View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0759_low_78 (Length: 277)

Name: NF0759_low_78
Description: NF0759
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0759_low_78
NF0759_low_78
[»] chr8 (65 HSPs)
chr8 (1-257)||(5866139-5866395)
chr8 (1-257)||(21490995-21491251)
chr8 (1-257)||(17140916-17141172)
chr8 (1-257)||(21249384-21249640)
chr8 (1-257)||(21255222-21255478)
chr8 (1-253)||(26355562-26355815)
chr8 (92-257)||(38855205-38855372)
chr8 (1-257)||(6520368-6520626)
chr8 (1-257)||(23760703-23760962)
chr8 (92-241)||(21285613-21285765)
chr8 (1-241)||(21673720-21673962)
chr8 (1-238)||(20498581-20498822)
chr8 (83-257)||(17612053-17612231)
chr8 (91-241)||(983357-983511)
chr8 (142-257)||(22626736-22626850)
chr8 (159-257)||(31971257-31971354)
chr8 (134-260)||(6759255-6759381)
chr8 (159-257)||(16199668-16199765)
chr8 (180-257)||(21396024-21396101)
chr8 (180-257)||(21790517-21790594)
chr8 (185-257)||(21919050-21919121)
chr8 (89-250)||(13508034-13508199)
chr8 (142-256)||(28649050-28649164)
chr8 (156-250)||(13597637-13597731)
chr8 (144-257)||(18818417-18818530)
chr8 (180-257)||(21389494-21389571)
chr8 (180-257)||(21778820-21778897)
chr8 (185-257)||(7372778-7372849)
chr8 (142-257)||(16092348-16092463)
chr8 (185-257)||(18879281-18879352)
chr8 (185-257)||(23406379-23406450)
chr8 (186-257)||(45131047-45131117)
chr8 (187-257)||(21923980-21924049)
chr8 (185-257)||(20536208-20536279)
chr8 (142-257)||(22875065-22875179)
chr8 (91-238)||(37116366-37116518)
chr8 (89-254)||(14409438-14409606)
chr8 (89-254)||(1484402-1484570)
chr8 (89-254)||(5853286-5853454)
chr8 (89-254)||(15203225-15203393)
chr8 (89-254)||(20403227-20403395)
chr8 (89-254)||(22001753-22001921)
chr8 (186-238)||(24353039-24353091)
chr8 (195-254)||(4542477-4542535)
chr8 (142-238)||(17266998-17267096)
chr8 (91-238)||(17439457-17439609)
chr8 (195-254)||(19896265-19896323)
chr8 (195-254)||(20046299-20046357)
chr8 (204-254)||(26225359-26225409)
chr8 (142-250)||(16413367-16413474)
chr8 (185-238)||(19154936-19154989)
chr8 (204-260)||(19937118-19937174)
chr8 (89-254)||(41598188-41598356)
chr8 (204-254)||(26219717-26219767)
chr8 (204-250)||(45290807-45290853)
chr8 (204-241)||(15070571-15070608)
chr8 (89-254)||(4483281-4483448)
chr8 (204-238)||(19801493-19801527)
chr8 (204-254)||(25484380-25484430)
chr8 (89-150)||(18862427-18862488)
chr8 (89-150)||(21383920-21383981)
chr8 (89-150)||(21387340-21387401)
chr8 (89-150)||(21411213-21411274)
chr8 (89-150)||(21805705-21805766)
chr8 (89-150)||(21827796-21827857)
[»] chr7 (72 HSPs)
chr7 (1-257)||(34200786-34201042)
chr7 (1-257)||(28505163-28505419)
chr7 (1-257)||(11995892-11996148)
chr7 (1-257)||(15754751-15755008)
chr7 (89-257)||(16495402-16495570)
chr7 (1-257)||(67745-68003)
chr7 (4-253)||(18005650-18005902)
chr7 (1-253)||(44014182-44014431)
chr7 (1-257)||(16219579-16219835)
chr7 (92-253)||(811084-811248)
chr7 (92-257)||(47831807-47831975)
chr7 (1-241)||(16056344-16056586)
chr7 (92-257)||(22072913-22073083)
chr7 (142-257)||(2280125-2280238)
chr7 (89-257)||(13647325-13647497)
chr7 (142-254)||(3564370-3564482)
chr7 (185-257)||(16386297-16386369)
chr7 (142-257)||(38227481-38227595)
chr7 (159-257)||(12698831-12698930)
chr7 (158-257)||(19486766-19486865)
chr7 (187-257)||(27847881-27847951)
chr7 (156-257)||(10063838-10063939)
chr7 (25-241)||(12901339-12901559)
chr7 (186-255)||(40443393-40443462)
chr7 (185-257)||(9509189-9509260)
chr7 (142-254)||(18456419-18456530)
chr7 (25-238)||(20220075-20220290)
chr7 (1-119)||(15113084-15113202)
chr7 (1-119)||(15116621-15116739)
chr7 (185-257)||(10589039-10589110)
chr7 (185-257)||(26211995-26212067)
chr7 (142-254)||(48273392-48273504)
chr7 (89-254)||(17061909-17062077)
chr7 (89-257)||(18430709-18430880)
chr7 (154-228)||(12255809-12255885)
chr7 (89-254)||(456321-456489)
chr7 (89-254)||(11972496-11972664)
chr7 (89-254)||(14949116-14949284)
chr7 (89-254)||(15376707-15376875)
chr7 (89-254)||(16232520-16232688)
chr7 (89-254)||(18640272-18640440)
chr7 (89-254)||(20385117-20385285)
chr7 (89-254)||(21189589-21189757)
chr7 (89-254)||(24702238-24702406)
chr7 (89-254)||(32125491-32125659)
chr7 (89-254)||(41522917-41523085)
chr7 (89-254)||(41525379-41525547)
chr7 (195-254)||(3386333-3386391)
chr7 (89-253)||(11393281-11393448)
chr7 (186-241)||(14044762-14044817)
chr7 (186-241)||(14354792-14354847)
chr7 (195-254)||(16213684-16213742)
chr7 (195-254)||(16410059-16410117)
chr7 (195-254)||(24704688-24704746)
chr7 (91-241)||(1867946-1868100)
chr7 (204-254)||(13869346-13869396)
chr7 (1-63)||(16324202-16324264)
chr7 (204-254)||(20110556-20110606)
chr7 (142-250)||(24275175-24275282)
chr7 (142-254)||(44116509-44116620)
chr7 (89-254)||(27216860-27217028)
chr7 (194-241)||(15144096-15144142)
chr7 (204-254)||(13831373-13831423)
chr7 (186-228)||(14036283-14036325)
chr7 (186-228)||(14346313-14346355)
chr7 (142-234)||(15008504-15008597)
chr7 (188-239)||(18154894-18154944)
chr7 (185-228)||(48991209-48991252)
chr7 (204-250)||(38898489-38898535)
chr7 (1-63)||(47832004-47832066)
chr7 (91-151)||(14044857-14044917)
chr7 (91-151)||(14354887-14354947)
[»] chr5 (59 HSPs)
chr5 (1-257)||(19660700-19660956)
chr5 (1-253)||(22959397-22959649)
chr5 (1-257)||(19668898-19669156)
chr5 (1-253)||(21565546-21565801)
chr5 (1-257)||(21329359-21329618)
chr5 (1-257)||(21502016-21502277)
chr5 (1-238)||(20026802-20027043)
chr5 (1-257)||(26011897-26012154)
chr5 (156-257)||(36314577-36314678)
chr5 (185-257)||(21729114-21729185)
chr5 (185-257)||(21808439-21808510)
chr5 (185-257)||(8286893-8286964)
chr5 (185-257)||(21997584-21997655)
chr5 (142-257)||(24493569-24493683)
chr5 (89-257)||(40725853-40726025)
chr5 (142-257)||(1096467-1096582)
chr5 (142-238)||(22144068-22144164)
chr5 (185-257)||(23390546-23390617)
chr5 (185-257)||(25421532-25421603)
chr5 (142-257)||(13025311-13025425)
chr5 (142-257)||(13095495-13095609)
chr5 (186-257)||(21293020-21293090)
chr5 (180-250)||(37723910-37723980)
chr5 (185-254)||(24529223-24529291)
chr5 (185-257)||(9077952-9078023)
chr5 (185-257)||(22075018-22075090)
chr5 (142-254)||(22412187-22412298)
chr5 (89-136)||(36314672-36314719)
chr5 (89-254)||(264762-264930)
chr5 (89-254)||(20909012-20909180)
chr5 (185-257)||(25431395-25431465)
chr5 (89-254)||(29329934-29330102)
chr5 (89-254)||(39363384-39363552)
chr5 (195-254)||(10733044-10733102)
chr5 (195-254)||(11581303-11581361)
chr5 (195-254)||(20918052-20918110)
chr5 (91-238)||(22178171-22178323)
chr5 (195-254)||(39245136-39245194)
chr5 (204-254)||(2154726-2154776)
chr5 (204-254)||(36154892-36154942)
chr5 (204-254)||(38619434-38619484)
chr5 (204-253)||(23064512-23064561)
chr5 (206-254)||(10775790-10775838)
chr5 (89-254)||(42245359-42245527)
chr5 (195-241)||(20902113-20902158)
chr5 (204-254)||(29345980-29346030)
chr5 (204-254)||(31061068-31061118)
chr5 (204-251)||(18319146-18319193)
chr5 (207-254)||(29348453-29348500)
chr5 (207-254)||(29350926-29350973)
chr5 (204-254)||(20806854-20806904)
chr5 (187-241)||(26732884-26732937)
chr5 (204-254)||(32027393-32027443)
chr5 (89-150)||(10753627-10753688)
chr5 (89-150)||(22120146-22120207)
chr5 (204-253)||(26704075-26704124)
chr5 (204-253)||(26973808-26973857)
chr5 (1-49)||(21741407-21741455)
chr5 (92-148)||(21741486-21741541)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (1-257)||(11292-11548)
scaffold0046 (25-257)||(1997-2229)
scaffold0046 (201-257)||(4552-4608)
scaffold0046 (185-257)||(28414-28485)
[»] scaffold0175 (2 HSPs)
scaffold0175 (1-257)||(34123-34379)
scaffold0175 (204-257)||(273-326)
[»] chr6 (72 HSPs)
chr6 (1-257)||(28496336-28496592)
chr6 (1-257)||(29808747-29809003)
chr6 (1-257)||(1561303-1561560)
chr6 (1-253)||(19652199-19652452)
chr6 (1-241)||(19668387-19668631)
chr6 (1-238)||(23019425-23019665)
chr6 (1-257)||(20109140-20109400)
chr6 (156-257)||(27333238-27333339)
chr6 (156-257)||(27393978-27394079)
chr6 (92-241)||(9098466-9098619)
chr6 (144-257)||(20076700-20076812)
chr6 (141-241)||(4185826-4185926)
chr6 (185-257)||(16496244-16496315)
chr6 (159-257)||(35245586-35245682)
chr6 (89-257)||(8227460-8227632)
chr6 (180-257)||(16920674-16920751)
chr6 (142-257)||(29060540-29060655)
chr6 (141-241)||(4186383-4186483)
chr6 (189-257)||(22831503-22831571)
chr6 (181-241)||(25644336-25644396)
chr6 (159-257)||(17287819-17287917)
chr6 (142-256)||(18409833-18409947)
chr6 (142-257)||(19303547-19303661)
chr6 (185-257)||(20638333-20638404)
chr6 (89-254)||(22782227-22782395)
chr6 (188-257)||(20361013-20361081)
chr6 (142-257)||(20593773-20593888)
chr6 (142-256)||(30676761-30676874)
chr6 (192-254)||(25656629-25656690)
chr6 (195-257)||(25714417-25714478)
chr6 (141-202)||(4668216-4668277)
chr6 (141-202)||(4675063-4675124)
chr6 (204-257)||(22780295-22780348)
chr6 (204-257)||(25629423-25629476)
chr6 (142-254)||(25754809-25754920)
chr6 (89-254)||(1595549-1595717)
chr6 (89-254)||(2291174-2291342)
chr6 (89-254)||(12742317-12742485)
chr6 (89-254)||(18334586-18334754)
chr6 (89-254)||(19005046-19005214)
chr6 (89-254)||(19858913-19859081)
chr6 (89-254)||(24422547-24422715)
chr6 (89-254)||(33861794-33861962)
chr6 (89-254)||(33864278-33864446)
chr6 (195-254)||(8055029-8055087)
chr6 (194-245)||(11185517-11185568)
chr6 (195-254)||(26924744-26924802)
chr6 (1-198)||(22080601-22080800)
chr6 (1-238)||(35008167-35008409)
chr6 (186-238)||(23076749-23076801)
chr6 (195-254)||(1541015-1541073)
chr6 (195-254)||(3852121-3852179)
chr6 (195-254)||(20556996-20557054)
chr6 (94-253)||(31155354-31155514)
chr6 (1-63)||(9098387-9098449)
chr6 (1-63)||(27333147-27333209)
chr6 (1-63)||(27393887-27393949)
chr6 (193-254)||(25688502-25688562)
chr6 (195-256)||(34963371-34963431)
chr6 (204-251)||(16448639-16448686)
chr6 (195-238)||(18456735-18456777)
chr6 (195-238)||(18461895-18461937)
chr6 (195-238)||(18821904-18821946)
chr6 (210-257)||(22080799-22080846)
chr6 (185-236)||(33443068-33443118)
chr6 (2-60)||(4668077-4668135)
chr6 (2-60)||(4674924-4674982)
chr6 (89-150)||(22949408-22949469)
chr6 (89-150)||(22953364-22953425)
chr6 (89-150)||(23871852-23871913)
chr6 (89-150)||(23875808-23875869)
chr6 (89-150)||(27325385-27325446)
[»] chr4 (67 HSPs)
chr4 (1-257)||(15551817-15552072)
chr4 (1-219)||(16596686-16596904)
chr4 (1-253)||(12774011-12774256)
chr4 (1-253)||(8846360-8846631)
chr4 (1-241)||(12288071-12288315)
chr4 (1-238)||(13712-13953)
chr4 (1-257)||(39706151-39706409)
chr4 (15-241)||(43198428-43198660)
chr4 (142-241)||(52243200-52243301)
chr4 (185-257)||(3096293-3096364)
chr4 (185-257)||(12902757-12902828)
chr4 (185-257)||(17046487-17046559)
chr4 (185-257)||(7088877-7088948)
chr4 (185-257)||(7798774-7798845)
chr4 (142-254)||(16377529-16377639)
chr4 (185-257)||(52873417-52873488)
chr4 (142-257)||(6899891-6900005)
chr4 (154-257)||(16270254-16270356)
chr4 (185-250)||(23374409-23374473)
chr4 (185-257)||(7893703-7893774)
chr4 (142-257)||(16239976-16240090)
chr4 (159-257)||(14053325-14053422)
chr4 (89-254)||(18215268-18215436)
chr4 (187-255)||(22636437-22636504)
chr4 (185-257)||(44052829-44052900)
chr4 (142-256)||(19618223-19618336)
chr4 (142-254)||(14280316-14280427)
chr4 (142-254)||(23803316-23803427)
chr4 (185-254)||(44928974-44929042)
chr4 (142-254)||(51463919-51464030)
chr4 (142-254)||(54798760-54798872)
chr4 (89-254)||(12301-12469)
chr4 (142-254)||(8574875-8574985)
chr4 (89-254)||(15118346-15118514)
chr4 (204-260)||(19242693-19242749)
chr4 (89-254)||(44615288-44615456)
chr4 (89-254)||(44773081-44773249)
chr4 (89-254)||(52312510-52312678)
chr4 (195-254)||(1837613-1837671)
chr4 (195-254)||(7641286-7641344)
chr4 (195-254)||(12610950-12611008)
chr4 (185-252)||(14038653-14038719)
chr4 (188-255)||(22353835-22353901)
chr4 (146-238)||(46640464-46640558)
chr4 (195-254)||(50222443-50222501)
chr4 (188-238)||(6190481-6190531)
chr4 (204-254)||(18239531-18239581)
chr4 (204-254)||(44102214-44102264)
chr4 (204-257)||(15367690-15367743)
chr4 (204-257)||(15370018-15370071)
chr4 (204-257)||(15371202-15371255)
chr4 (204-257)||(15373483-15373536)
chr4 (204-257)||(15402703-15402756)
chr4 (204-257)||(16223532-16223585)
chr4 (186-238)||(53082202-53082254)
chr4 (195-254)||(3515007-3515065)
chr4 (204-250)||(15355437-15355483)
chr4 (1-49)||(15099559-15099607)
chr4 (89-150)||(630725-630786)
chr4 (89-150)||(3331994-3332055)
chr4 (89-150)||(13812760-13812821)
chr4 (89-150)||(14953912-14953973)
chr4 (204-241)||(14970819-14970856)
chr4 (91-148)||(15099461-15099517)
chr4 (91-148)||(15190428-15190484)
chr4 (89-150)||(25690170-25690231)
chr4 (1-49)||(15190526-15190574)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (1-254)||(15664-15917)
[»] chr1 (57 HSPs)
chr1 (1-241)||(20918620-20918860)
chr1 (89-257)||(14295504-14295672)
chr1 (1-257)||(33681010-33681266)
chr1 (8-253)||(20248283-20248527)
chr1 (1-241)||(52927844-52928075)
chr1 (1-257)||(22237630-22237887)
chr1 (86-204)||(22130857-22130975)
chr1 (1-253)||(22921731-22921986)
chr1 (1-250)||(21754052-21754294)
chr1 (89-189)||(51130632-51130732)
chr1 (1-238)||(21861431-21861672)
chr1 (91-238)||(35261032-35261180)
chr1 (1-238)||(21896120-21896358)
chr1 (88-257)||(45574835-45575008)
chr1 (186-257)||(20847205-20847275)
chr1 (142-256)||(50210219-50210333)
chr1 (159-241)||(16758665-16758749)
chr1 (180-257)||(38801432-38801508)
chr1 (185-257)||(27250779-27250850)
chr1 (185-254)||(34509783-34509851)
chr1 (185-257)||(21026680-21026751)
chr1 (188-256)||(20454606-20454673)
chr1 (185-257)||(22532269-22532340)
chr1 (142-238)||(50614121-50614219)
chr1 (142-238)||(50621949-50622047)
chr1 (142-255)||(21840766-21840878)
chr1 (204-257)||(13212974-13213027)
chr1 (89-254)||(13988866-13989034)
chr1 (141-253)||(21161720-21161831)
chr1 (204-260)||(21342090-21342146)
chr1 (89-254)||(21923285-21923453)
chr1 (89-254)||(22123061-22123230)
chr1 (89-254)||(433012-433178)
chr1 (1-64)||(12271743-12271806)
chr1 (142-238)||(16368291-16368388)
chr1 (195-254)||(23593839-23593897)
chr1 (195-254)||(29298137-29298195)
chr1 (195-254)||(29776688-29776746)
chr1 (195-254)||(31612313-31612371)
chr1 (204-254)||(21346961-21347011)
chr1 (204-254)||(21707167-21707217)
chr1 (204-254)||(21711709-21711759)
chr1 (204-260)||(15860121-15860177)
chr1 (1-133)||(20636975-20637107)
chr1 (89-254)||(21475081-21475249)
chr1 (142-238)||(41050040-41050138)
chr1 (206-256)||(16361915-16361965)
chr1 (204-253)||(21714546-21714595)
chr1 (92-238)||(16093836-16093987)
chr1 (188-256)||(22468749-22468816)
chr1 (1-49)||(49261550-49261598)
chr1 (187-238)||(50686630-50686681)
chr1 (204-254)||(16275476-16275526)
chr1 (186-228)||(26064967-26065009)
chr1 (89-150)||(1924911-1924972)
chr1 (89-150)||(20923925-20923986)
chr1 (1-49)||(35981550-35981598)
[»] chr3 (82 HSPs)
chr3 (1-257)||(13210191-13210448)
chr3 (29-253)||(12174152-12174376)
chr3 (1-253)||(16097332-16097587)
chr3 (1-253)||(16103784-16104038)
chr3 (1-250)||(32307684-32307926)
chr3 (1-253)||(9512924-9513166)
chr3 (1-253)||(9520899-9521141)
chr3 (92-257)||(15470927-15471092)
chr3 (1-253)||(49667947-49668193)
chr3 (92-257)||(14234487-14234655)
chr3 (1-148)||(49389492-49389639)
chr3 (1-250)||(1644546-1644787)
chr3 (142-257)||(12399209-12399324)
chr3 (142-238)||(52523733-52523831)
chr3 (89-257)||(24340672-24340844)
chr3 (142-257)||(14972854-14972969)
chr3 (142-257)||(18438534-18438649)
chr3 (134-257)||(11424758-11424880)
chr3 (1-80)||(12934174-12934253)
chr3 (89-257)||(37642214-37642386)
chr3 (156-257)||(23274687-23274788)
chr3 (1-238)||(37251029-37251270)
chr3 (185-257)||(20698485-20698556)
chr3 (154-254)||(27165250-27165350)
chr3 (154-254)||(53301569-53301669)
chr3 (89-257)||(43550472-43550644)
chr3 (185-257)||(13442274-13442345)
chr3 (185-257)||(23083411-23083482)
chr3 (192-254)||(28194693-28194755)
chr3 (185-257)||(17487856-17487927)
chr3 (185-257)||(17499338-17499409)
chr3 (142-254)||(24153215-24153326)
chr3 (185-257)||(26686887-26686958)
chr3 (159-241)||(14572605-14572686)
chr3 (89-257)||(22147474-22147646)
chr3 (142-254)||(17672626-17672737)
chr3 (89-254)||(7781341-7781509)
chr3 (142-257)||(25476391-25476506)
chr3 (142-254)||(36166598-36166708)
chr3 (142-238)||(43925977-43926075)
chr3 (99-254)||(29172587-29172745)
chr3 (144-238)||(22110358-22110454)
chr3 (89-254)||(9707601-9707769)
chr3 (89-254)||(17463178-17463346)
chr3 (89-254)||(34159326-34159494)
chr3 (185-257)||(43840932-43841003)
chr3 (89-254)||(45606901-45607069)
chr3 (89-254)||(55476491-55476659)
chr3 (195-254)||(6469238-6469296)
chr3 (195-254)||(15977515-15977573)
chr3 (195-254)||(17737236-17737294)
chr3 (195-254)||(28848715-28848773)
chr3 (195-254)||(55500942-55501000)
chr3 (204-254)||(8499518-8499568)
chr3 (204-254)||(10556985-10557035)
chr3 (142-255)||(13544024-13544136)
chr3 (204-254)||(15412429-15412479)
chr3 (89-252)||(16282805-16282971)
chr3 (185-239)||(42386428-42386481)
chr3 (204-254)||(45577950-45578000)
chr3 (142-250)||(12567564-12567671)
chr3 (142-254)||(40213727-40213838)
chr3 (142-254)||(50242822-50242933)
chr3 (89-254)||(8899094-8899262)
chr3 (89-254)||(16454275-16454443)
chr3 (89-254)||(38961885-38962053)
chr3 (204-252)||(41123892-41123940)
chr3 (142-238)||(12377940-12378038)
chr3 (142-241)||(21618462-21618559)
chr3 (188-238)||(606378-606428)
chr3 (204-254)||(10247835-10247885)
chr3 (204-254)||(12119837-12119887)
chr3 (204-254)||(44494809-44494859)
chr3 (89-254)||(13151784-13151953)
chr3 (89-254)||(13154249-13154418)
chr3 (193-238)||(53070755-53070799)
chr3 (185-241)||(14576882-14576937)
chr3 (1-44)||(1465273-1465316)
chr3 (195-254)||(17446759-17446816)
chr3 (91-148)||(1465363-1465419)
chr3 (89-150)||(19776031-19776092)
chr3 (89-150)||(37439418-37439479)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (1-238)||(6831-7068)
scaffold0556 (1-175)||(8097-8274)
[»] chr2 (63 HSPs)
chr2 (36-257)||(23071849-23072070)
chr2 (1-253)||(25175854-25176109)
chr2 (1-252)||(28405981-28406236)
chr2 (1-256)||(22134079-22134326)
chr2 (94-253)||(7679589-7679750)
chr2 (89-257)||(19671830-19672001)
chr2 (1-241)||(18786764-18787008)
chr2 (159-257)||(38138-38235)
chr2 (180-257)||(20309108-20309185)
chr2 (89-254)||(22105412-22105581)
chr2 (185-254)||(298864-298933)
chr2 (1-227)||(7594-7824)
chr2 (185-257)||(23060513-23060584)
chr2 (185-257)||(23103445-23103516)
chr2 (185-257)||(23285865-23285936)
chr2 (89-257)||(23708568-23708738)
chr2 (1-119)||(22459423-22459541)
chr2 (185-257)||(23076442-23076513)
chr2 (159-257)||(23654409-23654507)
chr2 (142-257)||(23660023-23660137)
chr2 (187-257)||(22731286-22731355)
chr2 (185-257)||(8946657-8946728)
chr2 (185-257)||(22337115-22337186)
chr2 (193-257)||(23040247-23040310)
chr2 (1-238)||(23207296-23207537)
chr2 (89-254)||(6725995-6726163)
chr2 (204-257)||(22738247-22738300)
chr2 (1-238)||(23791292-23791534)
chr2 (89-254)||(18808943-18809111)
chr2 (89-254)||(23130862-23131030)
chr2 (89-254)||(23133329-23133497)
chr2 (89-254)||(23709526-23709694)
chr2 (89-254)||(23712007-23712175)
chr2 (89-254)||(26505379-26505547)
chr2 (89-254)||(26507857-26508025)
chr2 (89-254)||(34402516-34402684)
chr2 (89-254)||(39682313-39682481)
chr2 (195-254)||(571397-571455)
chr2 (195-254)||(23135590-23135648)
chr2 (204-254)||(28577099-28577149)
chr2 (204-254)||(32039610-32039660)
chr2 (204-254)||(38967374-38967424)
chr2 (204-254)||(45029966-45030016)
chr2 (195-252)||(43137301-43137357)
chr2 (186-238)||(20520243-20520295)
chr2 (195-251)||(21155164-21155219)
chr2 (89-254)||(24367774-24367942)
chr2 (195-251)||(24643054-24643109)
chr2 (204-256)||(32215033-32215085)
chr2 (204-254)||(24529641-24529691)
chr2 (188-238)||(32451981-32452031)
chr2 (185-238)||(22413187-22413240)
chr2 (89-254)||(24898189-24898358)
chr2 (89-254)||(24900672-24900841)
chr2 (89-254)||(24903149-24903318)
chr2 (89-254)||(24905626-24905795)
chr2 (89-254)||(24908101-24908270)
chr2 (186-238)||(23004767-23004819)
chr2 (186-238)||(25108906-25108958)
chr2 (186-236)||(23287384-23287433)
chr2 (89-150)||(1283690-1283751)
chr2 (187-236)||(26392403-26392451)
chr2 (89-150)||(30344773-30344834)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (1-210)||(29142-29354)
scaffold0218 (1-241)||(7938-8179)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (1-253)||(45654-45909)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (1-241)||(10403-10646)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (89-257)||(1022-1190)
[»] scaffold0161 (2 HSPs)
scaffold0161 (1-188)||(2307-2494)
scaffold0161 (229-257)||(2493-2521)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (1-241)||(129921-130164)
scaffold0010 (142-238)||(60721-60818)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (1-253)||(160688-160942)
scaffold0001 (195-250)||(501088-501142)
scaffold0001 (204-254)||(85692-85742)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (1-253)||(133-387)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (1-241)||(22536-22775)
scaffold0037 (142-254)||(82072-82183)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (1-257)||(6535-6793)
scaffold0621 (1-241)||(8482-8728)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (1-253)||(19268-19523)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (1-257)||(12766-13025)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (1-239)||(62216-62454)
scaffold0028 (1-253)||(132662-132910)
scaffold0028 (89-254)||(136680-136848)
scaffold0028 (89-254)||(139149-139317)
scaffold0028 (89-254)||(144087-144255)
scaffold0028 (89-254)||(134211-134379)
scaffold0028 (89-254)||(141618-141786)
[»] scaffold0023 (8 HSPs)
scaffold0023 (1-253)||(100378-100633)
scaffold0023 (1-253)||(40036-40291)
scaffold0023 (184-257)||(119875-119948)
scaffold0023 (176-253)||(101503-101580)
scaffold0023 (89-254)||(94411-94579)
scaffold0023 (195-254)||(44454-44512)
scaffold0023 (204-250)||(17552-17598)
scaffold0023 (1-37)||(101616-101652)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (1-241)||(1098-1341)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (1-257)||(5985-6244)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (1-241)||(5659-5901)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (1-241)||(10543-10786)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (1-253)||(2507-2762)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (1-253)||(14559-14814)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (1-257)||(6611-6870)
scaffold0333 (1-257)||(13991-14250)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (6-253)||(32102-32345)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (1-227)||(53410-53640)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (1-257)||(32538-32794)
scaffold0034 (188-238)||(51936-51985)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (92-257)||(987-1155)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (1-253)||(2666-2923)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (92-257)||(12942-13107)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (1-238)||(12587-12827)
[»] scaffold0020 (3 HSPs)
scaffold0020 (154-257)||(15795-15898)
scaffold0020 (1-63)||(15694-15756)
scaffold0020 (204-253)||(178898-178947)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (1-236)||(7920-8161)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (154-257)||(23901-24001)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (142-256)||(3192-3306)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (142-257)||(3157-3271)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (89-257)||(11464-11636)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (1-103)||(28673-28775)
scaffold0211 (181-253)||(28814-28887)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (89-257)||(38205-38377)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (159-257)||(10448-10544)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (159-257)||(1289-1385)
scaffold0106 (180-257)||(7266-7343)
scaffold0106 (188-254)||(15291-15356)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (180-257)||(16282-16359)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (180-257)||(51582-51659)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (142-257)||(4849-4964)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (180-256)||(174767-174843)
scaffold0021 (1-238)||(136229-136471)
scaffold0021 (1-238)||(144937-145179)
scaffold0021 (187-257)||(121766-121835)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (159-238)||(1051-1130)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (142-241)||(16106-16205)
scaffold0357 (142-238)||(13147-13243)
scaffold0357 (186-238)||(2680-2732)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (142-241)||(27755-27854)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (186-257)||(32067-32137)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (159-257)||(13497-13594)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (89-257)||(17976-18148)
scaffold0247 (204-254)||(2241-2291)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (159-257)||(15487-15584)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (142-255)||(39479-39591)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (142-250)||(26071-26179)
scaffold0122 (142-254)||(44713-44825)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (142-255)||(75221-75333)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (185-257)||(1098-1169)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (1-199)||(2080-2281)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (185-257)||(4712-4783)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (154-254)||(38720-38820)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (185-257)||(168028-168099)
scaffold0011 (189-257)||(51913-51980)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (159-257)||(1074-1170)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (142-257)||(38761-38875)
scaffold0145 (154-257)||(32942-33044)
scaffold0145 (195-259)||(9744-9807)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (142-257)||(32963-33077)
scaffold0120 (142-257)||(45928-46042)
scaffold0120 (185-257)||(16113-16184)
scaffold0120 (195-257)||(17389-17450)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (185-256)||(17267-17337)
scaffold0056 (195-238)||(79388-79430)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (187-257)||(46995-47065)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (159-254)||(5153-5246)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (185-257)||(13211-13282)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (185-257)||(1851-1922)
scaffold0016 (84-150)||(207465-207531)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (154-257)||(39913-40015)
scaffold0080 (142-238)||(19889-19987)
scaffold0080 (89-150)||(48936-48997)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (154-257)||(25896-25998)
scaffold0026 (154-257)||(39858-39960)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (91-241)||(25122-25276)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (159-257)||(8556-8650)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (185-257)||(1952-2023)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (185-257)||(3470-3541)
scaffold0292 (185-257)||(343-414)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (1-241)||(103500-103736)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (159-254)||(339972-340065)
scaffold0003 (89-254)||(158444-158612)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (185-257)||(6171-6245)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (91-238)||(128921-129072)
scaffold0022 (204-254)||(116430-116480)
scaffold0022 (142-234)||(78345-78438)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (144-257)||(16608-16721)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (185-257)||(8479-8550)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (185-257)||(11493-11564)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (181-257)||(20910-20986)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (190-257)||(4888-4954)
[»] scaffold1137 (1 HSPs)
scaffold1137 (1-103)||(2165-2267)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (142-255)||(10772-10884)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (92-238)||(6235-6386)
scaffold0420 (191-238)||(13793-13840)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (185-239)||(24353-24406)
[»] scaffold0475 (2 HSPs)
scaffold0475 (141-202)||(9133-9194)
scaffold0475 (2-60)||(9275-9333)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (89-254)||(20747-20915)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (89-254)||(37821-37989)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (142-238)||(569-666)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (195-254)||(13392-13450)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (195-254)||(22886-22944)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (195-254)||(16784-16842)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (89-238)||(20373-20524)
scaffold0031 (203-257)||(128751-128805)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (91-238)||(97024-97176)
scaffold0006 (91-238)||(106302-106454)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (142-254)||(4694-4805)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (185-234)||(38339-38388)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (195-251)||(4300-4355)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (195-255)||(9241-9300)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (89-254)||(13947-14115)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (195-254)||(106-164)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (142-236)||(4545-4639)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (195-254)||(40400-40458)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (208-254)||(161206-161252)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (195-256)||(12353-12413)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (204-253)||(23843-23892)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (195-240)||(29946-29990)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (204-253)||(36454-36503)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (185-238)||(2694-2747)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (206-254)||(4214-4262)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (210-254)||(12064-12108)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (185-257)||(4508-4578)
scaffold0228 (185-257)||(12090-12160)
scaffold0228 (185-257)||(22042-22112)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (195-238)||(11982-12024)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (204-251)||(1393-1440)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (142-256)||(11286-11399)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (89-150)||(30-91)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 65)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 5866139 - 5866395
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  5866139 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 5866238  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5866239 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgc 5866338  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5866339 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 5866395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21491251 - 21490995
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  21491251 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcctatgaattaatgttgcttataatgttat 21491152  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21491151 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcaatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgc 21491052  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21491051 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21490995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 17141172 - 17140916
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  17141172 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 17141073  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17141072 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgatgatttacattcgatattattatgtcatgatggattgcatactgcctatgttgc 17140973  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17140972 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 17140916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21249640 - 21249384
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  || ||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  21249640 atgtgagtttatcttagaggttaggaactaagttgtt-accctgctgttaatgtctcactaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 21249542  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  21249541 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgaattgcatactgcttatgttgc 21249442  T
Q  201 t-gtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21249441 tatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21249384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21255478 - 21255222
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  || ||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  21255478 atgtgagtttatcttagaggttaggaactaagttgtt-accctgctgttaatgtctcactaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 21255380  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  21255379 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgaattgcatactgcttatgttgc 21255280  T
Q  201 t-gtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21255279 tatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21255222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 26355562 - 26355815
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||  || || ||||||||||||    
T  26355562 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatctttttgttattgttctagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttat 26355661  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat--ttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgtt 198  Q
    |||||||||||||||||| |||   || | |||||   |||| ||||| |  || ||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  26355662 ataattgtatatacattaaatggaatatg-ttgatggctgagatgttgttgattgcattcgatattgttatatcgtgatgatttgcatactgcctatgtt 26355760  T
Q  199 gctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  26355761 gttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 26355815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 92 - 257
Target Start/End: Original strand, 38855205 - 38855372
Alignment:
Q  92 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatac 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  38855205 taatgttatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 38855303  T
Q  189 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  38855304 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 38855372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 6520626 - 6520368
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||  |||| |||||||  |||    ||| |  || || || |  |||||||||    
T  6520626 atgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttat 6520527  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtt--tgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgtt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||  || | ||   |||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  6520526 ataattgtatatacattacatgaattatgttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgtt 6520427  T
Q  199 gctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  6520426 gctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6520368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 23760703 - 23760962
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttc---cagtaagattga-tgcatatgaattagtgatgcttataatg 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||    |||||||  ||| |  ||||||  || || || |  |||||    
T  23760703 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgttgttgttgttgtttcagtaagcctgaataaatatgatctaatgttgttgttaatg 23760802  T
Q  97 ttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcct 193  Q
     ||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   ||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||  || ||||||||||    
T  23760803 gtatataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgaattcaatattgttatatcatgatgatttacatactgcct 23760901  T
Q  194 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  23760902 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 23760962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 92 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21285765 - 21285613
Alignment:
Q  92 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatac 188  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||  |||||   |||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||  ||||||||    
T  21285765 taatgatatataattgtatatacattacatgaactatgtttgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatac 21285666  T
Q  189 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  21285665 tgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttg 21285613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21673962 - 21673720
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattga-tgcatatgaattagtgatgcttataatgtta 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||  |||| ||||||| |||| |  ||||||  || || || |  ||||| ||    
T  21673962 atgtgagttgatattagaggttaaaaactaagttgtt-atcttgttgttgttgtttcagtaagcttgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggta 21673864  T
Q  100 tataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatg 196  Q
    ||||||||||||||||||| || | |||  || |||| |||||   |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  21673863 tataattgtatatacattaaataaattatatt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcataatgcctatg 21673765  T
Q  197 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    ||| ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  21673764 ttgttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggtctaagttg 21673720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20498822 - 20498581
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||| |||| ||||| | |||||| ||||| |||||| ||  || || ||||||||| ||    
