View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0767_low_35 (Length: 266)

Name: NF0767_low_35
Description: NF0767
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0767_low_35
NF0767_low_35
[»] chr5 (91 HSPs)
chr5 (31-266)||(25804025-25804262)
chr5 (30-266)||(18511254-18511492)
chr5 (30-266)||(10529141-10529379)
chr5 (30-266)||(4236628-4236866)
chr5 (30-266)||(38882105-38882342)
chr5 (30-266)||(21948025-21948263)
chr5 (30-266)||(40221521-40221760)
chr5 (30-266)||(18509360-18509598)
chr5 (30-266)||(25921515-25921753)
chr5 (30-266)||(34477095-34477334)
chr5 (30-266)||(6745068-6745305)
chr5 (30-266)||(18469010-18469248)
chr5 (30-266)||(39854482-39854720)
chr5 (30-266)||(2174918-2175155)
chr5 (30-266)||(18466683-18466921)
chr5 (30-266)||(6747305-6747541)
chr5 (30-266)||(16092241-16092480)
chr5 (30-266)||(17072882-17073121)
chr5 (30-266)||(34479460-34479699)
chr5 (30-266)||(25904102-25904340)
chr5 (30-266)||(31545079-31545317)
chr5 (30-264)||(16776157-16776392)
chr5 (30-266)||(27912535-27912773)
chr5 (30-266)||(31179413-31179651)
chr5 (30-266)||(21684494-21684731)
chr5 (30-266)||(2954415-2954653)
chr5 (50-266)||(27910469-27910687)
chr5 (30-266)||(31542734-31542971)
chr5 (53-266)||(658395-658610)
chr5 (30-266)||(1189650-1189889)
chr5 (30-266)||(2818377-2818616)
chr5 (30-266)||(15552244-15552482)
chr5 (30-266)||(17818532-17818770)
chr5 (30-266)||(24126855-24127093)
chr5 (30-266)||(36402370-36402608)
chr5 (38-254)||(37705834-37706052)
chr5 (48-266)||(18596662-18596883)
chr5 (30-266)||(39398035-39398273)
chr5 (30-266)||(10474365-10474603)
chr5 (38-258)||(26097740-26097961)
chr5 (31-266)||(31472654-31472892)
chr5 (30-266)||(10586841-10587068)
chr5 (30-264)||(12555967-12556203)
chr5 (30-210)||(6756493-6756674)
chr5 (30-266)||(695888-696115)
chr5 (30-261)||(34530712-34530946)
chr5 (97-266)||(41585786-41585956)
chr5 (30-189)||(20045009-20045169)
chr5 (30-188)||(20043049-20043208)
chr5 (108-266)||(20505883-20506042)
chr5 (55-247)||(31466040-31466233)
chr5 (113-266)||(39798130-39798284)
chr5 (97-266)||(4410090-4410259)
chr5 (127-266)||(10749797-10749937)
chr5 (30-266)||(21288763-21288998)
chr5 (30-181)||(26098379-26098531)
chr5 (64-266)||(9020256-9020456)
chr5 (30-266)||(6661227-6661462)
chr5 (127-266)||(10757274-10757413)
chr5 (92-266)||(2723964-2724130)
chr5 (72-266)||(17413208-17413402)
chr5 (30-266)||(20053846-20054073)
chr5 (127-266)||(23665141-23665280)
chr5 (127-266)||(23793307-23793446)
chr5 (127-266)||(3373179-3373319)
chr5 (127-266)||(15354617-15354756)
chr5 (127-266)||(15356893-15357032)
chr5 (127-266)||(38960174-38960313)
chr5 (133-266)||(23741901-23742034)
chr5 (113-266)||(36208658-36208814)
chr5 (113-264)||(15143548-15143702)
chr5 (31-266)||(2144604-2144840)
chr5 (30-111)||(20507660-20507742)
chr5 (72-190)||(4754198-4754313)
chr5 (130-264)||(4897828-4897965)
chr5 (126-266)||(15445308-15445454)
chr5 (55-188)||(42770796-42770924)
chr5 (160-244)||(42770940-42771025)
chr5 (222-266)||(26098331-26098375)
chr5 (126-190)||(35385572-35385635)
chr5 (113-256)||(35430260-35430408)
chr5 (31-184)||(29748352-29748502)
chr5 (126-212)||(31782554-31782640)
chr5 (81-168)||(34033711-34033797)
chr5 (126-190)||(1170810-1170873)
chr5 (113-188)||(16093413-16093488)
chr5 (126-165)||(2298145-2298184)
chr5 (126-169)||(10627363-10627406)
chr5 (130-165)||(22672837-22672872)
chr5 (203-266)||(23667492-23667555)
chr5 (130-190)||(25452498-25452557)
[»] chr3 (130 HSPs)
chr3 (30-266)||(4308321-4308559)
chr3 (30-266)||(18099210-18099448)
chr3 (30-266)||(30005820-30006058)
chr3 (31-266)||(18096940-18097177)
chr3 (30-266)||(11170383-11170621)
chr3 (30-266)||(38890019-38890257)
chr3 (30-266)||(43228270-43228508)
chr3 (30-266)||(53917704-53917942)
chr3 (30-266)||(43226065-43226302)
chr3 (30-266)||(27101221-27101459)
chr3 (30-266)||(28102042-28102280)
chr3 (32-266)||(10084429-10084665)
chr3 (30-266)||(18162642-18162881)
chr3 (30-266)||(1626723-1626961)
chr3 (30-266)||(10956067-10956305)
chr3 (30-266)||(25533421-25533659)
chr3 (30-266)||(43423503-43423741)
chr3 (30-266)||(45882918-45883156)
chr3 (30-266)||(51943350-51943587)
chr3 (38-266)||(1313396-1313626)
chr3 (30-266)||(29956665-29956903)
chr3 (30-264)||(4103938-4104173)
chr3 (30-266)||(746736-746974)
chr3 (38-266)||(9604647-9604877)
chr3 (30-266)||(10958363-10958601)
chr3 (30-266)||(25388885-25389122)
chr3 (30-266)||(42990283-42990521)
chr3 (30-266)||(43421455-43421693)
chr3 (30-266)||(51727047-51727284)
chr3 (30-266)||(455886-456124)
chr3 (30-266)||(458263-458501)
chr3 (30-266)||(10621570-10621808)
chr3 (30-266)||(36011806-36012044)
chr3 (30-266)||(53468495-53468733)
chr3 (30-266)||(53915536-53915774)
chr3 (30-262)||(5191632-5191865)
chr3 (30-265)||(6561789-6562028)
chr3 (30-266)||(880491-880730)
chr3 (30-266)||(3314663-3314902)
chr3 (30-266)||(24979686-24979925)
chr3 (30-266)||(6063486-6063724)
chr3 (30-266)||(6065836-6066074)
chr3 (30-266)||(3859507-3859744)
chr3 (32-266)||(10191350-10191585)
chr3 (64-266)||(1321493-1321696)
chr3 (30-266)||(5926804-5927042)
chr3 (50-266)||(28413072-28413290)
chr3 (30-266)||(50493978-50494216)
chr3 (30-266)||(35917983-35918227)
chr3 (30-266)||(12268015-12268244)
chr3 (31-266)||(32264077-32264316)
chr3 (30-259)||(22114352-22114583)
chr3 (30-266)||(28761468-28761706)
chr3 (30-266)||(47148935-47149173)
chr3 (30-266)||(38210349-38210587)
chr3 (30-262)||(889817-890049)
chr3 (30-266)||(26720527-26720764)
chr3 (38-266)||(48361711-48361941)
chr3 (30-244)||(39715448-39715664)
chr3 (72-266)||(7606628-7606822)
chr3 (30-266)||(51674806-51675033)
chr3 (30-205)||(28100143-28100319)
chr3 (30-266)||(5522667-5522893)
chr3 (31-266)||(54691614-54691851)
chr3 (30-210)||(35777400-35777582)
chr3 (64-266)||(6484373-6484577)
chr3 (72-266)||(32219106-32219302)
chr3 (101-266)||(25688200-25688367)
chr3 (30-266)||(53591174-53591401)
chr3 (113-266)||(5886263-5886415)
chr3 (113-266)||(5899736-5899888)
chr3 (38-210)||(28181009-28181182)
chr3 (31-266)||(31151329-31151561)
chr3 (30-266)||(53597219-53597454)
chr3 (30-218)||(15780839-15781039)
chr3 (71-266)||(4666535-4666734)
chr3 (32-261)||(54884138-54884367)
chr3 (64-266)||(13420225-13420425)
chr3 (64-266)||(561816-562017)
chr3 (114-266)||(11168165-11168318)
chr3 (30-166)||(42992265-42992402)
chr3 (30-266)||(36871341-36871576)
chr3 (31-266)||(23633440-23633671)
chr3 (68-266)||(17795280-17795476)
chr3 (68-266)||(19103720-19103916)
chr3 (72-189)||(28137424-28137541)
chr3 (30-142)||(41849131-41849244)
chr3 (98-264)||(6231849-6232015)
chr3 (31-218)||(23637007-23637191)
chr3 (64-243)||(25635398-25635575)
chr3 (51-218)||(1673975-1674140)
chr3 (113-266)||(1620501-1620656)
chr3 (94-189)||(4560402-4560497)
chr3 (113-261)||(14634486-14634637)
chr3 (31-154)||(24177260-24177380)
chr3 (30-107)||(11163129-11163207)
chr3 (178-266)||(47701711-47701800)
chr3 (128-243)||(3306839-3306955)
chr3 (30-104)||(27635830-27635905)
chr3 (30-103)||(6231428-6231502)
chr3 (170-266)||(27635698-27635795)
chr3 (164-266)||(24181494-24181598)
chr3 (30-104)||(47701798-47701873)
chr3 (64-161)||(25633937-25634031)
chr3 (30-93)||(3306778-3306842)
chr3 (113-259)||(7768633-7768781)
chr3 (50-168)||(13419883-13419997)
chr3 (113-209)||(11066653-11066751)
chr3 (198-266)||(42992418-42992487)
chr3 (139-190)||(11073033-11073085)
chr3 (130-210)||(27762085-27762165)
chr3 (89-152)||(31021300-31021362)
chr3 (126-210)||(47882981-47883065)
chr3 (126-190)||(10094194-10094257)
chr3 (126-190)||(10201074-10201137)
chr3 (126-190)||(16462202-16462265)
chr3 (126-190)||(22626104-22626167)
chr3 (126-165)||(6303309-6303348)
chr3 (126-165)||(10100235-10100274)
chr3 (193-266)||(25634030-25634105)
chr3 (126-165)||(27544272-27544311)
chr3 (126-171)||(4535613-4535658)
chr3 (94-139)||(7606828-7606873)
chr3 (126-210)||(11079516-11079600)
chr3 (130-210)||(29914052-29914132)
chr3 (130-210)||(47878270-47878350)
chr3 (130-210)||(54193229-54193309)
chr3 (113-145)||(1618824-1618856)
chr3 (126-190)||(10208120-10208183)
chr3 (126-190)||(16996874-16996937)
[»] chr1 (101 HSPs)
chr1 (30-266)||(10399872-10400110)
chr1 (30-266)||(47906269-47906507)
chr1 (30-266)||(2617515-2617753)
chr1 (30-266)||(15294878-15295116)
chr1 (31-266)||(17324680-17324917)
chr1 (30-266)||(21948232-21948469)
chr1 (30-266)||(51750038-51750276)
chr1 (38-266)||(9241129-9241360)
chr1 (30-266)||(16428652-16428891)
chr1 (30-266)||(50307590-50307829)
chr1 (30-266)||(12302549-12302787)
chr1 (30-266)||(28840679-28840916)
chr1 (30-266)||(2949275-2949513)
chr1 (30-266)||(39932072-39932310)
chr1 (30-266)||(13761836-13762073)
chr1 (30-266)||(46431752-46431989)
chr1 (30-266)||(38925524-38925760)
chr1 (30-266)||(6823014-6823251)
chr1 (30-266)||(13215080-13215323)
chr1 (30-261)||(28842494-28842726)
chr1 (30-266)||(6995744-6995982)
chr1 (30-266)||(15823545-15823783)
chr1 (31-266)||(16226167-16226404)
chr1 (31-266)||(31735565-31735802)
chr1 (30-255)||(48665176-48665404)
chr1 (30-266)||(14098013-14098252)
chr1 (30-266)||(18307108-18307347)
chr1 (30-266)||(50078864-50079103)
chr1 (30-266)||(11457519-11457757)
chr1 (30-266)||(41646919-41647157)
chr1 (30-258)||(20302458-20302687)
chr1 (30-266)||(18839586-18839825)
chr1 (30-266)||(50076715-50076954)
chr1 (30-266)||(2510369-2510606)
chr1 (30-266)||(9459461-9459699)
chr1 (30-266)||(9463288-9463526)
chr1 (30-259)||(20291456-20291686)
chr1 (30-266)||(47177361-47177599)
chr1 (30-266)||(47179712-47179950)
chr1 (30-266)||(27336984-27337220)
chr1 (30-259)||(28998304-28998535)
chr1 (30-259)||(29004020-29004251)
chr1 (30-266)||(17186171-17186410)
chr1 (30-266)||(40133943-40134182)
chr1 (30-266)||(24325663-24325900)
chr1 (30-266)||(39462518-39462756)
chr1 (30-266)||(6756526-6756764)
chr1 (30-266)||(31425058-31425301)
chr1 (30-266)||(25127871-25128110)
chr1 (30-262)||(27339179-27339412)
chr1 (30-256)||(3579671-3579898)
chr1 (30-266)||(4131419-4131661)
chr1 (30-249)||(50248633-50248854)
chr1 (30-266)||(25251318-25251557)
chr1 (30-266)||(28207112-28207348)
chr1 (30-266)||(31489914-31490150)
chr1 (30-266)||(51752364-51752600)
chr1 (30-243)||(31422940-31423156)
chr1 (31-262)||(17324065-17324297)
chr1 (30-221)||(6823884-6824083)
chr1 (30-266)||(17318892-17319125)
chr1 (30-266)||(42922233-42922468)
chr1 (97-266)||(16231630-16231800)
chr1 (31-254)||(47451648-47451867)
chr1 (30-266)||(14183635-14183868)
chr1 (64-266)||(15669437-15669638)
chr1 (30-266)||(8347316-8347551)
chr1 (127-266)||(23785936-23786076)
chr1 (97-265)||(25248596-25248766)
chr1 (28-266)||(16432402-16432632)
chr1 (30-252)||(8349109-8349330)
chr1 (115-266)||(16429042-16429195)
chr1 (30-266)||(13125501-13125738)
chr1 (113-266)||(30738671-30738829)
chr1 (122-266)||(51757623-51757767)
chr1 (31-266)||(27916500-27916734)
chr1 (64-261)||(49495259-49495454)
chr1 (30-243)||(18800640-18800851)
chr1 (113-266)||(6115146-6115301)
chr1 (113-266)||(155789-155944)
chr1 (113-266)||(26613283-26613439)
chr1 (173-266)||(23816029-23816123)
chr1 (31-218)||(26520206-26520397)
chr1 (113-266)||(30790444-30790599)
chr1 (113-243)||(16561549-16561681)
chr1 (72-252)||(28279309-28279490)
chr1 (116-266)||(43104245-43104399)
chr1 (113-254)||(14353048-14353190)
chr1 (113-187)||(26332613-26332687)
chr1 (31-169)||(26332704-26332836)
chr1 (126-190)||(4144803-4144866)
chr1 (113-168)||(49959130-49959186)
chr1 (126-190)||(2232596-2232659)
chr1 (126-190)||(14997039-14997102)
chr1 (202-266)||(15916562-15916628)
chr1 (130-210)||(2401320-2401400)
chr1 (130-210)||(21353445-21353525)
chr1 (130-210)||(25134074-25134154)
chr1 (127-168)||(37990773-37990814)
chr1 (130-190)||(9526469-9526528)
chr1 (127-190)||(13785391-13785455)
[»] chr8 (75 HSPs)
chr8 (30-266)||(14807806-14808044)
chr8 (30-266)||(32339364-32339602)
chr8 (30-266)||(28283262-28283499)
chr8 (30-266)||(15072765-15073004)
chr8 (30-266)||(3874065-3874303)
chr8 (30-266)||(22684695-22684936)
chr8 (30-266)||(608789-609027)
chr8 (30-266)||(15809274-15809511)
chr8 (30-266)||(28251609-28251847)
chr8 (30-266)||(30480545-30480783)
chr8 (30-266)||(41384799-41385037)
chr8 (30-266)||(27829352-27829589)
chr8 (30-266)||(1225221-1225460)
chr8 (30-266)||(27911070-27911307)
chr8 (30-266)||(27957489-27957726)
chr8 (30-266)||(18810763-18811000)
chr8 (30-266)||(27827041-27827278)
chr8 (30-264)||(27106941-27107177)
chr8 (30-266)||(15068036-15068274)
chr8 (30-266)||(43079657-43079895)
chr8 (30-266)||(4424073-4424311)
chr8 (30-266)||(25952576-25952814)
chr8 (30-266)||(43082028-43082266)
chr8 (30-266)||(44720898-44721136)
chr8 (30-266)||(13858526-13858764)
chr8 (30-266)||(24873223-24873461)
chr8 (30-218)||(14477331-14477520)
chr8 (30-266)||(36865593-36865829)
chr8 (30-266)||(14419232-14419471)
chr8 (72-264)||(43530213-43530406)
chr8 (30-259)||(5372226-5372458)
chr8 (30-189)||(33541508-33541668)
chr8 (31-266)||(41382729-41382955)
chr8 (72-266)||(18812980-18813174)
chr8 (64-259)||(15956051-15956244)
chr8 (64-266)||(21480596-21480796)
chr8 (30-258)||(15185764-15185990)
chr8 (65-266)||(31162303-31162503)
chr8 (64-266)||(21482404-21482604)
chr8 (30-266)||(3005673-3005906)
chr8 (30-151)||(26775256-26775378)
chr8 (30-170)||(5622877-5623018)
chr8 (113-266)||(31035256-31035411)
chr8 (113-266)||(31578319-31578475)
chr8 (97-244)||(181622-181772)
chr8 (64-189)||(37214320-37214436)
chr8 (31-240)||(31573794-31574000)
chr8 (30-137)||(35872555-35872658)
chr8 (126-266)||(6376140-6376282)
chr8 (113-212)||(13985176-13985277)
chr8 (31-146)||(31035126-31035238)
chr8 (70-154)||(2468261-2468341)
chr8 (30-85)||(12517248-12517304)
chr8 (196-266)||(35872482-35872553)
chr8 (113-211)||(17847662-17847763)
chr8 (126-190)||(28332630-28332693)
chr8 (126-210)||(9021206-9021290)
chr8 (113-212)||(13985909-13986010)
chr8 (192-266)||(2468171-2468247)
chr8 (126-190)||(16752642-16752705)
chr8 (126-190)||(16757387-16757450)
chr8 (126-190)||(28327907-28327970)
chr8 (126-190)||(28895501-28895564)
chr8 (126-190)||(30423211-30423275)
chr8 (222-266)||(33541452-33541496)
chr8 (126-212)||(2267120-2267206)
chr8 (126-165)||(17799568-17799607)
chr8 (126-168)||(28228513-28228555)
chr8 (113-154)||(33839077-33839119)
chr8 (30-74)||(3886153-3886198)
chr8 (130-210)||(33032657-33032737)
chr8 (130-190)||(590797-590856)
chr8 (126-190)||(4812607-4812670)
chr8 (126-190)||(15949533-15949597)
chr8 (126-154)||(21033869-21033897)
[»] chr7 (101 HSPs)
chr7 (30-266)||(44724588-44724826)
chr7 (30-266)||(20297371-20297609)
chr7 (30-266)||(38393995-38394233)
chr7 (30-266)||(48457662-48457900)
chr7 (30-266)||(20626047-20626285)
chr7 (30-266)||(20629938-20630176)
chr7 (30-266)||(20642357-20642595)
chr7 (30-264)||(4295978-4296215)
chr7 (30-266)||(3878586-3878824)
chr7 (30-266)||(21990159-21990397)
chr7 (30-266)||(27306272-27306509)
chr7 (30-264)||(35638-35874)
chr7 (37-266)||(20299475-20299707)
chr7 (30-266)||(20137150-20137389)
chr7 (30-266)||(24748603-24748842)
chr7 (30-262)||(18345550-18345784)
chr7 (30-265)||(7470065-7470302)
chr7 (30-266)||(13099516-13099756)
chr7 (30-261)||(42331044-42331279)
chr7 (30-266)||(31435088-31435327)
chr7 (30-266)||(42223166-42223405)
chr7 (30-266)||(1849990-1850228)
chr7 (30-266)||(21592185-21592423)
chr7 (31-266)||(443605-443842)
chr7 (37-251)||(11757245-11757462)
chr7 (30-266)||(40836785-40837022)
chr7 (30-256)||(44573-44801)
chr7 (30-266)||(9679068-9679306)
chr7 (30-266)||(39146028-39146267)
chr7 (30-266)||(7351694-7351932)
chr7 (30-266)||(7472022-7472260)
chr7 (30-266)||(11355267-11355505)
chr7 (30-266)||(37412167-37412408)
chr7 (30-266)||(40946337-40946575)
chr7 (30-266)||(1046967-1047204)
chr7 (30-266)||(1049338-1049575)
chr7 (30-266)||(3035730-3035971)
chr7 (30-266)||(9680828-9681067)
chr7 (30-266)||(21678075-21678313)
chr7 (30-246)||(28485575-28485793)
chr7 (30-266)||(28487562-28487800)
chr7 (30-266)||(43253559-43253796)
chr7 (30-266)||(7349315-7349553)
chr7 (30-266)||(21680036-21680274)
chr7 (30-266)||(31155953-31156191)
chr7 (40-255)||(25276160-25276378)
chr7 (30-266)||(24258472-24258714)
chr7 (30-266)||(25542539-25542775)
chr7 (30-266)||(27832674-27832913)
chr7 (89-266)||(7092254-7092432)
chr7 (89-266)||(7094502-7094679)
chr7 (30-266)||(24817395-24817629)
chr7 (30-212)||(26804578-26804764)
chr7 (30-266)||(22828674-22828913)
chr7 (30-251)||(22251602-22251822)
chr7 (30-266)||(7188552-7188787)
chr7 (127-266)||(2935375-2935515)
chr7 (55-266)||(20091589-20091797)
chr7 (50-264)||(24813542-24813755)
chr7 (98-266)||(38396713-38396881)
chr7 (127-266)||(1606487-1606626)
chr7 (127-266)||(22137185-22137324)
chr7 (127-266)||(40552212-40552351)
chr7 (30-138)||(18567622-18567731)
chr7 (127-266)||(9027236-9027375)
chr7 (127-266)||(22108174-22108313)
chr7 (127-266)||(40549934-40550073)
chr7 (113-256)||(6332312-6332458)
chr7 (31-266)||(6048885-6049120)
chr7 (64-210)||(24465585-24465727)
chr7 (113-266)||(16297064-16297221)
chr7 (64-167)||(22392509-22392608)
chr7 (31-212)||(11081522-11081699)
chr7 (115-220)||(40281466-40281572)
chr7 (113-190)||(11084468-11084545)
chr7 (178-259)||(22393880-22393963)
chr7 (113-212)||(26210632-26210734)
chr7 (86-168)||(12310157-12310238)
chr7 (113-210)||(2120883-2120982)
chr7 (126-171)||(21369641-21369686)
chr7 (156-266)||(6046629-6046741)
chr7 (150-256)||(6348912-6349020)
chr7 (160-243)||(26295587-26295671)
chr7 (126-210)||(25351352-25351436)
chr7 (126-210)||(25357046-25357130)
chr7 (126-210)||(25410129-25410213)
chr7 (126-190)||(3320170-3320233)
chr7 (126-190)||(3324918-3324981)
chr7 (126-190)||(7069779-7069842)
chr7 (126-190)||(7074786-7074849)
chr7 (126-190)||(25405392-25405455)
chr7 (30-81)||(38396325-38396377)
chr7 (126-190)||(42006662-42006725)
chr7 (126-165)||(15541139-15541178)
chr7 (113-190)||(2990750-2990828)
chr7 (72-243)||(13290540-13290710)
chr7 (30-59)||(7092426-7092455)
chr7 (130-210)||(44143965-44144045)
chr7 (130-210)||(44512624-44512704)
chr7 (126-190)||(8378624-8378687)
chr7 (130-190)||(30246973-30247032)
[»] chr4 (113 HSPs)
chr4 (34-266)||(9148310-9148543)
chr4 (30-266)||(22800904-22801142)
chr4 (30-266)||(40637127-40637365)
chr4 (30-266)||(37089414-37089651)
chr4 (30-266)||(14633372-14633609)
chr4 (30-266)||(8631461-8631699)
chr4 (30-266)||(24348271-24348509)
chr4 (30-266)||(48486372-48486610)
chr4 (30-259)||(22802783-22803014)
chr4 (30-266)||(5198473-5198711)
chr4 (49-266)||(26086019-26086237)
chr4 (30-266)||(22046728-22046965)
chr4 (30-266)||(19095935-19096174)
chr4 (30-266)||(38928219-38928458)
chr4 (30-266)||(14787473-14787711)
chr4 (30-266)||(24888849-24889087)
chr4 (30-266)||(47868454-47868692)
chr4 (30-249)||(5637524-5637745)
chr4 (30-266)||(22044433-22044670)
chr4 (30-266)||(24879042-24879281)
chr4 (30-266)||(36921535-36921774)
chr4 (31-266)||(24880505-24880743)
chr4 (30-266)||(11435008-11435245)
chr4 (30-266)||(38409258-38409495)
chr4 (31-266)||(2484915-2485151)
chr4 (30-266)||(13544012-13544250)
chr4 (30-266)||(11006279-11006517)
chr4 (30-266)||(12395887-12396125)
chr4 (30-266)||(18847206-18847444)
chr4 (30-266)||(33415530-33415767)
chr4 (30-266)||(40091457-40091695)
chr4 (30-266)||(18709206-18709443)
chr4 (30-266)||(22132434-22132670)
chr4 (30-266)||(51015299-51015536)
chr4 (30-266)||(56030497-56030732)
chr4 (30-266)||(6764892-6765135)
chr4 (30-266)||(36378345-36378584)
chr4 (30-266)||(12400849-12401087)
chr4 (30-266)||(44599880-44600118)
chr4 (30-266)||(47274780-47275017)
chr4 (50-251)||(3824627-3824830)
chr4 (30-266)||(11008610-11008846)
chr4 (30-243)||(16453362-16453577)
chr4 (30-266)||(36919626-36919865)
chr4 (30-266)||(37313107-37313346)
chr4 (30-266)||(17662287-17662514)
chr4 (30-266)||(22780415-22780653)
chr4 (30-266)||(22782780-22783018)
chr4 (30-266)||(41997545-41997784)
chr4 (30-266)||(619489-619727)
chr4 (30-266)||(9176516-9176754)
chr4 (30-266)||(31849641-31849879)
chr4 (30-266)||(7941374-7941614)
chr4 (30-266)||(22134659-22134895)
chr4 (33-266)||(16934185-16934420)
chr4 (30-262)||(9174192-9174426)
chr4 (33-266)||(16931831-16932066)
chr4 (30-266)||(19322750-19322985)
chr4 (30-266)||(47210794-47211020)
chr4 (53-266)||(36380425-36380641)
chr4 (30-204)||(3937314-3937489)
chr4 (31-266)||(18537516-18537749)
chr4 (30-266)||(53405183-53405426)
chr4 (30-243)||(18409413-18409627)
chr4 (64-266)||(18534874-18535075)
chr4 (30-158)||(52942597-52942726)
chr4 (32-189)||(6132927-6133085)
chr4 (64-266)||(27499133-27499334)
chr4 (90-266)||(16455355-16455533)
chr4 (64-266)||(38890267-38890468)
chr4 (31-266)||(8756293-8756528)
chr4 (118-243)||(2891433-2891559)
chr4 (113-266)||(12102223-12102379)
chr4 (127-266)||(13547305-13547445)
chr4 (30-137)||(38270158-38270266)
chr4 (31-257)||(28453742-28453965)
chr4 (30-266)||(15032590-15032816)
chr4 (153-266)||(4215483-4215597)
chr4 (173-266)||(5635518-5635612)
chr4 (173-266)||(11437560-11437653)
chr4 (64-266)||(30136640-30136841)
chr4 (115-266)||(3982218-3982374)
chr4 (113-266)||(31983569-31983725)
chr4 (31-266)||(40998991-40999226)
chr4 (30-111)||(5101050-5101132)
chr4 (126-266)||(16185877-16186019)
chr4 (31-266)||(9863765-9864001)
chr4 (113-253)||(47150948-47151091)
chr4 (30-137)||(24446756-24446859)
chr4 (31-266)||(10112927-10113161)
chr4 (113-266)||(25357773-25357933)
chr4 (30-93)||(2891370-2891434)
chr4 (178-264)||(5101131-5101218)
chr4 (82-169)||(10114435-10114520)
chr4 (196-266)||(24446683-24446754)
chr4 (113-239)||(54906723-54906852)
chr4 (126-190)||(5336902-5336965)
chr4 (130-190)||(25699752-25699811)
chr4 (130-210)||(4556158-4556238)
chr4 (126-210)||(4570093-4570177)
chr4 (126-210)||(7050356-7050440)
chr4 (130-210)||(16489352-16489432)
chr4 (126-190)||(11853548-11853611)
chr4 (81-168)||(38208825-38208911)
chr4 (126-169)||(25614060-25614103)
chr4 (223-266)||(47563009-47563052)
chr4 (126-165)||(55822264-55822303)
chr4 (130-210)||(4558314-4558394)
chr4 (130-210)||(15316961-15317041)
chr4 (130-210)||(31300427-31300507)
chr4 (178-230)||(52942537-52942590)
chr4 (130-190)||(8529270-8529329)
chr4 (130-190)||(18586969-18587028)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (30-266)||(69334-69571)
scaffold0025 (30-129)||(73203-73303)
scaffold0025 (93-136)||(73160-73203)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (30-266)||(183683-183920)
scaffold0005 (30-266)||(52019-52257)
[»] chr2 (83 HSPs)
chr2 (30-266)||(42923551-42923789)
chr2 (30-266)||(19007615-19007853)
chr2 (30-266)||(23452279-23452517)
chr2 (30-266)||(45280026-45280265)
chr2 (30-266)||(35218005-35218243)
chr2 (30-266)||(27104774-27105010)
chr2 (30-266)||(42064490-42064727)
chr2 (30-264)||(19504390-19504625)
chr2 (30-266)||(42452758-42452994)
chr2 (30-266)||(19502053-19502291)
chr2 (30-266)||(21520735-21520973)
chr2 (30-266)||(6258858-6259095)
chr2 (30-266)||(22287378-22287616)
chr2 (30-266)||(28196612-28196850)
chr2 (30-266)||(35215628-35215866)
chr2 (30-266)||(45239019-45239256)
chr2 (30-266)||(13910087-13910324)
chr2 (30-218)||(15539566-15539755)
chr2 (30-266)||(6264190-6264425)
chr2 (31-266)||(17848419-17848653)
chr2 (30-266)||(40032095-40032338)
chr2 (30-243)||(3022138-3022352)
chr2 (30-266)||(17849092-17849330)
chr2 (30-266)||(34979620-34979859)
chr2 (31-243)||(44289133-44289347)
chr2 (32-266)||(11739601-11739838)
chr2 (63-266)||(28459231-28459436)
chr2 (30-266)||(43623622-43623848)
chr2 (30-266)||(24162265-24162492)
chr2 (30-266)||(14837248-14837481)
chr2 (30-266)||(31732818-31733045)
chr2 (30-266)||(11578150-11578384)
chr2 (64-266)||(18800355-18800555)
chr2 (104-266)||(5375388-5375550)
chr2 (64-266)||(22874144-22874344)
chr2 (127-266)||(36558906-36559046)
chr2 (127-266)||(36561183-36561323)
chr2 (31-266)||(20146650-20146884)
chr2 (32-266)||(17897287-17897519)
chr2 (30-154)||(38020177-38020302)
chr2 (113-266)||(40699432-40699588)
chr2 (30-151)||(22163106-22163227)
chr2 (30-125)||(22407593-22407689)
chr2 (127-266)||(45332223-45332363)
chr2 (63-238)||(27136195-27136369)
chr2 (167-266)||(22407496-22407596)
chr2 (126-257)||(20589762-20589896)
chr2 (31-243)||(43139356-43139564)
chr2 (30-109)||(5377629-5377709)
chr2 (50-256)||(35107294-35107498)
chr2 (97-189)||(38414201-38414291)
chr2 (180-266)||(7462990-7463077)
chr2 (113-266)||(17921755-17921910)
chr2 (113-169)||(27583479-27583535)
chr2 (192-266)||(22707795-22707870)
chr2 (113-243)||(37963007-37963135)
chr2 (113-257)||(15693960-15694109)
chr2 (126-212)||(28458925-28459012)
chr2 (113-217)||(30720703-30720810)
chr2 (72-187)||(35028595-35028707)
chr2 (194-266)||(23870956-23871029)
chr2 (126-190)||(2736204-2736267)
chr2 (126-190)||(2740940-2741003)
chr2 (222-266)||(22163064-22163108)
chr2 (113-168)||(26345663-26345718)
chr2 (126-165)||(39680044-39680083)
chr2 (126-266)||(33603993-33604135)
chr2 (126-210)||(20054864-20054948)
chr2 (126-190)||(17462435-17462498)
chr2 (126-190)||(22712636-22712699)
chr2 (126-190)||(22717345-22717408)
chr2 (126-190)||(39686982-39687045)
chr2 (126-190)||(45567408-45567471)
chr2 (113-190)||(34575229-34575307)
chr2 (127-187)||(10942634-10942695)
chr2 (127-187)||(10948503-10948564)
chr2 (130-210)||(17932637-17932717)
chr2 (130-210)||(17943540-17943620)
chr2 (130-210)||(27517738-27517818)
chr2 (113-168)||(7502976-7503032)
chr2 (130-190)||(12781341-12781400)
chr2 (126-154)||(20050177-20050205)
chr2 (130-190)||(30478997-30479056)
[»] scaffold0131 (3 HSPs)
scaffold0131 (30-266)||(14424-14662)
scaffold0131 (30-264)||(15027-15263)
scaffold0131 (126-154)||(31140-31168)
[»] chr6 (79 HSPs)
chr6 (30-266)||(30967235-30967473)
chr6 (30-266)||(1230291-1230529)
chr6 (30-266)||(11983071-11983309)
chr6 (30-266)||(28241363-28241601)
chr6 (34-265)||(15530166-15530398)
chr6 (30-266)||(4816273-4816511)
chr6 (30-266)||(20915398-20915636)
chr6 (30-266)||(3390413-3390652)
chr6 (30-266)||(3631979-3632218)
chr6 (30-266)||(14458809-14459045)
chr6 (38-266)||(3629906-3630136)
chr6 (31-266)||(9019961-9020198)
chr6 (30-266)||(13057228-13057467)
chr6 (30-266)||(26065020-26065254)
chr6 (30-266)||(26084989-26085223)
chr6 (30-266)||(2628928-2629165)
chr6 (30-266)||(15532723-15532961)
chr6 (31-266)||(14507218-14507454)
chr6 (30-266)||(3233772-3234011)
chr6 (30-266)||(32280030-32280269)
chr6 (31-266)||(30034645-30034882)
chr6 (30-266)||(19704609-19704849)
chr6 (30-266)||(13039788-13040027)
chr6 (30-238)||(25477308-25477518)
chr6 (30-266)||(15541182-15541420)
chr6 (30-266)||(12195557-12195795)
chr6 (30-266)||(30728866-30729108)
chr6 (30-266)||(26932604-26932842)
chr6 (30-266)||(24338488-24338728)
chr6 (30-248)||(12161617-12161835)
chr6 (55-266)||(3027895-3028106)
chr6 (94-266)||(5273258-5273431)
chr6 (31-203)||(19227514-19227687)
chr6 (64-243)||(15719715-15719891)
chr6 (30-243)||(22490673-22490889)
chr6 (127-266)||(26066166-26066306)
chr6 (127-266)||(26068437-26068577)
chr6 (127-266)||(29754751-29754891)
chr6 (31-266)||(16455467-16455701)
chr6 (115-266)||(1069760-1069913)
chr6 (127-266)||(33308989-33309128)
chr6 (127-264)||(33311258-33311395)
chr6 (113-266)||(12186113-12186269)
chr6 (64-241)||(17012112-17012287)
chr6 (72-243)||(14466399-14466572)
chr6 (72-266)||(20526885-20527078)
chr6 (113-266)||(22857995-22858151)
chr6 (117-266)||(26945265-26945417)
chr6 (82-266)||(15367121-15367303)
chr6 (30-107)||(1072079-1072157)
chr6 (30-103)||(17852576-17852650)
chr6 (30-122)||(32447502-32447596)
chr6 (31-266)||(19696479-19696713)
chr6 (30-123)||(13870608-13870702)
chr6 (126-266)||(12937235-12937377)
chr6 (113-264)||(25078601-25078754)
chr6 (113-187)||(11138424-11138499)
chr6 (126-266)||(12911488-12911630)
chr6 (113-244)||(28037794-28037927)
chr6 (31-94)||(8995514-8995578)
chr6 (192-266)||(25465633-25465708)
chr6 (126-193)||(3577632-3577697)
chr6 (173-266)||(30445701-30445797)
chr6 (127-239)||(7542452-7542566)
chr6 (194-266)||(15346546-15346619)
chr6 (126-190)||(13878726-13878789)
chr6 (126-190)||(13883474-13883537)
chr6 (126-190)||(16785918-16785981)
chr6 (126-190)||(26887344-26887407)
chr6 (126-190)||(31248834-31248897)
chr6 (126-190)||(35201446-35201509)
chr6 (135-190)||(5165935-5165989)
chr6 (64-140)||(15346452-15346524)
chr6 (126-168)||(24542815-24542857)
chr6 (50-86)||(10584175-10584212)
chr6 (130-210)||(17694950-17695030)
chr6 (36-105)||(17904566-17904632)
chr6 (133-193)||(25941650-25941708)
chr6 (130-190)||(17036058-17036117)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (31-266)||(79194-79431)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (30-266)||(41525-41763)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (30-266)||(11515-11753)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (30-266)||(79867-80105)
scaffold0004 (126-210)||(188341-188425)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (30-266)||(6207-6445)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (30-264)||(2888-3123)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (30-266)||(4005-4242)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (30-266)||(29179-29416)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (30-266)||(49-287)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (29-266)||(85237-85477)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (30-266)||(2050-2287)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (90-266)||(1495-1671)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (30-201)||(35647-35819)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (30-266)||(15863-16098)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (30-266)||(1684-1911)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (31-243)||(16716-16925)
[»] scaffold0140 (2 HSPs)
scaffold0140 (127-266)||(22222-22361)
scaffold0140 (127-266)||(24497-24636)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (113-253)||(4902-5045)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (30-87)||(1053-1111)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (126-266)||(57470-57614)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (126-190)||(224818-224881)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (130-190)||(16328-16387)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 186; Significance: 1e-101; HSPs: 91)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 31 - 266
Target Start/End: Original strand, 25804025 - 25804262
Alignment:
Q  31 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaa 129  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  25804025 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 25804124  T
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  25804125 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 25804224  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25804225 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 25804262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18511492 - 18511254
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  18511492 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 18511393  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  18511392 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttg 18511293  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18511292 taaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 18511254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 10529379 - 10529141
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  10529379 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttttatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 10529280  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  10529279 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 10529180  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  10529179 taacgttactcatcatatagtgaatcggaaggctgctct 10529141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 4236628 - 4236866
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  4236628 gaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaa 4236727  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  4236728 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 4236827  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4236828 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 4236866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 38882105 - 38882342
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  38882105 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 38882204  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  38882205 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 38882304  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38882305 aacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 38882342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 21948025 - 21948263
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  21948025 gaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 21948124  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||| |||| ||| ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  21948125 acactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtggaattaggcgggagacttattcttgtaaccccttgatatctcttttg 21948224  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21948225 taacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 21948263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 40221521 - 40221760
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  40221521 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttggaaa 40221620  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  40221621 acactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgggacttttggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 40221720  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  40221721 taaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctct 40221760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18509598 - 18509360
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  18509598 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 18509499  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||    
T  18509498 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagaatgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcgttgatatctattttg 18509399  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  18509398 taaagttactcatcatatagtgaaacggtgggctgctct 18509360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 25921753 - 25921515
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||    
T  25921753 gaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaa 25921654  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || | ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  25921653 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactctgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 25921554  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25921553 taacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctct 25921515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 34477334 - 34477095
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  34477334 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 34477235  T
Q  129 acactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggta-ggagacttattcttgtaacccgttgatttcctttt 226  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||    
T  34477234 acactattatgattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 34477135  T
Q  227 gtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34477134 gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 34477095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 6745068 - 6745305
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||| ||||||||   |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  6745068 gaaacaagtgtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaa 6745166  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  6745167 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 6745266  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6745267 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 6745305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 18469010 - 18469248
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  18469010 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaa 18469109  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  18469110 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagactttttcttgtaacccattgatttctcttttg 18469209  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||    
T  18469210 taacgatactcatcatctagtggaacgaagagctgctct 18469248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 39854482 - 39854720
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  39854482 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaa 39854581  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||  |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  39854582 acactattaggattgagtctcatggttacgggaagagactggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 39854681  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39854682 taacgctactcatcatatagtggatcggagggctgctct 39854720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 2174918 - 2175155
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  2174918 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 2175017  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgt 228  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  2175018 acactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 2175117  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2175118 aacgttacttatcatatagtggatcggagggctgctct 2175155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 18466683 - 18466921
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  18466683 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttggatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaa 18466782  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  18466783 acactattaggattgagtctcttggttacggaaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 18466882  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  18466883 taacgatactcatcatataatggaacggagagctgctct 18466921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 6747305 - 6747541
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactag-gtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  6747305 gaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagagtttgtataaaatttgtctctttgaaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaa 6747403  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  6747404 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctttttgt 6747503  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  6747504 aacgttactcgtcatatagtggatcggagggctgctct 6747541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16092480 - 16092241
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  16092480 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtctgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 16092381  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||    
T  16092380 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgagatctcttttg 16092281  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  16092280 taaggttactcatcattatagtgaaacggagggttgctct 16092241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 17072882 - 17073121
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  17072882 gaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 17072981  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||  | ||||||||||||||||| | ||||| || ||||||    
T  17072982 acactattaggattgaatctcttggttaggggaagagattggggctttcgatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttg 17073081  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  17073082 taaggttactcatcattatagtaaaacggagggctgctct 17073121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 34479699 - 34479460
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  34479699 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 34479600  T
Q  129 acactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggta-ggagacttattcttgtaacccgttgatttcctttt 226  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||    
T  34479599 acactattatgattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 34479500  T
Q  227 gtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34479499 gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 34479460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 25904102 - 25904340
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaggt-ttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  25904102 gaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 25904201  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||| |||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| || || |||    
T  25904202 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagggctttgagtataattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctctattg 25904301  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||    
T  25904302 taacgttacttatcatatagtgaaacggatgactgctct 25904340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 31545079 - 31545317
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  31545079 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 31545178  T
Q  129 acactattaggatt-gagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttg 227  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  31545179 acactattaggattagagtctcttggttacgggaagaaattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 31545278  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  31545279 taacagtactcatcatatagtggattggagggctgctct 31545317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 264
Target Start/End: Original strand, 16776157 - 16776392
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  16776157 gaaacaagggtttacaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 16776256  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  16776257 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatttctcttttg 16776355  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgct 264  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  16776356 taacgttacttatcatatagtggatcggagggctgct 16776392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 27912535 - 27912773
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  27912535 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaataataggttttgagggttgattcaccttgggaa 27912634  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27912635 acactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 27912734  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  27912735 taacgatactcatcatatagtggaacagagaactgctct 27912773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 31179651 - 31179413
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  31179651 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 31179552  T
Q  129 acactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttg 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||  ||||    
T  31179551 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattcatttctctttg 31179452  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  31179451 taacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 31179413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 21684731 - 21684494
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||| |||||| |||||| |     
T  21684731 gaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggat 21684632  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||    
T  21684631 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgt 21684532  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21684531 aacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctct 21684494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 2954415 - 2954653
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttg-caacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaa 127  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  2954415 gaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgtgtataatttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcactttggaa 2954514  T
Q  128 aacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||    
T  2954515 aacactattaggattgagtctcttagttacgagaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctctttg 2954614  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  2954615 taaagttactcatcatatagtgaagcggagggatgctct 2954653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 50 - 266
Target Start/End: Original strand, 27910469 - 27910687
Alignment:
Q  50 caacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtct 148  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  27910469 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaatct 27910568  T
Q  149 cttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatcatatag 247  Q
    |||||||||| ||||||  || | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||     
T  27910569 cttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgatactcatcatataa 27910668  T
Q  248 tggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  27910669 tggaacggagagctgctct 27910687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 31542734 - 31542971
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  31542734 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 31542833  T
Q  129 acactattaggatt-gagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttg 227  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||| | ||||| ||||||||  ||||    
T  31542834 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctcg-aacccattgatttctctttg 31542932  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  31542933 taacagtactcatcatatagtggattggagggctgctct 31542971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 53 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 658610 - 658395
Alignment:
Q  53 caacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctctt 151  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  658610 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattaggatcgagtctctt 658511  T
Q  152 ggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatcatatagtgg 250  Q
    ||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||     
T  658510 ggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtga 658411  T
Q  251 aacggagggctgctct 266  Q
    |||||| |||||||||    
T  658410 aacggatggctgctct 658395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 1189889 - 1189650
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacta-ggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  1189889 gaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactacggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcactttgggaa 1189790  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||| || ||||||    
T  1189789 acactattatgattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttg 1189690  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  1189689 taaggttactcataattatagtggaacggagggatgctct 1189650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 2818616 - 2818377
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacta-ggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggct-gattcaccttggaa 127  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  2818616 gaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtttgattcaccttggaa 2818517  T
Q  128 aacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-ctttt 226  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||  |||| |||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||| | ||||  || |||||    
T  2818516 aacactattacgattgagtctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctctttt 2818417  T
Q  227 gtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  2818416 gtaacgttactcatcatatagtgaaacggaggactgctct 2818377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 15552244 - 15552482
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| | | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  15552244 gaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 15552343  T
Q  129 acactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttg 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  15552344 acactattaggattggagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 15552443  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15552444 taacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 15552482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17818770 - 17818532
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactag-gtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||    
T  17818770 gaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagttcgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgggaa 17818671  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  17818670 acactattaagactgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 17818571  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  17818570 taaagttactcatcatacagtggaacagagggcttctct 17818532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 24126855 - 24127093
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |  ||||| ||||||| ||    
T  24126855 gaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgtcaacaaatactagggtttgaagattgattgaccttgggaa 24126954  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    ||||||||||||||||| | ||||| || ||||||    
T  24126955 acactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgatagacttattcttgtaactcattgatatctcttttg 24127054  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24127055 taaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 24127093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 36402608 - 36402370
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36402608 gaaacaagggtttagaatgacaatcacgaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaa 36402509  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||  |||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||| || ||||| || ||||||    
T  36402508 atactattaggattgaatctcttggttacgggaggagattggaactttgggtaaaattaggctggagacttattattgtaatccattgatatctcttttg 36402409  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||    
T  36402408 taacgttactcatcatatagtgaaacagatgtctgctct 36402370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 38 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 37706052 - 37705834
Alignment:
Q  38 ggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactatt 136  Q
    ||||||||| | |||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  37706052 ggtttagaaaggcaacgacaaatctagggtttgtatagactttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 37705953  T
Q  137 aggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgtta 235  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||    
T  37705952 aggattgagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggtta 37705853  T
Q  236 ctcatcatatagtggaacg 254  Q
    |||||||||||||| ||||    
T  37705852 ctcatcatatagtgaaacg 37705834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 48 - 266
Target Start/End: Original strand, 18596662 - 18596883
Alignment:
Q  48 gacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagt 146  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18596662 gacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacaatatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactgttaggattgagt 18596761  T
Q  147 ctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-ta 244  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||  ||||||||||| ||||||| | ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||    
T  18596762 ctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatcatta 18596861  T
Q  245 tagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  18596862 tagtggaacggatggctgctct 18596883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 39398273 - 39398035
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttg-caacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaa 127  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |    
T  39398273 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttggga 39398175  T
Q  128 aacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-ctttt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  39398174 aacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggaactttgggtagaattaggcagtagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 39398075  T
Q  227 gtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    || |||||||  || |||||||  |||||| |||||||||    
T  39398074 gtgacgttaccaattatatagtaaaacggatggctgctct 39398035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 10474603 - 10474365
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||    
T  10474603 gaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgatacaccttgggaa 10474504  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||  |||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||     
T  10474503 acactattaagattgaatctcttggttacaggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttc 10474404  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  10474403 taaggttactcatcatatagtgaaacggatggctgctct 10474365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 38 - 258
Target Start/End: Original strand, 26097740 - 26097961
Alignment:
Q  38 ggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactatt 136  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  26097740 ggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttggatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttagagggttgattcaccttgg-aaacactatt 26097838  T
Q  137 aggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgtta 235  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||| |   |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||    
T  26097839 aggaatgagtctcttggttacgggaaaatgctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgtta 26097938  T
Q  236 ctcatcatatagtggaacggagg 258  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  26097939 ctcatcatatagtggaacagagg 26097961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 31 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 31472892 - 31472654
Alignment:
Q  31 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaa 129  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||    
T  31472892 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaa 31472793  T
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  |||  | | ||||| |||||| ||||| || |||||||    
T  31472792 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggatgcatcttcttctaacccattgatatctcttttgt 31472693  T
Q  229 aacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  31472692 aaagttactcatcattatagtgaaacggagggttgctct 31472654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 10586841 - 10587068
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaggtttgtatagagtttgtctctttgc-aacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||          ||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  10586841 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactag----------agtttgtctctttgggaacaaacgatagggtttgagggttgattcaccttgggaa 10586930  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgt 228  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||    
T  10586931 acactattaggattcagtctcttgcttacggaaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttattcttttaacccattgatttctctttgt 10587030  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10587031 aacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 10587068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 30 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 12556203 - 12555967
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactag-gtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||    
T  12556203 gaaataagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaa 12556104  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttg--atttcctttt 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| | ||| |||||||||||  | ||||||| |||||||||| | |||  || || ||||    
T  12556103 acactattaggattgtgtctcttggctacgggaagagattggag-ttttggtagaattagacaagagactttttcttgtaactcattgacatctcttttt 12556005  T
Q  227 gtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgct 264  Q
    ||||||||||||||| || || | ||||||||||||||    
T  12556004 gtaacgttactcatcttaaagcgaaacggagggctgct 12555967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 210
Target Start/End: Original strand, 6756493 - 6756674
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacta-ggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  6756493 gaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattctccttgggaa 6756592  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaac 210  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  6756593 acactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 6756674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 695888 - 696115
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaa 129  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||          |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  695888 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagg----------gtttgtatctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaa- 695976  T
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  695977 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 696076  T
Q  229 aacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    || |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  696077 aaagttattcatcattatagtgaaacggagggctgctct 696115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 30 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 34530946 - 34530712
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||| ||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  34530946 gaaacaagtgtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaa 34530847  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||  |||||||||||  ||||| ||||||||||||| | ||||| || ||||||    
T  34530846 acactattaggattgagtctcttggctacgggaagagattaggactttgagtagaattaggcgggagatttattcttgtaactcattgatatctcttttg 34530747  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggct 261  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||||||  |||||||    
T  34530746 taaagttgctcatcattatagtggaagagagggct 34530712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 97 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 41585956 - 41585786
Alignment:
Q  97 actagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggaga 196  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  41585956 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactagtaggattgagtctcttggctacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcaggaga 41585857  T
