View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0761_high_2 (Length: 481)

Name: NF0761_high_2
Description: NF0761
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0761_high_2
NF0761_high_2
[»] chr3 (11 HSPs)
chr3 (19-460)||(17201747-17202188)
chr3 (28-460)||(30150468-30150900)
chr3 (14-460)||(13963938-13964384)
chr3 (14-460)||(8270982-8271428)
chr3 (14-457)||(17321177-17321620)
chr3 (19-362)||(25768424-25768767)
chr3 (19-461)||(6149441-6149883)
chr3 (19-460)||(22149334-22149775)
chr3 (64-460)||(15943228-15943624)
chr3 (307-371)||(22259971-22260035)
chr3 (307-371)||(22268464-22268528)
[»] chr6 (11 HSPs)
chr6 (14-460)||(22364853-22365299)
chr6 (28-460)||(16378876-16379308)
chr6 (14-460)||(16646458-16646904)
chr6 (14-460)||(21412015-21412461)
chr6 (64-458)||(14149746-14150139)
chr6 (7-460)||(1660325-1660778)
chr6 (19-460)||(16103651-16104092)
chr6 (289-458)||(19982365-19982534)
chr6 (7-226)||(18421144-18421363)
chr6 (118-313)||(17786689-17786884)
chr6 (28-75)||(15007262-15007309)
[»] chr8 (5 HSPs)
chr8 (19-460)||(21193344-21193785)
chr8 (7-460)||(20649135-20649588)
chr8 (7-460)||(21847117-21847570)
chr8 (175-460)||(16415634-16415918)
chr8 (14-68)||(22553265-22553319)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (14-461)||(25048-25494)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (33-458)||(20242-20667)
scaffold0021 (33-458)||(29818-30243)
scaffold0021 (19-461)||(8667-9109)
scaffold0021 (163-460)||(91013-91310)
[»] chr7 (7 HSPs)
chr7 (28-460)||(27104141-27104573)
chr7 (28-460)||(7827371-7827803)
chr7 (28-460)||(27173752-27174184)
chr7 (14-462)||(4443392-4443840)
chr7 (47-458)||(13459484-13459895)
chr7 (7-107)||(16575119-16575219)
chr7 (7-107)||(16590443-16590543)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (28-460)||(20827822-20828254)
chr1 (14-460)||(22128854-22129301)
chr1 (14-458)||(41214277-41214721)
chr1 (14-460)||(20928551-20928997)
chr1 (64-460)||(20528550-20528946)
chr1 (350-460)||(23312571-23312681)
chr1 (32-445)||(20172643-20173056)
chr1 (14-81)||(20959752-20959819)
[»] chr5 (4 HSPs)
chr5 (14-460)||(24584596-24585042)
chr5 (14-461)||(21828202-21828648)
chr5 (7-460)||(23509071-23509524)
chr5 (98-328)||(33313828-33314075)
[»] chr4 (4 HSPs)
chr4 (14-460)||(15289502-15289948)
chr4 (52-372)||(18272656-18272976)
chr4 (7-460)||(15000128-15000588)
chr4 (70-460)||(12339274-12339664)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (14-458)||(25131574-25132019)
chr2 (14-461)||(22281217-22281664)
[»] scaffold0561 (1 HSPs)
scaffold0561 (28-460)||(5374-5806)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (28-460)||(4168-4599)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (14-458)||(35520-35963)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (29-460)||(97038-97467)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (7-460)||(3266-3719)
[»] scaffold0467 (2 HSPs)
scaffold0467 (7-460)||(12671-13124)
scaffold0467 (64-460)||(18-414)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (7-461)||(25689-26142)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (14-462)||(3999-4447)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (14-460)||(26907-27353)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (19-459)||(3215-3663)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (19-460)||(27287-27728)
scaffold0008 (163-460)||(130982-131282)
[»] scaffold0151 (2 HSPs)
scaffold0151 (186-458)||(32394-32665)
scaffold0151 (14-140)||(32264-32391)
[»] scaffold1140 (1 HSPs)
scaffold1140 (19-461)||(101-543)
[»] scaffold0193 (2 HSPs)
scaffold0193 (117-367)||(2180-2430)
scaffold0193 (18-85)||(2427-2494)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (64-460)||(4768-5163)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (14-460)||(6204-6653)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (118-460)||(402-744)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (169-460)||(12127-12418)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (288-460)||(24474-24646)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (64-461)||(8786-9175)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (262-460)||(16412-16610)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (7-434)||(7776-8203)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (323-460)||(73290-73427)
scaffold0011 (323-460)||(77671-77808)
scaffold0011 (349-461)||(182500-182612)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (356-460)||(35587-35691)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (289-458)||(77934-78103)
scaffold0058 (67-209)||(78183-78325)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (289-460)||(49170-49341)
[»] scaffold0302 (2 HSPs)
scaffold0302 (7-203)||(3178-3374)
scaffold0302 (412-460)||(1722-1770)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 310; Significance: 1e-174; HSPs: 11)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 17202188 - 17201747
Alignment:
Q  19 tgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccgaatatt 118  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17202188 tgggtgcagggcatggagaggatatttcgtgctatggtgacgagtgatgaacagaaggtgaggttggctactcacatgcttgctgaggaggccgagtatt 17202089  T
Q  119 ggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagattt 218  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17202088 agtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcaaagttcaaagctgagttcttgaggaagtattttcctgaagattt 17201989  T
Q  219 aaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcg 318  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| | ||| || ||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  17201988 gaggaccaggaaggaagtggagttcctgaacttgaagcaagggagcatgtccatagctgtgtatgtggcgaagtttgaggagcttttgaggttttgtccg 17201889  T
Q  319 tacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgag 418  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||    
T  17201888 tacatcaatgctgaggatgcgatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggatatctatcagtatatgtgtgtttaggagatcctag 17201789  T
Q  419 attttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17201788 attttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 17201747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 28 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 30150900 - 30150468
Alignment:
Q  28 ggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccgaatattggtggacta 127  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  30150900 ggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtgaggttggctactcacatgcttgctgaggaggctgagtattggtggacca 30150801  T
Q  128 atgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagatttaaggaccag 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  30150800 atgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttggacaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactttccagaggatttgaggactag 30150701  T
Q  228 gaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaat 327  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| |||| ||||| || || ||| ||| || |||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||    
T  30150700 gaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtctgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgcaaggttttgtccctacatcaat 30150601  T
Q  328 gttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgata 427  Q
    |  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  30150600 gcggaggatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttgata 30150501  T
Q  428 ctttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30150500 ctttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 30150468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 14 - 460
Target Start/End: Original strand, 13963938 - 13964384
Alignment:
Q  14 agacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccga 113  Q
    |||||||| || | |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||| ||||||||| ||    
T  13963938 agacatggttgcaaggcatggaaaggatctttcgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtgaggttggctactcacatgcttgttgaggaggctga 13964037  T
Q  114 atattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaa 213  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  13964038 gtattggtggaccaatgctaagggaagacttgagattgatggagaggttgtgacttggacaaggttcaaagctgagtttttgaggaagtactttccagag 13964137  T
Q  214 gatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggtttt 313  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||| |||| |||||||| || ||| ||| || |||||||||||||||| | |||||||    
T  13964138 gatttgaggactaggaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtccgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgcaaggtttt 13964237  T
Q  314 gttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagat 413  Q
    || | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  13964238 gtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttcaggagat 13964337  T
Q  414 ccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13964338 ccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 13964384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 14 - 460
Target Start/End: Original strand, 8270982 - 8271428
Alignment:
Q  14 agacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccga 113  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| || | |||||||||||||||||| ||    
T  8270982 agacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactagtgatgatcaaaaggtgaggttggctactcgcatgcttgctgaggaggctga 8271081  T
Q  114 atattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaa 213  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  8271082 gtattggtggaccaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttggacaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactttccagag 8271181  T
Q  214 gatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggtttt 313  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||| |||| |||||||| || ||| ||| || |||||||||||||||| | |||||||    
T  8271182 gatttgaggactaggaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtccgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgcaaggtttt 8271281  T
Q  314 gttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagat 413  Q
    || | |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  8271282 gtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcaaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttcaggagat 8271381  T
Q  414 ccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  8271382 ccgagactttgatactttggtgaataagtgtcgtatgtttgatgatg 8271428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 14 - 457
Target Start/End: Original strand, 17321177 - 17321620
Alignment:
Q  14 agacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccga 113  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||| ||    
T  17321177 agacatgggtgcaaggcatggagaggatcttccgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtcaggttggctaaccacatgcttgctaaggaggctga 17321276  T
Q  114 atattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaa 213  Q
     ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||     
T  17321277 gtattggtggacgaatgctaaggggagactcgagataggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaaggttgagtttttgaggaagtactttccagag 17321376  T
Q  214 gatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggtttt 313  Q
    ||||| || || || ||||||||||| ||| |||||||  || || ||||||||||||| |||||| |||  |  |||||||| ||||||||||||||||    
T  17321377 gatttgagaactagaaaggaagtggagttcttgaacttgcagtaagggagcatgtccgtggctgagtatgcagcaaagtttgaagagctttcgaggtttt 17321476  T
Q  314 gttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagat 413  Q
      |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17321477 tctcgtacattaatgttgaggatgcgatggtgtccaagtgtgtgaaatttgaaagtggacttaggccggatatctatcagtatatgtgtgttcaggagat 17321576  T
Q  414 ccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatg 457  Q
     ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17321577 tcgagagtttgataccttggtgcataagtgtcgtatgtttgatg 17321620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 25768767 - 25768424
Alignment:
Q  19 tgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccgaatatt 118  Q
    |||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||    
T  25768767 tgggtgcagggcatagagaggatattccgtgctatggtgacgagtgatgaccaaaaggtcagattggcgactcatatgcttgctgaggaggccgaacatt 25768668  T
Q  119 ggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagattt 218  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  25768667 ggtggactaatgccaaaggaagacttgagttgggaggagaagttgtgacctgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtatttccctgaagattt 25768568  T
Q  219 aaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcg 318  Q
     |||||||||||||| || || || |||||||| || ||| | ||||| || ||||||  | |||  |  ||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  25768567 gaggaccaggaaggaggttgagtttctgaacttgaaacaaggaagcatatctgtagctacgtatgcagaaaagtttgaggagctttcaaggttttgtccg 25768468  T
Q  319 tacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagtt 362  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  25768467 tacatcaatgctgaagatgctatggtttcaaagtgtgtgaagtt 25768424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 461
Target Start/End: Original strand, 6149441 - 6149883
Alignment:
Q  19 tgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccgaatatt 118  Q
    |||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||||||||  | | |||||||||||||||  | ||||| || |||||||||||||| || ||  | |    
T  6149441 tgggtgcagggtatggagcggattttccgagctatggtgacaggaggtgaccagaaggtcaggctagcgactcatatgcttgctgaggaagcagagcact 6149540  T
Q  119 ggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagattt 218  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| || || || || ||||| ||||||||||| || | ||| |||||||||||||| || |||||||| ||    
T  6149541 ggtggactaatgccaaaggaagacttgagatgggaggtgatgtggtgacctgggcgaagtttaaggttgaattcttgaggaagtatttccctgaagactt 6149640  T
Q  219 aaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcg 318  Q
     ||||||| ||||||  | || || |||||  | || ||| | |||||||| || || ||| ||| || |||||||||||| ||||||||||||||  |     
T  6149641 gaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaaggaagcatgtctgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggaactttcgaggttttgcccc 6149740  T
