34177797 ttcaacaacaacaagtcataattcaccaattgaacataatt-ctcaactacccatttatatacatcatgaacatgcaattttatcatcaacaattcaatt 34177699  T
Q  304 atcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaa 351  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||| ||| |||||    
T  34177698 atcatgtaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaa 34177651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 90 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 820177 - 820090
Alignment:
Q  90 caacaactcatttctccacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaaca 176  Q
    ||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  820177 caacatctcatttctccataacaaaatcatgaatcatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaaca 820090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 18494598 - 18494497
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||| || || |||||||| || |||||    
T  18494598 caccaacaacatctcatttctcaacaacaagtcatgaatcatgcatacccaagccatgagttaccatcaacaacatcacttaacaacaacagcaacaatt 18494499  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  18494498 ga 18494497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 21959733 - 21959632
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    |||||||||||  | ||||||| || |||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  21959733 caccaacaacatttaatttctcaaccacaaactatgaatcatgcaagcccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacatcaatt 21959634  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  21959633 ga 21959632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 37 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 7186159 - 7185981
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaa 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   | |||||||||||||| ||||  || | |||||||| | ||  | ||||||    
T  7186159 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttcacaaa---aacaacaacaactcatatctcatcatcaaatcatgatttataaacacccaa 7186063  T
Q  135 gccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 217  Q
    |||||| || |||| ||| || ||  | || ||||||||||||||||| |||| ||| || || | |||||||||||||||||    
T  7186062 gccatgaatcatcaacaataatatctcttagcaacaacaacatcaatt-aaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacat 7185981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 7965000 - 7964848
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacat 163  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  || | |||||||| | ||| | || ||||||||| || |||| |||||| || || |    
T  7965000 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt 7964901  T
Q  164 atcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 217  Q
    | ||||||||| ||||||| |||| |||||| || |  ||||||||||||||||    
T  7964900 agcaacaacaaaatcaatt-aaacatgattctcatcataattcaacaacaacat 7964848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 12837468 - 12837369
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 183  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||| || || ||||||||||||| ||||    
T  12837468 accaacaacaacttatttctc-acaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatccattg 12837370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Original strand, 15044784 - 15044955
Alignment:
Q  64 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgac 161  Q
    ||||||||||||| || ||| || ||||||||| | |||||||  || ||| |||||| | ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  15044784 atcaacccattttcaccaaagcaacaacaacaatttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcac 15044883  T
Q  162 atatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 234  Q
     || |||||||||||||||||||| | ||| ||  | | |||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  15044884 ttagcaacaacaacatcaattgaa-catgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcatcaatt 15044955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 85 - 184
Target Start/End: Original strand, 27960950 - 27961049
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 183  Q
    |||||||| | |||||||||| |||| || |||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  27960950 accaacaatatctcatttctcaacaataaatcat-aatcatgcatacccaaaccatgaattatcatcaacaacatcacttaacaacaacaacatcaattg 27961048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Original strand, 30457880 - 30457981
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaat 181  Q
    ||||||||||| |||||||||| | |||||  | |||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  30457880 caccaacaacatctcatttctctataacaaaataatgaattatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaaccacatgacttaacaacaacaacaacaat 30457978  T
Q  182 tga 184  Q
    |||    
T  30457979 tga 30457981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 185
Target Start/End: Original strand, 14901197 - 14901311
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaaca 170  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  || |||| ||||||| ||||| ||||| | |||| || |||| ||||| ||| || || |||||    
T  14901197 attttacaaaaccaccaacaacaacccatttctcatcatcaattcatgaattatgcacacccatgtcatgaatcatcaacaacagcatcacttagcaaca 14901296  T
Q  171 acaacatcaattgaa 185  Q
    |||||||||||||||    
T  14901297 acaacatcaattgaa 14901311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 15675041 - 15674967
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    |||||  |||||||||||||||||||    
T  15675041 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacctcaacttaggcttcactttagctcctaa 15674967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 251
Target Start/End: Original strand, 22738313 - 22738414
Alignment:
Q  149 tcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcac 248  Q
    ||||||||||| |  | ||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||   ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  22738313 tcaacaacatgtctaagcaacaacaacatccattggaacttgattcacactc-aattcaataacaactcatcataaaccatcaattaagcataatttcac 22738411  T
Q  249 aac 251  Q
    |||    
T  22738412 aac 22738414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 435 - 532
Target Start/End: Original strand, 22738577 - 22738675
Alignment:
Q  435 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaatt-ctccaatcttcaagttttcccc 532  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| | |||   |||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  22738577 tgattatgatgaagacaaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaggcttcactttagctcctaattgcttcaatcttcaagtttccccc 22738675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 15272588 - 15272354
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||  | |||||||||||| |||||||||||| |||| |||  | ||||| || || ||||||||||||| |||||    
T  15272588 caacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaacaacaacaacatctattga 15272489  T
Q  185 aacttgattcacaccccaattcaacaacaac-atgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatt 283  Q
       | ||  || | | ||||||| ||||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||    
T  15272488 tcatggaa-catatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatt 15272391  T
Q  284 tcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacata 320  Q
    |||||| |||| |||| |||| |||  ||||||||||    
T  15272390 tcatcatcaaccattcgtttaacatcaaattaacata 15272354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 434 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 40885491 - 40885418
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctccta 507  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  40885491 atgattatgatgaattctaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcactttagctccta 40885418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 435 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 55376525 - 55376452
Alignment:
Q  435 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||||    
T  55376525 tgattatgatgaagactaacccccttaccttagataaggatcaacccaaacttaggcttcaatttagctcctaa 55376452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15109640 - 15109469
Alignment:
Q  64 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgac 161  Q
    ||||||||||||| || ||| || ||||||||| | |||||||  || ||| |||||| | ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  15109640 atcaacccattttcaccaaagcaacaacaacaatttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacattac 15109541  T
Q  162 atatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 234  Q
     || |||||||||||||||||||| | ||| ||  | | |||||||||||||||||  ||||| | |||||||    
T  15109540 ttagcaacaacaacatcaattgaa-catgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataatttatcaatt 15109469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 41166228 - 41166066
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaaca 170  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||||||||  |||||| |||| | | ||| | ||||||||||||  | |||| ||||||||| || || |||||    
T  41166228 atttcacaaaaccacccacaacaactcatttctcatcaacaaatcataagttatgaatacccaagccatgattcatcaacaacaacatcacttagcaaca 41166129  T
Q  171 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 234  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||   || |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  41166128 acaacatcaattgaa-catgactcttgccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 41166066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 10104202 - 10104128
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    |||||  |||| ||||||||||||||    
T  10104202 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacctcaacttaggctttactttagctcctaa 10104128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 15135939 - 15135865
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  15135939 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 15135865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 15272243 - 15272169
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  15272243 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 15272169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 436 - 532
Target Start/End: Original strand, 18248527 - 18248624
Alignment:
Q  436 gattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaatt-ctccaatcttcaagttttcccc 532  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||||| | ||||| |||   ||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  18248527 gattatgataataactaacccccttaccttagatgatgattaatcttaacttaagcttcactttaactcctaattgcttcaatcttcaagtttccccc 18248624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 475
Target Start/End: Original strand, 33241011 - 33241052
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgat 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33241011 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgat 33241052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 437 - 508
Target Start/End: Original strand, 31132628 - 31132699
Alignment:
Q  437 attatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    |||||  ||| |||||||||||||||    
T  31132628 attatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacctcaacttaggctccactttagctcctaa 31132699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 208 - 334
Target Start/End: Original strand, 49071788 - 49071914
Alignment:
Q  208 acaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttca-caacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatc 306  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||  |  ||| | |||| || |||||||||  ||||||||| ||| |||||| ||| |    
T  49071788 acaacaacatgtcataattcatcaattgagcata-tttcatcaagtattcatatacatatatcatgaacatgcaatttcatcatcaataattcaattaac 49071886  T
Q  307 attcaattaacatactcaaacttatcac 334  Q
    ||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  49071887 atcaaattaacatactcaaacatatcac 49071914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 307
Target Start/End: Original strand, 54398406 - 54398583
Alignment:
Q  129 acccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtca 228  Q
    |||||||||||| || |||| |||||| ||  | || ||||||||||||||||| |||| |||||| || | ||| |||||||||||||  || || |||    
T  54398406 acccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcacaaatcaacaacaacataacacaattca 54398504  T
Q  229 tcaatta-agcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatca 307  Q
     |||||| |||| || ||||||| |    ||||||||| | ||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  54398505 acaattagagcacaa-ttcacaatatattattttcatatactatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatca 54398583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Original strand, 13246737 - 13246811
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  13246737 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 13246811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 251
Target Start/End: Original strand, 26339080 - 26339165
Alignment:
Q  165 tcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaac 251  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||| ||||| | ||| || |||| ||||||||| |||||||||||    
T  26339080 tcaacaacaacatccattgaaacttgtttctctcctcaattcaac-acaacttatcacaaatcattaattaagcaaaatttcacaac 26339165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 30232763 - 30232665
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||| | |||||| ||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||| || || ||||||||||||| |||||    
T  30232763 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaataatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatccattga 30232665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 41256660 - 41256416
Alignment:
Q  64 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgac 161  Q
    ||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||||  || | |||||||| | ||| | |||||| ||||| || |||| |||||| ||  |    
T  41256660 atcaacccatttttataaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatctc 41256561  T
Q  162 atatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaa-ttaagcataatttcacaacaacccattt 260  Q
     || ||||||||||||||||| |||| || ||| || | ||||||||||||||| |  || || ||| ||| || ||||||| ||||||| |   |||||    
T  41256560 ttaacaacaacaacatcaatt-aaacatggttctcatcacaattcaacaacaacctagcacaattcaacaatttgagcataa-ttcacaatatatcattt 41256463  T
Q  261 tcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatca 307  Q
    ||| | | ||||||||||  |||||| || |||||||||| ||||||    
T  41256462 tcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatca 41256416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 176
Target Start/End: Original strand, 44346816 - 44346897
Alignment:
Q  96 ctcatttctccacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaaca 176  Q
    |||||||||| ||||||| | | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||  | |||||||||||    
T  44346816 ctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacgacatcactaaacaacaacaaca 44346897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 54118200 - 54118168
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54118200 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 54118168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 434 - 532
Target Start/End: Original strand, 8378493 - 8378592
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaatt-ctccaatcttcaagttttcccc 532  Q
    ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||| | ||| | |||   ||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  8378493 atgattatgataataactaatccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaagcttcactttaactcctaattgcttcaatcttcaagtttccccc 8378592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 397 - 466
Target Start/End: Original strand, 14996409 - 14996477
Alignment:
Q  397 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaa-caattatgattatgatgaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  14996409 tttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgataataactaacccccttacctta 14996477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 15013549 - 15013328
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    ||||||||| |||||||||  || ||| |||||| | ||| | |||||||||||| || |||| |||||| ||  | || ||||||||| ||||||| ||    
T  15013549 caacaacaagtcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaatatcaatt-aa 15013451  T
Q  186 acttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaa-ttaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttattt 284  Q
    || |||||| || | ||||||||||||||| |  || || ||| ||| || ||||||| ||||||| |   |||||||| | | ||||||||||  ||||    
T  15013450 acatgattctcatcacaattcaacaacaacctagcacaattcaacaatttgagcataa-ttcacaatatgtcattttcacatactatgaacatgcaattt 15013352  T
Q  285 catcaccaacaattcatttatcat 308  Q
    || || |||||||||| |||||||    
T  15013351 caccaacaacaattcaattatcat 15013328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 18238381 - 18238204
Alignment:
Q  129 acccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtca 228  Q
    |||||||| ||| || |||| |||||| ||  | || ||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||||||||  || || |||    
T  18238381 acccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattca 18238283  T
Q  229 tcaatta-agcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatca 307  Q
     |||||| |||| || ||||||| |   |||||||| | | ||||||||||  |||||| || |||||||||| ||||||    
T  18238282 acaattagagcacaa-ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatca 18238204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 400 - 467
Target Start/End: Original strand, 26680484 - 26680550
Alignment:
Q  400 catacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 467  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26680484 catacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaac-atgattatgataaagactaacccccttaccttag 26680550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 40905214 - 40905071
Alignment:
Q  73 ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaa 171  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||  || | |||||||| | ||| | |||||||||| |  | |||| |||||| ||  | || ||||||    
T  40905214 ttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccacgagtcatcaacaacaatatctcttagcaacaa 40905115  T
Q  172 caacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 217  Q
    |||||||||||  ||| |||||| || | |||||||||||||||||    
T  40905114 caacatcaatt--aacatgattctcatcacaattcaacaacaacat 40905071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 52265749 - 52265628
Alignment:
Q  112 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaa 211  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||| || |||| || ||| || || || |||||||||||||||||||| | ||| ||  | | |||||||||||    
T  52265749 aatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacatcaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaa-catgaatcttatcacaattcaacaa 52265651  T
Q  212 caacatgtcataagtcatcaatt 234  Q
    ||||||  ||||| ||| |||||    
T  52265650 caacattgcataattcaacaatt 52265628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 467
Target Start/End: Original strand, 7850314 - 7850347
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 467  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7850314 atgattatggtgaagactaacccccttaccttag 7850347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 467
Target Start/End: Original strand, 14952085 - 14952118
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 467  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14952085 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 14952118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 16327908 - 16327840
Alignment:
Q  397 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16327908 tttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaac-atgattatgataaagactaacccccttacctta 16327840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 16609045 - 16609012
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 467  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16609045 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 16609012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 22352242 - 22352197
Alignment:
Q  165 tcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaaca 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  22352242 tcaacaacaacatccattgaaacttgtttctcacctcaattcaaca 22352197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 164 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 47468537 - 47468485
Alignment:
Q  164 atcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 217  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||||||||    
T  47468537 atcaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcacaattcaacaacaacat 47468485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 47535328 - 47535243
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaac 156  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||   ||| |||||||||| ||| | || ||||||||| || |||| |||||||    
T  47535328 attttacaaaaccatcaacaacaactcatttctcattaacaaatcatgaattatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaac 47535243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 8872699 - 8872651
Alignment:
Q  128 aacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaaca 176  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  8872699 aacccaagccatgagttatcatcaacaacatgactaaacaacaacaaca 8872651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Original strand, 21417471 - 21417547
Alignment:
Q  271 tgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagta 347  Q
    ||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||   |||| ||||| |||||| |||| | ||||||||||||    
T  21417471 tgaacatgaaatttcatcatcaacaattcaattatcaacaaattcacatattcaaacatatctctaaaacaagagta 21417547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 373; Significance: 0; HSPs: 101)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 373; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 37 - 527
Target Start/End: Original strand, 19946629 - 19947120
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 136  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19946629 acatcatcaaaatcaaacttctatattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 19946728  T
Q  137 catggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19946729 catggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacctcaattcaacaacaacatgtcataaatcatcaattaa 19946828  T
Q  237 gcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcacca 336  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19946829 gcataatttcacaactactcattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaatttatcacca 19946928  T
Q  337 aaacaagagtacgaaaattagagattgggttcatatgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgc-aaacaaacaattat 435  Q
    ||||||||| |||||| | | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  19946929 aaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcatataaattcttactcaattaagcattttttcaaacaaaccaag-aaaattgcaaaacaaacaattat 19947027  T
Q  436 gattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcct-aattctccaatcttcaagttt 527  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||    
T  19947028 gattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgattaatccaaacttaggcttcactttaactcctaaatccttcaatcttcaagttt 19947120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 16934263 - 16933803
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaa 171  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || |||||||   ||||||||||| | ||| | |||||||||||  || || | |||||||||| |  | ||||||    
T  16934263 atttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcacaaacaatcatgatttatgaatacccaagccataaatcataaacaacaacatgtctcagcaacaa 16934164  T
Q  172 caacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16934163 caacatcaattgaaacttgattctcaccttaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattat 16934064  T
Q  272 gaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaaaattagagattgggttcata 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16934063 gaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaatcttatcatcaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcata 16933964  T
Q  372 tgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtta 471  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16933963 tgaattctcacttaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaactaacaattatgattatgataaagactaacccccttaccttaggtta 16933864  T
Q  472 tgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 532  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16933863 tgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 16933803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 166 - 532
Target Start/End: Original strand, 14285021 - 14285387
Alignment:
Q  166 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcata 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  14285021 caacaacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcatattttcacaactacccattttcata 14285120  T
Q  266 cattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaaaattagagattggg 365  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |  | |||||    
T  14285121 cactatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaagggttggg 14285220  T
Q  366 ttcatatgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaac-aaacaattatgattatgatgaagactaacccccttacct 464  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14285221 ttcatataaatacttactcaattaagcactatttcatacaaaccaag-aaaattgcaaacaaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttacct 14285319  T
Q  465 taggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 532  Q
    ||| | ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14285320 tagataatgattaatccaaacttaagcttcactttagctcctaattcttcaatcttcaagtttccccc 14285387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 37 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 9303425 - 9303110
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattt-ctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaag 135  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    ||| | |||||||    
T  9303425 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccgttttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatggtatatgaacacccaag 9303326  T
Q  136 ccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta 235  Q
    ||||   | ||  ||||||||||  |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9303325 ccataattcatagtcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacagcaacatgtcataagtcatcaatta 9303226  T
Q  236 agcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcacc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9303225 agcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcacc 9303126  T
Q  336 aaaacaagagtacgaa 351  Q
    |||||||||| |||||    
T  9303125 aaaacaagagcacgaa 9303110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 85 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 8276120 - 8275855
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||||||||||   ||| | |||||||||||  || || | |||||||||| |  | |||||| |||||||||| |    
T  8276120 accaacaacatcttatttctcaccaacaatcatgatatatgaacacccaagccata-atcataaacaacaacatgtctcagcaacaataacatcaattaa 8276022  T
Q  185 aacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttattt 284  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8276021 aacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttattt 8275922  T
Q  285 catcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaa 351  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8275921 catcaccaacaattcatttatcgttcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 8275855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 85 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 8269020 - 8268755
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||||||||||   ||| | |||||||||||  || || | |||||||||| |  | |||||| |||||||||| |    
T  8269020 accaacaacatcttatttctcaccaacaatcatgatatatgaacacccaagccata-atcataaacaacaacatgtctcagcaacaataacatcaattaa 8268922  T
Q  185 aacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttattt 284  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8268921 aacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcataacaaccaattttcatacattatgaacatgttattt 8268822  T
Q  285 catcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaa 351  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8268821 catcaccaacaattcatttatcgttcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 8268755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 169 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 11477383 - 11477201
Alignment:
Q  169 caacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11477383 caacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaattcaaccacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatgcat 11477284  T
Q  269 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaa 351  Q
    |||||||||||||||| || | | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11477283 tatgaacatgttattttattaaccacaaatcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 11477201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 332
Target Start/End: Original strand, 33341812 - 33342106
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 136  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33341812 acataatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 33341911  T
Q  137 catggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaa-catgtcataagtcatcaatta 235  Q
    |||| |||||||||||| | |||||  | ||||||||||| | |||| | | |||  || | |  |||||| |||||| |||| ||||| ||| |||||     
T  33341912 catgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattg-atcatgaaacatatcataattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattg 33342009  T
Q  236 agcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 332  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||| | |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  33342010 agcataatttaccaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcattaaacatcaaattaacatattcaaacatatc 33342106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 37 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 54685625 - 54685331
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54685625 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccagcaacagcaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaatccaagc 54685526  T
Q  137 catggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaa-catgtcataagtcatcaatta 235  Q
    |||| |||||||||||| | |||||  | ||||||||||| | |||| | | |||  || | | ||||||| |||||| |||| ||||| ||| |||||     
T  54685525 catgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattg-atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattg 54685428  T
Q  236 agcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 332  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  54685427 agcataatttaccaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatc 54685331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 332
Target Start/End: Original strand, 7853913 - 7854207
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7853913 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaatcatgattcatgcaaacccaagc 7854012  T
Q  137 catggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaa-catgtcataagtcatcaatta 235  Q
    |||| |||||||||||| | |||||  | ||||||||||| | |||| | | |||  || | | ||||||| |||||| |||| ||||| ||| |||||     
T  7854013 catgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattg-atcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcatg-cataattcaccaattg 7854110  T
Q  236 agcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 332  Q
    | ||||||||  |||  | |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  7854111 aacataatttaccaattatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatc 7854207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 434 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 12902039 - 12901933
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttccccc 533  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12902039 atgattatgatgataactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttaactcctaattctccaatcttcaaattttccccc 12901940  T
Q  534 tttgcta 540  Q
    |||||||    
T  12901939 tttgcta 12901933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 434 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 15938426 - 15938320
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttccccc 533  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15938426 atgattataatgataactaacccccttaccttaggctatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttccccc 15938327  T
Q  534 tttgcta 540  Q
    |||||||    
T  15938326 tttgcta 15938320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 47785064 - 47784915
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaag 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||| | |||||||    
T  47785064 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacagaatcaccaacaacaactcatttctcaccaacaaatcatgaattatgaacacccaag 47784965  T
Q  136 ccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    ||||| || || | ||||||||| || || ||||||||||||||| ||||    
T  47784964 ccatgaatcattaacaacaacatcacttaacaacaacaacatcaactgaa 47784915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 434 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 15936584 - 15936478
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttccccc 533  Q
    |||||||| ||||  |||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15936584 atgattataatgataactaacccccataccttaggctacgatcaattcaaacttgagcttcacttttgctcctaattctccaatcttcaagttttccccc 15936485  T
Q  534 tttgcta 540  Q
    |||||||    
T  15936484 tttgcta 15936478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 397 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 11477163 - 11477029
Alignment:
Q  397 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaa-caattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttca 495  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||    
T  11477163 tttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgaagaagactaacccccttaccttaggtaatgattaattcaaacttaggcttca 11477066  T
Q  496 ctttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 532  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  11477065 ctttaactcctaattcttcaatcttcaagtttccccc 11477029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 59 - 332
Target Start/End: Original strand, 30152893 - 30153167
Alignment:
Q  59 tcattatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaac 156  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||     
T  30152893 tcataatcaacccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatatatcatcatcaacaat 30152992  T
Q  157 atgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaa-catgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacc 255  Q
    |||||  | ||||||||||| | |||| | | |||  || | | ||||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||    
T  30152993 atgactaaacaacaacaacaaccattg-atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacc 30153090  T
Q  256 cattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 332  Q
    ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  30153091 cattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatc 30153167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Original strand, 35123674 - 35123774
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 183  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35123674 caccaacaacatctcatttctcaacacaaatcatgaatcatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 35123773  T
Q  184 a 184  Q
    |    
T  35123774 a 35123774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Original strand, 14298399 - 14298499
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 183  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  14298399 caccaacaacatctcatttctcaacacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatattaataacaacatcaattg 14298498  T
Q  184 a 184  Q
    |    
T  14298499 a 14298499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Original strand, 14304026 - 14304126
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 183  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  14304026 caccaacaacatctcatttctcaacacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatattaataacaacatcaattg 14304125  T
Q  184 a 184  Q
    |    
T  14304126 a 14304126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 202 - 371
Target Start/End: Original strand, 18970016 - 18970185
Alignment:
Q  202 aattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaa-caacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 300  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  18970016 aattcaacaacaacatgtcataattcatcaattgagcataatt-cacaaactacccatttacatacatcatgaacatgaaatttcatcatcaacaattca 18970114  T
Q  301 tttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaaaattagagattgggttcata 371  Q
     ||| |||  |||||||||||| |||| |||||| | |||| ||| |||||  | | ||||||||||||||    
T  18970115 attaacatcaaattaacatacttaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcata 18970185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Original strand, 14295415 - 14295516
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||    
T  14295415 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagaaacaacaacatcaatt 14295514  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  14295515 ga 14295516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 87 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 53898721 - 53898624
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    |||||||| |||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53898721 caacaacatctcatttctcaacataaatcatgaatcttgcaaacccaagccatgaattatcaccaacaacatgacatatcaacaacaacattaattga 53898624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 87 - 332
Target Start/End: Original strand, 45581611 - 45581856
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||  | ||||||||||| | ||| ||    
T  45581611 caacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccatt-aa 45581709  T
Q  186 acttgattcacaccccaattcaacaacaa-catgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttattt 284  Q
     | |||  || | | ||||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||    
T  45581710 tcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaattt 45581808  T
Q  285 catcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 332  Q
    ||||| |||||||||||| |||||  |||||||||| |||||| ||||    
T  45581809 catcatcaacaattcattaatcatcaaattaacatattcaaacatatc 45581856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 85 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 14059482 - 14059381
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcatttctccacaaca-atcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 183  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  14059482 accaacaacatctcatttctcatcaacagatcatgaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacatagcaacaataacatcaattg 14059383  T
Q  184 aa 185  Q
    ||    
T  14059382 aa 14059381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 87 - 327
Target Start/End: Original strand, 38167894 - 38168134
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||| || || ||||||||||||| |||||     
T  38167894 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat 38167993  T
Q  186 acttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttc 285  Q
     | |||  |  |   ||||||| |||||||||  ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||    
T  38167994 -catgaaacttattacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttc 38168092  T
Q  286 atcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaac 327  Q
    |||| |||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  38168093 atcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaac 38168134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 65 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 38811297 - 38811176
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacat 163  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   || |||  ||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||||| || |    
T  38811297 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctgatcatcaaaacatgaattatgcacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcactt 38811198  T
Q  164 atcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  38811197 agcaacaacaacatcaattgaa 38811176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 85 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 11329230 - 11329130
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 183  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  11329230 accaacaacatctcatttctcatcaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattg 11329131  T
Q  184 a 184  Q
    |    
T  11329130 a 11329130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 85 - 184
Target Start/End: Original strand, 17139486 - 17139586
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 183  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  17139486 accaacaacatctcatttcgcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattg 17139585  T
