View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0759_low_41 (Length: 363)

Name: NF0759_low_41
Description: NF0759
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0759_low_41
NF0759_low_41
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (24-363)||(53223-53562)
[»] chr8 (11 HSPs)
chr8 (23-363)||(14892445-14892785)
chr8 (24-363)||(21211663-21212002)
chr8 (97-363)||(22832121-22832387)
chr8 (116-328)||(25036076-25036288)
chr8 (116-328)||(25050113-25050325)
chr8 (116-355)||(33600601-33600840)
chr8 (116-328)||(12916388-12916600)
chr8 (116-328)||(18233759-18233971)
chr8 (116-328)||(18243210-18243422)
chr8 (124-336)||(23749913-23750125)
chr8 (206-329)||(45497837-45497960)
[»] chr6 (8 HSPs)
chr6 (32-359)||(29541764-29542091)
chr6 (24-363)||(18161374-18161713)
chr6 (24-363)||(16899255-16899594)
chr6 (24-363)||(31358870-31359209)
chr6 (26-363)||(34766667-34767004)
chr6 (26-363)||(18710671-18711008)
chr6 (26-363)||(18704736-18705073)
chr6 (206-299)||(11375039-11375132)
[»] chr4 (7 HSPs)
chr4 (26-362)||(17150684-17151020)
chr4 (25-363)||(16254548-16254881)
chr4 (24-363)||(6693527-6693866)
chr4 (26-363)||(520606-520943)
chr4 (26-363)||(7845151-7845488)
chr4 (117-336)||(54698491-54698710)
chr4 (125-336)||(26813342-26813553)
[»] chr7 (17 HSPs)
chr7 (24-363)||(9543933-9544272)
chr7 (24-363)||(16140877-16141216)
chr7 (24-363)||(5389864-5390203)
chr7 (24-363)||(26304865-26305204)
chr7 (24-363)||(26361614-26361953)
chr7 (24-363)||(32099689-32100028)
chr7 (24-363)||(46498423-46498762)
chr7 (24-363)||(6535793-6536132)
chr7 (24-363)||(8502358-8502697)
chr7 (24-363)||(44898608-44898947)
chr7 (70-363)||(13284123-13284416)
chr7 (222-363)||(42596865-42597006)
chr7 (26-185)||(42596698-42596857)
chr7 (117-327)||(7582477-7582687)
chr7 (117-185)||(15175386-15175454)
chr7 (242-354)||(14643482-14643594)
chr7 (248-336)||(15175517-15175605)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (24-363)||(16156192-16156531)
chr1 (26-363)||(1987882-1988219)
chr1 (84-362)||(22959697-22959974)
[»] chr5 (17 HSPs)
chr5 (24-363)||(18362586-18362925)
chr5 (24-363)||(26201018-26201357)
chr5 (24-363)||(27413457-27413796)
chr5 (24-363)||(33940629-33940968)
chr5 (26-363)||(20949166-20949503)
chr5 (33-360)||(23375593-23375920)
chr5 (116-327)||(5601579-5601790)
chr5 (117-336)||(24413672-24413891)
chr5 (117-336)||(30453316-30453535)
chr5 (117-336)||(30458394-30458613)
chr5 (116-336)||(21083013-21083233)
chr5 (26-99)||(19781874-19781947)
chr5 (116-328)||(24299318-24299530)
chr5 (206-329)||(15329389-15329512)
chr5 (206-329)||(18709247-18709370)
chr5 (116-185)||(24289954-24290023)
chr5 (116-185)||(22456714-22456783)
[»] chr3 (9 HSPs)
chr3 (24-363)||(8974155-8974494)
chr3 (24-363)||(6423616-6423955)
chr3 (24-363)||(9538444-9538783)
chr3 (24-363)||(12387297-12387635)
chr3 (116-327)||(48979673-48979884)
chr3 (125-336)||(28366791-28367002)
chr3 (116-304)||(4384341-4384529)
chr3 (125-175)||(28374773-28374823)
chr3 (125-175)||(28382595-28382645)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (24-363)||(148017-148356)
[»] chr2 (6 HSPs)
chr2 (24-363)||(18652527-18652866)
chr2 (32-363)||(45015670-45016001)
chr2 (26-363)||(27168679-27169016)
chr2 (24-363)||(9512457-9512796)
chr2 (70-363)||(22903494-22903787)
chr2 (116-327)||(1791955-1792166)
[»] scaffold0313 (2 HSPs)
scaffold0313 (26-363)||(7080-7417)
scaffold0313 (26-363)||(10862-11199)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (26-363)||(6261-6598)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (24-363)||(20084-20423)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (33-360)||(16545-16872)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (191-363)||(1-173)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (84-362)||(189221-189498)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (117-336)||(103005-103224)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (116-328)||(257898-258110)
[»] scaffold0500 (1 HSPs)
scaffold0500 (248-327)||(5117-5196)


Alignment Details
Target: scaffold0058 (Bit Score: 300; Significance: 1e-168; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 24 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 53562 - 53223
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53562 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaatagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 53463  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53462 taaagctagactctttctatcatgtgcattaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttaaaaata 53363  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53362 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 53263  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 363  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53262 tgtatgctagatttactacaatagtaaatgatatgagatc 53223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 293; Significance: 1e-164; HSPs: 11)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 14892785 - 14892445
Alignment:
Q  23 atcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaatt 122  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14892785 atcatcacatatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaatt 14892686  T
Q  123 ctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  14892685 ctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtaagaatgataaagaggtatgggataccttaaaaat 14892586  T
Q  223 acatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgag 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14892585 acatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaaccagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaactattgatgag 14892486  T
Q  323 atgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 363  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14892485 atgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 14892445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 24 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 21212002 - 21211663
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 123  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  21212002 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaacaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 21211903  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||  |||||||||||  ||||||||    
T  21211902 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaaggagtatgggatactctgaaaata 21211803  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21211802 catcatgagggtacttctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 21211703  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 363  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21211702 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 21211663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 97 - 363
Target Start/End: Original strand, 22832121 - 22832387
Alignment:
Q  97 tgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgct 196  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||     
T  22832121 tgaaaaagctcaggtattactaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatgaaagaaagtgaaagagttgatgagtgtaaaaatgcc 22832220  T
Q  197 aaagaggtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaa 296  Q
    |||||||||||||| || |||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  22832221 aaagaggtatgggacactttgagagtacatcatgaaggtacatctcatatcaaagaaactagaattgataatggagtcagaaagtttaaggtctttgaaa 22832320  T
Q  297 tgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 363  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22832321 tgagtgagaatgaaaccatttatgagatgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 22832387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 25036288 - 25036076
Alignment:
Q  116 ttaaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggatacct 215  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |  |  || |||||  | |||||||| |    
T  25036288 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgcaccacggcaaaagaaatttgggatacat 25036189  T
Q  216 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 315  Q
    | |||||||||||||| || ||    |||||||||||||| || || |||||||| ||  ||||||||||| | || |||||||||||| | |||| |||    
T  25036188 taaaaatacatcatgaaggaactagccatgtcaaagaaacaaggatagacattggcgtacgaaaatttgaaattttcgaaatgagtgaagaagaaaacat 25036089  T
Q  316 tgatgagatgtat 328  Q
    |||||| ||||||    
T  25036088 tgatgaaatgtat 25036076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 25050325 - 25050113
Alignment:
Q  116 ttaaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggatacct 215  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |  |  || |||||  | |||||||| |    
T  25050325 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgcaccacggcaaaagaaatttgggatacat 25050226  T
Q  216 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 315  Q
    | |||||||||||||| || ||    |||||||||||||| || || |||||||| ||  ||||||||||| | || |||||||||||| | |||| |||    
T  25050225 taaaaatacatcatgaaggaactagccatgtcaaagaaacaaggatagacattggcgtacgaaaatttgaaattttcgaaatgagtgaagaagaaaacat 25050126  T
Q  316 tgatgagatgtat 328  Q
    |||||| ||||||    
T  25050125 tgatgaaatgtat 25050113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 33600840 - 33600601
Alignment:
Q  116 ttaaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggatacct 215  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||  || |||||| ||  | ||| |||||  | ||||| || |    
T  33600840 ttaaattccaaagctcaactctttctacaatgttcattaaccatggaagaaagtgaaaggatttatgaatgtagtactgcaaaagaaatttgggacacat 33600741  T
Q  216 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 315  Q
