View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0761_low_21 (Length: 251)

Name: NF0761_low_21
Description: NF0761
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0761_low_21
NF0761_low_21
[»] chr3 (49 HSPs)
chr3 (10-251)||(11298628-11298869)
chr3 (16-251)||(19726008-19726240)
chr3 (10-251)||(11862571-11862809)
chr3 (10-251)||(18384016-18384254)
chr3 (10-251)||(322370-322608)
chr3 (10-251)||(12172574-12172812)
chr3 (10-251)||(12496037-12496273)
chr3 (97-251)||(11849093-11849247)
chr3 (10-251)||(855915-856156)
chr3 (57-251)||(15067458-15067654)
chr3 (10-251)||(16369176-16369416)
chr3 (10-251)||(14878617-14878857)
chr3 (18-251)||(15878160-15878392)
chr3 (10-170)||(15051367-15051524)
chr3 (10-207)||(23053188-23053383)
chr3 (10-146)||(12038052-12038185)
chr3 (10-146)||(26196532-26196666)
chr3 (18-251)||(23408205-23408436)
chr3 (10-207)||(23077578-23077772)
chr3 (10-117)||(15060196-15060300)
chr3 (10-100)||(11851510-11851597)
chr3 (34-138)||(12852662-12852763)
chr3 (52-153)||(16796195-16796295)
chr3 (11-146)||(11557486-11557621)
chr3 (134-251)||(16796074-16796192)
chr3 (184-251)||(12852797-12852864)
chr3 (185-247)||(12038212-12038274)
chr3 (64-146)||(11595291-11595373)
chr3 (64-146)||(1982963-1983047)
chr3 (64-145)||(3390089-3390171)
chr3 (87-207)||(13210504-13210624)
chr3 (10-145)||(3403057-3403191)
chr3 (64-146)||(42325824-42325906)
chr3 (192-251)||(26196700-26196759)
chr3 (10-108)||(14665321-14665417)
chr3 (194-251)||(11557657-11557713)
chr3 (128-193)||(16909667-16909731)
chr3 (192-251)||(3403226-3403285)
chr3 (13-108)||(15850169-15850263)
chr3 (192-250)||(1983081-1983138)
chr3 (10-108)||(14668477-14668573)
chr3 (66-169)||(23274549-23274652)
chr3 (21-108)||(7793454-7793539)
chr3 (208-251)||(16909649-16909692)
chr3 (34-108)||(327281-327354)
chr3 (122-207)||(14682206-14682291)
chr3 (194-250)||(11595409-11595465)
chr3 (194-250)||(42325732-42325788)
chr3 (36-108)||(20461618-20461689)
[»] chr5 (45 HSPs)
chr5 (10-251)||(20805327-20805568)
chr5 (10-251)||(20766749-20766990)
chr5 (10-251)||(21366765-21367003)
chr5 (10-251)||(22032098-22032339)
chr5 (10-251)||(18770102-18770345)
chr5 (10-251)||(23201135-23201376)
chr5 (64-251)||(17919295-17919482)
chr5 (10-251)||(21873030-21873270)
chr5 (64-251)||(123455-123642)
chr5 (10-146)||(1859077-1859210)
chr5 (10-251)||(14078925-14079165)
chr5 (10-251)||(23511876-23512114)
chr5 (87-251)||(22107789-22107955)
chr5 (18-169)||(23501464-23501612)
chr5 (63-219)||(23571884-23572042)
chr5 (18-251)||(26703853-26704083)
chr5 (18-251)||(26973586-26973816)
chr5 (10-146)||(23458471-23458608)
chr5 (10-146)||(23462732-23462869)
chr5 (10-146)||(23439860-23439997)
chr5 (10-146)||(23451227-23451364)
chr5 (87-207)||(37723727-37723848)
chr5 (11-146)||(24221757-24221892)
chr5 (11-149)||(31342027-31342162)
chr5 (192-251)||(1859244-1859303)
chr5 (64-146)||(12028717-12028799)
chr5 (64-146)||(22757010-22757090)
chr5 (184-251)||(23439767-23439834)
chr5 (184-251)||(23451134-23451201)
chr5 (87-207)||(21293145-21293266)
chr5 (11-146)||(26680464-26680597)
chr5 (11-146)||(26952071-26952204)
chr5 (85-207)||(19661009-19661131)
chr5 (192-250)||(24221666-24221723)
chr5 (10-108)||(24767646-24767742)
chr5 (87-207)||(21808565-21808685)
chr5 (184-251)||(23458378-23458445)
chr5 (184-251)||(23462639-23462706)
chr5 (122-207)||(21729276-21729361)
chr5 (21-105)||(17410360-17410442)
chr5 (87-207)||(22074845-22074965)
chr5 (194-250)||(12028835-12028891)
chr5 (193-251)||(21877310-21877370)
chr5 (193-251)||(21887065-21887125)
chr5 (64-108)||(23535724-23535767)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (10-251)||(673-913)
[»] chr6 (44 HSPs)
chr6 (10-251)||(21766471-21766711)
chr6 (10-251)||(16523484-16523722)
chr6 (20-251)||(18692022-18692250)
chr6 (10-251)||(18906889-18907127)
chr6 (10-251)||(18180272-18180510)
chr6 (84-251)||(21830612-21830778)
chr6 (63-251)||(22408442-22408631)
chr6 (10-251)||(21740132-21740375)
chr6 (18-251)||(19862754-19862986)
chr6 (18-251)||(22335006-22335238)
chr6 (18-251)||(25642296-25642528)
chr6 (10-251)||(15894539-15894778)
chr6 (18-251)||(19872896-19873128)
chr6 (18-251)||(22432025-22432257)
chr6 (18-251)||(22438575-22438807)
chr6 (18-155)||(22074312-22074446)
chr6 (11-149)||(20908083-20908221)
chr6 (10-155)||(15041651-15041794)
chr6 (11-146)||(27553673-27553808)
chr6 (34-251)||(16965437-16965650)
chr6 (87-251)||(31165017-31165178)
chr6 (64-146)||(27567762-27567846)
chr6 (87-207)||(35245409-35245530)
chr6 (192-251)||(22074470-22074529)
chr6 (64-146)||(19790931-19791013)
chr6 (192-251)||(20908252-20908310)
chr6 (67-165)||(31155546-31155644)
chr6 (87-166)||(4738725-4738805)
chr6 (82-138)||(23657583-23657638)
chr6 (90-207)||(1561127-1561244)
chr6 (21-108)||(17804114-17804199)
chr6 (21-108)||(27325722-27325807)
chr6 (87-251)||(11185289-11185458)
chr6 (194-250)||(27553844-27553899)
chr6 (92-166)||(4186240-4186315)
chr6 (87-251)||(22831285-22831448)
chr6 (122-165)||(25603601-25603644)
chr6 (122-165)||(25611939-25611982)
chr6 (33-108)||(25767283-25767357)
chr6 (194-250)||(19791049-19791105)
chr6 (194-250)||(27567882-27567938)
chr6 (211-251)||(2077035-2077075)
chr6 (64-108)||(12706615-12706658)
chr6 (64-108)||(16741132-16741175)
[»] chr8 (41 HSPs)
chr8 (16-251)||(16410351-16410586)
chr8 (10-251)||(17926806-17927043)
chr8 (18-251)||(22010774-22011005)
chr8 (10-251)||(30643392-30643630)
chr8 (10-251)||(16861425-16861663)
chr8 (10-251)||(377048-377287)
chr8 (18-210)||(15611568-15611756)
chr8 (18-210)||(15603116-15603304)
chr8 (10-251)||(20466141-20466383)
chr8 (10-251)||(23776936-23777176)
chr8 (10-251)||(20856525-20856767)
chr8 (82-251)||(39095097-39095264)
chr8 (10-251)||(16184496-16184736)
chr8 (18-251)||(19898870-19899103)
chr8 (10-251)||(21168832-21169074)
chr8 (10-251)||(21162159-21162401)
chr8 (10-193)||(19259692-19259872)
chr8 (18-247)||(19982872-19983101)
chr8 (34-251)||(44384970-44385189)
chr8 (18-233)||(17354052-17354266)
chr8 (10-166)||(24755577-24755730)
chr8 (87-207)||(5866450-5866571)
chr8 (87-207)||(45131172-45131293)
chr8 (192-251)||(23913834-23913893)
chr8 (87-251)||(21396156-21396325)
chr8 (87-251)||(21790649-21790818)
chr8 (87-168)||(16199820-16199901)
chr8 (87-166)||(21249250-21249329)
chr8 (87-166)||(21255088-21255167)
chr8 (87-166)||(21389626-21389705)
chr8 (87-166)||(21778952-21779031)
chr8 (66-165)||(31971123-31971222)
chr8 (66-166)||(13597773-13597873)
chr8 (66-166)||(21490860-21490960)
chr8 (122-207)||(17140739-17140826)
chr8 (208-251)||(19259847-19259890)
chr8 (128-207)||(7372604-7372682)
chr8 (66-166)||(21919156-21919255)
chr8 (174-251)||(6520134-6520214)
chr8 (64-108)||(16231612-16231655)
chr8 (64-108)||(22044810-22044853)
[»] chr2 (31 HSPs)
chr2 (18-251)||(37524462-37524692)
chr2 (10-251)||(25963816-25964053)
chr2 (10-251)||(22812012-22812250)
chr2 (10-251)||(24673342-24673585)
chr2 (10-251)||(40622311-40622552)
chr2 (10-251)||(21318737-21318977)
chr2 (10-251)||(21327668-21327908)
chr2 (10-251)||(45678230-45678470)
chr2 (10-251)||(24679959-24680204)
chr2 (10-251)||(40428240-40428479)
chr2 (18-251)||(22741073-22741305)
chr2 (10-251)||(23019807-23020047)
chr2 (10-251)||(22799227-22799467)
chr2 (18-248)||(22758828-22759057)
chr2 (10-136)||(21916199-21916322)
chr2 (10-146)||(24716629-24716762)
chr2 (11-146)||(24174680-24174815)
chr2 (11-146)||(24655440-24655575)
chr2 (10-146)||(25961634-25961768)
chr2 (192-251)||(24716796-24716855)
chr2 (87-207)||(38292-38412)
chr2 (11-146)||(24869760-24869895)
chr2 (192-251)||(9784573-9784632)
chr2 (192-250)||(24174589-24174646)
chr2 (192-250)||(25961802-25961860)
chr2 (87-207)||(23103571-23103691)
chr2 (87-207)||(23072125-23072246)
chr2 (192-250)||(24655609-24655666)
chr2 (192-250)||(24869669-24869726)
chr2 (66-168)||(20308972-20309073)
chr2 (34-108)||(24735320-24735393)
[»] chr4 (38 HSPs)
chr4 (10-251)||(16348764-16349001)
chr4 (10-251)||(16357052-16357289)
chr4 (10-251)||(16488178-16488415)
chr4 (10-251)||(15121901-15122142)
chr4 (18-251)||(5339081-5339315)
chr4 (21-251)||(23843253-23843483)
chr4 (10-251)||(15125142-15125383)
chr4 (10-251)||(15093551-15093791)
chr4 (10-251)||(12569791-12570030)
chr4 (34-251)||(17048435-17048652)
chr4 (18-251)||(44675407-44675640)
chr4 (10-155)||(13813119-13813261)
chr4 (18-251)||(13569278-13569510)
chr4 (33-146)||(631104-631214)
chr4 (21-155)||(12423563-12423696)
chr4 (11-146)||(16351953-16352088)
chr4 (11-146)||(15353409-15353544)
chr4 (187-251)||(631243-631307)
chr4 (87-251)||(14053477-14053646)
chr4 (184-251)||(12423480-12423547)
chr4 (192-251)||(13813450-13813509)
chr4 (87-207)||(23374529-23374649)
chr4 (184-231)||(13813353-13813400)
chr4 (13-108)||(22634509-22634602)
chr4 (192-250)||(15353577-15353634)
chr4 (122-207)||(17046311-17046397)
chr4 (192-233)||(13817961-13818002)
chr4 (64-138)||(25555371-25555445)
chr4 (87-166)||(15551683-15551762)
chr4 (66-207)||(12902582-12902722)
chr4 (17-108)||(20157567-20157656)
chr4 (66-166)||(3096159-3096258)
chr4 (64-146)||(11250713-11250795)
chr4 (192-232)||(16352122-16352162)
chr4 (21-108)||(36134066-36134151)
chr4 (194-250)||(11250831-11250887)
chr4 (111-155)||(13813293-13813337)
chr4 (111-155)||(13813382-13813426)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (17-251)||(21632-21863)
[»] chr7 (40 HSPs)
chr7 (18-251)||(2759917-2760148)
chr7 (10-251)||(14429662-14429899)
chr7 (10-250)||(12321842-12322079)
chr7 (10-251)||(17138161-17138402)
chr7 (10-251)||(12186794-12187035)
chr7 (18-251)||(19649598-19649830)
chr7 (10-146)||(3271706-3271839)
chr7 (18-251)||(18154950-18155181)
chr7 (18-250)||(32216657-32216889)
chr7 (18-146)||(39268008-39268133)
chr7 (18-251)||(9703039-9703271)
chr7 (34-251)||(15211230-15211449)
chr7 (23-251)||(24054241-24054467)
chr7 (52-151)||(18301918-18302016)
chr7 (13-108)||(15580618-15580710)
chr7 (184-251)||(18301853-18301920)
chr7 (11-146)||(9446260-9446395)
chr7 (64-149)||(20569748-20569833)
chr7 (192-251)||(20487359-20487418)
chr7 (73-146)||(42203876-42203949)
chr7 (13-108)||(12318053-12318146)
chr7 (17-108)||(14932842-14932931)
chr7 (17-108)||(15356277-15356366)
chr7 (17-108)||(15360391-15360480)
chr7 (10-108)||(9751855-9751951)
chr7 (87-168)||(27848006-27848087)
chr7 (87-168)||(34200649-34200730)
chr7 (123-207)||(28505496-28505581)
chr7 (194-250)||(42203785-42203840)
chr7 (66-207)||(11996183-11996324)
chr7 (21-108)||(14152097-14152182)
chr7 (122-207)||(15755162-15755248)
chr7 (87-168)||(16386424-16386505)
chr7 (87-164)||(26211863-26211940)
chr7 (90-168)||(15755067-15755145)
chr7 (10-108)||(2832542-2832638)
chr7 (122-207)||(10588861-10588946)
chr7 (64-108)||(9593271-9593314)
chr7 (21-105)||(15605365-15605447)
chr7 (64-108)||(16583182-16583225)
[»] scaffold1296 (1 HSPs)
scaffold1296 (10-251)||(174-409)
[»] chr1 (35 HSPs)
chr1 (10-251)||(3473023-3473261)
chr1 (10-251)||(22449366-22449604)
chr1 (10-251)||(17678686-17678925)
chr1 (10-251)||(6151624-6151864)
chr1 (10-251)||(18182221-18182456)
chr1 (10-251)||(22831487-22831723)
chr1 (18-251)||(20091585-20091814)
chr1 (18-251)||(8761733-8761968)
chr1 (10-251)||(21788143-21788385)
chr1 (18-251)||(42865322-42865555)
chr1 (34-236)||(22131206-22131408)
chr1 (18-251)||(21714323-21714554)
chr1 (34-251)||(48603044-48603262)
chr1 (10-170)||(21022488-21022647)
chr1 (64-251)||(22468855-22469043)
chr1 (13-146)||(3705169-3705302)
chr1 (10-108)||(24783193-24783289)
chr1 (64-146)||(45489895-45489977)
chr1 (10-146)||(45310469-45310602)
chr1 (87-207)||(20847330-20847450)
chr1 (192-251)||(41781782-41781841)
chr1 (85-166)||(20916093-20916174)
chr1 (87-207)||(38801563-38801684)
chr1 (21-108)||(21313045-21313130)
chr1 (73-138)||(33050178-33050242)
chr1 (13-108)||(36819396-36819489)
chr1 (64-146)||(18394117-18394199)
chr1 (128-193)||(21022374-21022438)
chr1 (196-231)||(3705340-3705375)
chr1 (208-251)||(21022356-21022399)
chr1 (128-170)||(21022442-21022484)
chr1 (194-250)||(18394235-18394291)
chr1 (67-166)||(21161588-21161688)
chr1 (194-250)||(45490013-45490069)
chr1 (174-251)||(33680777-33680857)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (10-251)||(73867-74105)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (10-251)||(2185-2418)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (16-251)||(6512-6743)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (10-251)||(1608-1846)
scaffold0104 (10-251)||(9291-9529)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (14-251)||(46831-47067)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (10-251)||(42407-42643)
scaffold0124 (36-138)||(24949-25048)
scaffold0124 (184-251)||(25082-25149)
[»] scaffold0393 (2 HSPs)
scaffold0393 (10-220)||(1303-1510)
scaffold0393 (160-195)||(1267-1302)
[»] scaffold1220 (1 HSPs)
scaffold1220 (18-251)||(1578-1809)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (10-251)||(14867-15103)
[»] scaffold1326 (1 HSPs)
scaffold1326 (18-251)||(1589-1819)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (10-251)||(4208-4446)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (10-251)||(2608-2848)
scaffold0158 (10-251)||(6274-6514)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (47-251)||(7264-7468)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (10-251)||(1655-1897)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (12-251)||(18810-19055)
scaffold0080 (176-251)||(16740-16815)
scaffold0080 (10-74)||(18758-18821)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (10-251)||(21904-22146)
scaffold0210 (10-251)||(29796-30038)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (10-251)||(17212-17449)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (18-251)||(19392-19627)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (10-251)||(280991-281237)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (10-251)||(15311-15550)
scaffold0017 (10-251)||(19833-20072)
scaffold0017 (34-251)||(193099-193318)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (10-251)||(38580-38820)
scaffold0023 (87-207)||(119700-119820)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (79-251)||(5372-5543)
scaffold0476 (79-251)||(6567-6738)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (10-171)||(16-175)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (10-251)||(7071-7311)
scaffold0114 (88-207)||(15641-15761)
[»] scaffold0036 (2 HSPs)
scaffold0036 (10-251)||(68655-68894)
scaffold0036 (21-108)||(66519-66604)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (10-237)||(12551-12779)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (10-248)||(14187-14425)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (10-251)||(4905-5147)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (18-251)||(33329-33564)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (64-251)||(7423-7610)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (10-251)||(5870-6111)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (18-251)||(9072-9304)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (18-251)||(69570-69802)
[»] scaffold0297 (2 HSPs)
scaffold0297 (18-251)||(10631-10859)
scaffold0297 (18-251)||(15788-16019)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (64-251)||(27275-27462)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (10-251)||(23455-23695)
scaffold0081 (10-251)||(38879-39119)
scaffold0081 (10-251)||(14439-14680)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (10-146)||(43964-44097)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (18-251)||(3517-3750)
scaffold0149 (18-251)||(7948-8181)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (10-251)||(16449-16690)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (8-251)||(7916-8157)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (18-251)||(18563-18796)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (18-250)||(65907-66137)
scaffold0031 (21-108)||(53482-53567)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (10-146)||(30843-30977)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (12-251)||(35022-35259)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (18-251)||(19757-19988)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (18-251)||(36231-36462)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (18-251)||(10270-10503)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (16-251)||(32222-32454)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (122-216)||(8351-8445)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (88-251)||(3294-3458)
scaffold0165 (88-251)||(7357-7522)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (18-251)||(18012-18244)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (115-251)||(195119-195253)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (11-146)||(414152-414284)
scaffold0003 (192-251)||(414318-414376)
[»] scaffold0327 (2 HSPs)
scaffold0327 (10-146)||(171-305)
scaffold0327 (192-251)||(55-114)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (18-250)||(1116-1347)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (18-251)||(23621-23851)
[»] scaffold0550 (2 HSPs)
scaffold0550 (11-146)||(7355-7486)
scaffold0550 (192-251)||(7263-7321)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (18-251)||(178676-178906)
[»] scaffold0289 (1 HSPs)
scaffold0289 (64-146)||(2450-2532)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (11-146)||(422633-422767)
scaffold0001 (192-251)||(422802-422860)
scaffold0001 (13-108)||(173218-173311)
[»] scaffold0142 (2 HSPs)
scaffold0142 (34-146)||(7942-8051)
scaffold0142 (184-251)||(8077-8144)
[»] scaffold0439 (4 HSPs)
scaffold0439 (11-146)||(2538-2673)
scaffold0439 (11-146)||(10398-10533)
scaffold0439 (192-250)||(2706-2763)
scaffold0439 (192-250)||(10566-10623)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (127-251)||(48661-48787)
scaffold0102 (10-108)||(48561-48657)
[»] scaffold1276 (1 HSPs)
scaffold1276 (112-251)||(2053-2193)
[»] scaffold0484 (2 HSPs)
scaffold0484 (34-155)||(542-662)
scaffold0484 (128-251)||(422-547)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (87-207)||(10600-10721)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (87-207)||(13320-13441)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (64-146)||(205215-205297)
scaffold0014 (194-250)||(205333-205389)
[»] scaffold0410 (2 HSPs)
scaffold0410 (64-149)||(2048-2133)
scaffold0410 (194-250)||(1960-2015)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (64-151)||(4378-4465)
scaffold0184 (194-250)||(4473-4529)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (87-168)||(1153-1234)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (87-207)||(174590-174711)
[»] scaffold0819 (2 HSPs)
scaffold0819 (128-193)||(1917-1981)
scaffold0819 (208-251)||(1899-1942)
[»] scaffold1873 (2 HSPs)
scaffold1873 (192-251)||(1041-1100)
scaffold1873 (21-108)||(1173-1258)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (192-251)||(6375-6434)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (10-79)||(6409-6475)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (87-207)||(5304-5425)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (87-168)||(1225-1306)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (87-207)||(11620-11740)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (10-108)||(10143-10239)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (87-207)||(2576-2697)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (87-207)||(31892-32012)
[»] scaffold0637 (2 HSPs)
scaffold0637 (64-146)||(8443-8525)
scaffold0637 (194-250)||(8351-8407)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (87-167)||(1817-1897)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (66-207)||(4537-4677)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (122-207)||(51405-51492)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (87-207)||(46819-46940)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (66-166)||(1204-1303)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (128-207)||(16105-16186)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (66-166)||(168134-168233)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (87-166)||(1862-1941)
scaffold0046 (87-166)||(4417-4496)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (13-108)||(18719-18812)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (13-108)||(20103-20196)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (13-108)||(12830-12923)
scaffold0044 (13-108)||(19114-19207)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (13-108)||(2759-2852)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (13-108)||(228459-228552)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (87-207)||(33947-34068)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (122-207)||(31984-32070)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (122-207)||(20734-20819)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (34-108)||(29014-29087)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (194-250)||(4687-4743)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (64-108)||(25106-25149)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 49)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 11298628 - 11298869
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11298628 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 11298727  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactat 209  Q
     |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11298728 tgttgggggttcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtataataatactat 11298827  T
Q  210 aatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  11298828 aatgttgggggctcatgtcctgaattggtaccacatgcatat 11298869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 251
Target Start/End: Original strand, 19726008 - 19726240
Alignment:
Q  16 ataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgg 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||     
T  19726008 ataagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgttgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgc 19726104  T
Q  116 gggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgtt 215  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19726105 gggttcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgtt 19726204  T
Q  216 gggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  19726205 gggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 19726240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 11862809 - 11862571
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||| |||||||||||||  | |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11862809 agatgattaagatgatgttgtgc-tccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatt 11862713  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactat 209  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11862712 tgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataactgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactat 11862613  T
Q  210 aatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  11862612 aatgatgagggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 11862571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 18384016 - 18384254
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18384016 agatgattaagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatt 18384112  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactat 209  Q
     |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18384113 tgttgggggcttatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataattgttgggggtttatgccctgaaagtatattaatactat 18384212  T
Q  210 aatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||    
T  18384213 aatgctgggggctcatgccctgtattggttccacatgcatat 18384254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 322608 - 322370
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  322608 agatgattatgatgatgttgaac-tccaaattattggat--gcatatgacatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatt 322512  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactat 209  Q
     |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  322511 tgttgggggcttatgccctgaagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataattgttgggggcttatgccgtgaaagtatattaatactat 322412  T
Q  210 aatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||    
T  322411 aatgctgggggctcatgccctatattggtaccacatgcatat 322370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 12172812 - 12172574
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||     
T  12172812 agatgattatgatgatgttgaacctccaaattattggatatatat--gagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatt 12172715  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactat 209  Q
     |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  12172714 tgttgggggctcatgccctgtagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaataa-tgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatattaa 12172616  T
Q  210 aatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  12172615 aatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 12172574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 12496273 - 12496037
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12496273 agatgaataagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagattatttagatgattgagtccatgcattagcatacatt 12496177  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactat 209  Q
     |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  12496176 tgttgggggctcatgccctggagctttttactcaccatgatggagcattttctcaaaataa-tgttggggg-ttataccctaaaagtatattaatactat 12496079  T
Q  210 aatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  12496078 aatgctgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatat 12496037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 97 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 11849247 - 11849093
Alignment:
Q  97 attagcatacatccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagt 196  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  11849247 attagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataactgttgggggcttatgccctgaaagt 11849148  T
Q  197 atattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  11849147 atattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 11849093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 856156 - 855915
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||     
T  856156 agatgattaagatgatgtttatcctccaaattattggatatatat--gagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattaacatacatt 856059  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact-- 207  Q
     ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||      
T  856058 tgttggaggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaataa-cgatgggggctcatgccttgaaagtatattaatactaa 855960  T
Q  208 -ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  855959 aataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 855915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 57 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 15067654 - 15067458
Alignment:
Q  57 gagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagca 156  Q
    ||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15067654 gagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagca 15067555  T
Q  157 tttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact---ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    || |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  15067554 ttagctcaaaataa-cgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatactaaaataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 15067458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16369416 - 16369176
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||     
T  16369416 agatgaataagatgatgttgaacctccaaattattggatatatat--gagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatt 16369319  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact-- 207  Q
     |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  16369318 tgttgggagcttatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaataa-cgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatactaa 16369220  T
Q  208 -ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
     ||||||||   ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  16369219 aataatgtt-aaggctcatgccctgcattggtaccacatgcatat 16369176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 14878617 - 14878857
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   ||| ||||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||     
T  14878617 agatgaataagatgatgttgaatctccaaattattggatac--ataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacata 14878714  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact-- 207  Q
     || ||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||| || ||||||| |||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  14878715 tgtagggggctcatgccctggagattagtactcaccacgatggagctttagctcaaattaa-agatgggggcttatgccctggaagtatattaatactca 14878813  T
Q  208 ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||| ||||| ||||||||||||  ||||| |||| ||||||||    
T  14878814 ataacgttggaggctcatgccctatattggtaccacatgcatat 14878857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Original strand, 15878160 - 15878392
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggg 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||| ||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  15878160 aagatgatgttgaacctccaaattattggataa--ataagagatgatgattatgatgtttaaga-gatcgagttcatgcattagcatacatttgttgggg 15878256  T
Q  118 gctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact---ataatgt 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| || |||| |||| |    ||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||| |     
T  15878257 gctcatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctc-aaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaataacga 15878355  T
Q  215 tgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  15878356 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 15878392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 15051524 - 15051367
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||     
T  15051524 agatgaataagatgatcttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatt 15051428  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa 170  Q
     ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15051427 tgttggggcctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaataa 15051367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 207
Target Start/End: Original strand, 23053188 - 23053383
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||     
T  23053188 agatgattaagataatgttgaac-tccaaattattggatgtatataagagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacata 23053286  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact 207  Q
     |||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| | |    ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  23053287 tgttgggggatcatgccttggagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaact-agaaatgggggcttatgccctggaaatatattaatact 23053383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 146
Target Start/End: Original strand, 12038052 - 12038185
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||     
T  12038052 agatgattaagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgttttatatgatagagtccatgcattagcatacatt 12038148  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcacca 146  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12038149 tgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 12038185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 146
Target Start/End: Original strand, 26196532 - 26196666
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgtttta-gatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26196532 agatgattaagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagttcatgcattagcatacat 26196628  T
Q  109 ccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcacca 146  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  26196629 ttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 26196666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 23408436 - 23408205
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggg 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||  ||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  23408436 aagatgatgttgaacctccaaattattggataa--ataagagatgatgattttgatgtttaaga-gatcgagttcatgcattagcatacatttgttgggg 23408340  T
Q  118 gctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact---ataatgt 214  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| || |||||||| || |||||||   |    |||||||| |||||||| |||||||||||||||   |||  |     
T  23408339 gctcatgccctagagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagcgatgggggctcatgccctggaagtatattaatactcaaatagcga 23408242  T
Q  215 tgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  23408241 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 23408205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 207
Target Start/End: Original strand, 23077578 - 23077772
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgtttt--agatgattgagtccatgcattagcataca 107  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||| |||||| |||||||||  ||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  23077578 agatgattaagatgatgttgaac-tccaaattagtggatat--ataagagatgatgattgagatgtttttaaga-gatcgagtccattcattagcataca 23077673  T
Q  108 tccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact 207  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||||||  |||||| | |    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23077674 tatgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattatctcaaact-agcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatact 23077772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 15060300 - 15060196
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||     
T  15060300 agatgaataagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatt 15060204  T
Q  110 cgttgggg 117  Q
     |||||||    
T  15060203 tgttgggg 15060196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 11851597 - 11851510
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcatta 100  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11851597 agatgattaagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcatta 11851510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 34 - 138
Target Start/End: Original strand, 12852662 - 12852763
Alignment:
Q  34 tccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagc 133  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  12852662 tccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgttt-agatgatagagtcaatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagc 12852758  T
Q  134 tttgt 138  Q
    |||||    
T  12852759 tttgt 12852763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 52 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 16796295 - 16796195
Alignment:
Q  52 tatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatg 151  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16796295 tataagagatgatgattatgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatg 16796197  T
