View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0759_low_111 (Length: 227)

Name: NF0759_low_111
Description: NF0759
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0759_low_111
NF0759_low_111
[»] chr7 (73 HSPs)
chr7 (1-227)||(34200791-34201017)
chr7 (1-227)||(11995917-11996143)
chr7 (1-227)||(28505188-28505414)
chr7 (1-227)||(15754776-15755003)
chr7 (64-227)||(16495407-16495570)
chr7 (55-227)||(44014183-44014354)
chr7 (67-216)||(16219670-16219822)
chr7 (67-227)||(67750-67911)
chr7 (67-227)||(811084-811247)
chr7 (67-227)||(18005651-18005813)
chr7 (67-227)||(47831812-47831975)
chr7 (67-227)||(22072918-22073083)
chr7 (67-216)||(16056344-16056495)
chr7 (117-216)||(2280125-2280224)
chr7 (155-227)||(16386292-16386364)
chr7 (117-227)||(3564370-3564480)
chr7 (47-227)||(13647330-13647513)
chr7 (57-213)||(20220132-20220290)
chr7 (48-216)||(12901339-12901511)
chr7 (57-225)||(19486686-19486858)
chr7 (117-227)||(38227486-38227595)
chr7 (131-222)||(10063838-10063929)
chr7 (117-227)||(18456419-18456528)
chr7 (134-227)||(40443396-40443488)
chr7 (129-210)||(12255809-12255892)
chr7 (155-227)||(12698836-12698907)
chr7 (57-216)||(1867937-1868100)
chr7 (134-227)||(9509194-9509287)
chr7 (162-227)||(27847881-27847946)
chr7 (117-223)||(26212005-26212111)
chr7 (117-227)||(48273394-48273504)
chr7 (64-227)||(17061909-17062075)
chr7 (155-227)||(10589044-10589115)
chr7 (48-216)||(14044762-14044935)
chr7 (48-216)||(14354792-14354965)
chr7 (57-209)||(15008441-15008597)
chr7 (64-227)||(456323-456489)
chr7 (64-227)||(11393281-11393447)
chr7 (64-227)||(11972498-11972664)
chr7 (64-227)||(14949116-14949282)
chr7 (64-227)||(15376707-15376873)
chr7 (64-227)||(16232522-16232688)
chr7 (64-227)||(18430714-18430880)
chr7 (64-227)||(18640274-18640440)
chr7 (64-227)||(20385117-20385283)
chr7 (64-227)||(21189589-21189755)
chr7 (64-227)||(24702240-24702406)
chr7 (64-227)||(32125493-32125659)
chr7 (64-227)||(41522919-41523085)
chr7 (64-227)||(41525381-41525547)
chr7 (117-225)||(24275175-24275282)
chr7 (179-227)||(3386335-3386383)
chr7 (179-227)||(13869348-13869396)
chr7 (179-227)||(16213686-16213734)
chr7 (179-227)||(16410061-16410109)
chr7 (179-227)||(20110558-20110606)
chr7 (179-227)||(24704690-24704738)
chr7 (117-227)||(44116511-44116620)
chr7 (64-227)||(27216862-27217028)
chr7 (160-206)||(48991206-48991252)
chr7 (170-227)||(13831375-13831431)
chr7 (179-216)||(15144105-15144142)
chr7 (179-225)||(38898489-38898535)
chr7 (163-211)||(9177718-9177766)
chr7 (161-204)||(14036282-14036325)
chr7 (161-204)||(14346312-14346355)
chr7 (179-214)||(18154909-18154944)
chr7 (32-94)||(15116621-15116683)
chr7 (1-94)||(15113084-15113177)
chr7 (179-227)||(14932802-14932850)
chr7 (179-227)||(15356237-15356285)
chr7 (179-227)||(15360351-15360399)
chr7 (161-213)||(18203831-18203882)
[»] chr8 (67 HSPs)
chr8 (1-227)||(5866164-5866390)
chr8 (1-227)||(21491000-21491226)
chr8 (1-227)||(17140921-17141147)
chr8 (12-227)||(21249389-21249605)
chr8 (12-227)||(21255227-21255443)
chr8 (1-227)||(26355587-26355814)
chr8 (67-227)||(38855205-38855367)
chr8 (67-227)||(6520373-6520535)
chr8 (67-216)||(21285613-21285765)
chr8 (67-216)||(23760798-23760949)
chr8 (67-216)||(21673720-21673871)
chr8 (64-225)||(17612059-17612224)
chr8 (56-216)||(983347-983511)
chr8 (57-225)||(13508027-13508199)
chr8 (1-213)||(20498581-20498797)
chr8 (117-227)||(22626741-22626850)
chr8 (134-227)||(31971262-31971354)
chr8 (160-227)||(21396029-21396096)
chr8 (160-227)||(21790522-21790589)
chr8 (131-225)||(13597637-13597731)
chr8 (134-227)||(16199668-16199760)
chr8 (109-227)||(6759263-6759381)
chr8 (160-227)||(21389499-21389566)
chr8 (160-227)||(21778825-21778892)
chr8 (117-227)||(21919006-21919116)
chr8 (117-227)||(28649050-28649160)
chr8 (48-213)||(17439439-17439609)
chr8 (119-227)||(18818417-18818525)
chr8 (117-227)||(16092348-16092458)
chr8 (134-227)||(7372783-7372876)
chr8 (134-227)||(23406384-23406477)
chr8 (134-227)||(45131021-45131112)
chr8 (155-227)||(18879276-18879347)
chr8 (57-213)||(37116366-37116527)
chr8 (134-227)||(20536213-20536306)
chr8 (117-227)||(22875070-22875179)
chr8 (48-213)||(17266926-17267096)
chr8 (162-227)||(21923980-21924044)
chr8 (64-227)||(14409438-14409604)
chr8 (117-213)||(24353039-24353136)
chr8 (64-227)||(1484404-1484570)
chr8 (64-227)||(5853286-5853452)
chr8 (64-227)||(15203225-15203391)
chr8 (64-227)||(20403229-20403395)
chr8 (64-227)||(22001755-22001921)
chr8 (117-225)||(16413367-16413474)
chr8 (179-227)||(4542485-4542533)
chr8 (179-227)||(19896267-19896315)
chr8 (179-227)||(20046307-20046355)
chr8 (179-227)||(26225359-26225407)
chr8 (64-227)||(41598190-41598356)
chr8 (179-225)||(45290807-45290853)
chr8 (179-216)||(15070571-15070608)
chr8 (160-213)||(19154936-19154989)
chr8 (179-216)||(26219730-26219767)
chr8 (179-227)||(19937118-19937166)
chr8 (64-227)||(4483283-4483448)
chr8 (179-227)||(25484380-25484428)
chr8 (179-225)||(18678170-18678216)
chr8 (179-213)||(19801493-19801527)
chr8 (161-211)||(22525579-22525628)
chr8 (64-125)||(18862427-18862488)
chr8 (64-125)||(21383920-21383981)
chr8 (64-125)||(21387340-21387401)
chr8 (64-125)||(21411213-21411274)
chr8 (64-125)||(21805705-21805766)
chr8 (64-125)||(21827796-21827857)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (1-227)||(2002-2228)
scaffold0046 (1-227)||(11297-11523)
scaffold0046 (117-227)||(28419-28529)
scaffold0046 (176-227)||(4557-4608)
[»] chr5 (59 HSPs)
chr5 (1-227)||(19660725-19660951)
chr5 (5-227)||(22959426-22959648)
chr5 (1-227)||(19668903-19669131)
chr5 (1-227)||(21565547-21565776)
chr5 (67-227)||(21329450-21329613)
chr5 (69-216)||(26011990-26012140)
chr5 (131-227)||(36314582-36314678)
chr5 (67-227)||(21502109-21502272)
chr5 (54-213)||(20026880-20027043)
chr5 (49-213)||(22144068-22144236)
chr5 (117-227)||(21729070-21729180)
chr5 (117-227)||(21808395-21808505)
chr5 (117-227)||(24529225-24529335)
chr5 (134-227)||(25421537-25421630)
chr5 (57-225)||(40725860-40726032)
chr5 (129-227)||(21997552-21997650)
chr5 (117-227)||(22412189-22412298)
chr5 (117-227)||(24493574-24493683)
chr5 (117-225)||(1096474-1096582)
chr5 (155-227)||(8286888-8286959)
chr5 (57-213)||(22178162-22178323)
chr5 (117-227)||(13025316-13025425)
chr5 (117-227)||(13095500-13095609)
chr5 (134-227)||(23390519-23390612)
chr5 (160-225)||(37723910-37723975)
chr5 (117-227)||(9077957-9078067)
chr5 (117-223)||(22075028-22075134)
chr5 (161-227)||(21293020-21293085)
chr5 (64-111)||(36314672-36314719)
chr5 (64-227)||(264762-264928)
chr5 (64-227)||(20909014-20909180)
chr5 (64-227)||(29329936-29330102)
chr5 (64-227)||(39363386-39363552)
chr5 (64-227)||(36154777-36154940)
chr5 (179-227)||(2154726-2154774)
chr5 (179-227)||(10733052-10733100)
chr5 (179-227)||(11581311-11581359)
chr5 (179-227)||(20918060-20918108)
chr5 (179-227)||(23064513-23064561)
chr5 (117-212)||(25431414-25431509)
chr5 (179-227)||(38619436-38619484)
chr5 (179-227)||(39245138-39245186)
chr5 (181-227)||(10775790-10775836)
chr5 (64-227)||(42245359-42245525)
chr5 (179-216)||(20902121-20902158)
chr5 (179-227)||(29345982-29346030)
chr5 (179-227)||(31061070-31061118)
chr5 (179-226)||(18319146-18319193)
chr5 (64-227)||(32027395-32027561)
chr5 (182-227)||(29348455-29348500)
chr5 (182-227)||(29350928-29350973)
chr5 (179-227)||(20806854-20806902)
chr5 (179-227)||(26704076-26704124)
chr5 (179-227)||(26973809-26973857)
chr5 (134-216)||(18418596-18418677)
chr5 (162-216)||(26732884-26732937)
chr5 (64-125)||(10753627-10753688)
chr5 (64-125)||(22120146-22120207)
chr5 (67-123)||(21741486-21741541)
[»] chr2 (64 HSPs)
chr2 (11-227)||(23071849-23072065)
chr2 (67-227)||(28405981-28406144)
chr2 (67-227)||(25175855-25176017)
chr2 (69-227)||(7679590-7679750)
chr2 (64-225)||(19671837-19672001)
chr2 (66-216)||(18786854-18787008)
chr2 (134-227)||(38138-38230)
chr2 (49-216)||(23708553-23708724)
chr2 (64-227)||(22105414-22105581)
chr2 (134-227)||(23654409-23654502)
chr2 (155-227)||(298859-298931)
chr2 (1-211)||(22134104-22134306)
chr2 (48-213)||(7666-7835)
chr2 (160-227)||(20309113-20309180)
chr2 (117-227)||(23060518-23060628)
chr2 (154-227)||(23103439-23103511)
chr2 (155-227)||(23285870-23285941)
chr2 (134-227)||(23076447-23076540)
chr2 (117-227)||(23660028-23660137)
chr2 (120-213)||(23207296-23207391)
chr2 (1-213)||(23791292-23791509)
chr2 (64-227)||(6725997-6726163)
chr2 (134-227)||(22731257-22731350)
chr2 (117-225)||(32214972-32215079)
chr2 (155-227)||(8946662-8946733)
chr2 (179-227)||(22337120-22337168)
chr2 (179-227)||(23040257-23040305)
chr2 (57-213)||(22413078-22413240)
chr2 (64-227)||(18808945-18809111)
chr2 (64-227)||(23130864-23131030)
chr2 (64-227)||(23133331-23133497)
chr2 (64-227)||(23709526-23709692)
chr2 (64-227)||(23712007-23712173)
chr2 (64-227)||(26505381-26505547)
chr2 (64-227)||(26507859-26508025)
chr2 (64-227)||(34402516-34402682)
chr2 (64-227)||(39682315-39682481)
chr2 (170-227)||(45029958-45030014)
chr2 (179-227)||(571399-571447)
chr2 (179-227)||(22738247-22738295)
chr2 (179-227)||(23135592-23135640)
chr2 (161-213)||(25108906-25108958)
chr2 (179-227)||(28577101-28577149)
chr2 (179-227)||(38967376-38967424)
chr2 (179-227)||(43137301-43137349)
chr2 (117-213)||(20520198-20520295)
chr2 (179-226)||(21155172-21155219)
chr2 (64-216)||(24367787-24367942)
chr2 (179-226)||(24643062-24643109)
chr2 (1-94)||(22459448-22459541)
chr2 (170-227)||(24529633-24529689)
chr2 (179-227)||(32039610-32039658)
chr2 (117-213)||(23004767-23004865)
chr2 (64-227)||(24898189-24898356)
chr2 (64-227)||(24900672-24900839)
chr2 (64-227)||(24903149-24903316)
chr2 (64-227)||(24905626-24905793)
chr2 (64-227)||(24908101-24908268)
chr2 (163-213)||(32451981-32452031)
chr2 (161-213)||(24697657-24697709)
chr2 (161-211)||(23287384-23287433)
chr2 (64-125)||(1283690-1283751)
chr2 (162-211)||(26392403-26392451)
chr2 (64-125)||(30344773-30344834)
[»] chr4 (66 HSPs)
chr4 (12-227)||(15551822-15552037)
chr4 (1-194)||(16596686-16596879)
chr4 (1-227)||(8846361-8846606)
chr4 (1-227)||(12774012-12774231)
chr4 (67-227)||(39706242-39706404)
chr4 (1-213)||(13737-13953)
chr4 (48-216)||(12288143-12288315)
chr4 (1-216)||(43198439-43198660)
chr4 (117-216)||(52243200-52243301)
chr4 (117-227)||(12902762-12902872)
chr4 (117-224)||(16377529-16377634)
chr4 (155-227)||(3096298-3096369)
chr4 (160-227)||(17046492-17046559)
chr4 (134-227)||(7088882-7088975)
chr4 (134-227)||(7798779-7798872)
chr4 (134-227)||(52873390-52873483)
chr4 (134-227)||(14053325-14053417)
chr4 (117-227)||(6899896-6900005)
chr4 (129-227)||(16270254-16270351)
chr4 (134-227)||(22636440-22636533)
chr4 (155-225)||(23374404-23374473)
chr4 (47-227)||(18215252-18215434)
chr4 (134-227)||(7893708-7893801)
chr4 (117-227)||(16239976-16240085)
chr4 (134-227)||(44052834-44052927)
chr4 (117-225)||(19618223-19618330)
chr4 (57-227)||(44928866-44929040)
chr4 (117-227)||(14038653-14038763)
chr4 (117-227)||(14280318-14280427)
chr4 (117-227)||(23803316-23803425)
chr4 (121-213)||(46640464-46640558)
chr4 (117-227)||(51463919-51464028)
chr4 (117-227)||(54798760-54798870)
chr4 (64-227)||(12301-12467)
chr4 (117-215)||(8574875-8574971)
chr4 (64-227)||(15118346-15118512)
chr4 (64-227)||(44615290-44615456)
chr4 (64-227)||(44773081-44773247)
chr4 (64-227)||(52312512-52312678)
chr4 (179-227)||(1837621-1837669)
chr4 (179-227)||(7641294-7641342)
chr4 (179-227)||(12610952-12611000)
chr4 (179-227)||(18239531-18239579)
chr4 (179-227)||(19242701-19242749)
chr4 (179-227)||(44102216-44102264)
chr4 (179-227)||(50222451-50222499)
chr4 (163-213)||(6190481-6190531)
chr4 (179-225)||(15355437-15355483)
chr4 (179-225)||(15367697-15367743)
chr4 (179-225)||(15370025-15370071)
chr4 (179-225)||(15371209-15371255)
chr4 (179-225)||(15373490-15373536)
chr4 (179-225)||(15402710-15402756)
chr4 (179-225)||(16223539-16223585)
chr4 (48-213)||(53082085-53082254)
chr4 (179-227)||(3515009-3515057)
chr4 (179-227)||(22353838-22353886)
chr4 (179-216)||(14970819-14970856)
chr4 (55-123)||(15099461-15099528)
chr4 (55-123)||(15190428-15190495)
chr4 (64-125)||(630725-630786)
chr4 (64-125)||(3331994-3332055)
chr4 (64-125)||(13812760-13812821)
chr4 (64-125)||(14953912-14953973)
chr4 (64-125)||(25690170-25690231)
chr4 (181-213)||(21815699-21815731)
[»] scaffold0175 (2 HSPs)
scaffold0175 (1-227)||(34128-34354)
scaffold0175 (179-224)||(281-326)
[»] chr1 (57 HSPs)
chr1 (1-216)||(20918620-20918835)
chr1 (64-227)||(14295504-14295667)
chr1 (1-227)||(20248284-20248509)
chr1 (1-216)||(33681023-33681241)
chr1 (1-216)||(52927869-52928075)
chr1 (47-179)||(22130843-22130975)
chr1 (37-216)||(22237643-22237825)
chr1 (67-227)||(22921823-22921985)
chr1 (64-164)||(51130632-51130732)
chr1 (1-225)||(21754052-21754269)
chr1 (57-213)||(35261023-35261180)
chr1 (47-213)||(21896188-21896358)
chr1 (57-213)||(21861512-21861672)
chr1 (134-216)||(16758665-16758749)
chr1 (63-227)||(45574835-45575003)
chr1 (117-227)||(50210219-50210329)
chr1 (117-227)||(34509785-34509895)
chr1 (161-227)||(20847205-20847270)
chr1 (134-227)||(27250752-27250845)
chr1 (156-227)||(38801433-38801503)
chr1 (155-227)||(21026685-21026756)
chr1 (117-213)||(50614121-50614219)
chr1 (117-213)||(50621949-50622047)
chr1 (117-225)||(21840771-21840878)
chr1 (57-227)||(433014-433185)
chr1 (117-213)||(16368291-16368388)
chr1 (116-227)||(21161721-21161831)
chr1 (117-227)||(22532274-22532384)
chr1 (64-227)||(13988868-13989034)
chr1 (163-225)||(20454606-20454667)
chr1 (64-227)||(21923285-21923451)
chr1 (64-227)||(22123061-22123228)
chr1 (170-227)||(21707169-21707225)
chr1 (170-227)||(21711711-21711767)
chr1 (57-227)||(23593722-23593895)
chr1 (179-227)||(13212974-13213022)
chr1 (179-227)||(21342098-21342146)
chr1 (179-227)||(21346963-21347011)
chr1 (179-227)||(29298139-29298187)
chr1 (179-227)||(29776690-29776738)
chr1 (179-227)||(31612315-31612363)
chr1 (56-213)||(16093825-16093987)
chr1 (117-213)||(41050040-41050138)
chr1 (64-227)||(21475081-21475247)
chr1 (179-227)||(15860121-15860169)
chr1 (181-225)||(16361921-16361965)
chr1 (179-227)||(21714547-21714595)
chr1 (134-227)||(16275432-16275524)
chr1 (54-108)||(20636975-20637029)
chr1 (57-213)||(50686630-50686791)
chr1 (179-225)||(22468764-22468810)
chr1 (161-211)||(26064959-26065009)
chr1 (55-93)||(49261481-49261519)
chr1 (64-125)||(1924911-1924972)
chr1 (64-125)||(20923925-20923986)
chr1 (161-213)||(21533923-21533974)
chr1 (55-123)||(35981629-35981696)
[»] chr6 (68 HSPs)
chr6 (1-227)||(28496361-28496587)
chr6 (1-227)||(29808772-29808998)
chr6 (1-227)||(1561308-1561535)
chr6 (1-227)||(19652200-19652427)
chr6 (1-216)||(19668387-19668606)
chr6 (131-227)||(27333238-27333334)
chr6 (131-227)||(27393978-27394074)
chr6 (67-213)||(23019425-23019574)
chr6 (67-216)||(9098466-9098619)
chr6 (33-216)||(20109154-20109343)
chr6 (119-227)||(20076705-20076812)
chr6 (57-225)||(8227453-8227625)
chr6 (117-227)||(16496249-16496359)
chr6 (117-227)||(19303547-19303656)
chr6 (134-227)||(35245591-35245682)
chr6 (116-216)||(4185826-4185926)
chr6 (117-216)||(25644336-25644436)
chr6 (117-227)||(29060545-29060655)
chr6 (134-227)||(20638306-20638399)
chr6 (160-227)||(16920679-16920746)
chr6 (117-227)||(18409833-18409943)
chr6 (47-227)||(22782229-22782411)
chr6 (134-227)||(17287819-17287912)
chr6 (116-216)||(4186383-4186483)
chr6 (169-220)||(11185517-11185568)
chr6 (164-227)||(22831508-22831571)
chr6 (117-225)||(30676761-30676868)
chr6 (155-227)||(22780272-22780343)
chr6 (161-213)||(23076749-23076801)
chr6 (161-213)||(35008167-35008219)
chr6 (117-227)||(20593778-20593888)
chr6 (129-227)||(25656631-25656728)
chr6 (117-227)||(25754811-25754920)
chr6 (64-227)||(1595551-1595717)
chr6 (64-227)||(2291174-2291340)
chr6 (64-227)||(12742319-12742485)
chr6 (64-227)||(18334586-18334752)
chr6 (64-227)||(19005048-19005214)
chr6 (64-227)||(19858913-19859079)
chr6 (134-227)||(20360983-20361076)
chr6 (64-227)||(24422549-24422715)
chr6 (64-227)||(33861796-33861962)
chr6 (64-227)||(33864280-33864446)
chr6 (179-227)||(8055031-8055079)
chr6 (179-227)||(25629423-25629471)
chr6 (179-227)||(25714422-25714470)
chr6 (179-227)||(26924752-26924800)
chr6 (179-227)||(1541023-1541071)
chr6 (179-227)||(3852129-3852177)
chr6 (179-227)||(20557004-20557052)
chr6 (129-173)||(22080756-22080800)
chr6 (179-226)||(16448639-16448686)
chr6 (116-174)||(4668216-4668274)
chr6 (116-174)||(4675063-4675121)
chr6 (179-213)||(18456735-18456769)
chr6 (179-213)||(18461895-18461929)
chr6 (179-213)||(18821912-18821946)
chr6 (69-227)||(31155354-31155513)
chr6 (179-225)||(34963377-34963423)
chr6 (179-216)||(25688515-25688552)
chr6 (160-211)||(33443068-33443118)
chr6 (179-225)||(19848063-19848109)
chr6 (185-227)||(22080799-22080841)
chr6 (64-125)||(22949408-22949469)
chr6 (64-125)||(22953364-22953425)
chr6 (64-125)||(23871852-23871913)
chr6 (64-125)||(23875808-23875869)
chr6 (64-125)||(27325385-27325446)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (1-227)||(15666-15892)
[»] chr3 (83 HSPs)
chr3 (1-227)||(13210216-13210443)
chr3 (4-227)||(12174152-12174375)
chr3 (1-227)||(16097333-16097562)
chr3 (1-227)||(16103785-16104013)
chr3 (67-216)||(15470940-15471092)
chr3 (1-225)||(32307684-32307901)
chr3 (1-227)||(9512925-9513141)
chr3 (1-227)||(9520900-9521116)
chr3 (67-227)||(14234492-14234655)
chr3 (57-213)||(52523669-52523831)
chr3 (129-227)||(49668094-49668192)
chr3 (1-225)||(1644571-1644787)
chr3 (1-123)||(49389517-49389639)
chr3 (57-225)||(24340665-24340837)
chr3 (117-227)||(12399214-12399324)
chr3 (57-225)||(37642207-37642379)
chr3 (117-227)||(14972859-14972969)
chr3 (117-227)||(18438539-18438649)
chr3 (131-214)||(23274705-23274788)
chr3 (109-227)||(11424758-11424875)
chr3 (129-227)||(27165252-27165350)
chr3 (129-227)||(53301569-53301667)
chr3 (117-227)||(17672628-17672737)
chr3 (47-227)||(43550456-43550639)
chr3 (134-227)||(26686892-26686985)
chr3 (155-227)||(20698480-20698551)
chr3 (134-227)||(13442279-13442372)
chr3 (134-216)||(14572605-14572686)
chr3 (57-225)||(22147467-22147639)
chr3 (117-227)||(24153215-24153324)
chr3 (48-213)||(37251101-37251270)
chr3 (155-227)||(23083406-23083477)
chr3 (167-227)||(28194695-28194755)
chr3 (134-224)||(43840940-43841030)
chr3 (117-213)||(43925977-43926075)
chr3 (64-227)||(7781341-7781507)
chr3 (134-227)||(17487861-17487954)
chr3 (134-227)||(17499343-17499436)
chr3 (117-227)||(36166600-36166708)
chr3 (119-213)||(22110358-22110454)
chr3 (74-227)||(29172587-29172743)
chr3 (117-227)||(25476391-25476501)
chr3 (117-227)||(40213727-40213836)
chr3 (64-227)||(9707601-9707767)
chr3 (64-227)||(16282805-16282971)
chr3 (64-227)||(17463180-17463346)
chr3 (64-227)||(34159328-34159494)
chr3 (117-214)||(42386428-42386525)
chr3 (64-227)||(45606901-45607067)
chr3 (64-227)||(55476493-55476659)
chr3 (117-225)||(12567564-12567671)
chr3 (117-225)||(13544029-13544136)
chr3 (179-227)||(6469246-6469294)
chr3 (179-227)||(8499520-8499568)
chr3 (179-227)||(10556987-10557035)
chr3 (179-227)||(15412431-15412479)
chr3 (179-227)||(15977517-15977565)
chr3 (179-227)||(17737238-17737286)
chr3 (179-227)||(28848723-28848771)
chr3 (179-227)||(41123892-41123940)
chr3 (179-227)||(45577950-45577998)
chr3 (117-216)||(50242835-50242933)
chr3 (179-227)||(55500944-55500992)
chr3 (47-227)||(8899096-8899278)
chr3 (117-213)||(12377940-12378038)
chr3 (117-216)||(21618462-21618559)
chr3 (64-216)||(38961885-38962040)
chr3 (64-227)||(16454275-16454441)
chr3 (179-227)||(10247835-10247883)
chr3 (179-227)||(12119837-12119885)
chr3 (179-227)||(44494811-44494859)
chr3 (64-227)||(13151784-13151951)
chr3 (64-227)||(13154249-13154416)
chr3 (117-216)||(14576839-14576937)
chr3 (163-213)||(606378-606428)
chr3 (179-213)||(53070765-53070799)
chr3 (1-70)||(12934199-12934268)
chr3 (55-123)||(1465352-1465419)
chr3 (179-227)||(17446767-17446814)
chr3 (57-170)||(2051141-2051260)
chr3 (179-225)||(46822272-46822318)
chr3 (64-125)||(19776031-19776092)
chr3 (64-125)||(37439418-37439479)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (64-227)||(1022-1185)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (1-213)||(6831-7043)
scaffold0556 (67-150)||(8097-8183)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (1-177)||(2332-2508)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (1-185)||(29167-29354)
scaffold0218 (48-216)||(8007-8179)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (1-216)||(10428-10646)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (1-227)||(45679-45908)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (1-216)||(129921-130139)
scaffold0010 (117-213)||(60721-60818)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (1-227)||(160689-160917)
scaffold0001 (179-225)||(501088-501134)
scaffold0001 (179-227)||(85692-85740)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (37-227)||(134-327)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (1-216)||(22561-22775)
scaffold0037 (117-227)||(82074-82183)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (1-216)||(1098-1316)
[»] scaffold0023 (7 HSPs)
scaffold0023 (67-227)||(100379-100541)
scaffold0023 (67-227)||(40128-40290)
scaffold0023 (159-227)||(119880-119948)
scaffold0023 (151-227)||(101504-101580)
scaffold0023 (64-227)||(94413-94579)
scaffold0023 (179-227)||(44456-44504)
scaffold0023 (179-225)||(17552-17598)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (67-227)||(6540-6702)
scaffold0621 (1-216)||(8482-8703)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (67-227)||(19269-19431)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (1-227)||(6010-6239)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (67-216)||(12782-12934)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (67-216)||(10543-10695)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (67-227)||(987-1150)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (67-227)||(6616-6779)
scaffold0333 (67-227)||(13996-14159)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (67-216)||(5659-5810)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (67-227)||(2599-2761)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (67-214)||(62216-62362)
scaffold0028 (1-227)||(132663-132885)
scaffold0028 (64-227)||(136682-136848)
scaffold0028 (64-227)||(139151-139317)
scaffold0028 (64-227)||(144089-144255)
scaffold0028 (64-227)||(134213-134379)
scaffold0028 (64-227)||(141620-141786)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (67-216)||(12955-13107)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (1-213)||(53435-53651)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (67-227)||(14651-14813)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (67-216)||(32552-32703)
scaffold0034 (163-213)||(51936-51985)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (1-227)||(32103-32325)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (129-227)||(15795-15893)
scaffold0020 (179-227)||(178899-178947)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (117-227)||(2812-2922)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (117-216)||(16106-16205)
scaffold0357 (117-213)||(13147-13243)
scaffold0357 (161-213)||(2680-2732)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (117-216)||(27755-27854)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (129-216)||(23901-23988)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (57-225)||(11471-11643)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (57-225)||(38198-38370)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (117-227)||(3192-3302)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (117-227)||(3157-3266)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (117-223)||(39486-39591)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (117-223)||(75221-75326)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (134-213)||(1051-1130)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (160-227)||(7271-7338)
scaffold0106 (134-227)||(1294-1385)
scaffold0106 (179-227)||(15306-15354)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (57-225)||(17969-18141)
scaffold0247 (179-216)||(2241-2278)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (117-225)||(26071-26179)
scaffold0122 (117-227)||(44713-44823)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (155-227)||(1093-1164)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (155-227)||(4717-4788)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (155-227)||(168023-168094)
scaffold0011 (134-227)||(51918-52011)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (117-227)||(4854-4964)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (134-227)||(10448-10539)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (57-213)||(12587-12746)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (129-227)||(38720-38818)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (134-227)||(339972-340063)
scaffold0003 (64-227)||(158444-158610)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (134-227)||(13502-13594)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (134-227)||(15487-15579)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (134-227)||(32072-32163)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (162-227)||(47000-47065)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (1-211)||(7945-8161)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (155-227)||(16118-16189)
scaffold0120 (117-227)||(32963-33072)
scaffold0120 (117-227)||(45933-46042)
scaffold0120 (179-227)||(17397-17445)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (140-227)||(51587-51672)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (54-213)||(136308-136471)
scaffold0021 (54-213)||(145016-145179)
scaffold0021 (160-227)||(174771-174838)
scaffold0021 (162-227)||(121771-121835)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (160-227)||(16287-16354)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (117-227)||(17221-17333)
scaffold0056 (179-213)||(79396-79430)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (134-227)||(5153-5244)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (134-227)||(1074-1165)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (117-227)||(38766-38875)
scaffold0145 (129-227)||(32947-33044)
scaffold0145 (179-227)||(9751-9799)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (66-216)||(25122-25276)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (134-226)||(11466-11558)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (57-213)||(128912-129072)
scaffold0022 (179-227)||(116432-116480)
scaffold0022 (117-209)||(78345-78438)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (155-227)||(6166-6240)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (129-224)||(25904-25998)
scaffold0026 (129-227)||(39863-39960)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (67-176)||(2172-2283)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (134-227)||(13216-13309)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (129-227)||(39918-40015)
scaffold0080 (117-213)||(19889-19987)
scaffold0080 (64-125)||(48936-48997)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (134-227)||(1856-1949)
scaffold0016 (64-125)||(207470-207531)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (148-227)||(28806-28886)
scaffold0211 (1-78)||(28698-28775)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (134-227)||(8556-8645)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (48-216)||(103572-103736)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (67-213)||(6235-6386)
scaffold0420 (166-213)||(13793-13840)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (117-227)||(348-457)
scaffold0292 (134-227)||(3475-3568)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (117-225)||(10777-10884)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (119-227)||(16608-16716)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (117-225)||(20917-21026)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (155-227)||(1957-2028)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (57-213)||(97024-97185)
scaffold0006 (57-213)||(106302-106463)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (117-213)||(569-666)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (117-211)||(4545-4639)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (155-214)||(24348-24406)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (64-213)||(20373-20524)
scaffold0031 (178-227)||(128756-128805)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (66-213)||(267679-267830)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (64-227)||(20749-20915)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (64-227)||(37823-37989)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (117-216)||(4707-4805)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (179-227)||(8484-8532)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (179-227)||(13394-13442)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (179-227)||(22888-22936)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (179-227)||(16786-16834)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (179-226)||(4300-4347)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (117-209)||(38339-38433)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (165-227)||(4888-4949)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (179-225)||(9246-9292)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (64-227)||(13949-14115)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (179-227)||(108-156)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (179-227)||(23844-23892)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (179-215)||(29946-29982)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (179-227)||(36455-36503)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (179-227)||(40402-40450)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (183-227)||(161206-161250)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (117-227)||(4513-4622)
scaffold0228 (117-227)||(12095-12204)
scaffold0228 (117-227)||(22047-22156)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (179-226)||(1393-1440)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (129-213)||(2694-2780)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (181-227)||(4216-4262)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (179-213)||(11982-12016)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (179-225)||(12361-12407)
[»] scaffold0475 (1 HSPs)
scaffold0475 (116-174)||(9136-9194)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (185-227)||(12066-12108)
[»] scaffold1137 (1 HSPs)
scaffold1137 (29-78)||(2218-2267)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (117-225)||(11292-11399)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (64-125)||(30-91)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 73)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34201017 - 34200791
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34201017 aactaagttgtttaccttgctgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 34200918  T
Q  101 taagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34200917 taagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 34200818  T
Q  201 gagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  34200817 gagtcggtctaagttgttgaagatgat 34200791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 11995917 - 11996143
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11995917 aactaatttgtttaccttgctgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 11996016  T
Q  101 taagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcat 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  11996017 taagtttgatatttgagttgttgatttacattcaatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttaattaactaagatgcat 11996116  T
Q  201 gagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  11996117 gagtcggtctaagttgttgaagatgat 11996143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 28505188 - 28505414
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28505188 aactaagttgtttaccttgttgtcaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 28505287  T
Q  101 taagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcat 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28505288 taagtttgataattgagttgctgatttatatccgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 28505387  T
Q  201 gagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||    
T  28505388 gagtcggtctaagatgatgaagatgat 28505414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 15754776 - 15755003
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaatt-aatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgac 99  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15754776 aactaagttgtttatcttgctgttaatattccagtaagactgatgcatatgaatttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgac 15754875  T
Q  100 ttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgca 199  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15754876 ttatgtttgatatttgagttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgca 15754975  T
Q  200 tgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15754976 tgagtcagtctaagttgttgaagatgat 15755003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16495570 - 16495407
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16495570 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 16495471  T
Q  164 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16495470 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 16495407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 55 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 44014354 - 44014183
Alignment:
Q  55 taatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgg 154  Q
    |||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||     
T  44014354 taatgttgtttttaatggtatataactgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatga 44014256  T
Q  155 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  44014255 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgat 44014183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 67 - 216
Target Start/End: Original strand, 16219670 - 16219822
Alignment:
Q  67 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  || || |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16219670 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttaagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 16219769  T
Q  164 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16219770 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg 16219822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 67911 - 67750
Alignment:
Q  67 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||| |||||   ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  67911 taatgttatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgat-attgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 67814  T
Q  164 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  67813 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 67750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Original strand, 811084 - 811247
Alignment:
Q  67 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||  | |||| ||   || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  811084 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 811183  T
Q  164 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  811184 tgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgat 811247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18005813 - 18005651
Alignment:
Q  67 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 163  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  18005813 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttccatac 18005715  T
Q  164 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  18005714 tgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgat 18005651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 47831975 - 47831812
Alignment:
Q  67 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||  ||  | |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  47831975 taatgttatataattgtatatacattatatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatatgcatac 47831876  T
Q  164 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  47831875 tgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 47831812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22073083 - 22072918
