View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0760_low_2 (Length: 713)

Name: NF0760_low_2
Description: NF0760
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0760_low_2
NF0760_low_2
[»] chr7 (39 HSPs)
chr7 (13-680)||(13833625-13834298)
chr7 (13-678)||(27974006-27974691)
chr7 (13-678)||(566965-567646)
chr7 (39-678)||(29024325-29024951)
chr7 (13-512)||(4949641-4950146)
chr7 (39-382)||(27436160-27436510)
chr7 (13-403)||(5207177-5207579)
chr7 (432-678)||(27436511-27436757)
chr7 (415-678)||(5206887-5207150)
chr7 (13-352)||(8812594-8812937)
chr7 (13-155)||(1900166-1900309)
chr7 (531-666)||(38412256-38412391)
chr7 (13-154)||(13491232-13491371)
chr7 (21-452)||(12586519-12586955)
chr7 (39-157)||(15186452-15186571)
chr7 (39-157)||(29082879-29082998)
chr7 (39-157)||(16146569-16146688)
chr7 (13-155)||(13268539-13268681)
chr7 (13-400)||(840315-840693)
chr7 (13-400)||(847491-847869)
chr7 (13-400)||(1205495-1205873)
chr7 (13-111)||(34136937-34137035)
chr7 (23-155)||(23884753-23884885)
chr7 (130-402)||(4829916-4830193)
chr7 (524-656)||(3428700-3428832)
chr7 (232-475)||(1959468-1959706)
chr7 (543-636)||(12587035-12587128)
chr7 (13-155)||(804909-805054)
chr7 (13-81)||(16270644-16270710)
chr7 (223-280)||(16270442-16270498)
chr7 (13-92)||(3430724-3430803)
chr7 (214-334)||(23884567-23884692)
chr7 (32-85)||(16228645-16228699)
chr7 (13-61)||(9463104-9463151)
chr7 (13-61)||(16400050-16400097)
chr7 (13-61)||(30376543-30376590)
chr7 (415-452)||(803203-803240)
chr7 (415-452)||(16292070-16292107)
chr7 (416-461)||(34136598-34136643)
[»] chr2 (26 HSPs)
chr2 (13-678)||(15950317-15950986)
chr2 (13-678)||(24287742-24288385)
chr2 (13-682)||(35140749-35141426)
chr2 (13-678)||(42571801-42572479)
chr2 (13-678)||(21857383-21858050)
chr2 (13-678)||(16275554-16276245)
chr2 (13-489)||(25493980-25494466)
chr2 (20-369)||(21112150-21112506)
chr2 (13-403)||(3764018-3764418)
chr2 (415-678)||(3763728-3763991)
chr2 (13-155)||(26730967-26731110)
chr2 (13-155)||(34541156-34541299)
chr2 (201-403)||(30691456-30691664)
chr2 (37-148)||(24701129-24701241)
chr2 (13-136)||(40388514-40388637)
chr2 (37-148)||(24692290-24692402)
chr2 (13-113)||(21767056-21767154)
chr2 (202-280)||(24701289-24701366)
chr2 (91-157)||(42386963-42387029)
chr2 (202-280)||(24692449-24692526)
chr2 (415-461)||(24692661-24692707)
chr2 (123-154)||(12377267-12377298)
chr2 (77-140)||(20278855-20278918)
chr2 (415-461)||(24701501-24701547)
chr2 (417-461)||(19990255-19990297)
chr2 (39-68)||(42386926-42386955)
[»] chr8 (20 HSPs)
chr8 (13-678)||(39842868-39843531)
chr8 (13-678)||(17680211-17680876)
chr8 (13-677)||(6665875-6666544)
chr8 (13-258)||(6673537-6673777)
chr8 (13-155)||(16761728-16761871)
chr8 (13-155)||(19837545-19837686)
chr8 (13-352)||(20735863-20736209)
chr8 (13-155)||(20740901-20741043)
chr8 (13-352)||(20744421-20744767)
chr8 (32-192)||(22104942-22105104)
chr8 (13-149)||(32001904-32002040)
chr8 (13-152)||(22160921-22161060)
chr8 (13-136)||(23917521-23917644)
chr8 (20-399)||(24709061-24709436)
chr8 (13-111)||(25857102-25857200)
chr8 (214-352)||(22160721-22160856)
chr8 (255-352)||(20741148-20741251)
chr8 (415-456)||(32002307-32002348)
chr8 (415-461)||(25856759-25856805)
chr8 (288-350)||(25856869-25856930)
[»] chr3 (58 HSPs)
chr3 (13-682)||(41000421-41001098)
chr3 (13-682)||(41009203-41009880)
chr3 (13-682)||(8202817-8203499)
chr3 (13-678)||(25265673-25266342)
chr3 (84-666)||(17928027-17928609)
chr3 (39-678)||(10719996-10720658)
chr3 (13-403)||(9552601-9552993)
chr3 (11-314)||(15682786-15683093)
chr3 (13-352)||(14420436-14420777)
chr3 (21-668)||(3242630-3243272)
chr3 (432-678)||(15682448-15682694)
chr3 (23-344)||(8608327-8608652)
chr3 (13-155)||(15697794-15697936)
chr3 (13-155)||(12557195-12557336)
chr3 (13-345)||(30093459-30093798)
chr3 (13-333)||(11183583-11183903)
chr3 (13-351)||(14885413-14885754)
chr3 (32-155)||(14890876-14891000)
chr3 (13-155)||(18881266-18881408)
chr3 (23-352)||(12477128-12477456)
chr3 (32-461)||(70314-70729)
chr3 (13-157)||(7095802-7095946)
chr3 (13-461)||(15622593-15623041)
chr3 (13-352)||(23285736-23286071)
chr3 (416-643)||(27881584-27881810)
chr3 (23-280)||(8806485-8806741)
chr3 (23-187)||(15912056-15912220)
chr3 (23-155)||(21609933-21610065)
chr3 (13-155)||(18960552-18960683)
chr3 (613-682)||(9552489-9552558)
chr3 (13-136)||(13109591-13109714)
chr3 (13-155)||(15599553-15599688)
chr3 (13-352)||(6196558-6196889)
chr3 (13-106)||(8618616-8618708)
chr3 (13-106)||(15535066-15535158)
chr3 (13-106)||(46398513-46398605)
chr3 (524-656)||(3679627-3679759)
chr3 (524-656)||(30016197-30016329)
chr3 (32-86)||(17919962-17920016)
chr3 (13-113)||(6970197-6970295)
chr3 (214-352)||(33568206-33568341)
chr3 (202-334)||(21610113-21610250)
chr3 (13-92)||(30014230-30014309)
chr3 (13-155)||(41433823-41433968)
chr3 (415-461)||(12477020-12477066)
chr3 (415-461)||(14885303-14885349)
chr3 (13-92)||(3677659-3677738)
chr3 (32-68)||(4436511-4436547)
chr3 (13-92)||(20436660-20436739)
chr3 (493-609)||(26384076-26384192)
chr3 (13-61)||(46373802-46373849)
chr3 (202-257)||(14396298-14396353)
chr3 (39-85)||(24215391-24215438)
chr3 (415-461)||(8806886-8806932)
chr3 (284-345)||(8618870-8618929)
chr3 (416-461)||(14420843-14420888)
chr3 (415-452)||(20438484-20438521)
chr3 (415-452)||(41435649-41435686)
[»] chr1 (22 HSPs)
chr1 (13-682)||(31542081-31542758)
chr1 (13-678)||(2387295-2387963)
chr1 (32-678)||(13470882-13471530)
chr1 (13-314)||(31554281-31554592)
chr1 (433-678)||(31554693-31554938)
chr1 (13-155)||(13452956-13453098)
chr1 (23-352)||(22430075-22430404)
chr1 (32-403)||(1957985-1958356)
chr1 (11-280)||(14817945-14818202)
chr1 (20-106)||(2341525-2341610)
chr1 (32-128)||(19370984-19371081)
chr1 (13-325)||(6202787-6203100)
chr1 (214-333)||(19371138-19371260)
chr1 (113-461)||(35071822-35072165)
chr1 (13-160)||(27168225-27168373)
chr1 (415-461)||(6202651-6202697)
chr1 (214-280)||(2341361-2341427)
chr1 (415-461)||(14817763-14817809)
chr1 (32-85)||(22473489-22473543)
chr1 (13-61)||(5635719-5635766)
chr1 (415-461)||(22430466-22430512)
chr1 (415-452)||(19371337-19371374)
[»] chr5 (47 HSPs)
chr5 (13-682)||(24962560-24963236)
chr5 (13-678)||(21993638-21994291)
chr5 (13-403)||(20378632-20379025)
chr5 (445-678)||(28846480-28846712)
chr5 (13-403)||(28846073-28846460)
chr5 (254-678)||(23638462-23638889)
chr5 (254-678)||(23833998-23834427)
chr5 (13-274)||(21866131-21866389)
chr5 (415-678)||(12178351-12178616)
chr5 (415-678)||(27231425-27231688)
chr5 (13-403)||(12178647-12179047)
chr5 (13-403)||(33842911-33843311)
chr5 (13-403)||(26087416-26087816)
chr5 (13-403)||(11811500-11811901)
chr5 (415-678)||(33842621-33842884)
chr5 (415-678)||(26087120-26087383)
chr5 (415-678)||(11811197-11811460)
chr5 (20-259)||(23638203-23638439)
chr5 (20-259)||(23834451-23834687)
chr5 (13-309)||(22956781-22957078)
chr5 (13-270)||(27231843-27232101)
chr5 (13-350)||(29895244-29895576)
chr5 (59-352)||(20097251-20097550)
chr5 (13-352)||(25528337-25528673)
chr5 (13-155)||(36450393-36450535)
chr5 (13-400)||(26871190-26871568)
chr5 (13-280)||(7259793-7260060)
chr5 (13-106)||(1800288-1800380)
chr5 (13-106)||(12393443-12393535)
chr5 (13-106)||(21690733-21690825)
chr5 (13-117)||(29890230-29890334)
chr5 (524-656)||(37580755-37580887)
chr5 (32-155)||(358860-358983)
chr5 (13-88)||(20395672-20395746)
chr5 (415-461)||(7259625-7259671)
chr5 (416-473)||(21865921-21865978)
chr5 (21-64)||(37578782-37578825)
chr5 (415-461)||(29895640-29895686)
chr5 (13-61)||(15791307-15791354)
chr5 (13-61)||(36382575-36382622)
chr5 (13-61)||(37007247-37007294)
chr5 (415-461)||(22956632-22956678)
chr5 (415-461)||(25528734-25528780)
chr5 (288-345)||(7789240-7789295)
chr5 (288-345)||(12393225-12393280)
chr5 (284-325)||(21690984-21691024)
chr5 (415-452)||(34464032-34464069)
[»] chr6 (33 HSPs)
chr6 (34-682)||(25503768-25504426)
chr6 (13-678)||(16636282-16636956)
chr6 (13-403)||(28269987-28270386)
chr6 (13-403)||(28348737-28349136)
chr6 (13-403)||(28304954-28305355)
chr6 (13-403)||(27056372-27056773)
chr6 (536-682)||(5006783-5006929)
chr6 (415-678)||(27056064-27056327)
chr6 (13-344)||(22326025-22326361)
chr6 (13-352)||(620927-621270)
chr6 (13-155)||(27538305-27538448)
chr6 (13-352)||(27071864-27072204)
chr6 (13-155)||(25700474-25700616)
chr6 (32-352)||(19715822-19716143)
chr6 (13-157)||(18219274-18219418)
chr6 (23-155)||(20056100-20056231)
chr6 (39-157)||(18112836-18112955)
chr6 (32-352)||(20457035-20457358)
chr6 (13-157)||(23981842-23981986)
chr6 (13-155)||(3694321-3694465)
chr6 (13-106)||(27512121-27512213)
chr6 (39-111)||(22777010-22777082)
chr6 (214-317)||(27512302-27512407)
chr6 (13-106)||(16823023-16823115)
chr6 (34-86)||(18911256-18911308)
chr6 (218-280)||(20055967-20056028)
chr6 (39-155)||(28266931-28267047)
chr6 (39-155)||(28345680-28345796)
chr6 (245-345)||(22776802-22776905)
chr6 (13-61)||(9143000-9143047)
chr6 (415-461)||(18946917-18946963)
chr6 (415-461)||(27071751-27071797)
chr6 (288-345)||(20045665-20045720)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (13-666)||(73906-74566)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (13-678)||(1849-2516)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (13-402)||(12103-12491)
scaffold0056 (499-678)||(12567-12746)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (13-473)||(144300-144762)
scaffold0023 (13-241)||(131477-131706)
[»] scaffold0605 (1 HSPs)
scaffold0605 (13-462)||(6752-7217)
[»] chr4 (35 HSPs)
chr4 (419-678)||(21528930-21529189)
chr4 (445-678)||(8100380-8100612)
chr4 (13-403)||(21529217-21529586)
chr4 (13-403)||(8100633-8101020)
chr4 (39-314)||(26218314-26218595)
chr4 (432-678)||(26217977-26218224)
chr4 (13-149)||(3386336-3386471)
chr4 (13-157)||(14736116-14736260)
chr4 (13-155)||(1888796-1888938)
chr4 (13-352)||(20556056-20556393)
chr4 (13-280)||(16725868-16726133)
chr4 (20-352)||(14883695-14884022)
chr4 (493-677)||(12510293-12510477)
chr4 (13-352)||(15900530-15900867)
chr4 (13-155)||(3841888-3842030)
chr4 (38-101)||(9187022-9187085)
chr4 (578-668)||(12511465-12511555)
chr4 (13-106)||(18038434-18038526)
chr4 (13-106)||(22706146-22706238)
chr4 (222-344)||(15077321-15077447)
chr4 (578-668)||(12511038-12511128)
chr4 (214-317)||(18038616-18038721)
chr4 (13-352)||(15079619-15079961)
chr4 (218-403)||(3359573-3359761)
chr4 (36-136)||(17304043-17304144)
chr4 (214-280)||(3841764-3841828)
chr4 (415-461)||(14919898-14919944)
chr4 (418-461)||(16725687-16725730)
chr4 (415-461)||(3386030-3386076)
chr4 (543-656)||(15077014-15077127)
chr4 (39-106)||(10787570-10787637)
chr4 (415-461)||(9187384-9187430)
chr4 (13-59)||(23994001-23994047)
chr4 (416-461)||(20556457-20556502)
chr4 (284-325)||(22706397-22706437)
[»] scaffold2162 (2 HSPs)
scaffold2162 (415-678)||(452-715)
scaffold2162 (13-403)||(5-407)
[»] scaffold0582 (1 HSPs)
scaffold0582 (21-403)||(4881-5268)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (36-352)||(192297-192620)
scaffold0004 (543-653)||(192001-192111)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (13-345)||(19394-19728)
scaffold0019 (415-461)||(18481-18527)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (13-352)||(17178-17520)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (13-321)||(30575-30886)
[»] scaffold0551 (3 HSPs)
scaffold0551 (13-344)||(5047-5385)
scaffold0551 (415-461)||(4929-4975)
scaffold0551 (415-461)||(11043-11089)
[»] scaffold1818 (1 HSPs)
scaffold1818 (13-155)||(92-234)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (37-461)||(31033-31463)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (23-349)||(10309-10630)
scaffold0138 (594-669)||(10861-10936)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (13-155)||(8459-8601)
scaffold0357 (219-352)||(8665-8804)
scaffold0357 (415-461)||(8869-8915)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (23-280)||(31714-31970)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (13-155)||(2430-2574)
[»] scaffold0320 (2 HSPs)
scaffold0320 (23-155)||(4146-4278)
scaffold0320 (214-352)||(3947-4090)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (32-155)||(20756-20880)
[»] scaffold0306 (1 HSPs)
scaffold0306 (13-352)||(17784-18122)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (13-156)||(38679-38815)
[»] scaffold0478 (3 HSPs)
scaffold0478 (23-152)||(314-443)
scaffold0478 (415-456)||(2-43)
scaffold0478 (218-344)||(115-246)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (13-345)||(98758-99089)
[»] scaffold0441 (1 HSPs)
scaffold0441 (13-155)||(9183-9326)
[»] scaffold0157 (2 HSPs)
scaffold0157 (493-677)||(10000-10184)
scaffold0157 (578-668)||(9352-9442)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (36-160)||(301177-301297)
scaffold0005 (498-636)||(301586-301724)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (21-193)||(11374-11545)
scaffold0125 (543-613)||(11857-11926)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (13-155)||(8134-8270)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (21-155)||(16685-16811)
scaffold0243 (418-461)||(17062-17105)
[»] scaffold0362 (2 HSPs)
scaffold0362 (23-155)||(1872-1998)
scaffold0362 (522-668)||(1382-1528)
[»] scaffold0202 (1 HSPs)
scaffold0202 (214-352)||(25380-25522)
[»] scaffold0435 (2 HSPs)
scaffold0435 (23-106)||(14601-14684)
scaffold0435 (415-455)||(14277-14317)
[»] scaffold0393 (2 HSPs)
scaffold0393 (222-352)||(3834-3968)
scaffold0393 (13-155)||(3626-3768)
[»] scaffold0364 (2 HSPs)
scaffold0364 (13-155)||(291-433)
scaffold0364 (288-352)||(96-159)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (13-106)||(23085-23177)
scaffold0068 (288-325)||(22886-22922)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (222-461)||(37076-37319)
scaffold0104 (23-101)||(37438-37516)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (23-155)||(208-340)
[»] scaffold0866 (1 HSPs)
scaffold0866 (13-113)||(4586-4684)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (13-101)||(299420-299507)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (214-353)||(33885-34029)
[»] scaffold0014 (3 HSPs)
scaffold0014 (13-160)||(185841-185989)
scaffold0014 (543-613)||(184024-184094)
scaffold0014 (415-452)||(184177-184214)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (590-649)||(29015-29074)
scaffold0031 (13-155)||(29511-29653)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (32-85)||(84320-84374)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (214-280)||(152039-152104)
[»] scaffold0782 (1 HSPs)
scaffold0782 (415-452)||(5901-5938)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 461; Significance: 0; HSPs: 39)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 461; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 680
Target Start/End: Original strand, 13833625 - 13834298
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13833625 agaacccgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtctttaccaagtggcgttgttatccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 13833724  T
Q  113 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgg 212  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||       ||||||| ||||    
T  13833725 atgtactttataataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactttttccatcaaaaa-ttgaaggacttagacaagttttttgcaaacattatgg 13833823  T
Q  213 gtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgtactctttccttggtttcgttcttaccttt 312  Q
     ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13833824 atatggactttgtaagaatgaacacaaagagatacaacttcaaaaatt-ttaactaagctttagcttttgtactctttccttgatttcgttcttaccttt 13833922  T
Q  313 tgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttc--------n 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
T  13833923 tgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttcaaaaaaaaa 13834022  T
Q  405 nnnnnnnnnnctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgtttctaccagcaaaaggtcaat 504  Q
              |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  13834023 aaaaacaaaactatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtatgtgtttcatattttgtttctactagcaaaaggttaat 13834122  T
Q  505 ccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccac 604  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  13834123 ccatcagtaaagtcgttcaatgtcttcatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggatcggcttgagcaagaggtccat 13834222  T
Q  605 gagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggcca 680  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  13834223 gagctgcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagagaagttaactagcctaatatcttcattgatggcca 13834298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 13 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 27974691 - 27974006
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  27974691 agaacccgtgatacaggtacgtttt-aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttaccattgactccaacgttgtggaacttaccctcaccatgtattc 27974593  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaa-----ttgaaggacttagacaagnnnnnnncaaaca 206  Q
    |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     ||||||||||||||||||        |||||    
T  27974592 tatccactt-agcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaaccttttccatcaaaaaaattttttgaaggacttagacaagtttttgt-aaaca 27974495  T
Q  207 tcatgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagcttt-agctttcgt------actctttccttggttt 299  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||  ||      ||| ||||||||||||    
T  27974494 tcacggatatggaccttgtaagaatgaacaccaagaaatacaacttccaaaa-tcttaactaagcttttagcttatgttaaagaactttttccttggttt 27974396  T
Q  300 cgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacg-tctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagt 398  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||   |||| ||||| |||||| |||| | |||||||||| | ||||||||| |||||||| | ||||    
T  27974395 cgttcttaccttttgaaaaagaaacctattgtaaatatcttgacaattttcaaa-tgaaacaatgttcctctgccatgtttacatttcactttaacaagt 27974297  T
Q  399 ccttcnnnnnnnnnnn-----------ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgt-ttc 486  Q
    |||||                      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| | | ||| |||    
T  27974296 ccttcaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaatctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtctgtatctcacactgtgtcttc 27974197  T
Q  487 taccagcaaaaggtcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcga 586  Q
    | |||  ||||||||||| ||| |||||||| ||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||  |||||| |    
T  27974196 t-ccataaaaaggtcaattcattagtaaagtggtcagatgtcttcatccaagttcggctcacatatgcagacactcgtgcaaacacaaaagttggatcaa 27974098  T
Q  587 cttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 678  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27974097 cttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaagtaacaacacttcgggctgaggtagagaagttaactagccttgtatcttcattgatggc 27974006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 567646 - 566965
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||| |||| ||||| |||||||||    
T  567646 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacctttgactccaacgtcgtggaacttaccctcaccatgtattc 567548  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaatt----------gaaggacttagacaagnnnnnnnc 201  Q
    |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||          ||||||||||||||||            
T  567547 tatccactt-agcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaaccttttccatcaaaaaattttttttttttgaaggacttagacaagtttttgt- 567450  T
Q  202 aaacatcatgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgtactctttccttggtttcg 301  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||  | |   | |||  |||||||||||||    
T  567449 aaacatcacggatatggaccttgtaagaatgaacaccgagaaatacaacttccaaaa-tcttaactaagcttatgttaaagaacttcttccttggtttcg 567351  T
Q  302 ttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacg-tctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtcc 400  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||| ||   |||| ||||| |||||| |||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||| | ||||||    
T  567350 ttcttaccttttgaaaaagaaacctattgtaaatatcttgacaattttcaaa-tgaaaccatgttcctctgccatgtttacatttcactttaacaagtcc 567252  T
Q  401 ttcnnnnnnnnnnn---------ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgt-ttctacc 490  Q
    |||                    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| | | ||| |||| ||    
T  567251 ttcaaaaaaaaaaaaaaaaaaatctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtctgtatctcacactgtgtcttct-cc 567153  T
Q  491 agcaaaaggtcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttg 590  Q
    |  ||| ||||||| ||| |||||||| ||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||| |||||    
T  567152 ataaaagggtcaattcattagtaaagtggtcagatgtcttcatccaagttcggctcacatatgcagacactcgtgcaaacacaaaagatggatcaacttg 567053  T
Q  591 agcaagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 678  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  567052 agcaagaggtccacgagcttcgtggagaagtaacaacacttcgggctgaggtagagaagttaactagccttgtatcttcattgatggc 566965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 39 - 678
Target Start/End: Original strand, 29024325 - 29024951
Alignment:
Q  39 aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataaccatgcatac 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||          
T  29024325 aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacat-gtggacttaacctcatcatgta---------ctttagcataaccat------ 29024408  T
Q  139 atgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgggtatggaccttgtaagaatgaacacc 238  Q
              |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||        ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29024409 ----------tcataaacaactttttccatcaaaaa-ttgaaggatttagacaagtttttgt-aaacatcatggatatggaccttgtaagaatgaacacc 29024496  T
Q  239 aagagatacaacttcaaaaaa------tcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgt 327  Q
    |||||||||||||||||||||      ||||||||||| ||||||||| ||     ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |    
T  29024497 aagagatacaacttcaaaaaaaaaatctcttaactaagttttagcttttgttaagaactttttccttggtttcgttcttatcatttgaaaaagga-cctt 29024595  T
Q  328 ttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaa-ttcactttgataagtccttcnnnnnnnnnnnct----attttt 422  Q
    ||||||  |||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||                  |||| |    
T  29024596 ttgcaatatcttcacaattttcaaa-tgaaaccatgtttctctacaatgtttaaaaattaactttgataagtcctttaaaaaaaaaaatagtacatttct 29024694  T
Q  423 gcataagcctatcatgcatcat-tttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgtttctaccagcaaaaggtcaatccatcagtaaagtcgtt 521  Q
    ||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| || | || |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| || |||||  ||     
T  29024695 gcataaatatatcatgcatcatctttgcattcatagtttctagtccatgcctcatattttgtttttacctacaaaaggtcaatccaacattaaaggggtc 29024794  T
Q  522 caatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggt 621  Q
      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  29024795 agatgtcttcatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggaccggcttgagcaagaggttcatgagcttcgtggagaggt 29024894  T
Q  622 aacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 678  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  29024895 aacaacacttagggctgaggtagagaagttaactagccttgtatcttcattgatggc 29024951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 512
Target Start/End: Complemental strand, 4950146 - 4949641
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgg-acttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||||     
T  4950146 agaacccgtgatacaggtaca-tttaaaaacatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattgtggaacttaccctcaccatatattt 4950048  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaagga--cttagacaagnnnnnnncaaacatca 209  Q
    |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||  ||||||||||        ||||||||    
T  4950047 tatgaattttagcataaccatgtatacatgcattcattcataaacaact-tttcca-ccaaaaattgaaggactcttagacaagtttttgt-aaacatca 4949951  T
Q  210 tgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttc 304  Q
     |  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||     |||||||||||||||||||||    
T  4949950 cgaataatgaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaactt-taaaaatcttaactaagctttaacttttgtttagaactctttccttggtttcgttc 4949852  T
Q  305 ttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttc- 403  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||  |||||||||| ||| |||||||  ||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  4949851 ttaccttttgaaaaaggaatctattgcaatatctttacaattttc-aaatgaaatcatgttcgtctgccatgtttacaattcac-ttgataagtccttca 4949754  T
Q  404 ----nnnnnnnnnnnctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgtttctaccagcaaaagg 499  Q
                   |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||  | ||| | || |  |||||||    
T  4949753 aaaaaaaaaaaaaatctatttttgcataagcatatcatgcctcattttgcattcatagtttctagtatgtgtcttatcatgtgtctttatctacaaaagg 4949654  T
Q  500 tcaatccatcagt 512  Q
    |||||||||||||    
T  4949653 tcaatccatcagt 4949641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 39 - 382
Target Start/End: Original strand, 27436160 - 27436510
Alignment:
Q  39 aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgt-ggacttaacctcatcatgtattc------tatgtactttagcataacca 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||      ||||||||||| ||||||||    
T  27436160 aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttggctccaacattgtgggacttaacctcaccatgtattctatgtatatgtactttaacataacca 27436259  T
Q  132 tgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgggtatggaccttgtaagaat 231  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||         |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  27436260 tgcatacatgcattcattcatgaataactttttccatc-aaaaattgaaggacttagataa-atttttgtaaacatcacggatatggaccttgtaagaat 27436357  T
Q  232 gaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccg 326  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||| ||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27436358 gaacaccaagagatacagcttc--aaaatcttaactaagctttaacttttgttaagaactctttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaacct 27436455  T
Q  327 tttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttaca 382  Q
     ||||||  |||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  27436456 attgcaatatctttaaaattttc-aaatgaaaccatgttcctctactgtgtttaca 27436510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 5207579 - 5207177
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  5207579 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttaccattgactccaacgttgtggaacttaccctcaccatgtattc 5207481  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaa--------ttgaaggacttagacaagnnnnnnncaa 203  Q
    |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||        ||||||||||||||||||        ||    
T  5207480 tatccactt-agcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaaccttttccatcaaaaaaaattttttttgaaggacttagacaagtttttgt-aa 5207383  T
Q  204 acatcatgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagc-tttagctttcgt------actctttccttgg 296  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||  ||      |||  ||||||||    
T  5207382 acatcacggatatggaccttgtaagaatgaacaccgagaaatacaacttc-caaaatcttaactaagcttttagcttatgttaaagaacttcttccttgg 5207284  T
Q  297 tttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttg-caacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgata 395  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||  |||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||| | |    
T  5207283 tttcgttcttaccttttgaaaaagaaacctattgtaaatatcttgacaattttc-aaatgaaaccatgttcctctgccatgtttacatttcactttaaca 5207185  T
Q  396 agtccttc 403  Q
    ||||||||    
T  5207184 agtccttc 5207177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 432 - 678
Target Start/End: Original strand, 27436511 - 27436757
Alignment:
Q  432 tatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgtttctaccagcaaaaggtcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtctcc 531  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||| ||||||||  ||   |||||  |    
T  27436511 tatcatccatcactttgcattcatagtttctagtccatgtctcatattttgtttttacctacaagaggtcaatccaacagtaaaggggtcagatgtcgtc 27436610  T
Q  532 atccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacactt 631  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27436611 atccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaacaggaaacatggatcagcttgagcaagaagtccaggagcttcgtggagaggtaacaacactt 27436710  T
Q  632 cgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 678  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  27436711 cgggctgaggtagagaagttagctagcctagtatcctcattgatggc 27436757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 415 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 5207150 - 5206887
Alignment:
Q  415 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgt-ttctaccagcaaaaggtcaatccatcagta 513  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| | | ||| |||| |||  ||| ||||||| ||| ||||    
T  5207150 ctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtctgtatctcacactgtgtcttct-ccataaaagggtcaattcattagta 5207052  T
Q  514 aagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgt 613  Q
    |||| ||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  5207051 aagtggtcagatgtcttcatccaagttcggctcacatatgcagacactcgtgcaaacacaaaagatggatcaacttgagcaagaggtccacgagcttcgg 5206952  T
Q  614 ggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 678  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  5206951 ggagaagtaacaacacttagggctgaggtagagaagttaactagccttgtatcttcattgatggc 5206887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 352
Target Start/End: Original strand, 8812594 - 8812937
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 112  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||     
T  8812594 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcattgttaccctcgactccaacattgtggacttaacctcaccatgcattcc 8812692  T
Q  113 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaac---tatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatc 208  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   | ||||  |||  || || |||||||||||| |||        |||||||    
T  8812693 atgttcttcagcataaacatgcatacatgcattcattcataaa-aacttttttttctctcactaatatcgaaggacttagataagttcttgt-aaacatc 8812790  T
Q  209 atgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgtt 303  Q
    |  | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||     ||| |||  |||||||||||    
T  8812791 aaagatatggaccttgtaagaaggaacaccaagaaatacaacttc-aaaaatcttaactaagctttagcttttgttaagaactttttttttggtttcgtt 8812889  T
Q  304 cttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 352  Q
    |||| |||||||||| ||||||  ||| ||| |||| ||||| ||||||    
T  8812890 ctta-cttttgaaaagggaaccaattggaacatcttcacaattttcaaa 8812937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 1900309 - 1900166
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgccctt-gactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1900309 agaacccgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgtcaccttttgactccaacattgtggacttaacctcattatgtattc 1900210  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 155  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1900209 tatgtacttcagcataagcatgcatccatgcattcattcataaa 1900166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 531 - 666
Target Start/End: Original strand, 38412256 - 38412391
Alignment:
Q  531 catccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacact 630  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |  || |||||||||||||||||||||||    
T  38412256 catccaagtccggctcgcatatgcaaacactcgtgcaaacaggaaaaatggatcgacttgagcaagaagtacgggaacttcgtggagaggtaacaacact 38412355  T
Q  631 tcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatc 666  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  38412356 tcgggctgaggtagagaagttaactagtcttgtatc 38412391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 13491371 - 13491232
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 112  Q
    |||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||     
T  13491371 agaacccgtgatacaggtata-tttaaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacat-gtggacttaacctcattatgtattcc 13491274  T
Q  113 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataa 154  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  13491273 atgtattttagcataatcatgcatgcatgcatccattcataa 13491232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 452
Target Start/End: Original strand, 12586519 - 12586955
Alignment:
Q  21 tgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgccc-ttgactccaacattgtggacttaa--cctcatcatgtattc----ta 113  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||| |||||||||| |||  ||||| ||||| |||    |     
T  12586519 tgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcgtatttaccccttgactccatcattgtggacctaaaacctcaccatgttttcaccatt 12586617  T
Q  114 tgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatggg 213  Q
    ||| |   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | | |||||| |||||||||       |||||||||  |     
T  12586618 tgtgc---agcataatcatgcatacatgcattcattcataaacaaatttttccatcaaaca-tcgaaggatttagacaagttttta-caaacatcacaga 12586712  T
Q  214 t--atggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaa-cttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttct 305  Q
    |  | |||||||||||| | ||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     ||| |||| |||||||||||||    
T  12586713 tgaacggaccttgtaaggaagaacaccaagaaattcaaacttcaaaaa-tcttaactaagctttagcttttgttaagaactttttctttggtttcgttct 12586811  T
Q  306 taccttttg-aaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttcn 404  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||  |||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||| || ||||||     
T  12586812 taccttttgaaaaaaggaacctattgcaatatctttacaat-ttttaaatgaaaccatgttcctctataatgtttccaaat-actttgacaaatccttca 12586909  T
Q  405 nnnnnnnnnnctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcatt 452  Q
              ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  12586910 aaaaatgtgtctatttttgcataagc--atcatgcatcattttgcatt 12586955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 39 - 157
Target Start/End: Original strand, 15186452 - 15186571
Alignment:
Q  39 aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgg-acttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataaccatgcata 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||    
T  15186452 aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattgtggaacttaccctcaccatgtattctatgtacttgagcattatcatacata 15186551  T
Q  138 catgcattcattcataaaca 157  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15186552 catgcattcattcataaaca 15186571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 39 - 157
Target Start/End: Original strand, 29082879 - 29082998
Alignment:
Q  39 aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgg-acttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataaccatgcata 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||    
T  29082879 aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattgtggaacttaccctcaccatgtattctatgtacttgagcattatcatacata 29082978  T
Q  138 catgcattcattcataaaca 157  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29082979 catgcattcattcataaaca 29082998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 16146688 - 16146569
Alignment:
Q  39 aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgg-acttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataaccatgcata 137  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||    
T  16146688 aaaccatagtccttaccagatggcgttgttacccttgactccaacattgtggaacttaccctcaccatgtattctatgtacttgagcattatcatacata 16146589  T
Q  138 catgcattcattcataaaca 157  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16146588 catgcattcattcataaaca 16146569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 13268681 - 13268539
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  13268681 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccctaccaaatggcgttgttatccttaagctccaacattatggacttaacctcaccatgcattc 13268583  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 155  Q
     |||| | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  13268582 catgttccttagcataatcatgcatacaagcattcattcataaa 13268539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 400
Target Start/End: Original strand, 840315 - 840693
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  840315 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccctgccaaatggcgttgttatccttaagctccaacattatggacttaacctcaccatgcattc 840413  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcat 210  Q
     ||        |||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| | |||  |  || |||||||||||| |||        ||||||||     
T  840414 gat--------gcataatcatgcatacatgcattcattgataa--aaccattttc-tcactattatcgaaggacttagataagtttttgt-aaacatcaa 840501  T
Q  211 gggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttct 305  Q
     | ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || | |||| ||     ||| ||||||||||||||||||    
T  840502 agatatggtccttgtaagaaggaacaccaagaaatacaacttc-aaaaatcttaactaagtttcaacttttgttaagaactttttccttggtttcgttct 840600  T
Q  306 taccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtcc 400  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||   ||||| ||| ||| |||| |  |||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  840601 tacc-tttgaagagggaaccgtttgcaatacctttataattttc-aaataagtccatgttcttctacaatgtttacaaattactttgacaagtcc 840693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 400
Target Start/End: Original strand, 847491 - 847869
