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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0761_low_18 (Length: 279)

Name: NF0761_low_18
Description: NF0761
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0761_low_18
NF0761_low_18
[»] chr4 (38 HSPs)
chr4 (112-279)||(24470821-24470993)
chr4 (119-279)||(24420633-24420799)
chr4 (128-275)||(24420877-24421024)
chr4 (115-255)||(24421089-24421235)
chr4 (110-275)||(24421213-24421384)
chr4 (119-272)||(24470684-24470843)
chr4 (104-233)||(24477392-24477527)
chr4 (149-255)||(24470959-24471065)
chr4 (151-255)||(24420561-24420665)
chr4 (151-279)||(24421161-24421289)
chr4 (110-239)||(24470531-24470666)
chr4 (149-243)||(24477064-24477158)
chr4 (151-275)||(24420493-24420617)
chr4 (110-279)||(24421257-24421432)
chr4 (110-275)||(24470339-24470510)
chr4 (110-272)||(24477497-24477665)
chr4 (174-275)||(24477638-24477739)
chr4 (110-279)||(24470291-24470466)
chr4 (151-279)||(24470626-24470754)
chr4 (151-279)||(24477394-24477522)
chr4 (115-279)||(24470488-24470658)
chr4 (196-279)||(24481477-24481559)
chr4 (110-233)||(24421063-24421192)
chr4 (174-272)||(24421360-24421458)
chr4 (174-272)||(24470265-24470363)
chr4 (112-254)||(24470868-24471016)
chr4 (175-248)||(24471033-24471106)
chr4 (178-262)||(24477459-24477543)
chr4 (112-260)||(24420604-24420758)
chr4 (149-260)||(24421324-24421435)
chr4 (157-279)||(24421113-24421235)
chr4 (154-279)||(24420921-24421046)
chr4 (151-272)||(24470434-24470555)
chr4 (110-245)||(24476975-24477107)
chr4 (211-275)||(24421405-24421469)
chr4 (174-206)||(24421495-24421527)
chr4 (174-206)||(24470196-24470228)
chr4 (211-275)||(24470254-24470318)
[»] scaffold0879 (7 HSPs)
scaffold0879 (112-255)||(4536-4685)
scaffold0879 (151-279)||(4485-4613)
scaffold0879 (128-242)||(4750-4864)
scaffold0879 (178-275)||(4464-4561)
scaffold0879 (110-233)||(4582-4711)
scaffold0879 (154-279)||(4536-4661)
scaffold0879 (154-279)||(4728-4853)
[»] chr1 (6 HSPs)
chr1 (163-278)||(11879442-11879557)
chr1 (210-255)||(11902373-11902418)
chr1 (110-251)||(11879479-11879626)
chr1 (190-278)||(11879661-11879749)
chr1 (149-227)||(52821569-52821647)
chr1 (163-275)||(11902038-11902150)
[»] chr2 (5 HSPs)
chr2 (149-278)||(41899851-41899980)
chr2 (154-255)||(41899922-41900023)
chr2 (119-279)||(41900234-41900400)
chr2 (128-279)||(41900282-41900433)
chr2 (110-255)||(41899826-41899977)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 112 - 279
Target Start/End: Original strand, 24470821 - 24470993
Alignment:
Q  112 ccatatgtttacaagtcaccaccacctccatctccctctcctcc-----atatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccata 206  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24470821 ccatatgtatataagtcaccacctcctccatctccctctcctccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccata 24470920  T
Q  207 cgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatctctacatgtcaccaccaccacca 279  Q
    |||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  24470921 cgtttataagtcacctcctccagcatctccttcaccacctcctccatatatctacaagtcaccaccaccacca 24470993  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 119 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 24420799 - 24420633
Alignment:
Q  119 tttacaagtcaccaccacctccatctccctctcctcc------atatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgttta 212  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24420799 tttataagtcgccaccacctccatctccctctcctcccccaccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgttta 24420700  T
Q  213 caagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatctctacatgtcaccaccaccacca 279  Q
     || ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  24420699 taaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccatatatctacaagtcaccaccaccacca 24420633  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 128 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 24421024 - 24420877
Alignment:
Q  128 caccaccacctccatctccctctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctcc 227  Q
    |||| ||| ||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||    
T  24421024 cacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccacctccatatgtctacaaatctccaccccc 24420925  T
Q  228 gccatctccttcaccacctcctccatatctctacatgtcaccaccacc 275  Q
     ||||| |||||||| ||||| |||||| | || | ||||||||||||    
T  24420924 accatcaccttcaccccctccaccatatgtatataagtcaccaccacc 24420877  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 115 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 24421235 - 24421089
Alignment:
Q  115 tatgtttacaagtcaccaccacctccatctccctc------tcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||      |||||||||||| |||||||||| ||| ||||| || ||||| ||||||||||||||      
T  24421235 tatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatata 24421136  T
Q  209 tttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatat 255  Q
    |||||||||| || || || ||||| || ||||| ||||| ||||||    
T  24421135 tttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccatat 24421089  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 24421384 - 24421213
Alignment:
Q  110 ctccatatgtttacaagtcaccaccacctccatctccctctcctcc------atatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctcc 203  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||      |||||| || |||   | ||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  24421384 ctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctcc 24421285  T
Q  204 atacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatctctacatgtcaccaccacc 275  Q
    ||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || || ||| | |||| ||||||||||||    
T  24421284 atatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccaccttatgtttacaagtcaccaccacc 24421213  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 119 - 272
