View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0772_high_3 (Length: 406)

Name: NF0772_high_3
Description: NF0772
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0772_high_3
NF0772_high_3
[»] chr6 (49 HSPs)
chr6 (3-386)||(26143481-26143864)
chr6 (3-386)||(25580335-25580718)
chr6 (3-386)||(25483672-25484055)
chr6 (3-386)||(25539156-25539539)
chr6 (2-386)||(26056534-26056918)
chr6 (2-386)||(26076504-26076888)
chr6 (16-386)||(26656591-26656961)
chr6 (16-386)||(26762562-26762932)
chr6 (16-386)||(26884696-26885066)
chr6 (37-386)||(26862227-26862576)
chr6 (35-386)||(26647124-26647475)
chr6 (35-386)||(26753092-26753443)
chr6 (40-386)||(27337281-27337627)
chr6 (40-386)||(27398021-27398367)
chr6 (30-386)||(27530487-27530843)
chr6 (138-386)||(25511640-25511888)
chr6 (30-386)||(26623911-26624267)
chr6 (30-386)||(26729888-26730244)
chr6 (3-386)||(25492505-25492888)
chr6 (30-386)||(28786878-28787234)
chr6 (30-386)||(28792999-28793355)
chr6 (30-386)||(27717685-27718041)
chr6 (30-386)||(27610306-27610662)
chr6 (30-386)||(31285199-31285555)
chr6 (35-386)||(27215097-27215448)
chr6 (30-386)||(28781741-28782097)
chr6 (30-386)||(27603890-27604246)
chr6 (46-386)||(26803102-26803442)
chr6 (46-386)||(27705590-27705930)
chr6 (46-383)||(27426801-27427138)
chr6 (46-386)||(27679606-27679946)
chr6 (30-386)||(27697772-27698128)
chr6 (30-386)||(27592207-27592563)
chr6 (46-386)||(27676806-27677146)
chr6 (35-240)||(26824464-26824669)
chr6 (3-92)||(25511551-25511640)
chr6 (150-233)||(28140295-28140378)
chr6 (158-240)||(28097775-28097857)
chr6 (151-227)||(26937790-26937866)
chr6 (139-204)||(26849461-26849526)
chr6 (133-221)||(28243538-28243626)
chr6 (158-221)||(28227720-28227783)
chr6 (158-221)||(28235333-28235396)
chr6 (133-240)||(28297072-28297179)
chr6 (133-240)||(28514894-28515001)
chr6 (171-241)||(26724349-26724419)
chr6 (158-240)||(26950511-26950593)
chr6 (139-204)||(26975700-26975765)
chr6 (149-221)||(29843338-29843410)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (16-387)||(28126860-28127231)
chr1 (16-387)||(28163561-28163931)
chr1 (30-386)||(267526-267882)
[»] chr4 (7 HSPs)
chr4 (30-386)||(18678742-18679098)
chr4 (30-386)||(18698582-18698938)
chr4 (46-386)||(18654659-18654999)
chr4 (46-386)||(18730686-18731026)
chr4 (46-386)||(18723267-18723607)
chr4 (46-383)||(18074417-18074754)
chr4 (133-241)||(5090284-5090392)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (30-386)||(8127-8483)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (30-386)||(12861-13217)
scaffold0277 (30-386)||(3898-4254)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (30-386)||(2725-3081)
[»] chr8 (1 HSPs)
chr8 (30-386)||(29273024-29273380)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (46-383)||(60225-60562)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (141-240)||(3280410-3280509)
chr2 (135-240)||(17992547-17992652)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (141-240)||(16691618-16691717)
[»] scaffold0038 (3 HSPs)
scaffold0038 (133-221)||(43700-43788)
scaffold0038 (158-221)||(28218-28281)
scaffold0038 (158-221)||(35495-35558)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 352; Significance: 0; HSPs: 49)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 3 - 386
Target Start/End: Original strand, 26143481 - 26143864
Alignment:
Q  3 catctcgaataatatcaatcatgttttcttaaatgtagccaaataccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacaagggc 102  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  26143481 catctccaacaatatcaatcatgtttttttaaatgtagccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaagaagtgaaattgcttcttgacatgggc 26143580  T
Q  103 tctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26143581 tctgaggatgaggtccgcatggtaggactttttggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttg 26143680  T
Q  203 aaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaacca 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26143681 aaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaacca 26143780  T
Q  303 taagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 386  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26143781 taagttaggagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 26143864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 3 - 386
Target Start/End: Original strand, 25580335 - 25580718
Alignment:
Q  3 catctcgaataatatcaatcatgttttcttaaatgtagccaaataccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacaagggc 102  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25580335 catctccaacaatatcaatcatgtttttttaaacgtagccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggc 25580434  T
Q  103 tctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttg 202  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25580435 tctgaggatgtggtccacatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttg 25580534  T
Q  203 aaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaacca 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||  |  |||||||||||| || |||||||||  ||      
T  25580535 aaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagatttcaattcttaataacttgaaacatctccattattatctccttttaataatagttaaattttactt 25580634  T
Q  303 taagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 386  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25580635 taagttagtagatgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgatttttgatgatgt 25580718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 3 - 386
Target Start/End: Original strand, 25483672 - 25484055
Alignment:
Q  3 catctcgaataatatcaatcatgttttcttaaatgtagccaaataccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacaagggc 102  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25483672 catctccaacaatatcaatcatgattttttaaacgtagccaaataccctgttggattacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatgggc 25483771  T
Q  103 tctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25483772 tctgaggatgaggtccgcatggtaggactttttggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattttcttgctgatcaatttg 25483871  T
Q  203 aaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataacctgaaacatctccaggaagat-ctccttttaagaacagttaaattgaacc 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| || || |||||||||  ||     
T  25483872 aaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataacctgaaacatctcca-aaagatgctcctttcaaaaatagttaaatttgacg 25483970  T
Q  302 ataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 386  Q
     |||||||| || |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25483971 gtaagttagaagatgttagtgagggaataccaatcataaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattgttgatgatgt 25484055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 3 - 386
Target Start/End: Original strand, 25539156 - 25539539
Alignment:
Q  3 catctcgaataatatcaatcatgttttcttaaatgtagccaaataccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacaagggc 102  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  25539156 catctccaacaatatcaatcatgtttttttatatgtggccaaataccctgttggattacagtccccaatagaacaagtgaaattgcttcttgacttgggc 25539255  T
Q  103 tctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25539256 tctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattttgttgctgatcaatttg 25539355  T
Q  203 aaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaacca 302  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |  | ||||||| || || |||||||||  ||      
T  25539356 aagttgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataacttgaaacatctccaaaagaagctcctttcaaaaatagttaaatttgacgg 25539455  T
Q  303 taagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 386  Q
    |||||||| || |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25539456 taagttagaagatgttagtgagggaataacaatcataaaggaaagactatctaaaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 25539539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 2 - 386
Target Start/End: Original strand, 26056534 - 26056918
Alignment:
Q  2 gcatctcgaataatatcaatcatgttttcttaaatgtagccaaataccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacaaggg 101  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26056534 gcatctccaacaagatcaatcatgtttttttaaacgtagccaaataccctgttggattgcagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatggg 26056633  T
Q  102 ctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaattt 201  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  26056634 ctctgagaatgaggtccgcatggtaggaatttttggtaccggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattctattgctgatcaattt 26056733  T
Q  202 gaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaacc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||| |  | ||||||| || || |||||||||  ||     
T  26056734 gaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaactcttaagaacttgaaacatctccagaagaagctcctttcaaaaatagttaaatttgacg 26056833  T
Q  302 ataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 386  Q
     | |||||| || |||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26056834 gtcagttagaagatgttagtgagggaataccaattataaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgacgatgt 26056918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 2 - 386
Target Start/End: Original strand, 26076504 - 26076888
Alignment:
Q  2 gcatctcgaataatatcaatcatgttttcttaaatgtagccaaataccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacaaggg 101  Q
    ||||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26076504 gcatctccaacaagatcaatcatgtttttttaaacgtagccaaataccctgttggattgcagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacatggg 26076603  T
Q  102 ctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaattt 201  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  26076604 ctctgagaatgaggtccgcatggtaggaatttttggtaccggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattctattgctgatcaattt 26076703  T
