View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0759_low_30 (Length: 395)

Name: NF0759_low_30
Description: NF0759
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0759_low_30
NF0759_low_30
[»] chr6 (32 HSPs)
chr6 (49-385)||(33682076-33682413)
chr6 (49-385)||(14033109-14033445)
chr6 (49-385)||(23835024-23835360)
chr6 (52-384)||(28359728-28360062)
chr6 (49-385)||(27562412-27562747)
chr6 (82-282)||(12941800-12942000)
chr6 (82-333)||(28290133-28290384)
chr6 (47-293)||(1592722-1592971)
chr6 (47-293)||(22906928-22907178)
chr6 (47-282)||(19726569-19726807)
chr6 (47-293)||(21724725-21724974)
chr6 (101-282)||(21566163-21566346)
chr6 (82-282)||(12167237-12167439)
chr6 (82-282)||(19286146-19286348)
chr6 (82-282)||(19877330-19877532)
chr6 (82-282)||(19883106-19883308)
chr6 (82-258)||(25470691-25470868)
chr6 (82-258)||(29615199-29615376)
chr6 (82-258)||(34647652-34647829)
chr6 (82-258)||(23837580-23837758)
chr6 (82-258)||(34640978-34641155)
chr6 (82-282)||(19786847-19787050)
chr6 (82-258)||(24562282-24562459)
chr6 (47-282)||(937658-937896)
chr6 (121-255)||(29416468-29416605)
chr6 (170-282)||(18788448-18788560)
chr6 (170-282)||(18799428-18799540)
chr6 (170-282)||(19439792-19439904)
chr6 (156-258)||(11289602-11289705)
chr6 (55-282)||(14581831-14582056)
chr6 (56-282)||(19588556-19588781)
chr6 (82-120)||(11283984-11284022)
[»] chr8 (29 HSPs)
chr8 (49-385)||(36799343-36799678)
chr8 (49-385)||(1804364-1804701)
chr8 (49-385)||(18681400-18681736)
chr8 (49-385)||(31567709-31568045)
chr8 (49-385)||(31572930-31573266)
chr8 (48-385)||(9273054-9273394)
chr8 (47-293)||(22055682-22055930)
chr8 (47-293)||(22050164-22050412)
chr8 (47-282)||(22177549-22177787)
chr8 (82-258)||(44476236-44476414)
chr8 (82-258)||(44479498-44479676)
chr8 (82-258)||(19902928-19903105)
chr8 (82-258)||(23865434-23865611)
chr8 (82-282)||(17053597-17053799)
chr8 (55-282)||(22025559-22025791)
chr8 (82-258)||(23825124-23825301)
chr8 (82-258)||(25409554-25409731)
chr8 (82-282)||(30766925-30767126)
chr8 (55-282)||(22063562-22063794)
chr8 (82-282)||(14057583-14057784)
chr8 (152-282)||(25110911-25111043)
chr8 (56-282)||(41009433-41009658)
chr8 (82-257)||(18609793-18609969)
chr8 (57-282)||(21326822-21327047)
chr8 (127-282)||(21668901-21669059)
chr8 (217-282)||(21282196-21282261)
chr8 (82-282)||(21322234-21322439)
chr8 (56-164)||(20974118-20974228)
chr8 (56-282)||(10606904-10607136)
[»] chr7 (40 HSPs)
chr7 (49-385)||(806872-807207)
chr7 (49-385)||(18055583-18055919)
chr7 (49-377)||(23201382-23201712)
chr7 (49-377)||(23507509-23507839)
chr7 (49-385)||(18049104-18049440)
chr7 (49-385)||(11631814-11632150)
chr7 (49-385)||(20579816-20580151)
chr7 (82-333)||(23665753-23666004)
chr7 (47-301)||(15338789-15339046)
chr7 (82-333)||(29795730-29795981)
chr7 (82-333)||(29799549-29799800)
chr7 (47-293)||(15723180-15723429)
chr7 (82-282)||(11302852-11303052)
chr7 (47-293)||(35962701-35962951)
chr7 (50-293)||(15710956-15711202)
chr7 (47-293)||(14431952-14432201)
chr7 (47-320)||(19599805-19600080)
chr7 (47-282)||(1612586-1612825)
chr7 (82-258)||(12591635-12591812)
chr7 (82-293)||(14281609-14281822)
chr7 (82-258)||(14421354-14421532)
chr7 (82-282)||(13006306-13006508)
chr7 (82-258)||(13123971-13124148)
chr7 (82-282)||(16676192-16676393)
chr7 (82-258)||(12710900-12711077)
chr7 (82-258)||(13742505-13742682)
chr7 (82-258)||(4279963-4280140)
chr7 (82-258)||(19616295-19616472)
chr7 (82-282)||(17650429-17650629)
chr7 (81-257)||(16109067-16109244)
chr7 (155-293)||(14128244-14128383)
chr7 (82-282)||(20328224-20328425)
chr7 (55-282)||(6411792-6412023)
chr7 (113-282)||(11390302-11390473)
chr7 (113-282)||(11383814-11383985)
chr7 (113-282)||(18606896-18607067)
chr7 (127-282)||(21232009-21232167)
chr7 (56-282)||(11220086-11220311)
chr7 (195-282)||(36306034-36306121)
chr7 (82-166)||(37244401-37244484)
[»] chr2 (31 HSPs)
chr2 (49-382)||(12578760-12579092)
chr2 (49-382)||(12572278-12572610)
chr2 (49-385)||(27785662-27785998)
chr2 (49-385)||(27790883-27791219)
chr2 (48-385)||(27295877-27296215)
chr2 (82-385)||(10685498-10685801)
chr2 (47-293)||(2105540-2105790)
chr2 (82-282)||(20260824-20261024)
chr2 (82-258)||(6482321-6482499)
chr2 (82-258)||(6485788-6485966)
chr2 (82-282)||(23090006-23090207)
chr2 (82-258)||(5707014-5707191)
chr2 (82-282)||(23102434-23102635)
chr2 (82-282)||(9241333-9241534)
chr2 (82-258)||(26582675-26582852)
chr2 (82-258)||(23169298-23169475)
chr2 (82-258)||(23580555-23580732)
chr2 (82-282)||(23877838-23878040)
chr2 (82-258)||(200641-200818)
chr2 (82-240)||(27367600-27367760)
chr2 (82-258)||(43693401-43693578)
chr2 (82-258)||(6744324-6744501)
chr2 (102-282)||(22809901-22810084)
chr2 (84-256)||(23263985-23264158)
chr2 (125-282)||(21073954-21074114)
chr2 (127-282)||(19703456-19703615)
chr2 (56-282)||(20724011-20724236)
chr2 (56-282)||(23290904-23291129)
chr2 (125-166)||(24943419-24943460)
chr2 (84-160)||(23269201-23269276)
chr2 (84-160)||(23276070-23276145)
[»] chr4 (20 HSPs)
chr4 (48-385)||(635635-635974)
chr4 (49-385)||(42701193-42701529)
chr4 (49-385)||(51601946-51602282)
chr4 (49-385)||(51607827-51608163)
chr4 (49-385)||(41799825-41800161)
chr4 (49-385)||(53748625-53748960)
chr4 (82-282)||(15533786-15533986)
chr4 (47-293)||(23121562-23121812)
chr4 (47-301)||(20940223-20940480)
chr4 (82-282)||(18212138-18212339)
chr4 (47-293)||(14484392-14484642)
chr4 (82-258)||(11847053-11847230)
chr4 (47-293)||(17000131-17000381)
chr4 (82-258)||(8046897-8047074)
chr4 (47-282)||(43284871-43285109)
chr4 (55-255)||(4831090-4831293)
chr4 (55-255)||(4834385-4834588)
chr4 (55-293)||(11171222-11171464)
chr4 (127-282)||(15406955-15407113)
chr4 (125-282)||(14485552-14485713)
[»] chr3 (44 HSPs)
chr3 (49-366)||(13909496-13909813)
chr3 (49-366)||(13946441-13946758)
chr3 (49-385)||(44775168-44775504)
chr3 (49-385)||(44780352-44780688)
chr3 (49-366)||(13939955-13940268)
chr3 (49-385)||(4677131-4677466)
chr3 (49-385)||(8742783-8743119)
chr3 (49-385)||(8760953-8761289)
chr3 (49-385)||(41175444-41175779)
chr3 (49-385)||(41180582-41180917)
chr3 (48-333)||(12200169-12200454)
chr3 (47-293)||(14652680-14652929)
chr3 (47-293)||(16382844-16383093)
chr3 (47-293)||(16838466-16838714)
chr3 (56-282)||(13203514-13203743)
chr3 (97-282)||(12304763-12304949)
chr3 (101-282)||(17157079-17157262)
chr3 (82-258)||(9532849-9533027)
chr3 (104-282)||(24191783-24191963)
chr3 (82-282)||(41456123-41456325)
chr3 (82-282)||(16802425-16802626)
chr3 (59-293)||(14544155-14544394)
chr3 (82-258)||(8583294-8583471)
chr3 (82-258)||(14084531-14084708)
chr3 (82-258)||(14089932-14090109)
chr3 (82-258)||(49399473-49399650)
chr3 (82-258)||(24123203-24123380)
chr3 (82-240)||(13968850-13969010)
chr3 (82-240)||(13974325-13974485)
chr3 (82-237)||(17190836-17190992)
chr3 (55-255)||(34852211-34852414)
chr3 (48-282)||(14292667-14292906)
chr3 (171-293)||(16829943-16830065)
chr3 (47-205)||(16830055-16830215)
chr3 (113-282)||(23174189-23174358)
chr3 (125-282)||(17199015-17199175)
chr3 (193-282)||(31690570-31690659)
chr3 (82-281)||(12961378-12961580)
chr3 (195-282)||(23173876-23173963)
chr3 (124-257)||(17243680-17243815)
chr3 (56-144)||(18719250-18719339)
chr3 (82-143)||(11850780-11850840)
chr3 (193-282)||(12255238-12255326)
chr3 (125-169)||(18889009-18889053)
[»] chr5 (22 HSPs)
chr5 (49-385)||(21678141-21678475)
chr5 (48-385)||(17264667-17265005)
chr5 (48-385)||(17271149-17271487)
chr5 (48-385)||(22174980-22175320)
chr5 (82-333)||(9775467-9775718)
chr5 (47-293)||(758216-758464)
chr5 (82-282)||(37805292-37805492)
chr5 (47-301)||(22509126-22509382)
chr5 (47-293)||(22312793-22313042)
chr5 (82-258)||(19510999-19511177)
chr5 (47-331)||(20937557-20937845)
chr5 (82-282)||(23527448-23527651)
chr5 (82-282)||(22439701-22439902)
chr5 (82-258)||(21675471-21675648)
chr5 (82-240)||(1857520-1857680)
chr5 (55-255)||(10816746-10816949)
chr5 (55-255)||(23538773-23538976)
chr5 (82-170)||(23112827-23112914)
chr5 (81-166)||(19362597-19362678)
chr5 (82-166)||(19801964-19802044)
chr5 (193-282)||(22007896-22007986)
chr5 (82-143)||(24751647-24751707)
[»] chr1 (19 HSPs)
chr1 (48-385)||(27280158-27280496)
chr1 (47-293)||(3706727-3706976)
chr1 (82-258)||(20438531-20438709)
chr1 (47-293)||(23066665-23066915)
chr1 (82-258)||(21542056-21542233)
chr1 (82-258)||(42095903-42096080)
chr1 (82-258)||(20045879-20046056)
chr1 (55-282)||(22448244-22448469)
chr1 (55-282)||(20242503-20242735)
chr1 (82-282)||(19664105-19664306)
chr1 (82-282)||(41110814-41111016)
chr1 (55-282)||(32650074-32650304)
chr1 (47-181)||(955118-955256)
chr1 (82-282)||(19778434-19778639)
chr1 (56-282)||(29554419-29554645)
chr1 (82-166)||(36614935-36615015)
chr1 (195-291)||(955032-955128)
chr1 (82-166)||(24079551-24079634)
chr1 (82-166)||(24109120-24109203)
[»] scaffold0124 (4 HSPs)
scaffold0124 (131-385)||(40549-40804)
scaffold0124 (82-282)||(36793-36994)
scaffold0124 (49-127)||(8493-8571)
scaffold0124 (193-284)||(43965-44057)
[»] scaffold0239 (2 HSPs)
scaffold0239 (47-333)||(14421-14710)
scaffold0239 (117-293)||(7178-7356)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (55-333)||(141297-141577)
scaffold0021 (127-255)||(146611-146742)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (47-293)||(265063-265311)
scaffold0005 (47-293)||(258637-258885)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (47-282)||(41894-42132)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (47-282)||(63169-63407)
scaffold0026 (82-259)||(12876-13054)
scaffold0026 (55-282)||(124446-124677)
[»] scaffold0535 (1 HSPs)
scaffold0535 (47-282)||(6006-6245)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (47-282)||(152324-152562)
scaffold0011 (82-258)||(174561-174738)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (47-281)||(50948-51185)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (101-282)||(4275-4458)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (101-282)||(15432-15615)
scaffold0025 (148-282)||(71155-71291)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (82-282)||(4594-4795)
[»] scaffold0063 (2 HSPs)
scaffold0063 (47-301)||(13971-14228)
scaffold0063 (47-301)||(24172-24429)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (82-282)||(10234-10435)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (82-258)||(110758-110935)
scaffold0029 (82-150)||(116793-116861)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (48-282)||(10305-10543)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (82-258)||(174561-174739)
scaffold0001 (82-258)||(489127-489304)
scaffold0001 (81-166)||(179002-179083)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (59-293)||(47376-47615)
scaffold0067 (59-293)||(62796-63035)
scaffold0067 (59-293)||(56410-56649)
[»] scaffold0430 (1 HSPs)
scaffold0430 (52-293)||(14536-14779)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (82-240)||(9649-9809)
[»] scaffold0226 (1 HSPs)
scaffold0226 (48-282)||(5112-5350)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (82-258)||(38401-38578)
[»] scaffold0076 (3 HSPs)
scaffold0076 (82-258)||(35546-35723)
scaffold0076 (82-240)||(30162-30322)
scaffold0076 (103-282)||(51676-51858)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (82-258)||(46979-47156)
scaffold0028 (82-258)||(52384-52561)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (82-258)||(2566-2743)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (82-282)||(29748-29948)
[»] scaffold1299 (1 HSPs)
scaffold1299 (113-282)||(143-314)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (101-282)||(10217-10400)
[»] scaffold0348 (3 HSPs)
scaffold0348 (47-211)||(15511-15678)
scaffold0348 (217-282)||(3058-3123)
scaffold0348 (226-282)||(15454-15510)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (148-282)||(20493-20629)
[»] scaffold1773 (1 HSPs)
scaffold1773 (101-240)||(1-132)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (51-282)||(4981-5218)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (55-291)||(17447-17688)
[»] scaffold0811 (1 HSPs)
scaffold0811 (82-206)||(5-131)
[»] scaffold1913 (1 HSPs)
scaffold1913 (173-259)||(1-87)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (47-143)||(3621-3718)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (127-282)||(41592-41750)
[»] scaffold0506 (1 HSPs)
scaffold0506 (82-282)||(8410-8615)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (127-282)||(326816-326975)
scaffold0004 (56-282)||(321040-321266)
scaffold0004 (125-256)||(115778-115911)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (127-282)||(7293-7451)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (125-256)||(102930-103063)
[»] scaffold1615 (1 HSPs)
scaffold1615 (127-282)||(392-550)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (127-282)||(16914-17072)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (82-244)||(27781-27945)
[»] scaffold0097 (1 HSPs)
scaffold0097 (56-282)||(27840-28065)
[»] scaffold0301 (1 HSPs)
scaffold0301 (56-170)||(13504-13620)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (47-96)||(78538-78589)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (59-282)||(16021-16250)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (55-96)||(16913-16955)
scaffold0074 (193-282)||(17006-17095)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (193-282)||(55975-56065)
[»] scaffold0461 (2 HSPs)
scaffold0461 (193-284)||(1027-1119)
scaffold0461 (193-284)||(7963-8055)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 32)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 49 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 33682413 - 33682076
Alignment:
Q  49 atcactactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 148  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33682413 atcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatc 33682314  T
Q  149 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33682313 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccaaagctctcccactgttatgtt 33682214  T
Q  249 tatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt-agggaatttca 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |    
T  33682213 tatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctatacatatacataatatatgattcaccatccaatttacaactttaagggaatttta 33682114  T
Q  348 attaagtacaacatacattcagtcaacatccattcatc 385  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  33682113 attaagtacaacgtacattcagtcagcatccattcatc 33682076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 49 - 385
Target Start/End: Original strand, 14033109 - 14033445
Alignment:
Q  49 atcactactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14033109 atcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 14033208  T
Q  149 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14033209 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 14033308  T
Q  249 tatgcaactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt-agggaatttc 346  Q
     ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| |||| |||||||||     
T  14033309 aatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacacctttaagggaattt- 14033406  T
Q  347 aattaagtacaacatacattcagtcaacatccattcatc 385  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  14033407 aattaaatacaacattcattcagtcagcatccattcatc 14033445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 49 - 385
Target Start/End: Original strand, 23835024 - 23835360
Alignment:
Q  49 atcactactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23835024 atcaccactccactaagactcctctaaactcccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 23835123  T
Q  149 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23835124 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 23835223  T
Q  249 tatgcaactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt-agggaatttc 346  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||  | |  | || |||| ||| |||||     
T  23835224 tatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctatacatatacat-atatatgattcaccaatcaaccttcatctttaaggaaatttt 23835322  T
Q  347 aattaagtacaacatacattcagtcaacatccattcatc 385  Q
    |||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  23835323 aattatatacaacacaca-tcagtcaacatccattcatc 23835360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 52 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 28360062 - 28359728
Alignment:
Q  52 actactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacagg 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28360062 actactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacacctttgtcgaatggttaaagcattctcaacagg 28359963  T
Q  152 acataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttat 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28359962 acataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaat 28359863  T
Q  252 gcaactaatccccttg-agtatatctacataccaaccaacctaaacatatacata-atatatgagtcaccatccgatttacaactttagggaatttcaat 349  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||  |||||| || | ||||||| ||| ||||||| | |    
T  28359862 gcaactaatccccttgttgtatatctacataccaacccacctagacatatatatatatatatgtttcaccaaccaacttacaacgttaaggaattttatt 28359763  T
Q  350 taagtacaacatacattcagtcaacatccattcat 384  Q
    ||| |||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  28359762 taaatacaacattcaatcagtcagcatccattcat 28359728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 49 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 27562747 - 27562412
Alignment:
Q  49 atcactactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 148  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27562747 atcaccactccactaaaactcctctaa-cacccatgcatgtggtaccaagaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 27562649  T
Q  149 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27562648 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccgctgttatgtt 27562549  T
Q  249 tatgcaactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaactttagggaatttca 347  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||| ||| ||||||| |    
T  27562548 aatgcaactaatccccattgagtatatctacatactacccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacaacgttaaggaatttta 27562450  T
Q  348 attaagtacaacatacattcagtcaacatccattcatc 385  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  27562449 attaaacacaacattcattcagtcagcatccattcatc 27562412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 82 - 282
Target Start/End: Original strand, 12941800 - 12942000
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact-acaccactttg 180  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12941800 atgcatgtggtaccaaaa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccactttg 12941898  T
Q  181 agtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacat 280  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || | || ||||||||||||    
T  12941899 agcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacctgtgtatatctacat 12941998  T
Q  281 ac 282  Q
    ||    
T  12941999 ac 12942000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 82 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 28290384 - 28290133
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact-acaccactttg 180  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  28290384 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacatcactttg 28290286  T
Q  181 agtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacat 280  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| | || |||||||||||||||||    
T  28290285 agcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaaactctcccactgttatgctcatgcaactgacccacttgagtatatctacat 28290186  T
Q  281 accaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcacca-tccgatttacaac 333  Q
    || | || |||||| ||||||  | |||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  28290185 acaatcccacctaagcatatatgt-atatatgactcaccactccaatttacaac 28290133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 47 - 293
Target Start/End: Original strand, 1592722 - 1592971
Alignment:
Q  47 tcatcactactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc- 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  1592722 tcatcaccactccactaagactcctctaacaacacctatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtcgaatggttaaagcattca 1592820  T
Q  144 tcaacaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgt 242  Q
    |   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  1592821 ttttcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtactccaccactttgaacgagaaggcgttccagagccgaagctctcccactgt 1592920  T
Q  243 tatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 293  Q
    |||| || ||||||| | || |||| ||||| |||||||| | ||||||||    
T  1592921 tatgcttttgcaactgacccacttgtgtatacctacatacaacccaaccta 1592971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 47 - 293
Target Start/End: Original strand, 22906928 - 22907178
Alignment:
Q  47 tcatcactactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc- 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||     
T  22906928 tcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgtatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattca 22907026  T
Q  144 tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactg 241  Q
    |   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  22907027 ttttcaggacataagtcctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactg 22907126  T
Q  242 ttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 293  Q
    ||||| ||||||| || | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  22907127 ttatgcttatgcagctgacccacttgtgtatatctacatacaacccaaccta 22907178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 47 - 282
Target Start/End: Original strand, 19726569 - 19726807
Alignment:
Q  47 tcatcactactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc- 143  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||     
T  19726569 tcatcaccactccaccaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattca 19726667  T
Q  144 tcaacaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgt 242  Q
    |   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||| |||||||||||||||||||| |    
T  19726668 ttttcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttctagagccgaagctctcccacttt 19726767  T
Q  243 tatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    |||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  19726768 tatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 19726807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 47 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 21724974 - 21724725
Alignment:
Q  47 tcatcactactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc- 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||| | |||||||||||||||||     
T  21724974 tcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatacatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctatagaatggttaaagcattca 21724876  T
Q  144 tcaacaggacataagtcctcaccactac-accactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgt 242  Q
    |   |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   | || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  21724875 ttttcaggacataagtcctcaccactaataccactttgagcaactagtactccaccactttgatctattaggcgttccagagccgaagctctcccactgt 21724776  T
Q  243 tatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 293  Q
    |||| || ||||||| | || |||| ||||| |||||||| | ||||||||    
T  21724775 tatgcttttgcaactgacccacttgtgtatacctacatacaacccaaccta 21724725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 101 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 21566346 - 21566163
Alignment:
Q  101 tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccacc 198  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||  ||||| ||||||  |||||||  ||||||    
T  21566346 tcagggccgtgacccacaccgttgtcgaatggttaaagcattctcatcatgacataagtcctcaccgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccacc 21566247  T
Q  199 actttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
     ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  21566246 gctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccacttgtgtatatctacatac 21566163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 82 - 282
Target Start/End: Original strand, 12167237 - 12167439
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  12167237 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 12167336  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 279  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  || | || |||||||||||    
T  12167337 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaactaccccacctgtgtatatctaca 12167436  T
Q  280 tac 282  Q
    |||    
T  12167437 tac 12167439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 82 - 282
Target Start/End: Original strand, 19286146 - 19286348
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  19286146 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 19286245  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 279  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  || | || |||||||||||    
T  19286246 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaactaccccacctgtgtatatctaca 19286345  T
Q  280 tac 282  Q
    |||    
T  19286346 tac 19286348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 82 - 282
Target Start/End: Original strand, 19877330 - 19877532
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  19877330 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 19877429  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 279  Q
    ||  |||||||  |||||  ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  || | || |||||||||||    
T  19877430 gaacaactagtgttccactgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaactaccccacctgtgtatatctaca 19877529  T
Q  280 tac 282  Q
    |||    
T  19877530 tac 19877532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 82 - 282
Target Start/End: Original strand, 19883106 - 19883308
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  19883106 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 19883205  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 279  Q
    ||  |||||||  |||||  ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  || | || |||||||||||    
T  19883206 gaacaactagtgttccactgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaactaccccacctgtgtatatctaca 19883305  T
Q  280 tac 282  Q
    |||    
T  19883306 tac 19883308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 25470868 - 25470691
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  25470868 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcctcacctctccacaccgcttt 25470769  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  25470768 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaacta 25470691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 29615376 - 29615199
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  29615376 atgcatgtggtaccataac-cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 29615278  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  29615277 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 29615199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 34647829 - 34647652
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  34647829 atgcatgtggtaccgtaattcagggccgtgacccactccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 34647730  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  34647729 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgtttatgcaacta 34647652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Original strand, 23837580 - 23837758
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||  ||||| ||||    
T  23837580 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagttctcaccgctccacaccgcttt 23837679  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    ||  |||||||  ||||||  |||||| ||| | |  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  23837680 gaacaactagtgttccaccgttttgaacgacaaggtgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatggaacta 23837758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 34641155 - 34640978
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  34641155 atgcatgtggtaccgtaattcagggccgtgacccactccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 34641056  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| | | | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  34641055 gaacaactagtgttccaccgctttgaacggcgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgtttatgcaacta 34640978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19787050 - 19786847
