View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0773_low_4 (Length: 401)

Name: NF0773_low_4
Description: NF0773
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0773_low_4
NF0773_low_4
[»] chr5 (13 HSPs)
chr5 (155-310)||(41334571-41334726)
chr5 (151-312)||(2614553-2614714)
chr5 (155-311)||(18034018-18034174)
chr5 (153-312)||(5257030-5257189)
chr5 (151-297)||(33801519-33801665)
chr5 (161-311)||(38470615-38470765)
chr5 (154-311)||(7617169-7617326)
chr5 (180-297)||(22512355-22512472)
chr5 (154-253)||(25914903-25915002)
chr5 (211-286)||(39122397-39122472)
chr5 (145-260)||(39122254-39122369)
chr5 (155-227)||(30622627-30622699)
chr5 (156-227)||(32473303-32473374)
[»] chr3 (25 HSPs)
chr3 (154-312)||(54246055-54246213)
chr3 (155-311)||(53581766-53581922)
chr3 (154-312)||(36150165-36150323)
chr3 (154-311)||(42394326-42394483)
chr3 (153-310)||(46941090-46941247)
chr3 (155-312)||(54237131-54237288)
chr3 (155-312)||(40480784-40480941)
chr3 (155-312)||(40808900-40809057)
chr3 (155-311)||(24688310-24688466)
chr3 (153-305)||(52629870-52630022)
chr3 (155-312)||(45126836-45126993)
chr3 (154-297)||(47190933-47191076)
chr3 (144-312)||(25413716-25413886)
chr3 (163-310)||(42100725-42100872)
chr3 (155-310)||(27748600-27748746)
chr3 (156-313)||(51249342-51249499)
chr3 (154-253)||(1078312-1078411)
chr3 (154-245)||(29556866-29556956)
chr3 (208-310)||(53273645-53273747)
chr3 (154-310)||(11064629-11064785)
chr3 (154-227)||(4190172-4190245)
chr3 (248-298)||(4190266-4190316)
chr3 (155-227)||(9434244-9434316)
chr3 (158-233)||(19148882-19148957)
chr3 (175-223)||(45058584-45058632)
[»] chr8 (26 HSPs)
chr8 (152-312)||(11582801-11582961)
chr8 (152-312)||(36743388-36743548)
chr8 (154-312)||(30660649-30660807)
chr8 (159-312)||(29800862-29801015)
chr8 (156-299)||(42197344-42197487)
chr8 (155-297)||(2547046-2547188)
chr8 (156-311)||(26125671-26125825)
chr8 (161-312)||(29705397-29705548)
chr8 (154-287)||(20148820-20148953)
chr8 (161-297)||(2165877-2166013)
chr8 (154-285)||(30912469-30912600)
chr8 (155-286)||(31384725-31384856)
chr8 (153-312)||(45397351-45397509)
chr8 (155-305)||(9241594-9241744)
chr8 (155-312)||(3743806-3743963)
chr8 (155-297)||(42295245-42295386)
chr8 (183-312)||(5754938-5755067)
chr8 (154-287)||(1375602-1375735)
chr8 (155-284)||(40528542-40528671)
chr8 (251-312)||(42699292-42699353)
chr8 (153-227)||(35181636-35181710)
chr8 (154-227)||(34304908-34304980)
chr8 (254-309)||(16603633-16603688)
chr8 (182-227)||(18066653-18066698)
chr8 (248-305)||(18066719-18066776)
chr8 (155-227)||(10678060-10678132)
[»] chr7 (28 HSPs)
chr7 (152-312)||(24000917-24001077)
chr7 (161-312)||(42538345-42538496)
chr7 (154-312)||(5810831-5810989)
chr7 (155-309)||(41861712-41861868)
chr7 (155-297)||(26898310-26898452)
chr7 (161-299)||(27393174-27393312)
chr7 (154-314)||(16180264-16180424)
chr7 (159-297)||(5015445-5015583)
chr7 (154-287)||(44326238-44326371)
chr7 (153-297)||(44416840-44416984)
chr7 (161-312)||(32029731-32029882)
chr7 (150-297)||(42972902-42973049)
chr7 (155-297)||(43343532-43343674)
chr7 (154-287)||(4638106-4638239)
chr7 (154-287)||(45326080-45326213)
chr7 (155-286)||(10573810-10573941)
chr7 (154-297)||(35069771-35069914)
chr7 (155-310)||(43317480-43317635)
chr7 (179-311)||(38160511-38160643)
chr7 (155-310)||(5194139-5194294)
chr7 (161-293)||(9216355-9216487)
chr7 (155-286)||(24280504-24280635)
chr7 (154-267)||(47279631-47279744)
chr7 (153-227)||(40237039-40237113)
chr7 (154-227)||(31408540-31408613)
chr7 (154-227)||(31513407-31513480)
chr7 (248-305)||(31408634-31408691)
chr7 (248-293)||(31513341-31513386)
[»] chr6 (18 HSPs)
chr6 (161-312)||(9698247-9698398)
chr6 (159-310)||(7292784-7292935)
chr6 (153-297)||(21293583-21293727)
chr6 (154-297)||(26669916-26670059)
chr6 (156-297)||(13743130-13743271)
chr6 (156-297)||(13748630-13748771)
chr6 (154-310)||(3213437-3213593)
chr6 (154-304)||(21279972-21280122)
chr6 (161-310)||(7367586-7367735)
chr6 (154-297)||(7273242-7273385)
chr6 (155-297)||(30736032-30736174)
chr6 (149-297)||(24203889-24204037)
chr6 (154-285)||(26466861-26466992)
chr6 (156-312)||(30014378-30014534)
chr6 (248-305)||(27441584-27441641)
chr6 (154-227)||(27441662-27441735)
chr6 (155-227)||(33242523-33242595)
chr6 (144-227)||(33254034-33254118)
[»] chr1 (21 HSPs)
chr1 (155-312)||(5489811-5489968)
chr1 (155-297)||(48498870-48499012)
chr1 (153-310)||(4401365-4401522)
chr1 (155-300)||(23989431-23989576)
chr1 (155-310)||(43570994-43571149)
chr1 (156-310)||(37814815-37814969)
chr1 (154-297)||(7447875-7448018)
chr1 (149-311)||(2497464-2497626)
chr1 (154-311)||(24769406-24769563)
chr1 (153-311)||(50448166-50448324)
chr1 (154-312)||(750212-750370)
chr1 (151-305)||(4888085-4888238)
chr1 (154-227)||(44112797-44112870)
chr1 (175-225)||(47748463-47748513)
chr1 (248-305)||(38335960-38336017)
chr1 (155-227)||(35000021-35000093)
chr1 (248-293)||(35003348-35003393)
chr1 (154-227)||(35003414-35003487)
chr1 (155-227)||(45705945-45706017)
chr1 (248-293)||(46168437-46168482)
chr1 (248-293)||(48119682-48119727)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (154-311)||(112691-112848)
[»] chr2 (25 HSPs)
chr2 (154-311)||(19047193-19047350)
chr2 (154-312)||(43490308-43490466)
chr2 (152-297)||(4764631-4764776)
chr2 (154-297)||(30838682-30838825)
chr2 (143-297)||(42849754-42849908)
chr2 (155-312)||(1750449-1750606)
chr2 (155-310)||(43335671-43335826)
chr2 (161-312)||(12302167-12302318)
chr2 (155-312)||(16096782-16096940)
chr2 (188-287)||(13780676-13780775)
chr2 (154-284)||(34817683-34817813)
chr2 (150-305)||(39149197-39149350)
chr2 (179-287)||(42026829-42026937)
chr2 (208-286)||(8896544-8896622)
chr2 (154-227)||(34895648-34895721)
chr2 (155-227)||(11825562-11825634)
chr2 (155-227)||(16804088-16804160)
chr2 (155-227)||(16843370-16843442)
chr2 (155-227)||(43114677-43114749)
chr2 (154-227)||(6518401-6518474)
chr2 (145-227)||(18491825-18491907)
chr2 (155-227)||(4299328-4299400)
chr2 (154-227)||(41281881-41281954)
chr2 (155-227)||(966742-966814)
chr2 (265-305)||(14285718-14285758)
[»] chr4 (34 HSPs)
chr4 (155-312)||(27893750-27893907)
chr4 (154-297)||(27550359-27550502)
chr4 (154-312)||(55966253-55966411)
chr4 (154-312)||(27864599-27864757)
chr4 (155-312)||(23204686-23204843)
chr4 (158-310)||(48463361-48463513)
chr4 (154-312)||(1771173-1771331)
chr4 (153-305)||(23036022-23036174)
chr4 (154-310)||(43735779-43735935)
chr4 (154-305)||(28982729-28982880)
chr4 (155-297)||(33703191-33703333)
chr4 (155-285)||(43514594-43514724)
chr4 (155-287)||(35017792-35017924)
chr4 (155-310)||(43949709-43949864)
chr4 (153-287)||(31680962-31681096)
chr4 (155-312)||(25051728-25051885)
chr4 (154-312)||(21687041-21687199)
chr4 (155-297)||(51512173-51512315)
chr4 (161-311)||(12496992-12497142)
chr4 (152-310)||(27316617-27316776)
chr4 (154-284)||(28988536-28988665)
chr4 (153-284)||(41327449-41327580)
chr4 (179-297)||(39631151-39631269)
chr4 (159-297)||(45490225-45490363)
chr4 (153-306)||(56215804-56215956)
chr4 (154-287)||(41878466-41878592)
chr4 (160-310)||(41848008-41848158)
chr4 (167-294)||(46412389-46412516)
chr4 (154-227)||(19880074-19880147)
chr4 (155-227)||(55272284-55272356)
chr4 (248-305)||(712002-712059)
chr4 (151-227)||(3756156-3756232)
chr4 (248-293)||(17619153-17619198)
chr4 (248-293)||(55272377-55272422)
[»] scaffold0119 (1 HSPs)
scaffold0119 (154-297)||(735-878)
[»] scaffold0187 (2 HSPs)
scaffold0187 (155-312)||(14097-14253)
scaffold0187 (155-312)||(24425-24581)
[»] scaffold0385 (1 HSPs)
scaffold0385 (155-312)||(11286-11443)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (161-311)||(23335-23485)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (248-305)||(45720-45777)
scaffold0003 (154-227)||(45626-45699)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 13)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 155 - 310
Target Start/End: Original strand, 41334571 - 41334726
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41334571 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 41334670  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatg 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  41334671 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatg 41334726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 151 - 312
Target Start/End: Original strand, 2614553 - 2614714
Alignment:
Q  151 aatagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaag 250  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2614553 aatagagtaatgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaag 2614652  T
Q  251 ataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatggg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||    
T  2614653 ataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatggg 2614714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 155 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 18034174 - 18034018
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18034174 gagtgatgatacatgtaccaccccatatggcaatacaccctttacacccatataaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 18034075  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatgg 311  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||| |||||    
T  18034074 agtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaatacatagggtgtacaatgg 18034018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 153 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 5257189 - 5257030
Alignment:
Q  153 tagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  5257189 tagagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacatgtggcaatcttgaccccacataaatagaagat 5257090  T
Q  253 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatggg 312  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||    
T  5257089 aaagtgtggttgtgagatgaaattaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatggg 5257030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 151 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 33801665 - 33801519
Alignment:
Q  151 aatagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaag 250  Q
    ||||||||| ||||| |||||||  |  |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  33801665 aatagagtgatgatatatgtaccttcccatgtggcaatacactctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggatcccacacaaatagaag 33801566  T
Q  251 ataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  33801565 ataaagtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacat 33801519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 161 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 38470765 - 38470615
Alignment:
Q  161 tgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 260  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38470765 tgatacatgtaccacctcatatggcaatacaccctttacacccacataaaattctgatacgtggtaatctggaccccacataaatagaagataaagtgtg 38470666  T
Q  261 gttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatgg 311  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||| |||||    
T  38470665 attgtgaaatgaatttaccaaaatatccttaatacatggggtgtacaatgg 38470615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 154 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 7617326 - 7617169
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||||||| | | |||||||||||||||| |||| | || |||||| ||||||||||||    
T  7617326 agagtgatgatacatgtatcaccccatgtggcaatacaccttttacaccaacacaaaattctgacatgtgacaacttagatcccacataaatagaagata 7617227  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatgg 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||    
T  7617226 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtataatgg 7617169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 180 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 22512472 - 22512355
Alignment:
Q  180 tgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttacc 279  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22512472 tgtggcaatacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttacc 22512373  T
Q  280 aaaatatctttaatacat 297  Q
    ||||||||  ||||||||    
T  22512372 aaaatatccctaatacat 22512355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 154 - 253
Target Start/End: Original strand, 25914903 - 25915002
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25914903 agagtgatgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccatttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 25915002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 211 - 286
Target Start/End: Original strand, 39122397 - 39122472
Alignment:
Q  211 attctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 286  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  39122397 attctgacatgtggcaacctaaaccccacacaaatagaagataaagtgtagttgtgagatgaatttaccaaaatat 39122472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 145 - 260
Target Start/End: Original strand, 39122254 - 39122369
Alignment:
Q  145 atatataatagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaa 244  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |   |||||| ||| | || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  39122254 atatattaaagagtggtgatacatgtaccaccccatgtgacaatatatcatttacatccacacaagattctgacatgtggcaacctaaaccccacacaaa 39122353  T
Q  245 tagaagataaagtgtg 260  Q
    ||||||||||||||||    
