View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0796_low_44 (Length: 313)

Name: NF0796_low_44
Description: NF0796
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0796_low_44
NF0796_low_44
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (14-256)||(13211-13453)
[»] chr3 (96 HSPs)
chr3 (14-256)||(17487856-17488098)
chr3 (14-250)||(13442274-13442510)
chr3 (14-256)||(17499338-17499580)
chr3 (14-256)||(20698315-20698556)
chr3 (14-249)||(23083247-23083482)
chr3 (14-244)||(26686887-26687117)
chr3 (14-253)||(12399209-12399448)
chr3 (14-245)||(14972854-14973085)
chr3 (14-244)||(43840932-43841162)
chr3 (18-249)||(14576719-14576949)
chr3 (14-245)||(18438534-18438765)
chr3 (17-229)||(24153115-24153326)
chr3 (27-249)||(14572602-14572823)
chr3 (14-245)||(11424653-11424880)
chr3 (14-245)||(25476275-25476506)
chr3 (17-245)||(40213611-40213838)
chr3 (32-235)||(42386428-42386632)
chr3 (29-253)||(30029855-30030078)
chr3 (17-196)||(29172567-29172745)
chr3 (17-180)||(7781347-7781509)
chr3 (17-180)||(9707607-9707769)
chr3 (17-180)||(17463178-17463340)
chr3 (17-180)||(17672626-17672788)
chr3 (17-180)||(34159326-34159488)
chr3 (17-180)||(45606907-45607069)
chr3 (17-180)||(55476491-55476653)
chr3 (17-180)||(8899094-8899256)
chr3 (17-180)||(16454281-16454443)
chr3 (17-180)||(17446655-17446816)
chr3 (17-180)||(28848611-28848773)
chr3 (17-180)||(38961891-38962053)
chr3 (14-180)||(43550478-43550644)
chr3 (17-180)||(13151790-13151953)
chr3 (17-180)||(13154255-13154418)
chr3 (16-180)||(13544024-13544187)
chr3 (17-180)||(6469134-6469296)
chr3 (17-180)||(10247723-10247885)
chr3 (21-180)||(12567564-12567722)
chr3 (17-180)||(50242822-50242984)
chr3 (19-180)||(16282811-16282971)
chr3 (17-131)||(55500942-55501055)
chr3 (14-229)||(24340628-24340844)
chr3 (19-180)||(41123892-41124049)
chr3 (16-144)||(46822267-46822395)
chr3 (17-140)||(36166598-36166719)
chr3 (33-180)||(53070653-53070799)
chr3 (17-220)||(12119684-12119887)
chr3 (17-120)||(15412429-15412531)
chr3 (17-148)||(15977515-15977645)
chr3 (137-230)||(14179555-14179648)
chr3 (16-144)||(12511059-12511187)
chr3 (14-181)||(14234487-14234653)
chr3 (137-253)||(16796670-16796786)
chr3 (17-120)||(8499518-8499620)
chr3 (17-114)||(44494809-44494905)
chr3 (33-229)||(52523633-52523831)
chr3 (28-140)||(21618460-21618570)
chr3 (17-196)||(27165250-27165429)
chr3 (17-120)||(10556985-10557087)
chr3 (18-196)||(16097332-16097509)
chr3 (18-196)||(16103784-16103960)
chr3 (32-229)||(23274705-23274903)
chr3 (14-193)||(13210273-13210448)
chr3 (18-181)||(15470928-15471090)
chr3 (17-114)||(17737236-17737335)
chr3 (17-158)||(53301527-53301669)
chr3 (18-90)||(12174303-12174376)
chr3 (14-229)||(37642170-37642386)
chr3 (21-90)||(32307684-32307754)
chr3 (18-90)||(49668120-49668193)
chr3 (17-78)||(28194693-28194755)
chr3 (18-90)||(9512924-9512997)
chr3 (18-90)||(9520899-9520972)
chr3 (17-70)||(45577947-45578000)
chr3 (96-196)||(2051138-2051238)
chr3 (18-185)||(856140-856304)
chr3 (21-90)||(1644718-1644787)
chr3 (18-103)||(23408428-23408513)
chr3 (18-82)||(23077530-23077594)
chr3 (33-133)||(37251168-37251270)
chr3 (33-133)||(43925977-43926079)
chr3 (15-77)||(14665398-14665460)
chr3 (35-84)||(13919350-13919399)
chr3 (18-103)||(15878083-15878168)
chr3 (14-229)||(22147431-22147646)
chr3 (18-82)||(11298580-11298644)
chr3 (18-82)||(14878569-14878633)
chr3 (174-229)||(21618594-21618650)
chr3 (33-84)||(22110402-22110454)
chr3 (178-229)||(36166747-36166799)
chr3 (27-189)||(19725857-19726018)
chr3 (33-137)||(12377940-12378046)
chr3 (15-77)||(14668554-14668616)
chr3 (40-77)||(3389994-3390031)
chr3 (18-83)||(15060284-15060349)
chr3 (19-83)||(15051509-15051573)
[»] chr7 (79 HSPs)
chr7 (14-256)||(9509189-9509431)
chr7 (14-249)||(12698831-12699067)
chr7 (14-253)||(26211995-26212235)
chr7 (14-249)||(10589039-10589273)
chr7 (14-249)||(38227481-38227715)
chr7 (17-229)||(18456319-18456530)
chr7 (14-250)||(16386132-16386369)
chr7 (17-245)||(3564254-3564482)
chr7 (16-249)||(40443393-40443624)
chr7 (14-249)||(27847719-27847951)
chr7 (14-180)||(13647325-13647491)
chr7 (17-196)||(16213684-16213861)
chr7 (17-180)||(456321-456483)
chr7 (17-180)||(11972496-11972658)
chr7 (17-180)||(14949122-14949284)
chr7 (17-180)||(15376713-15376875)
chr7 (17-180)||(16232520-16232682)
chr7 (17-180)||(18640272-18640434)
chr7 (17-180)||(20385123-20385285)
chr7 (17-180)||(21189595-21189757)
chr7 (17-180)||(32125491-32125653)
chr7 (17-180)||(41522917-41523079)
chr7 (17-180)||(41525379-41525541)
chr7 (18-180)||(11393287-11393448)
chr7 (14-180)||(18430709-18430874)
chr7 (14-220)||(2280033-2280238)
chr7 (17-229)||(48273392-48273594)
chr7 (17-180)||(24702238-24702400)
chr7 (17-180)||(27216860-27217022)
chr7 (21-167)||(24275175-24275320)
chr7 (17-178)||(16410059-16410219)
chr7 (29-247)||(15143925-15144143)
chr7 (17-180)||(44116509-44116671)
chr7 (17-180)||(3386333-3386495)
chr7 (18-183)||(14932685-14932851)
chr7 (18-183)||(15356120-15356286)
chr7 (18-183)||(15360234-15360400)
chr7 (17-229)||(17061866-17062077)
chr7 (17-145)||(13869346-13869474)
chr7 (17-180)||(24704688-24704847)
chr7 (21-180)||(38898376-38898535)
chr7 (17-197)||(20110556-20110724)
chr7 (14-133)||(22072913-22073033)
chr7 (17-143)||(13831373-13831498)
chr7 (37-190)||(15211480-15211633)
chr7 (14-133)||(67745-67864)
chr7 (14-112)||(28505321-28505419)
chr7 (14-112)||(34200786-34200884)
chr7 (18-181)||(811086-811248)
chr7 (18-181)||(16219672-16219834)
chr7 (17-180)||(26355983-26356156)
chr7 (17-180)||(26358435-26358608)
chr7 (33-229)||(12756622-12756817)
chr7 (14-137)||(47831807-47831930)
chr7 (14-112)||(16495402-16495500)
chr7 (18-140)||(18005650-18005772)
chr7 (29-235)||(1867895-1868101)
chr7 (14-193)||(15754833-15755008)
chr7 (63-147)||(2530126-2530208)
chr7 (14-229)||(19486649-19486865)
chr7 (18-90)||(44014182-44014255)
chr7 (20-103)||(18154873-18154956)
chr7 (14-111)||(11996051-11996148)
chr7 (36-196)||(12255730-12255892)
chr7 (18-192)||(17138006-17138177)
chr7 (41-235)||(15008398-15008593)
chr7 (29-181)||(16056343-16056493)
chr7 (14-112)||(10063841-10063939)
chr7 (18-191)||(12187019-12187189)
chr7 (29-91)||(12901338-12901401)
chr7 (102-197)||(15113031-15113125)
chr7 (102-197)||(15116568-15116662)
chr7 (29-84)||(14044761-14044817)
chr7 (29-84)||(14354791-14354847)
chr7 (15-77)||(2832499-2832561)
chr7 (18-103)||(19649521-19649606)
chr7 (33-196)||(20220129-20220290)
chr7 (40-77)||(20569654-20569691)
chr7 (41-77)||(9446216-9446252)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (14-256)||(1851-2093)
[»] chr5 (75 HSPs)
chr5 (14-256)||(23390375-23390617)
chr5 (14-249)||(8286728-8286964)
chr5 (14-253)||(25421532-25421771)
chr5 (14-253)||(25431395-25431633)
chr5 (14-253)||(22075018-22075258)
chr5 (14-245)||(9077952-9078183)
chr5 (14-249)||(24493569-24493803)
chr5 (14-249)||(13025311-13025545)
chr5 (14-249)||(13095495-13095729)
chr5 (17-243)||(24529223-24529449)
chr5 (14-245)||(1096467-1096698)
chr5 (14-181)||(21808343-21808510)
chr5 (14-249)||(21292856-21293090)
chr5 (14-181)||(21729018-21729185)
chr5 (28-229)||(18418594-18418793)
chr5 (14-120)||(21997549-21997655)
chr5 (17-229)||(22412187-22412388)
chr5 (17-180)||(264768-264930)
chr5 (17-180)||(39363384-39363546)
chr5 (17-179)||(10732941-10733102)
chr5 (17-180)||(20909012-20909174)
chr5 (17-180)||(29329934-29330096)
chr5 (17-180)||(42245365-42245527)
chr5 (17-229)||(11581151-11581361)
chr5 (17-180)||(29345980-29346142)
chr5 (17-180)||(36154783-36154942)
chr5 (17-180)||(29348453-29348615)
chr5 (17-180)||(29350926-29351088)
chr5 (17-180)||(39245136-39245298)
chr5 (20-180)||(18319033-18319193)
chr5 (17-180)||(20902008-20902172)
chr5 (17-180)||(2154613-2154776)
chr5 (17-180)||(32027393-32027555)
chr5 (17-180)||(10775675-10775838)
chr5 (16-144)||(17517192-17517320)
chr5 (33-235)||(22144068-22144271)
chr5 (63-189)||(18356364-18356488)
chr5 (17-180)||(31061068-31061231)
chr5 (21-221)||(37723910-37724108)
chr5 (18-196)||(21565546-21565723)
chr5 (17-120)||(38619434-38619536)
chr5 (17-111)||(20918017-20918110)
chr5 (151-249)||(22107259-22107357)
chr5 (63-189)||(20910745-20910869)
chr5 (18-120)||(23064512-23064613)
chr5 (152-245)||(21986037-21986130)
chr5 (14-181)||(21329452-21329618)
chr5 (14-181)||(21502111-21502277)
chr5 (18-221)||(21873254-21873453)
chr5 (14-90)||(19660879-19660956)
chr5 (20-180)||(24067110-24067270)
chr5 (33-132)||(20026942-20027043)
chr5 (18-90)||(22959576-22959649)
chr5 (14-112)||(36314577-36314675)
chr5 (14-183)||(26011988-26012154)
chr5 (18-103)||(26704075-26704160)
chr5 (18-103)||(26973808-26973893)
chr5 (14-229)||(40725853-40726069)
chr5 (18-192)||(22032323-22032492)
chr5 (14-90)||(19668898-19668975)
chr5 (18-192)||(18769947-18770118)
chr5 (18-191)||(23572084-23572254)
chr5 (17-71)||(20806850-20806904)
chr5 (30-83)||(26732884-26732937)
chr5 (178-229)||(20766035-20766087)
chr5 (80-140)||(20766115-20766174)
chr5 (33-83)||(26740697-26740747)
chr5 (18-82)||(20805552-20805616)
chr5 (18-81)||(20766974-20767037)
chr5 (33-194)||(22178161-22178323)
chr5 (33-82)||(23469822-23469871)
chr5 (63-133)||(29448052-29448123)
chr5 (18-82)||(23512098-23512162)
chr5 (41-77)||(26680605-26680641)
chr5 (41-77)||(26952212-26952248)
[»] chr4 (73 HSPs)
chr4 (14-256)||(44052829-44053071)
chr4 (14-249)||(12902757-12902992)
chr4 (14-253)||(7088877-7089116)
chr4 (16-249)||(22636437-22636669)
chr4 (14-249)||(7893703-7893935)
chr4 (14-249)||(16239856-16240090)
chr4 (14-231)||(16270140-16270356)
chr4 (21-253)||(23374241-23374473)
chr4 (14-198)||(7798774-7798958)
chr4 (19-245)||(14038653-14038879)
chr4 (17-245)||(16377413-16377639)
chr4 (14-249)||(14053188-14053422)
chr4 (14-249)||(17046487-17046719)
chr4 (14-186)||(6899891-6900062)
chr4 (14-139)||(52873363-52873488)
chr4 (17-229)||(44928829-44929042)
chr4 (17-180)||(18215274-18215436)
chr4 (17-229)||(54798669-54798872)
chr4 (17-180)||(12307-12469)
chr4 (17-196)||(1837494-1837671)
chr4 (17-180)||(15118352-15118514)
chr4 (17-180)||(23803265-23803427)
chr4 (17-180)||(52312510-52312672)
chr4 (11-180)||(19242693-19242861)
chr4 (17-180)||(3515007-3515169)
chr4 (17-180)||(44615288-44615450)
chr4 (17-180)||(44773087-44773249)
chr4 (17-180)||(50222339-50222501)
chr4 (17-180)||(51463868-51464030)
chr4 (17-229)||(14280316-14280518)
chr4 (15-180)||(19618172-19618336)
chr4 (17-180)||(18239419-18239581)
chr4 (14-229)||(15367690-15367905)
chr4 (14-229)||(15402703-15402918)
chr4 (17-229)||(44102214-44102425)
chr4 (33-196)||(13790-13953)
chr4 (21-180)||(15355324-15355483)
chr4 (14-100)||(3096293-3096379)
chr4 (14-229)||(15371202-15371417)
chr4 (14-229)||(15373483-15373698)
chr4 (29-229)||(52243099-52243302)
chr4 (129-243)||(3096759-3096872)
chr4 (17-180)||(12610950-12611105)
chr4 (15-180)||(14970707-14970871)
chr4 (14-229)||(15370018-15370232)
chr4 (14-229)||(16223532-16223747)
chr4 (29-196)||(43198492-43198661)
chr4 (137-249)||(17047958-17048070)
chr4 (16-180)||(22353835-22353999)
chr4 (63-189)||(43256106-43256230)
chr4 (17-140)||(8574864-8574985)
chr4 (17-180)||(7641192-7641344)
chr4 (20-180)||(20149832-20149992)
chr4 (33-178)||(21815587-21815731)
chr4 (14-85)||(15551817-15551889)
chr4 (14-137)||(39706286-39706409)
chr4 (18-90)||(12774011-12774084)
chr4 (29-132)||(12288211-12288316)
chr4 (33-115)||(6190481-6190564)
chr4 (18-90)||(8846360-8846433)
chr4 (18-198)||(15093775-15093955)
chr4 (18-191)||(15121747-15121917)
chr4 (35-84)||(17333298-17333347)
chr4 (18-116)||(16348682-16348780)
chr4 (18-116)||(16356970-16357068)
chr4 (178-229)||(8574784-8574836)
chr4 (33-91)||(46640499-46640558)
chr4 (211-245)||(15091093-15091127)
chr4 (40-77)||(11250619-11250656)
chr4 (41-189)||(16488023-16488171)
chr4 (116-196)||(8846474-8846553)
chr4 (41-77)||(15353365-15353401)
chr4 (33-84)||(53082202-53082254)
[»] chr8 (74 HSPs)
chr8 (14-249)||(20536208-20536443)
chr8 (14-258)||(18818286-18818530)
chr8 (14-256)||(18879116-18879352)
chr8 (14-249)||(21918886-21919121)
chr8 (14-249)||(21923814-21924049)
chr8 (14-245)||(22626736-22626966)
chr8 (15-245)||(28648934-28649164)
chr8 (14-245)||(7372778-7373001)
chr8 (14-244)||(23406379-23406611)
chr8 (14-249)||(31971257-31971490)
chr8 (15-249)||(23648554-23648788)
chr8 (11-245)||(6759255-6759487)
chr8 (14-245)||(16092231-16092463)
chr8 (14-249)||(45130884-45131117)
chr8 (14-240)||(22875065-22875291)
chr8 (14-249)||(16199532-16199765)
chr8 (14-235)||(21389353-21389571)
chr8 (14-230)||(21395888-21396101)
chr8 (14-230)||(21790381-21790594)
chr8 (14-217)||(21778697-21778897)
chr8 (17-180)||(14409444-14409606)
chr8 (17-180)||(1484402-1484564)
chr8 (17-180)||(5853292-5853454)
chr8 (21-180)||(16413316-16413474)
chr8 (17-180)||(20403227-20403389)
chr8 (17-180)||(22001753-22001915)
chr8 (17-229)||(41598188-41598399)
chr8 (17-180)||(4483281-4483442)
chr8 (17-180)||(4542373-4542535)
chr8 (17-180)||(15203231-15203393)
chr8 (17-180)||(20046195-20046357)
chr8 (16-144)||(18678093-18678221)
chr8 (17-180)||(19896265-19896430)
chr8 (16-144)||(32121734-32121862)
chr8 (137-249)||(25363026-25363138)
chr8 (21-196)||(13508024-13508199)
chr8 (33-196)||(20498581-20498744)
chr8 (17-180)||(14823774-14823935)
chr8 (17-180)||(25484275-25484430)
chr8 (11-120)||(19937066-19937174)
chr8 (15-180)||(26223917-26224081)
chr8 (21-114)||(45290761-45290853)
chr8 (14-137)||(6520368-6520491)
chr8 (21-196)||(13597556-13597731)
chr8 (17-140)||(26219717-26219838)
chr8 (14-140)||(38855246-38855372)
chr8 (30-120)||(15070571-15070660)
chr8 (33-229)||(19801333-19801527)
chr8 (14-129)||(17140916-17141031)
chr8 (14-229)||(17612018-17612231)
chr8 (17-140)||(26225288-26225409)
chr8 (14-111)||(21490995-21491092)
chr8 (14-112)||(5866297-5866395)
chr8 (18-176)||(21285601-21285758)
chr8 (18-198)||(23776772-23776952)
chr8 (29-132)||(983407-983512)
chr8 (18-85)||(23760893-23760961)
chr8 (18-90)||(26355742-26355815)
chr8 (14-64)||(21249384-21249434)
chr8 (14-64)||(21255222-21255272)
chr8 (26-140)||(21673716-21673830)
chr8 (33-196)||(37116366-37116530)
chr8 (178-229)||(26222987-26223039)
chr8 (41-217)||(17439423-17439601)
chr8 (33-84)||(24353039-24353091)
chr8 (174-229)||(26219862-26219918)
chr8 (41-91)||(19154930-19154981)
chr8 (41-191)||(20465982-20466132)
chr8 (38-77)||(20533467-20533506)
chr8 (18-103)||(17353975-17354060)
chr8 (33-82)||(20502154-20502203)
chr8 (35-84)||(22525579-22525628)
chr8 (33-84)||(17267044-17267096)
chr8 (18-82)||(17926758-17926822)
[»] chr2 (68 HSPs)
chr2 (14-249)||(22731120-22731355)
chr2 (14-249)||(22738066-22738300)
chr2 (14-249)||(23285865-23286096)
chr2 (14-244)||(23060513-23060742)
chr2 (14-238)||(23076442-23076666)
chr2 (14-253)||(23654268-23654507)
chr2 (14-249)||(22337115-22337350)
chr2 (17-253)||(298696-298933)
chr2 (14-249)||(38002-38235)
chr2 (14-245)||(23660023-23660253)
chr2 (14-249)||(20309108-20309340)
chr2 (17-180)||(22105412-22105575)
chr2 (14-235)||(23708518-23708738)
chr2 (20-180)||(21155060-21155219)
chr2 (17-180)||(18808943-18809105)
chr2 (17-180)||(23130862-23131024)
chr2 (17-180)||(23133329-23133491)
chr2 (17-180)||(23709532-23709694)
chr2 (17-180)||(23712013-23712175)
chr2 (17-180)||(26505379-26505541)
chr2 (17-180)||(26507857-26508019)
chr2 (17-180)||(34402522-34402684)
chr2 (17-180)||(39682313-39682475)
chr2 (15-180)||(32214921-32215085)
chr2 (17-180)||(571397-571559)
chr2 (17-180)||(6725995-6726157)
chr2 (17-180)||(23135590-23135752)
chr2 (17-180)||(24367774-24367936)
chr2 (17-180)||(24898195-24898358)
chr2 (17-180)||(24900678-24900841)
chr2 (17-180)||(24903155-24903318)
chr2 (17-180)||(24905632-24905795)
chr2 (17-180)||(24908107-24908270)
chr2 (17-180)||(32039498-32039660)
chr2 (169-256)||(27753730-27753817)
chr2 (17-180)||(28577099-28577261)
chr2 (19-180)||(43137301-43137461)
chr2 (14-133)||(23103399-23103516)
chr2 (21-144)||(25616192-25616315)
chr2 (17-180)||(45029854-45030016)
chr2 (33-181)||(7687-7835)
chr2 (14-229)||(19671830-19672043)
chr2 (17-180)||(24529528-24529691)
chr2 (17-180)||(38967374-38967537)
chr2 (18-182)||(7679589-7679751)
chr2 (14-91)||(8946657-8946734)
chr2 (19-140)||(28405981-28406103)
chr2 (14-77)||(23040247-23040310)
chr2 (18-198)||(22799063-22799243)
chr2 (18-140)||(25175854-25175976)
chr2 (18-198)||(23019643-23019823)
chr2 (20-96)||(24643034-24643109)
chr2 (15-90)||(22134251-22134326)
chr2 (14-112)||(23071972-23072070)
chr2 (33-253)||(32451811-32452031)
chr2 (33-235)||(20520092-20520295)
chr2 (18-221)||(40622123-40622327)
chr2 (29-90)||(18786947-18787009)
chr2 (35-84)||(23287384-23287433)
chr2 (35-103)||(23038048-23038116)
chr2 (33-133)||(23207296-23207398)
chr2 (35-83)||(26392403-26392451)
chr2 (122-197)||(22459500-22459575)
chr2 (18-134)||(25963717-25963832)
chr2 (103-180)||(24642856-24642933)
chr2 (40-77)||(25961592-25961629)
chr2 (41-77)||(24655396-24655432)
chr2 (41-77)||(24869903-24869939)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (14-249)||(3470-3705)
scaffold0292 (14-245)||(343-573)
[»] chr6 (73 HSPs)
chr6 (14-249)||(20360846-20361081)
chr6 (14-256)||(20638162-20638404)
chr6 (14-246)||(22780116-22780348)
chr6 (14-253)||(17287678-17287917)
chr6 (14-245)||(29060540-29060771)
chr6 (15-258)||(18409704-18409947)
chr6 (14-245)||(25629245-25629476)
chr6 (14-241)||(19303435-19303661)
chr6 (14-245)||(20593773-20594004)
chr6 (14-181)||(16496244-16496411)
chr6 (14-181)||(20076700-20076863)
chr6 (14-249)||(16920519-16920751)
chr6 (17-180)||(1595549-1595711)
chr6 (14-189)||(35245586-35245758)
chr6 (17-180)||(12742317-12742479)
chr6 (17-180)||(18334592-18334754)
chr6 (17-180)||(19005046-19005208)
chr6 (17-180)||(19858919-19859081)
chr6 (17-180)||(22782227-22782389)
chr6 (17-180)||(24422547-24422709)
chr6 (17-180)||(25754809-25754971)
chr6 (17-180)||(33861794-33861956)
chr6 (17-180)||(33864278-33864440)
chr6 (14-249)||(22831503-22831737)
chr6 (15-180)||(30676710-30676874)
chr6 (29-235)||(25644335-25644543)
chr6 (17-180)||(2291180-2291342)
chr6 (17-180)||(8055029-8055191)
chr6 (17-180)||(26924640-26924802)
chr6 (15-180)||(34963371-34963535)
chr6 (37-253)||(25603267-25603482)
chr6 (17-180)||(25656629-25656791)
chr6 (33-229)||(18456735-18456930)
chr6 (17-180)||(1540911-1541073)
chr6 (14-196)||(20109140-20109322)
chr6 (17-160)||(25688502-25688644)
chr6 (20-180)||(16448526-16448686)
chr6 (17-180)||(3852017-3852179)
chr6 (16-180)||(19847949-19848114)
chr6 (17-180)||(20556894-20557054)
chr6 (37-253)||(25611605-25611820)
chr6 (33-167)||(18461895-18462028)
chr6 (41-245)||(15041441-15041644)
chr6 (16-144)||(23992429-23992554)
chr6 (33-249)||(11185524-11185737)
chr6 (63-189)||(27415887-27416011)
chr6 (14-90)||(27333262-27333339)
chr6 (14-90)||(27394002-27394079)
chr6 (33-198)||(18821782-18821946)
chr6 (14-229)||(8227416-8227632)
chr6 (14-75)||(25714417-25714478)
chr6 (14-112)||(28496494-28496592)
chr6 (14-112)||(29808905-29809003)
chr6 (14-193)||(1561303-1561478)
chr6 (18-90)||(19652199-19652272)
chr6 (14-181)||(23019408-23019572)
chr6 (29-91)||(9098557-9098620)
chr6 (26-129)||(4185827-4185930)
chr6 (35-91)||(33443068-33443124)
chr6 (29-132)||(19668386-19668491)
chr6 (18-103)||(19873120-19873205)
chr6 (18-82)||(21766695-21766759)
chr6 (14-61)||(22080799-22080846)
chr6 (41-134)||(18907134-18907226)
chr6 (18-103)||(19862978-19863063)
chr6 (18-67)||(31155465-31155514)
chr6 (26-129)||(4186379-4186482)
chr6 (196-244)||(5834388-5834436)
chr6 (196-244)||(20177096-20177144)
chr6 (196-244)||(22158847-22158895)
chr6 (40-77)||(19790837-19790874)
chr6 (33-84)||(23076749-23076801)
chr6 (33-84)||(35008167-35008219)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (14-256)||(6000-6245)
[»] chr1 (56 HSPs)
chr1 (14-253)||(27250611-27250850)
chr1 (14-253)||(21026680-21026919)
chr1 (14-245)||(22532269-22532500)
chr1 (15-245)||(50210103-50210333)
chr1 (17-245)||(34509783-34510011)
chr1 (91-249)||(22354458-22354616)
chr1 (15-247)||(20135188-20135420)
chr1 (15-228)||(22468604-22468816)
chr1 (125-256)||(22356053-22356185)
chr1 (125-256)||(22357739-22357871)
chr1 (14-249)||(38801277-38801508)
chr1 (17-196)||(23593719-23593897)
chr1 (17-180)||(13988866-13989028)
chr1 (17-180)||(21923291-21923453)
chr1 (14-180)||(45574842-45575008)
chr1 (17-229)||(433012-433222)
chr1 (17-180)||(21475087-21475249)
chr1 (17-180)||(31612313-31612475)
chr1 (16-180)||(21840766-21840929)
chr1 (17-180)||(29298137-29298298)
chr1 (17-180)||(29776688-29776850)
chr1 (17-180)||(16275363-16275526)
chr1 (15-196)||(16361915-16362095)
chr1 (14-114)||(20847175-20847275)
chr1 (33-196)||(21896195-21896358)
chr1 (33-195)||(21861510-21861672)
chr1 (14-220)||(13212821-13213027)
chr1 (17-217)||(21346961-21347161)
chr1 (137-230)||(48603637-48603730)
chr1 (11-217)||(21342090-21342296)
chr1 (11-136)||(15860052-15860177)
chr1 (20-180)||(40389157-40389317)
chr1 (17-180)||(22123067-22123230)
chr1 (63-189)||(33797570-33797694)
chr1 (17-180)||(21707167-21707329)
chr1 (17-180)||(21711709-21711871)
chr1 (18-196)||(33681011-33681188)
chr1 (18-198)||(21787979-21788159)
chr1 (33-223)||(35260992-35261180)
chr1 (29-235)||(16758664-16758872)
chr1 (15-82)||(20454606-20454673)
chr1 (18-176)||(22237631-22237788)
chr1 (18-140)||(22921864-22921986)
chr1 (18-103)||(21714546-21714631)
chr1 (21-121)||(21754052-21754152)
chr1 (14-112)||(14295574-14295672)
chr1 (30-112)||(20918620-20918702)
chr1 (18-193)||(20248283-20248454)
chr1 (29-90)||(52928014-52928076)
chr1 (33-133)||(50614117-50614219)
chr1 (33-133)||(50621945-50622047)
chr1 (33-133)||(41050036-41050138)
chr1 (194-253)||(20847101-20847161)
chr1 (33-91)||(16368329-16368388)
chr1 (15-77)||(24783150-24783212)
chr1 (18-103)||(42865245-42865330)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (14-249)||(51913-52148)
scaffold0011 (14-253)||(167861-168099)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (14-253)||(931-1169)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (32-256)||(24180-24406)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (14-249)||(38761-38995)
scaffold0145 (14-231)||(32942-33158)
scaffold0145 (12-180)||(9744-9912)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (17-245)||(22886-23113)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (14-244)||(8424-8650)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (14-245)||(3041-3271)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (14-253)||(4849-5088)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (14-253)||(25896-26134)
scaffold0026 (14-253)||(39858-40096)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (14-249)||(8479-8710)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (21-245)||(25955-26179)
scaffold0122 (17-140)||(44702-44825)
scaffold0122 (151-245)||(33385-33479)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (16-245)||(39479-39707)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (16-245)||(75105-75333)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (14-249)||(32067-32299)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (14-249)||(20910-21146)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (14-245)||(4508-4738)
scaffold0228 (14-245)||(12090-12320)
scaffold0228 (14-245)||(22042-22272)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (14-249)||(15351-15584)
scaffold0114 (18-191)||(7295-7465)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (14-245)||(39913-40143)
scaffold0080 (33-133)||(19885-19987)
scaffold0080 (41-193)||(18597-18749)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (15-245)||(17105-17337)
scaffold0056 (33-229)||(79235-79430)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (14-249)||(4712-4946)
scaffold0358 (79-249)||(1-170)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (14-249)||(13497-13730)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (14-245)||(16490-16721)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (15-218)||(3103-3306)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (14-249)||(1952-2187)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (66-244)||(13144-13322)
scaffold0175 (14-89)||(34123-34199)
scaffold0175 (14-70)||(273-329)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (104-256)||(124675-124827)
scaffold0021 (14-83)||(121766-121835)
scaffold0021 (15-133)||(174767-174883)
scaffold0021 (33-132)||(136370-136471)
scaffold0021 (33-132)||(145078-145179)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (17-245)||(339840-340065)
scaffold0003 (17-180)||(158450-158612)
scaffold0003 (63-189)||(71350-71474)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (14-249)||(10312-10544)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (14-231)||(32863-33077)
scaffold0120 (14-231)||(45928-46142)
scaffold0120 (14-225)||(16113-16323)
scaffold0120 (14-75)||(17389-17450)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (14-249)||(16282-16514)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (14-249)||(938-1170)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (14-152)||(28414-28552)
scaffold0046 (14-112)||(11292-11390)
scaffold0046 (14-112)||(1997-2095)
scaffold0046 (14-67)||(4552-4605)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (14-249)||(1289-1521)
scaffold0106 (14-249)||(7266-7498)
scaffold0106 (17-82)||(15291-15356)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (14-224)||(46995-47202)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (77-240)||(3424-3588)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (73-249)||(6669-6845)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (14-249)||(51582-51814)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (17-249)||(5017-5246)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (95-245)||(27911-28061)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (35-245)||(4545-4754)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (17-180)||(20747-20909)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (17-180)||(37821-37983)
[»] scaffold0023 (9 HSPs)
scaffold0023 (17-180)||(94411-94573)
scaffold0023 (21-180)||(17440-17598)
scaffold0023 (17-177)||(44454-44614)
scaffold0023 (18-141)||(100378-100501)
scaffold0023 (18-221)||(38394-38596)
scaffold0023 (14-85)||(119875-119947)
scaffold0023 (18-140)||(40169-40291)
scaffold0023 (18-90)||(101503-101576)
scaffold0023 (106-221)||(23581-23695)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (17-180)||(4694-4856)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (29-196)||(8481-8650)
scaffold0621 (14-140)||(6535-6661)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (17-180)||(13392-13554)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (17-180)||(13947-14109)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (17-180)||(82072-82234)
scaffold0037 (29-196)||(22610-22776)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (17-180)||(136680-136842)
scaffold0028 (17-180)||(139149-139311)
scaffold0028 (17-180)||(144087-144249)
scaffold0028 (17-180)||(134211-134373)
scaffold0028 (17-180)||(141618-141780)
scaffold0028 (16-112)||(62200-62296)
scaffold0028 (18-100)||(132662-132745)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (14-136)||(11442-11564)
scaffold0235 (198-249)||(11399-11450)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (17-229)||(16784-16995)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (15-180)||(11286-11450)
scaffold0029 (18-191)||(12763-12933)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (20-180)||(4300-4459)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (16-180)||(10772-10935)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (14-181)||(128751-128917)
scaffold0031 (33-232)||(20328-20524)
scaffold0031 (42-103)||(65830-65891)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (21-180)||(501088-501246)
scaffold0001 (17-220)||(85539-85742)
scaffold0001 (18-196)||(160688-160864)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (33-196)||(53488-53651)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (17-180)||(106-268)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (17-180)||(40400-40562)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (73-245)||(853-1021)
scaffold0395 (14-80)||(4888-4954)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (15-180)||(12249-12413)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (16-180)||(9241-9404)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (14-229)||(17932-18148)
scaffold0247 (17-220)||(2088-2291)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (17-180)||(4214-4377)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (137-249)||(1037-1149)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (33-220)||(13147-13336)
scaffold0357 (29-220)||(16014-16206)
scaffold0357 (33-84)||(2680-2732)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (29-220)||(27663-27855)
scaffold0165 (173-249)||(3640-3716)
scaffold0165 (173-249)||(7704-7780)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (31-180)||(29946-30094)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (17-220)||(161049-161252)
scaffold0007 (97-220)||(164550-164674)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (17-180)||(12064-12220)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (63-189)||(15362-15486)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (17-140)||(116430-116551)
scaffold0022 (33-196)||(128909-129072)
scaffold0022 (21-133)||(78328-78442)
scaffold0022 (178-229)||(116579-116631)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (35-196)||(7998-8161)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (20-180)||(1280-1440)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (29-196)||(10481-10647)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (33-196)||(12587-12749)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (17-196)||(38641-38820)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (14-196)||(11464-11646)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (14-196)||(38195-38377)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (174-245)||(10323-10394)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (26-196)||(129917-130086)
scaffold0010 (41-235)||(60614-60810)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (18-179)||(29558-29720)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (14-181)||(6078-6244)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (41-221)||(26851-27027)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (18-140)||(19268-19390)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (18-198)||(4741-4921)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (33-140)||(1051-1158)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (17-112)||(15664-15759)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (18-196)||(133-310)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (18-140)||(2801-2923)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (18-196)||(45732-45909)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (37-190)||(192920-193074)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (18-140)||(14692-14814)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (14-90)||(6611-6688)
scaffold0333 (14-90)||(13991-14068)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (14-90)||(15821-15898)
scaffold0020 (18-81)||(178898-178961)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (14-181)||(989-1155)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (14-181)||(12766-12932)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (193-249)||(17873-17929)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (26-140)||(5655-5769)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (14-112)||(1092-1190)
scaffold0184 (40-77)||(4284-4321)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (40-221)||(16264-16443)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (14-167)||(32538-32687)
scaffold0034 (33-253)||(51766-51985)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (18-221)||(23843-24048)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (18-85)||(2694-2762)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (18-137)||(12943-13062)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (18-90)||(28813-28887)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (18-221)||(21721-21920)
scaffold0210 (18-221)||(29613-29812)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (41-183)||(29117-29262)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (18-90)||(1086-1159)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (18-185)||(1881-2045)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (29-229)||(25121-25321)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (18-90)||(23927-24000)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (71-196)||(225465-225588)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (206-254)||(20595-20643)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (29-90)||(8118-8180)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (26-90)||(6824-6889)
scaffold0556 (89-181)||(8090-8181)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (29-133)||(10542-10646)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (18-112)||(32102-32197)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (18-81)||(36454-36517)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (33-75)||(11982-12024)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (18-103)||(69794-69879)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (41-133)||(38343-38437)
scaffold0139 (18-103)||(19980-20065)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (41-84)||(206575-206618)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (18-116)||(44081-44179)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (18-82)||(6095-6159)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (33-133)||(6284-6386)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (18-134)||(897-1012)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (18-82)||(10575-10639)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (18-134)||(1830-1945)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (33-91)||(569-628)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (40-79)||(4999-5038)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (33-196)||(97024-97188)
scaffold0006 (33-196)||(106302-106466)
[»] scaffold1895 (1 HSPs)
scaffold1895 (105-193)||(1169-1257)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (40-77)||(7328-7365)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (33-121)||(2694-2784)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (18-82)||(14664-14728)
scaffold0081 (18-82)||(23679-23743)
scaffold0081 (18-82)||(39103-39167)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (40-116)||(46745-46821)


Alignment Details
Target: scaffold0193 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 14 - 256
Target Start/End: Original strand, 13211 - 13453
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 13310  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13311 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 13410  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 256  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13411 cacaaattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 13453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 96)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 14 - 256
Target Start/End: Original strand, 17487856 - 17488098
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17487856 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 17487955  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17487956 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagatt 17488055  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17488056 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 17488098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Original strand, 13442274 - 13442510
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13442274 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacggcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 13442373  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13442374 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 13442473  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatg 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13442474 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatg 13442510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 14 - 256
Target Start/End: Original strand, 17499338 - 17499580
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499338 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 17499437  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17499438 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaacacatcttaaacagatt 17499537  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 256  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499538 cacaaattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 17499580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 14 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 20698556 - 20698315
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20698556 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacgtaataatatca 20698457  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  20698456 attgcaattcatcaacatcttatatattcaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacttcaacacatcttgaacagctt 20698358  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20698357 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaattctatcc 20698315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 23083482 - 23083247
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23083482 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagaatgacataataatatca 23083383  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| | | |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23083382 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattttacttctagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaatatcaacacatcttaaacagctt 23083283  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  23083282 cacagattgtaattaacatcatcactaagtcttaat 23083247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 244
Target Start/End: Original strand, 26686887 - 26687117
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26686887 acatcatcatcttcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 26686986  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||| | ||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26686987 attgcaagtcaacatcatcttaaatattccattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 26687086  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtc 244  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26687087 cacagattataattaacatcctcattaagtc 26687117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 253
Target Start/End: Original strand, 12399209 - 12399448
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12399209 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatca 12399308  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  12399309 aatgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataagacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaatagctt 12399408  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 253  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||    
T  12399409 cacagattatagttaacctcttcattatgtcttaatgcta 12399448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Original strand, 14972854 - 14973085
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14972854 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 14972953  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    | ||||| ||| |||||||| | |||| ||   ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14972954 aatgcaaatcaacaacatctcatatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 14973053  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtct 245  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14973054 catagattataattaacatcatcattaagtct 14973085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 244
Target Start/End: Original strand, 43840932 - 43841162
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43840932 acatcattatcttcatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 43841031  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43841032 attgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 43841131  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtc 244  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  43841132 cacagattataattaacatcctcgttaagtc 43841162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14576949 - 14576719
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 117  Q
    |||||||  ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  14576949 catcatcaacatcaacttagaccgactcattcaacttagttaaataacaacagcaacatagacagtata-aacaacagcatgacataataatatcaattg 14576851  T
Q  118 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 217  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14576850 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacaacttcaca 14576751  T
Q  218 gattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14576750 gattataattaacatcatcattaaatcttaat 14576719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Original strand, 18438534 - 18438765
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18438534 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatca 18438633  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    | ||||| ||| |||||||||   ||| ||   ||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18438634 aatgcaagtcaacaacatcttttttatacattcatatctcaagtaatgcatataacattatatcacatcatattcaacatcaacacatcttaaacagctt 18438733  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtct 245  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18438734 cacagattatagttaacatcatcattaagtct 18438765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24153326 - 24153115
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  24153326 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgatagcaacataggtagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 24153228  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 216  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24153227 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgcacataacataatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 24153128  T
Q  217 agattataattaa 229  Q
    |||||||||||||    
T  24153127 agattataattaa 24153115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 27 - 249
Target Start/End: Original strand, 14572602 - 14572823
Alignment:
Q  27 catcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatc 126  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | ||| |    
T  14572602 catcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaattgagagtcaac 14572700  T
Q  127 aacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataat 226  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | | |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  14572701 aacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgaaaaaaacattatatcacatcataaacaacataaacaaatcttaaacaacttcacaaattataat 14572800  T
Q  227 taacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  14572801 taacatcatcattaagtcttaat 14572823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 11424880 - 11424653
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  11424880 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataacaatatca 11424782  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    || ||||   |||||||||| || ||| ||   ||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  11424781 atagcaa---atcaacatctcaattatgcattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataaacaacttcaacacatcttaaacagctt 11424685  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtct 245  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11424684 cacagattaaaattaacatcaacattaagtct 11424653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 25476506 - 25476275
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25476506 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaaaaacaacagcaacacaggtagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 25476407  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    | ||||| ||| |||||||| || ||| ||   ||  |||||||||||   |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  25476406 aatgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgcataacattatatcacatcattatcatcatcaacacatcttaaacagctt 25476307  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtct 245  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  25476306 cacagattgtaattaacatcctcattaagtct 25476275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 17 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 40213838 - 40213611
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  40213838 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacatcaacacag-cagtatacataaacatcatgacataataatatcaaat 40213740  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 216  Q
    |||| ||| |||||||| || ||| ||   ||  | |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40213739 gcaagtcaacaacatctcaattatacattcataatccaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctttac 40213640  T
Q  217 agattataattaacatcatcattaagtct 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40213639 agattataattaacatcatcattaagtct 40213611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 32 - 235
Target Start/End: Original strand, 42386428 - 42386632
Alignment:
Q  32 acttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacat 131  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||    
T  42386428 acttagaccgactcatgcagtttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataacaatatcaaatgcaagtcaacaacat 42386527  T
Q  132 cttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttcacagattataattaac 230  Q
    || |||||||||   ||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  42386528 ctcaaatattcattcataattcaagcaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaaacagcttcacagattatcattaac 42386627  T
Q  231 atcat 235  Q
    |||||    
T  42386628 atcat 42386632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 29 - 253
Target Start/End: Original strand, 30029855 - 30030078
Alignment:
Q  29 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaa 128  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||    
T  30029855 tcaacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaatagcagcatagacagattacaacaacagcatgacataagaatatcatttgcaattca-caa 30029953  T
Q  129 catcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataatta 228  Q
    | ||||||||||||||  |  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||| | |    
T  30029954 cgtcttaaatattcaataaaacttcaagtaatgtacacaacattatatcacatcataatcaatgtcaaaacatcttaaacagcttcacatattatattaa 30030053  T
Q  229 acatcatcattaagtcttaatgcta 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  30030054 acatcatcattaagtcttaaagcta 30030078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 29172745 - 29172567
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29172745 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 29172647  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 196  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||  |  |||||||||||    
T  29172646 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatactatcaacatcaa 29172567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 7781509 - 7781347
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7781509 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 7781411  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  7781410 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 7781347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 9707769 - 9707607
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9707769 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 9707671  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
     ||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  9707670 acaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 9707607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 17463178 - 17463340
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17463178 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 17463276  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  17463277 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 17463340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 17672626 - 17672788
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17672626 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacata-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 17672724  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  17672725 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaaataatgcatatataattatatcaca 17672788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 34159326 - 34159488
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34159326 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 34159424  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  34159425 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 34159488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 45607069 - 45606907
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45607069 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 45606971  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  45606970 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 45606907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 55476491 - 55476653
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  55476491 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 55476589  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  55476590 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 55476653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 8899094 - 8899256
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8899094 tcatcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 8899192  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  8899193 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 8899256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 16454443 - 16454281
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16454443 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 16454345  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  16454344 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 16454281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 17446816 - 17446655
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17446816 tcatcatcttaatcaacttagac-gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 17446719  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  17446718 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatatcattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 17446655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 28848773 - 28848611
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28848773 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 28848675  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||| ||||||    
T  28848674 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcaca 28848611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 38962053 - 38961891
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38962053 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 38961955  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  38961954 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 38961891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 43550644 - 43550478
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  43550644 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataatgacagcaacatatgcagtatgcaaaaacaacatgacataataatatca 43550545  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    | ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  43550544 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgtatatacaattatatcaca 43550478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 13151953 - 13151790
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagctt-agttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 115  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13151953 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13151855  T
Q  116 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  13151854 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 13151790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 13154418 - 13154255
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagctt-agttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 115  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13154418 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13154320  T
Q  116 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  13154319 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 13154255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 180
Target Start/End: Original strand, 13544024 - 13544187
Alignment:
Q  16 atcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 115  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  13544024 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcaatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaa 13544122  T
Q  116 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  13544123 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 13544187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 6469296 - 6469134