T  20498822 atgtgagttgatcttggaggtaagaaactaagttgtttatcttgatgttgatgtttcggtaagactgatgtatatgatttgatgttgtttataatgtgat 20498723  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttg-ataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatg 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||  | || ||  ||||| |||||||   || |||| |||||| |||||||||| |   || |||||||||||||    
T  20498722 ataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctattttacatactgcctatg 20498623  T
Q  197 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  20498622 ttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 20498581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 257
Target Start/End: Original strand, 17612053 - 17612231
Alignment:
Q  83 tgatgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataatt---ga-gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg 178  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | |||| |||   || |||||| | |||| | |||||||||||||||||||||    
T  17612053 tgatgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg 17612152  T
Q  179 ggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
      ||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||    
T  17612153 ttttgcatactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 17612231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 91 - 241
Target Start/End: Original strand, 983357 - 983511
Alignment:
Q  91 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataat-tga-gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tgggttgcat 186  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||  | ||| |||||||| || |||| || ||| |||||||||||  | | ||||||    
T  983357 ataatgttatatagctgtatatacattacatgaattatgtttgatgttgtgatgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaacttgtttgcat 983456  T
Q  187 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  983457 actgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 983511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 142 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22626850 - 22626736
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22626850 gttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 22626752  T
Q  242 ttgaagatgatgatgt 257  Q
     |||||||||||||||    
T  22626751 atgaagatgatgatgt 22626736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 159 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 31971354 - 31971257
Alignment:
Q  159 gatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31971354 gatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 31971257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 134 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 6759381 - 6759255
Alignment:
Q  134 ataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacgg 232  Q
    ||||||||| |||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  6759381 ataattgagatgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 6759283  T
Q  233 tctaagttgttgaagatgatgatgtcca 260  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6759282 tctaagttgatgaagatgatgatgtcca 6759255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 159 - 257
Target Start/End: Original strand, 16199668 - 16199765
Alignment:
Q  159 gatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16199668 gatattattatgtcatgttgt-ttgaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16199765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 180 - 257
Target Start/End: Original strand, 21396024 - 21396101
Alignment:
Q  180 gttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21396024 gttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21396101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 180 - 257
Target Start/End: Original strand, 21790517 - 21790594
Alignment:
Q  180 gttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21790517 gttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21790594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 21919050 - 21919121
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21919050 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21919121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 89 - 250
Target Start/End: Original strand, 13508034 - 13508199
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgagttgttgatt---tacattcgatattattatatcatgatgggttgc 184  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| || ||||| ||||| ||   | | |||||||||||||||||||||||   |||    
T  13508034 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttgtgc 13508133  T
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatg 250  Q
    ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  13508134 atattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13508199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 142 - 256
Target Start/End: Original strand, 28649050 - 28649164
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagtt 240  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28649050 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgct-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 28649148  T
Q  241 gttgaagatgatgatg 256  Q
    | ||||||||||||||    
T  28649149 gatgaagatgatgatg 28649164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 156 - 250
Target Start/End: Original strand, 13597637 - 13597731
Alignment:
Q  156 ttcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatg 250  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  13597637 ttcgatattattatatcatgatgttttgcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatg 13597731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 144 - 257
Target Start/End: Original strand, 18818417 - 18818530
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgt 242  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||| ||||| ||  || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  18818417 tgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 18818515  T
Q  243 tgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||    
T  18818516 tgaagatgatgatgt 18818530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 180 - 257
Target Start/End: Original strand, 21389494 - 21389571
Alignment:
Q  180 gttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21389494 gttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21389571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 180 - 257
Target Start/End: Original strand, 21778820 - 21778897
Alignment:
Q  180 gttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21778820 gttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21778897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 7372849 - 7372778
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  7372849 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7372778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 257
Target Start/End: Original strand, 16092348 - 16092463
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagtt 240  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16092348 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 16092446  T
Q  241 gttgaagatgatgatgt 257  Q
    | |||||||||||||||    
T  16092447 gatgaagatgatgatgt 16092463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 18879281 - 18879352
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  18879281 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 18879352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 23406450 - 23406379
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  23406450 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23406379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 186 - 257
Target Start/End: Original strand, 45131047 - 45131117
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45131047 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 45131117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 187 - 257
Target Start/End: Original strand, 21923980 - 21924049
Alignment:
Q  187 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  21923980 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 21924049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 20536279 - 20536208
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20536279 atactgcctatgtttctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20536208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22875179 - 22875065
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  22875179 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctgtgttgctgct-gctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattg 22875081  T
Q  242 ttgaagatgatgatgt 257  Q
     |||||||||||||||    
T  22875080 atgaagatgatgatgt 22875065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 37116518 - 37116366
Alignment:
Q  91 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcat- 186  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||  | ||||  |||||   |||||||||| |||| |||||| |||||||||||   |||  ||     
T  37116518 ataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatg 37116419  T
Q  187 -actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
     ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  37116418 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Original strand, 14409438 - 14409606
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  14409438 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 14409537  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  14409538 tatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14409606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 1484570 - 1484402
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  1484570 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 1484471  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  1484470 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1484402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Original strand, 5853286 - 5853454
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  5853286 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 5853385  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  5853386 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 5853454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Original strand, 15203225 - 15203393
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  15203225 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttg 15203324  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||    
T  15203325 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatga 15203393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 20403395 - 20403227
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  20403395 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 20403296  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  20403295 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20403227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22001921 - 22001753
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  22001921 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 22001822  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  22001821 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22001753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24353091 - 24353039
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  24353091 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 24353039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Original strand, 4542477 - 4542535
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  4542477 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4542535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 238
Target Start/End: Original strand, 17266998 - 17267096
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcat--actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||   |||  ||  ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  17266998 gttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaaccgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 17267096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 238
Target Start/End: Original strand, 17439457 - 17439609
Alignment:
Q  91 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcat- 186  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||  | ||||  |||||   |||||||||| |||| |||||| |||||||||||   |||  ||     
T  17439457 ataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatg 17439556  T
Q  187 -actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
     ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  17439557 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggactaag 17439609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 19896323 - 19896265
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  19896323 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19896265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Original strand, 20046299 - 20046357
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  20046299 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20046357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 26225359 - 26225409
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  26225359 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26225409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 250
Target Start/End: Original strand, 16413367 - 16413474
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagtt 240  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16413367 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 16413464  T
Q  241 gttgaagatg 250  Q
    | | ||||||    
T  16413465 gattaagatg 16413474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Original strand, 19154936 - 19154989
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19154936 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 19154989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 260
Target Start/End: Original strand, 19937118 - 19937174
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgtcca 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||| |||||    
T  19937118 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 19937174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 41598356 - 41598188
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  41598356 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 41598257  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||| | | |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  41598256 tatactac-tgtgttgctgtt-gttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41598188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 26219767 - 26219717
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||    
T  26219767 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattatgatgatga 26219717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 250
Target Start/End: Original strand, 45290807 - 45290853
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  45290807 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 45290853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15070608 - 15070571
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15070608 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 4483448 - 4483281
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  4483448 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 4483349  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  4483348 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4483281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 238
Target Start/End: Original strand, 19801493 - 19801527
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19801493 ttgttatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 25484380 - 25484430
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| | ||||||||||    
T  25484380 ttgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatgatga 25484430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Original strand, 18862427 - 18862488
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  18862427 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 18862488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 21383981 - 21383920
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| |||||||| ||||| |||||||    
T  21383981 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatatttgagatgttgat 21383920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 21387401 - 21387340
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  21387401 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 21387340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 21411274 - 21411213
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  21411274 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 21411213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 21805766 - 21805705
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  21805766 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 21805705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Original strand, 21827796 - 21827857
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  21827796 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 21827857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 72)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 34201042 - 34200786
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  34201042 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 34200943  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34200942 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgc 34200843  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34200842 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34200786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 28505163 - 28505419
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  28505163 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgttgtcaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 28505262  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28505263 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgctgatttatatccgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgc 28505362  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  28505363 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgt 28505419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 11995892 - 11996148
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  11995892 atgtgagtttatcttagaggttagaaactaatttgtttaccttgctgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 11995991  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  11995992 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgatatttgagttgttgatttacattcaatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgt 11996091  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11996092 tgtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11996148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 15754751 - 15755008
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaatt-agtgatgcttataatgtta 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  15754751 atgtgagttgatcctagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttaatattccagtaagactgatgcatatgaatttaatgttgcttataatgtta 15754850  T
Q  100 tataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||    
T  15754851 tataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatattg 15754950  T
Q  200 ctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
     | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  15754951 ttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15755008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 89 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16495570 - 16495402
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatac 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16495570 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 16495471  T
Q  189 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16495470 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16495402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 68003 - 67745
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattga-tgcatatgaattagtgatgcttataatgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||| |||| ||  ||| |  ||||||  || || || |  ||||||||    
T  68003 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtgagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgtta 67904  T
Q  100 tataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatg 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||| |||||   ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  67903 tataattgtatatacattatatgaattatg-ttgat-attgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatg 67806  T
Q  197 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  67805 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 67745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18005902 - 18005650
Alignment:
Q  4 tgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgca-tatgaattagtgatgcttataatgttatat 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||  ||||  | |||||  || || || |  ||||| |||||    
T  18005902 tgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatat 18005803  T
Q  103 aattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttg 199  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  || |||||||| |||||||    
T  18005802 aattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttccatactgcttatgttg 18005704  T
Q  200 ctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  18005703 ctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 18005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 44014431 - 44014182
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattga-tgcatatgaattagtgatgcttataatgtta 99  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||| |||||||  ||| |  ||||||  || || || || ||||| ||    
T  44014431 atgtgagttgatc--agaggttaaaaactaagttgtt-atcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgtttttaatggta 44014335  T
Q  100 tataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttg 199  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  44014334 tataactgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttg 44014236  T
Q  200 ctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  44014235 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 44014182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 16219579 - 16219835
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||  |||   |||| |  || || || |  |||||||||    
T  16219579 atgttagttgatcttggaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgttaatgttat 16219678  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  || || |||||||   || ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16219679 ataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttaagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgt 16219778  T
Q  198 tgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  16219779 tgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 16219835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 92 - 253
Target Start/End: Original strand, 811084 - 811248
Alignment:
Q  92 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatac 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||  | |||| ||   || ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  811084 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 811183  T
Q  189 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  811184 tgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 811248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 92 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 47831975 - 47831807
Alignment:
Q  92 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatac 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||  ||  | |||||||   || ||||||||||| |||||||||||||   |||||||    
T  47831975 taatgttatataattgtatatacattatatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatatgcatac 47831876  T
Q  189 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  47831875 tgtctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 47831807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16056586 - 16056344
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||  |||| | |||||  |||   |||| |  || || || |  |||||||||    
T  16056586 atgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgatgttgttgtttcggtaagcctgaatgatataatctaatgttgttgttaatgttat 16056487  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||   |||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||  ||||||| || ||||||    
T  16056486 ataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgt-ttgcataatgtctatgt 16056388  T
Q  198 tgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  16056387 tgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtctaagttg 16056344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 92 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22073083 - 22072913
Alignment:
Q  92 taatgttatataattgtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgg-gttgcat 186  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||  ||||||    
T  22073083 taatgttatataattgcatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 22072984  T
Q  187 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| | |||||||||||||    
T  22072983 agtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgattaagatgatgatgt 22072913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 142 - 257
Target Start/End: Original strand, 2280125 - 2280238
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2280125 gttgttgatttgcatttgatattattatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 2280224  T
Q  242 ttgaagatgatgatgt 257  Q
       |||||||||||||    
T  2280225 --aaagatgatgatgt 2280238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 89 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13647497 - 13647325
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttg-ataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-ggttg 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||   |||    
T  13647497 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 13647398  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  13647397 catactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 13647325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 142 - 254
Target Start/End: Original strand, 3564370 - 3564482
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagtt 240  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||  || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3564370 gttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 3564468  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | ||||||||||||    
T  3564469 gatgaagatgatga 3564482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 16386297 - 16386369
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16386297 atactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16386369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 142 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 38227595 - 38227481
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  38227595 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtag 38227497  T
Q  242 ttgaagatgatgatgt 257  Q
     |||||||||||||||    
T  38227496 atgaagatgatgatgt 38227481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 12698930 - 12698831
Alignment:
Q  159 gatattattatatcatgatgggtt--gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatg 256  Q
    ||||||||||| ||||| || |||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  12698930 gatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 12698832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 158 - 257
Target Start/End: Original strand, 19486766 - 19486865
Alignment:
Q  158 cgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  19486766 cgatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 19486865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 187 - 257
Target Start/End: Original strand, 27847881 - 27847951
Alignment:
Q  187 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27847881 actgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 27847951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 156 - 257
Target Start/End: Original strand, 10063838 - 10063939
Alignment:
Q  156 ttcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgat 255  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||| || ||||    
T  10063838 ttcgatattattatatcatgatgttgtgcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagtcgttgaaggtgttgat 10063937  T
Q  256 gt 257  Q
    ||    
T  10063938 gt 10063939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 12901559 - 12901339
Alignment:
Q  25 aaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttatataattgtatatacattacatgac 124  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||| ||||   |||||| ||| || || |  |||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  12901559 aaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcttgaattatatgatttaatgttgttgttaatgttatatagttgtatatacattacatgaa 12901460  T
Q  125 ttaagtttgataat-tga-gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagc 220  Q
    ||| || ||||  | ||| |||| || ||| |||| |||||| |||||||||||  |   ||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  12901459 ttatgtatgatgttgtgatgttgctgttttgcatttgatattgttatatcatgaattattttgtatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagc 12901360  T
Q  221 tgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    |||||||| |||| |||||||    
T  12901359 tgcatgagtcggtttaagttg 12901339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 186 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 40443462 - 40443393
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgat 255  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  40443462 tactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 40443393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 9509260 - 9509189
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  9509260 atactgcctatgttactgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 9509189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 254
Target Start/End: Original strand, 18456419 - 18456530
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18456419 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctatc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 18456517  T
Q  242 ttgaagatgatga 254  Q
     | ||||||||||    
T  18456518 attaagatgatga 18456530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 238
Target Start/End: Original strand, 20220075 - 20220290
Alignment:
Q  25 aaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttatataattgtatatacattacatgac 124  Q
    ||||||||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||  ||||  | |||| ||  || || | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||     
T  20220075 aaactaagttgcttatcttactgttgttgttccagtaagcctgatttagatgatttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcattacatgaa 20220174  T
Q  125 ttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 222  Q
    |||  | ||||  ||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||||  ||  ||   |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  20220175 ttatatatgatgtttgagatgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctg 20220274  T
Q  223 catgagacggtctaag 238  Q
     ||||| |||||||||    
T  20220275 tatgagtcggtctaag 20220290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 15113202 - 15113084
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||| ||||  |||||| ||  || |  ||||||||| ||    
T  15113202 atgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcctgctgttattgtttcagtaagactgatttatatgagttgatgttaattataatgtgat 15113103  T
Q  101 ataattgtatatacattac 119  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  15113102 ataattgtatatatattac 15113084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 15116739 - 15116621
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | | |||||| |||| |||||||| ||||| |||||| ||  || |  ||||||||| ||    
T  15116739 atgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcctactgttattgtttcagtaagactgatgtatatgagttgatgttatttataatgtgat 15116640  T
Q  101 ataattgtatatacattac 119  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  15116639 ataattgtatatatattac 15116621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 10589110 - 10589039
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  10589110 atactgcatatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgtcgaagatgatgatgt 10589039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 26212067 - 26211995
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaag-atgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26212067 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 26211995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 142 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 48273504 - 48273392
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagtt 240  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  48273504 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtctaagtt 48273406  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  48273405 gattaagatgatga 48273392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Original strand, 17061909 - 17062077
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagt-ttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgc 184  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | || |||||||||   ||| ||| || |||| ||||||||||| ||||| |   |||     
T  17061909 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattatgtcatgctattttgt 17062008  T
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  17062009 atactgctga-gttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17062077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 89 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 18430880 - 18430709
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgc 184  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||  ||      
T  18430880 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgttttta 18430781  T
Q  185 -atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  18430780 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 18430709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 154 - 228
Target Start/End: Original strand, 12255809 - 12255885
Alignment:
Q  154 cattcgatattattatatcatga--tgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 228  Q
    |||| |||||| |||||||||||  ||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12255809 catttgatattgttatatcatgaattgatttgcatactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgag 12255885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 456489 - 456321
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  456489 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 456390  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  456389 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 456321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 11972664 - 11972496
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  11972664 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 11972565  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  11972564 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11972496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Original strand, 14949116 - 14949284
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  14949116 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 14949215  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  14949216 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 14949284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Original strand, 15376707 - 15376875
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  15376707 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 15376806  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  15376807 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15376875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16232688 - 16232520
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  16232688 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 16232589  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  16232588 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16232520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 18640440 - 18640272
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  18640440 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 18640341  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  18640340 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18640272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Original strand, 20385117 - 20385285
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  20385117 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 20385216  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  20385217 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20385285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Original strand, 21189589 - 21189757
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  21189589 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 21189688  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  21189689 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21189757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24702406 - 24702238
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  24702406 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttg 24702307  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  24702306 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24702238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 32125659 - 32125491
