View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0772_low_14 (Length: 316)

Name: NF0772_low_14
Description: NF0772
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0772_low_14
NF0772_low_14
[»] chr1 (54 HSPs)
chr1 (1-203)||(33256234-33256436)
chr1 (1-203)||(33276406-33276608)
chr1 (1-203)||(28492287-28492489)
chr1 (1-203)||(1577862-1578064)
chr1 (2-203)||(19717519-19717720)
chr1 (1-203)||(22600065-22600267)
chr1 (1-203)||(1900340-1900542)
chr1 (1-203)||(20954356-20954558)
chr1 (1-203)||(22153852-22154054)
chr1 (1-203)||(22201619-22201821)
chr1 (1-203)||(38282562-38282763)
chr1 (3-199)||(32785823-32786018)
chr1 (1-203)||(10757416-10757619)
chr1 (4-203)||(48704199-48704398)
chr1 (4-203)||(12284418-12284617)
chr1 (16-203)||(22427255-22427442)
chr1 (4-203)||(36134185-36134383)
chr1 (4-186)||(35401821-35402003)
chr1 (1-203)||(2268526-2268725)
chr1 (4-203)||(16235182-16235381)
chr1 (1-203)||(29215792-29215992)
chr1 (16-203)||(39200890-39201077)
chr1 (16-200)||(2267087-2267271)
chr1 (16-203)||(22464706-22464894)
chr1 (1-200)||(30893090-30893290)
chr1 (13-203)||(25448461-25448651)
chr1 (11-203)||(21028788-21028980)
chr1 (15-200)||(21191763-21191947)
chr1 (13-203)||(2834684-2834875)
chr1 (4-186)||(23036413-23036595)
chr1 (13-203)||(35040161-35040351)
chr1 (15-203)||(12613713-12613899)
chr1 (11-203)||(26702022-26702214)
chr1 (1-203)||(48570117-48570316)
chr1 (1-187)||(7309830-7310015)
chr1 (38-192)||(14263371-14263525)
chr1 (1-203)||(21702809-21703008)
chr1 (1-203)||(44821430-44821630)
chr1 (13-203)||(30572192-30572381)
chr1 (1-203)||(2327324-2327525)
chr1 (15-183)||(17024862-17025029)
chr1 (13-203)||(46088984-46089165)
chr1 (1-200)||(10250984-10251171)
chr1 (58-186)||(18896537-18896665)
chr1 (111-203)||(21121057-21121149)
chr1 (111-203)||(21135153-21135245)
chr1 (94-187)||(7745066-7745159)
chr1 (134-203)||(19215607-19215676)
chr1 (134-203)||(23024783-23024852)
chr1 (111-184)||(42284642-42284715)
chr1 (111-187)||(21984607-21984683)
chr1 (111-203)||(37642243-37642335)
chr1 (132-192)||(21204937-21204997)
chr1 (155-198)||(17371042-17371085)
[»] chr8 (61 HSPs)
chr8 (1-203)||(39693523-39693725)
chr8 (1-200)||(12757724-12757923)
chr8 (3-203)||(19156184-19156384)
chr8 (1-203)||(602681-602883)
chr8 (1-203)||(16188972-16189174)
chr8 (1-203)||(16207294-16207496)
chr8 (1-203)||(16681264-16681466)
chr8 (1-203)||(17914447-17914649)
chr8 (1-175)||(33082873-33083047)
chr8 (1-200)||(17525689-17525889)
chr8 (1-200)||(17441769-17441967)
chr8 (1-203)||(29693303-29693505)
chr8 (3-203)||(24646326-24646526)
chr8 (1-200)||(18321120-18321319)
chr8 (1-203)||(21932871-21933073)
chr8 (16-203)||(23185202-23185389)
chr8 (4-203)||(18679803-18680002)
chr8 (1-192)||(19943234-19943427)
chr8 (4-203)||(18718989-18719188)
chr8 (11-203)||(17701733-17701925)
chr8 (1-202)||(20382355-20382556)
chr8 (1-203)||(18121070-18121269)
chr8 (3-202)||(17267463-17267661)
chr8 (16-202)||(30421404-30421591)
chr8 (1-203)||(17797410-17797610)
chr8 (1-185)||(23263572-23263757)
chr8 (4-135)||(20255529-20255660)
chr8 (13-203)||(1237625-1237815)
chr8 (13-203)||(45538412-45538602)
chr8 (1-203)||(15336051-15336251)
chr8 (1-203)||(15425116-15425316)
chr8 (1-203)||(15516420-15516620)
chr8 (13-200)||(24551265-24551452)
chr8 (17-203)||(43644884-43645069)
chr8 (14-203)||(40845362-40845550)
chr8 (4-192)||(18722610-18722798)
chr8 (4-192)||(18730955-18731143)
chr8 (10-192)||(18685367-18685549)
chr8 (4-200)||(19707497-19707692)
chr8 (13-203)||(9320557-9320748)
chr8 (1-76)||(22745602-22745677)
chr8 (13-203)||(22673766-22673956)
chr8 (18-185)||(22461617-22461783)
chr8 (1-203)||(36105183-36105383)
chr8 (1-200)||(22663107-22663304)
chr8 (73-202)||(19956374-19956502)
chr8 (127-203)||(25164058-25164134)
chr8 (108-203)||(14989519-14989614)
chr8 (13-187)||(24833029-24833204)
chr8 (1-203)||(6407714-6407904)
chr8 (108-203)||(18151714-18151809)
chr8 (82-198)||(45567943-45568059)
chr8 (111-203)||(13430699-13430791)
chr8 (132-192)||(43639782-43639842)
chr8 (132-187)||(21301026-21301081)
chr8 (160-198)||(7018416-7018454)
chr8 (160-198)||(20259652-20259690)
chr8 (160-198)||(21046282-21046320)
chr8 (132-186)||(21288408-21288462)
chr8 (103-187)||(18772624-18772707)
chr8 (111-175)||(33560295-33560359)
[»] chr2 (65 HSPs)
chr2 (1-203)||(25829124-25829326)
chr2 (1-203)||(30666979-30667181)
chr2 (4-203)||(13963889-13964088)
chr2 (3-203)||(23234997-23235197)
chr2 (1-203)||(20568658-20568860)
chr2 (1-199)||(30621210-30621408)
chr2 (1-199)||(30623831-30624029)
chr2 (1-203)||(9015278-9015478)
chr2 (1-203)||(21537156-21537358)
chr2 (1-203)||(22188010-22188212)
chr2 (11-203)||(18376824-18377016)
chr2 (1-203)||(25037167-25037369)
chr2 (1-203)||(25041274-25041476)
chr2 (3-203)||(19540406-19540606)
chr2 (1-203)||(24576025-24576228)
chr2 (3-203)||(24377091-24377291)
chr2 (1-203)||(24850573-24850776)
chr2 (1-203)||(10009657-10009860)
chr2 (3-203)||(22317583-22317784)
chr2 (5-203)||(38781388-38781587)
chr2 (1-175)||(20151944-20152117)
chr2 (2-203)||(28140528-28140729)
chr2 (11-203)||(24779333-24779525)
chr2 (16-192)||(6574045-6574223)
chr2 (33-203)||(40782467-40782637)
chr2 (1-167)||(22260432-22260598)
chr2 (11-203)||(39037560-39037752)
chr2 (4-203)||(23595481-23595677)
chr2 (15-203)||(41121642-41121829)
chr2 (11-200)||(25189391-25189579)
chr2 (13-203)||(28711618-28711808)
chr2 (13-203)||(31800807-31800997)
chr2 (18-192)||(26619027-26619200)
chr2 (11-203)||(22454908-22455100)
chr2 (14-203)||(6392624-6392814)
chr2 (13-175)||(45087102-45087266)
chr2 (1-187)||(34321846-34322030)
chr2 (1-203)||(22802451-22802650)
chr2 (1-203)||(33074216-33074416)
chr2 (13-203)||(28701149-28701339)
chr2 (13-187)||(30557239-30557415)
chr2 (1-203)||(31327875-31328075)
chr2 (1-203)||(31334596-31334796)
chr2 (22-186)||(22272139-22272303)
chr2 (82-203)||(35743989-35744110)
chr2 (18-203)||(23184236-23184414)
chr2 (18-187)||(19115089-19115257)
chr2 (108-203)||(28550933-28551028)
chr2 (108-203)||(44840424-44840519)
chr2 (18-187)||(44881173-44881341)
chr2 (1-115)||(7609039-7609154)
chr2 (108-203)||(22776303-22776398)
chr2 (108-203)||(22781681-22781776)
chr2 (111-203)||(31968061-31968153)
chr2 (108-203)||(1587048-1587142)
chr2 (108-203)||(14581505-14581600)
chr2 (108-203)||(40332077-40332172)
chr2 (10-187)||(18430858-18431034)
chr2 (108-186)||(3277037-3277115)
chr2 (18-187)||(18702744-18702912)
chr2 (108-187)||(22785670-22785749)
chr2 (163-203)||(22258191-22258231)
chr2 (132-175)||(23392707-23392750)
chr2 (160-198)||(19498010-19498048)
chr2 (155-187)||(24814645-24814677)
[»] chr4 (59 HSPs)
chr4 (1-203)||(19666362-19666564)
chr4 (1-203)||(16632430-16632632)
chr4 (1-203)||(29680463-29680665)
chr4 (3-203)||(37985533-37985733)
chr4 (3-195)||(12601099-12601291)
chr4 (1-203)||(12811097-12811296)
chr4 (8-203)||(9140902-9141097)
chr4 (1-203)||(3395580-3395782)
chr4 (1-203)||(19884692-19884893)
chr4 (1-203)||(37435454-37435656)
chr4 (1-203)||(45833384-45833586)
chr4 (1-203)||(19620980-19621182)
chr4 (1-203)||(55380280-55380482)
chr4 (1-203)||(14604825-14605028)
chr4 (16-192)||(22675454-22675630)
chr4 (1-203)||(10072925-10073126)
chr4 (1-203)||(14904275-14904477)
chr4 (4-200)||(56034567-56034763)
chr4 (3-175)||(3483739-3483911)
chr4 (1-203)||(19911799-19912002)
chr4 (16-203)||(13576048-13576235)
chr4 (1-140)||(14833449-14833588)
chr4 (13-187)||(413008-413182)
chr4 (13-201)||(29121362-29121550)
chr4 (1-203)||(10692841-10693041)
chr4 (1-203)||(10906607-10906807)
chr4 (14-192)||(17247245-17247422)
chr4 (15-203)||(6641674-6641861)
chr4 (11-203)||(40846089-40846281)
chr4 (1-192)||(54679931-54680118)
chr4 (1-203)||(23750512-23750712)
chr4 (1-203)||(6517475-6517675)
chr4 (13-203)||(8105628-8105819)
chr4 (36-183)||(16940026-16940172)
chr4 (1-203)||(3105341-3105540)
chr4 (1-96)||(23123528-23123623)
chr4 (58-192)||(11915701-11915835)
chr4 (39-203)||(56533018-56533182)
chr4 (1-203)||(17398605-17398795)
chr4 (24-203)||(25651046-25651224)
chr4 (11-137)||(15139283-15139409)
chr4 (94-203)||(16853493-16853602)
chr4 (18-187)||(41114707-41114875)
chr4 (80-187)||(17788044-17788152)
chr4 (111-203)||(22190836-22190928)
chr4 (132-203)||(38513868-38513939)
chr4 (1-129)||(55731844-55731969)
chr4 (31-192)||(17540396-17540556)
chr4 (134-203)||(20977447-20977516)
chr4 (111-203)||(40860657-40860749)
chr4 (148-187)||(8685509-8685548)
chr4 (58-184)||(11901196-11901322)
chr4 (111-203)||(9751569-9751661)
chr4 (135-203)||(39419787-39419855)
chr4 (132-187)||(1672395-1672450)
chr4 (132-187)||(1674870-1674925)
chr4 (153-203)||(14154065-14154115)
chr4 (134-175)||(3499704-3499745)
chr4 (134-192)||(27188690-27188748)
[»] chr3 (67 HSPs)
chr3 (1-203)||(49642724-49642926)
chr3 (1-203)||(37467328-37467530)
chr3 (1-203)||(14392966-14393168)
chr3 (18-203)||(41494994-41495179)
chr3 (1-200)||(13948334-13948533)
chr3 (1-201)||(28582103-28582303)
chr3 (1-203)||(2561183-2561385)
chr3 (1-203)||(31303381-31303583)
chr3 (1-200)||(17238884-17239083)
chr3 (1-187)||(38177605-38177791)
chr3 (30-203)||(13780575-13780748)
chr3 (1-200)||(15903196-15903396)
chr3 (16-203)||(40799869-40800056)
chr3 (1-203)||(6090727-6090929)
chr3 (1-203)||(12963047-12963249)
chr3 (11-203)||(29951410-29951602)
chr3 (11-203)||(30000564-30000756)
chr3 (1-203)||(20646149-20646352)
chr3 (1-203)||(18121584-18121786)
chr3 (1-184)||(14969341-14969524)
chr3 (4-175)||(13824092-13824263)
chr3 (1-203)||(18142714-18142916)
chr3 (16-203)||(47207701-47207889)
chr3 (1-203)||(12726192-12726394)
chr3 (1-203)||(16658580-16658782)
chr3 (16-203)||(47405398-47405585)
chr3 (1-203)||(49553451-49553653)
chr3 (19-203)||(11223559-11223742)
chr3 (11-203)||(16032520-16032711)
chr3 (1-201)||(52920403-52920602)
chr3 (3-203)||(19888908-19889107)
chr3 (13-203)||(53056701-53056891)
chr3 (11-202)||(12388845-12389035)
chr3 (21-186)||(46349826-46349991)
chr3 (1-203)||(20627395-20627595)
chr3 (64-203)||(22804048-22804187)
chr3 (1-203)||(24775498-24775698)
chr3 (1-187)||(2785075-2785260)
chr3 (4-203)||(25398238-25398419)
chr3 (17-192)||(14955433-14955608)
chr3 (15-192)||(20725093-20725269)
chr3 (11-185)||(19249385-19249558)
chr3 (1-203)||(22140759-22140959)
chr3 (13-187)||(33583240-33583416)
chr3 (21-203)||(29855404-29855587)
chr3 (18-192)||(12968312-12968485)
chr3 (18-185)||(23538146-23538312)
chr3 (1-192)||(5213583-5213771)
chr3 (1-203)||(46796341-46796531)
chr3 (13-129)||(11869137-11869253)
chr3 (1-200)||(21640865-21641061)
chr3 (132-203)||(11868264-11868335)
chr3 (111-203)||(21605726-21605818)
chr3 (1-203)||(49666379-49666569)
chr3 (18-192)||(26417659-26417832)
chr3 (111-203)||(21636742-21636834)
chr3 (49-175)||(50300246-50300372)
chr3 (94-186)||(11909079-11909171)
chr3 (132-203)||(30054310-30054381)
chr3 (153-203)||(1728129-1728179)
chr3 (134-203)||(9700131-9700200)
chr3 (94-198)||(12752683-12752779)
chr3 (94-165)||(45858804-45858875)
chr3 (153-198)||(37412605-37412650)
chr3 (111-175)||(40850991-40851055)
chr3 (94-198)||(51341011-51341107)
chr3 (160-192)||(13557777-13557809)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (9-201)||(18542-18734)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (1-203)||(14644-14846)
[»] scaffold0084 (3 HSPs)
scaffold0084 (1-203)||(32481-32683)
scaffold0084 (1-203)||(49328-49530)
scaffold0084 (82-198)||(339-455)
[»] chr7 (73 HSPs)
chr7 (1-202)||(15088513-15088714)
chr7 (1-203)||(13302802-13303004)
chr7 (1-203)||(10883137-10883339)
chr7 (1-203)||(13137859-13138061)
chr7 (1-203)||(44467056-44467259)
chr7 (1-203)||(2500030-2500232)
chr7 (1-201)||(13730639-13730839)
chr7 (1-203)||(2913572-2913774)
chr7 (7-203)||(13880096-13880292)
chr7 (3-203)||(21695393-21695593)
chr7 (1-203)||(9069554-9069756)
chr7 (1-203)||(13648721-13648923)
chr7 (5-203)||(16316525-16316723)
chr7 (1-203)||(21692279-21692481)
chr7 (1-200)||(21283337-21283536)
chr7 (1-203)||(11792899-11793101)
chr7 (1-203)||(22577985-22578187)
chr7 (1-203)||(33691676-33691878)
chr7 (3-200)||(11319400-11319597)
chr7 (3-200)||(28409034-28409231)
chr7 (1-200)||(24788136-24788335)
chr7 (3-203)||(30025897-30026097)
chr7 (1-203)||(30944289-30944489)
chr7 (1-203)||(12366712-12366914)
chr7 (1-187)||(15467924-15468110)
chr7 (1-192)||(23279923-23280113)
chr7 (1-203)||(29935323-29935524)
chr7 (4-200)||(5000788-5000985)
chr7 (1-199)||(30945322-30945518)
chr7 (16-203)||(9709781-9709968)
chr7 (15-198)||(19237022-19237204)
chr7 (1-203)||(48236868-48237068)
chr7 (1-203)||(28622322-28622522)
chr7 (11-203)||(13018479-13018671)
chr7 (1-200)||(14426542-14426739)
chr7 (16-203)||(33605677-33605865)
chr7 (17-200)||(39284545-39284727)
chr7 (13-203)||(16111860-16112050)
chr7 (4-174)||(13692372-13692533)
chr7 (12-203)||(331637-331828)
chr7 (91-203)||(16309961-16310073)
chr7 (13-200)||(35952663-35952851)
chr7 (18-203)||(41842254-41842439)
chr7 (66-201)||(14193108-14193243)
chr7 (15-175)||(13880608-13880768)
chr7 (1-203)||(13260587-13260781)
chr7 (4-202)||(13893966-13894162)
chr7 (13-203)||(4821466-4821655)
chr7 (39-175)||(12174342-12174479)
chr7 (20-169)||(16543003-16543152)
chr7 (20-169)||(16622510-16622659)
chr7 (11-178)||(13032046-13032213)
chr7 (1-67)||(4494634-4494700)
chr7 (83-200)||(19711059-19711176)
chr7 (48-203)||(8182922-8183076)
chr7 (13-150)||(15704475-15704612)
chr7 (108-200)||(1293025-1293117)
chr7 (1-192)||(2265485-2265674)
chr7 (13-115)||(13472555-13472658)
chr7 (74-175)||(9098283-9098384)
chr7 (63-150)||(16556664-16556751)
chr7 (63-150)||(16608911-16608998)
chr7 (108-203)||(48062891-48062986)
chr7 (111-198)||(14425444-14425531)
chr7 (111-203)||(27871710-27871803)
chr7 (111-187)||(19339324-19339400)
chr7 (135-203)||(24794813-24794881)
chr7 (144-203)||(4494569-4494628)
chr7 (108-187)||(16412000-16412078)
chr7 (111-203)||(48805953-48806045)
chr7 (160-197)||(14745750-14745787)
chr7 (1-56)||(7339840-7339893)
chr7 (135-203)||(32264816-32264884)
[»] chr5 (46 HSPs)
chr5 (1-203)||(6512374-6512573)
chr5 (3-203)||(17814960-17815160)
chr5 (1-203)||(21910548-21910750)
chr5 (1-203)||(23412917-23413119)
chr5 (1-203)||(89365-89567)
chr5 (1-203)||(41566377-41566579)
chr5 (1-203)||(20550887-20551089)
chr5 (1-203)||(7745636-7745838)
chr5 (1-203)||(21072184-21072385)
chr5 (16-203)||(33022656-33022843)
chr5 (1-203)||(19536243-19536446)
chr5 (1-203)||(26784346-26784548)
chr5 (1-203)||(13545463-13545657)
chr5 (16-203)||(31117869-31118057)
chr5 (13-203)||(4887014-4887204)
chr5 (1-203)||(30742973-30743172)
chr5 (16-203)||(23881059-23881246)
chr5 (1-203)||(11993880-11994080)
chr5 (11-203)||(6499231-6499423)
chr5 (11-202)||(25096777-25096969)
chr5 (11-202)||(25154747-25154939)
chr5 (11-203)||(642661-642849)
chr5 (13-203)||(15516962-15517151)
chr5 (26-203)||(12352763-12352940)
chr5 (11-203)||(21198958-21199148)
chr5 (1-203)||(42243673-42243873)
chr5 (13-203)||(14086492-14086684)
chr5 (13-203)||(33933259-33933453)
chr5 (1-203)||(29138353-29138551)
chr5 (11-203)||(9398698-9398879)
chr5 (11-203)||(21099658-21099849)
chr5 (39-200)||(3245423-3245583)
chr5 (1-187)||(26759157-26759341)
chr5 (82-203)||(28139599-28139720)
chr5 (84-203)||(30115863-30115982)
chr5 (59-192)||(26765501-26765634)
chr5 (108-203)||(9088961-9089056)
chr5 (108-200)||(28464389-28464481)
chr5 (94-198)||(32160763-32160867)
chr5 (108-203)||(10848765-10848860)
chr5 (108-203)||(25930206-25930301)
chr5 (111-203)||(35932059-35932151)
chr5 (83-198)||(11208011-11208125)
chr5 (103-187)||(16607520-16607603)
chr5 (1-75)||(25930110-25930182)
chr5 (134-192)||(23391679-23391737)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (1-203)||(1686-1888)
[»] scaffold0004 (4 HSPs)
scaffold0004 (1-203)||(377472-377674)
scaffold0004 (1-203)||(220234-220435)
scaffold0004 (14-203)||(211394-211583)
scaffold0004 (22-194)||(244219-244390)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (1-200)||(25888-26087)
scaffold0083 (36-166)||(44652-44782)
[»] chr6 (47 HSPs)
chr6 (1-203)||(15302196-15302398)
chr6 (1-203)||(32544261-32544463)
chr6 (3-202)||(20112652-20112852)
chr6 (1-203)||(13602168-13602370)
chr6 (1-201)||(9717841-9718041)
chr6 (1-199)||(23284564-23284762)
chr6 (1-203)||(12715370-12715573)
chr6 (1-203)||(26972179-26972379)
chr6 (11-200)||(15987232-15987422)
chr6 (17-203)||(18378310-18378496)
chr6 (1-187)||(13435544-13435730)
chr6 (1-203)||(14100391-14100592)
chr6 (1-203)||(29918013-29918214)
chr6 (4-203)||(15531578-15531777)
chr6 (1-186)||(21625114-21625298)
chr6 (4-203)||(24116824-24117024)
chr6 (1-203)||(19086154-19086346)
chr6 (1-203)||(19623975-19624177)
chr6 (1-203)||(18435552-18435754)
chr6 (12-175)||(19688790-19688953)
chr6 (16-203)||(22802137-22802324)
chr6 (17-199)||(20730671-20730853)
chr6 (16-203)||(16265116-16265303)
chr6 (1-169)||(34451619-34451787)
chr6 (15-186)||(10640384-10640555)
chr6 (1-203)||(16336123-16336323)
chr6 (13-200)||(15954702-15954889)
chr6 (13-203)||(20487880-20488071)
chr6 (1-203)||(16877209-16877409)
chr6 (13-192)||(21618251-21618430)
chr6 (1-203)||(22076360-22076560)
chr6 (1-119)||(25597559-25597677)
chr6 (33-203)||(26943572-26943741)
chr6 (1-197)||(12348995-12349188)
chr6 (31-199)||(12423261-12423428)
chr6 (18-186)||(19470683-19470850)
chr6 (1-192)||(19832985-19833175)
chr6 (112-203)||(25594064-25594155)
chr6 (16-187)||(21235137-21235296)
chr6 (48-203)||(33351927-33352079)
chr6 (122-203)||(17381517-17381598)
chr6 (111-203)||(19066079-19066171)
chr6 (134-200)||(19482751-19482817)
chr6 (134-203)||(17316609-17316678)
chr6 (103-187)||(25930485-25930568)
chr6 (132-203)||(26589595-26589667)
chr6 (93-198)||(14051425-14051529)
[»] scaffold0771 (1 HSPs)
scaffold0771 (1-200)||(474-673)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (4-203)||(60012-60211)
scaffold0026 (1-203)||(7922-8124)
scaffold0026 (11-48)||(151794-151831)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (9-203)||(12205-12399)
[»] scaffold0227 (1 HSPs)
scaffold0227 (1-203)||(22672-22874)
[»] scaffold0161 (2 HSPs)
scaffold0161 (1-200)||(10020-10220)
scaffold0161 (132-200)||(14816-14884)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (1-200)||(15116-15315)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (1-203)||(5603-5805)
[»] scaffold0035 (3 HSPs)
scaffold0035 (1-200)||(19385-19584)
scaffold0035 (13-203)||(99133-99320)
scaffold0035 (108-184)||(29809-29884)
[»] scaffold0210 (1 HSPs)
scaffold0210 (1-203)||(1656-1858)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (1-194)||(7708-7901)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (3-203)||(20886-21086)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (1-203)||(27342-27544)
[»] scaffold0426 (1 HSPs)
scaffold0426 (31-203)||(13567-13739)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (1-203)||(9965-10167)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (3-203)||(36690-36890)
scaffold0120 (3-203)||(42115-42315)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (1-203)||(212350-212553)
scaffold0005 (1-140)||(6111-6250)
[»] scaffold0217 (3 HSPs)
scaffold0217 (9-203)||(19027-19221)
scaffold0217 (1-200)||(9559-9755)
scaffold0217 (13-203)||(22056-22246)
[»] scaffold0861 (1 HSPs)
scaffold0861 (4-181)||(4863-5040)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (1-186)||(103585-103770)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (1-203)||(89970-90170)
scaffold0003 (108-187)||(712-790)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (1-203)||(15789-15993)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (1-140)||(30283-30422)
scaffold0047 (13-203)||(9899-10088)
[»] scaffold1359 (2 HSPs)
scaffold1359 (1-200)||(570-767)
scaffold1359 (1-198)||(1680-1865)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-203)||(215412-215612)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (11-203)||(9952-10144)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (15-203)||(6003-6190)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (3-203)||(143093-143284)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (14-203)||(78292-78481)
[»] scaffold0439 (1 HSPs)
scaffold0439 (1-203)||(6655-6855)
[»] scaffold0334 (2 HSPs)
scaffold0334 (2-169)||(9825-9992)
scaffold0334 (165-200)||(7823-7858)
[»] scaffold1434 (1 HSPs)
scaffold1434 (1-134)||(699-832)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (15-203)||(5529-5717)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (1-200)||(60802-60999)
[»] scaffold1331 (1 HSPs)
scaffold1331 (1-203)||(1614-1814)
[»] scaffold0056 (3 HSPs)
scaffold0056 (18-185)||(36115-36281)
scaffold0056 (111-203)||(34827-34919)
scaffold0056 (111-200)||(25688-25777)
[»] scaffold0022 (5 HSPs)
scaffold0022 (11-203)||(159051-159242)
scaffold0022 (1-136)||(39488-39623)
scaffold0022 (1-136)||(137548-137683)
scaffold0022 (138-203)||(37398-37463)
scaffold0022 (138-203)||(135458-135523)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (18-186)||(1452-1619)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (1-203)||(9151-9350)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (11-202)||(43843-44032)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (3-83)||(4908-4988)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (82-203)||(25393-25514)
scaffold0247 (160-203)||(15811-15854)
[»] scaffold0471 (1 HSPs)
scaffold0471 (1-203)||(3300-3500)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (18-198)||(40638-40817)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (121-183)||(2028-2090)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (58-192)||(5634-5767)
[»] scaffold0414 (1 HSPs)
scaffold0414 (1-192)||(7071-7260)
[»] scaffold1747 (1 HSPs)
scaffold1747 (108-192)||(1324-1408)
[»] scaffold1745 (1 HSPs)
scaffold1745 (108-192)||(3-87)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (59-203)||(2702-2845)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (82-198)||(164940-165056)
scaffold0011 (1-145)||(65344-65485)
scaffold0011 (1-145)||(144389-144530)
[»] scaffold0527 (1 HSPs)
scaffold0527 (13-168)||(7963-8117)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (98-203)||(74577-74682)
scaffold0025 (15-48)||(74718-74751)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (108-203)||(17785-17880)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (83-198)||(15617-15732)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (1-70)||(5852-5922)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (83-192)||(38080-38189)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (94-186)||(1803-1895)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (132-203)||(7377-7448)
[»] scaffold0473 (1 HSPs)
scaffold0473 (135-203)||(2738-2806)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (132-203)||(87644-87715)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (113-203)||(846-935)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (132-192)||(3939-3999)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (162-203)||(6002-6043)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (111-192)||(31808-31888)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (132-192)||(7292-7352)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (134-192)||(731-789)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (155-187)||(6589-6621)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 54)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 33256234 - 33256436
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  33256234 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacgactattttaaaa 33256333  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33256334 ggatttgaaggcattggatgcttgttctttgaagggcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 33256433  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  33256434 gct 33256436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 33276406 - 33276608
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  33276406 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacgactattttaaaa 33276505  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33276506 ggatttgaaggcattggatgcttgttctttgaagggcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 33276605  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  33276606 gct 33276608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 28492287 - 28492489
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  28492287 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatatcgtctaagcattgcagaagactagaagagtgaagcaacaactattttgaaa 28492386  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28492387 ggatttgaaggcattggatgcttgttctttgaatagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 28492486  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  28492487 gct 28492489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 1578064 - 1577862
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1578064 aggagatgcaagacttagagcttcaaaggttgttcaatagatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacgactattttgaaa 1577965  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    | |||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1577964 gaatttgaaagcattggatgcttgttcttttaagagcgttgacaaagtataattgtactaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 1577865  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  1577864 gct 1577862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 19717720 - 19717519
Alignment:
Q  2 ggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaag 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19717720 ggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtcgaagcattgcagaggactggaagagtgaagcaacgactattttgaaag 19717621  T
Q  102 gattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctg 201  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  19717620 gatttgaaggcatcggatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaacaactaactccacaaatcagtttgtgtctctg 19717521  T
Q  202 ct 203  Q
    ||    
T  19717520 ct 19717519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 22600065 - 22600267
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  22600065 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggctgttcaatggatttaatcttgtctaagcattgcagaagactggaagagtaaaacaacgactattttgaaa 22600164  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  22600165 ggatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctct 22600264  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  22600265 gct 22600267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 1900542 - 1900340
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1900542 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttattcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacgactattttgaaa 1900443  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| ||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  1900442 ggatttaaaggcattgaatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacagttgtaagaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctct 1900343  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  1900342 gct 1900340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 20954356 - 20954558
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | | |||||||||    
T  20954356 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagacaggaagagtgaagcaatggccattttgaaa 20954455  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| || ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20954456 ggatttgaaagcattggaggcttattctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtaccaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtttctct 20954555  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  20954556 gct 20954558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22154054 - 22153852
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||| |||||||    
T  22154054 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggctgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactagaatagtgaagcaacaactaatttgaaa 22153955  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  22153954 ggatttgaaagcattggatgattgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctct 22153855  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  22153854 gct 22153852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 22201619 - 22201821
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||||||| ||||||||||||    
T  22201619 aggagatgcaagacttaaagcgacaaaggctgctcaatgcatttaatctcgtctaagcattgcagaagactgaaaaagtaaagcaacaactattttgaaa 22201718  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22201719 ggatttgaaggcattggatgcttgttctatgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 22201818  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  22201819 gct 22201821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 38282763 - 38282562
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  38282763 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcatcgcagaagactggaagagtgaagcaacgggtattttgaaa 38282664  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| ||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  38282663 ggatttaaaggcattgaatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagt-tacaaccactatctccactactctgtttttgtctct 38282565  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  38282564 gct 38282562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 199
Target Start/End: Original strand, 32785823 - 32786018
Alignment:
Q  3 gagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaagg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  32785823 gagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttca-tggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaaaagtgaagcaacgactagtttgaaagg 32785921  T
Q  103 attttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctc 199  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  32785922 atttgaaggcattggatgcttgttcttaaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactatgtttttgtctc 32786018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 10757619 - 10757416
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaa-ggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||| |||||||| |||||||||||    
T  10757619 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaaaatcagaagagtgaagcaacaactattttgaa 10757520  T
Q  100 aggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctc 199  Q
    ||||||| || |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10757519 aggatttgaaagcattggatgattgttctttgaagagcattgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatcttcactactcagtttgtgtctc 10757420  T
Q  200 tgct 203  Q
    ||||    
T  10757419 tgct 10757416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 48704398 - 48704199
Alignment:
Q  4 agatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaagga 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  48704398 agatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtttaagcaatgcagaagactggaagagtgaaacaacaactattttgaaagga 48704299  T
Q  104 ttttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  48704298 tttgaaggcactggatgcttgttctttgaagaacgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccaatgtctccactactcaatttatgtctctgct 48704199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 12284617 - 12284418
Alignment:
Q  4 agatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaagga 103  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12284617 agatgcaagacttagagcttcaaaggttgttcaatggattcaatctcgtccaagcattgcaaaagaccagaggagtgaagcaacgactattttgaaagga 12284518  T
Q  104 ttttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12284517 tttgaaagcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaacactatctccactaatcagtttgtgtctctgct 12284418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 16 - 203
Target Start/End: Original strand, 22427255 - 22427442
Alignment:
Q  16 taaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcatt 115  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22427255 taaagcttcaaagactgttcaatagatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaaaagtgaagcaacgactagtttgaaaggatttgaaggcatt 22427354  T
Q  116 ggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||    
T  22427355 ggatgcttgttcttaaaaaagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactttgtttttgtctctgct 22427442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 36134383 - 36134185
Alignment:
Q  4 agatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaagga 103  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||    
T  36134383 agatacaagacttaaagtttcaaaggttgttcaatggatttaatctcatctaaacaatgcagaagactggaaaagtggagcaacaactattttgaaagga 36134284  T
Q  104 ttttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||| ||| |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  36134283 tttgaag-cattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgct 36134185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 35402003 - 35401821
Alignment:
Q  4 agatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaagga 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  35402003 agatgcaagacttaaagcttcaaagactgttcaatggatttaatctcgtttaaacaatacagaagactggaaaagtgaagcaacgactattttgaaagga 35401904  T
Q  104 ttttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactact 186  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  35401903 tttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacaaagtgtacaaccactacctccactact 35401821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 2268725 - 2268526
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||   ||||||||||    
T  2268725 aggagatgcaagacttaaggcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaatcattgtagaagactggaagagttaagcaac---tattttgaaa 2268629  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
     ||||| ||||||||| || ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||    
T  2268628 tgatttgaaggcattgaatgcttgttcgtcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctcgactactctgtttttgtctct 2268529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 203
Target Start/End: Original strand, 16235182 - 16235381
Alignment:
Q  4 agatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaagga 103  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  16235182 agatgcaagatttaaaacttcaaaggttgttcaattgatttaatctcgtctaaacaatgcagaagactggaaaagtgaagcaacgactattttgaaagga 16235281  T
Q  104 ttttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||| ||||||||| || ||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||| ||||||||||    
T  16235282 tttgaaggcattgaatgcttgttctccaaagagtgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaacaactacctccactactccttttttgtctctgct 16235381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 29215992 - 29215792
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||| ||| |||||||    
T  29215992 aggagatgcaa--cttaaagcttcaaaggttgtttaatggatttaatctcgtctaagcattgcaaaagactagaaaagtgaagcaacggctagtttgaaa 29215895  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  29215894 ggatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgataacaaagtacaattgtacgaagtgtacaatcactagctccactactctgtttttgtctct 29215795  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  29215794 gct 29215792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 203
Target Start/End: Original strand, 39200890 - 39201077
Alignment:
Q  16 taaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcatt 115  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||    
T  39200890 taaagcttcaaaagctgttcaatggatttaatctcatgtaagcattgcagaagactgaaagagtgaagcaacggctagtttgaaaggatttgaagacatt 39200989  T
Q  116 ggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  39200990 ggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtttctgct 39201077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 2267271 - 2267087
Alignment:
Q  16 taaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||| |||| ||||||||    
T  2267271 taaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaaaagtgaagcaacaactagtttgaaagaatttgaaggcatt 2267172  T
Q  116 ggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    ||||  ||||||||  |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||    
T  2267171 ggatgtttgttcttcaaagagcgttgtcaaagtgcaattgtatgaagtgtacaaccactacctccactactatgtttttgtctct 2267087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 203
Target Start/End: Original strand, 22464706 - 22464894
Alignment:
Q  16 taaagcttcaaa-ggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcat 114  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||    
T  22464706 taaagcttcaaaaggttgttcaacggatttaatctcatctaagcattgcagaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaatgatttgaaggcat 22464805  T
Q  115 tggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||| ||||||||||    
T  22464806 tggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaagtgtacgaagtgtacatccactacctccactactctatttttgtctctgct 22464894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 30893290 - 30893090
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaa-ggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaa 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||   || ||| ||||||| | ||||||||||    
T  30893290 aggagatgcaagacttaaagtttcaaaaggttgttcattggattcaatctcgtccaagcattgcaaaagatcagaggagtgaagcaaaggctattttgaa 30893191  T
Q  100 aggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctc 199  Q
    ||||||| || ||| | ||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30893190 aggatttgaaagcactagatgcttgttctttgaatagcgctgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactaagtttgtgtctc 30893091  T
Q  200 t 200  Q
    |    
T  30893090 t 30893090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Original strand, 25448461 - 25448651
Alignment:
Q  13 acttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggc 112  Q
    ||||||||||||||| | |||| || ||||| || |||||||||  ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  25448461 acttaaagcttcaaaagctgtttaacggattcaaactcgtctaaagattgcagaagactggaaaagtgaagcagcgactattttgaaaggatttgaaggc 25448560  T
Q  113 attggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  25448561 attggatgcttattcttcaaagagcgttgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgct 25448651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 21028980 - 21028788
Alignment:
Q  11 agacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaag 110  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||| ||  || | | || |||    
T  21028980 agacttaaagcttcatatgttgttcaatgaatttaatctcatccaagcattgcagaagaccataagagtgaagcaacgactaattcaaatgaagttgaag 21028881  T
Q  111 gcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21028880 gcattggatgcttgctttttgaagagcgctgacaaagtacaattgtatgaagtgtacagccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 21028788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 200
Target Start/End: Original strand, 21191763 - 21191947
Alignment:
Q  15 ttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||| |  | || |||||||||||||  |||||| ||||||||  ||| ||  ||||||||| |||||||    
T  21191763 ttaaagcttcaaaggttgttcaaagtatttaatcacacccaa-cattgcagaagaccagaagagtgaagcaacagctaattcaaaaggatttgaaggcat 21191861  T
Q  115 tggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  21191862 tggatgcttgttctttgaagagcgttggcaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttgtgtctct 21191947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 2834875 - 2834684
Alignment:
Q  13 acttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggc 112  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| || || ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  2834875 acttaaagcttccaaagttgttcaatggattcaatctcgtctaagcattgttgaagactgaaaaagtgaagcaacggctaatttgaaaggatttgaaggc 2834776  T
Q  113 attggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtt-tgtgtctctgct 203  Q
    ||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  2834775 attggatgcttgttcttcaaagaacgttgacaaagtacgattgtacgaattgtacaaccactgcctccactactctgttctttgtctctgct 2834684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 186
Target Start/End: Original strand, 23036413 - 23036595
Alignment:
Q  4 agatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaagga 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||  || || ||| |||| |||||||||||||||    
T  23036413 agatgcaagacttaaagcttcaaaggctattcaatggatttaatctcgtctaaataatgcagaagactaaaaaagtgaaacaacaactattttgaaagga 23036512  T
Q  104 ttttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactact 186  Q
    ||| ||| |||||||| |||||||||  ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  23036513 tttgaagacattggatgcttgttcttcaaagagcgtcaacaaagaacaattgtacgaagtgtacaaccactacctcctctact 23036595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 35040351 - 35040161
Alignment:
Q  13 acttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggc 112  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||  || |||||||||  ||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  35040351 acttaaggcttcaaaagttgtttaatggatccaacctcgtctaaagattgcagaagactagaaaagtaaagcaacgactattttgaaaggatttgaaagc 35040252  T
Q  113 attggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  35040251 attggatgcttgatcttcaaagagcgttgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgct 35040161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Original strand, 12613713 - 12613899
Alignment:
Q  15 ttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcat 114  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||| ||  |||| |||| || ||||    
T  12613713 ttaaagcttcaaaggttgttcaaaagatttaatcacgccta-gcattgcagaagaccagaagagtgaagcaacggctaattcaaaag-atttgaaagcat 12613810  T
Q  115 tggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  12613811 tggttgcttgttctttgaagagcgttggcaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactaccttcactactctgtttgtgtctctgct 12613899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 203