Q  319 tacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgag 418  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||  |||| ||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  6149741 tacatcaatgctgaggatgctatggttttgaagtatgtgaagtttgagagtgggcttaggccgaatatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgag 6149840  T
Q  419 attttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatgt 461  Q
    | |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  6149841 actttgatactttggtgcattagtgttgtatgtttgatgatgt 6149883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Original strand, 22149334 - 22149775
Alignment:
Q  19 tgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccgaatatt 118  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||| | |||  |||||||| | |||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| || ||||    
T  22149334 tgggtgtagggcatagagaggatctttcatgcggtggtgactggcgatgaccagaaggttaggttggctactcatatgcttgctgaggaggcagagtatt 22149433  T
Q  119 ggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagattt 218  Q
     |||||||||||| || |||||||||||||| |  || || || ||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  22149434 agtggactaatgccaaaggaagacttgagatggagggggaggtggtgacttgggcaaggttcaaggccgagttcttgaggaagtatttttcggaagattt 22149533  T
Q  219 aaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcg 318  Q
     ||||| |||||||  || || ||| | ||||| |||||| | || ||||| || || ||| ||| || ||||||||| ||| || | |||||||||  |    
T  22149534 gaggacaaggaaggtggtagaattcttaaacttgaagcaaggaagtatgtctgtggccgagtatgcggcgaagtttgaagagtttgcaaggttttgtctg 22149633  T
Q  319 tacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgag 418  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| || |||  ||| |||||||||| || ||||| || |||||||| |    
T  22149634 tacatcaatgtcgagaatgcaatggtgtccaagtgtgtgaagtttgagagtgggctttggctagatgtctatcagtacatgtgtgtgcaagagatccgtg 22149733  T
Q  419 attttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  22149734 attttgacactttggtgcacaagtgtcatatgtttgatgatg 22149775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 64 - 460
Target Start/End: Original strand, 15943228 - 15943624
Alignment:
Q  64 gatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttg 163  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||| || ||| |  ||||||| || ||  | |||||||| ||||| |||||||| |||||| | |  || || || |    
T  15943228 gatgaccaaaaggttagactggcgactcatatgttgactgaggaagcggagcactggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttggaaggtgatgtgg 15943327  T
Q  164 tgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggag 263  Q
    |||| ||||| |||||||| | ||| ||||| |||||||| || || ||||| || ||||||| ||| ||  | || || |||||  |||||||| | |     
T  15943328 tgacctgggctaagttcaaggttgaattcttaaggaagtatttcccggaagacttgaggaccaagaatgagattgagtttctgaatctaaagcaaggaat 15943427  T
Q  264 catgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttc 363  Q
    | |||| || || ||| ||| || |||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||     
T  15943428 cttgtcagtggccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcgaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatgatttcgaagtgcgtgaagttt 15943527  T
Q  364 gaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15943528 gagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 15943624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 307 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 22260035 - 22259971
Alignment:
Q  307 aggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgg 371  Q
    ||||||||| | || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||    
T  22260035 aggttttgtccttatatcaatgttgaagatgctatggtgtccaagtgtgttaagtttgagagtgg 22259971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 307 - 371
Target Start/End: Original strand, 22268464 - 22268528
Alignment:
Q  307 aggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgg 371  Q
    ||||||||| | || ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| || |||||    
T  22268464 aggttttgtccttatatcaatgttgaagatgctatggtgtccaagtgtgttaagtttgagagtgg 22268528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 275; Significance: 1e-153; HSPs: 11)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 14 - 460
Target Start/End: Original strand, 22364853 - 22365299
Alignment:
Q  14 agacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccga 113  Q
    |||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  22364853 agacttgggtgcagggcatagagaggatattccgtgctatggtgacaagtgatgactagaaggtcaggttggttactcacatgcttgctgaggaggccga 22364952  T
Q  114 atattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaa 213  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  22364953 gtattggtggactaattctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcaaagttcaaagttgagttcttgaggaagtatttccctgaa 22365052  T
Q  214 gatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggtttt 313  Q
    | ||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||  ||||| |||||||||| ||||||||| ||  || ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  22365053 ggtttgaggaccaggaaggaagtagagttcttgaacttgtagcaagggagcatgtctgtagctgagtatacggcgaagtttgaagagctttcgagatttt 22365152  T
Q  314 gttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagat 413  Q
     | | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22365153 ttccatacatcaatgttgaagatgcaatggtttcgaagtgtgtgaagtttgaaagtgagcttaggccggatatctatcagtatatgtgtgttcaggagat 22365252  T
Q  414 ccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  22365253 ccgagattttgatactttggtgtataagtgtcgtatgtttgatgatg 22365299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 28 - 460
Target Start/End: Original strand, 16378876 - 16379308
Alignment:
Q  28 ggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccgaatattggtggacta 127  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  16378876 ggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtgaggttggctactcacatgcttgctgaggaggctgagtattggtggacca 16378975  T
Q  128 atgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagatttaaggaccag 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  16378976 atgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttggacaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactttccagaggatttgaggactag 16379075  T
Q  228 gaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaat 327  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| |||| ||||| || || ||| ||| || |||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||    
T  16379076 gaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtctgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgcaaggttttgtccctacatcaat 16379175  T
Q  328 gttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgata 427  Q
    |  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  16379176 gcggaggatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttgata 16379275  T
Q  428 ctttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16379276 ctttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 16379308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 14 - 460
Target Start/End: Original strand, 16646458 - 16646904
Alignment:
Q  14 agacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccga 113  Q
    |||||||| || | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||    
T  16646458 agacatggttgcaaggcatggagagaatctttcgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtgaggttggctactcacatgcttgctgaggaggctga 16646557  T
Q  114 atattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaa 213  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| | | ||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  16646558 gtattggtggaccaatgctaagggaagacttgagattgatggaggggttgtgacttggacaacgttcaagactgagtttttgaggaagtactttccagag 16646657  T
Q  214 gatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggtttt 313  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||| |||| |||||||| || ||| ||| || |||||||||||||||| | |||||||    
T  16646658 gatttgaggactaggaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtccgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgcaaggtttt 16646757  T
Q  314 gttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagat 413  Q
    || | |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  16646758 gtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgtgtgttaaggagat 16646857  T
Q  414 ccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16646858 ccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 16646904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 14 - 460
Target Start/End: Original strand, 21412015 - 21412461
Alignment:
Q  14 agacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccga 113  Q
    |||| |||||| ||||||||||| |||| || ||||| ||||||||  | |||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||    
T  21412015 agacttgggtgcagggcatggagcggatatttcgtgctatggtgacgggagatgaccaaaaggccagattggcgactcatatgcttgctgaggaggctga 21412114  T
Q  114 atattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaa 213  Q
     || |||||||||||||  || |||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||    
T  21412115 gtactggtggactaatgtcaaaggaagatttgagatgggaggagaagttgtgacctgggcgaagttcaaagcagaattcttaaggaagtatttccctgaa 21412214  T
Q  214 gatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggtttt 313  Q
    ||||| || || |||||||| ||||| || |||||| | |||||  | |||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  21412215 gatttgagaactaggaaggaggtggaatttctgaacctgaagcagggaagcatgtctgtagccgagtatgaggcgaagtttgaggagctttcgaagtttt 21412314  T
Q  314 gttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagat 413  Q
    || |||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21412315 gtccgtacatcaatgctgaagatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggatatctatcagtatatgtgtgttcaggagat 21412414  T
Q  414 ccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||    
T  21412415 ccgagactttgatactttggtgcataagtgttgcatgtttgttgatg 21412461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 64 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 14150139 - 14149746
Alignment:
Q  64 gatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttg 163  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| || |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  14150139 gatgatcagaaggtcaggttggctactcacatgtttgttgaggaggccgagtattggtggactaatgctaagggaaaacttgagattggtggagaggttg 14150040  T
Q  164 tgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggag 263  Q
    |||||||||| ||||||||  | ||||| ||||||||||||||||  || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| ||||||| |||||| ||||    
T  14150039 tgacttgggctaagttcaagaccgagtttttgaggaagtactttctagaggatttgaggactaggaaggaggtggagttcttgaacttgaagcaagggag 14149940  T
Q  264 catgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttc 363  Q
     |||||||| |||||| ||| || || |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  14149939 tatgtccgtggctgagtatgcggcgatgtttgaggagctgtcgaggttttgtccgtacatcaatgctgaggatgcgatggtgtccaagtgtgtgaaattt 14149840  T
Q  364 gaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatga 458  Q
    ||||||||| |||||| |||| |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||    
T  14149839 gaaagtgggcttaggctggatttctatctgtatatgtgtgttcaagagatccgagattttgatacctt-gtgcatcagtgtcgtatgtttgatga 14149746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Original strand, 1660325 - 1660778
Alignment:
Q  7 ggagcagagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    |||||| |||| |||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||  | |||||||||||||||||| | ||||| || ||| |||||||||    
T  1660325 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgtttgctgagg 1660424  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactt 206  Q
    | || || || |||||||  ||||| ||||| || |||||| | || || || || ||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| ||    
T  1660425 aagcagagtactggtggatcaatgccaagggcaggcttgagttgggcggtgatgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 1660524  T
Q  207 tcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcg 306  Q
     || ||||| || ||||||| |||||| || || || |||||  | || ||| ||| |||||| ||||| ||| ||| || |||||||||||| ||||||    
T  1660525 cccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagtttgaggaactttcg 1660624  T
Q  307 aggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttc 406  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||  ||||||||||| || |||||||    
T  1660625 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggtcatctatcagtacatgtgtgttc 1660724  T
Q  407 aggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1660725 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 1660778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 16104092 - 16103651
Alignment:
Q  19 tgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccgaatatt 118  Q
    |||||| |||| |||||| |||| ||||  || ||||||||  | |||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||| || ||  | |    
T  16104092 tgggtgcagggtatggagcggattttccaagctatggtgacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatgtgcttgctgaggaagcggagcact 16103993  T
Q  119 ggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagattt 218  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| || || || || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||    
T  16103992 ggtggactaatgccaaaggaagacttgaaatgggaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaagctgaattcttgaggaagtatttccctgaagactt 16103893  T
Q  219 aaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcg 318  Q
     ||||| | |||||| || || || ||||| || || ||| | |||||||| ||||| ||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||| | |     
T  16103892 gaggactaagaaggaggttgagtttctgaatttgaatcaaggaagcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagtttgaggagctttccaggttttttccc 16103793  T
Q  319 tacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgag 418  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| || || ||  ||||||||||||    
T  16103792 tacatcaatgctgaagatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgtgcgtctaggagatccgag 16103693  T
Q  419 attttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    | ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  16103692 actttcatactttggtgcaaaagtgtcgtatgtttgatgatg 16103651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 289 - 458
