View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0808_low_49 (Length: 268)

Name: NF0808_low_49
Description: NF0808
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0808_low_49
NF0808_low_49
[»] chr6 (36 HSPs)
chr6 (14-268)||(8465249-8465503)
chr6 (16-268)||(20465472-20465724)
chr6 (19-268)||(12039286-12039535)
chr6 (44-268)||(19077502-19077724)
chr6 (44-268)||(17234953-17235175)
chr6 (44-247)||(19171774-19171976)
chr6 (44-256)||(25969700-25969909)
chr6 (44-256)||(25974140-25974349)
chr6 (44-268)||(13195683-13195905)
chr6 (14-181)||(17864090-17864256)
chr6 (44-268)||(19100258-19100478)
chr6 (44-268)||(23879245-23879466)
chr6 (47-202)||(14259278-14259431)
chr6 (16-268)||(33666124-33666373)
chr6 (44-256)||(17527474-17527686)
chr6 (39-265)||(9281291-9281513)
chr6 (17-247)||(21723006-21723233)
chr6 (81-268)||(19894248-19894432)
chr6 (18-268)||(29253260-29253508)
chr6 (44-256)||(13869992-13870198)
chr6 (173-268)||(20653555-20653650)
chr6 (44-144)||(25965053-25965151)
chr6 (65-174)||(23882369-23882477)
chr6 (39-268)||(17855551-17855776)
chr6 (41-132)||(20989477-20989568)
chr6 (160-268)||(12028721-12028828)
chr6 (192-268)||(25805913-25805989)
chr6 (207-268)||(17876332-17876393)
chr6 (41-114)||(25805809-25805882)
chr6 (46-155)||(24542014-24542122)
chr6 (208-268)||(28623157-28623217)
chr6 (191-266)||(20989370-20989445)
chr6 (88-155)||(15930538-15930603)
chr6 (87-155)||(21322968-21323035)
chr6 (121-174)||(17869587-17869640)
chr6 (121-174)||(17879339-17879392)
[»] chr7 (20 HSPs)
chr7 (18-268)||(20991874-20992124)
chr7 (16-268)||(29545719-29545966)
chr7 (14-268)||(16207459-16207710)
chr7 (39-268)||(12326164-12326392)
chr7 (44-268)||(11588822-11589046)
chr7 (44-268)||(4459098-4459320)
chr7 (44-268)||(11999241-11999462)
chr7 (16-244)||(15506598-15506822)
chr7 (44-268)||(645493-645717)
chr7 (44-254)||(14165526-14165732)
chr7 (14-268)||(11520990-11521241)
chr7 (16-187)||(15438427-15438598)
chr7 (16-176)||(16437105-16437265)
chr7 (46-172)||(26132600-26132722)
chr7 (16-172)||(10280141-10280296)
chr7 (46-154)||(10661224-10661331)
chr7 (221-259)||(15438611-15438649)
chr7 (46-154)||(20924798-20924903)
chr7 (88-174)||(21260834-21260919)
chr7 (47-152)||(42636581-42636685)
[»] scaffold0226 (3 HSPs)
scaffold0226 (15-268)||(17703-17956)
scaffold0226 (15-268)||(27097-27350)
scaffold0226 (14-268)||(7116-7370)
[»] chr8 (12 HSPs)
chr8 (16-268)||(27925031-27925281)
chr8 (39-268)||(45136464-45136692)
chr8 (18-230)||(13659988-13660199)
chr8 (18-230)||(13718631-13718842)
chr8 (44-267)||(23540986-23541207)
chr8 (14-268)||(33962068-33962322)
chr8 (14-268)||(33977387-33977640)
chr8 (44-268)||(22485491-22485714)
chr8 (16-172)||(24092288-24092443)
chr8 (142-268)||(22476635-22476761)
chr8 (65-174)||(25240742-25240848)
chr8 (105-238)||(26536706-26536839)
[»] chr4 (17 HSPs)
chr4 (16-268)||(15162062-15162314)
chr4 (22-268)||(10724597-10724843)
chr4 (22-268)||(10938366-10938612)
chr4 (16-268)||(15699914-15700163)
chr4 (39-268)||(18601238-18601464)
chr4 (44-268)||(28019662-28019884)
chr4 (44-268)||(23399774-23399996)
chr4 (44-268)||(25117215-25117437)
chr4 (14-256)||(16384220-16384459)
chr4 (14-180)||(10191216-10191379)
chr4 (44-268)||(33898587-33898808)
chr4 (46-174)||(15622799-15622924)
chr4 (46-151)||(19183378-19183481)
chr4 (66-155)||(19659819-19659907)
chr4 (66-155)||(33746298-33746387)
chr4 (89-174)||(32862050-32862134)
chr4 (46-155)||(9069306-9069414)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (14-268)||(8158-8412)
[»] chr5 (20 HSPs)
chr5 (14-268)||(23757835-23758086)
chr5 (14-268)||(23823291-23823542)
chr5 (44-257)||(23420146-23420357)
chr5 (39-268)||(24190215-24190444)
chr5 (44-256)||(22404352-22404562)
chr5 (44-255)||(9422107-9422315)
chr5 (41-268)||(38405717-38405942)
chr5 (16-268)||(30605270-30605520)
chr5 (52-268)||(22251619-22251832)
chr5 (88-268)||(26037181-26037359)
chr5 (16-268)||(26328793-26329043)
chr5 (16-266)||(22082271-22082517)
chr5 (44-268)||(22245937-22246158)
chr5 (16-268)||(23624208-23624456)
chr5 (44-178)||(25105113-25105244)
chr5 (44-178)||(25164206-25164337)
chr5 (41-150)||(18221466-18221573)
chr5 (195-268)||(25105038-25105113)
chr5 (195-268)||(25164131-25164206)
chr5 (46-174)||(20714412-20714537)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (16-259)||(16208-16448)
[»] chr3 (22 HSPs)
chr3 (14-268)||(19634210-19634461)
chr3 (41-268)||(18063785-18064012)
chr3 (44-268)||(44452842-44453063)
chr3 (44-268)||(18548007-18548229)
chr3 (44-268)||(24195882-24196106)
chr3 (44-268)||(18482951-18483173)
chr3 (41-187)||(18034555-18034701)
chr3 (41-178)||(13515263-13515400)
chr3 (44-268)||(13791037-13791258)
chr3 (47-268)||(23954136-23954356)
chr3 (94-268)||(7028649-7028824)
chr3 (44-155)||(15635562-15635672)
chr3 (49-268)||(1918822-1919039)
chr3 (44-265)||(17135726-17135944)
chr3 (44-152)||(17702765-17702872)
chr3 (41-119)||(295808-295885)
chr3 (47-174)||(28051500-28051626)
chr3 (207-264)||(13515201-13515258)
chr3 (87-266)||(21253577-21253754)
chr3 (46-155)||(6579238-6579346)
chr3 (46-155)||(17042443-17042551)
chr3 (229-268)||(28051680-28051719)
[»] chr1 (15 HSPs)
chr1 (39-268)||(4246390-4246617)
chr1 (41-268)||(20840842-20841068)
chr1 (83-268)||(24986379-24986564)
chr1 (14-265)||(26971977-26972230)
chr1 (44-268)||(13165752-13165975)
chr1 (112-256)||(20200677-20200820)
chr1 (65-268)||(17850954-17851155)
chr1 (157-268)||(11667481-11667592)
chr1 (18-151)||(23477630-23477761)
chr1 (16-98)||(11667607-11667689)
chr1 (39-150)||(14745481-14745589)
chr1 (46-155)||(12753422-12753530)
chr1 (46-147)||(15803809-15803908)
chr1 (46-154)||(1625938-1626042)
chr1 (88-174)||(25349874-25349959)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (44-268)||(25256-25479)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (44-268)||(6266-6488)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (44-256)||(1958-2168)
[»] chr2 (8 HSPs)
chr2 (44-268)||(12910851-12911073)
chr2 (44-268)||(24789737-24789960)
chr2 (39-268)||(22611245-22611472)
chr2 (44-256)||(23758983-23759193)
chr2 (66-172)||(21530762-21530867)
chr2 (87-247)||(15328723-15328885)
chr2 (87-174)||(19445002-19445088)
chr2 (89-145)||(19466225-19466280)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (39-256)||(36945-37159)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (39-268)||(109837-110065)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (39-256)||(159426-159640)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (44-174)||(12183-12311)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (94-256)||(356885-357046)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (39-166)||(2273-2398)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (16-176)||(26735-26895)
[»] scaffold0059 (1 HSPs)
scaffold0059 (126-268)||(47970-48113)
[»] scaffold0259 (2 HSPs)
scaffold0259 (173-268)||(16904-16998)
scaffold0259 (41-131)||(16992-17082)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 36)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 14 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 8465503 - 8465249
Alignment:
Q  14 agacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaact 113  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8465503 agacgatacaagaaagaatcacaatataggttctaaacttgcatcataaacgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccttaaaaatctaaact 8465404  T
Q  114 ttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagc 213  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8465403 ttttagtgtgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtctcccttatatactgaagcagcttgggctaaattcattagttgggcttcagtacaaagc 8465304  T
Q  214 agaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  8465303 atatcggttcagctaatctgcaaaacaagaatcagaaacaaatatggaaagtcct 8465249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 20465724 - 20465472
Alignment:
Q  16 acgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaacttt 115  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20465724 acgatacaagaaaggttcacaatataggttctaaacttgcatcacaaaagataaaagaatagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaacttt 20465625  T
Q  116 ttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcag 215  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  20465624 ttagtatgacaacttgaatgatcaatttgttcttgaagtctcccttatatactgtagcagcttgggctaaatactttagttgggcttcaacacaaagcag 20465525  T
Q  216 accggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20465524 atcagttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatggaaagtcct 20465472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 12039535 - 12039286
Alignment:
Q  19 atacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaacttttta 118  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12039535 atacaagaaaggatcacaaaataggttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaacttttta 12039436  T
Q  119 gtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagacc 218  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||  ||||| ||||||||  ||||||| |||||||||| |    
T  12039435 gtatgacgactttaatgaccaattaggtcttgaagtctcccttatatactaaagcagcttggactaaatacattagttatgcttcaacacaaagcagatc 12039336  T
Q  219 ggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
     ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12039335 agttcagctaatatgcaaaataagaatcataaacaaatatggaaagtcct 12039286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Original strand, 19077502 - 19077724
Alignment:
Q  44 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 143  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||| |||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  19077502 ttctaaacttgcatga-acatgatacaagagcagaatacataaagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtattacggcttgaatgaacaatta 19077600  T
Q  144 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaaga 243  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| || || | ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19077601 ggtcttgaagtcttccttatatactgaagcagcttgggctagatac-ttagttgggcttcagcacaaagcagatcggttcagctaatctgcaaaacaaga 19077699  T
Q  244 atcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||    
T  19077700 atcagaaacaaatagggaaagtcct 19077724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Original strand, 17234953 - 17235175
Alignment:
Q  44 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 143  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17234953 ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagact-aaaaccctaaagatctaaactttttagtatgacggcttgaatgaacaatta 17235051  T
Q  144 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaaga 243  Q
    ||||||||||||  | ||||||||  ||||| |||||| |||| | ||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17235052 ggtcttgaagtcttctttatatactaaagcaacttgggctaaa-taatttgttgggcttcagcacaaagcagatcggttcagctaatctgcaaaacaaga 17235150  T
Q  244 atcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    |||| |||||||| || ||||||||    
T  17235151 atcagaaacaaatctggaaagtcct 17235175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 44 - 247
Target Start/End: Original strand, 19171774 - 19171976
Alignment:
Q  44 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 143  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19171774 ttctaaacttacatcacaaacgatacaagagcagaatacataaagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 19171873  T
Q  144 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaaga 243  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| ||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||    
T  19171874 ggtcttggagtcttccttatatactgaagcggcttgggctaaatac-ttagttgggcttcagcacaaagcagattggttcagctaatctacaaaacatga 19171972  T
Q  244 atca 247  Q
    ||||    
T  19171973 atca 19171976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 44 - 256
Target Start/End: Original strand, 25969700 - 25969909
Alignment:
Q  44 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 143  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25969700 ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaacacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaa-ctttttagtatgacggcttgaatgaacaatta 25969797  T
Q  144 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaaga 243  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||  |||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  25969798 ggtcttgaagtcttccttatatactgaagcagcttgggctaaa-taattcgttgggcttcagcacattgcagatcggttcagctaagctgcaaaacaaga 25969896  T
Q  244 atcataaacaaat 256  Q
    |||| ||| ||||    
T  25969897 atcaaaaataaat 25969909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 44 - 256
Target Start/End: Original strand, 25974140 - 25974349
Alignment:
Q  44 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 143  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25974140 ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaacacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaa-ctttttagtatgacggcttgaatgaacaatta 25974237  T
Q  144 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaaga 243  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||  |||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  25974238 ggtcttgaagtcttccttatatactgaagcagcttgggctaaa-taattcgttgggcttcagcacattgcagatcggttcagctaagctgcaaaacaaga 25974336  T
Q  244 atcataaacaaat 256  Q
    |||| ||| ||||    
T  25974337 atcaaaaataaat 25974349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Original strand, 13195683 - 13195905
Alignment:
Q  44 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 143  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| || || | |  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  13195683 ttctaaacttgcatcacaaacgataaaatagcataatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaaactttttagtataacggcttgaataaacaatta 13195781  T
Q  144 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaaga 243  Q
    ||||||  ||||  | |||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  13195782 ggtcttacagtcttctttatatactgaagcagcttgggctaaatac-ttagttgggcttcagcacaaagcagatcggttctgctaatctgcaaaacaaga 13195880  T
Q  244 atcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    |||| |||||||| |||||||||||    
T  13195881 atcagaaacaaatctgaaaagtcct 13195905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 17864256 - 17864090
Alignment:
Q  14 agacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaact 113  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17864256 agacgatacaagaaaggctcacaataaaggttctaaacttgcatca-acatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccccaaaaatctaaact 17864158  T
Q  114 ttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttggg 181  Q
    || ||| ||||||||||||||||   ||||| ||||||| || ||||||||| | |||||||||||||    
T  17864157 ttatagaatgacggcttgaatgaatcattagttcttgaaatctcccttatatgctgaagcagcttggg 17864090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Original strand, 19100258 - 19100478
Alignment:
Q  44 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaa-tt 142  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| |  || ||    
T  19100258 ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaa-tctaaacttgttactatgacggcttgaataaaaaaatt 19100355  T
Q  143 aggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaag 242  Q
    |||||||||||||  |||||||  | ||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19100356 aggtcttgaagtcttccttata--ctgaagcagcttgggctaaatac-taagttgggcttcagcacaaagcagatcggttcagctaatctgcaaaacaag 19100452  T