    | ||||| |||||||| || ||    ||||| ||||||||  | || || ||||| ||  ||||||||||| | || ||||||| |||| | |||| |||    
T  33600740 taaaaattcatcatgaaggaactagccatgttaaagaaacacggatagatattggcgtacgaaaatttgaaattttcgaaatgaatgaagaagaaaacat 33600641  T
Q  316 tgatgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaa 355  Q
    |||||| |||||| ||||||||||  | ||||||||||||    
T  33600640 tgatgaaatgtattccagatttacctctatagtaaatgaa 33600601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 116 - 328
Target Start/End: Original strand, 12916388 - 12916600
Alignment:
Q  116 ttaaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggatacct 215  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |  |  || |||||  | |||||||| |    
T  12916388 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgcactacggcaaaagaaatttgggatacgt 12916487  T
Q  216 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 315  Q
    | ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| || || || ||||| ||  ||||||||||| | || |||||||||||  | |||| |||    
T  12916488 taaaaattcatcatgaaggaaccagccatgttaaagaaacaaggatagatattggcgtacgaaaatttgaaattttagaaatgagtgatgaagaaaacat 12916587  T
Q  316 tgatgagatgtat 328  Q
    |||||| ||||||    
T  12916588 tgatgaaatgtat 12916600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 116 - 328
Target Start/End: Original strand, 18233759 - 18233971
Alignment:
Q  116 ttaaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggatacct 215  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||  |  || |||||  | |||||||| |    
T  18233759 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgtactacggcaaaagaaatttgggatacgt 18233858  T
Q  216 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 315  Q
    | ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| || || || ||||| ||  ||||||| ||| | || |||||||||||| | ||||  ||    
T  18233859 taaaaattcatcatgaaggaactagccatgttaaagaaacaaggatagatattggcgtacgaaaattcgaaattttcgaaatgagtgaagaagaaaatat 18233958  T
Q  316 tgatgagatgtat 328  Q
    |||||| ||||||    
T  18233959 tgatgaaatgtat 18233971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 116 - 328
Target Start/End: Original strand, 18243210 - 18243422
Alignment:
Q  116 ttaaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggatacct 215  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||  |  || |||||  | |||||||| |    
T  18243210 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgtactacggcaaaagaaatttgggatacgt 18243309  T
Q  216 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 315  Q
    | ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| || || || ||||| ||  ||||||| ||| | || |||||||||||| | ||||  ||    
T  18243310 taaaaattcatcatgaaggaactagccatgttaaagaaacaaggatagatattggcgtacgaaaattcgaaattttcgaaatgagtgaagaagaaaatat 18243409  T
Q  316 tgatgagatgtat 328  Q
    |||||| ||||||    
T  18243410 tgatgaaatgtat 18243422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 124 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 23750125 - 23749913
Alignment:
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||  ||| |||||| |||||||  ||| || |||||||  ||| ||||| || |||| ||  | |||||||||| |||||||  |||| |||||     
T  23750125 taaagctcaactttttctaacatgtgctttaagcagggaagaatatgatagagtagaagaatgtacaactgctaaagagatatgggaagccttaaaaatt 23750026  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    |||||||| || |||  ||||||||| |||   ||||| ||||| ||||| |  |||||||||  ||| || ||||  |||| |||||||||||||||||    
T  23750025 catcatgaaggaacaagtcatgtcaaggaagaaagaatagacatgggagttaagaaatttgaaaccttcgagatgaaagaaagtgaaaccattgatgaga 23749926  T
Q  324 tgtatgccagatt 336  Q
    ||| ||| |||||    
T  23749925 tgtttgcaagatt 23749913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 206 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 45497960 - 45497837
Alignment:
Q  206 tgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaa 305  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| |||||   ||| || |||||||| ||||||||||| || ||  |||||| |||| | || |||||||  ||||    
T  45497960 tgggatgctttgaaaatacatcatgaaggtaccagtcacgtgaaagaaacaagaattgacatcggtgtacgaaaatatgaactattcgaaatgaaggaaa 45497861  T
Q  306 atgaaaccattgatgagatgtatg 329  Q
      |||||||| ||||| |||||||    
T  45497860 ccgaaaccatagatgaaatgtatg 45497837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 284; Significance: 1e-159; HSPs: 8)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 32 - 359
Target Start/End: Original strand, 29541764 - 29542091
Alignment:
Q  32 gatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagcta 131  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29541764 gatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgttaaactctaaagcta 29541863  T
Q  132 gactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaatacatcatga 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29541864 gactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaatacatcatga 29541963  T
Q  232 gggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgcc 331  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29541964 gggtcaatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagttagaaaatttgaagtctttaaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgct 29542063  T
Q  332 agatttactacaatagtaaatgaaatga 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29542064 agatttactacaatagtaaatgaaatga 29542091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 24 - 363
Target Start/End: Original strand, 18161374 - 18161713
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  18161374 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 18161473  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  18161474 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 18161573  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18161574 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 18161673  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 363  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18161674 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 18161713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 24 - 363
Target Start/End: Original strand, 16899255 - 16899594
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 123  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  16899255 tcatcacagatggagactatgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 16899354  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||| |||||  ||||||||    
T  16899355 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgagatactctgaaaata 16899454  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16899455 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 16899554  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 363  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16899555 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 16899594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 24 - 363
Target Start/End: Original strand, 31358870 - 31359209
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 123  Q
    |||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  31358870 tcatcacaaatgaagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 31358969  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  31358970 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 31359069  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31359070 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 31359169  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 363  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31359170 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 31359209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 26 - 363
Target Start/End: Original strand, 34766667 - 34767004
Alignment:
Q  26 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattcta 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  34766667 atcacagatggagactttgttccactaaccaaagaagggatcatcaaagttaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgctaaactcta 34766766  T
Q  126 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaataca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34766767 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgcaaaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaagtaca 34766866  T
Q  226 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 325  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34766867 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaaccagaattgacattggagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 34766966  T
Q  326 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34766967 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 34767004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 26 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 18711008 - 18710671
Alignment:
Q  26 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattcta 125  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||    
T  18711008 atcacagatggagactttgttgcaacaaccaaataaggagctgtaaaggaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcatgtattactaaactcta 18710909  T
Q  126 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaataca 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||| || ||  ||| | ||||    
T  18710908 aagctagactctttttatcatgtgcactgaccatggaagaaagtgcaagagttgatgagtgtaaaaatgccaaagaggtatgagacactctgagagtaca 18710809  T
Q  226 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 325  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18710808 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 18710709  T