Alignment:
Q  67 taatgttatataattgtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgg-tttgcat 161  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  22073083 taatgttatataattgcatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 22072984  T
Q  162 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||    
T  22072983 agtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgattaagatgat 22072918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 67 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16056495 - 16056344
Alignment:
Q  67 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||   |||||||||| |||| |||||| |||||||||| || ||||||||     
T  16056495 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttg-tttgcataa 16056397  T
Q  164 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  16056396 tgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtctaagttg 16056344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 117 - 216
Target Start/End: Original strand, 2280125 - 2280224
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2280125 gttgttgatttgcatttgatattattatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 2280224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Original strand, 16386292 - 16386364
Alignment:
Q  155 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16386292 tttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 16386364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 3564370 - 3564480
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3564370 gttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 3564468  T
Q  216 gttgaagatgat 227  Q
    | ||||||||||    
T  3564469 gatgaagatgat 3564480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 47 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13647513 - 13647330
Alignment:
Q  47 ttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttg-ataattga---gttgttgatttacattcgatattatt 142  Q
    |||||| || |||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| || |||| |||||||||    
T  13647513 ttatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 13647415  T
Q  143 atatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    || ||||| ||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  13647414 atgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgat 13647330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 57 - 213
Target Start/End: Original strand, 20220132 - 20220290
Alignment:
Q  57 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tgg 154  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||  | ||||  ||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||  ||     
T  20220132 atgttgttaataatgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgt 20220231  T
Q  155 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    |||   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20220232 tttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgtatgagtcggtctaag 20220290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 48 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12901511 - 12901339
Alignment:
Q  48 tatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataat-tga-gttgttgatttacattcgatattattata 145  Q
    ||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||  | ||| |||| || ||| |||| |||||| |||||    
T  12901511 tatgatttaatgttgttgttaatgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtatgatgttgtgatgttgctgttttgcatttgatattgttata 12901412  T
Q  146 tcatga--tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    ||||||  |  |||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12901411 tcatgaattattttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagttg 12901339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 225
Target Start/End: Original strand, 19486686 - 19486858
Alignment:
Q  57 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataatt---ga-gttgttgatttacattcgatattattatatcatgat 152  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| || ||| |||  | |||| |||   || |||||| | |||| | ||||||||||||||||||||    
T  19486686 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 19486785  T
Q  153 ggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 225  Q
    | |||||||||||||||||||| || |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  19486786 gttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatg 19486858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 38227595 - 38227486
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38227595 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtag 38227497  T
Q  217 ttgaagatgat 227  Q
     ||||||||||    
T  38227496 atgaagatgat 38227486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 131 - 222
Target Start/End: Original strand, 10063838 - 10063929
Alignment:
Q  131 ttcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaag 222  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||    
T  10063838 ttcgatattattatatcatgatgttgtgcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagtcgttgaag 10063929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 18456419 - 18456528
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456419 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctatc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 18456517  T
Q  217 ttgaagatgat 227  Q
     | ||||||||    
T  18456518 attaagatgat 18456528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 40443488 - 40443396
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  40443488 gatattattatgtcatgctg-tttgtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatgttgaagatgat 40443396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 129 - 210
Target Start/End: Original strand, 12255809 - 12255892
Alignment:
Q  129 cattcgatattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 210  Q
    |||| |||||| |||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12255809 catttgatattgttatatcatgaattgatttgcatactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12698907 - 12698836
Alignment:
Q  155 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12698907 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 12698836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 216
Target Start/End: Original strand, 1867937 - 1868100
Alignment:
Q  57 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttg---atttacattcgatattattatatcatga-- 151  Q
    |||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||  | ||||  ||||| |||||   |||| |||| |||||| |||||||||||      
T  1867937 atgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttcatttgcatt-gatattgttatatcatgagc 1868035  T
Q  152 tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    || |||  |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1868036 tgttttatatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 1868100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 134 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 9509287 - 9509194
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatgatggt-ttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||| || | ||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9509287 gatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 9509194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 162 - 227
Target Start/End: Original strand, 27847881 - 27847946
Alignment:
Q  162 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  27847881 actgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgat 27847946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26212111 - 26212005
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  26212111 gttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagtt 26212013  T
Q  216 gttgaaga 223  Q
    ||||||||    
T  26212012 gttgaaga 26212005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 48273504 - 48273394
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48273504 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtctaagtt 48273406  T
Q  216 gttgaagatgat 227  Q
    | | ||||||||    
T  48273405 gattaagatgat 48273394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 17061909 - 17062075
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagt-ttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgc 159  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | || |||||||||   ||| ||| || |||| ||||||||||| ||||| |  ||||     
T  17061909 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattatgtcatgctattttgt 17062008  T
Q  160 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||  | |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  17062009 atactgctga-gttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 17062075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 10589115 - 10589044
Alignment:
Q  155 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  10589115 tttgtatactgcatatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgtcgaagatgat 10589044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 48 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14044935 - 14044762
Alignment:
Q  48 tatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacat---tcgatattattat 144  Q
    ||||| ||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  | ||||  ||||| |||||||| |  |   | |||||| ||||    
T  14044935 tatgatttaatgtttttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgattgatttgtattgatattgttat 14044836  T
Q  145 atcatga--tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    |||| ||  || |||   |||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044835 atcaggagctgttttatgtactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 14044762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 48 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14354965 - 14354792
Alignment:
Q  48 tatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacat---tcgatattattat 144  Q
    ||||| ||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  | ||||  ||||| |||||||| |  |   | |||||| ||||    
T  14354965 tatgatttaatgtttttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgattgatttgtattgatattgttat 14354866  T
Q  145 atcatga--tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    |||| ||  || |||   |||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354865 atcaggagctgttttatgtactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 14354792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 209
Target Start/End: Original strand, 15008441 - 15008597
Alignment:
Q  57 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatga-- 151  Q
    |||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||||| ||| |||  | ||||  |||||   |||||||||| |||| |||||| |||||||||||      
T  15008441 atgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtttgaggtgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaac 15008539  T
Q  152 tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 209  Q
    || |||  ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  15008540 tgttttatatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 15008597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 456489 - 456323
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  456489 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 456390  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  456389 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 456323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 11393281 - 11393447
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  11393281 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 11393380  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  11393381 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 11393447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 11972664 - 11972498
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  11972664 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 11972565  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  11972564 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 11972498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 14949116 - 14949282
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  14949116 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 14949215  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  14949216 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 14949282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 15376707 - 15376873
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  15376707 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 15376806  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15376807 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 15376873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16232688 - 16232522
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  16232688 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 16232589  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16232588 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16232522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18430880 - 18430714
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgc 159  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| |||      
T  18430880 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttta 18430781  T
Q  160 -atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  18430780 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 18430714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18640440 - 18640274
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  18640440 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 18640341  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  18640340 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 18640274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 20385117 - 20385283
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  20385117 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 20385216  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  20385217 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 20385283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 21189589 - 21189755
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  21189589 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 21189688  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  21189689 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 21189755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24702406 - 24702240
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  24702406 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttg 24702307  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  24702306 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 24702240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 32125659 - 32125493
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  32125659 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 32125560  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  32125559 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 32125493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 41523085 - 41522919
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  41523085 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 41522986  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  41522985 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41522919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 41525547 - 41525381
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  41525547 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 41525448  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  41525447 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41525381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 117 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 24275282 - 24275175
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275282 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 24275185  T
Q  216 gttgaagatg 225  Q
    | | ||||||    
T  24275184 gattaagatg 24275175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 3386383 - 3386335
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  3386383 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 3386335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13869396 - 13869348
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  13869396 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 13869348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16213734 - 16213686
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16213734 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16213686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16410109 - 16410061
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16410109 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16410061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20110606 - 20110558
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  20110606 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 20110558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24704738 - 24704690
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  24704738 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 24704690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 44116620 - 44116511
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44116620 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtt 44116523  T
Q  216 gttgaagatgat 227  Q
    | | ||||||||    
T  44116522 gattaagatgat 44116511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 27217028 - 27216862
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  27217028 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 27216929  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  27216928 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgat 27216862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 48991252 - 48991206
Alignment:
Q  160 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  48991252 atactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 48991206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13831431 - 13831375
Alignment:
Q  170 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  13831431 tgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgat 13831375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 216
Target Start/End: Original strand, 15144105 - 15144142
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144105 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15144142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 225
Target Start/End: Original strand, 38898489 - 38898535
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||    
T  38898489 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 38898535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 211
Target Start/End: Original strand, 9177718 - 9177766
Alignment:
Q  163 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 211  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  9177718 ctgcatatgttgttgtttattattgaattaagctgcatgagtcggtcta 9177766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 14036325 - 14036282
Alignment:
Q  161 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 204  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14036325 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 14036282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 161 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 14346355 - 14346312
Alignment:
Q  161 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 204  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14346355 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagt 14346312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 214
Target Start/End: Original strand, 18154909 - 18154944
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 214  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18154909 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagt 18154944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 15116683 - 15116621
Alignment:
Q  32 cagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattac 94  Q
    ||||||||||||||  ||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  15116683 cagtaagactgatgtatatgagttgatgttatttataatgtgatataattgtatatatattac 15116621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 15113177 - 15113084
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattac 94  Q
    ||||||||| |||| | || ||||| |||  |||||||||||||   ||||| || |||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  15113177 aactaagttgtttatcctgctgttattgtttcagtaagactgatttatatgagttgatgttaattataatgtgatataattgtatatatattac 15113084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Original strand, 14932802 - 14932850
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  14932802 ttgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgat 14932850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Original strand, 15356237 - 15356285
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  15356237 ttgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgat 15356285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Original strand, 15360351 - 15360399
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  15360351 ttgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgat 15360399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 18203882 - 18203831
Alignment:
Q  161 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  18203882 tactgtctatgttgttgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcgatctaag 18203831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 67)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 5866164 - 5866390
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5866164 aactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 5866263  T
Q  101 taagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5866264 taagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 5866363  T
Q  201 gagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5866364 gagtcggtctaagatgttgaagatgat 5866390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21491226 - 21491000
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21491226 aactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcctatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 21491127  T
Q  101 taagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21491126 taagtttgataattgagttgttgatttacattcaatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 21491027  T
Q  201 gagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  21491026 gagtcggtctaagttgttgaagatgat 21491000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17141147 - 17140921
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17141147 aactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 17141048  T
Q  101 taagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcat 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17141047 taagtttgataattgagttgatgatttacattcgatattattatgtcatgatggattgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 17140948  T
Q  201 gagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  17140947 gagtcggtctaagttgttgaagatgat 17140921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21249605 - 21249389
Alignment:
Q  12 ttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgata 111  Q
    ||||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21249605 ttaccctgctgttaatgtctcactaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgata 21249506  T
Q  112 attgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttg-ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21249505 attgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgaattgcatactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtct 21249406  T
Q  211 aagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||    
T  21249405 aagttgttgaagatgat 21249389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21255443 - 21255227
Alignment:
Q  12 ttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgata 111  Q
    ||||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21255443 ttaccctgctgttaatgtctcactaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgata 21255344  T
Q  112 attgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttg-ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21255343 attgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgaattgcatactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtct 21255244  T
Q  211 aagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||    
T  21255243 aagttgttgaagatgat 21255227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 26355587 - 26355814
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||       
T  26355587 aactaagttgtttatctttttgttattgttctagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaaatggaa 26355686  T
Q  101 taagtttgataattgagttgttgat--ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgc 198  Q
    || ||| |||   |||| ||||| |  || ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26355687 tatgtt-gatggctgagatgttgttgattgcattcgatattgttatatcgtgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgc 26355785  T
Q  199 atgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  26355786 atgagtcggtctaagttgatgatgatgat 26355814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Original strand, 38855205 - 38855367
Alignment:
Q  67 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  38855205 taatgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 38855303  T
Q  164 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  38855304 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 38855367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 6520535 - 6520373
Alignment:
Q  67 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtt--tgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatact 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  || | ||   |||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  6520535 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatact 6520436  T
Q  165 gcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  6520435 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 6520373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 67 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21285765 - 21285613
Alignment:
Q  67 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 163  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||  |||||   |||||||||| |||| |||||| |||||||||| || |||||||||    
T  21285765 taatgatatataattgtatatacattacatgaactatgtttgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatac 21285666  T
Q  164 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21285665 tgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttg 21285613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 67 - 216
Target Start/End: Original strand, 23760798 - 23760949
Alignment:
Q  67 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 163  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  23760798 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgaattcaatattgttatatcatgatgatttacatac 23760896  T
Q  164 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23760897 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 23760949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 67 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21673871 - 21673720
Alignment:
Q  67 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 163  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || | |||  || |||| |||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  21673871 taatggtatataattgtatatacattaaataaattatatt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcataa 21673773  T
Q  164 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  21673772 tgcctatgttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggtctaagttg 21673720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 64 - 225
Target Start/End: Original strand, 17612059 - 17612224
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataatt---ga-gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgc 159  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | |||| |||   || |||||| | |||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  17612059 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttttgc 17612158  T
Q  160 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 225  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  17612159 atactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 17612224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 56 - 216
Target Start/End: Original strand, 983347 - 983511
Alignment:
Q  56 aatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataat-tga-gttgttgatttacattcgatattattatatcatga-- 151  Q
    ||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||  | ||| |||||||| || |||| || ||| |||||||||||      
T  983347 aatgttgttgataatgttatatagctgtatatacattacatgaattatgtttgatgttgtgatgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaac 983446  T
Q  152 tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  983447 ttgtttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 983511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 57 - 225
Target Start/End: Original strand, 13508027 - 13508199
Alignment:
Q  57 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgagttgttgatt---tacattcgatattattatatcatgat 152  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| || ||||| ||||| ||   | | ||||||||||||||||||||||    
T  13508027 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgat 13508126  T
Q  153 ggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 225  Q
    | | |||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  13508127 gttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13508199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20498797 - 20498581
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    ||||||||| |||| |||| |||| ||||  | ||||||||||||  ||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  20498797 aactaagttgtttatcttgatgttgatgtttcggtaagactgatgtatatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaat 20498698  T
Q  101 taagtttga-taattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagct 196  Q
    ||  | ||| |  ||||| |||||||   || |||| |||||| |||||||||| |  ||| |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |    
T  20498697 tatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctattttacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagtt 20498598  T
Q  197 gcatgagtcggtctaag 213  Q
    |||||||||||||||||    
T  20498597 gcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22626850 - 22626741
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22626850 gttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 22626752  T
Q  217 ttgaagatgat 227  Q
     ||||||||||    
T  22626751 atgaagatgat 22626741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 134 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 31971354 - 31971262
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31971354 gatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 31971262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 160 - 227
Target Start/End: Original strand, 21396029 - 21396096
Alignment:
Q  160 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21396029 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 21396096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 160 - 227
Target Start/End: Original strand, 21790522 - 21790589
Alignment:
Q  160 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21790522 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 21790589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 131 - 225
Target Start/End: Original strand, 13597637 - 13597731
Alignment:
Q  131 ttcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  13597637 ttcgatattattatatcatgatgttttgcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13597731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 227
Target Start/End: Original strand, 16199668 - 16199760
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||| || |||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16199668 gatattattatgtcatgttg-tttgaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 16199760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 109 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 6759381 - 6759263
Alignment:
Q  109 ataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 207  Q
    ||||||||| |||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6759381 ataattgagatgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 6759283  T
Q  208 tctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  6759282 tctaagttgatgaagatgat 6759263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 160 - 227
Target Start/End: Original strand, 21389499 - 21389566
Alignment:
Q  160 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21389499 atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 21389566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 160 - 227
Target Start/End: Original strand, 21778825 - 21778892
Alignment:
Q  160 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21778825 atactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 21778892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 21919006 - 21919116
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21919006 gttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 21919104  T
Q  216 gttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||||    
T  21919105 gttgaagatgat 21919116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 28649050 - 28649160
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28649050 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgct-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 28649148  T
Q  216 gttgaagatgat 227  Q
    | ||||||||||    
T  28649149 gatgaagatgat 28649160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 48 - 213
Target Start/End: Original strand, 17439439 - 17439609
Alignment:
Q  48 tatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattat 144  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||  | ||||  |||||   |||||||||| |||| |||||| ||||    
T  17439439 tatgatttaatgttgataataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttat 17439538  T
Q  145 atcatga--tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    |||||||  || |||   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17439539 atcatgaactgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggactaag 17439609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 119 - 227
Target Start/End: Original strand, 18818417 - 18818525
Alignment:
Q  119 tgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgt 217  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18818417 tgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 18818515  T
Q  218 tgaagatgat 227  Q
    ||||||||||    
T  18818516 tgaagatgat 18818525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 16092348 - 16092458
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092348 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 16092446  T
Q  216 gttgaagatgat 227  Q
    | ||||||||||    
T  16092447 gatgaagatgat 16092458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 7372876 - 7372783
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7372876 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 7372783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23406477 - 23406384
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23406477 gatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 23406384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 227
Target Start/End: Original strand, 45131021 - 45131112
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45131021 gatattattatgtcatgctg-tttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 45131112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Original strand, 18879276 - 18879347