Target Start/End: Original strand, 26702022 - 26702214
Alignment:
Q  11 agacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaag 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||| | |||||||||||||||  | |||| |||||||| | || ||  || | | || |||    
T  26702022 agacttaaagcttcaaaggctgttatatggattcaatctcgtttgagcattgcagaagaccaggagagtgaagcaacaattaattcaaatgaagttgaag 26702121  T
Q  111 gcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  26702122 gcattggattcttgctttttgaagagtgatgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactacttagtatgtgtctctgct 26702214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 48570117 - 48570316
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||| | |||| || ||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||| ||   | |||||||||||||| ||    
T  48570117 aggagatgcaa--cttaaagtttcaaaagctgtttaacggattcaaactcgtctaag-attgcagaagactagaaaagtataacaacgactattttggaa 48570213  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||  |||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  48570214 ggattaaaaggcattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctct 48570313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 7310015 - 7309830
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||||  ||||| |||||||||   |||||| |     
T  7310015 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaagctgttcaatggattcagtgtcgtctaaggattgcagaagactataagagtgaagcaacggtcattttgtag 7309916  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactc 187  Q
    |||||| |||||||||||| || |||| || || |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  7309915 ggatttgaaggcattggatgctcgttc-ttcaaaagcgttaacgtagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccaatactc 7309830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 192
Target Start/End: Original strand, 14263371 - 14263525
Alignment:
Q  38 tggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagc 137  Q
    |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||  ||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  14263371 tggattaaatcccgtctaaggattgcagaagactggagaagcaaaacaacgactattttgaaaggatttgaaggcattggatacttgttcctcaaagagc 14263470  T
Q  138 gttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 192  Q
    |||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14263471 gttggcaaagcacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 14263525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 21703008 - 21702809
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||  |||||  | ||||| || |||||||||| ||||||||||||| ||| ||   ||||||| |||||||||||    
T  21703008 aggagatgcaa--cttaaagcttcaaaatttgtttcaaggattcaaactcgtctaag-attgcagaagacttgaaaagtatagcaacggctattttgaaa 21702912  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||  | ||||||| || ||| |||||  ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  21702911 ggattgaagggcattgaatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctct 21702812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 44821430 - 44821630
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||| || ||||| || ||||||||||  ||| ||||||||| || ||   |||||||||||||||| ||    
T  44821430 aggagatgcaa--cttaaagcttcaaaagttgtttaaaggattcaaactcgtctaaggtttgtagaagactgaaaaagtatagcaacgactattttggaa 44821527  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| ||||| ||| || ||| |||||  ||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  44821528 ggatttgaaggctttgtatgcttattcttcaaagagtgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaactactatctccactactctgtttttgtctct 44821627  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  44821628 gct 44821630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 30572381 - 30572192
Alignment:
Q  13 acttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggc 112  Q
    ||||||||||||||  | ||||  | ||||| || ||||||| || ||||||||||||||||| ||   ||||||| ||||||||||||||||  || ||    
T  30572381 acttaaagcttcaatagctgtttcaaggattcaaactcgtctgag-attgcagaagactggaaaagtatagcaacggctattttgaaaggattgaaaagc 30572283  T
Q  113 attggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||||||  || ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  30572282 attggatgtttattcttagaagagcgttgacatagtacgattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtttctgct 30572192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 2327324 - 2327525
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||| |||| || |||||||||  |||||||| ||||| || || |||||||  ||||||||||||    
T  2327324 aggagatgcaa--cttaaagcttcaaaagttgtttaatagattcaaactcgtctaaagattgcagatgactgaaaaagtgaagcaaaaactattttgaaa 2327421  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgtt-ctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctc 199  Q
    |||||  || ||||||||| |||||| ||   |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || ||||||    
T  2327422 ggattcgaacgcattggatgcttgttcctcaaaagagcattgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctggttttgtctc 2327521  T
Q  200 tgct 203  Q
    ||||    
T  2327522 tgct 2327525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 183
Target Start/End: Original strand, 17024862 - 17025029
Alignment:
Q  15 ttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcat 114  Q
    |||||||||||| |  ||||||| |||||||||| ||  ||| ||||||| |||||   ||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||    
T  17024862 ttaaagcttcaatgtctgttcaaaggatttaatcacgcataa-cattgcaaaagaccataagagtgaagcaacgactaattcaaaaggatttgaaggcat 17024960  T
Q  115 tggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccact 183  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17024961 tggatgcttgttctttaaagagcgttgaaaaatgacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccact 17025029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 46089165 - 46088984
Alignment:
Q  13 acttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggc 112  Q
    ||||||||||||||| | ||||  | ||||| || |||| ||||  ||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||         |    
T  46089165 acttaaagcttcaaaagctgtttcaaggattcaaactcgcctaaaaattgcagaagactggaaaagtatggcaacgactattttgaaagg---------c 46089075  T
Q  113 attggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  46089074 attggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgct 46088984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 10251171 - 10250984
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||   | ||||| ||| |||| ||    
T  10251171 aggagatgcaa--cttaaagcttcaaaagttgtttaaaggattcaaactcgtctaag-attgcagaagactggaaaagtataacaacggctaatttggaa 10251075  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    ||         |||||||| ||| |||||  |||||  |||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||    
T  10251074 gg---------cattggatgcttattcttcaaagagttttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccattatctccactactctgtttttgtctct 10250984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 58 - 186
Target Start/End: Original strand, 18896537 - 18896665
Alignment:
Q  58 cattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgta 157  Q
    |||||||||||||| ||||   ||||||||| ||| ||  |||| |||| |||||||||||| |||  |||||| ||| |||||  |||| ||| |||||    
T  18896537 cattgcagaagactagaagcaagaagcaacggctaattcaaaagaatttgaaggcattggatgcttagtctttggagaacgttggaaaaggacagttgta 18896636  T
Q  158 cgaagtgtacaaccactatctccactact 186  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18896637 cgaagtgtacaaccactacctccactact 18896665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 203
Target Start/End: Original strand, 21121057 - 21121149
Alignment:
Q  111 gcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||    
T  21121057 gcattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgacgtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctctgct 21121149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 203
Target Start/End: Original strand, 21135153 - 21135245
Alignment:
Q  111 gcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||||| ||| |||||  ||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||    
T  21135153 gcattggatgcttattcttcaaagagtgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactaaatccactactctgtttttgtctctgct 21135245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 187
Target Start/End: Original strand, 7745066 - 7745159
Alignment:
Q  94 tttgaaaggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactc 187  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||| ||| | |||  |||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  7745066 tttgaaaggatttgaatgcatttgatgcttatccttcaaagagcgttgacaaagtacgtttatacaaagtgtacaaccactacctccactactc 7745159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 134 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 19215676 - 19215607
Alignment:
Q  134 gagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  19215676 gagcgttgacatagtgtgattgtacgaagtgtacaaccactatctgcactactctgtttttgtctctgct 19215607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 134 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 23024852 - 23024783
Alignment:
Q  134 gagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  23024852 gagcgttgacatagtgcgtttgtacgaagtgtacaaccactatctgcactactctgtttttgtctctgct 23024783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 42284715 - 42284642
Alignment:
Q  111 gcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccacta 184  Q
    ||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  42284715 gcattggatgctttttcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccacta 42284642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 21984683 - 21984607
Alignment:
Q  111 gcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactc 187  Q
    ||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21984683 gcattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacttccactactc 21984607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 37642335 - 37642243
Alignment:
Q  111 gcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||||| ||  |||||  ||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||    
T  37642335 gcattggatgctaattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttatacgaagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctctgct 37642243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 132 - 192
Target Start/End: Original strand, 21204937 - 21204997
Alignment:
Q  132 aagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 192  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  21204937 aagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacttccactactctgttt 21204997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 155 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 17371085 - 17371042
Alignment:
Q  155 gtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtct 198  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  17371085 gtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtct 17371042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 61)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 39693725 - 39693523
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  39693725 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggattcaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaatgactattttgaaa 39693626  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39693625 ggatttgaaagcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 39693526  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  39693525 gct 39693523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 12757724 - 12757923
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  12757724 aggagatgcaagacttaaaactttaaaggatgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactgaaagagtgaagcaacaactattttgaaa 12757823  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12757824 ggatttgaaggcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 12757923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 3 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 19156384 - 19156184
Alignment:
Q  3 gagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaagg 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  19156384 gagatgcaagaattaaagcttcaaaggctgttcaatggatttaatctcgtctatgcattgcagaagactagaagagtgaagcaacgactaatttgaaagg 19156285  T
Q  103 attttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgc 202  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19156284 atttgaaggcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaaatgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgc 19156185  T
Q  203 t 203  Q
    |    
T  19156184 t 19156184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 602681 - 602883
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  602681 aggaaatgcaagacttaaaacttcaaaggttgttcattggattcaatctcgtctaagcattgcagaagacttgaagagtgaagcaatgactattttgaaa 602780  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  602781 ggatttgaaagcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 602880  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  602881 gct 602883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 16189174 - 16188972
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16189174 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgtttaatggatttaatctcgtccaaccattgcagaagactggaagagtgaagcaacgactattttgaaa 16189075  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
     ||||| |||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16189074 tgatttgaaggcattggatgcttattcttctaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtatgtgtctct 16188975  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  16188974 gct 16188972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 16207496 - 16207294
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  16207496 aggagatgcaagacttaaagcttcaaacgctgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtaaagcaactactattttgaaa 16207397  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  16207396 ggatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctct 16207297  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  16207296 gct 16207294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 16681264 - 16681466
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  16681264 aggagatgcaagacttagagcttcaaaggctgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacgtctagtttgaaa 16681363  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  16681364 ggatttgaaggcattagatgcttgttctttgaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctctagtactcagtttgtgtctct 16681463  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  16681464 gct 16681466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 17914649 - 17914447
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  17914649 aggagttgcaagagttaaagcttcaaaagttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactgtaagagtgaagcaacaactattttgaaa 17914550  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  17914549 ggatttgaaggcattagatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtataaccactatctccactactcaatttgtttctct 17914450  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  17914449 gct 17914447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 33083047 - 33082873
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||    
T  33083047 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagatcagaagagtgaagcaacgactattttgaaa 33082948  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccacta 175  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33082947 ggatttgaaggcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccacta 33082873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 17525689 - 17525889
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaa-ggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||    
T  17525689 aggagatgcaagacttaaatcttcaaaaggttgttcaatggatttaatatcgtctaagcactgcagaagactggaagagtgaaacaacaactattttgaa 17525788  T
Q  100 aggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctc 199  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17525789 aggatttgaaagcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacaaagtgtacaaccactatcttcactactcagtttgtgtctc 17525888  T
Q  200 t 200  Q
    |    
T  17525889 t 17525889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 17441769 - 17441967
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  17441769 aggagatgcaagacttaaagctttaaaggttgttcaatggacttaatctcctctaagcattgcagaagactggaagactaaagcaacgactattttgaaa 17441868  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17441869 ggatttgaa-gcattggatgcttattctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtactaagtgtacaaccactatctccactactcattttgtgtctct 17441967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 29693505 - 29693303
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  29693505 aggagatgcaagacttaaagctccaaagactgtttaatgaatttaatctcgtctaagcattgcagaagactgaaagagtgaagcaaccactattttgaaa 29693406  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| || |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29693405 ggatttgaaagcattgtatgcttgttctttgaagagctttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccattatctccactactcagtttgtgtctct 29693306  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  29693305 gct 29693303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 24646526 - 24646326
Alignment:
Q  3 gagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaagg 102  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| | ||||||  |||||||||||||    
T  24646526 gagatgcaagagttaaagcttcaaaggttgttcaattgatttaatctcgtctaagcattgcataagactaaaagagtgtagcaacagctattttgaaagg 24646427  T
Q  103 attttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgc 202  Q
    ||||  ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24646426 atttgcaggcattggatgcttattctttgaagagtgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgc 24646327  T
Q  203 t 203  Q
    |    
T  24646326 t 24646326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 18321120 - 18321319
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||   ||||| ||||||||  ||||||| |||    
T  18321120 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcatgagaccaaaagagtgaagcaacagctattttcaaa 18321219  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18321220 ggatttgagggcattggatgcttgttctttgaagggcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccattatctccactactcagtttgtgtctct 18321319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 21933073 - 21932871
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  21933073 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcataagactgaaagagtgaaacaacggctattttgaaa 21932974  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| ||||||||| || |||||| ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  21932973 ggatttaaaggcattgtatgcttgtttttcaaagagcgttgacaaagtaaaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactcagtgtttgtctct 21932874  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  21932873 gct 21932871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 203
Target Start/End: Original strand, 23185202 - 23185389
Alignment:
Q  16 taaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  23185202 taaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaaaagtgaagcaacgactagtttgaaaggatttgaaggcatt 23185301  T
Q  116 ggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  23185302 ggatgcttattcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactgctctgtttttgtctctgct 23185389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 18680002 - 18679803
Alignment:
Q  4 agatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaagga 103  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||  || |||  |||||||||||||||||| ||||    
T  18680002 agatgcaagacttagagcttcaaaggtagttcagtggattcaatctcgtctaagcattgcaaaagaccagaggagtaaagcaacgactattttgatagga 18679903  T
Q  104 ttttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18679902 tttgaaagcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctctactactcagtttgtgtctctgct 18679803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 19943427 - 19943234
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaa-ggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  19943427 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaaggctattcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacaactattttgaa 19943328  T
Q  100 aggattttaaggcattggatacttgtt-ctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 192  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19943327 aggatttgaaggcattggatgcttgttcctttaaaaagcgttgacaaagtaaaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 19943234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 18719188 - 18718989
Alignment:
Q  4 agatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaagga 103  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||  |||||||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  18719188 agatgcaagacttagagcttcaaaggctgttcagtggattcaatctcgttcaagcattgcaaaagaccagaggagtgaagcaacgactattttgatagga 18719089  T
Q  104 ttttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18719088 tttgaaagcattggatgcttgttctttgaagagcgttgtcatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 18718989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 17701925 - 17701733
Alignment:
Q  11 agacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  17701925 agacttaaagcttcaaaggttgttcaatgaatttaatctcgtctaagcattgcagaagatcagaagagtgaagcaacaactattttgaaaggatttgaag 17701826  T
Q  111 gcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||||| ||  ||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17701825 gcattggatgctaattcctttaagagcgttggcaaagtataattgtacgaagtttacaaccactacctccactactcagtttgtgtctctgct 17701733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 20382355 - 20382556
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||| || ||| ||||||||| ||||| |||||    
T  20382355 aggagatgcaagtcttaaagcttcaaaggctgttcaatggattcaatctcgtccatgcattgcaaaagactagaggagtgaagcaacggctattctgaaa 20382454  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| || | | |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20382455 ggatttgaaagtagtggatgtttgttctttgaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactaatcagtttgtgtctct 20382554  T
Q  201 gc 202  Q
    ||    
T  20382555 gc 20382556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 18121070 - 18121269
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||||||||||    
T  18121070 aggagatgcaagacttaaagtttcaaaggctgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactagaagagtgaagcaactgctattttgaaa 18121169  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||    
T  18121170 ggatttaaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcattaacaaagtacaattgtacgaagtgt---accactacctcaactactctgtttctgtctct 18121266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 17267661 - 17267463
Alignment:
Q  3 gagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaagg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||||| | | ||| ||||||||  |||||||||||||    
T  17267661 gagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatgg-ttcaatctcgtccaagcattgcaaaagaccgcaggagtgaagcaacagctattttgaaagg 17267563  T
Q  103 attttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgc 202  Q
    |||| || ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17267562 atttgaaagcattagatgcttgttctttgaagagcattgacatagtacaattgtacgaattgtacaaccactatctccactactcagtttttgtctctgc 17267463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 202
Target Start/End: Original strand, 30421404 - 30421591
Alignment:
Q  16 taaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcatt 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  30421404 taaagcttcaaaggctgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaaaagtgaagcaacgactagtttgaatggatttgaaggcatt 30421503  T
Q  116 ggatacttgttcttt--gaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgc 202  Q
    |||| ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  30421504 ggatgcttgttcttttcaaagagcgttgacaaagtac-attgtacgaagtttacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgc 30421591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 17797610 - 17797410
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| || || |||||| ||| |||||||    
T  17797610 aggagatgcaa--cttaaagcctcaaaagttgttcaatggattcaatctcgtctaaccattacagaagactggaaaagtgatgcaacggctagtttgaaa 17797513  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  17797512 ggaattgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctct 17797413  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  17797412 gct 17797410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 23263572 - 23263757
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaa-agcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaa 99  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  23263572 aggagatgcaaaacttaagaacttcaaaggttgttcaatagatttaatctcgtctaaacaatgcagaagactagaagagtgaaacaatgactattttgaa 23263671  T
Q  100 aggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactac 185  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23263672 aggatttgaaggcattggatgtttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacagttgtacgaagtgtacaaccactacctccactac 23263757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 135
Target Start/End: Original strand, 20255529 - 20255660
Alignment:
Q  4 agatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaagga 103  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  20255529 agatgcaagacttaaagcgtcaaaggctgttcaatggatttaatctcgtctaagcattacagaagactggaaaagtgaagcaacgactattttgaaagga 20255628  T
Q  104 ttttaaggcattggatacttgttctttgaaga 135  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  20255629 tttgaaggcattggatgcttgttctttgaaga 20255660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 1237815 - 1237625
Alignment:
Q  13 acttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggc 112  Q
    |||||| |||||||| | |||| |||||||| || |||||||||  |||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1237815 acttaaggcttcaaaagctgtttaatggattcaacctcgtctaaagattgcagaagaccggaaaagtgaagcaacgactattttgaaaggatttgaaggc 1237716  T
Q  113 attggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||||||||    
T  1237715 attggatatttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacttttgtgcgaagtgtacaaccactacctccactactctgttgttgtctctgct 1237625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Original strand, 45538412 - 45538602
Alignment:
Q  13 acttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggc 112  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||| |    
T  45538412 acttaaggcttcaaaagttgtttaatggattcaacctcgtctaaagattgcagaagactggaaaagtgaagcaacaactattttgaaaggatttgaagac 45538511  T
Q  113 attggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  45538512 attggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaatcacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgct 45538602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 15336051 - 15336251
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||| | || |||||||||  ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||    
T  15336051 aggagatgcaa--cttaaagcttcaaaagttgtttaatggaatcaaactcgtctaaagattgcagaagactgagaaagtgaagcaacgactattttgaaa 15336148  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |    
T  15336149 ggatttgaaggcattggatgcttattcgtcaaagagcgttgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtcttt 15336248  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  15336249 gct 15336251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 15425116 - 15425316
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||| | || |||||||||  ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||    
T  15425116 aggagatgcaa--cttaaagcttcaaaagttgtttaatggaatcaaactcgtctaaagattgcagaagactgagaaagtgaagcaacgactattttgaaa 15425213  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |    
T  15425214 ggatttgaaggcattggatgcttattcgtcaaagagcgttgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtcttt 15425313  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  15425314 gct 15425316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 15516420 - 15516620
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||| | || |||||||||  ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||    
T  15516420 aggagatgcaa--cttaaagcttcaaaagttgtttaatggaatcaaactcgtctaaagattgcagaagactgagaaagtgaagcaacgactattttgaaa 15516517  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |    
T  15516518 ggatttgaaggcattggatgcttattcgtcaaagagcgttgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtcttt 15516617  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  15516618 gct 15516620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 24551452 - 24551265
Alignment:
Q  13 acttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggc 112  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  24551452 acttaaggcttcaaaagttgtttaatggattcaacctcgtctaaagattgcagaagactggaaaagtgaagcaacgactattttgaaaagatttgaaggc 24551353  T
Q  113 attggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||    
T  24551352 attggatgcttgttcttcaaagagcgttaacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactttgtttttgtctct 24551265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 43645069 - 43644884
Alignment:
Q  17 aaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattg 116  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||| ||||||||||||||  |||||| |||| |||| ||| ||  || | |||| |||||||||    
T  43645069 aaagcttcaaaggttgttcaaatgatttaatcacgccta-gcattgcagaagaccagaagagtgaagaaacggctaattcaaatgaatttgaaggcattg 43644971  T
Q  117 gatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  43644970 gatgcttgttctttgaagagcgttaataaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactcggtttgtgtctctgct 43644884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 203
Target Start/End: Original strand, 40845362 - 40845550
Alignment:
Q  14 cttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggca 113  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||||| || |||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||| |||||||  ||||||    
T  40845362 cttaaagcttcaaaagttgtttaa-ggattcaaactcgtctaaagattgcagaagactggaaaagtatagcaacgactattttggaaggattggaaggca 40845460  T
Q  114 ttggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||||| ||| |||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  40845461 ttggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgct 40845550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 192
Target Start/End: Original strand, 18722610 - 18722798
Alignment:
Q  4 agatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgca-gaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaagg 102  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||  ||||||| |||||||||| || ||| |||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  18722610 agatgaaagagttaatgcttcaaagactgttcaaaggatttaatcacggcta-gcattgcaagaagacaagaagagtgaagcaacgactattttgaaaga 18722708  T
Q  103 attttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 192  Q
    |||| |||||||| ||| ||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18722709 atttgaaggcattagatgcttattttttgaagagcgttgaaaaactacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgttt 18722798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 192
Target Start/End: Original strand, 18730955 - 18731143
Alignment:
Q  4 agatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgca-gaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaagg 102  Q
    ||||| |||| |||| |||||||||  ||||||| |||||||||| || ||| |||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||     
T  18730955 agatgaaagagttaatgcttcaaagactgttcaaaggatttaatcacggcta-gcattgcaagaagacaagaagagtgaagcaacgactattttgaaaga 18731053  T
Q  103 attttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 192  Q
    |||| |||||||| ||| ||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18731054 atttgaaggcattagatgcttattttttgaagagcgttgaaaaactacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgttt 18731143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 192
Target Start/End: Original strand, 18685367 - 18685549
Alignment:
Q  10 aagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgca-gaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggatttta 108  Q
    |||| |||| |||||||||  ||||||| |||| ||||| |||||| |||||||| ||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||| |||| |    
T  18685367 aagagttaatgcttcaaagactgttcaaaggatataatcacgtcta-gcattgcaagaagaccagaagagtgaagcaacaactattttgaaagaatttga 18685465  T
Q  109 aggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 192  Q
    ||||||| ||| ||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18685466 aggcattagatgcttattttttgaagagcgttgaaaaactacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgttt 18685549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 19707692 - 19707497
Alignment:
Q  4 agatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaagga 103  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||    |||| |||||||||||||  |||||| ||||||||| ||| ||  || | |    
T  19707692 agatgaaagaattaaagcttcaaaggctgttcaaaggacttaatcattcctaa-cattgcagaagaccagaagagtgaagcaacggctaattcaaatgaa 19707594  T
Q  104 ttttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    ||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  19707593 tttgaaggcattgaatggttgttctttgaagaacgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacatcctctactcagtttgtgtctct 19707497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 9320748 - 9320557
Alignment:
Q  13 acttaaagcttcaaaggttgttcaat-ggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaagg 111  Q
    |||||| |||||||| | |||| ||| ||||| || |||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||| || |    
T  9320748 acttaaggcttcaaaagctgtttaattggattcaacctcgtctaaagattgcagaagactggaaaagtgaagcaacaattattttgaaaggatttgaacg 9320649  T
Q  112 cattggatacttgttctttgaa-gagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||||||| ||| |||||  || |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  9320648 cattggatgcttattcttcaaaagagcgttgacaaagtatatttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtctctgct 9320557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 22745677 - 22745602
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaag 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22745677 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgtagaagactggaag 22745602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22673956 - 22673766
Alignment:
Q  13 acttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggc 112  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| || |||||||    ||||||||||||| ||| ||   ||||||  |||||||| |||||||  ||| |    
T  22673956 acttaaagcttcaaaagttgtttaacggattcaaactcgtctggagattgcagaagactagaaaagtatagcaacatctattttggaaggattagaagac 22673857  T
Q  113 attggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  22673856 attggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactttgtttttgtctctgct 22673766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Original strand, 22461617 - 22461783
Alignment:
Q  18 aagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattgg 117  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |  ||  |||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||||    
T  22461617 aagcttcaaaggttgttcgaaggatttaatctagcatat-cattgcagaagactagaagaatgaagcaacgactaattcaaatggatttgaaggcattgg 22461715  T
Q  118 atacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactac 185  Q
    || ||| ||| ||| |||| ||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  22461716 atgcttattcgttggagagagttgaaaaaggacaattgtacggagtgcacaaccactatctccactac 22461783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 36105383 - 36105183
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| | |||| || ||||| || |||||||||  ||||||||||| ||||| ||   | ||||| |||||||| ||    
T  36105383 aggagatgcaa--cttaaagcttcaaaagctgtttaacggattcaaactcgtctaaagattgcagaagattggaaaagtataacaacggctattttggaa 36105286  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| ||||||||||||  || |||||  ||||||||||| | |||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||    
T  36105285 ggatttgaaggcattggatgtttattcttcaaagagcgttgatatagtacgtttgtacaaagtgtacaaccactacctccactgctctgtttttgtctct 36105186  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  36105185 gct 36105183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 22663304 - 22663107
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| | |||| || ||||| || ||||||| |  ||||||||||||||||| |    |||||| ||||||||| ||    
T  22663304 aggagatgcaa--cttaaagcttcaaaagctgtttaacggattcaaactcgtctgaagattgcagaagactggaaaaatatagcaacaactattttggaa 22663207  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
     ||||  ||| |||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||    
T  22663206 agattagaagacattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccaatatctccactactctatttttgtctct 22663107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 73 - 202
Target Start/End: Original strand, 19956374 - 19956502
Alignment:
Q  73 gaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaacca 172  Q
    |||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||||||    
T  19956374 gaagagtgaagcaacgactaattctaaaggatttgaaggcattggatactttttcattgaagagcgttgaaaaaggacaattgtactaattgtacaacca 19956473  T
Q  173 ctatctccactactcagtttgtgtctctgc 202  Q
    ||| ||||| ||| | |||| |||||||||    
T  19956474 ctacctccaataccctgttt-tgtctctgc 19956502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 127 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 25164134 - 25164058
Alignment:
Q  127 ctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25164134 ctttgaagagtgttgtcatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcaatttgtgtctctgct 25164058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 108 - 203
Target Start/End: Original strand, 14989519 - 14989614
Alignment:
Q  108 aaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  14989519 aaggcattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaattgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgct 14989614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 24833029 - 24833204
Alignment:
Q  13 acttaaagcttcaaaggttgttcaatgg-atttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaagg 111  Q
    |||||| |||||||| | |||| ||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| | ||| |||||| |||||| || |    
T  24833029 acttaaggcttcaaaagctgtttaatgggattcaacctcgtctaaggattgcagaagactgaaa-agtgaagcaatggctactttgaagggatttgaacg 24833127  T
Q  112 cattggatacttgttctttgaa-gagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactc 187  Q
    |||||||| ||||||| |  || |||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  24833128 cattggatgcttgttcctcaaaagagcgttgacatggtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccattactc 24833204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 6407904 - 6407714
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| | |||| || ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||     ||||| ||||||||       
T  6407904 aggagatgcaa--cttaaagcttcaaaagctgtttaaaggattcaaactcgtctaag-attgcagaagactggaaaagtattacaacggctattttg--- 6407811  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
           |||||||||||| ||  |||||  ||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  6407810 ------gaaggcattggatgctaattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttctacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctct 6407717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 203
Target Start/End: Original strand, 18151714 - 18151809
Alignment:
Q  108 aaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||||||||||| ||| |||||  |||||| |||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  18151714 aaggcattggatgcttattcttcaaagagcattgacatagtacgtttgtacgaattgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgct 18151809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 82 - 198
Target Start/End: Original strand, 45567943 - 45568059
Alignment:
Q  82 agcaacgactattttgaaaggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctcca 181  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||  || | |||  |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||| || ||    
T  45567943 agcaacggctaatttgaaaggatttgaaggcattggatgattatccttcaaagagcgttgacaaagtacttctgtacgaagtgtacgaccactaccttca 45568042  T
Q  182 ctactcagtttgtgtct 198  Q
    |||||| |||| |||||    
T  45568043 ctactctgtttatgtct 45568059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 203
Target Start/End: Original strand, 13430699 - 13430791
Alignment:
Q  111 gcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||||| ||| |||||  ||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||| |||||    
T  13430699 gcattggatgcttattcttcaaagagtgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtccctgct 13430791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 43639842 - 43639782
Alignment:
Q  132 aagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 192  Q
    |||||||||||||   |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43639842 aagagcgttgacatgttacgtttgcacgaagtgtacaaccactatctccactactctgttt 43639782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 132 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 21301081 - 21301026
Alignment:
Q  132 aagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactc 187  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21301081 aagagcgttgacatagtacgtttgtacaaagtgtacaaccactacttccactactc 21301026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 198
