View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF0790_low_11 (Length: 464)
Name: NF0790_low_11
Description: NF0790
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF0790_low_11 |
 | |
|
Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 421; Significance: 0; HSPs: 22)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 4777532 - 4777108
Alignment:
| Q |
11 |
cacagacctaaattacatttcagatgccaaattcatagatagcggtgtgagtaagaaaatattgtctacaaacaatgttcgacggtatctagaatatgtg |
110 |
Q |
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| T |
4777532 |
cacagacctaaattacatttcagatgccaaattcatagatagcggtgtgagtaagaagatattgtctacaaacaatgttcgacggtatctagaatatgtg |
4777433 |
T |
|
| Q |
111 |
agaagctttccaagtggagtgagaaattgttacagaataaatgtaacatctggtactaaatatttaatcagagcttctttctattatggtaactatgatg |
210 |
Q |
| |
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|
| T |
4777432 |
agaagctttccaagtggagtgagaaattgttacagaataaatgtaacatctggtactaaatatttaatcagagcttctttctattatggtaactatgatg |
4777333 |
T |
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| Q |
211 |
atttaaatgaccctccacaatttgatcttcattttggagctaatgtttgggatactgtgaagttccccaatgcatcacgtatgagattcaatgagatcat |
310 |
Q |
| |
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| T |
4777332 |
atttaaatgaccctccacaatttgatcttcattttggagctaatgtttgggatactgtgaagttccccaatgcatcacgtatgagattcaatgagatcat |
4777233 |
T |
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| Q |
311 |
ttacagtccatcacaagattacatacaaccatgtcttgttaacacaggccaagggactccattcatttcggctatagaattgaggcctttgaacaatgaa |
410 |
Q |
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| T |
4777232 |
ttacagtccatcacaagattacatacaaccatgtcttgttaacacaggccaagggactccattcatttcggctatagaattgaggcctttgaacaatgaa |
4777133 |
T |
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| Q |
411 |
acttacgtcacatcttcagtattat |
435 |
Q |
| |
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| T |
4777132 |
acttacgtcacatcttcagtattat |
4777108 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 99 - 422
Target Start/End: Original strand, 4725485 - 4725808
Alignment:
| Q |
99 |
ctagaatatgtgagaagctttccaagtggagtgagaaattgttacagaataaatgtaacatctggtactaaatatttaatcagagcttctttctattatg |
198 |
Q |
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| T |
4725485 |
ctagaatatgtgagaagctttccaagtggagtgagaaattgttacaaaataaatataacaagtggtactaaatatttaatcagagcttctttctattatg |
4725584 |
T |
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| Q |
199 |
gtaactatgatgatttaaatgaccctccacaatttgatcttcattttggagctaatgtttgggatactgtgaagttccccaatgcatcacgtatgagatt |
298 |
Q |
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| T |
4725585 |
gtaactatgatgatctaaacaagccaccacaatttgatcttcattttggagctaatgtttgggatactgtaaacttcaccaatctatcgcgcatcacaac |
4725684 |
T |
|
| Q |
299 |
caatgagatcatttacagtccatcacaagattacatacaaccatgtcttgttaacacaggccaagggactccattcatttcggctatagaattgaggcct |
398 |
Q |
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| T |
4725685 |
cagtgagatcatttacactccatcactagattacatacaaccatgtcttgttaacacagacaaagggactccattcatttcagctatagaattgaggact |
4725784 |
T |
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| Q |
399 |
ttgaacaatgaaacttacgtcaca |
422 |
Q |
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||||||||| ||||||| |||||| |
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| T |
4725785 |
ttgaacaataaaacttatgtcaca |
4725808 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 99 - 428
Target Start/End: Original strand, 4702717 - 4703046
Alignment:
| Q |
99 |
ctagaatatgtgagaagctttccaagtggagtgagaaattgttacagaataaatgtaacatctggtactaaatatttaatcagagcttctttctattatg |
198 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| || ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
4702717 |
ctagaacatgtgaggagttttcctaatggagtgagaaattgttacagaataaatgtaacaagtgatactaaatatttaatcagagctactttctattatg |
4702816 |
T |
|
| Q |
199 |
gtaactatgatgatttaaatgaccctccacaatttgatcttcattttggagctaatgtttgggatactgtgaagttccccaatgcatcacgtatgagatt |
