View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0799_low_2 (Length: 562)

Name: NF0799_low_2
Description: NF0799
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0799_low_2
NF0799_low_2
[»] chr8 (14 HSPs)
chr8 (290-562)||(40670120-40670393)
chr8 (1-292)||(13882095-13882385)
chr8 (40-292)||(8669782-8670034)
chr8 (1-293)||(29226286-29226577)
chr8 (1-282)||(35634693-35634975)
chr8 (1-291)||(32305717-32306008)
chr8 (4-279)||(37533779-37534055)
chr8 (1-283)||(8106903-8107185)
chr8 (43-293)||(42569953-42570206)
chr8 (190-291)||(45177496-45177598)
chr8 (67-161)||(36741718-36741815)
chr8 (41-260)||(17855397-17855617)
chr8 (197-279)||(42450364-42450447)
chr8 (202-267)||(27420124-27420190)
[»] chr4 (13 HSPs)
chr4 (1-291)||(43034023-43034313)
chr4 (40-291)||(30537524-30537775)
chr4 (1-294)||(26877172-26877468)
chr4 (1-291)||(27627762-27628052)
chr4 (1-291)||(782802-783093)
chr4 (1-291)||(3067738-3068026)
chr4 (1-291)||(50150212-50150500)
chr4 (1-295)||(36187328-36187623)
chr4 (1-292)||(25934350-25934647)
chr4 (48-243)||(33313287-33313483)
chr4 (198-292)||(22651745-22651839)
chr4 (82-257)||(56551402-56551573)
chr4 (202-269)||(29989964-29990031)
[»] chr3 (21 HSPs)
chr3 (1-293)||(54748000-54748292)
chr3 (1-291)||(26848053-26848343)
chr3 (1-294)||(35612908-35613203)
chr3 (1-291)||(25095895-25096170)
chr3 (46-291)||(48905527-48905772)
chr3 (1-298)||(50834016-50834313)
chr3 (1-298)||(50841540-50841837)
chr3 (39-291)||(22515686-22515941)
chr3 (1-292)||(23026176-23026470)
chr3 (1-293)||(46320443-46320736)
chr3 (46-276)||(9663814-9664041)
chr3 (43-292)||(20922665-20922916)
chr3 (1-179)||(25313373-25313552)
chr3 (43-294)||(49794858-49795098)
chr3 (215-291)||(30363802-30363878)
chr3 (222-288)||(25313559-25313625)
chr3 (90-135)||(31612861-31612906)
chr3 (247-291)||(9663769-9663813)
chr3 (88-136)||(33280368-33280416)
chr3 (215-269)||(32619589-32619643)
chr3 (262-294)||(48593262-48593294)
[»] chr7 (11 HSPs)
chr7 (1-291)||(24989723-24990013)
chr7 (46-291)||(7568072-7568317)
chr7 (39-291)||(23319869-23320122)
chr7 (40-293)||(18674552-18674805)
chr7 (57-292)||(41850906-41851142)
chr7 (54-292)||(45062518-45062756)
chr7 (41-291)||(48390213-48390464)
chr7 (1-168)||(8417668-8417835)
chr7 (40-292)||(48394054-48394306)
chr7 (190-276)||(8417896-8417982)
chr7 (86-142)||(965166-965222)
[»] chr2 (18 HSPs)
chr2 (1-292)||(41435501-41435792)
chr2 (1-291)||(21344974-21345261)
chr2 (1-292)||(39778542-39778836)
chr2 (1-297)||(25186948-25187244)
chr2 (1-240)||(10448728-10448967)
chr2 (1-281)||(10728196-10728477)
chr2 (1-295)||(11964160-11964440)
chr2 (46-291)||(7105608-7105853)
chr2 (1-293)||(42993696-42993990)
chr2 (4-288)||(10700120-10700405)
chr2 (1-292)||(13693422-13693713)
chr2 (1-293)||(19926678-19926969)
chr2 (4-293)||(22066289-22066556)
chr2 (1-284)||(36191475-36191759)
chr2 (39-293)||(28831005-28831259)
chr2 (3-130)||(41462677-41462805)
chr2 (200-293)||(41462842-41462935)
chr2 (262-291)||(10448966-10448995)
[»] chr6 (4 HSPs)
chr6 (1-292)||(1365654-1365946)
chr6 (346-562)||(2915748-2915963)
chr6 (1-281)||(7243319-7243600)
chr6 (1-291)||(24337909-24338196)
[»] chr5 (11 HSPs)
chr5 (3-292)||(33314340-33314629)
chr5 (1-293)||(40385125-40385421)
chr5 (1-175)||(21262907-21263081)
chr5 (40-295)||(3097437-3097695)
chr5 (4-292)||(24868479-24868768)
chr5 (1-291)||(41174553-41174844)
chr5 (346-562)||(31858866-31859085)
chr5 (190-292)||(21262494-21262596)
chr5 (57-178)||(4237918-4238039)
chr5 (40-131)||(2934942-2935034)
chr5 (201-232)||(4238206-4238237)
[»] chr1 (22 HSPs)
chr1 (1-292)||(16130404-16130698)
chr1 (6-281)||(35050208-35050483)
chr1 (4-293)||(5800329-5800617)
chr1 (1-292)||(1553726-1554023)
chr1 (1-292)||(16129850-16130148)
chr1 (1-291)||(30222702-30222992)
chr1 (39-293)||(40987959-40988213)
chr1 (1-292)||(27654615-27654905)
chr1 (1-224)||(27332899-27333122)
chr1 (3-291)||(34546661-34546949)
chr1 (1-292)||(45192466-45192756)
chr1 (74-293)||(27846418-27846638)
chr1 (43-256)||(36834287-36834495)
chr1 (58-293)||(4813644-4813878)
chr1 (1-172)||(9411737-9411909)
chr1 (106-285)||(35428415-35428598)
chr1 (57-266)||(23933236-23933446)
chr1 (39-114)||(35121218-35121293)
chr1 (77-294)||(13878943-13879161)
chr1 (198-291)||(35121354-35121446)
chr1 (218-291)||(9412283-9412356)
chr1 (85-286)||(11907972-11908172)
[»] scaffold0067 (1 HSPs)
scaffold0067 (1-293)||(6712-7007)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (1-293)||(258216-258500)
[»] scaffold0057 (2 HSPs)
scaffold0057 (58-292)||(30477-30711)
scaffold0057 (91-269)||(30741-30919)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 213; Significance: 1e-116; HSPs: 14)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 290 - 562
Target Start/End: Original strand, 40670120 - 40670393
Alignment:
Q  290 tatttcatacgatcacccccaacttatcaaacaactggccgaaaatcaaagagtgc-gctgatacacaaacattattatgtggcaaacccccttatacac 388  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40670120 tatttcatacgatcacccccaacttatcaaacaactggccgaaaatcaaagagtgctgctgaaacacaaacattcttatgtggcaaacccccttatacac 40670219  T
Q  389 ttcctatgtagcannnnnnnattaattacattaagggcaattttgtaaattcacacccactgctctcccctcttccttcccaccctctctgtactcacgt 488  Q
     ||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40670220 ctcctatgtagcatttttttattaattacattaagggcaattttgtaaattcacacccgctgctctcccctcttccttcccaccctctatgtactcacgt 40670319  T
Q  489 ttctccaaccccatcaccttcttctttctcacgaaccaccgtcgcccaccacccactgtctctgctcctcctca 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  40670320 ttctccaaccccatcaccttcttctttctcacgaaccaccgtcgcccaccacccattgtcgctgctcatcctca 40670393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Original strand, 13882095 - 13882385
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtg 100  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13882095 cggtcctttttattagaaataaaagtgagaatttttttggtcctttttataagaagattgatcaagtttcaaatatgtttgaagctaaatttcatttgtg 13882194  T
Q  101 cccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataag 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||       ||||||| |||    
T  13882195 cccttattgattatgagagagaatatt-aaagtaagtaagttgatggaataaagagtaattaatttaagggtattcatagaattattttaaatgtagaag 13882293  T
Q  201 tgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagtat 292  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13882294 tgtattaaatgaagatgactattttcaatgtaatttcttggtgttgatgttttatgttttttgtttcttgtataaaagaccggagggagtat 13882385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 40 - 292
Target Start/End: Original strand, 8669782 - 8670034
Alignment:
Q  40 gtcctttttataagaagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtgcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8669782 gtcctttttataagaagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagttaaatttcatttgtgcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagtaa 8669881  T
Q  140 gttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataagtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttcctt 239  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |        ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||    
T  8669882 gttgatggaataaagagtaattaatttaagggtattcataaattttttttaaatgtagaagtgtattaaatgaagatgactattttcaatgtattttttt 8669981  T
Q  240 ggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagtat 292  Q
    |||  ||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||| |||||    
T  8669982 ggtgttgatgttttatgtcttttgtttcttttataaaggatcggaggtagtat 8670034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Original strand, 29226286 - 29226577
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||       | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29226286 cggtcctttttattagaaacaaaagtgagaatttttttgttcctttttataagaagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtg 29226385  T
Q  101 cccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataag 200  Q
    || |||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||       ||||||| |||    
T  29226386 cc-ttattgattatgaatgaaaatattaaaagtaagtaagttgatggaataaagagtaattaatttaagggtattgatagaatttttttaaatgtagaag 29226484  T
Q  201 tgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagtatt 293  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  29226485 tgtattaaatgaagatgactattttcaatgtatttttttggtgttgatgttttatgtcttttgtttcttgtataaaggaccgtagggaatatt 29226577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 282
Target Start/End: Complemental strand, 35634975 - 35634693
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaag-attgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgt 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||        ||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35634975 cggtcatttttattataaacaaaagtgagaattttttttgtcatttttataagaaatattgaccaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgt 35634876  T
Q  100 gcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataa 199  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| ||||| || |||||||  |        ||||||| ||    
T  35634875 gcccttatttattatgagagagaatattaaaagtaagtaagttggtgcgataaagagtaattaatttagggttattcatggattttttttaaatgtaaaa 35634776  T
Q  200 gtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccg 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  35634775 gtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttctttggtactgatgttttatgtcttttgtttcttgtataaaggaccg 35634693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Original strand, 32305717 - 32306008
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaag-attgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgt 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||       |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32305717 cggtcctttttattagaaacaaaagtgaaaatttttttggtcctttttataagaaatattgaccaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgt 32305816  T
Q  100 gcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataa-nnnnnnnaaatgtata 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||        ||||||| |    
T  32305817 gcccttatttattatgagagagaatattaaaagtaagtaagttggtggaataaagaataattaatttaggggtattcatggaatattttttaaatgtaga 32305916  T
Q  199 agtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagta 291  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32305917 gatgtattaaat-aagataactattttcaatgtatttctttagtcttgatgttttatgtcttttgtttcttgtataaaggaccggagggagta 32306008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 4 - 279
Target Start/End: Original strand, 37533779 - 37534055
Alignment:
Q  4 tcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtgccc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||       | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  37533779 tcctttttattataaacaaaagtgagaatttttttgatcctttttattagaagattgatcaagtttcaaatatatttgaagttaaatttcgtttgtgccc 37533878  T
Q  104 ttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataa-nnnnnnnaaatgtataagtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||        ||||||| || ||    
T  37533879 ttattgattatgagagagaatattaaaaataagtaagttgatggaataaagagtaattaatttaaatgtattcatataattttttttaaatgtagaaatg 37533978  T
Q  203 tattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaagga 279  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  37533979 tattaaatgaagatgactatttttaatgtattttcttgatgttgatgttttatgtcttttgtttcttgtataaagga 37534055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 283
Target Start/End: Original strand, 8106903 - 8107185
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||       | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8106903 cggtcctttttattagaaacaaaaatgagaatttttttgatcctttttataagaagattgaccaagtttcaagtatgtttgaaactaaatttcatttgtg 8107002  T
Q  101 cccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataag 200  Q
     ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||  |||||  |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||  |        ||||||| |||    
T  8107003 tccttatttattatgagatagaaaattaaaagtaaataagttagtggaataaagaggaattaatttaggggtattcatgaattttttttaaatgtagaag 8107102  T
Q  201 tgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccgg 283  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  8107103 tgtattaaatgaagaggactattttcaatgtatttccttggtcttgatgttttatgtcttttgtttcttgtataaaggaccgg 8107185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 43 - 293
Target Start/End: Original strand, 42569953 - 42570206
Alignment:
Q  43 ctttttataagaag-attgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtgcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagt 141  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  42569953 ctttttataagaaatattgaccaagttttaagtatcattgaagctaaattttatttgtgcatttatttattatgagagagaatattaaaaataagtaagt 42570052  T