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  19787050 atgcatgtggtaccataattcagggccattacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 19786951  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttt-atgcaactaatccccttgagtatatctac 278  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||  || | || ||||||||||    
T  19786950 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttaatgcaactaccccacctgtgtatatctac 19786851  T
Q  279 atac 282  Q
    ||||    
T  19786850 atac 19786847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Original strand, 24562282 - 24562459
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 178  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  24562282 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 24562380  T
Q  179 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  24562381 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 24562459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 937896 - 937658
Alignment:
Q  47 tcatcactactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc- 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||| | || |  ||| |||| |||| |||||||||||||||||     
T  937896 tcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcatgaccttagccctcacctctgtagaatggttaaagcattca 937798  T
Q  144 tcaacaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgt 242  Q
    |   ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||||||||||      
T  937797 ttttcaggacataagtcctcacctctaacaccactttgagcaacgagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccaaagccgaagctctcccacttc 937698  T
Q  243 tatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    |||| |||||||| | | || || | ||||||||||||||    
T  937697 tatgcttatgcaattgacccactcgtgtatatctacatac 937658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 121 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 29416605 - 29416468
Alignment:
Q  121 gctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcat 217  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | |       
T  29416605 gctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggtgc 29416506  T
Q  218 tccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaa 255  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  29416505 tccagagccgaagctctcccacttttatgattatgcaa 29416468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 282
Target Start/End: Original strand, 18788448 - 18788560
Alignment:
Q  170 acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgag 269  Q
    ||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||| |    
T  18788448 acaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccaaagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccacttgtg 18788547  T
Q  270 tatatctacatac 282  Q
    |||||||||||||    
T  18788548 tatatctacatac 18788560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 282
Target Start/End: Original strand, 18799428 - 18799540
Alignment:
Q  170 acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgag 269  Q
    ||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||| |    
T  18799428 acaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccaaagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccacttgtg 18799527  T
Q  270 tatatctacatac 282  Q
    |||||||||||||    
T  18799528 tatatctacatac 18799540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 282
Target Start/End: Original strand, 19439792 - 19439904
Alignment:
Q  170 acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgag 269  Q
    ||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||| | || |||| |    
T  19439792 acaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccgcttttatgcttatgtaactgacccacttgtg 19439891  T
Q  270 tatatctacatac 282  Q
    |||||||||||||    
T  19439892 tatatctacatac 19439904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 11289705 - 11289602
Alignment:
Q  156 aagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgc 253  Q
    ||||||||||| ||  ||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  11289705 aagtcctcaccgctccacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgtttatgc 11289607  T
Q  254 aacta 258  Q
    |||||    
T  11289606 aacta 11289602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 55 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 14582056 - 14581831
Alignment:
Q  55 actccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcaacagga 152  Q
    |||||||||||||||||||| |     ||||||||||||||| ||  |||||||| | ||| ||||||| | |||||||||||||||||  ||| |||||    
T  14582056 actccactaagactcctctata-----atgcatgtggtaccataa--cagggccgaggccctcaccgctatagaatggttaaagcattctttcatcagga 14581964  T
Q  153 cataagtcctcaccact--acaccactttgagtaac-tagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctc-ccactgttatgtt 248  Q
    ||| ||||||||||  |  ||||| ||||||  ||| | ||  ||| |||||||||||||| | |||||||||  ||||||  ||| || || ||||| |    
T  14581963 catgagtcctcaccgttaaacaccgctttgaacaacattgtgttcctccactttgaatgacaaggcattccaggaccgaagtcctcaccgctattatgct 14581864  T
Q  249 tatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||| |||||||    
T  14581863 tatgcaactaa-ccccttatgtatatatacatac 14581831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 56 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19588781 - 19588556
Alignment:
Q  56 ctccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcaacaggac 153  Q
    ||||||||||||||||||| |     ||||||||||||||| || |||||||||   ||| |||||||  | |||||||||||| |||| |   || |||    
T  19588781 ctccactaagactcctctaca-----atgcatgtggtaccataa-tcagggccgaatccctcaccgctaattgaatggttaaagtattcattttcatgac 19588688  T
Q  154 ataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttat 251  Q
    ||||||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||| ||  | || |||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||    
T  19588687 ataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgataaggcgttccagggccgaagccctcccgcttttatgcttat 19588588  T
Q  252 gcaactaa-tccccttgagtatatctacatac 282  Q
    |||||||| ||| || | ||||||||||||||    
T  19588587 gcaactaactccactggtgtatatctacatac 19588556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 11284022 - 11283984
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacacc 120  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  11284022 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacacc 11283984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 29)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 49 - 385
Target Start/End: Original strand, 36799343 - 36799678
Alignment:
Q  49 atcactactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36799343 atcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 36799442  T
Q  149 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36799443 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 36799542  T
Q  249 tatgcaactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaactttagggaatttca 347  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||| ||| ||||||| |    
T  36799543 tatgcaactaatccccattgagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacaacgttaaggaattt-a 36799640  T
Q  348 attaagtacaacatacattcagtcaacatccattcatc 385  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  36799641 attaagtacaacattcattcagtcagcatccattcatc 36799678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 49 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 1804701 - 1804364
Alignment:
Q  49 atcactactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1804701 atcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 1804602  T
Q  149 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1804601 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 1804502  T
Q  249 tatgcaactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaac-tttagggaatttc 346  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | | || |||| || ||| |||||     
T  1804501 tatgcaactaatccccattgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacat-atatatgattcaccattcaacttgcaacattaaggaaatttt 1804403  T
Q  347 aattaagtacaacatacattcagtcaacatccattcatc 385  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||| |||| |||||||    
T  1804402 aattaaatacaacattcattcaatcagcatctattcatc 1804364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 49 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 18681736 - 18681400
Alignment:
Q  49 atcactactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18681736 atcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 18681637  T
Q  149 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18681636 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 18681537  T
Q  249 tatgcaactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt-agggaatttc 346  Q
     ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| |||| |||||||||     
T  18681536 aatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacacctttaagggaattt- 18681439  T
Q  347 aattaagtacaacatacattcagtcaacatccattcatc 385  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  18681438 aattaaatacaacattcattcagtcagcatccattcatc 18681400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 49 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 31568045 - 31567709
Alignment:
Q  49 atcactactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31568045 atcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 31567946  T
Q  149 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31567945 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 31567846  T
Q  249 tatgcaactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt-agggaatttc 346  Q
     ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| |||| |||||||||     
T  31567845 aatgcaactaatccccatagagtatatctatataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacacctttaagggaattt- 31567748  T
Q  347 aattaagtacaacatacattcagtcaacatccattcatc 385  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  31567747 aattaaatacaacattcattcagtcagcatccattcatc 31567709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 49 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 31573266 - 31572930
Alignment:
Q  49 atcactactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31573266 atcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 31573167  T
Q  149 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31573166 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 31573067  T
Q  249 tatgcaactaatcc-ccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt-agggaatttc 346  Q
     ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| |||| |||||||||     
T  31573066 aatgcaactaatcctcatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacacctttaagggaattt- 31572969  T
Q  347 aattaagtacaacatacattcagtcaacatccattcatc 385  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  31572968 aattaaatacaacattcattcagtcagcatccattcatc 31572930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 48 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 9273394 - 9273054
Alignment:
Q  48 catcactactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaa 147  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9273394 catcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcat 9273295  T
Q  148 caggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatg 246  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9273294 cagaacataagtcctcaccactaacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgaccaagcgttccagagccgaagctctcccactgttatg 9273195  T
Q  247 tttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaac-tttagggaa--t 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |||| | ||  |    
T  9273194 tttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacat-atatatgattcaccatccaacttacaacatttaagtaaatt 9273096  T
Q  344 ttcaattaagtacaacatacattcagtcaacatccattcatc 385  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  9273095 tttaattaaatacaacatacattcagtcagcatctattcatc 9273054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 47 - 293
Target Start/End: Original strand, 22055682 - 22055930
Alignment:
Q  47 tcatcactactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc- 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||     
T  22055682 tcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattca 22055780  T
Q  144 tcaacaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgt 242  Q
    |   |||||| ||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  22055781 ttttcaggacctaaatcctcaccactaacaccactttaagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgt 22055880  T
Q  243 tatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 293  Q
    |||| |||||||| | | || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22055881 tatgcttatgcaaatgacccacttgagtatatctacata-caaccaaccta 22055930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 47 - 293
Target Start/End: Original strand, 22050164 - 22050412
Alignment:
Q  47 tcatcactactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc- 143  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||     
T  22050164 tcatcaccattccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattca 22050262  T
Q  144 tcaacaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgt 242  Q
    |   |||||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22050263 ttttcaggacctaagtcctcaccactaacaccactttaagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccaaagccgaagctctcccactgt 22050362  T
Q  243 tatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 293  Q
    |||| |||||||| | | || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22050363 tatgcttatgcaaatgacccacttgagtatatctacata-caaccaaccta 22050412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 47 - 282
Target Start/End: Original strand, 22177549 - 22177787
Alignment:
Q  47 tcatcactactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc- 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||     
T  22177549 tcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattca 22177647  T
Q  144 tcaacaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgt 242  Q
    |   ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| |    
T  22177648 ttttcaggacataagtcttcaccactaacaccactttgagcaacttgtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttt 22177747  T
Q  243 tatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    | || |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  22177748 tttgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 22177787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Original strand, 44476236 - 44476414
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||  |||    
T  44476236 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgtttt 44476335  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  44476336 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 44476414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Original strand, 44479498 - 44479676
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||  |||    
T  44479498 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgtttt 44479597  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  44479598 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 44479676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 19903105 - 19902928
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  19903105 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 19903006  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || ||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  19903005 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagagccgaagctctcccact-tgatatttatgcaacta 19902928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Original strand, 23865434 - 23865611
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  23865434 atgcatgtggtaccataatccagggccatgacccacaccgctgtcaaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccgctccacaccgcttt 23865533  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  23865534 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgtttatgcaacta 23865611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 282
Target Start/End: Original strand, 17053597 - 17053799
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  17053597 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccactgccgaatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 17053696  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 279  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||  || | || |||||||||||    
T  17053697 gaacaactagttttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagctgaagctctcccactttgatgtttatgcaactaccccacctgtgtatatctaca 17053796  T
Q  280 tac 282  Q
    |||    
T  17053797 tac 17053799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 55 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22025791 - 22025559
Alignment:
Q  55 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcaacag 150  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||  |   |||    
T  22025791 actcctctaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcatttttcag 22025693  T
Q  151 gacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 248  Q
    |||||||||||||||| |||  |||| ||||||| |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  22025692 gacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgagcaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgct 22025593  T
Q  249 tatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    ||||||||| | || ||||  |||||||||||||    
T  22025592 tatgcaactgacccacttgtctatatctacatac 22025559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Original strand, 23825124 - 23825301
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 178  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  23825124 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 23825222  T
Q  179 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  23825223 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 23825301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Original strand, 25409554 - 25409731
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||  ||||| ||||    
T  25409554 atgcatgtggtaccataac-cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcatcaccgctccacaccgcttt 25409652  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | ||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  25409653 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgatccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 25409731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 82 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 30767126 - 30766925
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 178  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  30767126 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcataaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 30767028  T
Q  179 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctac 278  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||| ||  | || ||||||||||    
T  30767027 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ctatgcaactactcaacctgtgtatatctac 30766929  T
Q  279 atac 282  Q
    ||||    
T  30766928 atac 30766925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 55 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22063794 - 22063562
Alignment:
Q  55 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcaacag 150  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||| | |||||| || |||||| ||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||  |   |||    
T  22063794 actcctctaagactcctctaacaacacccatgcatttagtaccataa-tcagggtcgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcatttttcag 22063696  T
Q  151 gacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 248  Q
    |||||||||||||||| |||  |||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||| | || |||| ||||||||||||||||||| ||||| |    
T  22063695 gacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgagcaactagtgctccaccgctttgaacgacaaggcgttccggagccgaagctctcccacttttatgct 22063596  T
Q  249 tatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    ||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  22063595 tatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 22063562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 82 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 14057784 - 14057583
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccacta--caccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||   ||| ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||  |||| ||||    
T  14057784 atgcatgtggtaccatat-tcagggccggagccctcaccgctatcgaatggttaaagcattcttatcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgcttt 14057686  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 279  Q
    ||  |||||||  |||||  ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||| |||||| ||||    
T  14057685 gaacaactagtgttccactgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccacttgtgtatatttaca 14057586  T
Q  280 tac 282  Q
    |||    
T  14057585 tac 14057583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 152 - 282
Target Start/End: Original strand, 25110911 - 25111043
Alignment:
Q  152 acataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttt 249  Q
    ||||||||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  25110911 acataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaagacattccagagccgaagctctcccacttttatgctt 25111010  T
Q  250 atgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  25111011 atgcaactaacccacttgtgtatatctacatac 25111043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 56 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 41009658 - 41009433
Alignment:
Q  56 ctccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcaacaggac 153  Q
    ||||||||||||||||||| |     ||||||||||||||| || |||||||||  |||| |||||||  | ||||||||||||||||| |   ||||||    
T  41009658 ctccactaagactcctctaca-----atgcatgtggtaccataa-tcagggccgaaaccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattttcaggac 41009565  T
Q  154 ataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttat 251  Q
    ||||||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||    
T  41009564 ataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccgcttttatgcttat 41009465  T
Q  252 gcaactaa-tccccttgagtatatctacatac 282  Q
    |||||||| ||| || | ||||||||||||||    
T  41009464 gcaactaactccactggtgtatatctacatac 41009433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 82 - 257
Target Start/End: Original strand, 18609793 - 18609969
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||   ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  18609793 atgcatgtggtaccatat-tcagggccggagccctcactgctatcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgcttt 18609891  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaact 257  Q
    ||  |||||||  |||||| |||| || ||| | ||||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  18609892 gaacaactagtgttccaccgctttcaacgacaaggcattccagggccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaact 18609969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 57 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 21327047 - 21326822
Alignment:
Q  57 tccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcaa--caggac 153  Q
    |||||||||||||||||| |     ||||||||||||||| || |||||||||   ||| |||||||  ||||||||||||||||||||     ||||||    
T  21327047 tccactaagactcctctaca-----atgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattctttttccaggac 21326954  T
Q  154 ataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttat 251  Q
    ||||||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||| ||||| || ||||| || | ||||||||    
T  21326953 ataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaggccctcccgctttcatgtttat 21326854  T
Q  252 gcaact-aatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  21326853 gcaactaaatccacttgtgtatatctacatac 21326822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 282
Target Start/End: Original strand, 21668901 - 21669059
Alignment:
Q  127 gaatggttaaagcattc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccaga 223  Q
    ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||    
T  21668901 gaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccaga 21669000  T
Q  224 gccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||| |||| |  | |||| |||||| |||||||    
T  21669001 gccgaagctctcccgcttttatgcttatgtaactgactcacttgtgtatatatacatac 21669059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 282
Target Start/End: Original strand, 21282196 - 21282261
Alignment:
Q  217 ttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  21282196 ttccagagccgaagctctcccgcttttatgcttatgcaactaacccacttgtgtatatctacatac 21282261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 21322439 - 21322234
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcaa--caggacataagtcctcaccact--acaccac 176  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||   ||| |||||||  ||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| ||  ||||| |    
T  21322439 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattcttttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgc 21322341  T
Q  177 tttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaa-tccccttgagtatatc 275  Q
    |||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || ||| || |||||  | ||||| || | |||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  21322340 tttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagggccgagaccctcccgctttcatgtttatgcaactaactccacttgtgtatatc 21322241  T
Q  276 tacatac 282  Q
    |||||||    
T  21322240 tacatac 21322234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 56 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 20974228 - 20974118
Alignment:
Q  56 ctccactaagactcctcta-aacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcaa-cagga 152  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||||   ||| |||||||  | ||||||||||||||||||    |||||    
T  20974228 ctccactaagactcttctacaacactcatgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctaatagaatggttaaagcattctttttcagga 20974130  T
Q  153 cataagtcctca 164  Q
    ||||||||||||    
T  20974129 cataagtcctca 20974118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 282
Target Start/End: Original strand, 10606904 - 10607136
Alignment:
Q  56 ctccactaagactcctcta-aacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcaa-cagga 152  Q
    |||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||||   ||| |||||||  | ||||||||||||||||||    |||||    
T  10606904 ctccactaagacccttctacaacactcatgcatgtggtaccataa-tcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattctttttcagga 10607002  T
Q  153 cataagtcctcaccact--acaccactttgagtaacta-gtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttt 249  Q
    |||||||||||||| ||  ||||| | ||||  ||| | ||  |||||| ||||||| ||| | || |||||| |||  ||| ||||| || ||||| ||    
T  10607003 cataagtcctcaccgctaaacaccgcgttgaacaacaaggtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccagagccctcccgcttttatgctt 10607102  T
Q  250 atgcaact-aatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    |||||||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  10607103 atgcaactgactccacttgtgtatatctacatac 10607136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 270; Significance: 1e-151; HSPs: 40)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 49 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 807207 - 806872
Alignment:
Q  49 atcactactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  807207 atcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 807108  T
Q  149 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  807107 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 807008  T
Q  249 tatgcaactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaactttagggaatttca 347  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||| ||| ||||||| |    
T  807007 tatgcaactaatccccattgagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacaacgttaaggaattt-a 806910  T
Q  348 attaagtacaacatacattcagtcaacatccattcatc 385  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  806909 attaagtacaacattcattcagtcagcatccattcatc 806872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 49 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 18055919 - 18055583
Alignment:
Q  49 atcactactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18055919 atcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 18055820  T
Q  149 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18055819 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 18055720  T
