View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0808_low_26 (Length: 342)

Name: NF0808_low_26
Description: NF0808
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0808_low_26
NF0808_low_26
[»] chr6 (36 HSPs)
chr6 (85-342)||(8465249-8465506)
chr6 (85-342)||(20465472-20465729)
chr6 (93-342)||(12039286-12039535)
chr6 (118-342)||(19077502-19077724)
chr6 (118-342)||(17234953-17235175)
chr6 (118-321)||(19171774-19171976)
chr6 (118-330)||(25969700-25969909)
chr6 (118-330)||(25974140-25974349)
chr6 (118-342)||(13195683-13195905)
chr6 (85-255)||(17864090-17864259)
chr6 (85-342)||(19100226-19100478)
chr6 (118-342)||(23879245-23879466)
chr6 (121-276)||(14259278-14259431)
chr6 (85-342)||(33666119-33666373)
chr6 (118-330)||(17527474-17527686)
chr6 (113-339)||(9281291-9281513)
chr6 (85-321)||(21723006-21723239)
chr6 (155-342)||(19894248-19894432)
chr6 (92-342)||(29253260-29253508)
chr6 (118-330)||(13869992-13870198)
chr6 (247-342)||(20653555-20653650)
chr6 (118-218)||(25965053-25965151)
chr6 (139-248)||(23882369-23882477)
chr6 (113-342)||(17855551-17855776)
chr6 (115-206)||(20989477-20989568)
chr6 (234-342)||(12028721-12028828)
chr6 (266-342)||(25805913-25805989)
chr6 (281-342)||(17876332-17876393)
chr6 (115-188)||(25805809-25805882)
chr6 (120-229)||(24542014-24542122)
chr6 (282-342)||(28623157-28623217)
chr6 (265-340)||(20989370-20989445)
chr6 (162-229)||(15930538-15930603)
chr6 (161-229)||(21322968-21323035)
chr6 (195-248)||(17869587-17869640)
chr6 (195-248)||(17879339-17879392)
[»] chr7 (20 HSPs)
chr7 (92-342)||(20991874-20992124)
chr7 (85-342)||(29545719-29545971)
chr7 (85-342)||(16207459-16207713)
chr7 (113-342)||(12326164-12326392)
chr7 (118-342)||(11588822-11589046)
chr7 (118-342)||(4459098-4459320)
chr7 (118-342)||(11999241-11999462)
chr7 (85-318)||(15506593-15506822)
chr7 (118-342)||(645493-645717)
chr7 (85-342)||(11520990-11521244)
chr7 (85-328)||(14165493-14165732)
chr7 (85-261)||(15438422-15438598)
chr7 (85-250)||(16437100-16437265)
chr7 (120-246)||(26132600-26132722)
chr7 (85-246)||(10280136-10280296)
chr7 (120-228)||(10661224-10661331)
chr7 (295-333)||(15438611-15438649)
chr7 (120-228)||(20924798-20924903)
chr7 (162-248)||(21260834-21260919)
chr7 (121-226)||(42636581-42636685)
[»] scaffold0226 (3 HSPs)
scaffold0226 (89-342)||(17703-17956)
scaffold0226 (89-342)||(27097-27350)
scaffold0226 (85-342)||(7116-7373)
[»] chr8 (12 HSPs)
chr8 (85-342)||(27925031-27925286)
chr8 (113-342)||(45136464-45136692)
chr8 (92-304)||(13659988-13660199)
chr8 (92-304)||(13718631-13718842)
chr8 (118-341)||(23540986-23541207)
chr8 (85-342)||(33962065-33962322)
chr8 (85-342)||(33977384-33977640)
chr8 (118-342)||(22485491-22485714)
chr8 (90-246)||(24092288-24092443)
chr8 (216-342)||(22476635-22476761)
chr8 (139-248)||(25240742-25240848)
chr8 (179-312)||(26536706-26536839)
[»] chr4 (17 HSPs)
chr4 (85-342)||(15162062-15162319)
chr4 (96-342)||(10724597-10724843)
chr4 (96-342)||(10938366-10938612)
chr4 (85-342)||(15699914-15700168)
chr4 (85-342)||(18601238-18601490)
chr4 (118-342)||(28019662-28019884)
chr4 (118-342)||(23399774-23399996)
chr4 (118-342)||(25117215-25117437)
chr4 (85-330)||(16384217-16384459)
chr4 (85-254)||(10191213-10191379)
chr4 (118-342)||(33898587-33898808)
chr4 (120-248)||(15622799-15622924)
chr4 (120-225)||(19183378-19183481)
chr4 (140-229)||(19659819-19659907)
chr4 (140-229)||(33746298-33746387)
chr4 (163-248)||(32862050-32862134)
chr4 (120-229)||(9069306-9069414)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (85-342)||(8158-8415)
[»] chr5 (20 HSPs)
chr5 (85-342)||(23757835-23758089)
chr5 (85-342)||(23823291-23823545)
chr5 (118-331)||(23420146-23420357)
chr5 (113-342)||(24190215-24190444)
chr5 (118-330)||(22404352-22404562)
chr5 (118-329)||(9422107-9422315)
chr5 (115-342)||(38405717-38405942)
chr5 (85-342)||(30605270-30605525)
chr5 (126-342)||(22251619-22251832)
chr5 (162-342)||(26037181-26037359)
chr5 (90-342)||(26328793-26329043)
chr5 (85-340)||(22082271-22082522)
chr5 (85-342)||(23624203-23624456)
chr5 (118-342)||(22245937-22246158)
chr5 (118-252)||(25105113-25105244)
chr5 (118-252)||(25164206-25164337)
chr5 (115-224)||(18221466-18221573)
chr5 (269-342)||(25105038-25105113)
chr5 (269-342)||(25164131-25164206)
chr5 (120-248)||(20714412-20714537)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (85-333)||(16208-16453)
[»] chr3 (22 HSPs)
chr3 (85-342)||(19634207-19634461)
chr3 (83-342)||(18063785-18064044)
chr3 (118-342)||(44452842-44453063)
chr3 (118-342)||(18548007-18548229)
chr3 (118-342)||(24195882-24196106)
chr3 (118-342)||(18482951-18483173)
chr3 (115-261)||(18034555-18034701)
chr3 (115-252)||(13515263-13515400)
chr3 (85-342)||(13791005-13791258)
chr3 (121-342)||(23954136-23954356)
chr3 (168-342)||(7028649-7028824)
chr3 (118-229)||(15635562-15635672)
chr3 (123-342)||(1918822-1919039)
chr3 (118-339)||(17135726-17135944)
chr3 (118-226)||(17702765-17702872)
chr3 (115-193)||(295808-295885)
chr3 (85-248)||(28051463-28051626)
chr3 (281-338)||(13515201-13515258)
chr3 (161-340)||(21253577-21253754)
chr3 (120-229)||(6579238-6579346)
chr3 (120-229)||(17042443-17042551)
chr3 (303-342)||(28051680-28051719)
[»] chr1 (16 HSPs)
chr1 (113-342)||(4246390-4246617)
chr1 (115-342)||(20840842-20841068)
chr1 (157-342)||(24986379-24986564)
chr1 (85-339)||(26971977-26972233)
chr1 (118-342)||(13165752-13165975)
chr1 (186-330)||(20200677-20200820)
chr1 (139-342)||(17850954-17851155)
chr1 (231-342)||(11667481-11667592)
chr1 (85-172)||(11667607-11667694)
chr1 (92-225)||(23477630-23477761)
chr1 (113-224)||(14745481-14745589)
chr1 (120-229)||(12753422-12753530)
chr1 (120-221)||(15803809-15803908)
chr1 (120-228)||(1625938-1626042)
chr1 (162-248)||(25349874-25349959)
chr1 (85-133)||(24986324-24986372)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (118-342)||(25256-25479)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (85-342)||(6233-6488)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (118-330)||(1958-2168)
[»] chr2 (8 HSPs)
chr2 (85-342)||(12910819-12911073)
chr2 (118-342)||(24789737-24789960)
chr2 (113-342)||(22611245-22611472)
chr2 (85-330)||(23758951-23759193)
chr2 (140-246)||(21530762-21530867)
chr2 (161-321)||(15328723-15328885)
chr2 (161-248)||(19445002-19445088)
chr2 (163-219)||(19466225-19466280)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (113-330)||(36945-37159)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (113-342)||(109837-110065)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (113-330)||(159426-159640)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (118-248)||(12183-12311)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (168-330)||(356885-357046)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (85-240)||(2247-2398)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (85-250)||(26730-26895)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (200-342)||(47970-48113)
[»] scaffold0259 (2 HSPs)
scaffold0259 (247-342)||(16904-16998)
scaffold0259 (115-205)||(16992-17082)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 36)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 85 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 8465506 - 8465249
Alignment:
Q  85 cacagacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaa 184  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8465506 cacagacgatacaagaaagaatcacaatataggttctaaacttgcatcataaacgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccttaaaaatctaa 8465407  T
Q  185 actttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaa 284  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  8465406 actttttagtgtgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtctcccttatatactgaagcagcttgggctaaattcattagttgggcttcagtacaa 8465307  T
Q  285 agcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  8465306 agcatatcggttcagctaatctgcaaaacaagaatcagaaacaaatatggaaagtcct 8465249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 85 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20465729 - 20465472
Alignment:
Q  85 cacagacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaa 184  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20465729 cacaaacgatacaagaaaggttcacaatataggttctaaacttgcatcacaaaagataaaagaatagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaa 20465630  T
Q  185 actttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaa 284  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  20465629 actttttagtatgacaacttgaatgatcaatttgttcttgaagtctcccttatatactgtagcagcttgggctaaatactttagttgggcttcaacacaa 20465530  T
Q  285 agcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20465529 agcagatcagttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatggaaagtcct 20465472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 93 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12039535 - 12039286
Alignment:
Q  93 atacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaacttttta 192  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12039535 atacaagaaaggatcacaaaataggttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaacttttta 12039436  T
Q  193 gtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagacc 292  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||||||  ||||||| |||||||||| |    
T  12039435 gtatgacgactttaatgaccaattaggtcttgaagtctcccttatatactaaagcagcttggactaaatacattagttatgcttcaacacaaagcagatc 12039336  T
Q  293 ggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
     ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12039335 agttcagctaatatgcaaaataagaatcataaacaaatatggaaagtcct 12039286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 118 - 342
Target Start/End: Original strand, 19077502 - 19077724
Alignment:
Q  118 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 217  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||| |||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  19077502 ttctaaacttgcatga-acatgatacaagagcagaatacataaagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtattacggcttgaatgaacaatta 19077600  T
Q  218 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaaga 317  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19077601 ggtcttgaagtcttccttatatactgaagcagcttgggctagatac-ttagttgggcttcagcacaaagcagatcggttcagctaatctgcaaaacaaga 19077699  T
Q  318 atcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||    
T  19077700 atcagaaacaaatagggaaagtcct 19077724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 118 - 342
Target Start/End: Original strand, 17234953 - 17235175
Alignment:
Q  118 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 217  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17234953 ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagact-aaaaccctaaagatctaaactttttagtatgacggcttgaatgaacaatta 17235051  T
Q  218 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaaga 317  Q
    ||||||||||||  | ||||||||  ||||| |||||| |||| | ||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17235052 ggtcttgaagtcttctttatatactaaagcaacttgggctaaa-taatttgttgggcttcagcacaaagcagatcggttcagctaatctgcaaaacaaga 17235150  T
Q  318 atcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    |||| |||||||| || ||||||||    
T  17235151 atcagaaacaaatctggaaagtcct 17235175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 118 - 321
Target Start/End: Original strand, 19171774 - 19171976
Alignment:
Q  118 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 217  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19171774 ttctaaacttacatcacaaacgatacaagagcagaatacataaagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 19171873  T
Q  218 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaaga 317  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||    
T  19171874 ggtcttggagtcttccttatatactgaagcggcttgggctaaatac-ttagttgggcttcagcacaaagcagattggttcagctaatctacaaaacatga 19171972  T
Q  318 atca 321  Q
    ||||    
T  19171973 atca 19171976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 118 - 330
Target Start/End: Original strand, 25969700 - 25969909
Alignment:
Q  118 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 217  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25969700 ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaacacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaa-ctttttagtatgacggcttgaatgaacaatta 25969797  T
Q  218 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaaga 317  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||  |||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  25969798 ggtcttgaagtcttccttatatactgaagcagcttgggctaaa-taattcgttgggcttcagcacattgcagatcggttcagctaagctgcaaaacaaga 25969896  T
Q  318 atcataaacaaat 330  Q
    |||| ||| ||||    
T  25969897 atcaaaaataaat 25969909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 118 - 330
Target Start/End: Original strand, 25974140 - 25974349
Alignment:
Q  118 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 217  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25974140 ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaacacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaa-ctttttagtatgacggcttgaatgaacaatta 25974237  T
Q  218 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaaga 317  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||  |||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  25974238 ggtcttgaagtcttccttatatactgaagcagcttgggctaaa-taattcgttgggcttcagcacattgcagatcggttcagctaagctgcaaaacaaga 25974336  T
Q  318 atcataaacaaat 330  Q
    |||| ||| ||||    
T  25974337 atcaaaaataaat 25974349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 118 - 342
Target Start/End: Original strand, 13195683 - 13195905
Alignment:
Q  118 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 217  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| || || | |  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  13195683 ttctaaacttgcatcacaaacgataaaatagcataatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaaactttttagtataacggcttgaataaacaatta 13195781  T
Q  218 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaaga 317  Q
    ||||||  ||||  | |||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  13195782 ggtcttacagtcttctttatatactgaagcagcttgggctaaatac-ttagttgggcttcagcacaaagcagatcggttctgctaatctgcaaaacaaga 13195880  T
Q  318 atcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  13195881 atcagaaacaaatctgaaaagtcct 13195905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 85 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 17864259 - 17864090
Alignment:
Q  85 cacagacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaa 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17864259 cacagacgatacaagaaaggctcacaataaaggttctaaacttgcatca-acatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccccaaaaatctaa 17864161  T
Q  185 actttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttggg 255  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||   ||||| ||||||| || ||||||||| | |||||||||||||    
T  17864160 actttatagaatgacggcttgaatgaatcattagttcttgaaatctcccttatatgctgaagcagcttggg 17864090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 85 - 342
Target Start/End: Original strand, 19100226 - 19100478
Alignment:
Q  85 cacagacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaa 184  Q
    ||||||||||||||||||| | |||    ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||| |||||||| |||||    
T  19100226 cacagacgatacaagaaagaa-cacacagtagattctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaa-tctaa 19100322  T
Q  185 actttttagtatgacggcttgaatgatcaa-ttaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaataca 283  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |  || |||||||||||||||  |||||||  | ||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||  |||    
T  19100323 acttgttactatgacggcttgaataaaaaaattaggtcttgaagtcttccttata--ctgaagcagcttgggctaaatac-taagttgggcttcagcaca 19100419  T
