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Alignment Overview

Query: NF0793_low_13 (Length: 387)

Name: NF0793_low_13
Description: NF0793
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0793_low_13
NF0793_low_13
[»] chr8 (15 HSPs)
chr8 (80-359)||(22081063-22081342)
chr8 (96-363)||(16283210-16283483)
chr8 (163-359)||(44562932-44563131)
chr8 (96-306)||(19687859-19688069)
chr8 (163-359)||(9354453-9354652)
chr8 (163-359)||(19659224-19659423)
chr8 (80-334)||(19674183-19674437)
chr8 (96-287)||(31490013-31490204)
chr8 (96-290)||(19286226-19286420)
chr8 (96-306)||(28362199-28362409)
chr8 (96-306)||(16277315-16277525)
chr8 (96-306)||(2137503-2137713)
chr8 (96-306)||(19208604-19208814)
chr8 (96-306)||(27609149-27609359)
chr8 (136-306)||(33258524-33258694)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (80-359)||(21312-21591)
[»] chr4 (22 HSPs)
chr4 (80-359)||(15391564-15391844)
chr4 (80-359)||(14235751-14236036)
chr4 (85-359)||(1900025-1900302)
chr4 (85-359)||(15227638-15227915)
chr4 (85-359)||(15285154-15285431)
chr4 (96-334)||(5005646-5005884)
chr4 (96-306)||(27163602-27163812)
chr4 (134-333)||(30753556-30753755)
chr4 (97-306)||(21969478-21969687)
chr4 (96-333)||(33674068-33674305)
chr4 (134-333)||(39850437-39850636)
chr4 (163-359)||(24460831-24461030)
chr4 (96-363)||(24592536-24592806)
chr4 (96-306)||(14664794-14665004)
chr4 (96-290)||(54833166-54833360)
chr4 (96-306)||(17013776-17013986)
chr4 (96-242)||(31126867-31127013)
chr4 (96-242)||(14098317-14098463)
chr4 (96-242)||(18800971-18801117)
chr4 (202-326)||(36344777-36344901)
chr4 (96-287)||(40105942-40106133)
chr4 (96-306)||(6569629-6569839)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (80-307)||(27392734-27392961)
chr2 (85-359)||(19456636-19456913)
chr2 (85-359)||(21703379-21703656)
chr2 (163-363)||(27118515-27118718)
chr2 (163-359)||(31891543-31891742)
chr2 (96-306)||(27434718-27434928)
chr2 (97-306)||(32049556-32049765)
chr2 (163-359)||(34156838-34157037)
chr2 (163-359)||(34303518-34303717)
chr2 (134-334)||(11635435-11635635)
chr2 (134-334)||(11641624-11641824)
chr2 (96-306)||(21677456-21677666)
chr2 (163-308)||(3784481-3784626)
chr2 (96-333)||(12586558-12586795)
chr2 (163-359)||(16163426-16163625)
chr2 (96-306)||(261039-261249)
chr2 (96-363)||(13936755-13937028)
chr2 (96-306)||(34279206-34279416)
chr2 (96-333)||(27776964-27777201)
chr2 (96-332)||(27816731-27816967)
chr2 (96-333)||(9350241-9350478)
chr2 (322-367)||(27392958-27393003)
chr2 (96-333)||(27803449-27803686)
chr2 (96-333)||(40233256-40233493)
chr2 (96-242)||(12716943-12717089)
chr2 (96-306)||(23128840-23129050)
chr2 (96-306)||(28881971-28882181)
chr2 (96-306)||(37925250-37925460)
chr2 (96-242)||(16829676-16829822)
chr2 (96-242)||(16891659-16891805)
chr2 (96-306)||(31876038-31876248)
chr2 (96-306)||(34286111-34286321)
chr2 (96-306)||(34291171-34291381)
chr2 (96-306)||(34861437-34861647)
chr2 (96-306)||(37686183-37686393)
chr2 (96-306)||(37701448-37701658)
chr2 (205-306)||(12655408-12655509)
chr2 (205-306)||(20837784-20837885)
chr2 (136-306)||(19416773-19416943)
chr2 (96-306)||(22926302-22926512)
chr2 (96-242)||(39889819-39889965)
chr2 (202-306)||(39052102-39052206)
[»] chr1 (7 HSPs)
chr1 (85-359)||(16208257-16208531)
chr1 (85-307)||(20460857-20461079)
chr1 (163-359)||(20340561-20340760)
chr1 (96-306)||(41793593-41793803)
chr1 (96-306)||(10962430-10962640)
chr1 (136-306)||(28584781-28584951)
chr1 (96-242)||(51637978-51638124)
[»] chr3 (44 HSPs)
chr3 (85-359)||(18530108-18530379)
chr3 (98-365)||(16626767-16627037)
chr3 (96-306)||(7996284-7996494)
chr3 (96-306)||(10642792-10643002)
chr3 (96-363)||(7072934-7073207)
chr3 (96-334)||(28116255-28116493)
chr3 (163-359)||(17994051-17994250)
chr3 (96-332)||(15893006-15893242)
chr3 (96-306)||(47023175-47023385)
chr3 (96-333)||(36997388-36997625)
chr3 (96-333)||(51781733-51781970)
chr3 (96-333)||(51796822-51797059)
chr3 (163-363)||(5713016-5713222)
chr3 (163-363)||(5723926-5724132)
chr3 (163-363)||(5757345-5757551)
chr3 (163-363)||(5768236-5768442)
chr3 (134-333)||(11110660-11110859)
chr3 (96-290)||(4721353-4721547)
chr3 (96-306)||(4796979-4797189)
chr3 (96-306)||(35880488-35880698)
chr3 (163-359)||(4625736-4625935)
chr3 (163-359)||(5652179-5652378)
chr3 (96-333)||(20577161-20577398)
chr3 (96-333)||(29665284-29665521)
chr3 (96-306)||(5013434-5013644)
chr3 (96-290)||(5466707-5466901)
chr3 (96-306)||(18224913-18225123)
chr3 (134-306)||(6192076-6192248)
chr3 (96-306)||(8301590-8301800)
chr3 (202-333)||(48465743-48465874)
chr3 (96-306)||(8295697-8295907)
chr3 (96-290)||(15741424-15741618)
chr3 (96-242)||(17985346-17985492)
chr3 (96-306)||(18050984-18051194)
chr3 (96-306)||(22871200-22871410)
chr3 (96-306)||(22886259-22886469)
chr3 (96-333)||(18242449-18242686)
chr3 (96-306)||(18330396-18330601)
chr3 (96-306)||(29149081-29149291)
chr3 (96-333)||(6542773-6543010)
chr3 (136-306)||(24327921-24328091)
chr3 (96-306)||(28339024-28339234)
chr3 (96-306)||(31964799-31965009)
chr3 (96-306)||(50134397-50134607)
[»] chr7 (27 HSPs)
chr7 (85-359)||(16450110-16450387)
chr7 (85-359)||(16041077-16041354)
chr7 (96-330)||(16503527-16503761)
chr7 (96-330)||(16518563-16518797)
chr7 (96-363)||(5127754-5128027)
chr7 (96-333)||(3445056-3445293)
chr7 (163-359)||(31088576-31088775)
chr7 (163-359)||(45733292-45733491)
chr7 (96-306)||(5147511-5147721)
chr7 (96-306)||(45387105-45387315)
chr7 (96-333)||(11441322-11441559)
chr7 (96-330)||(2154335-2154569)
chr7 (96-306)||(26435019-26435229)
chr7 (96-290)||(4145310-4145504)
chr7 (96-306)||(9618413-9618623)
chr7 (96-306)||(11424947-11425157)
chr7 (96-306)||(16736631-16736841)
chr7 (96-306)||(16751685-16751895)
chr7 (96-306)||(17523294-17523504)
chr7 (96-306)||(17529711-17529921)
chr7 (96-330)||(26320016-26320250)
chr7 (96-306)||(10917036-10917246)
chr7 (96-306)||(24592712-24592922)
chr7 (96-306)||(26275265-26275475)
chr7 (96-306)||(26485915-26486125)
chr7 (202-306)||(26538044-26538148)
chr7 (96-242)||(31124673-31124819)
[»] chr5 (42 HSPs)
chr5 (82-359)||(23891962-23892245)
chr5 (82-359)||(25198788-25199068)
chr5 (140-359)||(22888287-22888509)
chr5 (205-363)||(24969903-24970061)
chr5 (163-359)||(13184771-13184970)
chr5 (163-359)||(13440617-13440816)
chr5 (163-359)||(33877087-33877286)
chr5 (96-306)||(30168239-30168449)
chr5 (163-359)||(11325634-11325833)
chr5 (96-333)||(18500903-18501140)
chr5 (96-333)||(31431198-31431435)
chr5 (96-306)||(8665657-8665867)
chr5 (96-306)||(24688339-24688549)
chr5 (96-306)||(11549124-11549334)
chr5 (96-242)||(18375658-18375804)
chr5 (96-306)||(22999296-22999506)
chr5 (96-306)||(23718170-23718380)
chr5 (96-306)||(23752632-23752842)
chr5 (96-306)||(30151788-30151998)
chr5 (96-306)||(33777257-33777467)
chr5 (96-333)||(37754738-37754975)
chr5 (96-333)||(37771154-37771391)
chr5 (142-306)||(43078065-43078229)
chr5 (96-306)||(9548725-9548935)
chr5 (96-330)||(12131925-12132159)
chr5 (96-242)||(24681207-24681353)
chr5 (96-242)||(24723734-24723880)
chr5 (96-170)||(24951880-24951954)
chr5 (96-242)||(33516126-33516272)
chr5 (96-306)||(40473734-40473944)
chr5 (96-333)||(3789296-3789533)
chr5 (96-333)||(31826574-31826811)
chr5 (96-306)||(5637680-5637890)
chr5 (96-306)||(9317221-9317431)
chr5 (96-306)||(15658942-15659152)
chr5 (96-306)||(26480162-26480372)
chr5 (96-306)||(30934406-30934616)
chr5 (96-333)||(37671647-37671884)
chr5 (134-306)||(15759039-15759211)
chr5 (136-306)||(29967248-29967418)
chr5 (136-306)||(30029225-30029395)
chr5 (206-306)||(41674589-41674689)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (85-307)||(20162-20384)
scaffold0124 (96-306)||(30214-30424)
[»] chr6 (27 HSPs)
chr6 (85-363)||(20160454-20160732)
chr6 (85-363)||(22172099-22172377)
chr6 (123-306)||(22477501-22477684)
chr6 (163-359)||(28162485-28162684)
chr6 (163-359)||(13522242-13522441)
chr6 (163-359)||(33374425-33374624)
chr6 (96-290)||(26918138-26918332)
chr6 (96-333)||(3695821-3696058)
chr6 (163-359)||(8892479-8892678)
chr6 (163-359)||(8903714-8903913)
chr6 (96-306)||(26999831-27000041)
chr6 (96-333)||(34463562-34463799)
chr6 (205-363)||(22935045-22935206)
chr6 (205-363)||(23857490-23857651)
chr6 (96-290)||(4525047-4525241)
chr6 (96-306)||(13299179-13299389)
chr6 (96-306)||(24863475-24863685)
chr6 (96-306)||(26988759-26988969)
chr6 (134-333)||(16673923-16674122)
chr6 (96-306)||(15424545-15424755)
chr6 (96-306)||(16749612-16749822)
chr6 (96-306)||(24304846-24305056)
chr6 (96-242)||(30558308-30558454)
chr6 (96-333)||(27484875-27485112)
chr6 (136-330)||(16944231-16944425)
chr6 (96-306)||(29572771-29572981)
chr6 (96-333)||(27007470-27007707)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (163-359)||(2884-3083)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (96-332)||(29524-29760)
scaffold0089 (96-306)||(40354-40564)
scaffold0089 (205-306)||(47270-47371)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (96-306)||(415-625)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (96-290)||(7993-8187)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (96-242)||(15279-15425)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (96-306)||(27053-27263)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (96-330)||(7500-7734)
[»] scaffold0496 (1 HSPs)
scaffold0496 (134-306)||(18-190)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (96-287)||(26506-26697)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (96-306)||(9351-9561)
scaffold0159 (134-306)||(19814-19986)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (142-333)||(5796-5989)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 15)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 80 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 22081342 - 22081063
Alignment:
80 atggacatcatcagacgaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacc 179  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
22081342 atggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatctgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccatcaatgctgctcagctacc 22081243  T
180 tccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaat 279  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
22081242 tccgccgtatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaat 22081143  T
280 gccattgctcagcaaatgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaacaaaccagacctacctttcctccgatacc 359  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
22081142 gccattgctcagcaaatgcagcaacagccgttggctcaacagcagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgatacc 22081063  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 96 - 363
Target Start/End: Original strand, 16283210 - 16283483
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || |||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  | |||||| | || |  ||     
16283210 gaaagaaacggaagtagggatggtgtctgccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctattaatgctgcccaaatgcctccgtcgtacccatat 16283309  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
      ||  |||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||    || ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| || |    
16283310 gcgccgtactctcagcatcctttctttccgccattctatcattagtatcctttgccaccaggtcaacctcaggtacccattaatgcaattgctcaacaga 16283409  T
296 tgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaa------caacaaaccagacctacctttcctccgataccgatg 363  Q
    || ||||||||  || || |||||| || |||      |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
16283410 tgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacatcaacaagctagacctaccttccctccgataccgatg 16283483  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 163 - 359
Target Start/End: Original strand, 44562932 - 44563131
Alignment:
163 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaac 262  Q
    ||||||||||||||||||||| | || | |||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    ||  | || ||||    
44562932 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggacaac 44563031  T
263 ctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagccgctggctcaaca---gcagcaacaacaaaccagacctacctttcctccgatacc 359  Q
    ||||||||||||| ||||||   | ||||| ||||||||||||||| |  ||||||||    ||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||    
44563032 ctcaggtacccgttaatgccgccgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgatacc 44563131  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Original strand, 19687859 - 19688069
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || |||||||||||||| |  |||||| || |||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||  | |||||| |||| |  ||     
19687859 gaaagaaacggaagtagggatggtgtcagccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgctgcccaaatgcctccgtcatacccatat 19687958  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
      ||  || || |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |  || || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |    
19687959 gcgccgtattcccagcatcctttctttccgccattctatcaccagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacaga 19688058  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
19688059 tgaaacaacag 19688069  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 163 - 359
Target Start/End: Original strand, 9354453 - 9354652
Alignment:
163 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaac 262  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    ||  | |||||||    
9354453 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 9354552  T
263 ctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagccgctggctcaaca---gcagcaacaacaaaccagacctacctttcctccgatacc 359  Q
    ||||||||||||| |||||| | |  |||| ||||||||||||||| |  ||||||||    ||||| |||||  | |||||||||||||||| ||||||    
9354553 ctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgatacc 9354652  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 163 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 19659423 - 19659224
Alignment:
163 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaac 262  Q
    ||||||||||||||||||||| | || | |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    ||  | |||||||    
19659423 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 19659324  T
263 ctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagccgctggctcaaca---gcagcaacaacaaaccagacctacctttcctccgatacc 359  Q
    ||||||||||||| |||||| | |  |||| |||||||||||| || |  ||||||||    ||||| |||||  | |||||||||||||||| ||||||    
19659323 ctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacaacctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgatacc 19659224  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 80 - 334
Target Start/End: Original strand, 19674183 - 19674437
Alignment:
80 atggacatcatcagacgaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacc 179  Q
    ||||||||||  ||| |||||| || || || |||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||  | ||    
19674183 atggacatcacaagaagaaagaaacggacgtggggatggtgtcagctggagccagtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcc 19674282  T
180 tccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaat 279  Q
    |||| |||| |  || ||||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || || || |  || || ||||||||||| || |||||||||    
19674283 tccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaat 19674382  T
280 gccattgctcagcaaatgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaacaaa 334  Q
    || ||||| || || ||| ||||||||  || || |||||| || ||||||||||    
19674383 gcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaacaaa 19674437  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 31490204 - 31490013
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
31490204 gaaagaaactgaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgcccctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 31490105  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 287  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||    
31490104 atgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcgattgc 31490013  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 290
Target Start/End: Original strand, 19286226 - 19286420
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
19286226 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagcgggagccggtcaatccatggccactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 19286325  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 290  Q
     |||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||   ||| || || ||||||||||| || |||||||||||||||||    
19286326 gtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttaccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccattgctca 19286420  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 28362409 - 28362199
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||  || ||| || |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
28362409 gaaagaaactgaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 28362310  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
28362309 atgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 28362210  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
28362209 tgaaacaacag 28362199  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Original strand, 16277315 - 16277525
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || |||||||||||||| |  || ||| || |||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  | |||||| |||| |  ||     
16277315 gaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatat 16277414  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
      ||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |  || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |    
16277415 gcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacaga 16277514  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
16277515 tgaaacaacag 16277525  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 2137713 - 2137503
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || |||||||||||||| |  || ||| || |||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  | |||||| |||| |  ||     
2137713 gaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatat 2137614  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
      ||  || ||||||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||| || |  || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |    
2137613 gcgccgtattctcagcatcctttctttccgtcattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacaga 2137514  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
2137513 tgaaacaacag 2137503  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 19208814 - 19208604
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
19208814 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 19208715  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
19208714 atgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 19208615  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
19208614 tgaaacaacag 19208604  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 27609359 - 27609149
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||| |||||||||| |  || ||| || |||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  | |||||| |||| |  ||     
27609359 gaaagaaacggaaatagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatat 27609260  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
     ||   || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |  || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |    
27609259 gtgtcgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacaga 27609160  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
27609159 tgaaacaacag 27609149  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 306
Target Start/End: Original strand, 33258524 - 33258694
Alignment:
136 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatc 235  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||    
33258524 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 33258623  T
236 accagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacag 306  Q
    | ||||| ||    ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || ||| ||||||||    
33258624 atcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacag 33258694  T