Q  152 ga 153  Q
    ||    
T  16796196 ga 16796195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 146
Target Start/End: Original strand, 11557486 - 11557621
Alignment:
Q  11 gatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagat-gttttagat-gattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    ||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||   |||  |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  11557486 gatgaataagatgttgctgagc-tccaaattattggatgcatatt-gagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatactt 11557583  T
Q  109 ccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcacca 146  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  11557584 ttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 11557621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 134 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16796192 - 16796074
Alignment:
Q  134 tttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact--ataatgttgggggctcatgccctg 231  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||    | |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||     
T  16796192 tttgtactcaccacgatggagctttagctcaaattagcgat-gggggcttatgccctggaagtatattaatactcaataacgttgggggctcatgcccta 16796094  T
Q  232 aattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||| |||| ||||||||    
T  16796093 aattggtaccacatgcatat 16796074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 184 - 251
Target Start/End: Original strand, 12852797 - 12852864
Alignment:
Q  184 atgccctgaaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  12852797 atgccctaaaagtatattaatactatgatgttgagggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 12852864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 185 - 247
Target Start/End: Original strand, 12038212 - 12038274
Alignment:
Q  185 tgccctgaaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgc 247  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  12038212 tgccctaaaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgc 12038274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 146
Target Start/End: Original strand, 11595291 - 11595373
Alignment:
Q  64 tgattaagat-gttttagat-gattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcacca 146  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  11595291 tgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatactt--gttgggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 11595373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 146
Target Start/End: Original strand, 1982963 - 1983047
Alignment:
Q  64 tgattaagat-gttttagat-gattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcacca 146  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  1982963 tgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatacttttgttgggggctcatgccctggagctatgtcctcacca 1983047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 145
Target Start/End: Original strand, 3390089 - 3390171
Alignment:
Q  64 tgattaagat-gttttagat-gattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcacc 145  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  3390089 tgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatacttt-gttgggggctcatgccctggagctttgtcctcacc 3390171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 207
Target Start/End: Original strand, 13210504 - 13210624
Alignment:
Q  87 gagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggctt-a 184  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| |    ||||||||| |    
T  13210504 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctc-aaattagcgatgggggcttga 13210601  T
Q  185 tgccctgaaagtatattaatact 207  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  13210602 tgccctgaaagtatattaatact 13210624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 10 - 145
Target Start/End: Original strand, 3403057 - 3403191
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagat-gttttagat-gattgagtccatgcattagcataca 107  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||   |||  |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||     
T  3403057 agatgaataagatgttgttgagc-tccaaattagtggatgcatatt-gagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattaacatact 3403154  T
Q  108 tccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcacc 145  Q
    |  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  3403155 tt-gttgggggctcatgccctggagctttgtcctcacc 3403191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 42325906 - 42325824
Alignment:
Q  64 tgattaagat-gttttagat-gattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcacca 146  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  42325906 tgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatactt--gttgggggctcataccctggagctttgtcctcacca 42325824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 192 - 251
Target Start/End: Original strand, 26196700 - 26196759
Alignment:
Q  192 aaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||    
T  26196700 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctttattggtaccacatgcatat 26196759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 14665417 - 14665321
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagatt--atgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcataca 107  Q
    |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||  ||||||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  14665417 agatgattaagatgatgatgaac-tccaaattattggat--gtataagagatttgatgattaagatatttt-gttgatagagtccatgcattagcataca 14665322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 251
Target Start/End: Original strand, 11557657 - 11557713
Alignment:
Q  194 agtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  11557657 agtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatat 11557713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 128 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 16909731 - 16909667
Alignment:
Q  128 tggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaa 193  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  16909731 tggagctttgtactaaccacgatggagcattagctcaaaataa-tgttgggggctcatgccctgaa 16909667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 251
Target Start/End: Original strand, 3403226 - 3403285
Alignment:
Q  192 aaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  3403226 aaagtatatcaatattatgatgttgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatat 3403285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 108
Target Start/End: Original strand, 15850169 - 15850263
Alignment:
Q  13 tgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    |||||||| |||||  |||| ||||||||||||||| | ||   || || |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  15850169 tgaataagttgatgaagaac-tccaaattattggatgtataagtgatatgatgattaagatgtttttgttgatagagtccatgcattagcatacat 15850263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 192 - 250
Target Start/End: Original strand, 1983081 - 1983138
Alignment:
Q  192 aaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcata 250  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  1983081 aaagtatattaatactatgatgttggggcctcatgccctg-attggtaccacatgcata 1983138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 14668573 - 14668477
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagatt--atgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcataca 107  Q
    |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||  |||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||| ||||||    
T  14668573 agatgattaagatgatgatgaac-tccaaattattggat--gtataagagatttgatgattaaaatgtttt-gttgatagagtccatgcattaacataca 14668478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 23274652 - 23274549
Alignment:
Q  66 attaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctca 164  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||      ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  23274652 attaagatgtttaagaag-tcgagtccatgcattagcatttcagtgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctca 23274554  T
Q  165 aaata 169  Q
    |||||    
T  23274553 aaata 23274549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 108
Target Start/End: Original strand, 7793454 - 7793539
Alignment:
Q  21 atgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagatt--atgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||  ||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  7793454 atgatgatgaac-tccaaattattggat--gtataagagatttgatgatgaagatgtttt-gttgatagagtccatgcattagcatacat 7793539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 208 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16909692 - 16909649
Alignment:
Q  208 ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  16909692 ataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacttgcatat 16909649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 108
Target Start/End: Original strand, 327281 - 327354
Alignment:
Q  34 tccaaattattggatatgtatacgagatt--atgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||  |||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||    
T  327281 tccaaattattggat--gtataagagatttgatgattaagatgtttt-gttgatagagtccatgcatgagcatacat 327354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 14682291 - 14682206
Alignment:
Q  122 atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggctt-atgccctgaaagtatattaatact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||| |||| |    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  14682291 atgccttggagctttgtactcaccacgttggagctttagctc-aaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 14682206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 194 - 250
Target Start/End: Original strand, 11595409 - 11595465
Alignment:
Q  194 agtatattaatactataat-gttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcata 250  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  11595409 agtatattaatactatgattgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata 11595465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 194 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 42325788 - 42325732
Alignment:
Q  194 agtatattaatactataat-gttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcata 250  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  42325788 agtatattaatactatgattgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata 42325732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 108
Target Start/End: Original strand, 20461618 - 20461689
Alignment:
Q  36 caaattattggatatgtatacgagatt--atgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||  ||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  20461618 caaattattggat--gtataagagatttgatgattacgatgtttt-gttgatagagtccatgcattagcatacat 20461689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 45)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 20805568 - 20805327
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20805568 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacata 20805469  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactat 209  Q
     |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20805468 tgttgggggctcatgcccttgagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactat 20805369  T
Q  210 aatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  20805368 aatgctgagggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 20805327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 20766990 - 20766749
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  20766990 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatatgagatgatgattaagatgttttaaatgattgagtccatgcattagcatacata 20766891  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactat 209  Q
     |||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20766890 tgttgggggttcatgccctatagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattgttgagggcttatgccctgaaattatattaatactat 20766791  T
Q  210 aatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  20766790 aatgctgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 20766749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 21366765 - 21367003
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21366765 agatgattaagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatt 21366861  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactat 209  Q
     |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21366862 tgttgggggcttatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactat 21366961  T
Q  210 aatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  21366962 aatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 21367003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 22032339 - 22032098
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||     
T  22032339 agatgattaagatgatgttgaacctccaaattattggatatatat--gagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatt 22032242  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact-- 207  Q
     |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  22032241 tgttgagggctcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagcattagctcaaaataa-cgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatactaa 22032143  T
Q  208 -ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  22032142 aataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 22032098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 18770102 - 18770345
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||     
T  18770102 agatgattaagatgatgttgaacctccaaattattggatatatagatgagatgatgattaagatgttttaagagactgagtccatgcattagcatacatt 18770201  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact-- 207  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  18770202 tgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaataa-cgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatactaa 18770300  T
Q  208 -ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  18770301 aataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 18770345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 23201376 - 23201135
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||     
T  23201376 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattggatac--ataagagatgatgattatgatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacata 23201279  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact-- 207  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||| |    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||      
T  23201278 tgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgatggagcattagctc-aaattagcgatgggggcttatgcactggaagtatattaatactta 23201180  T
Q  208 -ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
     |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  23201179 aataacgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 23201135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 251
Target Start/End: Original strand, 17919295 - 17919482
Alignment:
Q  64 tgattaagat-gttttagat-gattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgc 161  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||  |    
T  17919295 tgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcattcatatgttgggggctcatgccctggagcttagtcctcaccacgatggagcattaac 17919394  T
Q  162 tcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  17919395 tcaaa-taaatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatat 17919482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 21873270 - 21873030
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||  ||||| || ||||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||     
T  21873270 agatgaataagatgatgttgaccctccaaattattggatacatat--gagatgatcattaacatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacata 21873173  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact-- 207  Q
     |||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| |||| |||| |    ||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  21873172 tgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctc-aaattagcaatgggggcttatgccctggaagtatattaatactca 21873074  T
Q  208 ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  21873073 ataacgatgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatat 21873030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 64 - 251
Target Start/End: Original strand, 123455 - 123642
Alignment:
Q  64 tgattaagat-gttttagat-gattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgc 161  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||   ||  |||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  123455 tgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcaatgatatgttgggggctcatgccctggagcttagtcctcaccacgatggagcatttgc 123554  T
Q  162 tcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  123555 tcaaa-taaatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaactattgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatat 123642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 146
Target Start/End: Original strand, 1859077 - 1859210
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  1859077 agatgaataagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgttttagttgattgagtccatgcattagcatacatt 1859173  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcacca 146  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  1859174 tgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 1859210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 14079165 - 14078925
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||   ||| ||||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||     
T  14079165 agatgattaagatgatgttgaacctccaa-ttattggatac--ataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatg 14079069  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact-- 207  Q
     |||||||||||||||| | |||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| |||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  14079068 tgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaattaa-cgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactca 14078970  T
Q  208 -ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
      ||| | || |||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  14078969 actaacgatgagggctcatgccccgaattggtaccacatgcatat 14078925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 23512114 - 23511876
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttt-tagatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||||||||||| ||   ||| |||  |||||||||||||||||    
T  23512114 agatgaataagatgatgttgaacctccaaattattggatac--ataagagatgatgattaagatgtttataagagatcgagctcatgcattagcatacat 23512017  T
Q  109 ccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaata--c 206  Q
      |||   |||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||| |||    ||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  23512016 atgtt---ggcttatgccctggagcttagtactcaccacgatggagctttagctcaaattaa-agatgggggcttatgccctggaagtatattaatattc 23511921  T
Q  207 tataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  23511920 aataacgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 23511876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 251
Target Start/End: Original strand, 22107789 - 22107955
Alignment:
Q  87 gagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatg 186  Q
    ||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |    ||||||||||||    
T  22107789 gagtctatgcattaacatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctc-aaattagcgatgggggcttatg 22107887  T
Q  187 ccctgaaagtatattaatact---ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||| |||||||||||||||   |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  22107888 ccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 22107955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 18 - 169
Target Start/End: Original strand, 23501464 - 23501612
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggg 117  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||   ||||||||| ||| ||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23501464 aagatgatgttgaacttccaaaatattggataa--atacgagatgatgtttatgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 23501560  T
Q  118 gctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaata 169  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  23501561 gctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaaata 23501612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 63 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 23572042 - 23571884
Alignment:
Q  63 atgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgct 162  Q
    |||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  23572042 atgattaaaatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatttgtttggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagct 23571943  T
Q  163 caaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact---ataatgttgggg 219  Q
      |||| |    ||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||    
T  23571942 -taaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaataatgttgggg 23571884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 26704083 - 26703853
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggg 117  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||   ||| ||||| ||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  26704083 aagatgatgttgaacctctaaattattggataa--ataagagatgatgattgtgatgtttaaga-gattgagtccatgcattagcatagatttgttgggg 26703987  T
Q  118 gctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact---ataatgt 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| || ||||||    |    ||||||||||||||||| | |||||||||||||   |||  |     
T  26703986 gctcatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaa---tagcgatgggggcttatgccctggaggtatattaatactcaaatagcga 26703890  T
Q  215 tgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||    
T  26703889 tgggggctcatgccctaaattggtaccacaagcatat 26703853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 26973816 - 26973586
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggg 117  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||   ||| ||||| ||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  26973816 aagatgatgttgaacctctaaattattggataa--ataagagatgatgattgtgatgtttaaga-gattgagtccatgcattagcatagatttgttgggg 26973720  T
Q  118 gctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact---ataatgt 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| || ||||||    |    ||||||||||||||||| | |||||||||||||   |||  |     
T  26973719 gctcatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaa---tagcgatgggggcttatgccctggaggtatattaatactcaaatagcga 26973623  T
Q  215 tgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||    
T  26973622 tgggggctcatgccctaaattggtaccacaagcatat 26973586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 23458608 - 23458471
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgtt---ttagatgattgagtccatgcattagcatac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||  |||||  ||| |||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23458608 agatgaataagatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatt-gagatgttgactaagatgttgattaagatgattgagtccatgcattagcatac 23458511  T
Q  107 atccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcacca 146  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  23458510 atttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 23458471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 23462869 - 23462732
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgtt---ttagatgattgagtccatgcattagcatac 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||  |||||  ||| |||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23462869 agatgaataagatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatt-gagatgttgactaagatgttgattaagatgattgagtccatgcattagcatac 23462772  T
Q  107 atccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcacca 146  Q
    ||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  23462771 atttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 23462732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 23439997 - 23439860
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgtt---ttagatgattgagtccatgcattagcatac 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||  |||||  |||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23439997 agatgaataagataatgttgaac-tccaaattattggatgtatatt-gagatgttgattaagatgttgattaagatgattgagtccatgcattagcatac 23439900  T
Q  107 atccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcacca 146  Q
    ||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  23439899 atttgttgggggctcatgccctagagctttgtcctcacca 23439860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 23451364 - 23451227
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgtt---ttagatgattgagtccatgcattagcatac 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | |||  |||||  |||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23451364 agatgaataagataatgttgaac-tccaaattattggatgtatatt-gagatgttgattaagatgttgattaagatgattgagtccatgcattagcatac 23451267  T
Q  107 atccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcacca 146  Q
    ||  |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  23451266 atttgttgggggctcatgccctagagctttgtcctcacca 23451227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 37723848 - 37723727
Alignment:
Q  87 gagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggctt-a 184  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |    ||||||||| |    
T  37723848 gagtccatgcattagcattcata-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcatttgctcaaaattagcgatgggggcttga 37723750  T
Q  185 tgccctgaaagtatattaatact 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  37723749 tgccctggaagtatattaatact 37723727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 24221892 - 24221757
Alignment:
Q  11 gatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagat-gttttagat-gattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||   |||  |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |    
T  24221892 gatgaataagatgttgttgagc-tccaaattattggatgcatatt-gagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattaacatactt 24221795  T
Q  109 ccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcacca 146  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24221794 ttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 24221757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 31342162 - 31342027
Alignment:
Q  11 gatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagat-gattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||   |||  |||||  ||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |     
T  31342162 gatgaataagatgttgttgagc-tccaaattattggatgcatatt-gagatattgattaagattgtttagattgatcgagtccatgcattagcatactt- 31342066  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatga 149  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31342065 -gttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccatga 31342027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 192 - 251
Target Start/End: Original strand, 1859244 - 1859303
Alignment:
Q  192 aaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  1859244 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 1859303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 146
Target Start/End: Original strand, 12028717 - 12028799
Alignment:
Q  64 tgattaagat-gttttagat-gattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcacca 146  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  12028717 tgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatactt--gttgggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 12028799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 22757090 - 22757010
Alignment:
Q  64 tgattaagat-gttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcacca 146  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  22757090 tgattaagattgttttag-tgattgagtccatgcattagcatactt--gttgggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 22757010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 23439834 - 23439767
Alignment:
Q  184 atgccctgaaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  23439834 atgccttgaaagtatattaatactaaactgttgggggctcatgcccagaattggtaccacatgcatat 23439767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 23451201 - 23451134
Alignment:
Q  184 atgccctgaaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  23451201 atgccttgaaagtatattaatactaaactgttgggggctcatgcccagaattggtaccacatgcatat 23451134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 207
Target Start/End: Original strand, 21293145 - 21293266
Alignment:
Q  87 gagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggctt-a 184  Q
    ||||||||| |||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |    ||||||||| |    
T  21293145 gagtccatgaattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttga 21293243  T
Q  185 tgccctgaaagtatattaatact 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  21293244 tgccctggaagtatattaatact 21293266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 26680597 - 26680464
Alignment:
Q  11 gatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagat-gttttagat-gattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||   |||  ||| |  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |    
T  26680597 gatgaataagatgttgttgagc-tccaaattattggatgcatatt-gagttgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattatcatactt 26680500  T
Q  109 ccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcacca 146  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  26680499 --gttgggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 26680464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 26952204 - 26952071
Alignment:
Q  11 gatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagat-gttttagat-gattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||   |||  ||| |  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |    
T  26952204 gatgaataagatgttgttgagc-tccaaattattggatgcatatt-gagttgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattatcatactt 26952107  T
Q  109 ccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcacca 146  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  26952106 --gttgggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 26952071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 207
Target Start/End: Original strand, 19661009 - 19661131
Alignment:
Q  85 ttgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggctt 183  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| |    |||||||||    
T  19661009 ttgagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccatggagctttgtactcaccacgttggagcattagctc-aaattagcgatgggggctt 19661106  T
Q  184 -atgccctgaaagtatattaatact 207  Q
     |||||||| |||||||||||||||    
T  19661107 gatgccctggaagtatattaatact 19661131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24221723 - 24221666
Alignment:
Q  192 aaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcata 250  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  24221723 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata 24221666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 108
Target Start/End: Original strand, 24767646 - 24767742
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagatt--atgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcataca 107  Q
    |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||  |||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||    
T  24767646 agatgattaagatgatgatgaac-tccaaattattggat--gtataagagatttgatgattaagatgtttt-gttgatagaatccatgcattagcataca 24767741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 207
Target Start/End: Original strand, 21808565 - 21808685
Alignment:
Q  87 gagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttat 185  Q
    |||||||||||||||| | |||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||    | ||||  | ||    
T  21808565 gagtccatgcattagccttcatt-gttgggggcttgatgccttggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgatgggggtttgat 21808663  T
Q  186 gccctgaaagtatattaatact 207  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  21808664 gccctggaagtatattaatact 21808685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 23458445 - 23458378
Alignment:
Q  184 atgccctgaaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  23458445 atgccttgaaagtatattaatattaaactgttgggggctcctgccatgaattggtaccacatgcatat 23458378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 23462706 - 23462639
Alignment:
Q  184 atgccctgaaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||| |||||||||||||||| || | |||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  23462706 atgccttgaaagtatattaatattaaactgttgggggctcctgccatgaattggtaccacatgcatat 23462639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 207
Target Start/End: Original strand, 21729276 - 21729361
Alignment:
Q  122 atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||    | ||||  | |||||||| |||||||||||||||    
T  21729276 atgccttggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgatgggggtttgatgccctggaagtatattaatact 21729361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 17410442 - 17410360
Alignment:
Q  21 atgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagatt--atgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcata 105  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||  |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  17410442 atgatgatgaac-tccaaattattggat--gtataagagattttatgattaagatgtttt-gttgatggagtccatgcattagcata 17410360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 22074965 - 22074845
Alignment:
Q  87 gagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggctt-a 184  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | | ||| ||| |||| |||| |    ||||||||| |    
T  22074965 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgtttgagtattagctc-aaattagcgatgggggcttga 22074868  T
Q  185 tgccctgaaagtatattaatact 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  22074867 tgccctggaagtatattaatact 22074845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 194 - 250
Target Start/End: Original strand, 12028835 - 12028891
Alignment:
Q  194 agtatattaatactataat-gttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcata 250  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  12028835 agtatattaatactatgattgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata 12028891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 193 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 21877370 - 21877310
Alignment:
Q  193 aagtatattaatact--ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  21877370 aagtatattaatactcaataacgatgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatat 21877310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 193 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 21887125 - 21887065
Alignment:
Q  193 aagtatattaatact--ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  21887125 aagtatattaatactcaataacgatgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatat 21887065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 108