Target Start/End: Original strand, 19982365 - 19982534
Alignment:
Q  289 aagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatct 388  Q
    |||||| ||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||| |||||| || ||| | || ||||| || || |    
T  19982365 aagtttaaggagctatcaaggttttgttcgtatattaatgttgaggatgctatggtttcaaaatgtgagaagtttgagagtcgtttgaggcccgagattt 19982464  T
Q  389 atcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatga 458  Q
    ||||||| ||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  19982465 atcagtacatacgttttcatgagatccgagatttttatactttggtacacaagtatcgtatgtttgatga 19982534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 7 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18421363 - 18421144
Alignment:
Q  7 ggagcagagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    |||||| |||| |||||| |||| |||||| |||| |||||  | |||||||| || |||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||| |||    
T  18421363 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgatctatggtgacgagggatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgcttgctaagg 18421264  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactt 206  Q
    | || ||  | |||||||||||||| || |||||||||||||| || || || |||||||| ||||| |||||| | | ||| |||||||||||||| ||    
T  18421263 aagcagagcactggtggactaatgccaaaggaagacttgagatgggaggtgatgttgtgacctgggctaagttccaggttgaattcttgaggaagtattt 18421164  T
Q  207 tcctgaagatttaaggacca 226  Q
     |||||||| || |||||||    
T  18421163 ccctgaagacttgaggacca 18421144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 17786884 - 17786689
Alignment:
Q  118 tggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagatt 217  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| || || || || ||||| | ||| |||||||| |  || ||||||||||| || || |||||||| |    
T  17786884 tggtggactaatgccaaaggaagacttgagatgggaggtgatgtggtgacctaggctaagttcaaggtcgaattcttgaggaaatatttccctgaagact 17786785  T
Q  218 taaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggtttt 313  Q
    | ||||||| ||||||  | || || |||||  | || ||| | |||||||| ||||| ||  ||| || |||||| ||||| |||||||||||||    
T  17786784 tgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaaggaagcatgtctgtagccgaatatgcggcgaagttcgaggaactttcgaggtttt 17786689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 75
Target Start/End: Original strand, 15007262 - 15007309
Alignment:
Q  28 ggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaag 75  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  15007262 ggcatggaaaggatcttccgtgctatggtgactagtgatgatcagaag 15007309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 5)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Original strand, 21193344 - 21193785
Alignment:
Q  19 tgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccgaatatt 118  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  21193344 tgggtgcagggcatggagaggatattttgtgctatggtgacgagtgatgaccagaaggtcagattgacgactcatatgcttgctgaggaggccgaatatt 21193443  T
Q  119 ggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagattt 218  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21193444 ggtggaccaatgccaagggaagacttgagattgttggggaagtcgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtatttccctgaagattt 21193543  T
Q  219 aaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcg 318  Q
     |||||||||||||| || |  || |||||||| ||| || ||||||| || ||||| ||| ||| || |||||| ||| ||||||||||||||||| ||    
T  21193544 gaggaccaggaaggaggtagcgtttctgaacttgaagtaagggagcatctctgtagccgagtatgcggcgaagttcgagaagctttcgaggttttgtccg 21193643  T
Q  319 tacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgag 418  Q
    ||||||| || ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21193644 tacatcattgctgaagatgcgatggtttcgaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggatatctatcagtatatgtgtgttcaggagatccgag 21193743  T
Q  419 attttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  21193744 attttgatactttggtgcataagtgtcgtaagtttgatgatg 21193785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Original strand, 20649135 - 20649588
Alignment:
Q  7 ggagcagagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||||||| || | || || || ||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  20649135 ggagcacagacttgggtgcagggcatggagcgggtttttcgagctatggtgacgggagatgaccagaaggtcagactggcgactcatatgcttgctgagg 20649234  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactt 206  Q
    | || ||  | | |||||||||||| || |||||||||||| | || || || |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||    
T  20649235 aagcagagcacttgtggactaatgccaaaggaagacttgagttgggaggtgatgttgtgacctgggcgaagttcaaagttgaattcttgaggaagtgttt 20649334  T
Q  207 tcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcg 306  Q
     |||||||| || ||||||| |||||| || || || ||||| ||||| ||| | |||||||| ||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  20649335 ccctgaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatttaaaacaaggaagcatgtctgtagccgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 20649434  T
Q  307 aggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttc 406  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| || | ||| |    
T  20649435 aggttttgtccctacatcaatgttgaagatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtaaatgtatgtac 20649534  T
Q  407 aggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  20649535 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttaatgatg 20649588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Original strand, 21847117 - 21847570
Alignment:
Q  7 ggagcagagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    |||||| |||| |||||| |||| |||||| |||| ||||  || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  21847117 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccaagctatggttactggtgatgaccagaaggtcagattggcgactcatatgctagctgagg 21847216  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactt 206  Q
    | || || || |||||||| ||||| ||||| ||||||||| | |  || |  |||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| ||    
T  21847217 aagcagagtactggtggaccaatgccaagggcagacttgagttggaaggtggtgttgtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 21847316  T
Q  207 tcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcg 306  Q
     || ||||| || ||||||| |||||| || || || |||||  | || ||| ||| |||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  21847317 cccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggtgaagtttgaggagctttcg 21847416  T
Q  307 aggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttc 406  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  21847417 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttc 21847516  T
Q  407 aggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21847517 aggagattcgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 21847570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 175 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 16415918 - 16415634
Alignment:
Q  175 aagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtag 274  Q
    |||||||| | ||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||||| ||||||  | || || |||||  | || ||| ||| |||||| ||||    
T  16415918 aagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttccccgaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaatggatcatgtctgtag 16415819  T
Q  275 ctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtt 374  Q
    | ||  ||| || |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||| |    
T  16415818 ccgaatatgcggcgaagtttgaggaactttcgaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggct 16415719  T
Q  375 taggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||    
T  16415718 taggccggatatctatcagtacatgtgtgtccaggggatccgagactttgatactttggtgcataactgttg-atgtttgatgatg 16415634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 22553319 - 22553265
Alignment:
Q  14 agacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatga 68  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||    
T  22553319 agacatgggtgcaagacatggagaggatcttccgtgctatgatgactaatgatga 22553265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 14 - 461
Target Start/End: Original strand, 25048 - 25494
Alignment:
Q  14 agacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccga 113  Q
    ||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| || ||||| || |  |||||||| |||||||||||    
T  25048 agacatgggtgcaaggcatggggtggatcttccgtgctatgatgactagtgatgatcagaaggtgaggttggctactctaatgcttgccgaggaggccga 25147  T
Q  114 atattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaa 213  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  25148 gtattggtggaccaatgctaatggaagacttgagattggtggagaagtt-tgacttgggctaagttcaaagctgagtttttgaggaagtactttccagag 25246  T
Q  214 gatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggtttt 313  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| ||| || ||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  25247 gatttaaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgttcgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggagcttccgaggtttt 25346  T
Q  314 gttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagat 413  Q
    || |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  25347 gtccgtacatcaatgctgaggatgcgatggtttccaagtgcgcgaagtttgaaagtgggattaggccggatgtctatcagtatatgtgtgttcaagagat 25446  T
Q  414 ccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatgt 461  Q
     | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25447 tcaagattttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgt 25494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 33 - 458
Target Start/End: Original strand, 20242 - 20667
Alignment:
Q  33 ggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccgaatattggtggactaatgct 132  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20242 ggagaggatcttctgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggttaggttggctacccacatgcttgctgaggaggccgagtattggtggactaatgct 20341  T
Q  133 aagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagatttaaggaccaggaagg 232  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  20342 aagggaagacttgagattggtggataggtggtgccttgggctaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactttccagaggatttgaggactaggaagg 20441  T
Q  233 aagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaatgttga 332  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||| |||| |||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||| | |    
T  20442 aagtggagttcttgaacttgaagcaagggagtatgtccgtggctgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgtgaggttttgtccgtacattaatgctaa 20541  T
Q  333 ggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgatactttg 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20542 ggatgcgatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggatatctaccagtatatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttg 20641  T
Q  433 gtacataagtgtcgtatgtttgatga 458  Q
    || |||| ||||| ||||||||||||    
T  20642 gtgcataggtgtcatatgtttgatga 20667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 33 - 458
Target Start/End: Original strand, 29818 - 30243
Alignment:
Q  33 ggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccgaatattggtggactaatgct 132  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29818 ggagaggatcttctgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggttaggttggctacccacatgcttgctgaggaggccgagtattggtggactaatgct 29917  T
Q  133 aagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagatttaaggaccaggaagg 232  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||    
T  29918 aagggaagacttgagattggtggataggtggtgccttgggctaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactttccagaggatttgaggactaggaagg 30017  T
Q  233 aagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaatgttga 332  Q
    ||||||| ||| ||||||| |||||| |||| |||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||| | |    
T  30018 aagtggagttcttgaacttgaagcaagggagtatgtccgtggctgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgtgaggttttgtccgtacattaatgctaa 30117  T
Q  333 ggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgatactttg 432  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30118 ggatgcgatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggatatctaccagtatatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttg 30217  T
Q  433 gtacataagtgtcgtatgtttgatga 458  Q
    || |||| ||||| ||||||||||||    
T  30218 gtgcataggtgtcatatgtttgatga 30243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 9109 - 8667
Alignment:
Q  19 tgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccgaatatt 118  Q
    |||||| |||||| |||| |||| ||| |||| ||||||||  | | ||| |||||||||| | ||||||| |  ||||||| |||||| || ||  | |    
T  9109 tgggtgcagggcacggagcggatattcggtgctatggtgacgggaggtgatcagaaggtcaaactggcgactcgtatgcttgttgaggaagctgagcact 9010  T
Q  119 ggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagattt 218  Q
      ||||||||||| || |||||| ||||||| || ||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||| ||    
T  9009 attggactaatgccaaaggaagaattgagatgggaggtaaagttgtgacctgggcgaagttcaaagctgaattcttgatgaagtatttccctgaagactt 8910  T
Q  219 aaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcg 318  Q
     ||||||| |||||| || || || |||||  | || ||| | |||||||| ||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  8909 gaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaaggaagcatgtctgtagccgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcgaggttttatccg 8810  T
Q  319 tacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgag 418  Q
    |||||||||| | | ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  8809 tacatcaatgctaaagatgctatggtttcgaagtgtgtaaagtttgaaagtgggcttaggccgaatatttatcagtatttgtgtgtccaggagatccgag 8710  T
Q  419 attttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatgt 461  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8709 actttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatgt 8667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 163 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 91310 - 91013
Alignment:
Q  163 gtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacgga 262  Q
