View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0765_low_18 (Length: 299)

Name: NF0765_low_18
Description: NF0765
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0765_low_18
NF0765_low_18
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (11-294)||(15962-16245)
[»] chr1 (75 HSPs)
chr1 (11-167)||(9307618-9307774)
chr1 (11-159)||(12039081-12039229)
chr1 (11-167)||(24991624-24991780)
chr1 (54-159)||(39864110-39864215)
chr1 (54-159)||(40144861-40144966)
chr1 (54-159)||(15699121-15699226)
chr1 (54-167)||(8896346-8896459)
chr1 (54-159)||(49224000-49224105)
chr1 (56-159)||(7759214-7759317)
chr1 (54-167)||(2572460-2572572)
chr1 (13-159)||(28748990-28749136)
chr1 (11-165)||(31042790-31042944)
chr1 (54-167)||(44707774-44707887)
chr1 (56-159)||(14757610-14757713)
chr1 (24-159)||(26093393-26093528)
chr1 (56-180)||(10495819-10495940)
chr1 (18-159)||(917023-917164)
chr1 (54-165)||(42409987-42410098)
chr1 (54-156)||(6160473-6160575)
chr1 (54-167)||(24880864-24880980)
chr1 (56-157)||(45331339-45331443)
chr1 (57-154)||(6023666-6023763)
chr1 (54-167)||(16395061-16395173)
chr1 (54-159)||(20209854-20209959)
chr1 (54-159)||(36701920-36702025)
chr1 (54-159)||(36718024-36718129)
chr1 (54-159)||(37276460-37276565)
chr1 (55-159)||(31978667-31978771)
chr1 (57-159)||(11449884-11449984)
chr1 (11-159)||(23168964-23169112)
chr1 (54-157)||(29074885-29074988)
chr1 (60-159)||(33733282-33733381)
chr1 (70-160)||(22856267-22856357)
chr1 (54-159)||(37506123-37506231)
chr1 (54-159)||(13579635-13579740)
chr1 (54-159)||(34031541-34031646)
chr1 (18-167)||(30754919-30755068)
chr1 (91-159)||(35367801-35367869)
chr1 (56-167)||(4441619-4441730)
chr1 (54-159)||(38787340-38787445)
chr1 (54-159)||(52429343-52429448)
chr1 (56-155)||(12151179-12151278)
chr1 (74-156)||(32219695-32219777)
chr1 (62-159)||(32826013-32826113)
chr1 (54-156)||(32970581-32970683)
chr1 (54-159)||(44761545-44761650)
chr1 (59-159)||(7351635-7351735)
chr1 (54-126)||(22181368-22181440)
chr1 (54-126)||(17988572-17988646)
chr1 (54-167)||(9379222-9379336)
chr1 (54-159)||(21910020-21910124)
chr1 (92-159)||(25089137-25089205)
chr1 (91-159)||(37539126-37539194)
chr1 (54-134)||(41121839-41121919)
chr1 (108-167)||(2137437-2137496)
chr1 (54-161)||(41080597-41080702)
chr1 (69-159)||(29778425-29778515)
chr1 (110-159)||(6785255-6785304)
chr1 (74-159)||(9412837-9412922)
chr1 (74-167)||(52837271-52837364)
chr1 (107-159)||(3260590-3260642)
chr1 (63-167)||(27896946-27897050)
chr1 (56-124)||(35538677-35538745)
chr1 (54-101)||(27687298-27687345)
chr1 (111-156)||(26256159-26256204)
chr1 (56-138)||(44426751-44426836)
chr1 (125-159)||(35682879-35682913)
chr1 (118-167)||(4659767-4659816)
chr1 (54-147)||(26257954-26258047)
chr1 (54-159)||(31154127-31154232)
chr1 (54-123)||(34688861-34688930)
chr1 (54-123)||(34693389-34693458)
chr1 (66-102)||(39395018-39395054)
chr1 (108-160)||(39887833-39887885)
chr1 (54-102)||(43614453-43614501)
[»] chr4 (76 HSPs)
chr4 (11-167)||(32884792-32884948)
chr4 (11-159)||(47464339-47464487)
chr4 (18-167)||(38405083-38405232)
chr4 (56-159)||(17237315-17237418)
chr4 (11-159)||(34360654-34360802)
chr4 (11-167)||(35311197-35311353)
chr4 (11-159)||(40122828-40122976)
chr4 (54-160)||(11907616-11907722)
chr4 (11-158)||(53346759-53346906)
chr4 (54-159)||(49428359-49428464)
chr4 (56-159)||(47773038-47773141)
chr4 (54-167)||(5841444-5841558)
chr4 (54-167)||(2653411-2653524)
chr4 (54-159)||(6643677-6643782)
chr4 (54-159)||(33790748-33790853)
chr4 (11-167)||(2942619-2942774)
chr4 (11-159)||(7061638-7061786)
chr4 (54-161)||(17114437-17114544)
chr4 (11-159)||(43237242-43237390)
chr4 (11-167)||(22130034-22130194)
chr4 (54-159)||(35380350-35380455)
chr4 (54-159)||(36985785-36985890)
chr4 (54-159)||(52247445-52247550)
chr4 (54-154)||(52859816-52859916)
chr4 (54-165)||(11288647-11288757)
chr4 (11-159)||(16821305-16821453)
chr4 (54-124)||(46396900-46396970)
chr4 (54-159)||(21240721-21240826)
chr4 (54-159)||(42616920-42617025)
chr4 (18-159)||(54506787-54506928)
chr4 (11-123)||(4972595-4972707)
chr4 (54-167)||(2066780-2066893)
chr4 (54-159)||(6609760-6609865)
chr4 (56-165)||(25233174-25233283)
chr4 (54-159)||(49175951-49176056)
chr4 (59-159)||(50264102-50264202)
chr4 (57-159)||(26147635-26147738)
chr4 (56-159)||(38502501-38502604)
chr4 (56-159)||(49746960-49747063)
chr4 (57-159)||(18741494-18741596)
chr4 (54-152)||(44536213-44536311)
chr4 (55-160)||(53412106-53412211)
chr4 (54-159)||(28500908-28501005)
chr4 (54-165)||(32469965-32470075)
chr4 (64-167)||(35998803-35998905)
chr4 (54-160)||(30682213-30682319)
chr4 (54-159)||(42517655-42517763)
chr4 (54-159)||(461957-462062)
chr4 (54-159)||(3689561-3689666)
chr4 (65-158)||(38663475-38663568)
chr4 (54-105)||(51625136-51625187)
chr4 (60-159)||(47358972-47359071)
chr4 (13-124)||(29575142-29575253)
chr4 (54-159)||(49579195-49579300)
chr4 (54-159)||(39397343-39397448)
chr4 (98-159)||(51624785-51624846)
chr4 (88-160)||(44526377-44526449)
chr4 (58-116)||(8175601-8175659)
chr4 (54-155)||(19265811-19265912)
chr4 (54-159)||(20612188-20612293)
chr4 (60-125)||(27880264-27880329)
chr4 (54-123)||(30192240-30192309)
chr4 (56-124)||(52869106-52869174)
chr4 (110-160)||(31370373-31370423)
chr4 (54-164)||(41711473-41711583)
chr4 (54-159)||(43902250-43902358)
chr4 (88-129)||(16506284-16506325)
chr4 (107-159)||(10672652-10672704)
chr4 (107-159)||(10886292-10886344)
chr4 (66-126)||(12567211-12567271)
chr4 (54-122)||(17512356-17512424)
chr4 (131-167)||(25142473-25142509)
chr4 (56-102)||(35251945-35251991)
chr4 (74-159)||(2400777-2400862)
chr4 (54-119)||(3098757-3098822)
chr4 (54-95)||(25869861-25869902)
[»] chr7 (63 HSPs)
chr7 (54-164)||(24516307-24516417)
chr7 (11-159)||(11373403-11373551)
chr7 (54-157)||(34947508-34947611)
chr7 (54-159)||(41506083-41506188)
chr7 (11-159)||(28103739-28103887)
chr7 (54-164)||(7463214-7463324)
chr7 (24-167)||(30865965-30866108)
chr7 (54-159)||(3178222-3178327)
chr7 (54-159)||(9785994-9786099)
chr7 (11-159)||(21350603-21350748)
chr7 (56-159)||(23670492-23670595)
chr7 (13-159)||(2459477-2459621)
chr7 (54-160)||(43873928-43874034)
chr7 (54-155)||(21760002-21760103)
chr7 (54-167)||(29835432-29835544)
chr7 (11-167)||(22738699-22738855)
chr7 (56-159)||(28202329-28202432)
chr7 (11-159)||(34100522-34100670)
chr7 (18-160)||(26974031-26974176)
chr7 (54-160)||(38391753-38391859)
chr7 (54-159)||(42935664-42935772)
chr7 (54-159)||(83391-83496)
chr7 (54-159)||(759109-759214)
chr7 (11-149)||(5524396-5524534)
chr7 (54-159)||(46478311-46478416)
chr7 (11-159)||(8592415-8592563)
chr7 (60-159)||(32346076-32346175)
chr7 (54-159)||(21390301-21390406)
chr7 (55-159)||(37245696-37245799)
chr7 (54-165)||(13961959-13962070)
chr7 (54-159)||(27920994-27921099)
chr7 (54-159)||(33819220-33819325)
chr7 (55-167)||(17828370-17828481)
chr7 (54-159)||(19271751-19271856)
chr7 (11-159)||(7457396-7457544)
chr7 (13-145)||(16560547-16560679)
chr7 (13-145)||(16604983-16605115)
chr7 (54-159)||(40076324-40076426)
chr7 (54-160)||(49101668-49101777)
chr7 (54-159)||(32018933-32019039)
chr7 (58-159)||(32018734-32018835)
chr7 (65-159)||(6494963-6495057)
chr7 (54-159)||(16904385-16904490)
chr7 (79-159)||(42796011-42796094)
chr7 (91-159)||(25571425-25571493)
chr7 (57-157)||(35333051-35333151)
chr7 (54-159)||(48608872-48608973)
chr7 (65-159)||(30546384-30546478)
chr7 (62-159)||(31930523-31930622)
chr7 (96-159)||(36790746-36790809)
chr7 (64-119)||(39452390-39452445)
chr7 (54-123)||(2850899-2850968)
chr7 (54-102)||(44180268-44180316)
chr7 (54-121)||(47045472-47045538)
chr7 (16-123)||(12631347-12631454)
chr7 (109-167)||(17610900-17610958)
chr7 (102-159)||(44424150-44424207)
chr7 (56-159)||(31665736-31665840)
chr7 (69-136)||(21937820-21937887)
chr7 (76-159)||(24166997-24167080)
chr7 (107-159)||(37850798-37850850)
chr7 (54-121)||(46211472-46211542)
chr7 (111-159)||(47045546-47045594)
[»] chr3 (64 HSPs)
chr3 (54-159)||(37695677-37695782)
chr3 (11-159)||(43253831-43253979)
chr3 (13-160)||(11632079-11632225)
chr3 (54-159)||(30190671-30190776)
chr3 (11-159)||(1778642-1778789)
chr3 (11-159)||(37311949-37312097)
chr3 (54-167)||(11905813-11905926)
chr3 (11-159)||(23004351-23004498)
chr3 (54-157)||(24569111-24569214)
chr3 (56-159)||(30711072-30711175)
chr3 (11-159)||(36460384-36460532)
chr3 (24-159)||(19823010-19823145)
chr3 (54-159)||(45710849-45710954)
chr3 (60-159)||(36476583-36476682)
chr3 (11-159)||(3313253-3313397)
chr3 (11-161)||(27471332-27471482)
chr3 (54-159)||(29023977-29024081)
chr3 (18-159)||(8679029-8679170)
chr3 (24-160)||(28690763-28690899)
chr3 (24-160)||(37497490-37497626)
chr3 (57-159)||(44301561-44301663)
chr3 (54-159)||(3901160-3901265)
chr3 (54-159)||(51837970-51838075)
chr3 (54-159)||(54726484-54726589)
chr3 (19-159)||(10366618-10366765)
chr3 (61-159)||(39043772-39043873)
chr3 (57-148)||(54477473-54477564)
chr3 (54-160)||(19611907-19612012)
chr3 (54-159)||(34750495-34750600)
chr3 (54-159)||(37772975-37773080)
chr3 (54-159)||(5322948-5323053)
chr3 (54-167)||(14194547-14194659)
chr3 (54-153)||(43719272-43719370)
chr3 (54-165)||(52290886-52290997)
chr3 (54-160)||(19609297-19609403)
chr3 (54-156)||(38795346-38795448)
chr3 (54-159)||(12736583-12736688)
chr3 (54-159)||(30682077-30682182)
chr3 (54-123)||(49830164-49830233)
chr3 (54-159)||(53560216-53560321)
chr3 (54-159)||(17652751-17652852)
chr3 (60-167)||(38137460-38137570)
chr3 (54-166)||(26467101-26467214)
chr3 (13-105)||(31158492-31158583)
chr3 (65-166)||(25108547-25108648)
chr3 (56-159)||(12904863-12904967)
chr3 (54-166)||(34957495-34957607)
chr3 (98-165)||(41038448-41038515)
chr3 (66-160)||(36462969-36463063)
chr3 (11-85)||(33491051-33491125)
chr3 (92-149)||(33491408-33491465)
chr3 (98-167)||(40194494-40194563)
chr3 (108-169)||(41351629-41351690)
chr3 (131-167)||(24703653-24703689)
chr3 (54-159)||(49447805-49447907)
chr3 (66-128)||(42278695-42278757)
chr3 (79-152)||(48541036-48541109)
chr3 (107-159)||(38705174-38705226)
chr3 (66-102)||(52206870-52206906)
chr3 (11-123)||(50035185-50035297)
chr3 (58-159)||(24245109-24245209)
chr3 (69-125)||(48893773-48893829)
chr3 (131-167)||(50036520-50036556)
chr3 (54-86)||(51064829-51064861)
[»] chr2 (57 HSPs)
chr2 (13-166)||(45235573-45235726)
chr2 (54-159)||(8947061-8947166)
chr2 (54-159)||(15359096-15359201)
chr2 (54-159)||(37322427-37322532)
chr2 (11-159)||(5789614-5789762)
chr2 (11-160)||(16377622-16377775)
chr2 (61-167)||(14523388-14523494)
chr2 (24-159)||(39691489-39691624)
chr2 (18-157)||(43410427-43410566)
chr2 (66-164)||(39329685-39329782)
chr2 (54-159)||(39785584-39785692)
chr2 (54-159)||(16463688-16463793)
chr2 (54-159)||(35313886-35313991)
chr2 (24-159)||(17695329-17695464)
chr2 (54-159)||(25637480-25637585)
chr2 (54-159)||(36794283-36794388)
chr2 (61-159)||(36354459-36354557)
chr2 (54-152)||(43115811-43115909)
chr2 (18-159)||(31448666-31448807)
chr2 (56-163)||(17346373-17346480)
chr2 (24-159)||(16805880-16806015)
chr2 (24-159)||(16845161-16845296)
chr2 (24-159)||(34225589-34225724)
chr2 (11-155)||(3323252-3323382)
chr2 (57-160)||(35242309-35242412)
chr2 (57-159)||(11742541-11742642)
chr2 (73-159)||(32831203-32831289)
chr2 (62-160)||(43730614-43730709)
chr2 (18-102)||(19937733-19937817)
chr2 (54-157)||(41220955-41221058)
chr2 (54-124)||(1206712-1206782)
chr2 (54-155)||(34120448-34120547)
chr2 (56-159)||(9458282-9458380)
chr2 (54-159)||(28170592-28170697)
chr2 (107-167)||(19937376-19937436)
chr2 (92-160)||(26863405-26863473)
chr2 (56-164)||(18853211-18853320)
chr2 (54-143)||(19426470-19426560)
chr2 (54-118)||(32783404-32783468)
chr2 (54-156)||(43699608-43699707)
chr2 (62-166)||(43730424-43730526)
chr2 (107-166)||(16807765-16807824)
chr2 (107-166)||(16847046-16847105)
chr2 (80-147)||(26608178-26608245)
chr2 (110-159)||(5272204-5272253)
chr2 (56-161)||(34451346-34451451)
chr2 (24-85)||(26607947-26608008)
chr2 (64-160)||(28186212-28186308)
chr2 (116-159)||(7494909-7494952)
chr2 (54-116)||(11367121-11367183)
chr2 (54-136)||(31976370-31976452)
chr2 (110-159)||(7438917-7438966)
chr2 (56-89)||(12520861-12520894)
chr2 (111-160)||(18202103-18202152)
chr2 (54-160)||(36173351-36173452)
chr2 (91-123)||(3601419-3601451)
chr2 (54-118)||(4411003-4411067)
[»] chr8 (60 HSPs)
chr8 (54-157)||(44761506-44761609)
chr8 (54-165)||(10098003-10098114)
chr8 (11-159)||(39482614-39482762)
chr8 (61-167)||(9300132-9300238)
chr8 (54-156)||(21216113-21216215)
chr8 (54-159)||(45425678-45425783)
chr8 (54-159)||(7172913-7173018)
chr8 (13-167)||(11976907-11977061)
chr8 (24-159)||(34948669-34948804)
chr8 (54-159)||(5053165-5053270)
chr8 (54-159)||(31271020-31271125)
chr8 (54-159)||(32476286-32476391)
chr8 (14-123)||(1875564-1875673)
chr8 (13-167)||(17719229-17719383)
chr8 (54-167)||(31082610-31082723)
chr8 (54-159)||(31231729-31231834)
chr8 (54-159)||(42886999-42887104)
chr8 (18-159)||(10179923-10180064)
chr8 (24-156)||(42972490-42972625)
chr8 (54-160)||(4428363-4428469)
chr8 (54-159)||(22771847-22771952)
chr8 (54-159)||(40996377-40996482)
chr8 (54-166)||(5356593-5356703)
chr8 (57-157)||(13335217-13335317)
chr8 (60-156)||(14854952-14855048)
chr8 (55-123)||(41092029-41092097)
chr8 (11-159)||(39405761-39405909)
chr8 (57-159)||(17823920-17824022)
chr8 (54-159)||(396623-396728)
chr8 (56-116)||(7703170-7703230)
chr8 (56-160)||(27294073-27294177)
chr8 (91-159)||(32678402-32678470)
chr8 (54-159)||(34393966-34394075)
chr8 (92-159)||(29226578-29226645)
chr8 (13-119)||(39300912-39301018)
chr8 (56-159)||(36006901-36007004)
chr8 (54-156)||(40028514-40028620)
chr8 (56-159)||(4924081-4924184)
chr8 (54-105)||(36967414-36967465)
chr8 (56-159)||(2767305-2767414)
chr8 (54-135)||(3117032-3117111)
chr8 (54-159)||(26626124-26626229)
chr8 (54-147)||(31331419-31331512)
chr8 (65-129)||(44648555-44648619)
chr8 (24-128)||(51143-51246)
chr8 (11-86)||(6611769-6611844)
chr8 (58-163)||(34455701-34455803)
chr8 (54-155)||(33765663-33765764)
chr8 (54-102)||(12559649-12559697)
chr8 (91-159)||(35732120-35732188)
chr8 (56-155)||(34057632-34057731)
chr8 (108-167)||(43719302-43719361)
chr8 (56-86)||(1739712-1739742)
chr8 (91-159)||(10953787-10953852)
chr8 (91-159)||(10961792-10961857)
chr8 (107-169)||(24199349-24199411)
chr8 (65-105)||(10946063-10946103)
chr8 (54-98)||(10953420-10953464)
chr8 (54-98)||(10961425-10961469)
chr8 (95-167)||(21649414-21649486)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (24-159)||(8724988-8725123)
chr5 (11-159)||(29570391-29570539)
chr5 (11-159)||(40530190-40530338)
chr5 (24-159)||(27542794-27542929)
chr5 (56-167)||(7827937-7828048)
chr5 (11-159)||(8698308-8698456)
chr5 (54-160)||(27580598-27580704)
chr5 (54-159)||(6754028-6754132)
chr5 (55-159)||(22848394-22848498)
chr5 (11-159)||(4818550-4818698)
chr5 (54-159)||(6315786-6315891)
chr5 (54-159)||(40899917-40900022)
chr5 (11-159)||(31655052-31655200)
chr5 (11-167)||(41496071-41496227)
chr5 (56-159)||(42803631-42803734)
chr5 (18-159)||(1248577-1248718)
chr5 (69-159)||(6753682-6753772)
chr5 (54-159)||(21060629-21060734)
chr5 (54-159)||(29374341-29374446)
chr5 (18-159)||(2232046-2232183)
chr5 (56-159)||(4441020-4441123)
chr5 (56-159)||(6615891-6615993)
chr5 (54-167)||(37184088-37184201)
chr5 (11-120)||(9515784-9515893)
chr5 (15-161)||(15818450-15818598)
chr5 (54-167)||(30512694-30512808)
chr5 (54-167)||(30553034-30553148)
chr5 (57-159)||(11796179-11796281)
chr5 (54-168)||(18841469-18841583)
chr5 (54-159)||(41492301-41492406)
chr5 (54-159)||(19929945-19930050)
chr5 (66-160)||(26285499-26285593)
chr5 (59-149)||(29856056-29856146)
chr5 (54-159)||(41478826-41478931)
chr5 (54-119)||(32440180-32440245)
chr5 (73-148)||(38161440-38161515)
chr5 (56-159)||(41062171-41062274)
chr5 (54-155)||(11904208-11904310)
chr5 (54-119)||(15439328-15439393)
chr5 (54-123)||(38508196-38508265)
chr5 (131-167)||(41492251-41492287)
chr5 (56-165)||(3348136-3348250)
chr5 (74-159)||(5129261-5129346)
chr5 (78-166)||(7330500-7330587)
chr5 (59-159)||(11761313-11761412)
chr5 (131-167)||(41478776-41478812)
chr5 (131-167)||(41480142-41480178)
chr5 (54-160)||(39325861-39325965)
chr5 (54-86)||(3076662-3076694)
chr5 (131-167)||(10598226-10598262)
chr5 (131-167)||(32439863-32439899)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (11-159)||(136005-136153)
[»] chr6 (46 HSPs)
chr6 (54-159)||(13087529-13087634)
chr6 (54-159)||(11655956-11656061)
chr6 (54-159)||(24983459-24983564)
chr6 (11-159)||(31894177-31894325)
chr6 (12-159)||(15058116-15058263)
chr6 (54-159)||(6801930-6802035)
chr6 (54-159)||(13909423-13909528)
chr6 (54-158)||(5302351-5302455)
chr6 (11-156)||(23142669-23142814)
chr6 (11-159)||(3720208-3720356)
chr6 (54-156)||(1781805-1781906)
chr6 (54-159)||(29363305-29363410)
chr6 (56-159)||(181555-181658)
chr6 (54-161)||(32440655-32440762)
chr6 (54-159)||(21010172-21010281)
chr6 (24-159)||(7920238-7920372)
chr6 (54-159)||(30716899-30717004)
chr6 (54-155)||(1063613-1063714)
chr6 (54-159)||(1225047-1225151)
chr6 (54-159)||(3291778-3291883)
chr6 (55-159)||(11143597-11143702)
chr6 (55-159)||(1955990-1956094)
chr6 (92-160)||(34657610-34657678)
chr6 (54-165)||(22398406-22398516)
chr6 (54-165)||(15582276-15582387)
chr6 (56-159)||(17828939-17829042)
chr6 (61-166)||(34299987-34300092)
chr6 (56-160)||(6834381-6834485)
chr6 (54-155)||(21804539-21804639)
chr6 (56-151)||(17835391-17835486)
chr6 (56-102)||(4590610-4590656)
chr6 (110-159)||(15046123-15046171)
chr6 (62-102)||(4581999-4582039)
chr6 (79-123)||(8695080-8695124)
chr6 (131-167)||(21425644-21425680)
chr6 (54-110)||(27367446-27367502)
chr6 (54-110)||(27457793-27457849)
chr6 (131-167)||(31283488-31283524)
chr6 (92-159)||(33510139-33510206)
chr6 (63-129)||(34436244-34436310)
chr6 (74-159)||(10923408-10923493)
chr6 (56-105)||(24106337-24106386)
chr6 (54-119)||(27448166-27448231)
chr6 (107-159)||(16205221-16205273)
chr6 (55-143)||(16431035-16431123)
chr6 (131-167)||(28106016-28106052)
[»] scaffold0330 (1 HSPs)
scaffold0330 (54-166)||(5382-5494)
[»] scaffold0159 (1 HSPs)
scaffold0159 (11-159)||(33987-34135)
[»] scaffold0294 (1 HSPs)
scaffold0294 (10-160)||(17033-17183)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (54-159)||(105683-105788)
[»] scaffold1809 (1 HSPs)
scaffold1809 (56-159)||(697-800)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (54-159)||(7992-8097)
[»] scaffold0583 (1 HSPs)
scaffold0583 (54-159)||(2024-2129)
[»] scaffold0110 (1 HSPs)
scaffold0110 (54-159)||(1703-1808)
[»] scaffold0182 (1 HSPs)
scaffold0182 (54-157)||(20364-20467)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (11-159)||(50203-50351)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (108-167)||(14233-14292)
[»] scaffold1391 (1 HSPs)
scaffold1391 (56-123)||(1830-1897)
[»] scaffold0470 (1 HSPs)
scaffold0470 (11-86)||(1057-1132)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (91-159)||(252853-252920)
scaffold0003 (54-119)||(39127-39192)


Alignment Details
Target: scaffold0302 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 11 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16245 - 15962
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  16245 acaatattagtagtttaagatttgttcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgattttaatgataaaattaatagcatttactaaaacacactta 16146  T
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaagatataaattaatataaaaatgtaacaaaacatagaatgattggatcaat 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16145 ttaattgtagttaatgaagcagttaagatggatgaaattcaataaataaggatataaattaatataaaaatgtaacaagacatagaatgattggatcaat 16046  T
Q  211 gatacacattcaacaaactccatggataccattatgttcaccactaatttatacttcacttgcaaatttgctaatgtggtttat 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16045 gatacacattcaacaaactccatggataccattatgttcaccactaatttatacttcacttgcaaatttgctaatgtgttttat 15962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 75)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 9307774 - 9307618
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||       ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||     
T  9307774 acaatattagtcgtttaaggtttgtacacgattattaaggaaatgattaactgtgttgatttcaatgataaaattaatagcatttactaaaacacccttg 9307675  T
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaagatataa 167  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9307674 ttaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaattcaataaataaaggtataa 9307618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 12039229 - 12039081
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  12039229 acaatattagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtaacatttactaatacactctta 12039130  T
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  12039129 ttaattgtagttaatggagtatttaagttggatgtaattcaataaataa 12039081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 24991624 - 24991780
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||  |||    
T  24991624 acaatattagtcgtttaaggtttgtacacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaacggtaaaattaatagtatttactacaacaccttta 24991723  T
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaagatataa 167  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24991724 ttaattgtagttagtggaatagttaagttggatgaaattcaataaataaaggtataa 24991780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 39864215 - 39864110
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39864215 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaatactcttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaattcaat 39864116  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  39864115 aaataa 39864110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 40144861 - 40144966
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  40144861 tgattaattgtgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaaacacccttattaattgtagttaatggagtagttaagttggatgaagttcaat 40144960  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  40144961 aaataa 40144966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 15699226 - 15699121
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  15699226 tgattaattgtgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaagttcaat 15699127  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  15699126 aaataa 15699121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 54 - 167
Target Start/End: Original strand, 8896346 - 8896459
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |   |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  8896346 tgattgattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatatatttattaattgtagttagtggagtggttaagttggatgaaattcaat 8896445  T
Q  154 aaataaagatataa 167  Q
    |||||||| |||||    
T  8896446 aaataaaggtataa 8896459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 49224000 - 49224105
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  49224000 tgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaagttcaat 49224099  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  49224100 aaataa 49224105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 56 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 7759317 - 7759214
Alignment:
Q  56 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataa 155  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  7759317 attaattgtgttgatttcaatggtgaaattaatatcatttactaaaatactcttattaattgtagttagtggaatagttaagttgaatgaaattcaataa 7759218  T
Q  156 ataa 159  Q
    ||||    
T  7759217 ataa 7759214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 2572572 - 2572460
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  2572572 tgattaattgtattgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaat-acaattattaattgtagttagtggagtagttaagttgaatgaaattcaat 2572474  T
Q  154 aaataaagatataa 167  Q
    ||||||| ||||||    
T  2572473 aaataaaaatataa 2572460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 28749136 - 28748990
Alignment:
Q  13 aatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttatt 112  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  28749136 aatatttgtcatttaagatttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaacacccttatt 28749037  T
Q  113 aattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||||| ||| | ||   ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  28749036 aattgtaattagtagaattgttaagttggatgaaattttataaataa 28748990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 31042944 - 31042790
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| || |||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  || || ||||    
T  31042944 acaatattagtcatttaaggtttgtgcatgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtatcatttactgtaataccctta 31042845  T
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaagatat 165  Q
    |||||||||| || || || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31042844 ttaattgtaggtagtgaagtaattaagttgaatgaaattcaataaataaagatat 31042790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 167
Target Start/End: Original strand, 44707774 - 44707887
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  44707774 tgattaattatattgatttcaatgataaaattagtagtatttactaaaacacatttattaattgtagttagtgaagcagttaagttggatgaaattcaat 44707873  T
Q  154 aaataaagatataa 167  Q
    |||||||| |||||    
T  44707874 aaataaaggtataa 44707887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 56 - 159
Target Start/End: Original strand, 14757610 - 14757713
Alignment:
Q  56 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataa 155  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||| |||||    
T  14757610 attaattgtgttgatttcaacgataaaattagtaacatttactaaaacactcttattaattgtagttagtgaagtagttaagttcgatgaaatttaataa 14757709  T
Q  156 ataa 159  Q
    ||||    
T  14757710 ataa 14757713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 26093528 - 26093393
Alignment:
Q  24 tttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagtta 123  Q
    |||||||||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |  |||||||||||||||||    
T  26093528 tttaagatttgtgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttattaaaatatccttattaattgtagtta 26093429  T
Q  124 atggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
     || || | ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  26093428 gtgaagtaattaagttagatgaagttcaataaataa 26093393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 56 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 10495940 - 10495819
Alignment:
Q  56 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataa 155  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10495940 attaattttgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacact-ttattaattgtaattagtggagtagttaagttggatgaaattcaataa 10495842  T
Q  156 ataaagatataaattaatataaaaa 180  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||    
T  10495841 ataaatatataa--taatataaaaa 10495819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 917164 - 917023
Alignment:
Q  18 tagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattg 117  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||       ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  917164 tagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaaataaatgattaattatgttgatttaaatggtaaaattaatatcatttactaaaatacccttattaattg 917065  T
Q  118 tagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    |||||| | ||  |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  917064 tagttagtagattagttaagttgcatgaaatttaataaataa 917023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 54 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 42410098 - 42409987
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |   |||||||| ||||||| ||||||    
T  42410098 tgattaattgtgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaagcacccttattaattgtagttagttggatagttaagtaggatgaagttcaat 42409999  T
Q  154 aaataaagatat 165  Q
    ||||||||||||    
T  42409998 aaataaagatat 42409987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 156
Target Start/End: Original strand, 6160473 - 6160575
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||    
T  6160473 tgattaattgtgttgatttcaatgataaaattagtattatttactaaaatactcttattaattgtagttaatggaatagttaagttgaatgtaattcaat 6160572  T
Q  154 aaa 156  Q
    |||    
T  6160573 aaa 6160575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 24880980 - 24880864
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagt---taagttggatgaaattc 150  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||| |||   |||||||||||||||||    
T  24880980 tgattgattatgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatacttttattaattgtagttagtggagtagttagtaagttggatgaaattc 24880881  T
Q  151 aataaataaagatataa 167  Q
    ||||||| | |||||||    
T  24880880 aataaattaggatataa 24880864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 56 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 45331443 - 45331339
Alignment:
Q  56 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggag---cagttaagttggatgaaattcaa 152  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| |||||    
T  45331443 attaattatgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaaacacccttattaattgtagttaatggaggaatagttaagttggatgaagttcaa 45331344  T
Q  153 taaat 157  Q
    |||||    
T  45331343 taaat 45331339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 57 - 154
Target Start/End: Original strand, 6023666 - 6023763