Q  184 a 184  Q
    |    
T  17139586 a 17139586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 204 - 406
Target Start/End: Original strand, 48421674 - 48421877
Alignment:
Q  204 ttcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatt-tcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatt 302  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||| ||| ||| ||||||||  |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||| |    
T  48421674 ttcaacaacaacatgtcataattcaccaattgaacataattctca-aactacccatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcaccaacaattcaat 48421772  T
Q  303 tatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaaaattagagattgggttcatatgaat-tctcactcaattaagcactttttca 401  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||| ||| | |||  | | |||||||||||| |  |||  || | |||||||||||||| ||||    
T  48421773 tatcatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcatgaatttcaaagattgggttcacaataatcacttattcaattaagcacttattca 48421872  T
Q  402 tacaa 406  Q
    |||||    
T  48421873 tacaa 48421877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 17956274 - 17956026
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaaca 170  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||  | |||||    
T  17956274 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaaca 17956175  T
Q  171 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaa-catgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacatt 269  Q
    |||||| | |||| | | |||  || | | ||||||| |||||| |||| |||||  || ||||| || |||||||   ||| || |||||||||||||     
T  17956174 acaacaaccattg-atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatg-cataatacaccaattgagtataatttacaaactactcattttcatacatc 17956077  T
Q  270 atgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacata 320  Q
    |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  17956076 atgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacata 17956026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 117 - 182
Target Start/End: Original strand, 8631801 - 8631866
Alignment:
Q  117 tgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8631801 tgaatcatgcaaacccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 8631866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 471 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 9303036 - 9302968
Alignment:
Q  471 atgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttccccctttgcta 540  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9303036 atgatcaattcaaacttgagcttcactttaactcctaattctccaatcttcaag-tttccccctttgcta 9302968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 14528282 - 14528181
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  14528282 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcattcatacccaagccatgaattaccatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaatt 14528183  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  14528182 ga 14528181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 68 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 17523176 - 17523059
Alignment:
Q  68 acccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaaca-tgacatat 165  Q
    ||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||     
T  17523176 acccattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacacaaatcataaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaaaattgacttag 17523077  T
Q  166 caacaacaacatcaattg 183  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17523076 caacaacaacatcaattg 17523059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 22144542 - 22144441
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||    
T  22144542 caccaacaacatctcatttctcaaccacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgtattatcatcaacaacatggcttaacaacaacaacaacaatt 22144443  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  22144442 ga 22144441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 19570957 - 19570857
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 183  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||    
T  19570957 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaccaagaattatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaattg 19570858  T
Q  184 a 184  Q
    |    
T  19570857 a 19570857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 184
Target Start/End: Original strand, 17938582 - 17938652
Alignment:
Q  114 tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17938582 tcatgaatcatgtaaacccaagccatgaatgattatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 17938652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 54038399 - 54038159
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    ||||||||| | ||||||  ||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||  | ||||||||||| | ||| ||    
T  54038399 caacaacaatttatttcttaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaactatatgactaaacaacaacaacaaccatt-aa 54038301  T
Q  186 acttgattcacaccccaattcaacaacaac-atgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttattt 284  Q
     | |||  || | | || |||| ||||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||    
T  54038300 tcatgaaacatatcacatttcatcaacaaccatg-cataattcaccaatttagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaattt 54038202  T
Q  285 catcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaac 327  Q
    ||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  54038201 catcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaac 54038159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 332
Target Start/End: Original strand, 3992529 - 3992775
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||  | |||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||| || || ||||||||||||| |||||    
T  3992529 caacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattga 3992628  T
Q  185 aacttgattcacaccccaattcaacaacaac-atgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatt 283  Q
      | |||  |  | | ||||||| ||||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||| ||||| |||||| ||  |||    
T  3992629 t-catgaaacttatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcctacatcatgaacctgcaatt 3992726  T
Q  284 tcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 332  Q
    |||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  3992727 tcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatc 3992775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 332
Target Start/End: Original strand, 23492353 - 23492598
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||| || || ||||||||||||| |||| |    
T  23492353 caacaacaacttatttcacaacaacaaactatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattg-a 23492451  T
Q  186 acttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttc 285  Q
     | |||  || | | ||||||| |||||||    ||||| ||| || || ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||    
T  23492452 tcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatccataattcaccatttgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttc 23492551  T
Q  286 atcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 332  Q
    || | |||||||||||||| |||  |||||||| | |||||| ||||    
T  23492552 ataatcaacaattcatttaacatcaaattaacacattcaaacatatc 23492598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 317778 - 317677
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||    
T  317778 caccaacaacatctcatttctccacaacaaaccaagaattatacaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaatt 317679  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  317678 ga 317677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 6147015 - 6146915
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccaca-acaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||    
T  6147015 caccaacaacatctcatttctccatacaaaatcatgaatcatg-aaacccaagccatgaattattatcaacaacatgacttaacaacaacagcaacaatt 6146917  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  6146916 ga 6146915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 6154600 - 6154500
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccaca-acaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||    
T  6154600 caccaacaacatctcatttctccatacaaaattatgaatcatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaataacaacaacaatt 6154502  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  6154501 ga 6154500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 176
Target Start/End: Original strand, 13817492 - 13817585
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaaca 176  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| | | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  13817492 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaaca 13817585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Original strand, 14301042 - 14301143
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||    
T  14301042 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaacatgaatcatgcaaaccaaagacatgaataatcatcaacaacatcacttagaaacaacaacatcaatt 14301141  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  14301142 ga 14301143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 16182215 - 16182114
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    ||||| ||||| |||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |  |||||||||| |||||    
T  16182215 caccaccaacatctcatttctcaacaacaatccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaaaaacaacaacaacaatt 16182116  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  16182115 ga 16182114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 115 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 50112289 - 50112220
Alignment:
Q  115 catgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  50112289 catgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacatcaattga 50112220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 87 - 320
Target Start/End: Original strand, 53771020 - 53771254
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||  | |||||||||||| |||||||||||| |||| |||  | ||||| || || ||||||||||||| |||||    
T  53771020 caacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaacaacaacaacatctattga 53771119  T
Q  185 aacttgattcacaccccaattcaacaacaac-atgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatt 283  Q
      | |||  || | | ||||||| ||||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||    
T  53771120 t-catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatt 53771217  T
Q  284 tcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacata 320  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||  ||||||||||    
T  53771218 tcatcatcaaccattcatttaacatcaaattaacata 53771254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 55441119 - 55441018
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||    
T  55441119 caccaacaacatctcatttctcaacaaaaaatcatgaattatgcatacccaagtcatgaattatcatcaacaacatcacttagcatcaacaacatcaatt 55441020  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  55441019 ga 55441018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 112 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 12349970 - 12349899
Alignment:
Q  112 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  12349970 aatcatgaatcatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacaacaattga 12349899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 11986112 - 11986038
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||  |||||| ||||||||||||    
T  11986112 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcaatttagctcctaa 11986038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 112 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12488967 - 12488846
Alignment:
Q  112 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaa 211  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||| | | ||| ||  | | |||||||||||    
T  12488967 aatcatgaattatgaacacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattg-atcatgaatcttatcacaattcaacaa 12488869  T
Q  212 caacatgtcataagtcatcaatt 234  Q
    ||||||  ||||| |||||||||    
T  12488868 caacataacataattcatcaatt 12488846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 116 - 320
Target Start/End: Original strand, 2844201 - 2844404
Alignment:
Q  116 atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaac 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||| || || ||||||||||||| |||||  | |||  |  | | ||||||| ||| |||    
T  2844201 atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat-catgaaacttatcacaattcatcaagaac 2844299  T
Q  216 -atgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaatt 314  Q
     ||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  ||||    
T  2844300 catg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaatt 2844398  T
Q  315 aacata 320  Q
    ||||||    
T  2844399 aacata 2844404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 85 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12560505 - 12560373
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 183  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||| | |||| |||| ||||||| || || ||||||||||||| ||||    
T  12560505 accaacaacatctcatttctcaacatcaaatcatgaatcatgcatacccaagccaggaattaacatccacaacatcacttagcaacaacaacatccattg 12560406  T
Q  184 aaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 217  Q
    |  | ||| ||| | | |||||||||||||||||    
T  12560405 at-catgaatcatatcacaattcaacaacaacat 12560373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 116 - 320
Target Start/End: Original strand, 16261463 - 16261666
Alignment:
Q  116 atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaa- 214  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||| || || ||||||||||||| |||| | | |||  || | | ||||||| ||||||     
T  16261463 atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattg-atcatgaaacatatcacaattcatcaacaac 16261561  T
Q  215 catgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaatt 314  Q
    |||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||| ||||| |||||| ||  ||||||||| |||| ||||||||| |||  ||||    
T  16261562 catg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcgtacatcatgaacttgcaatttcatcatcaaccattcatttaacatcaaatt 16261660  T
Q  315 aacata 320  Q
    ||||||    
T  16261661 aacata 16261666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 92 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 16996321 - 16996228
Alignment:
Q  92 acaactcatttctccacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    |||||||||||||| ||||||| | | |||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||    
T  16996321 acaactcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaattga 16996228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 17960602 - 17960481
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacat 163  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||| |  |||||||| || |    
T  17960602 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttcccatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagtcatgaattattaataacaacatcactt 17960503  T
Q  164 atcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    | || |||  ||||||||||||    
T  17960502 agcagcaaacacatcaattgaa 17960481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 212 - 351
Target Start/End: Original strand, 15550703 - 15550842
Alignment:
Q  212 caacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaa-caacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattc 310  Q
    |||||||||| || ||||||||| |||| |||| ||||| | ||||||||  |||||| |||||||||  ||||||||| ||| |||||| |||||||      
T  15550703 caacatgtcacaattcatcaattgagcacaatt-cacaaactacccatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaaaaattcaattatcatca 15550801  T
Q  311 aattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaa 351  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | |||| ||| |||||    
T  15550802 aattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaa 15550842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 217
Target Start/End: Original strand, 1990759 - 1990913
Alignment:
Q  64 atcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaac-aatcatgaatcatgca-aacccaagccatggattatcatcaacaacatgac 161  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || | |||||||| | ||| | || |||||||||| || |||| |||||| ||  |    
T  1990759 atcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacaaaccaagccatgaatcatcaacaacaatatctc 1990858  T
Q  162 atatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 217  Q
     || ||||||||||||| ||| |||| |||||| || | || ||||||||||||||    
T  1990859 ttaacaacaacaacatc-atttaaacatgattctcatcacagttcaacaacaacat 1990913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 12349810 - 12349708
Alignment:
Q  88 aacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacc-----caagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaat 181  Q
    |||||||||| |||||||  || ||| | ||||||||||||||||     |||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12349810 aacaacaacttatttctcatcatcaaattatgaatcatgcaaaccatggccaagccatgatttatcatctacaacatgacatatcaacaacaacatcaat 12349711  T
Q  182 tga 184  Q
    |||    
T  12349710 tga 12349708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Original strand, 16261777 - 16261851
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  16261777 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaattccaacttaggcttcactttagctcctaa 16261851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 234
Target Start/End: Original strand, 17191519 - 17191668
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 183  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||| | || ||||||||| || |||| ||||||||| || || ||||| |||||||||||     
T  17191519 accaccaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaacattacttagcaacagcaacatcaatt- 17191617  T
Q  184 aaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 234  Q
    |||| ||||||  | | ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||    
T  17191618 aaacatgattcttatcacaattcagcaacaacataacataattcatcaatt 17191668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 214
Target Start/End: Original strand, 17204667 - 17204807
Alignment:
Q  74 tttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaac 172  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||  | |||||||||||| || |||| |||||| || || || |||||||    
T  17204667 tttacaaaaccactaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattataaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatattacttagcaacaac 17204766  T
Q  173 aacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaa 214  Q
    |||||| ||| |||| ||||||  | | ||||||||||||||    
T  17204767 aacatccatt-aaacatgattcctatcacaattcaacaacaa 17204807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 434 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 51961063 - 51960990
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctccta 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||   |||||||||| ||||||    
T  51961063 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttagacttcactttacctccta 51960990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 59 - 217
Target Start/End: Original strand, 12952915 - 12953074
Alignment:
Q  59 tcattatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaac 156  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||  || | |||||||| | ||| | |||||||||||| || |||| ||||||     
T  12952915 tcataatcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaat 12953014  T
Q  157 atgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 217  Q
    ||  | || ||||||||||||||||| |||| | | || || | |||||||||||||||||    
T  12953015 atctcttagcaacaacaacatcaatt-aaacataaatctcatcacaattcaacaacaacat 12953074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 220 - 332
Target Start/End: Original strand, 28558284 - 28558396
Alignment:
Q  220 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 319  Q
    ||||| ||| ||||| ||||| ||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||    
T  28558284 cataattcaccaattgagcatcatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaatttatttatcatcaaattaacat 28558383  T
Q  320 actcaaacttatc 332  Q
    | |||||| ||||    
T  28558384 attcaaacatatc 28558396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 217
Target Start/End: Original strand, 16880131 - 16880233
Alignment:
Q  114 tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaaca 213  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| || || |||||| ||||||||||||| | ||| ||  | | |||||||||||||    
T  16880131 tcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcatccacaacatcacttagcaacaataacatcaattgaa-catgaatcttatcacaattcaacaaca 16880229  T
Q  214 acat 217  Q
    ||||    
T  16880230 acat 16880233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Original strand, 53771365 - 53771439
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  53771365 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 53771439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 87 - 184
Target Start/End: Original strand, 54423993 - 54424090
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||| | || || ||| |||||||||||||||    
T  54423993 caacaacaacttatttctc-ataacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaataatcatccacaacgtcacttagcaataacaacatcaattga 54424090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 9591035 - 9590922
Alignment:
Q  73 ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaa 171  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||  || ||| |||||||  ||| | ||||||| |||| || |||| |||||| || || || ||||||    
T  9591035 ttttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgaactatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatcacttaacaacaa 9590936  T
Q  172 caacatcaattgaa 185  Q
    ||||||||||||||    
T  9590935 caacatcaattgaa 9590922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 185
Target Start/End: Original strand, 15876046 - 15876147
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 183  Q
    ||||||| |||||||||||||  | |||| |||||||| ||| | ||| |||||||| || ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  15876046 accaacaccaactcatttctcatccacaaatcatgaattatgaatacctaagccatgaatcatcattaacaacatcacttaccaacaacaacatcaattg 15876145  T
Q  184 aa 185  Q
    ||    
T  15876146 aa 15876147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3576705 - 3576558
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||| | |||||||||||| || |||| | |||| || || || ||||||||||||||| | ||    
T  3576705 caacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaaccacaatattacttagcaacaacaacatcaa-tcaa 3576607  T
Q  186 acttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 234  Q
    || ||| ||  | | |||||||||||||||||  |||||  ||||||||    
T  3576606 acatgactcttatcacaattcaacaacaacatagcataatccatcaatt 3576558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 351
Target Start/End: Original strand, 10912945 - 10913130
Alignment:
Q  166 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta-agcataatttcacaaca-acccattttca 263  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| || |||| || |||||| |||||||  || || ||| |||||| |||| |||| ||||| | |||||||||||    
T  10912945 caacaacaacatcaatt-aaacatgaatctcaccacatttcaaccacaacatagcacaattcaacaattagagcacaatt-cacaatatacccattttca 10913042  T
Q  264 tacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaa 351  Q
     | |||||| |||||  ||||||||| |||||||||| ||||||   |||| |  ||||||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  10913043 catattatggacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaaattcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 10913130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 90 - 184
Target Start/End: Original strand, 17100636 - 17100731
Alignment:
Q  90 caacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    |||||||| ||||| | ||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  17100636 caacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaataacatcaattga 17100731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 90 - 184
Target Start/End: Original strand, 17101321 - 17101416
Alignment:
Q  90 caacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    |||||||| ||||| | ||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||| || || |||||| ||||||||||||    
T  17101321 caacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaataacatcaattga 17101416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 153
Target Start/End: Original strand, 28558186 - 28558253
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaac 153  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  28558186 caacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaac 28558253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 253 - 332
Target Start/End: Original strand, 55513016 - 55513095
Alignment:
Q  253 acccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 332  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  55513016 acccattttcatacatcattaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcgaattaacatattcaaacatatc 55513095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Original strand, 2050115 - 2050189
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  2050115 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 2050189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 6228916 - 6228672
Alignment:
Q  64 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgac 161  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | |||||  || ||| |||||| | ||| | |||||||||||| || |||| |||||| ||  |    
T  6228916 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacttaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatttc 6228817  T
Q  162 atatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta-agcataatttcacaacaacccattt 260  Q
     || ||||||||||||||||| |||| |||| |||| |  ||||| ||||||||||  || || ||| || ||| |||| || ||||||| |   |||||    
T  6228816 ttagcaacaacaacatcaatt-aaacatgatccacatcataattcgacaacaacatagcacaattcaacatttagagcacaa-ttcacaatatatcattt 6228719  T
Q  261 tcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatca 307  Q
    ||| | | ||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||    
T  6228718 tcacatactatgaacatgtaatttcaccaacaacaattcaattatca 6228672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Original strand, 38168237 - 38168311
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  38168237 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 38168311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 38375797 - 38375699
Alignment:
Q  253 acccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaa 351  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||  |||||||||| |||||||  |||| |  ||||||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  38375797 acccattttcacaaattatgaacatgcaatttcatctacaacaattcaattatcatcaaattcatgtactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 38375699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Original strand, 54651764 - 54651838
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||  |||||||  |||||| || |||||||||    
T  54651764 atgattatgatgaagacaaacccccttaccttagatgatgattaacccaaacttttgcttcaattaagctcctaa 54651838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 184
Target Start/End: Original strand, 3578057 - 3578166
Alignment:
Q  73 ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaa 171  Q
    |||||| ||| ||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    || | |||||||||||||| || ||||||    
T  3578057 ttttaccaaaacaccaacaacctctcattcctccacaacaaatcatgaatcatgcatacctaagcca--atttttaatcaacaacatgacttagcaacaa 3578154  T
Q  172 caacatcaattga 184  Q
    ||| |||||||||    
T  3578155 caa-atcaattga 3578166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 467
Target Start/End: Original strand, 13839200 - 13839233
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 467  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13839200 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 13839233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 181
Target Start/End: Original strand, 34559857 - 34559974
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacat 163  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||  || | ||| |||| | ||| | || ||||||||| || |||| |||||| || || |    
T  34559857 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaattctcatcatcaaattatgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt 34559956  T
Q  164 atcaacaacaacatcaat 181  Q
    | ||||||||||||||||    
T  34559957 agcaacaacaacatcaat 34559974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 15857195 - 15857163
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15857195 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 15857163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 409 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 8268708 - 8268649
Alignment:
Q  409 caagaaaaattgcaaacaaa-caattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 467  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  8268708 caaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgataataactaacccccttaccttag 8268649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 409 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 8275808 - 8275749
Alignment:
Q  409 caagaaaaattgcaaacaaa-caattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 467  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  8275808 caaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgataataactaacccccttaccttag 8275749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 397 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 2449220 - 2449151
Alignment:
Q  397 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 467  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2449220 tttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaac-atgattatgataaagactaacccccttaccttag 2449151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Original strand, 33342204 - 33342278
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  33342204 atgattatgataaagactaaccctcttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 33342278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 397 - 467
Target Start/End: Original strand, 45861086 - 45861155
Alignment:
Q  397 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 467  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||| ||  ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  45861086 tttcatacaattcatgaaaaattgcaaagaatgaat-atgattatggtaaagactaacccccttaccttag 45861155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 112 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 11061247 - 11061174
Alignment:
Q  112 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||| || |||| |||||| || || || || |||||||||||||||||    
T  11061247 aatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaccaacaacatcaattgaa 11061174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 14842519 - 14842486
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 467  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14842519 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 14842486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 17912430 - 17912397
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 467  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17912430 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 17912397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 19260781 - 19260748
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 467  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19260781 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 19260748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 467
Target Start/End: Original strand, 23492696 - 23492729
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 467  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23492696 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 23492729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 51961361 - 51961308
Alignment:
Q  129 acccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    |||||| ||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  51961361 acccaaaccatgaatcatcaacaacaacatctcatatcaacaacaacatcaatt 51961308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 7854305 - 7854337
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7854305 atgattatgatgaaaactaacccccttacctta 7854337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 40 - 76
Target Start/End: Original strand, 8901257 - 8901293
Alignment:
Q  40 tcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccatttt 76  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  8901257 tcatcaaaatcaaacttctccattttcaacccatttt 8901293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 15615137 - 15615169
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15615137 atgattatgataaagactaacccccttacctta 15615169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 17955916 - 17955884
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17955916 atgattatgataaagactaacccccttacctta 17955884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 337; Significance: 0; HSPs: 53)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 37 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 109158 - 108686
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattt-ctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaag 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||| | |||||||    
T  109158 acatcatcaaaatcaaacttcttctctatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag 109059  T
Q  136 ccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta 235  Q
    ||||   | || |||||||||||  |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109058 ccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta 108959  T
Q  236 agcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcacc 335  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  108958 agcataatttcacaacaatccattttcatacattatgaacatgttaattcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcacc 108859  T
Q  336 aaaacaagagtacgaaaattagagattgggttcatatgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattat 435  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  108858 aaaacaagagcacgaaaattagggattgggttcatatgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattat 108759  T
Q  436 gattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  ||||||||||| |||||||    
T  108758 gattatgatgaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttacctcctaa 108686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 9730672 - 9730216
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaa 171  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || |||||||   |||||||||||   ||| | |||||||||||  || || | |||||| ||| |  | ||||||    
T  9730672 atttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcacaaacaatcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaatatgtctcagcaacaa 9730573  T
Q  172 caacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattat 271  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9730572 caacatcaatcgaaacttgattctcaccttaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattat 9730473  T
Q  272 gaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaaaattagagattgggttcata 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9730472 gaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaatcttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcata 9730373  T
Q  372 tgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtta 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9730372 tgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtta 9730273  T
Q  472 tgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaatt-ctccaatcttcaagttt 527  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  9730272 tgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaattgcttcaatcttcaagttt 9730216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 166 - 532
Target Start/End: Original strand, 7528960 - 7529326
Alignment:
Q  166 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcata 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7528960 caacaacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcacaactacccattttcata 7529059  T
Q  266 cattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaaaattagagattggg 365  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |  | |||||    
T  7529060 cactatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaagggttggg 7529159  T
Q  366 ttcatatgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaac-aaacaattatgattatgatgaagactaacccccttacct 464  Q
    ||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7529160 ttcatataaatacttactcaattaagcactatttcatacaaaccaag-aaaattgcaaacaaaacaattatgattatgaagaagactaacccccttacct 7529258  T
Q  465 taggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 532  Q
    ||| | ||||| ||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  7529259 tagataatgattaatccaaacttaggcttcactttagctcccaattcttcaatcttcaagtttccccc 7529326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 37 - 320
Target Start/End: Original strand, 16105573 - 16105856
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattt-ctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaag 135  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||| | ||| |||    
T  16105573 acatcatcaaaatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacctaag 16105672  T
Q  136 ccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta 235  Q
    ||||   | || |||||||||||  |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16105673 ccataattcataatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta 16105772  T
Q  236 agcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacata 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  16105773 agcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatattatttcatcatcaaccattcatttaaca-tcaattaacata 16105856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 85 - 351
Target Start/End: Original strand, 17909485 - 17909750
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    |||||||||| || |||||||  || |||||||||   ||| | |||||||||||  || || | |||||||||| |  |||| |||||||||||||| |    
T  17909485 accaacaacatcttatttctcaccaccaatcatgatatatgaacacccaagccata-atcataaacaacaacatgtcgcatcagcaacaacatcaattaa 17909583  T
Q  185 aacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttattt 284  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17909584 aacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttattt 17909683  T
Q  285 catcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaa 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17909684 catcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 17909750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 38 - 176
Target Start/End: Original strand, 11583982 - 11584121
Alignment:
Q  38 catcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgc-aaacccaagc 136  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11583982 catcatcaaaaacaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaaccacgaacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaaacccaagc 11584081  T
Q  137 catggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaaca 176  Q
    |||| |||||||||||| | |||||  | |||||||||||    
T  11584082 catgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaaca 11584121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 84 - 332
Target Start/End: Original strand, 2031787 - 2032035
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  | ||||||||||| | |||    
T  2031787 caccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaatatgactaaacaacaacaacaaccatt 2031886  T
Q  183 gaaacttgattcacaccccaattcaacaacaa-catgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgtta 281  Q
    | | | |||  || | | ||||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  |    
T  2031887 g-atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaa 2031984  T
Q  282 tttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 332  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  2031985 tttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatc 2032035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 59 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 1168500 - 1168373
Alignment:
Q  59 tcattatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaac 156  Q
    |||| ||||||||||||| |  ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1168500 tcataatcaacccattttcatcaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaac 1168401  T
Q  157 atgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||    
T  1168400 atgacttagcaacaacaacatcaattga 1168373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 397 - 532
Target Start/End: Original strand, 17909787 - 17909921
Alignment:
Q  397 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaa-caattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttca 495  Q