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  32125659 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 32125560  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  32125559 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32125491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 41523085 - 41522917
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  41523085 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 41522986  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  41522985 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41522917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 41525547 - 41525379
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  41525547 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 41525448  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  41525447 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 41525379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 3386391 - 3386333
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  3386391 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3386333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 253
Target Start/End: Original strand, 11393281 - 11393448
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  11393281 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 11393380  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  11393381 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 11393448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14044817 - 14044762
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14044817 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 14044762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14354847 - 14354792
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14354847 tactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 14354792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16213742 - 16213684
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  16213742 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16213684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16410117 - 16410059
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  16410117 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16410059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24704746 - 24704688
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  24704746 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24704688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 241
Target Start/End: Original strand, 1867946 - 1868100
Alignment:
Q  91 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttg---atttacattcgatattattatatcatga--tgggttgca 185  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||  | ||||  ||||| |||||   |||| |||| |||||| |||||||||||  ||  ||  |    
T  1867946 ataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttcatttgcatt-gatattgttatatcatgagctgttttata 1868044  T
Q  186 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    |||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1868045 tactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 1868100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 13869396 - 13869346
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  13869396 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13869346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 16324264 - 16324202
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaag 63  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||  |||| |||||||    
T  16324264 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgttgatcttgctgttgttgtttcagtaag 16324202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 20110606 - 20110556
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  20110606 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20110556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24275282 - 24275175
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagtt 240  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24275282 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 24275185  T
Q  241 gttgaagatg 250  Q
    | | ||||||    
T  24275184 gattaagatg 24275175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 44116620 - 44116509
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagtt 240  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || | ||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  44116620 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtt 44116523  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  44116522 gattaagatgatga 44116509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 27217028 - 27216860
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  27217028 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 27216929  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||    
T  27216928 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 27216860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 241
Target Start/End: Original strand, 15144096 - 15144142
Alignment:
Q  194 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15144096 atgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15144142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 13831423 - 13831373
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||    
T  13831423 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 13831373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14036325 - 14036283
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 228  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  14036325 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgag 14036283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14346355 - 14346313
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 228  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  14346355 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgag 14346313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 142 - 234
Target Start/End: Original strand, 15008504 - 15008597
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtc 234  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  ||  ||  ||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  15008504 gttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 15008597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 188 - 239
Target Start/End: Original strand, 18154894 - 18154944
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagt 239  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18154894 ctgcctatgttgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagt 18154944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 48991252 - 48991209
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  48991252 atactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgag 48991209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 250
Target Start/End: Original strand, 38898489 - 38898535
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||    
T  38898489 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatg 38898535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 47832066 - 47832004
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaag 63  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||| ||||  |||| |||||||    
T  47832066 atgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttatcttgttgttgttgtttcagtaag 47832004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 14044917 - 14044857
Alignment:
Q  91 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatt 151  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  | ||||  ||||| ||||||||    
T  14044917 ataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgatt 14044857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 14354947 - 14354887
Alignment:
Q  91 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatt 151  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  | ||||  ||||| ||||||||    
T  14354947 ataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgatt 14354887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 59)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 19660700 - 19660956
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  19660700 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 19660799  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19660800 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttatattcgatatcattatatcaagatggtttgcatactgcctatgttgc 19660899  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19660900 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 19660956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 22959397 - 22959649
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||| | || || ||| ||||||||    
T  22959397 atgtgagttgatcttagaggttaaaaaccaagttgtttatcttgttgtttttgttccagtaagactgatgcatatgaatcaatgttggttaaaatgttat 22959496  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  22959497 ataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgc 22959596  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  22959597 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 22959649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 19669156 - 19668898
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaat--tagtgatgcttataatgtt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||  |  || || ||||||||||    
T  19669156 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagtcgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaatattgatgttgtttataatgtt 19669057  T
Q  99 atataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgtt 198  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||| |||||||    
T  19669056 atataattgtatatacattacaggacttatgtttgatatttgagttgttgatttgcattcgatattgttatatcacgatgatttgcatactgtctatgtt 19668957  T
Q  199 gctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    | |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  19668956 gttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 19668898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 21565801 - 21565546
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||  || || ||||||||||||    
T  21565801 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttctagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttat 21565702  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||   |||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  21565701 ataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttggatactgcctatgt 21565602  T
Q  198 tgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  21565601 tgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 21565546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 21329359 - 21329618
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||  |||| |||||||  |||    ||| |  || || || |  |||||||||    
T  21329359 atgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttat 21329458  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||  | |||||||   ||  |||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  21329459 ataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgaattcgatattgttatattatgatgatttgcatactgcctatgt 21329558  T
Q  198 tgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  21329559 tgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 21329618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 21502016 - 21502277
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggtta-aaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattga-tgcatatgaattagtgatgcttataatgtt 98  Q
    |||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||  ||| |  ||||||  || || || |  |||||||    
T  21502016 atgttagttgatcttggaagttagaaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgtt 21502115  T
Q  99 atataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctat 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  || || || ||||   || ||||||||||| |||||||||| ||  || ||||||||||||    
T  21502116 atataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttaagatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttacatactgcctat 21502215  T
Q  196 gttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  21502216 gttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 21502277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 20026802 - 20027043
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||   |||| |||||||  |||   |||||  ||| || || | |||||| |||    
T  20026802 atgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgttgtagttgtttcagtaagcctgaattatatgttttaatgttgttgataatgctat 20026901  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataat-tga-gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tgggttgcatactgcctatg 196  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  | ||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||  ||  ||| ||||||||||||    
T  20026902 atagttgtatatacattacatgaattatgtttgatgttgtgatgttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttttggatactgcctatg 20027001  T
Q  197 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20027002 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20027043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 26011897 - 26012154
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| | ||  |||| |||||||  |||   |||| |  |  || || |  | |||||||    
T  26011897 atgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttgtttatcttgttattgttgtttcagtaagcctgaactatataatctgatgttgttgttgatgttat 26011996  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||   ||||||||| ||||| |||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  26011997 ataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgattcacatttgatattgttatatcatgttgctttgcatactgcctatgt 26012096  T
Q  198 tgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||    
T  26012097 tgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg--aaagatgatgatgt 26012154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 156 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 36314678 - 36314577
Alignment:
Q  156 ttcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgat 255  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  36314678 ttcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 36314579  T
Q  256 gt 257  Q
    ||    
T  36314578 gt 36314577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 21729114 - 21729185
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21729114 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21729185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 21808439 - 21808510
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21808439 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 21808510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 8286893 - 8286964
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  8286893 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8286964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 21997584 - 21997655
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  21997584 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 21997655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 24493683 - 24493569
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  24493683 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttg 24493585  T
Q  242 ttgaagatgatgatgt 257  Q
     |||||||||||||||    
T  24493584 atgaagatgatgatgt 24493569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 89 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 40726025 - 40725853
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataatt---ga-gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgc 184  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | |||| |||   || |||||| | |||| | |||||||||||||||||||||  ||||    
T  40726025 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgctttgc 40725926  T
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  40725925 atactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 40725853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 1096582 - 1096467
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-ggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagtt 240  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| | ||| ||   ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1096582 gttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 1096484  T
Q  241 gttgaagatgatgatgt 257  Q
    | |||||||| ||||||    
T  1096483 gatgaagatgttgatgt 1096467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22144164 - 22144068
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    ||||||||||| || | |||||| |||||||||| ||  ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22144164 gttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttgttttgcatactacctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 22144068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 23390546 - 23390617
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  23390546 atactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23390617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 25421603 - 25421532
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  25421603 atactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25421532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13025425 - 13025311
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    |||||||| || |||| ||||| | ||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  13025425 gttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttg 13025327  T
Q  242 ttgaagatgatgatgt 257  Q
     |||||||||||||||    
T  13025326 atgaagatgatgatgt 13025311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13095609 - 13095495
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    |||||||| || |||| ||||| | ||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  13095609 gttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttg 13095511  T
Q  242 ttgaagatgatgatgt 257  Q
     |||||||||||||||    
T  13095510 atgaagatgatgatgt 13095495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 186 - 257
Target Start/End: Original strand, 21293020 - 21293090
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21293020 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 21293090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 180 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 37723980 - 37723910
Alignment:
Q  180 gttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatg 250  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  37723980 gttgtatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagatgttgaagatg 37723910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24529291 - 24529223
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  24529291 atactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 24529223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 9078023 - 9077952
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||    
T  9078023 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 9077952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22075090 - 22075018
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaag-atgatgatgt 257  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22075090 atacttcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgaatgagtcggtctaagttgttgaagaatgatgatgt 22075018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22412298 - 22412187
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| | |  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  22412298 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttatc-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg 22412200  T
Q  242 ttgaagatgatga 254  Q
     | ||||||||||    
T  22412199 attaagatgatga 22412187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 89 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 36314719 - 36314672
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgata 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36314719 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagttcgata 36314672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Original strand, 264762 - 264930
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  264762 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 264861  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  264862 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 264930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 20909180 - 20909012
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  20909180 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 20909081  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  20909080 tatactgt-tgtgttgct-tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20909012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 25431465 - 25431395
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||    
T  25431465 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa-tttatgaagatgatgatgt 25431395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 29330102 - 29329934
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  29330102 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttg 29330003  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  29330002 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29329934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 39363552 - 39363384
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  39363552 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 39363453  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  39363452 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39363384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Original strand, 10733044 - 10733102
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  10733044 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10733102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Original strand, 11581303 - 11581361
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  11581303 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 11581361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Original strand, 20918052 - 20918110
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  20918052 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20918110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 238
Target Start/End: Original strand, 22178171 - 22178323
Alignment:
Q  91 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tgggttgca 185  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||  | ||||  |||||   |||||||||| |||| |||||| | |||||||||  ||  ||  |    
T  22178171 ataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgttttata 22178270  T
Q  186 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  22178271 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22178323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 39245194 - 39245136
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  39245194 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39245136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 2154726 - 2154776
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  2154726 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2154776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 36154892 - 36154942
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  36154892 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 36154942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 38619484 - 38619434
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  38619484 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38619434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23064561 - 23064512
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  23064561 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 23064512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 206 - 254
Target Start/End: Original strand, 10775790 - 10775838
Alignment:
Q  206 gttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  10775790 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10775838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Original strand, 42245359 - 42245527
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  42245359 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 42245458  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  42245459 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 42245527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 241
Target Start/End: Original strand, 20902113 - 20902158
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20902113 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20902158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 29346030 - 29345980
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  29346030 ttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29345980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 31061118 - 31061068
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  31061118 ttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31061068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 251
Target Start/End: Original strand, 18319146 - 18319193
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatga 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||    
T  18319146 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 18319193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 29348500 - 29348453
Alignment:
Q  207 ttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  29348500 ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29348453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 29350973 - 29350926
Alignment:
Q  207 ttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  29350973 ttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29350926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 20806854 - 20806904
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||    
T  20806854 ttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 20806904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 241
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732937
Alignment:
Q  187 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtctatgttg 26732937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 32027443 - 32027393
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  32027443 ttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 32027393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 10753688 - 10753627
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  10753688 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 10753627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Original strand, 22120146 - 22120207
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  22120146 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 22120207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 204 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 26704124 - 26704075
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | | |||||||||    
T  26704124 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26704075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 204 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 26973857 - 26973808
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | | |||||||||    
T  26973857 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26973808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 21741407 - 21741455
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgtt 49  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||| ||||    
T  21741407 atgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttaattaccttgatgtt 21741455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 148
Target Start/End: Original strand, 21741486 - 21741541
Alignment:
Q  92 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttg 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||| ||||| |||||    
T  21741486 taatgttatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttg 21741541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 11548 - 11292
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  11548 atgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttggtgttaatgttcaagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 11449  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgc 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11448 ataatagtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgc 11349  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11348 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 11292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 25 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 2229 - 1997
Alignment:
Q  25 aaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttatataattgtatatacattacatgac 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2229 aaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagtctgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgac 2130  T
Q  125 ttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgca 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  2129 ttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagctgca 2030  T
Q  225 tgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2029 tgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 201 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 4608 - 4552
Alignment:
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4608 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 28485 - 28414
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  28485 atactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 28414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 34379 - 34123
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  34379 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaattttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 34280  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgc 200  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  34279 ataattgtatatatattacttgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgtatactgcctatgttgt 34180  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34179 tgtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 34123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 326 - 273
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  326 ttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagataatgatgt 273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 72)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 28496336 - 28496592
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  28496336 atgtgagttgatcttagagtttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcatatgaattaatgttgcttataatgttat 28496435  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28496436 ataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgc 28496535  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28496536 taattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 28496592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 29808747 - 29809003
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  29808747 atgtgagttgatcttagagtttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcatatgaattaatgttgcttataatgttat 29808846  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29808847 ataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgc 29808946  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29808947 taattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgt 29809003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 1561560 - 1561303
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaatt-agtgatgcttataatgtta 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  1561560 atgtgagttgatcctagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttaatattccagtaagactgatgcatatgaatttaatgttgcttataatgtta 1561461  T
Q  100 tataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||    
T  1561460 tataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatattg 1561361  T
Q  200 ctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
     | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  1561360 ttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 1561303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 19652452 - 19652199
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  || || ||||||||||||    
T  19652452 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttat 19652353  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat--ttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgtt 198  Q
    |||||||||||||| ||| |||  ||| | |||||  ||||| ||||| |  || ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  19652352 ataattgtatatactttaaatggattatg-ttgatgtttgagatgttgttgattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgtt 19652254  T
Q  199 gctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  19652253 gttgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19652199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19668631 - 19668387
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||  ||||| ||||||  ||||| || | ||||||||||    
T  19668631 atgtgagttgatcttggaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagtctgatgtatatgatgtagtgttgttgataatgttat 19668532  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataat-tga-gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tgggttgcatactgcctatg 196  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||  | ||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  ||  |||||||||  |||||    
T  19668531 atagttgtatatacattacatgaattacgtatgatgttgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgcatactatctatg 19668432  T
Q  197 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19668431 ttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 19668387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23019665 - 23019425
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||  |||   |||| |  || ||  | |  |||||||||    
T  23019665 atgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaactatataatctaatgtcgttgttaatgttat 23019566  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||   ||||||| || |||| |||||| |||||||||| ||  ||||||||||| |||||    
T  23019565 ataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcttatgt 23019466  T
Q  198 tgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||    
T  23019465 tgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggtctaag 23019425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 20109400 - 20109140
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |    ||| ||||||| ||||| |||| ||||  || || ||||||||| ||    
T  20109400 atgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgatgtctttctagtaagactgatgtatatcaattgatgttgtttataatgtgat 20109301  T
Q  101 ataat--tgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgccta 194  Q
    |||||  |||||||||||||| ||| |||  | ||| || ||||| |||||||   || |||| |||||| |||||| ||| ||  ||||||||||||||    
T  20109300 ataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgttgttttgcatactgccta 20109201  T
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||    
T  20109200 tgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg--aaagatgatgatgt 20109140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 156 - 257
Target Start/End: Original strand, 27333238 - 27333339
Alignment:
Q  156 ttcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgat 255  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  27333238 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 27333337  T
Q  256 gt 257  Q
    ||    
T  27333338 gt 27333339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 156 - 257
Target Start/End: Original strand, 27393978 - 27394079
Alignment:
Q  156 ttcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgat 255  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  27393978 ttcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgat 27394077  T
Q  256 gt 257  Q
    ||    
T  27394078 gt 27394079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 92 - 241
Target Start/End: Original strand, 9098466 - 9098619
Alignment:
Q  92 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataat-tga-gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tgggttgcata 187  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||  | ||| ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||  ||  |||||||    
T  9098466 taatgttatataattatatatacattacatgaattatgtttgatgttgtgaagttgttgaaatgcatttgatattgttatatcatgaattgttttgcata 9098565  T
Q  188 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9098566 ctgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 9098619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 144 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 20076812 - 20076700
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgtt 243  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||  |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  20076812 tgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtttactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20076714  T
Q  244 gaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||    
T  20076713 gaagatgatgatgt 20076700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 141 - 241
Target Start/End: Original strand, 4185826 - 4185926
Alignment:
Q  141 agttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagtt 240  Q
    ||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  4185826 agttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagtt 4185925  T
Q  241 g 241  Q
    |    
T  4185926 g 4185926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16496315 - 16496244
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16496315 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 16496244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 159 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 35245682 - 35245586