Q  243 aatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    |||||||||||||| || ||||||||    
T  19100453 aatcataaacaaatctggaaagtcct 19100478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Original strand, 23879245 - 23879466
Alignment:
Q  44 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 143  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||| || |||    
T  23879245 ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-cccgaaaaatctaaactttt-agaatgacggcttgaatgaaca-tta 23879341  T
Q  144 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagct-aatctgcaaaacaag 242  Q
    ||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||| | || ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  23879342 ggtcttgaagtcttccttatatgctgaagcagcttgggctaaata-attcgttgggcttcaacaaaatgcagatcggttcagcttaatctgcaaaacaag 23879440  T
Q  243 aatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||    
T  23879441 aatcagaaacaaatctggaaagtcct 23879466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 47 - 202
Target Start/End: Original strand, 14259278 - 14259431
Alignment:
Q  47 taaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggt 146  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  14259278 taaacttgcatca-acatgatacaagagtagaatacataaagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttaatatgacgacttgaatgatcaattaggt 14259376  T
Q  147 cttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggctt 202  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  14259377 cttgaagtcttccttatatactgaagcagcttgggctaaatac-ttagttgggctt 14259431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 33666124 - 33666373
Alignment:
Q  16 acgatacaagaaaggat-cacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactt 114  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||| | |  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33666124 acgatacaagaaagaacacacgatata--ttctaaacttgcatcacaagcgatacaagagcataatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaaactt 33666220  T
Q  115 tttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagca 214  Q
    || || |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||  | || |||    
T  33666221 tt-agaatgatggcttgaataaacaattaggtcttgaagtcttccttatatactgaagcagcttgggctaaa-taatttgttgggcttcagcaaaatgca 33666318  T
Q  215 gaccggttcagc-taatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  33666319 gatcggttcagcttaatctgcaaaacaataatcagaaacaaatctggaaagtcct 33666373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 17527686 - 17527474
Alignment:
Q  44 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 143  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17527686 ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaattctaaactttttagtatgacggcttgaatgagcaatta 17527588  T
Q  144 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaat-acaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaa 241  Q
    |||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||| | | || ||| | ||||| ||| |||||||| ||||||    
T  17527587 ggtcttaaagtcttccttatatactgaagcagcttgggctaaa-taatttgttgggcttcagtaagaatgcatatcggtttagcttaatctgctaaacaa 17527489  T
Q  242 gaatcataaacaaat 256  Q
    |||||| ||| ||||    
T  17527488 gaatcagaaagaaat 17527474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 9281513 - 9281291
Alignment:
Q  39 ataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatc 138  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||| |||||| |||||||| |||| ||||| |||||| ||||| |||||||||| |    
T  9281513 atagattctaaacttgcatcacaaatgatacaagagcagaatacatgaagactc-aaaccctacaaatttaaac-ttttagaatgactgcttgaatgaac 9281416  T
Q  139 aattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaa 237  Q
    |||||||||||||||||  |||  ||||| ||||||||||||| |||| | | | ||||||||||| || || ||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  9281415 aattaggtcttgaagtcttcct--tatactgaagcagcttgggctaaa-taactcgttgggcttcagtaaaatgcagatcggttcagcttaatctgtaaa 9281319  T
Q  238 acaagaatcataaacaaatatgaaaagt 265  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||    
T  9281318 acaagaatcagaaacaaatctggaaagt 9281291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 21723233 - 21723006
Alignment:
Q  17 cgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttt 116  Q
    ||||||||||||||  |||  || || |||||||| ||||||| |||||||||||| | |||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21723233 cgatacaagaaaggcacacagtaaagattctaaacctgcatcaaaaatgatacaagtgcagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaaactttt 21723135  T
Q  117 tagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcaga 216  Q
     || |||||||| ||||| | |||||||| |||||||||  | |||||||| ||||||||||||| |||| | ||| ||||||||| | | ||||||| |    
T  21723134 -agaatgacggcatgaataaacaattagggcttgaagtcttctttatatactgaagcagcttgggctaaa-taattcgttgggctttagtgcaaagcaaa 21723037  T
Q  217 ccggttcagctaatctgcaaaacaagaatca 247  Q
      ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21723036 taggttcagctaatctgcataacaagaatca 21723006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 81 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 19894432 - 19894248
Alignment:
Q  81 acatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgg 180  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  19894432 acatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaaactttt-agaatgacagcttgaatgaacaattaggtcttgaagtcttccttatatactgaagcagcttgg 19894335  T
Q  181 gataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    | ||||   ||| ||||||||||| || || ||||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  19894334 gctaaa--aattcgttgggcttcagtaaaatgcagttcggttcagcttaatctgcaaaacaataatcagaaacaaatctggaaagtcct 19894248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 29253508 - 29253260
Alignment:
Q  18 gatacaagaaaggatcacgatata-ggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttt 116  Q
    ||||||||||||| |||| ||| | ||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  29253508 gatacaagaaaggctcacaataaaaggtactaaacttgcatca-acatgatacaagaatagaacacatgaagactcaaaatcctaaaag-ctaaactttt 29253411  T
Q  117 tagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcaga 216  Q
    ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||  |||  |||| ||||| ||||||||| |||  ||||    | |||||||||||| ||||| ||||    
T  29253410 tagaatgatggcttggatgatcaattaggtcttgttgtcttccttttatactgaagcagctcgggtcaaatattcttgttgggcttcaaaacaaaacaga 29253311  T
Q  217 ccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
     | || ||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||    
T  29253310 tc-gtccagctgatctgcaaaacaggaatcagagacaaatatggaaagtcct 29253260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 13870198 - 13869992
Alignment:
Q  44 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 143  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||  |||||   ||||||| |||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||  || |     
T  13870198 ttctaaacttgcgtcacaaacgatacaagagcagaatacatg---actcaaa-ccctaaaaatctaaacttgt-agaatgacagcttgaatgaataactg 13870104  T
Q  144 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaaga 243  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||| |||  ||| |||||  ||| |||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  13870103 ggtcttgaagtcttccttatatactgaagtagcacgggctaaata-atttgttgggcttcagcacaaagcacatcggttcagctaatctgcaaaacaaga 13870005  T
Q  244 atcataaacaaat 256  Q
    |||| ||||||||    
T  13870004 atcagaaacaaat 13869992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 173 - 268
Target Start/End: Original strand, 20653555 - 20653650
Alignment:
Q  173 cagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20653555 cagcttgggctaaatacattagttgggcttcaacacaaagcagatcagttcagctaatatgcaaaacaagaatcagaaacaaatatggaaagtcct 20653650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 144
Target Start/End: Original strand, 25965053 - 25965151
Alignment:
Q  44 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 143  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25965053 ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaacacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaa-ctttttagtatgacggcttgaatgaacaatta 25965150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 65 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 23882477 - 23882369
Alignment:
Q  65 gatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttata 164  Q
    |||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||    
T  23882477 gatacaagagtagaacacacaaagactcaaaaccctaaaa-tctaaactttatataatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagccttccttata 23882379  T
Q  165 taccgaagca 174  Q
    ||| ||||||    
T  23882378 tactgaagca 23882369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 268
Target Start/End: Original strand, 17855551 - 17855776
Alignment:
Q  39 ataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatc 138  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| | |  ||||  ||||||||| ||| ||||||||||   ||| || ||||| |||||||| |      
T  17855551 atagattctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcataatacataaagactcaaacccc-aaaaatctaac--tttcagaatgacagcttgaataaag 17855647  T
Q  139 aattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaa 237  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| || |||| | | | ||||||||||| || ||  |||| ||||||||| |||||||||||    
T  17855648 aattaggtcttgaagtcttccttatatactgaagcagctt-ggctaaa-taactcgttgggcttcagtaaaattcagatcggttcagcttaatctgcaaa 17855745  T
Q  238 acaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    ||||||| || |||||||| || ||||||||    
T  17855746 acaagaagcagaaacaaatctggaaagtcct 17855776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 41 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 20989568 - 20989477
Alignment:
Q  41 aggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttga 132  Q
    |||||||| |||||||||| ||  ||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20989568 aggttctagacttgcatcacaaccgatacaagattagaggacataaagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacagcttga 20989477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 160 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 12028828 - 12028721
Alignment:
Q  160 ttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatg 259  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||| | || ||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||| |||||||||||    
T  12028828 ttatatactgaagcagcttggactaaatac-ttcgttgggctttagtaaaaagcagatcggttcagctaatctgcaaaacagaattcagaaacaaatatg 12028730  T
Q  260 aaaagtcct 268  Q
    |||||||||    
T  12028729 aaaagtcct 12028721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 192 - 268
Target Start/End: Original strand, 25805913 - 25805989
Alignment:
Q  192 tagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||    
T  25805913 tagttgggcttcagcacaaagcagatcggttcagctaatctgcaaaacaggaatcagagacaaatatggaaagtcct 25805989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 207 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 17876393 - 17876332
Alignment:
Q  207 acaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  17876393 acaaagcagatcggttcagctaatctgcaaaacaagaatcaaaaacaaatatcgaaagtcct 17876332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 41 - 114
Target Start/End: Original strand, 25805809 - 25805882
Alignment:
Q  41 aggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactt 114  Q
    ||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25805809 aggttctaaactttcatcacaaccgatacaagagtagagcacataaagactcaaaaccctaaaaatcaaaactt 25805882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 155
Target Start/End: Original strand, 24542014 - 24542122
Alignment:
Q  46 ctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaa-ctttttagtatgacggcttgaatgatcaattag 144  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |  ||||||    
T  24542014 ctaaacttgcatca-acataatacaagagtagaacacacaacgactcaaaaccctaaaaa-ctaaacctttttagtttgacggcttgaataaataattag 24542111  T
Q  145 gtcttgaagtc 155  Q
    |||||||||||    
T  24542112 gtcttgaagtc 24542122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 208 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 28623217 - 28623157
Alignment:
Q  208 caaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  28623217 caaagcagatcggttcagctaatctgcaaaacagaaatcataaacaaagatggaaagtcct 28623157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 20989445 - 20989370
Alignment:
Q  191 ttagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtc 266  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | ||||| ||||| ||||||    
T  20989445 ttagttgggcttcagcacaaagcagatcggttcagctaatcagaaaaacaagaattagaaacagatatggaaagtc 20989370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 88 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 15930603 - 15930538
Alignment:
Q  88 gactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtc 155  Q
    ||||||||||||||||   ||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  15930603 gactcaaaaccctaaag--ctatactttttagaatgacggcttgaattctcaattaggtcttgaagtc 15930538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 87 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 21323035 - 21322968
Alignment:
Q  87 agactcaaaaccctaaaaatctaaacttttt-agtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtc 155  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21323035 agactcaaaaccctaaaa--ctagacttttttaggacgacggcttgaattatcaattaggtcttgaagtc 21322968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 121 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 17869640 - 17869587
Alignment:
Q  121 atgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagca 174  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||    
T  17869640 atgacggcttgcataatcaattaggtcttgaagtcttccttttatactgaagca 17869587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 121 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 17879392 - 17879339
Alignment:
Q  121 atgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagca 174  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||    
T  17879392 atgacggcttgcataatcaattaggtcttgaagtcttccttttatactgaagca 17879339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 20)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 18 - 268
Target Start/End: Original strand, 20991874 - 20992124
Alignment:
Q  18 gatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaacttttt 117  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20991874 gatacaagaaaggatcacaatatatgttctaaacttgcatcacaaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaacttttt 20991973  T
Q  118 agtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagac 217  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||||     
T  20991974 agtatgacggattgaatgatcaattaggtcttgaagtctcccttatatactgaagcaacttgggataaatacattagtcgggcttcagcacaaagcagat 20992073  T
Q  218 cggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20992074 cggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatggaaagtcct 20992124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 29545966 - 29545719
Alignment:
Q  16 acgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaacttt 115  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29545966 acgatacaagaaaggctcacaataaaggttctaaacttgcatcacaatcaatacaagagtagagcacatgtagactcaaaactctaaaaatctaaacttt 29545867  T