Target Start/End: Original strand, 24470684 - 24470843
Alignment:
Q  119 tttacaagtcaccaccacctccatctccctc------tcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgttta 212  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||      |||||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||    
T  24470684 tttataagtcgccaccacctccatctccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccaccaccatatgtcta 24470783  T
Q  213 caagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatctctacatgtcaccacc 272  Q
    ||| ||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||| | || | |||||||||    
T  24470784 caaatctccacccccaccatcaccttcaccccctccaccatatgtatataagtcaccacc 24470843  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 104 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24477527 - 24477392
Alignment:
Q  104 ctccatctccatatgtttacaagtcaccaccacctccatctccctctcctcc------atatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccacc 197  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||      |||||| ||||||   |  |||| |||||||||||| |||||    
T  24477527 ctccacctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctcctctaccttctccatcaccacc 24477428  T
Q  198 acctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatc 233  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  24477427 acctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatc 24477392  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 149 - 255
Target Start/End: Original strand, 24470959 - 24471065
Alignment:
Q  149 ctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcc 248  Q
    ||||||||||| | |||||||||| ||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||    
T  24470959 ctcctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccatacgtctataagtcccctcctcctccttctccttcaccccctcc 24471058  T
Q  249 tccatat 255  Q
    |||||||    
T  24471059 tccatat 24471065  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 151 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 24420665 - 24420561
Alignment:
Q  151 cctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctc 250  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||| ||||| || || || |||||||||||||| || || ||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  24420665 cctccatatatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccacctccatatgtctataagtcccctcctcctccttctccttcaccccctcctc 24420566  T
Q  251 catat 255  Q
    |||||    
T  24420565 catat 24420561  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 151 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 24421289 - 24421161
Alignment:
Q  151 cctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctc 250  Q
    ||||||||||| |||||||| |  |||||||| || || || || || || || || ||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||||    
T  24421289 cctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccaccttatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctc 24421190  T
Q  251 catatctctacatgtcaccaccaccacca 279  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  24421189 catatgtctacaagtcaccaccaccacca 24421161  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 239
Target Start/End: Original strand, 24470531 - 24470666
Alignment:
Q  110 ctccatatgtttacaagtcaccaccacctccatctccctctcctcc------atatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctcc 203  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |||||      |||||| || |||   | ||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  24470531 ctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctcc 24470630  T
Q  204 atacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttc 239  Q
    ||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  24470631 atatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccttc 24470666  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 24477158 - 24477064
Alignment:
Q  149 ctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcacca 243  Q
    ||||||||||||| || ||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||| |||||    
T  24477158 ctcctccatatgtctataaggcaccacctcctccatctccatccccaccacctccatatgtttacaaatctccacccccaccatcccctccacca 24477064  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 24420617 - 24420493
Alignment:
Q  151 cctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctc 250  Q
    ||||||||||| || ||||| |  ||||| |||||||| || || || |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| |    
T  24420617 cctccatatgtctataagtcccctcctcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctcctcccccaccatctccttcaccccctccac 24420518  T
Q  251 catatctctacatgtcaccaccacc 275  Q
    | ||| |||| | |||||| |||||    
T  24420517 cctatgtctataagtcacctccacc 24420493  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 24421432 - 24421257
Alignment:
Q  110 ctccatatgtttacaagtcaccaccacctccatctccctctc------ctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctcc 203  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||      |||||||||| |||||||||| |||||| || ||||| || || || || ||    
T  24421432 ctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccacc 24421333  T
Q  204 atacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatctctacatgtcaccaccaccacca 279  Q
    ||| || || |||  ||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||| || || ||||||    
T  24421332 atatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccacca 24421257  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 275
Target Start/End: Original strand, 24470339 - 24470510
Alignment:
Q  110 ctccatatgtttacaagtcaccaccacctccatctccctctcctcc------atatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctcc 203  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || |||||      |||||| || |||   | ||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  24470339 ctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatcaccttcacctcccccaccatatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctcc 24470438  T
