View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0760_low_14 (Length: 428)

Name: NF0760_low_14
Description: NF0760
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0760_low_14
NF0760_low_14
[»] chr8 (18 HSPs)
chr8 (19-428)||(23902046-23902464)
chr8 (2-428)||(22436185-22436620)
chr8 (2-412)||(16875559-16875978)
chr8 (2-412)||(23155506-23155923)
chr8 (2-428)||(21195004-21195438)
chr8 (2-428)||(20650819-20651254)
chr8 (2-412)||(21848801-21849220)
chr8 (247-428)||(22317063-22317253)
chr8 (2-108)||(16414302-16414408)
chr8 (98-242)||(22988807-22988951)
chr8 (14-146)||(19869866-19869998)
chr8 (127-278)||(20390140-20390291)
chr8 (179-257)||(6605720-6605798)
chr8 (169-251)||(22131672-22131754)
chr8 (181-238)||(24631309-24631366)
chr8 (204-257)||(28982973-28983026)
chr8 (204-257)||(28988192-28988245)
chr8 (164-284)||(31415095-31415215)
[»] scaffold0876 (2 HSPs)
scaffold0876 (2-428)||(970-1405)
scaffold0876 (247-428)||(4381-4571)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (2-428)||(31447-31873)
scaffold0021 (2-307)||(21871-22175)
scaffold0021 (60-425)||(7064-7438)
[»] chr2 (15 HSPs)
chr2 (2-428)||(25130056-25130491)
chr2 (2-428)||(24568229-24568664)
chr2 (2-412)||(22760130-22760549)
chr2 (2-412)||(24829749-24830168)
chr2 (29-367)||(22279621-22279960)
chr2 (36-371)||(10037927-10038263)
chr2 (36-371)||(10098312-10098648)
chr2 (247-412)||(12639039-12639213)
chr2 (100-236)||(23098677-23098813)
chr2 (169-278)||(23112342-23112451)
chr2 (179-257)||(1065378-1065456)
chr2 (100-290)||(23278370-23278560)
chr2 (160-242)||(24818949-24819031)
chr2 (100-242)||(30010843-30010985)
chr2 (204-290)||(31832252-31832338)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (2-428)||(41215949-41216385)
chr1 (2-412)||(20829485-20829904)
chr1 (2-329)||(20926992-20927320)
chr1 (28-371)||(21200998-21201342)
chr1 (10-174)||(20527147-20527311)
chr1 (8-116)||(22133855-22133963)
chr1 (312-428)||(22133961-22134085)
chr1 (2-69)||(35930918-35930985)
chr1 (179-290)||(38911096-38911207)
chr1 (365-411)||(20926917-20926963)
chr1 (169-257)||(31538257-31538345)
chr1 (169-257)||(48424915-48425003)
chr1 (169-257)||(52987783-52987871)
chr1 (179-290)||(20855030-20855141)
chr1 (169-257)||(37679091-37679179)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (2-371)||(6953-7323)
[»] chr7 (23 HSPs)
chr7 (2-428)||(4441733-4442168)
chr7 (2-428)||(17925455-17925890)
chr7 (2-412)||(7825721-7826140)
chr7 (10-412)||(13457856-13458267)
chr7 (2-412)||(27105804-27106223)
chr7 (2-412)||(27172102-27172521)
chr7 (18-371)||(15716949-15717303)
chr7 (2-146)||(13378981-13379123)
chr7 (247-428)||(14938151-14938341)
chr7 (247-428)||(15365744-15365934)
chr7 (50-323)||(17143354-17143628)
chr7 (208-296)||(16948686-16948774)
chr7 (365-428)||(13354954-13355017)
chr7 (100-281)||(11386535-11386716)
chr7 (103-291)||(23503979-23504167)
chr7 (103-257)||(14139665-14139819)
chr7 (181-330)||(15122236-15122384)
chr7 (204-290)||(26116800-26116886)
chr7 (169-257)||(26092973-26093061)
chr7 (169-257)||(49154287-49154375)
chr7 (164-251)||(11770433-11770520)
chr7 (179-242)||(48813459-48813522)
chr7 (204-278)||(11301423-11301497)
[»] chr6 (19 HSPs)
chr6 (2-428)||(14130149-14130584)
chr6 (2-412)||(1646980-1647399)
chr6 (2-412)||(16380539-16380958)
chr6 (2-412)||(16648135-16648554)
chr6 (2-412)||(23997944-23998363)
chr6 (2-412)||(16099705-16100130)
chr6 (2-412)||(23025912-23026310)
chr6 (185-425)||(18836257-18836506)
chr6 (225-408)||(19985805-19985997)
chr6 (247-428)||(21928885-21929074)
chr6 (225-371)||(18577954-18578101)
chr6 (247-408)||(16234728-16234898)
chr6 (157-242)||(23080344-23080429)
chr6 (73-146)||(14643721-14643794)
chr6 (169-290)||(24366239-24366360)
chr6 (193-296)||(14378273-14378376)
chr6 (193-296)||(14379823-14379926)
chr6 (193-278)||(19487629-19487714)
chr6 (172-229)||(22760791-22760848)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (2-428)||(15905-16340)
[»] scaffold0302 (2 HSPs)
scaffold0302 (2-425)||(7003-7435)
scaffold0302 (10-425)||(61-485)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (2-412)||(25257-25676)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (2-412)||(14771-15190)
scaffold0162 (2-371)||(11198-11568)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (2-428)||(24023-24458)
[»] scaffold0077 (3 HSPs)
scaffold0077 (2-428)||(26290-26725)
scaffold0077 (372-428)||(25358-25414)
scaffold0077 (247-291)||(25270-25314)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (2-412)||(42121-42540)
scaffold0076 (193-281)||(55115-55203)
[»] chr3 (23 HSPs)
chr3 (2-412)||(30139267-30139686)
chr3 (2-412)||(30148818-30149237)
chr3 (2-412)||(8272659-8273078)
chr3 (2-412)||(15611564-15611983)
chr3 (2-412)||(25767779-25768198)
chr3 (2-371)||(6151113-6151483)
chr3 (2-412)||(13965612-13966032)
chr3 (2-297)||(15948730-15949025)
chr3 (190-371)||(6710865-6711047)
chr3 (267-428)||(18751388-18751558)
chr3 (256-425)||(16258591-16258769)
chr3 (247-412)||(55514237-55514411)
chr3 (160-242)||(55498492-55498574)
chr3 (303-412)||(12795697-12795814)
chr3 (306-412)||(18915187-18915301)
chr3 (164-290)||(11950319-11950445)
chr3 (100-242)||(15261260-15261402)
chr3 (193-290)||(18132786-18132883)
chr3 (204-257)||(28755943-28755996)
chr3 (211-290)||(12179930-12180009)
chr3 (103-257)||(16379278-16379432)
chr3 (204-257)||(47125569-47125622)
chr3 (115-251)||(14874872-14875008)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (2-412)||(33948-34367)
[»] chr5 (6 HSPs)
chr5 (2-412)||(23507430-23507849)
chr5 (2-412)||(21935391-21935810)
chr5 (2-371)||(24583005-24583375)
chr5 (247-408)||(23504994-23505164)
chr5 (204-257)||(24796802-24796855)
chr5 (166-290)||(25849952-25850076)
[»] scaffold1488 (1 HSPs)
scaffold1488 (2-428)||(827-1261)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (2-412)||(1976-2395)
scaffold0218 (13-350)||(26261-26598)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (2-412)||(5830-6251)
scaffold0124 (211-290)||(14194-14273)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (2-412)||(7885-8304)
[»] chr4 (7 HSPs)
chr4 (2-412)||(15291179-15291598)
chr4 (28-412)||(12340912-12341305)
chr4 (247-412)||(14999147-14999321)
chr4 (247-412)||(9292667-9292841)
chr4 (181-301)||(8322976-8323096)
chr4 (204-290)||(44660089-44660175)
chr4 (169-257)||(3262982-3263070)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (2-371)||(7029-7395)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (2-428)||(1908-2334)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (2-428)||(132513-132948)
scaffold0008 (179-371)||(25738-25931)
scaffold0008 (10-113)||(25938-26041)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (19-352)||(8867-9201)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (2-242)||(1645-1885)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (13-284)||(107-378)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (225-428)||(2119-2323)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (2-140)||(6888-7026)
[»] scaffold0635 (1 HSPs)
scaffold0635 (36-371)||(8807-9143)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (2-106)||(2117-2221)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (247-412)||(13093-13267)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (225-425)||(25024-25233)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (246-412)||(54210-54385)
[»] scaffold1486 (1 HSPs)
scaffold1486 (246-412)||(37-212)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (247-404)||(10979-11145)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (303-425)||(104899-105029)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (247-425)||(46682-46869)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (303-408)||(181791-181904)
scaffold0011 (100-251)||(24655-24806)
[»] scaffold0719 (1 HSPs)
scaffold0719 (24-86)||(4785-4847)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (164-371)||(76335-76543)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (247-317)||(34670-34741)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (306-412)||(2850-2964)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (109-242)||(14510-14643)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (164-290)||(31505-31631)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (164-290)||(24208-24334)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (58-242)||(103275-103459)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (2-60)||(13649-13707)
[»] scaffold1646 (1 HSPs)
scaffold1646 (103-296)||(1312-1505)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (169-290)||(14904-15025)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (193-290)||(250614-250711)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (100-284)||(9156-9340)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (100-296)||(79953-80149)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (100-144)||(114699-114743)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (169-257)||(40524-40612)
scaffold0010 (104-242)||(3956-4094)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (179-242)||(25155-25218)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (100-251)||(7209-7360)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (211-290)||(50413-50492)
scaffold0067 (211-290)||(59447-59526)
scaffold0067 (211-290)||(65835-65914)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (160-242)||(10923-11005)
scaffold0018 (160-242)||(17115-17197)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (100-242)||(495060-495202)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (193-290)||(9055-9152)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (118-251)||(11379-11512)
[»] scaffold0062 (1 HSPs)
scaffold0062 (204-257)||(9009-9062)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (169-242)||(115172-115245)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (100-144)||(123-167)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (164-236)||(5919-5991)
scaffold0270 (164-236)||(13049-13121)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 18)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 19 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 23902464 - 23902046
Alignment:
Q  19 aaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaatgcgccaggtgtcttca 118  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  23902464 aaggtggaagatatatccaaaaccgcgttccaaacgaggcatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatccaatgcactaggtgtcttca 23902365  T
Q  119 tggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23902364 tggaatatatgaatagaatatttcatccttttctggaccgttttatggtagtgtttatcgatgatattttggtgtattcgaagtttgaggaggagcatgc 23902265  T
Q  219 tgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgcgag-tgtgagtttccttggt 317  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||    
T  23902264 tgagcatttgaggattatgttgcgtgtcttgaaggaaaattagttgtgtgctaagtggtcgaagtgcgagctttggttgcgagaagtgagtttccttggt 23902165  T
Q  318 catgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttgatg--------cagtgggaatcacctaagtctgtctttgagattagaagctttc 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||        ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  23902164 catgtgatttctaagggtggtattgtcgtggatccgtcgaaggttgatgttgtgttacagtgggaatcccctaagtctgtttttgagcttagaagctttc 23902065  T
Q  410 ttgtataggcaggttatta 428  Q
    ||| || | ||||||||||    
T  23902064 ttggattgacaggttatta 23902046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 2 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 22436620 - 22436185
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22436620 atcatcatattagagtgaaagcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacaaggtatggacagtatgagtattctgtgatgccatttggagtatccaa 22436521  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22436520 tgcgccaggtgtcttaatggaataaatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgtttatagatgatattttggtgtattcgaag 22436421  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgcgag 301  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| | |    
T  22436420 tctgaggagaagcatgctgagcatttgaggatagtgttgcgagtcttaaaggagaatcagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgtggg 22436321  T
Q  302 -tgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtctt 392  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||        ||||||||||||| ||||||||| | ||    
T  22436320 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttccgtggatccgtcgaaggttgatgcagtgttgcagtgggaatctcctaagtctatttt 22436221  T
Q  393 tgagattagaagctttcttgtataggcaggttatta 428  Q
    ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  22436220 tgatattagaagctttcttggattggcaggttatta 22436185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 412
Target Start/End: Original strand, 16875559 - 16875978
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  16875559 atcatcagattagagtaaaggcagaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 16875658  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||    
T  16875659 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 16875758  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttg-cga 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||| |||||  |     
T  16875759 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 16875858  T
Q  301 gtgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtctt 392  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||||||||        |||||||||| || ||||||||||| ||    
T  16875859 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtcccctaagtctgtttt 16875958  T
Q  393 tgagattagaagctttcttg 412  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16875959 tgagattagaagctttcttg 16875978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 412
Target Start/End: Original strand, 23155506 - 23155923
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  23155506 atcatcagattagagtgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgaggtatggacactg--agtattctgtgatgccatttggagcacccaa 23155603  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||  |||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  23155604 tgcgctaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatccttatttggaccgttttgtggtggtgtttattgatgatattttagtgtattcgaag 23155703  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttg-cga 300  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| |||||  |     
T  23155704 tctgaggaggatcatgttgagcatttgaggattgtgttgtaagtcttgaaggataatcagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 23155803  T
Q  301 gtgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtctt 392  Q
      |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||  || |||||||| |||||||||        ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  23155804 aagtgagtttccttagtcatgtgatttctaaggatggtatttctgcggatccgtcgaaggttgatgcagtgttgcagtgggaatctcctaagtctgtttt 23155903  T
Q  393 tgagattagaagctttcttg 412  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  23155904 tgagattagaagttttcttg 23155923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 2 - 428
Target Start/End: Original strand, 21195004 - 21195438
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  ||    
T  21195004 atcatcataatagagtgaaggcggaagatatatccaaaaccgtgttccgaacaaggtatggacactatgagtattttgtgatgcaatttggagtatataa 21195103  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    || |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||| || |||||  ||| ||||||||||||||||||     
T  21195104 tgtgccaggta-cttcatggaatatatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtatttatagatgctattttggtgtattcgaaa 21195202  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgc-ga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||| |||| ||| | |||||| |||||| |     
T  21195203 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtattgaaggagaaccagttatgtgctaagttgtctaagagtgagttttggttgcagg 21195302  T
Q  301 gtgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtctt 392  Q
      || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||||||        ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  21195303 aagtaagtttccttggtcatgtgatttctcagggtggtattttcgtggatccgtcgaaggttgatgcagtgttgcagtgggaatctcctaagtctgtttt 21195402  T
Q  393 tgagattagaagctttcttgtataggcaggttatta 428  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||    
T  21195403 tgagattagaagctgtcttggattggcaggttatta 21195438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 428
Target Start/End: Original strand, 20650819 - 20651254
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  20650819 atcatcaaattagagtaaaggcagaagatatatccaaaacagcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 20650918  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||  | || ||||| ||  ||||||||||||||||||||||     
T  20650919 tgcgccaggtgtcttcatagagtatatgaatagaatattttatccttatctggaccgttttgtagtggtgttcatagatgatattttggtgtattcgaaa 20651018  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttg-cga 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||| |||| ||||| ||| || |||||  |     
T  20651019 tctgaggaggagcatgccgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaggagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagatttggttgaagg 20651118  T
Q  301 gtgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtctt 392  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  || |||||        |||||||||| || ||||||||||| ||    
T  20651119 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccgtctaaagttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 20651218  T
Q  393 tgagattagaagctttcttgtataggcaggttatta 428  Q
    |||||||| || |||||||| || ||||||||||||    
T  20651219 tgagattaaaaactttcttggattggcaggttatta 20651254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 412
Target Start/End: Original strand, 21848801 - 21849220
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  21848801 atcatcagattagagtaaaggcgaaagatatatccaaaactgcgttccgaacaaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 21848900  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||    
T  21848901 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 21849000  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttg-cga 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||| |||||  |     
T  21849001 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgggagttttggttgaagg 21849100  T
Q  301 gtgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttgatgc--------agtgggaatcacctaagtctgtctt 392  Q
      |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||||| |||||        ||||||| || ||||||||||| ||    
T  21849101 aagtgagttttcttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggtggatgcagtgttgtagtgggagtctcctaagtctgtttt 21849200  T
Q  393 tgagattagaagctttcttg 412  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21849201 tgagattagaagctttcttg 21849220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 247 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 22317253 - 22317063
Alignment:
Q  247 ttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgcg-agtgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttg 345  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  22317253 ttgaaggaggatcagttatgtgctaagttgtcgaagtgtgagttttggttgcggaaagttggtttccttggtaatgtgatttctaagggtggtattgtcg 22317154  T
Q  346 tggatccgttgaaggttgatgc--------agtgggaatcacctaagtctgtctttgagattagaagctttcttgtataggcaggttatta 428  Q
    ||||||||| ||||||||||||        |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||  || ||||||||||||    
T  22317153 tggatccgtcgaaggttgatgcagtgttacagtgggaatcacctaagtctgtttttgaggttaaaagctttcttagattggcaggttatta 22317063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 16414408 - 16414302
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||||| |||||  ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  16414408 atcatcatactagaggaaaggtagaagatatatccaaaaccgcattccgaacaaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggaatatccaa 16414309  T
Q  102 tgcgcca 108  Q
    |||||||    
T  16414308 tgcgcca 16414302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 22988951 - 22988807
Alignment:
Q  98 ccaatgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattc 197  Q
    ||||| ||||| |||| || |||||||| ||||||   || |||||| | ||  |||| |||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| | |||||    
T  22988951 ccaatacgccacgtgtgtttatggaatacatgaatcacatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatatattc 22988852  T
Q  198 gaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgca 242  Q
     ||| |||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22988851 caagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgca 22988807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 19869998 - 19869866
Alignment:
Q  14 gagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaatgcgccaggtgt 113  Q
    |||||||| ||||||||||||| || || || ||| ||||    ||||| || ||| ||||||  |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||    
T  19869998 gagcgaagtcggaagatatatcgaagactgccttcagaacccgttatggtcattatgagtattcagtgatgccttttggagtgtccaacgcgccaggagt 19869899  T
Q  114 cttcatggaatatatgaatagaatatttcatcc 146  Q
