View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0759_low_65 (Length: 300)

Name: NF0759_low_65
Description: NF0759
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0759_low_65
NF0759_low_65
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (1-219)||(15388184-15388402)
chr4 (1-219)||(14760112-14760330)
chr4 (1-219)||(14668261-14668479)
chr4 (1-219)||(5009120-5009338)
chr4 (1-219)||(6573103-6573321)
chr4 (1-219)||(17016291-17016509)
chr4 (1-219)||(34185766-34185984)
chr4 (1-219)||(18313984-18314202)
chr4 (1-219)||(24589167-24589385)
chr4 (1-219)||(54836636-54836854)
chr4 (1-219)||(14101788-14102006)
chr4 (1-215)||(20335227-20335441)
chr4 (1-219)||(24115907-24116125)
chr4 (1-208)||(39853893-39854100)
chr4 (9-219)||(15231117-15231327)
chr4 (1-219)||(27160123-27160341)
chr4 (1-219)||(36341323-36341541)
chr4 (1-218)||(1903500-1903717)
chr4 (1-208)||(18797420-18797627)
chr4 (1-219)||(33670606-33670824)
chr4 (1-217)||(15281743-15281959)
chr4 (1-219)||(21972946-21973164)
chr4 (1-219)||(30757005-30757223)
chr4 (1-219)||(31123318-31123536)
chr4 (1-219)||(40102443-40102661)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (1-219)||(27394793-27395011)
chr2 (1-219)||(23125363-23125581)
chr2 (1-219)||(12658767-12658985)
chr2 (1-219)||(34294385-34294603)
chr2 (1-219)||(37948657-37948875)
chr2 (2-219)||(28885438-28885655)
chr2 (1-217)||(27431236-27431452)
chr2 (1-208)||(27806945-27807152)
chr2 (1-219)||(20841144-20841362)
chr2 (1-219)||(39048614-39048832)
chr2 (1-208)||(13933342-13933549)
chr2 (1-219)||(11631979-11632197)
chr2 (1-208)||(257448-257655)
chr2 (1-208)||(12590050-12590257)
chr2 (1-219)||(39893300-39893518)
chr2 (1-219)||(40236739-40236957)
chr2 (1-217)||(19453218-19453434)
chr2 (1-219)||(16826133-16826351)
chr2 (1-219)||(16895129-16895347)
chr2 (1-219)||(19413296-19413514)
chr2 (1-219)||(31879517-31879735)
chr2 (1-219)||(32053034-32053252)
chr2 (1-219)||(34864915-34865133)
chr2 (1-219)||(37380908-37381126)
chr2 (1-219)||(37682690-37682908)
chr2 (1-219)||(37697955-37698173)
chr2 (1-219)||(37928600-37928818)
chr2 (1-208)||(9346781-9346988)
chr2 (1-208)||(21673970-21674177)
chr2 (1-219)||(12713396-12713614)
chr2 (1-198)||(21699966-21700163)
chr2 (1-109)||(31890286-31890394)
chr2 (1-109)||(3785834-3785942)
chr2 (1-109)||(16164821-16164929)
chr2 (9-109)||(22924951-22925051)
chr2 (1-109)||(27119865-27119973)
chr2 (1-109)||(27779575-27779683)
chr2 (1-109)||(27819332-27819440)
chr2 (6-109)||(34158185-34158288)
chr2 (116-178)||(12383932-12383994)
chr2 (116-178)||(22949665-22949727)
chr2 (1-45)||(27827865-27827909)
[»] chr8 (21 HSPs)
chr8 (1-219)||(22077678-22077896)
chr8 (1-219)||(27605672-27605890)
chr8 (1-219)||(14560855-14561073)
chr8 (1-219)||(18793935-18794153)
chr8 (1-219)||(2134027-2134245)
chr8 (1-219)||(19691329-19691547)
chr8 (1-208)||(19205129-19205336)
chr8 (1-219)||(9357856-9358074)
chr8 (1-219)||(29832557-29832775)
chr8 (25-208)||(28358743-28358926)
chr8 (1-219)||(19677678-19677896)
chr8 (1-219)||(33261965-33262183)
chr8 (1-219)||(18712715-18712933)
chr8 (1-219)||(12089490-12089708)
chr8 (1-219)||(31357759-31357977)
chr8 (1-219)||(31486638-31486856)
chr8 (1-109)||(15770915-15771023)
chr8 (1-109)||(44564325-44564433)
chr8 (6-93)||(21344943-21345030)
chr8 (158-219)||(16286632-16286694)
chr8 (117-208)||(19844409-19844500)
[»] chr6 (47 HSPs)
chr6 (1-219)||(27287113-27287331)
chr6 (1-219)||(27022365-27022583)
chr6 (1-219)||(29552786-29553004)
chr6 (1-219)||(13295700-13295918)
chr6 (1-219)||(15421069-15421287)
chr6 (1-219)||(22931633-22931851)
chr6 (1-219)||(23854078-23854296)
chr6 (1-219)||(24866945-24867163)
chr6 (1-215)||(27626460-27626674)
chr6 (1-219)||(16677369-16677587)
chr6 (1-219)||(27179685-27179903)
chr6 (1-219)||(27269336-27269554)
chr6 (1-219)||(3699312-3699530)
chr6 (1-219)||(4760992-4761210)
chr6 (1-215)||(17089192-17089406)
chr6 (1-219)||(27010960-27011178)
chr6 (1-219)||(34461255-34461473)
chr6 (6-219)||(26921606-26921819)
chr6 (6-219)||(16753050-16753263)
chr6 (1-219)||(27060735-27060953)
chr6 (1-219)||(4528514-4528732)
chr6 (1-219)||(4542523-4542741)
chr6 (1-219)||(4720884-4721102)
chr6 (1-219)||(27488362-27488580)
chr6 (1-219)||(29504645-29504863)
chr6 (1-219)||(29576243-29576461)
chr6 (1-219)||(30554765-30554983)
chr6 (1-198)||(20171797-20171994)
chr6 (1-198)||(22163997-22164194)
chr6 (9-219)||(16940784-16940994)
chr6 (1-219)||(26113161-26113379)
chr6 (1-219)||(28210683-28210901)
chr6 (1-219)||(4776109-4776327)
chr6 (1-109)||(22455863-22455971)
chr6 (1-147)||(26992096-26992242)
chr6 (1-109)||(14142143-14142251)
chr6 (1-109)||(26775376-26775484)
chr6 (1-109)||(26789155-26789263)
chr6 (1-109)||(27197524-27197632)
chr6 (1-109)||(27251603-27251711)
chr6 (1-109)||(27358859-27358967)
chr6 (1-109)||(27449202-27449310)
chr6 (1-103)||(8902452-8902554)
chr6 (1-120)||(33373180-33373299)
chr6 (9-103)||(28163836-28163930)
chr6 (1-109)||(13520941-13521048)
chr6 (116-178)||(9136217-9136279)
[»] chr3 (61 HSPs)
chr3 (1-219)||(5593206-5593424)
chr3 (1-219)||(18054455-18054673)
chr3 (1-219)||(18273901-18274119)
chr3 (1-219)||(18289202-18289420)
chr3 (1-219)||(18304503-18304721)
chr3 (1-218)||(4793484-4793701)
chr3 (1-217)||(8286319-8286535)
chr3 (1-219)||(6205096-6205314)
chr3 (1-219)||(8299164-8299382)
chr3 (1-219)||(18333823-18334041)
chr3 (1-219)||(21677896-21678114)
chr3 (1-219)||(4686848-4687066)
chr3 (1-219)||(4724824-4725042)
chr3 (1-219)||(15737943-15738161)
chr3 (1-219)||(15889554-15889772)
chr3 (1-219)||(22384427-22384645)
chr3 (1-219)||(29145605-29145823)
chr3 (1-219)||(29661819-29662037)
chr3 (1-219)||(35883959-35884177)
chr3 (1-208)||(32442355-32442562)
chr3 (1-219)||(8214928-8215146)
chr3 (1-219)||(20069233-20069451)
chr3 (1-208)||(20573692-20573899)
chr3 (1-219)||(7076399-7076617)
chr3 (1-219)||(28024475-28024693)
chr3 (1-219)||(28112803-28113021)
chr3 (1-219)||(47026646-47026864)
chr3 (1-219)||(48469120-48469338)
chr3 (1-219)||(5606163-5606381)
chr3 (1-219)||(10399337-10399555)
chr3 (1-219)||(28342370-28342588)
chr3 (26-219)||(11107226-11107419)
chr3 (1-208)||(18245945-18246152)
chr3 (1-219)||(4343525-4343743)
chr3 (1-219)||(4420108-4420326)
chr3 (1-219)||(5016907-5017125)
chr3 (1-219)||(5470181-5470399)
chr3 (1-219)||(6539591-6539809)
chr3 (1-219)||(7999753-7999971)
chr3 (1-219)||(10646266-10646484)
chr3 (1-219)||(17981798-17982016)
chr3 (1-219)||(18228389-18228607)
chr3 (1-219)||(22867697-22867915)
chr3 (1-219)||(22882756-22882974)
chr3 (1-217)||(16621339-16621555)
chr3 (1-219)||(24331356-24331574)
chr3 (1-219)||(31961304-31961522)
chr3 (1-219)||(51785216-51785434)
chr3 (1-215)||(19697687-19697901)
chr3 (1-109)||(17992780-17992888)
chr3 (1-109)||(4627088-4627196)
chr3 (1-109)||(32293931-32294039)
chr3 (1-109)||(5714376-5714484)
chr3 (1-109)||(5725286-5725394)
chr3 (1-109)||(5766974-5767082)
chr3 (1-109)||(31033085-31033193)
chr3 (116-180)||(15592875-15592939)
chr3 (116-180)||(15918749-15918813)
chr3 (116-178)||(5950766-5950828)
chr3 (122-180)||(20443349-20443407)
chr3 (122-180)||(41440475-41440533)
[»] chr7 (38 HSPs)
chr7 (1-219)||(10913560-10913778)
chr7 (1-208)||(26516032-26516239)
chr7 (1-219)||(2157803-2158021)
chr7 (1-219)||(26534564-26534782)
chr7 (9-219)||(2106862-2107072)
chr7 (9-219)||(11421478-11421688)
chr7 (1-219)||(26271777-26271995)
chr7 (1-219)||(26438486-26438704)
chr7 (1-219)||(45390449-45390667)
chr7 (1-217)||(16515121-16515337)
chr7 (1-219)||(5131225-5131443)
chr7 (1-219)||(5144031-5144249)
chr7 (1-219)||(22145424-22145642)
chr7 (1-219)||(26316539-26316757)
chr7 (1-217)||(10844851-10845067)
chr7 (9-217)||(16044550-16044758)
chr7 (1-217)||(10842685-10842901)
chr7 (1-208)||(31561081-31561288)
chr7 (1-219)||(3448535-3448753)
chr7 (1-219)||(4141937-4142155)
chr7 (1-219)||(4202618-4202836)
chr7 (1-219)||(11444116-11444334)
chr7 (1-219)||(24589225-24589443)
chr7 (1-208)||(16748208-16748415)
chr7 (1-219)||(26666605-26666823)
chr7 (1-198)||(16446697-16446894)
chr7 (72-219)||(9621879-9622026)
chr7 (1-109)||(2776593-2776701)
chr7 (1-109)||(26512387-26512495)
chr7 (1-109)||(26681797-26681905)
chr7 (1-109)||(31127246-31127354)
chr7 (1-109)||(39209830-39209938)
chr7 (9-103)||(45734658-45734752)
chr7 (1-109)||(31087313-31087421)
chr7 (116-178)||(9469590-9469652)
chr7 (116-178)||(16393240-16393302)
chr7 (116-178)||(30369752-30369814)
chr7 (132-180)||(16287201-16287249)
[»] chr5 (58 HSPs)
chr5 (1-219)||(15655461-15655679)
chr5 (1-219)||(41677944-41678162)
chr5 (1-219)||(11552594-11552812)
chr5 (1-219)||(33295767-33295985)
chr5 (1-219)||(33780728-33780946)
chr5 (1-219)||(22995820-22996038)
chr5 (1-219)||(23629209-23629427)
chr5 (1-219)||(24684848-24685066)
chr5 (1-219)||(24973145-24973363)
chr5 (1-208)||(40470253-40470460)
chr5 (1-219)||(18372237-18372455)
chr5 (1-219)||(31434703-31434921)
chr5 (1-219)||(37355346-37355564)
chr5 (1-217)||(23895447-23895663)
chr5 (1-219)||(3792780-3792998)
chr5 (1-219)||(9320715-9320933)
chr5 (1-219)||(12135414-12135632)
chr5 (1-219)||(26483633-26483851)
chr5 (1-219)||(34619757-34619975)
chr5 (1-219)||(43081494-43081712)
chr5 (1-219)||(13321533-13321751)
chr5 (1-219)||(18497428-18497646)
chr5 (1-219)||(28652481-28652699)
chr5 (1-219)||(30937874-30938092)
chr5 (1-219)||(32592977-32593195)
chr5 (1-219)||(37767694-37767912)
chr5 (1-219)||(5641027-5641245)
chr5 (1-219)||(6877544-6877762)
chr5 (1-219)||(8662178-8662396)
chr5 (1-219)||(24586613-24586831)
chr5 (1-219)||(28956488-28956706)
chr5 (1-219)||(30032667-30032885)
chr5 (1-219)||(30155270-30155488)
chr5 (1-219)||(30171708-30171926)
chr5 (1-219)||(31823110-31823328)
chr5 (1-219)||(33519619-33519837)
chr5 (1-219)||(37668189-37668407)
chr5 (1-219)||(37758222-37758440)
chr5 (1-214)||(22891707-22891920)
chr5 (1-217)||(25203519-25203735)
chr5 (1-217)||(25267674-25267890)
chr5 (1-208)||(15755555-15755762)
chr5 (1-219)||(2514301-2514519)
chr5 (1-219)||(24727208-24727426)
chr5 (1-120)||(13183496-13183615)
chr5 (1-112)||(13439386-13439497)
chr5 (1-109)||(18125119-18125227)
chr5 (1-109)||(9547412-9547520)
chr5 (1-109)||(11326986-11327094)
chr5 (1-109)||(29887900-29888008)
chr5 (1-109)||(33878480-33878587)
chr5 (116-178)||(5440043-5440105)
chr5 (116-178)||(11944240-11944302)
chr5 (116-178)||(15784543-15784605)
chr5 (116-178)||(17957376-17957438)
chr5 (116-178)||(36375780-36375842)
chr5 (116-178)||(37000434-37000496)
chr5 (132-180)||(34468900-34468948)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (1-217)||(3301-3517)
scaffold0089 (81-219)||(43877-44015)
scaffold0089 (146-217)||(32096-32167)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (1-219)||(9268-9486)
[»] scaffold0143 (3 HSPs)
scaffold0143 (1-219)||(30525-30743)
scaffold0143 (1-217)||(19304-19520)
scaffold0143 (1-109)||(7302-7410)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (1-208)||(21894555-21894762)
chr1 (1-219)||(51641452-51641670)
chr1 (1-214)||(20339107-20339320)
chr1 (1-208)||(10965910-10966117)
chr1 (1-219)||(3644366-3644587)
chr1 (1-219)||(28588219-28588437)
chr1 (1-208)||(41790116-41790323)
chr1 (1-219)||(10948311-10948529)
chr1 (9-217)||(20464212-20464420)
chr1 (1-216)||(16204840-16205055)
chr1 (1-109)||(28153080-28153188)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (1-219)||(15813-16031)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (1-214)||(1430-1643)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (1-219)||(12803-13021)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (1-219)||(22997-23215)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (1-219)||(9254-9472)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (1-219)||(11734-11952)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (1-219)||(5985-6203)
scaffold0159 (147-219)||(23111-23183)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-219)||(11181-11399)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (1-217)||(9279-9495)
[»] scaffold0748 (1 HSPs)
scaffold0748 (8-217)||(5484-5693)
[»] scaffold1888 (1 HSPs)
scaffold1888 (111-219)||(1155-1263)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (6-209)||(43541-43754)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (116-180)||(35161-35225)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (144-205)||(33706-33770)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (91-178)||(29443-29530)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 15388184 - 15388402
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15388184 tcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacacaat 15388283  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15388284 aggttgattctttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 15388383  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15388384 acttgcttttcggtctgtg 15388402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 14760112 - 14760330
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  14760112 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 14760211  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  14760212 aggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctg 14760311  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  14760312 acttgcttctcggtctgtg 14760330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 14668479 - 14668261
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  14668479 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 14668380  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  14668379 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaatctctg 14668280  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  14668279 acttgcttctcggtctgtg 14668261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 5009338 - 5009120
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  5009338 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 5009239  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  5009238 aggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctg 5009139  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  5009138 acttgcttctctgtctgtg 5009120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6573321 - 6573103
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  6573321 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 6573222  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6573221 aggctgattctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 6573122  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  6573121 acttgcttctctgtctgtg 6573103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 17016509 - 17016291
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  17016509 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 17016410  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  17016409 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctg 17016310  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  17016309 acttgcttctcggtctgtg 17016291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 34185766 - 34185984
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| || ||||||| |||||| |||||    
T  34185766 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaat 34185865  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34185866 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggtccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 34185965  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  34185966 acttgcttctcggtctgtg 34185984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 18313984 - 18314202
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  18313984 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaat 18314083  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| || || ||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18314084 aggctgattcttgctcagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 18314183  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  18314184 acttgcttctctgtctgtg 18314202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 24589167 - 24589385
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| | ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| || ||||||| |||||| |||||    
T  24589167 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaat 24589266  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24589267 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 24589366  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  24589367 acttgcttctcagtctgtg 24589385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 54836854 - 54836636
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  54836854 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 54836755  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  54836754 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcagacgtccgaggaaacctctg 54836655  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  54836654 acttgcttctcggtctgtg 54836636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 14102006 - 14101788
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||     
T  14102006 tcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattccatacaac 14101907  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  14101906 aggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctg 14101807  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  14101806 acttgcttctctgtctgtg 14101788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 20335227 - 20335441
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| ||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  20335227 tcaaaggccttccttctacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 20335326  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  20335327 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctg 20335426  T
Q  201 acttgcttttcggtc 215  Q
    |||||||| ||||||    
T  20335427 acttgcttctcggtc 20335441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24116125 - 24115907
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| || |     
T  24116125 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacgac 24116026  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  24116025 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctg 24115926  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  24115925 acttgcttctcggtctgtg 24115907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 39854100 - 39853893
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  39854100 tcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 39854001  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| || |  ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39854000 aggctggttctttctaagcagcttgaagataggcccgcaggttgtggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 39853901  T
Q  201 acttgctt 208  Q
    ||||||||    
T  39853900 acttgctt 39853893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15231327 - 15231117
Alignment:
Q  9 cttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaataggttgat 108  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||| | ||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  15231327 cttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggctgat 15231228  T
Q  109 tgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgctt 208  Q
    | || |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  15231227 tcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttgttt 15231128  T
Q  209 ttcggtctgtg 219  Q
     ||||||||||    
T  15231127 ctcggtctgtg 15231117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 27160123 - 27160341
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  27160123 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 27160222  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| || |  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27160223 aggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 27160322  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  27160323 acttgcttctctgtctgtg 27160341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 36341323 - 36341541
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||| ||||| |||||| || ||    