298 |
Q |
| |
|
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|
| T |
4702817 |
gtaactatgatgatttaaatgatcccccagaatttgatcttcattttggacctaatgtctgggatacagtgaacttccccaatgcatcactcgtcacatt |
4702916 |
T |
|
| Q |
299 |
caatgagatcatttacagtccatcacaagattacatacaaccatgtcttgttaacacaggccaagggactccattcatttcggctatagaattgaggcct |
398 |
Q |
| |
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| T |
4702917 |
tatggagatcatttacactccatcactagattacatacaaccatgtcttgttaacacaggcaaagggactccattcatttcagttattgaattgaggact |
4703016 |
T |
|
| Q |
399 |
ttgaacaatgaaacttacgtcacatcttca |
428 |
Q |
| |
|
||||||||| || |||| ||||||| |||| |
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|
| T |
4703017 |
ttgaacaataaagcttatgtcacatattca |
4703046 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 8 - 423
Target Start/End: Original strand, 4680493 - 4680911
Alignment:
| Q |
8 |
gagcacagacctaaattacatttcagatgccaaattcatagatagcggtgtgagtaagaaaatattgtctacaaacaat---gttcgacggtatctagaa |
104 |
Q |
| |
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|||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| ||| | |||||| |||| |||| || | | || ||| |
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|
| T |
4680493 |
gagcacaggcataagttacatttcagatgccaaattcatagacagtggtgtaagtaagaggatactacctacaagcaatactgttctacagcaactggaa |
4680592 |
T |
|
| Q |
105 |
tatgtgagaagctttccaagtggagtgagaaattgttacagaataaatgtaacatctggtactaaatatttaatcagagcttctttctattatggtaact |
204 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
4680593 |
tatgtgaggagctttcccagtggagtgaaaaattgttacaaaatagatgtaaccaatggtaccaaatatttaatcagagcttctttctattatggaaact |
4680692 |
T |
|
| Q |
205 |
atgatgatttaaatgaccctccacaatttgatcttcattttggagctaatgtttgggatactgtgaagttccccaatgcatcacgtatgagattcaatga |
304 |
Q |
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| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| | ||| |||||| |||| | |||| || |
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| T |
4680693 |
acgatgatttaaatgagccaccacaatttgatcttcattttggacctaatgtttgggatacagtaaagttcacaaatttatcacgcatgacaatcaagga |
4680792 |
T |
|
| Q |
305 |
gatcatttacagtccatcacaagattacatacaaccatgtcttgttaacacaggccaagggactccattcatttcggctatagaattgaggcctttgaac |
404 |
Q |
| |
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|||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||| | |
|
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| T |
4680793 |
gatcatatacactccatcactagattacatacaaccatgtcttgttaacacaggcaaagggactccgttcatttcagccatagaattgaggactttggat |
4680892 |
T |
|
| Q |
405 |
aatgaaacttacgtcacat |
423 |
Q |
| |
|
||| || |||| ||||||| |
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|
| T |
4680893 |
aataaagcttatgtcacat |
4680911 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 99 - 407
Target Start/End: Original strand, 4688221 - 4688529
Alignment:
| Q |
99 |
ctagaatatgtgagaagctttccaagtggagtgagaaattgttacagaataaatgtaacatctggtactaaatatttaatcagagcttctttctattatg |
198 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
4688221 |
ctagaacatgtgaggagttttcctagtggagtgagaaattgttacagaataaatgtaacaagtgatactaaatatttaatcagagcgtctttctattatg |
4688320 |
T |
|
| Q |
199 |
gtaactatgatgatttaaatgaccctccacaatttgatcttcattttggagctaatgtttgggatactgtgaagttccccaatgcatcacgtatgagatt |
298 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| | ||| ||||| || | |
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| T |
4688321 |
gaaactatgatgatttaaacgagccaccacaatttgatcttcattttggcgctaatgtttgggatacagtaaagttcacaaatttatcactcatcgcaac |
4688420 |
T |
|
| Q |
299 |
caatgagatcatttacagtccatcacaagattacatacaaccatgtcttgttaacacaggccaagggactccattcatttcggctatagaattgaggcct |
398 |
Q |
| |
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|
|
| T |
4688421 |
cagtgagatcatttacactccatcacaagattacatacaaccatgtcttgttaacacaggcaacgggactccattcatttcatctatagaattgaggact |
4688520 |
T |
|
| Q |
399 |
ttgaacaat |
407 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
4688521 |
ttgaacaat |
