View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0759_high_6 (Length: 479)

Name: NF0759_high_6
Description: NF0759
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0759_high_6
NF0759_high_6
[»] chr6 (11 HSPs)
chr6 (5-458)||(1660325-1660778)
chr6 (5-458)||(16103651-16104104)
chr6 (5-458)||(21412008-21412461)
chr6 (5-326)||(17786674-17786996)
chr6 (5-458)||(16646451-16646904)
chr6 (11-458)||(22364852-22365299)
chr6 (29-458)||(16378879-16379308)
chr6 (5-267)||(18421101-18421363)
chr6 (62-456)||(14149746-14150139)
chr6 (287-456)||(19982365-19982534)
chr6 (223-327)||(976255-976359)
[»] chr8 (4 HSPs)
chr8 (5-458)||(21847117-21847570)
chr8 (5-458)||(20649135-20649588)
chr8 (157-458)||(16415634-16415934)
chr8 (5-458)||(21193332-21193785)
[»] chr4 (5 HSPs)
chr4 (5-458)||(15000128-15000588)
chr4 (5-458)||(15289495-15289948)
chr4 (194-458)||(12339400-12339664)
chr4 (98-374)||(18272652-18272928)
chr4 (214-283)||(28266083-28266152)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (5-458)||(26907-27360)
[»] scaffold1140 (1 HSPs)
scaffold1140 (5-459)||(101-555)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (8-458)||(6200-6653)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (8-458)||(20928551-20929001)
chr1 (9-458)||(20528550-20528999)
chr1 (29-458)||(20827825-20828254)
chr1 (5-458)||(22128847-22129301)
chr1 (5-456)||(41214270-41214721)
chr1 (348-458)||(23312571-23312681)
chr1 (262-443)||(20172643-20172824)
chr1 (305-458)||(21200280-21200433)
[»] scaffold0467 (2 HSPs)
scaffold0467 (5-458)||(12671-13124)
scaffold0467 (45-458)||(1-414)
[»] chr3 (12 HSPs)
chr3 (8-458)||(15943174-15943624)
chr3 (5-459)||(6149429-6149883)
chr3 (13-458)||(17201747-17202192)
chr3 (100-458)||(13964026-13964384)
chr3 (29-458)||(30150468-30150897)
chr3 (98-458)||(8271068-8271428)
chr3 (5-361)||(25768423-25768779)
chr3 (62-458)||(22149379-22149775)
chr3 (11-455)||(17321176-17321620)
chr3 (5-65)||(5224953-5225013)
chr3 (305-369)||(22259971-22260035)
chr3 (305-369)||(22268464-22268528)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (8-459)||(22281217-22281668)
chr2 (5-456)||(25131574-25132026)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (29-458)||(315-744)
[»] chr5 (4 HSPs)
chr5 (5-458)||(23509071-23509524)
chr5 (5-458)||(24584596-24585049)
chr5 (5-459)||(21828202-21828655)
chr5 (262-333)||(33314011-33314082)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (5-433)||(7776-8204)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (8-458)||(130829-131282)
scaffold0008 (5-458)||(27287-27740)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (5-459)||(25689-26142)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (5-457)||(3215-3675)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (8-459)||(8732-9175)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (5-458)||(4711-5163)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (5-458)||(3266-3719)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (5-458)||(97038-97489)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (5-459)||(8667-9121)
scaffold0021 (151-458)||(91013-91320)
scaffold0021 (98-456)||(20309-20667)
scaffold0021 (98-456)||(29885-30243)
[»] scaffold0465 (2 HSPs)
scaffold0465 (164-458)||(12124-12418)
scaffold0465 (5-127)||(11999-12121)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (85-458)||(4226-4599)
[»] chr7 (8 HSPs)
chr7 (29-458)||(27104144-27104573)
chr7 (98-458)||(27173752-27174112)
chr7 (29-458)||(7827371-7827800)
chr7 (249-460)||(4443392-4443603)
chr7 (191-456)||(13459484-13459749)
chr7 (5-106)||(16575119-16575220)
chr7 (5-106)||(16590442-16590543)
chr7 (354-458)||(14218525-14218629)
[»] scaffold0302 (2 HSPs)
scaffold0302 (5-211)||(3168-3374)
scaffold0302 (410-458)||(1722-1770)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (232-458)||(16412-16638)
scaffold0162 (5-121)||(16637-16753)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (279-458)||(24474-24653)
[»] scaffold0011 (5 HSPs)
scaffold0011 (5-191)||(73065-73251)
scaffold0011 (5-191)||(77446-77632)
scaffold0011 (311-458)||(77661-77808)
scaffold0011 (311-458)||(73280-73427)
scaffold0011 (344-459)||(182500-182615)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (162-459)||(25197-25494)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (5-456)||(35513-35963)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (161-458)||(5509-5806)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (191-456)||(32401-32665)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (354-458)||(35587-35691)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (298-460)||(3999-4161)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (287-456)||(77934-78103)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (249-363)||(2182-2296)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (287-458)||(49170-49341)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 410; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 458
Target Start/End: Original strand, 1660325 - 1660778
Alignment:
5 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgagg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
1660325 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgtttgctgagg 1660424  T
105 aagcagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 204  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
1660425 aagcagagtactggtggatcaatgccaagggcaggcttgagttgggcggtgatgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 1660524  T
205 cccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
1660525 cccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagtttgaggaactttcg 1660624  T
305 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttc 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
1660625 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggtcatctatcagtacatgtgtgttc 1660724  T
405 aggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatg 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
1660725 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 1660778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 5 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 16104104 - 16103651
Alignment:
5 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgagg 104  Q
    |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||    
16104104 ggagtacaaacttgggtgcagggtatggagcggattttccaagctatggtgacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatgtgcttgctgagg 16104005  T
105 aagcagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 204  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||| || || |||||  ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||    
16104004 aagcggagcactggtggactaatgccaaaggaagacttgaaatgggaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaagctgaattcttgaggaagtattt 16103905  T
205 cccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 304  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
16103904 ccctgaagacttgaggactaagaaggaggttgagtttctgaatttgaatcaaggaagcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcc 16103805  T
305 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttc 404  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||      
16103804 aggttttttccctacatcaatgctgaagatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgtgcgtct 16103705  T
405 aggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatg 458  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
16103704 aggagatccgagactttcatactttggtgcaaaagtgtcgtatgtttgatgatg 16103651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 5 - 458
Target Start/End: Original strand, 21412008 - 21412461
Alignment:
5 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgagg 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||| | |||||||    
21412008 ggagctcagacttgggtgcagggcatggagcggatatttcgtgctatggtgacgggagatgaccaaaaggccagattggcgactcatatgcttgctgagg 21412107  T
105 aagcagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 204  Q
    | || |||||||||||||| |||| ||| || ||  ||||| ||| ||| |  || ||||||||||| |||||||| |  |||||||| |||||||||||    
21412108 aggctgagtactggtggactaatgtcaaaggaagatttgagatgggaggagaagttgtgacctgggcgaagttcaaagcagaattcttaaggaagtattt 21412207  T
205 cccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 304  Q
    ||| ||||| ||||| || | ||||||||| || |||||||| ||||| || || | |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
21412208 ccctgaagatttgagaactaggaaggaggtggaatttctgaacctgaagcagggaagcatgtctgtagccgagtatgaggcgaagtttgaggagctttcg 21412307  T
305 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttc 404  Q
    | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
21412308 aagttttgtccgtacatcaatgctgaagatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggatatctatcagtatatgtgtgttc 21412407  T
405 aggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatg 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||    
21412408 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgttgcatgtttgttgatg 21412461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 5 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 17786996 - 17786674
Alignment:
5 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaagg-tcagactagcgactcatatgttagctgag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
17786996 ggagcacagacttgggtgcagggtatggaacggattttccgagctatggttacgggaaatgaccagaaggctcagactagcgactcatatgctagctgag 17786897  T
104 gaagcagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatt 203  Q
    |||| || | |||||||||| |||||||| || || |||||| ||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
17786896 gaagaagggcactggtggactaatgccaaaggaagacttgagatgggaggtgatgtggtgacctaggctaagttcaaggtcgaattcttgaggaaatatt 17786797  T
204 tcccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttc 303  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||    
17786796 tccctgaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaaggaagcatgtctgtagccgaatatgcggcgaagttcgaggaactttc 17786697  T
304 gaggttttgtccctacatcaatg 326  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||    
17786696 gaggttttatccttacataaatg 17786674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 5 - 458
Target Start/End: Original strand, 16646451 - 16646904
Alignment:
5 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgagg 104  Q
    ||||| ||||| ||| |||| || |||||| | || || || |||||||| ||  | ||||| |||||||| ||  | || ||||| ||| | |||||||    
16646451 ggagctcagacatggttgcaaggcatggagagaatctttcgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtgaggttggctactcacatgcttgctgagg 16646550  T
105 aagcagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 204  Q
    | || ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || || || || ||||| ||| | | |||||||  ||| || ||||||||||| ||    
16646551 aggctgagtattggtggaccaatgctaagggaagacttgagattgatggaggggttgtgacttggacaacgttcaagactgagtttttgaggaagtactt 16646650  T
205 cccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 304  Q
     || || || |||||||| | |||||| || ||||| |||||| |||| |||||||  ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |     
16646651 tccagaggatttgaggactaggaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtccgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgca 16646750  T
305 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttc 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||     
16646751 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgtgtgtta 16646850  T
405 aggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatg 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
16646851 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 16646904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 458
Target Start/End: Original strand, 22364852 - 22365299
Alignment:
11 cagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgaggaagcag 110  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| |||||||| ||  | |||||| ||||||||||  | |  ||||| ||| | |||||||| || |    
22364852 cagacttgggtgcagggcatagagaggatattccgtgctatggtgacaagtgatgactagaaggtcaggttggttactcacatgcttgctgaggaggccg 22364951  T
111 agtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttcccgga 210  Q
    |||| |||||||| ||| | ||||| || |||||| | |  || |  || ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    
22364952 agtattggtggactaattctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcaaagttcaaagttgagttcttgaggaagtatttccctga 22365051  T
211 agacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcgaggttt 310  Q
    ||  |||||||||| |||||| || |||||  ||||  || | ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||    
22365052 aggtttgaggaccaggaaggaagtagagttcttgaacttgtagcaagggagcatgtctgtagctgagtatacggcgaagtttgaagagctttcgagattt 22365151  T
311 tgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttcaggaga 410  Q
    | ||| |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
22365152 tttccatacatcaatgttgaagatgcaatggtttcgaagtgtgtgaagtttgaaagtgagcttaggccggatatctatcagtatatgtgtgttcaggaga 22365251  T
411 tccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatg 458  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
22365252 tccgagattttgatactttggtgtataagtgtcgtatgtttgatgatg 22365299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 458
Target Start/End: Original strand, 16378879 - 16379308
Alignment:
29 atggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgaggaagcagagtactggtggaccaatg 128  Q
    |||||| |||| || || |||||||| ||  | ||||| |||||||| ||  | || ||||| ||| | |||||||| || ||||| |||||||||||||    
16378879 atggagaggatctttcgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtgaggttggctactcacatgcttgctgaggaggctgagtattggtggaccaatg 16378978  T
129 ccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttcccggaagacttgaggaccaagaa 228  Q
    | ||||| || |||||| | |  || |  || ||||| ||| | | |||||||| ||| || ||||||||||| || || || || |||||||| | |||    
16378979 ctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttggacaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactttccagaggatttgaggactaggaa 16379078  T