    ||||||||||  |||| |||||||| |||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||    
T  17909787 tttcatacaa--caaggaaaattgctaacaaaacaatcatgattatgaagaacactaacccccttaccttaggttatgattaatccaaacttaggcttca 17909884  T
Q  496 ctttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 532  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  17909885 ctttaactcctaattcttcaatcttcaagtttccccc 17909921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 11337455 - 11337355
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 183  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  11337455 caccaacaacatctcatttctcaacaacaatcatgaatcatgtaaactcaagccatgaattatcatcaacgacatgacttagcaacaacaacatcaattg 11337356  T
Q  184 a 184  Q
    |    
T  11337355 a 11337355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 59 - 332
Target Start/End: Original strand, 11342635 - 11342910
Alignment:
Q  59 tcattatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaac 156  Q
    |||| ||||||||||||| || ||  ||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||     
T  11342635 tcataatcaacccattttcaccaagacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatatatcatcatcaacaat 11342734  T
Q  157 atgac-atatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaa-catgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaac 254  Q
    ||||| | |  |||||||||| | |||| | | |||  || | | ||||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| ||    
T  11342735 atgactaaacaaacaacaacaaccattg-atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactac 11342832  T
Q  255 ccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 332  Q
    |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  11342833 ccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatc 11342910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 73 - 184
Target Start/End: Original strand, 19405503 - 19405615
Alignment:
Q  73 ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaa 171  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  ||    
T  19405503 ttttaccaaaacaccaacaacatctcatttctccacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacataccagtaa 19405602  T
Q  172 caacatcaattga 184  Q
    ||| |||||||||    
T  19405603 caatatcaattga 19405615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 434 - 527
Target Start/End: Original strand, 34939595 - 34939688
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttt 527  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34939595 atgattatgaagaacactaacccccttaccttaggttatgattaattcacacttagacttcactttagctcctaattcttcaatcttcaagttt 34939688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 206 - 507
Target Start/End: Original strand, 25004915 - 25005210
Alignment:
Q  206 caacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatt-tcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcattta 304  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||  ||||||| |  ||||||||| |||    
T  25004915 caacaacaacatgtcataaatcaccaattgagcataattctca-aactacccatttacatacatcatgaacatgcaatttcataattaacaattcaatta 25005013  T
Q  305 tcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaaaattagagattgggttcatatgaat-tctcactcaattaagcactttttcata 403  Q
    || || |||||||| |||||||| ||||||   |||| ||| |||||  | | |||||||||||| |  |||  || | |||||| ||||||| ||||||    
T  25005014 tccttaaattaacacactcaaacatatcacttcaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcacaataatcacttattcaattgagcacttattcata 25005113  T
Q  404 caaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagct 503  Q
    |||     |||||| |  |||| ||     ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||| |||||||  ||||||||||||||    
T  25005114 caacaattgaaaaact--aaactaa-----atgattatgatgaagactaacccccttactttagataatgattaatccaaacttaggcttcactttagct 25005206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 87 - 332
Target Start/End: Original strand, 21650675 - 21650920
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||| |||  | ||||| || || ||||||||||||| |||||     
T  21650675 caacaacaacttatttcaccacaacaaattatgaatcatgcatacccaaaccatgaattagcattcataacatcacttaacaacaacaacatctattgat 21650774  T
Q  186 acttgattcacaccccaattcaacaacaac-atgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttattt 284  Q
     | |||  |  | | ||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||    
T  21650775 -catgaaacttatcacaattcaacaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaattt 21650872  T
Q  285 catcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 332  Q
    ||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  21650873 catcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatc 21650920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 65 - 234
Target Start/End: Original strand, 7728378 - 7728547
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacat 163  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||  ||||||| ||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||| || |    
T  7728378 tcaacccatttttcaaagtcaccaacaacacctcatctctcaccaacaattcatgaattatgcacacccaagcgataaattatcatcaacaacatcactt 7728477  T
Q  164 atcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 234  Q
    | |||||||||||||||||||| | ||| ||  | | |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  7728478 agcaacaacaacatcaattgaa-catgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 7728547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 184
Target Start/End: Original strand, 20712056 - 20712154
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  20712056 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattga 20712154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 176
Target Start/End: Original strand, 21397066 - 21397159
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaaca 176  Q
    |||||| |||| |||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  21397066 caccaagaacatctcatttctcaataacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaataaca 21397159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Original strand, 23466434 - 23466535
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    |||||||||||  ||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||    
T  23466434 caccaacaacatatcattcctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaactatcatcaacatcatcacttagcaacaacaacatcaatt 23466533  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  23466534 ga 23466535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 176
Target Start/End: Original strand, 24475560 - 24475653
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaaca 176  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| | | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  24475560 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaaca 24475653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Original strand, 28261498 - 28261599
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| | | |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  | ||||||||||| |||||    
T  28261498 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcagcaacatgactaaacaacaacaacaacaatt 28261597  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  28261598 ga 28261599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 184
Target Start/End: Original strand, 21906729 - 21906795
Alignment:
Q  115 catgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||    
T  21906729 catgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgac---ttaacaacaacatcaattga 21906795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 112 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 24183370 - 24183301
Alignment:
Q  112 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24183370 aatcatgaatcatgcaaacccaagccattaattatcatc---aacatgacatatcaacaacaccatcaattga 24183301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 320
Target Start/End: Original strand, 21204905 - 21205139
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||  | |||||||||||| |||||||||||| ||||  || || ||||| || || |||||||||||   |||||    
T  21204905 caacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagaataaataacatcacttaacaacaacaacaaatattga 21205004  T
Q  185 aacttgattcacaccccaattcaacaacaac-atgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatt 283  Q
      | |||  || | | ||||||| ||||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||    
T  21205005 t-catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatt 21205102  T
Q  284 tcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacata 320  Q
    |||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  21205103 tcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacata 21205139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 87 - 217
Target Start/End: Original strand, 23493899 - 23494029
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    ||||||||||| |||||||  || ||| |||||||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  23493899 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 23493998  T
Q  186 acttgattcacaccccaattcaacaacaacat 217  Q
     | ||| ||  | | |||||||||||||||||    
T  23493999 -catgaatcttatcacaattcaacaacaacat 23494029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 27182503 - 27182429
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  27182503 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 27182429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 217
Target Start/End: Original strand, 21616974 - 21617126
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacat 163  Q
    |||||||||||||||||| || | |||||| |||| |||||  || ||| |||||||| ||| | |||||||||||| || | || |||||| || || |    
T  21616974 tcaacccattttacaaaaccaaccacaacagctcacttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcaacaacaacaatatcactt 21617073  T
Q  164 atcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 217  Q
    | |||||||||||||||||| ||| ||| || || | |||||||||||||||||    
T  21617074 agcaacaacaacatcaattg-aacatgaatctcatcacaattcaacaacaacat 21617126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 32966436 - 32966343
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaa-caatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaaca 157  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||| |||||  | ||||||||| |||||||  |||||||    
T  32966436 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctcatcaaccaattatgaattatgcacgctcaagccatgaattatcaataacaaca 32966343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 436 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 18531018 - 18530946
Alignment:
Q  436 gattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    |||||  |||||||||||||||||||    
T  18531018 gattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacctcaacttaggcttcactttagctcctaa 18530946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 217
Target Start/End: Original strand, 6456580 - 6456734
Alignment:
Q  64 atcaacccattt-tacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgac 161  Q
    |||||||| ||| ||||||| || ||||||||||| |||||||  || | |||||||| ||||| | |||||||||||| || |||| |||| | ||  |    
T  6456580 atcaacccgtttgtacaaaaacaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgattcatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacgatatctc 6456679  T
Q  162 atatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 217  Q
     || ||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||||||||    
T  6456680 ttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcacaattcaacaacaacat 6456734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 84 - 160
Target Start/End: Original strand, 4865239 - 4865317
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatg-gattatcatcaacaacatga 160  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4865239 caccaacaacacctcatctctcaacaacaattcaagaattatgcaaacccaagccatgaaattatcatcaacaacatga 4865317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 22053785 - 22053711
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    |||||   ||||||||||||||||||    
T  22053785 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacctcaacttagacttcactttagctcctaa 22053711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Original strand, 23507270 - 23507344
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||||| |||||  ||||||||||| |||||||    
T  23507270 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaattccaacttatgcttcactttaactcctaa 23507344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 24225634 - 24225596
Alignment:
Q  38 catcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccatttt 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24225634 catcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccatttt 24225596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 438 - 508
Target Start/End: Original strand, 32951016 - 32951086
Alignment:
Q  438 ttatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||||    
T  32951016 ttatgatgaagactaacccccttaccttaaataatgattaattcaaacttagacttcaatttagctcctaa 32951086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 21647009 - 21646908
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| | |  ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  | |||||||| || |||||    
T  21647009 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaataattatacaaacccaagccatgaattatcatcaacatcatgactaaacaacaacagcaacaatt 21646910  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  21646909 ga 21646908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 431 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 23981440 - 23981363
Alignment:
Q  431 attatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | | ||| ||| |||||||  |||||| ||||||||||||    
T  23981440 attatgattttgatgaagactaacccccttacctaagatgaagattaatccaaacttaggcttcaatttagctcctaa 23981363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 253 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22662784 - 22662668
Alignment:
Q  253 acccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaaa 352  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||| |||||  |||||| | |||| ||| |||||     
T  22662784 acccatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaacaattcaattatcatcaaattaacatattcaaatatatcactacaacatgagcacgaat 22662685  T
Q  353 attagagattgggttca 369  Q
     | | ||||||||||||    
T  22662684 ttcaaagattgggttca 22662668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 234
Target Start/End: Original strand, 19862186 - 19862336
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||| ||| | ||||||| |||| || |||| ||| || || || || |||||||||||||||||    
T  19862186 caccaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaataatatcacttagcaacaacaacatcaatt 19862285  T
Q  183 gaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 234  Q
    |  || ||||||  | | |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  19862286 g-cacatgattcttatcacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 19862336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 85 - 185
Target Start/End: Original strand, 16595486 - 16595587
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcatttctccacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 183  Q
    |||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| |||||||  |||| ||| |  || ||||| | ||||||||||    
T  16595486 accaacaacatctcatttctcatcaacaattcatgaatcatgcacacccaagtcatgaattatcaataacatcatcatttaacaacatctacatcaattg 16595585  T
Q  184 aa 185  Q
    ||    
T  16595586 aa 16595587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 23981806 - 23981646
Alignment:
Q  64 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgaca 162  Q
    ||||||||||| | |||||| ||  |||||||||| ||||| |  ||  |||||||| | ||| | |||||||||||| || |||| |||||| || ||     
T  23981806 atcaacccattctcacaaaaccaataacaacaacttatttcacatcacaaatcatgagttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcact 23981707  T
Q  163 tatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataa 224  Q
    || |||||||||||||||||||| | || ||| || |  |||||||||||||||| ||||||    
T  23981706 tagcaacaacaacatcaattgaa-catggttctcatcataattcaacaacaacatatcataa 23981646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 436 - 508
Target Start/End: Original strand, 2032135 - 2032207
Alignment:
Q  436 gattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||| ||  |||||||  |||||| ||||||||||||    
T  2032135 gattatgatgaaaactaacccccttaccttagataaggattaacccaaacttaggcttcaatttagctcctaa 2032207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 217
Target Start/End: Original strand, 24084100 - 24084187
Alignment:
Q  129 acccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 217  Q
    |||||||||||| ||  ||| |||||| ||  | || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  24084100 acccaagccatgaatcttcaacaacaatatttcttagcaacaacaacatcaatt-aaacatgattcacatcacaattcaacaacaacat 24084187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 397 - 467
Target Start/End: Original strand, 20623250 - 20623319
Alignment:
Q  397 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 467  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20623250 tttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaac-atgattatgataaagactaacccccttaccttag 20623319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 397 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 21233510 - 21233441
Alignment:
Q  397 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 467  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21233510 tttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaac-atgattatgataaagactaacccccttaccttag 21233441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 251
Target Start/End: Original strand, 23328618 - 23328703
Alignment:
Q  165 tcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaac 251  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||| |||| ||||| | ||| || |||| ||||| ||| |||||||||||    
T  23328618 tcaacaacaacatccattgaaacttgtttctcacctcaatccaac-acaacttatcacaaatcattaattaggcaaaatttcacaac 23328703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 251
Target Start/End: Original strand, 24616222 - 24616307
Alignment:
Q  165 tcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaac 251  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||| |||| ||||| | ||| || |||| ||||| ||| |||||||||||    
T  24616222 tcaacaacaacatccattgaaacttgtttctcacctcaatccaac-acaacttatcacaaatcattaattaggcaaaatttcacaac 24616307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 251
Target Start/End: Original strand, 24712598 - 24712683
Alignment:
Q  165 tcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaac 251  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||| |||| ||||| | ||| || |||| ||||| ||| |||||||||||    
T  24712598 tcaacaacaacatccattgaaacttgtttctcacctcaatccaac-acaacttatcacaaatcattaattaggcaaaatttcacaac 24712683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 251
Target Start/End: Original strand, 24745616 - 24745701
Alignment:
Q  165 tcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaac 251  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||| |||| ||||| | ||| || |||| ||||| ||| |||||||||||    
T  24745616 tcaacaacaacatccattgaaacttgtttctcacctcaatccaac-acaacttatcacaaatcattaattaggcaaaatttcacaac 24745701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 397 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 25900388 - 25900319
Alignment:
Q  397 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 467  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25900388 tttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaac-atgattatgataaagactaacccccttaccttag 25900319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 467
Target Start/End: Original strand, 16105967 - 16106000
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 467  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16105967 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 16106000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 300
Target Start/End: Original strand, 23417296 - 23417435
Alignment:
Q  161 catatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta-agcataatttcacaaca-acccat 258  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| ||| |  |||| ||| |||||||||||||  || || ||| |||||| |||| |||| ||||| | ||| ||    
T  23417296 cataacaacaacaacatcaatt-aaacatgaatgtcaccacaaatcaacaacaacatagcacaattcagcaattagagcacaatt-cacaatataccaat 23417393  T
Q  259 tttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 300  Q
    ||||| | ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  23417394 tttcacatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattca 23417435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 467
Target Start/End: Original strand, 37053061 - 37053094
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 467  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37053061 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 37053094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 168 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 61419 - 61048
Alignment:
Q  168 acaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcataca 267  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  61419 acaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcataca 61321  T
Q  268 ttatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaaaattagagattgggtt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  61320 ttatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattaaagattgggtt 61221  T
Q  368 catatgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 467  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  61220 catacaaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 61121  T
Q  468 gttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttccccctttgcta 540  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  61120 gttatgatcaattcaaacttgagcttaactttagctcataattctccaatcttcaagttttccccctttgcta 61048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Original strand, 48903 - 48977
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||  |||| ||||||||||||||    
T  48903 atgattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgctcaatctaaacttaggctttactttagctcctaa 48977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 70)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 3431570 - 3431114
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaa 171  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || |||||||   |||||||||||   ||| | |||||||||||  || || | |||||||||| |  | ||||||    
T  3431570 atttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcacaaacaatcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaacatgtctcagcaacaa 3431471  T
Q  172 caacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattat 271  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3431470 caacatcaatcgaaacttgattctcaccttaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaactcattttcatacattat 3431371  T
Q  272 gaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaaaattagagattgggttcata 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3431370 gaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaatcttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcata 3431271  T
Q  372 tgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtta 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3431270 tgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtta 3431171  T
Q  472 tgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaatt-ctccaatcttcaagttt 527  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  3431170 tgatcaatccaaacttgggcttcactttagctcctaattgcttcaatcttcaagttt 3431114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 166 - 532
Target Start/End: Original strand, 22886387 - 22886753
Alignment:
Q  166 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcata 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22886387 caacaacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaattca-caacaacatgtcatagttcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcata 22886485  T
Q  266 cattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaaaattagagattggg 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | | |||||||     
T  22886486 cattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttattaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgga 22886585  T
Q  366 ttcatatgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgc-aaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttacct 464  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22886586 ttcatataaattcttactcaattaagcactttttcatacaaaccaag-aaaattgcaaaaaaaacaattatgattatgattaagactaacccccttacct 22886684  T
Q  465 taggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa-ttctccaatcttcaagttttcccc 532  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  22886685 taggtaatgattaatccaaacttaagcttcactttagctcctaatttcttcaatcttcaagtttccccc 22886753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 85 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 21494725 - 21494290
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    |||||||||| |||| |||||  ||||||||||||   ||||| |||||||  ||  || || | |||||||||  |  | |||||||||||||||||||    
T  21494725 accaacaacatctcaattctcaccaacaatcatgatatatgcacacccaagttataaatcataaacaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga 21494626  T
Q  185 aacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttattt 284  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||||||||            |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21494625 aacttgattctcacctcaatccaacaacaacat------------caattaagcataatttcacaactaccccttttcatacattatgaacatgttattt 21494538  T
Q  285 catcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaaaattagagattgggttcatatgaattctcactc 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||| ||| || ||||    
T  21494537 catcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaaattatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcatataaatacttactc 21494438  T
Q  385 aattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaac-aaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaa 483  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||    
T  21494437 aattaagcactatttcatacaaaccaag-aaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgaagaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaa 21494339  T
Q  484 acttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 532  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  21494338 acttaggcttcactttagctcctaattcttcaatcttcaagtttacccc 21494290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 166 - 351
Target Start/End: Original strand, 22147498 - 22147683
Alignment:
Q  166 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcata 265  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22147498 caacaacaacatcaattaaaatttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcata 22147597  T
Q  266 cattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaa 351  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22147598 cattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 22147683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 85 - 351
Target Start/End: Original strand, 18612386 - 18612651
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||||||||||   ||| | || ||||||||  || || | |||||||||| |  | ||||||||||||||||| |    
T  18612386 accaacaacatcttatttctcaccaacaatcatgatatatgaacactcaagccata-atcataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaattaa 18612484  T
Q  185 aacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttattt 284  Q
    | |||||||  |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18612485 atcttgatttccacctcaattcaacaacaacatgtcacaattcatcaattaagcataatttcataacaatccattttcatacattatgaacatgttattt 18612584  T
Q  285 catcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaa 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18612585 catcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 18612651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 85 - 351
Target Start/End: Original strand, 18619291 - 18619556
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||||||||||   ||| | || ||||||||  || || | |||||||||| |  | ||||||||||||||||| |    
T  18619291 accaacaacatcttatttctcaccaacaatcatgatatatgaacactcaagccata-atcataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaattaa 18619389  T
Q  185 aacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttattt 284  Q
    | |||||||  |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18619390 atcttgatttccacctcaattcaacaacaacatgtcacaattcatcaattaagcataatttcataacaatccattttcatacattatgaacatgttattt 18619489  T
Q  285 catcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaa 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18619490 catcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 18619556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 72 - 351
Target Start/End: Original strand, 2544916 - 2545191
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaa 171  Q
    |||| |||||| ||| |||||||   |||||||| |||||||||||||   ||  | |||||||||||  || || | ||||||||||   |||||||||    
T  2544916 atttcacaaaaccactaacaacagtccatttctcaacaacaatcatgatatatcaacacccaagccata-atcataaacaacaacatg---tatcaacaa 2545011  T
Q  172 caacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  2545012 caacatcaattgaaacttgattcccacctcaattcaacaacaacatgttataattcatcaattaagcataattttacaactacccattttcacacattat 2545111  T
Q  272 gaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaa 351  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  2545112 gaatatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttattaccaaaataagagcacgaa 2545191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 414 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 16038839 - 16038713
Alignment:
Q  414 aaaattgcaaacaaa-caattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattct 512  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16038839 aaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgatgaagacaaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattct 16038740  T
Q  513 ccaatcttcaagttttccccctttgcta 540  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  16038739 ccaatcttcaag-tttccccctttgcta 16038713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 397 - 540
Target Start/End: Original strand, 2545229 - 2545371
Alignment:
Q  397 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaa-caattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttca 495  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  2545229 tttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgattaattcaaatttaagcttca 2545326  T
Q  496 ctttagctcctaattctccaatcttcaagttttccccctttgcta 540  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2545327 ctttagctcctaattcttcaatcttcaagttttccccctttgcta 2545371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 20573461 - 20573361
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 183  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20573461 caccaacaacatctcatttctcaacacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 20573362  T
Q  184 a 184  Q
    |    
T  20573361 a 20573361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 397 - 527
Target Start/End: Original strand, 22147720 - 22147849
Alignment:
Q  397 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaa-caattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttca 495  Q
    ||||||||||  |||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22147720 tttcatacaa--caaggaaaattgaaaacaaaacaatcatgattatgaagaacactaaaccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttca 22147817  T
Q  496 ctttagctcctaattctccaatcttcaagttt 527  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22147818 ccttagctcctaattcttcaatcttcaagttt 22147849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 16039156 - 16038892
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||| | |||||||||||| | |||||||||  |||| |||| | ||||| || || ||||||||||||| |||||     
T  16039156 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatatccaagccataaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat 16039057  T
Q  186 acttgattcacaccccaattcaacaacaac-atgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttattt 284  Q
     | |||  |  | | ||||||| ||||||| ||| ||||| |||  |||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||    
T  16039056 -catgaaacttatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcactaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaattt 16038959  T
Q  285 catcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaa 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16038958 catcatcaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttctcaccaaaacaagagcacgaa 16038892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 397 - 525
Target Start/End: Original strand, 18612688 - 18612815
Alignment:
Q  397 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaa-caattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttca 495  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  18612688 tttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattgtgaagaacactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaatttgggcttca 18612785  T
Q  496 ctttagctcctaattctccaatcttcaagt 525  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18612786 ctttagctcctaattcttcaatcttcaagt 18612815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 84 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 20567427 - 20567329
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20567427 caccaacaacatctcatttctcaacacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 20567329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 84 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 20573620 - 20573522
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20573620 caccaacaacatctcatttctcaacacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 20573522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 84 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 41507087 - 41506839
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  | ||||||||||| | |||    
T  41507087 caccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaatatgactaaacaacaacaacaaccatt 41506988  T
Q  183 gaaacttgattcacaccccaattcaacaacaa-catgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgtta 281  Q
    | | | |||  || | | ||||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  |    
T  41506987 g-atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaa 41506890  T
Q  282 tttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 332  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  41506889 tttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatc 41506839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 65 - 217
Target Start/End: Original strand, 38533607 - 38533759
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacat 163  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  38533607 tcaacccattttacaaagtctccaacaacatctcatttctcatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacct 38533706  T
Q  164 atcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 217  Q
    | |||||||||||||||||| ||| ||| || || | |||||||||||||||||    
T  38533707 agcaacaacaacatcaattg-aacatgaatctcatcacaattcaacaacaacat 38533759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 20648099 - 20647998
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  20648099 caccaacaaaatctcacttctccacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattaacatcaacaacatgacctagcaacaacgacatcaatt 20648000  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  20647999 ga 20647998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Original strand, 41246635 - 41246736
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  41246635 caccaacaacatttcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaatt 41246734  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  41246735 ga 41246736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 84 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 20567268 - 20567184
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaa 168  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20567268 caccaacaacatctcatttctcaacacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaa 20567184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 24717152 - 24716892
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaaca 170  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||| || ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||  | || ||    
T  24717152 attttacaaaaccaccaacaacaatccatttatcaacaacaaattatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacatca 24717053  T
Q  171 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaa-catgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacatt 269  Q
    |||||| | |||| ||| |||  || | | ||||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| | ||||||||||||||     
T  24717052 acaacaaccattg-aacatgaaacaaatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatc 24716955  T
Q  270 atgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 332  Q
     ||||| ||  ||||||| | |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  24716954 gtgaacttgcaatttcattatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatc 24716892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 85 - 184
Target Start/End: Original strand, 21680980 - 21681080
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 183  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||    
T  21680980 accaacaacatcttatttctccacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacataccagtaacaacatcaattg 21681079  T
Q  184 a 184  Q
    |    
T  21681080 a 21681080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 20654175 - 20654074
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  20654175 caccaacaaaatctcacttctccacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagcaatgaattaacatcaacaacatgacctagcaacaacgacatcaatt 20654076  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  20654075 ga 20654074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 65 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 22736127 - 22736006
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacat 163  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||| || ||||||||| |  |    
T  22736127 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttttcatcaacaattcatgaattatgcacacccaagccatgaattaacaacaacaacatcagtt 22736028  T
Q  164 atcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    | ||| ||||||||||||||||    
T  22736027 agcaagaacaacatcaattgaa 22736006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 72 - 234
Target Start/End: Original strand, 23837163 - 23837325
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaaca 170  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||| | |||||||||||| || |||| ||||||||| || || |||||    
T  23837163 atttcacaaaaccaccaccaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaaca 23837262  T
Q  171 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 234  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||  ||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  23837263 acaacatcaattg-aacatgactcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 23837325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Original strand, 25122513 - 25122614
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaat 181  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||    
T  25122513 caccaacaacatctcatttctccataacaaaatcatgaatcatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacatctat 25122611  T
Q  182 tga 184  Q
    |||    
T  25122612 tga 25122614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 184
Target Start/End: Original strand, 20481585 - 20481683
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  20481585 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattga 20481683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 19993324 - 19993223
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||    
T  19993324 caccaacaacatctcatttctcaacaacaatccaagaattatgcaaaccctagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaatt 19993225  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  19993224 ga 19993223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 85 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 39447034 - 39446935
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 183  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  39447034 accaacaacatctcatttctcaacaacaaatcat-aatcatgcatacccaagccatgaattattatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattg 39446936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 82 - 185
Target Start/End: Original strand, 15969794 - 15969897
Alignment:
Q  82 atcaccaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaat 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||  | |||||| || || ||||||| ||| ||||    
T  15969794 atcaccaacaacaactcatttctcctctacaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcaatagcaacatcacttaacaacaactacaccaat 15969893  T
Q  182 tgaa 185  Q