4688529 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 103 - 410
Target Start/End: Original strand, 4714057 - 4714364
Alignment:
| Q |
103 |
aatatgtgagaagctttccaagtggagtgagaaattgttacagaataaatgtaacatctggtactaaatatttaatcagagcttctttctattatggtaa |
202 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| || || |
|
|
| T |
4714057 |
aatatgtgaggagctttccaagtggagtgagaaattgttacagaataaatgtaacaagtggtattaaatatttaatcagatcttctttctattacggaaa |
4714156 |
T |
|
| Q |
203 |
ctatgatgatttaaatgaccctccacaatttgatcttcattttggagctaatgtttgggatactgtgaagttccccaatgcatcacgtatgagattcaat |
302 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
4714157 |
ctatgatgatttaaatgagccaccagaatttgatcttcattttggacctaatgtttgggatacagtgaagttaactaatatatcacacatcacagacagt |
4714256 |
T |
|
| Q |
303 |
gagatcatttacagtccatcacaagattacatacaaccatgtcttgttaacacaggccaagggactccattcatttcggctatagaattgaggcctttga |
402 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
4714257 |
gagatcatatacactccattattagattacatacaaccatgtcttgttaacacaggaaaagggactccattcatttcagttatagaattgaggactttga |
4714356 |
T |
|
| Q |
403 |
acaatgaa |
410 |
Q |
| |
|
|||||||| |
|
|
| T |
4714357 |
acaatgaa |
4714364 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 103 - 407
Target Start/End: Original strand, 4995518 - 4995822
Alignment:
| Q |
103 |
aatatgtgagaagctttccaagtggagtgagaaattgttacagaataaatgtaacatctggtactaaatatttaatcagagcttctttctattatggtaa |
202 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4995518 |
aatatgtgaggagctttccaattggaatgagaaactgttacagaataaatgtagcaagtggtactaaatatttaatcagagcatctttctattatggtaa |
4995617 |
T |
|
| Q |
203 |
ctatgatgatttaaatgaccctccacaatttgatcttcattttggagctaatgtttgggatactgtgaagttccccaatgcatcacgtatgagattcaat |
302 |
Q |
| |
|
||||||| || |||| | || ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||| || | | || | |
|
|
| T |
4995618 |
ctatgataatctaaacaagccaccagaatttgatcttcattttggacctaatgtttgggatacagtgaagttcgccagtctatcacacatcacagacagt |
4995717 |
T |
|
| Q |
303 |
gagatcatttacagtccatcacaagattacatacaaccatgtcttgttaacacaggccaagggactccattcatttcggctatagaattgaggcctttga |
402 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
4995718 |
gagatcatatacactccatcactagattacattcaaccatgtcttgttaacacaggcaaagggactccattcatttctgctattgaattgaggcctttga |
4995817 |
T |
|
| Q |
403 |
acaat |
407 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
4995818 |
acaat |
4995822 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 108 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 21440447 - 21440145
Alignment:
| Q |
108 |
gtgagaagctttccaagtggagtgagaaattgttacagaataaatgtaacatctggtactaaatatttaatcagagcttctttctattatggtaactatg |
207 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
21440447 |
gtgaggagctttccaagtggagtgagaaactgttacaaaataaatgtaacaagtggtactaaatatttaataagagcttctttctattatggaaactatg |
21440348 |
T |
|
| Q |
208 |
atgatttaaatgaccctccacaatttgatcttcattttggagctaatgtttgggatactgtgaagtt---ccccaatgcatcacgtatgagattcaatga |
304 |
Q |
| |
|
|| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| || | |||| || |
|
|
| T |
21440347 |
ataatctaaatgaaccaccacaatttgatcttcattttggagctaatgtgtgggatacagtgaagttgttctccaatgcatcacacatcactatcaagga |
21440248 |
T |
|
| Q |
305 |
gatcatttacagtccatcacaagattacatacaaccatgtcttgttaacacaggccaagggactccattcatttcggctatagaattgaggcctttgaac |
404 |
Q |
| |
|
||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
21440247 |
gattatttacactccatcagtagattacataaaaccatgtcttgttaacacaggcaaagggactccattcatttcagccatagaattgagggctatgaac |
21440148 |
T |
|
| Q |
405 |
aat |
407 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
21440147 |
aat |
21440145 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 7e-84
Query Start/End: Original strand, 170 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 4905213 - 4904976
Alignment:
| Q |
170 |
atatttaatcagagcttctttctattatggtaactatgatgatttaaatgaccctccacaatttgatcttcattttggagctaatgtttgggatactgtg |
269 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |
|
|
| T |
4905213 |