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Target: scaffold0109 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 80 - 359
Target Start/End: Original strand, 21312 - 21591
Alignment:
80 atggacatcatcagacgaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacc 179  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
21312 atggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatctgccggaaccagtcaatccgtggctactgttgcccccatcaatgcttctcagctacc 21411  T
180 tccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaat 279  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
21412 tccgccgtaccagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccaccaccgccgggtcaacctcaggtacccgtcaat 21511  T
280 gccattgctcagcaaatgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaacaaaccagacctacctttcctccgatacc 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21512 gccattgctcagcaaatgcaacaacagctgctggcttaacagcagcaacaacaaaccagacctacctttcctccgatacc 21591  T

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Target: chr4 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 22)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 80 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 15391844 - 15391564
Alignment:
80 atggacatcatcagacgaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgtt-gcccccattaatgctgctcagctac 178  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||    
15391844 atggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatctgctggaaccagtcaatccatggctactgtttgcccccatcaatgttgctcagctac 15391745  T
179 ctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaa 278  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
15391744 ctccgccgtatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatccgccatcgccgggtcaacctcaggtacccatcaa 15391645  T
279 tgccattgctcagcaaatgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaacaaaccagacctacctttcctccgatacc 359  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
15391644 tgccattgctcagcaaatgcagcaacagccgctggctcaacaacagcagcaacaaaccagacctacctttcctccgatacc 15391564  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 80 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 14236036 - 14235751
Alignment:
80 atggacatcatcagacgaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacc 179  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
14236036 atggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatctgccggaaccagtcaatccatggccactgttacccctattaatgctgctcagttacc 14235937  T
180 tccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaat 279  Q
    || ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||  | ||||| ||  |||||||||| |||    
14235936 tctgccgtaccagtatatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcatcagtaccctctaccatcgggtcacccataggtacccgttaat 14235837  T
280 gccattgctcagcaaatgcaacaacagccgctggct------caacagcagcaacaacaaaccagacctacctttcctccgatacc 359  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||    
14235836 gccattgctcagcaaatgcaacaacagccgccggctcagcaacaacagcagcaacaacaagctagacctacctttcctctgatacc 14235751  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 85 - 359
Target Start/End: Original strand, 1900025 - 1900302
Alignment:
85 catcatcagacgaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgc 184  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||     
1900025 catcataagaagaaagaaacagaagtagggatggtatctgccggagccggtcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgt 1900124  T
185 catatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccat 284  Q
    | || |  ||   || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    ||  | |||||||||||||||||||| |||||| |    
1900125 cgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgt 1900224  T
285 tgctcagcaaatgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaa---caacaaaccagacctacctttcctccgatacc 359  Q
     | ||||||||||||||||||||| |  | ||||||||| |||   |||||| | |||||||||||||||||||||||    
1900225 cgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacatcaacaagctagacctacctttcctccgatacc 1900302  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 85 - 359
Target Start/End: Original strand, 15227638 - 15227915
Alignment:
85 catcatcagacgaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgc 184  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||     
15227638 catcataagaagaaagaaacagaagtagggatggtatctgccggagctggtcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgt 15227737  T
185 catatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccat 284  Q
    | || | |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||    ||  | |||||||||||||||||||| |||||  |    
15227738 cgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgctgt 15227837  T
285 tgctcagcaaatgcaacaacagccgctggct---caacagcagcaacaacaaaccagacctacctttcctccgatacc 359  Q
     | ||||||||||||||||||||| |  |||   ||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
15227838 cgttcagcaaatgcaacaacagccaccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgatacc 15227915  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 85 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 15285431 - 15285154
Alignment:
85 catcatcagacgaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgc 184  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||      
15285431 catcataagaagaaagaaacagaagtatggatggtatctgccggagctggtcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccat 15285332  T
185 catatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccat 284  Q
      || |  ||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||  | |||||||||||||| ||||| ||||||||    
15285331 tgtacccatatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtcaacctcaggtgcccgttaatgccat 15285232  T
285 tgctcagcaaatgcaacaacagccgctggct---caacagcagcaacaacaaaccagacctacctttcctccgatacc 359  Q
     | ||||||||||||||||||||| |   ||   ||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
15285231 cgttcagcaaatgcaacaacagccaccaactcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgatacc 15285154  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 334
Target Start/End: Original strand, 5005646 - 5005884
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
5005646 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagcgggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 5005745  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |  || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |    
5005746 atgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacaga 5005845  T
296 tgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaacaaa 334  Q
    || ||||||||  || || |||||| || ||||||||||    
5005846 tgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaacaaa 5005884  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 27163812 - 27163602
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||  || ||| || ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
27163812 gaaagaaacggaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 27163713  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |  || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |    
27163712 atgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacaga 27163613  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
27163612 tgaaacaacag 27163602  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 134 - 333
Target Start/End: Original strand, 30753556 - 30753755
Alignment:
134 gtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattcta 233  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||    
30753556 gtcaatccatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccatttta 30753655  T
234 tcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaacaa 333  Q
    ||| ||||| || |  ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||| ||||||||  || || |||||| || |||||||||    
30753656 tcatcagtaccctctgccgccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaa 30753755  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 97 - 306
Target Start/End: Original strand, 21969478 - 21969687
Alignment:
97 aaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtaca 196  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||  | ||||||||||| |  || |    
21969478 aaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgccatacccatata 21969577  T
197 tgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaat 296  Q
    |||  || |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| || |  || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||    
21969578 tgccgtattctcagcatcctttcttcccgccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagat 21969677  T
297 gcaacaacag 306  Q
    | ||||||||    
21969678 gaaacaacag 21969687  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 96 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 33674305 - 33674068
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  |||    
33674305 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatac 33674206  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  |||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| || |  ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
33674205 atgccgtactctcagcatccgttcttcccaccattttaccatcagtaccccctgccgccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 33674106  T
296 tgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaacaa 333  Q
    || ||||||||  || || |||||| || |||||||||    
33674105 tgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaa 33674068  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 134 - 333
Target Start/End: Original strand, 39850437 - 39850636
Alignment:
134 gtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattcta 233  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  |||||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||    
39850437 gtcaatcaatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgtttta 39850536  T
234 tcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaacaa 333  Q
     || ||||| || |  ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||| ||||||||  || || |||||| || |||||||||    
39850537 ccatcagtaccccctgccgccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaa 39850636  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 163 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 24461030 - 24460831
Alignment:
163 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaac 262  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |    ||  | |||||||    
24461030 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtattctttgccatcgggtcaac 24460931  T
263 ctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagccgctggctcaaca---gcagcaacaacaaaccagacctacctttcctccgatacc 359  Q
    ||||||||||||| |||||| | |  |||| ||||||||||||||| |  ||||||||    ||||| |||||  | |||||||||||||||| ||||||    
24460930 ctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgatacc 24460831  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 24592806 - 24592536
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||| |||||||||| |  || ||| || |||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
24592806 gaaagaaacggaaatagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 24592707  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
     |||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |  || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |    
24592706 gtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacaga 24592607  T
296 tgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaa---caacaaaccagacctacctttcctccgataccgatg 363  Q
    || ||||||||  || || |||||| || |||   || ||| | |||||||| || |||||||||||||||    
24592606 tgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatg 24592536  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Original strand, 14664794 - 14665004
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || |||||||||||||| | ||||||| |  |||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||  | |||||| |||| |  ||     
14664794 gaaagaaacggaagtagggatggtgtctgccggagctggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgctgcccaaatgcctccgtcatacccatat 14664893  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
       |  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |  || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |    
14664894 gcaccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacaga 14664993  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
14664994 tgaaacaacag 14665004  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 290
Target Start/End: Original strand, 54833166 - 54833360
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
54833166 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagcgggagccggtcaatccatggccactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 54833265  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 290  Q
     |||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||   ||| || || ||||||||||| || |||||||||||||||||    
54833266 gtgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttaccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccattgctca 54833360  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Original strand, 17013776 - 17013986
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || |||||||||||||| |  |||||| |  |||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  | |||||  |||| |  ||     
17013776 gaaagaaacggaagtagggatggtgtcagccggagctggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccttcatacccatat 17013875  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
      ||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |  || || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |    
17013876 gcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacaga 17013975  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
17013976 tgaaacaacag 17013986  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 31127013 - 31126867
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||  || ||| || ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
31127013 gaaagaaactgaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 31126914  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagta 242  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||    
31126913 atgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagta 31126867  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 242
Target Start/End: Original strand, 14098317 - 14098463
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
14098317 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 14098416  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagta 242  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||    
14098417 atgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagta 14098463  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 18801117 - 18800971
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| |||||||| |||||||| |  || ||| || ||||| | |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
18801117 gaaagaaacagaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaagctatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 18801018  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagta 242  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
18801017 atgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagta 18800971  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 36344901 - 36344777
Alignment:
202 tactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaac 301  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| || ||||| ||||||||    || || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||  ||||||    
36344901 tactctcagcatccgttcttcctaccgttttatcatcagtatcctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaac 36344802  T
302 aacagccgctggctcaacagcagca 326  Q
    | || ||||  | ||||||||||||    
36344801 atcaaccgccagttcaacagcagca 36344777  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 96 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 40106133 - 40105942
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
40106133 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 40106034  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 287  Q
    ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    ||||| || || ||||| || ||||||||||| |||||    
40106033 atgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgc 40105942  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Original strand, 6569629 - 6569839
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| ||||| |||||||| || || |||||  ||||  | |||||| |||| |  ||     
6569629 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggccactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatat 6569728  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| || |  || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || || |    
6569729 atgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgcccaacaga 6569828  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
6569829 tgaaacaacag 6569839  T