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  847491 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccctgccaaatggcgttgttatccttaagctccaacattatggacttaacctcaccatgcattc 847589  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcat 210  Q
     ||        |||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| | |||  |  || |||||||||||| |||        ||||||||     
T  847590 gat--------gcataatcatgcatacatgcattcattgataa--aaccattttc-tcactattatcgaaggacttagataagtttttgt-aaacatcaa 847677  T
Q  211 gggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttct 305  Q
     | ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || | |||| ||     ||| ||||||||||||||||||    
T  847678 agatatggtccttgtaagaaggaacaccaagaaatacaacttc-aaaaatcttaactaagtttcaacttttgttaagaactttttccttggtttcgttct 847776  T
Q  306 taccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtcc 400  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||   ||||| ||| ||| |||| |  |||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  847777 tacc-tttgaagagggaaccgtttgcaatacctttataattttc-aaataagtccatgttcttctacaatgtttacaaattactttgacaagtcc 847869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 400
Target Start/End: Original strand, 1205495 - 1205873
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  1205495 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccctgccaaatggcgttgttatccttaagctccaacattatggacttaacctcaccatgcattc 1205593  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcat 210  Q
     ||        |||||| |||||||||||||||||||| ||||  ||| |||| | |||  |  || |||||||||||| |||        ||||||||     
T  1205594 gat--------gcataatcatgcatacatgcattcattgataa--aaccattttc-tcactattatcgaaggacttagataagtttttgt-aaacatcaa 1205681  T
Q  211 gggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttct 305  Q
     | ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || | |||| ||     ||| ||||||||||||||||||    
T  1205682 agatatggtccttgtaagaaggaacaccaagaaatacaacttc-aaaaatcttaactaagtttcaacttttgttaagaactttttccttggtttcgttct 1205780  T
Q  306 taccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtcc 400  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||   ||||| ||| ||| |||| |  |||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  1205781 tacc-tttgaagagggaaccgtttgcaatacctttataattttc-aaataagtccatgttcttctacaatgtttacaaattactttgacaagtcc 1205873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 34137035 - 34136937
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 111  Q
    ||||||| || |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  34137035 agaacctttgttacaagtgcaatttgaaaccatagtccttaccaaatggtgttgttacccttgactccaacattgtggacttaacctcaccatgcattc 34136937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 23884885 - 23884753
Alignment:
Q  23 atacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtacttt 121  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||| |||| ||||| |||| ||| |||| |||| |||| ||||    
T  23884885 atacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacctttaagctccatcattatggacctaacatcaccatgcattccatgttcttt 23884787  T
Q  122 agcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 155  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23884786 agcataatcatgcatacatgcattcattcataaa 23884753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 130 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 4830193 - 4829916
Alignment:
Q  130 catgcatacatgcattcattcataaacaactatt-tccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatca--tgggtatggaccttgta 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||| | | |||||| |||||||||       |||||||||  |  | | |||||||| |    
T  4830193 catgcatacatgcattcattcataaacaacttttgtttatcaaata-tcgaaggatttagacaagttttttgcaaacatcacatatgaacggaccttgaa 4830095  T
Q  227 agaatgaacaccaagagatacaa-cttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaag 320  Q
    || | ||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||  |     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4830094 aggaagaacaccaagaaattcaaacttcaaaaa-tcttaactaagccttagcttttattaagaactttttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaag 4829996  T
Q  321 gaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtcctt 402  Q
    |||||  ||||||  |||||||||| ||| |||||||  || ||||||||| ||||||| ||||| ||||||| || |||||    
T  4829995 gaacctattgcaatatctttacaattttc-aaatgaaatcacgttcctctataatgtttccaatt-actttgacaaatcctt 4829916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 524 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 3428832 - 3428700
Alignment:
Q  524 atgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgactt-gagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggta 622  Q
    |||||| ||| ||| ||| |||| || ||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  3428832 atgtcttcattcaacttcagctcacacatgcaaacactcgtgcaaacacaaaaaatggatcgacttagag-aagaggtccacgagcttcgtgaagaagta 3428734  T
Q  623 acaacacttcgggctgaggtagtgaagttaacta 656  Q
    ||   ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  3428733 actgtacttcgggccgaggtagagaagttaacta 3428700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 232 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 1959706 - 1959468
Alignment:
Q  232 gaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccg 326  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||     |||  |||||||||||||||||||| |||        |||| |    
T  1959706 gaacaccaagaaatacaacttcaaaaa-tcttaattaaactttagcttttgttaagaacttcttccttggtttcgttcttactttt--------gaactg 1959616  T
Q  327 tttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttcnnnnnnnnnnnctatttttgcat 426  Q
     ||||||  |||||||||| |||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||             ||||||||||    
T  1959615 attgcaatatctttacaattttcaaa-taaagttatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataggcccttcggaaaaatcctacatttttgcat 1959517  T
Q  427 aagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctca 475  Q
    || | ||  |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  1959516 aaacatacaatgcattattttgcattcatagtttctagttcgtgtctca 1959468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 543 - 636
Target Start/End: Original strand, 12587035 - 12587128
Alignment:
Q  543 gctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggc 636  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |   |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||| || ||||| ||||||||    
T  12587035 gctcgcatatgcaaacactcgtgcaaacacataaaatggatcaacttgaacaagaggtccacgagcttcgtaaagaagtgacaacgcttcgggc 12587128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 805054 - 804909
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgccc-ttgactccaacattgtggactt--aacctcatcatgtat 109  Q
    |||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||| ||||| |    
T  805054 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcgtgtttaccctttgactccatcattgtggacctaaaacctcaccatgttt 804956  T
Q  110 tc----tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 155  Q
    ||    | |||||   ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  804955 tcaccatttgtac---agcataatcatgcatacatgcattcatccataaa 804909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 16270710 - 16270644
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactcca 81  Q
    ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  16270710 agaacctgtgatacaagtacaat--gaaaccatagtccttaccaaatggcgttataccccttgactcca 16270644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 223 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 16270498 - 16270442
Alignment:
Q  223 tgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagcttt 280  Q
    |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16270498 tgtaaggaagaacaccaagaaatacaacttcaaaaa-tcttaactaagctttagcttt 16270442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 3430803 - 3430724
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgccc-ttgactccaacattgtggac 92  Q
    |||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||| ||||||||||    
T  3430803 agaacccgtgatacaggtacaaat-gagaccatagtccttaccaaatggcgtgtttaccctttgactccatcattgtggac 3430724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 23884692 - 23884567
Alignment:
Q  214 tatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----ac--tctttccttggtttcgttctt 306  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| ||     ||  | |||||||||||||||||||    
T  23884692 tatggatcttgtaagaaggaacaccaagaaatacaaactc-aaaaaccttaactaagctttagcttttgttaagaactttttttccttggtttcgttctt 23884594  T
Q  307 accttttgaaaaaggaaccgtttgcaac 334  Q
    | |||||||||| ||||||  |||||||    
T  23884593 a-cttttgaaaagggaaccaattgcaac 23884567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 85
Target Start/End: Original strand, 16228645 - 16228699
Alignment:
Q  32 caatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgccc-ttgactccaacat 85  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16228645 caatttaaaaccttagtccttaccaaatggcgttgttaccctttgactccaacat 16228699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 61
Target Start/End: Original strand, 9463104 - 9463151
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatgg 61  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  9463104 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatgg 9463151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 16400097 - 16400050
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatgg 61  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16400097 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatgg 16400050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 30376590 - 30376543
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatgg 61  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  30376590 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatgg 30376543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 415 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 803240 - 803203
Alignment:
Q  415 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcatt 452  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  803240 ctatttttgcataagcatatcatgcatcatcttgcatt 803203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 415 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 16292107 - 16292070
Alignment:
Q  415 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcatt 452  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  16292107 ctatttttgcataagcatatcatgcatcatcttgcatt 16292070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 34136643 - 34136598
Alignment:
Q  416 tatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 461  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  34136643 tatttttgcataagcatagcatgcatcattttgcatacataatttc 34136598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 407; Significance: 0; HSPs: 26)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 15950986 - 15950317
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 112  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15950986 agaacccgtgatacaggtacattttgaaaccatagtctttaccaagtggcgttgttatccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 15950887  T
Q  113 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||       ||||||| ||||    
T  15950886 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactttttccatca-aaaattgaaggacttagacaagttttttgcaaacattatgg 15950788  T
Q  213 gtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgtactctttccttggtttcgttcttaccttt 312  Q
     ||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15950787 atatggactttgtaagaataaacacaaagagatacaacttcaaaaaat-ttaactaagctttagcttttgtactctttccttgatttcgttcttaccttt 15950689  T
Q  313 tgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgttt-acaattcactttgataagtccttcnnnnnnnn 411  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||||| |||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||            
T  15950688 tgaaaaaggaaccgtttgcaatatcttcacaattttc-aaatgaaaccatgtttctctaccatgtttaaaaattaactttgataagtccttcaaaaaaaa 15950590  T
Q  412 nnnct-----atttttgcataagcctatcatgcatcat-tttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgtttctaccagcaaaaggtcaatc 505  Q
        |     ||||||||||||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15950589 aaaattgtacatttttgcataaatatataatgcatcatctttgcattcatagtttctagtctgtatctcatattttgtttctaccagcaaaaggtcaatc 15950490  T
Q  506 catcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacg 605  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15950489 catcagtaaagtcgttcaatgtcttcatccaagttcagcttgcatatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacg 15950390  T
Q  606 agcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 678  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15950389 agcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagagaagttaactagcctagtatcttcattgatggc 15950317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 371; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 678
Target Start/End: Original strand, 24287742 - 24288385
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||  || |||||||||    
T  24287742 agaacccgtgatacaggtacacttg--aaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaatattgtggaacttaacgccaccatgtattc 24287839  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatg 211  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||        ||||||||      
T  24287840 tatgttctt-agcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactttttccatcaaaaa-ttgaaggactaagacaagttttttgtaaacatcaca 24287937  T
Q  212 ggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgtactctttccttggtttcgttcttacctt 311  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||                     |||||||||||||||||    
T  24287938 gatatggaccttgtaagaatgaacaccaagatatacaacttcaaaaa-tcttaactaagctt---------------------ggtttcgttcttacctt 24288015  T
Q  312 ttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttcnnnnnnnn 411  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||            
T  24288016 ttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaaaccatgttcctctataatgtttacaattcactttgataagtccttcaaaatttt 24288115  T
Q  412 nnn---ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgtttctaccagcaaaaggtcaatccat 508  Q
          ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24288116 ttttatctatttttgcataagcacatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtccgtgtctcatattttgtttctaccagcaaagggtcaatccat 24288215  T
Q  509 cagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagc 608  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24288216 cagtaaagtcgttcaatgtcttcatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaacaagaaaaatcgatcgacttgagcaagaggtccacgagc 24288315  T
Q  609 ttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 678  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  24288316 ttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagagaagttaactagcctagtatcttcagtgatggc 24288385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 682
Target Start/End: Original strand, 35140749 - 35141426
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  35140749 agaacccgtaatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattgtggaacttaaccttaccatgtattc 35140848  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttc-catcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcat 210  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||| ||||        ||||||||     
T  35140849 tatgtactttagcattatcatgcatacatgcattcattcgtaaacaactttttttcatcaaaaa-ttgaaggacttaggcaagtttttgt-aaacatcaa 35140946  T
Q  211 gggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaa--tcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgtt 303  Q
     |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||     | | ||||||||||||||||    
T  35140947 aggtatggaccttttaagaatgatcaccaagagatacaacttcaaaaaaaatcttaactaagccttagcttttgttaagaagtttttccttggtttcgtt 35141046  T
Q  304 cttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttc 403  Q
    |||| ||||| |||||| ||||  ||||||  |||||||||| |||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35141047 cttaacttttaaaaaag-aacctattgcaatatctttacaattttcaaa-tgaaactatgttcctcgacaatgtttacaattcactttgataagtccttc 35141144  T
Q  404 nnnnnnnnnnn--ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagttt-ctggtacgtgtctcatattttgtttctaccagcaaaaggt 500  Q
                 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  35141145 aaaaaaaaattatctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagttttctagtccatgtctcatattttgcttctacctacaaaaggt 35141244  T
Q  501 caatccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggt 600  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35141245 caatccatcagtaaagtggtccaatgtcttcatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggatcgacttgagcaagaggt 35141344  T
Q  601 ccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggccaca 682  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35141345 ccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatcttcattgatggccaca 35141426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 42572479 - 42571801
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacc-tcatcatgtatt 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||    
T  42572479 agaacccgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatgatgttgttacccttgactccaacattgtggaacttaaacatcctcatgtatt 42572380  T
Q  111 ctatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcat 210  Q
    | ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||       ||||||| ||    
T  42572379 caatgtactttattataaccatgcatacatgcatttattcataaatatatttttccatcaaaaa-ttgaaggacttagacaagttttttgcaaacattat 42572281  T
Q  211 gggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttct 305  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     ||| |||||||||||||| | |    
T  42572280 ggatatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagcttttgttaagaactttttccttggtttcgattt 42572181  T
Q  306 taccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaa-ttcactttgataagtccttcn 404  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||||| ||||||| || || |||||||||||||||||     
T  42572180 taccttttgaaaaaagaaccttttgcaatatcttcacaattttcaaa-tgaaaccatgtttctctaccatgtttaaaaattaactttgataagtccttca 42572082  T
Q  405 nnnnnnnnnnctatttt-------tgcataagcctatcatgcatcat-tttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgtttctaccagcaaa 496  Q
                |||||       |||||||   |||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  42572081 aaaaaaaaaaaaattttacatttttgcataaatatatcattcatcatctttgcattcata-tttctagtctgtatctcatattttgtttctaccagcaaa 42571983  T
Q  497 aggtcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaag 596  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42571982 aggtcaatccatccgtaaagtcgttcaatgtcttcatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggatcgacttgagcaag 42571883  T
Q  597 aggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 678  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  42571882 aggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagagaagttaactagcctagtatcttcattgatggc 42571801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 13 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 21858050 - 21857383
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgg-acttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  21858050 agaacccgtgacaccggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattatgggacttaacctcatcatgtattc 21857951  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatg 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||        ||||||||||    
T  21857950 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcatccattcataaacaactttttccatca-aaaattgaaggacttagtcaagtttttgt-aaacatcatg 21857853  T
Q  212 ggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgtactctttccttggtttcgttcttacctt 311  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21857852 gatatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttc-aaaaatcttaactgagctttagcttttgtactttttccttggtttcgttcttacctt 21857754  T
Q  312 ttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttc-------n 404  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||   |||  |||||||| ||| ||||||||||||||||            
T  21857753 ttgaaaaaggaaccgtttgcgacgtctttacaatattcaaaatgaaaccatattc--gtactgtgtttacatttcgctttgataagtccttcaaaaaaat 21857656  T
Q  405 nnnnnnnnnnctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgt-ttctaccagcaaaaggtcaa 503  Q
               | ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| | ||| |||  ||| |||  ||||||||||    
T  21857655 tattatcttttttttttttcataagcatatcatgcatcattttgtattcatagtttctagtccgtgtcttacattgtgtcctct-cca-taaaaggtcaa 21857558  T
Q  504 tccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtcca 603  Q
    ||| ||| |||||  |    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  21857557 tccgtcaataaaggggccagatgtcgtcatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggaccggcttgagcaagaggttca 21857458  T
Q  604 cgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 678  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  21857457 tgagcttcgtggagaggtaacaacacttagggctgaggtagagaagttaactagccttgtatcttcattgatggc 21857383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 13 - 678
Target Start/End: Original strand, 16275554 - 16276245
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  16275554 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttaccattgactccaacgttgtggaacttaccctcaccatgtattc 16275652  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaatt-------------gaaggacttagacaagnnnnn 198  Q
    |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||             ||||||||||||||||         
T  16275653 tatccactt-agcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaaccttttccatcaaaaattttttttttttttttgaaggacttagacaagttttt 16275751  T
Q  199 nncaaacatcatgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagcttt-agctttcgt------actctttc 291  Q
       |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||  ||      |||  |||    
T  16275752 gt-aaacatcacggatatggaccttgtaagaatgaacaccgagaaatacaacttccaaaa-tcttaactaagcttttagcttatgttaaagaacttcttc 16275849  T
Q  292 cttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacg-tctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactt 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||   |||| ||||| |||||| |||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  16275850 cttggtttcgttcttaccttttgaaaaagaaacctattgtaaatatcttgacaattttcaaa-tgaaaccatgttcctctgccatgtttacatttcactt 16275948  T
Q  391 tgataagtccttcnnnnnnnnnnn-----------ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatatt 479  Q
    | | |||||||||                      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| | |    
T  16275949 taacaagtccttcaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaatctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtctgtatctcacact 16276048  T
Q  480 ttgtttctaccagcaaaaggtcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaat 579  Q
     | || || |||  ||||||||||| ||| |||||||| ||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |  ||| ||    
T  16276049 gtctt-ct-ccataaaaaggtcaattcattagtaaagtggtcagatgtcttcatccaagttcggctcacatatgcagacactcgagcaaacacaaaagat 16276146  T
Q  580 ggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 678  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  16276147 ggatcaacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaagtaacaacacttcgggctgaggtagagaagttaactagccttgtatcttcattgatggc 16276245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 489
Target Start/End: Original strand, 25493980 - 25494466
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||  ||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||    
T  25493980 agaacccgtgatacaggtacactt-gaaaccatagtccttaccagatggtgttgttacccttagctccaacattgtggaacttgccctcaccatgtattc 25494078  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatg 211  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||| |||||||       |||||||||||    
T  25494079 tatgtactttagcataatcatgcatacatgcattcattcataaacatcttttttcatcaaaaa-ttgaaggactaagacaagttttttgcaaacatcatg 25494177  T
Q  212 ggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttc-aaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttct 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||     ||| ||||||||||||||||||    
T  25494178 ggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaaatcttaactaagctttagcttttgttaagaactttttccttggtttcgttct 25494277  T
Q  306 taccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattc-actttgataagtccttcn 404  Q
    |||||||||||||| | ||| |||||||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||| || || ||||||| |||||||||     
T  25494278 taccttttgaaaaaaggaccttttgcaatatcttcacaattttc-aaatgaaaccatgtttctctaccatgtttaaaaatcaactttgacaagtccttca 25494376  T
Q  405 nnnnnnnnnnct----atttttgcataagcctatcatgcatcat-tttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgtttctac 489  Q
               |    ||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||    
T  25494377 aaaaaaagttttgtacatttttgcataaatatatcatgcatcatctttgcattcatagtttctagtctgtatctcatattttgtttctac 25494466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 20 - 369
Target Start/End: Original strand, 21112150 - 21112506
Alignment:
Q  20 gtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtact 119  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||    
T  21112150 gtgatacaggtaca-tatgaaaccatagtccttaccaaatgacgttgttacccttgactccaacattgtggacttaacttcaccatgttttctatgttct 21112248  T
Q  120 ttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaa--aaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgggtatg 217  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |  | |||||||| |  |||||| |||||||||||||||        ||||||||||  ||||    
T  21112249 ttagcataatcatgcatacatgcattcatccataaatatttttttccatccattaaaatttaaggacttagacaagttttttgtaaacatcatgaatatg 21112348  T
Q  218 gaccttgtaagaatgaacacc--aagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttc-----gtactctttccttggtttcgttcttacct 310  Q
    ||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||     | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  21112349 gattttgtaagaatgaacaccaaaagagatacaacttc-aaaaatcttaactaagctttcgctttcattaagaactttttccttggtttcgttcttacct 21112447  T
Q  311 tttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctc 369  Q
     |||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  21112448 gttgaaaaaggaatcgtttgcgacatctttacaattttcaaaataaaaccatgttcctc 21112506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 3764418 - 3764018
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  3764418 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttaccattgactccaacgttgtggaacttaccctcaccatgtattc 3764320  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaa------ttgaaggacttagacaagnnnnnnncaaac 205  Q
    |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||      ||||||||||||||||||        ||||    
T  3764319 tatccactt-agcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaaccttttccatcaaaaaaatttttttgaaggacttagacaagtttttgt-aaac 3764222  T
Q  206 atcatgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagc-tttagctttcgt------actctttccttggtt 298  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||  ||      |||  ||||||||||    
T  3764221 atcacggatatggaccttgtaagaatgaacaccgagaaatacaacttc-caaaatcttaactaagcttttagcttatgttaaagaacttcttccttggtt 3764123  T
Q  299 tcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttg-caacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataag 397  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||  |||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||| | |||    
T  3764122 tcgttcttaccttttgaaaaagaaacctattgtaaatatcttgacaattttc-aaatgaaaccatgttcctctgccatgtttacatttcactttaacaag 3764024  T
Q  398 tccttc 403  Q
    ||||||    
T  3764023 tccttc 3764018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 415 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 3763991 - 3763728
Alignment:
Q  415 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgt-ttctaccagcaaaaggtcaatccatcagta 513  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| | | ||| |||| |||  ||| ||||||| ||| ||||    
T  3763991 ctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtctgtatctcacactgtgtcttct-ccataaaagggtcaattcattagta 3763893  T
Q  514 aagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgt 613  Q
    |||| ||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3763892 aagtggtcagatgtcttcatccaagttcggctcacatatgcagacactcgtgcaaacacaaaagatggatcaacttgagcaagaggtccacgagcttcgt 3763793  T
Q  614 ggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 678  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  3763792 ggagaagtaacaacacttagggctgaggtagagaagttaactagccttgtatcttcattgatggc 3763728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 26731110 - 26730967
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgccctt-gactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26731110 agaacccgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgtcaccttttgactccaacattgtggacttaacctcattatgtattc 26731011  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 155  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  26731010 tatgtacttcagcataagcatgcatccatgcattcattcataaa 26730967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 34541299 - 34541156
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgccctt-gactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34541299 agaacccgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgtcaccttttgactccaacattgtggacttaacctcattatgtattc 34541200  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 155  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  34541199 tatgtacttcagcataagcatgcatccatgcattcattcataaa 34541156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 201 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 30691664 - 30691456
Alignment:
Q  201 caaacatcatgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaa-aaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttcctt 294  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||     ||| |||| ||    
T  30691664 caaacatcatgggtatggactttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaaatcttaactaaactttagcttttgttaagaactttttcttt 30691565  T
Q  295 ggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgttt-acaattcactttga 393  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| | ||| ||| ||||||| ||||||| |||||| |||||| | |||| |||||||    
T  30691564 ggtttcgatcttaccttttgaaaaaagaaccttttgcaatatcttcataattttc-aaatgaaaccatgtttctctaccatgtttaaaaattaactttga 30691466  T
Q  394 taagtccttc 403  Q
    ||||||||||    
T  30691465 taagtccttc 30691456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 148
Target Start/End: Original strand, 24701129 - 24701241
Alignment:
Q  37 tgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataaccatgca 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  24701129 tgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttaagctccaacattgtggacttaacctcaccatgcattccatgttctttagcataagcatgca 24701228  T
Q  136 tacatgcattcat 148  Q
    ||||| |||||||    
T  24701229 tacatacattcat 24701241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 40388637 - 40388514
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 112  Q
    |||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  40388637 agaacccgtgatataggtacatttggaaaccatagtccttaccaaatggtgttgttacccctaactccaacattgtggacctaacctcaccatgtattct 40388538  T
Q  113 atgtactttagcataaccatgcat 136  Q
     |||| |||||||||| |||||||    
T  40388537 ctgtattttagcataatcatgcat 40388514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 37 - 148
Target Start/End: Original strand, 24692290 - 24692402
Alignment:
Q  37 tgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataaccatgca 135  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||  |||||    
T  24692290 tgaaaccatagtccttatcaaatggtgttgttacccttaagctccaacattgtggacttaacctcaccatgcattccatgttctttagcataaagatgca 24692389  T
Q  136 tacatgcattcat 148  Q
    ||||| |||||||    
T  24692390 tacatacattcat 24692402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 21767154 - 21767056
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||| || |||| | ||||| | ||||| ||||    
T  21767154 agaacctgtgatacaagtacaattt-aaaccatagtccttaccaaatagcattg-tacccttgactccaaccttatggattcaaccttaccatgttttct 21767057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 280
Target Start/End: Original strand, 24701289 - 24701366
Alignment:
Q  202 aaacatcatgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagcttt 280  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||    
T  24701289 aaacatcaaagatatggaccttgtaagaaggaacaccaagaaatacaacttc-aaaagtcttaactagactttagcttt 24701366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 91 - 157
Target Start/End: Original strand, 42386963 - 42387029
Alignment:
Q  91 acttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaaca 157  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42386963 acttaccctcaccttgtattctatgtacttgagcattatcatacatacatgcattcattcataaaca 42387029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 202 - 280
Target Start/End: Original strand, 24692449 - 24692526
Alignment:
Q  202 aaacatcatgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagcttt 280  Q
    ||||||||  | |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||    
T  24692449 aaacatcaaagatatggaccttataagaaggaacaccaagaaatacaacttc-aaaagtcttaactagactttagcttt 24692526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 415 - 461
Target Start/End: Original strand, 24692661 - 24692707
Alignment:
Q  415 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 461  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  24692661 ctatttttgcataagcatatcgtgcatcattttgcattcataatttc 24692707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 154
Target Start/End: Original strand, 12377267 - 12377298
Alignment:
Q  123 gcataaccatgcatacatgcattcattcataa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12377267 gcataaccatgcatacatgcattcattcataa 12377298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 77 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 20278918 - 20278855
Alignment:
Q  77 ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataaccatgcatacat 140  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| |||| |||| |||| || |||||||| |||||||||||    
T  20278918 ctccaacattatggacttaatctcaccatgcattccatgttctgtagcataatcatgcatacat 20278855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 415 - 461
Target Start/End: Original strand, 24701501 - 24701547
Alignment:
Q  415 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 461  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  24701501 ctatttttgcataaacatatcgtgcatcattttgcattcataatttc 24701547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 417 - 461
Target Start/End: Original strand, 19990255 - 19990297
Alignment:
Q  417 atttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 461  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  19990255 atttttgcataagcgt--catgcatcattttgcattcatagtttc 19990297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 68
Target Start/End: Original strand, 42386926 - 42386955
Alignment:
Q  39 aaaccatagtccttaccaaatggcgttgtt 68  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42386926 aaaccatagtccttaccaaatggcgttgtt 42386955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 379; Significance: 0; HSPs: 20)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 39843531 - 39842868
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  39843531 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaagtggtgttgttaccctcgactccaacattgtggaacttaacctcctcatgtattc 39843433  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatg 211  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||       ||||||| |||    
T  39843432 aatgtactttagtataaccatgcatacatgcattcattaataaatatatttttccatcaaaaa-ttgaaggacttagacaagttttttgcaaacattatg 39843334  T
Q  212 ggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgtactctttccttggtttcgttcttacctt 311  Q
    | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39843333 gatatggaccttgtacgagtgaacaccaagagatacaacttcaaaaa-tcttaactaagctttaccttttgtactctttccttggtttcgttcttacctt 39843235  T
Q  312 ttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaa-ttcactttgataagtccttcnnnnnnn 410  Q
    ||||||||||  || |||||||  |||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||||| ||||||| || || |||||||||||||||||           
T  39843234 ttgaaaaaggg-ccttttgcaatatcttcacaattttcaaa-tgaaaccatgtttctctaccatgtttaaaaattaactttgataagtccttcaaaaaaa 39843137  T
Q  411 nnnnctatttttgcataagcctatcatgcatcat-tttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgtttctaccagcaaaaggtcaatccatc 509  Q
          ||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39843136 ttgtacatttttgcataaatatatcatgcatcatctttgcattcatagtttctagtctgtatctcatattttgtttctaccagcaaaaggtcaatccatc 39843037  T
Q  510 agtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagct 609  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39843036 agtaaagtcgttcaatgtcttcatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgaaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagct 39842937  T
Q  610 tcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 678  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39842936 tcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagagaagttaactagcctagtatcttcattgatggc 39842868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 374; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 17680876 - 17680211