Q  284 aagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  19100420 aagcagatcggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatctggaaagtcct 19100478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 118 - 342
Target Start/End: Original strand, 23879245 - 23879466
Alignment:
Q  118 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 217  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||    
T  23879245 ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-cccgaaaaatctaaactttt-agaatgacggcttgaatgaaca-tta 23879341  T
Q  218 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagct-aatctgcaaaacaag 316  Q
    ||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  23879342 ggtcttgaagtcttccttatatgctgaagcagcttgggctaaata-attcgttgggcttcaacaaaatgcagatcggttcagcttaatctgcaaaacaag 23879440  T
Q  317 aatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||    
T  23879441 aatcagaaacaaatctggaaagtcct 23879466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 121 - 276
Target Start/End: Original strand, 14259278 - 14259431
Alignment:
Q  121 taaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggt 220  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  14259278 taaacttgcatca-acatgatacaagagtagaatacataaagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttaatatgacgacttgaatgatcaattaggt 14259376  T
Q  221 cttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggctt 276  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  14259377 cttgaagtcttccttatatactgaagcagcttgggctaaatac-ttagttgggctt 14259431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 85 - 342
Target Start/End: Original strand, 33666119 - 33666373
Alignment:
Q  85 cacagacgatacaagaaaggat-cacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatcta 183  Q
    |||| |||||||||||||| |  |||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||| | |  ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  33666119 cacaaacgatacaagaaagaacacacgatata--ttctaaacttgcatcacaagcgatacaagagcataatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatcta 33666215  T
Q  184 aactttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaataca 283  Q
    ||||||| || |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||  | |    
T  33666216 aactttt-agaatgatggcttgaataaacaattaggtcttgaagtcttccttatatactgaagcagcttgggctaaa-taatttgttgggcttcagcaaa 33666313  T
Q  284 aagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    | ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  33666314 atgcagatcggttcagcttaatctgcaaaacaataatcagaaacaaatctggaaagtcct 33666373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 118 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 17527686 - 17527474
Alignment:
Q  118 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 217  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17527686 ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaattctaaactttttagtatgacggcttgaatgagcaatta 17527588  T
Q  218 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaat-acaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaa 315  Q
    |||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||| | | || ||| | ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  17527587 ggtcttaaagtcttccttatatactgaagcagcttgggctaaa-taatttgttgggcttcagtaagaatgcatatcggtttagcttaatctgctaaacaa 17527489  T
Q  316 gaatcataaacaaat 330  Q
    |||||| ||| ||||    
T  17527488 gaatcagaaagaaat 17527474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 113 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 9281513 - 9281291
Alignment:
Q  113 ataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatc 212  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||| |||||| |||||||| |||| ||||| |||||| ||||| |||||||||| |    
T  9281513 atagattctaaacttgcatcacaaatgatacaagagcagaatacatgaagactc-aaaccctacaaatttaaac-ttttagaatgactgcttgaatgaac 9281416  T
Q  213 aattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaa 311  Q
    |||||||||||||||||  |||  ||||| ||||||||||||| |||| | | | ||||||||||| || || ||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  9281415 aattaggtcttgaagtcttcct--tatactgaagcagcttgggctaaa-taactcgttgggcttcagtaaaatgcagatcggttcagcttaatctgtaaa 9281319  T
Q  312 acaagaatcataaacaaatatgaaaagt 339  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||    
T  9281318 acaagaatcagaaacaaatctggaaagt 9281291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 85 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 21723239 - 21723006
Alignment:
Q  85 cacagacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaa 184  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||  || || |||||||| ||||||| |||||||||||| | |||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  21723239 cacagccgatacaagaaaggcacacagtaaagattctaaacctgcatcaaaaatgatacaagtgcagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaa 21723141  T
Q  185 actttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaa 284  Q
    |||||| || |||||||| ||||| | |||||||| |||||||||  | |||||||| ||||||||||||| |||| | ||| ||||||||| | | |||    
T  21723140 actttt-agaatgacggcatgaataaacaattagggcttgaagtcttctttatatactgaagcagcttgggctaaa-taattcgttgggctttagtgcaa 21723043  T
Q  285 agcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatca 321  Q
    |||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21723042 agcaaataggttcagctaatctgcataacaagaatca 21723006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 155 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 19894432 - 19894248
Alignment:
Q  155 acatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgg 254  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  19894432 acatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaaactttt-agaatgacagcttgaatgaacaattaggtcttgaagtcttccttatatactgaagcagcttgg 19894335  T
Q  255 gataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    | ||||   ||| ||||||||||| || || ||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  19894334 gctaaa--aattcgttgggcttcagtaaaatgcagttcggttcagcttaatctgcaaaacaataatcagaaacaaatctggaaagtcct 19894248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 92 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 29253508 - 29253260
Alignment:
Q  92 gatacaagaaaggatcacgatata-ggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttt 190  Q
    ||||||||||||| |||| ||| | ||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  29253508 gatacaagaaaggctcacaataaaaggtactaaacttgcatca-acatgatacaagaatagaacacatgaagactcaaaatcctaaaag-ctaaactttt 29253411  T
Q  191 tagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcaga 290  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||  |||  |||| ||||| ||||||||| |||  ||||    | |||||||||||| ||||| ||||    
T  29253410 tagaatgatggcttggatgatcaattaggtcttgttgtcttccttttatactgaagcagctcgggtcaaatattcttgttgggcttcaaaacaaaacaga 29253311  T
Q  291 ccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
     | || ||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||    
T  29253310 tc-gtccagctgatctgcaaaacaggaatcagagacaaatatggaaagtcct 29253260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 118 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 13870198 - 13869992
Alignment:
Q  118 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 217  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||  |||||   ||||||| |||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||  || |     
T  13870198 ttctaaacttgcgtcacaaacgatacaagagcagaatacatg---actcaaa-ccctaaaaatctaaacttgt-agaatgacagcttgaatgaataactg 13870104  T
Q  218 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaaga 317  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||| |||  ||| |||||  ||| |||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  13870103 ggtcttgaagtcttccttatatactgaagtagcacgggctaaata-atttgttgggcttcagcacaaagcacatcggttcagctaatctgcaaaacaaga 13870005  T
Q  318 atcataaacaaat 330  Q
    |||| ||||||||    
T  13870004 atcagaaacaaat 13869992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 247 - 342
Target Start/End: Original strand, 20653555 - 20653650
Alignment:
Q  247 cagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20653555 cagcttgggctaaatacattagttgggcttcaacacaaagcagatcagttcagctaatatgcaaaacaagaatcagaaacaaatatggaaagtcct 20653650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 118 - 218
Target Start/End: Original strand, 25965053 - 25965151
Alignment:
Q  118 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 217  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25965053 ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaacacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaa-ctttttagtatgacggcttgaatgaacaatta 25965150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 139 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 23882477 - 23882369
Alignment:
Q  139 gatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttata 238  Q
    |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  23882477 gatacaagagtagaacacacaaagactcaaaaccctaaaa-tctaaactttatataatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagccttccttata 23882379  T
Q  239 taccgaagca 248  Q
    ||| ||||||    
T  23882378 tactgaagca 23882369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 113 - 342
Target Start/End: Original strand, 17855551 - 17855776
Alignment:
Q  113 ataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatc 212  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| | |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||   ||| || ||||| |||||||| |      
T  17855551 atagattctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcataatacataaagactcaaacccc-aaaaatctaac--tttcagaatgacagcttgaataaag 17855647  T
Q  213 aattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaa 311  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| || |||| | | | ||||||||||| || ||  |||| ||||||||| |||||||||||    
T  17855648 aattaggtcttgaagtcttccttatatactgaagcagctt-ggctaaa-taactcgttgggcttcagtaaaattcagatcggttcagcttaatctgcaaa 17855745  T
Q  312 acaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    ||||||| || |||||||| || ||||||||    
T  17855746 acaagaagcagaaacaaatctggaaagtcct 17855776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 20989568 - 20989477
Alignment:
Q  115 aggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttga 206  Q
    |||||||| |||||||||| ||  ||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20989568 aggttctagacttgcatcacaaccgatacaagattagaggacataaagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacagcttga 20989477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 234 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 12028828 - 12028721
Alignment:
Q  234 ttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatg 333  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||| | || ||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||    
T  12028828 ttatatactgaagcagcttggactaaatac-ttcgttgggctttagtaaaaagcagatcggttcagctaatctgcaaaacagaattcagaaacaaatatg 12028730  T
Q  334 aaaagtcct 342  Q
    |||||||||    
T  12028729 aaaagtcct 12028721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 266 - 342
Target Start/End: Original strand, 25805913 - 25805989
Alignment:
Q  266 tagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||    
T  25805913 tagttgggcttcagcacaaagcagatcggttcagctaatctgcaaaacaggaatcagagacaaatatggaaagtcct 25805989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 281 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17876393 - 17876332
Alignment:
Q  281 acaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  17876393 acaaagcagatcggttcagctaatctgcaaaacaagaatcaaaaacaaatatcgaaagtcct 17876332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 115 - 188
Target Start/End: Original strand, 25805809 - 25805882
Alignment:
Q  115 aggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactt 188  Q
    ||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25805809 aggttctaaactttcatcacaaccgatacaagagtagagcacataaagactcaaaaccctaaaaatcaaaactt 25805882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 229
Target Start/End: Original strand, 24542014 - 24542122
Alignment:
Q  120 ctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaa-ctttttagtatgacggcttgaatgatcaattag 218  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  24542014 ctaaacttgcatca-acataatacaagagtagaacacacaacgactcaaaaccctaaaaa-ctaaacctttttagtttgacggcttgaataaataattag 24542111  T
Q  219 gtcttgaagtc 229  Q
    |||||||||||    
T  24542112 gtcttgaagtc 24542122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 282 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 28623217 - 28623157
Alignment:
Q  282 caaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  28623217 caaagcagatcggttcagctaatctgcaaaacagaaatcataaacaaagatggaaagtcct 28623157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 265 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 20989445 - 20989370
Alignment:
Q  265 ttagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtc 340  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||||| ||||| ||||||    
T  20989445 ttagttgggcttcagcacaaagcagatcggttcagctaatcagaaaaacaagaattagaaacagatatggaaagtc 20989370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 162 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15930603 - 15930538
Alignment:
Q  162 gactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtc 229  Q
    ||||||||||||||||   ||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  15930603 gactcaaaaccctaaag--ctatactttttagaatgacggcttgaattctcaattaggtcttgaagtc 15930538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 21323035 - 21322968
Alignment:
Q  161 agactcaaaaccctaaaaatctaaacttttt-agtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtc 229  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21323035 agactcaaaaccctaaaa--ctagacttttttaggacgacggcttgaattatcaattaggtcttgaagtc 21322968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 17869640 - 17869587
Alignment:
Q  195 atgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagca 248  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||    
T  17869640 atgacggcttgcataatcaattaggtcttgaagtcttccttttatactgaagca 17869587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 17879392 - 17879339
Alignment:
Q  195 atgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagca 248  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||    
T  17879392 atgacggcttgcataatcaattaggtcttgaagtcttccttttatactgaagca 17879339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 20)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 92 - 342
Target Start/End: Original strand, 20991874 - 20992124
Alignment:
Q  92 gatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaacttttt 191  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20991874 gatacaagaaaggatcacaatatatgttctaaacttgcatcacaaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaacttttt 20991973  T
Q  192 agtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagac 291  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||     
T  20991974 agtatgacggattgaatgatcaattaggtcttgaagtctcccttatatactgaagcaacttgggataaatacattagtcgggcttcagcacaaagcagat 20992073  T
Q  292 cggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20992074 cggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatggaaagtcct 20992124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 85 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 29545971 - 29545719
Alignment:
Q  85 cacagacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaa 184  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29545971 cacaaacgatacaagaaaggctcacaataaaggttctaaacttgcatcacaatcaatacaagagtagagcacatgtagactcaaaactctaaaaatctaa 29545872  T
Q  185 actttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaa 284  Q