T  36341323 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggctttcatcattccatacgat 36341422  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  36341423 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctg 36341522  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    ||||| || || |||||||    
T  36341523 acttgtttctctgtctgtg 36341541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 1903717 - 1903500
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||| | |||||||||   ||||| |||||    
T  1903717 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcaacgttccatacaat 1903618  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| || |||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1903617 aggctgattcttcctgagtaacttgaagatcggcccgcaggctgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 1903518  T
Q  201 acttgcttttcggtctgt 218  Q
    ||||| || |||||||||    
T  1903517 acttgtttctcggtctgt 1903500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 18797420 - 18797627
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| || |  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  18797420 tcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtacttcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 18797519  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| || |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18797520 aggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 18797619  T
Q  201 acttgctt 208  Q
    ||||||||    
T  18797620 acttgctt 18797627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 33670606 - 33670824
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  33670606 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 33670705  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  33670706 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgcgatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctg 33670805  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  33670806 acttgcttctctgtctgtg 33670824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 15281743 - 15281959
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||   ||| |||||||||| ||| | ||||||||||  ||||| |||||    
T  15281743 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaaatcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaat 15281842  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  15281843 aggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctg 15281942  T
Q  201 acttgcttttcggtctg 217  Q
    ||||| || ||||||||    
T  15281943 acttgtttctcggtctg 15281959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21973164 - 21972946
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  21973164 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 21973065  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  21973064 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 21972965  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  21972964 acttgcttctctgtctgtg 21972946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 30757223 - 30757005
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  30757223 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 30757124  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |    
T  30757123 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaacctctg 30757024  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  30757023 acttgcttctctgtctgtg 30757005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 31123318 - 31123536
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  31123318 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 31123417  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  31123418 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 31123517  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  31123518 acttgcttctctgtctgtg 31123536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 40102443 - 40102661
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  40102443 tcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 40102542  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || || || ||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  40102543 aggctggttcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 40102642  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  40102643 acttgcttctctgtctgtg 40102661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27395011 - 27394793
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27395011 tcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacacaat 27394912  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27394911 aggttgattctttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 27394812  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27394811 acttgcttttcggtctgtg 27394793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 23125363 - 23125581
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  23125363 tcaaaggccttccttccacgggtggcacaaggataggtggttccagcaggtaatttttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 23125462  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23125463 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 23125562  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  23125563 acttgcttctcggtctgtg 23125581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12658985 - 12658767
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  12658985 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 12658886  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |    
T  12658885 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaacctctg 12658786  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||| ||||    
T  12658785 acttgcttctcggtttgtg 12658767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 34294603 - 34294385
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| |||||    
T  34294603 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaat 34294504  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  34294503 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctg 34294404  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  34294403 acttgcttctcggtctgtg 34294385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 37948657 - 37948875
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  37948657 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 37948756  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  37948757 aggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctg 37948856  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  37948857 acttgcttctcggtctgtg 37948875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 28885655 - 28885438
Alignment:
Q  2 caagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaata 101  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||| ||||| ||||| || ||||||| |||||| ||||||    
T  28885655 caagggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctgtcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaata 28885556  T
Q  102 ggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgga 201  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  28885555 ggttgattctttctgagtagcttgaagaccggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctga 28885456  T
Q  202 cttgcttttcggtctgtg 219  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  28885455 cttgcttctcggtctgtg 28885438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 27431236 - 27431452
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  27431236 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 27431335  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| | ||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |    
T  27431336 aggctaattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaacctctg 27431435  T
Q  201 acttgcttttcggtctg 217  Q
    |||||||| ||||||||    
T  27431436 acttgcttctcggtctg 27431452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 27807152 - 27806945
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  27807152 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 27807053  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27807052 aggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 27806953  T
Q  201 acttgctt 208  Q
    ||||||||    
T  27806952 acttgctt 27806945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 20841362 - 20841144
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||  || ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  20841362 tcaaaggccttccttccatgggtgggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 20841263  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  20841262 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctg 20841163  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  20841162 acttgcttctcggtctgtg 20841144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 39048614 - 39048832
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  39048614 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 39048713  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| || || ||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  39048714 aggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctt 39048813  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  39048814 acttgcttctcagtctgtg 39048832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 13933342 - 13933549
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  13933342 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 13933441  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| || || ||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13933442 aggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 13933541  T
Q  201 acttgctt 208  Q
    ||||||||    
T  13933542 acttgctt 13933549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 11631979 - 11632197
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  11631979 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 11632078  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  11632079 aggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctg 11632178  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  11632179 acttgcttctctgtctgtg 11632197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 257448 - 257655
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  257448 tcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 257547  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| || |  ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  257548 aggctggttctttctaagcagcttgaagatcggtccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 257647  T
Q  201 acttgctt 208  Q
    ||||||||    
T  257648 acttgctt 257655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 12590257 - 12590050
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||     
T  12590257 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaac 12590158  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  12590157 aggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctg 12590058  T
Q  201 acttgctt 208  Q
    ||||||||    
T  12590057 acttgctt 12590050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 39893518 - 39893300
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  39893518 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 39893419  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39893418 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 39893319  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  39893318 acttgcttctctgtctgtg 39893300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 40236957 - 40236739
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  40236957 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcgaaagcttcttggcattcattattccatacaat 40236858  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| || |  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  40236857 aggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctg 40236758  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  40236757 acttgcttctctgtctgtg 40236739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 19453218 - 19453434
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||  ||| ||| |||||| ||| | ||||||||||  ||||| |||||    
T  19453218 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgccatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaat 19453317  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  19453318 aggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctg 19453417  T
Q  201 acttgcttttcggtctg 217  Q
    ||||| || ||||||||    
T  19453418 acttgtttctcggtctg 19453434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 16826133 - 16826351
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  16826133 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 16826232  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  16826233 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 16826332  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  16826333 acttgcttctctgtctgtg 16826351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16895347 - 16895129
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  16895347 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 16895248  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  16895247 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 16895148  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  16895147 acttgcttctctgtctgtg 16895129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 19413296 - 19413514
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  19413296 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 19413395  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  19413396 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 19413495  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  19413496 acttgcttctctgtctgtg 19413514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 31879735 - 31879517
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  31879735 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 31879636  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| || |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  31879635 aggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 31879536  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  31879535 acttgcttctctgtctgtg 31879517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 32053252 - 32053034
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  32053252 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 32053153  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  32053152 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 32053053  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  32053052 acttgcttctctgtctgtg 32053034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 34865133 - 34864915
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  34865133 tcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 34865034  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  34865033 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 34864934  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  34864933 acttgcttctctgtctgtg 34864915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 37381126 - 37380908
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  37381126 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 37381027  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||| |    
T  37381026 aggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaagtgtccgaggaaacctctg 37380927  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    ||||| || ||||||||||    
T  37380926 acttgtttctcggtctgtg 37380908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 37682690 - 37682908
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  37682690 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 37682789  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  37682790 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 37682889  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  37682890 acttgcttctctgtctgtg 37682908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 37697955 - 37698173
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  37697955 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 37698054  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  37698055 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 37698154  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  37698155 acttgcttctctgtctgtg 37698173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 37928818 - 37928600
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  37928818 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 37928719  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  37928718 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 37928619  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  37928618 acttgcttctctgtctgtg 37928600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 9346781 - 9346988
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  9346781 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 9346880  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  9346881 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctg 9346980  T
Q  201 acttgctt 208  Q
    ||||||||    
T  9346981 acttgctt 9346988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 21673970 - 21674177
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  21673970 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 21674069  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  21674070 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 21674169  T
Q  201 acttgctt 208  Q
    ||||||||    
T  21674170 acttgctt 21674177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 12713396 - 12713614
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  || ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  12713396 tcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 12713495  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  12713496 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 12713595  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  12713596 acttgcttctctgtctgtg 12713614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 21699966 - 21700163
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||| | ||||||||||  ||||| |||||    
T  21699966 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggattggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaat 21700065  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctc 198  Q
    ||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21700066 aggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctc 21700163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 31890286 - 31890394
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  31890286 tcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattgttccatacaat 31890385  T
Q  101 aggttgatt 109  Q
    ||| |||||    
T  31890386 aggctgatt 31890394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 3785942 - 3785834
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  3785942 tcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcagttaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaat 3785843  T
Q  101 aggttgatt 109  Q
    ||| |||||    
T  3785842 aggctgatt 3785834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 16164929 - 16164821
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  16164929 tcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaat 16164830  T
Q  101 aggttgatt 109  Q
    ||| |||||    
T  16164829 aggctgatt 16164821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 9 - 109
Target Start/End: Original strand, 22924951 - 22925051
Alignment:
Q  9 cttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaataggttgat 108  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  22924951 cttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggttgat 22925050  T
Q  109 t 109  Q
    |    
T  22925051 t 22925051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 27119973 - 27119865