Q  202 gaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaacc 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||||||| |  | ||||||| || || |||||||||  ||     
T  26076704 gaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaactcttaagaacttgaaacatctccagaagaagctcctttcaaaaatagttaaatttgacg 26076803  T
Q  302 ataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 386  Q
     | || ||| || |||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26076804 gtcagatagaagatgttagtgagggaataccaattataaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgacgatgt 26076888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 386
Target Start/End: Original strand, 26656591 - 26656961
Alignment:
Q  16 atcaatcatgttttcttaaatgtagccaaataccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacaagggctctgaggatgagg 115  Q
    ||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  26656591 atcaatcgtgtttttttacatgttgccaaataccctgttggattagagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgataagggatctaaggatgagg 26656690  T
Q  116 tccgcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttt 215  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26656691 ttctcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgccaaagcaatttataattttgtcgctgatcaatttgaaggtgtatgttt 26656790  T
Q  216 tcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggt 315  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||| | ||||   ||||||||||| |    
T  26656791 tcttcacaatgtcagagagaattcagctcataataatttgaaacatctccaggaggagctcctttcaaaaactgttagagtgaatattaagttaggagat 26656890  T
Q  316 gttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 386  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26656891 gttagtgagggaattccaatcataaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 26656961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 16 - 386
Target Start/End: Original strand, 26762562 - 26762932
Alignment:
Q  16 atcaatcatgttttcttaaatgtagccaaataccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacaagggctctgaggatgagg 115  Q
    ||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  26762562 atcaatcgtgtttttttacatgttgccaaataccctgttggattagagtctcgagtacaacaagtgaaattgcttcttgataagggatctaaggatgagg 26762661  T
Q  116 tccgcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttt 215  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26762662 ttctcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgccaaagcaatttataattttgtcgctgatcaatttgaaggtgtatgttt 26762761  T
Q  216 tcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggt 315  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| || ||||||| || ||| |||| | ||||   ||||||||||| |    
T  26762762 tcttcacaatgtcagagagaattcagctcataataatttgaaacatctccaggaggagctcctttcaaaaactgttagagtgaatattaagttaggagat 26762861  T
Q  316 gttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 386  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26762862 gttagtgagggaattccaatcataaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 26762932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 16 - 386
Target Start/End: Original strand, 26884696 - 26885066
Alignment:
Q  16 atcaatcatgttttcttaaatgtagccaaataccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacaagggctctgaggatgagg 115  Q
    ||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||| ||||  ||| | || | ||    
T  26884696 atcaatcgtgttgttttacatgtagccaaataccctgttggattacagtaccgagtacaacaattaaaattgcttcttgataaggaatctaacgaagggg 26884795  T
Q  116 tccgcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttt 215  Q
    | | |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26884796 tacacatggtaggaatttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattatgttgctgatcaatttgaatgtgtatgttt 26884895  T
Q  216 tcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggt 315  Q
    ||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||| |||  ||||||||||| |    
T  26884896 tctgcataaagtcagggagaattcaactcataataacttgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacaattaaattaaacattaagttaggagat 26884995  T
Q  316 gttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 386  Q
    ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26884996 gttagtgagggaattccactcataaaggaaagactacatagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 26885066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 37 - 386
Target Start/End: Original strand, 26862227 - 26862576
Alignment:
Q  37 gtagccaaataccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacaagggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatg 136  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||| || | ||| | |||||||||||||||||    
T  26862227 gtagccaaataccctgttggattaaagtcccgagtagaacaagtgaaattgcttcttgatatggaatctgatgaaggggtacacatggtaggactttatg 26862326  T
Q  137 gtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaa 236  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  26862327 gtactggaggcatggggaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttgttgccgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataaagttagagagaa 26862426  T
Q  237 ttcaagtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatc 336  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||| | || || ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||| || |     
T  26862427 ttcaactcataatagcttgaaacatctccagaaggagcttcttttaaaaacagttaaattgaacattaagttaggagatgctagtgagggaattccactt 26862526  T
Q  337 attaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 386  Q
    || ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  26862527 ataaaggaaagactaaatagaatgaagattcttttgattctcgatgatgt 26862576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 35 - 386
Target Start/End: Original strand, 26647124 - 26647475
Alignment:
Q  35 atgtagccaaataccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacaagggctctgaggatgaggtccgcatggtaggacttta 134  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |  ||||| || | |||||  ||||||||||||||    
T  26647124 atgtagccaaataccctgttggattagagtcccgattagaacaagtgaaattgcttcttgataaagaatctgatgaaggggtccatatggtaggacttta 26647223  T
Q  135 tggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagag 234  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26647224 tggtactggaggtttgggtaaatcaacacttgccaaagcgatttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgctttcttcataatgtcagagag 26647323  T
Q  235 aattcaagtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaa 334  Q
    ||||||  |||||||||| |||||||||||||| | || ||||||| || |||||||||| |||||  |||||| |||  | || ||||||||||| |||    
T  26647324 aattcagctcataataacttgaaacatctccagaaggagctcctttcaaaaacagttaaagtgaacattaagtttggacatatttgtgagggaattccaa 26647423  T
Q  335 tcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 386  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26647424 tcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 26647475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 35 - 386
Target Start/End: Original strand, 26753092 - 26753443
Alignment:
Q  35 atgtagccaaataccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacaagggctctgaggatgaggtccgcatggtaggacttta 134  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |  ||||| || | |||||  ||||||||||||||    
T  26753092 atgtagccaaataccctgttggattagagtcccgattagaacaagtgaaattgcttcttgataaagaatctgatgaaggggtccatatggtaggacttta 26753191  T
Q  135 tggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagag 234  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26753192 tggtactggaggtttgggtaaatcaacacttgccaaagcgatttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgctttcttcataatgtcagagag 26753291  T
Q  235 aattcaagtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaa 334  Q
    ||||||  |||||||||| |||||||||||||| | || ||||||| || |||||||||| |||||  |||||| |||  | || ||||||||||| |||    
T  26753292 aattcagctcataataacttgaaacatctccagaaggagctcctttcaaaaacagttaaagtgaacattaagtttggacatatttgtgagggaattccaa 26753391  T
Q  335 tcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 386  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26753392 tcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 26753443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 40 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 27337627 - 27337281
Alignment:
Q  40 gccaaataccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacaagggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggta 139  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||  |||  ||||| || | ||||  ||||||||||||||||||||    
T  27337627 gccaaataccctgttggattacagtcccgagtacaacaagtaaaattgcttcttgatgaggaatctgatgaaggggtcaacatggtaggactttatggta 27337528  T
Q  140 ctggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattc 239  Q
    || ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  27337527 ctagaggcttgggaaaatcaacacttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaaggagtatgctttcttcataatgttagagagaattc 27337428  T
Q  240 aagtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcatt 339  Q
    |  || ||| ||| |||||||||||||| | || ||||||| || ||||||| || |||||  ||||||| ||| ||||  |||||||||| ||||||||    
T  27337427 agctcgtaaaaacttgaaacatctccagaaggagctcctttcaaaaacagttcaactgaacattaagttaagagatgtttctgagggaattccaatcatt 27337328  T
Q  340 aaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 386  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27337327 aaggaaaggctatgtaggaagaagattcttttgattctcgatgatgt 27337281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 40 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 27398367 - 27398021
Alignment:
Q  40 gccaaataccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacaagggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggta 139  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||  |||  ||||| || | ||||  ||||||||||||||||||||    
T  27398367 gccaaataccctgttggattacagtcccgagtacaacaagtaaaattgcttcttgatgaggaatctgatgaaggggtcaacatggtaggactttatggta 27398268  T
Q  140 ctggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattc 239  Q
    || ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  27398267 ctagaggcttgggaaaatcaacacttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaaggagtatgctttcttcataatgttagagagaattc 27398168  T
Q  240 aagtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcatt 339  Q
    |  || ||| ||| |||||||||||||| | || ||||||| || ||||||| || |||||  ||||||| ||| ||||  |||||||||| ||||||||    
T  27398167 agctcgtaaaaacttgaaacatctccagaaggagctcctttcaaaaacagttcaactgaacattaagttaagagatgtttctgagggaattccaatcatt 27398068  T
Q  340 aaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 386  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27398067 aaggaaaggctatgtaggaagaagattcttttgattctcgatgatgt 27398021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 30 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 27530843 - 27530487
Alignment:
Q  30 cttaaatgtagccaaataccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacaagggctctgaggatgaggtccgcatggtagga 129  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||||| || |||| ||||||  || ||||||  |    ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  27530843 cttagatgttgccaaatatcctgttggattacagtcccgagtacaacatgtgaaagggcatcttgatgaaaaatctgatgatgaggtccacatggtagga 27530744  T
Q  130 ctttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtca 229  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | ||||||||||  | ||||| |    
T  27530743 ctttatggtactggaggcataggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaagttttatgttttctagaaaatgtga 27530644  T
Q  230 gagagaattcaagtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaat 329  Q
    ||| |||||| | |    ||||| ||||||||||||| ||  | |||||||||| |||||||| |||| ||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  27530643 gagtgaattcgacttcagataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacagttagattggacattaagttaggaggtgttagtcagggaat 27530544  T
Q  330 ttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 386  Q
    | ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27530543 tccaatcattaagcaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 27530487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 138 - 386
Target Start/End: Original strand, 25511640 - 25511888
Alignment:
Q  138 tactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaat 237  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25511640 tactagaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttttaattctattgctgatcaatttgaaagtgtatgttttcttcataatgtcagagagaat 25511739  T
Q  238 tcaagtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatca 337  Q
    |||| || ||| ||| |||||||||||||| |  | ||||||| || || |||||||||  ||  | || ||| || |||||||||||||||  |||| |    
T  25511740 tcaactcttaagaacttgaaacatctccagaagaagctcctttcaaaaatagttaaatttgacggtcagatagaagatgttagtgagggaataccaatta 25511839  T
Q  338 ttaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 386  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25511840 taaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgacgatgt 25511888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 30 - 386
Target Start/End: Original strand, 26623911 - 26624267
Alignment:
Q  30 cttaaatgtagccaaataccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacaagggctctgaggatgaggtccgcatggtagga 129  Q
    |||| |||| || |||||||||||||| |||||||| | | || ||||||||||||  |||||||| || || ||||| |||| |||||  ||||| |||    
T  26623911 cttacatgttgctaaataccctgttggattacagtctcaactacaacaagtgaaatcacttcttgataatggatctgatgatggggtccatatggttgga 26624010  T
Q  130 ctttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtca 229  Q
     | ||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |    
T  26624011 atgtatgggattggaggcttgggcaaatcaacacttgcaagagcaatctataactttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcatgatgtga 26624110  T
Q  230 gagagaattcaagtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaat 329  Q
    |||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||| ||  | |||||||| | ||||  |  |||| |   |||||| |    |||||||||||||||    
T  26624111 gagagaattcagctcaaaataacttgaaacatctccaagagaagctcctttttaaaacaactggattggaaattaagttggaccatgttagtgagggaat 26624210  T
Q  330 ttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 386  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26624211 ttcaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 26624267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 30 - 386
Target Start/End: Original strand, 26729888 - 26730244
Alignment:
Q  30 cttaaatgtagccaaataccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacaagggctctgaggatgaggtccgcatggtagga 129  Q
    |||| |||| || |||||||||||||| |||||||| | | || ||||||||||||  |||||||| || || ||||| |||| |||||  ||||| |||    
T  26729888 cttacatgttgctaaataccctgttggattacagtctcaactacaacaagtgaaatcacttcttgataatggatctgatgatggggtccatatggttgga 26729987  T
Q  130 ctttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtca 229  Q
     | ||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |    
T  26729988 atgtatgggattggaggcttgggcaaatcaacacttgcaagagcaatctataactttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcatgatgtga 26730087  T
Q  230 gagagaattcaagtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaat 329  Q
    |||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||| ||  | |||||||| | ||||  |  |||| |   |||||| |    |||||||||||||||    
T  26730088 gagagaattcagctcaaaataacttgaaacatctccaagagaagctcctttttaaaacaactggattggaaattaagttggaccatgttagtgagggaat 26730187  T
Q  330 ttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 386  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26730188 ttcaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 26730244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 25492888 - 25492505
Alignment:
Q  3 catctcgaataatatcaatcatgttttcttaaatgtagccaaataccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacaagggc 102  Q
    ||||||| |||  ||||||| |||||  ||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||| |||||||||||||| ||  |||      
T  25492888 catctcggataggatcaatcgtgtttcattacatgttgccaaataccctgttggattacaatcccgagtacaacacgtgaaattgcttctagatgaggta 25492789  T
Q  103 tctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttg 202  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | ||||| ||  |||||||||||||||    
T  25492788 tctgaggatgagttccacatggtaggactttatggtactggaggcttaggtaaatcaacacttgcaaaatcaatctataacttcattgctgatcaatttg 25492689  T
Q  203 aaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaacca 302  Q
    ||||| ||||||||||     |||| ||||||||||||| ||  |  ||| ||||| ||||||||||| | |||||||  | ||  |||| |||  ||      
T  25492688 aaggtttatgttttctaggagatgtgagagagaattcaactccaagaaacttgaaagatctccaggaaaaactcctttcgaaaatggttagattagacat 25492589  T
Q  303 taagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 386  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||  || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25492588 taagttaagaagtgttagtgagggaattgcaatcataaaacaaggactatgtagagagaagattcttttgattctcgatgatgt 25492505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 30 - 386
Target Start/End: Original strand, 28786878 - 28787234
Alignment:
Q  30 cttaaatgtagccaaataccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacaagggctctgaggatgaggtccgcatggtagga 129  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||| || |||||||||||| |||||||||  | || ||||| ||||  |||||||||||||||    
T  28786878 cttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatgatggagtccgcatggtagga 28786977  T
Q  130 ctttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtca 229  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| |    
T  28786978 ctttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttggaaaagcaatttataattttatttctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtga 28787077  T
Q  230 gagagaattcaagtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaat 329  Q
    |||||||||||  |   |||||  |||||||||||||||| |  |||||||||| |||| || || ||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  28787078 gagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggtgctccttttaaaaacacttcaactgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaat 28787177  T
Q  330 ttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 386  Q
    | |    || |||||||| ||   || |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  28787178 tccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagactcttttgattctcgatgatgt 28787234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 30 - 386
Target Start/End: Original strand, 28792999 - 28793355
Alignment:
Q  30 cttaaatgtagccaaataccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacaagggctctgaggatgaggtccgcatggtagga 129  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||| || |||||||||||| |||||||||  | || ||||| ||||  |||||||||||||||    
T  28792999 cttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatgatggagtccgcatggtagga 28793098  T
Q  130 ctttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtca 229  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| |    
T  28793099 ctttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttggaaaagcaatttataattttatttctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtga 28793198  T
Q  230 gagagaattcaagtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaat 329  Q