Q  142 tgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcat--ataannnnnnnaaatgtataagtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttcctt 239  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||||  ||         || |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42570053 tgatgaaataaatagtaattaatttagggatattcatagattttttttttaattgtaaaggtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttcttt 42570152  T
Q  240 ggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagtatt 293  Q
    | |||| ||||||||||| || | |||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  42570153 gatcctaatgttttatgtcttttatttcttatataaaggatcggatggagtatt 42570206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 190 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 45177598 - 45177496
Alignment:
Q  190 aaatgtataagtgtattaaatgaagataactattttcaatg-tatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggaggga 288  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  45177598 aaatgtagaagtgtattaaatgaagatgactattttcaatgttattttcttggtgttgatgttttatgtcttttgttttttgtataaaggatcggaggga 45177499  T
Q  289 gta 291  Q
    |||    
T  45177498 gta 45177496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 67 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 36741815 - 36741718
Alignment:
Q  67 tttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtgcccttattgattatga---gagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaatt 161  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |   |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||    
T  36741815 tttcaaatgtgttagaagctaaatttcatttgtgtccttatttattattattagagagaatattaaaagtaagtaagttagtggaattaagagtaatt 36741718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 260
Target Start/End: Original strand, 17855397 - 17855617
Alignment:
Q  41 tcctttttataagaag-attgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtgcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||| |||| |||| ||| |||||||||||||||  ||||||| || |||||| | | ||||||||||||  ||    
T  17855397 tcctttttataagaaatattgaacaatttttaagtgtgttggaaactaaatttcatttgtatccttatttatgatgagaaatagtattaaaagtaattaa 17855496  T
Q  140 gttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataagtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttcctt 239  Q
    ||| |||||   || ||||||| ||||| |||||||| |  ||       ||||||||| | |||||||||||  |||   |||||||||||| |||||     
T  17855497 gttaatggaggcaatagtaattaatttaggggtattcttggaagaaatgtaaatgtataggagtattaaatgagaatagtcattttcaatgtacttccta 17855596  T
Q  240 ggtcctgatgttttatgtttt 260  Q
    | ||| |||| ||||||||||    
T  17855597 gttccggatgatttatgtttt 17855617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 197 - 279
Target Start/End: Original strand, 42450364 - 42450447
Alignment:
Q  197 taagtgtattaaatgaaga-taactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaagga 279  Q
    |||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||| | ||| ||||||| || |||||||| || ||||||    
T  42450364 taagagtattaaatgaaaaataactattttcaatgtttttcattggtcttaatggtttatgtattttgtttcttataaaaagga 42450447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 202 - 267
Target Start/End: Original strand, 27420124 - 27420190
Alignment:
Q  202 gtattaaatgaaga-taactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttc 267  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||| || ||||||    
T  27420124 gtattaaatgaaaaataactattttcaatgtttttcattggtcttgatattttatgtattttgtttc 27420190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 13)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 43034313 - 43034023
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43034313 cggtcctttttattagaaacaaaagtgagaatttttttggtcctttttataagaagattgatcaagtttcaaatatgtttgaagctaaatttcatttgtg 43034214  T
Q  101 cccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||       ||||||| |||    
T  43034213 cccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagtaagttgatggaataaagagtaattaatttaagggtattcatagaattattttaaatgtagaag 43034114  T
Q  201 tgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagta 291  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43034113 tgtattaaatgaagatgactattttcaatgtaatttcttggtgttgatgttttatgttttttgtttcttgtataaaggaccggagggagta 43034023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 40 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 30537775 - 30537524
Alignment:
Q  40 gtcctttttataagaagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtgcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30537775 gtcctttttataagaagattgaccaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtgcccttatttattatgagagagaatattaaaagtaagtaa 30537676  T
Q  140 gttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataagtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttcctt 239  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||       ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30537675 gttggtggaataaagagtaattaatttaggggtattcatgaaaaatttttaaatgtagaaatgtattaaatgaagatgactattttcaatgtatttcctt 30537576  T
Q  240 ggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagta 291  Q
    | || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30537575 gatcttgatgttttatgtcttttgtttcttgtataaaggaccggaggtagta 30537524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 26877172 - 26877468
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaag-attgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgt 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||  ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26877172 cggtcctttttattagaaacaaaagtgagaatttttttggtcctttttataagaaatattgaccaaattttaagtatgtttgaagctaaatttcatttgt 26877271  T
Q  100 gcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcat--ataannnnnnnaaatgtat 197  Q
    | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||   |         |||||||     
T  26877272 gtccttatttattatgagatagaatattaaaagtaagtaagttggtggaataaagagtaattaatttaggggtattcatgatttttttttttaaatgtag 26877371  T
Q  198 aagtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagtattt 294  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26877372 aggtgtattaactgaagataactattttcaatgtatttccttggtcttgatgttttatatcttttgtttcttgtataaaggaccggagggagtattt 26877468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Original strand, 27627762 - 27628052
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaag-attgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgt 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  ||       | |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27627762 cggtcctttttattagaaacaaaagtggaaatttttttgatcctttttataagaaatattgaccaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgt 27627861  T
Q  100 gcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataa-nnnnnnnaaatgtata 198  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||        ||||||| |    
T  27627862 gcccttatttattat--gagagaatattaaaagtaagtaagttggtggaataaagagtaattaatttaggggtattcatgtaattttttttaaatgtaga 27627959  T
Q  199 agtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagta 291  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  27627960 aatatattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttgatcctgatgttttatgtcttttgtttcttgtataaagaaccgaagggagta 27628052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Original strand, 782802 - 783093
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaag-attgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgt 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |         ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  782802 cggtcctttttattagaaacaaaagtgatatttttttttgtcctttttataagaaatattgaccaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcttttgt 782901  T
Q  100 gcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataa-nnnnnnnaaatgtata 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||        ||||||| |    
T  782902 gcccttatttattatgagagagaatattaaaagtaagtaagttggtggaataaagaataattaatttaggggtattcatggaatattttttaaatgtaga 783001  T
Q  199 agtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagta 291  Q
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  783002 gatgtattaaat-aagataactattttcaatgtatttccttggtcttgatgttttatgtcttttgtttcttgtataaaggaccggagggagta 783093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Original strand, 3067738 - 3068026
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtg 100  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||        |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3067738 cggtcctttttattagaaa-aaaagtgagaattttttttgtcctttttataagaagattgaccaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtg 3067836  T
Q  101 cccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataag 200  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||  | |||||||||  |||| |||||  |||||||||  ||       ||||||| |||    
T  3067837 cccttatttattatgagagagaaaattaaaagtaaataagttagtagaataaagaagaattaatttagaggtattcat-gaatttttctaaatgtagaag 3067935  T
Q  201 tgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagta 291  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3067936 tgtattaaatgaagatgactattttcaatgtatttccttgatcttgatgttttatgtcttttgtttattgtataaaggaccggagggagta 3068026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 50150500 - 50150212
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||       ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50150500 cggtcctttttattagaaacaaaagggagaatttttttggtcctttttataagaagattgatcaagttttaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtg 50150401  T
Q  101 cccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataag 200  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||  |       ||||||| |||    
T  50150400 tccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagtaagttgatggaataaaaagtaattaatttaagggtattccta-gagttttttaaatgtagaag 50150302  T
Q  201 tgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagta 291  Q
      |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||  | || ||||| || || |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  50150301 catattaaatgaagatgattattttcaatgtattttcttagttttaatatttta-gtcttttgtttcttgtataaaggagcggaggaagta 50150212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Original strand, 36187328 - 36187623
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaag-attgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgt 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||          |||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36187328 cggtcctttttattagaaacaaaagtgaatttttttttggtcctttttataagaaatattaaccaagtttcaagtatatttgaagctaaatttcatttgt 36187427  T
Q  100 gcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataa-nnnnnnnaaatgtata 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||        ||||||| |    
T  36187428 gcccttatttattatgagagagaatattaaaagtaagtaagttggtggaataaagaataattaatttaggggtattcatggaatattttttaaatgtaga 36187527  T
Q  199 agtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagtatttc 295  Q
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36187528 gatgtattaaat-aagataactattttcaatgtattttcttggtcttgatgttttatgtcttttgtttcttgtataaaagaccggagggagtatttc 36187623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Original strand, 25934350 - 25934647
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||        |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25934350 cggtcctttttattagaaacaaaagtgagaattttttttgtcctttttataagaagattgaccaagtttcaagtatgtttgaagataaatttcatttgtg 25934449  T
Q  101 cccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattca-------tataannnnnnnaaat 193  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||  |||||  |||||||||||| |||| |||| ||||||||||       | |         ||||    
T  25934450 cccttatttattatgagagagaaaattaaaaataaataagttagtggaataaagaggaattaattt-agggtattcatgatttttttttttttttaaaat 25934548  T
Q  194 gtataagtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagtat 292  Q
     || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  25934549 atagaagtgtattaaatgaagatgactattttcaatgtatttctttagtcttgatgttttatgtcttttgtttcttgtataaaggatcagaggaagtat 25934647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 48 - 243
Target Start/End: Original strand, 33313287 - 33313483
Alignment:
Q  48 tataagaagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtgcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatgg 147  Q
    |||||||||||| | ||||||| || ||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||  |||    
T  33313287 tataagaagattaaccaagttttaaatatgtttaaatataaattttatttgtgcccttatttattatgagagagaaaattaaaagtaaataagttagtgg 33313386  T
Q  148 aataaagagtaattcatttaagggtattcat-ataannnnnnnaaatgtataagtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtc 243  Q