229 ggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcgaggttttgtccctacatcaatgct 328  Q
    ||| || ||||| |||||| |||| |||||||  ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||     
16379079 ggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtctgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgcaaggttttgtccctacatcaatgcg 16379178  T
329 gaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactt 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16379179 gaggatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactt 16379278  T
429 tggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatg 458  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
16379279 tggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 16379308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 5 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 18421363 - 18421101
Alignment:
5 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgagg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||    
18421363 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgatctatggtgacgagggatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgcttgctaagg 18421264  T
105 aagcagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 204  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| || || |||||| ||| ||||| ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
18421263 aagcagagcactggtggactaatgccaaaggaagacttgagatgggaggtgatgttgtgacctgggctaagttccaggttgaattcttgaggaagtattt 18421164  T
205 cccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtc 267  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
18421163 ccctgaagacttgaggaccaacaaggagattgagtttctgaatctataacaagggatcatgtc 18421101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 62 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 14150139 - 14149746
Alignment:
62 gatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgaggaagcagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtgg 161  Q
    ||||| |||||||||||  | || ||||| ||||| | |||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| |  |||||| | |  || |  || |    
14150139 gatgatcagaaggtcaggttggctactcacatgtttgttgaggaggccgagtattggtggactaatgctaagggaaaacttgagattggtggagaggttg 14150040  T
162 tgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttcccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggat 261  Q
    |||| ||||| |||||||||   || || ||||||||||| || |  || || |||||||| | ||||||||| |||||  ||||  |||| |||||||     
14150039 tgacttgggctaagttcaagaccgagtttttgaggaagtactttctagaggatttgaggactaggaaggaggtggagttcttgaacttgaagcaagggag 14149940  T
262 catgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcgaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagttt 361  Q
     ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||| |||    
14149939 tatgtccgtggctgagtatgcggcgatgtttgaggagctgtcgaggttttgtccgtacatcaatgctgaggatgcgatggtgtccaagtgtgtgaaattt 14149840  T
362 gagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatga 456  Q
    || ||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||  |||||||||||||||||||    
14149839 gaaagtgggcttaggctggatttctatctgtatatgtgtgttcaagagatccgagattttgatacctt-gtgcatcagtgtcgtatgtttgatga 14149746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 287 - 456
Target Start/End: Original strand, 19982365 - 19982534
Alignment:
287 aagtttgaggagctttcgaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatct 386  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||| | || || |||| |||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||| |  | ||||| || || |    
19982365 aagtttaaggagctatcaaggttttgttcgtatattaatgttgaggatgctatggtttcaaaatgtgagaagtttgagagtcgtttgaggcccgagattt 19982464  T
387 atcagtatatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatga 456  Q
    ||||||| ||  || |||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
19982465 atcagtacatacgttttcatgagatccgagatttttatactttggtacacaagtatcgtatgtttgatga 19982534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 223 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 976359 - 976255
Alignment:
223 caagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcgaggttttgtccctacatc 322  Q
    |||||||||| ||||||||||  | ||||||||||| |  ||| |  ||||  | |||||||| |||||||||||| | || ||||||||||| ||||||    
976359 caagaaggagattgagtttcttgaactgaaacaaggaaatatgaccatagcaaaatatgcggcaaagtttgaggagttgtccaggttttgtccatacatc 976260  T
323 aatgc 327  Q
    |||||    
976259 aatgc 976255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 398; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 458
Target Start/End: Original strand, 21847117 - 21847570
Alignment:
5 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgagg 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||    
21847117 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccaagctatggttactggtgatgaccagaaggtcagattggcgactcatatgctagctgagg 21847216  T
105 aagcagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21847217 aagcagagtactggtggaccaatgccaagggcagacttgagttggaaggtggtgttgtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 21847316  T
205 cccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
21847317 cccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggtgaagtttgaggagctttcg 21847416  T
305 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttc 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
21847417 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttc 21847516  T
405 aggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatg 458  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
21847517 aggagattcgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 21847570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 5 - 458
Target Start/End: Original strand, 20649135 - 20649588
Alignment:
5 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgagg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
20649135 ggagcacagacttgggtgcagggcatggagcgggtttttcgagctatggtgacgggagatgaccagaaggtcagactggcgactcatatgcttgctgagg 20649234  T
105 aagcagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 204  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||| || || |||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||    
20649235 aagcagagcacttgtggactaatgccaaaggaagacttgagttgggaggtgatgttgtgacctgggcgaagttcaaagttgaattcttgaggaagtgttt 20649334  T
205 cccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 304  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
20649335 ccctgaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatttaaaacaaggaagcatgtctgtagccgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 20649434  T
305 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttc 404  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| |    
20649435 aggttttgtccctacatcaatgttgaagatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtaaatgtatgtac 20649534  T
405 aggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatg 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
20649535 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttaatgatg 20649588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 157 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 16415934 - 16415634
Alignment:
157 tgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttcccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaa 256  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
16415934 tgtggtgacctcggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttccccgaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaa 16415835  T
257 gggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcgaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctga 356  Q
     |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
16415834 tggatcatgtctgtagccgaatatgcggcgaagtttgaggaactttcgaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtgtga 16415735  T
357 agtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatga 456  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||    
16415734 agtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgtgtgtccaggggatccgagactttgatactttggtgcataactgttg-atgtttgatga 16415636  T
457 tg 458  Q
    ||    
16415635 tg 16415634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 5 - 458
Target Start/End: Original strand, 21193332 - 21193785
Alignment:
5 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgagg 104  Q
    ||||| || |||||||||||||| |||||| |||| ||  | |||||||| ||| | |||||||||||||||||| |  ||||||||||| | |||||||    
21193332 ggagctcaaacttgggtgcagggcatggagaggatattttgtgctatggtgacgagtgatgaccagaaggtcagattgacgactcatatgcttgctgagg 21193431  T
105 aagcagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 204  Q
    | || || || |||||||||||||||||||| || |||||| | |  || |  || ||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||    
21193432 aggccgaatattggtggaccaatgccaagggaagacttgagattgttggggaagtcgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtattt 21193531  T
205 cccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 304  Q
    ||| ||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||  ||||  |||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||    
21193532 ccctgaagatttgaggaccaggaaggaggtagcgtttctgaacttgaagtaagggagcatctctgtagccgagtatgcggcgaagttcgagaagctttcg 21193631  T
305 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttc 404  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
21193632 aggttttgtccgtacatcattgctgaagatgcgatggtttcgaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggatatctatcagtatatgtgtgttc 21193731  T
405 aggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatg 458  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
21193732 aggagatccgagattttgatactttggtgcataagtgtcgtaagtttgatgatg 21193785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 385; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 385; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 15000588 - 15000128
Alignment:
5 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgagg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15000588 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgactagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgagg 15000489  T
105 aagcagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
15000488 aagcagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggggggtgatgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatt- 15000390  T
205 cccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||    
15000389 cccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatacggcgaagtttgaggaactttcg 15000290  T
305 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttc 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
15000289 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttc 15000190  T
405 aggagatccgagactttgatac--------tttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatg 458  Q
    ||||||||||||||||||||||        ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
15000189 aggagatccgagactttgatactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 15000128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 5 - 458
Target Start/End: Original strand, 15289495 - 15289948
Alignment:
5 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgagg 104  Q
    ||||| ||||| ||| |||| || |||||| |||| || || |||||||| ||  | ||||| |||||||| ||  | || ||||| ||| | |||||||    
15289495 ggagctcagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtgaggttggctactcacatgcttgctgagg 15289594  T
105 aagcagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 204  Q
    | || ||||| ||| |||||||||| ||||| || |||||| | |  || |  || ||||| ||| | | |||||||| ||| || ||||||||||| ||    
15289595 aggctgagtattggcggaccaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttggacaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactt 15289694  T
205 cccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 304  Q
     || || || |||||||| | |||||| || |||||  ||||| ||||  ||||||  ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |     
15289695 tccagaggatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaatttgaagtaagggagtatgtccgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgca 15289794  T
305 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttc 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
15289795 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagaatgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttc 15289894  T
405 aggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatg 458  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
15289895 aggagatctgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 15289948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 194 - 458
Target Start/End: Original strand, 12339400 - 12339664
Alignment:
194 aggaagtatttcccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttg 293  Q
    ||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||| || | || | |||| || |  || ||||| || ||||| |    
12339400 aggaagtattttccagagaatttgaggaccaagaaggaagtgaagttcttgaatctgaagcaggagaacttgtctgttgtggaatatgcagctaagttcg 12339499  T
294 aggagctttcgaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagta 393  Q
    || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  | ||||| || ||  |  ||||    
12339500 agaaactttcgaggttttgtccttacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaaatgtgtgaagtttgagagtggtttgaggccagagattcactagta 12339599  T
394 tatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatg 458  Q
    ||||||||||||||||||| | || || ||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||    
12339600 tatgtgtgttcaggagatcagggatttcgataccttggtgcctaagtttcgtatgtttgatgatg 12339664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 98 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 18272928 - 18272652
Alignment:
98 gctgaggaagcagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgagga 197  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||| | |  || |  || ||||| ||||| |||||||| | ||| || |||||||    
18272928 gctgaggaggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttgggcaaagttcaaagctgagtttttgagga 18272829  T
198 agtatttcccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgagga 297  Q
    ||||||| || ||||| || ||||| | |||| | || |||||  ||||  |||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
18272828 agtattttccagaagatttaaggactaggaagaaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccatagctgagtatgcggcgacgtttgagga 18272729  T
298 gctttcgaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggctta 374  Q
    ||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||  | |||||| ||||||||||  |||||||||    
18272728 gctatcgaggttttgttcgtacattaatgctgaggatgcaatggtgcccaagtgtgtgaagtttgaaggtgggctta 18272652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 214 - 283
Target Start/End: Original strand, 28266083 - 28266152
Alignment:
214 cttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcg 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
28266083 cttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtctgtagccgagtatgcg 28266152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 358; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 27360 - 26907
Alignment:
5 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgagg 104  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
27360 ggaggacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagattagcgactcatatgctagctgagg 27261  T
105 aagcagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
27260 aagcagagtactggtggaccaatgccaaaggaagacttgagatgggaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaagtttgaattcttgaggaattattt 27161  T
205 cccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 304  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
27160 cccgaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagtttgaggaactttct 27061  T
305 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttc 404  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
27060 aggttttgtccctacatcaatgttgaggatgctatgatttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttc 26961  T
405 aggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatg 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
26960 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgttgatg 26907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140 (Bit Score: 343; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold1140
Description:

Target: scaffold1140; HSP #1
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 555 - 101
Alignment:
5 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgagg 104  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
555 ggagcacatacttgggtgcagggtatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgctagctgagg 456  T
105 aagcagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 204  Q
    |||||||| |||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
455 aagcagagcactgatggactaatgccaaaggaaggcttgagttgggaggttatgtggtgacgtgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 356  T
205 cccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 304  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
355 cccgtaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtctgtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcg 256  T
305 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttc 404  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
255 aggttttgtccctacatcaatgttgaggatggtatgatctcgaagtgtttgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctattagtacatgtgtgttc 156  T
405 aggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatgt 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
155 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgt 101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 328; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 458
Target Start/End: Original strand, 6200 - 6653
Alignment:
8 gcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgaggaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
6200 gcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttgactgaggaag 6299  T
108 cagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttccc 207  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
6300 cagagcactagtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaaatgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttccc 6399  T
208 ggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgagga---gctttcg 304  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||    ||||||    
6400 tgaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaagcaaggaatcatgtctgtggccgagtatgcggcgaagttcgaggaattactttcg 6499  T
305 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttc 404  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
6500 aggttctgtccctacattaatgttgaggatgctatgatttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgtgtgttc 6599  T
405 aggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatg 458  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
6600 aagagatccgagactttgatactttagtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 6653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 327; Significance: 0; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 20929001 - 20928551
Alignment:
8 gcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgaggaag 107  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||    
20929001 gcacagacttgggtgtagggaatggaacggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactggcgactcataagttgactgaggaag 20928902  T
108 cagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttccc 207  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
20928901 cagagcattggtggaccaatgccaagggaaggcttgagatgggagatgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttaaggaagtatttccc 20928802  T
208 ggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcgagg 307  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||    
20928801 cgaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaagaaaggaatcatgtctgtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcaagg 20928702  T
308 ttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttcagg 407  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
20928701 ttttgtccctacatcaatgctcaggatgctatgatttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgtgtgttcagg 20928602  T
408 agatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatg 458  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
20928601 agatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 20928551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 9 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 20528999 - 20528550
Alignment:
9 cacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgaggaagc 108  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
20528999 cacagacttgggtgcagaggatggagcggattttccaagctatggttacggaagatgaccagaaggttagactagcgactcatatgttgactgaggaagc 20528900  T
109 agagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttcccg 208  Q
    |||| |||||||||| |||||||| || ||||||||| ||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
20528899 agagcactggtggactaatgccaaaggaaggcttgagatgggagatgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttcccc 20528800  T
209 gaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcgaggt 308  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
20528799 gaagacttgaggaccaagaaggacattgagtttctgaatctgaagtaaggaatcatgtctatagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcgaggt 20528700  T
309 tttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttcagga 408  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||    
20528699 tttttccctacatcaatgttgaggatgctatgatttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggagatctaccagtacatatgtgttcagga 20528600  T
409 gatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatg 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
20528599 gatccgagactttgatactttggtgaataagtatcgtatgtttgatgatg 20528550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 458
Target Start/End: Original strand, 20827825 - 20828254
Alignment:
29 atggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgaggaagcagagtactggtggaccaatg 128  Q
    |||||| |||| || || |||||||| ||  | ||||| |||||||| ||  | || ||||| ||| | |||||||| || ||||| |||||||||||||    
20827825 atggagaggatctttcgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtgaggttggctactcacatgcttgctgaggaggctgagtattggtggaccaatg 20827924  T
129 ccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttcccggaagacttgaggaccaagaa 228  Q
    | ||||| || |||||| | |  || |  || ||||| ||| | | |||||||| ||| || ||||||||||| || || || || |||||||| | |||    
20827925 ctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttggacaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactttccagaggatttgaggactaggaa 20828024  T
229 ggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcgaggttttgtccctacatcaatgct 328  Q
    ||| || ||||| |||||| |||| |||||||  ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||     
20828025 ggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtctgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgcaaggttttgtccctacatcaatgcg 20828124  T
329 gaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactt 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20828125 gaggatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactt 20828224  T
429 tggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatg 458  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
20828225 tggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 20828254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 5 - 458
Target Start/End: Original strand, 22128847 - 22129301
Alignment:
5 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgagg 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| || |||||| |||| || ||| ||||||| ||  | ||||| || ||||||||  | || ||||||||| | |||||||    
22128847 ggagctcagacgtgggtgcaaggcatggagaggatctttcgaactatggtgactagtgatgatcaaaaggtcaggttggctactcatatgattgctgagg 22128946  T
105 aagcagagtactggtggaccaatgccaagggcag-gcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatt 203  Q
    | || ||||| |||||||| ||||| ||||  |  ||||||| | |  |  |  || ||||| ||||| |||||||| | ||| || ||||||||||| |    
22128947 aggccgagtattggtggactaatgctaaggcaaaagcttgagattggtgaagaggttgtgacttgggctaagttcaaagctgagtttttgaggaagtact 22129046  T
204 tcccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttc 303  Q
    | || || || |||||||| | |||||| || |||||  ||||  |||| ||||||| |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| |    
22129047 ttccagaggatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggttgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgc 22129146  T
304 gaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgtt 403  Q
     ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
22129147 aaggttttgttcgtacatcaatgctgaggatgcgatggtttcgaagtgtgtgaaatttgaaagtgggcttaggccggatatctatcagtatatgtgtgtt 22129246  T
404 caggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatg 458  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
22129247 taggagatcctagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 22129301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 456
Target Start/End: Original strand, 41214270 - 41214721
Alignment:
5 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgagg 104  Q
    ||||| ||||| | |||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||| ||  | ||||| |||||||||||  | || || || ||| | |||||||    
41214270 ggagctcagacataggtgcaaggaatggagaggatcttccgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtcaggttggctacccacatgcttgctgagg 41214369  T
105 aagcagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 204  Q
    | || ||||| |||| ||| ||||| ||||| || || ||| | |  || |  || ||||| ||||| | |||||||  ||| || ||||||||||  ||    
41214370 aggctgagtattggtagacgaatgctaaggggagactcgagatcggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaagactgagtttttgaggaagtcctt 41214469  T
205 cccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 304  Q
     || || || |||||||| |  ||||| || |||||  ||||  |||| ||||||| |||||| || ||||||||||| |||| |||||| ||||||| |    
41214470 tcctgaggatttgaggactagaaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtctgtggctgagtatgctgcgatgtttgaagagcttttg 41214569  T
305 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttc 404  Q
    ||||||||||| || || |||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
41214570 aggttttgtccgtatattaatgctgaagatgggatggtttcgaagtgtgtgaagttcgaaagtgggctcaggctggatatctatcagtatatgtgtgttc 41214669  T
405 aggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatga 456  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
41214670 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgcatgtttgatga 41214721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 348 - 458
Target Start/End: Original strand, 23312571 - 23312681
Alignment:
348 agtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtat 447  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
23312571 agtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggatatctatcagtatatgtgtgttcatgagatccgagattttgatactttggtgcataagtgtcgtat 23312670  T
448 gtttgatgatg 458  Q
    |||||||||||    
23312671 gtttgatgatg 23312681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 262 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 20172824 - 20172643
Alignment:
262 catgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcgaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagttt 361  Q
    |||||| || || |||||||| || |||||||||||| | ||  |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| || |||||| ||||| ||    
20172824 catgtctgttgcggagtatgccgccaagtttgaggagatatcctggttttgtcccttcatcaatattgaggatgctatggtgtctaagtgtgtgaaggtt 20172725  T