Target Start/End: Original strand, 7018416 - 7018454
Alignment:
Q  160 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtct 198  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  7018416 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttgtgtct 7018454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 198
Target Start/End: Original strand, 20259652 - 20259690
Alignment:
Q  160 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtct 198  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  20259652 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttgtgtct 20259690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 198
Target Start/End: Original strand, 21046282 - 21046320
Alignment:
Q  160 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtct 198  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  21046282 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttgtgtct 21046320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 21288462 - 21288408
Alignment:
Q  132 aagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactact 186  Q
    ||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  21288462 aagagcgttgacatagttcgtttgtacgaagtgtacaaccactacttccactact 21288408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 103 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18772707 - 18772624
Alignment:
Q  103 attttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactc 187  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||| |||| || |||||||||| || |||||||||||    
T  18772707 atttgaaggcattggatgcttattctttggagaacgttggaaaaggacaatagtac-aaatgtacaaccattacctccactactc 18772624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 175
Target Start/End: Original strand, 33560295 - 33560359
Alignment:
Q  111 gcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccacta 175  Q
    ||||||||| ||  |||||  ||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||    
T  33560295 gcattggatgctaattcttcaaagagcgttgacataatacgtttgtacgaagtgtacaaccacta 33560359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 65)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 25829326 - 25829124
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25829326 aggagatgcaagacttagagcttcaaaggatgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacgactattttgaaa 25829227  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25829226 ggatttgaaggcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcattttgtgtctct 25829127  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  25829126 gct 25829124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 30667181 - 30666979
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  30667181 aggagatgcaagaattaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagaatgaagcaacgactattttgaaa 30667082  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30667081 ggatttgaaggcattggatgcttgatctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 30666982  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  30666981 gct 30666979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 4 - 203
Target Start/End: Original strand, 13963889 - 13964088
Alignment:
Q  4 agatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaagga 103  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  13963889 agatgcaagatttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgtagaagactgaaagagtgaagcaacgactattttgaaagaa 13963988  T
Q  104 ttttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13963989 tttgaaggcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 13964088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 3 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 23235197 - 23234997
Alignment:
Q  3 gagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaagg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||     
T  23235197 gagatgcaagacttaaagcttcaaaggctgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtaaagcaacgactattttgaaaga 23235098  T
Q  103 attttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgc 202  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23235097 atttgaaggcattggatgcttattctttgaagagtgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgc 23234998  T
Q  203 t 203  Q
    |    
T  23234997 t 23234997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 20568658 - 20568860
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  20568658 aggagatgcaagacttaaagctttaaaggctgttccatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacaacaattttgaaa 20568757  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  20568758 ggatttgaaggcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatccccactactcagtttgtgtatct 20568857  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  20568858 gct 20568860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 30621408 - 30621210
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  30621408 aggagatgcaagaattaaaggttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtgtaagcattgcagaagactggaagagtgaagcagcgactattttgaaa 30621309  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctc 199  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30621308 ggatttgaaggcattggatgtttgatctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtaaaaccactatctccactactcagtttgtgtctc 30621210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 30624029 - 30623831
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  30624029 aggagatgcaagaattaaaggttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtgtaagcattgcagaagactggaagagtgaagcagcgactattttgaaa 30623930  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctc 199  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30623929 ggatttgaaggcattggatgtttgatctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtaaaaccactatctccactactcagtttgtgtctc 30623831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 9015278 - 9015478
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  9015278 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatcttgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaaacaacaactattttgaaa 9015377  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9015378 ggatttgaaagcattggatgcttattctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacg--gtgtacaaccactatctccactactcagtttgtatctct 9015475  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  9015476 gct 9015478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 21537156 - 21537358
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21537156 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtttaaacattgcagaagaccagaagagtgaagcaacgactattttgaaa 21537255  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    || |||  ||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21537256 ggttttggaggcattggatgcttgctttttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtcttt 21537355  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  21537356 gct 21537358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 22188010 - 22188212
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||     
T  22188010 aggacatgcaagacttaaagcttcaaaggctgttcaatggatttaatctcgtctaagtattgcagaagactgaaagagtgaagcaacaactattttgaat 22188109  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
     ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22188110 agatttgaaggcattggatgcttgttctttgaagagcgttaacaaagtataattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 22188209  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  22188210 gct 22188212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 203
Target Start/End: Original strand, 18376824 - 18377016
Alignment:
Q  11 agacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaag 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||| |||| |||||||||||||||||| |||    
T  18376824 agacttaaagcttcaaaggctgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagattttaatagtgaatcaactactattttgaaaggatttgaag 18376923  T
Q  111 gcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18376924 gcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 18377016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 25037167 - 25037369
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  25037167 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggattcaatcttgtcgaagcattgcagaagactggaagagtgatgtaacgactaatttgaaa 25037266  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| || |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25037267 ggatttgaaagcattggatgtttgttctttgaaaagcgttgacaaagtacaattgttcgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 25037366  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  25037367 gct 25037369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 25041274 - 25041476
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  25041274 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggattcaatcttgtcgaagcattgcagaagactggaagagtgatgtaacgactaatttgaaa 25041373  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| || |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25041374 ggatttgaaagcattggatgtttgttctttgaaaagcgttgacaaagtacaattgttcgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 25041473  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  25041474 gct 25041476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 19540606 - 19540406
Alignment:
Q  3 gagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaagg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  19540606 gagatgcaagacttaaagcttcaaatgttgttcaatggatttaatctcatctaagcattgcagaagactaggagagtgaagcaacggctatttcgaaagg 19540507  T
Q  103 attttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgc 202  Q
     ||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19540506 ttttgaaggtattggatgcttgttctttaaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgc 19540407  T
Q  203 t 203  Q
    |    
T  19540406 t 19540406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 24576228 - 24576025
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaa-tctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaa 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  24576228 aggagatgcaatacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaaatctcatctaagcattgcagaagactggaaaagtgaagcaacaactattttgaa 24576129  T
Q  100 aggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctc 199  Q
    ||||||| |||||||||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  24576128 aggatttaaaggcattggttgtttgttcgttgaagagagttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactacttagtttgtgtctc 24576029  T
Q  200 tgct 203  Q
    ||||    
T  24576028 tgct 24576025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 24377291 - 24377091
Alignment:
Q  3 gagatgcaagacttaaagcttcaaa-ggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24377291 gagatgcaagacttaaagcttcaaaaggttgttcaatggatttaatcacgccta-gcattgcagaagaccagaagagtgaagcaacgactattttgaaag 24377193  T
Q  102 gattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctg 201  Q
    | ||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24377192 gttttgagagcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctg 24377093  T
Q  202 ct 203  Q
    ||    
T  24377092 ct 24377091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 24850573 - 24850776
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaa-ggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||| |||||||||| |||||||||    
T  24850573 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctacgcattgctgaagaccagaagagtgaagcaacgaatattttgaa 24850672  T
Q  100 aggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctc 199  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  24850673 aggatttcaaagcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaagtgtacgaaatgtacaaccactacatccactactcagtgtgtgtctc 24850772  T
Q  200 tgct 203  Q
    ||||    
T  24850773 tgct 24850776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 10009657 - 10009860
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactg-gaagagggaagcaacgactattttgaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||   || ||| |||||||| |||||||||||    
T  10009657 aggagatgcaagacttaaagcttcaagggctgttcaatggattcaatctcgtccaagcattgcaaaagaccaagaggagtgaagcaacaactattttgaa 10009756  T
Q  100 aggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctc 199  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10009757 aggatttgaaagcattggatgcttgttctttgaagaacgttgacatagtacaattgtacgaaatgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctc 10009856  T
Q  200 tgct 203  Q
    ||||    
T  10009857 tgct 10009860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22317784 - 22317583
Alignment:
Q  3 gagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactatttt-gaaag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  22317784 gagatgcaagacttaaagcttcaaaggcttttcattggatttaatctcatctaagcattgcataagactagaagagtgaagcaacgactatttttgaaag 22317685  T
Q  102 gattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctg 201  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| | ||||||    
T  22317684 gatttaaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtatacaaccactacctccactattcagtttttatctctg 22317585  T
Q  202 ct 203  Q
    ||    
T  22317584 ct 22317583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 38781587 - 38781388
Alignment:
Q  5 gatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggat 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  38781587 gatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaattgatttaatctcgtctaaacaatgtagaagactggaaaagtgaagcaacaactattttgaaaggat 38781488  T
Q  105 tttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactc-agtttgtgtctctgct 203  Q
    || ||||||||| ||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||||||||    
T  38781487 ttgaaggcattgaatgattgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacatccactactctattttttgtctctgct 38781388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 20151944 - 20152117
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  || |||||||    
T  20151944 aggagatgcaaca-ttaaagcttcaaaagttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaaaagtgaagcaacggttagtttgaaa 20152042  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccacta 175  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20152043 ggatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccacta 20152117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 2 - 203
Target Start/End: Original strand, 28140528 - 28140729
Alignment:
Q  2 ggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaag 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||      ||| |||||||| |||||||||||||    
T  28140528 ggagatgcaagacttaaaacttcaaaggttgttcaatggattcaatctcgtccaagcattgcaaaagatcattggagtgaagcaacaactattttgaaag 28140627  T
Q  102 gattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctg 201  Q
    ||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28140628 gatttgaaaacattggatgcttgttctttgaagagcgttgacatagtacaattgtacaaagtgtaccatcactatctccactactcagtttgtgtctctg 28140727  T
Q  202 ct 203  Q
    ||    
T  28140728 ct 28140729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 24779525 - 24779333
Alignment:
Q  11 agacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaag 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  24779525 agacttgaagcttcaaaggttgttcaatggattcaatctcgtccaagcattgaaaaagaccagaggagtgaagcaacgactattttgaaaggatttgaaa 24779426  T
Q  111 gcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24779425 gcatcggatgtttgttctttgaagagtgttgacatagtacaattgtatgaagtgtataaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 24779333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 192
Target Start/End: Original strand, 6574045 - 6574223
Alignment:
Q  16 taaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaa-gcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  6574045 taaagcttcaaaggttgttcaattgatttaatctcgtctaatgcattgcagaagactggaaaagtgaagcaacgactagtttgaaaggatttgaaggcat 6574144  T
Q  115 tggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtac-aattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 192  Q
    |||||  ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  6574145 tggatgtttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 6574223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 33 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 40782637 - 40782467
Alignment:
Q  33 ttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattggatacttgttctttga 132  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||    
T  40782637 ttcaatggattcaatctcgtccaagcattgcaaaagaccagaggagtgaagcaacgactattttgaaaggatttgaaagcattggatgtttgttctttga 40782538  T
Q  133 agagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  40782537 agagcgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccaatacttagtttgtgtctctgct 40782467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 22260598 - 22260432
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||| ||    
T  22260598 aggagatgcaagacttaaagcgtcaaaagttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaaaagtgaagcaacaaatattttggaa 22260499  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtac 167  Q
    |||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  22260498 ggatttgaaggaactggatgcttgttctttgaagagctttgacatagtacaattgtaagaagtgtac 22260432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 203
Target Start/End: Original strand, 39037560 - 39037752
Alignment:
Q  11 agacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaag 110  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | || ||||||||| ||| ||  || | | || |||    
T  39037560 agacttaaaacttcaaaggttgttcattggatttgatctcgtctaagcattgcagaagattaggaaagtgaagcaacggctaattcaaatgaagttgaag 39037659  T
Q  111 gcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39037660 gcattagatgcttgctttttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactcagtttgtgtctctgct 39037752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 203
Target Start/End: Original strand, 23595481 - 23595677
Alignment:
Q  4 agatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaagga 103  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||  || | |    
T  23595481 agatgaaagaattaaagcttcaaaggttgttcaaaggatttaatcacaccta-gcattgcagaagaccagaagagtgaagcaacgactaattcaaatgaa 23595579  T
Q  104 ttttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  23595580 tttgaaggcattggattcttgttctctgaag--cgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtagaaccactacctcctctactcagtttgtgtctctgct 23595677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Original strand, 41121642 - 41121829
Alignment:
Q  15 ttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcat 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||| ||  ||||||||| |||||||    
T  41121642 ttaaagcttcaaaggctgttcaaaggatttaatcacgccta-gcattgcagaagattggatgagtgaagcaaagactaattcaaaaggatttgaaggcat 41121740  T
Q  115 tggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  41121741 tggattattgctctttgaagagcattgacaaagtacaattgtgcgaaatgtacaaccactacctccactactctgtttgtgtctctgct 41121829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 25189579 - 25189391
Alignment:
Q  11 agacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||  | |||| ||||||| ||||| ||  || | | || |||    
T  25189579 agacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatcacaccta-gcattgcagaagaccaggagagtgaagcaatgactaattcaaatgaagttgaag 25189481  T
Q  111 gcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  25189480 gcattggattcttgctttttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaaatgtacaaccactacctccactactcaatttgtgtctct 25189391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Original strand, 28711618 - 28711808
Alignment:
Q  13 acttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggc 112  Q
    |||||| |||||||| | |||| |||||||| || || ||||||  ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| ||| | |||| |||||    
T  28711618 acttaaggcttcaaaagctgtttaatggattcaaccttgtctaaagattgcagaagactggaaaagtaaagcaacgactatttcgaatgaatttgaaggc 28711717  T
Q  113 attggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  28711718 attggatgcttgttcttcaaagagcgttgaaaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgct 28711808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Original strand, 31800807 - 31800997
Alignment:
Q  13 acttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggc 112  Q
    ||||||||||||||| | || | | |||||  || ||||||||   ||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||||||||| || ||    
T  31800807 acttaaagcttcaaaagctgcttagtggatccaaactcgtctatttattgcagaagactggaaaagtgaaacaacaactattttgaaaggatttgaaagc 31800906  T
Q  113 attggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||||||  ||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  31800907 attggatgtttgatcttcaaagagcgttgacaaagtacatttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgct 31800997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 18 - 192
Target Start/End: Original strand, 26619027 - 26619200
Alignment:
Q  18 aagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||  |||| |||| |||||||||     
T  26619027 aagcttcaaaggttgttcaaatgatttaatcacgcctat-cattgcagaagactggaagaatgaagcaacaactatttcaaaagaatttgaaggcattga 26619125  T
Q  118 atacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 192  Q
    || ||| ||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26619126 atgcttattctttggagaacgttgaaaaaggacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgttt 26619200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 203
Target Start/End: Original strand, 22454908 - 22455100
Alignment:
Q  11 agacttaaagcttcaaa-ggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaa 109  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || | || |||||||||||||  |||||| ||||||||   || ||  || | | || ||    
T  22454908 agacttaaagcttcaaaagggtgttcaatggatttaatcacgcccaa-cattgcagaagaccagaagagtgaagcaacagttaattcaaatgaagttgaa 22455006  T
Q  110 ggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  22455007 ggcattggatgcttgctttttgaaaagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccagtacctccactactcagtttgtgtctctgct 22455100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 6392814 - 6392624
Alignment:
Q  14 cttaaagcttcaaaggttgttcaatg-gatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggc 112  Q
    ||||| |||||||| | |||| |||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  6392814 cttaaggcttcaaaagctgtttaatgtgattcaacctcgtctaaggattgcagaagactggaaaagtgaagcaacgactattttgaaaggatttgaacgc 6392715  T
Q  113 attggatacttgtt-ctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  6392714 attggatgcttgttcctcaaaagagcgttgacaaagtacgtttgtacgaagtgcgcaaccactacctccactactctgttt-tgtctctgct 6392624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 175
Target Start/End: Original strand, 45087102 - 45087266
Alignment:
Q  13 acttaaagcttcaaag-gttgttcaatgg-atttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaag 110  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  45087102 acttaaagcttcaaaaagttgtttaatgggattcaacctcgtctaaggattgcagaagactggaaaagtgaagcaacgactattttgaaaggatttgaat 45087201  T
Q  111 gcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccacta 175  Q
    ||||| ||| ||| ||||   |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  45087202 gcattagatgcttattctcaaaagagcgttgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccacta 45087266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 34321846 - 34322030
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||| | |||| || ||||| || |||||||||  |||||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  34321846 aggagatgcaa--cttaaagcctcaaaagctgtttaaaggattcaaactcgtctaaagattgcagaagcctggaaaagtatagcaacgactattttgaaa 34321943  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactc 187  Q
    |||||  |||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34321944 ggattgaaaggcattggattcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtatgaagtgtacaaccactatcttcactactc 34322030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22802650 - 22802451
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||| | | || |||||||| || |||||||||  ||||||||||||| |||  |  |||||| | |||||||||||    
T  22802650 aggagatgcaa--cttaaagattcaaaagctatttaatggattcaaactcgtctaaagattgcagaagactagaaaggtaaagcaatggctattttgaaa 22802553  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||  ||| ||| |||||  ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  22802552 ggatttgaaggcatatgatgcttattcttcaaagagagttgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtctct 22802454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 33074416 - 33074216
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||| | |||| || ||||| || |||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||| |     
T  33074416 aggagatgcaa--cttaaaacttcaaaagctgtttaaaggattcaaactcgtctaaagattgcagaagactggaaaagtatagcaacgactattttggac 33074319  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
     ||||  |||||||| ||| ||| |||||  || | |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  33074318 agattggaaggcattagatgcttattcttcaaaaaacgttgacataatacgattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctct 33074219  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  33074218 gct 33074216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Original strand, 28701149 - 28701339
Alignment:
Q  13 acttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggc 112  Q
    |||||| |||||||| | |||| ||| |||| || ||||||| |  ||||||||||||||||| ||  |||||||   |||||||||||||||| |||||    
T  28701149 acttaaggcttcaaaagctgtttaatagattcaacctcgtcttaagattgcagaagactggaaaagtaaagcaacagatattttgaaaggatttgaaggc 28701248  T
Q  113 attggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||| |||| |||||    
T  28701249 attggatgcttgttcttcaaagggcgttgacaaagtaagtttgtacgaagtgtacaaccattacctccactactttgtttttgtccctgct 28701339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Original strand, 30557239 - 30557415
Alignment:
Q  13 acttaaagcttcaaaggttgttcaatgg-atttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaagg 111  Q
    |||||| ||||||||  ||||| ||||| ||| || |||||||||| |||||||| ||||| || || |||||| ||||||||||||||| |||| ||      
T  30557239 acttaaggcttcaaaaattgtttaatgggattcaacctcgtctaaggattgcagaggactgaaaaagtgaagcatcgactattttgaaagaatttgaaca 30557338  T
Q  112 cattggatacttgttctttgaa-gagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactc 187  Q
    |||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30557339 cattggatgcttgttcctcaaaagagcgttgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactc 30557415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 31327875 - 31328075
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaag-gttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaa 99  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||  ||||||||| ||||| || |||| ||||  ||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||| |    
T  31327875 aggagatgcaa--cttaaagtttcaaaaagttgttcaacggattcaaactcgcctaaagattgcagaagactagagaagtgaagcaacgactattttgga 31327972  T
Q  100 aggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctc 199  Q
     || ||| || ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||   | | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  31327973 gggttttgaaagcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtatgttcgaacgaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtctc 31328071  T
Q  200 tgct 203  Q
    ||||    
T  31328072 tgct 31328075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 31334596 - 31334796
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaag-gttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaa 99  Q
    |||||||||||  ||||||| ||||||  ||||||||| ||||| || |||| ||||  ||||||||||||| ||  || |||||||||||||||||| |    
T  31334596 aggagatgcaa--cttaaagtttcaaaaagttgttcaacggattcaaactcgcctaaagattgcagaagactagagaagtgaagcaacgactattttgga 31334693  T
Q  100 aggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctc 199  Q
     || ||| || ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||   | | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  31334694 gggttttgaaagcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtatgttcgaacgaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtctc 31334792  T
Q  200 tgct 203  Q
    ||||    
T  31334793 tgct 31334796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 22 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 22272303 - 22272139
Alignment:
Q  22 ttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattggatac 121  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||  || |||||| |||||||||||| |    
T  22272303 ttcaaaggttgttcaaatgatttaatcacgtctat-cattgcagaagactggaagaatgaagcaatgactaattcaaatggatttgaaggcattggatgc 22272205  T
Q  122 ttgtt-ctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactact 186  Q
    || || | ||| |||| ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22272204 ttttttcgttggagagagttgaaaaaggaaaattgtaagaagtgtacaaccactatctccactact 22272139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 82 - 203
Target Start/End: Original strand, 35743989 - 35744110
Alignment:
Q  82 agcaacgactattttgaaaggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctcca 181  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || ||  |||||  ||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  35743989 agcaacgactattttggaaggatttgaaggcattgaatgctaattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaaatgtacaactactatctcca 35744088  T
Q  182 ctactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  35744089 ctactcagtttttgtctctgct 35744110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 203
Target Start/End: Original strand, 23184236 - 23184414
Alignment:
Q  18 aagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattgg 117  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| |  ||| |||| |||||||||  |||||| |||||| |||||| ||  || | |||| ||||||||||    
T  23184236 aagcttcaaaggttgttcaaaggatt-aatcacaccta-gcat-gcagaagaccagaagagtgaagca-cgactaattcaaatgaatttgaaggcattgg 23184331  T
Q  118 atacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    || || ||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  23184332 attct-gttctctgaag--cgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtagaaccactacctcctctactcagtttgtgtctctgct 23184414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 19115257 - 19115089
Alignment:
Q  18 aagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattgg 117  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||   |||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||   | |||| | ||| || |||    
T  19115257 aagcttcaaaggttgttcaaagaatttaatctcgcctact-attgcagaagactggaagaatgaagcaacaactaattcagatggatgtgaagccagtgg 19115159  T
Q  118 atacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactc 187  Q
    || | | ||| ||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19115158 atgcctattcgttggagagtgttgaaaaaggacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactc 19115089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 108 - 203
Target Start/End: Original strand, 28550933 - 28551028
Alignment:
Q  108 aaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  28550933 aaggcattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgct 28551028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 108 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 44840519 - 44840424
Alignment:
Q  108 aaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  44840519 aaggcattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgct 44840424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 44881341 - 44881173
Alignment:
Q  18 aagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattgg 117  Q
    |||||||||||| |||||||  || |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||  |||||| |  ||| ||  || || ||| ||||||||||    
T  44881341 aagcttcaaaggctgttcaaatgacttaatcacgtctat-cattgcagaagactggaagaatgaagcagcagctaattcaaatgggtttgaaggcattgg 44881243  T
Q  118 atacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactc 187  Q
    ||  || ||  ||| |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44881242 atgtttttttgttggagagagttgaaaaaggacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactc 44881173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 7609154 - 7609039
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaaga-ctggaagagggaagcaacgactattttgaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||| |  || ||| ||||||||  ||||||||||    
T  7609154 aggagatgcaagacttaaagcttcaagggctgttcaatggattcaatctcgtccaagcattacaaaagaccaagaggagtgaagcaacacctattttgaa 7609055  T
Q  100 aggattttaaggcatt 115  Q
    ||||||| ||||||||    
T  7609054 aggatttgaaggcatt 7609039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 108 - 203
Target Start/End: Original strand, 22776303 - 22776398
Alignment:
Q  108 aaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  22776303 aaggcattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccagtactctgtttttgtctctgct 22776398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 108 - 203
Target Start/End: Original strand, 22781681 - 22781776
Alignment:
Q  108 aaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  22781681 aaggcattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccagtactctgtttttgtctctgct 22781776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 111 - 203
Target Start/End: Original strand, 31968061 - 31968153
Alignment:
Q  111 gcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  31968061 gcattggatgcttattcttcaaagagcgttgacataatacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgct 31968153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 203
Target Start/End: Original strand, 1587048 - 1587142
Alignment:
Q  108 aaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||||||||||| ||  |||||  ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  1587048 aaggcattggatgctaattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgttt-tgtctctgct 1587142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 14581600 - 14581505
Alignment:
Q  108 aaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||    
T  14581600 aaggcattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccacttctctgattttgtctctgct 14581505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 40332172 - 40332077
Alignment:
Q  108 aaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  40332172 aaggcattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactaactccattactctgtttttgtctctgct 40332077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 187
Target Start/End: Original strand, 18430858 - 18431034
Alignment:
Q  10 aagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaa 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||| || |||  |||||||||||||| ||||   ||||||||| ||| ||  |||| |||| ||    
T  18430858 aagaattaaagcttcaaaggttgttcaaatgttttaatcacgcctat-cattgcagaagactagaagcatgaagcaacggctaattcaaaagaatttgaa 18430956  T
Q  110 ggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactc 187  Q
    ||||||| || ||| ||||||| | | |||||  |||  ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  18430957 ggcattgaatgcttattctttggaaaacgttggaaaacgacaatagtacgaagtgtacaaccacgacctccactactc 18431034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 3277115 - 3277037
Alignment:
Q  108 aaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactact 186  Q
    |||||||||||| ||| |||||  ||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3277115 aaggcattggatgcttattcttcaaagagcgttgatatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccactact 3277037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18702912 - 18702744
Alignment:
Q  18 aagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||  |||| ||||||||| ||||   |||| |||| ||| ||  |||| |||| |||||||| |    
T  18702912 aagcttcaaaggttgttcaaatgttttaatcacgtctat-cattacagaagactagaagcatgaagtaacggctaattcaaaagaatttgaaggcattag 18702814  T
Q  118 atacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactc 187  Q
    || |||  |||||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  18702813 atgcttactctttggagaacgttggaaaaggacaattgtacgaagtatgcaacaactatctccactactc 18702744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 108 - 187
Target Start/End: Original strand, 22785670 - 22785749
Alignment:
Q  108 aaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactc 187  Q
    |||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22785670 aaggcattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacttttgtacaaagtgtataaccactatctccactactc 22785749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22258231 - 22258191
Alignment:
Q  163 tgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22258231 tgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 22258191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 132 - 175
Target Start/End: Original strand, 23392707 - 23392750
Alignment:
Q  132 aagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccacta 175  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23392707 aagagcgttgacctagtacaactgtacgaagtgtacaaccacta 23392750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 198
Target Start/End: Original strand, 19498010 - 19498048
Alignment:
Q  160 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtct 198  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19498010 aagtgtacaaccactacctccactactctgtttgtgtct 19498048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 187
Target Start/End: Original strand, 24814645 - 24814677
Alignment:
Q  155 gtacgaagtgtacaaccactatctccactactc 187  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24814645 gtacgaagtgtacaaccactacctccactactc 24814677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 59)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 19666564 - 19666362
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19666564 aggagatgcaagacttaaagcttgaaaggttattcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacgactattttgaaa 19666465  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19666464 ggatttgaaagcattgaatacttgttctttgaagagagttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 19666365  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  19666364 gct 19666362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 16632632 - 16632430
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16632632 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtataagcattgcagaagactggaagagtgaatcaacgactattttgaaa 16632533  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
     ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||    
T  16632532 agatttgaaggcattggattcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccaccaatcagtttgtgtctct 16632433  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  16632432 gct 16632430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 29680463 - 29680665
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29680463 aggagatgcaagacttaaagctccaaaggttgttcaatggatttaatcttgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacgactattttgaaa 29680562  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  29680563 ggatttgaaagcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaatcattatctccactactcagtatgtgtctct 29680662  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  29680663 gct 29680665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 3 - 203
Target Start/End: Original strand, 37985533 - 37985733
Alignment:
Q  3 gagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaagg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||    
T  37985533 gagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcatctaagcatcgcagaagactgaaaaagtgaagcaacaactattttgaaagg 37985632  T
Q  103 attttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgc 202  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37985633 atttgaaggcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgc 37985732  T
Q  203 t 203  Q
    |    
T  37985733 t 37985733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 12601291 - 12601099
Alignment:
Q  3 gagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaagg 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  12601291 gagatgcaagacttaaagcgtcaaaggctgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagacttgaatagtgaatcaacgactattttgaaagg 12601192  T
Q  103 attttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtg 195  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12601191 atttgaaggcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtg 12601099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 12811097 - 12811296
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12811097 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttagtttcgtctaagcattgcagaagactgaaagagtgaagcaacgactattttgaaa 12811196  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||   || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12811197 ggatttgaaggcattggatgcttgttct---aatagcgttgacaaagtaaaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 12811293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 8 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 9141097 - 9140902
Alignment:
Q  8 gcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggatttt 107  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||     
T  9141097 gcaagacttaaagcttcaagggttgttcaatggattcaatctcgtctaagcattgtagaagactggaaaagtaaagcaacgactattttgaaaggatttg 9140998  T