     || ||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  19869898 gtttatggagtatatgaacagaattttccatcc 19869866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 20390291 - 20390140
Alignment:
Q  127 atgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatt 226  Q
    ||||||||||| || ||| | ||| |||| || ||  |||| ||||||||  |||| || ||| | ||||| ||| |||| || |||||||| |||||||    
T  20390291 atgaatagaattttccatgctttcttggatcggtttgtggttgtgtttattgatgacatcttgatttattctaagactgaagaagagcatgcggagcatt 20390192  T
Q  227 tgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtc 278  Q
    | | |||||||||||| || |||||||||||  |||||| ||| ||| ||||    
T  20390191 taaagattgtgttgcaagtgttgaaggaaaaaaagttgtatgccaagttgtc 20390140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 6605798 - 6605720
Alignment:
Q  179 atgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaa 257  Q
    ||||||||||  | ||||| |||  ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  6605798 atgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaggtgttgaaggaaaa 6605720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 169 - 251
Target Start/End: Original strand, 22131672 - 22131754
Alignment:
Q  169 gtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaa 251  Q
    ||||||||| ||||||||||| | || || ||| |||| || || |||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||    
T  22131672 gtgtttatcgatgatattttgatctactccaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgtcttgcaagtgttgaa 22131754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 181 - 238
Target Start/End: Original strand, 24631309 - 24631366
Alignment:
Q  181 gatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgt 238  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||    
T  24631309 gatatcttggtgtcttcgaagtcggaggaggagcatgcagagcatctgatgatcgtgt 24631366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 28983026 - 28982973
Alignment:
Q  204 tgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaa 257  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||| || |||||||||||    
T  28983026 tgaggaggagcatgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaa 28982973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 28988245 - 28988192
Alignment:
Q  204 tgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaa 257  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||| || |||||||||||    
T  28988245 tgaggaggagcatgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaa 28988192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 284
Target Start/End: Original strand, 31415095 - 31415215
Alignment:
Q  164 tggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagtt 263  Q
    |||| ||||||||  |||||||| || | ||||| ||| | || ||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||| || || || |||||  ||||    
T  31415095 tggttgtgtttattgatgatattctgatttattctaagaccgaagaggagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttaaaagaaaagaagtt 31415194  T
Q  264 gtgtgctaagctgtcgaagtg 284  Q
    || ||||||| |||| |||||    
T  31415195 gtatgctaagttgtcaaagtg 31415215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 2)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 2 - 428
Target Start/End: Original strand, 970 - 1405
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  970 atcatcagattagagtgaaggcggaagatatacctaaaaccatgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttgcagtatccaa 1069  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  1070 tgcgccaggtatcttcatggaatatatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttatggtggtgtttatagatgatattttggtgtattcgaag 1169  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgc-ga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||||||  |||||||||| ||||||  ||||| ||    
T  1170 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaggagaaccaattatgtgctaaattgtcgaagtgtgagttttagttgcaga 1269  T
Q  301 gtgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtctt 392  Q
      |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||        ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  1270 aagtgagtttcctttgtcatgtgatttctaagggtggtatttttgtggatccgtcgaaggttgatgcagtgttgcagtgggaatctcctaagtctgtttt 1369  T
Q  393 tgagattagaagctttcttgtataggcaggttatta 428  Q
    | |||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  1370 ttagattagaagctttcttggattagcaggttatta 1405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 247 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 4571 - 4381
Alignment:
Q  247 ttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgcgagt-gtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttg 345  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |     
T  4571 ttgaaggagaatcagttgtgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgcgggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtgttatttatt 4472  T
Q  346 tggatccgttgaaggttgatg--------cagtgggaatcacctaagtctgtctttgagattagaagctttcttgtataggcaggttatta 428  Q
    ||||||| |  ||||||||||        ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||    
T  4471 tggatccttctaaggttgatgcagtatggcagtgggaatctcctaagtttgtttttgagattagaagttttcttggtttggcaggttatta 4381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 2 - 428
Target Start/End: Original strand, 31447 - 31873
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  31447 atcatcatattagagtgaaggcggaagatatattcaaaaccgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattatgtgatgccatttaaagtatccaa 31546  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||  |||| || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  31547 tgcaccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatccttatctggactgttttgtggtggtttttatagatgatattttggtgtattcgaag 31646  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgcgag 301  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||   ||||||| || || ||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |    
T  31647 tttgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgt-atgcgaatcttgaacgagaaccagttatgtgctaagttgtcgaagtgtgagttttggttgcggg 31745  T
Q  302 -tgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttgatgcagtgggaatcacctaagtctgtctttgagatta 400  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||    
T  31746 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttccgtggatccgtcgaaggttgatgcagtgggagtcccctaagtctgtttttgggatta 31845  T
Q  401 gaagctttcttgtataggcaggttatta 428  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||    
T  31846 gaagctttcttagattggcaggttatta 31873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 307
Target Start/End: Original strand, 21871 - 22175
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  21871 atcatcatattagagtgaaggcggaagatatattcaaaaccgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattatgtgatgccatttaaagtatccaa 21970  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||  |||| || |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21971 tgcaccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatccttatctggactgttttgtggtggtttttatagatgatattttggtgtattcgaag 22070  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgcgag 301  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||   ||||||| || || ||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |    
T  22071 tttgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgt-atgcgaatcttgaacgagaaccagttatgtgctaagttgtcgaagtgtgagttttggttgcgng 22169  T
Q  302 tgtgag 307  Q
    | ||||    
T  22170 tttgag 22175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 60 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 7438 - 7064
Alignment:
Q  60 tggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaatgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgt 159  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |  ||| |||||    
T  7438 tggacactatgagtattatgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtgtcttcatggagtatatgaatataatatttcatccttatctgaaccgt 7339  T
Q  160 ttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatc 259  Q
    ||  |||| | ||| ||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||| || || || |    
T  7338 tttgtggtggagttcatagatgatattttggtatattcgaaatctgaggaggagcatgttgagcatatgaggattgtgttgtaagtcttaaaagagaacc 7239  T
Q  260 agttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgc-gagtgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaa 358  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||| |||||| |||||| |   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||    
T  7238 agttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgcaggaagtgagtttcctgggtcatgtgatttctaagggtggtatttatgtggatccgtctaa 7139  T
Q  359 ggt--------tgatgcagtgggaatcacctaagtctgtctttgagattagaagctttcttgtataggcaggtta 425  Q
    |||        || ||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||| ||||||| || |||||||||    
T  7138 ggtcgatgcagtgttgcagtgggaatctcttaagtctgtttttgagatcagaagttttcttggattggcaggtta 7064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 15)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 2 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 25130491 - 25130056
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  25130491 atcatcagattagagtgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctatgatgccatttggagtatccaa 25130392  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||||||  ||||||||||||| ||| |||||    
T  25130391 tgcgccaggtgtcttcctggaatatatgaatagaatatttcatcctttcctggaccgctttgtggtggtgtttatatatgatattttggtatatacgaag 25130292  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgc-ga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||| |||| ||| ||||||||| ||| |||||| |||||| |||||| ||    
T  25130291 tctgaggaggagcatgctgagcatttgagggttgtgttgcgagtcttaaaggagaatcggttatgtgctaagttgttgaagtgtgagttttggttgcgga 25130192  T
Q  301 gtgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtctt 392  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||  |||||||||        |||||||||||||| |||||||||| ||    
T  25130191 aagtgagtttctttggtcatgtgatttctaagggtggtatctccgtggatccgacgaaggttgatgcagtgttgcagtgggaatcagctaagtctgtttt 25130092  T
Q  393 tgagattagaagctttcttgtataggcaggttatta 428  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  25130091 tgagattagaagctttcttagattggcaggttatta 25130056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 2 - 428
Target Start/End: Original strand, 24568229 - 24568664
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  24568229 atcatcatattagagtgaaggcggaagatatatccaaaaccacgttccaaacaaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 24568328  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  ||||  |||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  24568329 tgcatcaggtgtcttcatggagtatatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtgttgtttatagattatattttggtgtattcgaag 24568428  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgcgag 301  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||  |||||| |    
T  24568429 tctgaggaggagcatgttgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaggagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttagttgcggg 24568528  T
Q  302 -tgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtctt 392  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  | ||||||        ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  24568529 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttatgtggatccgtctagggttgatgcagtgttgcagtgggaatctcctaagtctgtttt 24568628  T
Q  393 tgagattagaagctttcttgtataggcaggttatta 428  Q
    ||| |||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  24568629 tgaaattagaagctttcttggattggcaggttatta 24568664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 412
Target Start/End: Original strand, 22760130 - 22760549
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  22760130 atcatcatattagagtgaaggcggaagatatatccaaaaccgtgttcaaaacaaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatccga 22760229  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||     
T  22760230 tgcgctaggtgtcttcatggagtatatgaatagaatatttcatccttacctggaccgttttgtggtggtgtttatagatgatattttggtgtatttgaaa 22760329  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgc-ga 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||| |||| || ||||| ||||||||| |||| |||||  ||||| |||||| |     
T  22760330 tctgaggaggagcatgctaagcatctgaggattgtgttgcaagttttggaggagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtaagttttggttgcagg 22760429  T
Q  301 gtgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtctt 392  Q
      ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||   |||||||||| |||||||||        |||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  22760430 aagtgagtttccttggtcatgtgatttttaagggtgatatttccgtggatccgtcgaaggttgatgcggtgttgcaatgggaatctcctaagtctgtttt 22760529  T
Q  393 tgagattagaagctttcttg 412  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  22760530 tgagattagaagttttcttg 22760549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 412
Target Start/End: Original strand, 24829749 - 24830168
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  24829749 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaaccgcgtttcgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 24829848  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||    
T  24829849 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 24829948  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgcgag 301  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| || || ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||| |||| | ||    
T  24829949 tctgaggaagagcatgcggagcatttgaggattgtgttgcaattcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggtt-caag 24830047  T
Q  302 --tgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtct 391  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |  ||||||||        |||||||||| || ||||||||| | |    
T  24830048 gaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtagatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctattt 24830147  T
Q  392 ttgagattagaagctttcttg 412  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  24830148 ttgagattagaagctttcttg 24830168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 29 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 22279960 - 22279621
Alignment:
Q  29 atatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaatgcgccaggtgtcttcatggaatatat 128  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||    
T  22279960 atatatccaaaacagcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccatgtgtctttatggaatacat 22279861  T
Q  129 gaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttg 228  Q
    ||||||||||||| |||| |  |||||||||||  |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  22279860 gaatagaatattttatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcgaaatcgaaggaggagcatgctgagcatttg 22279761  T
Q  229 aggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttg-cgagtgtgagtttccttggtcatgtgattt 327  Q
    |||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||| ||| |||| ||||| || ||| |||||  |   |||||||||||||||||||||||||    
T  22279760 aggattgtgttgcaagtattgaaagagaaccagttatgtgcaaagttgtctaagtgtgaattttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgattt 22279661  T
Q  328 ctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttgatgc 367  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||  |||||||||||    
T  22279660 ctaagtgtggtatttctgtggatccgtctaaggttgatgc 22279621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 36 - 371
Target Start/End: Original strand, 10037927 - 10038263
Alignment:
Q  36 caaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaatgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaataga 135  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| |||||| | || | ||||||| ||||||| ||  | |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  10037927 caaaactgcatttcgaacgaggtatgggcactatgaatactttgtgatgtcatttggtgtgactaatgcgcttggtgtcttcatggaatacatgaataga 10038026  T
Q  136 atatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattg 235  Q
    || || ||||| |   |||| |  || ||||| ||||||||  | ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  10038027 atcttccatccttatttggatcagtttatggtggtgtttatagacgatatcttgatgtattcgaagtcagaggaggagcatgcagagcatctaaggattg 10038126  T
Q  236 tgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgcgag-tgtgagtttccttggtcatgtgatttctaaggg 334  Q
    ||||||||   ||||| || ||| |||||| || |||| |||| ||||| ||||||  |||||| |  ||||||||||||||||||||||| || |  ||    
T  10038127 tgttgcatactttgaaagagaataagttgtttgataagttgtcaaagtgtgagttttagttgcgggaagtgagtttccttggtcatgtgatctcgagagg 10038226  T
Q  335 tggtattgttgtggatccgttgaaggttgatgcagtg 371  Q
    ||| || || ||||||| ||  |||||||||||||||    
T  10038227 tggaatagtagtggatctgtctaaggttgatgcagtg 10038263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 36 - 371
Target Start/End: Original strand, 10098312 - 10098648
Alignment:
Q  36 caaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaatgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaataga 135  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| |||||| | || | ||||||| ||||||| ||  | |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  10098312 caaaactgcatttcgaacgaggtatgggcactatgaatactttgtgatgtcatttggtgtgactaatgcgcttggtgtcttcatggaatacatgaataga 10098411  T
Q  136 atatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattg 235  Q
    || || ||||| |   |||| |  || ||||| ||||||||  | ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  10098412 atcttccatccttatttggatcagtttatggtggtgtttatagacgatatcttgatgtattcgaagtcagaggaggagcatgcggagcatctaaggattg 10098511  T
Q  236 tgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgcgag-tgtgagtttccttggtcatgtgatttctaaggg 334  Q
    ||||||||   ||||| || ||| |||||| || |||| |||  ||||| ||||||  |||||| |  ||||||||||||||||||||||| || |  ||    
T  10098512 tgttgcatactttgaaagagaataagttgtttgataagttgttaaagtgtgagttttagttgcgggaagtgagtttccttggtcatgtgatctcgagagg 10098611  T
Q  335 tggtattgttgtggatccgttgaaggttgatgcagtg 371  Q
    ||| || || ||||||| ||  |||||||||| ||||    
T  10098612 tggaatagtagtggatctgtctaaggttgatgtagtg 10098648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 247 - 412
Target Start/End: Original strand, 12639039 - 12639213
Alignment:
Q  247 ttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgcgagt-gtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttg 345  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| |||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  12639039 ttgaaagagaatcagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctg 12639138  T
Q  346 tggatccgttgaaggt--------tgatgcagtgggaatcacctaagtctgtctttgagattagaagctttcttg 412  Q
    |||||||||  |||||        || |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12639139 tggatccgtctaaggtcgatgcggtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgagattagaagctttcttg 12639213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 236
Target Start/End: Original strand, 23098677 - 23098813
Alignment:
Q  100 aatgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcga 199  Q
    |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || |||||| | || |||||  | ||| |||| ||||||||  ||||||||||  | ||||| |    
T  23098677 aatgcgcctggtgtatttatggagtatatgaataggatttttcatgcttttctggatagattcgtggtggtgtttattgatgatattttaatttattcta 23098776  T
Q  200 agtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgt 236  Q
    || |||| || |||||||| |||||| ||||||||||    
T  23098777 agactgaagaagagcatgccgagcatctgaggattgt 23098813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 169 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 23112451 - 23112342
Alignment:
Q  169 gtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtg 268  Q
    ||||||||  ||||||| ||| | ||||| ||| |||| || |||||||| |||||||| | |||||||||||| || |||||||||||  |||||| ||    
T  23112451 gtgtttattgatgatatcttgatttattctaagactgaagaagagcatgcagagcatttaaagattgtgttgcaagtgttgaaggaaaagaagttgtatg 23112352  T
Q  269 ctaagctgtc 278  Q
    | ||| ||||    
T  23112351 ccaagttgtc 23112342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 1065456 - 1065378
Alignment:
Q  179 atgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaa 257  Q
    ||||||||||  | ||||| |||  ||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||| || |||||||||||    
T  1065456 atgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaa 1065378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 23278560 - 23278370
Alignment:
Q  100 aatgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcga 199  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||| || ||| | |  |||||   |||| |||| || |||||  |||| ||| || | ||||| |    
T  23278560 aatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaattttccatgcttatctggataatttcgtggttgtttttattgatgacattctgatttattcta 23278461  T
Q  200 agtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtt 290  Q
    || |||| || |||||||| || ||| ||| ||||||||||||  | ||||| || ||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23278460 agactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaaatattgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgcgagtt 23278370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 242