Q  249 tatgcaactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt-agggaatttc 346  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| |||| |||||||||     
T  18055719 tatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacacctttaagggaatttt 18055621  T
Q  347 aattaagtacaacatacattcagtcaacatccattcatc 385  Q
    |||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  18055620 aattatatacaacacaca-tcagtcaacatccattcatc 18055583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 49 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 23201712 - 23201382
Alignment:
Q  49 atcactactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 148  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23201712 atcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatc 23201613  T
Q  149 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  23201612 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctctcacttttatgtt 23201513  T
Q  249 tatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacata-atatatgagtcaccatccgatttacaac-tttagggaatttc 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| || |||||||||     
T  23201512 tatgcaactaatccccttgagtatatccacataccaaccaacctaaacatatacatatatatatgattcaccatccaacttacaacattaagggaatttt 23201413  T
Q  347 aattaagtacaacatacattcagtcaacatc 377  Q
    |||||| ||  |||||||||||||| |||||    
T  23201412 aattaaataagacatacattcagtccacatc 23201382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 49 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 23507839 - 23507509
Alignment:
Q  49 atcactactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 148  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23507839 atcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatc 23507740  T
Q  149 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  23507739 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctctcacttttatgtt 23507640  T
Q  249 tatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacata-atatatgagtcaccatccgatttacaac-tttagggaatttc 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| || |||||||||     
T  23507639 tatgcaactaatccccttgagtatatccacataccaaccaacctaaacatatacatatatatatgattcaccatccaacttacaacattaagggaatttt 23507540  T
Q  347 aattaagtacaacatacattcagtcaacatc 377  Q
    |||||| ||  |||||||||||||| |||||    
T  23507539 aattaaataagacatacattcagtccacatc 23507509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 49 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 18049440 - 18049104
Alignment:
Q  49 atcactactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18049440 atcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 18049341  T
Q  149 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18049340 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccacctctttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 18049241  T
Q  249 tatgcaactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt-agggaatttc 346  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| |||| |||||||||     
T  18049240 tatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacacctttaagggaatttt 18049142  T
Q  347 aattaagtacaacatacattcagtcaacatccattcatc 385  Q
    |||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  18049141 aattatatacaacacaca-tcagtcaacatccattcatc 18049104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 49 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 11632150 - 11631814
Alignment:
Q  49 atcactactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11632150 atcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 11632051  T
Q  149 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11632050 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 11631951  T
Q  249 tatgcaactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt-agggaatttc 346  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| |||| |||||||||     
T  11631950 tatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacacctttaagggaatttt 11631852  T
Q  347 aattaagtacaacatacattcagtcaacatccattcatc 385  Q
    | |||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  11631851 atttatatacaacacaca-tcagtcagcatccattcatc 11631814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 49 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 20580151 - 20579816
Alignment:
Q  49 atcactactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20580151 atcaccactccactaagactcctctaaactcccatgcatgtggtaccataaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 20580052  T
Q  149 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20580051 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 20579952  T
Q  249 tatgcaactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt-agggaatttc 346  Q
     ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| |||| | |||||||     
T  20579951 aatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacacctttaaaggaattt- 20579854  T
Q  347 aattaagtacaacatacattcagtcaacatccattcatc 385  Q
    |||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  20579853 aattatatacaacacaca-tcagtcagcatccattcatc 20579816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 82 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 23666004 - 23665753
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccacta-caccactttg 180  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23666004 atgcatgtggtaccaaaa-tcagggccgtgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccactttg 23665906  T
Q  181 agtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacat 280  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | || |||||||||||||||||    
T  23665905 agcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgctcatgcaactgacccacttgagtatatctacat 23665806  T
Q  281 accaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcacca-tccgatttacaac 333  Q
    || | || |||||| ||||||  | |||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  23665805 acaatcccacctaagcatatatgt-atatatgactcaccactccaatttacaac 23665753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 47 - 301
Target Start/End: Original strand, 15338789 - 15339046
Alignment:
Q  47 tcatcactactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc- 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||     
T  15338789 tcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattca 15338887  T
Q  144 tcaacaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgt 242  Q
    |   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15338888 ttttcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgt 15338987  T
Q  243 tatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatata 301  Q
    |||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  15338988 tatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaacctatacatata 15339046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 82 - 333
Target Start/End: Original strand, 29795730 - 29795981
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccacta-caccactttg 180  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29795730 atgcatgtggtaccaaaac-cagggccgtgacccataccactgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccactttg 29795828  T
Q  181 agtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacat 280  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | || |||||||||||||||||    
T  29795829 agcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgctcatgcaactgacccacttgagtatatctacat 29795928  T
Q  281 accaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcacca-tccgatttacaac 333  Q
    || | || |||||| ||||||  | |||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  29795929 acaatcccacctaagcatatatgt-atatatgactcaccactccaatttacaac 29795981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 82 - 333
Target Start/End: Original strand, 29799549 - 29799800
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccacta-caccactttg 180  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29799549 atgcatgtggtaccaaaac-cagggccgtgacccataccactgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccactttg 29799647  T
Q  181 agtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacat 280  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | || |||||||||||||||||    
T  29799648 agcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgctcatgcaactgacccacttgagtatatctacat 29799747  T
Q  281 accaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcacca-tccgatttacaac 333  Q
    || | || |||||| ||||||  | |||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  29799748 acaatcccacctaagcatatatgt-atatatgactcaccactccaatttacaac 29799800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 47 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 15723429 - 15723180
Alignment:
Q  47 tcatcactactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc- 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||     
T  15723429 tcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattca 15723331  T
Q  144 tcaacaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgt 242  Q
    |   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15723330 ttttcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgt 15723231  T
Q  243 tatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 293  Q
    |||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  15723230 tatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaaccta 15723180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 82 - 282
Target Start/End: Original strand, 11302852 - 11303052
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccacta-caccactttg 180  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11302852 atgcatgtggtaccaaaa-tcagggccgtgacccacacctttgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccactttg 11302950  T
Q  181 agtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacat 280  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || | || ||||||||||||    
T  11302951 agcaactagtactccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacctgtgtatatctacat 11303050  T
Q  281 ac 282  Q
    ||    
T  11303051 ac 11303052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 47 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 35962951 - 35962701
Alignment:
Q  47 tcatcactactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc- 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||     
T  35962951 tcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattca 35962853  T
Q  144 tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactg 241  Q
    |   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||     
T  35962852 ttttcaggacataagtcctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactt 35962753  T
Q  242 ttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 293  Q
    ||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  35962752 ttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaaccta 35962701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 50 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 15711202 - 15710956
Alignment:
Q  50 tcactactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tca 146  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |      
T  15711202 tcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaatcattcattt 15711104  T
Q  147 acaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttat 245  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15711103 tcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtactccaccactttgaacgacaaggcgttccagatccgaagctctcccactgttat 15711004  T
Q  246 gtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 293  Q
    | |||||||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  15711003 gcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaaccta 15710956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 47 - 293
Target Start/End: Original strand, 14431952 - 14432201
Alignment:
Q  47 tcatcactactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc- 143  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||     
T  14431952 tcatcaccactccactaagacccctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattca 14432050  T
Q  144 tcaacaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgt 242  Q
    |   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||||||||||||    
T  14432051 ttttcaggacctaagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagtcgaagctctcccactgt 14432150  T
Q  243 tatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 293  Q
    |||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  14432151 tatgcttatgcaactgacccacttgagtatatctacatacaatccaaccta 14432201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 47 - 320
Target Start/End: Original strand, 19599805 - 19600080
Alignment:
Q  47 tcatcactactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc- 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||      
T  19599805 tcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccacgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattta 19599903  T
Q  144 tcaacaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgt 242  Q
    |   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| |    
T  19599904 ttttcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgatccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactat 19600003  T
Q  243 tatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcacca 320  Q
    |||| |||| ||||| | || |||| |||||||||||||| | | ||||||  |||||| || |||||||| ||||||    
T  19600004 tatgcttatacaactgacccacttgtgtatatctacatacaaccaaacctatgcatatatat-atatatgactcacca 19600080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 47 - 282
Target Start/End: Original strand, 1612586 - 1612825
Alignment:
Q  47 tcatcactactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc- 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||     
T  1612586 tcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagcccccaccgctgtagaatggttaaagcattca 1612684  T
Q  144 tcaacaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgt 242  Q
    |   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| |    
T  1612685 ttttcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaaatagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttt 1612784  T
Q  243 tatgtttatgcaact-aatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    |||| |||| ||||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  1612785 tatgcttatccaactgactccacttgtgtatatctacatac 1612825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 12591812 - 12591635
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  12591812 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 12591713  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    ||  ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  12591712 gaacaactagtgctccaccgctttgaacgacgaagcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaacta 12591635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 14281822 - 14281609
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactt 178  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  14281822 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcatcaccactaaacaccactt 14281724  T
Q  179 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctac 278  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||    
T  14281723 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctac 14281624  T
Q  279 ataccaaccaaccta 293  Q
    |||| | ||||||||    
T  14281623 atacaacccaaccta 14281609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Original strand, 14421354 - 14421532
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  14421354 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 14421453  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    ||  ||||||   |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  14421454 gaacaactagcgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 14421532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 82 - 282
Target Start/End: Original strand, 13006306 - 13006508
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  13006306 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 13006405  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 279  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  || | || |||||||||||    
T  13006406 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaactaccccacctgtgtatatctaca 13006505  T
Q  280 tac 282  Q
    |||    
T  13006506 tac 13006508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 13124148 - 13123971
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  13124148 atgcatgtggtaccataatccagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 13124049  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  13124048 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgtttatgcaacta 13123971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 82 - 282
Target Start/End: Original strand, 16676192 - 16676393
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| |  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  16676192 atgcatgtggtaccatat-taaggaccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcgacaccgcttt 16676290  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 279  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || || |||  |||||||||||    
T  16676291 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaaccaacccacttatgtatatctaca 16676390  T
Q  280 tac 282  Q
    |||    
T  16676391 tac 16676393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 12711077 - 12710900
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  12711077 atgcatgtggtaccataatccagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 12710978  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  12710977 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagtcgaagctctcccact-tgatatttatgcaacta 12710900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Original strand, 13742505 - 13742682
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  13742505 atgcatgtggtaccataatttagggccgttacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 13742604  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  13742605 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaaactctcccact-tgatgtttatgcaacta 13742682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Original strand, 4279963 - 4280140
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 178  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  4279963 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 4280061  T
Q  179 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  4280062 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 4280140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Original strand, 19616295 - 19616472
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 178  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  19616295 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 19616393  T
Q  179 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  19616394 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 19616472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 282
Target Start/End: Original strand, 17650429 - 17650629
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| |  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  17650429 atgcatgtggtaccatattt-aggaccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcgacaccgcttt 17650527  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 279  Q
    ||  |||||||  |||||| | ||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || || |||  |||||||||||    
T  17650528 gaacaactagtgttccaccgc-ttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaaccaacccacttatgtatatctaca 17650626  T
Q  280 tac 282  Q
    |||    
T  17650627 tac 17650629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 81 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16109244 - 16109067
Alignment:
Q  81 catgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacaggacataagtcctcaccacta-caccactt 178  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16109244 catgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaacaccactt 16109146  T
Q  179 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaact 257  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16109145 tgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaaactctcccacttttatgcttatgcaact 16109067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 155 - 293
Target Start/End: Original strand, 14128244 - 14128383
Alignment:
Q  155 taagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgc 253  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14128244 taagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagtcgaagctctcccactgttatgcttatgc 14128343  T
Q  254 aactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 293  Q
    |||| | || ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  14128344 aactgacccacttgagtatatctacatacaatccaaccta 14128383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 82 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 20328425 - 20328224
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccacta--caccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| | | |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||  |||| ||||    
T  20328425 atgcatgtggtaccatata-caggaccgtagcccacaccgctgtcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgcttt 20328327  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 279  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || | |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||    
T  20328326 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgtcccagagccgaagctctcccacttttatgattatgcaactgacccacttgtgtatatctaca 20328227  T
Q  280 tac 282  Q
    |||    
T  20328226 tac 20328224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 55 - 282
Target Start/End: Original strand, 6411792 - 6412023
Alignment:
Q  55 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagg 151  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| || |||||||||   ||| ||||||||| |||| |||||||||||| |   ||||    
T  6411792 actccactaagactcctctaacaacactcatgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctgtagaattgttaaagcattcattttcagg 6411890  T
Q  152 acataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttt 249  Q
    ||||||||||||||| |||  |||  ||||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||| || ||||| ||    
T  6411891 acataagtcctcaccgctatacactgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaatgcgttccagagccgaagctctcccgcttttatgctt 6411990  T
Q  250 atgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    |||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  6411991 atgcaactaaccctcttgtgtatatctacatac 6412023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 113 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 11390473 - 11390302
Alignment:
Q  113 cccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgac 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||| |||    
T  11390473 cccactccgctgtcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtcctcaccactaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgac 11390374  T
Q  211 taagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
     | || ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  11390373 aaggcgttctagagccgaagctctcccacttttatgattatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 11390302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 11383985 - 11383814
Alignment:
Q  113 cccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgac 210  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||| |||  |||| ||||||   ||||||  |||||| |||||||  ||    
T  11383985 cccactccgctgtcgaatggttaaagcattcttttcaggacttaagtcctcaccgctaaacaccgctttgaaccactagtgttccaccgctttgaacaac 11383886  T
Q  211 taagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
     | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  11383885 aaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgattatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 11383814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 282
Target Start/End: Original strand, 18606896 - 18607067
Alignment:
Q  113 cccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||| ||  ||||| ||||||   ||||||  |||||| |||||||  ||    
T  18606896 cccacaccgctgtcgaatggttaaagcattcttttcagaacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaaccactagtgttccaccgctttgaaccac 18606995  T
Q  211 taagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
     | || |||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  18606996 aaggcgttccagagtcgaagctctctcacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 18607067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 127 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 21232167 - 21232009
Alignment:
Q  127 gaatggttaaagcattc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccaga 223  Q
    ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||    
T  21232167 gaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccaga 21232068  T
Q  224 gccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || ||||  |||||||||||||    
T  21232067 gccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtatatatctacatac 21232009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 56 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 11220311 - 11220086
Alignment:
Q  56 ctccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtc-gaatggttaaagcattc-tcaacaggac 153  Q
    ||||||||||||||||||| |     ||||||||||||||| || |||||||||   ||| ||||||| |  ||||||||||||||||| |   ||||||    
T  11220311 ctccactaagactcctctaca-----atgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctatttgaatggttaaagcattcattttcaggac 11220218  T
Q  154 ataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttat 251  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||| |||||||| |||||||| ||||| || |    
T  11220217 ataagtcctcaccgcttaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccacttttatgcttct 11220118  T
Q  252 gcaactaa-tccccttgagtatatctacatac 282  Q
    |||||||| ||| || | ||||||||||||||    
T  11220117 gcaactaactccactggtgtatatctacatac 11220086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 195 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 36306121 - 36306034
Alignment:
Q  195 caccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    |||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  36306121 caccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcacacttttatgcttatgcaactaacccacttgtgtatatctacatac 36306034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 37244484 - 37244401
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtc--gaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcacc 166  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||   ||| |||||||||   |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  37244484 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattc--atcaggacataagtcctcacc 37244401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 31)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 49 - 382
Target Start/End: Original strand, 12578760 - 12579092
Alignment:
Q  49 atcactactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12578760 atcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 12578859  T
Q  149 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12578860 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 12578959  T
Q  249 tatgcaactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaactttagggaatttca 347  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||| ||| ||||||| |    
T  12578960 tatgcaactaatccccattgagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacaacgttaaggaattt-a 12579057  T
Q  348 attaagtacaacatacattcagtcaacatccattc 382  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  12579058 attaagtacaacattcattcagtcagcatccattc 12579092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 49 - 382
Target Start/End: Original strand, 12572278 - 12572610
Alignment:
Q  49 atcactactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 148  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12572278 atcaccactccgctaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 12572377  T
Q  149 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12572378 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 12572477  T
Q  249 tatgcaactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaactttagggaatttca 347  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||| ||| ||||||| |    
T  12572478 tatgcaactaatccccattgagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacaacgttaaggaattt-a 12572575  T