Q  116 ttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcag 215  Q
    |||| |||||||     |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||   |||||||||||| |  |||||||||    
T  29545866 ttagaatgacgg-----atgatcaattaggttttgaagtctcccttatatactgaagcagcttgggccaaataatttagttgggctttagaacaaagcag 29545772  T
Q  216 accggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    | |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  29545771 atcggttcagctaatctgcaaaacagaaatcagaaacaaatatggaaagtcct 29545719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 16207710 - 16207459
Alignment:
Q  14 agacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaact 113  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |  |||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16207710 agacgatacaagaaaggctcacaaaa--ggttctaaacttacatcacaaacgatacaagaatagagcacataaagactcaaaaccctaaaaatctaaact 16207613  T
Q  114 ttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagc 213  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||  |||||| ||||| | |||| |||||||||  |||||||    
T  16207612 ttttagtatgatggcttgaataaacaattaggtcttgaagtcttccttatatactgaagcttcttgggctaaatac-ttaggtgggcttcagcacaaagc 16207514  T
Q  214 agaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    ||| |||  || |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  16207513 agatcggcacaactaatctgcaaaacaagaattagaaacaaatatggaaagtcct 16207459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 39 - 268
Target Start/End: Original strand, 12326164 - 12326392
Alignment:
Q  39 ataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatga-t 137  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  12326164 ataggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatagagcacatg-agactcaaaaccctaaaaacctaaactttttagtatgacaacttgaatgaat 12326262  T
Q  138 caattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaa 237  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||| |||||   ||||||||| || |  |||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  12326263 caattaggtcttaaagtctcccttatatactgaagcatcttgggctaaatat-ttagttgggatttagcacaaagcagatcggttcagctaatcttcaaa 12326361  T
Q  238 acaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    |||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  12326362 acaagaattagaaacaaatatggaaagtcct 12326392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Original strand, 11588822 - 11589046
Alignment:
Q  44 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 143  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11588822 ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaaactttttagtaagacggcttgaatgaacaatta 11588920  T
Q  144 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaat-acaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaa 241  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||  |||| | ||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  11588921 ggtcttgaagtcttccttatatactgaagcagcttggtctaaa-taattcgttgggcttcagtaacaaagcagatcggttcagcttaatctgcaaaacaa 11589019  T
Q  242 gaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    |||| | |||||||| || ||||||||    
T  11589020 gaattagaaacaaatctggaaagtcct 11589046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Original strand, 4459098 - 4459320
Alignment:
Q  44 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 143  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4459098 ttctaaactttcatca-acatgatacaagagcagaatacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgagcaatta 4459196  T
Q  144 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaaga 243  Q
    ||||||||||||    ||||||||  |||||||||||| ||||| | ||| || |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  4459197 ggtcttgaagtcttgtttatatactaaagcagcttgggctaaatac-ttatttaggcttcagaacaaagcagatcggttcagctaatctgcaaaacagaa 4459295  T
Q  244 atcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    |||| |||||| |||| ||| ||||    
T  4459296 atcagaaacaattatggaaaatcct 4459320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Original strand, 11999241 - 11999462
Alignment:
Q  44 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 143  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||||||    
T  11999241 ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaaactttttagaatgacgacttgaataa-caatta 11999338  T
Q  144 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaaga 243  Q
    ||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  11999339 ggttttgaagtcttccttatatactgaagcagcttgggctaaatac-ttagttgggcttcagcacaaagcagatcggttcggctaatctgcaaaacaaga 11999437  T
Q  244 atcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    ||   ||||||| ||||||||||||    
T  11999438 atatgaaacaaaaatgaaaagtcct 11999462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 244
Target Start/End: Original strand, 15506598 - 15506822
Alignment:
Q  16 acgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaacttt 115  Q
    ||||||||||||||  |||| ||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15506598 acgatacaagaaagactcacaataaaggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatgaagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaacttt 15506697  T
Q  116 ttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcag 215  Q
       |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||| ||  |||||| || |||| |     
T  15506698 ---gtatgacggcttgaataagcaattaggtcttgaagtcttccttatatactgaagcagcttgggctaaatac-ttaattacgcttcagtaaaaagaaa 15506793  T
Q  216 accggttcagctaatctgcaaaacaagaa 244  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15506794 atcggtttagctaatctgcaaaacaagaa 15506822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Original strand, 645493 - 645717
Alignment:
Q  44 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 143  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||    
T  645493 ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaataaagaatta 645591  T
Q  144 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaat-acaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaa 241  Q
    ||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||| |||| | ||  ||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  645592 ggtcttgaagtcttctttatatactgaagcagcttgggctaaa-taatacgttgggcttcagtaacaatgcagaccggttcagcttaatttgcaaaacaa 645690  T
Q  242 gaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    |||||| ||| |||| || ||||||||    
T  645691 gaatcagaaataaatctggaaagtcct 645717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 254
Target Start/End: Original strand, 14165526 - 14165732
Alignment:
Q  44 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| | |  ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  14165526 ttctaaacttgcatca-acatgatacaagagcataatacacgaagactcaaa-ccctaaaaatctaaactttt-agaatgacggcttgaatgaacaatta 14165622  T
Q  144 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaaga 243  Q
    ||||||||||||  |||| ||||| |||||| |||||| |||||  ||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14165623 ggtcttgaagtcttccttttatactgaagcaacttgggctaaata-attcgttgggcttcaacacaatgcagatcggttcagctaatctgcaaaacaaga 14165721  T
Q  244 atcataaacaa 254  Q
    |||| ||||||    
T  14165722 atcagaaacaa 14165732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 11521241 - 11520990
Alignment:
Q  14 agacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaact 113  Q
    |||||||||||||||| | |||   |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||| |||||||||| |||       
T  11521241 agacgatacaagaaagaa-cacacaatagattctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatataac-- 11521146  T
Q  114 ttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaat-acaaag 212  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||| | |||| |    
T  11521145 ttttagaatgacggcttgaataatcaattaggtcttgaagtcttccttatatactgaagcagcttgggctaaa-taattcgttgggcttcagtaacaatg 11521047  T
Q  213 cagaccggttcagc-taatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  11521046 cagatcggttcagcttgatctgcaaaacaagaatcagaaacaaatctggaaagtcct 11520990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 187
Target Start/End: Original strand, 15438427 - 15438598
Alignment:
Q  16 acgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaacttt 115  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| |||||||| ||||||| || ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15438427 acgatacaagaaaggctcacaataaaggttctagacttgcaacacaaacgatacaagaatggagcacatgtagactcaaaatcctaaaaatctaaacttt 15438526  T
Q  116 ttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaat 187  Q
    |||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||| || |||||    
T  15438527 ttagtatgacgggttgaataatttattaggtcttgaagtcttccttatatactaaagcagcttaggctaaat 15438598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 176
Target Start/End: Original strand, 16437105 - 16437265
Alignment:
Q  16 acgatacaagaaaggatcacgatata-ggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactt 114  Q
    ||||||||||||||| || | ||| | ||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||    ||||||    
T  16437105 acgatacaagaaaggctcgcaataaaaggtactaaacttgcatca-acatgatacaagaatagaacacatgaagacttaaaaccctaaaagctaaaactt 16437203  T
Q  115 tttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagc 176  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||| ||||||||    
T  16437204 tttagaatgatggcttgaataatcaattaggtcttgatgtcttccttttatactgaagcagc 16437265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 46 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 26132722 - 26132600
Alignment:
Q  46 ctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattagg 145  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||    |||||||    
T  26132722 ctaaacttgcatca-acacgatacaagagtaga-cacacaaagactcaaaaccctaaaa--ctagactttttagaatgacggcttgaatacctaattagg 26132627  T
Q  146 tcttgaagtcgcccttatataccgaag 172  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||||    
T  26132626 tcttgaagtcttccttatatactgaag 26132600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 172
Target Start/End: Original strand, 10280141 - 10280296
Alignment:
Q  16 acgatacaagaaaggatcacgatata-ggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactt 114  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| | ||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||| |||||||||  | |||||  ||||||||    
T  10280141 acgatacaagaaaggctcacaataaaaggtactaaacttgcatca-acatgatacaagaatagaacacatgaagactcaaactcgtaaaag-ctaaactt 10280238  T
Q  115 tttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaag 172  Q
    ||||| || |||||||||||  |  |||||||||||| |||  |||| ||||| ||||    
T  10280239 tttagaataacggcttgaatagtacattaggtcttgatgtcttccttttatactgaag 10280296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 154
Target Start/End: Original strand, 10661224 - 10661331
Alignment:
Q  46 ctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaa-ctttttagtatgacggcttgaatgatcaattag 144  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||   |||  ||||||    
T  10661224 ctaaacttgcatca-acacgatacaagagtagaacacacaaagactcaaaaccctaaaaa-ctaaacctttttagtttgacggcttcggtgacaaattag 10661321  T
Q  145 gtcttgaagt 154  Q
    ||||||||||    
T  10661322 gtcttgaagt 10661331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 221 - 259
Target Start/End: Original strand, 15438611 - 15438649
Alignment:
Q  221 ttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15438611 ttcagctaatctgcaaaacaagaatcagaaacaaatatg 15438649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 20924903 - 20924798
Alignment:
Q  46 ctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgta-gactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattag 144  Q
    |||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||  |||||||  ||||||||    
T  20924903 ctaaacttacatca-acatgatacaagagtaga-cacacatacgactcaaaaccctaaag--ctagactttttagaatgacatcttgaattctcaattag 20924808  T
Q  145 gtcttgaagt 154  Q
    ||||||||||    
T  20924807 gtcttgaagt 20924798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 174
Target Start/End: Original strand, 21260834 - 21260919
Alignment:
Q  88 gactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagca 174  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||    |||||| |||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  21260834 gactcaaaaccctaaaaa-ctattcttttagaaatgacgacttgaatgaataattaggtcttgaagtcttccttatatactgaagca 21260919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 152
Target Start/End: Original strand, 42636581 - 42636685
Alignment:
Q  47 taaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaa-ctttttagtatgacggcttgaatgatcaattagg 145  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||   |||  |||||||    
T  42636581 taaacttgcatca-acacgatacaagagtagaacacacaaagactcaaaaccctaaaaa-ctaaacctttttagtttgacgacttcggtgacaaattagg 42636678  T
Q  146 tcttgaa 152  Q
    |||||||    
T  42636679 tcttgaa 42636685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 3)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 17956 - 17703
Alignment:
Q  15 gacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactt 114  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17956 gacgatacaagaaaggctcacaatataggttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaagtctaaactt 17857  T
Q  115 tttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagca 214  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||   |||||||||||||  |||||||||    
T  17856 tttagaatgacgacttgaatgatcactttggtcttgaagtctcccttatatactgaagcagcttgggctaaatagtttagttgggcttcggtacaaagca 17757  T
Q  215 gaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17756 gatcggttcagctattctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 17703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 27350 - 27097
Alignment:
Q  15 gacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactt 114  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27350 gacgatacaagaaaggctcacaatataggttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaagtctaaactt 27251  T
Q  115 tttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagca 214  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||   |||||||||||||  |||||||||    
T  27250 tttagaatgacgacttgaatgatcactttggtcttgaagtctcccttatatactgaagcagcttgggctaaatagtttagttgggcttcggtacaaagca 27151  T
Q  215 gaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27150 gatcggttcagctattctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 27097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 7370 - 7116
Alignment:
Q  14 agacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaact 113  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7370 agacgatacaagaaaggctcacaatataggttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaact 7271  T
Q  114 ttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagc 213  Q
    | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||||| | ||| |||||||||| |||||||     
T  7270 tattagaatggcggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtctcccttatatactgaagcagctcgggctaaatactttatttgggcttcagtacaaagt 7171  T
Q  214 agaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    ||| |||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  7170 agatcggttcggctaatctgaaaaacaagaaccagaaacaaatatggaaagtcct 7116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 12)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 27925281 - 27925031