    ||||||||| |||||||     |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||   |||||||||||| |  ||||    
T  29545871 actttttagaatgacgg-----atgatcaattaggttttgaagtctcccttatatactgaagcagcttgggccaaataatttagttgggctttagaacaa 29545777  T
Q  285 agcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  29545776 agcagatcggttcagctaatctgcaaaacagaaatcagaaacaaatatggaaagtcct 29545719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 85 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16207713 - 16207459
Alignment:
Q  85 cacagacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaa 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |  |||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16207713 cacagacgatacaagaaaggctcacaaaa--ggttctaaacttacatcacaaacgatacaagaatagagcacataaagactcaaaaccctaaaaatctaa 16207616  T
Q  185 actttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaa 284  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||  |||||| ||||| | |||| |||||||||  ||||    
T  16207615 actttttagtatgatggcttgaataaacaattaggtcttgaagtcttccttatatactgaagcttcttgggctaaatac-ttaggtgggcttcagcacaa 16207517  T
Q  285 agcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    |||||| |||  || |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  16207516 agcagatcggcacaactaatctgcaaaacaagaattagaaacaaatatggaaagtcct 16207459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 113 - 342
Target Start/End: Original strand, 12326164 - 12326392
Alignment:
Q  113 ataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatga-t 211  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  12326164 ataggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatagagcacatg-agactcaaaaccctaaaaacctaaactttttagtatgacaacttgaatgaat 12326262  T
Q  212 caattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaa 311  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||   ||||||||| || |  |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  12326263 caattaggtcttaaagtctcccttatatactgaagcatcttgggctaaatat-ttagttgggatttagcacaaagcagatcggttcagctaatcttcaaa 12326361  T
Q  312 acaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  12326362 acaagaattagaaacaaatatggaaagtcct 12326392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 118 - 342
Target Start/End: Original strand, 11588822 - 11589046
Alignment:
Q  118 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 217  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11588822 ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaaactttttagtaagacggcttgaatgaacaatta 11588920  T
Q  218 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaat-acaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaa 315  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||  |||| | ||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  11588921 ggtcttgaagtcttccttatatactgaagcagcttggtctaaa-taattcgttgggcttcagtaacaaagcagatcggttcagcttaatctgcaaaacaa 11589019  T
Q  316 gaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    |||| | |||||||| || ||||||||    
T  11589020 gaattagaaacaaatctggaaagtcct 11589046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 118 - 342
Target Start/End: Original strand, 4459098 - 4459320
Alignment:
Q  118 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 217  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4459098 ttctaaactttcatca-acatgatacaagagcagaatacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgagcaatta 4459196  T
Q  218 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaaga 317  Q
    ||||||||||||    ||||||||  |||||||||||| ||||| | ||| || |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  4459197 ggtcttgaagtcttgtttatatactaaagcagcttgggctaaatac-ttatttaggcttcagaacaaagcagatcggttcagctaatctgcaaaacagaa 4459295  T
Q  318 atcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    |||| |||||| |||| ||| ||||    
T  4459296 atcagaaacaattatggaaaatcct 4459320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 118 - 342
Target Start/End: Original strand, 11999241 - 11999462
Alignment:
Q  118 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 217  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||    
T  11999241 ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaaactttttagaatgacgacttgaataa-caatta 11999338  T
Q  218 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaaga 317  Q
    ||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  11999339 ggttttgaagtcttccttatatactgaagcagcttgggctaaatac-ttagttgggcttcagcacaaagcagatcggttcggctaatctgcaaaacaaga 11999437  T
Q  318 atcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    ||   ||||||| ||||||||||||    
T  11999438 atatgaaacaaaaatgaaaagtcct 11999462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 85 - 318
Target Start/End: Original strand, 15506593 - 15506822
Alignment:
Q  85 cacagacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaa 184  Q
    |||| ||||||||||||||  |||| ||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506593 cacaaacgatacaagaaagactcacaataaaggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatgaagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaa 15506692  T
Q  185 actttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaa 284  Q
    |||||   |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| ||  |||||| || ||    
T  15506693 acttt---gtatgacggcttgaataagcaattaggtcttgaagtcttccttatatactgaagcagcttgggctaaatac-ttaattacgcttcagtaaaa 15506788  T
Q  285 agcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaa 318  Q
    || | | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15506789 agaaaatcggtttagctaatctgcaaaacaagaa 15506822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 118 - 342
Target Start/End: Original strand, 645493 - 645717
Alignment:
Q  118 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 217  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  645493 ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataaagaatta 645591  T
Q  218 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaat-acaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaa 315  Q
    ||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||| |||| | ||  ||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  645592 ggtcttgaagtcttctttatatactgaagcagcttgggctaaa-taatacgttgggcttcagtaacaatgcagaccggttcagcttaatttgcaaaacaa 645690  T
Q  316 gaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    |||||| ||| |||| || ||||||||    
T  645691 gaatcagaaataaatctggaaagtcct 645717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 85 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 11521244 - 11520990
Alignment:
Q  85 cacagacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaa 184  Q
    ||||||||||||||||||| | |||   |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||| |||||||||| |||    
T  11521244 cacagacgatacaagaaagaa-cacacaatagattctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatataa 11521147  T
Q  185 actttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaat-aca 283  Q
       |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||| | |||    
T  11521146 c--ttttagaatgacggcttgaataatcaattaggtcttgaagtcttccttatatactgaagcagcttgggctaaa-taattcgttgggcttcagtaaca 11521050  T
Q  284 aagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    | ||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  11521049 atgcagatcggttcagcttgatctgcaaaacaagaatcagaaacaaatctggaaagtcct 11520990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 85 - 328
Target Start/End: Original strand, 14165493 - 14165732
Alignment:
Q  85 cacagacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaa 184  Q
    ||||| ||||||||| ||||  |||  || || |||||||||||||||| | |||||||||||| | |  ||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  14165493 cacaggcgatacaagtaaggcacacattaaagattctaaacttgcatca-acatgatacaagagcataatacacgaagactcaaa-ccctaaaaatctaa 14165590  T
Q  185 actttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaa 284  Q
    |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||| |||||| |||||  ||| |||||||||||| ||||    
T  14165591 actttt-agaatgacggcttgaatgaacaattaggtcttgaagtcttccttttatactgaagcaacttgggctaaata-attcgttgggcttcaacacaa 14165688  T
Q  285 agcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaa 328  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14165689 tgcagatcggttcagctaatctgcaaaacaagaatcagaaacaa 14165732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 85 - 261
Target Start/End: Original strand, 15438422 - 15438598
Alignment:
Q  85 cacagacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaa 184  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||| || ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15438422 cacaaacgatacaagaaaggctcacaataaaggttctagacttgcaacacaaacgatacaagaatggagcacatgtagactcaaaatcctaaaaatctaa 15438521  T
Q  185 actttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaat 261  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| || |||||    
T  15438522 actttttagtatgacgggttgaataatttattaggtcttgaagtcttccttatatactaaagcagcttaggctaaat 15438598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 250
Target Start/End: Original strand, 16437100 - 16437265
Alignment:
Q  85 cacagacgatacaagaaaggatcacgatata-ggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatcta 183  Q
    |||| ||||||||||||||| || | ||| | ||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||    |    
T  16437100 cacatacgatacaagaaaggctcgcaataaaaggtactaaacttgcatca-acatgatacaagaatagaacacatgaagacttaaaaccctaaaagctaa 16437198  T
Q  184 aactttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagc 250  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||| ||||||||    
T  16437199 aactttttagaatgatggcttgaataatcaattaggtcttgatgtcttccttttatactgaagcagc 16437265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 26132722 - 26132600
Alignment:
Q  120 ctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattagg 219  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||    |||||||    
T  26132722 ctaaacttgcatca-acacgatacaagagtaga-cacacaaagactcaaaaccctaaaa--ctagactttttagaatgacggcttgaatacctaattagg 26132627  T
Q  220 tcttgaagtcgcccttatataccgaag 246  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||||    
T  26132626 tcttgaagtcttccttatatactgaag 26132600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 246
Target Start/End: Original strand, 10280136 - 10280296
Alignment:
Q  85 cacagacgatacaagaaaggatcacgatata-ggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatcta 183  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||| | ||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||| |||||||||  | |||||  |||    
T  10280136 cacaaacgatacaagaaaggctcacaataaaaggtactaaacttgcatca-acatgatacaagaatagaacacatgaagactcaaactcgtaaaag-cta 10280233  T
Q  184 aactttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaag 246  Q
    |||||||||| || |||||||||||  |  |||||||||||| |||  |||| ||||| ||||    
T  10280234 aactttttagaataacggcttgaatagtacattaggtcttgatgtcttccttttatactgaag 10280296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 228
Target Start/End: Original strand, 10661224 - 10661331
Alignment:
Q  120 ctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaa-ctttttagtatgacggcttgaatgatcaattag 218  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||   |||  ||||||    
T  10661224 ctaaacttgcatca-acacgatacaagagtagaacacacaaagactcaaaaccctaaaaa-ctaaacctttttagtttgacggcttcggtgacaaattag 10661321  T
Q  219 gtcttgaagt 228  Q
    ||||||||||    
T  10661322 gtcttgaagt 10661331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 295 - 333
Target Start/End: Original strand, 15438611 - 15438649
Alignment:
Q  295 ttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatg 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15438611 ttcagctaatctgcaaaacaagaatcagaaacaaatatg 15438649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20924903 - 20924798
Alignment:
Q  120 ctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgta-gactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattag 218  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||  |||||||  ||||||||    
T  20924903 ctaaacttacatca-acatgatacaagagtaga-cacacatacgactcaaaaccctaaag--ctagactttttagaatgacatcttgaattctcaattag 20924808  T
Q  219 gtcttgaagt 228  Q
    ||||||||||    
T  20924807 gtcttgaagt 20924798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 248
Target Start/End: Original strand, 21260834 - 21260919
Alignment:
Q  162 gactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagca 248  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||    |||||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  21260834 gactcaaaaccctaaaaa-ctattcttttagaaatgacgacttgaatgaataattaggtcttgaagtcttccttatatactgaagca 21260919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 121 - 226
Target Start/End: Original strand, 42636581 - 42636685
Alignment:
Q  121 taaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaa-ctttttagtatgacggcttgaatgatcaattagg 219  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||   |||  |||||||    
T  42636581 taaacttgcatca-acacgatacaagagtagaacacacaaagactcaaaaccctaaaaa-ctaaacctttttagtttgacgacttcggtgacaaattagg 42636678  T
Q  220 tcttgaa 226  Q
    |||||||    
T  42636679 tcttgaa 42636685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 3)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 89 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17956 - 17703
Alignment:
Q  89 gacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactt 188  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17956 gacgatacaagaaaggctcacaatataggttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaagtctaaactt 17857  T
Q  189 tttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagca 288  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||   |||||||||||||  |||||||||    
T  17856 tttagaatgacgacttgaatgatcactttggtcttgaagtctcccttatatactgaagcagcttgggctaaatagtttagttgggcttcggtacaaagca 17757  T
Q  289 gaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17756 gatcggttcagctattctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 17703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 89 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27350 - 27097
Alignment:
Q  89 gacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactt 188  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27350 gacgatacaagaaaggctcacaatataggttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaagtctaaactt 27251  T
Q  189 tttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagca 288  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||   |||||||||||||  |||||||||    
T  27250 tttagaatgacgacttgaatgatcactttggtcttgaagtctcccttatatactgaagcagcttgggctaaatagtttagttgggcttcggtacaaagca 27151  T
Q  289 gaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27150 gatcggttcagctattctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 27097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 85 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 7373 - 7116
Alignment:
Q  85 cacagacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaa 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7373 cacagacgatacaagaaaggctcacaatataggttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaa 7274  T
Q  185 actttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaa 284  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||| |||||    
T  7273 acttattagaatggcggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtctcccttatatactgaagcagctcgggctaaatactttatttgggcttcagtacaa 7174  T
Q  285 agcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    || ||| |||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  7173 agtagatcggttcggctaatctgaaaaacaagaaccagaaacaaatatggaaagtcct 7116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 12)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 85 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 27925286 - 27925031