T  39122354 tagaagataaagtgtg 39122369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Original strand, 30622627 - 30622699
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    ||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||   ||||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  30622627 gagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaattttgacatgtggcaa 30622699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 227
Target Start/End: Original strand, 32473303 - 32473374
Alignment:
Q  156 agtggtgatacatgtaccacctt-atgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  32473303 agtggtgatacatgtac-acctccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaattctgacatgtggcaa 32473374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 25)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 154 - 312
Target Start/End: Original strand, 54246055 - 54246213
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54246055 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacattctttacacccacataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 54246154  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatggg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  54246155 aagtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatctctaatacatagggtgtacaatggg 54246213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 155 - 311
Target Start/End: Original strand, 53581766 - 53581922
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53581766 gagtgatgatacctgtaccaccctatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 53581865  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatgg 311  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  53581866 agtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatccctaatacataggatgtacaatgg 53581922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 154 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 36150323 - 36150165
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36150323 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggactccacacaaatagaagata 36150224  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatggg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||    
T  36150223 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctgatacatagggtgtataatggg 36150165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 154 - 311
Target Start/End: Original strand, 42394326 - 42394483
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42394326 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattttgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagata 42394425  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatgg 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||    
T  42394426 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatgg 42394483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 153 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 46941247 - 46941090
Alignment:
Q  153 tagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46941247 tagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagat 46941148  T
Q  253 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatg 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||    
T  46941147 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatg 46941090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 155 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 54237288 - 54237131
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  54237288 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccatacaatattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagataa 54237189  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatggg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||    
T  54237188 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatggg 54237131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 155 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 40480941 - 40480784
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40480941 gagtgatgatacatgtatcaccccatgcggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccctacacaaatagaagataa 40480842  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatggg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  40480841 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacataggatgtacaatggg 40480784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 155 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 40809057 - 40808900
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40809057 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccttttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 40808958  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatggg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||    
T  40808957 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatggg 40808900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 155 - 311
Target Start/End: Original strand, 24688310 - 24688466
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24688310 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacccccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacataaatagaagataa 24688409  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatgg 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||    
T  24688410 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatgg 24688466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 153 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 52630022 - 52629870
Alignment:
Q  153 tagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  52630022 tagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtagcaacctggaccctacataaatagaagat 52629923  T
Q  253 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgta 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  52629922 aaagtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccttaatacatagggtgta 52629870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 155 - 312
Target Start/End: Original strand, 45126836 - 45126993
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||| ||||    
T  45126836 gagtggtgatacatgtaccactccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctggcatgtggtaatctggaccccacataaatagaaaataa 45126935  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatggg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||    
T  45126936 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatggg 45126993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 154 - 297
Target Start/End: Original strand, 47190933 - 47191076
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| ||||||||||||||    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47190933 agagtgatgatacatgtaccattccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacatgtggtaacttggaccccacacaaatagaagata 47191032  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  47191033 aagtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatctctaatacat 47191076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 144 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 25413886 - 25413716
Alignment:
Q  144 tatatataat--agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacac 241  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||  || || |||||||| ||||||||||| | |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  25413886 tatatataatccagagtgatgatacatgtaccaccccatatgacaatacaccctttacacccacacaaaactctgacacgtggtaacctggaccccacac 25413787  T
Q  242 aaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatggg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| | |||| ||||||    
T  25413786 aaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaatacataaggtgtacaatggg 25413716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 163 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 42100872 - 42100725
Alignment:
Q  163 atacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggt 262  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  42100872 atacatgtaccacctcatgtggcaatgcaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacctgaactccacacaaataaaagataaaatgtggt 42100773  T
Q  263 tgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatg 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||    
T  42100772 tgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatg 42100725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 155 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 27748746 - 27748600
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||         | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27748746 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacac---------cgacacaaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 27748656  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatg 310  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||    
T  27748655 agtattgttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacataaggtgtataatg 27748600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 156 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 51249499 - 51249342
Alignment:
Q  156 agtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaa 255  Q
    ||||||||||||||||   ||| || ||  ||||||| | |||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  51249499 agtggtgatacatgtatatcctcatatgataatacactccttacattcatacaaaattctgacatgtggcaatctggatcccacacaaatagaagagaaa 51249400  T
Q  256 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatgggt 313  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||  | ||||||||||||    
T  51249399 gtgtggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgcatgaggtgtataatgggt 51249342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 154 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 1078411 - 1078312
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  1078411 agagtgatgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctgaactccacacaaatagaagata 1078312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 154 - 245
Target Start/End: Original strand, 29556866 - 29556956
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29556866 agagtggtgatacatgtaccactacatgtggcaatacacaatttacacccatataaaa-tctgacatgtggcaacctgaaccccacacaaat 29556956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 208 - 310
Target Start/End: Original strand, 53273645 - 53273747
Alignment:
Q  208 aaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtata 307  Q
    |||||||||| | |||| |||||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |    
T  53273645 aaaattctgatacgtggtaacctggatcccacataaataaaagataaagtatggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgggatgtaca 53273744  T
Q  308 atg 310  Q
    |||    
T  53273745 atg 53273747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 154 - 310
Target Start/End: Original strand, 11064629 - 11064785
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||||||||||||||||   ||| |||| |||||||| | ||||||||| | |||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||      
T  11064629 agagtggtgatacatgtacactcttgtgtgacaatacaccccttacacccacacaaaattttgacatgtggtaatctagaccccacacaaatagaagagt 11064728  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatg 310  Q
    ||||||| || ||||||||| | | |||||||||| |||  |||||| |||| ||||    
T  11064729 aagtgtgattatgagatgaattaatcaaaatatctctaaagcatagggtgtacaatg 11064785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 227
Target Start/End: Original strand, 4190172 - 4190245
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||   ||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  4190172 agagtggtgatacatgtatacccttatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 4190245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 298
Target Start/End: Original strand, 4190266 - 4190316
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacata 298  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  4190266 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatctctaatacata 4190316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 9434316 - 9434244
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    ||||||||||||||||||   |  ||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  9434316 gagtggtgatacatgtacactcccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaattctgacatgtggcaa 9434244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 158 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19148957 - 19148882
Alignment:
Q  158 tggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctgga 233  Q
    |||||| ||||||||  ||  ||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  19148957 tggtgacacatgtacacccccatgtggcaatacaccacttacacccacacaaaattctgacatatggcaacctgga 19148882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 175 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 45058632 - 45058584
Alignment:
Q  175 ccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtg 223  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  45058632 ccttaggtggcaatacacccttgacacccacataaaaatctgacatgtg 45058584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 26)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 152 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 11582961 - 11582801
Alignment:
Q  152 atagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaaga 251  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11582961 atagagtaatgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaaga 11582862  T
Q  252 taaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatggg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||    
T  11582861 taaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatggg 11582801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 152 - 312
Target Start/End: Original strand, 36743388 - 36743548
Alignment:
Q  152 atagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaaga 251  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36743388 atagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccatttacacccatacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaaga 36743487  T
Q  252 taaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatggg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||    
T  36743488 taaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatggg 36743548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 154 - 312
Target Start/End: Original strand, 30660649 - 30660807
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| ||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30660649 agagtgatgatacatgtatcatcctatgtggcaatacaccctttacatccacataaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 30660748  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatggg 312  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||    
T  30660749 aagtgtggttgtaagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatggg 30660807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 159 - 312
Target Start/End: Original strand, 29800862 - 29801015
Alignment:
Q  159 ggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtg 258  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||    
T  29800862 ggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacatgtggcaatcttgaccccacataaatagaagataaagtg 29800961  T
Q  259 tggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatggg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||    
T  29800962 tggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatggg 29801015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 156 - 299
Target Start/End: Original strand, 42197344 - 42197487
Alignment:
Q  156 agtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaa 255  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42197344 agtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattttgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagataaa 42197443  T
Q  256 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacatag 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  42197444 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatag 42197487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 155 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 2547188 - 2547046
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  2547188 gagtgatgatacatgtaccaccctatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggatcccacacaaatagaagataa 2547089  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  2547088 agtgtggttgtgagatgaacttactaaaatatccctaatacat 2547046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 156 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 26125825 - 26125671
Alignment:
Q  156 agtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaa 255  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  26125825 agtggtgatatatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccgcataaaattctgacacgtggcaatctggaccc-acataaatagaagataaa 26125727  T
Q  256 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatgg 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||    
T  26125726 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatgg 26125671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 161 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 29705548 - 29705397
Alignment:
Q  161 tgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 260  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29705548 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccgcacaaatagaagataaagtgtg 29705449  T
Q  261 gttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatggg 312  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||| || |||| ||||||    
T  29705448 gttgtgagatgaacttatcaaaatatccctaatacatggggtgtacaatggg 29705397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 154 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 20148953 - 20148820
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||    
T  20148953 agagtggtgatacatgtaccacaccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaatctggatcccacataaatagatgata 20148854  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20148853 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 20148820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 161 - 297
Target Start/End: Original strand, 2165877 - 2166013
Alignment:
Q  161 tgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 260  Q
    |||||||||||||| |  ||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2165877 tgatacatgtaccatcccatgtgacaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctgaaccccacacaaatagaagataaagtgtg 2165976  T
Q  261 gttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacat 297  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2165977 gttatgagatgaacttaccaaaatatctctaatacat 2166013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 154 - 285
Target Start/End: Original strand, 30912469 - 30912600
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30912469 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctagaccccacacaaatagaagata 30912568  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaata 285  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30912569 aggtgcggttgtgagatgaacttaccaaaata 30912600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 155 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 31384856 - 31384725
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31384856 gagtgatgatatatgtaccaccccatgtggcaatataccctttacatccacataaaattctgacacgtagcaacctggaccccacacaaatagaagataa 31384757  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31384756 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 31384725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 153 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 45397509 - 45397351
Alignment:
Q  153 tagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  45397509 tagagtgatgatacatgtaccaccc-atgtggcaacacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaatctggagcccacacaaatagaagat 45397411  T
Q  253 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatggg 312  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||| ||||||    
T  45397410 aaattgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaatacatagggtgtagaatggg 45397351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 155 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 9241744 - 9241594
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9241744 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaacacaccctttgcacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacataaatagaagataa 9241645  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgta 305  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||| ||||    
T  9241644 agtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaatatatagggtgta 9241594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 155 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 3743963 - 3743806
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| ||||| ||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||    
T  3743963 gagtgatgatatatgtaccaccccatgtagcaatacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaatctgaaccctacataaatagaagataa 3743864  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatggg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| || || |||||||||||    
T  3743863 agtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatacttaatatatggggtgtataatggg 3743806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 155 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 42295386 - 42295245
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| ||||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  42295386 gagtgatgataaatgtaccatcctatgtggcaatataccctttacatccacacaaaattctgacatgtggcaacttggaccc-acataaatagaagataa 42295288  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  42295287 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacat 42295245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 183 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 5755067 - 5754938
Alignment:
Q  183 ggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaa 282  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5755067 ggcaatacaccctttacacccacacaaaattctaacacgtggcaacttggatcccacataaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaa 5754968  T
Q  283 atatctttaatacataggatgtataatggg 312  Q
    |||||  ||||| || ||||||| ||||||    
T  5754967 atatccctaatatatgggatgtacaatggg 5754938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 154 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 1375735 - 1375602
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||| | || ||||| ||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  1375735 agagtggtgatacatgtaccaccctatgtgacaatacattctttacacccacacaagattctaacacgtggcaatctgaactccacacaaatagaagata 1375636  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 287  Q
    |||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  1375635 aagtgtagttgtgagataaatttaccaaaatatc 1375602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 155 - 284
Target Start/End: Original strand, 40528542 - 40528671
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    |||||||||||||||| |  ||| ||||| ||||| |   |||||| ||| | |||||| ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  40528542 gagtggtgatacatgtgcaccctcatgtgacaatatatcatttacatccacacaaaattatgacatgtgacaacttgaaccccacacaaatagaagagaa 40528641  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaat 284  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  40528642 agtgtggttgtgagataaatttatcaaaat 40528671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 42699353 - 42699292
Alignment:
Q  251 ataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatggg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||| | |||| ||||||    
T  42699353 ataaagtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccataatacataaggtgtacaatggg 42699292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 153 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 35181710 - 35181636
Alignment:
Q  153 tagagtggtgatacatgtaccacctt-atgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  35181710 tagagtggtgatacatgtac-accttcatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 35181636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 154 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 34304980 - 34304908
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||   ||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  34304980 agagtggtgatacatgtac-accccatgtggcaatacacctcttacacccaaacaaaatcctgacatgtggcaa 34304908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 254 - 309
Target Start/End: Original strand, 16603633 - 16603688
Alignment:
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataat 309  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| || ||||||||    
T  16603633 aagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatgtctttaatgcatggggtgtataat 16603688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 227
Target Start/End: Original strand, 18066653 - 18066698
Alignment:
Q  182 tggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    |||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18066653 tggcaatacacctcttacacccacataaaattctgacatgtggcaa 18066698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 305
Target Start/End: Original strand, 18066719 - 18066776
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgta 305  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||  |||||||| |||||||    
T  18066719 aagagaaagtatggttgtgagatgaaattactaaaatatccctaatacatgggatgta 18066776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Original strand, 10678060 - 10678132
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    ||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||    ||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  10678060 gagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacatctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 10678132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 28)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 152 - 312
Target Start/End: Original strand, 24000917 - 24001077
Alignment:
Q  152 atagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaaga 251  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24000917 atagagtaatgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaaga 24001016  T
Q  252 taaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatggg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||    