    ||||    
T  15969894 tgaa 15969897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21198434 - 21198272
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaaca 170  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||| ||| | |||||||||||| || || | || |||||| || || |||||    
T  21198434 attttaccaaaccaccaacaacaactcatttctcatccacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcattaacagcaacatcacttagcaaca 21198335  T
Q  171 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 234  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||  ||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  21198334 acaacatcaattg-aacatgattcttaccacaattcaacaacaacataacataattcaacaatt 21198272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 65 - 217
Target Start/End: Original strand, 5854572 - 5854724
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacat 163  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||  || ||| |||||| | ||| | |||||||||||| || |||| |||||| || || |    
T  5854572 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt 5854671  T
Q  164 atcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 217  Q
    | |||||||||||||||||| ||| ||| || || | |||||||||||||||||    
T  5854672 agcaacaacaacatcaattg-aacatgaatctcatcacaattcaacaacaacat 5854724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 209 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 21259644 - 21259502
Alignment:
Q  209 caacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaa-caacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatca 307  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| |||| |||| ||||| | ||||||||  |||||| |||||||||  ||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  21259644 caacaacatgtcacaattcatcaattgagcacaatt-cacaaactacccatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaaaaattcaattatca 21259546  T
Q  308 ttcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaa 351  Q
    |  ||||||||||||||||| |||||| | |||| ||| |||||    
T  21259545 tcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaa 21259502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Original strand, 37611645 - 37611746
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaat 181  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  37611645 caccaacaacatttcatttctccataacaaaatcatgaattatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaaccacatgacttaacaacaacaacaacaat 37611743  T
Q  182 tga 184  Q
    |||    
T  37611744 tga 37611746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 59 - 161
Target Start/End: Original strand, 29759893 - 29759997
Alignment:
Q  59 tcattatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaac 156  Q
    |||| ||||||||||||  || ||| ||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||     
T  29759893 tcataatcaacccatttacaccaaaacaccaacaacaaaccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatatatcatcatcaacaat 29759992  T
Q  157 atgac 161  Q
    |||||    
T  29759993 atgac 29759997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 87 - 332
Target Start/End: Original strand, 274423 - 274668
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||| | |||| ||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||| || || ||| ||||||||| |||||     
T  274423 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgattcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaataacaacatctattgat 274522  T
Q  186 acttgattcacaccccaattcaacaacaac-atgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttattt 284  Q
     | |||  |  | | ||||||| ||||||| ||| ||||| ||| ||||| | ||||||||   ||| || ||||||||||||| |||||| ||  ||||    
T  274523 -catgaaacttatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgaacataatttacaaactacacattttcatacatcatgaacttgcaattt 274620  T
Q  285 catcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 332  Q
    ||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  274621 catcatcaacaattcatttagcatcaaattaacatattcaaacatatc 274668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 87 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 641426 - 641181
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||| | |||| ||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||| || || ||| ||||||||| |||||     
T  641426 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgattcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaataacaacatctattgat 641327  T
Q  186 acttgattcacaccccaattcaacaacaac-atgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttattt 284  Q
     | |||  |  | | ||||||| ||||||| ||| ||||| ||| ||||| | ||||||||   ||| || ||||||||||||| |||||| ||  ||||    
T  641326 -catgaaacttatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgaacataatttacaaactacacattttcatacatcatgaacttgcaattt 641229  T
Q  285 catcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 332  Q
    ||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  641228 catcatcaacaattcatttagcatcaaattaacatattcaaacatatc 641181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 87 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 827232 - 826987
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||| | |||| ||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||| || || ||| ||||||||| |||||     
T  827232 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgattcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaataacaacatctattgat 827133  T
Q  186 acttgattcacaccccaattcaacaacaac-atgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttattt 284  Q
     | |||  |  | | ||||||| ||||||| ||| ||||| ||| ||||| | ||||||||   ||| || ||||||||||||| |||||| ||  ||||    
T  827132 -catgaaacttatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgaacataatttacaaactacacattttcatacatcatgaacttgcaattt 827035  T
Q  285 catcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 332  Q
    ||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  827034 catcatcaacaattcatttagcatcaaattaacatattcaaacatatc 826987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 371
Target Start/End: Original strand, 17502259 - 17502425
Alignment:
Q  205 tcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaa-caacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcattt 303  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||| | |||| |||  |||||| |||||||||  |||||||||  ||||||||| |     
T  17502259 tcaacaaaaacatgtcataattcatcaattgaacataatt-cacaaactacccttttatatacatcatgaacatgcaatttcatcattaacaattcaatc 17502357  T
Q  304 atcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaaaattagagattgggttcata 371  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||| ||| || ||  | | ||||||||||||||    
T  17502358 atcatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacaaatttcaaagattgggttcata 17502425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 201 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 22321607 - 22321476
Alignment:
Q  201 caattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 300  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||| | |||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  22321607 caatttaacaataacatgttataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacgtcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 22321508  T
Q  301 tttatcattcaattaacatactcaaacttatc 332  Q
     ||| |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  22321507 attaacatcaaattaacatattcaaacatatc 22321476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 204 - 334
Target Start/End: Original strand, 23217974 - 23218104
Alignment:
Q  204 ttcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcac-aacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatt 302  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||| ||| | ||||||  |||||| || ||||||  |||||||||  ||||||||| |    
T  23217974 ttcaacaacaacatgtcataattcatcaattgaacataa-ttcacaaactagccatttatatacatcattaacatgcaatttcatcattaacaattcaat 23218072  T
Q  303 tatcattcaattaacatactcaaacttatcac 334  Q
     |||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  23218073 catcatcaaattaacatactcaaacatatcac 23218104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 31194606 - 31194492
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaaca 170  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||   |||||||| ||| || |||| |||||| || |  || |||||    
T  31194606 attttacaaagtcaccaacaacaactcatttttcaccaacaaatcatgaatcatgtgcacccaagctatgaatcatcaacaacaatatcatttagcaaca 31194507  T
Q  171 acaacatcaattgaa 185  Q
    |||||||||||||||    
T  31194506 acaacatcaattgaa 31194492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 217
Target Start/End: Original strand, 33528383 - 33528535
Alignment:
Q  64 atcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgaca 162  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  || | |||||||| | ||| | |||||||||||| || |||| ||| || ||  |     
T  33528383 atcaacccattttacaaaatcaacaacaacaacccatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaa-aatatctct 33528481  T
Q  163 tatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 217  Q
    || ||||||||||||||||| |||| ||| || || | |||||||||||||||||    
T  33528482 tagcaacaacaacatcaatt-aaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacat 33528535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 22235038 - 22234890
Alignment:
Q  118 gaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 217  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||| | | |||  || | | ||||||| ||||||||     
T  22235038 gaattatgcaaacccaatccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaattg-atcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaa 22234940  T
Q  218 gtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcataca 267  Q
      ||||| ||| ||||| |||||| |||||||   |||||||||||||||    
T  22234939 tgcataattcaccaattgagcatattttcacacatacccattttcataca 22234890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 217
Target Start/End: Original strand, 26011452 - 26011604
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacat 163  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||  || ||| |||||| | ||| | |||||||||||| || |||| |||||| || || |    
T  26011452 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaacttaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt 26011551  T
Q  164 atcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 217  Q
    | |||||||||||||||||  ||| ||| || || | |||||||||||||||||    
T  26011552 agcaacaacaacatcaatt-caacatgaatctcatcacaattcaacaacaacat 26011604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 332
Target Start/End: Original strand, 39115285 - 39115500
Alignment:
Q  116 atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaac 215  Q
    |||||||||||| || |||| |||| |||||||||||| | |||||  | ||||||||||| | |||||  | |||  || | | | ||||| |||||||    
T  39115285 atgaatcatgcatacacaagtcatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattgat-catgaaacatatcacgattcatcaacaac 39115383  T
Q  216 -atgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaatt 314  Q
     ||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||  |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  ||||    
T  39115384 tatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaattacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaatt 39115482  T
Q  315 aacatactcaaacttatc 332  Q
    |||||| |||||| ||||    
T  39115483 aacatattcaaacatatc 39115500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 24385913 - 24385782
Alignment:
Q  201 caattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 300  Q
    ||||||| ||||||||   | ||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  24385913 caattcatcaacaacaatgcttaattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattca 24385814  T
Q  301 tttatcattcaattaacatactcaaacttatc 332  Q
    |||| |||  ||||| |||| |||||| ||||    
T  24385813 tttaacatcaaattatcatattcaaacatatc 24385782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 205 - 334
Target Start/End: Original strand, 4233953 - 4234082
Alignment:
Q  205 tcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaa-caacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcattt 303  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| |  |||||| ||||| | ||||||||  |||||| || ||||||  |||||||||  ||||||||| |     
T  4233953 tcaacaacaacttgtcataattcatcaattgaaaataatt-cacaaactacccatttatatacatcataaacatgcaatttcatcattaacaattcaatc 4234051  T
Q  304 atcattcaattaacatactcaaacttatcac 334  Q
    |||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  4234052 atcatcaaattaacatactcaaacatatcac 4234082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 24385684 - 24385610
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  24385684 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 24385610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 43373424 - 43373350
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  43373424 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 43373350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 73 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 27233348 - 27233204
Alignment:
Q  73 ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaa 171  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||   | ||| |||||| | ||| | |||||||||||| || |||| |||||| ||  | || ||||||    
T  27233348 ttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcattatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaa 27233249  T
Q  172 caacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 217  Q
    ||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||||||||    
T  27233248 caacatcaatt-aaacatgattctcatcacaattcaacaacaacat 27233204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 18261762 - 18261608
Alignment:
Q  64 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgac 161  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | |||||  || ||| |||||| | ||| | |||||||| ||| || |||| |||||| ||  |    
T  18261762 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacttaattctcatcatcaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctc 18261663  T
Q  162 atatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 217  Q
     || ||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||||||||    
T  18261662 ttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcacaattcaacaacaacat 18261608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 424 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 16404942 - 16404900
Alignment:
Q  424 acaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16404942 acaaataatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 16404900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 22907196 - 22907127
Alignment:
Q  397 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 467  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22907196 tttcatacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaac-atgattatgataaagactaacccccttaccttag 22907127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 217
Target Start/End: Original strand, 15933256 - 15933408
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacat 163  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||  |  ||| |||||| | |   | |||||||||||| || |||| |||||| || || |    
T  15933256 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaattctcatcttcaaatcatgatttacaaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt 15933355  T
Q  164 atcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 217  Q
    | |||||||||||||||||||| | ||| || || |  ||||||||||||||||    
T  15933356 agcaacaacaacatcaattgaa-catgaatctcatcataattcaacaacaacat 15933408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 112 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 23226317 - 23226244
Alignment:
Q  112 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||| || |||| |||||| || || || ||||||||||||||||||||    
T  23226317 aatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttaacaacaacaacatcaattgaa 23226244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 33611334 - 33611190
Alignment:
Q  73 ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaa 171  Q
    |||||||||| || ||||||||||| || ||||  || ||| |||||| | ||| | || ||||||||| || |||| |||||| || || || ||||||    
T  33611334 ttttacaaaaccaacaacaacaacttatatctcatcatcaaatcatgatttatgaacacacaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaa 33611235  T
Q  172 caacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 217  Q
    ||||||||||| |||| || ||| || | |||||||||||||||||    
T  33611234 caacatcaatt-aaacatggttctcaacacaattcaacaacaacat 33611190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 129 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 45559161 - 45558946
Alignment:
Q  129 acccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtca 228  Q
    |||||||| ||| || |||| |||||| ||  | || ||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||||||||  || || |||    
T  45559161 acccaagctatgaatcatcaacaacaatatcccttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattca 45559063  T
Q  229 tcaatta-agcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaac 327  Q
     |||||| |||| || ||||||| |   |||||||| | | ||||||||||  |||||| || |||||||||| |||||| | | || |  |||||||||    
T  45559062 acaattagagcacaa-ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatcactaatttcatgtactcaaac 45558964  T
Q  328 ttatcaccaaaacaagag 345  Q
     ||||| || ||||||||    
T  45558963 atatcatcataacaagag 45558946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 23152072 - 23152001
Alignment:
Q  114 tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||| || |||| |||||| || ||||| |||||||| |||||||||||    
T  23152072 tcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacatagcaacaacagcatcaattgaa 23152001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 38635915 - 38635785
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    |||||||||||  ||||||  |||||| | |||| ||||| | |||||||||||| || |||| |||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||    
T  38635915 caacaacaacttgtttctcatcaacaaattatgattcatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaacaacatcaatt-aa 38635817  T
Q  186 acttgattcacaccccaattcaacaacaacat 217  Q
    || |||||| || |  ||||||||||||||||    
T  38635816 acatgattctcatcataattcaacaacaacat 38635785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 397 - 467
Target Start/End: Original strand, 5238368 - 5238437
Alignment:
Q  397 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 467  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5238368 tttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaac-atgattatgataaagactaacccccttaccttag 5238437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 434 - 464
Target Start/End: Original strand, 17345887 - 17345917
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttacct 464  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17345887 atgattatgatgaagactaacccccttacct 17345917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 397 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 24661230 - 24661161
Alignment:
Q  397 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 467  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24661230 tttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaac-atgattatgataaagactaacccccttaccttag 24661161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 434 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 41506741 - 41506671
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctc 504  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||| ||  |||||||  |||||| ||||||||    
T  41506741 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttagataaggattaacccaaacttaggcttcaatttagctc 41506671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 397 - 467
Target Start/End: Original strand, 43685827 - 43685896
Alignment:
Q  397 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 467  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43685827 tttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaac-atgattatgataaagactaacccccttaccttag 43685896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 435 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 7000551 - 7000478
Alignment:
Q  435 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||| | | ||| ||  |||||||  |||||| ||||||||||||    
T  7000551 tgattatgatgaaaactaacccccttactttagataaggattaacccaaacttaggcttcaatttagctcctaa 7000478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 185
Target Start/End: Original strand, 23149736 - 23149860
Alignment:
Q  64 atcaacccattt--tacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatga 160  Q
    ||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||| ||  || | |||||||||| ||| | || ||||||||| || |||| ||||||||| |    
T  23149736 atcaacccatttcttacaaaaccaacaacaacaactcatttttcatcatcaaatcatgaattatgaatactcaagccatgaatcatcaacaacaacatca 23149835  T
Q  161 catatcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    | || |||||| |||| | ||||||    
T  23149836 cttagcaacaaaaacaactattgaa 23149860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 31194249 - 31194216
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 467  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31194249 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttag 31194216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 116 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 24385988 - 24385920
Alignment:
Q  116 atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | || || || || ||||||||||||| |||||    
T  24385988 atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataaaatcacttaacaacaacaacatctattga 24385920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 24716794 - 24716762
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24716794 atgattatgataaagactaacccccttacctta 24716762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 68)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 527
Target Start/End: Original strand, 371055 - 371511
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaa 171  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || |||||||   |||||||||||   ||| | |||||||||||  || || | |||||||||| |    ||||||    
T  371055 atttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcacaaacaatcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaacatgtctcggcaacaa 371154  T
Q  172 caacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattat 271  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  371155 caacatcaatcgaaacttgattctcaccttaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattat 371254  T
Q  272 gaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaaaattagagattgggttcata 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  371255 gaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaatcttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcata 371354  T
Q  372 tgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtta 471  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  371355 tgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtta 371454  T
Q  472 tgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaatt-ctccaatcttcaagttt 527  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  371455 tgatcaattcaaacttgggcttcactttagctcctaattgcttcaatattcaagttt 371511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 37 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 7284376 - 7284229
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 136  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7284376 acatcgtcaaaatcaaacttctccattatcaacccatttaacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaactcaagc 7284277  T
Q  137 catggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7284276 catgaattattatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 7284229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 434 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 18253792 - 18253685
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaag-ttttcccc 532  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18253792 atgattataatgataactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaatttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagtttttcccc 18253693  T
Q  533 ctttgcta 540  Q
    ||||||||    
T  18253692 ctttgcta 18253685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 434 - 540
Target Start/End: Original strand, 15862226 - 15862332
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttccccc 533  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15862226 atgattatgataataactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcaacttaactcctaattctccaatcttcaagttttccccc 15862325  T
Q  534 tttgcta 540  Q
    |||||||    
T  15862326 tttgcta 15862332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 59 - 332
Target Start/End: Original strand, 126366 - 126640
Alignment:
Q  59 tcattatcaacccatttta-caaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaac 156  Q
    |||| |||||||||||||  | ||| ||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||      
T  126366 tcataatcaacccattttctccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacagt 126465  T
Q  157 atgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaa-catgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacc 255  Q
    |||||  | ||||||||||| | |||| | | |||  || | | ||||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||    
T  126466 atgactaaacaacaacaacaaccattg-atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacc 126563  T
Q  256 cattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 332  Q
    ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  126564 cattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatc 126640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 45452435 - 45452335
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 183  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  45452435 caccaacaacatctcatttctccacacaaatcatgaatcatgccaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacgacaattg 45452336  T
Q  184 a 184  Q
    |    
T  45452335 a 45452335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 84 - 180
Target Start/End: Original strand, 11287394 - 11287491
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaa 180  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  11287394 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaa 11287491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 15822701 - 15822600
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15822701 caccaacaacatctcatttctcaaccacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 15822602  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  15822601 ga 15822600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 433 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 47480977 - 47480878
Alignment:
Q  433 tatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 532  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  47480977 tatgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcactttacctcctaattcttcaatcttcaagtttccccc 47480878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 14272203 - 14272054
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaag 135  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  || | |||||||||| ||| | || ||||    
T  14272203 acatcattaaaataaaacttcttcatcatcaacccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttctcatcatctaatcatgaattatgaacactcaag 14272104  T
Q  136 ccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    ||||| || |||| |||||| || |  || ||||||||||||||||||||    
T  14272103 ccatgaatcatcaacaacaatatcatttagcaacaacaacatcaattgaa 14272054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Original strand, 12758965 - 12759065
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 183  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  12758965 caccaacaacatctcatttctccacacaaatcataaatcctgcaaacccaagccatgaattatcaccaacaacatgacttaacaacaacaacaacaattg 12759064  T
Q  184 a 184  Q
    |    
T  12759065 a 12759065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 72 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17224220 - 17224058
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaaca 170  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||| | |||||||||||| || ||||| |||||||| || || |||||    
T  17224220 attttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcattaacaacatcacttagcaaca 17224121  T
Q  171 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 234  Q
    ||||||||||||||| | ||| ||  ||  |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  17224120 acaacatcaattgaa-catgactcttacaacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 17224058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 87 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 111543 - 111299
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaa 186  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||   ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||  | ||||||||||| | |||||      
T  111543 caacaacaatttatttctcaacaacaaatttgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccattgat- 111445  T
Q  187 cttgattcacaccccaattcaacaacaac-atgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttc 285  Q
    | |||  || | | ||||||| ||||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||||    
T  111444 catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttc 111346  T
Q  286 atcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 332  Q
    |||| |||| ||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  111345 atcatcaaccattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatc 111299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 39046893 - 39046792
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaaca-atcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||    
T  39046893 caccaacaacatctcatttctcaacaacagatcaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaatt 39046794  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  39046793 ga 39046792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 73 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 16570287 - 16570175
Alignment:
Q  73 ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaa 171  Q
    |||||| ||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||| || || ||||||    
T  16570287 ttttaccaaaacacccacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatccacgacatcacttagcaacaa 16570188  T
Q  172 caacatcaattga 184  Q
    |||||||||||||    
T  16570187 caacatcaattga 16570175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 73 - 184
Target Start/End: Original strand, 16595375 - 16595487
Alignment:
Q  73 ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaa 171  Q
    |||||| ||| |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||| || || ||||||    
T  16595375 ttttaccaaaacacccacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatccacgacatcacttagcaacaa 16595474  T
Q  172 caacatcaattga 184  Q
    |||||||||||||    
T  16595475 caacatcaattga 16595487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 49047943 - 49047843
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 183  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  49047943 accaacaacatctcgtttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcagcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattg 49047844  T
Q  184 a 184  Q
    |    
T  49047843 a 49047843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 26070531 - 26070433
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  26070531 caacaacaacttatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaataatcatccacaacatcacttagcaacaacaacatcaattga 26070433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 26094318 - 26094220
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  26094318 caacaacaacttatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaataatcatccacaacatcacttagcaacaacaacatcaattga 26094220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 12248391 - 12248290
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||||| || || ||||||||||||| |||    
T  12248391 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagtcatgcattatcatccacaacatcacttagcaacaacaacatccatt 12248292  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  12248291 ga 12248290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 85 - 184
Target Start/End: Original strand, 13274765 - 13274865
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcatttctccacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 183  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  13274765 accaacaacatctcatttctcaacaacaaaacatgaatcatgcataccaaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattg 13274864  T
Q  184 a 184  Q
    |    
T  13274865 a 13274865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 199 - 351
Target Start/End: Original strand, 13352044 - 13352196
Alignment:
Q  199 cccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaatt 298  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |  || ||||||||  |||||| |||||||||  |||||| || |||||| |    
T  13352044 cccaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattgagcataattaaaatactacccatttatatacatcatgaacatgcaatttcaccatcaacaaat 13352143  T
Q  299 catttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaa 351  Q
    ||  ||||||  |||||||||||| |||| |||||| | |||| ||| |||||    
T  13352144 caaatatcatcaaattaacatactgaaacatatcactacaacatgagcacgaa 13352196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 32494321 - 32494076
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||| | |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||  | |||||  | ||||||||||| | ||| ||    
T  32494321 caacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcatacacaagccatgaattatcatcaatcatatgactaaacaacaacaacaaccatt-aa 32494223  T
Q  186 acttgattcacaccccaattcaacaacaac-atgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttattt 284  Q
     | |||  || | | ||||||| ||||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||    
T  32494222 tcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaattt 32494124  T
Q  285 catcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 332  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  32494123 catcatcaacaatttatttaacatcaaattaacatattcaaacatatc 32494076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 88 - 332
Target Start/End: Original strand, 3049564 - 3049807
Alignment:
Q  88 aacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaa 186  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||| || || ||||||||||||| |||| |     
T  3049564 aacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatctattg-at 3049662  T
Q  187 cttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttca 286  Q
    | |||  |  | | ||||||| |||||||||  ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||| ||||||||| |||||| ||  ||||||    
T  3049663 catgaaacttatcacaattcatcaacaacatagcataattcaccaattgagcataatttacaaactacccatattcatacatcatgaacttgcaatttca 3049762  T
Q  287 tcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 332  Q
    ||| |  ||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  3049763 tcatc-ccaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatc 3049807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 65 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 16915217 - 16915096
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacat 163  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||  || ||| |||||| | ||| | |||||||||||| || |||| |||||| ||||| |    
T  16915217 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaattctcttcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatgactt 16915118  T
Q  164 atcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  16915117 agcaacaacaacatcaattgaa 16915096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 205 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 39291666 - 39291520
Alignment:
Q  205 tcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaa-caacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcattt 303  Q
    |||||||||| |||||| || ||| ||||| ||||||||| ||||| | ||||||||  |||||| || ||||||  ||||||||| |||||||||| ||    
T  39291666 tcaacaacaatatgtcacaattcaccaattgagcataatt-cacaaactacccatttatatacatcatcaacatgcaatttcatcatcaacaattcaatt 39291568  T
Q  304 atcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaa 351  Q
    |||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||| ||| |||||    
T  39291567 atcatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaa 39291520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Original strand, 13321334 - 13321408
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||| |  |||||||||||||||||||    
T  13321334 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacctaggcttcactttagctcctaa 13321408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Original strand, 25124450 - 25124524
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||  ||||||  |||||||||||||||||||    
T  25124450 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatctaaacttaggcttcactttagctcctaa 25124524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 161
Target Start/End: Original strand, 35094794 - 35094872
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgac 161  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  35094794 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcaagaattatgcaaacccaagccatgatttatcatcaacaacatgac 35094872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 174
Target Start/End: Original strand, 143622 - 143713
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaa 174  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  143622 caccaacaacatctcatttctccataacaaaatcatgaattatgcaa-cccaagccatgaattatcattaacaacatgacttaacaacaacaa 143713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 217
Target Start/End: Original strand, 48356602 - 48356754
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacat 163  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||  || ||| |||||| | ||| | |||||||||||| || |||| |||||| || || |    
T  48356602 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt 48356701  T
Q  164 atcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 217  Q
    | |||||||||||||||||||| | ||| || || |  ||||||||||||||||    
T  48356702 agcaacaacaacatcaattgaa-catgaatctcatcataattcaacaacaacat 48356754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 87 - 327
Target Start/End: Original strand, 2028900 - 2029141
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||  | |||||||||||| ||||||| |||| |||| |||| | ||||| || || |||| |||||||| |||||    
T  2028900 caacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagtcatgaattagcatccataacatcacttaacaacgacaacatctattga 2028999  T
Q  185 aacttgattcacaccccaattcaacaacaa-catgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatt 283  Q
      | |||  |  | | ||||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||| ||||| |||||| ||  |||    
T  2029000 t-catgaaacttatcacaattcatcaacaatcatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcgtacatcatgaacttgcaatt 2029097  T
Q  284 tcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaac 327  Q
    |||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  2029098 tcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaac 2029141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Original strand, 13377485 - 13377656
Alignment:
Q  64 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgac 161  Q
    ||||||||||||| || ||| || ||||||||||| |||||||  || ||| |||||| | ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  13377485 atcaacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacattac 13377584  T
Q  162 atatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 234  Q
     || |||||||||||||||||||| | ||| ||  | | |||||||||||||||||  ||||| | |||||||    
T  13377585 ttagcaacaacaacatcaattgaa-catgaatcttatcacaattcaacaacaacatagcataattaatcaatt 13377656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 84 - 176
Target Start/End: Original strand, 44865204 - 44865297
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaaca 176  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| || |||||||||||    
T  44865204 caccaacaacatctcatttctccataacaaaatcatgaattatgcaa-cccaagccatgaattatcataaactacatgacttaacaacaacaaca 44865297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Original strand, 47289758 - 47289859
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaac--aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaat 181  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| || || ||||| || ||||    
T  47289758 caccaacaacatctcatttctccataacaaaatcatgaatcatgc-aacacaagccatgaattatcatcatcaacatgacttaacagcaacagcaacaat 47289856  T
Q  182 tga 184  Q
    |||    
T  47289857 tga 47289859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 42056565 - 42056331
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||  | |||||||||||| |||||||||||| |||| |||  | || || || || ||||||||||||| |||||    
T  42056565 caacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataatatcacttaacaacaacaacatctattga 42056466  T