Q  348 attaagtacaacatacattcagtcaacatccattc 382  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  12572576 attaagtacaacattcattcagtcagcatccattc 12572610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 49 - 385
Target Start/End: Original strand, 27785662 - 27785998
Alignment:
Q  49 atcactactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27785662 atcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 27785761  T
Q  149 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27785762 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 27785861  T
Q  249 tatgcaactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt-agggaatttc 346  Q
     ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| |||| |||||||||     
T  27785862 aatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacacctttaagggaattt- 27785959  T
Q  347 aattaagtacaacatacattcagtcaacatccattcatc 385  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  27785960 aattaaatacaacattcattcagtcagcatccattcatc 27785998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 49 - 385
Target Start/End: Original strand, 27790883 - 27791219
Alignment:
Q  49 atcactactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27790883 atcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 27790982  T
Q  149 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27790983 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 27791082  T
Q  249 tatgcaactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt-agggaatttc 346  Q
     ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| |||| |||||||||     
T  27791083 aatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacacctttaagggaattt- 27791180  T
Q  347 aattaagtacaacatacattcagtcaacatccattcatc 385  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  27791181 aattaaatacaacattcattcagtcagcatccattcatc 27791219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 48 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 27296215 - 27295877
Alignment:
Q  48 catcactactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaa 147  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27296215 catcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcat 27296116  T
Q  148 caggacataagtcctcaccact-acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatg 246  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27296115 caggacataagtcctcaccactaacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgaccgagcgttccagagccgaagctctcccactgttatg 27296016  T
Q  247 tttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaac--tttagggaatt 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||  || || |||||    
T  27296015 tttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaatct-aacatatacat-atatatgattcaccatccaatttacaacatttaagtgaatt 27295918  T
Q  345 tcaattaagtacaacatacattcagtcaacatccattcatc 385  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  27295917 ttaattaaatacaacatacattcagtcagcatctattcatc 27295877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 82 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 10685801 - 10685498
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccacta-caccactttg 180  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10685801 atgcatgtggtaccaaaa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccactttg 10685703  T
Q  181 agtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatcccc-ttgagtatatctaca 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  10685702 agtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttaatgcaactaatccccatagagtatatctaca 10685603  T
Q  280 taccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaactttagggaatttcaattaagtacaacatacattcagtcaacatcca 379  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| ||||| || | || |||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  10685602 taccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacacctttaagggagtttaattaaatacaacattcattcagtcagcatcca 10685504  T
Q  380 ttcatc 385  Q
    ||||||    
T  10685503 ttcatc 10685498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 47 - 293
Target Start/End: Original strand, 2105540 - 2105790
Alignment:
Q  47 tcatcactactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc- 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||     
T  2105540 tcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataattcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattca 2105639  T
Q  144 tcaacaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgt 242  Q
    |   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  2105640 ttttcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgt 2105739  T
Q  243 tatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 293  Q
    |||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  2105740 tatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaaccta 2105790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 82 - 282
Target Start/End: Original strand, 20260824 - 20261024
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact-acaccactttg 180  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20260824 atgcatgtggtaccaaaa-tcagggccgtgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccactttg 20260922  T
Q  181 agtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacat 280  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || | || ||||||||||||    
T  20260923 agcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacctgtgtatatctacat 20261022  T
Q  281 ac 282  Q
    ||    
T  20261023 ac 20261024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Original strand, 6482321 - 6482499
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  6482321 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 6482420  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  6482421 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 6482499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Original strand, 6485788 - 6485966
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  6485788 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 6485887  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  6485888 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 6485966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 82 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 23090207 - 23090006
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  23090207 atgcatgtggtaccatat-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgcttt 23090109  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 279  Q
    || ||||||||  |||||| |||| || ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  23090108 gaataactagtgttccaccgcttttaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccacttgtgtatatctaca 23090009  T
Q  280 tac 282  Q
    |||    
T  23090008 tac 23090006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 5707191 - 5707014
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  5707191 atgcatgtggtaccgtaattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 5707092  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    ||  ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  5707091 gaacaactagtgctccaccgctttgaacgacgaagcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgattatgcaacta 5707014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 23102635 - 23102434
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  23102635 atgcatgtggtaccatat-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgcttt 23102537  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 279  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  23102536 gaaaaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggagttccagagccgaagctctcccacttttaggcttatgcaactaacccacttgtgtatatctaca 23102437  T
Q  280 tac 282  Q
    |||    
T  23102436 tac 23102434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 82 - 282
Target Start/End: Original strand, 9241333 - 9241534
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  9241333 atgcatgtggtaccataa-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgcttt 9241431  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 279  Q
    ||  ||||| |  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||    
T  9241432 gaacaactaatgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagttcttccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctaca 9241531  T
Q  280 tac 282  Q
    |||    
T  9241532 tac 9241534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Original strand, 26582675 - 26582852
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  26582675 atgcatgtggtaccataac-cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 26582773  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  26582774 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 26582852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 23169475 - 23169298
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  23169475 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 23169377  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||    
T  23169376 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaaactctcccactttgatgcttatgcaacta 23169298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 23580732 - 23580555
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  23580732 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 23580634  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||    
T  23580633 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaaactctcccactttgatgcttatgcaacta 23580555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 282
Target Start/End: Original strand, 23877838 - 23878040
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||  ||||| ||||    
T  23877838 atgcatgtggtaccatatttcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattatcatcaggacataagtcttcaccgctcaacaccgcttt 23877937  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 279  Q
    ||  |||||||  |||||| |||||||  || | || ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| || |||| |||||||||||    
T  23877938 gaacaactagtgttccaccgctttgaactacaaggcgttccaaagccgaagctctcccacttttatgcttatgcgactaacccacttgtgtatatctaca 23878037  T
Q  280 tac 282  Q
    |||    
T  23878038 tac 23878040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Original strand, 200641 - 200818
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 178  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  200641 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 200739  T
Q  179 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  200740 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 200818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 27367760 - 27367600
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 178  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  27367760 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 27367662  T
Q  179 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccact 240  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  27367661 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 27367600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Original strand, 43693401 - 43693578
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 178  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  43693401 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgttgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 43693499  T
Q  179 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  43693500 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 43693578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 6744501 - 6744324
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 178  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  6744501 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaaacattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 6744403  T
Q  179 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    |||  ||| |||  |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  6744402 tgaacaaccagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 6744324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 282
Target Start/End: Original strand, 22809901 - 22810084
Alignment:
Q  102 cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccacc 198  Q
    |||||||| | ||| ||||||| | ||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||  |||||||  ||||||    
T  22809901 cagggccgaggccctcaccgctatagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaacaccgctttgaacaactagtgttccacc 22810000  T
Q  199 actttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
     ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  22810001 gctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcctgcttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 22810084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 84 - 256
Target Start/End: Original strand, 23263985 - 23264158
Alignment:
Q  84 gcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccactttga 181  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||   ||| |||| || ||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||    
T  23263985 gcatgtggtaccatat-tcagggccggagccctcaccactatcgaatgattaaagcattcttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttga 23264083  T
Q  182 gtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaac 256  Q
      |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  23264084 acaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaac 23264158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 21074114 - 21073954
Alignment:
Q  125 tcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccag 222  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||  ||||||||| ||  ||||| ||||||  ||| |||  |||||| ||||||| ||| |  | ||||||    
T  21074114 tcgaatggttaaagcattcttttcaggacatgggtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaagtgttccaccgctttgaacgacaagacgttccag 21074015  T
Q  223 agccgaagctctcccactgttatgtttatgcaact-aatccccttgagtatatctacatac 282  Q
     |||||||| ||||| || ||||| |||||||| | ||||| |||| ||||||||||||||    
T  21074014 ggccgaagccctcccgcttttatggttatgcaattgaatccacttgtgtatatctacatac 21073954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 127 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19703615 - 19703456
Alignment:
Q  127 gaatggttaaagcattc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccaga 223  Q
    ||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||  ||  |||| ||||||  |||||||  |||||| |||||||  || | || ||||||     
T  19703615 gaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgataaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacaacaaggcgttccagg 19703516  T
Q  224 gccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaa-tccccttgagtatatctacatac 282  Q
    |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||| ||| || | ||||||||||||||    
T  19703515 gccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaactaactccactggtgtatatctacatac 19703456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 56 - 282
Target Start/End: Original strand, 20724011 - 20724236
Alignment:
Q  56 ctccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcaacaggac 153  Q
    ||||||||||||||||||| |     ||||||||||||||| || |||||||||   ||| |||||||  | ||||||||||||||||| |   ||||||    
T  20724011 ctccactaagactcctctaca-----atgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattttcaggac 20724104  T
Q  154 ataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttat 251  Q
    || |||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || ||| || |||||||| ||||| || || || ||||    
T  20724105 atgagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagggccgaagccctcccgcttttttgcttat 20724204  T
Q  252 gcaactaa-tccccttgagtatatctacatac 282  Q
    |||||||| ||| || | ||||||||||||||    
T  20724205 gcaactaactccactggtgtatatctacatac 20724236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 56 - 282
Target Start/End: Original strand, 23290904 - 23291129
Alignment:
Q  56 ctccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcaacaggaca 154  Q
    ||||||||||||||||||| |     ||||||||||||||| |  |||||||||   ||| |||||||  |||||||||||||||||||    |||||||    
T  23290904 ctccactaagactcctctaca-----atgcatgtggtaccatat-tcagggccggagccctcaccgctaatcgaatggttaaagcattcgtttcaggaca 23290997  T
Q  155 taagtcctcaccacta--caccactttgagtaacta-gtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttat 251  Q
    |||||||||||| |||  |||| ||||||  ||| | ||  | |||| ||||||| ||| | || |||||| |||| ||| |||||||| || || ||||    
T  23290998 taagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgtttcaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccggagccctcccacttttgtgcttat 23291097  T
Q  252 gcaactaa-tccccttgagtatatctacatac 282  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  23291098 gcaactaactccacttgtgtatatctacatac 23291129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 166
Target Start/End: Original strand, 24943419 - 24943460
Alignment:
Q  125 tcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcacc 166  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  24943419 tcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtcctcacc 24943460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 160
Target Start/End: Original strand, 23269201 - 23269276
Alignment:
Q  84 gcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtc 160  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  23269201 gcatgtggtaccatat-tcagggccggagccctcaccgctatcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtc 23269276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 84 - 160
Target Start/End: Original strand, 23276070 - 23276145
Alignment:
Q  84 gcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtc 160  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||   ||| ||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  23276070 gcatgtggtaccatat-tcagggccggagccctcaccgctatcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtc 23276145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 20)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 48 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 635974 - 635635
Alignment:
Q  48 catcactactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaa 147  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  635974 catcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcat 635875  T
Q  148 caggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatg 246  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  635874 caggacataagtcctcaccactaacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgaccaagcgttccagagccgaagctctcccactgttatg 635775  T
Q  247 tttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaac--tttagggaatt 344  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||  || || |||||    
T  635774 tttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacat-atatatgattcaccatccaatttacaacatttaagtgaatt 635676  T
Q  345 tcaattaagtacaacatacattcagtcaacatccattcatc 385  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  635675 ttaattaaatacaacatacattcagtcagcatctattcatc 635635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 49 - 385
Target Start/End: Original strand, 42701193 - 42701529
Alignment:
Q  49 atcactactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42701193 atcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 42701292  T
Q  149 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42701293 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 42701392  T
Q  249 tatgcaactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt-agggaatttc 346  Q
     ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||| || | ||||| |||| |||||||||     
T  42701393 aatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacgt-atatatgattcaccaaccaacttacacctttaagggaattt- 42701490  T
Q  347 aattaagtacaacatacattcagtcaacatccattcatc 385  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  42701491 aattaaatacaacattcattcagtcagcatccattcatc 42701529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 49 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 51602282 - 51601946
Alignment:
Q  49 atcactactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51602282 atcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 51602183  T
Q  149 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51602182 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 51602083  T
Q  249 tatgcaactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt-agggaatttc 346  Q
     ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||| || | ||||| |||| |||||||||     
T  51602082 aatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacgt-atatatgattcaccaaccaacttacacctttaagggaattt- 51601985  T
Q  347 aattaagtacaacatacattcagtcaacatccattcatc 385  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  51601984 aattaaatacaacattcattcagtcagcatccattcatc 51601946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 49 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 51608163 - 51607827
Alignment:
Q  49 atcactactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51608163 atcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 51608064  T
Q  149 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51608063 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 51607964  T
Q  249 tatgcaactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt-agggaatttc 346  Q
     ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||| || | ||||| |||| |||||||||     
T  51607963 aatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacgt-atatatgattcaccaaccaacttacacctttaagggaattt- 51607866  T
Q  347 aattaagtacaacatacattcagtcaacatccattcatc 385  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  51607865 aattaaatacaacattcattcagtcagcatccattcatc 51607827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 49 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 41800161 - 41799825
Alignment:
Q  49 atcactactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41800161 atcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 41800062  T
Q  149 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41800061 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 41799962  T
Q  249 tatgcaactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt-agggaatttc 346  Q
     ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||| || | ||| | |||| |||||||||     
T  41799961 aatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacgt-atatatgattcaccaaccaacttatacctttaagggaattt- 41799864  T
Q  347 aattaagtacaacatacattcagtcaacatccattcatc 385  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  41799863 aattaaatacaacattcattcagtcagcatccattcatc 41799825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 49 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 53748960 - 53748625
Alignment:
Q  49 atcactactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53748960 atcaccactccactaagactcctctaaactcccatgcatgtggtaccataaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 53748861  T
Q  149 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53748860 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 53748761  T
Q  249 tatgcaactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt-agggaatttc 346  Q
     ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| |||| |||||||||     
T  53748760 aatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacacctttaagggaattt- 53748663  T
Q  347 aattaagtacaacatacattcagtcaacatccattcatc 385  Q
    |||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  53748662 aattatatacaacacaca-tcagtcagcatccattcatc 53748625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 82 - 282
Target Start/End: Original strand, 15533786 - 15533986
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact-acaccactttg 180  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15533786 atgcatgtggtaccaaaa-tcagggccgtgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccactttg 15533884  T
Q  181 agtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacat 280  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || | || ||||||||||||    
T  15533885 agcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacctgtgtatatctacat 15533984  T
Q  281 ac 282  Q
    ||    
T  15533985 ac 15533986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 47 - 293
Target Start/End: Original strand, 23121562 - 23121812
Alignment:
Q  47 tcatcactactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc- 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||     
T  23121562 tcatcaccactccactaagactcctctaacaacactcatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattca 23121660  T
Q  144 tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactg 241  Q
    |   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23121661 ttttcaggacataagtcctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacgaggcattccagagccgaagctctcccactg 23121760  T
Q  242 ttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 293  Q
    ||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  23121761 ttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaaccta 23121812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 47 - 301
Target Start/End: Original strand, 20940223 - 20940480
Alignment:
Q  47 tcatcactactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc- 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||| ||| |||||||||||||||||     
T  20940223 tcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgttgtagaatggttaaagcattca 20940321  T
Q  144 tcaacaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgt 242  Q
    |   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  || | || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  20940322 ttttcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacaacaaggcgttccagagctgaagctctcccactgt 20940421  T
Q  243 tatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatata 301  Q
    |||| | |||||||| | || ||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||    
T  20940422 tatgctcatgcaactgacccacttgagtatatctacatacaatcccacctaagcatata 20940480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 82 - 282
Target Start/End: Original strand, 18212138 - 18212339
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  18212138 atgcatgtggtaccatat-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgcttt 18212236  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 279  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||    
T  18212237 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctaca 18212336  T
Q  280 tac 282  Q
    |||    
T  18212337 tac 18212339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 47 - 293
Target Start/End: Original strand, 14484392 - 14484642
Alignment:
Q  47 tcatcactactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc- 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||| |||||     
T  14484392 tcatcaccactccactaagactccactaacaacacccatacatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaaacattca 14484490  T
Q  144 tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactg 241  Q
    |   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||     
T  14484491 ttttcaggacataagtcctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactt 14484590  T
Q  242 ttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 293  Q
    ||||| |||||||||| | || |||| || ||||||||||| | ||||||||    
T  14484591 ttatgcttatgcaactgacccacttgtgtgtatctacatacaacccaaccta 14484642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Original strand, 11847053 - 11847230
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  11847053 atgcatgtggtaccataaa-cagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 11847151  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  11847152 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 11847230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 47 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 17000381 - 17000131
Alignment:
Q  47 tcatcactactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc- 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||   || |||||||||  |||||||||| |||||     
T  17000381 tcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagtcctcaccgctgtaaaatggttaaaacattca 17000283  T
Q  144 tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactg 241  Q
    |   |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | |  ||||||||||||||||||| ||||     