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  27119973 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 27119874  T
Q  101 aggttgatt 109  Q
    ||| |||||    
T  27119873 aggctgatt 27119865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 27779683 - 27779575
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  27779683 tcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaat 27779584  T
Q  101 aggttgatt 109  Q
    ||| |||||    
T  27779583 aggctgatt 27779575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 27819440 - 27819332
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  27819440 tcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaat 27819341  T
Q  101 aggttgatt 109  Q
    ||| |||||    
T  27819340 aggctgatt 27819332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 34158288 - 34158185
Alignment:
Q  6 ggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaataggtt 105  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||| |    
T  34158288 ggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaataggct 34158189  T
Q  106 gatt 109  Q
    ||||    
T  34158188 gatt 34158185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 12383994 - 12383932
Alignment:
Q  116 gagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 178  Q
    ||||| |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12383994 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 12383932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 22949727 - 22949665
Alignment:
Q  116 gagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 178  Q
    ||||| |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22949727 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 22949665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 27827909 - 27827865
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttcca 45  Q
    |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  27827909 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttcca 27827865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 21)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 22077678 - 22077896
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22077678 tcaagggccttccttccactggcgggacaaggataggtggttccagcagataatctttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacacaat 22077777  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22077778 aggttgattctttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatcagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 22077877  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22077878 acttgcttttcggtctgtg 22077896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 27605672 - 27605890
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  27605672 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 27605771  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27605772 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 27605871  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  27605872 acttgcttctcggtctgtg 27605890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 14561073 - 14560855
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| || ||||||| |||||| |||||    
T  14561073 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaat 14560974  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  14560973 aggttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctg 14560874  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  14560873 acttgcttctcggtctgtg 14560855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18794153 - 18793935
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  18794153 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 18794054  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  18794053 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatttaaacgcccgaggaaacctctg 18793954  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  18793953 acttgcttctcggtctgtg 18793935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 2134027 - 2134245
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  || ||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  2134027 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaggcttcttggcattcatcattccatacaat 2134126  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  2134127 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctg 2134226  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  2134227 acttgcttctcggtctgtg 2134245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19691547 - 19691329
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  19691547 tcaaaggccttccttccgcgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 19691448  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |    
T  19691447 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaacctctg 19691348  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||| ||||    
T  19691347 acttgcttctcggtttgtg 19691329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 19205129 - 19205336
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  19205129 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 19205228  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  19205229 aggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctg 19205328  T
Q  201 acttgctt 208  Q
    ||||||||    
T  19205329 acttgctt 19205336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 9358074 - 9357856
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  9358074 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 9357975  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |    
T  9357974 aggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaacctctg 9357875  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  9357874 acttgcttctctgtctgtg 9357856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 29832775 - 29832557
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  29832775 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 29832676  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |    
T  29832675 aggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaggaaacctctg 29832576  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  29832575 acttgcttctctgtctgtg 29832557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 208
Target Start/End: Original strand, 28358743 - 28358926
Alignment:
Q  25 ggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaataggttgattgtttctgagtaattt 124  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||  ||    
T  28358743 ggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctgattctttctgagtagctt 28358842  T
Q  125 gaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgctt 208  Q
    ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  28358843 gaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgctt 28358926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19677896 - 19677678
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  19677896 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 19677797  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  19677796 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgcgatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctg 19677697  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  19677696 acttgcttctctgtctgtg 19677678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 33262183 - 33261965
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  33262183 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 33262084  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  33262083 aggctggttctttctaagtagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 33261984  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  33261983 acttgcttctctgtctgtg 33261965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18712933 - 18712715
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||   ||| |||||||||| ||||| || ||||||| |||||| ||||     
T  18712933 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaac 18712834  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |    
T  18712833 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgtaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaaacctctg 18712734  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    ||||| || ||||||||||    
T  18712733 acttgtttctcggtctgtg 18712715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 12089490 - 12089708
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  12089490 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 12089589  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  12089590 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 12089689  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  12089690 acttgcttctctgtctgtg 12089708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 31357977 - 31357759
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  31357977 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 31357878  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||| | ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  31357877 agggtggttctttttaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 31357778  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  31357777 acttgcttctctgtctgtg 31357759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 31486638 - 31486856
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  31486638 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 31486737  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| || |  ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  31486738 aggctggttttttctaagcagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcagacgcccgaggaaacctctg 31486837  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  31486838 acttgcttctctgtctgtg 31486856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 15771023 - 15770915
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  15771023 tcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaat 15770924  T
Q  101 aggttgatt 109  Q
    ||| |||||    
T  15770923 aggctgatt 15770915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 44564433 - 44564325
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||| | |||||    
T  44564433 tcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttctatacaat 44564334  T
Q  101 aggttgatt 109  Q
    ||| |||||    
T  44564333 aggctgatt 44564325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 6 - 93
Target Start/End: Original strand, 21344943 - 21345030
Alignment:
Q  6 ggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattcc 93  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| || ||||||| |||||    
T  21344943 ggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattcc 21345030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16286694 - 16286632
Alignment:
Q  158 tatgaatcgggagatgtaattcaaacgcc-cgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  16286694 tatgaatcgggagatgtaattcaatcgtctcgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 16286632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 117 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 19844500 - 19844409
Alignment:
Q  117 agtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgctt 208  Q
    ||||| ||||||||||| || || || || |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| |  || || ||||||| |||||||||    
T  19844500 agtaacttgaaaattggtccacatgtggcagtcatatgagatataaatctggagatgtagttcaatctaccaagaaaacctctgacttgctt 19844409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 47)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 27287113 - 27287331
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  27287113 tcaaaggccttccttccacaggtgggacgaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 27287212  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27287213 aggctgattatttctgagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 27287312  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  27287313 acttgcttctcggtctgtg 27287331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27022583 - 27022365
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  27022583 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 27022484  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27022483 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatataaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 27022384  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  27022383 acttgcttctcggtctgtg 27022365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 29553004 - 29552786
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  29553004 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 29552905  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29552904 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 29552805  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  29552804 acttgcttctcagtctgtg 29552786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 13295700 - 13295918
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| | |||||||| |||||| |||||    
T  13295700 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttagcattcatcattccatacaat 13295799  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  13295800 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctg 13295899  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  13295900 acttgcttctcggtctgtg 13295918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 15421069 - 15421287
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  15421069 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 15421168  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  15421169 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctg 15421268  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  15421269 acttgcttctcggtctgtg 15421287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 22931633 - 22931851
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| || ||||||| |||||| |||||    
T  22931633 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtagttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaat 22931732  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22931733 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 22931832  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  22931833 acttgcttctcggtctgtg 22931851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 23854078 - 23854296
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| || ||||||| |||||| |||||    
T  23854078 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtagttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaat 23854177  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23854178 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 23854277  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  23854278 acttgcttctcggtctgtg 23854296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24867163 - 24866945
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||   ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  24867163 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 24867064  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  24867063 aggctgattctttctgagtagcttaaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctg 24866964  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  24866963 acttgcttctcggtctgtg 24866945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 27626460 - 27626674
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  27626460 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccacacaat 27626559  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  27626560 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctg 27626659  T
Q  201 acttgcttttcggtc 215  Q
    |||||||| ||||||    
T  27626660 acttgcttctcggtc 27626674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16677587 - 16677369
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  16677587 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 16677488  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16677487 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcagattgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 16677388  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    ||||| || || |||||||    
T  16677387 acttgtttctctgtctgtg 16677369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27179903 - 27179685
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||| ||||| ||  |||| |||||||||||||||| ||| ||||  ||| ||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||    
T  27179903 tcaaaggccttccgtccacgggtgggacgaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaaacttcttggcattcatcattccatacaat 27179804  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27179803 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 27179704  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  27179703 acttgcttctcggtctgtg 27179685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 27269336 - 27269554
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||| ||||| ||  |||| |||||||||||||||| ||| ||||  ||| ||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||    
T  27269336 tcaaaggccttccgtccacgggtgggacgaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaaacttcttggcattcatcattccatacaat 27269435  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27269436 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 27269535  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  27269536 acttgcttctcggtctgtg 27269554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 3699530 - 3699312
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| ||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  3699530 tcaaaggccttccttccacacgtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattccatacaat 3699431  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| || || ||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3699430 aggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 3699331  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    ||||| || || |||||||    
T  3699330 acttgtttctctgtctgtg 3699312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4761210 - 4760992
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  4761210 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 4761111  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  4761110 aggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 4761011  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  4761010 acttgcttctctgtctgtg 4760992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 17089192 - 17089406
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||    
T  17089192 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccacacaat 17089291  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17089292 aggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaggtagcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 17089391  T
Q  201 acttgcttttcggtc 215  Q
    |||||||| ||||||    
T  17089392 acttgcttctcggtc 17089406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27011178 - 27010960
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  27011178 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 27011079  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  27011078 aggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 27010979  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  27010978 acttgcttctctgtctgtg 27010960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 34461255 - 34461473
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  34461255 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 34461354  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| || |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34461355 aggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 34461454  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  34461455 acttgcttctcagtctgtg 34461473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 26921819 - 26921606
Alignment:
Q  6 ggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaataggtt 105  Q