Alignment:
Q  155 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18879276 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 18879347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 37116527 - 37116366
Alignment:
Q  57 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatga-- 151  Q
    |||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||  | ||||  |||||   |||||||||| |||| |||||| |||||||||||      
T  37116527 atgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaac 37116428  T
Q  152 tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    || |||   |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37116427 tgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 134 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20536306 - 20536213
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20536306 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 20536213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22875179 - 22875070
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||| ||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22875179 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctgtgttgctgct-gctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattg 22875081  T
Q  217 ttgaagatgat 227  Q
     ||||||||||    
T  22875080 atgaagatgat 22875070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 48 - 213
Target Start/End: Original strand, 17266926 - 17267096
Alignment:
Q  48 tatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattat 144  Q
    ||||| || |||||| | ||||||| |||||| ||||||| ||||||| || |||  | ||||  |||||   |||||||||| |||| |||||| ||||    
T  17266926 tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacaagaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttat 17267025  T
Q  145 atcatgat--ggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    |||||||   | |||   |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17267026 atcatgaaccgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 17267096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 162 - 227
Target Start/End: Original strand, 21923980 - 21924044
Alignment:
Q  162 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21923980 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 21924044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 14409438 - 14409604
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttg-ataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttg 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  14409438 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 14409537  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     |||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  14409538 tatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 14409604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 24353136 - 24353039
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  || |||   |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24353136 gttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 24353039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 1484570 - 1484404
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  1484570 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 1484471  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  1484470 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 1484404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 5853286 - 5853452
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  5853286 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 5853385  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  5853386 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 5853452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 15203225 - 15203391
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  15203225 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttg 15203324  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  15203325 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgat 15203391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20403395 - 20403229
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  20403395 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 20403296  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  20403295 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 20403229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22001921 - 22001755
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  22001921 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 22001822  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  22001821 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 22001755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 117 - 225
Target Start/End: Original strand, 16413367 - 16413474
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413367 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 16413464  T
Q  216 gttgaagatg 225  Q
    | | ||||||    
T  16413465 gattaagatg 16413474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Original strand, 4542485 - 4542533
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  4542485 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 4542533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19896315 - 19896267
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  19896315 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 19896267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Original strand, 20046307 - 20046355
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  20046307 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 20046355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Original strand, 26225359 - 26225407
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  26225359 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 26225407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 41598356 - 41598190
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  41598356 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 41598257  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||| | | ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  41598256 tatactac-tgtgttgctgtt-gttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41598190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 225
Target Start/End: Original strand, 45290807 - 45290853
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  45290807 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 45290853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15070608 - 15070571
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070608 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 213
Target Start/End: Original strand, 19154936 - 19154989
Alignment:
Q  160 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19154936 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 19154989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 26219767 - 26219730
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26219767 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 26219730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Original strand, 19937118 - 19937166
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  19937118 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgat 19937166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4483448 - 4483283
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  4483448 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 4483349  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  4483348 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 4483283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Original strand, 25484380 - 25484428
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||    
T  25484380 ttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatgat 25484428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 225
Target Start/End: Original strand, 18678170 - 18678216
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 225  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  18678170 ttgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 18678216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 213
Target Start/End: Original strand, 19801493 - 19801527
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19801493 ttgttatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 22525628 - 22525579
Alignment:
Q  161 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 211  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22525628 tactgcctaagttgttgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 22525579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 125
Target Start/End: Original strand, 18862427 - 18862488
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 125  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  18862427 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 18862488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 21383981 - 21383920
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 125  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| |||||||| ||||| |||||||    
T  21383981 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatatttgagatgttgat 21383920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 21387401 - 21387340
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 125  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  21387401 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 21387340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 21411274 - 21411213
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 125  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  21411274 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 21411213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 21805766 - 21805705
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 125  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  21805766 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 21805705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 125
Target Start/End: Original strand, 21827796 - 21827857
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 125  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  21827796 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 21827857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 2228 - 2002
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2228 aactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagtctgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 2129  T
Q  101 taagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  2128 taagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgcat 2029  T
Q  201 gagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  2028 gagtcggtctaagttgttgaagatgat 2002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 11523 - 11297
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11523 aactaagttgtttaccttggtgttaatgttcaagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataatagtatatacattacatgact 11424  T
Q  101 taagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11423 taagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 11324  T
Q  201 gagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  11323 gagtcggtctaagttgttgaagatgat 11297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 28529 - 28419
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28529 gttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 28431  T
Q  216 gttgaagatgat 227  Q
    | ||||||||||    
T  28430 gatgaagatgat 28419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 176 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4608 - 4557
Alignment:
Q  176 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4608 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 4557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 59)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 19660725 - 19660951
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19660725 aactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 19660824  T
Q  101 taagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19660825 taagtttgataattgagttgttgatttatattcgatatcattatatcaagatggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcat 19660924  T
Q  201 gagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  19660925 gagtcggtctaagttgttgaagatgat 19660951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 227
Target Start/End: Original strand, 22959426 - 22959648
Alignment:
Q  5 aagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaag 104  Q
    ||||| |||| |||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22959426 aagttgtttatcttgttgtttttgttccagtaagactgatgcatatgaatcaatgttggttaaaatgttatataattgtatatacattacatgacttatg 22959525  T
Q  105 tttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 204  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22959526 tttgatatttgagttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 22959625  T
Q  205 cggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||| ||| ||||||    
T  22959626 cggtctaagttgatgatgatgat 22959648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19669131 - 19668903
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaat--taatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatga 98  Q
    ||||||||  |||| |||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19669131 aactaagtcgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaatattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacagga 19669032  T
Q  99 cttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgc 198  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19669031 cttatgtttgatatttgagttgttgatttgcattcgatattgttatatcacgatgatttgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactgagctgc 19668932  T
Q  199 atgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    | |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  19668931 aagagtcggtctaagttgatgatgatgat 19668903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21565776 - 21565547
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    ||||||||| |||| |||||||||  ||| | |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21565776 aactaagttgtttatcttgttgttgttgttctagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaat 21565677  T
Q  101 taagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctg 197  Q
    || |||||||| ||||  |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  21565676 tatgtttgatatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttggatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctg 21565577  T
Q  198 catgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  21565576 catgagtcggtctaagttgatgatgatgat 21565547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Original strand, 21329450 - 21329613
Alignment:
Q  67 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||  | |||||||   ||  |||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  21329450 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgaattcgatattgttatattatgatgatttgcatac 21329549  T
Q  164 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  21329550 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 21329613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 69 - 216
Target Start/End: Original strand, 26011990 - 26012140
Alignment:
Q  69 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactg 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||   ||||||||| ||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||    
T  26011990 atgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgattcacatttgatattgttatatcatgttgctttgcatactg 26012089  T
Q  166 cctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26012090 cctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 26012140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 131 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 36314678 - 36314582
Alignment:
Q  131 ttcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36314678 ttcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 36314582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Original strand, 21502109 - 21502272
Alignment:
Q  67 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  || || || ||||   || ||||||||||| |||||||||| || ||| |||||    
T  21502109 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttaagatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttacatac 21502208  T
Q  164 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  21502209 tgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 21502272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 54 - 213
Target Start/End: Original strand, 20026880 - 20027043
Alignment:
Q  54 ttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataat-tga-gttgttgatttacattcgatattattatatcatga 151  Q
    ||||||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  | ||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  20026880 ttaatgttgttgataatgctatatagttgtatatacattacatgaattatgtttgatgttgtgatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatga 20026979  T
Q  152 --tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
      || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20026980 actgttttggatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 49 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 22144236 - 22144068
Alignment:
Q  49 atgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattat 144  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| |  |||||   |||||||||| || | |||||| ||||    
T  22144236 atgaattgatgttgtttacaatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttat 22144137  T
Q  145 atcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144136 atcatgttgttttgcatactacctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 21729070 - 21729180
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21729070 gttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 21729168  T
Q  216 gttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||||    
T  21729169 gttgaagatgat 21729180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 21808395 - 21808505
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21808395 gttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 21808493  T
Q  216 gttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||||    
T  21808494 gttgaagatgat 21808505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24529335 - 24529225
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||||||| || |||| ||||| ||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529335 gttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 24529237  T
Q  216 gttgaagatgat 227  Q
    | ||||||||||    
T  24529236 gatgaagatgat 24529225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 25421630 - 25421537
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25421630 gatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 25421537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 40726032 - 40725860
Alignment:
Q  57 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataatt---ga-gttgttgatttacattcgatattattatatcatgat 152  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | |||| |||   || |||||| | |||| | ||||||||||||||||||||    
T  40726032 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 40725933  T
Q  153 ggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 225  Q
    | ||||||||||||||| |||| || |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  40725932 gctttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatg 40725860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 129 - 227
Target Start/End: Original strand, 21997552 - 21997650
Alignment:
Q  129 cattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21997552 catttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 21997650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22412298 - 22412189
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22412298 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttatc-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg 22412200  T
Q  217 ttgaagatgat 227  Q
     | ||||||||    
T  22412199 attaagatgat 22412189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24493683 - 24493574
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| | || |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24493683 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttg 24493585  T
Q  217 ttgaagatgat 227  Q
     ||||||||||    
T  24493584 atgaagatgat 24493574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 117 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 1096582 - 1096474
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| | ||| || ||| ||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1096582 gttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 1096484  T
Q  216 gttgaagatg 225  Q
    | ||||||||    
T  1096483 gatgaagatg 1096474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Original strand, 8286888 - 8286959
Alignment:
Q  155 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8286888 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 8286959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 213
Target Start/End: Original strand, 22178162 - 22178323
Alignment:
Q  57 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatga-- 151  Q
    |||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||  | ||||  |||||   |||||||||| |||| |||||| | |||||||||      
T  22178162 atgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagc 22178261  T
Q  152 tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    || |||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22178262 tgttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22178323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13025425 - 13025316
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    |||||||| || |||| ||||| | ||| ||||| || |||| ||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13025425 gttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttg 13025327  T
Q  217 ttgaagatgat 227  Q
     ||||||||||    
T  13025326 atgaagatgat 13025316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13095609 - 13095500
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    |||||||| || |||| ||||| | ||| ||||| || |||| ||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13095609 gttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttg 13095511  T
Q  217 ttgaagatgat 227  Q
     ||||||||||    
T  13095510 atgaagatgat 13095500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 134 - 227
Target Start/End: Original strand, 23390519 - 23390612
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23390519 gatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 23390612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 160 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 37723975 - 37723910
Alignment:
Q  160 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 225  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  37723975 atactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagatgttgaagatg 37723910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 9078067 - 9077957
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  9078067 gttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagtt 9077969  T
Q  216 gttgaagatgat 227  Q
    | ||||||||||    
T  9077968 gatgaagatgat 9077957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22075134 - 22075028
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22075134 gttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgaatgagtcggtctaagtt 22075036  T
Q  216 gttgaaga 223  Q
    ||||||||    
T  22075035 gttgaaga 22075028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 161 - 227
Target Start/End: Original strand, 21293020 - 21293085
Alignment:
Q  161 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  21293020 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgat 21293085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 36314719 - 36314672
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgata 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36314719 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagttcgata 36314672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 264762 - 264928
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  264762 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 264861  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  264862 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 264928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20909180 - 20909014
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  20909180 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 20909081  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  20909080 tatactgt-tgtgttgct-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 20909014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 29330102 - 29329936
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  29330102 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttg 29330003  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  29330002 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 29329936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 39363552 - 39363386
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  39363552 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 39363453  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  39363452 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 39363386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 36154777 - 36154940
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttg-ataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttg 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  36154777 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 36154876  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     |||||| || |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  36154877 tatactg-ctgtgttg----ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 36154940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Original strand, 2154726 - 2154774
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  2154726 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 2154774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Original strand, 10733052 - 10733100
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  10733052 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 10733100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Original strand, 11581311 - 11581359
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  11581311 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 11581359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Original strand, 20918060 - 20918108
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  20918060 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 20918108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23064561 - 23064513
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  23064561 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 23064513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 25431509 - 25431414
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 212  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25431509 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa 25431414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 38619484 - 38619436
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  38619484 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 38619436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 39245186 - 39245138
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  39245186 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 39245138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 227
Target Start/End: Original strand, 10775790 - 10775836
Alignment:
Q  181 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  10775790 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 10775836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 42245359 - 42245525
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  42245359 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 42245458  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  42245459 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 42245525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 216
Target Start/End: Original strand, 20902121 - 20902158
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20902121 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20902158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 29346030 - 29345982
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  29346030 ttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgat 29345982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 31061118 - 31061070
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  31061118 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 31061070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 226
Target Start/End: Original strand, 18319146 - 18319193
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatga 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  18319146 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 18319193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 32027561 - 32027395
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  32027561 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttg 32027462  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  32027461 tatactgt-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgat 32027395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 182 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 29348500 - 29348455
Alignment:
Q  182 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  29348500 ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgat 29348455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 182 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 29350973 - 29350928
Alignment:
Q  182 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  29350973 ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgat 29350928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Original strand, 20806854 - 20806902
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  20806854 ttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgat 20806902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26704124 - 26704076
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  26704124 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgat 26704076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26973857 - 26973809
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  26973857 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgat 26973809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18418677 - 18418596
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgtta-tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  18418677 gatattattatgtcatgctg-tttgtatactgcctatgttgatg-ttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaagttg 18418596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 162 - 216
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732937
Alignment:
Q  162 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgttg 26732937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 10753688 - 10753627
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 125  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  10753688 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 10753627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 125
Target Start/End: Original strand, 22120146 - 22120207
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 125  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  22120146 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 22120207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 123
Target Start/End: Original strand, 21741486 - 21741541
Alignment:
Q  67 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttg 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||| ||||| |||||    
T  21741486 taatgttatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttg 21741541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 64)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 227
Target Start/End: Original strand, 23071849 - 23072065
Alignment:
Q  11 tttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgat 110  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23071849 tttaccttgttgctaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgat 23071948  T
Q  111 aattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 210  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23071949 aattgagttgctgatttatattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggact 23072048  T
Q  211 aagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||    
T  23072049 aagttgttgaagatgat 23072065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 28406144 - 28405981
Alignment:
Q  67 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcata 162  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||| |||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  28406144 taatggtatataattgtatatacattttatgaattaagtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcata 28406046  T
Q  163 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  28406045 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 25176017 - 25175855
Alignment:
Q  67 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 163  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||| ||| |||| |||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  25176017 taatgttatataattatatatacgttatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 25175919  T
Q  164 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||    
T  25175918 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgtctaagttgatgatgatgat 25175855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 69 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 7679750 - 7679590
Alignment:
Q  69 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactg 165  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||  ||  | |||||||   ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  7679750 atgttatataattatatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttacatt-gatattgttatatcatgatgatttgcatactg 7679652  T
Q  166 cctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  7679651 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgat 7679590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19672001 - 19671837
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatt---tacattcgatattattatatcatgatggtttgca 160  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | |||  |||||| ||||| ||   | | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19672001 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatattgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttttgca 19671902  T
Q  161 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 225  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  19671901 tactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 19671837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Original strand, 18786854 - 18787008
Alignment:
Q  66 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataat-tga-gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcat 161  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  | ||| |||||||| || |||| || ||| |||||||||||  ||||||||||    
T  18786854 ataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtttgatgttgtgacgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaactggtttgcat 18786953  T
Q  162 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    ||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18786954 actacctatgttactgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 18787008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 134 - 227