    ||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||||| ||||||  | || || |||||  | || ||  |||    
T  91310 gtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttccctgaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacatggga 91211  T
Q  263 gcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagtt 362  Q
     |||||| ||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| | | |||| |||| |||||||||    
T  91210 tcatgtctgtagccgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcgaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctaagatttcgaagtatgtgaagtt 91111  T
Q  363 cgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
     || |||||| ||||| || | |||||||| || || ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  91110 tgagagtgggcttaggacgaaaatctatcaataaatgtgtgttcaggagatcagagactttgaaactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 91013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 7)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 28 - 460
Target Start/End: Original strand, 27104141 - 27104573
Alignment:
Q  28 ggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccgaatattggtggacta 127  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  27104141 ggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtgaggttggctactcacatgcttgctgaggaggctgagtattggtggacca 27104240  T
Q  128 atgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagatttaaggaccag 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  27104241 atgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttggacaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactttccagaggatttgaggactag 27104340  T
Q  228 gaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaat 327  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| |||| ||||| || || ||| ||| || |||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||    
T  27104341 gaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtctgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgcaaggttttgtccctacatcaat 27104440  T
Q  328 gttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgata 427  Q
    |  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  27104441 gcggaggatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttgata 27104540  T
Q  428 ctttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27104541 ctttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 27104573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 28 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 7827803 - 7827371
Alignment:
Q  28 ggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccgaatattggtggacta 127  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  7827803 ggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtgaggttggctactcacatgcttgctgaggaggctgagtattggtggacca 7827704  T
Q  128 atgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagatttaaggaccag 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  7827703 atgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttggacaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactttccagaggatttgaggactag 7827604  T
Q  228 gaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaat 327  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| |||| ||||| || || ||| ||| || |||||||||||||||| | ||||||||  | |||||||||    
T  7827603 gaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtctgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgcaaggttttgcccctacatcaat 7827504  T
Q  328 gttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgata 427  Q
    |  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  7827503 gcggaggatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttgata 7827404  T
Q  428 ctttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7827403 ctttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 7827371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 28 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 27174184 - 27173752
Alignment:
Q  28 ggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccgaatattggtggacta 127  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  27174184 ggcatggagaggatctttcgtgctatcgtgactagtgatgatcagaaggtgaggttggctactcacatgcttgctgaggaggctgagtattggtggacca 27174085  T
Q  128 atgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagatttaaggaccag 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  27174084 atgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttggacaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactttccagaggatttgaggactag 27173985  T
Q  228 gaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaat 327  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| |||| ||||| || || ||| ||| || |||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||    
T  27173984 gaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtctgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgcaaggttttgtccctacatcaat 27173885  T
Q  328 gttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgata 427  Q
    |  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  27173884 gcggaggatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttgata 27173785  T
Q  428 ctttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27173784 ctttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 27173752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 14 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 4443840 - 4443392
Alignment:
Q  14 agacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccga 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  4443840 agacatgggtgcagggcatggagaggatcttctatgctatggtgactagtgatgatcagaaggtcaggttggctacctacatgcttgctgaggaggccga 4443741  T
Q  114 atattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaa 213  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||| ||||||||| | ||||||  || |||| ||||||||||||||||| ||     
T  4443740 gtattggtggacgaatgctaagggaagacttgagatcggcagagaggttgggacttgggcaaggttcaagactaagtttttgaggaagtactttccagag 4443641  T
Q  214 gatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggtttt 313  Q
    ||||| ||||  || ||||||||||| ||| | ||||| |||||| |||||||||| || |||||| ||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  4443640 gatttgaggaatagaaaggaagtggagttcttaaacttgaagcaagggagcatgtctgtggctgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgcgaggtttt 4443541  T
Q  314 gttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagat 413  Q
     | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  4443540 atgcgtacattaatgttgaggatgcaatggtgtccaagtgtgtgaaatttgaaagtggacataggccggatatctatcagtatatgtgtgttaaggagat 4443441  T
Q  414 ccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatgtc 462  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4443440 ccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgtc 4443392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 47 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 13459895 - 13459484
Alignment:
Q  47 gtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttga 146  Q
    |||| ||||||||| |||||||  |||||||||  || || ||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  13459895 gtgctatggtgactggtgatgattagaaggtcaagttagctacccacatgcttgttgaggaggctgagcattggttgacgaatgctaagggaagacttga 13459796  T
Q  147 gattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctg 246  Q
    |||  ||||||| || ||||||| ||  | ||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||    
T  13459795 gatcagtggagaggtagtgacttaggttaggttcaagactgagtttttgaggaagtattttccagaggatttgaggagcaggaaggaagtggaattcttg 13459696  T
Q  247 aacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggttt 346  Q
    ||||| |||||| ||||| |||| ||  || || |||  |  ||||||||||| ||| ||||||||| | | ||||| ||||| || |||||||||||||    
T  13459695 aacttgaagcaagggagcttgtctgtcactaagtatgctgcaaagtttgaggaacttccgaggttttatccctacattaatgtcgaagatgcaatggttt 13459596  T
Q  347 ccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcg 446  Q
    | |||||||||||||| ||| ||||| ||| || |||||||||||||||| | |||||| |||| ||  |||| || ||||||||||| || ||||||||    
T  13459595 cgaagtgtgtgaagtttgaacgtgggcttaagctggatatctatcagtatgtgtgtgtttaggatattagagacttcgatactttggtgcacaagtgtcg 13459496  T
Q  447 tatgtttgatga 458  Q
    ||| || |||||    
T  13459495 tatattcgatga 13459484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 107
Target Start/End: Original strand, 16575119 - 16575219
Alignment:
Q  7 ggagcagagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    |||||| |||| | |||| ||||||||||| |||| |||| ||| |||||||   | |||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||    
T  16575119 ggagcacagacttaggtgcagggcatggagcggatattccatgccatggtgatgggagatgaccagaaggtcagactggcaactcatatgcttgctgagg 16575218  T
Q  107 a 107  Q
    |    
T  16575219 a 16575219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 16590543 - 16590443
Alignment:
Q  7 ggagcagagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    |||||| |||| | |||| ||||||||||| |||| |||| ||| |||||||   | |||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||    
T  16590543 ggagcacagacttaggtgcagggcatggagcggatattccatgccatggtgatgggagatgaccagaaggtcagactggcaactcatatgcttgctgagg 16590444  T
Q  107 a 107  Q
    |    
T  16590443 a 16590443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 28 - 460
Target Start/End: Original strand, 20827822 - 20828254
Alignment:
Q  28 ggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccgaatattggtggacta 127  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  20827822 ggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtgaggttggctactcacatgcttgctgaggaggctgagtattggtggacca 20827921  T
Q  128 atgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagatttaaggaccag 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  20827922 atgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttggacaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactttccagaggatttgaggactag 20828021  T
Q  228 gaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaat 327  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| |||| ||||| || || ||| ||| || |||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||    
T  20828022 gaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtctgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgcaaggttttgtccctacatcaat 20828121  T
Q  328 gttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgata 427  Q
    |  |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  20828122 gcggaggatgctatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttgata 20828221  T
Q  428 ctttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20828222 ctttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 20828254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 14 - 460
Target Start/End: Original strand, 22128854 - 22129301
Alignment:
Q  14 agacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccga 113  Q
    |||| |||||| | ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||| ||||||||||||||||    
T  22128854 agacgtgggtgcaaggcatggagaggatctttcgaactatggtgactagtgatgatcaaaaggtcaggttggctactcatatgattgctgaggaggccga 22128953  T
Q  114 atattggtggactaatgctaagggaaga-cttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctga 212  Q
     |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  22128954 gtattggtggactaatgctaaggcaaaagcttgagattggtgaagaggttgtgacttgggctaagttcaaagctgagtttttgaggaagtactttccaga 22129053  T
Q  213 agatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttt 312  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||| | |||| ||| || |||||||||||||||| | ||||||    
T  22129054 ggatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggttgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgcaaggttt 22129153  T
Q  313 tgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggaga 412  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  22129154 tgttcgtacatcaatgctgaggatgcgatggtttcgaagtgtgtgaaatttgaaagtgggcttaggccggatatctatcagtatatgtgtgtttaggaga 22129253  T
Q  413 tccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22129254 tcctagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 22129301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 14 - 458
Target Start/End: Original strand, 41214277 - 41214721
Alignment:
Q  14 agacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccga 113  Q
    |||||| |||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  41214277 agacataggtgcaaggaatggagaggatcttccgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtcaggttggctacccacatgcttgctgaggaggctga 41214376  T
Q  114 atattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaa 213  Q
     ||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||     
T  41214377 gtattggtagacgaatgctaaggggagactcgagatcggtggagaggttgtgacttgggcaaggttcaagactgagtttttgaggaagtcctttcctgag 41214476  T
Q  214 gatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggtttt 313  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||| || |||||| |||  | || |||||| ||||||| ||||||||    
T  41214477 gatttgaggactagaaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtctgtggctgagtatgctgcgatgtttgaagagcttttgaggtttt 41214576  T
Q  314 gttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagat 413  Q
    || |||| || |||| ||| ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41214577 gtccgtatattaatgctgaagatgggatggtttcgaagtgtgtgaagttcgaaagtgggctcaggctggatatctatcagtatatgtgtgttcaggagat 41214676  T
Q  414 ccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatga 458  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  41214677 ccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgcatgtttgatga 41214721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 20928997 - 20928551
Alignment:
Q  14 agacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccga 113  Q
    |||| |||||| |||| |||||  |||| ||||| || ||||| ||  | |||||||||||||||||| ||||||| || | | |  ||||||| || ||    
T  20928997 agacttgggtgtagggaatggaacggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactggcgactcataagttgactgaggaagcaga 20928898  T
Q  114 atattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaa 213  Q
      |||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || |  || || ||||| ||||| |||||||| | ||| ||||| |||||||| || || |||    
T  20928897 gcattggtggaccaatgccaagggaaggcttgagatgggagatgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttaaggaagtatttccccgaa 20928798  T
Q  214 gatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggtttt 313  Q
    || || ||||||| ||||||  | || || |||||  | ||| || | | |||||| ||||| ||| ||| || |||||| ||||| ||||| |||||||    
T  20928797 gacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaagaaaggaatcatgtctgtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcaaggtttt 20928698  T
Q  314 gttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagat 413  Q
    || | |||||||||| | ||||||| ||| |||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  20928697 gtccctacatcaatgctcaggatgctatgatttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgtgtgttcaggagat 20928598  T
Q  414 ccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20928597 ccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 20928551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 8e-62
Query Start/End: Original strand, 64 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 20528946 - 20528550
Alignment:
Q  64 gatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttg 163  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| || ||| |  ||||||| || ||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| || |  || || |    
T  20528946 gatgaccagaaggttagactagcgactcatatgttgactgaggaagcagagcactggtggactaatgccaaaggaaggcttgagatgggagatgatgtgg 20528847  T
Q  164 tgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggag 263  Q
    |||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| || || ||||| || ||||||| ||||||  | || || |||||  | ||| || | |     
T  20528846 tgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttccccgaagacttgaggaccaagaaggacattgagtttctgaatctgaagtaaggaat 20528747  T
Q  264 catgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttc 363  Q
    ||||||  |||| ||| ||| || |||||| ||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||     
T  20528746 catgtctatagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcgaggttttttccctacatcaatgttgaggatgctatgatttcgaagtgtgtgaagttt 20528647  T
Q  364 gaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    || |||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  20528646 gagagtgggcttaggccggagatctaccagtacatatgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgaataagtatcgtatgtttgatgatg 20528550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 350 - 460
Target Start/End: Original strand, 23312571 - 23312681
Alignment:
Q  350 agtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtat 449  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23312571 agtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggatatctatcagtatatgtgtgttcatgagatccgagattttgatactttggtgcataagtgtcgtat 23312670  T
Q  450 gtttgatgatg 460  Q
    |||||||||||    
T  23312671 gtttgatgatg 23312681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 20173056 - 20172643
Alignment:
Q  32 tggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccgaatattggtggactaatgc 131  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||| ||   ||| ||| |||| || |||||||| |  |||||||||||  ||||||| || |||||||||||||  ||    
T  20173056 tggagaggatctttcgtgctatggttaccgatgaggactagaaagttagattggctattcacatgcttgcacaggaggctgagtattggtggactagagc 20172957  T
Q  132 taagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagatttaaggaccaggaag 231  Q
    |||| |||||||||||   ||||||||||| ||| |||||| ||| |||||   ||||||  ||| ||||| |||| |  |||| || ||||  | |||     
T  20172956 taagagaagacttgaggccggtggagaagtggtgtcttgggagaaattcaagagtgagtttctgaagaagtgcttttcgaaagacttgaggaataagaaa 20172857  T
Q  232 gaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaatgttg 331  Q
    || ||||| ||| || | || |||||   || |||||| || || ||| |||  |  |||||||||||| | ||  |||||||| | | ||||||| |||    
T  20172856 gaggtggagttcttgcagttgaagcaggagaacatgtctgttgcggagtatgccgccaagtttgaggagatatcctggttttgtcccttcatcaatattg 20172757  T
Q  332 aggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgatacttt 431  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||| | || |||||  | || || || ||  ||||||| || ||  |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  20172756 aggatgctatggtgtctaagtgtgtgaaggttgagagtggtctgagtcccgagattcatcagtacatctgctttcatgagatctgagattttgatacttt 20172657  T
Q  432 ggtacataagtgtc 445  Q
    | | || |||||||    
T  20172656 gatgcacaagtgtc 20172643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 81
Target Start/End: Original strand, 20959752 - 20959819
Alignment:
Q  14 agacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcaga 81  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||| ||  |||  |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20959752 agacttgggtgcagggcatgaagaggatattttgtgttatggtgacaagtgatgaccagaaggtcaga 20959819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 4)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 14 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 24585042 - 24584596
Alignment:
Q  14 agacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccga 113  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| ||    
T  24585042 agacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtgaggttggctactcagatgcttgctgaggaggctga 24584943  T
Q  114 atattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaa 213  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  24584942 gtattggtggaccaatgctaagggaagacttgagattgatggagaggttgtgacttggacaatgttcaaaactgagtttttgaggaagtactttccagag 24584843  T
Q  214 gatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggtttt 313  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||| |||| |||||||| || ||| ||| || ||||||| |||||||| | |||||||    
T  24584842 gatttgaggactaggaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtccgtggccgagtatgcggcgaagtttaaggagcttgcaaggtttt 24584743  T
Q  314 gttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagat 413  Q
    || | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  24584742 gtccctacatcaatgttgaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagttggagagtgggcttaggtcggatatctatcagtacatgtgtgttcaggagat 24584643  T
Q  414 ccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24584642 ccgagagtttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 24584596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 14 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 21828648 - 21828202
Alignment:
Q  14 agacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccga 113  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  21828648 agacatggctgcaaggcatggagaggatcttccgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtcaggttggctacccacatgcttgctgaggaagctga 21828549  T
Q  114 atattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaa 213  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| | ||||||  | ||||| |||| ||| |||||||||||     
T  21828548 gttttggtggactaatgctaaggggagacttgaggtcggtggagaggttgtgacttgggctaggttcaagaccgagtttttgatgaaatactttcctgag 21828449  T
Q  214 gatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggtttt 313  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||| ||||||| ||| || |||| ||||| || |||||| |||  |  |||||||||||||||||||||||||    
T  21828448 gatttgaggactagaaaggaagtggagttcttgaacttgaagtaagggagtatgtctgtcgctgagtatgcagcaaagtttgaggagctttcgaggtttt 21828349  T
Q  314 gttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagat 413  Q
    || ||||||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21828348 gtacgtacattaatgctgaagatgcgatggtttcgaagtgtgtgaagttcgaaagtgggcttaggccggatatctatcagtatatgtgtgttcaggagat 21828249  T
Q  414 ccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatgt 461  Q
      ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21828248 tagagatttcgat-ctttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgt 21828202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 23509524 - 23509071
Alignment:
Q  7 ggagcagagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    |||||| |||| |||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||  | |||||||||||||||||| ||||||| || ||| |  ||||||    
T  23509524 ggagcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactggcgactcatatgttgactgagg 23509425  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactt 206  Q
    | || ||  | |||||||| ||||| || ||||| ||| || | || || || || ||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| ||    
T  23509424 aagcagagcactggtggaccaatgccaaaggaaggcttaagttgggaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 23509325  T
Q  207 tcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcg 306  Q
     || ||||| || ||||||| |||||   | || || |||||  | |||||| | | |||||| |||||  |||||| ||||||||| ||||| |||| |    
T  23509324 ccccgaagacttgaggaccaagaaggcgattgagtttctgaatctgaagcaaggaatcatgtctgtagccaagcatgtggtgaagttcgaggaacttttg 23509225  T
Q  307 aggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttc 406  Q
    ||||||||| | |||||||||| | ||||||| ||| |||| ||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  23509224 aggttttgtccatacatcaatgctaaggatgctatgatttcgaagtgtgcgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgtgtgttc 23509125  T
Q  407 aggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  23509124 aggagatccgagactttgatactttgatgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 23509071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 98 - 328
Target Start/End: Original strand, 33313828 - 33314075
Alignment:
Q  98 ttgctgaggaggccgaatattggtggactaatgctaagggaagac-----ttgagatt----ggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctga 188  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33313828 ttgctgaggaggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacaagacttgagattgattggtggagaggttgtgacttgggctaagttcaaagctga 33313927  T
Q  189 gttcttgaggaagtactttcctga---agatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaa-----cggagcatgtccgtagctgagc 280  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||    ||| | ||||| || ||||||| ||| ||| ||||||| ||||||     ||||||||||| |||||||||     
T  33313928 gtttttgaggaagtactttccagagggggatctgaggactagaaaggaagcggagttcttgaacttgaagcaagggatcggagcatgtcagtagctgagt 33314027  T
Q  281 atgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaatg 328  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  33314028 atgcggcgaagtttgaggagctttcgaggttttgtccgtacattaatg 33314075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 4)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 14 - 460
Target Start/End: Original strand, 15289502 - 15289948
Alignment:
Q  14 agacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccga 113  Q
    |||||||| || | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||    
T  15289502 agacatggttgcaaggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtgaggttggctactcacatgcttgctgaggaggctga 15289601  T
Q  114 atattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaa 213  Q
     |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  15289602 gtattggcggaccaatgctaagggaagacttgagattggtggagaggttgtgacttggacaaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactttccagag 15289701  T
Q  214 gatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggtttt 313  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| || ||| || |||| |||||||| || ||| ||| || |||||||||||||||| | |||||||    
T  15289702 gatttgaggactaggaaggaagtggagttcttgaatttgaagtaagggagtatgtccgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgcaaggtttt 15289801  T
Q  314 gttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagat 413  Q
    || | |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || | |||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  15289802 gtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagaatgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttcaggagat 15289901  T
Q  414 ccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15289902 ctgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 15289948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 52 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 18272976 - 18272656
Alignment:
Q  52 atggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattg 151  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18272976 atggtgactagtgacgatcagaaggtcaggtttgctacccacatgcttgctgaggaggccgagtattggtggactaatgctaagggaagacttgagattg 18272877  T
Q  152 gtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaactt 251  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||    
T  18272876 gtggagaggttgtgacttgggcaaagttcaaagctgagtttttgaggaagtattttccagaagatttaaggactaggaagaaagtggagttcttgaactt 18272777  T
Q  252 aaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaag 351  Q
     |||||| ||||||||||| |||||||| ||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||    
T  18272776 gaagcaagggagcatgtccatagctgagtatgcggcgacgtttgaggagctatcgaggttttgttcgtacattaatgctgaggatgcaatggtgcccaag 18272677  T
Q  352 tgtgtgaagttcgaaagtggg 372  Q
    ||||||||||| ||| |||||    
T  18272676 tgtgtgaagtttgaaggtggg 18272656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 15000588 - 15000128
Alignment:
Q  7 ggagcagagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    |||||| |||| |||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||  | |||||| ||||||||||| | ||||| || ||| | |||||||    
T  15000588 ggagcacagacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgactagaaggtcagactagcgactcatatgttagctgagg 15000489  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactt 206  Q
    | || || || |||||||| ||||| ||||| || |||||| | || || || || ||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| ||    
T  15000488 aagcagagtactggtggaccaatgccaagggcaggcttgagttggggggtgatgtggtgacctgggccaagttcaaggttgaattcttgaggaagta-tt 15000390  T
Q  207 tcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcg 306  Q
     || ||||| || ||||||| |||||| || || || |||||  | || ||| ||| |||||| ||||| ||| ||  || |||||||||||| ||||||    
T  15000389 cccggaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatacggcgaagtttgaggaactttcg 15000290  T
Q  307 aggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttc 406  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  15000289 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttc 15000190  T
Q  407 aggagatccgagattttgatac--------tttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||||| ||||||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15000189 aggagatccgagactttgatactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 15000128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 70 - 460