    |||||| ||||  |   ||||   |||||||||||||||| |  |||||||||| |||| || || ||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  28793199 gagagagttcagcttcaaatagattgaaacatctccaggaggtgctccttttaaaaacacttcaactgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaat 28793298  T
Q  330 ttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 386  Q
    | |    || |||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28793299 tccttatataaaggaaaggctacatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 28793355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 30 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 27718041 - 27717685
Alignment:
Q  30 cttaaatgtagccaaataccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacaagggctctgaggatgaggtccgcatggtagga 129  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||| || |||||||||||| |||||||||  |  | ||||| ||||  |||| ||||||||||    
T  27718041 cttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtagga 27717942  T
Q  130 ctttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtca 229  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| |    
T  27717941 ctttatggtactggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtga 27717842  T
Q  230 gagagaattcaagtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagtt-aaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaa 328  Q
    |||||||||||| |   |||||  |||||||||| ||| | || |||||||||| |||| || || |||||   |||||| |||||||||||||||||||    
T  27717841 gagagaattcaacttcaaataaattgaaacatcttcagaaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaa-attaagtttggaggtgttagtgagggaa 27717743  T
Q  329 tttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 386  Q
    || |    || |||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27717742 ttccttatataaaggaaaggctacatagaaagaaggttcttttgattcttgatgatgt 27717685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 27610662 - 27610306
Alignment:
Q  30 cttaaatgtagccaaataccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacaagggctctgaggatgaggtccgcatggtagga 129  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||| || ||||| | | || || ||||||||| |||||||||  |  | ||||| ||||  |||| ||||||||||    
T  27610662 cttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcaagtacaagaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtagga 27610563  T
Q  130 ctttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtca 229  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| |    
T  27610562 ctttatggtactggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtga 27610463  T
Q  230 gagagaattcaagtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagtt-aaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaa 328  Q
    |||||||||||| |   |||||  |||||||||| ||||| || |||||||||| |||| || || |||||   |||||| |||||||||||||||||||    
T  27610462 gagagaattcaacttcaaataaattgaaacatcttcaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaa-attaagtttggaggtgttagtgagggaa 27610364  T
Q  329 tttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 386  Q
    || |    || |||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27610363 ttccttatataaaggaaaggctacatagaaagaaggttcttttgattcttgatgatgt 27610306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 386
Target Start/End: Original strand, 31285199 - 31285555
Alignment:
Q  30 cttaaatgtagccaaataccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacaagggctctgaggatgaggtccgcatggtagga 129  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||| ||  |||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||   || |  | | ||| | ||||||||||    
T  31285199 cttacatgttgccaattaccctgttggatttaagtttcgaatacaacaagtgaaattgcttcttgataaggaaactaataaaggggtacacatggtagga 31285298  T
Q  130 ctttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtca 229  Q
    |||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||||||| |||| |    
T  31285299 ctttatgggataggaggcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttattggtgatcaatttgacggattatgttttcttcatgatgtga 31285398  T
Q  230 gagagaattcaagtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaat 329  Q
    |||||||||||  | | |||||| ||||||||||||| ||  | |||||||| | |||| ||  |||| |   ||||||||    |||||||||||||||    
T  31285399 gagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaagctccttttgaaaacaattggattggaaattaagttagaccatgttagtgagggaat 31285498  T
Q  330 ttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 386  Q
    | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31285499 tccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 31285555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 35 - 386
Target Start/End: Original strand, 27215097 - 27215448
Alignment:
Q  35 atgtagccaaataccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacaagggctctgaggatgaggtccgcatggtaggacttta 134  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||  ||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||| |    
T  27215097 atgttgccaaacaccctgttggattacatacccaaatacaacaagtaaaattgcttcttgacaagggatctaaggaagaggtccacatggtaggacttca 27215196  T
Q  135 tggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagag 234  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||||||| |||||||||  || ||||||  |  |||| | ||||    
T  27215197 tggagctggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttttaatttcattgctgatcagtttgaaggttcatattttctagaagatgtgaaagag 27215296  T
Q  235 aattcaagtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaa 334  Q
    ||||||| |   |||||| ||||||| || |||||| |  ||||| | | ||| |||| |||  || ||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  27215297 aattcaactttaaataacttgaaacacctgcaggaaaagatccttatgaaaacggttagattagacgataagttaggaggtgttagtgaggggattacaa 27215396  T
Q  335 tcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 386  Q
      || ||  |||  |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27215397 agataaaaaaaatgctatgtcaaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 27215448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 30 - 386
Target Start/End: Original strand, 28781741 - 28782097
Alignment:
Q  30 cttaaatgtagccaaataccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacaagggctctgaggatgaggtccgcatggtagga 129  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||   | || | |||  |||  ||| | |||||||||    
T  28781741 cttacatgttgccaattaccctgttggattacagtcccgagtacaacaagtgaaatcgcttcttggtgaaggatatgataatggagtcaggatggtagga 28781840  T
Q  130 ctttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtca 229  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| |    
T  28781841 ctttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttgtaaaagcagtttataacttaattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtga 28781940  T
Q  230 gagagaattcaagtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaat 329  Q
    |||||||||||  |   |||||  |||||||||||||||| || |||||||||| | || || || ||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  28781941 gagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttttaaaagcacttcaactgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaat 28782040  T
Q  330 ttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 386  Q
    | |    || |||||||| ||   || |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  28782041 tccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagactcttttgattctcgatgatgt 28782097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 30 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 27604246 - 27603890
Alignment:
Q  30 cttaaatgtagccaaataccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacaagggctctgaggatgaggtccgcatggtagga 129  Q
    |||| |||| ||||| || ||| |||| || ||||| ||| || ||||||||||||  ||||||||  |  | ||||| ||||  |||| ||||||||||    
T  27604246 cttacatgttgccaattatcctattggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatctcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtagga 27604147  T
Q  130 ctttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtca 229  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| |    
T  27604146 ctttatggtactggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtga 27604047  T
Q  230 gagagaattcaagtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagtt-aaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaa 328  Q
    |||||||||||  |   |||||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| || || |||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  27604046 gagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaa-attaagttaggaggtgttagtgagggaa 27603948  T
Q  329 tttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 386  Q
    ||||    || |||||||| ||   |  || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  27603947 tttctcatataaaggaaaggctgcattcaatgaagattcttttgattctcgatgatgt 27603890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 46 - 386
Target Start/End: Original strand, 26803102 - 26803442
Alignment:
Q  46 taccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacaagggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggag 145  Q
    ||||||||||| || || || ||| || || ||||||||| |||||||||  ||||  |||| |||| |||||  ||||| ||| ||||||| | |||||    
T  26803102 taccctgttggattgcactctcgagtacaagaagtgaaatcgcttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttggaatttatgggattggag 26803201  T
Q  146 gcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtca 245  Q
    || ||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||    
T  26803202 gcttgggtaaatcagcacttgcaagagcaatctataattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctca 26803301  T
Q  246 taataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcattaaggaa 345  Q
     |||||| ||||||||||||| ||  | || ||| ||| ||||  |  ||||||    |||||||    |||| ||||||| ||| |||| || ||||||    