Q  204 atacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatctctacatgtcaccaccacc 275  Q
    ||| || ||||||||||||||||| ||| | || ||||| || || || ||| | |||| ||||||||||||    
T  24470439 atatgtctacaagtctcctcctccaccaacaccctcacctcccccgccctatgtttacaagtcaccaccacc 24470510  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 24477665 - 24477497
Alignment:
Q  110 ctccatatgtttacaagtcaccaccacctccatctccctct------cctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctcc 203  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||      |||||| |||| ||||| |||| |||||| || ||||| | ||| || || ||    
T  24477665 ctccatatgtgtacaagtccccaccacctccatctctctctcctccgcctccacatgtctacaaatcaccacctcctccgtctcctttccctcccccacc 24477566  T
Q  204 atacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatctctacatgtcaccacc 272  Q
    ||| || || |||  ||| || || |||||||| ||||| || ||||||||| |||||| |||||||||    
T  24477565 atatgtctataagagtccaccaccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaagtcaccacc 24477497  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 24477739 - 24477638
Alignment:
Q  174 acctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatctctacatgtcaccacca 273  Q
    ||||||||  || ||||| |||||||| || || || || ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||    
T  24477739 acctccacgatccccatcaccaccaccaccttatgtctataagtctcctccaccaccatctccctcaccacctcctccatatgtgtacaagtccccacca 24477640  T
Q  274 cc 275  Q
    ||    
T  24477639 cc 24477638  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 110 - 279
Target Start/End: Original strand, 24470291 - 24470466
Alignment:
Q  110 ctccatatgtttacaagtcaccaccacctccatctccct------ctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctcc 203  Q
    |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||      ||||||||||||| |||||||||| |||||| || || || || || || || ||    
T  24470291 ctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatcaccttcacctcccccacc 24470390  T
Q  204 atacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatctctacatgtcaccaccaccacca 279  Q
    ||| || || |||  ||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||| || || ||||||    
T  24470391 atatgtctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccacca 24470466  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 151 - 279
Target Start/End: Original strand, 24470626 - 24470754
Alignment:
Q  151 cctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctc 250  Q
    ||||||||||| |||||||| |  |||||||| || || || || || || || ||  |||| ||||| || || || |||||||||||||| |||||||    
T  24470626 cctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccttctcctcccccaccctatatttataagtcgccaccacctccatctccttcacctcctcctc 24470725  T
Q  251 catatctctacatgtcaccaccaccacca 279  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  24470726 catatgtctacaagtcaccacctccacca 24470754  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 151 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 24477522 - 24477394
Alignment:
Q  151 cctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctc 250  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||| || || || || ||||| || ||||||  ||||||||  || ||||| |||||||| ||||    
T  24477522 cctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctacaagagtcctcctctaccttctccatcaccaccacctc 24477423  T
Q  251 catatctctacatgtcaccaccaccacca 279  Q
    ||||| |||||| ||| || || ||||||    
T  24477422 catatgtctacaagtctcctcctccacca 24477394  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 115 - 279
Target Start/End: Original strand, 24470488 - 24470658
Alignment:
Q  115 tatgtttacaagtcaccaccacctccatctccctc------tcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacg 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || ||      |||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||| || || || || ||||| |    
T  24470488 tatgtttacaagtcaccaccacctccttccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatg 24470587  T
Q  209 tttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatctctacatgtcaccaccaccacca 279  Q
    | || |||  ||| || || || ||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||| || || ||||||    
T  24470588 tctataagagtccaccaccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccacca 24470658  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 24481559 - 24481477
Alignment:
Q  196 ccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatctctacatgtcaccaccaccacca 279  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||| | |||| ||| ||||| ||||||    
T  24481559 ccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatctccatcaccacc-ccaccatatgtatacaagtcgccacctccacca 24481477  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24421192 - 24421063
Alignment:
Q  110 ctccatatgtttacaagtcaccaccacctccatctccctctcc------tccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctcc 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||      ||||||| |||||||||| | ||| ||||| || ||||| || || || ||    
T  24421192 ctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccacc 24421093  T
Q  204 atacgtttacaagtctcctcctccgccatc 233  Q
    |||  | ||||||||||||||||| |||||    
T  24421092 atatatatacaagtctcctcctccaccatc 24421063  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 24421458 - 24421360
Alignment:
Q  174 acctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatctctacatgtcaccacc 272  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || || || |||||||| || || |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  24421458 acctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccacc 24421360  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 272