Q  108 aaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9140997 aaggcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatcttcactactcagtttgtgtctctgct 9140902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 3395782 - 3395580
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||||    
T  3395782 aggagatgcaagacttaaatcttcaaaagttgttcaatggattaaatatcgtctaagcattgcagaaaactgaaaaagtgaagcaacgactattttgaaa 3395683  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3395682 ggatttgaaagcattggatgctagttctttgaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 3395583  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  3395582 gct 3395580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 19884893 - 19884692
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  19884893 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggatgttca-tggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaaaagtgaagcaacgactagtttgaaa 19884795  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||    
T  19884794 ggatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactaatctgtttttgtctct 19884695  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  19884694 gct 19884692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 37435454 - 37435656
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37435454 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtccaagcattgcagaagattggaagagtgaagcaacgactattttgaaa 37435553  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||    
T  37435554 ggatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacatagtactattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactttgtttttgtctct 37435653  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  37435654 gct 37435656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 45833586 - 45833384
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||    
T  45833586 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagttaagcaacttctattttgaaa 45833487  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    | |||| || ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||    
T  45833486 gtatttgaatgcattggatgctttttcttttaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgttttggtctct 45833387  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  45833386 gct 45833384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 19620980 - 19621182
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||  ||  || |||||||||||||||||||||    
T  19620980 aggagatgcaagagttaaagcttcaaaggttgttcaatggattcaatctcgtccaagcattgcaaaagaccagagaagtgaagcaacgactattttgaaa 19621079  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19621080 ggatttgaaagcattggatgcttgttctatgaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactattcagtttgtgtctct 19621179  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  19621180 gct 19621182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 55380482 - 55380280
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaa-ggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||    
T  55380482 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaaggctgttcaatggatttaatcatgcctaa-cattgcagaagaccagaagagtgaagcaacaactattttgaa 55380384  T
Q  100 aggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctc 199  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55380383 aggatttgaaagcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctc 55380284  T
Q  200 tgct 203  Q
    ||||    
T  55380283 tgct 55380280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 14604825 - 14605028
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||    
T  14604825 aggagatccaagacttaaagcttcaaaggctattctatggattcaatctcgtctaagcattgcagaagactagaagagtgaagcaacaactatttttaaa 14604924  T
Q  101 -ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctc 199  Q
     |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||     
T  14604925 aggatttgaaagcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtcta 14605024  T
Q  200 tgct 203  Q
    ||||    
T  14605025 tgct 14605028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 192
Target Start/End: Original strand, 22675454 - 22675630
Alignment:
Q  16 taaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcatt 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22675454 taaagcttcaaaggctgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactagaaaagtgaagcaacgactagtttgaaaggatttgaaggcatt 22675553  T
Q  116 ggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 192  Q
     ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22675554 tgatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactcagttt 22675630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 10073126 - 10072925
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||  ||| |||||||    
T  10073126 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttca-tggatttaatctcgtttaagcatagcagaagactggaaaagtgaagcaactgctagtttgaaa 10073028  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||||||  |||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  10073027 ggatttgaaggcattggaggcttgttattcaaagagcgttgacaaagtacaaatgtacgaagtgtacaaccactatctccactactatgtttttgtctct 10072928  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  10072927 gct 10072925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 14904275 - 14904477
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||    
T  14904275 aggagatgcaagacctaaagcttcaaaagctattcaaaggatttaatctcgtctaggcattgcagaagactggaaaagtgaagcaacgtccattttgaaa 14904374  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  14904375 ggatttgaagacattggatgcttattctttgaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtaaacaaccattatctccaccactcagtttgtgtctct 14904474  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  14904475 gct 14904477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 4 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 56034763 - 56034567
Alignment:
Q  4 agatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaagga 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |    
T  56034763 agatgcaagacttaaagcttcaaagactgttcaatggatttaatctcgtccaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacgactattttgaaataa 56034664  T
Q  104 ttttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    ||| ||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  56034663 tttgaaggcattggatgtttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtctaaaatgtacaactactatctccactactcaatatgtgtctct 56034567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 3483911 - 3483739
Alignment:
Q  3 gagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaagg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  3483911 gagatgcaagacttaaagcttcaaaaactattcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaaaagtgaagcaacgactattttgaaagg 3483812  T
Q  103 attttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccacta 175  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  3483811 atttgaaggcattggatgcttattcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagcgcacaaccacta 3483739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 19911799 - 19912002
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||  ||  || |||||||||||||||||||||    
T  19911799 aggagatgcaagacttaaagctttaaaggttgttcaatagattcaatctcgtccaagcattgcaaaagaccagagcagtgaagcaacgactattttgaaa 19911898  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttg-aagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctc 199  Q
    |||||| || ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  19911899 ggatttgaaagcattggatgcttattctttgaaagagcgttgacatagtataattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactcagtttgtgcctc 19911998  T
Q  200 tgct 203  Q
    ||||    
T  19911999 tgct 19912002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 203
Target Start/End: Original strand, 13576048 - 13576235
Alignment:
Q  16 taaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcatt 115  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  13576048 taaagcttcaaagcctgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacgcctagtttgaaaggatttgaaggcatt 13576147  T
Q  116 ggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
     ||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||| ||| |||| ||||||||||    
T  13576148 agatgcttgttcttcaaagagcgttgacatagtacaactgtacgaagtgtaaaaccactacatccactgctctgtttttgtctctgct 13576235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 14833588 - 14833449
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14833588 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggatgttcaatagattcaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacgactattttgaaa 14833489  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgtt 140  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14833488 ggatttgaaagcattggatgcttgttctttgaagagcgtt 14833449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 413182 - 413008
Alignment:
Q  13 acttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggc 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  413182 acttaaagcttcaaaagttgttcaatggattcaatctcgtctaagcattgcagaagactcgaaaagtgaagcaacggctaatttgaaaggatttgaaggc 413083  T
Q  113 attggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactc 187  Q
    |||| ||  ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  413082 attgaatgtttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacgaagtgtacaaccactgcctccactactc 413008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 29121550 - 29121362
Alignment:
Q  13 acttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggc 112  Q
    |||||| |||||||| | |||| |||||||| || |||||||||  |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29121550 acttaaggcttcaaaagctgtttaatggattcaacctcgtctaaagattgcagaagactgaaaaagtgaagcaacgactattttgaaaggatttgaaggc 29121451  T
Q  113 attggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctg 201  Q
    | ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  29121450 actggatgcttgttctttaaagagcgttgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctg 29121362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 10693041 - 10692841
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||| || ||||| || |||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  10693041 aggagatgcaa--cttaaagcttcaaaagttgtttaacggattcaaactcgtctaaagattgcagaagactggaaaagtgaagcaacaactattttgaaa 10692944  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  10692943 ggatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgtttacaaagtacgtttgtatgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctct 10692844  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  10692843 gct 10692841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 10906807 - 10906607
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||| || ||||| || |||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  10906807 aggagatgcaa--cttaaagcttcaaaagttgtttaacggattcaaactcgtctaaagattgcagaagactggaaaagtgaagcaacaactattttgaaa 10906710  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  10906709 ggatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgtttacaaagtacgtttgtatgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctct 10906610  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  10906609 gct 10906607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 17247422 - 17247245
Alignment:
Q  14 cttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggca 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  17247422 cttaaagcttcaaaagttgttcaatggattcaatctcgtctaagcattgcagaagattggaa-agtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggca 17247324  T
Q  114 ttggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 192  Q
    ||| ||  ||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  17247323 ttgaatgtttgttcttcaaagaacattgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactgcctccactactctgttt 17247245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 6641861 - 6641674
Alignment:
Q  15 ttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||| |||||| ||||||   |||||| ||| ||||| ||| ||  ||||||||| |||||||    
T  6641861 ttaaagcttcaaaggttgttcaaaggatttaatcatgccta-gcattgtagaagatcagaagagtgaaacaacggctaattcaaaaggatttgaaggcat 6641763  T
Q  115 tggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  6641762 ttgatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttatgtctctgct 6641674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 40846281 - 40846089
Alignment:
Q  11 agacttaaagcttcaaa-ggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaa 109  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  | | || ||||||||||||| ||  || | | || ||    
T  40846281 agacttaaagcttcaaaaggctgttcaatggatttaatcacgccta-gcattgcagaagaccaggaaagtgaagcaacgactaattcaaatgaagttgaa 40846183  T
Q  110 ggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
     ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40846182 agcattggatgcttgctttttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtatctctgct 40846089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 54680118 - 54679931
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| | |||| |||||  | || |||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  54680118 aggagatgcaa--cttaaagcttcaaaagctgtttaatgg--tcaaactcgtctaatgattgcagaagactggaaaagtgaagcaacaactattttgaaa 54680023  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 192  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||  |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  54680022 ggatttgaaggcattggatgtttgttcttcaaagagcattgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 54679931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 23750712 - 23750512
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaa-ggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||  ||  ||    
T  23750712 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaaggttgttcaatggatttaatcacgccta-gcactgcagaagaccaggagagtgaagcaacgactgcttcaaa 23750614  T
Q  100 aggattttaaggcattggatacttgttctt-tgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtct 198  Q
     | | || |||||||| ||| |||||| || ||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23750613 tgaagttaaaggcatttgatgcttgtttttatgaagtgcgt---caaagtacaattgtacgaagtgtacaaccattatctccactactcagtttgtgtct 23750517  T
Q  199 ctgct 203  Q
    |||||    
T  23750516 ctgct 23750512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 6517675 - 6517475
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||| || || ||||| || |||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||| ||    
T  6517675 aggagatgcaa--cttaaagcttcaaaagttatttaaaggattcaaactcgtctaaagattgcagaagactggaaaagtatagcaacgactattttggaa 6517578  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||  || ||||  ||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  6517577 ggattggaaagcatgagatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctct 6517478  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  6517477 gct 6517475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 8105819 - 8105628
Alignment:
Q  13 acttaaagcttcaaaggttgttcaatgg-atttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaagg 111  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  8105819 acttaaggcttcaaaagttgtttaatgggattcaacttcgtctaaggattgcagaagactggaaaattgaagcaacggctattttgaaaggatttgaacg 8105720  T
Q  112 cattggatacttgtt-ctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  8105719 cattggatgcttgttcctcaaaagagcgttgacaaagtacgtttgtacgaaatgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtctctgct 8105628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 36 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 16940172 - 16940026
Alignment:
Q  36 aatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattggatacttgttctttgaaga 135  Q
    |||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||| |||||  | ||    
T  16940172 aatggattcaaactcgtctaag-attgcagaagactggaaaagtatagcaacgactattttgaaaggattgaaaggcattgaatgcttattcttcaagga 16940074  T
Q  136 gcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccact 183  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16940073 gcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccact 16940026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 3105341 - 3105540
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| | ||||  | ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||     ||||| |||||||||||    
T  3105341 aggagatgcaa--cttaaagcttcaaaagctgtttcaaggattcaaactcgtctaag-attgcagaagactggaaaagtattccaacggctattttgaaa 3105437  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||  || | |||||||  || |||||  ||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  3105438 ggattgaaaagtattggatggttattcttcaaagagcgttgacatagtatgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctct 3105537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 23123623 - 23123528
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactatttt 96  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  23123623 aggagatgcaagacttaaagcttcaaagattgttcaatgaatttaatctcgtctaagtattgtagaagactgaaagagtgaagcaatgactatttt 23123528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 58 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 11915835 - 11915701
Alignment:
Q  58 cattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgta 157  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||    
T  11915835 cattgcagaagactaaaagagtgaagcaacgactatttcaaatggatttgaaggcattggatgcttattctttgaagagcgttggaaaaggacaattgta 11915736  T
Q  158 cgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 192  Q
    | ||||||||||||||   ||||||||||| ||||    
T  11915735 caaagtgtacaaccaccgcctccactactctgttt 11915701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 203
Target Start/End: Original strand, 56533018 - 56533182
Alignment:
Q  39 ggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattggatacttgttctttgaa-gagc 137  Q
    ||||| || |||||||||| |||||||||||||| || |  ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||  |||||| |  || ||||    
T  56533018 ggattcaacctcgtctaaggattgcagaagactgaaaaaatgaagcaacggctattttgaaaggatttgaatgcattagatgtttgttcctcaaaagagc 56533117  T
Q  138 gttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||    
T  56533118 gttgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacttccactactctgttt-tgtctctgct 56533182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 17398605 - 17398795
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||||  | ||||| || |||| ||||  ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  17398605 aggagatgcaa--cttaaagcttcaaaagttgtttcaaggattcaaactcgcctaaa-attgcagaagactggaaaagtatagcaacgactattttgaaa 17398701  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    ||         |||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  17398702 gg---------cattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactaactccactactctgtttttgtctct 17398792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 203
Target Start/End: Original strand, 25651046 - 25651224
Alignment:
Q  24 caaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattggatactt 123  Q
    |||| |||||| || ||||| || || ||||||  || |||||||||| ||| || ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| || |||    
T  25651046 caaaagttgtttaacggattcaaacttgtctaaagatcgcagaagacttgaaaagtgaagcaacggctattttggaaggatttgaaggcattgaatgctt 25651145  T
Q  124 gttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
     |||||  ||||||||||||  |||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  25651146 attcttcaaagagcgttgacgtagtacgtttgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtctctgct 25651224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 15139409 - 15139283
Alignment:
Q  11 agacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaag 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||| ||  || | | || |||    
T  15139409 agacttaaagattcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtttaagcattgcagaagaccaggagagtgaagcaacgactaattcaaatgaagttgaag 15139310  T
Q  111 gcattggatacttgttctttgaagagc 137  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||    
T  15139309 gcattggatgcttgctttttgaagagc 15139283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 94 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 16853602 - 16853493
Alignment:
Q  94 tttgaaaggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttg 193  Q
    |||||| |||||| || ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||     
T  16853602 tttgaagggatttgaaagcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacatctgtatgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttt 16853503  T
Q  194 tgtctctgct 203  Q
    ||||||||||    
T  16853502 tgtctctgct 16853493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 187
Target Start/End: Original strand, 41114707 - 41114875
Alignment:
Q  18 aagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||   ||||||| |||||| |||||  ||||||||| ||||||  || | |||| ||||||||||    
T  41114707 aagcttcaaaggttgttcaattgatttaatcaagcctgt-cattgcaaaagactagaagaatgaagcaacggctatttcaaatgaatttgaaggcattgg 41114805  T
Q  118 atacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactc 187  Q
    || ||| ||  ||| |||| ||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||    
T  41114806 atgcttttttgttggagagagttgaaaaaggacaattgtacgtcgtgtacaaccactatttccaccactc 41114875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 187
Target Start/End: Original strand, 17788044 - 17788152
Alignment:
Q  80 gaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttg-acaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatct 178  Q
    ||||||| ||||||||  || | |||| |||||||| ||| ||| ||||||| ||| ||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17788044 gaagcaatgactatttcaaaggaatttaaaggcattagatgcttattctttggagaacgttggaaaaaggacaattgtacgatgtgtacaaccactatct 17788143  T
Q  179 ccactactc 187  Q
    |||||||||    
T  17788144 ccactactc 17788152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22190928 - 22190836
Alignment:
Q  111 gcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||||| ||  |||||  ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||    
T  22190928 gcattggatgctgattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctctgct 22190836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 38513939 - 38513868
Alignment:
Q  132 aagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||| ||||||||||    
T  38513939 aagagcgttgacatagtacgattgtacgaagtgtacaaccactactttcactactctgtttttgtctctgct 38513868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 55731969 - 55731844
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaag-caacgactattttgaa 99  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||| |||||| |||||||| || |||||||||  |||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||||||||    
T  55731969 aggagatgcaa--cttaaaacttcaaaagttgtttaatggattcaaactcgtctaacaattgcaaaagactgga-gaggtaaatcaacgactattttgaa 55731873  T
Q  100 aggattttaaggcattggatacttgttctt 129  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||| |||||    
T  55731872 aggatttgaagg-attggatgcttattctt 55731844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 17540556 - 17540396
Alignment:
Q  31 tgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattggatacttgttcttt 130  Q
    |||||||  |||||||||||| |||  ||||||| ||||||| ||||  |||||||| |||| ||   | |||| | ||| || ||||| | | ||| ||    
T  17540556 tgttcaaatgatttaatctcgcctat-cattgcaaaagactgaaagaatgaagcaacaactaattcagatggatgtgaagccagtggatgcctattcgtt 17540458  T
Q  131 gaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 192  Q
    | |||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  17540457 ggagagtgttgaaaaaggacaattgtacgaagtgtacaaccattatctccactactctgttt 17540396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 134 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 20977516 - 20977447
Alignment:
Q  134 gagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  20977516 gagcgttgacatagtgcgtttgtacgaagtgtacaaccactatctgcactactctgtttttgtctctgct 20977447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 40860749 - 40860657
Alignment:
Q  111 gcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||  ||||| || ||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||    
T  40860749 gcattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtatgatgtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctctgct 40860657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 148 - 187
Target Start/End: Original strand, 8685509 - 8685548
Alignment:
Q  148 tacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactc 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8685509 tacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactc 8685548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 58 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 11901322 - 11901196
Alignment:
Q  58 cattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgta 157  Q
    |||||||||||||| |||    ||||||||||||| ||  ||||  ||| |||||||||||| ||| |||| || ||| ||||   |||| |||||||||    
T  11901322 cattgcagaagactagaaacatgaagcaacgactaattcaaaagattttgaaggcattggatgcttattctctggagaacgttagaaaaggacaattgta 11901223  T
Q  158 cgaagtgtacaaccactatctccacta 184  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||    
T  11901222 cgaagtgtacaatcactatctacacta 11901196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 111 - 203
Target Start/End: Original strand, 9751569 - 9751661
Alignment:
Q  111 gcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||||| ||  |||||  ||||||||||||| ||||   ||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||    
T  9751569 gcattggatgctaattcttcaaagagcgttgacatagtatgtttgcacgaagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctctgct 9751661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 203
Target Start/End: Original strand, 39419787 - 39419855
Alignment:
Q  135 agcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||| ||||||||||    
T  39419787 agcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacttccattactctgtttttgtctctgct 39419855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 1672450 - 1672395
Alignment:
Q  132 aagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactc 187  Q
    |||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1672450 aagaacgttgacaaaatacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactc 1672395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 1674925 - 1674870
Alignment:
Q  132 aagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactc 187  Q
    |||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1674925 aagaacgttgacaaaatacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactc 1674870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 203
Target Start/End: Original strand, 14154065 - 14154115
Alignment:
Q  153 ttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  14154065 ttgtacgaagtgtacaaccaccttctccactactctgtttttgtctctgct 14154115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 175
Target Start/End: Original strand, 3499704 - 3499745
Alignment:
Q  134 gagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccacta 175  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3499704 gagcgttgacatagtacatttgtacgaagtgtacaaccacta 3499745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 192
Target Start/End: Original strand, 27188690 - 27188748
Alignment:
Q  134 gagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 192  Q
    ||||||||||| ||| |  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  27188690 gagcgttgacatagtgcgtttgtacgaagtgtataaccactatctgcactactctgttt 27188748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 175; Significance: 3e-94; HSPs: 67)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 49642724 - 49642926
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49642724 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatagatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacgactattttgaaa 49642823  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49642824 ggatttgaaggcattggatgattgttcttttaagagcgttgacaaagtacaattgtacaaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 49642923  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  49642924 gct 49642926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 37467530 - 37467328
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37467530 aggagatgcaaaacttaaatcttcaaagcttgttcaatggatttaatctcatctaagcattgtagaagactggaagagtgaagcaacgactattttgaaa 37467431  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37467430 ggatttgaaggcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactacccagtttgtgtctct 37467331  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  37467330 gct 37467328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 14392966 - 14393168
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  14392966 aggagatacaagacttaaagtttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagaccagaagagtgaaacaacgactattttgaaa 14393065  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14393066 ggatttgaaagcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactacttagtttgtgtctct 14393165  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  14393166 gct 14393168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 18 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 41495179 - 41494994
Alignment:
Q  18 aagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattgg 117  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41495179 aagcttcaaaggctgttcaatggatttaatctcgtctaaacattgcagaagactggaagagtgaagcaacgactattttgaaaggatttgaaggcattgg 41495080  T
Q  118 atacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41495079 atgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtatctgct 41494994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 13948533 - 13948334
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  13948533 aggagatgcaagacttaaagcgtcaaaggatgttcaattgatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaatagtgaagcaacgactattttgaaa 13948434  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  13948433 ggatttgaaggcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccattatctccattactcaggttgtgtctct 13948334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 28582303 - 28582103
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28582303 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggctgttcaatggatttaatctcgtctatgcattgcagaagattggaagagtgaagcaacgactattttgaaa 28582204  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| | |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  28582203 ggatttaatggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaaatacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactcagtttttgtctct 28582104  T
Q  201 g 201  Q
    |    
T  28582103 g 28582103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 2561385 - 2561183
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  2561385 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacaactattttgaaa 2561286  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||  ||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  2561285 ggatttgaagaaattggatgcttgttcttcaaagatcgttgacaaagtacaagtgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctct 2561186  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  2561185 gct 2561183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 31303583 - 31303381
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  31303583 aggagatgaaagacttaaagctttaaaggttgttcaatgaatttaatctcgtctaagcattgcagaagactgaaagagtgaaggaacaactattttgaaa 31303484  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| ||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31303483 ggatttgaagacatttgatgtttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaacaactatctccactactcagtttgtgtctct 31303384  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  31303383 gct 31303381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 17238884 - 17239083
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  17238884 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggctgatcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagaccagaagagtgaagcatcgactattttgaaa 17238983  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| || |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  17238984 ggatttgaaagcattggatgattgttctttgaatagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactacttagtttgtatctct 17239083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Original strand, 38177605 - 38177791
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  38177605 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatgaatttaatctcgtctgagcaatgcagaagattggaagagtgaagcaacaactattttgaaa 38177704  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactc 187  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38177705 ggatttgaaggcattggatgcttgttctttaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactc 38177791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 30 - 203
Target Start/End: Original strand, 13780575 - 13780748
Alignment:
Q  30 ttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattggatacttgttctt 129  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  13780575 ttgttcaatgaatttaatctcgtctaagcattgcagaagactgaaagagtgaagcaacgactattttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttatt 13780674  T
Q  130 tgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13780675 tgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccacgactcagtttgtgtctctgct 13780748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 15903396 - 15903196
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15903396 aggagatgcaagacttaaagcttcaaacgctgttcaatggattcaatctcgtctaagcattacagaagactagaagagtgaagcaacgactattttgaaa 15903297  T
Q  101 ggattttaaggcattggatac-ttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctc 199  Q
    |||||| || |||||| || | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15903296 ggatttgaaagcattgcatgctttgttctttgaagagcattgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaacaactatctccactactcagtttgtgtctc 15903197  T
Q  200 t 200  Q
    |    
T  15903196 t 15903196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 16 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 40800056 - 40799869
Alignment:
Q  16 taaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcatt 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||| |||| |||    
T  40800056 taaagcttcaaaggctgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaaaagcgaagcaacgactagtttgaaagtatttgaaggaatt 40799957  T
Q  116 ggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  40799956 ggatacttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgct 40799869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 6090929 - 6090727
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||| |||||||    
T  6090929 aggagatgcaagacttaaaacttcaaaggttgctcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactagaagagtgaagcaacatctaatttgaaa 6090830  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| ||||||||| || |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  6090829 ggatttgaaggcattgaatgcttgttctttaaaaagctttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctct 6090730  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  6090729 gct 6090727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 12963047 - 12963249
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||  ||    
T  12963047 aggagatgcaagacttaaagcttcaagggttgttcaagggatttaatcttgtctaagcaatgcagaagactgggagagtgaagcaacaactattttagaa 12963146  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    || ||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12963147 ggttttgaaagcattggatgcttgttctttgaagagtgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtatgtgtctct 12963246  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  12963247 gct 12963249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 203
Target Start/End: Original strand, 29951410 - 29951602
Alignment:
Q  11 agacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaag 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  29951410 agacttaaagcttcaaaggtttttcaatggatttaatctcgtctaagcattgtagaagaccagaggagtgaagcaacaactattttgaaaggatttgaag 29951509  T
Q  111 gcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  29951510 gcattggatgcttgttctttgaagagagttaacaaagtacaattgtacaaagtgtacaaccactatctccaccactcagtttgagtctctgct 29951602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 203
Target Start/End: Original strand, 30000564 - 30000756
Alignment:
Q  11 agacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaag 110  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  30000564 agacttaaagcttcaaaggtttttcaatggatttaatctcgtctaagcattgtagaagaccagaggagtgaagcaacaactattttgaaaggatttgaag 30000663  T
Q  111 gcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  30000664 gcattggatgcttgttctttgaagagagttaacaaagtacaattgtacaaagtgtacaaccactatctccaccactcagtttgagtctctgct 30000756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 20646352 - 20646149
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaa-ggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  20646352 aggagatgcaagacttaaagctttaaaaggctgttcaatgtatttcatctcgtccaagcattgtagaagaccagaagagtgaagcaacgtctattttgaa 20646253  T
Q  100 aggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctc 199  Q
    ||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20646252 aggatttgaaagcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactcagtttgtgtctc 20646153  T
Q  200 tgct 203  Q
    ||||    
T  20646152 tgct 20646149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 18121584 - 18121786
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  18121584 aggagatgcaagatttaaagcttcaaaggttgttcaatggattcaatctcgtttgagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacaactattttgaaa 18121683  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| ||||||||| || ||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||    
T  18121684 ggatttaaaggcattgaatgctttttcttcaaagagcgtttacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtgtttgtctct 18121783  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  18121784 gct 18121786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 14969524 - 14969341
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  14969524 aggatatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtaaagcaacaactattttgaaa 14969425  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccacta 184  Q
    |||||| | |||||||||| ||| |||||  || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14969424 ggatttgatggcattggatgcttattcttcaaatagcgttgacaaagtacatttttacgaagtgtacaaccactatctccacta 14969341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 13824263 - 13824092
Alignment:
Q  4 agatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaagga 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  13824263 agatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaaacaatgaagaagactggaagagtgaagcaacaactattttgaaatga 13824164  T
Q  104 ttttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccacta 175  Q
    ||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13824163 tttgaaggcattggatgtttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccacta 13824092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 18142714 - 18142916
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  18142714 aggagatgcaagatttaaagcttcaaaggctattcaatggattcaatctcgtttgagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacaactattttgaaa 18142813  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| ||||||||| || ||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||    
T  18142814 ggatttaaaggcattgaatgctttttcttcaaagagcgtttacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtgtttgtctct 18142913  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  18142914 gct 18142916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 16 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 47207889 - 47207701
Alignment:
Q  16 taaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaa-gcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcat 114  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||    
T  47207889 taaaacttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaaagcattgcagaagactggaaaagtgaagcaacggctagtttgaaatgatttgaaggcat 47207790  T
Q  115 tggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  47207789 tggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctttgct 47207701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 12726192 - 12726394
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12726192 aggagattcaagacttaaagcttcaaaggctattcaatggattcaatctcgtctaagctttgcagaagactagaagagtgaagtaacgactattttgaaa 12726291  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| || ||||||||| |||  ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  12726292 ggatttgaaagcattggatgcttactctttaaagagagttaacaaagtacaattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctct 12726391  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  12726392 gct 12726394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 16658580 - 16658782
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| || |||||  ||  || |||||||||||||||||||||    
T  16658580 aggagatgcaagacttgaaacttcaaaggttgttcaattgattcaatctcgtccaagcattacaaaagaccagagcagtgaagcaacgactattttgaaa 16658679  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  16658680 ggatttgaaagcattggatgcttattctttgaagagcgttgacataatacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactacttagtttgtgtctct 16658779  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  16658780 gct 16658782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 16 - 203
