View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0759_high_34 (Length: 282)

Name: NF0759_high_34
Description: NF0759
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0759_high_34
NF0759_high_34
[»] chr3 (35 HSPs)
chr3 (11-281)||(16743998-16744270)
chr3 (54-259)||(13839025-13839232)
chr3 (54-259)||(14842487-14842693)
chr3 (54-259)||(2049941-2050147)
chr3 (54-259)||(12030073-12030279)
chr3 (127-282)||(2449238-2449394)
chr3 (11-189)||(19231982-19232164)
chr3 (127-282)||(17912483-17912638)
chr3 (117-259)||(51158008-51158150)
chr3 (101-259)||(15858996-15859156)
chr3 (54-173)||(19260749-19260869)
chr3 (134-259)||(15936634-15936759)
chr3 (127-259)||(13975722-13975853)
chr3 (127-259)||(45860937-45861068)
chr3 (127-259)||(13954890-13955021)
chr3 (134-259)||(15938476-15938601)
chr3 (11-88)||(15857120-15857198)
chr3 (11-85)||(3992873-3992948)
chr3 (11-85)||(55513193-55513268)
chr3 (139-259)||(55316351-55316471)
chr3 (11-85)||(2844514-2844589)
chr3 (139-259)||(41270207-41270327)
chr3 (11-85)||(54037981-54038056)
chr3 (161-239)||(16821291-16821369)
chr3 (11-85)||(17955837-17955916)
chr3 (171-251)||(15614973-15615053)
chr3 (11-85)||(7854305-7854380)
chr3 (25-85)||(45581954-45582016)
chr3 (143-184)||(14080715-14080756)
chr3 (13-65)||(12031852-12031904)
chr3 (13-65)||(17205024-17205076)
chr3 (134-206)||(11986173-11986245)
chr3 (13-65)||(17191884-17191936)
chr3 (13-65)||(38810868-38810920)
chr3 (134-206)||(54651642-54651714)
[»] chr1 (21 HSPs)
chr1 (11-259)||(41394353-41394602)
chr1 (54-259)||(20913161-20913367)
chr1 (54-259)||(20931476-20931682)
chr1 (127-282)||(51452599-51452755)
chr1 (54-223)||(37844374-37844546)
chr1 (54-259)||(20445810-20446019)
chr1 (54-259)||(20893551-20893758)
chr1 (66-259)||(20531575-20531770)
chr1 (139-259)||(2116386-2116506)
chr1 (139-259)||(45051554-45051674)
chr1 (11-85)||(21860334-21860409)
chr1 (12-85)||(44034829-44034903)
chr1 (138-258)||(22227941-22228061)
chr1 (138-258)||(22232638-22232758)
chr1 (139-259)||(5072388-5072508)
chr1 (139-259)||(18601118-18601238)
chr1 (11-65)||(41218749-41218803)
chr1 (13-65)||(27675139-27675191)
chr1 (13-69)||(20177513-20177570)
chr1 (143-184)||(22143361-22143402)
chr1 (13-65)||(13376711-13376763)
[»] chr2 (21 HSPs)
chr2 (11-259)||(20627195-20627445)
chr2 (11-259)||(43642838-43643089)
chr2 (54-258)||(462870-463075)
chr2 (11-259)||(19794586-19794836)
chr2 (127-282)||(19689401-19689557)
chr2 (127-282)||(23820178-23820334)
chr2 (127-282)||(14906440-14906596)
chr2 (60-259)||(8891373-8891574)
chr2 (54-259)||(36982364-36982573)
chr2 (127-282)||(20015118-20015274)
chr2 (54-259)||(24341309-24341521)
chr2 (127-259)||(25265390-25265522)
chr2 (127-259)||(17396653-17396784)
chr2 (54-149)||(22863169-22863267)
chr2 (11-85)||(22275045-22275120)
chr2 (11-85)||(22284278-22284353)
chr2 (11-84)||(15633538-15633612)
chr2 (177-258)||(7507894-7507975)
chr2 (139-259)||(19886661-19886781)
chr2 (13-69)||(19660217-19660273)
chr2 (13-65)||(43646237-43646289)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (54-259)||(16193643-16193848)
chr8 (11-259)||(16404857-16405107)
chr8 (54-259)||(24928716-24928923)
chr8 (127-282)||(5238194-5238350)
chr8 (127-282)||(22907214-22907370)
chr8 (127-282)||(24661248-24661404)
chr8 (127-282)||(43685653-43685809)
chr8 (54-259)||(43373392-43373600)
chr8 (127-259)||(17345700-17345832)
chr8 (139-259)||(6774258-6774378)
chr8 (143-259)||(21844576-21844692)
chr8 (139-259)||(24549113-24549233)
chr8 (143-259)||(21851969-21852085)
chr8 (11-85)||(274766-274841)
chr8 (11-85)||(641008-641083)
chr8 (11-85)||(826814-826889)
chr8 (11-85)||(24716719-24716794)
chr8 (139-259)||(30120854-30120974)
chr8 (139-259)||(16674392-16674512)
chr8 (11-85)||(39115598-39115673)
chr8 (143-184)||(23149985-23150026)
chr8 (143-184)||(23226076-23226117)
chr8 (13-65)||(17285548-17285600)
chr8 (13-65)||(21198005-21198057)
[»] chr4 (20 HSPs)
chr4 (11-259)||(54118125-54118376)
chr4 (54-259)||(122020-122226)
chr4 (127-282)||(26680307-26680463)
chr4 (127-282)||(10488669-10488825)
chr4 (127-282)||(16327926-16328082)
chr4 (54-259)||(13246561-13246769)
chr4 (54-259)||(15675009-15675221)
chr4 (54-259)||(10104170-10104382)
chr4 (127-259)||(13048221-13048353)
chr4 (54-189)||(33240901-33241043)
chr4 (154-255)||(31115764-31115865)
chr4 (11-85)||(25119064-25119139)
chr4 (143-259)||(10644351-10644467)
chr4 (139-259)||(47357786-47357906)
chr4 (11-85)||(5682385-5682460)
chr4 (143-252)||(40885570-40885680)
chr4 (54-159)||(31132545-31132657)
chr4 (144-184)||(13809511-13809551)
chr4 (13-65)||(41165808-41165860)
chr4 (13-65)||(47534933-47534985)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (54-259)||(1255-1462)
scaffold0266 (54-259)||(3508-3714)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (54-259)||(48729-48935)
scaffold0023 (161-259)||(36225-36323)
[»] chr7 (29 HSPs)
chr7 (13-255)||(3060101-3060344)
chr7 (54-259)||(16211897-16212103)
chr7 (127-282)||(11516334-11516490)
chr7 (127-282)||(15441564-15441720)
chr7 (127-282)||(30262129-30262285)
chr7 (54-259)||(13036938-13037146)
chr7 (127-282)||(7293123-7293279)
chr7 (54-259)||(36052795-36053003)
chr7 (54-259)||(11580661-11580871)
chr7 (127-258)||(47481031-47481162)
chr7 (134-259)||(18253842-18253967)
chr7 (127-259)||(25292338-25292470)
chr7 (128-252)||(13321152-13321278)
chr7 (145-259)||(16478968-16479082)
chr7 (143-259)||(13572808-13572924)
chr7 (11-85)||(32493903-32493978)
chr7 (139-259)||(10989541-10989661)
chr7 (62-255)||(295900-296094)
chr7 (138-258)||(2437590-2437710)
chr7 (139-251)||(13911024-13911136)
chr7 (11-85)||(126738-126813)
chr7 (11-85)||(1936874-1936949)
chr7 (127-169)||(14113989-14114031)
chr7 (127-169)||(14423639-14423681)
chr7 (11-85)||(111126-111201)
chr7 (13-65)||(13377872-13377924)
chr7 (13-65)||(13389698-13389750)
chr7 (11-65)||(7283913-7283967)
chr7 (13-65)||(16919874-16919926)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (66-259)||(51121-51314)
[»] chr5 (25 HSPs)
chr5 (127-282)||(20623076-20623232)
chr5 (127-282)||(21233528-21233684)
chr5 (127-282)||(37052851-37053007)
chr5 (54-259)||(23507096-23507302)
chr5 (127-282)||(16536304-16536460)
chr5 (54-259)||(27182471-27182679)
chr5 (129-282)||(25900408-25900561)
chr5 (54-258)||(18530988-18531198)
chr5 (54-259)||(22053753-22053965)
chr5 (127-259)||(34939408-34939540)
chr5 (139-259)||(29188284-29188404)
chr5 (143-257)||(27009975-27010089)
chr5 (142-259)||(43443398-43443515)
chr5 (139-259)||(19500031-19500151)
chr5 (139-259)||(22366481-22366601)
chr5 (139-259)||(25426760-25426880)
chr5 (142-259)||(18777995-18778112)
chr5 (139-259)||(12506-12626)
chr5 (139-251)||(4199985-4200097)
chr5 (139-259)||(21073595-21073715)
chr5 (11-65)||(11584394-11584448)
chr5 (143-184)||(21310709-21310750)
chr5 (143-184)||(23981516-23981557)
chr5 (13-65)||(21222462-21222514)
chr5 (134-206)||(32950879-32950951)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (54-259)||(882-1088)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (54-259)||(41860-42066)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (53-259)||(36836-37045)
scaffold0077 (11-65)||(15324-15378)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (54-259)||(172036-172242)
scaffold0001 (54-259)||(177739-177945)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (127-282)||(26902-27058)
scaffold0141 (134-282)||(22647-22796)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (127-282)||(1582-1738)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (127-282)||(37066-37222)
scaffold0078 (11-85)||(41632-41707)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (54-259)||(5990-6196)
[»] chr6 (20 HSPs)
chr6 (54-259)||(23153578-23153786)
chr6 (98-258)||(14626089-14626249)
chr6 (127-259)||(1657748-1657880)
chr6 (127-259)||(15862602-15862734)
chr6 (127-259)||(35009439-35009571)
chr6 (139-259)||(1650105-1650225)
chr6 (11-85)||(19983149-19983224)
chr6 (11-85)||(35015014-35015089)
chr6 (54-122)||(23148266-23148335)
chr6 (127-210)||(27751605-27751688)
chr6 (139-259)||(25175695-25175815)
chr6 (139-259)||(27653983-27654103)
chr6 (139-259)||(16825752-16825874)
chr6 (11-85)||(18583640-18583715)
chr6 (127-224)||(29666040-29666137)
chr6 (13-65)||(21623511-21623563)
chr6 (143-184)||(16887792-16887833)
chr6 (143-184)||(33324898-33324939)
chr6 (143-184)||(35136013-35136054)
chr6 (13-65)||(22361619-22361671)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (54-259)||(12244-12450)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (62-259)||(19337-19537)
scaffold0195 (127-259)||(21421-21553)
[»] scaffold0162 (3 HSPs)
scaffold0162 (54-257)||(26340-26545)
scaffold0162 (127-259)||(8180-8312)
scaffold0162 (13-65)||(6877-6929)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (54-259)||(247366-247574)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (54-259)||(128095-128301)
scaffold0008 (161-251)||(31697-31787)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (63-259)||(4996-5193)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (54-259)||(123087-123296)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (54-259)||(89378-89586)
scaffold0028 (54-178)||(107708-107835)
scaffold0028 (143-184)||(79745-79786)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (54-259)||(272156-272362)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (54-259)||(9009-9215)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (95-259)||(148852-149018)
scaffold0025 (65-259)||(8980-9180)
scaffold0025 (54-153)||(146838-146938)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (134-259)||(5660-5785)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (127-259)||(13637-13769)
scaffold0132 (11-85)||(42677-42749)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (134-259)||(48318-48443)
scaffold0049 (11-65)||(20513-20567)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (127-257)||(534-664)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (127-258)||(41780-41911)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (134-259)||(107878-108003)
scaffold0026 (143-259)||(64527-64648)
scaffold0026 (142-184)||(89863-89905)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (127-257)||(34460-34590)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (138-259)||(3094-3215)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (139-259)||(13325-13445)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (143-259)||(167-283)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (161-259)||(9371-9469)
scaffold0215 (161-259)||(16269-16367)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (11-85)||(80187-80262)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (162-259)||(43129-43226)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (177-258)||(5254-5335)
scaffold0022 (144-184)||(102923-102963)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (139-259)||(1304-1424)
[»] scaffold0016 (3 HSPs)
scaffold0016 (11-86)||(166121-166197)
scaffold0016 (12-86)||(162036-162111)
scaffold0016 (13-65)||(116410-116462)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (11-85)||(31137-31212)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (12-85)||(5735-5809)
scaffold0686 (12-85)||(5941-6015)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (161-259)||(14083-14181)
scaffold0139 (138-256)||(21115-21233)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (11-86)||(309-385)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (127-210)||(3370-3453)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (177-258)||(3854-3936)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (11-65)||(1721-1775)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (11-65)||(19807-19861)
scaffold0122 (11-65)||(24111-24165)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (143-184)||(1546-1587)
scaffold0456 (143-184)||(8691-8732)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (143-184)||(8216-8257)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (134-252)||(56106-56226)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (143-184)||(70307-70348)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (13-65)||(35821-35873)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (15-65)||(114-164)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (143-181)||(1348-1386)
scaffold0409 (143-181)||(9603-9641)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (11-65)||(6261-6315)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (143-184)||(22422-22463)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (143-184)||(93773-93814)
[»] scaffold1295 (1 HSPs)
scaffold1295 (13-65)||(447-499)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (13-65)||(1363-1415)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (144-184)||(10868-10908)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (13-65)||(76699-76751)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 35)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 11 - 281
Target Start/End: Original strand, 16743998 - 16744270
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagg-ggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16743998 cataggagctaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaacgaggttagtctttaccataatcatcatcattttgtaaattttcaaatg 16744097  T
Q  110 ttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttgg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16744098 ttgtatgaattttgattatggatgattgttgttaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatccatgaattgataataagtgtatgattgttgg 16744197  T
Q  210 ttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgtt 281  Q
    ||| ||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16744198 ttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgtt 16744270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13839232 - 13839025
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-ttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtg 151  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  13839232 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatgaataattgttgctaaattcgtg 13839133  T
Q  152 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaa 251  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||    
T  13839132 ctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 13839033  T
Q  252 aattgtgc 259  Q
    ||||||||    
T  13839032 aattgtgc 13839025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 14842487 - 14842693
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14842487 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcactttgcaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 14842586  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| |||| |||||| |||||||||||    
T  14842587 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgttggtgaaattgcatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttatgaaa 14842686  T
Q  253 attgtgc 259  Q
    |||||||    
T  14842687 attgtgc 14842693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 2050147 - 2049941
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  2050147 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatcaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 2050048  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| | |||| || || |||||    
T  2050047 tccaactgtgacgatatgtttgtatgcctgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaacatgataacttgtgaaa 2049948  T
Q  253 attgtgc 259  Q
    |||||||    
T  2049947 attgtgc 2049941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 12030073 - 12030279
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 152  Q
    |||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  12030073 taaggtaagggggttaatcattatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgacttttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 12030172  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| || ||| ||||| |||||    
T  12030173 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaagtgataagttgtgaaa 12030272  T
Q  253 attgtgc 259  Q
     ||||||    
T  12030273 gttgtgc 12030279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 127 - 282
Target Start/End: Original strand, 2449238 - 2449394
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  2449238 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 2449337  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttg 282  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2449338 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttg 2449394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 19232164 - 19231982
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-ttttcaaat 108  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19232164 cataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcttaatcatcatcattttgtgaaattttcaaat 19232065  T
Q  109 gttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgat 189  Q
    ||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  19232064 gttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttatattcatgaattgat 19231982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 127 - 282
Target Start/End: Original strand, 17912483 - 17912638
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  17912483 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactt-gatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 17912581  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttg 282  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  17912582 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaattgatgaatttgatatgttg 17912638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 117 - 259
Target Start/End: Original strand, 51158008 - 51158150
Alignment:
Q  117 aattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagatt 216  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||    
T  51158008 aattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatt 51158107  T
Q  217 ccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
     |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  51158108 acatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 51158150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 101 - 259
Target Start/End: Original strand, 15858996 - 15859156
Alignment:
Q  101 tttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgt 198  Q
    |||||| |||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  15858996 tttcaattgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgt 15859095  T
Q  199 atgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    |||||||||||| | ||| |||||| ||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||    
T  15859096 atgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgaacaaatgataagttgtgaaaattgtgc 15859156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 54 - 173
Target Start/End: Original strand, 19260749 - 19260869
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  19260749 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaagttttcaaatgttgtatgaattttttttatggataattgttgctaaattcgtgc 19260848  T
Q  153 tccaactttgatgatatgttt 173  Q
    || || | |||||||||||||    
T  19260849 tctaattatgatgatatgttt 19260869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 134 - 259
Target Start/End: Original strand, 15936634 - 15936759
Alignment:
Q  134 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgta 233  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||    
T  15936634 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 15936733  T
Q  234 gaaatgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||    
T  15936734 aaaatgataagttgtgaaaattgtgc 15936759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 127 - 259
Target Start/End: Original strand, 13975722 - 13975853
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || | |||||||||||||||   ||| |||||||||    
T  13975722 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatg-ttgtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13975820  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  13975821 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 13975853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 127 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 45861068 - 45860937
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || | |||||||||||||||   ||| |||||||||    
T  45861068 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatg-ttgtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 45860970  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  45860969 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 45860937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 127 - 259
Target Start/End: Original strand, 13954890 - 13955021
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || | |||||||||||||||   ||| |||||||||    
T  13954890 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatg-ttgtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13954988  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||| ||| ||||||  ||||||||| |||||||    
T  13954989 ataagtaaaaatgatcagttatgaatattgtgc 13955021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 259
Target Start/End: Original strand, 15938476 - 15938601
Alignment:
Q  134 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgta 233  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||    
T  15938476 attgttactaaatacgtgctccaactgtaatgatatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 15938575  T
Q  234 gaaatgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||    
T  15938576 aaaatgataagttgtgaaaattgtgc 15938601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 88
Target Start/End: Original strand, 15857120 - 15857198
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatcat 88  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  15857120 cataggagctaaagtgaagctagagctaatacttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcat 15857198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 3992948 - 3992873
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  3992948 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 3992873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 55513268 - 55513193
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  55513268 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 55513193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 55316471 - 55316351
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  55316471 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 55316372  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  55316371 gataagttatgaatattgtgc 55316351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 2844589 - 2844514
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  2844589 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagtttgagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 2844514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 41270327 - 41270207
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||   ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  41270327 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtggaattacatgttcatatatgcaaaaat 41270228  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  41270227 gataagttatgaatattgtgc 41270207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 54037981 - 54038056
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  54037981 cataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 54038056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16821369 - 16821291
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatg 239  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||    
T  16821369 tgatgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatg 16821291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 17955837 - 17955916
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctag----agctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||| |||||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  17955837 cataggagcaaaagtgaagctaggtagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 17955916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 15615053 - 15614973
Alignment:
Q  171 tttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaa 251  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  15615053 tttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 15614973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 7854380 - 7854305
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  7854380 cataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 7854305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 45582016 - 45581954
Alignment:
Q  25 tgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa--ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||    
T  45582016 tgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaaggggggttagtttttatcataatcat 45581954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 14080756 - 14080715
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14080756 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 14080715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 12031904 - 12031852
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  12031904 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 12031852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 17205076 - 17205024
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  17205076 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 17205024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 206
Target Start/End: Original strand, 11986173 - 11986245
Alignment:
Q  134 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgt 206  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| || || ||||||| || || |||| |||||||||||    
T  11986173 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttaatgataattgtatgattgt 11986245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 17191936 - 17191884
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  17191936 taggagctaaagtgaagtttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 17191884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 38810868 - 38810920
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||| ||||||||||||    
T  38810868 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataactaaggtaagggg 38810920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 54651714 - 54651642
Alignment:
Q  134 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgt 206  Q
    |||||||||||||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  54651714 attgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgt 54651642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 21)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 41394602 - 41394353
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatg 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41394602 cataggagctaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatg 41394503  T
Q  110 ttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttgg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  41394502 ttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttgg 41394403  T
Q  210 ttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    | |  || |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  41394402 tgaagttacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 41394353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20913367 - 20913161
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  20913367 taaggtaagggggttagtctttatcgtaatcatcctcattttgcaaattttcaattgttgtatgaattttgcttacggataattgttgctaaattcgtgc 20913268  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| | ||||||| |||||| |||||||||||    
T  20913267 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaa 20913168  T
Q  253 attgtgc 259  Q
    |||||||    
T  20913167 attgtgc 20913161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20931682 - 20931476
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  20931682 taaggtaagggggttagcctttatcataatcatcctcattttgcaaattttcaattgttgtatgaagtttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 20931583  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| | ||||||| |||||| |||||||||||    
T  20931582 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaa 20931483  T
Q  253 attgtgc 259  Q
    |||||||    
T  20931482 attgtgc 20931476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 127 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 51452755 - 51452599
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  51452755 atggataattgttgctaaattcgtgcttcaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 51452656  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttg 282  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51452655 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttg 51452599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 54 - 223
Target Start/End: Original strand, 37844374 - 37844546
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||| |    
T  37844374 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcat 37844473  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtt 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  37844474 gctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtt 37844546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20446019 - 20445810
Alignment:
Q  54 taaggtaaggg-gttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-ttttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 149  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  20446019 taaggtaagggagttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 20445920  T
Q  150 tgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatg 249  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || || | | |||||| ||||  ||    
T  20445919 tgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtg 20445820  T
Q  250 aaaattgtgc 259  Q
    ||||||||||    
T  20445819 aaaattgtgc 20445810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 20893551 - 20893758
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||| |    
T  20893551 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgt-aattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattctt 20893649  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 250  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  20893650 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgttgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 20893749  T
Q  251 aaattgtgc 259  Q
    |||||||||    
T  20893750 aaattgtgc 20893758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 66 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20531770 - 20531575
Alignment:
Q  66 ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttga 163  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||    
T  20531770 ttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaaatgtga 20531671  T
Q  164 tgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || || | | |||||| ||||  ||||||||||||    
T  20531670 taatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtgaaaattgtgc 20531575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 2116506 - 2116386
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||| |||||||||   ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  2116506 tgctagattcgtgcttttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 2116407  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || ||||| ||||||| ||||    
T  2116406 gataagttgtgaaaatggtgc 2116386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 45051674 - 45051554
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||| ||||||| ||  ||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  45051674 tgctagattcgtgttcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 45051575  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || ||||| ||||||||||||    