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Target: chr2 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 80 - 307
Target Start/End: Original strand, 27392734 - 27392961
Alignment:
80 atggacatcatcagacgaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacc 179  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
27392734 atggtcatcataagaagaaagagacagaagtagggatggtatctgccggaaccagtcaatctgtggctactgttgcccccatcgatgctgctcagctacc 27392833  T
180 tccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaat 279  Q
    ||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
27392834 tccaccgtaccagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccgggtcaacctcaggtacccgtcaat 27392933  T
280 gccattgctcagcaaatgcaacaacagc 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
27392934 gccattgctcagcaaatgcaacaacagc 27392961  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 85 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 19456913 - 19456636
Alignment:
85 catcatcagacgaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgc 184  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||     
19456913 catcataagaagaaagaaacagaagtagggatggtatctgccggagctggtcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgt 19456814  T
185 catatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccat 284  Q
    | || |  ||   |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||  | |||||||||||||| ||||| ||||||||    
19456813 cgtacccatatgcgcaatactttcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtcaacctcaggtgcccgttaatgccat 19456714  T
285 tgctcagcaaatgcaacaacagccgctggct---caacagcagcaacaacaaaccagacctacctttcctccgatacc 359  Q
     | | ||||||||||||||||||| |  |||   ||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
19456713 cgtttagcaaatgcaacaacagccaccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgatacc 19456636  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 85 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 21703656 - 21703379
Alignment:
85 catcatcagacgaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgc 184  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||||     
21703656 catcataagaagaaagaaacagaagtagggatggtatctgccggagccggtcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcctagttacctccgt 21703557  T
185 catatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccat 284  Q
    | || |  ||   || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    ||  | |||||||||||||||||||| |||||| |    
21703556 cgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgt 21703457  T
285 tgctcagcaaatgcaacaacagccgctggct---caacagcagcaacaacaaaccagacctacctttcctccgatacc 359  Q
     | ||| ||||||||||||||||| |  | |   ||||| ||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||    
21703456 cgttcaacaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctaccttccctccgatacc 21703379  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 163 - 363
Target Start/End: Original strand, 27118515 - 27118718
Alignment:
163 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaac 262  Q
    ||||||||||||||||||||| | || | | |   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    ||  | |||||||    
27118515 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgcatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 27118614  T
263 ctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagccgctggctcaaca---gcagcaacaacaaaccagacctacctttcctccgatacc 359  Q
    ||||||||||||| |||||| | | ||||| ||||||||||||||| |  ||||||||    ||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||    
27118615 ctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctaccttccctccgatacc 27118714  T
360 gatg 363  Q
    ||||    
27118715 gatg 27118718  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 163 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 31891742 - 31891543
Alignment:
163 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaac 262  Q
    ||||||||||||||||||||| | || | |||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    ||  | || ||||    
31891742 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggacaac 31891643  T
263 ctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagccgctggctcaaca---gcagcaacaacaaaccagacctacctttcctccgatacc 359  Q
    ||||||||||||| |||||| | | ||||| ||||||||||||||| |  ||||||||    ||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||    
31891642 ctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgatacc 31891543  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 27434928 - 27434718
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || |||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  | |||||| | || |  ||     
27434928 gaaagaaacggaagtagggatggtgtctgccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctattaatgctgcccaaatgcctccgtcgtacccatat 27434829  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
      ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||    || || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |    
27434828 gcgccgtactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacaga 27434729  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
27434728 tgaaacaacag 27434718  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 97 - 306
Target Start/End: Original strand, 32049556 - 32049765
Alignment:
97 aaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtaca 196  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||  | ||||||||||| |  || |    
32049556 aaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgccatacccatata 32049655  T
197 tgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaat 296  Q
    |||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |  || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || ||    
32049656 tgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagat 32049755  T
297 gcaacaacag 306  Q
    | ||||||||    
32049756 gaaacaacag 32049765  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 163 - 359
Target Start/End: Original strand, 34156838 - 34157037
Alignment:
163 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaac 262  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    ||  | |||||||    
34156838 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 34156937  T
263 ctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagccgctggctcaaca---gcagcaacaacaaaccagacctacctttcctccgatacc 359  Q
    ||||||||||||| |||||| | |  |||| ||||||||||||||| |  ||||||||    ||||| |||||  | |||||||||||||||| ||||||    
34156938 ctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgatacc 34157037  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 163 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 34303717 - 34303518
Alignment:
163 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaac 262  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    ||  | |||||||    
34303717 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 34303618  T
263 ctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagccgctggctcaaca---gcagcaacaacaaaccagacctacctttcctccgatacc 359  Q
    ||||||||||||| |||| | | |  |||| ||||||||||||||| |  ||||||||    ||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||    
34303617 ctcaggtacccgttaatgtcgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgatacc 34303518  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 134 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 11635635 - 11635435
Alignment:
134 gtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattcta 233  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||    
11635635 gtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccatttta 11635536  T
234 tcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaacaa 333  Q
    ||| ||||| || |  || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||| ||||||||  || || |||||| || |||||||||    
11635535 tcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaacaa 11635436  T
334 a 334  Q
    |    
11635435 a 11635435  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 134 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 11641824 - 11641624
Alignment:
134 gtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattcta 233  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||    
11641824 gtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatcctttcttcccgccatttta 11641725  T
234 tcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaacaa 333  Q
    ||| ||||| || |  || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||| ||||||||  || || |||||| || |||||||||    
11641724 tcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaacaa 11641625  T
334 a 334  Q
    |    
11641624 a 11641624  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 21677666 - 21677456
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||  || ||| || ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | ||||||||||| |  ||     
21677666 gaaagaaactgaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgccatacccatat 21677567  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |  || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
21677566 atgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacaga 21677467  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
21677466 tgaaacaacag 21677456  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 163 - 308
Target Start/End: Original strand, 3784481 - 3784626
Alignment:
163 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaac 262  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    ||  | |||||||    
3784481 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 3784580  T
263 ctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagcc 308  Q
    ||||||||||||| |||||| | |  |||| |||||||||||||||    
3784581 ctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcc 3784626  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 333
Target Start/End: Original strand, 12586558 - 12586795
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||||||| |||||||||| || || |||||  ||||  | |||||| ||||||  |||    
12586558 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatgactactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatatccatac 12586657  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| || |  || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
12586658 atgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 12586757  T
296 tgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaacaa 333  Q
    || ||||||||  || || |||||| || |||||||||    
12586758 tgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaa 12586795  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 163 - 359
Target Start/End: Original strand, 16163426 - 16163625
Alignment:
163 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaac 262  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |    ||  | |||||||    
16163426 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtattctttgccatcgggtcaac 16163525  T
263 ctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagccgctggctcaaca---gcagcaacaacaaaccagacctacctttcctccgatacc 359  Q
    ||||||||||||| |||||| | |  |||| ||||||||||||||| |  ||||||||    ||||| |||||  | |||||||||||||||| ||||||    
16163526 ctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgatacc 16163625  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 261249 - 261039
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||||||||| || || |||||  ||||  | |||||| |||| |  |||    
261249 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatac 261150  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |  || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
261149 atgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 261050  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
261049 tgaaacaacag 261039  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 13937028 - 13936755
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || |||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
13937028 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 13936929  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| || |  || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
13936928 atgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 13936829  T
296 tgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaa------caaaccagacctacctttcctccgataccgatg 363  Q
    || ||||||||| || || |||||| || || |||      ||| |||||||||| || |||||||||||||||    
13936828 tgaaacaacagctgccggttcaacaacaacagcaaagtcagcaagccagacctactttccctccgataccgatg 13936755  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Original strand, 34279206 - 34279416
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || |||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
34279206 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagcgggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 34279305  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| || |  || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |    
34279306 atgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacaga 34279405  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
34279406 tgaaacaacag 34279416  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 333
Target Start/End: Original strand, 27776964 - 27777201
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| ||| |||||||||| || || |||||  ||||  | |||||| |||| |  |||    
27776964 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatgactactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatac 27777063  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| || |  || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
27777064 atgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccaccaggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 27777163  T
296 tgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaacaa 333  Q
    || ||||||||  || || |||||| || |||||||||    
27777164 tgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaa 27777201  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 96 - 332
Target Start/End: Original strand, 27816731 - 27816967
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| ||| |||||||||| || || |||||  ||||  | |||||| |||| |  |||    
27816731 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatgactactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatac 27816830  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| || |  || |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
27816831 atgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccaccaggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 27816930  T
296 tgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaaca 332  Q
    || ||||||||  || || |||||| || ||||||||    
27816931 tgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaca 27816967  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 96 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 9350478 - 9350241
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| ||| |||||||||| || || |||||  ||||  | |||||| |||| |  |||    
9350478 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatgactactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatac 9350379  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| || |  |  || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
9350378 atgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgctaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 9350279  T
296 tgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaacaa 333  Q
    || ||||||||| || || |||||| || |||||||||    
9350278 tgaaacaacagctgccggttcaacaacaacaacaacaa 9350241  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 322 - 367
Target Start/End: Original strand, 27392958 - 27393003
Alignment:
322 cagcaacaacaaaccagacctacctttcctccgataccgatgatgt 367  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
27392958 cagcaacaacaaaccagacctacctttcctccgataccaatgatgt 27393003  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 96 - 333
Target Start/End: Original strand, 27803449 - 27803686
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| ||| |||||||||| || || |||||  ||||  | |||||| |||| |  |||    
27803449 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatgactactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatac 27803548  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| || |  || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
27803549 atgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 27803648  T
296 tgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaacaa 333  Q
    || ||||||||  || || |||||| || |||||||||    
27803649 tgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaa 27803686  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 96 - 333
Target Start/End: Original strand, 40233256 - 40233493
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
40233256 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 40233355  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  |||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||| || |  || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
40233356 atgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 40233455  T
296 tgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaacaa 333  Q
    || ||||||||  || || |||||| || |||||||||    
40233456 tgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaa 40233493  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 12717089 - 12716943
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || |||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
12717089 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 12716990  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagta 242  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
12716989 atgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagta 12716943  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23129050 - 23128840
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || |||||||||||||| |  || ||| || |||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  | |||||| |||| |  ||     
23129050 gaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatat 23128951  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
      ||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |  || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |    
23128950 gcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacaga 23128851  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
23128850 tgaaacaacag 23128840  T

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Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Original strand, 28881971 - 28882181
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||| |||||||||| |  || ||| || |||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  | |||||| |||| |  ||     
28881971 gaaagaaacggaaatagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatat 28882070  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
     |||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |  || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |    
28882071 gtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacaga 28882170  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
28882171 tgaaacaacag 28882181  T