Target Start/End: Original strand, 47405398 - 47405585
Alignment:
Q  16 taaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcatt 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  47405398 taaagcttcaaaggctgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaaaaatgaagcaacaactagtttgaaaggatttgaaggcatt 47405497  T
Q  116 ggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
     |||  ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||    
T  47405498 tgatgtttgttcttcaaagagtgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactatgtttttgtctctgct 47405585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 49553451 - 49553653
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||  |||||||||||||    
T  49553451 aggagatgcaagacttaaagtttcaaaggctgtttaatagatttaacatcgtctaagcattgcagaagattgaaagagtgaagcagtgactattttgaaa 49553550  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||    
T  49553551 ggatttgaaggcattggatgtttgttcttcagagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtctct 49553650  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  49553651 gct 49553653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 11223742 - 11223559
Alignment:
Q  19 agcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattgga 118  Q
    ||||||||| | |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11223742 agcttcaaaagctgttcaatgggttcaatctcgtctatgcattgcagaagactgaaaaagtgaagcaacgactattttgaaaggatttgaaggcattgga 11223643  T
Q  119 tacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    | |||||||||  ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  11223642 tgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtatgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgttt-tgtctctgct 11223559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 16032711 - 16032520
Alignment:
Q  11 agacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||  || ||||||||||  | |||| | | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16032711 agacttaaagcttcaaaggttgttcaaaggatttaatcatgcctat-cactgcagaagaccaggagagtgtatcaacgactattttgaaaggatttgaag 16032613  T
Q  111 gcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  16032612 gcattggatgcttgttctttgaagagcattgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgct 16032520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 52920602 - 52920403
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||| |||    
T  52920602 aggagatgcaagacttaaagtttcaaaggctgctcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactagaagagtgaagcaacaactaattt-aaa 52920504  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    | |||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| | |||| |||||||    
T  52920503 gtatttgaaggcatttgatgcttgttctttaaagagcgttgacaaattaaaattgtacgaagtatacaaccactacctctactaccctgtttttgtctct 52920404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 203
Target Start/End: Original strand, 19888908 - 19889107
Alignment:
Q  3 gagatgcaagacttaaagcttcaaaggt-tgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaag 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||  || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  19888908 gagatgcaagacttaaagcttaaaaagactgttcaatggattcaatctcgtccaagcattgcaaaagaccagatgagtgaagcaacgactattttgaaag 19889007  T
Q  102 gattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctg 201  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  19889008 gatttgaaagcattggatgcttgttctttgaataggattgacatattacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccac--ctcagtttgtgtctctg 19889105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Original strand, 53056701 - 53056891
Alignment:
Q  13 acttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggc 112  Q
    |||||| | |||||| | |||| |||||||| ||  ||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  53056701 acttaaggtttcaaaagctgtttaatggattcaacatcgtctaaagattgcagaagactggaaaagtgaagcaacgactattttgaaaggatttgaaggc 53056800  T
Q  113 attggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  53056801 attggatgcttgttcttcaaagagcgtttacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgct 53056891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 202
Target Start/End: Original strand, 12388845 - 12389035
Alignment:
Q  11 agacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| | |||||||||||   ||| || ||||| ||||||| ||  |||| ||||||||    
T  12388845 agacttaaagcttcaaaggttgttcaaaggatttaatcatgtcta-gaattgcagaagatcagaacagtgaagctacgactaattcaaaagaattttaag 12388943  T
Q  111 gcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgc 202  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  12388944 gcattggatgcttcttctttgaagagcgttggcaaaggacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgc 12389035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 186
Target Start/End: Original strand, 46349826 - 46349991
Alignment:
Q  21 cttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattggata 120  Q
    ||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  46349826 cttcaaaagttgttcaattgatccaatctcgtctaagcattgcagaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatg 46349925  T
Q  121 cttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactact 186  Q
    |||||||||   ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  46349926 cttgttcttcagagaacattgacaaagtacgattgtacgaagtgtacaaccactgcctccactact 46349991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 20627395 - 20627595
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| | |||| |||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||     
T  20627395 aggagatgcaa--cttaaagcttcaaaagatgtttaatggattcaaactcgtctaatgattgcagaagactggaaaagtgaagcaacaactattttgaat 20627492  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||  |  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| | |||||    
T  20627493 ggatttgaaggcattggatgcttgtttatcaaagagcgttgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactttgtttttatctct 20627592  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  20627593 gct 20627595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 64 - 203
Target Start/End: Original strand, 22804048 - 22804187
Alignment:
Q  64 agaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagt 163  Q
    |||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22804048 agaagaccagaagagtgaagcaacggctattttgaaaggacttgaaggcattcgatgattgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagt 22804147  T
Q  164 gtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22804148 gtaaaaccactatctccactactcaatttgtgtctctgct 22804187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 24775498 - 24775698
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| | |||| || ||||| || |||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  24775498 aggagatgcaa--cttaaagcttcaaaagctgtttaacggattcaaactcgtctaaagattgcagaagactggaaaagtgaagcaacaactattttgaaa 24775595  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| ||||||||| || ||| |||||  |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||    
T  24775596 ggatttgaaggcattgaatgcttattcttcaaagagctttgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacatccactactctgtttttgtctct 24775695  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  24775696 gct 24775698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 2785260 - 2785075
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||| || ||||| || |||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  2785260 aggagatgcaa--cttaaagcttcaaaagttgtttaacggattcaaactcgtctaaagattgcagaagactggaaaagtgaagcaacaactattttgaaa 2785163  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgtt-ctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactc 187  Q
    |||||| || ||||||||| |||||| ||   ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2785162 ggatttgaacgcattggatgcttgttcctcaaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactc 2785075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 203
Target Start/End: Original strand, 25398238 - 25398419
Alignment:
Q  4 agatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaagga 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||                  |||||||||||||||||||||||    
T  25398238 agatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatgaatttaatctcgtctaaacaatg------------------aagcaacgactattttgaaagga 25398319  T
Q  104 ttttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||| ||||||||| ||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  25398320 tttgaaggcattgcatatttgctcttcaaagagcgttgacaaagcacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgct 25398419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 14955608 - 14955433
Alignment:
Q  17 aaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattg 116  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  14955608 aaagcttcaaaagctgtttaatggattcaaactcgtctaaagattgcagaagactggaaaggtaaagcaacaactattttgaaagtatttgaaggcattg 14955509  T
Q  117 gatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 192  Q
    ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  14955508 gatgcttattcttcaaagagcgttgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 14955433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 20725269 - 20725093
Alignment:
Q  15 ttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcat 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||| ||||| |||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||    
T  20725269 ttaaagcttcaaaggctgttcaaaagatctaatcacgtcta-gcattgcagaagaccagaagagtgaagcaacgactaattcaaaaggatttgaagacat 20725171  T
Q  115 tggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 192  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  20725170 tggatgcttgtttcttgaagagcgttgaaaaaggacaattgtacgaagtgtacaataactatctccactactctgttt 20725093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 185
Target Start/End: Original strand, 19249385 - 19249558
Alignment:
Q  11 agacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||  ||| ||  ||||||||| |||    
T  19249385 agacttaaagcttcaaaggttgttcaaacgatttaatcacgccta-gcattgcagaagaccagaagagtgaagcaacagctaattcaaaaggatttgaag 19249483  T
Q  111 gcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactac 185  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  19249484 gcattggatgtttgttctttgaagagcgctgaaataggacaattgtacgaagtgtacaaccacttactccactac 19249558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22140959 - 22140759
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||| | ||||||| ||||| || |||| ||||| ||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||||||||     
T  22140959 aggagatgcaa--cttaaagtttcaaaagctgttcaacggattcaaactcgcctaaggattgcagaagactagataagtgaaccaacgactattttgaag 22140862  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    || ||| ||  |||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||   ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  22140861 ggttttgaaaacattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacatagtacgtatgtacgaagtgtataaccactacctccactactctgtttttgtctct 22140762  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  22140761 gct 22140759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 33583416 - 33583240
Alignment:
Q  13 acttaaagcttcaaaggttgttcaatgg-atttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaagg 111  Q
    |||||| |||||||| ||||||  |||| ||| || || ||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| || |    
T  33583416 acttaaggcttcaaaagttgttttatgggattcaaccttgtctaaggattgtagaagactggaaaagtgaagcaacggctattttgaaaggatttgaacg 33583317  T
Q  112 cattggatacttgtt-ctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactc 187  Q
    |||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  33583316 cattggatgcttgttcctcaaaagagcgttgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccaatactc 33583240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 29855587 - 29855404
Alignment:
Q  21 cttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagg-gaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattggat 119  Q
    ||||||| | |||| |||||||| || |||||||||  |||||||||||||  || | | ||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||    
T  29855587 cttcaaaagctgtttaatggattcaacctcgtctaaagattgcagaagactaaaaaaagtgaagcaacggctagtttgaaagaatttgaaggcattggat 29855488  T
Q  120 acttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
     |||||||||  || |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  29855487 gcttgttcttcaaaaagcgttgacagagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttatctctgct 29855404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 18 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 12968485 - 12968312
Alignment:
Q  18 aagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattgg 117  Q
    ||||||||||||||||| ||  | ||||||| | ||||  |||||||||||||| ||||   |||| |||||||| ||  |||| |||| ||||||||||    
T  12968485 aagcttcaaaggttgtttaaatgttttaatcacatctat-cattgcagaagactagaagcatgaagtaacgactaattcaaaagaatttgaaggcattgg 12968387  T
Q  118 atacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 192  Q
    |||||| ||||||||||| |||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12968386 atacttattctttgaagaacgttggaaaaggacaattatacgaagtgtacaaccactatctccactactctgttt 12968312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Original strand, 23538146 - 23538312
Alignment:
Q  18 aagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattgg 117  Q
    ||||||||||| ||||||||  | ||||||| || |||  ||||||||||||||||||||  ||| |||||  |||||  |||| |||| |||||||||     
T  23538146 aagcttcaaagtttgttcaaatgttttaatcacgcctat-cattgcagaagactggaagaatgaaacaacggttatttcaaaagaatttgaaggcattga 23538244  T
Q  118 atacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactac 185  Q
    || ||| ||||||  ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23538245 atgcttattctttagagaacgttgaaaaaggacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactac 23538312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 5213771 - 5213583
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| | |||| || ||||| || ||||| |||  ||||||||||||||||| ||   |||||| ||||||||| ||    
T  5213771 aggagatgcaa--cttaaagcttcaaaagctgtttaacggattcaaactcgtataaagattgcagaagactggaaaagtatagcaacaactattttggaa 5213674  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 192  Q
    |||||| |||||||| ||| ||| ||  || || |||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  5213673 ggatttgaaggcattagatgcttatt-attcaaaagcgttgacgtagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 5213583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 46796341 - 46796531
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||| || ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||     ||||| ||| |||||||    
T  46796341 aggagatgcaa--cttaaagcttcaaaagttgtttaaaggattcaaactcgtctaag-attgcagaagactggaaaagtattacaacggctaatttgaaa 46796437  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    ||         |||| ||||||| |||||  ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  46796438 gg---------cattagatacttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactttgtttttgtctct 46796528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 11869253 - 11869137
Alignment:
Q  13 acttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggc 112  Q
    |||||| ||||||||  ||||| |||| ||| ||||||||||||| | | ||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  11869253 acttaaggcttcaaaatttgtttaatgaattcaatctcgtctaagaaatacagaagactggaaaagtgaagcaacgtctagtttgaaaggatttgaaggc 11869154  T
Q  113 attggatacttgttctt 129  Q
    ||||||| |||||||||    
T  11869153 attggatgcttgttctt 11869137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 21641061 - 21640865
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  |||||||| ||||| | ||||  | ||||| || |||| ||||| |||| |||||||||||| ||   ||||||| |||||||| ||    
T  21641061 aggagatgcaa--cttaaagcctcaaaagctgtttcaaggattcaaactcgcctaag-attgtagaagactggaaaagtatagcaacggctattttggaa 21640965  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||  || ||||||||| ||| || ||  ||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  21640964 ggattgaaaagcattggatgcttatttttcaaagagcgttgacatagtacgtttttacgaagtgtacaaccactatctccactactctatttttgtctct 21640865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 132 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 11868335 - 11868264
Alignment:
Q  132 aagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  11868335 aagagcgttgacaaagtacgattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgct 11868264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 111 - 203
Target Start/End: Original strand, 21605726 - 21605818
Alignment:
Q  111 gcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  21605726 gcattggatgcttattcttcaaagagcgttgacataatacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgct 21605818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 49666379 - 49666569
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||||  | ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||||||    
T  49666379 aggagatgcaa--cttaaagcttcaaaagttgtttcaaggattcaaactcgtctaag-attgcagaagactggaaaagtataacaacgactattttgaaa 49666475  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||  |||         || | |||||  |||||| |||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||    
T  49666476 ggattgaaag---------acatattcttcaaagagcattgacatattacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgattctgtctct 49666566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 192
Target Start/End: Original strand, 26417659 - 26417832
Alignment:
Q  18 aagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattgg 117  Q
    ||||||||||| ||||||||  | ||||||| || |||  |||| ||||||||| |||||  ||||||||| ||| ||  |||| |||| ||||||||||    
T  26417659 aagcttcaaagtttgttcaaatgttttaatcacgcctat-cattccagaagactagaagaatgaagcaacggctaattcaaaagaatttgaaggcattgg 26417757  T
Q  118 atacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 192  Q
    || ||  ||||||| ||| |||||  |||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  26417758 atgctcattctttggagaacgttggaaaatgacaattgtacaaagtgtacaaccactatcttcactactctgttt 26417832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 203
Target Start/End: Original strand, 21636742 - 21636834
Alignment:
Q  111 gcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||    
T  21636742 gcattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctctgct 21636834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 49 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 50300372 - 50300246
Alignment:
Q  49 tcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattggatacttgttctttgaa-gagcgttgacaaag 147  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  |||||| ||| |||||| || |||||||||   ||||| |  || ||||||||||||||    
T  50300372 tcgtctaaggattgcagaagactggaaaagtgaagcaactgctattt-gaagggatttgaacgcattggatgtatgttcctcaaaagagcgttgacaaag 50300274  T
Q  148 tacaattgtacgaagtgtacaaccacta 175  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||    
T  50300273 tacgtttgtacgaagtgtacaaccacta 50300246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 186
Target Start/End: Original strand, 11909079 - 11909171
Alignment:
Q  94 tttgaaaggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactact 186  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||  |||||||||||||||||||   | |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  11909079 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttatccttcaaagagcgttgacaaagtacgtctttacgaagtgtacgaccactacctccactact 11909171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 203
Target Start/End: Original strand, 30054310 - 30054381
Alignment:
Q  132 aagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  30054310 aagagcgttgacatagtacgtttgtacgaaatgtacaaccactaactccactactctgtttttgtctctgct 30054381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 153 - 203
Target Start/End: Original strand, 1728129 - 1728179
Alignment:
Q  153 ttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  1728129 ttgtacgaagtgtacaaccactatctgcactactctgtttttgtctctgct 1728179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 203
Target Start/End: Original strand, 9700131 - 9700200
Alignment:
Q  134 gagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||||||| ||| |  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  9700131 gagcgttgacatagtgcgtttgtacgaagtgtataaccactatctgcactactctgtttttgtctctgct 9700200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 198
Target Start/End: Original strand, 12752683 - 12752779
Alignment:
Q  94 tttgaaaggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttg 193  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||        |||||||| |||||||||||||| |||| ||||     
T  12752683 tttgaaaggaattgaaggcattggatacttatccttcaaagagcgttgacaaagtaca--------aagtgtacgaccactatctccacaactctgttta 12752774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 165
Target Start/End: Original strand, 45858804 - 45858875
Alignment:
Q  94 tttgaaaggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgt 165  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||  |||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  45858804 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttatccttcaaagagcgttgacaaagtacgtctgtacgaagtgt 45858875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 37412650 - 37412605
Alignment:
Q  153 ttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtct 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  37412650 ttgtacgaaatgtacaaccactatctccactactctgtttctgtct 37412605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 40851055 - 40850991
Alignment:
Q  111 gcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccacta 175  Q
    ||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||    
T  40851055 gcattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtatgtttgtacgaagtgtacaaccacta 40850991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 94 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 51341107 - 51341011
Alignment:
Q  94 tttgaaaggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttg 193  Q
    |||||||||| || |||||||||||| ||| | |||  |||||||||||||||        ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||     
T  51341107 tttgaaaggaattgaaggcattggatgcttatccttcaaagagcgttgacaaa--------gtacgaagtgtacgaccactacctccactactctgtttt 51341016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 13557809 - 13557777
Alignment:
Q  160 aagtgtacaaccactatctccactactcagttt 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13557809 aagtgtacaaccactatctccactactctgttt 13557777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 173; Significance: 5e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 9 - 201
Target Start/End: Original strand, 18542 - 18734
Alignment:
Q  9 caagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggatttta 108  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18542 caagatttaaagcttcaaaggctgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacgactattttgaaaggatttga 18641  T
Q  109 aggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctg 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18642 aggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattttacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctg 18734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 171; Significance: 8e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 14846 - 14644
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  14846 aggaaatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacaactattttgaaa 14747  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14746 ggatttgaaggcattggatgcttgtactttgaagagcgttgacaaagtacaattttacgaagtgtacaaccactacctccactactcagtttgtgtctct 14647  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  14646 gct 14644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 171; Significance: 8e-92; HSPs: 3)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 32683 - 32481
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  32683 aggagatgcaagacttaaagcttcaaagactgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagtaacgactattttgaaa 32584  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32583 ggatttgaatgcatttgatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 32484  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  32483 gct 32481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 49530 - 49328
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  49530 aggagatgcaagtcttaaagcttcaaagtttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagatttgaagagtgaagcaactactattttgaaa 49431  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49430 ggatttgaaggcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaacaactatctccactactcagtttgtgtctct 49331  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  49330 gct 49328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 82 - 198
Target Start/End: Original strand, 339 - 455
Alignment:
Q  82 agcaacgactattttgaaaggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctcca 181  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||  |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  339 agcaacggctaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttatccttcaaagagcgttgacaaagtacgtctgtacgaagtgtacgaccactacctcca 438  T
Q  182 ctactcagtttgtgtct 198  Q
    |||||| |||| |||||    
T  439 ctactctgtttatgtct 455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 73)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 15088714 - 15088513
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15088714 aggagatgcaagacgtaaagcttcaaaggctgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactgaaagagtgaagcaacgactattttgaaa 15088615  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15088614 ggatttgaagacattggatgcttgttcttttaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 15088515  T
Q  201 gc 202  Q
    ||    
T  15088514 gc 15088513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 13303004 - 13302802
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  13303004 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatatcgtctaagcattgtagaagactagaagagtgaagcaacgactattttgaaa 13302905  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13302904 ggatttgaaggcattagatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacaaagtgtacaaccactatcaccactactcagtttgtgtctct 13302805  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  13302804 gct 13302802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 10883137 - 10883339
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10883137 aggagatgcaagacttaaagtttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaatcatttcagaagactggaagagtgaagcaacgactattttgaaa 10883236  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  10883237 ggatttgaaggcattggatgcctgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaatcactacctccactactcagtttgcgtctct 10883336  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  10883337 gct 10883339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 13137859 - 13138061
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  13137859 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttaatcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactgaaagagtgaagcaacaactattttgaaa 13137958  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
     ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  13137959 agatttgaaggcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccattactcagtttatgtctct 13138058  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  13138059 gct 13138061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 44467259 - 44467056
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaa-ggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  44467259 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactagaagagtgaagcaacgactattttgaa 44467160  T
Q  100 aggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctc 199  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  44467159 aggatttgaaggcattggatgcttgttctttaaagagtgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctc 44467060  T
Q  200 tgct 203  Q
    ||||    
T  44467059 tgct 44467056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 2500232 - 2500030
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  2500232 aggagatgcaagacttaaagcttcaaatgttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacaactattttgaaa 2500133  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| || ||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2500132 ggatttgaaagcattggatgcttatcctttgaagagagttgacaaagtacaattgtacaaagtgtacaaccactttctccactactcagtttgtgtctct 2500033  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  2500032 gct 2500030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 13730639 - 13730839
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  13730639 aggagatgcaaggcttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcataagactaaaagagtgaagcaacggctattttgaaa 13730738  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
     ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13730739 agatttgaatgcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccattatctccactactcagtttgtgtctct 13730838  T
Q  201 g 201  Q
    |    
T  13730839 g 13730839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 2913572 - 2913774
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||    
T  2913572 aggagatgcaagacttaaatcttcaaaggctgttcaatgaatttaatctcatctaaacaatgcagaagactagaaaagtggagcaacgactattttgaaa 2913671  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2913672 ggatttgaaggcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 2913771  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  2913772 gct 2913774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 7 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 13880292 - 13880096
Alignment:
Q  7 tgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattt 106  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13880292 tgcaagacataaagcttcaaaggctgttcaatggacttaatctcgtctaagcattgcagaagactcgacgagtgaagcaacgactattttgaaaggattt 13880193  T
Q  107 taaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
     |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13880192 gaaggcattagatgcttattctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcactttgtgtctctgct 13880096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 3 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 21695593 - 21695393
Alignment:
Q  3 gagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaagg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||  ||| |    
T  21695593 gagatgcaagacttaaagcttcaaaagttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagaccagaagagtgaagcaacgactatttcaaaatg 21695494  T
Q  103 attttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgc 202  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  21695493 atttgaaggcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccagtacctcaactactcagtttgtgtctctgc 21695394  T
Q  203 t 203  Q
    |    
T  21695393 t 21695393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 9069756 - 9069554
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9069756 aggagatgcaaaacttaaagcttcaaaggttgttcaagggatttaatatcgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacgactattttgaaa 9069657  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| ||||||||| || |||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  9069656 ggatttaaaggcattgtatgcttgttcttcaaggagcattgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactcagtttttgtctct 9069557  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  9069556 gct 9069554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 13648923 - 13648721
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  13648923 aggagatgcgagacttaaagcttcaaaagatgttcaatggatttaatcgcgtctaagcattgcagaagactgaaagagtgaagcaacggctattttgaaa 13648824  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13648823 ggatttaaagacattggatgcttgatctttgaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcaatttgtgtctct 13648724  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  13648723 gct 13648721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 203
Target Start/End: Original strand, 16316525 - 16316723
Alignment:
Q  5 gatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggat 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  16316525 gatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatcacgtctaagaattgcagaagaccagaagagtgaagcaacagctattttgaaaggat 16316624  T
Q  105 tttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16316625 ttgaagccattggatgcttgttctttgaagagcgttgaaatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 16316723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 21692481 - 21692279
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  21692481 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaagttattcaatgattttaatctcttctaagcattgcagaagaccagaagagtgaagcaacgactgttttgaaa 21692382  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21692381 ggatttgaaggcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtatgaagtgtacaaccactacctccactactcagtttgtgtctct 21692282  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  21692281 gct 21692279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 21283337 - 21283536
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||    
T  21283337 aggatatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtaaagcaacgtccattttgaaa 21283436  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  21283437 ggatttgaaggcattggatgcttgttattcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctct 21283536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 11793101 - 11792899
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||   ||||| |||||||||||||||||||||    
T  11793101 aggagatgcaagacttaaagctttaaaggttgttcaatggacttaatctcgtctaagcattgcgaaagaccataagagtgaagcaacgactattttgaaa 11793002  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    | |||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  11793001 gcatttgaaagcatttgatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccaccacttagtttgtgtctct 11792902  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  11792901 gct 11792899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 22577985 - 22578187
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  22577985 aggagatgcaagacttaaagcttcaaagggtgttcaatagatttaatctcgtttaagcattgcagaagactgtaagagtgaagcaacaactattttgaaa 22578084  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| ||||||||| ||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  22578085 ggatttgaaggcattgaatgattgttcttaaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctct 22578184  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  22578185 gct 22578187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 33691676 - 33691878
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33691676 aggagatgcaagacataaagcttcaaaggctgttaaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacgactattttgaaa 33691775  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    | |||| ||||| || ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  33691776 gaatttaaaggcgttagatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtataaccactacctccactactctgtttttgtctct 33691875  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  33691876 gct 33691878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 11319597 - 11319400
Alignment:
Q  3 gagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaagg 102  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  11319597 gagatgcaagacttcaagcttcaaaggatgttcaatggatttaatcttgtctaagcattgcagaagactgaaagagtgaagtaacaactattttgaaagg 11319498  T
Q  103 attttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||| || ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11319497 atttgaatgcattggatgcgtgttttttgaagagcgttgacaaattacaattgcacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 11319400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 3 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 28409231 - 28409034
Alignment:
Q  3 gagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaagg 102  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  28409231 gagatgcaagacataaggcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaaacattgcagaagactagaagagtgaagcaacaattattttgaaagg 28409132  T
Q  103 attttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  28409131 atttgaaggcattggatgtttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctct 28409034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 24788335 - 24788136
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  24788335 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatagatttaatatcatctaagcattgcagaagactagaagagtgaagcaacgaatattttgaaa 24788236  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  24788235 ggatttgaaggcattgggtgcttgttcttcaaagagaattgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctct 24788136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 30026097 - 30025897
Alignment:
Q  3 gagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaagg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  30026097 gagatgcaagacttaaagcttcaaacgctggtcaatggatttagtctcgtataagcatcgcagaagactgaaagagtgaagcaacggctattttgaaaag 30025998  T
Q  103 attttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgc 202  Q
    | || |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30025997 aattgaaggcattcgatgcttgttcttttaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccaatatctctactactcagtttgtgtctctgc 30025898  T
Q  203 t 203  Q
    |    
T  30025897 t 30025897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 30944289 - 30944489
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  30944289 aggagatgcaa--cttaaagcttcaaaggttgttcaacggatttaatctcgtctaagtattgcagaagattggaaaagtgaagcaacaactattttgaaa 30944386  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  30944387 ggatttgaaggcattggatgcttattcttcaaagagcgttgacaaaatacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctct 30944486  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  30944487 gct 30944489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 12366712 - 12366914
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  12366712 aggaggtgcaaaacttaaagcttcaagggctgttcaatggatttaatctcgtttaagcattgcagaagactgggagagtgaagcaacaactattttgaaa 12366811  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  12366812 ggatttgaaagcattggatgtctgttctttgaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtatacaaccactacctccactaatcagtctgtgtctct 12366911  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  12366912 gct 12366914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 15468110 - 15467924
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  15468110 aggagatgcaagacttaaagcttcaaagggtgttcaatagatttaatctcgtctaggcaatgcagaagactggaagagtgaatcaacgactattttaaaa 15468011  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactc 187  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  15468010 ggatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaggtgtacaaccattacctccactactc 15467924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 23279923 - 23280113
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || | ||||||| ||| |||||||    
T  23279923 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggctattca-tggatttaatcttgtctaagcattgtagaagactggaaaagtggagcaacggctagtttgaaa 23280021  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 192  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23280022 ggatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgttt 23280113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 29935323 - 29935524
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||| |   ||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  29935323 aggagatgcaagacttaaaatttcaaaggttgttcaatatatttaatcacacttaa-cattgcagaagaccagaagagtgaagcaacgactattttgaaa 29935421  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29935422 ggatttgaaagcattggatgcttgttctttaaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactacttagtttgtgtctct 29935521  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  29935522 gct 29935524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 200
Target Start/End: Original strand, 5000788 - 5000985
Alignment:
Q  4 agatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagg-gaagcaacgactattttgaaagg 102  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||||    ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  5000788 agatgcaagacttagagcttcaaaggttgttcaatggattcaatctcgcccaagcattgcaaaagaccaagagaagtgaagcaacgactattttgaaagg 5000887  T
Q  103 attttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||| || |||||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5000888 atttgaaagcattgaatgcttgttctttgaagaacgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 5000985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 30945322 - 30945518
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  30945322 aggagatgcaa--cttaaagcttcaaaggttgttcaacggatttaatctcgtctaagtattgtagaagattggaaaagtgaagcaacaactattttgaaa 30945419  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctc 199  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||    
T  30945420 ggatttgaaggcattggatgcttgttcctcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactttgtttttgtctc 30945518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 203
Target Start/End: Original strand, 9709781 - 9709968
Alignment:
Q  16 taaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcatt 115  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  9709781 taaagcttcaaagcctgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacgcctagtttgaaaggatttgaaggcatt 9709880  T
Q  116 ggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
     ||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||| ||| |||| ||||||||||    
T  9709881 agatgcttgttcttcaaagagcgttgacatagtacaactgtacgaagtgtaaaaccactacatccactgctctgtttttgtctctgct 9709968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 15 - 198
Target Start/End: Original strand, 19237022 - 19237204
Alignment:
Q  15 ttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcat 114  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  19237022 ttaaagcttcaaaggctgttcaaaggatttaatctcgtcta-gcattgcagaagaccagaagagtgaagcaacggctactttgaaaggatttgaaggcat 19237120  T
Q  115 tggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtct 198  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19237121 tggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaactacaattatacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttgtgtct 19237204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 48236868 - 48237068
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||| | |||||||    
T  48236868 aggagatgcaa--cttaaagcttcaaaagttgttcaatggattcaatctcgtctaagcattgcataagactgaaaaggtgaagcaacgacaagtttgaaa 48236965  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||  ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||    
T  48236966 ggatttgaaggcatcagatgcttattcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactttgtttttgtctct 48237065  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  48237066 gct 48237068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 28622322 - 28622522
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||| ||| |||||||    
T  28622322 aggagatgcaa--cttaaagcttcaaaagttgttcaatggattcaatctcgtctaagcattgcagaatactagaaaagtgaagcaacggctaatttgaaa 28622419  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||| |||| |||||||    
T  28622420 ggatttgaaggcattggatgtttgtttttcaaagggcgttgacaaagtacaattgtacgaggtgtacaaccactacctctacttctctgtttttgtctct 28622519  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  28622520 gct 28622522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 203
Target Start/End: Original strand, 13018479 - 13018671
Alignment:
Q  11 agacttaaagcttcaaa-ggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaa 109  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || | | | ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| || | | || ||    
T  13018479 agacttaaagcttcaaaaggctgttcaatggatttaatcacgccca-gtattgcagaagactaggagagtgaagcaacgactattttaaatgaagttgaa 13018577  T
Q  110 ggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||||||||| || | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13018578 ggcattggatgctggatttttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctgtgct 13018671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 14426739 - 14426542
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||| | | |||| |||||||| || ||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  14426739 aggagatgcaa--cttaaagcttcagaagctgtttaatggattcaaactcatctaaagattgcagaagactggaaaagtgaagcaacgactattttgaaa 14426642  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  14426641 ggatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacgtttgtactaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctct 14426542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 16 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 33605865 - 33605677
Alignment:
Q  16 taaagcttcaaa-ggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcat 114  Q
    |||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  33605865 taaagcttcaaaaggcttttcaacggatttaatctcgtctaagcaatgcagatgactggaaaattgaagcaatgactattttgaaaggatttgaaggcat 33605766  T
Q  115 tggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||| ||||||||||    
T  33605765 tggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacgattgtacgaagtgtacaaccactaccttcactactatgtttttgtctctgct 33605677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 200
Target Start/End: Original strand, 39284545 - 39284727
Alignment:
Q  17 aaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattg 116  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||| ||||||| ||||||  |||||| ||| ||||||||| ||  || | |||| |||||||||    
T  39284545 aaagcttcaaaggctgttcaaaggatttaatcacgccta-gcattgctgaagaccagaagagtgaaacaacgactaattcaaatgaatttgaaggcattg 39284643  T
Q  117 gatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39284644 gatgtttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactcagtttgtgtctct 39284727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Original strand, 16111860 - 16112050
Alignment:
Q  13 acttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggc 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||| || |||||||||  | |||||||||| | || || |||||||||||| ||||| ||| | || |||||    
T  16111860 acttaaagcttcaaaagttgttttatggattcaacctcgtctaaagagtgcagaagacggaaaaagtgaagcaacgacttttttggaagaaattgaaggc 16111959  T
Q  113 attggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  16111960 attggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgct 16112050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 13692533 - 13692372
Alignment:
Q  4 agatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaagga 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||         
T  13692533 agatgtaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtataagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacaactattttga----- 13692439  T
Q  104 ttttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccact 174  Q
        ||| |||||||| |||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13692438 ----aagacattggatgcttgatctttatagagtgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccact 13692372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 331828 - 331637
Alignment:
Q  12 gacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactatttt-gaaaggattttaag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||| | |||    
T  331828 gacttaaagcttcaaaggttgttttatggattcaaggtcgtccaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacagctatttttgaaaggatctgaag 331729  T
Q  111 gcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||||| ||| ||  |  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  331728 gcattggatgcttattgctcaaa-agcgttgacaaagtacaaatgtacgaagtgtacaaccactacctccactacacagtttgtgtctctgct 331637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 91 - 203
Target Start/End: Original strand, 16309961 - 16310073
Alignment:
Q  91 tattttgaaaggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagt 190  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16309961 tattttgaaaggatttgaaggcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctacactactcagt 16310060  T
Q  191 ttgtgtctctgct 203  Q
    |||||||||||||    
T  16310061 ttgtgtctctgct 16310073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Original strand, 35952663 - 35952851
Alignment:
Q  13 acttaaagcttcaaaggttgttcaatgg-atttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaagg 111  Q
    |||||| |||||||| | |||| ||||| ||| || |||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35952663 acttaaggcttcaaaagctgtttaatgggattcaacctcgtctaaggattgaagaagactggaaaagtgaagcaacgactattttgaaaggatttgaagg 35952762  T
Q  112 cattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    ||||||||  |||||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||    
T  35952763 cattggatgtttgttcatcaaagagcgttgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccattactctgtttttgtctct 35952851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 203
Target Start/End: Original strand, 41842254 - 41842439
Alignment:
Q  18 aagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattgg 117  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||| ||||   | |||| ||||||||||||| ||  || | | || ||| ||||||    
T  41842254 aagcttcaaaggttgttcatttgatttgatctcgtctaagcactgcataagatcaggagagtgaagcaacgactaattcaaatgaagttgaagacattgg 41842353  T
Q  118 atacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  41842354 atacttgttttttaaagtgcgttgacagagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctgcactactcagtttgtgtctctgct 41842439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 66 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 14193243 - 14193108
Alignment:
Q  66 aagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgt 165  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14193243 aagactggaagagtgaagcaacgactattttgaaaggatttgaaggcattgaatgcttgttcttcaaagagcgttaacaaagtacaagtgtacgaagtgt 14193144  T
Q  166 acaaccactatctccactactcagtttgtgtctctg 201  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||    
T  14193143 acaaccactacctctactactctgtttttgtctctg 14193108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 13880768 - 13880608
Alignment:
Q  15 ttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcat 114  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||     
T  13880768 ttaaagcttcaaaggctgttcaaaagatttaatcacgccta-gcattgcagaagactagaagagtgaagcaacgactaattcaaaaggatttgaaggcac 13880670  T
Q  115 tggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagt-gtacaaccacta 175  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13880669 tggatgcttgttctttgaagagcgttgaaaaaggacaattgtacgaagtggtacaaccacta 13880608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 13260587 - 13260781
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  || |||  ||||||| |||||| | |      
T  13260587 aggagatgcaagacttaaagctccaaagactgtt-aatggatttaatctcgtccaagcattgcggaagaccagaggagtaaagcaacaactattctta-- 13260683  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
         | || ||||||||| ||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13260684 -----tgaaagcattggatgcttgttcttggaagagcattgagatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactacccagtttgtgtctct 13260778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 202
Target Start/End: Original strand, 13893966 - 13894162
Alignment:
Q  4 agatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaagga 103  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||| ||  ||||||    
T  13893966 agatgaaatacttaaagcttcaaaggttgttcaaaggatttaatcacgccta-gcattgcagaagaccagaagagtgaagcaacggctaattcaaaagga 13894064  T
Q  104 ttttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgc 202  Q
    ||| ||||||||| ||  ||||||||| || ||| |||| |||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  13894065 tttgaaggcattgaatgtttgttctttaaaaagcattgaaaaaggacaattgtacaacgtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtctctgc 13894162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 4821655 - 4821466
Alignment:
Q  13 acttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggc 112  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||   ||| || |||||||||  ||| ||||||||| ||| || | ||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  4821655 acttaaagcttcaaaagctgtttaacaaattcaaactcgtctaaagattacagaagactagaaaagtggagcaacggctattttgaaag-atttgaaggc 4821557  T
Q  113 attggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  4821556 attggatgcttgttcttcaaagagcgttgaaaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgct 4821466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 39 - 175
Target Start/End: Original strand, 12174342 - 12174479
Alignment:
Q  39 ggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattggatacttgtt-ctttgaagagc 137  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||   ||||||    
T  12174342 ggattcaacctcgtctaaggattgcagaagactggaaaagtgaagcaacgactattttgaaaggatttgaacgcattggatgcttgttcctcaaaagagc 12174441  T
Q  138 gttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccacta 175  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  12174442 gttgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccacta 12174479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 169
Target Start/End: Original strand, 16543003 - 16543152
Alignment:
Q  20 gcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattggat 119  Q
    |||||||| | |||| |||||||| || ||||| |||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16543003 gcttcaaaagctgtttaatggattcaaactcgtttaatgattgcagaagactggaaaagtgaagcaacgactattttgaaatgatttgaaggcattggat 16543102  T
Q  120 acttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaa 169  Q
     |||||||||  ||||||  |||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  16543103 gcttgttcttcaaagagctctgacaaagtacgtttgtacgatgtgtacaa 16543152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 16622659 - 16622510
Alignment:
Q  20 gcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattggat 119  Q
    |||||||| | |||| |||||||| || ||||| |||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  16622659 gcttcaaaagctgtttaatggattcaaactcgtttaatgattgcagaagactggaaaagtgaagcaacgactattttgaaatgatttgaaggcattggat 16622560  T
Q  120 acttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaa 169  Q
     |||||||||  ||||||  |||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  16622559 gcttgttcttcaaagagctctgacaaagtacgtttgtacgatgtgtacaa 16622510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 178
Target Start/End: Original strand, 13032046 - 13032213
Alignment:
Q  11 agacttaaagcttcaaa-ggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaa 109  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||  | |||| |||||||| |||||||  || | | || ||    
T  13032046 agacttaaagcttcaaatggttgttcaatggatttaatcacgccta-gtattgcagaagaccaggagagtgaagcaacaactatttcaaatgaagttgaa 13032144  T
Q  110 ggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatct 178  Q
    | |||| ||| || | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13032145 gacattagatgctggctttttgaagagcgttgacaaagtataattgtacgaagtgtacaaccactatct 13032213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 4494700 - 4494634
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaa 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4494700 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaa 4494634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 83 - 200
Target Start/End: Original strand, 19711059 - 19711176
Alignment:
Q  83 gcaacgactattttgaaaggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccac 182  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||  |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19711059 gcaacgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttatccttcaaagagcattgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactatttccac 19711158  T
Q  183 tactcagtttgtgtctct 200  Q
    ||||| |||| |||||||    
T  19711159 tactctgtttttgtctct 19711176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 48 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 8183076 - 8182922
Alignment:
Q  48 ctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaag 147  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||   |||||| |||||||||||||||||  ||| || | ||| ||| |||||  ||||||||||||| |     
T  8183076 ctcgtctaag-attgcagaagactggaaaagtatagcaacaactattttgaaaggattgaaagacacttgatgcttattcttcaaagagcgttgacataa 8182978  T
Q  148 tacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  8182977 tacgtctgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgct 8182922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 150
Target Start/End: Original strand, 15704475 - 15704612
Alignment:
Q  13 acttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggc 112  Q
    ||||||||||||||| | |||| || ||||| || |||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  15704475 acttaaagcttcaaaagctgtttaacggattcaaactcgtctaaagattgcagaagactggaaaagtatagcaacgactattttggaaggatttgaaggc 15704574  T
Q  113 attggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtac 150  Q
    ||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||    
T  15704575 attggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtac 15704612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 108 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 1293117 - 1293025
Alignment:
Q  108 aaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  1293117 aaggcattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctct 1293025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 2265485 - 2265674
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||| | |||| ||  |||| || |||||||||  |||||||||||||| || ||   ||||||| |||||||| ||    
T  2265485 aggagatgcaa--cttaaagctttaaaagctgtttaacagattcaaactcgtctaaagattgcagaagactgaaaaagtatagcaacggctattttggaa 2265582  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 192  Q
    |||||| |||| |||  || ||| |||||  ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  2265583 ggatttgaaggtatttaatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactgctctgttt 2265674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 115
Target Start/End: Original strand, 13472555 - 13472658
Alignment:
Q  13 acttaaagcttcaaa-ggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaagg 111  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||    
T  13472555 acttaaagctttaaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgtagaagatcataagagtgaagcaacaactattttgaaaggatttgatgg 13472654  T
Q  112 catt 115  Q
    ||||    
T  13472655 catt 13472658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 175
Target Start/End: Original strand, 9098283 - 9098384
Alignment:
Q  74 aagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccac 173  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||  ||||||||| || ||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9098283 aagagtgaagcaacggctaattcaaaaggatttgaatgcattagatgtttgttctttgaagagcgttgaaaaaggacaattgtacgaagtgtacaaccac 9098382  T
Q  174 ta 175  Q
    ||    
T  9098383 ta 9098384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 150
Target Start/End: Original strand, 16556664 - 16556751
Alignment:
Q  63 cagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtac 150  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  16556664 cagaagactggaaaagtgaagcaacggctattttgaaaggattttaaggcattgattgcttgttcttcaaagagcgttgaaaaagtac 16556751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 16608998 - 16608911
Alignment:
Q  63 cagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtac 150  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  16608998 cagaagactggaaaagtgaagcaacggctattttgaaaggattttaaggcattgattgcttgttcttcaaagagcgttgaaaaagtac 16608911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 203
Target Start/End: Original strand, 48062891 - 48062986
Alignment:
Q  108 aaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  48062891 aaggcattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagcgtacaaccactatctccattactctgtttctgtctctgct 48062986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 111 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 14425531 - 14425444
Alignment:
Q  111 gcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtct 198  Q
    ||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  14425531 gcattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatattacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtct 14425444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 111 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 27871803 - 27871710
Alignment:
Q  111 gcattggatacttgttctttgaaga-gcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||||| ||| |||||  |||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  27871803 gcattggatgcttattcttcaaagaagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgct 27871710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 187
Target Start/End: Original strand, 19339324 - 19339400
Alignment:
Q  111 gcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactc 187  Q
    ||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19339324 gcattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactc 19339400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 203
Target Start/End: Original strand, 24794813 - 24794881
Alignment:
Q  135 agcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||    
T  24794813 agcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctctgct 24794881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 4494628 - 4494569
Alignment:
Q  144 aaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||| ||||||||||    
T  4494628 aaagtacaattgtacgaagtgtacaaccgctacctccactactctctttttgtctctgct 4494569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 16412078 - 16412000
Alignment:
Q  108 aaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactc 187  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||   |||| ||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  16412078 aaggcattggatgcttattctttgaagagcgttcgaaaaggacaatagtac-aattgtacaaccattatctccactactc 16412000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 203
Target Start/End: Original strand, 48805953 - 48806045
Alignment:
Q  111 gcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||||| ||  |||||  ||||||||||||| |||||  | |||| ||||||||||||||||  |||||||||| | || ||||||||||    
T  48805953 gcattggatgctatttcttcaaagagcgttgacatagtacgttcgtacaaagtgtacaaccactacttccactactctgattttgtctctgct 48806045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 197
Target Start/End: Original strand, 14745750 - 14745787
Alignment:
Q  160 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtc 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  14745750 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtc 14745787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 56
Target Start/End: Original strand, 7339840 - 7339893
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaa 56  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  7339840 aggagatgcaa--cttaaagcttcaaaaattgtttaatggatttaaactcgtctaa 7339893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 203
Target Start/End: Original strand, 32264816 - 32264884
Alignment:
Q  135 agcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||||||||| |||||  ||||||  |||||||||||| || ||||||| ||| |||| ||||||||||    
T  32264816 agcgttgacatagtacgtttgtacagagtgtacaaccagtacctccactgctctgtttttgtctctgct 32264884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 46)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 6512374 - 6512573
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6512374 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcagtggatttaatctcgtctaagcattgctgaagactggaagagtgaagcaacgactattttgaaa 6512473  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6512474 ggatttgaaggcattgg---cttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatcttcactactcagtttgtgtctct 6512570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 3 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 17815160 - 17814960
Alignment:
Q  3 gagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaagg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  17815160 gagatgcaagacttaaagcttcaaaggctgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacgactattctgaaagg 17815061  T
Q  103 attttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgc 202  Q
    |||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17815060 atttgaaagcattagatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacggagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgc 17814961  T
Q  203 t 203  Q
    |    
T  17814960 t 17814960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 21910750 - 21910548
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  21910750 aggagatgcaagacttaaagcgtcaaaggctgttgaattgatttaatctcgtctaagcattacaaaagactggaaaagtgaagcaacgattattttgaaa 21910651  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21910650 ggatttgaaggcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 21910551  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  21910550 gct 21910548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 23412917 - 23413119
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  23412917 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcatccaagcattgcagaagaccagaagagtgaagcaacgattattttgaaa 23413016  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23413017 ggatttgaaagcattggatgcttgttttttgaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 23413116  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  23413117 gct 23413119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 89365 - 89567
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  89365 aggagatgcaaaacttaaagcttcaaaagttgttcaatggatttaatctcgtctaagaattgcagaagaccagaagagtgaagcaacgactattttgaaa 89464  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    | |||| || |||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  89465 gaatttgaaagcattgcatgcttgttctttgaagagcattgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 89564  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  89565 gct 89567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 41566377 - 41566579
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||    
T  41566377 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaagctattcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactagaaaagtgaagcaacgtctattttgaaa 41566476  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| ||||||||||||  || |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41566477 ggatttgaaggcattggatgtttattctttgaagagcgttgatatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 41566576  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  41566577 gct 41566579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 20551089 - 20550887
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaa-ggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  20551089 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaaggttgttcaatggttttaatctcgtctaagcattgcagaaaactagaagagtgaagcaacgactattttgaa 20550990  T
Q  100 aggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctc 199  Q
    | ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  20550989 aagatttgaaggcattggatgcttgttctttaaagagcgttgacaaa-tacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctc 20550891  T
Q  200 tgct 203  Q
    ||||    
T  20550890 tgct 20550887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 7745636 - 7745838
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  7745636 aggagatgtaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatcgcatccaagcattggagaagactagaagagtgaagcaacaactattttgaaa 7745735  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  7745736 ggatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactcggtttttgtctct 7745835  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  7745836 gct 7745838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 21072184 - 21072385
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||  |||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  21072184 aggagatgcaagacttaaagcttaaaaggttgttctatggatttaatcac-tcacagcattgcagaagaccagaagagtgaagcaacaactattttgaaa 21072282  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21072283 ggatttgaaagcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctctactactcagtttgtgtctct 21072382  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  21072383 gct 21072385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 16 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 33022843 - 33022656
Alignment:
Q  16 taaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcatt 115  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  33022843 taaagcttcaaaggctgttcaatggatttaatctcatctaagcattgcagaagactggaaaagtgaagcaacgactagtttgaaaggatttgaaggcatt 33022744  T
Q  116 ggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||    
T  33022743 ggatgtttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactatgtttttgtctctgct 33022656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 19536243 - 19536446
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaag-agggaagcaacgactattttgaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||   ||| || |||||||||||| |||||||    
T  19536243 aggagatgcaagacttaaagcttcaagggctgttcaatggattcaatctcgtccaagcattgcaaaagaccaaaaggagtgaagcaacgacttttttgaa 19536342  T
Q  100 aggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctc 199  Q
     |||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19536343 tggatttgaaagcattggatgtttgttctttgaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactacttagtttgtgtctc 19536442  T
Q  200 tgct 203  Q
    ||||    
T  19536443 tgct 19536446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 26784548 - 26784346
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||  ||  || |||||||||||||||||||||    
T  26784548 aggagatgcaagatttaaagctttaaaggctgttcaatggattcaatctcgtccaagcattgcaaaagaccagagcagtgaagcaacgactattttgaaa 26784449  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    ||||||  | | | ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  26784448 ggatttggaagaactggatgcttattctttgaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactcagtttgtgtgtct 26784349  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  26784348 gct 26784346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 13545463 - 13545657
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||        ||||||| |||| |||||||    
T  13545463 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggacttaatctcgtctaagcattgcagaagagtg--------aagcaacaactactttgaaa 13545554  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||| |||||||    
T  13545555 ggatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaagtgtacgaagtgtacaaccaccacctccactactctatttttgtctct 13545654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 31118057 - 31117869
Alignment:
Q  16 taaagcttcaaa-ggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcat 114  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  31118057 taaagcttcaaaaggttgtttaacggatttaaactcgtctaagcattgcagaagactggaaaagtgaagcaacgactaatttgaaagaatttgaaggcat 31117958  T
Q  115 tggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||| ||||||||||    
T  31117957 tggatgcttgttcttcaaagagtgttgacaaagtacaaatgtacgaagtgtacatccactacttccactactctgtttttgtctctgct 31117869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 4887204 - 4887014
Alignment:
Q  13 acttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggc 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |  |||||| |||||||||| ||   ||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  4887204 acttaaagcttcaaaagttgttcaatggatttaaacttgtcttaagattgcaaaagactggaaaagtatagcaacgactattttgaaaagatttgaaggc 4887105  T
Q  113 attggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  4887104 attggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacgtgtgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgct 4887014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 30743172 - 30742973
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||  |  ||||||||| ||||||||||    
T  30743172 aggagatgcaa--cttaaagcttcaaaagttgtttaatggattcaaactcgtctaaagattgcagaagactggaaaggcaaagcaacgattattttgaaa 30743075  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| ||||||||||||  || |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  30743074 ggatttgaaggcattggatgtttattcttcaaagagcgttgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtctct 30742976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 23881246 - 23881059
Alignment:
Q  16 taaagcttcaaa-ggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcat 114  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||  | |||| ||||||||||||| ||  || | | || |||||||    
T  23881246 taaagcttcaaaaggttgtttaatggatttaatcacgccta-gcattgcagaagaccaggagagtgaagcaacgactaattcaaatgaagttgaaggcat 23881148  T
Q  115 tggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23881147 tggatgcttgctttttgaagagcgttgacaaagtgcaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactacttagtttgtgtctctgct 23881059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 11994080 - 11993880
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||| | ||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||     
T  11994080 aggagatgcaa--cttaaagtttcaaaagatgttcaacggattcaaactcgtctaaggattgcagaagactggaatagtgaagcaacggctaatttgaag 11993983  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||    
T  11993982 ggatttgaaagcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacgtatgtacgaagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctct 11993883  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  11993882 gct 11993880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 6499423 - 6499231
Alignment:
Q  11 agacttaaagcttcaaa-ggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaa 109  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  | | | ||||||||||||  | |||| ||||||||  ||||||  || | | || ||    
T  6499423 agacttaaagcttcaaaaggttgttcaatggatttaatcacaccca-gtattgcagaagaccaggagagtgaagcaacatctatttcaaatgaagttgaa 6499325  T
Q  110 ggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6499324 ggcatcggatgcttgctttttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 6499231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 202
Target Start/End: Original strand, 25096777 - 25096969
Alignment:
Q  11 agacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| || ||  ||||||||| |||    
T  25096777 agacttaaagcttcaaaggttgttcaaaggatttaattacgccta-gcattgcagaagaccagaagagtgaagcaacgattaattcaaaaggatttgaag 25096875  T
Q  111 gcattggatacttgttctttgaagagcgttg---acaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgc 202  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||||||   | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  25096876 acattggatgcttgttctttaaagagcgttgaaaaaaaaggacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtctctgc 25096969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 202
Target Start/End: Original strand, 25154747 - 25154939
Alignment:
Q  11 agacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||| || ||  ||||||||| |||    
T  25154747 agacttaaagcttcaaaggttgttcaaaggatttaattacgccta-gcattgcagaagaccagaagagtgaagcaacgattaattcaaaaggatttgaag 25154845  T
Q  111 gcattggatacttgttctttgaagagcgttg---acaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgc 202  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||||||   | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  25154846 acattggatgcttgttctttaaagagcgttgaaaaaaaaggacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtctctgc 25154939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 203
Target Start/End: Original strand, 642661 - 642849
Alignment:
Q  11 agacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaag 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||| |||||||   | |||| ||| ||||| ||| ||  ||   | || |||    
T  642661 agacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatcacaccta-gcattacagaagatcaggagagtgaaacaacggctaattcaaataaagttgaag 642759  T
Q  111 gcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  642760 gcattggatgcttgttttttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactc---ttgtgtctctgct 642849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 15517151 - 15516962
Alignment:
Q  13 acttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggc 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||  ||||||||||||||||| ||   ||||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  15517151 acttaaagcttcaaaagttgttcaacggattcaaactcgtctaaagattgcagaagactggaaaagtatagcaacggctattttggaaggatttgaaggc 15517052  T
Q  113 attggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||| ||| |||||  ||||| |||| || |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  15517051 attggatgcttattcttcaaagagtgttggcatagtacttttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtctctgct 15516962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 203
Target Start/End: Original strand, 12352763 - 12352940
Alignment:
Q  26 aaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattggatacttgt 125  Q
    |||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||   | || | ||||||| | ||| ||  || | | || |||||||||||| ||||     
T  12352763 aaggctgttcattggatttgatcttgtctaagcattgcagaagatcaggagggtgaagcaatggctaattcaaatgaagttaaaggcattggatgcttgc 12352862  T
Q  126 tctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12352863 attttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 12352940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 203
Target Start/End: Original strand, 21198958 - 21199148
Alignment:
Q  11 agacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaag 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| | | ||||||||||  ||| |  || |||||| ||| ||  || | |||| |||    
T  21198958 agacttaaagcttcaaaggttgttcaaaggatttaatcacgccta-gtactgcagaagaccagaaaaatga-gcaacggctaattcaaatgaatttgaag 21199055  T
Q  111 gcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21199056 gcattggatgctcgttctttggaaagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaatcactacctccactactcagtttgtgtctctgct 21199148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 42243873 - 42243673
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| | |||| || ||||| || |||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  42243873 aggagatgcaa--cttaaagcttcaaaagctgtttaacggattcaaactcgtctaaaaattgcagaagactggaaaagtgaagcaacaactattttgaaa 42243776  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgtt-ctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctc 199  Q
    |||||| ||| |||| |||  ||||| |||  ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  42243775 ggatttgaagacatttgatgtttgttccttaaaagagcgttgacaaaatacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtctc 42243677  T
Q  200 tgct 203  Q
    ||||    
T  42243676 tgct 42243673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Original strand, 14086492 - 14086684
Alignment:
Q  13 acttaaagcttcaaaggttgttcaatgg-atttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaagg 111  Q
    |||||| |||||||| | |||| ||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||||| || |    
T  14086492 acttaaggcttcaaaagctgtttaatgggattcaacctcgtctaaggattgcagaagactggaaaagtgaagcaacggctattttgaagtgatttgaatg 14086591  T
Q  112 cattggatacttgttctttgaa-gagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||||||| ||||||| |  || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  14086592 cattggatgcttgttcctcaaaagagcgttgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccgctacctccactactctgtttttgtctctgct 14086684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 33933453 - 33933259
Alignment:
Q  13 acttaaagcttcaaag--gttgttcaatgg-atttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaa 109  Q
    |||||||||||||||   |||||| ||||| ||| || |||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  33933453 acttaaagcttcaaaaaagttgtttaatgggattcaacctcgtctaaggattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacaactattttgaaaggatttaaa 33933354  T
Q  110 ggcattggatacttgtt-ctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
     ||||||||| |||||| ||   ||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  33933353 cgcattggatgcttgttcctcaaaagagcgttgatatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgct 33933259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 29138353 - 29138551
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||| | |||| ||  |||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||   |||||| ||||||||| ||    
T  29138353 aggagatgcaa--cttaaagtttcaaaagctgtttaacagattcaaaatcgtctaag-attgcagaagactggaa-agtatagcaacaactattttggaa 29138448  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||  |||||||||||| ||| |||||  |||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29138449 ggattagaaggcattggatgcttattcttcaaagagcgttgtcatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttgtgtctct 29138548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 203
Target Start/End: Original strand, 9398698 - 9398879
Alignment:
Q  11 agacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaag 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||  ||| ||| ||||        |||||||||| ||  || | | || |||    
T  9398698 agacttaaaggttcaaaggttgttcattggatttgatctcgtctaag-at--caggagagtgga--------gcaacgactaattcaaatgaagttgaag 9398786  T
Q  111 gcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||||| || |||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9398787 gcattgaatgcttactttttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtataaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 9398879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 203
Target Start/End: Original strand, 21099658 - 21099849
Alignment:
Q  11 agacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaag 110  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  | ||| ||||| || |||||    |||| |||||||| |||| ||  || | |  | |||    
T  21099658 agacttaaagcttcaaaggctgttaaatggatttaatcatgccta-gcattacaaaagaccaagagagtgaagcaacaactaattcaaatgaagctgaag 21099756  T
Q  111 gcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||||| ||||   |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21099757 gcattggatgcttgccttttgaagaacgtttacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactcagtttgtgtctctgct 21099849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 200
Target Start/End: Original strand, 3245423 - 3245583
Alignment:
Q  39 ggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcg 138  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||   ||||||| |||||||||||| |||  |||||||| ||| ||| |||||  |||||||    