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6469296 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 6469198  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || || ||| ||||  || |||||||| |||||  |||||||||||    
T  6469197 gcaagtcaacaacgtctcaattagtcacatataattgaagtaatgcatatacaattatatcaca 6469134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 10247885 - 10247723
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10247885 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaacagcagcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 10247787  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  10247786 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 10247723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 180
Target Start/End: Original strand, 12567564 - 12567722
Alignment:
Q  21 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 120  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  12567564 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcaatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaa 12567662  T
Q  121 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
     ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  12567663 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 12567722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 50242822 - 50242984
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  50242822 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagt-agtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 50242920  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  50242921 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 50242984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 16282971 - 16282811
Alignment:
Q  19 atcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgc 118  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  16282971 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatattgaatgc 16282873  T
Q  119 aattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    || ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  16282872 aagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 16282811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 131
Target Start/End: Original strand, 55500942 - 55501055
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  55500942 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 55501040  T
Q  117 gcaattcatcaacat 131  Q
    |||| ||| ||||||    
T  55501041 gcaagtcaacaacat 55501055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24340844 - 24340628
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  24340844 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcagtatgcacaa-catcatgatataataatatc 24340746  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 211  Q
     |  |||| | | |||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
T  24340745 gaacgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagc 24340646  T
Q  212 ttcacagattataattaa 229  Q
    ||||||||| || |||||    
T  24340645 ttcacagatcatcattaa 24340628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 180
Target Start/End: Original strand, 41123892 - 41124049
Alignment:
Q  19 atcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgc 118  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41123892 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacacaa----cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 41123987  T
Q  119 aattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    || ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  41123988 aagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 41124049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 144
Target Start/End: Original strand, 46822267 - 46822395
Alignment:
Q  16 atcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 115  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||  |||| || ||||||| |||||||||    
T  46822267 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacaacaagacataaaaatatcaat 46822366  T
Q  116 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaa 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46822367 tgcaattcaacaacatcttaaatattcaa 46822395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 140
Target Start/End: Original strand, 36166598 - 36166719
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  36166598 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 36166695  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatat 140  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||    
T  36166696 gcaagtcaacaacatctcaaatat 36166719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 33 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 53070799 - 53070653
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatc 132  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||    
T  53070799 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataa-cagtatacaaaaacaacaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 53070701  T
Q  133 ttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    | || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  53070700 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 53070653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12119887 - 12119684
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12119887 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 12119789  T
Q  117 gcaattc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttc 214  Q
    |||| || |||||| ||| || |||||| | ||  |  || ||||| |||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||||||    
T  12119788 gcaagtcaatcaacgtctcaattattcacagataatctaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttc 12119690  T
Q  215 acagat 220  Q
    ||||||    
T  12119689 acagat 12119684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 120
Target Start/End: Original strand, 15412429 - 15412531
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15412429 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 15412527  T
Q  117 gcaa 120  Q
    ||||    
T  15412528 gcaa 15412531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 148
Target Start/End: Original strand, 15977515 - 15977645
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  15977515 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-atagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 15977613  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatat 148  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||    
T  15977614 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatat 15977645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 137 - 230
Target Start/End: Original strand, 14179555 - 14179648
Alignment:
Q  137 atattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaac 230  Q
    ||||||||||| |  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14179555 atattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattaac 14179648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 16 - 144
Target Start/End: Original strand, 12511059 - 12511187
Alignment:
Q  16 atcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 115  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||  |||| || ||||||| |||||||||    
T  12511059 atcaacatcttaatcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacaacaagacataaaaatatcaat 12511158  T
Q  116 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaa 144  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  12511159 tgcaattcaacaacatcttcaatattcaa 12511187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 181
Target Start/End: Original strand, 14234487 - 14234653
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  14234487 acatcatcatcttaatcaacttagactgattcatgcagcttagttaaataacaagcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 14234585  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacat 181  Q
     | ||||| ||||||||||| |||| | ||||| ||  |||| ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  14234586 gaatgcaagtcatcaacatcataaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacat 14234653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 137 - 253
Target Start/End: Original strand, 16796670 - 16796786
Alignment:
Q  137 atattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatc 236  Q
    ||||||||||| |  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | || ||    
T  16796670 atattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaaaaacaacacatcttaaacaacttcacatattataattagcctcttc 16796769  T
Q  237 attaagtcttaatgcta 253  Q
    |||||||||||||||||    
T  16796770 attaagtcttaatgcta 16796786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 120
Target Start/End: Original strand, 8499518 - 8499620
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  8499518 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 8499616  T
Q  117 gcaa 120  Q
    ||||    
T  8499617 gcaa 8499620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 114
Target Start/End: Original strand, 44494809 - 44494905
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 114  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44494809 tcatcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcataacataataatatcaa 44494905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 33 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 52523831 - 52523633
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaac 129  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||  ||||| |||| |||||| | ||||| ||| ||||    
T  52523831 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagttcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaac 52523733  T
Q  130 atcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataatta 228  Q
    |||| ||| ||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| ||||||||| ||||| || ||||    
T  52523732 atctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa-tcatcttataacagcttctcagatcatcatta 52523634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 140
Target Start/End: Original strand, 21618460 - 21618570
Alignment:
Q  28 atcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatca 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||    
T  21618460 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 21618557  T
Q  128 acatcttaaatat 140  Q
    |||||| ||||||    
T  21618558 acatctcaaatat 21618570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 196
Target Start/End: Original strand, 27165250 - 27165429
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 115  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| | |||||| ||||| |||  ||||||||     
T  27165250 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaatatagacagtatgc-aaaacaacatgatataccaatatcaaa 27165348  T
Q  116 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 196  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||||| ||||  || ||||| ||  ||||  |||||||||||  |||| |||||||||    
T  27165349 tgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataatttaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 27165429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 120
Target Start/End: Original strand, 10556985 - 10557087
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  10556985 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-tcagcatacaaaaacggcatgacataataatatcaaat 10557083  T
Q  117 gcaa 120  Q
    ||||    
T  10557084 gcaa 10557087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 196
Target Start/End: Original strand, 16097332 - 16097509
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| | ||| || ||| | |||| |||||| | |    
T  16097332 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcaatatgc-aaatcatcatcatataacaatatcgaat 16097430  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 196  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||  ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  16097431 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 16097509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 196
Target Start/End: Original strand, 16103784 - 16103960
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  16103784 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacgaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 16103882  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 196  Q
    |||| ||| |||||||| ||||| ||||| ||  ||||  |||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  16103883 gcaa-tcaacaacatctcaaata-tcaaacataattcatttaatgtatataaaattatataacattataaacaacatcaa 16103960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 229
Target Start/End: Original strand, 23274705 - 23274903
Alignment:
Q  32 acttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaaca 130  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |  |||| | | |||||    
T  23274705 acttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaaca 23274803  T
Q  131 tcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaa-acagcttcacagattataattaa 229  Q
    ||| ||||||||| ||||  ||||||||| | |||||  |||| ||||||| |||| |||||||||  |||| |||  ||||||||||||| || |||||    
T  23274804 tctcaaatattcacatataattcaagtaaagaatatacaattacatcacattataaacaacatcaaatcatcataattcagcttcacagatcatcattaa 23274903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 13210448 - 13210273
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  13210448 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 13210350  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacat 193  Q
     | |||||   ||||||| |||||||| ||||| ||   ||| ||||||||||||  ||||||| |||| |||| ||||||    
T  13210349 gaatgcaa---atcaacaacttaaata-tcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacat 13210273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 18 - 181
Target Start/End: Original strand, 15470928 - 15471090
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  15470928 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 15471026  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacat 181  Q
    |||| |||||||||||| ||| | ||||| ||  |||| ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  15471027 gcaagtcatcaacatctcaaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacat 15471090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 114
Target Start/End: Original strand, 17737236 - 17737335
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagta---tacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||   ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17737236 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcaatatactacaacaacagcatgacataataatatca 17737334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 17 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 53301669 - 53301527
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 115  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||     
T  53301669 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaa 53301571  T
Q  116 tgcaattca-tcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagta 158  Q
    ||||| ||| |||| |||| ||||||||| ||||  ||||||||    
T  53301570 tgcaagtcattcaatatctcaaatattcatatataattcaagta 53301527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 12174376 - 12174303
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 90  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  12174376 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 12174303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 37642386 - 37642170
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    |||||| |||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||  |||  | |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  37642386 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 37642288  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 211  Q
        | || | | |||||||| ||||| ||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
T  37642287 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagc 37642188  T
Q  212 ttcacagattataattaa 229  Q
    ||||||||| || |||||    
T  37642187 ttcacagatcatcattaa 37642170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 90
Target Start/End: Original strand, 32307684 - 32307754
Alignment:
Q  21 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 90  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  32307684 catcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 32307754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 49668193 - 49668120
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 90  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  49668193 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 49668120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 78
Target Start/End: Original strand, 28194693 - 28194755
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatag 78  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28194693 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 28194755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 90
Target Start/End: Original strand, 9512924 - 9512997
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 90  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  9512924 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 9512997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 90
Target Start/End: Original strand, 9520899 - 9520972
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 90  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  9520899 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 9520972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 17 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 45578000 - 45577947
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacag 70  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45578000 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacag 45577947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 2051238 - 2051138
Alignment:
Q  96 catgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatca 195  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||||||| ||| ||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| ||||||||    
T  2051238 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatca 2051139  T
Q  196 a 196  Q
    |    
T  2051138 a 2051138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Original strand, 856140 - 856304
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaac-agcatgacataataatatcaatt 116  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| ||| | ||||  ||||| ||| |||||    
T  856140 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttagttgaataacaatagcaacataggcagattacaacaacaatcatg--ataattataccaatt 856237  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcata 185  Q
     ||||||| ||||||||||  ||| ||| || ||||||||||||  ||| |||||||||  ||||||||    
T  856238 -caattcaacaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatacata-aacattataatacatcata 856304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 1644787 - 1644718
Alignment:
Q  21 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaa 90  Q
    |||| ||||||||||||||  ||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  1644787 catcgtcatcaacttagaccaacttatgttgcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatgcaaa 1644718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 103
Target Start/End: Original strand, 23408428 - 23408513
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 103  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||||||||| |||  ||||| |||||| ||||||    
T  23408428 catcatcttgatcatcttatactgactcatgcaacttggttaattaacaatagcaacatagacagattacaacaacagcgtgacat 23408513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 23077594 - 23077530
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 82  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23077594 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttggttaaataacaacagcaacataggcag 23077530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 37251270 - 37251168
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaac 129  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||||    
T  37251270 cttagaccgagtcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtata-taaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 37251172  T
Q  130 atct 133  Q
    ||||    
T  37251171 atct 37251168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 133
Target Start/End: Original strand, 43925977 - 43926079
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaac 129  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||||    
T  43925977 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtaca-taaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 43926075  T
Q  130 atct 133  Q
    ||||    
T  43926076 atct 43926079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 77
Target Start/End: Original strand, 14665398 - 14665460
Alignment:
Q  15 catcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 77  Q
    |||||||||||| |||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  14665398 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcaacata 14665460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 84
Target Start/End: Original strand, 13919350 - 13919399
Alignment:
Q  35 tagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagta 84  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  13919350 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacatagggagta 13919399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 15878168 - 15878083
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 103  Q
    ||||||||| |||| |||| || |||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||  |||||||    
T  15878168 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacaatatgacat 15878083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 22147646 - 22147431
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    |||||| |||||||| | |||| ||| || ||||||||||||||||  |||  | ||||||| ||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  22147646 acatcaacatcttcaacgacttggaccgagtcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcggtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 22147548  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 211  Q
        | || | | |||||||| ||||| ||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||| ||  |||| |||| ||||    
T  22147547 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat-aaatcatcataaatcagc 22147449  T
Q  212 ttcacagattataattaa 229  Q
    ||||||||| || |||||    
T  22147448 ttcacagatcatcattaa 22147431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 11298644 - 11298580
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 82  Q
    |||||||||  ||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  11298644 catcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcag 11298580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 14878633 - 14878569
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 82  Q
    |||||||||  ||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  14878633 catcatcttattcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcag 14878569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 229
Target Start/End: Original strand, 21618594 - 21618650
Alignment:
Q  174 tatcacatcataatcaacatcaacacat-cttaaacagcttcacagattataattaa 229  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||    
T  21618594 tatgacatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagcttcatagattatcattaa 21618650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 22110454 - 22110402
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 84  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  22110454 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagta 22110402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 229
Target Start/End: Original strand, 36166747 - 36166799
Alignment:
Q  178 acatcataatcaacatcaacacat-cttaaacagcttcacagattataattaa 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||    
T  36166747 acatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagcttcatagattatcattaa 36166799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 19726018 - 19725857
Alignment:
Q  27 catcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatc 126  Q
    ||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  |||   |||  ||||||||||| | |||||||||||| || |||| |    
T  19726018 catcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcatgac-tcataatatcaatt-catttcaac 19725921  T
Q  127 aacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataa-cattatatcacatcataatca 189  Q
    |||||||| |  ||||||  ||  |||||||||||||  ||| ||||| ||||||| |||||||    
T  19725920 aacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgtaattaatcattaaatcacattataatca 19725857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 137
Target Start/End: Original strand, 12377940 - 12378046
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaa-acagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaaca 130  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| |||| |   ||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  12377940 cttagaccgactcatacagcttagttaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaatagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 12378039  T
Q  131 tcttaaa 137  Q
     ||||||    
T  12378040 acttaaa 12378046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 77
Target Start/End: Original strand, 14668554 - 14668616
Alignment:
Q  15 catcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 77  Q
    |||||||||||| |||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  14668554 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcata 14668616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 3390031 - 3389994
Alignment:
Q  40 tgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 77  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  3390031 tgactcatgcaacttagttaaataacaacagcagcata 3389994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 83
Target Start/End: Original strand, 15060284 - 15060349
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagt 83  Q
    |||||||||  ||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  15060284 catcatcttattcatcttacaatgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagt 15060349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 83
Target Start/End: Original strand, 15051509 - 15051573
Alignment:
Q  19 atcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagt 83  Q
    ||||||||  ||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  15051509 atcatcttattcatcttacaatgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagt 15051573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 79)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 14 - 256
Target Start/End: Original strand, 9509189 - 9509431
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9509189 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagtaacataggcagtatacaataacagcatgacataataatatca 9509288  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9509289 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 9509388  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 256  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9509389 cacagattataattaacatcctcattaagtcttaatgctatcc 9509431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 12698831 - 12699067
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-acagcatgacataataatatc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12698831 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataataatatc 12698930  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12698931 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 12699030  T
Q  213 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  12699031 tcacagattataattaacatcctcattaactcttaat 12699067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 253
Target Start/End: Original strand, 26211995 - 26212235
Alignment:
Q  14 acatcatcat-cttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26211995 acatcatcattcttcaacaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 26212094  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 212  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26212095 aattgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacattataatcaacaacaacacatcttaaacagct 26212194  T
Q  213 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 253  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  26212195 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgcta 26212235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 10589039 - 10589273
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    ||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  10589039 acatcatcatcttcgacaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatatgcagtatacaaaaacaacatgacataatcatatca 10589138  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  10589139 attgcaattcaacaacatcttcaatgttcaaatattcttcaagcaatgcata-aacattatatcacatcataatcagcaacaacacatcttaaatagctt 10589237  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10589238 cacagattataattaacctcatcattaagtcttaat 10589273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 38227481 - 38227715
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38227481 acatcatcatcttcatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 38227579  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  38227580 aatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaattaatgtacatatcattatatcacatcttaatcaacatcaacatatcttaaatatctt 38227679  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38227680 cacatattataattaacatcatcattaagtcttaat 38227715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 17 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18456530 - 18456319
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |    
T  18456530 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgatagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaat 18456432  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 216  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456431 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 18456332  T
Q  217 agattataattaa 229  Q
    |||||||||||||    
T  18456331 agattataattaa 18456319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16386369 - 16386132
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  16386369 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacgacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 16386270  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 212  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16386269 aattgtatttcatcaacatcttaaatattcaaacaattctcaagtaatgcataaaacattatattacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagct 16386170  T
Q  213 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatg 250  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  16386169 tcacagattatagttaacctcttcattaagtcttaatg 16386132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 17 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 3564482 - 3564254
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  3564482 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 3564383  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 216  Q
    | || ||| |||||||| || ||| ||   ||  |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  3564382 gtaagtcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattagatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacaacttcat 3564283  T
Q  217 agattataattaacatcatcattaagtct 245  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  3564282 aggttataattaacatcatcattaagtct 3564254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 16 - 249
Target Start/End: Original strand, 40443393 - 40443624
Alignment:
Q  16 atcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 114  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40443393 atcatcatcttcaacatcttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacatacgcagtaaacaaa--cagcatgacataataatatcaa 40443490  T
Q  115 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 214  Q
    || ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||    
T  40443491 tttcaattcatcaacatcttaggtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacgacatatcttatacagcttc 40443589  T
Q  215 acagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  40443590 acagattataattaacctcattgttaagtcttaat 40443624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 27847951 - 27847719
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||   ||| |||||||||| |||||    
T  27847951 acatcatcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagtgtacaa---cagtatgacataattatatc 27847855  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 212  Q
    || | ||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||    
T  27847854 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattatcacacatcataatcaacaacaacatatcttattcagct 27847756  T
Q  213 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    |||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||    
T  27847755 tcacagattatagttaatctcattattaagtcttaat 27847719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 180
Target Start/End: Original strand, 13647325 - 13647491
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13647325 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatca 13647424  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    | ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  13647425 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 13647491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 196
Target Start/End: Original strand, 16213684 - 16213861
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  16213684 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 16213782  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 196  Q
     ||| ||| |||| |||||| |||||| ||||  ||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16213783 ccaagtcaacaacgtcttaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaacataa-caacatcaa 16213861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 456321 - 456483
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  456321 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 456419  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  456420 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 456483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 11972496 - 11972658
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11972496 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 11972594  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  11972595 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 11972658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 14949284 - 14949122
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14949284 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14949186  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  14949185 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 14949122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 15376875 - 15376713
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15376875 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 15376777  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  15376776 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 15376713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 16232520 - 16232682
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16232520 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 16232618  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  16232619 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 16232682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 18640272 - 18640434
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18640272 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18640370  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  18640371 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 18640434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 20385285 - 20385123
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20385285 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20385187  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  20385186 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20385123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 21189757 - 21189595
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21189757 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 21189659  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  21189658 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 21189595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 32125491 - 32125653
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32125491 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 32125589  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  32125590 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 32125653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 41522917 - 41523079
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41522917 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 41523015  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  41523016 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 41523079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 41525379 - 41525541
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41525379 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 41525477  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  41525478 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 41525541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 18 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 11393448 - 11393287
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 117  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11393448 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatg 11393350  T
Q  118 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    ||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  11393349 caagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 11393287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 180
Target Start/End: Original strand, 18430709 - 18430874
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  18430709 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatataaaaacatcatgacataataatatca 18430807  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    | ||||| ||| |||||||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  18430808 aatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 18430874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 2280238 - 2280033
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  2280238 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataataatatc 2280142  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagc 211  Q
    || ||||| ||| |||||||| ||||||||| ||||  ||||| ||||  |||||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| ||||||    
T  2280141 aaatgcaaatcaacaacatctcaaatattcatatataattcaaataatacatataaaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcttataacagc 2280042  T
Q  212 ttcacagat 220  Q
    |||||||||    
T  2280041 ttcacagat 2280033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 229
Target Start/End: Original strand, 48273392 - 48273594
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48273392 tcatcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 48273491  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttca 215  Q
    |||| ||| ||||||| | ||||| ||   ||  ||||||||      ||||     ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48273492 gcaagtcaacaacatc-tcaatatacattcataattcaagta------ataa----gtatgacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttca 48273580  T
Q  216 cagattataattaa 229  Q
    |||||||| |||||    
T  48273581 cagattatcattaa 48273594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 24702238 - 24702400
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  24702238 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 24702336  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  24702337 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24702400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 27216860 - 27217022
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27216860 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 27216958  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  27216959 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 27217022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 167
Target Start/End: Original strand, 24275175 - 24275320
Alignment:
Q  21 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 120  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24275175 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 24275273  T
Q  121 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatata 167  Q
     ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||    
T  24275274 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatata 24275320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 178
Target Start/End: Original strand, 16410059 - 16410219
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16410059 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 16410157  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatca 178  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||  |||||  |||||||||    
T  16410158 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatacaattatatca 16410219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 29 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15144143 - 15143925
Alignment:
Q  29 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaa 128  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||| ||||||| || || |||||||||| |||||  || |||    
T  15144143 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatct-cagtatgcaataacagcaagatatcataatatcaaatgcaagccaacaa 15144045  T
Q  129 catcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacagattataatt 227  Q
    ||||| || ||| ||   ||  || ||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||| |     
T  15144044 catctcaagtatacattcataatttaagtaatgcgtataacatcatatcacatcataatcaatgtcaaaacatcttaaaacagcttgacagattatatta 15143945  T
Q  228 aacatcatcattaagtctta 247  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15143944 aacatcatcattaagtctta 15143925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 44116509 - 44116671
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  44116509 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 44116607  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  |||||| |||| |||||  |||||||||||    
T  44116608 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagcaatgcatatacaattatatcaca 44116671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 3386333 - 3386495
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  3386333 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacatgataatatcaaat 3386431  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||  |||||  |||||||||||    
T  3386432 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatacaattatatcaca 3386495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 14932851 - 14932685
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  14932851 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattg 14932752  T
Q  118 caa-ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatca 183  Q
    ||| |||| |||||  ||||||||||||  |  |||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  14932751 caatttcaacaacactttaaatattcaataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcacatca 14932685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 15356286 - 15356120
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  15356286 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattg 15356187  T
Q  118 caa-ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatca 183  Q
    ||| |||| |||||  ||||||||||||  |  |||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  15356186 caatttcaacaacactttaaatattcaataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcacatca 15356120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 18 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 15360400 - 15360234
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 117  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || | |||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  15360400 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattg 15360301  T
Q  118 caa-ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatca 183  Q
    ||| |||| |||||  ||||||||||||  |  |||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  15360300 caatttcaacaacactttaaatattcaataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcacatca 15360234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17062077 - 17061866
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 115  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||     
T  17062077 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaac-tcagcagtatac-aaaatagcatgacataataatatcaaa 17061980  T
Q  116 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttc 214  Q
    ||||| ||| |||| ||| || |||| | ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||||||    
T  17061979 tgcaagtcagcaacgtctcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttc 17061881  T
Q  215 acagattataattaa 229  Q
    |||||| || |||||    
T  17061880 acagatcattattaa 17061866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 145
Target Start/End: Original strand, 13869346 - 13869474
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13869346 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 13869444  T
Q  117 gcaattc-atcaacatcttaaatattcaaa 145  Q
    |||| || |||||| ||| || ||||||||    
T  13869445 gcaagtcaatcaacgtctcaattattcaaa 13869474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 24704688 - 24704847
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||   || |||||||||||||||| |    
T  24704688 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaa---caagacataataatatcaaat 24704783  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  24704784 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24704847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 38898535 - 38898376
Alignment:
Q  21 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 120  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38898535 catcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacaca-gcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 38898437  T
Q  121 ttc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
     || |||||||||| || |||||| | ||  ||||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  38898436 gtcaatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 38898376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 197
Target Start/End: Original strand, 20110556 - 20110724
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20110556 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagc-----------tatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20110644  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaac 197  Q
    |||| |||  ||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  20110645 gcaagtcaataacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaac 20110724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 133
Target Start/End: Original strand, 22072913 - 22073033
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  22072913 acatcatcatcttaatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcactatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 22073012  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatct 133  Q
    || || || ||| ||||||||    
T  22073013 aaatgtaagtcaacaacatct 22073033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 143
Target Start/End: Original strand, 13831373 - 13831498
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||| || |    
T  13831373 tcatcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaaca-cggtagtatacaaaaacaacatgacataataatataaaat 13831471  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattca 143  Q
    |||| ||| |||| ||| || ||||||    
T  13831472 gcaagtcaacaacgtctcaattattca 13831498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 190
Target Start/End: Original strand, 15211480 - 15211633
Alignment:
Q  37 gactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtat-acaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatctta 135  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||| |||| |||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||| |    
T  15211480 gactgactcatgcaacttagttaattaacaacagcagcataggcagaatcacaacaacatcatgacataacaatatcatttataattca-caacatctca 15211578  T
Q  136 aatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaa 190  Q
    | |||||||  |  |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15211579 attattcaataaaacttcaagcgatgtatacaacattatatcacatcataatcaa 15211633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 133
Target Start/End: Original strand, 67745 - 67864
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  67745 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 67843  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatct 133  Q
     | ||||| ||| ||||||||    
T  67844 gaatgcaaatcaacaacatct 67864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 28505419 - 28505321
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  28505419 acatcatcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 28505321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 112
Target Start/End: Original strand, 34200786 - 34200884
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  34200786 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 34200884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 811248 - 811086
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  811248 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 811150  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacat 181  Q
    |||| |||| |||||| |||| | ||||| ||  |||| ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  811149 gcaagtcattaacatcataaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacat 811086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 16219834 - 16219672
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  16219834 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 16219736  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacat 181  Q
    |||| |||||||||||||||| | ||||| ||  |||| ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  16219735 gcaagtcatcaacatcttaaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacat 16219672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 26356156 - 26355983
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagg----------cagtatacaaaaacagcatgacataat 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |            ||||||||||||||||||| |||||||    
T  26356156 tcatcatcttaatcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataacaacaacaacacaacataaacacaacagtatacaaaaacagcataacataat 26356057  T
Q  107 aatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||||||| ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  26356056 aatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 26355983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 26358608 - 26358435
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagg----------cagtatacaaaaacagcatgacataat 106  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |            ||||||||||||||||||| |||||||    
T  26358608 tcatcatcttaatcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataacaacaacaacacaacataaacacaacagtatacaaaaacagcataacataat 26358509  T
Q  107 aatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||||||| ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  26358508 aatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 26358435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 33 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 12756817 - 12756622
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatc 132  Q
    ||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | | |||| ||    
T  12756817 cttagaccgactcgagcagtttagttaaataacaacagcaacacaa-caatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtaaacaacgtc 12756719  T
Q  133 ttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 229  Q
    | || |||||| |||   ||||||||||| |||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||| |||||||| || |||||    
T  12756718 tcaattattcacataaaattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcatcacagatcatcattaa 12756622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 137
Target Start/End: Original strand, 47831807 - 47831930
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| | | | || ||||| |||| ||||||    
T  47831807 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgc-atatcatcatgatataacaatatc 47831905  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaa 137  Q
     | ||||| ||||||||||| ||||    