Alignment:
Q  16 acgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaacttt 115  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  27925281 acgatacaagaaaggatcacaatataggttctaaacttgcatcacaaatgataaaagaatagaacacatgtagactcaaaatcctaaaaatctaaccttt 27925182  T
Q  116 ttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcag 215  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||| |||||||||    
T  27925181 ttagtatgccagcttgaatgatcaattaggtcttgaagtctcccttatatactgaagcagcttgggctaaatac-ttagtt-ggcttcaacacaaagcag 27925084  T
Q  216 accggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  27925083 atcggttcagctaatctgcaaaacaagaatcagaaacaaatatggaaagtcct 27925031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 39 - 268
Target Start/End: Original strand, 45136464 - 45136692
Alignment:
Q  39 ataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatc 138  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  45136464 ataggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatagagctcataaagactcaaaaccctaaaaatctatactttttagtatgacggcttgaataatc 45136563  T
Q  139 aattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaa 238  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||| ||||||| | ||||||||||||||  |||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  45136564 aattaggtcttgaagtcttccttatatactcaagcagcttgagataaatac-ttagttgggcttcagcacaaagcaaatcagttcagctaatctgcaaaa 45136662  T
Q  239 caagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45136663 caagaatcataaacaaatatggaaagtcct 45136692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 13660199 - 13659988
Alignment:
Q  18 gatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaacttttt 117  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||    
T  13660199 gatacaagaaagtatcacaataaaggttctaaacttgcatcacaaacgatacaagaatagagcacatgtagactcaaaactctaaaatt-taaatttttt 13660101  T
Q  118 agtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagac 217  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||     
T  13660100 agtataacgacttgaatgatcaattaggtcttgaagtttcctttatatactgaagcagcttgggctaaatacattaattgggcttcagcacaaagcagat 13660001  T
Q  218 cggttcagctaat 230  Q
    |||||||||||||    
T  13660000 cggttcagctaat 13659988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 18 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 13718842 - 13718631
Alignment:
Q  18 gatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaacttttt 117  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||    
T  13718842 gatacaagaaagtatcacaataaaggttctaaacttgcatcacaaacgatacaagaatagagcacatgtagactcaaaactctaaaatt-taaatttttt 13718744  T
Q  118 agtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagac 217  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||     
T  13718743 agtataacgacttgaatgatcaattaggtcttgaagtttcctttatatactgaagcagcttgggctaaatacattaattgggcttcagcacaaagcagat 13718644  T
Q  218 cggttcagctaat 230  Q
    |||||||||||||    
T  13718643 cggttcagctaat 13718631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 44 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 23541207 - 23540986
Alignment:
Q  44 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||| |||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  23541207 ttctaaacttgcatca-acatgataaaagagcagaatacataaagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacgacttgaatgattaatta 23541109  T
Q  144 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaaga 243  Q
    ||| ||| ||||  |||||||||  ||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23541108 ggtattggagtcttccttatatattgaagcagcttgggctaaatac-ttagttgggtttcagcacaaagcagatcggttcaactaatctgcaaaacaaga 23541010  T
Q  244 atcataaacaaatatgaaaagtcc 267  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  23541009 atcagaaacaaatatggaaagtcc 23540986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 268
Target Start/End: Original strand, 33962068 - 33962322
Alignment:
Q  14 agacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaact 113  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||     
T  33962068 agacgatacgagaaaggctcacaataaaggttctaaacttgcatcagcag-gatacaagagtagagcacatgtagactcaaaatcttaaaaatctaaac- 33962165  T
Q  114 ttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgccctta---tataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaa 210  Q
    |||||| ||||||||||||||  |  |||||||||||||||| | ||||   ||||| ||||||||| |||  |||| | ||||||||||||||  ||||    
T  33962166 ttttagaatgacggcttgaatagttcattaggtcttgaagtctcacttatattatactgaagcagctcgggtcaaatactttagttgggcttcagaacaa 33962265  T
Q  211 agcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  33962266 agcagatcggttcagctaatctgcaaaac-agaatcagagacaaatatgtaaagtcct 33962322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 268
Target Start/End: Original strand, 33977387 - 33977640
Alignment:
Q  14 agacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaact 113  Q
    ||||||||| ||||||| |||| ||| || ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  33977387 agacgatacgagaaaggctcacaataaagattctaaacttgaatca-acatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccttaaaaatctaaac- 33977484  T
Q  114 ttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatat--accgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaa 211  Q
    |||||| ||||||||||||||  |  |||||||||||||||| | |||||||    | |||||||| |||  |||| | ||||||||||||||  |||||    
T  33977485 ttttagaatgacggcttgaatagttgattaggtcttgaagtctcacttatattatactaagcagctcgggtcaaatactttagttgggcttcagaacaaa 33977584  T
Q  212 gcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  33977585 gcagatcggttcagctaatctgcaaaac-agaatcagagacaaatatgtaaagtcct 33977640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Original strand, 22485491 - 22485714
Alignment:
Q  44 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22485491 ttctaaacttgcatcacaaatgatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-cccaaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgaacaatta 22485589  T
Q  144 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaag 242  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||| ||||    ||  |||||||||| || || ||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  22485590 ggtcttgaagtcttccttatatactgaagcaacttgggctaaa-gatttcattgggcttcagtaaaatgcagatcgattcagcttaatctgcaaaacaag 22485688  T
Q  243 aatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||    
T  22485689 aatcagaaacaaatctggaaagtcct 22485714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 172
Target Start/End: Original strand, 24092288 - 24092443
Alignment:
Q  16 acgatacaagaaaggatcacgatata-ggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactt 114  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| | ||| |||||| ||||||| | ||||||||||  |||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  24092288 acgatacaagaaaggctcacaataaaaggtactaaacctgcatca-acatgatacaagcctagcacacatgtagactcaaacccctaaaa-tctaaactt 24092385  T
Q  115 tttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaag 172  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  24092386 tttagaatgacggcttgaatactcaattaggtgttgaagtctcccttatatactgaag 24092443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 142 - 268
Target Start/End: Original strand, 22476635 - 22476761
Alignment:
Q  142 taggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagct-aatctgcaaaaca 240  Q
    |||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||   | | |||||||||| |  || ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  22476635 taggtcttcaagtcttccttatatactgaagcagcttgggctaaatatttca-ttgggcttcagttaaatgcagatcggttcagcttaatctgcaaaaca 22476733  T
Q  241 agaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    ||||||| |||||||| || ||||||||    
T  22476734 agaatcagaaacaaatctggaaagtcct 22476761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 174
Target Start/End: Original strand, 25240742 - 25240848
Alignment:
Q  65 gatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttata 164  Q
    |||||||||||||| ||||   ||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||  |||| ||    
T  25240742 gatacaagagtagaacacac--agagttaaaaccctaaaag-ctaaactttttagtatgacggcttgaatacctaattaggtcttgaagtcttccttcta 25240838  T
Q  165 taccgaagca 174  Q
    ||| ||||||    
T  25240839 tactgaagca 25240848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 105 - 238
Target Start/End: Original strand, 26536706 - 26536839
Alignment:
Q  105 atctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagtt-gggcttc 203  Q
    |||||||||||| || |||||| |||||||  |  |||||||||||||||| | ||||||| | |||| |||| |||  |||| | |||||| ||||||     
T  26536706 atctaaactttt-agaatgacgacttgaatagttcattaggtcttgaagtctcacttatatgctgaagtagctcgggtcaaatactttagtttgggcttt 26536804  T
Q  204 aatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaa 238  Q
    |  |||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  26536805 agaacaaagcatatcggttcagctaatctgcaaaa 26536839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 161; Significance: 6e-86; HSPs: 17)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 15162314 - 15162062
Alignment:
Q  16 acgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaacttt 115  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  15162314 acgatacaagaaaggatcacactaaaggttctaaacttgcatcataaacgatacaagagtagagcacatgtagacttaaaactctaaaaatctaaacttt 15162215  T
Q  116 ttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcag 215  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  |||||||||    
T  15162214 ttagaatgatggcttgaataatcaattaggtcttgaagtctcccttatatactgaagcagcttgggctaaatactttagttgggcttcagcacaaagcag 15162115  T
Q  216 accggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    |  ||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||    
T  15162114 ataggttcagttaatttgcaaaacatgaatcataaaaaaatatggaaagtcct 15162062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 22 - 268
Target Start/End: Original strand, 10724597 - 10724843
Alignment:
Q  22 caagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagta 121  Q
    ||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  10724597 caagaaaggctcactataaaggtcctaaacttgcatcacaaacgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctacacttttcagaa 10724696  T
Q  122 tgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||| | |||||||||||||   |||||||||| ||||    
T  10724697 tgacggcttaaatgatcaattaggtcttgaagtctcccttatatactgaagcaacttgggctaaatactttagttgggcttcggcacaaagcagatcggt 10724796  T
Q  222 tcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10724797 tcagctaatctgcaaaacaagaatcaaaaacaaatatggaaagtcct 10724843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 22 - 268
Target Start/End: Original strand, 10938366 - 10938612
Alignment:
Q  22 caagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagta 121  Q
    ||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  10938366 caagaaaggctcactataaaggtcctaaacttgcatcacaaacgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctacacttttcagaa 10938465  T
Q  122 tgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggt 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||| | |||||||||||||   |||||||||| ||||    
T  10938466 tgacggcttaaatgatcaattaggtcttgaagtctcccttatatactgaagcaacttgggctaaatactttagttgggcttcggcacaaagcagatcggt 10938565  T
Q  222 tcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10938566 tcagctaatctgcaaaacaagaatcaaaaacaaatatggaaagtcct 10938612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 15700163 - 15699914
Alignment:
Q  16 acgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaacttt 115  Q
    ||||||||||||||| |||| |||  ||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  15700163 acgatacaagaaaggctcacaataagggtactaaacttgcatca-acatgatacaagaatagaacacatgtagactcaaaaccctaaaag-ctaaacttt 15700066  T
Q  116 ttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcag 215  Q
    |||| ||||| | ||||||| |  |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||  |||| |  | |||||||||||  ||||| |||    
T  15700065 ttagaatgacagattgaatggttcattaggtcttgaagtttcccttatatactgaagcagctcgggtcaaatactcttgttgggcttcagaacaaaacag 15699966  T
Q  216 accggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    | | || ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  15699965 atc-gtccagctgatctgcaaaacaagaatcagagacaaatatggaaagtcct 15699914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 18601464 - 18601238
Alignment:
Q  39 ataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatc 138  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||      
T  18601464 atagattctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaac--ttttagaatgacggcttgaatgaat 18601368  T
Q  139 aattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagct-aatctgcaaa 237  Q
    |||||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||| || ||  ||| |||||||||||  |||| ||||| || ||||||| ||||||||||    
T  18601367 aattagttcttgaagtctttcttatatactgaagcagcttgggctacata-attcgttgggcttcagcacaatgcagatcgattcagcttaatctgcaaa 18601269  T
Q  238 acaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18601268 acaagaatcataaacaaatatggaaagtcct 18601238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Original strand, 28019662 - 28019884
Alignment:
Q  44 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 143  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||||| |||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  28019662 ttctaaacttgcatcacaaacgagacaagagcagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaac--ttttagaatgacggcttgaataaacaatta 28019758  T
Q  144 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaat-acaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaa 241  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||| |||| | ||| ||||||||||||| |||| | ||| ||||| ||| |||||||||||||||    
T  28019759 ggtcttgaagtcttccttatatactgaagcaacttgggctaaa-taattcgttgggcttcaataacaatgtagatcggtttagcttaatctgcaaaacaa 28019857  T
Q  242 gaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||    
T  28019858 gaatcagaaacaaatctgaaaagtcct 28019884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 23399996 - 23399774
Alignment:
Q  44 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 143  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| |||||| || |||||||||||||||  |||||| ||||| | |||||||| ||||||    
T  23399996 ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactcgaa-ccctaaaaatctaaa--ttttagaatgacagtttgaatgaacaatta 23399900  T
Q  144 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaat-acaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaa 241  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||| ||| || |||| | ||  ||||||||||| | |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  23399899 ggtcttgaagtcttccttatatactgaagcaacttaggctaaa-taatatgttgggcttcactaacaatgcagatcggttcagcttaatctgcaaaacaa 23399801  T
Q  242 gaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||    
T  23399800 gaatcagaaacaaatttggaaagtcct 23399774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Original strand, 25117215 - 25117437
Alignment:
Q  44 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 143  Q
    |||||||||| | ||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||   |||||| |||| ||||||||| | ||||||    
T  25117215 ttctaaacttacctcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaac--ttttagaatgatggcttgaattaacaatta 25117311  T