T  45051574 gataagttgtgaaaattgtgc 45051554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 21860409 - 21860334
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  21860409 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 21860334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Original strand, 44034829 - 44034903
Alignment:
Q  12 ataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  44034829 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 44034903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 138 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22228061 - 22227941
Alignment:
Q  138 ttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaa 237  Q
    |||||||||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||    
T  22228061 ttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaa 22227962  T
Q  238 tgagaagttatgaaaattgtg 258  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  22227961 tgataagttatgaaaattgtg 22227941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 138 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22232758 - 22232638
Alignment:
Q  138 ttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaa 237  Q
    |||||||||||||||||   || ||||| ||| ||  | ||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||    
T  22232758 ttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaa 22232659  T
Q  238 tgagaagttatgaaaattgtg 258  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  22232658 tgataagttatgaaaattgtg 22232638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Original strand, 5072388 - 5072508
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||| |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  5072388 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 5072487  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  5072488 gataagttatgaatattgtgc 5072508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Original strand, 18601118 - 18601238
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    |||||||||| |||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  18601118 tgctaaattcatgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 18601217  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  18601218 gataagttatgaatattgtgc 18601238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 41218803 - 41218749
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  41218803 cataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaagggg 41218749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 27675191 - 27675139
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  27675191 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggagataattaaggtaagggg 27675139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 20177570 - 20177513
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttag 69  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20177570 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaatggggttag 20177513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 184
Target Start/End: Original strand, 22143361 - 22143402
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  22143361 aaattcgtgctctaactatgatgatgtgtttgtatgcatgaa 22143402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 13376711 - 13376763
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  13376711 taggagctaaagtgaagtttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 13376763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 21)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 20627195 - 20627445
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-ttttcaaat 108  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  20627195 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaacggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaaattttcaaat 20627294  T
Q  109 gttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttg 208  Q
     ||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||    
T  20627295 attgtatgaattatgattatggataattgttgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcacgaattgatgataattgtatgattgttg 20627394  T
Q  209 gttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || | ||| |||||  ||||||||| |||||| || || ||||||||||||    
T  20627395 gtgaaattacatgtccaaatatgtaaaaatgataacttgtgaaaattgtgc 20627445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 43642838 - 43643089
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagg-ggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43642838 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaagggaaggaggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatg 43642937  T
Q  110 ttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgtt 207  Q
    |||||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  43642938 ttgtatgaatttttgcatagtggataattgttgctaaatttgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgtt 43643037  T
Q  208 ggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||| | ||| |||||| ||||| | | |||||  ||||| ||||||||||||    
T  43643038 ggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgc 43643089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 54 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 463075 - 462870
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  463075 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 462976  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  462975 tccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 462876  T
Q  253 attgtg 258  Q
    ||||||    
T  462875 attgtg 462870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 19794586 - 19794836
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatg 109  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  19794586 cataagagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattttgtaaattt-caaatg 19794684  T
Q  110 ttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgtt 207  Q
    |||||||||||||   || |||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19794685 ttgtatgaatttttgcataatggataattgtcgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgtt 19794784  T
Q  208 ggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||||||||||    
T  19794785 ggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgc 19794836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 127 - 282
Target Start/End: Original strand, 19689401 - 19689557
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  19689401 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 19689500  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttg 282  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19689501 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttg 19689557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 127 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 23820334 - 23820178
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  23820334 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 23820235  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttg 282  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23820234 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttg 23820178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 127 - 282
Target Start/End: Original strand, 14906440 - 14906596
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  14906440 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 14906539  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttg 282  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14906540 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttg 14906596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 60 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 8891574 - 8891373
Alignment:
Q  60 aaggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaa 157  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8891574 aaggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaa 8891475  T
Q  158 ctttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgt 257  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||||||||    
T  8891474 ctgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggcgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 8891375  T
Q  258 gc 259  Q
    ||    
T  8891374 gc 8891373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 36982364 - 36982573
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcatttt-gtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 149  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  36982364 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 36982463  T
Q  150 tgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatg 249  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||| |||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||    
T  36982464 tgctccaactgtgatgatatgtttgtattcatgaattgatgataattgtaagattgctggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 36982563  T
Q  250 aaaattgtgc 259  Q
    ||||||||||    
T  36982564 aaaattgtgc 36982573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 127 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 20015274 - 20015118
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  20015274 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgcatgcatgaattgataataattgtgtgattgttggttaaattacatgtttga 20015175  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttg 282  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20015174 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttg 20015118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 24341309 - 24341521
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 146  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    ||||  | ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  24341309 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 24341408  T
Q  147 tcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagtt 246  Q
    || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||  ||||| || |||||| ||||| ||||||    
T  24341409 tcatgcttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattatatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 24341508  T
Q  247 atgaaaattgtgc 259  Q
     ||||||||||||    
T  24341509 gtgaaaattgtgc 24341521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 127 - 259
Target Start/End: Original strand, 25265390 - 25265522
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  25265390 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 25265489  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
     |||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  25265490 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgc 25265522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 127 - 259
Target Start/End: Original strand, 17396653 - 17396784
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  17396653 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 17396751  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||| ||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  17396752 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgc 17396784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 54 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 22863267 - 22863169
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcg 149  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  22863267 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaattgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 22863169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 22275120 - 22275045
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  22275120 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagcctttatcataatcat 22275045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 22284353 - 22284278
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  22284353 cataggagcaaaagtgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22284278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 15633612 - 15633538
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagg-ggttagtctttaccataatca 84  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  15633612 cataggagcaaaagtgaagctagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtctttatcataatca 15633538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 177 - 258
Target Start/End: Original strand, 7507894 - 7507975
Alignment:
Q  177 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg 258  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  7507894 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttatgaaaattgtg 7507975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Original strand, 19886661 - 19886781
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | || |    
T  19886661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 19886760  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  19886761 gataagttatgaagattgtgc 19886781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 19660273 - 19660217
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaaggggttag 69  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  19660273 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaaggggttag 19660217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 43646289 - 43646237
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  43646289 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 43646237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 16193643 - 16193848
Alignment:
Q  54 taaggtaaggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgct 153  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16193643 taaggtaaggggttagtctttatcataatcatcatcatttggtaaattttcaaatattgtatgaattttgcttatggatgattgttgctaaattcgtgct 16193742  T
Q  154 ccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaa 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||    
T  16193743 ccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaa 16193842  T
Q  254 ttgtgc 259  Q
    ||||||    
T  16193843 ttgtgc 16193848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 16404857 - 16405107
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatg 109  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  16404857 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattt-gtaaattttcaaatg 16404955  T
Q  110 ttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgtt 207  Q
    |||||||||||||   || |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  16404956 ttgtatgaatttttgcatgatggataattattgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgtt 16405055  T
Q  208 ggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||| | ||| |||||| ||||| | | |||||  ||||| ||||||||||||    
T  16405056 ggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgc 16405107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 24928716 - 24928923
Alignment:
Q  54 taaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-ttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtg 151  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24928716 taaggtaatggggttagtctttatcataatcatcgtcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggataattgttgctaaattcgtg 24928815  T
Q  152 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaa 251  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||||    
T  24928816 ctccaactgtgattatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 24928915  T
Q  252 aattgtgc 259  Q
    ||||||||    
T  24928916 aattgtgc 24928923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 127 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 5238350 - 5238194
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  5238350 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 5238251  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttg 282  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5238250 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttg 5238194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 127 - 282