Alignment:
Q  85 cacagacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaa 184  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27925286 cacaaacgatacaagaaaggatcacaatataggttctaaacttgcatcacaaatgataaaagaatagaacacatgtagactcaaaatcctaaaaatctaa 27925187  T
Q  185 actttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaa 284  Q
     |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||| ||||    
T  27925186 cctttttagtatgccagcttgaatgatcaattaggtcttgaagtctcccttatatactgaagcagcttgggctaaatac-ttagtt-ggcttcaacacaa 27925089  T
Q  285 agcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  27925088 agcagatcggttcagctaatctgcaaaacaagaatcagaaacaaatatggaaagtcct 27925031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 113 - 342
Target Start/End: Original strand, 45136464 - 45136692
Alignment:
Q  113 ataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatc 212  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  45136464 ataggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatagagctcataaagactcaaaaccctaaaaatctatactttttagtatgacggcttgaataatc 45136563  T
Q  213 aattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  45136564 aattaggtcttgaagtcttccttatatactcaagcagcttgagataaatac-ttagttgggcttcagcacaaagcaaatcagttcagctaatctgcaaaa 45136662  T
Q  313 caagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45136663 caagaatcataaacaaatatggaaagtcct 45136692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 92 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 13660199 - 13659988
Alignment:
Q  92 gatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaacttttt 191  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||    
T  13660199 gatacaagaaagtatcacaataaaggttctaaacttgcatcacaaacgatacaagaatagagcacatgtagactcaaaactctaaaatt-taaatttttt 13660101  T
Q  192 agtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagac 291  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||     
T  13660100 agtataacgacttgaatgatcaattaggtcttgaagtttcctttatatactgaagcagcttgggctaaatacattaattgggcttcagcacaaagcagat 13660001  T
Q  292 cggttcagctaat 304  Q
    |||||||||||||    
T  13660000 cggttcagctaat 13659988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 92 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 13718842 - 13718631
Alignment:
Q  92 gatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaacttttt 191  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||    
T  13718842 gatacaagaaagtatcacaataaaggttctaaacttgcatcacaaacgatacaagaatagagcacatgtagactcaaaactctaaaatt-taaatttttt 13718744  T
Q  192 agtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagac 291  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||     
T  13718743 agtataacgacttgaatgatcaattaggtcttgaagtttcctttatatactgaagcagcttgggctaaatacattaattgggcttcagcacaaagcagat 13718644  T
Q  292 cggttcagctaat 304  Q
    |||||||||||||    
T  13718643 cggttcagctaat 13718631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 118 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 23541207 - 23540986
Alignment:
Q  118 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 217  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||| |||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  23541207 ttctaaacttgcatca-acatgataaaagagcagaatacataaagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacgacttgaatgattaatta 23541109  T
Q  218 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaaga 317  Q
    ||| ||| ||||  |||||||||  ||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23541108 ggtattggagtcttccttatatattgaagcagcttgggctaaatac-ttagttgggtttcagcacaaagcagatcggttcaactaatctgcaaaacaaga 23541010  T
Q  318 atcataaacaaatatgaaaagtcc 341  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  23541009 atcagaaacaaatatggaaagtcc 23540986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 85 - 342
Target Start/End: Original strand, 33962065 - 33962322
Alignment:
Q  85 cacagacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaa 184  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  33962065 cacagacgatacgagaaaggctcacaataaaggttctaaacttgcatcagcag-gatacaagagtagagcacatgtagactcaaaatcttaaaaatctaa 33962163  T
Q  185 actttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgccctta---tataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaata 281  Q
    || |||||| ||||||||||||||  |  |||||||||||||||| | ||||   ||||| ||||||||| |||  |||| | ||||||||||||||  |    
T  33962164 ac-ttttagaatgacggcttgaatagttcattaggtcttgaagtctcacttatattatactgaagcagctcgggtcaaatactttagttgggcttcagaa 33962262  T
Q  282 caaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  33962263 caaagcagatcggttcagctaatctgcaaaac-agaatcagagacaaatatgtaaagtcct 33962322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 85 - 342
Target Start/End: Original strand, 33977384 - 33977640
Alignment:
Q  85 cacagacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaa 184  Q
    |||||||||||| ||||||| |||| ||| || ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33977384 cacagacgatacgagaaaggctcacaataaagattctaaacttgaatca-acatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccttaaaaatctaa 33977482  T
Q  185 actttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatat--accgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatac 282  Q
    || |||||| ||||||||||||||  |  |||||||||||||||| | |||||||    | |||||||| |||  |||| | ||||||||||||||  ||    
T  33977483 ac-ttttagaatgacggcttgaatagttgattaggtcttgaagtctcacttatattatactaagcagctcgggtcaaatactttagttgggcttcagaac 33977581  T
Q  283 aaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  33977582 aaagcagatcggttcagctaatctgcaaaac-agaatcagagacaaatatgtaaagtcct 33977640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 118 - 342
Target Start/End: Original strand, 22485491 - 22485714
Alignment:
Q  118 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 217  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22485491 ttctaaacttgcatcacaaatgatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-cccaaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgaacaatta 22485589  T
Q  218 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaag 316  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||| ||||    ||  |||||||||| || || ||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  22485590 ggtcttgaagtcttccttatatactgaagcaacttgggctaaa-gatttcattgggcttcagtaaaatgcagatcgattcagcttaatctgcaaaacaag 22485688  T
Q  317 aatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||    
T  22485689 aatcagaaacaaatctggaaagtcct 22485714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 90 - 246
Target Start/End: Original strand, 24092288 - 24092443
Alignment:
Q  90 acgatacaagaaaggatcacgatata-ggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactt 188  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| | ||| |||||| ||||||| | ||||||||||  |||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  24092288 acgatacaagaaaggctcacaataaaaggtactaaacctgcatca-acatgatacaagcctagcacacatgtagactcaaacccctaaaa-tctaaactt 24092385  T
Q  189 tttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaag 246  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  24092386 tttagaatgacggcttgaatactcaattaggtgttgaagtctcccttatatactgaag 24092443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 342
Target Start/End: Original strand, 22476635 - 22476761
Alignment:
Q  216 taggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagct-aatctgcaaaaca 314  Q
    |||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||   | | |||||||||| |  || ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  22476635 taggtcttcaagtcttccttatatactgaagcagcttgggctaaatatttca-ttgggcttcagttaaatgcagatcggttcagcttaatctgcaaaaca 22476733  T
Q  315 agaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||    
T  22476734 agaatcagaaacaaatctggaaagtcct 22476761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 139 - 248
Target Start/End: Original strand, 25240742 - 25240848
Alignment:
Q  139 gatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttata 238  Q
    |||||||||||||| ||||   ||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||| ||    
T  25240742 gatacaagagtagaacacac--agagttaaaaccctaaaag-ctaaactttttagtatgacggcttgaatacctaattaggtcttgaagtcttccttcta 25240838  T
Q  239 taccgaagca 248  Q
    ||| ||||||    
T  25240839 tactgaagca 25240848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 312
Target Start/End: Original strand, 26536706 - 26536839
Alignment:
Q  179 atctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagtt-gggcttc 277  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||  |  |||||||||||||||| | ||||||| | |||| |||| |||  |||| | |||||| ||||||     
T  26536706 atctaaactttt-agaatgacgacttgaatagttcattaggtcttgaagtctcacttatatgctgaagtagctcgggtcaaatactttagtttgggcttt 26536804  T
Q  278 aatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaa 312  Q
    |  |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  26536805 agaacaaagcatatcggttcagctaatctgcaaaa 26536839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 17)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 85 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15162319 - 15162062
Alignment:
Q  85 cacagacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaa 184  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  15162319 cacaaacgatacaagaaaggatcacactaaaggttctaaacttgcatcataaacgatacaagagtagagcacatgtagacttaaaactctaaaaatctaa 15162220  T
Q  185 actttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaa 284  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  ||||    
T  15162219 actttttagaatgatggcttgaataatcaattaggtcttgaagtctcccttatatactgaagcagcttgggctaaatactttagttgggcttcagcacaa 15162120  T
Q  285 agcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    ||||||  ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  15162119 agcagataggttcagttaatttgcaaaacatgaatcataaaaaaatatggaaagtcct 15162062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 96 - 342
Target Start/End: Original strand, 10724597 - 10724843
Alignment:
Q  96 caagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagta 195  Q
    ||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  10724597 caagaaaggctcactataaaggtcctaaacttgcatcacaaacgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctacacttttcagaa 10724696  T
Q  196 tgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggt 295  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||| | |||||||||||||   |||||||||| ||||    
T  10724697 tgacggcttaaatgatcaattaggtcttgaagtctcccttatatactgaagcaacttgggctaaatactttagttgggcttcggcacaaagcagatcggt 10724796  T
Q  296 tcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10724797 tcagctaatctgcaaaacaagaatcaaaaacaaatatggaaagtcct 10724843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 96 - 342
Target Start/End: Original strand, 10938366 - 10938612
Alignment:
Q  96 caagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagta 195  Q
    ||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  10938366 caagaaaggctcactataaaggtcctaaacttgcatcacaaacgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctacacttttcagaa 10938465  T
Q  196 tgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggt 295  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||| | |||||||||||||   |||||||||| ||||    
T  10938466 tgacggcttaaatgatcaattaggtcttgaagtctcccttatatactgaagcaacttgggctaaatactttagttgggcttcggcacaaagcagatcggt 10938565  T
Q  296 tcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10938566 tcagctaatctgcaaaacaagaatcaaaaacaaatatggaaagtcct 10938612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 85 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 15700168 - 15699914
Alignment:
Q  85 cacagacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaa 184  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||  ||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  15700168 cacaaacgatacaagaaaggctcacaataagggtactaaacttgcatca-acatgatacaagaatagaacacatgtagactcaaaaccctaaaag-ctaa 15700071  T
Q  185 actttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaa 284  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||| |  |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||  |||| |  | |||||||||||  ||||    
T  15700070 actttttagaatgacagattgaatggttcattaggtcttgaagtttcccttatatactgaagcagctcgggtcaaatactcttgttgggcttcagaacaa 15699971  T
Q  285 agcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    | |||| | || ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  15699970 aacagatc-gtccagctgatctgcaaaacaagaatcagagacaaatatggaaagtcct 15699914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 85 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18601490 - 18601238
Alignment:
Q  85 cacagacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaa 184  Q
    |||||||||||||||||  || |||   |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  18601490 cacagacgatacaagaa--gaacacacaatagattctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaa 18601394  T
Q  185 actttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaa 284  Q
       |||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||| || ||  ||| |||||||||||  ||||    
T  18601393 c--ttttagaatgacggcttgaatgaataattagttcttgaagtctttcttatatactgaagcagcttgggctacata-attcgttgggcttcagcacaa 18601297  T
Q  285 agcagaccggttcagct-aatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
     ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18601296 tgcagatcgattcagcttaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatggaaagtcct 18601238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 118 - 342
Target Start/End: Original strand, 28019662 - 28019884
Alignment:
Q  118 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 217  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||||| |||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  28019662 ttctaaacttgcatcacaaacgagacaagagcagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaac--ttttagaatgacggcttgaataaacaatta 28019758  T
Q  218 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaat-acaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaa 315  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||| |||| | ||| ||||||||||||| |||| | ||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  28019759 ggtcttgaagtcttccttatatactgaagcaacttgggctaaa-taattcgttgggcttcaataacaatgtagatcggtttagcttaatctgcaaaacaa 28019857  T
Q  316 gaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||    
T  28019858 gaatcagaaacaaatctgaaaagtcct 28019884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 118 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 23399996 - 23399774
Alignment:
Q  118 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 217  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| |||||| || |||||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||| ||||||    
T  23399996 ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactcgaa-ccctaaaaatctaaa--ttttagaatgacagtttgaatgaacaatta 23399900  T
Q  218 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaat-acaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaa 315  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||| ||| || |||| | ||  ||||||||||| | |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  23399899 ggtcttgaagtcttccttatatactgaagcaacttaggctaaa-taatatgttgggcttcactaacaatgcagatcggttcagcttaatctgcaaaacaa 23399801  T
Q  316 gaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||    
T  23399800 gaatcagaaacaaatttggaaagtcct 23399774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 118 - 342
Target Start/End: Original strand, 25117215 - 25117437
Alignment:
Q  118 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 217  Q