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Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Original strand, 37925250 - 37925460
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
37925250 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 37925349  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
37925350 atgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacaga 37925449  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
37925450 tgaaacaacag 37925460  T

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Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16829822 - 16829676
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||  ||||  | |||||| |||| |  ||     
16829822 gaaagaaactgaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatat 16829723  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagta 242  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||    
16829722 atgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagta 16829676  T

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Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 242
Target Start/End: Original strand, 16891659 - 16891805
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||  ||||  | |||||| |||| |  ||     
16891659 gaaagaaactgaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatat 16891758  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagta 242  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||    
16891759 atgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagta 16891805  T

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Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Original strand, 31876038 - 31876248
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
31876038 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 31876137  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
31876138 atgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacaga 31876237  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
31876238 tgaaacaacag 31876248  T

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Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Original strand, 34286111 - 34286321
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || |||||||||||||| |  |  ||| || ||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
34286111 gaaagaaacggaagtagggatggtgtcaggtggagccggtcaatccatggccactgttgctcctatcaatgcggctcaaatgcctccgtcatacccatat 34286210  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || || |||||||||||||| || ||||| || || ||||| || |  || || ||||||||||  ||||||||||||||  ||||||| || |    
34286211 atgccgtattcccagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctccagtacccgtcaatgcagttgctcaacaga 34286310  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
34286311 tgaaacaacag 34286321  T

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Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Original strand, 34291171 - 34291381
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || |||||||||||||| |  |  ||| || ||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
34291171 gaaagaaacggaagtagggatggtgtcaggtggagccggtcaatccatggccactgttgctcctatcaatgcggctcaaatgcctccgtcatacccatat 34291270  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || || |||||||||||||| || ||||| || || ||||| || |  || || ||||||||||  ||||||||||||||  ||||||| || |    
34291271 atgccgtattcccagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctccagtacccgtcaatgcagttgctcaacaga 34291370  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
34291371 tgaaacaacag 34291381  T

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Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Original strand, 34861437 - 34861647
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
34861437 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 34861536  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
34861537 atgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacaga 34861636  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
34861637 tgaaacaacag 34861647  T

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Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 37686393 - 37686183
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
37686393 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 37686294  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
37686293 atgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacaga 37686194  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
37686193 tgaaacaacag 37686183  T

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Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 37701658 - 37701448
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
37701658 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 37701559  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
37701558 atgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacaga 37701459  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
37701458 tgaaacaacag 37701448  T

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Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 306
Target Start/End: Original strand, 12655408 - 12655509
Alignment:
205 tctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaac 304  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |  || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||| ||||||    
12655408 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaac 12655507  T
305 ag 306  Q
    ||    
12655508 ag 12655509  T

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Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 306
Target Start/End: Original strand, 20837784 - 20837885
Alignment:
205 tctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaac 304  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |  || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||| ||||||    
20837784 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaac 20837883  T
305 ag 306  Q
    ||    
20837884 ag 20837885  T

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Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 19416943 - 19416773
Alignment:
136 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatc 235  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||    
19416943 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcggctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 19416844  T
236 accagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacag 306  Q
    | ||||| ||    ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || ||| ||||||||    
19416843 atcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacag 19416773  T

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Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22926512 - 22926302
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || |||||||||||||||| || || || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
22926512 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagcgggagccggtcaatccatggctaccgtcgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 22926413  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
22926412 atgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 22926313  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
22926312 tgaaacaacag 22926302  T

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Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 242
Target Start/End: Original strand, 39889819 - 39889965
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
39889819 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggccactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 39889918  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagta 242  Q
    ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||    
39889919 atgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagta 39889965  T

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Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 202 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 39052206 - 39052102
Alignment:
202 tactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaac 301  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||| || |  || || ||||||||||| || |||||||| || ||||| || || ||| |||    
39052206 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaacgcaattgcccaacagatgaaac 39052107  T
302 aacag 306  Q
    |||||    
39052106 aacag 39052102  T

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Target: chr1 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 7)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 85 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16208531 - 16208257
Alignment:
85 catcatcagacgaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgc 184  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
16208531 catcataagaagaaagaaacagaagtagagatggtatctgccggagccggtcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgc 16208432  T
185 catatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccat 284  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||| |||||||||||| | ||||||||    
16208431 cgtatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccaccaccatcgggtcagcctcaggtacccattaatgccat 16208332  T
285 tgctcagcaaatgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaacaaaccagacctacctttcctccgatacc 359  Q
     | ||||||||||||||||||||| |  | |||||| || || |||||| | |||||||||||||||||||||||    
16208331 cgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacatcaacaagctagacctacctttcctccgatacc 16208257  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 85 - 307
Target Start/End: Original strand, 20460857 - 20461079
Alignment:
85 catcatcagacgaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgc 184  Q
    |||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
20460857 catcataagaagaaagaaatagaagtagggatggtatctgccggagccggtcaatccatggctactattgcccctattaatgctgcccagttacctccgc 20460956  T
185 catatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccat 284  Q
    | || | |||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| | |||  | |||||||||||||||||||| ||||||||    
20460957 cgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcaatatcctctaccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccat 20461056  T
285 tgctcagcaaatgcaacaacagc 307  Q
     | ||||||||||||||||||||    
20461057 cgttcagcaaatgcaacaacagc 20461079  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 163 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 20340760 - 20340561
Alignment:
163 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaac 262  Q
    ||||||||||||||||||||| | || | ||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    ||  | |||||||    
20340760 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtacgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 20340661  T
263 ctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagccgctggct---caacagcagcaacaacaaaccagacctacctttcctccgatacc 359  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||| |  |||   ||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||    
20340660 ctcaggtacccgtcaatgccgtcgttcaacaaatgcaacaacagcctccagctcaacaacaacagcatcagcaagctagacctacctttcctccgatacc 20340561  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 41793803 - 41793593
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| || |||||||  || ||| || |||||||||||||||| ||||| || || ||||| || ||  | |||||| |||| |  ||     
41793803 gaaagaaacggaagtgggaatggtatcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatat 41793704  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |  || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||  || |    
41793703 atgccgtattctcaacatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctccacaga 41793604  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
41793603 tgaaacaacag 41793593  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Original strand, 10962430 - 10962640
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
10962430 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 10962529  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
10962530 atgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 10962629  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
10962630 tgaaacaacag 10962640  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 306
Target Start/End: Original strand, 28584781 - 28584951
Alignment:
136 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatc 235  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| | ||| ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||    
28584781 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccgtatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 28584880  T
236 accagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacag 306  Q
    | ||||| ||    ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || ||| ||||||||    
28584881 atcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacag 28584951  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 242
Target Start/End: Original strand, 51637978 - 51638124
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
51637978 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 51638077  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagta 242  Q
    ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||    
51638078 atgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagta 51638124  T