Alignment:
Q  57 ttaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaata 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6023666 ttaattgtgttgatttcaatggtaaatttagtagcttttactaaaatacctttattaattgtagttattggagtagttaagttggatgaaattcaata 6023763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 167
Target Start/End: Original strand, 16395061 - 16395173
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||| || |||||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  16395061 tgattaattgtgttgattttgatagtaaaattagtatcatttactaaaatac-ctttttaattgtagttagtggagtagttaagttagatgaaattcaat 16395159  T
Q  154 aaataaagatataa 167  Q
    |||||| |||||||    
T  16395160 aaataatgatataa 16395173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 20209854 - 20209959
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||| |||||||||  || ||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  20209854 tgattaattatgttgattttgatagtaaaattagtatcatttactaaaacatccttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaagttcaat 20209953  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  20209954 aaataa 20209959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 36702025 - 36701920
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||||||    
T  36702025 tgattaattatgttgatttcaatggtaaaattagtatcatttactaaaatgcccttattaattgtagttagtggaatcgttaagtttgatgaaattcaat 36701926  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  36701925 aaataa 36701920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 36718129 - 36718024
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||||||    
T  36718129 tgattaattatgttgatttcaatggtaaaattagtatcatttactaaaatgcccttattaattgtagttagtggaatcgttaagtttgatgaaattcaat 36718030  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  36718029 aaataa 36718024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 37276565 - 37276460
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  37276565 tgattaactgtgttgattttgatggtaaaattagtatcgtttactaaaacacccttattaattgtagttagtggaatagttaaattggatgaaattcaat 37276466  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  37276465 aaataa 37276460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 55 - 159
Target Start/End: Original strand, 31978667 - 31978771
Alignment:
Q  55 gattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaata 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |  |||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||| ||    
T  31978667 gattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcacttactaaactattcttattaattatagttaatggagtagttaagttgaattaaattcatta 31978766  T
Q  155 aataa 159  Q
    |||||    
T  31978767 aataa 31978771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 57 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 11449984 - 11449884
Alignment:
Q  57 ttaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaa 156  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  11449984 ttaattatgttgatttcaatggtaaaattaataa--ttttctataacacatttattaattgtagttaatagagtagtaaaattggatgaaattcaataaa 11449887  T
Q  157 taa 159  Q
    |||    
T  11449886 taa 11449884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Original strand, 23168964 - 23169112
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||       | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||    
T  23168964 acaatattagtcgtttaaagtttgtgcacgattattaagaaaataattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaacatcctta 23169063  T
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    |||||| |||||| |  |  ||||||||  | |||||||||||||||||    
T  23169064 ttaattatagttagttaaatagttaagtgaggtgaaattcaataaataa 23169112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 54 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 29074988 - 29074885
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||  | |||||||||| ||||| | |  |||||||||||||||||||||||    
T  29074988 tgattagttgtgttgattttaatggtaaaattaatatcatttattaaaacatccatattaattgttgttaacgtaatagttaagttggatgaaattcaat 29074889  T
Q  154 aaat 157  Q
    ||||    
T  29074888 aaat 29074885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 60 - 159
Target Start/End: Original strand, 33733282 - 33733381
Alignment:
Q  60 attgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| | |||  |||| || | ||||||||||||||||||    
T  33733282 attgtgttgatttcaatggtaaaattattaacatttactaaaatacttttattaattgtagttagtagagtggttaggtagaatgaaattcaataaataa 33733381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 70 - 160
Target Start/End: Original strand, 22856267 - 22856357
Alignment:
Q  70 tttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaa 160  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22856267 tttcaatcataaaattaataccatttactaaaataccctaattaattgtagttagtggagtagttaagctggatgaaattcaataaataaa 22856357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 37506231 - 37506123
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataa---catttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattc 150  Q
    |||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||    |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  37506231 tgattaattgtgttgattttgatgataaaattagtactatcatttactaaaacacttttattaattgtagttagtggagtagttaagttgaatgaaattc 37506132  T
Q  151 aataaataa 159  Q
    |||||||||    
T  37506131 aataaataa 37506123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 13579635 - 13579740
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||||||  |||  || ||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  13579635 tgattaattgtgttgattttgatgacaatattaatatcatttacaaaaacacccatattaattgtagttagtggagtatttaagtttgatgaaattcaat 13579734  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  13579735 aaataa 13579740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 34031541 - 34031646
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||| || |  ||| | |||| ||||||||||||    
T  34031541 tgattacttgtgttgattccaatggtaaaattaatatcatttactaaaataccgttattaattgtagttagtgtaatagtaaggttgaatgaaattcaat 34031640  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  34031641 aaataa 34031646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 167
Target Start/End: Original strand, 30754919 - 30755068
Alignment:
Q  18 tagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattg 117  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||       ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||  ||||||||||| |   |||||||||     
T  30754919 tagtcgtttaagatttatgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgattttaagggtaaaatttatattatttactaaaatatcattattaatta 30755018  T
Q  118 tagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaagatataa 167  Q
    |||||| || |  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  30755019 tagttagtgaaatagttaagttagatgaaattcaataaataaaggtataa 30755068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 91 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 35367869 - 35367801
Alignment:
Q  91 catttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35367869 catttactaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttagatgaaattcaataaataa 35367801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 56 - 167
Target Start/End: Original strand, 4441619 - 4441730
Alignment:
Q  56 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataa 155  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||    ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| | |||| || ||||||||| |||||    
T  4441619 attaattgtggtgattttaatggtaaaattaatcgtctttactaaaacacccttgttaattgtagttagtggagtaattaaattagatgaaatttaataa 4441718  T
Q  156 ataaagatataa 167  Q
    |||||| |||||    
T  4441719 ataaaggtataa 4441730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 38787445 - 38787340
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||| || || ||||| | ||||||  |||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  38787445 tgattgattgtgttgattttgatggtaaaactagtatcatttgccaaaacatccttattaattatagttagtggagtagttaaattggatgaaattcaat 38787346  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  38787345 aaataa 38787340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 52429448 - 52429343
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||  ||||||| | |||||||| |||||  |||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  52429448 tgattaatttggttgattacgatggtaaatttaatgtcatttattaaaatacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttgaatgaaattcatt 52429349  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  52429348 aaataa 52429343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 56 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 12151278 - 12151179
Alignment:
Q  56 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataa 155  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| |   | |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  12151278 attaattatgttgatttcaatgataaaattagtatcatttactaaaatattgtaattaattgtagttagtggagcagttaagttgggtggaattctataa 12151179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 74 - 156
Target Start/End: Original strand, 32219695 - 32219777
Alignment:
Q  74 aatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaa 156  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||| |||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  32219695 aatggtaaaattaatatcatttattaaaatactcttattaattatagtttgtggagtggttaagttggatgaaattcaataaa 32219777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 62 - 159
Target Start/End: Original strand, 32826013 - 32826113
Alignment:
Q  62 tgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaat---ggagcagttaagttggatgaaattcaataaata 158  Q
    |||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||| ||| |   |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  32826013 tgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacacctttattaattgtaattagtggaggagtagttaagttggatgaagttcaataaata 32826112  T
Q  159 a 159  Q
    |    
T  32826113 a 32826113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 156
Target Start/End: Original strand, 32970581 - 32970683
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| || | |||||||||| |||| |  |  | ||||||||||| |||||||||    
T  32970581 tgattaattgtgttgatttcaatgataaaattaatattatttactaaaatactcgtattaattgttgttagtaaaataattaagttggataaaattcaat 32970680  T
Q  154 aaa 156  Q
    |||    
T  32970681 aaa 32970683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 44761545 - 44761650
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||| |   ||||||||| |||||| ||||   ||||||||| ||||||||||||    
T  44761545 tgattaattatgttaattttaatgataaaattaatatcatttactaaaatatctttattaattatagttagtggaatggttaagttgaatgaaattcaat 44761644  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  44761645 aaataa 44761650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 59 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 7351735 - 7351635
Alignment:
Q  59 aattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaata 158  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||| |||||| ||||  | ||||||||||  ||||||||||||||    
T  7351735 aattgtgttgattttaatgataaaattaatattatttactaaaataaccttattaattctagttagtggaataattaagttggacaaaattcaataaata 7351636  T
Q  159 a 159  Q
    |    
T  7351635 a 7351635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 22181440 - 22181368
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatg 126  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||    
T  22181440 tgattagttgagttcatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaacacccttagttattgtagttaatg 22181368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 126
Target Start/End: Original strand, 17988572 - 17988646
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaatta--ataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatg 126  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  17988572 tgattaattgtgttgatttcaatgttaaaattagtatattatttactaaaatactcttattaattgtagttaatg 17988646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 9379336 - 9379222
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaat-ggagcagttaagttggatgaaattcaa 152  Q
    |||||||||||  |||||| |||| ||||||||||| |||||| ||||| |   |||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||| ||    
T  9379336 tgattaattgtaatgattttaatgataaaattaatatcatttattaaaatatatttattaattgtagttagtgggagtagttaagtttgatgaaatttaa 9379237  T
Q  153 taaataaagatataa 167  Q
    |||||| || |||||    
T  9379236 taaatataggtataa 9379222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 21910020 - 21910124
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| || | ||| ||||||||| |||||||| | |||||   |||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  21910020 tgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcgtttgctaaaacac-cttattaactatagtttgaggagtagttaagtttgatggaattcaat 21910118  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  21910119 aaataa 21910124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 159
Target Start/End: Original strand, 25089137 - 25089205
Alignment:
Q  92 atttactaaaacacgctt-attaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25089137 atttactaaaacatcctttattaattgtagttagtgaagtagttaagttggatgaaattcaataaataa 25089205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 37539194 - 37539126
Alignment:
Q  91 catttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37539194 catttactacaacactcttgttaattgtagttagtagagtagttaagtttgatgaaattcaataaataa 37539126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 134
Target Start/End: Original strand, 41121839 - 41121919
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagtt 134  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||  |  ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  41121839 tgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagcataatttactaaaatacccttattaattgtagttagtggagtagtt 41121919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 167
Target Start/End: Original strand, 2137437 - 2137496
Alignment:
Q  108 ttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaagatataa 167  Q
    ||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2137437 ttattaattgttgttattggagtatttaagttggataaaattcaataaataaagatataa 2137496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 41080702 - 41080597
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||| | ||| |   |||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  41080702 tgattaattgtgttgattttaatagtaaaatttatatcatttattgaaatatctttattaattgtaattagtggag-aggtaagttggatg-aattcaat 41080605  T
Q  154 aaataaag 161  Q
    ||||||||    
T  41080604 aaataaag 41080597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 159
Target Start/End: Original strand, 29778425 - 29778515
Alignment:
Q  69 atttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| |   |||||||||||||||| |  || |  |||||||||| |||||||||||||||    
T  29778425 atttcaatggtaaaattagtatcatttactaaaatatcattattaattgtagttagttaagaacctaagttggataaaattcaataaataa 29778515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 6785304 - 6785255
Alignment:
Q  110 attaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6785304 attaattgtagttagtggagtagttaagtttgatgaaattcaataaataa 6785255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 159
Target Start/End: Original strand, 9412837 - 9412922
Alignment:
Q  74 aatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    |||||||||||||  | |||||| ||||| |  || |||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  9412837 aatggtaaaattagaagcatttaataaaatattctgattaattgtagttaatggaatagttgggttggatgaaattcaataaataa 9412922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 52837364 - 52837271
Alignment:
Q  74 aatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaagatataa 167  Q
    |||||||||||||||  ||  |||||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||||  || |||||||||||||| ||||| |||||    
T  52837364 aatggtaaaattaatttcaactactaaaatactcttattaattgtagctagtggagtagttaatatgaatgaaattcaataattaaaggtataa 52837271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 107 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 3260642 - 3260590
Alignment:
Q  107 cttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  3260642 cttattaattgtagttagtggagaagttaagtttgatgaaattgaataaataa 3260590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 63 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 27897050 - 27896946
Alignment:
Q  63 gtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaaga 162  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||  |||||  |||| |  |||||||||| |||||| ||||| | || |||||||||||||| |||||||||||     
T  27897050 gtgttgattttaatgataaaattagtataatttatcaaaatattcttattaattatagttagtggagtaatttagttggatgaaatttaataaataaagg 27896951  T
Q  163 tataa 167  Q
    |||||    
T  27896950 tataa 27896946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 35538745 - 35538677
Alignment:
Q  56 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  |||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  35538745 attaattgtgttgatttcaatgataaaatggatattatttactaaaatatccttattaattgtagttaa 35538677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 27687345 - 27687298
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaa 101  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27687345 tgattagttgtgttgatttcaatggtaaaattaatattatttactaaa 27687298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 156
Target Start/End: Original strand, 26256159 - 26256204
Alignment:
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaa 156  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  26256159 ttaattgtagttaatagagtagttaagttggatgaaagtcaataaa 26256204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 138
Target Start/End: Original strand, 44426751 - 44426836
Alignment:
Q  56 attaattgtgttgatttcaatggtaaaatt---aataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagt 138  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||   | || ||||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  44426751 attagttgagttgatttcaatggtaaaatttgtagtatcatttactaaaacatctttattaattgtaattagtggagcaattaagt 44426836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 125 - 159
Target Start/End: Original strand, 35682879 - 35682913
Alignment:
Q  125 tggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35682879 tggagtagttaagttggatgaaattcaataaataa 35682913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 4659816 - 4659767
Alignment:
Q  118 tagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaagatataa 167  Q
    |||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  4659816 tagttagtggagtaattaagttgaatgaaattcaataaataaggatataa 4659767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 147
Target Start/End: Original strand, 26257954 - 26258047
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaa 147  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||| | || |||||||||||| ||  |||||||| || |||| | ||  | |||||||||||||||    
T  26257954 tgattaattgtattgatttcaatagcaaaatgattatcatttactaaaatacctttattaatcgtggttagtagaataattaagttggatgaaa 26258047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 31154232 - 31154127
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||  || |||||||   |  |||||||||||||||  | |||   ||||||| ||||||||||| |    
T  31154232 tgattaattgtgttgattttaatgataaaattagtattatctactaaattgcatttattaattgtagttggtagagtgcttaagtttgatgaaattcagt 31154133  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  31154132 aaataa 31154127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 123
Target Start/End: Original strand, 34688861 - 34688930
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagtta 123  Q
    |||||||||  |||||||| |||| |||||||| || | ||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  34688861 tgattaatttggttgatttaaatgataaaattagtatcgtttactaaaccaggcttattaattttagtta 34688930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 123
Target Start/End: Original strand, 34693389 - 34693458
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagtta 123  Q
    |||||||||  |||||||| |||| |||||||| || | ||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  34693389 tgattaatttggttgatttaaatgataaaattagtatcgtttactaaaccaggcttattaattttagtta 34693458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 66 - 102
Target Start/End: Original strand, 39395018 - 39395054
Alignment:
Q  66 ttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  39395018 ttgatttcaatggtaaaattaatatcattttctaaaa 39395054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 39887885 - 39887833
Alignment:
Q  108 ttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaa 160  Q
    |||||||| ||||||| | ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39887885 ttattaatagtagttagttgagtaattaagtttgatgaaattcaataaataaa 39887833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 43614501 - 43614453
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaa 102  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||    
T  43614501 tgattaagtgtgttgattttaatggtaaaattagtatcattgactaaaa 43614453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 76)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 32884948 - 32884792
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||| ||||    
T  32884948 acaatattagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtagaattagtagcatttagtaaaacactctta 32884849  T
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaagatataa 167  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  32884848 ttaattgtagttagtggagtagttaagttggatggaattcaataaataaggatataa 32884792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Original strand, 47464339 - 47464487
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    |||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||||    
T  47464339 acaatattagtcgtttaaggtttgagcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaaaactctta 47464438  T
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  47464439 ttaattgtagttggtggagtagttaagttggatgaaattcaataaataa 47464487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 167
Target Start/End: Original strand, 38405083 - 38405232
Alignment:
Q  18 tagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattg 117  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||       ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  38405083 tagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattctgttgatttaaatggtaaaattaatatcatttactaaaatacccttattaattg 38405182  T
Q  118 tagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaagatataa 167  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38405183 tagttagtggtgtagttaagttggatgaaattcaataaataaaggtataa 38405232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 56 - 159
Target Start/End: Original strand, 17237315 - 17237418
Alignment:
Q  56 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataa 155  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17237315 attaattgtgttgattgcaatggtaaaattagtaacatttactaaaacaaccttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaattcaataa 17237414  T
Q  156 ataa 159  Q
    ||||    
T  17237415 ataa 17237418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 34360802 - 34360654
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    ||||||||| || |||||  ||||| ||||||||||       ||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  34360802 acaatattaatcgtttaaagtttgtgcacgattattaaagaaatgattaattgtattgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaacactctta 34360703  T
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||    
T  34360702 ttaattgtagttagtggagtagttaagttgaataaaattcaataaataa 34360654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 35311197 - 35311353
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    |||||||||  | |||||| ||||| ||||||||||       ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||    
T  35311197 acaatattaagcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattatgttaatttcaatggtaaaattaattgcatttactagaacactctta 35311296  T
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaagatataa 167  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35311297 ttaattgtagttagtggagtaattaagttggatgaaattcaataaataaaggtataa 35311353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Original strand, 40122828 - 40122976
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||       |||||||||| |||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  40122828 acaatattagtcgtttaagctttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgcgttgattttaatgttaaaattagtagcatttactaaaacaccctta 40122927  T
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  40122928 ttgattgtagttagtggagcagttaagttcgacgaaattcaataaataa 40122976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 54 - 160
Target Start/End: Original strand, 11907616 - 11907722
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  11907616 tgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacacccttattaattgtagttattggagtagttaagttggatgaagttcaat 11907715  T
Q  154 aaataaa 160  Q
    |||||||    
T  11907716 aaataaa 11907722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 53346906 - 53346759
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||       | ||| ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  53346906 acaatattagtcgtttaaaatttgtgcacgattattaagaaaataattgattgtgttagtttcaatggtaaaattaatagcatttactaaaacaccctta 53346807  T
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaata 158  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  53346806 ttaattttagttagtggagtagttaagtttgatgaaattcaataaata 53346759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 49428359 - 49428464
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  49428359 tgattatttgtgttgatttcaatggtaaaattaatataatttactaaaatacccttattaattgtagttagtggagtaattaagttggatgaaattcaat 49428458  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  49428459 aaataa 49428464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 56 - 159
Target Start/End: Original strand, 47773038 - 47773141
Alignment:
Q  56 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataa 155  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  47773038 attaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaagttcaataa 47773137  T
Q  156 ataa 159  Q
    ||||    
T  47773138 ataa 47773141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 54 - 167
Target Start/End: Original strand, 5841444 - 5841558
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcag-ttaagttggatgaaattcaa 152  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  5841444 tgattgattgcgttgattttaatggtaaaattaatatcatttactaaaatacccttattaattgtagttagtggagtagtttaagttggatgaaattcaa 5841543  T
Q  153 taaataaagatataa 167  Q
    ||||||||| |||||    
T  5841544 taaataaaggtataa 5841558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 2653524 - 2653411
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||    
T  2653524 tgattaattgtgttgatttcaattgtaaaattagtatcatttattaaaatactcttattaattgtagttaaaggagtagttaaattggatgaaatttaat 2653425  T
Q  154 aaataaagatataa 167  Q
    |||||||| |||||    
T  2653424 aaataaaggtataa 2653411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 6643677 - 6643782
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||   |||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||    
T  6643677 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaacatctttattaattgtagttagtggtatagttaagttggatgaaattcaat 6643776  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  6643777 aaataa 6643782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 33790748 - 33790853
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| |  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33790748 tgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtttcatttgctaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaattcaat 33790847  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  33790848 aaataa 33790853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Original strand, 2942619 - 2942774
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    |||||||||||| |||||| |||||  | |||||||       |||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  2942619 acaatattagtcgtttaaggtttgtataagattattaaagaaatgattaattgtgttgatttcgatgataaaattagtagcatttactaaaacac-ctta 2942717  T
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaagatataa 167  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  2942718 ttaattgtagttagtggagtggttaagttgaatgaatttcaataaacaaagatataa 2942774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Original strand, 7061638 - 7061786
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |   |||    
T  7061638 acaatattagtcgtttaaggtttgtacacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtatcatttactataatatcttta 7061737  T
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||||||||||| ||||  | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  7061738 ttaattgtagttagtggattaattaagttgaatgaaattcaataaataa 7061786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 54 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 17114544 - 17114437
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||| ||||||    