T  24001017 taaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatggg 24001077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 161 - 312
Target Start/End: Original strand, 42538345 - 42538496
Alignment:
Q  161 tgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 260  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42538345 tgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 42538444  T
Q  261 gttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatggg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||    
T  42538445 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatggg 42538496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 154 - 312
Target Start/End: Original strand, 5810831 - 5810989
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5810831 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattttgacatgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 5810930  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatggg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||| |||| ||||||    
T  5810931 aagtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatccctaatatatagggtgtacaatggg 5810989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 155 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 41861868 - 41861712
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41861868 gagtggtgatacatgtaccactccatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccatacaaatagaagataa 41861769  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaata--tctttaatacataggatgtataat 309  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||    
T  41861768 agtgtggttgtgagataaacttaccaaaatatctctataatacatagggtgtataat 41861712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 155 - 297
Target Start/End: Original strand, 26898310 - 26898452
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26898310 gagtggtgatacatgtaccatcctatgtggcaatacaccttttacacccacataaaattctgacacgtggtaacctggaccccacacaaatagaatataa 26898409  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacat 297  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  26898410 agtgtggttgtaagatgaacttaccaaaatatccctaatacat 26898452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 161 - 299
Target Start/End: Original strand, 27393174 - 27393312
Alignment:
Q  161 tgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 260  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27393174 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacatcctttacacccacataaaattctgacatgaggcaacctggaccccacataaatagaagataaagtgtg 27393273  T
Q  261 gttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacatag 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  27393274 gttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaatacatag 27393312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 154 - 314
Target Start/End: Original strand, 16180264 - 16180424
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16180264 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccttttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 16180363  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatgggtg 314  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| | || |||| ||||||||    
T  16180364 aagtgtggttgtgagatgaatttaccaaaatatttataatacgtggggtgtacaatgggtg 16180424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 159 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 5015583 - 5015445
Alignment:
Q  159 ggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtg 258  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||| || | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5015583 ggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccttttacactcacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataaagtg 5015484  T
Q  259 tggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  5015483 tggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacat 5015445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 154 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 44326371 - 44326238
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||    
T  44326371 agagtggtgatacatgtaccacaccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaatctggatcccacataaatagatgata 44326272  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44326271 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 44326238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 153 - 297
Target Start/End: Original strand, 44416840 - 44416984
Alignment:
Q  153 tagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||| | ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44416840 tagagtgatgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccttttacatccacacaaatttctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagat 44416939  T
Q  253 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  44416940 aaagtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatccctaatacat 44416984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 161 - 312
Target Start/End: Original strand, 32029731 - 32029882
Alignment:
Q  161 tgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 260  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32029731 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacataaatagaagataaagtgtg 32029830  T
Q  261 gttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatggg 312  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||    
T  32029831 gttgttagatgaatttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatggg 32029882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 150 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 42973049 - 42972902
Alignment:
Q  150 taatagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaa 249  Q
    |||||||||  |||||||||||| | | |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42973049 taatagagtaatgatacatgtactatcctatgtggcaatacaccatttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaa 42972950  T
Q  250 gataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacat 297  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  42972949 gataaaatgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacat 42972902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 155 - 297
Target Start/End: Original strand, 43343532 - 43343674
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||| | ||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43343532 gagtgatgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccttttacatccacacaaatttctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 43343631  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  43343632 agtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatccctaatacat 43343674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 154 - 287
Target Start/End: Original strand, 4638106 - 4638239
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4638106 agagtggtgatacatgtaccaccctacgtgacaatacaccctttacatccatacaagattctgacacgtggtaacctagaccccacacaaatagaagata 4638205  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 287  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4638206 aagtatggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 4638239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 154 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 45326213 - 45326080
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||| |  |||||||||||| ||||||||||||    
T  45326213 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtgacaatacaccatttacacccacataaaattctgacaggtggtagtctggaccccacataaatagaagata 45326114  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 287  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45326113 aagtgtgattgtgagatgaacttaccaaaatatc 45326080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 155 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 10573941 - 10573810
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  10573941 gagtggtgatacatgtaccaccgcatgtgacaatatatcctttacacccacataaaattctgatatgtggcaatcttgaccccacataaatagaagataa 10573842  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 286  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10573841 agtgtggttgtgagatgaatttaccaaaatat 10573810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 154 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 35069914 - 35069771
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||| | | | |||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  35069914 agagtgatgatacatgtaccatcctatgtggcaatatatcctttacatctacacaaaattctgacacgtggcaacttggacctcacataaatagaagata 35069815  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  35069814 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacat 35069771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 155 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 43317635 - 43317480
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |    
T  43317635 gagtggtgatacatgtacacccttgtgtggcaatacaccccttacacccacacaaaattctgacatgtggcaatctagaccccacacaaatagaagagta 43317536  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatg 310  Q
    |||||| |||||||||||| ||| |||||||||  |||  ||||||||||| ||||    
T  43317535 agtgtgattgtgagatgaatttatcaaaatatccctaaagcataggatgtacaatg 43317480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 179 - 311
Target Start/End: Original strand, 38160511 - 38160643
Alignment:
Q  179 atgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttac 278  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  38160511 atgtggcaatacaccccttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacataaatagaagataaagtgtagttgtgagatgaagttac 38160610  T
Q  279 caaaatatctttaatacataggatgtataatgg 311  Q
     ||||||||  |||||||| || |||| |||||    
T  38160611 taaaatatccctaatacatggggtgtacaatgg 38160643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 155 - 310
Target Start/End: Original strand, 5194139 - 5194294
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    |||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||  | ||||||||| | |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |    
T  5194139 gagtagtgatacatgtacacccttgtgtggcaatacaacccttacacccacacaaaattttgacatgtggcaatctagaccccacacaaatagaagagta 5194238  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatg 310  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  5194239 agtgtgattgtgagatgaatttatcaaaatatccttaaaacatagggtgtacaatg 5194294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 161 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 9216487 - 9216355
Alignment:
Q  161 tgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 260  Q
    ||||| || |||||||  ||||| ||||||||  |||||| ||| | |||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9216487 tgatatatataccaccccatgtgacaatacaccttttacatccacacaaaattctgacatgcggcaacttaaaccccacacaaatagaagataaaatgtg 9216388  T
Q  261 gttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaat 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9216387 gttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaat 9216355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 155 - 286
Target Start/End: Original strand, 24280504 - 24280635
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||||||||||||||||  | ||| |||  |||||||   |||||| |  | |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  24280504 gagtggtgatacatgtacacctttacgtgataatacacctcttacactcgcacaaaattctgatatatggcaacttggaccccacacaaatagaagagaa 24280603  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 286  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  24280604 agtgtgattgtgagatgaatttaccaaaatat 24280635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 154 - 267
Target Start/End: Original strand, 47279631 - 47279744
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    ||||||||||||||||||||| |  || || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||| || ||||| || | | ||||||||||||    
T  47279631 agagtggtgatacatgtaccatcccatctgacaatacaccctttatacccacataaaattctgatatgtggtaatctggatcctatataaatagaagata 47279730  T
Q  254 aagtgtggttgtga 267  Q
    ||||||||||||||    
T  47279731 aagtgtggttgtga 47279744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 40237113 - 40237039
Alignment:
Q  153 tagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||   ||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  40237113 tagagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 40237039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 154 - 227
Target Start/End: Original strand, 31408540 - 31408613
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    |||||||||||||||||||  ||  ||||| ||||||||   ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  31408540 agagtggtgatacatgtacacccccatgtgacaatacacctcttacacccacataaaatcctgacatgtggcaa 31408613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 154 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 31513480 - 31513407
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||   ||||| | | | ||||| ||||||||||||||    
T  31513480 agagtggtgatacatgtacacccttatgtggcaatacacctcttacatctacacaaaatcctgacatgtggcaa 31513407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 305
Target Start/End: Original strand, 31408634 - 31408691