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  17680876 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaagtggcgttgttaccctcgactccaacattgtggaacttaacctcctcatgtattc 17680778  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatg 211  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||       ||||||| |||    
T  17680777 agtgtactttagtataaccatgcatacatgcattcattaataaatatatttttccatcaaaaa-ttgaaggacttagacaagttttttgcaaacattatg 17680679  T
Q  212 ggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgtactctttccttggtttcgttcttacctt 311  Q
    | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17680678 gatatggaccttgtacgagtgaacaccaagagatacaacttcaaaaa-tcttaactaagctttagcttttgtactctttccttggtttcgttcttacctt 17680580  T
Q  312 ttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaa-ttcactttgataagtccttcnnnnnnn 410  Q
    ||||||||||| || |||||||  |||| ||||| |||||| |||| ||||||| |||||| ||||||| || || ||||||||||||||||            
T  17680579 ttgaaaaagga-ccttttgcaatatcttcacaattttcaaa-tgaaaccatgtttctctaccatgtttaaaaattaactttgataagtccttaaaaaaaa 17680482  T
Q  411 nnnncta--tttttgcataagcctatcatgcatcat-tttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgtttctaccagcaaaaggtcaatcca 507  Q
         ||  |||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17680481 aattgtacatttttgcataaatatatcatgcatcatctttgcattcatagtttctagtttgtatctcatattttgtttctaccagcaaaaggtcaatcca 17680382  T
Q  508 tcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgag 607  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17680381 tcagtaaagtcgttcaatgtcttcatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgag 17680282  T
Q  608 cttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 678  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17680281 cttcgtgcagaggtaacaacacttcgggctgaggtagagaagttaactagcctagtatcttcattgatggc 17680211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 677
Target Start/End: Original strand, 6665875 - 6666544
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 112  Q
    |||||| |||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | |||| ||||||||||    
T  6665875 agaacccgtgatacatgcaca-ttggaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacat-gtggactctatctcaccatgtattct 6665972  T
Q  113 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |         |||||||| ||    
T  6665973 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactttttccatc--aaaattgaaggacttagacga-atttttgtaaacatcacgg 6666069  T
Q  213 gtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttctta 307  Q
     ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||     ||| |||||||||||||||||||     
T  6666070 atatggacattgtaagaaggaacaccaagagatgcaaattc-aaaaatcttaactaagctttagcttttgttaagaactttttccttggtttcgttctt- 6666167  T
Q  308 ccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttc---- 403  Q
      |||  ||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||        
T  6666168 --tttgaaaaaaggaatcgtttgcaacatccttacaatgtttaaaatgaaaccattttcctctacaatgtttacatttcactttgataaatccttcaaaa 6666265  T
Q  404 ---nnnnnnnnnnncta-tttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgt-ttctaccagcaaaag 498  Q
                  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |   ||| |||| | |   | ||    
T  6666266 aaaaaaagaattatctattttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtccgtgtctcacaccgtgtcttctccaaaagagag 6666365  T
Q  499 gtcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagag 598  Q
    |||||||| ||||| |||| || | |||||| | | ||| || |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  6666366 gtcaatccgtcagtgaagtggtccgatgtcttctttcaactttggctcgcatatgaagacactcgtgcagacaggaaaaacggatcggcttgagcaagag 6666465  T
Q  599 gtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatgg 677  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  6666466 gtccatgagctgcgtggagaggtaacaacactttgggctgaggtagaaaagttaactgacctagtatcttcattgatgg 6666544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 258
Target Start/End: Original strand, 6673537 - 6673777
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 112  Q
    |||||| |||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | |||| ||||||||||    
T  6673537 agaacccgtgatacatgcaca-ttggaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacat-gtggactctatctcaccatgtattct 6673634  T
Q  113 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgg 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |         |||||||| ||    
T  6673635 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactttttccatc--aaaattgaaggacttagacga-atttttgtaaacatcacgg 6673731  T
Q  213 gtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaa 258  Q
     ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||    
T  6673732 atatggacattgtaagaaggaacaccaagagatgcaaattcaaaaa 6673777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 155
Target Start/End: Original strand, 16761728 - 16761871
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgccctt-gactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16761728 agaacccgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgtcaccttttgactccaacattgtggacttaacctcattatgtattc 16761827  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 155  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16761828 tatgtacttcagcataagcatgcatccatgcattcattcataaa 16761871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 155
Target Start/End: Original strand, 19837545 - 19837686
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 112  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19837545 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccgtagtcctcaccaaatggcattgttacctttgactccaacattgtggacttaacctcatcatttattct 19837643  T
Q  113 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 155  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19837644 atgtactttaacataagcatgcatacatgcattcattcataaa 19837686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 352
Target Start/End: Original strand, 20735863 - 20736209
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 112  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||     
T  20735863 agaacccgtgatacaagtgcaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgtcgttacccttggctccaactttgtggacttaacctccccatgcattcc 20735962  T
Q  113 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaa---aaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatca 209  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||   ||  |   | || |||| ||||||| |||        ||||||||    
T  20735963 atgttctttagcataatcatgcatacatgcattcattcataaa-aactttttttttctcactaatatcgaagtacttagataagtgtttgt-aaacatca 20736060  T
Q  210 tgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaa-cttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctt-tccttggtttcgt 302  Q
      | ||  ||||||||||| | ||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     ||| || |||||||||||||    
T  20736061 aagatacagaccttgtaaggaagaacaccaagaaatccaaacttcaaaaa-tcttaactaagctttagcttttgttaagaacttttatccttggtttcgt 20736159  T
Q  303 tcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 352  Q
    |||||| ||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  20736160 tcttactttttgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaattttcaaa 20736209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 155
Target Start/End: Original strand, 20740901 - 20741043
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 112  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||     
T  20740901 agaacccgtgatacaagtgcaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcatcgttacccttggctccaaatttgtggacttaacctcaccatgcattcc 20741000  T
Q  113 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 155  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20741001 atgttctttagcataatcatgcatacatgcattcattcataaa 20741043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 352
Target Start/End: Original strand, 20744421 - 20744767
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 112  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||     
T  20744421 agaacccgtgatacaagtgcaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcatcgttacccttggctccaaatttgtggacttaacctcaccatgcattcc 20744520  T
Q  113 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaa---aaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatca 209  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||   ||  |   | || |||| ||||||| |||        ||||||||    
T  20744521 atgttctttagcataatcatgcatacatgcattcattcataaa-aactttttttttctcactaatatcgaagtacttagataagtgtttgt-aaacatca 20744618  T
Q  210 tgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaa-cttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctt-tccttggtttcgt 302  Q
      | ||  ||||||||||| | ||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     ||| || |||||||||||||    
T  20744619 aagatacagaccttgtaaggaagaacaccaagaaatccaaacttcaaaaa-tcttaactaagctttagcttttgttaagaacttttatccttggtttcgt 20744717  T
Q  303 tcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 352  Q
    |||||| ||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  20744718 tcttactttttgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaattttcaaa 20744767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 22105104 - 22104942
Alignment:
Q  32 caatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaa-cctcatcatgtattctatgtactt-tagcataac 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||| || || ||||| |||   ||   | ||||||||     
T  22105104 caatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgtttttacccttaactccaactttatggacttaaaccccaccatgttttcaccgtttgtgtagcataat 22105005  T
Q  130 catgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105004 catgcatacatgcattcattcataaacaactctttccatcaaaaaattgaaggacttagacaa 22104942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 149
Target Start/End: Original strand, 32001904 - 32002040
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||| |||||||||| ||||  |||    
T  32001904 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccctaccaaatggcgttgttacccttaagctccaactttgtgggcttaacctcaccatgcgttc 32002002  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcatt 149  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32002003 catgttctttagcataatcatgcatacatgcattcatt 32002040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 22161060 - 22160921
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||  |||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  22161060 agaacccgtgatacatgtaca-tttgaaaccgtagtacctaccaaatggcgttgttatccttaagctccaacattatggacttaacctcaccatgcattc 22160962  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcat 152  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22160961 catgttctttagcataatcatgcatacatgcattcattcat 22160921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 136
Target Start/End: Original strand, 23917521 - 23917644
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgg-acttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||| ||||||| ||  |||||||||    
T  23917521 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacaattgactccaacattatggaacttaacttccccatgtattc 23917619  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcat 136  Q
    ||||||||||||||| | |||||||    
T  23917620 tatgtactttagcattatcatgcat 23917644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 24709436 - 24709061
Alignment:
Q  20 gtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtact 119  Q
    ||||| |||||||| | ||||||| |||||| ||||| | | |||  || ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||  |||| |     ||    
T  24709436 gtgattcaggtaca-tgtgaaaccgtagtccctaccatacgacgtgttttccctttactccaacattatggacttaacctca-cacctatttt-----ct 24709344  T
Q  120 ttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnnc--aaacatcatgggtatg 217  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||| || | ||||||||||||| ||||          ||||||||    ||||    
T  24709343 ttagcataatcatgcatacatgcactcattcataaataatt-tttccatccaata-ttgaaggacttagtcaagtttttgttgtaaacatcacatatatg 24709246  T
Q  218 gaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttcttaccttt 312  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||     | |  |||||||| |||||||||   |||    
T  24709245 ggccttgtaagaaggaacaccaagaaatacaacttc-aaaagtcttaactaagctttagcttttgttaagaatttcttccttggcttcgttcttgttttt 24709147  T
Q  313 tgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtc 399  Q
    |||||| ||||||| ||||||  |||||||||| ||| || | || |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  24709146 tgaaaagggaaccgattgcaatatctttacaattttc-aattaaaaccatgttcctctgcaatgtctacaatttactttgaaaagtc 24709061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 25857200 - 25857102
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  25857200 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccctaccaaatggcgttgttatccttaagctccaacattatggacttaacctcaccatgcattc 25857102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 214 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 22160856 - 22160721
Alignment:
Q  214 tatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttcttac 308  Q
    ||||||||||||||||| |||||||      ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||     | | ||||||||||||||||||||     
T  22160856 tatggaccttgtaagaaggaacacc------tacaacttcaaaaac-cttaactaagctttagcttttgttatgaattttttccttggtttcgttctta- 22160765  T
Q  309 cttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 352  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  22160764 cttttgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaattttcaaa 22160721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 255 - 352
Target Start/End: Original strand, 20741148 - 20741251
Alignment:
Q  255 aaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctt-tccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgtt 348  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||     ||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||| ||    
T  20741148 aaaaatcttaactaagctttagcttttgtttagaacttttatccttggtttcgttcttactttttgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaatttt 20741247  T
Q  349 caaa 352  Q
    ||||    
T  20741248 caaa 20741251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 415 - 456
Target Start/End: Original strand, 32002307 - 32002348
Alignment:
Q  415 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcata 456  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  32002307 ctatttttgcataagcatagcatgcatcattttgcattcata 32002348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 415 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 25856805 - 25856759
Alignment:
Q  415 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 461  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  25856805 ctatttttgcataagcatagcatgcatcattttgcatacataatttc 25856759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 25856930 - 25856869
Alignment:
Q  288 tttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttca 350  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||| ||||    
T  25856930 tttccttggtttcgttctta-cttttgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaattttca 25856869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 366; Significance: 0; HSPs: 58)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 682
Target Start/End: Original strand, 41000421 - 41001098
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  41000421 agaacccgtaatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattgtggagcttaaccttaccatgtattc 41000520  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttc-catcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcat 210  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||| ||||        ||||||||     
T  41000521 tatgtactttagcattatcatgcatacatgcattcattcgtaaacaactttttttcatcaaaaa-ttgaaggacttaggcaagtttttgt-aaacatcaa 41000618  T
Q  211 gggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttca-aaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttc 304  Q
     |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||     | | |||||||||||||||||    
T  41000619 aggtatggaccttttaagaatgatcaccaagagatacaacttcataaaaatcttaactaagccttagcttttgttaagaagtttttccttggtttcgttc 41000718  T
Q  305 ttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttcn 404  Q
    ||| |||||||||||| ||||  || |||  |||||||||| |||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41000719 ttaacttttgaaaaag-aacctattccaatatctttacaattttcaaa-tgaaactatgttcctcgacaatgtttacaattcactttgataagtccttca 41000816  T
Q  405 nnnnnnnnnn---ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagttt-ctggtacgtgtctcatattttgtttctaccagcaaaaggt 500  Q
                 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  41000817 aaaaaaaaattatctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagttttctagtccatgtctcatattttgcttctacctacaaaaggt 41000916  T
Q  501 caatccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggt 600  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41000917 caatccatcagtaaagtggtccaatgtcttcatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggatcgacttgagcaagaggt 41001016  T
Q  601 ccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggccaca 682  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41001017 ccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatcttcattgatggccaca 41001098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 682
Target Start/End: Original strand, 41009203 - 41009880
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  41009203 agaacccgtaatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattgtggagcttaaccttaccatgtattc 41009302  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttc-catcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcat 210  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||| ||||        ||||||||     
T  41009303 tatgtactttagcattatcatgcatacatgcattcattcgtaaacaactttttttcatcaaaaa-ttgaaggacttaggcaagtttttgt-aaacatcaa 41009400  T
Q  211 gggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttca-aaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttc 304  Q
     |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||     | | |||||||||||||||||    
T  41009401 aggtatggaccttttaagaatgatcaccaagagatacaacttcataaaaatcttaactaagccttagcttttgttaagaagtttttccttggtttcgttc 41009500  T
Q  305 ttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttcn 404  Q
    ||| |||||||||||| ||||  || |||  |||||||||| |||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  41009501 ttaacttttgaaaaag-aacctattccaatatctttacaattttcaaa-tgaaactatgttcctcgacaatgtttacaattcactttgataagtccttca 41009598  T
Q  405 nnnnnnnnnn---ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagttt-ctggtacgtgtctcatattttgtttctaccagcaaaaggt 500  Q
                 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  41009599 aaaaaaaaattatctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagttttctagtccatgtctcatattttgcttctacctacaaaaggt 41009698  T
Q  501 caatccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggt 600  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41009699 caatccatcagtaaagtggtccaatgtcttcatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggatcgacttgagcaagaggt 41009798  T
Q  601 ccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggccaca 682  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41009799 ccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatcttcattgatggccaca 41009880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 8203499 - 8202817
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  8203499 agaacccgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatgacgttgttacccttgactccaacattgtggaacttaacctcaccatgtactc 8203400  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnn-caaacatcat 210  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||        ||||||| ||    
T  8203399 tatgtactttagcataatcatgcatacatgcattcattcacaaacaactttctccatcaaaaa-ttgaaggacttacacaagtttttttgcaaacattat 8203301  T
Q  211 gggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt------actctttccttggtttcgttc 304  Q
    || |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       ||| ||||||||||||| |||    
T  8203300 ggatatggaccgtgtaagaatgaacatcaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagcttttgattaagaactttttccttggtttcattc 8203201  T
Q  305 ttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaa-ttcactttgataagtccttc 403  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||  |||||||||| || |||||||| |||||||||| || |||||||| || || | |||| ||| ||||||    
T  8203200 ttaccttttgaaaaaagaacctattgcaatatctttacaatttt-aaaatgaatccatgttcctttaaaatgtttataaattaagtttggtaaatccttc 8203102  T
Q  404 nnnnnnnnnnnct------atttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgtttctaccagcaaaa 497  Q
                       |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  8203101 gataaaaaaaaaattgtacatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtctgtgtctcatattttgtttccatcagcaaaa 8203002  T
Q  498 ggtcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaaga 597  Q
    ||||||| | |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||    
T  8203001 ggtcaatacgtcagtaaagtggttcgatgtcttcatccaagttcggctcgcatatgcagtcactcgtgcaaacacaaaaaatggatcgatttgagcaaga 8202902  T
Q  598 ggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggccaca 682  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8202901 ggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacactttgggctgaggtagagaagttaactagcctagtatcttcattgatggccaca 8202817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 13 - 678
Target Start/End: Original strand, 25265673 - 25266342
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  25265673 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatgacgttgttaccattgactccaacattgtggaacttaccctcaccatgtattc 25265771  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaa---aaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatc 208  Q
    |||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||   ||||||||||||||||||||||        |||||||    
T  25265772 tatccactt-agcataatcatgcatacatgcattcattcataaacaactttttccataaataaaaaattgaaggacttagacaagtttttgt-aaacatc 25265869  T
Q  209 atgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagcttt-agctttcgt------actctttccttggtttcg 301  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||| |||||  ||      |||  |||||||||||||    
T  25265870 acggatatggaccttgtaagaatgaacaccaagaaatacaacttccaaaatt-ttaactaagcttttagcttatgttaaagaacttcttccttggtttcg 25265968  T
Q  302 ttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacg-tctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtcc 400  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||| ||   |||| ||||| |||||| |||| |||| ||||||| | ||||||||| |||||||| | ||||||    
T  25265969 ttcttaccttttgaaaaagaaacctattgtaaatatcttgacaattttcaaa-tgaaaccatattcctctgccatgtttacatttcactttaacaagtcc 25266067  T
Q  401 ttcnnnnnnnnnnnctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgt-ttctaccagcaaaagg 499  Q
    |||           |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| | | ||| |||| |||  ||||||    
T  25266068 ttcaaaaaaat---ctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtctgtatctcacactgtgtcttct-ccataaaaagg 25266163  T
Q  500 tcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagagg 599  Q
    ||||| ||| |||||||| ||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  25266164 tcaattcattagtaaagtggtcagatgtcttcatccaagttcggctcacatatgcagacactcgtgcaaacacaaaagatggatcaacttgagcaagagg 25266263  T
Q  600 tccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 678  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  25266264 tccacgagcttcgtggagaagtaacaacacttcgggctgaggtagagaagttaactagccttgtatcttcattgatggc 25266342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 84 - 666
Target Start/End: Original strand, 17928027 - 17928609
Alignment:
Q  84 attgtggacttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaagga 183  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  17928027 attgtgaacttaacctcatcatgtattctatgtactttaacataactaggaatacatgcattcattcataaacaactttttccatcaaaac-ttgaagga 17928125  T
Q  184 cttagacaagnnnnnnncaaacatcatgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt 283  Q
     ||||||||        ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  17928126 tttagacaaattttttgcaaacatcacggttatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatagaacttcaaaaa-tcttaattaagctttcgctttcgt 17928224  T
Q  284 -----actcttt--ccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatg 376  Q
         ||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||| | |||   ||||||  |||||||||| |||||| |||| |||||||||||| | |||    
T  17928225 taagtactttttttccttggtttcgttcttaccttgtgaaaaggaaacatattgcaatatctttacaattttcaaa-tgaaaccatgttcctctgccatg 17928323  T
Q  377 tttacaattcactttgataagtccttcnnnnnnnnnnncta-tttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagttt-ctggtacgtgtctc 474  Q
    |||||      ||||||||||||||||            |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||    
T  17928324 tttac------ctttgataagtccttcaaaaaaaaaaattcctttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagttttctagtccatgtctc 17928417  T
Q  475 atattttgtttctaccagcaaaaggtcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaatagga 574  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |    
T  17928418 atattttgtttctacctacaaaaggtcaatccgtcagtaaagtggttcgatgtcttcatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgtaaacacaa 17928517  T
Q  575 aaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatc 666  Q
    || ||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  17928518 aagatggatcaacttgagcaagaagtccaggaacttcgtggagaggtaataacacttcgggttgaggtagagaagttaactagccttgtatc 17928609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 39 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 10720658 - 10719996
Alignment:
Q  39 aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataaccatgcata 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  10720658 aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttaccattgactccaacgttgtggaacttaccctcaccatgtattctatccactt-agcataaccatgcata 10720560  T
Q  138 catgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaatt-------gaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgggtatggaccttgtaagaa 230  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||       ||||||||||||||||        |||||||| || |||||||||||||||||    
T  10720559 catgcattcattcataaacaaccttttccatcaaaaaatttttttttgaaggacttagacaagtttttgt-aaacatcacggatatggaccttgtaagaa 10720461  T
Q  231 tgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagcttt-agctttcgt------actctttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaa 323  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||  ||      |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10720460 tgaacaccgagaaatacaacttccaaaa-tcttaactaagcttttagcttatgttaaagaacttcttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaagaaa 10720362  T
Q  324 ccgtttgcaacg-tctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttcnnnnnnnnnnn-------- 414  Q
    ||  ||| ||   |||| ||||| |||||| |||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||| | |||||||||                       
T  10720361 cctattgtaaatatcttgacaattttcaaa-tgaaaccatgttcctctgccatgtttacatttcactttaacaagtccttcaaaaaaaaaaaaaaaaaaa 10720263  T
Q  415 ---ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgt-ttctaccagcaaaaggtcaatccatca 510  Q
       |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| | | ||| |||| |||  ||| ||||||| ||| |    
T  10720262 aatctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtctgtatctcacactgtgtcttct-ccataaaagggtcaattcatta 10720164  T
Q  511 gtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagctt 610  Q
    ||||||| ||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10720163 gtaaagtggtcagatgtcttcatccaagttcggctcacatatgcagacactcgtgcaaacacaaaagatggatcaacttgagcaagaggtccacgagctt 10720064  T
Q  611 cgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 678  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  10720063 cgtggagaagtaacaacacttagggctgaggtagagaagttaactagccttgtatcttcattgatggc 10719996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 13 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 9552993 - 9552601
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 111  Q
    ||||||| || |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  9552993 agaacctttgttacaagtacatttt-aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattgtggaacttaacctcaccatatattc 9552895  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatg 211  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||        ||||||||      
T  9552894 tatgtactttagcattatcatgcatacatgcattcattcataaaaaactttttccatca-aaaattgaaggacttagacaagtttttgt-aaacatcaaa 9552797  T
Q  212 ggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaa-atcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttct 305  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||     ||| |||||||||||| |||||    
T  9552796 ggtatggaacttttaagaatgatcaccaagagatacaacttcaaaaatatcttaactaagctttagcttttgttaagaactttttccttggtttagttct 9552697  T
Q  306 taccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttc 403  Q
    || ||||||||||| |||||  ||||||  |||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9552696 taacttttgaaaaa-gaacctattgcaatatctttacaattttc-aaatgaaactatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttc 9552601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 11 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 15683093 - 15682786
Alignment:
Q  11 gcagaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtatt 110  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  15683093 gcagaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttaccctcgactccaacat-gtggacttaacatcaccatgtatt 15682996  T
Q  111 ctatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaag-nnnnnnncaaacatca 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||        |||||||||    
T  15682995 ctatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaactactttttccatca-aaaattgaaggacttacacaagtttttttgcaaacatca 15682897  T
Q  210 tgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttc-aaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgtt 303  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||     ||| |||||||||||| | |    
T  15682896 tgggtatggaccttgtaaggatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaaatcttaactaagttttaacttttgttaagaactttttccttggttttgat 15682797  T
Q  304 cttaccttttg 314  Q
    |||||||||||    
T  15682796 cttaccttttg 15682786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 352
Target Start/End: Original strand, 14420436 - 14420777
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 112  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14420436 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtcattaccaaatggcgttgttacctttgactccaacattgtggacttaacctcaccatgtattct 14420534  T
Q  113 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgg 212  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||  |||||        |||||||| ||    
T  14420535 atgtactttagcatcaccatgcatacatgcattcattcataaacaactttttccatc-aaaaattgaaggatttgtacaagtttttgt-aaacatcacgg 14420632  T
Q  213 gtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----ac-tctttccttggtttcgttctt 306  Q
     ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||     || | |||||||||||||||||||    
T  14420633 atatggtccttataagaaggaacaccaagaaatacaacttc-aaaaatcttaactaagctttagcttttgttaagaacttttttccttggtttcgttctt 14420731  T
Q  307 accttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 352  Q
    || ||||||||| ||||||  | ||||| |||| ||||| ||||||    
T  14420732 actttttgaaaagggaaccaatagcaacatcttcacaattttcaaa 14420777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 3243272 - 3242630
Alignment:
Q  21 tgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcat--catgtattctatgtac 118  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||  || |||||||||||| |||| | ||| |||| |||   ||||| |||||||| |    
T  3243272 tgatacaggtaca-tgtgaaaccatagtccttaccatgtggcgtgtttacccttgactccatcattatagacctaacttcacaccatgttttctatgttc 3243174  T
Q  119 tttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttc-catcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgggtatg 217  Q
    |||||||||| |||||||| ||        | ||||| |||| |||| |||||| |  | ||||||||||||||||        ||||||||  ||||||    
T  3243173 tttagcataatcatgcatagat--------tgataaataactttttctcatcaata--tcgaaggacttagacaagttttttgtaaacatcaaaggtatg 3243084  T
Q  218 gaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttcttaccttt 312  Q
     |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||     |||  |||||||| ||| ||||| | |||    
T  3243083 aaccttgtaagaaggaacaccaagaaatacaacttcaaaaa-tcttaactaagcttttgcttttgttaagaacttcttccttggcttctttcttgc-ttt 3242986  T
Q  313 tgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttcnnnnnnnnn 412  Q
    |||||| ||||||| ||||||  |||||||||| |||||| | || |||||||||| | |||||||||||||| ||||| | ||| |||||             
T  3242985 tgaaaatggaaccgattgcaatatctttacaattttcaaa-taaaaccatgttcctatgcaatgtttacaattaactttaacaagcccttcaaaaaaaat 3242887  T
Q  413 nn-ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttg-cattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgtttctaccagcaaaaggtcaatccatca 510  Q
       | |||||||||||| | ||||||||||| ||||  |||||||||||||| || ||||||||| | | ||| | | | |  ||||||| |||||||||    
T  3242886 tgtccatttttgcataaacatatcatgcatcgttttttcattcatagtttctagtccgtgtctcacactgtgtcttttcaat-aaaaggttaatccatca 3242788  T
Q  511 gtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagctt 610  Q
    ||||||| ||   |||||  ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  3242787 gtaaagtggtctgatgtcctcatccaaattcggctcgcacatgcaaactctcgtgcaaatacaaaaaatggatcagcttgaacaagaggtccacgagctt 3242688  T
Q  611 cgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctt 668  Q
    || | |||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||||    
T  3242687 cgcgaagaggtgacaacacttcgggccgagttagagaagttaactaaactagtatctt 3242630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 432 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 15682694 - 15682448
Alignment:
Q  432 tatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgt-ttctaccagcaaaaggtcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtctc 530  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| | | ||| |||| |||  |||||||| |||||| |||||||| ||   ||||||     
T  15682694 tatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtctgtatctcacactgtgtcttct-ccataaaaaggtccatccattagtaaagtggtcagatgtctt 15682596  T
Q  531 catccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacact 630  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15682595 catccaagttcggctcacacatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggaccggcttgagcaagaggttcatgagcttcgtggagaggtaacaacact 15682496  T
Q  631 tcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 678  Q
    | ||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  15682495 tagggctgaagtagagaagttaactagccttgtatcttcattgatggc 15682448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 23 - 344
Target Start/End: Original strand, 8608327 - 8608652
Alignment:
Q  23 atacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtacttt 121  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||| |||| |||| |||| |||| ||||    
T  8608327 atacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaattggcgttgttacccttaagctccaacattatggacttaatctcaccatgcattccatgttcttt 8608425  T
Q  122 agcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgggtatggac 220  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||  || || |||||||||||| ||         ||||||||  | ||| | |    
T  8608426 agcataatcatgcatacatgcattcattcataaa-aacttttttcctcactaatatcgaaggacttagataa-attcttgtaaacatcaaagatattgtc 8608523  T
Q  221 cttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctt-tccttggtttcgttcttaccttttg 314  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     ||| || ||||||||||| |||||| ||||||    
T  8608524 cttgtaagaaggaacaccaagaaatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagcttttgttaagaacttttatccttggtttcattctta-cttttg 8608622  T
Q  315 aaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaa 344  Q
    |||| ||||||  ||||||| |||| ||||    
T  8608623 aaaagggaaccaattgcaacatcttcacaa 8608652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 155
Target Start/End: Original strand, 15697794 - 15697936
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15697794 agaacccgtgatacaggtatatttt-aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttaaactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 15697892  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  15697893 tatgtactttagcataatcatccatacatgcattcatgcataaa 15697936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 155
Target Start/End: Original strand, 12557195 - 12557336
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 112  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||     
T  12557195 agaaccagtgataaaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcattgttacccttggctccaacattggggacttaacctcaccatgcattcc 12557293  T
Q  113 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 155  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12557294 atgttctttagcataatcatgcatacatgcattcattcataaa 12557336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 30093798 - 30093459
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  30093798 agaacccgtgatacaggtaca-tgtgaaaccatagtccctaccaaatggcgttgttacccttaaactccaacattgtggacttaacctcaccatgcattc 30093700  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcat---aaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacat 207  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    || |||| ||| | |||  || ||||||||||||||| |||        ||||||    
T  30093699 catgttctttagcataatcatgcatacatgcattcattcattgataaaaacttttttc-tcactaatattgaaggacttagataagttcttgt-aaacat 30093602  T