    |||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| || ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||| ||| |    
T  26921819 ggccttccttccacgggtgggacaaagataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcattattccaaacaacaggct 26921720  T
Q  106 gattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttg 205  Q
    |||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  26921719 gattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttg 26921620  T
Q  206 cttttcggtctgtg 219  Q
    ||| ||||||||||    
T  26921619 cttctcggtctgtg 26921606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16753263 - 16753050
Alignment:
Q  6 ggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaataggtt 105  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| || ||||||| |||||| |||||||| |    
T  16753263 ggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaataggct 16753164  T
Q  106 gattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttg 205  Q
    |||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||    
T  16753163 gattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaaacctctgacttg 16753064  T
Q  206 cttttcggtctgtg 219  Q
     || ||||||||||    
T  16753063 tttctcggtctgtg 16753050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27060953 - 27060735
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||     
T  27060953 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaac 27060854  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |    
T  27060853 aggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcagacgtccgaggaaacctctg 27060754  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  27060753 acttgcttctctgtctgtg 27060735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4528732 - 4528514
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| || ||| ||||     
T  4528732 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatcccatacaac 4528633  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| |||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  4528632 aggctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 4528533  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  4528532 acttgcttctctgtctgtg 4528514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 4542523 - 4542741
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  4542523 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 4542622  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  4542623 aggctggttctttctaagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 4542722  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  4542723 acttgcttctctgtctgtg 4542741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 4720884 - 4721102
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  4720884 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 4720983  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  4720984 aggctggttctttctaagtagcttgaaaatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 4721083  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  4721084 acttgcttctctgtctgtg 4721102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27488580 - 27488362
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  27488580 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 27488481  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  27488480 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 27488381  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  27488380 acttgcttctctgtctgtg 27488362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 29504863 - 29504645
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  29504863 tcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 29504764  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |    
T  29504763 aggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaggaaacctctg 29504664  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  29504663 acttgcttctctgtctgtg 29504645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 29576461 - 29576243
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  || ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  29576461 tcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 29576362  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |    
T  29576361 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaggaaacctctg 29576262  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  29576261 acttgcttctctgtctgtg 29576243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 30554765 - 30554983
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  30554765 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 30554864  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  30554865 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 30554964  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  30554965 acttgcttctctgtctgtg 30554983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 20171994 - 20171797
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||  |||||||   ||| | |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  20171994 tcaaaggccttccttccatgggtgggacaaggataggtggttcctgcagataactcttgatactatcaaaagcttcttggcattcatcgttccacacaat 20171895  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctc 198  Q
     |||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20171894 gggttgattcttcctgagtagcttgaaaattggcccgcaggtcgcggtcatatgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctc 20171797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 22163997 - 22164194
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||  |||||||   ||| | |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  22163997 tcaaaggccttccttccatgggtgggacaaggataggtggttcctgcagataactcttgatactatcaaaagcttcttggcattcatcgttccacacaat 22164096  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctc 198  Q
     |||||||| || |||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22164097 gggttgattcttcctgagtagcttgaaaattggcccgcaggtcgcggtcatatgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctc 22164194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 219
Target Start/End: Original strand, 16940784 - 16940994
Alignment:
Q  9 cttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaataggttgat 108  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||| ||| || |    
T  16940784 cttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaacaggctggt 16940883  T
Q  109 tgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgctt 208  Q
    | ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||    
T  16940884 tctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgctt 16940983  T
Q  209 ttcggtctgtg 219  Q
     || |||||||    
T  16940984 ctctgtctgtg 16940994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 26113161 - 26113379
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  26113161 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 26113260  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  26113261 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 26113360  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  26113361 acttgcttctctgtctgtg 26113379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 28210901 - 28210683
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  28210901 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 28210802  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  28210801 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 28210702  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  28210701 acttgcttctctgtctgtg 28210683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4776327 - 4776109
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||  ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  4776327 tcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 4776228  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  4776227 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 4776128  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  4776127 acttgcttctctgtctgtg 4776109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 22455863 - 22455971
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22455863 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaagaataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcattattccacacaat 22455962  T
Q  101 aggttgatt 109  Q
    |||||||||    
T  22455963 aggttgatt 22455971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 26992242 - 26992096
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| || ||||||| |||||| | |||    
T  26992242 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatagaat 26992143  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcgg 147  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||    
T  26992142 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcgg 26992096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 14142143 - 14142251
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  14142143 tcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaat 14142242  T
Q  101 aggttgatt 109  Q
    ||| |||||    
T  14142243 aggctgatt 14142251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 26775376 - 26775484
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  26775376 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaat 26775475  T
Q  101 aggttgatt 109  Q
    ||| |||||    
T  26775476 aggctgatt 26775484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 26789263 - 26789155
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  26789263 tcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaat 26789164  T
Q  101 aggttgatt 109  Q
    ||| |||||    
T  26789163 aggctgatt 26789155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 27197632 - 27197524
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  27197632 tcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaat 27197533  T
Q  101 aggttgatt 109  Q
    ||| |||||    
T  27197532 aggctgatt 27197524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 27251603 - 27251711
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  27251603 tcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaat 27251702  T
Q  101 aggttgatt 109  Q
    ||| |||||    
T  27251703 aggctgatt 27251711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 27358859 - 27358967
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  27358859 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaat 27358958  T
Q  101 aggttgatt 109  Q
    ||| |||||    
T  27358959 aggctgatt 27358967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 27449202 - 27449310
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  27449202 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaat 27449301  T
Q  101 aggttgatt 109  Q
    ||| |||||    
T  27449302 aggctgatt 27449310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 8902452 - 8902554
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||   || |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  8902452 tcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcatgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattccatacaat 8902551  T
Q  101 agg 103  Q
    |||    
T  8902552 agg 8902554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 33373180 - 33373299
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||| ||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  33373180 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctgtcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 33373279  T
Q  101 aggttgattgtttctgagta 120  Q
    ||| || || ||||||||||    
T  33373280 aggctggttctttctgagta 33373299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 28163930 - 28163836
Alignment:
Q  9 cttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaatagg 103  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  28163930 cttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 28163836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 13520941 - 13521048
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| |||||| |||||||||  ||||| |||||    
T  13520941 tcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcc-ggcattcatcgttccatacaat 13521039  T
Q  101 aggttgatt 109  Q
    ||| |||||    
T  13521040 aggctgatt 13521048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 178
Target Start/End: Original strand, 9136217 - 9136279
Alignment:
Q  116 gagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 178  Q
    ||||| |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9136217 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 9136279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 61)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 5593206 - 5593424
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||     
T  5593206 tcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattccatacaac 5593305  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5593306 aggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 5593405  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  5593406 acttgcttctctgtctgtg 5593424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18054673 - 18054455
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| || ||||||| |||||| |||||    
T  18054673 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaat 18054574  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18054573 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 18054474  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  18054473 acttgcttctcggtctgtg 18054455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 18273901 - 18274119
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  18273901 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 18274000  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  18274001 aggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctg 18274100  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  18274101 acttgcttctcggtctgtg 18274119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 18289202 - 18289420
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  18289202 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 18289301  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  18289302 aggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctg 18289401  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  18289402 acttgcttctcggtctgtg 18289420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 18304503 - 18304721
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  18304503 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 18304602  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  18304603 aggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctg 18304702  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  18304703 acttgcttctcggtctgtg 18304721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 218
Target Start/End: Original strand, 4793484 - 4793701
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  4793484 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 4793583  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4793584 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 4793683  T
Q  201 acttgcttttcggtctgt 218  Q
    |||||||| |||||||||    
T  4793684 acttgcttctcggtctgt 4793701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 8286319 - 8286535
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  8286319 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 8286418  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8286419 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 8286518  T
Q  201 acttgcttttcggtctg 217  Q
    |||||||| ||||||||    
T  8286519 acttgcttctcggtctg 8286535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6205314 - 6205096
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  6205314 tcaagggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 6205215  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6205214 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 6205115  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  6205114 acttgcttctcagtctgtg 6205096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 8299382 - 8299164
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| || ||||||| |||||| |||||    
T  8299382 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaat 8299283  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  8299282 aggttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctg 8299183  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  8299182 acttgcttctcggtctgtg 8299164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18334041 - 18333823
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  18334041 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 18333942  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18333941 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 18333842  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  18333841 acttgcttctcggtctgtg 18333823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 21678114 - 21677896
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| || ||||||| |||||| |||||    
T  21678114 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaat 21678015  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21678014 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 21677915  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  21677914 acttgcttctcggtctgtg 21677896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4687066 - 4686848
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||| || ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  4687066 tcaagggccttccttccacgggtggaacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 4686967  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4686966 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 4686867  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  4686866 acttgcttctcagtctgtg 4686848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4725042 - 4724824
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||| || ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  4725042 tcaagggccttccttccacgggtggaacaaggataggtggtttcagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 4724943  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4724942 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 4724843  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  4724842 acttgcttctcagtctgtg 4724824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 15737943 - 15738161
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| || ||||||| |||||| ||| |    
T  15737943 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacagt 15738042  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15738043 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 15738142  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  15738143 acttgcttctcggtctgtg 15738161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 15889554 - 15889772
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  15889554 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 15889653  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| |||||||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  15889654 aggctgattctttctgaggagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctg 15889753  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  15889754 acttgcttctcggtctgtg 15889772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 22384427 - 22384645
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| || ||||||| |||||| |||||    
T  22384427 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaat 22384526  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |    
T  22384527 aggttgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgttcgaggaaacctctg 22384626  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  22384627 acttgcttctcggtctgtg 22384645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 29145605 - 29145823