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgta 305  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  31408634 aagagaaagtatggttgtgaaatgaatttaccaaaatatccttaatgcatgggatgta 31408691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 31513386 - 31513341
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaat 293  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  31513386 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaat 31513341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 116; Significance: 7e-59; HSPs: 18)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 161 - 312
Target Start/End: Original strand, 9698247 - 9698398
Alignment:
Q  161 tgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 260  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9698247 tgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 9698346  T
Q  261 gttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatggg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||    
T  9698347 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatggg 9698398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 159 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 7292935 - 7292784
Alignment:
Q  159 ggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtg 258  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7292935 ggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacacaaacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtg 7292836  T
Q  259 tggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatg 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  7292835 tggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtataatg 7292784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 153 - 297
Target Start/End: Original strand, 21293583 - 21293727
Alignment:
Q  153 tagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  21293583 tagagtggtgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaatctggaccccacataaatagaagat 21293682  T
Q  253 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacat 297  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21293683 aaagtgtggttgtgaaatgaatttaccaaaatatccttaatacat 21293727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 154 - 297
Target Start/End: Original strand, 26669916 - 26670059
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26669916 agagcggtgatatatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggactccacacaaatagaagata 26670015  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  26670016 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacat 26670059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 156 - 297
Target Start/End: Original strand, 13743130 - 13743271
Alignment:
Q  156 agtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaa 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13743130 agtggtgatacatgtaccaccctatgtggcaatatatcctttacacccacacaagattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaa 13743229  T
Q  256 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13743230 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacat 13743271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 156 - 297
Target Start/End: Original strand, 13748630 - 13748771
Alignment:
Q  156 agtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaa 255  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13748630 agtggtgatacatgtaccaccctatgtggcaatatatcctttacacccacacaagattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaa 13748729  T
Q  256 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  13748730 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacat 13748771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 154 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3213593 - 3213437
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  3213593 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaatctggaccccacataaatagaagata 3213494  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatg 310  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||    
T  3213493 aagtatggttgtgaaatgaatttaccaaaatatccttaatacatggggtgtacaatg 3213437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 154 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 21280122 - 21279972
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21280122 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatataccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 21280023  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgt 304  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  21280022 aagtgtggttgtgagatgaatttaccaaaatatccctaatacatgggatgt 21279972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 161 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 7367735 - 7367586
Alignment:
Q  161 tgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 260  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  7367735 tgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggatcccacataaatagaaaataaagtgtg 7367636  T
Q  261 gttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatg 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||    
T  7367635 gttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgggatgtacaatg 7367586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 154 - 297
Target Start/End: Original strand, 7273242 - 7273385
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| |||| |||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  7273242 agagtgatgatgcatgtaccaccccatgtggtaatacactctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacataaatagaagata 7273341  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacat 297  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7273342 aagtgtgattgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacat 7273385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 155 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 30736174 - 30736032
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30736174 gagtgatgatacatgtaccatcccatgtggcaatacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacataaatagaagataa 30736075  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacat 297  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  30736074 agtgtgattgtgagatgaacttaccaaaatatcactaatacat 30736032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 149 - 297
Target Start/End: Original strand, 24203889 - 24204037
Alignment:
Q  149 ataatagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaataga 248  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  24203889 ataattgagtgatgatacatgtaccactccatgtgacaatacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaataga 24203988  T
Q  249 agataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacat 297  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  24203989 atataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacat 24204037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 154 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 26466992 - 26466861
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  26466992 agagtgatgatacatttaccaccctatgtggcaatacaccttttacacccatacaaaatcctgatacgtggcaacctgaaccccaaacaaatagaagata 26466893  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaata 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26466892 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaata 26466861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 156 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 30014534 - 30014378
Alignment:
Q  156 agtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaa 255  Q
    |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| |||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  30014534 agtgatgatacatgtatcaccccatgtggcaatacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggtaacttggaccccatataaatagaagataaa 30014435  T
Q  256 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatggg 312  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||    
T  30014434 gtatggttgtgagatgaacttaccaaaatatgcctaatacatgggatgtataatggg 30014378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 27441641 - 27441584
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgta 305  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27441641 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatacataggatgta 27441584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 27441735 - 27441662
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtac-caccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||   ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  27441735 agagtggtgatacatgtacacaccc-atgtggcaatacacctcttacacccacataaaatcctgacatgtggcaa 27441662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 33242595 - 33242523
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    ||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||   ||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  33242595 gagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 33242523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 33254118 - 33254034
Alignment:
Q  144 tatatata-atagagtggtgatacatgtaccacctt-atgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||  |||| ||||| | ||||| | ||||||||||||    
T  33254118 tatatatatatagagtggtgatacatgtac-acctccatgtggcaatacaccttttatacccacacaaaatccggacatgtggcaa 33254034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 21)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 155 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 5489968 - 5489811
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5489968 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 5489869  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatggg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||    
T  5489868 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatggg 5489811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 155 - 297
Target Start/End: Original strand, 48498870 - 48499012
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  48498870 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 48498969  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  48498970 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacat 48499012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 153 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 4401522 - 4401365
Alignment:
Q  153 tagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 252  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  4401522 tagagtgatgatacatgtaccaccctatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcatattggaccccacacaaatagaagat 4401423  T
Q  253 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatg 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||    
T  4401422 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctctaatacatggggtgtacaatg 4401365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 155 - 300
Target Start/End: Original strand, 23989431 - 23989576
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23989431 gagtggtgatacatgtaccaccctatatggcaatacaccctttacacccacacaagattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 23989530  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacatagg 300  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||    
T  23989531 agtgtggttgtgagataaatttaccaaaatatccctaatacatagg 23989576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 155 - 310
Target Start/End: Original strand, 43570994 - 43571149
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43570994 gagtgatgatatatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 43571093  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatg 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||    
T  43571094 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatg 43571149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 156 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 37814969 - 37814815
Alignment:
Q  156 agtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaa 255  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  37814969 agtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacatccatataaaattctgacacgtggcaatctggaccccacataaatagaagataaa 37814870  T
Q  256 gtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatg 310  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| || |||| ||||    
T  37814869 gtgtggttgtgaaatgaatttaccaaaatatccttaatacatggggtgtacaatg 37814815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 154 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 7448018 - 7447875
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| ||||||||||||||    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7448018 agagtgatgatacatgtaccattccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 7447919  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  7447918 aagtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatctgtaatacat 7447875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 149 - 311
Target Start/End: Original strand, 2497464 - 2497626
Alignment:
Q  149 ataatagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaataga 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||| |||||||    
T  2497464 ataatagagtggtgatacatgtaccacaccatgtggcaatacaccctttatacccacataaaattctgacacgtgacaatctggatcccacataaataga 2497563  T