atatttaattagagctactttctattatggtaattatgatgatttaaatgaccctccacaatttgatcttcattttggagcaaatgtttgggatacagta |
4905114 |
T |
|
| Q |
270 |
aagttccccaatgcatcacgtatgagattcaatgagatcatttacagtccatcacaagattacatacaaccatgtcttgttaacacaggccaagggactc |
369 |
Q |
| |
|
|||||| | | |||||||| | | | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
4905113 |
aagttcacaattgcatcactcactacaatcaaggagatcatttacactccatcacaagattacatacaaccatgtcttgttaacacaggcaaagggactc |
4905014 |
T |
|
| Q |
370 |
cattcatttcggctatagaattgaggcctttgaacaat |
407 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4905013 |
cattcatttcagccatagaattgaggcctttgaacaat |
4904976 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 8 - 407
Target Start/End: Original strand, 10445877 - 10446279
Alignment:
| Q |
8 |
gagcacagacctaaattacatttcagatgccaaattcatagatagcggtgtgagtaagaaaatattgtctacaaacaatgttcgacggtatctagaatat |
107 |
Q |
| |
|
||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||| ||| | || | | || ||| || | | ||||||||| |
|
|
| T |
10445877 |
gagcacatacataaattacatttcagataccaaattcatagatacaggtgtaagcaagaggatacaatttaaagatgatattcaacagcaactagaatat |
10445976 |
T |
|
| Q |
108 |
gtgagaagctttccaagtggagtgagaaattgttacagaataaatgtaacatctggtactaaatatttaatcagagcttctttctattatggtaactatg |
207 |
Q |
| |
|
||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
10445977 |
gtgaggagctttcctagtggagtgagaaattgttacagaataaatgttacaagtggtattcaatatttaatcagagtttctttctattatggaaactatg |
10446076 |
T |
|
| Q |
208 |
atgatttaaatgaccctccacaatttgatcttcattttggagctaatgtttgggatactgtgaagtt---ccccaatgcatcacgtatgagattcaatga |
304 |
Q |
| |
|
|| || ||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||| | |||||| | | | | |||||| || |
|
|
| T |
10446077 |
ataatctaaatgaaacaccacagtttgatcttcattttggacctaatgtgtgggatacagtgacgttctcctccaatgatttagggttcgcattcaagga |
10446176 |
T |
|
| Q |
305 |
gatcatttacagtccatcacaagattacatacaaccatgtcttgttaacacaggccaagggactccattcatttcggctatagaattgaggcctttgaac |
404 |
Q |
| |
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|||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
10446177 |
gatcatatacactccatcacaagattacatacaaccatgtcttgttaacacaggcaaagggattccattcatttcagctatagaattgaggactttgaac |
10446276 |
T |
|
| Q |
405 |
aat |
407 |
Q |
| |
|
||| |
|
|
| T |
10446277 |
aat |
10446279 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 99 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 4891245 - 4890934
Alignment:
| Q |
99 |
ctagaatatgtgagaagctttccaagtggagtgagaaattgttacagaataaatgtaacatctggtactaaatatttaatcagagcttctttctattatg |
198 |
Q |
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| T |
4891245 |
ctagaatatgtgagaagctttccaagtggagtgagaaactgttacaacataagtgtaacaagtggtactaaatattttatcagaacttcttttctttatg |
4891146 |
T |
|
| Q |
199 |
gtaactatgatgatttaaatgaccctccacaatttgatcttcattttggagctaatgtttgggatactgtgaagtt---ccccaatgcatcacgtatgag |
295 |
Q |
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| T |
4891145 |
gaaactatgataatctaaacaagccaccacaatttgatcttcactttggagctaatgtgtgggatacagtgaagttgtcctccaatgcatcactcttcac |
4891046 |
T |
|
| Q |
296 |
attcaatgagatcatttacagtccatcacaagattacatacaaccatgtcttgttaacacaggccaagggactccattcatttcggctatagaattgagg |
395 |
Q |
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| T |
4891045 |
attcagggaaatcatttacactccgtcgctagattacatacaaccatgtcttgttaacacaggaaaagggactccattcatttcagctatagaattgagg |
4890946 |
T |
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| Q |
396 |
cctttgaacaat |
407 |
Q |
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| T |
4890945 |
cctttgaacaat |
4890934 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 106 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 4914392 - 4914096
Alignment:
| Q |
106 |
atgtgagaagctttccaagtggagtgagaaattgttacagaataaatgtaacatctggtactaaatatttaatcagagcttctttctattatggtaacta |
205 |
Q |
| |
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| T |
4914392 |
atgtgaggagttttcctagtggagttagaaactgttacagaataaatgtaacaagtggtactaaatatttaatcagagcttctttttattatggaaacta |