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Target: chr3 (Bit Score: 121; Significance: 7e-62; HSPs: 44)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 85 - 359
Target Start/End: Original strand, 18530108 - 18530379
Alignment:
85 catcatcagacgaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgc 184  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||      
18530108 catcataagaagaaagaaacagaagtagggatggtatctgccggaactagtcaatccatggctactgttacccctattaatgctgcccagttacctccat 18530207  T
185 catatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccat 284  Q
    | || | |||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | |||  | ||||||||||| || ||||| |||||| |    
18530208 cgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtcaacctcaagtgcccgttaatgccgt 18530307  T
285 tgctcagcaaatgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaacaaaccagacctacctttcctccgatacc 359  Q
     | ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    | |||||||||||||||||||||||    
18530308 cgttcagcaaatgcaacaacagccaccagctcaacagcagcaacaag---ctagacctacctttcctccgatacc 18530379  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 98 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 16627037 - 16626767
Alignment:
98 aagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacat 197  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| | || | |||       
16627037 aagaaacagaagtagggatggtatctgccggagccggtcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacccgtatgc 16626938  T
198 gcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatg 297  Q
     ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| | |||  | |||||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||    
16626937 acaatactctcagcatcccttctttccaccgttctatcatcagtatcctctaccatcgggtcaacctccggtacccgttaatgccatcgttcagcaaatg 16626838  T
298 caacaacagccgctggct---caacagcagcaacaacaaaccagacctacctttcctccgataccgatgat 365  Q
    ||||||||||| |  |||   ||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||    
16626837 caacaacagccaccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgat 16626767  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Original strand, 7996284 - 7996494
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||  | ||||||||||| |  ||     
7996284 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgccatacccatat 7996383  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |  || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |    
7996384 atgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacaga 7996483  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
7996484 tgaaacaacag 7996494  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Original strand, 10642792 - 10643002
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||  | ||||||||||| |  ||     
10642792 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgccatacccatat 10642891  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |  || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |    
10642892 atgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacaga 10642991  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
10642992 tgaaacaacag 10643002  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 96 - 363
Target Start/End: Original strand, 7072934 - 7073207
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
7072934 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccagtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 7073033  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| || |  || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |    
7073034 atgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacaga 7073133  T
296 tgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaa------caaaccagacctacctttcctccgataccgatg 363  Q
    || ||||||||  || || |||||| || ||||||      ||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
7073134 tgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctccgataccgatg 7073207  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 96 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 28116493 - 28116255
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || |||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
28116493 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 28116394  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |  || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |    
28116393 atgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacaga 28116294  T
296 tgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaacaaa 334  Q
    || ||||||||  || || |||||| || ||||||||||    
28116293 tgaaacaacagatgccggttcaacaacaacaacaacaaa 28116255  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 163 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 17994250 - 17994051
Alignment:
163 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaac 262  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    ||  | |||||||    
17994250 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 17994151  T
263 ctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagccgctggctcaaca---gcagcaacaacaaaccagacctacctttcctccgatacc 359  Q
    ||||||||||||| |||||| | |  |||| ||||||||||||||| |  ||||||||    ||||| |||||  | |||||||||||||||| ||||||    
17994150 ctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgatacc 17994051  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 15893242 - 15893006
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || |||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||  | |||||| | || |  ||     
15893242 gaaagaaacggaagtagggatggtgtctgccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgctgcccaaatgcctccgtcgtacccatat 15893143  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
      ||  |||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||| ||    || || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |    
15893142 gcgccgtactctcagcatcctttctttccgcccttctatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacaga 15893043  T
296 tgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaaca 332  Q
    || ||||||||  || || |||||| || ||||||||    
15893042 tgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaca 15893006  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Original strand, 47023175 - 47023385
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||||||||| || || |||||  ||||  | |||||| |||| |  |||    
47023175 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatac 47023274  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |  || || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |    
47023275 atgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaggtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 47023374  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
47023375 tgaaacaacag 47023385  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 36997625 - 36997388
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  |||    
36997625 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatac 36997526  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |  || || || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |    
36997525 atgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccacccggccaacctcaggtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 36997426  T
296 tgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaacaa 333  Q
    || ||||||||  || || |||||| || |||||||||    
36997425 tgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaa 36997388  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 333
Target Start/End: Original strand, 51781733 - 51781970
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  |||    
51781733 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatac 51781832  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  |||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||| || |  ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
51781833 atgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccgccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 51781932  T
296 tgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaacaa 333  Q
    || ||||||||  || || |||||| || |||||||||    
51781933 tgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaa 51781970  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 333
Target Start/End: Original strand, 51796822 - 51797059
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  |||    
51796822 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatac 51796921  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  |||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||| || |  ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
51796922 atgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccgccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 51797021  T
296 tgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaacaa 333  Q
    || ||||||||  || || |||||| || |||||||||    
51797022 tgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaa 51797059  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 363
Target Start/End: Original strand, 5713016 - 5713222
Alignment:
163 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaac 262  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |  || || |||||||    
5713016 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtcaac 5713115  T
263 ctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaa------caaaccagacctacctttcctccgat 356  Q
    |||| || ||||||||||| || || || || ||| ||||||||  || || |||||| || ||||||      ||| |||||||||| || ||||||||    
5713116 ctcaagtgcccgtcaatgcaatcgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagccagacctactttccctccgat 5713215  T
357 accgatg 363  Q
    |||||||    
5713216 accgatg 5713222  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 363
Target Start/End: Original strand, 5723926 - 5724132
Alignment:
163 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaac 262  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |  || || |||||||    
5723926 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtcaac 5724025  T
263 ctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaa------caaaccagacctacctttcctccgat 356  Q
    |||| || ||||||||||| || || || || ||| ||||||||  || || |||||| || ||||||      ||| |||||||||| || ||||||||    
5724026 ctcaagtgcccgtcaatgcaatcgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagccagacctactttccctccgat 5724125  T
357 accgatg 363  Q
    |||||||    
5724126 accgatg 5724132  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 5757551 - 5757345
Alignment:
163 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaac 262  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |  || || |||||||    
5757551 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtcaac 5757452  T
263 ctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaa------caaaccagacctacctttcctccgat 356  Q
    |||| || ||||||||||| || || || || ||| ||||||||  || || |||||| || ||||||      ||| |||||||||| || ||||||||    
5757451 ctcaagtgcccgtcaatgcaatcgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagccagacctactttccctccgat 5757352  T
357 accgatg 363  Q
    |||||||    
5757351 accgatg 5757345  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 163 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 5768442 - 5768236
Alignment:
163 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaac 262  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |  || || |||||||    
5768442 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtcaac 5768343  T
263 ctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaa------caaaccagacctacctttcctccgat 356  Q
    |||| || ||||||||||| || || || || ||| ||||||||  || || |||||| || ||||||      ||| |||||||||| || ||||||||    
5768342 ctcaagtgcccgtcaatgcaatcgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagccagacctactttccctccgat 5768243  T
357 accgatg 363  Q
    |||||||    
5768242 accgatg 5768236  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 11110859 - 11110660
Alignment:
134 gtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattcta 233  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || |||||  ||||  | |||||| |||| |  |||||||  || ||||||||||||||||||||||| || ||    
11110859 gtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgtttta 11110760  T
234 tcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaacaa 333  Q
    ||| ||||| || |  || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||| ||||||||  || || |||||| || |||||||||    
11110759 tcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaa 11110660  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 290
Target Start/End: Original strand, 4721353 - 4721547
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || |||||||||||||| |  || ||| || |||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
4721353 gaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 4721452  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 290  Q
     |||  || |||||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||| || |  || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
4721453 gtgccgtattctcagcatcttttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgctca 4721547  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 4797189 - 4796979
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || |||||||||||||| |  || ||| || |||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  | |||||| |||| |  ||     
4797189 gaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatat 4797090  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
     |||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |  || || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |    
4797089 gtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacaga 4796990  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
4796989 tgaaacaacag 4796979  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Original strand, 35880488 - 35880698
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || |||||||||||||| |  || ||| || |||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
35880488 gaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 35880587  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
     |||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |  || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |    
35880588 gtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacaga 35880687  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
35880688 tgaaacaacag 35880698  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 163 - 359
Target Start/End: Original strand, 4625736 - 4625935
Alignment:
163 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaac 262  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||    ||  | |||||||    
4625736 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattatatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 4625835  T
263 ctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagccgctggctcaaca---gcagcaacaacaaaccagacctacctttcctccgatacc 359  Q
    ||||||||||||| |||| | | |  |||| ||||||||||||||| |  ||||||||    ||||| |||||  | |||||||||||||||| ||||||    
4625836 ctcaggtacccgttaatgtcgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgatacc 4625935  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 163 - 359
Target Start/End: Original strand, 5652179 - 5652378
Alignment:
163 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaac 262  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||     |   | |||||||    
5652179 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcgtttgcaatcgggtcaac 5652278  T
263 ctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagccgctggctcaaca---gcagcaacaacaaaccagacctacctttcctccgatacc 359  Q
    ||||||||||||| |||||| | |  |||| ||||||||||||||| |  ||||||||    ||||| |||||  | |||||||||||||||| ||||||    
5652279 ctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgatacc 5652378  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 20577398 - 20577161
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||||||||| || || |||||  ||||  | |||||| |||| |  |||    
20577398 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatac 20577299  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| || |  || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
20577298 atgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 20577199  T
296 tgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaacaa 333  Q
    || ||||||||  || || |||||| || |||||||||    
20577198 tgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaa 20577161  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 29665521 - 29665284
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  |||    
29665521 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatac 29665422  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
29665421 atgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 29665322  T
296 tgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaacaa 333  Q
    || ||||||||  || || |||||| || |||||||||    
29665321 tgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaa 29665284  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Original strand, 5013434 - 5013644
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||  || ||| || ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
5013434 gaaagaaacggaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 5013533  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
5013534 atgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacaga 5013633  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
5013634 tgaaacaacag 5013644  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 290
Target Start/End: Original strand, 5466707 - 5466901
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  |||||| || ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
5466707 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagccggagccggtcaatctatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 5466806  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 290  Q
    ||||  || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||    || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||    
5466807 atgccgtattctcagcatccgttcttcccaccattttatcatcagtaccctttgccacccggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctca 5466901  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Original strand, 18224913 - 18225123
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||  || ||| || ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
18224913 gaaagaaacggaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 18225012  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
18225013 atgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacaga 18225112  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
18225113 tgaaacaacag 18225123  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 306
Target Start/End: Original strand, 6192076 - 6192248
Alignment:
134 gtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattcta 233  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||  |||  || |||||||||||||||||  | ||||| ||    
6192076 gtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatgtgccgtattctcagcatcctttcttttcgccatttta 6192175  T
234 tcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacag 306  Q
    |||  |||| || |  || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||    
6192176 tcattagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacag 6192248  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 8301800 - 8301590
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccata-tcagta 194  Q
    |||||| || |||||| ||||||| | ||||||| || ||||||||||||||| |||||| || || |||||||| ||  | |||||| | || ||| ||    
8301800 gaaagaaacggaagtatggatggtgtctgccggagccggtcaatccatggctattgttgctcctatcaatgctgcccaaatgcctccgtcgtactca-ta 8301702  T
195 catgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaa 294  Q
       ||  || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||    || || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||     
8301701 tgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacag 8301602  T
295 atgcaacaacag 306  Q
    ||| ||||||||    
8301601 atgaaacaacag 8301590  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 333
Target Start/End: Original strand, 48465743 - 48465874
Alignment:
202 tactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaac 301  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||| || || || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||| |||    
48465743 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatcagtaccccccgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaac 48465842  T
302 aacagccgctggctcaacagcagcaacaacaa 333  Q
    |||||  || || |||||| || |||||||||    
48465843 aacagttgccggttcaacaacaacaacaacaa 48465874  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Original strand, 8295697 - 8295907
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || |||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  | |||||| |||| |  ||     
8295697 gaaagaaacggaagtagggatggtgtctgccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatat 8295796  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
      ||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |   | || ||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |    
8295797 gcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgtcaccgggtcaacctcaagtacctgttaatgcaatcgctcaacaga 8295896  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
8295897 tgaaacaacag 8295907  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 15741618 - 15741424
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || |||||||||||||| |  || ||| || |||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  | |||||| |||| |  ||     
15741618 gaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatat 15741519  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 290  Q
     |||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |  || || ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||    
15741518 gtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctca 15741424  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 17985492 - 17985346
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
17985492 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 17985393  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagta 242  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||    
17985392 atgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagta 17985346  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Original strand, 18050984 - 18051194
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || |||||||||||||| |  || ||| || |||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  | |||||| |||| |  ||     
18050984 gaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatat 18051083  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
      ||  || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |  || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |    
18051084 gcgccgtattctcaacatcctttctttccgccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacaga 18051183  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
18051184 tgaaacaacag 18051194  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22871410 - 22871200
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||| | |||||| |||| |  ||     
22871410 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatctatggctactgttgcacctatcaatgcagctcagatgcctccgtcatacccatat 22871311  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    || ||||| || ||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
22871310 atgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccaggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 22871211  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
22871210 tgaaacaacag 22871200  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22886469 - 22886259
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||| | |||||| |||| |  ||     
22886469 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatctatggctactgttgcacctatcaatgcagctcagatgcctccgtcatacccatat 22886370  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    || ||||| || ||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
22886369 atgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccaggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 22886270  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
22886269 tgaaacaacag 22886259  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 333
Target Start/End: Original strand, 18242449 - 18242686
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  |||||| || ||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
18242449 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagccggagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 18242548  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||  |    ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |    
18242549 atgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtactctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccagcaga 18242648  T
296 tgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaacaa 333  Q
    || ||||||||  || || |||||| || |||||||||    
18242649 tgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaa 18242686  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Original strand, 18330396 - 18330601
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || |||||||||||||| |  || ||| || |||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
18330396 gaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 18330495  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
     |||  || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |    || |||||||   ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |    
18330496 gtgccgtattctcagcatcctttctttccaccattttatcatc--cctctgccaccg---ggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacaga 18330590  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
18330591 tgaaacaacag 18330601  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 29149291 - 29149081
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || |||||||||||||| |  || ||| || ||||||||||||||||| |||| || || ||||| || ||  | |||||| |||| |  ||     
29149291 gaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactattgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatat 29149192  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
     |||  || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||    || || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||| || |    
29149191 gtgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtgcccgttaatgcaatcgctcaacaga 29149092  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
29149091 tgaaacaacag 29149081  T

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Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 6543010 - 6542773
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
6543010 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 6542911  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    || || || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
6542910 atgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 6542811  T
296 tgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaacaa 333  Q
    || ||||||||  || || |||||| || |||||||||    
6542810 tgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaa 6542773  T

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Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 306
Target Start/End: Original strand, 24327921 - 24328091
Alignment:
136 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatc 235  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||    
24327921 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 24328020  T
236 accagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacag 306  Q
    | ||||| ||    ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || ||| ||||||||    
24328021 atcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacag 24328091  T

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Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Original strand, 28339024 - 28339234
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || |||||||||||||||| || || || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
28339024 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagcgggagccggtcaatccatggctaccgtcgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 28339123  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
28339124 atgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 28339223  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
28339224 tgaaacaacag 28339234  T

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Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 31965009 - 31964799
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || |||||||||||||||| || || || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
31965009 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagcgggagccggtcaatccatggctaccgtcgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 31964910  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
31964909 atgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 31964810  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
31964809 tgaaacaacag 31964799  T

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Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 50134607 - 50134397
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || |||||||||||||||| || || || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
50134607 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagcgggagccggtcaatccatggctaccgtcgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 50134508  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
50134507 atgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 50134408  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
50134407 tgaaacaacag 50134397  T