T  47831906 gaatgcaagtcatcaacatcataaa 47831930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 112
Target Start/End: Original strand, 16495402 - 16495500
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  16495402 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 16495500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 140
Target Start/End: Original strand, 18005650 - 18005772
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||   ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  18005650 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataagcagtat-ggaaatcatcatgatataacaatatcgaat 18005748  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatat 140  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||    
T  18005749 gcaaatcaacaacatctcaaatat 18005772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1868101 - 1867895
Alignment:
Q  29 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagc--atgacataataatatcaattgcaattcat 125  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||  |||| |||| ||||||||| |||| | |     
T  1868101 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaactaacaacaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatataacaatatcaat-gcaaatgaa 1868004  T
Q  126 caacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataa 225  Q
    |||||||| ||| || || ||||  |||| |||||| |||||  | |||||||||| || | |||||||||  ||||||||| |||||||||||| || |    
T  1868003 caacatctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatcttaaaaagcttcacagatcatca 1867905  T
Q  226 ttaacatcat 235  Q
    |||| |||||    
T  1867904 ttaatatcat 1867895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15755008 - 15754833
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaac-agcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||| ||||| ||||  || ||||| |||||||||||    
T  15755008 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgcaaac-catcatgatataataatatc 15754910  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacat 193  Q
     | |||||   ||||||| || |||||| |||| ||   ||| ||||||||||||  ||||||| |||| |||| ||||||    
T  15754909 gaatgcaa---atcaacaactcaaatat-caaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacat 15754833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 63 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 2530208 - 2530126
Alignment:
Q  63 aacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaata 147  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  2530208 aacaacagcaacataggcaacatacaaa--caacatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaatattcaaata 2530126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19486865 - 19486649
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    |||||| |||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||  |||  | |||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||    
T  19486865 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatc 19486767  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 211  Q
        | || | | |||||||| ||||| ||| ||||  ||||||| ||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
T  19486766 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagttatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagc 19486667  T
Q  212 ttcacagattataattaa 229  Q
    ||||||||| || |||||    
T  19486666 ttcacagatcatcattaa 19486649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 90
Target Start/End: Original strand, 44014182 - 44014255
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 90  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  44014182 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 44014255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 20 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 18154956 - 18154873
Alignment:
Q  20 tcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 103  Q
    ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  18154956 tcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcaacataggcagattacaacaacagtatgacat 18154873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 11996148 - 11996051
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatat 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||    
T  11996148 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcatcttagttaattaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatat 11996051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 36 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 12255892 - 12255730
Alignment:
Q  36 agactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacag-catgacataataatatcaattgcaattcatcaacatct 133  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||   |  ||||| |||| |||||||| || |||||  ||||||||    
T  12255892 agacagactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagtcagtatgcaaatcaattcatgatataacaatatcaaatgaaattctacaacatct 12255793  T
Q  134 taaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 196  Q
     ||| ||||| ||||  ||||||||||  |||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  12255792 caaacattcatatataattcaagtaatacatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 12255730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 17138177 - 17138006
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaac-agcatgacataataatatcaatt 116  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| ||| | ||||  ||||| ||| |||||    
T  17138177 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaacataggcagattacaacaacaatcatg--ataattataccaatt 17138080  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaaca 192  Q
     ||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||| ||||||    
T  17138079 -caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcatattcaaca 17138006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 41 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15008593 - 15008398
Alignment:
Q  41 gactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaa 137  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||| |||||| |||| |||  ||||| |||| ||||||||| |||| ||| ||||| || |||    
T  15008593 gactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatataaaa-cagttcatgatataacaatatcaat-gcaaatcaacaacacctcaaa 15008496  T
Q  138 tattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataattaacatcat 235  Q
     || || ||||  ||||||||||| |||||  | |||||||||| || | |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  15008495 cat-catatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatcttataacagcttcacagattatcattaatatcat 15008398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 181
Target Start/End: Original strand, 16056343 - 16056493
Alignment:
Q  29 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatca 127  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |  ||||| ||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||    
T  16056343 tcaacttagaccgactgatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacattatgc--aaacaacatgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca 16056440  T
Q  128 acatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacat 181  Q
    |||||| ||| | ||||| ||  |||| ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  16056441 acatctcaaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacat 16056493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 10063939 - 10063841
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    |||||| || ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| | | |||| ||||| |||||||||||    
T  10063939 acatcaacaccttcaacgacttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcggtatgc-acaacatcatgatataataatatc 10063841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 191
Target Start/End: Original strand, 12187019 - 12187189
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacag-catgacataataatatcaatt 116  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||  |||  |||||  |||| ||| |||||    
T  12187019 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaacataggcagattacaattacaatcatga--taattataccaatt 12187116  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaac 191  Q
     ||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||| |||||    
T  12187117 -caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcatattcaac 12187189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 91
Target Start/End: Original strand, 12901338 - 12901401
Alignment:
Q  29 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa 91  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  12901338 tcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatacaaaa 12901401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 15113031 - 15113125
Alignment:
Q  102 ataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaac 197  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||||||||| || |||||| ||||   ||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15113031 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaa-tattcacatataactcaagtaatatatatacaattatatcacattataattaacatcaac 15113125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 197
Target Start/End: Original strand, 15116568 - 15116662
Alignment:
Q  102 ataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaac 197  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||   ||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||  |||||||||    
T  15116568 ataacaatatcaattgcaagtcatcaacatc-tcaatattcacatataactcaagtaatatatatacaattatatcacattataaataacatcaac 15116662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 84
Target Start/End: Original strand, 14044761 - 14044817
Alignment:
Q  29 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 84  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  14044761 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagta 14044817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 84
Target Start/End: Original strand, 14354791 - 14354847
Alignment:
Q  29 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 84  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  14354791 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagta 14354847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 2832561 - 2832499
Alignment:
Q  15 catcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 77  Q
    |||||||||||| |||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  2832561 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcata 2832499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 19649606 - 19649521
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 103  Q
    ||||||||| |||| |||| || |||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| |||  ||||| ||||  |||||||    
T  19649606 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcatagacagattacaacaacaatatgacat 19649521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 20220290 - 20220129
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaac 129  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||| |  |||||||  ||||| |||| |||||||| |||||   ||||||    
T  20220290 cttagaccgactcatacagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtaca-taaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaa---atcaac 20220195  T
Q  130 atcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 196  Q
    |||| ||| | ||| ||||  |||| |||||| |||||  |||||||||||| || | |||||||||    
T  20220194 atctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacaattatatcacattattaacaacatcaa 20220129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 20569691 - 20569654
Alignment:
Q  40 tgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 77  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  20569691 tgactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacata 20569654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 9446252 - 9446216
Alignment:
Q  41 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 77  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9446252 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacata 9446216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 14 - 256
Target Start/End: Original strand, 1851 - 2093
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1851 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 1950  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1951 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaatagctt 2050  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 256  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  2051 cacagattataattaacatcctcattaagtcttaatactatcc 2093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 75)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 14 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 23390617 - 23390375
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23390617 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 23390518  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23390517 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaatagctt 23390418  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 256  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  23390417 cacagattataattaacatcctcattaagtcttaatactatcc 23390375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 8286964 - 8286728
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaa-cagcatgacataataatatc 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8286964 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaacagcatgacataataatatc 8286865  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286864 aattgcaattcatcaacatcttaaataatcaaacattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 8286765  T
Q  213 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8286764 tcacataatataattaacatcttcattaagtcttaat 8286728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 14 - 253
Target Start/End: Original strand, 25421532 - 25421771
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25421532 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 25421631  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25421632 attgcaagtcaacagcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 25421731  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25421732 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatgcta 25421771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 253
Target Start/End: Original strand, 25431395 - 25431633
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25431395 acatcatcatcttcataaa-ttagaccgactcatgcatcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 25431493  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25431494 attgcaagtcaacaacatcttaaatgttcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 25431593  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25431594 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatgcta 25431633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 253
Target Start/End: Original strand, 22075018 - 22075258
Alignment:
Q  14 acatcatcat-cttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22075018 acatcatcattcttcaacaacttagaccgactcattcagcttagttaaataacaacagcaacataggaagtatacaaaatcaacatgacataataatatc 22075117  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 212  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22075118 aattgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagct 22075217  T
Q  213 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 253  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  22075218 tcacatattataattaacctcttcattaagtcttaatgcta 22075258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Original strand, 9077952 - 9078183
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9077952 acatcatcatcttcatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatca 9078051  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    | ||||| ||| |||||||| || ||| ||   ||   ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9078052 agtgcaagtcaacaacatctcaattatacattcataactcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 9078151  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtct 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9078152 cacagattataattaacatcatcattaagtct 9078183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 24493569 - 24493803
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24493569 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaagtaacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 24493667  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  24493668 aatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtgatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacatatcttaaatagctt 24493767  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24493768 cacagattataattaacatcattattaagtcttaat 24493803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 13025311 - 13025545
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  13025311 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacatattgatatca 13025409  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  13025410 aatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgtacataacattatatcacatcgtaatcaacatcaacatatcttaaacaactt 13025509  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13025510 cacatattataattaacatcatcattaagtcttaat 13025545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 13095495 - 13095729
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  13095495 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacatattgatatca 13095593  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  13095594 aatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgtacataacattatatcacatcgtaatcaacatcaacatatcttaaacaactt 13095693  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13095694 cacatattataattaacatcatcattaagtcttaat 13095729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 17 - 243
Target Start/End: Original strand, 24529223 - 24529449
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  24529223 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataatgatatcaaat 24529322  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 216  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||| ||   ||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529323 gcaagtcaacaacatcttaattatacattcatatctcaagtaatgcttataacattatatcacatcatattcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 24529422  T
Q  217 agattataattaacatcatcattaagt 243  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    
T  24529423 agattatagttaacatcatcattaagt 24529449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Original strand, 1096467 - 1096698
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  1096467 acatcaacatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggtagtatgcaaaaacaacataacataataatatca 1096566  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    | ||||| ||| |||||||| | |||| ||   ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1096567 aatgcaaatcaacaacatctcacatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 1096666  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtct 245  Q
    || || |||||||||||||| |||||||||||    
T  1096667 cataggttataattaacatcctcattaagtct 1096698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 14 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 21808510 - 21808343
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21808510 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatca 21808411  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacat 181  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  21808410 attgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacat 21808343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21293090 - 21292856
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||    
T  21293090 acatcatcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac--aaacagtatgacataataatatca 21292993  T
Q  114 --attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagc 211  Q
      |||  |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||| |    
T  21292992 atattcaaattcatcaacatcttaggtatacaattattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacaac 21292894  T
Q  212 ttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  21292893 ttcacagattataattaacctcattattaagtcttaat 21292856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 21729185 - 21729018
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21729185 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatca 21729086  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacat 181  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  21729085 attgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaatattatatcacat 21729018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 229
Target Start/End: Original strand, 18418594 - 18418793
Alignment:
Q  28 atcaacttagactgactcatgcagcttagttaaa-taacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatc 126  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  18418594 atcaacttagactgactcgtgcaacttagttaaaataacaacatcaacataggcagtatacaaa--cagcatgacataataatatcatttgcaattca-c 18418690  T
Q  127 aacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttcacagattataa 225  Q
    |||||||||| |||||||  |  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18418691 aacatcttaa-tattcaataaaacttcaagtaatgtacacaacattatatcacatcataatcaatgtcaaaacatcttaaaacagcttcacaggttataa 18418789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 21997655 - 21997549
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21997655 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 21997556  T
Q  114 attgcaa 120  Q
    | |||||    
T  21997555 aatgcaa 21997549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 229
Target Start/End: Original strand, 22412187 - 22412388
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  22412187 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacgataacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 22412285  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 216  Q
    |||| ||| |||||||| |||||| ||   ||  ||||||||      ||||     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22412286 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagta------ataa----gtatgacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 22412375  T
Q  217 agattataattaa 229  Q
    |||||||||||||    
T  22412376 agattataattaa 22412388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 264930 - 264768
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  264930 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 264832  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  264831 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 264768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 39363384 - 39363546
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39363384 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 39363482  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  39363483 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 39363546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 10733102 - 10732941
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10733102 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 10733004  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcac 179  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  10733003 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcac 10732941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 20909012 - 20909174
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20909012 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20909110  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  20909111 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20909174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 29329934 - 29330096
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  29329934 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 29330032  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  29330033 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29330096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 42245527 - 42245365
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42245527 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 42245429  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  42245428 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 42245365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 11581361 - 11581151
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  11581361 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 11581263  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttca 215  Q
    |||| |||  ||| ||| || ||||||  |||  |||||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| || |||||    
T  11581262 gcaagtcaataacgtctcaattattcacgtataattcaagtaatgtatatacaattatatcacaatataa-caacatcaa-tcatcataaatcaacttca 11581165  T
Q  216 cagattataattaa 229  Q
    |||||||| |||||    
T  11581164 cagattatcattaa 11581151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 29345980 - 29346142
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29345980 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaacagcatcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 29346078  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  29346079 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29346142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 36154942 - 36154783
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36154942 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaaca-ca---gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 36154847  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  36154846 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 36154783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 29348453 - 29348615
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29348453 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataagaacagcatcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 29348551  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  29348552 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29348615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 29350926 - 29351088
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29350926 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataagaacagcatcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 29351024  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  29351025 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29351088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 39245136 - 39245298
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39245136 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 39245234  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| |||  ||| ||  || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||| ||||||    
T  39245235 gcaagtcaataacgtcccaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcaca 39245298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 18319193 - 18319033
Alignment:
Q  20 tcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 119  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18319193 tcatcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 18319095  T
Q  120 attc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    | || |||||| ||| || |||||| ||||  ||||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  18319094 agtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 18319033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 20902172 - 20902008
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcat-caacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 115  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20902172 tcatcatcttaattcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaag 20902074  T
Q  116 tgcaattcatcaacatcttaaata-ttcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    ||||| ||| |||| ||| || || |||| ||||  ||||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  20902073 tgcaagtcaacaacgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcaca 20902008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 2154776 - 2154613
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2154776 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaact 2154678  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaata-ttcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || || |||| ||||  ||||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  2154677 gcaagtcaacaacgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcaca 2154613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 32027393 - 32027555
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32027393 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacaacaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 32027491  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
     ||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  32027492 ccaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 32027555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 10775838 - 10775675
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |    
T  10775838 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgacagcgacaca-gcagtatataaaaccagcatgacataataatatcaaat 10775740  T
Q  117 gcaattc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| || |||||| ||| || |||||| ||||  ||||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  10775739 gcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 10775675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 17517320 - 17517192
Alignment:
Q  16 atcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 115  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||  ||||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  17517320 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaat 17517221  T
Q  116 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaa 144  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||    
T  17517220 cgcaattcaacaacatcttaaatattcaa 17517192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 33 - 235
Target Start/End: Original strand, 22144068 - 22144271
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacat 131  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  22144068 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacatcaacataggtagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaattgcaaatcaacaacat 22144166  T
Q  132 cttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataattaac 230  Q
    || ||| ||||| ||||  ||||||||||| |||||  ||||||||||||  ||| |||||||||  ||||||| |||| |||||||| | || |||||     
T  22144167 ctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattgtaaacaacatcaattcatcttataacaacttcacaggtcatcattaat 22144266  T
Q  231 atcat 235  Q
    |||||    
T  22144267 atcat 22144271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 63 - 189
Target Start/End: Original strand, 18356364 - 18356488
Alignment:
Q  63 aacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgt 162  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||     
T  18356364 aacaacagcaacataggcagcatacaaa--cagcatgatataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaatattcaaatatttcttaagtaatgc 18356461  T
Q  163 atataacattatatcacatcataatca 189  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  18356462 ataaaacattatatcacattataatca 18356488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 31061068 - 31061231
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31061068 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaaaaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 31061166  T
Q  117 gcaattc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| || |||||| | | || |||||| | ||  || || ||||| |||||| |||||||||||    
T  31061167 gcaagtcaatcaacgtatcaattattcacaaataatttaattaatgcatataaaattatatcaca 31061231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 221
Target Start/End: Original strand, 37723910 - 37724108
Alignment:
Q  21 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 119  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| || ||||||| |  |    
T  37723910 catcttcaacatcttagactgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatac---aacagcatgacatgattatatcaaattaa 37724006  T
Q  120 attcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatg-tatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacag 218  Q
    |||||||||||||| ||  |||||   ||  |||||||||||  ||  ||||||||||||||||||| ||||||  ||||  ||  ||||||||||||||    
T  37724007 attcatcaacatctcaatcattcattcataattcaagtaatgcaattaaacattatatcacatcatattcaacactaacatctc-aaaacagcttcacag 37724105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 18 - 196
Target Start/End: Original strand, 21565546 - 21565723
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  21565546 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtat-ccaaatcatcatgatataacaatatcgaat 21565644  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 196  Q
    |||| |||||||||| | ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||  ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  21565645 gcaagtcatcaacatttcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 21565723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 120
Target Start/End: Original strand, 38619434 - 38619536
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38619434 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 38619532  T
Q  117 gcaa 120  Q
    ||||    
T  38619533 gcaa 38619536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 20918110 - 20918017
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatat 111  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20918110 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacaaaataatat 20918017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 151 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22107357 - 22107259
Alignment:
Q  151 ttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    ||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22107357 ttcaagtaatgcataatatattatatcacatcataatcaacaacaacacaccttaaacagcttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaat 22107259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 20910869 - 20910745
Alignment:
Q  63 aacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaata-ttcttcaagtaatg 161  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||| ||||||||    
T  20910869 aacaacagcaacatagacagcatacaaa--cagcatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaacattcaaataattctt-aagtaatg 20910773  T
Q  162 tatataacattatatcacatcataatca 189  Q
     ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  20910772 cataaaacattatatcacattataatca 20910745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 120
Target Start/End: Original strand, 23064512 - 23064613
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 117  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  23064512 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacctaataatatcaaatg 23064610  T
Q  118 caa 120  Q
    |||    
T  23064611 caa 23064613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 152 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 21986130 - 21986037
Alignment:
Q  152 tcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtct 245  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  21986130 tcaagtaatgcatataacattttatcacctcatattcaacatcaacacatcttaaacaacttcacaaattatagttaacatcatcatcaagtct 21986037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 21329618 - 21329452
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||| | |||| ||||||    
T  21329618 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcataatataacaatatc 21329520  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacat 181  Q
     | | ||| ||||||||||| |||| | ||||| ||  |||| ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  21329519 gaattcaagtcatcaacatcataaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacat 21329452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 21502277 - 21502111
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||   ||| |||||||| |||| ||||||    
T  21502277 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtat-gtaaatcagcatgatataacaatatc 21502179  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacat 181  Q
     | ||||| |||||| ||||||||| | ||||| ||  |||| ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  21502178 gaatgcaagtcatcatcatcttaaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacat 21502111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 21873254 - 21873453
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 117  Q
    |||||||||  ||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| | ||||||||| | |||||||||||      
T  21873254 catcatcttattcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaaaagcagcataggcaggatacaacatcagcatgacttcataatatcaatct 21873353  T
Q  118 caattcatcaacatcttaaatattcaaatat-tcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 216  Q
    || |   ||||||||||||  ||||||  || |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  || | |||||||||||    
T  21873354 catt---tcaacatcttaaccattcaataatatctt-aagtaatgcacataacattatatcacatcatattcaacattaacatttcat-aacagcttcac 21873448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 19660956 - 19660879
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 90  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  19660956 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 19660879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 180
Target Start/End: Original strand, 24067110 - 24067270
Alignment:
Q  20 tcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 119  Q
    ||||||| |||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  24067110 tcatcttaatcaacttagaccgaccaatgcagcttggttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 24067208  T
Q  120 attc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    | || |||| | ||| || |||||| ||||  ||||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  24067209 agtcaatcatcgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 24067270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 33 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 20027043 - 20026942
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaac 129  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  20027043 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat-ccaaaacagttcatgatataataatatcaaatgcaattcaacaac 20026945  T
Q  130 atc 132  Q
    |||    
T  20026944 atc 20026942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 22959649 - 22959576
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 90  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  22959649 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 22959576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 112
Target Start/End: Original strand, 36314577 - 36314675
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  36314577 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 36314675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 26012154 - 26011988
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  26012154 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaagcaacatgatataacaatatc 26012058  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatca 183  Q
    || ||  | ||| |||||||| ||| | ||||| ||  |||| ||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  26012057 aaatgtgaatcaacaacatctcaaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacatca 26011988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 103
Target Start/End: Original strand, 26704075 - 26704160
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 103  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  26704075 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacat 26704160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 103
Target Start/End: Original strand, 26973808 - 26973893
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 103  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  26973808 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacat 26973893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 40725853 - 40726069
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    |||||| |||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||  |||  | ||||||| |||||||||| ||||  || ||||| |||||||||||    
T  40725853 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaag-catcatgatataataatatc 40725951  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 211  Q
        | || | | |||||||| ||||| ||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
T  40725952 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagc 40726051  T
Q  212 ttcacagattataattaa 229  Q
    ||||||||| || |||||    
T  40726052 ttcacagatcatcattaa 40726069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 192
Target Start/End: Original strand, 22032323 - 22032492
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 117  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||| | | |||||  |||| ||| |||||     
T  22032323 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaacataggcagattacaaaca-atcatga--taattataccaatt- 22032418  T
Q  118 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaaca 192  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||| ||||||    
T  22032419 caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcatattcaaca 22032492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 14 - 90
Target Start/End: Original strand, 19668898 - 19668975
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 90  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||    
T  19668898 acatcatcatcatcatcaacttagaccgactcttgcagctcagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcaaa 19668975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 18770118 - 18769947
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaac-agcatgacataataatatcaatt 116  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||||||||||  ||||| ||| | ||||  ||||| ||| |||||    
T  18770118 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggtcgaataacaatagcaacataggcagattacaacaacaatcatg--ataattataccaatt 18770021  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaaca 192  Q
     ||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||| ||||||    
T  18770020 -caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcatattcaaca 18769947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 191
Target Start/End: Original strand, 23572084 - 23572254
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacag-catgacataataatatcaatt 116  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||||| ||||||| |||||||| | || |||||||||   |||| ||||  |||||  |||| ||| |||||    
T  23572084 catcatcttaatcatcttatatggactcatgcaacttagttcaataacaataacagcataggcagatcacaacaacaatcatga--taattataccaatt 23572181  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaac 191  Q
     ||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  23572182 -caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcataatcaac 23572254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 17 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 20806904 - 20806850
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagc 71  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20806904 tcatcatcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttaattaaataacaacagc 20806850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 26732937 - 26732884
Alignment:
Q  30 caacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagt 83  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26732937 caacatagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagt 26732884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 178 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20766087 - 20766035
Alignment:
Q  178 acatcataatcaacatcaacacat-cttaaacagcttcacagattataattaa 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  20766087 acatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagcttcacagattatcattaa 20766035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 80 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 20766174 - 20766115
Alignment:
Q  80 cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 140  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  20766174 cagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatat 20766115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 26740747 - 26740697
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagt 83  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  26740747 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacatagacagt 26740697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 82
Target Start/End: Original strand, 20805552 - 20805616
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 82  Q
    |||||||||  ||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  20805552 catcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcag 20805616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 81
Target Start/End: Original strand, 20766974 - 20767037
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggca 81  Q
    |||||||||  ||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  20766974 catcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggca 20767037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22178323 - 22178161
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaac 129  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||| || ||||||||||||||||  |||||||  ||||| || | |||||||| ||||| ||| ||||    
T  22178323 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtata-taaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaac 22178225  T
Q  130 atcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatc 194  Q
    |||| ||| | ||| ||||  |||| |||||| |||||   ||||||||||| || | |||||||    
T  22178224 atctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatc 22178161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 82
Target Start/End: Original strand, 23469822 - 23469871
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 82  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  23469822 cttagaccgactcatgcagcttaattaatatacaacagcaacataggcag 23469871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 63 - 133
Target Start/End: Original strand, 29448052 - 29448123
Alignment:
Q  63 aacaacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaacatct 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  29448052 aacaacagcaacataggcagtata-taaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatct 29448123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 82
Target Start/End: Original strand, 23512098 - 23512162
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 82  Q
    |||||||||  ||| |||| | |||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  23512098 catcatcttattcatcttataatgactcatgcactttagttaaataacaatagcagcataggcag 23512162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 77
Target Start/End: Original strand, 26680605 - 26680641
Alignment:
Q  41 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 77  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  26680605 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcagcata 26680641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 77
Target Start/End: Original strand, 26952212 - 26952248
Alignment:
Q  41 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 77  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  26952212 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcagcata 26952248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 73)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 14 - 256
Target Start/End: Original strand, 44052829 - 44053071
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44052829 acatcatcatcttcatcaacttaggccgactcatgcagctcagttaaataacaacatcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 44052928  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44052929 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgctcataacattatatcacatcataatcaacatcagcacatcttaaacagctt 44053028  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44053029 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 44053071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 12902757 - 12902992
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902757 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 12902856  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12902857 attgtaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagctt 12902956  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  12902957 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaat 12902992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 253
Target Start/End: Original strand, 7088877 - 7089116
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7088877 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 7088976  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||    
T  7088977 attgcaattcatcaacatcttacatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataattagcaacaacacatcttaaacaactt 7089076  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 253  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  7089077 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgcta 7089116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 16 - 249
Target Start/End: Original strand, 22636437 - 22636669
Alignment:
Q  16 atcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 115  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22636437 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacatagacagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaat 22636536  T
Q  116 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22636537 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcgacatcaacacatctt-aacagcttca 22636635  T
Q  216 cagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  22636636 cagattataattaacatcctcgttaagtcttaat 22636669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 7893703 - 7893935
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7893703 acatcatcatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 7893802  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||   || ||||||||||||||||||||    
T  7893803 attgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataccattatttcacatcataat---cagcaacacatcttaaacagctt 7893899  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7893900 cacagattataattaacatcatcgttaagtcttaat 7893935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16240090 - 16239856
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16240090 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttaattaaataacaatagcaaaataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 16239992  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16239991 aatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatactttaagtaatgcaaataacattatatcatatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 16239892  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16239891 cgcagattataattaacatcatcattaagtcttaat 16239856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16270356 - 16270140
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16270356 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 16270258  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    | ||||| | | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16270257 aatgcaagttaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 16270158  T
Q  214 cacagattataattaaca 231  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  16270157 cacagattataatcaaca 16270140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23374473 - 23374241
Alignment:
Q  21 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 120  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  23374473 catcttcaacaacttagaacgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaa 23374374  T
Q  121 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagat 220  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  23374373 ttcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacagatcttaaaaagcttcagagat 23374274  T
Q  221 tataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 253  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  23374273 tatagttaacctcttcattaagtcttaatgcta 23374241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 198
Target Start/End: Original strand, 7798774 - 7798958
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7798774 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 7798873  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaaca 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  7798874 attgcaagtcatcaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattgtatcacaacataatcaacatcaaca 7798958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 245
Target Start/End: Original strand, 14038653 - 14038879
Alignment:
Q  19 atcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgc 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||    
T  14038653 atcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacatgcagtatacaaaaacaacatggcataataatatcaaatgc 14038752  T