Alignment:
Q  159 gatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35245682 gatattattatgtcatgttg--ttgtatactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 35245586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 89 - 257
Target Start/End: Original strand, 8227460 - 8227632
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataatt---ga-gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgc 184  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | |||| |||   || |||||| | |||| | |||||||||||||||||||||  ||||    
T  8227460 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttttgc 8227559  T
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  8227560 atactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatgttgatgt 8227632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 180 - 257
Target Start/End: Original strand, 16920674 - 16920751
Alignment:
Q  180 gttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  16920674 gttgtatactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaagatgttgaagatgatgatgt 16920751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 29060655 - 29060540
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagtt 240  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  29060655 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagct 29060557  T
Q  241 gttgaagatgatgatgt 257  Q
    | |||||||||||||||    
T  29060556 gatgaagatgatgatgt 29060540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 4186483 - 4186383
Alignment:
Q  141 agttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagtt 240  Q
    ||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||    
T  4186483 agttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgtctatgttgctgcctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagtt 4186384  T
Q  241 g 241  Q
    |    
T  4186383 g 4186383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 189 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22831571 - 22831503
Alignment:
Q  189 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  22831571 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgt 22831503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 181 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25644396 - 25644336
Alignment:
Q  181 ttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25644396 ttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 25644336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 159 - 257
Target Start/End: Original strand, 17287819 - 17287917
Alignment:
Q  159 gatattattatatcatgatgggtt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  17287819 gatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 17287917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 256
Target Start/End: Original strand, 18409833 - 18409947
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagtt 240  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || | ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  18409833 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactgagctgcatgagtcggtctaagtt 18409931  T
Q  241 gttgaagatgatgatg 256  Q
    | ||||||||||||||    
T  18409932 gatgaagatgatgatg 18409947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 257
Target Start/End: Original strand, 19303547 - 19303661
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  19303547 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatacttcctgtgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatg 19303645  T
Q  242 ttgaagatgatgatgt 257  Q
     |||||||||||||||    
T  19303646 atgaagatgatgatgt 19303661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 20638333 - 20638404
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  20638333 atactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20638404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22782395 - 22782227
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| ||| || ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  22782395 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 22782296  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  22782295 tatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22782227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 188 - 257
Target Start/End: Original strand, 20361013 - 20361081
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||    
T  20361013 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgatgaaaatgatgatgt 20361081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 20593888 - 20593773
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagtt 240  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || | ||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  20593888 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgttt-ttatttaactgagctgcatgattcggtctaagtt 20593790  T
Q  241 gttgaagatgatgatgt 257  Q
    | |||||||||||||||    
T  20593789 gatgaagatgatgatgt 20593773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 256
Target Start/End: Original strand, 30676761 - 30676874
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagtt 240  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  || | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30676761 gttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 30676858  T
Q  241 gttgaagatgatgatg 256  Q
    | | |||||| |||||    
T  30676859 gattaagatgttgatg 30676874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 25656690 - 25656629
Alignment:
Q  192 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  25656690 ctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 25656629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714417
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  25714478 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 25714417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 141 - 202
Target Start/End: Original strand, 4668216 - 4668277
Alignment:
Q  141 agttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctg 202  Q
    ||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4668216 agttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctg 4668277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 141 - 202
Target Start/End: Original strand, 4675063 - 4675124
Alignment:
Q  141 agttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctg 202  Q
    ||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4675063 agttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctg 4675124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 204 - 257
Target Start/End: Original strand, 22780295 - 22780348
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  22780295 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 22780348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 204 - 257
Target Start/End: Original strand, 25629423 - 25629476
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  25629423 ttgtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 25629476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 25754920 - 25754809
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagtt 240  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||  || | ||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25754920 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 25754823  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  25754822 gattaagatgatga 25754809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 1595717 - 1595549
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  1595717 ttatattgtgatataattgtatatccattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttg 1595618  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||    
T  1595617 tatactgt-tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatga 1595549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Original strand, 2291174 - 2291342
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  2291174 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttg 2291273  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  2291274 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 2291342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 12742485 - 12742317
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  12742485 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 12742386  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  12742385 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12742317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Original strand, 18334586 - 18334754
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  18334586 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 18334685  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  18334686 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18334754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 19005214 - 19005046
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  19005214 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 19005115  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  19005114 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19005046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Original strand, 19858913 - 19859081
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  19858913 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 19859012  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  19859013 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 19859081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24422715 - 24422547
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  24422715 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 24422616  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  24422615 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24422547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 33861962 - 33861794
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  33861962 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 33861863  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  33861862 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33861794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 33864446 - 33864278
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  33864446 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 33864347  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  33864346 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 33864278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 8055087 - 8055029
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  8055087 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8055029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 11185568 - 11185517
Alignment:
Q  194 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttga 245  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  11185568 atgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttga 11185517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Original strand, 26924744 - 26924802
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  26924744 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26924802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 22080601 - 22080800
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaag-attgatgcatatgaattagtgatgcttataatgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||  |||| |||||||  |  ||  ||||||  || ||||| |  ||||||||    
T  22080601 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgcttatcttgctcttgttgtttcagtaagcctaaattgatatgacctaatgatgttgttaatgtta 22080700  T
Q  100 tataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttg--atttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgt 197  Q
    ||||| ||||||||||||| || | ||| |   |||  ||||| |||||   | | ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22080701 tataaatgtatatacattatattaattatg-acgatgtttgagatgttgttctgtgcattcgatattgttatatcatgatgttttgcatactgcctatgt 22080799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 35008409 - 35008167
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||| | | ||| | ||||||||||| ||| ||| |||||| |||| |||||||  ||||  | |||| ||  || || | ||||||| ||    
T  35008409 atgtgagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttattgtttcagtaagcctgatatagatgatttgatgttgttaataatgtgat 35008310  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgtt---gatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcat--actgcctat 195  Q
    ||| |||||||| |||||||||| |||  | ||||  || |||||||   ||||  || | ||||||||||||||  |||  |||  ||  |||||||||    
T  35008309 atatttgtatattcattacatgaattatatatgatgtttaagttgtttttgattatcacttgatattattatatctggatatgttttatgtactgcctat 35008210  T
Q  196 gttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  35008209 gttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35008167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 186 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23076801 - 23076749
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  23076801 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23076749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Original strand, 1541015 - 1541073
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||    
T  1541015 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 1541073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Original strand, 3852121 - 3852179
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  3852121 tgttgctgtt-gttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3852179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Original strand, 20556996 - 20557054
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||    
T  20556996 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 20557054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 253
Target Start/End: Original strand, 31155354 - 31155514
Alignment:
Q  94 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtt--tgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgc 191  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||| |||  ||||| |  ||||| ||| || ||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||     
T  31155354 atgttatataaatgtataaacattgcatgatttatgttgatgata-tgaagttgatgaattgcattcgatattgttatatcacgatgacttgcatactgt 31155452  T
Q  192 ctatgttgctgttt-gttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
     || |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |  || |||||| ||| |||||||    
T  31155453 tta-gttgctgttttgttatttaactaagttgcatgagtcaatccaagttgatgatgatgatg 31155514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 9098387 - 9098449
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaag 63  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||| |||| |||| |||||||    
T  9098387 atgtgagttgatcttagaggtaagaaactaatttgtttatcttgcagttattgtttcagtaag 9098449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 27333147 - 27333209
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaag 63  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||  |||| |||||||    
T  27333147 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaaattgtttatcttgatgttgctgtttcagtaag 27333209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 27393887 - 27393949
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaag 63  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||  |||| |||||||    
T  27393887 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaaattgtttatcttgatgttgctgtttcagtaag 27393949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 25688562 - 25688502
Alignment:
Q  193 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||| ||||    
T  25688562 tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagataatga 25688502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 34963431 - 34963371
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatg 256  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||| |||||    
T  34963431 tgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 34963371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 251
Target Start/End: Original strand, 16448639 - 16448686
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatga 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||    
T  16448639 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatga 16448686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18456777 - 18456735
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18456777 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 18461937 - 18461895
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18461937 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 238
Target Start/End: Original strand, 18821904 - 18821946
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18821904 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 210 - 257
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080846
Alignment:
Q  210 tttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||    
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatgatgt 22080846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 185 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 33443118 - 33443068
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtcta 236  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  33443118 atactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 4668077 - 4668135
Alignment:
Q  2 tgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagt 60  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  || | ||||||| ||||||||||    
T  4668077 tgtgagttgatcttagatgttaagaactaagttgcctagcatgctgttgatgttccagt 4668135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 4674924 - 4674982
Alignment:
Q  2 tgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagt 60  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  || | ||||||| ||||||||||    
T  4674924 tgtgagttgatcttagatgttaagaactaagttgcctagcatgctgttgatgttccagt 4674982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 22949469 - 22949408
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  22949469 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 22949408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 22953425 - 22953364
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  22953425 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 22953364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 23871913 - 23871852
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  23871913 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 23871852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 23875869 - 23875808
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  23875869 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 23875808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Original strand, 27325385 - 27325446
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 150  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| ||| | ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  27325385 ttataatgttatataattatatatatattgcattaattatgtttgatgattgagatgttgat 27325446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 67)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15552072 - 15551817
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| | || |||||||||||||||    
T  15552072 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtt-accctgctgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaatcaatgttgcttataatgttat 15551974  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15551973 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttaccttcgatattattatatcatgatggattgcatactgcctatgttgc 15551874  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15551873 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 15551817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 16596904 - 16596686
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||| || |||||||||||||||    
T  16596904 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttcaagtaagactgatgcttataaattaatgttgcttataatgttat 16596805  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  16596804 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgatgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactacctatgttgc 16596705  T
Q  201 tgtttgttatttaactaag 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16596704 tgtttgttatttaactaag 16596686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 12774256 - 12774011
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||  || || ||||||||||      
T  12774256 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgtt-- 12774159  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat--ttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgtt 198  Q
          |||||||||||| |||  ||| ||| |||||||||| ||||| |  ||  |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  12774158 ------gtatatacattaaatggattatgtt-gataattgagatgttgttgattgtattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgtt 12774066  T
Q  199 gctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  12774065 gctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 12774011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 8846631 - 8846360
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||  |||  ||||||||||||| |||||||||||||||  || || ||||||||||||    
T  8846631 atgtgagttgaacttagagattagaaactaagttgtttatcttgtagttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttat 8846532  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat------------------tta-cattcgatattattatatcatgatgggt 181  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||                  ||| ||||||||||| |||| ||||||||  |    
T  8846531 ataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttagcattcgatattgttatctcatgatgatt 8846432  T
Q  182 tgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||| |||||||    
T  8846431 tgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgatgatgatgatg 8846360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 12288071 - 12288315
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||  |||   |||||| ||| || || |  |||||||||    
T  12288071 atgtgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttggtaatgttat 12288170  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataat-tga-gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tgggttgcatactgcctatg 196  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  | ||| |||||||| || |||| |||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  12288171 atagttgtatatacattacatgaattatgtttgatgttgtgatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactggtttgcatactgcctatg 12288270  T
Q  197 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12288271 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 12288315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 13712 - 13953
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||| |||||  ||||| ||  || || ||||||||| ||    
T  13712 atgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatctttatgttgatgttccagtaagactgatgtttatgatttgatgttgtttataatgtgat 13811  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttg-ataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatg 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||  | || ||| ||||| |||||||   || |||| |||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  13812 ataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatg 13911  T
Q  197 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  13912 ttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 39706151 - 39706409
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||| ||| |||  || ||||||||||| |||||||||  ||||  ||||||  |||   ||||||  || || || |  |||||||||    
T  39706151 atgtgagttgatcttggagattaggaattaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcctgaattatatgatctaatgttgttgctaatgttat 39706250  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtt--tgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgtt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||  || | ||   |||  ||| || ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  39706251 ataattgtatatacattacatgaattatgttgatgtttatgatgttcatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgtt 39706350  T
Q  199 gctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  39706351 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 39706409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 241
Target Start/End: Original strand, 43198428 - 43198660
Alignment:
Q  15 tagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttatataattgtatatac 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||  || || ||||||||| ||||||||||||||||    
T  43198428 tagaggtaaaaaactaagttgtttatcttgttgttgatgttccagtaagactaatgcatatgaattgatgttgtttataatgtgatataattgtatatac 43198527  T
Q  115 attacatgacttaagtttg-ataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tgggttgcatactgcctatgttgctgtttgtt 208  Q
    ||||| ||| |||  | || ||| |||||   ||| ||| || |||| |||||  |||||||||||  ||  ||||||| || |||||||||||||||||    
T  43198528 attacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcatgaattgttttgcatattgtctatgttgctgtttgtt 43198627  T
Q  209 atttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43198628 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 43198660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 142 - 241
Target Start/End: Original strand, 52243200 - 52243301
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagt 239  Q
    |||||||| || |||| |||||| |||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52243200 gttgttgaatttcatttgatattgttatatcatgaactgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 52243299  T
Q  240 tg 241  Q
    ||    
T  52243300 tg 52243301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 3096364 - 3096293
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3096364 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 3096293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 12902828 - 12902757
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902828 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 12902757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 17046559 - 17046487
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17046559 atactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 17046487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 7088948 - 7088877
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  7088948 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7088877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 7798845 - 7798774
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  7798845 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7798774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 254
Target Start/End: Original strand, 16377529 - 16377639
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16377529 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 16377626  T
Q  242 ttgaagatgatga 254  Q
     ||||||| ||||    
T  16377627 atgaagataatga 16377639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 52873417 - 52873488
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  52873417 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 52873488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 6900005 - 6899891
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||   ||| ||  ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  6900005 gttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttg 6899907  T
Q  242 ttgaagatgatgatgt 257  Q
     |||||||||||||||    
T  6899906 atgaagatgatgatgt 6899891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 154 - 257
Target Start/End: Original strand, 16270254 - 16270356
Alignment:
Q  154 cattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  16270254 catttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatg 16270352  T
Q  254 atgt 257  Q
    ||||    
T  16270353 atgt 16270356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 250
Target Start/End: Original strand, 23374409 - 23374473
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatg 250  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  23374409 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgttctaagttgttgaagatg 23374473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 7893774 - 7893703
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  7893774 atactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 7893703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 257
Target Start/End: Original strand, 16239976 - 16240090
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||    
T  16239976 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctattttgctatt-gttatttaattaagttgcatgagttggtctaagttg 16240074  T
Q  242 ttgaagatgatgatgt 257  Q
     |||||||||||||||    
T  16240075 atgaagatgatgatgt 16240090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 257
Target Start/End: Original strand, 14053325 - 14053422
Alignment:
Q  159 gatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  14053325 gatattattatgtcatgctgt-ttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagatgttgaagatgatgatgt 14053422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Original strand, 18215268 - 18215436
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  18215268 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 18215367  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  18215368 tatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18215436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 187 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22636504 - 22636437
Alignment:
Q  187 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgat 255  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  22636504 actgtctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 22636437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 44052900 - 44052829
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  44052900 atactgcctatgttgatgtt-gttatttaactgagctgcatgagtcggcctaagttgatgaagatgatgatgt 44052829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 256
Target Start/End: Original strand, 19618223 - 19618336
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagtt 240  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||  || | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19618223 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 19618320  T
Q  241 gttgaagatgatgatg 256  Q
    | | |||||| |||||    
T  19618321 gattaagatgttgatg 19618336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 14280427 - 14280316
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagtt 240  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || | ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14280427 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccg-tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 14280330  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  14280329 gattaagatgatga 14280316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 254
Target Start/End: Original strand, 23803316 - 23803427
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagtt 240  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||  || | ||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23803316 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 23803413  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  23803414 gattaagatgatga 23803427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 185 - 254
Target Start/End: Original strand, 44928974 - 44929042
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  44928974 atactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44929042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 254
Target Start/End: Original strand, 51463919 - 51464030
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagtt 240  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||  || | ||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51463919 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 51464016  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  51464017 gattaagatgatga 51464030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 254
Target Start/End: Original strand, 54798760 - 54798872
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagtt 240  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || | ||||||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  54798760 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgtt-gttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 54798858  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  54798859 gattaagatgatga 54798872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Original strand, 12301 - 12469
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  12301 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 12400  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  12401 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 254
Target Start/End: Original strand, 8574875 - 8574985
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||  | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  8574875 gttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactg-ttgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtta 8574972  T
Q  242 ttgaagatgatga 254  Q
     | ||||||||||    
T  8574973 attaagatgatga 8574985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Original strand, 15118346 - 15118514
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  15118346 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 15118445  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  15118446 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15118514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 19242749 - 19242693
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgtcca 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  19242749 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 19242693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 44615456 - 44615288
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  44615456 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttg 44615357  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  44615356 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44615288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Original strand, 44773081 - 44773249
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  44773081 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 44773180  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  44773181 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44773249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 52312678 - 52312510
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  52312678 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 52312579  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  52312578 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 52312510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Original strand, 1837613 - 1837671
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  1837613 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 1837671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Original strand, 7641286 - 7641344
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  7641286 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7641344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 12611008 - 12610950
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  12611008 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12610950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 14038719 - 14038653
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgat 252  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  14038719 atactgcatgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgat 14038653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22353901 - 22353835
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgat 255  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22353901 ctgcctatgctgctgtt-gttatttacctaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgat 22353835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 238
Target Start/End: Original strand, 46640464 - 46640558
Alignment:
Q  146 ttgatttacattcgatattattatatcatga--tgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||||||  ||  ||  |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  46640464 ttgattttcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 46640558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Original strand, 50222443 - 50222501
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  50222443 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 50222501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 6190531 - 6190481
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6190531 ctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 18239531 - 18239581
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  18239531 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18239581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 44102264 - 44102214
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  44102264 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44102214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15367743 - 15367690
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||    
T  15367743 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15367690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15370071 - 15370018
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||    
T  15370071 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15370018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15371255 - 15371202
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||    