Q  249 agataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatgg 311  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||| |||||    
T  2497564 tgataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccttaatatatggggtgtacaatgg 2497626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 154 - 311
Target Start/End: Original strand, 24769406 - 24769563
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24769406 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 24769505  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatgg 311  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||| || |||| |||||    
T  24769506 aagtgtggttgtgataagaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatgg 24769563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 153 - 311
Target Start/End: Original strand, 50448166 - 50448324
Alignment:
Q  153 tagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  50448166 tagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacatggaacccacaaaaatagaagat 50448265  T
Q  253 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatgg 311  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||| | |||| |||||    
T  50448266 aaaatgtggttgtaagatgaacttacaaaaatatccctaatacataaggtgtacaatgg 50448324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 154 - 312
Target Start/End: Original strand, 750212 - 750370
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  750212 agagtgatgatacatgtaccatcccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggtaacatggaccccacacaaatagaagata 750311  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatggg 312  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||  | |||||| || |||| ||||||    
T  750312 aagtgtggttttgagatgaatttatcaaaatatccctgatacatggggtgtacaatggg 750370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 151 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 4888238 - 4888085
Alignment:
Q  151 aatagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaag 250  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |  ||||||| ||| | |||||||||| |  ||||||  ||||| ||||||||||||||     
T  4888238 aatagagtgatgatacatgtaccaccc-atgtggcaatatatcctttacatccacacaaaattctgatacatggcaatttggacaccacacaaatagaaa 4888140  T
Q  251 ataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgta 305  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  4888139 ataaagtgtggttgtgagataaacttaccaaaatatccctaatacatgggatgta 4888085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 154 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 44112870 - 44112797
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccacctt-atgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  44112870 agagtggtgatacatgtac-accttcatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaattctgacatgtggcaa 44112797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 225
Target Start/End: Original strand, 47748463 - 47748513
Alignment:
Q  175 ccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggc 225  Q
    ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  47748463 ccttaggtggcaatacacccttgacacccatataaaaatctgacatgtggc 47748513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 248 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 38336017 - 38335960
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgta 305  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  38336017 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgcatgggatgta 38335960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Original strand, 35000021 - 35000093
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    ||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  35000021 gagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacatctcttacacccatacaaaatcctgacatgtggcaa 35000093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 35003393 - 35003348
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaat 293  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  35003393 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaat 35003348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 35003487 - 35003414
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    |||||||||||||||| ||  ||  ||||||||||||||   ||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  35003487 agagtggtgatacatgcacacccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 35003414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 45706017 - 45705945
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccacctt-atgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||   ||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  45706017 gagtggtgatacatgtac-acctccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 45705945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 46168482 - 46168437
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaat 293  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  46168482 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaat 46168437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 48119727 - 48119682
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaat 293  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  48119727 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaat 48119682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 154 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 112848 - 112691
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  112848 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattttgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagata 112749  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatgg 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||    
T  112748 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatgg 112691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 25)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 154 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 19047350 - 19047193
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19047350 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattttgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagata 19047251  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatgg 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||    
T  19047250 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatgg 19047193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 154 - 312
Target Start/End: Original strand, 43490308 - 43490466
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  43490308 agagtgatgctacatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacataaatagaagata 43490407  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatggg 312  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||| ||||||    
T  43490408 aagtgtggttatgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagagtgtacaatggg 43490466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 152 - 297
Target Start/End: Original strand, 4764631 - 4764776
Alignment:
Q  152 atagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaaga 251  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4764631 atagagtgatgatacatgtaccacctcatgtggcaatacaccttttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaaga 4764730  T
Q  252 taaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacat 297  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  4764731 taaagtgtggttgtgagatgaatttaccaaaatatttataatacat 4764776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 154 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 30838825 - 30838682
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30838825 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccttttacacctacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 30838726  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  30838725 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacat 30838682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 143 - 297
Target Start/End: Original strand, 42849754 - 42849908
Alignment:
Q  143 atatatata-atagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacac 241  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  42849754 atatatatatatatagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacac 42849853  T
Q  242 aaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacat 297  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  42849854 aaatagaa-ataaagtgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatccctaatacat 42849908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 155 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 1750606 - 1750449
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| |||||  |||||||||  ||||||||| |||| |||||||| || | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1750606 gagtgatgatatttgtaccaccccatgtggcaacacaccctttacactcacacaaaattctgacacgtggcaatctggaccccacacaaatagaagataa 1750507  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatggg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||| ||||||    
T  1750506 agtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaatacatagggtgtacaatggg 1750449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 155 - 310
Target Start/End: Original strand, 43335671 - 43335826
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||| ||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  43335671 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatataccttttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggatcccacataaatagaagataa 43335770  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatg 310  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||    
T  43335771 agtgtagttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgggatgtacaatg 43335826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 161 - 312
Target Start/End: Original strand, 12302167 - 12302318
Alignment:
Q  161 tgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 260  Q
    ||||||||||| ||||  |||||||||||||  ||||||| ||| | ||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12302167 tgatacatgtatcaccccatgtggcaatacatcctttacatccacacaaaattctgacacatggtaacctggaccccacataaatagaagataaagtgtg 12302266  T
Q  261 gttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatggg 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||| ||||||    
T  12302267 gttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaatacatagggtgtacaatggg 12302318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 155 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 16096940 - 16096782
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggacccc-acacaaatagaagata 253  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| | |||||| ||| || |||||||||    
T  16096940 gagtgatgatacatgtaccacatcatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttagacccccacataagtagaagata 16096841  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatggg 312  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||| || |||||||||||    
T  16096840 aagtgtggttgtgagattaactcaccaaaatatccctaatacatggggtgtataatggg 16096782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 188 - 287
Target Start/End: Original strand, 13780676 - 13780775
Alignment:
Q  188 tacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 287  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  13780676 tacaccctttacacctatacaaaattctgacatgtggcaacctggaccccacataaatagaagagaaagtgtggttgtgagatgaatttatcaaaatatc 13780775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 154 - 284
Target Start/End: Original strand, 34817683 - 34817813
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| ||||||||||||  ||  |||||||||| | | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| |    
T  34817683 agagtgatgatacatgtacacccccatgtggcaatgctccccttacacccatacaaaattctgacatgtggcaacctggatcccgtacaaatagaagaga 34817782  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaat 284  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34817783 aagtgtggttgtgagatgaatttaccaaaat 34817813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 150 - 305
Target Start/End: Original strand, 39149197 - 39149350
Alignment:
Q  150 taatagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaa 249  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||  |||||||||| | |||||| ||| | |||| ||  | ||||| ||||||||| ||    
T  39149197 taatagagtgatgatacatgtaccaccc-atgtggtaatacaccttttacacccacacaaaattatgagacgtggtaatttagaccc-acacaaataaaa 39149294  T
Q  250 gataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgta 305  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39149295 gataaagtgtagttgtgggatgaacttaccaaaatatctctaatacataggatgta 39149350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 179 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 42026937 - 42026829
Alignment:
Q  179 atgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttac 278  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| || |    
T  42026937 atgtggcaatacaccccttacacccacacaaaattctgacatcttgcaacctagaccccacacaaatagaaaagaaagtgtagttgtgagatgaatttgc 42026838  T
Q  279 caaaatatc 287  Q
    |||||||||    
T  42026837 caaaatatc 42026829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 208 - 286
Target Start/End: Original strand, 8896544 - 8896622
Alignment:
Q  208 aaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatat 286  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  8896544 aaaattctgacatgtggcaacctgaacctcacacaaatagaaaagaaagtgtgattgtgagatgaatttaccaaaatat 8896622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 154 - 227
Target Start/End: Original strand, 34895648 - 34895721
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    |||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||   ||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  34895648 agagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 34895721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Original strand, 11825562 - 11825634
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    ||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||   ||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  11825562 gagtggtgatacatgtacatccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 11825634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16804160 - 16804088
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    ||||||||||||||||||  || ||| || ||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  16804160 gagtggtgatacatgtacacccctatatgacaatacacctcttacacccacacaaaattctgacatgtggcaa 16804088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16843442 - 16843370
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    ||||||||||||||||||  || ||| || ||||||||   ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  16843442 gagtggtgatacatgtacacccctatatgacaatacacctcttacacccacacaaaattctgacatgtggcaa 16843370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 43114749 - 43114677
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||   ||||||||| | ||||| |||||| |||||||    
T  43114749 gagtggtgatacatgtacaccctcatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacaagtggcaa 43114677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 227
Target Start/End: Original strand, 6518401 - 6518474
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccacctt-atgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||  |||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  6518401 agagtggtgatacatgtac-acctccatgtgtcaatacaccttttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 6518474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18491907 - 18491825
Alignment:
Q  145 atatataatagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||   ||||||||| | ||||| || |||||||||||    
T  18491907 atataaaaaagagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctaacatgtggcaa 18491825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Original strand, 4299328 - 4299400
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccacctt-atgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    ||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  4299328 gagtggtgatacatgta-caccttcatgtggcaatacatctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 4299400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 227
Target Start/End: Original strand, 41281881 - 41281954
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    |||||||||||||||||||  ||  || |||||||||||   ||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  41281881 agagtggtgatacatgtacacccccatatggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 41281954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Original strand, 966742 - 966814
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    ||||||||||||||||||  ||  |||||| |||||||   ||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  966742 gagtggtgatacatgtacatccccatgtggaaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 966814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 265 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 14285758 - 14285718
Alignment:
Q  265 tgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgta 305  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14285758 tgagatgaatttaccaaaatatctttaatatatagggtgta 14285718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 34)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 155 - 312
Target Start/End: Original strand, 27893750 - 27893907
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  27893750 gagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacatgtggcaatcttgaccccacataaatagaagataa 27893849  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatggg 312  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||    
T  27893850 agtgtggttgtgagatgaaattaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatggg 27893907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 154 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 27550502 - 27550359
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27550502 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccatacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacataaatagaagata 27550403  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacat 297  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  27550402 aagtgtggttgtaagatgaacttaccaaaatatccctaatacat 27550359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 154 - 312
Target Start/End: Original strand, 55966253 - 55966411
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  55966253 agagtggtgatacatgtaccactccatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacaggtggcaatctagaccccacataaatagaagata 55966352  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatggg 312  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||    
T  55966353 aattgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgggatgtacaatggg 55966411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 154 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 27864757 - 27864599
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||| |||    
T  27864757 agagtggtgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacatccacataaaattctgacatgtggtaatctgaaccccacataaatagaaaata 27864658  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatggg 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||||    
T  27864657 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatggg 27864599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 155 - 312
Target Start/End: Original strand, 23204686 - 23204843
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| ||||||| |||||| |  ||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23204686 gagtgatgatacacgtaccatcccatgtggcaatatatcctttacacccacataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacataaatagaagataa 23204785  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatggg 312  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  23204786 agtgtggttgtgacatgaacttacaaaaatatccctaatacataggatgtacaatggg 23204843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 158 - 310
Target Start/End: Original strand, 48463361 - 48463513
Alignment:
Q  158 tggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagt 257  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  48463361 tggtgatacatgtaccactctatgtggcaatacaccctttacacccacataaaattctgacatgtggtaatctgaaccccacataaatagaaaataaagt 48463460  T
Q  258 gtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatg 310  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||    
T  48463461 atggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatgggatgtacaatg 48463513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 154 - 312
Target Start/End: Original strand, 1771173 - 1771331
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||| | |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  1771173 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgagacgtggcaacttggaccccacataaatagaagata 1771272  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatggg 312  Q
    || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||| ||||||    
T  1771273 aaatgtggttgtgagatgaacttatcaaaatatctctaatacatggggtgtacaatggg 1771331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 153 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 23036174 - 23036022
Alignment:
Q  153 tagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 252  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||  ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23036174 tagagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaacacatcctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacataaatagaagat 23036075  T
Q  253 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgta 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||| ||||    
T  23036074 aaagtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaatatatagggtgta 23036022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 154 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 43735935 - 43735779
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  43735935 agagtgatgatacatgtaccaccccacgtggcaatacaccctttacatccacataaaattctgacacgtgacaacttggatcccacacaaatagaagata 43735836  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatg 310  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  43735835 aagtgtgattgtgagatgaacttatcaaaatatctctaatacatggaatgtataatg 43735779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 154 - 305
Target Start/End: Original strand, 28982729 - 28982880
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28982729 agagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccttttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagata 28982828  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgta 305  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||    
T  28982829 aagtgcggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatatatgggatgta 28982880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 155 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 33703333 - 33703191
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||    
T  33703333 gagtgatgatacatgtaccaccccatatggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacttggatcccgcacaaatagaagataa 33703234  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  33703233 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacat 33703191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 155 - 285
Target Start/End: Original strand, 43514594 - 43514724
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43514594 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacactctttacatccacaaaaaattctgacacgtggcaacctagaccccacacaaatagaagataa 43514693  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaata 285  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43514694 ggtgtggttgtgagatgaacttaccaaaata 43514724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 155 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 35017924 - 35017792
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||   |||||| ||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35017924 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacatcttttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacacaaatagaagataa 35017825  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35017824 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 35017792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 155 - 310
Target Start/End: Original strand, 43949709 - 43949864
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||   |||| ||| ||||||||||||||||    
T  43949709 gagtgatgatacatgtaccaccctatttggcaatacaccctttatacccatacaaaattctgacacgtggcatattggatcccgcacaaatagaagataa 43949808  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatg 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||| ||||    
T  43949809 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatggggtgtacaatg 43949864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 153 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 31681096 - 31680962
Alignment:
Q  153 tagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 252  Q
    ||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||  |||||||| |||||||||||    
T  31681096 tagagtggtgatacatgtagcatcccatgtggcaatacaccctttacacctacataaaattctgacacgtggcaatctaaaccccacataaatagaagat 31680997  T
Q  253 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31680996 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 31680962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 155 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 25051885 - 25051728
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||   |||||| ||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  25051885 gagtgatgatacatgtaccaccccacgtggcaatacatcatttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacttggaccccacataaatagaagataa 25051786  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatggg 312  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||    
T  25051785 agtgtgattgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacatagggtgtacaatggg 25051728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 154 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 21687199 - 21687041