    ||||||||  |||| ||||| || ||||||| |          |||| || ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||    
T  33313387 aataaagatgaattaatttatggatattcatgaatttttttttaaatataaaagtgtattaaatgaagatgactatttttaatgtatttctttggtc 33313483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 198 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 22651839 - 22651745
Alignment:
Q  198 aagtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagtat 292  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22651839 aagtgtattaaaagaagatgattattttcaatgtatttctttggtctcgatgttttatgtcttttgtttcttgtataaaggactggagggagtat 22651745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 82 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 56551573 - 56551402
Alignment:
Q  82 aagctaaatttcatttgtgcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatata 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||    |||||||||  |||||| |||||||||| || || |||||| |||  |    
T  56551573 aagctaaatttcatttgtgcccttaattattattagagagaatactaa----aagcaagtttgtggaattaagagtaattaatataggggtatacatgaa 56551478  T
Q  182 annnnnnnaaatgtataagtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgt 257  Q
    |       |||| |||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||  |||| |||||||    
T  56551477 ataaatttaaatttataggaatattaaatgaaaataactatttttaatgtgtttccttggtctagatgatttatgt 56551402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 269
Target Start/End: Original strand, 29989964 - 29990031
Alignment:
Q  202 gtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttctt 269  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| |||||| ||||| ||||||| || ||||||||    
T  29989964 gtattaaatgaaaatagctattttcaatatttttcattggtcttgatggtttatgtattttgtttctt 29990031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 21)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Original strand, 54748000 - 54748292
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54748000 cggtcctttttattagaaacaaaagtgagaatttttttggtcctttttataagaagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtg 54748099  T
Q  101 cccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||       ||||||| |||    
T  54748100 cccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagtaaattgatggaataaagagtaattaatttaagggtattcatataatttttttaaatgtagaag 54748199  T
Q  201 tgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagtatt 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||| || ||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  54748200 tgtattaaatgaagataactattttcaacgtattttcttggtgttgatgttttatgtcttttgtttattgtataaaggattggagggagtatt 54748292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 26848343 - 26848053
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26848343 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaatttttttggtcatttttataagaagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcttttgtg 26848244  T
Q  101 cccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||       || |||| |||    
T  26848243 cccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagtaagttgatggaataaagagtaattaatttaagggtgttcatagaatttttttaactgtagaag 26848144  T
Q  201 tgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagta 291  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  26848143 tgtattaaatgaagatgactattttcaatgtatttttttggtgttgatgttttatgtcttttgtttcttgtataaaagatcggagggagta 26848053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 35613203 - 35612908
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaag-attgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgt 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35613203 cggtcctttttattagaaacaaaagtgagaatttttttggtcctttttataagaaatattgaccaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgt 35613104  T
Q  100 gcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataa-nnnnnnnaaatgtata 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||        ||||||| |    
T  35613103 gcccttatttattatgagagagaatattaaaagtaaataagttggtggaataaagagtaattaatttaggggtattcatggaattttttttaaatgtaga 35613004  T
Q  199 agtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagtattt 294  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35613003 ggtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgtcttttatttcttgtataaaggactggagggagtattt 35612908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 25096170 - 25095895
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25096170 cggtcctttttattagaaacaaaagtgagaatttttttggtcctttttataagaagattgatcaaatttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtg 25096071  T
Q  101 cccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||               || ||     
T  25096070 cccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagtaaattgatggaataaagagtaattaatttaagggtattcata---------------tagaaa 25095986  T
Q  201 tgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagta 291  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25095985 tgtattaaatgaagatgactattttcaatgtattttcttggtgttgatgttttatgtcttttgtttcttgtataaaggatcggagggagta 25095895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 46 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 48905772 - 48905527
Alignment:
Q  46 tttataagaagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtgcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgat 145  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  48905772 tttataagaagattgaccaagtttcaagtatgtttgaaggtaaatttcatttgtgcccttatttattatgagagagaatattaaaagtaagtaagttggt 48905673  T
Q  146 ggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataagtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcct 245  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||       ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |    
T  48905672 ggaataaagagtaattaatttaggggtattcatgaaatttttttaaatgtagaaatgtattaaatgaagatgactattttcaatgtatttccttagtctt 48905573  T
Q  246 gatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagta 291  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48905572 gatgttttatgtcttttgtttcttgtataaaggaccggagggagta 48905527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 298
Target Start/End: Original strand, 50834016 - 50834313
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaag-attgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgt 99  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50834016 cggtcctttttattaggaacaaaagtgagaatttttttggtcctttttataagaaatattgaccaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgt 50834115  T
Q  100 gcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataa 199  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |        ||||||| |     
T  50834116 gcccttacttattatgagagagaatattaaaagtaagtaagttggtggaataaagagtaattaatttaagggtattcatggattttttttaaatgtagag 50834215  T
Q  200 gtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagtatttcata 298  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  50834216 atatattaaatgaagataactattttcaatatatttccttagtcctgatgttttatgtcttttgtttcttgtataaaggatc-gagggagtatttcata 50834313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 50841837 - 50841540
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaag-attgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgt 99  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50841837 cggtcctttttattaggaacaaaagtgagaatttttttggtcctttttataagaaatattgaccaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgt 50841738  T
Q  100 gcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataa 199  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |        ||||||| |     
T  50841737 gcccttacttattatgagagagaatattaaaagtaagtaagttggtggaataaagagtaattaatttaagggtattcatggattttttttaaatgtagag 50841638  T
Q  200 gtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagtatttcata 298  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  50841637 atatattaaatgaagataactattttcaatatatttccttagtcctgatgttttatgtcttttgtttcttgtataaaggatc-gagggagtatttcata 50841540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 39 - 291
Target Start/End: Original strand, 22515686 - 22515941
Alignment:
Q  39 ggtcctttttataagaag-attgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtgcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagc 137  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  22515686 ggtcctttttataagaaatattgaccaagtttcaagtatgtctgaagctaaatttcatttgtgcccttatttattatgagagagaatattaaaagtaagt 22515785  T
Q  138 aagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtat--aagtgtattaaatgaagataactattttcaatgtattt 235  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||| ||  ||       ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22515786 aagttggtggaataaagagtaattaatttaagaatatttatggaatttttttaaatgtattgaggtgtattaaatgaagataactattttcaatgtattt 22515885  T
Q  236 ccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagta 291  Q
    |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22515886 ccttagtcctgatgttttatgtcttttgtttcttgtataaaggatcagagggagta 22515941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 23026470 - 23026176
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaag-attgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgt 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||       |||| ||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23026470 cggtcctttttattagaaacaaaagtgagaatttttttggtcatttttataagaaatattgataaaatttcaagtatgtttgaagttaaatttcatttgt 23026371  T
Q  100 gcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcat--ataannnnnnnaaatgtat 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||   |         |||||||     
T  23026370 gcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagtaagttggtggaataaagagtaattaatttaggggcattcatgatttttttttttaaatgtag 23026271  T
Q  198 aagtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagtat 292  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23026270 agatgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttctttgatcctgatattttatgtcttttgtttcttgtataaaggatcggagggagtat 23026176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Original strand, 46320443 - 46320736
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaag-attgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgt 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46320443 cggtcctttttattagaaacaaaagtgagaattttttaggtcctttttataagaaatattgaccaagttttaagtatgtttgaagttaaatttcatttgt 46320542  T
Q  100 gcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataa 199  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||||| |||| || ||  ||       |||| || |     
T  46320543 acccttatttattatgagagagaatattaaaagtaagtaagttggtgaaataaagagtaattaatttaggggtgttaatggaagtttcttaaatatagag 46320642  T
Q  200 gtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagtatt 293  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46320643 gtgtattaaatgaatattactattttcaatgtatttctttggtcttgatgttttatgtctgttgtttcttgtataaaggaccggagggagtatt 46320736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 9664041 - 9663814
Alignment:
Q  46 tttataagaagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtgcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgat 145  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||| |    
T  9664041 tttataagaagattgaccaagtttcaag-atgtttgaaggtaaatttcatttgtgcccttatttattatgagaga--atattaaaagtaagtaagttggt 9663945  T
Q  146 ggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataagtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcct 245  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||       ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  9663944 ggaataaagagtaattaatttaggggtattcatgaaatttttttaaatgtagaaatgtattaaatgaagatgactattttcaatgtatttccttggtctt 9663845  T
Q  246 gatgttttatgttttctgtttcttgtataaa 276  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  9663844 gatgttttatgtcttttgtttcttgtataaa 9663814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 43 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 20922916 - 20922665
Alignment:
Q  43 ctttttataagaag-attgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtgcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagt 141  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20922916 ctttttataagaaatattgaccaagtttcaagtattcttgaagctaaatttcatttgtgctcttatttattatgagagagaatattaaaagtaagtaagt 20922817  T
Q  142 tgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatata-annnnnnnaaatgtataagtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttg 240  Q
    || ||||||||| | ||||| ||||| || |||||||  |         ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  20922816 tggtggaataaaaaataattaatttagggatattcattgatttttttttaaatgtagaggtgtattaaatgaagataaatattttcaatgtatttcctta 20922717  T