4914293 |
T |
|
| Q |
206 |
tgatgatttaaatgaccctccacaatttgatcttcattttggagctaatgtttgggatactgtgaagttccccaatgcatcacgtatgagattcaatgag |
305 |
Q |
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| T |
4914292 |
tgataatctaaatcaaccaccagaatttgatctacattttggagctaatgtttgggaaacagtaaagttcactaatgtatcaggcatcacactcaaggag |
4914193 |
T |
|
| Q |
306 |
atcatttacagtccatcacaagattacatacaaccatgtcttgttaacacaggccaagggactccattcatttcggctatagaattgaggcctttga |
402 |
Q |
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| T |
4914192 |
atcatatacactccatcacaagatcacatacaaccatgtcttgttaacataggcaaagggactccattcatttcagttttagaattgaggactttga |
4914096 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 114 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 4926113 - 4925826
Alignment:
| Q |
114 |
agctttccaagtggagtgagaaattgttacagaataaatgtaa-catctggtactaaatatttaatcagagcttctttctattatggtaactatgatgat |
212 |
Q |
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| T |
4926113 |
agctttccaagtggagttagaaactgttacagaataaatgtaaacatg-ggtgttcaatatttaatcagagctactttcctttatggaaactatgataat |
4926015 |
T |
|
| Q |
213 |
ttaaatgaccctccacaatttgatcttcattttggagctaatgtttgggatactgtgaagttccccaatgcatcacgtatgagattcaatgagatcattt |
312 |
Q |
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| T |
4926014 |
ataaatgaaccaccacaatttgatcttcattttggacctaatgtgtgggatacggtgttgttatccaatgcatcacgccccacaatcaaggagatcattt |
4925915 |
T |
|
| Q |
313 |
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401 |
Q |
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| T |
4925914 |
acattccatcaaaagattacatacaaccatgtcttgttaaaacaggcaaagggactccattcatttcaactatagaattgaggactttg |
4925826 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 407
Target Start/End: Original strand, 4744961 - 4745264
Alignment:
| Q |
99 |
ctagaatatgtgagaagctttccaagtggagtgagaaattgttacagaataaatgtaacatctggtactaaatatttaatcagagcttctttctattatg |
198 |
Q |
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| T |
4744961 |
ctagaatatgtgagaagctttccaagtggagtgagaaactg--aca---taagtgtaacaagtggaaatatatatttaatcagagcttctttctattatg |
4745055 |
T |
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| Q |
199 |
gtaactatgatgatttaaatgaccctccacaatttgatcttcattttggagctaatgtttgggatactgtgaagttccccaatgcatcacgtatgagatt |
298 |
Q |
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| T |
4745056 |
gaaactatgataatctaaatcaaccaccacaatttgatcttcattttggtgctaatgtgtgggatacggtgaatttccccaatgtatcagtcaccacaac |
4745155 |
T |
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| Q |
299 |
caatgagatcatttacagtccatcacaagattacatacaaccatgtcttgttaacacaggccaagggactccattcatttcggctatagaattgaggcct |
398 |
Q |
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| T |
4745156 |
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4745255 |
T |
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| Q |
399 |
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407 |
Q |
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| T |
4745256 |
ttgaacaat |
4745264 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 114 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 4876220 - 4875927
Alignment:
| Q |
114 |
agctttccaagtggagtgagaaattgttacagaataaatgtaacatctgg-tactaaatatttaatcagagcttctttctattatggtaactatgatgat |
212 |
Q |
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| T |
4876220 |
agctttccaagtggagtgagaaattgctacagaataaatgtaa-acatggatattcaatatttaatcagagctactttctattatggaaactatgataat |
4876122 |
T |
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| Q |
213 |
ttaaatgaccctccacaatttgatcttcattttggagctaatgtttgggatactgtgaagttccccaatgcatcacgtatgagattcaatgagatcattt |
312 |
Q |
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| T |
4876121 |
ctaaatgatccaccacaatttgatcttcattttggacctaatgtgtgggatacagtgaagttcacaaatttatcacgcaccacaatcaaggagatcatat |
4876022 |
T |
|
| Q |
313 |
acagtccatcacaagattacatacaaccatgtcttgttaacacaggccaagggactccattcatttcggctatagaattgaggcctttgaacaat |
407 |
Q |