Target Start/End: Original strand, 12339274 - 12339664
Alignment:
Q  70 cagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgactt 169  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||| || || ||  ||||||| ||||||||||| |||||| ||   |||||||| ||| ||||||    
T  12339274 cagaaggtcaggttggctacctacatgcttgttgaggaagctgagtaccggtggacgaatgctaaggggagacttaaggcaggtggagaggttatgactt 12339373  T
Q  170 gggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtc 269  Q
    |||| | | ||||   ||||||  | |||||||| ||||| ||  |||| ||||||| |||||||||| | ||| ||||  | |||||   || | ||||    
T  12339374 gggctaggctcaagagtgagtttgtaaggaagtattttccagagaatttgaggaccaagaaggaagtgaagttcttgaatctgaagcaggagaacttgtc 12339473  T
Q  270 cgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagt 369  Q
     || |  ||  |||  |  ||||| ||| | ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||    
T  12339474 tgttgtggaatatgcagctaagttcgagaaactttcgaggttttgtccttacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaaatgtgtgaagtttgagagt 12339573  T
Q  370 gggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    || || ||||| || ||  |  ||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  12339574 ggtttgaggccagagattcactagtatatgtgtgttcaggagatcagggatttcgataccttggtgcctaagtttcgtatgtttgatgatg 12339664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 218; Significance: 1e-119; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 14 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 25132019 - 25131574
Alignment:
Q  14 agacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccga 113  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  25132019 agacatgggtgcaaggcatggagaggatcttccgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtcaggttagctacccacatgcttgctgaggaggccga 25131920  T
Q  114 atattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaa 213  Q
     ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| | ||||||  ||||||| || |||||||||||||  ||     
T  25131919 gtattggtggacaaatgctaaggggagactcgagatcggcggagaggttgtgacttgggcaaggttcaagactgagttttttaggaagtactttcaagag 25131820  T
Q  214 gatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgag-gtgaagtttgaggagctttcgaggttt 312  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || ||| | ||||| |||||| |||| |||||||| |||||| ||| |    ||||||||||||||||||||||||    
T  25131819 gatttgaggactagaaaggaagtagagttcttaaacttgaagcaagggagtatgtccgtggctgagtatgcgacaaaagtttgaggagctttcgaggttt 25131720  T
Q  313 tgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggaga 412  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||  |||||||||| || ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  25131719 tgtccgtacattaatgttgaggatgcgatggtgtcacagtgtgtgaaatttgaaagtggacttaggccggatatttatcagtatatgtgtgttcaggaga 25131620  T
Q  413 tccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatga 458  Q
    | |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  25131619 ttcgagattttgataccttggtgcaaaagtgtcgtatgtttgatga 25131574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 22281664 - 22281217
Alignment:
Q  14 agacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccga 113  Q
    |||| |||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||  | |||||||||||||||||| ||||||| || ||| |  ||||||| || ||    
T  22281664 agacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactggcgactcatatgttgactgaggaagcaga 22281565  T
Q  114 atattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaa 213  Q
      | |||||||| ||||| || ||||| |||||||| || || || || || || ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| || ||  ||    
T  22281564 gcactggtggaccaatgccaaaggaaggcttgagatgggaggtgatgtggtaacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttcccgaaa 22281465  T
Q  214 gatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggtttt 313  Q
    || || ||||||| ||||||  | || ||  ||||  | ||| || | | |||||| ||||  ||| |||  | |||||| ||||| ||||||| |||||    
T  22281464 gacttgaggaccaagaaggagattgagtttttgaatctgaagtaaggaatcatgtctgtagtcgagtatgcagcgaagttcgaggaactttcgaagtttt 22281365  T
Q  314 gttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagat 413  Q
    || | |||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||    
T  22281364 gtccctacatcaatgctgaggatgctatgatttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatttatcagtacatgtttgttcaggagat 22281265  T
Q  414 ccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatgt 461  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22281264 ccgagacttttatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgt 22281217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0561 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0561
Description:

Target: scaffold0561; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 28 - 460
Target Start/End: Original strand, 5374 - 5806
Alignment:
Q  28 ggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccgaatattggtggacta 127  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  5374 ggcatggagaggatctttcgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtcaggttggctacccacatgcttgctgaggaggctgagtattggtggacga 5473  T
Q  128 atgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagatttaaggaccag 227  Q
    |||||||||| ||||||||  | |||||||| || ||||||||||| | |||||| | |||||| |||||||| |||||||| || ||||| || || ||    
T  5474 atgctaaggggagacttgaagtcggtggagaggtcgtgacttgggcaaggttcaaggttgagtttttgaggaaatactttccagaggatttgagaactag 5573  T
Q  228 gaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaat 327  Q
     ||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||| || |||||| ||| |   |||||||| ||||||||| |||||||| |||| || |||    
T  5574 aaaggaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtcagtggctgagtatgcgccaaagtttgaagagctttcgtggttttgtccgtatattaat 5673  T
Q  328 gttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgata 427  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  5674 gttgaagatgcaatggtttcgaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggatatctatcagtatatgtgtgttcaggagatttgagattttgata 5773  T
Q  428 ctttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
      ||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  5774 tcttggtgcataagcgtcgtatgtttgaagatg 5806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 28 - 460
Target Start/End: Original strand, 4168 - 4599
Alignment:
Q  28 ggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccgaatattggtggacta 127  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||| |||||| | ||| |||| || || |||||||||||||    
T  4168 ggcatggagaggatctttcatgctatggtgactagtgatgatcagaaggtaaggttgg-gactcacatggtagctaaggaagcagagtattggtggacta 4266  T
Q  128 atgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagatttaaggaccag 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   | |||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||| || || ||    
T  4267 atgctaagggaagacttgagattggtggggaggttgtgacttggataaggttcaaggctgagtttttgaggaagtactttccagaggatttgagaactag 4366  T
Q  228 gaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaat 327  Q
    |||||||||||| |||||||| || |||||| |||| ||||| || || ||| ||| || |||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||    
T  4367 gaaggaagtggagttcctgaatttgaagcaagggagtatgtctgtggccgagtatgcggcgaagtttgaggagcttgcaaggttttgtccctacatcaat 4466  T
Q  328 gttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgata 427  Q
    |  |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  4467 gcggaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttgata 4566  T
Q  428 ctttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4567 ctttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 4599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 14 - 458
Target Start/End: Original strand, 35520 - 35963
Alignment:
Q  14 agacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccga 113  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||    
T  35520 agacatgggtgcaaggcatggagaggatcttccgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtcaggttggctacccacatgcttgctgaggaagctga 35619  T
Q  114 atattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaa 213  Q
     | ||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||| | ||||||  | ||||| |||| ||| |||||||||||     
T  35620 gttttggtggactaatgctaaggggagacttgaggtcggtggagaggttgtgacttgggctaggttcaagaccgagtttttgacgaaatactttcctgag 35719  T
Q  214 gatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggtttt 313  Q
    ||||| || || || ||||||||||| ||| |||| || |||||| |||| ||||| || |||||| |||  |  |||||||||||||||||||||||||    
T  35720 gatttgagtactagaaaggaagtggagttcttgaatttgaagcaagggagtatgtctgtggctgagtatgcagcaaagtttgaggagctttcgaggtttt 35819  T
Q  314 gttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagat 413  Q
    || | ||||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35820 gtccatacattaatgctgaagatgcgatggtttcgaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttagcccggatatctatcagtatatgtgtgttcaggagat 35919  T
Q  414 ccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatga 458  Q
      ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35920 tagagatttcgat-ctttggtgcataagtgtcgtatgtttgatga 35963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 29 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 97467 - 97038
Alignment:
Q  29 gcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccgaatattggtggactaa 128  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| || ||  | |||||||||||    
T  97467 gcatggagcggatattccgtgctatggtgacgggagatgaccagaaggtcagattggcgactcatatgcttgctgaggaagctgagcagtggtggactaa 97368  T
Q  129 tgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagatttaaggaccagg 228  Q
    ||| ||  ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| || ||||||| |    
T  97367 tgccaaaagaagacttgagtttggtgaagaagttgtgacctggacaaagttcaaagctgaattcttgaggaaatatttccctgaagacttgaggaccaag 97268  T
Q  229 aaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaatg 328  Q
    ||||| || || ||  ||||  | || ||| | |||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  97267 aaggaggttgagtttttgaatctgaaacaaggaagcatgtctgtagccgagtatgaggcgaagtttgaggagctttcgaggttttgtccgtacatcaatg 97168  T
Q  329 ttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgatac 428  Q
    |||| ||||  |||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  97167 ttgaagatgttatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagt--atatgtgttcaggagatccgagactttgatac 97070  T
Q  429 tttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  97069 tttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 97038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Original strand, 3266 - 3719
Alignment:
Q  7 ggagcagagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    |||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||  | |||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||    
T  3266 ggagcacagacttgggtgcagggcatggagcggatattccatgctatggtgacgggagatgaccagaaggttagattggcgactcatatgcttactgagg 3365  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactt 206  Q
    | || ||  | |||||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  3366 aagcggagcactggtggactaatgccaagggaagacttgatatgggaggtgaagttgtgacctgggaaaagttcaaagctgaattcttgaggaagtattt 3465  T
Q  207 tcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcg 306  Q
     |||||||| || ||||||| |||||| || || ||  ||||  | || ||| | ||||||||  |||| ||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  3466 ccctgaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttttgaatctgaaacaaggaagcatgtctatagccgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 3565  T
Q  307 aggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttc 406  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||| ||||  |||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||| |    
T  3566 aggttttgtccctacatcaatgctgaagatgttatggtttcgaagtgtgtgaagtttgatagtgggcttaggccagatatctatcagtacatgtgtgtcc 3665  T
Q  407 aggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3666 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 3719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 170; Significance: 5e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 7 - 460
Target Start/End: Original strand, 12671 - 13124
Alignment:
Q  7 ggagcagagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    |||||| |||| |||||  |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||  | |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||    
T  12671 ggagcacagacttgggtctaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactggcgactcatatgctagctgagg 12770  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactt 206  Q
    | || ||  | |||||| ||||||| || |||||||||||||| || || || || ||||  ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| ||    
T  12771 aagcagagcactggtgggctaatgccaaaggaagacttgagatgggaggtgatgtggtgaactgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 12870  T
Q  207 tcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcg 306  Q
     |||||||| || ||||||| ||||||| | || || |||||  | || ||| | | |||||| ||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  12871 ccctgaagacttgaggaccaagaaggaaattgagtttctgaatctgaaacaaggaaacatgtctgtagccgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcg 12970  T
Q  307 aggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttc 406  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||     
T  12971 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaaatgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatcaatcagtacatgtgtgttt 13070  T
Q  407 aggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13071 aggagatccgagattttgatactttggttcataagtgtcgtatgtttgatgatg 13124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 64 - 460
Target Start/End: Original strand, 18 - 414
Alignment:
Q  64 gatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttg 163  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||| || ||  | |||||| ||||||| || |||||||||||||| || || || || |    
T  18 gatgaccagaaggtcagactggcgactcatatgctagctgaggaagcagagcactggtgggctaatgccaaaggaagacttgagatgggaggtgatgtgg 117  T
Q  164 tgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggag 263  Q