Q  241 gtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagtat 292  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20922716 gtcctaatgttttatgtcttttgttttttgtataaaggaccggagggagtat 20922665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 25313373 - 25313552
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaag-attgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgt 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25313373 cggtcctttttattagaaacaaaagtgagaattttttgggtcctttttataagaaatattgaccaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgt 25313472  T
Q  100 gcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcata 179  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  25313473 gcccttatttattatgagagagaatattaaaagtaagtaagttggtggaataaagaataattaatttaggggtattcata 25313552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 43 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 49795098 - 49794858
Alignment:
Q  43 ctttttataagaag-attgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtgcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagt 141  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  49795098 ctttttataagaaatattgatcaagtttcaagtatgtt-gaagctaaatttcatttgtactcttatttattatgagagaaaatattaaaagtaagtaagt 49795000  T
Q  142 tgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataagtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttgg 241  Q
    || ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||  ||       ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||           |||    
T  49794999 tggtggaataaagagtaattaattaaggggtattcatgaaaaaaaattaaatgtagaggtgtattaaatgaagataactattttca-----------tgg 49794911  T
Q  242 tcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagtattt 294  Q
    || ||||||||||||| || ||||||||||||||| || || | |||||||||    
T  49794910 tcttgatgttttatgtcttttgtttcttgtataaatgatcgcaaggagtattt 49794858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 30363878 - 30363802
Alignment:
Q  215 ataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagta 291  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30363878 ataactattttcaatgtattttcttggtcctgatgttttatgtcttttgtttcttgtataaaggaccggagagagta 30363802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 222 - 288
Target Start/End: Original strand, 25313559 - 25313625
Alignment:
Q  222 ttttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggaggga 288  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||    
T  25313559 ttttaaatgtatttttttggtcctgatgttttatgtcttttgtttcttgtataaaagatcggaggga 25313625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 90 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 31612906 - 31612861
Alignment:
Q  90 tttcatttgtgcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaa 135  Q
    |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31612906 tttcatctgtgtccttattcattatgagagagaatattaaaagtaa 31612861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 9663813 - 9663769
Alignment:
Q  247 atgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagta 291  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9663813 atgttttatgtcttttgtttcttgtataaaggatcggagggagta 9663769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 33280416 - 33280368
Alignment:
Q  88 aatttcatttgtgcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaag 136  Q
    |||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  33280416 aatttcatttgtgttcttatttattacgagagagaatattaaaagtaag 33280368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Original strand, 32619589 - 32619643
Alignment:
Q  215 ataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttctt 269  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||    
T  32619589 ataactatttttaatgtttttcattggtcttgatgatttatgttttttgtttctt 32619643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 262 - 294
Target Start/End: Original strand, 48593262 - 48593294
Alignment:
Q  262 tgtttcttgtataaaggaccggagggagtattt 294  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48593262 tgtttcttgtatataggaccggagggagtattt 48593294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 11)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Original strand, 24989723 - 24990013
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24989723 cggtcctttttattagaaacaaaagtgagaatttttttggtcctttttattagaagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtg 24989822  T
Q  101 cccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||       ||||||| |||    
T  24989823 cccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagtaagttgatggaataaagagtaattaatttaagggtattcatagaatttttttaaatgtagaag 24989922  T
Q  201 tgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagta 291  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||  | ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  24989923 tgtattaaatgaagatgactattttaaatgtattttcttggtattaatgttttatgtcttttgtttcttgtataaaagaccggaaggagta 24990013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 46 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 7568317 - 7568072
Alignment:
Q  46 tttataagaagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtgcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgat 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |    
T  7568317 tttataagaagattgatcaagtttcaagtatgtttgaaggtaaatttcatttgtgcccttatttattatgaaagagaatattaaaagtaagtaagttggt 7568218  T
Q  146 ggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataagtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcct 245  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||       ||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  7568217 ggaataaagagtaattaatttaggggtattcatgaaatttttttaaatgtagaaatgtattaaatgaagatgactattttcaatgtatttccttggtctt 7568118  T
Q  246 gatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagta 291  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7568117 gatgttttatgtcttttgtttcttgtacaaaggaccggagggagta 7568072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 39 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 23320122 - 23319869
Alignment:
Q  39 ggtcctttttataagaag-attgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtgcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagc 137  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  23320122 ggtcatttttataagaaatattgaccaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtgcccttatttattatgagagagaatattaaaagtaagt 23320023  T
Q  138 aagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataagtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttcc 237  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||       ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  23320022 aagttggtggaataaagagtaattaatttaggggtattcatggaaattttttaaatgtagaggtgtattaaacgaagataactattttcaatgtaattcc 23319923  T
Q  238 ttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagta 291  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23319922 ttggtcctgatgttttatgtcttttgtttcttgtataaaggaccggagggagta 23319869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 40 - 293
Target Start/End: Original strand, 18674552 - 18674805
Alignment:
Q  40 gtcctttttataagaagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtgcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaa 139  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||| ||    
T  18674552 gtcctttttataagaaaattgaccaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtgcccttatttattataagagagaatattgaaaataagtaa 18674651  T
Q  140 gttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataagtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttcctt 239  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||       ||||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18674652 gttggtggaataaagagtaattaatttaggggtattcatgaaatttttttaaatgtagaaatgtattaaatgaagatgactatattcaatgtatttcctt 18674751  T
Q  240 ggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagtatt 293  Q
    |||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18674752 ggtcttgatgttttatgtcttttgtttcttgtataaaggaccggaggtagtatt 18674805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 57 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 41851142 - 41850906
Alignment:
Q  57 attgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtgcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagag 156  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  41851142 attgaccaagtttcaagtatgtttgaaactaaatttcatttgtacccttatttattatgagagagaatattaaaagtaagtgagttggtggaataaagag 41851043  T
Q  157 taattcatttaagggtattcat-ataannnnnnnaaatgtataagtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttat 255  Q
    ||||| ||||| |||||||||| | ||       ||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41851042 taattaatttaggggtattcataaaaaaaaatttaaatgtagaggtgtattaaatgaagataacaattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttat 41850943  T
Q  256 gttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagtat 292  Q
    || || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41850942 gtcttttgtttcttgtataaaggatcggagggagtat 41850906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 54 - 292
Target Start/End: Original strand, 45062518 - 45062756
Alignment:
Q  54 aagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtgcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaa 153  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45062518 aagattgatcaagtttcaaatatgtttaaagctaaatttcatctgtgcccttgttgattatgagagagaatattaaaagtaagtaagttgatggaataaa 45062617  T
Q  154 gagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataagtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgtttt 253  Q
     ||||||| ||||||||||||||||| ||       ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |  |||||||||    
T  45062618 aagtaattaatttaagggtattcatagaatttttttaaatgtaaaagtgtattaaatgaagatgactattttcaatgtattttcttgatgttgatgtttt 45062717  T
Q  254 atgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagtat 292  Q
    |||| || |||||||||||||||||| | |||| |||||    
T  45062718 atgtcttttgtttcttgtataaaggatcagaggaagtat 45062756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 41 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 48390464 - 48390213
Alignment:
Q  41 tcctttttataagaag-attgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtgcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaa 139  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  48390464 tcctttttataagaaatattgaccaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtgtccttatttattatgagtgagaatattaaaagtaagtaa 48390365  T
Q  140 gttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataa-nnnnnnnaaatgtataagtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttcct 238  Q
    ||||||| |||||| | ||||| ||||| ||||||||||  ||        ||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  48390364 gttgatgaaataaaaaataattaatttaggggtattcatggaatattttttaaatgtagagatgtattaaat-aagataactattttcaatgtatttcct 48390266  T
Q  239 tggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagta 291  Q
    || || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48390265 tgatcttgatgttttatgtcttttgtttcttgtataaaggaccggagggagta 48390213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 8417668 - 8417835
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8417668 cggtcctttttattagaaacaaaagtgagaattttttttgtcctttttataagaagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtg 8417767  T
Q  101 cccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaa 168  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8417768 cccttattaattatgagagataatattaaaagtaagtaagttgatggaataaagagtaattaatttaa 8417835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 40 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 48394306 - 48394054
Alignment:
Q  40 gtcctttttataagaag-attgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtgcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagca 138  Q
    ||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||| |    
T  48394306 gtcctttttataagaaatattgaccaagttttaagtatgtttgaaactaaatttcatttgtgcccttatttattat--gaaagaatattaaaagtaagta 48394209  T
Q  139 agttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcat-ataannnnnnnaaatgtataagtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttcc 237  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |  |       ||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48394208 agttggtggaataaagagtaattaatttaggggtattcttgaagaagaagaaaaaagtagaggtgtattaaatgaagataaatattttcaatgtatttcc 48394109  T
Q  238 ttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagtat 292  Q