Q  144 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaa-gcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaa 241  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||| | ||  ||||||||||| || ||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||    
T  25117312 ggtcttgaagtcttccttatatactgaagcagcttgggctaaa-taatacgttgggcttcagtaaaaatgcagatcggttcagcttaatttgcaaaacaa 25117410  T
Q  242 gaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||    
T  25117411 gaatcagaaacaaatctggaaagtcct 25117437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 256
Target Start/End: Original strand, 16384220 - 16384459
Alignment:
Q  14 agacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaact 113  Q
    |||||||||||||||| | |||   |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||| | ||| |||||||||||||||||    
T  16384220 agacgatacaagaaagaa-cacacaatagattctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagagttaaa-ccctaaaaatctaaact 16384317  T
Q  114 ttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagc 213  Q
    ||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    |||||||||  |||||||||||| |||||  |||  ||||||||||  |  | ||    
T  16384318 ttt-agaatgatggcttgaataatcaattaggtcttgaagtatttcttatatactaaagcagcttgggctaaata-attcattgggcttcagcaagatgc 16384415  T
Q  214 agaccggttcagct-aatctgcaaaacaagaatcataaacaaat 256  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16384416 agatcggttcagcttaatctgcaaaacaagaatcagaaacaaat 16384459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 180
Target Start/End: Original strand, 10191216 - 10191379
Alignment:
Q  14 agacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaact 113  Q
    |||||||||||||||| | |||   |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  10191216 agacgatacaagaaagaa-cacacaatagattctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaaact 10191313  T
Q  114 ttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgg 180  Q
    ||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||    
T  10191314 ttt-agaatgacggcttgaatgaataattaggtcttgaagtcttccttatatagtgaagcagcttgg 10191379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 33898808 - 33898587
Alignment:
Q  44 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 143  Q
    ||||||| ||| |||| ||| |||||||||| | |  ||||| ||||||||| || |||||||||||   |||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  33898808 ttctaaatttgtatcacaaacgatacaagagcataatacatgaagactcaaatcc-taaaaatctaac--ttttagaatgacagcttgaatgaacaatta 33898712  T
Q  144 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagct-aatctgcaaaacaag 242  Q
    |||||||| |||  |||||||||  ||||||| ||||| |||||  ||| ||||| ||||| || || ||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  33898711 ggtcttgacgtcttccttatatagtgaagcagtttgggctaaata-attcgttggacttcagtaaaatgcagatcagttcagcttaatctgcaaaacaag 33898613  T
Q  243 aatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    |||||||||||||| || ||||||||    
T  33898612 aatcataaacaaatctggaaagtcct 33898587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 174
Target Start/End: Original strand, 15622799 - 15622924
Alignment:
Q  46 ctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtat-gacggcttgaatgatcaattag 144  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||  ||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||    
T  15622799 ctaaacttgcatca-acacgatacaagagtaga-cacacaaagactcaaaaccctaaaa--ctaaactttttagaaacgacggcttgaataatcaattag 15622894  T
Q  145 gtcttgaagtcgcccttatataccgaagca 174  Q
    |||||||||||  |||| ||||| ||||||    
T  15622895 gtcttgaagtcctccttttatactgaagca 15622924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 19183481 - 19183378
Alignment:
Q  46 ctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattagg 145  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||| |||| ||||   |||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  19183481 ctaaacttgcatca-acacgatacaagaatagaacacacaaagacacaaaaccctacaaa-ctaaactttttagaatgacgtcttgaatgatcaattagg 19183384  T
Q  146 tcttga 151  Q
    ||||||    
T  19183383 tcttga 19183378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Original strand, 19659819 - 19659907
Alignment:
Q  66 atacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtc 155  Q
    ||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  19659819 atacaagagtagaacacacaaagactcaaaaccctaaaaa-ctaaactttttagaatgacggcttgaatacataattaggtcttgaagtc 19659907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 66 - 155
Target Start/End: Original strand, 33746298 - 33746387
Alignment:
Q  66 atacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaa-ctttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtc 155  Q
    ||||||||| ||| ||||   |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  33746298 atacaagaggagaacacacaaagactcaaaaccttaaaaa-ctaaacctttttagtttgacggcttgaatgaataattaggtcttgaagtc 33746387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 174
Target Start/End: Original strand, 32862050 - 32862134
Alignment:
Q  89 actcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagca 174  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||    
T  32862050 actcaaaaccctaaaaa-ctattctttttgaaatgacggcttgaatgaacaattaggtcttgaagtcttccttatatcctgaagca 32862134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 46 - 155
Target Start/End: Original strand, 9069306 - 9069414
Alignment:
Q  46 ctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaa-ctttttagtatgacggcttgaatgatcaattag 144  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||| | ||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||   |||  ||||||    
T  9069306 ctaaacttgcatca-acacgatacaagagtagaacgcacaaagactcaaaaccctaaaaa-ctaaacctttttagtttgacggcttcggtgacaaattag 9069403  T
Q  145 gtcttgaagtc 155  Q
    |||||||||||    
T  9069404 gtcttgaagtc 9069414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 14 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 8412 - 8158
Alignment:
Q  14 agacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaact 113  Q
    ||||||||| ||||||| || | ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||     
T  8412 agacgatacgagaaaggctctcaataaaggttctaaacttgcatcacaaatgataaaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaacccaaacc 8313  T
Q  114 ttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagc 213  Q
    | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||| ||| |  |||||||    
T  8312 tcttagaatgtcggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtctcccttatatactgaagcagcttgggctaaatactttagttggactttagcacaaagc 8213  T
Q  214 agaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  8212 agatcggttcagctaatctgcataacaacaatcataaacaaatatggaaagtcct 8158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 20)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 23758086 - 23757835
Alignment:
Q  14 agacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaact 113  Q
    ||||||||||||||||  ||||   | |||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  23758086 agacgatacaagaaagactcac--aaaaggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatagagcacataaagactcaaaaccctaaaaatctaaact 23757989  T
Q  114 ttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagc 213  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  23757988 ttttagtatgacagcttgaatgatcaattaggtcttgtagtcttctttatatactgaagcagcttgggataaatac-ttagttgggcttcaacacaaagc 23757890  T
Q  214 agaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||| || ||||||||    
T  23757889 agatcggttcagctaatctgccaaacaagaacccgaaacaaatctggaaagtcct 23757835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 14 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 23823542 - 23823291
Alignment:
Q  14 agacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaact 113  Q
    ||||||||||||||||  ||||   | |||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  23823542 agacgatacaagaaagactcac--aaaaggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatagagcacataaagactcaaaaccctaaaaatctaaact 23823445  T
Q  114 ttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagc 213  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||    
T  23823444 ttttagtatgacagcttgaatgatcaattaggtcttgtagtcttctttatatactgaagcagcttgggataaatac-ttagttgggcttcaacacaaagc 23823346  T
Q  214 agaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||| || ||||||||    
T  23823345 agatcggttcagctaatctgccaaacaagaacccgaaacaaatctggaaagtcct 23823291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 44 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 23420357 - 23420146
Alignment:
Q  44 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 143  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23420357 ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgagcaatta 23420259  T
Q  144 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaaga 243  Q
    ||||||||||||    ||| |||| |||| |||||||| |||| | |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23420258 ggtcttgaagtcttttttacatactgaagtagcttgggctaaa-taattagttgggcttcagaacaaagcagatcggttcagctaatctgcaaaacaaga 23420160  T
Q  244 atcataaacaaata 257  Q
    |||| |||||||||    
T  23420159 atcagaaacaaata 23420146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 39 - 268
Target Start/End: Original strand, 24190215 - 24190444
Alignment:
Q  39 ataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatc 138  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||| || |||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24190215 atagattctaaacttgcatcacaaacgatacaaaagcagaatacatgaagact-aaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgaac 24190313  T
Q  139 aattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaat-acaaagcagaccggttcagc-taatctgcaa 236  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||| | ||  ||||||||||| | |||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  24190314 aattaggtcttgaagtcttccttatatactgaagcagcttgggctaaa-taatatgttgggcttcagtaacaatgcagatcggttcagcttaatctgcaa 24190412  T
Q  237 aacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  24190413 aacaagaatcagaaacaaatctggaaagtcct 24190444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 44 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22404562 - 22404352
Alignment:
Q  44 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |  | ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  22404562 ttctaaacttgcatcacaaatgatacaagagcataataaatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaaaatttt-agaatgacggcttgaataatcaatta 22404465  T
Q  144 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaag 242  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  22404464 ggtcttgaagtcttccttatatactgaagcagcttgggctaaa-taattcgttgggcttcagtaaaatgcagatcggttcagcttaatctgcaaaacaag 22404366  T
Q  243 aatcataaacaaat 256  Q
    ||||||||||||||    
T  22404365 aatcataaacaaat 22404352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 44 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 9422315 - 9422107
Alignment:
Q  44 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 143  Q
    |||||||||||||||| | | |||||||||| | |  ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  9422315 ttctaaacttgcatcacagacgatacaagagcataatacatgaagactcaat-ccctaaaaatctaaactttttagaatgacggcttgaataa-caatta 9422218  T
Q  144 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaaga 243  Q
    ||| ||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| ||||| | |||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9422217 ggtattgaagtcttccttatatactgaagcagtttgggctaaatac-ttagttggacttcagcacaaagcagatcggttcagctaatctgcaaaacaaga 9422119  T
Q  244 atcataaacaaa 255  Q
    |||| |||||||    
T  9422118 atcagaaacaaa 9422107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 41 - 268
Target Start/End: Original strand, 38405717 - 38405942
Alignment:
Q  41 aggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaa 140  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||    
T  38405717 aggttataaacttgcatca-acatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaacactaaaaatctaaactttttagaatgaaggcttgaatactcaa 38405815  T
Q  141 ttaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaaca 240  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||  ||||    ||||| |||||||  ||||| |||| | || ||| | ||||||||||||    
T  38405816 ttaagtcttgaagtcttccttatatactgaagcatcttgggtcaaatattctagtttggcttcagaacaaaacagatc-gtccagatgatctgcaaaaca 38405914  T
Q  241 agaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    ||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  38405915 agaatcagagacaaatatggaaagtcct 38405942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 30605520 - 30605270
Alignment:
Q  16 acgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaacttt 115  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30605520 acgacacaagaaaggctcacaataaaggtactaaacttgcatca-acatgatacaagagtagaacacatgtatactcaaaaccctaaaaatctaaacttt 30605422  T
Q  116 ttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcag 215  Q
    |||| || |||||||||||  |  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||   |  ||||  | | |||||||||||  ||||| |||    
T  30605421 ttagaattacggcttgaatagttcattaggtcttgaagtctcccttatatactgaagcaactcaagtcaaataaacttgttgggcttcagaacaaaacag 30605322  T
Q  216 accggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    | | || || || ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  30605321 atc-gtccaactgatctgcaaaacaagaattagaaacaaatatggaaagtcct 30605270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 52 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 22251832 - 22251619
Alignment:
Q  52 ttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttga 151  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22251832 ttgcatcacaaaagatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaac--ttttagaatgacggcttgaatgaacaattaggtcttga 22251736  T
Q  152 agtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaagaatcataa 250  Q
    ||||  |||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| |||||||||||  | || |||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  22251735 agtcttccttatatactgaagcagcttgggctaaa-taattcgttgggcttcagcaaaatgcagataggttcagcttaatctgcaaaacaagaataataa 22251637  T
Q  251 acaaatatgaaaagtcct 268  Q
    |||||| || ||||||||    
T  22251636 acaaatctggaaagtcct 22251619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 88 - 268
Target Start/End: Original strand, 26037181 - 26037359
Alignment:
Q  88 gactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaat 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||  ||||    
T  26037181 gactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagaatgacggcttgaatagttcattaggtcttgaagtctcccttatatactgaagcagctcgggtcaaat 26037280  T
Q  188 tcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
     | |||||| |||||||  |||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||    
T  26037281 actttagtttggcttcagaacaaagaagatcagttcagctaatctgcaaaac-agaatca-gaacaaatatggaaagtcct 26037359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 26329043 - 26328793
Alignment:
Q  16 acgatacaagaaaggatcacgatata-ggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactt 114  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| | ||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||     
T  26329043 acgatacaagaaaggctcacaataaaaggtactaaacttgcatca-acatgatacaagaatagaacacatgtatactcaaaaccctaaaag-ctaaactc 26328946  T