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  29145605 tcaaaggccttccctccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 29145704  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  29145705 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcta 29145804  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  29145805 acttgcttctcggtctgtg 29145823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 29661819 - 29662037
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  29661819 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 29661918  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| || || ||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  29661919 aggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctg 29662018  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  29662019 acttgcttctcggtctgtg 29662037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 35884177 - 35883959
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  35884177 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 35884078  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  35884077 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctg 35883978  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  35883977 acttgcttctcggtctgtg 35883959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 32442562 - 32442355
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  32442562 tcaaaggccttccttccacgggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 32442463  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||  ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  32442462 agactgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctg 32442363  T
Q  201 acttgctt 208  Q
    ||||||||    
T  32442362 acttgctt 32442355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 8215146 - 8214928
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||     
T  8215146 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccacacaac 8215047  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| |||||||| |  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |    
T  8215046 aggctgattttttctgagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaacctctg 8214947  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  8214946 acttgcttctctgtctgtg 8214928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 20069451 - 20069233
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| | ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| || ||    
T  20069451 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacgat 20069352  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20069351 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 20069252  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  20069251 acttgcttctcagtctgtg 20069233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 20573692 - 20573899
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||| | |||||| |||||    
T  20573692 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcctcattccatacaat 20573791  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| || |  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20573792 aggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggtccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 20573891  T
Q  201 acttgctt 208  Q
    ||||||||    
T  20573892 acttgctt 20573899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 7076617 - 7076399
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  7076617 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 7076518  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||||||||  ||||| || || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  7076517 aggctggttctttctgagtagcttgaagatcggtccgcaggttgcggtcatgcgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctg 7076418  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  7076417 acttgcttctcggtctgtg 7076399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 28024693 - 28024475
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||  ||| |||||||||| || || |||||||||| |||||| ||||     
T  28024693 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattccatacaac 28024594  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28024593 aggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 28024494  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  28024493 acttgcttctctgtctgtg 28024475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 28112803 - 28113021
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||| ||| | |||||||||| |||||| ||||     
T  28112803 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcattccatacaac 28112902  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  28112903 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgctgtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctg 28113002  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  28113003 acttgcttctctgtctgtg 28113021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 47026864 - 47026646
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  47026864 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 47026765  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| || |||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  47026764 aggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 47026665  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  47026664 acttgcttctctgtctgtg 47026646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 48469338 - 48469120
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||     
T  48469338 tcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcattattccatacaac 48469239  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| || |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  48469238 aggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctatg 48469139  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    ||||| || || |||||||    
T  48469138 acttgtttctctgtctgtg 48469120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 5606163 - 5606381
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  5606163 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 5606262  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||||||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  5606263 aggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 5606362  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  5606363 acttgcttctctgtctgtg 5606381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 10399555 - 10399337
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| | ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  10399555 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 10399456  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  10399455 aggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctg 10399356  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    ||||| || || |||||||    
T  10399355 acttgtttctctgtctgtg 10399337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 28342588 - 28342370
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  28342588 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 28342489  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||||||||  ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  28342488 aggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 28342389  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  28342388 acttgcttctctgtctgtg 28342370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 26 - 219
Target Start/End: Original strand, 11107226 - 11107419
Alignment:
Q  26 gacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaataggttgattgtttctgagtaatttg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||| | |||||| |||||||| ||| | ||||||||||  |||    
T  11107226 gacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcttcattccatacaataggctgactctttctgagtagcttg 11107325  T
Q  126 aaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtg 219  Q
    || || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  11107326 aagatcggcccacaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctgtg 11107419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18246152 - 18245945
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  18246152 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 18246053  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| |||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  18246052 aggctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 18245953  T
Q  201 acttgctt 208  Q
    ||||||||    
T  18245952 acttgctt 18245945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 4343525 - 4343743
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  4343525 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 4343624  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  4343625 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 4343724  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  4343725 acttgcttctctgtctgtg 4343743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4420326 - 4420108
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  4420326 tcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 4420227  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  4420226 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 4420127  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  4420126 acttgcttctctgtctgtg 4420108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 5017125 - 5016907
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  5017125 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 5017026  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| || |  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  5017025 aggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 5016926  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  5016925 acttgcttctctgtctgtg 5016907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 5470399 - 5470181
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  5470399 tcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 5470300  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  5470299 aggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 5470200  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  5470199 acttgcttctctgtctgtg 5470181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 6539591 - 6539809
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  6539591 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 6539690  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  6539691 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 6539790  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  6539791 acttgcttctctgtctgtg 6539809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 7999971 - 7999753
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  7999971 tcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 7999872  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  7999871 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 7999772  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  7999771 acttgcttctctgtctgtg 7999753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 10646484 - 10646266
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  10646484 tcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 10646385  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  10646384 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 10646285  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  10646284 acttgcttctctgtctgtg 10646266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 17981798 - 17982016
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  17981798 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 17981897  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  17981898 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 17981997  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  17981998 acttgcttctctgtctgtg 17982016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 18228607 - 18228389
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  18228607 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 18228508  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  18228507 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 18228408  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  18228407 acttgcttctctgtctgtg 18228389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 22867697 - 22867915
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  22867697 tcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 22867796  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  22867797 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 22867896  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  22867897 acttgcttctctgtctgtg 22867915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 22882756 - 22882974
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  22882756 tcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 22882855  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  22882856 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 22882955  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  22882956 acttgcttctctgtctgtg 22882974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 16621339 - 16621555
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||| | ||| ||||  ||| |||||||||| ||| | ||||||||||  ||||| |||||    
T  16621339 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaat 16621438  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  16621439 aggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctg 16621538  T
Q  201 acttgcttttcggtctg 217  Q
    ||||| || ||||||||    
T  16621539 acttgtttctcggtctg 16621555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24331574 - 24331356
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||  |||||||||| |||||| ||||     
T  24331574 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctttttggcattcatcattccatacaac 24331475  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  24331474 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 24331375  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  24331374 acttgcttctctgtctgtg 24331356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 31961304 - 31961522
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  31961304 tcaaaggccttccttccacgggagggacaagaataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 31961403  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  31961404 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 31961503  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  31961504 acttgcttctctgtctgtg 31961522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 51785434 - 51785216
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  || ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  51785434 tcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 51785335  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  51785334 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 51785235  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  51785234 acttgcttctctgtctgtg 51785216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19697901 - 19697687
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||  ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| |||||    
T  19697901 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgacgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaat 19697802  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||  ||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| |    
T  19697801 aggctgattcttcttgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaattgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaacctctg 19697702  T
Q  201 acttgcttttcggtc 215  Q
    ||||| || ||||||    
T  19697701 acttgtttctcggtc 19697687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 17992780 - 17992888
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  17992780 tcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaat 17992879  T
Q  101 aggttgatt 109  Q
    |||||||||    
T  17992880 aggttgatt 17992888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 4627196 - 4627088
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  4627196 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 4627097  T
Q  101 aggttgatt 109  Q
    ||| |||||    
T  4627096 aggctgatt 4627088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 32294039 - 32293931
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  32294039 tcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaat 32293940  T
Q  101 aggttgatt 109  Q
    ||| |||||    
T  32293939 aggctgatt 32293931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 5714484 - 5714376
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| |||||    
T  5714484 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaat 5714385  T
Q  101 aggttgatt 109  Q
    ||| |||||    
T  5714384 aggctgatt 5714376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 5725394 - 5725286
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| |||||    
T  5725394 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaat 5725295  T
Q  101 aggttgatt 109  Q
    ||| |||||    
T  5725294 aggctgatt 5725286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 5766974 - 5767082
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| |||||    
T  5766974 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaat 5767073  T
Q  101 aggttgatt 109  Q
    ||| |||||    
T  5767074 aggctgatt 5767082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 31033085 - 31033193
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| | |||    
T  31033085 tcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatataat 31033184  T
Q  101 aggttgatt 109  Q
    ||| |||||    
T  31033185 aggctgatt 31033193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 180
Target Start/End: Original strand, 15592875 - 15592939
Alignment:
Q  116 gagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattca 180  Q
    |||||||||||| || |||| ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15592875 gagtaatttgaatatcggcctgcacgttgctgtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattca 15592939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 15918813 - 15918749
Alignment:
Q  116 gagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattca 180  Q
    ||||| |||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15918813 gagtagtttgaatatcggtccgcacgttgctgtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattca 15918749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 178
Target Start/End: Original strand, 5950766 - 5950828
Alignment:
Q  116 gagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 178  Q
    ||||| |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5950766 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 5950828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 20443407 - 20443349
Alignment:
Q  122 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattca 180  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  20443407 tttgaatatcggcccacatgttgcagtcatatgagagatgaaacgggagatgtaattca 20443349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 41440533 - 41440475
Alignment:
Q  122 tttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattca 180  Q
    |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  41440533 tttgaatatcggcccacatgttgcagtcatatgagagatgaaacgggagatgtaattca 41440475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 38)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 10913560 - 10913778
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| || ||||||| |||||| |||||    
T  10913560 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaat 10913659  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10913660 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 10913759  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  10913760 acttgcttctcggtctgtg 10913778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 26516239 - 26516032