Q  119 aattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacag 218  Q
    || ||| |||||||| || ||| ||   ||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14038753 aagtcaacaacatctcaattatacattcatatttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatgttaaacagcttcacag 14038852  T
Q  219 attataattaacatcatcattaagtct 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  14038853 attataattaatatcatcattaagtct 14038879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 17 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16377639 - 16377413
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  16377639 tcattatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaa--cagcatgacataataatatcaaat 16377542  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 216  Q
    |||| ||| |||||||| || ||| ||   ||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  16377541 gcaagtcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctccac 16377442  T
Q  217 agattataattaacatcatcattaagtct 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16377441 agattataattaacatcatcattaagtct 16377413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 14053422 - 14053188
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    ||||||||||||||| || ||||||  |||||||||| |||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  14053422 acatcatcatcttcaacatcttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaaacaacagcatagacagtatacaaa--cagcatgacataataatatc 14053325  T
Q  113 aattgcaattcatcaacat-cttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagc 211  Q
    |||| |||||||||||||| ||||   || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||    
T  14053324 aatttcaattcatcaacattcttatgcatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacaacatatcttatacggc 14053226  T
Q  212 ttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  14053225 ttcacagattataattaacctcattgttaagtcttaat 14053188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 17046487 - 17046719
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||   ||||||||| |||||    
T  17046487 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatagaacaaca---tgacataattatatc 17046583  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 212  Q
    || | ||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||  |||||    
T  17046584 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgtata-aacattataacacatcttaatcaacaacaacatatcttattcagct 17046682  T
Q  213 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  17046683 tcacagattataattaaccttattattaagtcttaat 17046719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 186
Target Start/End: Original strand, 6899891 - 6900062
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  6899891 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacaacatagcataataatatca 6899989  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataa 186  Q
    | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  6899990 aatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgtacataacattatatcacatcataa 6900062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 52873488 - 52873363
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873488 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 52873389  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaata 139  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||    
T  52873388 attgcaagtcaacatcatcttaaata 52873363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 17 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 44929042 - 44928829
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  44929042 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatgtcaaat 44928943  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttca 215  Q
    |||| |||  ||||||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||  |||| |||||| ||  |||| |||| ||||||||    
T  44928942 gcaagtcaataacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataaacaacataaaatcatcataaatcagcttca 44928843  T
Q  216 cagattataattaa 229  Q
    ||||| || |||||    
T  44928842 cagatcatcattaa 44928829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 18215436 - 18215274
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18215436 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18215338  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  18215337 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 18215274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 54798872 - 54798669
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  54798872 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 54798773  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttca 215  Q
    |||| ||| |||||||| |||||| ||   ||  ||||||||      ||||     ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54798772 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagta------ataa----gtatgacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttca 54798683  T
Q  216 cagattataattaa 229  Q
    |||||||| |||||    
T  54798682 cagattatcattaa 54798669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 12469 - 12307
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12469 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 12371  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  12370 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 12307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 1837671 - 1837494
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  1837671 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataataccaaat 1837573  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 196  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  1837572 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacgattatatcacattataa-caacatcaa 1837494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 15118514 - 15118352
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15118514 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 15118416  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  15118415 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 15118352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 23803427 - 23803265
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23803427 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23803329  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  23803328 gcaaatcaacaacgtctaaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 23803265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 52312510 - 52312672
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  52312510 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 52312608  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  52312609 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 52312672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 180
Target Start/End: Original strand, 19242693 - 19242861
Alignment:
Q  11 tggacatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataata 110  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242693 tggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataata 19242791  T
Q  111 tcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  19242792 tcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 19242861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 3515007 - 3515169
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  3515007 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaaaaacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcaagacataataatatcaaat 3515105  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  3515106 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 3515169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 44615288 - 44615450
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  44615288 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 44615386  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  44615387 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 44615450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 44773249 - 44773087
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44773249 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 44773151  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| | ||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  44773150 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacaaataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 44773087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 50222501 - 50222339
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50222501 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acattatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 50222403  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  50222402 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 50222339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 51464030 - 51463868
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51464030 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 51463932  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  51463931 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaaataatgcatatataattatatcaca 51463868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 229
Target Start/End: Original strand, 14280316 - 14280518
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  14280316 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca-cggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 14280414  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttca 215  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||  |   ||  ||||||||      ||||     ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14280415 gcaagtcaacaacatctcaaatatagattcataattcaagta------ataa----gtatgacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttca 14280504  T
Q  216 cagattataattaa 229  Q
    |||||||| |||||    
T  14280505 cagattatcattaa 14280518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 19618336 - 19618172
Alignment:
Q  15 catcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 114  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19618336 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaa 19618238  T
Q  115 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
     ||||| ||| |||| ||| || ||||||  |||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  19618237 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacctataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 19618172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 18239581 - 18239419
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18239581 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcagcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18239483  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||| ||||||    
T  18239482 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcaca 18239419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 15367690 - 15367905
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15367690 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 15367788  T
Q  114 attgcaattc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 211  Q
    | ||||| || |||||| ||| || |||||| ||||  ||||| ||| | |||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
T  15367789 aatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagc 15367887  T
Q  212 ttcacagattataattaa 229  Q
    ||||||||| || |||||    
T  15367888 ttcacagatcatcattaa 15367905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 15402703 - 15402918
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15402703 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 15402801  T
Q  114 attgcaattc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 211  Q
    | ||||| || |||||| ||| || |||||| ||||  ||||| ||| | |||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
T  15402802 aatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagc 15402900  T
Q  212 ttcacagattataattaa 229  Q
    ||||||||| || |||||    
T  15402901 ttcacagatcatcattaa 15402918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 229
Target Start/End: Original strand, 44102214 - 44102425
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44102214 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaataacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 44102312  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttca 215  Q
    |||| | | |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||  |||| || ||||||  |||| |||| ||||||||    
T  44102313 gcaagtaaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-catcatcaaatcatcataaatcagcttca 44102411  T
Q  216 cagattataattaa 229  Q
    ||||| || |||||    
T  44102412 cagatcatcattaa 44102425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 33 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 13953 - 13790
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacat 131  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  13953 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 13855  T
Q  132 cttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 196  Q
    || ||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  13854 ctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 13790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 15355483 - 15355324
Alignment:
Q  21 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 120  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15355483 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 15355385  T
Q  121 ttc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
     || |||||| ||| || |||||| ||||  ||||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  15355384 gtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 15355324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 100
Target Start/End: Original strand, 3096293 - 3096379
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatga 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3096293 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatga 3096379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 15371202 - 15371417
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15371202 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 15371300  T
Q  114 attgcaattc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 211  Q
    | ||||| || |||||  ||| || |||||| ||||  ||||| ||| | |||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
T  15371301 aatgcaagtcaatcaatgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagc 15371399  T
Q  212 ttcacagattataattaa 229  Q
    ||||||||| || |||||    
T  15371400 ttcacagatcatcattaa 15371417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 15373483 - 15373698
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15373483 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 15373581  T
Q  114 attgcaattc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 211  Q
    | ||||| || |||||  ||| || |||||| ||||  ||||| ||| | |||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
T  15373582 aatgcaagtcaatcaatgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagc 15373680  T
Q  212 ttcacagattataattaa 229  Q
    ||||||||| || |||||    
T  15373681 ttcacagatcatcattaa 15373698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 29 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 52243302 - 52243099
Alignment:
Q  29 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcat 125  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||  ||||| |||| |||||||| || ||||||     
T  52243302 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaat-cagttcatgatataacaatatcaaatgaaattcaa 52243204  T
Q  126 caacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattata 224  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||  | ||||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||     
T  52243203 caacatctcaaacattcatatataatccaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcttataacagcttcacagatcatc 52243104  T
Q  225 attaa 229  Q
    |||||    
T  52243103 attaa 52243099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 129 - 243
Target Start/End: Original strand, 3096759 - 3096872
Alignment:
Q  129 catcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataatta 228  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3096759 catcataaatattcaaatattcttcaagtaatgcata-aacattgtatctcatcataatcagcaacaacacatcttaaacagcttcacatattataatta 3096857  T
Q  229 acatcatcattaagt 243  Q
    || ||||||||||||    
T  3096858 acctcatcattaagt 3096872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 12610950 - 12611105
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12610950 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca--------acaaaaacagcatgacataataatatcaaat 12611041  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  12611042 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 12611105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 14970871 - 14970707
Alignment:
Q  15 catcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 114  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14970871 catcaacattttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaacag-caatatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 14970773  T
Q  115 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
     ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||  |||||  |||||||||||    
T  14970772 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatataattatatcaca 14970707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 15370018 - 15370232
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15370018 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 15370116  T
Q  114 attgcaattc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 211  Q
    | ||||| || |||||| ||| || |||||| ||||  ||||| | | | |||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
T  15370117 aatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaact-acgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagc 15370214  T
Q  212 ttcacagattataattaa 229  Q
    ||||||||| || |||||    
T  15370215 ttcacagatcatcattaa 15370232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 16223532 - 16223747
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16223532 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatct 16223630  T
Q  114 attgcaattc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 211  Q
    | ||||| || |||||| ||| || |||||| ||||  ||||| |||   |||||  |||||||||||  |||| ||||||||   |||| |||| ||||    
T  16223631 aatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaactaacccatatacaattatatcacaatataa-caacatcacatcatcataaatcagc 16223729  T
Q  212 ttcacagattataattaa 229  Q
    ||||||||| || |||||    
T  16223730 ttcacagatcatcattaa 16223747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 43198661 - 43198492
Alignment:
Q  29 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacag-catgacataataatatcaattgcaattcatc 126  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||  |  ||||| ||||  ||||||| ||||| |||||    
T  43198661 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacaatatgcaaaacaattcatgatataaccatatcaaatgcaagtcatc 43198562  T
Q  127 aacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 196  Q
    || |||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  43198561 aatatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 43198492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 137 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 17048070 - 17047958
Alignment:
Q  137 atattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatc 236  Q
    ||||||||||| |  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||   || ||    
T  17048070 atattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacaggttgtaattagtctcttc 17047971  T
Q  237 attaagtcttaat 249  Q
    |||||||||||||    
T  17047970 attaagtcttaat 17047958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 180
Target Start/End: Original strand, 22353835 - 22353999
Alignment:
Q  16 atcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 115  Q
    |||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |  |  |||| |||||||||| |||||||||    
T  22353835 atcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttaggtaaataacaacagcagcataggcagattgtagcaacaacatgacataacaatatcaat 22353934  T
Q  116 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    | ||||||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  22353935 tacaattcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22353999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 43256230 - 43256106
Alignment:
Q  63 aacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaata-ttcttcaagtaatg 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||  || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  43256230 aacaacagcaacataggcagcataccaa--caacatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaatattcaaataattctt-aagtaatg 43256134  T
Q  162 tatataacattatatcacatcataatca 189  Q
     |||||| |||||||||||| |||||||    
T  43256133 catataatattatatcacattataatca 43256106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 8574985 - 8574864
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  8574985 tcatcatcttaattaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaat 8574888  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatat 140  Q
    | |||||| |||||||| ||||||    
T  8574887 gtaattcaacaacatctcaaatat 8574864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 7641344 - 7641192
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  7641344 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaac-----------acaaaaacaacatgacataataatatcaaat 7641256  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||| | ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  7641255 gcaagtcaacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 7641192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 180
Target Start/End: Original strand, 20149832 - 20149992
Alignment:
Q  20 tcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20149832 tcatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttgataaaataacaacagcgacacat-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 20149930  T
Q  120 attc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    | || |||| | ||| || |||||| ||||  ||||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  20149931 agtcaatcatcgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 20149992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 33 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 21815731 - 21815587
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatc 132  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||| ||    
T  21815731 cttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacgacagcaacacaa-ctgtatacaaaaacagcatgacataataatataaaatgcaagtcaacaacgtc 21815633  T
Q  133 ttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatca 178  Q
    | || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||    
T  21815632 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatca 21815587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 85
Target Start/End: Original strand, 15551817 - 15551889
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtat 85  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15551817 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 15551889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 39706409 - 39706286
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  39706409 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 39706311  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaa 137  Q
     | ||||| |||| |||||| ||||    
T  39706310 gaatgcaagtcatgaacatcataaa 39706286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 90
Target Start/End: Original strand, 12774011 - 12774084
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 90  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  12774011 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 12774084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 12288316 - 12288211
Alignment:
Q  29 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcat 125  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||  ||||| |||| |||||||| |||||||||     
T  12288316 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaa 12288218  T
Q  126 caacatc 132  Q
    |||||||    
T  12288217 caacatc 12288211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 33 - 115
Target Start/End: Original strand, 6190481 - 6190564
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 115  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  6190481 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatcaat 6190564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 90
Target Start/End: Original strand, 8846360 - 8846433
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 90  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  8846360 catcatcatcatcaacttagaccgacttattcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 8846433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 198
Target Start/End: Original strand, 15093775 - 15093955
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 117  Q
    ||||||||| |||| |||  | ||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||  ||   |||| ||||||||||| | ||||||||||||     
T  15093775 catcatcttaatcatcttgtattgactcatgcaacttagttaaagaacaatagcagcatagaaagatcacaacaacagcatgacttcataatatcaattt 15093874  T
Q  118 caattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaaca 198  Q
    || |||  |||||| ||||  ||||||  ||   | |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  15093875 catttctacaacatattaatcattcaataatatattaagtaatgcacataacattatatcacatcatattcaacattaaca 15093955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 15121917 - 15121747
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacag-catgacataataatatcaatt 116  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||||| ||| ||| |||||||| | || |||||||||  ||||| || |  |||||  |||| |||||||||    
T  15121917 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatatcagcataggcagattacaacaataatcatga--taattatatcaatt 15121820  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaac 191  Q
     ||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  15121819 -caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcataatcaac 15121747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 84
Target Start/End: Original strand, 17333298 - 17333347
Alignment:
Q  35 tagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagta 84  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  17333298 tagactgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacatagacagta 17333347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 16348780 - 16348682
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||  ||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||   |||| |||||||| |  | ||||||||||||    
T  16348780 catcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaatt 16348682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 16357068 - 16356970
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||  ||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||   |||| |||||||| |  | ||||||||||||    
T  16357068 catcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaatt 16356970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8574836 - 8574784
Alignment:
Q  178 acatcataatcaacatcaacacat-cttaaacagcttcacagattataattaa 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||    
T  8574836 acatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagcttcatagattatcattaa 8574784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 46640558 - 46640499
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa 91  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| ||||    
T  46640558 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatagacagtatataaaa 46640499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 211 - 245
Target Start/End: Original strand, 15091093 - 15091127
Alignment:
Q  211 cttcacagattataattaacatcatcattaagtct 245  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15091093 cttcacagattataattaacatcttcattaagtct 15091127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 11250656 - 11250619
Alignment:
Q  40 tgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 77  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11250656 tgactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacata 11250619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 41 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 16488171 - 16488023
Alignment:
Q  41 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 140  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  |||   |||||| |||||| || | |||||||||||| |  |||| ||||||||| |  ||    
T  16488171 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaaaagcagcataacttcataatatcaatt-cttttcaacaacatcttgatcat 16488073  T
Q  141 tcaaatattcttcaagtaatgtatataa-cattatatcacatcataatca 189  Q
    ||||  ||  ||||||||||| || ||| ||||| ||||||| |||||||    
T  16488072 tcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattataatca 16488023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 196
Target Start/End: Original strand, 8846474 - 8846553
Alignment:
Q  116 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 196  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||  |||| ||||||||||||  ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  8846474 tgcaagtcatcaacatctcaaatat-caaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 8846553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 15353401 - 15353365
Alignment:
Q  41 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 77  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15353401 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacata 15353365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 53082254 - 53082202
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 84  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||    
T  53082254 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagta 53082202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 74)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 20536208 - 20536443
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536208 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagaaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 20536307  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  20536308 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcgacatcaacacatcttaaacaactt 20536407  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20536408 cacagattataattaacatcctcattaagtcttaat 20536443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18818530 - 18818286
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818530 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 18818431  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    |||| || ||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818430 attgtaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 18818331  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatccta 258  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  18818330 cacagattataattaacatcctcattaagtcttaatactacccta 18818286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 18879352 - 18879116
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||    
T  18879352 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaca-----acataataatatca 18879258  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  18879257 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgctcataacattatatcacatcataatcaacatcagcacatctt-atcagctt 18879159  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 256  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18879158 cacagattatagttaacatcatcattaagtcttgatgctatcc 18879116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21919121 - 21918886
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21919121 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 21919022  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaat-attcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  21919021 attgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcagcagcaacacatcttaaacagct 21918923  T
Q  213 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    ||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21918922 tcacagatcgtaattaacctcatcgttaagtcttaat 21918886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21924049 - 21923814
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  21924049 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtctacaaaaacaacatgacatgataatatca 21923950  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||| |||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21923949 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataaccttattttgcatcataatcaacaacaacacatcttaaacagctt 21923850  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923849 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 21923814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Original strand, 22626736 - 22626966
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  22626736 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatca 22626834  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    | | ||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22626835 aatacaaatcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgtgtataacattatatcacatcattatcatcatcaacacatcttaaacagctt 22626934  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtct 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22626935 cacagattataattaacatcctcattaagtct 22626966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 28649164 - 28648934
Alignment:
Q  15 catcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28649164 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaa 28649065  T
Q  115 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 214  Q
     ||||| ||| ||||||||||| ||| ||   ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28649064 atgcaagtcaacaacatcttaattatacattcataattcaagtaatgtgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 28648965  T
Q  215 acagattataattaacatcatcattaagtct 245  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28648964 acatattataattaacatcatcattaagtct 28648934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Original strand, 7372778 - 7373001
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7372778 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 7372877  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||         |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7372878 attgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatg--------cttatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 7372969  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtct 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7372970 cacagattataattaacatcctcattaagtct 7373001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 244
Target Start/End: Original strand, 23406379 - 23406611
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23406379 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 23406478  T
Q  114 attgcaattcatc--aacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagc 211  Q
    ||||||| ||| |  | |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  23406479 attgcaagtcaacatatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacatagtcaacatcaacacatcttaaacaac 23406578  T
Q  212 ttcacagattataattaacatcatcattaagtc 244  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  23406579 ttcacatattataattaacatcctcattaagtc 23406611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 31971257 - 31971490
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  31971257 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatca 31971355  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    ||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||    
T  31971356 attccaattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacaacatatcttatacatctt 31971454  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  31971455 cacagattataattaacctcattgttaagtcttaat 31971490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 15 - 249
Target Start/End: Original strand, 23648554 - 23648788
Alignment:
Q  15 catcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 114  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||     
T  23648554 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatagcaacataggcagattacaacaacaacatgacataataatatcat 23648653  T
Q  115 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 214  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||  |  |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23648654 ttgcaatacaacaacatcttaaatattcaataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctta 23648753  T
Q  215 acagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23648754 acagattataattaacatcatcattaggtcttaat 23648788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 245
Target Start/End: Original strand, 6759255 - 6759487
Alignment:
Q  11 tggacatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataata 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6759255 tggacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacaacatgacataataata 6759354  T
Q  111 tcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaaca 209  Q
    |||| |||||    ||||||||| || ||| ||   ||  ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6759355 tcaaatgcaa---gtcaacatctcaattatacactcataattcaattaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaaaca 6759451  T
Q  210 gcttcacagattataattaacatcatcattaagtct 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6759452 gcttcacagattataattaacatcatcattaagtct 6759487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16092463 - 16092231
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092463 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 16092364  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagct 212  Q
    | ||||| ||| |||||||| |||||| ||   ||  || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  16092363 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataatttaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacaact 16092264  T
Q  213 tcacagattataattaacatcatcattaagtct 245  Q
    || || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  16092263 tcgcatattataattaacatcatccttaagtct 16092231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 45131117 - 45130884
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  45131117 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac--aaacagcatgacataataatatca 45131020  T
Q  114 attgc-aattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 212  Q
    ||| | |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||    
T  45131019 atttcaaattcatcaacatcttaggtatacaattattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcatcaacaacaaatcttatacagct 45130921  T
Q  213 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  45130920 tcacagattataattaacctcattattaagtcttaat 45130884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Original strand, 22875065 - 22875291
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  22875065 acatcatcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcagcagcaacacaggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatca 22875163  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagct 212  Q
    | ||||| ||| |||||||| |||||| ||   ||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22875164 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagct 22875263  T
Q  213 tcacagattataattaacatcatcatta 240  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||    
T  22875264 tcacagattataattaacatcaccatta 22875291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16199765 - 16199532
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||  || |||||||||||||||||    
T  16199765 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtattcaaa--caacatgacataataatatc 16199668  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 212  Q
    |||| ||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  16199667 aatttcaattcatctacatcttaggtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatattacatcataatcaacaacaacatatcttatacagct 16199569  T
Q  213 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  16199568 tcacagattataattaacctcattgttaagtcttaat 16199532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21389571 - 21389353
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  21389571 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatacaa---cagcatgacataattatatc 21389475  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 212  Q
    || | ||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||  |||||    
T  21389474 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaacaacaacatatcttattcagct 21389376  T
Q  213 tcacagattataattaacatcat 235  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||    
T  21389375 tcacatattacaattaacttcat 21389353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21396101 - 21395888
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||    
T  21396101 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac---aacagcatgagataattatatc 21396005  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 212  Q
    || | ||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||| | ||||| ||||||  |||||    
T  21396004 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaataacaacatatcttattcagct 21395906  T
Q  213 tcacagattataattaac 230  Q
    |||||||||| |||||||    
T  21395905 tcacagattacaattaac 21395888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21790594 - 21790381
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||    
T  21790594 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac---aacagcatgagataattatatc 21790498  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 212  Q
    || | ||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||| | ||||| ||||||  |||||    
T  21790497 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaataacaacatatcttattcagct 21790399  T
Q  213 tcacagattataattaac 230  Q
    |||||||||| |||||||    
T  21790398 tcacagattacaattaac 21790381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 21778897 - 21778697
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  21778897 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatacaa---cagcatgacataattatatc 21778801  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 212  Q
    || | ||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||  |||||    
T  21778800 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaacaacaacatatcttattcagct 21778702  T
Q  213 tcaca 217  Q
    |||||    
T  21778701 tcaca 21778697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 14409606 - 14409444
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14409606 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14409508  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  14409507 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 14409444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 1484402 - 1484564
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1484402 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 1484500  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  1484501 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 1484564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 5853454 - 5853292
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5853454 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 5853356  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  5853355 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 5853292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 16413474 - 16413316
Alignment:
Q  21 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 120  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16413474 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 16413376  T
Q  121 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
     ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  16413375 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 16413316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 20403227 - 20403389
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20403227 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20403325  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  20403326 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20403389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 22001753 - 22001915
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22001753 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 22001851  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  22001852 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22001915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 229
Target Start/End: Original strand, 41598188 - 41598399
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41598188 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataacaacagcaacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 41598286  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttca 215  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||| ||||    
T  41598287 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagtttca 41598385  T
Q  216 cagattataattaa 229  Q
    ||||| || |||||    
T  41598386 cagatcatcattaa 41598399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 4483281 - 4483442
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4483281 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa-taacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 4483378  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  4483379 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 4483442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 4542535 - 4542373
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4542535 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acaagatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 4542437  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  4542436 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatatagttcaagtaatgcatatacaattatatcaca 4542373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 15203393 - 15203231
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15203393 tcatcatcttaatcaacttagagcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 15203295  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    | || ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  15203294 gtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 15203231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 20046357 - 20046195
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  20046357 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 20046259  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||| | ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  20046258 gcaagtcaacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20046195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 18678221 - 18678093
Alignment:
Q  16 atcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 115  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  18678221 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaat 18678122  T
Q  116 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaa 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18678121 tgcaattcaacaacatcttaaatattcaa 18678093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 19896265 - 19896430
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgac---ataataatatca 113  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  19896265 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acggtatacaaaaacagcatgacataataataatatca 19896363  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    | ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  19896364 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 19896430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 144
Target Start/End: Original strand, 32121734 - 32121862
Alignment:
Q  16 atcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 115  Q
    |||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  32121734 atcaacatcttaatcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaat 32121833  T
Q  116 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaa 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32121834 tgcaattcaacaacatcttaaatattcaa 32121862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 137 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 25363138 - 25363026
Alignment:
Q  137 atattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatc 236  Q
    ||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||    
T  25363138 atattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattataccacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattagcctcttc 25363039  T
Q  237 attaagtcttaat 249  Q
    |||||||||||||    
T  25363038 attaagtcttaat 25363026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 13508199 - 13508024
Alignment:
Q  21 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 119  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| || || || ||||| ||||||||||| |  |||    
T  13508199 catcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcacaa-catcatgatataataatatcgaacgca 13508101  T
Q  120 attcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 196  Q
    | | | |||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  13508100 agtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 13508024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 196
Target Start/End: Original strand, 20498581 - 20498744
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacat 131  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||  ||||  ||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  20498581 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaaat-agcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 20498679  T
Q  132 cttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 196  Q
    || ||| ||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  20498680 ctcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 20498744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 14823774 - 14823935
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14823774 tcatcatcttaatcaatttagacc-actcatgcagcaaagttaaataacaacaacaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14823871  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  14823872 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 14823935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 25484430 - 25484275
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |        ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25484430 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcgtgcagcttagttaaataacaacagcta--------gtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 25484339  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  25484338 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 25484275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 19937174 - 19937066
Alignment:
Q  11 tggacatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataata 110  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19937174 tggacttcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataaga 19937076  T
Q  111 tcaattgcaa 120  Q
    |||| |||||    
T  19937075 tcaaatgcaa 19937066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 15 - 180
Target Start/End: Original strand, 26223917 - 26224081
Alignment:
Q  15 catcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 114  Q
    ||||| |||||| |||||||||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | || || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26223917 catcaacatcttaatcaacttagatcgacccatgcagcttaattaaataacaacagcaataaag-caatatacaaaaatagcatgacataataatatcaa 26224015  T
Q  115 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
     ||||| ||| |||||||| || |||||| ||||  || || ||||| |||||  |||||||||||    
T  26224016 atgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataatttaattaatgcatatacaattatatcaca 26224081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 45290853 - 45290761
Alignment:
Q  21 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 114  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290853 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 45290761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 137
Target Start/End: Original strand, 6520368 - 6520491
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  6520368 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 6520466  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaa 137  Q
     | ||||| ||||||||||| ||||    
T  6520467 gaatgcaagtcatcaacatcataaa 6520491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 13597731 - 13597556
Alignment:
Q  21 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 119  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| || ||||| || ||||| ||||||||||| |  |||    