Target Start/End: Original strand, 24818949 - 24819031
Alignment:
Q  160 ttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgca 242  Q
    |||||||| ||||| ||  ||||||||||| | || || ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24818949 ttcatggttgtgttcattgatgatattttgatatactctaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaggattgtcttgca 24819031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 242
Target Start/End: Original strand, 30010843 - 30010985
Alignment:
Q  100 aatgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcga 199  Q
    ||||||||||| || || ||| ||||||||||| | || |||||| | |  ||||| |||||  | || ||||||||  ||||||||||| | || || |    
T  30010843 aatgcgccaggagtgtttatgaaatatatgaatcgtatttttcatacttatctggatcgttttgttgtcgtgtttatagatgatattttgatatactcca 30010942  T
Q  200 agtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgca 242  Q
    |||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||||| |||||    
T  30010943 agtccgaggaggaacatgtcgagcatttgagaattgttttgca 30010985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 31832338 - 31832252
Alignment:
Q  204 tgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtt 290  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || |||||||||||   ||||| ||| ||| ||||||| || |||||    
T  31832338 tgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcgaaatgtgagtt 31832252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 2 - 428
Target Start/End: Original strand, 41215949 - 41216385
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41215949 atcatcagattagagtgaaggtgtaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgaggtatggaaactatgagtattctgtgatgccatttggagtatccaa 41216048  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  41216049 tgcgccaggtgttttcatgcaatatatgaatagaatatttcatccttttctggaccgttttatggtggtgtttattgatgatattttggtgtattcgaag 41216148  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgcgag 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||  ||| ||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||| |    
T  41216149 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcgagtcttgaaggagaattggttatgttctaagttgtcgaagtgtgagttttggttgcggg 41216248  T
Q  302 -tgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctg-tct 391  Q
      |||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    |||||||| | |||||||||        |||||||||||||||||||||||| | |    
T  41216249 aagtgagtttccttagtcatatgatttctaagggtagtatctacgtggatccatcgaaggttgatgcagtgttgcagtgggaatcacctaagtctgtttt 41216348  T
Q  392 ttgagattagaagctttcttgtataggcaggttatta 428  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  41216349 ttgagattagaagctttcttggattggcaggttatta 41216385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 412
Target Start/End: Original strand, 20829485 - 20829904
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  20829485 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 20829584  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||    
T  20829585 tgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 20829684  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttg-cga 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||| |||||  |     
T  20829685 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 20829784  T
Q  301 gtgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtctt 392  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||||||||        |||||||||| || ||||||||||| ||    
T  20829785 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 20829884  T
Q  393 tgagattagaagctttcttg 412  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20829885 tgagattagaagctttcttg 20829904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 2 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 20927320 - 20926992
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  20927320 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 20927221  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||| ||||  |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  20927220 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggacagttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcgaag 20927121  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttg-cga 300  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| | || ||||| |||||| |||||  |     
T  20927120 tctgaggaagagcatgatgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaggagaatcagttatgtgctaagttatctaagtgtgagttttggttgaagg 20927021  T
Q  301 gtgtgagtttccttggtcatgtgatttct 329  Q
      |||| |||||||||||| |||||||||    
T  20927020 aagtgattttccttggtcacgtgatttct 20926992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 28 - 371
Target Start/End: Original strand, 21200998 - 21201342
Alignment:
Q  28 gatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaatgcgccaggtgtcttcatggaatata 127  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||| | |||| ||||||||||||| | ||  | ||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  21200998 gatatatccaaaactgcgttccgaacgagatatggtcactatgaatattctgtgatgccatttagtgtgactaatacgccgagtgtcttcatggaatata 21201097  T
Q  128 tgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcattt 227  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||| || | ||  |||  |  |||||  ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||| |    
T  21201098 tgaatagaatatttcatccttatctgtactggtttgtggaggcttttatagatgatatcttggtgtattcgaagttggaggaggagcatgttaagcatct 21201197  T
Q  228 gaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgc-gagtgtgagtttccttggtcatgtgatt 326  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||  |||||| ||||||  |||||||||| || ||| || ||| |   ||||| || | |||||||||||||    
T  21201198 gaggattgtgttgcataccttgaaggataagaagttgtttgctaacttgtcgaagtgtgaattttggctgcaggaagtgagcttacctggtcatgtgatt 21201297  T
Q  327 tctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttgatgcagtg 371  Q
    || | |||||||||  || |||||||||||||| ||||| |||||    
T  21201298 tcgatgggtggtataattatggatccgttgaagattgatccagtg 21201342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 20527311 - 20527147
Alignment:
Q  10 attagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaatgcgccag 109  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20527311 attagagtgaaggcagaagataaatccaaaaccgcattccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcaccag 20527212  T
Q  110 gtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgttt 174  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||| ||||||    
T  20527211 gtgtctttatagaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttt 20527147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 8 - 116
Target Start/End: Original strand, 22133855 - 22133963
Alignment:
Q  8 atattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaatgcgcc 107  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22133855 atattagagtaaaggcggaagatatatccaagaccgcgttatgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatccaatgcgcc 22133954  T
Q  108 aggtgtctt 116  Q
    |||||||||    
T  22133955 aggtgtctt 22133963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 312 - 428
Target Start/End: Original strand, 22133961 - 22134085
Alignment:
Q  312 cttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtctttgagattagaa 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||        ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  22133961 cttggtcatgtgatttctaagggtggtatttccgaggatccgttgaaggttgatgcagtgttgcagtgggaatctcctaagtctgtttttgagataagaa 22134060  T
Q  404 gctttcttgtataggcaggttatta 428  Q
    ||||||||| || ||| ||||||||    
T  22134061 gctttcttggattggctggttatta 22134085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 69
Target Start/End: Original strand, 35930918 - 35930985
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactat 69  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  35930918 atcatcagattagagtgaaggcggaagatatatccaaaaccacgttccgaacgaggtatggacactat 35930985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 290
Target Start/End: Original strand, 38911096 - 38911207
Alignment:
Q  179 atgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtc 278  Q
    ||||||||||  | ||||| |||  ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || |||||||||||   ||||| ||||||||||||    
T  38911096 atgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagctgtc 38911195  T
Q  279 gaagtgcgagtt 290  Q
    ||| || |||||    
T  38911196 gaaatgtgagtt 38911207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 365 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 20926963 - 20926917
Alignment:
Q  365 tgcagtgggaatcacctaagtctgtctttgagattagaagctttctt 411  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20926963 tgcagtgggaatctcctaagtctgtttttgagattagaagttttctt 20926917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 257
Target Start/End: Original strand, 31538257 - 31538345
Alignment:
Q  169 gtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaa 257  Q
    ||||||||  ||||||||||  | ||||| |||  ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  31538257 gtgtttattgatgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaa 31538345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 48425003 - 48424915
Alignment:
Q  169 gtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaa 257  Q
    ||||||||  ||||||||||  | ||||| |||  ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  48425003 gtgtttattgatgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaa 48424915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 52987871 - 52987783
Alignment:
Q  169 gtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaa 257  Q
    ||||||||  ||||||||||  | ||||| |||  ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  52987871 gtgtttattgatgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaa 52987783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 290
Target Start/End: Original strand, 20855030 - 20855141
Alignment:
Q  179 atgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtc 278  Q
    ||||||||||| | ||||| ||  |||| ||||||||||| || || |||| ||||||||||||  | |||||||| |   |||||| ||| ||| ||||    
T  20855030 atgatattttgatttattctaaaactgaagaggagcatgcagaacacttgaagattgtgttgcagattttgaaggagagaaagttgtatgccaagttgtc 20855129  T
Q  279 gaagtgcgagtt 290  Q
    ||||||||||||    
T  20855130 gaagtgcgagtt 20855141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 169 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 37679179 - 37679091
Alignment:
Q  169 gtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaa 257  Q
    ||||||||  ||||||||||  | ||||| |||  ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  37679179 gtgtttattgatgatattttaatctattccaagaatgaggagaagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaa 37679091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 2 - 371
Target Start/End: Original strand, 6953 - 7323
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6953 atcatcagattagagtgaaggcggaagatatatccaaaacagcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatccaa 7052  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    ||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  7053 tgcaccaggtgtcttcattgagtatatgaataaaatatttcatccttatctggaccgttttatggtggtgtttataaatgatattttggtgtatttgaag 7152  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgc-ga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| |||||| |     
T  7153 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaggagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgcagg 7252  T
Q  301 gtgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttgatgcagtg 371  Q
      |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||    
T  7253 aagtgagtttccttggtcatatgatttctaagggtggtatttctgtggatccgtctaaggttgatgcagtg 7323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 23)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 2 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 4442168 - 4441733
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  4442168 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccggtcgaggtatgaacactaagagtattctgtgatgccattcggagtatccaa 4442069  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||  |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  4442068 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatataatattccatccttttctggaccgttttgtggtggtgtttatagatgatattttggtgtattcgaag 4441969  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgcgag 301  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |    
T  4441968 tctggggaggagcatgtcgagcatttgaggatggtgttgcgagtcttgaaggaaaatcggttatgtgctaagttgtcgaagtgtgagttttggttgcggg 4441869  T
Q  302 -tgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtctt 392  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| || |||||||||        ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  4441868 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttccgtggatcagtcgaaggttgatgcagtgttgcagtgggaatctcctaagtctgtttt 4441769  T
Q  393 tgagattagaagctttcttgtataggcaggttatta 428  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  4441768 tgagattagaagctttcttggattggcaggttatta 4441733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 2 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 17925890 - 17925455
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17925890 atcatcagattagagtgaagacggaagatatatccaaaaccgcgtttcgaatgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatccaa 17925791  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||  |||| ||||||||  || |||||||||| ||||| |||    
T  17925790 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatccttttctagaccgttttgtggtggtgtttatagattatattttggtatattcaaag 17925691  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgcgag 301  Q
    |||  ||||||||||| || |||||| || ||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||| || ||| ||||||| |    
T  17925690 tctagggaggagcatgttgtgcatttaagaattgtgttgcgcgtcttgaaggagaatcagttatgtgctaagttgtctaagtgtgaattttggttgcgtg 17925591  T
Q  302 -tgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttgatgca--------gtgggaatcacctaagtctgtctt 392  Q
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||        ||||||||||||||||||||| ||    
T  17925590 aagtgagtttccttggtcatgtgatttcgaagggtggtattgtcgtggatccgtcgaaggttgatgcagtgttgctgtgggaatcacctaagtctgtttt 17925491  T
Q  393 tgagattagaagctttcttgtataggcaggttatta 428  Q
     ||| ||||||| ||||||| ||  |||||||||||    
T  17925490 cgaggttagaagttttcttggattagcaggttatta 17925455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 7826140 - 7825721
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  7826140 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 7826041  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||    
T  7826040 tgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 7825941  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttg-cga 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||| |||||  |     
T  7825940 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 7825841  T
Q  301 gtgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtctt 392  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||||||||        |||||||||| || ||||||||||| ||    
T  7825840 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 7825741  T
Q  393 tgagattagaagctttcttg 412  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  7825740 tgagattagaagctttcttg 7825721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 10 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 13458267 - 13457856
Alignment:
Q  10 attagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaatgcgccag 109  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13458267 attagagtgaaggcgaaagatatatccgaaaccgtgttccgaacaaggtatggacactatgagtattttgtgatgtcatttggagtatccaatgcgccag 13458168  T
Q  110 gtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagtctgagga 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || | ||| |||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  13458167 gtgtcttcatggaatatatgaatagaacattccatccttttcaggatcgttttgtggtggtgtttatcgatgatattttggtgtattcgaggtcagagga 13458068  T
Q  210 ggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgcgag-tgtgagt 308  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || ||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||| |  ||||||    
T  13458067 ggagtatgctgagcatttgaggattgtgttgcgtgtcttgaaagagaatcatttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgcgggaagtgagt 13457968  T
Q  309 ttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttgatgcagtg--------ggaatcacctaagtctgtctttgagatta 400  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||        |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  13457967 ttccttgatcatgtgatttcgaaggatggtattgtcgtggatccatcgaaggttgatgcagtgttgcagttggaatcacctaagtctatttttgagatta 13457868  T
Q  401 gaagctttcttg 412  Q
    ||||||||||||    
T  13457867 gaagctttcttg 13457856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 412
Target Start/End: Original strand, 27105804 - 27106223
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  27105804 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 27105903  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||    
T  27105904 tgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 27106003  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttg-cga 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||| |||||  |     
T  27106004 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 27106103  T
Q  301 gtgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtctt 392  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||||||||        |||||||||| || ||||||||||| ||    
T  27106104 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 27106203  T
Q  393 tgagattagaagctttcttg 412  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27106204 tgagattagaagctttcttg 27106223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 27172521 - 27172102
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  27172521 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 27172422  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||    
T  27172421 tgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 27172322  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttg-cga 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||| |||||  |     
T  27172321 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 27172222  T
Q  301 gtgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtctt 392  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||||||||        |||||||||| || ||||||||||| ||    
T  27172221 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 27172122  T
Q  393 tgagattagaagctttcttg 412  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27172121 tgagattagaagctttcttg 27172102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 371
Target Start/End: Original strand, 15716949 - 15717303
Alignment:
Q  18 gaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaatgcgccaggtgtcttc 117  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  ||||| |||||| | |||| ||| |||||||||||  || | |||| |||  ||||||||    
T  15716949 gaaggcggaggatatatccaaaactgcgttccgaactagatatggtcactatgaatattctgtaatgccatttggtctaactaatgtgcctagtgtcttc 15717048  T
Q  118 atggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||  ||  |||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| | ||| |||||||||||||    
T  15717049 atggaatatatgaatagaatattccatccttttctggaccagtttttggtagtgtttatagacgatatcttggtttattcaatgtcggaggaggagcatg 15717148  T
Q  218 ctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgc-gagtgtgagtttccttgg 316  Q
    |||| ||||| ||||  ||||||||   ||||||||| ||  |||||| ||||||  |||||||||| |||||| | |||| |   |||||||| |||||    
T  15717149 ctgaacattttaggaccgtgttgcagaccttgaaggagaagaagttgtttgctaatttgtcgaagtgtgagttttgattgcaggaagtgagttttcttgg 15717248  T
Q  317 tcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttgatgcagtg 371  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  15717249 tcatgtgatttcaaagggcggtattgtggtggatccgtcgaaagttgatgtagtg 15717303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 13379123 - 13378981
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13379123 atcatcagatcagagtgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgaggtatggacactg--agtattctgtgatgccatttggagtatccaa 13379026  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcc 146  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13379025 tgcgccaggtgtcttcatgaaatatatgaatagaatatttcatcc 13378981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 247 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 14938341 - 14938151
Alignment:
Q  247 ttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgcgagt-gtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttg 345  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  14938341 ttgaaagacaatcagttgtgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgtgggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaaaggtggtattttcg 14938242  T