Target Start/End: Original strand, 23535724 - 23535767
Alignment:
Q  64 tgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  23535724 tgattaagatgtttt-gttgatagagtccatgcattagcatacat 23535767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 913 - 673
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  913 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtgtatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatt 814  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactat 209  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  813 tgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattgttggggg-ttatgccctgaaagtatattaatactat 715  T
Q  210 aatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  714 aatgttgggggctcatgccctaaattggtaccacatgcatat 673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 44)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 21766711 - 21766471
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  21766711 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagcccatgcattagcatacatt 21766612  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactat 209  Q
     |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21766611 tgttgggggctcatgccctggagttttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa-tgttgggggcttatgccttgaaagtatattaatactat 21766513  T
Q  210 aatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21766512 aatgttgggggctcatgccctgaattggcaccacatgcatat 21766471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 16523484 - 16523722
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16523484 agatgattaagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatt 16523580  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactat 209  Q
     |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16523581 tgttgggggcttatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataattgttgagggcttatgccctgaaagtatattaatactat 16523680  T
Q  210 aatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  16523681 aatgctgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatat 16523722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 251
Target Start/End: Original strand, 18692022 - 18692250
Alignment:
Q  20 gatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggc 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  18692022 gatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagttcatgcattagcatacatttgttgggggc 18692118  T
Q  120 tcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgttgggg 219  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18692119 ttatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgctgggg 18692218  T
Q  220 gctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  18692219 gctcatgccctgtattggtaccacatgcatat 18692250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 18907127 - 18906889
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgtttta-gatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18907127 agatgattaagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgcattagcatacat 18907031  T
Q  109 ccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatacta 208  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18907030 ttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaataa-tgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatacta 18906932  T
Q  209 taatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  18906931 aaatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 18906889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 18180510 - 18180272
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18180510 agatgaataagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgttgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacata 18180414  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactat 209  Q
     |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  18180413 tgttgggggctcatgccctggagccttgtcctcaccacgatggagctttagctcaaaataattgttgggggcttatgccctaaaagtatattaatactaa 18180314  T
Q  210 aatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  18180313 actgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 18180272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 84 - 251
Target Start/End: Original strand, 21830612 - 21830778
Alignment:
Q  84 attgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggctt 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  21830612 attgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa-tgttgggggctt 21830710  T
Q  184 atgccctgaaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  21830711 atgccctgaaagtatattaatactataatgttggaggttcatgccctgaattggtaccacatgcatat 21830778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 63 - 251
Target Start/End: Original strand, 22408442 - 22408631
Alignment:
Q  63 atgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgct 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  22408442 atgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgtcctggagctttgtcgtcaccacgatggagcatttgct 22408541  T
Q  163 caaaat-aattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  22408542 caaaataaactgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaaatgataggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 22408631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 21740132 - 21740375
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||     
T  21740132 agatgattaagatgatgttgaac-tccaaattattggatatatat--gagatgaagattaagatgttttaggagattgagtccatgcattagcatacatt 21740228  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatacta- 208  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||     
T  21740229 tgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatcagctcaaaataa-caatgggggctcatgccctgaaggtatattaatactaa 21740327  T
Q  209 -----taatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  21740328 aatattaatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 21740375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 19862986 - 19862754
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggg 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  19862986 aagatgatgttgaacctccaaattattggataa--ataagagatgatgattatgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacataagttgggg 19862890  T
Q  118 gctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact---ataatgt 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| || |||| |||| |    ||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||| |     
T  19862889 gctcatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctc-aaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaataacga 19862791  T
Q  215 tgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  19862790 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 19862754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Original strand, 22335006 - 22335238
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggg 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22335006 aagatgatgttgaacctccaaattattggat--gaataagagatgatgattaagatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 22335102  T
Q  118 gctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact---ataatgt 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || || |||||||| || |||| |||| |    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||   |||| ||    
T  22335103 gctcatgccctggagctttgtacgcaacacgatggagctttagctc-aaattagcgatgggggcttttgccctggaagtatattaatactcaaataacgt 22335201  T
Q  215 tgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  22335202 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 22335238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Original strand, 25642296 - 25642528
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggg 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||  |||||||    
T  25642296 aagatgatgttgaacttccaaattattggataa--ataagagatgatgattaagatgtttaaga-gatcaagtccatgcattagcatacatttgttgggg 25642392  T
Q  118 gctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact---ataatgt 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| || |||| |||| |    ||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||| |     
T  25642393 gctcatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctc-aaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaataacga 25642491  T
Q  215 tgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  25642492 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 25642528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 15894539 - 15894778
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||     
T  15894539 agatgattaagatgatgttgaac-tccaacttattggatat--ataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacata 15894635  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact-- 207  Q
     |||||||||| ||||| | |||||| |||| || || ||||||||||| |||| ||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  15894636 tgttgggggcttatgccctagagcttagtacacaacacgatggagcattagctc-aaataa-cgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactca 15894733  T
Q  208 -ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
     |||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  15894734 aataacgatgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatat 15894778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 19873128 - 19872896
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggg 117  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||   ||| ||||| ||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  19873128 aagatgatgttaaaccttcaaattattggataa--ataagagatgatgattatgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacataatttgggg 19873032  T
Q  118 gctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact---ataatgt 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| || |||| |||| |    ||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||| |     
T  19873031 gctcatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctc-aaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaataacga 19872933  T
Q  215 tgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  19872932 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 19872896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 22432257 - 22432025
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggg 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||   ||| ||||| ||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  22432257 aagatgatgttgaacctccaaattattgtataa--ataagagatgatgattatgatgtttaaga-gatcgagtccatgcatttgcatacatttgttgggg 22432161  T
Q  118 gctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact---ataatgt 214  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||| |    ||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||  |     
T  22432160 gctcatgctctggaactttgtactcaacacgatggagctttagctcaaaat-agcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaatagcga 22432062  T
Q  215 tgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  22432061 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 22432025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 22438807 - 22438575
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggg 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||   ||| ||||| ||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  22438807 aagatgatgttgaacctccaaattattgtataa--ataagagatgatgattatgatgtttaaga-gatcgagtccatgcatttgcatacatttgttgggg 22438711  T
Q  118 gctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact---ataatgt 214  Q
    ||||||||  |||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||| |    ||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||  |     
T  22438710 gctcatgctctggaactttgtactcaacacgatggagctttagctcaaaat-agcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaatagcga 22438612  T
Q  215 tgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  22438611 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 22438575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 155
Target Start/End: Original strand, 22074312 - 22074446
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggg 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  22074312 aagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtgcatgcattagcatacatttgttgggg 22074408  T
Q  118 gctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagc 155  Q
    ||||||||| |||||| |||| ||||||| ||| ||||    
T  22074409 gctcatgccctggagccttgtcctcaccacgattgagc 22074446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 149
Target Start/End: Original strand, 20908083 - 20908221
Alignment:
Q  11 gatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagat-gttttagat-gattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||  |||||  |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |    
T  20908083 gatgattaagatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatt-gagatgttgattaagattgttttagattgatagagtccatgcattagcatactt 20908180  T
Q  109 ccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatga 149  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  20908181 ttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcactatga 20908221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 155
Target Start/End: Original strand, 15041651 - 15041794
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| || | ||| | |||||| |||| ||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||     
T  15041651 agatgaacaagatgatgttgaacctccaaattattgg-tatataaaagagttgatgattgagatttttaaga-gaacgagtccatgcattagcatacatt 15041748  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagc 155  Q
     |||||||||||||||| | |||||| ||||||| || ||||||||    
T  15041749 tgttgggggctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagc 15041794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 146
Target Start/End: Original strand, 27553673 - 27553808
Alignment:
Q  11 gatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagat-gttttagat-gattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||   |||  |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  27553673 gatgaataagatgttgttgagc-tccaaattattggatgcatatt-gagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatactt 27553770  T
Q  109 ccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcacca 146  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27553771 ttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 27553808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 251
Target Start/End: Original strand, 16965437 - 16965650
Alignment:
Q  34 tccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagc 133  Q
    |||||||||||||| |  ||||  |||| || ||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||| || |||  | |||||||| ||||  ||||||    
T  16965437 tccaaattattggacaaatata--agatgataattgagatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagtattcatatgatgggggcttatgctctggagc 16965533  T
Q  134 tttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatac-tataatgttgggggctcatgccctga 232  Q
    || |||||||||| |||||||| || |||||||||||   || ||||||  ||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||     
T  16965534 ttagtactcaccacgatggagctttagctcaaaataacgatt-ggggctcttgccctg-aagtatattaatacttattacgttgggggcttatgccctgt 16965631  T
Q  233 attggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||| |||| ||||||||    
T  16965632 attggtaccacatgcatat 16965650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 87 - 251
Target Start/End: Original strand, 31165017 - 31165178
Alignment:
Q  87 gagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatg 186  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||| || |||| ||   |    |||||||| |||    
T  31165017 gagtccatgcattagcatacatt-gttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagctttagctcgaa--tagcgatgggggctcatg 31165113  T
Q  187 ccctgaaagtatattaatac-tataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  31165114 ccctg-aagtatattaatacttatagcgatgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatat 31165178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 64 - 146
Target Start/End: Original strand, 27567762 - 27567846
Alignment:
Q  64 tgattaagat-gttttagat-gattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcacca 146  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27567762 tgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatacttttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 27567846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 35245530 - 35245409
Alignment:
Q  87 gagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggctt-a 184  Q
    ||||| |||||||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |    ||||||||| |    
T  35245530 gagtctatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttga 35245432  T
Q  185 tgccctgaaagtatattaatact 207  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  35245431 tgccctgaaagtatattaatact 35245409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 251
Target Start/End: Original strand, 22074470 - 22074529
Alignment:
Q  192 aaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  22074470 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatat 22074529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 64 - 146
Target Start/End: Original strand, 19790931 - 19791013
Alignment:
Q  64 tgattaagat-gttttagat-gattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcacca 146  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19790931 tgattaagattgttttagattgattgagttcatgcattagcatactt--gttgggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 19791013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 192 - 251
Target Start/End: Original strand, 20908252 - 20908310
Alignment:
Q  192 aaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  20908252 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatat 20908310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 165
Target Start/End: Original strand, 31155546 - 31155644
Alignment:
Q  67 ttaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctca-tgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaa 165  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||   |||||||||||||||||| |||||||| || ||||||    
T  31155546 ttaagatgtttaagatg-tcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggcttactgctccggagctttgtactcaccacgatggagctttagctcaa 31155644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 166
Target Start/End: Original strand, 4738725 - 4738805
Alignment:
Q  87 gagtccatgcattagcatacatccgttgggggctca-tgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaa 166  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||   |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  4738725 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggcttactgctccggagctttgtactcaccacgatggagctttagctcaaa 4738805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 138
Target Start/End: Original strand, 23657583 - 23657638
Alignment:
Q  82 tgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagctttgt 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23657583 tgattgagtccatgcattagcatacct-tgttgggggctcatgccctggagctttgt 23657638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 1561244 - 1561127
Alignment:
Q  90 tccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggctt-atgc 187  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| |    ||||||||| ||||    
T  1561244 tccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctc-aaattagcgatgggggcttgatgc 1561147  T
Q  188 cctgaaagtatattaatact 207  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  1561146 cctggaagtatattaatact 1561127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 17804199 - 17804114
Alignment:
Q  21 atgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagatt--atgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||  |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  17804199 atgatgatgaac-tccaaattattggat--gtataagagatttgatgattaagatgtttt-gttgatagagtccatgcattagcatacat 17804114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 108
Target Start/End: Original strand, 27325722 - 27325807
Alignment:
Q  21 atgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagatt--atgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||  |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  27325722 atgatgatgaac-tccaaattattggat--gtataagagatttaatgattaagatgtttt-gttgatagagtccatgcattagcatacat 27325807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 11185458 - 11185289
Alignment:
Q  87 gagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggctt-a 184  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||  ||||||||||||  | ||||||||| ||||||||| |    ||||||||| |    
T  11185458 gagtccatgcattagcattcata-gttgggggcttgatgccctggatttttgtactcaccgcgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttga 11185360  T
Q  185 tgccctgaaagtatattaatact---ataatgttgggggc-tcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||  |||||||||||||||   |||| | ||||||| | |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  11185359 tgccctagaagtatattaatactcaaataacgatgggggctttatgccctgtattggtaccacatgcatat 11185289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 250
Target Start/End: Original strand, 27553844 - 27553899
Alignment:
Q  194 agtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcata 250  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||    
T  27553844 agtatattaatactatgatgttgggggctcatgccttg-attggtaccacatgcata 27553899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 4186315 - 4186240
Alignment:
Q  92 catgcattagcatacatccgttgggggctca-tgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaa 166  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| | |||   |||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  4186315 catgcattagcatacatttgttgggggcttactgctccggagctttgtactcaccacgatggagctttagctcaaa 4186240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 87 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 22831448 - 22831285
Alignment:
Q  87 gagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggctt-a 184  Q
    |||||||| ||||||||| |||  ||||||||||  || || ||||||||||||||||| | | ||||||||| ||| ||||| |    ||||||||| |    
T  22831448 gagtccatacattagcattcata-gttgggggcttgattccctggagctttgtactcacgacgttggagcattagctaaaaattagcgatgggggcttga 22831350  T
Q  185 tgccctgaaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||  ||||  | |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  22831349 tgccctggaagtatattaatactcaaatg--ggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatat 22831285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 165
Target Start/End: Original strand, 25603601 - 25603644
Alignment:
Q  122 atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaa 165  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  25603601 atgccctggagctttgtactcaccatgttggagcattagctcaa 25603644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 165
Target Start/End: Original strand, 25611939 - 25611982
Alignment:
Q  122 atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaa 165  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  25611939 atgccctggagctttgtactcaccatgttggagcattagctcaa 25611982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 108
Target Start/End: Original strand, 25767283 - 25767357
Alignment:
Q  33 atccaaattattggatatgtatacgagatt--atgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||  ||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  25767283 atccaaattattggat--gtataagagatttgatggttaagatgtttt-gttgatagagtccatgcattagcatacat 25767357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 194 - 250
Target Start/End: Original strand, 19791049 - 19791105
Alignment:
Q  194 agtatattaatactataat-gttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcata 250  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  19791049 agtatattaatactatgattgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata 19791105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 194 - 250
Target Start/End: Original strand, 27567882 - 27567938
Alignment:
Q  194 agtatattaatactataatgttgggg-gctcatgccctgaattggcaccagatgcata 250  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  27567882 agtatattaatactatgatgttggggagctcatgccctg-attggtaccacatgcata 27567938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 211 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 2077075 - 2077035
Alignment:
Q  211 atgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  2077075 atgttgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatat 2077035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 12706658 - 12706615
Alignment:
Q  64 tgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  12706658 tgattaagatgtttt-gttgatagagtccatgcattagcatacat 12706615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 16741175 - 16741132
Alignment:
Q  64 tgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  16741175 tgattaagatgtttt-gttgatagagtccatgcattagcatacat 16741132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 41)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 16 - 251
Target Start/End: Original strand, 16410351 - 16410586
Alignment:
Q  16 ataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgg 115  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  16410351 ataagatgatgttgaatatccaaattattggatatgtatatgagatgatgattaagatggtttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgg 16410450  T
Q  116 gggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgtt 215  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410451 gggctcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataactgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgtt 16410550  T
Q  216 gggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  16410551 gggggctcatgccctgaattggtaccacattcatat 16410586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 17926806 - 17927043
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  17926806 agatgaataagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagtatacatt 17926902  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactat 209  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17926903 tgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa-tgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactat 17927001  T
Q  210 aatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  17927002 aatgctggaggctcatgccctgtattggtaccacatgcatat 17927043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Original strand, 22010774 - 22011005
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggg 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||    
T  22010774 aagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttaggg 22010870  T
Q  118 gctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaat-aattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgttg 216  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22010871 gctcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataaactgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgctg 22010970  T
Q  217 ggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  22010971 ggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 22011005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 30643392 - 30643630
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgtttta-gatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30643392 agatgattaagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgcattagcatacat 30643488  T
Q  109 ccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatacta 208  Q
      |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30643489 ttgttgggggctcatgccctggaactttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaataa-tgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatacta 30643587  T
Q  209 taatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
     | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  30643588 aactgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 30643630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 16861425 - 16861663
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||     
T  16861425 agatgaataagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgttgattaagatgttttaggtgattgagtccatgcattaacatacata 16861521  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactat 209  Q
     ||||||||| |||||| |||||| |||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16861522 tgttgggggcacatgccctggagccttgtcctcaccacgatggagctttagctcaaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactaa 16861621  T
Q  210 aatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    | |||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  16861622 actgttgggggctcatgccctgaattgataccacatgcatat 16861663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 377287 - 377048
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||   |||||||||||| |||| ||||||||     
T  377287 agatgattaagatgatgttgaac-tccaaattattggatatatatatgagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatccatttgcatacatt 377189  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactat 209  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  377188 tgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagctttagctcaaaataa-tgttgggggctcatgccttgaaagtatattaatactaa 377090  T
Q  210 aatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  377089 aatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 377048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 15611568 - 15611756
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggg 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15611568 aagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgtcttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 15611664  T
Q  118 gctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactata 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15611665 gctcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa-tgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactata 15611756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 15603116 - 15603304
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggg 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  15603116 aagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgtcttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 15603212  T
Q  118 gctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactata 210  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15603213 gctcatgccctggagatttctactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa-tgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactata 15603304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 20466141 - 20466383
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||     
T  20466141 agatgattaagatgatgttgaac-tccaaattattggatatatataagagatgattattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatt 20466239  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatac--- 206  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  20466240 tgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctc-aaattagcgatgggggcttatgccctgaaagtatattaatacaaa 20466338  T
Q  207 tataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
     |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  20466339 aataatgttggaggctcatgccctgtattggtaccacatgcatat 20466383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 23776936 - 23777176
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||| |||||| ||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||     
T  23776936 agatgaataagatgatgttgaacctccaaattattggatac--ataagagatgatgattgagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacata 23777033  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact-- 207  Q
     |||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| |||| |||| |    |||||||||||||| || |||||||||||||||      
T  23777034 tgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctc-aaattagcgatgggggcttatgccttggaagtatattaatactca 23777132  T
Q  208 ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  23777133 ataatgatgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatat 23777176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 20856525 - 20856767
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagat-gttttagat-gattgagtccatgcattagcataca 107  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||   |||  |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20856525 agatgaataagatgttgttgagc-tccaaattattggatgcatatt-gagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcataca 20856622  T
Q  108 tccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatac- 206  Q
    |  |||||||||||||||| |||||  |||| ||||| | |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20856623 tttgttgggggctcatgccctggagtcttgtcctcacaacgatggagctttagctcaaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact 20856722  T
Q  207 tataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    || | ||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||    
T  20856723 taaactgttgggggctcatgccttgtattggtaccacatgcatat 20856767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 82 - 251
Target Start/End: Original strand, 39095097 - 39095264
Alignment:
Q  82 tgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggc 181  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  39095097 tgattgagtctatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagcttagtcctcaccacgatgaagcatttgctcaaa-taattgttgggggc 39095195  T
Q  182 ttatgccctgaaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  39095196 ttatgccctgaaagtatattaatactaaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatat 39095264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16184736 - 16184496
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||     
T  16184736 agatgattaagatgatgttgaac-tccaaattattggatac--ataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacata 16184640  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact-- 207  Q
     |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| |||| |||| |    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||      
T  16184639 tgttgggggcttatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctc-aaattagcgatgggggcttatgccctggaagaatattaatactca 16184541  T
Q  208 -ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  16184540 aataacgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 16184496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 19899103 - 19898870
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggg 117  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||   ||||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  19899103 aagacgatgttgaacctccaaattattggatacctaa--gagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggg 19899006  T
Q  118 gctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact---ataatgt 214  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| |||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||| |     
T  19899005 gctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattcgctcaaattaa-cgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaataacga 19898907  T