362 gagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtc 443  Q
    |||||||| || || || || ||  ||||||| || ||  |||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
20172724 gagagtggtctgagtcccgagattcatcagtacatctgctttcatgagatctgagattttgatactttgatgcacaagtgtc 20172643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 305 - 458
Target Start/End: Original strand, 21200280 - 21200433
Alignment:
305 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttc 404  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| || || ||  ||||||||||||  |   | || || || || |||| ||| || ||| |||    
21200280 aggttttgtccctacatcaatgcggaggatactatggtatcaaaatgcgtgaagtttgagaacgatttgagacccgagatttatccgtacatctgttttc 21200379  T
405 aggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatg 458  Q
    | |||||| | || |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
21200380 atgagatcagggattttgatacattggtgcacaagtgccgcatgtttgatgatg 21200433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 5 - 458
Target Start/End: Original strand, 12671 - 13124
Alignment:
5 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgagg 104  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
12671 ggagcacagacttgggtctaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactggcgactcatatgctagctgagg 12770  T
105 aagcagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 204  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||| || || |||||| ||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
12771 aagcagagcactggtgggctaatgccaaaggaagacttgagatgggaggtgatgtggtgaactgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 12870  T
205 cccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 304  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
12871 ccctgaagacttgaggaccaagaaggaaattgagtttctgaatctgaaacaaggaaacatgtctgtagccgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 12970  T
305 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttc 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||     
12971 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaaatgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatcaatcagtacatgtgtgttt 13070  T
405 aggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatg 458  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
13071 aggagatccgagattttgatactttggttcataagtgtcgtatgtttgatgatg 13124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 45 - 458
Target Start/End: Original strand, 1 - 414
Alignment:
45 gagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgaggaagcagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttga 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| || || |||||    
1 gagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactggcgactcatatgctagctgaggaagcagagcactggtgggctaatgccaaaggaagacttga 100  T
145 gttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttcccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctg 244  Q
    | ||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
101 gatgggaggtgatgtggtgaactgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttccctgaagacttgaggaccaagaaggaaattgagtttctg 200  T
245 aatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcgaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggttt 344  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
201 aatctgaaacaaggaaacatgtctgtagccgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcgaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggttt 300  T
345 cgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcg 444  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||    
301 cgaaatgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatcaatcagtacatgtgtgtttaggagatccgagattttgatactttggttcataagtgtcg 400  T
445 tatgtttgatgatg 458  Q
    ||||||||||||||    
401 tatgtttgatgatg 414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 323; Significance: 0; HSPs: 12)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 458
Target Start/End: Original strand, 15943174 - 15943624
Alignment:
8 gcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgaggaag 107  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
15943174 gcacagacttgggtgcaagggatggagcagattttccgagctatggttacaggagatgaccaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaag 15943273  T
108 cagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttccc 207  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
15943274 cggagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttggaaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttaaggaagtatttccc 15943373  T
208 ggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcgagg 307  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||| ||| |||| || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
15943374 ggaagacttgaggaccaagaatgagattgagtttctgaatctaaagcaaggaatcttgtcagtggccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcgagg 15943473  T
308 ttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttcagg 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
15943474 ttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatgatttcgaagtgcgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgtgtgttcagg 15943573  T
408 agatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatg 458  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
15943574 agatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 15943624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 5 - 459
Target Start/End: Original strand, 6149429 - 6149883
Alignment:
5 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgagg 104  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||    
6149429 ggagcacaaacttgggtgcagggtatggagcggattttccgagctatggtgacaggaggtgaccagaaggtcaggctagcgactcatatgcttgctgagg 6149528  T
105 aagcagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 204  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| || || |||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
6149529 aagcagagcactggtggactaatgccaaaggaagacttgagatgggaggtgatgtggtgacctgggcgaagtttaaggttgaattcttgaggaagtattt 6149628  T
205 cccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 304  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
6149629 ccctgaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaaggaagcatgtctgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggaactttcg 6149728  T
305 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttc 404  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
6149729 aggttttgcccctacatcaatgctgaggatgctatggttttgaagtatgtgaagtttgagagtgggcttaggccgaatatctatcagtacatgtgtgttc 6149828  T
405 aggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatgt 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
6149829 aggagatccgagactttgatactttggtgcattagtgttgtatgtttgatgatgt 6149883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 17202192 - 17201747
Alignment:
13 gacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgaggaagcagag 112  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||| ||| | ||||| |||||||| ||  | || ||||| ||| | |||||||| || |||    
17202192 gacttgggtgcagggcatggagaggatatttcgtgctatggtgacgagtgatgaacagaaggtgaggttggctactcacatgcttgctgaggaggccgag 17202093  T
113 tactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttcccggaag 212  Q
    || | |||||| ||||| ||||| || |||||| | |  || |  || ||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||| || ||||    
17202092 tattagtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcaaagttcaaagctgagttcttgaggaagtattttcctgaag 17201993  T
213 acttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcgaggttttg 312  Q
    | |||||||||| |||||| || ||||| |||||  |||| ||||||| ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
17201992 atttgaggaccaggaaggaagtggagttcctgaacttgaagcaagggagcatgtccatagctgtgtatgtggcgaagtttgaggagcttttgaggttttg 17201893  T
313 tccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttcaggagatc 412  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
17201892 tccgtacatcaatgctgaggatgcgatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggatatctatcagtatatgtgtgtttaggagatc 17201793  T
413 cgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatg 458  Q
    | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
17201792 ctagattttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 17201747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 8e-99
Query Start/End: Original strand, 100 - 458
Target Start/End: Original strand, 13964026 - 13964384
Alignment:
100 tgaggaagcagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaag 199  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || || |  || ||||| ||| | | |||||| | ||| || |||||||||    
13964026 tgaggaggctgagtattggtggaccaatgctaagggaagacttgagattgatggagaggttgtgacttggacaaggttcaaagctgagtttttgaggaag 13964125  T
200 tatttcccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagc 299  Q
    || || || || || |||||||| | |||||| || ||||| |||||| |||| |||||||  ||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
13964126 tactttccagaggatttgaggactaggaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtccgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggagc 13964225  T
300 tttcgaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtg 399  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
13964226 ttgcaaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtacatgtg 13964325  T
400 tgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatg 458  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
13964326 tgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 13964384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 30150897 - 30150468
Alignment:
29 atggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgaggaagcagagtactggtggaccaatg 128  Q
    |||||| |||| || || |||||||| ||  | ||||| |||||||| ||  | || ||||| ||| | |||||||| || ||||| |||||||||||||    
30150897 atggagaggatctttcgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtgaggttggctactcacatgcttgctgaggaggctgagtattggtggaccaatg 30150798  T
129 ccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttcccggaagacttgaggaccaagaa 228  Q
    | ||||| || |||||| | |  || |  || ||||| ||| | | |||||||| ||| || ||||||||||| || || || || |||||||| | |||    
30150797 ctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttggacaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactttccagaggatttgaggactaggaa 30150698  T
229 ggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcgaggttttgtccctacatcaatgct 328  Q
    ||| || ||||| |||||| |||| |||||||  ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||     
30150697 ggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtctgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgcaaggttttgtccctacatcaatgcg 30150598  T
329 gaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactt 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30150597 gaggatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactt 30150498  T
429 tggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatg 458  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
30150497 tggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 30150468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 98 - 458
Target Start/End: Original strand, 8271068 - 8271428
Alignment:
98 gctgaggaagcagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgagga 197  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |  || |  || ||||| ||| | | |||||||| ||| || |||||||    
8271068 gctgaggaggctgagtattggtggaccaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttggacaaggttcaaggctgagtttttgagga 8271167  T
198 agtatttcccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgagga 297  Q
    |||| || || || || |||||||| | |||||| || ||||| |||||| |||| |||||||  ||||| || || |||||||||||||||||||||||    
8271168 agtactttccagaggatttgaggactaggaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtccgtggccgagtatgcggcgaagtttgagga 8271267  T
298 gctttcgaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatg 397  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
8271268 gcttgcaaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcaaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggacatctatcagtacatg 8271367  T
398 tgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatg 458  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
8271368 tgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgaataagtgtcgtatgtttgatgatg 8271428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 5 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 25768779 - 25768423
Alignment:
5 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgagg 104  Q
    ||||| || |||||||||||||| || ||| |||| ||||| |||||||| ||| | |||||||| ||||||||| | |||||||||||| | |||||||    
25768779 ggagctcatacttgggtgcagggcatagagaggatattccgtgctatggtgacgagtgatgaccaaaaggtcagattggcgactcatatgcttgctgagg 25768680  T
105 aagcagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 204  Q
    | || ||  | |||||||| |||||||| || || |||||||||| ||| |  || ||||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||    
25768679 aggccgaacattggtggactaatgccaaaggaagacttgagttgggaggagaagttgtgacctgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtattt 25768580  T
205 cccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 304  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| || ||||||  |||||| |  |||||||||||||||||     
25768579 ccctgaagatttgaggaccaggaaggaggttgagtttctgaacttgaaacaaggaagcatatctgtagctacgtatgcagaaaagtttgaggagctttca 25768480  T
305 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagttt 361  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
25768479 aggttttgtccgtacatcaatgctgaagatgctatggtttcaaagtgtgtgaagttt 25768423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 62 - 458
Target Start/End: Original strand, 22149379 - 22149775
Alignment:
62 gatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgaggaagcagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtgg 161  Q