Q  197 cttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||| ||||||  | ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41585856 cttatttttgtaagtcattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 41585786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 189
Target Start/End: Original strand, 20045009 - 20045169
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||| |   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  20045009 gaaacaagggtttaggaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 20045108  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg 189  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  20045109 acactattatgattgagtctcttggttccgggaagagattgggactttgggtagaattagg 20045169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 188
Target Start/End: Original strand, 20043049 - 20043208
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  20043049 gaaacaagtgtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 20043148  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattag 188  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| | |||||||||    
T  20043149 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttggatagaattag 20043208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 108 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 20506042 - 20505883
Alignment:
Q  108 agggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgt 207  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  20506042 agggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 20505943  T
Q  208 aacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20505942 aacacattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 20505883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 55 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 31466233 - 31466040
Alignment:
Q  55 acaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgg 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  31466233 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacaccagggtttgacggttgattcaccttgagaaacagtattaggattgagtctcttgg 31466134  T
Q  154 ttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatcatatag 247  Q
    ||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  31466133 ttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcatatag 31466040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 113 - 266
Target Start/End: Original strand, 39798130 - 39798284
Alignment:
Q  113 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaaccc 212  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  39798130 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 39798229  T
Q  213 gttgatttc-cttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
     |||||||| ||||| ||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  39798230 attgatttctcttttataatgatactcatcgtatagtggatcggagggctgctct 39798284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 97 - 266
Target Start/End: Original strand, 4410090 - 4410259
Alignment:
Q  97 actagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggaga 196  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  |||||    
T  4410090 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 4410189  T
Q  197 cttattcttgtaacccgttgatttccttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||  ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  4410190 cttattcttgtaacctattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggattggagagctgctct 4410259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 127 - 266
Target Start/End: Original strand, 10749797 - 10749937
Alignment:
Q  127 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttt 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  10749797 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 10749896  T
Q  226 tgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  10749897 tgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctct 10749937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 21288763 - 21288998
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtt------tgagggctgattcacct 122  Q
    |||| |||||||||||||  |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||      |||||| ||||||||||    
T  21288763 gaaataagggtttagaatagcaacaataaaaatagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttagggtttgagggttgattcacct 21288862  T
Q  123 tggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttcc 222  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||| | |||||||| |  ||||| || |||||||||| | |       |    
T  21288863 tg-aaaacactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattaggactttggatagaattaagcgggagattttttcttgtaactcat-------c 21288954  T
Q  223 ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21288955 ttttgtaacgttactcatcttatagtgaaacggagggctgctct 21288998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 26098531 - 26098379
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  26098531 gaaataagggtttagaatggcaacaagaagactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgacaa 26098432  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggta 181  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||    
T  26098431 acactattatgattgagtctcttggttacggaaagagattggggttttgggta 26098379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 64 - 266
Target Start/End: Original strand, 9020256 - 9020456
Alignment:
Q  64 ggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaag 163  Q
    |||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||  ||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||    
T  9020256 ggtttgtatagagttg--ctcttggcaacaaacactagggttgaagt--tgattcaccttggaaaacactattaagattgagtttcttggtcacgggaag 9020351  T
Q  164 agattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggct 261  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||  |||||||||| ||||||||| |||| ||||    
T  9020352 agattggagctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggatcggatggct 9020451  T
Q  262 gctct 266  Q
    |||||    
T  9020452 gctct 9020456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 6661462 - 6661227
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaggtt-tgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||| |||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |  || ||||||||| ||| ||    
T  6661462 gaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaattagggtatgtatagagtttgt-tcttggcaacaaacactagagttgg--ggttgattcaccatgggaa 6661367  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |  ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  6661366 acactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaaattgagattttgggtacaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 6661267  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||| ||||| | |||||||||||||| | |||||||    
T  6661266 taaagttgctcataattatagtggaacggatgactgctct 6661227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 127 - 266
Target Start/End: Original strand, 10757274 - 10757413
Alignment:
Q  127 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttt 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||   ||    
T  10757274 aaacactattaggattggagtctcttggttacg-gaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttttctt 10757372  T
Q  226 tgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  10757373 tgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctct 10757413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 92 - 266
Target Start/End: Original strand, 2723964 - 2724130
Alignment:
Q  92 caaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggta 191  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||         ||||||||||||      
T  2723964 caaacactagggtttgagggatgattcaccttgggaaacaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagatt---------ggtagaattaggcg 2724054  T
Q  192 ggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    || || ||||||||||||||| ||||| || |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2724055 ggtgatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 2724130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 72 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17413402 - 17413208
Alignment:
Q  72 tagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggg 171  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |  |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |    
T  17413402 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcaagggaagagattgag 17413306  T
Q  172 gctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
     ||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  17413305 actttaggtagaattaggtttgaaaacttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctct 17413208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 20053846 - 20054073
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactag-gtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||  |||||||| |||| |||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||    
T  20053846 gaaacaagggtttagaagg-caacacaaaaactagagtttatataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gaggt-tgattcaccttgggaa 20053941  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | || | |||||||    
T  20053942 acactattaggattgagtctcttggtt-----tggagattgggactttaagtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccgat-atct-cttttgt 20054034  T
Q  229 aacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    || ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  20054035 aaagttactcatcattatagtagaacggaaggctgctct 20054073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 127 - 266
Target Start/End: Original strand, 23665141 - 23665280
Alignment:
Q  127 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttt 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  | ||||| ||||||||||||| ||||||||  ||    
T  23665141 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctctt 23665239  T
Q  226 tgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  23665240 tgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctct 23665280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 127 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 23793446 - 23793307
Alignment:
Q  127 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttt 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  | ||||| ||||||||||||| ||||||||  ||    
T  23793446 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctctt 23793348  T
Q  226 tgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  23793347 tgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctct 23793307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 127 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 3373319 - 3373179
Alignment:
Q  127 aaacactattaggattga-gtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttt 225  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  3373319 aaacactattaggattgaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 3373220  T
Q  226 tgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||  |||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  3373219 tgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggttgctct 3373179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 127 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 15354756 - 15354617
Alignment:
Q  127 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttt 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  | ||||| ||||||||||||| ||||||||  ||    
T  15354756 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctctt 15354658  T
Q  226 tgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  15354657 tgtaacgttactcattaaatagtggatcggagggctgctct 15354617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 127 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 15357032 - 15356893
Alignment:
Q  127 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttt 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  | ||||| ||||||||||||| ||||||||  ||    
T  15357032 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctctt 15356934  T
Q  226 tgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  15356933 tgtaacgttactcattaaatagtggatcggagggctgctct 15356893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 127 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 38960313 - 38960174
Alignment:
Q  127 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttt 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||   ||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||    
T  38960313 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgggagact-attcttgtaacccattgatttctctt 38960215  T
Q  226 tgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  38960214 tgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctct 38960174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 133 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 23742034 - 23741901
Alignment:
Q  133 tattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgtaac 231  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  | ||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  23742034 tattaggattggagtctcttgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctctttgtaac 23741936  T
Q  232 gttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  23741935 gttactcatcaaatagtggatcggagggctgctct 23741901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 113 - 266
Target Start/End: Original strand, 36208658 - 36208814
Alignment:
Q  113 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaacc 211  Q
    ||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  36208658 tgattcaccttgggaaacattactaagattgagtctcttggtaacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgtagacttattcttgtaacc 36208757  T
Q  212 cgttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    | ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  36208758 cattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggcgggctgctct 36208814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 113 - 264
Target Start/End: Original strand, 15143548 - 15143702
Alignment:
Q  113 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaacc 211  Q
    ||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||  ||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  15143548 tgattcacctttggaagcactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagatttggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaacc 15143647  T
Q  212 cgttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgct 264  Q
    | ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  15143648 ctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggggagctgct 15143702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 31 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 2144840 - 2144604
Alignment:
Q  31 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaa-acactagggtttgagggctgattcaccttgga-aa 128  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||||| || | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |  |  |||||||||||||| ||    
T  2144840 aaacaagggtttagaa-gccaacactaaaactagggtt-tgtagagtttg-ctcttggcaacaacacactagggttgg--gattgattcaccttggagaa 2144746  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagatt-ggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaacc-cgttgatttccttt 225  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  || |||||||||  || |||| ||| |||||||| | | ||||| ||||||||||||   || || ||  ||    
T  2144745 acactattaggatggagtctcttggtcgcgggaagagattcaggactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttgtaaccttttttatatctctt 2144646  T
Q  226 tgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2144645 tgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctct 2144604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 20507742 - 20507660
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacta-ggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgaggg 111  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||    
T  20507742 gaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaattaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacaagggtttaaggg 20507660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 190
Target Start/End: Original strand, 4754198 - 4754313
Alignment:
Q  72 tagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggg 171  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||   |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||  |||||||||| |    
T  4754198 tagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gagat-tgattcaccttgaaaaacactattagaattgagcctcttggtcactggaagagattgtg 4754294  T
Q  172 gctttaggtagaattaggt 190  Q
     |||| | |||||||||||    
T  4754295 actttggatagaattaggt 4754313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 130 - 264
Target Start/End: Original strand, 4897828 - 4897965
Alignment:
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| | |||| |||||||||||| | | ||||| ||||||||||||  ||||| || || |||    
T  4897828 cactgttaggattgagtatcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcttgaagactgattcttgtaaccatttgatatctctattg 4897927  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgct 264  Q
    ||| ||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||    
T  4897928 taaagttactcatcattatagcggaacagtgggctgct 4897965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 15445454 - 15445308
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacga---gaagagattggggctttaggtagaattaggtagga-gacttattcttgtaacccgttgatttc 221  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||   | |   |||||||||| | ||||  ||||||||||||  || || | ||||||||||||| ||||| ||    
T  15445454 aaaacactgttaggattgagtctcttggcggccacatgaagagattgagactttgagtagaattaggtttgaagaatgattcttgtaaccctttgatatc 15445355  T
Q  222 -cttttgtaacgttactcatcat-atagtggaacggagggctgctct 266  Q
     ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15445354 tcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaagggctgctct 15445308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 55 - 188
Target Start/End: Original strand, 42770796 - 42770924
Alignment:
Q  55 acaaaactaggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggt 154  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||| ||||| ||||||||||||| ||||   ||| | ||||||| ||| ||  |||||||||| |||||||||||||    
T  42770796 acaaaattaggtttatatagaatttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt--ggggttcattcaccatgggaa--actattaggactgagtctcttggt 42770890  T
Q  155 tacgagaagagattggggctttaggtagaattag 188  Q
     ||| |||||||||| | |||| |||||||||||    
T  42770891 cacgggaagagattgagactttgggtagaattag 42770924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 244
Target Start/End: Original strand, 42770940 - 42771025
Alignment:
Q  160 gaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatcata 244  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  42770940 gaagagattgagactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacctattgatatctcttttgtaaagttactcatcata 42771025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 222 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 26098375 - 26098331
Alignment:
Q  222 cttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  26098375 cttttgtaacgttactcatcatatggtgaaacggagggctgctct 26098331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 35385635 - 35385572
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| |||| |||||||||||||    
T  35385635 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattaggt 35385572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 256
Target Start/End: Original strand, 35430260 - 35430408
Alignment:
Q  113 tgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagatt-ggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaa 209  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||   | ||||||||| ||| |||| |||||||||||| | | ||||| ||||||||||    
T  35430260 tgattcaccttggagaaacactattacaattgagtctcttggtctagggaagagattcgggtctttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaa 35430359  T
Q  210 -cccgttgatttccttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacgga 256  Q
      |  ||||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  35430360 ttcttttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacgga 35430408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 184
Target Start/End: Original strand, 29748352 - 29748502
Alignment:
Q  31 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttgga-aa 128  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||| ||| ||   ||||| |||||||||| |||||||  |||  ||||||  |||||| ||    
T  29748352 aaacaagggtttagaa-gccaacaagaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacagtagggtt--aggattgattcgtcttggagaa 29748445  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagatt-ggggctttaggtagaa 184  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||| |||| |||||||    
T  29748446 acactaataggattgagtctcttggtcacgggaatagattcgggactttgggtagaa 29748502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 31782640 - 31782554
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaaccc 212  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||  || |||||||||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  31782640 aaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt-gggaattgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccc 31782554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 81 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 34033797 - 34033711
Alignment:
Q  81 tctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagatt 168  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |  |  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  34033797 tctcttggcaacaaacactagcgttgg--gattgatttaccttggagaaacactattaggattgagtctcttggtcgcgggaagagatt 34033711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Original strand, 1170810 - 1170873
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||||    
T  1170810 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggt 1170873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 16093488 - 16093413
Alignment:
Q  113 tgattcaccttggaaaa-cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattag 188  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||  |||| | ||||||||||||||    
T  16093488 tgattcaccttgaaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagtctgggac-ttaggtagaattag 16093413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 2298184 - 2298145
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagag 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2298184 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 2298145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 169
Target Start/End: Original strand, 10627363 - 10627406
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattg 169  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  10627363 aaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattg 10627406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 130 - 165
Target Start/End: Original strand, 22672837 - 22672872
Alignment:
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagag 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22672837 cactattaggattgagtctcttggtcacgagaagag 22672872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 203 - 266
Target Start/End: Original strand, 23667492 - 23667555
Alignment:
Q  203 cttgtaacccgttgatttccttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||| ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  23667492 cttgcaacccattgatttctctttgtaacgtcactcatcaaataatggatcggagggctgctct 23667555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Original strand, 25452498 - 25452557
Alignment:
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||||    
T  25452498 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggt 25452557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 130)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 4308559 - 4308321
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  4308559 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 4308460  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  4308459 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 4308360  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4308359 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 4308321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18099448 - 18099210
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  18099448 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 18099349  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  18099348 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 18099249  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18099248 taacattactcatcatatagtggaacggagggctgctct 18099210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 30005820 - 30006058
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  30005820 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 30005919  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  30005920 acactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttg 30006019  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30006020 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 30006058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 31 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18097177 - 18096940
Alignment:
Q  31 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaa 129  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  18097177 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 18097078  T
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgattt-ccttttgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  18097077 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttcccttttgt 18096978  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18096977 aacgttactcatcatatagtggaacggagagctgctct 18096940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 11170383 - 11170621
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||    
T  11170383 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgcggattgattcaccttgggaa 11170482  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  11170483 acactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 11170582  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11170583 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 11170621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 38890019 - 38890257
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  38890019 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 38890118  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  38890119 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 38890218  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38890219 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 38890257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 43228270 - 43228508
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactag-gtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  43228270 gaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagcgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 43228369  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  43228370 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 43228469  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43228470 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 43228508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 53917942 - 53917704
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  53917942 gaaacaatggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 53917843  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  53917842 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 53917743  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  53917742 taaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 53917704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 43226065 - 43226302
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaa 129  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  43226065 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactacgtttgtatagagtttgtctcgttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 43226164  T
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  43226165 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 43226264  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43226265 aacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 43226302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 27101459 - 27101221
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  27101459 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaa 27101360  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  27101359 acactattaggattgagtctcttggttacaggaagagaatgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 27101260  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27101259 caacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctct 27101221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 28102280 - 28102042
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  28102280 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 28102181  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  28102180 acgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 28102081  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  28102080 taaagttacttatcatatagtggaacggatggctgctct 28102042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 32 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 10084665 - 10084429
Alignment:
Q  32 aacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaac 130  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  10084665 aacaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaac 10084566  T
Q  131 actattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgta 229  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10084565 actattaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttgatttctcttttgta 10084466  T
Q  230 acgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10084465 acgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 10084429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 18162642 - 18162881
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  18162642 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttttgaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaa 18162741  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgat-ttccttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||    
T  18162742 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatttattttg 18162841  T
Q  228 t-aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18162842 taaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 18162881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 1626961 - 1626723
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  1626961 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaa 1626862  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  1626861 acactattaggattgagtctcttggttacggggagagattgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 1626762  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1626761 taaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 1626723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 10956305 - 10956067
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  10956305 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaa 10956206  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  10956205 acattattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttg 10956106  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10956105 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 10956067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 25533421 - 25533659
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  25533421 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaa 25533520  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  || | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  25533521 acactattaggattgagtcttttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 25533620  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25533621 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 25533659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 43423741 - 43423503
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  43423741 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 43423642  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||| | ||||| || ||||||    
T  43423641 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatctcttttg 43423542  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  43423541 taacgttactcatcatatagtgaaactgagagctgctct 43423503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 45882918 - 45883156
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||    
T  45882918 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctctttggaacaaacaataaggtttgagggttgattcaccttgggaa 45883017  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||    
T  45883018 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttg 45883117  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45883118 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 45883156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 51943350 - 51943587
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  51943350 gaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 51943449  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| | ||||  || ||||||    
T  51943450 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggcgggagactt-ttcttgtaactcattgacgtctcttttg 51943548  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  51943549 taacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctct 51943587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 38 - 266
Target Start/End: Original strand, 1313396 - 1313626
Alignment:
Q  38 ggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactatt 136  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  1313396 ggtttacaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 1313495  T
Q  137 aggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgtta 235  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  1313496 aggattgagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgtta 1313595  T
Q  236 ctcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1313596 ctcatcatatagtgaaacggagggctgctct 1313626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 29956665 - 29956903
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  29956665 gaaacaagggtttagaaattcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggttgattcaccttgggaa 29956764  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  29956765 acactattaggattgaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttg 29956864  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29956865 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 29956903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 30 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 4104173 - 4103938
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  4104173 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagcttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 4104074  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  4104073 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 4103974  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgct 264  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4103973 aacgatactcatcatatagtggatcggagggctgct 4103938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 746736 - 746974
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  746736 gaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 746835  T
Q  129 acactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttg 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  746836 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 746935  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  746936 taacgttactcatcatatagtggatcggaggactgctct 746974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 38 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 9604877 - 9604647
Alignment:
Q  38 ggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactatt 136  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  9604877 ggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttgaaagaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 9604778  T
Q  137 aggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgtta 235  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  9604777 aggattgagtctcttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 9604678  T
Q  236 ctcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9604677 ctcatcatatagtggatcggagggctgctct 9604647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 10958601 - 10958363
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  10958601 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaa 10958502  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||   |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  10958501 acactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgacactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttg 10958402  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10958401 taacgttactcttcatatagtggaacggagggctgctct 10958363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 25388885 - 25389122
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  25388885 gaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaa 25388984  T
Q  129 acactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttg 227  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  25388985 -cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacatattcttgtaacccattgatttctctttg 25389083  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25389084 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 25389122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 42990283 - 42990521
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  42990283 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggttgattcaccttgggaa 42990382  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  42990383 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttg 42990482  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  42990483 taacgttactcatcatatggtgaatcggagggctgctct 42990521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 43421693 - 43421455
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  43421693 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 43421594  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  43421593 acactattagaattgagtctcttggttacgggaaaagattggggatttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 43421494  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  43421493 taacgttactcatcatatagtgaaacagatggctgctct 43421455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 51727284 - 51727047
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaggtt-tgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  51727284 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtatgtatagagtttgtctctttggaacaaacact-gggtttgagggttgattcaccttgggaa 51727186  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  || | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  51727185 acactattaggattgagtctcttggttacggtaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 51727086  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51727085 taacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctct 51727047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 455886 - 456124
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  455886 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 455985  T
Q  129 acactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttg 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  455986 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 456085  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  456086 taacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 456124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 458263 - 458501
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  458263 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 458362  T
Q  129 acactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttg 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  458363 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 458462  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  458463 taacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 458501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 10621808 - 10621570
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  10621808 gaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 10621709  T
Q  129 acactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttg 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  10621708 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 10621609  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  10621608 taacggtactcatcatatagtggattggagggctgctct 10621570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 36011806 - 36012044
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacta-ggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||    
T  36011806 gaaacaaggatttagaaagacaacaacgaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactatggtttgagggttgattcacgttgggaa 36011905  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  36011906 acactattaggattgaatatcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattagttgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 36012005  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36012006 taacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctct 36012044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 53468733 - 53468495
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaa 129  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||   ||||||||||||| |||    
T  53468733 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaaccaggtttgtatagagtttgtctctttggaagaaacactagggtttgagcattgattcaccttgggaaa 53468634  T
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgt 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  53468633 cactattaggattgaatctcttggttacggggagagattgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 53468534  T
Q  229 aacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  53468533 aaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctct 53468495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 53915774 - 53915536
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||  ||    
T  53915774 gaaacaagggtttaggatgacaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctcttgggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgtgaa 53915675  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  53915674 acattattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 53915575  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  53915574 taatgttactcatcatttagtgaaacggagggctgctct 53915536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 262
Target Start/End: Original strand, 5191632 - 5191865
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  5191632 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 5191731  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  5191732 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatttctctttgt 5191831  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctg 262  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  5191832 aacgatactcatcatatagtggatcagagggctg 5191865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 265
Target Start/End: Original strand, 6561789 - 6562028
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  6561789 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgattcaccttgggaa 6561888  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttg--atttcctttt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||  || || ||||    
T  6561889 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttt 6561988  T
Q  227 gtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctc 265  Q
    |||| || |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  6561989 gtaaggtaactcatcattatagtggagcggagggctgctc 6562028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 880730 - 880491
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttg-caacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaa 127  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  880730 gaaacaagagtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttcgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 880631  T
Q  128 aacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-ctttt 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  880630 aacactattagcattgagtctcttggttacggaaagagattggggctttgggtagaattagacgggagagttattcttgtaacccattgatatctctttt 880531  T
Q  227 gtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||| |||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  880530 gtaaagttactcatcatatagtaaaatggagggctgctct 880491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 3314663 - 3314902
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||| |||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  3314663 gaaataagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 3314762  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  3314763 acactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 3314862  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||  ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  3314863 taaaattattcatcattatagtgaaacggagggctgctct 3314902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 24979686 - 24979925
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  24979686 gaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 24979785  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||   || || ||  |||||    
T  24979786 atactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacaaattaatatcttttttg 24979885  T
Q  228 t-aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  24979886 taaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctct 24979925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 6063724 - 6063486
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  6063724 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 6063625  T
Q  129 acactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttg 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  6063624 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 6063525  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  6063524 taacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 6063486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 6066074 - 6065836
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  6066074 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 6065975  T
Q  129 acactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttg 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  6065974 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 6065875  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  6065874 taacgaaactcatcatatagtggattggatggctgctct 6065836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 3859507 - 3859744
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  3859507 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 3859606  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||    
T  3859607 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttctctttgt 3859706  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||  |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  3859707 aacaatactcatcatatagtggatcgtagggctgctct 3859744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 32 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 10191585 - 10191350
Alignment:
Q  32 aacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaac 130  Q
    ||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  10191585 aacaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttttatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaac 10191486  T
Q  131 actattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgta 229  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||  | || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10191485 actattaggatcgagtctcttggttacaggaagaggct-ggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttcatttctcttttgta 10191387  T
Q  230 acgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10191386 acgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 10191350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 64 - 266
Target Start/End: Original strand, 1321493 - 1321696
Alignment:
Q  64 ggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaag 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  1321493 ggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaag 1321592  T
Q  164 agattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctg 262  Q
    ||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1321593 aggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctg 1321692  T
Q  263 ctct 266  Q
    ||||    
T  1321693 ctct 1321696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 5927042 - 5926804
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactag-gtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  5927042 gaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcgccttgggaa 5926943  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgat-ttccttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || || |  ||||||    
T  5926942 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatatcttttg 5926843  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||||||||||| || |||||| | |||||||    
T  5926842 taaggttactcatcatataatgaaacggatgactgctct 5926804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 50 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 28413290 - 28413072
Alignment:
Q  50 caacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattga-gtc 147  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  28413290 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgaagtc 28413191  T
Q  148 tcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgtaacgttactcatcatatag 247  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||  |||||||||||||    
T  28413190 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatag 28413091  T
Q  248 tggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||  |||||||||||||    
T  28413090 tggattggagggctgctct 28413072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 50493978 - 50494216
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  50493978 gaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 50494077  T
Q  129 acactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttg 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  50494078 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagggattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 50494177  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  50494178 taacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 50494216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 35918227 - 35917983
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacac------tagggtttgagggctgattcacct 122  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||      ||| ||||||||| ||||||||||    
T  35918227 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacaaacactagagtttgagggttgattcacct 35918128  T
Q  123 tggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc- 221  Q
    ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  35918127 tgcgaaacactattagaattgagtctcttggttacgagaagagactgggaatttgggtagaaataggagggagacttattcttgtaacccattgatttct 35918028  T
Q  222 cttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  35918027 cttttgtaacgttactcattatatagtggaacggagagctgctct 35917983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12268244 - 12268015
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaa-ctagg-tttgtatagagtttgtctctttg-caacaaacactagggtttgagggctgattcaccttgga 126  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  12268244 gaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttcgg 12268145  T
Q  127 aaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttcctttt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||           |||||    
T  12268144 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac----------tctttt 12268055  T
Q  227 gtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  12268054 gtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctct 12268015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 31 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 32264316 - 32264077
Alignment:
Q  31 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactag-gtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaa 129  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  32264316 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 32264217  T
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttg--atttccttttg 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||  |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| |||  || || |||||    
T  32264216 cactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctggaactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttttg 32264117  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32264116 taaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctct 32264077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22114583 - 22114352
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||    
T  22114583 gaaacaagggtttagaaaggcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaa 22114484  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22114483 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 22114384  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggaggg 259  Q
    ||||||||||||||||||| || | |||||||    
T  22114383 taacgttactcatcatataatgaatcggaggg 22114352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 28761706 - 28761468
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  28761706 gaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacacaagggtttgagagttgattcaccttggaaa 28761608  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  28761607 acactattaggattgagtctcttggttacaggaagatattgagactttaggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 28761508  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  28761507 taaagttactcatcattatagtgaaacggaggactgctct 28761468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 47149173 - 47148935
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaa-caaacactagggtttgagggctgattcaccttggaa 127  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||||||    
T  47149173 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaaacaaacactgggatttgatggttgattcaccttggaa 47149074  T
Q  128 aacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-ctttt 226  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  47149073 a-cactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgggtctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 47148975  T
Q  227 gtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  47148974 gtatcgttactcatcatatagtgaaacagaggactgctct 47148935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 38210349 - 38210587
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  38210349 gaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 38210448  T
Q  129 acactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttg 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||    
T  38210449 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttg 38210548  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||  |||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  38210549 taacgaaactcatcatatagtggattggagagctgctct 38210587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 30 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 890049 - 889817
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttg-caacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaa 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |    
T  890049 gaaacaagggtttagaatggcaacaa--aacctagggtttgtatagagtttgtctatttggcaacaaacactggggtttgatggttgattcaccttggga 889952  T
Q  128 aacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-ctttt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||| || |||||    
T  889951 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagag-ttggggctttgggtagaattaggcaggagagttattcttgtaacccactgatatctctttt 889853  T
Q  227 gtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctg 262  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  889852 gtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggctg 889817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 26720527 - 26720764
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||       
T  26720527 gaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggtt 26720626  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  26720627 a-actattaggattgagtttcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttttaaccctttgatttctcttttg 26720725  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  26720726 taacgatactcatcatatagtggaacggatgactgctct 26720764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 38 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 48361941 - 48361711
Alignment:
Q  38 ggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactatt 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  48361941 ggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaaaactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactatt 48361842  T
Q  137 aggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgtta 235  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||| |||||||||| | ||||  || |||||| |||||||    
T  48361841 aggattgagtctcttagttacgggaagagattggggcttttggtagaattaggcggaagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgcaacgtta 48361742  T
Q  236 ctcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||| |||||||  ||||||| ||||||||    