Q  215 tgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  19898906 tgggggcgcatgccctgaattggtaccacatgcatat 19898870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 21168832 - 21169074
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagt--ccatgcattagcataca 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||| |||||||||||||||||   ||| ||||  |||||||||||||||||    
T  21168832 agatgaataagatgatgttgaacctccaaattattggatac--ataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtttccatgcattagcataca 21168929  T
Q  108 tccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact 207  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| |||| |||| |    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21168930 tatgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctc-aaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatact 21169028  T
Q  208 --ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
      |||| | |||||||||||||| || ||| | |||| ||||||||    
T  21169029 caataacgatgggggctcatgccatgtattagtaccacatgcatat 21169074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 21162159 - 21162401
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagt--ccatgcattagcataca 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||   ||||| |||||||||||||||||   ||| ||||  |||||||||||||||||    
T  21162159 agatgaataagatgatgttgaacctccaaattattggatacttaa--gagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtttccatgcattagcataca 21162256  T
Q  108 tccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaata-- 205  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| |||| |||| |    |||||||||||||| || |||||||||||||      
T  21162257 tatgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctc-aaattagcgatgggggcttatgccttggaagtatattaatacc 21162355  T
Q  206 ctataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    | |||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  21162356 caataacgatgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatat 21162401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Original strand, 19259692 - 19259872
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||  ||||| || ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||     
T  19259692 agatgaataagatgatgttgtacctccaaattattggatatatat--gagatgataattaagatgttttaatagattgagtccatgcagtagcatacatt 19259789  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaa 193  Q
     |||||||||||||||| | || |||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  19259790 tgttgggggctcatgccctagaactttttcctcaccacgatggagcattagctcaaaataa-tgttgggggctcatgccctgaa 19259872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 19983101 - 19982872
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggg 117  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| ||||  || |  |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  19983101 aagacgatgttgaacctccaaattattagatacataaa--agatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatatgttgggg 19983004  T
Q  118 gctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact---ataatgt 214  Q
    ||||||||| |||||||| ||| ||| || ||||||||| | ||||||| |||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||| |     
T  19983003 gctcatgccctggagcttagtagtcaacacgatggagcactagctcaaattaa-cgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaataacga 19982905  T
Q  215 tgggggctcatgccctgaattggcaccagatgc 247  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  19982904 tgggggctcaggccctgaattggtaccacatgc 19982872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 34 - 251
Target Start/End: Original strand, 44384970 - 44385189
Alignment:
Q  34 tccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgatt-gagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggag 132  Q
    ||||||||||||||    |||| ||||| ||||||  ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||    
T  44384970 tccaaattattggactaatataagagatgatgattgtgatgtttaaga-gattcgagtccatgcattagcattcatttgttgggggctcatgccctggag 44385068  T
Q  133 ctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact---ataatgttgggggctcatgccc 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||   || | ||||||||||||| |||||||||||||||   |||| | |||||||||||||||    
T  44385069 ctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaattaacgatt-gaggcttatgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggctcatgccc 44385167  T
Q  230 tgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    | |||||| |||| ||||||||    
T  44385168 ttaattggtaccacatgcatat 44385189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Original strand, 17354052 - 17354266
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggg 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||| ||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||  ||| |||    
T  17354052 aagatgatgttgaacctccaaattattggataa--ataagagatgatgattatgatgtttaagaa-atcgagtccatgcattagcatacatttgttaggg 17354148  T
Q  118 gctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact---ataatgt 214  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||| |    |||||||||||||| || |||||||||||||||    ||| |     
T  17354149 gctcatgccctagagctttgtactcaacacgatggagcattagctc-aaattagcgatgggggcttatgccttggaagtatattaatactcaattaacga 17354247  T
Q  215 tgggggctcatgccctgaa 233  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17354248 tgggggctcatgccctgaa 17354266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 24755730 - 24755577
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||     
T  24755730 agatgattaagatgatgttgaac-tccaaattattggatac--ataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacata 24755634  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaa 166  Q
     |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  24755633 tgttgggggcttatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaa 24755577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 207
Target Start/End: Original strand, 5866450 - 5866571
Alignment:
Q  87 gagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggctt-a 184  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |    ||||||||| |    
T  5866450 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttga 5866548  T
Q  185 tgccctgaaagtatattaatact 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  5866549 tgccctggaagtatattaatact 5866571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 207
Target Start/End: Original strand, 45131172 - 45131293
Alignment:
Q  87 gagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggctt-a 184  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |    ||||||||| |    
T  45131172 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttga 45131270  T
Q  185 tgccctgaaagtatattaatact 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  45131271 tgccctggaagtatattaatact 45131293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 23913893 - 23913834
Alignment:
Q  192 aaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  23913893 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatat 23913834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 251
Target Start/End: Original strand, 21396156 - 21396325
Alignment:
Q  87 gagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggctt-a 184  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |    ||| ||||| |    
T  21396156 gagtccatgcattagcattcata-gttgggggctttatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatggcggcttga 21396254  T
Q  185 tgccctgaaagtatattaatact---ataatgttgggggc-tcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||  |||||||||||||||   |||  | ||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  21396255 tgccctagaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttaatgccctgtattggcaccacatgcatat 21396325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 251
Target Start/End: Original strand, 21790649 - 21790818
Alignment:
Q  87 gagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggctt-a 184  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |    ||| ||||| |    
T  21790649 gagtccatgcattagcattcata-gttgggggctttatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatggcggcttga 21790747  T
Q  185 tgccctgaaagtatattaatact---ataatgttgggggc-tcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||  |||||||||||||||   |||  | ||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||    
T  21790748 tgccctagaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttaatgccctgtattggcaccacatgcatat 21790818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 168
Target Start/End: Original strand, 16199820 - 16199901
Alignment:
Q  87 gagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaat 168  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  16199820 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaat 16199901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 21249329 - 21249250
Alignment:
Q  87 gagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaa 166  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  21249329 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaa 21249250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 21255167 - 21255088
Alignment:
Q  87 gagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaa 166  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  21255167 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaa 21255088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 166
Target Start/End: Original strand, 21389626 - 21389705
Alignment:
Q  87 gagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaa 166  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  21389626 gagtccatgcattagcattcata-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaa 21389705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 166
Target Start/End: Original strand, 21778952 - 21779031
Alignment:
Q  87 gagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaa 166  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  21778952 gagtccatgcattagcattcata-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaa 21779031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 66 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 31971222 - 31971123
Alignment:
Q  66 attaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctca 164  Q
    |||||| |||||||   ||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  31971222 attaagttgttttaagagatcgagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctca 31971124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 166
Target Start/End: Original strand, 13597773 - 13597873
Alignment:
Q  66 attaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctca 164  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||      ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  13597773 attaagatgtttaagaag-tcgagtccatgcattagcatttcagtgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccatgttggagcattagctca 13597871  T
Q  165 aa 166  Q
    ||    
T  13597872 aa 13597873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 21490960 - 21490860
Alignment:
Q  66 attaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctca 164  Q
    ||||||||||||||   | | |||||||||||||||||| | |  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  21490960 attaagatgttttaagaggtcgagtccatgcattagcattcgtt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctca 21490862  T
Q  165 aa 166  Q
    ||    
T  21490861 aa 21490860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 17140826 - 17140739
Alignment:
Q  122 atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctc-aaaataattcttgggggctt-atgccctgaaagtatattaatact 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||| |    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  17140826 atgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 17140739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 208 - 251
Target Start/End: Original strand, 19259847 - 19259890
Alignment:
Q  208 ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  19259847 ataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacgtgcatat 19259890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 7372682 - 7372604
Alignment:
Q  128 tggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggctt-atgccctgaaagtatattaatact 207  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| || |||||||   |||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  7372682 tggagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tattgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 7372604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 66 - 166
Target Start/End: Original strand, 21919156 - 21919255
Alignment:
Q  66 attaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctca 164  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||| |||  |||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| || |||||    
T  21919156 attaagatgtttaagagg-tcgagtccatgcattagcattcatt-gttgcgggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctca 21919253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 6520214 - 6520134
Alignment:
Q  174 ttgggggctt-atgccctgaaagtatattaatac-tataatgttgggggc-tcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||| |||| | |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  6520214 ttgggggcttgatgccctgaaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatat 6520134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 108
Target Start/End: Original strand, 16231612 - 16231655
Alignment:
Q  64 tgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  16231612 tgattaagatgtttt-gttgatagagtccatgcattagcatacat 16231655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 22044853 - 22044810
Alignment:
Q  64 tgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  22044853 tgattaagatgtttt-gttgatagagtccatgcattagcatacat 22044810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 31)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 37524692 - 37524462
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggg 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  37524692 aagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 37524596  T
Q  118 gctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgttgg 217  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37524595 gctcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgttgg 37524496  T
Q  218 gggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  37524495 gggctcatgccctgtattggtaccacatgcatat 37524462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 25963816 - 25964053
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25963816 agatgaataagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatt 25963912  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactat 209  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25963913 tgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataa-tgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactat 25964011  T
Q  210 aatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  25964012 aatgctgggggcttatgccctgtattggtaccacatgcatat 25964053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 22812012 - 22812250
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgtttta-gatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22812012 agatgattaagatgatgttgaacg-ccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgcattagcatacat 22812108  T
Q  109 ccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatacta 208  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22812109 ttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaat-attgttgggggcttatgcccttaaagtatattaatacta 22812207  T
Q  209 taatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  22812208 taatgctgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatat 22812250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 24673585 - 24673342
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||     
T  24673585 agatgattaagatgatgttgaac-tccaaattattggatatatatatgagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatt 24673487  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact-- 207  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||  |    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||      
T  24673486 tgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagctttagctcaaaaataacgatgggagctcatgccctgaaagtatattaatactaa 24673387  T
Q  208 -ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  24673386 aataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 24673342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 40622311 - 40622552
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||     
T  40622311 agatgattaagatgatgttgaacctccaaattattggatatatat--gagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatt 40622408  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact-- 207  Q
     |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    || ||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  40622409 tgttgtgggctcatgcccttgagctttgtactcaccatgatggagcattagctcaaaataa-cgatgtgggctcatgccctgaaagtatattaatactaa 40622507  T
Q  208 -ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  40622508 aataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 40622552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 21318737 - 21318977
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgat-taagatgtttta-gatgattgagtccatgcattagcataca 107  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||  |||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21318737 agatgaatgagatgttgttgaac-tccaaattattggatgtatata--agatgatgatctaagatgttttaagatgaatgagtccatgcattagcataca 21318833  T
Q  108 tccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact 207  Q
    |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21318834 tatgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccgcgatggagcatttgctcaaaaataacgttgggggcttaagccctgaaagtatattaatact 21318933  T
Q  208 ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    | | ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  21318934 aaactgttgggggcttatgccctgaattggtaccacatgcatat 21318977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 21327668 - 21327908
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgat-taagatgtttta-gatgattgagtccatgcattagcataca 107  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||  |||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21327668 agatgaataagatgttgttgaac-tccaaattattggatgtatata--agatgatgatctaagatgttttaagatgaatgagtccatgcattagcataca 21327764  T
Q  108 tccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact 207  Q
    |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |   ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  21327765 tatgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccgcgatggagcatttgctcaaaaataacgttgggggcttaagccctgaaagtatgttaatact 21327864  T
Q  208 ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    | |  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  21327865 aaacagttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 21327908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 45678230 - 45678470
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||     
T  45678230 agatgattaagatgatgttgaac-tccaaattattggaaatatat--gagatgatgattaagatgttttaggagattgagtccatgcattagcatacatt 45678326  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact-- 207  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    |||||||| |||| |||||||||||||||||||      
T  45678327 tgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaataa-cgatgggggctaatgcactgaaagtatattaatactaa 45678425  T
Q  208 -ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
     |||| | |||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  45678426 aataaagatgggggctcatgccatgaattggtaccacatgcatat 45678470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 24680204 - 24679959
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatac--gagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcataca 107  Q
    |||||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||   ||||| |||||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||    
T  24680204 agatgattaagatggtgttgaacttc-aaattattggatatatatatatgagatgatgattaagatgttttaagagattgagtcaatgcattagcataca 24680106  T
Q  108 tccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact 207  Q
    |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24680105 tttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaaataacgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatact 24680006  T
Q  208 ---ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  24680005 aaaataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 24679959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 40428479 - 40428240
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagat-gttttagat-gattgagtccatgcattagcataca 107  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||   |||  |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40428479 agatgaataagatgttgttgagc-tccaaattattggatgcatatt-gagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcataca 40428382  T
Q  108 tccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact 207  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40428381 tatgttgggggctcatgccctggagcttagtcctcaccacgatggagcatttgctc-aaataattgttgagggcttatgccctgaaagtatattaatact 40428283  T
Q  208 ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    | | |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  40428282 aaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatat 40428240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Original strand, 22741073 - 22741305
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggg 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22741073 aagatgatgttgaacttccaaattattggataa--ataagagatgatgattaagatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 22741169  T
Q  118 gctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact---ataatgt 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| || |||| |||| |    ||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||| |     
T  22741170 gctcatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctc-aaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaataacga 22741268  T
Q  215 tgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  22741269 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 22741305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 23019807 - 23020047
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||     
T  23019807 agatgattaagatgatgtcgaacctccaaattattggatat--ataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacata 23019904  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact-- 207  Q
     |||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||| | ||| |||| |||| |    ||||||||||||||||| | |||||||||||||      
T  23019905 tgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggtgaattagctc-aaattagcgatgggggcttatgccctggatgtatattaatactca 23020003  T
Q  208 ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  23020004 ataacgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 23020047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 22799227 - 22799467
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||   ||| ||||| |||||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||||     
T  22799227 agatgaataagatgatgttgaatctccaaattattggatac--ataagagatgatgattaagatgttttaagagaccgagtccatgcattagcatacata 22799324  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact-- 207  Q
     |||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||| || |||| |||| |    ||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  22799325 tgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactca 22799423  T
Q  208 ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||| | | |||||||||||| || ||||| |||| ||||||||    
T  22799424 ataacgataggggctcatgccttgtattggtaccacatgcatat 22799467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 248
Target Start/End: Original strand, 22758828 - 22759057
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggg 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22758828 aagatgatgttgaacatccaaattattggataa--ataagagatgatgattaagatgtataaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 22758924  T
Q  118 gctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact---ataatgt 214  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| || |||||||| || |||| |||| |    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||   |||| |     
T  22758925 gctcatgccctagagctttgtactcaacacgatggagctttagctc-aaattagcgatgggggcctatgccctggaagtatataaatactcaaataacga 22759023  T
Q  215 tgggggctcatgccctgaattggcaccagatgca 248  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  22759024 tgggggctcatgccttgaattggtaccacatgca 22759057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 136
Target Start/End: Original strand, 21916199 - 21916322
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21916199 agatgattaagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatt 21916295  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagcttt 136  Q
     |||||||||||||||| |||||||||    
T  21916296 tgttgggggctcatgccctggagcttt 21916322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 146
Target Start/End: Original strand, 24716629 - 24716762
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||     
T  24716629 agatgaataagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgggttaaatgattgagtccatgcattaacatacatt 24716725  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcacca 146  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24716726 tgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 24716762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 24174815 - 24174680
Alignment:
Q  11 gatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagat-gttttagat-gattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||   |||  |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  24174815 gatgaataagatgttgttgagc-tccaaattattggatgcatatt-gagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatactt 24174718  T
Q  109 ccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcacca 146  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24174717 ttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 24174680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 146
Target Start/End: Original strand, 24655440 - 24655575
Alignment:
Q  11 gatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagat-gttttagat-gattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||   |||  |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  24655440 gatgaataagatgttgttgagc-tccaaattattggatgcatatt-gagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatactt 24655537  T
Q  109 ccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcacca 146  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24655538 ttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 24655575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 146
Target Start/End: Original strand, 25961634 - 25961768
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagat-gattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||   |||  |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |    
T  25961634 agatgaataagatgttgttgagc-tccaaattattggattcatatt-gagatg-tgattaagatgttttagattgattgagtcaatgcattagcatactt 25961730  T
Q  109 ccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcacca 146  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  25961731 ttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 25961768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 192 - 251
Target Start/End: Original strand, 24716796 - 24716855
Alignment:
Q  192 aaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  24716796 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 24716855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 207
Target Start/End: Original strand, 38292 - 38412
Alignment:
Q  87 gagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggctt-at 185  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||  | ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |    ||||||||| ||    
T  38292 gagtccatgcattagcattcatt-gttggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttgat 38390  T
Q  186 gccctgaaagtatattaatact 207  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  38391 gccctggaagtatattaatact 38412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 24869895 - 24869760
Alignment:
Q  11 gatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagat-gttttaga-tgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||   |||  |||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |    
T  24869895 gatgaataagatgttgttgagc-tccaaattattggatgcatatt-gagatgttgattaagattgttttagagtgattgagtccatggattagcatactt 24869798  T
Q  109 ccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcacca 146  Q
      ||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24869797 ttgttaggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 24869760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 9784632 - 9784573
Alignment:
Q  192 aaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  9784632 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatat 9784573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24174646 - 24174589
Alignment:
Q  192 aaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcata 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  24174646 aaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata 24174589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 250
Target Start/End: Original strand, 25961802 - 25961860
Alignment:
Q  192 aaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcata 250  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  25961802 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcata 25961860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 207
Target Start/End: Original strand, 23103571 - 23103691
Alignment:
Q  87 gagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggctt-at 185  Q
    |||||||||||||||||  |||  |||||||  | ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |    ||||||||| ||    
T  23103571 gagtccatgcattagcactcatt-gttggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttgat 23103669  T
Q  186 gccctgaaagtatattaatact 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||    
T  23103670 gccctgaaagtatattactact 23103691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 207
Target Start/End: Original strand, 23072125 - 23072246
Alignment:
Q  87 gagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggctt-a 184  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||  | ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |    ||||||||| |    
T  23072125 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgctctagagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttga 23072223  T
Q  185 tgccctgaaagtatattaatact 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  23072224 tgccctggaagtatattaatact 23072246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 250
Target Start/End: Original strand, 24655609 - 24655666
Alignment:
Q  192 aaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcata 250  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  24655609 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata 24655666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24869726 - 24869669
Alignment:
Q  192 aaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcata 250  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  24869726 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata 24869669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 20309073 - 20308972
Alignment:
Q  66 attaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctca 164  Q
    |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| || |||||    
T  20309073 attaagttgtttaagatg-tcgagtccatgcattagcattcata-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctca 20308976  T
Q  165 aaat 168  Q
    ||||    
T  20308975 aaat 20308972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 34 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 24735393 - 24735320
Alignment:
Q  34 tccaaattattggatatgtatacgagatt--atgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||  |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  24735393 tccaaattattggat--gtataagagatttgatgattaagatgtttt-gttgatagagtccatgcattagcatacat 24735320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 16348764 - 16349001
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16348764 agatgaataagatgatgttgaac-tctaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatt 16348860  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactat 209  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16348861 tgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa-tgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactat 16348959  T
Q  210 aatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  16348960 aatgctgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 16349001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 16357052 - 16357289
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16357052 agatgaataagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatt 16357148  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactat 209  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  16357149 tgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa-tgttggaggcttatgccctaaaagtatattaatactgt 16357247  T
Q  210 aatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  16357248 aatgctgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 16357289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 16488178 - 16488415
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgtttta-gatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16488178 agatgattaagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtacatgcattagcatacat 16488274  T
Q  109 ccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatacta 208  Q
     |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16488275 tcgttgggg-ctcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagcattagctcaaaataatg-ttgggggcttatgccctgaaagtatattaatacta 16488372  T
Q  209 taatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
     |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||    
T  16488373 aaatgttgggggctcattccctgtattggtaccacatgcatat 16488415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 15121901 - 15122142
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||     
T  15121901 agatgattaagatgatgttgaacctccaaattattggatatatat--gagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatt 15121998  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact-- 207  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  15121999 tgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaataa-caatgggggctcatgccctgaaagtatattaatactaa 15122097  T