    |||||||||||||| ||  | || ||||||||| | |||||||| |||||||| | |||||| |||||||| || || |||||| |||| || |  ||||    
22149379 gatgaccagaaggttaggttggctactcatatgcttgctgaggaggcagagtattagtggactaatgccaaaggaagacttgagatggagggggaggtgg 22149478  T
162 tgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttcccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggat 261  Q
    |||| ||||| | ||||||||  || |||||||||||||||||  ||||||| |||||||| | ||||| ||| || ||  | ||  |||| ||||| |     
22149479 tgacttgggcaaggttcaaggccgagttcttgaggaagtatttttcggaagatttgaggacaaggaaggtggtagaattcttaaacttgaagcaaggaag 22149578  T
262 catgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcgaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagttt 361  Q
     ||||| || || |||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||  ||||||||||  ||| |||| ||||| || |||||| ||||||||    
22149579 tatgtctgtggccgagtatgcggcgaagtttgaagagtttgcaaggttttgtctgtacatcaatgtcgagaatgcaatggtgtccaagtgtgtgaagttt 22149678  T
362 gagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatg 458  Q
    |||||||||||| |||  ||  |||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
22149679 gagagtgggctttggctagatgtctatcagtacatgtgtgtgcaagagatccgtgattttgacactttggtgcacaagtgtcatatgtttgatgatg 22149775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 455
Target Start/End: Original strand, 17321176 - 17321620
Alignment:
11 cagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgaggaagcag 110  Q
    ||||| |||||||| || |||||| |||| ||||| |||||||| ||  | ||||| |||||||||||  | || |  || ||| | ||| |||| || |    
17321176 cagacatgggtgcaaggcatggagaggatcttccgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtcaggttggctaaccacatgcttgctaaggaggctg 17321275  T
111 agtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttcccgga 210  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| || || ||| | |  || |  || ||||| ||||| | |||||||||||| || ||||||||||| || || ||    
17321276 agtattggtggacgaatgctaaggggagactcgagataggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggttgagtttttgaggaagtactttccaga 17321375  T
211 agacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcgaggttt 310  Q
     || ||||| || |  ||||| || |||||  ||||  || |  |||||| |||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
17321376 ggatttgagaactagaaaggaagtggagttcttgaacttgcagtaagggagcatgtccgtggctgagtatgcagcaaagtttgaagagctttcgaggttt 17321475  T
311 tgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttcaggaga 410  Q
    |   | ||||| |||| ||||||||| ||||| || |||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
17321476 ttctcgtacattaatgttgaggatgcgatggtgtccaagtgtgtgaaatttgaaagtggacttaggccggatatctatcagtatatgtgtgttcaggaga 17321575  T
411 tccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatg 455  Q
    | ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
17321576 ttcgagagtttgataccttggtgcataagtgtcgtatgtttgatg 17321620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 5225013 - 5224953
Alignment:
5 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatg 65  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
5225013 ggagcatagacttgggtgcaggggatggagcggattttccaagctatggttacgggagatg 5224953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22260035 - 22259971
Alignment:
305 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgg 369  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||    
22260035 aggttttgtccttatatcaatgttgaagatgctatggtgtccaagtgtgttaagtttgagagtgg 22259971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 305 - 369
Target Start/End: Original strand, 22268464 - 22268528
Alignment:
305 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgg 369  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||    
22268464 aggttttgtccttatatcaatgttgaagatgctatggtgtccaagtgtgttaagtttgagagtgg 22268528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 320; Significance: 1e-180; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 8 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 22281668 - 22281217
Alignment:
8 gcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgaggaag 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
22281668 gcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactggcgactcatatgttgactgaggaag 22281569  T
108 cagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttccc 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22281568 cagagcactggtggaccaatgccaaaggaaggcttgagatgggaggtgatgtggtaacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttccc 22281469  T
208 ggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcgagg 307  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||| |||||||| ||||  |||||||| |||||||| ||||| ||||||| |    
22281468 gaaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttttgaatctgaagtaaggaatcatgtctgtagtcgagtatgcagcgaagttcgaggaactttcgaag 22281369  T
308 ttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttcagg 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||    
22281368 ttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatgatttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatttatcagtacatgtttgttcagg 22281269  T
408 agatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatgt 459  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
22281268 agatccgagacttttatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgt 22281217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 25132026 - 25131574
Alignment:
5 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgagg 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| || |||||| |||| ||||| |||||||| ||  | ||||| |||||||||||  |||| || || ||| | |||||||    
25132026 ggagctcagacatgggtgcaaggcatggagaggatcttccgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtcaggttagctacccacatgcttgctgagg 25131927  T
105 aagcagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 204  Q
    | || ||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||| | |  || |  || ||||| ||||| | |||||||  ||| || || |||||||| ||    
25131926 aggccgagtattggtggacaaatgctaaggggagactcgagatcggcggagaggttgtgacttgggcaaggttcaagactgagttttttaggaagtactt 25131827  T
205 cccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaa-gtttgaggagctttc 303  Q
     |  || || |||||||| |  ||||| || |||||  | ||  |||| |||||||  ||||| || |||||||||||| | || |||||||||||||||    
25131826 tcaagaggatttgaggactagaaaggaagtagagttcttaaacttgaagcaagggagtatgtccgtggctgagtatgcgacaaaagtttgaggagctttc 25131727  T
304 gaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgtt 403  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| ||  ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
25131726 gaggttttgtccgtacattaatgttgaggatgcgatggtgtcacagtgtgtgaaatttgaaagtggacttaggccggatatttatcagtatatgtgtgtt 25131627  T
404 caggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatga 456  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
25131626 caggagattcgagattttgataccttggtgcaaaagtgtcgtatgtttgatga 25131574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 29 - 458
Target Start/End: Original strand, 315 - 744
Alignment:
29 atggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgaggaagcagagtactggtggaccaatg 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| || |    
315 atggagcggattttccgagctatggttacgggagatgactagaaggtcaaacttgcaactcatatgctagctgaagaagcagagcactggtggacaaacg 414  T
129 ccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttcccggaagacttgaggaccaagaa 228  Q
    |||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
415 ccaaaggaaggcttgagttgggaggtgatgtggtgacctgggctacgttcaaggttgaattcttgaggaagtatttcccggaagacttgaggaccaagaa 514  T
229 ggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcgaggttttgtccctacatcaatgct 328  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||     
515 ggagattgagtttctaaatctgaagcaaggaatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcgaggttttgtctctacatcaatgcg 614  T
329 gaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactt 428  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
615 gaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactt 714  T
429 tggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatg 458  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
715 tggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 4)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 5 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 23509524 - 23509071
Alignment:
5 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgagg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||    
23509524 ggagcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactggcgactcatatgttgactgagg 23509425  T
105 aagcagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 204  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
23509424 aagcagagcactggtggaccaatgccaaaggaaggcttaagttgggaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 23509325  T
205 cccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 304  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||  || ||| || |||||| ||||| |||| |    
23509324 ccccgaagacttgaggaccaagaaggcgattgagtttctgaatctgaagcaaggaatcatgtctgtagccaagcatgtggtgaagttcgaggaacttttg 23509225  T
305 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttc 404  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
23509224 aggttttgtccatacatcaatgctaaggatgctatgatttcgaagtgtgcgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgtgtgttc 23509125  T
405 aggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatg 458  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
23509124 aggagatccgagactttgatactttgatgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 23509071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 24585049 - 24584596
Alignment:
5 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgagg 104  Q
    ||||| ||||| ||| |||| || |||||| |||| || || |||||||| ||  | ||||| |||||||| ||  | || ||||| ||| | |||||||    
24585049 ggagctcagacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtgaggttggctactcagatgcttgctgagg 24584950  T
105 aagcagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 204  Q
    | || ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | || || |  || ||||| ||| | | ||||||   ||| || ||||||||||| ||    
24584949 aggctgagtattggtggaccaatgctaagggaagacttgagattgatggagaggttgtgacttggacaatgttcaaaactgagtttttgaggaagtactt 24584850  T
205 cccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 304  Q
     || || || |||||||| | |||||| || ||||| |||||| |||| |||||||  ||||| || || |||||||||||||||||| |||||||| |     
24584849 tccagaggatttgaggactaggaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtccgtggccgagtatgcggcgaagtttaaggagcttgca 24584750  T
305 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttc 404  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||    
24584749 aggttttgtccctacatcaatgttgaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagttggagagtgggcttaggtcggatatctatcagtacatgtgtgttc 24584650  T
405 aggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatg 458  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
24584649 aggagatccgagagtttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 24584596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 21828655 - 21828202
Alignment:
5 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgagg 104  Q
    ||||| ||||| ||| |||| || |||||| |||| ||||| |||||||| ||  | ||||| |||||||||||  | || || || ||| | |||||||    
21828655 ggagctcagacatggctgcaaggcatggagaggatcttccgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtcaggttggctacccacatgcttgctgagg 21828556  T
105 aagcagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 204  Q
    |||| ||||  |||||||| ||||| ||||| || |||||| | |  || |  || ||||| ||||| | |||||||   || || |||| ||| || ||    
21828555 aagctgagttttggtggactaatgctaaggggagacttgaggtcggtggagaggttgtgacttgggctaggttcaagaccgagtttttgatgaaatactt 21828456  T
205 cccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 304  Q
     || || || |||||||| |  ||||| || |||||  ||||  ||||  ||||||  ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
21828455 tcctgaggatttgaggactagaaaggaagtggagttcttgaacttgaagtaagggagtatgtctgtcgctgagtatgcagcaaagtttgaggagctttcg 21828356  T
305 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttc 404  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
21828355 aggttttgtacgtacattaatgctgaagatgcgatggtttcgaagtgtgtgaagttcgaaagtgggcttaggccggatatctatcagtatatgtgtgttc 21828256  T
405 aggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatgt 459  Q
    |||||||  |||| || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
21828255 aggagattagagatttcgat-ctttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgt 21828202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 262 - 333
Target Start/End: Original strand, 33314011 - 33314082
Alignment:
262 catgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcgaggttttgtccctacatcaatgctgagga 333  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
33314011 catgtcagtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcgaggttttgtccgtacattaatgcagagga 33314082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 317; Significance: 1e-179; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 5 - 433
Target Start/End: Original strand, 7776 - 8204
Alignment:
5 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgagg 104  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
7776 ggagcacagacttgggtgtaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcaaactagcgactcatatgctagctgagg 7875  T
105 aagcagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 204  Q
    ||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
7876 aagcatagcactagtggaccaatgccaaaggcaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctatgttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 7975  T
205 cccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 304  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||| |    