T  17000282 ttttcaggacataagttctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggtgttccagagccgaagctctctcactt 17000183  T
Q  242 ttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 293  Q
    ||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  17000182 ttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaaccta 17000131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 8047074 - 8046897
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcac--cactacaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | | ||||| ||||    
T  8047074 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcactgctccacaccgcttt 8046975  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  8046974 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgtttatgccacta 8046897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 47 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 43285109 - 43284871
Alignment:
Q  47 tcatcactactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc- 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| | || |||| ||||||||||| |||||     
T  43285109 tcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctctcctctgtagaatggttaaatcattca 43285011  T
Q  144 tcaacaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgt 242  Q
    |   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  || | || | |||||||||||||||||||||| |    
T  43285010 ttttcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacaacaaggcgtcccagagccgaagctctcccacttt 43284911  T
Q  243 tatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    |||| |||||||||| | || ||   ||||||||||||||    
T  43284910 tatgcttatgcaactgacccactcttgtatatctacatac 43284871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 55 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 4831293 - 4831090
Alignment:
Q  55 actccactaagactcctcta-aacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagga 152  Q
    |||||||||||||||||| | ||  | |||||||||||||||| |  ||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||    
T  4831293 actccactaagactcctcaacaatgcgcatgcatgtggtaccatat-tcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcagga 4831195  T
Q  153 cataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttta 250  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  4831194 cataagtcctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgatta 4831095  T
Q  251 tgcaa 255  Q
    |||||    
T  4831094 tgcaa 4831090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 55 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 4834588 - 4834385
Alignment:
Q  55 actccactaagactcctcta-aacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagga 152  Q
    |||||||||||||||||| | ||  | |||||||||||||||| |  ||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||    
T  4834588 actccactaagactcctcaacaatgcgcatgcatgtggtaccatat-tcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcagga 4834490  T
Q  153 cataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttta 250  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  4834489 cataagtcctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgatta 4834390  T
Q  251 tgcaa 255  Q
    |||||    
T  4834389 tgcaa 4834385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 55 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 11171464 - 11171222
Alignment:
Q  55 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagg 151  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||| || |||||| |||  ||| |||||| || ||||||||||||||||| |   ||||    
T  11171464 actccactaagactcctctaataacaaccatgcatgtagtaccataa-tcagggtcgtagccctcaccgccgtagaatggttaaagcattcattttcagg 11171366  T
Q  152 acataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttt 249  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||  | || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  11171365 acataagtcatcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttaaacgataaggcgttccaaagccgaagctctcccacttttatgttt 11171266  T
Q  250 atgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 293  Q
    |||||||| | || |||| |||||| |||||||||  |||||||    
T  11171265 atgcaactgacccacttgtgtatatatacataccactcaaccta 11171222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 282
Target Start/End: Original strand, 15406955 - 15407113
Alignment:
Q  127 gaatggttaaagcattc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccaga 223  Q
    ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||    
T  15406955 gaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccaga 15407054  T
Q  224 gccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    |||||||||||| | || | |||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  15407055 gccgaagctctctcgctttcatgtttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 15407113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 282
Target Start/End: Original strand, 14485552 - 14485713
Alignment:
Q  125 tcgaatggttaaagcattctcaa-caggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaacta-gtactccaccactttgaatgactaagcattcc 220  Q
    ||||||||||||||||||||    |||||||| |||||||||| |||  |||| ||||||  ||| | ||  |||||| ||||||| ||| | |  ||||    
T  14485552 tcgaatggttaaagcattctttttcaggacatgagtcctcaccgctaatcaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggtgttcc 14485651  T
Q  221 agagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    || |||||||| ||||| || ||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  14485652 agggccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 14485713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 44)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 49 - 366
Target Start/End: Original strand, 13909496 - 13909813
Alignment:
Q  49 atcactactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 148  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13909496 atcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatc 13909595  T
Q  149 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13909596 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 13909695  T
Q  249 tatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaactt-tagggaatttca 347  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||  ||| ||||| |    
T  13909696 aatgcaactaa-ccccttgagtatatctacataccaaccaacctatacatatacataatatatgattcaccatccaatttaaaacttcaaggaaatttta 13909794  T
Q  348 attaagtacaacatacatt 366  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  13909795 attaaatacaacatacatt 13909813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 49 - 366
Target Start/End: Original strand, 13946441 - 13946758
Alignment:
Q  49 atcactactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 148  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13946441 atcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatc 13946540  T
Q  149 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13946541 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaaactctcccactgttatgtt 13946640  T
Q  249 tatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaactt-tagggaatttca 347  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||| ||||| |    
T  13946641 aatgcaactaa-ccccttgagtatatctacataccaaccaacctatacatatacataatatatgattcaccatccaatttacaacttcaaggaaatttta 13946739  T
Q  348 attaagtacaacatacatt 366  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  13946740 attaaatacaacatacatt 13946758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 49 - 385
Target Start/End: Original strand, 44775168 - 44775504
Alignment:
Q  49 atcactactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44775168 atcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 44775267  T
Q  149 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44775268 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 44775367  T
Q  249 tatgcaactaatcc-ccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt-agggaatttc 346  Q
     ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| |||| |||||||||     
T  44775368 aatgcaactaatcctcatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacacctttaagggaattt- 44775465  T
Q  347 aattaagtacaacatacattcagtcaacatccattcatc 385  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  44775466 aattaaatacaacattcattcagtcagcatccattcatc 44775504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 49 - 385
Target Start/End: Original strand, 44780352 - 44780688
Alignment:
Q  49 atcactactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44780352 atcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 44780451  T
Q  149 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44780452 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 44780551  T
Q  249 tatgcaactaatcc-ccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt-agggaatttc 346  Q
     ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| |||| |||||||||     
T  44780552 aatgcaactaatcctcatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacacctttaagggaattt- 44780649  T
Q  347 aattaagtacaacatacattcagtcaacatccattcatc 385  Q
    |||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  44780650 aattaaatacaacattcattcagtcagcatccattcatc 44780688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 49 - 366
Target Start/End: Original strand, 13939955 - 13940268
Alignment:
Q  49 atcactactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 148  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13939955 atcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatc 13940054  T
Q  149 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13940055 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 13940154  T
Q  249 tatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaactt-tagggaatttca 347  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||| ||||| |    
T  13940155 aatgcaactaa-ccccttgagtatatctacataccaaccaacct----atatacataatatatgattcaccatccaatttacaacttcaaggaaatttta 13940249  T
Q  348 attaagtacaacatacatt 366  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  13940250 attaaatacaacatacatt 13940268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 49 - 385
Target Start/End: Original strand, 4677131 - 4677466
Alignment:
Q  49 atcactactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4677131 atcaccactccactaagactcctctaaactcccatgcatgtggtaccataaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 4677230  T
Q  149 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4677231 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 4677330  T
Q  249 tatgcaactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt-agggaatttc 346  Q
     ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| |||| |||||||||     
T  4677331 aatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacacctttaagggaattt- 4677428  T
Q  347 aattaagtacaacatacattcagtcaacatccattcatc 385  Q
    |||||  |||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  4677429 aattatatacaacataca-ccagtcagcatccattcatc 4677466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 49 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 8743119 - 8742783
Alignment:
Q  49 atcactactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8743119 atcaccactccactaagactcctctaaactcccatgcatgtggtaccaaaattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 8743020  T
Q  149 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8743019 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 8742920  T
Q  249 tatgcaactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt-agggaatttc 346  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||  | | ||||| |||| ||||||| |     
T  8742919 tatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctatacatatacat-atatatgattcaccaatcaacttacacctttaagggaatctt 8742821  T
Q  347 aattaagtacaacatacattcagtcaacatccattcatc 385  Q
    |||||  ||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  8742820 aattatatacaacacaca-ccagtcaacatccattcatc 8742783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 49 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 8761289 - 8760953
Alignment:
Q  49 atcactactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8761289 atcaccactccactaagactcctctaaactcccatgcatgtggtaccaaaattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 8761190  T
Q  149 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8761189 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 8761090  T
Q  249 tatgcaactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt-agggaatttc 346  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||  | | ||||| |||| ||||||| |     
T  8761089 tatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctatacatatacat-atatatgattcaccaatcaacttacacctttaagggaatctt 8760991  T
Q  347 aattaagtacaacatacattcagtcaacatccattcatc 385  Q
    |||||  ||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  8760990 aattatatacaacacaca-ccagtcaacatccattcatc 8760953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 49 - 385
Target Start/End: Original strand, 41175444 - 41175779
Alignment:
Q  49 atcactactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41175444 atcaccactccactaagactcctctaaactcccatgcatgtggtaccataaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 41175543  T
Q  149 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41175544 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 41175643  T
Q  249 tatgcaactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt-agggaatttc 346  Q
     ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| |||| |||||||||     
T  41175644 aatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacacctttaagggaattt- 41175741  T
Q  347 aattaagtacaacatacattcagtcaacatccattcatc 385  Q
    |||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  41175742 aattatatacaacacaca-tcagtcagcatccattcatc 41175779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 49 - 385
Target Start/End: Original strand, 41180582 - 41180917
Alignment:
Q  49 atcactactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 148  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41180582 atcaccactccactaagactcctctaaactcccatgcatgtggtaccataaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 41180681  T
Q  149 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41180682 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 41180781  T
Q  249 tatgcaactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaacttt-agggaatttc 346  Q
     ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||| |||| |||||||||     
T  41180782 aatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacacctttaagggaattt- 41180879  T
Q  347 aattaagtacaacatacattcagtcaacatccattcatc 385  Q
    |||||  ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  41180880 aattatatacaacacaca-tcagtcagcatccattcatc 41180917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 48 - 333
Target Start/End: Original strand, 12200169 - 12200454
Alignment:
Q  48 catcactactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaa 147  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12200169 catcaccactccactaagactcctgtaaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcat 12200267  T
Q  148 caggacataagtcctcaccact-acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatg 246  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |    ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12200268 caggacataagttctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaagttgttccagagctgaagctctcccactgttatg 12200367  T
Q  247 tttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcacca-tccgatttacaac 333  Q
     |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  12200368 cttatgcaacttacccacttgagtatatctacataccaaccaacctaagcatatacgt-atatatgactcaccactccaatttacaac 12200454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 47 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 14652929 - 14652680
Alignment:
Q  47 tcatcactactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc- 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||     
T  14652929 tcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattca 14652831  T
Q  144 tcaacaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgt 242  Q
    |   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| |    
T  14652830 ttttcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactat 14652731  T
Q  243 tatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 293  Q
    |||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  14652730 tatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaaccta 14652680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 47 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 16383093 - 16382844
Alignment:
Q  47 tcatcactactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc- 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||     
T  16383093 tcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattca 16382995  T
Q  144 tcaacaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgt 242  Q
    |   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  16382994 ttttcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgt 16382895  T
Q  243 tatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 293  Q
     ||| |||||||||| | || |||| ||||||||||| || | ||||||||    
T  16382894 aatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacacacaacccaaccta 16382844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 47 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 16838714 - 16838466
Alignment:
Q  47 tcatcactactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc- 143  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| |||| | || ||||||||| |||||||||||||||||     
T  16838714 tcatcacctctccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgt-agcctcaccgctgtagaatggttaaagcattca 16838617  T
Q  144 tcaacaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgt 242  Q
    |   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  16838616 tttccaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgt 16838517  T
Q  243 tatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 293  Q
    |||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16838516 tatgcttatgcaactgacccacttgagtatatctacatacaatccaaccta 16838466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 56 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 13203743 - 13203514
Alignment:
Q  56 ctccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagga 152  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||  ||| ||||||||| |||| |||||||||||| |   |||||    
T  13203743 ctccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataaa-caggaccgtagccctcaccgctgtagaatagttaaagcattcattttcagga 13203645  T
Q  153 cataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttat 251  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13203644 cctaagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttat 13203545  T
Q  252 gcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  13203544 gcaactaacccacttgagtatatctacatac 13203514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 97 - 282
Target Start/End: Original strand, 12304763 - 12304949
Alignment:
Q  97 aaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact-acaccactttgagtaactagtactcc 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  12304763 aaaatcagggccgtgacccacaccgttgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctcc 12304862  T
Q  196 accactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    ||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |  | | || ||||||||||||||    
T  12304863 accactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgactcacctgtgtatatctacatac 12304949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 101 - 282
Target Start/End: Original strand, 17157079 - 17157262
Alignment:
Q  101 tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccacc 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||  |||||||  ||||||    
T  17157079 tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccacc 17157178  T
Q  199 actttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
     ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  17157179 gctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccccttgtgtatatctacatac 17157262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Original strand, 9532849 - 9533027
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||    
T  9532849 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccacttt 9532948  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  9532949 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 9533027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 104 - 282
Target Start/End: Original strand, 24191783 - 24191963
Alignment:
Q  104 gggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccaccact 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||  ||||| ||||||  |||||||  |||||| ||    
T  24191783 gggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagttctcaccgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgct 24191882  T
Q  202 ttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    ||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  24191883 ttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccccttgtgtatatctacatac 24191963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 41456325 - 41456123
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  41456325 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 41456226  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 279  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  || | || |||||||||||    
T  41456225 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaactatcccacctgtgtatatctaca 41456126  T
Q  280 tac 282  Q
    |||    
T  41456125 tac 41456123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 82 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16802626 - 16802425
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||  ||||| ||||    
T  16802626 atgcatgtggtaccatat-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaaacattctcatcaggacataagtcatcaccgctcaacaccgcttt 16802528  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 279  Q
    ||  |||||||  || ||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| || |||| |||||||||||    
T  16802527 gaacaactagtgttctaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcgactaacccacttgtgtatatctaca 16802428  T
Q  280 tac 282  Q
    |||    
T  16802427 tac 16802425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 59 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 14544394 - 14544155
Alignment:
Q  59 cactaagactcctctaa--acaccca-tgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaa-caggaca 154  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||    
T  14544394 cactaagactcctctaacaacacccaatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgttgtcgaatggttaaagcattctttttcaggaca 14544296  T
Q  155 taagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatg 252  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||| ||| | || ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  14544295 taagtcctcaccactaaacaccgctttgagcaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttctagagccgaagctctcccacttttatgcttatg 14544196  T
Q  253 caactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 293  Q
    ||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  14544195 caactgacccgcttgtgtatatctacatacaacccaaccta 14544155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 8583471 - 8583294
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 178  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  8583471 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 8583373  T
Q  179 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  8583372 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 8583294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Original strand, 14084531 - 14084708
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 178  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  14084531 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 14084629  T
Q  179 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  14084630 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 14084708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Original strand, 14089932 - 14090109
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 178  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  14089932 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 14090030  T
Q  179 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  14090031 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 14090109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Original strand, 49399473 - 49399650
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 178  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  49399473 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaccaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 49399571  T
Q  179 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  49399572 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 49399650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 24123380 - 24123203
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 178  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  24123380 atgcacgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 24123282  T
Q  179 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  24123281 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 24123203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 82 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13969010 - 13968850
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 178  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  13969010 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 13968912  T
Q  179 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccact 240  Q
    |||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  13968911 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 13968850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 82 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13974485 - 13974325
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 178  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  13974485 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 13974387  T
Q  179 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccact 240  Q
    |||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  13974386 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 13974325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 82 - 237
Target Start/End: Original strand, 17190836 - 17190992
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcacc--actacaccacttt 179  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||| ||||    
T  17190836 atgcatgtggtaccaaat-tcagggccgtgacccacaccgttgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgatcaacaccgcttt 17190934  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctccc 237  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||    
T  17190935 gaacaactagtgttccaccgctttgaaagacaaggcgttccagagccgaagctctccc 17190992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 34852414 - 34852211
Alignment:
Q  55 actccactaagactcctcta-aacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagga 152  Q
    |||||||||||||||||| | ||  | |||||||||||||||| |  ||||||||||  ||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |   |||||    
T  34852414 actccactaagactcctcaacaatgcgcatgcatgtggtaccatat-tcagggccgtagccctcaccgttgtagaatggttaaagcattcattttcagga 34852316  T
Q  153 cataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttta 250  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||    
T  34852315 cataagtcctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctctcacttttatgatta 34852216  T
Q  251 tgcaa 255  Q
    |||||    
T  34852215 tgcaa 34852211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 48 - 282
Target Start/End: Original strand, 14292667 - 14292906
Alignment:
Q  48 catcactactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-- 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||| || |||||||||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||      
T  14292667 catcaccactccactaagactcctctaacaacatccatacatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 14292765  T
Q  144 tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactg 241  Q
    |    |||||||||||||||||| |||  |||| ||||||| ||||||| ||||| | ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||     
T  14292766 tttttaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgagcaactagtgctccaacgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactt 14292865  T