T  48361741 ctcataatatagtaaaacggagagctgctct 48361711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 30 - 244
Target Start/End: Original strand, 39715448 - 39715664
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||| |||||||||||  | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  39715448 gaaataagggtttagagaggcaacaccaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaa 39715547  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  39715548 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttg 39715647  T
Q  228 taacgttactcatcata 244  Q
    ||| |||||||||||||    
T  39715648 taaagttactcatcata 39715664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 72 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 7606822 - 7606628
Alignment:
Q  72 tagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggg 171  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  7606822 tagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggg 7606723  T
Q  172 gctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
     |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  7606722 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttctatttgtaacgttactcgtcatatagtggatcggagggctgctct 7606628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 51675033 - 51674806
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaa 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |          ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51675033 gaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaag----------gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaa 51674944  T
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||| || |||||||    
T  51674943 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggattttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgt 51674844  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    || ||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  51674843 aatgttactcatcatatactgaaatggagggctgctct 51674806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 30 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 28100319 - 28100143
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28100319 gaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaa 28100220  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattctt 205  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  28100219 acgctattaggattgagtcttttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattctt 28100143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 5522893 - 5522667
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaa 129  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||          ||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||||| |||    
T  5522893 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagg----------gtttgtctcttcggaacaaacactcgggtttgtgggttgatttaccttgggaaa 5522804  T
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgta 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  5522803 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 5522704  T
Q  230 acgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5522703 acgatactcatcatatagtggatcggagggctgctct 5522667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 31 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 54691851 - 54691614
Alignment:
Q  31 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaa 129  Q
    |||||||| ||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  54691851 aaacaaggttttagaaaggcgacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 54691752  T
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgt 228  Q
    ||||||||||||||| | | ||||||| | ||||||||| |||||||  || ||||||||  |||||||||||||||||   | ||||| || |||||||    
T  54691751 cactattaggattgaattttttggttatgggaagagattagggctttgagttgaattaggcgggagacttattcttgtatttcattgatatctcttttgt 54691652  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  54691651 aacgttacccatcatatagttaaacggagggctgctct 54691614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 30 - 210
Target Start/End: Original strand, 35777400 - 35777582
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  35777400 gaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 35777499  T
Q  129 acactattaggatt-gagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaac 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  35777500 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 35777582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 64 - 266
Target Start/End: Original strand, 6484373 - 6484577
Alignment:
Q  64 ggtttgtatagagtttgtctctttg-caacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaa 162  Q
    ||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  6484373 ggtttgtgtagagtttgtctcttcggcaacaaataccggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggtttgagtctcttggttacgggaa 6484472  T
Q  163 gagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggct 261  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6484473 gagattggggttttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattgatatcttttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggagggct 6484572  T
Q  262 gctct 266  Q
    |||||    
T  6484573 gctct 6484577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 72 - 266
Target Start/End: Original strand, 32219106 - 32219302
Alignment:
Q  72 tagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggg 171  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  32219106 tagagtttgtctctttgtaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatcaggattgagtctcttggttgcgggaagagattggg 32219205  T
Q  172 gctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgt-aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
     |||| || |||||||||  | ||||||||| ||||||||| ||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  32219206 actttgggcagaattaggcggaagacttatttttgtaacccattgatatcttttttgtaaacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctct 32219302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 101 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 25688367 - 25688200
Alignment:
Q  101 gggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagactta 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||  |||||||||    
T  25688367 gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactta 25688268  T
Q  201 ttcttgtaacccgttgatttc-cttttgt-aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25688267 ttcttgtaacccattgatatctcttttgtaaacgttacgcatcatatagtgaaacggagggctgctct 25688200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 53591174 - 53591401
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaa 129  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||          ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  53591174 gaaacaagagtttagaaagacaacaacaaaactagg----------gtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 53591263  T
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgt 228  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||| || ||||| || | |||||    
T  53591264 cactattcgaattgagtctcttggttacgagaatagatttggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttctaatccattgatatctcatttgt 53591363  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||    
T  53591364 aacgttactcatcatatagtgaaacgaagggatgctct 53591401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 113 - 266
Target Start/End: Original strand, 5886263 - 5886415
Alignment:
Q  113 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaaccc 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  5886263 tgattcaccttggaaa-cactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 5886361  T
Q  213 gttgatttccttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
     |||||||   |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5886362 attgatttgtctttgaaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 5886415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 113 - 266
Target Start/End: Original strand, 5899736 - 5899888
Alignment:
Q  113 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaaccc 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  5899736 tgattcaccttggaaa-cactattagggttgagtctcttggttacgggaagtgattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 5899834  T
Q  213 gttgatttccttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
     ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5899835 attgatttctctttgcaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 5899888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 210
Target Start/End: Original strand, 28181009 - 28181182
Alignment:
Q  38 ggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactatt 136  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||| |||| |||||| |||    
T  28181009 ggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactgggatttgagggttgattcactttgggaaacaccatt 28181108  T
Q  137 aggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaac 210  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||  |||||| ||||||| ||||    
T  28181109 aggattgagtctattggttacgggaagagattgggactttggatagaattaggcgggagacgtattcttataac 28181182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 31 - 266
Target Start/End: Original strand, 31151329 - 31151561
Alignment:
Q  31 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaa 129  Q
    ||||||||||||||||   |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |  || ||||||||||||| |||    
T  31151329 aaacaagggtttagaaat-caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggttgg--ggttgattcaccttgggaaa 31151424  T
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||  |||| || |||||||    
T  31151425 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaaccc--tgatatctcttttgt 31151522  T
Q  229 aacgttactca-tcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    || |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  31151523 aaagttactcattgttatagtggaacggagggctgctct 31151561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 53597219 - 53597454
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaggt-ttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||||| || | |||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||   ||||||||||||| ||    
T  53597219 gaaacaagggtttataa-gtcaacaagaaaactaggggttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggttgaagt--tgattcaccttgggaa 53597314  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgat-ttccttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |  |||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  53597315 acactattaggattgagtctcttggtcatgagaatagattgagattttgagtagaattaggcaagagacttattcttgtaacccgttgatatttcttttg 53597414  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  53597415 taaagttactcatcattatagtggaatggagggttgctct 53597454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 218
Target Start/End: Original strand, 15780839 - 15781039
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg------------tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgatt 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||            |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  15780839 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatt 15780938  T
Q  118 caccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttga 217  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  || | |||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||    
T  15780939 caccttgggaaacactattacgattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttcggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattga 15781038  T
Q  218 t 218  Q
    |    
T  15781039 t 15781039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 71 - 266
Target Start/End: Original strand, 4666535 - 4666734
Alignment:
Q  71 atagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgg 170  Q
    |||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||     
T  4666535 atagggtttgtctcttgacaacagacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattatgattgagtctctaggttacgggaagagattga 4666634  T
Q  171 ggctttaggtagaattaggtaggaga--cttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    | |||| ||||||||||||  |||||  ||||||||||||| || ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  4666635 gactttgggtagaattaggcgggagatccttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctct 4666734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 32 - 261
Target Start/End: Original strand, 54884138 - 54884367
Alignment:
Q  32 aacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaaca 131  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||  || | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  54884138 aacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagaatt-tgtagagtttgtttctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcatcttggaaaaca 54884236  T
Q  132 ctattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaa 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||   ||||   ||||||||||  ||||||||||| |||||| |  ||||| || |||||||||    
T  54884237 ctattaggattgagtctcttggttacagaaagagattgaaactttgaatagaattaggagggagacttatt-ttgtaatctattgatatctcttttgtaa 54884335  T
Q  231 cgttactcatca-tatagtggaacggagggct 261  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  54884336 agttactcatcattatagtggaacggatggct 54884367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 64 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13420425 - 13420225
Alignment:
Q  64 ggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaag 163  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||   | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  13420425 ggtttgtatagagttt-tctctaggcaacaaacactagggtt---gagttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaag 13420330  T
Q  164 agattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggct 261  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||| |||    
T  13420329 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcattattataatggaacggagagct 13420230  T
Q  262 gctct 266  Q
    |||||    
T  13420229 gctct 13420225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 64 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 562017 - 561816
Alignment:
Q  64 ggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaag 163  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    || |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  562017 ggtttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggttca--ggttgattcacattgggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgtgaag 561921  T
Q  164 agattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggct 261  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||| ||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  561920 agattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaagtcattgatatcttttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgaagggct 561821  T
Q  262 gctct 266  Q
    |||||    
T  561820 gctct 561816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 114 - 266
Target Start/End: Original strand, 11168165 - 11168318
Alignment:
Q  114 gattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccg 213  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||  ||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||     
T  11168165 gattcaccttgggaaacactattaggattgagtgtcttggttacgggaagaggctgggaatttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaaccca 11168264  T
Q  214 ttgatttc-cttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  11168265 ttgatttctcttttgtaacgttacttatcatatattggaacggagggctgctct 11168318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 166
Target Start/End: Original strand, 42992265 - 42992402
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||    
T  42992265 gaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaa 42992364  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagaga 166  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  42992365 acactattaggattgagtctcttggttatgggaagaga 42992402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 36871576 - 36871341
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaggt-ttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||||| || | |||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||  |||  ||||||||||||||||    
T  36871576 gaaacaagggtttacaa-gccaacaagaaaactagggcttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggtt--aggattgattcaccttggaaa 36871481  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttg 227  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| ||| | ||  ||||    
T  36871480 acactgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgttatctctttg 36871381  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36871380 taaagttaatcatcattatagtggaacggagggctgctct 36871341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 266
Target Start/End: Original strand, 23633440 - 23633671
Alignment:
Q  31 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaa 129  Q
    |||||||| ||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |  || ||||| |||  || |||    
T  23633440 aaacaaggatttagaa-gccaacaagaaaactagggtttgtatagtgtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgatttacc--gggaaa 23633533  T
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgta 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||| |||| ||  ||||||    
T  23633534 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccgatgatatctctttgta 23633633  T
Q  230 acgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    | ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  23633634 aagttactcatcattatagtgaaaaggagggctgctct 23633671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 266
Target Start/End: Original strand, 17795280 - 17795476
Alignment:
Q  68 tgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagat 167  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||   ||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  17795280 tgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagat 17795375  T
Q  168 tggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctc 265  Q
    || |||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| |||| || |||||| ||||||||    
T  17795376 tgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacggaaggctgctc 17795475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 266
Target Start/End: Original strand, 19103720 - 19103916
Alignment:
Q  68 tgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagat 167  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||   ||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  19103720 tgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagat 19103815  T
Q  168 tggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctc 265  Q
    || |||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| |||| || |||||| ||||||||    
T  19103816 tgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataatgaaacggaaggctgctc 19103915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 72 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 28137541 - 28137424
Alignment:
Q  72 tagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggg 171  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28137541 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggatgaagtctcttggttacgggaagagattggg 28137442  T
Q  172 gctttaggtagaattagg 189  Q
    ||||| ||||||||||||    
T  28137441 gctttgggtagaattagg 28137424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 142
Target Start/End: Original strand, 41849131 - 41849244
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  41849131 gaaacaagggtttagaataacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 41849230  T
Q  129 acactattaggatt 142  Q
    || |||||||||||    
T  41849231 actctattaggatt 41849244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 98 - 264
Target Start/End: Original strand, 6231849 - 6232015
Alignment:
Q  98 ctagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagac 197  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||||  ||||||    
T  6231849 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagtgttgagtctcttggttacgggaagagatt-gggatttgggtagaattaggcgggagac 6231947  T
Q  198 ttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgct 264  Q
    ||||||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  6231948 ttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagctactcatcattacagt-gaacggagggctgct 6232015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 218
Target Start/End: Original strand, 23637007 - 23637191
Alignment:
Q  31 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaa 129  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||  || ||||| ||||||  |||    
T  23637007 aaacaagggtttagaa-gccaacaagaaaactagggtttgtatagagtctg-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgatttaccttgagaaa 23637102  T
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgat 218  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | | ||||| ||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  23637103 cactattaggattgagtctcttgttcatgggaagatattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 23637191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 243
Target Start/End: Original strand, 25635398 - 25635575
Alignment:
Q  64 ggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaag 163  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |  |  || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  25635398 ggtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattggttcaccttgggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgggaag 25635494  T
Q  164 agattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatcat 243  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||| ||||||||||||    
T  25635495 agattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctattttgtaaagttactcatcat 25635575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 51 - 218
Target Start/End: Original strand, 1673975 - 1674140
Alignment:
Q  51 aacaacaaaactag-gtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctc 149  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||  |||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  1673975 aacaagaaaactagtgtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--aggattgattcaccatgggaaacactattaggattgagtctc 1674071  T
Q  150 ttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgat 218  Q
    ||| | ||| |||||||||||| |||| ||||||| |||   |||||||||||| |||||||| |||||    
T  1674072 ttgatcacgggaagagattgggactttgggtagaaatagacgggagacttattcgtgtaaccctttgat 1674140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 113 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 1620656 - 1620501
Alignment:
Q  113 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaacc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||| | | || ||  |||||||||||    
T  1620656 tgattcaccttggaaaacactattaggattaggtcttttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaaggctagttcttgtaacc 1620557  T
Q  212 cgttgatttccttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    | ||||| ||  |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1620556 ctttgatatctctttgtaaacttactcatcattatagtggaacggagggctgctct 1620501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 94 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 4560497 - 4560402
Alignment:
Q  94 aacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg 189  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  4560497 aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattgagcctgttggttaccggaagagattggagctttgggtagaattagg 4560402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 14634637 - 14634486
Alignment:
Q  113 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaacc 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| | |||| ||||| |||||| | | ||||| |||||||||| |    
T  14634637 tgattcaccttgggaaacactattaggattgtgtctcttagtcacgagaagagattgagactttgggtagcattaggtttgaagactgattcttgtaaac 14634538  T
Q  212 cgttgatttc-cttttgtaacgttactcatcat-atagtggaacggagggct 261  Q
    | ||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  14634537 ctttgatatctcttttgtaaagttactcatcataatagtggaacggatggct 14634486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 154
Target Start/End: Original strand, 24177260 - 24177380
Alignment:
Q  31 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaa 129  Q
    ||||||| ||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |  || |||||||||||||||||    
T  24177260 aaacaagagtttaga-tgtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggttgg--ggttgattcaccttggaaaa 24177355  T
Q  130 cactattaggattgagtctcttggt 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  24177356 cactattaggattgagtctcttggt 24177380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 107
Target Start/End: Original strand, 11163129 - 11163207
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttg 107  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11163129 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttg 11163207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 178 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 47701800 - 47701711
Alignment:
Q  178 ggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47701800 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 47701711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 128 - 243
Target Start/End: Original strand, 3306839 - 3306955
Alignment:
Q  128 aacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-ctttt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||| | ||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  3306839 aacactattaggattgagtctcttggttacagaaagatattggagttttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctctttt 3306938  T
Q  227 gtaacgttactcatcat 243  Q
    |||| ||||||||||||    
T  3306939 gtaaagttactcatcat 3306955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 27635905 - 27635830
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggt 104  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  27635905 gaaacaagggtttagaatgcaaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggt 27635830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 30 - 103
Target Start/End: Original strand, 6231428 - 6231502
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactaggg 103  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6231428 gaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactaggg 6231502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 170 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 27635795 - 27635698
Alignment:
Q  170 gggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||| |||| |||||||  |||||||| |||||||||| | ||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27635795 gggctttgggtaaaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 27635698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 164 - 266
Target Start/End: Original strand, 24181494 - 24181598
Alignment:
Q  164 agattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgat-ttccttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggct 261  Q
    |||||||| |||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||    
T  24181494 agattgggactttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatttcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgact 24181593  T
Q  262 gctct 266  Q
    |||||    
T  24181594 gctct 24181598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 47701873 - 47701798
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggt 104  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  47701873 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacaccagggt 47701798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 161
Target Start/End: Original strand, 25633937 - 25634031
Alignment:
Q  64 ggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgaga 161  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |  |  ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25633937 ggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggctgg--gattgattcaccttgggagacattattaggattgagtctcttggtcacgaga 25634031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 93
Target Start/End: Original strand, 3306778 - 3306842
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaaca 93  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  3306778 gaaacaagggtttagaaatacaacaacaaaactaggatttgaatagagtttgtctctttggaaca 3306842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 259
Target Start/End: Original strand, 7768633 - 7768781
Alignment:
Q  113 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaacc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |   | |||||  ||||  ||||||||||| | | ||||| ||||||||||||    
T  7768633 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgctcacgggctaaaattggaactttgagtagaattaggtttgaagactaattcttgtaacc 7768732  T
Q  212 cgttgatttccttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggaggg 259  Q
      || || | | ||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  7768733 ttttaatatacctttgtaaagttactcattattatagtggaacgaaggg 7768781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 168
Target Start/End: Original strand, 13419883 - 13419997
Alignment:
Q  50 caacaacaaaactaggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctc 149  Q
    |||||| ||||||||| || | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |  |  ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||    
T  13419883 caacaagaaaactagggtt-tgtagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactattaggatcaagtctc 13419978  T
Q  150 ttggttacgagaagagatt 168  Q
    ||||| |||  ||||||||    
T  13419979 ttggtcacggaaagagatt 13419997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 209
Target Start/End: Original strand, 11066653 - 11066751
Alignment:
Q  113 tgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagatt-ggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaa 209  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||  || ||| ||||||||||    
T  11066653 tgattcaccttggagaaacactattaggattgaatcttttgatcacgggaagagattcgggactttgggtagaattaggtttgaaactgattcttgtaa 11066751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 266
Target Start/End: Original strand, 42992418 - 42992487
Alignment:
Q  198 ttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  42992418 ttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttagtcatcatatagtgaatcggggggctgctct 42992487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 190
Target Start/End: Original strand, 11073033 - 11073085
Alignment:
Q  139 gattgagtctcttggttacgagaagaga-ttggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  11073033 gattgagtctcttggtcacgagaagagatttgggactttaggtagaattaggt 11073085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 27762165 - 27762085
Alignment:
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | || |||||||||||| | | ||||| |||||||||||    
T  27762165 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 27762085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 31021362 - 31021300
Alignment:
Q  89 caacaaacactagggtttgagggctgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttg 152  Q
    ||||||||||||||||| |  |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31021362 caacaaacactagggttgg--gattgattcaccttggagaaacactattaggattgagtctcttg 31021300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 47883065 - 47882981
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||| | | ||||| |||||||||||    
T  47883065 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 47882981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 10094257 - 10094194
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||||    
T  10094257 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggt 10094194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 10201137 - 10201074
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||||    
T  10201137 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggt 10201074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Original strand, 16462202 - 16462265
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||||    
T  16462202 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggt 16462265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 22626167 - 22626104
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||||    
T  22626167 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggt 22626104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 165
Target Start/End: Original strand, 6303309 - 6303348
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagag 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  6303309 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 6303348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 10100274 - 10100235
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagag 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  10100274 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 10100235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 193 - 266
Target Start/End: Original strand, 25634030 - 25634105
Alignment:
Q  193 gagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||    
T  25634030 gagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaatggctgctct 25634105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 165
Target Start/End: Original strand, 27544272 - 27544311
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagag 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  27544272 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 27544311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 126 - 171
Target Start/End: Original strand, 4535613 - 4535658
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggg 171  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  4535613 aaaacaccgttaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggg 4535658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 94 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 7606873 - 7606828
Alignment:
Q  94 aacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattagg 139  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  7606873 aacagtaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattagg 7606828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 126 - 210
Target Start/End: Original strand, 11079516 - 11079600
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaac 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||  |||| | ||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||    
T  11079516 aaaacactatcaggattgagtctcttggtcacgggaaaaggctgggac-ttaggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 11079600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 29914132 - 29914052
Alignment:
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||| | | ||||| |||||||||||    
T  29914132 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 29914052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 47878350 - 47878270
Alignment:
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||| | | ||||| |||||||||||    
T  47878350 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 47878270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 210
Target Start/End: Original strand, 54193229 - 54193309
Alignment:
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||| | | ||||| |||||||||||    
T  54193229 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 54193309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 1618856 - 1618824
Alignment:
Q  113 tgattcaccttggaaaacactattaggattgag 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1618856 tgattcaccttggaaaacactattatgattgag 1618824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 10208183 - 10208120
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||||    
T  10208183 aaaacactattacgattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggt 10208120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Original strand, 16996874 - 16996937
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||  |||| ||| ||| ||| |||||||||||||    
T  16996874 aaaacactgttaggattgagtctcttggtcacggaaagaaatt-gggatttgggtagaattaggt 16996937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 101)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 10400110 - 10399872
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  10400110 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaa 10400011  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  10400010 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 10399911  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10399910 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 10399872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 47906269 - 47906507
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacta-ggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||    
T  47906269 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaa 47906368  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  47906369 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 47906468  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  47906469 taacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctct 47906507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 2617515 - 2617753
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  2617515 gaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaa 2617614  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  2617615 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 2617714  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2617715 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 2617753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 15295116 - 15294878
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  15295116 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaa 15295017  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15295016 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttgtaacccattgatttctcttttg 15294917  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  15294916 taacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctct 15294878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 31 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17324917 - 17324680
Alignment:
Q  31 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaa 129  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  17324917 aaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactggggtttgtatagagtttgtctctatggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 17324818  T
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||    
T  17324817 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgt 17324718  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17324717 aacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 17324680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 21948469 - 21948232
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  21948469 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaa 21948370  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  21948369 -cactattaggattgagtctcttggttacgggaagacgctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 21948271  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21948270 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 21948232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 51750038 - 51750276
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  51750038 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 51750137  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  51750138 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 51750237  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51750238 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 51750276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 38 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 9241360 - 9241129
Alignment:
Q  38 ggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactatt 136  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  9241360 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacattatt 9241261  T
Q  137 aggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgtta 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||| ||||    
T  9241260 aggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagtta 9241161  T
Q  236 ctcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9241160 ctcatcattatagtggaacggagggctgctct 9241129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 16428652 - 16428891
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16428652 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgacaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttggaaa 16428751  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  16428752 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 16428851  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  16428852 taaggttactcatcattttagtgaaacggagggctgctct 16428891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 50307829 - 50307590
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttg-caacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaa 127  Q
    |||| |||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  50307829 gaaaaaagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 50307730  T
Q  128 aacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-ctttt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||  || |||||    
T  50307729 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttt 50307630  T
Q  227 gtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50307629 gtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 50307590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12302787 - 12302549
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  12302787 gaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 12302688  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| | ||||  || ||||||    
T  12302687 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttataactcattgacatctcttttg 12302588  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12302587 taacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 12302549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 28840679 - 28840916
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  28840679 gaaacaagggtttagaaaggaaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 28840778  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  28840779 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 28840878  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28840879 aacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 28840916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 2949513 - 2949275
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactag-gtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||    
T  2949513 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaggggttgatggttgattcaccttgggaa 2949414  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||| | ||||  || ||||||    
T  2949413 acactattaggattgagtctcttgtttacgagaatagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttg 2949314  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  2949313 taacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctct 2949275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 39932072 - 39932310
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||    
T  39932072 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattaaccttgggaa 39932171  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || | |||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  39932172 acactattaggattgaatctcttggttacgggaagagactgagactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatttctcttttg 39932271  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39932272 taacgatactcatcatatagtggaacggagggctgctct 39932310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 13761836 - 13762073
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  13761836 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacataactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgggggttgattcaacttggaaa 13761935  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  13761936 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagtctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 13762035  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  13762036 aacgttactcatcatatagtggaccggagggcttctct 13762073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 46431989 - 46431752
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  46431989 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaagtagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 46431890  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  46431889 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggatgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 46431790  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46431789 aacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctct 46431752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 38925760 - 38925524
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||| ||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38925760 gaaacaagagttcagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaa 38925661  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  38925660 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 38925561  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  38925560 taacgttactcatc--atagtaaaacggagggctgctct 38925524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 6823014 - 6823251
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  6823014 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 6823112  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  6823113 atactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttg 6823212  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6823213 taacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctct 6823251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 13215080 - 13215323
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  13215080 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 13215179  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttga----tttc-ct 223  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    |||| ||    
T  13215180 acactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatttttctct 13215279  T
Q  224 tttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13215280 tttgtaaatttactcatcattatagtggaacggagggctgctct 13215323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 30 - 261
Target Start/End: Original strand, 28842494 - 28842726
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||    
T  28842494 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacattgggaa 28842593  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgt 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  || | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  28842594 acactattaggattgagtctattggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 28842693  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggct 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28842694 aacgttactcatcatatagtggaacggagggct 28842726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 6995982 - 6995744
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  6995982 gaaacaacggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaa 6995883  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||| |||||||||| | ||||  || |||||     
T  6995882 acactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggatactttttcttgtaactcattgacatctctttta 6995783  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6995782 taacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 6995744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 15823545 - 15823783
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  15823545 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 15823644  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||  || | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || || |||    
T  15823645 acactattaatattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctattg 15823744  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15823745 taacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctct 15823783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 31 - 266
Target Start/End: Original strand, 16226167 - 16226404
Alignment:
Q  31 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaa 129  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  16226167 aaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 16226266  T
Q  130 cactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgt 228  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  16226267 cactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 16226366  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16226367 aacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 16226404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 31 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 31735802 - 31735565
Alignment:
Q  31 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaa 129  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  31735802 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 31735703  T
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgt 228  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  31735702 cactattaaggttgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatttctcttttgt 31735603  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31735602 aacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctct 31735565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 255
Target Start/End: Original strand, 48665176 - 48665404
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  48665176 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaa 48665275  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggtta-cgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-ctttt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  48665276 acactattaggattgagtctcttggttaccgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 48665375  T
Q  227 gtaacgttactcatcatatagtggaacgg 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48665376 gtaacgttactcatcatatagtggaacgg 48665404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 14098252 - 14098013
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||| |||||| || | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  14098252 gaaacaatggtttaaaaaggcaactacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttggaaa 14098153  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  14098152 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 14098053  T
Q  228 t-aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14098052 taaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 14098013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 18307108 - 18307347
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||    
T  18307108 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaa 18307207  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||| || | ||||| || ||||||    
T  18307208 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtgacgcattgatatctcttttg 18307307  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  18307308 taaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctct 18307347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 50079103 - 50078864
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50079103 gaaacaagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgcatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaa 50079004  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  50079003 acactattaggattaagtctcttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 50078904  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  50078903 taaagttattcatcattatagtggaacagatggctgctct 50078864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 11457757 - 11457519
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  11457757 gaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgattcttggcaacaattactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 11457658  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  11457657 acactattatgattgagtctcttggttacgcgaagagattgggggtttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 11457558  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  11457557 taaagttactcatcatatagtgaaacggatgtctgctct 11457519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 41646919 - 41647157
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| | || ||||||||||||| ||    
T  41646919 gaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacttggtttttatggttgattcaccttgggaa 41647018  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||    
T  41647019 acactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttg 41647118  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41647119 taacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 41647157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 30 - 258
Target Start/End: Original strand, 20302458 - 20302687
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  20302458 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaa 20302557  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  20302558 acactattaggattgagtctcttggttatgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 20302657  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagg 258  Q
    |||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  20302658 aacgatactcatcagatagtggatcggagg 20302687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 18839586 - 18839825
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  18839586 gaaacaagggtttagataggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacagtagggttttagggttgattcaccttgggaa 18839685  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  18839686 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagaatgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 18839785  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  18839786 taaggttactcatcattatagtgaaacagagggctgctct 18839825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 50076954 - 50076715
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  50076954 gaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 50076855  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||    
T  50076854 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaatccattgatatctcttttg 50076755  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  50076754 taaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctct 50076715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 2510606 - 2510369
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||||| || | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||    
T  2510606 gaaacaagggtttataaaggcaaccacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctttggaa 2510507  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| || |||    
T  2510506 acactattaggattgagtcttttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggca-gagacttattcttgtaacccattgatttctctcttg 2510408  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  2510407 taaagttactcatcatatagtgaaacggatggctgctct 2510369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 9459699 - 9459461
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  9459699 gaaacaagggtttagaaagtcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 9459600  T
Q  129 acactattaggattga-gtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttg 227  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||    
T  9459599 acactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctctttg 9459500  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  9459499 taacggtactcatcatatagtggattggagggctgctct 9459461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 9463526 - 9463288
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  9463526 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 9463427  T
Q  129 acactattaggattga-gtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttg 227  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||    
T  9463426 acactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctctttg 9463327  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  9463326 taacggtactcatcatatagtggattggagggctgctct 9463288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 259
Target Start/End: Original strand, 20291456 - 20291686
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||    
T  20291456 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaagttttgagggttgattcaccttgggaa 20291555  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  20291556 acactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 20291655  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggaggg 259  Q
    |||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  20291656 aacgattctcatcatatagtggatcggaggg 20291686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 47177361 - 47177599
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  47177361 gaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 47177460  T
Q  129 acactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttg 227  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  47177461 acactattaggatgggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 47177560  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  47177561 taacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 47177599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 47179712 - 47179950
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  47179712 gaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 47179811  T
Q  129 acactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttg 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  47179812 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 47179911  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  47179912 taacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 47179950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 27337220 - 27336984