T  13597731 catcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataagcagaatgcaaaa-catcatgatataataatatcgaacgca 13597633  T
Q  120 attcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 196  Q
    | | | |||||||  ||||||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  13597632 agtaaacaacatcccaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 13597556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 140
Target Start/End: Original strand, 26219717 - 26219838
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |    
T  26219717 tcatcatcataatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gcagtatac-aaaatagtatgacataataatatcaaat 26219814  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatat 140  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||    
T  26219815 gcaagtcaacaacatctcaaatat 26219838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 38855372 - 38855246
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  38855372 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 38855274  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 140  Q
     | ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  38855273 gaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 38855246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 120
Target Start/End: Original strand, 15070571 - 15070660
Alignment:
Q  30 caacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 120  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15070571 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 15070660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 33 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19801527 - 19801333
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatc 132  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||    
T  19801527 cttagaccggctcatgcagcttagttaaataacaatagcaacacaa-cagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaacgcaagtcaacaacgtc 19801430  T
Q  133 ttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 229  Q
    | || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||| ||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||||||||||||| || |||||    
T  19801429 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattataacacaatataa-caacatcaagtcatcgtaaatcagcttcacagatcatcattaa 19801333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 129
Target Start/End: Original strand, 17140916 - 17141031
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||  || |||||||||||||||||    
T  17140916 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aatccatcatgacataataatatc 17141014  T
Q  113 aattgcaattcatcaac 129  Q
     | || || ||||||||    
T  17141015 gaatgtaaatcatcaac 17141031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17612231 - 17612018
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||    
T  17612231 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcaacaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatc 17612133  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 211  Q
        | || | | |||||||| ||||| ||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||   ||||||||  |||| |||| ||||    
T  17612132 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattata---aacatcaaatcatcataaatcagc 17612036  T
Q  212 ttcacagattataattaa 229  Q
    ||||||||| || |||||    
T  17612035 ttcacagatcatcattaa 17612018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 26225409 - 26225288
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  || ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  26225409 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acaatatac-aaaacagtatgacataataatatcaaat 26225312  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatat 140  Q
     ||| ||| |||||||| ||||||    
T  26225311 acaagtcaacaacatctcaaatat 26225288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 111
Target Start/End: Original strand, 21490995 - 21491092
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatat 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||    
T  21490995 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatat 21491092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 14 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 5866395 - 5866297
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  5866395 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 5866297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 21285601 - 21285758
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||| |    
T  21285601 catcttcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaat 21285699  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatat 176  Q
    |||| ||| |||||||| ||| | ||||| ||  |||| ||||||||||||  |||||||    
T  21285700 gcaaatcaacaacatctcaaaca-tcaaacatagttcatgtaatgtatatacaattatat 21285758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 23776952 - 23776772
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 117  Q
    |||||||||  ||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||   |||| | ||||||||| |  |||||||||||     
T  23776952 catcatcttattcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataactatagcagcataggcagatcacaacatcagcatgacttcttaatatcaattt 23776853  T
Q  118 caattcatcaacatcttaaatattcaaatat-tcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaaca 198  Q
    || |||| |||||||||||  ||||||  || |||| |||||||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  23776852 catttcaacaacatcttaatcattcaataatatctt-aagtaatgcacataacattatataacatcatattcaacatcaaca 23776772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 983512 - 983407
Alignment:
Q  29 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaa-aacagcatgacataataatatcaattgcaattcatc 126  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||   ||||| |||| ||| |||| ||||||||| |    
T  983512 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaacaagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaac 983413  T
Q  127 aacatc 132  Q
    ||||||    
T  983412 aacatc 983407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 23760961 - 23760893
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtat 85  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23760961 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 23760893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 26355815 - 26355742
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 90  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  26355815 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 26355742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 64
Target Start/End: Original strand, 21249384 - 21249434
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataa 64  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21249384 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 21249434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 64
Target Start/End: Original strand, 21255222 - 21255272
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataa 64  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21255222 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 21255272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 140
Target Start/End: Original strand, 21673716 - 21673830
Alignment:
Q  26 tcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattca 124  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||    
T  21673716 tcatcaacttagaccgactcatgcatcatagttaaataacaaacaacaacataggcattatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatca 21673814  T
Q  125 tcaacatcttaaatat 140  Q
     |||||||| ||||||    
T  21673815 acaacatctcaaatat 21673830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 196
Target Start/End: Original strand, 37116366 - 37116530
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaac 129  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||||    
T  37116366 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtaca-taaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 37116464  T
Q  130 atcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 196  Q
    |||| ||| | ||| ||||  |||| |||||| |||||  | |||||||||| || | |||||||||    
T  37116465 atctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaa 37116530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 178 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 26223039 - 26222987
Alignment:
Q  178 acatcataatcaacatcaacacat-cttaaacagcttcacagattataattaa 229  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  26223039 acatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagcttcacagattatcattaa 26222987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 17439601 - 17439423
Alignment:
Q  41 gactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaa 137  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||| |  |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||||||| |||    
T  17439601 gactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtaca-taaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaa 17439503  T
Q  138 tattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcaca 217  Q
     | ||| ||||  |||| |||||| |||||  | |||||||||| || |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||    
T  17439502 ca-tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattatcaacattaaatcatattataacagcttcaca 17439423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 84
Target Start/End: Original strand, 24353039 - 24353091
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 84  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  24353039 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagta 24353091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 229
Target Start/End: Original strand, 26219862 - 26219918
Alignment:
Q  174 tatcacatcataatcaacatcaacacat-cttaaacagcttcacagattataattaa 229  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||    
T  26219862 tatgacatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagcttcatagattatcattaa 26219918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 41 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 19154981 - 19154930
Alignment:
Q  41 gactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaa 91  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  19154981 gactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaa 19154930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 41 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 20466132 - 20465982
Alignment:
Q  41 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 140  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||   |||| |||| ||| || | |||||||||||| || |||| ||||||||| |  ||    
T  20466132 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagtataggcagatcacaacaacaacataacttcataatatcaatt-catttcaacaacatcttgatcat 20466034  T
Q  141 tcaaatattcttcaagtaatgtatataa-cattatatcacatcataatcaac 191  Q
    ||||  ||  ||||||||||| |  ||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  20466033 tcaataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaac 20465982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 20533506 - 20533467
Alignment:
Q  38 actgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 77  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20533506 actgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacata 20533467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 17354060 - 17353975
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 103  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||  |||||||    
T  17354060 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacattatgacat 17353975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 20502203 - 20502154
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 82  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  20502203 cttagaccgactcatgcagcttaattaacatacaacagcaacataggcag 20502154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 84
Target Start/End: Original strand, 22525579 - 22525628
Alignment:
Q  35 tagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagta 84  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||    
T  22525579 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacaacaacttaggcagta 22525628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 17267096 - 17267044
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 84  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||    
T  17267096 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagta 17267044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 17926822 - 17926758
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 82  Q
    |||||||||  ||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||    
T  17926822 catcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacaatagtagcataggcag 17926758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 68)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22731355 - 22731120
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22731355 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 22731256  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22731255 attgcaattcatcaacatattaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 22731156  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22731155 cacagattataattaacatcctcattaagtcttaat 22731120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22738300 - 22738066
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22738300 acatcatcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacattaa-ataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 22738202  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22738201 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 22738102  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22738101 cacagattataattaacatcctcattaagtcttaat 22738066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 23285865 - 23286096
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  23285865 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacag----acataataatatca 23285960  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23285961 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatgttcttcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagctt 23286060  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23286061 cacagattataattaacatcttcattaagtcttaat 23286096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 14 - 244
Target Start/End: Original strand, 23060513 - 23060742
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23060513 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 23060612  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23060613 attgcaagtcaacaacatcttaaatattaaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 23060712  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtc 244  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23060713 caca-attataattaacatcatcattaagtc 23060742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 14 - 238
Target Start/End: Original strand, 23076442 - 23076666
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076442 acatcatcatcttcatccacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 23076541  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23076542 attgcaagtcaacaatatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacagcttaaacagctt 23076641  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcat 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  23076642 cacagattataattaacatcatcat 23076666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23654507 - 23654268
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  23654507 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacagcataggcagcatacaaatacatcatgacataataatatca 23654408  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  23654407 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaagtattactcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataattaacaacaacacatcttaaacagctt 23654308  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 253  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  23654307 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgcta 23654268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 22337115 - 22337350
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22337115 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggctgtatataaaaacagcatgacataataatatca 22337214  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    | |||||  || |||||||| |||||| ||   ||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  22337215 aatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacatatcttaaacaactt 22337314  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22337315 cacaaattataattaacatcatcattaagtcttaat 22337350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 17 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 298933 - 298696
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 115  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  298933 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 298834  T
Q  116 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 215  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  298833 tgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataattaataacaacacatcttatacagcttca 298734  T
Q  216 cagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 253  Q
    || |||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  298733 catattatagttaacctcttcattaagtcttaatgcta 298696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 38235 - 38002
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38235 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatca 38137  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    ||| | |||||||| |||||||  ||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||    
T  38136 atttcgattcatcatcatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacaacatgtcttatacagctt 38038  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    || |||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  38037 cagagattataattaacctcattgttaagtcttaat 38002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Original strand, 23660023 - 23660253
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  23660023 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtatcttagttaaacaacaacagcaacataggcagtatacgaaa-caggatgacataataatatca 23660121  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    | ||||| ||| |||||||||||||||||||  ||   ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23660122 aatgcaaatcaacaacatcttaaatattcaatcataactcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 23660221  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtct 245  Q
     ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  23660222 tacaaattataattaacatcatcaataagtct 23660253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 20309108 - 20309340
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaac-agcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  20309108 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacataattatatc 20309204  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 212  Q
    || | ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||    
T  20309205 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcataatcaacaacaacatatcttattcagct 20309303  T
Q  213 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    |||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
T  20309304 tcacagattatagttaacctcattcttaagtcttaat 20309340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 22105412 - 22105575
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22105412 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaat 22105511  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  22105512 gcaagtcaacaacttctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22105575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23708738 - 23708518
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  23708738 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcaagcagcttagttaaataacagatagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatc 23708642  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagc 211  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| ||||||    
T  23708641 aattgcaaatcatcgacatctcaaacattcaaatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaattcatcttataacagc 23708542  T
Q  212 ttcacagattataattaacatcat 235  Q
    ||||||||| || ||||| |||||    
T  23708541 ttcacagatcatcattaatatcat 23708518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 21155219 - 21155060
Alignment:
Q  20 tcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 119  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21155219 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 21155121  T
Q  120 attcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    | ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  21155120 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 21155060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 18808943 - 18809105
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18808943 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18809041  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  18809042 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 18809105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 23130862 - 23131024
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23130862 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23130960  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  23130961 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 23131024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 23133329 - 23133491
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23133329 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23133427  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  23133428 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 23133491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 23709694 - 23709532
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23709694 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23709596  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  23709595 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 23709532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 23712175 - 23712013
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23712175 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23712077  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  23712076 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 23712013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 26505379 - 26505541
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  26505379 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaat 26505477  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  26505478 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 26505541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 26507857 - 26508019
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  26507857 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaat 26507955  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  26507956 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 26508019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 34402684 - 34402522
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34402684 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 34402586  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  34402585 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 34402522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 39682313 - 39682475
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39682313 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 39682411  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  39682412 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 39682475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 32215085 - 32214921
Alignment:
Q  15 catcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 114  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32215085 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 32214987  T
Q  115 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
     ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  32214986 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 32214921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 571397 - 571559
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  571397 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 571495  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || | |||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  571496 gcaagtcaacaacgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 571559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 6725995 - 6726157
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6725995 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 6726093  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    | || ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  6726094 gtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 6726157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 23135590 - 23135752
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23135590 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23135688  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||| ||||||    
T  23135689 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcaca 23135752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 24367774 - 24367936
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24367774 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 24367872  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  24367873 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24367936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 24898358 - 24898195
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagctt-agttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 115  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24898358 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24898260  T
Q  116 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  24898259 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24898195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 24900841 - 24900678
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagctt-agttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 115  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24900841 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24900743  T
Q  116 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  24900742 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24900678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 24903318 - 24903155
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagctt-agttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 115  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24903318 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24903220  T
Q  116 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  24903219 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24903155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 24905795 - 24905632
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagctt-agttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 115  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24905795 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24905697  T
Q  116 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  24905696 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24905632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 24908270 - 24908107
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagctt-agttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 115  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24908270 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24908172  T
Q  116 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  24908171 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24908107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 32039660 - 32039498
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32039660 tcatcatcttaatcaacttagaccggctcatgcagcttagttaaataacaacagtaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 32039562  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  32039561 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 32039498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 169 - 256
Target Start/End: Original strand, 27753730 - 27753817
Alignment:
Q  169 cattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27753730 cattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagtttcacatattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 27753817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 28577099 - 28577261
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  28577099 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacgca-acagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaat 28577197  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    ||||  || |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  28577198 gcaagccaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 28577261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 180
Target Start/End: Original strand, 43137301 - 43137461
Alignment:
Q  19 atcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgc 118  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  43137301 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gtaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgc 43137399  T
Q  119 aattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    || ||| |||| ||| || | |||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  43137400 aagtcaacaacgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 43137461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 23103516 - 23103399
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||    
T  23103516 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaacagcaacataggcagtatac--aaacagcatgacatgattatatca 23103419  T
Q  114 attgcaattcatcaacatct 133  Q
    | | ||||||||||||||||    
T  23103418 aattcaattcatcaacatct 23103399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 144
Target Start/End: Original strand, 25616192 - 25616315
Alignment:
Q  21 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||  ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  25616192 catcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaattacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaattgcaa 25616291  T
Q  121 ttcatcaacatcttaaatattcaa 144  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  25616292 ttcaacaacatcttaaatattcaa 25616315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 45030016 - 45029854
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  45030016 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaca-acaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 45029918  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||   ||||||||||    
T  45029917 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacatttatatcaca 45029854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 7835 - 7687
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacat 131  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  7835 cttagactgaatcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 7737  T
Q  132 cttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacat 181  Q
    || ||| ||||| ||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  7736 ctcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacat 7687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Original strand, 19671830 - 19672043
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||    
T  19671830 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatc 19671928  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagc 211  Q
     |  |||| | | ||||||| | |||||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||  |||| || | ||||    
T  19671929 gaacgcaagtaaacaacatc-tcaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataa-caacatcaa-tcatcatagatcagc 19672025  T
Q  212 ttcacagattataattaa 229  Q
    |||||||||||| |||||    
T  19672026 ttcacagattatcattaa 19672043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 24529691 - 24529528
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24529691 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaacaacaacaca-tcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagt 24529593  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaata-ttcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| | | |||| ||| || || |||| ||||  ||||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  24529592 gcaagttaacaacgtctcaattatttcatatataattcaaataatgcatatacaattatatcaca 24529528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 38967374 - 38967537
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |  || |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |    
T  38967374 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacatcgacaca-acaatatacaaaaatagcatgaaataataatatcaaat 38967472  T
Q  117 gcaattc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| || |||||||||| || |||||| ||||  ||||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  38967473 gcaagtcaatcaacatctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 38967537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 182
Target Start/End: Original strand, 7679589 - 7679751
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||||| |    
T  7679589 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaa-t 7679686  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatc 182  Q
    | || ||||||||||| |||| | ||||| ||  |||| ||||||||||||  ||||||| |||||    
T  7679687 gtaagtcatcaacatcataaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatataattatataacatc 7679751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 91
Target Start/End: Original strand, 8946657 - 8946734
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8946657 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttagataacaatagcaacataggcagtatacaaaa 8946734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 140
Target Start/End: Original strand, 28405981 - 28406103
Alignment:
Q  19 atcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 117  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| | ||    
T  28405981 atcatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 28406080  T
Q  118 caattcatcaacatcttaaatat 140  Q
    ||| ||| |||||||| ||||||    
T  28406081 caaatcaacaacatctcaaatat 28406103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 23040310 - 23040247
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 77  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23040310 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 23040247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22799243 - 22799063
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 117  Q
    |||||||||  ||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||   |||| |||| |||||| | ||||||||||||     
T  22799243 catcatcttattcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacatcatgacttcataatatcaattt 22799144  T
Q  118 caattcatcaacatcttaaatattcaaatat-tcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaaca 198  Q
    || |||| |||||||||||  ||||||  || |||| |||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22799143 catttcaacaacatcttaatcattcaataatatctt-aagtaaggcacataacattatatcacatcatattcaacattaaca 22799063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 140
Target Start/End: Original strand, 25175854 - 25175976
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  25175854 catcatcatcatcaacttagacagattcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 25175952  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatat 140  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||    
T  25175953 gcaaatcaacaacatctcaaatat 25175976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 18 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 23019823 - 23019643
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 117  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||||||   |||| |||| |||||| | ||||||||||||     
T  23019823 catcatcttaatcatcttatattgactcataaaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacaacatgacttcataatatcaattt 23019724  T
Q  118 caattcatcaacatcttaaatattcaaatat-tcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaaca 198  Q
    || |||| |||||||||||  ||||||  || |||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  23019723 catttcaacaacatcttaatcattcaataatatctt-aagtaatgcacataacgttatatcacatcatattcaacattaaca 23019643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 20 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 24643109 - 24643034
Alignment:
Q  20 tcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagc 96  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  24643109 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-tcagtatacaaaaacagc 24643034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 22134326 - 22134251
Alignment:
Q  15 catcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaa 90  Q
    |||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22134326 catcatcatcatcatcatcatagaccgactcatgcagcttagttaaatatcaacagcaacataggcagtatgcaaa 22134251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 23072070 - 23071972
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  23072070 acatcatcatcttcaacaacttagtccgactcatgcagcttagttaaataacgaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 23071972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 33 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 32452031 - 32451811
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaa-ca 130  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||| |||||  || ||| ||    
T  32452031 cttagaccgactcatgcagcttggttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatcaa-tgcaagccaacaatca 32451933  T
Q  131 tcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcat-aatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaa 229  Q
    ||| || ||||||  ||  ||||||||||||  ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||   | | |||||||||||| ||| |||||||    
T  32451932 tctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtat-acataatatcacatcataaatcaacattaacatcccat-aacagcttcacaaattgtaattaa 32451835  T
Q  230 catcatcattaagtcttaatgcta 253  Q
     |||||  | ||||||||||||||    
T  32451834 tatcatattcaagtcttaatgcta 32451811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20520295 - 20520092
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaac 129  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||| |  |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||||    
T  20520295 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatatgcagtaca-taaaacagttcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaac 20520198  T
Q  130 atcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataatta 228  Q
    |||| ||| | ||| ||||  ||||||||||| |||||  | |||||||||| || | | |||||||  ||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  20520197 atctcaaaca-tcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacgacatcaaatcatcttataacaacttcacagattatcatta 20520099  T
Q  229 acatcat 235  Q
    | |||||    
T  20520098 atatcat 20520092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 40622327 - 40622123
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacag-catgacataataatatcaatt 116  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||||| ||| ||| |||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||  |||||  |||| |||||||||    
T  40622327 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcagcataggcagattacaacaacaatcatga--taattatatcaatt 40622230  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattca-----aatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacag 210  Q
     ||||||||||||||||||  ||| ||     |||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||| | |||||    
T  40622229 -caattcatcaacatcttatgtatacagtacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcataatcaaca-caa-acatctcataacag 40622134  T
Q  211 cttcacagatt 221  Q
    |||||||||||    
T  40622133 cttcacagatt 40622123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 18787009 - 18786947
Alignment:
Q  29 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaa 90  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||    
T  18787009 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagtaacataggtagtatgcaaa 18786947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 84
Target Start/End: Original strand, 23287384 - 23287433
Alignment:
Q  35 tagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagta 84  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  23287384 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagta 23287433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 103
Target Start/End: Original strand, 23038048 - 23038116
Alignment:
Q  35 tagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 103  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  23038048 tagacggactcatgcagcttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacat 23038116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 133
Target Start/End: Original strand, 23207296 - 23207398
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaac 129  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||| | ||    
T  23207296 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtata-taaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacgac 23207394  T
Q  130 atct 133  Q
    ||||    
T  23207395 atct 23207398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 83
Target Start/End: Original strand, 26392403 - 26392451
Alignment:
Q  35 tagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagt 83  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26392403 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagt 26392451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22459575 - 22459500
Alignment:
Q  122 tcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaac 197  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||   ||||||||||||||||  |||||||||||| ||||  |||||||||    
T  22459575 tcatcaacatctcaaatattcacatataactcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaataacatcaac 22459500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 25963832 - 25963717
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 117  Q
    |||||||||  ||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||   |||| |||||||| |  | ||||||||||||     
T  25963832 catcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttcaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaatt- 25963734  T
Q  118 caattcatcaacatctt 134  Q
    || |||| |||||||||    
T  25963733 catttcaacaacatctt 25963717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 103 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 24642933 - 24642856
Alignment:
Q  103 taataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||||||||||| ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  24642933 taataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24642856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 25961629 - 25961592
Alignment:
Q  40 tgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 77  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  25961629 tgactcatgcaacttagttaaataacaacagcagcata 25961592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 24655432 - 24655396
Alignment:
Q  41 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 77  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24655432 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacata 24655396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 77
Target Start/End: Original strand, 24869903 - 24869939
Alignment:
Q  41 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 77  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  24869903 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcagcata 24869939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 3470 - 3705
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3470 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataactaaagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 3569  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3570 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcaaataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 3669  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3670 catagattataattaacatcctcattaagtcttaat 3705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Original strand, 343 - 573
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  343 acatcatcatctttatcgacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaataacataggcagtatacaaaat-agcatgacgtaataatatca 441  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    |||| || ||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  442 attggaagtcaacaacatcttaaatattcgattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 541  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtct 245  Q
    || | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  542 catatattataattaacatcctcattaagtct 573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 73)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 20361081 - 20360846
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20361081 acatcatcattttcatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagcatacaaaaacagcatgacataataatatca 20360982  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20360981 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagctt 20360882  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20360881 cacatattataattaacctcatcattaagtcttaat 20360846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 14 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 20638404 - 20638162
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20638404 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 20638305  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20638304 attgcaatttatcaacatctttaatattcaaacattcttcaagtaatgcataaaacgttatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 20638205  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20638204 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgttatcc 20638162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22780348 - 22780116
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22780348 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacaaaaacataggcaatatacaaaaacagcttgacataataatatca 22780249  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22780248 attgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacgcaacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 22780149  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtctt 246  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22780148 cacagattatgattaacatcatcattaagtctt 22780116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 17287917 - 17287678
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17287917 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggtagtatacaaacacagcatgacataataatatca 17287818  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17287817 attgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatgtcataacataatcaacctcaacacatcttaaacagctt 17287718  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 253  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  17287717 cacaggttataattaacatcctcattaagtctcaatgcta 17287678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Original strand, 29060540 - 29060771
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29060540 acatcatcatcttcatcagcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 29060639  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    | ||||| ||| |||||||| || ||| ||   ||  ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29060640 aatgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatctcatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 29060739  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtct 245  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29060740 cacagattataattaatatcatcattaagtct 29060771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 15 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18409947 - 18409704
Alignment:
Q  15 catcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  18409947 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctcagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacgaaaacaacatgacataataatatcaa 18409848  T
Q  115 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 214  Q
     ||||| ||| |||||||| ||  || ||   ||  ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18409847 atgcaagtcaacaacatctcaatcatccattcataattcaaataatacatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 18409748  T
Q  215 acagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatccta 258  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  18409747 acatattataattaacatcatcattaagtctcaatactacccta 18409704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 25629476 - 25629245
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25629476 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaattacaacaggaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataacaatatca 25629377  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    | ||||| ||| |||||||| || ||| ||   ||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25629376 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 25629277  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtct 245  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25629276 cacagattataattaacaacatcattaagtct 25629245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19303661 - 19303435
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  19303661 acatcatcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaggaagtatacaaaa-caacatgacataataatatca 19303563  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    | ||||| ||| |||||||| || ||| ||   ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19303562 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacattcatatttcaagtaatgtacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttcaacagctt 19303463  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaa 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19303462 cacagattataattaacatcatcattaa 19303435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Original strand, 20593773 - 20594004
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20593773 acatcatcatcttcatcaacttagaccgaatcatgcagctcagttaaataaaaacagcaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataataatatca 20593872  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    | ||||| ||| |||||||| || ||| |||  ||   ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20593873 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataaatcaagtaatgcgtataacaatatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 20593972  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtct 245  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  20593973 cacagattataattatcattatcattaagtct 20594004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 181
Target Start/End: Original strand, 16496244 - 16496411
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16496244 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatca 16496343  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacat 181  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  16496344 attgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaatattatatcacat 16496411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 181
Target Start/End: Original strand, 20076700 - 20076863
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  20076700 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac-aaaacagcatgacataataatatca 20076798  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacat 181  Q
    | |||||   |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  20076799 aatgcaa---atcaacatcttaaaaattcaattatacttcaagtaatgcgtataacattatatcacat 20076863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16920751 - 16920519
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||   || ||||||||||  |||||    
T  16920751 acatcatcatcttcaacatctttgaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcagcataggcagtatacaa---catcatgacataagtatatc 16920655  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 212  Q
    || | | ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||  |||||    
T  16920654 aaattccattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattataccacatcataatcaacaacaacttatcttattcagct 16920556  T
Q  213 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
T  16920555 tcatagattatagttaacctcattcttaagtcttaat 16920519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 1595549 - 1595711