Q  115 tttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaat-tcattagttgggcttcaatacaaagc 213  Q
    ||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||  |||  |||| | ||| |||||||||||  ||||| |    
T  26328945 tttagaatgacggcttgaatggttcattaggtcttgatgtcttccttttataccgaagcagcaagggtcaaatattatt-gttgggcttcagaacaaaac 26328847  T
Q  214 agaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    ||| | || ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  26328846 agatc-gtccagctgatctgcaaaacaagaatcagagacaaatatggaaagtcct 26328793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 16 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22082517 - 22082271
Alignment:
Q  16 acgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaacttt 115  Q
    |||| |||||||||| |||  ||| |||| ||||| |||||||| | ||||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  22082517 acgacacaagaaaggttcataataaaggtactaaatttgcatca-acatgatacaaaaatagaacacatgtagactcaaaactctaaaag-ctaaacttt 22082420  T
Q  116 ttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcag 215  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||| |||  |||| | || ||||| || ||  ||||| |||    
T  22082419 ttagaatgacagcttgaatgctcaattaggttttgaagtctcccttatatactaaagcagctcgggtcaaatac-tttgttggactccagaacaaaacag 22082321  T
Q  216 accggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtc 266  Q
    | | || ||||| || |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  22082320 atc-gtccagctgatatgcaaaacaagaatcagagacaaatatggaaagtc 22082271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 22246158 - 22245937
Alignment:
Q  44 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 143  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| | |   |||| ||||||||| ||||||||||||||   |||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  22246158 ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcaaaatccatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaac--ttttagaatgacgacttgaatgaacaatta 22246062  T
Q  144 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaag 242  Q
    ||||||||||||  ||||||||||   ||||||||||| |||| | | | |||||||||||  | || ||||| ||||||| | ||||||||||||| ||    
T  22246061 ggtcttgaagtcttccttatatactatagcagcttgggctaaa-taactcgttgggcttcagcaaaatgcagatcggttcaacttaatctgcaaaacgag 22245963  T
Q  243 aatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||    
T  22245962 aatcaaaaacaaatctggaaagtcct 22245937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 268
Target Start/End: Original strand, 23624208 - 23624456
Alignment:
Q  16 acgatacaagaaaggatcacgatata-ggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactt 114  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| | ||| ||| |||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||| |||  ||||||||  ||||||||    
T  23624208 acgatacaagaaaggctcacaataaaaggtactagacttgcatca-acatgatacaagaatagaacacatgtagacccaa--ccctaaaag-ctaaactt 23624303  T
Q  115 tttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagca 214  Q
    ||||| ||||||||||||||  |  |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||  |||| |  | ||||||||||| |||||| ||    
T  23624304 tttagaatgacggcttgaatagttcattaggtcttgaagtctcctttatatactgaagcagctcgggtcaaatactcttgttgggcttcagtacaaaaca 23624403  T
Q  215 gaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    || | ||  |||| |||||||||||| |||||| | ||||| | ||||||||||    
T  23624404 gatc-gtctagctgatctgcaaaacaggaatcagagacaaaaaagaaaagtcct 23624456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 25105244 - 25105113
Alignment:
Q  44 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 143  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||   |||||| |||| |||||||||||  |||||    
T  25105244 ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagtagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaac--ttttagaatgatggcttgaatgaaaaatta 25105148  T
Q  144 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagctt 178  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  25105147 ggtcttgaagtcttccttatatactgaagcagctt 25105113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 44 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 25164337 - 25164206
Alignment:
Q  44 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 143  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||   |||||| |||| |||||||||||  |||||    
T  25164337 ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagtagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaac--ttttagaatgatggcttgaatgaaaaatta 25164241  T
Q  144 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagctt 178  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  25164240 ggtcttgaagtcttccttatatactgaagcagctt 25164206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 41 - 150
Target Start/End: Original strand, 18221466 - 18221573
Alignment:
Q  41 aggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaa 140  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  18221466 aggtactaaacttgcatca-acatgatacaagaatagaacacatgaagactcaaaaccctaaaag-ctaaactttttagaatgtccgcttgaatgatcaa 18221563  T
Q  141 ttaggtcttg 150  Q
    ||||||||||    
T  18221564 ttaggtcttg 18221573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 25105113 - 25105038
Alignment:
Q  195 ttgggcttcaata-caaagcagaccggttcagct-aatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  25105113 ttgggcttcaataacaatgcagatcggttcagcttaatctgcaaaacaagaatcagaaacaaatctggaaagtcct 25105038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 25164206 - 25164131
Alignment:
Q  195 ttgggcttcaata-caaagcagaccggttcagct-aatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  25164206 ttgggcttcaataacaatgcagatcggttcagcttaatctgcaaaacaagaatcagaaacaaatctggaaagtcct 25164131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 20714537 - 20714412
Alignment:
Q  46 ctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattagg 145  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||   | ||||||||||||||||| ||| ||||||    ||||||| ||||||  |||||||||    
T  20714537 ctaaacttgcatca-acacgatacaagagtaga-cacacaaaaactcaaaaccctaaaaa-ctagacttttagaaatgacggtttgaatattcaattagg 20714441  T
Q  146 tcttgaagtcgcccttatataccgaagca 174  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  20714440 tcttgaagtcttccttatatactgaagca 20714412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 16 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16448 - 16208
Alignment:
Q  16 acgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaacttt 115  Q
    |||||||||||||||||||| | |  ||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16448 acgatacaagaaaggatcacaaaa--ggttctaaactcgcatcacaaacgatacaagaatagagcacatgtaaattcaaaaccctaaaaatctaaacttt 16351  T
Q  116 ttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcag 215  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||  |||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||  |||||||||    
T  16350 ttaatatgacggcttgaatgaacaattaggtcctgaagtcccccttatatattgaagcatcttgggctaaatac-ttagttgggcttcagcacaaagcag 16252  T
Q  216 accggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatg 259  Q
    |   |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16251 attagttcagctaatctgcaaaacaagaatcagaaacaaatatg 16208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 22)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 268
Target Start/End: Original strand, 19634210 - 19634461
Alignment:
Q  14 agacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaact 113  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |  ||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  19634210 agacgatacaagaaaggctcacaaaa--ggttctagacttgcatcataaacgatacaagaatagagcacataaagactcaaaaccctaaaaatctaaact 19634307  T
Q  114 ttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagc 213  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||  |||||||    
T  19634308 ttttagtatgacggcttgaattaacaattaggtcttgaagtcttccttatatactgaagcaacttgggctaaatac-ttagttgggcttcagcacaaagc 19634406  T
Q  214 agaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
     || |  |||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  19634407 tgatcaattcagcaaacctgcaaaacaagaatcagaaacaaatctggaaagtcct 19634461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 41 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 18064012 - 18063785
Alignment:
Q  41 aggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaa 140  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18064012 aggttctaaacttgcatcacaaacgatacatgagtagagcacataaagactcaaaaccgtaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgaacaa 18063913  T
Q  141 ttaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaaca 240  Q
    |||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||| |||  ||||    |||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18063912 ttaggtattgaagtcttccttatatactgaagcagctcgggccaaatattctagttgggcttcagcacaaagcagatcggtttagctaatctgcaaaaca 18063813  T
Q  241 agaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    ||||| | | ||||||||| ||||||||    
T  18063812 agaattagagacaaatatggaaagtcct 18063785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Original strand, 44452842 - 44453063
Alignment:
Q  44 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 143  Q
    |||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  44452842 ttctaaacttgcttcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaaactttttagaatgacggcttgaataa-caatta 44452939  T
Q  144 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaaga 243  Q
    ||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44452940 ggtcttgaagtctttcttatatactgaagcagcttgggctaaatac-ttagttgggcttcagcacaaagtagatcggttcagctaatctgcaaaacaaga 44453038  T
Q  244 atcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    |||| |||||||  |||||||||||    
T  44453039 atcagaaacaaaactgaaaagtcct 44453063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Original strand, 18548007 - 18548229
Alignment:
Q  44 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 143  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  18548007 ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-ccttaaaaatctaaactttttagaatgacggcttgaatgaacaatta 18548105  T
Q  144 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaaga 243  Q
    ||| ||||||||  | |||||||| ||||||||||||| |||| |  |||| |||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  18548106 ggttttgaagtcttctttatatactgaagcagcttgggctaaa-tatttagatgggcttcagcacaaagcaaatcggttcagctaatctgcaaaacaaga 18548204  T
Q  244 atcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    |||| |||||||| || ||||||||    
T  18548205 atcagaaacaaatctggaaagtcct 18548229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Original strand, 24195882 - 24196106
Alignment:
Q  44 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 143  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24195882 ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagacgaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgaacaatta 24195980  T
Q  144 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaat-acaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaa 241  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||| | ||  |||||| |||| | |||| | ||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  24195981 ggtcttgaagtcttccttatatactgaagcagcttgggctaaa-taatatgttgggtttcagtaacaatgtagatcagttcagcttaatctgcaaaacaa 24196079  T
Q  242 gaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||    
T  24196080 gaatcagaaacaaatttgaaaagtcct 24196106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 18483173 - 18482951
Alignment:
Q  44 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | |  ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||||    
T  18483173 ttctaaacttgcatcacaaatgatacaagagcataatacataaagactcaaa-ccctaaaaatctaaactttt-agaatgacgacttgaatgaacaatta 18483076  T
Q  144 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaag 242  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| ||| |||||||  | || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  18483075 ggtcttgaagtcttccttatatactgaagcagcttgggctaaa-taattcgtttggcttcagcataatgcagatcggttcagcttaatctgcaaaacaag 18482977  T
Q  243 aatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||    
T  18482976 aatcggaaacaaatctgaaaagtcct 18482951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 41 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18034701 - 18034555
Alignment:
Q  41 aggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaa 140  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  18034701 aggttctaaacttgcatcacaaacaatacaagagtagagcacataaagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgaaaaa 18034602  T
Q  141 ttaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaat 187  Q
    |||||||||||||||   ||||||||| |||| |||| ||| |||||    
T  18034601 ttaggtcttgaagtcttacttatatactgaagaagctcgggctaaat 18034555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 41 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 13515400 - 13515263
Alignment:
Q  41 aggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaa 140  Q
    |||||||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13515400 aggttctagacttgcatcacaaacgatacaagaatagagcacataaagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgataaa 13515301  T
Q  141 ttaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagctt 178  Q
    ||| |||||||||||  ||||||| || ||||||||||    
T  13515300 ttaagtcttgaagtcttccttataaactgaagcagctt 13515263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Original strand, 13791037 - 13791258
Alignment:
Q  44 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 143  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  13791037 ttctaaacatgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaac--ttttagaatgacggcttgaataatcaatta 13791133  T
Q  144 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaag 242  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||| | | | |||||||||||  | || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13791134 ggtcttgaagtcttccttatatactgaagcagcttgggctaaa-taaatcgttgggcttcagcaaaatgcagatcggttcagcttaatctgcaaaacaag 13791232  T
Q  243 aatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    ||| | |||||||| || ||||||||    
T  13791233 aattagaaacaaatctggaaagtcct 13791258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 47 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 23954356 - 23954136
Alignment:
Q  47 taaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggt 146  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| || |||  ||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  23954356 taaacttgcatcacaaacgatacaaaagcagaatacatgaagactcaaa-ccttgaaaatctaaactttt-agaatgacggcttgaatgaacaattaggt 23954259  T
Q  147 cttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaat-acaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaagaa 244  Q
    |||||||||  | |||||||| ||||||| ||||| |||| | ||  ||||||||||| | |||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23954258 cttgaagtcttctttatatactgaagcagtttgggctaaa-taatatgttgggcttcagtaacaatggagatcggttcagcttaatctgcaaaacaagaa 23954160  T
Q  245 tcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    ||| |||||||| || ||||||||    
T  23954159 tcaaaaacaaatctggaaagtcct 23954136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 94 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 7028824 - 7028649