7976 cccggaagacttgagggccaagaaggagatgaagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgtggcgaagttcgaggaacttttg 8075  T
305 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttc 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
8076 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatgatttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgcgcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttc 8175  T
405 aggagatccgagactttgatactttggtg 433  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||    
8176 aggagatcccagactttgatattttggtg 8204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 304; Significance: 1e-171; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 8 - 458
Target Start/End: Original strand, 130829 - 131282
Alignment:
8 gcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgaggaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
130829 gcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttctgagctattgttacggaagatgaccaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaag 130928  T
108 cagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttccc 207  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
130929 cagagcactagtggaccaatgccaagggaaggcttgaattgggagatgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttccc 131028  T
208 ggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgagga---gctttcg 304  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||    ||||||    
131029 tgaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaagcaaggaatcatgtctgtggccgagtatgcggcgaagttcgaggaattactttcg 131128  T
305 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttc 404  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
131129 aggttctgtccctacattaatgttgaggatgctatgatttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgtgtgttc 131228  T
405 aggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatg 458  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
131229 aagagatccgagactttgatactttagtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 131282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 302; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 5 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 27740 - 27287
Alignment:
5 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgagg 104  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
27740 ggagcacaaacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctacggtcacgagagatgaccagaaggtcagactagcgacttatatgcttgctgagg 27641  T
105 aagcagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 204  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||| || || |||||| ||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||    
27640 aagcaaagcactggtggactaatgccaaaggaagacttgagatgggaggtgatgtggggacctgggctaagttcaaagtcaaattcttgaggaagtattt 27541  T
205 cccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 304  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
27540 ccctgaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaaggaagcatgtctgtagccgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 27441  T
305 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttc 404  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||    
27440 aggttttgtccctatatcaatgctgaggatgctgtggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtggacttaggccggatatctatcaatacatgtgtgttc 27341  T
405 aggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatg 458  Q
    || |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
27340 agtagatcctagacttttatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 27287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 5 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 26142 - 25689
Alignment:
5 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgagg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||    
26142 ggagcacagacttgggtgcagggtatggggtggattttccgagctatggtgacaggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgcttgttgagg 26043  T
105 aagcagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 204  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||| || || |||||| ||| ||||  ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
26042 aagcagagcactggtggactaatgccaaaggaagacttgagatgggaggtaatgtggtgacttgggctaagttcaaagttgaattcttg-ggaagtattt 25944  T
205 cccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 304  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||    
25943 ccctgaagacttgagaactaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaaggaagcatgtttgtagccgagtatgcggcgaagtttaagaagctttcg 25844  T
305 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttc 404  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
25843 aggttttgtccttacatcaatgctgaagatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtatatgtgtgttg 25744  T
405 aggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatgt 459  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
25743 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgt 25689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 300; Significance: 1e-168; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 5 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 3675 - 3215
Alignment:
5 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgagg 104  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
3675 ggagcacaaacttgggtgcagggtatggagcggattttccgagctatggtgacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgcttgctgagg 3576  T
105 aagcagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 204  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||| || || |||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| | | |||| ||||||||||||||    
3575 aagcagagaactagtggactaatgccaaaggaagacttgagatgggaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaagcttaattattgaggaagtattt 3476  T
205 cccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 304  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
3475 ccctgaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaaggaagcatgtctgtagccgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 3376  T
305 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttc 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |    
3375 aggttttgtccctacatcaatgctgaagatgatatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtatatgtgtatcc 3276  T
405 aggagatccgagact--------ttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgat 457  Q
    | |||||||||||||        |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
3275 aagagatccgagactttgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgttgat 3215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 8 - 459
Target Start/End: Original strand, 8732 - 9175
Alignment:
8 gcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgaggaag 107  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| |    
8732 gcacagacttggatgcagggtatggagcggattttccgagctatggttacggaagatgaccagaaggtcaggctagcgactcatatgttgactgaggagg 8831  T
108 cagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttccc 207  Q
    ||||| |||||||||| |  ||||| || || | |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
8832 cagagcactggtggactagcgccaaaggaagacatgagttgggaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttccc 8931  T
208 ggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcgagg 307  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||    
8932 tgaagacttgaggaccaataaggaggttgagtttctgaatctgaaacaaggaagcatgtctgtagccgagtatgcggcgaagtttgaggagctgtctagg 9031  T
308 ttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttcagg 407  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||| |||    
9032 ttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtggacttaggccggatatctatcaatacatgtgtgttaagg 9131  T
408 agatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatgt 459  Q
    |||||        ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
9132 agatc--------tgagactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgt 9175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 5 - 458
Target Start/End: Original strand, 4711 - 5163
Alignment:
5 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgagg 104  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||    
4711 ggagcacgaacttgggtgcagggcatggaacagattttctgagctgtggtcacaggagatgaccagaaggtcagactggcgactcaaatgcttgctgagg 4810  T
105 aagcagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 204  Q
    |||||||| ||| || ||| |||| ||| || ||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
4811 aagcagagcactagttgactaatgtcaaaggaagg-ttgagatgggaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaattctagaggaagtattt 4909  T
205 cccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 304  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||| | ||||    
4910 ccctgaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtctttcgccgagtatgcggcgaagtttgaggaaccttcg 5009  T
305 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttc 404  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |    
5010 aggttttgcccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttagaccggatatctatcagtacatgtgtgtcc 5109  T
405 aggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatg 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
5110 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 5163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 5 - 458
Target Start/End: Original strand, 3266 - 3719
Alignment:
5 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgagg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |  ||||||    
3266 ggagcacagacttgggtgcagggcatggagcggatattccatgctatggtgacgggagatgaccagaaggttagattggcgactcatatgcttactgagg 3365  T
105 aagcagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 204  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||||| || |||||  ||| |||||  || ||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||    
3366 aagcggagcactggtggactaatgccaagggaagacttgatatgggaggtgaagttgtgacctgggaaaagttcaaagctgaattcttgaggaagtattt 3465  T
205 cccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 304  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
3466 ccctgaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttttgaatctgaaacaaggaagcatgtctatagccgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 3565  T
305 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttc 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |    
3566 aggttttgtccctacatcaatgctgaagatgttatggtttcgaagtgtgtgaagtttgatagtgggcttaggccagatatctatcagtacatgtgtgtcc 3665  T
405 aggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatg 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
3666 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 3719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 5 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 97489 - 97038
Alignment:
5 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgagg 104  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||||    
97489 ggagcccagacttgggtacagagcatggagcggatattccgtgctatggtgacgggagatgaccagaaggtcagattggcgactcatatgcttgctgagg 97390  T
105 aagcagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 204  Q
    |||| ||| | |||||||| ||||||||  | || |||||||| |  |  |  || ||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||| |||||    
97389 aagctgagcagtggtggactaatgccaaaagaagacttgagtttggtgaagaagttgtgacctggacaaagttcaaagctgaattcttgaggaaatattt 97290  T
205 cccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 304  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
97289 ccctgaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttttgaatctgaaacaaggaagcatgtctgtagccgagtatgaggcgaagtttgaggagctttcg 97190  T
305 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttc 404  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||    
97189 aggttttgtccgtacatcaatgttgaagatgttatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtatat--gtgttc 97092  T
405 aggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatg 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
97091 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 97038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 5 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 9121 - 8667
Alignment:
5 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgagg 104  Q
    |||||||| || ||||||||||| | ||||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||| |||| | | |||||    
9121 ggagcacaaacgtgggtgcagggcacggagcggatattcggtgctatggtgacgggaggtgatcagaaggtcaaactggcgactcgtatgcttgttgagg 9022  T
105 aagcagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 204  Q
    |||| ||| |||  ||||| |||||||| || ||  ||||| ||| ||||   || ||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||    
9021 aagctgagcactattggactaatgccaaaggaagaattgagatgggaggtaaagttgtgacctgggcgaagttcaaagctgaattcttgatgaagtattt 8922  T
205 cccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 304  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
8921 ccctgaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaaggaagcatgtctgtagccgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 8822  T
305 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttc 404  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||| |    
8821 aggttttatccgtacatcaatgctaaagatgctatggtttcgaagtgtgtaaagtttgaaagtgggcttaggccgaatatttatcagtatttgtgtgtcc 8722  T
405 aggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatgt 459  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
8721 aggagatccgagactttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatgt 8667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 151 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 91320 - 91013
Alignment:
151 aggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttcccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctg 250  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
91320 aggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttccctgaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctg 91221  T