Q  208 catgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatac-aacttcaaaaaatcttaactaagctttagcttt-----cgtactctt-tccttggtttc 300  Q
    ||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||      | ||| || |||||||||||    
T  30093601 caaagatatggtccttgtaagaaagaacaccaagaaatccaaacttc-aaaaatcttaactaagctttagcttttcttaagaacttttatccttggtttc 30093503  T
Q  301 gttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaat 345  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||| |||||    
T  30093502 gttctta-cttttgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaat 30093459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 333
Target Start/End: Original strand, 11183583 - 11183903
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||| | |||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||    
T  11183583 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccctaccaaatggcattgttatccttaagctccaacattatggacttaatctcaccatgcattc 11183681  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcat 210  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||  |||  || || |||||||||||| |||        ||||||||     
T  11183682 catgttctttagcataatcatgcatacatgcattcattcat-aacacctttttc--tcactaatatcgaaggacttagataagttcttgt-aaacatcaa 11183777  T
Q  211 gggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttct 305  Q
     | ||||| ||||| ||||| |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||     ||| ||||||||||||||||||    
T  11183778 agatatggtccttgcaagaaggaacactaagaaatacaacttc-aaaaatcttaactaagctttagcttttgttaagaactttttccttggtttcgttct 11183876  T
Q  306 taccttttgaaaaaggaaccgtttgcaa 333  Q
    || |||||||| | | |||| |||||||    
T  11183877 ta-cttttgaagaggtaaccatttgcaa 11183903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 14885754 - 14885413
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| | | |||| ||||    
T  14885754 agaacccgtgatacaagtgcaaatt-aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttaaactccaacattgtggacttaacattaccatgcattc 14885656  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcat 210  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |  | ||||  |||  || || |||||||||||| |||        ||||||||     
T  14885655 catgttctttagcataatcatgcatacattctttcattcataaaaacttttttctctcactaatatcgaaggacttagataaggttcttgtaaacatcaa 14885556  T
Q  211 gggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttct 305  Q
     | ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||||| |||| |||| ||     ||| ||||||||||||||||||    
T  14885555 agatatggtccttgtaagaaggaacaccaagaaatgcaatttc-aaaaatcttaactaag-tttatcttttgttaagaactttttccttggtttcgttct 14885458  T
Q  306 taccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaa 351  Q
    ||| ||||| ||||||||||  ||||||| |||| ||||| |||||    
T  14885457 tactttttg-aaaaggaaccaattgcaacatcttcacaattttcaa 14885413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 32 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 14891000 - 14890876
Alignment:
Q  32 caatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataacc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||| |    
T  14891000 caatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgatgttacccttaagctccaacattgtggacttaacctcaccatgcattccatgttctttagcataatc 14890901  T
Q  131 atgcatacatgcattcattcataaa 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  14890900 atgcatacatgcattcattcataaa 14890876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 18881408 - 18881266
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgg-acttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  18881408 agaacccgtgatgcaggtacattttgaa-ccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattgtggaacttaaccttaccatgtattc 18881310  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 155  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||| ||||||    
T  18881309 tatgtactttagcataatcatacacacatgcatccatccataaa 18881266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 12477456 - 12477128
Alignment:
Q  23 atacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgccctt-gactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtacttt 121  Q
    |||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| |||  |||| ||||    
T  12477456 atacaggtacaaat-gaagcgatagtccttaccaaatggcggtgttaccctttgcctccaacattttggacttaacctcaccatgcatttcatgttcttt 12477358  T
Q  122 agcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgggtatggac 220  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||  || || |||||||||||| |||        ||||||||  | ||||| |    
T  12477357 agcataatcatgcatacatgcattcattcataaa-aacttttttc-tcactaatatcgaaggacttagataagttcttgt-aaacatcaaagatatggtc 12477261  T
Q  221 cttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttc----gtactctttccttggtttcgttcttaccttttgaa 316  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||    | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  12477260 cttgtaagaaggaacaccaaaaaataaaacttc--aaaatcttaactaagctttagctttcttaagaactttttccttggtctcgttctta-cttttgaa 12477164  T
Q  317 aaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 352  Q
    || ||||||  ||||| | |||| ||||| ||||||    
T  12477163 aagggaaccaattgcagcatcttcacaattttcaaa 12477128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 32 - 461
Target Start/End: Original strand, 70314 - 70729
Alignment:
Q  32 caatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataacc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||            ||||| |    
T  70314 caatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgatgttacccttaagctccaacattgtggacttaacctcaccatgcattc------------cataaac 70401  T
Q  131 atgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgggtatggaccttgtaaga 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||| ||| || |||||||||||| |||        ||||||||  | ||||| |||| |||||    
T  70402 atgcatacatgcattcattcataaa-aacttttttc-tcacaaatatcgaaggacttagataagttcttgt-aaacatcaaagatatggtccttataaga 70498  T
Q  230 atgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaac 324  Q
    | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||     ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  70499 aggaacaccaagaaatacaacttc-aaaaatcttaaccaagctttagcttttgttaagaact-tttccttggtttcgttctta-cttttgaaaagggaac 70595  T
Q  325 cgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttcnnnnnnnnnnnctatttttgc 424  Q
    |  ||||||| | || ||||| ||| |||| || | |||||||| ||  | |||||||| | ||||||| |||||||||           ||||||||||    
T  70596 caattgcaacattttcacaattttc-aaataaaacaatgttcct-tatcaagtttacaa-tgactttgacaagtccttcaaaaaatgtgtctatttttgc 70692  T
Q  425 ataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 461  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  70693 ataagcatagcatgcatcattttgcattcataatttc 70729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 7095946 - 7095802
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgg-acttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| ||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  7095946 agaacccgtgatgcaagtgcaattt-aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattgtggaacttaccctcaccatgtattc 7095848  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaaca 157  Q
    |||||| || ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7095847 tatgtaattgagcattatcatacatacatgcattcattcataaaca 7095802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 461
Target Start/End: Original strand, 15622593 - 15623041
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||| |||| ||| || || |||    
T  15622593 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccctaccaaatggcgttgttacccttaagctccgacattgtggacctaacatcaccacgttttc 15622691  T
Q  112 tatg-tactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatca 209  Q
       | |  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||  || || |||||||||||| |||        ||||||||    
T  15622692 accgtttgtgtagcataatcatgcatacatgcattcattcataaa-aactttttc--tcactaatatcgaaggacttagataagttcttgt-aaacatca 15622787  T
Q  210 tgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttc 304  Q
      | || || |||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||     ||| |||||||||||||||||    
T  15622788 aagatagggtccttataagaaggaacaccaagaaatacaacttc-aaaaatcttaactaagctttagcttttgttaagaact-tttccttggtttcgttc 15622885  T
Q  305 ttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttc- 403  Q
    ||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||| ||| |||| || | |||||||| ||  | |||||||||| ||||||| |||||||||     
T  15622886 tta-cttttgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaattttc-aaataaaacaatgttcct-tatcaagtttacaatt-actttgacaagtccttca 15622981  T
Q  404 --nnnnnnnnnnnctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 461  Q
                 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15622982 aaaaaaaatgtgtctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcataatttc 15623041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 23286071 - 23285736
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||    
T  23286071 agaacccgtgatacaagtgcaaatt-aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttaaactccaacattgtggacttaaccttaccatgcattc 23285973  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcat 210  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||   |||  || || |||||||||||| |||        ||||||||     
T  23285972 catgttctttagcataatcatgcatacatgcattcattcgtaaa-aactttttttctcactaatatcgaaggacttagataagttcttgt-aaacatcaa 23285875  T
Q  211 gggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttct 305  Q
     | ||||||||||||||||| |||||||      ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||     | | ||||||||||||| ||||    
T  23285874 agatatggaccttgtaagaaggaacacc------tacaacttc-aaaaaccttaactaagttttagcttttgtaaagaattttttccttggtttcattct 23285782  T
Q  306 taccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 352  Q
    || |||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  23285781 ta-cttttgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaattttcaaa 23285736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 416 - 643
Target Start/End: Original strand, 27881584 - 27881810
Alignment:
Q  416 tatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgtttctaccagcaaaaggtcaatccatcagtaaa 515  Q
    ||||||| ||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||| || ||| ||||||| | |||||||  |  ||||||  |||||| ||||||||    
T  27881584 tatttttacataagcatttcatgcatcatgt-gcattcatagtttctagtccgtatctcatactctgtttctgtctacaaaagtccaatccgtcagtaaa 27881682  T
Q  516 gtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtgg 615  Q
    || ||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||| || ||||  ||||| |||||  |||  ||||||||| |    
T  27881683 gtggtctgatgtcttcatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtacaaacacaaaagattgatcagcttgaacaagaattccttgagcttcgtag 27881782  T
Q  616 agaggtaacaacacttcgggctgaggta 643  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27881783 agaggcaacaacacttcgggctgaggta 27881810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 23 - 280
Target Start/End: Original strand, 8806485 - 8806741
Alignment:
Q  23 atacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtacttt 121  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||| |||| ||||| |||| ||| |||| |||| |||| ||||    
T  8806485 atacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacctttaagctccatcattatggacctaacatcaccatgcattccatgttcttt 8806583  T
Q  122 agcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgggtatggac 220  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  | ||||  |||  || || |||||||||||| |||        ||||||||  | ||||| |    
T  8806584 agcataatcatgcatacatgcattcattcataaaaacttttttctctcactaatatcgaaggacttagataagtttttgt-aaacatcaaagatatggtc 8806682  T
Q  221 cttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagcttt 280  Q
     ||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  8806683 tttgtaagaaggaacatcaagaaatacaacttc-aaaaatcttaactaagcttttgcttt 8806741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 187
Target Start/End: Original strand, 15912056 - 15912220
Alignment:
Q  23 atacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacct--catcatgtattctatgtact 119  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||||  |    
T  15912056 atacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcgttattacccttaagctccaacattgtggacttaacctcacaccatgttttctatgtttt 15912154  T
Q  120 ttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttc-catcaaaaaattgaaggactta 187  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||| |||| |||||||| || ||||||||||    
T  15912155 ttagcataatcatgcatacat-cattcattcataa--aactttttctcatcaaaatatcgaaggactta 15912220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 155
Target Start/End: Original strand, 21609933 - 21610065
Alignment:
Q  23 atacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtacttt 121  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||| |||| ||||| |||| ||| |||| |||| |||| ||||    
T  21609933 atacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacctttaagctccatcattatggacctaacatcaccatgcattccatgttcttt 21610031  T
Q  122 agcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 155  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21610032 agcataatcatgcatacatgcattcattcataaa 21610065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 18960683 - 18960552
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 112  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||         |    
T  18960683 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacctttaactccaaca-tgtggacttaacctcat---------t 18960595  T
Q  113 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 155  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  18960594 atgtattttagcataatcatgcatgcatgcatccattcataaa 18960552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 613 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 9552558 - 9552489
Alignment:
Q  613 tggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggccaca 682  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9552558 tggagaggtaacaacacttcggactgaggtagagaagttaactagcctagtatcttcattgatggccaca 9552489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 13109714 - 13109591
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  13109714 agaacccgtgatacaggtaca-tttaaaaccatagtccctaccaaatggcgttgttatccttaagctccaacattatggacttaacctcaccatgcattc 13109616  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcat 136  Q
     |||| | ||||||||| |||||||    
T  13109615 catgttccttagcataatcatgcat 13109591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 15599688 - 15599553
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 112  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||  || ||||||||||||||| |      | ||||||| |||| ||||     
T  15599688 agaacccgtgatacaggtaca-tctgaaaccgtagtccttaccaaatgacgtctttacccttgactccaacact------taaacctcaccatgcattcc 15599596  T
Q  113 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 155  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15599595 atgttctttagcataatcatgcatacatgcattcattcataaa 15599553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 352
Target Start/End: Original strand, 6196558 - 6196889
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 112  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||   |||||||||||||||| |||||||| |||           
T  6196558 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcattgttactctaagctccaacattgtggacctaacctcaccat------- 6196649  T
Q  113 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaac--------tatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaa 204  Q
              |||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||        | ||| |||||||| || |||||||||||| |||        |||    
T  6196650 ----------gcatgatcatgcatacatgcattcatccataaaaaacttttttttttttttcatcaaaatatcgaaggacttagataagttttcgt-aaa 6196738  T
Q  205 catcatgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggttt 299  Q
    |||||  | || || |||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||     ||| ||||||||||||    
T  6196739 catcaaagatacggtccttataagaaggaacaccaagaaatacaacttc-aaaaatcttaactaagctttagcttttgttaagaactttttccttggttt 6196837  T
Q  300 cgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 352  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  6196838 cgttctta-cttttgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaattttcaaa 6196889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Original strand, 8618616 - 8618708
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatg 106  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8618616 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcattgttaccctaagctccaacattgtggacttaacctcaccatg 8618708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 15535158 - 15535066
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatg 106  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15535158 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcattgttaccctaagctccaacattgtggacttaacctcaccatg 15535066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 46398605 - 46398513
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatg 106  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46398605 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcattgttaccctaagctccaacattgtggacttaacctcaccatg 46398513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 524 - 656
Target Start/End: Original strand, 3679627 - 3679759
Alignment:
Q  524 atgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgactt-gagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggta 622  Q
    |||||| ||| ||| ||| |||| || ||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  3679627 atgtcttcattcaacttcagctcacacatgcaaacactcgtgcaaacacaaaaaatggatcgacttagag-aagaggtccacgagcttcgtgaagaagta 3679725  T
Q  623 acaacacttcgggctgaggtagtgaagttaacta 656  Q
    ||   ||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  3679726 actgtacttcgggccggggtagagaagttaacta 3679759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 524 - 656
Target Start/End: Original strand, 30016197 - 30016329
Alignment:
Q  524 atgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgactt-gagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggta 622  Q
    |||||| ||| ||| ||| |||| || ||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  30016197 atgtcttcattcaacttcagctcacacatgcaaacactcgtgcaaacacaaaaaatggatcgacttagag-aagaggtccatgagcttcgtgaagaagta 30016295  T
Q  623 acaacacttcgggctgaggtagtgaagttaacta 656  Q
    ||   ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  30016296 actgtacttcgggccgaggtagagaagttaacta 30016329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 86
Target Start/End: Original strand, 17919962 - 17920016
Alignment:
Q  32 caatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacatt 86  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  17919962 caatttgaaaccttagtccttaccaaatggtgttgttacccttgactccaacatt 17920016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 6970295 - 6970197
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||| | |||||||||||||| || |||| | ||||||| ||||| ||||    
T  6970295 agaacctgtgatacaagtacaattt-aaaccatagtccttaccaaataacattg-tacccttgactccaaccttatggattcaacctcaccatgttttct 6970198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 214 - 352
Target Start/End: Original strand, 33568206 - 33568341
Alignment:
Q  214 tatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttcttac 308  Q
    ||||||||||||||||| |||||||      ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||     | | ||||||||||||||||||||     
T  33568206 tatggaccttgtaagaaggaacacc------tacaacttcaaaaac-cttaactaagctttagcttttgttaagaattttttccttggtttcgttctta- 33568297  T
Q  309 cttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 352  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  33568298 cttttgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaattttcaaa 33568341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 334
Target Start/End: Original strand, 21610113 - 21610250
Alignment:
Q  202 aaacatcatgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----ac--tctttcctt 294  Q
    ||||||||  | |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||| |||||||||||||||||||| ||     ||  | |||||||    
T  21610113 aaacatcaaagatatggatcttgtaagaaggaacaccaagaaatacaaactc-aaaaaccttaactaagctttagcttttgttaagaactttttttcctt 21610211  T
Q  295 ggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaac 334  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||    
T  21610212 ggtttcgttctta-cttttgaaaagggaaccaattgcaac 21610250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 92
Target Start/End: Original strand, 30014230 - 30014309
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgccc-ttgactccaacattgtggac 92  Q
    |||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||| ||||||||||    
T  30014230 agaacccgtgatacaggtacaaat-gagaccatagtccttaccaaatggcgtgtttaccctttgactccatcattgtggac 30014309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 155
Target Start/End: Original strand, 41433823 - 41433968
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgccc-ttgactccaacattgtggactt--aacctcatcatgtat 109  Q
    |||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||  || ||| ||||||||| |||||||||| |  ||||||| ||||| |    
T  41433823 agaacccgtgatacaggtacaaat-gagaccatagtccttaccaaatgacgtgtttaccctttgactccatcattgtggacctaaaacctcaccatgttt 41433921  T
Q  110 tc----tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 155  Q
    ||    | |||||   ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  41433922 tcaccatttgtac---agcataatcatgcatacatgcattcatccataaa 41433968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 415 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 12477066 - 12477020
Alignment:
Q  415 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 461  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  12477066 ctatttttgcataagcatagcatgcatcattttgcattcataatttc 12477020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 415 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 14885349 - 14885303
Alignment:
Q  415 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 461  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  14885349 ctatttttgcataagcatagcatgcatcattttgcattcataatttc 14885303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 92
Target Start/End: Original strand, 3677659 - 3677738
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgccc-ttgactccaacattgtggac 92  Q
    |||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||  || ||| ||||||||| ||||||||||    
T  3677659 agaacccgtgatacaggtacaaat-gagaccatagtccttaccaaatgacgtgtttaccctttgactccatcattgtggac 3677738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 68
Target Start/End: Original strand, 4436511 - 4436547
Alignment:
Q  32 caatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgtt 68  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4436511 caatttgaaaccttagtccttaccaaatggcgttgtt 4436547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 92
Target Start/End: Original strand, 20436660 - 20436739
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgccc-ttgactccaacattgtggac 92  Q
    |||||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| |||  || ||| ||||||||| ||||||||||    
T  20436660 agaacccgtgatacaggtacaaat-gagaccatagtccttaccaaatgacgtgtttaccctttgactccatcattgtggac 20436739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 493 - 609
Target Start/End: Complemental strand, 26384192 - 26384076
Alignment:
Q  493 caaaaggtcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgag 592  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||  ||| |||  | |||| ||||  ||||||||||||| |  || |||||||| ||||||     
T  26384192 caaagggtcaatccattagtaaagtggtccaatgtcttcactcaaattcaacccgcacatgcgaacactcgtgcaaacacaaagaatggatcaacttgaa 26384093  T
Q  593 caagaggtccacgagct 609  Q
    |||||||||||| ||||    
T  26384092 caagaggtccacaagct 26384076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 61
Target Start/End: Original strand, 46373802 - 46373849
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatgg 61  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  46373802 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatgg 46373849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 14396353 - 14396298
Alignment:
Q  202 aaacatcatgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaa 257  Q
    ||||||||  |||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  14396353 aaacatcagaggtatggaccttgtaaaaaggaacaccgagaaatacaacttcaaaa 14396298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 24215438 - 24215391
Alignment:
Q  39 aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgccc-ttgactccaacat 85  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  24215438 aaaccttagtccttaccaaatggcgttgttaccctttgactccaacat 24215391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 415 - 461
Target Start/End: Original strand, 8806886 - 8806932
Alignment:
Q  415 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 461  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  8806886 ctatttttgcataagcatgacatgcatcattttgcattcataatttc 8806932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 345
Target Start/End: Original strand, 8618870 - 8618929
Alignment:
Q  284 actctttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaat 345  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  8618870 actttttccttggtttcgttctta-cttttg-aaagggaaccaattgcaacgtctttacaat 8618929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 461
Target Start/End: Original strand, 14420843 - 14420888
Alignment:
Q  416 tatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 461  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  14420843 tatttttgcataagcatagcatgcatcatttttcattcataatttc 14420888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 415 - 452
Target Start/End: Original strand, 20438484 - 20438521
Alignment:
Q  415 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcatt 452  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  20438484 ctatttttgcataagcatatcatgcatcatcttgcatt 20438521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 415 - 452
Target Start/End: Original strand, 41435649 - 41435686
Alignment:
Q  415 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcatt 452  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  41435649 ctatttttgcataagcatatcatgcatcatcttgcatt 41435686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 366; Significance: 0; HSPs: 22)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 682
Target Start/End: Original strand, 31542081 - 31542758
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 111  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||    
T  31542081 agaacctgtaatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattgtggagcttaaccttaccatgtattc 31542180  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttc-catcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcat 210  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||| ||||        ||||||||     
T  31542181 tatgtactttagcattatcatgcatacatgcattcattcgtaaacaactttttttcatcaaaaa-ttgaaggacttaggcaagtttttgt-aaacatcaa 31542278  T
Q  211 gggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaa-tcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttc 304  Q
     |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||     | | |||||||||||||||||    
T  31542279 aggtatggaccttttaagaatgatcaccaagagatacaacttcaaaaaaatcttaactaagccttagcttttgttaagaagtttttccttggtttcgttc 31542378  T
Q  305 ttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttcn 404  Q
    ||| |||||||||||| ||||  ||||||  |||||||||| |||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31542379 ttaacttttgaaaaag-aacctattgcaatatctttacaattttcaaa-tgaaactatgttcctcgacaatgtttacaattcactttgataagtccttca 31542476  T
Q  405 nnnnnnnnnn---ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagttt-ctggtacgtgtctcatattttgtttctaccagcaaaaggt 500  Q
                 |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  31542477 aaaaaaaaattatctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagttttctagtccatgtctcatattttgcttctacctacaaaaggt 31542576  T
Q  501 caatccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggt 600  Q
    |||||||||| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31542577 caatccatcaataaagtggtccaatgtcttcatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggatcgacttgagcaagaggt 31542676  T
Q  601 ccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggccaca 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31542677 ccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggatgaggtagtgaagttaactagcctagtatcttcattgatggccaca 31542758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 678
Target Start/End: Original strand, 2387295 - 2387963
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 111  Q
    ||||||| || |||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  2387295 agaacctttgttacaagtgcaattt-aaaccatagtccttaccaaatgacgttgttacccttggctccaacattgtggaacttaccctcaccatgtattc 2387393  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatg 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||  |||| |||||        |||||||| |    
T  2387394 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaaatttttccatcaaaaa-ttgaagagcttaaacaagttttttgtaaacatcacg 2387492  T
Q  212 ggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgtactctttccttggtttcgttcttacctt 311  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2387493 gatatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaa-atcttaactaagcttaagcttttgtactctttccttggtttcgttcttagctt 2387591  T
Q  312 ttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgttta-caattcactttgataagtccttc-----nn 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||           
T  2387592 ttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaaaccatgttcctctacaatgtttagaaattaacttcgataagtccttcaaaaata 2387691  T
Q  406 nnnnnnnnnctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgt-ttctaccagcaaaaggtcaat 504  Q
              ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |  || ||| ||||  || |||||||| |||    
T  2387692 aaaatttatatatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtccgtgtcttaccttgtgtcttct--catcaaaaggttaat 2387789  T
Q  505 ccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccac 604  Q
    || |||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2387790 ccgtcagtaaagtggttcgatgtctttatccaagttcggctcgcatatacagacactcatgcaaacaggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccac 2387889  T
Q  605 gagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 678  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2387890 gcgcttcgtggagaggtaacaacgcttcgggccaaggtagagaagttaactagcctagtatcttcattgatggc 2387963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 32 - 678
Target Start/End: Original strand, 13470882 - 13471530
Alignment:
Q  32 caatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataacc 130  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | || ||||| ||| ||||||||||||||| |  |||||    
T  13470882 caatttgaaaccttagtccttaccaaatggcgttgttatccttgactccaacattgtggaacgtaccctcaccatatattctatgtactttggtctaacc 13470981  T
Q  131 atgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgggtatggaccttgtaagaa 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||| || |||||||||||||||||    
T  13470982 atgcatacatgcattcattcataaacaactttttccat-aaaaaattgaaggacttagacaagttttttgtaaacatcacggatatggaccttgtaagaa 13471080  T
Q  231 tgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt------actctttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaac 324  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||       | |||||||||| |||  ||      |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13471081 tgaacaccaagagatacaactgcaaa-------atctaagctttaacttctgttaaagaacttcttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaagaaac 13471173  T
Q  325 cgtttg-caacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtcctt----cnnnnnnnnnnnctatt 419  Q
    |  ||| |||  |||||||||| ||| ||||||| ||||||||| || | ||||||||| |||||||||| ||||||||                |||||    
T  13471174 ctattgtcaatatctttacaattttc-aaatgaaaccatgttccgctgccatgtttacatttcactttgacaagtccttaaaaaaaaaaaaatgtctatt 13471272  T
Q  420 tttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgt-ttctaccagcaaaaggtcaatccatcagtaaagtc 518  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |   ||| ||||    | ||| ||||||| | ||||| ||||     
T  13471273 tttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtcagtgtctcacaccgtgtcttct--ttgtaaatggtcaattcgtcagtcaagtg 13471370  T
Q  519 gttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggaga 618  Q
    ||   |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13471371 gtcagatgtcttcatccaagttcggctcgcatatgtagacactcgtgcaaacacaaaagatggatcaacttgagcaagaggtccacgagcttcgttgaga 13471470  T
Q  619 ggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 678  Q
      ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  13471471 tttaacaacactttgggctgaggtagagaagttaactagccttgtatcttcattgatggc 13471530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 314
Target Start/End: Original strand, 31554281 - 31554592
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgg-acttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  31554281 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttaccattgactccaacgttgtggaacttaccctcaccatgtattc 31554379  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaa------ttgaaggacttagacaagnnnnnnncaaac 205  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||      ||||||||||||||||||        ||||    
T  31554380 tatccac-ttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaactaccttttccatcaaaaaaaattttttgaaggacttagacaagtttttgt-aaac 31554477  T
Q  206 atcatgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttc-aaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggttt 299  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||     ||| ||||||||||||    
T  31554478 atcacggatatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaaatcttaactaagttttaacttttgttaagaactttttccttggttt 31554577  T
Q  300 cgttcttaccttttg 314  Q
     | ||||||||||||    
T  31554578 tgatcttaccttttg 31554592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 433 - 678
Target Start/End: Original strand, 31554693 - 31554938
Alignment:
Q  433 atcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgt-ttctaccagcaaaaggtcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtctcc 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| | | ||| |||| |||  ||||||||||| ||| |||||||| ||   |||||| |    
T  31554693 atcatgcatcattttgcattcatagtttctagtctgtatctcacactgtgtcttct-ccataaaaaggtcaattcattagtaaagtggtcagatgtcttc 31554791  T
Q  532 atccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacactt 631  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31554792 atccaagttcggctcacatatgcagacactcgtgcaaacacaaaagatggatcaacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaagtaacaacactt 31554891  T
Q  632 cgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 678  Q
     |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  31554892 agggctgaggtagagaatttaactagccttgtatcttcattgatggc 31554938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 155
Target Start/End: Original strand, 13452956 - 13453098
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgg-acttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  13452956 agaacctgtgatgcaggtaca-tttgaaaccttagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattgtggaacttaccctcaccatgtattc 13453054  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 155  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  13453055 tatgtactttagcattatcatgcatacatgcattcatccataaa 13453098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 23 - 352
Target Start/End: Original strand, 22430075 - 22430404
Alignment:
Q  23 atacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtacttt 121  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || | ||||    
T  22430075 atacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaaggacgttgttacccttaagctccaacattgtggacttaacctcaccatgcattccattttcttt 22430173  T
Q  122 agcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgggtatggac 220  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||   |||  || || |||||||||||| |||        ||||||||  | ||||| |    
T  22430174 agcataatcatgcatacatgcattcattcataaa-aactttttttctcactaatatcgaaggacttagataagttattgt-aaacatcaaagatatggtc 22430271  T
Q  221 cttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttc----gtactctttccttggtttcgttcttaccttttgaa 316  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    | ||| |||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  22430272 cttgtaagaaggaacaccaaaatatacaacttc--aaaatcttaactaagctttagctttcttaagaactttttccttgatttcgttctt-gcttttgaa 22430368  T
Q  317 aaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 352  Q
    || ||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  22430369 aagggaaccaattgcaacatcttcacaattttcaaa 22430404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 32 - 403
Target Start/End: Original strand, 1957985 - 1958356
Alignment:
Q  32 caatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataacc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||| ||||||||||| |    
T  1957985 caatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgctgttactcttaagctccaacattgtggacttaacctcaccatacattccatgttctttagcataatc 1958084  T
Q  131 atgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgggtatggaccttgtaaga 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||   |||  || || |||||||||||| |||        ||||||||  | || |||||||||||||    
T  1958085 atgcatacatgcattcattcataa--aac-atttttctcactaatatcgaaggacttagataagttcttgt-aaacatcaaagatacggaccttgtaaga 1958180  T