Q  346 tggatccgttgaaggttgatgc--------agtgggaatcacctaagtctgtctttgagattagaagctttcttgtataggcaggttatta 428  Q
    ||||||||| ||||||||||||        |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  14938241 tggatccgtcgaaggttgatgcagtgttgtagtgggaatctcctaagtctgtttttgagattagaagttttcttggattggcaggttatta 14938151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 247 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 15365934 - 15365744
Alignment:
Q  247 ttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgcgagt-gtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttg 345  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |    
T  15365934 ttgaaagacaatcagttgtgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgtgggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaaaggtggtattttcg 15365835  T
Q  346 tggatccgttgaaggttgatgc--------agtgggaatcacctaagtctgtctttgagattagaagctttcttgtataggcaggttatta 428  Q
    ||||||||| ||||||||||||        |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  15365834 tggatccgtcgaaggttgatgcagtgttgtagtgggaatctcctaagtctgtttttgagattagaagttttcttggattggcaggttatta 15365744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 50 - 323
Target Start/End: Original strand, 17143354 - 17143628
Alignment:
Q  50 gaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaatgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatccctt 149  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||| || |||| ||||||| ||  | ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |     
T  17143354 gaacgaggtatggacactatgaatattctgcgatgtcatttggtgtgactaatacgcccggtgtcttcatggaatatatgaatagaatcttccatcctta 17143453  T
Q  150 cctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttg 249  Q
      |||| |  ||  |||| ||||||||  | ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |   |||    
T  17143454 tttggatcagtttgtggtggtgtttatagacgatatcttggtgtattcgaagtcagaggaggatcatgcggagcatatgaggattgtgttgcgtacgttg 17143553  T
Q  250 aaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgcgag-tgtgagtttccttggtcatgtg 323  Q
    ||||| ||  |||||| || |||| |||||||||| |||||| ||||||| |  | |||||||||||||||||||    
T  17143554 aaggagaagaagttgtttgataagttgtcgaagtgtgagttttggttgcgtgaagggagtttccttggtcatgtg 17143628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 208 - 296
Target Start/End: Original strand, 16948686 - 16948774
Alignment:
Q  208 gaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggtt 296  Q
    |||||||| || |||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||  |||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  16948686 gaggagcacgcagagcatctgaagattgtgttgcaagtcttgaaagaaaagaagttgtatgctaagctgtcaaagtgtgagttttggtt 16948774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 365 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 13355017 - 13354954
Alignment:
Q  365 tgcagtgggaatcacctaagtctgtctttgagattagaagctttcttgtataggcaggttatta 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||  |||||||||||    
T  13355017 tgcagtgggaatcacctaagtctgtttttgagatcagaaactttcttggattagcaggttatta 13354954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 281
Target Start/End: Original strand, 11386535 - 11386716
Alignment:
Q  100 aatgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcga 199  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||| ||| ||||| |||||| | || |||||  | ||| |||| ||||||||  ||||||||||  | ||||| |    
T  11386535 aatgcgccaggtgtatttatggagtataagaacagaatttttcatgcttttctggatagattcgtggtggtgtttattgatgatattttaatttattcta 11386634  T
Q  200 agtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaa 281  Q
    || |||| || |||||||| |||||| |||||||||| || || ||  |||| || ||  |||||| ||||||| |||||||    
T  11386635 agactgaagaagagcatgccgagcatctgaggattgtattacaggttctgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaa 11386716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 291
Target Start/End: Original strand, 23503979 - 23504167
Alignment:
Q  103 gcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagt 202  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||| | || |||||    ||| |||| || |||||  |||||||| || | |||||||||     
T  23503979 gcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattctgatttattcgaaga 23504078  T
Q  203 ctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagttt 291  Q
    |||| || |||||||| || ||| |||| ||||||||||| || ||||| ||||   |||||| ||| || |||||||| || ||||||    
T  23504079 ctgaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgttgcaagttttgaaagaaaggaagttgtatgccaaactgtcgaaatgtgagttt 23504167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 14139819 - 14139665
Alignment:
Q  103 gcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagt 202  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||| | || |||||    ||| |||| || |||||  ||||||||||| | ||||| |||     
T  14139819 gcgcctggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtggtatttattgatgatattttgatttattctaaga 14139720  T
Q  203 ctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaa 257  Q
    |||| || |||||||| || ||| |||| ||||||||||| || ||||| |||||    
T  14139719 ctgaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgttgcaagtattgaaagaaaa 14139665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 330
Target Start/End: Original strand, 15122236 - 15122384
Alignment:
Q  181 gatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcga 280  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||| | |||  |||| ||| |||||| || |||| ||||||    
T  15122236 gatatcttggtgtattcaaagttggaggaggagcttgcggagcatatgagaattgtgttgca-gactt-taggagaataagttgtatgttaaggtgtcga 15122333  T
Q  281 agtgcgagtttgggttgcgag-tgtgagtttccttggtcatgtgatttcta 330  Q
    |||| |||||   ||||| ||  |||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15122334 agtgtgagttctagttgcaagaagtgagtttccttggtcatatgatatcta 15122384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 290
Target Start/End: Original strand, 26116800 - 26116886
Alignment:
Q  204 tgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtt 290  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||   ||||| ||| ||| ||||||| || |||||    
T  26116800 tgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcgaaatgtgagtt 26116886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 257
Target Start/End: Original strand, 26092973 - 26093061
Alignment:
Q  169 gtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaa 257  Q
    ||||||||  ||||||||||  | ||||| |||  ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  26092973 gtgtttattgatgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaa 26093061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 49154375 - 49154287
Alignment:
Q  169 gtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaa 257  Q
    ||||||||  ||||||||||  | ||||| |||  ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  49154375 gtgtttattgatgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaa 49154287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 164 - 251
Target Start/End: Original strand, 11770433 - 11770520
Alignment:
Q  164 tggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaa 251  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||| | || || ||||||||||  || |||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||    
T  11770433 tggttgtgttcatcgatgatattttgatatactccaagtctgagggagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaa 11770520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 242
Target Start/End: Original strand, 48813459 - 48813522
Alignment:
Q  179 atgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgca 242  Q
    ||||||||||| | || || |||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48813459 atgatattttgatatactctaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgtgttgca 48813522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 278
Target Start/End: Original strand, 11301423 - 11301497
Alignment:
Q  204 tgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtc 278  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||| || |||||||||||   ||||| ||||||| ||||    
T  11301423 tgaggaggagcatgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttgtc 11301497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 19)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 2 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 14130584 - 14130149
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  14130584 atcatcagattagagtgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgtttcgaacgaggtatggatactatgagtattatgtgatgtcatttggattatccaa 14130485  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |   ||||||||||  |||| |||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  14130484 tgtgctaggtgtcttcatggaatatatgaatagaacatttcatccttatttggaccgttttgtggtggtgtttagagatgatattttggtgtattcgaag 14130385  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgcgag 301  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| |||    
T  14130384 tttgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttacgagtcttgaaggagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgtgag 14130285  T
Q  302 -tgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtctt 392  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||  | | ||    
T  14130284 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaaaggtggtatttctgtggatccgttgaaggttgatgcagtgttgcagtgggaatcacctaagattttttt 14130185  T
Q  393 tgagattagaagctttcttgtataggcaggttatta 428  Q
    |||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  14130184 tgagattataagctttcttggattagcaggttatta 14130149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 2 - 412
Target Start/End: Original strand, 1646980 - 1647399
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  1646980 atcatcagattagagtgaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 1647079  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||||    
T  1647080 tgcgccaggtgtctttatggaatatatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgacattttggtgtattcgaag 1647179  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttg-cga 300  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || | ||||||||| ||| |||| ||||| |||||| |||||  |     
T  1647180 tttgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagataaccggttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 1647279  T
Q  301 gtgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtctt 392  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||||||||        |||||||||| || ||||||||||| ||    
T  1647280 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 1647379  T
Q  393 tgagattagaagctttcttg 412  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  1647380 tgagattagaagctttcttg 1647399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 412
Target Start/End: Original strand, 16380539 - 16380958
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  16380539 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 16380638  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||    
T  16380639 tgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 16380738  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttg-cga 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||| |||||  |     
T  16380739 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 16380838  T
Q  301 gtgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtctt 392  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||||||||        |||||||||| || ||||||||||| ||    
T  16380839 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 16380938  T
Q  393 tgagattagaagctttcttg 412  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16380939 tgagattagaagctttcttg 16380958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 412
Target Start/End: Original strand, 16648135 - 16648554
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  16648135 atcatcagattagagtaaaggcagaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 16648234  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||    
T  16648235 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 16648334  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttg-cga 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| || ||| |||| ||||| |||||| |||||  |     
T  16648335 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgcgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 16648434  T
Q  301 gtgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtctt 392  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |  ||||||||        |||||||||| || ||||||||||| ||    
T  16648435 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggacccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 16648534  T
Q  393 tgagattagaagctttcttg 412  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16648535 tgagattagaagctttcttg 16648554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 23998363 - 23997944
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  23998363 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 23998264  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||  |||    
T  23998263 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattgaaag 23998164  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgcgag 301  Q
    || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| || || ||||| ||||| ||| |||| ||||| |||||| ||||| |||    
T  23998163 tccgaggaagagcatgctgaacatttgaggattgtgttgtaagtcttgaaagagaaccagttatgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttg-gag 23998065  T
Q  302 --tgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttgatg--------cagtgggaatcacctaagtctgtct 391  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |  ||||||||||        |||||||| || ||||||||||| |    
T  23998064 gaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtagatccttccaaggttgatgcagtgttacagtgggagtctcctaagtctgttt 23997965  T
Q  392 ttgagattagaagctttcttg 412  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  23997964 ttgagattagaagctttcttg 23997944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 16100130 - 16099705
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  16100130 atcatcagattatagtgaaggcggaagatatatccaaaacatcgttacgaacgaggtatggacactatgagtattatgtaatgccatttggagtgtctaa 16100031  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcat------ggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtat 195  Q
    || |||||||||||| ||      ||| ||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||  |||| ||||||||  |||||| ||||||||||    
T  16100030 tgtgccaggtgtctttatctttatggagtatatgaatagaatatttcatccatatttggaccgttttgtggtggtgtttatagatgataatttggtgtat 16099931  T
Q  196 tcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggt 295  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| |||    
T  16099930 tcgaagtctaaggaggagcacgctgagcatttaaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggt 16099831  T
Q  296 tgc-gagtgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttgatgc--------agtgggaatcacctaagtc 386  Q
    ||| |   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||        |||||||||| ||||||||    
T  16099830 tgcaggaagtgaatttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttatgtggatccttcgaaggttgatgcagtgttgtagtgggaatctcctaagtc 16099731  T
Q  387 tgtctttgagattagaagctttcttg 412  Q
    | | ||||||||||||||||||||||    
T  16099730 tatttttgagattagaagctttcttg 16099705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 2 - 412
Target Start/End: Original strand, 23025912 - 23026310
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||        
T  23025912 atcatcagattagagtgaaggcggaagatatatccaaaactacgtctcgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtat---- 23026007  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
                    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||  || |||||||  |||| ||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  23026008 ----------------atg-aatatatgaatagaatatttcatccttttatgaaccgttttgtggtggtgtttatagatgatattttggtgtatttgaag 23026090  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgcgag 301  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||| |    
T  23026091 tctgaggaggagcatgcttcgcatttgaggattgtgttgcgagtcttgaaggagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgcggg 23026190  T
Q  302 -tgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtctt 392  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||        ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  23026191 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttccgtggatccgtcgaaggttgatgtatagttgcagtgggaatcacctaagtctatttt 23026290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 185 - 425
Target Start/End: Original strand, 18836257 - 18836506
Alignment:
Q  185 ttttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtg 284  Q
    ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || || ||||| ||||||||| | || |||||    
T  18836257 ttttggtgtattcaaaatctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttggaagagaaccagttatgtgctaagttatctaagtg 18836356  T
Q  285 cgagtttgggttg-cgagtgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaa 375  Q
     |||||| |||||  | | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||        |||||||||||    
T  18836357 tgagttttggttgaagggagtgagcttccttggtcacgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccgtctaaggttgatgcagtgttgcagtgggaa 18836456  T
Q  376 tcacctaagtctgtctttgagattagaagctttcttgtataggcaggtta 425  Q
    || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| || ||| |||||    
T  18836457 tctcctaagtctgtttttgagattataagttttcttggattggcgggtta 18836506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 225 - 408
Target Start/End: Original strand, 19985805 - 19985997
Alignment:
Q  225 tttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgcgagt-gtgagtttccttggtcatgtg 323  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| |||||   |  | |||||| ||||||||||||    
T  19985805 tttgaggattgtgttgcaggtcttgaaggagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagcgagttttcttggtcatgtg 19985904  T
Q  324 atttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtctttgagattagaagcttt 408  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||||||||        |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19985905 atttctaagggtggtatttctgtggatccttctaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgagattagaagcttt 19985997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 247 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 21929074 - 21928885
Alignment:
Q  247 ttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgcgagt-gtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttg 345  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  21929074 ttgaaggagaatcagttgtgtgctaagttgtcaaagtgtgagttttggttgcgggaagggagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgtca 21928975  T
Q  346 tggatccgttgaaggt-------tgatgcagtgggaatcacctaagtctgtctttgagattagaagctttcttgtataggcaggttatta 428  Q
    |||||||||  ||| |       || | ||||||||||||||||||||  | |||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||    
T  21928974 tggatccgtcaaagttaatgtcatgttacagtgggaatcacctaagtcaatttttgagatcaaaagctttcttggattggcaggttatta 21928885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 225 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 18578101 - 18577954
Alignment:
Q  225 tttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgcgagt-gtgagtttccttggtcatgtg 323  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || || || || ||||||||| |||| ||||  |||||| |||||   |  |||||||||||||||||||||    
T  18578101 tttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccaattatgtgctaagttgtctaagtatgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtg 18578002  T
Q  324 atttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttgatgcagtg 371  Q
    ||||||||||||||||||  ||  ||||| |  |||||||||||||||    
T  18578001 atttctaagggtggtatttctgcagatccttctaaggttgatgcagtg 18577954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 247 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 16234898 - 16234728
Alignment:
Q  247 ttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgcgagt-gtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttg 345  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||| || ||| |||||   |  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  16234898 ttgaaggagaatcagttatgtgctaagttgtctaagtgtgaattttggttgaaggaagggagtttcctgggtcatgtgatttctaagggtggtatttctg 16234799  T
Q  346 tggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtctttgagattagaagcttt 408  Q
    |||||||    ||||||||        |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16234798 tggatcctcctaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgagattagaagcttt 16234728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 23080429 - 23080344
Alignment:
Q  157 cgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgca 242  Q