Target Start/End: Original strand, 38138 - 38230
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38138 gatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 38230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 49 - 216
Target Start/End: Original strand, 23708553 - 23708724
Alignment:
Q  49 atgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgagttgt---tgatttacattcgatattattat 144  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  ||||| |  ||||| |||   |||||| || | |||||| ||||    
T  23708553 atgaattgatgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttat 23708652  T
Q  145 atcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23708653 atcatgttgttttgcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagttg 23708724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22105581 - 22105414
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttg-ataattg---agttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttg 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | || |||||||   ||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  22105581 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 22105482  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  22105481 catactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 22105414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 227
Target Start/End: Original strand, 23654409 - 23654502
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatgatgg-tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23654409 gatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 23654502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Original strand, 298859 - 298931
Alignment:
Q  155 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  298859 tttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 298931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 22134104 - 22134306
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| | | | |||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||        |||||||||||| |||  |    
T  22134104 aactaagttgtttatcttgctgtcatttttccagtaagactgatgcatatgaattggtgttgtttataatgtt--------gtatatacattaaatggat 22134195  T
Q  101 taagtttgataattgagttgttgat--ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgc 198  Q
    || ||| ||||| |||| ||||  |  || ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  22134196 tatgtt-gataaatgagatgttattgattgcattcgatattgttatattatgatgatttgcatactgcctatgttgctg-ttgatatttaactaagctgc 22134293  T
Q  199 atgagtcggtcta 211  Q
    |||||||||||||    
T  22134294 atgagtcggtcta 22134306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 48 - 213
Target Start/End: Original strand, 7666 - 7835
Alignment:
Q  48 tatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgagttgttgat---ttacattcgatattatta 143  Q
    ||||| ||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  | ||| |  ||||| |||||||   || |||| |||||| |||    
T  7666 tatgatttaatgttgttgttaatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgtta 7765  T
Q  144 tatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||    
T  7766 tatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaag 7835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 160 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20309180 - 20309113
Alignment:
Q  160 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20309180 atactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 20309113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23060628 - 23060518
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23060628 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23060530  T
Q  216 gttgaagatgat 227  Q
    | ||||||||||    
T  23060529 gatgaagatgat 23060518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 154 - 227
Target Start/End: Original strand, 23103439 - 23103511
Alignment:
Q  154 gtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23103439 gtttgtatactgcctatgttgctgttt-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 23103511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23285941 - 23285870
Alignment:
Q  155 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23285941 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 23285870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 134 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23076540 - 23076447
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  23076540 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtggatgaagatgat 23076447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23660137 - 23660028
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||  || || | ||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  23660137 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctgtttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagttg 23660039  T
Q  217 ttgaagatgat 227  Q
     ||||||||||    
T  23660038 atgaagatgat 23660028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 120 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23207391 - 23207296
Alignment:
Q  120 gttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    |||||||| |||| |||||| |||||||||||  || |||  ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23207391 gttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23207296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23791509 - 23791292
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    ||||||||| |||| |||||||||  |||  ||||||| ||||    ||||| || |||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |    
T  23791509 aactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaat 23791410  T
Q  101 taagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagc 195  Q
    ||  | | ||  |||||   |||||||||| |||| |||||| |||||||||||  || |||   ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  23791409 tatatataatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatttttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgttgtttgcttattaactaagc 23791310  T
Q  196 tgcatgagtcggtctaag 213  Q
    | ||||||||||||||||    
T  23791309 tacatgagtcggtctaag 23791292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 6726163 - 6725997
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  6726163 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttg 6726064  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  6726063 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 6725997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 227
Target Start/End: Original strand, 22731257 - 22731350
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22731257 gatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgat 22731350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 225
Target Start/End: Original strand, 32214972 - 32215079
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32214972 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 32215069  T
Q  216 gttgaagatg 225  Q
    | | ||||||    
T  32215070 gattaagatg 32215079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 8946733 - 8946662
Alignment:
Q  155 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8946733 tttgtatactgcctatgttgctatt-gttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 8946662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22337168 - 22337120
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22337168 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 22337120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Original strand, 23040257 - 23040305
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23040257 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 23040305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 57 - 213
Target Start/End: Original strand, 22413078 - 22413240
Alignment:
Q  57 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatat--tattatatcatga 151  Q
    |||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||  | ||||  |||||   |||||||||| |||| |||||  | |||||||||||    
T  22413078 atgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatgatg-ttgagatgttgttgatttgcatttgatatattgttatatcatga 22413176  T
Q  152 --tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
      || |||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22413177 gctgttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22413240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18809111 - 18808945
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  18809111 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 18809012  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  18809011 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 18808945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23131030 - 23130864
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  23131030 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 23130931  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  23130930 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 23130864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23133497 - 23133331
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  23133497 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 23133398  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  23133397 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 23133331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 23709526 - 23709692
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  23709526 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 23709625  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  23709626 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 23709692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 23712007 - 23712173
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  23712007 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 23712106  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  23712107 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 23712173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26505547 - 26505381
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| |  ||| |    
T  26505547 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttg 26505448  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  26505447 tatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 26505381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26508025 - 26507859
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| |  ||| |    
T  26508025 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttg 26507926  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  26507925 tatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 26507859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 34402516 - 34402682
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  34402516 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 34402615  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  34402616 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 34402682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 39682481 - 39682315
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  39682481 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 39682382  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  39682381 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 39682315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 227
Target Start/End: Original strand, 45029958 - 45030014
Alignment:
Q  170 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  45029958 tgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 45030014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 571447 - 571399
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  571447 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 571399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Original strand, 22738247 - 22738295
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  22738247 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgat 22738295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23135640 - 23135592
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  23135640 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 23135592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 25108958 - 25108906
Alignment:
Q  161 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25108958 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 25108906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 28577149 - 28577101
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  28577149 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 28577101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 38967424 - 38967376
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  38967424 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 38967376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 43137349 - 43137301
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  43137349 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 117 - 213
Target Start/End: Original strand, 20520198 - 20520295
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  || |||   |||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20520198 gttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 20520295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 226
Target Start/End: Original strand, 21155172 - 21155219
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatga 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21155172 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 21155219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 24367942 - 24367787
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  24367942 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 24367843  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
     ||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367842 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 24367787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 226
Target Start/End: Original strand, 24643062 - 24643109
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatga 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24643062 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 24643109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 22459448 - 22459541
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattac 94  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||| |||  ||||||||||||||  || || || |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22459448 aactaagttgtttatcttgctgttattgtttcagtaagactgatgtatacgagttgatgttatttataatgtgatataattgtatatacattac 22459541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 227
Target Start/End: Original strand, 24529633 - 24529689
Alignment:
Q  170 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  24529633 tgttgttgtt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 24529689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Original strand, 32039610 - 32039658
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  32039610 ttgttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatgat 32039658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23004865 - 23004767
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||  |  |||   |||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23004865 gttgttgatttgcatttgatattattatatcctgaactattttatgtactacctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 23004767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 24898189 - 24898356
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  24898189 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 24898288  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  24898289 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 24898356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 24900672 - 24900839
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  24900672 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 24900771  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  24900772 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 24900839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 24903149 - 24903316
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  24903149 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 24903248  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  24903249 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 24903316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 24905626 - 24905793
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  24905626 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 24905725  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  24905726 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 24905793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 24908101 - 24908268
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  24908101 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 24908200  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  24908201 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 24908268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 213
Target Start/End: Original strand, 32451981 - 32452031
Alignment:
Q  163 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32451981 ctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 32452031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 213
Target Start/End: Original strand, 24697657 - 24697709
Alignment:
Q  161 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    ||||||||| |||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  24697657 tactgcctacgttgttgtttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaag 24697709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 23287433 - 23287384
Alignment:
Q  161 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 211  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23287433 tactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 1283751 - 1283690
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 125  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  1283751 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 1283690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 162 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392403
Alignment:
Q  162 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 211  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 125
Target Start/End: Original strand, 30344773 - 30344834
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 125  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  30344773 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 30344834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 66)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15552037 - 15551822
Alignment:
Q  12 ttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgata 111  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15552037 ttaccctgctgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaatcaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgata 15551938  T
Q  112 attgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 211  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15551937 attgagttgttgatttaccttcgatattattatatcatgatggattgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 15551838  T
Q  212 agttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||||||||    
T  15551837 agttgttgaagatgat 15551822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 16596879 - 16596686
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16596879 aactaagttgtttaccttgctgttaatgttcaagtaagactgatgcttataaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 16596780  T
Q  101 taagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaag 194  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16596779 taagtttgataattgagttgatgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaag 16596686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 8846606 - 8846361
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||  ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8846606 aactaagttgtttatcttgtagttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaat 8846507  T
Q  101 taagtttgataattgagttgttgat------------------tta-cattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttg 181  Q
    || |||||||| ||||| |||||||                  ||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  8846506 tatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttagcattcgatattgttatctcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttg 8846407  T
Q  182 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  8846406 ttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatgat 8846361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12774231 - 12774012
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||  ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||        |||||||||||| |||  |    
T  12774231 aactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgtt--------gtatatacattaaatggat 12774140  T
Q  101 taagtttgataattgagttgttgat--ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgc 198  Q
    || ||| |||||||||| ||||| |  ||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12774139 tatgtt-gataattgagatgttgttgattgtattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgc 12774041  T
Q  199 atgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  12774040 atgagtcggtctaagttgatgatgatgat 12774012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Original strand, 39706242 - 39706404
Alignment:
Q  67 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtt--tgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatact 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  || | ||   |||  ||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  39706242 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgttgatgtttatgatgttcatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatact 39706341  T
Q  165 gcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  39706342 gcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 39706404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 13737 - 13953
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    ||||||||| |||| |||  |||| |||| ||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  13737 aactaagttgtttatctttatgttgatgttccagtaagactgatgtttatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaat 13836  T
Q  101 taagtttga-taattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagct 196  Q
    ||  | ||| || ||||| |||||||   || |||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  13837 tatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagct 13936  T
Q  197 gcatgagtcggtctaag 213  Q
    |||||||||||||||||    
T  13937 gcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 48 - 216
Target Start/End: Original strand, 12288143 - 12288315
Alignment:
Q  48 tatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataat-tga-gttgttgatttacattcgatattattata 145  Q
    ||||| ||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  | ||| |||||||| || |||| |||||| |||||    
T  12288143 tatgatttaatgttgttggtaatgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtttgatgttgtgatgttgttgaattgcatttgatattgttata 12288242  T
Q  146 tcatga--tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12288243 tcatgaactggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 12288315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 43198439 - 43198660
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  43198439 aactaagttgtttatcttgttgttgatgttccagtaagactaatgcatatgaattgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaat 43198538  T
Q  101 taagtttg-ataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaag 194  Q
    ||  | || ||| |||||   ||| ||| || |||| |||||  |||||||||||  || |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  43198539 tatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcatgaattgttttgcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaag 43198638  T
Q  195 ctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  43198639 ctgcatgagtcggtctaagttg 43198660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 117 - 216
Target Start/End: Original strand, 52243200 - 52243301
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 214  Q
    |||||||| || |||| |||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52243200 gttgttgaatttcatttgatattgttatatcatgaactgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 52243299  T
Q  215 tg 216  Q
    ||    
T  52243300 tg 52243301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12902872 - 12902762
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||| ||| ||||| | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902872 gttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 12902774  T
Q  216 gttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||||    
T  12902773 gttgaagatgat 12902762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 117 - 224
Target Start/End: Original strand, 16377529 - 16377634
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16377529 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 16377626  T
Q  217 ttgaagat 224  Q
     |||||||    
T  16377627 atgaagat 16377634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 3096369 - 3096298
Alignment:
Q  155 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3096369 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 3096298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 160 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17046559 - 17046492
Alignment:
Q  160 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17046559 atactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 17046492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 7088975 - 7088882
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7088975 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 7088882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 7798872 - 7798779
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7798872 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 7798779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 227
Target Start/End: Original strand, 52873390 - 52873483
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52873390 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 52873483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 227
Target Start/End: Original strand, 14053325 - 14053417
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  14053325 gatattattatgtcatgctg-tttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagatgttgaagatgat 14053417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 6900005 - 6899896
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||   ||| || |||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6900005 gttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttg 6899907  T
Q  217 ttgaagatgat 227  Q
     ||||||||||    
T  6899906 atgaagatgat 6899896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 129 - 227
Target Start/End: Original strand, 16270254 - 16270351
Alignment:
Q  129 cattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16270254 catttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgat 16270351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 134 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22636533 - 22636440
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22636533 gatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 22636440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 155 - 225
Target Start/End: Original strand, 23374404 - 23374473
Alignment:
Q  155 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 225  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23374404 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgttctaagttgttgaagatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 47 - 227
Target Start/End: Original strand, 18215252 - 18215434
Alignment:
Q  47 ttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttg-ataattga---gttgttgatttacattcgatattatt 142  Q
    |||||| || |||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| || |||| |||||||||    
T  18215252 ttatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 18215350  T
Q  143 atatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    || ||||| ||  |||| |||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  18215351 atgtcatgctgtttttgtatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 18215434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 7893801 - 7893708
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  7893801 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagatgat 7893708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 16239976 - 16240085
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||| ||| | || ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||    
T  16239976 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctattttgctatt-gttatttaattaagttgcatgagttggtctaagttg 16240074  T
Q  217 ttgaagatgat 227  Q
     ||||||||||    
T  16240075 atgaagatgat 16240085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 44052927 - 44052834
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  44052927 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatgtt-gttatttaactgagctgcatgagtcggcctaagttgatgaagatgat 44052834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 225
Target Start/End: Original strand, 19618223 - 19618330
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19618223 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 19618320  T
Q  216 gttgaagatg 225  Q
    | | ||||||    
T  19618321 gattaagatg 19618330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Original strand, 44928866 - 44929040
Alignment:
Q  57 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgagttgtt---gatttacattcgatattattatatcatgat 152  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| |||||||| ||||   || || |||| || |||||||| ||||| |    
T  44928866 atgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgct 44928965  T
Q  153 ggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    | ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  44928966 gtttttgtatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 44929040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 14038763 - 14038653
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||  |||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14038763 gttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 14038665  T
Q  216 gttgaagatgat 227  Q
    | ||||||||||    
T  14038664 gatgaagatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 14280427 - 14280318
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280427 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 14280330  T
Q  216 gttgaagatgat 227  Q
    | | ||||||||    
T  14280329 gattaagatgat 14280318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 23803316 - 23803425
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| | | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23803316 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23803413  T
Q  216 gttgaagatgat 227  Q
    | | ||||||||    
T  23803414 gattaagatgat 23803425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 121 - 213
Target Start/End: Original strand, 46640464 - 46640558
Alignment:
Q  121 ttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||||||  || |||  |||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  46640464 ttgattttcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 46640558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 51463919 - 51464028
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| | | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51463919 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 51464016  T
Q  216 gttgaagatgat 227  Q
    | | ||||||||    
T  51464017 gattaagatgat 51464028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 54798760 - 54798870
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  54798760 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgtt-gttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 54798858  T
Q  216 gttgaagatgat 227  Q
    | | ||||||||    
T  54798859 gattaagatgat 54798870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 12301 - 12467
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  12301 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 12400  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  12401 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 12467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 215
Target Start/End: Original strand, 8574875 - 8574971
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||  | ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8574875 gttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 8574971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 15118346 - 15118512
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  15118346 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 15118445  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15118446 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 15118512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 44615456 - 44615290
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgg-tttg 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  44615456 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttg 44615357  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  44615356 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 44615290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 44773081 - 44773247
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  44773081 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 44773180  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  44773181 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 44773247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 52312678 - 52312512
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  52312678 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 52312579  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  52312578 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 52312512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Original strand, 1837621 - 1837669
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  1837621 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 1837669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Original strand, 7641294 - 7641342
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  7641294 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 7641342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12611000 - 12610952
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  12611000 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 12610952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Original strand, 18239531 - 18239579
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  18239531 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 18239579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19242749 - 19242701
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  19242749 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 19242701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 44102264 - 44102216
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  44102264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 44102216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Original strand, 50222451 - 50222499
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  50222451 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 50222499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 6190531 - 6190481
Alignment:
Q  163 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6190531 ctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 225
Target Start/End: Original strand, 15355437 - 15355483