T  17114544 tgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagttaatttggaggaagttcaat 17114445  T
Q  154 aaataaag 161  Q
    ||||||||    
T  17114444 aaataaag 17114437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 43237390 - 43237242
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    |||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||       |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |   |||    
T  43237390 acaatattagtcgtttaaggtttatgcacgattattaaggaaatgattaattgtgtttatttcaatggtaaaattagtaatatttactaaaaaatcatta 43237291  T
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    |||||| |||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  43237290 ttaattatagttagtgaagtagttaagttggatgaaattcaataaataa 43237242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 22130194 - 22130034
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgt----gttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacg 106  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||       |||||||||||    |||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||      
T  22130194 acaatattagtcgtttaaggtttgtgcacggttattaaggaaatgattaattgtatgtgttgatttcaatggtataattagtatcatttacaaaaacatc 22130095  T
Q  107 cttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaagatataa 167  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22130094 cttattaattgtagttagtggagtaattaagttggatgaaattcaataaataaaggtataa 22130034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 35380350 - 35380455
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  35380350 tgattaattatgttgattttaatggtaaaattagtagcatttactaaaacatcattattaattgtagttagtggagtggttaagttggatgaaattcaat 35380449  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  35380450 aaataa 35380455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 36985890 - 36985785
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || | ||||||||||||||| | ||  | |||||||||||||||||||||    
T  36985890 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtatcatttactaaaatacccgtattaattgtagttagtagaataattaagttggatgaaattcaat 36985791  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  36985790 aaataa 36985785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 52247445 - 52247550
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  52247445 tgattaattgtgttaatttcaatggtaaaattaatacaatttactaaaatatccttattaattgtagttagtggagtagttaagttgaatgaaattcatt 52247544  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  52247545 aaataa 52247550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 54 - 154
Target Start/End: Original strand, 52859816 - 52859916
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  52859816 tgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacatccttattaattgtagttagtggagtagttaagttgaatgaaattcaat 52859915  T
Q  154 a 154  Q
    |    
T  52859916 a 52859916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 54 - 165
Target Start/End: Original strand, 11288647 - 11288757
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  11288647 tgattaattgtattgatttcaatggcaaaattaatatcatttactaaaatat-cttattaattgtagttggtggagtagttaagttggataaaattcaat 11288745  T
Q  154 aaataaagatat 165  Q
    ||||||| ||||    
T  11288746 aaataaaaatat 11288757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Original strand, 16821305 - 16821453
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| || |  ||||    
T  16821305 acaaaattagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaatgcaatgattaattgtgttgatttcaatgataaaattagtatcatttactataatatcctta 16821404  T
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    |||||| |||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16821405 ttaattatagttagtggagtatttaagttgaatgaaattcaataaataa 16821453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 124
Target Start/End: Original strand, 46396900 - 46396970
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaa 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  46396900 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatagcatttactaaaacactcttattaattgtagttaa 46396970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 21240721 - 21240826
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||| || |||||||||| |||  ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  21240721 tgattaactgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaacacatccttattaattgtagttagttgagtagttaagttggatgaaattcaat 21240820  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  21240821 aaataa 21240826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 42616920 - 42617025
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |   |||||||||||||| | ||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  42616920 tgattaactgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatatttttattaattgtagtaagtggagtagttaagtcgaatgaaattcaat 42617019  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  42617020 aaataa 42617025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 54506928 - 54506787
Alignment:
Q  18 tagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattg 117  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||||       ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |   |||| |||||    
T  54506928 tagtcgtttaagatttgtttacggttattaagaaaatgattaactgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttattaaaatatcattatcaattg 54506829  T
Q  118 tagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    |||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  54506828 tagttagtggagtagttaagtttgatgaaattcaattaataa 54506787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 4972707 - 4972595
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||| | ||||||  | |||||||||||||||| ||||    
T  4972707 acaatattagtcgtttaagatttgtgcacgattattaatgaaatgattaattgtgttgatttcaattgaaaaattggtgacatttactaaaacactctta 4972608  T
Q  111 ttaattgtagtta 123  Q
    |||||||||||||    
T  4972607 ttaattgtagtta 4972595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 54 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 2066893 - 2066780
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||  ||||| |||||||| |||||||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  2066893 tgattaattgtgttgattttgatggtaaagttagtattatttattaaaacacccttattaattttagttagtggggtagttaagttagatgaaattcaat 2066794  T
Q  154 aaataaagatataa 167  Q
    |||||||| |||||    
T  2066793 aaataaaggtataa 2066780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 6609865 - 6609760
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||| ||||||   |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  6609865 tgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttacaaaaacatctttattaattgtaattattggagtagttaagttggatgaaactcaat 6609766  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  6609765 aaataa 6609760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 56 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 25233283 - 25233174
Alignment:
Q  56 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataa 155  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||| || |||||||||||||||   |||||||| |||||| || || |||||||||||||||| ||||||||    
T  25233283 attaattgtgttaattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacactagtattaattatagttagtgaagtagttaagttggatgaagttcaataa 25233184  T
Q  156 ataaagatat 165  Q
    ||||||||||    
T  25233183 ataaagatat 25233174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 49175951 - 49176056
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||| || |||||||||||| |  |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  49175951 tgattaattgtggagatttcaatgataaaattagtatcatttactaaaataaccttattaattgtagttagcggagtagttaagttggataaaattcaat 49176050  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  49176051 aaataa 49176056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 59 - 159
Target Start/End: Original strand, 50264102 - 50264202
Alignment:
Q  59 aattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaata 158  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||| || |  | |||||||| |||||||||||||||||    
T  50264102 aattgtgttgatttcaatgttaaaattaacatcatttactaaaatactcttattaattgtagttagtgaaatatttaagttgaatgaaattcaataaata 50264201  T
Q  159 a 159  Q
    |    
T  50264202 a 50264202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 57 - 159
Target Start/End: Original strand, 26147635 - 26147738
Alignment:
Q  57 ttaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaa-attcaataa 155  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  26147635 ttaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacattcttattaattgtagttagtggagtaattaagttggatgaattttcaataa 26147734  T
Q  156 ataa 159  Q
    ||||    
T  26147735 ataa 26147738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 56 - 159
Target Start/End: Original strand, 38502501 - 38502604
Alignment:
Q  56 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataa 155  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||| ||||| ||  ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||    
T  38502501 attaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttattaaaatacttttattaattatagttaatgtagtagttaagttggataaaattcaataa 38502600  T
Q  156 ataa 159  Q
    ||||    
T  38502601 ataa 38502604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 56 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 49747063 - 49746960
Alignment:
Q  56 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataa 155  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||| ||  | ||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49747063 attaattgtgttgatttcaatgataaaattagtagtatttactaaaataccttcattaattatagttagttgagtagttaagttggatgaaattcaataa 49746964  T
Q  156 ataa 159  Q
    ||||    
T  49746963 ataa 49746960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 159
Target Start/End: Original strand, 18741494 - 18741596
Alignment:
Q  57 ttaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaa 156  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||| |  |||||| ||||| |   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18741494 ttaattatattgatttcaacggtaaaattagtgtcatttattaaaatatctttattaattgtagttaatggagtagttaagttggatgaaattcaataaa 18741593  T
Q  157 taa 159  Q
    |||    
T  18741594 taa 18741596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 152
Target Start/End: Original strand, 44536213 - 44536311
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaa 152  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||    
T  44536213 tgattaattgtgttgattttaatggtaaaattagcaggatttattaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagctaagttagatgaaattcaa 44536311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 55 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 53412211 - 53412106
Alignment:
Q  55 gattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaata 154  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |   ||||||||| |||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  53412211 gattaattttattgatttcaatggtaaaattagtatcatttactaaaatatttttattaattatagtttgtggaatagttaagttggatgaaattcaata 53412112  T
Q  155 aataaa 160  Q
    ||||||    
T  53412111 aataaa 53412106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 28500908 - 28501005
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||        ||||||||| |||||||||||||    
T  28500908 tgattgattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatacccttattaattgcagtt--------agttaagtttgatgaaattcaat 28500999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 54 - 165
Target Start/End: Original strand, 32469965 - 32470075
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||  |||||||| ||||||||||  ||   ||||||| ||| |||||||||    
T  32469965 tgattaattgtgttgattttaatggtaaaattagtatcatttattaaaacattcttattaactgtagttaataaagtttttaagtttgat-aaattcaat 32470063  T
Q  154 aaataaagatat 165  Q
    ||||||||||||    
T  32470064 aaataaagatat 32470075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 35998905 - 35998803
Alignment:
Q  64 tgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaagat 163  Q
    ||||||||| ||  ||||||||| ||||||||| ||||| |   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35998905 tgttgattttaacagtaaaattagtaacatttattaaaatatcattattaattgtagttgatggagtagttaagttggatg-aattcaataaataaagat 35998807  T
Q  164 ataa 167  Q
    ||||    
T  35998806 ataa 35998803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 160
Target Start/End: Original strand, 30682213 - 30682319
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||| || |  ||||||| ||||||||| | ||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  30682213 tgattaattgtgttaattttattggtaaaattaatatcatttactataatatccttattagttgtagttagtagagtagttaatttgaatgaaattcaat 30682312  T
Q  154 aaataaa 160  Q
    |||||||    
T  30682313 aaataaa 30682319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 42517655 - 42517763
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatg---gagcagttaagttggatgaaattc 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||||| |||||| ||    |  ||| ||||| ||||||||||    
T  42517655 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaagatcatttactaaaatacccttattaattatagttagtgaaatactagtaaagttagatgaaattc 42517754  T
Q  151 aataaataa 159  Q
    |||||||||    
T  42517755 aataaataa 42517763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 462062 - 461957
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |  ||||||||||||| |||  |||| |||||||||| || ||||||||     
T  462062 tgattaattgtattgatttcaatggtaaaagtaatattatttactaaaatatccttattaattgtaattagcggagtagttaagttgaataaaattcaac 461963  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  461962 aaataa 461957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 3689666 - 3689561
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| |||||| | |||  |||||||| ||||||||| |||    
T  3689666 tgattaattgtattgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacactcttattaattatagttagttgagttgttaagttagatgaaattaaat 3689567  T
Q  154 aaataa 159  Q
     |||||    
T  3689566 taataa 3689561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 65 - 158
Target Start/End: Original strand, 38663475 - 38663568
Alignment:
Q  65 gttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaata 158  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||| ||||||| |  || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38663475 gttgttttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaacacttttattaatcgtagttagtaaagtagttaagttggatgaaatttaataaata 38663568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 51625187 - 51625136
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacac 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51625187 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtaacatttactaaaacac 51625136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 159
Target Start/End: Original strand, 47358972 - 47359071
Alignment:
Q  60 attgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  |  |||| |||||| ||  |||||||||||||| | ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  47358972 attgtgttgatttcaatgataaaattagaataattttctaaaatacttttattaattgtagtcagtggagtaattaagttgaatgaaattcaataaataa 47359071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 29575253 - 29575142
Alignment:
Q  13 aatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttatt 112  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||| |       ||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| ||    
T  29575253 aatattagtcgtttaaaatttgtacacgattactaagaaaatgattaattatgttaatttaaatgataaaattaataacatttattaaaatactcttgtt 29575154  T
Q  113 aattgtagttaa 124  Q
    ||||||||||||    
T  29575153 aattgtagttaa 29575142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 49579195 - 49579300
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttc-aatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaa 152  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||  ||| ||||||||||  |||||||||||||||| || |   |||||||||||||||||||||    
T  49579195 tgattaattgtgttgatttttaatgataaaattattattatt-actaaaacacttttattaattgtagttattgaaattgttaagttggatgaaattcaa 49579293  T
Q  153 taaataa 159  Q
    |||||||    
T  49579294 taaataa 49579300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 39397448 - 39397343
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||  | | ||||||||||||||| | ||  ||||||  ||||||||||| |||    
T  39397448 tgattaattatgttgatttcattggtaaatttaatgtcatttactaaaatccccatattaattgtagttactagattagttaaaatggatgaaatttaat 39397349  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  39397348 aaataa 39397343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 98 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 51624846 - 51624785
Alignment:
Q  98 taaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51624846 taaaacacttttattatttgtagttagtggagtagttaagttggatgaaattcaataaataa 51624785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 44526449 - 44526377
Alignment:
Q  88 taacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaa 160  Q
    ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  44526449 taacatttattaaaacatccttattaattgtagttagtggaatagtgaagttggatgaaatttaataaataaa 44526377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 116
Target Start/End: Original strand, 8175601 - 8175659
Alignment:
Q  58 taattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||| ||||||    
T  8175601 taattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttattaaaatactcttgttaatt 8175659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 19265912 - 19265811
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||| | || ||||||||  ||||||||||   ||||| ||||| |  |||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  19265912 tgattaattatatttatttcaataataaaattaatgttatttattaaaataaccttattaattatagttagtggagtagttaagttgaatgaaattcaat 19265813  T
Q  154 aa 155  Q
    ||    
T  19265812 aa 19265811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 20612188 - 20612293
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||| ||| |||||||||| || |||| ||| ||  ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| || ||||||||    |||||||||||    
T  20612188 tgattagttgagttgatttcattgctaaagttagtataatttactaaaacaccattattaattgtagataatgaagtagttaagtgaattgaaattcaat 20612287  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  20612288 aaataa 20612293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 125
Target Start/End: Original strand, 27880264 - 27880329
Alignment:
Q  60 attgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaat 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || || ||||| ||||||| |||||    
T  27880264 attgtgttgatttcaatggtaaaattagtatcatttactagaatactcttatcaattgtacttaat 27880329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 30192309 - 30192240
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagtta 123  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||||| |  |||||||||||||||||    
T  30192309 tgattaattgtgttgatttcaattataaaattaatgtcatttgctaaaatattcttattaattgtagtta 30192240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 52869174 - 52869106
Alignment:
Q  56 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaa 124  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||| ||||| ||  |||||||||||||||||    
T  52869174 attaattgtgttgatttcaatagtaagattaatatcgtttattaaaatacctttattaattgtagttaa 52869106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 160
Target Start/End: Original strand, 31370373 - 31370423
Alignment:
Q  110 attaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaa 160  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31370373 attaattatagttagtggagtagttaagttggatgaaaatcaataaataaa 31370423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 164
Target Start/End: Original strand, 41711473 - 41711583
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||| |   || |||||| || |||  ||||  ||||||||  ||||||||||||    
T  41711473 tgattaattatgttgattttaatggtaaaattaatatcattttttaaaatatcatttttaattttatttagcggagttgttaagttttatgaaattcaat 41711572  T
Q  154 aaataaagata 164  Q
    |||||| ||||    
T  41711573 aaataaggata 41711583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 43902358 - 43902250
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatt---tactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattc 150  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||  |||   || ||||| |  |||||||||  |||||| ||||| | |||||||| |||||||||    
T  43902358 tgattaattatgttgattttaatgataaaattaatattattatttattaaaatattcttattaatcatagttagtggagtaattaagttgcatgaaattc 43902259  T
Q  151 aataaataa 159  Q
    |||||||||    
T  43902258 aataaataa 43902250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 129
Target Start/End: Original strand, 16506284 - 16506325
Alignment:
Q  88 taacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggag 129  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16506284 taacatttactaaaacacatttattaattgtagttaatggag 16506325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 10672704 - 10672652
Alignment:
Q  107 cttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    |||||||||| |||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10672704 cttattaattttagtcaatgaaatagttaagttggatgaaattcaataaataa 10672652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 10886344 - 10886292
Alignment:
Q  107 cttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    |||||||||| |||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10886344 cttattaattttagtcaatgaaatagttaagttggatgaaattcaataaataa 10886292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 126
Target Start/End: Original strand, 12567211 - 12567271
Alignment:
Q  66 ttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatg 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||  | |||| |||||||||||||    
T  12567211 ttgattttaatggtaaaattaatatcatttaataaaacagtcatattgattgtagttaatg 12567271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 122
Target Start/End: Original strand, 17512356 - 17512424
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagtt 122  Q
    |||||| ||| |||||||| || |||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  17512356 tgattagttgagttgattttaaaggtaaaattaatataatttactaaaataccattattaattgtagtt 17512424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 167
Target Start/End: Original strand, 25142473 - 25142509
Alignment:
Q  131 agttaagttggatgaaattcaataaataaagatataa 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25142473 agttaagttggatgaaattcaataaataaggatataa 25142509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 35251991 - 35251945
Alignment:
Q  56 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaa 102  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  35251991 attaattgtggttatttcaatgataaaattaatatcatttactaaaa 35251945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 2400862 - 2400777
Alignment:
Q  74 aatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||||| |||||| |  |||||||||||||| || ||| |||||||||  ||||| ||||||||   || |||||||||||||||    
T  2400862 aatggtacaattaacattatttactaaaacaccctcattgattgtagtttgtggagtagttaagtataataaaattcaataaataa 2400777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 3098822 - 3098757
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgta 119  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |   ||||||||||||    
T  3098822 tgattaattatattgatttcaatgataaaattgatatcatttactaaaatatctttattaattgta 3098757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 95
Target Start/End: Original strand, 25869861 - 25869902
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacattt 95  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  25869861 tgattaattgtgttgatttcaattttaaaattagtaacattt 25869902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 63)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 54 - 164
Target Start/End: Original strand, 24516307 - 24516417
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24516307 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtaacatttactaaaaaaaccttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaattcaat 24516406  T
Q  154 aaataaagata 164  Q
    |||||||||||    
T  24516407 aaataaagata 24516417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Original strand, 11373403 - 11373551
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    |||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||       || ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  11373403 acaatattagtcgtttaaggattgtgcacgattattaaggaaatgtttaattgtgttgatttcgatggtaaaattagtagcatttactaaaacaccctta 11373502  T
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11373503 ttaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaattcaataaataa 11373551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 54 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 34947611 - 34947508
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34947611 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattattatcatttactaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaattcaat 34947512  T
Q  154 aaat 157  Q
    ||||    
T  34947511 aaat 34947508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 41506083 - 41506188
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41506083 tgattaattgtgttaattttaatggtaaaattagtagcatttactaaaacactcttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaattcaat 41506182  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  41506183 aaataa 41506188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 28103887 - 28103739
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| ||||    
T  28103887 acaatatttgtcgtttaaggtttgtgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagcagcatttaccaaaacaccctta 28103788  T
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28103787 ttaattgtagttagtgaagtggttaagttggatgaaattcaataaataa 28103739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 54 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 7463324 - 7463214
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7463324 tgattaattgtgttgatttcaatgataaaattagtagcatttacttaaataccctcattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaattcaat 7463225  T
Q  154 aaataaagata 164  Q
    |||||||||||    
T  7463224 aaataaagata 7463214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 30866108 - 30865965
Alignment:
Q  24 tttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagtta 123  Q
    |||||| ||||| ||||||||||       |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||||| || |||    
T  30866108 tttaaggtttgtgcacgattattaaagaaatgattaattgtgttaatttcaatggtataattaatatcatttactaaaatactcttattaattataatta 30866009  T
Q  124 atggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaagatataa 167  Q
     ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30866008 gtggagtagttaagttagatgaaattcaataaataaagatataa 30865965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 3178222 - 3178327
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3178222 tgattgattgtgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaaacacctttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaattcaat 3178321  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  3178322 aaataa 3178327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 9786099 - 9785994
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||    
T  9786099 tgattaattgtgttgattttgatggtaaaattaatttcatttactaaaacacgcttattaattgtagttagtgaagtagttaagttggataaaattcaat 9786000  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  9785999 aaataa 9785994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Original strand, 21350603 - 21350748
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||| || |   |||||||||||||| ||||    
T  21350603 acaatattagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaa---attaattgtgttgatttcaatggtaaaaatagttgtatttactaaaacaccctta 21350699  T
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21350700 ttaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaattcaataaataa 21350748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 56 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 23670595 - 23670492
Alignment:
Q  56 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataa 155  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  23670595 attaattgtgttgatttccatggtaaaattaatagcatttactaaaacactcttattaatggtagttagtggagtagttaagtttgatgaaatttaataa 23670496  T
Q  156 ataa 159  Q
    ||||    
T  23670495 ataa 23670492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 2459621 - 2459477
Alignment:
Q  13 aatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttatt 112  Q
    |||||||||| |||||  ||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||| ||||| ||||||    
T  2459621 aatattagtcgtttaatgtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaacggtaaaattagt--catttactacaacacccttatt 2459524  T
Q  113 aattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2459523 aattgtagttagtggagtagttaagtaggatgaaattcaataaataa 2459477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 54 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 43874034 - 43873928