Q  242 ttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    ||||| |||||||||| | || ||||  ||| |||||||||    
T  14292866 ttatgcttatgcaactgacccacttgtatatttctacatac 14292906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 171 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 16830065 - 16829943
Alignment:
Q  171 caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagt 270  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||    
T  16830065 caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttatgcaactgacccacttgagt 16829966  T
Q  271 atatctacataccaaccaaccta 293  Q
    |||||||||||| | ||||||||    
T  16829965 atatctacatacaatccaaccta 16829943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 47 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16830215 - 16830055
Alignment:
Q  47 tcatcactactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc- 143  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| |||| | || ||||||||| |||||||||||||||||     
T  16830215 tcatcacctctccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgt-agcctcaccgctgtagaatggttaaagcattca 16830118  T
Q  144 tcaacaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttga 205  Q
    |   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  16830117 tttccaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttga 16830055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 282
Target Start/End: Original strand, 23174189 - 23174358
Alignment:
Q  113 cccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgact 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||| |||     
T  23174189 cccacaccgctgtcgaatggttaaagcatttttt-caggacataagtcctcaccgctaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgaca 23174287  T
Q  212 aagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    | || ||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  23174288 aggcgttcaagagccgaagctctcccacttttatgcttttgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 23174358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 125 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 17199175 - 17199015
Alignment:
Q  125 tcgaatggttaaagcattctca-acaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccag 222  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || ||||||    
T  17199175 tcgaatggttaaagcattcttttacaggacctaagtcctcaccgctaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 17199076  T
Q  223 agccgaagctctcccactgt-tatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||  | || |||| ||||||||||||||    
T  17199075 agccgaagctctcccgctgtatatgactatgcaaccgacccacttgtgtatatctacatac 17199015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 31690659 - 31690570
Alignment:
Q  193 tccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    |||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  31690659 tccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagccctcccgcttttatgtttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 31690570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 82 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 12961580 - 12961378
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccact 177  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||  |||| |||||||  | ||||||||||||||||| |   ||||||||||||| ||||| |||  |||| ||    
T  12961580 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgaaaccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcatcaccgctaaacaccgct 12961482  T
Q  178 ttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatcta 277  Q
    ||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||| |||||||| || || || ||||  |||||||||| | || |||| |||||||||    
T  12961481 ttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagcccttccgcttttatacttatgcaactgacccacttgtgtatatcta 12961382  T
Q  278 cata 281  Q
    ||||    
T  12961381 cata 12961378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 282
Target Start/End: Original strand, 23173876 - 23173963
Alignment:
Q  195 caccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    |||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  23173876 caccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcacacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 23173963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 124 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 17243815 - 17243680
Alignment:
Q  124 gtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattcca 221  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||  ||| |||  |||||| ||||||| ||| |  | ||| |    
T  17243815 gtcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaagtgttccaccgctttgaacgacaagacgttcta 17243716  T
Q  222 gagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaact 257  Q
    | |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||    
T  17243715 gggccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaact 17243680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 18719339 - 18719250
Alignment:
Q  56 ctccactaagactcctcta-aacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattct 144  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||||   ||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  18719339 ctccactaagactcttctacaacactcatgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgcttatcgaatggttaaagcattct 18719250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 11850840 - 11850780
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 143  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  11850840 atgcatgtggtaccatat-tcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattc 11850780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 282
Target Start/End: Original strand, 12255238 - 12255326
Alignment:
Q  193 tccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    |||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  12255238 tccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagccctcccgct-ttatacttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 12255326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 169
Target Start/End: Original strand, 18889009 - 18889053
Alignment:
Q  125 tcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact 169  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||    
T  18889009 tcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtcctcatcact 18889053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 22)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 49 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 21678475 - 21678141
Alignment:
Q  49 atcactactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 148  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21678475 atcaccactccactaagactcctctaat-acccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaac 21678377  T
Q  149 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21678376 aggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 21678277  T
Q  249 tatgcaactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaactttagggaatttca 347  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||| || | ||||||| ||| ||||||| |    
T  21678276 tatgcaactaatccccattgagtatatctacataccaaccaacctagacatatacat-atatatgattcaccaaccaacttacaacgttaaggaattt-a 21678179  T
Q  348 attaagtacaacatacattcagtcaacatccattcatc 385  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  21678178 attaaatacaacattcattcagtcagcatccattcatc 21678141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 48 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 17265005 - 17264667
Alignment:
Q  48 catcactactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaa 147  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17265005 catcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcat 17264906  T
Q  148 caggacataagtcctcaccact-acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatg 246  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17264905 caggacataagtcctcaccactaacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgaccgagcgttccagagccgaagctctcccactgtgatg 17264806  T
Q  247 tttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaac--tttagggaatt 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||  || || |||||    
T  17264805 tttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaatct-aacatatac-ttatatatgattcaccatccaatttacaacatttaagtgaatt 17264708  T
Q  345 tcaattaagtacaacatacattcagtcaacatccattcatc 385  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  17264707 ttaattaaatacaacatacattcagtcagcatctattcatc 17264667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 48 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 17271487 - 17271149
Alignment:
Q  48 catcactactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaa 147  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  17271487 catcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgttgaatggttaaagcattctcat 17271388  T
Q  148 caggacataagtcctcaccact-acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatg 246  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17271387 caggacataagtcctcaccactaacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgaccgagcgttccagagccgaagctctcccactgtgatg 17271288  T
Q  247 tttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaac--tttagggaatt 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||  || || |||||    
T  17271287 tttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaatct-aacatatac-ttatatatgattcaccatccaatttacaacatttaagtgaatt 17271190  T
Q  345 tcaattaagtacaacatacattcagtcaacatccattcatc 385  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  17271189 ttaattaaatacaacatacattcagtcagcatctattcatc 17271149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 48 - 385
Target Start/End: Original strand, 22174980 - 22175320
Alignment:
Q  48 catcactactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaa 147  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22174980 catcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcat 22175079  T
Q  148 caggacataagtcctcaccact-acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatg 246  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22175080 caggacataagtcctaaccactaacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgaccaagcgttccagagccgaagctctcccactgttatg 22175179  T
Q  247 -tttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaac-tttagggaa-- 342  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| |||| | ||      
T  22175180 ttttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaatct-aacatatacat-atatatgattcaccatccaacttacaacgtttaagtaaat 22175277  T
Q  343 tttcaattaagtacaacatacattcagtcaacatccattcatc 385  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  22175278 ttttaattaaatacaacatacattcagtcagcatctattcatc 22175320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 82 - 333
Target Start/End: Original strand, 9775467 - 9775718
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccacta-caccactttg 180  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9775467 atgcatgtggtaccaaaa-tcagggccgtgacccacaccactgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccactttg 9775565  T
Q  181 agtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacat 280  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | || |||||||||||||||||    
T  9775566 agcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgctcatgcaactgacccacttgagtatatctacat 9775665  T
Q  281 accaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcacca-tccgatttacaac 333  Q
    || | || |||||| ||||||  | |||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  9775666 acaatcccacctaagcatatatgt-atatatgactcaccactccaatttacaac 9775718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 47 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 758464 - 758216
Alignment:
Q  47 tcatcactactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattct 144  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||     
T  758464 tcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattca 758366  T
Q  145 caacaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgtt 243  Q
       |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  758365 tttcaggacgtaagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgtt 758266  T
Q  244 atgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 293  Q
    ||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  758265 atgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaaccta 758216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 82 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 37805492 - 37805292
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact-acaccactttg 180  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37805492 atgcatgtggtaccaaaa-tcagggtcgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccactaacaccactttg 37805394  T
Q  181 agtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacat 280  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| ||| | || || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || | || ||||||||||||    
T  37805393 agcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttacagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacctgtgtatatctacat 37805294  T
Q  281 ac 282  Q
    ||    
T  37805293 ac 37805292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 47 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 22509382 - 22509126
Alignment:
Q  47 tcatcactactccactaagactcctctaaacac-ccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-t 144  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||| | ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  22509382 tcatcaccactcaactaagactcctctaacaacaccatgcatgtggtaccaaaa-tcaagaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 22509284  T
Q  145 caacaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgtt 243  Q
       ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22509283 tttcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtactccaccactttgaacgacaaggcgttccagatccgaagctctcccactgtt 22509184  T
Q  244 atgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatata 301  Q
    ||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  22509183 atgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaacctatacatata 22509126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 47 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22313042 - 22312793
Alignment:
Q  47 tcatcactactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc- 143  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||     
T  22313042 tcatcacctctccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattca 22312944  T
Q  144 tcaacaggacataagtcctcaccact-acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgt 242  Q
    |   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||| ||||||||||||||| |    
T  22312943 ttttcaggacataagtcctcaccactgacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagtcgaagctctcccacttt 22312844  T
Q  243 tatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 293  Q
    |||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  22312843 tatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaaccta 22312793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Original strand, 19510999 - 19511177
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  19510999 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 19511098  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  19511099 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 19511177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 47 - 331
Target Start/End: Original strand, 20937557 - 20937845
Alignment:
Q  47 tcatcactactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc- 143  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||| ||| |||||||||||||||||     
T  20937557 tcatcaccaccccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgatgtagaatggttaaagcattca 20937655  T
Q  144 tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactg 241  Q
    |   || ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||| ||||||||||||||||||     
T  20937656 ttttcaagacataagtcctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccacagccgaagctctcccactt 20937755  T
Q  242 ttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcacca-tccgatttaca 331  Q
    ||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||  |||||| ||  ||||||| |||||| |||||||||||    
T  20937756 ttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaacctatgcatatatat-gtatatgactcaccactccgatttaca 20937845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 82 - 282
Target Start/End: Original strand, 23527448 - 23527651
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  23527448 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 23527547  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttt-atgcaactaatccccttgagtatatctac 278  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||  || | || ||||||||||    
T  23527548 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttaatgcaactaccccacctgtgtatatctac 23527647  T
Q  279 atac 282  Q
    ||||    
T  23527648 atac 23527651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22439902 - 22439701
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  22439902 atgcatgtggtaccatat-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaaacattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgcttt 22439804  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 279  Q
    ||  |||||||  | |||| ||||||| ||| | || ||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||  |||||||||||    
T  22439803 gaacaactagtgtttcaccgctttgaacgacaaggcgttctagagccggagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccacttatgtatatctaca 22439704  T
Q  280 tac 282  Q
    |||    
T  22439703 tac 22439701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 21675648 - 21675471
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 178  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  21675648 atgcatgtggtaccatat-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 21675550  T
Q  179 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    |||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  21675549 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 21675471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 82 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 1857680 - 1857520
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 178  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  1857680 atgcatgtggtaccatat-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 1857582  T
Q  179 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccact 240  Q
    |||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  1857581 tgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 1857520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 55 - 255
Target Start/End: Original strand, 10816746 - 10816949
Alignment:
Q  55 actccactaagactcctcta-aacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagga 152  Q
    |||||||||||||||||| | ||  | |||||||||||||||| |  |||| | |||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||    
T  10816746 actccactaagactcctcaacaatgcgcatgcatgtggtaccatat-tcagtgtcgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattttcagga 10816844  T
Q  153 cataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttta 250  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  10816845 cataagtcctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccaatttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgatta 10816944  T
Q  251 tgcaa 255  Q
    |||||    
T  10816945 tgcaa 10816949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 55 - 255
Target Start/End: Original strand, 23538773 - 23538976
Alignment:
Q  55 actccactaagactcctcta-aacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagga 152  Q
    |||||||||||||||||| | ||  | |||||||||||||||| |  ||||||||||  ||| ||||||||| | ||||||||||||||| |   |||||    
T  23538773 actccactaagactcctcaacaatgcgcatgcatgtggtaccatat-tcagggccgtagccctcaccgctgtagtatggttaaagcattcattttcagga 23538871  T
Q  153 cataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttta 250  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |  | ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||    
T  23538872 cataagtcctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaagtcgttccagagccgaagctctctcacttttatgatta 23538971  T
Q  251 tgcaa 255  Q
    |||||    
T  23538972 tgcaa 23538976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 82 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 23112914 - 23112827
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccacta 170  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23112914 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgaccctcaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccacta 23112827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 81 - 166
Target Start/End: Original strand, 19362597 - 19362678
Alignment:
Q  81 catgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcacc 166  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  19362597 catgcatgtggtaccaaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggacataagtcctcacc 19362678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 82 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 19802044 - 19801964
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcacc 166  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  19802044 atgcatgtggtaccaaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcattc--atcaggacataagtcctcacc 19801964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22007986 - 22007896
Alignment:
Q  193 tccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactg-ttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    |||||| ||||||| ||| | || |||||| |||||||| ||||||||  ||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  22007986 tccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccacttattatgattatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 22007896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 24751707 - 24751647
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 143  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  24751707 atgcatgtggtaccatat-tcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattc 24751647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 19)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 48 - 385
Target Start/End: Original strand, 27280158 - 27280496
Alignment:
Q  48 catcactactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaa 147  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27280158 catcaccactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcat 27280257  T
Q  148 caggacataagtcctcaccact-acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatg 246  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27280258 caggacataagtcctcaccactaacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgaccgagcgttccagagccgaagctctcccactgttatg 27280357  T
Q  247 tttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgatttacaac--tttagggaatt 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||  || || |||||    
T  27280358 tttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaatct-aacatatacat-atatatgattcaccatccaatttacaacatttaagtgaatt 27280455  T
Q  345 tcaattaagtacaacatacattcagtcaacatccattcatc 385  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  27280456 ttaattaaatacaacatacattcagtcagcatctattcatc 27280496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 47 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 3706976 - 3706727
Alignment:
Q  47 tcatcactactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc- 143  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||     
T  3706976 tcatcaccgctccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattca 3706878  T
Q  144 tcaacaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgt 242  Q
    |   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||    
T  3706877 ttttcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaattagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgt 3706778  T
Q  243 tatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 293  Q
    |||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  3706777 tatgcttatgcaactgacccacttgagtatatctacatacaatccaaccta 3706727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 20438709 - 20438531
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  20438709 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 20438610  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  20438609 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 20438531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 47 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 23066915 - 23066665
Alignment:
Q  47 tcatcactactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc- 143  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||  |||  ||| | ||||||| |||||||||||||||||     
T  23066915 tcatcaccactccactaagacaactctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggatcgtagccctctccgctgtagaatggttaaagcattca 23066817  T
Q  144 tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactg 241  Q
    |   ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||     
T  23066816 ttttcaggacataagtcatcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactt 23066717  T
Q  242 ttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 293  Q
    ||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  23066716 ttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaaccta 23066665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Original strand, 21542056 - 21542233
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 178  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  21542056 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 21542154  T
Q  179 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  21542155 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 21542233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 42096080 - 42095903
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 178  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  42096080 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 42095982  T
Q  179 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  42095981 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 42095903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 20046056 - 20045879
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  20046056 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtagaatggttaaagcattctcagcaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 20045957  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||||    
T  20045956 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacgaggcgttccagagccgaagctctcccgct-tgatgtttatgaaacta 20045879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 55 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 22448469 - 22448244
Alignment:
Q  55 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacagg 151  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||    
T  22448469 actccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcagggccgtagccctcaccgctgttgaatggttaaagcattcatttacagg 22448371  T
Q  152 acataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttat 251  Q
    |||||||||||        |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||    
T  22448370 acataagtcct--------caccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctcttctacttttatgcttat 22448279  T
Q  252 gcaactaat----ccccttgagtatatctacatac 282  Q
    |||| ||||    || |||| ||||||||||||||    
T  22448278 gcaattaattgacccacttgtgtatatctacatac 22448244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 55 - 282
Target Start/End: Original strand, 20242503 - 20242735
Alignment:
Q  55 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc--tcaacag 150  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||   |||  |||||||| ||||| |||| ||||||  |   |||    
T  20242503 actccactaagacttctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaaggccgaagccctaaccgctgtagaatgattaaggcattcattttccag 20242601  T
Q  151 gacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 248  Q
    |||||||||||||||| |||  |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  20242602 gacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgct 20242701  T
Q  249 tatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    ||||||| | | || |||| ||||||||||||||    