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  15355437 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15355483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15367743 - 15367697
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  15367743 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 15367697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15370071 - 15370025
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  15370071 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 15370025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15371255 - 15371209
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  15371255 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 15371209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15373536 - 15373490
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  15373536 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 15373490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 15402756 - 15402710
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  15402756 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 15402710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16223585 - 16223539
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  16223585 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 16223539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 213
Target Start/End: Original strand, 53082085 - 53082254
Alignment:
Q  48 tatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgtt---gatttacattcgatattattat 144  Q
    ||||| || |||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||  | ||||  ||||| ||||   ||||| | || |||||| ||||    
T  53082085 tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgcttt-gatattgttat 53082183  T
Q  145 atcatga--tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    |||||||  || |||   |||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53082184 atcatgaactgttttatgtactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 53082254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 3515057 - 3515009
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  3515057 ttgttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 3515009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22353886 - 22353838
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  22353886 ttgttatttacctaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgat 22353838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 216
Target Start/End: Original strand, 14970819 - 14970856
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14970819 ttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttg 14970856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 15099528 - 15099461
Alignment:
Q  55 taatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttg 123  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||| ||||| |||||    
T  15099528 taatgttgatgataatgttatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttg 15099461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 15190495 - 15190428
Alignment:
Q  55 taatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttg 123  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||| ||||| |||||    
T  15190495 taatgttgatgataatgttatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttg 15190428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 125
Target Start/End: Original strand, 630725 - 630786
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 125  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  630725 ttataatgttatataattggatatatattgcatgcattatgtttgatgattgagatgttgat 630786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 3332055 - 3331994
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 125  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  3332055 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 3331994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 125
Target Start/End: Original strand, 13812760 - 13812821
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 125  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  13812760 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 13812821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 125
Target Start/End: Original strand, 14953912 - 14953973
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 125  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  14953912 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 14953973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 25690231 - 25690170
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 125  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  25690231 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 25690170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 181 - 213
Target Start/End: Original strand, 21815699 - 21815731
Alignment:
Q  181 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21815699 gttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34354 - 34128
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  34354 aactaagttgtttaccttgctgttaattttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatatattacttgact 34255  T
Q  101 taagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34254 taagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgtat 34155  T
Q  201 gagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  34154 gagtcggtctaagttgttgaagatgat 34128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 326 - 281
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagat 224  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  326 ttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagat 281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 57)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20918835 - 20918620
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918835 aactaagtcgtttaccttgttgttaatgttccagtaagactcatgcttatgaattgatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 20918736  T
Q  101 taagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  20918735 taagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgcagtttgttatttaactaagctgcat 20918636  T
Q  201 gagtcggtctaagttg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  20918635 gagtcggtctaagttg 20918620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 14295504 - 14295667
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14295504 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 14295603  T
Q  164 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14295604 tacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatgat 14295667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20248509 - 20248284
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    |||||||||||||| |||| ||||  ||||| |||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20248509 aactaagttatttatcttgatgttgttgtcc-agtaagactgatgcatatgaatccatgttgtttataatgatatataattgtatatacattacatgact 20248411  T
Q  101 taagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcat 200  Q
    || |||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  20248410 tatgtttgatatttaagttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttttttaactaagttgcat 20248311  T
Q  201 gagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20248310 gagtcggtctaagttgatgatgatgat 20248284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 33681241 - 33681023
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    ||||||||| |||| |||||||||  ||| | |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33681241 aactaagttgtttatcttgttgttgttgttctagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaat 33681142  T
Q  101 taagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctg 197  Q
    || |||||||| ||||| ||||||    || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  33681141 tatgtttgatatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttg 33681042  T
Q  198 catgagtcggtctaagttg 216  Q
    |||||||||||||||||||    
T  33681041 catgagtcggtctaagttg 33681023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 52927869 - 52928075
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||  ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  52927869 aactaagttgtttatcttgctattgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaat 52927968  T
Q  101 taagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcat 200  Q
    || |||||||| ||||| ||         |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52927969 tatgtttgatatttgagatg---------attcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcat 52928059  T
Q  201 gagtcggtctaagttg 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  52928060 gagtcggtctaagttg 52928075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 47 - 179
Target Start/End: Original strand, 22130843 - 22130975
Alignment:
Q  47 ttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatat 146  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22130843 ttatgatttgatgttgcttataatgttatataattgtatatgcattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatat 22130942  T
Q  147 catgatggtttgcatactgcctatgttgttgtt 179  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  22130943 catgatggtttggatactgcctatgttgctgtt 22130975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 37 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 22237825 - 22237643
Alignment:
Q  37 agactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattc 133  Q
    |||||||| | |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||   || |||||    
T  22237825 agactgatacatatgaattgatgttgtttctaaagttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattc 22237726  T
Q  134 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22237725 gatattgttatatcatgatgatttgcataatgcctatgtcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttg 22237643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Original strand, 22921823 - 22921985
Alignment:
Q  67 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||| ||||   ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  22921823 taatgttatataattgtatatacattatatgaattttg-ttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 22921921  T
Q  164 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  22921922 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgat 22921985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 51130732 - 51130632
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51130732 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 51130633  T
Q  164 t 164  Q
    |    
T  51130632 t 51130632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21754269 - 21754052
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| | ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||        |||||||||||| |||  |    
T  21754269 aactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgtt--------gtatatacattaaatggat 21754178  T
Q  101 taagtttgataattgagttgttgat--ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgc 198  Q
    || ||| |||||||||| ||||| |  || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21754177 tatgtt-gataattgagatgttgttgattgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgc 21754079  T
Q  199 atgagtcggtctaagttgttgaagatg 225  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  21754078 atgagtcggtctaagttgatgatgatg 21754052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 57 - 213
Target Start/End: Original strand, 35261023 - 35261180
Alignment:
Q  57 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggt 155  Q
    |||||| | ||||||| || ||||||||||| |||||| ||| ||| || ||| |  ||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||| || |    
T  35261023 atgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttgagatgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgtt 35261122  T
Q  156 ttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35261123 ttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 47 - 213
Target Start/End: Original strand, 21896188 - 21896358
Alignment:
Q  47 ttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgagttgttgat---ttacattcgatattatt 142  Q
    |||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  | ||| |  ||||| |||||||   || |||| |||||| ||    
T  21896188 ttatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgtt 21896287  T
Q  143 atatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21896288 atatcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 57 - 213
Target Start/End: Original strand, 21861512 - 21861672
Alignment:
Q  57 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgat 152  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  | ||| |  ||||| |||||||   || |||| |||||| |||||||||| |    
T  21861512 atgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgct 21861611  T
Q  153 ggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21861612 gttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16758749 - 16758665
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16758749 gatattgttatatcatgaactggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 16758665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 63 - 227
Target Start/End: Original strand, 45574835 - 45575003
Alignment:
Q  63 cttataatgttatataattgtatatacattacatgactta-agtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gttt 157  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| ||| |  || ||||||||   |||||||| || |||| | ||||||||| ||||| ||  |||    
T  45574835 cttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgttttt 45574934  T
Q  158 gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  45574935 gcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgat 45575003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 50210219 - 50210329
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50210219 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 50210317  T
Q  216 gttgaagatgat 227  Q
    | ||||||||||    
T  50210318 gatgaagatgat 50210329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34509895 - 34509785
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||||||| || |||| ||||| ||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34509895 gttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 34509797  T
Q  216 gttgaagatgat 227  Q
    | ||||||||||    
T  34509796 gatgaagatgat 34509785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 161 - 227
Target Start/End: Original strand, 20847205 - 20847270
Alignment:
Q  161 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20847205 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 20847270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 227
Target Start/End: Original strand, 27250752 - 27250845
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27250752 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 27250845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 156 - 227
Target Start/End: Original strand, 38801433 - 38801503
Alignment:
Q  156 ttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  38801433 ttgcacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagatgttgaagatgat 38801503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21026756 - 21026685
Alignment:
Q  155 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21026756 tttgtatactgcctatattgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgacgatgat 21026685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 213
Target Start/End: Original strand, 50614121 - 50614219
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  || |||   |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50614121 gttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50614219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 213
Target Start/End: Original strand, 50621949 - 50622047
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  || |||   |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50621949 gttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50622047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21840878 - 21840771
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21840878 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 21840781  T
Q  216 gttgaagatg 225  Q
    | | ||||||    
T  21840780 gattaagatg 21840771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 433185 - 433014
Alignment:
Q  57 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgat 152  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| || ||||    
T  433185 atgttgtttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgat 433086  T
Q  153 ggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    | ||| | ||||||||| |||||  |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  433085 gtttttgtatactgcctgtgttgccgtt----atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 433014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 213
Target Start/End: Original strand, 16368291 - 16368388
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  || |||  || |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16368291 gttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaattgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 16368388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21161831 - 21161721
Alignment:
Q  116 agttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    ||||| ||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||  | ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  21161831 agttgatgaattgcattcgatattgttatatcacgatgatttgcatactgttt-tgttgctgtttgttgtttaactaagttgcatgagtcgatccaagtt 21161733  T
Q  216 gttgaagatgat 227  Q
    | ||| ||||||    
T  21161732 gatgatgatgat 21161721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22532384 - 22532274
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  22532384 gttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaaattgcatgagttggtctaagtt 22532286  T
Q  216 gttgaagatgat 227  Q
    | ||||||||||    
T  22532285 gatgaagatgat 22532274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13989034 - 13988868
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  13989034 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 13988935  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  13988934 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 13988868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 225
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454667
Alignment:
Q  163 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 225  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 20454667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 21923285 - 21923451
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  21923285 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 21923384  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  21923385 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 21923451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 22123061 - 22123228
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||| | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| |  ||| |    
T  22123061 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacattgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttg 22123160  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  22123161 tatactgt-tgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagattaagatgat 22123228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21707225 - 21707169
Alignment:
Q  170 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  21707225 tgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 21707169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21711767 - 21711711
Alignment:
Q  170 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  21711767 tgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 21711711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 227
Target Start/End: Original strand, 23593722 - 23593895
Alignment:
Q  57 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgat 152  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| |    
T  23593722 atgttgtttatattgtgatataattatatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 23593821  T
Q  153 ggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    | ||| | ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  23593822 gtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 23593895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Original strand, 13212974 - 13213022
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  13212974 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 13213022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21342146 - 21342098
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  21342146 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 21342098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21347011 - 21346963
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  21347011 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 21346963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 29298187 - 29298139
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  29298187 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 29298139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 29776738 - 29776690
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  29776738 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 29776690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 31612363 - 31612315
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  31612363 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 31612315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 56 - 213
Target Start/End: Original strand, 16093825 - 16093987
Alignment:
Q  56 aatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttg----atttacattcgatattattatatcatga 151  Q
    ||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||  | ||||  ||||| |||||    |||| |||| |||||| |||||||||||    
T  16093825 aatgttgattttaatgtgatatatttgtatatacattacatgaattacctatgatgtttgagatgttgtttgatttgcatt-gatattgttatatcatga 16093923  T
Q  152 --tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
      || |||  ||||||||||||||| | ||||||  ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  16093924 gctgttttctatactgcctatgttgctatttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaag 16093987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 117 - 213
Target Start/End: Original strand, 41050040 - 41050138
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  |  |||  ||||||||||||||| |||| |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  41050040 gttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactattttatatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaag 41050138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 21475081 - 21475247
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  21475081 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 21475180  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  21475181 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgat 21475247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Original strand, 15860121 - 15860169
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  15860121 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgat 15860169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 16361965 - 16361921
Alignment:
Q  181 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  16361965 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 16361921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21714595 - 21714547
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  21714595 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgat 21714547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 134 - 227
Target Start/End: Original strand, 16275432 - 16275524
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16275432 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgtcgttgtt-gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16275524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 54 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 20637029 - 20636975
Alignment:
Q  54 ttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttg 108  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  20637029 ttaatgttgatgataatgttatataattgtatatacattatatgaattatgtttg 20636975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 50686791 - 50686630
Alignment:
Q  57 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg 153  Q
    |||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||  | ||||  |||||   |||||||||| |||| || ||| |||||||||||      
T  50686791 atgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgacattgttatatcatgaac 50686692  T
Q  154 gtttgcat--actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
      ||  ||  |||||||||||||  |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  50686691 tattttatgaactgcctatgttgccgtttgtttattaactaaactgcatgagtcggtctaag 50686630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 225
Target Start/End: Original strand, 22468764 - 22468810
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 225  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  22468764 ttgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 22468810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 26065009 - 26064959
Alignment:
Q  161 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||    
T  26065009 tactgcctatgttgctgtttgtttatcaactaagctgcatgagttggtcta 26064959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 49261519 - 49261481
Alignment:
Q  55 taatgttgcttataatgttatataattgtatatacatta 93  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49261519 taatgttgatgataatgttatataattgtatatacatta 49261481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 125
Target Start/End: Original strand, 1924911 - 1924972
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 125  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  1924911 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 1924972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 125
Target Start/End: Original strand, 20923925 - 20923986
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 125  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  20923925 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 20923986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 213
Target Start/End: Original strand, 21533923 - 21533974
Alignment:
Q  161 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  21533923 tactgcgtatgttgttgttgtttagt-aactaagctgcatgagtcggtctaag 21533974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 123
Target Start/End: Original strand, 35981629 - 35981696
Alignment:
Q  55 taatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttg 123  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| | |||||| ||||| |||||    
T  35981629 taatgttgatgataatgttatataattgcatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttg 35981696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 68)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 28496361 - 28496587
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28496361 aactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcatatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 28496460  T
Q  101 taagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcat 200  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  28496461 tatgtttgatatttgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcat 28496560  T
Q  201 gagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  28496561 gagtcggtctaagtttttgaagatgat 28496587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 29808772 - 29808998
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29808772 aactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcatatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 29808871  T
Q  101 taagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcat 200  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  29808872 tatgtttgatatttgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctaattgttatttaactaagctgcat 29808971  T
Q  201 gagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  29808972 gagtcggtctaagtttttgaagatgat 29808998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 1561535 - 1561308
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaatt-aatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgac 99  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1561535 aactaagttgtttatcttgctgttaatattccagtaagactgatgcatatgaatttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgac 1561436  T
Q  100 ttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgca 199  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1561435 ttatgtttgatatttgagttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgca 1561336  T
Q  200 tgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  1561335 tgagtcagtctaagttgttgaagatgat 1561308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19652427 - 19652200
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |    
T  19652427 aactaagttgtttatcttgctgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatactttaaatggat 19652328  T
Q  101 taagtttgataattgagttgttgat--ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgc 198  Q
    || ||| |||  ||||| ||||| |  || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19652327 tatgtt-gatgtttgagatgttgttgattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgc 19652229  T
Q  199 atgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  19652228 atgagtcggtctaagttgatgatgatgat 19652200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 19668606 - 19668387
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||  |||  ||||||| ||||||  |||||  || ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  19668606 aactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagtctgatgtatatgatgtagtgttgttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaat 19668507  T
Q  101 taagtttgataat-tga-gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagct 196  Q
    || || ||||  | ||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  || ||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  19668506 tacgtatgatgttgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgcatactatctatgttgctgtttgttaattaactaagct 19668407  T
Q  197 gcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19668406 gcatgagtcggtctaagttg 19668387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 131 - 227
Target Start/End: Original strand, 27333238 - 27333334
Alignment:
Q  131 ttcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  27333238 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 27333334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 131 - 227
Target Start/End: Original strand, 27393978 - 27394074
Alignment:
Q  131 ttcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  27393978 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 27394074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23019574 - 23019425
Alignment:
Q  67 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||   ||||||| || |||| |||||| |||||||||| || |||||||||    
T  23019574 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatac 23019475  T
Q  164 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    ||| ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23019474 tgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtctaag 23019425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 67 - 216
Target Start/End: Original strand, 9098466 - 9098619
Alignment:
Q  67 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataat-tga-gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcata 162  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||  | ||| ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||  || ||||||||    
T  9098466 taatgttatataattatatatacattacatgaattatgtttgatgttgtgaagttgttgaaatgcatttgatattgttatatcatgaattgttttgcata 9098565  T
Q  163 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9098566 ctgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 9098619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 20109343 - 20109154
Alignment:
Q  33 agtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataat--tgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgagttgttgat---t 126  Q
    |||||||||||||  ||| |||| |||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||| |||  | ||| || ||||| |||||||   |    
T  20109343 agtaagactgatgtatatcaattgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgact 20109244  T
Q  127 tacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    | |||| |||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20109243 tgcatttgatattgttatattatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20109154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 119 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20076812 - 20076705
Alignment:
Q  119 tgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgtt 218  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20076812 tgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20076714  T
Q  219 gaagatgat 227  Q
    |||||||||    
T  20076713 gaagatgat 20076705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 57 - 225
Target Start/End: Original strand, 8227453 - 8227625
Alignment:
Q  57 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataatt---ga-gttgttgatttacattcgatattattatatcatgat 152  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | |||| |||   || |||||| | |||| | ||||||||||||||||||||    
T  8227453 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 8227552  T
Q  153 ggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 225  Q
    | ||||||||||||||| |||| || |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8227553 gttttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatg 8227625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16496359 - 16496249
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16496359 gttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 16496261  T
Q  216 gttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||||    
T  16496260 gttgaagatgat 16496249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 19303547 - 19303656
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19303547 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatacttcctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 19303645  T
Q  217 ttgaagatgat 227  Q
     ||||||||||    
T  19303646 atgaagatgat 19303656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 35245682 - 35245591
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35245682 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 35245591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 116 - 216
Target Start/End: Original strand, 4185826 - 4185926
Alignment:
Q  116 agttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    ||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  4185826 agttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagtt 4185925  T
Q  216 g 216  Q
    |    
T  4185926 g 4185926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 117 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25644436 - 25644336
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||| ||| ||||||| |||||| |||||||| | || ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25644436 gttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 25644337  T
Q  216 g 216  Q
    |    
T  25644336 g 25644336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 29060655 - 29060545
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29060655 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagct 29060557  T
Q  216 gttgaagatgat 227  Q
    | ||||||||||    
T  29060556 gatgaagatgat 29060545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 227
Target Start/End: Original strand, 20638306 - 20638399
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20638306 gatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgat 20638399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 160 - 227
Target Start/End: Original strand, 16920679 - 16920746