Q  185 aacttgattcacaccccaattcaacaacaac-atgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaa-caacccattttcatacattatgaacatgttat 282  Q
      | |||  || | | ||||||| ||||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||| ||  ||    
T  42056465 t-catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataatt-cacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaat 42056369  T
Q  283 ttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacata 320  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||  ||||||||||    
T  42056368 ttcatcatcaaccattcatttaacatcaaattaacata 42056331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 2190431 - 2190228
Alignment:
Q  116 atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaac 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||| || || ||||| ||||||| |||||  | |||  || | | ||||||| |||||||    
T  2190431 atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacatcaacatctattgat-catgaaacatatcacaattcatcaacaac 2190333  T
Q  216 -atgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaatt 314  Q
     ||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| | |||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||| ||||||||| |||  ||||    
T  2190332 catg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactatccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaaccattcatttaacatcaaatt 2190234  T
Q  315 aacata 320  Q
    ||||||    
T  2190233 aacata 2190228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 435 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 10000318 - 10000225
Alignment:
Q  435 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaatt-ctccaatcttcaagttt 527  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| | |||   |||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  10000318 tgattatgatgaagacaaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaggcttcactttagctcctaattgcttcaatcttcaagttt 10000225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 217
Target Start/End: Original strand, 31501179 - 31501283
Alignment:
Q  112 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaa 211  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||| || |||| |||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||    
T  31501179 aatcatgactcatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcataacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcacaattcaacaa 31501277  T
Q  212 caacat 217  Q
    ||||||    
T  31501278 caacat 31501283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 34241477 - 34241325
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacat 163  Q
    ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| ||  || | |||||||| | ||| | || ||||||||| || |||| ||||||  | || |    
T  34241477 tcaaccctttttacaaaaccaacaacaacaactcatttttcatcatcaaatcatgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatgtcactt 34241378  T
Q  164 atcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 217  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| || |  ||||||||||||||||    
T  34241377 atcaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcataattcaacaacaacat 34241325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Original strand, 2029244 - 2029318
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||||| |||||  |||||| ||||||||||||    
T  2029244 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaattccaacttaggcttcaatttagctcctaa 2029318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 165 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 10000565 - 10000480
Alignment:
Q  165 tcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaac 251  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| | ||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  10000565 tcaacagcaacatccattgaaacttgtttctcacctcaattcaac-acaacttatcacaaatcatcaattaagcaaaatttcacaac 10000480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Original strand, 36052971 - 36053045
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  36052971 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 36053045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 42056220 - 42056146
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  42056220 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 42056146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 201 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 15978002 - 15977869
Alignment:
Q  201 caattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||||   |||  | |||| |  |||||  |||||||||  ||||||||| ||| ||||||    
T  15978002 caattcaacaacaacatgtcataattcatcatttgagtataattcatcaagtatccatatatatacaccatgaacatgcaatttcatcatcaataattca 15977903  T
Q  301 tttatcattcaattaacatactcaaacttatcac 334  Q
     ||||||   ||||||||||||||||| ||||||    
T  15977902 attatcaacaaattaacatactcaaacatatcac 15977869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 435 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 48622614 - 48622521
Alignment:
Q  435 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaatt-ctccaatcttcaagttt 527  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||| | |||   |||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  48622614 tgattatgatgaaaacaaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaggcttcactttagctcctaattgcttcaatcttcaagttt 48622521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 1937290 - 1937200
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgac 161  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||  |||||||| |||| || | |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||    
T  1937290 atttcacaaaaccaccaacaataatccatttctcaacaaaaaattatgaatcatgcaaacccaagtcatgtatcatcatcaacaatatgac 1937200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 184
Target Start/End: Original strand, 3895005 - 3895103
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    ||||||||||| ||||  | ||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||| || || ||||||||||||| |||||    
T  3895005 caacaacaacttattttacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattga 3895103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 467
Target Start/End: Original strand, 7293297 - 7293366
Alignment:
Q  397 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 467  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7293297 tttcatacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaac-atgattatgataaagactaacccccttaccttag 7293366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 11580693 - 11580619
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  11580693 atgattatgataaagactaatccccttaccttagattaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 11580619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 13036970 - 13036896
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  13036970 atgattatggtgaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 13036896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Original strand, 15709469 - 15709543
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| ||    |||||  |||||||||||||||||||    
T  15709469 atgattatgatgaagactaatcctcttaccttagattatgattaacctcaacttaggcttcactttagctcctaa 15709543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Original strand, 16212071 - 16212145
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  16212071 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 16212145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 251
Target Start/End: Original strand, 16418558 - 16418643
Alignment:
Q  165 tcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaac 251  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| | ||| || |||| ||||| ||| |||||||||||    
T  16418558 tcaacaacaacatccattgaaacttgtttctcacctcaattcaac-acaacttatcacaaatcattaattaggcaaaatttcacaac 16418643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 435 - 532
Target Start/End: Original strand, 16418805 - 16418903
Alignment:
Q  435 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaatt-ctccaatcttcaagttttcccc 532  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||| | |||   ||||  ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||    
T  16418805 tgattatgatgaaaacaaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaactaaagcttcactttagctcctaattgtttcaatcttcaagtttccccc 16418903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 20583821 - 20583601
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    ||||||||||| |||||||  || ||| |||||| | ||| | |||||||||||| || |||| |||||| ||  | || ||||||||||||||||| ||    
T  20583821 caacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcccttaacaacaacaacatcaatt-aa 20583723  T
Q  186 acttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaa-ttaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttattt 284  Q
    || |||||| || |  ||||||||||||||||  || || ||| ||| || ||||||| ||||||| |   |||||||| | | ||||||||||  ||||    
T  20583722 acatgattctcatcataattcaacaacaacatagcacaattcaacaatttgagcataa-ttcacaatatatcattttcacatactatgaacatgcaattt 20583624  T
Q  285 catcaccaacaattcatttatca 307  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||    
T  20583623 catcaacaataattcaattatca 20583601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 30262111 - 30262042
Alignment:
Q  397 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 467  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30262111 tttcatacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaac-atgattatgataaagactaacccccttaccttag 30262042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 214
Target Start/End: Original strand, 4484683 - 4484834
Alignment:
Q  64 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgac 161  Q
    ||||||||||||| |||||| ||   ||||||||| |||||||  || ||| |||||| ||||| | |||||||| ||| || |||| |||||| ||  |    
T  4484683 atcaacccatttttacaaaaccaagcacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgattcatgaatacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctc 4484782  T
Q  162 atatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaa 214  Q
     || ||||||||||||||||| |||| |||||| || | ||||||||||||||    
T  4484783 ttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcacaattcaacaacaa 4484834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 12370107 - 12370011
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    |||| |||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||||||| || || ||  ||||||| || || |||||||||||||||||    
T  12370107 caactacaacttatttctcaataacaaatcatgaatcatgcatacctaagccatgaataattatgcacaacatcacttagcaacaacaacatcaatt 12370011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 283 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 17984827 - 17984759
Alignment:
Q  283 ttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaa 351  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||   ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  17984827 ttcatcatcaacaattcaattatcaacaaattaacatacccaaacatatcactaaaacaagagcacgaa 17984759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 434 - 504
Target Start/End: Original strand, 36024452 - 36024523
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaa-cccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctc 504  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||    |||||  |||||||||||||||    
T  36024452 atgattatgatgaagactaaccccccttaccttagattatgattaacctcaacttaggcttcactttagctc 36024523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 397 - 467
Target Start/End: Original strand, 11516508 - 11516577
Alignment:
Q  397 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 467  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11516508 tttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaac-atgattatgataaagactaacccccttaccttag 11516577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 397 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 14113971 - 14113902
Alignment:
Q  397 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 467  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14113971 tttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaac-atgattatgataaagactaacccccttaccttag 14113902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 397 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 14423621 - 14423553
Alignment:
Q  397 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 467  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14423621 tttcatacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaac-atgattatgat-aagactaacccccttaccttag 14423553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 397 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 15441546 - 15441477
Alignment:
Q  397 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 467  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15441546 tttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaac-atgattatgataaagactaacccccttaccttag 15441477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 182
Target Start/End: Original strand, 25124153 - 25124206
Alignment:
Q  129 acccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    ||||| |||||| || |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25124153 acccatgccatgaatcatcaacaacaacatctcatatcaacaacaacatcaatt 25124206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 111201 - 111169
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  111201 atgattatgatgaaaactaacccccttacctta 111169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 129 - 217
Target Start/End: Original strand, 15358820 - 15358907
Alignment:
Q  129 acccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 217  Q
    |||||||||||| || |||| |||||| |   | || ||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||||||||    
T  15358820 acccaagccatgaatcatcaacaacaaaacttcttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattcccatcacaattcaacaacaacat 15358907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 85 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 6492 - 6043
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    |||||||||| || |||||||  ||||||| ||||   ||| | |||||||||||  || || |||||||||||  |  | || ||||||||||||||||    
T  6492 accaacaacatcttatttctcatcaacaattatgatatatgaacacccaagccataaatcataatcaacaacatatctcagcatcaacaacatcaattga 6393  T
Q  185 aacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttattt 284  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6392 aacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcttaatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttattt 6293  T
Q  285 catcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaaaattagagattgggttcatatgaattctcac-t 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6292 catcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaatcttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcatatgaattctcactt 6193  T
Q  384 caattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaa 483  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6192 aaactaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgtttaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaa 6093  T
Q  484 acttgagcttcactttagctcctaa-ttctccaatcttcaagttttcccc 532  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  6092 acttgggcttcactttagctcctaatttcttcaatcttcaagttttcccc 6043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 314; Significance: 1e-177; HSPs: 58)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 37 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 24827044 - 24826615
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattt-ctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaag 135  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||   |||   |||||||    
T  24827044 acatcatcaatatcaaacttcttctttatcaacccattttacaaaaccaccaacaacagctcattttctcaacaacaatcatgataaatgagcacccaag 24826945  T
Q  136 ccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta 235  Q
    ||||   | || ||||||||| |  |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24826944 ccataattcataatcaacaacgtatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacacctcaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta 24826845  T
Q  236 agcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcacc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24826844 agcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcacc 24826745  T
Q  336 aaaacaagagtacgaaaattagagattgggttcatatgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattat 435  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24826744 aaaacaagagcacgaaaattagagattgggttcatatgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaagcaaacaattat 24826645  T
Q  436 gattatgatgaagactaacccccttacctt 465  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  24826644 gattatgatgatgactaacccctttacctt 24826615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 166 - 527
Target Start/End: Original strand, 17204391 - 17204753
Alignment:
Q  166 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcata 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17204391 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacacctcaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcata 17204490  T
Q  266 cattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaaaattagagattggg 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17204491 cattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatgatgcaattaacatactcaatcttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattggg 17204590  T
Q  366 ttcatatgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttacctt 465  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17204591 ttcatatgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttacttt 17204690  T
Q  466 aggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa-ttctccaatcttcaagttt 527  Q
    |||||||||| ||| |||||||   |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  17204691 aggttatgattaatccaaacttagacttcactttaactcctaatttcttcaatcttcaagttt 17204753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 168 - 508
Target Start/End: Original strand, 33128107 - 33128446
Alignment:
Q  168 acaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcataca 267  Q
    ||||||| ||||||| |||| |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33128107 acaacaatatcaatt-aaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcataca 33128205  T
Q  268 ttatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaaaattagagattgggtt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  33128206 ttatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaaattaaagattgggtt 33128305  T
Q  368 catatgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 467  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33128306 cataaaaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 33128405  T
Q  468 gttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    |||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  33128406 gttatgattaatccaaacttaggcttcactttagctcctaa 33128446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 85 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 28031516 - 28031068
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcattt-ctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 183  Q
    |||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||   ||| | |||||||||||  || || | |||||||||  |  | ||||||||||||||||||    
T  28031516 accaacaacatctcattttctcatcaacaatcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaacatatctcaacaacaacaacatcaattg 28031417  T
Q  184 aaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatt 283  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28031416 aaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatatcataattcatcaattaagcataatttcacaactacccattttcacacattatgaacatgttatt 28031317  T
Q  284 tcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaaaattagagattgggttcatatgaattctcact 383  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||| ||| ||  ||    
T  28031316 tcatcaccaacaattcatttatcaatcaattaacatactaaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcatataaatacttgct 28031217  T
Q  384 caattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaac-aaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattca 482  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  28031216 caattaagcactttctcatacaaaccaag-aaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaatgattaattca 28031118  T
Q  483 aacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 532  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  28031117 aacttaggcttcactttaactcctaattcttcaatcttcaagtttccccc 28031068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 37 - 320
Target Start/End: Original strand, 25212977 - 25213261
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattt--ctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaa 134  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||   ||| | ||||||    
T  25212977 acatcatcaaaatcaaatttcttctttatcaacccattttacaaaaccaccaccaacaactcatttttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaa 25213076  T
Q  135 gccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 234  Q
    |||||   | || |||||||||||  |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25213077 gccataattcattatcaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 25213176  T
Q  235 aagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacata 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  25213177 aagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatattatttcatcatcaaccattcatttaaca-tcaattaacata 25213261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 166 - 352
Target Start/End: Original strand, 15633273 - 15633459
Alignment:
Q  166 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcata 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  15633273 caacaacaacatcaattgaaacttgtttctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcacaactacccattttcaaa 15633372  T
Q  266 cattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaaa 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15633373 cattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaa 15633459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 434 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 7507789 - 7507683
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttccccc 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7507789 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagtttcactttaactcctaattctccaatcttcaagctttccccc 7507690  T
Q  534 tttgcta 540  Q
    |||||||    
T  7507689 tttgcta 7507683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19433649 - 19433452
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaag 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||| | |||||||    
T  19433649 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaacacccaag 19433550  T
Q  136 ccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 234  Q
    ||||| || |||| |||||| ||  | || |||||||||||||||||| ||| ||||||  ||  |||||||| ||||||||  ||||| ||| |||||    
T  19433549 ccatgaatcatcaacaacaatatctcttagcaacaacaacatcaattg-aacatgattcttacaacaattcaataacaacatagcataattcaacaatt 19433452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 434 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 23777994 - 23777888
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttccccc 533  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23777994 atgattatgatgataactaacccctttaccttaggttatgatcaattcaaatttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttctagttttccccc 23777895  T
Q  534 tttgcta 540  Q
    |||||||    
T  23777894 tttgcta 23777888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 4448402 - 4448302
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 183  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4448402 caccaacaacatctcatttttcaacacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 4448303  T
Q  184 a 184  Q
    |    
T  4448302 a 4448302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 65 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 3529 - 3409
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacata 164  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||| | |||||||||||| || |||||||||||||| || ||    
T  3529 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctcatctacaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcactta 3430  T
Q  165 tcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  3429 gcaacaacaacatcaattgaa 3409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Original strand, 271148 - 271248
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 183  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  271148 caccaacaacatctcattcctcaacacaaatcatgaatcatgcaaacccaagctatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 271247  T
Q  184 a 184  Q
    |    
T  271248 a 271248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 73 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 22580140 - 22580028
Alignment:
Q  73 ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaa 171  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||     
T  22580140 ttttaccaaaacaccaacaacatctcatttctccacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacatatcagcag 22580041  T
Q  172 caacatcaattga 184  Q
    |||||||||||||    
T  22580040 caacatcaattga 22580028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 72 - 332
Target Start/End: Original strand, 22274688 - 22274947
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaaca 170  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||| |||||  | || ||    
T  22274688 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaattcatgaatcatgcaa-cccaagccatctatcatcatcaacaatatgactaaacatca 22274786  T
Q  171 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaac-atgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacatt 269  Q
    |||||| | |||||  | |||  |||| | ||||||| ||||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||     
T  22274787 acaacaaccattgat-catgaaacacatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaacaacccattttcatacatc 22274884  T
Q  270 atgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 332  Q
    |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  22274885 atgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatc 22274947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Original strand, 28974026 - 28974127
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  28974026 caccaacaacatctcatttctcatcaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaatt 28974125  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  28974126 ga 28974127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 184
Target Start/End: Original strand, 25601989 - 25602102
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaaca 170  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||    
T  25601989 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacctaagccatgatttatcataaacaacatgacatagcaaca 25602088  T
Q  171 acaacatcaattga 184  Q
    ||||||||||||||    
T  25602089 acaacatcaattga 25602102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Original strand, 27261783 - 27261884
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  27261783 caccaacaacatctcatttcttaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaatatcaatt 27261882  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  27261883 ga 27261884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Original strand, 32465835 - 32465936
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  32465835 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacatcaatt 32465934  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  32465935 ga 32465936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 234
Target Start/End: Original strand, 43645824 - 43646020
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 136  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |  |  ||  |||||||||| ||| | |||||||     
T  43645824 acatcatcaaaatcaaactttttcattaccaacccattttacaaaaccaccaccaacaactcaaatgacatcacaaatcatgaattatgaacacccaagt 43645923  T
Q  137 catggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 234  Q
    |||| || |||  ||||||||| || || |||||||||||||||||| ||| ||||||  ||| || ||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  43645924 catgaatcatcgacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattg-aacatgattcttaccacagttcaacaacaacatagcataattcaacaatt 43646020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 332
Target Start/End: Original strand, 22283921 - 22284180
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaaca 170  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| | |||  | || ||    
T  22283921 atttcacaaaaccaccaacaacaattcatttctcaacagcaattcatgaatcatgc-aacccaagccatgtatcatcatcaacaataagactaaacatca 22284019  T
Q  171 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaa-catgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacatt 269  Q
    | |||| | |||| | | |||  |||| | ||||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |  |||||||||||||     
T  22284020 aaaacaacgattg-atcatgaaacacatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataatttactaactattcattttcatacatc 22284117  T
Q  270 atgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 332  Q
    |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||    
T  22284118 atgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacattaaattaacatattcaaacatatc 22284180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 87 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 9653172 - 9652926
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||  | |||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||| || || ||||| ||||||| |||||    
T  9653172 caacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacatcaacatctattga 9653073  T
Q  185 aacttgattcacaccccaattcaacaacaac-atgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatt 283  Q
      | |||   | | | ||||||| ||||||| ||| ||||| ||| ||||| || |||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||    
T  9653072 t-catgaaaaatatcgcaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgagtataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatt 9652975  T
Q  284 tcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 332  Q
    |||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  9652974 tcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatc 9652926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 23836975 - 23836874
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||  | ||||||||||| |||||    
T  23836975 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcaagaattatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaaaatgactaaacaacaacaacaacaatt 23836876  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  23836875 ga 23836874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 24571572 - 24571461
Alignment:
Q  73 ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaa 171  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| || | |||||| |||  |||||||||||||||| || || ||||||    
T  24571572 ttttaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatacatagccaagc-atgagttatcatcaacaacatcacttaacaacaa 24571474  T
Q  172 caacatcaattga 184  Q
    |||||||||||||    
T  24571473 caacatcaattga 24571461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 202 - 351
Target Start/End: Original strand, 7321612 - 7321761
Alignment:
Q  202 aattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaa-caacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattca 300  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| |||| ||||| | ||||||||  |||||| || ||||||  |||||||||  || ||||||    
T  7321612 aattcaacaacaacatgtcacaattcatcaattgagcacaatt-cacaaactacccatttatatacatcataaacatgaaatttcatcataaaaaattca 7321710  T
Q  301 tttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaa 351  Q
     |||||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||| ||| |||||    
T  7321711 attatcatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaa 7321761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 36890952 - 36890854
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||| || || ||||||||||| |||||||    
T  36890952 caacaacaacttatttctcaacaacaaatcaagaatcatgcatacccaagccatgaataatcatccacaacatcacttagcaacaacaacaacaattga 36890854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 185
Target Start/End: Original strand, 722353 - 722474
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacat 163  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||| || |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||  |||||||| || |    
T  722353 tcaaccaattttacaaagtcaccaacaacaactcatatctcatcaataaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcaataacaacatcactt 722452  T
Q  164 atcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    | || |||| || |||||||||    
T  722453 agcagcaactacttcaattgaa 722474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 217
Target Start/End: Original strand, 24884643 - 24884796
Alignment:
Q  64 atcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgaca 162  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || | |||||||| | ||| | ||||||| |||| || |||| |||||| ||        
T  24884643 atcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcctcatcaaatcatgatttatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatctat 24884742  T
Q  163 tatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 217  Q
    || ||||||||||||||||| |||| ||| || || | ||||||||||| |||||    
T  24884743 tagcaacaacaacatcaatt-aaacatgaatctcatcacaattcaacaataacat 24884796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 25265335 - 25265261
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||| ||||| |  |||||||||||||||||||    
T  25265335 atgattatgatgaagactaacccccttacattagataatgattaatccaaacctaggcttcactttagctcctaa 25265261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 185
Target Start/End: Original strand, 25305423 - 25305524
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 183  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||| | ||||| |||||| || |||| ||||||||| || || | ||||||||||||||||    
T  25305423 accaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaggccatgaatcatcaacaacaacatcacttagccacaacaacatcaattg 25305522  T
Q  184 aa 185  Q
    ||    
T  25305523 aa 25305524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 25876154 - 25875994
Alignment:
Q  118 gaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 217  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||| || ||| | | |||  || | | ||||||| ||||||||     
T  25876154 gaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaataacaacaacatttg-atcatgaagcatatcacaattcatcaacaacaa 25876056  T
Q  218 gtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgt 279  Q
      ||||| ||| ||||| |||||| |||||||   ||||||||||||||| | |||||||||    
T  25876055 tgcataattcaccaattgagcatattttcacacatacccattttcatacactttgaacatgt 25875994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19669376 - 19669222
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaaca-atcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    |||||||||||||||| ||  || ||  |||||||| ||| | |||||||||||| || |||| ||| ||||| || || |||||||||||||||||| |    
T  19669376 caacaacaactcatttttcatcatcagttcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaataacatcacttagcaacaacaacatcaattg-a 19669278  T
Q  186 acttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtc-atcaattaagcat 240  Q
    || || |||||| |  |||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||    
T  19669277 acatggttcacatcataattcaacaacaacatatcataattcaaccaattaagcat 19669222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 435 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 5888578 - 5888480
Alignment:
Q  435 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaatt-ctccaatcttcaagttttcccc 532  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||| | |||   ||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||    
T  5888578 tgattatgatgaaaacaaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaagcttcactttagctcctaattgcgtcaatcttcaagtttccccc 5888480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 435 - 532
Target Start/End: Original strand, 21142203 - 21142301
Alignment:
Q  435 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaatt-ctccaatcttcaagttttcccc 532  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||| | |||   |||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  21142203 tgattatgatgaaaacaaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaggcttcactttagctcctaattgcttcaatcttcaagtttccccc 21142301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 24341341 - 24341267
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    |||||  |||||| ||||||||||||    
T  24341341 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacctcaacttaggcttcattttagctcctaa 24341267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 234
Target Start/End: Original strand, 67952 - 68119
Alignment:
Q  68 acccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatat 165  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||  || ||| |||||||| ||| | || ||||||||| || | || |||||| || || ||     
T  67952 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacgcaagccatgaatcaccaacaacaatatcacttag 68051  T
Q  166 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 234  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||  ||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  68052 caacaacaacatcaattg-aacatgaatcttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 68119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 31146451 - 31146348
Alignment:
Q  83 tcaccaacaacaactcatttctccacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaat 181  Q
    |||||||||| ||||||||| ||  ||||||| ||||||| ||||| ||| | ||||||  |||||||||||||||| || || |||||  |||||||||    
T  31146451 tcaccaacaataactcatttatcaccaacaattcatgaattatgcacacctaggccatgatttatcatcaacaacatcacttagcaacagtaacatcaat 31146352  T
Q  182 tgaa 185  Q
    ||||    
T  31146351 tgaa 31146348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Original strand, 463043 - 463117
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  463043 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 463117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 5888825 - 5888740
Alignment:
Q  165 tcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaac 251  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| | ||| || |||| ||||| ||| |||||||||||    
T  5888825 tcaacaacaacatccattgaaacttgtttctcacctcaattcaac-acaacttatcacaaatcattaattaggcaaaatttcacaac 5888740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 166 - 307
Target Start/End: Original strand, 9636805 - 9636945
Alignment:
Q  166 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta-agcataatttcacaacaacccattttcat 264  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||||||||  || || ||| |||||| ||||||| ||||||| |   ||||||||     
T  9636805 caacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatagcacaattcaacaattagagcataa-ttcacaatatatcattttcac 9636902  T
Q  265 acattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatca 307  Q
    | | ||||||||||  |||||| || |||||||||| ||||||    
T  9636903 atactatgaacatgcaatttcaccaacaacaattcaattatca 9636945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Original strand, 6879414 - 6879515
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    ||||||||||| |||| ||||| ||||||| | | |||| ||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  |  |||||||||| |||||    
T  6879414 caccaacaacatctcaattctcaacaacaaaccaagaattatttaaacccaagacatgtattatcatcaacaacatgactaaataacaacaacaacaatt 6879513  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  6879514 ga 6879515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 397 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 19689383 - 19689315
Alignment:
Q  397 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19689383 tttcatacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaac-atgattatgataaagactaacccccttacctta 19689315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 116 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 21274293 - 21274091
Alignment:
Q  116 atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaac 215  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||| |||| | ||||| || || ||||||||||||| |||||  | |||  || |   ||||||| |||||||    
T  21274293 atgaatcatgcta-cccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat-catgaaacatattacaattcatcaacaac 21274196  T
Q  216 -atgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaatt 314  Q
     ||| ||||| ||| ||||| || |||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||| ||||||||| |||  ||||    
T  21274195 catg-cataattcaccaattgagtataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaaccattcatttaacatcaaatt 21274097  T
Q  315 aacata 320  Q
    ||||||    
T  21274096 aacata 21274091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 112 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 24294764 - 24294691
Alignment:
Q  112 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    |||||||||| ||| | || ||||||||| || |||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||    
T  24294764 aatcatgaattatgaatactcaagccatgaatcatcatcaacatcatcacttagcaacaacaacatcaattgaa 24294691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 435 - 508
Target Start/End: Original strand, 32466177 - 32466249
Alignment:
Q  435 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||  |||||||  |||||| ||||||||||||    
T  32466177 tgattatgatgaagactaa-ccccttaccttagataaggatcaacccaaacttaggcttcaatttagctcctaa 32466249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 19794661 - 19794629
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19794661 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 19794629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 23821892 - 23821773
Alignment:
Q  68 acccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatat 165  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| |  || ||| |||||||| ||| | ||||| |||||| || |||| |||||| || || ||     
T  23821892 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcatgaattatgaacacccatgccatgaatcatcaacaacaatatcacttag 23821793  T
Q  166 caacaacaacatcaattgaa 185  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  23821792 caacaacaacatcaattgaa 23821773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 23830971 - 23830852
Alignment:
Q  68 acccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatat 165  Q
    ||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| |  || ||| |||||||| ||| | ||||| |||||| || |||| |||||| || || ||     
T  23830971 acccattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttcacatcatcaaatcatgaattatgaacacccatgccatgaatcatcaacaacaatatcacttag 23830872  T
Q  166 caacaacaacatcaattgaa 185  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  23830871 caacaacaacatcaattgaa 23830852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 9652828 - 9652754
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  | |||| ||||||||||||    
T  9652828 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttaggtttcaatttagctcctaa 9652754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 397 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 14906422 - 14906353
Alignment:
Q  397 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 467  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14906422 tttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaac-atgattatgataaagactaacccccttaccttag 14906353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 397 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 17396635 - 17396566
Alignment:
Q  397 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 467  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17396635 tttcatacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaac-atgattatggtaaagactaacccccttaccttag 17396566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Original strand, 22863235 - 22863309
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  ||| || ||||||||||||    
T  22863235 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggctgcaatttagctcctaa 22863309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 251
Target Start/End: Original strand, 23774197 - 23774282
Alignment:
Q  165 tcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaac 251  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||| |||| ||||| | ||| || |||| ||||| ||| |||||||||||    
T  23774197 tcaacaacaacatccattgaaacttgtttctcacctcaatccaac-acaacttatcacaaatcattaattaggcaaaatttcacaac 23774282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 397 - 467
Target Start/End: Original strand, 23820352 - 23820421
Alignment:
Q  397 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 467  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23820352 tttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaac-atgattatgataaagactaacccccttaccttag 23820421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 255 - 345
Target Start/End: Original strand, 25595168 - 25595258
Alignment:
Q  255 ccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagag 345  Q
    ||||||||| | |||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||   |||| |  ||||||||| ||||| || ||||||||    
T  25595168 ccattttcacatattatggacatgcaatttcatcaacaacaattcatttatcaccaaattcatgtactcaaacatatcatcataacaagag 25595258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 36982396 - 36982363
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 467  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36982396 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 36982363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 74 - 185
Target Start/End: Original strand, 19666495 - 19666607
Alignment:
Q  74 tttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaac 172  Q
    ||||||||| || |||||||||  ||||||||  || |||  ||||||| ||| | |||||||||||| || |||| | |||| || || || |||||||    
T  19666495 tttacaaaaccaacaacaacaatccatttctcatcatcaaaacatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacgacaatatcacttagcaacaac 19666594  T
Q  173 aacatcaattgaa 185  Q
    |||||||||||||    
T  19666595 aacatcaattgaa 19666607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 22284278 - 22284310
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22284278 atgattatgataaagactaacccccttacctta 22284310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 129 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 24560955 - 24560868
Alignment:
Q  129 acccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 217  Q
    |||||||| ||| || |||| |||||| ||  |||| ||||||||||||||||| |||| ||| || |||| || ||||||||||||||    
T  24560955 acccaagctatgaatcatcaacaacaatatctcataacaacaacaacatcaatt-aaacatgaatctcaccacatttcaacaacaacat 24560868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 265; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 85 - 532
Target Start/End: Original strand, 5201 - 5647
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    |||||||||| || ||||||   ||||||||||||   ||| | |||||||||||  || || | |||||||||| |  | ||||||||||||||||| |    
T  5201 accaacaacatcttatttcttaccaacaatcatgatatatgaacacccaagccata-atcataaacaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaattaa 5299  T
Q  185 aacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttattt 284  Q
    | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5300 atcttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattcatcaattaagcataatttcataacaacccattttcatacattatgaacatgttattt 5399  T
Q  285 catcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaaaattagagattgggttcatatgaattctcactc 384  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  5400 catcaccaacaattcatttatcaatcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttcatataaattcttactc 5499  T
Q  385 aattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaac-aaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaa 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  5500 aattaagcactttttcatacaaaccaag-aaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaatgattaatccaa 5598  T
Q  484 acttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 532  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  5599 acttgggcttcattttagctcctaattcttcaatcttcaagtttccccc 5647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 68 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 5875 - 5411
Alignment:
Q  68 acccattt-tacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatc 166  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||   ||| | ||||||| |||  || || | |||||||||  |  | |    
T  5875 acccatttatacaaaacaaccaacaacatctcatttctcaccaacaatcatgacatatgaacacccaagtcataaatcataaacaacaacatttctcagc 5776  T
Q  167 aacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatac 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5775 aacaacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcattaattaagcataatttcaaaacaacccattttcatac 5676  T
Q  267 attatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaaaattagagattgggt 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||| | |    
T  5675 attatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattagat 5576  T
Q  367 tcatatgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaac-aaacaattatgattatgatgaagactaacccccttacctt 465  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5575 tcatataaattcttactcaattaagcactttttcttacaaactaag-aaaattgcaaacaaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttacctt 5477  T
Q  466 aggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 532  Q
    |||| ||||| ||| ||| |||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  5476 aggtaatgattaatccaatcttaggcttcactttagctcctaa-tcttcaatcttcaagtttccccc 5411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 169 - 532
Target Start/End: Original strand, 17761 - 18124
Alignment:
Q  169 caacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacat 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17761 caacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcacaactacccattttcatacat 17860  T
Q  269 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaaaattagagattgggttc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||    
T  17861 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaaagattgggttc 17960  T
Q  369 atatgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaac-aaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 467  Q
    |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17961 atataaatacttactcaattaagcactttttcatacaaacaaag-aaaattgcaaacaaaataattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 18059  T
Q  468 gttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 532  Q
     | ||||| ||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  18060 ataatgattaatccaaacttaggcttcactttaactcctaattcttcaatcttcatgtttccccc 18124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 168 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 17506 - 17208
Alignment:
Q  168 acaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcataca 267  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17506 acaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcacaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacagcaacccattttcataca 17408  T
Q  268 ttatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaaaattagagattgggtt 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17407 ttatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcatacttatcaccaaaacaagagtacgaaaattaaagattgggtt 17308  T
Q  368 catatgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 467  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17307 catacaaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 17208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 255; Significance: 1e-141; HSPs: 39)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 72 - 434
Target Start/End: Complemental strand, 21650329 - 21649967
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaa 171  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || |||||||   |||||||||||   ||| | |||||||||||  || || | |||||||||| |  | ||||||    
T  21650329 atttcacaaaaccaccaacaacatcttatttctcacaaacaatcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaacatgtctcaacaacaa 21650230  T
Q  172 caacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21650229 caacatcaattgaaacttgattctcaccttaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattat 21650130  T
Q  272 gaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaaaattagagattgggttcata 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  21650129 gaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaatcttatcaccaaaacaagagcacgaaaattagagattgagttcata 21650030  T
Q  372 tgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaatta 434  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21650029 tgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaatta 21649967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 166 - 345
Target Start/End: Original strand, 20254373 - 20254552
Alignment:
Q  166 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcata 265  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  20254373 caacaacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcacaattcatcaattaagcataatttcataacaactcattttcata 20254472  T
Q  266 cattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagag 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20254473 cattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagag 20254552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 397 - 540
Target Start/End: Original strand, 20254595 - 20254736
Alignment:
Q  397 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaa-caattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttca 495  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20254595 tttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgaagaacactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttca 20254692  T
Q  496 ctttagctcctaattctccaatcttcaagttttccccctttgcta 540  Q
    ||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  20254693 ctttagctcataattcctcaatcttcaag-tttccccctttgcta 20254736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Original strand, 21718206 - 21718306
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 183  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21718206 caccaacaacatctcatttctcaagaacaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 21718305  T
Q  184 a 184  Q
    |    
T  21718306 a 21718306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 35522588 - 35522488
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 183  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35522588 caccaacaacatctcatttctcaacacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacgtatcaacaacaacatcaattg 35522489  T
Q  184 a 184  Q
    |    
T  35522488 a 35522488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 59 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 15861728 - 15861456
Alignment:
Q  59 tcattatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaac 156  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||     
T  15861728 tcataatcaacccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgcatcatcatcaacaat 15861629  T
Q  157 atgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaa-catgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacc 255  Q
    |||||  | ||  ||||||| | |||| | | |||  || | | ||||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||    
T  15861628 atgactaaaca--aacaacaaccattg-atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacc 15861533  T
Q  256 cattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 332  Q
    ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  15861532 cattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatc 15861456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 59 - 332
Target Start/End: Original strand, 22366970 - 22367243
Alignment:
Q  59 tcattatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaac 156  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||     
T  22366970 tcataatcaacccattttcaccaaaacaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgtatcatcatcaacaat 22367069  T
Q  157 atgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaa-catgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacc 255  Q
    |||||  | ||||||||||| | |||| | | |||  || | | ||||||| |||||| |||| ||| | ||| ||||| ||||||||||   ||| ||     
T  22367070 atgactaaacaacaacaacaaccattg-atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatg-cat-attcaccaattgagcataatttacaaactact 22367166  T
Q  256 cattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 332  Q
    ||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  22367167 cattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatc 22367243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 65 - 185
Target Start/End: Original strand, 27674755 - 27674875
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacata 164  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||  |||||||| || ||    
T  27674755 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctcatcaaaaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatcaataacaacatcactta 27674854  T
Q  165 tcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
     ||||||| ||| ||||||||    
T  27674855 acaacaactacaccaattgaa 27674875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Original strand, 49967628 - 49967728
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 183  Q
    ||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  49967628 caccaacaacatctcattcctcaacaacaaccatgaatcatgcaaaccgaagcaatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattg 49967727  T
Q  184 a 184  Q
    |    
T  49967728 a 49967728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 112 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 9784341 - 9784269
Alignment:
Q  112 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9784341 aatcatgaatcatgcaagcccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 9784269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 73 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 51627945 - 51627833
Alignment:
Q  73 ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaa 171  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| || || ||||||    
T  51627945 ttttaccaaaccaccaacaacatctcatttctcaacagcaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacatcatcacttagcaacaa 51627846  T
Q  172 caacatcaattga 184  Q
    |||||||||||||    
T  51627845 caacatcaattga 51627833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 72 - 234
Target Start/End: Original strand, 20177140 - 20177302
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaaca 170  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||| | | |||||||||| || |||||||||||||| || || |||||    
T  20177140 atttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcttcaacaaatcatgaattatgaatatccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaaca 20177239  T
Q  171 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 234  Q
    ||||||||||||| ||||||| |   ||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  20177240 acaacatcaattg-aacttgacttttaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 20177302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 87 - 332
Target Start/End: Original strand, 21859991 - 21860236
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||  | ||||||||||| | ||| ||    
T  21859991 caacaacaattcatttctcaacaacaaattatgaatcatgcaaacccgagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaacaacaacaaccatt-aa 21860089  T
Q  186 acttgattcacaccccaattcaacaacaa-catgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttattt 284  Q
     | |||  || | | ||||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| || ||||||||| ||| |||||| ||  ||||    
T  21860090 tcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactactcattttcattcatcatgaacttgcaattt 21860188  T
Q  285 catcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 332  Q
    |||||  ||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  21860189 catcattaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatc 21860236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 85 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 22403379 - 22403287
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcatttctccacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaaca 176  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  22403379 accaacaacatctcatttctccataacaaaatcatgaatcatg-aaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaaca 22403287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 66 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 22829712 - 22829629
Alignment:
Q  66 caacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatca 148  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||    
T  22829712 caacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgcacacccaagccatgaattatca 22829629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 65 - 185
Target Start/End: Original strand, 19603055 - 19603176
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacat 163  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| || || ||||||| |||| |||||||  ||| |||| || |    
T  19603055 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattattcacacccaagtcatgaattatcaataaccacatcactt 19603154  T
Q  164 atcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    | || |||| ||||||||||||    
T  19603155 agcagcaactacatcaattgaa 19603176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 176
Target Start/End: Original strand, 41212046 - 41212139
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaaca 176  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| | | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  41212046 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaaca 41212139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 65 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 38033962 - 38033842
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacata 164  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||  ||||| |||||||||||| |||| || || |||||| || ||    
T  38033962 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaacttatttctcatcaacaatcgtgaactatgcacacccaagccatgaattaacaacagcaacatcactta 38033863  T
Q  165 tcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
     || |||  ||||||||||||    
T  38033862 gcagcaatcacatcaattgaa 38033842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 77 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 44035255 - 44035006
Alignment:
Q  77 acaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaac 175  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||| | |||||  | ||||||||||    
T  44035255 acaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaattatgaatcatgcaaactcaagccatt-atcatcatcaactatatgactaaacaacaacaac 44035157  T
Q  176 atcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaac-atgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaa 274  Q
    | | |||||  | |||  || | | ||||||| ||||||| ||| ||||| ||| ||| | ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||    
T  44035156 aaccattgat-catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaaatgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaa 44035059  T
Q  275 catgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaac 327  Q
    | ||  ||||||||| |||||||||||| | |||  |||||||||| ||||||    
T  44035058 cttgcaatttcatcatcaacaattcattaaacatcaaattaacatattcaaac 44035006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 20893583 - 20893509
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  20893583 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 20893509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 13377122 - 13377009
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaaca 170  Q
    |||| |||||| | |||||||||| |||||||||  |||||| |||||||| ||| | || ||||||||| || | |||||||||||| || || |||||    
T  13377122 atttcacaaaaccgccaacaacaattcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatactcaagccatgaatcaacatcaacaacatcacttagcaaca 13377023  T
Q  171 acaacatcaattga 184  Q
    ||||||||||||||    
T  13377022 acaacatcaattga 13377009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 72 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 41229221 - 41229107
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaaca 170  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||||  | |||| |||||||| ||| | || ||||||||| || || | ||||||||| || || |||||    
T  41229221 attttaccaaactaccaacaacaactcatttctcatccacaaatcatgaattatgaacactcaagccatgaatcattaacaacaacatcacttagcaaca 41229122  T
Q  171 acaacatcaattgaa 185  Q
    |||||||||||||||    
T  41229121 acaacatcaattgaa 41229107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 20955728 - 20955607
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacat 163  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |  |||||| ||| |||| || || ||| |||||||| |||||||  |||||||| || |    
T  20955728 tcaaccccttttacaaagtcacccacaacaactcatttcacaccaacaattcacgaattattcacaccgaagccatgaattatcaataacaacatcactt 20955629  T
Q  164 atcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    | || |||| ||||||||||||    
T  20955628 agcagcaactacatcaattgaa 20955607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 36356557 - 36356461
Alignment:
Q  90 caacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    ||||||||||||||||  | |||| |||||||| ||| | |||||||||||  || |||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||    
T  36356557 caacaactcatttctcatccacaaatcatgaattatgaacacccaagccataaatcatcatcaacaacatcacttagaaacaacaacatcaattgaa 36356461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 73 - 215
Target Start/End: Original strand, 21194980 - 21195122
Alignment:
Q  73 ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaa 171  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||||||||  || | |||||||| | ||| | |||||||||||| || |||| |||||| ||  | || ||||||    
T  21194980 ttttataaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatctcttaacaacaa 21195079  T
Q  172 caacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaac 215  Q
    |||||| |||| |||| |||||| || | |||||||||||||||    
T  21195080 caacattaatt-aaacatgattctcatcacaattcaacaacaac 21195122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 7641129 - 7641044
Alignment:
Q  165 tcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaac 251  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| | ||| || |||| ||||| ||| |||||||||||    
T  7641129 tcaacaacaacatccattgaaacttgtttctcacctcaattcaac-acaacttatcacaaatcattaattaggcaaaatttcacaac 7641044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Original strand, 20913335 - 20913409
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  20913335 atgattacgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 20913409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 184
Target Start/End: Original strand, 35054736 - 35054834
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    ||||||||||| ||| | | ||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||| || || ||||||||||||| |||||    
T  35054736 caacaacaacttattccacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatccattga 35054834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 27329992 - 27329924
Alignment:
Q  116 atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||| || || ||||||||||||| |||||    
T  27329992 atgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatccattga 27329924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Original strand, 20931650 - 20931724
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||| ||||    
T  20931650 atgattatgataaaggctaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctgctaa 20931724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 251
Target Start/End: Original strand, 22035508 - 22035593
Alignment:
Q  165 tcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaac 251  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||| |||| ||||| | ||| || |||| ||||| ||| |||||||||||    
T  22035508 tcaacaacaacatccattgaaacttgtttctcacctcaatccaac-acaacttatcacaaatcattaattaggcaaaatttcacaac 22035593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 37844406 - 37844332
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |  || ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  37844406 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaaaattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 37844332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 397 - 467
Target Start/End: Original strand, 51452773 - 51452842
Alignment:
Q  397 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 467  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  51452773 tttcatacaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaac-atgattaagataaagactaacccccttaccttag 51452842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 37234149 - 37234028
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacat 163  Q
    |||||||||||||||||| || | |||| |||||| || ||  || ||| |||||| | ||| | ||||||| |||| || |||| |||||| || || |    
T  37234149 tcaacccattttacaaaaccaaccacaaaaactcaattttcatcatcaaatcatgatttatggacacccaagtcatgaatcatcaacaacaatatcactt 37234050  T
Q  164 atcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  37234049 agcaacaacaacatcaattgaa 37234028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 129 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8538134 - 8538047
Alignment:
Q  129 acccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 217  Q
    |||||||||||| || |||| |||||| ||  | || ||||||||||||||||| |||| |||||| || |  ||||||||||||||||    
T  8538134 acccaagccatgaatcatcaacaacaatattccttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcataattcaacaacaacat 8538047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 129 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8603373 - 8603286
Alignment:
Q  129 acccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 217  Q
    |||||||||||| || |||| |||||| ||  | || ||||||||||||||||| |||| |||||| || |  ||||||||||||||||    
T  8603373 acccaagccatgaatcatcaacaacaatattccttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcataattcaacaacaacat 8603286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 112 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 22143602 - 22143530
Alignment:
Q  112 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||| || |||| |||||| || || || || ||||||||||||||||    
T  22143602 aatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcagcaacaacatcaattga 22143530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 41394527 - 41394559
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41394527 atgattatgataaagactaacccccttacctta 41394559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 45051726 - 45051758
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45051726 atgattatgataaagactaacccccttacctta 45051758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 167 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 34607 - 34242
Alignment:
Q  167 aacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatac 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  34607 aacaacaacatcaattgaaacttgattttcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatttcacaactacccattttcacac 34508  T
Q  267 attatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaaaattagagattgggt 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| | |  |||| |||    
T  34507 attatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcattaaaacaagagcacgaaattcaaggattaggt 34408  T
Q  367 tcatatgaattctcactcaattaagcactttttcatacaaaccaagaaaaattgcaaac-aaacaattatgattatgatgaagactaacccccttacctt 465  Q
    || ||| ||| || ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34407 tcgtataaatacttactcaattaagcactatttcatacaaactaag-aaaattgcaaacaaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttacctt 34309  T
Q  466 aggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 532  Q
    || | ||||| ||| |||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  34308 agataatgattaatccaaacttaggcttcattttagctcctaattcttcaatctttaagtttccccc 34242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 175; Significance: 6e-94; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 37 - 370
Target Start/End: Original strand, 130486 - 130819
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcattt-ctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaag 135  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||   ||| | |||||||    
T  130486 acatcatcaaaatcaaacttcttctttattaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcattttctcaacaacaatcatgatatatgaacacccaag 130585  T
Q  136 ccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta 235  Q
    ||||   | || |||||||||||  |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130586 ccataattcataatcaacaacatatctcaacaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta 130685  T
Q  236 agcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcacc 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||| ||  ||||| |||| |     
T  130686 agcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatattatttcatcatcaaccattcatttaaca-tcaattaacgtatccaaacatatctct 130784  T
Q  336 aaaacaagagtacgaaaattagagattgggttcat 370  Q
    | |||| ||| |||||  | | |||||||||||||    
T  130785 acaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcat 130819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 244
Target Start/End: Original strand, 79519 - 79677
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    |||||||||||||||||||  || |||| ||||||| ||| | |||||||||||| || |||| ||| || || || || |||||||||||||||||| |    
T  79519 caacaacaactcatttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaataatatcacttagcaacaacaacatcaattg-a 79617  T
Q  186 acttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtc-atcaattaagcataatt 244  Q
    || || |||||| |  |||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||    
T  79618 acatggttcacatcataattcaacaacaacatatcataattcaaccaattaagcataatt 79677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 89410 - 89336
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||| |||| |||||||    
T  89410 atgatcatgatgaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttaactcctaa 89336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 107740 - 107666
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||| |||| |||||||    
T  107740 atgatcatgatgaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttaactcctaa 107666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 6)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 145 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 165182 - 164976
Alignment:
Q  145 atcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatt 244  Q
    ||||| ||||||||| |  | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  165182 atcataaacaacatgtctcagcaacaacaacatcaattaaaacttgattctcacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaagcataatt 165083  T
Q  245 tcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaaga 344  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  165082 tcataagaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaaga 164983  T
Q  345 gtacgaa 351  Q
    | |||||    
T  164982 gcacgaa 164976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Original strand, 60784 - 60884
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 183  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  60784 caccaacaacatctcatttctccacacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 60883  T
Q  184 a 184  Q
    |    
T  60884 a 60884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 397 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 164939 - 164810
Alignment:
Q  397 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaa-caattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttca 495  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  164939 tttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgaagaacactaacccccttaccttaggttatgattaattcaaatttaagcttca 164842  T
Q  496 ctttagctcctaattctccaatcttcaagttt 527  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  164841 ctttagctcctaattcttcaatcttcaagttt 164810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 84 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 70892 - 70797
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatc 178  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  70892 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacatc 70797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Original strand, 172210 - 172284
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  172210 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 172284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Original strand, 177913 - 177987
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  177913 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 177987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 153; Significance: 8e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 85 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 50124 - 49864
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    |||||||||| || |||| ||  ||||||||||||   ||| | |||||||||||  || || | |||||||||  |  | |||||||||||||||||||    
T  50124 accaacaacatcttatttttcatcaacaatcatgatatatgaacacccaagccataaatcataaacaacaacatatctcagcaacaacaacatcaattga 50025  T
Q  185 aacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttattt 284  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50024 aacttgattctcacctcaattcaaccacaacatgtcataattcatcaattaagtataatttcacaactacccattttcatacactatgaacatgttattt 49925  T
Q  285 catcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagag 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49924 catcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagag 49864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 397 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 49820 - 49686
Alignment:
Q  397 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaa-caattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttca 495  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||  ||||||    
T  49820 tttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgaagaagactaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaacttaggcttca 49723  T
Q  496 ctttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 532  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  49722 ctttagctcctaattcttcaatcttcaagtttccccc 49686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 147; Significance: 3e-77; HSPs: 5)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 166 - 352
Target Start/End: Original strand, 11805 - 11990
Alignment:
Q  166 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcata 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  11805 caacaacaacatcaattgaaacttgattctcacctcaattcaacaa-aacatgtcatgattcatcaattaagcataatttcacaactacccattttcaaa 11903  T
Q  266 cattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaaa 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  11904 cattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaatagcacgaaa 11990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Original strand, 12063 - 12137
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||  |||||| ||||||||||||    
T  12063 atgattatgatgaagactaacccccttatcttagataatgattaatccaaactttggcttcaatttagctcctaa 12137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 8125 - 8051
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaaccccc-ttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctccta 507  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||| |||||||  |||||| |||||||||||    
T  8125 atgattatgatgaagactaaccccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcattttagctccta 8051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 7287 - 7193
Alignment:
Q  92 acaactcatttctccacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||| | || ||||||||| || |||| |||||| || || || || |||||||||||||||||    
T  7287 acaactcatttctcatcaacaattcatgaattatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcagcaacaacatcaattgaa 7193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 26372 - 26298
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | | |||  |||||| ||||||||||||    
T  26372 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccatcttaggcttcaatttagctcctaa 26298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0833 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0833
Description:

Target: scaffold0833; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 37 - 184
Target Start/End: Original strand, 3230 - 3377
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3230 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 3329  T
Q  137 catggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3330 catgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 3377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1867 (Bit Score: 128; Significance: 6e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold1867
Description:

Target: scaffold1867; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 37 - 184
Target Start/End: Original strand, 75 - 222
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  75 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcagcaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 174  T
Q  137 catggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  175 catgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 37 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 430 - 283
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  430 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaaaagctcatttctcaacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 331  T
Q  137 catggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  330 tatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 6679 - 6603