Target Start/End: Original strand, 24470265 - 24470363
Alignment:
Q  174 acctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatctctacatgtcaccacc 272  Q
    ||||||||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||| || || || |||||||| || || |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  24470265 acctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccacc 24470363  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 254
Target Start/End: Original strand, 24470868 - 24471016
Alignment:
Q  112 ccatatgtttacaagtcaccaccacctccatctccctctcc------tccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||      |||||| ||||| |||||||  |||||| | ||||| || ||||| |||||||    
T  24470868 ccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataagtcacctcctccagcatctccttcaccacctcctccat 24470967  T
Q  206 acgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccata 254  Q
    |  | |||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24470968 atatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccccctccata 24471016  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 248
Target Start/End: Original strand, 24471033 - 24471106
Alignment:
Q  175 cctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcc 248  Q
    ||||| |||||||| || || || |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  24471033 cctcctccttctccttcaccccctcctccatatgtttacaaatctcctcccccaccatctccttcacctcctcc 24471106  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 24477543 - 24477459
Alignment:
Q  178 ccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatctctaca 262  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||| ||||||    
T  24477543 ccaccatctccctcacctccacctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctcccccaccatatgtctaca 24477459  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 112 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 24420758 - 24420604
Alignment:
Q  112 ccatatgtttacaagtcaccaccacctccatctccctctcc------tccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||      |||||| ||||| || || |  |||||||| ||||| || ||||| |||||||    
T  24420758 ccatatgtttacaagtcaccacctccaccgtctccatccccaccacctccatacgtttataaatctcctcctccaccatctccttcaccaccgcctccat 24420659  T
Q  206 acgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatctcta 260  Q
    |  | |||||||| || || || ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  24420658 atatctacaagtcaccaccaccaccatccccttcaccaccacctccatatgtcta 24420604  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 149 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 24421435 - 24421324
Alignment:
Q  149 ctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcc 248  Q
    ||||||| ||||| |||||||| | ||| || || ||||| || || || |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||    
T  24421435 ctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacctccatctccctctcctcctcctccatatgtctacaagtcaccacctcctccatctccttcacctccccc 24421336  T
Q  249 tccatatctcta 260  Q
     |||||| ||||    
T  24421335 accatatgtcta 24421324  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 24421235 - 24421113
Alignment:
Q  157 tatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatc 256  Q
    |||||||||||||||| ||| || || || || || || || |||||||| || |||||||| || || || ||||| || || ||||| |||||||||     
T  24421235 tatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatata 24421136  T
Q  257 tctacatgtcaccaccaccacca 279  Q
    | |||| ||| ||||||||||||    
T  24421135 tttacaagtccccaccaccacca 24421113  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 24421046 - 24420921
Alignment:
Q  154 ccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccat 253  Q
    |||||||| || || |||| ||| || || ||||||||||| || || ||||| || |||||||| || ||||| ||||| || || ||||| |||||||    
T  24421046 ccatatgtatataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccacctccat 24420947  T
Q  254 atctctacatgtcaccaccaccacca 279  Q
    || ||||||  || ||||| ||||||    
T  24420946 atgtctacaaatctccacccccacca 24420921  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 272
Target Start/End: Original strand, 24470434 - 24470555
Alignment:
Q  151 cctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctc 250  Q
    ||||||||||| |||||||| |  ||||||||  | || || || || || || || ||||||||||| || || || || || |||||||| |||||||    
T  24470434 cctccatatgtctacaagtctcctcctccaccaacaccctcacctcccccgccctatgtttacaagtcaccaccacctccttccccttcacctcctcctc 24470533  T
Q  251 catatctctacatgtcaccacc 272  Q
    ||||| |||||| |||||||||    
T  24470534 catatgtctacaagtcaccacc 24470555  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 24477107 - 24476975
Alignment:
Q  110 ctccatatgtttacaagtcaccaccacctccatctccctctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgt 209  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || ||||   || |||| |||||| | || ||||||| |||||| || ||||| || || || || ||||| ||    
T  24477107 ctccatatgtttacaaatctccacccccaccat---cccctccaccatatctatataagtcaccacctcctccatctccctctcctcccccaccatatgt 24477011  T
Q  210 ttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacc 245  Q
     |||||||| || ||||| |||||| ||||||||||    
T  24477010 atacaagtcaccacctccaccatctacttcaccacc 24476975  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 211 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 24421469 - 24421405
Alignment:
Q  211 tacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatctctacatgtcaccaccacc 275  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | |||| ||| ||||||||    
T  24421469 tacaaatctccacctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacc 24421405  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 24421527 - 24421495
Alignment:
Q  174 acctccaccttctccatccccaccacctccata 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24421527 acctccaccttctccatcgccaccacctccata 24421495  T