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| || |||    
T  43874034 tgattaattgtgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaaacacccttattaaatgtagttagtggagtagttaagttggatgaagtttaat 43873935  T
Q  154 aaataaa 160  Q
    |||||||    
T  43873934 aaataaa 43873928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 155
Target Start/End: Original strand, 21760002 - 21760103
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21760002 tgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttaataaaacacccttactaattgtagttaatggagtagttaagttggatgaaattcaat 21760101  T
Q  154 aa 155  Q
    ||    
T  21760102 aa 21760103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 167
Target Start/End: Original strand, 29835432 - 29835544
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  29835432 tgattaattatgttgatttaaatggtaaaattagtagcatttactaaaacactcttattaattgcagttaacggagtagtt-agttggatgtaattcaat 29835530  T
Q  154 aaataaagatataa 167  Q
    ||||||||||||||    
T  29835531 aaataaagatataa 29835544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 22738855 - 22738699
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    |||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||       ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |  || |    
T  22738855 acaatattagtcgtttaaggtttatgcacgattattaaagaaatgattaattgtgtagatttcaatggtaaaattagtatcatttactaaaatatcctca 22738756  T
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaagatataa 167  Q
    ||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22738755 ttaattgtagttagtagattagttaagttggatgaaatttaataaataaaggtataa 22738699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 56 - 159
Target Start/End: Original strand, 28202329 - 28202432
Alignment:
Q  56 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataa 155  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  28202329 attaattgtgttgattttgatggtaaaattaatgtcatttactaaaacatccttattaattgtagttagtggagtagtaaagttggatgaaattcaataa 28202428  T
Q  156 ataa 159  Q
    ||||    
T  28202429 ataa 28202432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Original strand, 34100522 - 34100670
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    |||||||||||  ||||||||||||  |||||||||       ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |   |||    
T  34100522 acaatattagttgtttaagatttgtcaacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatagtaaaattagtagcatttactaaaatatcttta 34100621  T
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34100622 ttaattgtagttactgaagtagttaagttggatgacattcaataaataa 34100670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 26974176 - 26974031
Alignment:
Q  18 tagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacat---ttactaaaacacgcttattaa 114  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||| || ||||||||    
T  26974176 tagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatcatttactaaaatactcttattaa 26974077  T
Q  115 ttgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaa 160  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  26974076 ttgtagttagtggagtagttaagttgaatgaaatttattaaataaa 26974031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 54 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 38391859 - 38391753
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||    
T  38391859 tgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacactcttgttaattgtagttagtggaataattaagttggatgaaattcaat 38391760  T
Q  154 aaataaa 160  Q
    |||||||    
T  38391759 aaataaa 38391753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 42935772 - 42935664
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaat---ggagcagttaagttggatgaaattc 150  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |   |||| |||||||||||||||| |||    
T  42935772 tgattaattgtgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaaacacccttattaattgtagttagtggaggaggagttaagttggatgaagttc 42935673  T
Q  151 aataaataa 159  Q
    |||||||||    
T  42935672 aataaataa 42935664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 83496 - 83391
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  83496 tgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacattcttattaattgtagttagcggagtagttaagtttgatgaaattcaat 83397  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  83396 aaataa 83391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 759109 - 759214
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| || || ||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  759109 tgattaattgtgttgattttgatggtaaaactagtatcatttactaaaacatccttattaattgtagttagcggagtagttaagttggatgaaattcaat 759208  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  759209 aaataa 759214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 5524534 - 5524396
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    |||||||| ||| |||||  ||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||    
T  5524534 acaatatttgtcgtttaaagtttgtgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtaacatttaataaaacactttta 5524435  T
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaatt 149  Q
    |||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||    
T  5524434 ttaattatagttagttgagtagttaagttggatgaaatt 5524396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 46478311 - 46478416
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||| |||| ||| ||||| ||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  46478311 tgattaattgtgttaattttaatagtaaagttagtagcatttactaaaatacccttattaattgtagttaattgagtagttaagttggatgaaattcaat 46478410  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  46478411 aaataa 46478416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Original strand, 8592415 - 8592563
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    |||||||||| | |||||| ||||| || |||||||       |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||| |||||||| ||||    
T  8592415 acaatattagccgtttaaggtttgtgcatgattattaaagaaatgattaattgtgttgatttcaatggttaaattagtagtatttaataaaacaccctta 8592514  T
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||    
T  8592515 ttaattgtagttagtggagtagtaaagttagatgaaatttaataaataa 8592563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 159
Target Start/End: Original strand, 32346076 - 32346175
Alignment:
Q  60 attgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||| || ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32346076 attgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatctactaaaatactcttattaattataattagtggagtagttaagttgaatgaaattcaataaataa 32346175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 21390406 - 21390301
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  21390406 tgattaattgtgttaattttgatggtaaaactaatatcatttactaaaacatccttattgattgtagttagtggagtagttaagttagatgaaattcaat 21390307  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  21390306 aaataa 21390301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 55 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 37245799 - 37245696
Alignment:
Q  55 gattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaata 154  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  37245799 gattaattctgttgatttcaatggtaaa-ttagtagcatttactaaaacactcttattaattgtaataagtggagtggttaagttggatgaaattcaata 37245701  T
Q  155 aataa 159  Q
    |||||    
T  37245700 aataa 37245696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 54 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 13962070 - 13961959
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||| ||||| |  |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  13962070 tgattaattgtgttgattttaatgataaaattaatatcacttaataaaatatccttattaagtgtagttagtggagtagttaagttggatgaaatttaat 13961971  T
Q  154 aaataaagatat 165  Q
    |||||| |||||    
T  13961970 aaataatgatat 13961959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 27921099 - 27920994
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||| ||||||    
T  27921099 tgattaattatgttgattttaatggtaaaattagtatcatttattaaaacactcttattaattgtagttagtgcattagttaagttggatgaagttcaat 27921000  T
Q  154 aaataa 159  Q
     |||||    
T  27920999 caataa 27920994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 33819325 - 33819220
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||||||||||| |||  ||||| ||| |||||| |||||||||| |    
T  33819325 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttacaaaatcactcttattaattgttgtttgtggagtagtgaagttgaatgaaattcatt 33819226  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  33819225 aaataa 33819220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 55 - 167
Target Start/End: Original strand, 17828370 - 17828481
Alignment:
Q  55 gattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaata 154  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  || ||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||    
T  17828370 gattatttttgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttacaaaattactcttatcaattgtagttagtggagtaattaagttggatg-aattcaata 17828468  T
Q  155 aataaagatataa 167  Q
    ||||| |||||||    
T  17828469 aataatgatataa 17828481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 19271751 - 19271856
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||| |  |||| ||||||| ||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  19271751 tgattaattgtgttgatttcaatgatcaaattagtggcattgactaaaatacttttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaaattaat 19271850  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  19271851 aaataa 19271856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Original strand, 7457396 - 7457544
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    |||||||||||  |||||  ||||| ||||||||||       ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||    
T  7457396 acaatattagttatttaatgtttgtgcacgattattaaaaaaatgattaattatgttgatttcaatggtaaaattagttacatttactaaaagaccctta 7457495  T
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    |||| ||||||||  |||  | |||||||  || |||||||||||||||    
T  7457496 ttaaatgtagttagcggaataattaagttaaattaaattcaataaataa 7457544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 145
Target Start/End: Original strand, 16560547 - 16560679
Alignment:
Q  13 aatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttatt 112  Q
    |||| ||||| |||||||||| | ||||||||||       |||||||||||||| ||||  ||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||    
T  16560547 aataatagtcatttaagatttatgcacgattattaaggaaatgattaattgtgtttattttgatggtaaaactagtatcatttactaaaacatccttatt 16560646  T
Q  113 aattgtagttaatggagcagttaagttggatga 145  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  16560647 aattgtagttagtggggtagttaagttggatga 16560679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 16605115 - 16604983
Alignment:
Q  13 aatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttatt 112  Q
    |||| ||||| |||||||||| | ||||||||||       |||||||||||||| ||||  ||||||||| || || ||||||||||||||  ||||||    
T  16605115 aataatagtcatttaagatttatgcacgattattaaggaaatgattaattgtgtttattttgatggtaaaactagtatcatttactaaaacatccttatt 16605016  T
Q  113 aattgtagttaatggagcagttaagttggatga 145  Q
    ||||||||||| ||| | |||||||||||||||    
T  16605015 aattgtagttagtggggtagttaagttggatga 16604983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 40076426 - 40076324
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||| |||   ||  |||||||||||||||||||||||    
T  40076426 tgattaattgtgttaattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacactattattaattgtactta---gattagttaagttggatgaaattcaat 40076330  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  40076329 aaataa 40076324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 54 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 49101777 - 49101668
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttacta---aaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattc 150  Q
    |||||||||||||| |||| || | ||||||||||| |||||||||   ||| || | ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  49101777 tgattaattgtgtttattttaaggataaaattaatatcatttactattaaaatactcatattaattgtagttagtggagtagttaagttgaatgaaattc 49101678  T
Q  151 aataaataaa 160  Q
    ||||||||||    
T  49101677 aataaataaa 49101668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 32018933 - 32019039
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttc-aatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaa 152  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||  || |||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||| ||    
T  32018933 tgattaattgtgttgattttgaatagtaaaatttctatcatttactaaaatactcttattaattgttgttagtggagtaattaagttggatgaaatttaa 32019032  T
Q  153 taaataa 159  Q
    |||||||    
T  32019033 taaataa 32019039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 58 - 159
Target Start/End: Original strand, 32018734 - 32018835
Alignment:
Q  58 taattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaat 157  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||| || |||||||||||| |||| | ||| | ||||||||||| ||||| |||||||    
T  32018734 taattgtgttgatttcaatagtaaaatttctatcatttactaaaatactcttattaattgtcgttagtagagtaattaagttggattaaatttaataaat 32018833  T
Q  158 aa 159  Q
    ||    
T  32018834 aa 32018835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 65 - 159
Target Start/End: Original strand, 6494963 - 6495057
Alignment:
Q  65 gttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||||||  |||||||||||| |   ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  6494963 gttgattttgatggtaaaattagtgttatttactaaaacacttttattaattgtagttagtggagtagtaaagttggatgaaatttaataaataa 6495057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 16904490 - 16904385
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || || |||||| || | |||||||| |||||| || |  | ||||||||||| |||||||||    
T  16904490 tgattaattgtgttgatttcaatagtaaaattattatcactttctaaaatactcgtattaattatagttagtgaaataattaagttggatcaaattcaat 16904391  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  16904390 aaataa 16904385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 79 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 42796094 - 42796011
Alignment:
Q  79 taaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagca---gttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |   |||||||||||||||||||| |||||||    
T  42796094 taaaattagtaacatttattaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagttgttaagttggatgaaattcattaaataa 42796011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 91 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 25571493 - 25571425
Alignment:
Q  91 catttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25571493 catttactaaaatacccttattagttgtagttagtggaatagttaagttggatgaaattcaataaataa 25571425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 57 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 35333151 - 35333051
Alignment:
Q  57 ttaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaa 156  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||  ||||| ||||| |   |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||    
T  35333151 ttaattgtgttgatttcaattatataattaatattatttattaaaatattattattaattgtagttagtggagtagttaagttagatgaaattcaacaaa 35333052  T
Q  157 t 157  Q
    |    
T  35333051 t 35333051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 48608973 - 48608872
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| || ||    |||||||||||  ||||||||| ||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||    
T  48608973 tgattaattgtgttgattttgatggtaaaactagta----ttactaaaacatccttattaatcgtagttagtgatgtagttaagttggatgaaattcaat 48608878  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  48608877 aaataa 48608872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 159
Target Start/End: Original strand, 30546384 - 30546478
Alignment:
Q  65 gttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||  || ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||||||||||    
T  30546384 gttgagttcaatggaaaaattgatttcacttactaaaacacctttattaattgtagttattggagtagttaagtggagtgaaattcaataaataa 30546478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 159
Target Start/End: Original strand, 31930523 - 31930622
Alignment:
Q  62 tgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggag--cagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||   ||||  ||||| || ||||||||||||||||| |||||   ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31930523 tgtgttgattttaatggtaaaactaatctaattttttaaaatacccttattaattgtagttagtggagtatagttaagtttgatgaaattcaataaataa 31930622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 36790809 - 36790746
Alignment:
Q  96 actaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  36790809 actaaaacacccttattaattgtagttagttgagtagttatgtcggatgaaattcaataaataa 36790746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 64 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 39452445 - 39452390
Alignment:
Q  64 tgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgta 119  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  39452445 tgttgattttaatggtaaaattaatatcatttactaaaatacccttattaattgta 39452390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 123
Target Start/End: Original strand, 2850899 - 2850968
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagtta 123  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||| || || ||||||| ||||||    
T  2850899 tgattaattatgttgatttcaatgataaaattaatattatttactaaaataccctcattaattatagtta 2850968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 44180316 - 44180268
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  44180316 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtataatttactaaaa 44180268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 121
Target Start/End: Original strand, 47045472 - 47045538
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagt 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  47045472 tgattaattgagttgatttcaatg-taaaattagtatcatttcctaaaatacccttattaattgtagt 47045538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 12631454 - 12631347
Alignment:
Q  16 attagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaat 115  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||       | ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||  |||||  ||||||  |||||||||    
T  12631454 attagtcatttaaggtttgtgcacgattattaaggaaataattaattgtattgatttcaatagtaaaattagtagtatttatcaaaacatccttattaat 12631355  T
Q  116 tgtagtta 123  Q
    ||||||||    
T  12631354 tgtagtta 12631347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 17610958 - 17610900
Alignment:
Q  109 tattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaagatataa 167  Q
    ||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  17610958 tattaattgtagttattgaaatagttaagttggatgaaattcaatacacaaagatataa 17610900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 102 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 44424207 - 44424150
Alignment:
Q  102 acacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  44424207 acacccttattaaatgtagttagtggagtaattaagttggatgaagttcaataaataa 44424150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 56 - 159
Target Start/End: Original strand, 31665736 - 31665840
Alignment:
Q  56 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattaa-taacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaata 154  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| |   |||||||| ||||||| | ||| |||||| || ||| || |||||||    
T  31665736 attagttgtgttgattttaatggtaaaattaattttcatttactaaaatatatttattaatagtagttagtagagtagttaaattagataaatttcaata 31665835  T
Q  155 aataa 159  Q
    |||||    
T  31665836 aataa 31665840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 69 - 136
Target Start/End: Original strand, 21937820 - 21937887
Alignment:
Q  69 atttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaa 136  Q
    |||| |||| |||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  21937820 attttaatgataaaattagtgtcatttactaaagcactcttattaattgtagttagtggagtagttaa 21937887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 76 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 24167080 - 24166997
Alignment:
Q  76 tggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    |||||||||||||   ||||||||||| || ||||||||| ||||||| || || |||||  ||| ||||||||||| ||||||    
T  24167080 tggtaaaattaatgttatttactaaaatacccttattaatagtagttagtgcagtagttacattgaatgaaattcaagaaataa 24166997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 159
Target Start/End: Original strand, 37850798 - 37850850
Alignment:
Q  107 cttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||| || ||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  37850798 cttataaactgtagttaatggagttgttaagttagatgaaaatcaataaataa 37850850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 46211542 - 46211472
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataa---catttactaaaacacgcttattaattgtagt 121  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| || ||    ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  46211542 tgattaattgtgttgattttgatggtaaaactagtactatcatttactaaaacatccttattaattgtagt 46211472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 159
Target Start/End: Original strand, 47045546 - 47045594
Alignment:
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    |||||||| |||| || || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47045546 ttaattgtggttagtgtagtagttaagttggatgaaattcaacaaataa 47045594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 64)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 37695677 - 37695782
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  37695677 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttagatgaaattcaat 37695776  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  37695777 aaataa 37695782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Original strand, 43253831 - 43253979
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    ||||||||  || |||||| ||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  43253831 acaatattgatcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaacaccctta 43253930  T
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  43253931 ttaattgtagttagtggagtagttaagtgggatgaaattcattaaataa 43253979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 11632225 - 11632079
Alignment:
Q  13 aatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttatt 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||  |||||    
T  11632225 aatattagtcatttaagatttgtgcacgattattaaaaaa-tgattaattgtgttgatttcaacggtaaaattagtagtatttactaaaacacctttatt 11632127  T
Q  113 aattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaa 160  Q
    ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11632126 aattgtagttagtggaaaagttaagttggatgaaattcaataaataaa 11632079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 30190671 - 30190776
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30190671 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtatcatttactaaaatacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaattcaat 30190770  T
Q  154 aaataa 159  Q
     |||||    
T  30190771 taataa 30190776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 1778789 - 1778642
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| || |||||||       |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||    
T  1778789 acaatattagtcgtttaaggtttgtgcatgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatgataaaattaatgacatttactaaaacatcctta 1778690  T
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    || |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  1778689 tt-attgtagttagtggagtagataagttggatgaaattcaataaataa 1778642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 37312097 - 37311949
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    |||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||||    
T  37312097 acaatattagtcgtttaaggtttatgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaaaaccctta 37311998  T
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  37311997 ttaattgtagttagtggagtagttaaatttaatgaaattcaataaataa 37311949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 54 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 11905926 - 11905813
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||| ||||  ||| |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  11905926 tgattaattgtgttaattttgatgataaaattagtatcatttactaaagcacccttattaattgtagttaatggagttgttaagttggatgaaattcaat 11905827  T
Q  154 aaataaagatataa 167  Q
    ||||||||||||||    
T  11905826 aaataaagatataa 11905813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Original strand, 23004351 - 23004498
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| || ||||||       ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||| ||||    
T  23004351 acaatattagtcgtttaaggtttgtt-actattattaaggaaatgattaattgtgtcgatttcaatggtaaaattagtagtatatactaaaacaccctta 23004449  T
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23004450 ttaattgtagttagtggagtagttaagttgtatgaaattcaataaataa 23004498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 54 - 157
Target Start/End: Original strand, 24569111 - 24569214
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  24569111 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatattatttactaaaatacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttgaatgaaattcatt 24569210  T
Q  154 aaat 157  Q
    ||||    
T  24569211 aaat 24569214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 56 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 30711175 - 30711072
Alignment:
Q  56 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataa 155  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  30711175 attaattatgttgattttaatgataaaattaatatcatttactaaaacaccattattaattgtagttaatggagcaattaagttagatgaaattcaataa 30711076  T
Q  156 ataa 159  Q
    ||||    
T  30711075 ataa 30711072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Original strand, 36460384 - 36460532
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    |||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||       | |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |  ||||    
T  36460384 acaatattagtcgtttaaagtttgtgcacgattattaagaaaattattaattgtgttaatttcaatagtaaaattagtaacatttattaaaatattctta 36460483  T
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  36460484 ttaattgtagttaatggagtaattaagttggatgaaattcaataaataa 36460532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 19823145 - 19823010
Alignment:
Q  24 tttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagtta 123  Q
    |||||| ||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||  |||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19823145 tttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtagaattagtatcatttactaaaacacccttattaattgtagtta 19823046  T
Q  124 atggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
     ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19823045 gtggaatagttaagttggatgaaattcaataaataa 19823010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 45710954 - 45710849
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  45710954 tgattaattatgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaaacacttttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaagttcaat 45710855  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  45710854 aaataa 45710849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 60 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 36476682 - 36476583
Alignment:
Q  60 attgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36476682 attgtgttgattgcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatacccttattaattgtagttagtagagtagttaagtttgatgaaattcaataaataa 36476583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 3313397 - 3313253
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||       ||||||    ||| ||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||| ||||    
T  3313397 acaatattagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaagaaaatgatta----tgtcgatttcaatggtaaaattagtagaattaactaaaacaccctta 3313302  T
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  3313301 ttaattgtagttaatggagtatttaagttggatgaaattcaataaataa 3313253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 27471482 - 27471332
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    |||| |||| || |||||||||||| ||||||||||       ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||| ||||    
T  27471482 acaacattaatcgtttaagatttgtgcacgattattaagaaaatgattaattatgttgatttcaatggtgaaattagttgcatttactaaaacactctta 27471383  T
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaag 161  Q
    |||||| ||  || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27471382 ttaattataagtagtggagtagttaagttgaatgaaattcaataaataaag 27471332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 29023977 - 29024081
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  29023977 tgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacat-cttattaattgtagttagtggagtaattaagttggatgaaattcaat 29024075  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  29024076 aaataa 29024081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 159