    |||  ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||||| ||||||| | || || |||||  | || ||| | |     
T  118 tgaactgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttccctgaagacttgaggaccaagaaggaaattgagtttctgaatctgaaacaaggaaa 217  T
Q  264 catgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttc 363  Q
    |||||| ||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||     
T  218 catgtctgtagccgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcgaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaaatgtgtgaagttt 317  T
Q  364 gaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    || |||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  318 gagagtgggcttaggccggatatcaatcagtacatgtgtgtttaggagatccgagattttgatactttggttcataagtgtcgtatgtttgatgatg 414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 163; Significance: 7e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 7e-87
Query Start/End: Original strand, 7 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 26142 - 25689
Alignment:
Q  7 ggagcagagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    |||||| |||| |||||| |||| |||| | |||| ||||| || ||||||||  | |||||||||||||||||| | ||||| || ||||||| |||||    
T  26142 ggagcacagacttgggtgcagggtatggggtggattttccgagctatggtgacaggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgcttgttgagg 26043  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactt 206  Q
    | || ||  | |||||||||||||| || |||||||||||||| || ||  | || ||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||| ||    
T  26042 aagcagagcactggtggactaatgccaaaggaagacttgagatgggaggtaatgtggtgacttgggctaagttcaaagttgaattcttg-ggaagtattt 25944  T
Q  207 tcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcg 306  Q
     |||||||| || || || | |||||| || || || |||||  | || ||| | |||||||  ||||| ||| ||| || ||||||| || ||||||||    
T  25943 ccctgaagacttgagaactaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaaggaagcatgtttgtagccgagtatgcggcgaagtttaagaagctttcg 25844  T
Q  307 aggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttc 406  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  25843 aggttttgtccttacatcaatgctgaagatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtatatgtgtgttg 25744  T
Q  407 aggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatgt 461  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25743 aggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgt 25689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 4447 - 3999
Alignment:
Q  14 agacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccga 113  Q
    ||||||||||| | | |||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||    
T  4447 agacatgggtgcaagccatggagagggtcttccgtgttatggttactagtgatgatcagaaggtcaggttggctacccacatgcttgttgaggaggctga 4348  T
Q  114 atattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaa 213  Q
     ||||||||||||||||||||||  |||||||||  | ||||| | || ||||||||||| | ||||||  | ||||| ||||||||||| ||||| ||     
T  4347 gtattggtggactaatgctaaggtgagacttgaggctagtggaaaggtcgtgacttgggctaggttcaagacagagtttttgaggaagtattttccggag 4248  T
Q  214 gatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggtttt 313  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||   ||    ||| || || ||| ||   |   ||||||  | |||||| |||||||    
T  4247 gatttgaggaccaggaaggaagtagagttcttgaacttcaagcatgagaatcggtcagtggcagagtatactgcatagtttgtagtgctttccaggtttt 4148  T
Q  314 gttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagat 413  Q
    |  ||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  4147 gcccgtacatcaatgcggaggatgttatggtttccaagtgtgtgaagtttgaaagtaggcttaggctggatatgtatcagtatatttgtgtccaggagat 4048  T
Q  414 ccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatgtc 462  Q
    |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4047 cgaagattttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgtc 3999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 27353 - 26907
Alignment:
Q  14 agacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccga 113  Q
    |||| |||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||  | |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| || ||    
T  27353 agacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagattagcgactcatatgctagctgaggaagcaga 27254  T
Q  114 atattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaa 213  Q
     || |||||||| ||||| || |||||||||||||| || || || || ||||| ||||| ||||||||   ||| ||||||||||| || || ||  ||    
T  27253 gtactggtggaccaatgccaaaggaagacttgagatgggaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaagtttgaattcttgaggaattatttcccgaaa 27154  T
Q  214 gatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggtttt 313  Q
    || || ||||||| ||||||  | || || |||||  | || ||| ||| |||||| ||||| ||| ||| || |||||||||||| ||||| |||||||    
T  27153 gacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagtttgaggaactttctaggtttt 27054  T
Q  314 gttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagat 413  Q
    || | |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  27053 gtccctacatcaatgttgaggatgctatgatttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttcaggagat 26954  T
Q  414 ccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  26953 ccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgttgatg 26907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 148; Significance: 6e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 3663 - 3215
Alignment:
Q  19 tgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccgaatatt 118  Q
    |||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||||||||  | |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||| || ||  | |    
T  3663 tgggtgcagggtatggagcggattttccgagctatggtgacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgcttgctgaggaagcagagaact 3564  T
Q  119 ggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagattt 218  Q
     |||||||||||| || |||||||||||||| || || || || ||||| ||||| |||||||||||| | || ||||||||||| || |||||||| ||    
T  3563 agtggactaatgccaaaggaagacttgagatgggaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaagcttaattattgaggaagtatttccctgaagactt 3464  T
Q  219 aaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcg 318  Q
     ||||||| |||||| || || || |||||  | || ||| | |||||||| ||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| |     
T  3463 gaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaaggaagcatgtctgtagccgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcgaggttttgtccc 3364  T
Q  319 tacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatcc--- 415  Q
    |||||||||| ||| ||||  |||||||| |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||       
T  3363 tacatcaatgctgaagatgatatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtatatgtgtatccaagagatccgag 3264  T
Q  416 -----gagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgat 459  Q
         |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  3263 actttgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgttgat 3215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 27728 - 27287
Alignment:
Q  19 tgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccgaatatt 118  Q
    |||||| |||| |||||| |||| ||||| || | ||| || || |||||||||||||||||| | |||||  | |||||||||||||| ||  |  | |    
T  27728 tgggtgcaggggatggagcggattttccgagctacggtcacgagagatgaccagaaggtcagactagcgacttatatgcttgctgaggaagcaaagcact 27629  T
Q  119 ggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagattt 218  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| || || || || | ||| ||||| ||||||||||   | |||||||||||||| || |||||||| ||    
T  27628 ggtggactaatgccaaaggaagacttgagatgggaggtgatgtggggacctgggctaagttcaaagtcaaattcttgaggaagtatttccctgaagactt 27529  T
Q  219 aaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcg 318  Q
     ||||||| |||||| || || || |||||  | || ||| | |||||||| ||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| |     
T  27528 gaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaaacaaggaagcatgtctgtagccgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcgaggttttgtccc 27429  T
Q  319 tacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgag 418  Q
    || ||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||| ||    
T  27428 tatatcaatgctgaggatgctgtggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtggacttaggccggatatctatcaatacatgtgtgttcagtagatcctag 27329  T
Q  419 attttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    | ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27328 acttttatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 27287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 163 - 460
Target Start/End: Original strand, 130982 - 131282
Alignment:
Q  163 gtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacgga 262  Q
    ||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||||| |||||| || || || |||||  | |||||| | |    
T  130982 gtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttccctgaagacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaagcaaggaa 131081  T
Q  263 gcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggag---ctttcgaggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaa 359  Q
     |||||| || || ||| ||| || |||||| |||||    ||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  131082 tcatgtctgtggccgagtatgcggcgaagttcgaggaattactttcgaggttctgtccctacattaatgttgaggatgctatgatttcgaagtgtgtgaa 131181  T
Q  360 gttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgat 459  Q
    ||| || |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  131182 gtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgtgtgttcaagagatccgagactttgatactttagtgcataagtgtcgtatgtttgatgat 131281  T
Q  460 g 460  Q
    |    
T  131282 g 131282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 186 - 458
Target Start/End: Original strand, 32394 - 32665
Alignment:
Q  186 tgagttcttgaggaagtactttcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgag 285  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||   ||| |||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||| ||| |    
T  32394 tgagtttttgaggaagtactttccagaggatttgaggactcagaaagaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgttcgtggctgagtatgcg 32493  T
Q  286 gtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggata 385  Q
    |  || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| | |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  32494 gcaaaatttgaggagcttgcgaggttttgttcgtacattaatgttgaggatgtgatg-tgtccaagtgtgtgaattttgaaagtgggcttaggccggata 32592  T
Q  386 tctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatga 458  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  32593 tctatcagtatatgtgtgtttaggagatccaagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatga 32665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 140
Target Start/End: Original strand, 32264 - 32391
Alignment:
Q  14 agacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgc-ttgctgaggaggccg 112  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| | || ||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  32264 agacatgggtgcaaggcatgtagaggatcttccgtgctatggtgactagtgatgatgagaagattaggttggctactcacatgcattgctgaggaggccg 32363  T
Q  113 aatattggtggactaatgctaagggaag 140  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||    
T  32364 agtattggtggactaatgctaagggaag 32391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold1140
Description:

Target: scaffold1140; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 19 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 543 - 101
Alignment:
Q  19 tgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccgaatatt 118  Q
    |||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||  | |||||||||||||||||| | ||||| || ||||| |||||||| || ||  | |    
T  543 tgggtgcagggtatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgctagctgaggaagcagagcact 444  T
Q  119 ggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagattt 218  Q
    | ||||||||||| || ||||| |||||| | || ||  | || ||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| || ||  |||| ||    
T  443 gatggactaatgccaaaggaaggcttgagttgggaggttatgtggtgacgtgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttcccgtaagactt 344  T
Q  219 aaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcg 318  Q
     ||||||| ||||||  | || || |||||  | || ||| ||| |||||| ||||| ||| ||| || |||||| ||||| ||||||||||||||| |     
T  343 gaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtctgtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcgaggttttgtccc 244  T
Q  319 tacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgag 418  Q
    |||||||||||||||||||  ||| | || |||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  243 tacatcaatgttgaggatggtatgatctcgaagtgtttgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctattagtacatgtgtgttcaggagatccgag 144  T
Q  419 attttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatgt 461  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  143 actttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgt 101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 131; Significance: 9e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 117 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 2430 - 2180
Alignment:
Q  117 ttggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagat 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||   |||||||  ||||||| ||||||||||||||||  || |||    
T  2430 ttggtggactaatgctaagggaagacttgagaatggtggagaggttatgacttgggatcagttcaagactgagtttttgaggaagtactttctagaggat 2331  T
Q  217 ttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgtt 316  Q
    || ||||| |||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||||     
T  2330 ttgaggactaggaagcaagtggagttcttgaacttgaagcaagggagcatgtccgtggctgagtatgcggcgaagtttgaggagctttcgaggatttgtc 2231  T
Q  317 cgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaa 367  Q
    ||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  2230 cgtacattaatgttgaagatgcgatggtttcgaagtgtgtgaagtttgaaa 2180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 2494 - 2427
Alignment:
Q  18 atgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattgg 85  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  2494 atgggtgcaaggcatggagaggatctcccgtgctatggtgactagtgatgatcagaaggtcaggttgg 2427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 64 - 460