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Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 206
Target Start/End: Original strand, 24470196 - 24470228
Alignment:
Q  174 acctccaccttctccatccccaccacctccata 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24470196 acctccaccttctccatcgccaccacctccata 24470228  T

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Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 211 - 275
Target Start/End: Original strand, 24470254 - 24470318
Alignment:
Q  211 tacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatctctacatgtcaccaccacc 275  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | |||| ||| ||||||||    
T  24470254 tacaaatctccacctccaccatctccctcaccacctcctccgtatgtgtacaagtccccaccacc 24470318  T

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Target: scaffold0879 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 7)
Name: scaffold0879
Description:

Target: scaffold0879; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 112 - 255
Target Start/End: Original strand, 4536 - 4685
Alignment:
Q  112 ccatatgtttacaagtcaccaccacctccatctccctc------tcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccat 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||      |||||||||||| |||||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||||||||    
T  4536 ccatatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccat 4635  T
Q  206 acgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatat 255  Q
    |  |||||||||| || || || ||||| || ||||| ||||| ||||||    
T  4636 atatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccaccatat 4685  T

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Target: scaffold0879; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 151 - 279
Target Start/End: Original strand, 4485 - 4613
Alignment:
Q  151 cctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctc 250  Q
    ||||||||||| |||||||| |  |||||||| || || || || || || ||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||||    
T  4485 cctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccaccatatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctc 4584  T
Q  251 catatctctacatgtcaccaccaccacca 279  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  4585 catatgtctacaagtcaccaccaccacca 4613  T

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Target: scaffold0879; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 242
Target Start/End: Original strand, 4750 - 4864
Alignment:
Q  128 caccaccacctccatctccctctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctcc 227  Q
    |||| ||| ||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| || ||    
T  4750 cacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccacctccatatgtctacaaatctccaccccc 4849  T
Q  228 gccatctccttcacc 242  Q
     ||||| ||||||||    
T  4850 accatcaccttcacc 4864  T