T  26803302 aaataacttgaaacatctccaagagaagcttcttctaaaaacaactggattgaaaatcaagttagatcatgtttgtgaggggattccaattataaaggaa 26803401  T
Q  346 agactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 386  Q
    ||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  26803402 agactgtgtagaaataagattcttttgattctcgatgatgt 26803442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 46 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 27705930 - 27705590
Alignment:
Q  46 taccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacaagggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggag 145  Q
    ||||||||||| || ||||| ||| || ||||||||||||  ||||||||  ||||  |||| |||| |||||  ||||| ||| ||| ||| | |||||    
T  27705930 taccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcacttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttggaatttttggcattggag 27705831  T
Q  146 gcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtca 245  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||    
T  27705830 gcttgggtaaatcaacacttgcaagagcaatttataattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctca 27705731  T
Q  246 taataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcattaaggaa 345  Q
     ||| || ||||||||||||| ||  | || ||| ||| ||||  |  || |||    |||||||    |||| ||||||| ||| || |||| ||||||    
T  27705730 aaatgacttgaaacatctccaagagaagcttcttctaaaaacaactggatcgaaaataaagttagatcatgtttgtgaggggattccattcataaaggaa 27705631  T
Q  346 agactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 386  Q
    || || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27705630 aggctgtgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 27705590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 46 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 27427138 - 27426801
Alignment:
Q  46 taccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacaagggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggag 145  Q
    ||||||||||| || ||||| ||| || |||||||||||| |||||||||  ||||  |||| |||| |||||  ||||| ||| ||||||| | |||||    
T  27427138 taccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttggaatttatgggattggag 27427039  T
Q  146 gcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtca 245  Q
    ||   ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  | |||||||||||||||  |      
T  27427038 gctcaggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttgaacaagtcagagagaattcagcttc 27426939  T
Q  246 taataacctgaaacatctccaggaagat-ctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcattaagga 344  Q
     |||| | |||||| | |||||| |||| ||||||| ||  ||| || || ||||   |||||||| || ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  27426938 aaatagcttgaaacgtttccagg-agatgctcctttcaaagacacttcaactgaaaattaagttagcagatgtcagtgagggaatctcaatcataaagga 27426840  T
Q  345 aagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatga 383  Q
    |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27426839 aaggttgtgtagaaagaagattcttttgattctcgatga 27426801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 46 - 386
Target Start/End: Original strand, 27679606 - 27679946
Alignment:
Q  46 taccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacaagggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggag 145  Q
    ||||||||||| || ||||| ||| || |||||||||||| |||||||||  |||| || || |||| |||||  ||||| ||| ||||||| | |||||    
T  27679606 taccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgagggatccgatgatggggtccatatggttggaatttatggcattggag 27679705  T
Q  146 gcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtca 245  Q
    |  |||| |||||||||||||||| |  | | |||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||    
T  27679706 gtttggggaaatcaacacttgcaagacaaatctataattttgttgcagatcaattcgaaggttcatgttttcttcatgatgtgagagagaattcagctca 27679805  T
Q  246 taataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcattaaggaa 345  Q
     |||||| ||||| ||||||| ||  | |||||||||| ||||      ||| |   ||||||||    |||||||||||||||| || |||| ||||||    
T  27679806 aaataacttgaaatatctccaagagaagctccttttaaaaacaacaggtttggaaattaagttagaccatgttagtgagggaattccagtcataaaggaa 27679905  T
Q  346 agactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 386  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27679906 agattatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 27679946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 27698128 - 27697772
Alignment:
Q  30 cttaaatgtagccaaataccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacaagggctctgaggatgaggtccgcatggtagga 129  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||| | | || ||  ||||||||   ||||||| || || ||||| |||| |||||  ||||| |||    
T  27698128 cttacatgttgccaattaccctgttggattacagtctcaagtacaaagagtgaaatcaattcttgataatggatctgatgatggggtccatatggttgga 27698029  T
Q  130 ctttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtca 229  Q
     ||| ||| | ||||||| |||| |||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  27698028 atttttgggattggaggcttgggaaaatcaacacttgcaagagcaatctataatttggttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttcataatgtga 27697929  T
Q  230 gagagaattcaagtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaat 329  Q
    ||  |||||||  | | |||||| || |||||||||| ||  | |||||||| | ||||  |  || | |   ||| ||||    ||||||||| |||||    
T  27697928 gaatgaattcagctaaaaataacttggaacatctccaagagaagctcctttttaaaacaactggatcggaaattaatttagaccatgttagtgacggaat 27697829  T
Q  330 ttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 386  Q
    | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  27697828 tccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgacgatgt 27697772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 27592563 - 27592207
Alignment:
Q  30 cttaaatgtagccaaataccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacaagggctctgaggatgaggtccgcatggtagga 129  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||||| || ||||| ||| || |||||||||||| |||||||||  | || |||||  ||| |||||  ||||| |||    
T  27592563 cttaaatgttgccacttaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttgga 27592464  T
Q  130 ctttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtca 229  Q
     ||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| |    
T  27592463 atttatgggattggaggcttgggaaaatcaacacttgcgaaagcaatttataactttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtga 27592364  T
Q  230 gagagaattcaagtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagtt-aaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaa 328  Q
     ||||| ||||  |   |||||| ||||| |||||||| | || |||||||||| |||| || || |||||   |||||||||| ||||||| || ||||    
T  27592363 aagagagttcagcttcaaataacttgaaaaatctccagcaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaa-attaagttaggaagtgttagcgaaggaa 27592265  T
Q  329 tttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 386  Q
    || | |  || |||||||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27592264 ttcctaaaataaaggaaaggctacatggaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 27592207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 46 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 27677146 - 27676806
Alignment:
Q  46 taccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacaagggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggag 145  Q
    ||||||||||| || ||||| ||| || ||||| |||||| |||||||||  | || |||||  ||| |||||  ||||| ||| ||||||| | |||||    
T  27677146 taccctgttggattgcagtctcgagtacaacaaatgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatcatggggtccatatggttggaatttatgggattggag 27677047  T
Q  146 gcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtca 245  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| | ||||| ||||  |      
T  27677046 gcttgggaaaatcaacacttgcgaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgaaagagagttcagcttc 27676947  T
Q  246 taataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagtt-aaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcattaagga 344  Q
     |||||| ||||| |||||||| | || |||||||||| |||| || || |||||   |||||||||| ||||||| || |||||| | |  || |||||    
T  27676946 aaataacttgaaaaatctccagcaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaa-attaagttaggaagtgttagcgaaggaattcctaaaataaagga 27676848  T
Q  345 aagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 386  Q
    ||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27676847 aaggctacatggaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 27676806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 35 - 240
Target Start/End: Original strand, 26824464 - 26824669
Alignment:
Q  35 atgtagccaaataccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacaagggctctgaggatgaggtccgcatggtaggacttta 134  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| || |  ||||| |||| |||||  ||||||||||||||    
T  26824464 atgttgccaaatacccggttggattacagtcccgagtacaacaagtgaaatctcttcttgataacgaatctgatgatgtggtccatatggtaggacttta 26824563  T
Q  135 tggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagag 234  Q
     |||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||  || ||||| | |||||||| ||||||||| | | ||||||||| | || || ||||||    
T  26824564 cggtattggaggtttaggtaaatcaacacttgcaaaagcaacttttaattctattgctgataaatttgaagttttttgttttcttgagaacgtgagagag 26824663  T
Q  235 aattca 240  Q
    ||||||    
T  26824664 aattca 26824669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 92
Target Start/End: Original strand, 25511551 - 25511640
Alignment:
Q  3 catctcgaataatatcaatcatgttttcttaaatgtagccaaataccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttct 92  Q
    |||||| || || |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25511551 catctccaacaagatcaatcatgtttttttgaacgtagccaaataccctgttggattgcagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttct 25511640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 150 - 233