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  27337220 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttataga-tttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 27337122  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  || | |||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  27337121 acactattaggattgggtctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 27337022  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27337021 aacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 27336984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 30 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 28998535 - 28998304
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgc-aacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaa 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  28998535 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct-tttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 28998437  T
Q  128 aacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-ctttt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||| | ||||  || |||||    
T  28998436 aacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctctttt 28998337  T
Q  227 gtaacgttactcatcatatagtggaacggaggg 259  Q
    | ||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  28998336 gcaacgttactcatcatatggtgaaactgaggg 28998304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 30 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 29004251 - 29004020
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgc-aacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaa 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  29004251 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct-tttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 29004153  T
Q  128 aacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-ctttt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||| | ||||  || |||||    
T  29004152 aacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctctttt 29004053  T
Q  227 gtaacgttactcatcatatagtggaacggaggg 259  Q
    | ||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  29004052 gcaacgttactcatcatatggtgaaactgaggg 29004020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17186410 - 17186171
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  17186410 gaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 17186311  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| || || || ||||||    
T  17186310 acactatcaggattgagtctcttggttacgggaagagatttgaactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttg 17186211  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||    
T  17186210 taaagttactcatcattataatggaacggagtgctgctct 17186171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 40133943 - 40134182
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacta-ggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  40133943 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacgaaggtttgtatagaatttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 40134042  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    | |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||    
T  40134043 atactactaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggttttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 40134142  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  40134143 taaagttactcatcattatagtgaaacggatggctgctct 40134182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 24325663 - 24325900
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||    
T  24325663 gaaacaagggtt-agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttaggaa 24325761  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  24325762 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 24325861  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| |||||||||||||||||| | || | |||||||||    
T  24325862 taatgttactcatcatatagtgaatcgaatggctgctct 24325900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 39462518 - 39462756
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||| |||||||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||    
T  39462518 gaaacaaaggtttagaaatgcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttttagggttgattcaccttgggaa 39462617  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  39462618 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagaattattcttgtaaccctttgatatctcttttg 39462717  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
     || |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  39462718 aaaagttattcatcatatagtgaaacggagagctgctct 39462756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 6756526 - 6756764
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttg-caacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaa 127  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  6756526 gaaacaagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 6756625  T
Q  128 aacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-ctttt 226  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||| || |||||    
T  6756626 aacactattaggattgag--tcttgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctttt 6756723  T
Q  227 gtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||    
T  6756724 gtaaagttactcatcattatagtgaaacggaagactgctct 6756764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 31425301 - 31425058
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttg-caacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaa 127  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31425301 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtatctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaa 31425202  T
Q  128 aacactattaggattgag---tctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-ct 223  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||  |||| |||||||||||||| | ||||| || ||    
T  31425201 aacactattaggattgagtgatctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaggcttattcttgtaactcattgatatctct 31425102  T
Q  224 tttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  31425101 tttgtaaggttactcatcattatagtgaaacggaaggctgctct 31425058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 25127871 - 25128110
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  25127871 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtgtcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaa 25127970  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||  | ||||| || ||||||    
T  25127971 acactatttggattgagtctcttggttacgggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaattcattgatatctcttttg 25128070  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||||||| |||| || ||||||||||||||||    
T  25128071 taaggttactcatcattatattgaaacggagggctgctct 25128110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 30 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 27339412 - 27339179
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||| |||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  27339412 gaaacaagggcttagaaaggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 27339313  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgt 228  Q
    | ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||  || | |||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  27339312 atactattacgattgagtctcttagttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggcgacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 27339213  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctg 262  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27339212 aacgttactcatcatatagtggatcggagggctg 27339179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 30 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 3579898 - 3579671
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||| |||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  3579898 gaaacaagggttcagaaaggcagcaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaa 3579799  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  3579798 acacaattaggattgagtctcttgattacggaaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 3579699  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacgga 256  Q
    ||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  3579698 taaagttactcatcat-tagtgaaacgga 3579671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 4131661 - 4131419
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  4131661 gaaacaaggatttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaa 4131562  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-----ct 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | || |||| ||||||||||||   || ||||||||||||||||| ||||| ||     ||    
T  4131561 acactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgagaaacttattcttgtaacccattgatatctttctct 4131463  T
Q  224 tttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4131462 tttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctct 4131419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 50248854 - 50248633
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  50248854 gaaacaaaggtttaaaaagacaacaacaaaactatgatttatatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaa 50248755  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | | |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||  || ||||||    
T  50248754 acactattaggattgagtctcttggttacaggaagagatcgagactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgacatctcttttg 50248655  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtg 249  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  50248654 taaggttactcatcatatagtg 50248633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 25251557 - 25251318
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  25251557 gaaacaaaggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtataacgtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaa 25251458  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgat-ttccttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  | | ||||||||||||||||| ||||| |  ||||||    
T  25251457 acactattaggattgagtctctcggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatatcttttg 25251358  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| |||||| |||| ||||||| ||| ||||| ||||||    
T  25251357 taaggttacttatcattatagtgaaacagagggttgctct 25251318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 28207348 - 28207112
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||    
T  28207348 gaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtgtaaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagagtttattcaccttgggaa 28207249  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||   || ||||| |  |||||||| |||||||||| | ||||  || ||||||    
T  28207248 acactattaggattgtgtctcttggttacaggaagagattggggctttgaatataattacgcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttg 28207149  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  28207148 taacgttactcatc--atagtgaaacggagggctgctct 28207112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 31489914 - 31490150
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  31489914 gaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatag--tttgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaa 31490011  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| | |||| | ||||||||||  | ||||||||||||||||| | ||||| || ||||||    
T  31490012 acactattaggattgaatttcttggttacgggaagagattgagactttggatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttg 31490111  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  31490112 taaggttattcatcatatggtgaaacggagggctgctct 31490150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 51752364 - 51752600
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaggt-ttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||| |||||||| |  |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||    
T  51752364 gaaacaagagtttagaaaggtaacaacaaaattagggcttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgtgaa 51752463  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgt 228  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  || | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  51752464 acactattag-attgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 51752562  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  51752563 aacgatactcaccatatagtggattggagggctgctct 51752600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 30 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 31423156 - 31422940
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttg-caacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaa 127  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  | ||||||||||||| |    
T  31423156 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctctttggcattaaacactagggtttgaaagttgattcaccttggga 31423057  T
Q  128 aacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-ctttt 226  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||  || |||||    
T  31423056 aacactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacatctctttt 31422957  T
Q  227 gtaacgttactcatcat 243  Q
    |||| ||||||||||||    
T  31422956 gtaaggttactcatcat 31422940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 31 - 262
Target Start/End: Original strand, 17324065 - 17324297
Alignment:
Q  31 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaac 130  Q
    ||||||||||| |||| | | ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  17324065 aaacaagggttcagaaaggccacaacaaaact-gatttttatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaac 17324163  T
Q  131 actattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgta 229  Q
    ||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||  |||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  17324164 actattaggattgagtctcttgaatatgggaagagattggaactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgta 17324263  T
Q  230 acgttactcatca-tatagtggaacggagggctg 262  Q
    | |||| |||||| ||||||| |||||| |||||    
T  17324264 aggttattcatcattatagtgaaacggaaggctg 17324297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 30 - 221
Target Start/End: Original strand, 6823884 - 6824083
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  6823884 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 6823983  T
Q  129 acactattaggattgagtctctt-------ggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc 221  Q
    ||||||||| |||||| ||||||       ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6823984 acactattacgattgaatctcttggttacgggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcggcagacttattcttgtaacccattgatttc 6824083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 17318892 - 17319125
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||| ||    
T  17318892 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtttagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttggaaggttgattcaccttgggaa 17318991  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    ||      |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||   ||||| || ||||||    
T  17318992 ac------aggattgagtctcttggttacgggaacagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacttattgatatctcttttg 17319085  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    | | ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||    
T  17319086 ttaagttactcatcattatagtaaaacggagggctgctct 17319125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 42922233 - 42922468
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||| |||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||  ||    
T  42922233 gaaataagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggtt-gaggt-tgattcaccttgcgaa 42922328  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  42922329 aaactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 42922428  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  42922429 taaagttactcatcattagagtggaacggaggactgctct 42922468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 97 - 266
Target Start/End: Original strand, 16231630 - 16231800
Alignment:
Q  97 actagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggag 195  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||  ||||    
T  16231630 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagcctttgggtagaattaggcgggag 16231729  T
Q  196 acttattcttgtaacccgttgatttccttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16231730 acttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 16231800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 31 - 254
Target Start/End: Original strand, 47451648 - 47451867
Alignment:
Q  31 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaa 129  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| || |        
T  47451648 aaacaagggtttggaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattagtgt- 47451746  T
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgt 228  Q
         |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||  ||| |||| |||||||||| | ||||  || |||||||    
T  47451747 -----ttaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggaaactttttcttgtaactcattgacatctcttttgt 47451841  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacg 254  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  47451842 aacgttactcatcatatagtgaaacg 47451867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 14183868 - 14183635
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||||| |||||   |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||    
T  14183868 gaaacaagggtttagaatg-caacac--aaactagggtttgtatagaggttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggaaa 14183775  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| |   ||| ||||||||||||  | ||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||    
T  14183774 acactattataattgagtctcttggttacgggaagagattagaattttgggtagaattaggcggaagacttattcttgcaacccattgatatctcttttg 14183675  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  14183674 taaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctct 14183635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 64 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 15669638 - 15669437
Alignment:
Q  64 ggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaag 163  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| |  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  15669638 ggtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaag 15669542  T
Q  164 agattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggct 261  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || || | |||| | ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15669541 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctctcgtaaagctactcatcattatagtggaacggatggct 15669442  T
Q  262 gctct 266  Q
    |||||    
T  15669441 gctct 15669437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 8347551 - 8347316
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| | ||||  |||| ||||||||||| | ||    
T  8347551 gaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagattg-ctcttggcaacaaacaccaaggtt--agggttgattcaccttaggaa 8347456  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||| | ||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  8347455 acactattatgattgagtctcttgatcacgggaagagattgagactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 8347356  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||    
T  8347355 taaagttactcattattatagtggaacggagggatgctct 8347316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 127 - 266
Target Start/End: Original strand, 23785936 - 23786076
Alignment:
Q  127 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttt 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  23785936 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 23786035  T
Q  226 tgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  23786036 tgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctct 23786076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 97 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 25248766 - 25248596
Alignment:
Q  97 actagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggaga 196  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||  |||||    
T  25248766 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattaagtctctcggttacaggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggaga 25248667  T
Q  197 cttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctc 265  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||    
T  25248666 cttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcataattatagtgaaacggaggactgctc 25248596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 266
Target Start/End: Original strand, 16432402 - 16432632
Alignment:
Q  28 cagaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaa 127  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||          ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  16432402 cagaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagg----------gtttgtctcttggcgacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 16432491  T
Q  128 aacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-ctttt 226  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||   |||| |||||||||| |  ||| | ||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  16432492 aacattattaggattgaatctcttggttatgggaagagattgaaactttgggtagaattatgcgggacaattattcttgtaacccattgatatctctttt 16432591  T
Q  227 gtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||    
T  16432592 gtaatgttactcatcattatagtgaaacggcggactgctct 16432632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 8349330 - 8349109
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacta-ggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |  || | ||||||||||| ||    
T  8349330 gaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaattaaggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggtttattcaccttgggaa 8349235  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||  || |||||||||||||||| | ||| | || ||||||    
T  8349234 acactattaggattgagtttgatggtcacgggaagagattaggactttaggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaactcattggtatctcttttg 8349135  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaa 252  Q
    | | ||||||||||| ||||||||||    
T  8349134 ttaagttactcatcattatagtggaa 8349109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 115 - 266
Target Start/End: Original strand, 16429042 - 16429195
Alignment:
Q  115 attcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgt 214  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |    
T  16429042 attcaacttgggaaacactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccat 16429141  T
Q  215 tgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||| || ||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  16429142 tgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagcgaaacggagggctgctct 16429195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13125738 - 13125501
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaggttt--gtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaa 127  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||  |||||||| ||  |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||  |||||||| |||| |    
T  13125738 gaaacaagggttaagaa-gccaacaaggaaactagggtttggtatagagtttg-ctcttggcgacaaacactagggtt-gaggt-tgattcacattggga 13125643  T
Q  128 aacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttt 225  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||| | | |||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||| || ||||    
T  13125642 aacgctgttaggattgaggctcttggtcaagggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctcttt 13125543  T
Q  226 tgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  13125542 tgtaaagttactcatcattatagtggaacggagagttgctct 13125501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 113 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 30738829 - 30738671
Alignment:
Q  113 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaacc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||  ||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  30738829 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcataggaagagattgggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaacc 30738730  T
Q  212 cgttgatttc-cttttgtaacgttactcatca---tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    | ||||| || ||||||||| |||||||||||   ||||||| ||||||||| ||||||    
T  30738729 ctttgatgtctcttttgtaaagttactcatcatattatagtgaaacggagggatgctct 30738671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 122 - 266
Target Start/End: Original strand, 51757623 - 51757767
Alignment:
Q  122 ttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc 221  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  51757623 ttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctatcgatttc 51757722  T
Q  222 cttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
      ||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  51757723 tctttgtaacgatactcaccatatagtggattggagggctgctct 51757767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 266
Target Start/End: Original strand, 27916500 - 27916734
Alignment:
Q  31 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaac 130  Q
    |||||||||||||||| | || ||| ||||||||| || | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||    
T  27916500 aaacaagggtttagaa-gccagcaagaaaactagggtt-tgtagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttggaat--tgattcaccttggaaaac 27916594  T
Q  131 actattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaacc--cgttgatttccttttg 227  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||| ||| |||||||| | | ||||| |||||| |||||  | ||||| ||  ||||    
T  27916595 actattagaattgagtctcttggtcacatgaagagattgtgactttgggtggaattaggtttgaagactaattcttttaaccttctttgatatctctttg 27916694  T
Q  228 taacgttactcatc-atatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  27916695 taaagttactcatcgttatagtggaacggagggctgctct 27916734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 64 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 49495454 - 49495259
Alignment:
Q  64 ggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaag 163  Q
    |||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||   | | ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||| ||||| |||  |||    
T  49495454 ggtttgcatatagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gagttgattcaccttgggaaacactaataaaattgagtcttttggtcacggtaag 49495359  T
Q  164 agattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggct 261  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  49495358 agattggggctttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacgaagggct 49495259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18800851 - 18800640
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacta-ggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| |  || ||||||||| ||  ||    
T  18800851 gaaacaaaggtttagaa-gtcaacaagaaaactacggtttgtatagagtttg-ctcttggccacaaatactagggttgg--ggttgattcaccctgagaa 18800756  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| |  |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||| ||||| || ||||||    
T  18800755 acactattaggattgagtctctaggtcacgggtagagatttgaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtatcccattgatatctcttttg 18800656  T
Q  228 taacgttactcatcat 243  Q
    ||| ||||||||||||    
T  18800655 taaagttactcatcat 18800640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 113 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 6115301 - 6115146
Alignment:
Q  113 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaaccc 212  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||     
T  6115301 tgattcaccttgaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggggacttattcttgtaacca 6115202  T
Q  213 gttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
     ||||| || |||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||    
T  6115201 attgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtgaaacggaatgctgctct 6115146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 266
Target Start/End: Original strand, 155789 - 155944
Alignment:
Q  113 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaacc 211  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||| | |||||||||| | | ||| | ||||||||||||    
T  155789 tgattcaccttgggaaacactattaggattgaatctcttggtcacgggaagagattgggactttggatagaattaggtttgaagagtaattcttgtaacc 155888  T
Q  212 cgttgatttccttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
      ||| | ||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  155889 ttttgttatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctct 155944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 26613439 - 26613283
Alignment:
Q  113 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaacc 211  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  26613439 tgattcaccttgggaaacactattcggattgagtcacttggtcacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaacc 26613340  T
Q  212 cgttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    | ||||| || |||||| || |||||| |||| ||||||||||| ||| ||| ||||    
T  26613339 ctttgatatctcttttggaaagttactaatcattatagtggaacagagagcttctct 26613283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 173 - 266
Target Start/End: Original strand, 23816029 - 23816123
Alignment:
Q  173 ctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  23816029 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatggatcggagggatgctct 23816123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 26520397 - 26520206
Alignment:
Q  31 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaa 129  Q
    |||||| ||||||||| | |||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||| |||    
T  26520397 aaacaacggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagatt-gaggt-tgattcaccttgggaaa 26520302  T
Q  130 cactattaggattgagtctcttg------gttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaacccgttgat 218  Q
    |||||||| ||||||||||||||      || ||| |||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  26520301 cactattatgattgagtctcttggtcacagtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggaaacttattcttgtaacccattgat 26520206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 30790599 - 30790444
Alignment:
Q  113 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggta-ggagacttattcttgtaacc 211  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| | | ||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  30790599 tgatttaccttgggaaacactgttaggat-gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc 30790501  T
Q  212 cgttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    | ||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||    
T  30790500 cattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaatggatgactgctct 30790444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 243
Target Start/End: Original strand, 16561549 - 16561681
Alignment:
Q  113 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaacc 211  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||  || |||||| | |||| ||||||| |||| | | ||||||||||||||||||    
T  16561549 tgattcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggccacggaaatagattgagactttgggtagaaataggtttgaagacttattcttgtaacc 16561648  T
Q  212 cgttgatttc-cttttgtaacgttactcatcat 243  Q
    | ||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  16561649 ctttgatatctcttttgtaaagttactcatcat 16561681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 72 - 252
Target Start/End: Original strand, 28279309 - 28279490
Alignment:
Q  72 tagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgg 170  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |  |  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||    
T  28279309 tagagtttg-ctcttgacaacaaacactagggttgg--gattgattccccttggagaaacactattaggattgagcttcttggtcacgggaagagattgg 28279405  T
Q  171 ggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtggaa 252  Q
    | |||| |||||||||||| | | ||||| ||||||||||| | |||   || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  28279406 gacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactcattggcatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaa 28279490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 116 - 266
Target Start/End: Original strand, 43104245 - 43104399
Alignment:
Q  116 ttcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggaga-cttattcttgtaacccg 213  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||  ||||| ||||   |||| |||||||||||| | | |||  || ||||||||||||     
T  43104245 ttcaccttggaaaacactattagaattgagtcttttggtcacaggaagacattgaaactttgggtagaattaggtttgaagatttttttcttgtaaccct 43104344  T
Q  214 ttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||    
T  43104345 ttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagagatgctct 43104399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 254
Target Start/End: Original strand, 14353048 - 14353190
Alignment:
Q  113 tgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagatt-ggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaac 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||| | | |||| |||||||||||||  || || ||||||||||||    
T  14353048 tgattcaccttggagaaacactattaggatttagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaattaggtttgaaac-tattcttgtaac 14353146  T
Q  211 ccgttgatttccttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacg 254  Q
    || ||||  | ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  14353147 cctttgaaat-cttttgtaaagttattcatcattatagtggaacg 14353190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 26332687 - 26332613
Alignment:
Q  113 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaatta 187  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||  |||||||||    
T  26332687 tgattcaccttcggaaacactattaggatttagtctcttggtcacgagaagagattgagactttgtgtagaatta 26332613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 26332836 - 26332704
Alignment:
Q  31 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaac 130  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||| |||| || | ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||| | ||||    
T  26332836 aaacaagggtttagaa-gccaaca-caaaaatagggtt-tgtagagtttg-ctcttggcaacaaacactagg-tttg-ggtttgattcaccttcggaaac 26332743  T
Q  131 actattaggattgagtctcttggttacgagaagagattg 169  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||    
T  26332742 actattaggatttagtctcttggtcacgaaaatagattg 26332704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 4144866 - 4144803
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| | || |||||||||||||    
T  4144866 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattaggt 4144803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 168
Target Start/End: Original strand, 49959130 - 49959186
Alignment:
Q  113 tgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagatt 168  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||    
T  49959130 tgattcaccttggagaaacactattaggaatgagtctcttggtcatgagaagagatt 49959186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Original strand, 2232596 - 2232659
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||||    
T  2232596 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggt 2232659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Original strand, 14997039 - 14997102
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| | | || |||||||||||||    
T  14997039 aaaacactgttaggattgagtctcttggttactggaagagattgagac-ttgggtagaattaggt 14997102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 266
Target Start/End: Original strand, 15916562 - 15916628
Alignment:
Q  202 tcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatcat-atagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  15916562 tcttgtaacccattgatatctcttttataaagttactcgtcattatagtggaacggagggctgctct 15916628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 2401400 - 2401320
Alignment:
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||| | | ||||| |||||||||||    
T  2401400 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 2401320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 21353525 - 21353445
Alignment:
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||| | | ||||| |||||||||||    
T  21353525 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 21353445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 210
Target Start/End: Original strand, 25134074 - 25134154
Alignment:
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||| | | ||||| |||||||||||    
T  25134074 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 25134154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 127 - 168
Target Start/End: Original strand, 37990773 - 37990814
Alignment:
Q  127 aaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagatt 168  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  37990773 aaacactattagaattgagtctcttgatcacgagaagagatt 37990814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Original strand, 9526469 - 9526528
Alignment:
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||||    
T  9526469 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggt 9526528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 127 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 13785455 - 13785391
Alignment:
Q  127 aaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagatt-ggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||| || | |||||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  13785455 aaacacaattaggattgagtttcttggtcacaaaaagagattcgggactttgggtagaattaggt 13785391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 171; Significance: 7e-92; HSPs: 75)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 14807806 - 14808044
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  14807806 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 14807905  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  14807906 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 14808005  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14808006 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 14808044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 32339364 - 32339602
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  32339364 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggtaa 32339463  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  32339464 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 32339563  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32339564 taacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctct 32339602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 28283499 - 28283262
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  28283499 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgactctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaa 28283400  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgt 228  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||    
T  28283399 acactattaggattgaatctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggtggtagacttattcttgcaacccattgatttctctttgt 28283300  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28283299 aacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 28283262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 15072765 - 15073004
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacta-ggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15072765 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttttagggttgattcaccttggaaa 15072864  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaaga-gattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-ctttt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  15072865 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagggttgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctctttt 15072964  T
Q  227 gtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15072965 gtaacgttactcatcatacagtggaacggagggctgctct 15073004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 3874065 - 3874303
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactag-gtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  3874065 gaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 3874164  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  3874165 acactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 3874264  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3874265 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 3874303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22684936 - 22684695
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  22684936 gaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaa 22684837  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaaccc---gttgatttc-ctt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    |||||||| ||     
T  22684836 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccaatattgatttctcta 22684737  T
Q  225 ttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22684736 ttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 22684695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 608789 - 609027
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  608789 gaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaa 608888  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  608889 acactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 608988  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  608989 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 609027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 15809274 - 15809511
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  15809274 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtct-tttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaa 15809372  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15809373 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaaactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 15809472  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  15809473 taacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 15809511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 28251847 - 28251609
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||    
T  28251847 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaa 28251748  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| |||| |||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||    
T  28251747 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttataacccattgatttctcttttg 28251648  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28251647 taatgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 28251609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 30480783 - 30480545
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactag-gtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  30480783 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 30480684  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  30480683 acactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 30480584  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  30480583 taacgttagtcatcatatagtgaaatggatggctgctct 30480545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 41384799 - 41385037
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  41384799 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaa 41384898  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| | ||||  || ||||||    
T  41384899 acaccattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttaggtagaattaggtgggagaatttttcttgtaactcattgacatctcttttg 41384998  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  41384999 taacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctct 41385037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 27829352 - 27829589
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  27829352 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 27829451  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| | || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  27829452 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 27829551  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27829552 aacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctct 27829589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 1225221 - 1225460
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||    
T  1225221 gaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttgggaa 1225320  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttg--atttcctttt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| | |||  || || ||||    
T  1225321 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttt 1225420  T
Q  227 gtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  1225421 gtaacgttactcatcatatagtgaaacggatggccgctct 1225460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 27911070 - 27911307
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  27911070 gaaacaagggtttagaagg-caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 27911168  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| | ||||| || || |||    
T  27911169 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattg 27911268  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  27911269 taaagttactcatcatatagtgaaacggagggttgctct 27911307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 27957489 - 27957726
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  27957489 gaaacaagggtttagaagg-caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 27957587  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||| | ||||| || || |||    
T  27957588 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctctattg 27957687  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  27957688 taaagttactcatcatatagtgaaacggagggttgctct 27957726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 18810763 - 18811000
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  18810763 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 18810862  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  18810863 acactattaggattgagtctcttggttacgggaataggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 18810962  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18810963 aacaatactcatcatatagtggattggagggctgctct 18811000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 27827041 - 27827278
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  27827041 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 27827140  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| | || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  27827141 acactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgggaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 27827240  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27827241 aacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctct 27827278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 30 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 27107177 - 27106941
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||    
T  27107177 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaa 27107078  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||    
T  27107077 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatagatatctcttttg 27106978  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgct 264  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27106977 tagggttactcatcatatagtgaaacggagggctgct 27106941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 15068036 - 15068274
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||    
T  15068036 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaaccagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaa 15068135  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  15068136 atactattaggattgagtcttttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 15068235  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15068236 taacgttactcatcatataatggaacggagggctgctct 15068274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 43079657 - 43079895
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  43079657 gaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 43079756  T
Q  129 acactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttg 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  43079757 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 43079856  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  43079857 taacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 43079895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 4424073 - 4424311
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||    
T  4424073 gaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcgcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccgtgggaa 4424172  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgattt-ccttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||    
T  4424173 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttatcttttg 4424272  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  4424273 taacattactcatcatatagtggatcagagggctgctct 4424311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 25952576 - 25952814
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaa 129  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25952576 gaaacaagggtttagaaaggcaacaataaaattagggttgtatatagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaa 25952675  T
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgt 228  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | || |||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||| || |||||||    
T  25952676 caatattaggattgagtctcttggttacgagaagaaattgagacattgggtagaattaggcagaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgt 25952775  T
Q  229 aacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25952776 aaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctct 25952814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 43082028 - 43082266
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacta-ggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  43082028 gaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 43082127  T
Q  129 acactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttg 227  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  43082128 acactatcaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 43082227  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  43082228 taacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 43082266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 44720898 - 44721136
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaggttt-gtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttgg-aa 127  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  44720898 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactatgttttgtatagagtctgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 44720997  T
Q  128 aacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttg 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  44720998 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 44721097  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  44721098 taacggtactcatcatatagtggattggagagctgctct 44721136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13858764 - 13858526
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  13858764 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgacaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 13858665  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||| | ||| || || || ||||||    
T  13858664 acactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaagcgggagacttattcttgcagcccatt-atatctcttttg 13858566  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  13858565 taaagttactcatcattatagtgaaacagagggctgctct 13858526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 24873461 - 24873223
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||    
T  24873461 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctttggaa 24873362  T
Q  129 acactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttg 227  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||    
T  24873361 acactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccgattgatttctctttg 24873262  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  24873261 taacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 24873223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 30 - 218
Target Start/End: Original strand, 14477331 - 14477520
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  14477331 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 14477430  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgat 218  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| || |||||    
T  14477431 acgctattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgat 14477520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 36865593 - 36865829
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  36865593 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaa 36865692  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    ||||||||||||||||||||||   | ||| |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || || || ||||||    
T  36865693 acactattaggattgagtctct---tcacgggaagagattggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttg 36865789  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||    
T  36865790 taaagttactcatcattatagtgaaacggaatgctgctct 36865829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 14419471 - 14419232
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  14419471 gaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacattggggtttgagggttgattcaccttgggaa 14419372  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgat-ttccttttg 227  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || || |  ||||||    
T  14419371 acactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatgtcttttg 14419272  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||    
T  14419271 taaggttactcatcattatagtgaaacagatggctgctct 14419232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 72 - 264
Target Start/End: Original strand, 43530213 - 43530406
Alignment:
Q  72 tagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggg 171  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||    
T  43530213 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctctcggttacgggaagaggctggg 43530312  T
Q  172 gctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgct 264  Q
     |||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43530313 actttgggtagaattaggcgggagacttattcctgtaacccattgatttctcttttgtaacgctactcatcatatagtggatcggagggctgct 43530406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 30 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 5372458 - 5372226
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||    
T  5372458 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttatatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaa 5372359  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||  ||| |||||||  | ||||||||||||||||| | ||||| ||  |||||    
T  5372358 acactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgggactttgagtataattaggcggcagacttattcttgtaactcattgatatcttttttg 5372259  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggaggg 259  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  5372258 taaggttactcatcattatagtgaaacggaggg 5372226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 30 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 33541668 - 33541508
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  33541668 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaa 33541569  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg 189  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  33541568 acactattaggattgagtatcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattagg 33541508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 31 - 266
Target Start/End: Original strand, 41382729 - 41382955
Alignment:
Q  31 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaa 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||||           
T  41382729 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagaatttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacct------- 41382821  T
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgt 228  Q
        |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||| | ||||  || |||||||    
T  41382822 ----attatgattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgt 41382917  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  41382918 aacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctct 41382955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 72 - 266
Target Start/End: Original strand, 18812980 - 18813174
Alignment:
Q  72 tagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggg 171  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  || |    
T  18812980 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgggtacgggaagaggctgtg 18813079  T
Q  172 gctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
     |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18813080 actttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggattggagggctgctct 18813174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 64 - 259
Target Start/End: Original strand, 15956051 - 15956244
Alignment:
Q  64 ggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaag 163  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||| ||| ||||    
T  15956051 ggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgaatcttttggtcacgggaag 15956146  T
Q  164 agattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggaggg 259  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  15956147 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaggg 15956244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 64 - 266
Target Start/End: Original strand, 21480596 - 21480796
Alignment:
Q  64 ggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaag 163  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||   ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21480596 ggtttgtatggagtttg-ctcttggcaacaaacactaggttt---gggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggttacgggaag 21480691  T
Q  164 agattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggct 261  Q
    | ||||||| ||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  21480692 atattggggtttttggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacagagggct 21480791  T
Q  262 gctct 266  Q
    |||||    
T  21480792 gctct 21480796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 15185990 - 15185764
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacta-ggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  15185990 gaaacaagggtttagaaagaaaataacaaaactatggtttatataaagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtaaa 15185891  T
Q  129 acactattaggattgagt--ctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttt 225  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||       ||| ||||||||||||   ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||    
T  15185890 acactattagaattgagtctctcttggttacgggaagaga-------tttgggtagaattaggcgagagacctattcttgtaacccattgatatctcttt 15185798  T
Q  226 tgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagg 258  Q
    | ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  15185797 tttaaggttactcatcattatagtgaaacggagg 15185764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 65 - 266
Target Start/End: Original strand, 31162303 - 31162503
Alignment:
Q  65 gtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaaga 164  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||  |||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||    
T  31162303 gtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactaacgtt--agggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcaccggaaga 31162399  T
Q  165 gattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctg 262  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  31162400 gattgggactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaacagagggctg 31162499  T
Q  263 ctct 266  Q
    ||||    
T  31162500 ctct 31162503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 64 - 266
Target Start/End: Original strand, 21482404 - 21482604
Alignment:
Q  64 ggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaag 163  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||    
T  21482404 ggtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgagtcaccttgggaaacactattaagattgagtctcttggttatgggaag 21482499  T
Q  164 agattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggct 261  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||   | |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||  | |||||||||||    
T  21482500 agattggggctttgggtagaattaggcgagtgacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattataaagaaacggagggct 21482599  T
Q  262 gctct 266  Q
    |||||    
T  21482600 gctct 21482604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 3005906 - 3005673
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactag-gtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |  ||||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||| ||    |||||||| |||||||    
T  3005906 gaaacaagggtttagaa--acaaataacaaactagagtttgtatagagtttg-ctcttaacaacaaacaatagggttggat---tgattcactttggaaa 3005813  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||| || ||||||    
T  3005812 acactattagcattgagtctcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttg 3005713  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  3005712 taaagttgctcatcattatagtggaacggaggggtgctct 3005673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 151
Target Start/End: Original strand, 26775256 - 26775378
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  26775256 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaatactagggtttgtatatagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttggaaa 26775355  T
Q  129 acactattaggattgagtctctt 151  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  26775356 acactattagaattgagtctctt 26775378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 5623018 - 5622877
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||    
T  5623018 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctattgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatctttggaa 5622919  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgg 170  Q
    ||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  5622918 acattatttggattgagtctcttgattacgggaagagattgg 5622877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 113 - 266
Target Start/End: Original strand, 31035256 - 31035411
Alignment:
Q  113 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaacc 211  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| | ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  31035256 tgattcaccttgggaaacaccgttatgattgagtctcttggtcacaggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaacc 31035355  T
Q  212 cgttgatttccttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    | ||||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31035356 ctttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctct 31035411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 31578475 - 31578319
Alignment:
Q  113 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaacc 211  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| | | |||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||||| ||||||||||||    
T  31578475 tgattcaccttgggaaacactgttatgattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaacc 31578376  T
Q  212 cgttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
      ||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  31578375 ttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctct 31578319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 97 - 244
Target Start/End: Original strand, 181622 - 181772
Alignment:
Q  97 actagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactatt-aggattgagtctcttggttacgag--aagagattggggctttaggtagaattaggtagg 193  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| |||||| |  |||||| |||| |||| ||||||||||||  |     
T  181622 actagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatttaggattaagtctcttagttacgcgggaagagaatgggactttgggtagaattaggcgga 181721  T
Q  194 agacttattcttgtaacccgttgatttccttttgtaacgttactcatcata 244  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |||||||||||||    
T  181722 agacttattcttgtaacccattgatatctctttgtaaagttactcatcata 181772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 37214436 - 37214320
Alignment:
Q  64 ggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaag 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||         ||||||||||||||||||| ||||    
T  37214436 ggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaac---------attgagtctcttggttacgggaag 37214346  T
Q  164 agattggggctttaggtagaattagg 189  Q
     ||||||  |||| ||||||||||||    
T  37214345 cgattggaactttgggtagaattagg 37214320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 31574000 - 31573794
Alignment:
Q  31 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaac 130  Q
    |||||| ||||||||| | |||||  ||||||||| || | |||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |  |  ||||||||||||| ||||    
T  31574000 aaacaaaggtttagaa-gccaacacgaaaactaggatt-tgtagagttt-tctcttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaac 31573906  T
Q  131 actattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgt 228  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||| |||||||||||| | | ||||| ||||||||||  | ||||| || |||||||    
T  31573905 actgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaattctttgatatctcttttgt 31573806  T
Q  229 aacgttactcat 240  Q
    || |||||||||    
T  31573805 aaagttactcat 31573794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 35872658 - 35872555
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaa 129  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |     ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  35872658 gaaacaagggtttagaaaggcaacaactag----ggtttgtatagagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 35872563  T
Q  130 cactatta 137  Q
    ||||||||    
T  35872562 cactatta 35872555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 6376140 - 6376282
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaacccgttgatttcctt 224  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| ||  |||||||||| | ||||| ||||||||||| | | ||||| |||||||| |||  ||||| ||  |    
T  6376140 aaaacactgttaagattgagtctcttggtcacatgaagagattgagactttatgtagaattaggtttgaagactaattcttgttaccttttgatatctct 6376239  T
Q  225 ttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  6376240 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacagaaggctgctct 6376282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13985277 - 13985176
Alignment:
Q  113 tgattcaccttggaaaa-cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagatt-ggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaac 210  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||| |||||||||||||  || ||| |||||||||||    
T  13985277 tgattcaccttgaaaaaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaattaggtttgaaactgattcttgtaac 13985178  T
Q  211 cc 212  Q
    ||    
T  13985177 cc 13985176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 146
Target Start/End: Original strand, 31035126 - 31035238
Alignment:
Q  31 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaa 129  Q
    |||||| ||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |  |  ||||||||||||| |||    
T  31035126 aaacaatggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaa 31035221  T
Q  130 cactattaggattgagt 146  Q
    ||| |||||||||||||    
T  31035222 caccattaggattgagt 31035238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 2468341 - 2468261
Alignment:
Q  70 tatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggt 154  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||   ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  2468341 tatagagtttg-ctcttggcaacaaatactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattagaattgagtctcttggt 2468261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 12517304 - 12517248
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacta-ggtttgtatagagtttgtctct 85  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12517304 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 12517248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 35872553 - 35872482
Alignment:
Q  196 acttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35872553 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 35872482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 211
Target Start/End: Original strand, 17847662 - 17847763
Alignment:
Q  113 tgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaa 209  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||| | |||| |||||||||||| | | ||||| ||||||||||    
T  17847662 tgattcaccttgaacgaaacactattaggattgaatctcttgatcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 17847761  T
Q  210 cc 211  Q
    ||    
T  17847762 cc 17847763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Original strand, 28332630 - 28332693
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| | || |||||||||||||    
T  28332630 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagaggctgggac-ttgggtagaattaggt 28332693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 9021290 - 9021206
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||| | | ||||| |||||||||||    
T  9021290 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 9021206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 13986010 - 13985909
Alignment:
Q  113 tgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagatt-ggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaac 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  | ||| ||||||||| ||| |||| |||| |||||| |  || ||| |||||||||||    
T  13986010 tgattcaccttggagaaacactattaggattgagactcttaatcacgggaagagattcgggactttgggtataattagttttgaaactgattcttgtaac 13985911  T
Q  211 cc 212  Q
    ||    
T  13985910 cc 13985909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 2468247 - 2468171
Alignment:
Q  192 ggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||    
T  2468247 ggagacttattcttgtagcccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaatagagggctgctct 2468171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 16752705 - 16752642
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||||    
T  16752705 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggt 16752642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 16757450 - 16757387
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||||    
T  16757450 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggt 16757387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Original strand, 28327907 - 28327970
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||||    
T  28327907 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggt 28327970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Original strand, 28895501 - 28895564
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||||    
T  28895501 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggt 28895564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Original strand, 30423211 - 30423275
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||  |||| | |||||||||||    
T  30423211 aaaacacttttaggattgagtctcttggtcgcgggaagagattggaactttggatagaattaggt 30423275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 33541496 - 33541452
Alignment:
Q  222 cttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  33541496 cttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggaaggctgctct 33541452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 2267206 - 2267120
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaaccc 212  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||||| || | || |||||||||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  2267206 aaaacactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattaggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccc 2267120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 17799607 - 17799568
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagag 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  17799607 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 17799568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 168
Target Start/End: Original strand, 28228513 - 28228555
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagatt 168  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||    
T  28228513 aaaacactattaggatagagactcttggtcacgagaagagatt 28228555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 33839119 - 33839077
Alignment:
Q  113 tgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggt 154  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33839119 tgattcaccttgaagaaacactattaggattgagtctcttggt 33839077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 3886198 - 3886153
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacta-ggtttgtatag 74  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||    
T  3886198 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 3886153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 210
Target Start/End: Original strand, 33032657 - 33032737
Alignment:
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||| | | ||||| |||||||||||    
T  33032657 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 33032737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Original strand, 590797 - 590856
Alignment:
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||||    
T  590797 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggt 590856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 4812670 - 4812607
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||||    
T  4812670 aaaacactattaggattgagtcttttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggt 4812607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Original strand, 15949533 - 15949597
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||| |||  || |||| ||||||||    
T  15949533 aaaacactattaggatatagtctcttggtcacgggaagagattcgggacttgggtaaaattaggt 15949597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 154
Target Start/End: Original strand, 21033869 - 21033897
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggt 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21033869 aaaacactattaggattgagtctcttggt 21033897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 171; Significance: 7e-92; HSPs: 101)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 44724588 - 44724826
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  44724588 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 44724687  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  44724688 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 44724787  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44724788 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 44724826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 20297371 - 20297609
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  20297371 gaaacaagggtttagaatggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacagtagggtttgagggttgattcaccttgggaa 20297470  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20297471 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaaataggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 20297570  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  20297571 taacgatactcatcatatagtggattggagggctgctct 20297609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 38393995 - 38394233
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  38393995 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 38394094  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  38394095 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 38394194  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38394195 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 38394233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 48457662 - 48457900
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||    
T  48457662 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttcattcacctagggaa 48457761  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  48457762 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 48457861  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48457862 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 48457900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 20626047 - 20626285
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  20626047 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaa 20626146  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20626147 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 20626246  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20626247 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 20626285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 20629938 - 20630176
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  20629938 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaa 20630037  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20630038 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 20630137  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20630138 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 20630176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 20642357 - 20642595
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  20642357 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaa 20642456  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20642457 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 20642556  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20642557 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 20642595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 30 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 4296215 - 4295978
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttg-caacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaa 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |    
T  4296215 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttggga 4296116  T
Q  128 aacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-ctttt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||  || |||||    
T  4296115 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttt 4296016  T
Q  227 gtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgct 264  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  4296015 gtaacgttactcatcatatagtgaaacagagggctgct 4295978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 3878586 - 3878824
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||| ||    
T  3878586 gaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggcttgtgggttgattcaccttggtaa 3878685  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  3878686 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 3878785  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3878786 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 3878824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 21990159 - 21990397
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  21990159 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactatgatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaa 21990258  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||  |||||||| |||||||||| | ||||| || ||||||    
T  21990259 acactattagaattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgagtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgatatctcttttg 21990358  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21990359 taacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctct 21990397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 27306509 - 27306272
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaa 129  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  27306509 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttttatagagtttgtctctttggaacaaaaactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 27306410  T
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| |||| |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||    
T  27306409 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgt 27306310  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27306309 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 27306272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 30 - 264
Target Start/End: Original strand, 35638 - 35874
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  35638 gaaacaagggttcagaaagacaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaa 35737  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  35738 acactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 35837  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgct 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35838 taacgttactcatcatatagtggaacggagagctgct 35874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 37 - 266
Target Start/End: Original strand, 20299475 - 20299707
Alignment:
Q  37 gggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggttt-gagggctgattcaccttggaaaacacta 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  20299475 gggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacacta 20299574  T
Q  135 ttaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgt 233  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20299575 ttaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgt 20299674  T
Q  234 tactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  20299675 tactcatcatatagtggatcggagggttgctct 20299707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 20137389 - 20137150
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactag-gtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  20137389 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 20137290  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  20137289 acactattaagattgagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 20137190  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  20137189 taaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctct 20137150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 24748603 - 24748842
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  24748603 gaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaa 24748702  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  24748703 acactattacgattgagtctcttggttccgggaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 24748802  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24748803 taaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctct 24748842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 262
Target Start/End: Original strand, 18345550 - 18345784
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  18345550 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaatactaggttttgagggttgattcaccttgggaa 18345649  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  18345650 acactattaggattgagtctcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 18345749  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctg 262  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18345750 taacgatactcatcatatagtggatcggagggctg 18345784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 30 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 7470302 - 7470065
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||    
T  7470302 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaa 7470203  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  7470202 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 7470103  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctc 265  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7470102 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 7470065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13099756 - 13099516
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||    
T  13099756 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaa 13099657  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttg--atttcctttt 226  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||  || || ||||    
T  13099656 acactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttt 13099557  T
Q  227 gtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  13099556 gtaaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctct 13099516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 30 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 42331279 - 42331044
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacta-ggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  42331279 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 42331180  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggtt--acgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||    
T  42331179 acactattaggattgagtctcttggttacacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttt 42331080  T
Q  226 tgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggct 261  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  42331079 tgtaaagttactcattatatagtgaaacggagggct 42331044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 31435327 - 31435088
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  31435327 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaa 31435228  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||  |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  31435227 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggaactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 31435128  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31435127 taaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctct 31435088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 42223166 - 42223405
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttg-caacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaa 127  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42223166 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaa 42223265  T
Q  128 aacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-ctttt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||  | | ||||||||||| ||||  ||||| || |||||    
T  42223266 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggagctttggatagaattaggcggaaaacttattcttgaaacctattgatatctctttt 42223365  T
Q  227 gtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  42223366 gtaacgttactcatcatatagtgaaatggatggctgctct 42223405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 1849990 - 1850228
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  1849990 gaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaa 1850089  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||  |||| ||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  1850090 acactattaggattgagtttcttgcttacgggaagaggctgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 1850189  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1850190 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 1850228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 21592423 - 21592185
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||| |||||||||   ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  21592423 gaaacaaaggtttagaaatgcaacaacaaaagtaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggcaa 21592324  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||  || ||||||    
T  21592323 gcactattaggatttagtctcttggttacgcgaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttg 21592224  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21592223 taacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 21592185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 31 - 266
Target Start/End: Original strand, 443605 - 443842
Alignment:
Q  31 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaa 129  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  443605 aaacaatggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 443704  T
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||   ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |    
T  443705 cactattaggattgagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatctcttttat 443804  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  443805 aacgttactcatcatatagtgaaacgaagggctgctct 443842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 37 - 251
Target Start/End: Original strand, 11757245 - 11757462
Alignment:
Q  37 gggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggttt-gagggctgattcaccttggaaaacacta 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  11757245 gggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacacta 11757344  T
Q  135 ttaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgt 233  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  11757345 ttaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgt 11757444  T
Q  234 tactcatcatatagtgga 251  Q
    ||||||||||||||||||    
T  11757445 tactcatcatatagtgga 11757462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 40837022 - 40836785
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  40837022 gaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 40836923  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  40836922 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 40836823  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40836822 aacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctct 40836785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 30 - 256
Target Start/End: Original strand, 44573 - 44801
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||    
T  44573 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttaggaa 44672  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  44673 acactattatgattgagtcttttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattatgtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 44772  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacgga 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44773 taacgttactcatcatatagtggaacgga 44801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 9679068 - 9679306
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttg-caacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaa 127  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |    
T  9679068 gaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgaggattgattcaccttggga 9679166  T
Q  128 aacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-ctttt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  9679167 aacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 9679266  T
Q  227 gtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  9679267 gtaaagttactcatcatatagtgaaacggagtactgctct 9679306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 39146267 - 39146028
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  39146267 gaaacaagggtttagatagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaa 39146168  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||    
T  39146167 acactattatgattgagtctcttggttacgggaagagattggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctcttttg 39146068  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  39146067 taaggttactcatcattatagtgaaacggggggctgctct 39146028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 7351932 - 7351694
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  7351932 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggctttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 7351833  T
Q  129 acactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttg 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  7351832 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 7351733  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  7351732 taacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 7351694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 7472260 - 7472022
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  7472260 gaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 7472161  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||  |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  7472160 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctggaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 7472061  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  7472060 taacgttactcatcatatagtggatcggatggctgctct 7472022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 11355267 - 11355505
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  11355267 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 11355366  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| ||  |||||    
T  11355367 acactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatcttttttg 11355466  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  11355467 taacgtttctcatcatatagtggaacagagagctgctct 11355505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 37412408 - 37412167
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctcttt-gcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaa 127  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  37412408 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 37412309  T
Q  128 aacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttg--atttccttt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||  || || |||    
T  37412308 aacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctttt 37412209  T
Q  226 tgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  37412208 tgtaaggttactcatcattatagtggaacggatggctgctct 37412167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 40946337 - 40946575
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||    
T  40946337 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagaaacaaacactagggtttgtgggttgatttactttggaaa 40946436  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  40946437 acactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttctcttttg 40946536  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  40946537 taacgttactcatcatatagtggatcgaagggctgctct 40946575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 1047204 - 1046967
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||| ||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  1047204 gaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 1047105  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  1047104 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 1047005  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1047004 aacgatactcatcatatagtggattggagggctgctct 1046967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 1049575 - 1049338
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  1049575 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 1049476  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgt 228  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  1049475 acactatcaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 1049376  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1049375 aacgatactcatcatatagtggattggagggctgctct 1049338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 3035730 - 3035971
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  3035730 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 3035829  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacg---agaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-ctt 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  3035830 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagaggctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 3035929  T
Q  225 ttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  3035930 ttgcaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctct 3035971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 9680828 - 9681067
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacta-ggtttgtatagagtttgtctctttg-caacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaa 127  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |    
T  9680828 gaaacaagggtttagaagggcaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcggga 9680927  T
Q  128 aacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgat-ttcctttt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||| | ||||| |  |||||    
T  9680928 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatctttt 9681027  T
Q  227 gtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  9681028 gtaaagttactcatcatatagtgaaatggagggctgctct 9681067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 21678075 - 21678313
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  21678075 gaaacaagggtttagaaaggcaacatcaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 21678174  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgat-ttccttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||||    
T  21678175 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagatattgggactttgggtagcattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatatcttttg 21678274  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| |||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  21678275 taaggttacttatcatatagtgaaacagtgggctgctct 21678313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 246
Target Start/End: Original strand, 28485575 - 28485793
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||    
T  28485575 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgcgggttgattcacctttggaa 28485674  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  28485675 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttgagtataattaggcgggagatttattcttgtaatccattgatttctcttttg 28485774  T
Q  228 taacgttactcatcatata 246  Q
    |||||||||||||||||||    
T  28485775 taacgttactcatcatata 28485793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 28487562 - 28487800
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactag-gtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| | ||| ||||||||||| | ||    
T  28487562 gaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttcgaaactaacactagggttcgtgggttgattcacctttggaa 28487661  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  28487662 acactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 28487761  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||    
T  28487762 taacgttactcatcatatagtgaatcagagggttgctct 28487800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 43253796 - 43253559
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  43253796 gaaacaaggttttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaa 43253698  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  || | |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  43253697 acactattaggattgagtctcttgattacggaaagaggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttg 43253598  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  43253597 taacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 43253559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 7349553 - 7349315
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  7349553 gaaacaggggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 7349454  T
Q  129 acactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttg 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  7349453 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 7349354  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  7349353 taacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 7349315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 21680036 - 21680274
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  21680036 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaa 21680135  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||   ||||| |||||||||||||||  |||| || ||||||    
T  21680136 acactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgggactttgggtagaattagacgggagatttattcttgtaacccaatgatatctcttttg 21680235  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||    
T  21680236 taaggttactcatcatatagtgaaacagagagctgctct 21680274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 31156191 - 31155953
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||    
T  31156191 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactaggatttgtgggttgattcaccttgggaa 31156092  T
Q  129 acactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttg 227  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  31156091 acactattaggattggagtctcttgggtacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 31155992  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  31155991 taacggtactcatcctatagtggattggagggctgctct 31155953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 40 - 255
Target Start/End: Original strand, 25276160 - 25276378
Alignment:
Q  40 tttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattag 138  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  25276160 tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattag 25276259  T
Q  139 gattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttact 237  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||| ||||||    
T  25276260 gattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatatctcttttgtaaagttact 25276359  T
Q  238 catca-tatagtggaacgg 255  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  25276360 catcattatagtggaacgg 25276378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 24258472 - 24258714
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24258472 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttggaaa 24258571  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| | |||| | ||||||||||  | | ||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  24258572 acactattaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgagactttggatagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 24258671  T
Q  228 taacgttactcatca----tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| |||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  24258672 taaagttactcatcattattatagtggaacggagggctgctct 24258714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 25542539 - 25542775
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  25542539 gaaacaaaggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaaaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaa 25542638  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgt 228  Q
      |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  25542639 g-actattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 25542737  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  25542738 aacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctct 25542775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 27832913 - 27832674
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacta-ggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||||| || | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  27832913 gaaacaagggtttaaaaaggcaacaacagaactaaggtttgtatagagtttgtctcttggcaacatacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 27832814  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||    
T  27832813 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttctg 27832714  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||    
T  27832713 taaagttactcatcattatagtgaaatggagggcttctct 27832674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 89 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 7092432 - 7092254
Alignment:
Q  89 caacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattag 188  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7092432 caacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattag 7092333  T
Q  189 gtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  7092332 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctct 7092254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 89 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 7094679 - 7094502
Alignment:
Q  89 caacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattag 188  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7094679 caacaaaca-tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttaattacgggaagagattggggctttgggtagaattag 7094581  T
Q  189 gtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  7094580 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctct 7094502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 24817629 - 24817395
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||    
T  24817629 gaaacaagggtttagaa-gtcaacaagagaactagggtttgtatagagtttg-ctctttgcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttggaaa 24817535  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
     || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||    
T  24817534 gcagtattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatgtctcttttg 24817435  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24817434 taaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctct 24817395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 30 - 212
Target Start/End: Original strand, 26804578 - 26804764
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactag---ggtttgagggctgattcaccttgg 125  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||    
T  26804578 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagtagggtttgagggttgattcaccttgg 26804677  T
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaaccc 212  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  || | |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26804678 gaaacactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 26804764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22828913 - 22828674
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacta-ggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   |||||||||||| |||||| || |||||||  || ||||    
T  22828913 gaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttatctcttgaaaacaaacactagagtttgatggttgattcagattagaaa 22828814  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  22828813 acactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 22828714  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||  |||||||| | ||||||| ||| ||||||||||||    
T  22828713 taaaattactcattattatagtgaaacagagggctgctct 22828674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 22251822 - 22251602
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactag-gtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |     
T  22251822 gaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttggga- 22251724  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-----ct 223  Q
           ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||     ||    
T  22251723 -------taggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctttctct 22251631  T
Q  224 tttgtaacgttactcatca-tatagtgga 251  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22251630 tttgtaaagttactcatcattatagtgga 22251602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 7188552 - 7188787
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||| |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||    
T  7188552 gaaacaagggtttagaa-gtcaacaataaaaatagggtttgtatagggtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggaaa 7188647  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgat-ttccttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| | |||| |||||||||| |  ||||||||||| || |||||| ||||| || ||||||    
T  7188648 acactattaggattgagtctcttggtcacgggaatagattgagactttgggtagaattaagcgggagacttatttttataacccattgatatttcttttg 7188747  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  7188748 taaagttattcatcattatagtggaacggaaggctgctct 7188787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 127 - 266
Target Start/End: Original strand, 2935375 - 2935515
Alignment:
Q  127 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttt 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  2935375 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 2935474  T
Q  226 tgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  2935475 tgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctct 2935515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 55 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 20091797 - 20091589
Alignment:
Q  55 acaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgg 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||| | ||||||| |  || ||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  20091797 acaaaactagggtttgtatagagtttg-ctattggcaacaaagattagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattaaatctcttgg 20091701  T
Q  154 ttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatcatatagtggaa 252  Q
    | ||| |||||||||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  20091700 tcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatc--atagtggaa 20091603  T
Q  253 cggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||    
T  20091602 cggagggctgctct 20091589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 50 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 24813755 - 24813542
Alignment:
Q  50 caacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtct 148  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||   ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  24813755 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaagaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaagcactattaggattgagtct 24813660  T
Q  149 cttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tata 246  Q
    |||||| ||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || || || | ||||||| ||||||||||| ||||    
T  24813659 cttggtgacgggaagtgattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatttatatctcctttgtaaagttactcatcattata 24813560  T
Q  247 gtggaacggagggctgct 264  Q
    ||||| |||| |||||||    
T  24813559 gtggagcggatggctgct 24813542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 98 - 266
Target Start/End: Original strand, 38396713 - 38396881
Alignment:
Q  98 ctagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagac 197  Q
    ||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||    
T  38396713 ctaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggatcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagac 38396812  T
Q  198 ttattcttgtaacccgttgatttccttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  38396813 ttatttttgtaacccattgatttctctttgtaactttactcatcatatagtggatcggagggcttctct 38396881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 127 - 266
Target Start/End: Original strand, 1606487 - 1606626
Alignment:
Q  127 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttt 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||    
T  1606487 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctctt 1606585  T
Q  226 tgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  1606586 tgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctct 1606626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 127 - 266
Target Start/End: Original strand, 22137185 - 22137324
Alignment:
Q  127 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttt 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  | ||||| ||||||||||||| ||||||||  ||    
T  22137185 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctctt 22137283  T
Q  226 tgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22137284 tgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctct 22137324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 127 - 266
Target Start/End: Original strand, 40552212 - 40552351
Alignment:
Q  127 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttt 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  | ||||| ||||||||||||| ||||||||  ||    
T  40552212 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctctt 40552310  T
Q  226 tgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  40552311 tgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctct 40552351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 138
Target Start/End: Original strand, 18567622 - 18567731
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  18567622 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaa 18567721  T
Q  129 acactattag 138  Q
    ||||||||||    
T  18567722 acactattag 18567731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 127 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 9027375 - 9027236
Alignment:
Q  127 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttt 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||    
T  9027375 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctctt 9027277  T
Q  226 tgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  9027276 tgtaacgttactcatcaaatagtggataggagggctgctct 9027236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 127 - 266
Target Start/End: Original strand, 22108174 - 22108313
Alignment:
Q  127 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttt 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||  | ||||| ||||||||||||| ||||||||  ||    
T  22108174 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctctt 22108272  T
Q  226 tgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22108273 tgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctct 22108313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 127 - 266
Target Start/End: Original strand, 40549934 - 40550073
Alignment:
Q  127 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttt 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||  | ||||| ||||||||||||| ||||||||  ||    
T  40549934 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaacccattgatttctctt 40550032  T
Q  226 tgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  40550033 tgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctct 40550073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 113 - 256
Target Start/End: Original strand, 6332312 - 6332458
Alignment:
Q  113 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaacc 211  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  6332312 tgattcagtttggaaaacactattaagattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggtagaattaggcttgaagacttattcttgtaacc 6332411  T
Q  212 cgttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacgga 256  Q
    | || || || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  6332412 ctttaatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacgga 6332458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 31 - 266
Target Start/End: Original strand, 6048885 - 6049120
Alignment:
Q  31 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttgga-aa 128  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||| ||| ||   ||||| ||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||| | ||    
T  6048885 aaacaagggtttagaa-gccaacatcaaaactagggtttgtaaagaatt---ctcttggcaacaaacactagg-tttg-ggattgattcaccttgaagaa 6048978  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttg 227  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| | |||| | |||||||||| | | |||| ||||||| |||||| ||||| ||| ||||    
T  6048979 acactattaggattgaatctcttggtcacgagaagatattgagactttggatagaattaggtttgaagacgtattcttataaccctttgatatccctttg 6049078  T
Q  228 taacgttactcatc---atatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||||||   |||||||||||||||| | ||||||    
T  6049079 taaagttactcatcattatatagtggaacggagagttgctct 6049120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 64 - 210
Target Start/End: Original strand, 24465585 - 24465727
Alignment:
Q  64 ggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaag 163  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||  |    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  24465585 ggtttgtatagcgtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgaat---tgattcaccttgggaaacaatattaggattgagtctcttggtcatgggaag 24465680  T
Q  164 agattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaac 210  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  24465681 agattgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttttaac 24465727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16297221 - 16297064