Q  230 atgaacaccaagagatac-aacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctt-tccttggtttcgttcttaccttttgaaaaagga 322  Q
    | ||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||     ||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  1958181 aagaacaccaagaaatccaaacttc-aaaaatcttaactaagctttagcttttgttaagaacttttatccttggtttcgttctta-cttttgaaaaggga 1958278  T
Q  323 accgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttc 403  Q
    |||  ||||||| |||| ||||| ||| |||| || | |||||||| | ||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  1958279 accaattgcaacatcttcacaattttc-aaataaaacaatgttccttttcaa-gtttacaatt-actttgacaagtccttc 1958356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 14818202 - 14817945
Alignment:
Q  11 gcagaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtatt 110  Q
    ||||||||  || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||    
T  14818202 gcagaacccttgttacaagtgcaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgtcgttacccttggctccaactttgtggacttaacctcaccatgcatt 14818103  T
Q  111 ctatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcat 210  Q
    | |||| |||||||||||         |||||||||||||||||| |||| ||| || |  || || |||||| ||||| |||        ||||||||     
T  14818102 ccatgttctttagcataa--------tcatgcattcattcataaa-aacttttttcacc--aatatcgaaggatttagataagttcttgt-aaacatcaa 14818015  T
Q  211 gggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagcttt 280  Q
     | |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14818014 agatatggaccttgtaagaagaaacaccaagaaatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagcttt 14817945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 2341610 - 2341525
Alignment:
Q  20 gtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatg 106  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2341610 gtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattgtggacttaacctcaccatg 2341525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 8e-29
Query Start/End: Original strand, 32 - 128
Target Start/End: Original strand, 19370984 - 19371081
Alignment:
Q  32 caatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataa 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||    
T  19370984 caatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttaagctccaacattgtggacttaacctcaccatgcattccatgttctttagcataa 19371081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 6203100 - 6202787
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||| |||| ||| | ||| |||    
T  6203100 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtcccgaccaaatggcgttgttacccttaagctccgacattgtggacctaacatcaccgtgttttc 6203002  T
Q  112 tatg-tactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatca 209  Q
       | |  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||  || || ||| |||||||| |||        ||||||||    
T  6203001 accgtttgtgtagcataatcatgcatacatgcattcattcataaa-aactttttc--tcactaatatcgaatgacttagataagttcttgt-aaacatca 6202906  T
Q  210 tgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttc 304  Q
      | ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||     ||| |||||||||||||||||    
T  6202905 aagatatggtccttataagaaggaacaccaagaaatacaacttc-aaaaatcataactaagctttagcttttgttaagaactttttccttggtttcgttc 6202807  T
Q  305 ttaccttttgaaaaaggaacc 325  Q
    ||| |||||||||| ||||||    
T  6202806 tta-cttttgaaaagggaacc 6202787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 214 - 333
Target Start/End: Original strand, 19371138 - 19371260
Alignment:
Q  214 tatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttcttac 308  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||     ||| |||||||| |||||||||||     
T  19371138 tatggtccttgtaagaaggaacaccaagaaatacaacttc-aaaaatcttaactaagcttcaacttttgttaagaactttttccttgatttcgttcttat 19371236  T
Q  309 cttttgaaaaaggaaccgtttgcaa 333  Q
    | |||||| ||||||||||||||||    
T  19371237 c-tttgaagaaggaaccgtttgcaa 19371260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 113 - 461
Target Start/End: Original strand, 35071822 - 35072165
Alignment:
Q  113 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaa-attgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatg 211  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||   |||  || || |||||||||||| |||        ||||||||      
T  35071822 atgttctttagcataatcatgcatacatgcattcattcataaa-aactttttttctcactaatatcgaaggacttagataagttcttgt-aaacatcaaa 35071919  T
Q  212 ggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttctt 306  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||      ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||     | | |||||||||||||||||||    
T  35071920 gatatggaccttgtaagaaggaacacc------tacaacttcaaaaac-cttaactaagttttagcttttgttaagaattttttccttggtttcgttctt 35072012  T
Q  307 accttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttcnnn 406  Q
    || ||||||||| ||||||  ||||||| ||||  |||| |||||| | || | ||||||||   ||| |||||||||| ||||||| ||||||||        
T  35072013 ac-ttttgaaaagggaaccaattgcaacatcttctcaattttcaaa-taaaacaatgttccttatcaa-gtttacaatt-actttgacaagtccttaaaa 35072108  T
Q  407 nnnnnnnn--ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 461  Q
              |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35072109 aaaaaagtgtctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcataatttc 35072165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 160
Target Start/End: Original strand, 27168225 - 27168373
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggac--ttaacctcatcatgtatt 110  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| | || ||| |  | ||||||| ||||| ||    
T  27168225 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcgtt-atacccttgactccatcgttatgggccttaaacctcaccatgtttt 27168322  T
Q  111 c----tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaact 160  Q
    |    | |||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27168323 caccgtttgtac---agcataatcatgcatacatgcattcattcataaataact 27168373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 415 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 6202697 - 6202651
Alignment:
Q  415 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 461  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6202697 ctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcataatttc 6202651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 214 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 2341427 - 2341361
Alignment:
Q  214 tatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaa-cttcaaaaaatcttaactaagctttagcttt 280  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2341427 tatggtccttgtaagaaagaacaccaagaaatccaaacttcaaaaa-tcttaactaagctttagcttt 2341361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 415 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 14817809 - 14817763
Alignment:
Q  415 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 461  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  14817809 ctatttttgcataagcatagcatgcatcattttgcattcataatttc 14817763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 85
Target Start/End: Original strand, 22473489 - 22473543
Alignment:
Q  32 caatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgccc-ttgactccaacat 85  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  22473489 caatttaaaaccttagtccttaccaaatggcgttgttaccctttgactccaacat 22473543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 5635766 - 5635719
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatgg 61  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  5635766 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatgg 5635719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 415 - 461
Target Start/End: Original strand, 22430466 - 22430512
Alignment:
Q  415 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 461  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22430466 ctatttttgcataagcataccatgcatcattttgtattcataatttc 22430512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 415 - 452
Target Start/End: Original strand, 19371337 - 19371374
Alignment:
Q  415 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcatt 452  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  19371337 ctatttttgcataagcatatcatgcaccattttgcatt 19371374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 364; Significance: 0; HSPs: 47)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 24963236 - 24962560
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||| | |||||||||    
T  24963236 agaacccgtaatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacatcgtgaaacttaaccttaccatgtattc 24963137  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttc-catcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcat 210  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||| ||||        ||||||||     
T  24963136 tatgtactttagcattatcatgcatacatgcattcattcgtaaacaactttttttcatcaaaaa-ttgaaggacttaggcaagtttttgt-aaacatcaa 24963039  T
Q  211 gggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaa-tcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttc 304  Q
     |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||     | | |||||||||||||||||    
T  24963038 aggtatggaccttttaagaatgatcaccaagagatacaacttcaaaaaaatcttaactaagccttagcttttgttaagaagtttttccttggtttcgttc 24962939  T
Q  305 ttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttcn 404  Q
    ||| |||||||||||| ||||  ||||||  |||||||||| |||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24962938 ttaacttttgaaaaag-aacctattgcaatatctttacaattttcaaa-tgaaactatgttcctcgacaatgtttacaattcactttgataagtccttca 24962841  T
Q  405 nnnnnnnnnn--ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagttt-ctggtacgtgtctcatattttgtttctaccagcaaaaggtc 501  Q
                |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  24962840 aaaaaaaattatctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagttttctagtccatgtctcatattttgcttctacctacaaaaggtc 24962741  T
Q  502 aatccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtc 601  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24962740 aatccatcagtaaagtggtccaatgtcttcatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtc 24962641  T
Q  602 cacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggccaca 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24962640 cacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatcttcattgatggccaca 24962560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 322; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 21994291 - 21993638
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgg-acttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  21994291 agaacccgtgacaccggtacaatttgaaaccatagtctttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattatgggacttaacctcatcatgtattc 21994192  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatg 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||       |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||        ||||||||||    
T  21994191 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcatcca-------acaactttttccatcaaaaa-ttgaaggacttagtcaagtttttgt-aaacatcatg 21994101  T
Q  212 ggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgtactctttccttggtttcgttcttacctt 311  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21994100 gatatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaa-tcttaactgagctttagcttttgtactttttccttggtttcgttcttacctt 21994002  T
Q  312 ttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttcnnnnnnnn 411  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||   |||  |||||||| ||| ||||||||||||||||            
T  21994001 ttgaaaaaggaaccgtttgcgacgtctttacaatattcaaaatgaaaccatattc--gtactgtgtttacatttcgctttgataagtccttcaaaaaaat 21993904  T
Q  412 nnnctat-ttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgt-ttctaccagcaaaaggtcaatccatc 509  Q
        ||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| | ||| ||| |||| |||  ||||||||||||| ||    
T  21993903 tat-tatctttttcataagcatatcatgcatcattttgtattcatagtttctagtccgtgtcttacattgtgtcttct-cca-taaaaggtcaatccgtc 21993807  T
Q  510 agtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagct 609  Q
    ||| |||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||    
T  21993806 agtcaagtggttagatgtcttcatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggatcggcttgagcaagaagtccaggatct 21993707  T
Q  610 tcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 678  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  21993706 tcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagagaaattaactagccttgtatcttcattgatggc 21993638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 403
Target Start/End: Original strand, 20378632 - 20379025
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 112  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  20378632 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccgaatggcgttgttaccctcgactccaacat-gtggacttaacatcaccatgtattct 20378729  T
Q  113 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaac-tatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatg 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||       |||||||||||    
T  20378730 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaacttttttccatc-aaaaattgaaggacttagacaagttttttgcaaacatcatg 20378828  T
Q  212 ggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttc-aaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttct 305  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||     ||| |||| ||||||||| |||    
T  20378829 ggtatggactttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaaatcttaactaaactttagcttttgttaagaactttttctttggtttcgatct 20378928  T
Q  306 taccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgttt-acaattcactttgataagtccttc 403  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||  |||| | ||| ||| ||||||| ||||||| |||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  20378929 tacctttcgaaaaa-gaaccttttgcaatatcttcataattttc-aaatgaaaccatgtttctctaccatgtttaaaaattaactttgataagtccttc 20379025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 445 - 678
Target Start/End: Original strand, 28846480 - 28846712
Alignment:
Q  445 tttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgtttctaccagcaaaaggtcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggc 544  Q
    |||||||||||| ||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28846480 tttgcattcata-tttctagtctgtatctcatattttgtttctaccagcaaaaggtcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtcttcatccaagttcggc 28846578  T
Q  545 tcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtag 644  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28846579 tcgcatatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtag 28846678  T
Q  645 tgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 678  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28846679 agaagttaactagcctagtatcttcattgatggc 28846712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 403
Target Start/End: Original strand, 28846073 - 28846460
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  28846073 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaagtggcgttgttaccctcgactccaacattgtagaacttaacctcctcatgtattc 28846171  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatg 211  Q
     ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||       ||||||| |||    
T  28846172 aatgaactttagtataaacatgcatacatgcattcattaataaatatatttttccatcaaaaa-ttgaaggacttagacaagttttttgcaaacattatg 28846270  T
Q  212 ggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgtactctttccttggtttcgttcttacctt 311  Q
    | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28846271 gatatggaccttgtacgagtgaacaccaagagatacaacttcaaaa-atcttaactgagctttagcttttgtactttttccttggtttcgttcttacctt 28846369  T
Q  312 ttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgttt-acaattcactttgataagtccttc 403  Q
    |||||||||| ||| |||||||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||||| |||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  28846370 ttgaaaaagg-accttttgcaatatcttcacaattttc-aaatgaaaccatgtttctctaccatgtttaaaaattaactttgataagtccttc 28846460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 254 - 678
Target Start/End: Original strand, 23638462 - 23638889
Alignment:
Q  254 aaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgtt 348  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||     ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||  |||| ||||| ||    
T  23638462 aaaaaatcttaactaagctttaacttttgttaagaactttttccttggtttcgttcttatcatttgaaaaagga-ccttttgcaatatcttcacaatttt 23638560  T
Q  349 caaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaa-ttcactttgataagtccttcnnnnnnnnnnnc-tat-ttttgcataagcctatcatgcatcat- 444  Q
    |||| |||| |||||||  ||||||||||||| || || |||||||||||||||||             ||  ||||||||||    ||||||||||||     
T  23638561 caaa-tgaaaccatgtttatctacaatgtttaaaaattaactttgataagtccttcaaaaaaaaaattgtacattttgcataa----atcatgcatcatc 23638655  T
Q  445 tttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgtttctaccagcaaaaggtcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggc 544  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||   |||||| ||||||||||||||    
T  23638656 tttgcattcatagtttctagtccatgtctcatattctgtttttacctacaaaaggtcaatccaacagtaaagtggtcagatgtcttcatccaagttcggc 23638755  T
Q  545 tcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtag 644  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23638756 tcgcatatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggaccggcttgagcaagaggttcatgagcttcgtggagaggtaacaacacttagggctgaggtag 23638855  T
Q  645 tgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 678  Q
     ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  23638856 agaagttaactagccttgtatcttcattgatggc 23638889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 254 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 23834427 - 23833998
Alignment:
Q  254 aaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgtt 348  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||     ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||  |||| ||||| ||    
T  23834427 aaaaaatcttaactaagctttaacttttgttaagaactttttccttggtttcgttcttatcatttgaaaaagga-ccttttgcaatatcttcacaatttt 23834329  T
Q  349 caaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaa-ttcactttgataagtccttcnnnnnnnnnnnctatt----tttgcataagcctatcatgcatca 443  Q
    |||| |||| |||||||  ||||||||||||| || || |||||||||||||||||            |  |    |||||||||    |||||||||||    
T  23834328 caaa-tgaaaccatgtttatctacaatgtttaaaaattaactttgataagtccttcaaaaaaaaaaaattgtacattttgcataa----atcatgcatca 23834234  T
Q  444 t-tttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgtttctaccagcaaaaggtcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcg 542  Q
    | |||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||   |||||| ||||||||||||    
T  23834233 tctttgcattcatagtttctagtccatgtctcatattctgtttttacctacaaaaggtcaatccaacagtaaagtggtcagatgtcttcatccaagttcg 23834134  T
Q  543 gctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggt 642  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23834133 gctcgcatatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggaccggcttgagcaagaggttcatgagcttcgtggagaggtaacaacacttagggctgaggt 23834034  T
Q  643 agtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 678  Q
    || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  23834033 agagaagttaactagccttgtatcttcattgatggc 23833998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 6e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 21866389 - 21866131
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  21866389 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttggcttcaacattgtggaacttaccctcaccatgtattc 21866291  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatg 211  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||        ||| |||| |    
T  21866290 tatgttctttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactttttccatc--aaaattgaaggacttagacaagtttttgt-aaatatcagg 21866194  T
Q  212 ggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagcttt 274  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21866193 gatatggatcttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttaaaaaaatcttaactaagcttt 21866131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 415 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 12178616 - 12178351
Alignment:
Q  415 ctatttttgcataagcctatcatgcatcat-tttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatatttt-gtttctaccagcaaaaggtcaatccatcagt 512  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||| ||||    
T  12178616 ctatttttgcataagcatatcatgcatcatctttgcattcatagtttctagtccatgtctcatatttttgtttttacctacaaaaggtcaatccaacagt 12178517  T
Q  513 aaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcg 612  Q
    ||||| ||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12178516 aaagtggtcagatgtcttcatccaagttcggctcacatatgcagacactcgtgcaaacacaaaagatggatcaacttgagcaagaggtccacgagcttcg 12178417  T
Q  613 tggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 678  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  12178416 tggagaaataacaacacttcgggctgaggtagagaagttaactagccttgtatcttcattgatggc 12178351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 415 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 27231688 - 27231425
Alignment:
Q  415 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgt-ttctaccagcaaaaggtcaatccatcagta 513  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| | | ||| |||| ||| ||||||||| |||||| ||||    
T  27231688 ctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtctgtatctcacactgtgtcttct-ccatcaaaaggtcgatccattagta 27231590  T
Q  514 aagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgt 613  Q
    |||| ||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||    
T  27231589 aagtggtcagatgtcttcatccaagttcggctcacatatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggaccggcttgagcaagaggttcatgagcttcgt 27231490  T
Q  614 ggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 678  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27231489 ggagaggtaacaacacttagggctgaggtagagaagttaactagccttgtatcttcattgatggc 27231425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 12179047 - 12178647
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  12179047 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttaccattgactccaacgttgtggaacttaccctcaccatgtattc 12178949  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaa------ttgaaggacttagacaagnnnnnnncaaac 205  Q
    |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||      ||||||||||||||||||        ||||    
T  12178948 tatccactt-agcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaaccttttccatcaaaaaaatttttttgaaggacttagacaagtttttgt-aaac 12178851  T
Q  206 atcatgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagc-tttagctttcgt------actctttccttggtt 298  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||  ||      |||  ||||||||||    
T  12178850 atcacggatatggaccttgtaagaatgaacaccgagaaatacaacttc-caaaatcttaactaagcttttagcttatgttaaagaacttcttccttggtt 12178752  T
Q  299 tcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttg-caacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataag 397  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||  |||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||| | |||    
T  12178751 tcgttcttaccttttgaaaaagaaacctattgtaaatatcttgacaattttc-aaatgaaaccatgttcctctgccatgtttacatttcactttaacaag 12178653  T
Q  398 tccttc 403  Q
    ||||||    
T  12178652 tccttc 12178647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 9e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 33843311 - 33842911
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  33843311 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttaccattgactccaacgttgtggaacttaccctcaccatgtattc 33843213  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaa------ttgaaggacttagacaagnnnnnnncaaac 205  Q
    |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||      ||||||||||||||||||        ||||    
T  33843212 tatccactt-agcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaaccttttccatcaaaaaactttttttgaaggacttagacaagtttttgt-aaac 33843115  T
Q  206 atcatgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagc-tttagctttcgt------actctttccttggtt 298  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||  ||      |||  ||||||||||    
T  33843114 atcacggatatggaccttgtaagaatgaacaccgagaaatacaacttc-caaaatcttaactaagcttttagcttatgttaaagaacttcttccttggtt 33843016  T
Q  299 tcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttg-caacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataag 397  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||  |||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||| | |||    
T  33843015 tcgttcttaccttttgaaaaagaaacctattgtaaatatcttgacaattttc-aaatgaaaccatgttcctctgccatgtttacatttcactttaacaag 33842917  T
Q  398 tccttc 403  Q
    ||||||    
T  33842916 tccttc 33842911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 26087816 - 26087416
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  26087816 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttaccattgactccaacgttgtggaacttaccctcaccatgtattc 26087718  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaa------ttgaaggacttagacaagnnnnnnncaaac 205  Q
    |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||      ||||||||||||||||||        ||||    
T  26087717 tatccactt-agcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaaccttttccatcaaaaaaaattttttgaaggacttagacaagtttttgt-aaac 26087620  T
Q  206 atcatgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagc-tttagctttcgt------actctttccttggtt 298  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||  ||      |||  ||||||||||    
T  26087619 atcacggatatggaccttgtaagaatgaacaccgagaaatacaacttc-caaaatcttaactaagcttttagcttatgttaaagaacttcttccttggtt 26087521  T
Q  299 tcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttg-caacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataag 397  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||  |||  ||  |||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||| | |||    
T  26087520 tcgttcttacctttggaaaaagaaacctattgtaaatatcttgacaattttc-aaatgaaaccatgttcctctgccatgtttacatttcactttaacaag 26087422  T
Q  398 tccttc 403  Q
    ||||||    
T  26087421 tccttc 26087416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 11811901 - 11811500
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  11811901 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttaccattgactccaacgttgtggaacttaccctcaccatgtattc 11811803  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaa-------ttgaaggacttagacaagnnnnnnncaaa 204  Q
    |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||       ||||||||||||||||||        |||    
T  11811802 tatccactt-agcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaaccttttccatcaaaaaaaatttttttgaaggacttagacaagtttttgt-aaa 11811705  T
Q  205 catcatgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagc-tttagctttcgt------actctttccttggt 297  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||  ||      |||  |||||||||    
T  11811704 catcacggatatggaccttgtaagaatgaacaccgagaaatacaacttc-caaaatcttaactaagcttttagcttatgttaaagaacttcttccttggt 11811606  T
Q  298 ttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttg-caacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataa 396  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  |||  ||  |||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||| | ||    
T  11811605 ttcgttcttacctttggaaaaagaaacctattgtaaatatcttgacaattttc-aaatgaaaccatgttcctctgccatgtttacatttcactttaacaa 11811507  T
Q  397 gtccttc 403  Q
    |||||||    
T  11811506 gtccttc 11811500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 415 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 33842884 - 33842621
Alignment:
Q  415 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgt-ttctaccagcaaaaggtcaatccatcagta 513  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| | | ||| |||| |||  ||| ||||||| ||| ||||    
T  33842884 ctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtctgtatctcacactgtgtcttct-ccataaaagggtcaattcattagta 33842786  T
Q  514 aagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgt 613  Q
    |||| ||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33842785 aagtggtcagatgtcttcatccaagttcggctcacatatgcagacactcgtgcaaacacaaaagatggatcaacttgagcaagaggtccacgagcttcgt 33842686  T
Q  614 ggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 678  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  33842685 ggagaagtaacaacacttcgggctgaggtagagaagttaactagccttgtatcttcattgatggc 33842621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 415 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 26087383 - 26087120
Alignment:
Q  415 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgt-ttctaccagcaaaaggtcaatccatcagta 513  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| | | ||| |||| |||  ||| ||||||| ||| ||||    
T  26087383 ctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtctgtatctcacactgtgtcttct-ccataaaagggtcaattcattagta 26087285  T
Q  514 aagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgt 613  Q
    |||| ||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26087284 aagtggtcagatgtcttcatccaagttcggctcacatatgcagacactcgtgcaaacacaaaagatggatcaacttgagcaagaggtccacgagcttcgt 26087185  T
Q  614 ggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 678  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26087184 ggagaaataacaacacttcgggctgaggtagagaagttaactagccttgtatcttcattgatggc 26087120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 415 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 11811460 - 11811197
Alignment:
Q  415 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgt-ttctaccagcaaaaggtcaatccatcagta 513  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| | | ||| |||| |||  ||| ||||||| ||| ||||    
T  11811460 ctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtctgtatctcacactgtgtcttct-ccataaaagggtcaattcattagta 11811362  T
Q  514 aagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgt 613  Q
    |||| ||   |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11811361 aagtggtcagatgtcttcatccaagttcggctcatatatgcagacactcgtgcaaacacaaaagatggatcaacttgagcaagaggtccacgagcttcgt 11811262  T
Q  614 ggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 678  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  11811261 ggagaaataacaacacttcgggctgaggtagagaagttaactagccttgtatcttcattgatggc 11811197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 259
Target Start/End: Original strand, 23638203 - 23638439
Alignment:
Q  20 gtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtact 119  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23638203 gtgatacagctaca-tttgagaccgtagtccttaccaaatgacgttgttacctttgactccaacat-gtggacttaacctcatcatgtattctatatact 23638300  T
Q  120 ttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgggtatgga 219  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||| ||||||||||||||||       |||||||| ||| ||||||    
T  23638301 ttagactaaccatgcatacatgcattcattcataaacaacgttttctatc-aaaaatggaaggacttagacaag-tttttgcaaacatcgtggatatgga 23638398  T
Q  220 ccttgtaagaatgaacacc-aagagatacaacttcaaaaaa 259  Q
    ||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  23638399 ccttacaagaatgaacaccaaagagatccaacttcaaaaaa 23638439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 20 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23834687 - 23834451
Alignment:
Q  20 gtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtact 119  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23834687 gtgatacagctaca-tttgagaccgtagtccttaccaaatgacgttgttacctttgactccaacat-gtggacttaacctcatcatgtattctatatact 23834590  T
Q  120 ttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgggtatgga 219  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||| ||||||||||||||||       |||||||| ||| ||||||    
T  23834589 ttagactaaccatgcatacatgcattcattcataaacaacgttttctatc-aaaaatggaaggacttagacaag-tttttgcaaacatcgtggatatgga 23834492  T
Q  220 ccttgtaagaatgaacacc-aagagatacaacttcaaaaaa 259  Q
    ||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  23834491 ccttacaagaatgaacaccaaagagatccaacttcaaaaaa 23834451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 22957078 - 22956781
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 112  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||     
T  22957078 agaacctgtgatacaggtaca-tttgaaacaatagtccttaccaaatggcgtctttacccttgactccaactttgtggacttaacctcaccatgcattcc 22956980  T
Q  113 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatg 211  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||| | |||  || || |||| ||||||| |||        ||||||||      
T  22956979 atgttctttagcataatcatgcatacatgcattcgttcagaaa-aacttttttc-tcactaatatcgaagcacttagataagttcttgt-aaacatcaaa 22956883  T
Q  212 ggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttctt 306  Q
    | |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||     ||| |||||||||||||||||||    
T  22956882 gatatggaccttctaagaaggaacaccaagaaatacaacttc-aaaaatcttaactaagctttagcttttgttaagaactttttccttggtttcgttctt 22956784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 27232101 - 27231843
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgg-acttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||    
T  27232101 agaacccgtgatacaggtacgtttttaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttaccatagactccaacattgtggaactcaccctcaccatgtattc 27232002  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaa---attgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatc 208  Q
    |||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    ||||||||||||||||||        |||||||    
T  27232001 tatccac-ttagcatgaccatgcatacatgcattcattcataaacaaccttttccatcaaaaattttttgaaggacttagacaagtttttgt-aaacatc 27231904  T
Q  209 atgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaag 270  Q
    |  | |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  27231903 acagatatggatcttgtaagaatgaacatcaagaaatacaacttc-caaaatcttaactaag 27231843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 350
Target Start/End: Original strand, 29895244 - 29895576
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga--ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtatt 110  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  29895244 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttactaaatggcgttgttacccttaaagctccaacattgtggacttaacctcaccatgcatt 29895342  T
Q  111 ctatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatca 209  Q
    | |||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||  |||  || || |||||||||||| |||        ||||||||    
T  29895343 ccatgttctttagcataatcatgcaaacatgcattcattcataaa-aactttttc--tcactaatatcgaaggacttagataagttcttgt-aaacatca 29895438  T
Q  210 tgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttc 304  Q
      | ||||| ||||||||||| |||||||      ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||     | | |||||||||||||||||    
T  29895439 aagatatggtccttgtaagaaggaacacc------tacaacttc-aaaaaccttaactaagctttagcttttgttaagaattttttccttggtttcgttc 29895531  T
Q  305 ttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttca 350  Q
    ||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||| ||||    
T  29895532 tta-cttttgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaattttca 29895576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 59 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 20097550 - 20097251
Alignment:
Q  59 tggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcat---aa 154  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    |    
T  20097550 tggcgttgttacccttaaactccaacattgtggacttaacctcaccatgcattccatgttctttagcataatcatgcatacatgcattcattcattgata 20097451  T
Q  155 acaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttc 253  Q
    | |||| ||| | |||  || ||||||||||||||| |||        ||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20097450 aaaacttttttc-tcactaatattgaaggacttagataagttcttgt-aaacatcaaagatatggtccttgtaagaaagaacaccaagaaatacaacttc 20097353  T
Q  254 aaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgtt 348  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||     ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||  ||||||| |||| ||||| ||    
T  20097352 -aaaaatcttaactaagctttagcttttgttaagaactttttccttggtttcgttctta-cttttgaaaaggaaaccaattgcaacatcttcacaatttt 20097255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 352
Target Start/End: Original strand, 25528337 - 25528673
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 112  Q
    |||||| |||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||     
T  25528337 agaacccgtgatacaagtgcaaatt-aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttaccctaagctccaactttgtggacctaacctcaccatgcattcc 25528435  T
Q  113 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgg 212  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||   |  || || |||||||||||| |||        ||||||||  |    
T  25528436 atgttctttagcataaacatgcatacatgcattcattcacaaa-aact-tttctcgc-taatatcgaaggacttagataagttcttgt-aaacatcaaag 25528531  T
Q  213 gtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagcttt-----cgtactctttccttggtttcgttctta 307  Q
     ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      | ||| ||||||||||||| ||||||    
T  25528532 atatggtccttataagaaggaacaccaagaaatacaacttc-aaaaatcttaactaagctttagcttttgctaagaact-tttccttggtttcattctta 25528629  T
Q  308 ccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 352  Q
     |||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  25528630 -cttttgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaattttcaaa 25528673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 155