Target Start/End: Original strand, 28140295 - 28140378
Alignment:
Q  150 gggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagaga 233  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||    
T  28140295 gggtaaaacaacacttgcacaagcaatttataattttattgccgatcaatttgaatgtttgtgttttcttcataatgtgagaga 28140378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 28097857 - 28097775
Alignment:
Q  158 caacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 240  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  28097857 caacacttgcaaaagcggtttataatttcattgctggtcaatttgaatgtgtctgtttccttcacaatgtgagagaaaattca 28097775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 151 - 227
Target Start/End: Original strand, 26937790 - 26937866
Alignment:
Q  151 ggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgt 227  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||  ||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  26937790 ggtaaatcaacacttgcacgagcaatttataatttgattggtgatcaatttgaaagtttgtgttttcttcataatgt 26937866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 139 - 204
Target Start/End: Original strand, 26849461 - 26849526
Alignment:
Q  139 actggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaa 204  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  26849461 actggaggaatgggaaaaacaacacttgctcaagcagtttataattcgattgctgatcaatttgaa 26849526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 221
Target Start/End: Original strand, 28243538 - 28243626
Alignment:
Q  133 tatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttca 221  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  28243538 tatgggactggtggaatgggaaagacaacacttgcaagagcagtttataattccatagctgatcaatttgattgtttatgttttcttca 28243626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 158 - 221
Target Start/End: Original strand, 28227720 - 28227783
Alignment:
Q  158 caacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttca 221  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | || ||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  28227720 caacacttgcaagggcagtttataattttatagccgatcaatttgatggtttgtgttttcttca 28227783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 158 - 221
Target Start/End: Original strand, 28235333 - 28235396
Alignment:
Q  158 caacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttca 221  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||   | |||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  28235333 caacacttgcaagagcagtttataattccatagctgatcaatttgatggtttgtgttttcttca 28235396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 133 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 28297179 - 28297072
Alignment:
Q  133 tatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagag 232  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||  |||||||||| | ||||||||||||||   | || ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |    
T  28297179 tatgggactggagggatgggaaagacaacacttgccagagcagtttataattccatagccgatcaatttgatggtttgtgttttcttcacaatgtaaggg 28297080  T
Q  233 agaattca 240  Q
    | ||||||    
T  28297079 aaaattca 28297072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 133 - 240
Target Start/End: Original strand, 28514894 - 28515001
Alignment:
Q  133 tatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagag 232  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||  |||||||||| | ||||||||||||||   | || ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| || |    
T  28514894 tatgggactggagggatgggaaagacaacacttgccagagcagtttataattccatagccgatcaatttgatggtttgtgttttcttcacaatgtaaggg 28514993  T
Q  233 agaattca 240  Q
    | ||||||    
T  28514994 aaaattca 28515001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 241
Target Start/End: Original strand, 26724349 - 26724419
Alignment:
Q  171 agcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaa 241  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||    
T  26724349 agcagtttatgatttgattgctgatcaatttgaagggttgtgtttccttcacaatgtgagagaaaattcaa 26724419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 240
Target Start/End: Original strand, 26950511 - 26950593
Alignment:
Q  158 caacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 240  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||| |   |||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  26950511 caacacttgctcaagcagtttataacttgattgctaatcaatttgaatgcaaatgttttcttcacaatgtgagagaaaattca 26950593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 204
Target Start/End: Original strand, 26975700 - 26975765
Alignment:
Q  139 actggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaa 204  Q
    ||||| || ||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  26975700 actgggggaatgggtaagacaacacttgctcaagcagtttataatttgattgctaatcaatttgaa 26975765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 149 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29843410 - 29843338
Alignment:
Q  149 tgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttca 221  Q
    |||||||| ||||||||||   |||| ||||||||||  |||||||| |||||||| || | |||||||||||    
T  29843410 tgggtaaaacaacacttgctcgagcaatttataatttgattgctgataaatttgaatgtttgtgttttcttca 29843338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 16 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 28127231 - 28126860
Alignment:
Q  16 atcaatcatgttttcttaaatgtagccaaataccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacaagggctctgaggatgagg 115  Q
    ||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||  || | || |||||||||| |||||||| || ||||| | ||| |||||||    
T  28127231 atcaatcgtgttttcttacatgttgccaaatatcctgttggattacaggaccaagtacaacaagtgaatttgcttctcgataagggatatgatgatgagg 28127132  T
Q  116 tccgcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttt 215  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  28127131 tccacatggtaggactttatggtattggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaaggtttatgttt 28127032  T
Q  216 tcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggt 315  Q
    |||  |  |||| ||||||| ||||| ||   ||||  ||||||||||||| ||| | |||||||| | |||||||  |||| ||  |||||||||||||    
T  28127031 tctagaagatgtgagagagatttcaactccatataatttgaaacatctccaagaaaagctccttttgaaaacagttggattggacattaagttaggaggt 28126932  T
Q  316 gttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgtc 387  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||  |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28126931 gttagtgagggaattgcaatcataaaacaaaggctatgcagaaagaagattcttttgattcttgatgatgtc 28126860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 28163931 - 28163561
Alignment:
Q  16 atcaatcatgttttcttaaatgtagccaaataccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacaagggctctgaggatgagg 115  Q
    ||||||| |||||| ||| |||| || ||||| |||||||| ||||| || | | || ||||||||||||||||||| || ||||| | ||| |||||||    
T  28163931 atcaatcgtgtttttttacatgttgcaaaatatcctgttggattacaatctcaagtacaacaagtgaaattgcttctcgataagggatatgatgatgagg 28163832  T
Q  116 tccgcatggtaggactttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttt 215  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  28163831 tccacatggtaggactttatgatactggaggcttgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataatttcattgctgatcaatttgaaggtttatgttt 28163732  T
Q  216 tcttcataatgtcagagagaattcaagtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggt 315  Q
    |||  |  |||| ||||||||||||| ||     ||| ||||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||| || | ||  |||||||||||||    
T  28163731 tctagaagatgtgagagagaattcaactccatccaacttgaaacatctccaggaagagctctttttga-aacagttagatcggacattaagttaggaggt 28163633  T
Q  316 gttagtgagggaatttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgtc 387  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||  |||| |||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  28163632 gttagtgagggaattacaatcataaaacaaaggctacatagaaataaaattcttttgattcttgatgatgtc 28163561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 30 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 267882 - 267526
Alignment:
Q  30 cttaaatgtagccaaataccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacaagggctctgaggatgaggtccgcatggtagga 129  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||| |||  ||| | | || |||||||||||||||||||||| || || ||||| |||| |||||  ||||| |||    
T  267882 cttacatgttgccaattaccctgttggattatggtctcaagtacaacaagtgaaattgcttcttgataatggatctgatgatggggtccatatggttgga 267783  T
Q  130 ctttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtca 229  Q
     ||||||| | ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |    
T  267782 atttatgggattggaggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataattttattgctgatcaatttgaaggattatgttttcttcatgatgtga 267683  T
Q  230 gagagaattcaagtcataa-taacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaa 328  Q
    |||| ||||| ||  |||| |||| ||||||||||||| ||  | |||||||||| ||||  |  |||| |   ||||||||    |||||||||||| |    
T  267682 gagaaaattc-agctataagtaacttgaaacatctccaagagaagctccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagaccatgttagtgagggca 267584  T
Q  329 tttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 386  Q
    || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  267583 ttccaatcattaaggaaaggctatgtagaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 267526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 121; Significance: 7e-62; HSPs: 7)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 30 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 18679098 - 18678742
Alignment:
Q  30 cttaaatgtagccaaataccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacaagggctctgaggatgaggtccgcatggtagga 129  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||| || |||||||||||| |||||||||  |  | ||| | ||||  |||||||||||||||    