Q  326 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 363  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18710708 tatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 18710671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 26 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 18705073 - 18704736
Alignment:
Q  26 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattcta 125  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||    
T  18705073 atcacagatggagactttgttgcaacaaccaaataaggagctgtaaaggaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcatgtattactaaactcta 18704974  T
Q  126 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaataca 225  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||| ||||||||||| || ||  ||| | ||||    
T  18704973 aagctagactctttttatcatgtgcactgaccatggaagaaagtgcaagagttgatgagtgtaaaaatgccaaagaggtatgagacactctgagagtaca 18704874  T
Q  226 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 325  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18704873 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaattttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatt 18704774  T
Q  326 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 363  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18704773 tatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 18704736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 299
Target Start/End: Original strand, 11375039 - 11375132
Alignment:
Q  206 tgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatga 299  Q
    |||||||| || |||||||||||||| || ||   |||||| |||||||| ||||||||||| || ||  ||||||||||| | || |||||||    
T  11375039 tgggatacattaaaaatacatcatgaaggaactagtcatgtgaaagaaacaagaattgacataggtgtacgaaaatttgaattattcgaaatga 11375132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 281; Significance: 1e-157; HSPs: 7)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 26 - 362
Target Start/End: Original strand, 17150684 - 17151020
Alignment:
Q  26 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattcta 125  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||    
T  17150684 atcacagatggagactttgttccaacaaccaacgaaggaactgtcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaatgctcaggtattgttaaacttta 17150783  T
Q  126 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaataca 225  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17150784 aagctagactctttctatcatttgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaataca 17150883  T
Q  226 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17150884 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagttagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 17150983  T
Q  326 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagat 362  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17150984 tatgctagatttactacaatagtaaattaaatgagat 17151020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 25 - 363
Target Start/End: Original strand, 16254548 - 16254881
Alignment:
Q  25 catcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattct 124  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  16254548 catcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagttgtcacagaaaagagtacatggtcaacagatgaaaaagctcaagtattgttaaactct 16254647  T
Q  125 aaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaatac 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     ||||||||||||||||    
T  16254648 aaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtaagaatgctaaagagg-----gataccttgaaaatac 16254742  T
Q  225 atcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagat 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16254743 atcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagat 16254842  T
Q  325 gtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 363  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16254843 gtatgctagatttactacaatagtaaatgatatgagatc 16254881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 24 - 363
Target Start/End: Original strand, 6693527 - 6693866
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 123  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  6693527 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaacaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 6693626  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||  |||||||||||  ||||||||    
T  6693627 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaaggagtatgggatactctgaaaata 6693726  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6693727 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 6693826  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 363  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6693827 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 6693866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 26 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 520943 - 520606
Alignment:
Q  26 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattcta 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  520943 atcacagatggagactttgttccactaaccaaagaagggatcatcaaagttaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgctaaactcta 520844  T
Q  126 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaataca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  520843 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgcaaaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaagtaca 520744  T
Q  226 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 325  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  520743 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaaccagaattgacattggagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 520644  T
Q  326 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  520643 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 520606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 26 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 7845488 - 7845151
Alignment:
Q  26 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattcta 125  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||   || || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||    
T  7845488 atcacagatggagactttgttccaacaaacaaagaaggagctataaaggaaaagaaggcatggtcaacagatgaaaaggctcatgtattactaaactcta 7845389  T
Q  126 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaataca 225  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||  |||||||| |    
T  7845388 aagctagactttttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgagtgtaaaaatgccaaagaggtatgggacactctgaaaatata 7845289  T
Q  226 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7845288 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgatattggagtcagaaaatttgaagtttttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 7845189  T
Q  326 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 363  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7845188 tatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 7845151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 117 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 54698710 - 54698491
Alignment:
Q  117 taaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggatacctt 216  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||| ||||| || ||||| ||  |    
T  54698710 taaactctaaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgtgactgcaaaagaagtgtgggacactct 54698611  T
Q  217 gaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccatt 316  Q
     ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||  ||| |||| | ||||    
T  54698610 aaaaattcatcatgaaggaactagccatgtaaaagaaacaagaatagacattggcgtaagaaaatttgaaatctttgaaatgaacgaagatgagaacatt 54698511  T
Q  317 gatgagatgtatgccagatt 336  Q
    ||||| |||||  |||||||    
T  54698510 gatgaaatgtactccagatt 54698491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 336
Target Start/End: Original strand, 26813342 - 26813553
Alignment:
Q  125 aaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaatac 224  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |   | ||| ||||| || ||||| ||  | ||||| |    
T  26813342 aaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgttactgcaaaagaagtttgggacactctaaaaattc 26813441  T
Q  225 atcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagat 324  Q
    |||||||||| ||    || || |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| | ||||||||| ||    
T  26813442 atcatgagggaactagccacgtaaaagaaacaagaatagatattggcgtaagaaaatttgaaatcttcgaaatgaacgaagatgagaacattgatgaaat 26813541  T
Q  325 gtatgccagatt 336  Q
    |||  |||||||    
T  26813542 gtactccagatt 26813553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 17)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 24 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 9544272 - 9543933
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  9544272 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 9544173  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  9544172 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggataccctgaaaata 9544073  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544072 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtttttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 9543973  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9543972 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 9543933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 24 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 16141216 - 16140877