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  6679 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaagaacaactcaattctcaacaacaa 6603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 184
Target Start/End: Original strand, 24890 - 25036
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagc 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24890 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaatcatgaatcatgc-aacccaagc 24988  T
Q  137 catggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  24989 catgaattatcatcaacaacatgccatatcaacaacaacaacaattga 25036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 107 - 184
Target Start/End: Original strand, 25213 - 25289
Alignment:
Q  107 acaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  25213 acaacaatcatgaatcatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatgccatatcaacaacaacaacaattga 25289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 435 - 508
Target Start/End: Original strand, 25532 - 25605
Alignment:
Q  435 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||  |||||||  |||||| ||||||||||||    
T  25532 tgattatgatgaagactaacccccttaccttagataaggattaacccaaacttaggcttcaatttagctcctaa 25605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 113; Significance: 6e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 180
Target Start/End: Original strand, 21442 - 21586
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaag 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21442 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttcttaacaacaattcatgaatcatgcaaacccaag 21541  T
Q  136 ccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaa 180  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  21542 ccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaa 21586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 37 - 184
Target Start/End: Original strand, 31141 - 31289
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaag 135  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31141 acatcatcaaaatcaaactttttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaacaacaattcatgaatcatgcaaacccaag 31240  T
Q  136 ccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  31241 ccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaaaaacatcaattga 31289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 91; Significance: 8e-44; HSPs: 7)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 434 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 13299 - 13201
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 532  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13299 atgattatgatgataactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 13201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 166 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 13479 - 13395
Alignment:
Q  166 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaa 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  13479 caacaacaacatcaattgaaacttgatttccacctcaattcaacaacaacatgtcataattcatcaattaaacataatttcacaa 13395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 65 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 94061 - 93940
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacat 163  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||| |||   ||||||  |||| ||||||||||||||||| || |    
T  94061 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacatctcatttctcaccaacaaatcatgaattatgttcacccaaatcatgaattatcatcaacaacatcactt 93962  T
Q  164 atcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    || || ||||||||||||||||    
T  93961 attaataacaacatcaattgaa 93940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 327
Target Start/End: Original strand, 55591 - 55801
Alignment:
Q  116 atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaac 215  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||| || || ||||||||||||| |||||  | |||  |  | | ||||||| |||||||    
T  55591 atgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat-catgaaacttatcacaattcatcaacaac 55689  T
Q  216 -atgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaatt 314  Q
     ||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||| ||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  ||||    
T  55690 catg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcctacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaatt 55788  T
Q  315 aacatactcaaac 327  Q
    |||||| ||||||    
T  55789 aacatattcaaac 55801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 108107 - 108033
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||||| |||||  |||||| || |||||||||    
T  108107 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaattccaacttaggcttcaattcagctcctaa 108033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 104889 - 104793
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    |||||||||||||||| ||  || |||| ||||||| ||| | |||||||||||| || |||| |||||| || || || |||||||||||||||||    
T  104889 caacaacaactcatttatcatcatcaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaatt 104793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Original strand, 55904 - 55978
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | || ||  |||||| ||||||||||||    
T  55904 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaatttaggcttcaatttagctcctaa 55978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 397 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 9480 - 9345
Alignment:
Q  397 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaa-caattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttca 495  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9480 tttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgaagaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgggcttca 9383  T
Q  496 ctttagctcctaa-ttctccaatcttcaagttttcccc 532  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  9382 ctttagctcctaatttcttcaatcttcaagtttccccc 9345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 9782 - 9518
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||| | || || ||||||||||||| |||||     
T  9782 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacgtcacttaacaacaacaacatctattgat 9683  T
Q  186 acttgattcacaccccaattcaacaacaac-atgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttattt 284  Q
     | |||  |  | | ||||||| ||||||| ||| |||||||||  |||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| || ||| ||  ||||    
T  9682 -catgaaacttatcacaattcatcaacaaccatg-cataagtcactaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcataaacttgcaattt 9585  T
Q  285 catcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaa 351  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9584 catcatcaacaattcatttagcaatcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 9518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 234
Target Start/End: Original strand, 28466 - 28663
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaag 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||| ||| | |||||||    
T  28466 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcaccaataaatcatgaattatgaacacccaag 28565  T
Q  136 ccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 234  Q
    ||||| || || | ||||||||| || || |||||||||||||||||||| | | ||||  ||  |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  28566 ccatgaatcattaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaa-cataattcttactacaattcaacaacaacataccataattcaacaatt 28663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 37 - 87
Target Start/End: Original strand, 21637 - 21687
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaatcacc 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21637 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttacaaaaccacc 21687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 85; Significance: 3e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 73 - 184
Target Start/End: Original strand, 9903 - 10015
Alignment:
Q  73 ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaa 171  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  9903 ttttaccaaaacaccaacaacatctcatttctccacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaataatcatcaacaacatgacatatcaacaa 10002  T
Q  172 caacatcaattga 184  Q
    |||||||||||||    
T  10003 caacatcaattga 10015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 434 - 540
Target Start/End: Original strand, 108053 - 108159
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttccccc 533  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  108053 atgattataatgataactaacccccttaccttaggctataatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaaaatttccccc 108152  T
Q  534 tttgcta 540  Q
    |||||||    
T  108153 tttgcta 108159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 80 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 1096 - 991
Alignment:
Q  80 aaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatc 178  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1096 aaatcaccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacaac 997  T
Q  179 aattga 184  Q
    ||||||    
T  996 aattga 991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 7118 - 7025
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaaca 176  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| | | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  7118 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaaca 7025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 397 - 540
Target Start/End: Original strand, 48468 - 48610
Alignment:
Q  397 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaatt-atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttca 495  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||    
T  48468 tttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaacattcatgattatgaagaagactaacccccttacattaggttatgattaattcaaatttgggcttca 48565  T
Q  496 ctttagctcctaa-ttctccaatcttcaagttttccccctttgcta 540  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  48566 ctttagctcctaatttcttcaatcttcaag-tttccccctttgcta 48610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 84 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 11837 - 11616
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 183  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11837 caccaacaacatctcatttctccacacaaatcatgaattatgcaaacccaagtcatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacataaattg 11738  T
Q  184 aaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaaca-accca-ttttcatacattatgaacatgtta 281  Q
     | | |||  |  | | ||||||||||||||||   ||||| ||| |||||||||||| |||||  ||| ||||| |||||||||  | ||||||||| |    
T  11737 -atcatgaaactgatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattaagcatattttcaacacatacccatttttcatac--tttgaacatgtaa 11641  T
Q  282 tttcatcaccaacaattcatttatc 306  Q
    ||  |||| |||||||||| |||||    
T  11640 ttcaatcaacaacaattcaattatc 11616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 255084 - 254983
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  255084 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 254985  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  254984 ga 254983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 261690 - 261589
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  261690 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 261591  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  261590 ga 261589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 123119 - 123045
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  123119 atgattatggtgaagactaacccccttaccttaggtaaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 123045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 90 - 306
Target Start/End: Original strand, 1300 - 1516
Alignment:
Q  90 caacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaact 188  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |     
T  1300 caacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaatgatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg-atca 1398  T
Q  189 tgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaaca-accca-ttttcatacattatgaacatgttatttca 286  Q
    |||  |  | | ||||||||||||||||   ||||| ||| |||||||||||| |||||  ||| ||||| |||||||||  | ||||||||| |||  |    
T  1399 tgaaacttatcacaattcaacaacaacaaagcataattcaccaattaagcatattttcatcacatacccatttttcatac--tttgaacatgtaattcaa 1496  T
Q  287 tcaccaacaattcatttatc 306  Q
     ||||||||||||| |||||    
T  1497 ccaccaacaattcaattatc 1516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 84 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 11921 - 11828
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaaca 176  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  11921 caccaacaacatctcatttctccataacaaaatcatgagttatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaaca 11828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 87 - 351
Target Start/End: Original strand, 94955 - 95223
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| |||| |||| | ||||| || |||||||||||||||| |||||     
T  94955 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaaaccatgaattagcatccataacatcacttatcaacaacaacatctattgat 95054  T
Q  186 acttgattcacaccccaattcaacaacaac-atgtcataagtcatcaattaagcataattt-cacaacaac---ccattttcatacattatgaacatgtt 280  Q
     | |||  |  | | ||||||| ||||||| ||| ||||| |||  |||| |||||||||| || |  |||   | |||||||||||| |||||| ||      
T  95055 -catgaaacttatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcactaattgagcataatttacaaataaactatctattttcatacatcatgaacttgca 95152  T
Q  281 atttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaa 351  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  95153 atttcatcatcaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaa 95223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 397 - 527
Target Start/End: Original strand, 95262 - 95392
Alignment:
Q  397 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaa-caattatgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttca 495  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |  ||||||    
T  95262 tttcatacaa--caaggaaaattgcaaacaaaacaatcatgattatgaagaagactaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaacctaggcttca 95359  T
Q  496 ctttagctcct-aattctccaatcttcaagttt 527  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  95360 ctttagctcctaaatccttcaatcttcaagttt 95392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 24995 - 24897
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||| | |||||||||| | |||||||||| | |||| |||| | ||||| || || ||||||||||||| |||||    
T  24995 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgaatacccaagccaagaattaacatccataacatcacttaacaacaacaacatctattga 24897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 71; Significance: 7e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 434 - 532
Target Start/End: Original strand, 41965 - 42063
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 532  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  41965 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaacttaggcttcactttagctcctaattcttcaatcttcaagtttccccc 42063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 846 - 745
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  846 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgccaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaatt 747  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  746 ga 745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 434 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 7127 - 7034
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttt 527  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7127 atgattatgaagaacactaacccccttaccttaggttatgattaattcaaatttaagcttcactttagctcctaattcttcaatcttcaagttt 7034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 72 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 31570 - 31315
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaaca 170  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||  | |||||    
T  31570 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaattatgaatcatgcaaacctaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaaca 31471  T
Q  171 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaa-catgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacatt 269  Q
    |||||| | |||| | | |||  || | | ||||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| ||||||||||||||||     
T  31470 acaacaaccattg-atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatc 31373  T
Q  270 atgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaac 327  Q
    |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  31372 atgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaac 31315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 72 - 327
Target Start/End: Original strand, 41274 - 41529
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaaca 170  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||  | |||||    
T  41274 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaattatgaatcatgcaaacctaagccatgtatcatcatcaacaatatgactaaacaaca 41373  T
Q  171 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaa-catgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacatt 269  Q
    |||||| | |||| | | |||  || | | ||||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| ||||||||||||||||     
T  41374 acaacaaccattg-atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatc 41471  T
Q  270 atgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaac 327  Q
    |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  41472 atgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaac 41529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 37012 - 36979
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 467  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37012 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 36979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 434 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 34405 - 34312
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttt 527  Q
    ||||||||||| |  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34405 atgattatgataataactaaccctcttaccttaggtaatgatcaattcaagcttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttt 34312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 72 - 247
Target Start/End: Original strand, 4906 - 5081
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaaca 170  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  ||||||||  || ||| |||||||| ||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  4906 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcatcagcaaatcatgaattatgaacaaccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaaca 5005  T
Q  171 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttca 247  Q
    ||||||||||||| | | |||  |  | | ||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  5006 acaacatcaattg-atcatgaaacttatcacaattcaacaacaacaaatcataattcaccaattaagcatattttca 5081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 109732 - 109631
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  109732 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaatcccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaatt 109633  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  109632 ga 109631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 84 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 118233 - 118136
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaa 180  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  118233 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaccccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaa 118136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 69; Significance: 1e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 59 - 177
Target Start/End: Original strand, 1332 - 1452
Alignment:
Q  59 tcattatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaac 156  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  1332 tcataatcaacccattttcaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgatttatcatcaacaac 1431  T
Q  157 atgacatatcaacaacaacat 177  Q
    |||||||| ||||| ||||||    
T  1432 atgacatagcaacagcaacat 1452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 5516 - 5415
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  5516 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaatt 5417  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  5416 ga 5415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 9152 - 9051
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  9152 caccgacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacctaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaatt 9053  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  9052 ga 9051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 84 - 180
Target Start/End: Original strand, 8964 - 9061
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaa 180  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8964 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcaagcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaa 9061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 788 - 687
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  788 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgccaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagtaacaacaacatcaatt 689  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  688 ga 687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 463
Target Start/End: Original strand, 19514 - 19543
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttacc 463  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19514 atgattatgatgaagactaacccccttacc 19543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 132520 - 132419
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    |||||||||||  ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  132520 caccaacaacatttcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaatt 132421  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  132420 ga 132419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Original strand, 11664 - 11765
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||    
T  11664 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcataaccaagccatgaattatcatcaacaacgtcacttagcaacaacaacatcaatt 11763  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  11764 ga 11765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Original strand, 85309 - 85410
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  85309 caccaacaacgtctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaatt 85408  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  85409 ga 85410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Original strand, 159279 - 159377
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||   ||||||||   |||||| || || |||||||||||||||||    
T  159279 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccaaaaattatcat---caacatcacttagcaacaacaacatcaatt 159375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Original strand, 22668 - 22769
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  22668 caccaacaacatctcatttctcaataacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacaaaacaacaacaacatcaatt 22767  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  22768 ga 22769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 434 - 509
Target Start/End: Complemental strand, 128127 - 128052
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaat 509  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||| |||| ||||||||    
T  128127 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcattttatctcctaat 128052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 11977 - 11877
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 183  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  11977 caccaaaaacatctcatttctcaacaccaatcatgaaccatgcaaactcaagccatgaattatcatcaacaacatgacttagcaacaacaacatcaattg 11878  T
Q  184 a 184  Q
    |    
T  11877 a 11877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 84 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 24467 - 24368
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  24467 caccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagacatgaattatcatcaacaacatgacatagcaacaacaacaacaatt 24368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 204 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 1659 - 1494
Alignment:
Q  204 ttcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatt-tcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatt 302  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||| || |||||  |||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||| |    
T  1659 ttcaacaacaacatgtcataattcatcaattgagcataattctca-aactactcatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaacaattcaat 1561  T
Q  303 tatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaaaattagagattgggttca 369  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||| ||| |||||  | | ||||||||||||    
T  1560 tatcatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttca 1494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 332
Target Start/End: Original strand, 30056 - 30319
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaaca 170  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  | |||||    
T  30056 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaatatgactaaacaaca 30155  T
Q  171 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtca---taagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcataca 267  Q
    |||||| | |||| | | |||  || | | ||||||| |||||||    ||   | |  || ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||    
T  30156 acaacaaccattg-atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatacaatttcaaacaacaattgagcataatttacaaactacccattttcataca 30254  T
Q  268 ttatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 332  Q
    | |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  30255 tcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatc 30319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 72 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 6373 - 6118
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaaca 170  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| || ||  | |||||    
T  6373 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagtcatgtatcatcatcaacaatattactaaacaaca 6274  T
Q  171 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaa-catgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacatt 269  Q
    |||||| | |||| | | |||  || | | ||||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| ||||||||||||||||     
T  6273 acaacaaccattg-atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatc 6176  T
Q  270 atgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaac 327  Q
    |||||| ||  |||||||||  ||||| ||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  6175 atgaacttgcaatttcatcattaacaaatcatttaacatcaaattaacatattcaaac 6118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 5810 - 5777
Alignment:
Q  433 tatgattatgatgaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5810 tatgattatgatgaaaactaacccccttacctta 5777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 433 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 6016 - 5983
Alignment:
Q  433 tatgattatgatgaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6016 tatgattatgatgaaaactaacccccttacctta 5983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 84 - 287
Target Start/End: Original strand, 32180 - 32383
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| | | | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||    
T  32180 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaaggattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaatt 32279  T
Q  183 gaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaaca-acccattttcatacattatgaacatgtta 281  Q
    | | | |||  || | | ||||||| ||||||||  |||||| ||| ||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||| |    
T  32280 g-atcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaattcataattcaccaattgagcatattttca-aacatacccattttcatacactttgaacatgtaa 32377  T
Q  282 tttcat 287  Q
    ||||||    
T  32378 tttcat 32383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 84 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 42123 - 41920
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| | | | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||    
T  42123 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaaggattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacaatt 42024  T
Q  183 gaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaaca-acccattttcatacattatgaacatgtta 281  Q
    | | | |||  || | | ||||||| ||||||||  |||||| ||| ||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||| |    
T  42023 g-atcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaattcataattcaccaattgagcatattttca-aacatacccattttcatacactttgaacatgtaa 41926  T
Q  282 tttcat 287  Q
    ||||||    
T  41925 tttcat 41920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 65 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 103211 - 103090
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacat 163  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| || |    
T  103211 tcaacccattttacaaagtcaccaacaacaactcatttatcaccaacaattcatgaattatgcacacccaaaccatgaattatcatcaacaacatcactt 103112  T
Q  164 atcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    |  ||||| |||||||||||||    
T  103111 agaaacaataacatcaattgaa 103090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 112812 - 112714
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||| || |||||||||||| ||||    
T  112812 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgaatt---atcaacaacatgacttaacaacaacaacataaatt 112716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 85 - 180
Target Start/End: Original strand, 109568 - 109664
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaa 180  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  109568 accaacaacatctcatttctcatcaacaaatcatgaatcgtgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaa 109664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 68145 - 68004
Alignment:
Q  166 caacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatta-agcataatttcacaaca-acccattttca 263  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| || |||| || ||||||||||||||  || || ||| |||||| |||| |||| ||||| | |||||||||||    
T  68145 caacaacaacatcaatt-aaacatgaatctcaccacatttcaacaacaacataacacaattcaacaattagagcacaatt-cacaatatacccattttca 68048  T
Q  264 tacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatca 307  Q
     | ||||||||||||  ||||||||  |||||||||| ||||||    
T  68047 catattatgaacatgcaatttcatctacaacaattcaattatca 68004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 87 - 332
Target Start/End: Original strand, 79844 - 80089
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||  | ||||||||||| | ||| ||    
T  79844 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccatt-aa 79942  T
Q  186 acttgattcacaccccaattcaacaacaa-catgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttattt 284  Q
     | |||  || | | ||||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||    
T  79943 tcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaattt 80041  T
Q  285 catcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 332  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  80042 catcatcaacaatttatttaacatcaaattaacatattcaaacatatc 80089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 112 - 184
Target Start/End: Original strand, 40664 - 40736
Alignment:
Q  112 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||| || |||| |||||| || || || ||||||||||||| |||||    
T  40664 aatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatccattga 40736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Original strand, 80187 - 80219
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  80187 atgattatgataaagactaacccccttacctta 80219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 87 - 184
Target Start/End: Original strand, 1 - 99
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    |||||||||  |||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  1 caacaacaatccatttctcaacaacaaataatgaaacatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaagatgacatagcaacaacaacatcaattga 99  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 84 - 180
Target Start/End: Original strand, 3496 - 3593
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaa 180  Q
    |||||||||||   |||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  3496 caccaacaacattccatttctcaacaacaaataatgaaacatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaagatgacatagcaacaacaacatcaa 3593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 435 - 508
Target Start/End: Original strand, 339 - 412
Alignment:
Q  435 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||| |||||||  |||||| ||||||||||||    
T  339 tgattatgatgaagactaacccccttaccttagataaggattaatccaaacttaggcttcaatttagctcctaa 412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 182
Target Start/End: Original strand, 31010 - 31120
Alignment:
Q  73 ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaa 171  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||| | |||||||| |||    
T  31010 ttttaccaaaacaccaacaacatctcatttctcaacaacaagtcatgaatcatgcatacccaagccataaattatcatcaaaaacctcacatatcagcaa 31109  T
Q  172 caacatcaatt 182  Q
    |||||||||||    
T  31110 caacatcaatt 31120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 114
Target Start/End: Original strand, 70595 - 70636
Alignment:
Q  73 ttttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaat 114  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  70595 ttttaccaaatcaccaacaacatctcatttctccacaacaat 70636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 87 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 1254 - 1020
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||  | |||||||||||| |||||||||||| |||| |||  | ||||| || || ||||||||||||| |||||    
T  1254 caacaacaacttatttctcaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaacaacaacaacatctattga 1155  T
Q  185 aacttgattcacaccccaattcaacaacaac-atgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatt 283  Q
      | |||  || | | ||||||| ||||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||    
T  1154 t-catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatt 1057  T
Q  284 tcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacata 320  Q
    |||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  1056 tcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacata 1020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 910 - 836
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  910 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1295 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:

Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 204 - 406
Target Start/End: Original strand, 203 - 406
Alignment:
Q  204 ttcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaa-caacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatt 302  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||||| | || |||||  |||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||| |    
T  203 ttcaacaacaacatgtcataattcaacaattgagcataatt-cacaaactacacatttatatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaacaattcaat 301  T
Q  303 tatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaaaattagagattgggttcatatgaat-tctcactcaattaagcactttttca 401  Q
    ||||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||| ||| | |||  | | |||||||||||| |  |||  || | |||||||||||||| ||||    
T  302 tatcatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcaagaatttcaaagattgggttcacaataatcacttattcaattaagcacttattca 401  T
Q  402 tacaa 406  Q
    |||||    
T  402 tacaa 406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 184
Target Start/End: Original strand, 7812 - 7912
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 183  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  7812 accaacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccacaacatcacttagcaacaacaacatcaattg 7911  T
Q  184 a 184  Q
    |    
T  7912 a 7912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 87 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 17679 - 17434
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaaca-atcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||| || || ||||||||||||| |||||     
T  17679 caacaacaacttatttcacaacaacatattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattgat 17580  T
Q  186 acttgattcacaccccaattcaacaacaac-atgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttattt 284  Q
     | |||  |  | | ||||||| ||||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||    
T  17579 -catgaaacttatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaattt 17482  T
Q  285 catcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 332  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||  |||||||||| |||||| ||||    
T  17481 catcatcaacaattcatttaaaatcaaattaacatattcaaacatatc 17434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 72 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 77129 - 76967
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaaca 170  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||| | |||||||||||| || ||||  ||||| || || || |||||    
T  77129 atttcacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaataacaatatcacttagcaaca 77030  T
Q  171 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 234  Q
    ||||||||||||| ||| ||| || |||| |||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  77029 acaacatcaattg-aacatgaatctcaccacaattcaacaacaacatagcataattcaacaatt 76967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 118 - 184
Target Start/End: Original strand, 7581 - 7647
Alignment:
Q  118 gaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  7581 gaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgacttaacaacaacaacatcaattga 7647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 12795 - 12548
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||  | ||||||||||| | ||| ||    
T  12795 caacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaacaaccatt-aa 12697  T
Q  186 acttgattcacaccccaattcaacaacaa-catgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttattt 284  Q
     | |||  || | | ||||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||    
T  12696 tcatgaaacatatcacaattcatcaacaatcatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaattt 12598  T
Q  285 catcaccaacaatt--catttatcattcaattaacatactcaaacttatc 332  Q
    ||||| ||||||||  |||| |||||  |||||||||| |||||| ||||    
T  12597 catcatcaacaattcacattaatcatcaaattaacatattcaaacatatc 12548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 87 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 19176 - 19086
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaaca 176  Q
    ||||||||| | ||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||  | |||||||||||    
T  19176 caacaacaatttatttctcaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaaccatatgactaaacaacaacaaca 19086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 88 - 184
Target Start/End: Original strand, 1897 - 1994
Alignment:
Q  88 aacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||| | |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  1897 aacaacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatactcaagccaagaattatcatcatcaacatgacttagcaacaacaacatcaattga 1994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 87 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 13662 - 13428
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||  | |||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||| || || ||||||||||||| |||||    
T  13662 caacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattga 13563  T
Q  185 aacttgattcacaccccaattcaacaacaac-atgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatt 283  Q
      | |||  || | | ||||||| ||||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||    
T  13562 t-catgaaacatatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatt 13465  T
Q  284 tcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacata 320  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||  ||||||||||    
T  13464 tcatcatcaaccattcatttaacatcaaattaacata 13428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 13317 - 13243
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  13317 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 13243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 87 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 21636 - 21433
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||  | |||||||||||| |||||||||||| |||| |||  | ||||| || || ||||||||||||| ||||     
T  21636 caacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcattcataacatcacttaacaacaacaacatctattg- 21538  T