    |||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| | || || ||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  23080429 cgtttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatttactccaagtctgaggaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgca 23080344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 73 - 146
Target Start/End: Original strand, 14643721 - 14643794
Alignment:
Q  73 tattatgtgatgccatttggagtatccaatgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcc 146  Q
    |||| ||||||||||||||| ||  |  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  14643721 tattctgtgatgccatttggtgttactgatgcgcatggtgtcttcatggaatatatgaatagaatcttccatcc 14643794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 169 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 24366360 - 24366239
Alignment:
Q  169 gtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtg 268  Q
    ||||||||  ||||||||||  | ||||| |||  ||||||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||| || |||||||||||   ||||| ||    
T  24366360 gtgtttattgatgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcacctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatg 24366261  T
Q  269 ctaagctgtcgaagtgcgagtt 290  Q
    | ||| |||||||||| |||||    
T  24366260 caaagttgtcgaagtgtgagtt 24366239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 296
Target Start/End: Original strand, 14378273 - 14378376
Alignment:
Q  193 tattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttg 292  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||| |||||||| || ||  |||||| ||| ||| ||||||| || ||||||     
T  14378273 tattctaagactgaagaggagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtcttgaaagagaaaaagttgtatgccaagttgtcgaaatgtgagtttt 14378372  T
Q  293 ggtt 296  Q
    ||||    
T  14378373 ggtt 14378376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 296
Target Start/End: Original strand, 14379823 - 14379926
Alignment:
Q  193 tattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttg 292  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||| |||||||| || ||  |||||| ||| ||| ||||||| || ||||||     
T  14379823 tattctaagactgaagaggagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtcttgaaagagaaaaagttgtatgccaagttgtcgaaatgtgagtttt 14379922  T
Q  293 ggtt 296  Q
    ||||    
T  14379923 ggtt 14379926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 278
Target Start/End: Original strand, 19487629 - 19487714
Alignment:
Q  193 tattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtc 278  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||| |||  |||||| ||| ||| ||||    
T  19487629 tattctaagtctgaagaagagcatgcagagcatttaaagattgtgttgcaagtgttgaaggtaaagaagttgtatgccaagttgtc 19487714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 229
Target Start/End: Original strand, 22760791 - 22760848
Alignment:
Q  172 tttatcaatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttga 229  Q
    ||||| |||||||||||| | || || |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  22760791 tttattaatgatattttgatttactccaagtctgaagaagagcatgctgagcatttga 22760848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 2 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 16340 - 15905
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| ||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  16340 atcatcaaattagaatgaatgcggaagatatatctaaaaccgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccattttgagtatccaa 16241  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  |||||||||||  ||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16240 tgcgtcaggtgtcttcatggaatacatgaatagaatatttcaaccttatctggaccgttttgtggtgatgtttatagatgatattttggtgtattcgaag 16141  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgc-ga 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||| |||  | ||| || ||| |||||| |     
T  16140 tctgaggaggagcatgttgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaggagaaccagttatgtgctaagttgtttacgtgtgaattttggttgcagg 16041  T
Q  301 gtgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtctt 392  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||| |||||        ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16040 aagtgagtttccctggtcatgtgatttctaagggtggtatttccgtggatccgtcgaatgttgatgcagtgttgcagtgggaatcacctaagtctgtttt 15941  T
Q  393 tgagattagaagctttcttgtataggcaggttatta 428  Q
     ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  15940 cgagattagaagctttcttggattggcaggttatta 15905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 2)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 2 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 7435 - 7003
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||    
T  7435 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgtcatttggagtatctaa 7336  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  7335 tgcgccaggtgtttttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgtttatagatgatattttggtgtattcgaag 7236  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttg-cga 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| |||||  |     
T  7235 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 7136  T
Q  301 gtgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttgatgcag--------tgggaatcacctaagtctgtctt 392  Q
      |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||||        ||||| || | ||||||||| ||    
T  7135 aagtgagtttccttggtcatttgatttctaagggtggtatttatgtggatccttctaaggttgatgcagtgttgtaatgggagtctcttaagtctgtttt 7036  T
Q  393 tgagattagaagctttcttgtataggcaggtta 425  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  7035 tgagattagaagctttcttggttaggccggtta 7003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 485 - 61
Alignment:
Q  10 attagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaatgcgccag 109  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  485 attagagtaaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgtcatttggagtatctaatgcgccag 386  T
Q  110 gtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagtctgagga 209  Q
    |||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  385 gtgtttttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgtttatagatgatattttggtgtattcgaagtctgagga 286  T
Q  210 ggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttg-cgagtgtgagt 308  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||| | || ||||| |||||| |||||  |   ||||||    
T  285 agagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagttttgaaagagaaccagttatgtgctaagttttctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagt 186  T
Q  309 ttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttgatgcag--------tgggaatcacctaagtctgtctttgagatta 400  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||||        ||||| || | ||||||||| ||||||||||    
T  185 ttccttggtcatttgatttctaagggtggtatttatgtggatccttctaaggttgatgcagtgttgtaatgggagtctcttaagtctgtttttgagatta 86  T
Q  401 gaagctttcttgtataggcaggtta 425  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||    
T  85 gaagctttcttggttaggccggtta 61  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 25676 - 25257
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  25676 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 25577  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||    
T  25576 tgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 25477  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttg-cga 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||| |||||  |     
T  25476 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 25377  T
Q  301 gtgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtctt 392  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||||||||        |||||||||| || ||||||||||| ||    
T  25376 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 25277  T
Q  393 tgagattagaagctttcttg 412  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  25276 tgagattagaagctttcttg 25257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 15190 - 14771
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  15190 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 15091  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||    
T  15090 tgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 14991  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttg-cga 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||| |||||  |     
T  14990 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 14891  T
Q  301 gtgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtctt 392  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||||||||        |||||||||| || ||||||||||| ||    
T  14890 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 14791  T
Q  393 tgagattagaagctttcttg 412  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14790 tgagattagaagctttcttg 14771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 371
Target Start/End: Original strand, 11198 - 11568
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| || ||    
T  11198 atcatcagattagagtgaaggcggaagatatatccaaaaccgcattccgaacaaggtatggacactatgagtattctttgatgccatttggagtgtctaa 11297  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  11298 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcgaag 11397  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttg-cga 300  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||| | |  ||||| |||||| |||||  |     
T  11398 tctgaggaagagcataatgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttatgtgcaaagttatataagtgtgagttttggttgaagg 11497  T
Q  301 gtgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttgatgcagtg 371  Q
      ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||||||    
T  11498 aagtgagtttccttggtcaagtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttcaaaggttgatgcagtg 11568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 24458 - 24023
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  24458 atcatcagattagagtgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacaaggtatggacactatgagtatgctgtgatgccatttggagtatcgaa 24359  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    ||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||| ||||| ||  ||||||||||||| ||||||||     
T  24358 tgcgctaggtgtctttgtggagtatatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtatattcgaaa 24259  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgc-ga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||  || ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| |||||| |     
T  24258 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagttttgaaggggaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgcagg 24159  T
Q  301 gtgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtctt 392  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||        |||||||||| || ||||||||||| ||    
T  24158 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccgtctaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 24059  T
Q  393 tgagattagaagctttcttgtataggcaggttatta 428  Q
    |||||||||||| |||||||  | ||||||||||||    
T  24058 tgagattagaagttttcttggtttggcaggttatta 24023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 3)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 428
Target Start/End: Original strand, 26290 - 26725
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  26290 atcatcagattagagtgaaggcggaagagatatccaaaaccgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattttgtgatgccatttggagtatctaa 26389  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    |||||||||||||||  ||||||  ||||||||| |||||||||| |  |||||||||||  |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  26390 tgcgccaggtgtctttctggaatgcatgaatagagtatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcgaag 26489  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttg-cga 300  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| |||||  |     
T  26490 tctgaggaagagcatgctgaacatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 26589  T
Q  301 gtgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttgat--------gcagtgggaatcacctaagtctgtctt 392  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||| || |||||||||        |||||||||||| ||||||||||| ||    
T  26590 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggcatttctgtggatccatttaaggttgatgcagtgtcgcagtgggaatctcctaagtctgtttt 26689  T
Q  393 tgagattagaagctttcttgtataggcaggttatta 428  Q
    |||||||||||| |||||||  | ||||||||||||    
T  26690 tgagattagaagttttcttggtttggcaggttatta 26725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 372 - 428
Target Start/End: Original strand, 25358 - 25414
Alignment:
Q  372 ggaatcacctaagtctgtctttgagattagaagctttcttgtataggcaggttatta 428  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||    
T  25358 ggaatctcctaagtctgtttttgagattagaagttttcttggtttggcaggttatta 25414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 291
Target Start/End: Original strand, 25270 - 25314
Alignment:
Q  247 ttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagttt 291  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  25270 ttgaaggagaatcagttgtgtgctaagttgtctaagtgtgagttt 25314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 42540 - 42121
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  42540 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattttgtgatgccatttggagtatctaa 42441  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||    
T  42440 tgcgctaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 42341  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttg-cga 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||| |||||  |     
T  42340 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 42241  T
Q  301 gtgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtctt 392  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||||||||        |||||||||| || ||||||||||| ||    
T  42240 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 42141  T
Q  393 tgagattagaagctttcttg 412  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  42140 tgagattagaagctttcttg 42121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 193 - 281
Target Start/End: Original strand, 55115 - 55203
Alignment:
Q  193 tattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaa 281  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||| || ||| ||| |||||| ||||| || ||||| |||||  |||||| ||||||| |||||||    
T  55115 tattctaagactgaagaggagcatgcagaacatctgaagattgtattgcaagttttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaa 55203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 23)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 30139686 - 30139267
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  30139686 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 30139587  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||    
T  30139586 tgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 30139487  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttg-cga 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||| |||||  |     
T  30139486 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 30139387  T
Q  301 gtgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtctt 392  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||||||||        |||||||||| || ||||||||||| ||    
T  30139386 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 30139287  T
Q  393 tgagattagaagctttcttg 412  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  30139286 tgagattagaagctttcttg 30139267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 2 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 30149237 - 30148818
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  30149237 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 30149138  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||    
T  30149137 tgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 30149038  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttg-cga 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||| |||||  |     
T  30149037 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 30148938  T
Q  301 gtgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtctt 392  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||||||||        |||||||||| || ||||||||||| ||    
T  30148937 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 30148838  T
Q  393 tgagattagaagctttcttg 412  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  30148837 tgagattagaagctttcttg 30148818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 2 - 412
Target Start/End: Original strand, 8272659 - 8273078
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  8272659 atcatcagattagagtaaaggcagaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 8272758  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||    
T  8272759 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 8272858  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttg-cga 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| || ||| |||| ||||| |||||| |||||  |     
T  8272859 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgcgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 8272958  T
Q  301 gtgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtctt 392  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||||||||        |||||||||| || ||||||||||| ||    
T  8272959 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 8273058  T
Q  393 tgagattagaagctttcttg 412  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  8273059 tgagattagaagctttcttg 8273078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 2 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 15611983 - 15611564
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  15611983 atcatcagattagagtgaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 15611884  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  15611883 tgcaccaggtgtctttatggaatatatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcgaag 15611784  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttg-cga 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || | ||||||||| ||| |||| ||| | |||||| |||||  |     
T  15611783 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtcttgcaagttttgaaagataaccggttgtgtgccaagttgtctaagcgtgagttttggttgaagg 15611684  T
Q  301 gtgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtctt 392  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||||||||        |||||||||| || ||||||||||| ||    
T  15611683 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 15611584  T
Q  393 tgagattagaagctttcttg 412  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15611583 tgagattagaagctttcttg 15611564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 25768198 - 25767779
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| ||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  25768198 atcatcagattagagtgaaagcagatgatatatccaaaaccgcgttccaaacaaggtatggacactatgagtattctgtgatgccattcggagtatctaa 25768099  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||     
T  25768098 ttcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgtttatagatgatattttggtgtattcaaaa 25767999  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttg-cga 300  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| |||||  |     
T  25767998 tctgagaaggagcatgctgagcatttgaggattatgttgcaagtcttgaaggagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 25767899  T
Q  301 gtgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtctt 392  Q
      ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| | ||| |||||        ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  25767898 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctcagggtggtatttatgtggatccttcgaaagttgatgcagtgttgcagtgggaatctcctaagtctgtttt 25767799  T
Q  393 tgagattagaagctttcttg 412  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  25767798 tgagattagaagttttcttg 25767779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 371
Target Start/End: Original strand, 6151113 - 6151483
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  6151113 atcatcagattagagtgaaggcagaagatatatccaaaactgtgttccgaacgaggtatggacactatgagtattttgtgatgccatttggagtatctaa 6151212  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |  || ||||||||  |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  6151213 tgcgccaggtgtctttatggagtatatgaataaaatatttcatccttatctagaccgttttgtggtggtgtttatagatgatattttggtgtattcgaaa 6151312  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttg-cga 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||| |||| |||||||||||| |||||  |     
T  6151313 tctgaggaggagcatgctgagcatctgacgattgtgttgcaagtgttgaaggagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgcgagttttggttgaagg 6151412  T
Q  301 gtgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttgatgcagtg 371  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| | |||||||||    
T  6151413 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccgtctaagatcgatgcagtg 6151483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 412
Target Start/End: Original strand, 13965612 - 13966032