Target Start/End: Original strand, 8679029 - 8679170
Alignment:
Q  18 tagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattg 117  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |  ||||||||||     
T  8679029 tagtcgtttaagatttatgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaagatccttattaatta 8679128  T
Q  118 tagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    |||||| || |  | |||||||||||||||||||||||||||    
T  8679129 tagttagtgaattaattaagttggatgaaattcaataaataa 8679170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 160
Target Start/End: Original strand, 28690763 - 28690899
Alignment:
Q  24 tttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagtta 123  Q
    |||||| ||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |   ||||||||||||||||    
T  28690763 tttaaggtttgtgcacgattattaaagaaatgattaattgtgttgatttcaacggtaaaattaatatcatttactaaaatatctttattaattgtagtta 28690862  T
Q  124 atggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaa 160  Q
     ||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28690863 gtgagatagttaagttggatgaaattcaataaataaa 28690899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 37497626 - 37497490
Alignment:
Q  24 tttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagtta 123  Q
    |||||||||| | ||||||||||       ||||| |||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||||  || |||| ||||||||    
T  37497626 tttaagatttatgcacgattattaaggaaatgatttattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacaccgttgttaactgtagtta 37497527  T
Q  124 atggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaa 160  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37497526 gtggagtagttaagttggatgaaattcaataaataaa 37497490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 57 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 44301663 - 44301561
Alignment:
Q  57 ttaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaa 156  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44301663 ttaattatgttgatttcaatgataaaattagtatcatttactaaaatacccttatcaattgtaattagtggagtagttaagttggatgaaattcaataaa 44301564  T
Q  157 taa 159  Q
    |||    
T  44301563 taa 44301561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 3901160 - 3901265
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||    
T  3901160 tgattaattgtattaatttcaatgataaaattaatatcatttactaaaacattcttattagttgtagttagtggggtacttaagttggatgaaattcaat 3901259  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  3901260 aaataa 3901265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 51837970 - 51838075
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||||| || ||||| ||||| |||| |||||||||| |    
T  51837970 tgattaattgtgttgatttcaatgataaaattaatatcatttactaaaatacccttattagttgtagctagtggagtagttacgttgaatgaaattcatt 51838069  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  51838070 aaataa 51838075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 54726589 - 54726484
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||    
T  54726589 tgattaaatgtgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaaacatctttattaattgtagttaatggagtagttaagttagatgaagtttaat 54726490  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  54726489 aaataa 54726484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 159
Target Start/End: Original strand, 10366618 - 10366765
Alignment:
Q  19 agtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgc-------ttat 111  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| |       ||||    
T  10366618 agtcgtttaaggtttgtgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtatcatttattaaaacactcttattaattat 10366717  T
Q  112 taattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10366718 taattgtagttagtgaagtagttaagttggatgaaattcaataaataa 10366765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 61 - 159
Target Start/End: Original strand, 39043772 - 39043873
Alignment:
Q  61 ttgtgttgatttcaatggtaaaattaataa---catttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaat 157  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  39043772 ttgtgttgatttcaatggtaaaattaatagtatcatttactaaaatacctttattaattgtagttagtggagtagttaagttgaatgaaattcaataaat 39043871  T
Q  158 aa 159  Q
    ||    
T  39043872 aa 39043873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 57 - 148
Target Start/End: Original strand, 54477473 - 54477564
Alignment:
Q  57 ttaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaat 148  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |   |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  54477473 ttaattgtgttgattttaatggtaaaattaatatcatttactaaaatatttttattaattgtagttaatggagtagttaagttgaatgaaat 54477564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 54 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 19612012 - 19611907
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||| |  |||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  19612012 tgattaattgtgttgatttcaatgttaaaatta-tataatttactaaaatatccttattaattgttgttagtggagtagttaagtttgatgaaattcaat 19611914  T
Q  154 aaataaa 160  Q
    |||||||    
T  19611913 aaataaa 19611907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 34750600 - 34750495
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||| | |||    
T  34750600 tgattgattgtgttgattttaatggtaaaattagtatcatttactaaaacatccttattaattgtagttggtggagtagttaacttggatgaaaattaat 34750501  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  34750500 aaataa 34750495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 37772975 - 37773080
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||| | ||||  |||||||||| |||||||||| |    
T  37772975 tgattaattgtattgattacaatggtaaaattaatatcatttactaaaatacccttattaattatagtcagtggaatagttaagttgaatgaaattcatt 37773074  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  37773075 aaataa 37773080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 5322948 - 5323053
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| || ||| |  || ||||||||| |||||||||||||    
T  5322948 tgattaattatgttgatttcagtgataaaattaatatcatttactaaaatacacttattaattataattagtaaagtagttaagtttgatgaaattcaat 5323047  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  5323048 aaataa 5323053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 14194659 - 14194547
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||  |||| |||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  14194659 tgatcaattgtgttgatttcaatgataaaattagtaccatttactaaaatacttttatgaattgt-gttagtggagtaattaagttggatgaaattcaat 14194561  T
Q  154 aaataaagatataa 167  Q
     ||||||| |||||    
T  14194560 taataaaggtataa 14194547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 54 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 43719370 - 43719272
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| |||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  43719370 tgattaattgtgttgattttaatggtaaaatta-tatcattcactgaaacatccttattaattgtagttagtggagtagttaaattggatggaattcaat 43719272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 54 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 52290997 - 52290886
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||||||| || |||||| |||||||  |||||||||| |||||| ||||| |||||||||| || || ||||||    
T  52290997 tgattaattgtattgattttgatggtaaaattagtaccatttattaaaacagccttattaattatagttagtggagtagttaagttgaataaagttcaat 52290898  T
Q  154 aaataaagatat 165  Q
    |||||| |||||    
T  52290897 aaataaggatat 52290886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 19609403 - 19609297
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |  ||||||| |||| |||| ||||| || |||||| ||| |||||||||    
T  19609403 tgattatttgtgttgatttcaatcgtaaaattaatatcatttacaaaaatattcttattacttgttgttagtggagtagataagtttgataaaattcaat 19609304  T
Q  154 aaataaa 160  Q
    |||||||    
T  19609303 aaataaa 19609297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 38795448 - 38795346
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||  |||  | ||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||| |||    
T  38795448 tgattaattgtgtttatttcaatggtaaaattagtatcatttacccaaatgcccttattaattgtagttggtggagttgttaagttggatgaaatttaat 38795349  T
Q  154 aaa 156  Q
    |||    
T  38795348 aaa 38795346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 12736583 - 12736688
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||||| || ||||||||| || || ||||||||||||| ||| || || |||||| |||||| |||||||||    
T  12736583 tgattaattgtgttgattctaatgataaaattagtatcatttactacaatacccttattaattgtacttagtgtagtagttaatttggataaaattcaat 12736682  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  12736683 aaataa 12736688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 30682077 - 30682182
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||||| || |||| |||| |||||| | || |||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||    
T  30682077 tgattaattgttttaattttaatgttaaaatgagtatcatttactaaaataatcttattaattgtagttaatggaataattaagttggacgaaattcaat 30682176  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  30682177 aaataa 30682182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 49830233 - 49830164
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagtta 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  49830233 tgattaattgtgttgatttcaatagtaaaattaatatcatttactaaaataccattattaattgtagtta 49830164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 53560321 - 53560216
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||| | |||||| | ||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  53560321 tgattaattatgttgattttgatggtaaaatttgtatcatttactaaaacacccttattaaatatagttagtagagtagttaagttgaatgaagttcaat 53560222  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  53560221 aaataa 53560216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 17652852 - 17652751
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| || ||    |||||||||||  ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||| |||    
T  17652852 tgattaattgtgttgattttgatggtaaaactagta----ttactaaaacatccttattaattgtagttagtgaggtagttaagttggatgaaatttaat 17652757  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  17652756 aaataa 17652751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 167
Target Start/End: Original strand, 38137460 - 38137570
Alignment:
Q  60 attgtgttgatttcaatggtaaaattaata---acatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaa 156  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||| ||   |||| |||||||| |  |||||||| |||||||| ||| | |||||| || ||||||||||||||||    
T  38137460 attgtgtcgatttcaatagtaaaattagtactgacatctactaaaatattcttattaactgtagttagtggggtagttaaattcgatgaaattcaataaa 38137559  T
Q  157 taaagatataa 167  Q
    |||||||||||    
T  38137560 taaagatataa 38137570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 26467214 - 26467101
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagtta--atggagcagttaagttggatgaaattca 151  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||  |||||| |||||| ||||| | | ||||||||||||||||  ||| || ||||||||| |||||||||||    
T  26467214 tgattgattgtgttgattttaatgataag-ttaatatcatttattaaaatatgtttattaattgtagttataatgaagtagttaagttagatgaaattca 26467116  T
Q  152 ataaataaagatata 166  Q
    |||||||| ||||||    
T  26467115 ataaataatgatata 26467101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 105
Target Start/End: Original strand, 31158492 - 31158583
Alignment:
Q  13 aatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacac 105  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||       |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31158492 aatattagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaaaaaa-tgattaattgtgctgatttcgatagtaaaattaataacatttactaaaacac 31158583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 65 - 166
Target Start/End: Original strand, 25108547 - 25108648
Alignment:
Q  65 gttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaagata 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||    || |||| |||||||||| || |||||| | | ||||||||||||||||||| |||    
T  25108547 gttgatttcaatggtaaaattaatatcatcttctaaaacataagtactaatcgtagttaatgaagtagttaaatagaatgaaattcaataaataaaaata 25108646  T
Q  165 ta 166  Q
    ||    
T  25108647 ta 25108648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 12904967 - 12904863
Alignment:
Q  56 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaaca-cgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaata 154  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||| ||  |||||  |||| | |  |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  12904967 attaattatgttgatttcaattataaaattagtatgatttatcaaaatatcttttattaattgtagttagtggagtaattaagttggatgaaattcaata 12904868  T
Q  155 aataa 159  Q
    |||||    
T  12904867 aataa 12904863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 34957607 - 34957495
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||  ||  ||||||| ||| |  |||||||||| |||||| ||||| |||| ||||  ||||||||||||    
T  34957607 tgattaattgtgttgaatttgatggtaaaatttgtataatttacttaaatatccttattaattatagttagtggagtagttcagttaaatgaaattcaat 34957508  T
Q  154 aaataaagatata 166  Q
    |||||| ||||||    
T  34957507 aaataaggatata 34957495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 165
Target Start/End: Original strand, 41038448 - 41038515
Alignment:
Q  98 taaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaagatat 165  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  41038448 taaaatactcttattaattgtagttaatgaagtagttaagttggttgaagttcaataaataaggatat 41038515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 66 - 160
Target Start/End: Original strand, 36462969 - 36463063
Alignment:
Q  66 ttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaa 160  Q
    ||||||| |||| |||||||  || |||||||||||| |  |||||||||||| |||  ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36462969 ttgattttaatgttaaaattggtagcatttactaaaataaccttattaattgttgtttgtggagtaattaagttggatgaaattaaataaataaa 36463063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 85
Target Start/End: Original strand, 33491051 - 33491125
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaatt 85  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33491051 acaatattagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatagtaaaatt 33491125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 149
Target Start/End: Original strand, 33491408 - 33491465
Alignment:
Q  92 atttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaatt 149  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  33491408 atttactaaaacactcttattaattatagttagtggagtagttaagttgtatgaaatt 33491465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 98 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 40194563 - 40194494
Alignment:
Q  98 taaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaagatataa 167  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||| | |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  40194563 taaaatactcttattaattgtagttagtggcgtagttgagttggaagaaatttaataaataaagatataa 40194494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 169
Target Start/End: Original strand, 41351629 - 41351690
Alignment:
Q  108 ttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaagatataaat 169  Q
    ||||||||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  41351629 ttattaatgatagttagtggagtagttaagttgaatgaaattcaataaataaaggtataaat 41351690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 131 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 24703689 - 24703653
Alignment:
Q  131 agttaagttggatgaaattcaataaataaagatataa 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24703689 agttaagttggatgaaattcaataaataaagatataa 24703653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 49447805 - 49447907
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||||||||| |   ||| |||||  |||||| |||| || ||||||||||||||||| | ||  |||||| || ||||||||| |||    
T  49447805 tgattaattgtgttgatttcaacg---aaaataatattatttaccaaaatacccttattaattgtagttagtagaatagttaaatttgatgaaatttaat 49447901  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  49447902 aaataa 49447907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 42278757 - 42278695
Alignment:
Q  66 ttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatgga 128  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||    
T  42278757 ttgatttcaatcgtaaaattaacatcatttactaaaacactcatattaattatagttagtgga 42278695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 152
Target Start/End: Original strand, 48541036 - 48541109
Alignment:
Q  79 taaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaa 152  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| |  ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||| |||||||||||    
T  48541036 taaaattaatatcatttattaaaatattcttattaattgtaattagttgagtagttaagttgaatgaaattcaa 48541109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 38705226 - 38705174
Alignment:
Q  107 cttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||||||||||||||| | ||| | ||||||| |||||||||||||||||||    
T  38705226 cttattaattgtagttagttgagtaattaagttagatgaaattcaataaataa 38705174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 102
Target Start/End: Original strand, 52206870 - 52206906
Alignment:
Q  66 ttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  52206870 ttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaa 52206906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 123
Target Start/End: Original strand, 50035185 - 50035297
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    |||||||||| | |||||| ||||| || |||||||       ||| ||||| |||||||||||||  |||||||| || ||||||| |||||||  ||     
T  50035185 acaatattagacttttaaggtttgtgcatgattattaagaaaatgaataattatgttgatttcaataataaaattagtagcatttaccaaaacaccgttg 50035284  T
Q  111 ttaattgtagtta 123  Q
    |||||||||||||    
T  50035285 ttaattgtagtta 50035297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 159
Target Start/End: Original strand, 24245109 - 24245209
Alignment:
Q  58 taattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaat 157  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||| ||  |||||||||||||   |||||||||||| ||| |  || |||||| | ||||| ||||||||||||    
T  24245109 taattatgttgatttcaataataaaattagtattatttactaaaaca-tattattaattgtacttagtaaagtagttaaatcggatgcaattcaataaat 24245207  T
Q  158 aa 159  Q
    ||    
T  24245208 aa 24245209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 48893829 - 48893773
Alignment:
Q  69 atttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaat 125  Q
    |||| |||||||||||  ||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  48893829 attttaatggtaaaatatatatcatttgctaaaacactcttattaattatagttaat 48893773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 167
Target Start/End: Original strand, 50036520 - 50036556
Alignment:
Q  131 agttaagttggatgaaattcaataaataaagatataa 167  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  50036520 agttaagtttgatgaaattcaataaataaaggtataa 50036556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Original strand, 51064829 - 51064861
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaatta 86  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51064829 tgattaattgtgttgctttcaatggtaaaatta 51064861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 57)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 45235726 - 45235573
Alignment:
Q  13 aatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttatt 112  Q
    |||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||       ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  45235726 aataatagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattgattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaacacccttatt 45235627  T
Q  113 aattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaagatata 166  Q
    |||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  45235626 aattgtagttaatgaaatagttaagtttgatgaaattcaataaataaggatata 45235573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 8947061 - 8947166
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8947061 tgattaattgtgttgatttcaatgataaaattagtaatatttactaaaacatccttattaattatagttagtggagtagttaagttggatgaaattcaat 8947160  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  8947161 aaataa 8947166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 15359096 - 15359201
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  15359096 tgattaattgtgttgattttgatgataaaattaatatcatttactaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaagttcaat 15359195  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  15359196 aaataa 15359201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 37322532 - 37322427
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  37322532 tgattgattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttattaaaatacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttagatgaaattcaat 37322433  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  37322432 aaataa 37322427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Original strand, 5789614 - 5789762
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||       ||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |  ||||||||||||||| ||||    
T  5789614 acaatattagtcatttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtattgaattcaatagtaaaattagtggcatttactaaaacaccctta 5789713  T
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5789714 ttaattgtagttagtgaaatagttaagttggatgaaattcaataaataa 5789762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 160
Target Start/End: Original strand, 16377622 - 16377775
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||       |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |  ||||    
T  16377622 acaatattaatcgtttaagatttgtgcacgattattaaagaaatgattaattgtgttgattacaatggtaaaattaatatcatttaccaaaataacctta 16377721  T
Q  111 ttaattgtagttaatggagcag----ttaagttggatgaaattcaataaataaa 160  Q
    ||||||||||||| ||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16377722 ttaattgtagttagtggagtagttaattaagttggatgaaattcaataaataaa 16377775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 61 - 167
Target Start/End: Original strand, 14523388 - 14523494
Alignment:
Q  61 ttgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaa 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||     
T  14523388 ttgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatatccttattaattgtagttagtggagtagttaagttagatgaaattcaattaataag 14523487  T
Q  161 gatataa 167  Q
    |||||||    
T  14523488 gatataa 14523494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 39691624 - 39691489
Alignment:
Q  24 tttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagtta 123  Q
    |||||| ||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  39691624 tttaaggtttgtgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatgataaaattaatatcatttactaaaatactcttattaattgcagtta 39691525  T
Q  124 atggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
     ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  39691524 gtggagtagtaaagttgaatgaaattcaataaataa 39691489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 43410566 - 43410427
Alignment:
Q  18 tagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattg 117  Q
    |||||||||||  ||||| ||||||||||       | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||    
T  43410566 tagtcctttaatgtttgtgcacgattattaaggaaattattaattgtgttgatatcaatgataaaattaatatcatttactaaaatatccttattaattg 43410467  T
Q  118 tagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaat 157  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  43410466 tagttaatggagtagttaagttgaatgaaattcaataaat 43410427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 66 - 164
Target Start/End: Original strand, 39329685 - 39329782
Alignment:
Q  66 ttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaagata 164  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  39329685 ttgatttcaatgataaaattaatagcatttactaaaacactcttattaattgtagtt-atggagtagttaaattggatgaaattcaataaataacgata 39329782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 39785692 - 39785584
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataa---catttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattc 150  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  39785692 tgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtactatcatttactaaaacactcttattaattgtagttaatggagtagttaagttggatgaagttc 39785593  T
Q  151 aataaataa 159  Q
    |||||||||    
T  39785592 aataaataa 39785584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 16463793 - 16463688
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||| |||    
T  16463793 tgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttactaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagtaaagtttgatgaaatttaat 16463694  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  16463693 aaataa 16463688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 35313991 - 35313886
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||| ||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  35313991 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagtatttattaaagcaaccttattaattgtagttagtggagtagttaagtttgatgaaattcaat 35313892  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  35313891 aaataa 35313886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 24 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 17695464 - 17695329
Alignment:
Q  24 tttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagtta 123  Q
    |||||| ||||| ||||||||||       ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |  |||||||||| ||||||    
T  17695464 tttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtattgatttcaatggtaaaattgatatcatttacaaaaatattcttattaattatagtta 17695365  T
Q  124 atggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
     | ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17695364 gtagagtagttaagttggatgaaattcaataaataa 17695329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 25637585 - 25637480
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| |  |||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||    
T  25637585 tgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtgtcatttactaaaacacctttattaattgtagttataggagtagttaagttggatgaaatttaat 25637486  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  25637485 aaataa 25637480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 36794388 - 36794283
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| || | ||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  36794388 tgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcttttactaaaacgcccttattaactgtagttagtggagtagttaagttggatgaagttcaat 36794289  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  36794288 aaataa 36794283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 61 - 159
Target Start/End: Original strand, 36354459 - 36354557
Alignment:
Q  61 ttgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||||||||||  |||||||||||| ||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36354459 ttgtgttgattttgatggtaaaattagtattatttattgaaacactcttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaattcaataaataa 36354557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 54 - 152
Target Start/End: Original strand, 43115811 - 43115909
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaa 152  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  43115811 tgattaattgtgttgatttcaatgataaagttagtagcatttactaaaatactcttatttattgtagttagtggagtagttaagttgaatgaaattcaa 43115909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 159
Target Start/End: Original strand, 31448666 - 31448807
Alignment:
Q  18 tagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattg 117  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||  ||||||||||||    ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  31448666 tagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagagtcatttactaaaacacccttactaattg 31448765  T
Q  118 tagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
     ||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31448766 cagttagtgaaatagttaagttggatgaaattcaataaataa 31448807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 56 - 163
Target Start/End: Original strand, 17346373 - 17346480
Alignment:
Q  56 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataa 155  Q
    ||||||| | ||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||| |   |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  17346373 attaattattttgatttcaaaagtaaaattaatatcatttattaaaatatttttattaattgtagttagtggagtagttaagttggaagaaattcaataa 17346472  T
Q  156 ataaagat 163  Q
    ||||||||    
T  17346473 ataaagat 17346480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 16806015 - 16805880
Alignment:
Q  24 tttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagtta 123  Q
    |||||| ||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  16806015 tttaaggtttgtgcacgattattaaagaaatgattaattgtgttgattttaatagtaaaattagtatcatttactaaaatatccttattaattgtagtta 16805916  T
Q  124 atggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