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Target: scaffold0879; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 178 - 275
Target Start/End: Original strand, 4464 - 4561
Alignment:
Q  178 ccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatctctacatgtcaccaccacc 275  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || || |||||| | |||| ||||||||||||    
T  4464 ccaccctctccatcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccaccatcaccctcacctcccccaccatatgtttacaagtcaccaccacc 4561  T

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Target: scaffold0879; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 233
Target Start/End: Original strand, 4582 - 4711
Alignment:
Q  110 ctccatatgtttacaagtcaccaccacctccatctccctctcc------tccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctcc 203  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||      ||||||| |||||||||| | ||| ||||| || ||||| || || || ||    
T  4582 ctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccatatatttacaagtccccaccaccaccatccccatcaccccctccacc 4681  T
Q  204 atacgtttacaagtctcctcctccgccatc 233  Q
    |||  | ||||||||||||||||| |||||    
T  4682 atatatatacaagtctcctcctccaccatc 4711  T

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Target: scaffold0879; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 279
Target Start/End: Original strand, 4536 - 4661
Alignment:
Q  154 ccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccat 253  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || || || || || || || |||||||| || |||||||| || || || ||||| || || ||||| |||||||    
T  4536 ccatatgtttacaagtcaccaccacctccatccccttcacctcctcctccatatgtctacaagtcaccaccaccaccatccccatctccaccacctccat 4635  T
Q  254 atctctacatgtcaccaccaccacca 279  Q
    || | |||| ||| ||||||||||||    
T  4636 atatttacaagtccccaccaccacca 4661  T

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Target: scaffold0879; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 279
Target Start/End: Original strand, 4728 - 4853
Alignment:
Q  154 ccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccat 253  Q
    |||||||| || || |||| ||| || || ||||||||||| || || ||||| || |||||||| || ||||| ||||| || || ||||| |||||||    
T  4728 ccatatgtatataaatcaccaccacccccatctccatccccccctccaccatatgtctacaagtcaccacctccaccatccccatctccaccacctccat 4827  T
Q  254 atctctacatgtcaccaccaccacca 279  Q
    || ||||||  || ||||| ||||||    
T  4828 atgtctacaaatctccacccccacca 4853  T

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Target: chr1 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 6)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 278
Target Start/End: Original strand, 11879442 - 11879557
Alignment:
Q  163 tacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatctctaca 262  Q
    |||||||||| ||| |||||  |||| || ||||||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||    
T  11879442 tacaagtcaccaccaccaccaactccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccaccaccgccatctccttcaccaccacctccttatgtgtaca 11879541  T
Q  263 tgtcaccaccaccacc 278  Q
     |||||||||||||||    
T  11879542 agtcaccaccaccacc 11879557  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 255
Target Start/End: Original strand, 11902373 - 11902418
Alignment:
Q  210 ttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatat 255  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  11902373 ttacaagtctcctccaccaccatctccctcaccacctcctccatat 11902418  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 251
Target Start/End: Original strand, 11879479 - 11879626
Alignment:
Q  110 ctccatatgtttacaagtcaccaccacctccatctccctctcctcca------tatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctcc 203  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || || |||      ||||| |||||||||| ||| ||||| || || ||||||||||| ||    
T  11879479 ctccttatgtgtacaagtcaccaccaccgccatctccttcaccaccacctccttatgtgtacaagtcaccaccaccaccctcaccttccccaccaccacc 11879578  T
Q  204 atacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctcc 251  Q
    ||||   ||||||  |||||| || || ||||||||||| || |||||    
T  11879579 atactactacaagagtcctccaccaccttctccttcacctccacctcc 11879626  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 278
Target Start/End: Original strand, 11879661 - 11879749
Alignment:
Q  190 tccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatctctacatgtcaccaccaccacc 278  Q
    ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||||  ||||| ||| || ||||||||    
T  11879661 tccccaccaccaccatactattacaagtctcctccaccaccatctccctcacctccaccaccatattactacaagtctcccccaccacc 11879749  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 52821647 - 52821569
Alignment:
Q  149 ctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctcc 227  Q
    |||| |||||||  |||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||| || |||||    
T  52821647 ctccaccatatgagtacaagtctccacctccaccttccccatcccctccacctccttatgtatacaagtcaccacctcc 52821569  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 275
Target Start/End: Original strand, 11902038 - 11902150
Alignment:
Q  163 tacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatctctaca 262  Q
    |||||||||| ||| |||||  || | || ||||||||||| || || |||||||| || || || ||||||||||||||  | ||||| ||| | ||||    
T  11902038 tacaagtcaccaccaccaccaacttcttcaccaccacctccttatgtatacaagtcaccaccaccaccatctccttcaccgtcacctccttatgtgtaca 11902137  T
Q  263 tgtcaccaccacc 275  Q
     ||||||||||||    
T  11902138 agtcaccaccacc 11902150  T