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  16141216 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 16141117  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  16141116 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 16141017  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16141016 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 16140917  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 363  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16140916 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 16140877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 24 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 5390203 - 5389864
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 123  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  5390203 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 5390104  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  5390103 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 5390004  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5390003 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 5389904  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 363  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5389903 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 5389864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 24 - 363
Target Start/End: Original strand, 26304865 - 26305204
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 123  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  26304865 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 26304964  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  26304965 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 26305064  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26305065 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 26305164  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 363  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26305165 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 26305204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 24 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 26361953 - 26361614
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 123  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  26361953 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 26361854  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  26361853 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 26361754  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26361753 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 26361654  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 363  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26361653 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 26361614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 24 - 363
Target Start/End: Original strand, 32099689 - 32100028
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 123  Q
    |||||||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  32099689 tcatcacaaatggagattttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattattaaactc 32099788  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  32099789 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 32099888  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32099889 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 32099988  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 363  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32099989 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 32100028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 24 - 363
Target Start/End: Original strand, 46498423 - 46498762
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  46498423 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 46498522  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  46498523 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 46498622  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46498623 catcatgagggtacatttcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 46498722  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 363  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46498723 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 46498762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 24 - 363
Target Start/End: Original strand, 6535793 - 6536132
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 123  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  6535793 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaacaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcagcagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 6535892  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||  |||||||||||  ||||||||    
T  6535893 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaaggagtatgggatactctgaaaata 6535992  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6535993 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 6536092  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 363  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6536093 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 6536132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 24 - 363
Target Start/End: Original strand, 8502358 - 8502697
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 123  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  8502358 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaacaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 8502457  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||  |||||||||||  ||||||||    
T  8502458 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaaggagtatgggatactctgaaaata 8502557  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8502558 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaaa 8502657  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 363  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8502658 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 8502697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 24 - 363
Target Start/End: Original strand, 44898608 - 44898947
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 123  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  44898608 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaacaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 44898707  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||  |||||||||||  ||||||||    
T  44898708 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaaggagtatgggatactctgaaaata 44898807  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44898808 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtaaaaatgaaaccattgatgaga 44898907  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 363  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44898908 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 44898947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 70 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 13284416 - 13284123
Alignment:
Q  70 caaagataagagtgcatg-gtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaag 168  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13284416 caaagaaaagagtgcatgtgtcaacagatgaaaaatctcaagtattgttaaattctaaagctagactctttctattatgtgcactaaccatggaagaaag 13284317  T
Q  169 tgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacatt 268  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13284316 tgaaagagttgatgaatgcaagaatgctaaagaggtatgggatactttgaaagtacatcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacatt 13284217  T
Q  269 ggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 363  Q
    ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13284216 ggagtcaaaaagtttgaa-tctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatttactgcaatagtaaatgaaatgagatc 13284123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 222 - 363
Target Start/End: Original strand, 42596865 - 42597006
Alignment:
Q  222 tacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatga 321  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  42596865 tacatcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaactataattgacattagagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgtgaatgaaaccattgatga 42596964  T
Q  322 gatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42596965 gatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 42597006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 185
Target Start/End: Original strand, 42596698 - 42596857
Alignment:
Q  26 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattcta 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||| |   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42596698 atcacagatggagactttgttccaaagaccaaaaaaggaaccatcaaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaactcta 42596797  T
Q  126 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaat 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42596798 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagaggtgatgaat 42596857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 117 - 327
Target Start/End: Original strand, 7582477 - 7582687
Alignment:
Q  117 taaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggatacctt 216  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||| ||||| || ||||| ||  |    
T  7582477 taaattctaaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgtgactgcaaaagaagtttgggacactct 7582576  T
Q  217 gaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccatt 316  Q
     ||||| |||||||| || ||    ||| | |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| | ||||    
T  7582577 aaaaattcatcatgaaggaactagccatttaaaagaaacaagaatagacattggcgtaagaaaatttgaaatcttcgaaatgaacgaagatgagaacatt 7582676  T
Q  317 gatgagatgta 327  Q
    ||||| |||||    