Target Start/End: Original strand, 22907214 - 22907370
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22907214 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 22907313  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttg 282  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22907314 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttg 22907370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 127 - 282
Target Start/End: Original strand, 24661248 - 24661404
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  24661248 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 24661347  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttg 282  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24661348 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttg 24661404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 127 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 43685809 - 43685653
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  43685809 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 43685710  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttg 282  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43685709 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttg 43685653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 43373392 - 43373600
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   || |||||| |||  ||||||||||||    
T  43373392 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattaatgctaaattcgt 43373491  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 250  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  43373492 gctccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 43373591  T
Q  251 aaattgtgc 259  Q
    |||||||||    
T  43373592 aaattgtgc 43373600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 127 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 17345832 - 17345700
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||    
T  17345832 atggataattgttgcgaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 17345733  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  17345732 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgc 17345700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Original strand, 6774258 - 6774378
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  6774258 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 6774357  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || ||||| ||||||||||||    
T  6774358 gataagttgtgaaaattgtgc 6774378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 143 - 259
Target Start/End: Original strand, 21844576 - 21844692
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgaga 242  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  21844576 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 21844675  T
Q  243 agttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||||||||| |||||||    
T  21844676 agttatgaatattgtgc 21844692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24549233 - 24549113
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  24549233 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 24549134  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || ||||| ||||||| ||||    
T  24549133 gataagttgtgaaaatggtgc 24549113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 143 - 259
Target Start/End: Original strand, 21851969 - 21852085
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgaga 242  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||| |||||| |    
T  21851969 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtttaaatatgtaaaaatgata 21852068  T
Q  243 agttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||||||||| |||||||    
T  21852069 agttatgaatattgtgc 21852085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 274841 - 274766
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  274841 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 274766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 641008 - 641083
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  641008 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 641083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 826814 - 826889
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  826814 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 826889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 24716719 - 24716794
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24716719 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24716794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 30120974 - 30120854
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  30120974 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 30120875  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  30120874 gataagttatgaatattgtgc 30120854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Original strand, 16674392 - 16674512
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||| |||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  16674392 tgctaaattcgtgctctttctgtgatgttatgtttttatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 16674491  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  16674492 gataagttatgaatattgtgc 16674512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 39115673 - 39115598
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaaggg-gttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| || | |||||||||    
T  39115673 cataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtaataattaaggtaagggtgttagttttcatcataatcat 39115598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 23150026 - 23149985
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  23150026 aaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaa 23149985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 184
Target Start/End: Original strand, 23226076 - 23226117
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23226076 aaatttgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 23226117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 17285600 - 17285548
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  17285600 taggagctaaagtgaagcttgggttaggaattggtgataattaaggtaagggg 17285548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 21198005 - 21198057
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||| |||||||    
T  21198005 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaagataagggg 21198057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 20)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 259
Target Start/End: Original strand, 54118125 - 54118376
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatg 109  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54118125 cataagagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattttgtgaattttcaaatg 54118224  T
Q  110 ttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgtt 207  Q
    |||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  54118225 ttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgtt 54118324  T
Q  208 ggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||| | ||| |||||| ||||| | | || ||| ||||| ||||||||||||    
T  54118325 ggtgaaattacatgttcaaataggaacaattgataagttgtgaaaattgtgc 54118376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 122226 - 122020
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  122226 taaggtaaggggattagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaatttgtgc 122127  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  122126 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 122027  T
Q  253 attgtgc 259  Q
    |||||||    
T  122026 attgtgc 122020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 127 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 26680463 - 26680307
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26680463 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 26680364  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttg 282  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  26680363 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatagatgaatttgacatgttg 26680307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 127 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 10488825 - 10488669
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  10488825 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 10488726  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttg 282  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10488725 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttg 10488669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 127 - 282
Target Start/End: Original strand, 16327926 - 16328082
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  16327926 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16328025  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttg 282  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16328026 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttg 16328082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13246769 - 13246561
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| |||||||||    
T  13246769 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaaattcgt 13246670  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 250  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  13246669 gctacaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattaatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 13246570  T
Q  251 aaattgtgc 259  Q
    |||||||||    
T  13246569 aaattgtgc 13246561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 15675009 - 15675221
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 146  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    ||||  | ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  15675009 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 15675108  T
Q  147 tcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagtt 246  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| ||||| ||||||    
T  15675109 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 15675208  T
Q  247 atgaaaattgtgc 259  Q
     ||||||||||||    
T  15675209 gtgaaaattgtgc 15675221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 10104170 - 10104382
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 146  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    |||   | ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  10104170 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttacaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 10104269  T
Q  147 tcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagtt 246  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| ||||| ||||||    
T  10104270 ccgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 10104369  T
Q  247 atgaaaattgtgc 259  Q
     ||||||||||||    
T  10104370 gtgaaaattgtgc 10104382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 127 - 259
Target Start/End: Original strand, 13048221 - 13048353
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  13048221 atggataattgttgctaaattcatgctccaacttcaatgatatgtttgtatgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 13048320  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||||||| ||| || |||||||||| |||||||    
T  13048321 atatgtaaaaaggataagttatgaatattgtgc 13048353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 33241043 - 33240901
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 146  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    ||||  | ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  33241043 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 33240944  T
Q  147 tcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgat 189  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33240943 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgat 33240901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 154 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 31115865 - 31115764
Alignment:
Q  154 ccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaa 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| ||||||  | |||||| ||||| |||||| ||||||    
T  31115865 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttccattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaa 31115766  T
Q  254 tt 255  Q
    ||    
T  31115765 tt 31115764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 25119064 - 25119139
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaaggg-gttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  25119064 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggagttagtttttatcataatcat 25119139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 143 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 10644467 - 10644351
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgaga 242  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||||  |    
T  10644467 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 10644368  T
Q  243 agttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||||||||  |||||||    
T  10644367 agttatgagtattgtgc 10644351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 47357906 - 47357786
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||| ||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  47357906 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 47357807  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  47357806 gataagttatgaagattgtgc 47357786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 5682385 - 5682460
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaag-gggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  5682385 cataggagcaaaagtgaagcatgagctaatagttggtgataattaaggtaagtgggttagtttttatcataatcat 5682460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 252
Target Start/End: Original strand, 40885570 - 40885680
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaa-tatgtagaaatgag 241  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||| | |||| || ||| |||||||| | ||| |||||| ||| |||||| |||||      
T  40885570 aaattcgtactccaactgtggtgctatgtttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgtataaatgtc 40885669  T
Q  242 aagttatgaaa 252  Q
    |||||||||||    
T  40885670 aagttatgaaa 40885680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 31132657 - 31132545
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 146  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||    ||||  | ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  31132657 taaggtaagggggttagtcttcatcataattatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 31132558  T
Q  147 tcgtgctccaact 159  Q
    |||||||||||||    
T  31132557 tcgtgctccaact 31132545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 184
Target Start/End: Original strand, 13809511 - 13809551
Alignment:
Q  144 aattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  13809511 aattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaa 13809551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 41165808 - 41165860
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||| ||||||||    
T  41165808 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaacgtaagggg 41165860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 47534933 - 47534985
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | || || | |||| ||||||||||||||||||    
T  47534933 taggagctaaagtgaagcttgggcgaggaattggtgataattaaggtaagggg 47534985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 1462 - 1255
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaa-ttttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtg 151  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  1462 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttcttatggataattgttgctaaattcgtg 1363  T