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  26516239 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 26516140  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| || || ||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26516139 aggctgattcttccttagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 26516040  T
Q  201 acttgctt 208  Q
    ||||||||    
T  26516039 acttgctt 26516032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 2158021 - 2157803
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  2158021 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 2157922  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| || || ||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2157921 aggctgattcttcctcagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 2157822  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  2157821 acttgcttctcggtctgtg 2157803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 26534564 - 26534782
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  26534564 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 26534663  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26534664 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggaaatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 26534763  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||| ||||    
T  26534764 acttgcttctcggtttgtg 26534782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 219
Target Start/End: Original strand, 2106862 - 2107072
Alignment:
Q  9 cttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaataggttgat 108  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| || ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  2106862 cttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaataggttgat 2106961  T
Q  109 tgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgctt 208  Q
    | ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2106962 tctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctgacttgctt 2107061  T
Q  209 ttcggtctgtg 219  Q
     ||||| ||||    
T  2107062 ctcggtatgtg 2107072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 219
Target Start/End: Original strand, 11421478 - 11421688
Alignment:
Q  9 cttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaataggttgat 108  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| || ||||||| |||||| |||| ||| ||||    
T  11421478 cttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaacaggctgat 11421577  T
Q  109 tgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgctt 208  Q
    | ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  11421578 tctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaccctctgacttgctt 11421677  T
Q  209 ttcggtctgtg 219  Q
     ||||||||||    
T  11421678 ctcggtctgtg 11421688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 26271777 - 26271995
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  26271777 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaggcttcttggcattcatcattccatacaac 26271876  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26271877 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 26271976  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  26271977 acttgcttctctgtctgtg 26271995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 26438704 - 26438486
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  26438704 tcaacggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 26438605  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  26438604 aggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctg 26438505  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    ||||| || ||||||||||    
T  26438504 acttgtttctcggtctgtg 26438486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 45390667 - 45390449
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  45390667 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 45390568  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  45390567 aggctgattctttctgagtagtttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 45390468  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  45390467 acttgcttctctgtctgtg 45390449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 16515121 - 16515337
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| | ||| |||||||||| |||||| |||||    
T  16515121 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagattcttggcattcatcattccatacaat 16515220  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |    
T  16515221 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcagcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaacctctg 16515320  T
Q  201 acttgcttttcggtctg 217  Q
    |||||||| ||||||||    
T  16515321 acttgcttctcggtctg 16515337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 5131443 - 5131225
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  5131443 tcaaaggcctcccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 5131344  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  5131343 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctg 5131244  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  5131243 acttgcttctctgtctgtg 5131225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 5144031 - 5144249
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| || ||||||| |||||| |||||    
T  5144031 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaat 5144130  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |    
T  5144131 aggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgttattcaaacgtccgaggaaacctctg 5144230  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  5144231 acttgcttctcggtctgtg 5144249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 22145642 - 22145424
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  22145642 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 22145543  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||      
T  22145542 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtccgaggaaacctcta 22145443  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    ||||| || ||||||||||    
T  22145442 acttgtttctcggtctgtg 22145424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 26316539 - 26316757
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  26316539 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 26316638  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  26316639 aggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctg 26316738  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  26316739 acttgcttctctgtctgtg 26316757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 10845067 - 10844851
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| |||||    
T  10845067 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttacagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaat 10844968  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  10844967 aggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctg 10844868  T
Q  201 acttgcttttcggtctg 217  Q
    ||||| || ||||||||    
T  10844867 acttgtttctcggtctg 10844851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16044758 - 16044550
Alignment:
Q  9 cttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaataggttgat 108  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||| ||| || || ||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  16044758 cttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctattaaaagcctcttggcattcatcgttccatacaataggctgat 16044659  T
Q  109 tgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgctt 208  Q
    | || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  16044658 tcttcctgagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctgacttgttt 16044559  T
Q  209 ttcggtctg 217  Q
     ||||||||    
T  16044558 ctcggtctg 16044550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 10842685 - 10842901
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||| ||| | ||||||||||  ||||| |||||    
T  10842685 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaat 10842784  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| || |||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||      
T  10842785 aggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatataaatcgggagatgtaatgcaatcgcccgaggaaacctcta 10842884  T
Q  201 acttgcttttcggtctg 217  Q
    ||||| || ||||||||    
T  10842885 acttgtttctcggtctg 10842901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 31561081 - 31561288
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  31561081 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 31561180  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| |||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  31561181 aggctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 31561280  T
Q  201 acttgctt 208  Q
    ||||||||    
T  31561281 acttgctt 31561288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 3448753 - 3448535
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  3448753 tcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 3448654  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  3448653 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 3448554  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  3448553 acttgcttctctgtctgtg 3448535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 4141937 - 4142155
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  4141937 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 4142036  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  4142037 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 4142136  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  4142137 acttgcttctctgtctgtg 4142155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 4202836 - 4202618
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  4202836 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 4202737  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||  | ||||||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||      
T  4202736 aggctggctctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctcta 4202637  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  4202636 acttgcttctctgtctgtg 4202618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 11444334 - 11444116
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  11444334 tcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 11444235  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |    
T  11444234 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaacctctg 11444135  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  11444134 acttgcttctctgtctgtg 11444116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 24589225 - 24589443
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||||||  ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  24589225 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtgattccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 24589324  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  24589325 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 24589424  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  24589425 acttgcttctctgtctgtg 24589443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 16748208 - 16748415
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||| |||||||   ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  16748208 tcaaaggccttccttccacgggtgggacgaggataggtggttccagcagataactcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 16748307  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||||||||| || |||||||  ||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  16748308 aggttgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccacaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctg 16748407  T
Q  201 acttgctt 208  Q
    ||||||||    
T  16748408 acttgctt 16748415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 26666605 - 26666823
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| || |     
T  26666605 tcaaaggccttccttccacgggtggaacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacgac 26666704  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  26666705 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 26666804  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  26666805 acttgcttctctgtctgtg 26666823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 16446697 - 16446894
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||  | ||||||||||  ||||| |||||    
T  16446697 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagccccttggcattcatcgttccatacaat 16446796  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctc 198  Q
    ||  ||||| || |||||||  ||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  16446797 agtctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcctgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcacccgaggaaacctc 16446894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 72 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 9622026 - 9621879
Alignment:
Q  72 gcttcctggcattcattattccacacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggaga 171  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  9622026 gcttcttggcattcatcattccatacaataggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagaga 9621927  T
Q  172 tgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtg 219  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| || |||||||    
T  9621926 tgtaattcaaacgtccgaggaagcctctgacttgcttctctgtctgtg 9621879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 2776701 - 2776593
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  2776701 tcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaat 2776602  T
Q  101 aggttgatt 109  Q
    ||| |||||    
T  2776601 aggctgatt 2776593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 26512387 - 26512495
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  26512387 tcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaat 26512486  T
Q  101 aggttgatt 109  Q
    ||| |||||    
T  26512487 aggctgatt 26512495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 26681797 - 26681905
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  26681797 tcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaat 26681896  T
Q  101 aggttgatt 109  Q
    ||| |||||    
T  26681897 aggctgatt 26681905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 31127354 - 31127246
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  31127354 tcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaat 31127255  T
Q  101 aggttgatt 109  Q
    ||| |||||    
T  31127254 aggctgatt 31127246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 39209830 - 39209938
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||  ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  39209830 tcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaat 39209929  T
Q  101 aggttgatt 109  Q
    |||||||||    
T  39209930 aggttgatt 39209938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 45734752 - 45734658
Alignment:
Q  9 cttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaatagg 103  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  45734752 cttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaatagg 45734658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 31087313 - 31087421
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| || |||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| |||||    
T  31087313 tcaaaggccttccttccacgggagggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaat 31087412  T
Q  101 aggttgatt 109  Q
    ||| |||||    
T  31087413 aggctgatt 31087421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 9469652 - 9469590
Alignment:
Q  116 gagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 178  Q
    ||||| |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9469652 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 9469590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 178
Target Start/End: Original strand, 16393240 - 16393302
Alignment:
Q  116 gagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 178  Q
    ||||| |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16393240 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 16393302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 178
Target Start/End: Original strand, 30369752 - 30369814
Alignment:
Q  116 gagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 178  Q
    ||||| |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  30369752 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 30369814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 180
Target Start/End: Original strand, 16287201 - 16287249
Alignment:
Q  132 ggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattca 180  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16287201 ggcccacatgttgcagtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattca 16287249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 58)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 15655461 - 15655679
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  15655461 tcaaaggccttccttccacgggcgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 15655560  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
     || ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  15655561 gggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctg 15655660  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  15655661 acttgcttctcggtctgtg 15655679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 41678162 - 41677944
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  41678162 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 41678063  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  41678062 aggctgattctttctgagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctcta 41677963  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  41677962 acttgcttctcggtctgtg 41677944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 11552812 - 11552594
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  11552812 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 11552713  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11552712 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 11552613  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  11552612 acttgcttctcagtctgtg 11552594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 33295985 - 33295767
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  33295985 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 33295886  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  33295885 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctg 33295786  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  33295785 acttgcttctcggtctgtg 33295767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 33780946 - 33780728
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| || |||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  33780946 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 33780847  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33780846 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 33780747  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  33780746 acttgcttctcggtctgtg 33780728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 22995820 - 22996038
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| || ||||||| |||||| ||||     
T  22995820 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaac 22995919  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22995920 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 22996019  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  22996020 acttgcttctcagtctgtg 22996038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23629427 - 23629209
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  23629427 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 23629328  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  23629327 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgtaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctg 23629228  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  23629227 acttgcttctcggtctgtg 23629209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 24684848 - 24685066