Target Start/End: Original strand, 36450393 - 36450535
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  36450393 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccctaccaaatggcgttgttatccttaagctccaacattatggacttaacctcaccatgcattc 36450491  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 155  Q
     |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36450492 catgttccttagcataatcatgcatacatgcattcattcataaa 36450535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 400
Target Start/End: Original strand, 26871190 - 26871568
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| | ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  26871190 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgtcgttatccttcagctccaacattgtggacttaacatcaccatgcattc 26871288  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcat 210  Q
     |         |||||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||  |||  || ||  ||||||||||| |||        ||||||||     
T  26871289 ca--------cgcataatcatgcatacatgcattcattcataaa-acctttttc--tcaccaatatcaaaggacttagataagtttttgt-aaacatcaa 26871376  T
Q  211 gggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagcttt-----cgtactctttccttggtttcgttct 305  Q
     | ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||      | ||| ||||||||||||||||||    
T  26871377 agatatggtccttgtaagaaggaacaccaagaaataaaacttc-aaaaatcttaactaagcttcaacttttattaagaactttttccttggtttcgttct 26871475  T
Q  306 taccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtcc 400  Q
    |||| |||||| | ||| ||||||||||   ||||| ||  ||| || | |  |||||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  26871476 tacc-tttgaagagggagccgtttgcaatacctttataaatttc-aactaagtccatgttcttctacaatgtttacaaattactttgacaagtcc 26871568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 7260060 - 7259793
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 112  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||     
T  7260060 agaacccgtgatacaggtaca-tctgaaaccatagtccctaccaactggcatttttacccttgactccaacattgtggacttaacatcaccatgttttca 7259962  T
Q  113 atgtactt---tagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaac--tatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaaca 206  Q
      ||  ||   |||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||  | ||||  |||  || || |||||||||||| |||        |||||    
T  7259961 ccgt--ttgcgtagcgtaatcatgcatacacgcattcattcataaa-aactttttttctctcattaatatcgaaggacttagataagttcttgt-aaaca 7259866  T
Q  207 tcatgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagcttt 280  Q
    |||  | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  7259865 tcaaagatatggaccttgtaagaaggaacaccaagaaatacaacttc-aaaaatcttaactaagttttaacttt 7259793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Original strand, 1800288 - 1800380
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatg 106  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1800288 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcattgttaccctaagctccaacattgtggacttaacctcaccatg 1800380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 12393535 - 12393443
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatg 106  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12393535 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcattgttaccctaagctccaacattgtggacttaacctcaccatg 12393443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Original strand, 21690733 - 21690825
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatg 106  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21690733 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcattgttaccctaagctccaacattgtggacttaacctcaccatg 21690825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 29890334 - 29890230
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgg-acttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  29890334 agaacccgtgatgcaggtacatttt-aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttatccttaactccaacattgtggaacttaccctcaccatgtattc 29890236  T
Q  112 tatgta 117  Q
    | ||||    
T  29890235 tctgta 29890230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 524 - 656
Target Start/End: Original strand, 37580755 - 37580887
Alignment:
Q  524 atgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggtaa 623  Q
    |||||| ||| ||| ||| |||| || ||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||| || |    
T  37580755 atgtcttcattcaacttcagctcacacatgcaaacactcgtgcaaacacaaaaaatggatcgacttggagaagaggtccacgagcttcgtgaagaagtga 37580854  T
Q  624 caacacttcgggctgaggtagtgaagttaacta 656  Q
    | | ||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  37580855 ctatacttcgggccgaggtagagaagttaacta 37580887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 358983 - 358860
Alignment:
Q  32 caatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgccc-ttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataacc 130  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | || ||||||||||| | || || |||||| |||||| || | |    
T  358983 caatttaaaaccttagtccttaccaaatggcgttgttaccctttgactccaaca-tatgaacttaacctcaccgtgcatcctatgtgctttagtattatc 358885  T
Q  131 atgcatacatgcattcattcataaa 155  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||    
T  358884 atgcatacatgcatccatccataaa 358860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 20395746 - 20395672
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgt 88  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  20395746 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccgtagtccttaccaaatggcattgttacctttgactccaacattgt 20395672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 415 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 7259671 - 7259625
Alignment:
Q  415 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 461  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7259671 ctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcataatttc 7259625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 416 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 21865978 - 21865921
Alignment:
Q  416 tatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtct 473  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  21865978 tatttttgcgtaagcatatcatgcatcattttgcgttcatagtttctagttcgtgtct 21865921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 64
Target Start/End: Original strand, 37578782 - 37578825
Alignment:
Q  21 tgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgt 64  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37578782 tgatacaggtacaaaatgaaaccatagtccttaccaaatggcgt 37578825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 415 - 461
Target Start/End: Original strand, 29895640 - 29895686
Alignment:
Q  415 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 461  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  29895640 ctatttttgcataagcatagcatgcatcattttgcattcataatttc 29895686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 15791354 - 15791307
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatgg 61  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  15791354 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatgg 15791307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 36382622 - 36382575
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatgg 61  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  36382622 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatgg 36382575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 37007294 - 37007247
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatgg 61  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  37007294 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatgg 37007247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 415 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 22956678 - 22956632
Alignment:
Q  415 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 461  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22956678 ctatttttgcataagcataacatgcatcattttgtattcataatttc 22956632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 415 - 461
Target Start/End: Original strand, 25528734 - 25528780
Alignment:
Q  415 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 461  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  25528734 ctatttttgcataagcatagcatgcatcatattgcattcataatttc 25528780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 345
Target Start/End: Original strand, 7789240 - 7789295
Alignment:
Q  288 tttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaat 345  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  7789240 tttccttggtttcgttctta-cttttg-aaagggaaccaattgcaacgtctttacaat 7789295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 12393280 - 12393225
Alignment:
Q  288 tttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaat 345  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  12393280 tttccttggtttcgttctta-cttttg-aaagggaaccaattgcaacgtctttacaat 12393225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 325
Target Start/End: Original strand, 21690984 - 21691024
Alignment:
Q  284 actctttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaacc 325  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21690984 actttttccttggtttcgttctta-cttttgaaaaaggaacc 21691024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 415 - 452
Target Start/End: Original strand, 34464032 - 34464069
Alignment:
Q  415 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcatt 452  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  34464032 ctatttttgcataagcatatcatgcatcatcttgcatt 34464069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 358; Significance: 0; HSPs: 33)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 34 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 25504426 - 25503768
Alignment:
Q  34 atttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataaccat 132  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||    
T  25504426 attttaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattgtggaacttaacctcaccatatattctatgtactttagcattatcat 25504327  T
Q  133 gcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgggtatggaccttgtaagaatg 232  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  25504326 gcatacatgcattcattcataaaaaactttttccatcaaaaa-ttgaaggacttagacaagtttttgt-aaacatcaaaggtatggaccttttaagaatg 25504229  T
Q  233 aacaccaagagatacaacttcaaaaa-atcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccg 326  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||     ||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||     
T  25504228 atcaccaagagatacaacttcaaaaatatcttaactaagctttagcttttgttaagaactttttccttggtttagttcttaacttttgaaaaag-aacct 25504130  T
Q  327 tttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttcnnnnnnnnnnn------ctattt 420  Q
     ||||||  |||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                 ||||||    
T  25504129 attgcaatatctttacaattttcaaa-tgaaactatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttcaaattttatttttttatctattt 25504031  T
Q  421 ttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagttt-ctggtacgtgtctcatattttgtttctaccagcaaaaggtcaatccatcagtaaagtcg 519  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |    
T  25504030 ttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagttttctagtccatgtctcatattttgtttctacctacaaagggtcaatccatcagtaaagtgg 25503931  T
Q  520 ttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagag 619  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25503930 tccaatgtcttcatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccatgagcttcgtggagag 25503831  T
Q  620 gtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggccaca 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  25503830 gtaacaacacttcgggctgaggtagagaagttaaccagcctagtatcttcattgatggccaca 25503768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 13 - 678
Target Start/End: Original strand, 16636282 - 16636956
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  16636282 agaacccgtgatacaggtacgtttt-aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttaccattgactccaacattgtggaacttaccctcaccatgtattc 16636380  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaatt------gaaggacttagacaagnnnnnnncaaac 205  Q
    |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||      ||||||||||||||||        ||||    
T  16636381 tatccactt-agcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaaccttttccatcaaaaaattttttttgaaggacttagacaagtttttgt-aaac 16636478  T
Q  206 atcatgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagcttt-agctttcgt------actctttccttggtt 298  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||  ||      |||  ||||||| ||    
T  16636479 atcacggatatggaccttgtaagaatgaacaccaagaaatacaacttccaaaa-tcttaactaagcttttagcttctgttaaagaacttcttccttgatt 16636577  T
Q  299 tcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacg-tctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataag 397  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||   |||| ||||| |||| | |||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||| | |||    
T  16636578 tcgttcttaccttttgaaaaagaaacctattgtaaatatcttgacaattttcata-tgaaaccatgttcctctgccatgtttacatttcactttaacaag 16636676  T
Q  398 tccttcnnnnnnnnnnnctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgt-ttctaccagcaaa 496  Q
    ||||||           |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| | | ||| |||| |||  |||    
T  16636677 tccttcaaaaaaaaat-ctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtctgtatctcacactgtgtcttct-ccataaaa 16636774  T
Q  497 aggtcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaag 596  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||| |||| ||||||    
T  16636775 aggtcaattcattagtaaagtggtcagatgtcttcatccaagttcggctcacatatgcagacactcgtgcaaacacaaaagatggatcaacttaagcaag 16636874  T
Q  597 aggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 678  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  16636875 aggtccacgagcttcgtggagaagtaacaacacttcgggctgaggtagagaagttaactagccttgtatcttcattgatggc 16636956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 403
Target Start/End: Original strand, 28269987 - 28270386
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 112  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  28269987 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttaccctcgactccaacat-gtggacttaacatcaccatgtattct 28270084  T
Q  113 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaag-----nnnnnnncaaacat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||    
T  28270085 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactttttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagtttttttttttgcaaacat 28270184  T
Q  208 catgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttc-aaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcg 301  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||     ||| |||| |||||||||    
T  28270185 catgggtatggactttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaaatcttaactaaactttagcttttgttaagaactttttctttggtttcg 28270284  T
Q  302 ttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgttt-acaattcactttgataagtcc 400  Q
     ||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| | ||| ||| ||||||| ||||||| |||||| |||||| | |||| ||||||||||||||    
T  28270285 atcttaccttttgaaaaaagaaccttttgcaatatcttcataattttc-aaatgaaaccatgtttctctaccatgtttaaaaattaactttgataagtcc 28270383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 13 - 403
Target Start/End: Original strand, 28348737 - 28349136
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 112  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  28348737 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttaccctcgactccaacat-gtggacttaacatcaccatgtattct 28348834  T
Q  113 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaag-----nnnnnnncaaacat 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||    
T  28348835 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactttttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagtttttttttttgcaaacat 28348934  T
Q  208 catgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttc-aaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcg 301  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||     ||| |||| |||||||||    
T  28348935 catgggtatggactttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaaatcttaactaaactttagcttttgttaagaactttttctttggtttcg 28349034  T
Q  302 ttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgttt-acaattcactttgataagtcc 400  Q
     ||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| | ||| ||| ||||||| ||||||| |||||| |||||| | |||| ||||||||||||||    
T  28349035 atcttaccttttgaaaaaagaaccttttgcaatatcttcataattttc-aaatgaaaccatgtttctctaccatgtttaaaaattaactttgataagtcc 28349133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 13 - 403
Target Start/End: Original strand, 28304954 - 28305355
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 112  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  28304954 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttaccctcgactccaacat-gtggacttaacatcaccatgtattct 28305051  T
Q  113 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaag-------nnnnnnncaaac 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||              |||||    
T  28305052 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactttttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagtttttttttttttgcaaac 28305151  T
Q  206 atcatgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttc-aaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggttt 299  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||     ||| |||| |||||||    
T  28305152 atcatgggtatggactttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaaatcttaactaaactttagcttttgttaagaactttttctttggttt 28305251  T
Q  300 cgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgttt-acaattcactttgataagt 398  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| |||||||  |||| | ||| ||| ||||||| ||||||| |||||| |||||| | |||| ||||||||||||    
T  28305252 cgatcttaccttttgaaaaaagaaccttttgcaatatcttcataattttc-aaatgaaaccatgtttctctaccatgtttaaaaattaactttgataagt 28305350  T
Q  399 ccttc 403  Q
    |||||    
T  28305351 ccttc 28305355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 13 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 27056773 - 27056372
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  27056773 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttaccattgactccaacgttgtggaacttaccctcaccatgtattc 27056675  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaa-------ttgaaggacttagacaagnnnnnnncaaa 204  Q
    |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||       ||||||||||||||||||        |||    
T  27056674 tatccactt-agcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaaccttttccatcaaaaaaattttttttgaaggacttagacaagtttttgt-aaa 27056577  T
Q  205 catcatgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagc-tttagctttcgt------actctttccttggt 297  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||  ||      |||  |||||||||    
T  27056576 catcacggatatggaccttgtaagaatgaacaccgagaaatacaacttc-caaaatcttaactaagcttttagcttatgttaaagaacttcttccttggt 27056478  T
Q  298 ttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttg-caacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataa 396  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  |||  ||  |||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||| | ||    
T  27056477 ttcgttcttacctttggaaaaagaaacctattgtaaatatcttgacaattttc-aaatgaaaccatgttcctctgccatgtttacatttcactttaacaa 27056379  T
Q  397 gtccttc 403  Q
    |||||||    
T  27056378 gtccttc 27056372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 536 - 682
Target Start/End: Original strand, 5006783 - 5006929
Alignment:
Q  536 aagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcggg 635  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5006783 aagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagattcgtggagaggtaacaacacttcggg 5006882  T
Q  636 ctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggccaca 682  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5006883 ctgaggtagtgaagttaactagcctagtatcttcattgatggccaca 5006929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 415 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 27056327 - 27056064
Alignment:
Q  415 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgt-ttctaccagcaaaaggtcaatccatcagta 513  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| | | ||| |||| |||  ||| ||||||| ||| ||||    
T  27056327 ctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtctgtatctcacactgtgtcttct-ccataaaagggtcaattcattagta 27056229  T
Q  514 aagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgt 613  Q
    |||| ||   |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27056228 aagtggtcagatgtcttcatccaagttcggctcacatatgcaaacactcgtgcaaacacaaaagatggatcaacttgagcaagaggtccacgagcttcgt 27056129  T
Q  614 ggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 678  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27056128 ggagaagtaacaacacttagggctgaggtagagaagttaactagccttgtatcttcattgatggc 27056064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 344
Target Start/End: Original strand, 22326025 - 22326361
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22326025 agaacccgtgatacaggtaca-tgtgaaaccatagtccctaccaaatggcgttgttacccttaaactccaacattgtggacttaacctcaccatgcattc 22326123  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcat---aaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacat 207  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    || |||| ||| | |||  || || |||||||||||| |||        ||||||    
T  22326124 catgttctttagcataatcatgcatacatgcattcattcattgataaaaacttttttc-tcactaatatcgaaggacttagataagttcttgt-aaacat 22326221  T
Q  208 catgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgt 302  Q
    ||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||     ||| |||||||||||||||    
T  22326222 catagatatggtccttgtaagaaagaacaccaagaaatacaacttc-aaaaatcttaactaagctttagcttttgttaagaactttttccttggtttcgt 22326320  T
Q  303 tcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaa 344  Q
    ||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||    
T  22326321 tctta-cttttgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaa 22326361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 621270 - 620927
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 112  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||     
T  621270 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcattgttaccctcgactccaacattgtggacttaacctcaccatgcattcc 621172  T
Q  113 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaac---tatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatc 208  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||   | ||||  |||  || || |||||||||||| |||        |||||||    
T  621171 atgttcttcagcataaacatgcatacatgcattcattcataaa-aacttttttttctctcactaatatcgaaggacttagataagttcttgt-aaacatc 621074  T
Q  209 atgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgtt 303  Q
    |  | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||     ||| |||  |||||||||||    
T  621073 aaagatatggaccttgtaagaaggaacaccaagaaatacaacttcaaaaaa-cttaactaagctttagcttttgttaagaactttttttttggtttcgtt 620975  T
Q  304 cttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 352  Q
    |||| |||||||||| ||||||  ||| ||| |||| ||||| ||||||    
T  620974 ctta-cttttgaaaagggaaccaattggaacatcttcacaattttcaaa 620927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 155
Target Start/End: Original strand, 27538305 - 27538448
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgccctt-gactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27538305 agaacccgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgtcaccttttgactccaacattgtggacttaacctcattatgtattc 27538404  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 155  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  27538405 tatgtacttcagcataagcatgcatccatgcattcattcataaa 27538448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 27072204 - 27071864
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||| | |||||||||| |||| ||||    
T  27072204 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccctaccaaatggcgttgttacccttaagctccaactttgtaggcttaacctcaccatgcattc 27072106  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcat 210  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||   |||  || || |||||||||||| |||        ||||||||     
T  27072105 catgttctttagcataatcatgcatacacgcattcattcataa--aac-atttttctcactaatatcgaaggacttagataagtttttgt-aaacatcaa 27072010  T
Q  211 gggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttct 305  Q
     | ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||       | ||||||||||||||||||    
T  27072009 agatatggtccttgtaagaaggaacaccaagaaatacaacttcaaaaaaccttaactaagctttagcttttgttaagatttttttccttggtttcgttct 27071910  T
Q  306 taccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 352  Q
    || |||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  27071909 ta-cttttgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaattttcaaa 27071864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 155
Target Start/End: Original strand, 25700474 - 25700616
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  25700474 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccttagtccttaccaaatggtgttgtcacccttgactccaacattgtggaacttaccctcaccatgtattc 25700572  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 155  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  25700573 tatgtactttagcattatcatgcatacatgcattcatccataaa 25700616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 32 - 352
Target Start/End: Original strand, 19715822 - 19716143
Alignment:
Q  32 caatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataacca 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |  | ||||||||||| ||    
T  19715822 caatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgtgtttacccttgactccaacattgtggacttaacctcaccatgcattccacattctttagcataatca 19715921  T
Q  132 tgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgggtatggaccttgtaagaat 231  Q
    ||||||||||||||||| |||||  ||  |||  ||    || || |||||||||||| |||        ||||||||  | | ||||||| |||||||     
T  19715922 tgcatacatgcattcatacataagaaaaaattctca--ctaatatcgaaggacttagataagtttttgt-aaacatcaaagatgtggacctcgtaagaaa 19716018  T
Q  232 gaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----ac-tctttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaacc 325  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||     || | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  19716019 gaacaccaagaaatacaacttc-aaaaatcttaactaagctttaggttttgttaagaacttttttccttggtttcgttctta-cttttgaaaagggaacc 19716116  T
Q  326 gtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 352  Q
      || |||| |||| ||||| ||||||    
T  19716117 aattacaacatcttcacaattttcaaa 19716143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 18219418 - 18219274
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgg-acttaacctcatcatgtattc 111  Q
    ||||||| || |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  18219418 agaacctttgttacaagtgcaattt-aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattgtggaacttaccctcaccatgtattc 18219320  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaaca 157  Q
    ||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18219319 tatgtacttgagcattatcatacatacatgcattcattcataaaca 18219274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 20056231 - 20056100
Alignment:
Q  23 atacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtacttta 122  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||| |    
T  20056231 atacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcgttgtcaccctcgactccaacattgtggacttaacctcaccatgcattccatgttcttca 20056133  T
Q  123 gcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 155  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20056132 gcataaacatgcatacatgcattcattcataaa 20056100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 157
Target Start/End: Original strand, 18112836 - 18112955
Alignment:
Q  39 aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgg-acttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataaccatgcata 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| || ||||| | ||| ||||    
T  18112836 aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattgtggaacttaccctcaccatgtattctatgtatttgagcattatcatacata 18112935  T
Q  138 catgcattcattcataaaca 157  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18112936 catgcattcattcataaaca 18112955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 20457358 - 20457035
Alignment:
Q  32 caatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataacc 130  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||| ||||||||||| |    
T  20457358 caatttgaaaccatagtgcttaccaaatggcgctgttactcttaagctccaacattgtggacttaacctcaccatacattccatgttctttagcataatc 20457259  T
Q  131 atgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgggtatggaccttgtaaga 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||   |||  || || |||||||||||| |||        ||||||||  | || ||||||||||||     
T  20457258 atgcatacatgcattcattcataa--aac-atttttctcactaatatcgaaggacttagataagttcttgt-aaacatcaaagatacggaccttgtaagg 20457163  T
Q  230 atgaacaccaagagatac-aacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctt-tccttggtttcgttcttaccttttgaaaaagga 322  Q
    | ||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||     ||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  20457162 aagaacaccaagaaatccaaacttc-aaaaatcttaactaagctttagcttttgttaagaacttttatccttggtttcgttctta-cttttgaaaaggga 20457065  T
Q  323 accgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 352  Q
    |||  ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  20457064 accaattgcaacatcttcacaattttcaaa 20457035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 23981986 - 23981842
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 111  Q
    ||||||| || |||| || |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  23981986 agaacctttgttacaagtgcaattt-aaaccatagtccttaccaaatgacgttgttactcttgactccaacattgtggaacttaccctcaccatgtattc 23981888  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaaca 157  Q
    ||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23981887 tatgtacttgagcattatcatacatacatgcattcattcataaaca 23981842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 155
Target Start/End: Original strand, 3694321 - 3694465
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgg-acttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  3694321 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattgtggaacttaccctcaccatgtattc 3694419  T
Q  112 tatgtactt--tagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 155  Q
    | |||| ||   |  | || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  3694420 tctgtaattgaaaaaacaatcatgcatacatgcattcatgcataaa 3694465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Original strand, 27512121 - 27512213
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatg 106  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27512121 agaacccgtgatgcaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgtcgatatccttggctccaacattgtggacttaacctcaccatg 27512213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 22777082 - 22777010
Alignment:
Q  39 aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  22777082 aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacctttgactccaacactgtggacttaacctcaccatgcattc 22777010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 214 - 317
Target Start/End: Original strand, 27512302 - 27512407
Alignment:
Q  214 tatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt----actctttccttggtttcgttcttacc 309  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    |  ||||||||||||||||||||| |    
T  27512302 tatggtccttgtaagaaggaacaccaagaaatacaacttc-aaaaatcttaactaagctttagcttttgttaagaacctttccttggtttcgttctta-c 27512399  T
Q  310 ttttgaaa 317  Q
    ||||||||    
T  27512400 ttttgaaa 27512407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 16823115 - 16823023
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatg 106  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||   ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16823115 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcattgttaccctaagctccaacattgtggactcaacctcaccatg 16823023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 34 - 86
Target Start/End: Original strand, 18911256 - 18911308
Alignment:
Q  34 atttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacatt 86  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  18911256 atttgaaaccatagtccttacccaatggcgttgttacccttgactccatcatt 18911308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 20056028 - 20055967
Alignment:
Q  218 gaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagcttt 280  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  20056028 gaccttgttagaaggaacaccaagaaatacaacttca-aaaatcttaactaagttttagcttt 20055967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 28267047 - 28266931
Alignment:
Q  39 aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgccc-ttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataaccatgcata 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | || | ||||||||| | || || |||||| |||||| || | ||||||||    
T  28267047 aaaccttagtccttaccaaatggcgttgttaccctttgactccaaca-tatgaatttaacctcaccgtgcatcctatgtgctttagtattatcatgcata 28266949  T
Q  138 catgcattcattcataaa 155  Q
    |||| || ||| ||||||    
T  28266948 catgtatccatccataaa 28266931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 28345796 - 28345680
Alignment:
Q  39 aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgccc-ttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataaccatgcata 137  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | || | ||||||||| | || || |||||| |||||| || | ||||||||    
T  28345796 aaaccttagtccttaccaaatggcgttgttaccctttgactccaaca-tatgaatttaacctcaccgtgcatcctatgtgctttagtattatcatgcata 28345698  T
Q  138 catgcattcattcataaa 155  Q
    |||| || ||| ||||||    
T  28345697 catgtatccatccataaa 28345680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22776905 - 22776802
Alignment:
Q  245 tacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctt 339  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||     | | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| ||||    
T  22776905 tacaacttcaaaaac-cttaactaagctttagcttttgttaagaattttttccttggtttcgttctta-cttttgaaaagggaaccaattgcaacatctt 22776808  T
Q  340 tacaat 345  Q
     |||||    
T  22776807 cacaat 22776802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 9143047 - 9143000
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatgg 61  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  9143047 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatgg 9143000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 415 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 18946963 - 18946917
Alignment:
Q  415 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 461  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  18946963 ctatttttgcataagcatagcatgcatcattttgcatacataatttc 18946917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 415 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 27071797 - 27071751
Alignment:
Q  415 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 461  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  27071797 ctatttttgcataagcatagcatgcatcattttgcatacataatttc 27071751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20045720 - 20045665
Alignment:
Q  288 tttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaat 345  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  20045720 tttccttggtttcgttctta-cttttg-aaagggaaccaattgcaacgtctttacaat 20045665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 324; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 13 - 666
Target Start/End: Complemental strand, 74566 - 73906
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 112  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  74566 agaacctgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcattgttatatttgactccaacattgtggacttaacctcaccatgtaatct 74468  T
Q  113 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactattt-ccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatg 211  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||       |||||||||||    
T  74467 atattctttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaacttttttccatcaaaaa-ttgaaggacttggacaagtttttg-caaacatcatg 74370  T
Q  212 ggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttctt 306  Q
    | ||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     ||  |||  | ||||||||||||    
T  74369 gata--gaccttttaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaa-tcttaactaagctttagcttttgttaagaacctttttttcggtttcgttctt 74273  T
Q  307 accttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttcnnn 406  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||| |||||| |||| |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||       
T  74272 accttttgaaaaaggaacctattgcaatatctttacaattttcaaa-tgaaaccatgttcctttgccatgtttacaattcactttgataagtccttcata 74174  T
Q  407 nnnnnnnn-------ctatttttgcataagcctatcatgcatcat-tttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgtttctaccagcaaaag 498  Q
                   | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||  ||||||    
T  74173 aaaaaaaaaatttgtccatttttgcataagcatatcatgcatcatctttgcattcatagtttctagtccgtgtctcgtattttgtttctacctacaaaag 74074  T
Q  499 gtcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagag 598  Q