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||  |||||||  || | |||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  21687199 agagtgatgatatatgtaccaacctatgtggcaatacattctttacattcacacaaaattctgacacgtggcaacctgaactccagacaaatagaagata 21687100  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatggg 312  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  21687099 aagtatggttatgagatgaacttactaaaatatttctaatacataagatgtataatggg 21687041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 155 - 297
Target Start/End: Original strand, 51512173 - 51512315
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| ||||||||||||||||  | |||||||||||   || | ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51512173 gagtgatgatacatgtaccaccccacgtggcaatacatctttaatacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccccacacaaataaaagataa 51512272  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacat 297  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51512273 agtgtggttataagatgaacttaccaaaatatctctaatacat 51512315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 161 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 12497142 - 12496992
Alignment:
Q  161 tgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 260  Q
    ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||  |||||||||| | |||||||| ||| |||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12497142 tgatacatgcaccaccccatgtgacaatacacgttttacacccacacaaaattctaacacgtggcaaattgaacctcacacaaatagaagataaagtgtg 12497043  T
Q  261 gttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatgg 311  Q
     |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  12497042 attgtaagatgaacttaccaaaatatctctaatacatgggatgtacaatgg 12496992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Original strand, 27316617 - 27316776
Alignment:
Q  152 atagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaa-ttctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaag 250  Q
    |||||||| |||||||| || || |  ||||| |||||||| ||||||| ||| | |||| |||||||| |||||||| ||||| ||| | |||||||||    
T  27316617 atagagtgatgatacatttatcatcccatgtgacaatacaccctttacatccacacaaaaattctgacacgtggcaacttggactccaaataaatagaag 27316716  T
Q  251 ataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatg 310  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||    
T  27316717 ataaagtgtggttatgagatgaacttaccaaaatatccttaatacatggggtgtataatg 27316776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 154 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 28988665 - 28988536
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||| | |||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28988665 agagtggtgatacatgtacaccctcatgtgacaatacaccccttac-ctcatacaaaattctgacatatggcaacctggaccccacacaaatagaagaga 28988567  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaat 284  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  28988566 aagtgtggttatgagatgaatttatcaaaat 28988536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 153 - 284
Target Start/End: Original strand, 41327449 - 41327580
Alignment:
Q  153 tagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 252  Q
    |||||| |||||||||||||  | | || ||||||||||| | |||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  41327449 tagagtagtgatacatgtacatcttaatctggcaatacaccccttacactcacaaaaaattctaacatgtggcaacctggaccccacacaaattgaagag 41327548  T
Q  253 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaat 284  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  41327549 aaagtgtggatgtgagatgaatttaccaaaat 41327580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 179 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 39631269 - 39631151
Alignment:
Q  179 atgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttac 278  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||| | |||||||||||| ||| ||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39631269 atgtgacaatacatcctttacacccacacaaaattctgacacgtgacatattgaaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtgagatgaacttac 39631170  T
Q  279 caaaatatctttaatacat 297  Q
    |||||||||  ||||||||    
T  39631169 caaaatatccctaatacat 39631151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 159 - 297
Target Start/End: Original strand, 45490225 - 45490363
Alignment:
Q  159 ggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtg 258  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||| |   |||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  45490225 ggtgatacatgtagtaccctatgtggcaatatatcatttacacccacacaagattctgacacgtggcaacctggatcccgtacaaatagaagataaagtg 45490324  T
Q  259 tggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacat 297  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||  ||||||||    
T  45490325 tggttgtgagatgaatttactaaagtatccctaatacat 45490363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 153 - 306
Target Start/End: Original strand, 56215804 - 56215956
Alignment:
Q  153 tagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagat 252  Q
    ||||||||||||||||||||  |   ||||||| ||||||   ||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||     
T  56215804 tagagtggtgatacatgtacaccaccatgtggccatacacctcttacacccacacaaaattctgacatatagcaacctagaccccacacaaatag-agag 56215902  T
Q  253 aaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtat 306  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  56215903 aaagtgtggttgtgagataaattttccaaaatatcgctaatgcataggatgtat 56215956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 154 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 41878592 - 41878466
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| |       |||||| ||||||||| | | |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  41878592 agagtggtgatacatgtaccacctga-------atacactctttacaccaacacaaaattctgacacgtgacaatctggaccccacacaaatagaagaga 41878500  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatc 287  Q
    | || ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41878499 aggtttggttgtgagatgaacttatcaaaatatc 41878466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 160 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 41848158 - 41848008
Alignment:
Q  160 gtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgt 259  Q
    |||||||||||||  ||  |||||||||||||| | ||||| |||   |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  41848158 gtgatacatgtacacccccatgtggcaatacaccccttacatccacgcaaaattctgacatgtgacaatctgaaccccacacaaatagaagagaaagtgt 41848059  T
Q  260 ggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatg 310  Q
    ||||||| |||||| || ||||||| ||| |||| ||| || |||| ||||    
T  41848058 ggttgtgcgatgaatttgccaaaatgtctctaatgcatggggtgtacaatg 41848008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 167 - 294
Target Start/End: Original strand, 46412389 - 46412516
Alignment:
Q  167 atgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtggttgtg 266  Q
    |||||||||| ||| || ||||| ||  |||||| | | | |||||||||||| |||||||  |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46412389 atgtaccaccctatatgacaatatactttttacatctacacaaaattctgacacgtggcaatttaaaccccacataaatagaagataaagtgtggttgtg 46412488  T
Q  267 agatgaacttaccaaaatatctttaata 294  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  46412489 agaagaacttaccaaaatatctctaata 46412516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 154 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19880147 - 19880074
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    |||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||   ||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  19880147 agagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 19880074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 227
Target Start/End: Original strand, 55272284 - 55272356
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    ||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||   ||||||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  55272284 gagtggtgatacatgtacacccccatgtggcaatacacctcttacacccacacaaaatcctgacatgtggcaa 55272356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 712059 - 712002
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgta 305  Q
    |||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  712059 aagagaaagtatgtttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatgcatagggtgta 712002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 227
Target Start/End: Original strand, 3756156 - 3756232
Alignment:
Q  151 aatagagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacact-ttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    ||||||||||||||||||||||   |  ||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||    
T  3756156 aatagagtggtgatacatgtacactcccatgtggcaataca-actcttacacccacataaaatcatgacatgtggcaa 3756232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Original strand, 17619153 - 17619198
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaat 293  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  17619153 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaat 17619198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 293
Target Start/End: Original strand, 55272377 - 55272422
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaat 293  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  55272377 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaat 55272422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0119 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0119
Description:

Target: scaffold0119; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 154 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 878 - 735
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagata 253  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  878 agagcggtgatatatgtaccacctcatgtggcaatacaccctttacacccacacaaaattctgacacgtggcaacctggactccacacaaatagaagata 779  T
Q  254 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacat 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  778 aagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatacat 735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0187
Description:

Target: scaffold0187; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 155 - 312
Target Start/End: Original strand, 14097 - 14253
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14097 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccc-acacaaatagaagataa 14195  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatggg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  14196 agtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaatacataggatgtacaatggg 14253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 155 - 312
Target Start/End: Original strand, 24425 - 24581
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24425 gagtgatgatacatgtaccaccccatgtggcaatacaccctttacatccacacaaaattctgacacgtggcaacctggaccc-acacaaatagaagataa 24523  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatggg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||||    
T  24524 agtgtggttgtgagatgaacttacaaaaatatccctaatacataggatgtacaatggg 24581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0385 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0385
Description:

Target: scaffold0385; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 155 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 11443 - 11286
Alignment:
Q  155 gagtggtgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataa 254  Q
    ||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||  |||||||| | | |||||||||||| || ||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  11443 gagtgatgatacatgtaccatcccatgtggcaatacactatttacacctacacaaaattctgacacgtagcaacttggaccccacatcaatagaagataa 11344  T
Q  255 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatggg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || || |||| ||||||    
T  11343 agtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatccctaatatatggggtgtacaatggg 11286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 161 - 311
Target Start/End: Original strand, 23335 - 23485
Alignment:
Q  161 tgatacatgtaccaccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaacctggaccccacacaaatagaagataaagtgtg 260  Q
    ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||  |||||||||| | |||||||| ||| |||||||  || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23335 tgatacatgcaccaccccatgtgacaatacacgttttacacccacacaaaattctaacacgtggcaaattgaacctcacacaaatagaagataaagtgtg 23434  T
Q  261 gttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgtataatgg 311  Q
     |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||    
T  23435 attgtaagatgaacttaccaaaatatctctaatacatgggatgtacaatgg 23485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 305
Target Start/End: Original strand, 45720 - 45777
Alignment:
Q  248 aagataaagtgtggttgtgagatgaacttaccaaaatatctttaatacataggatgta 305  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45720 aagagaaagtatggttgtgagatgaatttaccaaaatatccttaatacataggatgta 45777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 227
Target Start/End: Original strand, 45626 - 45699
Alignment:
Q  154 agagtggtgatacatgtac-caccttatgtggcaatacacactttacacccatataaaattctgacatgtggcaa 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||   ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  45626 agagtggtgatacatgtacacaccc-atgtggcaatacacctcttacacccacataaaatcctgacatgtggcaa 45699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 4997 times since January 2019
Visitors: 5753