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||   ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  24684848 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 24684947  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  24684948 aggctgattctttctgagtagcttaaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctg 24685047  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  24685048 acttgcttctcggtctgtg 24685066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24973363 - 24973145
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24973363 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcattattccatacaat 24973264  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| |    
T  24973263 aggctgattctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaatttaagcgtccgaggaaacctctg 24973164  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  24973163 acttgcttctcggtctgtg 24973145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 40470253 - 40470460
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| || |||| ||| ||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  40470253 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattccatacaat 40470352  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| || |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40470353 aggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 40470452  T
Q  201 acttgctt 208  Q
    ||||||||    
T  40470453 acttgctt 40470460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 18372237 - 18372455
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||     
T  18372237 tcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattccatacaac 18372336  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  18372337 aggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctg 18372436  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  18372437 acttgcttctctgtctgtg 18372455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 31434921 - 31434703
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  31434921 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 31434822  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  31434821 aggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 31434722  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  31434721 acttgcttctctgtctgtg 31434703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 37355346 - 37355564
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  37355346 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 37355445  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  37355446 aggctggttctttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 37355545  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  37355546 acttgcttctctgtctgtg 37355564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 23895663 - 23895447
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||| | ||||| ||||||||||  ||||| |||||    
T  23895663 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaatttttgatgctatcataagcttcttggcattcatcgttccatacaat 23895564  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |    
T  23895563 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaacctctg 23895464  T
Q  201 acttgcttttcggtctg 217  Q
    ||||| || ||||||||    
T  23895463 acttgtttctcggtctg 23895447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 3792998 - 3792780
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| || |||| ||| ||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||     
T  3792998 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatagggggctccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattccatacaac 3792899  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3792898 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 3792799  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  3792798 acttgcttctctgtctgtg 3792780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 9320933 - 9320715
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  9320933 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 9320834  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  9320833 aggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctg 9320734  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  9320733 acttgcttctctgtctgtg 9320715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 12135632 - 12135414
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  12135632 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 12135533  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  12135532 aggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctg 12135433  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  12135432 acttgcttctctgtctgtg 12135414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 26483851 - 26483633
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  26483851 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 26483752  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  26483751 aggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctg 26483652  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  26483651 acttgcttctctgtctgtg 26483633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 34619975 - 34619757
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||  ||| |||||||||| || || |||||||||| |||||| ||||     
T  34619975 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattccatacaac 34619876  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34619875 aggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 34619776  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  34619775 acttgcttctctgtctgtg 34619757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 43081712 - 43081494
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  43081712 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 43081613  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  43081612 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctg 43081513  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  43081512 acttgcttctcggtctgtg 43081494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 13321533 - 13321751
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  13321533 tcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 13321632  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  13321633 aggctggttctttctaagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 13321732  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  13321733 acttgcttctctgtctgtg 13321751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 18497428 - 18497646
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  18497428 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 18497527  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| || |  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18497528 aggctggttctttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 18497627  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    ||||| || || |||||||    
T  18497628 acttgtttctctgtctgtg 18497646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 28652699 - 28652481
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||  ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  28652699 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 28652600  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  28652599 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctg 28652500  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  28652499 acttgcttctcggtctgtg 28652481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 30938092 - 30937874
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||| ||| |||   ||| |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| |||||    
T  30938092 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggatatgtggttccagcaggtaactcttggtgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaat 30937993  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| || || ||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  30937992 aggctgattcttcctcagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctg 30937893  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  30937892 acttgcttctcggtctgtg 30937874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 32592977 - 32593195
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||  ||| |||||||||| || || |||||||||| |||||| ||||     
T  32592977 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattccatacaac 32593076  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32593077 aggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgagagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 32593176  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  32593177 acttgcttctctgtctgtg 32593195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 37767694 - 37767912
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  37767694 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 37767793  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| |||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  37767794 aggctggttctttctaagtagtttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 37767893  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  37767894 acttgcttctctgtctgtg 37767912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 5641245 - 5641027
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  5641245 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 5641146  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  5641145 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 5641046  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  5641045 acttgcttctctgtctgtg 5641027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6877762 - 6877544
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| || ||| ||||     
T  6877762 tcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcatcccatacaac 6877663  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  6877662 aggctggttctttctaagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 6877563  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  6877562 acttgcttctctgtctgtg 6877544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 8662178 - 8662396
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  8662178 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 8662277  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  8662278 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 8662377  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  8662378 acttgcttctctgtctgtg 8662396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24586831 - 24586613
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  24586831 tcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 24586732  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  24586731 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 24586632  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  24586631 acttgcttctctgtctgtg 24586613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 28956488 - 28956706
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||  ||| |||||||||| || || |||||||||| |||||| |||||    
T  28956488 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattccatacaat 28956587  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| || |  ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28956588 aggctggttttttctaagcagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 28956687  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  28956688 acttgcttctctgtctgtg 28956706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 30032885 - 30032667
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  30032885 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 30032786  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| || |  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  30032785 aggctggttctttctaagcagcttaaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 30032686  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  30032685 acttgcttctctgtctgtg 30032667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 30155488 - 30155270
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  30155488 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 30155389  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  30155388 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 30155289  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  30155288 acttgcttctctgtctgtg 30155270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 30171926 - 30171708
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| ||||| |||| |||||| |||||    
T  30171926 tcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcactcatcattccatacaat 30171827  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| || |  ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30171826 aggctggttttttctaagcagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaaccgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 30171727  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  30171726 acttgcttctctgtctgtg 30171708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 31823110 - 31823328
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  31823110 tcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 31823209  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  31823210 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 31823309  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  31823310 acttgcttctctgtctgtg 31823328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 33519837 - 33519619
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  33519837 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 33519738  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  33519737 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 33519638  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  33519637 acttgcttctctgtctgtg 33519619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 37668189 - 37668407
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  37668189 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 37668288  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  37668289 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 37668388  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  37668389 acttgcttctctgtctgtg 37668407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 37758440 - 37758222
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  37758440 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 37758341  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  37758340 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 37758241  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  37758240 acttgcttctctgtctgtg 37758222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 22891920 - 22891707
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||| | ||||||||||  ||||| |||||    
T  22891920 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaat 22891821  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| || |||||||  ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22891820 aggctgattcttcctgagtagcttgaagatcgggccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 22891721  T
Q  201 acttgcttttcggt 214  Q
    ||||| || |||||    
T  22891720 acttgtttctcggt 22891707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 25203735 - 25203519
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||| | ||||| ||||  ||||| |||||    
T  25203735 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcagtcatcgttccatacaat 25203636  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |    
T  25203635 aggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaacctctg 25203536  T
Q  201 acttgcttttcggtctg 217  Q
    ||||| || ||||||||    
T  25203535 acttgtttctcggtctg 25203519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 25267890 - 25267674
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||| | ||||| ||||  ||||| |||||    
T  25267890 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcagtcatcgttccatacaat 25267791  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |    
T  25267790 aggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtccgaggaaacctctg 25267691  T
Q  201 acttgcttttcggtctg 217  Q
    ||||| || ||||||||    
T  25267690 acttgtttctcggtctg 25267674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 15755555 - 15755762
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  15755555 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 15755654  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  15755655 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 15755754  T
Q  201 acttgctt 208  Q
    ||||||||    
T  15755755 acttgctt 15755762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 2514519 - 2514301
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||   ||| |||||||||| || || |||||||||| |||||| ||||     
T  2514519 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaactcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcattccatacaac 2514420  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  2514419 aggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 2514320  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  2514319 acttgcttctctgtctgtg 2514301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 24727426 - 24727208
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  || ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  24727426 tcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagtaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 24727327  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  24727326 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 24727227  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  24727226 acttgcttctctgtctgtg 24727208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 13183496 - 13183615
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  ||||| |||||    
T  13183496 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggaattcatcgttccatacaat 13183595  T
Q  101 aggttgattgtttctgagta 120  Q
    ||| ||||| ||||||||||    
T  13183596 aggctgattctttctgagta 13183615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 112
Target Start/End: Original strand, 13439386 - 13439497
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  13439386 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaat 13439485  T
Q  101 aggttgattgtt 112  Q
    ||| ||||||||    
T  13439486 aggctgattgtt 13439497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 18125119 - 18125227
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  18125119 tcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaat 18125218  T
Q  101 aggttgatt 109  Q
    ||| |||||    
T  18125219 aggctgatt 18125227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 9547412 - 9547520
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| | |||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  9547412 tcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatactatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaat 9547511  T
Q  101 aggttgatt 109  Q
    ||| |||||    
T  9547512 aggctgatt 9547520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 11327094 - 11326986
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||| | ||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  11327094 tcaaaggccttccttccatgggagggacaaggataggtggttctagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaat 11326995  T
Q  101 aggttgatt 109  Q
    |||||||||    
T  11326994 aggttgatt 11326986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 29887900 - 29888008
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| |    |||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  29887900 tcaaaggccttccttccacggatgagacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaat 29887999  T