    |||||||| |||||||||| ||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  74073 gtcaatccgtcagtaaagtggtcagatgtcttcatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggatcggcttgagcaagag 73974  T
Q  599 gtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatc 666  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  73973 gtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagagaagttaactagccttgtatc 73906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 13 - 678
Target Start/End: Original strand, 1849 - 2516
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 112  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1849 agaacccgtgatacaggtaca-tttaaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 1947  T
Q  113 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgg 212  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| |       |||||||||| |    
T  1948 atgtactttaccataaccatgcatacatgcattcattcataaacaacttttttcatcaaaaaattgaaggacttatacatgttttttgcaaacatcatag 2047  T
Q  213 gtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttctta 307  Q
     | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| || | ||     |||||||| ||||||| |||||||    
T  2048 atttggacattgtaagaatgaacaccaagagatacaacttc--aaaatcttaactaagttttaactgttgttaagaactctttcgttggttttgttctta 2145  T
Q  308 ccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtcctt-cnnn 406  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||  |||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||         
T  2146 ccttttgaaaaaggaacctattgcaatatctttaaaattttc-aaatgaaaccatgttcctctactgtgtttacatttcactttgacaagtccttaaaaa 2244  T
Q  407 nnnnnnnnctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgt-ttctaccagcaaaaggtcaatc 505  Q
            |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| | | ||| ||||| ||  ||| ||| ||||    
T  2245 aaaattgtctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtctgtatctcacactgtgtcttcta-cataaaagggttaatc 2343  T
Q  506 catcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacg 605  Q
      |||||||||| ||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| || || |    
T  2344 tgtcagtaaagtggtcagatgtcttcatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggaacggcttgagcaagaagttcatg 2443  T
Q  606 agcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 678  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2444 agcttcgtggagaggtaacaacacttagggctgaggtagagaagttaactagcctagtatcttcattgatggc 2516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 13 - 402
Target Start/End: Original strand, 12103 - 12491
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  12103 agaacccgtaatacaggtacactt-gaaaccatagtccttaccaaatggcgttattacccttggctccaacattgtggaacttaacctcaccatgtattc 12201  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatg 211  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||       ||||| | |||    
T  12202 tatgtactttagtataaccatgcatacatgtattcattcataaacatctttttccatcaaaaa-ttgaaggacttagacaagttttttgcaaacgttatg 12300  T
Q  212 ggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaa-gctttagctttcgtactctttccttggtttcgttcttacct 310  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12301 gatatggaccatgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaa-tcttaactaaagctttagcttttgtactctttccttggtttcgttcttacct 12399  T
Q  311 tttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtcctt 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12400 tttgaaaaaggaaccgtttgcaacgactttacaatattcaaaatgaaaccatgttcctctactgtgtttacaattcactttgacaagtcctt 12491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 499 - 678
Target Start/End: Original strand, 12567 - 12746
Alignment:
Q  499 gtcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagag 598  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12567 gtcaatccatcagtaaagttgttcaatgtcttcatccaagttcggctcgcaaatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggatcgacttgaacaagag 12666  T
Q  599 gtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 678  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12667 gtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtggagaagttaactagcctagtatcttcattgatggc 12746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 240; Significance: 1e-132; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 13 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 144762 - 144300
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 111  Q
    ||||||| || |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||    
T  144762 agaacctttgttacaagtgcaattt-aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattatggaacttaccctcaccatgtattc 144664  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactattt---ccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatc 208  Q
      | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||   |||||||||| ||||||||||||||||||        ||| |||    
T  144663 cgttttctttagcataaccatgcatacatgcattcatttataaacaacttttttttccatcaaaaa-ttgaaggacttagacaagtttttgt-aaatatc 144566  T
Q  209 atgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgtactctttccttggtttcgttcttac 308  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  144565 atgcatatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaactttaaaaa-tcttaactaagctttagctttagtactctttccttggtttcgttcttac 144467  T
Q  309 cttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtcctt--cnnn 406  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||          
T  144466 cttttgaaaaagaaaccgtttgcaacgtctttacaatgtccaaaatgaagccatgttccactacaatgtttacaattcactttgattagtccttgaaaaa 144367  T
Q  407 nnnnnnnnctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtct 473  Q
            |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  144366 atataattctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtccgtgtct 144300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 131706 - 131477
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 111  Q
    ||||||| || |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  131706 agaacctttgttacaagtgcaattt-aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattgtggaacttaccctcaccatgtattc 131608  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaac---tatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatc 208  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||| ||||||||||||||||||||||||        ||| |||    
T  131607 tatgttctttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaacttttttttccat-aaaaaattgaaggacttagacaagtttttgt-aaatatc 131510  T
Q  209 atgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaag 241  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  131509 atggatatggaccttgtaagaatgaacaccaag 131477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0605 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0605
Description:

Target: scaffold0605; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 7217 - 6752
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgg-acttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  7217 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattatgggaattaacctcatcatgtattc 7118  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatg 211  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||        |||||||| |    
T  7117 tatgtactttcgcataaccatgcatacatgcattcattcataaacatctttttccatca-aaaattgaaggacttcgacaagttttttgtaaacatcacg 7019  T
Q  212 ggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----------------actctttcctt 294  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||                 |||||||||||    
T  7018 aatatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttc-aaaaatcgtaactaagctttagcttttgttaaaaaaaaaaaaaaaaactctttcctt 6920  T
Q  295 ggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgat 394  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6919 ggtttcgttcttacctttcaaaaagggaaccg-ttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaaaccatgtccctctacaacgtttacaattcactttgat 6821  T
Q  395 aagtccttc-nnnnnnnnnnnctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttct 462  Q
    |||||||||            |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6820 aagtccttcaaaaaaaattgtctatttttacataagcatatcatgcatcattttgcattcataatttct 6752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 35)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 419 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 21529189 - 21528930
Alignment:
Q  419 ttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgtttctaccagcaaaaggtcaatccatcagtaaagtc 518  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||     
T  21529189 ttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtccgtgtctcatattttgtttccaccaacaaaaggtcaatccatcagtaatgta 21529090  T
Q  519 gttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggaga 618  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21529089 gttcaatgtcttcatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggaga 21528990  T
Q  619 ggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 678  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21528989 ggtaacaacacttcgggctgaggtagagaagttaactagcctagtatcttcattgatggc 21528930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 445 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 8100612 - 8100380
Alignment:
Q  445 tttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgtttctaccagcaaaaggtcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggc 544  Q
    |||||||||||| ||||| ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8100612 tttgcattcata-tttctagtctgtatctcatattttgtttctaccagcaaaaggtcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtcttcatccaagttcggc 8100514  T
Q  545 tcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtag 644  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8100513 tcgcatatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtag 8100414  T
Q  645 tgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 678  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8100413 agaagttaactagcctagtatcttcattgatggc 8100380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 21529586 - 21529217
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgg-acttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  21529586 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgccctcggctccaacattgtggaacttaacctcctcatgtattc 21529488  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattc--ataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatca 209  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| | |  | |||||||| ||||||||||||||||||| |||       ||||||| |    
T  21529487 aatgtactttagtataaccatgcatacatgcattcattcgtatatatatatttttccatc-aaaaattgaaggacttagataagttttttgcaaacatta 21529389  T
Q  210 tgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgtactctttccttggtttcgttcttacc 309  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||                      ||||||| |||||||||    
T  21529388 tggatatggaccttgtaagaatgaacaccaagatatacaacttc-aaaaatcttaactaag---------------------attggttttgttcttacc 21529311  T
Q  310 ttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttc 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21529310 ttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttc 21529217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 8101020 - 8100633
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  8101020 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaagtggcgttgttaccctcgactccaacattgtagaacttaacctcctcatgtattc 8100922  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatg 211  Q
     ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| |  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||       ||||||| |||    
T  8100921 aatgaactttagtataaacatgcatacatgcattcattaataaatatatttttccatcaaaaa-ttgaaggacttagacaagttttttgcaaacattatg 8100823  T
Q  212 ggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgtactctttccttggtttcgttcttacctt 311  Q
    | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8100822 gatatggaccttgtacgagtgaacaccaagagatacaacttcaaaaa-tcttaactgagctttagcttttgtactttttccttggtttcgttcttacctt 8100724  T
Q  312 ttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgttt-acaattcactttgataagtccttc 403  Q
    |||||||||| ||| |||||||  |||| ||||| ||| ||||||| ||||||| |||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  8100723 ttgaaaaagg-accttttgcaatatcttcacaattttc-aaatgaaaccatgtttctctaccatgtttaaaaattaactttgataagtccttc 8100633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 39 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 26218595 - 26218314
Alignment:
Q  39 aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataaccatgcatac 138  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| || | ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26218595 aaaccatagtccttaccaaatgacgttgttaccttcgactccaacat-gtggacttaacatcaccatgtattctatgtactttagcataaccatgcatac 26218497  T
Q  139 atgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaag---nnnnnnncaaacatcatgggtatggaccttgtaagaatgaac 235  Q
    |||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26218496 atgcattcatccataaactactttttccatca-aaaattgaaggacttacacaagtttttttttgcaaacatcatgggtatggaccttgtaagaatgaac 26218398  T
Q  236 accaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttcttaccttttg 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||     ||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  26218397 accaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagttttaacttttgttaagaactttttccttggttttgatcttaccttttg 26218314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 432 - 678
Target Start/End: Complemental strand, 26218224 - 26217977
Alignment:
Q  432 tatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgt-ttctaccagcaaaagg-tcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtct 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| | | ||| |||| |||  || ||| | ||||| |||||||||| ||   ||||||    
T  26218224 tatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtctgtatctcacactgtgtcttct-ccataaagagggttaatccgtcagtaaagtggtcagatgtct 26218126  T
Q  530 ccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacac 629  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  26218125 tcatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaacaggaaaaatggatcggcttgagcaagaagtccaggaacttcggggagaggtaacaacac 26218026  T
Q  630 ttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 678  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26218025 ttcgggctgaggtagagaagttaactagccttgtatcttcattgatggc 26217977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 3386471 - 3386336
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 112  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||     
T  3386471 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttggctccaacattgtgaacttaacctcaccatgcattcc 3386373  T
Q  113 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcatt 149  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3386372 atgttctttagcataatcatgcatacatgcattcatt 3386336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 14736260 - 14736116
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgg-acttaacctcatcatgtattc 111  Q
    ||||||| || |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  14736260 agaacctttgttacaagtgcaattt-aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattgtggaacttaccctcaccatgtattc 14736162  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaaca 157  Q
    ||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14736161 tatgtacttgagcattatcatacatacatgcattcattcataaaca 14736116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 1888938 - 1888796
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgga-cttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||     
T  1888938 agaacccgtgatgcaggtacatttt-aaaccataatccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattgtgaaacttaccctcatcatgtatta 1888840  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 155  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  1888839 tatgtactttagcattatcatgcatacatgcattcatccataaa 1888796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 352
Target Start/End: Original strand, 20556056 - 20556393
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  20556056 agaacccgtgatacaagtaca-tttgaaaccgtagtccctaccaaatggcgttgttacccttaaactccaacattgtggacttgacctcaccatgcattc 20556154  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatc---aaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatc 208  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||   ||     || || |||||||||||| |||        |||||||    
T  20556155 gatgttctttagcataatcatgcatacatgcattcattcataaa-aactttttttttctcactaatatcgaaggacttagataagttcttgt-aaacatc 20556252  T
Q  209 atgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgtt 303  Q
    |  | ||||||||||||||||| |||||||      ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||     | | ||||||||||||||||    
T  20556253 aaagatatggaccttgtaagaaggaacacc------tacaacttc-aaaaaccttaactaagctttagcttttgttaagaattttttccttggtttcgtt 20556345  T
Q  304 cttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 352  Q
    |||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  20556346 ctta-cttttgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaattttcaaa 20556393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 9e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 16726133 - 16725868
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 112  Q
    ||||||| || |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||| ||| |||||     
T  16726133 agaacctttgttacaagtgcaattt-aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttggctccaatatggtggacttaacctcaccatatattcc 16726035  T
Q  113 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatg 211  Q
    || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||   |||  || || ||||||||| || |||        ||||||||      
T  16726034 atatcctttagcataatcatgcatacatgcattcattcataaa-aactttttttctcactaatatcgaaggacttggataagttcttgt-aaacatcaaa 16725937  T
Q  212 ggtatggaccttgt-aagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagcttt 280  Q
    | ||  |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16725936 gatacagaccttgtaaagaaggaacaccaagaaatacaacttc-aaaaatcttaactaagctttagcttt 16725868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 20 - 352
Target Start/End: Original strand, 14883695 - 14884022
Alignment:
Q  20 gtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtac 118  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||     ||| |||| |||| |    
T  14883695 gtgatacaggtacaact-gaaaccatagttcttactaaatggcgtcgttacccttaagctccaactttgtggacttaacc-----atgcattccatgttc 14883788  T
Q  119 tttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgggtatg 217  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||  || || |||||||||||| |||        |||| |||  | ||||    
T  14883789 tttagcataatcatgcatacatgcattcattcataaa-aacttttttc-tcactaatatcgaaggacttagataagttcttgt-aaacctcaaagatatg 14883885  T
Q  218 gaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttcttaccttt 312  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||      || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  14883886 gtccttgtaagaaggaacaccaagaaatacaacttc-aaaaatcttaactaagctttagcttttgttaatagctttttcc-tggtttcgttctta-cttt 14883982  T
Q  313 tgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 352  Q
    |||||| ||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  14883983 tgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaattttcaaa 14884022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 493 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 12510477 - 12510293
Alignment:
Q  493 caaaaggtcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgag 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| | | ||| ||| ||| ||||||||| ||||| || |||| |  ||| ||||||   ||||||    
T  12510477 caaaaggtcaatccatcagtaaagtggtctaatgtcttctttcaacttcagctagcatatgcaaacacttgtacaaacacaaaagatggattagcttgag 12510378  T
Q  593 caagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatgg 677  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  || ||||||| | ||||||    
T  12510377 caagaggtccacgaggttcgtgaagaggtaacaacacttcgggccgaggtagagaagttaactaatctggtatcttcactgatgg 12510293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 15900867 - 15900530
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || || || | ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||    
T  15900867 agaacccgtgatacaggtaca-tgtgaaaccatagtccttaccaaatggcgtttttacctttaagctccaacattgtggacttaacctctccatgcattc 15900769  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcat 210  Q
     |||| |||||| |||| ||||    |||||||| ||||||||| |||| |||   |||  || || |||||||||||| |||        ||||||||     
T  15900768 catgttctttagtataatcatg----catgcatttattcataaa-aactttttttctcactaatatcgaaggacttagataagttcttgt-aaacatcaa 15900675  T
Q  211 gggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagcttt-----cgtactctttccttggtttcgttct 305  Q
     | ||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      | ||| |||||| |||||||||||    
T  15900674 agatatggtccttgtaagaaggaacactaagaaatacaacttc-aaaaatcttaactaagctttagcttttattaagaactttttcctcggtttcgttct 15900576  T
Q  306 taccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 352  Q
    || |||||||||| ||| ||  ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  15900575 ta-cttttgaaaagggagccaattgcaacatcttcacaattttcaaa 15900530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 3842030 - 3841888
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccata-gtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||| |||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| |||| ||| |||| ||||    
T  3842030 agaacccgtgatacaggtacaact-gaaaccataagtccctaccaattggcattgttacccttgactccatcattatggacctaacatcaccatgcattc 3841932  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 155  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3841931 catgttctttagcataatcatgcatacatgcattcattcataaa 3841888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 38 - 101
Target Start/End: Original strand, 9187022 - 9187085
Alignment:
Q  38 gaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctca 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9187022 gaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaacattgtggacttaacctca 9187085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 578 - 668
Target Start/End: Original strand, 12511465 - 12511555
Alignment:
Q  578 atggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctt 668  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  12511465 atggatcaacttgagcaagaggtccacgagcttcgcgaagagaaaacaacacttcgggccgaggtagagaagttacctaacctagtatctt 12511555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Original strand, 18038434 - 18038526
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatg 106  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18038434 agaacccgtgatgcaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgtcgatatccttggctccaacattgtggacttaacctcaccatg 18038526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Original strand, 22706146 - 22706238
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatg 106  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22706146 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcattgttaccctaagctccaacattgtggacttaacctcaccatg 22706238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 222 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 15077447 - 15077321
Alignment:
Q  222 ttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----ac-tctttccttggtttcgttcttaccttttga 315  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||     || |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15077447 ttgtaagaaggaacaccaagaaatacaacttca-aaaatcttaactaagctttagcttttgttaagaacttctttccttggtttcgttctta-cttttga 15077350  T
Q  316 aaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaa 344  Q
    ||| ||||||  ||||||| |||| ||||    
T  15077349 aaagggaaccaattgcaacatcttcacaa 15077321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 578 - 668
Target Start/End: Original strand, 12511038 - 12511128
Alignment:
Q  578 atggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctt 668  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||   ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  12511038 atggatcaacttgagcaagaggtccacgagcttcgcgaagataaaacaacacttcgggccgaggtagagaagttacctaacctagtatctt 12511128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 7e-20
Query Start/End: Original strand, 214 - 317
Target Start/End: Original strand, 18038616 - 18038721
Alignment:
Q  214 tatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt----actctttccttggtttcgttcttacc 309  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    |  ||||||||||||||||||||| |    
T  18038616 tatggtccttgtaagaaggaacaccaagaaatacaacttc-aaaaatcttaactaagctttagcttttgttaagaacctttccttggtttcgttctta-c 18038713  T
Q  310 ttttgaaa 317  Q
    ||||||||    
T  18038714 ttttgaaa 18038721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 15079961 - 15079619
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtatt-- 110  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||||||||| |||| | ||| |||| ||| ||||| ||      
T  15079961 agaacccgtgatacaggtaca-tgtgaaaccatagtccttaccaaatggcatgtttttccttgactccatcattatagacctaacatcaccatgttttca 15079863  T
Q  111 ctatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatca 209  Q
    | || |  | | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||   |||  || || |||||||||||| |||        | ||||||    
T  15079862 ccat-ttgtgtggcataatcatgcatacatgcattcattcataaa-aactttttttctcactaatatcgaaggacttagataagttcttgt-agacatca 15079766  T
Q  210 tgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt------actctttccttggtttcgtt 303  Q
      | |||||   ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||        | ||||||||||||||||    
T  15079765 aagatatggtttttgtaagaaggaacaccaagaaatacaacttc-aaaaatcttaactaagctttagcttttgttaagaatttttttccttggtttcgtt 15079667  T
Q  304 cttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 352  Q
    |||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  15079666 ctta-cttttgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaattttcaaa 15079619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 218 - 403
Target Start/End: Original strand, 3359573 - 3359761
Alignment:
Q  218 gaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttcttaccttt 312  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||     ||| || |||||| |||| ||||||||||    
T  3359573 gaccttgcaagaaagaacgccaagaaatacaacttcaaaa-atcttaactaagctttagcttttgttaagaacttttcccttgggttcgctcttaccttt 3359671  T
Q  313 t-gaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttc 403  Q
    | ||||||  ||||  ||||||  |||||||||| ||| ||||||| | |||||| |||| ||||||| ||| ||||||||| || ||||||    
T  3359672 tggaaaaaaaaacctattgcaatatctttacaattttc-aaatgaaacaatgttcttctataatgtttccaa-tcactttgacaaatccttc 3359761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 136
Target Start/End: Original strand, 17304043 - 17304144
Alignment:
Q  36 ttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggac-ttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataaccatgc 134  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| |||  ||  | | |||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17304043 ttgaaaccatagtcattatcaaatgacgtatttatcttcgactccaacattttggaccttaacctcactatgtattctatgtcctttagcataaccatgc 17304142  T
Q  135 at 136  Q
    ||    
T  17304143 at 17304144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 3841828 - 3841764
Alignment:
Q  214 tatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagcttt 280  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  3841828 tatggtccttgtaagaaggaacatcaagaaatacaacttc--aaaatcttaactaagctttagcttt 3841764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 415 - 461
Target Start/End: Original strand, 14919898 - 14919944
Alignment:
Q  415 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 461  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14919898 ctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcataatttc 14919944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 418 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 16725730 - 16725687
Alignment:
Q  418 tttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 461  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16725730 tttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcataatttc 16725687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 415 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 3386076 - 3386030
Alignment:
Q  415 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 461  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  3386076 ctatttttgcataagcatagcatgcatcattttgcattcataatttc 3386030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 543 - 656
Target Start/End: Complemental strand, 15077127 - 15077014
Alignment:
Q  543 gctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggt 642  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| |  ||  ||||||| ||| |   |||||||||| |||||||| |  ||||| || ||||||||||| |||||    
T  15077127 gctcacatatgcaaacactcgtgcaaacacaaagtatggatcaactcggagaagaggtccatgagcttcgcgaggaggtcactacacttcgggccgaggt 15077028  T
Q  643 agtgaagttaacta 656  Q
    || |||||||||||    
T  15077027 agagaagttaacta 15077014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 106
Target Start/End: Original strand, 10787570 - 10787637
Alignment:
Q  39 aaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgccc-ttgactccaacattgtggacttaacctcatcatg 106  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | || | ||||||||||||||    
T  10787570 aaaccttagtccttaccaaatggcgttgttaccctttgactccaaca-tatgaatttaacctcatcatg 10787637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 415 - 461
Target Start/End: Original strand, 9187384 - 9187430
Alignment:
Q  415 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 461  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  9187384 ctatttttgcataagcatagcatgcatcattttgcatacataatttc 9187430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 23994047 - 23994001
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaat 59  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23994047 agaacctttgttacaagtgcaatttgaaaccatagtccttaccaaat 23994001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 416 - 461
Target Start/End: Original strand, 20556457 - 20556502
Alignment:
Q  416 tatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 461  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||    
T  20556457 tatttttgcataagcatagcatgcatcattttgcatacataatttc 20556502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 325
Target Start/End: Original strand, 22706397 - 22706437
Alignment:
Q  284 actctttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaacc 325  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22706397 actttttccttggtttcgttctta-cttttgaaaaaggaacc 22706437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2162 (Bit Score: 133; Significance: 9e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold2162
Description:

Target: scaffold2162; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 415 - 678
Target Start/End: Original strand, 452 - 715
Alignment:
Q  415 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttctggtacgtgtctcatattttgt-ttctaccagcaaaaggtcaatccatcagta 513  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  || ||||| | | ||| |||| |||  ||| ||||||| ||| ||||    
T  452 ctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcatagtttctagtctgtatctcacactgtgtcttct-ccataaaagggtcaattcattagta 550  T
Q  514 aagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgt 613  Q
    |||| ||   |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  551 aagtggtcagatgtcttcatccaagttcggctcaaatatgcagacactcgtgcaaacacaaaagatggatcaacttgagcaagaggtccacgagcttcgt 650  T
Q  614 ggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatggc 678  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  651 ggagaagtaacaacacttcgggctgaggtagagaagttaactagccttgtatcttcattgatggc 715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2162; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 403
Target Start/End: Original strand, 5 - 407
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgg-acttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  5 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttaccattgactccaacgttgtggaacttaccctcaccatgtattc 103  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaa--------ttgaaggacttagacaagnnnnnnncaa 203  Q
    |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||        ||||||||||||||||||        ||    
T  104 tatccac-ttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaacctttttcatcaaaaaaaaatttttttgaaggacttagacaagtttttgt-aa 201  T
Q  204 acatcatgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagc-tttagctttcgt------actctttccttgg 296  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||  ||      |||  ||||||||    
T  202 acatcacggatatggaccttgtaagaatgaacaccgagaaatacaacttc-caaaatcttaactaagcttttagcttatgttaaagaacttcttccttgg 300  T
Q  297 tttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttg-caacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgata 395  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||  |||  ||  |||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||| | |    
T  301 tttcgttcttacctttggaaaaagaaacctattgtaaatatcttgacaattttc-aaatgaaaccatgttcctctgccatgtttacatttcactttaaca 399  T
Q  396 agtccttc 403  Q
    ||||||||    
T  400 agtccttc 407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0582 (Bit Score: 120; Significance: 5e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0582
Description:

Target: scaffold0582; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 5268 - 4881
Alignment:
Q  21 tgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtact 119  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5268 tgatacaggtacaaaatgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttaagctccaacattgtgaacttaacctcaccatgtattctatgtact 5169  T
Q  120 ttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgg--gtatg 217  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||| ||||||||        |||||||||  |  | | |    
T  5168 atagcataatcatgcatacatgcattcattcataaacaactttttccatc-aaatatcgaaggatttagacaaattttttgcaaacatcacagatgaacg 5070  T
Q  218 gaccttgtaagaatgaacaccaagagatac-aacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttcttacctt 311  Q
    ||| ||||||  | ||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||     ||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  5069 gactttgtaaagaagaacaccaagaaattcaaacttc-aaaaatcttaactaagctttaggttttgttaagaactttttccttggtttcgttcttacttt 4971  T
Q  312 ttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttc 403  Q
    |  |||||||||||  | ||||  | |||||||  ||| ||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| || ||||||    
T  4970 tgaaaaaaggaacctatcgcaatatatttacaactttc-aaatgaaaccatattcctctataatgtttccaatt-actttgacaaatccttc 4881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 107; Significance: 3e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 36 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 192620 - 192297
Alignment:
Q  36 ttgaaaccatagtccttacc-aaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataaccatg 133  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  192620 ttgaaaccatagtccttacccaaatggcgtctttacccttaaactccaacattgtggatttaacctcaccatgtattctaagttctttagcataatcatg 192521  T
Q  134 catacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaag-nnnnnnncaaacat--catgggtatggaccttgtaagaa 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| || |||||| |||||||||        |||||||  |||  | | ||||||||||||||    
T  192520 catacatgcattcattcataaacaactttttgcatc-aaagatcgaaggatttagacaagtttttttccaaacatcacatatgaacggaccttgtaagaa 192422  T
Q  231 tgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaacc 325  Q
     ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||     ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||     
T  192421 agaacaccaagaaatgcaacttc-aaaaatcttaactaagctttagcttttgttaagaactttttccttggtttcgttctta-cttttgaaaagggaaca 192324  T
Q  326 gtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 352  Q
      ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  192323 aattgcaacatcttcacaattttcaaa 192297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 543 - 653
Target Start/End: Complemental strand, 192111 - 192001
Alignment:
Q  543 gctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggt 642  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| |  ||  ||||||| |||||   ||||||||||||||||||  |  ||||| || ||||||| ||| |||||    
T  192111 gctcgcatatgcaaacactcatgcaaacacaaagtatggatcaacttggagaagaggtccacgagcttcccgaggaggtgactacacttcaggccgaggt 192012  T
Q  643 agtgaagttaa 653  Q
    || ||||||||    
T  192011 agagaagttaa 192001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 103; Significance: 7e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 19728 - 19394
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 112  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||  ||||     
T  19728 agaacccgtgatacaagtgcaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgtctttacccttgactccaactttgtggacttaacttcaccatacattcc 19629  T
Q  113 atgtactttagcat-aaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcat 210  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | |||  || || |||||||||||| |||        ||||||||     
T  19628 atgttctttagcataaatcatgcatacatgcattcattcataaa-aacttttttc-tcactaatatcgaaggacttagataagttcttgt-aaacatcaa 19532  T
Q  211 gggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttct 305  Q
     | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||     | | |||||||||||| |||||    