T  7582677 gatgaaatgta 7582687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 117 - 185
Target Start/End: Original strand, 15175386 - 15175454
Alignment:
Q  117 taaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaat 185  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15175386 taaactctaaagcttgactttttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaat 15175454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 242 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 14643594 - 14643482
Alignment:
Q  242 catgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatttacta 341  Q
    ||||| |||||||| || || |||||||| ||  ||||||||||| | || |||||||||||  | |||| ||||||||| |||||| |  |||| |||     
T  14643594 catgttaaagaaacaaggatagacattggcgtacgaaaatttgaaattttcgaaatgagtgatgaagaaaacattgatgaaatgtattcacgattcactt 14643495  T
Q  342 caatagtaaatga 354  Q
    | |||||||||||    
T  14643494 ctatagtaaatga 14643482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 336
Target Start/End: Original strand, 15175517 - 15175605
Alignment:
Q  248 aaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatt 336  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| | ||||||||| |||||  |||||||    
T  15175517 aaagaaacaagaatagatattggcgtaagaaaatttgaaatcttcgaaatgaacgaagatgagaacattgatgaaatgtactccagatt 15175605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 280; Significance: 1e-157; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 24 - 363
Target Start/End: Original strand, 16156192 - 16156531
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  16156192 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 16156291  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  16156292 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 16156391  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16156392 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 16156491  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16156492 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 16156531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 26 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 1988219 - 1987882
Alignment:
Q  26 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattcta 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||     ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  1988219 atcacagatggagactttgttccattaaccaaagaaggaatcatcaaagttaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgctaaactcta 1988120  T
Q  126 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaataca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1988119 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgcaaaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaagtaca 1988020  T
Q  226 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 325  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1988019 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaaccagaattgacattggagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 1987920  T
Q  326 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1987919 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 1987882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 84 - 362
Target Start/End: Original strand, 22959697 - 22959974
Alignment:
Q  84 catggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatga 183  Q
    ||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  | ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  22959697 catggacaactgatgaaaaagataaggtattgttaaattctaaagttagcttatttttatcatgtgcattaaccttggaagaaagtgaaagggttgatga 22959796  T
Q  184 atttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaattt 283  Q
    || ||  ||||| ||||| || ||||| || || ||| |||||||||| || ||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||    
T  22959797 atgtacaaatgccaaagaagtgtgggacactttaaaagtacatcatgaaggaaccactcatgtcgaagaaacaagaattgacattggagtcag-aaagtt 22959895  T
Q  284 gaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagat 362  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  22959896 gaaatctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaaatgtatgatagattcacaacaatagtgaatgaaatgagat 22959974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 17)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 24 - 363
Target Start/End: Original strand, 18362586 - 18362925
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  18362586 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 18362685  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  18362686 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 18362785  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18362786 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 18362885  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 363  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18362886 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 18362925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 24 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 26201357 - 26201018
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 123  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  26201357 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 26201258  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  26201257 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 26201158  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26201157 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 26201058  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 363  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26201057 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 26201018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 24 - 363
Target Start/End: Original strand, 27413457 - 27413796
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||     
T  27413457 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaaggtcaggtattactaaattt 27413556  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  27413557 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 27413656  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27413657 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagttagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 27413756  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27413757 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 27413796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 24 - 363
Target Start/End: Original strand, 33940629 - 33940968
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 123  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  33940629 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaacaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 33940728  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||  |||||||||||  ||||||||    
T  33940729 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaaggagtatgggatactctgaaaata 33940828  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33940829 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 33940928  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 363  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33940929 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 33940968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 26 - 363
Target Start/End: Original strand, 20949166 - 20949503
Alignment:
Q  26 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattcta 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  20949166 atcacagatggagactttgttccactaaccaaagaagggatcatcaaagttaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgctaaactcta 20949265  T
Q  126 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaataca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20949266 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgcaaaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaagtaca 20949365  T
Q  226 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 325  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20949366 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaaccagaattgacattggagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 20949465  T
Q  326 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20949466 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 20949503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 33 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 23375920 - 23375593
Alignment:
Q  33 atggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctag 132  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||| |   |||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  23375920 atggagactttgttccaaagactaaagaaggaaccatcaaacaaaagagtgcatggtcaatagatgacaaagctcatgtattgttaaactctaaacctag 23375821  T
Q  133 actctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaatacatcatgag 232  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |  || | | |||  |||||     
T  23375820 actctttttatcatgtgcactaaccatggaagaaaatgaaagagttgataaatgcaagaatgctaaagaggtatgggaaattttaagagtacgccatgaa 23375721  T
Q  233 ggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgcca 332  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||   |    
T  23375720 ggtacctctcatgtcaaggaaaccagaattaacataggagtcagaaagtgtgaagtctttgaaatgagtgagaatgaaactattgatgaaatgtatttta 23375621  T
Q  333 gatttactacaatagtaaatgaaatgag 360  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||    
T  23375620 gatttactacaatagtaaatgagatgag 23375593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 116 - 327
Target Start/End: Original strand, 5601579 - 5601790
Alignment:
Q  116 ttaaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggatacct 215  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||| ||| |||| ||||||||      