Alignment:
Q  160 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16920679 atactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaagatgttgaagatgat 16920746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 18409833 - 18409943
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18409833 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagtt 18409931  T
Q  216 gttgaagatgat 227  Q
    | ||||||||||    
T  18409932 gatgaagatgat 18409943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 47 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22782411 - 22782229
Alignment:
Q  47 ttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattatt 142  Q
    |||||| || |||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| ||| || ||| ||||||||   ||||||| || |||| |||||||||    
T  22782411 ttatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 22782313  T
Q  143 atatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    || ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  22782312 atgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 22782229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 134 - 227
Target Start/End: Original strand, 17287819 - 17287912
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  17287819 gatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 17287912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 4186483 - 4186383
Alignment:
Q  116 agttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    ||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  4186483 agttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgtctatgttgctgcctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagtt 4186384  T
Q  216 g 216  Q
    |    
T  4186383 g 4186383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 169 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 11185568 - 11185517
Alignment:
Q  169 atgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttga 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11185568 atgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttga 11185517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 164 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22831571 - 22831508
Alignment:
Q  164 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  22831571 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgat 22831508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 225
Target Start/End: Original strand, 30676761 - 30676868
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676761 gttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 30676858  T
Q  216 gttgaagatg 225  Q
    | | ||||||    
T  30676859 gattaagatg 30676868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Original strand, 22780272 - 22780343
Alignment:
Q  155 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22780272 tttgtatattgcctatgtttttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 22780343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 161 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 23076801 - 23076749
Alignment:
Q  161 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076801 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23076749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 161 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 35008219 - 35008167
Alignment:
Q  161 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35008219 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35008167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20593888 - 20593778
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  20593888 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgttt-ttatttaactgagctgcatgattcggtctaagtt 20593790  T
Q  216 gttgaagatgat 227  Q
    | ||||||||||    
T  20593789 gatgaagatgat 20593778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 129 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 25656728 - 25656631
Alignment:
Q  129 cattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  25656728 catttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 25656631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 25754920 - 25754811
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| | | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25754920 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 25754823  T
Q  216 gttgaagatgat 227  Q
    | | ||||||||    
T  25754822 gattaagatgat 25754811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 1595717 - 1595551
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttg-ataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttg 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  1595717 ttatattgtgatataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttg 1595618  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  1595617 tatactg-ttatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgat 1595551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 2291174 - 2291340
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  2291174 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttg 2291273  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  2291274 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 2291340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12742485 - 12742319
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  12742485 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 12742386  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  12742385 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 12742319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 18334586 - 18334752
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  18334586 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 18334685  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  18334686 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 18334752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19005214 - 19005048
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  19005214 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 19005115  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  19005114 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 19005048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 19858913 - 19859079
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  19858913 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 19859012  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  19859013 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 19859079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 227
Target Start/End: Original strand, 20360983 - 20361076
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  20360983 gatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgatgaaaatgat 20361076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24422715 - 24422549
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  24422715 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 24422616  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  24422615 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 24422549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 33861962 - 33861796
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  33861962 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 33861863  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  33861862 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 33861796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 33864446 - 33864280
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  33864446 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 33864347  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  33864346 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 33864280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 8055079 - 8055031
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  8055079 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 8055031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Original strand, 25629423 - 25629471
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25629423 ttgtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 25629471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 25714470 - 25714422
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  25714470 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 25714422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Original strand, 26924752 - 26924800
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  26924752 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 26924800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Original strand, 1541023 - 1541071
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  1541023 ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgat 1541071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Original strand, 3852129 - 3852177
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  3852129 ttgttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 3852177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Original strand, 20557004 - 20557052
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  20557004 ttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgat 20557052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 129 - 173
Target Start/End: Original strand, 22080756 - 22080800
Alignment:
Q  129 cattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgtt 173  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22080756 cattcgatattgttatatcatgatgttttgcatactgcctatgtt 22080800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 226
Target Start/End: Original strand, 16448639 - 16448686
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatga 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||    
T  16448639 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 16448686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 116 - 174
Target Start/End: Original strand, 4668216 - 4668274
Alignment:
Q  116 agttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttg 174  Q
    ||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4668216 agttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttg 4668274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 116 - 174
Target Start/End: Original strand, 4675063 - 4675121
Alignment:
Q  116 agttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttg 174  Q
    ||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4675063 agttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttg 4675121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 18456769 - 18456735
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456769 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 18461929 - 18461895
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461929 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 213
Target Start/End: Original strand, 18821912 - 18821946
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821912 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 69 - 227
Target Start/End: Original strand, 31155354 - 31155513
Alignment:
Q  69 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtt--tgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgc 166  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||| |||  ||||| |  ||||| ||| || ||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||     
T  31155354 atgttatataaatgtataaacattgcatgatttatgttgatgata-tgaagttgatgaattgcattcgatattgttatatcacgatgacttgcatactgt 31155452  T
Q  167 ctatgttgttgttt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     || |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||  || |||||| ||| ||||||    
T  31155453 tta-gttgctgttttgttatttaactaagttgcatgagtcaatccaagttgatgatgatgat 31155513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 34963423 - 34963377
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 225  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  34963423 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 34963377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25688552 - 25688515
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25688552 ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttg 25688515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 33443118 - 33443068
Alignment:
Q  160 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 211  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33443118 atactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 225
Target Start/End: Original strand, 19848063 - 19848109
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 225  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  19848063 ttgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 19848109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 227
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080841
Alignment:
Q  185 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgat 22080841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 22949469 - 22949408
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 125  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  22949469 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 22949408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 22953425 - 22953364
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 125  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  22953425 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 22953364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 23871913 - 23871852
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 125  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  23871913 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 23871852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 23875869 - 23875808
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 125  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  23875869 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 23875808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 125
Target Start/End: Original strand, 27325385 - 27325446
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 125  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| ||| | ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  27325385 ttataatgttatataattatatatatattgcattaattatgtttgatgattgagatgttgat 27325446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15892 - 15666
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15892 aactaagttgtttaccttgctgttaatgatccagtaagactgattcttatgaaataatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 15793  T
Q  101 taagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  15792 taagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcac 15693  T
Q  201 gagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||    
T  15692 gagtcggtctaagttgattaagatgat 15666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 168; Significance: 3e-90; HSPs: 83)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 13210216 - 13210443
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaatt-aatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgac 99  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||  | |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13210216 aactaagttgtttatcttgttgttaacattccagtaaggctgatgcatatgaattcaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgac 13210315  T
Q  100 ttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgca 199  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  13210316 ttatgtttgatatttaagttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgca 13210415  T
Q  200 tgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13210416 tgagtcggtctaagttgttgaagatgat 13210443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 227
Target Start/End: Original strand, 12174152 - 12174375
Alignment:
Q  4 taagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaa 103  Q
    |||||| |||| |||| ||||  ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12174152 taagttgtttagcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaatcaatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgacttat 12174251  T
Q  104 gtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgag 203  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12174252 gtttgatatttgagttgttgttttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 12174351  T
Q  204 tcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||    
T  12174352 tcggtctaagttgatgatgatgat 12174375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16097562 - 16097333
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||  ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16097562 aactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaat 16097463  T
Q  101 taagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctg 197  Q
    || |||||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16097462 tatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatgatgatgatttgcatattgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctg 16097363  T
Q  198 catgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  16097362 catgagtcggtctaagttgatgatgatgat 16097333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16104013 - 16103785
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||  ||| ||||||||||| || | |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |    
T  16104013 aactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactaatccatatgaattgatgttgtttataatgttatataattttatatacattaaatgaat 16103914  T
Q  101 taagtttgataattgagttgttgat--ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgc 198  Q
    || |||||||| ||||| ||||| |  || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  16103913 tatgtttgatatttgagatgttgttgattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgc 16103814  T
Q  199 atgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  16103813 atgagtcggtctaagttgatgatgatgat 16103785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 67 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 15471092 - 15470940
Alignment:
Q  67 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  15471092 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 15470993  T
Q  164 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15470992 tgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15470940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 32307901 - 32307684
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||        |||||||||||| |||  |    
T  32307901 aactaagttgtttatcttgctgtcattgttctagtaagactgatgcttatgaattaatgttgtttataatgtt--------gtatatacattaaatggat 32307810  T
Q  101 taagtttgataattgagttgttgat--ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgc 198  Q
    || ||| |||||||||| ||||| |  || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32307809 tatgtt-gataattgagatgttgttgattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgc 32307711  T
Q  199 atgagtcggtctaagttgttgaagatg 225  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||    
T  32307710 atgagtcggtctaagttgatgatgatg 32307684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 9513141 - 9512925
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||        ||||||| |||  |    
T  9513141 aactaagttgtttaccttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttttata--------tacattaaatggat 9513050  T
Q  101 taagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcat 200  Q
    || ||| ||||| |||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  9513049 tatgtt-gataaatgagatgttgattg-cattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcat 9512952  T
Q  201 gagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||    
T  9512951 gagtcggtctaagatgatgatgatgat 9512925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 9521116 - 9520900
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||  ||||        ||||||| |||  |    
T  9521116 aactaagttgtttaccttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgtgttata--------tacattaaatggat 9521025  T
Q  101 taagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcat 200  Q
    || ||| ||||| |||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  9521024 tatgtt-gataaatgagatgttgattg-cattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcat 9520927  T
Q  201 gagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||||| || ||| ||||||    
T  9520926 gagtcggtctaagatgatgatgatgat 9520900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 14234655 - 14234492
Alignment:
Q  67 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||  | |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  14234655 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 14234556  T
Q  164 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||    
T  14234555 tgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaagttgattaagatgat 14234492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 57 - 213
Target Start/End: Original strand, 52523669 - 52523831
Alignment:
Q  57 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatga- 151  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| |  |||||   |||||||||| ||||||||||| |||||||||||     
T  52523669 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgaa 52523768  T
Q  152 -tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52523769 ctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 129 - 227
Target Start/End: Original strand, 49668094 - 49668192
Alignment:
Q  129 cattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  49668094 cattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgat 49668192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 225
Target Start/End: Original strand, 1644571 - 1644787
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||        |||||||||||| |||  |    
T  1644571 aactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgtt--------gtatatacattaaatggat 1644662  T
Q  101 taagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctg 197  Q
    || ||| ||||||||||   |||||||||   |||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||      
T  1644663 tatgtt-gataattgagatattgttgattgt-attcgatattgttatataatgatgatttgcatactgcctatgttgttg-ttgttatttaactaagcaa 1644759  T
Q  198 catgagtcggtctaagttgttgaagatg 225  Q
    ||| ||| ||||||||||| ||| ||||    
T  1644760 cataagttggtctaagttgatgacgatg 1644787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 49389517 - 49389639
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    ||||||||| |||| |||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  49389517 aactaagttgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaaatgaat 49389616  T
Q  101 taagtttgataattgagttgttg 123  Q
    || |||||||| ||||| |||||    
T  49389617 tatgtttgatagttgagatgttg 49389639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 57 - 225
Target Start/End: Original strand, 24340665 - 24340837
Alignment:
Q  57 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgagttgttgatt---tacattcgatattattatatcatgat 152  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| || ||||| ||||| ||   | | ||||||||||||||||||||||    
T  24340665 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgat 24340764  T
Q  153 ggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 225  Q
    | | |||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  24340765 gttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 24340837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12399324 - 12399214
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12399324 gttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 12399226  T
Q  216 gttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||||    
T  12399225 gttgaagatgat 12399214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 57 - 225
Target Start/End: Original strand, 37642207 - 37642379
Alignment:
Q  57 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataatt---ga-gttgttgatttacattcgatattattatatcatgat 152  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | |||| |||   || |||||| | |||| | ||||||||||||||||||||    
T  37642207 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 37642306  T
Q  153 ggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 225  Q
    | |||||||||||||||||||| || |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  37642307 gttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatg 37642379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 14972969 - 14972859
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14972969 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 14972871  T
Q  216 gttgaagatgat 227  Q
    | ||||||||||    
T  14972870 gatgaagatgat 14972859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18438649 - 18438539
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18438649 gttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 18438551  T
Q  216 gttgaagatgat 227  Q
    | ||||||||||    
T  18438550 gatgaagatgat 18438539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 131 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23274788 - 23274705
Alignment:
Q  131 ttcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  23274788 ttcgatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagt 23274705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 109 - 227
Target Start/End: Original strand, 11424758 - 11424875
Alignment:
Q  109 ataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 208  Q
    ||||||||| ||||||||| |  | |||||| |||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11424758 ataattgagatgttgatttgctattgatattgttatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagt 11424856  T
Q  209 ctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  11424857 ctaagttgatgaagatgat 11424875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 129 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 27165350 - 27165252
Alignment:
Q  129 cattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||| ||||||  ||||||||| || ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  27165350 catttgatattggtatatcatgttgttttgcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 27165252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 129 - 227
Target Start/End: Original strand, 53301569 - 53301667
Alignment:
Q  129 cattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  53301569 catttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgat 53301667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17672737 - 17672628
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17672737 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 17672640  T
Q  216 gttgaagatgat 227  Q
    | | ||||||||    
T  17672639 gattaagatgat 17672628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 227
Target Start/End: Original strand, 43550456 - 43550639
Alignment:
Q  47 ttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttg-ataattga---gttgttgatttacattcgatattatt 142  Q
    |||||| || |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| || |||| |||||||||    
T  43550456 ttatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 43550554  T
Q  143 atatcatgatg-gtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    || ||||| ||  |||||||||||| ||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  43550555 atgtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctg-tcattatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgat 43550639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 26686985 - 26686892
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26686985 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagaagatgat 26686892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Original strand, 20698480 - 20698551
Alignment:
Q  155 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20698480 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 20698551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 134 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13442372 - 13442279
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13442372 gatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 13442279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 134 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 14572686 - 14572605
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    ||||||||||| ||||| || |||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14572686 gatattattatgtcatgctgttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 14572605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 57 - 225
Target Start/End: Original strand, 22147467 - 22147639
Alignment:
Q  57 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataatt---ga-gttgttgatttacattcgatattattatatcatgat 152  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | |||| |||   || |||||| | |||| | ||||||||||||||||||||    
T  22147467 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 22147566  T
Q  153 ggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 225  Q
    | ||||||||| ||||| |||| || |  |||  |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||    
T  22147567 gttttgcataccgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgactcggtccaagtcgttgaagatg 22147639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 24153215 - 24153324
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||| ||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24153215 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactacctatgttgctatc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 24153313  T
Q  217 ttgaagatgat 227  Q
     | ||||||||    
T  24153314 attaagatgat 24153324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 48 - 213
Target Start/End: Original strand, 37251101 - 37251270
Alignment:
Q  48 tatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattat 144  Q
    ||||| || |||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||  | ||||  |||||   |||||||||| |||| |||||| ||||    
T  37251101 tatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatgatg-ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttat 37251199  T
Q  145 atcatga--tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    |||||||  || |||  ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37251200 atcatgaactgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtctaag 37251270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Original strand, 23083406 - 23083477
Alignment:
Q  155 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23083406 tttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 23083477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 28194755 - 28194695
Alignment:
Q  167 ctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  28194755 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 28194695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 43841030 - 43840940
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagat 224  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  43841030 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgatgaagat 43840940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 43926075 - 43925977
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  || |||   |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43926075 gttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 43925977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 7781341 - 7781507
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   |||||||||| |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  7781341 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 7781440  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  7781441 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 7781507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17487954 - 17487861
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17487954 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 17487861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17499436 - 17499343
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | |||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17499436 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 17499343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 36166708 - 36166600
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||| | ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36166708 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 36166611  T
Q  217 ttgaagatgat 227  Q
     | ||||||||    
T  36166610 attaagatgat 36166600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 119 - 213
Target Start/End: Original strand, 22110358 - 22110454
Alignment:
Q  119 tgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||||||||||  || |||   |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22110358 tgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 22110454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 227
Target Start/End: Original strand, 29172587 - 29172743
Alignment:
Q  74 atataattgtatatacattacatgacttaagtttg-ataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttgcatactgcct 168  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||| |||||| ||    
T  29172587 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg-ct 29172685  T
Q  169 atgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  29172686 gtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 29172743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 25476391 - 25476501
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| ||| ||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25476391 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctgtt-gttttttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 25476489  T
Q  216 gttgaagatgat 227  Q
    | ||||||||||    
T  25476490 gatgaagatgat 25476501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 40213727 - 40213836
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtt-tgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40213727 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactgc-tgtgttgatgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 40213824  T
Q  216 gttgaagatgat 227  Q
    | | ||||||||    
T  40213825 gattaagatgat 40213836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 9707601 - 9707767
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttg-ataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-gtttg 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  9707601 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttg 9707700  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     |||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  9707701 tatactg-ctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 9707767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 16282805 - 16282971
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || ||||| |||||||||| ||||| || ||| |    
T  16282805 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttg 16282904  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16282905 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17463346 - 17463180
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  17463346 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 17463247  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  17463246 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 17463180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34159494 - 34159328
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  34159494 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 34159395  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  34159394 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 34159328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 42386525 - 42386428
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 214  Q
    |||||||| || |||| |||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42386525 gttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaaactgcatgagtcggtctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 45606901 - 45607067