     |||||  |||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  16805915 gtggagttgttaagttggattaaatttaatagataa 16805880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 16845296 - 16845161
Alignment:
Q  24 tttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagtta 123  Q
    |||||| ||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  16845296 tttaaggtttgtgcacgattattaaagaaatgattaattgtgttgattttaatagtaaaattagtatcatttactaaaatatccttattaattgtagtta 16845197  T
Q  124 atggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
     |||||  |||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  16845196 gtggagttgttaagttggattaaatttaatagataa 16845161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 34225724 - 34225589
Alignment:
Q  24 tttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagtta 123  Q
    |||||| ||||| ||||||||||       ||| ||||| | ||||||| ||||||||| ||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34225724 tttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgaataattatattgattttaatggtaaacttagtattatttactaaaacacccttattaattgtagtta 34225625  T
Q  124 atggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    |||||| | |||||||| |||||||| |||||||||    
T  34225624 atggagtatttaagttgaatgaaatttaataaataa 34225589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 155
Target Start/End: Original strand, 3323252 - 3323382
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||              |||    
T  3323252 acaatattagtcgtttaaggtttgtgcacgattattataaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtaacat--------------tta 3323337  T
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataa 155  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3323338 ttaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaattcaataa 3323382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 160
Target Start/End: Original strand, 35242309 - 35242412
Alignment:
Q  57 ttaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaa 156  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||  | ||||||||| || |   |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35242309 ttaattgtgttgattttaatgttaaaattagaatcatttactagaatatatttattaattgtagttagttgagtagttaagttggatgaaattcaataaa 35242408  T
Q  157 taaa 160  Q
    ||||    
T  35242409 taaa 35242412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 57 - 159
Target Start/End: Original strand, 11742541 - 11742642
Alignment:
Q  57 ttaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaa 156  Q
    |||||||| |||||||  |||||||| | ||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  11742541 ttaattgtattgattttgatggtaaa-tcaatattatttattaaaacacccttattaattgtagttaatggagtagttaagtttgatgaagttcaataaa 11742639  T
Q  157 taa 159  Q
    |||    
T  11742640 taa 11742642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 73 - 159
Target Start/End: Original strand, 32831203 - 32831289
Alignment:
Q  73 caatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||| |||||| |  |||||||||||||||||||    
T  32831203 caatggtaaaattaatatcatttactaaaacatctttattaattgtagttattggagtagttaaatgagatgaaattcaataaataa 32831289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 62 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 43730709 - 43730614
Alignment:
Q  62 tgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaa 160  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  43730709 tgtgttgattttaatggtaaaattaatatcatttactaaaa-ac-cttattaattgtagttactagagtagttaagtagg-tgaaattcaataaataaa 43730614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 19937817 - 19937733
Alignment:
Q  18 tagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaa 102  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19937817 tagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaa 19937733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 157
Target Start/End: Original strand, 41220955 - 41221058
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||| ||||| |   ||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||| ||||||    
T  41220955 tgattaattgtgttgatttcaattataaaattagtatcatttattaaaatatttttattaattgtagttaatgaagtagttaagtcagatgaagttcaat 41221054  T
Q  154 aaat 157  Q
    ||||    
T  41221055 aaat 41221058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 124
Target Start/End: Original strand, 1206712 - 1206782
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaa 124  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  1206712 tgattaattatgttgatttcagtggtaaaattagtaacatttactaaaatatccttattaattgtagttaa 1206782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 155
Target Start/End: Original strand, 34120448 - 34120547
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| || ||  ||||||||||| |   |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  34120448 tgattaattgtgttgattttgatggtaaaactagtattatttactaaaatat--ttattaattgtagttagtggaatagttaagttggatgaaattcaat 34120545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 56 - 159
Target Start/End: Original strand, 9458282 - 9458380
Alignment:
Q  56 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataa 155  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |      || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  9458282 attaattgtgttgattttgatggtaaaattagtg-----tattaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagtaaagttggatgaaatttaataa 9458376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 28170592 - 28170697
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||| |  |||||||||  |||   |||||||||||||||||| ||  | |||| ||||||||||||| ||    
T  28170592 tgattaattatgttgatttcaagggtaaaattagttgcatttactagtacagctttattaattgtagttaatagaataattaaattggatgaaattctat 28170691  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  28170692 aaataa 28170697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 19937436 - 19937376
Alignment:
Q  107 cttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaagatataa 167  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||    
T  19937436 cttattaattgtagttagtggagtagttaagttgaataaaattcaataaataaaggtataa 19937376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 160
Target Start/End: Original strand, 26863405 - 26863473
Alignment:
Q  92 atttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaa 160  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  26863405 atttattaaaacacttttattaattgtagttagtggagtagttaagtcggatgaaattcattaaataaa 26863473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 164
Target Start/End: Original strand, 18853211 - 18853320
Alignment:
Q  56 attaattgtgttgatttcaatggtaa--aattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||||||||| |||  ||||  || ||||||| |||| || ||||||| ||||||||| | ||| | |||| ||||||||||||||||    
T  18853211 attaattgtgttgatttcaatgataattaattg-tatcatttaccaaaatactcttattagttgtagttagtagagtaattaatttggatgaaattcaat 18853309  T
Q  154 aaataaagata 164  Q
    |||||| ||||    
T  18853310 aaataaggata 18853320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 19426560 - 19426470
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgattt-caatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggat 143  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||| |   |||||||||||||| | | ||| |||||||||||||    
T  19426560 tgattaattgtgttgattttcaatgataaaattagcaacatttactaaaatatcattattaattgtagtaagtcgagtagttaagttggat 19426470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 32783468 - 32783404
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgt 118  Q
    |||||||||||||| ||||  || |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||    
T  32783468 tgattaattgtgtttattttgatagtaaaattaatatcatttactaaaacacctttattaattgt 32783404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 156
Target Start/End: Original strand, 43699608 - 43699707
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||| || | ||||||||    ||| ||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  43699608 tgattaactgtgttgatttcaatagtaaaattagtatcatttattaaaatacacctattaatt---tttagtggagtaattaagttggataaaattcaat 43699704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 62 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 43730526 - 43730424
Alignment:
Q  62 tgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaag 161  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||     |||||||||||| ||| | ||| |||||||| || ||||||||||||||||||     
T  43730526 tgtgttgattttaatggtaaaattaatatcatttact-aaatttttttattaattgtatttactagagtagttaagtcgg-tgaaattcaataaataaaa 43730429  T
Q  162 atata 166  Q
    |||||    
T  43730428 atata 43730424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 16807824 - 16807765
Alignment:
Q  107 cttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaagatata 166  Q
    ||||||||| ||||||||| |||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16807824 cttattaatagtagttaatagagttgttgagttagatgaaattcaataaataaagatata 16807765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 16847105 - 16847046
Alignment:
Q  107 cttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaagatata 166  Q
    ||||||||| ||||||||| |||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16847105 cttattaatagtagttaatagagttgttgagttagatgaaattcaataaataaagatata 16847046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 147
Target Start/End: Original strand, 26608178 - 26608245
Alignment:
Q  80 aaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaa 147  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||  |||||||||| ||||||    
T  26608178 aaaattaatatcatttactaaaatactcttattaattatagttagtggattagttaagttgaatgaaa 26608245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 110 - 159
Target Start/End: Original strand, 5272204 - 5272253
Alignment:
Q  110 attaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||    
T  5272204 attaattgtagttagtggagtaattaaattggatgaaattcaataaataa 5272253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 161
Target Start/End: Original strand, 34451346 - 34451451
Alignment:
Q  56 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataa 155  Q
    ||||||| |||||||||| |||  ||||||| ||  ||||||||||| |   | ||||||| |||||| || |  |||| ||||||||||||||||||||    
T  34451346 attaattatgttgatttcgatgagaaaattagtattatttactaaaatattttcattaattctagttattgaaatagtttagttggatgaaattcaataa 34451445  T
Q  156 ataaag 161  Q
    ||||||    
T  34451446 ataaag 34451451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 85
Target Start/End: Original strand, 26607947 - 26608008
Alignment:
Q  24 tttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaatt 85  Q
    |||||| ||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26607947 tttaaggtttgtgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaatt 26608008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 28186308 - 28186212
Alignment:
Q  64 tgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaa 160  Q
    ||||||| | |||||||||||||  | |||||| ||||| |  |||||| ||| ||||||   ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28186308 tgttgatattaatggtaaaattataatcatttattaaaatatccttattcattttagttagcagagtagttaagttgaatgaaattcaataaataaa 28186212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 159
Target Start/End: Original strand, 7494909 - 7494952
Alignment:
Q  116 tgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7494909 tgtagttagcggagtagttaagttggatgaaattcaataaataa 7494952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 11367183 - 11367121
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||  |||||||||    
T  11367183 tgattaattgtgttgattttaattgtaaaattaatgtcatttacttaaatacctttattaatt 11367121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 54 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 31976452 - 31976370
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaa 136  Q
    |||||| | |||||||||||||| |||||||   |  ||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||| ||||||    
T  31976452 tgattagtagtgttgatttcaatagtaaaatatgtttcatttactaaaacactcttaataattatagttagtggagtagttaa 31976370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 159
Target Start/End: Original strand, 7438917 - 7438966
Alignment:
Q  110 attaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||||| || ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7438917 attaattataattattggagtagttaagttgaatgaaattcaataaataa 7438966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 89
Target Start/End: Original strand, 12520861 - 12520894
Alignment:
Q  56 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattaata 89  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12520861 attaattgtgttgattttaatggtaaaattaata 12520894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 18202152 - 18202103
Alignment:
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaa 160  Q
    |||| |||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18202152 ttaaatgtagttagtgaagtagttaagttggatgaaatttaataaataaa 18202103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 160
Target Start/End: Original strand, 36173351 - 36173452
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||| ||||||||| | || ||||||||||| |||||| ||||| || ||||| |||| || ||| ||||    |||||||  ||||||||||||    
T  36173351 tgattaattttgttgattttagtgataaaattaatatcatttattaaaatactcttat-aattataattagtgga----ttaagtttaatgaaattcaat 36173445  T
Q  154 aaataaa 160  Q
    |||||||    
T  36173446 aaataaa 36173452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 3601451 - 3601419
Alignment:
Q  91 catttactaaaacacgcttattaattgtagtta 123  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3601451 catttactaaaacacccttattaattgtagtta 3601419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 118
Target Start/End: Original strand, 4411003 - 4411067
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgt 118  Q
    ||||||||  ||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  4411003 tgattaataatgttgattttaatggcaaaatgaatatcatttgctaaaacgcacttattaattgt 4411067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 60)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 54 - 157
Target Start/End: Original strand, 44761506 - 44761609
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44761506 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaattcaat 44761605  T
Q  154 aaat 157  Q
    ||||    
T  44761606 aaat 44761609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 54 - 165
Target Start/End: Original strand, 10098003 - 10098114
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  10098003 tgattaattgtattgattttgatggtaaaattaatatcatttactataacacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaagttcaat 10098102  T
Q  154 aaataaagatat 165  Q
    ||||||||||||    
T  10098103 aaataaagatat 10098114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 39482762 - 39482614
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| ||||    
T  39482762 acaatattagtcgtttaagatttgtgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaagggtaaaattagtagaatttactaaaacaccctta 39482663  T
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    |||||| |||||| ||||  |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  39482662 ttaattatagttagtggactagttaagtggaatgaaattcaataaataa 39482614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 61 - 167
Target Start/End: Original strand, 9300132 - 9300238
Alignment:
Q  61 ttgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaa 160  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||     
T  9300132 ttgtgttgattttaatggtaaaattaatagcatttactaaaacacccttattaattttagttagtggagtagttaagttgaatgaaattcaataaataag 9300231  T
Q  161 gatataa 167  Q
    |||||||    
T  9300232 gatataa 9300238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 54 - 156
Target Start/End: Original strand, 21216113 - 21216215
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21216113 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagttgcatttactaaaacatccttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaattcaat 21216212  T
Q  154 aaa 156  Q
    |||    
T  21216213 aaa 21216215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 45425678 - 45425783
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  45425678 tgattaattgtgttgattttaatggtaaaattaataacatttattaaaacattcttattaattgtagttagtggagtaattaagttgtatgaaattcaat 45425777  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  45425778 aaataa 45425783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 7173018 - 7172913
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||   ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  7173018 tgattaattgtgttgatttcaatgataaaattagtagcatttactaaaacatatttattaattgtagttaatgaagtagttaagttgaatgaaattcaat 7172919  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  7172918 aaataa 7172913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Original strand, 11976907 - 11977061
Alignment:
Q  13 aatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttatt 112  Q
    |||||||||| |||||| ||||| || |||||||       | ||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||| || ||||||    
T  11976907 aatattagtcgtttaaggtttgtgcatgattattatggaaatcattaattgtgttgatttcaatggtataatcagtagcatttactaaaatacccttatt 11977006  T
Q  113 aattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaagatataa 167  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  11977007 aattgtagttagtagagtagttaagttagatgaaattcaataaataaaggtataa 11977061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 24 - 159
Target Start/End: Original strand, 34948669 - 34948804
Alignment:
Q  24 tttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagtta 123  Q
    |||||||||||| ||| ||||||       ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||  ||||||  ||||||||||||||||    
T  34948669 tttaagatttgtacacaattattaaggaaatgattaattgtgttgatttaaatagtaaaattagtatcatttacagaaacacatttattaattgtagtta 34948768  T
Q  124 atggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34948769 gtggagtagttaagttggatgaaattcaataaataa 34948804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 5053165 - 5053270
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||| |||||||    
T  5053165 tgattaattgtgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaaacagtcttattaattgtagttagcggagtagttaaattggatgagattcaat 5053264  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  5053265 aaataa 5053270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 31271125 - 31271020
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  31271125 tgattgattgtgttgattttaatggtaaaattaatatcatatactaaaatactcttattaattatagttagtggagtagttaagttggataaaattcaat 31271026  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  31271025 aaataa 31271020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 32476391 - 32476286
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  32476391 tgattgattctgttgatttcaatgataaaattaatatcatttattaaaatacccttattaattgtagttaatgaagtagttaagtttgatgaaattcaat 32476292  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  32476291 aaataa 32476286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 123
Target Start/End: Original strand, 1875564 - 1875673
Alignment:
Q  14 atattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttatta 113  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||    
T  1875564 atattagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaacacccttatta 1875663  T
Q  114 attgtagtta 123  Q
    ||||||||||    
T  1875664 attgtagtta 1875673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 167
Target Start/End: Original strand, 17719229 - 17719383
Alignment:
Q  13 aatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttatt 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||       |||||||||||  |||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||||| |  ||||||    
T  17719229 aataatagtcgtttaagatttgtgcacgattattaaaaaaatgattaattgtaatgattttaatggtaaagttagtattatttactaaaatatccttatt 17719328  T
Q  113 aattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaagatataa 167  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  17719329 aattatagttagtggagtagttaagttggatgaaatttaataaataaaggtataa 17719383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 31082723 - 31082610
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |   |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  31082723 tgattaattgtcttgattttaatgataaaattagtggtatttactaaaacacccttattaattatagttagtggagtagttaagttggatgaaatttaat 31082624  T
Q  154 aaataaagatataa 167  Q
    |||||||| |||||    
T  31082623 aaataaaggtataa 31082610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 31231834 - 31231729
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||| |||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  31231834 tgatgaattgtgtcgattttgatggtaaaattaatatcatttactgaaacacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttggataaagttcaat 31231735  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  31231734 aaataa 31231729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 42887104 - 42886999
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  42887104 tgattaattgtgttgatttcaatagcaaaattagtatcatttactaaaatacctttattaattgtagttagtggcgtagttaagttggataaaattcaat 42887005  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  42887004 aaataa 42886999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 159
Target Start/End: Original strand, 10179923 - 10180064
Alignment:
Q  18 tagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattg 117  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||       ||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| || |||||||||||    
T  10179923 tagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaagaaaatgagtagttgtattgatttcaatggtaaaattagtataatttactaaaatacacttattaattg 10180022  T
Q  118 tagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  10180023 tagttagtggagtagttaagttgaatgaaattcaattaataa 10180064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 156
Target Start/End: Original strand, 42972490 - 42972625
Alignment:
Q  24 tttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagtta 123  Q
    |||||| ||||| ||||||||||       ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  42972490 tttaaggtttgtgcacgattattaagaaaatgattaattgttttgatttcaatggtaaaattaatatcgtttactaaaatacccttattaattatagtta 42972589  T
Q  124 atgga---gcagttaagttggatgaaattcaataaa 156  Q
     ||||   | |||||||||| |||||||||||||||    
T  42972590 gtggagacgtagttaagttgaatgaaattcaataaa 42972625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 160
Target Start/End: Original strand, 4428363 - 4428469
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||| ||  |||||||||||||||| || |  ||||||||| |||||||||||||    
T  4428363 tgattatttgtgttgattttaatgataaaattattatcatttactaaaatacaattattaattgtagttagtgaattagttaagttagatgaaattcaat 4428462  T
Q  154 aaataaa 160  Q
    |||||||    
T  4428463 aaataaa 4428469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 22771847 - 22771952
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||| |  |||||| |||||||| ||||||||||||||||| || || | ||| |||||||||||||||||    
T  22771847 tgattaattgggttgattttgatggtaaaattagtgtcatttattaaaacacccttattaattgtagttagtgaagtaattatgttggatgaaattcaat 22771946  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  22771947 aaataa 22771952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 40996377 - 40996482
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||||||  |  ||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |   ||||||||||||||||||||||    
T  40996377 tgattaattgtgttgattttgaatgtaaaattagtttcatttactaaaacacccttattaattgtagttagtgaaatggttaagttggatgaaattcaat 40996476  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  40996477 aaataa 40996482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 54 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 5356703 - 5356593
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||   ||  |||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  5356703 tgattagttgtgttgattttaatgataaaattaatatcatttactaatgtact-ttattaattgtagttaatggaataattaagttggatgaaattcaat 5356605  T
Q  154 aaataaagatata 166  Q
    ||| |||||||||    
T  5356604 aaa-aaagatata 5356593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 57 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 13335317 - 13335217
Alignment:
Q  57 ttaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaa 156  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||| ||||||||  |||||||||| ||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13335317 ttaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttagtaaaacacatttattaattgcagttagtagagtagttaagtttgatgaaattcaataaa 13335218  T
Q  157 t 157  Q
    |    
T  13335217 t 13335217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 156
Target Start/End: Original strand, 14854952 - 14855048
Alignment:
Q  60 attgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaa 156  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||| | || |||||||||||||||    
T  14854952 attgtgttgattttaatggtaaaattaattgcatttgctaaaacacctttattaattgtagttagtggagtagttaggctgaatgaaattcaataaa 14855048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 55 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 41092097 - 41092029
Alignment:
Q  55 gattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagtta 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  41092097 gattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttattaaaatactcttattaattgtagtta 41092029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 39405909 - 39405761
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||       |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||| || |   |||    
T  39405909 acaatattagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttaatttcaatgataaaattagtatcatttactataatatcttta 39405810  T
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||||  ||||| ||||| | |||||||| |||||||| |||||||||    
T  39405809 ttaattacagttagtggagtaattaagttgaatgaaattaaataaataa 39405761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 57 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 17824022 - 17823920
Alignment:
Q  57 ttaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaa 156  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| || | ||||||| || ||  |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  17824022 ttaatcgtgttgatttcaatgataaaattagtatcttttactagaatacctttattaattgtagttagtgaagtagttaagttggatgaaattaaataaa 17823923  T
Q  157 taa 159  Q
    |||    
T  17823922 taa 17823920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 396623 - 396728
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||| || |  |||||||||||||||||||| || |||||  |||||| |||||||||    
T  396623 tgattaattatgttgatttcaacggtaaaattagtatcatttactacaatatccttattaattgtagttaatgaagtagttatattggataaaattcaat 396722  T
Q  154 aaataa 159  Q
     |||||    
T  396723 taataa 396728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 56 - 116
Target Start/End: Original strand, 7703170 - 7703230
Alignment:
Q  56 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaatt 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  7703170 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatacccttattaatt 7703230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Original strand, 27294073 - 27294177
Alignment:
Q  56 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataa 155  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||||||| || | |||||||||| |   |||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  27294073 attaattgtgttcatttgaatgataaaattagtatcttttactaaaatatatttattaattgcagttagtggagtaattaagttggatgaaattcaataa 27294172  T
Q  156 ataaa 160  Q
    |||||    
T  27294173 ataaa 27294177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 91 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 32678470 - 32678402
Alignment:
Q  91 catttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32678470 catttactaaaacatccttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaattaaataaataa 32678402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 34393966 - 34394075
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaa----tggagcagttaagttggatgaaatt 149  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  ||||||||||||||  ||||||||| |||||||    ||||| ||||||||||||| || ||    
T  34393966 tgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtataatttactaaaacacctttattaattatagttaactagtggagtagttaagttggataaagtt 34394065  T
Q  150 caataaataa 159  Q
    ||||||||||    
T  34394066 caataaataa 34394075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 92 - 159
Target Start/End: Original strand, 29226578 - 29226645
Alignment:
Q  92 atttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29226578 atttattaaaacactcttattaattgtagttagtggagtagttaagttagatgaaattcaataaataa 29226645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 119
Target Start/End: Original strand, 39300912 - 39301018
Alignment:
Q  13 aatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttatt 112  Q
    |||| ||||| ||||||||||||  |||||||||       ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || || |||    
T  39300912 aatagtagtcgtttaagatttgtgtacgattattaaagaaatgattaattatgttgatttcgatggtaaaattaatatcatttactaaaaaaccctaatt 39301011  T