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Target: chr7 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 27)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 85 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16450387 - 16450110
Alignment:
85 catcatcagacgaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgc 184  Q
    |||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||     
16450387 catcataagaagaaagaaacaaaagtagggatggtatctgccggagccggtcaatccatagctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgt 16450288  T
185 catatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccat 284  Q
    | || | ||||  ||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||    ||  | |||||||||||||||||| | |||||| |    
16450287 cgtacccgtacgcgcagtactctcagcatcccttctttccaccattttatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgccgt 16450188  T
285 tgctcagcaaatgcaacaacagccgctggctcaacag---cagcaacaacaaaccagacctacctttcctccgatacc 359  Q
     | ||||||| ||||||||||||| |  |||||||||   ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
16450187 cgttcagcaagtgcaacaacagccaccagctcaacagcaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgatacc 16450110  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 85 - 359
Target Start/End: Original strand, 16041077 - 16041354
Alignment:
85 catcatcagacgaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgc 184  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||     
16041077 catcataagaagaaagaaacagaagtagggatggtatctgccggagccggtcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgt 16041176  T
185 catatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccat 284  Q
    | || |  ||   || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||     |  | |||||||||||||||||||| ||| || |    
16041177 cgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgtcatcgggtcaacctcaggtacccgttaattccgt 16041276  T
285 tgctcagcaaatgcaacaacagccgctggct---caacagcagcaacaacaaaccagacctacctttcctccgatacc 359  Q
     | ||||||||||||||||||||| |  | |   ||||| ||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||    
16041277 cgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctaccttccctccgatacc 16041354  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 96 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 16503761 - 16503527
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || |||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  | |||||| |||| |  ||     
16503761 gaaagaaacggaagtagggatggtgtctgccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctattaatgctgcccaaatgcctccgtcatacccatat 16503662  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
      ||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |    
16503661 gcgccgtactctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgcaattgctcaacaga 16503562  T
296 tgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaa 330  Q
    || ||||||||| || || |||||| || ||||||    
16503561 tgaaacaacagctgccggttcaacaacaacaacaa 16503527  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 96 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 16518797 - 16518563
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || |||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  | |||||| |||| |  ||     
16518797 gaaagaaacggaagtagggatggtgtctgccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctattaatgctgcccaaatgcctccgtcatacccatat 16518698  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
      ||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |    
16518697 gcgccgtactctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgcaattgctcaacaga 16518598  T
296 tgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaa 330  Q
    || ||||||||| || || |||||| || ||||||    
16518597 tgaaacaacagctgccggttcaacaacaacaacaa 16518563  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 96 - 363
Target Start/End: Original strand, 5127754 - 5128027
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || |||||||||||||| |  || ||| || |||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
5127754 gaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 5127853  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
     |||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |  || || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |    
5127854 gtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtatcctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacaga 5127953  T
296 tgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaa------caaaccagacctacctttcctccgataccgatg 363  Q
    || ||||||||  || || |||||| || ||||||      ||| | |||||||| ||||||||||||||||||    
5127954 tgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctccgataccgatg 5128027  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 96 - 333
Target Start/End: Original strand, 3445056 - 3445293
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  |||    
3445056 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatac 3445155  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  |||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||| || |  ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
3445156 atgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccgccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 3445255  T
296 tgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaacaa 333  Q
    || ||||||||  || || |||||| || |||||||||    
3445256 tgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaa 3445293  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 163 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 31088775 - 31088576
Alignment:
163 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaac 262  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    ||  | |||||||    
31088775 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 31088676  T
263 ctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagccgctggctcaaca---gcagcaacaacaaaccagacctacctttcctccgatacc 359  Q
    ||||||||||||| |||||| | |  |||| ||||||||||||||| |  ||||||||    ||||| |||||  | |||||||||||||||| ||||||    
31088675 ctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgatacc 31088576  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 163 - 359
Target Start/End: Original strand, 45733292 - 45733491
Alignment:
163 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaac 262  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    ||  | |||||||    
45733292 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 45733391  T
263 ctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagccgctggctcaaca---gcagcaacaacaaaccagacctacctttcctccgatacc 359  Q
    ||||||||||||| |||||| | |  |||| ||||||||||||||| |  ||||||||    ||||| |||||  | |||||||||||||||| ||||||    
45733392 ctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgatacc 45733491  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 5147721 - 5147511
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||||||||||||  |||| || || ||||| |||||  | |||||| ||||||  ||     
5147721 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccattgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatatccatat 5147622  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || |  || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |    
5147621 atgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacaga 5147522  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
5147521 tgaaacaacag 5147511  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Original strand, 45387105 - 45387315
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||  || ||| || ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
45387105 gaaagaaactgaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 45387204  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |  || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
45387205 atgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 45387304  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
45387305 tgaaacaacag 45387315  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 333
Target Start/End: Original strand, 11441322 - 11441559
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  |||    
11441322 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatac 11441421  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |  || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
11441422 atgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 11441521  T
296 tgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaacaa 333  Q
    || ||||||||  || || |||||| || |||||||||    
11441522 tgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaa 11441559  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 330
Target Start/End: Original strand, 2154335 - 2154569
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || |||||||||||||| |  || ||| || |||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  | |||||| |||| |  ||     
2154335 gaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatat 2154434  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
     |||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |  || || ||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||| || |    
2154435 gtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtatccgttaatgcaattgctcaacaga 2154534  T
296 tgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaa 330  Q
    |  ||||||||  ||||| |||||| || ||||||    
2154535 taaaacaacagttgctggttcaacaacaacaacaa 2154569  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Original strand, 26435019 - 26435229
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || |||| |||||||| |||||||| || || | ||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
26435019 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagcaggagccggtcagtccatggccactgttgctcctatcagtgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 26435118  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || |  || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |    
26435119 atgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacaga 26435218  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
26435219 tgaaacaacag 26435229  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 4145504 - 4145310
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||  || ||| || ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
4145504 gaaagaaactgaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 4145405  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 290  Q
    ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    || || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||    
4145404 atgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctca 4145310  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Original strand, 9618413 - 9618623
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||  || ||| || ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
9618413 gaaagaaactgaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 9618512  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
9618513 atgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 9618612  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
9618613 tgaaacaacag 9618623  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 11425157 - 11424947
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || |||||||||||||| |  || ||| || |||||||||||||||||||||| || || ||||  || ||  | |||||| |||| |  ||     
11425157 gaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgtagcccaaatgcctccgtcatacccatat 11425058  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| || |  || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |    
11425057 atgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacaga 11424958  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
11424957 tgaaacaacag 11424947  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 16736841 - 16736631
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||  || ||| || |||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||  |  ||||| |||| |  ||     
16736841 gaaagaaactgaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgtctccgtcatacccatat 16736742  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || || || |  || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
16736741 atgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 16736642  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
16736641 tgaaacaacag 16736631  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 16751895 - 16751685
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||  || ||| || |||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||  |  ||||| |||| |  ||     
16751895 gaaagaaactgaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgtctccgtcatacccatat 16751796  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || || || |  || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
16751795 atgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 16751696  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
16751695 tgaaacaacag 16751685  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Original strand, 17523294 - 17523504
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||  || ||| || |||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||  |  ||||| |||| |  ||     
17523294 gaaagaaactgaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgtctccgtcatacccatat 17523393  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || || || |  || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
17523394 atgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 17523493  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
17523494 tgaaacaacag 17523504  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 17529921 - 17529711
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||  || ||| || |||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||  |  ||||| |||| |  ||     
17529921 gaaagaaactgaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgtctccgtcatacccatat 17529822  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || || || |  || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
17529821 atgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 17529722  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
17529721 tgaaacaacag 17529711  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 26320250 - 26320016
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
26320250 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 26320151  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
26320150 atgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 26320051  T
296 tgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaa 330  Q
    || |||||||| ||| || |||||| || ||||||    
26320050 tgaaacaacagacgccggttcaacaacaacaacaa 26320016  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 10917246 - 10917036
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || |||||||||||||| |  || ||| || |||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  | ||| || |||| |  ||     
10917246 gaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgccttcgtcatacccatat 10917147  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
     |||  || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||| |  || || ||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |    
10917146 gtgccgtattctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtatcctctgccaccgggtcaacctcaagtacctgttaatgcaatcgctcaacaga 10917047  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
10917046 tgaaacaacag 10917036  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 24592922 - 24592712
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
24592922 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 24592823  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
24592822 atgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 24592723  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
24592722 tgaaacaacag 24592712  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26275475 - 26275265
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
26275475 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 26275376  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
26275375 atgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 26275276  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
26275275 tgaaacaacag 26275265  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26486125 - 26485915
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| || ||||| ||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
26486125 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatagctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 26486026  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  |||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||| || |  || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
26486025 atgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 26485926  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
26485925 tgaaacaacag 26485915  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26538148 - 26538044
Alignment:
202 tactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaac 301  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||| || |  || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||| |||    
26538148 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaac 26538049  T
302 aacag 306  Q
    |||||    
26538048 aacag 26538044  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 242
Target Start/End: Original strand, 31124673 - 31124819
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || |||||||||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
31124673 gaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 31124772  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagta 242  Q
    ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||    
31124773 atgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagta 31124819  T

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Target: chr5 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 42)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 82 - 359
Target Start/End: Original strand, 23891962 - 23892245
Alignment:
82 ggacatcatcagacgaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctc 181  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  | ||||    
23891962 ggacatcataagaagaaagaaacagaagtagggatggtatctgccggagccgatcaatccatggctactgttgctcctattaatgctgcccaaatgcctc 23892061  T
182 cgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgc 281  Q
    || | || |  ||   ||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||    ||  | ||||||||||||||||||||||||||    
23892062 cgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccaacattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtcaatgc 23892161  T
282 cattgctcagcaaatgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaa------caacaaaccagacctacctttcctccgatacc 359  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||| | || |||||| || |||      |||||| | |||||||||||||||||||||||    
23892162 catcgttcagcaaatgcaacaacagccaccggttcaacaacaacaacaacatcaacaagctagacctacctttcctccgatacc 23892245  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 82 - 359
Target Start/End: Original strand, 25198788 - 25199068
Alignment:
82 ggacatcatcagacgaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctc 181  Q
    ||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||  | ||||    
25198788 ggacatcataagaagaaggaaacagaagtagggatggtatccgccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctattaatgcttcccaattgcctc 25198887  T
182 cgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgc 281  Q
    || | || |  ||   ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    ||  | |||||||||||||||| ||| || ||    
25198888 cgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtactcgttaacgc 25198987  T
282 cattgctcagcaaatgcaacaacagccgctggct---caacagcagcaacaacaaaccagacctacctttcctccgatacc 359  Q
    | | | ||||||||||||||||||||| |  | |   ||||| ||||| |||||| | |||||||||||| ||||||||||    
25198988 cgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctaccttttctccgatacc 25199068  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 140 - 359
Target Start/End: Original strand, 22888287 - 22888509
Alignment:
140 ccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcacca 239  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| | || |  ||   || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
22888287 ccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatca 22888386  T
240 gtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagccgctggct---caacagcagcaacaacaaacc 336  Q
    ||||||    ||  | ||||||||||||||| |||| |||||| | | ||||||||||||||||||||| |  | |   ||||| ||||| |||||| |     
22888387 gtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtaaccgttaatgccgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagct 22888486  T
337 agacctacctttcctccgatacc 359  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
22888487 agacctaccttccctccgatacc 22888509  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 205 - 363
Target Start/End: Original strand, 24969903 - 24970061
Alignment:
205 tctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaac 304  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||    || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||||||    
24969903 tctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaac 24970002  T
305 agccgctggctcaacagcagcaacaacaaaccagacctacctttcctccgataccgatg 363  Q
    ||| || || |||||| || || |||||| | |||||||| || |||||||||||||||    
24970003 agctgccggttcaacaacaacatcaacaagctagacctactttccctccgataccgatg 24970061  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 163 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 13184970 - 13184771
Alignment:
163 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaac 262  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    ||  | |||||||    
13184970 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 13184871  T
263 ctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagccgctggctcaaca---gcagcaacaacaaaccagacctacctttcctccgatacc 359  Q
    ||||||||||||| |||||| | |  |||| ||||||||||||||| |  ||||||||    ||||| |||||  | |||||||||||||||| ||||||    
13184870 ctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgatacc 13184771  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 163 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 13440816 - 13440617
Alignment:
163 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaac 262  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    ||  | |||||||    
13440816 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 13440717  T
263 ctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagccgctggctcaaca---gcagcaacaacaaaccagacctacctttcctccgatacc 359  Q
    ||||||||||||| |||||| | |  |||| ||||||||||||||| |  ||||||||    ||||| |||||  | |||||||||||||||| ||||||    
13440716 ctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgatacc 13440617  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 163 - 359
Target Start/End: Original strand, 33877087 - 33877286
Alignment:
163 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaac 262  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    ||  | |||||||    
33877087 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 33877186  T
263 ctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagccgctggctcaaca---gcagcaacaacaaaccagacctacctttcctccgatacc 359  Q
    ||||||||||||| |||||| | |  |||| ||||||||||||||| |  ||||||||    ||||| |||||  | |||||||||||||||| ||||||    
33877187 ctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgatacc 33877286  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Original strand, 30168239 - 30168449
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
30168239 gaaagaaactgaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatccatggctactattgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 30168338  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
30168339 atgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 30168438  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
30168439 tgaaacaacag 30168449  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 163 - 359
Target Start/End: Original strand, 11325634 - 11325833
Alignment:
163 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaac 262  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    ||    || ||||    
11325634 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccattgggacaac 11325733  T
263 ctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagccgctggctcaaca---gcagcaacaacaaaccagacctacctttcctccgatacc 359  Q
    ||||||||||||| |||||| | | ||||| ||||||||||||||| |  ||||||||    ||||| |||||  | |||||||||||||||| ||||||    
11325734 ctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgatacc 11325833  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 18501140 - 18500903
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||||||||| || || |||||  ||||  | |||||| |||| |  |||    
18501140 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatacccatac 18501041  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |  || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
18501040 atgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 18500941  T
296 tgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaacaa 333  Q
    || ||||||||  || || |||||| || |||||||||    
18500940 tgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaa 18500903  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 333
Target Start/End: Original strand, 31431198 - 31431435
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||  || ||| || |||||||  ||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
31431198 gaaagaaacggaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatctgtggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 31431297  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || |  || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |    
31431298 atgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacaga 31431397  T
296 tgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaacaa 333  Q
    || ||||||||  || || |||||| || |||||||||    
31431398 tgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaa 31431435  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 8665867 - 8665657
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||  || ||| || ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | ||||||||||| |  ||     
8665867 gaaagaaactgaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgccatacccatat 8665768  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |   | || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
8665767 atgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgtcaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacaga 8665668  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
8665667 tgaaacaacag 8665657  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 24688549 - 24688339
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || |||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  | |||||| |||| |  ||     
24688549 gaaagaaacggaagtagggatggtgtctgccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatat 24688450  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
      ||  || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |  || || ||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| || |    
24688449 gcgccgtattctcaacatcctttctttccgccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatacaattgctcaacaga 24688350  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
24688349 tgaaacaacag 24688339  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Original strand, 11549124 - 11549334
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || |||||||||||||| |  || ||| || |||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  | |||||| |||| |  ||     
11549124 gaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatat 11549223  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
     |||  || || |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| || |  || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |    
11549224 gtgccgtattcacagcatcctttctttccaccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacaga 11549323  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
11549324 tgaaacaacag 11549334  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 18375804 - 18375658
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||  || ||| || ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
18375804 gaaagaaacggaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 18375705  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagta 242  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||    
18375704 atgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagta 18375658  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22999506 - 22999296
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||| |||||||||| |  || ||| || |||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  | |||||| |||| |  ||     
22999506 gaaagaaacggaaatagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatat 22999407  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
     |||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |  ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |    
22999406 gtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccgccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacaga 22999307  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
22999306 tgaaacaacag 22999296  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23718380 - 23718170
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || |||||||||||||| |  || ||| || |||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  | |||||| |||| |  ||     
23718380 gaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatat 23718281  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
     |||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |  || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |    
23718280 gtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacaga 23718181  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
23718180 tgaaacaacag 23718170  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23752842 - 23752632
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || |||||||||||||| |  || ||| || |||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  | |||||| |||| |  ||     
23752842 gaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatat 23752743  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
     |||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |  || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |    
23752742 gtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacaga 23752643  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
23752642 tgaaacaacag 23752632  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Original strand, 30151788 - 30151998
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||  || ||| || ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
30151788 gaaagaaacggaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 30151887  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
30151888 atgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacaga 30151987  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
30151988 tgaaacaacag 30151998  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Original strand, 33777257 - 33777467
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || |||||||||||||| |  || ||| |  |||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
33777257 gaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagctggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 33777356  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
     |||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |  || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |    
33777357 gtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacaga 33777456  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
33777457 tgaaacaacag 33777467  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 96 - 333
Target Start/End: Original strand, 37754738 - 37754975
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| ||||||  ||     
37754738 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatatccatat 37754837  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
37754838 atgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 37754937  T
296 tgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaacaa 333  Q
    || ||||||||  || || |||||| || |||||||||    
37754938 tgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaa 37754975  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 96 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 37771391 - 37771154
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||  || ||| || ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| | ||||  ||     
37771391 gaaagaaacggaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcgtatccatat 37771292  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
37771291 atgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 37771192  T
296 tgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaacaa 333  Q
    || ||||||||  || || |||||| || |||||||||    
37771191 tgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaa 37771154  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 142 - 306
Target Start/End: Original strand, 43078065 - 43078229
Alignment:
142 atggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagt 241  Q
    |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| | || |  |||||||  || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||    
43078065 atggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcgtacccatacatgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagt 43078164  T
242 atccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacag 306  Q
    | || |  || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||| ||||||||    
43078165 accctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacag 43078229  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 9548935 - 9548725
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||||||||| |||||||| || || ||| | || ||  | |||||| |||| |  ||     
9548935 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggccactgttgctcctatcaatacagcccaaatgcctccgtcatacccatat 9548836  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||||||||| || ||||| || || ||||| || |  || || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |    
9548835 atgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgctcaacaga 9548736  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
9548735 tgaaacaacag 9548725  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 330
Target Start/End: Original strand, 12131925 - 12132159
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
12131925 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 12132024  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
12132025 atgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 12132124  T
296 tgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaa 330  Q
    || |||||||| ||| || |||||| || ||||||    
12132125 tgaaacaacagacgccggttcaacaacaacaacaa 12132159  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 242
Target Start/End: Original strand, 24681207 - 24681353
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || |||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
24681207 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 24681306  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagta 242  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
24681307 atgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagta 24681353  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 242
Target Start/End: Original strand, 24723734 - 24723880
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || |||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
24723734 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 24723833  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagta 242  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
24723834 atgccgtattctcagcatcctttcttcccgccattttatcatcagta 24723880  T