    |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48394108 ttggtcctgatgttttatggcttttgtttcttgtataaaggatcggagggagtat 48394054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 276
Target Start/End: Original strand, 8417896 - 8417982
Alignment:
Q  190 aaatgtataagtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaa 276  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || | |||||| ||||||||| ||||||  ||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  8417896 aaatgtagaagtgtattaaatgaatatgaatatttttaatgtattttcttggtgttgatgttttatgtcttttgtttcttgtataaa 8417982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 86 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 965222 - 965166
Alignment:
Q  86 taaatttcatttgtgcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagtt 142  Q
    |||||||| ||||||  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  965222 taaatttcgtttgtgttcttatttattatgagaaagaatattaaaagtaagtaagtt 965166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 182; Significance: 4e-98; HSPs: 18)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 41435792 - 41435501
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41435792 cggtcctttttattagaaacaaaagtgagaatttttttggtcctttttataataagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtg 41435693  T
Q  101 cccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataag 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||       ||||||| |||    
T  41435692 cccttattgattatgagatagaatattaaaagtaaataagttgatgaaataaagagtaattaatttaagggtattcatgaaaaaaaattaaatgtagaag 41435593  T
Q  201 tgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagtat 292  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41435592 tgtattaaatgaagatgactattttcaatgcattttcttggtgttgatgttttatgttttttgtttcttatataaaggaccggagggagtat 41435501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 21345261 - 21344974
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21345261 cggtcctttttattagaaacaaaagtgagaatttttt-ggtcctttttataagaagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtg 21345163  T
Q  101 cccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataag 200  Q
     ||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||       ||||||| |||    
T  21345162 tccttattgattgtgagagaga--attaaaagtaagtaagttgatggaataaagagtaattaatttaagggtatttatagaattgttttaaatgtagaag 21345065  T
Q  201 tgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagta 291  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21345064 tgtaataaatgaagatgactattttcaatgtatttttttggtcttgatgttttatgtcttttgtttcttgtataaaggactggagggagta 21344974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 39778836 - 39778542
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaag-attgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgt 99  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||| ||       |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39778836 cggtcttttttattagaaacaaaagtgaaaatttttttggtcctttttataagaaatattgaccaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgt 39778737  T
Q  100 gcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataa--nnnnnnnaaatgtat 197  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||         |||||||     
T  39778736 gcccttatttattatgagagagaatattaaaagtaagtaagttggtggaataaagagtaattaatttaagggtattcatggaatttttttttaaatgtag 39778637  T
Q  198 aagtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagtat 292  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39778636 aggtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcttgatgttttatgtcttttatttcttgtataaaggaccggagggagtat 39778542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 25186948 - 25187244
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaag-attgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgt 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||       |||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25186948 cggtcctttttattagaaacaaaagtga-aatttttttggtcatttttataagaaatattgaccaagtttcaagtatgtctgaagctaaatttcatttgt 25187046  T
Q  100 gcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataa 199  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||  ||       ||||||| |     
T  25187047 gcccttatttattatgagagagaatattaaaagtaagtaagttggtggaattaagagtaattaatttaaggatattcatggaatttttttaaatgtagag 25187146  T
Q  200 gtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagtatttcat 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  25187147 gtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctaatgttttatgtcttttgtttcttgtataaaggaccagagggagtatgtcat 25187244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 10448728 - 10448967
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10448728 cggtcctttttattagaaacaaaagtgagaatttttttggtcctctttataagaagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagttaaatttcatttgtg 10448827  T
Q  101 cccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataag 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||       ||||||| |||    
T  10448828 ctcttattgattatgagagagaatattaaaagtaagtaagttgatggaataaatagtaattaatttaagggtattcatataacttttttaaatgtagaag 10448927  T
Q  201 tgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttg 240  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  10448928 tgtattaaatgaagatgactattttcaatatattttcttg 10448967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 10728477 - 10728196
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaag-attgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgt 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10728477 cggtcctttttattagaaacaaaagtgagaatttttttggtcctttttataagaaatattgacaaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttat 10728378  T
Q  100 gcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataa 199  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |        ||||||| |     
T  10728377 gcccttatttattatgagagagaatattaaaagtaagtaagttggtggaataaagagtaattaatttaggggtattcatgaattttttttaaatgtagag 10728278  T
Q  200 gtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggacc 281  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  10728277 gtgtattaactgaagataactattttcaatgtatttccttagtcttgatgttttatgtcttttgtttcttgtataaaggacc 10728196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Original strand, 11964160 - 11964440
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtg 100  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11964160 cggtcctttctattagaaacaaaagtgagaatttttttggtcctttttataagaagattgatcaagtttcaaatatgtttgaagctaaatttcatttgtg 11964259  T
Q  101 cccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataag 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||       ||||||| |||    
T  11964260 cccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagtaagttgatggaataaagagtaattaatttaagggtattcatagaa-ttttttaaatgtagaag 11964358  T
Q  201 tgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagtatttc 295  Q
    |||||||||||||||| ||||||||           ||||||  ||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11964359 tgtattaaatgaagatgactatttt-----------cttggtgttgatgttt--tgtcttttgtttcttgtataaaggaccggagggagtatttc 11964440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 46 - 291
Target Start/End: Original strand, 7105608 - 7105853
Alignment:
Q  46 tttataagaagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtgcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgat 145  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |    
T  7105608 tttataagaagattgaccaagtttcaagtatgcttgaaggtaaatttcatttgtgcccttatttattatgagagaaaatattaaaagtaagtaagttggt 7105707  T
Q  146 ggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataagtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcct 245  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||       ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |    
T  7105708 ggaataaagagtaattaatttaggggtattcatgaaaaaaatttaaatgtagaaatgtattaaatgaagatgactattttcaatgtatttatttggtctt 7105807  T
Q  246 gatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagta 291  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7105808 gatgttttatgtcttttgtttcttgtataaaggaccggagggagta 7105853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 42993990 - 42993696
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnn-ggtcctttttataagaagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgt 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42993990 cggtcctttttattagaaacaaaagtgagaattttttttggtcctttttataagaagattgaccaaatttcaagtatgtttgaagataaatttcatttgt 42993891  T
Q  100 gcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataa 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |||||  |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||  |        |||| || ||    
T  42993890 gcccttatttgttatgagagagaaaattaaaagtaaataagttagtggaataaagaggaattaatttaggggtattcatggattttatttaaatatagaa 42993791  T
Q  200 gtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgt-tttctgtttcttgtataaaggaccggagggagtatt 293  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42993790 gtgtattaaatgaagatgactattttcaatgtatttccttggtcttgatgttttatgtctttttgtttcttgtataaaggaccggagggagtatt 42993696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 10700405 - 10700120
Alignment:
Q  4 tcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaag-attgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtgcc 102  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||        ||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10700405 tcctttttattagaaacaaaagtgagaatttttttagtcttttttataagaaatattgaccaagtttcaagtatgtctgaagctaaatttcatttgtgcc 10700306  T
Q  103 cttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataagtg 202  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||       ||||||| | |||    
T  10700305 cttacttattatgagagagaatattaaaagtaaataagttggtggaataaagagtaattaatttaggggtattcatggaatttttttaaatgtagaggtg 10700206  T
Q  203 tattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggaggga 288  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  10700205 tattaaatgaaaataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttacgttttttgtttcttatataaaagaccggaggga 10700120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 13693713 - 13693422
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  13693713 cggtcctttttattagaaacaaaagtgagaatttttttggtcctttttataagaagattgaccaagtttcaagtatgtttaaagataaatttcatttctg 13693614  T
Q  101 cccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataag 200  Q
     ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||  |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||  |        |||| || |||    
T  13693613 tccttatttattatgagagagaaaattaaaagtaaataagttagtggaataaagaggaattaatttaggggtattcatgaatattttttaaatatagaag 13693514  T
Q  201 tgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagtat 292  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  13693513 tgtattaaatgaagatgactattttcaatgtatttccttgatcttgatgttttatgtcttttgtttcttgtataaaggaccgaagagagtat 13693422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 19926969 - 19926678
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaag-attgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgt 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |        |||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19926969 cggtcctttttattagaaacaaaagtgaaattttttttggtcctttttataagaaatattgaccaagttttaagtatgtttgaaactaaatttcatttgt 19926870  T
Q  100 gcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataa 199  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  |        ||| ||| |     
T  19926869 gcccttatttattatga--gagaatattaaaagtaagtaagttggtggaataaagagtaattaatttaggggtattcttgaagaagaaaaaaaagtagag 19926772  T
Q  200 gtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagtatt 293  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19926771 gtgtattaaatgaagataaatattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatggcttttgtttcttgtataaaggaccggagggagtatt 19926678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 4 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22066556 - 22066289
Alignment:
Q  4 tcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtgccc 103  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22066556 tcctttttattagaaacaaaagtgagaatttttttggtcctttttataagaagattgatcaagtttcaagtatgtttaaagctaaatttcatttgtgccc 22066457  T
Q  104 ttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataagtgt 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||                      ||    
T  22066456 ttattgattatgagagagaatattaaaagtaagttagttgatggaataaaaagtaattaatttaagggtattcgta----------------------gt 22066379  T