T  18679098 cttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaatgatcttatgatggagtccgcatggtagga 18678999  T
Q  130 ctttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtca 229  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| |    
T  18678998 ctttatggcattggaggcatgggtaaattaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtga 18678899  T
Q  230 gagagaattcaagtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaat 329  Q
    |||||||||||  |   ||| |  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||  | ||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  18678898 gagagaattcagcttcaaatcaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacactttcactgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaat 18678799  T
Q  330 ttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 386  Q
    | |    || |||||||| |||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18678798 tccttatataaaggaaaggctacatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 18678742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 18698938 - 18698582
Alignment:
Q  30 cttaaatgtagccaaataccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacaagggctctgaggatgaggtccgcatggtagga 129  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||| || |||||||||||  ||||||||| || || ||||| ||||  ||||||||| |||||    
T  18698938 cttacatgttgccaattaccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaagcgcttcttgataaaggatctgatgatggagtccgcatgttagga 18698839  T
Q  130 ctttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtca 229  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| |    
T  18698838 ctttatggcattggaggcatgggtaaatcaacacttgcgaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtga 18698739  T
Q  230 gagagaattcaagtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaat 329  Q
    |||||||||||  |   ||| |  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |   | ||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  18698738 gagagaattcagcttcaaatcaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacactagcactgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaat 18698639  T
Q  330 ttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 386  Q
    | |    || |||||||| ||   || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18698638 tccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 18698582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 46 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 18654999 - 18654659
Alignment:
Q  46 taccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacaagggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggag 145  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| || || ||||| | ||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18654999 taccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgataaaggatctgatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggag 18654900  T
Q  146 gcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtca 245  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || || |||||| | ||||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| ||||| ||||||  |      
T  18654899 gcatgggaaaatcaacacttgcaaaatcaattaataattgtattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagaaaattcatcttc 18654800  T
Q  246 taataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcattaaggaa 345  Q
     ||| |  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||  | ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |    || ||||||    
T  18654799 aaatcaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacactttcactgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaattccttatataaaggaa 18654700  T
Q  346 agactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 386  Q
    || |||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18654699 aggctacatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 18654659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 46 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 18731026 - 18730686
Alignment:
Q  46 taccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacaagggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggag 145  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| || || ||| | | ||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18731026 taccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgataaaggatcttatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggag 18730927  T
Q  146 gcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtca 245  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| ||||||||||||  |      
T  18730926 gcatgggaaaatcaacacttgctaaagtaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtgagagagaattcagcttc 18730827  T
Q  246 taataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcattaaggaa 345  Q
     ||| |  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| |   | ||||   |||||||||||||||||||||||||||| |    || ||||||    
T  18730826 aaatcaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacactagcactgaaaattaagttaggaggtgttagtgagggaattccctatataaaggaa 18730727  T
Q  346 agactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 386  Q
    || |||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18730726 aggctacatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 18730686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 46 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 18723607 - 18723267
Alignment:
Q  46 taccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacaagggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggag 145  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||| ||||||||| || || ||| | | ||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  18723607 taccctgttgggttgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgataaaggatctaatggtggagtccgcatgataggactttatggtattggag 18723508  T
Q  146 gcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtca 245  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||| | || || ||||||||||||  |      
T  18723507 gcatgggaaaatcaacacttgcaaaaggaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaacgtgagagagaattcagcttc 18723408  T
Q  246 taataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcattaaggaa 345  Q
     ||| |  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||  | ||||   ||| |||||||||||||||||| ||||| |    || ||| ||    
T  18723407 aaatcaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacactttcactgaaaattaacttaggaggtgttagtgagagaattccttatataaagaaa 18723308  T
Q  346 agactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 386  Q
    || |||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18723307 aggctacatacaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 18723267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 46 - 383
Target Start/End: Original strand, 18074417 - 18074754
Alignment:
Q  46 taccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacaagggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggag 145  Q
    ||||||||||| || ||||| ||| || |||||||||||| |||||||||  ||||  |||| |||| |||||  ||||| ||| ||||||| | |||||    
T  18074417 taccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttggaatttatgggattggag 18074516  T
Q  146 gcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtca 245  Q
    ||   ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  | |||||||||||||||  |      
T  18074517 gctcaggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttgaacaagtcagagagaattcagcttc 18074616  T
Q  246 taataacctgaaacatctccaggaagat-ctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcattaagga 344  Q
     |||| | |||||| | |||||| |||| ||||||| ||  ||| || || ||||   |||||||| || ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  18074617 aaatagcttgaaacgtttccagg-agatgctcctttcaaagacacttcaactgaaaattaagttagcagatgtcagtgagggaatctcaatcataaagga 18074715  T
Q  345 aagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatga 383  Q
    |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18074716 aaggttgtgtagaaagaagattcttttgattctcgatga 18074754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 5090392 - 5090284
Alignment:
Q  133 tatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagag 232  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||| || | ||||||||||  ||||| ||||    
T  5090392 tatgggactggaggaatgggtaaaaccacacttggaaaagcaatttacaatttcattgctcatcaatttgaatgtctttgttttcttcccaatgtgagag 5090293  T
Q  233 agaattcaa 241  Q
    | |||||||    
T  5090292 aaaattcaa 5090284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 386
Target Start/End: Original strand, 8127 - 8483
Alignment:
Q  30 cttaaatgtagccaaataccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacaagggctctgaggatgaggtccgcatggtagga 129  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||| || |||| ||||||| |||||||||  | || ||||| ||||  |||| ||||||||||    
T  8127 cttacatgttgccaattaccctgttggattacagtctcgagtacaacatgtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatgatggagtccacatggtagga 8226  T
Q  130 ctttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtca 229  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| |    
T  8227 ctttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttggaaaagcaatttataattttatttctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtga 8326  T
Q  230 gagagaattcaagtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaat 329  Q
    |||||||||||  |   |||||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| || ||  |||   |||||||||| ||||||||||||||||    
T  8327 gagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacacttcaacagaaaactaagttaggaagtgttagtgagggaat 8426  T