T  15371255 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15371202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15373536 - 15373483
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||    
T  15373536 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15373483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15402756 - 15402703
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||    
T  15402756 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 15402703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16223585 - 16223532
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||    
T  16223585 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 16223532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 186 - 238
Target Start/End: Original strand, 53082202 - 53082254
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  53082202 tactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 53082254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 3515065 - 3515007
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  3515065 tgttgctgtt-gttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 3515007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 250
Target Start/End: Original strand, 15355437 - 15355483
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  15355437 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 15355483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 15099607 - 15099559
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgtt 49  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  15099607 atgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttaccttgatgtt 15099559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Original strand, 630725 - 630786
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  630725 ttataatgttatataattggatatatattgcatgcattatgtttgatgattgagatgttgat 630786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 3332055 - 3331994
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  3332055 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 3331994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Original strand, 13812760 - 13812821
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  13812760 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 13812821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Original strand, 14953912 - 14953973
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  14953912 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 14953973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 204 - 241
Target Start/End: Original strand, 14970819 - 14970856
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14970819 ttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttg 14970856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 91 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 15099517 - 15099461
Alignment:
Q  91 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttg 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||| ||||| |||||    
T  15099517 ataatgttatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttg 15099461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 91 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 15190484 - 15190428
Alignment:
Q  91 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttg 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||||| ||||| |||||    
T  15190484 ataatgttatataattgtatatacattatatgaattatg-ttgatatttgagatgttg 15190428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 25690231 - 25690170
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  25690231 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 25690170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 15190574 - 15190526
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgtt 49  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  15190574 atgtgagttgatcttgggggttagaaactaagttatttaccttgatgtt 15190526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 15917 - 15664
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||| || || |||||||||||||||    
T  15917 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgatccagtaagactgattcttatgaaataatgttgcttataatgttat 15818  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  15817 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgtatactgcctatgttgc 15718  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  15717 tgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 57)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 20918860 - 20918620
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||  || |||||||||||||||    
T  20918860 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagtcgtttaccttgttgttaatgttccagtaagactcatgcttatgaattgatgttgcttataatgttat 20918761  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20918760 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgc 20918661  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20918660 agtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20918620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 89 - 257
Target Start/End: Original strand, 14295504 - 14295672
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatac 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14295504 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 14295603  T
Q  189 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  14295604 tacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatgatgatgt 14295672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 33681266 - 33681010
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||  || || ||||||||||||    
T  33681266 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttctagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttat 33681167  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgtt---gatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||   || || ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  33681166 ataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgt 33681067  T
Q  198 tgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  33681066 tgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 33681010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 8 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20248527 - 20248283
Alignment:
Q  8 ttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttatataattg 107  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||   || || |||||||| ||||||||||    
T  20248527 ttgatcttagaggttagaaactaagttatttatcttgatgttgttgt-ccagtaagactgatgcatatgaatccatgttgtttataatgatatataattg 20248429  T
Q  108 tatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgt 207  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  20248428 tatatacattacatgacttatgtttgatatttaagttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgt 20248329  T
Q  208 tatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    | |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  20248328 tttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 20248283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 52927844 - 52928075
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||  || || ||||||||||||    
T  52927844 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctattgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttat 52927943  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||         |||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||     
T  52927944 ataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatg---------attcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgttgt 52928034  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52928035 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 52928075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22237887 - 22237630
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctg-ttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||  ||| |||| ||||||||||  || || || ||| ||||    
T  22237887 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgattgttgttccagcgagactgatacatatgaattgatgttgtttctaaagtta 22237788  T
Q  100 tataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatg 196  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  22237787 tataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcataatgcctatg 22237688  T
Q  197 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  22237687 tcgctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 22237630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 86 - 204
Target Start/End: Original strand, 22130857 - 22130975
Alignment:
Q  86 tgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgca 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  22130857 tgcttataatgttatataattgtatatgcattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgga 22130956  T
Q  186 tactgcctatgttgctgtt 204  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22130957 tactgcctatgttgctgtt 22130975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 22921731 - 22921986
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattga-tgcatatgaattagtgatgcttataatgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||  ||| |  ||||||  || || || |  ||||||||    
T  22921731 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgtta 22921830  T
Q  100 tataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatg 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||  | |||||| ||||   ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  22921831 tataattgtatatacattatatgaattttg-ttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatg 22921929  T
Q  197 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||    
T  22921930 ttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 22921986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21754294 - 21754052
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||  || || ||||||||||      
T  21754294 atgtgagttgatctcagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgtt-- 21754197  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat--ttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgtt 198  Q
          |||||||||||| |||  ||| ||| |||||||||| ||||| |  || |||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  21754196 ------gtatatacattaaatggattatgtt-gataattgagatgttgttgattgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgtt 21754104  T
Q  199 gctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatg 250  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  21754103 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 21754052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 89 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 51130732 - 51130632
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatac 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51130732 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 51130633  T
Q  189 t 189  Q
    |    
T  51130632 t 51130632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 21861431 - 21861672
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| ||  |||| |||||||  |||    |||||  |  || || ||||||||| ||    
T  21861431 atgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctattgttgtttcagtaagcctgaatattatgatatgatgttgtttataatgtgat 21861530  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatg 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||  | ||| |  ||||| |||||||   || |||| |||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  21861531 ataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatg 21861630  T
Q  197 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    ||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21861631 ttgctgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaag 21861672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 91 - 238
Target Start/End: Original strand, 35261032 - 35261180
Alignment:
Q  91 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatact 189  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||| ||| ||| || ||| |  ||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||  |||||||||    
T  35261032 ataatgtgatgtaattgtatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttgagatgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatact 35261131  T
Q  190 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  35261132 gcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35261180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 21896120 - 21896358
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||| ||||   ||| |||||||  |||    ||||| ||  || || ||||||||| ||    
T  21896120 atgtgagttgatcttagatgtaagaaactaagttgtttatcttgttgtt---gtttcagtaagcctgaatattatgatttgatgttgtttataatgtgat 21896216  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatg 196  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  | ||| |  ||||| |||||||   || |||| |||||| |||||||||| ||  ||| ||||||||||||    
T  21896217 ataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgtatactgcctatg 21896316  T
Q  197 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  21896317 ttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 21896358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 88 - 257
Target Start/End: Original strand, 45574835 - 45575008
Alignment:
Q  88 cttataatgttatataattgtatatacattacatgactta-agtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-ggtt 182  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| ||| |  || ||||||||   |||||||| || |||| | ||||||||| ||||| ||   ||    
T  45574835 cttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgttttt 45574934  T
Q  183 gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  45574935 gcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 45575008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 186 - 257
Target Start/End: Original strand, 20847205 - 20847275
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20847205 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 20847275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 142 - 256
Target Start/End: Original strand, 50210219 - 50210333
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagtt 240  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50210219 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 50210317  T
Q  241 gttgaagatgatgatg 256  Q
    | ||||||||||||||    
T  50210318 gatgaagatgatgatg 50210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 16758749 - 16758665
Alignment:
Q  159 gatattattatatcatga--tgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    |||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16758749 gatattgttatatcatgaactggtttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttg 16758665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 180 - 257
Target Start/End: Original strand, 38801432 - 38801508
Alignment:
Q  180 gttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  38801432 gttgcacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagatgttgaagatgatgatgt 38801508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 27250779 - 27250850
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27250779 atactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 27250850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 185 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 34509851 - 34509783
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  34509851 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 34509783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21026751 - 21026680
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  21026751 atactgcctatattgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgacgatgatgatgt 21026680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 256
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454673
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatg 256  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 20454673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22532340 - 22532269
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22532340 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22532269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 238
Target Start/End: Original strand, 50614121 - 50614219
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcat--actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||   |||  ||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  50614121 gttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50614219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 238
Target Start/End: Original strand, 50621949 - 50622047
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcat--actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||   |||  ||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  50621949 gttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50622047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 21840878 - 21840766
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagtt 240  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||  || | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21840878 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 21840781  T
Q  241 gttgaagatgatgat 255  Q
    | | |||||| ||||    
T  21840780 gattaagatgttgat 21840766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 204 - 257
Target Start/End: Original strand, 13212974 - 13213027
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  13212974 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13213027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 13989034 - 13988866
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  13989034 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 13988935  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  13988934 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13988866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 21161831 - 21161720
Alignment:
Q  141 agttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagtt 240  Q
    ||||| ||| || ||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||| |||||||| || || |||||    
T  21161831 agttgatgaattgcattcgatattgttatatcacgatgatttgcatactgttt-tgttgctgtttgttgtttaactaagttgcatgagtcgatccaagtt 21161733  T
Q  241 gttgaagatgatg 253  Q
    | ||| |||||||    
T  21161732 gatgatgatgatg 21161720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21342146 - 21342090
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgtcca 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  21342146 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcca 21342090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Original strand, 21923285 - 21923453
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  21923285 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 21923384  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  21923385 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21923453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Original strand, 22123061 - 22123230
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||| | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| |   || |    
T  22123061 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacattgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttg 22123160  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||    
T  22123161 tatactgt-tgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagattaagatgatga 22123230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 433178 - 433012
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttg-ataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-ggttg 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| || |||| ||||||||||| || |||||   |||    
T  433178 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttg 433079  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||||| ||||||     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  433078 tatactgcctgtgttgc----cgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 433012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 12271806 - 12271743
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaaga 64  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||    
T  12271806 atgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcctgctgttattgtttcagtaaga 12271743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 238
Target Start/End: Original strand, 16368291 - 16368388
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcata--ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||   |||  |||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  16368291 gttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaattgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 16368388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Original strand, 23593839 - 23593897
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  23593839 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23593897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 29298195 - 29298137
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  29298195 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29298137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 29776746 - 29776688
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  29776746 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29776688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 31612371 - 31612313
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  31612371 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 31612313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 21347011 - 21346961
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  21347011 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21346961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 21707217 - 21707167
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  21707217 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21707167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 21711759 - 21711709
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  21711759 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 21711709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 260
Target Start/End: Original strand, 15860121 - 15860177
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgtcca 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||| |||||    
T  15860121 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaagtcca 15860177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 20637107 - 20636975
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||    ||||||||||  |||    |||   ||| || || | ||||||||||    
T  20637107 atgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttaccttgatgttgtcattccagtaagcctgaattgtattttttaatgttgatgataatgttat 20637008  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttg 133  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| |||||    
T  20637007 ataattgtatatacattatatgaattatgtttg 20636975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Original strand, 21475081 - 21475249
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  21475081 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 21475180  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||    
T  21475181 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatga 21475249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 238
Target Start/End: Original strand, 41050040 - 41050138
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  |   ||  |||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| |||||||||    
T  41050040 gttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactattttatatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaag 41050138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16361965 - 16361915
Alignment:
Q  206 gttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatg 256  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||||    
T  16361965 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 16361915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 21714595 - 21714546
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  21714595 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 21714546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 238
Target Start/End: Original strand, 16093836 - 16093987
Alignment:
Q  92 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttg----atttacattcgatattattatatcatga--tgggttgca 185  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||  | ||||  ||||| |||||    |||| |||| |||||| |||||||||||  ||  ||  |    
T  16093836 taatgtgatatatttgtatatacattacatgaattacctatgatgtttgagatgttgtttgatttgcatt-gatattgttatatcatgagctgttttcta 16093934  T
Q  186 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||| | |||||||| |||||||||    
T  16093935 tactgcctatgttgctatttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaag 16093987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 256
Target Start/End: Original strand, 22468749 - 22468816
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatg 256  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| | |||||||||| | |||||| |||||    
T  22468749 ctgcctatgttgctatt-gttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatg 22468816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 49261598 - 49261550
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgtt 49  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  49261598 atgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttaccttgatgtt 49261550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 187 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 50686681 - 50686630
Alignment:
Q  187 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  50686681 actgcctatgttgccgtttgtttattaactaaactgcatgagtcggtctaag 50686630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 16275476 - 16275526
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  16275476 ttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16275526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26065009 - 26064967
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 228  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  26065009 tactgcctatgttgctgtttgtttatcaactaagctgcatgag 26064967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Original strand, 1924911 - 1924972
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  1924911 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 1924972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Original strand, 20923925 - 20923986
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  20923925 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 20923986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 35981550 - 35981598
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgtt 49  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||| ||||    
T  35981550 atgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttatcttgatgtt 35981598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 82)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 13210191 - 13210448
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaatt-agtgatgcttataatgtta 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||| | || ||||||||||||||    
T  13210191 atgtgagttgatcctagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttaacattccagtaaggctgatgcatatgaattcaatgttgcttataatgtta 13210290  T
Q  100 tataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13210291 tataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttaagttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttg 13210390  T
Q  200 ctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13210391 ctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 13210448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 29 - 253
Target Start/End: Original strand, 12174152 - 12174376
Alignment:
Q  29 taagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaa 128  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12174152 taagttgtttagcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaatcaatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgacttat 12174251  T
Q  129 gtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 228  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12174252 gtttgatatttgagttgttgttttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgag 12174351  T
Q  229 acggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
     |||||||||||| ||| |||||||    
T  12174352 tcggtctaagttgatgatgatgatg 12174376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16097587 - 16097332
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||  || || ||||||||||||    
T  16097587 atgtgagttgatcttagagattagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttat 16097488  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| |||||| ||||||  ||||||| |||||||||    
T  16097487 ataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatgatgatgatttgcatattgcctatgt 16097388  T
Q  198 tgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  16097387 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16097332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16104038 - 16103784
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| | || ||||||||||  || || ||||||||||||    
T  16104038 atgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactaatccatatgaattgatgttgtttataatgttat 16103939  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat--ttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgtt 198  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| ||||| |  || ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16103938 ataattttatatacattaaatgaattatgtttgatatttgagatgttgttgattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgtt 16103839  T
Q  199 gctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  16103838 gctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 16103784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 32307926 - 32307684
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||| |||||| ||||||||| || || ||||||||||      
T  32307926 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttctagtaagactgatgcttatgaattaatgttgtttataatgtt-- 32307829  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat--ttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgtt 198  Q
          |||||||||||| |||  ||| ||| |||||||||| ||||| |  || ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  32307828 ------gtatatacattaaatggattatgtt-gataattgagatgttgttgattgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgtt 32307736  T
Q  199 gctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatg 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  32307735 gctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatg 32307684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9513166 - 9512924
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  || || |||||||||| |    
T  9513166 atgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgtttt 9513067  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgc 200  Q
    |||        ||||||| |||  ||| ||| ||||| |||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  9513066 ata--------tacattaaatggattatgtt-gataaatgagatgttgattg-cattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgc 9512977  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||    
T  9512976 tgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9512924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9521141 - 9520899
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  || || |||||||||  |    
T  9521141 atgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgtgtt 9521042  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgc 200  Q
    |||        ||||||| |||  ||| ||| ||||| |||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  9521041 ata--------tacattaaatggattatgtt-gataaatgagatgttgattg-cattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgc 9520952  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||    
T  9520951 tgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 9520899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 92 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 15471092 - 15470927
Alignment:
Q  92 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatac 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| |||||||   || ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  15471092 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 15470993  T
Q  189 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  15470992 tgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 15470927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 49667947 - 49668193
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||  || ||  ||||||| |      
T  49667947 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagactgatgcatatgagttgatgttgtatataatgct-- 49668044  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag----ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatg 196  Q
          |||||||| ||| |||  ||| ||| ||||| ||||    |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  49668045 ------gtatatactttaaatggattatgtt-gataaatgagatgtttgttgattg-cattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatg 49668136  T
Q  197 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||    
T  49668137 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 49668193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 92 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 14234655 - 14234487
Alignment:
Q  92 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatac 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||  | |||||||   || ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  14234655 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatac 14234556  T
Q  189 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| | |||||||||||||    
T  14234555 tgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaagttgattaagatgatgatgt 14234487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 49389492 - 49389639
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||  || || ||||||||||||    
T  49389492 atgtgtgttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttat 49389591  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttg 148  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||| |||||    
T  49389592 ataattgtatatacattaaatgaattatgtttgatagttgagatgttg 49389639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 250
Target Start/End: Original strand, 1644546 - 1644787
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  || || ||||||||        
T  1644546 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatg---- 1644641  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgt 197  Q
        |||||||||||||| |||  ||| | ||||||||||||   ||||||| ||  |||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  1644642 ----ttgtatatacattaaatggattatg-ttgataattgagatattgttga-ttgtattcgatattgttatataatgatgatttgcatactgcctatgt 1644735  T
Q  198 tgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatg 250  Q
    || || |||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||||| ||| ||||    
T  1644736 tgttg-ttgttatttaactaagcaacataagttggtctaagttgatgacgatg 1644787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 142 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 12399324 - 12399209
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagtt 240  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12399324 gttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 12399226  T
Q  241 gttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||    
T  12399225 gttgaagatgatgatgt 12399209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 142 - 238
Target Start/End: Original strand, 52523733 - 52523831
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  52523733 gttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgaactgttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 52523831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 89 - 257
Target Start/End: Original strand, 24340672 - 24340844
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgagttgttgatt---tacattcgatattattatatcatgatgggttgc 184  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| || ||||| ||||| ||   | | |||||||||||||||||||||||   |||    
T  24340672 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttgtgc 24340771  T
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||    
T  24340772 atactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 24340844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 142 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 14972969 - 14972854
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagtt 240  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||  || | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14972969 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 14972871  T
Q  241 gttgaagatgatgatgt 257  Q
    | |||||||||||||||    
T  14972870 gatgaagatgatgatgt 14972854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 142 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 18438649 - 18438534
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagtt 240  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||  || | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  18438649 gttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 18438551  T
Q  241 gttgaagatgatgatgt 257  Q
    | |||||||||||||||    
T  18438550 gatgaagatgatgatgt 18438534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 257
Target Start/End: Original strand, 11424758 - 11424880
Alignment:
Q  134 ataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggt 233  Q
    ||||||||| ||||||||| |  | |||||| |||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  11424758 ataattgagatgttgatttgctattgatattgttatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagt 11424856  T