    |||||||||| | ||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||   |||||| |||| ||||||||| | ||||||    
T  25117215 ttctaaacttacctcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaac--ttttagaatgatggcttgaattaacaatta 25117311  T
Q  218 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaa-gcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaa 315  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||| | ||  ||||||||||| || ||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  25117312 ggtcttgaagtcttccttatatactgaagcagcttgggctaaa-taatacgttgggcttcagtaaaaatgcagatcggttcagcttaatttgcaaaacaa 25117410  T
Q  316 gaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||    
T  25117411 gaatcagaaacaaatctggaaagtcct 25117437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 85 - 330
Target Start/End: Original strand, 16384217 - 16384459
Alignment:
Q  85 cacagacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaa 184  Q
    ||||||||||||||||||| | |||   |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||| | ||| ||||||||||||||    
T  16384217 cacagacgatacaagaaagaa-cacacaatagattctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagagttaaa-ccctaaaaatctaa 16384314  T
Q  185 actttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaa 284  Q
    |||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||  |||||||||||| |||||  |||  ||||||||||  |  |    
T  16384315 actttt-agaatgatggcttgaataatcaattaggtcttgaagtatttcttatatactaaagcagcttgggctaaata-attcattgggcttcagcaaga 16384412  T
Q  285 agcagaccggttcagct-aatctgcaaaacaagaatcataaacaaat 330  Q
     ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16384413 tgcagatcggttcagcttaatctgcaaaacaagaatcagaaacaaat 16384459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 85 - 254
Target Start/End: Original strand, 10191213 - 10191379
Alignment:
Q  85 cacagacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaa 184  Q
    ||||||||||||||||||| | |||   |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  10191213 cacagacgatacaagaaagaa-cacacaatagattctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaa 10191310  T
Q  185 actttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgg 254  Q
    |||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||    
T  10191311 actttt-agaatgacggcttgaatgaataattaggtcttgaagtcttccttatatagtgaagcagcttgg 10191379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 118 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 33898808 - 33898587
Alignment:
Q  118 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 217  Q
    ||||||| ||| |||| ||| |||||||||| | |  ||||| ||||||||| || |||||||||||   |||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  33898808 ttctaaatttgtatcacaaacgatacaagagcataatacatgaagactcaaatcc-taaaaatctaac--ttttagaatgacagcttgaatgaacaatta 33898712  T
Q  218 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagct-aatctgcaaaacaag 316  Q
    |||||||| |||  |||||||||  ||||||| ||||| |||||  ||| ||||| ||||| || || ||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  33898711 ggtcttgacgtcttccttatatagtgaagcagtttgggctaaata-attcgttggacttcagtaaaatgcagatcagttcagcttaatctgcaaaacaag 33898613  T
Q  317 aatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    |||||||||||||| || ||||||||    
T  33898612 aatcataaacaaatctggaaagtcct 33898587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 248
Target Start/End: Original strand, 15622799 - 15622924
Alignment:
Q  120 ctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtat-gacggcttgaatgatcaattag 218  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||    
T  15622799 ctaaacttgcatca-acacgatacaagagtaga-cacacaaagactcaaaaccctaaaa--ctaaactttttagaaacgacggcttgaataatcaattag 15622894  T
Q  219 gtcttgaagtcgcccttatataccgaagca 248  Q
    |||||||||||  |||| ||||| ||||||    
T  15622895 gtcttgaagtcctccttttatactgaagca 15622924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 120 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 19183481 - 19183378
Alignment:
Q  120 ctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattagg 219  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||| |||| ||||   |||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  19183481 ctaaacttgcatca-acacgatacaagaatagaacacacaaagacacaaaaccctacaaa-ctaaactttttagaatgacgtcttgaatgatcaattagg 19183384  T
Q  220 tcttga 225  Q
    ||||||    
T  19183383 tcttga 19183378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 140 - 229
Target Start/End: Original strand, 19659819 - 19659907
Alignment:
Q  140 atacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtc 229  Q
    ||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  19659819 atacaagagtagaacacacaaagactcaaaaccctaaaaa-ctaaactttttagaatgacggcttgaatacataattaggtcttgaagtc 19659907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 140 - 229
Target Start/End: Original strand, 33746298 - 33746387
Alignment:
Q  140 atacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaa-ctttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtc 229  Q
    ||||||||| ||| ||||   |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  33746298 atacaagaggagaacacacaaagactcaaaaccttaaaaa-ctaaacctttttagtttgacggcttgaatgaataattaggtcttgaagtc 33746387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 163 - 248
Target Start/End: Original strand, 32862050 - 32862134
Alignment:
Q  163 actcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagca 248  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||    
T  32862050 actcaaaaccctaaaaa-ctattctttttgaaatgacggcttgaatgaacaattaggtcttgaagtcttccttatatcctgaagca 32862134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 229
Target Start/End: Original strand, 9069306 - 9069414
Alignment:
Q  120 ctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaa-ctttttagtatgacggcttgaatgatcaattag 218  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||| | ||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||   |||  ||||||    
T  9069306 ctaaacttgcatca-acacgatacaagagtagaacgcacaaagactcaaaaccctaaaaa-ctaaacctttttagtttgacggcttcggtgacaaattag 9069403  T
Q  219 gtcttgaagtc 229  Q
    |||||||||||    
T  9069404 gtcttgaagtc 9069414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 85 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 8415 - 8158
Alignment:
Q  85 cacagacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaa 184  Q
    |||||||||||| ||||||| || | ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  8415 cacagacgatacgagaaaggctctcaataaaggttctaaacttgcatcacaaatgataaaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaacccaa 8316  T
Q  185 actttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaa 284  Q
    || | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||| ||| |  ||||    
T  8315 acctcttagaatgtcggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtctcccttatatactgaagcagcttgggctaaatactttagttggactttagcacaa 8216  T
Q  285 agcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  8215 agcagatcggttcagctaatctgcataacaacaatcataaacaaatatggaaagtcct 8158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 20)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 85 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 23758089 - 23757835
Alignment:
Q  85 cacagacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaa 184  Q
    |||||||||||||||||||  ||||   | |||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  23758089 cacagacgatacaagaaagactcac--aaaaggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatagagcacataaagactcaaaaccctaaaaatctaa 23757992  T
Q  185 actttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaa 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  23757991 actttttagtatgacagcttgaatgatcaattaggtcttgtagtcttctttatatactgaagcagcttgggataaatac-ttagttgggcttcaacacaa 23757893  T
Q  285 agcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||| || ||||||||    
T  23757892 agcagatcggttcagctaatctgccaaacaagaacccgaaacaaatctggaaagtcct 23757835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 85 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 23823545 - 23823291
Alignment:
Q  85 cacagacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaa 184  Q
    |||||||||||||||||||  ||||   | |||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  23823545 cacagacgatacaagaaagactcac--aaaaggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatagagcacataaagactcaaaaccctaaaaatctaa 23823448  T
Q  185 actttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaa 284  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  23823447 actttttagtatgacagcttgaatgatcaattaggtcttgtagtcttctttatatactgaagcagcttgggataaatac-ttagttgggcttcaacacaa 23823349  T
Q  285 agcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||| || ||||||||    
T  23823348 agcagatcggttcagctaatctgccaaacaagaacccgaaacaaatctggaaagtcct 23823291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 118 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 23420357 - 23420146
Alignment:
Q  118 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 217  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23420357 ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgagcaatta 23420259  T
Q  218 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaaga 317  Q
    ||||||||||||    ||| |||| |||| |||||||| |||| | |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23420258 ggtcttgaagtcttttttacatactgaagtagcttgggctaaa-taattagttgggcttcagaacaaagcagatcggttcagctaatctgcaaaacaaga 23420160  T
Q  318 atcataaacaaata 331  Q
    |||| |||||||||    
T  23420159 atcagaaacaaata 23420146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 113 - 342
Target Start/End: Original strand, 24190215 - 24190444
Alignment:
Q  113 ataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatc 212  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||| || |||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24190215 atagattctaaacttgcatcacaaacgatacaaaagcagaatacatgaagact-aaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgaac 24190313  T
Q  213 aattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaat-acaaagcagaccggttcagc-taatctgcaa 310  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||| | ||  ||||||||||| | |||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  24190314 aattaggtcttgaagtcttccttatatactgaagcagcttgggctaaa-taatatgttgggcttcagtaacaatgcagatcggttcagcttaatctgcaa 24190412  T
Q  311 aacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  24190413 aacaagaatcagaaacaaatctggaaagtcct 24190444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 118 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 22404562 - 22404352
Alignment:
Q  118 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 217  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |  | ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  22404562 ttctaaacttgcatcacaaatgatacaagagcataataaatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaaaatttt-agaatgacggcttgaataatcaatta 22404465  T
Q  218 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaag 316  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22404464 ggtcttgaagtcttccttatatactgaagcagcttgggctaaa-taattcgttgggcttcagtaaaatgcagatcggttcagcttaatctgcaaaacaag 22404366  T
Q  317 aatcataaacaaat 330  Q
    ||||||||||||||    
T  22404365 aatcataaacaaat 22404352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 118 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 9422315 - 9422107
Alignment:
Q  118 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 217  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||| | |  ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  9422315 ttctaaacttgcatcacagacgatacaagagcataatacatgaagactcaat-ccctaaaaatctaaactttttagaatgacggcttgaataa-caatta 9422218  T
Q  218 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaaga 317  Q
    ||| ||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| ||||| | |||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9422217 ggtattgaagtcttccttatatactgaagcagtttgggctaaatac-ttagttggacttcagcacaaagcagatcggttcagctaatctgcaaaacaaga 9422119  T
Q  318 atcataaacaaa 329  Q
    |||| |||||||    
T  9422118 atcagaaacaaa 9422107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 115 - 342
Target Start/End: Original strand, 38405717 - 38405942
Alignment:
Q  115 aggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaa 214  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||    
T  38405717 aggttataaacttgcatca-acatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaacactaaaaatctaaactttttagaatgaaggcttgaatactcaa 38405815  T
Q  215 ttaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaaca 314  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||  ||||    ||||| |||||||  ||||| |||| | || ||| | ||||||||||||    
T  38405816 ttaagtcttgaagtcttccttatatactgaagcatcttgggtcaaatattctagtttggcttcagaacaaaacagatc-gtccagatgatctgcaaaaca 38405914  T
Q  315 agaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  38405915 agaatcagagacaaatatggaaagtcct 38405942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 85 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 30605525 - 30605270
Alignment:
Q  85 cacagacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaa 184  Q
    |||| |||| |||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30605525 cacaaacgacacaagaaaggctcacaataaaggtactaaacttgcatca-acatgatacaagagtagaacacatgtatactcaaaaccctaaaaatctaa 30605427  T
Q  185 actttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaa 284  Q
    ||||||||| || |||||||||||  |  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||   |  ||||  | | |||||||||||  ||||    
T  30605426 actttttagaattacggcttgaatagttcattaggtcttgaagtctcccttatatactgaagcaactcaagtcaaataaacttgttgggcttcagaacaa 30605327  T
Q  285 agcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    | |||| | || || || ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  30605326 aacagatc-gtccaactgatctgcaaaacaagaattagaaacaaatatggaaagtcct 30605270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 126 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22251832 - 22251619
Alignment:
Q  126 ttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttga 225  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22251832 ttgcatcacaaaagatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaac--ttttagaatgacggcttgaatgaacaattaggtcttga 22251736  T
Q  226 agtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaagaatcataa 324  Q
    ||||  |||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||  | || |||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  22251735 agtcttccttatatactgaagcagcttgggctaaa-taattcgttgggcttcagcaaaatgcagataggttcagcttaatctgcaaaacaagaataataa 22251637  T
Q  325 acaaatatgaaaagtcct 342  Q
    |||||| || ||||||||    
T  22251636 acaaatctggaaagtcct 22251619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 162 - 342
Target Start/End: Original strand, 26037181 - 26037359
Alignment:
Q  162 gactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaat 261  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||  ||||    
T  26037181 gactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagaatgacggcttgaatagttcattaggtcttgaagtctcccttatatactgaagcagctcgggtcaaat 26037280  T
Q  262 tcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
     | |||||| |||||||  |||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||    
T  26037281 actttagtttggcttcagaacaaagaagatcagttcagctaatctgcaaaac-agaatca-gaacaaatatggaaagtcct 26037359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 90 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 26329043 - 26328793
Alignment:
Q  90 acgatacaagaaaggatcacgatata-ggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactt 188  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| | ||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||     