Q  152 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaa 251  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  1362 ctccaactttgatgatatgttagtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 1263  T
Q  252 aattgtgc 259  Q
    ||||||||    
T  1262 aattgtgc 1255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 3508 - 3714
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  3508 taaggtaagggggttagtctttgtcataatcatcttcattttgtaaattttcaaaagttgtatgaattttgattatagataattgttgctaaattcgtgc 3607  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  3608 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 3707  T
Q  253 attgtgc 259  Q
    |||||||    
T  3708 attgtgc 3714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 48935 - 48729
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  48935 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 48836  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||||    
T  48835 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaaaaatgataagttgtgaaa 48736  T
Q  253 attgtgc 259  Q
    |||||||    
T  48735 attgtgc 48729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 36323 - 36225
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| ||| || | ||||| | |||||| |||||||||| |||||||    
T  36323 tgatgttatgtttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgc 36225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 29)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 3060344 - 3060101
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaaggggtta-gtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgtt 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3060344 taggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataatgaaggtaagggggtaagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgtt 3060245  T
Q  112 gtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggtt 211  Q
     ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||  | |||||||     
T  3060244 atatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgataatatatttgtatgcattaattgatgataattgtaatactgttggtg 3060145  T
Q  212 agattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaatt 255  Q
    | ||| |||||| ||||||||| |||||| || || ||||||||    
T  3060144 aaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataaattgtgaaaatt 3060101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16212103 - 16211897
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  16212103 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggacaattgttgctaaattcgtgc 16212004  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  16212003 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 16211904  T
Q  253 attgtgc 259  Q
    |||||||    
T  16211903 attgtgc 16211897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 127 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 11516490 - 11516334
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  11516490 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 11516391  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttg 282  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11516390 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttg 11516334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 127 - 282
Target Start/End: Original strand, 15441564 - 15441720
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  15441564 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 15441663  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttg 282  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15441664 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttg 15441720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 127 - 282
Target Start/End: Original strand, 30262129 - 30262285
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  30262129 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 30262228  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttg 282  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30262229 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttg 30262285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 13036938 - 13037146
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  13036938 taaggtaagggggttagtcttcaccataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 13037037  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 250  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  13037038 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgatgaaattgcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 13037137  T
Q  251 aaattgtgc 259  Q
    |||||||||    
T  13037138 aaattgtgc 13037146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 127 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 7293279 - 7293123
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  7293279 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattaataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 7293180  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttg 282  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7293179 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttg 7293123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 36053003 - 36052795
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||  |    
T  36053003 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattgttgctaaatttat 36052904  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 250  Q
     |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  36052903 actccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtaaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 36052804  T
Q  251 aaattgtgc 259  Q
    |||||||||    
T  36052803 aaattgtgc 36052795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 11580661 - 11580871
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcatttt-gtgaattttcaaatgttgtatgaattttg---attatggatgattgttgctaaattc 148  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    || |||||| ||| |||||||||||    
T  11580661 taaggtaaggggattagtctttatcataatcatcatcatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttttgcataatggataattattgctaaattc 11580760  T
Q  149 gtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttat 248  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |    
T  11580761 gtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgt 11580860  T
Q  249 gaaaattgtgc 259  Q
    |||||||||||    
T  11580861 gaaaattgtgc 11580871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 127 - 258
Target Start/End: Original strand, 47481031 - 47481162
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||| |||||| ||    
T  47481031 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaa 47481130  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg 258  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  47481131 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtg 47481162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 134 - 259
Target Start/End: Original strand, 18253842 - 18253967
Alignment:
Q  134 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgta 233  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||    
T  18253842 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 18253941  T
Q  234 gaaatgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||    
T  18253942 aaaatgataagttgtgaaaattgtgc 18253967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 127 - 259
Target Start/End: Original strand, 25292338 - 25292470
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  25292338 atggataattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgtatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 25292437  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||||||| ||| || ||| |||||| |||||||    
T  25292438 atatgtaaaaaggataagctatgaatattgtgc 25292470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 128 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 13321278 - 13321152
Alignment:
Q  128 tggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgttt--a 225  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||  |    
T  13321278 tggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaa 13321179  T
Q  226 aatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    | |||||| |||||  |||||||||||    
T  13321178 agtatgtataaatgtcaagttatgaaa 13321152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 259
Target Start/End: Original strand, 16478968 - 16479082
Alignment:
Q  145 attcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaag 244  Q
    ||||||||||  |||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| |||    
T  16478968 attcgtgctcttactgcgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataag 16479067  T
Q  245 ttatgaaaattgtgc 259  Q
    || ||||||||||||    
T  16479068 ttgtgaaaattgtgc 16479082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 143 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13572924 - 13572808
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgaga 242  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  13572924 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 13572825  T
Q  243 agttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||||||||| |||||||    
T  13572824 agttatgaatattgtgc 13572808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 32493903 - 32493978
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  32493903 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 32493978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 10989661 - 10989541
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  10989661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 10989562  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  10989561 gataagttatgaatattgtgc 10989541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 255
Target Start/End: Original strand, 295900 - 296094
Alignment:
Q  62 ggggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaa-ttttg-attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaact 159  Q
    |||||| ||||| | ||||||  |||||||||| || |||||||||  ||||||||| ||||| || ||| || |||||||||||||||||| || || |    
T  295900 ggggtttgtcttcaacataattctcatcatttt-tgcattttcaaactttgtatgaaattttgcataatgaataattgttgctaaattcgtgttctaatt 295998  T
Q  160 ttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaatt 255  Q
      | || ||||||||| ||||||||| ||| ||||   ||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  295999 gaggtgttatgtttgtgtgcatgaatcgatgataatgttatgattgttggtgaaatttcatgttgaattatgtaaaaatgagaagttataaaaatt 296094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 2437710 - 2437590
Alignment:
Q  138 ttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaa 237  Q
    |||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | |||    
T  2437710 ttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 2437611  T
Q  238 tgagaagttatgaaaattgtg 258  Q
    ||| |||||||||| ||||||    
T  2437610 tgataagttatgaagattgtg 2437590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 251
Target Start/End: Original strand, 13911024 - 13911136
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  13911024 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 13911123  T
Q  239 gagaagttatgaa 251  Q
    || ||||||||||    
T  13911124 gataagttatgaa 13911136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 126813 - 126738
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  126813 cataggagcaaaaatgaagttagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 126738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 1936874 - 1936949
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagg-ggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  1936874 catagaagcaaaagtgaagctagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtttttatcataatcat 1936949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 127 - 169
Target Start/End: Original strand, 14113989 - 14114031
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatat 169  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14113989 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatat 14114031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 127 - 169
Target Start/End: Original strand, 14423639 - 14423681
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatat 169  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14423639 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatat 14423681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 111126 - 111201
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  111126 cataggagcaaaagtgaagcttgagctaaaagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 111201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 13377924 - 13377872
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  13377924 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 13377872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 13389750 - 13389698
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  13389750 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 13389698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 65
Target Start/End: Original strand, 7283913 - 7283967
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| || || |||| ||||||||||||||||||    
T  7283913 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaataattggtgataattaaggtaagggg 7283967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 16919926 - 16919874
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| |||||||||| |||||||    
T  16919926 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaagataagggg 16919874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 66 - 259
Target Start/End: Original strand, 51121 - 51314
Alignment:
Q  66 ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatg 165  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51121 ttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatg 51220  T
Q  166 atatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  51221 atatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaataggtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 51314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 25)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 127 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 20623232 - 20623076
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  20623232 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 20623133  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttg 282  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20623132 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttg 20623076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 127 - 282
Target Start/End: Original strand, 21233528 - 21233684
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  21233528 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 21233627  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttg 282  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21233628 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttg 21233684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 127 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 37053007 - 37052851
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  37053007 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37052908  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttg 282  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37052907 atatgtggaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttg 37052851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23507302 - 23507096
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  23507302 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatctccattttgtaagatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 23507203  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||    