T  3245423 ggattcaaactcgtctaag-attgcagaagactggaaaagtatagcaacggctattttgaaagaattgaaaggcatttgatgcttattcttcaaagagcg 3245521  T
Q  139 ttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  3245522 ttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccagtactctgtttttgtctct 3245583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 26759341 - 26759157
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||| || ||||| ||  ||| ||||  ||||||||||||||||| ||   | |||||||||||||| ||    
T  26759341 aggagatgcaa--cttaaagcttcaaaagttgtttaacggattcaaattcgcctaaagattgcagaagactggaaaagtataacaacgactattttggaa 26759244  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactc 187  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||  ||||||| ||| | ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26759243 ggatttgaaggcattggatgcttattcttcaaagagcgctgaaatagtaagtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactc 26759157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 82 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 28139720 - 28139599
Alignment:
Q  82 agcaacgactattttgaaaggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctcca 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||| |||||   |||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28139720 agcaacgactattttgaaaggattgaaagacattggatgcttattcttcatagagcgttgacatagtatgtttgtacgaagtgtacaaccactatctcca 28139621  T
Q  182 ctactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||||| |||| ||||||||||    
T  28139620 ctactctgtttttgtctctgct 28139599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 84 - 203
Target Start/End: Original strand, 30115863 - 30115982
Alignment:
Q  84 caacgactattttgaaaggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccact 183  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30115863 caacgactattttgaaaggattgaagggcatttgatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaaatgtacaaccactatctccact 30115962  T
Q  184 actcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||| |||| ||||||||||    
T  30115963 actctgtttttgtctctgct 30115982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 59 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 26765634 - 26765501
Alignment:
Q  59 attgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtac 158  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||  ||||||| ||| | |||||  ||||||    
T  26765634 attgcagaagactggaaaagtatagcaacaactattttggaaggatttgaaggcattggatgcttattcttcaaagagcgctgaaatagtacgtttgtac 26765535  T
Q  159 gaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 192  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  26765534 gaagtgtacaaccactgcctccactactctgttt 26765501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 108 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 9089056 - 9088961
Alignment:
Q  108 aaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||||||||||| ||  |||||  ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  9089056 aaggcattggatgctaattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgct 9088961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 200
Target Start/End: Original strand, 28464389 - 28464481
Alignment:
Q  108 aaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||    
T  28464389 aaggcattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctctactactctgtttttgtctct 28464481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 94 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 32160867 - 32160763
Alignment:
Q  94 tttgaaaggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttg 193  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||  |||||||||||||||| ||   |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||     
T  32160867 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttatccttcaaagagcgttgacaaagaacgtatgtacgaagtgtacgaccactacctccactactctgttta 32160768  T
Q  194 tgtct 198  Q
    |||||    
T  32160767 tgtct 32160763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 10848860 - 10848765
Alignment:
Q  108 aaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||| | |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  10848860 aaggcattagatgcttattcttcaaagagcgttgacataatacgtttgtacaaagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgct 10848765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 203
Target Start/End: Original strand, 25930206 - 25930301
Alignment:
Q  108 aaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||||||||||| ||| || ||  ||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  25930206 aaggcattggatgcttatttttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaattgtacaaccactatctctactactctgtttttgtctctgct 25930301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 203
Target Start/End: Original strand, 35932059 - 35932151
Alignment:
Q  111 gcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||||| ||| |||||  ||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||    
T  35932059 gcattggatgcttattcttcaaagagtgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctctgct 35932151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 198
Target Start/End: Original strand, 11208011 - 11208125
Alignment:
Q  83 gcaacgactattttgaaaggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccac 182  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || ||||||||| ||    |||  ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  11208011 gcaacgactattttgaagagatttgaatgcattggatgctcagccttcaaagagcgttgacaaagtactat-gtacgaagtgtataaccactacctccac 11208109  T
Q  183 tactcagtttgtgtct 198  Q
    ||||| |||| |||||    
T  11208110 tactctgtttttgtct 11208125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 103 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 16607603 - 16607520
Alignment:
Q  103 attttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactc 187  Q
    |||| |||||||||||  ||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16607603 atttgaaggcattggaagcttattctttggagaacgttggaaaaggacaatagtac-aagtgtacaaccactatctccactactc 16607520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 25930110 - 25930182
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaa 75  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||| || ||||| || |||||||||  |||||| ||||||||||    
T  25930110 aggagatgcaa--cttaaagcttcaaaagttgtttaaaggattcaaactcgtctaaagattgcataagactggaa 25930182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 192
Target Start/End: Original strand, 23391679 - 23391737
Alignment:
Q  134 gagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 192  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  23391679 gagcgttgacatagttcgtttgtacgaagtgtacaatcactatctgcactactctgttt 23391737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 1888 - 1686
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  1888 aggaaatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaggagtgaagcaacaactattttgaaa 1789  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  1788 ggatttgaaggcattggatgcttgtactttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactacttagtttgtgtctct 1689  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  1688 gct 1686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 4)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 377472 - 377674
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  377472 aggagatgcaagacttaaaacttcaaatgttgttgaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagaccggaagagtgaagcaacgactatattgaaa 377571  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  377572 ggatttgaaggcattggatgcttgttctttgaagagcattgacaaagtacaattgtaccaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 377671  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  377672 gct 377674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 220435 - 220234
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||| ||||||||| ||| ||  ||     
T  220435 aggagatgagagacttaaagcttcaaaggctgttcattggttttaatctcgtctaagcattgcagaagaccaggagagtgaagcaacggctaattcaaat 220336  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    | |||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  220335 gaatttgaag-cattggatgcttgttatttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtataaccactacctccactactcagtttgtgcctct 220237  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  220236 gct 220234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 211583 - 211394
Alignment:
Q  14 cttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggca 113  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||||| || |||||||||  ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  211583 cttaaagcttcaaaagttgtttaacggattcaaactcgtctaaagattgcagaagactggaaaagtatagcaacgactattttgtaaggattttaatgca 211484  T
Q  114 ttggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    || ||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  211483 tttgatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtatacaactactacctccactactctgtttttgtctctgct 211394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 22 - 194
Target Start/End: Original strand, 244219 - 244390
Alignment:
Q  22 ttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattggatac 121  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||| || ||  || |||||||||||  |||||| |||||||| |||| ||  ||||||||| ||| |||||||| |    
T  244219 ttcaaaggctgttcaaaagatttaatcacgcctg-gcgttgcagaagaccagaagagtgaagcaacaactaattcaaaaggatttgaagacattggatgc 244317  T
Q  122 ttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgt 194  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  244318 ttgttctttgaagagcgttgaaaaaggacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttgt 244390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 25888 - 26087
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  25888 aggagatgcaagacttaaagcgtcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaaaagtgaagcaacgactattttgaaa 25987  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25988 ggatttgaaggcattggatgcttgttctttgaagagggttgacatagtacaattgtatgaagtgtacaaccactatctcgactactcagtttgtgtctct 26087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 36 - 166
Target Start/End: Original strand, 44652 - 44782
Alignment:
Q  36 aatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattggatacttgttctttgaaga 135  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  44652 aatggatttaatctcgtctaagtattgtagaagactggaaaagtgaagcaacgtctattttgaaaggatttgaaggcattagatgcttgttctttgaaga 44751  T
Q  136 gcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgta 166  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  44752 gcgttgacataatacaattgtacgaagtgta 44782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 47)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 15302398 - 15302196
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  15302398 aggagatgcaagacttaaagcgtcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaaacattgcagaagactggaaaagtgaagcaacggctattttgaaa 15302299  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15302298 ggatttaaaggcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacattgtacaattgtacaaagtgtacaaccactatctccactactcagttagtgtctct 15302199  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  15302198 gct 15302196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 32544463 - 32544261
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  32544463 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacgtctattttgaaa 32544364  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| ||||||||||||  || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  32544363 ggatttaaaggcattggatgtttattcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttctgtctct 32544264  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  32544263 gct 32544261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 202
Target Start/End: Original strand, 20112652 - 20112852
Alignment:
Q  3 gagatgcaagacttaaagcttcaaa-ggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaag 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  20112652 gagatgcaagacttaaagcttaaaaaggttgttcaatggatttaatctcttctaagcattgcagaagaccggaagaatgaagcaacgactattttgaaag 20112751  T
Q  102 gattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctg 201  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20112752 gatttgaaagcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaaatgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctg 20112851  T
Q  202 c 202  Q
    |    
T  20112852 c 20112852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 13602370 - 13602168
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  13602370 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatcttgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaaccactattttgaaa 13602271  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
     || || |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13602270 tgaattgaaggcattggatgcttattctttgaagaacgttgacaaaatacaattgtaagaagtgtataaccactatctccactactcagtttgtgtctct 13602171  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  13602170 gct 13602168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9718041 - 9717841
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  9718041 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaaacattgtagaagactggaagagtgaagcaacaactattttgaaa 9717942  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  9717941 ggatttaaaggcatttgatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctct 9717842  T
Q  201 g 201  Q
    |    
T  9717841 g 9717841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 23284762 - 23284564
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||| |||||||||||    
T  23284762 aggagatgcaagacttaaagcttcaaatgttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagaccagaaaagtgaagcaacgcctattttgaaa 23284663  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctc 199  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23284662 ggatttgaaggcattgaatgcttgttccttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtataaccattatctccactactcagtttgtgtctc 23284564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 12715370 - 12715573
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaa-ggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12715370 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaaggctgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagattgaaagagtgaagcaacgactattttgaa 12715469  T
Q  100 aggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctc 199  Q
    | ||||| || |||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12715470 atgatttgaaagcattgtatgcctattctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtagaaccactatctccactactcagtttgtgtctc 12715569  T
Q  200 tgct 203  Q
    ||||    
T  12715570 tgct 12715573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 26972179 - 26972379
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  26972179 aggagatgcaagacttaaagcttcaaatgttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagacttgaagagtgaagcaacaactattttgaaa 26972278  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  26972279 ggatttaaaggcattggatgtttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattg--cgaagtgtacaaccactacctccactactcagtatttgtctct 26972376  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  26972377 gct 26972379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 11 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 15987422 - 15987232
Alignment:
Q  11 agacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaagg-attttaa 109  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||| ||    
T  15987422 agacttagagcttcaaaggatgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagaccagaagagtgaagcaatgactattttaaaagggatttgaa 15987323  T
Q  110 ggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15987322 ggcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccattactcagtttgtgtctct 15987232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 17 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 18378496 - 18378310
Alignment:
Q  17 aaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattg 116  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  18378496 aaagcttcaacggttgttcaatggattaaatctcgtctaagtattgcaaaagactggaagagtcaagcaacaactattttgaaaggatttgaaggcattg 18378397  T
Q  117 gatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18378396 gatgcatgttctttgaagagcgttgataaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 18378310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 13435730 - 13435544
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13435730 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggattttcaatggatttaatctcgtttaagcattgcagaagattggaagagtgaagcaacgactattttgaaa 13435631  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactc 187  Q
    |||||| || |||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13435630 ggatttgaaagcattgaatgattgttctttgaaaagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactc 13435544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 14100391 - 14100592
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  14100391 aggagatgcaagacttaaagtttcaaaggatgttcaatggatttaatctcatctaagcattgtagaagactggaagagtgaagaaacaactattttgaaa 14100490  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  14100491 ggatttgaaggcattggatgcttcttctttaaagagcgttgacaaagtacaattatacgaagtgtacaaccactacctccactactctgttt-tgtctct 14100589  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  14100590 gct 14100592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 29918214 - 29918013
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||    
T  29918214 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttca-tggatttaatctcgtctaagcattgcagaagattggaaaagtgaagcaacgactagtttgaaa 29918116  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
     ||||| |||||||  ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |    
T  29918115 agatttgaaggcatcagatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctat 29918016  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  29918015 gct 29918013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 203
Target Start/End: Original strand, 15531578 - 15531777
Alignment:
Q  4 agatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaagga 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||  |||||||||||||    
T  15531578 agatgcaagacttaaagcttgaaaggttgttcaatgaatttaatctcgtctaagcattgcagaagactagaagagtaaaacaacggttattttgaaagga 15531677  T
Q  104 ttttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||||    
T  15531678 tttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagcgtacaaccactacctccactactctgtctttgtctctgct 15531777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 21625298 - 21625114
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  21625298 aggagatgcaagacttacagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagattggaagagtaaagcaacggcta-tttgaaa 21625200  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactact 186  Q
    | |||| ||||||||| || |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21625199 gcatttgaaggcattgcatgcttgttcttcaaagagcgttaacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactact 21625114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 24117024 - 24116824
Alignment:
Q  4 agatgcaagacttaaagcttcaaa-ggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaagg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||  || ||| |||| | ||  ||||||||||||    
T  24117024 agatgcaagacttaaagcttcaaaaggctgttcaatggattcaatctcgtccaagcattgcaaaagaccagaggagtgaagtagcggttattttgaaagg 24116925  T
Q  103 attttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgc 202  Q
    |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24116924 atttgaaagcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgc 24116825  T
Q  203 t 203  Q
    |    
T  24116824 t 24116824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 19086346 - 19086154
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttg-ttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  19086346 aggagatgcaagacttaaagct-caagggctgattcaatggatttaatctcgtctaagtattgcagaagactgggagagtgaagcaacgactattttgaa 19086248  T
Q  100 aggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctc 199  Q
    ||          |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19086247 ag----------cattggatgcttgttctttgaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctc 19086158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 19624177 - 19623975
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||  || ||| ||||||||||||||| |||||    
T  19624177 aggagatgcaagtcttaaagcttcaaaggttgttcaatggattcaatctcgtccaagcattgcaaaagaccagaggagtgaagcaacgactattctgaaa 19624078  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgaca-aagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctc 199  Q
    |||||| || |||||||||  |||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19624077 ggatttgaaagcattggatgattgttctttggagagcgtt-acactagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctt 19623979  T
Q  200 tgct 203  Q
    ||||    
T  19623978 tgct 19623975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 18435754 - 18435552
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  18435754 aggagatgcaagacttaaagctttgaaggttattcaatggatttaatctcgtctaagaatttcaaaagactagaaaagtgaagcaacgactattttgaaa 18435655  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| ||| | |||| |||||||    
T  18435654 ggatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaagtgtacaaagtgtacaaccactacctccagtacactgtttttgtctct 18435555  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  18435554 gct 18435552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 12 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 19688953 - 19688790
Alignment:
Q  12 gacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaagg 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19688953 gacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttattctcgtccaagcattgtagaaaactggaagagtgaagcaaggactattttgaaaggatttgaagg 19688854  T
Q  112 cattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccacta 175  Q
    ||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19688853 cattggatgtttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtataaccacta 19688790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 16 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22802324 - 22802137
Alignment:
Q  16 taaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcatt 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||| | |||||||| |||| ||||||||    
T  22802324 taaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatattgtctaagcattgcagacgactggaaaagtgaaacaacgacaagtttgaaagaatttaaaggcatt 22802225  T
Q  116 ggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||    
T  22802224 ggatgcttgttcttcaaagagcgttaacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtctctgct 22802137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 17 - 199
Target Start/End: Original strand, 20730671 - 20730853
Alignment:
Q  17 aaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattg 116  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  20730671 aaagcttcaaaggctgttcaagggatttaatctcatctaagtattgcagaagactggaaaagtgaagcaacgactagtttgaaaggatttgaaggcattg 20730770  T
Q  117 gatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctc 199  Q
    |||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||    
T  20730771 gatgtttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacaaagtgtacaaccactacctccactgctctgtttttgtctc 20730853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 16 - 203
Target Start/End: Original strand, 16265116 - 16265303
Alignment:
Q  16 taaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcatt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||| || |||||||||| ||  |||||||| ||| || |||||    
T  16265116 taaagcttgaaaggttgttcaatggatttaatctcatctaagcattgcacaggactggaaaagtgaagcaacgagtagattgaaaggttttgaatgcatt 16265215  T
Q  116 ggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16265216 ggatgcttgttcttcaaagagcgttgagaaagtacaattgtacgaagtgtgcaaccactacctccactactctgtttgtgtctctgct 16265303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 34451619 - 34451787
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |    
T  34451619 aggagatgcaagacttaaagattcaaaggctgttcaatggattcagtatcgtctaagcattgcagaagactgaaagagtgaagcaacgactaatttgaga 34451718  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaa 169  Q
    |||||| || |||||| || | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34451719 ggatttgaaagcattgtatgcctattctttgaaaagcgttgacaaagtacaattgtacaaagtgtacaa 34451787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 186
Target Start/End: Original strand, 10640384 - 10640555
Alignment:
Q  15 ttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||    
T  10640384 ttaaagcttcaaaggttgttcaaaggatttaatcacgccta-gcattgcagaagaccagaagagtgaagcaacgactaattcaaaaggatttgaaggcat 10640482  T
Q  115 tggatacttgttctttgaagagcgttg-acaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactact 186  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10640483 tagatgcttgttctttgaagagcgttgaaaaaaggacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactact 10640555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 16336323 - 16336123
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  ||| |||||||||| |||||| || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||| ||    
T  16336323 aggagatgcaa--cttgaagcttcaaaagttgtttaaaggattcaaactcgtctaaacattgcagaagactggaaaagtatagcaacgactattttggaa 16336226  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||  ||||||||| || ||| |||||  ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  16336225 ggattagaaggcattgaatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgattgtacgaagtgtacaaccactatctacactactctgtttttgtctct 16336126  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  16336125 gct 16336123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 15954889 - 15954702
Alignment:
Q  13 acttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggc 112  Q
    ||||||||||||||| | |||| || ||||| || ||| |||||  ||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  15954889 acttaaagcttcaaaagctgtttaacggattcaaactcttctaaagattgcagaagactggaaaaatgaagcaacgactaatttgaaaggatttgaaggc 15954790  T
Q  113 attggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||| || |||||| ||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  15954789 attgaatgcttgttattcaaagagcgttgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctct 15954702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Original strand, 20487880 - 20488071
Alignment:
Q  13 acttaaagcttcaaaggttgttcaatggattt-aatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaagg 111  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||  || || |||||||||  |||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  20487880 acttaaggcttcaaaagttgtttaatggggttcaacctcgtctaaagattgcagaagactgtaaaagtgaagcaacggctattttgaaaggatttgaagg 20487979  T
Q  112 cattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  20487980 cattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacgtttgtacgaagtttacaaccactacctccactactctgtttttgtatctgct 20488071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 16877409 - 16877209
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||  ||||||||||||||  | || |||||||||||||| || |||    
T  16877409 aggagatgcaa--cttaaagcttcaaaagttgtttaatggattcaaactcgtctaaagattgcagaagactgagaaagtgaagcaacgactatcttaaaa 16877312  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||| ||||||| ||  ||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||    
T  16877311 ggatttgaaggaattggatgctaattcctcaaagagcgttgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgcctct 16877212  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  16877211 gct 16877209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 21618430 - 21618251
Alignment:
Q  13 acttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggc 112  Q
    ||||||||||||||| |||||| || ||||| || ||| |||||  |||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  21618430 acttaaagcttcaaaagttgtttaacggattcaaactcttctaaagattgtagaagactggaaaagtaaagcaacgactattttggaaggatttgaaggc 21618331  T
Q  113 attggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 192  Q
    ||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  21618330 attggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgttt 21618251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 22076360 - 22076560
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||| | |||| || |||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||| ||   |||||||||||||||| ||    
T  22076360 aggagatgcaa--cttaaagctttaaaagctgtttaaaggatttaaactcgtctaaagattgcagaagactcgaaaagtatagcaacgactattttggaa 22076457  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||  || ||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  22076458 ggattggaaagcatttgatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacatttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctct 22076557  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  22076558 gct 22076560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 25597677 - 25597559
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||    
T  25597677 aggacatgcaagacttaaagcttcaaaggatgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgtagaagactggaagagtgaagcgacggctatttcgaaa 25597578  T
Q  101 ggattttaaggcattggat 119  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  25597577 ggatttgaaggcattggat 25597559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 33 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 26943741 - 26943572
Alignment:
Q  33 ttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattggatacttgttctttga 132  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||  | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  26943741 ttcaaaggatttaatcatgtcta-gcattgcagaagactagaagagtgaagcaaccgctatttcaataggattagaaggcattggatgcttgttctttga 26943643  T
Q  133 agagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||| ||||    
T  26943642 agagcgttggcgaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctttgct 26943572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 12349188 - 12348995
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  |||| ||||||||| | ||||  | ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||    
T  12349188 aggagatgcaa--cttagagcttcaaaagctgtttcaaggattcaaactcgtctaag-attgcagaagactggaaaagtatagcaacgactattttgaaa 12349092  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtc 197  Q
    |||||  |||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  12349091 ggattgaaaggcattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacaaagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtc 12348995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 12423428 - 12423261
Alignment:
Q  31 tgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattggatacttgttcttt 130  Q
    |||| |||||||| || |||||||||| || |||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||| |||||     
T  12423428 tgtttaatggattcaaactcgtctaagaat-gcagaagactggaaaagtatagcaacgactattttgaaaggattggaaggcattgtatgcttattcttc 12423330  T
Q  131 gaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctc 199  Q
     ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  12423329 aaagagcgttgacatagtacctttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctc 12423261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 19470850 - 19470683
Alignment:
Q  18 aagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| || ||| |||||||| |||||  |||||  ||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  19470850 aagcttcaaaggttgttcaacagatttaatcacgccta-gcattgcacaagaccagaagaatgaagcaacgactaattcaaaaggatttgaaggcattgg 19470752  T
Q  118 atacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactact 186  Q
    || ||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19470751 atgcttgttctttgcagagcgtggaaaaaggacaattgtacgaagtttacaaccactacctccactact 19470683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 19832985 - 19833175
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  |||||||||| ||| | |||| || ||||| || ||| |||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  19832985 aggagatgcaa--cttaaagctttaaaagctgtttaacggattcaaactcatctaaagattgcagaagactggaaaagtgaagcaacgactattttgaaa 19833082  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgtt-ctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 192  Q
    |||||| || ||||||||| |||||| ||   ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||    
T  19833083 ggatttgaacgcattggatgcttgttcctcaaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaagcactacctccactactctgttt 19833175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 112 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 25594155 - 25594064
Alignment:
Q  112 cattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25594155 cattggatgcttgttctttgaagcgcgttgacaaagtacaattgtacgaaatgtacaaccactacctccactactcagtttgtgtctctgct 25594064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 21235296 - 21235137
Alignment:
Q  16 taaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcatt 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    | |||             ||||||| |||| ||||||||    
T  21235296 taaagctttaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcaaaaggctgttcaatggac------------ttgaaagcatttgaaggcatt 21235209  T
Q  116 ggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactc 187  Q
     ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21235208 cgatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtatgaagtgtacaaccactacctccactactc 21235137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 48 - 203
Target Start/End: Original strand, 33351927 - 33352079
Alignment:
Q  48 ctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaag 147  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||   ||||| | ||||||||||||||||  ||  ||||||||  || |||||  ||||||||||||| ||    
T  33351927 ctcgtctaag-agtgcagaagactggaaaagtatagcaagg-ctattttgaaaggattgaaaaacattggatgtttattcttc-aagagcgttgacatag 33352023  T
Q  148 tacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  33352024 tacgtttgtacgaagtgtacaatcactatctccactactctgtttttgtctctgct 33352079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 122 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 17381598 - 17381517
Alignment:
Q  122 ttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||| ||||||||||    
T  17381598 ttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaatcactacctccactattctgtttttgtctctgct 17381517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 203
Target Start/End: Original strand, 19066079 - 19066171
Alignment:
Q  111 gcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||    
T  19066079 gcattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtatgtttgtacgaagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtctctgct 19066171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 19482817 - 19482751
Alignment:
Q  134 gagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    ||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  19482817 gagcgttgacatagtgcgtttgtacgaagtgtacaaccactatctgcactactctgtttttgtctct 19482751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 203
Target Start/End: Original strand, 17316609 - 17316678
Alignment:
Q  134 gagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||    
T  17316609 gagcgttgacatagtgcgtttgtacgaagtgtacaaccactatctgcactactatgtttttgtctctgct 17316678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 25930568 - 25930485
Alignment:
Q  103 attttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactc 187  Q
    |||| ||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||  |||| | ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  25930568 atttgaagtcattggatgcttattccttgaagagcgttggaaaaggataatagtac-aattgtacaaccactatctccactactc 25930485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 26589667 - 26589595
Alignment:
Q  132 aagagcgttgacaaagtacaattgtacgaa-gtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||||||||| |||||   |||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||    
T  26589667 aagagcgttgacatagtacgtctgtacgaaagtgtacaaccactacttccactactctgtttctgtctctgct 26589595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 198
Target Start/End: Original strand, 14051425 - 14051529
Alignment:
Q  93 ttttgaaaggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 192  Q
    ||||||| | |||| ||| |||||||| ||| | |||  ||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||  ||||||||||| ||||    
T  14051425 ttttgaaggaatttgaagtcattggatgcttatccttcaaagagagtcgacaaagtaca-ttgtacgaagcgtacagccacttcctccactactctgttt 14051523  T
Q  193 gtgtct 198  Q
     |||||    
T  14051524 ttgtct 14051529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771 (Bit Score: 156; Significance: 7e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0771
Description:

Target: scaffold0771; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 673 - 474
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  673 aggagatgcaagacttaaagcgtcaaaggatgttcaattgatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaatagtgaagcaacgactattttgaaa 574  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  573 ggatttgaaggcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccattatctccattactcaggttgtgtctct 474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 156; Significance: 7e-83; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 60211 - 60012
Alignment:
Q  4 agatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaagga 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  60211 agatgcaagacttaaagcttcaaaggatgttcaatggatttaatctcgtccaagaattgcagaagactggaaaagtgaagcaacgactattttgaaagga 60112  T
Q  104 ttttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  60111 tttgaagccattggatgcttgttctttgaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctcttctactcagtttgtgtctctgct 60012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 8124 - 7922
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  8124 aggagatgcaaaacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtccaagcattgtagaagactgtaaaagtgaagcaacgactattttgaaa 8025  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  8024 ggatttgaattcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacatagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactacgaagtttgtgtctct 7925  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  7924 gct 7922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 48
Target Start/End: Original strand, 151794 - 151831
Alignment:
Q  11 agacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatc 48  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  151794 agacttaaagcttcaaaggttgttcaaaggatttaatc 151831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 12399 - 12205
Alignment:
Q  9 caagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggatttta 108  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| |    
T  12399 caagacttaaagcttcaaaggctgttcaatgaatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacaactattttgaaagaatttga 12300  T
Q  109 aggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12299 aagcattggatgcttattctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagattgtgtctctgct 12205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0227 (Bit Score: 151; Significance: 7e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0227
Description:

Target: scaffold0227; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22874 - 22672
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  22874 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaaaagtgaagcaacgactattttgaaa 22775  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  22774 ggatttgaaggcattggatgcttattcttcaaagagtgttgacaaagtacaattgtatgaagcgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctct 22675  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  22674 gct 22672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 10020 - 10220
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaa-ggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  10020 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaaggttgttcaatggatttaatctcatctaagctttgcagaagactagaagagtgaagcaacgactattttgaa 10119  T
Q  100 aggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctc 199  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  10120 aggatttgaaggcattggatgcttgttttttaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacgaccactacctccactactctgtttgtgtctc 10219  T
Q  200 t 200  Q
    |    
T  10220 t 10220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 132 - 200
Target Start/End: Original strand, 14816 - 14884
Alignment:
Q  132 aagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14816 aagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacgaccactacctccactactctgtttgtgtctct 14884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 15315 - 15116
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  15315 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggctgatcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagaccagaagagtgaagcatcgactattttgaaa 15216  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| || |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  15215 ggatttgaaagcattggatgattgttctttgaatagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactacttagtttgtatctct 15116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 5603 - 5805