T  5601579 ttaaattctaaagctcgactctttctatcatgtgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgatactgcaaaaaaggtgtgggatactc 5601678  T
Q  216 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 315  Q
    | ||| | |||||||| || |||   ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||| |||    
T  5601679 tcaaagtccatcatgaaggaacaagccatgttaaagaaacaagaattgacattggtgtgagaaagtttgaaatctttgaaatgattgaagatgaaaacat 5601778  T
Q  316 tgatgagatgta 327  Q
    |||||| |||||    
T  5601779 tgatgaaatgta 5601790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 117 - 336
Target Start/End: Original strand, 24413672 - 24413891
Alignment:
Q  117 taaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggatacctt 216  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||| ||||| || ||||| ||  |    
T  24413672 taaactctaaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgtgactgcaaaagaagtgtgggacactct 24413771  T
Q  217 gaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccatt 316  Q
     ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| | ||||    
T  24413772 aaaaattcatcatgaaggaactagccatgtaaaagaaacaagaatagacattggcgtaagaaaatttgaaatcttcgaaatgaacgaagatgagaacatt 24413871  T
Q  317 gatgagatgtatgccagatt 336  Q
    ||||| |||||  |||||||    
T  24413872 gatgaaatgtactccagatt 24413891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 117 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 30453535 - 30453316
Alignment:
Q  117 taaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggatacctt 216  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||| ||||| || ||||| ||  |    
T  30453535 taaactctaaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgtgactgcaaaagaagtgtgggacactct 30453436  T
Q  217 gaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccatt 316  Q
     ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| | ||||    
T  30453435 aaaaattcatcatgaaggaactagccatgtaaaagaaacaagaatagacattggcgtaagaaaatttgaaatcttcgaaatgaacgaagatgagaacatt 30453336  T
Q  317 gatgagatgtatgccagatt 336  Q
    ||||| |||||  |||||||    
T  30453335 gatgaaatgtactccagatt 30453316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 117 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 30458613 - 30458394
Alignment:
Q  117 taaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggatacctt 216  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||| ||||| || ||||| ||  |    
T  30458613 taaactctaaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgtgactgcaaaagaagtgtgggacactct 30458514  T
Q  217 gaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccatt 316  Q
     ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| | ||||    
T  30458513 aaaaattcatcatgaaggaactagccatgtaaaagaaacaagaatagacattggcgtaagaaaatttgaaatcttcgaaatgaacgaagatgagaacatt 30458414  T
Q  317 gatgagatgtatgccagatt 336  Q
    ||||| |||||  |||||||    
T  30458413 gatgaaatgtactccagatt 30458394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 21083233 - 21083013
Alignment:
Q  116 ttaaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggatacct 215  Q
    ||||| |||||||||  ||| |||||| |||||||  ||| || |||||||  ||| ||||| || |||| ||  | |||||||||| |||||||  |||    
T  21083233 ttaaactctaaagctcaactttttctaacatgtgctttaagcagggaagaatatgatagagtagaagaatgtacaactgctaaagagatatgggaagcct 21083134  T
Q  216 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 315  Q
    | ||||| |||||||| || |||  ||||||||| |||   ||||| ||||| ||||| |  |||||||||  ||| || ||||  |||| |||||||||    
T  21083133 taaaaattcatcatgaaggaacaagtcatgtcaaggaagaaagaatagacatgggagttaagaaatttgaaaccttcgagatgaaagaaagtgaaaccat 21083034  T
Q  316 tgatgagatgtatgccagatt 336  Q
    ||||||||||| ||| |||||    
T  21083033 tgatgagatgtttgcaagatt 21083013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 99
Target Start/End: Original strand, 19781874 - 19781947
Alignment:
Q  26 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatga 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  || || || ||||||||||| ||||||||    
T  19781874 atcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagttgtaaaggaaaatagtgcatggtccacagatga 19781947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 116 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 24299530 - 24299318
Alignment:
Q  116 ttaaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggatacct 215  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||  |  || |||||  | |||||||| |    
T  24299530 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgtactacggcaaaagaaatttgggatacgt 24299431  T
Q  216 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 315  Q
    | ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| || || || ||||| ||  ||||||| ||| | || |||||||||||| | ||||  ||    
T  24299430 taaaaattcatcatgaaggaactagccatgttaaagaaacaaggatagatattggcgtacgaaaattcgaaattttcgaaatgagtgaagaagaaaatat 24299331  T
Q  316 tgatgagatgtat 328  Q
    |||||| ||||||    
T  24299330 tgatgaaatgtat 24299318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 15329512 - 15329389
Alignment:
Q  206 tgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaa 305  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||||   ||| || |||||||| ||||||||||| || ||  |||||| |||| | || |||||||  ||||    
T  15329512 tgggattccttaaaaatacatcatgaaggtaccagtcacgtaaaagaaacaagaattgacatcggtgtacgaaaatatgaactattcgaaatgaaggaaa 15329413  T
Q  306 atgaaaccattgatgagatgtatg 329  Q
      |||||||||||||| |||||||    
T  15329412 ccgaaaccattgatgaaatgtatg 15329389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 206 - 329
Target Start/End: Original strand, 18709247 - 18709370
Alignment:
Q  206 tgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaa 305  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||||   ||| || |||||||| ||||||||||| || ||  |||||| |||| | || |||||||  ||||    
T  18709247 tgggattccttaaaaatacatcatgaaggtaccagtcacgtaaaagaaacaagaattgacatcggtgtacgaaaatatgaactattcgaaatgaaggaaa 18709346  T
Q  306 atgaaaccattgatgagatgtatg 329  Q
      |||||||||||||| |||||||    
T  18709347 ccgaaaccattgatgaaatgtatg 18709370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 24290023 - 24289954
Alignment:
Q  116 ttaaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaat 185  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  24290023 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaat 24289954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 22456783 - 22456714
Alignment:
Q  116 ttaaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaat 185  Q
    |||||||| ||||||  ||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  22456783 ttaaattccaaagctcaactctttttacaatgttcattaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaat 22456714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 9)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 24 - 363
Target Start/End: Original strand, 8974155 - 8974494
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  8974155 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 8974254  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  8974255 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 8974354  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8974355 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 8974454  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 363  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8974455 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 8974494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 24 - 363
Target Start/End: Original strand, 6423616 - 6423955
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  6423616 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaaatgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 6423715  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  6423716 taaagctagactctttctatcgtgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaagtatgggatactctgaaaata 6423815  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6423816 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 6423915  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6423916 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 6423955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 24 - 363
Target Start/End: Original strand, 9538444 - 9538783
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 123  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  9538444 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 9538543  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| | |||||||||||  ||||||||    
T  9538544 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaacaagtatgggatactctgaaaata 9538643  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9538644 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 9538743  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 363  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9538744 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 9538783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 24 - 363
Target Start/End: Original strand, 12387297 - 12387635
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||| ||    
T  12387297 tcatcacagatggagactttgttccaaaaaccaaagaaggaactgtcaaagaaaaaagtgcatggtcaacaaatgaaaaagctcaagtattaataaactc 12387396  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||    