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Target: chr2 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 5)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 149 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 41899980 - 41899851
Alignment:
Q  149 ctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcc 248  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| || ||||| || || || || |||||||| |  |||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  41899980 ctcctccatatgtttacaagtccccaccaccgccttccccgtcaccccctcctccatatgcgtacaagtctcctcccccaccatcaccttcaccgcctcc 41899881  T
Q  249 tccatatctctacatgtcaccaccaccacc 278  Q
    ||||||| | |||| ||| ||||| |||||    
T  41899880 tccatatgtttacaagtctccacctccacc 41899851  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 41900023 - 41899922
Alignment:
Q  154 ccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccat 253  Q
    |||||||| |||||||| | ||| |||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| || || ||||| ||||||||||    
T  41900023 ccatatgtctacaagtccccaccaccaccttccccctcaccacctcctccatatgtttacaagtccccaccaccgccttccccgtcaccccctcctccat 41899924  T
Q  254 at 255  Q
    ||    
T  41899923 at 41899922  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 41900400 - 41900234
Alignment:
Q  119 tttacaagtcaccaccacctccatctccctc------tcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgttta 212  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||      ||| |||||||| ||||| || |  || || || ||||| || |||||||||||||| || ||    
T  41900400 tttacaagtcaccaccacctccttctccttcacttcctccaccatatgtctacaaatctcctccacctccctctccttcaccaccacctccatatgtcta 41900301  T
Q  213 caagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatatctctacatgtcaccaccaccacca 279  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||| ||| | | | ||  |||||| ||| ||||||||||||    
T  41900300 caagtctcctcctccaccatctgcatcactacccctttcttacatctacaagtccccaccaccacca 41900234  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 41900433 - 41900282
Alignment:
Q  128 caccaccacctccatctccctctcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctccatacgtttacaagtctcctcctcc 227  Q
    |||||||| | ||||| ||  |||| || ||| |||||||||||| ||| || |||||||| || |  || || ||||| || ||||| |||||||| ||    
T  41900433 caccaccatccccatcaccacctccaccttatatttacaagtcaccaccacctccttctccttcacttcctccaccatatgtctacaaatctcctccacc 41900334  T
Q  228 gccatctccttcaccacctcctccatatctctacatgtcaccaccaccacca 279  Q
     || |||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| || || ||||||    
T  41900333 tccctctccttcaccaccacctccatatgtctacaagtctcctcctccacca 41900282  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 41899977 - 41899826
Alignment:
Q  110 ctccatatgtttacaagtcaccaccacctccatctccctc------tcctccatatgtttacaagtcacaacctccaccttctccatccccaccacctcc 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || || || ||      |||||||||||  |||||||| |  || ||||| || || || || || |||||    
T  41899977 ctccatatgtttacaagtccccaccaccgccttccccgtcaccccctcctccatatgcgtacaagtctcctcccccaccatcaccttcaccgcctcctcc 41899878  T
Q  204 atacgtttacaagtctcctcctccgccatctccttcaccacctcctccatat 255  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| || ||| ||||||| ||||| ||||||    
T  41899877 atatgtttacaagtctccacctccaccttcttcttcacctcctccaccatat 41899826  T

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