T  26329043 acgatacaagaaaggctcacaataaaaggtactaaacttgcatca-acatgatacaagaatagaacacatgtatactcaaaaccctaaaag-ctaaactc 26328946  T
Q  189 tttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaat-tcattagttgggcttcaatacaaagc 287  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||  |||  |||| | ||| |||||||||||  ||||| |    
T  26328945 tttagaatgacggcttgaatggttcattaggtcttgatgtcttccttttataccgaagcagcaagggtcaaatattatt-gttgggcttcagaacaaaac 26328847  T
Q  288 agaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    ||| | || ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  26328846 agatc-gtccagctgatctgcaaaacaagaatcagagacaaatatggaaagtcct 26328793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 85 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 22082522 - 22082271
Alignment:
Q  85 cacagacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaa 184  Q
    |||| |||| |||||||||| |||  ||| |||| ||||| |||||||| | ||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  22082522 cacaaacgacacaagaaaggttcataataaaggtactaaatttgcatca-acatgatacaaaaatagaacacatgtagactcaaaactctaaaag-ctaa 22082425  T
Q  185 actttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaa 284  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||| |||  |||| | || ||||| || ||  ||||    
T  22082424 actttttagaatgacagcttgaatgctcaattaggttttgaagtctcccttatatactaaagcagctcgggtcaaatac-tttgttggactccagaacaa 22082326  T
Q  285 agcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtc 340  Q
    | |||| | || ||||| || |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  22082325 aacagatc-gtccagctgatatgcaaaacaagaatcagagacaaatatggaaagtc 22082271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 85 - 342
Target Start/End: Original strand, 23624203 - 23624456
Alignment:
Q  85 cacagacgatacaagaaaggatcacgatata-ggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatcta 183  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| ||| | ||| ||| |||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||| |||  ||||||||  |||    
T  23624203 cacaaacgatacaagaaaggctcacaataaaaggtactagacttgcatca-acatgatacaagaatagaacacatgtagacccaa--ccctaaaag-cta 23624298  T
Q  184 aactttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaataca 283  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||  |||| |  | ||||||||||| ||||    
T  23624299 aactttttagaatgacggcttgaatagttcattaggtcttgaagtctcctttatatactgaagcagctcgggtcaaatactcttgttgggcttcagtaca 23624398  T
Q  284 aagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    || |||| | ||  |||| |||||||||||| |||||| | ||||| | ||||||||||    
T  23624399 aaacagatc-gtctagctgatctgcaaaacaggaatcagagacaaaaaagaaaagtcct 23624456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 118 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 22246158 - 22245937
Alignment:
Q  118 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 217  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| | |   |||| ||||||||| ||||||||||||||   |||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  22246158 ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcaaaatccatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaac--ttttagaatgacgacttgaatgaacaatta 22246062  T
Q  218 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaag 316  Q
    ||||||||||||  ||||||||||   ||||||||||| |||| | | | |||||||||||  | || ||||| ||||||| | ||||||||||||| ||    
T  22246061 ggtcttgaagtcttccttatatactatagcagcttgggctaaa-taactcgttgggcttcagcaaaatgcagatcggttcaacttaatctgcaaaacgag 22245963  T
Q  317 aatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||    
T  22245962 aatcaaaaacaaatctggaaagtcct 22245937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 25105244 - 25105113
Alignment:
Q  118 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 217  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||   |||||| |||| |||||||||||  |||||    
T  25105244 ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagtagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaac--ttttagaatgatggcttgaatgaaaaatta 25105148  T
Q  218 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagctt 252  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  25105147 ggtcttgaagtcttccttatatactgaagcagctt 25105113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 118 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 25164337 - 25164206
Alignment:
Q  118 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 217  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||   |||||| |||| |||||||||||  |||||    
T  25164337 ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagtagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaac--ttttagaatgatggcttgaatgaaaaatta 25164241  T
Q  218 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagctt 252  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  25164240 ggtcttgaagtcttccttatatactgaagcagctt 25164206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 224
Target Start/End: Original strand, 18221466 - 18221573
Alignment:
Q  115 aggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaa 214  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  18221466 aggtactaaacttgcatca-acatgatacaagaatagaacacatgaagactcaaaaccctaaaag-ctaaactttttagaatgtccgcttgaatgatcaa 18221563  T
Q  215 ttaggtcttg 224  Q
    ||||||||||    
T  18221564 ttaggtcttg 18221573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 25105113 - 25105038
Alignment:
Q  269 ttgggcttcaata-caaagcagaccggttcagct-aatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  25105113 ttgggcttcaataacaatgcagatcggttcagcttaatctgcaaaacaagaatcagaaacaaatctggaaagtcct 25105038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 25164206 - 25164131
Alignment:
Q  269 ttgggcttcaata-caaagcagaccggttcagct-aatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  25164206 ttgggcttcaataacaatgcagatcggttcagcttaatctgcaaaacaagaatcagaaacaaatctggaaagtcct 25164131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 120 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 20714537 - 20714412
Alignment:
Q  120 ctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattagg 219  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||   | ||||||||||||||||| ||| ||||||    ||||||| ||||||  |||||||||    
T  20714537 ctaaacttgcatca-acacgatacaagagtaga-cacacaaaaactcaaaaccctaaaaa-ctagacttttagaaatgacggtttgaatattcaattagg 20714441  T
Q  220 tcttgaagtcgcccttatataccgaagca 248  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  20714440 tcttgaagtcttccttatatactgaagca 20714412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 85 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 16453 - 16208
Alignment:
Q  85 cacagacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaa 184  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | |  ||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  16453 cacaaacgatacaagaaaggatcacaaaa--ggttctaaactcgcatcacaaacgatacaagaatagagcacatgtaaattcaaaaccctaaaaatctaa 16356  T
Q  185 actttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaa 284  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||  ||||    
T  16355 actttttaatatgacggcttgaatgaacaattaggtcctgaagtcccccttatatattgaagcatcttgggctaaatac-ttagttgggcttcagcacaa 16257  T
Q  285 agcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatg 333  Q
    ||||||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16256 agcagattagttcagctaatctgcaaaacaagaatcagaaacaaatatg 16208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 22)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 85 - 342
Target Start/End: Original strand, 19634207 - 19634461
Alignment:
Q  85 cacagacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaa 184  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |  ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19634207 cacagacgatacaagaaaggctcacaaaa--ggttctagacttgcatcataaacgatacaagaatagagcacataaagactcaaaaccctaaaaatctaa 19634304  T
Q  185 actttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaa 284  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||  ||||    
T  19634305 actttttagtatgacggcttgaattaacaattaggtcttgaagtcttccttatatactgaagcaacttgggctaaatac-ttagttgggcttcagcacaa 19634403  T
Q  285 agcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    ||| || |  |||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  19634404 agctgatcaattcagcaaacctgcaaaacaagaatcagaaacaaatctggaaagtcct 19634461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 83 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18064044 - 18063785
Alignment:
Q  83 agcacagacgatacaagaaaggatcacgatat-aggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatc 181  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||| |||  ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  18064044 agcacaaacgatacaagaa-ggaacacaataagaggttctaaacttgcatcacaaacgatacatgagtagagcacataaagactcaaaaccgtaaaaatc 18063946  T
Q  182 taaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaata 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||| |||  ||||    |||||||||||||  |    
T  18063945 taaactttttagtatgacggcttgaatgaacaattaggtattgaagtcttccttatatactgaagcagctcgggccaaatattctagttgggcttcagca 18063846  T
Q  282 caaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||    
T  18063845 caaagcagatcggtttagctaatctgcaaaacaagaattagagacaaatatggaaagtcct 18063785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 118 - 342
Target Start/End: Original strand, 44452842 - 44453063
Alignment:
Q  118 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 217  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  44452842 ttctaaacttgcttcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaaactttttagaatgacggcttgaataa-caatta 44452939  T
Q  218 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaaga 317  Q
    ||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44452940 ggtcttgaagtctttcttatatactgaagcagcttgggctaaatac-ttagttgggcttcagcacaaagtagatcggttcagctaatctgcaaaacaaga 44453038  T
Q  318 atcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    |||| |||||||  |||||||||||    
T  44453039 atcagaaacaaaactgaaaagtcct 44453063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 118 - 342
Target Start/End: Original strand, 18548007 - 18548229
Alignment:
Q  118 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 217  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18548007 ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-ccttaaaaatctaaactttttagaatgacggcttgaatgaacaatta 18548105  T
Q  218 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaaga 317  Q
    ||| ||||||||  | |||||||| ||||||||||||| |||| |  |||| |||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  18548106 ggttttgaagtcttctttatatactgaagcagcttgggctaaa-tatttagatgggcttcagcacaaagcaaatcggttcagctaatctgcaaaacaaga 18548204  T
Q  318 atcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    |||| |||||||| || ||||||||    
T  18548205 atcagaaacaaatctggaaagtcct 18548229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 118 - 342
Target Start/End: Original strand, 24195882 - 24196106
Alignment:
Q  118 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 217  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24195882 ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagacgaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgaacaatta 24195980  T
Q  218 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaat-acaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaa 315  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||| | ||  |||||| |||| | |||| | ||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  24195981 ggtcttgaagtcttccttatatactgaagcagcttgggctaaa-taatatgttgggtttcagtaacaatgtagatcagttcagcttaatctgcaaaacaa 24196079  T
Q  316 gaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||    
T  24196080 gaatcagaaacaaatttgaaaagtcct 24196106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 118 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 18483173 - 18482951
Alignment:
Q  118 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 217  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |  ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||    
T  18483173 ttctaaacttgcatcacaaatgatacaagagcataatacataaagactcaaa-ccctaaaaatctaaactttt-agaatgacgacttgaatgaacaatta 18483076  T
Q  218 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaag 316  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| ||| |||||||  | || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  18483075 ggtcttgaagtcttccttatatactgaagcagcttgggctaaa-taattcgtttggcttcagcataatgcagatcggttcagcttaatctgcaaaacaag 18482977  T
Q  317 aatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||    
T  18482976 aatcggaaacaaatctgaaaagtcct 18482951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 115 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 18034701 - 18034555
Alignment:
Q  115 aggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaa 214  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  18034701 aggttctaaacttgcatcacaaacaatacaagagtagagcacataaagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgaaaaa 18034602  T
Q  215 ttaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaat 261  Q
    |||||||||||||||   ||||||||| |||| |||| ||| |||||    
T  18034601 ttaggtcttgaagtcttacttatatactgaagaagctcgggctaaat 18034555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 115 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 13515400 - 13515263
Alignment:
Q  115 aggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaa 214  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13515400 aggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatagagcacataaagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgataaa 13515301  T
Q  215 ttaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagctt 252  Q
    ||| |||||||||||  ||||||| || ||||||||||    
T  13515300 ttaagtcttgaagtcttccttataaactgaagcagctt 13515263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 85 - 342
Target Start/End: Original strand, 13791005 - 13791258
Alignment:
Q  85 cacagacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaa 184  Q
    ||||||||||||||||||| | |||    ||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  13791005 cacagacgatacaagaaagaa-cacagagtagattctaaacatgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaa 13791102  T
Q  185 actttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaa 284  Q
       |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||| | | | |||||||||||  | ||    
T  13791103 c--ttttagaatgacggcttgaataatcaattaggtcttgaagtcttccttatatactgaagcagcttgggctaaa-taaatcgttgggcttcagcaaaa 13791199  T
Q  285 agcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||    
T  13791200 tgcagatcggttcagcttaatctgcaaaacaagaattagaaacaaatctggaaagtcct 13791258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 121 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 23954356 - 23954136
Alignment:
Q  121 taaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggt 220  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| || |||  ||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  23954356 taaacttgcatcacaaacgatacaaaagcagaatacatgaagactcaaa-ccttgaaaatctaaactttt-agaatgacggcttgaatgaacaattaggt 23954259  T
Q  221 cttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaat-acaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaagaa 318  Q
    |||||||||  | |||||||| ||||||| ||||| |||| | ||  ||||||||||| | |||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23954258 cttgaagtcttctttatatactgaagcagtttgggctaaa-taatatgttgggcttcagtaacaatggagatcggttcagcttaatctgcaaaacaagaa 23954160  T
Q  319 tcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    ||| |||||||| || ||||||||    
T  23954159 tcaaaaacaaatctggaaagtcct 23954136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 168 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 7028824 - 7028649