T  12387397 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaactgaaagagtttatgaatttaagaatgc-aaagaggtatgggataccttgatagta 12387495  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12387496 catcatgaagttacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattgaagtcataaagttggaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 12387595  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 363  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12387596 tgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaataagatc 12387635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 116 - 327
Target Start/End: Original strand, 48979673 - 48979884
Alignment:
Q  116 ttaaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggatacct 215  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||| ||| |||| ||||||||      
T  48979673 ttaaattctaaagctcgactctttctatcatgtgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgatactgcaaaaaaggtgtgggatactc 48979772  T
Q  216 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 315  Q
    | ||| | |||||||| || |||   ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||| |||    
T  48979773 tcaaagtccatcatgaaggaacaagccatgttaaagaaacaagaattgacattggtgtgagaaagtttgaaatctttgaaatgattgaagatgaaaacat 48979872  T
Q  316 tgatgagatgta 327  Q
    |||||| |||||    
T  48979873 tgatgaaatgta 48979884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 125 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 28367002 - 28366791
Alignment:
Q  125 aaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaatac 224  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |   | ||| ||||| || ||||| ||  | ||||| |    
T  28367002 aaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgtcactgcaaaagaagtttgggacactctaaaaattc 28366903  T
Q  225 atcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagat 324  Q
    |||||||||| ||    || || |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| | ||||||||| ||    
T  28366902 atcatgagggaactagccacgtaaaagaaacaagaatagatattggcgtaagaaaatttgaaatcttcgaaatgaacgaagatgagaacattgatgaaat 28366803  T
Q  325 gtatgccagatt 336  Q
    |||  |||||||    
T  28366802 gtactccagatt 28366791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 4384529 - 4384341
Alignment:
Q  116 ttaaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggatacct 215  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||||||   | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||| ||| |||| || ||||| |    
T  4384529 ttaaattctaaagctcgagtctatctatcatgcagattaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgatactgcaaaaaaggtttgagatactt 4384430  T
Q  216 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaa 304  Q
    | |||||  ||||||| || |||   || || |||||||| ||||| || || || || |||||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  4384429 taaaaatcaatcatgaaggaacaaggcacgtaaaagaaacaagaatagatatcggtgtaagaaaatttgaaatcttcgaaatgaatgaa 4384341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 28374823 - 28374773
Alignment:
Q  125 aaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaaga 175  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  28374823 aaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaaga 28374773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 28382645 - 28382595
Alignment:
Q  125 aaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaaga 175  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  28382645 aaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaaga 28382595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 24 - 363
Target Start/End: Original strand, 148017 - 148356
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||    
T  148017 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtaaaggaaaagagtgcatggtcaacaaatgaaaaagctcaggtattactaaactc 148116  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  148117 ttaagctagactctttctatcatgtgcacttaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtaagaatgctaaagaggtatgtgataccttaaaaata 148216  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  148217 catcatgagggtacttctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaactattgatgaga 148316  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 363  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  148317 tgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 148356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 6)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 24 - 363
Target Start/End: Original strand, 18652527 - 18652866
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 123  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  18652527 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaacaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 18652626  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||  |||||||||||  ||||||||    
T  18652627 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaaggagtatgggatactctgaaaata 18652726  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18652727 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 18652826  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 363  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18652827 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 18652866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 32 - 363
Target Start/End: Original strand, 45015670 - 45016001
Alignment:
Q  32 gatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagcta 131  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||    
T  45015670 gatgaagattttgttccaacaaccaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactatactctaaagcta 45015769  T
Q  132 gactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaatacatcatga 231  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45015770 gagtctttttatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtacaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaatacatcatga 45015869  T
Q  232 gggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgcc 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  45015870 gggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgct 45015969  T
Q  332 agatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45015970 agatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 45016001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 26 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 27169016 - 27168679
Alignment:
Q  26 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattcta 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  27169016 atcacagatggagactttgttccactaaccaaagaagggatcatcaaagttaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgctaaactcta 27168917  T
Q  126 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaataca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27168916 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgcaaaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaagtaca 27168817  T
Q  226 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 325  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27168816 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagagaccagaattgacattggagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 27168717  T
Q  326 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27168716 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 27168679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 24 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 9512796 - 9512457
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 123  Q
    |||||||  |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  9512796 tcatcacaaatggagactttgttccaacaaacaaagaaggagctgtcaaagcaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattactaaactc 9512697  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||  |||||||||||  ||||||||    
T  9512696 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgagtgtacaaatgctaaaggagtatgggatactctgaaaata 9512597  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9512596 catcatgagggtacatctcatgtcagagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 9512497  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 363  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9512496 tgtatgcaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 9512457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 70 - 363
Target Start/End: Original strand, 22903494 - 22903787
Alignment:
Q  70 caaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagt 169  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22903494 caaagaaaagagtgcatggtcaacagatgaaaaaactcaggtattgttaaactctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagt 22903593  T
Q  170 gaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattg 269  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||  |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22903594 gaaagagttgatgaatgtattaatgctaaagatgtatgggatattttgatattacatcatgatggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattg 22903693  T
Q  270 gagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 363  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22903694 gagttagaaagtttcaagtctttgaaatgagtgagaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatttattacaatagtaaatgaaatgagatc 22903787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 116 - 327
Target Start/End: Original strand, 1791955 - 1792166
Alignment:
Q  116 ttaaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggatacct 215  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||| ||| |||| ||||||||      
T  1791955 ttaaattctaaagctcgactctttctatcatgtgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgatactgcaaaaaaggtgtgggatactc 1792054  T
Q  216 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 315  Q
    | ||| | |||||||| || |||   ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||| |||    