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  1595549 tcatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 1595647  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||||||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  1595648 gcaattcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatggatatacaattatatcaca 1595711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 189
Target Start/End: Original strand, 35245586 - 35245758
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||    
T  35245586 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacaccaacataggcagtatacaacaaca---tgacataataatatc 35245682  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatca 189  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  35245683 aatttcaattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatca 35245758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 12742317 - 12742479
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12742317 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 12742415  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  12742416 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 12742479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 18334754 - 18334592
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18334754 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18334656  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  18334655 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 18334592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 19005046 - 19005208
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19005046 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 19005144  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  19005145 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 19005208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 19859081 - 19858919
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19859081 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 19858983  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  19858982 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 19858919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 22782227 - 22782389
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22782227 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 22782325  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| | ||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  22782326 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacacataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22782389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 24422547 - 24422709
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24422547 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 24422645  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  24422646 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24422709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 25754809 - 25754971
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25754809 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 25754907  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  25754908 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 25754971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 33861794 - 33861956
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33861794 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 33861892  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  33861893 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 33861956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 33864278 - 33864440
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33864278 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 33864376  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  33864377 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 33864440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 22831503 - 22831737
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    ||||||||||||||| ||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||  |||   ||||||||| |||||    
T  22831503 acatcatcatcttcaacatagtagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcactgttcaacgaca---tgacataatcatatc 22831599  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaat--attcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacag 210  Q
    || | |||||||||||||||||| ||  || |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||  |||    
T  22831600 aaattcaattcatcaacatcttagatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcataatcaacaacaacatatcttattcag 22831698  T
Q  211 cttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||  | ||||||||||    
T  22831699 cttcacagattatagttaacctcattctcaagtcttaat 22831737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 30676874 - 30676710
Alignment:
Q  15 catcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 114  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30676874 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaa 30676776  T
Q  115 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
     ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  30676775 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 30676710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 235
Target Start/End: Original strand, 25644335 - 25644543
Alignment:
Q  29 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatca 127  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||| || || ||||||    
T  25644335 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcgtgatataacaatatcaaatgtaagtcatca 25644434  T
Q  128 acatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataat 226  Q
    |||||| ||| ||||| ||||  |||||||||||  ||||  |||||||||||||| || |||||||||  |||| || | ||||||||||||| || ||    
T  25644435 acatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcgtatacaattatatcacatcaaaaacaacatcaaatcatcatatatcagcttcacagatcatcat 25644534  T
Q  227 taacatcat 235  Q
    ||| |||||    
T  25644535 taatatcat 25644543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 2291342 - 2291180
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  2291342 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 2291244  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  2291243 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 2291180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 8055029 - 8055191
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8055029 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaaa-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 8055127  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  8055128 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 8055191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 26924802 - 26924640
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26924802 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 26924704  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  26924703 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 26924640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 180
Target Start/End: Original strand, 34963371 - 34963535
Alignment:
Q  15 catcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 114  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963371 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 34963469  T
Q  115 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
     ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  34963470 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 34963535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 37 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 25603482 - 25603267
Alignment:
Q  37 gactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaa 136  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||| |||| |||||||||| ||||||| ||  |||||| | |||||| ||    
T  25603482 gactgactcatgcgacttagttaattaacaacagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataacaatatcatttataattca-ctacatctcaa 25603384  T
Q  137 atattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatc 236  Q
     |||||||  |  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   | | |||||||||||||||||||||||| || | |||||| ||    
T  25603383 ttattcaataaaacttcaagtaatgtatacaacatcatatcacatcataatcaatgactaaacatcttaaacagcttcacagattctattaaacatcgtc 25603284  T
Q  237 attaagtcttaatgcta 253  Q
    |||||||||||| ||||    
T  25603283 attaagtcttaaagcta 25603267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 25656629 - 25656791
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25656629 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 25656727  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| | |  ||| ||| || |||||| ||||  ||||| ||||  |||||  |||||||||||    
T  25656728 gcaagttaataacgtctcaattattcacatataattcaactaatacatatataattatatcaca 25656791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 33 - 229
Target Start/End: Original strand, 18456735 - 18456930
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatc 132  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||    
T  18456735 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 18456833  T
Q  133 ttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 229  Q
    | || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||||||||||||| || |||||    
T  18456834 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaa 18456930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 1541073 - 1540911
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  1541073 tcatcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagtatgacataataatatcaaat 1540975  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||| ||||||    
T  1540974 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcaca 1540911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Original strand, 20109140 - 20109322
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| | |||| ||||||    
T  20109140 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacataatataacaatatc 20109236  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatat--aacattatatcacatcataatcaacatcaa 196  Q
    || ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||| |||| |||||||||    
T  20109237 aaatgcaagtcatcaacatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaa 20109322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 160
Target Start/End: Original strand, 25688502 - 25688644
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25688502 tcattatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaact 25688600  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaat 160  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||    
T  25688601 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaat 25688644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 16448686 - 16448526
Alignment:
Q  20 tcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 119  Q
    ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16448686 tcatcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 16448588  T
Q  120 attc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    | || |||||| ||| || |||||| ||||  ||||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  16448587 agtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 16448526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 3852179 - 3852017
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |    
T  3852179 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtttaataacaacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacatgataatataaaat 3852081  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  3852080 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 3852017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 19848114 - 19847949
Alignment:
Q  16 atcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 115  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||  |||||||  |||||| |||||||||    
T  19848114 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaacacataaaaatatcaat 19848015  T
Q  116 tgcaattcatcaacatcttaaata-ttcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| |||| ||||  ||||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  19848014 tgcaattcaacaatatcttaaatatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcaca 19847949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 20557054 - 20556894
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  20557054 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatggcataataatatcaaat 20556956  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| ||   |||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  20556955 gcaagtcaacaacgtctcaa--tttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20556894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 25611820 - 25611605
Alignment:
Q  37 gactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaa 136  Q
    |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||| |||| |||||||||| ||||||| ||  |||||| | |||||| ||    
T  25611820 gactgactcatgcgacttagttaattaacaacagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataacaatatcatttataattca-ctacatctcaa 25611722  T
Q  137 atattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatc 236  Q
     |||||||  |  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   | | |||||||||||||||||| ||||| |  | |||||| ||    
T  25611721 ttattcaataaaacttcaagtaatgtatacaacatcatatcacatcataatcaatgactaaacatcttaaacagcttcatagattctgttaaacatcgtc 25611622  T
Q  237 attaagtcttaatgcta 253  Q
    |||||||| ||| ||||    
T  25611621 attaagtcctaaagcta 25611605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 33 - 167
Target Start/End: Original strand, 18461895 - 18462028
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatc 132  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||    
T  18461895 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 18461993  T
Q  133 ttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatata 167  Q
    | || |||||| ||||  ||||||||||| |||||    
T  18461994 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatata 18462028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 41 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15041644 - 15041441
Alignment:
Q  41 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 140  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||   |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||| |||    
T  15041644 gactcatgcaacttagttaaataacaatagtagcataggcagatcacaacaacagcatgacattataatatcaaatgcaattcaataacatcttaagtat 15041545  T
Q  141 tcaa-atattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcatt 239  Q
    |||| | | || |||||||||| | || |||||| | || ||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||    
T  15041544 tcaataaaatc-tcaagtaatgcacat-acattaaaccaaatcttaattatcatcaacacatcttaaacagctttacagattgtatctaacatcatcatt 15041447  T
Q  240 aagtct 245  Q
    | ||||    
T  15041446 aggtct 15041441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 144
Target Start/End: Original strand, 23992429 - 23992554
Alignment:
Q  16 atcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 115  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  23992429 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagctaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaat 23992528  T
Q  116 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaa 144  Q
    ||||||   ||||||||||||||||||||    
T  23992529 tgcaat---tcaacatcttaaatattcaa 23992554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 33 - 249
Target Start/End: Original strand, 11185524 - 11185737
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacat 131  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||| |||   |||| ||||||||||| ||||||| | |||||||||| |||    
T  11185524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatgtgcagtgtac---aacaacatgacataattatatcaaattcaattcatcagcat 11185620  T
Q  132 cttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaaca 231  Q
    |||   ||| |||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||||  || ||||||||||||   |||||     
T  11185621 cttttgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aactttataacacttcataatcagcaacaacatatcttattcatcttcacagattacggttaacc 11185719  T
Q  232 tcatcattaagtcttaat 249  Q
    |||  |||||||||||||    
T  11185720 tcactattaagtcttaat 11185737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 63 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 27416011 - 27415887
Alignment:
Q  63 aacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaat-attcttcaagtaatg 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||| | ||||||    
T  27416011 aacaacagcaacataggcagcatacaaa--cagcatgacataatattatcaatttcaattcaacaacatcttgagtattcaaataattctt-aggtaatg 27415915  T
Q  162 tatataacattatatcacatcataatca 189  Q
     ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  27415914 cataaaacattatatcacattataatca 27415887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 27333339 - 27333262
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 90  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  27333339 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 27333262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 27394079 - 27394002
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 90  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  27394079 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 27394002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 33 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18821946 - 18821782
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaa-cat 131  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||  || ||| |||    
T  18821946 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgccataacaatatcaa-cgcaagccaacaatcat 18821849  T
Q  132 cttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcat-aatcaacatcaaca 198  Q
    || || ||||||  ||  ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18821848 ctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtat-acattatatcacatcataaatcaacattaaca 18821782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 8227632 - 8227416
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    |||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||  |||  | ||||||| |||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  8227632 acatcaacatcttcaacaacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 8227534  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 211  Q
        | || | | |||||||| ||||| ||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
T  8227533 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagc 8227434  T
Q  212 ttcacagattataattaa 229  Q
    ||||||||| || |||||    
T  8227433 ttcacagatcatcattaa 8227416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 75
Target Start/End: Original strand, 25714417 - 25714478
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 75  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25714417 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 25714478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 28496592 - 28496494
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  28496592 acatcatcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 28496494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 29809003 - 29808905
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  29809003 acatcatcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 29808905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 193
Target Start/End: Original strand, 1561303 - 1561478
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaac-agcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||| ||||| ||||  || ||||| |||||||||||    
T  1561303 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgcaaac-catcatgatataataatatc 1561401  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacat 193  Q
     | |||||   ||||||| || |||||| |||| ||   ||| ||||||||||||  ||||||| |||| |||| ||||||    
T  1561402 gaatgcaa---atcaacaactcaaatat-caaacataagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacat 1561478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 90
Target Start/End: Original strand, 19652199 - 19652272
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 90  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  19652199 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 19652272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 181
Target Start/End: Original strand, 23019408 - 23019572
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    |||||||||||||  ||| ||||||| |||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||    
T  23019408 acatcatcatctt--tcatcttagaccgacttatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatc 23019504  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacat 181  Q
    || ||||| ||| |||||||| ||| | ||||| ||  |||| ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  23019505 aaatgcaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacat 23019572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 9098620 - 9098557
Alignment:
Q  29 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa 91  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  9098620 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacaaaggcagtatgcaaaa 9098557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 4185930 - 4185827
Alignment:
Q  26 tcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattca 124  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||  || ||||| |||| |||||| | |||||||||    
T  4185930 tcatcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacagacagcaacataggcagtatgc-aactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattca 4185832  T
Q  125 tcaac 129  Q
    |||||    
T  4185831 tcaac 4185827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 91
Target Start/End: Original strand, 33443068 - 33443124
Alignment:
Q  35 tagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa 91  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33443068 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagtatataaaa 33443124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 132
Target Start/End: Original strand, 19668386 - 19668491
Alignment:
Q  29 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcat 125  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||| | |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| |||     
T  19668386 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacagcaacatagatagtatgc-aaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaa 19668484  T
Q  126 caacatc 132  Q
    |||||||    
T  19668485 caacatc 19668491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 103
Target Start/End: Original strand, 19873120 - 19873205
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 103  Q
    ||||||||| |||| |||| || |||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  19873120 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacat 19873205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 82
Target Start/End: Original strand, 21766695 - 21766759
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 82  Q
    |||||||||  ||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21766695 catcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcaacataggcag 21766759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 22080846 - 22080799
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaa 61  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22080846 acatcatcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaa 22080799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 134
Target Start/End: Original strand, 18907134 - 18907226
Alignment:
Q  41 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatctt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||   |||| |||||||| || | |||||||||||| || |||| |||||||||    
T  18907134 gactcatgcagcttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacagcataacttcataatatcaatt-catttcaacaacatctt 18907226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 103
Target Start/End: Original strand, 19862978 - 19863063
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 103  Q
    ||||||||| |||| |||| || |||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||| ||  ||||| ||||| |||||||    
T  19862978 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggaagattacaacaacagtatgacat 19863063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 31155514 - 31155465
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 67  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31155514 catcatcatcatcaacttggattgactcatgcaacttagttaaataacaa 31155465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 129
Target Start/End: Original strand, 4186379 - 4186482
Alignment:
Q  26 tcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattca 124  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| |||||| | ||  || ||||| |||| |||||| | |||||||||    
T  4186379 tcatcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacaggcagcaacatagacagtatgc-aactcatcatgatataacaatatcgaatgcaattca 4186477  T
Q  125 tcaac 129  Q
    |||||    
T  4186478 tcaac 4186482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 5834436 - 5834388
Alignment:
Q  196 acacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtc 244  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  5834436 acacatcttaaacagctttacatattataattagcatcaccattaagtc 5834388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 244
Target Start/End: Original strand, 20177096 - 20177144
Alignment:
Q  196 acacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtc 244  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  20177096 acacatcttaaacagctttacatattataattagcatcaccattaagtc 20177144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 196 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22158895 - 22158847
Alignment:
Q  196 acacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtc 244  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  22158895 acacatcttaaacagctttacatattataattagcatcaccattaagtc 22158847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 19790874 - 19790837
Alignment:
Q  40 tgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 77  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  19790874 tgactcatgcaacttagttaaataacaacagcagcata 19790837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 84
Target Start/End: Original strand, 23076749 - 23076801
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 84  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||    
T  23076749 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagta 23076801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 84
Target Start/End: Original strand, 35008167 - 35008219
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 84  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||    
T  35008167 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagta 35008219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 14 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 6245 - 6000
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca---taggcagtatacaaaaacagcatgacataataata 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6245 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaacataggtagtatacaaaaacagcatgacatgataata 6146  T
Q  111 tcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacag 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6145 tcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacag 6046  T
Q  211 cttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 256  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6045 cttcacattttataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 6000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 56)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 27250850 - 27250611
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27250850 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 27250751  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27250750 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagctt 27250651  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 253  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||    
T  27250650 cacagattataattaacctcttcattaagtatcaatgcta 27250611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 14 - 253
Target Start/End: Original strand, 21026680 - 21026919
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||    
T  21026680 acatcatcatcgtcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaatataggcagtatacaaaatcagcatgacgtaaatatatca 21026779  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21026780 attgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacagcaacacatcttaaacagctt 21026879  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 253  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  21026880 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgcta 21026919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Original strand, 22532269 - 22532500
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22532269 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaatttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcc 22532368  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||   ||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22532369 attgcaattcaacaacatcttaaatattcattcataattcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 22532468  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtct 245  Q
    ||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  22532469 cacagttcataaataacatcatcattaagtct 22532500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 15 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 50210333 - 50210103
Alignment:
Q  15 catcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50210333 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 50210234  T
Q  115 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 214  Q
     ||||| ||| |||||||| || ||| ||   ||  |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50210233 atgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 50210134  T
Q  215 acagattataattaacatcatcattaagtct 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50210133 acagattataattaacatcatcattaagtct 50210103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 17 - 245
Target Start/End: Original strand, 34509783 - 34510011
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  34509783 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataatgatatcaaat 34509882  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 216  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||| ||   ||   ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  34509883 gcaagtcaacaacatcttaattatacattcatatctcaagtaatgcttataacattatatcacatcatattcaacatcaacacatcttaaacagcttcaa 34509982  T
Q  217 agattataattaacatcatcattaagtct 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34509983 agattataattaacatcatcattaagtct 34510011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 91 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22354616 - 22354458
Alignment:
Q  91 aacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaa 190  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22354616 aacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaa 22354517  T
Q  191 catcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22354516 catcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcctcattaagtcttaat 22354458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 15 - 247
Target Start/End: Original strand, 20135188 - 20135420
Alignment:
Q  15 catcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 114  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||     
T  20135188 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaacaacaatagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataataatatcat 20135287  T
Q  115 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 214  Q
     ||||||||| ||||||||||| |||||||  |  |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20135288 gtgcaattcaacaacatcttaagtattcaataaaacttcaagtaatgcatacaacattatatcatatcataatgaacatcaacacatcttaaacagcttc 20135387  T
Q  215 acagattataattaacatcatcattaagtctta 247  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20135388 acagattataattaacaacatcattaggtctta 20135420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 15 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22468816 - 22468604
Alignment:
Q  15 catcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 114  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  22468816 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcaacataggcagattacaacaacagcatgacatcataatatcaa 22468717  T
Q  115 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 214  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||  ||   |||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  22468716 ttgcaattcaacaacatcttaattattcaataatatctcaagtaatgcacataacattatatcacatcataat-tacatcagcacatcttaaacagcttc 22468618  T
Q  215 acagattataatta 228  Q
    ||||||||||||||    
T  22468617 acagattataatta 22468604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 125 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22356185 - 22356053
Alignment:
Q  125 tcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaa-catcaacacatcttaaacagcttcacagattat 223  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22356185 tcaacatcataaatattcaaacattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaatcatcaacacatcttaaatagcttcacagattat 22356086  T
Q  224 aattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22356085 aattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 22356053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 125 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22357871 - 22357739
Alignment:
Q  125 tcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaa-catcaacacatcttaaacagcttcacagattat 223  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22357871 tcaacatcataaatattcaaacattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaatcatcaacacatcttaaatagcttcacagattat 22357772  T
Q  224 aattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22357771 aattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 22357739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 38801508 - 38801277
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||   ||||| |||||||| |||||    
T  38801508 acatcatcatcttcaacatcttagac-gactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtgcaa---cagcaagacataattatatc 38801413  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 212  Q
    || | |||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||  |||||    
T  38801412 aaattcaattcatcaacatattatatatacaattattcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcgtaatcaacaacaacatatcttattcagct 38801314  T
Q  213 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    ||||| |||||| ||||  |||| |||||||||||||    
T  38801313 tcacaaattatagttaatctcattattaagtcttaat 38801277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 23593897 - 23593719
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23593897 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23593799  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 196  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||  |||| |||||||||    
T  23593798 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataaacaacatcaa 23593719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 13988866 - 13989028
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13988866 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 13988964  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  13988965 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 13989028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 21923453 - 21923291
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21923453 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 21923355  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  21923354 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 21923291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 45575008 - 45574842
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  45575008 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatacca 45574909  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    | ||||| ||| |||| ||| || |||| | ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  45574908 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 45574842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 229
Target Start/End: Original strand, 433012 - 433222
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    
T  433012 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacg---gcaacacaggcagtatacaaaaacatcaagacataataatatcaaat 433108  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttca 215  Q
    |||| ||| |||||||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||||| |    
T  433109 gcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatcatcataaatcagcttta 433208  T
Q  216 cagattataattaa 229  Q
    ||||| || |||||    
T  433209 cagatcatcattaa 433222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 21475249 - 21475087
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21475249 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 21475151  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  21475150 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 21475087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 31612313 - 31612475
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31612313 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 31612411  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||||||| |  |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  31612412 gcaagtcaacaacatctcagttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 31612475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 180
Target Start/End: Original strand, 21840766 - 21840929
Alignment:
Q  16 atcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 115  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  21840766 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaa 21840864  T
Q  116 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  || |||||||| |||||  |||||||||||    
T  21840865 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataatttaagtaatgcatatataattatatcaca 21840929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 29298137 - 29298298
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  29298137 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga-ataataatatcaaat 29298234  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  29298235 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29298298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 29776688 - 29776850
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |    
T  29776688 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaataacatgacataataatatcaaat 29776786  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  29776787 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29776850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 16275526 - 16275363
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16275526 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacaacgacatag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 16275428  T
Q  117 gcaattc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| || |||||| ||| || |||||| |||   ||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  16275427 gcaagtcaatcaacgtctcaattattcacataaaattcaattaatgcatataccattatatcaca 16275363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 196
Target Start/End: Original strand, 16361915 - 16362095
Alignment:
Q  15 catcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 114  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16361915 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgacagcaacaca-acagtatataaaaacaacatgacataataatatcaa 16362013  T
Q  115 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 196  Q
     ||||| ||| |||| ||| || |||||| | ||  ||||||||||| |||||  |||||||||||  |||| |||||||||    
T  16362014 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacaaataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataaacaacatcaa 16362095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 20847275 - 20847175
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||    
T  20847275 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtacacaaaatcagcatgacataaatatatca 20847176  T
Q  114 a 114  Q
    |    
T  20847175 a 20847175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 33 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 21896358 - 21896195
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacat 131  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  21896358 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 21896260  T
Q  132 cttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 196  Q
    || ||| ||||| ||||  |||| ||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  21896259 ctcaaacattcatatataattcatgtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 21896195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 33 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 21861672 - 21861510
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacat 131  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  21861672 cttagaccgactcatgcagcttagctaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 21861574  T
Q  132 cttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatca 195  Q
    || ||| ||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||    
T  21861573 ctcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatca 21861510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13213027 - 13212821
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13213027 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacgca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 13212929  T
Q  114 attgcaattc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 211  Q
    | ||||| || |||||| ||| || |||||| | ||  ||||| ||||| |||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| || |    
T  13212928 aatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcaac 13212830  T
Q  212 ttcacagat 220  Q
    |||||||||    
T  13212829 ttcacagat 13212821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 217
Target Start/End: Original strand, 21346961 - 21347161
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  21346961 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaaagacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 21347059  T
Q  117 gcaattc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttc 214  Q
    |||| || |||||| ||| || |||||| | ||  ||||| ||||| |||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||||||    
T  21347060 gcaagtcaatcaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttc 21347158  T
Q  215 aca 217  Q
    |||    
T  21347159 aca 21347161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 137 - 230
Target Start/End: Original strand, 48603637 - 48603730
Alignment:
Q  137 atattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaac 230  Q
    ||||||||||| |  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48603637 atattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattaac 48603730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 21342090 - 21342296
Alignment:
Q  11 tggacatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataata 110  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21342090 tggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaaagacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataata 21342188  T
Q  111 tcaattgcaattc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-c 208  Q
    |||| ||||| || |||||| ||| || |||||| | ||  ||||| ||||| |||||  |||| ||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |    
T  21342189 tcaaatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattacatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatc 21342287  T
Q  209 agcttcaca 217  Q
    |||||||||    
T  21342288 agcttcaca 21342296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 15860177 - 15860052
Alignment:
Q  11 tggacatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataata 110  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15860177 tggacttcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataata 15860079  T
Q  111 tcaattgcaattc-atcaacatcttaa 136  Q
    | || ||||| || |||||| ||||||    
T  15860078 ttaaatgcaagtcaatcaacgtcttaa 15860052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 180
Target Start/End: Original strand, 40389157 - 40389317
Alignment:
Q  20 tcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 119  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40389157 tcatcttaatcaacctagactgactcatgcaacttggttaaataacaacagcgacacat-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 40389255  T
Q  120 attc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    | || |||| | ||| || |||||| ||||  ||||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  40389256 agtcaatcatcgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 40389317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 22123230 - 22123067
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 115  Q
    |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  22123230 tcatcatcttaatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcaaacagcaacacaa-cagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaa 22123132  T
Q  116 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    ||||| ||| |||  ||| || |||||| || |  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  22123131 tgcaagtcaacaatgtctcaattattcacatttaattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22123067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 189
Target Start/End: Original strand, 33797570 - 33797694
Alignment:
Q  63 aacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaat-attcttcaagtaatg 161  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||    
T  33797570 aacaacagcaacatatgcagcatacaaa--caacatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaatattcaaataattctt-aagtaatg 33797666  T
Q  162 tatataacattatatcacatcataatca 189  Q
     ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  33797667 cataaaacattatatcacattataatca 33797694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 21707167 - 21707329
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |   |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  21707167 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaat-agtatacaaaaaaagcatgacagaataatatcaaat 21707265  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||   ||| ||||||  ||||  |||||||||||    
T  21707266 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataaatcatgtaatgcctatacaattatatcaca 21707329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 21711709 - 21711871
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |   |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  21711709 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaat-agtatacaaaaaaagcatgacagaataatatcaaat 21711807  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||   ||| ||||||  ||||  |||||||||||    
T  21711808 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataaatcatgtaatgcctatacaattatatcaca 21711871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 196
Target Start/End: Original strand, 33681011 - 33681188
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  33681011 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 33681109  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 196  Q
    |||| || ||||||||| ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||  ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  33681110 gcaagtcgtcaacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 33681188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 21788159 - 21787979
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 117  Q
    |||||||||  ||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||   |||| ||||||||||| |  |||||||||||     
T  21788159 catcatcttattcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataaccatagcagcataggcagatcacaacaacagcatgacttcgtaatatcaattt 21788060  T
Q  118 caattcatcaacatcttaaatattcaaatat-tcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaaca 198  Q
    || |||| |||||||||||  ||||||  || |||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21788059 catttcaacaacatcttaatcattcaataatatctt-aagtaatgcacataacattatataacatcataatcaacatcaaca 21787979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 33 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 35261180 - 35260992
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacat 131  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||| |||||   ||||||||    
T  35261180 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaa---atcaacat 35261085  T
Q  132 cttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattat 223  Q
    || ||| ||||| | ||  ||||||||||| |||||  |||| ||||||| || | |||||||||  ||||||| |||| ||||||| |||||    
T  35261084 ctcaaacattcatacataattcaagtaatgcatatacaattacatcacattattaacaacatcaaatcatcttataacaacttcacatattat 35260992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 235
Target Start/End: Original strand, 16758664 - 16758872
Alignment:
Q  29 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcat 125  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||  ||||| |||| |||||||| | |||| ||     
T  16758664 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaatacaa 16758762  T
Q  126 caacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattata 224  Q
    |||||||   || ||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| ||||| |||  ||| ||| ||||||||||||||| ||     
T  16758763 caacatc-acaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacaacaaatcatattataacagcttcacagatcatc 16758861  T
Q  225 attaacatcat 235  Q
    ||||| |||||    
T  16758862 attaatatcat 16758872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 20454673 - 20454606
Alignment:
Q  15 catcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 82  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20454673 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 20454606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 176
Target Start/End: Original strand, 22237631 - 22237788
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  22237631 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaaacagcgacataggcattatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 22237729  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatat 176  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||  |||||||    
T  22237730 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatat 22237788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 22921986 - 22921864
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  22921986 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 22921888  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatat 140  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||    
T  22921887 gcaaatcaacaacatctcaaatat 22921864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 103
Target Start/End: Original strand, 21714546 - 21714631
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 103  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  21714546 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacat 21714631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 121
Target Start/End: Original strand, 21754052 - 21754152
Alignment:
Q  21 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 119  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||||| ||||    
T  21754052 catcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaatgca 21754150  T
Q  120 at 121  Q
    ||    
T  21754151 at 21754152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 14295672 - 14295574
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  14295672 acatcatcatcttcaacattttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 14295574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 112
Target Start/End: Original strand, 20918620 - 20918702
Alignment:
Q  30 caacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  20918620 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaactgcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 20918702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 193
Target Start/End: Original strand, 20248283 - 20248454
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  20248283 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaaaaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 20248381  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacat 193  Q
    ||||   ||||||| |||||||| ||||| ||   ||| ||||||||||||  |||||||  ||| |||| ||||||    
T  20248382 gcaa---atcaacaacttaaata-tcaaacataagtcatgtaatgtatatacaattatatatcattataaacaacat 20248454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 52928076 - 52928014
Alignment:
Q  29 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 90  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||    