251 aaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcgaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagt 350  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
91220 aaacatgggatcatgtctgtagccgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcgaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctaagatttcgaagt 91121  T
351 gtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtt 450  Q
     | ||||||||||||||||||||||| || | |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
91120 atgtgaagtttgagagtgggcttaggacgaaaatctatcaataaatgtgtgttcaggagatcagagactttgaaactttggtgcataagtgtcgtatgtt 91021  T
451 tgatgatg 458  Q
    ||||||||    
91020 tgatgatg 91013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 98 - 456
Target Start/End: Original strand, 20309 - 20667
Alignment:
98 gctgaggaagcagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgag-ttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgagg 196  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||| ||||  | | | |||||| | ||||| | |||||||| ||| || ||||||    
20309 gctgaggaggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggatag-gtggtgccttgggctaggttcaaggctgagtttttgagg 20407  T
197 aagtatttcccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgagg 296  Q
    ||||| || || || || |||||||| | |||||| || |||||  ||||  |||| |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
20408 aagtactttccagaggatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagtatgtccgtggctgagtatgcggcgaagtttgagg 20507  T
297 agctttcgaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatat 396  Q
    |||||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
20508 agcttgtgaggttttgtccgtacattaatgctaaggatgcgatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggatatctaccagtatat 20607  T
397 gtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatga 456  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
20608 gtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcataggtgtcatatgtttgatga 20667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 98 - 456
Target Start/End: Original strand, 29885 - 30243
Alignment:
98 gctgaggaagcagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgag-ttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgagg 196  Q
    |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||| ||||  | | | |||||| | ||||| | |||||||| ||| || ||||||    
29885 gctgaggaggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggatag-gtggtgccttgggctaggttcaaggctgagtttttgagg 29983  T
197 aagtatttcccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgagg 296  Q
    ||||| || || || || |||||||| | |||||| || |||||  ||||  |||| |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
29984 aagtactttccagaggatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagtatgtccgtggctgagtatgcggcgaagtttgagg 30083  T
297 agctttcgaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatat 396  Q
    |||||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
30084 agcttgtgaggttttgtccgtacattaatgctaaggatgcgatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggatatctaccagtatat 30183  T
397 gtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatga 456  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
30184 gtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcataggtgtcatatgtttgatga 30243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 2)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 164 - 458
Target Start/End: Original strand, 12124 - 12418
Alignment:
164 acctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttcccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatca 263  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
12124 acctgggctaagttcaaggttgaattattgaggaagtatttccccgaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaaggaatca 12223  T
264 tgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcgaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttga 363  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
12224 tgtctgtagccgagtatgcggcgaagttcgagcaactttcgaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatgatttcgaagtgtgtgaagtttga 12323  T
364 gagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatg 458  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
12324 gagtgggcttaggccagatatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 12418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 5 - 127
Target Start/End: Original strand, 11999 - 12121
Alignment:
5 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgagg 104  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||    
11999 ggagcacggacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactggcgactcatatgttgactgagg 12098  T
105 aagcagagtactggtggaccaat 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
12099 aagcagagcactggtggaccaat 12121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 178; Significance: 8e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 85 - 458
Target Start/End: Original strand, 4226 - 4599
Alignment:
85 gactcatatgttagctgaggaagcagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggtt 184  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||| | |  || |  || ||||| |||   | |||||||| |    
4226 gactcacatggtagctaaggaagcagagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggggaggttgtgacttggataaggttcaaggct 4325  T
185 gaattcttgaggaagtatttcccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcgg 284  Q
    || || ||||||||||| || || || || ||||| || | |||||| || ||||| |||||| |||| |||||||  ||||| || || ||||||||||    
4326 gagtttttgaggaagtactttccagaggatttgagaactaggaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtctgtggccgagtatgcgg 4425  T
285 cgaagtttgaggagctttcgaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacat 384  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
4426 cgaagtttgaggagcttgcaaggttttgtccctacatcaatgcggaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggacat 4525  T
385 ctatcagtatatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatg 458  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
4526 ctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 4599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 178; Significance: 8e-96; HSPs: 8)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 458
Target Start/End: Original strand, 27104144 - 27104573
Alignment:
29 atggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgaggaagcagagtactggtggaccaatg 128  Q
    |||||| |||| || || |||||||| ||  | ||||| |||||||| ||  | || ||||| ||| | |||||||| || ||||| |||||||||||||    
27104144 atggagaggatctttcgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtgaggttggctactcacatgcttgctgaggaggctgagtattggtggaccaatg 27104243  T
129 ccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttcccggaagacttgaggaccaagaa 228  Q
    | ||||| || |||||| | |  || |  || ||||| ||| | | |||||||| ||| || ||||||||||| || || || || |||||||| | |||    
27104244 ctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttggacaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactttccagaggatttgaggactaggaa 27104343  T
229 ggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcgaggttttgtccctacatcaatgct 328  Q
    ||| || ||||| |||||| |||| |||||||  ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||     
27104344 ggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtctgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgcaaggttttgtccctacatcaatgcg 27104443  T
329 gaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactt 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
27104444 gaggatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactt 27104543  T
429 tggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatg 458  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
27104544 tggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 27104573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 98 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 27174112 - 27173752
Alignment:
98 gctgaggaagcagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgagga 197  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||| | |  || |  || ||||| ||| | | |||||||| ||| || |||||||    
27174112 gctgaggaggctgagtattggtggaccaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttggacaaggttcaaggctgagtttttgagga 27174013  T
198 agtatttcccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgagga 297  Q
    |||| || || || || |||||||| | |||||| || ||||| |||||| |||| |||||||  ||||| || || |||||||||||||||||||||||    
27174012 agtactttccagaggatttgaggactaggaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtctgtggccgagtatgcggcgaagtttgagga 27173913  T
298 gctttcgaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatg 397  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
27173912 gcttgcaaggttttgtccctacatcaatgcggaggatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggacatctatcagtacatg 27173813  T
398 tgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatg 458  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
27173812 tgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 27173752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 29 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 7827800 - 7827371
Alignment:
29 atggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgaggaagcagagtactggtggaccaatg 128  Q
    |||||| |||| || || |||||||| ||  | ||||| |||||||| ||  | || ||||| ||| | |||||||| || ||||| |||||||||||||    
7827800 atggagaggatctttcgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtgaggttggctactcacatgcttgctgaggaggctgagtattggtggaccaatg 7827701  T
129 ccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttcccggaagacttgaggaccaagaa 228  Q
    | ||||| || |||||| | |  || |  || ||||| ||| | | |||||||| ||| || ||||||||||| || || || || |||||||| | |||    
7827700 ctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttggacaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactttccagaggatttgaggactaggaa 7827601  T
229 ggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcgaggttttgtccctacatcaatgct 328  Q
    ||| || ||||| |||||| |||| |||||||  ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||     
7827600 ggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtctgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgcaaggttttgcccctacatcaatgcg 7827501  T
329 gaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactt 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
7827500 gaggatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactt 7827401  T
429 tggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatg 458  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
7827400 tggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 7827371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 249 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 4443603 - 4443392
Alignment:
249 tgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcgaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaa 348  Q
    |||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||| |||| ||||||||| ||||| || ||    
4443603 tgaagcaagggagcatgtctgtggctgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgcgaggttttatgcgtacattaatgttgaggatgcaatggtgtccaa 4443504  T
349 gtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatg 448  Q
    |||| |||| ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
4443503 gtgtgtgaaatttgaaagtggacataggccggatatctatcagtatatgtgtgttaaggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatg 4443404  T
449 tttgatgatgtc 460  Q
    ||||||||||||    
4443403 tttgatgatgtc 4443392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 191 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 13459749 - 13459484
Alignment:
191 ttgaggaagtatttcccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagt 290  Q
    |||||||||||||| || || || ||||||| || |||||| || || ||  ||||  |||| ||||||| | |||| ||  || ||||||| || ||||    
13459749 ttgaggaagtattttccagaggatttgaggagcaggaaggaagtggaattcttgaacttgaagcaagggagcttgtctgtcactaagtatgctgcaaagt 13459650  T
291 ttgaggagctttcgaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatca 390  Q
    ||||||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||  || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| || ||| ||||||||    
13459649 ttgaggaacttccgaggttttatccctacattaatgtcgaagatgcaatggtttcgaagtgtgtgaagtttgaacgtgggcttaagctggatatctatca 13459550  T
391 gtatatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatga 456  Q
    |||| |||||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
13459549 gtatgtgtgtgtttaggatattagagacttcgatactttggtgcacaagtgtcgtatattcgatga 13459484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 106
Target Start/End: Original strand, 16575119 - 16575220
Alignment:
5 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgagg 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||  || ||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||    
16575119 ggagcacagacttaggtgcagggcatggagcggatattccatgccatggtgatgggagatgaccagaaggtcagactggcaactcatatgcttgctgagg 16575218  T
105 aa 106  Q
    ||    
16575219 aa 16575220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 16590543 - 16590442
Alignment:
5 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgagg 104  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||  || ||||| | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||    
16590543 ggagcacagacttaggtgcagggcatggagcggatattccatgccatggtgatgggagatgaccagaaggtcagactggcaactcatatgcttgctgagg 16590444  T
105 aa 106  Q
    ||    
16590443 aa 16590442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 354 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 14218629 - 14218525
Alignment:
354 tgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttga 453  Q
    |||||||||||| ||| || ||||| || || || ||||| || ||| | || |||||| | || || ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