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  45606901 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 45607000  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  45607001 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 45607067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 55476659 - 55476493
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  55476659 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 55476560  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  55476559 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 55476493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 117 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 12567671 - 12567564
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| | ||| ||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567671 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 12567574  T
Q  216 gttgaagatg 225  Q
    | | ||||||    
T  12567573 gattaagatg 12567564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 117 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13544136 - 13544029
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| | ||| ||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544136 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 13544039  T
Q  216 gttgaagatg 225  Q
    | | ||||||    
T  13544038 gattaagatg 13544029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Original strand, 6469246 - 6469294
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  6469246 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 6469294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 8499568 - 8499520
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  8499568 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 8499520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 10557035 - 10556987
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  10557035 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 10556987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15412479 - 15412431
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15412479 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 15412431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15977565 - 15977517
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15977565 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 15977517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17737286 - 17737238
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  17737286 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 17737238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Original strand, 28848723 - 28848771
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  28848723 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 28848771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 41123940 - 41123892
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  41123940 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Original strand, 45577950 - 45577998
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  45577950 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 45577998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 50242933 - 50242835
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| | | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50242933 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 50242836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 55500992 - 55500944
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  55500992 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 55500944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 47 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 8899278 - 8899096
Alignment:
Q  47 ttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattatt 142  Q
    |||||| || |||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| |||||||||    
T  8899278 ttatgatttgatgttg-ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatt 8899180  T
Q  143 atatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    || ||||| || ||| | ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  8899179 atgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgat 8899096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 117 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 12378038 - 12377940
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  |  |||  ||||||||||||||| |||||||   |||||||||||| |||||||||||||||    
T  12378038 gttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctattttatatactgcctatgttgctgtttgtctattaactaagctgtatgagtcggtctaag 12377940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 117 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 21618559 - 21618462
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||  | ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618559 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgt-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21618462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 216
Target Start/End: Original strand, 38961885 - 38962040
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  38961885 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 38961984  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
     ||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961985 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 38962040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 16454275 - 16454441
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  16454275 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 16454374  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16454375 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16454441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Original strand, 10247835 - 10247883
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  10247835 ttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgat 10247883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Original strand, 12119837 - 12119885
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  12119837 ttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 12119885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 44494859 - 44494811
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  44494859 ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgat 44494811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 13151784 - 13151951
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  13151784 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 13151883  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  13151884 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 13151951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 13154249 - 13154416
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  13154249 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 13154348  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  13154349 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 13154416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 216
Target Start/End: Original strand, 14576839 - 14576937
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || | |  |||||| |||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  14576839 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgtttatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgaatgagtcggtctaagttg 14576937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 213
Target Start/End: Original strand, 606378 - 606428
Alignment:
Q  163 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  606378 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtataag 606428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 213
Target Start/End: Original strand, 53070765 - 53070799
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070765 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 12934199 - 12934268
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataat 70  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| | ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  12934199 aactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataat 12934268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 123
Target Start/End: Original strand, 1465352 - 1465419
Alignment:
Q  55 taatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttg 123  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||| |||||    
T  1465352 taatgttgatgataatgttatacaattgtatatacattacatgaattatg-ttgatatttgagatgttg 1465419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Original strand, 17446767 - 17446814
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  17446767 ttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgattaagatgat 17446814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 170
Target Start/End: Original strand, 2051141 - 2051260
Alignment:
Q  57 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatga- 151  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| |  |||||   |||||||||| |||| |||||| |||||||||||     
T  2051141 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaa 2051240  T
Q  152 -tggtttgcatactgcctat 170  Q
     || ||||||||||||||||    
T  2051241 ctgttttgcatactgcctat 2051260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 46822318 - 46822272
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 225  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||    
T  46822318 ttgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatg 46822272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 19776092 - 19776031
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 125  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  19776092 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 19776031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 125
Target Start/End: Original strand, 37439418 - 37439479
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 125  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  37439418 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 37439479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 1022 - 1185
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1022 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 1121  T
Q  164 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1122 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 1185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 149; Significance: 7e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 7043 - 6831
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7043 aactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattaatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgact 6944  T
Q  101 taagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcat 200  Q
    || |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  6943 tatgtttgatatttgagttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactgagctgcat 6844  T
Q  201 gagtcggtctaag 213  Q
    |||||||||||||    
T  6843 gagtcggtctaag 6831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 8183 - 8097
Alignment:
Q  67 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatg 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||   |||||||| || |||| |||||| ||||||||||    
T  8183 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatg 8097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 141; Significance: 4e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 2332 - 2508
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2332 aactaagttttttaccttgctattaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattaaatgact 2431  T
Q  101 taagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttg 177  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  2432 taagtttgataattgagttgctgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatacggtctaagttgttg 2508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 29167 - 29354
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataat---gttatataattgtatatacattacatg 97  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||    
T  29167 aactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataattatgttatataattgtatatacagtacatg 29266  T
Q  98 acttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttat 185  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  29267 acttaagtttgataattgagttgctgatttacattcgatattattatatcatgatagtttgaatactacctatgttgctgtttgttat 29354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 48 - 216
Target Start/End: Original strand, 8007 - 8179
Alignment:
Q  48 tatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataat-tga-gttgttgatttacattcgatattattata 145  Q
    ||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  | ||||  | ||| |||||||||||  ||| |||||| |||||    
T  8007 tatgatttaatgttgttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatgttgtgatgttgttgatttgtatttgatattgttata 8106  T
Q  146 tcatga--tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    ||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8107 tcatgaactggtttgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 8179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 10428 - 10646
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    ||||||||| |||| |||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10428 aactaagttgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaat 10527  T
Q  101 taagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctg 197  Q
    || |||||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10528 tatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 10627  T
Q  198 catgagtcggtctaagttg 216  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  10628 cataagtcggtctaagttg 10646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 45679 - 45908
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    ||||||||| ||||  ||| ||| | ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  45679 aactaagttgtttatattgctgtaattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacatcacatgaat 45778  T
Q  101 taagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctg 197  Q
    || |||||||||||||| |||||||   |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  45779 tatgtttgataattgagatgttgatgacttacattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatttttctgtttgttatttaactaagctg 45878  T
Q  198 catgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  45879 catgagtcggtctaagttgatgatgatgat 45908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 130139 - 129921
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||  ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  130139 aactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttacaatgttatataattgtatatacattacatgaat 130040  T
Q  101 taagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctg 197  Q
    || |||||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||    
T  130039 tatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtgtgttatttaactaagatg 129940  T
Q  198 catgagtcggtctaagttg 216  Q
    |||||||||||||||||||    
T  129939 catgagtcggtctaagttg 129921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 213
Target Start/End: Original strand, 60721 - 60818
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    ||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||  || |||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  60721 gttgttgatttgcatt-gatattggtatatcatgagctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 60818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 160917 - 160689
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    ||||||||| |||| |||||||||  |||  | ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  160917 aactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcggtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatatattacatgact 160818  T
Q  101 taagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctg 197  Q
    || |||||||| ||||   ||||||||||  |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  160817 tatgtttgatatttgacatgttgttgattg-catttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctg 160719  T
Q  198 catgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  160718 catgagtcggtctaagttgatgatgatgat 160689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 501134 - 501088
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  501134 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 501088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Original strand, 85692 - 85740
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  85692 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgat 85740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 37 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 327 - 134
Alignment:
Q  37 agactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattc 133  Q
    |||||||| | |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||   |||||||||| |||||    
T  327 agactgatacatatgaattgatgttgtttataatattatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgttgatttgcattc 228  T
Q  134 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  227 gatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgat 134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 22561 - 22775
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    ||||||||| |||  |||| ||||  ||| |||||||||||||||| |||    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22561 aactaagttgtttgtcttgatgttgctgttccagtaagactgatgcatat----tgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaat 22656  T
Q  101 taagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctg 197  Q
    || |||||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22657 tatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctg 22756  T
Q  198 catgagtcggtctaagttg 216  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22757 catgagtcggtctaagttg 22775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 82183 - 82074
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| | | ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  82183 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagtt 82086  T
Q  216 gttgaagatgat 227  Q
    | | ||||||||    
T  82085 gattaagatgat 82074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 1316 - 1098
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    ||||||||| |||| |||||||||  ||| |||||||||||||||  ||||| || |||||| |  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  1316 aactaagttttttatcttgttgttgttgttccagtaagactgatgtatatgatttgatgttgttgttaatgttatatagttgtatatacattccatgaat 1217  T
Q  101 taagtttgataattgagttgttgatttac---attcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctg 197  Q
    || |||||||  ||||  |||||||   |   |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1216 tatgtttgatgtttgaaatgttgatgacctgtattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctg 1117  T
Q  198 catgagtcggtctaagttg 216  Q
    |||||||||||||||||||    
T  1116 catgagtcggtctaagttg 1098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 102; Significance: 8e-51; HSPs: 7)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 100541 - 100379
Alignment:
Q  67 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | || ||| ||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  100541 taatgttatataattgtatatacattatatgaattatg-ttaatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgatttgcatac 100443  T
Q  164 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  100442 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgat 100379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Original strand, 40128 - 40290
Alignment:
Q  67 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 163  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||    
T  40128 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcctac 40226  T
Q  164 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  40227 tgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgatgatgat 40290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 119948 - 119880
Alignment:
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  119948 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 119880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 151 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 101580 - 101504
Alignment:
Q  151 atggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||    
T  101580 atggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgat 101504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 94579 - 94413
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  94579 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 94480  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  94479 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 94413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 44504 - 44456
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  44504 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 44456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 225
Target Start/End: Original strand, 17552 - 17598
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  17552 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 6702 - 6540
Alignment:
Q  67 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 163  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  6702 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 6604  T
Q  164 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  6603 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgat 6540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8703 - 8482
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataat--tgtatatacattacatga 98  Q
    ||||||||| |||| |||| || |  ||| |||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||    
T  8703 aactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgtatatgaattgatgttgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttga 8604  T
Q  99 cttaagtttga-taattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaag 194  Q
     |||  | ||| || ||||| |||||||   || |||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8603 attatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaag 8504  T
Q  195 ctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  8503 ctgcatgagtcggtctaagttg 8482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19431 - 19269
Alignment:
Q  67 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 163  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  19431 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 19333  T
Q  164 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  19332 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgat 19269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 6010 - 6239
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||  ||||||| ||||    ||| |  |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6010 aactaagttatttatcttgctgttattgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtatatacattacatgaat 6109  T
Q  101 taagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctg 197  Q
    || |||||||  ||  | |||| ||   || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  6110 tatgtttgatgtttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttactgtttgttatttaactaagctg 6209  T
Q  198 catgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  6210 catgagtcggtctaagttgattaagatgat 6239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 67 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12934 - 12782
Alignment:
Q  67 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||  | |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||     
T  12934 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatat 12835  T
Q  164 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12834 tgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaagttg 12782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 91; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 67 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 10695 - 10543
Alignment:
Q  67 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 163  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||  ||||| |||||||   || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  10695 taatgtcatataattgtatatacattacatgaattatgttcgatgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 10596  T
Q  164 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  10595 tgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtctaagttg 10543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Original strand, 987 - 1150
Alignment:
Q  67 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||  | |||||||   || |||||||| || ||||||||||||| | |||||||    
T  987 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatgttgttatatcatgatgatctgcatac 1086  T
Q  164 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  1087 tacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 1150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 6779 - 6616
Alignment:
Q  67 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||    || ||||   || ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  6779 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttataatgatgataacttgcattcgatattgttatatcatcatgatttgcatac 6680  T
Q  164 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  6679 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 6616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 14159 - 13996
Alignment:
Q  67 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||    || ||||   || ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  14159 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttataatgatgataacttgcattcgatattgttatatcatcatgatttgcatac 14060  T
Q  164 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  14059 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 13996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 87; Significance: 7e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 67 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 5810 - 5659
Alignment:
Q  67 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 163  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  5810 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttcatac 5712  T
Q  164 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5711 tgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaagttg 5659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Original strand, 2599 - 2761
Alignment:
Q  67 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 163  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   |||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||| |||||    
T  2599 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcaatattgttataacatgatgatttacatac 2697  T
Q  164 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2698 tgcctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgat 2761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 67 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 62362 - 62216
Alignment:
Q  67 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgc 166  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||| ||||| | | ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  62362 taatgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgtgcattcgatattattataccatgatgtttttcatactgc 62264  T
Q  167 ctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 214  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  62263 ctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaagt 62216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 132885 - 132663
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    ||||||||| |||| |||  ||||  ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||      ||||||||| |||  |    
T  132885 aactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaatggat 132792  T
Q  101 taagtttgataattgagttgttgat--ttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctg 197  Q
    || ||| ||||||||||  ||||||  |||||||||||||| || |||||||||| ||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  132791 tatgtt-gataattgagacgttgatgattacattcgatattgttgtatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctaagctg 132693  T
Q  198 catgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  132692 catgagtcggtctaagatgatgatgatgat 132663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 136848 - 136682
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgg-tttg 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  136848 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttg 136749  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  136748 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 136682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 139317 - 139151
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgg-tttg 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  139317 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttg 139218  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  139217 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 139151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 144255 - 144089
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgg-tttg 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  144255 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttg 144156  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  144155 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 144089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 134379 - 134213
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgg-tttg 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  134379 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttg 134280  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  134279 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgat 134213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 141786 - 141620
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgg-tttg 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  141786 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttg 141687  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  141686 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgat 141620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 67 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13107 - 12955
Alignment:
Q  67 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||  ||  | |||||||   || ||||||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  13107 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttgcatac 13008  T
Q  164 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  13007 tgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagttg 12955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 213
Target Start/End: Original strand, 53435 - 53651
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    ||||||||| |||| |||  |||| |||| ||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  53435 aactaagttgtttatctttatgttgatgttccagtaagactgatgtttatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaat 53534  T
Q  101 taagtttg-ataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagct 196  Q
    ||  | || ||| ||||| |||||||   || |||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  53535 tatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagct 53634  T
Q  197 gcatgagtcggtctaag 213  Q
    |||||| || |||||||    
T  53635 gcatgaatcagtctaag 53651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 67 - 227
Target Start/End: Original strand, 14651 - 14813
Alignment:
Q  67 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 163  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| | |||    
T  14651 taatggtatataatagtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttcttac 14749  T
Q  164 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  14750 tgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgat 14813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 67 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 32703 - 32552
Alignment:
Q  67 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat--ttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatact 164  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||| |  || |||| |||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  32703 taatgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgattgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatact 32604  T
Q  165 gcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32603 gcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 32552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 213
Target Start/End: Original strand, 51936 - 51985
Alignment:
Q  163 ctgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    |||||||||| | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51936 ctgcctatgt-gctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 32325 - 32103
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    ||||||||| |||| |||  ||||  ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||      ||||||||| |||  |    
T  32325 aactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata------tatacattaaatggat 32232  T
Q  101 taagtttgataattgagttgttgat--ttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctg 197  Q
    || ||| ||||||||||  ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32231 tatgtt-gataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgttgtttgttatttatctaagctg 32133  T
Q  198 catgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  32132 catgagtcggtctaagatgatgatgatgat 32103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 129 - 227
Target Start/End: Original strand, 15795 - 15893
Alignment:
Q  129 cattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  15795 cattcgatattgttatatcatcatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 15893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 178947 - 178899
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  178947 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgat 178899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 2812 - 2922
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2812 gttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 2911  T
Q  217 ttgaagatgat 227  Q
     ||| ||||||    
T  2912 atgatgatgat 2922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 117 - 216
Target Start/End: Original strand, 16106 - 16205
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16106 gttgttgatttacatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 16205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 117 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 13243 - 13147
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13243 gttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2680
Alignment:
Q  161 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2732 tactgcctatgttgttgcttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 2680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 117 - 216
Target Start/End: Original strand, 27755 - 27854
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27755 gttgttgatttacatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 27854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 72; Significance: 7e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 129 - 216
Target Start/End: Original strand, 23901 - 23988
Alignment:
Q  129 cattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23901 cattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg 23988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 57 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11643 - 11471
Alignment:
Q  57 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataatt---ga-gttgttgatttacattcgatattattatatcatgat 152  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | |||| |||   || |||||| | |||| | ||||||||||||||||||||    
T  11643 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 11544  T
Q  153 ggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 225  Q