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13965612 atcatcagattagagtaaaggcggtagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatccaa 13965711  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  13965712 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcgaag 13965811  T
Q  202 tctgagg-aggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttg-cg 299  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || || ||||||| ||| ||  |||| ||||| |||||| |||||  |    
T  13965812 tctgaggaagaagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagacttgaaagagaaccagttgtctgccaatttgtctaagtgtgagttttggttgaag 13965911  T
Q  300 agtgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtct 391  Q
       |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||||||||        |||||||||| || ||||||||||| |    
T  13965912 gaagtgagttttcttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgttt 13966011  T
Q  392 ttgagattagaagctttcttg 412  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  13966012 ttgagattagaagctgtcttg 13966032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 297
Target Start/End: Original strand, 15948730 - 15949025
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15948730 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattccgtgatgccatttggagtatccaa 15948829  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||| ||  |||| || || ||  |||||||||||||||||||||||    
T  15948830 tgcgccaggtgtctttatggaatatatgaatagaatatttcatccttatttggaccgatttgtggtggttttcatagatgatattttggtgtattcgaag 15948929  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttg 297  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| || ||| |||| ||||| || ||| |||||    
T  15948930 tctgaggaagagcatgttgagcatctgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgagccaagttgtctaagtgtgaattttggttg 15949025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 190 - 371
Target Start/End: Original strand, 6710865 - 6711047
Alignment:
Q  190 gtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagt 289  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||    
T  6710865 gtgtattcaaagtcagaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcgtgttttgaaggagaatcagttgtttgctaagttgtctaagtgtgagt 6710964  T
Q  290 ttgggttgcgag-tgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttgatgcagtg 371  Q
    || ||||  | |  ||||||||||||||| |||||||||| || ||  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  6710965 tttggttttgggaagtgagtttccttggttatgtgatttcgaaagggtgtattgtcgtggatccgtcgaaggttgatgcagtg 6711047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 267 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 18751558 - 18751388
Alignment:
Q  267 tgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgcgagt-gtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttga- 364  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||  |||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||     
T  18751558 tgctaagttgtcgaagtgtgagtttttgttgcgggaagtgagtttcctttgtcatgtgatttctaagggtggtatctctgtggatccgttgaaggttgat 18751459  T
Q  365 -------tgcagtgggaatcacctaagtctgtctttgagattagaagctttcttgtataggcaggttatta 428  Q
           ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  18751458 accgtgttgcagcgggaatcacctaagtctgtttttgagattagaagctttcttggattggtaggttatta 18751388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 256 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 16258769 - 16258591
Alignment:
Q  256 aatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgcgagt-gtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgt 354  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |    
T  16258769 aatcagttgtgtgcaaagttgtctaagtgcgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttacgtggatcctt 16258670  T
Q  355 tgaaggttgatgc--------agtgggaatcacctaagtctgtctttgagattagaagctttcttgtataggcaggtta 425  Q
      |||||||||||        |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||  | |||||||||    
T  16258669 ctaaggttgatgcagtgttacagtgggaatctcctaagtctgtttttgaggttagaagctttcttggtttggcaggtta 16258591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 247 - 412
Target Start/End: Original strand, 55514237 - 55514411
Alignment:
Q  247 ttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgcgagt-gtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttg 345  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |    
T  55514237 ttgaaggagaatcatttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgcgggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatctccg 55514336  T
Q  346 tggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtctttgagattagaagctttcttg 412  Q
    ||||||| |  ||||||||        ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  55514337 tggatccatcaaaggttgatgcagtgttgcagtgggaatcacctaagtctgtttttgagataagaaactttcttg 55514411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 160 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 55498574 - 55498492
Alignment:
Q  160 ttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgca 242  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  55498574 ttcatggtggtgtttatcgatgatatcttagtgtattcgaagtcggaggagcagcatgcagagcatttcaggattgtgttgca 55498492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 303 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 12795814 - 12795697
Alignment:
Q  303 gtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttgatgc--------agtgggaatcacctaagtctgtctttg 394  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |  |||||||||||        ||||||| || ||||||||||| ||||    
T  12795814 gtgagttttcttggtcatgtgatttctaagggtagtatttctgtggatccttctaaggttgatgcagtgttacagtgggagtctcctaagtctgtttttg 12795715  T
Q  395 agattagaagctttcttg 412  Q
    ||||||||||||||||||    
T  12795714 agattagaagctttcttg 12795697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 18915301 - 18915187
Alignment:
Q  306 agtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtctttgaga 397  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |  ||||||||        |||| ||||| || ||||||||||| |||||||    
T  18915301 agtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgttgatccttccaaggttgatgtagtgttgcaatgggagtctcctaagtctgtttttgaga 18915202  T
Q  398 ttagaagctttcttg 412  Q
    ||||||| |||||||    
T  18915201 ttagaagttttcttg 18915187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 290
Target Start/End: Original strand, 11950319 - 11950445
Alignment:
Q  164 tggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagtt 263  Q
    |||| ||||||||  |||||||| || | ||||| ||| |||| || |||||||| || ||||||| |||||||||||| || ||||| || ||  ||||    
T  11950319 tggttgtgtttattgatgatattctgatttattctaagactgaagaagagcatgcagaacatttgaagattgtgttgcaagtattgaaagagaagaagtt 11950418  T
Q  264 gtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtt 290  Q
    || ||||||| |||||||||| |||||    
T  11950419 gtatgctaagttgtcgaagtgtgagtt 11950445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 15261402 - 15261260
Alignment:
Q  100 aatgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcga 199  Q
    |||||||||||||| || ||||| || |||||| | || |||||| | ||  |||| |||||| |||| || || ||| ||||||||||| | ||||| |    
T  15261402 aatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatctttcatgcgtttttggatcgtttcgtggttgtattcatcgatgatattttgatatattcca 15261303  T
Q  200 agtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgca 242  Q
    || |||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  15261302 agactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgca 15261260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 193 - 290
Target Start/End: Original strand, 18132786 - 18132883
Alignment:
Q  193 tattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtt 290  Q
    ||||| ||| |||| ||||||| | | || ||| |||||||| ||||||| || ||||| |||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  18132786 tattcaaagactgaagaggagcttacggaacatctgaggattatgttgcaagtgttgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaagtgcgagtt 18132883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 28755996 - 28755943
Alignment:
Q  204 tgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaa 257  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  28755996 tgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtgttgcaagtgttgaaggaaaa 28755943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 12180009 - 12179930
Alignment:
Q  211 gagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtt 290  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||  | ||||| |||||  |||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  12180009 gagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaaatattgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagtt 12179930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 257
Target Start/End: Original strand, 16379278 - 16379432
Alignment:
Q  103 gcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagt 202  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||| |||| |||||    ||| |||| || |||||  |||||||| || | ||||| |||     
T  16379278 gcgcccggtgtgttcatggagtatatgaatcgaatttttcatgcctttctggataaattcctggtggtatttattgatgatattctgatttattctaaga 16379377  T
Q  203 ctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaa 257  Q
    || | || |||||||| || ||| |||| ||||||||||| || ||||| |||||    
T  16379378 cttaagaagagcatgcagaacatctgagaattgtgttgcaagtattgaaagaaaa 16379432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 47125622 - 47125569
Alignment:
Q  204 tgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaa 257  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||| || |||||||||||    
T  47125622 tgaggaggagcatgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaa 47125569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 251
Target Start/End: Original strand, 14874872 - 14875008
Alignment:
Q  115 ttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagc 214  Q
    |||||||| || |||||| | || |||||| ||||  |||| || ||| |||| || |||||| ||||||||||| | || || ||| |||| || || |    
T  14874872 ttcatggagtacatgaatcgcatctttcatgcctttttggatcgattcgtggttgtttttatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaac 14874971  T
Q  215 atgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaa 251  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||| || |||||    
T  14874972 atgctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaa 14875008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 2 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 34367 - 33948
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34367 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatacccaaaaccgcgtttcgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatccaa 34268  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  34267 tgcgccaggtgtcttcatggagtatatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcgaag 34168  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgcgag 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||| |||| ||||| || ||| ||||| |||    
T  34167 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttatgtgcaaagttgtctaagtgtgaattttggttg-gag 34069  T
Q  302 --tgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtct 391  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||        |||| ||||| || |||| |||||| |    
T  34068 gaagtaagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccgtctaaggttgatgcggtgttgcaatgggattctcctacgtctgttt 33969  T
Q  392 ttgagattagaagctttcttg 412  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  33968 ttgagattagaagctttcttg 33948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 6)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 2 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 23507849 - 23507430
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  23507849 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 23507750  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  23507749 tgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcgaag 23507650  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttg-cga 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||  ||||| ||| |||| ||||| |||||| |||||  |     
T  23507649 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtattgaaagagaaccagtgatgtgcaaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 23507550  T
Q  301 gtgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtctt 392  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||||||||        ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  23507549 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttatgtggatccttctaaggttgatgcactgttgcagtgggaatctcctaagtctgtttt 23507450  T
Q  393 tgagattagaagctttcttg 412  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  23507449 tgagattagaagctttcttg 23507430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 412
Target Start/End: Original strand, 21935391 - 21935810
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  21935391 atcatcagattagagtaaaggcagaagatatatccaaaactgcgttccgaacaaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 21935490  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||    
T  21935491 tgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 21935590  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttg-cga 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||| |||||  |     
T  21935591 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 21935690  T
Q  301 gtgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtctt 392  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||||||||        |||||||||| || ||||||||||| ||    
T  21935691 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 21935790  T
Q  393 tgagattagaagctttcttg 412  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21935791 tgagattagaagctttcttg 21935810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 24583375 - 24583005
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| |||||||  |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  24583375 atcatcagattagagtaaaggcaaaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 24583276  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||    
T  24583275 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 24583176  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttg-cga 300  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||| || ||| |||| ||||| |||||| |||||  |     
T  24583175 tttgaggaagagcatgctgagcatttgagaattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgcgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 24583076  T
Q  301 gtgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttgatgcagtg 371  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||| |  |||||||||||||||    
T  24583075 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctatagatccttccaaggttgatgcagtg 24583005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 247 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 23505164 - 23504994
Alignment:
Q  247 ttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgcgagt-gtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttg 345  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||| |||| ||||| |||||| |||||   |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  23505164 ttgaaggagaatcggttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttatg 23505065  T
Q  346 tggatccgttgaaggttgatgc--------agtgggaatcacctaagtctgtctttgagattagaagcttt 408  Q
    ||||||| |  |||||||||||        ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23505064 tggatccttcaaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgagattagaagcttt 23504994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 257
Target Start/End: Original strand, 24796802 - 24796855
Alignment:
Q  204 tgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaa 257  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||| || |||||||||||    
T  24796802 tgaggaggagcatgcagagcatctgagaatagtgttgcaagtgttgaaggaaaa 24796855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 166 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 25850076 - 25849952
Alignment:
Q  166 gtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgt 265  Q
    |||||||| ||  ||||||| ||| | |||||||||  ||| ||||||||||| |||||| |||| || || ||||| || |||||||||||   |||||    
T  25850076 gtagtgttcattgatgatatcttgatttattcgaagaatgaagaggagcatgcagagcatctgagaatagtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgt 25849977  T
Q  266 gtgctaagctgtcgaagtgcgagtt 290  Q
     ||| ||| ||||||| || |||||    
T  25849976 atgcaaagttgtcgaaatgtgagtt 25849952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1488 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold1488
Description:

Target: scaffold1488; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 2 - 428
Target Start/End: Original strand, 827 - 1261
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  827 atcatcagattagagtgaaggcggaagatatatccaaaactgtgttccgaacgaggtatgaacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatccaa 926  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||| |||  |||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  927 tgcgccagttgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatccttatttggaccattttgtggtggtgtttatagatgata-tttggtgtattcgaag 1025  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgc-ga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||| |||||||||| || ||| |||||| |     
T  1026 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagttttgaaagagaaccagttatgtgctaagttgtcgaagtgtgaattttggttgcagg 1125  T
Q  301 gtgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtctt 392  Q
      ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||   |||||||||| ||| | |||        ||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  1126 aagtgagtttccttggtcacgtgatttcgaagggaggtatttccgtggatccgtcgaatgctgatgcggtgttgcagtgagaatctcctaagtctgtttt 1225  T
Q  393 tgagattagaagctttcttgtataggcaggttatta 428  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  1226 tgagattagaagctttcttggattgccaggttatta 1261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 412
Target Start/End: Original strand, 1976 - 2395
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  1976 atcatcaaattagagtgaaggcggaagatatatccaaaaccgcattccgaacgaggtatagacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 2075  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||| |||  |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||    
T  2076 tgcaccaggtgtctttatggaataaatgaatagaatatttcatccttatctggaccattttgtggtggtgttaatagatgatattttggtgtattcaaag 2175  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgcgag 301  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| |||    
T  2176 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattatgttgcaggtcttgaaagagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttg-gag 2274  T
Q  302 --tgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtct 391  Q
       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||  ||||||||        ||||||||||||| ||||| ||||| |    
T  2275 gaagtgagtttccttggtcatgtgatttataagggtggtatttatgtggatccgtctaaggttgatgtagtgttgcagtgggaatctcctaactctgttt 2374  T
Q  392 ttgagattagaagctttcttg 412  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  2375 ttgagattagaagttttcttg 2395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 26598 - 26261
Alignment:
Q  13 agagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaatgcgccaggtg 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  26598 agagtgaaggcggaagatatatccaataccgctttccgaacaaggtatggacactatgagtattctgtgatgtcatttagagtatctaatgcgccaggtg 26499  T
Q  113 tcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagtctgaggagga 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||  |||||||  |||| ||||||||||||||||||   |||||| |    
T  26498 tcttcatggaatatatgaatagaatatttcatccttttctggaccgttttgtggtgatgtttatttatgacattttggtgtattcgaagatcgaggagta 26399  T
Q  213 gcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgcgag-tgtgagtttc 311  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||  ||||||||| |||||  ||||||  |||||| | |||||||| |||||| ||||||| |  |||| ||||    
T  26398 gcatgttgagca-ttgagaattgtgttgggtgtcttgaaagaaaagaagttgttagctaagttttcgaagtgtgagttttggttgcgggaagtgactttc 26300  T
Q  312 cttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggat 350  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  26299 cttggtcatgtgatttcgaaaggtggtattgtcgtggat 26261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 2 - 412
Target Start/End: Original strand, 5830 - 6251
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  5830 atcatcagattagagtaaaggcagaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 5929  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaa-tatatgaata-gaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcga 199  Q
    ||||||||||||||| || ||| || ||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||  |||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  5930 tgcgccaggtgtctttattgaaatacatgaataagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcga 6029  T