T  19531 agatatggaccttgtaagaaggaacaccaagaaatacaac-tccaaaaatcttaactaagctttagcttttgttaagaaatttttccttggttttgttct 19433  T
Q  306 taccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaat 345  Q
    |||| |||||||| ||||||  ||||||| |||| |||||    
T  19432 tacc-tttgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaat 19394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 415 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 18527 - 18481
Alignment:
Q  415 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 461  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  18527 ctatttttgcataagcataacatgcatcattttgtattcataatttc 18481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 98; Significance: 7e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 352
Target Start/End: Original strand, 17178 - 17520
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  17178 agaacctgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttaagctccaacattgtggacttaacctcaccatgcattc 17276  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcat 210  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  | |||   |||  || || ||||| |||||| |||        ||||||||     
T  17277 catgttctttagcataatcatgcatacatgcattcattcataaaaacttttttttctcattaatatcgaagggcttagataagttcttgt-aaacatcaa 17375  T
Q  211 gggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttct 305  Q
     | ||||  | ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||     | | ||||||||||||||||||    
T  17376 agatatgatctttgtaagaaggaacaccaagaaatacaacttc-aaaaatcataactaagctttagcttttgttaagaaatttttccttggtttcgttct 17474  T
Q  306 taccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 352  Q
    || |||||| ||| ||||||  ||||||| |||| ||| | ||||||    
T  17475 ta-cttttggaaagggaaccaattgcaacatcttcacatttttcaaa 17520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 97; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 321
Target Start/End: Original strand, 30575 - 30886
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  30575 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaatcatagtccttaccaaatggcgttgttacccttaagctccaacattgtggacttaacctcaccatgcattc 30673  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcat 210  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| ||| | |||  || || |||||||||||| |||        ||||||||     
T  30674 catgttctttagcataatcatgcatacatgcattcattcatgaa-aacttttttc-tcactaatatcgaaggacttagataagtttttgt-aaacatcaa 30770  T
Q  211 gggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatac-aacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctt-tccttggtttcgtt 303  Q
     | ||||| ||||||||||| ||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||     ||| || ||||||||||||||    
T  30771 agatatggtccttgtaagaaggaacaccaagaaatccaaacttc-aaaaatcttaactaagctttagcttttgttaagaacttttatccttggtttcgtt 30869  T
Q  304 cttaccttttgaaaaagg 321  Q
    |||| |||||||||||||    
T  30870 ctta-cttttgaaaaagg 30886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0551 (Bit Score: 91; Significance: 1e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0551
Description:

Target: scaffold0551; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 5385 - 5047
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 112  Q
    ||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||     
T  5385 agaacctttgttacaagtgcaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgtcgttatccttggctccaacattgtggacttaacctcaccatgcattcc 5286  T
Q  113 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaaca---actatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatc 208  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |    || ||||  |||  || || |||||||||||| |||        |||||||    
T  5285 atgttctttagcataattatgcatacatgcattcattcataaaaactttctttttctctcactaatatcgaaggacttagataagttcctgt-aaacatc 5187  T
Q  209 atgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----ac-tctttccttggtttcgt 302  Q
    |  | ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||     || | |||||||||||||||    
T  5186 aatgatatggtccttgtaagaaggaacaccaagaaatacaactt-taaaaatcttaactaaactttagcttttgttaagaacttttttccttggtttcgt 5088  T
Q  303 tcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaa 344  Q
    ||||| |||||||||| |||| |  ||||||| |||| ||||    
T  5087 tctta-cttttgaaaagggaatcaattgcaacatcttcacaa 5047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0551; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 415 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 4975 - 4929
Alignment:
Q  415 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 461  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4975 ctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcataatttc 4929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0551; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 415 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 11089 - 11043
Alignment:
Q  415 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 461  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11089 ctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcataatttc 11043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1818 (Bit Score: 88; Significance: 6e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1818
Description:

Target: scaffold1818; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 234 - 92
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  234 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttaagctccaacattgtggacttaacctcaccattcattc 136  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 155  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  135 catgttctttagcataatcatgcatacatgcattcattcataaa 92  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 88; Significance: 6e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 37 - 461
Target Start/End: Original strand, 31033 - 31463
Alignment:
Q  37 tgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataaccatgca 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  31033 tgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacctttaagctccaacattgcggacttaacctcaccatgcattccatgttctttagcataatcatgca 31132  T
Q  136 tacatgcattcattcataaacaac---tatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgggtatggaccttgtaagaat 231  Q
    |||||||||||||||||||| |||   | |||   |||  || || |||||||||||| |||        ||||||||  | ||||| |||||||||||     
T  31133 tacatgcattcattcataaa-aacttttttttttctcactaatatcgaaggacttagataagttcttgt-aaacatcaaagatatggtccttgtaagaag 31230  T
Q  232 gaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt------actctttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaacc 325  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| ||      ||| |||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  31231 gaacaccaagaaatacaacttc-aaaaatcttaactaagcttcaacttttgttaaagaactttttccttggtttcgttctca-cttttgaaaagggaacc 31328  T
Q  326 gtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttc--nnnnnnnnnnnctatttttg 423  Q
      ||||||| |||| ||||| ||| |||| || | |||||||| ||  | |||||||||| ||||||| |||||||||             |||||||||    
T  31329 aattgcaacatcttcacaattttc-aaataaaacaatgttcct-tatcaagtttacaatt-actttgacaagtccttcaaaaaaaatgtgtctatttttg 31425  T
Q  424 cataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 461  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  31426 cataagcatatcatgcatcattttacattcataatttc 31463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 349
Target Start/End: Original strand, 10309 - 10630
Alignment:
Q  23 atacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtacttt 121  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||      | ||    
T  10309 atacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttaagctccaacattgtggacttaacctcaccatgcattc------catt 10401  T
Q  122 agcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgggtatggac 220  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  | |||  |||  || || ||||||||||||  ||        ||||||||  | |||||||    
T  10402 agcataaacatgcatacatgcattcattcataaaaaaaaaattc--tcactaatatcgaaggacttagatgagttcttgt-aaacatcaaagatatggac 10498  T
Q  221 cttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttcttaccttttga 315  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||     ||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10499 cttgtaaaaaggaacaccaagaaatacaacttc-aaaaatcttaactaagctttaccttttgttaagaact-tttccttggtttcgttcttactttttga 10596  T
Q  316 aaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttc 349  Q
    ||| ||||||  || |||| |||| |||||||||    
T  10597 aaagggaaccaattacaacatcttaacaatgttc 10630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 594 - 669
Target Start/End: Original strand, 10861 - 10936
Alignment:
Q  594 aagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatcttt 669  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||| ||||||| ||||| ||| | ||| ||||||||    
T  10861 aagaggtccacgagcttcgtgaggaggtgactacacttcgggccgaggtagagaagtgaaccaacctggtatcttt 10936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 84; Significance: 2e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 155
Target Start/End: Original strand, 8459 - 8601
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  8459 agaacccgtgatacaggtaga-tttgaaaccatagtccctaccaaatggcgttgttacccttaagctccaacattgtgaacttaacctcaccatgcattc 8557  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 155  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8558 catgttctttagcataatcatgcatacatgcattcattcataaa 8601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 219 - 352
Target Start/End: Original strand, 8665 - 8804
Alignment:
Q  219 accttgtaagaatgaacaccaagagatacaa-cttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctt-tccttggtttcgttcttacctt 311  Q
    |||||||||| | ||||||| ||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     ||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  8665 accttgtaaggaagaacacccagaaatccaaacttcaaaaa-tcttaactaagctttagcttttgttaagaacttttatccttggtttcgttcttacttt 8763  T
Q  312 ttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 352  Q
    ||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  8764 ttgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaattttcaaa 8804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 415 - 461
Target Start/End: Original strand, 8869 - 8915
Alignment:
Q  415 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 461  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  8869 ctatttttgcataagcatagcatgcatcattttgcattcataatttc 8915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 80; Significance: 4e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 31970 - 31714
Alignment:
Q  23 atacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtacttt 121  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||    
T  31970 atacaggtacaaat-gaaatcatagtccttaccaaatgtcgttgttacccttaagctccaacattgtggacttaacctcagcatgcattccatgttcttt 31872  T
Q  122 agcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatgggtatggac 220  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| | |||  ||||| |||||||||||  ||        |||||||||  | |||||||    
T  31871 agcataatcatgcatacatgcattcattcgtaaa-aacttttttc-tcactaaaatcgaaggacttaggtaaagttcttgcaaacatcaaagatatggac 31774  T
Q  221 cttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaa-ctaagctttagcttt 280  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  31773 cttgtgagaaggaacaccaagaaatacaatttc-aaaaatcttaaccaaagctttagcttt 31714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 2574 - 2430
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgg-acttaacctcatcatg--tat 109  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||    
T  2574 agaacccgtaatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgtcgttacccttgactccaacattgtggaacttaccctcaccatgtatat 2476  T
Q  110 tctatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 155  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  2475 tctatgtactttagcattatcatgcatgcatgcattcatccataaa 2430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0320 (Bit Score: 78; Significance: 6e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0320
Description:

Target: scaffold0320; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 23 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 4278 - 4146
Alignment:
Q  23 atacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtacttt 121  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||    
T  4278 atacaggtacaaat-gaaaccatagtccctaccaaatggcgttgttacccttaagctccaacattgtggacttaacctcaccatgcattccatgttcttt 4180  T
Q  122 agcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 155  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  4179 agcataatcatgcatacatacattcattcataaa 4146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0320; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 4090 - 3947
Alignment:
Q  214 tatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaa-cttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt------actctttccttggtttcgttctt 306  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||| |||||||||| || |||||||  |      ||| |||||||||||||||||||    
T  4090 tatggaccctgtaagaaggaacaccaagaaatccaaacttcaaaaa-tcttaactaaactgtagcttttttttaagaactttttccttggtttcgttctt 3992  T
Q  307 accttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 352  Q
    || ||||||||| | ||||  ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  3991 ac-ttttgaaaaggaaaccaattgcaacatcttcacaattttcaaa 3947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 20880 - 20756
Alignment:
Q  32 caatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataacc 130  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||| |    
T  20880 caatttgaaaccatagtccctacaaaatggcgttgttacgcttaagctccaacattgtggacttaacctcaccatgcattccatgttctttagcataatc 20781  T
Q  131 atgcatacatgcattcattcataaa 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  20780 atgcatacatgcattcattcataaa 20756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 76; Significance: 9e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 352
Target Start/End: Original strand, 17784 - 18122
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||| | |||||||||| |||||||||||||| |||| |||     
T  17784 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccattgtccctaccaaatggcgttgttatccttaagctccaacattatggacttaacctcaccatgcattt 17882  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccat---caaaaa-attgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacat 207  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||   |   ||  || || |||||||||||| |||        ||||||    
T  17883 gatgttctttagcataatcatgcatacatgcattcattcataaa-aacttttttttttctcactaatatcgaaggacttagataagttcttgt-aaacat 17980  T
Q  208 catgggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgt 302  Q
    ||  | ||||||||||||||||| |||||||      ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||     | | |||||||||||||||    
T  17981 caaagatatggaccttgtaagaaggaacacc------tacaacttcaaaaac-cttaactaagctttagcttttgttaagaattttttccttggtttcgt 18073  T
Q  303 tcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 352  Q
    ||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  18074 tctta-cttttgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaattttcaaa 18122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 76; Significance: 9e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 156
Target Start/End: Original strand, 38679 - 38815
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtgg-acttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  38679 agaacccgtgatacaggtaaaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacctttgactccaacactgtggaacttaacctcaccatgtattc 38778  T
Q  112 tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaac 156  Q
    |||        ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  38779 tat--------gcaaaatcatgcatacatgcattcattcataaac 38815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0478 (Bit Score: 75; Significance: 4e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0478
Description:

Target: scaffold0478; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 443 - 314
Alignment:
Q  23 atacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtacttt 121  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||  |||| |||| ||||    
T  443 atacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttaaactccaacattgtggacttgacctcaccatccattcgatgttcttt 345  T
Q  122 agcataaccatgcatacatgcattcattcat 152  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  344 agcataatcatgcatacatgcattcattcat 314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0478; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 415 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 43 - 2
Alignment:
Q  415 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcata 456  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43 ctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcata 2  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0478; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 218 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 246 - 115
Alignment:
Q  218 gaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaa-cttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctt-tccttggtttcgttcttacct 310  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| || ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||     ||| || |||||||||||||||||| ||    
T  246 gaccttgtaaggaagaacaccaagaaatccaaacttcaaaaa-tcttaactaagctttagcttttgttatgaacttttatccttggtttcgttctta-ct 149  T
Q  311 tttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaa 344  Q
    |||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||    
T  148 tttgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaa 115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 75; Significance: 4e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 345
Target Start/End: Original strand, 98758 - 99089
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 112  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||  | ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||  |||     
T  98758 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggtgtcgttatctttggctccaactttgtgggcttaacctcaccatgcgttcc 98856  T
Q  113 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatca-aaaaattgaaggacttagacaagnnnnnnncaaacatcatg 211  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || | || ||||  |||  || || |||||||||||| |||        ||||||||      
T  98857 atgttctttagcataatcatgcatacatgcattcatttattaa-acctttttc--tcactaatatcgaaggacttagataagttctggt-aaacatcaaa 98952  T
Q  212 ggtatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----actctttccttggtttcgttctt 306  Q
      ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||     ||| |||||||||||||||||||    
T  98953 catatggaccttgtaagaaggaataccaagaaatacaatttc-aaaaatcttaactaatctttaacttttgttaagaactttttccttggtttcgttctt 99051  T
Q  307 accttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaat 345  Q
    |  ||||||||| ||||||  ||||||| |||| |||||    
T  99052 a-gttttgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaat 99089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0441 (Bit Score: 73; Significance: 6e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0441
Description:

Target: scaffold0441; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 155
Target Start/End: Original strand, 9183 - 9326
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattc 111  Q
    |||||| |||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  9183 agaacccgtgatacaagtacaaat-gaaaccatagtccctaccaaatggcgttgttgcccttaagctccaacattgtggacttaacctcaccatgcattc 9281  T
Q  112 tatgtactttagcataacca-tgcatacatgcattcattcataaa 155  Q
     |||| |||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  9282 catgttctttggcataatcatttcatacatgcattcattcataaa 9326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 73; Significance: 6e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 493 - 677
Target Start/End: Original strand, 10000 - 10184
Alignment:
Q  493 caaaaggtcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgag 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| | | ||| ||| ||| ||||||||| ||||| || |||| |  ||| ||||||   ||||||    
T  10000 caaaaggtcaatccatcagtaaagtggtctaatgtcttctttcaacttcagctagcatatgcaaacacttgtacaaacacaaaagatggattagcttgag 10099  T
Q  593 caagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctttattgatgg 677  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  || ||||||| | ||||||    
T  10100 caagaggtccacgaggttcgtgaagaggtaacaacacttcgggccgaggtagagaagttaactaatctggtatcttcactgatgg 10184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 578 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 9442 - 9352
Alignment:
Q  578 atggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctt 668  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  9442 atggatcaacttgagcaagaggtccacgagcttcgcgaagagaaaacaacacttcgggccgaggtagagaagttacctaacctagtatctt 9352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 36 - 160
Target Start/End: Original strand, 301177 - 301297
Alignment:
Q  36 ttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtactttagcataaccatgca 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  |     ||    
T  301177 ttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccaatattgtggatttaacctcaccatgtgttctatgttctttagcaata----tca 301272  T
Q  136 tacatgcattcattcataaacaact 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  301273 tacatgcattcattcataaacaact 301297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 498 - 636
Target Start/End: Original strand, 301586 - 301724
Alignment:
Q  498 ggtcaatccatcagtaaagtcgttcaatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaaga 597  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  || ||| ||  ||| ||| ||||||| ||||  |||||  |||||| |  || |||||||| |||||| ||| |    
T  301586 ggtcaatccatcggtaaagtggtttgatctcttcactcaaattcagctcgcacatgcgaacactattgcaaacacaaagaatggatcaacttgaacaaaa 301685  T
Q  598 ggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggc 636  Q
    |||| |||||||||||| ||| || |||| |||||||||    
T  301686 ggtcgacgagcttcgtgaagaagtgacaagacttcgggc 301724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 70; Significance: 3e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 193
Target Start/End: Original strand, 11374 - 11545
Alignment:
Q  21 tgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatg-tact 119  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||| |||  || |  |    
T  11374 tgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaattgcgtttttacccttgactccaacattatgagcttaacctcaccatgttttcactgtttgt 11472  T
Q  120 ttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaactatttccatcaaaaaattgaaggacttagacaag 193  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| || |||||| |||||||||    
T  11473 gtagcataatcatgcatacatgcattcattcataaacaacttttgccatc-aaacatcgaaggatttagacaag 11545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 543 - 613
Target Start/End: Original strand, 11857 - 11926
Alignment:
Q  543 gctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgt 613  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| |   |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  11857 gctcacatatgcaaacactcgtgcaaacacataaaatggatcaacttgaacaagaggtcca-gagcttcgt 11926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 155
Target Start/End: Original strand, 8134 - 8270
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 112  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| |     ||||| |||||||||||||| |||| ||||     
T  8134 agaacccgtgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccctaccaaatggtgttgttatccttaa-----acattatggacttaacctcaccatgcattcc 8227  T
Q  113 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 155  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8228 atgttctttagcataatcatgcatacatgcattcattcataaa 8270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 155
Target Start/End: Original strand, 16685 - 16811
Alignment:
Q  21 tgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtactt 120  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||       |||||||||| |||| |||| |||| |||    
T  16685 tgatacaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgactttacccttgactccaaca-------cttaacctcaccatgcattccatgttctt 16776  T
Q  121 tagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 155  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16777 tagcataatcatgcatacatgcattcattcataaa 16811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 418 - 461
Target Start/End: Original strand, 17062 - 17105
Alignment:
Q  418 tttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 461  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  17062 tttttgcataagcatatcatacatcattttgcattcataatttc 17105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0362 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0362
Description:

Target: scaffold0362; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 1998 - 1872
Alignment:
Q  23 atacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatgtacttt 121  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | || ||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||      | ||    
T  1998 atacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcgctcttacccttaaactccaacattgtggacttaacctcaccatgcattc------catt 1906  T
Q  122 agcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 155  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1905 agcataatcatgcatacatgcattcattcataaa 1872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0362; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 522 - 668
Target Start/End: Complemental strand, 1528 - 1382
Alignment:
Q  522 caatgtctccatccaagttcggctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggt 621  Q
    |||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |   |||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  1528 caatgtcttcattcaacttcagctcgcatatgcaaacactcgtgcaaacacataaaatggatcaatttgaacaagaggtccatgagcttcgtgaggaggt 1429  T
Q  622 aacaacacttcgggctgaggtagtgaagttaactagcctagtatctt 668  Q
     || |||||| |||| ||||||| ||||||||| | ||| |||||||    
T  1428 gactacactttgggccgaggtagagaagttaaccaacctggtatctt 1382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0202 (Bit Score: 58; Significance: 5e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0202
Description:

Target: scaffold0202; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 214 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 25522 - 25380
Alignment:
Q  214 tatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt------actctttccttggtttcgttctta 307  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||      | | ||||||||||||||||||||    
T  25522 tatggtccttgtaagaaggaacaccaagaaatacaacttca-aaaatcttaactaagctttagcttttgttaagaaattttttccttggtttcgttctta 25424  T
Q  308 ccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 352  Q
     |||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  25423 -cttttgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaattttcaaa 25380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0435 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0435
Description:

Target: scaffold0435; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 23 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 14684 - 14601
Alignment:
Q  23 atacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctcatcatg 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14684 atacaggtacaatt-gaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttaagctccaacattgtggacttaacctcaccatg 14601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0435; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 415 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 14317 - 14277
Alignment:
Q  415 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcat 455  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14317 ctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcat 14277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 222 - 352
Target Start/End: Original strand, 3834 - 3968
Alignment:
Q  222 ttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----ac-tctttccttggtttcgttcttaccttttga 315  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||     || |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3834 ttgtaagaaggaacaccaagaaatacaacttc-aaaaatcttaactaagctttagcttttgttaagaacttctttccttggtttcgttctta-cttttga 3931  T
Q  316 aaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 352  Q
    ||| ||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  3932 aaagggaaccaattgcaacatcttcacaattttcaaa 3968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 155
Target Start/End: Original strand, 3626 - 3768
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtatt-- 110  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||||||||| |||| | ||| |||| ||| ||||| ||      
T  3626 agaacccgtgatacaggtaca-tgtgaaaccatagtccttaccaaatggcatgtttttccttgactccatcattatagacctaacatcaccatgttttca 3724  T
Q  111 ctatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 155  Q
    | || |  | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3725 ccat-ttgtgtggcataatcatgcatacatgcattcattcataaa 3768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 56; Significance: 8e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 433 - 291
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 112  Q
    |||||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||| | |||     
T  433 agaacccgtaatacaggtaca-tatgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttacccttgactccgacattgtggacctaacatcaccattttttca 335  T
Q  113 atg-tactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 155  Q
      | |  |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  334 ccgtttgtgcagcataatcatgcatacatgcattcattcataaa 291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 288 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 159 - 96
Alignment:
Q  288 tttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaa 352  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |||| ||||| ||||||    
T  159 tttccttggtttcgttctta-cttttgaaaagggaaccaattgcaacatcttcacaattttcaaa 96  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 23177 - 23085
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatg 106  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23177 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcattgttaccctaagctccaacattgtggacttaacctcaccatg 23085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 22922 - 22886
Alignment:
Q  288 tttccttggtttcgttcttaccttttgaaaaaggaacc 325  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22922 tttccttggtttcgttctta-cttttgaaaaaggaacc 22886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 222 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 37319 - 37076
Alignment:
Q  222 ttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt-----ac-tctttccttggtttcgttcttaccttttga 315  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||     || | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  37319 ttgtaagaaggaacaccaagaaatacaacttca-aaaatcttaactaagctttagcttttgttaagaacttttttccttggtttcgttctta-cttttga 37222  T
Q  316 aaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaatgaagccatgttcctctacaatgtttacaattcactttgataagtccttc--nnnnnnnnnn 413  Q
    ||| |||||   ||||||| |||| ||||  ||| |||| || | |||||||| ||  | || ||||||| ||||||| |||||||||                
T  37221 aaagggaactaattgcaacatcttcacaaatttc-aaataaaacaatgttcctttatcaagtctacaatt-actttgacaagtccttcaaataaaaaatg 37124  T
Q  414 nctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcattcatagtttc 461  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37123 tctatttttgcataagcatatcatgcatcattttgcattcataatttc 37076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 23 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 37516 - 37438
Alignment:
Q  23 atacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttga-ctccaacattgtggacttaacctca 101  Q
    |||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  37516 atacaggtacaaat-gaaatcgtagtccttaccaaatggcgtttttacccttaagctccaacattgtggacttaacctca 37438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 50; Significance: 3e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 23 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 340 - 208
Alignment:
Q  23 atacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattctatg-tacttt 121  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||| ||| ||||| |||   | |  | |    
T  340 atacaggtacaaat-gaaaccatagttcttaccaaatggcgttgttacccttgacttcgacattgtggacctaacatcagcatgttttcaccgtttgtgt 242  T
Q  122 agcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 155  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  241 agcataatcatgcatacatgctttcattcataaa 208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0866 (Bit Score: 49; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0866
Description:

Target: scaffold0866; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 4684 - 4586
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||| ||||    
T  4684 agaacctgtgatacaagtacaattt-aaaccatagtccttaccaaatagcattgta-cccttgactccaactttatggactcaacctcaccatgttttct 4587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 45; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 101
Target Start/End: Original strand, 299420 - 299507
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctca 101  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  299420 agaacccgtgatgcaggtaca-tttgaaaccatagtccttaccaaatggcgtcgatatccttggctccaacattgtgaagttaacctca 299507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 44; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 34029 - 33885
Alignment:
Q  214 tatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatac-aacttcaaaaaatcttaactaagctttagctttcgt------actctttccttggtttcgttctt 306  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||      ||| ||||||||||||| |||||    
T  34029 tatggaccttgtaagaaagaacaccaagaaatccaaacttc-aaaaatcttaactaagctatagcttttgttaaagaactttttccttggtttccttctt 33931  T
Q  307 accttttgaaaaaggaaccgtttgcaacgtctttacaatgttcaaaa 353  Q
    | |||||||||| ||||||  ||||||||| || || || |||||||    
T  33930 a-cttttgaaaagggaaccaattgcaacgttttcacgattttcaaaa 33885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 185989 - 185841
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggac--ttaacctcatcatgtatt 110  Q
    |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| | || ||| |  | ||||||| ||||| ||    
T  185989 agaacccgtgatacaggtacaaat-gaaaccatagtccttaccaaatggcgtt-atacccttgactccatcgttatgggccttaaacctcaccatgtttt 185892  T
Q  111 c----tatgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaacaact 160  Q
    |    | |||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  185891 caccgtttgtac---agcataatcatgcatacatgcattcattcataaataact 185841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 543 - 613
Target Start/End: Complemental strand, 184094 - 184024
Alignment:
Q  543 gctcgcatatgcagacactcgtgcaaataggaaaaatggatcgacttgagcaagaggtccacgagcttcgt 613  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| |   |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  184094 gctcacatatgcaaacactcgtgcaaacacataaaatggatcaacttgaacaagaggtccatgagcttcgt 184024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 415 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 184214 - 184177
Alignment:
Q  415 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcatt 452  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  184214 ctatttttgcataagcatatcatgcatcatcttgcatt 184177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 590 - 649
Target Start/End: Complemental strand, 29074 - 29015
Alignment:
Q  590 gagcaagaggtccacgagcttcgtggagaggtaacaacacttcgggctgaggtagtgaag 649  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  29074 gagcaagcggtccacgagcttcgtgaagaggtgacaacacttcgggccgagatagagaag 29015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 29653 - 29511
Alignment:
Q  13 agaacctgtgatacaggtacaatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgcccttgactccaacattgtggacttaacctcatcatgtattct 112  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||| |  || || ||| |  ||||||| ||||| | ||| || ||||| ||||    
T  29653 agaacccgtgatacatgtacatttgaaaatcatagtccttaccaaatggcatgtttaccattggccacaacattatggacctcaccacaccatgttttct 29554  T
Q  113 atgtactttagcataaccatgcatacatgcattcattcataaa 155  Q
      || ||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  29553 ccgttctttagcatattcattcatacatgcatacattcataaa 29511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 85
Target Start/End: Original strand, 84320 - 84374
Alignment:
Q  32 caatttgaaaccatagtccttaccaaatggcgttgttgccc-ttgactccaacat 85  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  84320 caatttaaaaccttagtccttaccaaatggcgttgttaccctttgactccaacat 84374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 280
Target Start/End: Original strand, 152039 - 152104
Alignment:
Q  214 tatggaccttgtaagaatgaacaccaagagatacaacttcaaaaaatcttaactaagctttagcttt 280  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  152039 tatggaccttgtaaaaaggagcaccaagaaatacaacttc-aaaagtcttaactaaactttagcttt 152104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0782 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0782
Description:

Target: scaffold0782; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 415 - 452
Target Start/End: Original strand, 5901 - 5938
Alignment:
Q  415 ctatttttgcataagcctatcatgcatcattttgcatt 452  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  5901 ctatttttgcataagcatatcatgcatcatcttgcatt 5938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 2895 times since January 2019
Visitors: 4802