Alignment:
Q  113 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattag-gtaggagacttattcttgtaacc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||| |||||||||||  | | ||| | ||||||||||||    
T  16297221 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattagatttgaagattgattcttgtaacc 16297122  T
Q  212 c-gttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |  || || || |||||| || ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  16297121 cttttaatatctcttttgcaaagttactcatcattatagtagaacggagagctgctct 16297064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 64 - 167
Target Start/End: Original strand, 22392509 - 22392608
Alignment:
Q  64 ggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaag 163  Q
    |||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  22392509 ggtttgtatagaatttg-ctattggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaag 22392604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 212
Target Start/End: Original strand, 11081522 - 11081699
Alignment:
Q  31 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaa 129  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||| |||||||||||||||||| |||   |||||||| |||| |||    
T  11081522 aaacaagggtttagaa-gccaacaacaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactagggtt-gagat-tgattcactttgggaaa 11081615  T
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaaccc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||  |||  ||| ||||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  11081616 cactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagattaggattttgtgtaaaattaggtttgaagactaattcttgtaaccc 11081699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 40281572 - 40281466
Alignment:
Q  115 attcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaacccg 213  Q
    ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| | |||| ||| |||||||| | | |||||||||||||||||||     
T  40281572 attcaccttgggaaacaccgttaggattgagtctgttggtcacgggaagagattgagacttttggtggaattaggtttgaagacttattcttgtaaccct 40281473  T
Q  214 ttgattt 220  Q
    |||||||    
T  40281472 ttgattt 40281466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 190
Target Start/End: Original strand, 11084468 - 11084545
Alignment:
Q  113 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||| |||| ||||||||    
T  11084468 tgatttaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattcgaactttgggtaaaattaggt 11084545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 178 - 259
Target Start/End: Original strand, 22393880 - 22393963
Alignment:
Q  178 ggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggaggg 259  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  22393880 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaacggaggg 22393963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 212
Target Start/End: Original strand, 26210632 - 26210734
Alignment:
Q  113 tgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagatt-ggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaa 209  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||| |||| |||||||||||| | | ||||| ||||||||||    
T  26210632 tgattcaccttggagaaatactattaggattgagtctcttggtaacggaaagagattcgggactttcggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaa 26210731  T
Q  210 ccc 212  Q
    |||    
T  26210732 ccc 26210734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 12310238 - 12310157
Alignment:
Q  86 ttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagatt 168  Q
    |||||||||||||||||||| |  |  |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  12310238 ttgcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgaacaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatt 12310157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 210
Target Start/End: Original strand, 2120883 - 2120982
Alignment:
Q  113 tgattcaccttgga--aaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaa 209  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||| | | ||||| ||||||||||    
T  2120883 tgattcaccttggacaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaa 2120981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 171
Target Start/End: Original strand, 21369641 - 21369686
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggg 171  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  21369641 aaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattggg 21369686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 156 - 266
Target Start/End: Original strand, 6046629 - 6046741
Alignment:
Q  156 acgagaagagattggggctttaggtagaattaggtagga-gacttattcttgtaacccgttgatttccttttgtaacgttactcatca-tatagtggaac 253  Q
    ||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||  || ||||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||     
T  6046629 acgagaaaagaatgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaacctttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaat 6046728  T
Q  254 ggagggctgctct 266  Q
    | || ||||||||    
T  6046729 gaagagctgctct 6046741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 150 - 256
Target Start/End: Original strand, 6348912 - 6349020
Alignment:
Q  150 ttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatag 247  Q
    ||||| ||| ||| |||||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||  |||||||||| || ||    
T  6348912 ttggtcacgggaaaagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcattacag 6349011  T
Q  248 tggaacgga 256  Q
    |||||||||    
T  6349012 tggaacgga 6349020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 160 - 243
Target Start/End: Original strand, 26295587 - 26295671
Alignment:
Q  160 gaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatcat 243  Q
    |||| ||||| | |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  26295587 gaagcgattgtgactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 26295671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 210
Target Start/End: Original strand, 25351352 - 25351436
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||| | | ||||| |||||||||||    
T  25351352 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 25351436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 210
Target Start/End: Original strand, 25357046 - 25357130
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||| | | ||||| |||||||||||    
T  25357046 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 25357130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 210
Target Start/End: Original strand, 25410129 - 25410213
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||| | | ||||| |||||||||||    
T  25410129 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 25410213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 3320233 - 3320170
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||||    
T  3320233 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggt 3320170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 3324981 - 3324918
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||||    
T  3324981 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggt 3324918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Original strand, 7069779 - 7069842
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||||    
T  7069779 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggt 7069842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Original strand, 7074786 - 7074849
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||||    
T  7074786 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggt 7074849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Original strand, 25405392 - 25405455
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||||    
T  25405392 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggt 25405455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 81
Target Start/End: Original strand, 38396325 - 38396377
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacta-ggtttgtatagagtttgt 81  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  38396325 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgt 38396377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Original strand, 42006662 - 42006725
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||||    
T  42006662 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggt 42006725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 15541178 - 15541139
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagag 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  15541178 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 15541139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 2990828 - 2990750
Alignment:
Q  113 tgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||| ||  ||||||||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  2990828 tgattcaccttgaataaacactgttaggattgagtatcttggtcacatgaagagattcgggattttggtagaaataggt 2990750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 13290710 - 13290540
Alignment:
Q  72 tagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgg 170  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| || |  |  ||||||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||| ||  ||||| ||| |    
T  13290710 tagagttt-tctcttggcaacaaacactaggcttgggag--tgattcaccttcgagaaacactattagaatttagtctcttggtcacaggaagatattag 13290614  T
Q  171 ggctttaggtagaattaggtagga-gacttattcttgtaacccgttgatttccttttgtaacgttactcatcat 243  Q
      || | |||||||||||||  || || | ||||||||||||  ||||| ||  ||||||| ||||||||||||    
T  13290613 aactctgggtagaattaggtttgaagaataattcttgtaaccttttgatatctctttgtaaagttactcatcat 13290540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 7092455 - 7092426
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaa 59  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7092455 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaa 7092426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 44144045 - 44143965
Alignment:
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| |||| || ||||||||| | | ||||| |||||||||||    
T  44144045 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggcagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 44143965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 44512704 - 44512624
Alignment:
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||| | | ||||| |||||||||||    
T  44512704 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 44512624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 8378687 - 8378624
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||||    
T  8378687 aaaacactattaagattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggt 8378624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Original strand, 30246973 - 30247032
Alignment:
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||||    
T  30246973 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggt 30247032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 113)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 34 - 266
Target Start/End: Original strand, 9148310 - 9148543
Alignment:
Q  34 caagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacac 132  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  9148310 caagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacac 9148409  T
Q  133 tattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgtaacg 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  9148410 tattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 9148509  T
Q  233 ttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9148510 ttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 9148543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22801142 - 22800904
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactag-gtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22801142 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaa 22801043  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  || | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  22801042 acactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 22800943  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22800942 taacgttactcatcatatagtggaacagagggctgctct 22800904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 40637127 - 40637365
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  40637127 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 40637226  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  40637227 acactattaggatcgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 40637326  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40637327 taacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctct 40637365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 37089651 - 37089414
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  37089651 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 37089552  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  37089551 acactattaggattgagtctcttgattacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 37089452  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37089451 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 37089414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 14633372 - 14633609
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactag-gtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  14633372 gaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 14633471  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  14633472 acactattaggattgagtctcttggttacg-gaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 14633570  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14633571 taatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 14633609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 8631699 - 8631461
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  8631699 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 8631600  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  8631599 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 8631500  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8631499 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 8631461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 24348271 - 24348509
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacta-ggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  24348271 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 24348370  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  24348371 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 24348470  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24348471 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 24348509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 48486372 - 48486610
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  48486372 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 48486471  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||  || ||||||    
T  48486472 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgaaatctcttttg 48486571  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  48486572 taacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctct 48486610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 30 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22803014 - 22802783
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  22803014 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaa 22802915  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  22802914 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 22802815  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggaggg 259  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22802814 taatgttactcatcatatagtggaacggaggg 22802783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 5198473 - 5198711
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||    
T  5198473 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcactttgggaa 5198572  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  5198573 acactattaggattgagtcttttggttacgggaagagattggggctttgtgtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 5198672  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  5198673 taacgatactcatcatatagtggattggagggctgctct 5198711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 49 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 26086237 - 26086019
Alignment:
Q  49 acaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtc 147  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26086237 acaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtc 26086138  T
Q  148 tcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgtaacgttactcatcatatag 247  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||    
T  26086137 tcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgttttctctttgtaacgatactcatcatatag 26086038  T
Q  248 tggaacggagggctgctct 266  Q
    |||| |||| |||||||||    
T  26086037 tggatcggaaggctgctct 26086019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22046965 - 22046728
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  22046965 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 22046866  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  22046865 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 22046766  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22046765 aacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 22046728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 19095935 - 19096174
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttg-caacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaa 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  19095935 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtga 19096034  T
Q  128 aacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-ctttt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||    
T  19096035 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattagagctttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctctttt 19096134  T
Q  227 gtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  19096135 gtaacgttacttatcatatagtgaaacggagagctgctct 19096174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 38928458 - 38928219
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttg-caacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaa 127  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  38928458 gaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 38928359  T
Q  128 aacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-ctttt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||  || |||||    
T  38928358 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaaaagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttt 38928259  T
Q  227 gtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  38928258 gtaacgttactcatcatatagtaaaacggagggctgctct 38928219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 14787711 - 14787473
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  14787711 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaa 14787612  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||  || ||||||    
T  14787611 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttg 14787512  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14787511 taacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 14787473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 24888849 - 24889087
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaggt-ttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  24888849 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggattgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggctttgagggttgattcaccttgggaa 24888948  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||    
T  24888949 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcatgtaacccattgatatctcttttg 24889048  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24889049 taacgttacttatcatatagtggaacggagggctgctct 24889087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 47868454 - 47868692
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  47868454 gaaagaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctccttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttggaaa 47868553  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  47868554 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 47868653  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47868654 taacgatactcatcatatagtggaacggatggctgctct 47868692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 30 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 5637745 - 5637524
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  5637745 gaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaa 5637646  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  5637645 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 5637546  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtg 249  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5637545 taacgttactcatcatatagtg 5637524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22044670 - 22044433
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||    
T  22044670 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattccccttgggaa 22044571  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||    
T  22044570 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctctttgt 22044471  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22044470 aacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 22044433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 24879042 - 24879281
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  24879042 gaaactagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacaccagggtttgagggttgattcaccttgggaa 24879141  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  24879142 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 24879241  T
Q  228 t-aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    | |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24879242 taaacgatacacatcatatagtgaaacggagggctgctct 24879281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 36921774 - 36921535
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttg-caacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaa 127  Q
    |||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  36921774 gaaacaagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatatagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 36921675  T
Q  128 aacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-ctttt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||| || |||||    
T  36921674 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctctttt 36921575  T
Q  227 gtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36921574 gtaacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctct 36921535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 31 - 266
Target Start/End: Original strand, 24880505 - 24880743
Alignment:
Q  31 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaa 129  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||    
T  24880505 aaactagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttggttcaccttgggaaa 24880604  T
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  24880605 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 24880704  T
Q  229 -aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
     |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24880705 aaacgttacgcatcatatagtgaaacggagggctgctct 24880743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 11435008 - 11435245
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  11435008 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 11435107  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||  | || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  11435108 acactattaggattgagtctcctggttaccggaagagtctaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 11435207  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11435208 aacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 11435245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 38409258 - 38409495
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||| |||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  38409258 gaaacaatggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 38409357  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  38409358 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 38409457  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38409458 aacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctct 38409495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 31 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 2485151 - 2484915
Alignment:
Q  31 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaa 129  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||    
T  2485151 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttctgggttgattcaccttgggaaa 2485052  T
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgta 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||  ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  2485051 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagagataggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 2484952  T
Q  230 acgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2484951 acgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 2484915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 13544012 - 13544250
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttg-caacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaa 127  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |    
T  13544012 gaaacaaggatctagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgaggattgattcaccttggga 13544110  T
Q  128 aacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-ctttt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  13544111 aacactattaggattgagtctcttggttacgtgaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 13544210  T
Q  227 gtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  13544211 gtaaagttactcatcatatagtgaaacggagtactgctct 13544250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 11006517 - 11006279
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  11006517 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 11006418  T
Q  129 acactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttg 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  11006417 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 11006318  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11006317 taatggtactcatcatatagtggatcggagggctgctct 11006279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12396125 - 12395887
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  12396125 gaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctagccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 12396026  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||    
T  12396025 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttg 12395926  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  12395925 taaggttactcatcatatagtgaaacggggggctgctct 12395887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 18847206 - 18847444
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  18847206 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaa 18847305  T
Q  129 acactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttg 227  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  18847306 acactattagcattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 18847405  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18847406 taacggtactcatcatatagtggattggagggctgctct 18847444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 33415767 - 33415530
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||    
T  33415767 gaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgg-aacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaa 33415669  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  33415668 acactattaagatcgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 33415569  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33415568 taaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 33415530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 40091695 - 40091457
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaggt-ttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||    
T  40091695 gaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtttagagtttgtctctttggaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttgggaa 40091596  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  40091595 acactattatgattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 40091496  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  40091495 taatgttactcatcatatagtgaaacagagggctgctct 40091457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18709443 - 18709206
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||    
T  18709443 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgagttgattcaccttgggaa 18709344  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgt 228  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  18709343 acactattagggttgagtctcttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 18709244  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||  |||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  18709243 aacgaaactcatcatatagtggattggaggactgctct 18709206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22132670 - 22132434
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  22132670 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctcttcg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 22132572  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  22132571 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 22132472  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  22132471 aacggtactcatcatatagtggattggagggctgctct 22132434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 51015299 - 51015536
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  51015299 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 51015398  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  51015399 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 51015498  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  51015499 aacaatactcatcatatagtggatcggaggtctgctct 51015536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 56030497 - 56030732
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactag-gtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  56030497 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 56030596  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttga-tttccttttg 227  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||| | ||||  || ||||||    
T  56030597 acactattaggattgagtttcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatttcttttg 56030696  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||| ||||||||   || ||||||||||||||||    
T  56030697 taacgttattcatcata---tgaaacggagggctgctct 56030732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 6764892 - 6765135
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctcttt-----gcaacaaacactagggtttgagggctgattcacctt 123  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  6764892 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctt 6764991  T
Q  124 ggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-c 222  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||  |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  6764992 gggaaacactgttaggattgagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctc 6765091  T
Q  223 ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  6765092 ttttgtaacgttactcatcatatagtggattggagggctgctct 6765135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 36378345 - 36378584
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  36378345 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaa 36378444  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| | ||||| || || |||    
T  36378445 acactattaggattaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctcttg 36378544  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36378545 tgaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctct 36378584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12401087 - 12400849
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  12401087 gaaacaaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctggccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 12400988  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||    
T  12400987 acactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctcttttg 12400888  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  12400887 taaggttactcatcatatagtgaaacggggggctgctct 12400849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 44600118 - 44599880
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  44600118 gaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 44600019  T
Q  129 acactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttg 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||    
T  44600018 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttg 44599919  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  44599918 taacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 44599880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 47274780 - 47275017
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  47274780 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaa 47274878  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  47274879 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 47274978  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  47274979 taaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 47275017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 50 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 3824830 - 3824627
Alignment:
Q  50 caacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtct 148  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3824830 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtct 3824731  T
Q  149 cttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatcatatag 247  Q
     ||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3824730 attggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatag 3824631  T
Q  248 tgga 251  Q
    ||||    
T  3824630 tgga 3824627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 11008846 - 11008610
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  11008846 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 11008747  T
Q  129 acactattaggatt-gagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttg 227  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  11008746 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc--tttg 11008649  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  11008648 taatggtactcatcatatagtggattggagggctgctct 11008610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 243
Target Start/End: Original strand, 16453362 - 16453577
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactag-gtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  16453362 gaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagagtttgtacaaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 16453461  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  16453462 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgggactttgggtagtattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 16453561  T
Q  228 taacgttactcatcat 243  Q
    ||| ||||||||||||    
T  16453562 taaggttactcatcat 16453577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 36919865 - 36919626
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttg-caacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaa 127  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  36919865 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttggataaagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 36919766  T
Q  128 aacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-ctttt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||| || |||||    
T  36919765 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctctttt 36919666  T
Q  227 gtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||    
T  36919665 gtaacgttattcatcatatagtggaatagatggctgctct 36919626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 37313346 - 37313107
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||    
T  37313346 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagagttgattcaccttgagaa 37313247  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || || || ||||||    
T  37313246 acactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctcttttg 37313147  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37313146 taaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctct 37313107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17662514 - 17662287
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaa 129  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||          ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  17662514 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagg----------gtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaa 17662425  T
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  17662424 cactattaggattgagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 17662325  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17662324 aacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 17662287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22780653 - 22780415
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||| ||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  22780653 gaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 22780554  T
Q  129 acactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttg 227  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  22780553 acactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 22780454  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  22780453 taacgatactcatcatatagtggattggagggctgctct 22780415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22783018 - 22782780
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||| ||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  22783018 gaaacaggggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 22782919  T
Q  129 acactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttg 227  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  22782918 acactgttaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 22782819  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  22782818 taacgatactcatcatatagtggattggagggctgctct 22782780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 41997545 - 41997784
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactag-gtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||| ||| |||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41997545 gaaacaagtgttcagaaaggaaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaa 41997644  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||    
T  41997645 acactattaggattgagtctcttagttacgggaaaagattgagattttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccctttaatatctcttttg 41997744  T
Q  228 taacgttactcatcat-atagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  41997745 taaagttactcatcatcatagtgaaacggagggccgctct 41997784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 619727 - 619489
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  619727 gaaacaagggtttataaagacaacaacaaaactagggtttgcatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaa 619628  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||| | |||||||| |||||| ||||| || ||||||    
T  619627 acactattaggattgactgtcttggttaagggaagagattgggtctttgggtagaattaggcgggaaaattattcttataacccattgatatctcttttg 619528  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  619527 taacgttactcatcatatagtgaaacggatgactgctct 619489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 9176754 - 9176516
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  9176754 gaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 9176655  T
Q  129 acactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttg 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  9176654 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 9176555  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  9176554 taacggtactcatcatatagtggattggagggctgctct 9176516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 31849879 - 31849641
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggttt-gagggctgattcaccttggaa 127  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||| |    
T  31849879 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaaggttttgtgggttgattcaccttggga 31849780  T
Q  128 aacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttg 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  || | |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  31849779 aacactattaggattgagtctcttgcttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 31849680  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31849679 taacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctct 31849641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 7941374 - 7941614
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaa--cactagggtttgagggctgattcaccttgga 126  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   | ||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||     
T  7941374 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttacgagcaaatgcactagggtttgtgggttgattcaccttggg 7941473  T
Q  127 aaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  7941474 aaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 7941573  T
Q  226 tgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  7941574 tgtaacgatactcatcatatagtggattggagggctgctct 7941614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22134895 - 22134659
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  22134895 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttca-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 22134797  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||  |||| | || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  22134796 acactattaggattgagtctcttggttatgggaaaaggctgggacattgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 22134697  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  22134696 aacggtactcatcatatagtggattggagggctgctct 22134659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 33 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16934420 - 16934185
Alignment:
Q  33 acaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaaca 131  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||    
T  16934420 acaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaaca 16934321  T
Q  132 ctattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgtaa 230  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  16934320 ctattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaa 16934221  T
Q  231 cgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||  |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16934220 cgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 16934185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 30 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 9174426 - 9174192
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| | | | ||||||||||||| ||    
T  9174426 gaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggttcgtgagttgattcaccttgggaa 9174327  T
Q  129 acactattaggattga-gtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttg 227  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||    
T  9174326 acactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttg 9174227  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctg 262  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  9174226 taacggtactcatcatatagtggattggagggctg 9174192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 33 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16932066 - 16931831
Alignment:
Q  33 acaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaaca 131  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||    
T  16932066 acaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtctgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaaca 16931967  T
Q  132 ctattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgtaa 230  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  16931966 ctattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaa 16931867  T
Q  231 cgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||  |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16931866 cgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 16931831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 19322750 - 19322985
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||    
T  19322750 gaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgattcaccttgggaa 19322845  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||    
T  19322846 acactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttg 19322945  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  19322946 taaagttactcatcattatagtggaacggagggatgctct 19322985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 47211020 - 47210794
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |            |||| ||    
T  47211020 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg------------ttgggaa 47210933  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  47210932 acactattaggattgagtctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 47210833  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47210832 taacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctct 47210794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 53 - 266
Target Start/End: Original strand, 36380425 - 36380641
Alignment:
Q  53 caacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctctt 151  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  36380425 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaaaaaccattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatctt 36380524  T
Q  152 ggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgat-ttccttttgtaacgttactcatca-tatagtg 249  Q
    ||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| |  ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  36380525 ggttaccggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaaagttactcatcattatagtg 36380624  T
Q  250 gaacggagggctgctct 266  Q
    |||| ||| ||||||||    
T  36380625 gaactgagtgctgctct 36380641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 30 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 3937489 - 3937314
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactag-gtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  3937489 gaaacaagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagagtttgtatagagtttgtttcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 3937390  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattct 204  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  3937389 acactattggaattgagtctcttggttacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtgggagacttattct 3937314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 31 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18537749 - 18537516
Alignment:
Q  31 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaa 129  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |  || ||||||||||| | |||    
T  18537749 aaacaagggtttagaaaca-aacaacaaa-ctagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaccactagggttgg--ggttgattcaccttaggaaa 18537655  T
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  18537654 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 18537555  T
Q  229 aacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18537554 aaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctct 18537516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 53405183 - 53405426
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||  ||    
T  53405183 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaa-actaggttttgagggttgattcaccttgagaa 53405281  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggaga------cttattcttgtaacccgttgatttc- 221  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||  || | ||||||||||||||| |  |||||      |||||||||||||||| ||||||||     
T  53405282 acactattaagattgagtctcttggttacggaaagaggctgagactttaggtagaattaagcgggagacttattcttattcttgtaacccattgatttct 53405381  T
Q  222 cttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  53405382 cttttgaaacgatactcatcatatagtggaacagagagctgctct 53405426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 18409627 - 18409413
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  |    
T  18409627 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcacttggcaacaaacactagggtttgagggttgattaaccttcggga 18409528  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||| | |||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  18409527 acactattaggattgagtctcttagttataggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttg 18409428  T
Q  228 taacgttactcatcat 243  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  18409427 taa-gttacccatcat 18409413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 64 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18535075 - 18534874
Alignment:
Q  64 ggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaag 163  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |  || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18535075 ggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaag 18534979  T
Q  164 agattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggct 261  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||   ||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  18534978 agattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaactactcataattatagtggaacggaggggt 18534879  T
Q  262 gctct 266  Q
    |||||    
T  18534878 gctct 18534874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 52942726 - 52942597
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  52942726 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaa 52942627  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacg 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52942626 acactattaggattgagtctcttggttacg 52942597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 32 - 189
Target Start/End: Original strand, 6132927 - 6133085
Alignment:
Q  32 aacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaggt-ttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaac 130  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||    
T  6132927 aacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttgtatagagtttgtctattggcaacaaacactagggtttgagggttgagtcaccctgggaaac 6133026  T
Q  131 actattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg 189  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  6133027 actattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 6133085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 64 - 266
Target Start/End: Original strand, 27499133 - 27499334
Alignment:
Q  64 ggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaag 163  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  27499133 ggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcctgagaaacactattaggattgagtctattggttacgataag 27499232  T
Q  164 agattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggct 261  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||  ||||||||||| ||||||||   | || || ||||||||| ||||||||||| |||| || |||| ||||||    
T  27499233 agattgaggctttgggtataattaggcgggagacttatttttgtaacc---taatatctcttttgtaaggttactcatcattatattgaaacgaagggct 27499329  T
Q  262 gctct 266  Q
    |||||    
T  27499330 gctct 27499334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 90 - 266
Target Start/End: Original strand, 16455355 - 16455533
Alignment:
Q  90 aacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg 189  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  16455355 aacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 16455454  T
Q  190 taggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
      ||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| | |||||||    
T  16455455 cgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttactcgtcattatagtgaaacggatgactgctct 16455533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 64 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 38890468 - 38890267
Alignment:
Q  64 ggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaag 163  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |  || |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||    
T  38890468 ggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacattagggttgg--ggttgattcatattgggaaacactattaggattgagtctcttgatcacgggaag 38890372  T
Q  164 agattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggct 261  Q
    |||||| | |||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  38890371 agattgagactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggct 38890272  T
Q  262 gctct 266  Q
    |||||    
T  38890271 gctct 38890267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 8756528 - 8756293
Alignment:
Q  31 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaa 129  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |  || ||||||||||||| |||    
T  8756528 aaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaattaggatttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaa 8756433  T
Q  130 cactattaggattgagtctc-ttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| | ||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||    
T  8756432 cactactaggattgagtctctttggtcacgggaagagattgagactttgagtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttg 8756333  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| |||||| |||| |||||||||||||| || ||||||    
T  8756332 taaagttactaatcattatagtggaacggatggttgctct 8756293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 118 - 243
Target Start/End: Original strand, 2891433 - 2891559
Alignment:
Q  118 caccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttga 217  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  2891433 caccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttgttcttgtaacccattga 2891532  T
Q  218 tttc-cttttgtaacgttactcatcat 243  Q
    | || ||||||||| ||||||||||||    
T  2891533 tatctcttttgtaaggttactcatcat 2891559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 113 - 266
Target Start/End: Original strand, 12102223 - 12102379
Alignment:
Q  113 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaacc 211  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | | ||| |||||||  |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  12102223 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtatcttggtcatgggaaaagattggaactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacc 12102322  T
Q  212 cgttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |  |||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12102323 cactgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctct 12102379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 127 - 266
Target Start/End: Original strand, 13547305 - 13547445
Alignment:
Q  127 aaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgat-ttccttt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||| | ||||| |  ||||    
T  13547305 aaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatcttt 13547404  T
Q  226 tgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  13547405 tgtaaagttactcatcatatagtgaaatggagggctgctct 13547445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 38270266 - 38270158
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38270266 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtcttttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaa 38270167  T
Q  129 acactatta 137  Q
    |||||||||    
T  38270166 acactatta 38270158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 257
Target Start/End: Original strand, 28453742 - 28453965
Alignment:
Q  31 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaac 130  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||||| || |  |||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |  |  ||||||||||||| ||||    
T  28453742 aaacaagggtttagaa-gccaacactaaaactagggtt-tgcagagtttg-ctcttggcaagaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaac 28453836  T
Q  131 actattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgta 229  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | || ||||||||||||| | ||||| |||||||||| |  ||||| || ||||||||    
T  28453837 actgttaggattgagtctcttggttacgggaagagatttggaccttgggtagaattaggttgaagactaattcttgtaaacttttgatatctcttttgta 28453936  T
Q  230 acgttactcatca-tatagtggaacggag 257  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  28453937 aagttactcatcattatagtggaacggag 28453965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 15032816 - 15032590
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||          |||||  |||||||  || | ||    
T  15032816 gaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctctttgcaacaaa----------tgaggt-tgattcatatttggaa 15032730  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| || |||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  15032729 acactattaggattgagtctcttggacacgagaaaagatttggacttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttg 15032630  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||||| || ||||||||    
T  15032629 taaagttactcatcattacagtggaacgaagagctgctct 15032590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 153 - 266
Target Start/End: Original strand, 4215483 - 4215597
Alignment:
Q  153 gttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatcatatagtgga 251  Q