Q  113 aattgta 119  Q
    |||||||    
T  39301012 aattgta 39301018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 56 - 159
Target Start/End: Original strand, 36006901 - 36007004
Alignment:
Q  56 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataa 155  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||||||||  ||| ||||||| |  | ||||||||||||||| ||| | | ||||||| |||||||||||||||    
T  36006901 attagttgtgttgattttaatgataaaattaatattattgactaaaatatccctattaattgtagttagtggggtaattaagtttgatgaaattcaataa 36007000  T
Q  156 ataa 159  Q
    ||||    
T  36007001 ataa 36007004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 40028620 - 40028514
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgta----gttaatggagcagttaagttggatgaaatt 149  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |   ||||||||||||    |||| || || | ||||||| |||||||||    
T  40028620 tgattaattatgttgatttcaatggtaaaattaatagcatttattaaaatatcattattaattgtatttagttagtgaagtaattaagttagatgaaatt 40028521  T
Q  150 caataaa 156  Q
    |||||||    
T  40028520 caataaa 40028514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 159
Target Start/End: Original strand, 4924081 - 4924184
Alignment:
Q  56 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataa 155  Q
    |||| ||||||  |||| ||||||||||||| ||  ||||||||||| |   |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| | |||||    
T  4924081 attagttgtgtatattttaatggtaaaattagtattatttactaaaatatctttattaattgtagttaatagagtagttaagttgaatgaaacttaataa 4924180  T
Q  156 ataa 159  Q
    ||||    
T  4924181 ataa 4924184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 36967465 - 36967414
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacac 105  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36967465 tgattaattgtgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaaacac 36967414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 56 - 159
Target Start/End: Original strand, 2767305 - 2767414
Alignment:
Q  56 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatg------gagcagttaagttggatgaaatt 149  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||| |||||||  ||||||| ||||||||| ||      ||| ||||||||||||| || ||    
T  2767305 attaattgtgttgattttgatggtaaaattagtatcatttattaaaacatccttattatttgtagttagtggaggatgagtagttaagttggattaagtt 2767404  T
Q  150 caataaataa 159  Q
    ||||||||||    
T  2767405 caataaataa 2767414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 135
Target Start/End: Original strand, 3117032 - 3117111
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagtta 135  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  3117032 tgattaatagtgttgatttcaatggtaaaatgtgt--catttactaaaacacccttgttaattatagttaatggagtagtta 3117111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 26626124 - 26626229
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||||  ||  ||||| ||||| |  ||||||||||||||||| ||||| |||   |||| ||||||||||||    
T  26626124 tgattaattgtgttgaatttgatggtaaaatttgtataatttattaaaatatccttattaattgtagttagtggagtagtccggttgaatgaaattcaat 26626223  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  26626224 aaataa 26626229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 31331512 - 31331419
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaa 147  Q
    ||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||  ||||||||||| |   |||||||||||||||| || || | |||||||||||||||    
T  31331512 tgattaattgtattgatttcaattataaaattattattatttactaaaatatcattattaattgtagttagtgaagtaattaagttggatgaaa 31331419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 65 - 129
Target Start/End: Original strand, 44648555 - 44648619
Alignment:
Q  65 gttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggag 129  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||| |||||||| ||| |||||    
T  44648555 gttgatttcaatggtaaaattagtatcatttactaaaacatacttactaattgtaattagtggag 44648619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 51246 - 51143
Alignment:
Q  24 tttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagtta 123  Q
    |||||| ||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||| |||| |||||| | || ||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  51246 tttaaggtttgtgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgattttaatg-taaaataagtatcatttacaaaaacacatttattaattgtagtta 51148  T
Q  124 atgga 128  Q
     ||||    
T  51147 gtgga 51143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 6611844 - 6611769
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaatta 86  Q
    |||||||||||| ||||||||||   ||||||||||       ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6611844 acaatattagtcgtttaagatttacacacgattattaaaaaaatgattaattatgttgatttcaatggtaaaatta 6611769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 58 - 163
Target Start/End: Original strand, 34455701 - 34455803
Alignment:
Q  58 taattgtgttgatttcaatggtaaaa-ttaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaa 156  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| ||| || |||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||    
T  34455701 taattgtgttgattttaatgataaaatttagtatcattta-taaaatacgttta-taattgtagttaatggag-agttaagttggat-aagtttaataaa 34455796  T
Q  157 taaagat 163  Q
    |||||||    
T  34455797 taaagat 34455803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 33765764 - 33765663
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||| ||||||||| |||  |||||||| || |||||||||| | ||  |||||||||||||||  || | ||| ||| |||| |||||||||||    
T  33765764 tgattaattatgttgattttaatactaaaattactatcatttactaatatacttttattaattgtagttggtgaatcagataaattgggtgaaattcaat 33765665  T
Q  154 aa 155  Q
    ||    
T  33765664 aa 33765663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 12559697 - 12559649
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaa 102  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  12559697 tgattaattgtgttgattttaataataaaattaataccatttactaaaa 12559649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 35732188 - 35732120
Alignment:
Q  91 catttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||| ||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  35732188 catttactaaaatactcctattaattgtaattagtggagtagtaaagttagatgaaattcaatatataa 35732120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 56 - 155
Target Start/End: Original strand, 34057632 - 34057731
Alignment:
Q  56 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataa 155  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||| || ||  ||||||||||| |   || ||| ||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||    
T  34057632 attaattatgttgatttcaataataaaactagtattatttactaaaatatcgttgttatttgtagttagtgaaatagttaagttggatgaaattcaataa 34057731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 108 - 167
Target Start/End: Original strand, 43719302 - 43719361
Alignment:
Q  108 ttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaagatataa 167  Q
    ||||||||| |||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43719302 ttattaattatagttagttgaataattaagttggatgaaattcaataaataaaggtataa 43719361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 1739742 - 1739712
Alignment:
Q  56 attaattgtgttgatttcaatggtaaaatta 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1739742 attaattgtgttgatttcaatggtaaaatta 1739712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 159
Target Start/End: Original strand, 10953787 - 10953852
Alignment:
Q  91 catttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||   |||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  10953787 catttactaaaacacccttattaatt---gttagtggagtagttaagttagatcaaattcaatatataa 10953852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 159
Target Start/End: Original strand, 10961792 - 10961857
Alignment:
Q  91 catttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||   |||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  10961792 catttactaaaacacccttattaatt---gttagtggagtagttaagttagatcaaattcaatatataa 10961857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 169
Target Start/End: Original strand, 24199349 - 24199411
Alignment:
Q  107 cttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaagatataaat 169  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| |  |||||||||||||||||| | ||||||    
T  24199349 cttaataattgtagttaatagatcagttaagtggagtgaaattcaataaataaataaataaat 24199411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 10946103 - 10946063
Alignment:
Q  65 gttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacac 105  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  10946103 gttgatttcaatgttaaaattaatatcatttattaaaacac 10946063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 98
Target Start/End: Original strand, 10953420 - 10953464
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttact 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||    
T  10953420 tgattaattgtgttgattttaatgatataattaatagcatttact 10953464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 98
Target Start/End: Original strand, 10961425 - 10961469
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttact 98  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || |||||||| ||||||||    
T  10961425 tgattaattgtgttgattttaatgatataattaatagcatttact 10961469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 167
Target Start/End: Original strand, 21649414 - 21649486
Alignment:
Q  95 tactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaagatataa 167  Q
    |||||||| ||  ||||||||  |||||| | ||| |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  21649414 tactaaaatacatttattaatcatagttagttgagtagttaaattgaatgaaattcaataaataatgatataa 21649486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 159
Target Start/End: Original strand, 8724988 - 8725123
Alignment:
Q  24 tttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagtta 123  Q
    |||||| ||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8724988 tttaaggtttgtgcacgattattaaagaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaacacacttattaattgtagtta 8725087  T
Q  124 atggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
     ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  8725088 gtggagtagttaacttgaatgaaattcaataaataa 8725123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 29570539 - 29570391
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||  |||| |||||||||  |||    
T  29570539 acaatattagtcgtttaagatttgtgcacgattattaaagaaatgattaattgtgttgattttaatgttaaaattattagtatttgctaaaacaccttta 29570440  T
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29570439 ttaattgtagttaatggaatagttaagttggatgaaattcaataaataa 29570391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Original strand, 40530190 - 40530338
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    |||||||| ||| |||||| | ||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  40530190 acaatatttgtcgtttaaggtctgtgcacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaacaccctta 40530289  T
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||    
T  40530290 ttaattgtagttagtggagtggttaagttggatgaaattaaataaataa 40530338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 27542929 - 27542794
Alignment:
Q  24 tttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagtta 123  Q
    |||||| ||||| ||||||||||       ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  27542929 tttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattgattgtgttgatttcaatggtaaaattaataccatttactaaaatactcttattaattgtagtta 27542830  T
Q  124 atggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
     ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27542829 gtggagtagttaagttggataaaattcaataaataa 27542794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 56 - 167
Target Start/End: Original strand, 7827937 - 7828048
Alignment:
Q  56 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataa 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  7827937 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtatcatttattaaaatacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaatttaataa 7828036  T
Q  156 ataaagatataa 167  Q
    |||| |||||||    
T  7828037 ataaggatataa 7828048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 8698456 - 8698308
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    |||||||| ||  |||||| ||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||    
T  8698456 acaatatttgttgtttaaggtttgtgcacgattattaaagaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagttgcatttaccaaaacaccctta 8698357  T
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8698356 ttaattgtagttagtggagtggttaagttggatgaaattcaataaataa 8698308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 54 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 27580704 - 27580598
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| | |    
T  27580704 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttgaatgaaattaatt 27580605  T
Q  154 aaataaa 160  Q
    |||||||    
T  27580604 aaataaa 27580598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 6754132 - 6754028
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6754132 tgattaatt-tgttgatttcaatagtaaaattaatgtcatttactaaaacactcttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaattcaat 6754034  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  6754033 aaataa 6754028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 55 - 159
Target Start/End: Original strand, 22848394 - 22848498
Alignment:
Q  55 gattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaata 154  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  22848394 gattaattgtgttgatttcaatagtaaaattaatagtatttattaaaacacccttattaattgtagttaatggagtagttagattggatgaaattcaata 22848493  T
Q  155 aataa 159  Q
    |||||    
T  22848494 aataa 22848498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 4818698 - 4818550
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    |||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||       | ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  4818698 acaatatttgtcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaataattaattgtgttgatttcaattgtaaaattagtagcatttactaaaacaccctta 4818599  T
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||||||||||| |||||   ||||||| |||||||||||||||||||    
T  4818598 ttaattgtagttagtggagtgattaagttagatgaaattcaataaataa 4818550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 6315786 - 6315891
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  6315786 tgattgattgtgttaatttcaatgataaaattaatatcatttactaaaatacccttattaattgtagttagtgaagtagttaagttggatgaaattcaat 6315885  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  6315886 aaataa 6315891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 40900022 - 40899917
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  40900022 tgattaattgtgttgattttgatggcaaaattagtatcatttactaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttagatgaaattcaat 40899923  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  40899922 aaataa 40899917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 31655200 - 31655052
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    |||||||||||| |||||  |||||  |||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |  ||||    
T  31655200 acaatattagtcgtttaaagtttgtgtacgattattaaagaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactataatatcctta 31655101  T
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  31655100 ttaattgtagttagtggagtaattatgttgaatgaaattcaataaataa 31655052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 41496227 - 41496071
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||       | ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||   |||    
T  41496227 acaatattagtcgattaaggtttgtacacgattattaaaaaaataattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagttgcatttagtaaaacatcatta 41496128  T
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaagatataa 167  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  41496127 ttaattgtagttagtggagtagttaaattggatgaaatgcaataaataaaggtataa 41496071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 56 - 159
Target Start/End: Original strand, 42803631 - 42803734
Alignment:
Q  56 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataa 155  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  42803631 attaattgtgttcatttcaattgtaaaattagtagtatttactaaaacaccattattaattgtagttaatggagtggttaagttggatgaaattcaataa 42803730  T
Q  156 ataa 159  Q
    ||||    
T  42803731 ataa 42803734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 159
Target Start/End: Original strand, 1248577 - 1248718
Alignment:
Q  18 tagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattg 117  Q
    ||||| |||||||||||| |||| |||||       | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  1248577 tagtcgtttaagatttgtgcacggttattaaggaaattattaattatgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatacccttattaattg 1248676  T
Q  118 tagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    |||||| || || |||||||||| || ||||||||| |||||    
T  1248677 tagttagtgaagtagttaagttgaataaaattcaattaataa 1248718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 69 - 159
Target Start/End: Original strand, 6753682 - 6753772
Alignment:
Q  69 atttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6753682 atttcaatggtaaaattagtatcatttactaaaatacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaatttaataaataa 6753772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 21060734 - 21060629
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||  ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21060734 tgattaattgtgtttattttgatggtaaaattagtattatttactaaaatactcttattaattgtagttagtggagtagttaagttggataaaattcaat 21060635  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  21060634 aaataa 21060629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 29374446 - 29374341
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||| |||||| ||| || |||||||||    
T  29374446 tgattaattatgttgatttcaatgataaaattaatagcatttactaaaagacctttattaattgtagttagtggagtagttaaattgaataaaattcaat 29374347  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  29374346 aaataa 29374341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 159
Target Start/End: Original strand, 2232046 - 2232183
Alignment:
Q  18 tagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattg 117  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||       ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| || ||||||||||     
T  2232046 tagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaagaaaatgaataattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttattaaaaaactcttattaatt- 2232144  T
Q  118 tagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
       ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2232145 ---ttagtggagtagttaagttggatgaaattcaataaataa 2232183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 56 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 4441123 - 4441020
Alignment:
Q  56 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataa 155  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| |   |||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  4441123 attaattgtgttgattttaatgataaaattaatattatttactaaaatatttttattaattgtagttagtggagtagttaaattggatgaaattcaataa 4441024  T
Q  156 ataa 159  Q
    ||||    
T  4441023 ataa 4441020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 56 - 159
Target Start/End: Original strand, 6615891 - 6615993
Alignment:
Q  56 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataa 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||  |||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  6615891 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttaccaaaacatccttattaattttagttagtggagtggttaagttggatg-aattcaataa 6615989  T
Q  156 ataa 159  Q
    ||||    
T  6615990 ataa 6615993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 54 - 167
Target Start/End: Original strand, 37184088 - 37184201
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |   ||||| |||||||||||| ||    ||||||| |||||||||||||    
T  37184088 tgattaattgagttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatatctttattcattgtagttaatagactgattaagtttgatgaaattcaat 37184187  T
Q  154 aaataaagatataa 167  Q
    ||||||| ||||||    
T  37184188 aaataaatatataa 37184201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 9515893 - 9515784
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||    
T  9515893 acaatattagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaagataatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtatcatttactaaaacatcctta 9515794  T
Q  111 ttaattgtag 120  Q
    ||||| ||||    
T  9515793 ttaatagtag 9515784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 161
Target Start/End: Original strand, 15818450 - 15818598
Alignment:
Q  15 tattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacat--ttactaaaacacgcttatt 112  Q
    |||||||| |||||| ||| | ||||||||||       || |||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||  |||||    
T  15818450 tattagtcgtttaaggtttatgcacgattattaaggaaatgtttaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatatttactaaaacacctttatt 15818549  T
Q  113 aattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaag 161  Q
    ||||||| | | ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  15818550 aattgtaatcagtggagtagttaaattggatgaaatttaataaataaag 15818598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 167
Target Start/End: Original strand, 30512694 - 30512808
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaa-ttgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaa 152  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| | || ||||||||  |||||||| || |  ||||||||||||||||||| ||    
T  30512694 tgattaattgtattgatttcaatggtaaaattaacatcatttactaagatactcttattaacatgtagttagtgaaatagttaagttggatgaaatttaa 30512793  T
Q  153 taaataaagatataa 167  Q
    ||||||| |||||||    
T  30512794 taaataaggatataa 30512808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 167
Target Start/End: Original strand, 30553034 - 30553148
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaa-ttgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaa 152  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| | || ||||||||  |||||||| || |  ||||||||||||||||||| ||    
T  30553034 tgattaattgtattgatttcaatggtaaaattaacatcatttactaagatactcttattaacatgtagttagtgaaatagttaagttggatgaaatttaa 30553133  T
Q  153 taaataaagatataa 167  Q
    ||||||| |||||||    
T  30553134 taaataaggatataa 30553148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 57 - 159
Target Start/End: Original strand, 11796179 - 11796281
Alignment:
Q  57 ttaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaa 156  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||| |   |||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||| ||||||    
T  11796179 ttaattgtgttgattttaatgataaaattaatattatttactaaaatattattattaattgtagttagtgtagtagttaagttagatgaaatttaataaa 11796278  T
Q  157 taa 159  Q
    |||    
T  11796279 taa 11796281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 18841583 - 18841469
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||  |||||||||||||||| || |  | |||| |||| |||||||||||    
T  18841583 tgattaattatattgatttaaatggtaaaattaatatcatttaataaaataccgttattaattgtagttagtgaaataattaaattgggtgaaattcaat 18841484  T
Q  154 aaataaagatataaa 168  Q
    ||||||| |||||||    
T  18841483 aaataaaaatataaa 18841469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 41492406 - 41492301
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaaca-cgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaa 152  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||| | | ||| |||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  41492406 tgattaattgtgcttatttcaatggtaaaattagtgacatttactaaaatatcccttgttaaatgtagttaatgga-tagttaagttagatgaaattcaa 41492308  T
Q  153 taaataa 159  Q
    |||||||    
T  41492307 taaataa 41492301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 19930050 - 19929945
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||| ||    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||    
T  19930050 tgattaattttgttgattttgatggtaaaactagcgtcatttactaaaacatccttattaattgtagttagtgaaatagttaagttggatgaaattcaat 19929951  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  19929950 aaataa 19929945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 160
Target Start/End: Original strand, 26285499 - 26285593
Alignment:
Q  66 ttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaa 160  Q
    ||||||| || |||||||||| || ||||||  ||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  26285499 ttgattttaacggtaaaattagtatcatttatgaaaacacacgtattaattgtagttaatgaagtagttaagttgtataaaattcaataaataaa 26285593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 59 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 29856146 - 29856056
Alignment:
Q  59 aattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaatt 149  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| || || |||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||    
T  29856146 aattgcgttgatttcaatgataaaattaatatcacttgctaaaatactcttattaattgtagttagtggagtagttaagttgaatgcaatt 29856056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 41478931 - 41478826
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaaca-cgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaa 152  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| |  |||||||||||| | | ||| ||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  41478931 tgattaattgtgcttatttcaatggtaaaattagtgtcatttactaaaatatcccttgttaattgcagttaatgga-tagttaagttagatgaaattcaa 41478833  T
Q  153 taaataa 159  Q
    |||||||    
T  41478832 taaataa 41478826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 54 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 32440245 - 32440180
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgta 119  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  32440245 tgattaattgtgttaatttcaatgataaaattaatatcatttactaaaatacccttattaattgta 32440180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 73 - 148
Target Start/End: Original strand, 38161440 - 38161515
Alignment:
Q  73 caatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaat 148  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||| |  ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  38161440 caatggtaaaattcatatcatttactaaaatatccttattaatcgtagttagtggagtagttaagttggatgaaat 38161515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 56 - 159
Target Start/End: Original strand, 41062171 - 41062274
Alignment:
Q  56 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataa 155  Q
    ||||||| |||||||||  ||| |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||  | ||||| |||||| | ||||||||    
T  41062171 attaattatgttgattttgatgataaaattagtatcatttactaaaacacccttattaattgtagttagtagaataattaagctggatggagttcaataa 41062270  T
Q  156 ataa 159  Q
    ||||    
T  41062271 ataa 41062274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 11904310 - 11904208
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta-ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaa 152  Q
    ||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||||||||||  ||||| |||||| || ||| ||| ||||    
T  11904310 tgattaattgtattgagttcaataataaaattaatatcatttactaaaatactcttatttaattgtagttggtggagtagttaaattcgataaaaatcaa 11904211  T
Q  153 taa 155  Q
    |||    
T  11904210 taa 11904208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 119
Target Start/End: Original strand, 15439328 - 15439393
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgta 119  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  15439328 tgattaattgtattaatttcaatggtaaaattagtatcatttactaaaatacttttattaattgta 15439393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 123
Target Start/End: Original strand, 38508196 - 38508265
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagtta 123  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| || || | | ||||| || |||||||||||||||||    
T  38508196 tgattaattgtgttaatttcaatggtaaaattagtatcactcattaaaatactcttattaattgtagtta 38508265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 131 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 41492287 - 41492251
Alignment:
Q  131 agttaagttggatgaaattcaataaataaagatataa 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41492287 agttaagttggatgaaattcaataaataaagatataa 41492251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 165
Target Start/End: Original strand, 3348136 - 3348250
Alignment:
Q  56 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataac-----atttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattc 150  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||| || |     ||||| |||||||| |||||||| |||||||  || || | |||||||||||||| |||    
T  3348136 attaattatgttgattttgatggtaaaattagtaccccattatttattaaaacacccttattaaatgtagttggtgaagtaattaagttggatgaagttc 3348235  T
Q  151 aataaataaagatat 165  Q
    ||||||||| |||||    
T  3348236 aataaataaggatat 3348250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 159
Target Start/End: Original strand, 5129261 - 5129346