T  23507202 tccatttgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 23507103  T
Q  253 attgtgc 259  Q
    |||||||    
T  23507102 attgtgc 23507096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 127 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16536460 - 16536304
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  16536460 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaatttataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16536361  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttg 282  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16536360 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttg 16536304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 27182471 - 27182679
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||| |    
T  27182471 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcat 27182570  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 250  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| | | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  27182571 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaactgatgataattgtatgattgttgatgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 27182670  T
Q  251 aaattgtgc 259  Q
    |||||||||    
T  27182671 aaattgtgc 27182679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 129 - 282
Target Start/End: Original strand, 25900408 - 25900561
Alignment:
Q  129 ggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaat 228  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||  |||||| |||    
T  25900408 ggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggttaaattatatgtttgaat 25900507  T
Q  229 atgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttg 282  Q
    ||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  25900508 atgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaa-ttgacatgttg 25900561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 54 - 258
Target Start/End: Original strand, 18530988 - 18531198
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatc---atcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaat-tttgattat-ggatgattgttgctaaatt 147  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||   ||||||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||| || || |||| ||||||||||||||    
T  18530988 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcgtcatcatcattttgcaatttttcaaatgtggtatgaatgtttcataattggataattgttgctaaatt 18531087  T
Q  148 cgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagtta 247  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| ||||| ||||||     
T  18531088 cgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttg 18531187  T
Q  248 tgaaaattgtg 258  Q
    |||||||||||    
T  18531188 tgaaaattgtg 18531198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 22053753 - 22053965
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcat--tttgtgaa--ttttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 146  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  22053753 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgaaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 22053852  T
Q  147 tcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagtt 246  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| ||||| ||||||    
T  22053853 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgtatgaattgatgatagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 22053952  T
Q  247 atgaaaattgtgc 259  Q
     ||||||||||||    
T  22053953 gtgaaaattgtgc 22053965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 127 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 34939540 - 34939408
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||    
T  34939540 atggataactgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 34939441  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  34939440 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgc 34939408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Original strand, 29188284 - 29188404
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  29188284 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 29188383  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || ||||| ||||||| ||||    
T  29188384 gataagttgtgaaaatggtgc 29188404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 143 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 27010089 - 27009975
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgaga 242  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  27010089 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 27009990  T
Q  243 agttatgaaaattgt 257  Q
    ||||||||| |||||    
T  27009989 agttatgaatattgt 27009975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 142 - 259
Target Start/End: Original strand, 43443398 - 43443515
Alignment:
Q  142 taaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgag 241  Q
    |||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||||     
T  43443398 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgat 43443497  T
Q  242 aagttatgaaaattgtgc 259  Q
    |||||||||| |||||||    
T  43443498 aagttatgaatattgtgc 43443515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19500151 - 19500031
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  19500151 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 19500052  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  19500051 gataagttatgaagattgtgc 19500031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Original strand, 22366481 - 22366601
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  22366481 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 22366580  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  22366581 gataagttatgaagattgtgc 22366601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 25426880 - 25426760
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  25426880 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 25426781  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  25426780 gataagttatgaagattgtgc 25426760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 259
Target Start/End: Original strand, 18777995 - 18778112
Alignment:
Q  142 taaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgag 241  Q
    |||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||||     
T  18777995 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgat 18778094  T
Q  242 aagttatgaaaattgtgc 259  Q
    |||||||||| |||||||    
T  18778095 aagttatgaagattgtgc 18778112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 12626 - 12506
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | || |    
T  12626 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 12527  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  12526 gataagttatgaagattgtgc 12506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 251
Target Start/End: Original strand, 4199985 - 4200097
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  4199985 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 4200084  T
Q  239 gagaagttatgaa 251  Q
    || ||||||||||    
T  4200085 gataagttatgaa 4200097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Original strand, 21073595 - 21073715
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||| |||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  21073595 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 21073694  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  21073695 gataagttatgaagattgtgc 21073715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 11584448 - 11584394
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  11584448 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggg 11584394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 184
Target Start/End: Original strand, 21310709 - 21310750
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21310709 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgaatgcatgaa 21310750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 184
Target Start/End: Original strand, 23981516 - 23981557
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  23981516 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgtatgcatgaa 23981557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 21222462 - 21222514
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||| ||||    
T  21222462 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtatgggg 21222514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 32950951 - 32950879
Alignment:
Q  134 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgt 206  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| || || || |||| ||||| |||| |||||||||||    
T  32950951 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgtatgatttgatgataattgtatgattgt 32950879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 882 - 1088
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||   |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  882 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcactttacaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 981  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||| | ||||| |||||    
T  982 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaa 1081  T
Q  253 attgtgc 259  Q
    |||||||    
T  1082 attgtgc 1088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 42066 - 41860
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 152  Q
    |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  42066 taaggtaagggggttggtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 41967  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||   ||||||||| | ||| |||| | ||||||||| |||||| || || |||||    
T  41966 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtcatattgttggtgaaattacatgctcaaatatgtaaaaatgataatttgtgaaa 41867  T
Q  253 attgtgc 259  Q
    |||||||    
T  41866 attgtgc 41860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 53 - 259
Target Start/End: Original strand, 36836 - 37045
Alignment:
Q  53 ttaaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 149  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| ||||||||    
T  36836 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaaattcg 36935  T
Q  150 tgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatg 249  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||    
T  36936 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 37035  T
Q  250 aaaattgtgc 259  Q
    ||||||||||    
T  37036 aaaattgtgc 37045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 65
Target Start/End: Original strand, 15324 - 15378
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15324 cataggagcaaaagtgaagcttgggctaatagttggagataattaaggtaagggg 15378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 172242 - 172036
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  172242 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtataaattttgattatggataactgttgctaaatacgtgc 172143  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||||    
T  172142 tccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 172043  T
Q  253 attgtgc 259  Q
    |||||||    
T  172042 attgtgc 172036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 177945 - 177739
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  177945 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtataaattttgattatggataactgttgctaaatacgtgc 177846  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||||    
T  177845 tccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 177746  T
Q  253 attgtgc 259  Q
    |||||||    
T  177745 attgtgc 177739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 127 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 27058 - 26902
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  27058 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 26959  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttg 282  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26958 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttg 26902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 134 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22796 - 22647
Alignment:
Q  134 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgta 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||     
T  22796 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtg 22697  T
Q  234 gaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttg 282  Q
     |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22696 aaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttg 22647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 127 - 282
Target Start/End: Original strand, 1582 - 1738
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  1582 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 1681  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttg 282  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1682 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttg 1738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 127 - 282
Target Start/End: Original strand, 37066 - 37222
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  37066 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37165  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc-aaatggatgaatttgacatgttg 282  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37166 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgacatgttg 37222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 41707 - 41632
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||    
T  41707 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatcat 41632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 5990 - 6196
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5990 taaggtaagggggttagtctttatcataatcattttcactttgcaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 6089  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||| | ||||| | |||    
T  6090 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtaaaa 6189  T
Q  253 attgtgc 259  Q
    |||||||    
T  6190 attgtgc 6196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 114; Significance: 7e-58; HSPs: 20)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23153786 - 23153578
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||| ||||||||||    
T  23153786 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgtttctaaattcgt 23153687  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 250  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  23153686 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 23153587  T
Q  251 aaattgtgc 259  Q
    |||||||||    
T  23153586 aaattgtgc 23153578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 98 - 258
Target Start/End: Original strand, 14626089 - 14626249
Alignment:
Q  98 aattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtg 197  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  14626089 aattctcaaatgttgtttgaattgtgattatggataattattgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattg 14626188  T
Q  198 tatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg 258  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  14626189 tatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtg 14626249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 127 - 259
Target Start/End: Original strand, 1657748 - 1657880
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||    
T  1657748 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 1657847  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  1657848 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgc 1657880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 127 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15862734 - 15862602
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||  |||||| ||    