Q  204 attaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagtatt 293  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22066378 attaaatgaagatgactattttcaatgtattttattgatgttgatgttttatgtcttttgtttcttgtataaaggacaggagggagtatt 22066289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 36191759 - 36191475
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaag-attgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgt 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||        |||||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36191759 cggtcctttttattagaaacaaaagtgagattttttttggtcctttttataagaaatattgactaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgt 36191660  T
Q  100 gcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcat--ataannnnnnnaaatgtat 197  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||   |         |||| ||     
T  36191659 gcccttatttattatgagagagaatattaaaagtaagtaagttg-tggaataaagagtaattaatttaggggtattaatgattttttttttgaaatatag 36191561  T
Q  198 aagtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccgga 284  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  36191560 aggtgtattaaataaagataactattttcaatgtattttcttggtcct-atgttttatgtcttttgtttcttgtataaaggaccgga 36191475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 39 - 293
Target Start/End: Original strand, 28831005 - 28831259
Alignment:
Q  39 ggtcctttttataagaag-attgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtgcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagc 137  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||     
T  28831005 ggtcctttttataagaaatattgaccaaattttaagtatgtttgaagttaaatttcatttgtgtccttatttattatgagagaaaatattaaaagtaagt 28831104  T
Q  138 aagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataagtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttcc 237  Q
    || ||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||  |        ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28831105 aaattggtgcaataaagagtaattaatttaggggtattcat-gatttttttaaaacgtagaggtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttct 28831203  T
Q  238 ttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagtatt 293  Q
    |||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28831204 ttggtcctgatgttttatatcttttgtgtcttgtataaaggaccggagggagtatt 28831259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 130
Target Start/End: Original strand, 41462677 - 41462805
Alignment:
Q  3 gtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaag-attgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtgc 101  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41462677 gtcctttttattagaaacaaaagtgagaattttttaggtcctttttataagaaatattgaccaagttttaaatatgtttgaagttaaatttcatttgtgc 41462776  T
Q  102 ccttattgattatgagagagaatattaaa 130  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  41462777 ccttatttattatgagagagaataataaa 41462805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 200 - 293
Target Start/End: Original strand, 41462842 - 41462935
Alignment:
Q  200 gtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagtatt 293  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41462842 gtgtattaaatgaagattaccattttcaatatatttccttgatcttgatgttttatgtctgttgtttcttgtataaaggaccggaaggagtatt 41462935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 262 - 291
Target Start/End: Original strand, 10448966 - 10448995
Alignment:
Q  262 tgtttcttgtataaaggaccggagggagta 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10448966 tgtttcttgtataaaggaccggagggagta 10448995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 4)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Original strand, 1365654 - 1365946
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaag-attgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgt 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1365654 cggtcctttttattagaaacaaaagtgagaattttgttggtcctttttataagaaatattgaccaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgt 1365753  T
Q  100 gcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataa-nnnnnnnaaatgtata 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||        ||||||| |    
T  1365754 gcccttatttattatgagagagaatattaaaagtaagtaagttggtggaataaagagtaattaatttaagggtattcatggaattttttgtaaatgtaga 1365853  T
Q  199 agtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagtat 292  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1365854 gatgtattaaatgaagataactattttcaatgtattt-cttggtcctgatgtttcatgtcttttgtttcttgtataaaggaccggagagagtat 1365946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 346 - 562
Target Start/End: Original strand, 2915748 - 2915963
Alignment:
Q  346 gctgatacacaaacattattatgtggcaaacccccttatacacttcctatgtagcannnnnnnattaattacattaagggcaattttgtaaattcacacc 445  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2915748 gctgatacacaaacattcttatgtggcaaacccccttatacacctcctatgtagcatttttt-attaattacattaagggcaattttgtaaattcacacc 2915846  T
Q  446 cactgctctcccctcttccttcccaccctctctgtactcacgtttctccaaccccatcaccttcttctttctcacgaaccaccgtcgcccaccacccact 545  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2915847 cactgctctcccctcttccttcccaccctctctgtactcacgtttctccaaccccatcaccttcttctttctcacgaaccaccgtcgcccaccatccact 2915946  T
Q  546 gtctctgctcctcctca 562  Q
     || || ||| ||||||    
T  2915947 atcgctactcatcctca 2915963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 7243600 - 7243319
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaag-attgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7243600 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaacttttttggtcttttttataagaaatattgaccaagtttcaagtatgtttgaagttaaatttcatttgt 7243501  T
Q  100 gcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataa 199  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  |        ||||||| |     
T  7243500 gcccttatttattatgagagagaatattaaaagtaagtaagttggtggaataaagaataattaatttaggggtattcatggattttttttaaatgtagag 7243401  T
Q  200 gtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggacc 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  7243400 gtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttctttggtcctgatattttatgtcttttgtttcttgtataaaggacc 7243319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 24338196 - 24337909
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaag-attgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgt 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||       |||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24338196 cggtcctttttattagaaacaaaagtgagaatttttttggtcttttttataagaaatattgaccaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgt 24338097  T
Q  100 gcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataa 199  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||  ||       ||||||| |     
T  24338096 gcccttatttattatgagagagaatattaaaagtaagtaagttggtggaataaagagtaattaatttagggttattcatggaatttttttaaatgtagag 24337997  T
Q  200 gtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagta 291  Q
    |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24337996 g----ttaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgtcttttatttcttgtataaaggaccggaaggagta 24337909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 11)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 3 - 292
Target Start/End: Original strand, 33314340 - 33314629
Alignment:
Q  3 gtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtgcc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33314340 gtcctttttattataaacaaaagtgagattatttttggtcctttttataagaagattgatcaagtttcaaatatgtttgaagctaaatttcatttgtgcc 33314439  T
Q  103 cttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataagtg 202  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |  |||||||  ||       || |||| || ||    
T  33314440 ctcatttattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttggtggaataaagagtaattaatttaggaatattcatgaaatttttttaagtgtagaaatg 33314539  T
Q  203 tattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagtat 292  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  33314540 tattaaatgaagatgaccattttcaatgtatttccttggtcttgatgttttatgtattttgtttcttgtataaaggatcggaggtagtat 33314629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 40385421 - 40385125
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaaga---ttgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcattt 97  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40385421 cggtcctttttattagaaacaaaagtgagaatttttttggtcctttttataagaagaagattgaccaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcattt 40385322  T
Q  98 gtgcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcat--ataannnnnnnaaatgt 195  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||  |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||  || |       ||||||    
T  40385321 gtgcccttatttattatgagagagaaaattaaaagtaaataagttagtggaataaagaggaattaatttaggggtattcatggatta-ttttttaaatgt 40385223  T
Q  196 ataagtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagtatt 293  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40385222 agaagtgtattaaatgaagatgactattttcaatgtatatctttggtcttgatgttttatgtcttttgtttcttgtataaaggatcggagggagtatt 40385125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 21263081 - 21262907
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21263081 cggtcctttttattagaaacaaaagtgataatttttttggtcctttttataagaagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgcg 21262982  T
Q  101 cccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtatt 175  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21262981 cccatattgattatgagagagaatattaaaagtaagtaagttgatggaataaagagtaattaatttaagggtatt 21262907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 40 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 3097695 - 3097437
Alignment:
Q  40 gtcctttttataagaagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtgcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaa 139  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||  ||    
T  3097695 gtcctttttataagaagattgaccaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtgcccttatttattatgagagtgaaaattaaaagtaaataa 3097596  T
Q  140 gttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattc----atataannnnnnnaaatgtataagtgtattaaatgaagataactattttcaatgtattt 235  Q
    |||  |||||||||||| | || ||||| |||||| |    || |         ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3097595 gttagtggaataaagaggatttaatttaggggtatacatggattttttttttttaaatgtagaagtgtattaaatgaagattactattttcaatgtattt 3097496  T
Q  236 ccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagtatttc 295  Q
    ||||| || |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3097495 ccttgatcttgatgttttatg-tctatgtttcttgtataaaggaccggagggagtatttc 3097437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 292
Target Start/End: Original strand, 24868479 - 24868768
Alignment:
Q  4 tcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaag-attgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtgcc 102  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||        ||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  24868479 tcctttttattagaaacaaaagtgagaattttttttgtcttttttataagaaatattgaccaagtttcaagtatgtttgaagttaaatttcatttgtacc 24868578  T
Q  103 cttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataagtg 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| || ||  ||       || | || | |||    
T  24868579 cttatttattatgagagagaatattaaaagtaagtaagttggtggaataaagagtaattaatttaggggtgttaatggaattttcttaattatagaggtg 24868678  T
Q  203 tattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagtat 292  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  24868679 tattaaatgaagattactattttcaatgtattttcttagacttgatgttttatgtcttttgtttcttgtataaaggatcggatggagtat 24868768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 41174844 - 41174553
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtg 100  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  41174844 cggtcctttttaatagaaacaaaagtgagaatttttttggtcctttttataagaagattgaccaagtttcaagtatattttaagctaaatttcatttgtg 41174745  T
Q  101 cccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcat-ataannnnnnnaaatgtataa 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||||  || ||||||||| |||| ||| | |||||||||| |          |||| || ||    
T  41174744 cccttatttattatgagagagaaagttaaaagtaaataagttagtgaaataaagaggaattaattgaggggtattcatgaattttttttaaaatatagaa 41174645  T
Q  200 gtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagta 291  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  41174644 gtatattaaatgaagatgactattttcaatgtatttccttgatcttgatgttttatgtcttttgtttcttgcataaaggaccggaggaagta 41174553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 346 - 562
Target Start/End: Original strand, 31858866 - 31859085
Alignment:
Q  346 gctgatacacaaacattattatgtggcaaacccccttatacacttcctatgtagcannnnnnnattaattacattaagggcaattttgtaaattcacacc 445  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| | |||||| |||       |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  31858866 gctgatacacaaacatcattatatggcaaacccccctatacaccttctatgtggcattgttt-attaattatattaagggtaattttgtaaattcacacc 31858964  T
Q  446 cactgctctcccct--cttcc---ttcccaccctctctgtactcacgtttctccaaccccatcaccttcttctttctcacgaaccaccgtcgcccaccac 540  Q
    |||| |||||| ||  |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||    
T  31858965 cacttctctcctcttccttcccacttcccaccctctctgtactcacgtttctccaaccc-atcatcttcttctttctcaccaaccaccgtcgtcgaccac 31859063  T
Q  541 ccactgtctctgctcctcctca 562  Q
    |||| ||| |||||| ||||||    
T  31859064 ccaccgtcgctgctcatcctca 31859085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 190 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 21262596 - 21262494
Alignment:
Q  190 aaatgtataagtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggag 289  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  21262596 aaatgtagaagcgtattaaatgaagatgactattttcaatgtattttcttggtgttgatgttttatgtcttttgtttcttttataaaggaccggaggtag 21262497  T
Q  290 tat 292  Q
    |||    
T  21262496 tat 21262494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 178
Target Start/End: Original strand, 4237918 - 4238039
Alignment:
Q  57 attgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtgcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagag 156  Q
    |||||| || ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||  ||| || ||| |||||| |||||    
T  4237918 attgataaattttcatggatgtttgaagttaaatttcatttgtgccgttatttattatgagatagaataataaaatgaagtaaattggtggaatcaagag 4238017  T
Q  157 taattcatttaagggtattcat 178  Q
    ||||| ||||| ||||||||||    
T  4238018 taattaatttaggggtattcat 4238039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 40 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 2935034 - 2934942
Alignment:
Q  40 gtcctttttataagaa-gattgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtgcccttattgattatgagagagaatattaaaa 131  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||| ||| |||| | ||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  2935034 gtcctttttataagaaagatttaccaatttttaagtgtatttgaagttaaatttcatttatacccttatttattatgagagaggttattaaaa 2934942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 232
Target Start/End: Original strand, 4238206 - 4238237
Alignment:
Q  201 tgtattaaatgaagataactattttcaatgta 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4238206 tgtattaaatgaagataactattttcaatgta 4238237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 22)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 16130698 - 16130404
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaag-attgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgt 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||       |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16130698 cggtcctttttattagaaacaaaagtgaaaaaaaatttggtcctttttataagaaatattgaccaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgt 16130599  T
Q  100 gcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcat--ataannnnnnnaaatgtat 197  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||         |||||||     
T  16130598 gcccttatttattatgagagagaatattaaaagtaagtaagttggtggaataaaaagtaattaatttaagggtattcatggattttttttttaaatgtag 16130499  T
Q  198 aagtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagtat 292  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16130498 aggtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttgatcttgatgttttatctcttttgtttcttgtataaaggaccggagggagtat 16130404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 6 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 35050483 - 35050208
Alignment:
Q  6 ctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtgccctt 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||||       ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  35050483 ctttttattagaaacaaaagtgagaatttttttggttctttttataaaaagatcgatcaagtttcaagtatgtctgaagctaaatttcatttgtgtcctt 35050384  T
Q  106 attgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataagtgtat 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||         ||||||| ||||||||    
T  35050383 attgattatgagagagaatattaaaagtaagtaagttgatgaaataaagagtaattaatttaagggtatacatattttttttttaaatgtagaagtgtat 35050284  T
Q  206 taaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggacc 281  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  35050283 taaatgaagatgactattttcaatgtattttcttgatgttgatgttttatgtcttttgtttcttgtataaaggacc 35050208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 5800617 - 5800329
Alignment:
Q  4 tcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtgccc 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||       ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  5800617 tcctttttattagaaacaaaagtgggaatttttttggtcctttttataagaagattgaccaagtttcaagtatgtttgaagataaatttcatttgtgtcc 5800518  T
Q  104 ttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataagtgt 203  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||  |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||  ||        ||| || ||||||    
T  5800517 ttatttattatgagagagaaaattaaaagtaaataagttagtggaataaagagaaattaatttaggggtattcat-gaattttttttaatatagaagtgt 5800419  T
Q  204 attaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagtatt 293  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5800418 attaaatgaagatgactattttcaatgtatttccttggtcttgatgttttatgtcttttgtttcttgtataaaggaccggagggagtatt 5800329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Original strand, 1553726 - 1554023
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaag-attgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgt 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||       |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1553726 cggtcctttttattagaaacaaaa-tgagaatttttgtggtcctttttataagaagtattgatcaaatttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgt 1553824  T
Q  100 gcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||       ||||||| ||    
T  1553825 gcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagtaagttgatggaataaagagtaattaatttaagggtatttatagaatttttttaaatgtagaa 1553924  T
Q  200 gtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttcc------ttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagtat 292  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |      |||||  || |||||||||||||   ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  1553925 gtgtattaaatgaagttgactattttcaatgtattttcttggtgttggtgttggtgttttatgtttttgtttttttgtataaaggactggagggagtat 1554023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 16130148 - 16129850
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaag-attgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgt 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||       |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16130148 cggtcctttttattagaaacaaaagtgaaaaaaaatttggtcctttttataagaaatattgaccaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgt 16130049  T
Q  100 gcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattca------tataannnnnnnaaat 193  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||      | |         ||||    
T  16130048 gcccttatttattatgagagagaatattaaaagtaagtaagttggtggaataaaaagtaattaatttaggggtattcatggattttttttttttttaaat 16129949  T
Q  194 gtataagtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagtat 292  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16129948 gtaaaggtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttgattttgatgttttatgtcttttgtttcttgtataaaggaccggagggagtat 16129850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Original strand, 30222702 - 30222992
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||       | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  30222702 cggtcctttttattagaaacaaaaatgagaatttttttgatcatttttataagaagattgatcaagtttcaaatatgtttgatgctaaaattcatttgtg 30222801  T
Q  101 cccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataag 200  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||        ||||||| |||    
T  30222802 ttcttattgattatgaaagagaatattaaaagtaagtaagttgatggattaaagagtaattaatttaaggatattcatatactttttttaaatgtagaag 30222901  T
Q  201 tgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagta 291  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||| || ||||| || ||||||| |||||||||||||    
T  30222902 tatattaaatgaagatgactattttcaatgtattttcttggtgttgatattttatgtcttttgttttttatataaagaaccggagggagta 30222992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 39 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 40988213 - 40987959
Alignment:
Q  39 ggtcctttttataagaag-attgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtgcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagc 137  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||     
T  40988213 ggtcctttttataagaaatattgaccaagttttaagtatgtttgaaactaaatttcatttgtgcccttatttattatgagaga--atattaaaagtaagt 40988116  T
Q  138 aagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnn-aaatgtataagtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttc 236  Q
    ||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||        ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40988115 aagttggcggaataaagagtaattaatttaggggtattcattgaattttttttaaatgtagaggtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttc 40988016  T
Q  237 cttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagtatt 293  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40988015 cttggtcctgatgttttatgtcttttgtttcttgtataaaggaccggaggaagtatt 40987959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Original strand, 27654615 - 27654905
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaag-attgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgt 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  27654615 cggtcctttttattagaaacaaaagtgagaatttttttggtcctttttataagaaatattgatcaagttttaagtatctttgaagttaaatttcatttgt 27654714  T
Q  100 gcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataa 199  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| || ||  ||       |||| || |     
T  27654715 gcccttatttattat--gagagaatattaaaagtaagtaagttggtggaataaagagtaattaatttaggggttttaatggaattttcttaaatatagag 27654812  T
Q  200 gtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagtat 292  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  27654813 gtgtattaaatgaagattactattttcaatgtatttccttggtcttgatgttttatgtcttttgtttcttatataaaggatcggagggagtat 27654905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 27333122 - 27332899
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  27333122 cggtcctttttattagaaacaaaagtgagaatttttttggtcctttttataagaagattgatcaagttttaagtatgtttgaagctaaatttcatttgta 27333023  T
Q  101 cccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataag 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||       |||| || |||    
T  27333022 cccttattgattatgagagaaaatattaaaagtaagtaagttaatggaataaagagtaattaatttaagggtatttatagaatttttttaaatatagaag 27332923  T
Q  201 tgtattaaatgaagataactattt 224  Q
    |||||||||||||||| |||||||    
T  27332922 tgtattaaatgaagatgactattt 27332899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 291
Target Start/End: Original strand, 34546661 - 34546949
Alignment:
Q  3 gtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaag-attgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtgc 101  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||        ||| ||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  34546661 gtcctttttattagaaataaaagtgagaattttttttgtcttttttataaaaaatattgatcaagttttaagtatgtttgaagctaa-tttcatttctgc 34546759  T
Q  102 ccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcat--ataannnnnnnaaatgtataa 199  Q
    ||||||| ||||||||| |  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||         ||||||| |     
T  34546760 ccttatttattatgagaaa--atattaaaagtaagtaagttggtggaataaagagtaattaatttaggggtattcatgaattttttttttaaatgtaaag 34546857  T
Q  200 gtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagta 291  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34546858 gtgcattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgtcttttgtttcttgtataaaggaccggagggagta 34546949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 45192756 - 45192466
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||       | |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| | |||||| ||||||||||    
T  45192756 cggtcctttttattagaaacaaaagtgagaatttttttgatcctttttataagaagattgattaagtttctaatattttttatgctaaaattcatttgtg 45192657  T