Q  234 ctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  11424857 ctaagttgatgaagatgatgatgt 11424880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 12934174 - 12934253
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaatt 80  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12934174 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagactgatgcatatgaatt 12934253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 89 - 257
Target Start/End: Original strand, 37642214 - 37642386
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataatt---ga-gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgc 184  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | |||| |||   || |||||| | |||| | |||||||||||||||||||||  ||||    
T  37642214 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttttgc 37642313  T
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  37642314 atactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 37642386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 156 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 23274788 - 23274687
Alignment:
Q  156 ttcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgat 255  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  | ||||||| ||||    
T  23274788 ttcgatattattatatcatgatgttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagtcatcgaagatgttgat 23274689  T
Q  256 gt 257  Q
    ||    
T  23274688 gt 23274687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 37251029 - 37251270
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||  |||   |||||| ||  || || | ||||||| ||    
T  37251029 atgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagtctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgat 37251128  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tgggttgcatactgcctat 195  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||  | ||||  |||||   |||||||||| |||| |||||| |||||||||||  ||  ||  |||||||||||    
T  37251129 ataaatgtatatgcattacatgaattatttatgatg-ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctat 37251227  T
Q  196 gttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||    
T  37251228 gttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtctaag 37251270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 20698485 - 20698556
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20698485 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 20698556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 27165350 - 27165250
Alignment:
Q  154 cattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||| ||||||  ||||||||| ||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  27165350 catttgatattggtatatcatgttgttttgcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 27165251  T
Q  254 a 254  Q
    |    
T  27165250 a 27165250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 254
Target Start/End: Original strand, 53301569 - 53301669
Alignment:
Q  154 cattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  53301569 catttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 53301668  T
Q  254 a 254  Q
    |    
T  53301669 a 53301669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 89 - 257
Target Start/End: Original strand, 43550472 - 43550644
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttg-ataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-ggttg 183  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||   |||    
T  43550472 ttatattgtgatataattgtatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttg 43550571  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  43550572 catactgcatatgttgctg-tcattatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgt 43550644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13442345 - 13442274
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  13442345 atactgcctatgttgccgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 13442274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 23083411 - 23083482
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  23083411 atactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23083482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 192 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 28194755 - 28194693
Alignment:
Q  192 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  28194755 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28194693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 17487927 - 17487856
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  17487927 atactgtctattttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17487856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 17499409 - 17499338
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  17499409 atactgtctattttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17499338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 142 - 254
Target Start/End: Original strand, 24153215 - 24153326
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24153215 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactacctatgttgctatc-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 24153313  T
Q  242 ttgaagatgatga 254  Q
     | ||||||||||    
T  24153314 attaagatgatga 24153326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 26686958 - 26686887
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  26686958 atactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagaagatgatgatgt 26686887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 14572686 - 14572605
Alignment:
Q  159 gatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14572686 gatattattatgtcatgctgttttgtatactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 14572605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 257
Target Start/End: Original strand, 22147474 - 22147646
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataatt---ga-gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgc 184  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | |||| |||   || |||||| | |||| | |||||||||||||||||||||  ||||    
T  22147474 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttttgc 22147573  T
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||| ||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  22147574 ataccgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgactcggtccaagtcgttgaagatgttgatgt 22147646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 142 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 17672737 - 17672626
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagtt 240  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||  || | ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17672737 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 17672640  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  17672639 gattaagatgatga 17672626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Original strand, 7781341 - 7781509
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   |||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  7781341 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 7781440  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  7781441 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 7781509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 257
Target Start/End: Original strand, 25476391 - 25476506
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagtt 240  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || | ||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  25476391 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctgtt-gttttttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 25476489  T
Q  241 gttgaagatgatgatgt 257  Q
    | |||||||||||||||    
T  25476490 gatgaagatgatgatgt 25476506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 36166708 - 36166598
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36166708 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgc-tgtgtcgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 36166611  T
Q  242 ttgaagatgatga 254  Q
     | ||||||||||    
T  36166610 attaagatgatga 36166598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 43926075 - 43925977
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcat--actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||   |||  ||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  43926075 gttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 43925977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 254
Target Start/End: Original strand, 29172587 - 29172745
Alignment:
Q  99 atataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gcatactgcct 193  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || | ||||||| |    
T  29172587 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-t 29172685  T
Q  194 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  29172686 gtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 29172745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 238
Target Start/End: Original strand, 22110358 - 22110454
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcat--actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||||||||||   |||  ||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  22110358 tgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 22110454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Original strand, 9707601 - 9707769
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  9707601 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttg 9707700  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  9707701 tatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 9707769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 17463346 - 17463178
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  17463346 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 17463247  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  17463246 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17463178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 34159494 - 34159326
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  34159494 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 34159395  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  34159394 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34159326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 43841003 - 43840932
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  43841003 atactgtctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgatgaagataatgatgt 43840932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Original strand, 45606901 - 45607069
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  45606901 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 45607000  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  45607001 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45607069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 55476659 - 55476491
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  55476659 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 55476560  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  55476559 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 55476491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Original strand, 6469238 - 6469296
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  6469238 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6469296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 15977573 - 15977515
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  15977573 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15977515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 17737294 - 17737236
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  17737294 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17737236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Original strand, 28848715 - 28848773
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  28848715 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28848773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 55501000 - 55500942
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  55501000 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 55500942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 8499568 - 8499518
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  8499568 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 8499518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 10557035 - 10556985
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  10557035 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10556985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 13544136 - 13544024
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagtt 240  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||  || | ||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13544136 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 13544039  T
Q  241 gttgaagatgatgat 255  Q
    | | |||||| ||||    
T  13544038 gattaagatgttgat 13544024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 15412479 - 15412429
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  15412479 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 15412429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 252
Target Start/End: Original strand, 16282805 - 16282971
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || ||||| |||||||||| ||||| ||  || |    
T  16282805 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttg 16282904  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgat 252  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  16282905 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 16282971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 42386481 - 42386428
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagt 239  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  42386481 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaaactgcatgagtcggtctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 45577950 - 45578000
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  45577950 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45578000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 12567671 - 12567564
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagtt 240  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||  || | ||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12567671 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 12567574  T
Q  241 gttgaagatg 250  Q
    | | ||||||    
T  12567573 gattaagatg 12567564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 254
Target Start/End: Original strand, 40213727 - 40213838
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggt-tgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagtt 240  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||  | || ||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  40213727 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactgc-tgtgttgatgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagtt 40213824  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  40213825 gattaagatgatga 40213838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 50242933 - 50242822
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagtt 240  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||  || | ||||| | | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50242933 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 50242836  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | || |||||||    
T  50242835 gattaaaatgatga 50242822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 8899262 - 8899094
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  8899262 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 8899163  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||||||    
T  8899162 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatga 8899094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Original strand, 16454275 - 16454443
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  16454275 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 16454374  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  16454375 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16454443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Original strand, 38961885 - 38962053
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  38961885 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 38961984  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||    
T  38961985 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 38962053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 41123940 - 41123892
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgat 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  41123940 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 41123892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12378038 - 12377940
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  |   ||  |||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  12378038 gttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctattttatatactgcctatgttgctgtttgtctattaactaagctgtatgagtcggtctaag 12377940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 21618559 - 21618462
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||  | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21618559 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactg-ttgtgtcgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21618462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Original strand, 606378 - 606428
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  606378 ctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtataag 606428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 10247835 - 10247885
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  10247835 ttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 10247885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 12119837 - 12119887
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  12119837 ttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12119887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 44494859 - 44494809
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||    
T  44494859 ttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 44494809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Original strand, 13151784 - 13151953
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  13151784 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 13151883  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  13151884 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13151953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Original strand, 13154249 - 13154418
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  13154249 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 13154348  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  13154349 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13154418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 238
Target Start/End: Original strand, 53070755 - 53070799
Alignment:
Q  193 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53070755 tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 241
Target Start/End: Original strand, 14576882 - 14576937
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  14576882 atactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgaatgagtcggtctaagttg 14576937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 1465273 - 1465316
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttg 44  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||    
T  1465273 atgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttaccttg 1465316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Original strand, 17446759 - 17446816
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||    
T  17446759 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagttgattaagatgatga 17446816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 91 - 148
Target Start/End: Original strand, 1465363 - 1465419
Alignment:
Q  91 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttg 148  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||| |||||    
T  1465363 ataatgttatacaattgtatatacattacatgaattatg-ttgatatttgagatgttg 1465419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 19776092 - 19776031
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  19776092 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 19776031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Original strand, 37439418 - 37439479
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  37439418 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 37439479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 7068 - 6831
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  7068 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattaatgttgtttataatgttat 6969  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  6968 ataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgc 6869  T
Q  201 tgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  6868 tgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaag 6831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 8274 - 8097
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| | |||||||  |||| |||||||  |||   |||| |  || || || |  |||||||||    
T  8274 atgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttatcctgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgttaatgttat 8175  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatg 175  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||   |||||||| || |||| |||||| ||||||||||    
T  8174 ataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatg 8097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 63)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 36 - 257
Target Start/End: Original strand, 23071849 - 23072070
Alignment:
Q  36 tttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgat 135  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23071849 tttaccttgttgctaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgat 23071948  T
Q  136 aattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtct 235  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  23071949 aattgagttgctgatttatattcgatattattatatcatgatggtttgcatactgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggact 23072048  T
Q  236 aagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  23072049 aagttgttgaagatgatgatgt 23072070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 25176109 - 25175854
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattga-tgcatatgaattagtgatgcttataatgtta 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||  ||| |  ||||||  || || || |  ||||||||    
T  25176109 atgtaagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgtta 25176010  T
Q  100 tataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatg 196  Q
    ||||||| ||||||| ||| |||| ||| ||| |||| |||||   |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  25176009 tataattatatatacgttatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatg 25175911  T
Q  197 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||| |||||||    
T  25175910 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgtctaagttgatgatgatgatg 25175854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 28406236 - 28405981
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgca-tatgaattagtgatgcttataatgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||  ||||||  | ||  | |||||  || || || |  ||||| ||    
T  28406236 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgttaatggta 28406137  T
Q  100 tataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gcatactgcctat 195  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||| |||||   |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||    
T  28406136 tataattgtatatacattttatgaattaagtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctat 28406038  T
Q  196 gttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgat 252  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  28406037 gttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgat 28405981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 22134079 - 22134326
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||        
T  22134079 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcatttttccagtaagactgatgcatatgaattggtgttgtttataatg---- 22134174  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat--ttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgtt 198  Q
        |||||||||||||| |||  ||| | ||||||| |||| ||||  |  || ||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  22134175 ----ttgtatatacattaaatggattatg-ttgataaatgagatgttattgattgcattcgatattgttatattatgatgatttgcatactgcctatgtt 22134269  T
Q  199 gctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatg 256  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||| ||||||||||    
T  22134270 gctg-ttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatgatg 22134326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 7679750 - 7679589
Alignment:
Q  94 atgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactg 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||  ||  | |||||||   ||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  7679750 atgttatataattatatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttacatt-gatattgttatatcatgatgatttgcatactg 7679652  T
Q  191 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||    
T  7679651 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 7679589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 89 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 19672001 - 19671830
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatt---tacattcgatattattatatcatgatgggttgca 185  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | |||  |||||| ||||| ||   | | |||||||||||||||||||||||  |||||    
T  19672001 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatattgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttttgca 19671902  T
Q  186 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||    
T  19671901 tactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 19671830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 18786764 - 18787008
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| | |||||||  |||| |||||||  | |   |||||| | | || |  | ||||||||||    
T  18786764 atgtgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcatgctgttgttgtttcagtaagcctaaattatatgattgaatgttattgataatgttat 18786863  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataat-tga-gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tgggttgcatactgcctatg 196  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  | ||| |||||||| || |||| || ||| |||||||||||  ||| ||||||||| ||||||    
T  18786864 atagttgtatatacattacatgaattatgtttgatgttgtgacgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaactggtttgcatactacctatg 18786963  T
Q  197 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18786964 ttactgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 18787008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 159 - 257
Target Start/End: Original strand, 38138 - 38235
Alignment:
Q  159 gatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38138 gatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 38235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 180 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 20309185 - 20309108
Alignment:
Q  180 gttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20309185 gttgtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 20309108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22105581 - 22105412
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttg-ataattg---agttgttgatttacattcgatattattatatcatgatg-ggttg 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | || |||||||   ||||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||   |||    
T  22105581 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 22105482  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  22105481 catactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22105412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 185 - 254
Target Start/End: Original strand, 298864 - 298933
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  298864 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 298933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 7594 - 7824
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| | || ||||  |||| |||||||  |||   |||||| ||| || || |  |||||| ||    
T  7594 atgtgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcatgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttgttaatgtgat 7693  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatg 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||  | ||| |  ||||| |||||||   || |||| |||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  7694 ataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatg 7793  T
Q  197 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 227  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  7794 ttgctgtttgtttattaactaagctgcatga 7824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 23060584 - 23060513
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  23060584 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23060513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 23103445 - 23103516
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23103445 atactgcctatgttgctgttt-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 23103516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 23285936 - 23285865
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  23285936 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23285865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 89 - 257
Target Start/End: Original strand, 23708568 - 23708738
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgagttgt---tgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgc 184  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  ||||| |  ||||| |||   |||||| || | |||||| |||||||||| ||  ||||    
T  23708568 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcatgttgttttgc 23708667  T
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||   |||||||||||||    
T  23708668 atactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagttg--aaagatgatgatgt 23708738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Original strand, 22459423 - 22459541
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| || ||  || |  ||||||||| ||    
T  22459423 atgtgagttgaccttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgttattgtttcagtaagactgatgtatacgagttgatgttatttataatgtgat 22459522  T
Q  101 ataattgtatatacattac 119  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22459523 ataattgtatatacattac 22459541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 23076513 - 23076442
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  23076513 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtggatgaagatgatgatgt 23076442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 159 - 257
Target Start/End: Original strand, 23654409 - 23654507
Alignment:
Q  159 gatattattatatcatgatgggtt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||| ||||||||  || | || ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23654409 gatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 23654507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 142 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 23660137 - 23660023
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||  ||  | | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  23660137 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctgtttcgtatactgcctatgttgctgtt-gttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagttg 23660039  T
Q  242 ttgaagatgatgatgt 257  Q
     |||||||||||||||    
T  23660038 atgaagatgatgatgt 23660023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 187 - 257
Target Start/End: Original strand, 22731286 - 22731355
Alignment:
Q  187 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  22731286 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatgt 22731355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 8946728 - 8946657
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  8946728 atactgcctatgttgctatt-gttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8946657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22337186 - 22337115
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  22337186 atacagcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 22337115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 193 - 257
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040310
Alignment:
Q  193 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  23040247 tatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 23040310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23207537 - 23207296
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| ||| ||| |||||  ||||| ||||||  |||   |||||| ||  || || | ||||||| ||    
T  23207537 atgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttcaagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgat 23207438  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataat--tgagttgt---tgatttacattcgatattattatatcatga--tgggttgcatactgcct 193  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||   || |||||  |||| |||   |||||| |||| |||||| |||||||||||  ||  ||  |||||||||    
T  23207437 ataaatgtatatgcattacatgaatta---tttataatgttgagatgtcgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcct 23207341  T
Q  194 atgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  23207340 atgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23207296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 6726163 - 6725995
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  6726163 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttg 6726064  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  6726063 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 6725995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 204 - 257
Target Start/End: Original strand, 22738247 - 22738300
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  22738247 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgatgt 22738300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23791534 - 23791292
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||| |||| ||||  |||| |||||||  |||   |||||| ||  || || | ||||||| ||    
T  23791534 atgtgagttgatcttgggggttggaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgat 23791435  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcat--actgcctat 195  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||  | | ||  |||||   |||||||||| |||| |||||| |||||||||||   |||  ||  |||||||||    
T  23791434 ataaatgtatatgcattacatgaattatatataatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatttttatatcatgaactgttttatgtactgcctat 23791335  T
Q  196 gttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    |||| |||||| |  ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  23791334 gttgttgtttgcttattaactaagctacatgagtcggtctaag 23791292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 18809111 - 18808943
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  18809111 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 18809012  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  18809011 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 18808943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 23131030 - 23130862
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  23131030 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 23130931  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  23130930 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23130862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 23133497 - 23133329
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  23133497 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 23133398  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  23133397 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23133329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Original strand, 23709526 - 23709694
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  23709526 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 23709625  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  23709626 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23709694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Original strand, 23712007 - 23712175
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  23712007 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 23712106  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  23712107 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23712175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 26505547 - 26505379
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| |   || |    
T  26505547 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttg 26505448  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  26505447 tatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26505379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 26508025 - 26507857
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| |   || |    
T  26508025 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttg 26507926  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  26507925 tatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 26507857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Original strand, 34402516 - 34402684