Q  208 -ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  15122098 aataacgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 15122142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Original strand, 5339081 - 5339315
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgtt---ttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttg 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||  |||||  ||||||| |||||   | ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  5339081 aagatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatt-gagatgttgattaaaatgttgattaagatgatcgagtccatgcattagcatacatatgttg 5339178  T
Q  115 ggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgt 214  Q
    |||||||||||| |||||| ||||  |||||| |||||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  5339179 ggggctcatgccctggagccttgtcatcaccacgatggagctttagctctaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaactgt 5339278  T
Q  215 tgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  5339279 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 5339315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 23843483 - 23843253
Alignment:
Q  21 atgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggct 120  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23843483 atgatgttgaacctccaaattattggatac--ataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggggct 23843386  T
Q  121 catgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact---ataatgttgg 217  Q
    |||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| |||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||| | |||    
T  23843385 catgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattggctcaaattaa-cgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgg 23843287  T
Q  218 gggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  23843286 gggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 23843253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 15125142 - 15125383
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||   ||| ||||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||     
T  15125142 agatgattaagatgatgtcgaacctccaaattattggatac--ataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacata 15125239  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact-- 207  Q
     ||||||||||||| || |||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| |||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  15125240 tgttgggggctcattccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaattaa-cgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactca 15125338  T
Q  208 -ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
     |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  15125339 aataacgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 15125383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 15093791 - 15093551
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgtttt-agatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  15093791 agatgattaagatgatgttgaacctccaaattattggatat--ataagagatgatgattaagatgtttttaga-gatcgagtccatgcattagcatacat 15093695  T
Q  109 ccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact- 207  Q
      |||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| |||| |||| |    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||     
T  15093694 atgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctc-aaattagcgatggtggcttatgccctggaagtatattaatactc 15093596  T
Q  208 -ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
     |||| | || |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  15093595 aataacgatgagggctcatgccctgtattggtaccacatgcatat 15093551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 12570030 - 12569791
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||     
T  12570030 agatgattaagatgatgttgaac-tccaaattattggatat--ataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacata 12569934  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact-- 207  Q
     |||||||||| || || |||||||| ||||||| || ||||||||||| |||| ||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  12569933 tgttgggggcttataccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctc-aaataa-cgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactca 12569836  T
Q  208 -ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
     |||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  12569835 aataacgatgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatat 12569791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 34 - 251
Target Start/End: Original strand, 17048435 - 17048652
Alignment:
Q  34 tccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagc 133  Q
    ||||||||||||||    |||| ||||| ||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  17048435 tccaaattattggactaatataagagatgatgattatgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagc 17048533  T
Q  134 tttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact--ataatgttgggggctcatgccctg 231  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||| |||| |    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  17048534 tttgtactcaccacgatggagctttagctc-aaattagcgatgggggcatatgccctggaagtatattaatactcaataacgttgggggctcatgccctg 17048632  T
Q  232 aattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||| |||| ||||||||    
T  17048633 aattggtaccacatgcatat 17048652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 44675640 - 44675407
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggg 117  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||   ||| ||||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  44675640 aagacgatgttgaacctccaaattactggatac--ataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggg 44675543  T
Q  118 gctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact---ataatgt 214  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| |||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||  |     
T  44675542 gctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaattaa-cgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaatagcga 44675444  T
Q  215 tgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  44675443 tgggggctcatgtcctgaattggtaccacatgcatat 44675407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 155
Target Start/End: Original strand, 13813119 - 13813261
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  13813119 agatgattaagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgttttagatgatagagtccatgcattagcatacatt 13813215  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagc 155  Q
     |||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||| ||||    
T  13813216 tgttgggggctcatgccctgaagctttgtcctcaccacgattgagc 13813261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 13569510 - 13569278
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggg 117  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||| ||||| |||||||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  13569510 aagatgatgttcaacctccaaattattggatac--ataagagatgatgattaatatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggg 13569413  T
Q  118 gctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact---ataatgt 214  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| |||  |||| |    ||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||  |     
T  13569412 gctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagct-gaaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaatagcga 13569314  T
Q  215 tgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  13569313 tgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatat 13569278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 33 - 146
Target Start/End: Original strand, 631104 - 631214
Alignment:
Q  33 atccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggag 132  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  631104 atccaaattattggatatatat--gagatgataattaagatgttt-agatgatagagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggag 631200  T
Q  133 ctttgtactcacca 146  Q
    |||||| |||||||    
T  631201 ctttgtcctcacca 631214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 12423696 - 12423563
Alignment:
Q  21 atgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgtttt-agat-gattgagtccatgcattagcatacatccgttggggg 118  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||    
T  12423696 atgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgtttttagattgattgagtccatgcgttaacatacatttgttggggg 12423600  T
Q  119 ctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagc 155  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  12423599 ctcatgccctggagctttgtcctcaccacgattgagc 12423563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 146
Target Start/End: Original strand, 16351953 - 16352088
Alignment:
Q  11 gatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagat-gttttagat-gattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||   |||  |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  16351953 gatgaataagatgttgttgagc-tccaaattattggatgcatatt-gagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatactt 16352050  T
Q  109 ccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcacca 146  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16352051 ctgttgggggctcatgccttggagctttgtcctcacca 16352088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 146
Target Start/End: Original strand, 15353409 - 15353544
Alignment:
Q  11 gatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagat-gttttagat-gattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||   |||  |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  15353409 gatgaataagatgttgttgagc-tccaaattattggatgcatatt-gagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatactt 15353506  T
Q  109 ccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcacca 146  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  15353507 ttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 15353544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 187 - 251
Target Start/End: Original strand, 631243 - 631307
Alignment:
Q  187 ccctgaaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  631243 ccctaaaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 631307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 87 - 251
Target Start/End: Original strand, 14053477 - 14053646
Alignment:
Q  87 gagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggctt-a 184  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |    ||||||||| |    
T  14053477 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttga 14053575  T
Q  185 tgccctgaaagtatattaatactataat---gttgggggc-tcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||   | ||||||| | |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  14053576 tgccctggaagtatattaatactaaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatat 14053646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 184 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 12423547 - 12423480
Alignment:
Q  184 atgccctgaaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  12423547 atgccctaaaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgtcctgaattggtaccaaatgcatat 12423480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 192 - 251
Target Start/End: Original strand, 13813450 - 13813509
Alignment:
Q  192 aaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  13813450 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 13813509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 207
Target Start/End: Original strand, 23374529 - 23374649
Alignment:
Q  87 gagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttat 185  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    ||||||  | ||    
T  23374529 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaatagcgattggggcttgat 23374627  T
Q  186 gccctgaaagtatattaatact 207  Q
    |||||| ||||||| |||||||    
T  23374628 gccctggaagtataataatact 23374649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 184 - 231
Target Start/End: Original strand, 13813353 - 13813400
Alignment:
Q  184 atgccctgaaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctg 231  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13813353 atgccctaaaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctg 13813400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 108
Target Start/End: Original strand, 22634509 - 22634602
Alignment:
Q  13 tgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagatt--atgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||  |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  22634509 tgaataagttgatgatgaac-tccaaattattggat--gtataagagatttgatgattaagatgtttt-gttgatagagtccatgcattagcatacat 22634602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 250
Target Start/End: Original strand, 15353577 - 15353634
Alignment:
Q  192 aaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcata 250  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  15353577 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata 15353634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 122 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 17046397 - 17046311
Alignment:
Q  122 atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggctt-atgccctgaaagtatattaatact 207  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||| |    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17046397 atgccctggagctttgcactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttgatgccctgaaagtatattaatact 17046311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 233
Target Start/End: Original strand, 13817961 - 13818002
Alignment:
Q  192 aaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaa 233  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13817961 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctgaa 13818002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 25555445 - 25555371
Alignment:
Q  64 tgattaagat-gttttagat-gattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagctttgt 138  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  25555445 tgattaagattgttttagattgattgaatccatgcattagcatactt--gttgggggctcatgccctggagctttgt 25555371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 15551762 - 15551683
Alignment:
Q  87 gagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaa 166  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  15551762 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaa 15551683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12902722 - 12902582
Alignment:
Q  66 attaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctca 164  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| || ||||     
T  12902722 attaagatgtttaagagg-tcgagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctc- 12902626  T
Q  165 aaataattcttgggggctt-atgccctgaaagtatattaatact 207  Q
    |||| |    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  12902625 aaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 12902582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 108
Target Start/End: Original strand, 20157567 - 20157656
Alignment:
Q  17 taagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagatt--atgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    ||||| |||| ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||  |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  20157567 taagacgatgatgaac-tccaaattattggat--gtataagagatttgatgattaagatgtttt-gttgatagagtccatgcattagcatacat 20157656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 3096258 - 3096159
Alignment:
Q  66 attaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctca 164  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | || |||||| |||||    
T  3096258 attaagatgtttaagagg-tcgagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgaagcattagctca 3096161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 146
Target Start/End: Original strand, 11250713 - 11250795
Alignment:
Q  64 tgattaagat-gttttagat-gattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcacca 146  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  11250713 tgattaagattgttttagattgattgactccatgcattagcatactt--gttgggggatcatgccctggagttttgtcctcacca 11250795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 232
Target Start/End: Original strand, 16352122 - 16352162
Alignment:
Q  192 aaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctga 232  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  16352122 aaagtatattaatactatgatgttgggagctcatgccctga 16352162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 21 - 108
Target Start/End: Original strand, 36134066 - 36134151
Alignment:
Q  21 atgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagatt--atgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||  |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  36134066 atgatgatgaac-tccaaattattgaat--gtataagagatttgatgattaagatgtttt-gttgatagagtccatgcattagcatacat 36134151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 194 - 250
Target Start/End: Original strand, 11250831 - 11250887
Alignment:
Q  194 agtatattaatactataat-gttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcata 250  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  11250831 agtatattaatactatgattgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata 11250887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 155
Target Start/End: Original strand, 13813293 - 13813337
Alignment:
Q  111 gttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagc 155  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  13813293 gttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacgattgagc 13813337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 155
Target Start/End: Original strand, 13813382 - 13813426
Alignment:
Q  111 gttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagc 155  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  13813382 gttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacgattgagc 13813426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 17 - 251
Target Start/End: Original strand, 21632 - 21863
Alignment:
Q  17 taagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttggg 116  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  21632 taagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttggg 21728  T
Q  117 ggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgttg 216  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  21729 ggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataattgttgggggcttatgccttgaaagtatattaatactaaaatgttg 21828  T
Q  217 ggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  21829 ggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 21863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 40)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 2760148 - 2759917
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggg 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  2760148 aagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 2760052  T
Q  118 gctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaat-aattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgttg 216  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2760051 gctcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgcttaaaataaactgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgttg 2759952  T
Q  217 ggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  2759951 ggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 2759917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 14429899 - 14429662
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14429899 agatgattaagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatt 14429803  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactat 209  Q
     |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14429802 -gttgggggcttatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactat 14429704  T
Q  210 aatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  14429703 aatgctgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatat 14429662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 10 - 250
Target Start/End: Original strand, 12321842 - 12322079
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgtttta-gatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    |||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12321842 agatgattaagaagatgttaaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgcattagcatacat 12321938  T
Q  109 ccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatacta 208  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  12321939 ttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataa-tgttgggggcttatgccctgaacgtatatttatacta 12322037  T
Q  209 taatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcata 250  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  12322038 aaatgttgggggctcatcccctgaattggtaccacatgcata 12322079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 17138161 - 17138402
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||     
T  17138161 agatgattaagatgatgttgaacctccaaattattggatatatat--gagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatt 17138258  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact-- 207  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  17138259 tgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaataa-cgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatactaa 17138357  T
Q  208 -ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  17138358 aataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 17138402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 12187035 - 12186794
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||     
T  12187035 agatgattaagatgatgttgaacctccaaattattggatatatat--gagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatt 12186938  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact-- 207  Q
     |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  12186937 tgttgggggctcatgccctagagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaataa-cgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatactaa 12186839  T
Q  208 -ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
     |||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  12186838 aataatgttggaggctcatgccctaaattggtaccacatgcatat 12186794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Original strand, 19649598 - 19649830
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggg 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||| ||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  19649598 aagatgatgttgaacctccaaattattggataa--ataagagatgatgattatgatatttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 19649694  T
Q  118 gctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact---ataatgt 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| || |||| |||| |    ||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||| |     
T  19649695 gctcatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctc-aaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaataacga 19649793  T
Q  215 tgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  19649794 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatggatat 19649830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 3271839 - 3271706
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  3271839 agatgaataagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgttttagataattgagtccatgcattagcatacatt 3271743  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcacca 146  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  3271742 tgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 3271706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Original strand, 18154950 - 18155181
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggg 117  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||| |||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18154950 aagatgaagttgaacctccaaattattggataa--ataagagatgatgattgagatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggg 18155046  T
Q  118 gctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact---ataatgt 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| || |||||||   |    ||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||  |     
T  18155047 gctcatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaatagcga 18155144  T
Q  215 tgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  18155145 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 18155181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 250
Target Start/End: Original strand, 32216657 - 32216889
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggg 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||   ||| ||||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  32216657 aagatgatgttgaacctccaaattattggttac--ataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggg 32216754  T
Q  118 gctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact---ataatgt 214  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| | || ||||||||||| |||| |||| |    |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||   |||  |     
T  32216755 gctcatgccctggagcttagtacttaacacgatggagcattagctc-aaattagcgatgggggcttatgccttgaaaatattttaatactcaaatagcga 32216853  T
Q  215 tgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcata 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  32216854 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcata 32216889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 18 - 146
Target Start/End: Original strand, 39268008 - 39268133
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggg 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  39268008 aagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgttttagatgatagagtccatgcattagcatacatttgttgggg 39268104  T
Q  118 gctcatgccttggagctttgtactcacca 146  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  39268105 gctcatgccctggagctttgtcctcacca 39268133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 9703271 - 9703039
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggg 117  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||| ||||| |||||||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  9703271 aagatgatgttcaacctccaaattattggatac--ataagagatgatgattaatatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggg 9703174  T
Q  118 gctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact---ataatgt 214  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| |||  |||| |    ||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||  |     
T  9703173 gctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagct-gaaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaatagcga 9703075  T
Q  215 tgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  9703074 tgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatat 9703039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 34 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 15211449 - 15211230
Alignment:
Q  34 tccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagc 133  Q
    ||||||||||||||    |||| ||||| |||||||||||||||||   | | ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||    
T  15211449 tccaaattattggactaatataagagatgatgattaagatgttttaagagttagagtccatgcattagcatacataagttgggggcttatgccctggagc 15211350  T
Q  134 tttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact---ataatgttgggggctcatgccct 230  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||    |||||||| |||||||| ||||||||||||| |   |||| ||||||||||||||||||    
T  15211349 tttgtactcaccacgatggagctttagctcaaattaa-cgatgggggctcatgccctggaagtatattaatattcaaataacgttgggggctcatgccct 15211251  T
Q  231 gaattggcaccagatgcatat 251  Q
    | |||||  ||| ||||||||    
T  15211250 gtattggtgccacatgcatat 15211230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 23 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 24054467 - 24054241
Alignment:
Q  23 gatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctca 122  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||  ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  24054467 gatgttgaacctccaaattattggataa--ataagagatgatgattgtgatgtttaag-tgatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctca 24054371  T
Q  123 tgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact---ataatgttgggg 219  Q
    |||| |||||||||||||||| |  |||||||| || |||||||   |    |||||||| |||||||| |||||||||||||||   |||  | |||||    
T  24054370 tgccctggagctttgtactcaacgcgatggagctttagctcaaa--tagagatgggggctcatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggg 24054273  T
Q  220 gctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  24054272 gctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 24054241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 52 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 18302016 - 18301918
Alignment:
Q  52 tatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatg 151  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  18302016 tatatgagatgatgattaagatgttt-agatgatagagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccacgatg 18301918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 15580710 - 15580618
Alignment:
Q  13 tgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagatt-atgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15580710 tgaataagatgatgatgaac-tccaaattattggat--gtatgagagattgatgattaagatgttt-agatgattgagtccatgcattagcatacat 15580618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 184 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 18301920 - 18301853
Alignment:
Q  184 atgccctgaaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  18301920 atgccctaaaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatacatat 18301853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 146
Target Start/End: Original strand, 9446260 - 9446395
Alignment:
Q  11 gatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagat-gttttagat-gattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||   |||   ||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  9446260 gatgaataagatgttgttgagc-tccaaattattggatgcatattt-agatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatactt 9446357  T
Q  109 ccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcacca 146  Q
      || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  9446358 ttgtcgggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 9446395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 149
Target Start/End: Original strand, 20569748 - 20569833
Alignment:
Q  64 tgattaagat-gttttagat-gattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatga 149  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20569748 tgattaagattgttttagattgattgagttcatgcattagcatattt--gttgggggctcatgccttggagctttgtcctcaccatga 20569833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 20487418 - 20487359
Alignment:
Q  192 aaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  20487418 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctgaattgataccatatgcatat 20487359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 42203949 - 42203876
Alignment:
Q  73 tgttttagat-gattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcacca 146  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  42203949 tgttttagattgattgagtccatgcattagcatacttt-gttgggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 42203876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 12318146 - 12318053
Alignment:
Q  13 tgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagatt--atgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||||  |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  12318146 tgaataagatgatgatgaac-tccaaactattggat--gtataagagatttgatgattaagatgtttt-gttgatagagtccatgcattagcatacat 12318053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 108
Target Start/End: Original strand, 14932842 - 14932931
Alignment:
Q  17 taagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagatt--atgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||  |||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||    
T  14932842 taagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtataagagatttgatgattaagatgtttt-gttgatagagttcatgcattagcatacat 14932931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 108
Target Start/End: Original strand, 15356277 - 15356366
Alignment:
Q  17 taagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagatt--atgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||  |||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||    
T  15356277 taagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtataagagatttgatgattaagatgtttt-gttgatagagttcatgcattagcatacat 15356366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 17 - 108
Target Start/End: Original strand, 15360391 - 15360480
Alignment:
Q  17 taagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagatt--atgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||  |||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||    
T  15360391 taagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtataagagatttgatgattaagatgtttt-gttgatagagttcatgcattagcatacat 15360480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 108
Target Start/End: Original strand, 9751855 - 9751951
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagatt--atgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcataca 107  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| || |||  |||||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||    
T  9751855 agatgattaagatgatgttgaac-tccaaattattgg--atgtataagatatttgatgattaagatgtttt-gttgatagagttcatgcattagcataca 9751950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 168
Target Start/End: Original strand, 27848006 - 27848087
Alignment:
Q  87 gagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaat 168  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  27848006 gagtccatgcattagcattcata-gttgggggcttgatgccctgaagctttgtactcaccatgttggagcattagctcaaaat 27848087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 34200730 - 34200649
Alignment:
Q  87 gagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaat 168  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  34200730 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaat 34200649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 207
Target Start/End: Original strand, 28505496 - 28505581
Alignment:
Q  123 tgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggctt-atgccctgaaagtatattaatact 207  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  28505496 tgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 28505581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 194 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 42203840 - 42203785
Alignment:
Q  194 agtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcata 250  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  42203840 agtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata 42203785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 207
Target Start/End: Original strand, 11996183 - 11996324