Target Start/End: Original strand, 4768 - 5163
Alignment:
Q  64 gatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttg 163  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||  | | || ||||||||  || |||||  ||||||| || || || || |    
T  4768 gatgaccagaaggtcagactggcgactcaaatgcttgctgaggaagcagagcactagttgactaatgtcaaaggaagg-ttgagatgggaggtgatgtgg 4866  T
Q  164 tgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggag 263  Q
    |||| ||||| |||||||| | ||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||||||| ||||||  | || || |||||  | || ||| |||     
T  4867 tgacctgggctaagttcaaggttgaattctagaggaagtatttccctgaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaagggat 4966  T
Q  264 catgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttc 363  Q
    ||||||  | || ||| ||| || |||||||||||| | ||||||||||||  | |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  4967 catgtctttcgccgagtatgcggcgaagtttgaggaaccttcgaggttttgcccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagttt 5066  T
Q  364 gaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    || |||||| |||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5067 gagagtgggcttagaccggatatctatcagtacatgtgtgtccaggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 5163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 460
Target Start/End: Original strand, 6204 - 6653
Alignment:
Q  14 agacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccga 113  Q
    |||| |||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||  | |||||||||||||||||| | ||||| || ||| |  ||||||| || ||    
T  6204 agacttgggtgcagggaatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcagactagcgactcatatgttgactgaggaagcaga 6303  T
Q  114 atattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaa 213  Q
      | | |||||| ||||| |||||||| |||||| | ||    || || ||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| || ||||||    
T  6304 gcactagtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaaatgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttccctgaa 6403  T
Q  214 gatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggag---ctttcgaggt 310  Q
    || || ||||||| |||||| || || || |||||  | |||||| | | |||||| || || ||| ||| || |||||| |||||    ||||||||||    
T  6404 gacttgaggaccaagaaggaggttgagtttctgaatctgaagcaaggaatcatgtctgtggccgagtatgcggcgaagttcgaggaattactttcgaggt 6503  T
Q  311 tttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcagga 410  Q
    | ||| | ||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  6504 tctgtccctacattaatgttgaggatgctatgatttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgtgtgttcaaga 6603  T
Q  411 gatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  6604 gatccgagactttgatactttagtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 6653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 118 - 460
Target Start/End: Original strand, 402 - 744
Alignment:
Q  118 tggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagatt 217  Q
    |||||||| || || || ||||| |||||| | || || || || ||||| ||||| | |||||| | ||| |||||||||||||| || || ||||| |    
T  402 tggtggacaaacgccaaaggaaggcttgagttgggaggtgatgtggtgacctgggctacgttcaaggttgaattcttgaggaagtatttcccggaagact 501  T
Q  218 taaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttc 317  Q
    | ||||||| ||||||  | || || || ||  | |||||| | | |||||| ||||| ||| ||| || |||||| ||||| |||||||||||||||      
T  502 tgaggaccaagaaggagattgagtttctaaatctgaagcaaggaatcatgtcggtagccgagtatgcggcgaagttcgaggaactttcgaggttttgtct 601  T
Q  318 gtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccga 417  Q
     ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  602 ctacatcaatgcggaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccga 701  T
Q  418 gattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  702 gactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 169 - 460
Target Start/End: Original strand, 12127 - 12418
Alignment:
Q  169 tgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgt 268  Q
    ||||| |||||||| | ||| || ||||||||||| || || ||||| || ||||||| ||||||  | || || |||||  | || ||| | | |||||    
T  12127 tgggctaagttcaaggttgaattattgaggaagtatttccccgaagacttgaggaccaagaaggagattgagtttctgaatctgaaacaaggaatcatgt 12226  T
Q  269 ccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaag 368  Q
    | ||||| ||| ||| || |||||| ||| | ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||| || ||    
T  12227 ctgtagccgagtatgcggcgaagttcgagcaactttcgaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatgatttcgaagtgtgtgaagtttgagag 12326  T
Q  369 tgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12327 tgggcttaggccagatatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 12418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 288 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 24646 - 24474
Alignment:
Q  288 gaagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatc 387  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  24646 gaagtttgaggagcttgcaaggttttgcccctacatcaatgcggaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagtttgaaagtgggcttaggccggacatc 24547  T
Q  388 tatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24546 tatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 24474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 64 - 461
Target Start/End: Original strand, 8786 - 9175
Alignment:
Q  64 gatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttg 163  Q
    |||||||||||||||||  | ||||| || ||| |  |||||||||| ||  | ||||||||||  || || ||||||| |||| | || || || || |    
T  8786 gatgaccagaaggtcaggctagcgactcatatgttgactgaggaggcagagcactggtggactagcgccaaaggaagacatgagttgggaggtgatgtgg 8885  T
Q  164 tgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggag 263  Q
    |||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||| || |||||||| || |||||||  ||||| || || || |||||  | || ||| | ||    
T  8886 tgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagtatttccctgaagacttgaggaccaataaggaggttgagtttctgaatctgaaacaaggaag 8985  T
Q  264 catgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttc 363  Q
    |||||| ||||| ||| ||| || ||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||     
T  8986 catgtctgtagccgagtatgcggcgaagtttgaggagctgtctaggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatggtttcgaagtgtgtgaagttt 9085  T
Q  364 gaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatgt 461  Q
    || |||||  ||||||||||||||||||| || || |||||| ||||||||        ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9086 gagagtggacttaggccggatatctatcaatacatgtgtgttaaggagatc--------tgagactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatgt 9175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 262 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 16610 - 16412
Alignment:
Q  262 agcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagt 361  Q
    |||||||| ||||| ||| ||| || ||||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  16610 agcatgtctgtagccgagtatgcggcgaagtttcaggagctgtctaggttttgtccctacatcaatcttgaggatgctatggtttcgaagcgtgtgaagt 16511  T
Q  362 tcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    | || |||||  || ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16510 ttgagagtggacttgggccggatatctatcagtacatgtgtgttcaagagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 16412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 434
Target Start/End: Original strand, 7776 - 8203
Alignment:
Q  7 ggagcagagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    |||||| |||| |||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||  | |||||||||||||||| | | ||||| || ||||| |||||||    
T  7776 ggagcacagacttgggtgtaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggtcaaactagcgactcatatgctagctgagg 7875  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactt 206  Q
    | ||  |  | | |||||| ||||| || || || |||||| | || || || |  ||||| ||||| | |||||| | ||| |||||||||||||| ||    
T  7876 aagcatagcactagtggaccaatgccaaaggcaggcttgagttgggaggtgatgaggtgacctgggctatgttcaaggttgaattcttgaggaagtattt 7975  T
Q  207 tcctgaagatttaaggaccaggaaggaagtggatttcctgaacttaaagcaacggagcatgtccgtagctgagcatgaggtgaagtttgaggagctttcg 306  Q
     || ||||| || ||| ||| ||||||  || | || |||||  | || ||| ||| |||||| ||||| ||| ||| || |||||| ||||| |||| |    
T  7976 cccggaagacttgagggccaagaaggagatgaagtttctgaatctgaaacaagggatcatgtcggtagccgagtatgtggcgaagttcgaggaacttttg 8075  T
Q  307 aggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttc 406  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||| || |||| | |||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  8076 aggttttgtccctacatcaatgctgaggatgctatgatttcgaagtgtgtgaagtttgagagtgcgcttaggccggacatctatcagtacatgtgtgttc 8175  T
Q  407 aggagatccgagattttgatactttggt 434  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  8176 aggagatcccagactttgatattttggt 8203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 323 - 460
Target Start/End: Original strand, 73290 - 73427
Alignment:
Q  323 tcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattt 422  Q
    ||||||||||||| || ||| | || ||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||    
T  73290 tcaatgttgaggacgctatgatctcgaagtgtgtgaattttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactt 73389  T
Q  423 tgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  73390 tgatactttggtgcaaaaatgtcgtatgtttgatgatg 73427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 323 - 460
Target Start/End: Original strand, 77671 - 77808
Alignment:
Q  323 tcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattt 422  Q
    ||||||||||||| || ||| | || ||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||    
T  77671 tcaatgttgaggacgctatgatctcgaagtgtgtgaattttgagagtgggcttaggccggatatctatcagtacatgtgtgttcaggagatccgagactt 77770  T
Q  423 tgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  77771 tgatactttggtgcacaaatgtcgtatgtttgatgatg 77808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 349 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 182612 - 182500
Alignment:
Q  349 aagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgta 448  Q
    |||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  182612 aagtgtttgaagtttgagagtgggcttaggccggatatctattagtacatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgta 182513  T
Q  449 tgtttgatgatgt 461  Q
    |||||||||||||    
T  182512 tgtttgatgatgt 182500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 356 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 35691 - 35587
Alignment:
Q  356 tgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatctatcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttga 455  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  35691 tgaagtttgagagtgggcttaggccggacatctatcagtatatgtgtgttcaggagatccgagactttgatactttggtgcacaagtgtcgtatgtttga 35592  T
Q  456 tgatg 460  Q
    |||||    
T  35591 tgatg 35587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 289 - 458
Target Start/End: Complemental strand, 78103 - 77934
Alignment:
Q  289 aagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatct 388  Q
    |||||||||||||| || |||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||||| || || |    
T  78103 aagtttgaggagctatcaaggttttgtcgctacattaatgttgaggatgctatggtgtcgaaatgtgtgaagtttgagagtggattgaggcccgagattt 78004  T
Q  389 atcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatga 458  Q
    |||||||||| ||  |||| |||||  | || |||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||    
T  78003 atcagtatatctgctttcatgagatttgtgactttgatactttggtgcacaagtgtcgcctgtttgatga 77934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 67 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 78325 - 78183
Alignment:
Q  67 gaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgaggaggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtga 166  Q
    |||||||| || |||||||| |  || |||||||| |||||||  || ||||||||| |||  | |||| |||||||||||  |||||||||||| |||     
T  78325 gaccagaaagttagattggctattcatatgcttgcagaggaggatgagtattggtgggctagagttaagagaagacttgaggctggtggagaagtggtgt 78226  T
Q  167 cttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagtactttcc 209  Q
    ||| |||||| |||||   ||||||  ||||||||||||||||    
T  78225 cttaggcgaaattcaagagtgagtttctgaggaagtactttcc 78183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 289 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 49341 - 49170
Alignment:
Q  289 aagtttgaggagctttcgaggttttgttcgtacatcaatgttgaggatgcaatggtttccaagtgtgtgaagttcgaaagtgggtttaggccggatatct 388  Q
    ||||| |||||| | |||| ||||||  ||||||| |||||||||||||| ||| | || || ||||||||||| || ||||| || ||||| || || |    
T  49341 aagttcgaggagttgtcgatgttttgcccgtacattaatgttgaggatgctatgatatctaaatgtgtgaagtttgagagtggtttgaggcctgagattt 49242  T
Q  389 atcagtatatatgtgttcaggagatccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    |||| || || ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||  |||||| ||||||    
T  49241 atcaatacatctgttttcatgagatcagagattttgatactttggtgcacaagtgtcacatgtttaatgatg 49170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 49; Significance: 8e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 3374 - 3178
Alignment:
Q  7 ggagcagagacatgggtgaagggcatggagaggatcttccgtgcaatggtgactagtgatgaccagaaggtcagattggcgacccacatgcttgctgagg 106  Q
    |||||| |||| |||||| |||| |||||| |||| ||||| || ||||| ||  | |||||||||||||| ||| ||||||| || ||| |  ||||||    
T  3374 ggagcacagacttgggtgcaggggatggagcggattttccgagctatggttacgggagatgaccagaaggttagactggcgactcatatgttgactgagg 3275  T
Q  107 aggccgaatattggtggactaatgctaagggaagacttgagattggtggagaagttgtgacttgggcgaagttcaaagctgagttcttgaggaagta 203  Q
    | || ||  |||||||||| ||||| |||||||| |||||| | || || || || ||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  3274 aagcagagcattggtggaccaatgccaagggaaggcttgagttgggaggtgatgtggtgacctgggctaagttcaaggttgaattcttgaggaagta 3178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 412 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 1770 - 1722
Alignment:
Q  412 atccgagattttgatactttggtacataagtgtcgtatgtttgatgatg 460  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1770 atccgagactttgatactttggtgcataagtgtcgtatgtttgatgatg 1722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 4959 times since January 2019
Visitors: 4844