Alignment:
Q  74 aatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||||||||||||||||| | ||| |||||| ||| || ||| | |||||||||    
T  5129261 aatggtaaaattaatataatttactataacattcttattaattgtagttattagagtagttaaattgaataaaaattaataaataa 5129346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 7330587 - 7330500
Alignment:
Q  78 gtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaagatata 166  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||| || ||| ||||| |||||| |||||| ||||| |||| |||||| ||||    
T  7330587 gtaaaattaatatcattcagtaaaacactcttattaattctaattagtggagtagttaa-ttggataaaatttaatacataaaggtata 7330500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 159
Target Start/End: Original strand, 11761313 - 11761412
Alignment:
Q  59 aattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaata 158  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || || ||||||||| || ||||| |||| || | | || |  ||||||||||| || |||||||||||||    
T  11761313 aattgtgttgattttaatggtaaaattagtatca-ttactaaaatactcttataaattatactaagtgaaatagttaagttggttggaattcaataaata 11761411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 41478812 - 41478776
Alignment:
Q  131 agttaagttggatgaaattcaataaataaagatataa 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41478812 agttaagttggatgaaattcaataaataaaggtataa 41478776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 41480178 - 41480142
Alignment:
Q  131 agttaagttggatgaaattcaataaataaagatataa 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41480178 agttaagttggatgaaattcaataaataaaggtataa 41480142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 54 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 39325965 - 39325861
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||  |||||   ||||||||| | ||  ||||||  | |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  39325965 tgattaattatgttgtttttaatggtaa--ttaatgtaatttactaagatacctttattacatatagttagtggagtagttaagttggattaaattcaat 39325868  T
Q  154 aaataaa 160  Q
    |||||||    
T  39325867 aaataaa 39325861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 54 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 3076694 - 3076662
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaatta 86  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3076694 tgattaattgtgttgatttcaatgataaaatta 3076662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 167
Target Start/End: Original strand, 10598226 - 10598262
Alignment:
Q  131 agttaagttggatgaaattcaataaataaagatataa 167  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  10598226 agttaagttggataaaatttaataaataaagatataa 10598262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 32439899 - 32439863
Alignment:
Q  131 agttaagttggatgaaattcaataaataaagatataa 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  32439899 agttaagttggatgaaattcaataaatagggatataa 32439863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Original strand, 136005 - 136153
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||||||||       ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  136005 acaatattagtcgtttaagatttatgcacgattattaaataaatgattaataatgttgatttcaatggtaaaattaatagcatttactaaaacaccctta 136104  T
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    |||||| |||||| || || ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  136105 ttaattatagttagtgaagtagttaagtttgatgaaattaaataaataa 136153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 46)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 13087634 - 13087529
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||| || || | |||||||||||||||||||||    
T  13087634 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatatcatttactaaaacatccttattaattatagttagtgaagtaattaagttggatgaaattcaat 13087535  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  13087534 aaataa 13087529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 11655956 - 11656061
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  11655956 tgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtgtcatttactaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagtaaagttggatgaaattcaat 11656055  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  11656056 aaataa 11656061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 24983459 - 24983564
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  24983459 tgattagttgagttgatttcaatggtaaaattagtgtcatttactaaaacacccttattaattgtagttagtggagtagttaagttgggtgaaattcaat 24983558  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  24983559 aaataa 24983564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Original strand, 31894177 - 31894325
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    ||||||||| || ||||||||||||  | |||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    |||    
T  31894177 acaatattaatcgtttaagatttgtgtatgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttactaaaacgtcatta 31894276  T
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31894277 ttaattgtagttagtgaagtagttaagttggatgaaatttaataaataa 31894325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 15058263 - 15058116
Alignment:
Q  12 caatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttat 111  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||       |||||||||  ||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||| || |||||    
T  15058263 caatattagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaagaaaatgattaattaagttaatttcaatggtaaaattagtggcatttactaaaatacccttat 15058164  T
Q  112 taattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    |||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  15058163 taattgtagttagtgaagtatttaagttggatgaaattcaataaataa 15058116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 6802035 - 6801930
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  6802035 tgattaattatgttgattttgatggtaaaattaatatcatttactaaaacgcccttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaagttcgat 6801936  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  6801935 aaataa 6801930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 13909528 - 13909423
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||| |||    
T  13909528 tgattaaatgtgttgatttcaatggtaaaattagtgacatttactaaaatacccttattaattgtagttagtggagtaattaagttagatgaaattgaat 13909429  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  13909428 aaataa 13909423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 54 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 5302455 - 5302351
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||  |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  5302455 tgattaaatgtgttgattttgatggtaaaattaatataatttaccaaaacatccttattaattgtagttaatggagtagttaagttggatgaagttcaat 5302356  T
Q  154 aaata 158  Q
    |||||    
T  5302355 aaata 5302351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 23142814 - 23142669
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    |||||||||||  |||||| ||| | ||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||| ||||    
T  23142814 acaatattagttatttaaggtttatccacgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaaatagtggcatttactaaaacaccctta 23142715  T
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaa 156  Q
    |||||||||| || ||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  23142714 ttaattgtaggtagtggagtagttaagctagatgaaattcaataaa 23142669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Original strand, 3720208 - 3720356
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||       |||||||||||||||||||||||  |||||||  ||  |||||| ||||||| ||||    
T  3720208 acaatattagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaatgaaatgattaattgtgttgatttcaattataaaatttgtagtatttacaaaaacactctta 3720307  T
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  3720308 ttaattgtagttagtggaatagttaagttgaatgaaattcagtaaataa 3720356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 1781906 - 1781805
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  1781906 tgattaattatgttgatctcaatggtaaaattagtagcatttactaaaacacccttattaattgtagttagtggag-tgttaagttgaatgaaattcaat 1781808  T
Q  154 aaa 156  Q
    |||    
T  1781807 aaa 1781805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 29363410 - 29363305
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| || || ||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||  |||||||||||||||||||||||    
T  29363410 tgattaattgtgttgattttgatggtaaaactagtatcatttactaaaacatccttattaattgtagttagcggattagttaagttggatgaaattcaat 29363311  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  29363310 aaataa 29363305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 56 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 181658 - 181555
Alignment:
Q  56 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataa 155  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||   ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  181658 attaattgtattgatttcaatagtaaaattagtagtatttactaaaacatcattattaattatagttagtggagtagttaagttggatgaaattcaataa 181559  T
Q  156 ataa 159  Q
    ||||    
T  181558 ataa 181555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 54 - 161
Target Start/End: Original strand, 32440655 - 32440762
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||  |||    
T  32440655 tgattaattgtgttgattttgatggtaaaattagtattatttactaaaacacccttattaattgtaattagtagagtagttaagttggatgaaatgtaat 32440754  T
Q  154 aaataaag 161  Q
    ||||||||    
T  32440755 aaataaag 32440762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 21010281 - 21010172
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaa----tggagcagttaagttggatgaaatt 149  Q
    |||||||||||||| ||||  |||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    ||||| |||||||||||||||||||    
T  21010281 tgattaattgtgttaattttgatggaaaaattagtatcatttactaaaacacccttataaattgtagttaattagtggagtagttaagttggatgaaatt 21010182  T
Q  150 caataaataa 159  Q
    ||||||||||    
T  21010181 caataaataa 21010172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 7920372 - 7920238
Alignment:
Q  24 tttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagtta 123  Q
    |||||||||||| ||||||| ||       ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  7920372 tttaagatttgtgcacgatttttaaagaaatgattaattttgttgatttcaatggtaaaattaaaaccatttactaaaata-tcttattaattgtagtta 7920274  T
Q  124 atggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
     || || | |||| ||| ||||||||||||||||||    
T  7920273 gtgaagtatttaatttgaatgaaattcaataaataa 7920238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 30717004 - 30716899
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||| | |||| ||  |||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  30717004 tgattaattttattgactttgatggtaaaattagtatcatttacttaaacacccttattaattgtagttagtggagtagtaaagttggataaaattcaat 30716905  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  30716904 aaataa 30716899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 155
Target Start/End: Original strand, 1063613 - 1063714
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||| || || | |||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||| |||    
T  1063613 tgattaattgtgttgatttcaatgataaaattagtattatttactaaaatactctgagtaattgtagttagtggagtagttaagttaaatgaaatttaat 1063712  T
Q  154 aa 155  Q
    ||    
T  1063713 aa 1063714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 1225151 - 1225047
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||| |||||| || || ||||||||||||| ||||| |||    
T  1225151 tgattaattgtgttgatttaaatagtaaaattaatattatttactaaaatattcttattaattttagttagtgaagaagttaagttggat-aaattgaat 1225053  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  1225052 aaataa 1225047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 3291778 - 3291883
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||||| |||| ||  ||||||||||| ||  |||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||    
T  3291778 tgattaattgtatcgattttaatggtaatattagtattatttactaaaatacctttattaattgtagttagtgaagtagttaagttggataaaattcaat 3291877  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  3291878 aaataa 3291883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 55 - 159
Target Start/End: Original strand, 11143597 - 11143702
Alignment:
Q  55 gattaattg-tgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||| |||||||||  ||| |||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||| |||||| || || |||||||||||||||| ||||||    
T  11143597 gattaattgatgttgattttgatgataaaattagtatcatttactaaatcacccttattaattatagttagtgaagtagttaagttggatgaagttcaat 11143696  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  11143697 aaataa 11143702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 55 - 159
Target Start/End: Original strand, 1955990 - 1956094
Alignment:
Q  55 gattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaata 154  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| | || ||||||||||||||||| || || || |  ||| ||| ||||||||||    
T  1955990 gattaattgtattgatttcaatggtaaaattagtatcatttactaatatactcttattaattgtagttagtgaagtagctgtgttcgataaaattcaata 1956089  T
Q  155 aataa 159  Q
    |||||    
T  1956090 aataa 1956094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 92 - 160
Target Start/End: Original strand, 34657610 - 34657678
Alignment:
Q  92 atttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaa 160  Q
    ||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34657610 atttattaaaacacttttattaattgtagttagtggagtagttaagttggatgaaattcaataaataaa 34657678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 54 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 22398516 - 22398406
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| | |||| | |||  ||| ||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||    
T  22398516 tgattaattgtgtagattttaatgataaaattaaca-cattcattaagtcactcttattaattgtagttattgaagtagttaagttagatgaaattcaat 22398418  T
Q  154 aaataaagatat 165  Q
    ||||||| ||||    
T  22398417 aaataaatatat 22398406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 54 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 15582387 - 15582276
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||| ||  ||| |  ||||||||| || ||  ||||||||  ||||||||||||    
T  15582387 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaatcagtatcatttattaaaatacatttacttgttgtagttagtgaagtggttaagtttaatgaaattcaat 15582288  T
Q  154 aaataaagatat 165  Q
    |||||| |||||    
T  15582287 aaataaggatat 15582276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 56 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 17829042 - 17828939
Alignment:
Q  56 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataa 155  Q
    |||||| ||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||| |   |||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||| ||| |    
T  17829042 attaatagtgttaatttcaacagtaaaattaatatcatttactaaaatatctttattaattgtagttagtgaagtaattaagttggatgaaatttaatta 17828943  T
Q  156 ataa 159  Q
    ||||    
T  17828942 ataa 17828939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 61 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 34300092 - 34299987
Alignment:
Q  61 ttgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaa 160  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||||| |  |||||||||||| |||| || || ||||||||||||||  |||||||||||||     
T  34300092 ttgttttgatttgaatgataaaattagtattatttactaaaatatccttattaattgtggttagtgaagtagttaagttggatggtattcaataaataag 34299993  T
Q  161 gatata 166  Q
    ||||||    
T  34299992 gatata 34299987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 160
Target Start/End: Original strand, 6834381 - 6834485
Alignment:
Q  56 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataa 155  Q
    |||||||||||||||||  || || ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||| | ||  || ||| ||| |||| |||||||||    
T  6834381 attaattgtgttgattttgatagtcaaattaatatcatttactaaaacacctttattaattatagttagtagaatagataaattgaatgagattcaataa 6834480  T
Q  156 ataaa 160  Q
    |||||    
T  6834481 ataaa 6834485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 155
Target Start/End: Original strand, 21804539 - 21804639
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||||||||| || |||||||| ||| |  ||||||||||||||||| ||||  | |||||||||| |||||| |||    
T  21804539 tgattaattgtattaatttcaattgtaaaattagtatcatttacttaaata-tcttattaattgtagttagtggaaaaattaagttggaagaaatttaat 21804637  T
Q  154 aa 155  Q
    ||    
T  21804638 aa 21804639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 17835486 - 17835391
Alignment:
Q  56 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattca 151  Q
    ||||||||| ||||||| |||  ||||||||||  |||||||||||| ||  |||||||||||||||  |  || ||||||||||||||| |||||    
T  17835486 attaattgtattgattttaataataaaattaatctcatttactaaaatacatttattaattgtagtttgtttagtagttaagttggatgatattca 17835391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 102
Target Start/End: Original strand, 4590610 - 4590656
Alignment:
Q  56 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaa 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  4590610 attaattgtgttgatttcaatagtaaaattaatatcgtttactaaaa 4590656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 110 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 15046171 - 15046123
Alignment:
Q  110 attaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15046171 attaattgtagttagtggagtagtta-gttggatgaaattcaataaataa 15046123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 102
Target Start/End: Original strand, 4581999 - 4582039
Alignment:
Q  62 tgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaa 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4581999 tgtgttgattttaatggtaaaattaatatcatttactaaaa 4582039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 8695124 - 8695080
Alignment:
Q  79 taaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagtta 123  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8695124 taaaattaatagcatttactaaaacattcttattaattgtagtta 8695080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 167
Target Start/End: Original strand, 21425644 - 21425680
Alignment:
Q  131 agttaagttggatgaaattcaataaataaagatataa 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21425644 agttaagttggatgaaattcaataaataaggatataa 21425680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 110
Target Start/End: Original strand, 27367446 - 27367502
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  27367446 tgattaattgtgttgattttagttgtaaaattaattgcatttactaaaacaccctta 27367502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 54 - 110
Target Start/End: Original strand, 27457793 - 27457849
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||||  ||||||||||||||| ||||    
T  27457793 tgattaattgtgttgattttagttgtaaaattaattgcatttactaaaacaccctta 27457849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 167
Target Start/End: Original strand, 31283488 - 31283524
Alignment:
Q  131 agttaagttggatgaaattcaataaataaagatataa 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31283488 agttaagttggatgaaattcaataaataaggatataa 31283524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 92 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 33510206 - 33510139
Alignment:
Q  92 atttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||||||||| |   |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  33510206 atttactaaaatatttttattaattgtaattaattgagtagttaagttggatgaaatttattaaataa 33510139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 129
Target Start/End: Original strand, 34436244 - 34436310
Alignment:
Q  63 gtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggag 129  Q
    |||||||||| ||| |||||||  ||  |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  34436244 gtgttgattttaattgtaaaatatatgtcatttactaaaatactcttattaattatagttaatggag 34436310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 159
Target Start/End: Original strand, 10923408 - 10923493
Alignment:
Q  74 aatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||| ||  || |||||||||| || ||||  | |||| || |||||||||||||||||||    
T  10923408 aatgataaaattaatattatttactaaaataccgttgttaattgtagctagtggaataattaaattagatgaaattcaataaataa 10923493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 105
Target Start/End: Original strand, 24106337 - 24106386
Alignment:
Q  56 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacac 105  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  24106337 attagttgtgttgatttcaataataaaatgaatcacatttactaaaacac 24106386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 119
Target Start/End: Original strand, 27448166 - 27448231
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgta 119  Q
    |||||||||||||||||||  ||| | |||||| || ||||||||||||||   ||||||||||||    
T  27448166 tgattaattgtgttgattttgatgatgaaattagtatcatttactaaaacatcattattaattgta 27448231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 107 - 159
Target Start/End: Original strand, 16205221 - 16205273
Alignment:
Q  107 cttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | ||||||| ||||||| |||||||||||    
T  16205221 cttattaattgtagttagtggaatatttaagttagatgaaactcaataaataa 16205273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 55 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 16431123 - 16431035
Alignment:
Q  55 gattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggat 143  Q
    ||||||| ||||||| || || |||||||||  |  |||||||||||| || ||||||| |||||||| ||| || | |||||||||||    
T  16431123 gattaatagtgttgagtttaaaggtaaaatttgtgtcatttactaaaatactcttattacttgtagtttatgaagtaattaagttggat 16431035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 167
Target Start/End: Original strand, 28106016 - 28106052
Alignment:
Q  131 agttaagttggatgaaattcaataaataaagatataa 167  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  28106016 agttaagttgaatgaaattcaataaataatgatataa 28106052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0330 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0330
Description:

Target: scaffold0330; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 54 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 5494 - 5382
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5494 tgattaactgtgttgaattcaatggtaaaattaatatcatttactaaaatatccttattaattttagttagtggagtagttaagttggatgaaattcaat 5395  T
Q  154 aaataaagatata 166  Q
    |||||||| ||||    
T  5394 aaataaaggtata 5382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Original strand, 33987 - 34135
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||       ||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |  ||||||||||||||| ||||    
T  33987 acaatattagtcatttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtattgaattcaatagtaaaattagtggcatttactaaaacaccctta 34086  T
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34087 ttaattgtagttagtgaaatagttaagttggatgaaattcaataaataa 34135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0294 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0294
Description:

Target: scaffold0294; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 17183 - 17033
Alignment:
Q  10 aacaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctt 109  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| || ||||| |||    
T  17183 aacaatattagtcgtttaaggtttgtgcatgattattaagaaaatgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattagtagcatttattagaacaccctt 17084  T
Q  110 attaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaa 160  Q
    ||||||| |||||||||| | | ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  17083 attaattatagttaatggcgtaattacgttgaatgaaattcaataaataaa 17033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 105788 - 105683
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||| ||    
T  105788 tgattaattgtgtttatttcaatggtaaaattaatagcgtttactaaaacacccttattaattgtagttagtgaagtagttaagttgaatgaaattcgat 105689  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  105688 aaataa 105683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1809 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1809
Description:

Target: scaffold1809; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 56 - 159
Target Start/End: Original strand, 697 - 800
Alignment:
Q  56 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataa 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||   |||| ||||||||||||||||||    
T  697 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattaatagcatttactaaaacacctttattgattgtagttagtggagtgtttaaattggatgaaattcaataa 796  T
Q  156 ataa 159  Q
    ||||    
T  797 ataa 800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Original strand, 7992 - 8097
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  7992 tgattaattttgttgatttggatggtaaaattaatattatttaccaaaacacccttattaattgtagttagtggagtaattaagttggatgaagttcaat 8091  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  8092 aaataa 8097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0583 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0583
Description:

Target: scaffold0583; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 2129 - 2024
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||  | |||  || |||||||||||||    
T  2129 tgattaattgtgttaatttcaatgataaaattaatatcatttactaaaacatccttattaattgtagttagtggattaattacattcgatgaaattcaat 2030  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  2029 aaataa 2024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0110 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0110
Description:

Target: scaffold0110; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 54 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 1808 - 1703
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||| || |||||||| |||||| | ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  1808 tgattaattatgttgattttgatggtaaaattagtatcatttacttaaacacccgtattaattgtagtcagtggagtagttaagttggattaaattcaat 1709  T
Q  154 aaataa 159  Q
    ||||||    
T  1708 aaataa 1703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 54 - 157
Target Start/End: Original strand, 20364 - 20467
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaat 153  Q
    |||||||||||||||||||  || ||||||||| || |||||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  20364 tgattaattgtgttgattttgattgtaaaattagtatcatttagtaaaatacccttattaattgcagttagtgaagtagttaagttggatgaaattcaat 20463  T
Q  154 aaat 157  Q
    ||||    
T  20464 aaat 20467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 50351 - 50203
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgctta 110  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||       |||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||| || |   |||    
T  50351 acaatattagtcgtttaaggtttgtgcacgattattaaggaaatgattaattgtgttaatttcaatgataaaattagtatcatttactataatatcttta 50252  T
Q  111 ttaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    ||||||  ||||| ||||| | |||||||| |||||||| |||||||||    
T  50251 ttaattacagttagtggagtaattaagttgaatgaaattaaataaataa 50203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 167
Target Start/End: Original strand, 14233 - 14292
Alignment:
Q  108 ttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataaagatataa 167  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  14233 ttattaattatagttaatggagtagttaaatttgatgaaattcaataaataaaggtataa 14292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1391 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1391
Description:

Target: scaffold1391; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 123
Target Start/End: Original strand, 1830 - 1897
Alignment:
Q  56 attaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgtagtta 123  Q
    |||||||||||||||||  || || ||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  1830 attaattgtgttgattttgatagtcaaattaatatcatttactaaaacacctttattaattatagtta 1897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0470 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0470
Description:

Target: scaffold0470; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 1132 - 1057
Alignment:
Q  11 acaatattagtcctttaagatttgttcacgattattnnnnnnntgattaattgtgttgatttcaatggtaaaatta 86  Q
    |||||||||||| ||||||||||   ||||||||||       ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1132 acaatattagtcgtttaagatttacacacgattattaaaaaaatgattaattatgttgatttcaatggtaaaatta 1057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 91 - 159
Target Start/End: Original strand, 252853 - 252920
Alignment:
Q  91 catttactaaaacacgcttattaattgtagttaatggagcagttaagttggatgaaattcaataaataa 159  Q
    |||||||||||| |   |||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  252853 catttactaaaatatcgttattaattgtagt-attggagtagttaagttgaatgaaattcaataaataa 252920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 54 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 39192 - 39127
Alignment:
Q  54 tgattaattgtgttgatttcaatggtaaaattaataacatttactaaaacacgcttattaattgta 119  Q
    |||||||||||||||||||  ||| | |||||| || ||||||||||||||   ||||||||||||    
T  39192 tgattaattgtgttgattttgatgatgaaattagtatcatttactaaaacatcattattaattgta 39127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 4797 times since January 2019
Visitors: 4839