Alignment:
Q  66 attaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggc-tcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctca 164  Q
    ||||||||||||||   | |||||||||||||||||||| |||  ||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||| | |||||| || ||||     
T  11996183 attaagatgttttaagaggttgagtccatgcattagcattcat-tgttgggggcttgatgctctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctc- 11996280  T
Q  165 aaataattcttgggggctt-atgccctgaaagtatattaatact 207  Q
    |||| |    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  11996281 aaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 11996324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 108
Target Start/End: Original strand, 14152097 - 14152182
Alignment:
Q  21 atgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagatt--atgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||  |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  14152097 atgatgatgaac-tccaaattattggat--gtataagagatttgatgattaagatgtttt-gttgatagagtccatgcattagcatacat 14152182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 122 - 207
Target Start/End: Original strand, 15755162 - 15755248
Alignment:
Q  122 atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggctt-atgccctgaaagtatattaatact 207  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||| |    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  15755162 atgccttggaggtttgtactcgccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 15755248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 87 - 168
Target Start/End: Original strand, 16386424 - 16386505
Alignment:
Q  87 gagtccatgcattagcatacatccgttgggggc-tcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaat 168  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||| | ||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  16386424 gagtccatgcattagcattcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttttactcaccacgttggagcattagctcaaaat 16386505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 87 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 26211940 - 26211863
Alignment:
Q  87 gagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctca 164  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  26211940 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctca 26211863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 90 - 168
Target Start/End: Original strand, 15755067 - 15755145
Alignment:
Q  90 tccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaat 168  Q
    ||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||    
T  15755067 tccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccatgttggtgcattacctcaaaat 15755145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 108
Target Start/End: Original strand, 2832542 - 2832638
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagatt--atgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcataca 107  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |  ||| ||||||  |||||||||||||||| | |||| ||||| || ||||||||||||    
T  2832542 agatgattaagatgatgatgaac-tccaaattattggattt--ataagagatttgatgattaagatgtttt-gttgatagagtctatacattagcataca 2832637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 10588946 - 10588861
Alignment:
Q  122 atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggctt-atgccctgaaagtatattaatact 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| |    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  10588946 atgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctc-aaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 10588861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 9593314 - 9593271
Alignment:
Q  64 tgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  9593314 tgattaagatgtttt-gttgatagagtccatgcattagcatacat 9593271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 105
Target Start/End: Original strand, 15605365 - 15605447
Alignment:
Q  21 atgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagatt--atgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcata 105  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| | ||||  |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  15605365 atgatgatgaac-tccaaattattggat--gtataagtgatttgatgattaagatgtttt-gttgatagagtccatgcattagcata 15605447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 16583225 - 16583182
Alignment:
Q  64 tgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  16583225 tgattaagatgtttt-gttgatagagtccatgcattagcatacat 16583182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 409 - 174
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  409 agatgattaagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagat---gattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatt 316  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactat 209  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  315 tgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactat 216  T
Q  210 aatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  215 aatgctaggggctcatgccctgaattggtaccgcatgcatat 174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 35)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 3473023 - 3473261
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3473023 agatgattaagttgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatt 3473119  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactat 209  Q
     ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3473120 tgttgggggctcataccctggagctttgtcctcaccacgatggagcttttgctcaaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactat 3473219  T
Q  210 aatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  3473220 aatgttgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatat 3473261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 22449366 - 22449604
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgtttta-gatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22449366 agatgattaagatgatgctgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgcattagcatacat 22449462  T
Q  109 ccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatacta 208  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22449463 ttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataa-tgttaggggcttatgccctgaaagtatattaatacta 22449561  T
Q  209 taatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
     |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||    
T  22449562 aaatgttgggggctcattccctgtattggtaccacatgcatat 22449604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 17678686 - 17678925
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17678686 agatgaataagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgttgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacata 17678782  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaat-aattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatacta 208  Q
     |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17678783 tgttgggggctcatgccctggagccttgtcctcaccacgatggagctttagctcaaaataaattgttgggggcttatgccctaaaagtatattaatacta 17678882  T
Q  209 taatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
     | ||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  17678883 aactgttgggggatcatgctctgaattggtaccacatgcatat 17678925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 6151864 - 6151624
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||     
T  6151864 agatgattaagatgatgttgaac-tccaaattattggatatatat--gagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatt 6151768  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact-- 207  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  6151767 tgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaataa-cgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatactaa 6151669  T
Q  208 -ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  6151668 aataatgttgggggctcatgccttgaattggtaccacatgcatat 6151624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 18182221 - 18182456
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||     
T  18182221 agatgattaagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgtttaaga-gatcaagtccatgcattagcatacatt 18182316  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactat 209  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18182317 tgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgaaggagcatttgctcaaaataa-tgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactaa 18182415  T
Q  210 aatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||| |||||||||||| || ||||| |||| ||||||||    
T  18182416 aatgtt-ggggctcatgccatgtattggtaccacatgcatat 18182456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 22831487 - 22831723
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||  ||||| |  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||     
T  22831487 agatgattaagatgatgt-gaac-tccaaattattggatatatat--gagatgaatattaagatgttttaggagattgagtccatgcattagcatacatt 22831582  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactat 209  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  22831583 tgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagctttagctcaaaataa-cgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatactaa 22831681  T
Q  210 aatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  22831682 aatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 22831723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Original strand, 20091585 - 20091814
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggg 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||| ||| ||  ||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20091585 aagatgatgttgaacctccaaattattggataa--ataagagatgatgtttttgatgtttaagaag-tcgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 20091681  T
Q  118 gctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgttgg 217  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20091682 gctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagctttagctcaaaataa-tgttgggggctcatgccttgaaagtatattaatactaaaatgttgg 20091780  T
Q  218 gggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  20091781 gggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 20091814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Original strand, 8761733 - 8761968
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgtt---ttagatgattgagtccatgcattagcata-catccgtt 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||  |||||  | |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||    
T  8761733 aagatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatt-gagatgtttattaagatgttgattaagatgattgagtccatgcattagcataacatatgtt 8761830  T
Q  114 gggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatg 213  Q
    ||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  8761831 gggggctcatgccctggagccttgtcctcaccacgatggagctttagctcaaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaactg 8761930  T
Q  214 ttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  8761931 ttggggtctcatgtcctgaattggtaccacatgcatat 8761968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 21788143 - 21788385
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgtttt--agatgattgagtccatgcattagcataca 107  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||||||||||||  ||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  21788143 agatgaataagatgatgttgaacctccaaattattggatac--ataagagatgatgattaagatgtttttaaga-gatcgagtctatgcattagcataca 21788239  T
Q  108 tccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact 207  Q
    |  ||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21788240 tatgttgggggctcataccctggagcttagtactcaccacgatggagcattagctcaaaataa-cgatgggggcttatgccctggaagtatattaatact 21788338  T
Q  208 ---ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
       |||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  21788339 caaataacgatgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatat 21788385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Original strand, 42865322 - 42865555
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggg 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  42865322 aagatgatgttgaacctccaaattattggatac--ataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggg 42865419  T
Q  118 gctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact---ataatgt 214  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| | |    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||   ||| ||     
T  42865420 gctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaact-agcgatggaggcttatgccctggaagtatattaatactcaaatagtga 42865518  T
Q  215 tgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  42865519 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 42865555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 236
Target Start/End: Original strand, 22131206 - 22131408
Alignment:
Q  34 tccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagc 133  Q
    ||||||||||||||    |||| ||||| ||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  22131206 tccaaattattggactaatataagagatgatgattatgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagc 22131304  T
Q  134 tttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact--ataatgttgggggctcatgccctg 231  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||| |||| |    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||    
T  22131305 tttgtactcaccacgatggagctttagctc-aaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaataacgttgggggctcatgccctg 22131403  T
Q  232 aattg 236  Q
    |||||    
T  22131404 aattg 22131408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 21714554 - 21714323
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggg 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21714554 aagatgatgttgaacctccaaattattggataa--ataagagatgatgattgtgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 21714458  T
Q  118 gctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact---ataatgt 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| || |||||||   |    ||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||  |     
T  21714457 gctcatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaatagcga 21714360  T
Q  215 tgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  21714359 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 21714323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 34 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 48603262 - 48603044
Alignment:
Q  34 tccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagc 133  Q
    ||||||||||||||    |||| ||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  48603262 tccaaattattggactaatataagagatgatgattatgatgtttaaga-gattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagc 48603164  T
Q  134 tttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact--ataa-tgttgggggctcatgccct 230  Q
    ||||||||||||| |||||||| || |||| |||| |    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||   |||||||||||||||||    
T  48603163 tttgtactcaccacgatggagctttagctc-aaattagcgatggaggcttatgccctggaagtatattaatactcaataacctttgggggctcatgccct 48603065  T
Q  231 gaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||| |||| ||||||||    
T  48603064 gaattggtaccacatgcatat 48603044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 21022647 - 21022488
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgatt-aagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| || ||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  21022647 agatgattaagatgatgttgaac-tccaaattattggatatatatatgagatgataatttaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacat 21022549  T
Q  109 ccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa 170  Q
      ||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21022548 ttgttgggg-ctcatgccctagagctttgtcctcaccacgatggagcattagctcaaaataa 21022488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 64 - 251
Target Start/End: Original strand, 22468855 - 22469043
Alignment:
Q  64 tgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctc 163  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||| |||| || || |||||||| || ||||    
T  22468855 tgattaagatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatatatttgttgggggctcatgccctggagcttagtacccaacacgatggagctttagctc 22468953  T
Q  164 aaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact---ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
     |||| |    ||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  22468954 -aaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 22469043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 146
Target Start/End: Original strand, 3705169 - 3705302
Alignment:
Q  13 tgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagat-gttttagat-gattgagtccatgcattagcatacatcc 110  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| | |||  |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |      
T  3705169 tgaataagatgttgttgagc-tccaaattattggatgtatatt-gagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatactttt 3705266  T
Q  111 gttgggggctcatgccttggagctttgtactcacca 146  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  3705267 gttgggggctcatgccctggagctttctcctcacca 3705302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 108
Target Start/End: Original strand, 24783193 - 24783289
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagatt--atgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcataca 107  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24783193 agatgattaagatgatgatgaa-atccaaattattggat--gtataagagatttgatgattaagatgttt-agatgattgagttcatgcattagcataca 24783288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 146
Target Start/End: Original strand, 45489895 - 45489977
Alignment:
Q  64 tgattaagat-gttttagat-gattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcacca 146  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  45489895 tgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatactt--gttgggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 45489977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 146
Target Start/End: Original strand, 45310469 - 45310602
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagat-gttttagat-gattgagtccatgcattagcataca 107  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||   |||  |||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  45310469 agatgaata-gatgttgttgaac-tccaaattattggatgcatatt-gagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcactagcatact 45310565  T
Q  108 tccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcacca 146  Q
    |  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  45310566 t--gttgggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 45310602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 87 - 207
Target Start/End: Original strand, 20847330 - 20847450
Alignment:
Q  87 gagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttat 185  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||    ||||||  | ||    
T  20847330 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgattggggcttgat 20847428  T
Q  186 gccctgaaagtatattaatact 207  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  20847429 gccctggaagtatattaatact 20847450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 192 - 251
Target Start/End: Original strand, 41781782 - 41781841
Alignment:
Q  192 aaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||    
T  41781782 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctgtattggtaccacatacatat 41781841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 85 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 20916174 - 20916093
Alignment:
Q  85 ttgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaa 166  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  20916174 ttgagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaa 20916093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 207
Target Start/End: Original strand, 38801563 - 38801684
Alignment:
Q  87 gagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggctt-a 184  Q
    |||||||||||| ||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||| |    ||||||||| |    
T  38801563 gagtccatgcataagcattcata-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattaactcaaaattagcgatgggggcttga 38801661  T
Q  185 tgccctgaaagtatattaatact 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  38801662 tgccctggaagtatattaatact 38801684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 21313130 - 21313045
Alignment:
Q  21 atgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagatt--atgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||  |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  21313130 atgatgatgaac-tccaaattattggat--gtataagagatttgatgattaagatgtttt-gttgatagagtccatgcattagcatacat 21313045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 73 - 138
Target Start/End: Original strand, 33050178 - 33050242
Alignment:
Q  73 tgttttagat-gattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagctttgt 138  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  33050178 tgttttagattgattgagtccatgtattagcatactt--gttgggggctcatgccctggagctttgt 33050242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 108
Target Start/End: Original strand, 36819396 - 36819489
Alignment:
Q  13 tgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagatt--atgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| | ||||  |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  36819396 tgaataagttgatgatgaac-tccaaattattggat--gtataagtgatttaatgattaagatgtttt-gttgatagagtccatgcattagcatacat 36819489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 146
Target Start/End: Original strand, 18394117 - 18394199
Alignment:
Q  64 tgattaagat-gttttagat-gattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcacca 146  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||  |||| |||||| |||||||    
T  18394117 tgattaagattgttttagattgattaagtccatgcattagcatactt--gttgggggctcatgctctggaactttgtcctcacca 18394199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 21022438 - 21022374
Alignment:
Q  128 tggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaa 193  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| | |||||| || ||||||||||    
T  21022438 tggagctttgtactcaccacgatggagcattaactcaaaataa-tgttggggcctcatgccctgaa 21022374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 196 - 231
Target Start/End: Original strand, 3705340 - 3705375
Alignment:
Q  196 tatattaatactataatgttgggggctcatgccctg 231  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3705340 tatattaatactatgatgttgggggctcatgccctg 3705375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 208 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 21022399 - 21022356
Alignment:
Q  208 ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  21022399 ataatgttggggcctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 21022356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 21022484 - 21022442
Alignment:
Q  128 tggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa 170  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21022484 tggagctttgtcctcaccacgatggagcattagctcaaaataa 21022442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 194 - 250
Target Start/End: Original strand, 18394235 - 18394291
Alignment:
Q  194 agtatattaatactataat-gttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcata 250  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  18394235 agtatattaatactatgattgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata 18394291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 67 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 21161688 - 21161588
Alignment:
Q  67 ttaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctca-tgccttggagctttgtactcaccatga-tggagcatttgctca 164  Q
    ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||   |||||||||||||||||| || |||||| || |||||    
T  21161688 ttaagatgtttaagatg-tcaagtccatgcattagcatacatttgttgggggcttactgctccggagctttgtactcaccacgattggagctttagctca 21161590  T
Q  165 aa 166  Q
    ||    
T  21161589 aa 21161588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 194 - 250
Target Start/End: Original strand, 45490013 - 45490069
Alignment:
Q  194 agtatattaatactataat-gttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcata 250  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  45490013 agtatattaatactatgattgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata 45490069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 33680857 - 33680777
Alignment:
Q  174 ttgggggctt-atgccctgaaagtatattaatac-tataatgttgggggc-tcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| | |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  33680857 ttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttattacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatat 33680777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 159; Significance: 9e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 73867 - 74105
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  73867 agatgattaagatgatgttgaa-atccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatt 73963  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactat 209  Q
     |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  73964 tgttgggggcttatgccctggagctttgtactaaccacgatggagcatttgctcaaaataattgttgggggcttatgccctaaaagtatattaatacaat 74063  T
Q  210 aatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  74064 aatgctgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatat 74105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 2185 - 2418
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2185 agatgaataagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgtattagatgattgagtccatgcattagcatacatt 2281  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactat 209  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2282 tgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa-tgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactat 2380  T
Q  210 aatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||    |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  2381 aa----gggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatat 2418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 251
Target Start/End: Original strand, 6512 - 6743
Alignment:
Q  16 ataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgg 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  6512 ataagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagataatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgg 6608  T
Q  116 gggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgtt 215  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||      
T  6609 gggcttatgccctagagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataa-tgttgggggcttatgccctaaaagtatattaatactataatgcc 6707  T
Q  216 gggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  6708 gggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 6743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 1846 - 1608
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  1846 agatgaataagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgttgattaagatagtttagatgattgagtctatgcattagcatacatt 1750  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactat 209  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  1749 tgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaactaattgttgggggcttatgccctaaaagtatagtaatactat 1650  T
Q  210 aatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  1649 aatgctgggggctcatgccctgaattggtaccatatgcatat 1608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 9529 - 9291
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  9529 agatgaataagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgttgattaagatagtttagatgattgagtctatgcattagcatacatt 9433  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactat 209  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  9432 tgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaactaattgttgggggcttatgccctaaaagtatagtaatactat 9333  T
Q  210 aatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  9332 aatgctgggggctcatgccctgaattggtaccatatgcatat 9291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 154; Significance: 9e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Original strand, 46831 - 47067
Alignment:
Q  14 gaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgtt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  46831 gaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatatatatgagatgatgattaagatgttttatgagattgagtccatgcattagcatacatttgtt 46930  T
Q  114 gggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatg 213  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46931 aggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaataa-tgttgagggcttatgccctgaaagtatattaatactaaaatg 47029  T
Q  214 ttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  47030 ttgggggcttatgccctgtattggtaccacatgcatat 47067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 42643 - 42407
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  42643 agatgattaagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagat---gattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatt 42550  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaat-aattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatacta 208  Q
     |||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42549 tgttgggggatcatgccctggaggtttgtactcaccacgatggagtatttgctcaaaataaactgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatacta 42450  T
Q  209 taatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  42449 taatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 42407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 36 - 138
Target Start/End: Original strand, 24949 - 25048
Alignment:
Q  36 caaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagctt 135  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  24949 caaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgttt-agatgatagagtccttgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctt 25045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 184 - 251
Target Start/End: Original strand, 25082 - 25149
Alignment:
Q  184 atgccctgaaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  25082 atgccctaaaagtatattaatactatgatgtttggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 25149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 10 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 1510 - 1303
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  1510 agatgattaagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgaggtgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatt 1414  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactat 209  Q
     |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1413 tgttgggggcttatgccctggagctttgtactcaccacgatagagcattttctcaaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactat 1314  T
Q  210 aatgttggggg 220  Q
    |||| ||||||    
T  1313 aatgctggggg 1303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 1302 - 1267
Alignment:
Q  160 gctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaag 195  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1302 gctcaaaataattgttgggggcttatgccctgaaag 1267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold1220
Description:

Target: scaffold1220; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 1809 - 1578
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgtttt-agat-gattgagtccatgcattagcatacatccgttgg 115  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||| ||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  1809 aagatgatgttgaac-tccaaattattagat--gtatatgagatgatgattaggatgtttttagattgattgagtccatgcattagcatacatttgttgg 1713  T
Q  116 gggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgtt 215  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1712 gggctcatgccctggagctttgtcctcaccatgatggagcatttgctc-aaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgtt 1614  T
Q  216 gggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||| ||||||||| |||||||  |||| ||||||||    
T  1613 gggcgctcatgccatgaattgataccacatgcatat 1578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 15103 - 14867
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgtttta-gatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15103 agatgattaagatgatgttgaac-tccaacttattgggt--gtatatgagatgatgattaagatattttaagatgattgagtccatgcattagcatacat 15007  T
Q  109 ccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatacta 208  Q
      ||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15006 ttgttgggggctca--ccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataatg-ttgggggcttatgccctgaaagtatattaatacta 14910  T
Q  209 taatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
     | |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  14909 aattgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 14867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1326 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold1326
Description:

Target: scaffold1326; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Original strand, 1589 - 1819
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagat-gattgagtccatgcattagcatacatccgttggg 116  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| | | |  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  1589 aagatgatattgaac-tccaaattattggatttatgt--gagatgatgattaagatgttttagattgattgagtccatacattagcatacatttgttggg 1685  T
Q  117 ggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgttg 216  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1686 ggctcatgccctggagccttgtcctcaccacgatggagcattagctcaaaataatg-ttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgttg 1784  T
Q  217 ggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  1785 ggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 1819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 4446 - 4208
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgtttta-gatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4446 agatgattaagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgttataagatgattgagtccatgcattagcatacat 4350  T
Q  109 ccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatacta 208  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  4349 ttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggaacatttgctcaaaataa-tgttgggggtgcatgccctgaaagtatattaatacta 4251  T
Q  209 taatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  4250 aaatgttgggggttcatgccctgaattggtaccacatgtatat 4208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 2848 - 2608
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||     
T  2848 agatgattaagatgatgttgaac-tccaaattattggatatatat--gagatgatgattaagatgttttaagtgattgagtccatgcattaccatacatt 2752  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact-- 207  Q
     |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  2751 tgttgggggctcatgcccttgagctttgtactcaccacgatggagctttagctcaaaataa-tgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatactaa 2653  T