T  20242702 tatgcaaatgacccacttgtgtatatctacatac 20242735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 82 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19664306 - 19664105
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccacta--caccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||   ||| ||| ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||  |||| ||||    
T  19664306 atgcatgtggtaccatat-tcagggccggagccctcactgctatcgaatggttaaagcattcttatcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgcttt 19664208  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 279  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| || |||| |||||||||||    
T  19664207 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttaatgcttatgcaactaacccacttgtgtatatctaca 19664108  T
Q  280 tac 282  Q
    |||    
T  19664107 tac 19664105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 82 - 282
Target Start/End: Original strand, 41110814 - 41111016
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||| ||||| || |||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  41110814 atgcatgtgataccataattcagggtcatgacccacaccattgtcgaatggttaaagcattctcagcatgacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 41110913  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 279  Q
    ||   ||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  || | || |||||||||||    
T  41110914 gaacgactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaactaccccacctgtgtatatctaca 41111013  T
Q  280 tac 282  Q
    |||    
T  41111014 tac 41111016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 55 - 282
Target Start/End: Original strand, 32650074 - 32650304
Alignment:
Q  55 actccactaagactcctcta-aacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggac 153  Q
    |||||||||||||||||| | ||  | |||||||||||||||| |  ||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  32650074 actccactaagactcctcaacaatgcgcatgcatgtggtaccatat-tcaggaccgtagcccacaccgttgtcgaatggttaaagcattcttttcaggac 32650172  T
Q  154 ataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttat 251  Q
    ||||||| ||||| |||  |||| ||||||  ||||| |  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  32650173 ataagtcatcaccgctaaacaccgctttgaacaactaatgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgattat 32650272  T
Q  252 gcaact-aatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    |||||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  32650273 gcaactgactccacttgtgtatatctacatac 32650304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 955256 - 955118
Alignment:
Q  47 tcatcactactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc- 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||| |||| |||| |||||||||||||||||     
T  955256 tcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtacc-aaaatcaggaccgtagccctcaccactgtagaatggttaaagcattca 955158  T
Q  144 tcaacaggacataagtcctcaccact--acaccactttga 181  Q
    |   ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  955157 ttttcaggacataagccctcaccactaaacaccactttga 955118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 19778639 - 19778434
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgt-cgaatggttaaagcattctcaa--caggacataagtcctcaccacta--caccac 176  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| |||  |||  |    
T  19778639 atgcatgtggtaccataa-tcagggtcgcagccctcaccgctgttcgaatggttaaagcattctttttccaggacataagtcctcaccgctaaacacagc 19778541  T
Q  177 tttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaa-tccccttgagtatatc 275  Q
    |||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | ||||||||| ||||| || ||||| || | |||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  19778540 tttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagggccgaggccctcccgctttcatgtttatgcaactaactccacttgtgtatatc 19778441  T
Q  276 tacatac 282  Q
    |||||||    
T  19778440 tacatac 19778434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 29554645 - 29554419
Alignment:
Q  56 ctccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcaacaggac 153  Q
    |||||||||||||||||||    || ||||||||||||||| || |||||||||   ||| ||| |||  | ||||||||||||||||| |   ||||||    
T  29554645 ctccactaagactcctcta----ccaatgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcactgctaattgaatggttaaagcattcattttcaggac 29554551  T
Q  154 ataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttat 251  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||| |||| ||| ||||| || || || ||||    
T  29554550 ataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccggagccctcccgcttttgtgcttat 29554451  T
Q  252 gcaact-aatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    |||||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  29554450 gcaactgactccacttgtgtatatctacatac 29554419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 166
Target Start/End: Original strand, 36614935 - 36615015
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcacc 166  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||  |||| ||||||| | |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  36614935 atgcatgtggtaccaaaa--cagggccgaaaccctcaccgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggacataagtcctcacc 36615015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 195 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 955128 - 955032
Alignment:
Q  195 caccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacc 291  Q
    |||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||| ||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||    
T  955128 caccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctcttccacttttatgctcatgctactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaacc 955032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 166
Target Start/End: Original strand, 24079551 - 24079634
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtc--gaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcacc 166  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||   ||| |||||||||   |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  24079551 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattc--atcaggacataagtcctcacc 24079634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 24109203 - 24109120
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtc--gaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcacc 166  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||   ||| |||||||||   |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  24109203 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctgttttgaatggttaaagcattc--atcaggacataagtcctcacc 24109120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 4)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 131 - 385
Target Start/End: Original strand, 40549 - 40804
Alignment:
Q  131 ggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaag 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  40549 ggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccactttgaacgaccaagcattccagagccgaag 40648  T
Q  231 ctctcccactgttatgttt-atgcaactaatcccc-ttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcaccatccgattt 328  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||  | | ||    
T  40649 ctcttccactgttatgtttaatgcaactaatccccatagagtatatctacataccaaccaacctatacatatacat-atatatgattcaccaatcaactt 40747  T
Q  329 acaacttt-agggaatttcaattaagtacaacatacattcagtcaacatccattcatc 385  Q
    ||| |||| ||| ||||| |||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  40748 acatctttaaggaaattttaattatatacaacacaca-tcagtcaacatccattcatc 40804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 82 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 36994 - 36793
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  36994 atgcatgtggtaccataa-tcagggccatgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattcttatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgcttt 36896  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 279  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| | || |||| |||||||||||    
T  36895 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctctcacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctaca 36796  T
Q  280 tac 282  Q
    |||    
T  36795 tac 36793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 49 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 8571 - 8493
Alignment:
Q  49 atcactactccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcg 127  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8571 atcaccactccactaagactcctctaaacccccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcg 8493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 44057 - 43965
Alignment:
Q  193 tccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaa-ctaatccccttgagtatatctacatacca 284  Q
    |||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||| ||||| || | ||| |||||||| | | ||| |||| ||||||||||||||||    
T  44057 tccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagccctcccgctttaatgcttatgcaaccgactccacttgtgtatatctacatacca 43965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 121; Significance: 7e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 47 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 14710 - 14421
Alignment:
Q  47 tcatcactactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc- 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||     
T  14710 tcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattca 14612  T
Q  144 tcaacaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgt 242  Q
    |   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| |    
T  14611 ttttcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttt 14512  T
Q  243 tatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcacca-tccgatttacaac 333  Q
    |||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||  |||||| ||  ||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  14511 tatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaacctatgcatatatat-gtatatgactcaccactccaatttacaac 14421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 117 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 7356 - 7178
Alignment:
Q  117 caccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacaggacataagtcctcaccactac-accactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaag 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | |    
T  7356 caccgctgtagaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaataccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaagg 7257  T
Q  215 cattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 293  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  7256 cgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttatccaactgtcccacttgtgtatatctacatacaacccaaccta 7178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 116; Significance: 7e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 55 - 333
Target Start/End: Original strand, 141297 - 141577
Alignment:
Q  55 actccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacagga 152  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| |||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||    |||||    
T  141297 actccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcatttcagga 141395  T
Q  153 cataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttat 251  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  141396 cgtaagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgttatgcttat 141495  T
Q  252 gcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatatacataatatatgagtcacca-tccgatttacaac 333  Q
    |||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||  ||||||  | |||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  141496 gcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaacctatgcatatatgt-atatatgactcaccactccaatttacaac 141577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 127 - 255
Target Start/End: Original strand, 146611 - 146742
Alignment:
Q  127 gaatggttaaagcattc-tcaacaggacataagtcctcaccactaca--ccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccaga 223  Q
    ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||    
T  146611 gaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccactaaaaaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccaga 146710  T
Q  224 gccgaagctctcccactgttatgtttatgcaa 255  Q
    | ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  146711 gacgaagctctcccacttttatgattatgcaa 146742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 47 - 293
Target Start/End: Original strand, 265063 - 265311
Alignment:
Q  47 tcatcactactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattct 144  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||  ||||||||| |||||||||||||||||     
T  265063 tcatcaccactccactaagactcttctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccttcaccgctgtagaatggttaaagcattca 265161  T
Q  145 caacaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgtt 243  Q
       || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  265162 tttcatgacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgccccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgtt 265261  T
Q  244 atgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 293  Q
    ||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  265262 atgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacataccacccaaccta 265311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 47 - 293
Target Start/End: Original strand, 258637 - 258885
Alignment:
Q  47 tcatcactactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattct 144  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||  ||||||||| |||||||||||||||||     
T  258637 tcatcaccactccactaagactcttctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccttcaccgctgtagaatggttaaagcattca 258735  T
Q  145 caacaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgtt 243  Q
       || |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||    
T  258736 tttcatgacatatgtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgccccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactgtt 258835  T
Q  244 atgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 293  Q
    ||| |||||||||| | || |||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  258836 atgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacataccacccaaccta 258885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 47 - 282
Target Start/End: Original strand, 41894 - 42132
Alignment:
Q  47 tcatcactactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc- 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||     
T  41894 tcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattca 41992  T
Q  144 tcaacaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgt 242  Q
    |   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||| |||||||||| |    
T  41993 ttttcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaaactctcccacttt 42092  T
Q  243 tatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    |||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  42093 tatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 42132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 47 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 63407 - 63169
Alignment:
Q  47 tcatcactactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc- 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||     
T  63407 tcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattca 63309  T
Q  144 tcaacaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgt 242  Q
    |   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||  | || |||||||||||||||||||||||| |    
T  63308 ttttcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgataaggcgttccagagccgaagctctcccacttt 63209  T
Q  243 tatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    |||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  63208 tatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 63169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 82 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13054 - 12876
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcac--cactacaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||  | ||||||| ||||    
T  13054 atgcatgtggtaccataa-tcaggtccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattcttatcaggacctaagtcctcaccgctctacaccgcttt 12956  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaa 259  Q
    ||  |||| ||  |||||| ||||||| ||| | || ||| ||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  12955 gaacaacttgtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagagccgaaactctcccactttgatgcttatgcaactaa 12876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 55 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 124677 - 124446
Alignment:
Q  55 actccactaagactcctcta-aacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcaa-cagg 151  Q
    |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| || |||||||||   ||| |||||||  ||||||||||||||||||||    ||||    
T  124677 actccactaagactcctctacaatactcatgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgcttatcgaatggttaaagcattctttttcagg 124579  T
Q  152 acataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgttt 249  Q
    |||| |||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||||||||||| ||| | || ||||||  | ||||| ||||| || ||||| ||    
T  124578 acatgagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccaggtcagaagccctcccgcttttatgctt 124479  T
Q  250 atgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    |||||||| | || ||||  |||||||||||||    
T  124478 atgcaactgacccacttgtttatatctacatac 124446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0535 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0535
Description:

Target: scaffold0535; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 47 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 6245 - 6006
Alignment:
Q  47 tcatcactactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc- 143  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||     
T  6245 tcatcaccattccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattca 6147  T
Q  144 tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactg 241  Q
    |   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||     
T  6146 ttttcaggacataagtcctcaccactaaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactt 6047  T
Q  242 ttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    ||||| ||||| |||||| || |||  ||||||||||||||    
T  6046 ttatgcttatgtaactaacccacttatgtatatctacatac 6006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 47 - 282
Target Start/End: Original strand, 152324 - 152562
Alignment:
Q  47 tcatcactactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc- 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| || | |||| |||||||||||||| ||     
T  152324 tcatcaccactccactaagactcctctaacaacaaccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaacactgtagaatggttaaagcaatca 152422  T
Q  144 tcaacaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgt 242  Q
    |   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| |    
T  152423 ttttcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttt 152522  T
Q  243 tatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    |||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  152523 tatgcttatgcaactaacccacttgtgtatatctacatac 152562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 174738 - 174561
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 178  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  174738 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 174640  T
Q  179 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  174639 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 174561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 47 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 51185 - 50948
Alignment:
Q  47 tcatcactactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc- 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||     
T  51185 tcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcg 51087  T
Q  144 tcaacaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgt 242  Q
    |   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||  | || ||| |||||||||||||||||||| |    
T  51086 ttttcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgataaggcgttctagagccgaagctctcccacttt 50987  T
Q  243 tatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacata 281  Q
    |||| |||||||||| | |  |||| |||||||||||||    
T  50986 tatgcttatgcaactgacctacttgtgtatatctacata 50948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 101 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 4458 - 4275
Alignment:
Q  101 tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccacc 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| || |||  || ||||  ||||||    
T  4458 tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgctgtgaacaattagtgttccacc 4359  T
Q  199 actttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
     ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  4358 gctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaatccacttgtgtatatctacatac 4275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 101 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 15615 - 15432
Alignment:
Q  101 tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccacc 198  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||  |||||||  ||||||    
T  15615 tcagggccgtgacccacaccgttgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgctttgaacaactagtgttccacc 15516  T
Q  199 actttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
     ||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  15515 gctttgaatgacaaggcgttccagagtcgaagctctcccacttttatgcttgtgcaactaacccccttgtgtatatctacatac 15432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 148 - 282
Target Start/End: Original strand, 71155 - 71291
Alignment:
Q  148 caggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttat 245  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||| || ||||    
T  71155 caggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccgcttttat 71254  T
Q  246 gtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    | |||||||||| |  | |||| ||||||||||||||    
T  71255 gcttatgcaactgacacacttgtgtatatctacatac 71291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 82 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 4795 - 4594
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  4795 atgcatgtggtaccatat-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaattgttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgcttt 4697  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 279  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||  |||||||||||    
T  4696 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaacccacttatgtatatctaca 4597  T
Q  280 tac 282  Q
    |||    
T  4596 tac 4594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 47 - 301
Target Start/End: Original strand, 13971 - 14228
Alignment:
Q  47 tcatcactactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc- 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||  ||| |||| | || |||||||||||||||||     
T  13971 tcatcaccactccactaagactccgctaacaacacccatgcatgtggtatcgaaa-tcaggaccgtagccctcacctcggtagaatggttaaagcattca 14069  T
Q  144 tcaacaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgt 242  Q
    |   |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| | || ||| ||||||||||||||||||||      
T  14070 ttttcaggacataagtcctcgccactaacaccactttgagcaacgagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttctagagccgaagctctcccacttc 14169  T
Q  243 tatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatata 301  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | | |||||| |||||||    
T  14170 tatgtttatgcaactaacccccttgtgtatatctacatacaacctaacctatacatata 14228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 47 - 301
Target Start/End: Original strand, 24172 - 24429
Alignment:
Q  47 tcatcactactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc- 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||  ||| |||| |||| |||||||||||||||||     
T  24172 tcatcaccactccactaagactccgctaacaacacccatgcatctggtaccataa-tcaggaccgtagccctcacctctgtagaatggttaaagcattca 24270  T
Q  144 tcaacaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgt 242  Q
    |   |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||| | || ||| |||||||||||||| |||||      
T  24271 ttttcaggacataagtcctcgccactaacaccactttgaggaatgagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttctagagccgaagctcttccacttc 24370  T
Q  243 tatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacctaaacatata 301  Q
    |||| |||||||||||| | ||||| ||||||| |||||| | | |||||| |||||||    
T  24371 tatgcttatgcaactaaccgccttgtgtatatccacatacaacctaacctatacatata 24429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 82 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 10435 - 10234
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  10435 atgcatgtggtaccatat-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgcttt 10337  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 279  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| | || |||  |||||||||||    
T  10336 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagctgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttatgtatatctaca 10237  T
Q  280 tac 282  Q
    |||    
T  10236 tac 10234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Original strand, 110758 - 110935
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  110758 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcatt 110857  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  110858 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgtttatgcaacta 110935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 82 - 150
Target Start/End: Original strand, 116793 - 116861
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacag 150  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  116793 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgttgtcgaatggttaaagcattcttaacag 116861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 48 - 282
Target Start/End: Original strand, 10305 - 10543
Alignment:
Q  48 catcactactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-t 144  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  10305 catcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcagggccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 10403  T
Q  145 caacaggacataagtcctcaccactacac--cactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgt 242  Q
       ||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| | || | |||||||||||||||||||||| |    
T  10404 tttcaggacataagtcctcatcactaaacatcactttgagcaaccagtgctccaccactttgaacgacaaggcgtcccagagccgaagctctcccacttt 10503  T
Q  243 tatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    |||| |||||||||| | |  || | ||||||||||||||    
T  10504 tatgattatgcaactgaccgactcgtgtatatctacatac 10543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 174739 - 174561
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  174739 atgcatgtggtaccataattcttggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 174640  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
     |  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  174639 taacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatgtttatgcaacta 174561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Original strand, 489127 - 489304
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  489127 atgcatgtggtaccataattcagggccatgacccacaacactgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 489226  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  489227 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact-tgatgtttatgcaacta 489304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 81 - 166
Target Start/End: Original strand, 179002 - 179083
Alignment:
Q  81 catgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcacc 166  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||   ||| ||||||| | |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  179002 catgcatgtggtaccaaaa--caggaccgaagccctcaccgcttttgaatggttaaagcat--tcatcaggacataagtcctcacc 179083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 59 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 47615 - 47376
Alignment:
Q  59 cactaagactcctctaa--acaccca-tgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaa-caggaca 154  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||    
T  47615 cactaagactcctctaacaacacccaatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgttgtcgaatggttaaagcattctttttcaggaca 47517  T
Q  155 taagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatg 252  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  47516 taagtcctcaccactaaacaccgctttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttctagagccgaaactctcccacttttatgcttatg 47417  T
Q  253 caactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 293  Q
    ||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  47416 caactgacccgcttgtgtatatctacatacaacccaaccta 47376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 59 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 63035 - 62796
Alignment:
Q  59 cactaagactcctctaa--acaccca-tgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaa-caggaca 154  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||    
T  63035 cactaagactcctctaacaacacccaatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgttgtcgaatggttaaagcattctttttcaggaca 62937  T
Q  155 taagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatg 252  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  62936 taagtcctcaccactaaacaccgctttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttctagagccgaaactctcccacttttatgcttatg 62837  T
Q  253 caactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 293  Q
    ||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  62836 caactgacccgcttgtgtatatctacatacaacccaaccta 62796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 59 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 56649 - 56410
Alignment:
Q  59 cactaagactcctctaa--acaccca-tgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaa-caggaca 154  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||    
T  56649 cactaagactcctctaacaacacccaatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgttgtcgaatggttaaagcattctttttcaggaca 56551  T
Q  155 taagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatg 252  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||  |||||||||||||| ||| | || ||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  56550 taagtcctcaccactaaacaccgctttgagcaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttctagagccgaatctctcccacttttatgcttatg 56451  T
Q  253 caactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 293  Q
    ||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||||    
T  56450 caactgaccctcttgtgtatatctacatacaacccaaccta 56410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0430 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0430
Description:

Target: scaffold0430; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 52 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 14779 - 14536
Alignment:
Q  52 actactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaaca 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| || |  ||||| ||||  ||  || |||||| ||||||||||| |||||    ||    
T  14779 actactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtatcatat-tcaggaccgtagccatcatcgctgtagaatggttaaaacattcatttca 14681  T
Q  150 ggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 248  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  14680 ggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaggcgttctagagccgaagctctcccactgttatgct 14581  T
Q  249 tatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaaccta 293  Q
    ||| ||||| |  | |||  |||||||||||||| | ||||||||    
T  14580 tattcaactgactcacttatgtatatctacatacaacccaaccta 14536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 82 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 9809 - 9649
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  9809 atgcatgtggtaccataattcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaataggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 9710  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccact 240  Q
    ||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  9709 gaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 9649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 48 - 282
Target Start/End: Original strand, 5112 - 5350
Alignment:
Q  48 catcactactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-t 144  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || | ||||||    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  5112 catcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataatt-agggccaaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcat 5210  T
Q  145 caacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgt 242  Q
       ||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||| || |    
T  5211 tttcaggacataagtcctcaccgctatacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccgcttt 5310  T
Q  243 tatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    |||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  5311 tatgcttatgcaactaaccctcttgtgtatatctacatac 5350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Original strand, 38401 - 38578
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 178  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  38401 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 38499  T
Q  179 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  38500 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 38578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 35723 - 35546
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 178  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  35723 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 35625  T
Q  179 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  35624 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 35546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 82 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 30322 - 30162
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 178  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  30322 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 30224  T
Q  179 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccact 240  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  30223 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 30162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 103 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 51858 - 51676
Alignment:
Q  103 agggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccacca 199  Q
    ||||||| | ||| ||||||| | ||||||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||| |||  |||| ||||||  ||||| |  ||||||     
T  51858 agggccgaggccctcaccgctatagaatggttaaagcattcattttcaggacataagccctcaccgctaaacaccgctttgaacaactactgttccaccg 51759  T
Q  200 ctttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    ||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||| || ||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  51758 ctttgaatgacaaggcgttccaaagccgaagctctcccgcttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 51676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 47156 - 46979
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 178  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  47156 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 47058  T
Q  179 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  47057 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 46979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 52561 - 52384
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccac-tt 178  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||    
T  52561 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 52463  T
Q  179 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    |||  |||||||  |||||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  52462 tgaacaactagtgttccaccactttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccactttgatg-ttatgcaacta 52384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 258
Target Start/End: Original strand, 2566 - 2743
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  2566 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacctaagtcctcaccgctcaacaccgcttt 2664  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaacta 258  Q
    ||  |||| ||  |||||| ||||||| ||| | || ||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  2665 gaacaactggtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagagccgaagctctcccactttgatgcttatgcaacta 2743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 282
Target Start/End: Original strand, 29748 - 29948
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  29748 atgcatgtggtaccataa-tcagggccgtaacccacaccgttgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccacttt 29846  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctaca 279  Q
    ||  ||| |||  |||||| ||||||| ||| | || |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||  ||||| | || |||| |||||||||||    
T  29847 gaacaacaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccaaagctctcccacttttatgcttagacaact-acccacttgtgtatatctaca 29945  T
Q  280 tac 282  Q
    |||    
T  29946 tac 29948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1299 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold1299
Description:

Target: scaffold1299; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 113 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 314 - 143
Alignment:
Q  113 cccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||| |||    
T  314 cccacaccgctgtcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgac 215  T
Q  211 taagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
     | || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  214 aaggcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 101 - 282
Target Start/End: Original strand, 10217 - 10400
Alignment:
Q  101 tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccacc 198  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||  |||||||  || |||    
T  10217 tcagggccgtgacccactccgctgtcgaatggttaaagcattctcatcaggacataagtcctcaccgctcaacaccgctttgaacaactagtgttctacc 10316  T
Q  199 actttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
     ||||||| ||| | || ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| ||  ||| ||||||| ||||||    
T  10317 gctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcacacttttatgcttatgcgactaacccatttgtgtatatccacatac 10400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 47 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 15678 - 15511
Alignment:
Q  47 tcatcactactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc- 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| ||||||||| |||| ||||||||||||     
T  15678 tcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccataa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatcgttaaagcattca 15580  T
Q  144 tcaacaggacataagtcctcaccacta-caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgact 211  Q
    |   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  15579 ttttcaggacataagtcctcaccactaacaccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgact 15511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 282
Target Start/End: Original strand, 3058 - 3123
Alignment:
Q  217 ttccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  3058 ttccagagccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaactaacccacttgtgtatatctacatac 3123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 226 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 15510 - 15454
Alignment:
Q  226 cgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || || | ||||||||||||||    
T  15510 cgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccactcgtgtatatctacatac 15454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 148 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 20629 - 20493
Alignment:
Q  148 caggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20629 caggacataagtcctcaccactaaacaccgcgttgagcaactagtactccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccacttttat 20530  T
Q  246 gtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    | |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  20529 gcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 20493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1773 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1773
Description:

Target: scaffold1773; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 101 - 240
Target Start/End: Original strand, 1 - 132
Alignment:
Q  101 tcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccactacaccactttgagtaactagtactccaccac 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        |||| ||||||  |||||||  ||||||||    
T  1 tcaggaccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacctaagtcct--------caccgctttgaacaactagtgttccaccac 92  T
Q  201 tttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccact 240  Q
    |||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  93 tttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctctcccact 132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 51 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 5218 - 4981
Alignment:
Q  51 cactactccactaagactcctctaaacaccc---atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tca 146  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||   ||||||||||||||| || |||||||||   ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |      
T  5218 cactactccactaagattcctctaatcaaccctcatgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattcattt 5120  T
Q  147 acaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaacta-gtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgtt 243  Q
     |||||||| |||||||||| |||  |||| ||||||  ||| | || ||||||| ||||||| ||| | ||||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  5119 tcaggacatgagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgctccaccgctttgaacgacaaggcattccagggccgaagccctcccgctttt 5020  T
Q  244 atgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    ||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  5019 atgcttatgcaactaacccacttgtgtatatctacatac 4981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 55 - 291
Target Start/End: Original strand, 17447 - 17688
Alignment:
Q  55 actccactaagactcctctaaacaccc---atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc-tcaacag 150  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||   ||||||||||||||| || || ||||||   ||| || |||||| ||||||||||||||||| |   |||    
T  17447 actccactaagactcttctaatcaaccctcatgcatgtggtaccataa-tcggggccgaagccctcatcgctgtagaatggttaaagcattcattttcag 17545  T
Q  151 gacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtt 248  Q
    |||||||||||||||| |||  |||| ||||||  ||||||| ||||||| ||||||| ||| | || |||||||||||||||| |||| || ||||| |    
T  17546 gacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgctccaccgctttgaacgacaaggcgttccagagccgaagctttcccgcttttatgct 17645  T
Q  249 tatgcaactaatccccttgagtatatctacataccaaccaacc 291  Q
    ||||||||| | || |||| |||||||||||||| | ||||||    
T  17646 tatgcaactgacccacttgtgtatatctacatacaacccaacc 17688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0811 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0811
Description:

Target: scaffold0811; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 131 - 5
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccacttt 179  Q
    ||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||    
T  131 atgcatgtggtaccataatccagggccgtgatccacaccgctgtcgaatggttaaagcattatcaacaggacctaagtcctcaccgctccacaccgcttt 32  T
Q  180 gagtaactagtactccaccactttgaa 206  Q
    ||  |||||||  |||||| |||||||    
T  31 gaacaactagtgttccaccgctttgaa 5  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1913 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1913
Description:

Target: scaffold1913; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 173 - 259
Target Start/End: Original strand, 1 - 87
Alignment:
Q  173 ccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaa 259  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1 ccactttgagcaactagtgctccaccactttgaacgacaaagcgttccagagccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactaa 87  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 47 - 143
Target Start/End: Original strand, 3621 - 3718
Alignment:
Q  47 tcatcactactccactaagactcctctaa--acacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgtcgaatggttaaagcattc 143  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  3621 tcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtaccaaaa-tcaggaccgtagccctcaccgctgtagaatggttaaagcattc 3718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 127 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 41750 - 41592
Alignment:
Q  127 gaatggttaaagcattc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccaga 223  Q
    ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| |||| || ||| | || |||||||    
T  41750 gaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgcttttaacgacaaggcgttccaga 41651  T
Q  224 gccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  41650 gccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 41592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0506 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0506
Description:

Target: scaffold0506; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 282
Target Start/End: Original strand, 8410 - 8615
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgt-cgaatggttaaagcattctcaa--caggacataagtcctcaccacta--caccac 176  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||| |||  |||  |    
T  8410 atgcatgtggtaccataa-tcagggtcgcagccctcaccgctgttcgaatggttaaagcattctttttccaggacataagtcctcaccgctaaacacagc 8508  T
Q  177 tttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaa-tccccttgagtatatc 275  Q
    |||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | ||||||||| ||||| || ||||| || | |||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  8509 tttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcattccagggccgaggccctcccgctttcatgtttatgcaactaactccacttgtgtatatc 8608  T
Q  276 tacatac 282  Q
    |||||||    
T  8609 tacatac 8615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 127 - 282
Target Start/End: Original strand, 326816 - 326975
Alignment:
Q  127 gaatggttaaagcattc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccaga 223  Q
    ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || ||| ||     
T  326816 gaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagg 326915  T
Q  224 gccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaa-tccccttgagtatatctacatac 282  Q
    |||||||| |||||||| || || |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  326916 gccgaagccctcccacttttgtgcttatgcaactaactccccttgtgtatatctacatac 326975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 56 - 282
Target Start/End: Original strand, 321040 - 321266
Alignment:
Q  56 ctccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcaacaggac 153  Q
    ||||||||||||||||||| | |    |||||||||||||| || |||||||||   ||| |||||||  | ||||||||||||||||| |   ||||||    
T  321040 ctccactaagactcctctacaaa----tgcatgtggtaccataa-tcagggccggagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattttcaggac 321134  T
Q  154 ataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttat 251  Q
    ||||||||||||| ||  ||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || |||||| |||||||| |||||| | || || ||||    
T  321135 ataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccatttttgtgcttat 321234  T
Q  252 gcaactaa-tccccttgagtatatctacatac 282  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  321235 gcaacaaactccccttgtgtatatctacatac 321266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 125 - 256
Target Start/End: Original strand, 115778 - 115911
Alignment:
Q  125 tcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccag 222  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||  |||  ||  |||||| ||||||| ||| | || ||||||    
T  115778 tcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacgggtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccag 115877  T
Q  223 agccgaagctctcccactgttatgtttatgcaac 256  Q
     | |||||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  115878 ggtcgaagccctcccgcttttatgcttatgcaac 115911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 282
Target Start/End: Original strand, 7293 - 7451
Alignment:
Q  127 gaatggttaaagcattc-tcaacaggacataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccaga 223  Q
    ||||||||||||||||| |   ||||| ||||||||| |||||||  |||| |||||| || |||||  |||||| || |||| ||| | || |||||||    
T  7293 gaatggttaaagcattcattttcaggatataagtccttaccactaaacaccgctttgaatatctagtgttccaccgctatgaacgacaaggcgttccaga 7392  T
Q  224 gccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  7393 gccgaagctctcccgcttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 7451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 125 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 103063 - 102930
Alignment:
Q  125 tcgaatggttaaagcattctcaacaggacataagtcctcaccact--acaccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccag 222  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| |  | ||||||    
T  103063 tcgaatggttaaagcattcttttcaggacataagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaactcgttccag 102964  T
Q  223 agccgaagctctcccactgttatgtttatgcaac 256  Q
     |||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  102963 ggccgaagctctcccgcttttatgcttatgcaac 102930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1615 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1615
Description:

Target: scaffold1615; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 550 - 392
Alignment:
Q  127 gaatggttaaagcattc-tcaacaggacataagtcctcaccactacac--cactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccaga 223  Q
    ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||| | ||| ||  | ||||||  |||||||  ||||||  |||||| ||| | || |||||||    
T  550 gaatggttaaagcattcattttcaggacataagtcctcatcgctaaactccgctttgaacaactagtgttccaccgatttgaacgacaaggcgttccaga 451  T
Q  224 gccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  450 gccgaagctctcccactttaatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 127 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 17072 - 16914
Alignment:
Q  127 gaatggttaaagcattc-tcaacaggacataagtcctcaccactacaccac--tttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccaga 223  Q
    ||||||||||||||||| |   ||||||||||| ||||||| ||| ||  |  |||||  |||||||  |||||  ||||||| ||| | || |||||||    
T  17072 gaatggttaaagcattcattttcaggacataaggcctcaccgctaaactccgttttgaacaactagtgttccactgctttgaacgacaaggcgttccaga 16973  T
Q  224 gccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  16972 gccgaagctctcccacttttatgcttatgcaactgacccacttgtgtatatctacatac 16914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 27945 - 27781
Alignment:
Q  82 atgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgt-cgaatggttaaagcattctca-acaggacataagtcctcaccacta-caccactt 178  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||| | ||| |||| |||    
T  27945 atgcatgtggtaccataa-tcagggccggagccctcaccgctattcgaatggttaaagcattcttttataggacataagtcctcatcgctaacaccgctt 27847  T
Q  179 tgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgtta 244  Q
    |||  |||| ||  |||||||||||||| ||| |  | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27846 tgaacaactcgtgttccaccactttgaacgacaagccgttccagagccgaagctctcccgctgtta 27781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 282
Target Start/End: Original strand, 27840 - 28065
Alignment:
Q  56 ctccactaagactcctctaaacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattc-tcaacaggac 153  Q
    ||||||||||||||||||| |     ||||||||||||||| || |||||||||   ||| |||||||  | ||||||||||||||||| |   ||||||    
T  27840 ctccactaagactcctctaca-----atgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctaattgaatggttaaagcattcattttcaggac 27933  T
Q  154 ataagtcctcaccacta--caccactttgagtaactagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttat 251  Q
    || |||||||||| |||  |||| ||||||  |||||||  |||||| ||||||| ||| | || ||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||    
T  27934 atgagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaactagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttctagggccgaagccctcccgcttttatgcttat 28033  T
Q  252 gcaactaa-tccccttgagtatatctacatac 282  Q
    |||||||| ||| || | ||||||||||||||    
T  28034 gcaactaactccactggtgtatatctacatac 28065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0301
Description:

Target: scaffold0301; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 13620 - 13504
Alignment:
Q  56 ctccactaagactcctcta-aacacccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctg-tcgaatggttaaagcattctcaa-cagga 152  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| || |||||||||   ||| |||||||  | ||||||||||||||||||    |||||    
T  13620 ctccactaagactcttctacaacactcatgcatgtggtaccataa-tcagggccgaagccctcaccgctaatagaatggttaaagcattctttttcagga 13522  T
Q  153 cataagtcctcaccacta 170  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13521 cataagtcctcaccacta 13504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 47 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 78589 - 78538
Alignment:
Q  47 tcatcactactccactaagactcctcta--aacacccatgcatgtggtacca 96  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  78589 tcatcaccactccactaagactcctctaacaacacccatgcatgtggtacca 78538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 16250 - 16021
Alignment:
Q  59 cactaagactcctctaaaca--cccatgcatgtggtaccaaaaatcagggccgtgacccacaccgctgt-cgaatggttaaagcattctcaacaggacat 155  Q
    |||||||||||||||| | |  | |||||||||||||||| |  ||||||||||  ||| ||||||| | |||||| ||||||||||||   ||||||||    
T  16250 cactaagactcctctacaaatgctcatgcatgtggtaccatat-tcagggccgtagccctcaccgctattcgaatgcttaaagcattcttttcaggacat 16152  T
Q  156 aagtcctcaccact--acaccactttgagtaac-tagtactccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatg 252  Q
    ||||||||||| ||  ||||| ||||||  |||  |||  |||||| ||||||| ||| | || |||||| |||| ||| ||||  || || || |||||    
T  16151 aagtcctcaccgctaaacaccgctttgaacaacaaagtgttccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccggagccctcctgcttttgtgcttatg 16052  T
Q  253 caact-aatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    ||||| | ||| |||| ||||||||||||||    
T  16051 caactgactccacttgtgtatatctacatac 16021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 55 - 96
Target Start/End: Original strand, 16913 - 16955
Alignment:
Q  55 actccactaagactcctcta-aacacccatgcatgtggtacca 96  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16913 actccactaagactcctctacaacactcatgcatgtggtacca 16955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 282
Target Start/End: Original strand, 17006 - 17095
Alignment:
Q  193 tccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaatccccttgagtatatctacatac 282  Q
    |||||| ||||||| ||| | || |||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||| | || ||||  |||||||||||||    
T  17006 tccaccgctttgaacgacaaggcgttccagcgccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaactgacccacttgtatatatctacatac 17095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 282
Target Start/End: Original strand, 55975 - 56065
Alignment:
Q  193 tccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaa-tccccttgagtatatctacatac 282  Q
    |||||| ||||||| ||| | || |||||| |||| ||| ||||| || || ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  55975 tccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccggagccctcccgcttttgtgtttatgcaactaactccacttgtgtatatctacatac 56065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 1119 - 1027
Alignment:
Q  193 tccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaa-tccccttgagtatatctacatacca 284  Q
    |||||| ||||||| ||| | || |||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||  | ||| |||| ||||||||||||||||    
T  1119 tccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaaccgactccacttgtgtatatctacatacca 1027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 8055 - 7963
Alignment:
Q  193 tccaccactttgaatgactaagcattccagagccgaagctctcccactgttatgtttatgcaactaa-tccccttgagtatatctacatacca 284  Q
    |||||| ||||||| ||| | || |||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||||  | ||| |||| ||||||||||||||||    
T  8055 tccaccgctttgaacgacaaggcgttccagggccgaagccctcccgcttttatgcttatgcaaccgactccacttgtgtatatctacatacca 7963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 4898 times since January 2019
Visitors: 4840