Q  200 agtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttg-c 298  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||| |||||      
T  6030 agtctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgtgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaa 6129  T
Q  299 gagtgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtc 390  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||        |||||||||| || |||||||||||     
T  6130 ggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttttgtggatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtt 6229  T
Q  391 tttgagattagaagctttcttg 412  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  6230 tttgagattagaagctttcttg 6251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 14273 - 14194
Alignment:
Q  211 gagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtt 290  Q
    |||||||| |||||| ||| ||||||||||||  | ||||| |||||  |||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  14273 gagcatgcagagcatctgaagattgtgttgcaaatattgaaagaaaagaagttgtatgctaagttgtcgaagtgtgagtt 14194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 412
Target Start/End: Original strand, 7885 - 8304
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  7885 atcatcagattagagtaaaggcgaaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 7984  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  7985 tgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttttggtggtgtttatagatgatattttagtgtattcgaag 8084  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttg-cga 300  Q
    || ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||| |||| ||||| | |||| |||||  |     
T  8085 tcggaggaagagcatgttgagcatctgaggattgtgttgcaagttttgaaagagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgtgttttggttgaagg 8184  T
Q  301 gtgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtctt 392  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||        ||||||||||||| ||||||||| | ||    
T  8185 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaatggtggtattgctgtggatccgtctaaggttgatgcagtgttgcagtgggaatctcctaagtctatttt 8284  T
Q  393 tgagattagaagctttcttg 412  Q
    |||||||||||| |||||||    
T  8285 tgagattagaagttttcttg 8304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 7)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 2 - 412
Target Start/End: Original strand, 15291179 - 15291598
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  15291179 atcatcagattagagtaaaggcagaagatatatccaaaactgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 15291278  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| |  ||||||| |||  |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||| |||    
T  15291279 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaataaaatatttcatccttatctggaccattttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaag 15291378  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttg-cga 300  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| || ||| |||| ||||| |||||| |||||  |     
T  15291379 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttgtgcgccaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 15291478  T
Q  301 gtgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtctt 392  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |  ||||||||        |||||||||| || ||||||||||| ||    
T  15291479 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtagatccttccaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 15291578  T
Q  393 tgagattagaagctttcttg 412  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15291579 tgagattagaagctttcttg 15291598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 28 - 412
Target Start/End: Original strand, 12340912 - 12341305
Alignment:
Q  28 gatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaatgcgccaggtgtcttcatggaatata 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12340912 gatatatccaaaaccgcgttccgaacagggaatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtgactaatgcgccaggtgtcttcatggaatata 12341011  T
Q  128 tgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcattt 227  Q
    ||||||| ||||| ||||| || |||||| ||||  ||||| | |||||| ||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  12341012 tgaataggatattccatccttttctggactgttttgtggtaatatttatcgatgatatcttcgtgtatacgaagtcagaggaggagcatgctgagcatct 12341111  T
Q  228 gaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgcgag-tgtgagtttccttggtcatgtgatt 326  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| | ||||||| || || || |||||| |||| || |  || ||||||||||||||| |||||    
T  12341112 gaggattgtgttgcgtgtcttgaaggaaaagaagttgttttctaagctttcaaattgtgagttttggttacgggaagtaagtttccttggtcatatgatt 12341211  T
Q  327 tctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtctttgagattagaagctttcttg 412  Q
    |  |||||||||||||   ||||||| |  | ||||||        ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12341212 ttgaagggtggtattgcgatggatccatcaatggttgatgtagtgttgcagtgggaatcgccgaagtctgtttttgagattagaagctttcttg 12341305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 247 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 14999321 - 14999147
Alignment:
Q  247 ttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgcgagt-gtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttg 345  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||| || ||| |||||   |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14999321 ttgaaggagaatcagttctgtgctaagttgtctaagtgtgaattttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttttg 14999222  T
Q  346 tggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtctttgagattagaagctttcttg 412  Q
    ||||||| |  ||||||||        |||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14999221 tggatccttccaaggttgatgtagtgttgcagtaggagtctcctaagtctgtttttgagattagaagctttcttg 14999147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 247 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 9292841 - 9292667
Alignment:
Q  247 ttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgcgagtg-tgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttg 345  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||||| |||||| |||||   |   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  9292841 ttgaaggagaatcagttatgtgcgaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaaatgactttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctg 9292742  T
Q  346 tggatccgttgaagg--------ttgatgcagtgggaatcacctaagtctgtctttgagattagaagctttcttg 412  Q
    ||||||| |  ||||         || |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9292741 tggatccttcaaaggataatacaatgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgagattagaagctttcttg 9292667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 181 - 301
Target Start/End: Original strand, 8322976 - 8323096
Alignment:
Q  181 gatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcga 280  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||| |  |||||||||| ||  | |||| ||||||| ||||||    
T  8322976 gatattttggtgtattcgaagttggaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattggagatcttgaaggagaagaaattgtatgctaagttgtcga 8323075  T
Q  281 agtgcgagtttgggttgcgag 301  Q
    |||| || ||  |||||||||    
T  8323076 agtgtgatttctggttgcgag 8323096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 290
Target Start/End: Original strand, 44660089 - 44660175
Alignment:
Q  204 tgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtt 290  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||   ||||| ||| ||| ||||||| || |||||    
T  44660089 tgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtgttgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgcaaagttgtcgaaatgtgagtt 44660175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 257
Target Start/End: Original strand, 3262982 - 3263070
Alignment:
Q  169 gtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaa 257  Q
    ||||||||  ||||||||||  | ||||| |||  ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  3262982 gtgtttattgatgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaa 3263070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 371
Target Start/End: Original strand, 7029 - 7395
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7029 atcatcatattagagtgaaggcggaagatatatccaaaacagcgttccaaacgaggtatggacactatgggtattctgtgatgccatttggagtatccaa 7128  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||  |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||     
T  7129 tgcgccaggtatcttcatggaatatatgaatagaatatttcatccttatatggaccgttttgtggtggtgtttatagatgatattttggtgtattcgaaa 7228  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggtt-gcga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||     ||||| | |  ||||||||||| |||||||| |||| |||| |||| ||||  |||||| ||||   |     
T  7229 tctgaggaggagcatgctgagcattt----tttgtgctacgagtcttgaaggagaatcagttatgtgttaagttgtctaagtttgagttttggttatagg 7324  T
Q  301 gtgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttgatgcagtg 371  Q
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  7325 aagtgagtttccttggtcatgtgatttcgaagggtggcattgtcgtggatccgtcaaaggttgatgcagtg 7395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 428
Target Start/End: Original strand, 1908 - 2334
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||    
T  1908 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttctgatcgaggtatggacactatgagtattcggtgatgccatttggagtatctaa 2007  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||  |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||     
T  2008 tgcaccaggtgtcttcatggagtatatgaatagaatatttcatccttatctggactgttttgtggtggtgttcatagatgatattttggtgtattcgaaa 2107  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgcgag 301  Q
    ||||||||          ||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||| |||| ||||| |||||| ||||||| |    
T  2108 tctgagga---------cgagcatttgaggattgtgttgcaagtcttgaaagagaaccagttatgtgcaaagttgtctaagtgtgagttttggttgcggg 2198  T
Q  302 -tgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtctt 392  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||        |||| |||||||| ||||||||||| ||    
T  2199 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttctgtggatccgtctaaggttgatgcggtgttgcaatgggaatctcctaagtctgtttt 2298  T
Q  393 tgagattagaagctttcttgtataggcaggttatta 428  Q
    |||||||||||| |||||||  | ||||||||||||    
T  2299 tgagattagaagttttcttggtttggcaggttatta 2334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 179; Significance: 2e-96; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 2 - 428
Target Start/End: Original strand, 132513 - 132948
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| |||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||    
T  132513 atcatcagattagagtaaaggctgaagatatatcccaaaccgcgttccgaacgagatatggacactatgagtactctgtgatgccatttggagtatctaa 132612  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||| |  |||||| ||||  |||| || |||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  132613 tgcgcccggtgtctttatggaatacatgaatagaatattttatccttatctggactgttttgtggtggtctttatagatgatattttagtgtattcgaag 132712  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttg-cga 300  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| |||||  |     
T  132713 tttgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagttttgaaagagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgaagg 132812  T
Q  301 gtgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtctt 392  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| |  ||||||||        |||||||||| || ||||||||||| ||    
T  132813 aagtgagtttccttggtcatgtgatttctatgggtggtatttctgtggatccttctaaggttgatgcagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgtttt 132912  T
Q  393 tgagattagaagctttcttgtataggcaggttatta 428  Q
    |||||||||||| |||||||  | ||||||||||||    
T  132913 tgagattagaagttttcttggtttggcaggttatta 132948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 179 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 25931 - 25738
Alignment:
Q  179 atgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtc 278  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| || ||| | ||||||||| |  |    
T  25931 atgatattttggtatattcgaaatctgaggaagaacatgctgagcatttgaggattgtgttgcaagatttgaaggagaaccagctatgtgctaagtttcc 25832  T
Q  279 gaagtgcgagtttgggttgc-gagtgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttgatgcagtg 371  Q
     ||||| |||||| |||||| |   || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||    
T  25831 taagtgtgagttttggttgcaggaagtaagtttcattggtcatgtgatttctaagggtggtatttatgtggatccgtctaaggttgatgcagtg 25738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 26041 - 25938
Alignment:
Q  10 attagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaatgcgccag 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  26041 attagagtgaaggcggaagatatatccataaccgcgttccaaacgaagtatggacactatgagtattctgtgatgccatttagagtatgcaatgcgccag 25942  T
Q  110 gtgt 113  Q
    ||||    
T  25941 gtgt 25938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 163; Significance: 6e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 352
Target Start/End: Original strand, 8867 - 9201
Alignment:
Q  19 aaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaatgcgccaggtgtcttca 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |    
T  8867 aaggcggaagatatatccaaaaccgcgtttcgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcaccaggtgtcttta 8966  T
Q  119 tggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgc 218  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||| |  ||||| |||||  || | ||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  8967 tgggatacatgaatagaatatttcatccttatctggatcgttttgtgatggtgttcatagatgatattttggtgtattcaaagtctgaggaagagcatgc 9066  T
Q  219 tgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttg-cgagtgtgagtttccttggt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||  |||| |||| |||| | || ||||| |||||| |||||  |   |||||||||||||||    
T  9067 tgagcatttgaggattgtgttgcaagtattgaaagagaactagttatgtgttaagttatctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggt 9166  T
Q  318 catgtgatttctaagggtggtattgttgtggatcc 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  9167 catgtgatttctaagggtggtatttctgtggatcc 9201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 242
Target Start/End: Original strand, 1645 - 1885
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||  || |||||||||||||| |||||    
T  1645 atcatcagattagagtgaaggcagaagatgtatccaaaaccgcgttccgaacaaggtatggaaactatgagtattccgtaatgccatttggagtttccaa 1744  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaag 201  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  1745 tgcgccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatttcatccttatctggaccgttttgtggtggtgtttatagatgatattttggtgtattcgaag 1844  T
Q  202 tctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgca 242  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1845 tctgaggaagagcatgctgagcatttgaggattgtgttgca 1885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 378 - 107
Alignment:
Q  13 agagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaatgcgccaggtg 112  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  378 agagtgaaggcggaatatatatccaaaatcgcgttccgaacaaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaatgcgccaggtg 279  T
Q  113 tcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagtctgaggagga 212  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||| |  ||| || ||||  |||| ||||||||  |||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||    
T  278 tcttcatagagtatatgaatagaatatttcatccttatctgtactgttttgtggtggtgtttatagatgatattttggggtatttgaaatctgaggaaga 179  T
Q  213 gcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtg 284  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||  |||| ||||||||| |||| |||||    
T  178 gcatgctgagcatttgaggattatgttgcaagtcttgaaggagaactagttatgtgctaagttgtctaagtg 107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 225 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 2323 - 2119
Alignment:
Q  225 tttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgcgagt-gtgagtttccttggtcatgtg 323  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||| |||| ||||| |||||| |||||   |  |||||||| |||||||||||     
T  2323 tttgaggattgtgttgcaagccttgaaggagaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagttttcttggtcatgtt 2224  T
Q  324 atttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttgatgcagtgggaatcacctaagtctgtctttgagattagaagctttcttgtataggcaggt 423  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||  | |||||||    
T  2223 atttctaagggtggtatttctgtggatccttctaaggttgatgcagtgggagtctcctaagtctgtttttgagattagaagttttcttggtttggcaggt 2124  T
Q  424 tatta 428  Q
    |||||    
T  2123 tatta 2119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 7026 - 6888
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  7026 atcatcagattagagtaaaggcggaagatatattcaaaacttcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctgtgatgccatttggagtatctaa 6927  T
Q  102 tgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatt 140  Q
    ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  6926 tgcaccaggtgtctttatggaatacatgaatagaatatt 6888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0635 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0635
Description:

Target: scaffold0635; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 36 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 9143 - 8807
Alignment:
Q  36 caaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaatgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaataga 135  Q
    |||||| || || ||||||| |||||| |||||| | || | ||||||| ||||||| ||  | |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  9143 caaaactgcatttcgaacgaggtatgggcactatgaatactttgtgatgtcatttggtgtgactaatgcgcttggtgtcttcatggaatacatgaataga 9044  T
Q  136 atatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattg 235  Q
    || || ||||| |   |||| |  || ||||| ||||||||  | ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  9043 atcttccatccttatttggatcagtttatggtggtgtttatagacgatatcttgatgtattcgaagtcagaggaggagcatgcagagcatctaaggattg 8944  T
Q  236 tgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgcgag-tgtgagtttccttggtcatgtgatttctaaggg 334  Q
    ||||||||   ||||| || ||| |||||| || |||| |||| ||||| ||||||  |||||| |  ||||||||||||||||||||||| || |  ||    
T  8943 tgttgcatactttgaaagagaataagttgtttgataagttgtcaaagtgtgagttttagttgcgggaagtgagtttccttggtcatgtgatctcgagagg 8844  T
Q  335 tggtattgttgtggatccgttgaaggttgatgcagtg 371  Q
    ||| || || ||||||| ||  |||||||||||||||    
T  8843 tggaatagtagtggatctgtctaaggttgatgcagtg 8807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 2 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 2221 - 2117
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaa 101  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2221 atcatcagattagagtgaaggcggaagatatatccaaaactgtgttccgaacgaggtatggacactatgagtattatgtgatgccatttggagtatctaa 2122  T
Q  102 tgcgc 106  Q
    |||||    
T  2121 tgcgc 2117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 74; Significance: 8e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 247 - 412
Target Start/End: Original strand, 13093 - 13267
Alignment:
Q  247 ttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgcgagt-gtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttg 345  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  13093 ttgaaggagaatcagttgtgtgctaagttgtctaagtgtgagttttggttgcgggaagtgagtttccttggtcatgtgatttcttagggtggtatttctg 13192  T
Q  346 tggatccgttgaaggttgat--------gcagtgggaatcacctaagtctgtctttgagattagaagctttcttg 412  Q
    ||||||| |  |||||||||        |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  13193 tggatccttctaaggttgatgcagtgtggcagtgggaatctcctaagtctgtttttgagattagaagttttcttg 13267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 225 - 425
Target Start/End: Original strand, 25024 - 25233
Alignment:
Q  225 tttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgcgagt-gtgagtttccttggtcatgtg 323  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||| | || ||||| || ||| |||||   |  |||||||||||||||||||||    
T  25024 tttgaggattgtgttgcaagtcttgaaggagaaccagttatgtgcaaagttatctaagtgtgaattttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtg 25123  T
Q  324 atttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttgatgcagtg-------ggaa-tcacctaagtctgtctttgagattagaagctttcttgtat 415  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||||||       |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  25124 atttctaagggtggtatttctgtggatccttctaaggttgatgcagtgttgcagtggaagtctcctaagtctgtttttgagattagaagctttcttggat 25223  T
Q  416 aggcaggtta 425  Q
     || ||||||    
T  25224 tggtaggtta 25233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 246 - 412
Target Start/End: Original strand, 54210 - 54385
Alignment:
Q  246 cttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgcgagt-gtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgtt 344  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||| |||||| |||||   |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  54210 cttgaaggagaatcagttgtgtgctaagttatctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaatggtggtattttt 54309  T