Q  208 -ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  2652 aataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 2608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 6514 - 6274
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||     
T  6514 agatgattaagatgatgttgaac-tccaaattattggatatatat--gagatgatgattaagatgttttaagggattgagtccatgcattaccatacatt 6418  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatac--- 206  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||       
T  6417 tgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagctttagctcaaaataa-tgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatacaaa 6319  T
Q  207 tataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  6318 aataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 6274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 47 - 251
Target Start/End: Original strand, 7264 - 7468
Alignment:
Q  47 atatgtatacgagattatgattaagatgtttta-gatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcacc 145  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  7264 atatatatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtaatcacc 7363  T
Q  146 atgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagat 245  Q
    | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||    
T  7364 acgatggagcatttgctcaaaataa-tgttgggggcttatgccctgaaagtttattaatactaaaatgttgggggctcatgccctgtattggttccacat 7462  T
Q  246 gcatat 251  Q
    ||||||    
T  7463 gcatat 7468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 1897 - 1655
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||     
T  1897 agatgattaagatgatgttgaacctccaaaatattggatatatat--gagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatt 1800  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact-- 207  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||  |    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||      
T  1799 tgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagctttagctcaaaaataacgatgggagctcatgccctgaaagtatattaatactaa 1700  T
Q  208 -ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  1699 aataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 1655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 18810 - 19055
Alignment:
Q  12 atgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatac------gagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcata 105  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||       ||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  18810 atgattaagatgatgttgaac-tccaaattattggatatatatatatatatgagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcata 18908  T
Q  106 catccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaata 205  Q
    |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18909 catttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaataa-cgatggggtcttatgccctgaaagtatattaata 19007  T
Q  206 ctata--atgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  19008 ctaaaatatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 19055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 176 - 251
Target Start/End: Original strand, 16740 - 16815
Alignment:
Q  176 gggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  16740 gggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaacagttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 16815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 74
Target Start/End: Original strand, 18758 - 18821
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatg 74  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  18758 agatgattaagatgatgttgaac-tccaaattattggatatatatatgagataatgattaagatg 18821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 21904 - 22146
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcat-acat 108  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  21904 agatgattaagatgatgttgaacctccaaattattggatatatat--gagatgatgattaagatgttttaagagattgagcccatgcattagcattacat 22001  T
Q  109 ccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact- 207  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  22002 ttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattaactcaaaataa-cgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatacta 22100  T
Q  208 --ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  22101 aaataatgttgggggctcatgccctgaattgataccacatgcatat 22146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 29796 - 30038
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcat-acat 108  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  29796 agatgattaagatgatgttgaacctccaaattattggatatatat--gagatgatgattaagatgttttaagagattgagcccatgcattagcattacat 29893  T
Q  109 ccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact- 207  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  29894 ttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattaactcaaaataa-cgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatacta 29992  T
Q  208 --ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  29993 aaataatgttgggggctcatgccctgaattgataccacatgcatat 30038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 17212 - 17449
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgtttta-gatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||     
T  17212 agatgattaagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgttataagatgatcgagtccatgcattagcatacaa 17308  T
Q  109 ccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatacta 208  Q
      ||||||| || ||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17309 ttgttgggg-ctaatgccctggagcttcatactcaccacgatggagcatttgctcaaaataatg-ttgggggcttatgccctgaaagtatattaatacta 17406  T
Q  209 taatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
     | |||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||    
T  17407 aattgttgggggctcatgccctgtattagtaccacatgcatat 17449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Original strand, 19392 - 19627
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgtt---ttagatgattgagtccatgcattagcata-catccgtt 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||  |||||  | |||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||    
T  19392 aagatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatt-gagatgtttattaagatgttgattaagatgattgagtccatgcattagcataacatatgtt 19489  T
Q  114 gggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatg 213  Q
    ||||||||||||| | |||| |||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  19490 gggggctcatgccctagagccttgtcctcaccacgatggagctttagctcaaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaactg 19589  T
Q  214 ttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  19590 ttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 19627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 280991 - 281237
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacg-----agattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcat 104  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||       | || ||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  280991 agatgattaagatgatgttgaac-tccaaattattggatatatatatatatatatatgatgattaagatgtttta-agaattgagtccatgcattagcat 281088  T
Q  105 acatccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaat 204  Q
    ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  281089 acatttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaataa-cgatgggggctcatgccctgaaagtatattaat 281187  T
Q  205 act---ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  281188 actaaaataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 281237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 15311 - 15550
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagat-gttttagat-gattgagtccatgcattagcataca 107  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||   |||  |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15311 agatgaataagatgttgttgagc-tccaaattattggatgcatatt-gagatgttgattaagattgttttagatcgattgagtccatgcattagcataca 15408  T
Q  108 tccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact 207  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15409 tatgttgggggctcatgccatggagcttagtcctcaccacgatggagaatttgctc-aaataattgttgggggcttatgccctaaaagtatattaatact 15507  T
Q  208 ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    | | ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  15508 aaattgttgggggctcatgccct-aattggtaccacatgcatat 15550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 19833 - 20072
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagat-gttttagat-gattgagtccatgcattagcataca 107  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||   |||  |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19833 agatgaataagatgttgttgagc-tccaaattattggatgcatatt-gagatgttgattaagattgttttagatcgattgagtccatgcattagcataca 19930  T
Q  108 tccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact 207  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19931 tatgttgggggctcatgccatggagcttagtcctcaccacgatggagaatttgctc-aaataattgttgggggcttatgccctaaaagtatattaatact 20029  T
Q  208 ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    | | ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  20030 aaattgttgggggctcatgccct-aattggtaccacatgcatat 20072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 34 - 251
Target Start/End: Original strand, 193099 - 193318
Alignment:
Q  34 tccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagc 133  Q
    ||||||||||||||    |||| ||||| |||||||||||| ||||   | | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  193099 tccaaattattggactaatataagagatgatgattaagatgctttaacagttagagtccatgcattagcatacatatgttgggggctcatgccctggagc 193198  T
Q  134 tttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact---ataatgttgggggctcatgccct 230  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||    |||||||| |||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  193199 tttgtactcaccacgatggagctttagctcaaattaa-cgatgggggctcatgccctggaagtatattaatactcaaataatgttgggggctcatgccct 193297  T
Q  231 gaattggcaccagatgcatat 251  Q
      ||||| |||| ||||||||    
T  193298 atattggtaccacatgcatat 193318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 38580 - 38820
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||| ||||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||     
T  38580 agatgattaagatgatgttgaacctccaaattattggattt--ataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacata 38677  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact-- 207  Q
     |||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||| ||||||| |||| |||| |    ||||||||||||||||  |||||||||||||||      
T  38678 tgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgattgagcattagctc-aaattagcaatgggggcttatgccctagaagtatattaatactca 38776  T
Q  208 ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  38777 ataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 38820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 119820 - 119700
Alignment:
Q  87 gagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggctt-a 184  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||| |||||  ||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||| |||| |    ||||||||| |    
T  119820 gagtccatgcattagcattcatt-gttgagggcttgatgccctggagctctgtactcaccacgttggagcattagctc-aaattagcgatgggggcttga 119723  T
Q  185 tgccctgaaagtatattaatact 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  119722 tgccctggaagtatattaatact 119700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 79 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 5543 - 5372
Alignment:
Q  79 agatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttggg 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  5543 agatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctgtagccttgtcctcaccacgatggagcatttgctc-aaataattgttggg 5445  T
Q  179 ggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||    
T  5444 ggcttatgccctgaaagtatattaatactaaactgttgggggctcatgccctatattggtaccacatgcatat 5372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 79 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 6738 - 6567
Alignment:
Q  79 agatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttggg 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  6738 agatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctgtagccttgtcctcaccacgatggagcatttgctc-aaataattgttggg 6640  T
Q  179 ggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||    
T  6639 ggcttatgccctgaaagtatattaatactaaactgttgggggctcatgccctatattggtaccacatgcatat 6567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 175 - 16
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgtttta-gatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  175 agatgattaagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgcattagcatacat 79  T
Q  109 ccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataat 171  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  78 ttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataat 16  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 7311 - 7071
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||     
T  7311 agatgattaagatgatgttgaacctccaaattattggatatatat--gagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatt 7214  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact-- 207  Q
     |||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||    |||||||| ||||||||||||||||||||||||      
T  7213 tgttttgggttcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagctttagctc-aaataa-cgatgggggctcatgccctgaaagtatattaatactaa 7116  T
Q  208 -ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||    
T  7115 aataatgttgggggctcataccctgaattggtgccacatgcatat 7071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 88 - 207
Target Start/End: Original strand, 15641 - 15761
Alignment:
Q  88 agtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggctt-at 185  Q
    ||||||||||||| ||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |    ||||||||| ||    
T  15641 agtccatgcattaacattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttgat 15739  T
Q  186 gccctgaaagtatattaatact 207  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  15740 gccctggaagtatattaatact 15761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 68894 - 68655
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagat-gttttagat-gattgagtccatgcattagcataca 107  Q
    ||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||   |||  |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  68894 agatgaataagatgtcgttgagc-tccaaattattggatgcatatt-gagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcattca 68797  T
Q  108 tccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact 207  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  68796 tatgttgggggctcatgccctggagcttagtcctcaccacgatggagcatttgctc-aaataaatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact 68698  T
Q  208 ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    | | |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  68697 aaactgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatat 68655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 108
Target Start/End: Original strand, 66519 - 66604
Alignment:
Q  21 atgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagatt--atgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||  |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  66519 atgatgatgaac-tccaaattattggat--gtataagagatttgatgattaagatgtttt-gttgatagagtccatgcattagcatacat 66604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12779 - 12551
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||| |||||||||||| ||  |||||||  |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||     
T  12779 agatgattaagatgatgttaaat-tccaaatcgttggatatatatatgagatgatgattaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatt 12681  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact-- 207  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| | |  |||||||||| || ||| ||||||| |||||||      
T  12680 tgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctc-aaattagtgatgggggcttacgctctggaagtatactaatactca 12582  T
Q  208 -ataatgttgggggctcatgccctgaattgg 237  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12581 aataatgttgggggctcatgccctgaattgg 12551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 248
Target Start/End: Original strand, 14187 - 14425
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||     
T  14187 agatgattaagatgatgttgaac-tccaaattattggatatatataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacata 14285  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact-- 207  Q
     |||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| |||| ||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  14286 tgttgggggcttatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctc-aaataa-cgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactca 14383  T
Q  208 -ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgca 248  Q
     |||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  14384 aataacgatgggggctcatgccctgtattggtaccatatgca 14425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 4905 - 5147
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||||| ||||||| ||     
T  4905 agatgattaagatgatgttgaacctccaaattattggatatatataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcaatagcatagata 5004  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact-- 207  Q
     |||||||||| ||||| |  ||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||| |    ||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  5005 tgttgggggcttatgccctaaagcttagtactcaacatgatggagcattagctc-aaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactca 5103  T
Q  208 ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||    
T  5104 ataatgatgggggctcataccctgtattggtaccacatgcatat 5147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 33564 - 33329
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgtt---ttagatgattgagtccatgcattagcata-catccgtt 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||  |||||  |  ||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||    
T  33564 aagatgatgttgaac-tccaaattattggatgtatatt-gagatgttttttaagatgttgattaagatgattgagtccatgcattagcataacatatgtt 33467  T
Q  114 gggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatg 213  Q
    | ||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||    
T  33466 gcgggctcatgccctggagccttgtcctcaccacgatggagctttagctcaaaataattgttgggggcttatgccctgaatgtatattaatactaaactg 33367  T
Q  214 ttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    | |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  33366 tcgggggctcatgccctgaattcgtaccacatgcatat 33329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 251
Target Start/End: Original strand, 7423 - 7610
Alignment:
Q  64 tgattaagat-gttttagat-gattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgc 161  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  7423 tgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcattaatatgttgggggctcatgccctgaagcttagtcctcaccacgatggagcatttgc 7522  T
Q  162 tcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||    
T  7523 tcaaa-taaatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaactgttgggggctcatgccct-aattggtaccacatgcatat 7610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 6111 - 5870
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||     
T  6111 agatgattaagatgatgttgaacctccaaattattggatac--ataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacata 6014  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact-- 207  Q
     |||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||||||| || |||| |||| |    |||| |||||||||||| |||||||||||||||      
T  6013 tgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagctttagctc-aaattagcgatgggagcttatgccctggaagtatattaatactca 5915  T
Q  208 -ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
     |||| |||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  5914 aataacgttgggggcttatgtcctgaattggtaccacatgcatat 5870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Original strand, 9072 - 9304
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggg 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||| ||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  9072 aagatgatgttgaacctccaaattattggataa--ataagagatgatgattatgatgtttaagaa-atcgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 9168  T
Q  118 gctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact---ataatgt 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||| |    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    ||| |     
T  9169 gctcatgccctggagctttgtactcaacacgatggagcattagctc-aaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaattaacga 9267  T
Q  215 tgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  9268 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 9304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 96; Significance: 3e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 69802 - 69570
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggg 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  69802 aagatgatgttgaacctccaaattattggataa--ataagagatgatgattatgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 69706  T
Q  118 gctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact---ataatgt 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| || |||| |||| |    ||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||  |     
T  69705 gctcatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctc-aaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaatagcga 69607  T
Q  215 tgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  69606 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 69570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Original strand, 10631 - 10859
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggg 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||   ||| ||||| ||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  10631 aagatgatgttgaacctccaaat-attggataa--ataagagatgatgattatgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattaggatacatttgttgggg 10726  T
Q  118 gctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact---ataatgt 214  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||| |     
T  10727 gctcatgccctagagctttgtactcaacacgatggagcattagctcaaattaa----tgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaataacga 10822  T
Q  215 tgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  10823 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 10859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Original strand, 15788 - 16019
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggg 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||| ||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||  |||| ||    
T  15788 aagatgatgttgaacctccaaattattggataa--ataagagatgatgattatgatgtttaaga-gatcaagtccatgcattagcatacatttgttgcgg 15884  T
Q  118 gctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact--ataatgtt 215  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||  ||| |||| |    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| | |    
T  15885 gctcatgccctggagctttgtactcaacacgatggagcattaactc-aaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaataacgat 15983  T
Q  216 gggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  15984 gggggcttatgccctgaattggtaccacatgcatat 16019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 64 - 251
Target Start/End: Original strand, 27275 - 27462
Alignment:
Q  64 tgattaagat-gttttagat-gattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgc 161  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  27275 tgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcattcatatgttgggggctcatgccctggagcttagtcctcaccacgatggagcatttgc 27374  T
Q  162 tcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||    
T  27375 tc-aaataaatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaacacttgggggctcataccctg-attggtaccacatgcatat 27462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 23695 - 23455
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||   ||| ||||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||     
T  23695 agatgattaagatgatgttgagcctccaaattattggatac--ataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacata 23598  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact-- 207  Q
     |||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||| ||| ||| |||||| || |   ||||||||||| ||||| |||||||||||||||      
T  23597 tgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgatgtagctttttctcaaatta-tcgatgggggcttattccctggaagtatattaatactca 23499  T
Q  208 ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  23498 ataacgatgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatat 23455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 39119 - 38879
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||   ||| ||||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||     
T  39119 agatgattaagatgatgttgagcctccaaattattggatac--ataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacata 39022  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact-- 207  Q
     |||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||| |||||| |||| |||| |     |||||||||| ||||| |||||||||||||||      
T  39021 tgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgatgcagcattagctc-aaattagcgaagggggcttataccctggaagtatattaatactca 38923  T
Q  208 ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  38922 ataacgatgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatat 38879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 14680 - 14439
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgtt-gaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||   ||| | ||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||    
T  14680 agatgattaagatgatgtttgaacctccaaattatttgatac--ataagggatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacat 14583  T
Q  109 ccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact- 207  Q
      |||||||||||||||| |||||||| ||||||| || |||| |||||| |||| |||| |     |||||||||| ||||| |||||||||||||||     
T  14582 atgttgggggctcatgccctggagcttagtactcaacacgatgtagcattagctc-aaattagcgaagggggcttattccctggaagtatattaatactc 14484  T
Q  208 -ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
     |||| | ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  14483 aataacgatgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatat 14439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 44097 - 43964
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  44097 agatgaataagatgatgttgaac-tctaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatt 44001  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcacca 146  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44000 tgttgggggctcatgccctggagctttgtactcacca 43964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 3750 - 3517
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggg 117  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||    
T  3750 aagatgattctgaacctccaaattactggatat--ataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagtatacatatgttaggg 3653  T
Q  118 gctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact---ataatgt 214  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||   |||| |     
T  3652 gctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaaataa-cgatgggggcttatgccctggaagtatatttatactcaaataacga 3554  T
Q  215 tgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  3553 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 3517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 8181 - 7948
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggg 117  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||| ||||||  ||| |||    
T  8181 aagatgattctgaacctccaaattactggatat--ataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagtatacatatgttaggg 8084  T
Q  118 gctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact---ataatgt 214  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||   |||| |     
T  8083 gctcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaaataa-cgatgggggcttatgccctggaagtatatttatactcaaataacga 7985  T
Q  215 tgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  7984 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 7948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 251
Target Start/End: Original strand, 16449 - 16690
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatc 109  Q
    ||||||| || |||||||||||  || |||||||||||||   ||| ||||| ||||||| || ||||||   ||| ||||||||||||||||||||||     
T  16449 agatgaacaatatgatgttgaatctctaaattattggatac--ataagagatgatgattatgacgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacata 16546  T
Q  110 cgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact-- 207  Q
     |||||||| ||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  16547 tgttgggggatcatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaaataa-cgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactca 16645  T
Q  208 -ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
     |||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  16646 aataacgatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 16690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 251
Target Start/End: Original strand, 7916 - 8157
Alignment:
Q  8 tgagatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcataca 107  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  7916 tgagatgatcaagatgatgttgaacttccaaattattggataa--ataagagatgatgattatgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattaacataca 8012  T
Q  108 tccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact 207  Q
    |  |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||| | |  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8013 tttgttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgatggagcattagctc-aaattagtgatgggggcttatgccctggaagtatattaatact 8111  T
Q  208 ---ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
       |||  | |||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||    
T  8112 caaatagcgatgggggctcatgccct-aaatggtaccacatgcatat 8157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Original strand, 18563 - 18796
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggg 117  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||| | |||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18563 aagaagatgttgaacctccaaattattggatac--ataagagatgaagattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggg 18660  T
Q  118 gctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact---ataatgt 214  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| |||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||| |     
T  18661 gctcatgccctagagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaattaa-cgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaataacga 18759  T
Q  215 tgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||    
T  18760 tgggggctcatgccctgaaatggtaacacatgcatat 18796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 18 - 250
Target Start/End: Original strand, 65907 - 66137
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggg 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  65907 aagatgatgttgaacctccaaattattggataa--ataagagatgatgattatgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 66003  T
Q  118 gctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact---ataatgt 214  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||   |    ||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||| ||     
T  66004 gctcatgccctggagctttgaactcaacacgatggagctttagctcaaa--tagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaatagtga 66101  T
Q  215 tgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcata 250  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  66102 tgggggctcatgccctgaaatggtaccacatgcata 66137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 53567 - 53482
Alignment:
Q  21 atgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagatt--atgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||  |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  53567 atgatgatgaac-tccaaattattggat--gtataagagatttgatgattaagatgtttt-gttgatagagtccatgcattagcatacat 53482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 146
Target Start/End: Original strand, 30843 - 30977
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgtttta-gatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30843 agatgaataagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgattgagtccatgcattagcatacat 30939  T
Q  109 ccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcacca 146  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  30940 ttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 30977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 35022 - 35259
Alignment:
Q  12 atgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccg 111  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||  |    
T  35022 atgattaagatgatgttgaac-tccaaattattggatac--ataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatg 35118  T
Q  112 ttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact---a 208  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||| |||| ||||||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||   |    
T  35119 ttgggggcttatgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctc-aaataa-cgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaa 35216  T
Q  209 taatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||   |||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||    
T  35217 taacaatgggggctcatgccttgtattggtaccacatgcatat 35259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 19988 - 19757
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggg 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  19988 aagatgatgttgaacctccaaattattggataa--ataagagataatgattatgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 19892  T
Q  118 gctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact---ataatgt 214  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||| || ||||  ||| |    |||||||| |||||||| |||||||||||||||   |||  |     
T  19891 gctcatgccctggagttttgtactcaacacgatggagctttagctc--aattagcgatgggggctcatgccctggaagtatattaatactcaaatagcga 19794  T
Q  215 tgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  19793 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 19757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 36462 - 36231
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggg 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||  ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  36462 aagatgatgttgaacctccaaattattggataa--ataagagatgatgattgtgatgtttaagagg-ttgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 36366  T
Q  118 gctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact---ataatgt 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||   |    |||||||| |||||||| |||||||||||||||   |||  |     