T  1792055 tcaaagtccatcatgaaggaacaagccatgttaaagaaacaagaattgacattggtgtgagaaagtttgaaatctttgaaatgattgaagatgaaaacat 1792154  T
Q  316 tgatgagatgta 327  Q
    |||||| |||||    
T  1792155 tgatgaaatgta 1792166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 2)
Name: scaffold0313
Description:

Target: scaffold0313; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 26 - 363
Target Start/End: Original strand, 7080 - 7417
Alignment:
Q  26 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattcta 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  7080 atcacagatggagactttgttccactaaccaaagaagggatcatcaaagttaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgctaaactcta 7179  T
Q  126 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaataca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7180 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgcaaaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaagtaca 7279  T
Q  226 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 325  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7280 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaaccagaattgacattggagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 7379  T
Q  326 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7380 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 7417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0313; HSP #2
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 26 - 363
Target Start/End: Original strand, 10862 - 11199
Alignment:
Q  26 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattcta 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  10862 atcacagatggagactttgttccactaaccaaagaagggatcatcaaagttaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgctaaactcta 10961  T
Q  126 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaataca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10962 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgcaaaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaagtaca 11061  T
Q  226 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 325  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11062 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaaccagaattgacattggagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 11161  T
Q  326 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11162 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 11199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 26 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 6598 - 6261
Alignment:
Q  26 atcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattcta 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||      ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  6598 atcacagatggagactttgttccactaaccaaagaagggatcatcaaagttaagagtgcatggtcaacagatgaaaaggctcaggtattgctaaactcta 6499  T
Q  126 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaataca 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6498 aagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgcaaaaatgctaaagaggtatgggataccttgaaagtaca 6399  T
Q  226 tcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 325  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6398 tcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaaccagaattgacattggagtcagaaagtttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatg 6299  T
Q  326 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6298 tatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 6261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 24 - 363
Target Start/End: Original strand, 20084 - 20423
Alignment:
Q  24 tcatcactgatggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattc 123  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||    
T  20084 tcatcacagatggagactttgttccaacaaccaaagaaggagctgtaaaagaaaaaagtgcatggtcaacagatgaaaaatctcaggtattactaaactc 20183  T
Q  124 taaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaata 223  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||  | ||| ||||| ||||| |||||||| ||  ||| | ||    
T  20184 caaagctagactctttctatcatgtgcactgactagggaagaaagtgaaagagttgatgtgtgtaaaaatgccaaagatgtatgggacactctgagagta 20283  T
Q  224 catcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 323  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20284 catcataaaggtacatctcatgtcaaaggaactagaattgacattggagtcagaaagtttgaactctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgaga 20383  T
Q  324 tgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 363  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20384 tgtatgctagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 20423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 33 - 360
Target Start/End: Original strand, 16545 - 16872
Alignment:
Q  33 atggagactttgttccaataaccaaagaaggagctgccaaagataagagtgcatggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctag 132  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||| |   |||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  16545 atggagactttgttccaaagactaaagaaggaaccatcaaacaaaagagtgcatggtcaatagatgacaaagctcatgtattgttaaactctaaacctag 16644  T
Q  133 actctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaatacatcatgag 232  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |  || | | |||  |||||     
T  16645 actctttttatcatgtgcactaaccatggaagaaaatgaaagagttgataaatgcaagaatgctaaagaggtatgggaaattttaagagtacgccatgaa 16744  T
Q  233 ggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgcca 332  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||   |    
T  16745 ggtacctctcatgtcaaggaaaccagaattaacataggagtcagaaagtgtgaagtctttgaaatgagtgagaatgaaactattgatgaaatgtatttta 16844  T
Q  333 gatttactacaatagtaaatgaaatgag 360  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16845 gatttactacaatagtaaatgagatgag 16872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 191 - 363
Target Start/End: Original strand, 1 - 173
Alignment:
Q  191 aatgctaaagaggtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtct 290  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  1 aatgctaaagaggtatgggatactttgaaagtacatcatgaaggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagttagaaagtttgaagtct 100  T
Q  291 ttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  101 ttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgaaagatttactacaatagtaaatgaaatgagatc 173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 84 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 189498 - 189221
Alignment:
Q  84 catggtcaacagatgaaaaagctcaggtattgttaaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatga 183  Q
    ||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||  | ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  189498 catggacaactgatgaaaaagataaggtattgttaaattctaaagttagcttatttttatcatgtgcactaaccttggaagaaattgaaagggttgatga 189399  T
Q  184 atttaagaatgctaaagaggtatgggataccttgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaattt 283  Q
    || ||  ||||| ||||| || ||||| || || ||| |||||||||| || || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||    
T  189398 atgtacaaatgccaaagaagtgtgggacactttaaaagtacatcatgaaggaacctctcatgtcgaagaaacaagaattgacattggagtcag-aaagtt 189300  T
Q  284 gaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgtatgccagatttactacaatagtaaatgaaatgagat 362  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||  ||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  189299 gaaatctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgataaaatatatgatagattcacaacaatagtgaatgaaatgagat 189221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 117 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 103224 - 103005
Alignment:
Q  117 taaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggatacctt 216  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||| ||||| || ||||| ||  |    
T  103224 taaactctaaagctcgactctttctatcatgcgcactaagcatggaagaaagtgaaagagttgatgaatgtgtgactgcaaaagaagtgtgggacactct 103125  T
Q  217 gaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccatt 316  Q
     ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||  ||| |||| | ||||    
T  103124 aaaaattcatcatgaaggaactagccatgtaaaagaaacaagaatagacattggcgtaagaaaatttgaaatctttgaaatgaacgaagatgagaacatt 103025  T
Q  317 gatgagatgtatgccagatt 336  Q
    ||||| |||||  |||||||    
T  103024 gatgaaatgtactccagatt 103005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 328
Target Start/End: Original strand, 257898 - 258110
Alignment:
Q  116 ttaaattctaaagctagactctttctatcatgtgcactaaccatggaagaaagtgaaagagttgatgaatttaagaatgctaaagaggtatgggatacct 215  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||  |  || |||||  |||||||||| |    
T  257898 ttaaactctaaagctcaactctttttacaatgttcactaaccatggaagaaagtgaaagaatttatgaatgtactacggcaaaagaaatatgggatacgt 257997  T
Q  216 tgaaaatacatcatgagggtacatctcatgtcaaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccat 315  Q
    | ||||| |||||||| || ||    ||||| |||||||| || || || ||||| ||  ||||||| ||| | || |||||||||||| | ||||  ||    
T  257998 taaaaattcatcatgaaggaactagccatgttaaagaaacaaggatagatattggcgtacgaaaattcgaaattttcgaaatgagtgaagaagaaaatat 258097  T
Q  316 tgatgagatgtat 328  Q
    |||||| ||||||    
T  258098 tgatgaaatgtat 258110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 248 - 327
Target Start/End: Original strand, 5117 - 5196
Alignment:
Q  248 aaagaaactagaattgacattggagtcagaaaatttgaagtctttgaaatgagtgaaaatgaaaccattgatgagatgta 327  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||| | ||||||||||  ||||  |||||||| ||||| |||||    
T  5117 aaagaaacaagaattgacattggtgttcgaaaatttgaactatttgaaatgaaagaaaccgaaaccatagatgaaatgta 5196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 3150 times since January 2019
Visitors: 4805