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  34402516 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 34402615  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  34402616 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 34402684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 39682481 - 39682313
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  39682481 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 39682382  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  39682381 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 39682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 571455 - 571397
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  571455 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 571397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 23135648 - 23135590
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  23135648 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 23135590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 28577149 - 28577099
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  28577149 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 28577099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 32039610 - 32039660
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  32039610 ttgttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatgatga 32039660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 38967424 - 38967374
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  38967424 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 38967374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 45029966 - 45030016
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  45029966 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 45030016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 43137357 - 43137301
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgat 252  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  43137357 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 43137301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 186 - 238
Target Start/End: Original strand, 20520243 - 20520295
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  20520243 tactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 20520295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 251
Target Start/End: Original strand, 21155164 - 21155219
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatga 251  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  21155164 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 21155219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24367942 - 24367774
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  24367942 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 24367843  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||    
T  24367842 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatga 24367774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 251
Target Start/End: Original strand, 24643054 - 24643109
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatga 251  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  24643054 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 24643109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 256
Target Start/End: Original strand, 32215033 - 32215085
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatg 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||||    
T  32215033 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 32215085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 24529641 - 24529691
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  24529641 ttgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24529691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Original strand, 32451981 - 32452031
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  32451981 ctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 32452031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Original strand, 22413187 - 22413240
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  22413187 atactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 22413240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Original strand, 24898189 - 24898358
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  24898189 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 24898288  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  24898289 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24898358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Original strand, 24900672 - 24900841
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  24900672 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 24900771  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  24900772 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24900841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Original strand, 24903149 - 24903318
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  24903149 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 24903248  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  24903249 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24903318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Original strand, 24905626 - 24905795
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  24905626 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 24905725  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  24905726 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24905795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Original strand, 24908101 - 24908270
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  24908101 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 24908200  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaa-gctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  24908201 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 24908270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23004819 - 23004767
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  23004819 tactacctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 23004767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 25108958 - 25108906
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  25108958 tactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 25108906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23287433 - 23287384
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtcta 236  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  23287433 tactgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 1283751 - 1283690
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  1283751 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 1283690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 187 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392403
Alignment:
Q  187 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtcta 236  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgttgtttatt-aactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Original strand, 30344773 - 30344834
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  30344773 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 30344834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 29142 - 29354
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataat---gt 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||   ||    
T  29142 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataattatgt 29241  T
Q  98 tatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgt 197  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||    
T  29242 tatataattgtatatacagtacatgacttaagtttgataattgagttgctgatttacattcgatattattatatcatgatagtttgaatactacctatgt 29341  T
Q  198 tgctgtttgttat 210  Q
    |||||||||||||    
T  29342 tgctgtttgttat 29354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 7938 - 8179
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||   ||| |||||||  |||   |||||| ||| || || | ||||||||||    
T  7938 atgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgtt---gtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttgataatgttat 8034  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataat-tga-gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tgggttgcatactgcctatg 196  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||  | ||||  | ||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||||||    
T  8035 atagttgtatatacattacatgaattatatatgatgttgtgatgttgttgatttgtatttgatattgttatatcatgaactggtttgtatactgcctatg 8134  T
Q  197 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8135 ttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 8179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 45654 - 45909
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||  || || ||||||||||||    
T  45654 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatattgctgtaattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttat 45753  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgt 197  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  45754 ataattgtatatacatcacatgaattatgtttgataattgagatgttgatgacttacattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctattt 45853  T
Q  198 tgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  45854 ttctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 45909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 10403 - 10646
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||  || || ||||||||||||    
T  10403 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttat 10502  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10503 ataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgt 10602  T
Q  198 tgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  10603 tgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttg 10646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 149; Significance: 9e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 89 - 257
Target Start/End: Original strand, 1022 - 1190
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatac 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1022 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 1121  T
Q  189 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1122 tgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 188
Target Start/End: Original strand, 2307 - 2494
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  2307 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttttttaccttgctattaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttat 2406  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatac 188  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2407 ataattgtatatacattaaatgacttaagtttgataattgagttgctgatttacattcgatattattatatcatgatggtttgcatac 2494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 257
Target Start/End: Original strand, 2493 - 2521
Alignment:
Q  229 acggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2493 acggtctaagttgttgaagatgatgatgt 2521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 146; Significance: 6e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 130164 - 129921
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||  || || ||| ||||||||    
T  130164 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttacaatgttat 130065  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  130064 ataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgt 129965  T
Q  198 tgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  129964 tgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttg 129921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 238
Target Start/End: Original strand, 60721 - 60818
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    ||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||  ||  ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  60721 gttgttgatttgcatt-gatattggtatatcatgagctgttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 60818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 160942 - 160688
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||  |||| | |||||| |||||||||||||||  || || ||||||||||||    
T  160942 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcggtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttat 160843  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgt 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||   |||||||| || |||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  160842 ataattgtatatatattacatgacttatgtttgatatttgacatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgt 160744  T
Q  198 tgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  160743 tgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 160688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 501142 - 501088
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatg 250  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  501142 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 501088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 85692 - 85742
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||    
T  85692 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatga 85742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 387 - 133
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||  ||||| ||| ||| |||| ||||||||||  || || ||||||| ||||    
T  387 atgtgagttgatcttagaggttagaaactgagttgtt-atcttgctgttgttgttctagtgagactgatacatatgaattgatgttgtttataatattat 289  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||   |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  288 ataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgt 189  T
Q  198 tgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||    
T  188 tgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 22536 - 22775
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||  ||    | || ||||||||||||    
T  22536 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttgtcttgatgttgctgttccagtaagactgatgcatattgat----gttgtttataatgttat 22631  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||   || ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  22632 ataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgtctatgt 22731  T
Q  198 tgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22732 cgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 22775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 82183 - 82072
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagtt 240  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||  || | ||||| | | |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  82183 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagtt 82086  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  82085 gattaagatgatga 82072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 6793 - 6535
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattga-tgcatatgaattagtgatgcttataatgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||| |||||||  ||| |  ||||||  || || || |  ||||| ||    
T  6793 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtt-atcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggta 6695  T
Q  100 tataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatg 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  6694 tataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatg 6596  T
Q  197 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  6595 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgt 6535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 8728 - 8482
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||| ||||| |||||||||  || || ||||||||| ||    
T  8728 atgtgaattgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgtatatgaattgatgttgtttataatgtgat 8629  T
Q  101 ataat--tgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgccta 194  Q
    |||||  |||||||||||||| ||| |||  | ||| || ||||| |||||||   || |||| |||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  8628 ataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgccta 8529  T
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8528 tgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 8482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 19523 - 19268
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgca-tatgaattagtgatgcttataatgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||   ||||  | |||||  || || || |  ||||| ||    
T  19523 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgatgttgttgtttcagtaaccctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggta 19424  T
Q  100 tataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatg 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19423 tataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatg 19325  T
Q  197 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  19324 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 19268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13025 - 12766
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||  |||   ||||||  || || || |  |||||||||    
T  13025 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagtggtttatcttgctgttgttgttccagtaagcctgaattatatgatctaatgttgttattaatgttat 12926  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||  | |||||||   || ||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  12925 ataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatattgcctatgt 12826  T
Q  198 tgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||    
T  12825 tgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgattatgatgatgt 12766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 62454 - 62216
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattga-tgcatatgaattagtgatgcttataatgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||  ||| |   |||||| || ||||| |  ||||||||    
T  62454 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgttatgaactaatgatgttgttaatgtta 62355  T
Q  100 tataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttg 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||| ||||| | | ||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||    
T  62354 tataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgtgcattcgatattattataccatgatgtttttcatactgcctatgttg 62256  T
Q  200 ctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagt 239  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  62255 ctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaagt 62216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 132910 - 132662
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||  || || |||||||||| |    
T  132910 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgt 132811  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat--ttacattcgatattattatatcatgatg-ggttgcatactgcctatgt 197  Q
    |      ||||||||||| |||  ||| | ||||||||||||  ||||||  |||||||||||||| || ||||||||||   ||||||||| | |||||    
T  132810 a------tatatacattaaatggattatg-ttgataattgagacgttgatgattacattcgatattgttgtatcatgatgattttgcatactacttatgt 132718  T
Q  198 tgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||    
T  132717 tgctgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 132662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 136848 - 136680
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  136848 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttg 136749  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  136748 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 136680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 139317 - 139149
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  139317 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttg 139218  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  139217 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 139149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 144255 - 144087
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  144255 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttg 144156  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  144155 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 144087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 134379 - 134211
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  134379 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttg 134280  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||    
T  134279 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatga 134211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 141786 - 141618
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  141786 ttatactgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttg 141687  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  141686 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 141618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 8)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 100633 - 100378
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattga-tgcatatgaattagtgatgcttataatgtta 99  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||  |||| |||||||  | | |  ||||||  || || || |  ||||||||    
T  100633 atgtgacttgctcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctaaattaatatgatctaatgttgttgttaatgtta 100534  T
Q  100 tataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatg 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| | || ||| ||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  100533 tataattgtatatacattatatgaattatg-ttaatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgatttgcatactgcctatg 100435  T
Q  197 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  100434 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 100378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 40036 - 40291
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattga-tgcatatgaattagtgatgcttataatgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||  ||| |  ||||||  |  || || |  ||||| ||    
T  40036 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgatgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatcttatgttgttgttaatggta 40135  T
Q  100 tataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatg 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  40136 tataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcctactgcctatg 40234  T
Q  197 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||    
T  40235 ttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgatgatgatg 40291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 184 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 119948 - 119875
Alignment:
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  119948 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 119875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 176 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 101580 - 101503
Alignment:
Q  176 atgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||    
T  101580 atggtttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgatgatgatg 101503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 94579 - 94411
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  94579 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 94480  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  94479 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 94411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 44512 - 44454
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  44512 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 44454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 250
Target Start/End: Original strand, 17552 - 17598
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  17552 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 101652 - 101616
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtt 37  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  101652 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtt 101616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1341 - 1098
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||| ||||  ||||||||||||| ||||| |||||| ||  || || |  |||||||||    
T  1341 atgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttttttatcttgttgttgttgttccagtaagactgatgtatatgatttgatgttgttgttaatgttat 1242  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttac---attcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgt 197  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||  ||||  |||||||   |   |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1241 atagttgtatatacattccatgaattatgtttgatgtttgaaatgttgatgacctgtattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgt 1142  T
Q  198 tgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1141 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 1098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Original strand, 5985 - 6244
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||  |||    ||| |  || || || |  |||||||||    
T  5985 atgttagttgatcttggaggttaaaaactaagttatttatcttgctgttattgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttat 6084  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||  | |||| ||   || ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  6085 ataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgt 6184  T
Q  198 tgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  6185 tactgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 5901 - 5659
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattga-tgcatatgaattagtgatgcttataatgtta 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||  |||| |||||||  ||| |  ||||||  || || || |  ||||| ||    
T  5901 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagtt-tttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggta 5803  T
Q  100 tataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatg 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||    
T  5802 tataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttcatactgcctatg 5704  T
Q  197 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5703 ttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaagttg 5659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 10786 - 10543
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||  |||   |||| |  || || || |  |||||| ||    
T  10786 atgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgttaatgtcat 10687  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||  ||||| |||||||   || ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10686 ataattgtatatacattacatgaattatgttcgatgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgt 10587  T
Q  198 tgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    || ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  10586 tgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtctaagttg 10543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 2507 - 2762
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattga-tgcatatgaattagtgatgcttataatgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |  |||| |||||||  ||| |  ||||||  || || || |  ||||| ||    
T  2507 atgtgagttgatcttagaggttagaaattaagttgtttatcttgctgatgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggta 2606  T
Q  100 tataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatg 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||  || |||||||||||||    
T  2607 tataattgtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcaatattgttataacatgatgatttacatactgcctatg 2705  T
Q  197 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  2706 ttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 2762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 14559 - 14814
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgca-tatgaattagtgatgcttataatgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||  |||| |||||||  ||||  | |||||  || || |  |  ||||| ||    
T  14559 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtatatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgtttttgttaatggta 14658  T
Q  100 tataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatg 196  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||   |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  || | |||||||||||    
T  14659 tataatagtatatacattatatgaattatgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttcttactgcctatg 14757  T
Q  197 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  14758 ttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 14814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 6870 - 6611
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||| || |||||||||||| |||||||||  ||||  |||||| ||||   ||||||  || || || |  |||||||||    
T  6870 atgtgagttgaacttggagattagaatctaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcttgaattatatgatctaatgttgttgttaatgttat 6771  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||    || ||||   || ||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  6770 ataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttataatgatgataacttgcattcgatattgttatatcatcatgatttgcatactgcctatgt 6671  T
Q  198 tgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  6670 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 6611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 14250 - 13991
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||| || |||||||||||| |||||||||  ||||  |||||| ||||   ||||||  || || || |  |||||||||    
T  14250 atgtgagttgaacttggagattagaatctaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcttgaattatatgatctaatgttgttgttaatgttat 14151  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||    || ||||   || ||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  14150 ataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttataatgatgataacttgcattcgatattgttatatcatcatgatttgcatactgcctatgt 14051  T
Q  198 tgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  14050 tgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 13991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 6 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 32345 - 32102
Alignment:
Q  6 agttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttatataat 105  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||||||  || || |||||||||| ||||      
T  32345 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata-- 32248  T
Q  106 tgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat--ttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gcatactgcctatgttgctg 202  Q
        ||||||||| |||  ||| ||| ||||||||||  ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||| | ||||||| ||    
T  32247 ----tatacattaaatggattatgtt-gataattgagacgttgatgattacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgttg 32153  T
Q  203 tttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||    
T  32152 tttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 53410 - 53640
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||| |||||  ||||| ||  || || ||||||||| ||    
T  53410 atgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatctttatgttgatgttccagtaagactgatgtttatgatttgatgttgtttataatgtgat 53509  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttg-ataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatg 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||  | || ||| ||||| |||||||   || |||| |||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  53510 ataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatg 53609  T
Q  197 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatga 227  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  53610 ttgctgtttgtttattaactaagctgcatga 53640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 32794 - 32538
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||| |||| |||||||  |||   |||| |  || || |  |  |||||||||    
T  32794 atgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgttgttattgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgtttttgttaatgttat 32695  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat--ttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgtt 198  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||| ||||| |  || |||| |||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  32694 atagttgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgattgcatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgcctatgtt 32595  T
Q  199 gctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||    
T  32594 gctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg--aaagatgatgatgt 32538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Original strand, 51936 - 51985
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51936 ctgcctatgt-gctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 92 - 257
Target Start/End: Original strand, 987 - 1155
Alignment:
Q  92 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatac 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||  | |||||||   || |||||||| || |||||||||||||   |||||||    
T  987 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatgttgttatatcatgatgatctgcatac 1086  T
Q  189 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  1087 tacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 2666 - 2923
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgca-tatgaattagtgatgcttataatgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||  ||||  | |||||  || || || |  ||||| ||    
T  2666 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctattgttgttgttaatggta 2765  T
Q  100 tataattgtatata----cattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcc 192  Q
    ||  ||||||||||    ||||  |||| ||||| | |||| |||||   |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  2766 ta--attgtatatatatacattttatgaattaagct-gatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcc 2862  T
Q  193 tatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||||    
T  2863 tatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgatgatgatg 2923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 92 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13107 - 12942
Alignment:
Q  92 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatac 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||  ||  | |||||||   || ||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||    
T  13107 taatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatttgcatac 13008  T
Q  189 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||    
T  13007 tgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaa---gttgaagatgatgatgt 12942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12827 - 12587
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||  | |||  ||| | ||  || || ||||||||| ||    
T  12827 atgtgagttgatcttagaggtaataaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagtctaatgtgtattatttgatgttgtttataatgtgat 12728  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgagttgttgat---ttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatg 196  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||  | | | || ||||| |||||||   || |||| |||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  12727 ataattgtatatacattac-tgaattatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatg 12629  T
Q  197 ttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  12628 ttgctgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 12587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 154 - 257
Target Start/End: Original strand, 15795 - 15898
Alignment:
Q  154 cattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  15795 cattcgatattgttatatcatcatgatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 15894  T
Q  254 atgt 257  Q
    ||||    
T  15895 atgt 15898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 15694 - 15756
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaag 63  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||    
T  15694 atgtgagttgatcttggagattagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaag 15756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 204 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 178947 - 178898
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | | |||||||||    
T  178947 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 178898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 7920 - 8161
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||| ||| ||||| |||||| ||  || || ||||||||| ||    
T  7920 atgtgagttgatcttagaggtatgaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtgagactgatgtatatgatttgatgttgtttataatgtgat 8019  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattga----gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tgggttgcatactgccta 194  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||  | |||   || |    |||||||| || |||| ||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||    
T  8020 ataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatgagctgatttgcatactgccta 8119  T
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtcta 236  Q
    || |||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  8120 tgctgctatttgttatttaattaagctgcatgcgtcggtcta 8161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 154 - 257
Target Start/End: Original strand, 23901 - 24001
Alignment:
Q  154 cattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||   |||||||||||||    
T  23901 cattcgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaa---gttgaagatgatg 23997  T
Q  254 atgt 257  Q
    ||||    
T  23998 atgt 24001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 142 - 256
Target Start/End: Original strand, 3192 - 3306
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagtt 240  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||  || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3192 gttgttgaattacatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 3290  T