T  15862734 atggataattgttactaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 15862635  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  15862634 ttatgtataaatgtgaagttatgaaaattgtgc 15862602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 127 - 259
Target Start/End: Original strand, 35009439 - 35009571
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  35009439 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 35009538  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
     |||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  35009539 ttatgtaaaaatgtgaagttttgaaaattgtgc 35009571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Original strand, 1650105 - 1650225
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||| ||||||||||  ||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||  |||    
T  1650105 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaagaat 1650204  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || ||||| ||||||||||||    
T  1650205 gataagttgtgaaaattgtgc 1650225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 19983149 - 19983224
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  19983149 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 19983224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 35015014 - 35015089
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  35015014 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 35015089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 23148335 - 23148266
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttt 122  Q
    |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23148335 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 23148266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 27751688 - 27751605
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggt 210  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  27751688 atggataaatgtagctaaattcgtgctctaattgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgacaattgtatgattgttggt 27751605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 25175815 - 25175695
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||||||||||   || || || |||||||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  25175815 tgctaaattcgtgctcttgctgtgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 25175716  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  25175715 gataagttatgaagattgtgc 25175695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Original strand, 27653983 - 27654103
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||| ||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  27653983 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 27654082  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  27654083 gataagttatgaagattgtgc 27654103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Original strand, 16825752 - 16825874
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgta--tgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaa 236  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||  | ||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||    
T  16825752 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtaattaattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaa 16825851  T
Q  237 atgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    |||| |||||||||| |||||||    
T  16825852 atgataagttatgaagattgtgc 16825874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 18583715 - 18583640
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  18583715 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 18583640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 127 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 29666137 - 29666040
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgttt 224  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| | || ||||| ||| ||  |||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||| | ||| |||||||    
T  29666137 atggataattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgttt 29666040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 21623563 - 21623511
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  21623563 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 21623511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 184
Target Start/End: Original strand, 16887792 - 16887833
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  16887792 aaattcgtgctctaactatgataatatgtttgtatgcatgaa 16887833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 33324939 - 33324898
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  33324939 aaattcgtgctctaactaggatgatatgtttgtatgcatgaa 33324898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 184
Target Start/End: Original strand, 35136013 - 35136054
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  35136013 aaattcgtgctctaactaggatgatatgtttgtatgcatgaa 35136054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 22361619 - 22361671
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  22361619 taggagctaaagtgaagcttggcctaggaattggtgataattaaggtaagggg 22361671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 12450 - 12244
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaa-ttttgattatggatgattgttgctaaattcgtg 151  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12450 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttaattttgt-aactttcaaatgctgtatgaaattttgattatggataattgttgctaaattcgtg 12352  T
Q  152 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaa 251  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | | | ||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||    
T  12351 ctctaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgtttaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaa 12252  T
Q  252 aattgtgc 259  Q
    ||||||||    
T  12251 aattgtgc 12244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 62 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19537 - 19337
Alignment:
Q  62 ggggttagtctttaccataatcatcatcatttt-gtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaac 158  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19537 ggggttagtcttcatcataatcatcataatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaac 19438  T
Q  159 tttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg 258  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  19437 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtg 19338  T
Q  259 c 259  Q
    |    
T  19337 c 19337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 127 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21553 - 21421
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| ||    
T  21553 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 21454  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  21453 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 21421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 54 - 257
Target Start/End: Original strand, 26340 - 26545
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg-attatggatgattgttgctaaattcgtg 151  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||    
T  26340 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatgatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttcataatgtataattgttgctaaattcgtg 26439  T
Q  152 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaa 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||| ||||| | | | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  26440 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattattggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 26539  T
Q  252 aattgt 257  Q
    ||||||    
T  26540 aattgt 26545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 127 - 259
Target Start/End: Original strand, 8180 - 8312
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| | ||| || ||| ||    
T  8180 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattacaggttcaa 8279  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
     |||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  8280 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgc 8312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 6877 - 6929
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  6877 taggagttaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 6929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 247366 - 247574
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  247366 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 247465  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 250  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||    
T  247466 gctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgagggtgaaatttcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 247565  T
Q  251 aaattgtgc 259  Q
    |||||||||    
T  247566 aaattgtgc 247574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 128095 - 128301
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  128095 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcattttgcaaattttcaaaagttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 128194  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| |||| |||| |  ||  ||||| |||||    
T  128195 ttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaggtgttaagttgtgaaa 128294  T
Q  253 attgtgc 259  Q
    |||||||    
T  128295 attgtgc 128301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 251
Target Start/End: Original strand, 31697 - 31787
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaa 251  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| ||| || | ||||| | |||||| ||||||||||    
T  31697 tgatgttatgtttgaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 31787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 63 - 259
Target Start/End: Original strand, 4996 - 5193
Alignment:
Q  63 gggttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg-attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaacttt 161  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  4996 gggttagtctttatcataatcattatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttcataatggataattgttgctaaattcgtactccaactgt 5095  T
Q  162 gatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||| | | | |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  5096 gacgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 5193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 123087 - 123296
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcatttt-gtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 149  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  123087 taaggtaagggggttagtcttcaccataatcatcataatttttgtaaatttgcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 123186  T
Q  150 tgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatg 249  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| ||    
T  123187 tgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtg 123286  T
Q  250 aaaattgtgc 259  Q
    ||||||||||    
T  123287 aaaattgtgc 123296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Original strand, 89378 - 89586
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  89378 taaggtaagggggttagtcttcatcatgatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttctatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 89477  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatga 250  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||| | | |||| | ||||| |||    
T  89478 gctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaattataagttgtga 89577  T
Q  251 aaattgtgc 259  Q
    |||||||||    
T  89578 aaattgtgc 89586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 178
Target Start/End: Original strand, 107708 - 107835
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcgt 150  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||| |||||||||||||    
T  107708 taaggtaagggggttagtcttcatcatgatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataatttttgctaaattcgt 107807  T
Q  151 gctccaactttgatgatatgtttgtatg 178  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  107808 gctccaactgtgatgatatatttgtatg 107835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 79786 - 79745
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  79786 aaattcgtgcactaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 79745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 272362 - 272156
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | | ||||||||| ||| |    
T  272362 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatattgtataaattttgattatggataaatattgctaaatacgtac 272263  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| |||  | ||| |||||| ||||| | | |||||| ||||| |||||    
T  272262 tccaactgtaatgatatgtttgtatgaatgaattgatgataattgtatgattgatggagaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 272163  T
Q  253 attgtgc 259  Q
    |||||||    
T  272162 attgtgc 272156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 9215 - 9009
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  9215 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcattttgcaaattttcaaaagttgtacgaattttgcttatggaaaattgttgctaaattcgtgc 9116  T
Q  153 tccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    ||||  | ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||| | ||| |||||| || |||||| |||||  ||||| |||||    
T  9115 tccatttgtgatgttatgtttgtatgcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgttaagttgtgaaa 9016  T
Q  253 attgtgc 259  Q
    |||||||    
T  9015 attgtgc 9009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 95 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 149018 - 148852
Alignment:
Q  95 gtgaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataat 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||   || || ||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  149018 gtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgcataattgataattgttgttaaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgat 148919  T
Q  193 aagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || |||| |||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  148918 aattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgc 148852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 65 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 9180 - 8980
Alignment:
Q  65 gttagtctttaccataatcatcatcat----tttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaattcgtgctccaac 158  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||    ||||  | ||||||||||| ||||| |||||   ||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  9180 gttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgtatttttcataattggataattgttgctaaattcgtgctccatc 9081  T
Q  159 tttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg 258  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  9080 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtg 8981  T
Q  259 c 259  Q
    |    
T  8980 c 8980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 146938 - 146838
Alignment:
Q  54 taaggtaagggg-ttagtctttaccataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 152  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||    
T  146938 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttcctaaattcatgc 146839  T
Q  153 t 153  Q
    |    
T  146838 t 146838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 134 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 5785 - 5660
Alignment:
Q  134 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgta 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  5785 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgta 5686  T
Q  234 gaaatgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
     |||||| |||| ||||| |||||||    
T  5685 aaaatgataagtcatgaatattgtgc 5660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 127 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13769 - 13637