Q  345 gtggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtctttgagattagaagctttcttg 412  Q
    |||||||| |  ||||||||        ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  54310 gtggatccttctaaggttgatgcagtgttgcagtgggaatctcctaagtctgtttttgagattagaagttttcttg 54385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1486 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1486
Description:

Target: scaffold1486; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 246 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 212 - 37
Alignment:
Q  246 cttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgcgagt-gtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgtt 344  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | || ||||| |||||| |||||   |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  212 cttgaaggagaatcagttgtgtgctaagttatctaagtgtgagttttggttgaaggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaaaggtggtatttat 113  T
Q  345 gtggatccgttgaaggttgatgc--------agtgggaatcacctaagtctgtctttgagattagaagctttcttg 412  Q
    |||||||| |  |||||||||||        |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  112 gtggatccttctaaggttgatgcagtgttgcagtgggaatctcctaagtctgtttttgagattagaagttttcttg 37  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 247 - 404
Target Start/End: Original strand, 10979 - 11145
Alignment:
Q  247 ttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgc-gagtgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttg 345  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||| |||||  | | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  10979 ttgaaggaaaaccagttatgtgctaagttgtctaagtgcgaattttggttgaagggagtgattttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttatg 11078  T
Q  346 tggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtctttgagattagaag 404  Q
    ||||||| |  ||||||||        ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11079 tggatccttctaaggttgacgcagtgttgcagtgggaatctcctaagtctgtttttgagattagaag 11145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 303 - 425
Target Start/End: Original strand, 104899 - 105029
Alignment:
Q  303 gtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggt--------tgatgcagtgggaatcacctaagtctgtctttg 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||        || ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  104899 gtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttatgtggatccgtctaaggtttatgcagtgttgcagtgggaatctcctaagtctgtttttg 104998  T
Q  395 agattagaagctttcttgtataggcaggtta 425  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||    
T  104999 agattagaagcttccttggattggcaggtta 105029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 247 - 425
Target Start/End: Original strand, 46682 - 46869
Alignment:
Q  247 ttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgcgagt-gtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttg 345  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| || ||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    |    
T  46682 ttgaaggagaatcaattgtgtgctaagttgtctaagtgtgaattttggttgcgggaagtgagtttccttggtcatgtgatttctaagagtggtatctccg 46781  T
Q  346 tggatccgttgaaggt--------tgatgcagtgggaatcacctaagtctgtctttgagattagaagctttcttgtataggcaggtta 425  Q
    |||||||||  || ||        || ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||  | |||||||||    
T  46782 tggatccgtctaaagttgtggcagtgttgcagtgggaatctcctaggtctgtttttgagattagaagttttcttggtttggcaggtta 46869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 303 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 181904 - 181791
Alignment:
Q  303 gtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttga--------tgcagtgggaatcacctaagtctgtctttg 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |  ||||||||        |||||||||| || ||||||||||| |||     
T  181904 gtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtatttatgtggatccttctaaggttgatgtagtgttgcagtgggagtctcctaagtctgttttta 181805  T
Q  395 agattagaagcttt 408  Q
    ||||||||||||||    
T  181804 agattagaagcttt 181791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 100 - 251
Target Start/End: Original strand, 24655 - 24806
Alignment:
Q  100 aatgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcga 199  Q
    |||||||||||||| || ||||| || |||||| | || |||||| | ||  |||| |||||| |||| ||||| ||| ||||||||||| | || ||||    
T  24655 aatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggaacgtttcgtggttgtgttcatcgatgatattttgatatactcga 24754  T
Q  200 agtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaa 251  Q
    || |||| || || |||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||    
T  24755 agactgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgcaagtgttgaa 24806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0719 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0719
Description:

Target: scaffold0719; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 4847 - 4785
Alignment:
Q  24 ggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtatggacactataagtattatgtgatgcc 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  4847 ggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgaggtatggacactatgagtattctatgatgcc 4785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 164 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 76543 - 76335
Alignment:
Q  164 tggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagtt 263  Q
    |||||||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| | ||  || |||||||    || ||| | ||  ||||    
T  76543 tggtagtgtttatagacgatatcttggtgtattcaaagtcagaggaggagcatgttgagcatcttagagttatgttgcacacttttaagaagaagaagtt 76444  T
Q  264 gtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgcgag-tgtgagtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggtt 362  Q
    || ||||||| | |||||||| |||||| || |||| |  |||||||| ||| || |||||||||| | ||||||||| |  |||||||||| |||||||    
T  76443 gtttgctaagttttcgaagtgtgagttttggctgcgggaagtgagttttcttagttatgtgatttcgatgggtggtatagcagtggatccgtcgaaggtt 76344  T
Q  363 gatgcagtg 371  Q
    |||| ||||    
T  76343 gatgtagtg 76335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 247 - 317
Target Start/End: Original strand, 34670 - 34741
Alignment:
Q  247 ttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggttgcgag-tgtgagtttccttggt 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  34670 ttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagtagtcgaagtgcgagttttggttgcaagaagtgagtttccttggt 34741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 306 - 412
Target Start/End: Complemental strand, 2964 - 2850
Alignment:
Q  306 agtttccttggtcatgtgatttctaagggtggtattgttgtggatccgttgaaggttgatgc--------agtgggaatcacctaagtctgtctttgaga 397  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||        ||||| |||| || |||||||| |||||||    
T  2964 agttttcttcgtcttgtgatttcgaagggtggtattgcggtggatccgtcgaaggttgatgcagtgttgcagtggaaatcgccgaagtctgtatttgaga 2865  T
Q  398 ttagaagctttcttg 412  Q
    |||||||||||||||    
T  2864 ttagaagctttcttg 2850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 14643 - 14510
Alignment:
Q  109 ggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagtctgagg 208  Q
    ||||| || |||||||| |||||| |||| |||||| | ||  |||| |||||| |||| ||||| ||| | ||||||||| | || |||||||| || |    
T  14643 ggtgtgtttatggaatacatgaatcgaatttttcatgcgtttttggatcgtttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatatactcgaagtccgaag 14544  T
Q  209 aggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgca 242  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  14543 aagagcatgctgagcatttgaagattgttttgca 14510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 290
Target Start/End: Original strand, 31505 - 31631
Alignment:
Q  164 tggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagtt 263  Q
    |||| ||||||||  |||||||| || | ||||| ||| |||| ||||||||||| |||||| ||| |||| | ||||| |||||||| |||||  ||||    
T  31505 tggtggtgtttattgatgatattctgatttattctaagactgaagaggagcatgcagagcatctgaagattatattgcaagtcttgaaagaaaagaagtt 31604  T
Q  264 gtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtt 290  Q
    || ||| |||||||| ||||| |||||    
T  31605 gtatgcaaagctgtcaaagtgtgagtt 31631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 24334 - 24208
Alignment:
Q  164 tggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagtt 263  Q
    |||| ||||||||  |||||||| || | ||||| ||| |||| ||||||||||| || ||| ||| |||||||||||| || || || |||||  ||||    
T  24334 tggttgtgtttattgatgatattctgatttattctaagactgaagaggagcatgcagaacatctgaagattgtgttgcaagtattaaaagaaaagaagtt 24235  T
Q  264 gtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtt 290  Q
    || ||||||| |||||||||| |||||    
T  24234 gtatgctaagttgtcgaagtgtgagtt 24208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 103459 - 103275
Alignment:
Q  58 tatggacactataagtattatgtgatgccatttggagtatccaatgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggacc 157  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||| || || ||  | |||||||||||||| || ||||| |  |||||| | || |||||| | ||  |||| |    
T  103459 tatggacactatgagtataaagtgatgcctttcggtgttgcaaatgcgccaggtgtgtttatggagtgcatgaatcgcatttttcatgcatttttggatc 103360  T
Q  158 gtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgca 242  Q
    ||||| ||||||| || ||| ||||||||||| | || || ||||||||||| || ||||| || ||||||| || ||| |||||    
T  103359 gtttcgtggtagtattcatcgatgatattttgatttactccaagtctgaggaagaacatgccgaacatttgaagactgttttgca 103275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 60
Target Start/End: Original strand, 13649 - 13707
Alignment:
Q  2 atcatcatattagagcgaaggcggaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgacgtat 60  Q
    ||||||| |||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13649 atcatcagattacagtgaaggcaaaagatatatccaaaaccgcgttccgaacgaggtat 13707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1646 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1646
Description:

Target: scaffold1646; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 103 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 1505 - 1312
Alignment:
Q  103 gcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagt 202  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||  |||| |||||| | || |||||    ||| ||||||| || ||  ||||||||||  | ||||| |||     
T  1505 gcgcctggtgtgttcatggagtatatgaaccgaatttttcatgcttttctggataaattcgtggtagtattcattgatgatattttaatttattctaaga 1406  T
Q  203 ctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggtt 296  Q
    |||| ||||||||||| || ||| |||||||||| || || || ||||| |||||  |||||| ||||||  |||| || ||||||||| ||||    
T  1405 ctgaagaggagcatgcagaacatctgaggattgtattacaggttttgaaagaaaagaagttgtatgctaaattgtcaaaatgcgagttttggtt 1312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 169 - 290
Target Start/End: Original strand, 14904 - 15025
Alignment:
Q  169 gtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtg 268  Q
    ||||||||  ||||||||||  | ||||| |||  ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || |||||||||||   ||||| ||    
T  14904 gtgtttattgatgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatg 15003  T
Q  269 ctaagctgtcgaagtgcgagtt 290  Q
    | ||| ||||||| || |||||    
T  15004 caaagttgtcgaaatgtgagtt 15025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 193 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 250711 - 250614
Alignment:
Q  193 tattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtt 290  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||| || |||||||||||   ||||| ||||||| ||||||| || |||||    
T  250711 tattctaagactgaagaggagcatgcagagcatctgaagattgtattgcaagtgttgaaggaaaagaggttgtatgctaagttgtcgaaatgtgagtt 250614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 284
Target Start/End: Original strand, 9156 - 9340
Alignment:
Q  100 aatgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcga 199  Q
    |||||||||||||| || ||||| || |||||| | || |||||| | |   | || |||||| |||| ||||| ||  ||||||||||| | || || |    
T  9156 aatgcgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcgtatttagatcgtttcgtggttgtgttcatggatgatattttgatatactcta 9255  T
Q  200 agtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtg 284  Q
    ||||||| || || |||| |||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||  |||| | ||| |||||||| |||||    
T  9256 agtctgaagaagaacatgttgagcatttgaggattgttttgcaagtgctgaaggagaagaagttatatgccaagctgtcaaagtg 9340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 296
Target Start/End: Original strand, 79953 - 80149
Alignment:
Q  100 aatgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcga 199  Q
    |||||||  ||||| |||||||| |||||||| || || |||||| | ||||||||    ||  ||||||| || ||  ||||||||||  | ||||| |    
T  79953 aatgcgcttggtgtgttcatggagtatatgaacaggatttttcatgctttcctggataagtttgtggtagtattcattgatgatattttaatttattcta 80052  T
Q  200 agtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtttgggtt 296  Q
    || |||| |||||||||||  ||||| |||||||||| || || || ||||| |||||  |||||| ||||||  |||| || ||||||||| ||||    
T  80053 agactgaagaggagcatgcaaagcatctgaggattgtattacaggttttgaaagaaaagaagttgtatgctaaattgtcaaaatgcgagttttggtt 80149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 114743 - 114699
Alignment:
Q  100 aatgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcat 144  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  114743 aatgcgcctggtgtgttcatggaatatatgaatagaatttttcat 114699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 169 - 257
Target Start/End: Original strand, 40524 - 40612
Alignment:
Q  169 gtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaa 257  Q
    ||||||||  ||||||||||  | ||||| |||  ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  40524 gtgtttattgatgatattttaatctattccaagaatgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaa 40612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 104 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 4094 - 3956
Alignment:
Q  104 cgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagtc 203  Q
    |||||||||| || ||||| || |||||| | || |||||| | ||  |||| |||||| |||| ||||| ||| | ||||||||| | || || ||| |    
T  4094 cgccaggtgtgtttatggagtacatgaatcgtatttttcatgcatttttggatcgtttcgtggttgtgttcatcgacgatattttgatatactccaagac 3995  T
Q  204 tgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgca 242  Q
    ||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  3994 tgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgtattgca 3956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 25218 - 25155
Alignment:
Q  179 atgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgca 242  Q
    ||||||||||| | ||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
T  25218 atgatattttgatttattctaagactgaagaggagcatgcagagcacttgaagattgtgttgca 25155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 251
Target Start/End: Original strand, 7209 - 7360
Alignment:
Q  100 aatgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcga 199  Q
    ||||| || ||||| || ||||| || |||||| |||| |||||| | ||  |||| ||||||||||| || || ||| |||| |||||||| || || |    
T  7209 aatgcacctggtgtgtttatggagtacatgaatcgaatctttcatgcatttttggatcgtttcatggttgtattcatcgatgacattttggtttactcca 7308  T
Q  200 agtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaa 251  Q
    || |||| || || |||||||||||||||| || ||| ||||| || |||||    
T  7309 agactgaagaagaacatgctgagcatttgaagactgttttgcaagtgttgaa 7360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 290
Target Start/End: Original strand, 50413 - 50492
Alignment:
Q  211 gagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtt 290  Q
    |||||||| || ||| ||| |||||||||||| || ||||| || ||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  50413 gagcatgcggaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgcgagtt 50492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 290
Target Start/End: Original strand, 59447 - 59526
Alignment:
Q  211 gagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtt 290  Q
    |||||||| || ||| ||| |||||||||||| || ||||| || ||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  59447 gagcatgcggaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgcgagtt 59526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 290
Target Start/End: Original strand, 65835 - 65914
Alignment:
Q  211 gagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtt 290  Q
    |||||||| || ||| ||| |||||||||||| || ||||| || ||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  65835 gagcatgcggaacatctgaagattgtgttgcaagtgttgaaagagaaaaagttgtatgctaagttgtcgaagtgcgagtt 65914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 242
Target Start/End: Original strand, 10923 - 11005
Alignment:
Q  160 ttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgca 242  Q
    |||||||| ||||| ||  ||||||||||| | || || ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10923 ttcatggttgtgttcattgatgatattttgatatactctaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaggattgtcttgca 11005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 242
Target Start/End: Original strand, 17115 - 17197
Alignment:
Q  160 ttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgca 242  Q
    |||||||| ||||| ||  ||||||||||| | || || ||| |||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17115 ttcatggttgtgttcattgatgatattttgatatactctaagactgaagaagaacatgctgagcatttgaggattgtcttgca 17197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 495202 - 495060
Alignment:
Q  100 aatgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcga 199  Q
    |||||||||||||| || || || || |||||| | || |||||| | ||  |||| |||||  |||| ||||| ||| | ||||||||| | || ||||    
T  495202 aatgcgccaggtgtgtttattgagtacatgaatcgtatttttcatgcgtttttggatcgttttgtggttgtgttcatcgacgatattttgatatactcga 495103  T
Q  200 agtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgca 242  Q
    ||||||| || || ||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  495102 agtctgaagaagaacatgctgagtatttgaagattgttttgca 495060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 9152 - 9055
Alignment:
Q  193 tattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaatcagttgtgtgctaagctgtcgaagtgcgagtt 290  Q
    ||||| ||| |||| || |||||||| || ||| ||| ||||||||| || || ||||| || ||  |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  9152 tattcaaagactgaagaagagcatgcagaacatctgaagattgtgttacaagttttgaaagagaaaaagttgtgtgctaagttgtcgaagtgtgagtt 9055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 251
Target Start/End: Original strand, 11379 - 11512
Alignment:
Q  118 atggaatatatgaatagaatatttcatcccttcctggaccgtttcatggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatg 217  Q
    ||||| ||||||||| | || || ||| ||||  |||| || ||| |||| ||||||||| ||||||||||| | || || ||| |||| || || ||||    
T  11379 atggagtatatgaatcgcatcttccatgcctttttggatcggttcgtggtggtgtttatcgatgatattttgatttactccaagactgaagaagaacatg 11478  T
Q  218 ctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaa 251  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||| || |||||    
T  11479 ctgagcatctgaagattgtcttgcaagtgttgaa 11512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0062 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0062
Description:

Target: scaffold0062; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 204 - 257
Target Start/End: Original strand, 9009 - 9062
Alignment:
Q  204 tgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgcatgtcttgaaggaaaa 257  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || |||||||||||    
T  9009 tgaggaggagcatgcagagcatctgagaattgtattgcaagtgttgaaggaaaa 9062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 169 - 242
Target Start/End: Original strand, 115172 - 115245
Alignment:
Q  169 gtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgtgttgca 242  Q
    ||||| ||| ||||||||||| | || || |||||||| || || |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  115172 gtgttcatcgatgatattttgatatactctaagtctgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgttttgca 115245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 100 - 144
Target Start/End: Original strand, 123 - 167
Alignment:
Q  100 aatgcgccaggtgtcttcatggaatatatgaatagaatatttcat 144  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  123 aatgcgcctggtgtgttcatggagtatatgaatagaatttttcat 167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 5991 - 5919
Alignment:
Q  164 tggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgt 236  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||| | || |||||||| || || || |||||||||||||||| ||||||    
T  5991 tggttgtgttcatcgatgatattttgatatactcgaagtccgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgt 5919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 164 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 13121 - 13049
Alignment:
Q  164 tggtagtgtttatcaatgatattttggtgtattcgaagtctgaggaggagcatgctgagcatttgaggattgt 236  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||| | || |||||||| || || || |||||||||||||||| ||||||    
T  13121 tggttgtgttcatcgatgatattttgatatactcgaagtccgaagaagaacatgctgagcatttgaagattgt 13049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 3115 times since January 2019
Visitors: 4805