Q  241 gttgaagatgatgatg 256  Q
    | ||||||||||||||    
T  3291 gatgaagatgatgatg 3306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 142 - 257
Target Start/End: Original strand, 3157 - 3271
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3157 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 3255  T
Q  242 ttgaagatgatgatgt 257  Q
     |||||||||||||||    
T  3256 atgaagatgatgatgt 3271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 89 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 11636 - 11464
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataatt---ga-gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgc 184  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | |||| |||   || |||||| | |||| | |||||||||||||||||||||  ||||    
T  11636 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttttgc 11537  T
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| ||||||    
T  11536 atactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 28673 - 28775
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||  || || ||||||||||||    
T  28673 atgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttat 28772  T
Q  101 ata 103  Q
    |||    
T  28773 ata 28775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 181 - 253
Target Start/End: Original strand, 28814 - 28887
Alignment:
Q  181 ttgcatactgcctatgttgctgtt-tgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  28814 ttgcatactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatg 28887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 89 - 257
Target Start/End: Original strand, 38205 - 38377
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataatt---ga-gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgc 184  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | |||| |||   || |||||| | |||| | |||||||||||||||||||||  ||||    
T  38205 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttttgc 38304  T
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| ||||||    
T  38305 atactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgt 38377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 257
Target Start/End: Original strand, 10448 - 10544
Alignment:
Q  159 gatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10448 gatattattatgtcatgctg--ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 10544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 159 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 1385 - 1289
Alignment:
Q  159 gatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||| ||||| ||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1385 gatataattatgtcatgatg--ttgtacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 180 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 7343 - 7266
Alignment:
Q  180 gttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7343 gttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 7266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 254
Target Start/End: Original strand, 15291 - 15356
Alignment:
Q  188 ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||    
T  15291 ctgcctatgttgctatt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatga 15356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 180 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16359 - 16282
Alignment:
Q  180 gttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16359 gttgtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 16282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 180 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 51659 - 51582
Alignment:
Q  180 gttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  51659 gttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaaatgatgatgt 51582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 142 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 4964 - 4849
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagtt 240  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  4964 gttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagtt 4866  T
Q  241 gttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||    
T  4865 gttgaagatgatgatgt 4849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 180 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 174843 - 174767
Alignment:
Q  180 gttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatg 256  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||    
T  174843 gttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagttgatgatg 174767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 136229 - 136471
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaatt-agtgatgcttataatgtta 99  Q
    ||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||  |||   |||||| || | || || |  ||||||||    
T  136229 atgtgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgattttaatgttgttgttaatgtta 136328  T
Q  100 tataattgtatatacattacatgacttaagtttgataat-tga-gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tgggttgcatactgcctat 195  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| ||  ||| || ||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  ||  |||  ||||||||||    
T  136329 tatagttgtatatacattacatgaattatgtacgatgatgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgtgtactgcctat 136428  T
Q  196 gttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    || ||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  136429 gtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 136471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 238
Target Start/End: Original strand, 144937 - 145179
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaatt-agtgatgcttataatgtta 99  Q
    ||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||  |||   |||||| || | || || |  ||||||||    
T  144937 atgtgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgattttaatgttgttgttaatgtta 145036  T
Q  100 tataattgtatatacattacatgacttaagtttgataat-tga-gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tgggttgcatactgcctat 195  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| ||  ||| || ||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  ||  |||  ||||||||||    
T  145037 tatagttgtatatacattacatgaattatgtacgatgatgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttgtgtactgcctat 145136  T
Q  196 gttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    || ||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  145137 gtcgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 145179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 187 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121766
Alignment:
Q  187 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  121835 actgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 121766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 159 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1130 - 1051
Alignment:
Q  159 gatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    |||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1130 gatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 1051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 142 - 241
Target Start/End: Original strand, 16106 - 16205
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||  ||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16106 gttgttgatttacatttgatattgttatatcatgttgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 16205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13243 - 13147
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  13243 gttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2680
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    |||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  2732 tactgcctatgttgttgcttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 2680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 142 - 241
Target Start/End: Original strand, 27755 - 27854
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||  ||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27755 gttgttgatttacatttgatattgttatatcatgctgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 27854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 186 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 32137 - 32067
Alignment:
Q  186 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32137 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 32067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 159 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13594 - 13497
Alignment:
Q  159 gatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||| || ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  13594 gatattatcatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagttgatgatgt 13497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 89 - 257
Target Start/End: Original strand, 17976 - 18148
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgagttgttgatt---tacattcgatattattatatcatgatgggttgc 184  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| || ||||| ||||| ||   | | |||||||||||||||||||||||   |||    
T  17976 ttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttgtgc 18075  T
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||    
T  18076 ataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgt 18148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Original strand, 2241 - 2291
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||||    
T  2241 ttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgattaaaatgatga 2291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 159 - 257
Target Start/End: Original strand, 15487 - 15584
Alignment:
Q  159 gatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  15487 gatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctctt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgt 15584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 39591 - 39479
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39591 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 39493  T
Q  242 ttgaagatgatgat 255  Q
     |||||| ||||||    
T  39492 atgaagacgatgat 39479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 250
Target Start/End: Original strand, 26071 - 26179
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagtt 240  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||  || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26071 gttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 26169  T
Q  241 gttgaagatg 250  Q
    | ||||||||    
T  26170 gatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 142 - 254
Target Start/End: Original strand, 44713 - 44825
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagtt 240  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || | ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  44713 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtt 44811  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | ||||||||||    
T  44812 gattaagatgatga 44825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 142 - 255
Target Start/End: Original strand, 75221 - 75333
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  75221 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 75319  T
Q  242 ttgaagatgatgat 255  Q
     |||||| ||||||    
T  75320 atgaagacgatgat 75333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 1098 - 1169
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1098 atactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 2080 - 2281
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgca-tatgaattagtgatgcttataatgtta 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||  |||| |||||||  ||||  | |||||   | || || |  ||||| ||    
T  2080 atgtgagttgatcttagaggttagaaaataagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatccaatgttgttgttaatggta 2179  T
Q  100 tataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatg 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| |  ||||| ||||   ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  2180 tataattgtatatacattatatgaattatg-ctgatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgatttgcatactgcctatg 2278  T
Q  197 ttg 199  Q
    |||    
T  2279 ttg 2281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 4783 - 4712
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4783 atactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 4712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 254
Target Start/End: Original strand, 38720 - 38820
Alignment:
Q  154 cattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| | |||||||||    
T  38720 catttgatattgttatatcatgttgttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaagttgattaagatgatg 38819  T
Q  254 a 254  Q
    |    
T  38820 a 38820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 168028 - 168099
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  168028 atactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgt 168099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 189 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 51980 - 51913
Alignment:
Q  189 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  51980 tgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 51913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 159 - 257
Target Start/End: Original strand, 1074 - 1170
Alignment:
Q  159 gatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||| ||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1074 gatataattatgtcatgatg--ttgtatactgcctatgttgatgtttattaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 38875 - 38761
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  38875 gttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgactcggtctaagttg 38777  T
Q  242 ttgaagatgatgatgt 257  Q
     |||||||||||||||    
T  38776 atgaagatgatgatgt 38761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 154 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 33044 - 32942
Alignment:
Q  154 cattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  33044 catttgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatg 32946  T
Q  254 atgt 257  Q
    ||||    
T  32945 atgt 32942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 9807 - 9744
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgtcc 259  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  9807 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcc 9744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 257
Target Start/End: Original strand, 32963 - 33077
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32963 gttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 33061  T
Q  242 ttgaagatgatgatgt 257  Q
     |||||||||||||||    
T  33062 atgaagatgatgatgt 33077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 142 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 46042 - 45928
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    |||||||| || || | ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46042 gttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttgtatactgcctgtgttgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 45944  T
Q  242 ttgaagatgatgatgt 257  Q
     |||||||||||||||    
T  45943 atgaagatgatgatgt 45928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16184 - 16113
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  16184 atactgcctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 16113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 257
Target Start/End: Original strand, 17389 - 17450
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  17389 tgttgctgtt-gttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 17450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 185 - 256
Target Start/End: Original strand, 17267 - 17337
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatg 256  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  17267 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 17337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 238
Target Start/End: Original strand, 79388 - 79430
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  79388 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 187 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 47065 - 46995
Alignment:
Q  187 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47065 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 46995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 159 - 254
Target Start/End: Original strand, 5153 - 5246
Alignment:
Q  159 gatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||| ||||| ||||||||  ||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  5153 gatataattatgtcatgatg--ttgtataatacctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatga 5246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 13282 - 13211
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  13282 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgt 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 1922 - 1851
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  1922 atactgtctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 1851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 150
Target Start/End: Original strand, 207465 - 207531
Alignment:
Q  84 gatgcttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 150  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||  |||||||    
T  207465 gatgtttataatgttatataattatatatatattgcatgaattatgtttgatgattgaaatgttgat 207531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 154 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 40015 - 39913
Alignment:
Q  154 cattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  40015 catttgatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 39917  T
Q  254 atgt 257  Q
    ||||    
T  39916 atgt 39913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 238
Target Start/End: Original strand, 19889 - 19987
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    |||||||| || |||| |||||| |||||||||||  ||  ||  ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  19889 gttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggtctaag 19987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Original strand, 48936 - 48997
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  48936 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 48997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 52; Significance: 7e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 154 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 25998 - 25896
Alignment:
Q  154 cattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||| ||||||||||| |||||||   ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  25998 catttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgatgaagataatg 25900  T
Q  254 atgt 257  Q
    ||||    
T  25899 atgt 25896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 154 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 39960 - 39858
Alignment:
Q  154 cattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||| ||||||||||| |||||||   ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  39960 catttgatattattatgtcatgatattttgtatactgcctatgttgctatt-gttatttaactaagcttcatgagttggtctaagttgatgaagatgatg 39862  T
Q  254 atgt 257  Q
    ||||    
T  39861 atgt 39858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 91 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 25276 - 25122
Alignment:
Q  91 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tgggttgca 185  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||  | ||||  |||||   |||||||||| |||| |||||  |||||||||||  ||  ||  |    
T  25276 ataatgtgatatatttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatatcgttatatcatgagctgttttata 25178  T
Q  186 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25177 tactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 25122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 257
Target Start/End: Original strand, 8556 - 8650
Alignment:
Q  159 gatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||  ||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  8556 gatattattatgtcatgctgtttttgatactgcctatgttgctgtt----atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 2023 - 1952
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2023 atactgcctatgtcgctgtt-gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 1952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 3541 - 3470
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  3541 atactgcctatgttgct-ttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 3470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 414 - 343
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||    
T  414 atactgcctatgttattgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgataaagatgatgatgt 343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 103500 - 103736
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||   |||||||||| |||| ||| |||||  |||| |||||||  |||   |||||| ||| || || |  |||||||||    
T  103500 atgtgagttgatcttggaggtaggaaactaagttctttatcttcctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttgttaatgttat 103599  T
Q  101 ataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tgggttgcatactgcctatgtt 198  Q
     || ||||||||||||||||||| ||| || ||||      ||||||| ||| |||| |||||| |||||||||||  ||  ||  ||||| ||||||||    
T  103600 gtagttgtatatacattacatgaattatgtatgat------gttgttgttttgcatttgatattgttatatcatgaattgttttttatactacctatgtt 103693  T
Q  199 gctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttg 241  Q
    ||||||| ||  ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  103694 gctgtttatttattaactaagctgcattagtcggtctaagttg 103736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 254
Target Start/End: Original strand, 339972 - 340065
Alignment:
Q  159 gatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  339972 gatattattatgtcatgttgttttgtatactgcctatgttgttgt--gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgacgaagatgatga 340065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Original strand, 158444 - 158612
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  158444 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 158543  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  158544 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 158612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 6171 - 6245
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtt--tgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  6171 atactacctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 6245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 238
Target Start/End: Original strand, 128921 - 129072
Alignment:
Q  91 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcat- 186  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||  | ||||  |||||   |||||||||| |||| |||||| |||||||||||   |||  ||     
T  128921 ataatgtgatatatttgtatatccattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaattgttttatg 129020  T
Q  187 -actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  129021 tactgcctatgttgctgtttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 129072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 116480 - 116430
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  116480 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 116430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 78438 - 78345
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcata--ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtc 234  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||   |||  |||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  78438 gttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtc 78345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 257
Target Start/End: Original strand, 16608 - 16721
Alignment:
Q  144 tgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgt 242  Q
    |||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||     
T  16608 tgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattga 16706  T
Q  243 tgaagatgatgatgt 257  Q
    |||||||||||||||    
T  16707 tgaagatgatgatgt 16721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 8550 - 8479
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  8550 atactacctatgttgctatt-gttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 8479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Original strand, 11493 - 11564
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  11493 atactacctatgttgttgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgttgaagatgaagatgt 11564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 181 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 20986 - 20910
Alignment:
Q  181 ttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  20986 ttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtctaagtcgttgaagatgttgatgt 20910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 190 - 257
Target Start/End: Original strand, 4888 - 4954
Alignment:
Q  190 gcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  4888 gcctatgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgt 4954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Original strand, 2165 - 2267
Alignment:
Q  1 atgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagattgatgcatatgaattagtgatgcttataatgttat 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |  | | ||||||||| |||||||||||||||  || || |||||||||| |    
T  2165 atgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgatcttatcccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgt 2264  T
Q  101 ata 103  Q
    |||    
T  2265 ata 2267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 10884 - 10772
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagtt 240  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||  || | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10884 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 10787  T
Q  241 gttgaagatgatgat 255  Q
    | | |||||| ||||    
T  10786 gattaagatgttgat 10772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 238
Target Start/End: Original strand, 6235 - 6386
Alignment:
Q  92 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatga--tgggttgcat 186  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||  | ||||  |||||   |||||||||| |||| |||||| | |||||||||  ||  ||  ||    
T  6235 taatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgttttatat 6334  T
Q  187 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  6335 actgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaag 6386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 191 - 238
Target Start/End: Original strand, 13793 - 13840
Alignment:
Q  191 cctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  13793 cctatgttgttgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtctaag 13840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 239
Target Start/End: Original strand, 24353 - 24406
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagt 239  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24353 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 141 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 9194 - 9133
Alignment:
Q  141 agttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcatactgcctatgttgctg 202  Q
    ||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9194 agttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagttgcatactgcctatgttgctg 9133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 9333 - 9275
Alignment:
Q  2 tgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagt 60  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  || | ||||||| ||||||||||    
T  9333 tgtgagttgatcttagatgttaagaactaagttgcctagcatgctgttgatgttccagt 9275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 20915 - 20747
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  20915 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 20816  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  20815 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 20747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 37989 - 37821
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  37989 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 37890  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  37889 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 37821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 666 - 569
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcata--ctgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||   |||  |||  |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  666 gttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 13450 - 13392
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  13450 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22944 - 22886
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  22944 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 22886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16842 - 16784
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  16842 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 16784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 238
Target Start/End: Original strand, 20373 - 20524
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttg-ataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgc 184  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | || ||||||||   |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  |||     
T  20373 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttgt 20472  T
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    ||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20473 atactg-atgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 128805 - 128751
Alignment:
Q  203 tttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||| | |||||||||||||    
T  128805 tttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaagatgatgatgt 128751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 97176 - 97024
Alignment:
Q  91 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcat- 186  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||  | ||||  |||||   |||||||||| |||| |||||| |||||||||||   |||  ||     
T  97176 ataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatg 97077  T
Q  187 -actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
     ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  97076 tactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaag 97024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 106454 - 106302
Alignment:
Q  91 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggttgcat- 186  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||  | ||||  |||||   |||||||||| |||| |||||| |||||||||||   |||  ||     
T  106454 ataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttttatg 106355  T
Q  187 -actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
     ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  106354 tactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaag 106302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 4805 - 4694
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagtt 240  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4805 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 4708  T
Q  241 gttgaagatgatga 254  Q
    | | | ||||||||    
T  4707 gattaggatgatga 4694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 38388 - 38339
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtc 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  38388 atactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 4355 - 4300
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatga 251  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  4355 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 9300 - 9241
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgat 255  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||    
T  9300 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgat 9241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 14115 - 13947
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttga-taattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-g 183  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||| |||  | ||| ||||||||   ||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || |    
T  14115 ttatattgtgatataattgtatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttg 14016  T
Q  184 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
     ||||||  | |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  14015 tatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 13947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 164 - 106
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||    
T  164 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatga 106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 142 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 4639 - 4545
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgg-gttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtcta 236  Q
    |||||||| ||| ||| |||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  4639 gttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtcta 4545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 40458 - 40400
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  40458 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatga 40400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 254
Target Start/End: Original strand, 161206 - 161252
Alignment:
Q  208 tatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  161206 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttggttaagatgatga 161252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 256
Target Start/End: Original strand, 12353 - 12413
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatg 256  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||| |||||    
T  12353 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgttgatg 12413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23892 - 23843
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  23892 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 23843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 29990 - 29946
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagtt 240  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29990 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 29946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 36503 - 36454
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatg 253  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  36503 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 36454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 185 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 2747 - 2694
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||| |||||||||    
T  2747 atactgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgagtcggtctaag 2694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 4262 - 4214
Alignment:
Q  206 gttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  4262 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 4214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 210 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 12108 - 12064
Alignment:
Q  210 tttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatga 254  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  12108 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 12064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 4578 - 4508
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  4578 atactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 4508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 12160 - 12090
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  12160 atactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 12090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 22112 - 22042
Alignment:
Q  185 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatgatgatgt 257  Q
    ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  22112 atactgcttgtgttgctgtt-gttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgt 22042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 195 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12024 - 11982
Alignment:
Q  195 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaag 238  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12024 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 251
Target Start/End: Original strand, 1393 - 1440
Alignment:
Q  204 ttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagttgttgaagatga 251  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  1393 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 1440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 142 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 11399 - 11286
Alignment:
Q  142 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgggtt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagacggtctaagtt 240  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| ||  || | ||||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| ||    
T  11399 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagttgcatgagtcggtctaattt 11302  T
Q  241 gttgaagatgatgatg 256  Q
    | | |||||| |||||    
T  11301 gattaagatgttgatg 11286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 89 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 91 - 30
Alignment:
Q  89 ttataatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgagttgttgat 150  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||    
T  91 ttataatgttatataattagatatatattgcatgaattatgtttgatgattgagatgttgat 30  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 3371 times since January 2019
Visitors: 4812