    |||||| |||||| ||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4215483 gttacgggaagaggttgtgacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 4215582  T
Q  252 acggagggctgctct 266  Q
    ||||| |||||||||    
T  4215583 acggatggctgctct 4215597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 173 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 5635612 - 5635518
Alignment:
Q  173 ctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5635612 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 5635518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 173 - 266
Target Start/End: Original strand, 11437560 - 11437653
Alignment:
Q  173 ctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11437560 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 11437653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 64 - 266
Target Start/End: Original strand, 30136640 - 30136841
Alignment:
Q  64 ggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaag 163  Q
    ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |  || ||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||    
T  30136640 ggtttgtatagagttta-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactatgattgggtctcttggtcacgagaag 30136736  T
Q  164 agattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggct 261  Q
    | |||| | |||| ||||||||||||  | |||||||||||||| || | | ||| || ||||||||| |||| |||||| ||||||| ||| || ||||    
T  30136737 aaattgtgactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtgactcatcgatatctcttttgtaaagttaatcatcattatagtgaaacagatggct 30136836  T
Q  262 gctct 266  Q
    |||||    
T  30136837 gctct 30136841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 115 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 3982374 - 3982218
Alignment:
Q  115 attcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaga-ttggggctttaggtagaatt-aggtaggagacttattcttgtaacc 211  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||| ||||||||| || | | ||||| |||||||||||     
T  3982374 attcaccttggagaaacactattaggattgagtttcttggtcacgggaagagatttgggactttgggtagaattaagtttgaagactgattcttgtaaca 3982275  T
Q  212 cgttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    | ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3982274 ctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctct 3982218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 31983725 - 31983569
Alignment:
Q  113 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaacc 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| | | |||||||||| | |||| |||||||||||| | | ||||||||| ||||||||    
T  31983725 tgattcaccttgggaaacactattaagattaagtctcttggtcatgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgtaacc 31983626  T
Q  212 cgttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    | ||||| ||  ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31983625 ctttgatatcttttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctct 31983569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 40999226 - 40998991
Alignment:
Q  31 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaggt-ttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaa 129  Q
    |||||||||||||||  | |||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||  |||||||||||||| || |||   |||||||||| ||||||    
T  40999226 aaacaagggtttagac-gtcaacaagaaaactaggggttgtatagagtttg-ctcttgacaacaaacactaggatt-gagat-tgattcacctaggaaaa 40999131  T
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | | |||| |||||||||||| | |||||||   | ||||||||| ||||| || ||||||    
T  40999130 cattattaggattgagtctcttggtcacgggaagagatcgagactttgggtagaattaggtttggagactgtgttttgtaaccctttgatatctcttttg 40999031  T
Q  228 taacgttactcatc-atatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||    
T  40999030 taaagttactcatcgttatagtggaacagagggatgctct 40998991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 111
Target Start/End: Original strand, 5101050 - 5101132
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgaggg 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5101050 gaaacaaaggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcactttggaacaaacactagggtttgaggg 5101132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16186019 - 16185877
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaacccgttgatttcctt 224  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||| |||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| ||||| |   |    
T  16186019 aaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattggaactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgatatatct 16185920  T
Q  225 ttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  16185919 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggctgctct 16185877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 266
Target Start/End: Original strand, 9863765 - 9864001
Alignment:
Q  31 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaa-ctaggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaa 129  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||| || | |||||||||| |||| ||||||||||||| |||| |  |  ||||||||||||| |||    
T  9863765 aaacaagggtttagaa-gccaaaaacaaaaactagggtt-tgtagagtttgt-tcttggcaacaaacactaaggttgg--gtttgattcaccttgggaaa 9863859  T
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaatt-aggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgt 228  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| | |||| ||||||||| || | | ||||| ||||||||||||  ||||| ||  |||||    
T  9863860 ccctattaggattgagtcttttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaagtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctctttgt 9863959  T
Q  229 aacgttactcatca----tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    || |||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||    
T  9863960 aaagttactcatcatcattatagtggaacggagagctgctct 9864001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 113 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 47151091 - 47150948
Alignment:
Q  113 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaacc 211  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |  ||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  47151091 tgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtctcttggtcacatgaagagattgagaatttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaacc 47150992  T
Q  212 cgttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtggaac 253  Q
    | ||||| || ||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  47150991 ctttgatatctcttttctaaagttgctcatcattatagtggaac 47150948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 24446859 - 24446756
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaa 129  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| |     ||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  24446859 gaaacaagggtttagaaaggcaacaactag----ggtttgtatagagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 24446764  T
Q  130 cactatta 137  Q
    ||||||||    
T  24446763 cactatta 24446756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 266
Target Start/End: Original strand, 10112927 - 10113161
Alignment:
Q  31 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaac 130  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||||| || | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||   ||||||||||| | ||||    
T  10112927 aaacaagggtttagaa-gccaacacaaaaactagggtt-tgtagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gagat-tgattcaccttaggaaac 10113021  T
Q  131 actattaggattgagtctcttggttac-gagaagagattggggctttaggtagaattag-gtaggagacttattcttgtaacc-cgttgatttccttttg 227  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||| || |||| |||||||||||  | | ||||| ||||||||||||   ||||| ||  ||||    
T  10113022 actattatgattgagtctcttggtcacggggaagagattaggactttgggtagaattagatttgaagactaattcttgtaacctttttgatatctctttg 10113121  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| |||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  10113122 taatgttactaatcattatagtggaatggagagctgctct 10113161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 266
Target Start/End: Original strand, 25357773 - 25357933
Alignment:
Q  113 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctt----taggtagaatt-aggtaggagacttattcttgt 207  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||    ||  ||||||| || | | ||||||||||||||    
T  25357773 tgattcaccttgggaaatactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggactttggatatatagaattaagtttgaagacttattcttgt 25357872  T
Q  208 aacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||    
T  25357873 aaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacggatagctgctct 25357933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 93
Target Start/End: Original strand, 2891370 - 2891434
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacta-ggtttgtatagagtttgtctctttgcaaca 93  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2891370 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaaca 2891434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 178 - 264
Target Start/End: Original strand, 5101131 - 5101218
Alignment:
Q  178 ggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgat-ttccttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgct 264  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  5101131 ggtagacttaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatgtcttttgtaaatttactcatcatatagtaaaacggagggctgct 5101218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 169
Target Start/End: Original strand, 10114435 - 10114520
Alignment:
Q  82 ctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattg 169  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |  |  |||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  10114435 ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcactttaggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgataagagattg 10114520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 24446754 - 24446683
Alignment:
Q  196 acttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24446754 acttatttttgtaagccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 24446683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 239
Target Start/End: Original strand, 54906723 - 54906852
Alignment:
Q  113 tgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagatt-ggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaa 209  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||   | ||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||    
T  54906723 tgattcaccatggagaaacactattagaattgagtctcttggtcactggaagagattcaagactttaggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaa 54906822  T
Q  210 cccgttgatttccttttgtaacgttactca 239  Q
    | | ||||| ||  ||||||| ||||||||    
T  54906823 ctctttgatatctctttgtaaagttactca 54906852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 5336965 - 5336902
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||||||||||    
T  5336965 aaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac-ttgggtagaattaggt 5336902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Original strand, 25699752 - 25699811
Alignment:
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  25699752 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggacttt-ggtagaattaggt 25699811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 4556238 - 4556158
Alignment:
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| |||| |||||||||||| | | ||||| |||||||||||    
T  4556238 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 4556158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 210
Target Start/End: Original strand, 4570093 - 4570177
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaac 210  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||| | || |||||||||||| | | ||||| |||||||||||    
T  4570093 aaaacactattaggatcgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 4570177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 7050440 - 7050356
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||| | | ||||| |||||||||||    
T  7050440 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 7050356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 210
Target Start/End: Original strand, 16489352 - 16489432
Alignment:
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| | || |||||||||||| | | ||||| |||||||||||    
T  16489352 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 16489432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Original strand, 11853548 - 11853611
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||||    
T  11853548 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggt 11853611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 38208911 - 38208825
Alignment:
Q  81 tctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagatt 168  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||   ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  38208911 tctcttggcaacaaacactagggtt-gagat-tgattcatcttggagaaacactattaagattgagtcttttggtcacaagaagagatt 38208825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 25614103 - 25614060
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattg 169  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25614103 aaaacactgttagaattgagtctcttggtcacgagaagagattg 25614060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 223 - 266
Target Start/End: Original strand, 47563009 - 47563052
Alignment:
Q  223 ttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  47563009 ttttgtaaggttactcatcttatagtgaaacggagggctgctct 47563052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 165
Target Start/End: Original strand, 55822264 - 55822303
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagag 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  55822264 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagag 55822303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 210
Target Start/End: Original strand, 4558314 - 4558394
Alignment:
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||| | | ||||| |||||||||||    
T  4558314 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 4558394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 210
Target Start/End: Original strand, 15316961 - 15317041
Alignment:
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||| | | ||||| |||||||||||    
T  15316961 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac 15317041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 210
Target Start/End: Original strand, 31300427 - 31300507
Alignment:
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||| | | ||||| |||||||||||    
T  31300427 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 31300507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 178 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 52942590 - 52942537
Alignment:
Q  178 ggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaa 230  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  52942590 ggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 52942537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Original strand, 8529270 - 8529329
Alignment:
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||||    
T  8529270 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggt 8529329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Original strand, 18586969 - 18587028
Alignment:
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||||    
T  18586969 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggt 18587028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 69571 - 69334
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  69571 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 69472  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  69471 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 69372  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  69371 aacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctct 69334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 73303 - 73203
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  73303 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaa 73204  T
Q  129 a 129  Q
    |    
T  73203 a 73203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 73203 - 73160
Alignment:
Q  93 aaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactatt 136  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  73203 aaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 73160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 183920 - 183683
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactag-gtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  183920 gaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 183821  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  183820 acactattaggattgagtctcttggttacg-gaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 183722  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  183721 taatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 183683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 52019 - 52257
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  52019 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaa 52118  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| | ||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||  || ||||||    
T  52119 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttg 52218  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52219 taacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 52257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 83)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 42923789 - 42923551
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42923789 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaa 42923690  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||||| || ||||||    
T  42923689 acactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttg 42923590  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  42923589 taaagttactcgtcatatagtgaaacggagggctgctct 42923551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 19007615 - 19007853
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacta-ggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  19007615 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaa 19007714  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  19007715 acactattagaattgagtttcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 19007814  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  19007815 taacgttactcatcatatagtgaaacgaagggctgctct 19007853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 23452517 - 23452279
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||    
T  23452517 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaa 23452418  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  23452417 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 23452318  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  23452317 taacgatactcatcatatagtggattggagggctgctct 23452279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 45280265 - 45280026
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatga-caacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaa 127  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| |    
T  45280265 gaaacaagggtttagaaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttagagggttgattcaccttggga 45280166  T
Q  128 aacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-ctttt 226  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  45280165 tacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttt 45280066  T
Q  227 gtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45280065 gtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 45280026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 35218243 - 35218005
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  35218243 gaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 35218144  T
Q  129 acactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttg 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  35218143 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccgttgatttctctttg 35218044  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  35218043 taacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 35218005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 27104774 - 27105010
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  27104774 gaaacaagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 27104872  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  27104873 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 27104972  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27104973 aacattactcatcatatagtggatcggagggctgctct 27105010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 42064490 - 42064727
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  42064490 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 42064589  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  42064590 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 42064689  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42064690 aacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctct 42064727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 30 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 19504625 - 19504390
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||  || ||||||||||||| ||    
T  19504625 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacacaagggtttgttggttgattcaccttgggaa 19504526  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  19504525 acactattaggattgagtctcttggttacg-gaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 19504427  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgct 264  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19504426 taacgatactcatcatatagtggatcggagggctgct 19504390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 42452758 - 42452994
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactag-gtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  42452758 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtataaagtttgtctctgt--aacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaa 42452855  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  42452856 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 42452955  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42452956 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 42452994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19502291 - 19502053
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  19502291 gaaacaagagtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 19502192  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  19502191 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 19502092  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  19502091 taacgatactcatcatatagtggatcgaagggctgctct 19502053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 21520973 - 21520735
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaggt-ttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  21520973 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggcttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaa 21520874  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | || |||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  21520873 acactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggctaggactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttg 21520774  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  21520773 taacgttactcatcatatagtgaaacggatggctgctct 21520735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 6259095 - 6258858
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||| |||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  6259095 gaaacaagagtttagaaaggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 6258996  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  6258995 acactattaggattgagtctcttggttacggga--agattggggctttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 6258898  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  6258897 taaagttactcattattatagtgaaacggagggctgctct 6258858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22287616 - 22287378
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  22287616 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtctgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaa 22287517  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    ||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||   |||  ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  22287516 acggtattaggattgagtctcttagttacgggaagagattgacacttcgggtagaattgggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttg 22287417  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  22287416 taacgttactcatcatatagtgaaatggagggctgctct 22287378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 28196612 - 28196850
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  28196612 gaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttaagggttgattcaccttgggaa 28196711  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||  | ||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  28196712 acactattaggattgagtctcttggttatgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagatttattcttgtaacccattgatatctcttttg 28196811  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  28196812 taacattactcatcatatagtgaaacgaatggctgctct 28196850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 35215866 - 35215628
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  35215866 gaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 35215767  T
Q  129 acactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttg 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||    
T  35215766 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagtttgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttg 35215667  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  35215666 taacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 35215628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 45239256 - 45239019
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  45239256 gaaacaatgatttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagactttctct-ttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 45239158  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  45239157 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattggggtttttggtagaattaagcgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 45239058  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45239057 taaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 45239019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 13910324 - 13910087
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||    
T  13910324 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcaccttgggaa 13910225  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgt 228  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||  |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  13910224 acaatattaggattgagtctcttggttacgggaagagactggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 13910125  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||  |||||||||||||||||| | || |||||||||    
T  13910124 aacaatactcatcatatagtggatcagatggctgctct 13910087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 15539755 - 15539566
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  15539755 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 15539656  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgat 218  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  15539655 acactattaggattgattctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 15539566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 6264425 - 6264190
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaa 129  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  6264425 gaaacaaaggtttagaaaggcaacaacaaag---ggtttgtatagagtttgtctctttggtacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 6264329  T
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgt 228  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  6264328 cactattaggattaagtctcttggttacgataaaagattggggctttggatagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 6264229  T
Q  229 aacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  6264228 aaagttactcatcattatagtgaaacggagggctgctct 6264190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 31 - 266
Target Start/End: Original strand, 17848419 - 17848653
Alignment:
Q  31 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttg-caacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  17848419 aaacgagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcactttgggaa 17848518  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||   |||  |||||||||||||||||| || ||||| || ||||||    
T  17848519 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtaga---aggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatatctcttttg 17848614  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||    
T  17848615 taacgttactcatcatatagtgaaacggatgactgctct 17848653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 40032338 - 40032095
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  40032338 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 40032239  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-----ct 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || || |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||| ||     ||    
T  40032238 acactattaggattgagtctcttggttacaggaagaggttaggactttgggtagaattaggcgtgagacttattcttgtaacccattgatatctttctct 40032139  T
Q  224 tttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||    
T  40032138 tttgcaaagttactcatcattatagtgaaacggagggccgctct 40032095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 30 - 243
Target Start/End: Original strand, 3022138 - 3022352
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactag-gtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||    
T  3022138 gaaacaagggtttataaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttaggaa 3022237  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || || ||  ||| |    
T  3022238 acactattaggattgagtctcttggttaccggaagagattgaggttttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctctttat 3022337  T
Q  229 aacgttactcatcat 243  Q
    || ||||||||||||    
T  3022338 aaagttactcatcat 3022352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 17849092 - 17849330
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactag-gtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  17849092 gaaacaagggtttagaaagataacaacaaaactagagttcgtatagagtttgcctctttggaagaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaa 17849191  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||    
T  17849192 acactattaagattgagtctcttggttacggtaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttg 17849291  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  17849292 taaggttactcatcattatagtgaaacgg-gggctgctct 17849330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 34979859 - 34979620
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||| |||||||| |  ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  34979859 gaaacaagcgtttagaaaggtaacaaaaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 34979760  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| || || || || ||||||    
T  34979759 acactattaagattgagtctcttggttacgggaagagattcggactttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccatttatatctcttttg 34979660  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  34979659 taaggttcctcatcattatagtggaacgaagggctactct 34979620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 31 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 44289347 - 44289133
Alignment:
Q  31 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactag-gtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaa 129  Q
    |||||| ||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  44289347 aaacaaaggtttaggaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtctgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaa 44289248  T
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgt 228  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||  |||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  44289247 cactattaggattgagtcacttggttacgggaagagattgggacttagggtagaattaagtggaaaacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgt 44289148  T
Q  229 aacgttactcatcat 243  Q
    ||  |||||||||||    
T  44289147 aagattactcatcat 44289133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 32 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 11739838 - 11739601
Alignment:
Q  32 aacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaac 130  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  11739838 aacaagggtttagaaagacaacaacaaaattagggtttgtatggagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaac 11739739  T
Q  131 actattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgta 229  Q
    |||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||| ||||||||| || || ||||| || |||||| |    
T  11739738 actattaggattgattctcttggttataggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagaattattcttggaatccattgatatctcttttgaa 11739639  T
Q  230 acgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  11739638 aggttactcatcattatagtggaacggatgactgctct 11739601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 63 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 28459436 - 28459231
Alignment:
Q  63 aggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaa 162  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28459436 aggtttgtatagagcttgtctcttggcaacaaaaactaggatttgagggtggattcaccttggcaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaa 28459337  T
Q  163 gagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggc 260  Q
    ||| ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  28459336 gagtttggggcttcaggtataattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttttaaagttactcatcattatagtgaaacggagggc 28459237  T
Q  261 tgctct 266  Q
    | ||||    
T  28459236 ttctct 28459231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 43623848 - 43623622
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||            |||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  43623848 gaaacaatggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc------------actaggttttgagggttgattcaccttgggaa 43623761  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  43623760 acaatattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 43623661  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43623660 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 43623622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 24162492 - 24162265
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  24162492 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 24162393  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgt 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |          |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  24162392 acactattaagattgagtctcttggttgc----------tgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 24162303  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    || | ||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  24162302 aatgctactcatcatatagtggattggatggctgctct 24162265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 14837248 - 14837481
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  14837248 gaaacaagggttaaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtacatagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 14837347  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||      |||||||||| | ||||| |||||||||||  || |||||||||||||||| | ||||| || ||||||    
T  14837348 acactattaggattgagtctcttgg------gaagagattgagactttaagtagaattaggcgggggacttattcttgtaactcattgatatctcttttg 14837441  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| |||||| || ||||||    
T  14837442 taaggttactcatcattatagtgaaacggatggatgctct 14837481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 31733045 - 31732818
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactag-gtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||    
T  31733045 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactaaggtttgagggttgattcacgttgggaa 31732946  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||            ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  31732945 acactgttaggattgagtctcttggt------------ttgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 31732858  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||    
T  31732857 taaagttactcatcattattgtgaaacggaggactgctct 31732818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 11578384 - 11578150
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||  ||||||| |  || |||||||||| || ||    
T  11578384 gaaacaagggtttagaa-gtcaacaaaaaaactagggtttgtatagaatttttctcttggcaacaaac--tagggttgg--ggttgattcacctcgggaa 11578290  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||    
T  11578289 acactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttg 11578190  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  11578189 taaggttactcatcattatagtcgaacggagggctgctct 11578150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 64 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18800555 - 18800355
Alignment:
Q  64 ggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaag 163  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||    
T  18800555 ggtttgtatagaggttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacaggaag 18800460  T
Q  164 agattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggct 261  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  18800459 agattggggctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcgtcattatagtgaaacggagggct 18800360  T
Q  262 gctct 266  Q
     ||||    
T  18800359 actct 18800355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 104 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 5375550 - 5375388
Alignment:
Q  104 tttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattc 203  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  5375550 tttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg-cggagacttattc 5375452  T
Q  204 ttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5375451 ttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtggaacggagggctgctct 5375388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 64 - 266
Target Start/End: Original strand, 22874144 - 22874344
Alignment:
Q  64 ggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaag 163  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||   ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||    
T  22874144 ggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gggttgattcaccttggaaaacagtattaggattgagtctcttagtcacgggaag 22874239  T
Q  164 agattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggct 261  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| |||    
T  22874240 agattgaggctttcggtagaattaggtgggagacttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgaaactgagagct 22874339  T
Q  262 gctct 266  Q
    |||||    
T  22874340 gctct 22874344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 127 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 36559046 - 36558906
Alignment:
Q  127 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttt 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  36559046 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 36558947  T
Q  226 tgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  36558946 tgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctct 36558906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 127 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 36561323 - 36561183
Alignment:
Q  127 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttt 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  36561323 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 36561224  T
Q  226 tgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  36561223 tgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctct 36561183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 31 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 20146884 - 20146650
Alignment:
Q  31 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaa 129  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||| |  |  ||||||||||||| |||    
T  20146884 aaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttgcc-cttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaa 20146789  T
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgt 228  Q
    || || ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |  ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||    
T  20146788 caatagtaggattgagtctcttggtcacgggaaaagattgagattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactctttgatatctcttttgt 20146689  T
Q  229 aacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20146688 aaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctct 20146650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 32 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 17897519 - 17897287
Alignment:
Q  32 aacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaac 130  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||   ||||||||||||| ||||    
T  17897519 aacaagggtttagaa-gtcaacaataaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttcgcaacaaacactagg--ttgagat-tgattcaccttgggaaac 17897425  T
Q  131 actattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgta 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |  |||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||    
T  17897424 actattaggattgagtctcttggtcatgagaaaagattgagattttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccctttgatatctattttgta 17897325  T
Q  230 acgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    | ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  17897324 aagttactcatcattatagtagaacggatggctgctct 17897287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 154
Target Start/End: Original strand, 38020177 - 38020302
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  38020177 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccatggtaa 38020276  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  38020277 acactattaggattgagtctcttggt 38020302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 113 - 266
Target Start/End: Original strand, 40699432 - 40699588
Alignment:
Q  113 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaacc 211  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||||||||| |||||| |    
T  40699432 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgtaatc 40699531  T
Q  212 cgttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    | ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  40699532 ctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggatgctct 40699588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 22163227 - 22163106
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22163227 gaaacaaggatttagaaaggcaacaacaacactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaa 22163128  T
Q  129 acactattaggattgagtctctt 151  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  22163127 acactattagg-ttgagtctctt 22163106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 22407689 - 22407593
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttgg 125  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22407689 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 22407593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 127 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 45332363 - 45332223
Alignment:
Q  127 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttt 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| ||||||||  ||    
T  45332363 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatttctctt 45332264  T
Q  226 tgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  45332263 tgtaaaggtactcatcatatagtgaattggagggctgctct 45332223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 63 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27136369 - 27136195
Alignment:
Q  63 aggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaa 162  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |  || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||    
T  27136369 aggtttatatagagcttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcatcttggaaaacactattaggattgaatctcttggtcacggaaa 27136273  T
Q  163 gagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactc 238  Q
    || |||||| ||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||| |||||||    
T  27136272 gaaattgggactttgagtagaattaggtttggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactc 27136195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 167 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22407596 - 22407496
Alignment:
Q  167 ttggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctc 265  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22407596 ttgggacttttggtagaattaggggggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctc 22407497  T
Q  266 t 266  Q
    |    
T  22407496 t 22407496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 126 - 257
Target Start/End: Original strand, 20589762 - 20589896
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaacccgttgatttc-ct 223  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||| || ||    
T  20589762 aaaacactgttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttttaacccattgatatctct 20589861  T
Q  224 tttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggag 257  Q
    ||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||    
T  20589862 tttgtgaagttactcatcattatagtgtaacggag 20589896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 243
Target Start/End: Original strand, 43139356 - 43139564
Alignment:
Q  31 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaac 130  Q
    |||||||||||||||| | |||||  |||||| || || | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||   ||||||| ||||| ||||    
T  43139356 aaacaagggtttagaa-gccaacacaaaaacttgggtt-tgtagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gagat-tgattcatcttgggaaac 43139450  T
Q  131 actattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt-aggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgta 229  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||    ||||| ||| ||||||||  ||||||||  ||||||    
T  43139451 attattaggattgagtctcttggtcacgggaagatattgagactttaggtagaattaggtctaaagactaattattgtaaccttttgatttctctttgta 43139550  T
Q  230 acgttactcatcat 243  Q
    | ||||||||||||    
T  43139551 aagttactcatcat 43139564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 5377709 - 5377629
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacta-ggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgag 109  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5377709 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgag 5377629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 50 - 256
Target Start/End: Original strand, 35107294 - 35107498
Alignment:
Q  50 caacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtct 148  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    || ||| ||  ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  35107294 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaaca----gggttg-ggattgattcaccttgagaaacattattaggattgagtct 35107387  T
Q  149 cttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattag--gtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-ta 244  Q
    |||||| ||| |||||||||| | |||| |||||||||||   | | |||||||||||||||| || ||| | || ||||||||| ||||||||||| ||    
T  35107388 cttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattagattttgaagacttattcttgtaa-cctttgttatctcttttgtaatgttactcatcatta 35107486  T
Q  245 tagtggaacgga 256  Q
    ||||||||||||    
T  35107487 tagtggaacgga 35107498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 97 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 38414291 - 38414201
Alignment:
Q  97 actagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg 189  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  38414291 actagggtttgaggt-tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcacg-gaaaagattgggacttttggtagaattagg 38414201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 180 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 7463077 - 7462990
Alignment:
Q  180 tagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  7463077 tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttacccattatatagtggatcggagggctgctct 7462990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 113 - 266
Target Start/End: Original strand, 17921755 - 17921910
Alignment:
Q  113 tgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagatt-ggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaa 209  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||| |||||||||||| |   | ||| ||||||| ||    
T  17921755 tgattcaccttgaagaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattcgggactttgggtagaattaggttttaaaactgattcttgcaa 17921854  T
Q  210 cccgttgatttccttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||  ||||  ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17921855 ccctttgatt--ctttcataaagttagtcatcattatagtggaacggagggctgctct 17921910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 27583535 - 27583479
Alignment:
Q  113 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattg 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  27583535 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattg 27583479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 192 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22707870 - 22707795
Alignment:
Q  192 ggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  22707870 ggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacagagggctgctct 22707795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 37963135 - 37963007
Alignment:
Q  113 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaaccc 212  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||||    ||||||||||||||||| ||    
T  37963135 tgattccccttagaaaacattattgagattgagtctcttggtcacctgaagagattgaggctttgggtagaattagacgagagacttattcttgtaatcc 37963036  T
Q  213 gttgatttccttttgtaacgttactcatcat 243  Q
     |||||||  |||||||| |||| |||||||    
T  37963035 attgattt--ttttgtaaagttattcatcat 37963007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 257
Target Start/End: Original strand, 15693960 - 15694109
Alignment:
Q  113 tgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaga-ttggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaa 209  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||| ||||| |||| |||||||||||| | | ||||| ||||||||||    
T  15693960 tgattcaccgtggagaaacactattaggataaagtctcttggtcacaggaagagatttgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 15694059  T
Q  210 cccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggag 257  Q
    ||  ||||| || ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  15694060 ccttttgatatctcttttgtaaagttactcatcattttagtggaacggag 15694109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 126 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 28459012 - 28458925
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaaccc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||| |||| |||||||||||| | | ||||| |||||||||||||    
T  28459012 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagatattgggactttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaaccc 28458925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 30720810 - 30720703
Alignment:
Q  113 tgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagatt-ggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaa 209  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| | | |||| |||||||||||| | | ||||| ||||||||||    
T  30720810 tgattcatcttggagaaacactattaggattgagtctctttggcacgagaagagattcgtgactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 30720711  T
Q  210 cccgttga 217  Q
    ||| ||||    
T  30720710 ccctttga 30720703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 187
Target Start/End: Original strand, 35028595 - 35028707
Alignment:
Q  72 tagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggg 171  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||   |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||      
T  35028595 tagagtttg-ctcttggtaacaaacactagggtt-gagat-tgattcgcattggaaaacactattatgattgagtctcttgatcacgagaagagattgac 35028691  T
Q  172 gctttaggtagaatta 187  Q
     |||| ||||||||||    
T  35028692 actttgggtagaatta 35028707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 266
Target Start/End: Original strand, 23870956 - 23871029
Alignment:
Q  194 agacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||| || || || |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  23870956 agacttattcttgtaacccattaatatctctttagtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggttgctct 23871029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Original strand, 2736204 - 2736267
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| |||| |||||||||||||    
T  2736204 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattaggt 2736267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Original strand, 2740940 - 2741003
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | || |||||||||||||    
T  2740940 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattaggt 2741003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 222 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22163108 - 22163064
Alignment:
Q  222 cttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  22163108 cttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagagctgctct 22163064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 168
Target Start/End: Original strand, 26345663 - 26345718
Alignment:
Q  113 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagatt 168  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  26345663 tgattcaccttagcaaacactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagatt 26345718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 165
Target Start/End: Original strand, 39680044 - 39680083
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagag 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39680044 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgagaagag 39680083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Original strand, 33603993 - 33604135
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaacccgttgatttcctt 224  Q
    ||||||||||||  ||||||||| ||||| | | |||| ||||| | ||||||| ||||||||| | | ||||| |||||| |||||  ||||| |   |    
T  33603993 aaaacactattataattgagtcttttggtcatgggaagtgattgagactttaggaagaattaggtttgaagactaattcttctaaccttttgatatatct 33604092  T
Q  225 ttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  33604093 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctct 33604135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20054948 - 20054864
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||| | | ||||| |||||||||||    
T  20054948 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 20054864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Original strand, 17462435 - 17462498
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||||    
T  17462435 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggt 17462498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 22712699 - 22712636
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||||    
T  22712699 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggt 22712636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 22717408 - 22717345
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||||    
T  22717408 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggt 22717345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Original strand, 39686982 - 39687045
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||||    
T  39686982 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggt 39687045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Original strand, 45567408 - 45567471
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||||    
T  45567408 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggt 45567471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 34575307 - 34575229
Alignment:
Q  113 tgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagatt-ggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  || ||| ||||| ||| |||| |||||||||||||    
T  34575307 tgattcaccttggagaaacactattaggatggagtctcttggtctcgggaa-agattcgggactttgggtagaattaggt 34575229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 127 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 10942695 - 10942634
Alignment:
Q  127 aaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagatt-ggggctttaggtagaatta 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||| ||| |||| ||||||||||    
T  10942695 aaacactattaggattgagtctctttgtcacgggaagaaattcgggactttgggtagaatta 10942634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 127 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 10948564 - 10948503
Alignment:
Q  127 aaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagatt-ggggctttaggtagaatta 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||| ||| |||| ||||||||||    
T  10948564 aaacactattaggattgagtctctttgtcacgggaagaaattcgggactttgggtagaatta 10948503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 210
Target Start/End: Original strand, 17932637 - 17932717
Alignment:
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||| | | ||||| |||||||||||    
T  17932637 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 17932717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 210
Target Start/End: Original strand, 17943540 - 17943620
Alignment:
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||| | | ||||| |||||||||||    
T  17943540 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaac 17943620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 27517818 - 27517738