14218629 tgaagtttgagaatggtctgaggccagagatttaccagtacatttgtttgcatgagatcagggatttcgatactttggtgcacaagtgttgcatgtttga 14218530  T
454 tgatg 458  Q
    |||||    
14218529 tgatg 14218525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 163; Significance: 7e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 3374 - 3168
Alignment:
5 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgagg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||    
3374 ggagcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggttagactggcgactcatatgttgactgagg 3275  T
105 aagcagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 204  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
3274 aagcagagcattggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 3175  T
205 cccggaa 211  Q
    |||||||    
3174 cccggaa 3168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 410 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 1770 - 1722
Alignment:
410 atccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatg 458  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
1770 atccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 1722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 232 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 16638 - 16412
Alignment:
232 ggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcgaggttttgtccctacatcaatgctgag 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||  ||||    
16638 ggttgagtttctgaatctgaaacaaggaagcatgtctgtagccgagtatgcggcgaagtttcaggagctgtctaggttttgtccctacatcaatcttgag 16539  T
332 gatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttgg 431  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
16538 gatgctatggtttcgaagcgtgtgaagtttgagagtggacttgggccggatatctatcagtacatgtgtgttcaagagatccgagactttgatactttgg 16439  T
432 tgcacaagtgtcgtatgtttgatgatg 458  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
16438 tgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 16412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 16753 - 16637
Alignment:
5 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgagg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||     
16753 ggagcacagacttgggtgcagggtatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccataaggtcagactagcaactcatatgctaggtgaga 16654  T
105 aagcagagtactggtgg 121  Q
    | || ||| ||||||||    
16653 aggcggagcactggtgg 16637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 148; Significance: 6e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 279 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 24653 - 24474
Alignment:
279 atgcggcgaagtttgaggagctttcgaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggcc 378  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
24653 atgcggcgaagtttgaggagcttgcaaggttttgcccctacatcaatgcggaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggcc 24554  T
379 ggacatctatcagtatatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatg 458  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
24553 ggacatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 24474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 191
Target Start/End: Original strand, 73065 - 73251
Alignment:
5 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgagg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
73065 ggagcacagacttgggtgcagggtatagcgcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgctagccgagg 73164  T
105 aagcagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattct 191  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
73165 aagcagagcactggtggactaacgccaaaggaaggcttgagttgggaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaattct 73251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 5 - 191
Target Start/End: Original strand, 77446 - 77632
Alignment:
5 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgagg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
77446 ggagcacagacttgggtgcagggtatagcgcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgctagccgagg 77545  T
105 aagcagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattct 191  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
77546 aagcagagcactggtggactaacgccaaaggaaggcttgagttgggaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaattct 77632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 311 - 458
Target Start/End: Original strand, 77661 - 77808
Alignment:
311 tgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttcaggaga 410  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
77661 tgtccctacttcaatgttgaggacgctatgatctcgaagtgtgtgaattttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgtgtgttcaggaga 77760  T
411 tccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatg 458  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
77761 tccgagactttgatactttggtgcacaaatgtcgtatgtttgatgatg 77808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 311 - 458
Target Start/End: Original strand, 73280 - 73427
Alignment:
311 tgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttcaggaga 410  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
73280 tgtccctacttcaatgttgaggacgctatgatctcgaagtgtgtgaattttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgtgtgttcaggaga 73379  T
411 tccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatg 458  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
73380 tccgagactttgatactttggtgcaaaaatgtcgtatgtttgatgatg 73427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 344 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 182615 - 182500
Alignment:
344 tcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtc 443  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
182615 tcgaagtgtttgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctattagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtc 182516  T
444 gtatgtttgatgatgt 459  Q
    ||||||||||||||||    
182515 gtatgtttgatgatgt 182500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 162 - 459
Target Start/End: Original strand, 25197 - 25494
Alignment:
162 tgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttcccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggat 261  Q
    |||| ||||| |||||||| | ||| || ||||||||||| || || || || || ||||| | |||||| || |||||  ||||  |||| |||||||     
25197 tgacttgggctaagttcaaagctgagtttttgaggaagtactttccagaggatttaaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggag 25296  T
262 catgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcgaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagttt 361  Q
    |||||  || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||   |||||||    
25297 catgttcgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggagcttccgaggttttgtccgtacatcaatgctgaggatgcgatggtttccaagtgcgcgaagttt 25396  T
362 gagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatgt 459  Q
    || |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
25397 gaaagtgggattaggccggatgtctatcagtatatgtgtgttcaagagattcaagattttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgt 25494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 128; Significance: 6e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 5 - 456
Target Start/End: Original strand, 35513 - 35963
Alignment:
5 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgagg 104  Q
    ||||| ||||| |||||||| || |||||| |||| ||||| |||||||| ||  | ||||| |||||||||||  | || || || ||| | |||||||    
35513 ggagctcagacatgggtgcaaggcatggagaggatcttccgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtcaggttggctacccacatgcttgctgagg 35612  T
105 aagcagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggaaggtggtgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 204  Q
    |||| ||||  |||||||| ||||| ||||| || |||||| | |  || |  || ||||| ||||| | |||||||   || || |||| ||| || ||    
35613 aagctgagttttggtggactaatgctaaggggagacttgaggtcggtggagaggttgtgacttgggctaggttcaagaccgagtttttgacgaaatactt 35712  T
205 cccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 304  Q
     || || || ||||| || |  ||||| || |||||  ||||| |||| |||||||  ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
35713 tcctgaggatttgagtactagaaaggaagtggagttcttgaatttgaagcaagggagtatgtctgtggctgagtatgcagcaaagtttgaggagctttcg 35812  T
305 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttc 404  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
35813 aggttttgtccatacattaatgctgaagatgcgatggtttcgaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttagcccggatatctatcagtatatgtgtgttc 35912  T
405 aggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatga 456  Q
    |||||||  |||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
35913 aggagattagagatttcgat-ctttggtgcataagtgtcgtatgtttgatga 35963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 161 - 458
Target Start/End: Original strand, 5509 - 5806
Alignment:
161 gtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttcccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaaggga 260  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||| || |||||||| || || || || || ||||| || |  ||||| || |||||  ||||  |||| |||||||    
5509 gtgacttgggcaaggttcaaggttgagtttttgaggaaatactttccagaggatttgagaactagaaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaaggga 5608  T
261 tcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcgaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtt 360  Q
     |||||| || |||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||    
5609 gcatgtcagtggctgagtatgcgccaaagtttgaagagctttcgtggttttgtccgtatattaatgttgaagatgcaatggtttcgaagtgtgtgaagtt 5708  T
361 tgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatg 458  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
5709 tgaaagtgggcttaggccggatatctatcagtatatgtgtgttcaggagatttgagattttgatatcttggtgcataagcgtcgtatgtttgaagatg 5806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 191 - 456
Target Start/End: Original strand, 32401 - 32665
Alignment:
191 ttgaggaagtatttcccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagt 290  Q
    ||||||||||| || || || || ||||||||  |||| || || |||||  ||||  |||| ||||||| |||||  || |||||||||||||| || |    
32401 ttgaggaagtactttccagaggatttgaggactcagaaagaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgttcgtggctgagtatgcggcaaaat 32500  T
291 ttgaggagctttcgaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatca 390  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||| ||||||||  ||| | || |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
32501 ttgaggagcttgcgaggttttgttcgtacattaatgttgaggatgtgatg-tgtccaagtgtgtgaattttgaaagtgggcttaggccggatatctatca 32599  T
391 gtatatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatga 456  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
32600 gtatatgtgtgtttaggagatccaagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatga 32665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 354 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 35691 - 35587
Alignment:
354 tgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttga 453  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
35691 tgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttga 35592  T
454 tgatg 458  Q
    |||||    
35591 tgatg 35587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 91; Significance: 7e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 298 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 4161 - 3999
Alignment:
298 gctttcgaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatg 397  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||| || |||||||||||     
4161 gctttccaggttttgcccgtacatcaatgcggaggatgttatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtaggcttaggctggatatgtatcagtatatt 4062  T
398 tgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatgtc 460  Q
    ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
4061 tgtgtccaggagatcgaagattttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgtc 3999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 287 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 78103 - 77934
Alignment:
287 aagtttgaggagctttcgaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatct 386  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||  | ||||| || || |    
78103 aagtttgaggagctatcaaggttttgtcgctacattaatgttgaggatgctatggtgtcgaaatgtgtgaagtttgagagtggattgaggcccgagattt 78004  T
387 atcagtatatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatga 456  Q
    |||||||||| ||  |||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
78003 atcagtatatctgctttcatgagatttgtgactttgatactttggtgcacaagtgtcgcctgtttgatga 77934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 249 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 2296 - 2182
Alignment:
249 tgaaacaagggatcatgtcggtagctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcgaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaa 348  Q
    |||| ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||| ||||| |||||||||||    
2296 tgaagcaagggagcatgtccgtggctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcgaggatttgtccgtacattaatgttgaagatgcgatggtttcgaa 2197  T
349 gtgtctgaagtttga 363  Q
    |||| ||||||||||    
2196 gtgtgtgaagtttga 2182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 287 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 49341 - 49170
Alignment:
287 aagtttgaggagctttcgaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtctgaagtttgagagtgggcttaggccggacatct 386  Q
    ||||| |||||| | |||| |||||| || ||||| |||| ||||||||||||| | || || ||| ||||||||||||||||  | ||||| || || |    
49341 aagttcgaggagttgtcgatgttttgcccgtacattaatgttgaggatgctatgatatctaaatgtgtgaagtttgagagtggtttgaggcctgagattt 49242  T
387 atcagtatatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttgatgatg 458  Q
    |||| || || ||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
49241 atcaatacatctgttttcatgagatcagagattttgatactttggtgcacaagtgtcacatgtttaatgatg 49170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 4221 times since January 2019
Visitors: 4829