Q  330 ttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 386  Q
    | |    || |||||||| ||   || |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  8427 tccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagactcttttgattctcgatgatgt 8483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 30 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 13217 - 12861
Alignment:
Q  30 cttaaatgtagccaaataccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacaagggctctgaggatgaggtccgcatggtagga 129  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||| || |||| ||||||| |||||||||  | || ||||| ||||  |||| ||||||||||    
T  13217 cttacatgttgccaattaccctgttggattacagtctcgagtacaacatgtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatgatggagtccacatggtagga 13118  T
Q  130 ctttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtca 229  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| |    
T  13117 ctttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttggaaaagcaatttataattttatttctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtga 13018  T
Q  230 gagagaattcaagtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaat 329  Q
    |||||||||||  |   |||||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| || ||  |||   |||||||||| ||||||||||||||||    
T  13017 gagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggaactccttttaaaaacacttcaacagaaaactaagttaggaagtgttagtgagggaat 12918  T
Q  330 ttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 386  Q
    | |    || |||||||| ||   || |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  12917 tccttatataaaggaaaggctgcatacaaagaagactcttttgattctcgatgatgt 12861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 30 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 4254 - 3898
Alignment:
Q  30 cttaaatgtagccaaataccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacaagggctctgaggatgaggtccgcatggtagga 129  Q
    |||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||| || |||| ||||||| |||||||||  | || |||||  |||  | || ||||||||||    
T  4254 cttacatgttgccaattaccctgttggattacagtctcgagtacaacatgtgaaatcgcttcttgatgaaggatctgatcatggagcccacatggtagga 4155  T
Q  130 ctttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtca 229  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |   |||||||||| | ||||| |    
T  4154 ctttatggtactggaggcttgggtaaatcaacacttggaaaagcaatttataattttattgctgatgaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtga 4055  T
Q  230 gagagaattcaagtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagtt-aaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaa 328  Q
    |||||||||||  |   |||||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||| || || |||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  4054 gagagaattcagcttcaaataaattgaaacatctccaggaggagctccttttaaaaacacttcaacttgaa-attaagttaggaggtgttagtgagggaa 3956  T
Q  329 tttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 386  Q
    ||||    || |||||||| ||   |  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3955 tttctcatataaaggaaaggctgcattcaaagaagattcttttgattctcgatgatgt 3898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 30 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 3081 - 2725
Alignment:
Q  30 cttaaatgtagccaaataccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacaagggctctgaggatgaggtccgcatggtagga 129  Q
    |||| |||| ||||| |||||||||||  |  |||| ||| || |||||||||||| |||||||||  |  | ||||| ||||  |||| ||||||||||    
T  3081 cttacatgttgccaattaccctgttggaatgaagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgaaagatctgatgatggagtccacatggtagga 2982  T
Q  130 ctttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtca 229  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||| | ||||| |    
T  2981 ctttatggtactggaggattgggtaaatcaacacttgcaaaagcaatttataattttattgctgatcaatttgaatgctcatgttttcttgaaaatgtga 2882  T
Q  230 gagagaattcaagtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagtt-aaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaa 328  Q
    |||||||||||  |   |||||  |||||||||| |||   || |||||||||| |||| || || |||||   |||||| |||||||||||||||||||    
T  2881 gagagaattcagcttcaaataaattgaaacatcttcagttggagctccttttaaaaacacttcaacttgaa-attaagtttggaggtgttagtgagggaa 2783  T
Q  329 tttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 386  Q
    || |    || |||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2782 ttccttatataaaggaaaggctacatagaaagaaggttcttttgattcttgatgatgt 2725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 1)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 29273380 - 29273024
Alignment:
Q  30 cttaaatgtagccaaataccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacaagggctctgaggatgaggtccgcatggtagga 129  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| | | || ||||||| |||| ||||||||| || || ||||| |||| | |||  ||||| |||    
T  29273380 cttacatgttgccaaataccctgttggattacagtctcaagtacaacaagtcaaatcgcttcttgataatggatctgatgatgggatccatatggttgga 29273281  T
Q  130 ctttatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtca 229  Q
     ||||||| | ||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |    
T  29273280 atttatgggattggtggcttgggtaaatcaacccttgcaagagcaatctataatttttttgctgatcaatttgaagatttatgttttcttcatgatgtga 29273181  T
Q  230 gagagaattcaagtcataataacctgaaacatctccaggaagatctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaat 329  Q
    |||||||||||  | | |||||| ||||||||||||| ||  | |||||||||| ||||  |  |||| |   ||||||||    |||||||||||| ||    
T  29273180 gagagaattcagctaaaaataacttgaaacatctccaagagaaactccttttaaaaacaactggattggaaattaagttagatcatgttagtgaggggat 29273081  T
Q  330 ttcaatcattaaggaaagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatgatgt 386  Q
    | |||| || ||||| || |||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  29273080 tccaattataaaggagaggctaagtagaaagaaaattcttttgattctcgatgatgt 29273024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 46 - 383
Target Start/End: Original strand, 60225 - 60562
Alignment:
Q  46 taccctgttgggttacagtcccgaatagaacaagtgaaattgcttcttgacaagggctctgaggatgaggtccgcatggtaggactttatggtactggag 145  Q
    ||||||||||| || ||||| ||| || |||||||||||| |||||||||  ||||  |||| |||| |||||  ||||| ||| ||||||| | |||||    
T  60225 taccctgttggattgcagtctcgagtacaacaagtgaaatcgcttcttgatgagggacctgatgatggggtccatatggttggaatttatgggattggag 60324  T
Q  146 gcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattcaagtca 245  Q
    ||   ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  | |||||||||||||||  |      
T  60325 gctcaggtaaatcaacacttgcaagagcaatctataattttgttgctgatcaatttgaaggtttatgttttcttgaacaagtcagagagaattcagcttc 60424  T
Q  246 taataacctgaaacatctccaggaagat-ctccttttaagaacagttaaattgaaccataagttaggaggtgttagtgagggaatttcaatcattaagga 344  Q
     |||| | |||||| | |||||| |||| ||||||| ||  ||| || || ||||   |||||||| || ||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  60425 aaatagcttgaaacgtttccagg-agatgctcctttcaaagacacttcaactgaaaattaagttagcagatgtcagtgagggaatctcaatcataaagga 60523  T
Q  345 aagactatctagaaagaagattcttttgattcttgatga 383  Q
    |||  | | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  60524 aaggttgtgtagaaagaagattcttttgattctcgatga 60562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 141 - 240
Target Start/End: Original strand, 3280410 - 3280509
Alignment:
Q  141 tggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 240  Q
    |||||| ||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||    
T  3280410 tggaggaatgggtaagacaactcttgcaagagcagtttataatttcattgctaatcaatttgaatgtgtatgttttcttcacaatgtgagagaaaattca 3280509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17992652 - 17992547
Alignment:
Q  135 tggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagag 234  Q
    ||||||||| || ||||| ||  |||| |||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||   ||||| ||||| ||||| |||||     
T  17992652 tggtactggtggaatgggcaagacaactcttgctcaagcagtttataatttggttgctaatcaatttcaatgtaagtgtttccttcacaatgtgagagaa 17992553  T
Q  235 aattca 240  Q
    ||||||    
T  17992552 aattca 17992547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 240
Target Start/End: Original strand, 16691618 - 16691717
Alignment:
Q  141 tggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttcataatgtcagagagaattca 240  Q
    |||||| || |||||| ||||||||||   |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || | |||||||||||| | || ||||| ||||||    
T  16691618 tggaggaatcggtaaaacaacacttgctcgagcaatttataatttgattgctgatcaatttgaatgtttgtgttttcttcatgacgtgagagaaaattca 16691717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 221
Target Start/End: Original strand, 43700 - 43788
Alignment:
Q  133 tatggtactggaggcatgggtaaatcaacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttca 221  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  43700 tatgggactggtggaatgggaaagacaacacttgcaagagcagtttataattccatagctgatcaatttgattgtttatgttttcttca 43788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 158 - 221
Target Start/End: Original strand, 28218 - 28281
Alignment:
Q  158 caacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttca 221  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| | || ||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  28218 caacacttgcaagggcagtttataattttatagccgatcaatttgatggtttgtgttttcttca 28281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 158 - 221
Target Start/End: Original strand, 35495 - 35558
Alignment:
Q  158 caacacttgcaaaagcagtttataattttgttgctgatcaatttgaaggtgtatgttttcttca 221  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||   | |||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  35495 caacacttgcaagagcagtttataattccatagctgatcaatttgatggtttgtgttttcttca 35558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 3383 times since January 2019
Visitors: 4813