T  52928076 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcaaa 52928014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 50614219 - 50614117
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaac 129  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||||    
T  50614219 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtaca-taaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 50614121  T
Q  130 atct 133  Q
    ||||    
T  50614120 atct 50614117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 50622047 - 50621945
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaac 129  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||||    
T  50622047 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtaca-taaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 50621949  T
Q  130 atct 133  Q
    ||||    
T  50621948 atct 50621945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 41050138 - 41050036
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-acagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaaca 130  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||| |||| |   ||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  41050138 cttagaccgactcatgcagcttagttactaaacgaacagcaacataggcagtatataaaatagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 41050039  T
Q  131 tct 133  Q
    |||    
T  41050038 tct 41050036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20847161 - 20847101
Alignment:
Q  194 caacacatctt-aaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 253  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||    
T  20847161 caacacatctttaaacagcttcatagattatggttaacctcttcattaagtcttaatgcta 20847101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 16368388 - 16368329
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa 91  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  16368388 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaa 16368329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 24783212 - 24783150
Alignment:
Q  15 catcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 77  Q
    |||||||||||| |||| ||||  | |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  24783212 catcatcatcttaatcatcttattcagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcata 24783150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 42865330 - 42865245
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 103  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||  | ||| ||||| |||||||    
T  42865330 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacatagttaaataacaatagcaacatatgcagattgcaacaacagtatgacat 42865245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 51913 - 52148
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51913 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcaatatacaaaaacagcatgacataataatatca 52012  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52013 attgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatctacatcaacacatcttaaacagctt 52112  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52113 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 52148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 168099 - 167861
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  168099 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatca 168000  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  167999 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaaccaaaacacatcttaaacagctt 167901  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 253  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  167900 caaagattataattaacctcttcattaagtcttaatgcta 167861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 14 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 1169 - 931
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1169 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatca 1070  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  1069 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaaccaaaacacatcttaaacagctt 971  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 253  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  970 caaagattataattaacctcttcattaagtcttaatgcta 931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 183; Significance: 5e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 32 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 24406 - 24180
Alignment:
Q  32 acttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-acagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaaca 130  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24406 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaaca 24307  T
Q  131 tcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataa-tcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaa 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24306 tcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataattcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaa 24207  T
Q  230 catcatcattaagtcttaatgctatcc 256  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  24206 catcctcaataagtcttaatactatcc 24180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 38761 - 38995
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38761 acatcatcatcttcatcaacttagaccgagtcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 38859  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    | ||||| | | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38860 aatgcaaataaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 38959  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38960 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 38995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 231
Target Start/End: Original strand, 32942 - 33158
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32942 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 33040  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    | ||||| | | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33041 aatgcaagttaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 33140  T
Q  214 cacagattataattaaca 231  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  33141 cacagattataatcaaca 33158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 180
Target Start/End: Original strand, 9744 - 9912
Alignment:
Q  12 ggacatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatat 111  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9744 ggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagaatgacataataatat 9842  T
Q  112 caattgcaattcatcaacatcttaaata-ttcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    ||| ||||| ||| |||| ||| || || |||| ||||  ||||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  9843 caagtgcaagtcaacaacgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcaca 9912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 17 - 245
Target Start/End: Original strand, 22886 - 23113
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22886 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacac-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 22984  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 216  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22985 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcgtaatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 23084  T
Q  217 agattataattaacatcatcattaagtct 245  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23085 agattataaataacatcatcattaagtct 23113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 14 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 8650 - 8424
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8650 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca---gcaacataggcagtat-caaaaacagcatgacataataatatca 8555  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8554 attgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 8455  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtc 244  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8454 cacagattataattaacatcctcattaagtc 8424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 3271 - 3041
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  3271 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatca 3173  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    | ||||| ||| |||||||| |||||| ||   ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3172 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 3073  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtct 245  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3072 cacaggttataattaacatcatcattaagtct 3041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 14 - 253
Target Start/End: Original strand, 4849 - 5088
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4849 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagattagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatca 4948  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    | ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4949 aatgcaattcaacaacatcttaagtattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagctt 5048  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 253  Q
    |||||||||||  ||||  | ||||||||||||| |||||    
T  5049 cacagattatagctaaccccttcattaagtcttattgcta 5088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 14 - 253
Target Start/End: Original strand, 25896 - 26134
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  25896 acatcattatcttcatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaat-atcatgacataataatatca 25994  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    | ||||| | | |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25995 aatgcaagtaaacaacatctcaaatattcaattatacttcaagtaatgcatttaacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 26094  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  26095 cacagattataattaacatcctcattaagtctcaatgcta 26134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 14 - 253
Target Start/End: Original strand, 39858 - 40096
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  39858 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgaagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaat-atcatgacataataatatca 39956  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    | ||||| | | |||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39957 aatgcaagtaaacaacatctcaaatattcaattatacttcaagtaatgcatttaacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 40056  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 253  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  40057 cacaaattataattaacatcctcattaagtctcaatgcta 40096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 8479 - 8710
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8479 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcaacataggtagtatacaaaaacagtatgacataataatatca 8578  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| |||||| | | |||||||||||| | |||||||||    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8579 attgcaagtcaacaacatcttaaacattcaagtgtacttcaagtaatgcacataacatta----acatcataatcaacatcaacacatcctaaacagctt 8674  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8675 cacagattgtaattaacatcatcattaagtcttaat 8710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 21 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26179 - 25955
Alignment:
Q  21 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  26179 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaa 26080  T
Q  121 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagat 220  Q
    |||| |||| ||| || ||| ||   ||  |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26079 ttcaacaacgtctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcatagat 25980  T
Q  221 tataattaacatcatcattaagtct 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  25979 tataattaacatcatcattaagtct 25955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 17 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 44825 - 44702
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44825 tcatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 44726  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatat 140  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||    
T  44725 gcaagtcaacaacatctcaaatat 44702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 151 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 33479 - 33385
Alignment:
Q  151 ttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtct 245  Q
    |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  33479 ttcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcataggttataattaacatcatcattaagtct 33385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 245
Target Start/End: Original strand, 39479 - 39707
Alignment:
Q  16 atcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  39479 atcatcgtcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaa 39577  T
Q  116 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 215  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||| ||   ||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39578 tgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 39677  T
Q  216 cagattataattaacatcatcattaagtct 245  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39678 tagattataattaacatcattattaagtct 39707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 16 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 75333 - 75105
Alignment:
Q  16 atcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  75333 atcatcgtcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaa 75235  T
Q  116 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 215  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||| ||   ||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75234 tgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 75135  T
Q  216 cagattataattaacatcatcattaagtct 245  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  75134 tagattataattaacatcattattaagtct 75105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 32067 - 32299
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  32067 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac--aaacaacatgacataataatatca 32164  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    ||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||    
T  32165 atttcaattcatcaacatcttaggtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacgacatatcttatacagctt 32263  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  32264 cacagattataattaacctcattgttaagtcttaat 32299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 20910 - 21146
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    |||||| |||||||| | |||||||| |||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  20910 acatcaacatcttcaacgacttagaccgactcataaagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcaaaaacaacatgacataataatatc 21009  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 212  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21010 aattgcaattcaacaacatcttatatattcaaatgttctacaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcagcatcaacacatcttaaacagct 21109  T
Q  213 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21110 tcacaggttataattaacatcttcattaagtcttaat 21146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Original strand, 4508 - 4738
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4508 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatca 4606  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    | ||||| ||| |||||||| |||||| ||   ||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4607 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 4706  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtct 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4707 cacagattataattaacatcatcattaagtct 4738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Original strand, 12090 - 12320
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12090 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatca 12188  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    | ||||| ||| |||||||| |||||| ||   ||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12189 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 12288  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtct 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12289 cacagattataattaacatcatcattaagtct 12320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Original strand, 22042 - 22272
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22042 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatca 22140  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    | ||||| ||| |||||||| |||||| ||   ||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22141 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 22240  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtct 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22241 cacagattataattaacatcatcattaagtct 22272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15584 - 15351
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  15584 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaagagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatca 15486  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    ||| ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||    
T  15485 atttcaattcatcaacatcttatgtataaaaatattcttcaagtaatgcata-aatattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagctt 15387  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  15386 cacagattataattaaccttattattaagtcttaat 15351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 191
Target Start/End: Original strand, 7295 - 7465
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacag-catgacataataatatcaatt 116  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||  |||||  |||| |||  ||||    
T  7295 catcatcttaatcatcttaaatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaacataggcagattacaacaacaatcatga--taattatacaaatt 7392  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaac 191  Q
     ||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||| |||||    
T  7393 -caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcatattcaac 7465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Original strand, 39913 - 40143
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  39913 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatca 40011  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    | ||||  |||  |||||||||||||||  | ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  40012 aatgcatgtcaataacatcttaaatatttgattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcataaagagctt 40111  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtct 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40112 cacagattataattaacatcatcattaagtct 40143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 19987 - 19885
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaac 129  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||  |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  19987 cttagaccgactcatgcagcttaattaataaacaaacagcaacataggcagtata-taaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaac 19889  T
Q  130 atct 133  Q
    ||||    
T  19888 atct 19885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 41 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18749 - 18597
Alignment:
Q  41 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatat 140  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||   |||| ||||| || || | |||||||||||| |  |||| ||||||||| |  ||    
T  18749 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagaataacttcataatatcaatt-cgtttcaacaacatcttgatcat 18651  T
Q  141 tcaaatattcttcaagtaatgtatataa-cattatatcacatcataatcaacat 193  Q
    ||||  ||  ||||||||||| |  ||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  18650 tcaataatatttcaagtaatggaattaatcattaaatcacattataatcaacat 18597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 15 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 17337 - 17105
Alignment:
Q  15 catcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtataca--aaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17337 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaaacagcatgacataataatatc 17238  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 212  Q
    || ||||| ||| |||||||| || ||| ||   ||  |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17237 aaatgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacgtcttaaacagct 17138  T
Q  213 tcacagattataattaacatcatcattaagtct 245  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17137 ttacagattataattaacatcatgattaagtct 17105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 79430 - 79235
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatc 132  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| |||| ||    
T  79430 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-gacagtatataaaaacagcatgacataataatttcaaatgcaagtcaacaacgtc 79332  T
Q  133 ttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 229  Q
    | || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  | |||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||||||||| ||| || |||||    
T  79331 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaagtatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttcactgatcatcattaa 79235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 4712 - 4946
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||    
T  4712 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataaatacatca 4811  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||    
T  4812 attgcaattcatcaaaatcttatgtatacaaatattcttcaagtaaggcata-aacattatatcacatcataatcaacaacaacatatcttatacaactt 4910  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    ||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
T  4911 cacagattatacttaacctcattgttaagtcttaat 4946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 79 - 249
Target Start/End: Original strand, 1 - 170
Alignment:
Q  79 gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatca 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||    
T  1 gcagtatacaaaaacagcatgacataaatacatcaattgcaattcatcaaaatcttatgtatacaaatattcttcaagtaaggcata-aacattatatca 99  T
Q  179 catcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
T  100 catcataatcaacaacaacatatcttatacaacttcacagattatacttaacctcattgttaagtcttaat 170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 13497 - 13730
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  13497 acatcatcaacttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacatgataatatca 13595  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    ||| | ||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||    
T  13596 atttcgattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacgacatatcttatacagctt 13694  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  13695 cacagattataattaacctcattgttaagtcttaat 13730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 16721 - 16490
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16721 acatcatcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacgaaaacagcatgacataataatatca 16622  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    | || || ||| || ||||| || ||| ||   ||  |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16621 aatggaagtcaacagcatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcaaaatcaacatcaacacatcttaaacagctt 16522  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtct 245  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16521 cacagactataattaacatcatcattaagtct 16490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 15 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 3306 - 3103
Alignment:
Q  15 catcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3306 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaa 3207  T
Q  115 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 214  Q
     || |||||| |||||||| || ||| ||   ||  |||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3206 atgtaattcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 3107  T
Q  215 acag 218  Q
    ||||    
T  3106 acag 3103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 1952 - 2187
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  1952 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaacagcgacataggcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatca 2051  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| || |||||||    
T  2052 attgcaattcaacaacatcttaaatattcaaacattattcaagtaatgcataaaacattatatctcatcataatcaacaacaacatatcatatacagctt 2151  T
Q  214 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
     ||| ||||| | |||| | ||||||||||||||||    
T  2152 tacatattattaataaccttatcattaagtcttaat 2187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 66 - 244
Target Start/End: Original strand, 13144 - 13322
Alignment:
Q  66 aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtata 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||| | |    
T  13144 aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcaca 13243  T
Q  166 taacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtc 244  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13244 taacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagtttcacagattataattaacatcttcattaagtc 13322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 89
Target Start/End: Original strand, 34123 - 34199
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaa 89  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  34123 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa 34199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 70
Target Start/End: Original strand, 273 - 329
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacag 70  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  273 acatcattatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaacag 329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 104 - 256
Target Start/End: Original strand, 124675 - 124827
Alignment:
Q  104 aataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatct 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  124675 aataatatcaattgcaattcatcaacgttttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatct 124774  T
Q  204 taaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  124775 taaacagcttcacagattataattaacatcctcattaagtcttaatgctatcc 124827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 83
Target Start/End: Original strand, 121766 - 121835
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagt 83  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  121766 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagt 121835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 133
Target Start/End: Original strand, 174767 - 174883
Alignment:
Q  15 catcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| || ||||||    
T  174767 catcatcaacttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatac---aacagcatgacatgattatatca 174863  T
Q  114 attgcaattcatcaacatct 133  Q
    | | ||||||| ||||||||    
T  174864 aattcaattcaacaacatct 174883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 136471 - 136370
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaac 129  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||| |||| |||||||||||| || |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||||    
T  136471 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacac-aaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 136373  T
Q  130 atc 132  Q
    |||    
T  136372 atc 136370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 145179 - 145078
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaac 129  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||| |||| |||||||||||| || |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||||    
T  145179 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacac-aaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 145081  T
Q  130 atc 132  Q
    |||    
T  145080 atc 145078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 17 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 340065 - 339840
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |    
T  340065 tcatcatcttcgtcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-caacaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaat 339968  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 216  Q
     ||| ||| |||||||| || ||| ||   ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  339967 -caagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgtgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 339869  T
Q  217 agattataattaacatcatcattaagtct 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  339868 agattataattaacgtcatcattaagtct 339840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 158612 - 158450
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  158612 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 158514  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  158513 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 158450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 63 - 189
Target Start/End: Original strand, 71350 - 71474
Alignment:
Q  63 aacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaat-attcttcaagtaatg 161  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||| |||||| | ||||||    
T  71350 aacaacagcaacataggcagcatacaaa--cagcatgacataatattatcaatttcaattcaacaacatcttgagtattcaaataattctt-aggtaatg 71446  T
Q  162 tatataacattatatcacatcataatca 189  Q
     ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  71447 cataaaacattatatcacattataatca 71474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 10544 - 10312
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  10544 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcatagttaattaacaaacagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacataataatatc 10448  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 212  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| || | ||| |||||| ||||||    
T  10447 aatttcaattcaacaacatcttaagtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacgacatatcttatacagct 10349  T
Q  213 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  10348 tcacagattataattaaccttattattaagtcttaat 10312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33077 - 32863
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33077 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaacagcaacacaggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatca 32979  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaaca-catcttaaacagct 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||  | ||| ||||    
T  32978 attgcaattcaacaacatcttaaatattc-attatacttcgagtaatgcatataacattataacacatcatgatcaacatcagcatca--taaaatagct 32882  T
Q  213 tcacagattataattaaca 231  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  32881 tcacagattataactaaca 32863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 231
Target Start/End: Original strand, 45928 - 46142
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45928 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaacagcaacacaggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatca 46026  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaaca-catcttaaacagct 212  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||  | ||| ||||    
T  46027 attgcaattcaacaacatcttaaatattc-attatacttcgagtaatgcatataacattataacacatcatgatcaacatcagcatca--taaaatagct 46123  T
Q  213 tcacagattataattaaca 231  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  46124 tcacagattataactaaca 46142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 225
Target Start/End: Original strand, 16113 - 16323
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  16113 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcaagatatcataatatca 16212  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagct 212  Q
    | |||||  || || ||||| || ||| ||   ||   |||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  16213 aatgcaagccaacatcatctcaagtatacattcataactcaagtaatgcatataacattatatcacgtcatgatcaacatca--acatcttaaaacagct 16310  T
Q  213 tcacagattataa 225  Q
    |||||||||||||    
T  16311 tcacagattataa 16323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 17450 - 17389
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 75  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17450 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaaca 17389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 16282 - 16514
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||    
T  16282 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataagaaacagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacataattatatc 16378  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 212  Q
    || | |||||||||||||| |||  ||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||    
T  16379 aaattcaattcatcaacatattatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcataatcaacaacaacatatcttattcagct 16477  T
Q  213 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  16478 tcacagattatagttaacctcattattaagtcttaat 16514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 1170 - 938
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||   || ||||||||||| |||||    
T  1170 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaataaacatcaacataggcagtatacaa---catcatgacataattatatc 1074  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 212  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||    
T  1073 aatttcaattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcataatcaacaacaacatattttatacagct 975  T
Q  213 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    |||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||    
T  974 tcacagattatagttaacctcattcttaagacttaat 938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 152
Target Start/End: Original strand, 28414 - 28552
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28414 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 28513  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattctt 152  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  28514 attgcaattcaacaacatcttatatattcaaatgttctt 28552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 14 - 112
Target Start/End: Original strand, 11292 - 11390
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  11292 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 11390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 112
Target Start/End: Original strand, 1997 - 2095
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  1997 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacacaaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 2095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 67
Target Start/End: Original strand, 4552 - 4605
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 67  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4552 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 4605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 1289 - 1521
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||   |||| ||||||||||| |||||    
T  1289 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtac---aacatcatgacataattatatc 1385  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 212  Q
    || | ||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||  |||||    
T  1386 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaacaacaacatatcttattcagct 1484  T
Q  213 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
T  1485 tcatagattatagttaacctcattcttaagtcttaat 1521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 7266 - 7498
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||   |||| ||||| ||||| |||||    
T  7266 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac---aacaacatgaaataattatatc 7362  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 212  Q
    || | ||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||  |||||    
T  7363 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaacaacaacatatcttattcagct 7461  T
Q  213 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
T  7462 tcatagattatagttaacctcattcttaagtcttaat 7498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 17 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 15356 - 15291
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 82  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15356 tcatcatcttaatcaacgtagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcag 15291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 224
Target Start/End: Original strand, 46995 - 47202
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||    ||||||||||||||||||||    
T  46995 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtttacag---cagcatgacataataatatc 47091  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 212  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||| ||||||    
T  47092 aatttcaattcatcaacatcttatgtatacaaatattctccaagtaatgcata-aacattatatcacatcataaacatcaacaacatatcttatacagct 47190  T
Q  213 tcacagattata 224  Q
    ||||||||||||    
T  47191 tcacagattata 47202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 77 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 3588 - 3424
Alignment:
Q  77 aggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatat 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| || ||| ||   ||  |||||||||||  |||||||||||||    
T  3588 aggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacactcataattcaagtaatgcgtataacattatat 3489  T
Q  177 cacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttcacagattataattaacatcatcatta 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3488 cacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttcatagattataattaacatcatcatta 3424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 73 - 249
Target Start/End: Original strand, 6669 - 6845
Alignment:
Q  73 acataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacatt 172  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||| ||    
T  6669 acataggcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatcaatagcaattcaacaacatcttaaatattcaaacattattcaagtaatgcataaaacgtt 6768  T
Q  173 atatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||||||    
T  6769 atatcacatcataatcaacaacaacatatcatatacagctttacagattataaataaccttatcattaaatcttaat 6845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 249
Target Start/End: Original strand, 51582 - 51814
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    |||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| ||| |    
T  51582 acatcatcattttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatac---aacatcatgacataattataac 51678  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 212  Q
    || | ||||||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| ||| ||||| |||||| ||||| ||||||  |||||    
T  51679 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaatatccttcaagaaatgcata-aacattataacacttcatattcaacaacaacatatcttattcagct 51777  T
Q  213 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    |||||||||||| ||||| |||   ||||||||||||    
T  51778 tcacagattatagttaacctcactcttaagtcttaat 51814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 17 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 5246 - 5017
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 115  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||   || ||||||||||| |||||||     
T  5246 tcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggtattatacaa---catcatgacataattatatcaaa 5150  T
Q  116 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 215  Q
    | ||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| || |||  ||| ||||    
T  5149 ttcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgtata-aacattataacacatcttaatcaacaacaacatattttattcagtttca 5051  T
Q  216 cagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    || |||||||||||| | || ||||| |||||||    
T  5050 catattataattaaccttattattaaatcttaat 5017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 95 - 245
Target Start/End: Original strand, 27911 - 28061
Alignment:
Q  95 gcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatc 194  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||| ||   ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27911 gcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatc 28010  T
Q  195 aacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtct 245  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28011 aacaaatcttaaacaacttcacaggttataattaacatcatcattaagtct 28061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 35 - 245
Target Start/End: Original strand, 4545 - 4754
Alignment:
Q  35 tagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatctt 134  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| | ||||| || || |||||||||| |  |||||| |||||||||    
T  4545 tagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacagcataggcagtatgcaacagcagcaagatatcataatatcaaatataattcaacaacatctt 4644  T
Q  135 aaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttcacagattataattaacatc 233  Q
    |||||||||  ||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  4645 aaatattcatttatacttcaagtaatgcataatacattatatcacatcatgatcaacatca--acatcttaaaacagcctcacaaattataattaacatc 4742  T
Q  234 atcattaagtct 245  Q
     ||| |||||||    
T  4743 ttcaataagtct 4754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 20747 - 20909
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20747 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20845  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  20846 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 37821 - 37983
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37821 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 37919  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  37920 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 37983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 9)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 94411 - 94573
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  94411 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 94509  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  94510 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 94573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 17598 - 17440
Alignment:
Q  21 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 120  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17598 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 17500  T
Q  121 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
     ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  17499 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 17440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 44454 - 44614
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaaacagcatgacataataatatcaat 115  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  44454 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaaacagcatgacataataatatcaaa 44552  T
Q  116 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatc 177  Q
    ||||| ||| |||||||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  ||||||||    
T  44553 tgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatagaattatatc 44614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 18 - 141
Target Start/End: Original strand, 100378 - 100501
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| | |    
T  100378 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataataatatcgaat 100476  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatatt 141  Q
    |||| ||| |||||||| |||||||    
T  100477 gcaaatcaacaacatctcaaatatt 100501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 38596 - 38394
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 117  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||   |||| |||| |||||| |  |||||||||||     
T  38596 catcatcttaatcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcatagacagatcacaacaacaacatgacttcttaatatcaattt 38497  T
Q  118 caattcatcaacatcttaaatattcaaatat-tcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 216  Q
    || |||| |||||||||||  ||||||  || |||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||  || | |||||||||||    
T  38496 catttcaacaacatcttaatcattcaataatatctt-aagtaatgcacataacgttatatcacatcatattcaacattaacatttcat-aacagcttcac 38399  T
Q  217 agatt 221  Q
    |||||    
T  38398 agatt 38394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 85
Target Start/End: Original strand, 119875 - 119947
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtat 85  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  119875 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 119947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 40291 - 40169
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  40291 catcatcatcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagtaggc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 40193  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatat 140  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||    
T  40192 gcaaatcaacaacatctcaaatat 40169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 18 - 90
Target Start/End: Original strand, 101503 - 101576
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 90  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  101503 catcatcatcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 101576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #9
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 23695 - 23581
Alignment:
Q  106 taatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatat-tcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt 204  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||||||  ||||||  || |||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||  || |    
T  23695 taatatcaatttcatttcaacaacatcttaatcattcaataatatctt-aagtaatgcacataacgttatatcacatcatattcaacattaacatttcat 23597  T
Q  205 aaacagcttcacagatt 221  Q
     ||||||||||||||||    
T  23596 -aacagcttcacagatt 23581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 4694 - 4856
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  4694 tcatcatcctaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 4792  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  4793 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 4856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 196
Target Start/End: Original strand, 8481 - 8650
Alignment:
Q  29 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatca 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||    
T  8481 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatca 8579  T
Q  128 acatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatat--aacattatatcacatcataatcaacatcaa 196  Q
    |||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||| |||| |||||||||    
T  8580 acatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaa 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 140
Target Start/End: Original strand, 6535 - 6661
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  6535 acatcatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 6633  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatat 140  Q
     | ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  6634 gaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 6661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 13392 - 13554
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13392 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 13490  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||| ||||||    
T  13491 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcaca 13554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 13947 - 14109
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13947 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagataaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14045  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  14046 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 14109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 82072 - 82234
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  82072 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaacagcaacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 82170  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  82171 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 82234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22776 - 22610
Alignment:
Q  29 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatca 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||||||    
T  22776 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcgacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 22678  T
Q  128 acatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 196  Q
    |||||| ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||  ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  22677 acatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 22610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 136680 - 136842
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  136680 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 136778  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  136779 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 136842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 139149 - 139311
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  139149 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 139247  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  139248 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 139311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 144087 - 144249
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  144087 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 144185  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  144186 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 144249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 134211 - 134373
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  134211 tcatcatcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 134309  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  134310 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 134373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 141618 - 141780
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  141618 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 141716  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  141717 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 141780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 112
Target Start/End: Original strand, 62200 - 62296
Alignment:
Q  16 atcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    ||||||||| || || ||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||  |||||||||||    
T  62200 atcatcatcatcttcgacttaaaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtat-gaaaaacatcatggtataataatatc 62296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 100
Target Start/End: Original strand, 132662 - 132745
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatga 100  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| || |||||    
T  132662 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacagcaacataagtagtatgcaaaatcatcatga 132745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 11564 - 11442
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11564 acatcttcatcttcaacaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggtagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 11465  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaa 136  Q
    ||| |||||||||||||| ||||    
T  11464 atttcaattcatcaacatgttaa 11442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 11450 - 11399
Alignment:
Q  198 acatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11450 acatgttaatcagcttcacagattataattaacctcatcattaagtcttaat 11399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 17 - 229
Target Start/End: Original strand, 16784 - 16995
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  16784 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 16882  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttca 215  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||| | ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||  |||| || ||||||  |||| |||| ||||||||    
T  16883 gcaagtcaacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-catcatcaaatcatcataaatcagcttca 16981  T
Q  216 cagattataattaa 229  Q
    ||||| || |||||    
T  16982 cagatcatcattaa 16995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 180
Target Start/End: Original strand, 11286 - 11450
Alignment:
Q  15 catcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 114  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11286 catcaacatcttaatcaaattagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 11384  T
Q  115 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
     ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  11385 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 11450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 191
Target Start/End: Original strand, 12763 - 12933
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacag-catgacataataatatcaatt 116  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||||| ||||||| |||||||| | || |||||||||   |||| ||||  |||||  |||| ||| |||||    
T  12763 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttcaataacaataacagcataggcagatcacaacaacaatcatga--taattataccaatt 12860  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaac 191  Q
     ||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  12861 -caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcataatcaac 12933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 180
Target Start/End: Original strand, 4300 - 4459
Alignment:
Q  20 tcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 119  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4300 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgca 4398  T
Q  120 attcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    | ||| |||| ||| || || ||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  4399 aatcaacaacgtctcaattaatcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 4459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 180
Target Start/End: Original strand, 10772 - 10935
Alignment:
Q  16 atcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 115  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  10772 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaa 10870  T
Q  116 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  || |||||||| |||||  |||||||||||    
T  10871 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataatttaagtaatgcatatataattatatcaca 10935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 181
Target Start/End: Original strand, 128751 - 128917
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 113  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |   |  | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  128751 acatcatcatcttaatcaaattagaccaactcatgcaacttagttaaataacaaaagcaacaaaaaaaaaaaa-aaaaacagcatgacataataatatca 128849  T
Q  114 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacat 181  Q
    | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  128850 aatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgtacataacattatatcacat 128917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 33 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 20524 - 20328
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatc 132  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||    
T  20524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacat-cagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 20427  T
Q  133 ttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacagattataattaaca 231  Q
    | || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||  ||||  ||||||||  |||| |||| ||||||||||||| || |||||||    
T  20426 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa--aacatcaaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaaca 20329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 65891 - 65830
Alignment:
Q  42 actcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 103  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  65891 actcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacat 65830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 180
Target Start/End: Original strand, 501088 - 501246
Alignment:
Q  21 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 120  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  501088 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 501186  T
Q  121 ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
     ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  501187 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 501246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 85742 - 85539
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  85742 tcatcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 85644  T
Q  117 gcaattc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttc 214  Q
    |||| || |||||| ||| || |||||| | ||  ||||| ||||| |||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||||||    
T  85643 gcaagtcaatcaacgtctgaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttc 85545  T
Q  215 acagat 220  Q
    ||||||    
T  85544 acagat 85539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 196
Target Start/End: Original strand, 160688 - 160864
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||||| |    
T  160688 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaat 160786  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 196  Q
    |||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||   ||| ||||| ||||||  ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  160787 gcaa-tcaacaacatgtcaaata-tcaaacataagtcatgtaatatatatacaattatataacattataaacaacatcaa 160864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 33 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 53651 - 53488
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacat 131  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  53651 cttagactgattcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 53553  T
Q  132 cttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 196  Q
    || ||||||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  53552 ctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 53488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 106 - 268
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  106 tcatcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 204  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  205 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 40400 - 40562
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  40400 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacaggatgacataataatatcaaat 40498  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| |||   ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  40499 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacataaaattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 40562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 79; Significance: 6e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 73 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 1021 - 853
Alignment:
Q  73 acataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacatt 172  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| |||| ||||||||||  ||  ||||||||||| | ||||||||    
T  1021 acataggcagtatacaa---cagcatggcataataatatcaat-gcaagtcaacaaaatctcaaatattcaatcataattcaagtaatgcacataacatt 926  T
Q  173 atatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtct 245  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| ||||||||||    
T  925 atatcacatcgtaatcgacatcaacacatcttaaacagcttcacatatcataaatagcatcaccattaagtct 853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 4954 - 4888
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggc 80  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4954 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggc 4888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 12413 - 12249
Alignment:
Q  15 catcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 114  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12413 catcaacatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagaatacaaaaacagcatgacaaaataatatcaa 12315  T
Q  115 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
     ||||| ||| |||| ||| || |||||| || |  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  12314 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatttaattcaagtaatgcatatataattatatcaca 12249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 180
Target Start/End: Original strand, 9241 - 9404
Alignment:
Q  16 atcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 115  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||     
T  9241 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatataaaaacatcatgacataataatatcaaa 9339  T
Q  116 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  || |||||||| |||||  |||||||||||    
T  9340 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataatttaagtaatgcatatataattatatcaca 9404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 18148 - 17932
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||| || || || ||||| |||||||||||    
T  18148 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcattatgcacaa-catcatgatataataatatc 18050  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 211  Q
     |  |||| | | |||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
T  18049 gaacgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagc 17950  T
Q  212 ttcacagattataattaa 229  Q
    ||||||||| || |||||    
T  17949 ttcacagatcatcattaa 17932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 2291 - 2088
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  2291 tcatcattttaatcaacttagaccgactcttgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 2193  T
Q  117 gcaattc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttc 214  Q
    |||| || || ||| ||| || |||||| | ||  ||||| ||||| |||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||||||    
T  2192 gcaagtcaattaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttc 2094  T
Q  215 acagat 220  Q
    ||||||    
T  2093 acagat 2088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 4214 - 4377
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  4214 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacgacagcgacaca-gcagtatacaaaaccagcatgacataataatatcaaat 4312  T
Q  117 gcaattc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| || |||||| ||| || |||||| ||||  ||||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  4313 gcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 4377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 137 - 249
Target Start/End: Original strand, 1037 - 1149
Alignment:
Q  137 atattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatc 236  Q
    ||||||||||| |  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || ||    
T  1037 atattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacatcttcacagattataattagcctcttc 1136  T
Q  237 attaagtcttaat 249  Q
    |||||||||||||    
T  1137 attaagtcttaat 1149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 33 - 220
Target Start/End: Original strand, 13147 - 13336
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacat 131  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||||||    
T  13147 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacat 13245  T
Q  132 cttaaat-attcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagat 220  Q
    || |||  ||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  13246 ctgaaaccattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaatcatcttataacagcttcacagat 13336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16206 - 16014
Alignment:
Q  29 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatca 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| || || ||| ||    
T  16206 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgtaaatcaaca 16108  T
Q  128 acatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagat 220  Q
    |||||| ||| ||||  ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  16107 acatctcaaacattcttatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaatcatcttataacagcttcacagat 16014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 84
Target Start/End: Original strand, 2680 - 2732
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagta 84  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||    
T  2680 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaagcaacaacataggcagta 2732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 27855 - 27663
Alignment:
Q  29 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatca 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || || ||| ||    
T  27855 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgtaaatcaaca 27757  T
Q  128 acatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagat 220  Q
    |||||| ||| ||||| ||||  ||| ||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  27756 acatctcaaacattcacatataattctagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaatcatcttataacagcttcacagat 27663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 173 - 249
Target Start/End: Original strand, 3640 - 3716
Alignment:
Q  173 atatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  3640 atatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattagcctcttcattaagtcttaat 3716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 173 - 249
Target Start/End: Original strand, 7704 - 7780
Alignment:
Q  173 atatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  7704 atatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattagcctcttcattaagtcttaat 7780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 180
Target Start/End: Original strand, 29946 - 30094
Alignment:
Q  31 aacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaaca 130  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||| ||||     
T  29946 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgtaagtcaacaacg 30044  T
Q  131 tcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    ||| || |||||| ||||  ||||| ||||  |||||  |||||||||||    
T  30045 tctcaattattcacatataattcaaataattcatatacaattatatcaca 30094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 161252 - 161049
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  161252 tcatcatcttaaccaacttagaccgactcatgcagcttagttaaatatcaacagcgacaca-gcagtatacaaaaacataatgacataataatatcaaat 161154  T
Q  117 gcaattc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttc 214  Q
    |||| || |||||||||| || |||||| | ||  ||||| ||||| |||||  |||||||||||  |||| ||| |||||  |||| |||| |||||||    
T  161153 gcaagtcaatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caatatcaaatcatcataaatcagcttc 161055  T
Q  215 acagat 220  Q
    ||||||    
T  161054 acagat 161049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 164674 - 164550
Alignment:
Q  97 atgacataataatatcaattgcaattc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatca 195  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||||| | ||  ||||| ||||| |||||  |||||||||||  |||| ||||||||    
T  164674 atgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatca 164576  T
Q  196 acacatcttaaa-cagcttcacagat 220  Q
    |  |||| |||| |||||||||||||    
T  164575 aatcatcataaatcagcttcacagat 164550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 180
Target Start/End: Original strand, 12064 - 12220
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||      |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  12064 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaa------cagcaacacag-cagtatactaaaacagcatgacataataatatcaaat 12156  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    |||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  12157 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 12220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 63 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15486 - 15362
Alignment:
Q  63 aacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaata-ttcttcaagtaatg 161  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15486 aacaacatcaacataggcagcatacaaa--cagcatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaatattcaaataattctt-aagtaatg 15390  T
Q  162 tatataacattatatcacatcataatca 189  Q
     ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  15389 cataaaacattatatcacattataatca 15362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 140
Target Start/End: Original strand, 116430 - 116551
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  116430 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatac-aaaacagcatgacataatcatatcaaat 116527  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatat 140  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||    
T  116528 gcaagtcaacaacatctcaaatat 116551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 129072 - 128909
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaa-acagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaaca 130  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||| |   ||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||||    
T  129072 cttagaccgactcatgcagcttagttaa-taacaaacagcaacataggcagtacataaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 128974  T
Q  131 tcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 196  Q
    ||| ||| | ||| ||||  |||| |||||| |||||  | |||||||||| || | |||||||||    
T  128973 tctcaaaca-tcatatataattcatgtaatggatatacaaatatatcacattattaacaacatcaa 128909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 133
Target Start/End: Original strand, 78328 - 78442
Alignment:
Q  21 catcttcat-caacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaatt 116  Q
    ||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||| |||| |||||||| |    
T  78328 catcttcattcatcttggaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcata-taaaacagttcatgatataacaatatcaa-t 78425  T
Q  117 gcaattcatcaacatct 133  Q
    |||| ||| ||||||||    
T  78426 gcaaatcaacaacatct 78442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 229
Target Start/End: Original strand, 116579 - 116631
Alignment:
Q  178 acatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 229  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  116579 acatcataatcaacattaacatatcctaaaacagcttcacagattatcattaa 116631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 35 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 8161 - 7998
Alignment:
Q  35 tagactgactcatgcagcttagttaaataacaac-agcaacataggcagtatacaaaaacagc--atgacataataatatcaattgcaattcatcaacat 131  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||  |||| ||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  8161 tagaccgacgcatgcagcttaattaaataacaaatagcagcataggcagtatgcaaat-cagctcatgatataataatatcaaatgaaattcaacaacat 8063  T
Q  132 cttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 196  Q
    |||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  8062 cttaaacattcatatataattcaagtaatgtatataaaattatatcacattataaacaacatcaa 7998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 20 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 1440 - 1280
Alignment:
Q  20 tcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 119  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1440 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaacaataacacatg-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 1342  T
Q  120 attc-atcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 180  Q
    | || |||| | ||| || |||||| ||||  ||||| ||||| |||||  |||||||||||    
T  1341 agtcaatcatcgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 1280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 10647 - 10481
Alignment:
Q  29 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatca 127  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||||||    
T  10647 tcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 10549  T
Q  128 acatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 196  Q
    |||||| ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||  ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  10548 acatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 10481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 33 - 196
Target Start/End: Original strand, 12587 - 12749
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacat 131  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  12587 cttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 12685  T
Q  132 cttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 196  Q
    || ||||| | | ||||  ||| |||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  12686 ctcaaatacttatatataattc-agtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 12749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 17 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 38820 - 38641
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 115  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||     
T  38820 tcatcatcttaatcaacttagacctactcatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaa 38722  T
Q  116 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 196  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||| | ||||  |||||||| ||  ||||  |||||||||||  |||| |||||||||    
T  38721 tgcaagtcatcaatatctcaaatatttatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 38641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Original strand, 11464 - 11646
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    |||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||    
T  11464 acatcaacatcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatc 11562  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 196  Q
        | || | | |||||||| ||||| ||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  11563 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 11646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 38377 - 38195
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    |||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||    
T  38377 acatcaacatcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatc 38279  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 196  Q
        | || | | |||||||| ||||| ||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  38278 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 38195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 174 - 245
Target Start/End: Original strand, 10323 - 10394
Alignment:
Q  174 tatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtct 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  10323 tatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattattattaacatcattattaagtct 10394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 196
Target Start/End: Original strand, 129917 - 130086
Alignment:
Q  26 tcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattca 124  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||    
T  129917 tcatcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacacacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtca 130015  T
Q  125 tcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 196  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||  ||||||| ||||  ||| |||||||||    
T  130016 tcaacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattgtaaacaacatcaa 130086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 41 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 60810 - 60614
Alignment:
Q  41 gactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaa 137  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||||  ||||| |||  |||||||| ||||| ||| |||||||| |||    
T  60810 gactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatac-aaaacagctcatgatataccaatatcaa-tgcaaatcaacaacatctcaaa 60713  T
Q  138 tattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataattaacatcat 235  Q
     ||||| ||||  ||||||||||| |||||  | |||||||||| || | |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  60712 cattcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacataattaacaacatcaaatcattttataacagcttcacagattatcattaatatcat 60614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 179
Target Start/End: Original strand, 29558 - 29720
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 117  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| || | |||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  29558 catcatcttaatcaacttagactgactcatgtgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaataatagcatgacataataatatcaattg 29657  T
Q  118 caa-ttcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcac 179  Q
    ||| |||| ||| |  ||||||||||||  |  |||||||||||| | | |||||||||||||    
T  29658 caatttcaacaagactttaaatattcaataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcac 29720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 6244 - 6078
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  6244 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagtaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 6146  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacat 181  Q
     | ||||| |||| |||||| |||| | ||||| ||  |||| ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  6145 gaatgcaagtcattaacatcataaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacat 6078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 41 - 221
Target Start/End: Original strand, 26851 - 27027
Alignment:
Q  41 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacag-catgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaata 139  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||  |||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||    
T  26851 gactcatgcatcttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacaatcatga--taattatatcaatt-caattcatcaacatcttatgta 26947  T
Q  140 ttcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagatt 221  Q
    | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  26948 tacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcataatcaaca-caa-acatctcataacagcttcacagatt 27027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 18 - 140
Target Start/End: Original strand, 19268 - 19390
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  19268 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 19366  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatat 140  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||    
T  19367 gcaaatcaacaacatctcaaatat 19390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 4921 - 4741
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 117  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||   |||| |||||| |||| | ||||||||||||     
T  4921 catcatcttaatcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataataatagcagcataggcagatcacaacaacagcttgacttcataatatcaattt 4822  T
Q  118 caattcatcaacatcttaaatattcaaatat-tcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaaca 198  Q
    || |||| |||||||||||  ||||||  || |||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  4821 catttcaacaacatcttaatcattcaataatatctt-aagtaatatacataacgttatatcacatcatattcaacattaaca 4741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 33 - 140
Target Start/End: Original strand, 1051 - 1158
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacat 131  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||| | | | ||||||||||    
T  1051 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacagcatgatataacaatatcaaatacgaatcatcaacat 1149  T
Q  132 cttaaatat 140  Q
    || ||||||    
T  1150 ctcaaatat 1158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 17 - 112
Target Start/End: Original strand, 15664 - 15759
Alignment:
Q  17 tcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||    
T  15664 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatac-aaaccatcatgatataataatatc 15759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 196
Target Start/End: Original strand, 133 - 310
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  133 catcatcatcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 231  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 196  Q
    |||| ||| |||||||| ||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||  ||||||| | || |||| |||||||||    
T  232 gcaaatcaacaacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataatattataaacaacatcaa 310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 2923 - 2801
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||||| |    
T  2923 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagctacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaat 2825  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatat 140  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||    
T  2824 gcaaatcaacaacatctcaaatat 2801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 45909 - 45732
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  45909 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagaaaaataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 45811  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 196  Q
    | || |||||||||||| || || ||||| ||  |||| || |||||||||  ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  45810 gtaagtcatcaacatctcaatta-tcaaacataattcatgtgatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 45732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 37 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 193074 - 192920
Alignment:
Q  37 gactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtat-acaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatctta 135  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||| |||| |||||||||| ||||||| ||  |||||| |||||||| |    
T  193074 gactgactcatgcaacttagttaattaacaacagcagcataggcagaatcacaacaacatcatgacataacaatatcatttataattca-caacatctca 192976  T
Q  136 aatattcaaatattcttcaagtaatgta-tataacattatatcacatcataatcaa 190  Q
    | |||||||  |  |||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  192975 attattcaataaaacttcaagtgatgtattacaacattatatcacaccataatcaa 192920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 14814 - 14692
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||| || ||||| ||| ||||||| | |    
T  14814 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaactaacaaacagcaacataggcagta-agaaaatcatcatgatatagtaatatcgaat 14716  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatat 140  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||    
T  14715 gcaaatcaacaacatctcaaatat 14692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 90
Target Start/End: Original strand, 6611 - 6688
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 90  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  6611 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 6688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 90
Target Start/End: Original strand, 13991 - 14068
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 90  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  13991 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 14068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 15898 - 15821
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 90  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  15898 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 15821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 81
Target Start/End: Original strand, 178898 - 178961
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggca 81  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  178898 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcagcataggca 178961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 1155 - 989
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| | | | || ||||| |||| || |||    
T  1155 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatgc-agatcatcatgatataacaacatc 1057  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacat 181  Q
     | ||||| ||||||||||| |||| | ||||| ||  |||| ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  1056 gaatgcaagtcatcaacatcataaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacat 989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 181
Target Start/End: Original strand, 12766 - 12932
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  12766 acatcatcataatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagctaaataacaaacaacaacataggcaatatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 12864  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacat 181  Q
     | ||||| ||||||||||| |||| | ||||| ||  |||| ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  12865 gaatgcaagtcatcaacatcataaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacat 12932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 193 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 17929 - 17873
Alignment:
Q  193 tcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17929 tcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcctcattaagtcttaat 17873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 26 - 140
Target Start/End: Original strand, 5655 - 5769
Alignment:
Q  26 tcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattca 124  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||    
T  5655 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagtaaaataacaaacagcaacataggcagtat-gaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatca 5753  T
Q  125 tcaacatcttaaatat 140  Q
     |||||||| ||||||    
T  5754 acaacatctcaaatat 5769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 1190 - 1092
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  1190 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 1092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 4321 - 4284
Alignment:
Q  40 tgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 77  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4321 tgactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacata 4284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16443 - 16264
Alignment:
Q  40 tgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtat-acaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaat 138  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||| |||| |||||| | ||||||||||||  | |||| |||||||||||      
T  16443 tgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggca-tatcacaacaacatcatgacttcataatatcaatt-aatttcaacaacatcttaatc 16346  T
Q  139 attcaaatat-tcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagatt 221  Q
    ||||||  || |||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  || | ||||||||||||||||    
T  16345 attcaataatatctt-aagtaatgcacataacattatatcacatcatattcaacattaacatttcat-aacagcttcacagatt 16264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 167
Target Start/End: Original strand, 32538 - 32687
Alignment:
Q  14 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||    
T  32538 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatc 32634  T
Q  113 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatata 167  Q
    || ||||| ||| |||||||| ||| | ||||| ||  |||| ||||||||||||    
T  32635 aaatgcaa-tcaacaacatctcaaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatata 32687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 33 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 51985 - 51766
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaa-ca 130  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||| |||||  || ||| ||    
T  51985 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagca-cataggcagcattcaaaaatagcaagacataataatatcaa-tgcaagccaacaatca 51888  T
Q  131 tcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcat-aatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaa 229  Q
    ||| || ||||||  ||  ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |  || | |||||||||||| ||| |||||||    
T  51887 tctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtat-acattatatcacatcataaatcaacattaatatctcat-aacagcttcacaaattgtaattaa 51790  T
Q  230 catcatcattaagtcttaatgcta 253  Q
     |||||  | ||||||||||||||    
T  51789 tatcatattcaagtcttaatgcta 51766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Original strand, 23843 - 24048
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 117  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||| ||||||| || ||| ||||      
T  23843 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcaccataggcagattacaacaacagtatgacatcat-ataacaatat 23941  T
Q  118 caatt----catcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 213  Q
    ||| |    || |||||||| ||  |||||   ||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||  ||||  |||| ||||||||    
T  23942 caaataaaacagcaacatctcaatcattcattcatagttcaagtaatgaaattaacattatatcacatcatattcaacactaacatctctt-aacagctt 24040  T
Q  214 cacagatt 221  Q
    ||||||||    
T  24041 cacagatt 24048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 2762 - 2694
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtat 85  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  2762 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggcagtat 2694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 137
Target Start/End: Original strand, 12943 - 13062
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| | |    
T  12943 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgctgctcagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcagcatgatataacaatatcgaat 13041  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaa 137  Q
    |||| ||||||||||| ||||    
T  13042 gcaagtcatcaacatcataaa 13062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 28887 - 28813
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataaca--acagcaacataggcagtatacaaa 90  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  28887 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacattacagcaacataggcagtatgcaaa 28813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21920 - 21721
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaac-agcatgacataataatatcaatt 116  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||| | ||||  ||||| ||| |||||    
T  21920 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacaatcatg--ataattataccaatt 21823  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttca 215  Q
     ||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||||||||||| ||| |||||||||  ||||| ||||||||| ||| |||||| | ||||||||||    
T  21822 -caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcttaatcaaca-caa-acatctcataacagcttca 21727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29812 - 29613
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaac-agcatgacataataatatcaatt 116  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||| | ||||  ||||| ||| |||||    
T  29812 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacaatcatg--ataattataccaatt 29715  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttca 215  Q
     ||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||||||||||| ||| |||||||||  ||||| ||||||||| ||| |||||| | ||||||||||    
T  29714 -caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcttaatcaaca-caa-acatctcataacagcttca 29619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 41 - 183
Target Start/End: Original strand, 29117 - 29262
Alignment:
Q  41 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattc-atcaacatcttaaata 139  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || | |||||| ||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  29117 gactcatgcatcttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattgcaattttaacaacaccttaaata 29216  T
Q  140 t--tcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatca 183  Q
    |  ||||  |  |||||||||||  | | |||||||||||||||||    
T  29217 tattcaataaaacttcaagtaatacacacaacattatatcacatca 29262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 90
Target Start/End: Original strand, 1086 - 1159
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 90  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  1086 catcttcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 1159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 185
Target Start/End: Original strand, 1881 - 2045
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaac-agcatgacataataatatcaatt 116  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| ||| | ||||  ||||| ||| |||||    
T  1881 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaacataggcagattacaacaacaatcatg--ataattataccaatt 1978  T
Q  117 gcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcata 185  Q
     ||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||    
T  1979 -caattcatcaacatcttatgtatacaattattcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcata 2045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 229
Target Start/End: Original strand, 25121 - 25321
Alignment:
Q  29 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcat 125  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||  ||||||| ||||| |||     
T  25121 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtata-taaaacagctcatgatataacgatatcaa-tgcaaatcaa 25218  T
Q  126 caacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattata 224  Q
    |||||||| ||| | ||| ||||  |||| ||||||||||||  | |||||||||| || | |||||||||  | ||||| ||||||||||||||| ||     
T  25219 caacatctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgtatatacaaatatatcacattatta-caacatcaaatcgtcttataacagcttcacagatcatc 25316  T
Q  225 attaa 229  Q
    |||||    
T  25317 attaa 25321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 18 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 24000 - 23927
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 90  Q
    ||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  24000 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 23927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 196
Target Start/End: Original strand, 225465 - 225588
Alignment:
Q  71 caacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataaca 170  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||| || |||||||| ||| ||||| ||||  ||||||||||| |||||  |    
T  225465 caacatagtcagtatgcaaaa-cagcgtgatataataatatcaaatgcaat-caacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaa 225562  T
Q  171 ttatatcacatcataatcaacatcaa 196  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||    
T  225563 ttatatcacattataaacaacatcaa 225588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 206 - 254
Target Start/End: Original strand, 20595 - 20643
Alignment:
Q  206 aacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctat 254  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20595 aacagcttcacagattatagttaacatcatcattaagtcttaatgctat 20643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 29 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 8180 - 8118
Alignment:
Q  29 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 90  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8180 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaacaaacaaacagcaacataggcagtatacaaa 8118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 90
Target Start/End: Original strand, 6824 - 6889
Alignment:
Q  26 tcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 90  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  6824 tcatcatcttagaccgactcatgcagctcagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 6889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 181
Target Start/End: Original strand, 8090 - 8181
Alignment:
Q  89 aaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacat 181  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| |||||||| ||| | ||||| ||  |||| ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  8090 aaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacat 8181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 29 - 133
Target Start/End: Original strand, 10542 - 10646
Alignment:
Q  29 tcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaattcatca 127  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| ||||||    
T  10542 tcaacttagaccgactcatgcagcttttttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 10640  T
Q  128 acatct 133  Q
    ||||||    
T  10641 acatct 10646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 112
Target Start/End: Original strand, 32102 - 32197
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 112  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| | ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  32102 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacaacaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatc 32197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 81
Target Start/End: Original strand, 36454 - 36517
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggca 81  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||    
T  36454 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagtagcataggca 36517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 75
Target Start/End: Original strand, 11982 - 12024
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 75  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11982 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 12024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 103
Target Start/End: Original strand, 69794 - 69879
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 103  Q
    ||||||||| |||| |||| || |||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  69794 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacat 69879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 41 - 133
Target Start/End: Original strand, 38343 - 38437
Alignment:
Q  41 gactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaacatct 133  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  |||||||  ||||| || | |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  38343 gactcatgcagcttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtata-taaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaattcaacaacatct 38437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 103
Target Start/End: Original strand, 19980 - 20065
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 103  Q
    ||||||||| |||| |||| || ||||||||||||||  ||||||||||| || | |||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  19980 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcagcttgattaaataacaatagtagcataggcagattacaacaacagtatgacat 20065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 41 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 206618 - 206575
Alignment:
Q  41 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagta 84  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  206618 gactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagta 206575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 18 - 116
Target Start/End: Original strand, 44081 - 44179
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    |||||||||  ||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||   |||| |||||||| |  | ||||||||||||    
T  44081 catcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaatt 44179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 82
Target Start/End: Original strand, 6095 - 6159
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 82  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  6095 catcatcttaatcatcttatattgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcag 6159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 6386 - 6284
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaac 129  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||  |||||||  ||||| || | |||||||| ||||| ||| ||||    
T  6386 cttagaccgactcatgcaacttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtata-taaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaac 6288  T
Q  130 atct 133  Q
    ||||    
T  6287 atct 6284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 134
Target Start/End: Original strand, 897 - 1012
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 117  Q
    |||||||||  ||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||   |||| |||||||| |  | ||||||||||||     
T  897 catcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttcaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaatt- 995  T
Q  118 caattcatcaacatctt 134  Q
    || |||| |||||||||    
T  996 catttcaacaacatctt 1012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 10639 - 10575
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 82  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  10639 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcaacataggcag 10575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 18 - 134
Target Start/End: Original strand, 1830 - 1945
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 117  Q
    |||||||||  ||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||   |||| |||||||| |  | ||||||||||||     
T  1830 catcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacaatggcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaatt- 1928  T
Q  118 caattcatcaacatctt 134  Q
    || |||| |||||||||    
T  1929 catttcaacaacatctt 1945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 91
Target Start/End: Original strand, 569 - 628
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa 91  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  569 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaa 628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 40 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 5038 - 4999
Alignment:
Q  40 tgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagg 79  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5038 tgactcatgcaacttggttaaataacaacagcaacatagg 4999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 196
Target Start/End: Original strand, 97024 - 97188
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaa-ataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaac 129  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||||    
T  97024 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtaca-taaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 97122  T
Q  130 atcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 196  Q
    |||| ||| | ||| ||||  |||| |||||| |||||  | |||||||||| || | |||||||||    
T  97123 atctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaa 97188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 196
Target Start/End: Original strand, 106302 - 106466
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaa-ataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaattcatcaac 129  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||||    
T  106302 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtaca-taaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 106400  T
Q  130 atcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 196  Q
    |||| ||| | ||| ||||  |||| |||||| |||||  | |||||||||| || | |||||||||    
T  106401 atctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaa 106466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1895 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1895
Description:

Target: scaffold1895; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 105 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1257 - 1169
Alignment:
Q  105 ataatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatat-tcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaacat 193  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||||||  ||||||  || |||| || ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1257 ataatatcaatttcatttcaacaacatcttaatcattcaataatatcttaaa-taatgcacataacattatatcacatcatattcaacat 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 7365 - 7328
Alignment:
Q  40 tgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 77  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  7365 tgactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacata 7328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 121
Target Start/End: Original strand, 2694 - 2784
Alignment:
Q  33 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaat 121  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||   |||| |||||||||||||||||||  |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||||    
T  2694 cttagaccgactcatgcagcttagtcaatagacaaacagcaacataggcagtata-taaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaat 2784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 82
Target Start/End: Original strand, 14664 - 14728
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 82  Q
    ||||||||| |||| |||| | |||||||| || ||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  14664 catcatcttaatcatcttatattgactcatacaacttggttaaataacaatagcagcataggcag 14728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 82
Target Start/End: Original strand, 23679 - 23743
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 82  Q
    ||||||||| |||| |||| | |||||||| || ||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  23679 catcatcttaatcatcttatattgactcatacaacttggttaaataacaatagcagcataggcag 23743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 18 - 82
Target Start/End: Original strand, 39103 - 39167
Alignment:
Q  18 catcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 82  Q
    ||||||||| |||| |||| | |||||||| || ||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  39103 catcatcttaatcatcttatattgactcatacaacttggttaaataacaatagcagcataggcag 39167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 40 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 46821 - 46745
Alignment:
Q  40 tgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 116  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||   |||| || ||||| || | ||||||||||||    
T  46821 tgactcatgcaacttagttacataacaatagcagcataggcagatcacaacaatagcataacttcataatatcaatt 46745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 6946 times since January 2019
Visitors: 5773