Alignment:
Q  168 aaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcatta 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||| |||| | ||      
T  7028824 aaaccctaaaaatctaaactttttaatatgacggcttaaataaacaattaggtcttgaagtcttccttatgtactgaagcagcttgggctaaa-taatac 7028726  T
Q  268 gttgggcttcaat-acaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    ||||||||||| | | || ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  7028725 gttgggcttcagtaataatgcagatcggttcaacttaatctgcaaaacaagaatcagaaacaaatctggaaagtcct 7028649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 118 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15635672 - 15635562
Alignment:
Q  118 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 217  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15635672 ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgaacaatta 15635574  T
Q  218 ggtcttgaagtc 229  Q
    | ||||||||||    
T  15635573 gttcttgaagtc 15635562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 123 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 1919039 - 1918822
Alignment:
Q  123 aacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtct 222  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  1919039 aacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaac--ttttagaatgacggcttgaatgaacaattaggtct 1918943  T
Q  223 tgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaat-acaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaagaatc 320  Q
    | |||||  |||||||||| ||||||||||||| |||| | ||  ||||||||||| | |||| ||| |   ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  1918942 taaagtcttccttatatactgaagcagcttgggctaaa-taatatgttgggcttcagtaacaatgcatattagttcaacttaatctgcaaaacaagaatc 1918844  T
Q  321 ataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    | |||||||| || ||||||||    
T  1918843 aaaaacaaatctggaaagtcct 1918822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 118 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 17135944 - 17135726
Alignment:
Q  118 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 217  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||   |||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  17135944 ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaac--ttttagaatgatggcttgaatgaacaatta 17135848  T
Q  218 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaat-acaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaa 315  Q
    ||||||||||||    |||||||| ||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||| | |||| |||||  |||| ||| |||||| ||||||||    
T  17135847 ggtcttgaagtc-ttattatatactgaagcagcttgggctaaa-taattcgttgggcttcagtaacaatgcagattggtttagcttaatcttcaaaacaa 17135750  T
Q  316 gaatcataaacaaatatgaaaagt 339  Q
    |||||| |||||||| || |||||    
T  17135749 gaatcaaaaacaaatctggaaagt 17135726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 118 - 226
Target Start/End: Original strand, 17702765 - 17702872
Alignment:
Q  118 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 217  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||  |||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  17702765 ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagacgagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaaactttttagtatgatggcttgaatgaacaatta 17702863  T
Q  218 ggtcttgaa 226  Q
    || ||||||    
T  17702864 gggcttgaa 17702872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 193
Target Start/End: Original strand, 295808 - 295885
Alignment:
Q  115 aggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttag 193  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  295808 aggttctaaacttacatca-acatgatataagagtagagcacatgtagaatcaaaatcctaaaaatctaaaatttttag 295885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 85 - 248
Target Start/End: Original strand, 28051463 - 28051626
Alignment:
Q  85 cacagacgatacaagaaaggatcacgatata-ggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatcta 183  Q
    |||| |||| |||||||||| |||| ||| | |||  ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || | |||    
T  28051463 cacaaacgacacaagaaaggctcacaataaaaggtaataaacttgcatca-acatgatacaagaatagaacacatgtagactcaaaaccct-aacagcta 28051560  T
Q  184 aactttttagtatgacggcttgaa-tgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagca 248  Q
    |||||||| | |||||| |||||| || |  |||||||||||||||| | | ||||||| ||||||    
T  28051561 aacttttttgaatgacgtcttgaattgtttcattaggtcttgaagtcactcatatatactgaagca 28051626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 281 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 13515258 - 13515201
Alignment:
Q  281 acaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaag 338  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13515258 acaaagtagatcggctcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatggaaag 13515201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 21253754 - 21253577
Alignment:
Q  161 agactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataa- 259  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||| |||  | |||||||| ||||||   |||| |||     
T  21253754 agactcaaaaccctacaaa-ctaaactttttagaatgagggcttgaatgaataattaggtcttgatgtcttcattatatactgaagcaatatgggctaat 21253656  T
Q  260 attcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtc 340  Q
    |  | ||| ||||||||||  |||||||||| | || ||||||||||||||||| || |||| | ||||| ||| ||||||    
T  21253655 aaacctta-ttgggcttcagaacaaagcagatc-gtccagctaatctgcaaaaccagtatcagagacaaaaatggaaagtc 21253577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 120 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 6579346 - 6579238
Alignment:
Q  120 ctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaa-ctttttagtatgacggcttgaatgatcaattag 218  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||   |||  ||||||    
T  6579346 ctaaacttgcatca-acacgatacaagagtagaacacacaaagactcaaaaccctaaaaa-ctaaacctttttagtttgacggcttcggtgacaaattag 6579249  T
Q  219 gtcttgaagtc 229  Q
    |||||||||||    
T  6579248 gtcttgaagtc 6579238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17042551 - 17042443
Alignment:
Q  120 ctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattagg 219  Q
    |||||||||||||| | | | |||||||||||| ||||   ||||||||||||||| |||   |||||||||||| |||||||||||||||  |||||      
T  17042551 ctaaacttgcatca-acacgttacaagagtagaacacacaaagactcaaaaccctacaaactaaaactttttagtttgacggcttgaatgaataattaaa 17042453  T
Q  220 tcttgaagtc 229  Q
    ||||||||||    
T  17042452 tcttgaagtc 17042443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 303 - 342
Target Start/End: Original strand, 28051680 - 28051719
Alignment:
Q  303 atctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28051680 atctgcaaaacaagaatcagaaacaaatatggaaagtcct 28051719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 126; Significance: 6e-65; HSPs: 16)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 113 - 342
Target Start/End: Original strand, 4246390 - 4246617
Alignment:
Q  113 ataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatc 212  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| | |  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  4246390 atagattctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcaaaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaaactttttagtatggcggcttgaatgaac 4246488  T
Q  213 aattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4246489 aattaggtcttgaagtcttctttatatactgaagcagcttgggctaaa-taattagttgggcttcagcacaaagcagatcggttcagctaatctgcaaaa 4246587  T
Q  313 caagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  4246588 caagaatcagaaacaaatattgaaagtcct 4246617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 115 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 20841068 - 20840842
Alignment:
Q  115 aggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaa 214  Q
    ||||| || |||||||||| ||| ||||||||| || |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20841068 aggttatagacttgcatcacaaacgatacaagaatatagcacataaagactcaaaacactaaaaatctaaactttttagtatgacggcttaaatgatcaa 20840969  T
Q  215 ttaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaaca 314  Q
    ||||||||||||||    ||||||||  |||| |||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  20840968 ttaggtcttgaagtatttcttatatattgaagaagcttgggctaaatac-ttagttgggcttcagtacaaagcagatcagttcagctaatctacaaaaca 20840870  T
Q  315 agaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20840869 agaatcagaaacaaatatggaaagtcct 20840842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 157 - 342
Target Start/End: Original strand, 24986379 - 24986564
Alignment:
Q  157 atgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttggga 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||     
T  24986379 atgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagaatgacggcttgaatgatctattaggtcttgaagtctcccttatatactgaagcagcttgggc 24986478  T
Q  257 taaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    ||||| | ||||||| ||||||  | |||||| | ||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24986479 taaatactttagttgcgcttcagaaaaaagcaaatcggttcagctaatctacaaaacagaaatcagaaacaaatatggaaagtcct 24986564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 85 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 26972233 - 26971977
Alignment:
Q  85 cacagacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaa 184  Q
    ||||||||||||||||||| | |||   |||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  26972233 cacagacgatacaagaaagaa-cacacaatagattctaaacttgaatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaa 26972136  T
Q  185 actttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgccc---ttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaat- 280  Q
    ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||   |||||||| ||||||||||||| |||| | ||| ||||||||| | |     
T  26972135 actatttagtatgacggcttgaatcaacaattaggtcttgaagtcttccttattatatactgaagcagcttgggctaaa-taatttgttgggctttagta 26972037  T
Q  281 acaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagt 339  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26972036 acaatgcagatcggttcagcttaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatggaaagt 26971977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 118 - 342
Target Start/End: Original strand, 13165752 - 13165975
Alignment:
Q  118 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 217  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||| |||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  13165752 ttctaaacttgcatcacaaccgatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaaactttttagtatgacgacttgaatgaacaatta 13165850  T
Q  218 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaag 316  Q
     |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||| |||| | |||  |||||||||| || || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13165851 tgtcttgaagtcttccttatatactgaagcaacttgggctaaa-taattcattgggcttcagtaaaatgcagatcggttcagcttaatctgcaaaacaag 13165949  T
Q  317 aatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    ||| | |||||||| || ||||||||    
T  13165950 aattagaaacaaatctggaaagtcct 13165975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 186 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 20200820 - 20200677
Alignment:
Q  186 ctttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaa 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||| |||||||||| || ||||| | |||||| |||||||  |||||    
T  20200820 ctttttagtatgacggcttgaatgatcaattatgtcttgaagtcttcgttatatactgaagcagcttaggctaaatac-ttagttaggcttcagcacaaa 20200722  T
Q  286 gcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaat 330  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20200721 gcagatcggttcagctaatctgcaaaacaagaatcatatacaaat 20200677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 139 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 17851155 - 17850954
Alignment:
Q  139 gatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttata 238  Q
    |||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  17851155 gatacaagagtagaacacacaaagactcaaaaccctaaaaa-ctacactttttagaatgacggcttgaataatcaattaggtcttgaagtcttccttata 17851057  T
Q  239 taccgaagcagcttgggataa-attcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaa 337  Q
    ||| |||| |   |||| ||| |  | || |||||||||||  |||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||| |||    
T  17851056 tactgaagaaatatgggctaataaacctt-gttgggcttcagaacaaagcaaatc-gtccagctaatctgcaaaacaagaatcagagataaaaatggaaa 17850959  T
Q  338 gtcct 342  Q
    |||||    
T  17850958 gtcct 17850954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 231 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 11667592 - 11667481
Alignment:
Q  231 cccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaat 330  Q
    ||||||||||| ||||||||||||   |||| | ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  11667592 cccttatatactgaagcagcttggaccaaatactttagttgggcttcaaaacaaagcagatcagttcagctaacctgcaaaacaagaattagaaacaaat 11667493  T
Q  331 atgaaaagtcct 342  Q
    ||| ||| ||||    
T  11667492 atggaaaatcct 11667481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 85 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 11667694 - 11667607
Alignment:
Q  85 cacagacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaacc 172  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  11667694 cacaaacgatacaagaaaggatcacaataaaggttctaaacttgaatcacaaacgatacaaaagtagaacacatgtagactcaaaacc 11667607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 92 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 23477761 - 23477630
Alignment:
Q  92 gatacaagaaaggatcacgatata-ggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttt 190  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||| |  |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  23477761 gatacaagaaaggatcacaataaaaggtactaaacttgcatcaca--tgatacaagaatagaacacatgaagactcaaaaccct-aaaagataaactttt 23477665  T
Q  191 tagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttga 225  Q
    ||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  23477664 tagaatgacggcttgaataatacattaggtcttga 23477630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 14745589 - 14745481
Alignment:
Q  113 ataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatc 212  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||| |||||| ||||||||||| |||||   |||||| |||||||||||||||| |    
T  14745589 atagattctaaacttgcatcacaaatgatacaagagaagaatacatgaagactc-aaaccctaaaattctaa--cttttagaatgacggcttgaatgaac 14745493  T
Q  213 aattaggtcttg 224  Q
    ||||||||||||    
T  14745492 aattaggtcttg 14745481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 229
Target Start/End: Original strand, 12753422 - 12753530
Alignment:
Q  120 ctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaacttttt-agtatgacggcttgaatgatcaattag 218  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||   ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||    
T  12753422 ctaaacttgcatca-acacgatacaagagtagaacacacaaagactaaaaaccctaaaaa-ctaaacttttttagtttgacggcttgaatgaataattag 12753519  T
Q  219 gtcttgaagtc 229  Q
    |||||||||||    
T  12753520 gtcttgaagtc 12753530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 120 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15803908 - 15803809
Alignment:
Q  120 ctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattagg 219  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||   | |||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  15803908 ctaaacttgcatca-acacgatacaagagtagaacacacaaatactcaaaatcctaaaa-tctagactttttagaatgacggcttgaataatcaattagg 15803811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 228
Target Start/End: Original strand, 1625938 - 1626042
Alignment:
Q  120 ctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattagg 219  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||  ||| ||||||    |||||||||||||| ||||||||||    