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Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 170
Target Start/End: Original strand, 24951880 - 24951954
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgc 170  Q
    |||||| || |||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||| || || ||||||||    
24951880 gaaagaaacggaagtagggatggtgtctgccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgctgc 24951954  T

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Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 242
Target Start/End: Original strand, 33516126 - 33516272
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
33516126 gaaagaaactgaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcggctcaaatgcctccgtcatacccatat 33516225  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagta 242  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||    
33516226 atgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagta 33516272  T

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Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 40473944 - 40473734
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||  | |||||| |||| |   ||    
40473944 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgcccctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccacac 40473845  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  |||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||| || |  ||||| || || ||||| || |||||||| || ||||| || || |    
40473844 atgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaacgcaattgcccaacaga 40473745  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
40473744 tgaaacaacag 40473734  T

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Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 333
Target Start/End: Original strand, 3789296 - 3789533
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
3789296 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 3789395  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    || || || || |||||||| ||||||||||| ||||| || || |    
3789396 atgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaggtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 3789495  T
296 tgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaacaa 333  Q
    || ||||||||  || || |||||| || |||||||||    
3789496 tgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaa 3789533  T

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Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 31826811 - 31826574
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
31826811 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 31826712  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
31826711 atgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 31826612  T
296 tgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaacaa 333  Q
    || ||||||||  || || |||||| || |||||||||    
31826611 tgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaa 31826574  T

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Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Original strand, 5637680 - 5637890
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
5637680 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 5637779  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
5637780 atgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 5637879  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
5637880 tgaaacaacag 5637890  T

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Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Original strand, 9317221 - 9317431
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
9317221 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 9317320  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
9317321 atgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 9317420  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
9317421 tgaaacaacag 9317431  T

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Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15659152 - 15658942
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||||||||| || || |||||  ||||  | |||||| ||||||  ||     
15659152 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcaactcaaatgcctccgtcatatccatat 15659053  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
     |||  || ||||||||||||||||| || || || || || ||||| || |  || || ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |    
15659052 gtgccgtattctcagcatcctttctttccgccgttttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacaga 15658953  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
15658952 tgaaacaacag 15658942  T

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Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Original strand, 26480162 - 26480372
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
26480162 gaaagaaactgaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 26480261  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
26480262 atgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 26480361  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
26480362 tgaaacaacag 26480372  T

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Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Original strand, 30934406 - 30934616
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || |||||||||||||| | | ||||| || | ||||||||| |||||||||| || || ||||| || ||  | |||||| |||| |  ||     
30934406 gaaagaaacggaagtagggatggtgtctaccggagccggccaatccatgactactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatat 30934505  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
     |||  || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || |  || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |    
30934506 gtgccgtattctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacaga 30934605  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
30934606 tgaaacaacag 30934616  T

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Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 37671884 - 37671647
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  |||||| || ||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
37671884 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagccggagccggtcaatctatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 37671785  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    || || || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
37671784 atgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 37671685  T
296 tgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaacaa 333  Q
    || ||||||||  || || |||||| || |||||||||    
37671684 tgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaa 37671647  T

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Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15759211 - 15759039
Alignment:
134 gtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattcta 233  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||    
15759211 gtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgtttta 15759112  T
234 tcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacag 306  Q
    ||| ||||| ||    ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || ||| ||||||||    
15759111 tcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacaacag 15759039  T

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Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 29967418 - 29967248
Alignment:
136 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatc 235  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||    
29967418 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 29967319  T
236 accagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacag 306  Q
    | ||||| ||    ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || ||| ||||||||    
29967318 atcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacag 29967248  T

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Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 306
Target Start/End: Original strand, 30029225 - 30029395
Alignment:
136 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatc 235  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||    
30029225 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 30029324  T
236 accagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacag 306  Q
    | ||||| ||    ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || ||| ||||||||    
30029325 atcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacag 30029395  T

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Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 206 - 306
Target Start/End: Original strand, 41674589 - 41674689
Alignment:
206 ctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaaca 305  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || || ||||| || |  || || |||| |||||| |||||||||||||| ||||| || || ||| |||||||    
41674589 ctcagcatcctttctttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtccacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaaca 41674688  T
306 g 306  Q
    |    
41674689 g 41674689  T

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Target: scaffold0124 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 85 - 307
Target Start/End: Original strand, 20162 - 20384
Alignment:
85 catcatcagacgaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgc 184  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||     
20162 catcataagaagaaagaaacagaagtagggatggtatctgccggagccggtcaatccatggctactgttgcccctattaatgctgcccagttacctccgt 20261  T
185 catatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccat 284  Q
    | || |  ||   || ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||    ||  | |||||||||||||||||||| |||||| |    
20262 cgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccatcattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgt 20361  T
285 tgctcagcaaatgcaacaacagc 307  Q
     | ||||||||||||||||||||    
20362 cgttcagcaaatgcaacaacagc 20384  T

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Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Original strand, 30214 - 30424
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||| |||||||||| |  || ||| || |||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  | |||||| |||| |  ||     
30214 gaaagaaacggaaatagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatat 30313  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
      ||  || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || |  || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |    
30314 gcgccgtattctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacaga 30413  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
30414 tgaaacaacag 30424  T