Q  101 cccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataag 200  Q
      |||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||       ||||||| |||    
T  45192656 ttcttattaattatgagacagaatattaaaaataagtaagttgatggaataaagagtaattaatttaagggtattcatggaatttttttaaatgtagaag 45192557  T
Q  201 tgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagtat 292  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |  ||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  45192556 tatattaaatgaagatgactattttcaatgtattttcttgatgttgatg-tttatgtcttttgtttcttgtataaagaaccggaggaagtat 45192466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 74 - 293
Target Start/End: Original strand, 27846418 - 27846638
Alignment:
Q  74 tatgtttgaagctaaatttcatttgtgcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggta 173  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||| |||||||| ||    
T  27846418 tatgtttgaagttaaatttcatttgtacccttatttattatgagagataatattaaaagtaagtaagttggtggaatagatagtaattaatttaaggata 27846517  T
Q  174 ttcatataannnnnnn-aaatgtataagtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgta 272  Q
    |||||  ||        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  27846518 ttcatggaattgtttttaaatgtagaagtgtattaaatgaagataactattttcaaagtatttccttggtcctgatgttttatgtcttttgtttcttgta 27846617  T
Q  273 taaaggaccggagggagtatt 293  Q
    ||| ||||| |||||||||||    
T  27846618 taagggaccagagggagtatt 27846638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 43 - 256
Target Start/End: Original strand, 36834287 - 36834495
Alignment:
Q  43 ctttttataagaagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtgcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagtt 142  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||   ||||||||||||||||||| |||||    
T  36834287 ctttttataagaaaattgattaaatttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtacccttatttattat--aagagaatattaaaagtaagtaagtt 36834384  T
Q  143 gatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataagtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggt 242  Q
    | ||||||||||||||||| |||||  |||||||||  ||       ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  36834385 ggtggaataaagagtaattaattta--ggtattcat-gaaattttttaaatgtagaagtgtattaaataaagatgactatttttaatgtatttctttggt 36834481  T
Q  243 cctgatgttttatg 256  Q
    | |||| |||||||    
T  36834482 cttgatattttatg 36834495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 58 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 4813878 - 4813644
Alignment:
Q  58 ttgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtgcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagt 157  Q
    |||| ||| ||| |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||| || |||    
T  4813878 ttgaccaatttttaagtgtgcttgaaactaaatttcatttgtgcccttatttattatgagaaggaatattaaaagtaagtaagttggtggaatgaaaagt 4813779  T
Q  158 aattcatttaagggtattcat-ataannnnnnnaaatgtataagtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatg 256  Q
    |||| |||||| |||||||||   ||       ||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  || ||||||    
T  4813778 aattaatttaaaggtattcatggaaaactatttaaatggagaggtgtattaaatgaagataactatttttaatgtatttccttggtctt--tgatttatg 4813681  T
Q  257 ttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagtatt 293  Q
    | || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4813680 tattttgtttcttatataaaggaccggagggagtatt 4813644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 9411737 - 9411909
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaag-attgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgt 99  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| ||       |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  9411737 cggtccattttattagaaacaaaagtgaaaatttttttggtcctttttataagaaatattgaccaagtttcaagtatatttgaagttaaatttcacttgt 9411836  T
Q  100 gcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggt 172  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  9411837 gcccttatttattatgagagagaatattaaaagtaagtaagttggtggaataaagagtaattaatttaggggt 9411909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 106 - 285
Target Start/End: Original strand, 35428415 - 35428598
Alignment:
Q  106 attgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttga----tggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataagt 201  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||       |||| || |||     
T  35428415 attgattatgagagagaaaattaaaagtaagtaagttgattgatggaataaagagtaattaatttaagggtattcataaaaatttttaaaatatagaagc 35428514  T
Q  202 gtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggag 285  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||    
T  35428515 gtgttaaatgaagatgactattttcaatgtattttcttgatgttgatgttttatgtcttttgtttcttttataaatgaccggag 35428598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 57 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 23933446 - 23933236
Alignment:
Q  57 attgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtgcccttattgattatgagagagaatatt-aaaagtaagcaagttgatggaataaaga 155  Q
    ||||| ||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||| |||| |||||| | |||| ||||    
T  23933446 attgaccaattttcaaatgtgtttgaagttaaatttcatttgtgcccttatttattatatgagagaatattaaaaaataagaaagttggtagaatcaaga 23933347  T
Q  156 gtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataagtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttat 255  Q
    |||||| ||||| ||||||||||  ||       ||||||| | || ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||  |||||| ||||| |||||    
T  23933346 gtaattaatttaggggtattcatgaaaaaaaattaaatgtagaggtatattaaaagaaaataattattttcaatgtatttttttggtcttgatgatttat 23933247  T
Q  256 gttttctgttt 266  Q
    || || |||||    
T  23933246 gtcttttgttt 23933236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 39 - 114
Target Start/End: Original strand, 35121218 - 35121293
Alignment:
Q  39 ggtcctttttataagaagattgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtgcccttattgattat 114  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  35121218 ggtcctttttataagaagattgaccaagtttcaagtatgtttgaagcaaaatttcatttgtgcccttatttattat 35121293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 77 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13879161 - 13878943
Alignment:
Q  77 gtttgaagctaaatttcatttgtgcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattc 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||  |||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  13879161 gtttaaagctaaatttcatttgtgcccttatttattatgagatagaatattaatagtaaataagttggtggaagaaagagtaattaatttaa-ggtattc 13879063  T
Q  177 at---ataannnnnnnaaatgtata---agtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcct-gatgttttatgttttctgtttctt 269  Q
    ||    |         ||||||| |   |||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||    
T  13879062 atgaatttttttttttaaatgtagaagtagtgtattaaatgaagatgactatt----atgtatttccttggttttcgatgttttatgtttt-tgtttctt 13878968  T
Q  270 gtataaaggaccggagggagtattt 294  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||    
T  13878967 gtataaaagactcgagggagtattt 13878943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 198 - 291
Target Start/End: Original strand, 35121354 - 35121446
Alignment:
Q  198 aagtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagta 291  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  || ||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  35121354 aagtgtattaaatgaagatgactatttccaatgtatttt-ttagtcttgatgttttatgtcttttgttttttgtataaaggatcggagggagta 35121446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 218 - 291
Target Start/End: Original strand, 9412283 - 9412356
Alignment:
Q  218 actattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagta 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||||||||||| | | |||||||||||    
T  9412283 actattttcaatgtatttccttggtcttgatgttttatgtcttttatttcttgtataaggaatcggagggagta 9412356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 286
Target Start/End: Original strand, 11907972 - 11908172
Alignment:
Q  85 ctaaatttcatttgtgcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataann 184  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||  |||||||| |||  |||||| |||||| |||||||||| || ||| |||||||||  ||      
T  11907972 ctaaatttcatttgtgtctttatttattatgagagag--tattaaaaataaataagttggtggaatcaagagtaattaatgtaaaggtattcatggaaga 11908069  T
Q  185 nnnnnaaatgtataagtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatg-ttttctgtttcttgtataaaggaccgg 283  Q
         ||||||| |   |||||||||||| |||   ||||||||||||||| |||| || | ||| |||||| |||| ||||||||||| | |||| |||    
T  11908070 aatttaaatgtacagaagtattaaatgaaaatagtcattttcaatgtattttcttgatcttaatgatttatgtttttttgtttcttgtaaagaggatcgg 11908169  T
Q  284 agg 286  Q
    |||    
T  11908170 agg 11908172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 123; Significance: 6e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Original strand, 6712 - 7007
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaag-attgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgt 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | ||       |||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6712 cggtcctttttattagaaacaaaagttaaaaaaaatttggtcatttttataagaaatattgaccaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgt 6811  T
Q  100 gcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcat--ataannnnnnnaaatgtat 197  Q
    || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||  | ||       |||||||     
T  6812 gcgcttatttattatgagaaagaatattaaaagtaagtaagttggtagaataaagagtaattaatttaaggatattcatagaaaaaaaaattaaatgtag 6911  T
Q  198 aagtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagtatt 293  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||| || ||||||||| |||||| | |||| ||||||||    
T  6912 agatgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttaatcttaatgttttatgtcttttgtttcttgaataaagaatcggatggagtatt 7007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 120; Significance: 4e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 258500 - 258216
Alignment:
Q  1 cggtcctttttattataaacaaaagtgagaannnnnnnggtcctttttataagaag-attgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgt 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||       |||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  258500 cggtcctttttattagaaacaaaagtgagaattttttaggtcctttttataagaaatattgaccaagttttaagtatgtttgaagttaaatttcatttgt 258401  T
Q  100 gcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataa 199  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |         |||||||| ||||| |||| || ||  ||       |||| || |     
T  258400 gcctttatttattatgagagagaatattaaaattaagtaagttta---------gagtaattaatttaggggtgttgatggaattttcttaaatatagag 258310  T
Q  200 gtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttcttgtataaaggaccggagggagtatt 293  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  258309 gtgtattaaatgaagattactattttcaatgtatttccttggtcttgatgttttatgtcttttgtttcttgtataaaggaccggagggagtatt 258216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 58 - 292
Target Start/End: Original strand, 30477 - 30711
Alignment:
Q  58 ttgatcaagtttcaagtatgtttgaagctaaatttcatttgtgcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagt 157  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||    
T  30477 ttgaccaattttcaagtttgtttgaaattaaatttcatttgtgcccttatttattatgagagacaatattaaaagtaagtaagttggcggaatcaagagt 30576  T
Q  158 aattcatttaagggtattcatataannnnnnnaaatgtataagtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgt 257  Q
    |||| ||||| ||||||| ||  ||       ||||| | | ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  30577 aattaatttaggggtatttatggaaaaaatttaaatgcagaggtgtattaaattaaaataactattttcaatgtatttcctcggtcttgatgatttatgt 30676  T
Q  258 tttctgtttcttgtataaaggaccggagggagtat 292  Q
     || ||||||||  | |||| || |||||||||||    
T  30677 cttttgtttcttagaaaaagcacaggagggagtat 30711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 30919 - 30741
Alignment:
Q  91 ttcatttgtgcccttattgattatgagagagaatattaaaagtaagcaagttgatggaataaagagtaattcatttaagg-----gtattcatataannn 185  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    | |||| |||||| |||||||||| ||||| ||     ||||||||  ||       
T  30919 ttcatgtgcgcccttatttattatgagagagaatattaaaagt----atgttggtggaatcaagagtaattaatttaggggtattgtattcatggaaaaa 30824  T
Q  186 nnnnaaatgtataagtgtattaaatgaagataactattttcaatgtatttccttggtcctgatgttttatgttttctgtttctt 269  Q
        ||||||  | || |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||    
T  30823 atttaaatgttgaggtatatt-aatgaaaataactattttcaatttatttccttggtcttgatgatttatgtcttttgtttctt 30741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 6423 times since January 2019
Visitors: 5768