T  1625938 ctaaacttgcatca-acacgatacaagagtaga-cacacaaagactcaaaaccctaaaa--ctagacttttagaaatgacggcttgaataatcaattagg 1626033  T
Q  220 tcttgaagt 228  Q
    |||||||||    
T  1626034 tcttgaagt 1626042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 25349959 - 25349874
Alignment:
Q  162 gactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagca 248  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||     ||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||    
T  25349959 gactcaaaaccctaaaaa-ctaatctttttagaatgatggcttgaatacctgattaggtcttgaagtcttccttttatactgaagca 25349874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 85 - 133
Target Start/End: Original strand, 24986324 - 24986372
Alignment:
Q  85 cacagacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatca 133  Q
    |||| |||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  24986324 cacaaacgatacaagtaaggctcacaataaaggttctaaacttgcatca 24986372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 118 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 25479 - 25256
Alignment:
Q  118 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 217  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  25479 ttctaaacgtgcatcacaaacgatacacgagtagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaacctttttagtatgacgacttgaatgaacaatta 25381  T
Q  218 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaag 316  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  25380 ggtcttgaagtcttccttatatactgaagcagcttgggctaaa-taattcgttgggcttcagtaaaatgcagatcggttcagcttaatctgcaaaacaag 25282  T
Q  317 aatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||    
T  25281 aatcagaaacaaatctggaaagtcct 25256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 85 - 342
Target Start/End: Original strand, 6233 - 6488
Alignment:
Q  85 cacagacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaa 184  Q
    ||||| ||||||||| ||||  |||  || || |||||||||||||||| | |||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6233 cacaggcgatacaagtaaggcacacagtaaagattctaaacttgcatca-acatgatacaagaacagaatacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaa 6331  T
Q  185 actttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaa 284  Q
    | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    || ||||| ||||||||||||| ||||| | || ||||||||| | |||||    
T  6332 attttttagtatgacggcttaaatgagcaattaggtcttgaagtcttgtttttatactgaagcagcttgggctaaatac-ttcgttgggctttagtacaa 6430  T
Q  285 agcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||   | |||||||||||| |||||||||||    
T  6431 agcagatcggttcagctaatctgcaaaactgaattcataaacaaatctgaaaagtcct 6488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 118 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 2168 - 1958
Alignment:
Q  118 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 217  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  2168 ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-ccttgaaaatctaaactttt-agaatgacggcttgaataatcaatta 2071  T
Q  218 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaag 316  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| |||| | ||| |||||||||||  |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  2070 ggtcttgaagtcttccttatatactgaagcagtttgggctaaa-taatttgttgggcttcagcacaaagcatatcggttcagcttaatctgcaaaacaag 1972  T
Q  317 aatcataaacaaat 330  Q
    ||||| ||||||||    
T  1971 aatcagaaacaaat 1958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 8)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 85 - 342
Target Start/End: Original strand, 12910819 - 12911073
Alignment:
Q  85 cacagacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaa 184  Q
    ||||||||||||||||||| | |||    ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  12910819 cacagacgatacaagaaagaa-cacacactagattctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaa 12910916  T
Q  185 actttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaa 284  Q
    |||||| |  |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||| ||||| |||| | ||| |||||||||||  ||||    
T  12910917 actttt-ataatgacggcttgaataaacaattaggtcttgaaatcttccttatatactgaagcagtttgggctaaa-taattcgttgggcttcagcacaa 12911014  T
Q  285 agcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  12911015 tgcagatcggttcagcttaatctgcaaaacaaaaatcagaaacaaatctggaaagtcct 12911073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 118 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 24789960 - 24789737
Alignment:
Q  118 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 217  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  24789960 ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagtagaatacacgaagactcaaa-ccctaaaaatctaaactttt-agaatgacggcttgaatgaacaatta 24789863  T
Q  218 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaat-acaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaa 315  Q
    ||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||| |||| | ||  ||||||||||| | |||| ||| |  | |||||| |||||||||||||||    
T  24789862 ggtcttgaagtcttacttatatactgaagcagcttgggctaaa-taatatgttgggcttcagtaacaatgcaaatggattcagcttaatctgcaaaacaa 24789764  T
Q  316 gaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||    
T  24789763 gaatcagaaacaaatctggaaagtcct 24789737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 113 - 342
Target Start/End: Original strand, 22611245 - 22611472
Alignment:
Q  113 ataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatc 212  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| | |||||||  |||  ||||| ||||||||| || |||||||||||   |||||| ||||||||||||| || |    
T  22611245 atagattctaaacttgcataacaaacggtacaagaacagaatacatgaagactcaaa-ccgtaaaaatctaac--ttttagaatgacggcttgaaggaac 22611341  T
Q  213 aattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaa-gcagaccggttcagc-taatctgcaa 310  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||| |||| | ||  ||||||||||| || ||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22611342 aattaggtcttgaagtcttccttatatactgaagcaccttgggctaaa-taatacgttgggcttcagtaaaaatgcagatcggttcagcttaatctgcaa 22611440  T
Q  311 aacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22611441 aacaagaatcataaacaaatttggaaagtcct 22611472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 85 - 330
Target Start/End: Original strand, 23758951 - 23759193
Alignment:
Q  85 cacagacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaa 184  Q
    ||||||||||||||||||| || ||    ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  23758951 cacagacgatacaagaaagaat-acacagtagattctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactc-aaaccctaaaaatctaa 23759048  T
Q  185 actttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaat-aca 283  Q
       |||||| |||||||||||||||  |||||||||||| || ||  |  ||| ||| ||||||||||||| |||| | ||  ||||||||||| | |||    
T  23759049 --cttttagaatgacggcttgaatgtgcaattaggtcttcaactcttctatatgtactgaagcagcttgggctaaa-taatacgttgggcttcagtaaca 23759145  T
Q  284 aagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaagaatcataaacaaat 330  Q
    | ||||| || |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  23759146 atgcagatcgtttcagcttaatctacaaaacaagaatcagaaacaaat 23759193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 140 - 246
Target Start/End: Original strand, 21530762 - 21530867
Alignment:
Q  140 atacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatat 239  Q
    ||||||||||||| ||||   | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||| |||    
T  21530762 atacaagagtagaacacacaaaaactcaaaaccctaaaaa-ctaaactttttagaatgacagcttgaatattcaattaggtcttgaagtcttccttttat 21530860  T
Q  240 accgaag 246  Q
    || ||||    
T  21530861 actgaag 21530867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 321
Target Start/End: Original strand, 15328723 - 15328885
Alignment:
Q  161 agactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatga----tcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttggga 256  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||    ||||||||||||||| |||  |||| ||||| ||||||||| |||     
T  15328723 agactcaaaaccctaaaaa-ctaaactttttagaatgacgggttgaatgaataatcaattaggtcttgatgtcttccttttatactgaagcagctcgggt 15328821  T
Q  257 taaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatca 321  Q
     ||||    | |||||||||||  ||||| |||| | || ||||| |||||||||||| ||||||    
T  15328822 caaatattcttgttgggcttcagaacaaaacagatc-gtccagctgatctgcaaaacaggaatca 15328885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 248
Target Start/End: Original strand, 19445002 - 19445088
Alignment:
Q  161 agactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaat-gatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagca 248  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||    
T  19445002 agactcaaaaccctaaaaa-ctaaactttttagaatgacggctagaatagat-aattaggtcttgaagtcttccttttatactgaagca 19445088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 19466280 - 19466225
Alignment:
Q  163 actcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattagg 219  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19466280 actcaaaaccctaaaag-ctagactttttagaatgacggcttgaatgatcaattagg 19466225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 113 - 330
Target Start/End: Original strand, 36945 - 37159
Alignment:
Q  113 ataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatc 212  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |    
T  36945 atagattctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaaactttt-agaatgacagcttgaatgaac 37042  T
Q  213 aattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaa 312  Q
    |||||||||||||||||  |||| || ||  ||| ||| |||| |||||  ||| ||||||| |||  |||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  37043 aattaggtcttgaagtcttccttctagactaaagtagcatgggctaaata-attcgttgggcctcagcacaaagcaaatcggttcagctagtctgcaaaa 37141  T
Q  313 caagaatcataaacaaat 330  Q
    ||||||||||||||||||    
T  37142 caagaatcataaacaaat 37159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 113 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 110065 - 109837
Alignment:
Q  113 ataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatc 212  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||| ||||||| |  |||  ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||| |    
T  110065 atagattctaaactttcatcacaaacgatacaaaaacagaatacatgaagactcaaa-ccctaataatctaaactttt-agaatgacggtttgaatgaac 109968  T
Q  213 aattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaat-acaaagcagaccggttcagc-taatctgcaa 310  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||| | |||| ||| |  |||||||| ||||||||||    
T  109967 aattaggtcttgaagtcttccttatatactgaagcagcttgggctaaa-taattcgttgggcttcagtaacaatgcatattggttcagcttaatctgcaa 109869  T
Q  311 aacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  109868 aacaagaatcagaaacaaatctggaaagtcct 109837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 113 - 330
Target Start/End: Original strand, 159426 - 159640
Alignment:
Q  113 ataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatc 212  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  | | | ||||||||| || |||||||||||   |||||| |||||||||||||||  |    
T  159426 atagattctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatatacgaagactcaaagcc-taaaaatctaac--ttttagaatgacggcttgaatggac 159522  T
Q  213 aattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaa 311  Q
    |||||||||||||||||  | |||| ||| |||||| |||||| |||| | ||| ||||||||||| || || ||||| |||||| || |||||||||||    
T  159523 aattaggtcttgaagtcttctttatgtactgaagcaacttgggctaaa-taattcgttgggcttcagtaaaatgcagatcggttcggcttaatctgcaaa 159621  T
Q  312 acaagaatcataaacaaat 330  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  159622 acaagaatcagaaacaaat 159640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 118 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 12311 - 12183
Alignment:
Q  118 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 217  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||| ||||||    
T  12311 ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaaactttt-agagtgacgacttgaatgagcaatta 12214  T
Q  218 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagca 248  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  12213 ggtcttgaagtcttccttatatactgaagca 12183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 168 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 357046 - 356885
Alignment:
Q  168 aaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcatta 267  Q
    |||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||| |||| | |||     
T  357046 aaaccctaaaaatctaac--ttttagaatgacggcttgaataatcaattaggttttgaagtcttccttatatactaaagcagcttgggctaaa-taattt 356950  T
Q  268 gttgggcttcaat-acaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaagaatcataaacaaat 330  Q
    | ||||||||| | |||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  356949 gatgggcttcagtaacaatgcagatcggttcagcttaatcttcaaaacaagaatcagaaacaaat 356885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 85 - 240
Target Start/End: Original strand, 2247 - 2398
Alignment:
Q  85 cacagacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaa 184  Q
    |||||||||||||||||  || |||   |||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  2247 cacagacgatacaagaa--gaacacacaatagattctaaacttgcgtcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagacttaaa-ccctaaaaatctaa 2343  T
Q  185 actttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatata 240  Q
    |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  2344 actttt-agaatgacggcttgaatgaacaattaggtcttgaagtcttccttatata 2398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 59; Significance: 6e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 85 - 250
Target Start/End: Original strand, 26730 - 26895
Alignment:
Q  85 cacagacgatacaagaaaggatcacgatata-ggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatcta 183  Q
    |||| ||||||||||||||| || | ||| | ||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||    |    
T  26730 cacatacgatacaagaaaggctcgcaataaaaggtactaaacttgcatca-acatgatacaagaatagaacacatgaagacttaaaaccctaaaagctaa 26828  T
Q  184 aactttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagc 250  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||| ||||||||    
T  26829 aactttttagaatgatggcttgaataatcaattaggtcttgatgtcttccttttatactgaagcagc 26895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 200 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 48113 - 47970
Alignment:
Q  200 ggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaat-acaaagcagaccggttca 298  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||| | ||  ||||||||||| | |||  ||| | |||||||    
T  48113 ggcttgaataatcaattaggtcttgaagtcttccttatatactgaagcagcttgggctaaa-taatacgttgggcttcagtaacagtgcaaatcggttca 48015  T
Q  299 gc-taatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    || |||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  48014 gcttaatatgcaaaacaagaatcaaaaacaaatctggaaagtcct 47970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 247 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 16998 - 16904
Alignment:
Q  247 cagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 342  Q
    ||||||||| ||||| | ||| |||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16998 cagcttgggttaaatac-ttatttggacttcagcacaaagcagatcggttcagctaatctgcgaaacagaaatcagaaacaaatatgaaaagtcct 16904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 17082 - 16992
Alignment:
Q  115 aggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttg 205  Q
    |||||||| || ||||||| ||| ||||||||| || |||||||  |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17082 aggttctagacctgcatcacaaacgatacaagaataaagcacataaagactcaaaaaccaataaatctaaactttttagtatgacagcttg 16992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 1022 times since January 2019
Visitors: 5823