T  36365 gctcatgccctggagctttgtactcaacatgatggagctttagctcaaa--tagcgatgggggctcatgccctggaagtatattaatactcaaatagcga 36268  T
Q  215 tgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||    
T  36267 tgggggctcatgccctgaattagtaccacatgcatat 36231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 10503 - 10270
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggg 117  Q
    |||| |||||||||| |||||||| |||||||  ||   ||||| | |||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  10503 aagacgatgttgaacctccaaattcttggatacctaa--gagatgacgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatatgttgggt 10406  T
Q  118 gctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact---ataatgt 214  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||| |||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||| |     
T  10405 gctcatgcccttgagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaattaa-cgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaataacga 10307  T
Q  215 tgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  10306 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 10270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 32454 - 32222
Alignment:
Q  16 ataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgg 115  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||   ||| ||||| |||||||||||||||||   ||| |||||||||||||| |||||||  |||||    
T  32454 ataagatgatgtcgaacctccaaattattggatac--ataagagatgatgattaagatgttttaagagatcgagtccatgcattatcatacatatgttgg 32357  T
Q  116 gggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact---ataat 212  Q
    ||||||||||| || ||||   || ||| || ||||||||||| ||||||| |||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||     
T  32356 gggctcatgccctgaagct---tagtcaacacgatggagcattagctcaaattaa-cgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaaataac 32261  T
Q  213 gttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  32260 gatgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 32222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 122 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 8445 - 8351
Alignment:
Q  122 atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgttg 216  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8445 atgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataattgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgttg 8351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 88 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 3458 - 3294
Alignment:
Q  88 agtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgc 187  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||    | ||||||||||||    
T  3458 agtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctgaagctttgtactcaccacgatggagctttagctcaaattagcgat-gggggcttatgc 3360  T
Q  188 cctgaaagtatattaatact--ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  3359 cctggaagtatattaatactcaataacgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 3294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 88 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 7522 - 7357
Alignment:
Q  88 agtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgc 187  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| || |||| |||| |    |||||||||||||    
T  7522 agtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctgaagctttgtactcaccacgatggagctttagctc-aaattagcgatgggggcttatgc 7424  T
Q  188 cctgaaagtatattaatact--ataa-tgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||   |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  7423 cctggaagtatattaatactcaataacctttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 7357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 18244 - 18012
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggg 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||| ||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18244 aagatgatgttgaacctccaaattattggataa--ataagagatgatgattatgatgtttaagaag-tcgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 18148  T
Q  118 gctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact---ataatgt 214  Q
    |||||| || |||||||| ||||| | || |||||||| || |||| |||| |    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    || ||     
T  18147 gctcataccctggagcttagtactgaacacgatggagctttagctc-aaattagcgatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaattattga 18049  T
Q  215 tgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  18048 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 18012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 115 - 251
Target Start/End: Original strand, 195119 - 195253
Alignment:
Q  115 ggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactataatgt 214  Q
    |||||||||||| ||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  195119 ggggctcatgccctggagcttaatcctcaccacgatggagcatttgctcaaa-taaatgttgggggcttatgccctgaaagtatattaatactaaactgt 195217  T
Q  215 tgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  195218 tgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcatat 195253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 146
Target Start/End: Original strand, 414152 - 414284
Alignment:
Q  11 gatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatcc 110  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |      
T  414152 gatgattaagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaaaatgttttagatgatagagtccatgcattagcatactttt 414248  T
Q  111 gttgggggctcatgccttggagctttgtactcacca 146  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  414249 gttgggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 414284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 251
Target Start/End: Original strand, 414318 - 414376
Alignment:
Q  192 aaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  414318 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctg-attggcaccacatgcatat 414376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 305 - 171
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgtttta-gatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  305 agatgattaagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgttttaagatgaaagagtccatgcattagcatacat 209  T
Q  109 ccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcacca 146  Q
      |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  208 ttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 114 - 55
Alignment:
Q  192 aaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  114 aaagtatattaatactaaattgttaggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatat 55  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 1347 - 1116
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggg 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||  ||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1347 aagatgatgttgaacctccaaattattggataa--ataagagatgatgattttgatttttaagat-atcgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 1251  T
Q  118 gctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact---ataatgt 214  Q
    |||||||   |||||||||||||||| || |||||||| || |||| |||| |    ||||||| ||||||||  |||||||||||||||   |||| |     
T  1250 gctcatgttctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctc-aaattagcgatgggggcatatgccctagaagtatattaatactcaaataacga 1152  T
Q  215 tgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcata 250  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  1151 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcata 1116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 23851 - 23621
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggg 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  23851 aagatgatgttgaacctccaaattattggataa--ataagagatgatgattgtgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 23755  T
Q  118 gctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact---ataatgt 214  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||| || ||||||    | |  ||||||||||||||||| | |||||||||||||   |||  |     
T  23754 gctcatgccatggagctttgtactcaacacgatagagctttagctcaa---tagtgatgggggcttatgccctggaggtatattaatactcaaatagcga 23658  T
Q  215 tgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  23657 tgggagctcatgccccgaattggtaccacatgcatat 23621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 7486 - 7355
Alignment:
Q  11 gatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatcc 110  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |      
T  7486 gatgattaagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgttttagatgatagagtccatgcattagcatac-ttt 7391  T
Q  111 gttgggggctcatgccttggagctttgtactcacca 146  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  7390 gttgggggctcatgccctagagctttgtcctcacca 7355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 7321 - 7263
Alignment:
Q  192 aaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  7321 aaagtatattaatactatgatgttgagggctcatgccctg-attggtaccacatgcatat 7263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 178906 - 178676
Alignment:
Q  18 aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggg 117  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  178906 aagatgatgttgaacctccaaattattggataa--ataagagatgatgattgtgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggg 178810  T
Q  118 gctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact---ataatgt 214  Q
    |||||| || |||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||    |    |||||||||||||||||   ||||||||| |||    ||  |     
T  178809 gctcataccctggagctttgtacttaacatgatggagctttagctcaa---tagcgatgggggcttatgccctggcggtatattaacactcaattagcga 178713  T
Q  215 tgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  178712 tgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 178676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0289
Description:

Target: scaffold0289; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 2532 - 2450
Alignment:
Q  64 tgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcacca 146  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  2532 tgattaagatgttttagacgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 2450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 146
Target Start/End: Original strand, 422633 - 422767
Alignment:
Q  11 gatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatg-ttttagat-gattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| | ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  422633 gatgattaagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtaaatgagatgatgattaagatggttttagattgattgagtccatgcattagcatactt 422729  T
Q  109 ccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcacca 146  Q
      |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  422730 ttgttgggggcttatgccctggagctttgtcctcacca 422767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 251
Target Start/End: Original strand, 422802 - 422860
Alignment:
Q  192 aaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  422802 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctg-attggtaccagatgcatat 422860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 173311 - 173218
Alignment:
Q  13 tgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagatta--tgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| | ||| |  ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  173311 tgaataagttgatgatgaac-tccaaattattggat--gtataagtgataagttgattaagatgtttt-gttgatagagtccatgcattagcatacat 173218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 34 - 146
Target Start/End: Original strand, 7942 - 8051
Alignment:
Q  34 tccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagc 133  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  7942 tccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgttt-agatgatagagtccctacattagcatacattcgttgggggctcatgccctggagc 8038  T
Q  134 tttgtactcacca 146  Q
    ||||| |||||||    
T  8039 tttgtcctcacca 8051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 184 - 251
Target Start/End: Original strand, 8077 - 8144
Alignment:
Q  184 atgccctgaaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  8077 atgccctaaaagtatattaatactatgatgttgggggctaatgccctgaattggtaccacatgcatat 8144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 4)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 146
Target Start/End: Original strand, 2538 - 2673
Alignment:
Q  11 gatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagat-gttttagat-gattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||   |||  |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  2538 gatgaataagatgttgttgagc-tccaaattattggatgcatatt-gagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatactt 2635  T
Q  109 ccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcacca 146  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2636 ttgttgggggctcatgccttggagctttgtcctcacca 2673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 146
Target Start/End: Original strand, 10398 - 10533
Alignment:
Q  11 gatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagat-gttttagat-gattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||   |||  |||||  |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  10398 gatgaataagatgttgttgagc-tccaaattattggatgcatatt-gagatgttgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatactt 10495  T
Q  109 ccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcacca 146  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10496 ttgttgggggctcatgccttggagctttgtcctcacca 10533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 250
Target Start/End: Original strand, 2706 - 2763
Alignment:
Q  192 aaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcata 250  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  2706 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata 2763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 250
Target Start/End: Original strand, 10566 - 10623
Alignment:
Q  192 aaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcata 250  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  10566 aaagtatattaatactatgatgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata 10623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 127 - 251
Target Start/End: Original strand, 48661 - 48787
Alignment:
Q  127 ttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact---ataatgttgggggctc 223  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||    |||||||| |||||||| |||||||||||||||   |||| |||||||||||    
T  48661 ttggagctttgtactcaccacaatggagctttagctcaaaataa-agatgggggctcatgccctggaagtatattaatactcaaataacgttgggggctc 48759  T
Q  224 atgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  48760 atgccctgaattggtaccacatgcatat 48787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 108
Target Start/End: Original strand, 48561 - 48657
Alignment:
Q  10 agatgaat-aagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    |||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||  ||| ||| ||||| ||| ||| ||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  48561 agatgaatcaagatgatgttgaatctccaaattattgg--atgaataagagatgatgtttacgatgtttaagaag-tcgagtccatgcattagcatacat 48657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1276 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1276
Description:

Target: scaffold1276; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 112 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 2193 - 2053
Alignment:
Q  112 ttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact--at 209  Q
    ||||||||| || || ||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||    
T  2193 ttgggggcttataccctggagcttactactcaccacgatggagcattagctcaaattaa-agatgggggcttatgccctggaagtatattaatactcaat 2095  T
Q  210 aatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    || ||||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||||    
T  2094 aaagttgggggctcatgccctgtatttgtaccacatgcatat 2053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 662 - 542
Alignment:
Q  34 tccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagc 133  Q
    ||||||||||||||    |||| ||||| ||||||| ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||    
T  662 tccaaattattggactaatataagagatgatgattatgatgtttaaga-gatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctcaggccctggagc 564  T
Q  134 tttgtactcaccatgatggagc 155  Q
    |||||||||||||  |||||||    
T  563 tttgtactcaccacaatggagc 542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 128 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 547 - 422
Alignment:
Q  128 tggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaaagtatattaatact--ataa-tgttgggggctca 224  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||    | || ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||   |||||||||||    
T  547 tggagctttgtactcaccacgatggagctttagctcaaattagcgat-ggaggcttatgccctggaagtatattaatactcaataacctttgggggctca 449  T
Q  225 tgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  448 tgccctgaattggtaccacatgcatat 422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 207
Target Start/End: Original strand, 10600 - 10721
Alignment:
Q  87 gagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggctt-a 184  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |    ||||||||| |    
T  10600 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttga 10698  T
Q  185 tgccctgaaagtatattaatact 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  10699 tgccctggaagtatattaatact 10721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 87 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 13441 - 13320
Alignment:
Q  87 gagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggctt-a 184  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |    ||||||||| |    
T  13441 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttga 13343  T
Q  185 tgccctgaaagtatattaatact 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  13342 tgccctggaagtatattaatact 13320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 64 - 146
Target Start/End: Original strand, 205215 - 205297
Alignment:
Q  64 tgattaagat-gttttagat-gattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcacca 146  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  205215 tgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatactt--gttgggggctcatgccctggagctttgtcctcacca 205297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 194 - 250
Target Start/End: Original strand, 205333 - 205389
Alignment:
Q  194 agtatattaatactataat-gttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcata 250  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  205333 agtatattaatactatgattgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata 205389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 64 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 2133 - 2048
Alignment:
Q  64 tgattaagat-gttttagat-gattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatga 149  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2133 tgattaagattgttttagattgatttagtccatgcattagcatactt--gttgggggctcatgccctggagctttgtcctcaccatga 2048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 2015 - 1960
Alignment:
Q  194 agtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcata 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||    
T  2015 agtatattaatactataatgttgggggctaatgccttg-attggtaccacatgcata 1960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 151
Target Start/End: Original strand, 4378 - 4465
Alignment:
Q  64 tgattaagat-gttttagat-gattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcaccatgatg 151  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| || |||||||| ||||||| ||||    
T  4378 tgattaagattgttttagattgattgagtccatgcattagcatactt--gttgggggctcatgccctgaagctttgtcctcaccacgatg 4465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 194 - 250
Target Start/End: Original strand, 4473 - 4529
Alignment:
Q  194 agtatattaatactataat-gttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcata 250  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  4473 agtatattaatactatgattgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata 4529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 1234 - 1153
Alignment:
Q  87 gagtccatgcattagcatacatccgttgggggct-catgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaat 168  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  1234 gagtccatgcattagcattcata-gttgggggcttcatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaat 1153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 174711 - 174590
Alignment:
Q  87 gagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggctt-a 184  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||| |    ||||||||| |    
T  174711 gagtccatgcattagcattcata-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacattggagaatttgctcaaaattagcgatgggggcttga 174613  T
Q  185 tgccctgaaagtatattaatact 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  174612 tgccctggaagtatattaatact 174590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 128 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1981 - 1917
Alignment:
Q  128 tggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggcttatgccctgaa 193  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  1981 tggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaataa-tgttgggggctcatgccctgaa 1917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 1942 - 1899
Alignment:
Q  208 ataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  1942 ataatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgcatat 1899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1873 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold1873
Description:

Target: scaffold1873; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 192 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 1100 - 1041
Alignment:
Q  192 aaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  1100 aaagtatattaatactatgatgatgggggctcatgccctgtattggtaccacatgcatat 1041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1873; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 1258 - 1173
Alignment:
Q  21 atgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagatt--atgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||  |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  1258 atgatgatgaac-tccaaattattggat--gtataagagatttgatgattaagatgtttt-gttgatagagtccatgcattagcatacat 1173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 192 - 251
Target Start/End: Original strand, 6375 - 6434
Alignment:
Q  192 aaagtatattaatactataatgttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcatat 251  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  6375 aaagtatattaatactatgatgttgagggctcatgccctgtattggtaccacatgcatat 6434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 79
Target Start/End: Original strand, 6409 - 6475
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgtttta 79  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6409 agatgattaagatgatgttgaac-tccaaattattggat--gtatatgagatgatgattaagatgtttta 6475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 207
Target Start/End: Original strand, 5304 - 5425
Alignment:
Q  87 gagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggctt-a 184  Q
    |||||||||||||| ||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |    ||||||||| |    
T  5304 gagtccatgcattaacattcata-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttga 5402  T
Q  185 tgccctgaaagtatattaatact 207  Q
    | ||||| |||||||||||||||    
T  5403 taccctggaagtatattaatact 5425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 168
Target Start/End: Original strand, 1225 - 1306
Alignment:
Q  87 gagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaat 168  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  1225 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaat 1306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 207
Target Start/End: Original strand, 11620 - 11740
Alignment:
Q  87 gagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggctt-a 184  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| |    ||||||||| |    
T  11620 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctc-aaattagcgatgggggcttga 11717  T
Q  185 tgccctgaaagtatattaatact 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  11718 tgccctggaagtatattaatact 11740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 10 - 108
Target Start/End: Original strand, 10143 - 10239
Alignment:
Q  10 agatgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagatt--atgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcataca 107  Q
    |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||  |||||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||||||    
T  10143 agatgattaagatgatgatgaac-tccaaattattggat--gtataagagatttgatgattaagatgtttt-gttgatagaatccatgcattagcataca 10238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 207
Target Start/End: Original strand, 2576 - 2697
Alignment:
Q  87 gagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggctt-a 184  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||| | ||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||| |    ||||||||| |    
T  2576 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctagagctttgtactcacaacgttggagcattagctcaaaattaacgatgggggcttga 2674  T
Q  185 tgccctgaaagtatattaatact 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  2675 tgccctggaagtatattaatact 2697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 87 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 32012 - 31892
Alignment:
Q  87 gagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggctt-a 184  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| |    ||||||||| |    
T  32012 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctc-aaattagcgatgggggcttga 31915  T
Q  185 tgccctgaaagtatattaatact 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  31914 tgccctggaagtatattaatact 31892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 8525 - 8443
Alignment:
Q  64 tgattaagat-gttttagatg-attgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctcatgccttggagctttgtactcacca 146  Q
    |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  8525 tgattaagattgttttagattcattgagtccatgcattagcatactt--gttgggggctcatgccctggagctttttcctcacca 8443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 194 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 8407 - 8351
Alignment:
Q  194 agtatattaatactataat-gttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcata 250  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  8407 agtatattaatactatgattgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata 8351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 1897 - 1817
Alignment:
Q  87 gagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaa 167  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  1897 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaa 1817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 4677 - 4537
Alignment:
Q  66 attaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctca 164  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||| |||  ||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||     
T  4677 attaagatgtttaagagg-tcgagtccatgcattagcattcatt-gttaggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctc- 4581  T
Q  165 aaataattcttgggggctt-atgccctgaaagtatattaatact 207  Q
    |||| |    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4580 aaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 4537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 51492 - 51405
Alignment:
Q  122 atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctc-aaaataattcttgggggctt-atgccctgaaagtatattaatact 207  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  51492 atgccctggagctttgtactcaccacgttggagcatttgctcaaaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 51405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 87 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 46940 - 46819
Alignment:
Q  87 gagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggctt-a 184  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||| | ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||| |    ||||||||| |    
T  46940 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctagagctttgtactccccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttga 46842  T
Q  185 tgccctgaaagtatattaatact 207  Q
    ||||||  |||||||||||||||    
T  46841 tgccctagaagtatattaatact 46819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 166
Target Start/End: Original strand, 1204 - 1303
Alignment:
Q  66 attaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctca 164  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| || |||||    
T  1204 attaagatgtttaagagg-tcgagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctca 1301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 128 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 16186 - 16105
Alignment:
Q  128 tggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctc-aaaataattcttgggggctt-atgccctgaaagtatattaatact 207  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  16186 tggagctttgtactcaccacgttggagcatttgctcaaaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 16105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 166
Target Start/End: Original strand, 168134 - 168233
Alignment:
Q  66 attaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctca 164  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | |||||| || |||||    
T  168134 attaagatgtttaagagg-tcgagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctca 168231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 1941 - 1862
Alignment:
Q  87 gagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaa 166  Q
    ||||| |||||||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  1941 gagtctatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaa 1862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 87 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 4496 - 4417
Alignment:
Q  87 gagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaa 166  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||    
T  4496 gagtccatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcacctcgttggagcattagctcaaa 4417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 108
Target Start/End: Original strand, 18719 - 18812
Alignment:
Q  13 tgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagatt--atgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| | ||||  ||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  18719 tgaataagttgatgatgaac-tccaaattattggat--gtataagtgatttgatgattaaggtgtttt-gttgatagagtccatgcattagcatacat 18812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 108
Target Start/End: Original strand, 20103 - 20196
Alignment:
Q  13 tgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagatta--tgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| | ||| |  ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  20103 tgaataagttgatgatgaac-tccaaattattggat--gtataagtgataagttgattaagatgtttt-gttgatagagtccatgcattagcatacat 20196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 12923 - 12830
Alignment:
Q  13 tgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagatta--tgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| | ||||   ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  12923 tgaataagttgatgatgaac-tccaaattattggat--gtataagtgatttgttgattaagatgtttt-gttgatagagtccatgcattagcatacat 12830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 19207 - 19114
Alignment:
Q  13 tgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagatta--tgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| | ||||   ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  19207 tgaataagttgatgatgaac-tccaaattattggat--gtataagtgatttgttgattaagatgtttt-gttgatagagtccatgcattagcatacat 19114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 108
Target Start/End: Original strand, 2759 - 2852
Alignment:
Q  13 tgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagatt--atgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| | ||||  |||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||    
T  2759 tgaataagttgatgatgaac-tccaaattattggat--gtataagtgatttgatgattaagatgtttt-gttgatagagtacatgcattagcatacat 2852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 108
Target Start/End: Original strand, 228459 - 228552
Alignment:
Q  13 tgaataagatgatgttgaacatccaaattattggatatgtatacgagatt--atgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| | ||||  ||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  228459 tgaataagttgatgatgaac-tccaaattattggat--gtataagtgatttgatgattaaggtgtttt-gttgatagagtccatgcattagcatacat 228552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 34068 - 33947
Alignment:
Q  87 gagtccatgcattagcatacatccgttgggggctc-atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggctt-a 184  Q
    ||||| |||||||||||| |||  ||||||||||  ||||| || | |||||||||||||| | |||||| || ||||||||| |    ||||||||| |    
T  34068 gagtctatgcattagcattcatt-gttgggggcttgatgccctgcaactttgtactcaccacgttggagctttagctcaaaattagcgatgggggcttga 33970  T
Q  185 tgccctgaaagtatattaatact 207  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  33969 tgccctggaagtatattaatact 33947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 32070 - 31984
Alignment:
Q  122 atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggctt-atgccctgaaagtatattaatact 207  Q
    ||||| |||||||||||||||||||   ||| ||||| ||||||||| |    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  32070 atgccctggagctttgtactcaccacattggggcattagctcaaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 31984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20819 - 20734
Alignment:
Q  122 atgccttggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataattcttgggggctt-atgccctgaaagtatattaatact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||| |||| |    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  20819 atgccttggagctttgtactcaccacgttggagctttagctc-aaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 20734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 29087 - 29014
Alignment:
Q  34 tccaaattattggatatgtatacgagattatgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    ||||||||||||||| | ||   || || |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  29087 tccaaattattggatgtataagtgatatgatgattaagatgtttt-gttgatagagtccatgcattagcatacat 29014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 194 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 4743 - 4687
Alignment:
Q  194 agtatattaatactataat-gttgggggctcatgccctgaattggcaccagatgcata 250  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  4743 agtatattaatactatgattgttgggggctcatgccctg-attggtaccacatgcata 4687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 64 - 108
Target Start/End: Original strand, 25106 - 25149
Alignment:
Q  64 tgattaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacat 108  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  25106 tgattaagatgtttt-gttgatagagtccatgcattagcatacat 25149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 5488 times since January 2019
Visitors: 4854