Alignment:
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||| | | ||||| |||||||||||    
T  27517818 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 27517738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 113 - 168
Target Start/End: Original strand, 7502976 - 7503032
Alignment:
Q  113 tgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagatt 168  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||    
T  7502976 tgatccaccttggagaaacactattaggattgagtatcttggtcaagggaagagatt 7503032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 12781400 - 12781341
Alignment:
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||||    
T  12781400 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggt 12781341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 20050205 - 20050177
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggt 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20050205 aaaacactattaggattgagtctcttggt 20050177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Original strand, 30478997 - 30479056
Alignment:
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||| | || |||||||||||||    
T  30478997 cactattaggattgagtctcttgatcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattaggt 30479056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 159; Significance: 9e-85; HSPs: 3)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 14662 - 14424
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  14662 gaaacaatggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 14563  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  || | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  14562 acactattaggatttagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 14463  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14462 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 14424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 30 - 264
Target Start/End: Original strand, 15027 - 15263
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||| | ||||||| | |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||    
T  15027 gaaacaatgatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttataaagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaa 15126  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  15127 acactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattcagactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 15226  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgct 264  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15227 taaagttactcatcatatagtggaacggaaggctgct 15263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 154
Target Start/End: Original strand, 31140 - 31168
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggt 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31140 aaaacactattaggattgagtctcttggt 31168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 159; Significance: 9e-85; HSPs: 79)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 30967235 - 30967473
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacta-ggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  30967235 gaaacaagggtttagaaagacaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 30967334  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||   |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  30967335 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgaaactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 30967434  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  30967435 taacgttactcatcatatagtggatcggagagctgctct 30967473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 1230529 - 1230291
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  1230529 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 1230430  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||   ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  1230429 acactattaggattgactctcttggttattggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 1230330  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1230329 taacgttactcatcatatagtggaacggatggctgctct 1230291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 11983309 - 11983071
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||| || |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  11983309 gaaacaaaggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaa 11983210  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  11983209 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 11983110  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11983109 taacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 11983071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 28241601 - 28241363
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  28241601 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 28241502  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  28241501 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 28241402  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  28241401 taacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctct 28241363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 34 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15530398 - 15530166
Alignment:
Q  34 caagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacac 132  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  15530398 caagggcttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacac 15530299  T
Q  133 tattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaac 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||    
T  15530298 tattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggttgaattaggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatatctcttttgtaac 15530200  T
Q  232 gttactcatcatatagtggaacggagggctgctc 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15530199 gttactcatcatatagtggaacggagggctgctc 15530166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 4816511 - 4816273
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  4816511 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaa 4816412  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  4816411 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 4816312  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  4816311 taacggtactcatcatatagtggattggagggctgctct 4816273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 20915636 - 20915398
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  20915636 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 20915537  T
Q  129 acactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttg 227  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  20915536 acactattaggattggagtctcttggttacgagaagagattgggacttcgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 20915437  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  20915436 taacggtactcatcatatagtggattggagggctgctct 20915398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 3390413 - 3390652
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  3390413 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttttctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 3390512  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  3390513 acactattaggattgagtctcttggttacagaaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 3390612  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  3390613 taaagttactcatcattacagtgaaacggagggctgctct 3390652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 3632218 - 3631979
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||    
T  3632218 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttaagggttgattcatcttgggaa 3632119  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  3632118 acactattaggattgagtctctttgttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 3632019  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  3632018 taaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctct 3631979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 14459045 - 14458809
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  14459045 gaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggctgattc--cttgggaa 14458948  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  14458947 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 14458848  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  14458847 taacgttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 14458809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 38 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 3630136 - 3629906
Alignment:
Q  38 ggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactatt 136  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  3630136 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 3630037  T
Q  137 aggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgtta 235  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||    
T  3630036 aggattgaatctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtta 3629937  T
Q  236 ctcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    || || |||||||| ||| ||||||||||||    
T  3629936 ctaataatatagtgaaactgagggctgctct 3629906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 31 - 266
Target Start/End: Original strand, 9019961 - 9020198
Alignment:
Q  31 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaa 129  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||    
T  9019961 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaatcactaggttttgagggttgattcaccttgggaaa 9020060  T
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  9020061 cactattaggattgagtctcttggttataggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 9020160  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  9020161 aaagttactcatcatatagtgaaacggggggctgctct 9020198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 13057228 - 13057467
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  13057228 gaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 13057327  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  13057328 acactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 13057427  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  13057428 taaggttactcatcattatagtgaaacggagggctactct 13057467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 26065020 - 26065254
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactag-gtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  26065020 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaa---acactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 26065116  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||    
T  26065117 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacttctctttgt 26065216  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  26065217 aacgttactcgttatatagtggatcggagggctgctct 26065254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 26084989 - 26085223
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactag-gtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  26084989 gaaacaagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaa---acactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 26085085  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||    
T  26085086 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacttctctttgt 26085185  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||    
T  26085186 aacgttactcgttatatagtggatcggagggctgctct 26085223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 2629165 - 2628928
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||    
T  2629165 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactaggttttaagggttgattcaccttgggaa 2629066  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggag-acttattcttgtaacccgttgatttccttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  |||| | ||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  2629065 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cggagaatttattcttgtaacccattgatttctctttg 2628967  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2628966 taacggtactcatcatatagtggatcggagggctgctct 2628928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 15532961 - 15532723
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15532961 gaaacaagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtttctttggaacaaacaatagggtttgagggttgattcaccttggaaa 15532862  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  15532861 acactattaggattgagtctcttggtcatgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 15532762  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15532761 taaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 15532723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 31 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 14507454 - 14507218
Alignment:
Q  31 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaa 129  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  14507454 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 14507355  T
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgta 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  14507354 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctctttgta 14507255  T
Q  230 acgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  14507254 acgatacttatcatatagtgaatcggagggctgctct 14507218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 3234011 - 3233772
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacta-ggtttgtatagagtttgtctctttgc-aacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaa 127  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  3234011 gaaacaaggatttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgtatatagtttgtctctttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 3233912  T
Q  128 aacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-ctttt 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||| | ||||  || |||||    
T  3233911 aacactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattgacatctctttt 3233812  T
Q  227 gtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  3233811 gtaacgttactcaccgtatagtgaaacggagggctgctct 3233772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 32280030 - 32280269
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  32280030 gaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcaccttgggaa 32280129  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  32280130 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggacttcaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 32280229  T
Q  228 taacgttactcatc-atatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||    
T  32280230 taaagttactcatcgttatagtaaaacggagggctgctct 32280269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 31 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 30034882 - 30034645
Alignment:
Q  31 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactag-gtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaa 129  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  30034882 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaattagagtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 30034783  T
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgt 228  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  30034782 cactattaggattgagtcaattggttaagggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 30034683  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  30034682 aacgttactcatcatatagcggatcggagggctgctct 30034645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 19704849 - 19704609
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  19704849 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaa 19704750  T
Q  129 acactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-ct-tt 225  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||    
T  19704749 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctctt 19704650  T
Q  226 tgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  19704649 tgtaacggtactcatcatatagtggattggagggctgctct 19704609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 13039788 - 13040027
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13039788 gaaacaagggtttagaaaggcaagaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaa 13039887  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | ||||  |||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  13039888 acactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgcgtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 13039987  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  13039988 taaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctct 13040027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 238
Target Start/End: Original strand, 25477308 - 25477518
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  25477308 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 25477407  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  25477408 acactattaggattgagtctcttggtcacggaaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 25477507  T
Q  228 taacgttactc 238  Q
    |||||||||||    
T  25477508 taacgttactc 25477518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 15541420 - 15541182
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  15541420 gaaacaagggtttagaaaggcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaa 15541321  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||  |||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  15541320 acactattagaattgagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtaggattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctcttttg 15541221  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| |||| ||||||||||||| ||| ||  ||||||||    
T  15541220 taaagttattcatcatatagtgaaacagaaagctgctct 15541182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12195795 - 12195557
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  12195795 gaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 12195696  T
Q  129 acactattaggatt-gagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttg 227  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  12195695 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaatcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 12195596  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  12195595 taacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 12195557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 30729108 - 30728866
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  30729108 gaaacaagggtatcgaaagacaacaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttgggaa 30729009  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-----ct 223  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| | ||||| ||     ||    
T  30729008 acactattaggattgactctcttggttacgggaagaggctggggctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctttctct 30728909  T
Q  224 tttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  30728908 tttgtaaagttactcatattatagtggaacggaaggctgctct 30728866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 26932842 - 26932604
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||| ||||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||    
T  26932842 gaaacaagggcttagaaaagcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagaagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaa 26932743  T
Q  129 acactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttg 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  26932742 acactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttg 26932643  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||  |||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  26932642 taacgaaactcatcatatagtggattggagggttgctct 26932604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 24338728 - 24338488
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactaggg-tttgagggctgattcaccttggaa 127  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  24338728 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgcataaagtttgtgtcttagcaacaaacactaggggtttgagggttgatttaccttggaa 24338629  T
Q  128 aacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-ctttt 226  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||| |  ||||||||  | |||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  24338628 aacactattaagattgagtcttttggttatggaaagagattaagactttgggtagaattagtcagaagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 24338529  T
Q  227 gtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24338528 gtaaggttactcatcattatagtgaaacggagggctgctct 24338488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 30 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 12161835 - 12161617
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||    
T  12161835 gaaacaagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct--ggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacgttgggaa 12161738  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  12161737 acactattaagatcgagtctattggttacgggaagagattgagactttaggtataattaagtgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttg 12161638  T
Q  228 taacgttactcatcatatagt 248  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  12161637 taaggttactcatcatatagt 12161617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 3028106 - 3027895
Alignment:
Q  55 acaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttgg 153  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3028106 acaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgg 3028010  T
Q  154 ttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtgga 251  Q
    | ||| |||||||||| | ||||  |||||||||||  ||||| ||||| ||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  3028009 tcacgtgaagagattgagactttgagtagaattaggctggagatttatttttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtgga 3027910  T
Q  252 acggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||    
T  3027909 acggagggctgctct 3027895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 94 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 5273431 - 5273258
Alignment:
Q  94 aacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtag 192  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  |    
T  5273431 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 5273332  T
Q  193 gagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||  ||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  5273331 gagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcttatagtggattggagggctgctct 5273258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 31 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 19227687 - 19227514
Alignment:
Q  31 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaa 129  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  19227687 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggatcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaa 19227588  T
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattc 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || | |||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  19227587 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattc 19227514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 64 - 243
Target Start/End: Original strand, 15719715 - 15719891
Alignment:
Q  64 ggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaag 163  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||   | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||    
T  15719715 ggtttgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gagttgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcatgggaag 15719810  T
Q  164 agattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatcat 243  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  15719811 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcat 15719891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 243
Target Start/End: Original strand, 22490673 - 22490889
Alignment:
Q  30 gaaacaagggttta-gaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaa 127  Q
    |||||||||||||  ||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    || |||||||  |    
T  22490673 gaaacaagggtttttgaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatatagtttgcctctttggaacaaacactagggtttgaggaggtatacaccttgcga 22490772  T
Q  128 aacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-ctttt 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||| |   |||||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  22490773 aacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattatgcgagagacttattcttgtaacccattgatatctctttt 22490872  T
Q  227 gtaacgttactcatcat 243  Q
    ||||  |||||||||||    
T  22490873 gtaagattactcatcat 22490889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 127 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 26066306 - 26066166
Alignment:
Q  127 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttt 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  26066306 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 26066207  T
Q  226 tgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  26066206 tgtaacgttacttatcaaatagtggatcggagggctgctct 26066166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 127 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 26068577 - 26068437
Alignment:
Q  127 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttt 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  26068577 aaacactattaggattggagtctcttgcttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 26068478  T
Q  226 tgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  26068477 tgtaacgttgctcatcaaatagtggatcggagggctgctct 26068437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 127 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 29754891 - 29754751
Alignment:
Q  127 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttt 225  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||  ||    
T  29754891 aaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttaggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctctt 29754792  T
Q  226 tgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  29754791 tgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctct 29754751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16455701 - 16455467
Alignment:
Q  31 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaa 129  Q
    |||||||||||||||| | |||||  ||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    || ||||||||||||| |||    
T  16455701 aaacaagggtttagaa-gtcaacacaaaaactagggtttgtacagagttt-tctcttggcaacgaacactagggttgt--ggttgattcaccttgggaaa 16455606  T
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgt 228  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | |||  ||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  16455605 cactgttaggattaagtctcttgctcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaaccctttgatatctcttttgt 16455506  T
Q  229 aacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16455505 aaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctct 16455467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 115 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 1069913 - 1069760
Alignment:
Q  115 attcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgt 214  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |    
T  1069913 attcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccat 1069814  T
Q  215 tgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||| || ||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    
T  1069813 tgatatctcttttgtaaggttactcatcattatagagaaacggagggctgctct 1069760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 127 - 266
Target Start/End: Original strand, 33308989 - 33309128
Alignment:
Q  127 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttt 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||    
T  33308989 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctctt 33309087  T
Q  226 tgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  33309088 tgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctct 33309128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 127 - 264
Target Start/End: Original strand, 33311258 - 33311395
Alignment:
Q  127 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttt 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||    
T  33311258 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagact-attcttgtaacccattgatttctctt 33311356  T
Q  226 tgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgct 264  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  33311357 tgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgct 33311395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 113 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12186269 - 12186113
Alignment:
Q  113 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaacc 211  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| | |||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||     
T  12186269 tgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttgttcacgggaagagattgagactttgggtacaattaggtttggagacttattcttgtaact 12186170  T
Q  212 cgttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    | ||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12186169 cattgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctct 12186113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 241
Target Start/End: Original strand, 17012112 - 17012287
Alignment:
Q  64 ggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaag 163  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17012112 ggtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt-gaggt-tgattcaccttctgaaacaatattaggattgagtctcttggtcacgagaag 17012208  T
Q  164 agattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatc 241  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  17012209 agattgatgcttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaagttactcatc 17012287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 72 - 243
Target Start/End: Original strand, 14466399 - 14466572
Alignment:
Q  72 tagagtttgtctctttgcaacaaacactagggttt-gagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattgg 170  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14466399 tagagtttgtctattggcaacaaacactagggttttgaggattgattcatcttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacggaaagagattgg 14466498  T
Q  171 ggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatcat 243  Q
    |  |||  |||||||||||   ||||| |||||||||||| | ||||| || ||||||||| |||| |||||||    
T  14466499 gagtttgagtagaattaggcgagagacatattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggttattcatcat 14466572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 72 - 266
Target Start/End: Original strand, 20526885 - 20527078
Alignment:
Q  72 tagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggg 171  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |    
T  20526885 tagagtttg-ctcttgacaacaaacactagggtt-gagat-tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggtcacaagaagagattaag 20526981  T
Q  172 gctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
     |||| |||||||||||| | | ||||| ||||||||||||  ||||| ||  ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  20526982 acttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatctctttgtaaagttattcatcattatagtggaacggagagctgctct 20527078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22858151 - 22857995
Alignment:
Q  113 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaacc 211  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||| ||||| | | ||||| ||||||||||||    
T  22858151 tgattcaccttgggaaacactattatgattgagtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggtagatttaggtttgaagactaattcttgtaacc 22858052  T
Q  212 c-gttgatttccttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |  ||||| |   ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  22858051 cttttgatatatctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggatggctgctct 22857995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 117 - 266
Target Start/End: Original strand, 26945265 - 26945417
Alignment:
Q  117 tcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaacccgtt 215  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||||||||| ||||||| | ||    
T  26945265 tcaccttgggaaacactattaggattaagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgtagacttatttttgtaactcatt 26945364  T
Q  216 gatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| || ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||    
T  26945365 gatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtagaacgaagggcagctct 26945417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 82 - 266
Target Start/End: Original strand, 15367121 - 15367303
Alignment:
Q  82 ctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggta 181  Q
    ||||| ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||  || ||||||||||   |||| ||||    
T  15367121 ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactcttaggattgagtctcttcgtcgcgggaagagattgaaactttgggta 15367217  T
Q  182 gaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
     |||||    ||||||||||||||||||||| || || || || |||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  15367218 aaattaatcgggagacttattcttgtaacccattaatatctctattgtaaagttattcatcatatagtgaaacggaaggctgctct 15367303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 1072157 - 1072079
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactag-gtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttg 107  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1072157 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttg 1072079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 103
Target Start/End: Original strand, 17852576 - 17852650
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactag-gtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactaggg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17852576 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttcgaacaaacactaggg 17852650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 32447596 - 32447502
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactag-ggtttgagggctgattcacct 122  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  32447596 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagagttttgagggttgattcacct 32447502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 266
Target Start/End: Original strand, 19696479 - 19696713
Alignment:
Q  31 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactaggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaac 130  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||    ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |    ||||||||||||| ||||    
T  19696479 aaacaagggtttagaaaca-aacaacaaattagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaatcactagggttcaaat--tgattcaccttgggaaac 19696574  T
Q  131 actattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgt 228  Q
    ||| ||||||||||||||||| || ||   ||||||||| | |||| | |||||||||| | | |||||||||||||||| || ||||| || |||||||    
T  19696575 actgttaggattgagtctctttgtcactgaaagagattgagactttggttagaattaggtttgaagacttattcttgtaatcctttgatatctcttttgt 19696674  T
Q  229 aacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    || |||| |||||| ||||||||||| ||  ||||||||    
T  19696675 aaagttattcatcattatagtggaacagatagctgctct 19696713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 13870702 - 13870608
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcacctt 123  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  13870702 gaaataagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatataaagtttgtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcacctt 13870608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12937377 - 12937235
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaacccgttgatttcctt 224  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||   |||| |||||||||||| | | || || ||||||||||||  || || ||  |    
T  12937377 aaaacactattaagattgagtctcttagtcacgagaatagattgaaacttttggtagaattaggtttgaaggctaattcttgtaaccatttaatatctct 12937278  T
Q  225 ttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12937277 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctct 12937235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 113 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 25078754 - 25078601
Alignment:
Q  113 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaacc 211  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||| |||  |||||||| | | |||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  25078754 tgattcaccttggtaaacaccgttaagattgagtctcttggtcacggaaagagatt-gagatttaagtagaattaggtttgaagacttattcttgtaacc 25078656  T
Q  212 cgttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgct 264  Q
    | ||||| || ||||||||| ||||||| ||| || ||||||||||||| |||||    
T  25078655 ctttgatatctcttttgtaaagttactcgtcattacagtggaacggaggactgct 25078601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 187
Target Start/End: Original strand, 11138424 - 11138499
Alignment:
Q  113 tgattcaccttgga-aaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaatta 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  11138424 tgattcaccttggagaaacactattaggattgagtcacttggtcacgggaagagatggggactttaggtagaatta 11138499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 12911630 - 12911488
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaacccgttgatttcctt 224  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || |||| || |||||| | |||| |||||| ||||| | | || || ||||||||||||  || || ||  |    
T  12911630 aaaacactattaagattgagtctcttagtcacgataatagattgagacttttggtagagttaggtttgaaggctaattcttgtaaccatttaatatctct 12911531  T
Q  225 ttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12911530 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctct 12911488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 28037927 - 28037794
Alignment:
Q  113 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggaga-cttattcttgtaacc 211  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| | |||  || |||||| | |||| |||||||||||||   | | |||||||||||||||    
T  28037927 tgattcaccttgggaaacactgttaggattgagtcccttgttcacggaaatagattgagactttgggtagaattaggtttaaaatcttattcttgtaacc 28037828  T
Q  212 cgttgatttc-cttttgtaacgttactcatcata 244  Q
    | ||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  28037827 ctttgatatctcttttgtaaagttactcatcata 28037794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 94
Target Start/End: Original strand, 8995514 - 8995578
Alignment:
Q  31 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacta-ggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaa 94  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8995514 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 8995578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 25465708 - 25465633
Alignment:
Q  192 ggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| ||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  25465708 ggagacttattcttgtacccctttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggaggactgctct 25465633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 3577697 - 3577632
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtagg 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| |||  ||||||||||||||||    
T  3577697 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt--ggtagaattaggtagg 3577632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 173 - 266
Target Start/End: Original strand, 30445701 - 30445797
Alignment:
Q  173 ctttaggtagaattaggtagga-gacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||| |||||||||||||  || |||| ||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    
T  30445701 ctttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagaactgctct 30445797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 127 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 7542566 - 7542452
Alignment:
Q  127 aaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagaga-ttggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaacccgttgatttcctt 224  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||  ||| | |||||||||| | | ||||| ||| ||||||||| ||||| ||  |    
T  7542566 aaacactattatgattgagtctcttggtcacgggaagagatttgggaatttggatagaattaggtttgaagactaatttttgtaaccctttgatatctct 7542467  T
Q  225 ttgtaacgttactca 239  Q
    |||||| ||||||||    
T  7542466 ttgtaaagttactca 7542452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 194 - 266
Target Start/End: Original strand, 15346546 - 15346619
Alignment:
Q  194 agacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || || |||||| |||| ||||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  15346546 agacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaaagttattcatcatatagtgaaacggaaagctgctct 15346619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Original strand, 13878726 - 13878789
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||||    
T  13878726 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggt 13878789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Original strand, 13883474 - 13883537
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||||    
T  13883474 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggt 13883537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Original strand, 16785918 - 16785981
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||||    
T  16785918 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggt 16785981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 26887407 - 26887344
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||||    
T  26887407 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggt 26887344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 31248897 - 31248834
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||||    
T  31248897 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggt 31248834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 35201509 - 35201446
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||||    
T  35201509 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggt 35201446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 5165989 - 5165935
Alignment:
Q  135 ttaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||||||||||    
T  5165989 ttaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggac-ttgggtagaattaggt 5165935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 64 - 140
Target Start/End: Original strand, 15346452 - 15346524
Alignment:
Q  64 ggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattagga 140  Q
    |||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15346452 ggtttgtataaaatttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactcttagga 15346524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 24542857 - 24542815
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagatt 168  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  24542857 aaaacacttttaggatagagtctcatggttacgagaagagatt 24542815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 50 - 86
Target Start/End: Original strand, 10584175 - 10584212
Alignment:
Q  50 caacaacaaaactag-gtttgtatagagtttgtctctt 86  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10584175 caacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctt 10584212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 17695030 - 17694950
Alignment:
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||| | | ||||| |||||||||||    
T  17695030 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 17694950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 36 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 17904632 - 17904566
Alignment:
Q  36 agggtttagaatgacaacaacaaaactaggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtt 105  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| || | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  17904632 agggtttagaa-gccaacaacaaaactagggtt-tgtagagttt-tctctttgcaacaaacactaaggtt 17904566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 133 - 193
Target Start/End: Original strand, 25941650 - 25941708
Alignment:
Q  133 tattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtagg 193  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| |||  ||||||||||||||||    
T  25941650 tattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggactt--ggtagaattaggtagg 25941708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Original strand, 17036058 - 17036117
Alignment:
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||||    
T  17036058 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggt 17036117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 31 - 266
Target Start/End: Original strand, 79194 - 79431
Alignment:
Q  31 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaa 129  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||    
T  79194 aaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaa 79293  T
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgt 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |  ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  79294 cactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgagaatttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgt 79393  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79394 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 79431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 41763 - 41525
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  41763 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 41664  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  41663 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 41564  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  41563 taacgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctct 41525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 11753 - 11515
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||    
T  11753 gaaacagggatttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttcgaacaaacactagggtttgagggttgattttccttgggaa 11654  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  11653 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatttctcttttg 11554  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  11553 taacgttactcatcatatagtggattggagagctgctct 11515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 79867 - 80105
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttg-caacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaa 127  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  79867 gaaacaagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaaaattagggtttgagggttgattcaccttggga 79966  T
Q  128 aacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-ctttt 226  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||| | ||||  || |||||    
T  79967 aacactattaggattaagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtag-attaggcaggagacttattcctgtaactcattgacatctctttt 80065  T
Q  227 gtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  80066 gtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 80105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 188425 - 188341
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaac 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||| | | ||||| |||||||||||    
T  188425 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaac 188341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 6207 - 6445
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||||||||   |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  6207 gaaacaagggtttagaaaagcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 6306  T
Q  129 acactattaggattga-gtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttg 227  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  6307 acactattaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatttctctttg 6406  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  6407 taacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctct 6445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 264
Target Start/End: Original strand, 2888 - 3123
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  2888 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaa 2987  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||    
T  2988 acactattaggattgagtctcttggttatgggaagaggcttggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgt 3087  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgct 264  Q
    ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  3088 aacgaaactcatcatatagtggattggagggctgct 3123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 4005 - 4242
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  4005 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaa 4103  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  4104 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaagctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 4203  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4204 taaagttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 4242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 29179 - 29416
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||| |||||| |||||| |     
T  29179 gaaacaagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggat 29278  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgt 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||    
T  29279 acactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgt 29378  T
Q  229 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29379 aacaatactcatcatatagtggatcggagggctgctct 29416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 49 - 287
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  49 gaaacaagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 148  T
Q  129 acactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttg 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||    
T  149 acactattaggattggagtctcttggttacgtgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattgatttctctttg 248  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  249 taacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 29 - 266
Target Start/End: Original strand, 85237 - 85477
Alignment:
Q  29 agaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaa 127  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  85237 agaaacaaggatttaaaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagcaacaaacactaaagtttgagggttgattcaccttggaa 85336  T
Q  128 aacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-ctttt 226  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||  ||||||| ||   ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||     
T  85337 aacactactaggattgagtcttttggttacgagaagagattgtgactttgagtagaatcagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctctttc 85436  T
Q  227 gtaacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  85437 gtaaagttactcatcattatagtggaacggatgactgctct 85477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Original strand, 2050 - 2287
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | || ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  2050 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtacagagtttgtctcttcggaataaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaa 2148  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||| |||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  2149 acactattaggattgagtctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattaatttctcttttg 2248  T
Q  228 taacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  2249 taacgttcctcatcatatagtgaatcggagggctactct 2287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 90 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 1671 - 1495
Alignment:
Q  90 aacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattagg 189  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||    
T  1671 aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattagg 1572  T
Q  190 taggagacttattcttgtaacccgttgatttccttttgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
      ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1571 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctct 1495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 201
Target Start/End: Original strand, 35647 - 35819
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||    
T  35647 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcacctagggaa 35746  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttat 201  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| |||| ||||||||||||  ||||||||||    
T  35747 acactattaggattaagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 35819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 16098 - 15863
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    |||| |||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||  ||    
T  16098 gaaataagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggtt-gaggt-tgattcaccttgcgaa 16003  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  16002 aaactattaggattgagtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttg 15903  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  15902 taaagttactcatcattagagtggaacggaggactgctct 15863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 1911 - 1684
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaa 128  Q
    ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||         |||||||||||||||||    || ||||||||||||| ||    
T  1911 gaaacaagggtttagaa-gtcaacaagaaaactagggtttgtatagagttt---------caacaaacactagggttgt--ggttgattcaccttgggaa 1824  T
Q  129 acactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttg 227  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  1823 acacaattaggattgagtttcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttg 1724  T
Q  228 taacgttactcatca-tatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  1723 taaagttactcatcattatagtggaacgtagggctgctct 1684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 16925 - 16716
Alignment:
Q  31 aaacaagggtttagaatgacaacaacaaaactagg-tttgtatagagtttgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggctgattcaccttggaaaa 129  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |  |  ||||||||||| | |||    
T  16925 aaacaagggttt-gaaagacaaca-caaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttaggaaa 16831  T
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttc-cttttgt 228  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| | |||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  16830 cactattaggattgagtcacttggtgacgggaagagattgagactttgggtagaattaggccagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgt 16731  T
Q  229 aacgttactcatcat 243  Q
    || ||||||||||||    
T  16730 aaagttactcatcat 16716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 127 - 266
Target Start/End: Original strand, 22222 - 22361
Alignment:
Q  127 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttt 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  | ||||| ||||||||||| | ||||||||  ||    
T  22222 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaactcattgatttctctt 22320  T
Q  226 tgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22321 tgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctct 22361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 127 - 266
Target Start/End: Original strand, 24497 - 24636
Alignment:
Q  127 aaacactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaacccgttgatttccttt 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||  | ||||| ||||||||||| | ||||||||  ||    
T  24497 aaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagact-attcttgtaactcattgatttctctt 24595  T
Q  226 tgtaacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  24596 tgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctct 24636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 253
Target Start/End: Original strand, 4902 - 5045
Alignment:
Q  113 tgattcaccttggaaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggtaggagacttattcttgtaaccc 212  Q
    |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  4902 tgattcatgttgggaaacactattaggattgagtctcttggtcatgagaagagattgaagcttttggtagaattaggcgggagacttatttttgtaaccc 5001  T
Q  213 gttg--atttccttttgtaacgttactcatca-tatagtggaac 253  Q
     |||  || || |||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  5002 attgatatctctttttgtaaagatactcatcattatagtggaac 5045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 1111 - 1053
Alignment:
Q  30 gaaacaagggtttagaatgacaacaacaaaacta-ggtttgtatagagtttgtctcttt 87  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1111 gaaacaagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttt 1053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 57614 - 57470
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagatt-ggggctttaggtagaattagg-taggagacttattcttgtaacccgttgatttc-c 222  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |   ||||||||| ||| |||| ||| |||||||| | | |||  |||||||||||||| ||||| ||      
T  57614 aaaacactattaggattgaatctcttggtcattggaagagattcgggactttgggtggaattaggtttgaagatctattcttgtaaccctttgatatcta 57515  T
Q  223 ttttgtaacgttactca-tcatatagtggaacggagggctgctct 266  Q
    |||||||| |||||||| | ||||| |||||| ||| ||||||||    
T  57514 ttttgtaaagttactcattaatataatggaacagagagctgctct 57470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 190
Target Start/End: Original strand, 224818 - 224881
Alignment:
Q  126 aaaacactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||||    
T  224818 aaaacactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggt 224881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 130 - 190
Target Start/End: Original strand, 16328 - 16387
Alignment:
Q  130 cactattaggattgagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggt 190  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||| | || |||||||||||||    
T  16328 cactattaggattgagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggt 16387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 5412 times since January 2019
Visitors: 4850