Q  185 aacttgattcacaccccaattcaacaacaa-catgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatt 283  Q
    | | |||  || | | ||||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  |||    
T  21537 atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatt 21439  T
Q  284 tcatca 289  Q
    ||||||    
T  21438 tcatca 21433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 65 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 44087 - 43935
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacat 163  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  || | |||||||| | ||| | |||||||||||| || |||| |||||| || || |    
T  44087 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacaactcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt 43988  T
Q  164 atcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 217  Q
    | ||||||||||||||||| |||| |||||| || |  ||||||||||||||||    
T  43987 agcaacaacaacatcaatt-aaacatgattctcatcataattcaacaacaacat 43935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 54; Significance: 9e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 72 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 253271 - 253158
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaaca 170  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  ||||||||  ||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||| |    
T  253271 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcatcaagaaatcatgaatcatgcaaacccaagccttgaattatcatcaacaacatgacttaacaaaa 253172  T
Q  171 acaacatcaattga 184  Q
    |||||| |||||||    
T  253171 acaacaacaattga 253158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 34107 - 34033
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||  ||||||   |||||| ||||||||||||    
T  34107 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaa 34033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 247398 - 247324
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  247398 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 247324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 85 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 33996 - 33897
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 183  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||    
T  33996 accaacaacatctcatttctcaacaacaaatcat-aatcatgcatacccaagccatgaattattatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattg 33898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 4)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 87 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 193763 - 193518
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||  | |||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||| || || ||||||||||||| |||||    
T  193763 caacaacaacttatttcgcaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattga 193664  T
Q  185 aacttgattcacaccccaat--tcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttat 282  Q
      | |||  || | | ||||  ||||||||  |||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||    
T  193663 t-catgaaacatatcacaataatcaacaac--catg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaat 193568  T
Q  283 ttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 332  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  193567 ttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatc 193518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 186801 - 186561
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||  | |||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||| || || ||||||||||||| |||||    
T  186801 caacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattga 186702  T
Q  185 aacttgattcacaccccaat--tcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttat 282  Q
      | |||  || | | ||||  ||||||||  |||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||    
T  186701 t-catgaaacatatcacaataatcaacaac--catg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaat 186606  T
Q  283 ttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaac 327  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||    
T  186605 ttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaac 186561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 193429 - 193355
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  193429 atgattatgataaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 193355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 214
Target Start/End: Original strand, 27453 - 27604
Alignment:
Q  64 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgac 161  Q
    ||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||| |  || ||| |||||| | ||| | |||||||| ||| || |||| |||||| ||  |    
T  27453 atcaacccatttttacaaaaccgacaacaacaactcatttcacatcatcaactcatgatttatgaacacccaagctatgaatcatcaacaacaatatctc 27552  T
Q  162 atatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaa 214  Q
     || |||||||| |||||||| |||| |||||| || | ||||||||||||||    
T  27553 ttaacaacaacatcatcaatt-aaacatgattctcatcacaattcaacaacaa 27604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 434 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 4378 - 4279
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcct-aattctccaatcttcaagttttcccc 532  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||    
T  4378 atgattatgataaagtctaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaacttttgcttcactttagctcctaaatccttcaatcttcaagtttacccc 4279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 220 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 170 - 58
Alignment:
Q  220 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 319  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  170 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 71  T
Q  320 actcaaacttatc 332  Q
    | |||||| ||||    
T  70 attcaaacatatc 58  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 220 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 4589 - 4489
Alignment:
Q  220 cataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacat 319  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  4589 cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacat 4490  T
Q  320 a 320  Q
    |    
T  4489 a 4489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 201 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 44275 - 44125
Alignment:
Q  201 caattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaa-caacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 299  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| | ||||| | ||  |||| ||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  44275 caattcaacaacaacatgtcataattcgtcaattgagcataact-cacaaactacttatttacatacatcatgaacatgcaatttcatcatcaacaattc 44177  T
Q  300 atttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaa 351  Q
    | ||| |||  ||||||||||||||||| |||||| | |||| ||| |||||    
T  44176 aattaccatcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaa 44125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 332
Target Start/End: Original strand, 14928 - 15174
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||  | |||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||| || || ||||||||||||| ||||     
T  14928 caacaacaacttatttcacaacaacaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatctattg- 15026  T
Q  185 aacttgattcacaccccaattcaacaacaa-catgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaaca-acccattttcatacattatgaacatgttat 282  Q
    | | |||  || | | ||||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||| |||||||||| |||| | |  ||||||||||||| |||||| ||  ||    
T  15027 atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataattt-acaaaataaacattttcatacatcatgaacttgcaat 15124  T
Q  283 ttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 332  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  15125 ttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatc 15174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 914 - 881
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 467  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  914 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 279
Target Start/End: Original strand, 14854 - 15046
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatcat-gaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   | |||||||||| |||||    
T  14854 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccgagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgac---taaacaacaacaacaatt 14950  T
Q  183 gaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgt 279  Q
    | | | |||  || | | ||||||| ||||||||   ||||| ||| ||||| |||||| |||||||   ||||||||||||||| | |||||||||    
T  14951 g-atcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatattttcacacatacccattttcatacactttgaacatgt 15046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 176
Target Start/End: Original strand, 14194 - 14287
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatcat-gaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaaca 176  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |   |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  14194 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccgagaattatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaaca 14287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 201 - 334
Target Start/End: Original strand, 5977 - 6110
Alignment:
Q  201 caattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaa-caacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 299  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| | |||||||| | || || |||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  5977 caattcaactacaacatgtcataaatcatcaattgagcacaatt-cacaaactacccatttacttatatcatgaacatgcaatttcatcatcaacaattc 6075  T
Q  300 atttatcattcaattaacatactcaaacttatcac 334  Q
    | |||||||  | ||||||||||||||| ||||||    
T  6076 aattatcatcaatttaacatactcaaacatatcac 6110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 6)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 162469 - 162213
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgac-atatcaac 169  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| | |  |||    
T  162469 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatatatcatcatcaacaatatgactaaacaaac 162370  T
Q  170 aacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaa-catgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacat 268  Q
    ||||||| | |||| | | |||  || | | ||||||| |||||| |||| || || ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||| |||||||    
T  162369 aacaacaaccattg-atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatg-cagaattcaccaattgagcataatttacaaactacccatttacatacat 162272  T
Q  269 tatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaac 327  Q
     |||||| ||  ||||||||| |||||| |||||||  ||  |||||||||| ||||||    
T  162271 catgaacttgcaatttcatcatcaacaaatcatttaatatcaaattaacatattcaaac 162213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 84 - 279
Target Start/End: Original strand, 164192 - 164387
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||||| | | |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  | ||||||||||| || ||    
T  164192 caccaacaccatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaagccatgaattaccatcaacaacatgactaaacaacaacaacaacattt 164291  T
Q  183 gaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgt 279  Q
    | | | |||  || | | ||||||| ||||||||   ||||| ||| ||||| ||||||  ||||||   ||||||||||||||| | |||||||||    
T  164292 g-atcatgaaacatatcacaattcatcaacaacaatgcataattcaccaattgagcatatcttcacacatacccattttcatacactttgaacatgt 164387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 166547 - 166463
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaa 155  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  166547 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttttcaacaacaaatcatgaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaa 166463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 116795 - 116687
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaaca 170  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||  |||||| |||||||| ||| | |||||||||||| || |||| |||||| || || || |||||    
T  116795 attttacaaaaccaccaacaacaatccatttttcatcaacaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaaca 116696  T
Q  171 acaacatca 179  Q
    |||||||||    
T  116695 acaacatca 116687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 162110 - 162078
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  162110 atgattatgatgaaaactaacccccttacctta 162078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 166196 - 166164
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 466  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  166196 atgattatgatgaaaactaacccccttacctta 166164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Original strand, 38275 - 38376
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaatt 182  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||    
T  38275 caccaacatcatctcatttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagttatgaattatcatcaacaacatgactaaacaacaacaacgtcaatt 38374  T
Q  183 ga 184  Q
    ||    
T  38375 ga 38376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 49; Significance: 9e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 85 - 184
Target Start/End: Original strand, 3297 - 3397
Alignment:
Q  85 accaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattg 183  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||| || || ||||| ||||||||||||    
T  3297 accaactacatctcatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatccacaacatcacttagcaacatcaacatcaattg 3396  T
Q  184 a 184  Q
    |    
T  3397 a 3397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 234
Target Start/End: Original strand, 270 - 436
Alignment:
Q  68 acccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatc 166  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||   ||||||| |||| || |||| ||| ||||| || || |    
T  270 acccagtttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgagcacccaaggcatgaataatcaacaaaaacatcacttagc 369  T
Q  167 aacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 234  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| ||  ||| ||||||||||| |||||  ||||| ||| |||||    
T  370 aacaacaacatcaattg-aacatgactcttaccacaattcaacaataacatagcataattcaacaatt 436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 6818 - 6573
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||| || || ||||||||| ||| |||||     
T  6818 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaagatctattgat 6719  T
Q  186 acttgattcacaccccaattcaacaacaac-atgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaacatgttattt 284  Q
     | | |  |  | | ||||||| ||||||| ||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||    
T  6718 -catcaaacttatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactacccattttcatacatcatgaacttgcaattt 6621  T
Q  285 catcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 332  Q
    ||||| |||||||||||||  |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  6620 catcatcaacaattcatttgacatcaaattaacatattcaaacatatc 6573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 6475 - 6401
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||  ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  6475 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaggaataatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 6401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 48; Significance: 4e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 234
Target Start/End: Original strand, 35444 - 35605
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaaca 170  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||| ||| | |||||||||||| || |||| ||||||||| || || |||||    
T  35444 attttacaaaaccaccaaca-caactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaaca 35542  T
Q  171 acaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 234  Q
    | ||||||||||| ||| ||| ||  ||| || ||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  35543 aaaacatcaattg-aacatgactcttaccacatttcaacaacaacatagcataaatcaacaatt 35605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 434 - 532
Target Start/End: Original strand, 3505 - 3601
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaattctccaatcttcaagttttcccc 532  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||    
T  3505 atgattatgaggaagaataacccc-ttaccttagatgatgattaattcaaacttaggcttcactttagctcctaa-tcttcaatcttcaagtttccccc 3601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 217
Target Start/End: Original strand, 69415 - 69567
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacat 163  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||  || ||| |||||| | ||| | |||||||||||| || |||| |||||| || || |    
T  69415 tcaacccattttacaaaaccaacaacaacacctcaattctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcactt 69514  T
Q  164 atcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 217  Q
    | |||||||||||||||||| ||| ||| || || | |||||||||||||||||    
T  69515 agcaacaacaacatcaattg-aacatgaatctcatcacaattcaacaacaacat 69567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 434 - 506
Target Start/End: Original strand, 272330 - 272402
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcct 506  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||    
T  272330 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcct 272402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 244959 - 244920
Alignment:
Q  205 tcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatt 244  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  244959 tcaacaacaacatgtcataattcatcaattgagcataatt 244920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Original strand, 48124 - 48225
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaat 181  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||| || | ||||    
T  48124 caccaacaacatctcatttctccataacaaaatcatgaattatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatggcttaacaacaataataacaat 48222  T
Q  182 tga 184  Q
    |||    
T  48223 tga 48225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 84 - 184
Target Start/End: Original strand, 61572 - 61673
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaa--tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaat 181  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||| || | ||||    
T  61572 caccaacaacatctcatttctccataacaaaatcatgaattatgcaa-cccaagccatgaattatcatcaacaacatggcttaacaacaataataacaat 61670  T
Q  182 tga 184  Q
    |||    
T  61671 tga 61673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 434 - 532
Target Start/End: Original strand, 45338 - 45437
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa-ttctccaatcttcaagttttcccc 532  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||| |||||||  |||||| || |||||||||  ||| |||||||||||||| ||||    
T  45338 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatggttaatccaaacttaggcttcaattaagctcctaagctcttcaatcttcaagtttccccc 45437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 527
Target Start/End: Original strand, 54724 - 54818
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa-ttctccaatcttcaagttt 527  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| | ||| ||||||| ||||||| || |||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  54724 atgattatgatgaagactaaccaccttaccttagataatggttaatccaaacttaagcttcaattaagctcctaagctcttcaatcttcaagttt 54818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 40 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 13048 - 12990
Alignment:
Q  40 tcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaact 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  13048 tcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccattttcacaaaaccatcaacaacaact 12990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 434 - 500
Target Start/End: Original strand, 13824 - 13890
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcacttta 500  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||  |||||||||||    
T  13824 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcacttta 13890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 10092 - 10013
Alignment:
Q  253 acccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatc 332  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||    
T  10092 acccattttcatacatcatgaacttgcaatttcatcatcaacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaacatatc 10013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 87 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 10241 - 10143
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||| || || ||||||||||||| |||||    
T  10241 caacaacaacttatttcacaacaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatccataacatcacttaacaacaacaacatccattga 10143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 9914 - 9840
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  9914 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 9840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 736 - 487
Alignment:
Q  77 acaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaac 175  Q
    |||||| ||||||||| ||  |||||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||   |  | |||||||    
T  736 acaaaaccaccaacaataatccatttctcaacaacaaattattaatcatgcaaacccaagccatgtatcatcatcaacaatatgagtaaatatcaacaac 637  T
Q  176 atcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaa-catgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaacaacccattttcatacattatgaa 274  Q
    | | |||| | | |||  || | | ||||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||| ||||||||||   ||| |  ||||||||||||| |||||    
T  636 aaccattg-atcatgaaacatatcacaattcatcaacaaccatg-cataattcaccaattgagcataatttacaaactattcattttcatacatcatgaa 539  T
Q  275 catgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaa 326  Q
    | ||  ||||||||| | |||||||||||| |||  |||||||||| |||||    
T  538 cttgcaatttcatcatctacaattcatttaacatcaaattaacatattcaaa 487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 185
Target Start/End: Original strand, 7994 - 8089
Alignment:
Q  91 aacaactcatttctccacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    |||||||||||||||  || |||| ||||||| ||| | |||||||| ||| || |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  7994 aacaactcatttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagctatgaatcatcaacaacaacatcacatagcaacaacaacatcaattgaa 8089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 470
Target Start/End: Original strand, 8331 - 8367
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtt 470  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  8331 atgattatgatgaattctaacccccttaccttaggtt 8367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 4002 - 3876
Alignment:
Q  201 caattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaa-caacccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattc 299  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||| ||||| | ||||||||  ||| || |||||||||  |||||||||  ||||||||    
T  4002 caattcaataacaacatgtcgtaattcatcaattgaacataatt-cacaaactacccatttatatatatcatgaacatgcaatttcatcattaacaattc 3904  T
Q  300 atttatcattcaattaacatactcaaac 327  Q
    | | |||||  |||||||||||||||||    
T  3903 aatcatcatcaaattaacatactcaaac 3876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0970 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 224
Target Start/End: Original strand, 2411 - 2572
Alignment:
Q  64 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgac 161  Q
    ||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| |||||||  || ||| | | |||| ||| | |||||||||||| || |||| ||||||||| ||    
T  2411 atcaacctattttcacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaataaggaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcac 2510  T
Q  162 atatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataa 224  Q
     || |||||||||||||||||||| | || ||| || |  |||||||||||||||| ||||||    
T  2511 ttagcaacaacaacatcaattgaa-catggttctcatcataattcaacaacaacatatcataa 2572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0740 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0740
Description:

Target: scaffold0740; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 84 - 157
Target Start/End: Original strand, 4284 - 4358
Alignment:
Q  84 caccaacaacaactcatttctccacaacaatc-atgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaaca 157  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| | | |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  4284 caccaacaacatctcatttctcaacaacaaaccaagaattatgcaaacccaaaccatgaattatcatcaacaaca 4358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Original strand, 9183 - 9257
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  9183 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 9257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 185
Target Start/End: Original strand, 6622 - 6740
Alignment:
Q  68 acccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatc 166  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||   |||||||||||| || |||| ||| ||||| || ||      
T  6622 acccagtttacaaaaccaccaacaacaactcatttctcatcaacaaatcatgaattatgaccacccaagccatgaatcatcaacaaaaacatcacttagg 6721  T
Q  167 aacaacaacatcaattgaa 185  Q
    |  ||||||||||||||||    
T  6722 agtaacaacatcaattgaa 6740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 217
Target Start/End: Original strand, 2483 - 2635
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacat 163  Q
    ||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||  || ||| |||||| | ||| | |||||| ||||| || |||| |||||| || || |    
T  2483 tcaacccattttagaaaaccaacaacaacaagtcatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatcactt 2582  T
Q  164 atcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 217  Q
    | |||||||||||||||||||| | ||| || || |  ||||||||||||||||    
T  2583 agcaacaacaacatcaattgaa-catgaatctcatcataattcaacaacaacat 2635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 435 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 12075 - 11982
Alignment:
Q  435 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaatt-ctccaatcttcaagttt 527  Q
    |||||||||| |  ||||||||||||||||||| | ||| | ||||  |||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  12075 tgattatgataataactaacccccttaccttagatgatgtttaattttaacttaggcttcactttagctcctaattgcttcaatcttcaagttt 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2607 - 2436
Alignment:
Q  64 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgac 161  Q
    ||||||||||||| || ||| || ||||||||||| |||||||  || |||  ||||||| ||| |  ||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  2607 atcaacccattttcaccaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaaacatgaattatgaacgcccaagccatgaatcatcatcaacaacatcac 2508  T
Q  162 atatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaatt 234  Q
     ||  ||||||||||||||||| ||| ||| ||  | |  ||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  2507 ttaggaacaacaacatcaattg-aacatgagtcttatcataattcaacaacaacatagcataattcatcaatt 2436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 77
Target Start/End: Original strand, 12694 - 12734
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaacccatttta 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12694 acatcatcaaaatcaaacttcttcactatcaacccatttta 12734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 435 - 527
Target Start/End: Original strand, 54182 - 54275
Alignment:
Q  435 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaatt-ctccaatcttcaagttt 527  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||| | |||   |||||  |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  54182 tgattatgatgaaaacaaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaggcttcactatagctcctaattgcttcaatcttcaagttt 54275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 22713 - 22559
Alignment:
Q  64 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgac 161  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||  || ||| |||| | ||||| | |||||| | ||| ||  ||| |||||| || |     
T  22713 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaactcaattctcatcatcaaatcataattcatgaacacccaaactatgaatcttcaacaacaatatcaa 22614  T
Q  162 atatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 217  Q
     || ||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  22613 ttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattcacatctcaattcaacaacaacat 22559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 3427 - 3392
Alignment:
Q  37 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaaccca 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3427 acatcatcaaaatcaaacttcttcattatcaaccca 3392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 981 - 883
Alignment:
Q  253 acccattttcatacattatgaacatgttatttcatcaccaacaattcatttatcattcaattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagtacgaa 351  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||   |||| |  ||||||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  981 acccattttcacatattatgaacatgcaatttcatcaacaacaattcaattatcaccaaattcatttactcaaacatatcatcataacaagagcacgaa 883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Original strand, 12418 - 12492
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |   ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  12418 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatagagattaatcctaacttaggcttcactttagctcctaa 12492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Original strand, 1430 - 1504
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| |||   |||||  |||||||||||||||||||    
T  1430 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcacaacttaggcttcactttagctcctaa 1504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 3540 - 3466
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  3540 atgattatgacaaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaa 3466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 23944 - 23859
Alignment:
Q  165 tcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaac 251  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| | ||| || |||| ||||| ||| |||||||||||    
T  23944 tcaacaacaacatccattgaaacttgtttctcacctcaattcaac-acaacttatcacaaatcattaattaggcaaaatttcacaac 23859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 57424 - 57350
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||||||||||| ||||    
T  57424 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctactaa 57350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Original strand, 9160 - 9234
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||    |||||  |||||||||||||||||||    
T  9160 atgattatgatgaagactaacacacttaccttagattatgattaacctcaacttaggcttcactttagctcctaa 9234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Original strand, 146906 - 146980
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | ||| ||| | |||||  |||||| ||||||||||||    
T  146906 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaa 146980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 184
Target Start/End: Original strand, 146581 - 146679
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    ||||||||||| ||||| | | ||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||| |||  | ||||| || || ||||||||||||| |||||    
T  146581 caacaacaacttatttcacaaaaacaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattaacatgcataacatcacttaacaacaacaacatctattga 146679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 251
Target Start/End: Original strand, 7270 - 7355
Alignment:
Q  165 tcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaac 251  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||| | ||| || |||| ||||| ||| |||||||||||    
T  7270 tcaacaacaacatccattgaaacttgtttctcacctcaattcaac-acaacttatcacaaatcattaattaggcaaaatttcacaac 7355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 435 - 532
Target Start/End: Original strand, 7517 - 7615
Alignment:
Q  435 tgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaatt-ctccaatcttcaagttttcccc 532  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||| | |||   ||||  ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||    
T  7517 tgattatgatgaaaacaaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaactaaagcttcactttagctcctaattgtttcaatcttcaagtttccccc 7615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 185
Target Start/End: Original strand, 30978 - 31099
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacat 163  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||  || | |||| ||| | ||| | || ||||||||| || |||| |||||  || || |    
T  30978 tcaacccattttacaaaagcaacaacaacaactcaattctcatcatcaaatcttgatttatgaacactcaagccatgaatcatcaacaacagtatcactt 31077  T
Q  164 atcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  31078 agcaacaacaacatcaattgaa 31099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 185
Target Start/End: Original strand, 10670 - 10741
Alignment:
Q  114 tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||| || |||| ||||||||| || || ||| ||||||||||||||||    
T  10670 tcatgaattatgaacacccaagccatgaatgatcaacaacaacatcacttagcaaaaacaacatcaattgaa 10741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 449 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 9282 - 9203
Alignment:
Q  449 actaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaatt-ctccaatcttcaagttt 527  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| | |||   |||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  9282 actaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaggcttcactttagctcctaattgcttcaatcttcaagttt 9203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 449 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 16180 - 16101
Alignment:
Q  449 actaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaatt-ctccaatcttcaagttt 527  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| | |||   |||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16180 actaacccccttaccttagatgatgtttaatcttaacttaggcttcactttagctcctaattgcttcaatcttcaagttt 16101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 217
Target Start/End: Original strand, 6500 - 6654
Alignment:
Q  64 atcaacccatttt-acaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaac-aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgac 161  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||  || | |||||||| | ||| | ||| |||||||| || |||| |||||| ||  |    
T  6500 atcaacccatttttacaaaaccaacaacaacaacttatttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacctaagccatgaatcatcaacaacaatatctc 6599  T
Q  162 atatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 217  Q
     || |||||||| |||||||| |||| |||||| || |  ||||||||||||||||    
T  6600 ttagcaacaacatcatcaatt-aaacatgattctcatcataattcaacaacaacat 6654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15741 - 15651
Alignment:
Q  87 caacaacaactcatttctccacaacaa-tcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaaca 176  Q
    ||||||||| | ||||||| |||| || | |||||||||||| |||||||||||| |||| |||| | ||||||||  | |||||||||||    
T  15741 caacaacaatttatttctcaacaaaaaattatgaatcatgcatacccaagccatgaattagcatctataacatgactaaacaacaacaaca 15651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 434 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 36869 - 36837
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36869 atgattatgataaagactaacccccttacctta 36837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1734 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1734
Description:

Target: scaffold1734; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 129
Target Start/End: Original strand, 1364 - 1422
Alignment:
Q  72 attttacaaaatcaccaacaacaactcatttctccacaac-aatcatgaatcatgcaaa 129  Q
    |||| |||||| ||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  1364 atttcacaaaaccaccaacaacaatccatttctcaacaacaaatcatgaatcatgcaaa 1422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 434 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 10288 - 10218
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctc 504  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||| | ||||| ||  | |||||  |||||||||||||||    
T  10288 atgattatgaagaagacaaacccccttaccttagatgatgattaaccccaacttaggcttcactttagctc 10218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 186
Target Start/End: Original strand, 4569 - 4643
Alignment:
Q  112 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaa 186  Q
    ||||||| || ||| | |||||||||||| || |||| |||||| || || || |||||||||||||||||||||    
T  4569 aatcatggattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaaa 4643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 186
Target Start/End: Original strand, 9183 - 9257
Alignment:
Q  112 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaa 186  Q
    ||||||| || ||| | |||||||||||| || |||| |||||| || || || |||||||||||||||||||||    
T  9183 aatcatggattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattgaaa 9257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 165 - 251
Target Start/End: Original strand, 6658 - 6743
Alignment:
Q  165 tcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacatgtcataagtcatcaattaagcataatttcacaac 251  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||| |||| |||| ||||| | ||| || |||| ||||||||| |||||||||||    
T  6658 tcaacaataacatccattgaaacttgtttctcacctcaatccaac-acaacttatcacaaatcattaattaagcaaaatttcacaac 6743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 397 - 467
Target Start/End: Original strand, 22821 - 22890
Alignment:
Q  397 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 467  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22821 tttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaac-atgattatgataaagactaacccccttaccttag 22890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 397 - 467
Target Start/End: Original strand, 27076 - 27145
Alignment:
Q  397 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 467  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27076 tttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaaggaac-atgattatgataaagactaacccccttaccttag 27145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 397 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 1564 - 1495
Alignment:
Q  397 tttcatacaaaccaagaaaaattgcaaacaaacaattatgattatgatgaagactaacccccttaccttag 467  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||| ||  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1564 tttcatccaaatcatgaaaaattgcaaagaatgaac-atgattatgataaagactaacccccttaccttag 1495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 434 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 56045 - 55971
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgatcaattcaaacttgagcttcactttagctcctaa 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||| ||| |||||||  |||| | |||| |||||||    
T  56045 atgattatgatgaagactaaccccctgaccgtagataatgattaatccaaacttaggctttaatttatctcctaa 55971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 197545 - 197390
Alignment:
Q  65 tcaacccattttacaaaat---caccaacaacaactcatttctccacaacaat-catgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatga 160  Q
    ||||||||||||||||||    || ||||||||||||| |||||  || |||  ||||| | ||| | |||||| ||||| || |||| |||||| || |    
T  197545 tcaacccattttacaaaactaacaacaacaacaactcaattctcatcatcaaagcatgatttatgaagacccaaaccatgaatcatcaacaacaatatca 197446  T
Q  161 catatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 217  Q
    | || |||||||||||||||||| ||| ||| || || | |||||||||||||||||    
T  197445 cttagcaacaacaacatcaattg-aacatgaatctcatcacaattcaacaacaacat 197390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 434 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 6022 - 5989
Alignment:
Q  434 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 467  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6022 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 5989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 133 - 185
Target Start/End: Original strand, 11121 - 11173
Alignment:
Q  133 aagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaa 185  Q
    |||||||| || || | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  11121 aagccatgaatcataaacaacaacatcacatagcaacaacaacatcaattgaa 11173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 129 - 217
Target Start/End: Original strand, 4628 - 4715
Alignment:
Q  129 acccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattgaaacttgattcacaccccaattcaacaacaacat 217  Q
    |||||||||||| || |||| |||||| |   | || ||||||||||||||||| |||| |||||| || | |||||||||||||||||    
T  4628 acccaagccatgaatcatcaacaacaaaacttcttaacaacaacaacatcaatt-aaacatgattcccatcacaattcaacaacaacat 4715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 112 - 184
Target Start/End: Original strand, 33668 - 33740
Alignment:
Q  112 aatcatgaatcatgcaaacccaagccatggattatcatcaacaacatgacatatcaacaacaacatcaattga 184  Q
    |||||||||| ||| | |||| ||||||| || |||| |||||| || || || |||||||||||||||||||    
T  33668 aatcatgaattatgaacaccctagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattga 33740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 2727 times since January 2019
Visitors: 4801