    | |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  11543 gttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatg 11471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 57 - 225
Target Start/End: Original strand, 38198 - 38370
Alignment:
Q  57 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataatt---ga-gttgttgatttacattcgatattattatatcatgat 152  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | |||| |||   || |||||| | |||| | ||||||||||||||||||||    
T  38198 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgat 38297  T
Q  153 ggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 225  Q
    | |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  38298 gttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatg 38370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 3192 - 3302
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3192 gttgttgaattacatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 3290  T
Q  216 gttgaagatgat 227  Q
    | ||||||||||    
T  3291 gatgaagatgat 3302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 3157 - 3266
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3157 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 3255  T
Q  217 ttgaagatgat 227  Q
     ||||||||||    
T  3256 atgaagatgat 3266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 117 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 39591 - 39486
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39591 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 39493  T
Q  217 ttgaaga 223  Q
     ||||||    
T  39492 atgaaga 39486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 117 - 223
Target Start/End: Original strand, 75221 - 75326
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75221 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 75319  T
Q  217 ttgaaga 223  Q
     ||||||    
T  75320 atgaaga 75326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 134 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 1130 - 1051
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1130 gatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 160 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 7338 - 7271
Alignment:
Q  160 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7338 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 7271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 1385 - 1294
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||| ||||| ||||||||  ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1385 gatataattatgtcatgatg--ttgtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 1294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Original strand, 15306 - 15354
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  15306 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgat 15354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 57 - 225
Target Start/End: Original strand, 17969 - 18141
Alignment:
Q  57 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgagttgttgatt---tacattcgatattattatatcatgat 152  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| || ||||| ||||| ||   | | ||||||||||||||||||||||    
T  17969 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgat 18068  T
Q  153 ggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 225  Q
    | | |||||| ||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  18069 gttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 18141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 216
Target Start/End: Original strand, 2241 - 2278
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2241 ttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttg 2278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 62; Significance: 6e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 117 - 225
Target Start/End: Original strand, 26071 - 26179
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26071 gttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 26169  T
Q  216 gttgaagatg 225  Q
    | ||||||||    
T  26170 gatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 44713 - 44823
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44713 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 44811  T
Q  216 gttgaagatgat 227  Q
    | | ||||||||    
T  44812 gattaagatgat 44823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Original strand, 1093 - 1164
Alignment:
Q  155 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1093 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 1164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4788 - 4717
Alignment:
Q  155 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4788 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 4717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Original strand, 168023 - 168094
Alignment:
Q  155 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  168023 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 168094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 134 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 52011 - 51918
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52011 gatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 51918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4964 - 4854
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4964 gttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagtt 4866  T
Q  216 gttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||||    
T  4865 gttgaagatgat 4854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 227
Target Start/End: Original strand, 10448 - 10539
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10448 gatattattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 10539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 12746 - 12587
Alignment:
Q  57 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgat 152  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  | | | || ||||| |||||||   || |||| |||||| |||||||||| |    
T  12746 atgttgtttataatgtgatataattgtatatacattac-tgaattatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgct 12648  T
Q  153 ggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12647 gttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 129 - 227
Target Start/End: Original strand, 38720 - 38818
Alignment:
Q  129 cattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||| |||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  38720 catttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaagttgattaagatgat 38818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 227
Target Start/End: Original strand, 339972 - 340063
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  339972 gatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgttgt--gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgacgaagatgat 340063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Original strand, 158444 - 158610
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  158444 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 158543  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  158544 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 158610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 134 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13594 - 13502
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||| || ||||| || |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13594 gatattatcatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagttgat 13502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 134 - 227
Target Start/End: Original strand, 15487 - 15579
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15487 gatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctctt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgat 15579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 134 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 32163 - 32072
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32163 gatattattatgtcatgttg-tttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 32072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 162 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 47065 - 47000
Alignment:
Q  162 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47065 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 47000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 7945 - 8161
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgact 100  Q
    ||||||||| |||| |||| || |  ||| ||||| |||||||||  ||||| || |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |    
T  7945 aactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtgagactgatgtatatgatttgatgttgtttataatgtgatataattttatatacattacttgaat 8044  T
Q  101 taagtttgataattga----gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaag 194  Q
    ||  | |||   || |    |||||||| || |||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||    
T  8045 tatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatgagctgatttgcatactgcctatgctgctatttgttatttaattaag 8144  T
Q  195 ctgcatgagtcggtcta 211  Q
    ||||||| |||||||||    
T  8145 ctgcatgcgtcggtcta 8161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16189 - 16118
Alignment:
Q  155 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16189 tttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 16118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 32963 - 33072
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32963 gttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 33061  T
Q  217 ttgaagatgat 227  Q
     ||||||||||    
T  33062 atgaagatgat 33072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 46042 - 45933
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46042 gttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 45944  T
Q  217 ttgaagatgat 227  Q
     ||||||||||    
T  45943 atgaagatgat 45933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Original strand, 17397 - 17445
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17397 ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 17445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 140 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 51672 - 51587
Alignment:
Q  140 attatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  51672 attatgtcatgatg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaaatgat 51587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 54 - 213
Target Start/End: Original strand, 136308 - 136471
Alignment:
Q  54 ttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataat-tga-gttgttgatttacattcgatattattatatcatga 151  Q
    ||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||  ||| || ||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  136308 ttaatgttgttgttaatgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtacgatgatgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatga 136407  T
Q  152 --tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
      || ||||  |||||||||||| | ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  136408 actgttttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 136471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 54 - 213
Target Start/End: Original strand, 145016 - 145179
Alignment:
Q  54 ttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataat-tga-gttgttgatttacattcgatattattatatcatga 151  Q
    ||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||  ||| || ||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  145016 ttaatgttgttgttaatgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtacgatgatgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatga 145115  T
Q  152 --tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
      || ||||  |||||||||||| | ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  145116 actgttttgtgtactgcctatgtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 145179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 160 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 174838 - 174771
Alignment:
Q  160 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  174838 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagttgat 174771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 162 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121771
Alignment:
Q  162 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 121771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 160 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16354 - 16287
Alignment:
Q  160 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16354 atactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 16287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Original strand, 17221 - 17333
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt---gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||   | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17221 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 17319  T
Q  214 ttgttgaagatgat 227  Q
    ||| ||||||||||    
T  17320 ttgatgaagatgat 17333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 213
Target Start/End: Original strand, 79396 - 79430
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79396 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 227
Target Start/End: Original strand, 5153 - 5244
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||| ||||| ||||||||  ||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5153 gatataattatgtcatgatg--ttgtataatacctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 5244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 227
Target Start/End: Original strand, 1074 - 1165
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||| ||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1074 gatataattatgtcatgatg--ttgtatactgcctatgttgatgtttattaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 1165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 38875 - 38766
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  38875 gttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgactcggtctaagttg 38777  T
Q  217 ttgaagatgat 227  Q
     ||||||||||    
T  38776 atgaagatgat 38766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 129 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 33044 - 32947
Alignment:
Q  129 cattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  33044 catttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgat 32947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 9799 - 9751
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  9799 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 9751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 66 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 25276 - 25122
Alignment:
Q  66 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgca 160  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||  | ||||  |||||   |||||||||| |||| |||||  |||||||||||  || |||  |    
T  25276 ataatgtgatatatttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatatcgttatatcatgagctgttttata 25178  T
Q  161 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25177 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 25122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 226
Target Start/End: Original strand, 11466 - 11558
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatga 226  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11466 gatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgttgaagatga 11558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 213
Target Start/End: Original strand, 128912 - 129072
Alignment:
Q  57 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatga-- 151  Q
    |||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||  | ||||  |||||   |||||||||| |||| |||||| |||||||||||      
T  128912 atgttgttaataatgtgatatatttgtatatccattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaat 129011  T
Q  152 tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    || |||   |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  129012 tgttttatgtactgcctatgttgctgtttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaag 129072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 116480 - 116432
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  116480 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 116432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 117 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 78438 - 78345
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 209  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  || |||  || |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  78438 gttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 78345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Original strand, 6166 - 6240
Alignment:
Q  155 tttgcatactgcctatgttgttgtt--tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6166 tttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 6240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 129 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 25998 - 25904
Alignment:
Q  129 cattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagat 224  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  25998 catttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgatgaagat 25904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 129 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 39960 - 39863
Alignment:
Q  129 cattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||| ||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  39960 catttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagcttcatgagttggtctaagttgatgaagatgat 39863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 67 - 176
Target Start/End: Original strand, 2172 - 2283
Alignment:
Q  67 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 163  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||| |  ||||| ||||   ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2172 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatg-ctgatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatac 2270  T
Q  164 tgcctatgttgtt 176  Q
    |||||||||||||    
T  2271 tgcctatgttgtt 2283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 134 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13309 - 13216
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  13309 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 13216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 129 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 40015 - 39918
Alignment:
Q  129 cattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||| ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  40015 catttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgat 39918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 213
Target Start/End: Original strand, 19889 - 19987
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    |||||||| || |||| |||||| |||||||||||  || |||  ||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19889 gttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggtctaag 19987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 125
Target Start/End: Original strand, 48936 - 48997
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 125  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  48936 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 48997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 134 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 1949 - 1856
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1949 gatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 1856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 125
Target Start/End: Original strand, 207470 - 207531
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 125  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||  |||||||    
T  207470 ttataatgttatataattatatatatattgcatgaattatgtttgatgattgaaatgttgat 207531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 227
Target Start/End: Original strand, 28806 - 28886
Alignment:
Q  148 atgatggtttgcatactgcctatgttgttgtt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  28806 atgatgatttgcatactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgat 28886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 28698 - 28775
Alignment:
Q  1 aactaagttatttaccttgttgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatata 78  Q
    ||||||||| |||| |||| ||| | ||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  28698 aactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatata 28775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 227
Target Start/End: Original strand, 8556 - 8645
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||| || |||  |||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8556 gatattattatgtcatgctgtttttgatactgcctatgttg----ctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 8645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 48 - 216
Target Start/End: Original strand, 103572 - 103736
Alignment:
Q  48 tatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatc 147  Q
    ||||| ||||||||| |  ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| || ||||      ||||||| ||| |||| |||||| |||||||    
T  103572 tatgatttaatgttgttgttaatgttatgtagttgtatatacattacatgaattatgtatgat------gttgttgttttgcatttgatattgttatatc 103665  T
Q  148 atga--tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    ||||  || |||  ||||| ||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  103666 atgaattgttttttatactacctatgttgctgtttatttattaactaagctgcattagtcggtctaagttg 103736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 67 - 213
Target Start/End: Original strand, 6235 - 6386
Alignment:
Q  67 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcat 161  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||  | ||||  |||||   |||||||||| |||| |||||| | |||||||||  || |||  ||    
T  6235 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgttttatat 6334  T
Q  162 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6335 actgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaag 6386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 166 - 213
Target Start/End: Original strand, 13793 - 13840
Alignment:
Q  166 cctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13793 cctatgttgttgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 457 - 348
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 216  Q
    |||||||| || || | ||||||||||  ||||| |  |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  457 gttgttgacttccaattgatattattacgtcatgctattttgtatactgcctatgttattgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcg 359  T
Q  217 ttgaagatgat 227  Q
     | ||||||||    
T  358 ataaagatgat 348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 3568 - 3475
Alignment:
Q  134 gatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3568 gatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct-ttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 3475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 10884 - 10777
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10884 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 10787  T
Q  216 gttgaagatg 225  Q
    | | ||||||    
T  10786 gattaagatg 10777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 119 - 227
Target Start/End: Original strand, 16608 - 16716
Alignment:
Q  119 tgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgt 217  Q
    |||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  16608 tgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattga 16706  T
Q  218 tgaagatgat 227  Q
    ||||||||||    
T  16707 tgaagatgat 16716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 117 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 21026 - 20917
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| || ||| ||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||     
T  21026 gttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtctaagtc 20927  T
Q  216 gttgaagatg 225  Q
    ||||||||||    
T  20926 gttgaagatg 20917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 2028 - 1957
Alignment:
Q  155 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||| ||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2028 tttgtatactgcctatgtcgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgat 1957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 97185 - 97024
Alignment:
Q  57 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatga-- 151  Q
    |||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||  | ||||  |||||   |||||||||| |||| |||||| |||||||||||      
T  97185 atgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaac 97086  T
Q  152 tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    || |||   |||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  97085 tgttttatgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaag 97024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 106463 - 106302
Alignment:
Q  57 atgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatga-- 151  Q
    |||||| | ||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||  | ||||  |||||   |||||||||| |||| |||||| |||||||||||      
T  106463 atgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaac 106364  T
Q  152 tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    || |||   |||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  106363 tgttttatgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaag 106302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 666 - 569
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  || |||  || |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  666 gttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 117 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 4639 - 4545
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggt-ttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 211  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||| ||||| || || | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4639 gttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 155 - 214
Target Start/End: Original strand, 24348 - 24406
Alignment:
Q  155 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 214  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24348 tttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 213
Target Start/End: Original strand, 20373 - 20524
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttg-ataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgc 159  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||||     
T  20373 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgt 20472  T
Q  160 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    ||||||  | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20473 atactg-atgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 178 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 128805 - 128756
Alignment:
Q  178 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| | ||||||||    
T  128805 tttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaagatgat 128756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 267830 - 267679
Alignment:
Q  66 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgca 160  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||  | ||||  |||||   |||||||||| |||| |||||| |||||||||||  || |||  |    
T  267830 ataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatg-ttgagatattgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttata 267732  T
Q  161 tactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    |||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  267731 tactgcatatgttgatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 267679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 20915 - 20749
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  20915 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 20816  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  20815 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 20749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 37989 - 37823
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  37989 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 37890  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  37889 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 37823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 4805 - 4707
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4805 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 4708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 8532 - 8484
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8532 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 8484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13442 - 13394
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  13442 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 13394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22936 - 22888
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  22936 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 22888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16834 - 16786
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16834 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 4347 - 4300
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatga 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  4347 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 117 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 38433 - 38339
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 209  Q
    |||||||| || |||| |||||| | |||||||||  || |||  ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38433 gttgttgaattgcatttgatattgtcatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 227
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4949
Alignment:
Q  165 gcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  4888 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgat 4949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 9292 - 9246
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  9292 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 9246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 14115 - 13949
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-g 158  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| |    
T  14115 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 14016  T
Q  159 catactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
     ||||||  | ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  14015 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 13949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 156 - 108
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  156 ttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgat 108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 23892 - 23844
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  23892 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgat 23844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 29982 - 29946
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29982 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 36503 - 36455
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  36503 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgat 36455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 40450 - 40402
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  40450 ttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgat 40402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 227
Target Start/End: Original strand, 161206 - 161250
Alignment:
Q  183 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  161206 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttggttaagatgat 161250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4622 - 4513
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgc-atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||   ||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4622 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagtt 4525  T
Q  216 gttgaagatgat 227  Q
    | |||| |||||    
T  4524 gatgaaaatgat 4513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12204 - 12095
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgc-atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||   ||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12204 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagtt 12107  T
Q  216 gttgaagatgat 227  Q
    | |||| |||||    
T  12106 gatgaaaatgat 12095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22156 - 22047
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgc-atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || |||   ||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22156 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagtt 22059  T
Q  216 gttgaagatgat 227  Q
    | |||| |||||    
T  22058 gatgaaaatgat 22047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 226
Target Start/End: Original strand, 1393 - 1440
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatga 226  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  1393 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 1440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 2780 - 2694
Alignment:
Q  129 cattcgatattattatatcatga--tggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    |||| |||||| |||||||||||  || |||  ||||||||||||||| |||||||   || |||||||||||||||||||||||||    
T  2780 catttgatattgttatatcatgagctgttttatatactgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgagtcggtctaag 2694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 181 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 4262 - 4216
Alignment:
Q  181 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  4262 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 4216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 12016 - 11982
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12016 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 179 - 225
Target Start/End: Original strand, 12361 - 12407
Alignment:
Q  179 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatg 225  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  12361 ttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatg 12407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 116 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 9194 - 9136
Alignment:
Q  116 agttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttg 174  Q
    ||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  9194 agttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttg 9136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 185 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12108 - 12066
Alignment:
Q  185 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgat 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  12108 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 12066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 78
Target Start/End: Original strand, 2218 - 2267
Alignment:
Q  29 tcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatata 78  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||    
T  2218 tcccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata 2267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 11399 - 11292
Alignment:
Q  117 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 215  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || ||| | ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  11399 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaattt 11302  T
Q  216 gttgaagatg 225  Q
    | | ||||||    
T  11301 gattaagatg 11292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 64 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 91 - 30
Alignment:
Q  64 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 125  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  91 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 30  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 3732 times since January 2019
Visitors: 4818