Q  101 aggttgatt 109  Q
    ||| |||||    
T  29888000 aggctgatt 29888008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 33878587 - 33878480
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| |||||| |||||||||  ||||| |||||    
T  33878587 tcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcc-ggcattcatcgttccatacaat 33878489  T
Q  101 aggttgatt 109  Q
    ||| |||||    
T  33878488 aggctgatt 33878480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 178
Target Start/End: Original strand, 5440043 - 5440105
Alignment:
Q  116 gagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 178  Q
    ||||| |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5440043 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 5440105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 178
Target Start/End: Original strand, 11944240 - 11944302
Alignment:
Q  116 gagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 178  Q
    ||||| |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11944240 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 11944302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 178
Target Start/End: Original strand, 15784543 - 15784605
Alignment:
Q  116 gagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 178  Q
    ||||| |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15784543 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 15784605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 17957438 - 17957376
Alignment:
Q  116 gagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 178  Q
    ||||| |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17957438 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 17957376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 178
Target Start/End: Original strand, 36375780 - 36375842
Alignment:
Q  116 gagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 178  Q
    ||||| |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  36375780 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 36375842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 178
Target Start/End: Original strand, 37000434 - 37000496
Alignment:
Q  116 gagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 178  Q
    ||||| |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  37000434 gagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 37000496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 34468948 - 34468900
Alignment:
Q  132 ggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattca 180  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34468948 ggcccacatgttgcagtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattca 34468900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 3517 - 3301
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| |||||    
T  3517 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcgttccatacaat 3418  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3417 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 3318  T
Q  201 acttgcttttcggtctg 217  Q
    |||||||| ||||||||    
T  3317 acttgcttctcggtctg 3301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 81 - 219
Target Start/End: Original strand, 43877 - 44015
Alignment:
Q  81 cattcattattccacacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattca 180  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43877 cattcatcattccatacaataggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattca 43976  T
Q  181 aacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||    
T  43977 aacgcccgaggaaacctctgacttgcttctgggtctgtg 44015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 146 - 217
Target Start/End: Original strand, 32096 - 32167
Alignment:
Q  146 ggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctg 217  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  32096 ggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctgacttgcttctcggtctg 32167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 9486 - 9268
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| |||   ||| |||||||||| ||||| || ||||||| |||||| ||||     
T  9486 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaactcttgatgctatcaaaagcttcttgacattcatcattccatacaac 9387  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9386 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 9287  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  9286 acttgcttctcggtctgtg 9268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 3)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 30743 - 30525
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  30743 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 30644  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  30643 aggctgattctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctg 30544  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  30543 acttgcttctcggtctgtg 30525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 19520 - 19304
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||| ||| | ||||||||||  ||||| |||||    
T  19520 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaat 19421  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||      
T  19420 aggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctcta 19321  T
Q  201 acttgcttttcggtctg 217  Q
    ||||| || ||||||||    
T  19320 acttgtttctcggtctg 19304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 7410 - 7302
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  7410 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 7311  T
Q  101 aggttgatt 109  Q
    ||| |||||    
T  7310 aggctgatt 7302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 21894555 - 21894762
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  21894555 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 21894654  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21894655 aggctgattctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctctg 21894754  T
Q  201 acttgctt 208  Q
    ||||||||    
T  21894755 acttgctt 21894762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 51641670 - 51641452
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||     
T  51641670 tcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcattccatacaac 51641571  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  51641570 aggctgattctttctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctg 51641471  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  51641470 acttgcttctctgtctgtg 51641452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 20339107 - 20339320
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||| | |||||||||| |||||| |||||    
T  20339107 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcattccatacaat 20339206  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  20339207 aggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctg 20339306  T
Q  201 acttgcttttcggt 214  Q
    ||||||||||||||    
T  20339307 acttgcttttcggt 20339320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 10966117 - 10965910
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  10966117 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 10966018  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| || |||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  10966017 aggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctg 10965918  T
Q  201 acttgctt 208  Q
    ||||||||    
T  10965917 acttgctt 10965910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 3644587 - 3644366
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataat-ctttgttgctatcaaaggcttcct-ggcattcattattccacaca 98  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| |||    
T  3644587 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattctttgatgctatcaaaagcttctttggcattcatcattccataca 3644488  T
Q  99 ataggttgattgttt-ctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacct 197  Q
    ||||| ||||| ||| || || |  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3644487 ataggctgattcttttctaagcagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacct 3644388  T
Q  198 cggacttgcttttcggtctgtg 219  Q
    | ||||||||| || |||||||    
T  3644387 ctgacttgcttctctgtctgtg 3644366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 28588437 - 28588219
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  28588437 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 28588338  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| || |  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  28588337 aggctggttctttctaagcagcttgaaaatcggcccacaggttgcggtcatatgagatatgaaccgggagatgtaattcagacgcccgaggaaacctctg 28588238  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  28588237 acttgcttctctgtctgtg 28588219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 41790116 - 41790323
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  41790116 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 41790215  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |    
T  41790216 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaagcctctg 41790315  T
Q  201 acttgctt 208  Q
    ||||||||    
T  41790316 acttgctt 41790323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 10948529 - 10948311
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  10948529 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 10948430  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  10948429 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 10948330  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  10948329 acttgcttctctgtctgtg 10948311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 20464420 - 20464212
Alignment:
Q  9 cttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaataggttgat 108  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||| | ||||||||||  ||||| |||||||| ||||    
T  20464420 cttccttccacgggtgggacaaggataggtgtttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcgttccatacaataggctgat 20464321  T
Q  109 tgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgctt 208  Q
    | || |||||||  ||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  20464320 tcttcctgagtagcttgaagatcggcccgtaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctcagacttgttt 20464221  T
Q  209 ttcggtctg 217  Q
     ||||||||    
T  20464220 ctcggtctg 20464212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Original strand, 16204840 - 16205055
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| |||   ||||| ||||  ||||| |||||    
T  16204840 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctctttggcagtcatcgttccatacaat 16204939  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| |    
T  16204940 aggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgtctgaggaaacctctg 16205039  T
Q  201 acttgcttttcggtct 216  Q
    |||||||| |||||||    
T  16205040 acttgcttctcggtct 16205055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 28153188 - 28153080
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  28153188 tcaaaggccttccttccacgggagggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcctggcattcatcgttccatacaat 28153089  T
Q  101 aggttgatt 109  Q
    ||| |||||    
T  28153088 aggctgatt 28153080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16031 - 15813
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  16031 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcagataattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 15932  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  15931 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccacaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtccgaggaaacctctg 15832  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  15831 acttgcttctcggtctgtg 15813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 114; Significance: 8e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 214
Target Start/End: Original strand, 1430 - 1643
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||| | |||||||||| |||||| |||||    
T  1430 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggaggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagctccttggcattcatcattccatacaat 1529  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| || |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  1530 aggctgattcttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaaacctctg 1629  T
Q  201 acttgcttttcggt 214  Q
    ||||||||||||||    
T  1630 acttgcttttcggt 1643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 13021 - 12803
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  13021 tcaaaggccttccttccacgggtgggataaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 12922  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |    
T  12921 aggctggttttttctgagtagcttgaagattggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaagcgtcccaggaaacctctg 12822  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  12821 acttgcttctctgtctgtg 12803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 22997 - 23215
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  22997 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaat 23096  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| || |||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  23097 aggctgattcttcctgagtagcttgaagattggcccgcaagttgcagtcatatgagatatgaatcgagagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 23196  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  23197 acttgcttctctgtctgtg 23215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 9472 - 9254
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  9472 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 9373  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  9372 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 9273  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  9272 acttgcttctctgtctgtg 9254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 11734 - 11952
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  11734 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 11833  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  11834 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 11933  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  11934 acttgcttctctgtctgtg 11952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 5985 - 6203
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||  ||||  ||| | |||||||| || || |||||||||| |||||| ||||     
T  5985 tcaacggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccaacaagtaattcttgatactatcaaaagcctcttggcattcatcattccatacaac 6084  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  6085 aggctggttctttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 6184  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  6185 acttgcttctctgtctgtg 6203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23183 - 23111
Alignment:
Q  147 gtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||| || |||||||    
T  23183 gtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctgacttgcttctctgtctgtg 23111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 11399 - 11181
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||     
T  11399 tcaaaggccttccttccacgggtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgctatcaaaagcttcttggcattcatcattccatacaac 11300  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| || || ||||| ||||  ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |    
T  11299 aggctggttctttctaagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcagtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgtcccaagaaacctctg 11200  T
Q  201 acttgcttttcggtctgtg 219  Q
    |||||||| || |||||||    
T  11199 acttgcttctctgtctgtg 11181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 9495 - 9279
Alignment:
Q  1 tcaagggccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaat 100  Q
    |||| ||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||| || ||||||| ||  | || |||||||  ||||| |||||    
T  9495 tcaaaggccttccttccacaagtgggacaaggataggtggttccagcaggtaattcttgatgttatcaaaagccccttgacattcatcgttccatacaat 9396  T
Q  101 aggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcgg 200  Q
    ||| ||||| || | |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |    
T  9395 aggctgattcttccagagtaacttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattcaatcgcccgaggaagcctctg 9296  T
Q  201 acttgcttttcggtctg 217  Q
    ||||| || ||||||||    
T  9295 acttgtttctcggtctg 9279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0748
Description:

Target: scaffold0748; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 217
Target Start/End: Original strand, 5484 - 5693
Alignment:
Q  8 ccttccttccactggcaggacaaggataggtggttccaacagataatctttgttgctatcaaaggcttcctggcattcattattccacacaataggttga 107  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||| || ||||| ||||  ||| |||||||||| || || |||||||||| ||| || || | |||||||    
T  5484 ccttccttccacaggtgggacaaggataggtggctctaacaggtaattcttgatgctatcaaaagcctcttggcattcatcatttcataccacaggttga 5583  T
Q  108 ttgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgct 207  Q
    || || |||||||  ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  5584 tttttcctgagtagcttgaagatcggcccgcaggtggcagtcatgtgagatatgaaccttgagatataattcaaacgcccgagaaaacctctgacttgct 5683  T
Q  208 tttcggtctg 217  Q
    | || |||||    
T  5684 tctcagtctg 5693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1888 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1888
Description:

Target: scaffold1888; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 111 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 1263 - 1155
Alignment:
Q  111 tttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattcaaacgcccgaggaaacctcggacttgctttt 210  Q
    ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||  |||||||||||| ||||||||| |    
T  1263 tttctgagtagcttgaagatcggcccgcaggttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgttattcattcgttcgaggaaacctctgacttgcttct 1164  T
Q  211 cggtctgtg 219  Q
    |||||||||    
T  1163 cggtctgtg 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 6 - 209
Target Start/End: Original strand, 43541 - 43754
Alignment:
Q  6 ggccttccttccactggcaggacaaggata-ggtggttccaacagataatct-ttgttgctatc--aaaggcttcctggcattcatt--attccacacaa 99  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||| ||| |||| | ||| ||||||   ||| ||||| ||||||||| |  |||||| ||||    
T  43541 ggccttccttccacgggtgggacaaggataaggtggttccagcaggtaatttcttgatgctatacaaaaagcttcttggcattcaattaattccatacaa 43640  T
Q  100 taggt-tgattgtttctga-gtaatttgaaaattggcccgcaggtt-gcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaa-ttcaaacgcccgaggaaac 195  Q
    ||||  ||||| ||||| | |||  ||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||    
T  43641 taggactgattctttctaaagtagcttgaagatcggcccgcaggtttgcggtcatgtgagatatgaatcgggagatgtaattttaagcgtccgaggaaac 43740  T
Q  196 ctcggacttgcttt 209  Q
    ||| ||||||||||    
T  43741 ctctgacttgcttt 43754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 180
Target Start/End: Original strand, 35161 - 35225
Alignment:
Q  116 gagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaattca 180  Q
    |||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  35161 gagtaatttgaatatcggcccgcacgttgccgtcatatgagaaatgaaacgggagatgtaattca 35225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 33770 - 33706
Alignment:
Q  144 gcggtcatatgagatat-gaa-tcgggagatgtaattcaaacg-cccgaggaaacctcggacttg 205  Q
    |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  33770 gcggtcatgtgagatatagaagtcgggagatgtaattcaaacgccccgaggaaacctctgacttg 33706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 91 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 29530 - 29443
Alignment:
Q  91 tccacacaataggttgattgtttctgagtaatttgaaaattggcccgcaggttgcggtcatatgagatatgaatcgggagatgtaatt 178  Q
    |||||||||||  ||| || || | ||||| |||||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29530 tccacacaataccttgttttttgcggagtagtttgaatatcggcccacaagttgcagtcatatgagaaatgaaccgggagatgtaatt 29443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University