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| |||||||| | ||||||  |||||||||||    
T  5603 aggagatgcaagacttagagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtccaagtattgtagaagattggaagagtggagcaacatctattttgaaa 5702  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5703 ggatatgaaggcattggatgcttgttcttttaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaactactatctccactactcagtttgtgtctct 5802  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  5803 gct 5805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 3)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 19385 - 19584
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  19385 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaagttgttcaatggatttaatttcgcctaagaattgcagaagactagaagagtgaagcaacaactattttgaaa 19484  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  19485 ggatttaaaagcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacataatacaattgtacgaagtgtacaaccactatattcactactcagtttgtgtctct 19584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Original strand, 99133 - 99320
Alignment:
Q  13 acttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggc 112  Q
    ||||||||||||||| | |||| || ||||| || |||||||||   ||||||| ||| |||| ||   |||||||||||||||| |||||||  |||||    
T  99133 acttaaagcttcaaaagctgtttaacggattcaaactcgtctaaag-ttgcagatgaccggaaaagtatagcaacgactattttggaaggattacaaggc 99231  T
Q  113 attggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||| ||| |||||  ||| ||  ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  99232 attggatgcttattcttcaaagcgc--tgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgct 99320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 29884 - 29809
Alignment:
Q  108 aaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccacta 184  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||   |||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  29884 aaggcattggatgcttattctttggagaacgttcgaaaaggacaatagtac-aagtggacaaccactatctccacta 29809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 1858 - 1656
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  1858 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggattcaatctcgtctaagctttgcagaagactagaagagtgaaacaacgactattttgaaa 1759  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| || ||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||    
T  1758 ggatttgaaagcattggatgcttactctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtaggaagtgtacaaccactacctccactactttgtttttgtctct 1659  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  1658 gct 1656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 7901 - 7708
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||    
T  7901 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggctgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcaaaagactggaagagtgaagccacgactattttggaa 7802  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgt 194  Q
    |||||| ||||||||| ||  || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7801 ggatttaaaggcattgtatgtttattcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactcagtttgt 7708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 3 - 203
Target Start/End: Original strand, 20886 - 21086
Alignment:
Q  3 gagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaagg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||   |||||||||||    
T  20886 gagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaattgatttaatctcgtctaagcattgcagaagactagaagagtgaagcaacggtcattttgaaagg 20985  T
Q  103 attttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgc 202  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||  |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  20986 atttgaaggcattggatgcttattcttcaaagagcgtcgaccaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgc 21085  T
Q  203 t 203  Q
    |    
T  21086 t 21086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 27342 - 27544
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||| |    
T  27342 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatgaatttaatctcgtctaagcattgcagaagactgaaagagtgaagcaacagctattttgata 27441  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||  |||||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  27442 ggattcgaaggcattggatgcttgctcttcaaagagcgttgacaaagtaccattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctct 27541  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  27542 gct 27544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0426
Description:

Target: scaffold0426; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 31 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 13739 - 13567
Alignment:
Q  31 tgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattggatacttgttcttt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||    
T  13739 tgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagattggaatagtgaagcaacaactattttgaaaggatttgaaggcattggatgtttgttcttt 13640  T
Q  131 gaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13639 gaagagcgttgacatagtacaattgtacaaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 13567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 10167 - 9965
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  10167 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggctattcaatggattcaatctcgtctaagctttgcagaagactagaagagtgaagtaacgactattttgaaa 10068  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| || ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  10067 ggatttgaaagcattggatgcttactctttgaagagcgttcacaaagtacaattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctct 9968  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  9967 gct 9965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 203
Target Start/End: Original strand, 36690 - 36890
Alignment:
Q  3 gagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaagg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  36690 gagatgcaagacttaaagcttcaaaggctgctcaatgaatttaatctcgtctaagcattgcagatgactagaaaagtgaagcaacgactaatttgaaagg 36789  T
Q  103 attttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgc 202  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||    
T  36790 atttgaaggcattggatgcttgttctttaaagagtgttgacaaagaacaattgtacgaagtgtacaaccactacctctactactctgtttttgtctctgc 36889  T
Q  203 t 203  Q
    |    
T  36890 t 36890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 42315 - 42115
Alignment:
Q  3 gagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaagg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  42315 gagatgcaagacttaaagcttcaaaggctgctcaatgaatttaatctcgtctaagcattgcagatgactagaaaagtgaagcaacgactaatttgaaagg 42216  T
Q  103 attttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgc 202  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||    
T  42215 atttgaaggcattggatgcttgttctttaaagagtgttgacaaagaacaattgtacgaagtgtacaaccactacctctactactctgtttttgtctctgc 42116  T
Q  203 t 203  Q
    |    
T  42115 t 42115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 212553 - 212350
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||    
T  212553 aggagatccaagacttaaagcttcaaaggctattctatggattcaatctcgtctaagcattgcagaagactagaagagtgaagcaacaactatttttaaa 212454  T
Q  101 -ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctc 199  Q
     |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||     
T  212453 aggatttgaaagcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtcta 212354  T
Q  200 tgct 203  Q
    ||||    
T  212353 tgct 212350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 6111 - 6250
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6111 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggatgttcaatagattcaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacgactattttgaaa 6210  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgtt 140  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6211 ggatttgaaagcattggatgcttgttctttgaagagcgtt 6250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 9 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 19221 - 19027
Alignment:
Q  9 caagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggatttta 108  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  19221 caagacttaaagcttgaaaggctgttcaatggatttaatctcgtcaaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacggctattttggaaggatttaa 19122  T
Q  109 aggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||| ||| |||||||||  ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19121 aggcatttgatgcttgttcttcaaagagcgttggaaaagtacaagtgtacgaagtgtacaaccactacctccactactcagtttttgtctctgct 19027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 9755 - 9559
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||||  | ||||| || || ||||||| ||||||||||||||| | ||   |||||||||||||||||||    
T  9755 aggagatgcaa--cttaaagcttcaaaagttgtttcaaggattcaaacttgtctaag-attgcagaagactgggaaagtatagcaacgactattttgaaa 9659  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||  | |||||||||| ||| ||||   || |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  9658 ggattgaagggcattggatgcttattctacaaacagcgttgacatagtacgactgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctct 9559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Original strand, 22056 - 22246
Alignment:
Q  13 acttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggc 112  Q
    |||||||| |||||| |||||| || ||||| || |||||||||  ||||||||||||||||  ||   |||||||||||| ||  |||||||  |||||    
T  22056 acttaaaggttcaaaagttgtttaaaggattaaaactcgtctaaagattgcagaagactggagaagtatagcaacgactatctttgaaggattggaaggc 22155  T
Q  113 attggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||| ||| |||||  | ||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  22156 attggatgcttattcttcaatgagcgttgacataatacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccagtactctgtttttgtctctgct 22246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 181
Target Start/End: Original strand, 4863 - 5040
Alignment:
Q  4 agatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaagga 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  4863 agatgcaagacttaaagcttcaaaggctgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgtagaagactgaaagagtgaagcgacgactattttgaaagga 4962  T
Q  104 ttttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctcca 181  Q
    ||| ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  4963 tttgaaggcattggatgtttgttctttatagagcgttgacaaagtacaattgtatgaagtgtacaaccactacctcca 5040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 103770 - 103585
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  103770 aggagatgcaagacttaaagcttgaaaggttgttaaatgaatttaattttgtctaaacattgcagaagactggaagagtgaagcaacggctattttgaaa 103671  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactact 186  Q
     ||| |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  103670 tgatattaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtgcaaccactacctccactact 103585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 124; Significance: 9e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 89970 - 90170
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  89970 aggagatgcaa--cttaaagcttcaaaggttgatcaatgtatttaatctcgtctaagtattacagaagactggaagagtgaaccaacggctattttgaaa 90067  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  90068 ggatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaaatacaagtgtacgaagtgtacaacccctacctccactactctgtttttgtctct 90167  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  90168 gct 90170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 108 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 790 - 712
Alignment:
Q  108 aaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactc 187  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||   |||| ||||| |||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  790 aaggcattggatgcttattctttgaagagcgttcgaaaaggacaatagtac-aattgtacaaccattatctccactactc 712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 15993 - 15789
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaagg-ttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||  || ||| |||||| | | |||||||||    
T  15993 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaagattgttcaatggattcaatctcgtccaagaattgcaaaagaccagaggagtgaagcaccaattattttgaa 15894  T
Q  100 aggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtac-aattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtct 198  Q
    |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  15893 aggacttgaaggcattggatgcttgttctttgaagagcgttgacatagtacaaattgtacgaagtgtacaaccaccatctctactactcagtttgtgtct 15794  T
Q  199 ctgct 203  Q
    |||||    
T  15793 ctgct 15789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 30422 - 30283
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30422 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggatgttcaatagattcaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacgactattttgaaa 30323  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgtt 140  Q
    |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30322 ggatttgaaagcattggatgcttgttctttgaagagcgtt 30283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 10088 - 9899
Alignment:
Q  13 acttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggc 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||   |||||| | | ||||||||| ||  || | |||| |||||    
T  10088 acttaaagcttcaaaggctgttctaaggatttaatcacgtcta-gcattgcagaagatcagaagagtgcaacaacgactaattcaaatgaatttgaaggc 9990  T
Q  113 attggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  9989 attagatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtaaaaccactacctccactactatgtttgtgtctctgct 9899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold1359
Description:

Target: scaffold1359; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 570 - 767
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||| | | ||||  ||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  570 aggagatgcaa--cttaaagcttcagaagctgtttgatggattcaaactcgtctaaagattgcagaagactggaaaagtgaagcaacgactattttgaaa 667  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  668 ggatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacgtttgtactaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctct 767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 1680 - 1865
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| ||||||  | ||||| || |||| |||| |||||||||||||||||| ||    |||||| |||||||||||    
T  1680 aggagatgcaa--cttaaagcttcaaaagttgtttcaaggattcaaactcgcctaa-cattgcagaagactggaaaagtatggcaacggctattttgaaa 1776  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtct 198  Q
     |         |||||||| ||| |||||  ||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  1777 tg---------cattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatattacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtct 1865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 104; Significance: 8e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 215412 - 215612
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||| | |||| |||||||| || |||||||||  ||||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||    
T  215412 aggagatgcaa--cttaaaacttcaaaagctgtttaatggattcaaactcgtctaaagattgcagaagactagaaaagtgaagcaacggctattttgaaa 215509  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||    
T  215510 ggatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgttttcgtctct 215609  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  215610 gct 215612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 10144 - 9952
Alignment:
Q  11 agacttaaagcttcaaa-ggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaa 109  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||   ||||| ||||||||| ||| ||  || | |||| ||    
T  10144 agacttaaagcttcaaatggctgttcaatggatttaatcacgccta-gcattgcagaagaccataagagtgaagcaacggctaattcaaatgaatttgaa 10046  T
Q  110 ggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  10045 ggcattcgatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacaaagtgtacaaccactacctccactactcagtttgtgtcgctgct 9952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 6190 - 6003
Alignment:
Q  15 ttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcat 114  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||  |||||  |||||||| |||| ||  ||||||||| |||||||    
T  6190 ttaaagcttcaaagactgttcaaaggatttaatcacgccta-gcattgcagaagaccagaagaccgaagcaacaactaattcaaaaggatttgaaggcat 6092  T
Q  115 tggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||    
T  6091 tggatgcttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacaaagtgtacaaccactacctctactactctatttgtgtctctgct 6003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 143284 - 143093
Alignment:
Q  3 gagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaagg 102  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  143284 gagatgcaagactcaaagcttgaaaggctattcaatggatttaatctcgtcaaagcattgcagaagactggaagagtgaagcaacgactattttggaagg 143185  T
Q  103 attttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgc 202  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||  |||||||         |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||    
T  143184 atttaaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcgttggaaaagtac---------aagtgtacaaccactacctccactacttagtttttgtctatgc 143094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 203
Target Start/End: Original strand, 78292 - 78481
Alignment:
Q  14 cttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggca 113  Q
    |||||||||||||| | | || |  ||||| || |||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  78292 cttaaagcttcaaaagctatttatcggattcaaactcgtctaaagattgcagaagactggaaaagtgaagcaacgactattttgaaaggatttgaaggca 78391  T
Q  114 ttggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||  |||| ||||||||||    
T  78392 ttggatgcttattctttaaagagcgttgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctacactactatgtttttgtctctgct 78481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 6655 - 6855
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| | |||| || ||||| || || ||||||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||    
T  6655 aggagatgcaa--cttaaagcttcaaaagctgtttaacggattcaaacttgtctaaggattgcagaagactggaaaagtgaagcaccgactattttgaaa 6752  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
     ||||| |||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||| |||||||    
T  6753 agatttgaaggcattggatgcttgttcttcaaagagcattgacaaagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccagtactctatttttgtctct 6852  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  6853 gct 6855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 9992 - 9825
Alignment:
Q  2 ggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaag 101  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||   ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  9992 ggagatgcaagatttaaagcttcaaggtttgtttaatggatttaatctcgtctaagcattatagaagaccaaaagagtgaagtaacgactattttgaaag 9893  T
Q  102 gattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaa 169  Q
    || || || ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  9892 gacttgaaagcattggatgcttgtgctttgaagagcgttgacatagtacaattgtacaaagtgtacaa 9825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 165 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 7858 - 7823
Alignment:
Q  165 tacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7858 tacaaccactatctcctctactcagtttgtgtctct 7823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1434 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold1434
Description:

Target: scaffold1434; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 699 - 832
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||    
T  699 aggagatgcaagacttaaaacttcaaagactgttcaatgaatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaatagtgaagcactgactattttgaaa 798  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaag 134  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  799 ggatttgaaggcattggatgcttgttctttgaag 832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 203
Target Start/End: Original strand, 5529 - 5717
Alignment:
Q  15 ttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcat 114  Q
    |||||| |||||| |||||| |||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  5529 ttaaagattcaaaagttgtttaatggattcaaactcgtctaaagattgcagaagactggaaaagtaaagcaacaactattttgaaaggatttgaaggcat 5628  T
Q  115 tggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    | ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||    
T  5629 ttgatgcttattcttcaaagagcgttgacaaagtacatttatatgaagtgtacaaccactacctccactactatgtttttgtctctgct 5717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 60999 - 60802
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||| |||||| || |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||   ||||||| |||||||| ||    
T  60999 aggagatgcaa--cttaaaacttcaaaagttgtttaaaggatttaaactcgtctaaaaattgcagaagactggaaaagtatagcaacggctattttggaa 60902  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||  ||||||||| || |||||||||  ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  60901 ggattggaaggcattgaatgcttgttcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctct 60802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1331 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1331
Description:

Target: scaffold1331; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Original strand, 1614 - 1814
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  || ||||||||||| | |||| |||||||| || ||||| |||  ||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||    
T  1614 aggagatgcaa--ctcaaagcttcaaaagctgtttaatggattcaaactcgtttaaatattgcagaagacttgaaaagtgaagcaacgactattttgaaa 1711  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| |||||| |||||  ||||||||  |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||| |||||||    
T  1712 ggatttgaaggcactggatgattgttcttcaaagagcgttgacaaagtacgtttttacgaagtgtacaaccactaccttcactgctctgtttttgtctct 1811  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  1812 gct 1814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Original strand, 36115 - 36281
Alignment:
Q  18 aagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||  || || ||| ||||||||||    
T  36115 aagcttcaaaggttgttcaattgatttaatcacgtctat-cattgcagaagactggaagaatgaagcaacaactatttcaaatggttttaaaggcattgg 36213  T
Q  118 atacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactac 185  Q
    || ||| ||| ||| |||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36214 atgctttttcgttggagagagttgaaaatggacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactac 36281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 203
Target Start/End: Original strand, 34827 - 34919
Alignment:
Q  111 gcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  34827 gcattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtatgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctctgct 34919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 111 - 200
Target Start/End: Original strand, 25688 - 25777
Alignment:
Q  111 gcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    ||||||||| ||| |||||  || |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  25688 gcattggatgcttattcttcaaaaagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctgtttttgtctct 25777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 5)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 159242 - 159051
Alignment:
Q  11 agacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaag 110  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||   |||||| ||||||||| ||| ||  || | |||| |||    
T  159242 agacttagagcttcaaaggatgttcaaaggatttaatcacgtctaa-cattgcaaaagatcagaagagtgaagcaacggctaattcaaatgaatttgaag 159144  T
Q  111 gcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||    
T  159143 gcattatatgcttgttctttgaagagcgttgacaaaggacaattgtatgaagtgtaaaaccactacctctactactttgtttgtgtctctgct 159051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 39623 - 39488
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||| |||||||| |||| |||||||    
T  39623 aggagatgcaagatttaaagcttcaaaggctgttcaatggatttaatctcgtctaggcattacaaaagactagaagagtgaagcaacaactaatttgaaa 39524  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagag 136  Q
    |||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||    
T  39523 ggatttgaaggcattagatgcatgttctttaaagag 39488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 137683 - 137548
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||| |||||||| |||| |||||||    
T  137683 aggagatgcaagatttaaagcttcaaaggctgttcaatggatttaatctcgtctaggcattacaaaagactagaagagtgaagcaacaactaatttgaaa 137584  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagag 136  Q
    |||||| |||||||| ||| | |||||||| |||||    
T  137583 ggatttgaaggcattagatgcatgttctttaaagag 137548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 138 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 37463 - 37398
Alignment:
Q  138 gttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||    
T  37463 gttggcaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtctctgct 37398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 138 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 135523 - 135458
Alignment:
Q  138 gttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||    
T  135523 gttggcaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactacctccactactctatttttgtctctgct 135458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 186
Target Start/End: Original strand, 1452 - 1619
Alignment:
Q  18 aagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattgg 117  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| || | |  ||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  1452 aagcttcaaaggttgttcaaatgatttaatcacgcccat-cattgcagaagactataggagtgaagcaacgactatttcaaaaggatttgaaggcattgg 1550  T
Q  118 atacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactact 186  Q
    |   || ||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1551 acgtttattctttgaagaacgttggaaaaggacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactact 1619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 9350 - 9151
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| | |||| || ||||| || ||| || ||| ||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||||| ||    
T  9350 aggagatgcaa--cttaaagcttcaaaagctgtttaacggattcaaactcatcaaag-attgcagaagattggaaaagtatagcaacgactattttggaa 9254  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||  |||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |    
T  9253 ggattagaaggcattggatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactgtgtttttgtctat 9154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 202
Target Start/End: Original strand, 43843 - 44032
Alignment:
Q  11 agacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaag 110  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||| || |||| ||||||||||||   |||||| ||||||| | ||| ||  ||| ||||| |||    
T  43843 agacttaaaacttcaaaggctgttcaaaagatttaatcacgcctaa-cattgcagaagatcagaagagtgaagcaaaggctaattcaaaaagatttgaag 43941  T
Q  111 gcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgc 202  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  43942 gcattggatgcctgttccttgaagagcgttgaaaaaggacatttgtacgaattgtacaaccactatctccactactctgttt-tgtctctgc 44032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 3 - 83
Target Start/End: Original strand, 4908 - 4988
Alignment:
Q  3 gagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaag 83  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4908 gagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactgaaagagtgaag 4988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 82 - 203
Target Start/End: Original strand, 25393 - 25514
Alignment:
Q  82 agcaacgactattttgaaaggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctcca 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| || |||||  ||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25393 agcaacgactattttgaaaggattgaagggcattggatagttattcttcaaagagtgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctcca 25492  T
Q  182 ctactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||||| |||| ||||||||||    
T  25493 ctactctgtttttgtctctgct 25514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 203
Target Start/End: Original strand, 15811 - 15854
Alignment:
Q  160 aagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  15811 aagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgct 15854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0471
Description:

Target: scaffold0471; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 3500 - 3300
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| | |||| || ||||| || |||||||||  ||||||||||| ||||| ||   | ||||| |||||||| ||    
T  3500 aggagatgcaa--cttaaagcttcaaaagctgtttaacggattcaaactcgtctaaagattgcagaagattggaaaagtataacaacggctattttggaa 3403  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctct 200  Q
    |||||| ||||||||||||  || |||||  ||||||||||| | |||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||    
T  3402 ggatttgaaggcattggatgtttattcttcaaagagcgttgatatagtacgtttgtacaaagtgtacaaccactacctccactgctctgtttttgtctct 3303  T
Q  201 gct 203  Q
    |||    
T  3302 gct 3300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 40817 - 40638
Alignment:
Q  18 aagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattgg 117  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||| |  ||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||| ||  |||| |||| |||||||  |    
T  40817 aagcttcaaaggctgttcaaaagatttaatcacaccta-gcattgcagaagaccagaagagtgaagcaacggctaattcaaaagaatttgaaggcatatg 40719  T
Q  118 atacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtct 198  Q
    ||  | ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||    
T  40718 atggtggttctttgaagagcgttgaaaaagaacaattgtaagaagtgtacaaccactaccttcactactctgtttatgtct 40638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 121 - 183
Target Start/End: Original strand, 2028 - 2090
Alignment:
Q  121 cttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccact 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2028 cttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccact 2090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 58 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 5767 - 5634
Alignment:
Q  58 cattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgta 157  Q
    |||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||  || | |||| |||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||  ||| ||||||||||    
T  5767 cattccagaagactagaagaatgaagcaacgactatttcaaatgaatttgaaggcattggatgcttattctttggagaacgttggaaaa-tacaattgta 5669  T
Q  158 cgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 192  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5668 cgaagtgtacaaccactacctccactactcagttt 5634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 7071 - 7260
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| | ||||  | ||||| || | ||||| |  ||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||| ||    
T  7071 aggagatgcaa--cttaaagcttcaaaagctgtttgaaggattcaaacccgtctgaagattgcagaagactggaaaagtatagcaacgactattttggaa 7168  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 192  Q
    |||||  || ||||||||| ||| |||||  || | ||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7169 ggattggaaagcattggatgcttattcttcaaacaacgttgacatggtacgtttgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgttt 7260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1747 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1747
Description:

Target: scaffold1747; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 108 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 1408 - 1324
Alignment:
Q  108 aaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 192  Q
    |||||||| ||| ||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1408 aaggcattagatgcttattttttgaagagcgttgaaaaactacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgttt 1324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1745 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1745
Description:

Target: scaffold1745; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 108 - 192
Target Start/End: Original strand, 3 - 87
Alignment:
Q  108 aaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 192  Q
    |||||||| ||| ||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3 aaggcattagatgcttattttttgaagagcgttgaaaaactacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactctgttt 87  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 59 - 203
Target Start/End: Original strand, 2702 - 2845
Alignment:
Q  59 attgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtac 158  Q
    ||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||| |||| ||  || ||||||||| | | |||||  ||||| ||||||| |||||  ||||||    
T  2702 attgcagaagactggaaaagtattgcaacgactattttggaagg-ttggaaagcattggatgcgtattcttcaaagagtgttgacatagtacgtttgtac 2800  T
Q  159 gaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  2801 gaagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgct 2845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 82 - 198
Target Start/End: Original strand, 164940 - 165056
Alignment:
Q  82 agcaacgactattttgaaaggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctcca 181  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||  |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  164940 agcaacaactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttatccttcaaagagcgttgacaaagtacgtctgtacgaagtgtacgaccactacctcca 165039  T
Q  182 ctactcagtttgtgtct 198  Q
    |||||| |||| |||||    
T  165040 ctactctgtttatgtct 165056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 65344 - 65485
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| | | ||  | ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||   || ||||||||||||||||    
T  65344 aggagatgcaa--cttaaagcttcaaaagctatttcaaggattcaaactcgtctaag-attgcagaagactggaaaagtatagaaacgactattttgaaa 65440  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaa 145  Q
    |||||  | |||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||    
T  65441 ggattaaagggcattggatgcttattcttcaaagagcgttgacaa 65485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 144389 - 144530
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaa 100  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| | | ||  | ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||    
T  144389 aggagatgcaa--cttaaagcttcaaaagctatttcaaggattcaaactcgtctaag-attgcagaagactggaaaagtatagcaacgactgttttgaaa 144485  T
Q  101 ggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaa 145  Q
    |||||  | |||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||    
T  144486 ggattaaagggcattggatgcttattcttcaaagagcgttgacaa 144530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0527 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0527
Description:

Target: scaffold0527; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 8117 - 7963
Alignment:
Q  13 acttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagactggaagagggaagcaacgactattttgaaaggattttaaggc 112  Q
    ||||||||||||||| | ||||  | ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||  |  ||    
T  8117 acttaaagcttcaaaagctgtttcaaggattcaaactcgtctaag-attgcagaagactggaaaagtatagcaacgactattttgaaaggattgaattgc 8019  T
Q  113 attggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtaca 168  Q
    ||| ||| ||| |||||  ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  8018 attcgatgcttattcttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtacgaagtgtaca 7963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 98 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 74682 - 74577
Alignment:
Q  98 aaaggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtc 197  Q
    ||||||||| |||| ||| ||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||  |||||| ||    
T  74682 aaaggatttgaaggaattagatgcttgctctttgaaaagcattgacaaagtacaattgtatgaagtgtacaaccactacctctactactttgtttgtatc 74583  T
Q  198 tctgct 203  Q
    ||||||    
T  74582 tctgct 74577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 74751 - 74718
Alignment:
Q  15 ttaaagcttcaaaggttgttcaatggatttaatc 48  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  74751 ttaaagcttcaaaggttgttcaaaggatttaatc 74718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 108 - 203
Target Start/End: Original strand, 17785 - 17880
Alignment:
Q  108 aaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||||||||||| ||| | |||  ||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  17785 aaggcattggatgcttatccttcaaagagcgttgacatagtacgtttgtatgaagtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgct 17880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 83 - 198
Target Start/End: Original strand, 15617 - 15732
Alignment:
Q  83 gcaacgactattttgaaaggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccac 182  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |  ||  |||||| ||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15617 gcaacggctagtttgaaaggatttgaaggcattggatgcttatctttcaaagagcattgacaaagtacgtctgtacgaagtgtacgaccactatctccac 15716  T
Q  183 tactcagtttgtgtct 198  Q
    ||||| |||| |||||    
T  15717 tactctgtttatgtct 15732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 5852 - 5922
Alignment:
Q  1 aggagatgcaagacttaaagcttcaaa-ggttgttcaatggatttaatctcgtctaagcattgcagaagac 70  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  5852 aggagatgcaagacttaaagcttcaaaaggatgttcaatggatttcatctcgtttaagcattgcagaagac 5922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 192
Target Start/End: Original strand, 38080 - 38189
Alignment:
Q  83 gcaacgactattttgaaaggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccac 182  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  38080 gcaatgactaatttgaaaggatttgaaggcattggatgcttatccttcaaagagcgttgacaaagtacgtccgtacgaagtgtacgaccactacctccac 38179  T
Q  183 tactcagttt 192  Q
    ||||| ||||    
T  38180 tactctgttt 38189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 186
Target Start/End: Original strand, 1803 - 1895
Alignment:
Q  94 tttgaaaggattttaaggcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactact 186  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||  |||||||||||||||||||   | |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  1803 tttgaaaggatttgaaggcattggatgcttatccttcaaagagcgttgacaaagtacgtctatacgaagtgtacgaccactacctccactact 1895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 7448 - 7377
Alignment:
Q  132 aagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||| |||||    
T  7448 aagagcgttgacatagtacatttgtacgaagtgtacaaccactacttccactactctgtttttgtccctgct 7377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 203
Target Start/End: Original strand, 2738 - 2806
Alignment:
Q  135 agcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  2738 agcgttgacatagtacgtttgtatgaagtgtacaaccactaactccactactctgtttttgtctctgct 2806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 132 - 203
Target Start/End: Original strand, 87644 - 87715
Alignment:
Q  132 aagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||    
T  87644 aagagcgttgacatagtacgtctgtacgaagtgtacaaccactacttccactactctgtttctgtctctgct 87715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 203
Target Start/End: Original strand, 846 - 935
Alignment:
Q  113 attggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    ||||||| ||| |||||  ||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||||||||    
T  846 attggatgcttattcttcaaagagcgttgacataatacgtttgtacgaagtgtacaaccactacttccactactctgttt-tgtctctgct 935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 132 - 192
Target Start/End: Original strand, 3939 - 3999
Alignment:
Q  132 aagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 192  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||    
T  3939 aagagcgttgacaaagtacatctgtacgaagtgtacgaccactacctccacttctctgttt 3999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 162 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 6043 - 6002
Alignment:
Q  162 gtgtacaaccactatctccactactcagtttgtgtctctgct 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  6043 gtgtacaaccactatctccactactctgtttttgtctctgct 6002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 111 - 192
Target Start/End: Original strand, 31808 - 31888
Alignment:
Q  111 gcattggatacttgttctttgaagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 192  Q
    ||||||||| ||| ||||||| ||| |||||  |||| ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  31808 gcattggatgcttattctttggagaacgttggaaaaggacaatagtac-aagtgtacaaccactacctccactactctgttt 31888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 7352 - 7292
Alignment:
Q  132 aagagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 192  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||    
T  7352 aagagtgttgacaaagtacatatgtacgaagtgtacgaccactacctccacttctctgttt 7292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 789 - 731
Alignment:
Q  134 gagcgttgacaaagtacaattgtacgaagtgtacaaccactatctccactactcagttt 192  Q
    ||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||    
T  789 gagcgttgacatagttcgtttgtacgaagtgtacaatcactatctgcactactctgttt 731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 155 - 187
Target Start/End: Original strand, 6589 - 6621
Alignment:
Q  155 gtacgaagtgtacaaccactatctccactactc 187  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6589 gtacgaagtgtacaaccactacctccactactc 6621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 4391 times since January 2019
Visitors: 4835