Alignment:
Q  94 aaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcatta 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||| |||| | ||      
T  7028824 aaaccctaaaaatctaaactttttaatatgacggcttaaataaacaattaggtcttgaagtcttccttatgtactgaagcagcttgggctaaa-taatac 7028726  T
Q  194 gttgggcttcaat-acaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    ||||||||||| | | || ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  7028725 gttgggcttcagtaataatgcagatcggttcaacttaatctgcaaaacaagaatcagaaacaaatctggaaagtcct 7028649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 44 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 15635672 - 15635562
Alignment:
Q  44 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 143  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15635672 ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgaacaatta 15635574  T
Q  144 ggtcttgaagtc 155  Q
    | ||||||||||    
T  15635573 gttcttgaagtc 15635562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 49 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 1919039 - 1918822
Alignment:
Q  49 aacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtct 148  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  1919039 aacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaac--ttttagaatgacggcttgaatgaacaattaggtct 1918943  T
Q  149 tgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaat-acaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaagaatc 246  Q
    | |||||  |||||||||| ||||||||||||| |||| | ||  ||||||||||| | |||| ||| |   ||||| | ||||||||||||||||||||    
T  1918942 taaagtcttccttatatactgaagcagcttgggctaaa-taatatgttgggcttcagtaacaatgcatattagttcaacttaatctgcaaaacaagaatc 1918844  T
Q  247 ataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    | |||||||| || ||||||||    
T  1918843 aaaaacaaatctggaaagtcct 1918822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 17135944 - 17135726
Alignment:
Q  44 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 143  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||| ||||||||||||||   |||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  17135944 ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaac--ttttagaatgatggcttgaatgaacaatta 17135848  T
Q  144 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaat-acaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaa 241  Q
    ||||||||||||    |||||||| ||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||| | |||| |||||  |||| ||| |||||| ||||||||    
T  17135847 ggtcttgaagtc-ttattatatactgaagcagcttgggctaaa-taattcgttgggcttcagtaacaatgcagattggtttagcttaatcttcaaaacaa 17135750  T
Q  242 gaatcataaacaaatatgaaaagt 265  Q
    |||||| |||||||| || |||||    
T  17135749 gaatcaaaaacaaatctggaaagt 17135726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 44 - 152
Target Start/End: Original strand, 17702765 - 17702872
Alignment:
Q  44 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 143  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||  |||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  17702765 ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagacgagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaaactttttagtatgatggcttgaatgaacaatta 17702863  T
Q  144 ggtcttgaa 152  Q
    || ||||||    
T  17702864 gggcttgaa 17702872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 41 - 119
Target Start/End: Original strand, 295808 - 295885
Alignment:
Q  41 aggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttag 119  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  295808 aggttctaaacttacatca-acatgatataagagtagagcacatgtagaatcaaaatcctaaaaatctaaaatttttag 295885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 47 - 174
Target Start/End: Original strand, 28051500 - 28051626
Alignment:
Q  47 taaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaa-tgatcaattagg 145  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||||| | |||||| |||||| || |  ||||||    
T  28051500 taaacttgcatca-acatgatacaagaatagaacacatgtagactcaaaaccct-aacagctaaacttttttgaatgacgtcttgaattgtttcattagg 28051597  T
Q  146 tcttgaagtcgcccttatataccgaagca 174  Q
    |||||||||| | | ||||||| ||||||    
T  28051598 tcttgaagtcactcatatatactgaagca 28051626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 13515258 - 13515201
Alignment:
Q  207 acaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaag 264  Q
    |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13515258 acaaagtagatcggctcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatggaaag 13515201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 21253754 - 21253577
Alignment:
Q  87 agactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataa- 185  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||| |||  | |||||||| ||||||   |||| |||     
T  21253754 agactcaaaaccctacaaa-ctaaactttttagaatgagggcttgaatgaataattaggtcttgatgtcttcattatatactgaagcaatatgggctaat 21253656  T
Q  186 attcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtc 266  Q
    |  | ||| ||||||||||  |||||||||| | || ||||||||||||||||| || |||| | ||||| ||| ||||||    
T  21253655 aaacctta-ttgggcttcagaacaaagcagatc-gtccagctaatctgcaaaaccagtatcagagacaaaaatggaaagtc 21253577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 6579346 - 6579238
Alignment:
Q  46 ctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaa-ctttttagtatgacggcttgaatgatcaattag 144  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||   |||  ||||||    
T  6579346 ctaaacttgcatca-acacgatacaagagtagaacacacaaagactcaaaaccctaaaaa-ctaaacctttttagtttgacggcttcggtgacaaattag 6579249  T
Q  145 gtcttgaagtc 155  Q
    |||||||||||    
T  6579248 gtcttgaagtc 6579238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 17042551 - 17042443
Alignment:
Q  46 ctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattagg 145  Q
    |||||||||||||| | | | |||||||||||| ||||   ||||||||||||||| |||   |||||||||||| |||||||||||||||  |||||      
T  17042551 ctaaacttgcatca-acacgttacaagagtagaacacacaaagactcaaaaccctacaaactaaaactttttagtttgacggcttgaatgaataattaaa 17042453  T
Q  146 tcttgaagtc 155  Q
    ||||||||||    
T  17042452 tcttgaagtc 17042443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 229 - 268
Target Start/End: Original strand, 28051680 - 28051719
Alignment:
Q  229 atctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28051680 atctgcaaaacaagaatcagaaacaaatatggaaagtcct 28051719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 15)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 39 - 268
Target Start/End: Original strand, 4246390 - 4246617
Alignment:
Q  39 ataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatc 138  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| | |  ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  4246390 atagattctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcaaaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaaactttttagtatggcggcttgaatgaac 4246488  T
Q  139 aattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaa 238  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4246489 aattaggtcttgaagtcttctttatatactgaagcagcttgggctaaa-taattagttgggcttcagcacaaagcagatcggttcagctaatctgcaaaa 4246587  T
Q  239 caagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  4246588 caagaatcagaaacaaatattgaaagtcct 4246617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 41 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 20841068 - 20840842
Alignment:
Q  41 aggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaa 140  Q
    ||||| || |||||||||| ||| ||||||||| || |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20841068 aggttatagacttgcatcacaaacgatacaagaatatagcacataaagactcaaaacactaaaaatctaaactttttagtatgacggcttaaatgatcaa 20840969  T
Q  141 ttaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaaca 240  Q
    ||||||||||||||    ||||||||  |||| |||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  20840968 ttaggtcttgaagtatttcttatatattgaagaagcttgggctaaatac-ttagttgggcttcagtacaaagcagatcagttcagctaatctacaaaaca 20840870  T
Q  241 agaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20840869 agaatcagaaacaaatatggaaagtcct 20840842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 83 - 268
Target Start/End: Original strand, 24986379 - 24986564
Alignment:
Q  83 atgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttggga 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||     
T  24986379 atgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagaatgacggcttgaatgatctattaggtcttgaagtctcccttatatactgaagcagcttgggc 24986478  T
Q  183 taaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    ||||| | ||||||| ||||||  | |||||| | ||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24986479 taaatactttagttgcgcttcagaaaaaagcaaatcggttcagctaatctacaaaacagaaatcagaaacaaatatggaaagtcct 24986564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 26972230 - 26971977
Alignment:
Q  14 agacgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaact 113  Q
    |||||||||||||||| | |||   |||| ||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  26972230 agacgatacaagaaagaa-cacacaatagattctaaacttgaatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaaact 26972133  T
Q  114 ttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgccc---ttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaat-aca 209  Q
     |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||   |||||||| ||||||||||||| |||| | ||| ||||||||| | | |||    
T  26972132 atttagtatgacggcttgaatcaacaattaggtcttgaagtcttccttattatatactgaagcagcttgggctaaa-taatttgttgggctttagtaaca 26972034  T
Q  210 aagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagt 265  Q
    | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26972033 atgcagatcggttcagcttaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatggaaagt 26971977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Original strand, 13165752 - 13165975
Alignment:
Q  44 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 143  Q
    |||||||||||||||| ||  |||||||||| |||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  13165752 ttctaaacttgcatcacaaccgatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaaactttttagtatgacgacttgaatgaacaatta 13165850  T
Q  144 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaag 242  Q
     |||||||||||  |||||||||| |||||| |||||| |||| | |||  |||||||||| || || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13165851 tgtcttgaagtcttccttatatactgaagcaacttgggctaaa-taattcattgggcttcagtaaaatgcagatcggttcagcttaatctgcaaaacaag 13165949  T
Q  243 aatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    ||| | |||||||| || ||||||||    
T  13165950 aattagaaacaaatctggaaagtcct 13165975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 112 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 20200820 - 20200677
Alignment:
Q  112 ctttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaa 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||| |||||||||| || ||||| | |||||| |||||||  |||||    
T  20200820 ctttttagtatgacggcttgaatgatcaattatgtcttgaagtcttcgttatatactgaagcagcttaggctaaatac-ttagttaggcttcagcacaaa 20200722  T
Q  212 gcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaat 256  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20200721 gcagatcggttcagctaatctgcaaaacaagaatcatatacaaat 20200677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 65 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 17851155 - 17850954
Alignment:
Q  65 gatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttata 164  Q
    |||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  17851155 gatacaagagtagaacacacaaagactcaaaaccctaaaaa-ctacactttttagaatgacggcttgaataatcaattaggtcttgaagtcttccttata 17851057  T
Q  165 taccgaagcagcttgggataa-attcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaa 263  Q
    ||| |||| |   |||| ||| |  | || |||||||||||  |||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||| |||    
T  17851056 tactgaagaaatatgggctaataaacctt-gttgggcttcagaacaaagcaaatc-gtccagctaatctgcaaaacaagaatcagagataaaaatggaaa 17850959  T
Q  264 gtcct 268  Q
    |||||    
T  17850958 gtcct 17850954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 157 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 11667592 - 11667481
Alignment:
Q  157 cccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaat 256  Q
    ||||||||||| ||||||||||||   |||| | ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  11667592 cccttatatactgaagcagcttggaccaaatactttagttgggcttcaaaacaaagcagatcagttcagctaacctgcaaaacaagaattagaaacaaat 11667493  T
Q  257 atgaaaagtcct 268  Q
    ||| ||| ||||    
T  11667492 atggaaaatcct 11667481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 18 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 23477761 - 23477630
Alignment:
Q  18 gatacaagaaaggatcacgatata-ggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttt 116  Q
    |||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||||| |  |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  23477761 gatacaagaaaggatcacaataaaaggtactaaacttgcatcaca--tgatacaagaatagaacacatgaagactcaaaaccct-aaaagataaactttt 23477665  T
Q  117 tagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttga 151  Q
    ||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  23477664 tagaatgacggcttgaataatacattaggtcttga 23477630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 11667689 - 11667607
Alignment:
Q  16 acgatacaagaaaggatcacgatataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaacc 98  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  11667689 acgatacaagaaaggatcacaataaaggttctaaacttgaatcacaaacgatacaaaagtagaacacatgtagactcaaaacc 11667607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 39 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 14745589 - 14745481
Alignment:
Q  39 ataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatc 138  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||| |||||| ||||||||||| |||||   |||||| |||||||||||||||| |    
T  14745589 atagattctaaacttgcatcacaaatgatacaagagaagaatacatgaagactc-aaaccctaaaattctaa--cttttagaatgacggcttgaatgaac 14745493  T
Q  139 aattaggtcttg 150  Q
    ||||||||||||    
T  14745492 aattaggtcttg 14745481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 46 - 155
Target Start/End: Original strand, 12753422 - 12753530
Alignment:
Q  46 ctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaacttttt-agtatgacggcttgaatgatcaattag 144  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||   ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||    
T  12753422 ctaaacttgcatca-acacgatacaagagtagaacacacaaagactaaaaaccctaaaaa-ctaaacttttttagtttgacggcttgaatgaataattag 12753519  T
Q  145 gtcttgaagtc 155  Q
    |||||||||||    
T  12753520 gtcttgaagtc 12753530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 46 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 15803908 - 15803809
Alignment:
Q  46 ctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattagg 145  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||   | |||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  15803908 ctaaacttgcatca-acacgatacaagagtagaacacacaaatactcaaaatcctaaaa-tctagactttttagaatgacggcttgaataatcaattagg 15803811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 154
Target Start/End: Original strand, 1625938 - 1626042
Alignment:
Q  46 ctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattagg 145  Q