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  13769 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 13670  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
     |||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  13669 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgc 13637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 42749 - 42677
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  42749 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagata---aaggtaagggggttagtttttatcataatcat 42677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 134 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 48443 - 48318
Alignment:
Q  134 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgta 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| ||||    
T  48443 attgttgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 48344  T
Q  234 gaaatgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||    
T  48343 aaaatgataagttgtgaaaattgtgc 48318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 20567 - 20513
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  20567 cataggagcaaaaatgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggg 20513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 127 - 257
Target Start/End: Original strand, 534 - 664
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  534 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 633  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgt 257  Q
    ||| | | ||||||  |||| ||||||||||    
T  634 ataggaacaaatgatgagttgtgaaaattgt 664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 127 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 41911 - 41780
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  41911 atggataattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 41812  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg 258  Q
     |||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  41811 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtg 41780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 134 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 108003 - 107878
Alignment:
Q  134 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgta 233  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||| || |    
T  108003 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgca 107904  T
Q  234 gaaatgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
     |||||| ||||| | ||||||||||    
T  107903 aaaatgataagttgtaaaaattgtgc 107878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 259
Target Start/End: Original strand, 64527 - 64648
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaatt-----gataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaa 237  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||| ||||||||||||     ||| || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||    
T  64527 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattatattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaa 64626  T
Q  238 tgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||| |||||||||| |||||||    
T  64627 tgataagttatgaatattgtgc 64648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 184
Target Start/End: Original strand, 89863 - 89905
Alignment:
Q  142 taaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  89863 taaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 89905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 127 - 257
Target Start/End: Original strand, 34460 - 34590
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaa 226  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||    
T  34460 atggataattattgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 34559  T
Q  227 atatgtagaaatgagaagttatgaaaattgt 257  Q
     | |||| ||||  |||||| ||||||||||    
T  34560 ttgtgtaaaaatatgaagttgtgaaaattgt 34590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 138 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 3215 - 3094
Alignment:
Q  138 ttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaa 237  Q
    |||||||||||||||||   || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| || |||||| |||    
T  3215 ttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaa 3116  T
Q  238 tgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || |||||| ||||||||||||    
T  3115 tgtgaagttgtgaaaattgtgc 3094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Original strand, 13325 - 13445
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||| ||||||||||  | | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||||    
T  13325 tgctagattcgtgctcttagtgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 13424  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || ||||| ||||||| ||||    
T  13425 gataagttgtgaaaatggtgc 13445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 143 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 283 - 167
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgaga 242  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  283 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 184  T
Q  243 agttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||||||| | |||||||    
T  183 agttatgtatattgtgc 167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 161 - 259
Target Start/End: Original strand, 9371 - 9469
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||    
T  9371 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgc 9469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 161 - 259
Target Start/End: Original strand, 16269 - 16367
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||    
T  16269 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgc 16367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 80262 - 80187
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  80262 cataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 80187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 43226 - 43129
Alignment:
Q  162 gatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||  |||||||||| |||||||    
T  43226 gatgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgaagattgtgc 43129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 177 - 258
Target Start/End: Original strand, 5254 - 5335
Alignment:
Q  177 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtg 258  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  5254 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtg 5335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 184
Target Start/End: Original strand, 102923 - 102963
Alignment:
Q  144 aattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  102923 aattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatgcatgaa 102963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Original strand, 1304 - 1424
Alignment:
Q  139 tgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaat 238  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| | ||| |||||| | ||||| | ||||    
T  1304 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 1403  T
Q  239 gagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    || |||||||||| |||||||    
T  1404 gataagttatgaatattgtgc 1424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Original strand, 166121 - 166197
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatc 86  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||    
T  166121 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatc 166197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 86
Target Start/End: Original strand, 162036 - 162111
Alignment:
Q  12 ataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatc 86  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||    
T  162036 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatc 162111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 116410 - 116462
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  116410 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 116462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 31137 - 31212
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||    
T  31137 cataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatcat 31212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Original strand, 5735 - 5809
Alignment:
Q  12 ataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  5735 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 5809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 85
Target Start/End: Original strand, 5941 - 6015
Alignment:
Q  12 ataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcat 85  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||    
T  5941 ataggagcaaaagtgaagctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 6015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 161 - 259
Target Start/End: Original strand, 14083 - 14181
Alignment:
Q  161 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaatgagaagttatgaaaattgtgc 259  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  14083 tgatgttatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttgaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgtgc 14181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 256
Target Start/End: Original strand, 21115 - 21233
Alignment:
Q  138 ttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgtagaaa 237  Q
    |||||||||||||||||    | ||||| ||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||||| || | ||| |||||| ||||||||| |||    
T  21115 ttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaa 21214  T
Q  238 tgagaagttatgaaaattg 256  Q
    ||| |||||||||| ||||    
T  21215 tgataagttatgaagattg 21233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Original strand, 309 - 385
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaa-ggggttagtctttaccataatcatc 86  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  309 cataggagcaaaagtgaagcttgagctaatagttggtgataattaaggtaacggggttattctttatcataatcatc 385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 3453 - 3370
Alignment:
Q  127 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggt 210  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| | || ||||| || ||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||    
T  3453 atggataattgatgctaaattcgtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggt 3370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 177 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 3936 - 3854
Alignment:
Q  177 tgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgtttaaatatgt-agaaatgagaagttatgaaaattgtg 258  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||| | |||||| |||||||| ||||||||    
T  3936 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaaatgataagttatggaaattgtg 3854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 1775 - 1721
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1775 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggg 1721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 65
Target Start/End: Original strand, 19807 - 19861
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  19807 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggg 19861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 65
Target Start/End: Original strand, 24111 - 24165
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24111 cataggagcaaaaatgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggg 24165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 184
Target Start/End: Original strand, 1546 - 1587
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1546 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 1587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 184
Target Start/End: Original strand, 8691 - 8732
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8691 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 8732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 8257 - 8216
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8257 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 8216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 252
Target Start/End: Original strand, 56106 - 56226
Alignment:
Q  134 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataagtgtatgattgttggttagattccatgttt--aaatatg 231  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||| || || ||||||| ||||| |||| ||||||||||| | | | ||| |||||||  || ||||    
T  56106 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgttttaaagtatg 56205  T
Q  232 tagaaatgagaagttatgaaa 252  Q
    || |||||  |||||||||||    
T  56206 tataaatgtcaagttatgaaa 56226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 143 - 184
Target Start/End: Original strand, 70307 - 70348
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  70307 aaattcgtactccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 70348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 35873 - 35821
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  35873 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattggtgataattaaggtaagggg 35821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 164 - 114
Alignment:
Q  15 ggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||| ||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  164 ggagcaaaagtgaagcttgagttaatagttggtgataattaaggtaagggg 114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 181
Target Start/End: Original strand, 1348 - 1386
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcat 181  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  1348 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcat 1386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 181
Target Start/End: Original strand, 9603 - 9641
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcat 181  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  9603 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcat 9641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 65
Target Start/End: Original strand, 6261 - 6315
Alignment:
Q  11 cataggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||| || |||| || ||||||||||||||||||    
T  6261 cataggagcaaaagtgaagcttgagttaatagtgggtgataattaaggtaagggg 6315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 184
Target Start/End: Original strand, 22422 - 22463
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  22422 aaattcgtgctctaaatatgatgatatgtttgtatgcatgaa 22463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 184
Target Start/End: Original strand, 93773 - 93814
Alignment:
Q  143 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  93773 aaattcgtgctccaattatgatgatatgtatgtatgcatgaa 93814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1295 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:

Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 499 - 447
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||| | ||||||||||    
T  499 taggagctaaagtgaagcttgagctaggaattggtgataactgaggtaagggg 447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 1363 - 1415
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||| ||||||||||    
T  1363 taggaactaaagtgaagcttgagctaggaattggtgataattgaggtaagggg 1415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 144 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 10908 - 10868
Alignment:
Q  144 aattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaa 184  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  10908 aattcgtgctctatctatgatgatatgtttgtatgcatgaa 10868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 76699 - 76751
Alignment:
Q  13 taggagctaaagtgaagctagagctagtagttggagataattaaggtaagggg 65  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| | |||  ||||||||||||||||||    
T  76699 taggagctaaagtgaagcttgggctaggaattgctgataattaaggtaagggg 76751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 4719 times since January 2019
Visitors: 4838