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Target: chr6 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 27)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 85 - 363
Target Start/End: Original strand, 20160454 - 20160732
Alignment:
85 catcatcagacgaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgc 184  Q
    |||||| ||| ||| || |||||||||||||||| || ||| |   || |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||||||| |    
20160454 catcataagaagaaggaaacagaagtagggatggaatttgctg---ccggtcaatccatggctactgttgcccctgttaatgctactcaattacctccac 20160550  T
185 catatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccat 284  Q
    |||| | ||     || |||||||| ||||||||||  |||||||| || || |||||||| | ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
20160551 catacctgtttgcacattactctcaacatcctttctatccaccattttaccatcagtatcctctaccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgccat 20160650  T
285 tgctcagcaaatgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaa---caacaaaccagacctacctttcctccgataccgatg 363  Q
    |||||||||||  || |||||||| |  |||||||| || |||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
20160651 tgctcagcaaaaacagcaacagccaccagctcaacaacaacaacagcaacaaactagacctacctttcctccgataccgatg 20160732  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 85 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 22172377 - 22172099
Alignment:
85 catcatcagacgaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgc 184  Q
    |||||| ||| ||| || |||||||||||||||| || ||| |   || |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||||||| |    
22172377 catcataagaagaaggaaacagaagtagggatggaatttgctg---ccggtcaatccatggctactgttgcccctgttaatgctactcaattacctccac 22172281  T
185 catatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccat 284  Q
    |||| | ||     || |||||||| ||||||||||  |||||||| || || |||||||| | ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
22172280 catacctgtttgcacattactctcaacatcctttctatccaccattttaccatcagtatcctctaccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgccat 22172181  T
285 tgctcagcaaatgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaa---caacaaaccagacctacctttcctccgataccgatg 363  Q
    |||||||||||  || |||||||| |  |||||||| || |||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
22172180 tgctcagcaaaaacagcaacagccaccagctcaacaacaacaacagcaacaaactagacctacctttcctccgataccgatg 22172099  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 123 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22477684 - 22477501
Alignment:
123 tgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttc 222  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| | | || | |||   ||| |||||||||||||| |||||     
22477684 tgccggaactagtcaatccatggctactgttgccccaattaatgctgcccaattacctctgtcgtacccgtatgcgcagtactctcagcatcccttcttt 22477585  T
223 ccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacag 306  Q
    ||||||||||||||  |||||||    ||  | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
22477584 ccaccattctatcattagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgcaattgctcaacaaatgcaacaacag 22477501  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 163 - 359
Target Start/End: Original strand, 28162485 - 28162684
Alignment:
163 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaac 262  Q
    ||||||||||||||||||||  | || | |||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    ||  | || ||||    
28162485 aatgctgctcagctacctccatcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggacaac 28162584  T
263 ctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagccgctggctcaaca---gcagcaacaacaaaccagacctacctttcctccgatacc 359  Q
    ||||||||||||| |||||| | | ||||| ||||||||||||||| |  ||||||||    ||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||    
28162585 ctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgatacc 28162684  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 163 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 13522441 - 13522242
Alignment:
163 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaac 262  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    ||  | |||||||    
13522441 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 13522342  T
263 ctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagccgctggctcaaca---gcagcaacaacaaaccagacctacctttcctccgatacc 359  Q
    ||||||||||||| |||||| | |  |||| ||||||||||||||| |  ||||||||    ||||| |||||  | |||||||||||||||| ||||||    
13522341 ctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgatacc 13522242  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 163 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 33374624 - 33374425
Alignment:
163 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaac 262  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    ||  | |||||||    
33374624 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 33374525  T
263 ctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagccgctggctcaaca---gcagcaacaacaaaccagacctacctttcctccgatacc 359  Q
    ||||||||||||| |||||| | |  |||| ||||||||||||||| |  ||||||||    ||||| |||||  | |||||||||||||||| ||||||    
33374524 ctcaggtacccgttaatgccgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgatacc 33374425  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 290
Target Start/End: Original strand, 26918138 - 26918332
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || |||||||||||||| |  || ||| || |||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
26918138 gaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 26918237  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 290  Q
     |||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |  || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
26918238 gtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgctca 26918332  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 333
Target Start/End: Original strand, 3695821 - 3696058
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  |||    
3695821 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatac 3695920  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| || |  || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
3695921 atgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttatcatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 3696020  T
296 tgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaacaa 333  Q
    || ||||||||  || || |||||| || |||||||||    
3696021 tgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaa 3696058  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 163 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 8892678 - 8892479
Alignment:
163 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaac 262  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |    ||  | |||||||    
8892678 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattatatcatcagtattctttgccatcgggtcaac 8892579  T
263 ctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagccgctggctcaaca---gcagcaacaacaaaccagacctacctttcctccgatacc 359  Q
    ||||||||||||| |||||| | | ||||| ||||||||||||||| |  ||||||||    ||||| |||||  | |||||||||||||||| ||||||    
8892578 ctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgatacc 8892479  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 163 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 8903913 - 8903714
Alignment:
163 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaac 262  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||   |||   |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||| |    ||  | |||||||    
8903913 aatgctgctcagctacctccgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatctcttctttccaccattctatcatcagtattctttgccatcgggtcaac 8903814  T
263 ctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagccgctggctcaaca---gcagcaacaacaaaccagacctacctttcctccgatacc 359  Q
    ||||||||||||| |||||| | | ||||| ||||||||||||||| |  ||||||||    ||||| |||||  | |||||||||||||||| ||||||    
8903813 ctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgatacc 8903714  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Original strand, 26999831 - 27000041
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || |||||||||||||| |  || ||| || |||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  | |||||| |||| |  ||     
26999831 gaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatat 26999930  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
     |||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |  || || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |    
26999931 gtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacaga 27000030  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
27000031 tgaaacaacag 27000041  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 34463799 - 34463562
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| ||| |||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  |||    
34463799 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatgactactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatac 34463700  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| || |  || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
34463699 atgccgtattctcagcatcctttcttcccaccgttttaccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 34463600  T
296 tgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaacaa 333  Q
    || ||||||||  || || |||||| || |||||||||    
34463599 tgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaa 34463562  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 22935206 - 22935045
Alignment:
205 tctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaac 304  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||    || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||    
22935206 tctcaacatcccttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaac 22935107  T
305 agccgctggctcaacagcagcaa---caacaaaccagacctacctttcctccgataccgatg 363  Q
    ||  || || |||||| || |||   || ||| | |||||||| || |||||||||||||||    
22935106 agttgccggttcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatg 22935045  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 205 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 23857651 - 23857490
Alignment:
205 tctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaac 304  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||    || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||    
23857651 tctcaacatcccttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaac 23857552  T
305 agccgctggctcaacagcagcaa---caacaaaccagacctacctttcctccgataccgatg 363  Q
    ||  || || |||||| || |||   || ||| | |||||||| || |||||||||||||||    
23857551 agttgccggttcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatg 23857490  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 290
Target Start/End: Original strand, 4525047 - 4525241
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
4525047 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatctatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 4525146  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 290  Q
    ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||    || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||    
4525147 atgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtatcctttgccaccaggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctca 4525241  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13299389 - 13299179
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || |||||||||||||| | ||||||| |  |||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  | |||||| |||| |  ||     
13299389 gaaagaaacggaagtagggatggtgtctgccggagctggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatat 13299290  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
      ||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |  || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |    
13299289 gcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacaga 13299190  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
13299189 tgaaacaacag 13299179  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Original strand, 24863475 - 24863685
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || |||||||||||||| |  |||||| || |||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  | |||||| | || |  ||     
24863475 gaaagaaacggaagtagggatggtgtcagccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcctacccatat 24863574  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
      ||  || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || | ||| ||  ||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || |    
24863575 gcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtaccctctaccaccgagtcaaccccaagtacccgttaatgcaattgctcaacaga 24863674  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
24863675 tgaaacaacag 24863685  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Original strand, 26988759 - 26988969
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || |||||||||||||| |  || ||| || |||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  | |||||| |||| |  ||     
26988759 gaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatat 26988858  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
     |||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |  || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |    
26988859 gtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacaga 26988958  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
26988959 tgaaacaacag 26988969  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 333
Target Start/End: Original strand, 16673923 - 16674122
Alignment:
134 gtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattcta 233  Q
    ||||||| || ||||| ||||| || || ||||| |||||  | |||||| ||||||  || ||||  |||||||||||||| ||||||||||| || ||    
16673923 gtcaatcaatagctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatatccatatatgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgtttta 16674022  T
234 tcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaacaa 333  Q
     || ||||| || |  || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||| ||||||||  || || |||||| || |||||||||    
16674023 ccatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaa 16674122  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15424755 - 15424545
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || |||||||||||||| |  || ||| || |||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  | |||||| |||| |  ||     
15424755 gaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatat 15424656  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
      ||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |  || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |    
15424655 gcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacaga 15424556  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
15424555 tgaaacaacag 15424545  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Original strand, 16749612 - 16749822
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || |||||||||||||| |  || ||| || |||||||||||||||||||||| || || || || |||||  |  ||||| |||| |  ||     
16749612 gaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaacgcagctcaaatgtctccgtcatacccatat 16749711  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
     |||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |  || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |    
16749712 gtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacaga 16749811  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
16749812 tgaaacaacag 16749822  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 24305056 - 24304846
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || |||||||||||||| |  || ||| || ||||||||||||||||||| || || || |||||||| ||  | |||||| |||| |  ||     
24305056 gaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgtcgctcctatcaatgctgcccaaatgcctccgtcatacccatat 24304957  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
     |||  || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| || |  || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |    
24304956 gtgccgtattctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacaga 24304857  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
24304856 tgaaacaacag 24304846  T

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Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 30558454 - 30558308
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
30558454 gaaagaaactgaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctaccgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 30558355  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagta 242  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||    
30558354 atgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagta 30558308  T

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Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 333
Target Start/End: Original strand, 27484875 - 27485112
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
27484875 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctaccgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 27484974  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |    
27484975 atgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccagcaga 27485074  T
296 tgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaacaa 333  Q
    || ||||||||  || || |||||| || |||||||||    
27485075 tgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaa 27485112  T

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Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 16944425 - 16944231
Alignment:
136 caatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatc 235  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||    
16944425 caatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatc 16944326  T
236 accagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaa 330  Q
    | ||||| ||    ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || ||| ||||||||  || || ||||||||| ||||||    
16944325 atcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacagcaacaacaa 16944231  T

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Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Original strand, 29572771 - 29572981
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
29572771 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 29572870  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
29572871 atgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 29572970  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
29572971 tgaaacaacag 29572981  T

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Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 333
Target Start/End: Original strand, 27007470 - 27007707
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
27007470 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacctatat 27007569  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    || || || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
27007570 atgccgtattctcagcatccattcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 27007669  T
296 tgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaacaa 333  Q
    || ||||||||  || || |||||| || |||||||||    
27007670 tgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacaa 27007707  T

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Target: scaffold0260 (Bit Score: 74; Significance: 7e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 163 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 3083 - 2884
Alignment:
163 aatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaac 262  Q
    ||||||||||||||||||||| | || | ||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    ||  | |||||||    
3083 aatgctgctcagctacctccgtcgtacccgtacgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaac 2984  T
263 ctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacagccgctggct---caacagcagcaacaacaaaccagacctacctttcctccgatacc 359  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||| |  |||   ||||| ||||| || ||| | |||||||||||||||||||||||    
2983 ctcaggtacccgtcaatgccgtcgttcaacaaatgcaacaacagcctccagctcaacaacaacagcatcagcaagctagacctacctttcctccgatacc 2884  T

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Target: scaffold0089 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 332
Target Start/End: Original strand, 29524 - 29760
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || |||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||  | |||||  | || | |||     
29524 gaaagaaacggaagtagggatggtgtctgccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctattaatgctgcccaaatgcctccatcgtacccgtat 29623  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
      ||  || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||    || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |    
29624 gcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatagctcaacaga 29723  T
296 tgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaaca 332  Q
    || ||||||||  || || |||||| || ||||||||    
29724 tgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaca 29760  T

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Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 40564 - 40354
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || |||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  | |||||||| || |  ||     
40564 gaaagaaacggaagtagggatggtgtctgccggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgccgtacccatat 40465  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
      ||  || ||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| ||    || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |    
40464 gcgccgtattctcagcatcctttctttctgccattctatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaggtacccgtaaatgcaattgctcaacaga 40365  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
40364 tgaaacaacag 40354  T

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Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 205 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 47371 - 47270
Alignment:
205 tctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaac 304  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |  || || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||| ||||||    
47371 tctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaac 47272  T
305 ag 306  Q
    ||    
47271 ag 47270  T

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Target: scaffold0029 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 625 - 415
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || |||||||||||||| |   | ||| || |||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
625 gaaagaaacggaagtagggatggtgtcaactggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 526  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
     |||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || |  || || ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || |    
525 gtgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacaga 426  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
425 tgaaacaacag 415  T

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Target: scaffold0336 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 290
Target Start/End: Original strand, 7993 - 8187
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||  || ||| || |||||||  ||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
7993 gaaagaaacggaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatctgtggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 8092  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctca 290  Q
    ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||    || ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||    
8093 atgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtatcctttgccaccaggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctca 8187  T

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Target: scaffold0237 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 15425 - 15279
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| ||||||||||  || ||| || ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
15425 gaaagaaacggaagtggggatggtatcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcccatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 15326  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagta 242  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||    
15325 atgccatattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagta 15279  T

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Target: scaffold0143 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Original strand, 27053 - 27263
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || |||||||||||||| |  || ||| || |||||||||||||||||||||| || || ||||| || ||  | |||||| |||| |  ||     
27053 gaaagaaacggaagtagggatggtgtcagctggagccggtcaatccatggctactgttgctcctatcaatgcagcccaaatgcctccgtcatacccatat 27152  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
      ||  || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| || | ||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||| || |    
27153 gcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctaccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacaga 27252  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
27253 tgaaacaacag 27263  T

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Target: scaffold0350 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 96 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 7734 - 7500
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
7734 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 7635  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
7634 atgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 7535  T
296 tgcaacaacagccgctggctcaacagcagcaacaa 330  Q
    || |||||||| ||| || |||||| || ||||||    
7534 tgaaacaacagacgccggttcaacaacaacaacaa 7500  T

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Target: scaffold0496 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0496
Description:

Target: scaffold0496; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 134 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 190 - 18
Alignment:
134 gtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattcta 233  Q
    ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| ||||||  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||    
190 gtcaatcaatggctactgttgcacctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatatccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgtttta 91  T
234 tcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacag 306  Q
    ||| ||||| ||    ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || ||| ||||||||    
90 tcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacag 18  T

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Target: scaffold0144 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 26697 - 26506
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || ||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
26697 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagctggagccggtcaatcaatggctactgttgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 26598  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgc 287  Q
    ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||   ||||| || || ||||| || ||||||||||| |||||    
26597 atgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtacccgttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgc 26506  T

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Target: scaffold0159 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 9561 - 9351
Alignment:
96 gaaagagacagaagtagggatggtatatgccggaaccagtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtac 195  Q
    |||||| || ||||| |||||||| |  || ||| || |||||||||||||||| || || || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  ||     
9561 gaaagaaacggaagtggggatggtgtcagcgggagccggtcaatccatggctaccgtcgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatat 9462  T
196 atgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaa 295  Q
    ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || |    
9461 atgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacaga 9362  T
296 tgcaacaacag 306  Q
    || ||||||||    
9361 tgaaacaacag 9351  T

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Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 134 - 306
Target Start/End: Original strand, 19814 - 19986
Alignment:
134 gtcaatccatggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattcta 233  Q
    |||||||||||||||| || || || || ||||| |||||  | |||||| |||| |  || ||||  || ||||||||||| ||||||||||| || ||    
19814 gtcaatccatggctaccgtcgctcctatcaatgcagctcaaatgcctccgtcatacccatatatgccgtattctcagcatccgttcttcccaccgtttta 19913  T
234 tcaccagtatccgccaccgccaggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatgcaacaacag 306  Q
    ||| ||||| ||    ||||| || || ||||| || ||||||||||| ||||| || || ||| ||||||||    
19914 tcatcagtaccctttgccgccgggccagcctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacag 19986  T

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Target: scaffold0415 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 333
Target Start/End: Original strand, 5796 - 5989
Alignment:
142 atggctactgttgcccccattaatgctgctcagctacctccgccatatcagtacatgcaatactctcagcatcctttcttcccacc-attctatcaccag 240  Q
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