    |||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||  ||| ||||||    |||||||||||||| ||||||||||    
T  1625938 ctaaacttgcatca-acacgatacaagagtaga-cacacaaagactcaaaaccctaaaa--ctagacttttagaaatgacggcttgaataatcaattagg 1626033  T
Q  146 tcttgaagt 154  Q
    |||||||||    
T  1626034 tcttgaagt 1626042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 25349959 - 25349874
Alignment:
Q  88 gactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagca 174  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||     ||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||    
T  25349959 gactcaaaaccctaaaaa-ctaatctttttagaatgatggcttgaatacctgattaggtcttgaagtcttccttttatactgaagca 25349874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 25479 - 25256
Alignment:
Q  44 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 143  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  25479 ttctaaacgtgcatcacaaacgatacacgagtagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaacctttttagtatgacgacttgaatgaacaatta 25381  T
Q  144 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaag 242  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  25380 ggtcttgaagtcttccttatatactgaagcagcttgggctaaa-taattcgttgggcttcagtaaaatgcagatcggttcagcttaatctgcaaaacaag 25282  T
Q  243 aatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||    
T  25281 aatcagaaacaaatctggaaagtcct 25256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Original strand, 6266 - 6488
Alignment:
Q  44 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 143  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  6266 ttctaaacttgcatca-acatgatacaagaacagaatacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaattttttagtatgacggcttaaatgagcaatta 6364  T
Q  144 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaaga 243  Q
    ||||||||||||    || ||||| ||||||||||||| ||||| | || ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |    
T  6365 ggtcttgaagtcttgtttttatactgaagcagcttgggctaaatac-ttcgttgggctttagtacaaagcagatcggttcagctaatctgcaaaactgaa 6463  T
Q  244 atcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
     |||||||||||| |||||||||||    
T  6464 ttcataaacaaatctgaaaagtcct 6488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 2168 - 1958
Alignment:
Q  44 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 143  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||| || | ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  2168 ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-ccttgaaaatctaaactttt-agaatgacggcttgaataatcaatta 2071  T
Q  144 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaag 242  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| |||| | ||| |||||||||||  |||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  2070 ggtcttgaagtcttccttatatactgaagcagtttgggctaaa-taatttgttgggcttcagcacaaagcatatcggttcagcttaatctgcaaaacaag 1972  T
Q  243 aatcataaacaaat 256  Q
    ||||| ||||||||    
T  1971 aatcagaaacaaat 1958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 8)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Original strand, 12910851 - 12911073
Alignment:
Q  44 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 143  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| | ||||||    
T  12910851 ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaaactttt-ataatgacggcttgaataaacaatta 12910948  T
Q  144 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaag 242  Q
    ||||||||| ||  |||||||||| ||||||| ||||| |||| | ||| |||||||||||  |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||     
T  12910949 ggtcttgaaatcttccttatatactgaagcagtttgggctaaa-taattcgttgggcttcagcacaatgcagatcggttcagcttaatctgcaaaacaaa 12911047  T
Q  243 aatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||    
T  12911048 aatcagaaacaaatctggaaagtcct 12911073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 44 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 24789960 - 24789737
Alignment:
Q  44 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 143  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||  ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  24789960 ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagtagaatacacgaagactcaaa-ccctaaaaatctaaactttt-agaatgacggcttgaatgaacaatta 24789863  T
Q  144 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaat-acaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaa 241  Q
    ||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||| |||| | ||  ||||||||||| | |||| ||| |  | |||||| |||||||||||||||    
T  24789862 ggtcttgaagtcttacttatatactgaagcagcttgggctaaa-taatatgttgggcttcagtaacaatgcaaatggattcagcttaatctgcaaaacaa 24789764  T
Q  242 gaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||    
T  24789763 gaatcagaaacaaatctggaaagtcct 24789737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 39 - 268
Target Start/End: Original strand, 22611245 - 22611472
Alignment:
Q  39 ataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatc 138  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| | |||||||  |||  ||||| ||||||||| || |||||||||||   |||||| ||||||||||||| || |    
T  22611245 atagattctaaacttgcataacaaacggtacaagaacagaatacatgaagactcaaa-ccgtaaaaatctaac--ttttagaatgacggcttgaaggaac 22611341  T
Q  139 aattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaa-gcagaccggttcagc-taatctgcaa 236  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||| |||| | ||  ||||||||||| || ||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22611342 aattaggtcttgaagtcttccttatatactgaagcaccttgggctaaa-taatacgttgggcttcagtaaaaatgcagatcggttcagcttaatctgcaa 22611440  T
Q  237 aacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22611441 aacaagaatcataaacaaatttggaaagtcct 22611472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 44 - 256
Target Start/End: Original strand, 23758983 - 23759193
Alignment:
Q  44 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 143  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| |||||| |||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||  ||||||    
T  23758983 ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactc-aaaccctaaaaatctaa--cttttagaatgacggcttgaatgtgcaatta 23759079  T
Q  144 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaat-acaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaa 241  Q
    |||||| || ||  |  ||| ||| ||||||||||||| |||| | ||  ||||||||||| | |||| ||||| || |||||| |||||| ||||||||    
T  23759080 ggtcttcaactcttctatatgtactgaagcagcttgggctaaa-taatacgttgggcttcagtaacaatgcagatcgtttcagcttaatctacaaaacaa 23759178  T
Q  242 gaatcataaacaaat 256  Q
    |||||| ||||||||    
T  23759179 gaatcagaaacaaat 23759193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 172
Target Start/End: Original strand, 21530762 - 21530867
Alignment:
Q  66 atacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatat 165  Q
    ||||||||||||| ||||   | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||  |||| |||    
T  21530762 atacaagagtagaacacacaaaaactcaaaaccctaaaaa-ctaaactttttagaatgacagcttgaatattcaattaggtcttgaagtcttccttttat 21530860  T
Q  166 accgaag 172  Q
    || ||||    
T  21530861 actgaag 21530867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 87 - 247
Target Start/End: Original strand, 15328723 - 15328885
Alignment:
Q  87 agactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatga----tcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttggga 182  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||    ||||||||||||||| |||  |||| ||||| ||||||||| |||     
T  15328723 agactcaaaaccctaaaaa-ctaaactttttagaatgacgggttgaatgaataatcaattaggtcttgatgtcttccttttatactgaagcagctcgggt 15328821  T
Q  183 taaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatca 247  Q
     ||||    | |||||||||||  ||||| |||| | || ||||| |||||||||||| ||||||    
T  15328822 caaatattcttgttgggcttcagaacaaaacagatc-gtccagctgatctgcaaaacaggaatca 15328885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 174
Target Start/End: Original strand, 19445002 - 19445088
Alignment:
Q  87 agactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaat-gatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagca 174  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||    
T  19445002 agactcaaaaccctaaaaa-ctaaactttttagaatgacggctagaatagat-aattaggtcttgaagtcttccttttatactgaagca 19445088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 19466280 - 19466225
Alignment:
Q  89 actcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattagg 145  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19466280 actcaaaaccctaaaag-ctagactttttagaatgacggcttgaatgatcaattagg 19466225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 39 - 256
Target Start/End: Original strand, 36945 - 37159
Alignment:
Q  39 ataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatc 138  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |    
T  36945 atagattctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaaactttt-agaatgacagcttgaatgaac 37042  T
Q  139 aattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaa 238  Q
    |||||||||||||||||  |||| || ||  ||| ||| |||| |||||  ||| ||||||| |||  |||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  37043 aattaggtcttgaagtcttccttctagactaaagtagcatgggctaaata-attcgttgggcctcagcacaaagcaaatcggttcagctagtctgcaaaa 37141  T
Q  239 caagaatcataaacaaat 256  Q
    ||||||||||||||||||    
T  37142 caagaatcataaacaaat 37159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 110065 - 109837
Alignment:
Q  39 ataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatc 138  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||| ||||||| |  |||  ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||| |    
T  110065 atagattctaaactttcatcacaaacgatacaaaaacagaatacatgaagactcaaa-ccctaataatctaaactttt-agaatgacggtttgaatgaac 109968  T
Q  139 aattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaat-acaaagcagaccggttcagc-taatctgcaa 236  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||| | ||| ||||||||||| | |||| ||| |  |||||||| ||||||||||    
T  109967 aattaggtcttgaagtcttccttatatactgaagcagcttgggctaaa-taattcgttgggcttcagtaacaatgcatattggttcagcttaatctgcaa 109869  T
Q  237 aacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  109868 aacaagaatcagaaacaaatctggaaagtcct 109837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 39 - 256
Target Start/End: Original strand, 159426 - 159640
Alignment:
Q  39 ataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatc 138  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  | | | ||||||||| || |||||||||||   |||||| |||||||||||||||  |    
T  159426 atagattctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatatacgaagactcaaagcc-taaaaatctaac--ttttagaatgacggcttgaatggac 159522  T
Q  139 aattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaa 237  Q
    |||||||||||||||||  | |||| ||| |||||| |||||| |||| | ||| ||||||||||| || || ||||| |||||| || |||||||||||    
T  159523 aattaggtcttgaagtcttctttatgtactgaagcaacttgggctaaa-taattcgttgggcttcagtaaaatgcagatcggttcggcttaatctgcaaa 159621  T
Q  238 acaagaatcataaacaaat 256  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  159622 acaagaatcagaaacaaat 159640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 12311 - 12183
Alignment:
Q  44 ttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaatta 143  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||| ||||||    
T  12311 ttctaaacttgcatcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagactcaaa-ccctaaaaatctaaactttt-agagtgacgacttgaatgagcaatta 12214  T
Q  144 ggtcttgaagtcgcccttatataccgaagca 174  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  12213 ggtcttgaagtcttccttatatactgaagca 12183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 94 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 357046 - 356885
Alignment:
Q  94 aaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcatta 193  Q
    |||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||  |||||||||||| |||| | |||     
T  357046 aaaccctaaaaatctaac--ttttagaatgacggcttgaataatcaattaggttttgaagtcttccttatatactaaagcagcttgggctaaa-taattt 356950  T
Q  194 gttgggcttcaat-acaaagcagaccggttcagc-taatctgcaaaacaagaatcataaacaaat 256  Q
    | ||||||||| | |||| ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  356949 gatgggcttcagtaacaatgcagatcggttcagcttaatcttcaaaacaagaatcagaaacaaat 356885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 166
Target Start/End: Original strand, 2273 - 2398
Alignment:
Q  39 ataggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttgaatgatc 138  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||  ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    
T  2273 atagattctaaacttgcgtcacaaacgatacaagagcagaatacatgaagacttaaa-ccctaaaaatctaaactttt-agaatgacggcttgaatgaac 2370  T
Q  139 aattaggtcttgaagtcgcccttatata 166  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||    
T  2371 aattaggtcttgaagtcttccttatata 2398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 176
Target Start/End: Original strand, 26735 - 26895
Alignment:
Q  16 acgatacaagaaaggatcacgatata-ggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactt 114  Q
    ||||||||||||||| || | ||| | ||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||    ||||||    
T  26735 acgatacaagaaaggctcgcaataaaaggtactaaacttgcatca-acatgatacaagaatagaacacatgaagacttaaaaccctaaaagctaaaactt 26833  T
Q  115 tttagtatgacggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagc 176  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||  |||| ||||| ||||||||    
T  26834 tttagaatgatggcttgaataatcaattaggtcttgatgtcttccttttatactgaagcagc 26895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0059 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:

Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 126 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 48113 - 47970
Alignment:
Q  126 ggcttgaatgatcaattaggtcttgaagtcgcccttatataccgaagcagcttgggataaattcattagttgggcttcaat-acaaagcagaccggttca 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||| | ||  ||||||||||| | |||  ||| | |||||||    
T  48113 ggcttgaataatcaattaggtcttgaagtcttccttatatactgaagcagcttgggctaaa-taatacgttgggcttcagtaacagtgcaaatcggttca 48015  T
Q  225 gc-taatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    || |||| |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  48014 gcttaatatgcaaaacaagaatcaaaaacaaatctggaaagtcct 47970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 173 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 16998 - 16904
Alignment:
Q  173 cagcttgggataaattcattagttgggcttcaatacaaagcagaccggttcagctaatctgcaaaacaagaatcataaacaaatatgaaaagtcct 268  Q
    ||||||||| ||||| | ||| |||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16998 cagcttgggttaaatac-ttatttggacttcagcacaaagcagatcggttcagctaatctgcgaaacagaaatcagaaacaaatatgaaaagtcct 16904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 41 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 17082 - 16992
Alignment:
Q  41 aggttctaaacttgcatcataaatgatacaagagtagagcacatgtagactcaaaaccctaaaaatctaaactttttagtatgacggcttg 131  Q
    |||||||| || ||||||| ||| ||||||||| || |||||||  |||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17082 aggttctagacctgcatcacaaacgatacaagaataaagcacataaagactcaaaaaccaataaatctaaactttttagtatgacagcttg 16992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 436 times since January 2019
Visitors: 5836