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| T |
4876021 |
acactccatcactagactacatagaaccatgtcttgttaacactggaaatggaactccattcatttcagttatagaattgaggactttgaacaat |
4875927 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 406
Target Start/End: Original strand, 4735874 - 4736267
Alignment:
| Q |
19 |
taaattacatttcagatgccaaattcatagatagcggtgtgagtaagaaaatattgtctacaaacaatg---ttcgacggtatctagaatatgtgagaag |
115 |
Q |
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| T |
4735874 |
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4735973 |
T |
|
| Q |
116 |
ctttccaagtggagtgagaaattgttacagaataaatgtaacatctggtactaaatatttaatcagagcttctttctattatggtaactatgatgattta |
215 |
Q |
| |
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| T |
4735974 |
ctttccaagtggagtgagaaattgttacaaaataaatgtaacaagtggtactaaatatttaatcagagctacttttctttatggaagctatgatggttta |
4736073 |
T |
|
| Q |
216 |
aatgaccctccacaatttgatcttcattttggagctaatgtttgggatactgtgaagttcccca---atgcatcacgtatgagattcaatgagatcattt |
312 |
Q |
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| | || |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||| |||| |||| ||| || |||||| | | || || || ||||||| |
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| T |
4736074 |
gacaagccaccacaatttgatcttcattttggacctaatgtggtggctacagtgaggttctccaaccatacatcacacttcacatacagggaaatcattt |
4736173 |
T |
|
| Q |
313 |
acagtccatcacaagattacatacaaccatgtcttgttaacacaggccaagggactccattcatttcggctatagaattgaggcctttgaacaa |
406 |
Q |
| |
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| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |
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|
| T |
4736174 |
atactccatcacaagattacatacaaccatgttttgttaacacaggaaacggaactccattcatttcagttatagaattgaggactttgaacaa |
4736267 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 71
Target Start/End: Original strand, 4713976 - 4714028
Alignment:
| Q |
19 |
taaattacatttcagatgccaaattcatagatagcggtgtgagtaagaaaata |
71 |
Q |
| |
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| T |
4713976 |
taaattatatttcagatgccaaattcatagatgcaggtgtaagtaagaaaata |
4714028 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 50
Target Start/End: Original strand, 4688138 - 4688169
Alignment:
| Q |
19 |
taaattacatttcagatgccaaattcatagat |
50 |
Q |
| |
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| T |
4688138 |
taaattacatttcagatgccaaattcatagat |
4688169 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 114 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 4905937 - 4905875
Alignment:
| Q |
114 |
agctttccaagtggagtgagaaattgttacagaataaatgtaacatctggtactaaatattta |
176 |
Q |
| |
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| T |
4905937 |
agctttcctagtggagtaggaaattgttacaaagtatatgtaacaagtggtactaaatattta |
4905875 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 51
Target Start/End: Original strand, 4995424 - 4995466
Alignment:
| Q |
9 |
agcacagacctaaattacatttcagatgccaaattcatagata |
51 |
Q |
| |
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|||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |
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| T |
4995424 |
agcacacacataaattacatttctgatgccaaattcatagata |
4995466 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 51
Target Start/End: Original strand, 4725402 - 4725434
Alignment:
| Q |
19 |
taaattacatttcagatgccaaattcatagata |
51 |
Q |
| |
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||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
4725402 |
taaattatatttcagatgccaaattcatagata |
4725434 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 19 - 51
Target Start/End: Complemental strand, 4891328 - 4891296
Alignment:
| Q |
19 |
taaattacatttcagatgccaaattcatagata |
51 |
Q |
| |
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| T |
4891328 |
taaattacatatcagatgccaaattcatagata |
4891296 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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